
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    8279] =>      8279 nucs 'mol-32-1e66-022145_8279'

Score:        8203
Aligned:      8280        nucs
Identic:      8273 (100%) nucs =>      6123 (100%)      2150 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55818329,55824451] EXCISED REGION [55824453,55826609]
 second seq =>  [       1,    6123] EXCISED REGION [    6125,    8279]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55824452,55824452]
 second seq =>         1 nucs [6124,6124]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [55824940,55824940]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55824452,55824452] to [55824453,55824453]
 second seq =>         1 nucs [6123,6123] to [6124,6124]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55818329 AGTGCTATGAAATCCCTTAAATCAAACTAACTAGCACACTTATGAAACCAGAGTACTATC 55818388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGCTATGAAATCCCTTAAATCAAACTAACTAGCACACTTATGAAACCAGAGTACTATC 60

 55818389 TTACTATGCCAGAGTATTCTTTTCGTATTCTGCCATCTAGTGAACAACAATCATTTGTAC 55818448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTACTATGCCAGAGTATTCTTTTCGTATTCTGCCATCTAGTGAACAACAATCATTTGTAC 120

 55818449 AACCTGGCTTGTAAATTGCTTCTTCCAAATTTAAAATAAACACACACGCACACGCACACG 55818508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACCTGGCTTGTAAATTGCTTCTTCCAAATTTAAAATAAACACACACGCACACGCACACG 180

 55818509 CACCCCTTCATTTTATGCTTTCTCATTATATATACTGGCAAAATATTCTTTCATGATATT 55818568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACCCCTTCATTTTATGCTTTCTCATTATATATACTGGCAAAATATTCTTTCATGATATT 240

 55818569 TTACAAACAAAATTCCTAAACATAGAGGAAAGAATAGAGTTCATCAGCTGAATCTGCACA 55818628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTACAAACAAAATTCCTAAACATAGAGGAAAGAATAGAGTTCATCAGCTGAATCTGCACA 300

 55818629 TTTCACCTTGGGCTCATTTTGAAATTTATATTTTTAAAGTCAAGGGAAATTCACAAGTTT 55818688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCACCTTGGGCTCATTTTGAAATTTATATTTTTAAAGTCAAGGGAAATTCACAAGTTT 360

 55818689 CCTTTACATTATGCCATCTCCTTTTATCATTAAAAACAACAAAAACAAAACATTTACTTG 55818748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTTTACATTATGCCATCTCCTTTTATCATTAAAAACAACAAAAACAAAACATTTACTTG 420

 55818749 TCAGCAACTTTCTTCTCTGTAATAAAATACCTTTATATAAATTATCTTTCTCCTGCAATG 55818808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAGCAACTTTCTTCTCTGTAATAAAATACCTTTATATAAATTATCTTTCTCCTGCAATG 480

 55818809 AGCATTGTTTAATATTATCAAAAGTTTTTTATCTCAAAAATTATTGTACATGATACACTA 55818868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCATTGTTTAATATTATCAAAAGTTTTTTATCTCAAAAATTATTGTACATGATACACTA 540

 55818869 GAGATATTATTTGAATGTTGTGGAAGTACCTTGTACAAATTTATTTTCTTGATATTTAGT 55818928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGATATTATTTGAATGTTGTGGAAGTACCTTGTACAAATTTATTTTCTTGATATTTAGT 600

 55818929 TCTATAAAAGCTTCCCTGATTTCTCCTAAGGTGGTCACTTATTTTGTGCTGTTAGCGTAC 55818988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTATAAAAGCTTCCCTGATTTCTCCTAAGGTGGTCACTTATTTTGTGCTGTTAGCGTAC 660

 55818989 CTTTGTGTCACTAGTATTGTGGTAGTATTATACTATATTTTAAATATTCATTTTCAAGCC 55819048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTGTGTCACTAGTATTGTGGTAGTATTATACTATATTTTAAATATTCATTTTCAAGCC 720

 55819049 TATCTTTGCAAAGGGCTCATGAATTTCCTGATTAAAGGGACTATGTAATATTCAGTTTTA 55819108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATCTTTGCAAAGGGCTCATGAATTTCCTGATTAAAGGGACTATGTAATATTCAGTTTTA 780

 55819109 TGTCTCCAATAACTCTCATGATGTATGGTATCTATTAGTTTTCAATAAATGTTAACGAAT 55819168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTCTCCAATAACTCTCATGATGTATGGTATCTATTAGTTTTCAATAAATGTTAACGAAT 840

 55819169 GATTTAAAATGATTGAACTGAATTATTGACAGATGTTTGAAACTTGACTAATTTTTATTC 55819228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATTTAAAATGATTGAACTGAATTATTGACAGATGTTTGAAACTTGACTAATTTTTATTC 900

 55819229 AAGTTGAAATAATATGTAAAGTAAGCAATCACAACATTCAGCTTCCTTCATGAAGTCCAG 55819288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGTTGAAATAATATGTAAAGTAAGCAATCACAACATTCAGCTTCCTTCATGAAGTCCAG 960

 55819289 AAGAGAACTGAACATATTGCCCAAGTGCCCAGAGGGCCCTAAAATATAGATGTGTGTTCA 55819348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGAGAACTGAACATATTGCCCAAGTGCCCAGAGGGCCCTAAAATATAGATGTGTGTTCA 1020

 55819349 TTAGGCTAATTGGAGACAGGTAGACAAAAATCCTCCTTTGAAATTTGTCCTCATAGGCAA 55819408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAGGCTAATTGGAGACAGGTAGACAAAAATCCTCCTTTGAAATTTGTCCTCATAGGCAA 1080

 55819409 TGGCATTATTCCCAGGCTTATCAAGTTCTTTCCCTTGGCAGATCTCTGTGGTCCATCTGC 55819468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGCATTATTCCCAGGCTTATCAAGTTCTTTCCCTTGGCAGATCTCTGTGGTCCATCTGC 1140

 55819469 TGAACTTAAATGCTGAAATGGTCTCAATGTGAACATGCCTAATGGACATCTTTATTCTGA 55819528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAACTTAAATGCTGAAATGGTCTCAATGTGAACATGCCTAATGGACATCTTTATTCTGA 1200

 55819529 GTGGCTATACCAGCACAATCCATAAATCTGAGCTATTTCAGATTACAAATGGAATTGTTC 55819588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGGCTATACCAGCACAATCCATAAATCTGAGCTATTTCAGATTACAAATGGAATTGTTC 1260

 55819589 TCCACAGTGTTCCATTGCCTTATAGATAATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATGAAA 55819648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCCACAGTGTTCCATTGCCTTATAGATAATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATGAAA 1320

 55819649 TTAGCTCTAAGAGTTCAATTGATATTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAATTC 55819708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTAGCTCTAAGAGTTCAATTGATATTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAATTC 1380

 55819709 ATCTATATATCTGAACTCATTCATTTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAAGT 55819768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCTATATATCTGAACTCATTCATTTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAAGT 1440

 55819769 AAAGACTCCATCTACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTAGG 55819828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAGACTCCATCTACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTAGG 1500

 55819829 TAACTGTTTTCATTTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATCAA 55819888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAACTGTTTTCATTTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATCAA 1560

 55819889 GCATTAAGTTTCTCGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGCTG 55819948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCATTAAGTTTCTCGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGCTG 1620

 55819949 TAGTCATCCCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAATTT 55820008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAGTCATCCCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAATTT 1680

 55820009 TCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTGAT 55820068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTGAT 1740

 55820069 ATCTTGACAGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGTGA 55820128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATCTTGACAGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGTGA 1800

 55820129 AGAAAGTAGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGT 55820188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGAAAGTAGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGT 1860

 55820189 TTTCTTCTTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCA 55820248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTCTTCTTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCA 1920

 55820249 CATGATCTGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTT 55820308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CATGATCTGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTT 1980

 55820309 ACAAACAGAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGC 55820368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACAAACAGAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGC 2040

 55820369 AGAAAATTTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACT 55820428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGAAAATTTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACT 2100

 55820429 TAGGTAATGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCT 55820488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAGGTAATGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCT 2160

 55820489 TTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTG 55820548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTG 2220

 55820549 GAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAA 55820608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAA 2280

 55820609 TTGAGACTTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAG 55820668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGAGACTTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAG 2340

 55820669 GGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACA 55820728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACA 2400

 55820729 GTCCACATGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTG 55820788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTCCACATGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTG 2460

 55820789 CTCTTTCAAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGT 55820848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTCTTTCAAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGT 2520

 55820849 TTATAAGTATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATT 55820908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTATAAGTATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATT 2580

 55820909 TCTAGGCACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGC 55820968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCTAGGCACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGC 2640

 55820969 ATTTTTATTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGT 55821028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTTTTATTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGT 2700

 55821029 ATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAA 55821088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAA 2760

 55821089 ACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAA 55821148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAA 2820

 55821149 AAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAA 55821208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAA 2880

 55821209 AGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAG 55821268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAG 2940

 55821269 TATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAA 55821328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAA 3000

 55821329 TTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAAT 55821388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAAT 3060

 55821389 CTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGT 55821448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGT 3120

 55821449 GGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTT 55821508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTT 3180

 55821509 TGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAG 55821568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAG 3240

 55821569 AATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAAC 55821628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAAC 3300

 55821629 AAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAAT 55821688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAAT 3360

 55821689 TGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTT 55821748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTT 3420

 55821749 AAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTA 55821808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTA 3480

 55821809 TATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGC 55821868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGC 3540

 55821869 AACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCT 55821928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCT 3600

 55821929 TGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGC 55821988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGC 3660

 55821989 AACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGAT 55822048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGAT 3720

 55822049 TTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGG 55822108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGG 3780

 55822109 CAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCC 55822168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCC 3840

 55822169 CAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGG 55822228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGG 3900

 55822229 CGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAG 55822288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAG 3960

 55822289 GGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACC 55822348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACC 4020

 55822349 CTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTG 55822408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTG 4080

 55822409 GGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTAT 55822468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTAT 4140

 55822469 TGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCT 55822528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCT 4200

 55822529 TCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAA 55822588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAA 4260

 55822589 AACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCC 55822648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCC 4320

 55822649 TATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAG 55822708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAG 4380

 55822709 TTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGG 55822768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGG 4440

 55822769 GGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGAT 55822828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGAT 4500

 55822829 GGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCT 55822888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCT 4560

 55822889 ATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGC 55822948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGC 4620

 55822949 TGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGT 55823008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGT 4680

 55823009 CACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAG 55823068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAG 4740

 55823069 GAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAA 55823128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAA 4800

 55823129 TCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCT 55823188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCT 4860

 55823189 TAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGA 55823248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGA 4920

 55823249 AACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCT 55823308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCT 4980

 55823309 CTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTA 55823368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTA 5040

 55823369 ATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAA 55823428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 ATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAA 5100

 55823429 ACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTT 55823488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 ACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTT 5160

 55823489 GAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGA 55823548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGA 5220

 55823549 TTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATG 55823608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATG 5280

 55823609 GATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACC 55823668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACC 5340

 55823669 TACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGA 55823728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGA 5400

 55823729 CCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTG 55823788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTG 5460

 55823789 AGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAAT 55823848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAAT 5520

 55823849 ATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACA 55823908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 ATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACA 5580

 55823909 GTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTT 55823968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTT 5640

 55823969 ATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAA 55824028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 ATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAA 5700

 55824029 TATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTT 55824088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTT 5760

 55824089 ATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCC 55824148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 ATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCC 5820

 55824149 AGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAA 55824208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 AGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAA 5880

 55824209 AGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATAT 55824268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 AGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATAT 5940

 55824269 TATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGT 55824328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGT 6000

 55824329 TTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAA 55824388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAA 6060

 55824389 AACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCC 55824448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 AACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCC 6120

 55824449 TTC 55824451
          |||
     6121 TTC 6123

EXCISED REGION

 55824453 TACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGC 55824512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6125 TACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGC 6184

 55824513 TAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTG 55824572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6185 TAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTG 6244

 55824573 ACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTT 55824632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6245 ACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTT 6304

 55824633 AAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGC 55824692
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     6305 AAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGC 6364

 55824693 ACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGC 55824752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6365 ACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGC 6424

 55824753 AACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCAC 55824812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6425 AACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCAC 6484

 55824813 ACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTG 55824872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6485 ACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTG 6544

 55824873 GAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACC 55824932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6545 GAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACC 6604

 55824933 CTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTC 55824992
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6605 CTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTC 6663

 55824993 TCACAAGTAAGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTG 55825052
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6664 TCACAAGTAAGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTG 6723

 55825053 ACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTAT 55825112
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6724 ACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTAT 6783

 55825113 CATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGG 55825172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6784 CATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGG 6843

 55825173 ACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAAT 55825232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6844 ACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAAT 6903

 55825233 CCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATT 55825292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6904 CCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATT 6963

 55825293 ATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGT 55825352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6964 ATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGGAGT 7023

 55825353 TTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCA 55825412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7024 TTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCA 7083

 55825413 TTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAG 55825472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7084 TTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAG 7143

 55825473 GCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAA 55825532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7144 GCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAA 7203

 55825533 ATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCT 55825592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7204 ATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCT 7263

 55825593 AAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTT 55825652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7264 AAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTT 7323

 55825653 TCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGA 55825712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7324 TCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGA 7383

 55825713 ACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACT 55825772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7384 ACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACT 7443

 55825773 TTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACA 55825832
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7444 TTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACA 7503

 55825833 ACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTAC 55825892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7504 ACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTAC 7563

 55825893 TGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAAT 55825952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7564 TGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAAT 7623

 55825953 GAAATGATCTACTTTTATAATATATATAAAATTATATTATTTTTGTAATATATATAAAAA 55826012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7624 GAAATGATCTACTTTTATAATATATATAAAATTATATTATTTTTGTAATATATATAAAAA 7683

 55826013 ATATGATTTTATATATAAAAAGATCTATTTTTATAATATATATAAAAATAGATTATTTTA 55826072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     7684 ATATGATTTTATATATAAAAAGATCTATTTTTATAATATATAT-AAAATAGATTATTTTA 7742

 55826073 TCACATGATATATAAAATAGATGGTTTTGTCCTCTCTCATATAATTCGTACTTACACAGG 55826132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7743 TCACATGATATATAAAATAGATGGTTTTGTCCTCTCTCATATAATTCGTACTTACACAGG 7802

 55826133 CTCTATAATTCTTCTAGGCTGTAAAATATCCTTTGTAGAAAGAGCTAAATATTAGTACAT 55826192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7803 CTCTATAATTCTTCTAGGCTGTAAAATATCCTTTGTAGAAAGAGCTAAATATTAGTACAT 7862

 55826193 GGAAATATTTTCAGCTCCTTATTAAAATATGAGACTGCTGAAAAACAATAATTAGACTTC 55826252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7863 GGAAATATTTTCAGCTCCTTATTAAAATATGAGACTGCTGAAAAACAATAATTAGACTTC 7922

 55826253 AATATTTAGGAGCTTTTGCATACTTTAAATGCTATGGTTTATTTTTAATATTTTCAAGAT 55826312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7923 AATATTTAGGAGCTTTTGCATACTTTAAATGCTATGGTTTATTTTTAATATTTTCAAGAT 7982

 55826313 TTTATTTTTGAAGATCATAAACCTTAATTATAATTGCAAATAATAAAAAAAGCAGTGGCC 55826372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7983 TTTATTTTTGAAGATCATAAACCTTAATTATAATTGCAAATAATAAAAAAAGCAGTGGCC 8042

 55826373 AGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCATATCAT 55826432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8043 AGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCATATCAT 8102

 55826433 CTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAAACCCGTCTCTACTCAAA 55826492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8103 CTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAAACCCGTCTCTACTCAAA 8162

 55826493 ATACAAAATGAGCTGGGTGTAGTAGCACGTGCCTGTCATCCCAGCTGCTTGGTAGGCTTA 55826552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8163 ATACAAAATGAGCTGGGTGTAGTAGCACGTGCCTGTCATCCCAGCTGCTTGGTAGGCTTA 8222

 55826553 GGCAGGACAATCACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCC 55826609
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8223 GGCAGGACAATCACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCC 8279

Alignment time is 19.9121 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4340] =>      4340 nucs 'mol-32-1e7c-103475_4340'

Score:        4283
Aligned:      4338        nucs
Identic:      4333 (100%) nucs =>       401 (100%)      3932 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55825555,55825957] EXCISED REGION [55846713,55850647]
 second seq =>  [       1,     403] EXCISED REGION [     407,    4340]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [404,406]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [403,403] to [406,406]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55825555 TATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCAT 55825614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCAT 60

 55825615 CTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGT 55825674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGT 120

 55825675 CCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACAT 55825734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACAT 180

 55825735 TTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAG 55825794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      181 TTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAGG 240

 55825795 GCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCT 55825854
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCT 300

 55825855 ACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGA 55825914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGA 360

 55825915 AATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 55825957
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 403

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      407 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 466

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      467 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 526

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      527 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 586

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      587 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 646

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      647 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 706

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      707 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 766

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      767 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 826

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      827 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 886

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      887 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 946

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      947 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 1006

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1007 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 1066

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1067 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 1126

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1127 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 1186

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1187 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 1246

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1247 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 1306

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 1366

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 55847732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     1367 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 1425

 55847733 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 55847792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 1485

 55847793 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 55847852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 1545

 55847853 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 55847912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 1605

 55847913 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 55847972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 1665

 55847973 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 55848032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 1725

 55848033 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 55848092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 1785

 55848093 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 55848152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1786 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 1845

 55848153 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 55848212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 1905

 55848213 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 55848272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 1965

 55848273 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 55848332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 2025

 55848333 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 55848392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 2085

 55848393 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 55848452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 2145

 55848453 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 55848512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 2205

 55848513 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 55848572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 2265

 55848573 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 55848632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 2325

 55848633 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 55848692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 2385

 55848693 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 55848752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 2445

 55848753 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 55848812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 2505

 55848813 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 55848872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 2565

 55848873 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 55848932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 2625

 55848933 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 55848992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 2685

 55848993 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 55849052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 2745

 55849053 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 55849112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 2805

 55849113 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 55849172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 2865

 55849173 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 55849232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 2925

 55849233 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 55849292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 2985

 55849293 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 55849352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 3045

 55849353 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 55849412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 3105

 55849413 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 55849472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 3165

 55849473 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 55849532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 3225

 55849533 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 55849592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 3285

 55849593 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 55849652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 3345

 55849653 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 55849712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 3405

 55849713 GAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCATGAGAA 55849772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 GAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCATGAGAA 3465

 55849773 CTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCACCTCC 55849832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 CTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCACCTCC 3525

 55849833 CACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAGATTTG 55849892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 CACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAGATTTG 3585

 55849893 GGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGCGCTCA 55849952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 GGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGCGCTCA 3645

 55849953 GAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTTATTTT 55850012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 GAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTTATTTT 3705

 55850013 AGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATACGCTA 55850072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 AGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATACGCTA 3765

 55850073 CACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGATTAAA 55850132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 CACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGATTAAA 3825

 55850133 GATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGTTTTTA 55850192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 GATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGTTTTTA 3885

 55850193 TCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATTTGTCA 55850252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 TCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATTTGTCA 3945

 55850253 TGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACAGTTTT 55850312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 TGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACAGTTTT 4005

 55850313 GAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGATGTTTT 55850372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 GAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGATGTTTT 4065

 55850373 TCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGCAGAAA 55850432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4066 TCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGCAGAAA 4125

 55850433 ACTGCATAGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAGTTCCC 55850492
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4126 ACTGCATGGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAGTTCCC 4185

 55850493 ACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAGCCTCC 55850552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4186 ACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAGCCTCC 4245

 55850553 AACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAAGGAAC 55850612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4246 AACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAAGGAAC 4305

 55850613 GCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGG 55850647
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4306 GCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGG 4340

Alignment time is 11.2506 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2125] =>      2125 nucs 'mol-32-1e87-091091_2125'

Score:        2112
Aligned:      2123        nucs
Identic:      2122 (100%) nucs =>       619 (100%)      1503 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55845906,55846524] EXCISED REGION [55846528,55848031]
 second seq =>  [       1,     619] EXCISED REGION [     623,    2125]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [620,622]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [620,620] to [622,622]

 55845906 TGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGA 55845965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGA 60

 55845966 CAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATT 55846025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATT 120

 55846026 TGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATG 55846085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATG 180

 55846086 AGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGC 55846145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGC 240

 55846146 CTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATG 55846205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATG 300

 55846206 CAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCC 55846265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCC 360

 55846266 CTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGC 55846325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGC 420

 55846326 ACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATT 55846385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATT 480

 55846386 TTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTC 55846445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTC 540

 55846446 TTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTT 55846505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTT 600

 55846506 TTAAAACACAGAGAGAAAG 55846524
          |||||||||||||||||||
      601 TTAAAACACAGAGAGAAAG 619

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      623 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 682

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 742

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      743 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 802

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      803 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 862

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      863 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 922

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      923 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 982

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      983 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 1042

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1043 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 1102

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1103 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 1162

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1163 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 1222

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1223 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 1282

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1283 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 1342

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1343 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 1402

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 1462

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 1522

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 1582

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 1642

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 1702

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 1762

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTG 55847727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     1763 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTG 1821

 55847728 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 55847787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 1881

 55847788 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 55847847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 1941

 55847848 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 55847907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 2001

 55847908 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 55847967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 2061

 55847968 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 55848027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 2121

 55848028 GATG 55848031
          ||||
     2122 GATG 2125

Alignment time is 5.53773 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    7252] =>      7252 nucs 'mol-32-1f21-120985_7252'

Score:        7137
Aligned:      7249        nucs
Identic:      7238 (100%) nucs =>      2313 (100%)      4925 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55823638,55825957] EXCISED REGION [55846713,55851641]
 second seq =>  [       1,    2318] EXCISED REGION [    2322,    7249]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [2319,2321]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [2318,2318] to [2321,2321]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55823638 AATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAG 55823697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAG 60

 55823698 TAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTG 55823757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTG 120

 55823758 CTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAA 55823817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAA 180

 55823818 GTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATC 55823877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATC 240

 55823878 CATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATAT 55823937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATAT 300

 55823938 TGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGT 55823997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGT 360

 55823998 ATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCT 55824057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCT 420

 55824058 TGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTT 55824117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTT 480

 55824118 AATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTT 55824177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTT 540

 55824178 TCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTA 55824237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTA 600

 55824238 GTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAAT 55824297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAAT 660

 55824298 TATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAAT 55824357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAAT 720

 55824358 CACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTA 55824417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTA 780

 55824418 ATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCTTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCT 55824477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCCTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCT 840

 55824478 AACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTT 55824537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTT 900

 55824538 TATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTT 55824597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTT 960

 55824598 ACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAAT 55824657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAAT 1020

 55824658 TTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGA 55824717
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGA 1080

 55824718 TCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGC 55824777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGC 1140

 55824778 AAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAG 55824837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAG 1200

 55824838 GCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACA 55824897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACA 1260

 55824898 CCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATT 55824957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||
     1261 CCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAA--TT 1318

 55824958 CATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGATGTAAACTTCAA 55825017
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1319 CATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGCTGTAAACTTCAA 1378

 55825018 GTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTT 55825077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTT 1438

 55825078 CTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCC 55825137
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 CTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCC 1498

 55825138 GTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGA 55825197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGA 1558

 55825198 GCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATA 55825257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATA 1618

 55825258 AATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATA 55825317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 AATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATA 1678

 55825318 CCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAG 55825377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 CCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAG 1738

 55825378 TCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCC 55825437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCC 1798

 55825438 CATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGC 55825497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGC 1858

 55825498 ATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTAT 55825557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 ATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTAT 1918

 55825558 TATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTC 55825617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTC 1978

 55825618 TGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCT 55825677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCT 2038

 55825678 AAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTC 55825737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTC 2098

 55825738 ATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCC 55825797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 ATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCC 2158

 55825798 AAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACA 55825857
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACA 2218

 55825858 TGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAAT 55825917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAAT 2278

 55825918 GAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 55825957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 2318

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 2381

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 2441

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 2501

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 2561

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 2621

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 2681

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 2741

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 2801

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 2861

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 2921

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 2981

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 3041

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 3101

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 3161

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 3221

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 3281

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 55847732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     3282 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 3340

 55847733 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 55847792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 3400

 55847793 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 55847852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 3460

 55847853 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 55847912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 3520

 55847913 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 55847972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 3580

 55847973 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 55848032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 3640

 55848033 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 55848092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 3700

 55848093 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 55848152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3701 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 3760

 55848153 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 55848212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 3820

 55848213 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 55848272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 3880

 55848273 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 55848332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 3940

 55848333 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 55848392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 4000

 55848393 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 55848452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 4060

 55848453 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 55848512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 4120

 55848513 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 55848572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 4180

 55848573 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 55848632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 4240

 55848633 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 55848692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 4300

 55848693 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 55848752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 4360

 55848753 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 55848812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 4420

 55848813 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 55848872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 4480

 55848873 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 55848932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 4540

 55848933 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 55848992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 4600

 55848993 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 55849052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 4660

 55849053 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 55849112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 4720

 55849113 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 55849172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 4780

 55849173 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 55849232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 4840

 55849233 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 55849292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 4900

 55849293 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 55849352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 4960

 55849353 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 55849412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 5020

 55849413 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 55849472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 5080

 55849473 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 55849532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 5140

 55849533 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 55849592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 5200

 55849593 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 55849652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 5260

 55849653 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 55849712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 5320

 55849713 GAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCATGAGAA 55849772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 GAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCATGAGAA 5380

 55849773 CTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCACCTCC 55849832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 CTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCACCTCC 5440

 55849833 CACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAGATTTG 55849892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 CACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAGATTTG 5500

 55849893 GGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGCGCTCA 55849952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 GGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGCGCTCA 5560

 55849953 GAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTTATTTT 55850012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 GAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTTATTTT 5620

 55850013 AGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATACGCTA 55850072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 AGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATACGCTA 5680

 55850073 CACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGATTAAA 55850132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 CACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGATTAAA 5740

 55850133 GATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGTTTTTA 55850192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5741 GATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGTTTTTA 5800

 55850193 TCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATTTGTCA 55850252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5801 TCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATTTGTCA 5860

 55850253 TGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACAGTTTT 55850312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5861 TGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACAGTTTT 5920

 55850313 GAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGATGTTTT 55850372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5921 GAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGATGTTTT 5980

 55850373 TCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGCAGAAA 55850432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5981 TCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGCAGAAA 6040

 55850433 ACTGCATAGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAGTTCCC 55850492
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6041 ACTGCATGGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAGTTCCC 6100

 55850493 ACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAGCCTCC 55850552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6101 ACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAGCCTCC 6160

 55850553 AACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAAGGAAC 55850612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6161 AACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAAGGAAC 6220

 55850613 GCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGAGCCTA 55850672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6221 GCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGAGCCTA 6280

 55850673 TATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAAATTTC 55850732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6281 TATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAAATTTC 6340

 55850733 TCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTATTGAC 55850792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6341 TCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTATTGAC 6400

 55850793 CTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATCTATCC 55850852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6401 CTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATCTATCC 6460

 55850853 CTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTTGAGCT 55850912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6461 CTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTTGAGCT 6520

 55850913 GTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGATTAAT 55850972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6521 GTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGATTAAT 6580

 55850973 GCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAACTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTTTTTCA 55851032
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6581 GCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAGCTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTTTTTCA 6640

 55851033 AACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTGCATAT 55851092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6641 AACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTGCATAT 6700

 55851093 CAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCTCTGAC 55851152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6701 CAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCTCTGAC 6760

 55851153 TTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTTCTGTG 55851212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6761 TTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTTCTGTG 6820

 55851213 AGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGTATGGAGGGCATGCTTTAAAAGAGCAAAGTT 55851272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6821 AGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGTATGGAGGGCATGCTTTAAAAGAGCAAAGTT 6880

 55851273 ACCACCCTATGAAACAAAATATGGGGTGATAACACCTGTAGTAATAAGAAAATGTTTTTG 55851332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6881 ACCACCCTATGAAACAAAATATGGGGTGATAACACCTGTAGTAATAAGAAAATGTTTTTG 6940

 55851333 CATTAGCACATGCCATTCCACCTTATGAGACACAGGACATCCTCAGACTAACAGCCTCTC 55851392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6941 CATTAGCACATGCCATTCCACCTTATGAGACACAGGACATCCTCAGACTAACAGCCTCTC 7000

 55851393 TGTATCTTAAACTATCTCAAACACTAAGAGTTACCTCTTAGGATTCATGGAAATTAAAAC 55851452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7001 TGTATCTTAAACTATCTCAAACACTAAGAGTTACCTCTTAGGATTCATGGAAATTAAAAC 7060

 55851453 ACATTAAAGATGTTCATTGTGGTGAGTAACATATTCTGATTATCAGAGGCCATTAGAACA 55851512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7061 ACATTAAAGATGTTCATTGTGGTGAGTAACATATTCTGATTATCAGAGGCCATTAGAACA 7120

 55851513 ACTCTGCCTATAGCCAGTAACTTCCAAATTGACCTTCCACTAAAAATCACAAATTTACAC 55851572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7121 ACTCTGCCTATAGCCAGTAACTTCCAAATTGACCTTCCACTAAAAATCACAAATTTACAC 7180

 55851573 ACACACACACATATACACACATATATATCTATATAAATACATATATACACATATATATCT 55851632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7181 ACACACACACATATACACACATATATATCTATATAAATACATATATACACATATATATCT 7240

 55851633 ATATATATA 55851641
          |||||||||
     7241 ATATATATA 7249

Alignment time is 17.31 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2318] =>      2318 nucs 'mol-32-1f21-120985_2318'

Score:        2263
Aligned:      2318        nucs
Identic:      2313 (100%) nucs =>      1300 (100%)      1013 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55823638,55824939] EXCISED REGION [55824942,55825957]
 second seq =>  [       1,    1302] EXCISED REGION [    1303,    2318]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55824940,55824941]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [55824940,55824953] to [55824942,55824955]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55824940,55824940] to [55824941,55824941]
 second seq =>         0 nucs

 55823638 AATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAG 55823697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAG 60

 55823698 TAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTG 55823757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTG 120

 55823758 CTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAA 55823817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAA 180

 55823818 GTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATC 55823877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATC 240

 55823878 CATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATAT 55823937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATAT 300

 55823938 TGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGT 55823997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGT 360

 55823998 ATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCT 55824057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCT 420

 55824058 TGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTT 55824117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTT 480

 55824118 AATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTT 55824177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTT 540

 55824178 TCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTA 55824237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTA 600

 55824238 GTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAAT 55824297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAAT 660

 55824298 TATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAAT 55824357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAAT 720

 55824358 CACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTA 55824417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTA 780

 55824418 ATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCTTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCT 55824477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCCTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCT 840

 55824478 AACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTT 55824537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTT 900

 55824538 TATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTT 55824597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTT 960

 55824598 ACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAAT 55824657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAAT 1020

 55824658 TTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGA 55824717
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGA 1080

 55824718 TCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGC 55824777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGC 1140

 55824778 AAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAG 55824837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAG 1200

 55824838 GCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACA 55824897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACA 1260

 55824898 CCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTC 55824939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTC 1302

EXCISED REGION

 55824942 AAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTA 55825001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 AAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTA 1362

 55825002 AGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACAT 55825061
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1363 AGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACAT 1422

 55825062 TGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTATCATCCCGAA 55825121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1423 TGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTATCATCCCGAA 1482

 55825122 TTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGC 55825181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 TTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGC 1542

 55825182 AGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTT 55825241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 AGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTT 1602

 55825242 GCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACC 55825301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 GCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACC 1662

 55825302 AAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGT 55825361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 AAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGT 1722

 55825362 GACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCA 55825421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 GACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCA 1782

 55825422 GTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATT 55825481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 GTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATT 1842

 55825482 TCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATA 55825541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 TCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATA 1902

 55825542 TAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAAC 55825601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 TAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAAC 1962

 55825602 ACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAAC 55825661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 ACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAAC 2022

 55825662 AGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTA 55825721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 AGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTA 2082

 55825722 CTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTA 55825781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 CTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTA 2142

 55825782 AAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAA 55825841
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 AAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAA 2202

 55825842 TTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCC 55825901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 TTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCC 2262

 55825902 ATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 55825957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 ATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 2318

Alignment time is 5.78102 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4525] =>      4525 nucs 'mol-32-1f58-244183_4525'

Score:        4501
Aligned:      4523        nucs
Identic:      4521 (100%) nucs =>      1470 (100%)      3051 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55845055,55846524] EXCISED REGION [55846528,55849580]
 second seq =>  [       1,    1470] EXCISED REGION [    1474,    4525]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [1471,1473]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [1471,1471] to [1473,1473]

 55845055 TATTTGATAAATAGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGT 55845114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTGATAAATAGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGT 60

 55845115 AACTGTAATTTTTTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCA 55845174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACTGTAATTTTTTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCA 120

 55845175 CGGTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTG 55845234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CGGTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTG 180

 55845235 TATTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTT 55845294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTT 240

 55845295 TCATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATC 55845354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATC 300

 55845355 TTATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTA 55845414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTA 360

 55845415 TTTTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAA 55845474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAA 420

 55845475 AAGGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCA 55845534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCA 480

 55845535 ACAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAA 55845594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAA 540

 55845595 ACAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCT 55845654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCT 600

 55845655 GAACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTT 55845714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTT 660

 55845715 GGTTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACAT 55845774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACAT 720

 55845775 TTATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATAT 55845834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATAT 780

 55845835 TAATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTG 55845894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTG 840

 55845895 TTCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTT 55845954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTT 900

 55845955 CTGTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAA 55846014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAA 960

 55846015 AATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGC 55846074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGC 1020

 55846075 ATTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCAC 55846134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCAC 1080

 55846135 TTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCC 55846194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCC 1140

 55846195 CATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATT 55846254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATT 1200

 55846255 CACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGT 55846314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGT 1260

 55846315 AATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTG 55846374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTG 1320

 55846375 TGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTT 55846434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTT 1380

 55846435 TTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTAC 55846494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTAC 1440

 55846495 TTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 55846524
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 1470

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 1533

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 1593

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 1653

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 1713

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 1773

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 1833

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 1893

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 1953

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 2013

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 2073

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 2133

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 2193

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 2253

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 2313

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 2373

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 2433

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 2493

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 2553

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 2613

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTG 55847727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2614 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTG 2672

 55847728 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 55847787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 2732

 55847788 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 55847847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 2792

 55847848 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 55847907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 2852

 55847908 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 55847967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 2912

 55847968 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 55848027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 2972

 55848028 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 55848087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 3032

 55848088 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAAC 55848147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3033 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAAC 3092

 55848148 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 55848207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 3152

 55848208 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 55848267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 3212

 55848268 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 55848327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 3272

 55848328 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 55848387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 3332

 55848388 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 55848447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 3392

 55848448 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 55848507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 3452

 55848508 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 55848567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 3512

 55848568 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 55848627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 3572

 55848628 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 55848687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 3632

 55848688 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 55848747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 3692

 55848748 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 55848807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 3752

 55848808 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 55848867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 3812

 55848868 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 55848927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 3872

 55848928 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 55848987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 3932

 55848988 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 55849047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 3992

 55849048 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 55849107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 4052

 55849108 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 55849167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 4112

 55849168 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 55849227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4113 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 4172

 55849228 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 55849287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4173 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 4232

 55849288 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 55849347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4233 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 4292

 55849348 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 55849407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4293 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 4352

 55849408 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 55849467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4353 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 4412

 55849468 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 55849527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4413 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 4472

 55849528 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACAC 55849580
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACAC 4525

Alignment time is 11.034 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2777] =>      2777 nucs 'mol-32-2383-157614_2777'

Score:        2763
Aligned:      2774        nucs
Identic:      2773 (100%) nucs =>      1612 (100%)      1161 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55844913,55846524] EXCISED REGION [55846528,55847689]
 second seq =>  [       1,    1612] EXCISED REGION [    1616,    2777]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [1613,1615]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [1613,1613] to [1615,1615]

 55844913 AACAACCCAAGACAACATAATTATTTCTCTGTAATATTCCTAGTTTTATTTTTTTCTTTA 55844972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACAACCCAAGACAACATAATTATTTCTCTGTAATATTCCTAGTTTTATTTTTTTCTTTA 60

 55844973 AACTTCAACATATCAAGTGTTTTAATGTAAGCTTGAAGTATCACTTCAAATTTTTTTCCA 55845032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACTTCAACATATCAAGTGTTTTAATGTAAGCTTGAAGTATCACTTCAAATTTTTTTCCA 120

 55845033 AGCAGCACAGTTATTCTAATGTTATTTGATAAATAGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACAT 55845092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCAGCACAGTTATTCTAATGTTATTTGATAAATAGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACAT 180

 55845093 TTTTAAGACCAAAAAAAATTGTAACTGTAATTTTTTTAGTTCTATGTTATTTATCATTAT 55845152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTAAGACCAAAAAAAATTGTAACTGTAATTTTTTTAGTTCTATGTTATTTATCATTAT 240

 55845153 GTCTATTTTGACAGTAGTTCCACGGTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGT 55845212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCTATTTTGACAGTAGTTCCACGGTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGT 300

 55845213 ATTATAATACTTTTTGTATTTGTATTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATT 55845272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTATAATACTTTTTGTATTTGTATTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATT 360

 55845273 GCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTCATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTA 55845332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTCATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTA 420

 55845333 ACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTT 55845392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTT 480

 55845393 ACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTTTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTA 55845452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTTTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTA 540

 55845453 TGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATT 55845512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATT 600

 55845513 CACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTA 55845572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTA 660

 55845573 GGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAA 55845632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAA 720

 55845633 AATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAA 55845692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAA 780

 55845693 ATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAA 55845752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAA 840

 55845753 TCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAG 55845812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAG 900

 55845813 TCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAG 55845872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAG 960

 55845873 ATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGT 55845932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGT 1020

 55845933 GCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCA 55845992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCA 1080

 55845993 ATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTG 55846052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTG 1140

 55846053 CATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGG 55846112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGG 1200

 55846113 TTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTC 55846172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTC 1260

 55846173 TGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACT 55846232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACT 1320

 55846233 CTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCA 55846292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCA 1380

 55846293 TCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAA 55846352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAA 1440

 55846353 GGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGAC 55846412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGAC 1500

 55846413 CAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATT 55846472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATT 1560

 55846473 TTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 55846524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 1612

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 1675

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 1735

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 1795

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 1855

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 1915

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 1975

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 2035

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 2095

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 2155

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2156 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGAGACCTTGGA 2215

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 2275

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 2335

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 2395

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 2455

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 2515

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 2575

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 2635

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 2695

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 2755

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATC 55847689
          ||||||||||||||||||||||
     2756 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATC 2777

Alignment time is 7.03065 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3117] =>      3117 nucs 'mol-32-287f-067233_3117'

Score:        3038
Aligned:      3117        nucs
Identic:      3109 (100%) nucs =>      1067 (100%)      2042 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55824886,55825957] EXCISED REGION [55846713,55848757]
 second seq =>  [       1,    1070] EXCISED REGION [    1074,    3117]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [1071,1073]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [1070,1070] to [1073,1073]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55824886 CCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAA 55824945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAA 60

 55824946 AAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGA 55825005
          ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
       61 AAAAAAAA--TTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGC 118

 55825006 TGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACATTGGT 55825065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      119 TGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACATTGGT 178

 55825066 CAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTATCATCCCGAATTCT 55825125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      179 CAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTATCATCCCGAATTCT 238

 55825126 CTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAG 55825185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 CTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAG 298

 55825186 CTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTC 55825245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 CTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTC 358

 55825246 CATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGC 55825305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 CATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGC 418

 55825306 ACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACA 55825365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 ACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACA 478

 55825366 GGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCC 55825425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 GGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCC 538

 55825426 CACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCC 55825485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 CACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCC 598

 55825486 ATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAA 55825545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 ATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAA 658

 55825546 TCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAA 55825605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 TCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAA 718

 55825606 GAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAA 55825665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 GAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAA 778

 55825666 CTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTC 55825725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 CTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTC 838

 55825726 AAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGA 55825785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 AAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGA 898

 55825786 ATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTAT 55825845
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 ATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTAT 958

 55825846 TTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATAT 55825905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 TTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATAT 1018

 55825906 ATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 55825957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 ATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 1070

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 1133

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 1193

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 1253

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 1313

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 1373

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 1433

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 1493

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 1553

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 1613

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1614 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTTATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 1673

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 1733

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 1793

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 1853

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 1913

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 1973

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 2033

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 55847732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     2034 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 2092

 55847733 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 55847792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 2152

 55847793 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 55847852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 2212

 55847853 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 55847912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 2272

 55847913 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 55847972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 2332

 55847973 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 55848032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 2392

 55848033 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 55848092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 2452

 55848093 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 55848152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2453 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 2512

 55848153 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 55848212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 2572

 55848213 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 55848272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 2632

 55848273 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 55848332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 2692

 55848333 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 55848392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 2752

 55848393 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 55848452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 2812

 55848453 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 55848512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 2872

 55848513 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 55848572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 2932

 55848573 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 55848632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 2992

 55848633 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 55848692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 3052

 55848693 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 55848752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 3112

 55848753 TGGTT 55848757
          |||||
     3113 TGGTT 3117

Alignment time is 7.79511 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3451] =>      3451 nucs 'mol-32-29a8-026547_3451'

Score:        3427
Aligned:      3449        nucs
Identic:      3447 (100%) nucs =>      1708 (100%)      1739 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55844817,55846524] EXCISED REGION [55846528,55848268]
 second seq =>  [       1,    1708] EXCISED REGION [    1712,    3451]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [1709,1711]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [1709,1709] to [1711,1711]

 55844817 ATATTACTTATTATCAATATATTTTATTATTTATGTAACAAACCAACAAAAATTTTCCTC 55844876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATTACTTATTATCAATATATTTTATTATTTATGTAACAAACCAACAAAAATTTTCCTC 60

 55844877 TTAGTTTGTGATTTTGATGTCATTTCAAAGGCCATTAACAACCCAAGACAACATAATTAT 55844936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAGTTTGTGATTTTGATGTCATTTCAAAGGCCATTAACAACCCAAGACAACATAATTAT 120

 55844937 TTCTCTGTAATATTCCTAGTTTTATTTTTTTCTTTAAACTTCAACATATCAAGTGTTTTA 55844996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTCTGTAATATTCCTAGTTTTATTTTTTTCTTTAAACTTCAACATATCAAGTGTTTTA 180

 55844997 ATGTAAGCTTGAAGTATCACTTCAAATTTTTTTCCAAGCAGCACAGTTATTCTAATGTTA 55845056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTAAGCTTGAAGTATCACTTCAAATTTTTTTCCAAGCAGCACAGTTATTCTAATGTTA 240

 55845057 TTTGATAAATAGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGTAA 55845116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTGATAAATAGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGTAA 300

 55845117 CTGTAATTTTTTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCACG 55845176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGTAATTTTTTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCACG 360

 55845177 GTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTGTA 55845236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTGTA 420

 55845237 TTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTC 55845296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTC 480

 55845297 ATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTT 55845356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTT 540

 55845357 ATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATT 55845416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATT 600

 55845417 TTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAA 55845476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAA 660

 55845477 GGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAAC 55845536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAAC 720

 55845537 AAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAAC 55845596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAAC 780

 55845597 AGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGA 55845656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGA 840

 55845657 ACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGG 55845716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGG 900

 55845717 TTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTT 55845776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTT 960

 55845777 ATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTA 55845836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTA 1020

 55845837 ATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTT 55845896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTT 1080

 55845897 CTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCT 55845956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCT 1140

 55845957 GTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAA 55846016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAA 1200

 55846017 TAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCAT 55846076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCAT 1260

 55846077 TACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTT 55846136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTT 1320

 55846137 CATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCA 55846196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCA 1380

 55846197 TGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCA 55846256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCA 1440

 55846257 CTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAA 55846316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAA 1500

 55846317 TGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTG 55846376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTG 1560

 55846377 GACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTT 55846436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTT 1620

 55846437 TTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTT 55846496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTT 1680

 55846497 GTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 55846524
          ||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 1708

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 1771

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 1831

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 1891

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 1951

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 2011

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 2071

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 2131

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 2191

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 2251

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 2311

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 2371

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 2431

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 2491

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 2551

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 2611

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 2671

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 2731

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 2791

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 2851

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTG 55847727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2852 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTG 2910

 55847728 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 55847787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 2970

 55847788 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 55847847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 3030

 55847848 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 55847907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 3090

 55847908 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 55847967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 3150

 55847968 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 55848027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 3210

 55848028 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 55848087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 3270

 55848088 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAAC 55848147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3271 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAAC 3330

 55848148 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 55848207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 3390

 55848208 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 55848267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 3450

 55848268 G 55848268
          |
     3451 G 3451

Alignment time is 8.5106 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2772] =>      2772 nucs 'mol-32-29d4-012401_2772'

Score:        2759
Aligned:      2770        nucs
Identic:      2769 (100%) nucs =>      1384 (100%)      1385 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55845141,55846524] EXCISED REGION [55846528,55847913]
 second seq =>  [       1,    1384] EXCISED REGION [    1388,    2772]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [1385,1387]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [1385,1385] to [1387,1387]

 55845141 ATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCACGGTTTTCATACTACGGTATCTTTAT 55845200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCACGGTTTTCATACTACGGTATCTTTAT 60

 55845201 AATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTGTATTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTT 55845260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTGTATTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTT 120

 55845261 TAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTCATGTTTATTTATTCTGATAAATCT 55845320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTCATGTTTATTTATTCTGATAAATCT 180

 55845321 TAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTC 55845380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTC 240

 55845381 AGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTTTGCTCAATTTTATTTTAACATAA 55845440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTTTGCTCAATTTTATTTTAACATAA 300

 55845441 TTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAATAAGTAGAACAACAAATCTG 55845500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAATAAGTAGAACAACAAATCTG 360

 55845501 AATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTC 55845560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTC 420

 55845561 CAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGG 55845620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGG 480

 55845621 CAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCT 55845680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCT 540

 55845681 CTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCATTTTAAACTCTGAAATAATT 55845740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCATTTTAAACTCTGAAATAATT 600

 55845741 ACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTATAATACTTAGAGAATATTC 55845800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTATAATACTTAGAGAATATTC 660

 55845801 ACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATTATAGTCTGCCTGCCCAACC 55845860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATTATAGTCTGCCTGCCCAACC 720

 55845861 ACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAA 55845920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAA 780

 55845921 AACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGACAGGACTCAGTTTAT 55845980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGACAGGACTCAGTTTAT 840

 55845981 TGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCT 55846040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCT 900

 55846041 ACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATGAGCTATTGCTACCCT 55846100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATGAGCTATTGCTACCCT 960

 55846101 TAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAA 55846160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAA 1020

 55846161 CCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTT 55846220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTT 1080

 55846221 TCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACT 55846280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACT 1140

 55846281 TCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAA 55846340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAA 1200

 55846341 AGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTG 55846400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTG 1260

 55846401 GGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTG 55846460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTG 1320

 55846461 GGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAG 55846520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAG 1380

 55846521 AAAG 55846524
          ||||
     1381 AAAG 1384

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 1447

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 1507

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 1567

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 1627

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 1687

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 1747

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 1807

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 1867

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 1927

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 1987

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 2047

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 2107

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 2167

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 2227

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 2287

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 2347

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 2407

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 2467

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 2527

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTG 55847727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2528 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTG 2586

 55847728 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 55847787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 2646

 55847788 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 55847847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 2706

 55847848 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 55847907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 2766

 55847908 CAGACT 55847913
          ||||||
     2767 CAGACT 2772

Alignment time is 7.128 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5316] =>      5316 nucs 'mol-32-29d4-015989_5316'

Score:        5287
Aligned:      5319        nucs
Identic:      5312 (100%) nucs =>       429 (100%)      4883 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55842585,55843013] EXCISED REGION [55843027,55847913]
 second seq =>  [       1,     429] EXCISED REGION [     431,    5316]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        13 nucs [55843014,55843026]
 second seq =>         1 nucs [430,430]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55843014,55843014] to [55843027,55843027]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55843013,55843013] to [55843027,55843027]
 second seq =>         1 nucs [429,429] to [431,431]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55842585 GAAACACTTGCAAACTGGGTATAGCTGTATACTCAACAAGGACTTCTCAAAATAAATGAT 55842644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAACACTTGCAAACTGGGTATAGCTGTATACTCAACAAGGACTTCTCAAAATAAATGAT 60

 55842645 TACTCGAGTTTGTATATACCTACAAACTGATACATATGTCATCTATGTGAATTTTGGTGT 55842704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACTCGAGTTTGTATATACCTACAAACTGATACATATGTCATCTATGTGAATTTTGGTGT 120

 55842705 AAAATGGTTAAACCCTCTTGCTGCTGCCAAAGGAGGTGTATTTTAATCGTATTCCAAAGA 55842764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAATGGTTAAACCCTCTTGCTGCTGCCAAAGGAGGTGTATTTTAATCGTATTCCAAAGA 180

 55842765 AAGTATGATGGTGTCACCCACCAGGAAATGTCTGTTAGTTTACACCCCTGCTTCTAAAGA 55842824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGTATGATGGTGTCACCCACCAGGAAATGTCTGTTAGTTTACACCCCTGCTTCTAAAGA 240

 55842825 GAGTTTTGAAGTACTTCTCCATTGCCTCACCAAATTCCCATACTTTGTAGAATTGTGCAG 55842884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGTTTTGAAGTACTTCTCCATTGCCTCACCAAATTCCCATACTTTGTAGAATTGTGCAG 300

 55842885 AAAAAAAACAGAATGGGAACAAAATGTTTGATAGGAATTACTTAACAAAGACTATATGCT 55842944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAAAAACAGAATGGGAACAAAATGTTTGATAGGAATTACTTAACAAAGACTATATGCT 360

 55842945 GAGTAAGTATATTAGCAAAAACTAAGATCTTTCTGCCTTATTAATAAGAAGGAAGAAGTG 55843004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGTAAGTATATTAGCAAAAACTAAGATCTTTCTGCCTTATTAATAAGAAGGAAGAAGTG 420

 55843005 AACTGAACC 55843013
          |||||||||
      421 AACTGAACC 429

EXCISED REGION

 55843027 CACTGGGAAATGAGAAATGCAGGCCATCCCAGCTCAGAACTTAGAAACTTTGCCACTAGA 55843086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      431 CACTGGGAAATGAGAAATGCAGGCCATCCCAGCTCAGAACTTAGAAACTTTGCCACTAGA 490

 55843087 TTCAGGTTTATCAGTGATTTTGTTTTTATTGAGAAAGAACTAACTAAAAGCAGAATTCAA 55843146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 TTCAGGTTTATCAGTGATTTTGTTTTTATTGAGAAAGAACTAACTAAAAGCAGAATTCAA 550

 55843147 GGTACAGGATTTCTAGTTGAAATGTATGTATTTGGGGCTAAATTAACACTAGAGTGAAAA 55843206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 GGTACAGGATTTCTAGTTGAAATGTATGTATTTGGGGCTAAATTAACACTAGAGTGAAAA 610

 55843207 CTGAATTGCTTACAATTTGTCAAGATTTCTTTGTTCTTAATCCAAAATGTGTTTTTAGCT 55843266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 CTGAATTGCTTACAATTTGTCAAGATTTCTTTGTTCTTAATCCAAAATGTGTTTTTAGCT 670

 55843267 TTCATCTCAGCTCCAAAGCACATAACTGCTAAACAATTTCCATATGGAAGCCATTGCGTT 55843326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 TTCATCTCAGCTCCAAAGCACATAACTGCTAAACAATTTCCATATGGAAGCCATTGCGTT 730

 55843327 AAGAGTTCTGGACAAAATAATGATACATGGTTGCCTTAAAGGAGTTTACTGTACAGTTGG 55843386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 AAGAGTTCTGGACAAAATAATGATACATGGTTGCCTTAAAGGAGTTTACTGTACAGTTGG 790

 55843387 AAAGATAGGCATGCAGATACAAAGATATAACACAAGGTCCTATAAAAATCTATAGCTCAT 55843446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 AAAGATAGGCATGCAGATACAAAGATATAACACAAGGTCCTATAAAAATCTATAGCTCAT 850

 55843447 TGTTTGCAGAGATTTTTCATGCATTCTACATTTAATAGAATCTCTATTCTACAAACAATA 55843506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 TGTTTGCAGAGATTTTTCATGCATTCTACATTTAATAGAATCTCTATTCTACAAACAATA 910

 55843507 TAAAGCTGTAATTAACCCTTTAAAGCTATTTGCCAAAGTAAATGTAAGTAATTACATTGC 55843566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 TAAAGCTGTAATTAACCCTTTAAAGCTATTTGCCAAAGTAAATGTAAGTAATTACATTGC 970

 55843567 TTTACTTAATTTTTAAAGTAGCAAAGAAAACTCTTCCAACTAAGTGGATTCATCTTGTTC 55843626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 TTTACTTAATTTTTAAAGTAGCAAAGAAAACTCTTCCAACTAAGTGGATTCATCTTGTTC 1030

 55843627 ATTGTACCTCCAGCATTTATCACGACACTTGTTATAGTAAGGATTCACTATTCCTCATAA 55843686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 ATTGTACCTCCAGCATTTATCACGACACTTGTTATAGTAAGGATTCACTATTCCTCATAA 1090

 55843687 ATATATAATATATACAGTAATGGCACCACATAACAATGTTTTGGTTAACAATGAACCAAT 55843746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 ATATATAATATATACAGTAATGGCACCACATAACAATGTTTTGGTTAACAATGAACCAAT 1150

 55843747 ATGCAACAGTGGTCTCATGACATTATAATGAAGCTGAAAAATTACTATTGCCTAGTGGGC 55843806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 ATGCAACAGTGGTCTCATGACATTATAATGAAGCTGAAAAATTACTATTGCCTAGTGGGC 1210

 55843807 TAGTTATTATAACATCATAGAGCATAACCTATTCTAAGTTTAGATTTGTGTAGATACACA 55843866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 TAGTTATTATAACATCATAGAGCATAACCTATTCTAAGTTTAGATTTGTGTAGATACACA 1270

 55843867 AATTGTGTAGTAATTGCCTACAGTATTCAGTCACATGCTGAACAGGTTTTTAGCCTAGAG 55843926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 AATTGTGTAGTAATTGCCTACAGTATTCAGTCACATGCTGAACAGGTTTTTAGCCTAGAG 1330

 55843927 GCAATAGGCTATAGCATATAATCCGGTTGTGTAGTAGACTATGCCATCTAGGTTTATAAA 55843986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 GCAATAGGCTATAGCATATAATCCGGTTGTGTAGTAGACTATGCCATCTAGGTTTATAAA 1390

 55843987 GTAGTTACATAAAGCCTAGATGGCATAGCTGACTACACAGTGTACTTACATAGCCTACTA 55844046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 GTAGTTACATAAAGCCTAGATGGCATAGCTGACTACACAGTGTACTTACATAGCCTACTA 1450

 55844047 CACAGTGCCCTAAAGTTTATGTAAATACACTGTACTTATATAACCTACTACACACTGTAC 55844106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 CACAGTGCCCTAAAGTTTATGTAAATACACTGTACTTATATAACCTACTACACACTGTAC 1510

 55844107 TTTCATAACCTACTATACAGTATACTTACAGTTTATAGTACTTAGTACACTGTACTTACA 55844166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 TTTCATAACCTACTATACAGTATACTTACAGTTTATAGTACTTAGTACACTGTACTTACA 1570

 55844167 TACTATGCCTAAAGATATATAATCCCCTAAGGTTACATTTCTTAGAAGAAATCCCTGTCA 55844226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 TACTATGCCTAAAGATATATAATCCCCTAAGGTTACATTTCTTAGAAGAAATCCCTGTCA 1630

 55844227 TTAGGTGACACATGAATAAAATTATTATTTGTCAATTCCATGAAAATTTTAAAAGATTAG 55844286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 TTAGGTGACACATGAATAAAATTATTATTTGTCAATTCCATGAAAATTTTAAAAGATTAG 1690

 55844287 TGGAAATAATTTTTAAAATTCAGACTAATGTATAAAAACATAAAATAGAAGATAAAGATG 55844346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 TGGAAATAATTTTTAAAATTCAGACTAATGTATAAAAACATAAAATAGAAGATAAAGATG 1750

 55844347 ACACAAAATTCAACCAGCTTTGTAAACAATCTAAAAGTACATTGTTTTGCTCAGATTTGT 55844406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 ACACAAAATTCAACCAGCTTTGTAAACAATCTAAAAGTACATTGTTTTGCTCAGATTTGT 1810

 55844407 GATGGCATTCTTAGAAAATTATTGTAATTGGAATTGCTATGTTTGAAGTATATTTTCATG 55844466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 GATGGCATTCTTAGAAAATTATTGTAATTGGAATTGCTATGTTTGAAGTATATTTTCATG 1870

 55844467 TTGCACTGCAATACTACTCTCAAAAAAGCTGACATTGCTTTACACTTCATTCACAAGTAT 55844526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 TTGCACTGCAATACTACTCTCAAAAAAGCTGACATTGCTTTACACTTCATTCACAAGTAT 1930

 55844527 ATGAAATTCCTATTTCCCCAAAATGACCCAGAACTTTGTCAATGCTTCCTTTTTGGTCAA 55844586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 ATGAAATTCCTATTTCCCCAAAATGACCCAGAACTTTGTCAATGCTTCCTTTTTGGTCAA 1990

 55844587 CCTGATATGTGACAAATAATCTTGCATTGCTATTTTCACTTGCATTCCTGTGATTACAAA 55844646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 CCTGATATGTGACAAATAATCTTGCATTGCTATTTTCACTTGCATTCCTGTGATTACAAA 2050

 55844647 ATAAAGCATTTTCTGTTCATTTTCCTTTAATACTTCTTTATGAATTGGCTCTTCTTGAAA 55844706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 ATAAAGCATTTTCTGTTCATTTTCCTTTAATACTTCTTTATGAATTGGCTCTTCTTGAAA 2110

 55844707 TTTTTCTCATGAATATGTAAGTTCTTTATACAGCACTATTATATAGTACCTTTTCCATCA 55844766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 TTTTTCTCATGAATATGTAAGTTCTTTATACAGCACTATTATATAGTACCTTTTCCATCA 2170

 55844767 TATATTGCAGTTTTTTCTGTTCTGTGCATTTGCTTTTAATGCCATACACTATATTACTTA 55844826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 TATATTGCAGTTTTTTCTGTTCTGTGCATTTGCTTTTAATGCCATACACTATATTACTTA 2230

 55844827 TTATCAATATATTTTATTATTTATGTAACAAACCAACAAAAATTTTCCTCTTAGTTTGTG 55844886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 TTATCAATATATTTTATTATTTATGTAACAAACCAACAAAAATTTTCCTCTTAGTTTGTG 2290

 55844887 ATTTTGATGTCATTTCAAAGGCCATTAACAACCCAAGACAACATAATTATTTCTCTGTAA 55844946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 ATTTTGATGTCATTTCAAAGGCCATTAACAACCCAAGACAACATAATTATTTCTCTGTAA 2350

 55844947 TATTCCTAGTTTTATTTTTTTCTTTAAACTTCAACATATCAAGTGTTTTAATGTAAGCTT 55845006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 TATTCCTAGTTTTATTTTTTTCTTTAAACTTCAACATATCAAGTGTTTTAATGTAAGCTT 2410

 55845007 GAAGTATCACTTCAAATTTTTTTCCAAGCAGCACAGTTATTCTAATGTTATTTGATAAAT 55845066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 GAAGTATCACTTCAAATTTTTTTCCAAGCAGCACAGTTATTCTAATGTTATTTGATAAAT 2470

 55845067 AGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGTAACTGTAATTTT 55845126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 AGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGTAACTGTAATTTT 2530

 55845127 TTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCACGGTTTTCATAC 55845186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 TTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCACGGTTTTCATAC 2590

 55845187 TACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTGTATTTTGTTGAA 55845246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 TACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTGTATTTTGTTGAA 2650

 55845247 AGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTCATGTTTATTT 55845306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 AGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTCATGTTTATTT 2710

 55845307 ATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTATTAGAACTG 55845366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 ATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTATTAGAACTG 2770

 55845367 GTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTTTGCTCAATT 55845426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 GTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTTTGCTCAATT 2830

 55845427 TTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAATAAGTA 55845486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 TTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAATAAGTA 2890

 55845487 GAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGACCCCT 55845546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 GAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGACCCCT 2950

 55845547 AGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGCTTTTC 55845606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 AGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGCTTTTC 3010

 55845607 AAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAAAGCCC 55845666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 AAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAAAGCCC 3070

 55845667 AAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCATTTTAA 55845726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 AAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCATTTTAA 3130

 55845727 ACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTATAATA 55845786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 ACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTATAATA 3190

 55845787 CTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATTATAGT 55845846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 CTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATTATAGT 3250

 55845847 CTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTATGAAT 55845906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 CTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTATGAAT 3310

 55845907 GAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGAC 55845966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 GAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGAC 3370

 55845967 AGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATTT 55846026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3371 AGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATTT 3430

 55846027 GTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATGA 55846086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 GTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATGA 3490

 55846087 GCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGCC 55846146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 GCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGCC 3550

 55846147 TCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATGC 55846206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 TCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATGC 3610

 55846207 AATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCCC 55846266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 AATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCCC 3670

 55846267 TGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGCA 55846326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 TGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGCA 3730

 55846327 CAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATTT 55846386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 CAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATTT 3790

 55846387 TATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTCT 55846446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3791 TATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTCT 3850

 55846447 TCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTTT 55846506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3851 TCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTTT 3910

 55846507 TAAAACACAGAGAGAAAGGTG---TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGG 55846563
          ||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3911 TAAAACACAGAGAGAAAG---ATATAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGG 3967

 55846564 ATCTACAGAATGATGGGACAACTGACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAA 55846623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 ATCTACAGAATGATGGGACAACTGACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAA 4027

 55846624 CAACACTATCATCAAATGAAATTTGCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGC 55846683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 CAACACTATCATCAAATGAAATTTGCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGC 4087

 55846684 ATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAGAACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGT 55846743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 ATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAGAACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGT 4147

 55846744 GCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACT 55846803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 GCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACT 4207

 55846804 AGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAA 55846863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 AGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAA 4267

 55846864 AAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAG 55846923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 AAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAG 4327

 55846924 AAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGA 55846983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 AAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGA 4387

 55846984 AGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTC 55847043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 AGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTC 4447

 55847044 AAATGGAACAGAAAAATCATATACAATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCAT 55847103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 AAATGGAACAGAAAAATCATATACAATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCAT 4507

 55847104 CAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAG 55847163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 CAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAG 4567

 55847164 AGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACC 55847223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 AGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACC 4627

 55847224 TTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTT 55847283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 TTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTT 4687

 55847284 GATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAA 55847343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 GATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAA 4747

 55847344 TGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTT 55847403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 TGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTT 4807

 55847404 TCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAA 55847463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 TCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAA 4867

 55847464 GATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTA 55847523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 GATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTA 4927

 55847524 ACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTG 55847583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 ACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTG 4987

 55847584 AAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCT 55847643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 AAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCT 5047

 55847644 GATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAA 55847703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 GATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAA 5107

 55847704 AAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAA 55847763
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 AAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAA 5166

 55847764 CTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCA 55847823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 CTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCA 5226

 55847824 TGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGA 55847883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 TGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGA 5286

 55847884 GTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGACT 55847913
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 GTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGACT 5316

Alignment time is 12.8454 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5896] =>      5896 nucs 'mol-32-2b55-081090_5896'

Score:        5712
Aligned:      5894        nucs
Identic:      5875 (100%) nucs =>      1986 (100%)      3889 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55824653,55826644] EXCISED REGION [55826651,55830547]
 second seq =>  [       1,    1990] EXCISED REGION [    1995,    5896]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [55826645,55826650]
 second seq =>         4 nucs [1991,1994]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1990,1990] to [1994,1994]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55826645,55826645] to [55826650,55826650]
 second seq =>         0 nucs

 55824653 ACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAG 55824712
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAG 60

 55824713 GCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCT 55824772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCT 120

 55824773 CTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTT 55824832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTT 180

 55824833 AGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGA 55824892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGA 240

 55824893 TCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAA 55824952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAA 300

 55824953 AAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGATGTAAAC 55825012
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      301 AA-TTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGCTGTAAAC 359

 55825013 TTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTC 55825072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 TTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTC 419

 55825073 TAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTT 55825132
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTT 479

 55825133 CTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAA 55825192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 CTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAA 539

 55825193 ATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCA 55825252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 ATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCA 599

 55825253 TGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAG 55825312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAG 659

 55825313 TCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAAC 55825372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAAC 719

 55825373 AAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGAT 55825432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 AAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGAT 779

 55825433 TCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAG 55825492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAG 839

 55825493 GTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTG 55825552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTG 899

 55825553 CCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGC 55825612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGC 959

 55825613 ATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACA 55825672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 ATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACA 1019

 55825673 GTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCAC 55825732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCAC 1079

 55825733 ATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAA 55825792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAA 1139

 55825793 AGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATG 55825852
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATG 1199

 55825853 CTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGA 55825912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGA 1259

 55825913 GAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAATGATCTACTTTTATAA 55825972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAATGATCTACTTTTATAA 1319

 55825973 TATATATAAAATTATATTATTTTTGTAATATATATAAAAAATATGATTTTATATATAAAA 55826032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TATATATAAAATTATATTATTTTTGTAATATATATAAAAAATATGATTTTATATATAAAA 1379

 55826033 AGATCTATTTTTATAATATATATAAAAATAGATTATTTTATCACATGATATATAAAATAG 55826092
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 AGATCTATTTTTATAATATATATAAAA-TAGATTATTTTATCACATGATATATAAAATAG 1438

 55826093 ATGGTTTTGTCCTCTCTCATATAATTCGTACTTACACAGGCTCTATAATTCTTCTAGGCT 55826152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 ATGGTTTTGTCCTCTCTCATATAATTCGTACTTACACAGGCTCTATAATTCTTCTAGGCT 1498

 55826153 GTAAAATATCCTTTGTAGAAAGAGCTAAATATTAGTACATGGAAATATTTTCAGCTCCTT 55826212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GTAAAATATCCTTTGTAGAAAGAGCTAAATATTAGTACATGGAAATATTTTCAGCTCCTT 1558

 55826213 ATTAAAATATGAGACTGCTGAAAAACAATAATTAGACTTCAATATTTAGGAGCTTTTGCA 55826272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 ATTAAAATATGAGACTGCTGAAAAACAATAATTAGACTTCAATATTTAGGAGCTTTTGCA 1618

 55826273 TACTTTAAATGCTATGGTTTATTTTTAATATTTTCAAGATTTTATTTTTGAAGATCATAA 55826332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TACTTTAAATGCTATGGTTTATTTTTAATATTTTCAAGATTTTATTTTTGAAGATCATAA 1678

 55826333 ACCTTAATTATAATTGCAAATAATAAAAAAAGCAGTGGCCAGGCATGGTGGCTCACACCT 55826392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 ACCTTAATTATAATTGCAAATAATAAAAAAAGCAGTGGCCAGGCATGGTGGCTCACACCT 1738

 55826393 GTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCATATCATCTGAGGTCAGGAGTTCAAGA 55826452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCATATCATCTGAGGTCAGGAGTTCAAGA 1798

 55826453 CCAGCCTGACCAACATGGAGAAAACCCGTCTCTACTCAAAATACAAAATGAGCTGGGTGT 55826512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CCAGCCTGACCAACATGGAGAAAACCCGTCTCTACTCAAAATACAAAATGAGCTGGGTGT 1858

 55826513 AGTAGCACGTGCCTGTCATCCCAGCTGCTTGGTAGGCTTAGGCAGGACAATCACTTGAAC 55826572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 AGTAGCACGTGCCTGTCATCCCAGCTGCTTGGTAGGCTTAGGCAGGACAATCACTTGAAC 1918

 55826573 CCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACA 55826632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CCGGGAGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACA 1978

 55826633 AGAGTGAAATTT 55826644
          ||||||||||||
     1979 AGAGTGAAATTT 1990

EXCISED REGION

 55826651 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGTAAAATGTGCCAGTAGAAGGAAACTGATCACTGA 55826710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGTAAAATGTGCCAGTAGAAGGAAACTGATCACTGA 2054

 55826711 TAGCATGCTTTTAATAGGCCAAATTAAATCAGACTTTCTAGGAACAAGAAGTGAAAATGT 55826770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2055 TAGCATGCTTTTAATAGGCCAAATTAAATCAGACTTTCTAGGAACAAGAAGTGAAAATTT 2114

 55826771 CACTTTTTTGGCATGATGCTAATAAGAATACAGATACCATAAATCTTTGTAAAGAATTTT 55826830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 CACTTTTTTGGCATGATGCTAATAAGAATACAGATACCATAAATCTTTGTAAAGAATTTT 2174

 55826831 CCAGAACAATACATAATACCTCATTGGTTTTGTTTAACATTTCCATCTGCATTTGAAACA 55826890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 CCAGAACAATACATAATACCTCATTGGTTTTGTTTAACATTTCCATCTGCATTTGAAACA 2234

 55826891 TCTCACTCAGATTGATACCTTTCCCAATTATAATTAATGCAGAACCTGTGACAGTAGGAT 55826950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 TCTCACTCAGATTGATACCTTTCCCAATTATAATTAATGCAGAACCTGTGACAGTAGGAT 2294

 55826951 CTTGATTTATTTTAATTATTTTCTAAAACTTTTTCAAATTACTTTGTCTTTTATAATGTT 55827010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 CTTGATTTATTTTAATTATTTTCTAAAACTTTTTCAAATTACTTTGTCTTTTATAATGTT 2354

 55827011 GTTTCATAGCTAGATGGTACAAGAGCAGACATGACCTTCAATCAATATTTTAATTGAATT 55827070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 GTTTCATAGCTAGATGGTACAAGAGCAGACATGACCTTCAATCAATATTTTAATTGAATT 2414

 55827071 CATTGAGTTCGCTAGAAACTTGATCATACCTGAGTAAAATGATAAAATTTAGATTCTAAG 55827130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 CATTGAGTTCGCTAGAAACTTGATCATACCTGAGTAAAATGATAAAATTTAGATTCTAAG 2474

 55827131 CCACCCAGGCCAAGAAATGGATCCTATGGAGACTCATCAACAGACAGACAGCCCAGGAAG 55827190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 CCACCCAGGCCAAGAAATGGATCCTATGGAGACTCATCAACAGACAGACAGCCCAGGAAG 2534

 55827191 TCCACATCAAACAGCAGGCTGGACATAGCCATTTCTTCACCCGAATACTAAAGCCCTATA 55827250
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2535 TCCACATCAAACAGCAGGCTGGACATAGCCATTTCCTCACCCGAATACTAAAGCCCTATA 2594

 55827251 CACACACAACACTTTAATTAGAGGATCTTCCACATTCTTTAAAGAAATAAAGAATGTTTT 55827310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 CACACACAACACTTTAATTAGAGGATCTTCCACATTCTTTAAAGAAATAAAGAATGTTTT 2654

 55827311 GTCACTCTTTTATTTTTTTATCCTTCCTGCCTGCCTACCTGCCT-TTTTTTTTTTTTACT 55827369
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2655 GTCACTCTTTTATTTTTTTATCCTTCCTGCCTGCCTACCTGCCTCTTTTTTTTTTTTACT 2714

 55827370 TCTTTGCTTCTCTTTTTTAAATTTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTCTCTCTATG----TCTC 55827425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||
     2715 TCTTTGCTTCTCTTTTTTAAATTTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTCTCTCTATGTCTCTCTC 2774

 55827426 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCCCCTCCACTC 55827485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCCCCTCCACTC 2834

 55827486 CCTTCCATTCCTTTCTCCTTTCTCTCTGGAAAATGAAATATGTTAACAAAAATCGATGAT 55827545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 CCTTCCATTCCTTTCTCCTTTCTCTCTGGAAAATGAAATATGTTAACAAAAATCGATGAT 2894

 55827546 AAAGAGACTATTTTCCAGTTCAAACTGAAAAATGAGTTGTCTTGTAGGAGAAACAAACAA 55827605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 AAAGAGACTATTTTCCAGTTCAAACTGAAAAATGAGTTGTCTTGTAGGAGAAACAAACAA 2954

 55827606 ACACAATGCAACATGACACTTCTTAACCAAAACTGGCCAAAATTCCAATGGATATTCACA 55827665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 ACACAATGCAACATGACACTTCTTAACCAAAACTGGCCAAAATTCCAATGGATATTCACA 3014

 55827666 GAAAAACCCTAAGCTTAAAATTGAGAACCTTAAATAGCTCTATCAGACAACTTATATTTC 55827725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 GAAAAACCCTAAGCTTAAAATTGAGAACCTTAAATAGCTCTATCAGACAACTTATATTTC 3074

 55827726 TACAACAGAAGTTTATTCAATAAAATTGTGAGCTGGAGGGAAACAAGCAGAAGTTGACAG 55827785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3075 TACAACAGAAGTTTATTCAATAAAATTGTGAGCTGGAGGGAAACAAGCAGAAGTTGACAG 3134

 55827786 ACGTAGAAGTGAAGGATAACAGAGTATTCAACAAATGAACCATAAATTTCAGAATTAAGG 55827845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 ACGTAGAAGTGAAGGATAACAGAGTATTCAACAAATGAACCATAAATTTCAGAATTAAGG 3194

 55827846 GAGACTCTAAGTTATTGTTATTATTAATCAGAAAATCCATGTCAAATTACTATTTCTGCT 55827905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 GAGACTCTAAGTTATTGTTATTATTAATCAGAAAATCCATGTCAAATTACTATTTCTGCT 3254

 55827906 GAAGAGATTTTGGCAACAACAATACACAGGCTACCTTCTGAACCAGAACCCCAAAAATGC 55827965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 GAAGAGATTTTGGCAACAACAATACACAGGCTACCTTCTGAACCAGAACCCCAAAAATGC 3314

 55827966 TTCAAGGATTAATAAATGCAAAGTTAATTCCAGAAATATCTGGTCATCAGATCCTCTCAC 55828025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 TTCAAGGATTAATAAATGCAAAGTTAATTCCAGAAATATCTGGTCATCAGATCCTCTCAC 3374

 55828026 AGAAAGACATCCAAAAGACAGCTTGGTTCTGCTGCCCTATGAAAGTTGTTAGAGTTTATA 55828085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 AGAAAGACATCCAAAAGACAGCTTGGTTCTGCTGCCCTATGAAAGTTGTTAGAGTTTATA 3434

 55828086 TAGACTCACTTTTGGTGAAAAGAACCAAAAACAAAAAAAAGAAACCCTAACAAATAGAGC 55828145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 TAGACTCACTTTTGGTGAAAAGAACCAAAAACAAAAAAAAGAAACCCTAACAAATAGAGC 3494

 55828146 CAGGAAAAGTCAAGAATGGAAAGTTCTCGAGCACACATGACTGATAACAAGAACTATCAC 55828205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3495 CAGGAAAAGTCAAGAATGGAAAGTTCTCGAGCACACATGACTGATAACAAGAACTATCAC 3554

 55828206 AGAAGACTGCAGAAAGCACAATTTGGCAAAAAGGCCATCACAAACGTATACAAGAAATAC 55828265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3555 AGAAGACTGCAGAAAGCACAATTTGGCAAAAAGGCCATCACAAACGTATACAAGAAATAC 3614

 55828266 TTCTGCAAGGACATCTGCCTTGCAACTGCCTGTCCAACCTCCAGCTGGCGCCACTCTTGT 55828325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 TTCTGCAAGGACATCTGCCTTGCAACTGCCTGTCCAACCTCCAGCTGGCGCCACTCTTGT 3674

 55828326 TATTGATCCTTGTAGCCAAGAATAATGATGTAATGCTCCTCATTTTTTCCTTTAAAAACC 55828385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3675 TATTGATCCTTGTAGCCAAGAATAATGATGTAATGCTCCTCATTTTTTCCTTTAAAAACC 3734

 55828386 TTTGCCTGTCTTCACCTCTCTGAATATGCAGAGTTCACTGTGGCATGCACATTCCCATTA 55828445
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3735 TTTGCCTGTCTTCACCTCTCTGAATATGCAGAGTTCACTATGGCATGCACATTCCCATTA 3794

 55828446 CAGTGCTCTATTCCCAAATAACTATCATTTTCTTTTAGAGAGCTTCTCTCTGTCATTTAG 55828505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3795 CAGTGCTCTATTCCCAAATAACTATCATTTTCTTTTAGAGAGCTTCTCTCTGTCATTTAG 3854

 55828506 ATTGACAGCCCAAGCTGACAGATTATACTACTTATGCCTGAAGATTAATACAACTTTCTC 55828565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3855 ATTGACAGCCCAAGCTGACAGATTATACTACTTATGCCTGAAGATTAATACAACTTTCTC 3914

 55828566 TTCTAAACTTTGCCAAAGGGAAATGCCTAAAATAAGTATATGCCTCTGGATAATCACCCA 55828625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3915 TTCTAAACTTTGCCAAAGGGAAATGCCTAAAATAAGTATATGCCTCTGGATAATCACCCA 3974

 55828626 CCTGGTTGTAGCACATCAACTGAGGTTCCTGGAAACACATCTGCCTCTGATGTGAGCTGC 55828685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3975 CCTGGTTGTAGCACATCAACTGAGGTTCCTGGAAACACATCTGCCTCTGATGTGAGCTGC 4034

 55828686 ACTGCACATCATCACTGAAATGTGATCAAGATAACTGGGGGCTTTTGCTCATTCTCTGGG 55828745
          ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4035 ACTGCACATCATCACTAAAATGTGATCAAGATAACTGGGGGTTTTTGCTCATTCTCTGGG 4094

 55828746 AGTGGTGAAAGATCTAATGACTCCGTGATCAAAGAGGTGTGGCAAGAAGTTATCTGAAGA 55828805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4095 AGTGGTGAAAGATCTAATGACTCCGTGATCAAAGAGGTGTGGCAAGAAGTTATCTGAAGA 4154

 55828806 TTTCAGACCTGCCACCTTCTGATTCTGAAGGATTAGCTGAGAGATAAAGAAAAATATCTG 55828865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4155 TTTCAGACCTGCCACCTTCTGATTCTGAAGGATTAGCTGAGAGATAAAGAAAAATATCTG 4214

 55828866 GCTCCCATCAGGACATTAAGTCCACTTCATTGATACACAGTGGCCACAATGTTTCTTTAC 55828925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4215 GCTCCCATCAGGACATTAAGTCCACTTCATTGATACACAGTGGCCACAATGTTTCTTTAC 4274

 55828926 TCACTCTGTGTTAGTGGTAAAATGTCTAATCCTCTACCCCAGAGCAATCTGAGATTGCTC 55828985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4275 TCACTCTGTGTTAGTGGTAAAATGTCTAATCCTCTACCCCAGAGCAATCTGAGATTGCTC 4334

 55828986 TGGTTTTAACACTGAAGGTCCCAAATCCCAGGAAACTCCCAGGTAAACTGGTATGGTTGG 55829045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4335 TGGTTTTAACACTGAAGGTCCCAAATCCCAGGAAACTCCCAGGTAAACTGGTATGGTTGG 4394

 55829046 CCACTCTAGATATCTGAGATAGATGTCTTCCCCTCTGTGTAAAAAAGACCTGCAGAGATG 55829105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4395 CCACTCTAGATATCTGAGATAGATGTCTTCCCCTCTGTGTAAAAAAGACCTGCAGAGATG 4454

 55829106 CCAACATGAGACTGTGAATAGGCTTCCACACATGCGCAGGTGGCTCTCAGCATGGGTGGA 55829165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4455 CCAACATGAGACTGTGAATAGGCTTCCACACATGCGCAGGTGGCTCTCAGCATGGGTGGA 4514

 55829166 ACAGAATCACACTGTTCTGGGCCCAAATCCAGAGAGGCCCTTGTTATGACACCCTTTTAT 55829225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4515 ACAGAATCACACTGTTCTGGGCCCAAATCCAGAGAGGCCCTTGTTATGACACCCTTTTAT 4574

 55829226 TCTGAAAACAGCAAAAGTAAAAAATTTGGCTCCCCAAAACAGTCACTTTAAGAATTCTAA 55829285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4575 TCTGAAAACAGCAAAAGTAAAAAATTTGGCTCCCCAAAACAGTCACTTTAAGAATTCTAA 4634

 55829286 TTTTTCTTCTGAATATAACAGACAAACTTATTTTTCACTACCCTAGCCCTGTACACTTTT 55829345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4635 TTTTTCTTCTGAATATAACAGACAAACTTATTTTTCACTACCCTAGCCCTGTACACTTTT 4694

 55829346 AAACCGAATCATTCAATTCTGATCACTGATTTTTAGCTAAATGAGGAACACTATTTAAAT 55829405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4695 AAACCGAATCATTCAATTCTGATCACTGATTTTTAGCTAAATGAGGAACACTATTTAAAT 4754

 55829406 AATACGCTGCAGTACCTGCATTGCACAACACAAAAACCCTTGCACTCTGTATTAGTTAAT 55829465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4755 AATACGCTGCAGTACCTGCATTGCACAACACAAAAACCCTTGCACTCTGTATTAGTTAAT 4814

 55829466 GAATCTCAGGTAAGTAACAAATTATTTTAGATGTCACTAGAACAGCTTTATTTAAAAATC 55829525
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4815 GAATCTCAGGTAAGTAACAAATTATTTTAGATGCCACTAGAACAGCTTTATTTAAAAATC 4874

 55829526 CATATCATAAAAGTAAAATCTTCCCTTCATTTTATAACTTAGTCTTTGCATTAGTTCATT 55829585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4875 CATATCATAAAAGTAAAATCTTCCCTTCATTTTATAACTTAGTCTTTGCATTAGTTCATT 4934

 55829586 CTCACATTGCTACAAAGTAACACCTGAGACTGGGTAATCTATAAGAAAAGAGGTTTAATT 55829645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4935 CTCACATTGCTACAAAGTAACACCTGAGACTGGGTAATCTATAAGAAAAGAGGTTTAATT 4994

 55829646 GGCTCACAGTTCTGCAGGCTGTAGAGGAAGCGTAGTGGCTTCTGCTTCTGGGGAGGCTTC 55829705
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4995 GGCTCACAGTTCTGCAGGCTGTAGAGCAAGCGTAGTGGCTTCTGCTTCTGGGGAGGCTTC 5054

 55829706 AGGAAGCTTCCAATCATGACAGAAGGCAAAGGGAGGTCACAGGCATCTCACATAGTGGGA 55829765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5055 AGGAAGCTTCCAATCATGACAGAAGGCAAAGGGAGGTCACAGGCATCTCACATAGTGGGA 5114

 55829766 GCAGGAGCAATAAAGCGGGGAGGAGGGGAAGGGGGCTACACACTTCTAAACTATCTACCA 55829825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5115 GCAGGAGCAATAAAGCGGGGAGGAGGGGAAGGGGGCTACACACTTCTAAACTATCTACCA 5174

 55829826 TCTCTCCCAATTTCTTCACAAAGCCACTTCAGTCCTGAAACATTTACCAGGAAAAGTTTC 55829885
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5175 TCTCTCCCAATTTCTTCACAAAGCCACTTCAGTCCTGCAACATTTACCAGGAAAAGTTTC 5234

 55829886 TTTGTCTGCTTCTGAATATGGTTCACCCATTTGATTTTCAATTTTCATGTTCGGTTAGCC 55829945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5235 TTTGTCTGCTTCTGAATATGGTTCACCCATTTGATTTTCAATTTTCATGTTCGGTTAGCC 5294

 55829946 TCCATCAAATTTTTCTTTCCAGCCAGCTCTTTTTTTTGTTGCCCCATATGAATAATGATT 55830005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5295 TCCATCAAATTTTTCTTTCCAGCCAGCTCTTTTTTTTGTTGCCCCATATGAATAATGATT 5354

 55830006 TTTCTTAAGAAGCGGTGGAAAAGAAAAGTTTAAAATAAAGAAAAAATGATATAGTAAAAT 55830065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5355 TTTCTTAAGAAGCGGTGGAAAAGAAAAGTTTAAAATAAAGAAAAAATGATATAGTAAAAT 5414

 55830066 AAACATGCTGAGAGAAAGGAAAAATATATATTTAAAGATGCATTTTATAGGGGAGGAATA 55830125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5415 AAACATGCTGAGAGAAAGGAAAAATATATATTTAAAGATGCATTTTATAGGGGAGGAATA 5474

 55830126 TTCATATGAAATCTAACTGGATCCATTAGCGGCAAAACACCAGATTAAAATATCGGAACA 55830185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5475 TTCATATGAAATCTAACTGGATCCATTAGCGGCAAAACACCAGATTAAAATATCGGAACA 5534

 55830186 CACCAGAAAGGTATATTTTATTAAATACTACCATAGGCATTTGCATTACATTTATCTCTT 55830245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5535 CACCAGAAAGGTATATTTTATTAAATACTACCATAGGCATTTGCATTACATTTATCTCTT 5594

 55830246 CTTTATTTCCATAGGGATGGCACCAGTTATGTATTTGGATATTAGAAATTAATATTTAAT 55830305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5595 CTTTATTTCCATAGGGATGGCACCAGTTATGTATTTGGATATTAGAAATTAATATTTAAT 5654

 55830306 GACAGCTCAAAAGAGGAAGACCAAAAATGGAGAATCCCCCCAAATTAAGGAAGCATTCTG 55830365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5655 GACAGCTCAAAAGAGGAAGACCAAAAATGGAGAATCCCCCCAAATTAAGGAAGCATTCTG 5714

 55830366 ATTAAGAAGAAAGTATGCTTCCCAGAAGCACCCTCTAAAACTGATCTCTTTTAGTGTTGT 55830425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5715 ATTAAGAAGAAAGTATGCTTCCCAGAAGCACCCTCTAAAACTGATCTCTTTTAGTGTTGT 5774

 55830426 ATATAAAAATTATTTTGAAAATAAAAATGTGATATTTAGTAATGGTTAGGAATTTATATA 55830485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5775 ATATAAAAATTATTTTGAAAATAAAAATGTGATATTTAGTAATGGTTAGGAATTTATATA 5834

 55830486 TATATACAACAGGACTTCATGGAGTAAAGTCTATTATCCGTTGCTATTTTCTGAAAATAT 55830545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5835 TATATACAACAGGACTTCATGGAGTAAAGTCTATTATCCGTTGCTATTTTCTGAAAATAT 5894

 55830546 CA 55830547
          ||
     5895 CA 5896

Alignment time is 13.9753 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5220] =>      5220 nucs 'mol-32-2e0a-045829_5220'

Score:        5174
Aligned:      5218        nucs
Identic:      5214 (100%) nucs =>      1469 (100%)      3745 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55845056,55846524] EXCISED REGION [55846528,55850276]
 second seq =>  [       1,    1469] EXCISED REGION [    1473,    5220]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [1470,1472]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [1470,1470] to [1472,1472]

 55845056 ATTTGATAAATAGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGTA 55845115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTGATAAATAGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGTA 60

 55845116 ACTGTAATTTTTTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCAC 55845175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTGTAATTTTTTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCAC 120

 55845176 GGTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTGT 55845235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTGT 180

 55845236 ATTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTT 55845295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTT 240

 55845296 CATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCT 55845355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCT 300

 55845356 TATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTAT 55845415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTAT 360

 55845416 TTTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAA 55845475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAA 420

 55845476 AGGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAA 55845535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAA 480

 55845536 CAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAA 55845595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAA 540

 55845596 CAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTG 55845655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTG 600

 55845656 AACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTG 55845715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTG 660

 55845716 GTTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATT 55845775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATT 720

 55845776 TATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATT 55845835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATT 780

 55845836 AATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGT 55845895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGT 840

 55845896 TCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTC 55845955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTC 900

 55845956 TGTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAA 55846015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAA 960

 55846016 ATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCA 55846075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCA 1020

 55846076 TTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACT 55846135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACT 1080

 55846136 TCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCC 55846195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCC 1140

 55846196 ATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTC 55846255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTC 1200

 55846256 ACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTA 55846315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTA 1260

 55846316 ATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGT 55846375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGT 1320

 55846376 GGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTT 55846435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTT 1380

 55846436 TTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACT 55846495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACT 1440

 55846496 TGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 55846524
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 1469

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 1532

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 1592

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 1652

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 1712

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 1772

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 1832

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 1892

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 1952

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 2012

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 2072

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 2132

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 2192

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 2252

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 2312

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 2372

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 2432

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 2492

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 2552

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 2612

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTG 55847727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2613 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTG 2671

 55847728 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 55847787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 2731

 55847788 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 55847847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 2791

 55847848 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 55847907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 2851

 55847908 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 55847967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 2911

 55847968 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 55848027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 2971

 55848028 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 55848087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 3031

 55848088 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAAC 55848147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3032 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAAC 3091

 55848148 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 55848207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 3151

 55848208 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 55848267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 3211

 55848268 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 55848327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 3271

 55848328 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 55848387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 3331

 55848388 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 55848447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 3391

 55848448 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 55848507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 3451

 55848508 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 55848567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3452 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 3511

 55848568 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 55848627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3512 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 3571

 55848628 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 55848687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 3631

 55848688 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 55848747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3632 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 3691

 55848748 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 55848807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3692 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 3751

 55848808 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 55848867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3752 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 3811

 55848868 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 55848927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3812 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 3871

 55848928 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 55848987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3872 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 3931

 55848988 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 55849047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3932 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 3991

 55849048 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 55849107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3992 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 4051

 55849108 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 55849167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4052 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 4111

 55849168 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 55849227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4112 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 4171

 55849228 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 55849287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4172 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 4231

 55849288 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 55849347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4232 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 4291

 55849348 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 55849407
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4292 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAGGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 4351

 55849408 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 55849467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4352 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 4411

 55849468 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 55849527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4412 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 4471

 55849528 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 55849587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4472 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 4531

 55849588 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 55849647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4532 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 4591

 55849648 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCA 55849707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4592 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTATATGGCAGCA 4651

 55849708 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 55849767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4652 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 4711

 55849768 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 55849827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4712 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 4771

 55849828 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 55849887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4772 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 4831

 55849888 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 55849947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4832 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 4891

 55849948 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 55850007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4892 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 4951

 55850008 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 55850067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4952 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 5011

 55850068 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 55850127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5012 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 5071

 55850128 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 55850187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5072 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 5131

 55850188 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATT 55850247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATT 5191

 55850248 TGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCT 55850276
          |||||||||||||||||||||||||||||
     5192 TGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCT 5220

Alignment time is 12.6849 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    6043] =>      6043 nucs 'mol-32-2e57-057079_6043'

Score:        5639
Aligned:      5694        nucs
Identic:      5689 (100%) nucs =>      1076 (100%)      4613 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55845449,55846524] EXCISED REGION [55846528,55851145]
 second seq =>  [     348,    1423] EXCISED REGION [    1427,    6043]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [1424,1426]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [1424,1424] to [1426,1426]

 55845449 AGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAA 55845508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      348 AGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAA 407

 55845509 AATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGC 55845568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      408 AATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGC 467

 55845569 CTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCAC 55845628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      468 CTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCAC 527

 55845629 TCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGA 55845688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      528 TCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGA 587

 55845689 TAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCT 55845748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      588 TAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCT 647

 55845749 TAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAAT 55845808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      648 TAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAAT 707

 55845809 ATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCT 55845868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      708 ATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCT 767

 55845869 AAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAA 55845928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      768 AAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAA 827

 55845929 TTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAA 55845988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      828 TTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAA 887

 55845989 CTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATT 55846048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      888 CTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATT 947

 55846049 TCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAG 55846108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      948 TCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAG 1007

 55846109 TGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTC 55846168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1008 TGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTC 1067

 55846169 CCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCA 55846228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1068 CCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCA 1127

 55846229 TACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGG 55846288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1128 TACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGG 1187

 55846289 CCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGC 55846348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1188 CCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGC 1247

 55846349 TGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTAT 55846408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 TGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTAT 1307

 55846409 GGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATAT 55846468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 GGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATAT 1367

 55846469 AATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 55846524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 AATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 1423

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 1486

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 1546

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 1606

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 1666

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 1726

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 1786

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 1846

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 1906

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 1966

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 2026

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 2086

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 2146

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 2206

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 2266

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 2326

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 2386

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2387 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCCTTTATTCATCATCT 2446

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 2506

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 2566

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTG 55847727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2567 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTG 2625

 55847728 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 55847787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 2685

 55847788 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 55847847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 2745

 55847848 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 55847907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 2805

 55847908 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 55847967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 2865

 55847968 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 55848027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 2925

 55848028 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 55848087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 2985

 55848088 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAAC 55848147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2986 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAAC 3045

 55848148 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 55848207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 3105

 55848208 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 55848267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 3165

 55848268 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 55848327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 3225

 55848328 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 55848387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 3285

 55848388 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 55848447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 3345

 55848448 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 55848507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 3405

 55848508 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 55848567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 3465

 55848568 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 55848627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 3525

 55848628 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 55848687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 3585

 55848688 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 55848747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 3645

 55848748 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 55848807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 3705

 55848808 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 55848867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 3765

 55848868 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 55848927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 3825

 55848928 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 55848987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 3885

 55848988 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 55849047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 3945

 55849048 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 55849107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 4005

 55849108 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 55849167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 4065

 55849168 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 55849227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4066 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 4125

 55849228 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 55849287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4126 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 4185

 55849288 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 55849347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4186 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 4245

 55849348 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 55849407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4246 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 4305

 55849408 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 55849467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4306 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 4365

 55849468 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 55849527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4366 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 4425

 55849528 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 55849587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4426 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 4485

 55849588 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 55849647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4486 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 4545

 55849648 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCA 55849707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4546 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCA 4605

 55849708 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 55849767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4606 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 4665

 55849768 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 55849827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4666 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 4725

 55849828 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 55849887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4726 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 4785

 55849888 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 55849947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4786 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 4845

 55849948 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 55850007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 4905

 55850008 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 55850067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4906 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 4965

 55850068 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 55850127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4966 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 5025

 55850128 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 55850187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5026 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 5085

 55850188 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATT 55850247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5086 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATT 5145

 55850248 TGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACA 55850307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5146 TGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACA 5205

 55850308 GTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGAT 55850367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5206 GTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGAT 5265

 55850368 GTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGC 55850427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5266 GTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGC 5325

 55850428 AGAAAACTGCATAGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAG 55850487
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5326 AGAAAACTGCATGGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAG 5385

 55850488 TTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAG 55850547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5386 TTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAG 5445

 55850548 CCTCCAACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAA 55850607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5446 CCTCCAACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAA 5505

 55850608 GGAACGCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGA 55850667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5506 GGAACGCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGA 5565

 55850668 GCCTATATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAA 55850727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5566 GCCTATATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAA 5625

 55850728 ATTTCTCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTA 55850787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5626 ATTTCTCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTA 5685

 55850788 TTGACCTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATC 55850847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5686 TTGACCTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATC 5745

 55850848 TATCCCTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTT 55850907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5746 TATCCCTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTT 5805

 55850908 GAGCTGTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGA 55850967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5806 GAGCTGTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGA 5865

 55850968 TTAATGCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAACTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTT 55851027
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     5866 TTAATGCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAGCTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTT 5925

 55851028 TTTCAAACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTG 55851087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5926 TTTCAAACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTG 5985

 55851088 CATATCAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTT 55851145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5986 CATATCAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTT 6043

Alignment time is 14.4187 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5495] =>      5495 nucs 'mol-32-2ef1-006837_5495'

Score:        5449
Aligned:      5493        nucs
Identic:      5489 (100%) nucs =>      1470 (100%)      4019 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55845055,55846524] EXCISED REGION [55846528,55850550]
 second seq =>  [       1,    1470] EXCISED REGION [    1474,    5495]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [1471,1473]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [1471,1471] to [1473,1473]

 55845055 TATTTGATAAATAGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGT 55845114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTGATAAATAGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGT 60

 55845115 AACTGTAATTTTTTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCA 55845174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACTGTAATTTTTTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCA 120

 55845175 CGGTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTG 55845234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CGGTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTG 180

 55845235 TATTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTT 55845294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTT 240

 55845295 TCATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATC 55845354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATC 300

 55845355 TTATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTA 55845414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTA 360

 55845415 TTTTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAA 55845474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAA 420

 55845475 AAGGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCA 55845534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCA 480

 55845535 ACAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAA 55845594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAA 540

 55845595 ACAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCT 55845654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCT 600

 55845655 GAACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTT 55845714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTT 660

 55845715 GGTTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACAT 55845774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACAT 720

 55845775 TTATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATAT 55845834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATAT 780

 55845835 TAATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTG 55845894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTG 840

 55845895 TTCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTT 55845954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTT 900

 55845955 CTGTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAA 55846014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAA 960

 55846015 AATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGC 55846074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGC 1020

 55846075 ATTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCAC 55846134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCAC 1080

 55846135 TTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCC 55846194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCC 1140

 55846195 CATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATT 55846254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATT 1200

 55846255 CACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGT 55846314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGT 1260

 55846315 AATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTG 55846374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTG 1320

 55846375 TGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTT 55846434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTT 1380

 55846435 TTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTAC 55846494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTAC 1440

 55846495 TTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 55846524
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 1470

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 1533

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 1593

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 1653

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 1713

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 1773

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 1833

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 1893

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 1953

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 2013

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 2073

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 2133

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 2193

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 2253

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 2313

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 2373

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 2433

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 2493

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 2553

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 2613

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTG 55847727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2614 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTG 2672

 55847728 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 55847787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 2732

 55847788 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 55847847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 2792

 55847848 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 55847907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 2852

 55847908 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 55847967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 2912

 55847968 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 55848027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 2972

 55848028 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 55848087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 3032

 55848088 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAAC 55848147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3033 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAAC 3092

 55848148 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 55848207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 3152

 55848208 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 55848267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 3212

 55848268 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 55848327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 3272

 55848328 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 55848387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 3332

 55848388 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 55848447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 3392

 55848448 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 55848507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 3452

 55848508 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 55848567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 3512

 55848568 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 55848627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 3572

 55848628 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 55848687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 3632

 55848688 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 55848747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 3692

 55848748 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 55848807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 3752

 55848808 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 55848867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 3812

 55848868 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 55848927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 3872

 55848928 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 55848987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 3932

 55848988 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 55849047
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 GGGATCACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 3992

 55849048 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 55849107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 4052

 55849108 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 55849167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 4112

 55849168 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 55849227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4113 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 4172

 55849228 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 55849287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4173 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 4232

 55849288 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 55849347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4233 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 4292

 55849348 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 55849407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4293 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 4352

 55849408 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 55849467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4353 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 4412

 55849468 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 55849527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4413 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 4472

 55849528 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 55849587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 4532

 55849588 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 55849647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4533 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 4592

 55849648 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCA 55849707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4593 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCA 4652

 55849708 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 55849767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4653 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 4712

 55849768 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 55849827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4713 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 4772

 55849828 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 55849887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4773 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 4832

 55849888 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 55849947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4833 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 4892

 55849948 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 55850007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4893 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 4952

 55850008 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 55850067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4953 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 5012

 55850068 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 55850127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5013 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 5072

 55850128 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 55850187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5073 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 5132

 55850188 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATT 55850247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5133 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATT 5192

 55850248 TGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACA 55850307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5193 TGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACA 5252

 55850308 GTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGAT 55850367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5253 GTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGAT 5312

 55850368 GTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGC 55850427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5313 GTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGC 5372

 55850428 AGAAAACTGCATAGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAG 55850487
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5373 AGAAAACTGCATGGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAG 5432

 55850488 TTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAG 55850547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5433 TTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAG 5492

 55850548 CCT 55850550
          |||
     5493 CCT 5495

Alignment time is 13.1134 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5071] =>      5071 nucs 'mol-32-2efc-018014_5071'

Score:        5047
Aligned:      5069        nucs
Identic:      5067 (100%) nucs =>      1350 (100%)      3717 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55845175,55846524] EXCISED REGION [55846528,55850246]
 second seq =>  [       1,    1350] EXCISED REGION [    1354,    5071]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [1351,1353]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [1351,1351] to [1353,1353]

 55845175 CGGTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTG 55845234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGGTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTG 60

 55845235 TATTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTT 55845294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTT 120

 55845295 TCATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATC 55845354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATC 180

 55845355 TTATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTA 55845414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTA 240

 55845415 TTTTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAA 55845474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAA 300

 55845475 AAGGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCA 55845534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCA 360

 55845535 ACAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAA 55845594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAA 420

 55845595 ACAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCT 55845654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCT 480

 55845655 GAACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTT 55845714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTT 540

 55845715 GGTTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACAT 55845774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACAT 600

 55845775 TTATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATAT 55845834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATAT 660

 55845835 TAATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTG 55845894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTG 720

 55845895 TTCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTT 55845954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTT 780

 55845955 CTGTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAA 55846014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAA 840

 55846015 AATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGC 55846074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGC 900

 55846075 ATTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCAC 55846134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCAC 960

 55846135 TTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCC 55846194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCC 1020

 55846195 CATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATT 55846254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATT 1080

 55846255 CACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGT 55846314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGT 1140

 55846315 AATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTG 55846374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTG 1200

 55846375 TGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTT 55846434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTT 1260

 55846435 TTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTAC 55846494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTAC 1320

 55846495 TTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 55846524
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 1350

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1354 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 1413

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1414 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 1473

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 1533

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 1593

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 1653

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 1713

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 1773

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 1833

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 1893

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 1953

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 2013

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 2073

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 2133

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 2193

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 2253

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 2313

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 2373

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 2433

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 2493

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTG 55847727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2494 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTG 2552

 55847728 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 55847787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 2612

 55847788 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 55847847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 2672

 55847848 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 55847907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 2732

 55847908 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 55847967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 2792

 55847968 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 55848027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 2852

 55848028 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 55848087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 2912

 55848088 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAAC 55848147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2913 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAAC 2972

 55848148 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 55848207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 3032

 55848208 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 55848267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 3092

 55848268 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 55848327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 3152

 55848328 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 55848387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 3212

 55848388 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 55848447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 3272

 55848448 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 55848507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 3332

 55848508 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 55848567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 3392

 55848568 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 55848627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 3452

 55848628 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 55848687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 3512

 55848688 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 55848747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 3572

 55848748 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 55848807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 3632

 55848808 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 55848867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 3692

 55848868 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 55848927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 3752

 55848928 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 55848987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 3812

 55848988 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 55849047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 3872

 55849048 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 55849107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 3932

 55849108 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 55849167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 3992

 55849168 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 55849227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 4052

 55849228 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 55849287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 4112

 55849288 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 55849347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4113 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 4172

 55849348 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 55849407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4173 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 4232

 55849408 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 55849467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4233 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 4292

 55849468 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 55849527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4293 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 4352

 55849528 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 55849587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4353 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 4412

 55849588 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 55849647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4413 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 4472

 55849648 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCA 55849707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCA 4532

 55849708 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 55849767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4533 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 4592

 55849768 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 55849827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4593 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 4652

 55849828 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 55849887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4653 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 4712

 55849888 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 55849947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4713 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 4772

 55849948 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 55850007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4773 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 4832

 55850008 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 55850067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4833 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 4892

 55850068 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 55850127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4893 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 4952

 55850128 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 55850187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4953 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 5012

 55850188 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTAT 55850246
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5013 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTAT 5071

Alignment time is 12.1126 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    8752] =>      8752 nucs 'mol-32-2fd8-227699_8752'

Score:        8651
Aligned:      8752        nucs
Identic:      8742 (100%) nucs =>      7084 (100%)      1658 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55818866,55825957] EXCISED REGION [55846713,55848372]
 second seq =>  [       1,    7090] EXCISED REGION [    7094,    8752]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [7091,7093]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [7090,7090] to [7093,7093]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55818866 CTAGAGATATTATTTGAATGTTGTGGAAGTACCTTGTACAAATTTATTTTCTTGATATTT 55818925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTAGAGATATTATTTGAATGTTGTGGAAGTACCTTGTACAAATTTATTTTCTTGATATTT 60

 55818926 AGTTCTATAAAAGCTTCCCTGATTTCTCCTAAGGTGGTCACTTATTTTGTGCTGTTAGCG 55818985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTTCTATAAAAGCTTCCCTGATTTCTCCTAAGGTGGTCACTTATTTTGTGCTGTTAGCG 120

 55818986 TACCTTTGTGTCACTAGTATTGTGGTAGTATTATACTATATTTTAAATATTCATTTTCAA 55819045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACCTTTGTGTCACTAGTATTGTGGTAGTATTATACTATATTTTAAATATTCATTTTCAA 180

 55819046 GCCTATCTTTGCAAAGGGCTCATGAATTTCCTGATTAAAGGGACTATGTAATATTCAGTT 55819105
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCTATCTTTGCAAAGGGCTCACGAATTTCCTGATTAAAGGGACTATGTAATATTCAGTT 240

 55819106 TTATGTCTCCAATAACTCTCATGATGTATGGTATCTATTAGTTTTCAATAAATGTTAACG 55819165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATGTCTCCAATAACTCTCATGATGTATGGTATCTATTAGTTTTCAATAAATGTTAACG 300

 55819166 AATGATTTAAAATGATTGAACTGAATTATTGACAGATGTTTGAAACTTGACTAATTTTTA 55819225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATGATTTAAAATGATTGAACTGAATTATTGACAGATGTTTGAAACTTGACTAATTTTTA 360

 55819226 TTCAAGTTGAAATAATATGTAAAGTAAGCAATCACAACATTCAGCTTCCTTCATGAAGTC 55819285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCAAGTTGAAATAATATGTAAAGTAAGCAATCACAACATTCAGCTTCCTTCATGAAGTC 420

 55819286 CAGAAGAGAACTGAACATATTGCCCAAGTGCCCAGAGGGCCCTAAAATATAGATGTGTGT 55819345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGAAGAGAACTGAACATATTGCCCAAGTGCCCAGAGGGCCCTAAAATATAGATGTGTGT 480

 55819346 TCATTAGGCTAATTGGAGACAGGTAGACAAAAATCCTCCTTTGAAATTTGTCCTCATAGG 55819405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCATTAGGCTAATTGGAGACAGGTAGACAAAAATCCTCCTTTGAAATTTGTCCTCATAGG 540

 55819406 CAATGGCATTATTCCCAGGCTTATCAAGTTCTTTCCCTTGGCAGATCTCTGTGGTCCATC 55819465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAATGGCATTATTCCCAGGCTTATCAAGTTCTTTCCCTTGGCAGATCTCTGTGGTCCATC 600

 55819466 TGCTGAACTTAAATGCTGAAATGGTCTCAATGTGAACATGCCTAATGGACATCTTTATTC 55819525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCTGAACTTAAATGCTGAAATGGTCTCAATGTGAACATGCCTAATGGACATCTTTATTC 660

 55819526 TGAGTGGCTATACCAGCACAATCCATAAATCTGAGCTATTTCAGATTACAAATGGAATTG 55819585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAGTGGCTATACCAGCACAATCCATAAATCTGAGCTATTTCAGATTACAAATGGAATTG 720

 55819586 TTCTCCACAGTGTTCCATTGCCTTATAGATAATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATG 55819645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCTCCACAGTGTTCCATTGCCTTATAGATAATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATG 780

 55819646 AAATTAGCTCTAAGAGTTCAATTGATATTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAA 55819705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATTAGCTCTAAGAGTTCAATTGATATTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAA 840

 55819706 TTCATCTATATATCTGAACTCATTCATTTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCA 55819765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCATCTATATATCTGAACTCATTCATTTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCA 900

 55819766 AGTAAAGACTCCATCTACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTT 55819825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTAAAGACTCCATCTACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTT 960

 55819826 AGGTAACTGTTTTCATTTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCAT 55819885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGTAACTGTTTTCATTTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCAT 1020

 55819886 CAAGCATTAAGTTTCTCGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAG 55819945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAAGCATTAAGTTTCTCGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAG 1080

 55819946 CTGTAGTCATCCCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAA 55820005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGTAGTCATCCCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAA 1140

 55820006 TTTTCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACT 55820065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACT 1200

 55820066 GATATCTTGACAGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGG 55820125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATATCTTGACAGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGG 1260

 55820126 TGAAGAAAGTAGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTA 55820185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGAAGAAAGTAGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTA 1320

 55820186 TGTTTTCTTCTTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAG 55820245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTTTTCTTCTTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAG 1380

 55820246 GCACATGATCTGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAA 55820305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCACATGATCTGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAA 1440

 55820306 GTTACAAACAGAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAA 55820365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTACAAACAGAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAA 1500

 55820366 GGCAGAAAATTTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAAC 55820425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGCAGAAAATTTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAAC 1560

 55820426 ACTTAGGTAATGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGA 55820485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTTAGGTAATGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGA 1620

 55820486 GCTTTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAG 55820545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTTTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAG 1680

 55820546 TTGGAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGG 55820605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTGGAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGG 1740

 55820606 CAATTGAGACTTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACA 55820665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAATTGAGACTTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACA 1800

 55820666 AAGGGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAG 55820725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGGGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAG 1860

 55820726 ACAGTCCACATGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTT 55820785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACAGTCCACATGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTT 1920

 55820786 CTGCTCTTTCAAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTT 55820845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGCTCTTTCAAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTT 1980

 55820846 TGTTTATAAGTATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGG 55820905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTTTATAAGTATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGG 2040

 55820906 ATTTCTAGGCACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTA 55820965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTTCTAGGCACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTA 2100

 55820966 GGCATTTTTATTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCA 55821025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGCATTTTTATTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCA 2160

 55821026 AGTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAA 55821085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAA 2220

 55821086 AAAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGG 55821145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGG 2280

 55821146 GAAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTG 55821205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTG 2340

 55821206 TAAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATG 55821265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATG 2400

 55821266 GAGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTA 55821325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTA 2460

 55821326 AAATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTG 55821385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTG 2520

 55821386 AATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTG 55821445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTG 2580

 55821446 GGTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAA 55821505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAA 2640

 55821506 GTTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTT 55821565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTT 2700

 55821566 AAGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAAT 55821625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAAT 2760

 55821626 AACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGG 55821685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGG 2820

 55821686 AATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATT 55821745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATT 2880

 55821746 TTTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTA 55821805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTA 2940

 55821806 TTATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAA 55821865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAA 3000

 55821866 GGCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTT 55821925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTT 3060

 55821926 GCTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTG 55821985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GCTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTG 3120

 55821986 AGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCC 55822045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCC 3180

 55822046 GATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAAT 55822105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAAT 3240

 55822106 AGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAA 55822165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAA 3300

 55822166 GCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAAC 55822225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAAC 3360

 55822226 AGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCC 55822285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCC 3420

 55822286 CAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTC 55822345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTC 3480

 55822346 ACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTAT 55822405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTAT 3540

 55822406 CTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCG 55822465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCG 3600

 55822466 TATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGC 55822525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGC 3660

 55822526 CCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAA 55822585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAA 3720

 55822586 AAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAAT 55822645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAAT 3780

 55822646 TCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAG 55822705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAG 3840

 55822706 AAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGA 55822765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGA 3900

 55822766 TGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGA 55822825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGA 3960

 55822826 GATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATG 55822885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATG 4020

 55822886 TCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCA 55822945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCA 4080

 55822946 TGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAA 55823005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAA 4140

 55823006 TGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCT 55823065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCT 4200

 55823066 CAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCT 55823125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCT 4260

 55823126 GAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAG 55823185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAG 4320

 55823186 GCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTAC 55823245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTAC 4380

 55823246 TGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACA 55823305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACA 4440

 55823306 GCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGG 55823365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGG 4500

 55823366 TTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTT 55823425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTT 4560

 55823426 TAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCC 55823485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCC 4620

 55823486 TTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAA 55823545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAA 4680

 55823546 TGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCA 55823605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCA 4740

 55823606 ATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAAT 55823665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAAT 4800

 55823666 ACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAA 55823725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAA 4860

 55823726 TGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAA 55823785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAA 4920

 55823786 GTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATG 55823845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATG 4980

 55823846 AATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGC 55823905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGC 5040

 55823906 ACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACC 55823965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 ACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACC 5100

 55823966 TTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAAT 55824025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAAT 5160

 55824026 TAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAA 55824085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAA 5220

 55824086 TTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTG 55824145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTG 5280

 55824146 TCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCAT 55824205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCAT 5340

 55824206 TAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATA 55824265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATA 5400

 55824266 TATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTT 55824325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTT 5460

 55824326 TGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCA 55824385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCA 5520

 55824386 GAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCT 55824445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCT 5580

 55824446 GCCTTCTTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACA 55824505
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GCCTTCCTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACA 5640

 55824506 GCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAA 55824565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAA 5700

 55824566 GATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTA 55824625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTA 5760

 55824626 TTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAA 55824685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5761 TTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAA 5820

 55824686 TCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAA 55824745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAA 5880

 55824746 CCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGT 55824805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGT 5940

 55824806 GATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTG 55824865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 GATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTG 6000

 55824866 GGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAG 55824925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 GGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAG 6060

 55824926 CAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTT 55824985
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAA--TTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTT 6118

 55824986 AAGAGTCTCACAAGTAAGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAA 55825045
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 AAGAGTCTCACAAGTAAGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAA 6178

 55825046 ACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCA 55825105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6179 ACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCA 6238

 55825106 CTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGC 55825165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 CTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGC 6298

 55825166 TTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCA 55825225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 TTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCA 6358

 55825226 AAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGA 55825285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 AAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGA 6418

 55825286 TTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTC 55825345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 TTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTC 6478

 55825346 TTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTA 55825405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 TTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTA 6538

 55825406 ATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGAT 55825465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 ATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGAT 6598

 55825466 ATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGA 55825525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 ATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGA 6658

 55825526 GGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCA 55825585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 GGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCA 6718

 55825586 CGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGAC 55825645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 CGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGAC 6778

 55825646 ACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAA 55825705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 ACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAA 6838

 55825706 CAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGT 55825765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 CAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGT 6898

 55825766 TTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTA 55825825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6899 TTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTA 6958

 55825826 TTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACA 55825885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6959 TTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACA 7018

 55825886 GCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATT 55825945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7019 GCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATT 7078

 55825946 TCATAATGAAAT 55825957
          ||||||||||||
     7079 TCATAATGAAAT 7090

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7094 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 7153

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7154 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 7213

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7214 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 7273

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7274 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 7333

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7334 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 7393

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7394 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 7453

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7454 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 7513

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7514 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 7573

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7574 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 7633

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7634 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 7693

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7694 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 7753

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7754 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 7813

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7814 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 7873

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7874 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 7933

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7934 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 7993

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7994 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 8053

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 55847732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     8054 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 8112

 55847733 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 55847792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8113 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 8172

 55847793 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 55847852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8173 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 8232

 55847853 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 55847912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8233 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 8292

 55847913 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 55847972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8293 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 8352

 55847973 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 55848032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8353 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 8412

 55848033 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 55848092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8413 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 8472

 55848093 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 55848152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     8473 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 8532

 55848153 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 55848212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8533 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 8592

 55848213 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 55848272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8593 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 8652

 55848273 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 55848332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8653 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 8712

 55848333 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTG 55848372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8713 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTG 8752

Alignment time is 20.7802 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    9814] =>      9814 nucs 'mol-32-2fee-161530_9814'

Score:        9703
Aligned:      9813        nucs
Identic:      9803 (100%) nucs =>      5635 (100%)      4168 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55820316,55825957] EXCISED REGION [55846713,55850883]
 second seq =>  [       1,    5641] EXCISED REGION [    5645,    9814]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [5642,5644]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [5641,5641] to [5644,5644]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55820316 GAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAAT 55820375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAAT 60

 55820376 TTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAA 55820435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAA 120

 55820436 TGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTT 55820495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTT 180

 55820496 GCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAAT 55820555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAAT 240

 55820556 TCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGAC 55820615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGAC 300

 55820616 TTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGT 55820675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGT 360

 55820676 AGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACA 55820735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACA 420

 55820736 TGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTC 55820795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTC 480

 55820796 AAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAG 55820855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAG 540

 55820856 TATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGC 55820915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGC 600

 55820916 ACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTA 55820975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTA 660

 55820976 TTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAG 55821035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAG 720

 55821036 TTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCC 55821095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCC 780

 55821096 TGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAAT 55821155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAAT 840

 55821156 TGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTT 55821215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTT 900

 55821216 TAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTG 55821275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTG 960

 55821276 GTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTAC 55821335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTAC 1020

 55821336 ATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTG 55821395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTG 1080

 55821396 AAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCC 55821455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCC 1140

 55821456 AGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAAC 55821515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAAC 1200

 55821516 CACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCA 55821575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCA 1260

 55821576 TTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTA 55821635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTA 1320

 55821636 AACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAG 55821695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAG 1380

 55821696 TGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATC 55821755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATC 1440

 55821756 TCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACA 55821815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACA 1500

 55821816 TTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAAT 55821875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAAT 1560

 55821876 TCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAG 55821935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAG 1620

 55821936 AAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATAC 55821995
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1621 AAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCGACATAC 1680

 55821996 TGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATA 55822055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATA 1740

 55822056 AAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAA 55822115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAA 1800

 55822116 TAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAA 55822175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAA 1860

 55822176 GAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTAT 55822235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTAT 1920

 55822236 ATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTG 55822295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTG 1980

 55822296 GTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCT 55822355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCT 2040

 55822356 TTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAG 55822415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAG 2100

 55822416 CCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGG 55822475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGG 2160

 55822476 ACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCT 55822535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCT 2220

 55822536 GCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTA 55822595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTA 2280

 55822596 CCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATA 55822655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATA 2340

 55822656 ATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCAC 55822715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCAC 2400

 55822716 TTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGC 55822775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGC 2460

 55822776 TACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAA 55822835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAA 2520

 55822836 ATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCAC 55822895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCAC 2580

 55822896 AGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCA 55822955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCA 2640

 55822956 TGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTT 55823015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTT 2700

 55823016 TCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTG 55823075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTG 2760

 55823076 AGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGA 55823135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGA 2820

 55823136 GCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGC 55823195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGC 2880

 55823196 AGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGA 55823255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGA 2940

 55823256 TTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGG 55823315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGG 3000

 55823316 TGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACA 55823375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACA 3060

 55823376 AACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAA 55823435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAA 3120

 55823436 GATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACA 55823495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACA 3180

 55823496 TTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATT 55823555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATT 3240

 55823556 TTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAA 55823615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAA 3300

 55823616 AGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAA 55823675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAA 3360

 55823676 AGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAAT 55823735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAAT 3420

 55823736 AAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATT 55823795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATT 3480

 55823796 AGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTG 55823855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTG 3540

 55823856 GACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAG 55823915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAG 3600

 55823916 TTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTC 55823975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTC 3660

 55823976 ATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACT 55824035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACT 3720

 55824036 TTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGG 55824095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGG 3780

 55824096 AAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCA 55824155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCA 3840

 55824156 AAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTT 55824215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTT 3900

 55824216 TATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCA 55824275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCA 3960

 55824276 TTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGA 55824335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGA 4020

 55824336 ATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGT 55824395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGT 4080

 55824396 TCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCTTAC 55824455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4081 TCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCCTAC 4140

 55824456 CATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAA 55824515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAA 4200

 55824516 TAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACT 55824575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACT 4260

 55824576 TTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAG 55824635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAG 4320

 55824636 ATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACT 55824695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4321 ATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACT 4380

 55824696 TTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAAC 55824755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAAC 4440

 55824756 ATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACC 55824815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACC 4500

 55824816 TGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAG 55824875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAG 4560

 55824876 GTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTG 55824935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTG 4620

 55824936 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCA 55824995
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TCTCAAAAAAAAAAAAAAA-TTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCA 4679

 55824996 CAAGTAAGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACA 55825055
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 CAAGTAAGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACA 4739

 55825056 ACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTATCAT 55825115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4740 ACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTATCAT 4799

 55825116 CCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACA 55825175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 CCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACA 4859

 55825176 GGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCA 55825235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 GGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCA 4919

 55825236 TGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATT 55825295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 TGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATT 4979

 55825296 CTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTT 55825355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 CTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTT 5039

 55825356 ACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTA 55825415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 ACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTA 5099

 55825416 ATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCA 55825475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 ATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCA 5159

 55825476 GAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATA 55825535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 GAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATA 5219

 55825536 TAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAG 55825595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 TAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAG 5279

 55825596 GCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCA 55825655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 GCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCA 5339

 55825656 ATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACC 55825715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 ATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACC 5399

 55825716 ATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTC 55825775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 ATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTC 5459

 55825776 ATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACA 55825835
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 ATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACA 5519

 55825836 TAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGT 55825895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 TAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGT 5579

 55825896 TAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAA 55825955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 TAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAA 5639

 55825956 AT 55825957
          ||
     5640 AT 5641

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5645 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 5704

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5705 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 5764

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5765 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 5824

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5825 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 5884

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5885 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 5944

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5945 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 6004

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6005 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 6064

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6065 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 6124

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6125 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 6184

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6185 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 6244

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6245 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 6304

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6305 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 6364

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6365 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 6424

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6425 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 6484

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6485 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 6544

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6545 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 6604

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 55847732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     6605 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 6663

 55847733 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 55847792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6664 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 6723

 55847793 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 55847852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6724 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 6783

 55847853 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 55847912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6784 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 6843

 55847913 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 55847972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6844 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 6903

 55847973 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 55848032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6904 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 6963

 55848033 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 55848092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6964 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 7023

 55848093 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 55848152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7024 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 7083

 55848153 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 55848212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7084 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 7143

 55848213 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 55848272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7144 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 7203

 55848273 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 55848332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7204 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 7263

 55848333 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 55848392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7264 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 7323

 55848393 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 55848452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7324 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 7383

 55848453 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 55848512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7384 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 7443

 55848513 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 55848572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7444 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 7503

 55848573 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 55848632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7504 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 7563

 55848633 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 55848692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7564 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 7623

 55848693 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 55848752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7624 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 7683

 55848753 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 55848812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7684 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 7743

 55848813 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 55848872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7744 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 7803

 55848873 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 55848932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7804 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 7863

 55848933 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 55848992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7864 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 7923

 55848993 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 55849052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7924 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 7983

 55849053 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 55849112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7984 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 8043

 55849113 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 55849172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8044 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 8103

 55849173 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 55849232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8104 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 8163

 55849233 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 55849292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8164 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 8223

 55849293 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 55849352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8224 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 8283

 55849353 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 55849412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8284 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 8343

 55849413 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 55849472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8344 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 8403

 55849473 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 55849532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8404 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 8463

 55849533 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 55849592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8464 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 8523

 55849593 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 55849652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8524 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 8583

 55849653 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 55849712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8584 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 8643

 55849713 GAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCATGAGAA 55849772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8644 GAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCATGAGAA 8703

 55849773 CTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCACCTCC 55849832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8704 CTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCACCTCC 8763

 55849833 CACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAGATTTG 55849892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8764 CACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAGATTTG 8823

 55849893 GGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGCGCTCA 55849952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8824 GGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGCGCTCA 8883

 55849953 GAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTTATTTT 55850012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8884 GAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTTATTTT 8943

 55850013 AGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATACGCTA 55850072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8944 AGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATACGCTA 9003

 55850073 CACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGATTAAA 55850132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9004 CACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGATTAAA 9063

 55850133 GATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGTTTTTA 55850192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9064 GATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGTTTTTA 9123

 55850193 TCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATTTGTCA 55850252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9124 TCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATTTGTCA 9183

 55850253 TGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACAGTTTT 55850312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9184 TGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACAGTTTT 9243

 55850313 GAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGATGTTTT 55850372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9244 GAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGATGTTTT 9303

 55850373 TCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGCAGAAA 55850432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9304 TCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGCAGAAA 9363

 55850433 ACTGCATAGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAGTTCCC 55850492
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9364 ACTGCATGGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAGTTCCC 9423

 55850493 ACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAGCCTCC 55850552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9424 ACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAGCCTCC 9483

 55850553 AACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAAGGAAC 55850612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9484 AACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAAGGAAC 9543

 55850613 GCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGAGCCTA 55850672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9544 GCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGAGCCTA 9603

 55850673 TATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAAATTTC 55850732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9604 TATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAAATTTC 9663

 55850733 TCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTATTGAC 55850792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9664 TCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTATTGAC 9723

 55850793 CTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATCTATCC 55850852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9724 CTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATCTATCC 9783

 55850853 CTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAG 55850883
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     9784 CTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAG 9814

Alignment time is 23.2015 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4170] =>      4170 nucs 'mol-32-2fee-161530_4170'

Score:        4148
Aligned:      4170        nucs
Identic:      4168 (100%) nucs =>       997 (100%)      3171 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55846713,55847709] EXCISED REGION [55847711,55850883]
 second seq =>  [       1,     997] EXCISED REGION [     998,    4170]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55847710,55847710]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [55848128,55848128]
 second seq =>         1 nucs [1415,1415]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 60

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 120

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 180

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 240

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 300

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 360

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 420

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 480

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 540

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 600

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 660

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 720

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 780

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 840

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 900

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 960

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA 55847709
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA 997

EXCISED REGION

 55847711 GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCT 55847770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCT 1057

 55847771 TCTTACAACTAAATTTGTAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTT 55847830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 TCTTACAACTAAATTTGTAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTT 1117

 55847831 TCATGGATTTATTATTGGTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTT 55847890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 TCATGGATTTATTATTGGTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTT 1177

 55847891 TCCTCTGGCATATACTGCAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACA 55847950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 TCCTCTGGCATATACTGCAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACA 1237

 55847951 CCCAGCTTGAACCATCAGCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGAC 55848010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 CCCAGCTTGAACCATCAGCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGAC 1297

 55848011 ACTGCTGTCTTTATGTAGATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATT 55848070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 ACTGCTGTCTTTATGTAGATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATT 1357

 55848071 TTAAAGTCCAAGAAAGGAACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAA 55848130
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1358 TTAAAGTCCAAGAAAGGAACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAA 1417

 55848131 GCACTCTCCAAAACAACGCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTG 55848190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 GCACTCTCCAAAACAACGCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTG 1477

 55848191 AAACTCCATTTGCTTCTCATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAG 55848250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 AAACTCCATTTGCTTCTCATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAG 1537

 55848251 CACAGTGCCCTAAATCCGATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGG 55848310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 CACAGTGCCCTAAATCCGATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGG 1597

 55848311 GACAGTCAACAATATGACTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATG 55848370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 GACAGTCAACAATATGACTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATG 1657

 55848371 TGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGG 55848430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGG 1717

 55848431 GTTCCCAGCTGCAGGAAGACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCA 55848490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 GTTCCCAGCTGCAGGAAGACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCA 1777

 55848491 GACAGCATAGCTTGAACCCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTG 55848550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 GACAGCATAGCTTGAACCCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTG 1837

 55848551 CTTCGTAATTTGGGAGGCACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAG 55848610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 CTTCGTAATTTGGGAGGCACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAG 1897

 55848611 AGCAGTAATTGTACGTCTCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATT 55848670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 AGCAGTAATTGTACGTCTCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATT 1957

 55848671 GTTCTACCAAGTCCTTAATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGG 55848730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 GTTCTACCAAGTCCTTAATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGG 2017

 55848731 CGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAG 55848790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 CGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAG 2077

 55848791 GAAGAAAATCCAAAATTCATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACA 55848850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 GAAGAAAATCCAAAATTCATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACA 2137

 55848851 GTCTTGATGAGCCATCTGTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGG 55848910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 GTCTTGATGAGCCATCTGTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGG 2197

 55848911 TGAGCAAGAGATACGTTTTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATG 55848970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TGAGCAAGAGATACGTTTTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATG 2257

 55848971 ATTCAAGGTATCCTAAAGGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTAT 55849030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 ATTCAAGGTATCCTAAAGGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTAT 2317

 55849031 TTGACTGTCTTGCTGTAGTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATA 55849090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 TTGACTGTCTTGCTGTAGTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATA 2377

 55849091 AGACGTGGGTTCCTGCCTAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTG 55849150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 AGACGTGGGTTCCTGCCTAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTG 2437

 55849151 ACTAGTGCTGTGATAGAATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTG 55849210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 ACTAGTGCTGTGATAGAATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTG 2497

 55849211 AAGAAATCAGAGATAGCTTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAA 55849270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 AAGAAATCAGAGATAGCTTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAA 2557

 55849271 AGGAGTAAGCATTATTGTAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGC 55849330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 AGGAGTAAGCATTATTGTAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGC 2617

 55849331 CAAGGAAGATAAAAGCCTCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACT 55849390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 CAAGGAAGATAAAAGCCTCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACT 2677

 55849391 AGAATGCAAGGTTTAATGTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGC 55849450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 AGAATGCAAGGTTTAATGTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGC 2737

 55849451 AGAGATGTTTATTTTGTTTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATT 55849510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 AGAGATGTTTATTTTGTTTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATT 2797

 55849511 TGATCCGTTAAGTTCAGAAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCT 55849570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 TGATCCGTTAAGTTCAGAAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCT 2857

 55849571 ATGAAGACACTACCCAAGACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAG 55849630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 ATGAAGACACTACCCAAGACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAG 2917

 55849631 TTCCACATGGCTGGCAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCA 55849690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 TTCCACATGGCTGGCAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCA 2977

 55849691 CATCTTACATGGCAGCAGGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATA 55849750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 CATCTTACATGGCAGCAGGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATA 3037

 55849751 AAACCGTCAGATCTCATGAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGC 55849810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 AAACCGTCAGATCTCATGAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGC 3097

 55849811 TCCTTATGATCCAATCACCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGA 55849870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 TCCTTATGATCCAATCACCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGA 3157

 55849871 TTACAATTTGAGATGAGATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGG 55849930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 TTACAATTTGAGATGAGATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGG 3217

 55849931 GGATTTGGGCTGCTGGCGCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTT 55849990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 GGATTTGGGCTGCTGGCGCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTT 3277

 55849991 TTCTTTATAAACTTTTTATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTA 55850050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 TTCTTTATAAACTTTTTATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTA 3337

 55850051 CAGAGAGTTCTCACATACGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTA 55850110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 CAGAGAGTTCTCACATACGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTA 3397

 55850111 TCATATATTTGTTACGATTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTT 55850170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 TCATATATTTGTTACGATTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTT 3457

 55850171 ATTCAGATTTCCTTAGTTTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGAT 55850230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 ATTCAGATTTCCTTAGTTTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGAT 3517

 55850231 ACCACATTACATTTATTTGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGG 55850290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 ACCACATTACATTTATTTGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGG 3577

 55850291 TTTTGATGACCTTGACAGTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACA 55850350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 TTTTGATGACCTTGACAGTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACA 3637

 55850351 GTTTGGGTTTGTCTGATGTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGA 55850410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 GTTTGGGTTTGTCTGATGTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGA 3697

 55850411 TGTATAAACTCTTAAGCAGAAAACTGCATAGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAA 55850470
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3698 TGTATAAACTCTTAAGCAGAAAACTGCATGGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAA 3757

 55850471 TTGAAAAGTGGGTACAGTTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTT 55850530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 TTGAAAAGTGGGTACAGTTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTT 3817

 55850531 TCTCTCCACTTCCCCAGCCTCCAACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCT 55850590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 TCTCTCCACTTCCCCAGCCTCCAACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCT 3877

 55850591 CTCAGGTTCTTCCCTAAGGAACGCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCT 55850650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 CTCAGGTTCTTCCCTAAGGAACGCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCT 3937

 55850651 CACTAGCTCACTTAAGAGCCTATATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATG 55850710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 CACTAGCTCACTTAAGAGCCTATATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATG 3997

 55850711 CTACTCTTTACCTAGAAATTTCTCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCAT 55850770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 CTACTCTTTACCTAGAAATTTCTCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCAT 4057

 55850771 TCCATTCTACACCCCTATTGACCTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCT 55850830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 TCCATTCTACACCCCTATTGACCTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCT 4117

 55850831 TCCCGAGGAAGACCATCTATCCCTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAG 55850883
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 TCCCGAGGAAGACCATCTATCCCTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAG 4170

Alignment time is 10.3418 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3873] =>      3873 nucs 'mol-32-2ff9-008507_3873'

Score:        3849
Aligned:      3871        nucs
Identic:      3869 (100%) nucs =>      1599 (100%)      2270 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55844926,55846524] EXCISED REGION [55846528,55848799]
 second seq =>  [       1,    1599] EXCISED REGION [    1603,    3873]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [1600,1602]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [1600,1600] to [1602,1602]

 55844926 AACATAATTATTTCTCTGTAATATTCCTAGTTTTATTTTTTTCTTTAAACTTCAACATAT 55844985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACATAATTATTTCTCTGTAATATTCCTAGTTTTATTTTTTTCTTTAAACTTCAACATAT 60

 55844986 CAAGTGTTTTAATGTAAGCTTGAAGTATCACTTCAAATTTTTTTCCAAGCAGCACAGTTA 55845045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAGTGTTTTAATGTAAGCTTGAAGTATCACTTCAAATTTTTTTCCAAGCAGCACAGTTA 120

 55845046 TTCTAATGTTATTTGATAAATAGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAA 55845105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTAATGTTATTTGATAAATAGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAA 180

 55845106 AAAAATTGTAACTGTAATTTTTTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACA 55845165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAAATTGTAACTGTAATTTTTTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACA 240

 55845166 GTAGTTCCACGGTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTT 55845225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTAGTTCCACGGTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTT 300

 55845226 TTGTATTTGTATTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGG 55845285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTATTTGTATTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGG 360

 55845286 ACCATTCTTTCATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCT 55845345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCATTCTTTCATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCT 420

 55845346 CTCCAAATCTTATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATG 55845405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCCAAATCTTATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATG 480

 55845406 AGGTAGTTATTTTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGC 55845465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGTAGTTATTTTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGC 540

 55845466 AAGAAAAAAAAGGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAA 55845525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGAAAAAAAAGGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAA 600

 55845526 ATCTTGTCAACAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACA 55845585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCTTGTCAACAAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACA 660

 55845586 AAAATGAAAACAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATC 55845645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAATGAAAACAGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATC 720

 55845646 AGCAATCCTGAACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAA 55845705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCAATCCTGAACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAA 780

 55845706 TAGACTCTTGGTTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCA 55845765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGACTCTTGGTTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCA 840

 55845766 ATATGACATTTATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATT 55845825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATATGACATTTATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATT 900

 55845826 TTTCCATATTAATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAAC 55845885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTCCATATTAATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAAC 960

 55845886 CTTAAGGTGTTCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAG 55845945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTAAGGTGTTCTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAG 1020

 55845946 TCGTTTCTTCTGTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAAT 55846005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCGTTTCTTCTGTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAAT 1080

 55846006 AAAAAACAAAATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAAT 55846065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAAAACAAAATAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAAT 1140

 55846066 GAAACCTGCATTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGA 55846125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAACCTGCATTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGA 1200

 55846126 GCCCTGCACTTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTAC 55846185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCCCTGCACTTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTAC 1260

 55846186 TCTCCTTCCCATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAG 55846245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTCCTTCCCATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAG 1320

 55846246 ACACAGATTCACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGT 55846305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACACAGATTCACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGT 1380

 55846306 AGATTATGTAATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTC 55846365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGATTATGTAATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTC 1440

 55846366 TTTGGGCTGTGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAA 55846425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTGGGCTGTGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAA 1500

 55846426 GGAGAATTTTTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATT 55846485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGAGAATTTTTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATT 1560

 55846486 ACCTATTACTTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 55846524
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCTATTACTTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 1599

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 1662

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 1722

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 1782

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 1842

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 1902

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 1962

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 2022

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 2082

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 2142

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 2202

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 2262

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 2322

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 2382

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 2442

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 2502

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 2562

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 2622

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 2682

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 2742

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTG 55847727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2743 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTG 2801

 55847728 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 55847787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 2861

 55847788 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 55847847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 2921

 55847848 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 55847907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 2981

 55847908 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 55847967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 3041

 55847968 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 55848027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 3101

 55848028 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 55848087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 3161

 55848088 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAAC 55848147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3162 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAAC 3221

 55848148 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 55848207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 3281

 55848208 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 55848267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 3341

 55848268 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 55848327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 3401

 55848328 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 55848387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 3461

 55848388 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 55848447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 3521

 55848448 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 55848507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 3581

 55848508 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 55848567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 3641

 55848568 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 55848627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 3701

 55848628 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 55848687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 3761

 55848688 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 55848747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 3821

 55848748 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAAT 55848799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAAT 3873

Alignment time is 9.5315 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    9541] =>      9541 nucs 'mol-32-2ff9-247792_9541'

Score:        9462
Aligned:      9539        nucs
Identic:      9532 (100%) nucs =>      8625 (100%)       907 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55817327,55825957] EXCISED REGION [55846713,55847620]
 second seq =>  [       1,    8630] EXCISED REGION [    8634,    9541]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [8631,8633]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [8630,8630] to [8633,8633]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55817327 TGTATGTGTGTAAAAAAATGAAACAAATATTCTAATACAAATTACATACTCTACATTTTA 55817386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTATGTGTGTAAAAAAATGAAACAAATATTCTAATACAAATTACATACTCTACATTTTA 60

 55817387 TTCTGCACCCTTTCCTTCCAATTAGTCATATACCTTGAAGATATTTTCTTAACAACACAA 55817446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTGCACCCTTTCCTTCCAATTAGTCATATACCTTGAAGATATTTTCTTAACAACACAA 120

 55817447 CTTGATTCTTAGGGACTGCAAAGTATTCCATTATGTGAACATTCCAAACTGGAAGGAGAT 55817506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTGATTCTTAGGGACTGCAAAGTATTCCATTATGTGAACATTCCAAACTGGAAGGAGAT 180

 55817507 ATTTGTATATTTCTATAGTGATAAATGTTTAGGTTATTTACAGGTTTGGGTCTTTGAAAT 55817566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTGTATATTTCTATAGTGATAAATGTTTAGGTTATTTACAGGTTTGGGTCTTTGAAAT 240

 55817567 AATGCTGCAACAAAACCAGTACCAGTGGAATTGTTCAAAGGAAACATTTCTAATATTGAA 55817626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATGCTGCAACAAAACCAGTACCAGTGGAATTGTTCAAAGGAAACATTTCTAATATTGAA 300

 55817627 AAATAACACAAAAGTGCTCATCATAAATAAAAATGTTTAATAGCTTTACCATCACGAGAG 55817686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATAACACAAAAGTGCTCATCATAAATAAAAATGTTTAATAGCTTTACCATCACGAGAG 360

 55817687 TGTCTATTACCTGCACATTCTTGGCGACGTCAAGTTTTCATCAAATTTTGTTTTTAAATG 55817746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTCTATTACCTGCACATTCTTGGCGACGTCAAGTTTTCATCAAATTTTGTTTTTAAATG 420

 55817747 TTTTGCCCATCTGACGAGTAAAAAGTGAACCCTGTAGCATTTTTTAAATAGCTCGATGTG 55817806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTGCCCATCTGACGAGTAAAAAGTGAACCCTGTAGCATTTTTTAAATAGCTCGATGTG 480

 55817807 ATGAAAACGGGGTTTTGGAAAGCTCATGCTGAGACAATATGGAGTTTAGCTTGGTCACAC 55817866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGAAAACGGGGTTTTGGAAAGCTCATGCTGAGACAATATGGAGTTTAGCTTGGTCACAC 540

 55817867 CAAGACTCAATGCAGAAGAGATGGAGAGGAGACAATTACAATAGACTGTGTAACAGATGA 55817926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAGACTCAATGCAGAAGAGATGGAGAGGAGACAATTACAATAGACTGTGTAACAGATGA 600

 55817927 AGACAGCTTAACTGGGGCAGTGCCTGGAATGTATTAGGGGAAATAGATATGATAGAGGCA 55817986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGACAGCTTAACTGGGGCAGTGCCTGGAATGTATTAGGGGAAATAGATATGATAGAGGCA 660

 55817987 CTATCAAAAAGTCCAGCTGTTGAGGAGGTACAGCAATAGACCTTTGTTCCTGATACTTAA 55818046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTATCAAAAAGTCCAGCTGTTGAGGAGGTACAGCAATAGACCTTTGTTCCTGATACTTAA 720

 55818047 TATTGTGTTAAGGGTGGGCGAGACGGAGGAAGGATTCAAGAATACCTCCTAGGTTTATGA 55818106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATTGTGTTAAGGGTGGGCGAGACGGAGGAAGGATTCAAGAATACCTCCTAGGTTTATGA 780

 55818107 GTTGGGAAGCCAGGATGATTGCAATGAAAATAACTGTCCTAGAAAACACAGAAAAAAGCA 55818166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTGGGAAGCCAGGATGATTGCAATGAAAATAACTGTCCTAGAAAACACAGAAAAAAGCA 840

 55818167 AAGATTTGGGAGCATGCCAGATAAAACGGGAATGATTTTAAAGGTCGTGTACAAATCTAA 55818226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGATTTGGGAGCATGCCAGATAAAACGGGAATGATTTTAAAGGTCGTGTACAAATCTAA 900

 55818227 GATGCTATAGTTTATTTATGGAAACTACCTTCATCTGTGGCAGAGGCTATTTCAAAATAC 55818286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATGCTATAGTTTATTTATGGAAACTACCTTCATCTGTGGCAGAGGCTATTTCAAAATAC 960

 55818287 TCACATCTATTTAATGTCACTTAATGAATCACGGAATTTTGCAGTGCTATGAAATCCCTT 55818346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCACATCTATTTAATGTCACTTAATGAATCACGGAATTTTGCAGTGCTATGAAATCCCTT 1020

 55818347 AAATCAAACTAACTAGCACACTTATGAAACCAGAGTACTATCTTACTATGCCAGAGTATT 55818406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAATCAAACTAACTAGCACACTTATGAAACCAGAGTACTATCTTACTATGCCAGAGTATT 1080

 55818407 CTTTTCGTATTCTGCCATCTAGTGAACAACAATCATTTGTACAACCTGGCTTGTAAATTG 55818466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTTTCGTATTCTGCCATCTAGTGAACAACAATCATTTGTACAACCTGGCTTGTAAATTG 1140

 55818467 CTTCTTCCAAATTTAAAATAAACACACACGCACACGCACACGCACCCCTTCATTTTATGC 55818526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTCTTCCAAATTTAAAATAAACACACACGCACACGCACACGCACCCCTTCATTTTATGC 1200

 55818527 TTTCTCATTATATATACTGGCAAAATATTCTTTCATGATATTTTACAAACAAAATTCCTA 55818586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTCTCATTATATATACTGGCAAAATATTCTTTCATGATATTTTACAAACAAAATTCCTA 1260

 55818587 AACATAGAGGAAAGAATAGAGTTCATCAGCTGAATCTGCACATTTCACCTTGGGCTCATT 55818646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AACATAGAGGAAAGAATAGAGTTCATCAGCTGAATCTGCACATTTCACCTTGGGCTCATT 1320

 55818647 TTGAAATTTATATTTTTAAAGTCAAGGGAAATTCACAAGTTTCCTTTACATTATGCCATC 55818706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGAAATTTATATTTTTAAAGTCAAGGGAAATTCACAAGTTTCCTTTACATTATGCCATC 1380

 55818707 TCCTTTTATCATTAAAAACAACAAAAACAAAACATTTACTTGTCAGCAACTTTCTTCTCT 55818766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCTTTTATCATTAAAAACAACAAAAACAAAACATTTACTTGTCAGCAACTTTCTTCTCT 1440

 55818767 GTAATAAAATACCTTTATATAAATTATCTTTCTCCTGCAATGAGCATTGTTTAATATTAT 55818826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTAATAAAATACCTTTATATAAATTATCTTTCTCCTGCAATGAGCATTGTTTAATATTAT 1500

 55818827 CAAAAGTTTTTTATCTCAAAAATTATTGTACATGATACACTAGAGATATTATTTGAATGT 55818886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAAAGTTTTTTATCTCAAAAATTATTGTACATGATACACTAGAGATATTATTTGAATGT 1560

 55818887 TGTGGAAGTACCTTGTACAAATTTATTTTCTTGATATTTAGTTCTATAAAAGCTTCCCTG 55818946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTGGAAGTACCTTGTACAAATTTATTTTCTTGATATTTAGTTCTATAAAAGCTTCCCTG 1620

 55818947 ATTTCTCCTAAGGTGGTCACTTATTTTGTGCTGTTAGCGTACCTTTGTGTCACTAGTATT 55819006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTTCTCCTAAGGTGGTCACTTATTTTGTGCTGTTAGCGTACCTTTGTGTCACTAGTATT 1680

 55819007 GTGGTAGTATTATACTATATTTTAAATATTCATTTTCAAGCCTATCTTTGCAAAGGGCTC 55819066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGGTAGTATTATACTATATTTTAAATATTCATTTTCAAGCCTATCTTTGCAAAGGGCTC 1740

 55819067 ATGAATTTCCTGATTAAAGGGACTATGTAATATTCAGTTTTATGTCTCCAATAACTCTCA 55819126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGAATTTCCTGATTAAAGGGACTATGTAATATTCAGTTTTATGTCTCCAATAACTCTCA 1800

 55819127 TGATGTATGGTATCTATTAGTTTTCAATAAATGTTAACGAATGATTTAAAATGATTGAAC 55819186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGATGTATGGTATCTATTAGTTTTCAATAAATGTTAACGAATGATTTAAAATGATTGAAC 1860

 55819187 TGAATTATTGACAGATGTTTGAAACTTGACTAATTTTTATTCAAGTTGAAATAATATGTA 55819246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGAATTATTGACAGATGTTTGAAACTTGACTAATTTTTATTCAAGTTGAAATAATATGTA 1920

 55819247 AAGTAAGCAATCACAACATTCAGCTTCCTTCATGAAGTCCAGAAGAGAACTGAACATATT 55819306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAGTAAGCAATCACAACATTCAGCTTCCTTCATGAAGTCCAGAAGAGAACTGAACATATT 1980

 55819307 GCCCAAGTGCCCAGAGGGCCCTAAAATATAGATGTGTGTTCATTAGGCTAATTGGAGACA 55819366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCCCAAGTGCCCAGAGGGCCCTAAAATATAGATGTGTGTTCATTAGGCTAATTGGAGACA 2040

 55819367 GGTAGACAAAAATCCTCCTTTGAAATTTGTCCTCATAGGCAATGGCATTATTCCCAGGCT 55819426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGTAGACAAAAATCCTCCTTTGAAATTTGTCCTCATAGGCAATGGCATTATTCCCAGGCT 2100

 55819427 TATCAAGTTCTTTCCCTTGGCAGATCTCTGTGGTCCATCTGCTGAACTTAAATGCTGAAA 55819486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATCAAGTTCTTTCCCTTGGCAGATCTCTGTGGTCCATCTGCTGAACTTAAATGCTGAAA 2160

 55819487 TGGTCTCAATGTGAACATGCCTAATGGACATCTTTATTCTGAGTGGCTATACCAGCACAA 55819546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGTCTCAATGTGAACATGCCTAATGGACATCTTTATTCTGAGTGGCTATACCAGCACAA 2220

 55819547 TCCATAAATCTGAGCTATTTCAGATTACAAATGGAATTGTTCTCCACAGTGTTCCATTGC 55819606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCCATAAATCTGAGCTATTTCAGATTACAAATGGAATTGTTCTCCACAGTGTTCCATTGC 2280

 55819607 CTTATAGATAATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTCTAAGAGTTCAA 55819666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTTATAGATAATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTCTAAGAGTTCAA 2340

 55819667 TTGATATTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATATATCTGAACTC 55819726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTGATATTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATATATCTGAACTC 2400

 55819727 ATTCATTTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACTCCATCTACTTT 55819786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTCATTTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACTCCATCTACTTT 2460

 55819787 GTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGTTTTCATTTTTC 55819846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGTTTTCATTTTTC 2520

 55819847 TTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATCAAGCATTAAGTTTCTCGTGG 55819906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATCAAGCATTAAGTTTCTCGTGG 2580

 55819907 CACACACTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCATCCCAGTCTATG 55819966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CACACACTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCATCCCAGTCTATG 2640

 55819967 ATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTGGCCCCCTGTTC 55820026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTGGCCCCCTGTTC 2700

 55820027 CCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTGATATCTTGACAGGCCTGACA 55820086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTGATATCTTGACAGGCCTGACA 2760

 55820087 CTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGTAGCATAAGTTA 55820146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGTAGCATAAGTTA 2820

 55820147 TTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGTTTTCTTCTTTTCATCTAT 55820206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGTTTTCTTCTTTTCATCTAT 2880

 55820207 TGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATCTGTGAAATATA 55820266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATCTGTGAAATATA 2940

 55820267 CTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACAGAACCAATCAG 55820326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACAGAACCAATCAG 3000

 55820327 TATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAATTTTAAATAATT 55820386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAATTTTAAATAATT 3060

 55820387 ATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAATGAGATTCATA 55820446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAATGAGATTCATA 3120

 55820447 ATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTTGCAGAAAAAAA 55820506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTTGCAGAAAAAAA 3180

 55820507 ACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAATTCGTGGTTTTA 55820566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAATTCGTGGTTTTA 3240

 55820567 AAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGACTTCACAAGGAA 55820626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGACTTCACAAGGAA 3300

 55820627 TGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGTAGAGCCTTGCA 55820686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGTAGAGCCTTGCA 3360

 55820687 AGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACATGTCACACAGT 55820746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACATGTCACACAGT 3420

 55820747 CAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTCAAAACAGATAT 55820806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTCAAAACAGATAT 3480

 55820807 TTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAGTATACTTAGGG 55820866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAGTATACTTAGGG 3540

 55820867 CCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGCACTAATGTTCA 55820926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGCACTAATGTTCA 3600

 55820927 AATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTATTCTAACACCT 55820986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTATTCTAACACCT 3660

 55820987 ACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAGTTTTTGATACT 55821046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAGTTTTTGATACT 3720

 55821047 GCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCCTGATCTAATGT 55821106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCCTGATCTAATGT 3780

 55821107 TCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAATTGGAATATGTA 55821166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAATTGGAATATGTA 3840

 55821167 AAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTTTAATATATAGC 55821226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTTTAATATATAGC 3900

 55821227 ATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTGGTGAAATTTTA 55821286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTGGTGAAATTTTA 3960

 55821287 AAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTACATGAATGTAGA 55821346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTACATGAATGTAGA 4020

 55821347 TCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTGAAATGCAAATT 55821406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTGAAATGCAAATT 4080

 55821407 CTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCCAGCAGTCAGGG 55821466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCCAGCAGTCAGGG 4140

 55821467 TTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAACCACTGGCATAG 55821526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAACCACTGGCATAG 4200

 55821527 TCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCATTCACACTTTA 55821586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCATTCACACTTTA 4260

 55821587 TATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTAAACAGCCACAT 55821646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTAAACAGCCACAT 4320

 55821647 GGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAGTGAATTATTTG 55821706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAGTGAATTATTTG 4380

 55821707 TAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATCTCTTAAGTGTA 55821766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATCTCTTAAGTGTA 4440

 55821767 TAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACATTTTATTTCTG 55821826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACATTTTATTTCTG 4500

 55821827 CTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAATTCCTTTAATGA 55821886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAATTCCTTTAATGA 4560

 55821887 AGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAGAAAATATCAGA 55821946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAGAAAATATCAGA 4620

 55821947 TGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATACTGATAAGGCTC 55822006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATACTGATAAGGCTC 4680

 55822007 CGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATAAAAGAATATGG 55822066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATAAAAGAATATGG 4740

 55822067 GACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAATAAAGAAGGAA 55822126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAATAAAGAAGGAA 4800

 55822127 GAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAGAAACCCCGAG 55822186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAGAAACCCCGAG 4860

 55822187 TGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTATATTAGGATACT 55822246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTATATTAGGATACT 4920

 55822247 AGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTGGTTTGACCAGG 55822306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTGGTTTGACCAGG 4980

 55822307 TATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCTTTAAATATGCA 55822366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCTTTAAATATGCA 5040

 55822367 AATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAGCCATGATGGTT 55822426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAGCCATGATGGTT 5100

 55822427 GCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGGACCCAGTTTCT 55822486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGGACCCAGTTTCT 5160

 55822487 AATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTTCTGCT 55822546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTTCTGCT 5220

 55822547 AGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTACCAAGGGAACC 55822606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTACCAAGGGAACC 5280

 55822607 CTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATAATACTCAGGTC 55822666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATAATACTCAGGTC 5340

 55822667 AGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGT 55822726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGT 5400

 55822727 TTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTG 55822786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTG 5460

 55822787 AATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAAT 55822846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAAT 5520

 55822847 GGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCACAGATAAAAACT 55822906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCACAGATAAAAACT 5580

 55822907 TAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCATGACCCGCCAT 55822966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCATGACCCGCCAT 5640

 55822967 CTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTT 55823026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTT 5700

 55823027 GACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAG 55823086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAG 5760

 55823087 AAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAGCCTATATACT 55823146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 AAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAGCCTATATACT 5820

 55823147 GGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAA 55823206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 GGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAA 5880

 55823207 GAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTT 55823266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTT 5940

 55823267 CTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACA 55823326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 CTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACA 6000

 55823327 GGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAA 55823386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 GGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAA 6060

 55823387 ATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCC 55823446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 ATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCC 6120

 55823447 ATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTT 55823506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 ATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTT 6180

 55823507 TTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACA 55823566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACA 6240

 55823567 ACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGG 55823626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 ACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGG 6300

 55823627 GAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGG 55823686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 GAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGG 6360

 55823687 GAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACC 55823746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 GAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACC 6420

 55823747 AGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCT 55823806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 AGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCT 6480

 55823807 GATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCT 55823866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 GATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCT 6540

 55823867 CTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACA 55823926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 CTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACA 6600

 55823927 TTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGA 55823986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGA 6660

 55823987 AATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACT 55824046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 AATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACT 6720

 55824047 AAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATT 55824106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 AAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATT 6780

 55824107 AAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTT 55824166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 AAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTT 6840

 55824167 CATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCT 55824226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 CATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCT 6900

 55824227 TGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTT 55824286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 TGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTT 6960

 55824287 TATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTC 55824346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 TATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTC 7020

 55824347 ACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTT 55824406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 ACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTT 7080

 55824407 CCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCTTACCATTTATTTTG 55824466
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     7081 CCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCCTACCATTTATTTTG 7140

 55824467 TGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATA 55824526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 TGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATA 7200

 55824527 ATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAA 55824586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 ATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAA 7260

 55824587 ACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTT 55824646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 ACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTT 7320

 55824647 TTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTG 55824706
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 TTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTG 7380

 55824707 AGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACC 55824766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 AGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACC 7440

 55824767 CAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAG 55824826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 CAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAG 7500

 55824827 CTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAC 55824886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 CTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGAC 7560

 55824887 CTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAA 55824946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 CTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAA 7620

 55824947 AAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGAT 55825006
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     7621 AAAAAAAA-TTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGCT 7679

 55825007 GTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACATTGGTC 55825066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7680 GTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACATTGGTC 7739

 55825067 AACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTATCATCCCGAATTCTC 55825126
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     7740 AACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTATCATCCCGAATTCTC 7799

 55825127 TAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGC 55825186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7800 TAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGC 7859

 55825187 TCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCC 55825246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7860 TCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCC 7919

 55825247 ATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCA 55825306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7920 ATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCA 7979

 55825307 CATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAG 55825366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7980 CATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAG 8039

 55825367 GGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCC 55825426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8040 GGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCC 8099

 55825427 ACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCA 55825486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8100 ACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCA 8159

 55825487 TGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAAT 55825546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8160 TGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAAT 8219

 55825547 CAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAG 55825606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8220 CAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAG 8279

 55825607 AATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAAC 55825666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8280 AATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAAC 8339

 55825667 TCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCA 55825726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8340 TCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCA 8399

 55825727 AAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAA 55825786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8400 AAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAA 8459

 55825787 TAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATT 55825846
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8460 TAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATT 8519

 55825847 TAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATA 55825906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8520 TAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATA 8579

 55825907 TGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 55825957
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8580 TGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 8630

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8634 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 8693

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8694 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 8753

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8754 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 8813

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8814 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 8873

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8874 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 8933

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8934 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 8993

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8994 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 9053

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9054 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 9113

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9114 GTAGAGAAATAAAGCTAATCGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 9173

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9174 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 9233

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9234 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 9293

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9294 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 9353

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9354 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 9413

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9414 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 9473

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9474 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 9533

 55847613 CAACAGGG 55847620
          ||||||||
     9534 CAACAGGG 9541

Alignment time is 23.0157 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    8177] =>      8177 nucs 'mol-32-3004-271666_8177'

Score:        8076
Aligned:      8177        nucs
Identic:      8167 (100%) nucs =>      6303 (100%)      1864 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55819647,55825957] EXCISED REGION [55846713,55848578]
 second seq =>  [       1,    6309] EXCISED REGION [    6313,    8177]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [6310,6312]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [6309,6309] to [6312,6312]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55819647 AATTAGCTCTAAGAGTTCAATTGATATTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAAT 55819706
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTAGCTCTAAGAGTTCAATTGAAATTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAAT 60

 55819707 TCATCTATATATCTGAACTCATTCATTTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAA 55819766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCATCTATATATCTGAACTCATTCATTTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAA 120

 55819767 GTAAAGACTCCATCTACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTA 55819826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTAAAGACTCCATCTACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTA 180

 55819827 GGTAACTGTTTTCATTTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATC 55819886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTAACTGTTTTCATTTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATC 240

 55819887 AAGCATTAAGTTTCTCGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGC 55819946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCATTAAGTTTCTCGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGC 300

 55819947 TGTAGTCATCCCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAAT 55820006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTAGTCATCCCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAAT 360

 55820007 TTTCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTG 55820066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTG 420

 55820067 ATATCTTGACAGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGT 55820126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATATCTTGACAGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGT 480

 55820127 GAAGAAAGTAGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTAT 55820186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAGAAAGTAGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTAT 540

 55820187 GTTTTCTTCTTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGG 55820246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTTTCTTCTTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGG 600

 55820247 CACATGATCTGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAG 55820306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACATGATCTGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAG 660

 55820307 TTACAAACAGAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAG 55820366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTACAAACAGAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAG 720

 55820367 GCAGAAAATTTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACA 55820426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCAGAAAATTTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACA 780

 55820427 CTTAGGTAATGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAG 55820486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTAGGTAATGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAG 840

 55820487 CTTTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGT 55820546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGT 900

 55820547 TGGAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGC 55820606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGC 960

 55820607 AATTGAGACTTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAA 55820666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATTGAGACTTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAA 1020

 55820667 AGGGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGA 55820726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGA 1080

 55820727 CAGTCCACATGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTC 55820786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGTCCACATGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTC 1140

 55820787 TGCTCTTTCAAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTT 55820846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGCTCTTTCAAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTT 1200

 55820847 GTTTATAAGTATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGA 55820906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTTATAAGTATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGA 1260

 55820907 TTTCTAGGCACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAG 55820966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCTAGGCACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAG 1320

 55820967 GCATTTTTATTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAA 55821026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCATTTTTATTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAA 1380

 55821027 GTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAA 55821086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAA 1440

 55821087 AAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGG 55821146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGG 1500

 55821147 AAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGT 55821206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGT 1560

 55821207 AAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGG 55821266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGG 1620

 55821267 AGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAA 55821326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAA 1680

 55821327 AATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGA 55821386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGA 1740

 55821387 ATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGG 55821446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGG 1800

 55821447 GTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAG 55821506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAG 1860

 55821507 TTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTA 55821566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTA 1920

 55821567 AGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATA 55821626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATA 1980

 55821627 ACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGA 55821686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGA 2040

 55821687 ATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTT 55821746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTT 2100

 55821747 TTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTAT 55821806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTAT 2160

 55821807 TATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAG 55821866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAG 2220

 55821867 GCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTG 55821926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTG 2280

 55821927 CTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGA 55821986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGA 2340

 55821987 GCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCG 55822046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCG 2400

 55822047 ATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATA 55822106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATA 2460

 55822107 GGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAG 55822166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAG 2520

 55822167 CCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACA 55822226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACA 2580

 55822227 GGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCC 55822286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCC 2640

 55822287 AGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCA 55822346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCA 2700

 55822347 CCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATC 55822406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATC 2760

 55822407 TGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGT 55822466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGT 2820

 55822467 ATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCC 55822526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCC 2880

 55822527 CTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAA 55822586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAA 2940

 55822587 AAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATT 55822646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATT 3000

 55822647 CCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGA 55822706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGA 3060

 55822707 AGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGAT 55822766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGAT 3120

 55822767 GGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAG 55822826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAG 3180

 55822827 ATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGT 55822886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGT 3240

 55822887 CTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCAT 55822946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCAT 3300

 55822947 GCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAAT 55823006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAAT 3360

 55823007 GTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTC 55823066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTC 3420

 55823067 AGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTG 55823126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTG 3480

 55823127 AATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGG 55823186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGG 3540

 55823187 CTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACT 55823246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACT 3600

 55823247 GAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAG 55823306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAG 3660

 55823307 CTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGT 55823366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGT 3720

 55823367 TAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTT 55823426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTT 3780

 55823427 AAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCT 55823486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCT 3840

 55823487 TTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAAT 55823546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAAT 3900

 55823547 GATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAA 55823606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAA 3960

 55823607 TGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATA 55823666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATA 4020

 55823667 CCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAAT 55823726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAAT 4080

 55823727 GACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAG 55823786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAG 4140

 55823787 TGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGA 55823846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGA 4200

 55823847 ATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCA 55823906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCA 4260

 55823907 CAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCT 55823966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCT 4320

 55823967 TTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATT 55824026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATT 4380

 55824027 AATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAAT 55824086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAAT 4440

 55824087 TTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGT 55824146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGT 4500

 55824147 CCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATT 55824206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATT 4560

 55824207 AAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATAT 55824266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATAT 4620

 55824267 ATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTT 55824326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 ATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTT 4680

 55824327 GTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAG 55824386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAG 4740

 55824387 AAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTG 55824446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTG 4800

 55824447 CCTTCTTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAG 55824506
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CCTTCCTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAG 4860

 55824507 CCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAG 55824566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAG 4920

 55824567 ATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTAT 55824626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTAT 4980

 55824627 TTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAAT 55824686
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4981 TTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAAT 5040

 55824687 CCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAAC 55824746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAAC 5100

 55824747 CTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTG 55824806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTG 5160

 55824807 ATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGG 55824866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGG 5220

 55824867 GAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGC 55824926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGC 5280

 55824927 AAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTA 55824986
          |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAA--TTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTA 5338

 55824987 AGAGTCTCACAAGTAAGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAA 55825046
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 AGAGTCTCACAAGTAAGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAA 5398

 55825047 CCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCAC 55825106
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5399 CCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCAC 5458

 55825107 TACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCT 55825166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 TACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCT 5518

 55825167 TAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAA 55825226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 TAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAA 5578

 55825227 AAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGAT 55825286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 AAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGAT 5638

 55825287 TAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCT 55825346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 TAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCT 5698

 55825347 TGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAA 55825406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 TGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAA 5758

 55825407 TTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATA 55825466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 TTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATA 5818

 55825467 TTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAG 55825526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 TTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAG 5878

 55825527 GGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCAC 55825586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 GGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCAC 5938

 55825587 GGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACA 55825646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 GGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACA 5998

 55825647 CCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAAC 55825706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 CCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAAC 6058

 55825707 AGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTT 55825766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 AGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTT 6118

 55825767 TTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTAT 55825826
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     6119 TTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTAT 6178

 55825827 TGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAG 55825886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 TGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAG 6238

 55825887 CATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTT 55825946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 CATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTT 6298

 55825947 CATAATGAAAT 55825957
          |||||||||||
     6299 CATAATGAAAT 6309

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6313 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 6372

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6373 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 6432

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6433 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 6492

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6493 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 6552

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6553 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 6612

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6613 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 6672

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6673 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 6732

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6733 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 6792

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6793 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 6852

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6853 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 6912

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6913 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 6972

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6973 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 7032

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7033 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 7092

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7093 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 7152

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7153 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 7212

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7213 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 7272

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 55847732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     7273 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 7331

 55847733 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 55847792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7332 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 7391

 55847793 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 55847852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7392 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 7451

 55847853 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 55847912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7452 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 7511

 55847913 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 55847972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7512 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 7571

 55847973 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 55848032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7572 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 7631

 55848033 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 55848092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7632 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 7691

 55848093 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 55848152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7692 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 7751

 55848153 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 55848212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7752 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 7811

 55848213 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 55848272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7812 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 7871

 55848273 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 55848332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7872 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 7931

 55848333 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 55848392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7932 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 7991

 55848393 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 55848452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7992 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 8051

 55848453 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 55848512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8052 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 8111

 55848513 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 55848572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8112 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 8171

 55848573 CTGCCT 55848578
          ||||||
     8172 CTGCCT 8177

Alignment time is 19.438 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,   11560] =>     11560 nucs 'mol-32-303b-223197_11560'

Score:       11460
Aligned:     11559        nucs
Identic:     11550 (100%) nucs =>      9175 (100%)      2375 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55816776,55825957] EXCISED REGION [55846713,55849089]
 second seq =>  [       1,    9181] EXCISED REGION [    9185,   11560]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [9182,9184]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [9181,9181] to [9184,9184]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55816776 AGACAACTATGGTCATGAAAGGCATTTCACGATATGCCCATTAATATGAAATTCTTCCTG 55816835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGACAACTATGGTCATGAAAGGCATTTCACGATATGCCCATTAATATGAAATTCTTCCTG 60

 55816836 AAGCATTGGAGAACCACTGAAGGCTTTTAAAAAGCTACCCCTTTTTATTATTATTAAAAT 55816895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGCATTGGAGAACCACTGAAGGCTTTTAAAAAGCTACCCCTTTTTATTATTATTAAAAT 120

 55816896 AGTATTTTTGCATTATTTTTAATGAAAAGATTAATTAGCCCTTTGACTTACCTTCCAGAA 55816955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTATTTTTGCATTATTTTTAATGAAAAGATTAATTAGCCCTTTGACTTACCTTCCAGAA 180

 55816956 ACAAGTTGATTAATGTACAAATTTATAGAAAACAGTAATACAGATCTTAGTGTATGCCAA 55817015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAAGTTGATTAATGTACAAATTTATAGAAAACAGTAATACAGATCTTAGTGTATGCCAA 240

 55817016 ATGCTGTTCAAAGTAAGTTATATTTATTAACCCATTTAATCTTCACAGCAGCCCTATTAC 55817075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGCTGTTCAAAGTAAGTTATATTTATTAACCCATTTAATCTTCACAGCAGCCCTATTAC 300

 55817076 GTAGTTATGATTATAGTTTTCATTTAACAAAGAGAAAACGGAAGCTCAGAAAGACTAACT 55817135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTAGTTATGATTATAGTTTTCATTTAACAAAGAGAAAACGGAAGCTCAGAAAGACTAACT 360

 55817136 GGCACGGGGTCCTAGAGCTTGTTAAAGTGGTGGAGTTAGGCTTTCAACCTAGCAATTATG 55817195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCACGGGGTCCTAGAGCTTGTTAAAGTGGTGGAGTTAGGCTTTCAACCTAGCAATTATG 420

 55817196 GCTCCATGACCTATATTCTTAACAACTTGGCTACAGTGCTTCATGTATCTACATATGTTG 55817255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTCCATGACCTATATTCTTAACAACTTGGCTACAGTGCTTCATGTATCTACATATGTTG 480

 55817256 TATGCATGTGTGGGAAAATGACCTATGCTGTTGAAAACTATGCTACAGTGCTACATATAT 55817315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATGCATGTGTGGGAAAATGACCTATGCTGTTGAAAACTATGCTACAGTGCTACATATAT 540

 55817316 TTACATGTGTTTGTATGTGTGTAAAAAAATGAAACAAATATTCTAATACAAATTACATAC 55817375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTACATGTGTTTGTATGTGTGTAAAAAAATGAAACAAATATTCTAATACAAATTACATAC 600

 55817376 TCTACATTTTATTCTGCACCCTTTCCTTCCAATTAGTCATATACCTTGAAGATATTTTCT 55817435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTACATTTTATTCTGCACCCTTTCCTTCCAATTAGTCATATACCTTGAAGATATTTTCT 660

 55817436 TAACAACACAACTTGATTCTTAGGGACTGCAAAGTATTCCATTATGTGAACATTCCAAAC 55817495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAACAACACAACTTGATTCTTAGGGACTGCAAAGTATTCCATTATGTGAACATTCCAAAC 720

 55817496 TGGAAGGAGATATTTGTATATTTCTATAGTGATAAATGTTTAGGTTATTTACAGGTTTGG 55817555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGAAGGAGATATTTGTATATTTCTATAGTGATAAATGTTTAGGTTATTTACAGGTTTGG 780

 55817556 GTCTTTGAAATAATGCTGCAACAAAACCAGTACCAGTGGAATTGTTCAAAGGAAACATTT 55817615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTCTTTGAAATAATGCTGCAACAAAACCAGTACCAGTGGAATTGTTCAAAGGAAACATTT 840

 55817616 CTAATATTGAAAAATAACACAAAAGTGCTCATCATAAATAAAAATGTTTAATAGCTTTAC 55817675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTAATATTGAAAAATAACACAAAAGTGCTCATCATAAATAAAAATGTTTAATAGCTTTAC 900

 55817676 CATCACGAGAGTGTCTATTACCTGCACATTCTTGGCGACGTCAAGTTTTCATCAAATTTT 55817735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATCACGAGAGTGTCTATTACCTGCACATTCTTGGCGACGTCAAGTTTTCATCAAATTTT 960

 55817736 GTTTTTAAATGTTTTGCCCATCTGACGAGTAAAAAGTGAACCCTGTAGCATTTTTTAAAT 55817795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTTTTAAATGTTTTGCCCATCTGACGAGTAAAAAGTGAACCCTGTAGCATTTTTTAAAT 1020

 55817796 AGCTCGATGTGATGAAAACGGGGTTTTGGAAAGCTCATGCTGAGACAATATGGAGTTTAG 55817855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCTCGATGTGATGAAAACGGGGTTTTGGAAAGCTCATGCTGAGACAATATGGAGTTTAG 1080

 55817856 CTTGGTCACACCAAGACTCAATGCAGAAGAGATGGAGAGGAGACAATTACAATAGACTGT 55817915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTGGTCACACCAAGACTCAATGCAGAAGAGATGGAGAGGAGACAATTACAATAGACTGT 1140

 55817916 GTAACAGATGAAGACAGCTTAACTGGGGCAGTGCCTGGAATGTATTAGGGGAAATAGATA 55817975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTAACAGATGAAGACAGCTTAACTGGGGCAGTGCCTGGAATGTATTAGGGGAAATAGATA 1200

 55817976 TGATAGAGGCACTATCAAAAAGTCCAGCTGTTGAGGAGGTACAGCAATAGACCTTTGTTC 55818035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGATAGAGGCACTATCAAAAAGTCCAGCTGTTGAGGAGGTACAGCAATAGACCTTTGTTC 1260

 55818036 CTGATACTTAATATTGTGTTAAGGGTGGGCGAGACGGAGGAAGGATTCAAGAATACCTCC 55818095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGATACTTAATATTGTGTTAAGGGTGGGCGAGACGGAGGAAGGATTCAAGAATACCTCC 1320

 55818096 TAGGTTTATGAGTTGGGAAGCCAGGATGATTGCAATGAAAATAACTGTCCTAGAAAACAC 55818155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGGTTTATGAGTTGGGAAGCCAGGATGATTGCAATGAAAATAACTGTCCTAGAAAACAC 1380

 55818156 AGAAAAAAGCAAAGATTTGGGAGCATGCCAGATAAAACGGGAATGATTTTAAAGGTCGTG 55818215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAAAAAAGCAAAGATTTGGGAGCATGCCAGATAAAACGGGAATGATTTTAAAGGTCGTG 1440

 55818216 TACAAATCTAAGATGCTATAGTTTATTTATGGAAACTACCTTCATCTGTGGCAGAGGCTA 55818275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACAAATCTAAGATGCTATAGTTTATTTATGGAAACTACCTTCATCTGTGGCAGAGGCTA 1500

 55818276 TTTCAAAATACTCACATCTATTTAATGTCACTTAATGAATCACGGAATTTTGCAGTGCTA 55818335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTCAAAATACTCACATCTATTTAATGTCACTTAATGAATCACGGAATTTTGCAGTGCTA 1560

 55818336 TGAAATCCCTTAAATCAAACTAACTAGCACACTTATGAAACCAGAGTACTATCTTACTAT 55818395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAAATCCCTTAAATCAAACTAACTAGCACACTTATGAAACCAGAGTACTATCTTACTAT 1620

 55818396 GCCAGAGTATTCTTTTCGTATTCTGCCATCTAGTGAACAACAATCATTTGTACAACCTGG 55818455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCCAGAGTATTCTTTTCGTATTCTGCCATCTAGTGAACAACAATCATTTGTACAACCTGG 1680

 55818456 CTTGTAAATTGCTTCTTCCAAATTTAAAATAAACACACACGCACACGCACACGCACCCCT 55818515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTGTAAATTGCTTCTTCCAAATTTAAAATAAACACACACGCACACGCACACGCACCCCT 1740

 55818516 TCATTTTATGCTTTCTCATTATATATACTGGCAAAATATTCTTTCATGATATTTTACAAA 55818575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCATTTTATGCTTTCTCATTATATATACTGGCAAAATATTCTTTCATGATATTTTACAAA 1800

 55818576 CAAAATTCCTAAACATAGAGGAAAGAATAGAGTTCATCAGCTGAATCTGCACATTTCACC 55818635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAAATTCCTAAACATAGAGGAAAGAATAGAGTTCATCAGCTGAATCTGCACATTTCACC 1860

 55818636 TTGGGCTCATTTTGAAATTTATATTTTTAAAGTCAAGGGAAATTCACAAGTTTCCTTTAC 55818695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGGGCTCATTTTGAAATTTATATTTTTAAAGTCAAGGGAAATTCACAAGTTTCCTTTAC 1920

 55818696 ATTATGCCATCTCCTTTTATCATTAAAAACAACAAAAACAAAACATTTACTTGTCAGCAA 55818755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTATGCCATCTCCTTTTATCATTAAAAACAACAAAAACAAAACATTTACTTGTCAGCAA 1980

 55818756 CTTTCTTCTCTGTAATAAAATACCTTTATATAAATTATCTTTCTCCTGCAATGAGCATTG 55818815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTTCTTCTCTGTAATAAAATACCTTTATATAAATTATCTTTCTCCTGCAATGAGCATTG 2040

 55818816 TTTAATATTATCAAAAGTTTTTTATCTCAAAAATTATTGTACATGATACACTAGAGATAT 55818875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTAATATTATCAAAAGTTTTTTATCTCAAAAATTATTGTACATGATACACTAGAGATAT 2100

 55818876 TATTTGAATGTTGTGGAAGTACCTTGTACAAATTTATTTTCTTGATATTTAGTTCTATAA 55818935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATTTGAATGTTGTGGAAGTACCTTGTACAAATTTATTTTCTTGATATTTAGTTCTATAA 2160

 55818936 AAGCTTCCCTGATTTCTCCTAAGGTGGTCACTTATTTTGTGCTGTTAGCGTACCTTTGTG 55818995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGCTTCCCTGATTTCTCCTAAGGTGGTCACTTATTTTGTGCTGTTAGCGTACCTTTGTG 2220

 55818996 TCACTAGTATTGTGGTAGTATTATACTATATTTTAAATATTCATTTTCAAGCCTATCTTT 55819055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCACTAGTATTGTGGTAGTATTATACTATATTTTAAATATTCATTTTCAAGCCTATCTTT 2280

 55819056 GCAAAGGGCTCATGAATTTCCTGATTAAAGGGACTATGTAATATTCAGTTTTATGTCTCC 55819115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCAAAGGGCTCATGAATTTCCTGATTAAAGGGACTATGTAATATTCAGTTTTATGTCTCC 2340

 55819116 AATAACTCTCATGATGTATGGTATCTATTAGTTTTCAATAAATGTTAACGAATGATTTAA 55819175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATAACTCTCATGATGTATGGTATCTATTAGTTTTCAATAAATGTTAACGAATGATTTAA 2400

 55819176 AATGATTGAACTGAATTATTGACAGATGTTTGAAACTTGACTAATTTTTATTCAAGTTGA 55819235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AATGATTGAACTGAATTATTGACAGATGTTTGAAACTTGACTAATTTTTATTCAAGTTGA 2460

 55819236 AATAATATGTAAAGTAAGCAATCACAACATTCAGCTTCCTTCATGAAGTCCAGAAGAGAA 55819295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATAATATGTAAAGTAAGCAATCACAACATTCAGCTTCCTTCATGAAGTCCAGAAGAGAA 2520

 55819296 CTGAACATATTGCCCAAGTGCCCAGAGGGCCCTAAAATATAGATGTGTGTTCATTAGGCT 55819355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGAACATATTGCCCAAGTGCCCAGAGGGCCCTAAAATATAGATGTGTGTTCATTAGGCT 2580

 55819356 AATTGGAGACAGGTAGACAAAAATCCTCCTTTGAAATTTGTCCTCATAGGCAATGGCATT 55819415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATTGGAGACAGGTAGACAAAAATCCTCCTTTGAAATTTGTCCTCATAGGCAATGGCATT 2640

 55819416 ATTCCCAGGCTTATCAAGTTCTTTCCCTTGGCAGATCTCTGTGGTCCATCTGCTGAACTT 55819475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTCCCAGGCTTATCAAGTTCTTTCCCTTGGCAGATCTCTGTGGTCCATCTGCTGAACTT 2700

 55819476 AAATGCTGAAATGGTCTCAATGTGAACATGCCTAATGGACATCTTTATTCTGAGTGGCTA 55819535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAATGCTGAAATGGTCTCAATGTGAACATGCCTAATGGACATCTTTATTCTGAGTGGCTA 2760

 55819536 TACCAGCACAATCCATAAATCTGAGCTATTTCAGATTACAAATGGAATTGTTCTCCACAG 55819595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TACCAGCACAATCCATAAATCTGAGCTATTTCAGATTACAAATGGAATTGTTCTCCACAG 2820

 55819596 TGTTCCATTGCCTTATAGATAATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTC 55819655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGTTCCATTGCCTTATAGATAATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTC 2880

 55819656 TAAGAGTTCAATTGATATTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATA 55819715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAAGAGTTCAATTGATATTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATA 2940

 55819716 TATCTGAACTCATTCATTTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACT 55819775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TATCTGAACTCATTCATTTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACT 3000

 55819776 CCATCTACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGT 55819835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCATCTACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGT 3060

 55819836 TTTCATTTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATCAAGCATTAA 55819895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTCATTTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATCAAGCATTAA 3120

 55819896 GTTTCTCGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCAT 55819955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTTTCTCGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCAT 3180

 55819956 CCCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTG 55820015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTG 3240

 55820016 GCCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTGATATCTTGA 55820075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GCCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTGATATCTTGA 3300

 55820076 CAGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGT 55820135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CAGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGT 3360

 55820136 AGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGTTTTCTTC 55820195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGTTTTCTTC 3420

 55820196 TTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATC 55820255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATC 3480

 55820256 TGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACA 55820315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACA 3540

 55820316 GAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAAT 55820375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAAT 3600

 55820376 TTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAA 55820435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAA 3660

 55820436 TGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTT 55820495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTT 3720

 55820496 GCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAAT 55820555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAAT 3780

 55820556 TCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGAC 55820615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGAC 3840

 55820616 TTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGT 55820675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGT 3900

 55820676 AGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACA 55820735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACA 3960

 55820736 TGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTC 55820795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTC 4020

 55820796 AAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAG 55820855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAG 4080

 55820856 TATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGC 55820915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGC 4140

 55820916 ACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTA 55820975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTA 4200

 55820976 TTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAG 55821035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAG 4260

 55821036 TTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCC 55821095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCC 4320

 55821096 TGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAAT 55821155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAAT 4380

 55821156 TGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTT 55821215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTT 4440

 55821216 TAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTG 55821275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTG 4500

 55821276 GTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTAC 55821335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTAC 4560

 55821336 ATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTG 55821395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTG 4620

 55821396 AAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCC 55821455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCC 4680

 55821456 AGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAAC 55821515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAAC 4740

 55821516 CACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCA 55821575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCA 4800

 55821576 TTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTA 55821635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTA 4860

 55821636 AACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAG 55821695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAG 4920

 55821696 TGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATC 55821755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATC 4980

 55821756 TCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACA 55821815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACA 5040

 55821816 TTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAAT 55821875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAAT 5100

 55821876 TCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAG 55821935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAG 5160

 55821936 AAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATAC 55821995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATAC 5220

 55821996 TGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATA 55822055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATA 5280

 55822056 AAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAA 55822115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAA 5340

 55822116 TAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAA 55822175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAA 5400

 55822176 GAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTAT 55822235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTAT 5460

 55822236 ATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTG 55822295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 ATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTG 5520

 55822296 GTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCT 55822355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCT 5580

 55822356 TTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAG 55822415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAG 5640

 55822416 CCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGG 55822475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGG 5700

 55822476 ACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCT 55822535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 ACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCT 5760

 55822536 GCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTA 55822595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTA 5820

 55822596 CCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATA 55822655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATA 5880

 55822656 ATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCAC 55822715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 ATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCAC 5940

 55822716 TTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGC 55822775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGC 6000

 55822776 TACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAA 55822835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAA 6060

 55822836 ATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCAC 55822895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 ATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCAC 6120

 55822896 AGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCA 55822955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 AGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCA 6180

 55822956 TGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTT 55823015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTT 6240

 55823016 TCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTG 55823075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTG 6300

 55823076 AGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGA 55823135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 AGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGA 6360

 55823136 GCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGC 55823195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 GCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGC 6420

 55823196 AGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGA 55823255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 AGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGA 6480

 55823256 TTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGG 55823315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 TTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGG 6540

 55823316 TGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACA 55823375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 TGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACA 6600

 55823376 AACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAA 55823435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 AACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAA 6660

 55823436 GATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACA 55823495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 GATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACA 6720

 55823496 TTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATT 55823555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 TTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATT 6780

 55823556 TTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAA 55823615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 TTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAA 6840

 55823616 AGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAA 55823675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 AGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAA 6900

 55823676 AGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAAT 55823735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 AGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAAT 6960

 55823736 AAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATT 55823795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 AAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATT 7020

 55823796 AGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTG 55823855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 AGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTG 7080

 55823856 GACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAG 55823915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 GACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAG 7140

 55823916 TTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTC 55823975
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 TTTCTCCCACATTACAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTC 7200

 55823976 ATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACT 55824035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 ATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACT 7260

 55824036 TTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGG 55824095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 TTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGG 7320

 55824096 AAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCA 55824155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 AAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCA 7380

 55824156 AAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTT 55824215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 AAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTT 7440

 55824216 TATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCA 55824275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 TATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCA 7500

 55824276 TTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGA 55824335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 TTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGA 7560

 55824336 ATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGT 55824395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 ATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGT 7620

 55824396 TCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCTTAC 55824455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7621 TCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCCTAC 7680

 55824456 CATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAA 55824515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 CATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAA 7740

 55824516 TAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACT 55824575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 TAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACT 7800

 55824576 TTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAG 55824635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 TTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAG 7860

 55824636 ATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACT 55824695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     7861 ATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACT 7920

 55824696 TTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAAC 55824755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 TTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAAC 7980

 55824756 ATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACC 55824815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 ATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACC 8040

 55824816 TGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAG 55824875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 TGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAG 8100

 55824876 GTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTG 55824935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 GTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTG 8160

 55824936 TCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCA 55824995
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 TCTCAAAAAAAAAAAAAAA-TTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCA 8219

 55824996 CAAGTAAGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACA 55825055
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8220 CAAGTAAGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACA 8279

 55825056 ACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTATCAT 55825115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     8280 ACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTATCAT 8339

 55825116 CCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACA 55825175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8340 CCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACA 8399

 55825176 GGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCA 55825235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8400 GGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCA 8459

 55825236 TGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATT 55825295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8460 TGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATT 8519

 55825296 CTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTT 55825355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8520 CTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTT 8579

 55825356 ACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTA 55825415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8580 ACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTA 8639

 55825416 ATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCA 55825475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8640 ATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCA 8699

 55825476 GAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATA 55825535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8700 GAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATA 8759

 55825536 TAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAG 55825595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8760 TAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAG 8819

 55825596 GCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCA 55825655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8820 GCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCA 8879

 55825656 ATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACC 55825715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8880 ATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACC 8939

 55825716 ATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTC 55825775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8940 ATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTC 8999

 55825776 ATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACA 55825835
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9000 ATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACA 9059

 55825836 TAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGT 55825895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9060 TAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGT 9119

 55825896 TAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAA 55825955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9120 TAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAA 9179

 55825956 AT 55825957
          ||
     9180 AT 9181

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9185 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 9244

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9245 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 9304

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9305 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 9364

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9365 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 9424

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9425 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 9484

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9485 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 9544

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9545 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 9604

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9605 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 9664

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9665 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 9724

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9725 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 9784

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9785 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 9844

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9845 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 9904

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9905 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 9964

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9965 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 10024

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10025 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 10084

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10085 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 10144

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 55847732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
    10145 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 10203

 55847733 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 55847792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10204 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 10263

 55847793 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 55847852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10264 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 10323

 55847853 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 55847912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10324 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 10383

 55847913 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 55847972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10384 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 10443

 55847973 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 55848032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10444 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 10503

 55848033 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 55848092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10504 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 10563

 55848093 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 55848152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
    10564 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 10623

 55848153 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 55848212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10624 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 10683

 55848213 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 55848272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10684 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 10743

 55848273 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 55848332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10744 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 10803

 55848333 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 55848392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10804 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 10863

 55848393 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 55848452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10864 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 10923

 55848453 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 55848512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10924 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 10983

 55848513 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 55848572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10984 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 11043

 55848573 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 55848632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11044 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 11103

 55848633 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 55848692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11104 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 11163

 55848693 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 55848752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11164 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 11223

 55848753 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 55848812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11224 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 11283

 55848813 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 55848872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11284 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 11343

 55848873 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 55848932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11344 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 11403

 55848933 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 55848992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11404 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 11463

 55848993 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 55849052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11464 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 11523

 55849053 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAAT 55849089
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11524 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAAT 11560

Alignment time is 27.932 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2376] =>      2376 nucs 'mol-32-303b-223197_2376'

Score:        2365
Aligned:      2376        nucs
Identic:      2375 (100%) nucs =>       997 (100%)      1378 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55846713,55847709] EXCISED REGION [55847711,55849089]
 second seq =>  [       1,     997] EXCISED REGION [     998,    2376]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55847710,55847710]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [55848128,55848128]
 second seq =>         1 nucs [1415,1415]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 60

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 120

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 180

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 240

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 300

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 360

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 420

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 480

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 540

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 600

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 660

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 720

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 780

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 840

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 900

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 960

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA 55847709
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA 997

EXCISED REGION

 55847711 GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCT 55847770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCT 1057

 55847771 TCTTACAACTAAATTTGTAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTT 55847830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 TCTTACAACTAAATTTGTAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTT 1117

 55847831 TCATGGATTTATTATTGGTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTT 55847890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 TCATGGATTTATTATTGGTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTT 1177

 55847891 TCCTCTGGCATATACTGCAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACA 55847950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 TCCTCTGGCATATACTGCAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACA 1237

 55847951 CCCAGCTTGAACCATCAGCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGAC 55848010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 CCCAGCTTGAACCATCAGCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGAC 1297

 55848011 ACTGCTGTCTTTATGTAGATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATT 55848070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 ACTGCTGTCTTTATGTAGATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATT 1357

 55848071 TTAAAGTCCAAGAAAGGAACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAA 55848130
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1358 TTAAAGTCCAAGAAAGGAACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAA 1417

 55848131 GCACTCTCCAAAACAACGCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTG 55848190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 GCACTCTCCAAAACAACGCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTG 1477

 55848191 AAACTCCATTTGCTTCTCATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAG 55848250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 AAACTCCATTTGCTTCTCATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAG 1537

 55848251 CACAGTGCCCTAAATCCGATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGG 55848310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 CACAGTGCCCTAAATCCGATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGG 1597

 55848311 GACAGTCAACAATATGACTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATG 55848370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 GACAGTCAACAATATGACTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATG 1657

 55848371 TGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGG 55848430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGG 1717

 55848431 GTTCCCAGCTGCAGGAAGACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCA 55848490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 GTTCCCAGCTGCAGGAAGACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCA 1777

 55848491 GACAGCATAGCTTGAACCCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTG 55848550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 GACAGCATAGCTTGAACCCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTG 1837

 55848551 CTTCGTAATTTGGGAGGCACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAG 55848610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 CTTCGTAATTTGGGAGGCACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAG 1897

 55848611 AGCAGTAATTGTACGTCTCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATT 55848670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 AGCAGTAATTGTACGTCTCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATT 1957

 55848671 GTTCTACCAAGTCCTTAATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGG 55848730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 GTTCTACCAAGTCCTTAATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGG 2017

 55848731 CGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAG 55848790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 CGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAG 2077

 55848791 GAAGAAAATCCAAAATTCATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACA 55848850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 GAAGAAAATCCAAAATTCATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACA 2137

 55848851 GTCTTGATGAGCCATCTGTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGG 55848910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 GTCTTGATGAGCCATCTGTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGG 2197

 55848911 TGAGCAAGAGATACGTTTTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATG 55848970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TGAGCAAGAGATACGTTTTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATG 2257

 55848971 ATTCAAGGTATCCTAAAGGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTAT 55849030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 ATTCAAGGTATCCTAAAGGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTAT 2317

 55849031 TTGACTGTCTTGCTGTAGTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAAT 55849089
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 TTGACTGTCTTGCTGTAGTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAAT 2376

Alignment time is 6.24025 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    9143] =>      9143 nucs 'mol-32-30f6-125621_9143'

Score:        8914
Aligned:      9138        nucs
Identic:      9116 (100%) nucs =>      7170 (100%)      1946 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55824238,55831421] EXCISED REGION [55831434,55833384]
 second seq =>  [       1,    7183] EXCISED REGION [    7193,    9143]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        12 nucs [55831422,55831433]
 second seq =>         9 nucs [7184,7192]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55824238 GTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAAT 55824297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAAT 60

 55824298 TATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAAT 55824357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAAT 120

 55824358 CACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTA 55824417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTA 180

 55824418 ATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCTTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCT 55824477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCCTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCT 240

 55824478 AACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTT 55824537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTT 300

 55824538 TATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTT 55824597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTT 360

 55824598 ACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAAT 55824657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAAT 420

 55824658 TTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGA 55824717
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGA 480

 55824718 TCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGC 55824777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGC 540

 55824778 AAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAG 55824837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAG 600

 55824838 GCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACA 55824897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACA 660

 55824898 CCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATT 55824957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||
      661 CCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAA--TT 718

 55824958 CATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGATGTAAACTTCAA 55825017
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      719 CATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGCTGTAAACTTCAA 778

 55825018 GTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTT 55825077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTT 838

 55825078 CTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCC 55825137
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 CTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCC 898

 55825138 GTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGA 55825197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 GTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGA 958

 55825198 GCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATA 55825257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 GCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATA 1018

 55825258 AATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATA 55825317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 AATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATA 1078

 55825318 CCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAG 55825377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAG 1138

 55825378 TCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCC 55825437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCC 1198

 55825438 CATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGC 55825497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGC 1258

 55825498 ATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTAT 55825557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 ATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTAT 1318

 55825558 TATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTC 55825617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTC 1378

 55825618 TGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCT 55825677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 TGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCT 1438

 55825678 AAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTC 55825737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 AAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTC 1498

 55825738 ATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCC 55825797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 ATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCC 1558

 55825798 AAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACA 55825857
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACA 1618

 55825858 TGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAAT 55825917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAAT 1678

 55825918 GAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAATGATCTACTTTTATAATATAT 55825977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 GAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAATGATCTACTTTTATAATATAT 1738

 55825978 ATAAAATTATATTATTTTTGTAATATATATAAAAAATATGATTTTATATATAAAAAGATC 55826037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 ATAAAATTATATTATTTTTGTAATATATATAAAAAATATGATTTTATATATAAAAAGATC 1798

 55826038 TATTTTTATAATATATATAAAAATAGATTATTTTATCACATGATATATAAAATAGATGGT 55826097
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TATTTTTATAATATATATAAAA-TAGATTATTTTATCACATGATATATAAAATAGATGGT 1857

 55826098 TTTGTCCTCTCTCATATAATTCGTACTTACACAGGCTCTATAATTCTTCTAGGCTGTAAA 55826157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TTTGTCCTCTCTCATATAATTCGTACTTACACAGGCTCTATAATTCTTCTAGGCTGTAAA 1917

 55826158 ATATCCTTTGTAGAAAGAGCTAAATATTAGTACATGGAAATATTTTCAGCTCCTTATTAA 55826217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 ATATCCTTTGTAGAAAGAGCTAAATATTAGTACATGGAAATATTTTCAGCTCCTTATTAA 1977

 55826218 AATATGAGACTGCTGAAAAACAATAATTAGACTTCAATATTTAGGAGCTTTTGCATACTT 55826277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 AATATGAGACTGCTGAAAAACAATAATTAGACTTCAATATTTAGGAGCTTTTGCATACTT 2037

 55826278 TAAATGCTATGGTTTATTTTTAATATTTTCAAGATTTTATTTTTGAAGATCATAAACCTT 55826337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TAAATGCTATGGTTTATTTTTAATATTTTCAAGATTTTATTTTTGAAGATCATAAACCTT 2097

 55826338 AATTATAATTGCAAATAATAAAAAAAGCAGTGGCCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAAT 55826397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 AATTATAATTGCAAATAATAAAAAAAGCAGTGGCCAGGCATGGTGGCTCACACCTGTAAT 2157

 55826398 CCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCATATCATCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGC 55826457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 CCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCATATCATCTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGC 2217

 55826458 CTGACCAACATGGAGAAAACCCGTCTCTACTCAAAATACAAAATGAGCTGGGTGTAGTAG 55826517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 CTGACCAACATGGAGAAAACCCGTCTCTACTCAAAATACAAAATGAGCTGGGTGTAGTAG 2277

 55826518 CACGTGCCTGTCATCCCAGCTGCTTGGTAGGCTTAGGCAGGACAATCACTTGAACCCGGG 55826577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 CACGTGCCTGTCATCCCAGCTGCTTGGTAGGCTTAGGCAGGACAATCACTTGAACCCGGG 2337

 55826578 AGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGT 55826637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 AGGCGGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCTTGGGCAACAAGAGT 2397

 55826638 GAAATTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCAGTAAAATGTGCCAGTAGAAGGA 55826697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     2398 GAAATTTCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-GGCAGTAAAATGTGCCAGTAGAAGGA 2456

 55826698 AACTGATCACTGATAGCATGCTTTTAATAGGCCAAATTAAATCAGACTTTCTAGGAACAA 55826757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 AACTGATCACTGATAGCATGCTTTTAATAGGCCAAATTAAATCAGACTTTCTAGGAACAA 2516

 55826758 GAAGTGAAAATGTCACTTTTTTGGCATGATGCTAATAAGAATACAGATACCATAAATCTT 55826817
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 GAAGTGAAAATTTCACTTTTTTGGCATGATGCTAATAAGAATACAGATACCATAAATCTT 2576

 55826818 TGTAAAGAATTTTCCAGAACAATACATAATACCTCATTGGTTTTGTTTAACATTTCCATC 55826877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 TGTAAAGAATTTTCCAGAACAATACATAATACCTCATTGGTTTTGTTTAACATTTCCATC 2636

 55826878 TGCATTTGAAACATCTCACTCAGATTGATACCTTTCCCAATTATAATTAATGCAGAACCT 55826937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 TGCATTTGAAACATCTCACTCAGATTGATACCTTTCCCAATTATAATTAATGCAGAACCT 2696

 55826938 GTGACAGTAGGATCTTGATTTATTTTAATTATTTTCTAAAACTTTTTCAAATTACTTTGT 55826997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 GTGACAGTAGGATCTTGATTTATTTTAATTATTTTCTAAAACTTTTTCAAATTACTTTGT 2756

 55826998 CTTTTATAATGTTGTTTCATAGCTAGATGGTACAAGAGCAGACATGACCTTCAATCAATA 55827057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 CTTTTATAATGTTGTTTCATAGCTAGATGGTACAAGAGCAGACATGACCTTCAATCAATA 2816

 55827058 TTTTAATTGAATTCATTGAGTTCGCTAGAAACTTGATCATACCTGAGTAAAATGATAAAA 55827117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TTTTAATTGAATTCATTGAGTTCGCTAGAAACTTGATCATACCTGAGTAAAATGATAAAA 2876

 55827118 TTTAGATTCTAAGCCACCCAGGCCAAGAAATGGATCCTATGGAGACTCATCAACAGACAG 55827177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TTTAGATTCTAAGCCACCCAGGCCAAGAAATGGATCCTATGGAGACTCATCAACAGACAG 2936

 55827178 ACAGCCCAGGAAGTCCACATCAAACAGCAGGCTGGACATAGCCATTTCTTCACCCGAATA 55827237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 ACAGCCCAGGAAGTCCACATCAAACAGCAGGCTGGACATAGCCATTTCTTCACCCGAATA 2996

 55827238 CTAAAGCCCTATACACACACAACACTTTAATTAGAGGATCTTCCACATTCTTTAAAGAAA 55827297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 CTAAAGCCCTATACACACACAACACTTTAATTAGAGGATCTTCCACATTCTTTAAAGAAA 3056

 55827298 TAAAGAATGTTTTGTCACTCTTTTATTTTTTTATCCTTCCTGCCTGCCTACCTGCCT-TT 55827356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     3057 TAAAGAATGTTTTGTCACTCTTTTATTTTTTTATCCTTCCTGCCTGCCTACCTGCCTCTT 3116

 55827357 TTTTTTTTTTACTTCTTTGCTTCTCTTTTTTAAATTTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTCTCT 55827416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TTTTTTTTTTACTTCTTTGCTTCTCTTTTTTAAATTTTCTTTCTTTTCTTTTCTTTCTCT 3176

 55827417 CTATGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT--GTCTGTCTCTCTCTCTCTCT 55827474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||
     3177 CTATGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTCTGTCTCTCTCTCTCTCT 3236

 55827475 CCCCTCCACTCCCTTCCATTCCTTTCTCCTTTCTCTCTGGAAAATGAAATATGTTAACAA 55827534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 CCCCTCCACTCCCTTCCATTCCTTTCTCCTTTCTCTCTGGAAAATGAAATATGTTAACAA 3296

 55827535 AAATCGATGATAAAGAGACTATTTTCCAGTTCAAACTGAAAAATGAGTTGTCTTGTAGGA 55827594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 AAATCGATGATAAAGAGACTATTTTCCAGTTCAAACTGAAAAATGAGTTGTCTTGTAGGA 3356

 55827595 GAAACAAACAAACACAATGCAACATGACACTTCTTAACCAAAACTGGCCAAAATTCCAAT 55827654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 GAAACAAACAAACACAATGCAACATGACACTTCTTAACCAAAACTGGCCAAAATTCCAAT 3416

 55827655 GGATATTCACAGAAAAACCCTAAGCTTAAAATTGAGAACCTTAAATAGCTCTATCAGACA 55827714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 GGATATTCACAGAAAAACCCTAAGCTTAAAATTGAGAACCTTAAATAGCTCTATCAGACA 3476

 55827715 ACTTATATTTCTACAACAGAAGTTTATTCAATAAAATTGTGAGCTGGAGGGAAACAAGCA 55827774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 ACTTATATTTCTACAACAGAAGTTTATTCAATAAAATTGTGAGCTGGAGGGAAACAAGCA 3536

 55827775 GAAGTTGACAGACGTAGAAGTGAAGGATAACAGAGTATTCAACAAATGAACCATAAATTT 55827834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 GAAGTTGACAGACGTAGAAGTGAAGGATAACAGAGTATTCAACAAATGAACCATAAATTT 3596

 55827835 CAGAATTAAGGGAGACTCTAAGTTATTGTTATTATTAATCAGAAAATCCATGTCAAATTA 55827894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 CAGAATTAAGGGAGACTCTAAGTTATTGTTATTATTAATCAGAAAATCCATGTCAAATTA 3656

 55827895 CTATTTCTGCTGAAGAGATTTTGGCAACAACAATACACAGGCTACCTTCTGAACCAGAAC 55827954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 CTATTTCTGCTGAAGAGATTTTGGCAACAACAATACACAGGCTACCTTCTGAACCAGAAC 3716

 55827955 CCCAAAAATGCTTCAAGGATTAATAAATGCAAAGTTAATTCCAGAAATATCTGGTCATCA 55828014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 CCCAAAAATGCTTCAAGGATTAATAAATGCAAAGTTAATTCCAGAAATATCTGGTCATCA 3776

 55828015 GATCCTCTCACAGAAAGACATCCAAAAGACAGCTTGGTTCTGCTGCCCTATGAAAGTTGT 55828074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 GATCCTCTCACAGAAAGACATCCAAAAGACAGCTTGGTTCTGCTGCCCTATGAAAGTTGT 3836

 55828075 TAGAGTTTATATAGACTCACTTTTGGTGAAAAGAACCAAAAACAAAAAAAAGAAACCCTA 55828134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 TAGAGTTTATATAGACTCACTTTTGGTGAAAAGAACCAAAAACAAAAAAAAGAAACCCTA 3896

 55828135 ACAAATAGAGCCAGGAAAAGTCAAGAATGGAAAGTTCTCGAGCACACATGACTGATAACA 55828194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 ACAAATAGAGCCAGGAAAAGTCAAGAATGGAAAGTTCTCGAGCACACATGACTGATAACA 3956

 55828195 AGAACTATCACAGAAGACTGCAGAAAGCACAATTTGGCAAAAAGGCCATCACAAACGTAT 55828254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 AGAACTATCACAGAAGACTGCAGAAAGCACAATTTGGCAAAAAGGCCATCACAAACGTAT 4016

 55828255 ACAAGAAATACTTCTGCAAGGACATCTGCCTTGCAACTGCCTGTCCAACCTCCAGCTGGC 55828314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 ACAAGAAATACTTCTGCAAGGACATCTGCCTTGCAACTGCCTGTCCAACCTCCAGCTGGC 4076

 55828315 GCCACTCTTGTTATTGATCCTTGTAGCCAAGAATAATGATGTAATGCTCCTCATTTTTTC 55828374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 GCCACTCTTGTTATTGATCCTTGTAGCCAAGAATAATGATGTAATGCTCCTCATTTTTTC 4136

 55828375 CTTTAAAAACCTTTGCCTGTCTTCACCTCTCTGAATATGCAGAGTTCACTGTGGCATGCA 55828434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4137 CTTTAAAAACCTTTGCCTGTCTTCACCTCTCTGAATATGCAGAGTTCACTATGGCATGCA 4196

 55828435 CATTCCCATTACAGTGCTCTATTCCCAAATAACTATCATTTTCTTTTAGAGAGCTTCTCT 55828494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 CATTCCCATTACAGTGCTCTATTCCCAAATAACTATCATTTTCTTTTAGAGAGCTTCTCT 4256

 55828495 CTGTCATTTAGATTGACAGCCCAAGCTGACAGATTATACTACTTATGCCTGAAGATTAAT 55828554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 CTGTCATTTAGATTGACAGCCCAAGCTGACAGATTATACTACTTATGCCTGAAGATTAAT 4316

 55828555 ACAACTTTCTCTTCTAAACTTTGCCAAAGGGAAATGCCTAAAATAAGTATATGCCTCTGG 55828614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 ACAACTTTCTCTTCTAAACTTTGCCAAAGGGAAATGCCTAAAATAAGTATATGCCTCTGG 4376

 55828615 ATAATCACCCACCTGGTTGTAGCACATCAACTGAGGTTCCTGGAAACACATCTGCCTCTG 55828674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 ATAATCACCCACCTGGTTGTAGCACATCAACTGAGGTTCCTGGAAACACATCTGCCTCTG 4436

 55828675 ATGTGAGCTGCACTGCACATCATCACTGAAATGTGATCAAGATAACTGGGGGCTTTTGCT 55828734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4437 ATGTGAGCTGCACTGCACATCATCACTGAAATGTGATCAAGATAACTGGGGGTTTTTGCT 4496

 55828735 CATTCTCTGGGAGTGGTGAAAGATCTAATGACTCCGTGATCAAAGAGGTGTGGCAAGAAG 55828794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 CATTCTCTGGGAGTGGTGAAAGATCTAATGACTCCGTGATCAAAGAGGTGTGGCAAGAAG 4556

 55828795 TTATCTGAAGATTTCAGACCTGCCACCTTCTGATTCTGAAGGATTAGCTGAGAGATAAAG 55828854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 TTATCTGAAGATTTCAGACCTGCCACCTTCTGATTCTGAAGGATTAGCTGAGAGATAAAG 4616

 55828855 AAAAATATCTGGCTCCCATCAGGACATTAAGTCCACTTCATTGATACACAGTGGCCACAA 55828914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 AAAAATATCTGGCTCCCATCAGGACATTAAGTCCACTTCATTGATACACAGTGGCCACAA 4676

 55828915 TGTTTCTTTACTCACTCTGTGTTAGTGGTAAAATGTCTAATCCTCTACCCCAGAGCAATC 55828974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 TGTTTCTTTACTCACTCTGTGTTAGTGGTAAAATGTCTAATCCTCTACCCCAGAGCAATC 4736

 55828975 TGAGATTGCTCTGGTTTTAACACTGAAGGTCCCAAATCCCAGGAAACTCCCAGGTAAACT 55829034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 TGAGATTGCTCTGGTTTTAACACTGAAGGTCCCAAATCCCAGGAAACTCCCAGGTAAACT 4796

 55829035 GGTATGGTTGGCCACTCTAGATATCTGAGATAGATGTCTTCCCCTCTGTGTAAAAAAGAC 55829094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 GGTATGGTTGGCCACTCTAGATATCTGAGATAGATGTCTTCCCCTCTGTGTAAAAAAGAC 4856

 55829095 CTGCAGAGATGCCAACATGAGACTGTGAATAGGCTTCCACACATGCGCAGGTGGCTCTCA 55829154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 CTGCAGAGATGCCAACATGAGACTGTGAATAGGCTTCCACACATGCGCAGGTGGCTCTCA 4916

 55829155 GCATGGGTGGAACAGAATCACACTGTTCTGGGCCCAAATCCAGAGAGGCCCTTGTTATGA 55829214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 GCATGGGTGGAACAGAATCACACTGTTCTGGGCCCAAATCCAGAGAGGCCCTTGTTATGA 4976

 55829215 CACCCTTTTATTCTGAAAACAGCAAAAGTAAAAAATTTGGCTCCCCAAAACAGTCACTTT 55829274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 CACCCTTTTATTCTGAAAACAGCAAAAGTAAAAAATTTGGCTCCCCAAAACAGTCACTTT 5036

 55829275 AAGAATTCTAATTTTTCTTCTGAATATAACAGACAAACTTATTTTTCACTACCCTAGCCC 55829334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 AAGAATTCTAATTTTTCTTCTGAATATAACAGACAAACTTATTTTTCACTACCCTAGCCC 5096

 55829335 TGTACACTTTTAAACCGAATCATTCAATTCTGATCACTGATTTTTAGCTAAATGAGGAAC 55829394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 TGTACACTTTTAAACCGAATCATTCAATTCTGATCACTGATTTTTAGCTAAATGAGGAAC 5156

 55829395 ACTATTTAAATAATACGCTGCAGTACCTGCATTGCACAACACAAAAACCCTTGCACTCTG 55829454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 ACTATTTAAATAATACGCTGCAGTACCTGCATTGCACAACACAAAAACCCTTGCACTCTG 5216

 55829455 TATTAGTTAATGAATCTCAGGTAAGTAACAAATTATTTTAGATGTCACTAGAACAGCTTT 55829514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5217 TATTAGTTAATGAATCTCAGGTAAGTAACAAATTATTTTAGATGCCACTAGAACAGCTTT 5276

 55829515 ATTTAAAAATCCATATCATAAAAGTAAAATCTTCCCTTCATTTTATAACTTAGTCTTTGC 55829574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 ATTTAAAAATCCATATCATAAAAGTAAAATCTTCCCTTCATTTTATAACTTAGTCTTTGC 5336

 55829575 ATTAGTTCATTCTCACATTGCTACAAAGTAACACCTGAGACTGGGTAATCTATAAGAAAA 55829634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 ATTAGTTCATTCTCACATTGCTACAAAGTAACACCTGAGACTGGGTAATCTATAAGAAAA 5396

 55829635 GAGGTTTAATTGGCTCACAGTTCTGCAGGCTGTAGAGGAAGCGTAGTGGCTTCTGCTTCT 55829694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 GAGGTTTAATTGGCTCACAGTTCTGCAGGCTGTAGAGGAAGCGTAGTGGCTTCTGCTTCT 5456

 55829695 GGGGAGGCTTCAGGAAGCTTCCAATCATGACAGAAGGCAAAGGGAGGTCACAGGCATCTC 55829754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 GGGGAGGCTTCAGGAAGCTTCCAATCATGACAGAAGGCAAAGGGAGGTCACAGGCATCTC 5516

 55829755 ACATAGTGGGAGCAGGAGCAATAAAGCGGGGAGGAGGGGAAGGGGGCTACACACTTCTAA 55829814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 ACATAGTGGGAGCAGGAGCAATAAAGCGGGGAGGAGGGGAAGGGGGCTACACACTTCTAA 5576

 55829815 ACTATCTACCATCTCTCCCAATTTCTTCACAAAGCCACTTCAGTCCTGAAACATTTACCA 55829874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5577 ACTATCTACCATCTCTCCCAATTTCTTCACAAAGCCACTTCAGTCCTGCAACATTTACCA 5636

 55829875 GGAAAAGTTTCTTTGTCTGCTTCTGAATATGGTTCACCCATTTGATTTTCAATTTTCATG 55829934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 GGAAAAGTTTCTTTGTCTGCTTCTGAATATGGTTCACCCATTTGATTTTCAATTTTCATG 5696

 55829935 TTCGGTTAGCCTCCATCAAATTTTTCTTTCCAGCCAGCTCTTTTTTTTGTTGCCCCATAT 55829994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 TTCGGTTAGCCTCCATCAAATTTTTCTTTCCAGCCAGCTCTTTTTTTTGTTGCCCCATAT 5756

 55829995 GAATAATGATTTTTCTTAAGAAGCGGTGGAAAAGAAAAGTTTAAAATAAAGAAAAAATGA 55830054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 GAATAATGATTTTTCTTAAGAAGCGGTGGAAAAGAAAAGTTTAAAATAAAGAAAAAATGA 5816

 55830055 TATAGTAAAATAAACATGCTGAGAGAAAGGAAAAATATATATTTAAAGATGCATTTTATA 55830114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 TATAGTAAAATAAACATGCTGAGAGAAAGGAAAAATATATATTTAAAGATGCATTTTATA 5876

 55830115 GGGGAGGAATATTCATATGAAATCTAACTGGATCCATTAGCGGCAAAACACCAGATTAAA 55830174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 GGGGAGGAATATTCATATGAAATCTAACTGGATCCATTAGCGGCAAAACACCAGATTAAA 5936

 55830175 ATATCGGAACACACCAGAAAGGTATATTTTATTAAATACTACCATAGGCATTTGCATTAC 55830234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 ATATCGGAACACACCAGAAAGGTATATTTTATTAAATACTACCATAGGCATTTGCATTAC 5996

 55830235 ATTTATCTCTTCTTTATTTCCATAGGGATGGCACCAGTTATGTATTTGGATATTAGAAAT 55830294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 ATTTATCTCTTCTTTATTTCCATAGGGATGGCACCAGTTATGTATTTGGATATTAGAAAT 6056

 55830295 TAATATTTAATGACAGCTCAAAAGAGGAAGACCAAAAATGGAGAATCCCCCCAAATTAAG 55830354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 TAATATTTAATGACAGCTCAAAAGAGGAAGACCAAAAATGGAGAATCCCCCCAAATTAAG 6116

 55830355 GAAGCATTCTGATTAAGAAGAAAGTATGCTTCCCAGAAGCACCCTCTAAAACTGATCTCT 55830414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 GAAGCATTCTGATTAAGAAGAAAGTATGCTTCCCAGAAGCACCCTCTAAAACTGATCTCT 6176

 55830415 TTTAGTGTTGTATATAAAAATTATTTTGAAAATAAAAATGTGATATTTAGTAATGGTTAG 55830474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 TTTAGTGTTGTATATAAAAATTATTTTGAAAATAAAAATGTGATATTTAGTAATGGTTAG 6236

 55830475 GAATTTATATATATATACAACAGGACTTCATGGAGTAAAGTCTATTATCCGTTGCTATTT 55830534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 GAATTTATATATATATACAACAGGACTTCATGGAGTAAAGTCTATTATCCGTTGCTATTT 6296

 55830535 TCTGAAAATATCATACCCTCACTTATTTCTGATTTAATTTTTTCAGTTTGTTACAAGCAG 55830594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 TCTGAAAATATCATACCCTCACTTATTTCTGATTTAATTTTTTCAGTTTGTTACAAGCAG 6356

 55830595 GCATTAACAAGATGGAAATCATCATTGAGATCCACAATTCTCTATGTTCTATTAATTATT 55830654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 GCATTAACAAGATGGAAATCATCATTGAGATCCACAATTCTCTATGTTCTATTAATTATT 6416

 55830655 TCAAATGCAGAGCTCTTTTTGTTTTTTGCTCTATCTTGTATTTTTATACAAGATATACTT 55830714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 TCAAATGCAGAGCTCTTTTTGTTTTTTGCTCTATCTTGTATTTTTATACAAGATATACTT 6476

 55830715 AGTAACATAGAGAGTATTTCTATACTTAGTGATATAGAAAGTTTATATTTCTTTGAAGTT 55830774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 AGTAACATAGAGAGTATTTCTATACTTAGTGATATAGAAAGTTTATATTTCTTTGAAGTT 6536

 55830775 AACAAACTTTTCACAGAGTAAGGACCATCAATAAGAGAATGTTCTGTGTAATGCTGTAGG 55830834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 AACAAACTTTTCACAGAGTAAGGACCATCAATAAGAGAATGTTCTGTGTAATGCTGTAGG 6596

 55830835 GCCTCTGTTCCCTGAATCTTGAATCTTGGGAAATATTCATTCTCATAGTTTCTTAACAGT 55830894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 GCCTCTGTTCCCTGAATCTTGAATCTTGGGAAATATTCATTCTCATAGTTTCTTAACAGT 6656

 55830895 GCCTTCCCAATATTCTACAACCTTTGGGCAAAACAGTAAATACACCCTAGATGTACTAGA 55830954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 GCCTTCCCAATATTCTACAACCTTTGGGCAAAACAGTAAATACACCCTAGATGTACTAGA 6716

 55830955 AAAAGAAAGAAAAGGAAGAGGAAACACATTAAGGATAATAGAGAGACCAGAGTTTTCATT 55831014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 AAAAGAAAGAAAAGGAAGAGGAAACACATTAAGGATAATAGAGAGACCAGAGTTTTCATT 6776

 55831015 TTCAGCAACTTGTTCTAAACTATAATTGATACTTTCTCCTTCACCATTGATTCCCTATTT 55831074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 TTCAGCAACTTGTTCTAAACTATAATTGATACTTTCTCCTTCACCATTGATTCCCTATTT 6836

 55831075 TCCTTACCTTCGGCCACCTTCAGCTGGTGAAGATTTTCCTCTGGCGGGGTGATTTAAACC 55831134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 TCCTTACCTTCGGCCACCTTCAGCTGGTGAAGATTTTCCTCTGGCGGGGTGATTTAAACC 6896

 55831135 TTTATCCTTTGTTCTGAAGAAGCCTGTGTAGGATGCAGTAGTATTGTGTTAATGTTTACT 55831194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 TTTATCCTTTGTTCTGAAGAAGCCTGTGTAGGATGCAGTAGTATTGTGTTAATGTTTACT 6956

 55831195 ATTGGCTATAGCAGTAGAATGAAGTATTCCCCGGGCATCCTTCCCTCCACCACCCACCTC 55831254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 ATTGGCTATAGCAGTAGAATGAAGTATTCCCCGGGCATCCTTCCCTCCACCACCCACCTC 7016

 55831255 CACCCTCCATCCCAGTCTTGGTTTCCACGCATCCATTTGGTTGCAACAATCCCCTTTCTT 55831314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 CACCCTCCATCCCAGTCTTGGTTTCCACGCATCCATTTGGTTGCAACAATCCCCTTTCTT 7076

 55831315 CCTGATGCTCAACATTACTTAACACAGAATTTTTTGCCTATTGTCCTAGTAAATTCAAAA 55831374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 CCTGATGCTCAACATTACTTAACACAGAATTTTTTGCCTATTGTCCTAGTAAATTCAAAA 7136

 55831375 TGACTAGGCAGCAATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 55831421
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 TGACTAGGCAGCAATTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 7183

EXCISED REGION

 55831434 GAGTCTGGCTCTGTCGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCCGCTCACTGAAAGCT 55831493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7193 GAGTCTGGCTCTGTCGCCCAGGTTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCCGCTCACTGAAAGCT 7252

 55831494 CTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTGCAGG 55831553
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     7253 CTGCCTCCCAGGTTCACGCCATTCTCCTGACTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTGCAGG 7312

 55831554 TGCCCGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTTGTCTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTA 55831613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7313 TGCCCGCCACCATGCCTGGCTAACTTTTTGTCTTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCGTA 7372

 55831614 TTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTCGTGGTCCACCCGCCCCGGCCTCCCCAAAG 55831673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7373 TTAGCCAGGATGGTCTCCATCTCCTGACCTCGTGGTCCACCCGCCCCGGCCTCCCCAAAG 7432

 55831674 TGCTGGGATTACAGGCGTAAGCCACCGCACTGGCCGACTAGGCAGCAATTTCTCGTGCAA 55831733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7433 TGCTGGGATTACAGGCGTAAGCCACCGCACTGGCCGACTAGGCAGCAATTTCTCGTGCAA 7492

 55831734 ATTTAGGGTTGAGAGAGAACACACATTTCCCACTCTTACCTTTGTCTTAGGGAGAAAGAA 55831793
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7493 ATTTAGGGTTGAGAGAGAACACACATTTCCCACTCATACCTTTGTCTTAGGGAGAAAGAA 7552

 55831794 ATTTATACTGTCTAGTAAGTGCATTCTTTGCTCATTCTCTTACTCTTCTTTTTGGATTGG 55831853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7553 ATTTATACTGTCTAGTAAGTGCATTCTTTGCTCATTCTCTTACTCTTCTTTTTGGATTGG 7612

 55831854 GGAATTTGGGAAAAGGAGTTTTATGATACCCTGCTCAACTTTTGGAGCTCTCCATTAGAG 55831913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7613 GGAATTTGGGAAAAGGAGTTTTATGATACCCTGCTCAACTTTTGGAGCTCTCCATTAGAG 7672

 55831914 CAACGTATCTTCCAGTTACAGATGCCCTCTCCACTATCAGGAGAAACCACTTTGCCCCTG 55831973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7673 CAACGTATCTTCCAGTTACAGATGCCCTCTCCACTATCAGGAGAAACCACTTTGCCCCTG 7732

 55831974 TCAGGGAGGCCTGTGATTCCAACAACTGGGAGGACAGACCTATGTACTTCACCAATCAAG 55832033
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     7733 TCAGGGAGGCCTGTGATTCCAACAACTGAGAGGACAGACCTATGTACTTCACCAATCAAG 7792

 55832034 GTTAGAAGGTCCAGCGTGGCCACATGCCTGCACCACATCTGTCTCTCCAGGTTCGGTCTC 55832093
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7793 GTTAGAAGGTCCAGCGTGGCCACGTGCCTGCACCACATCTGTCTCTCCAGGTTCGGTCTC 7852

 55832094 CTCTGAAGCTGGTATTTTCCCCATCTTACGTCTGACTTCTATACCTATCTTTCAATTAGT 55832153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7853 CTCTGAAGCTGGTATTTTCCCCATCTTACGTCTGACTTCTATACCTATCTTTCAATTAGT 7912

 55832154 TCCAAATTTGGATTTGGGTATGTGGTCATGGTTAACCTCTCCTAAAACCCCACACTACTG 55832213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7913 TCCAAATTTGGATTTGGGTATGTGGTCATGGTTAACCTCTCCTAAAACCCCACACTACTG 7972

 55832214 ATGAAAAGGAAAGATCATGTCCAAAGCAGAGCTTTGATTTTTTTCTAGGTGGTGAAATAG 55832273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7973 ATGAAAAGGAAAGATCATGTCCAAAGCAGAGCTTTGATTTTTTTCTAGGTGGTGAAATAG 8032

 55832274 GAATCTTCCCAATTGTTCCTACTCTTGGGTTCTTAAGTGGAACAAAAAATTAGGGAATTA 55832333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8033 GAATCTTCCCAATTGTTCCTACTCTTGGGTTCTTAAGTGGAACAAAAAATTAGGGAATTA 8092

 55832334 GGAACAAAGTTCATGAGAGAAGTTTACAGTCTTAGAATCTAGGCCATTCTATAAGAAAAT 55832393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8093 GGAACAAAGTTCATGAGAGAAGTTTACAGTCTTAGAATCTAGGCCATTCTATAAGAAAAT 8152

 55832394 ACAACTGTAGTTTTGTTCTATTTAACATATGTCAATTCTCAAACCATCAAGGACACAACA 55832453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8153 ACAACTGTAGTTTTGTTCTATTTAACATATGTCAATTCTCAAACCATCAAGGACACAACA 8212

 55832454 TAATATATATTGAGCTGTAAAGGTTTTTTTTTTAGTCTTATGTGATTTTGTAGGTTATAT 55832513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8213 TAATATATATTGAGCTGTAAAGGTTTTTTTTTTAGTCTTATGTGATTTTGTAGGTTATAT 8272

 55832514 AGAGCATCTTTCTTTCTTACTGTTTAATAAGCCAACTAACTAAAAGAATACTTTTCACAG 55832573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8273 AGAGCATCTTTCTTTCTTACTGTTTAATAAGCCAACTAACTAAAAGAATACTTTTCACAG 8332

 55832574 GTACTCTAGAAGATAATCACTTTAAGGCATTAGCCTAACATTTTGGGAACCTGGAGTAGT 55832633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8333 GTACTCTAGAAGATAATCACTTTAAGGCATTAGCCTAACATTTTGGGAACCTGGAGTAGT 8392

 55832634 TTTTTGTTATTAATATTTTCTTAAATTGATTATGGTGCTGTGATGTGGATGTGTTAAGAT 55832693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8393 TTTTTGTTATTAATATTTTCTTAAATTGATTATGGTGCTGTGATGTGGATGTGTTAAGAT 8452

 55832694 TTATACTGTGTAAATGAATGACTGTAAACTGAAGGGCTACATTTAATTAAATTATCAAAA 55832753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8453 TTATACTGTGTAAATGAATGACTGTAAACTGAAGGGCTACATTTAATTAAATTATCAAAA 8512

 55832754 CCTGTGCTATAATCGCCCTTTTTAAGGAAAGAGCTATTTTCTAACTCATTTTACTGAATA 55832813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8513 CCTGTGCTATAATCGCCCTTTTTAAGGAAAGAGCTATTTTCTAACTCATTTTACTGAATA 8572

 55832814 ACAAACTCACTGAACATATGTAAAAACTTACCTGTGAGAAAATTAGTATTTATTGTATTT 55832873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8573 ACAAACTCACTGAACATATGTAAAAACTTACCTGTGAGAAAATTAGTATTTATTGTATTT 8632

 55832874 GTTGCGTCATGTTATAAGATTATTATTTAAGCATAAGCCATTAACATGGGTAATTTCATT 55832933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8633 GTTGCGTCATGTTATAAGATTATTATTTAAGCATAAGCCATTAACATGGGTAATTTCATT 8692

 55832934 TTGTGGCTTTAACGTAGGTTTCCCTACGTTTCAGATAAGAATGTTGACCCAAAGAAGTGC 55832993
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8693 TTGTGGCTTTAACGTAGGTTTCTCTACGTTTCAGATAAGAATGTTGACCCAAAGAAGTGC 8752

 55832994 AGGCTTCAAATATATCACTTTGATTTGGAATGAGTTCTCTGAATATTTAAATAATATCCA 55833053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8753 AGGCTTCAAATATATCACTTTGATTTGGAATGAGTTCTCTGAATATTTAAATAATATCCA 8812

 55833054 AGTTGTATACATTTCTAAAGTAATTACTACATTAGATATATGGTTGTTAAACTTTAAAAA 55833113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8813 AGTTGTATACATTTCTAAAGTAATTACTACATTAGATATATGGTTGTTAAACTTTAAAAA 8872

 55833114 TAAAAATCAATTATAATGGAAAGCCTCCTTAAGTACTTGAACTATTTATTTTGAATAAAA 55833173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8873 TAAAAATCAATTATAATGGAAAGCCTCCTTAAGTACTTGAACTATTTATTTTGAATAAAA 8932

 55833174 TTGTTCAAATTATGGTTAAGCATATGTTATTAATAACTTCAGTCTTAGATAGACGGTTTT 55833233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8933 TTGTTCAAATTATGGTTAAGCATATGTTATTAATAACTTCAGTCTTAGATAGACGGTTTT 8992

 55833234 GAATTTATCATTATGTATGTTAGCCTTAACTTTTAGTTTTATGATGACATTTTTATTGAT 55833293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8993 GAATTTATCATTATGTATGTTAGCCTTAACTTTTAGTTTTATGATGACATTTTTATTGAT 9052

 55833294 TTTCCTCTGATTTAAATTGTATTATCCTTTAACCATTTGCTACCCTAAAAGAGGAGAAAC 55833353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9053 TTTCCTCTGATTTAAATTGTATTATCCTTTAACCATTTGCTACCCTAAAAGAGGAGAAAC 9112

 55833354 AAATTCCATTCTGATCAAGTAATAGCTAGTT 55833384
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     9113 AAATTCCATTCTGATCAAGTAATAGCTAGTT 9143

Alignment time is 21.4936 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    6392] =>      6392 nucs 'mol-32-3101-088419_6392'

Score:        6346
Aligned:      6390        nucs
Identic:      6386 (100%) nucs =>      1511 (100%)      4875 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55845014,55846524] EXCISED REGION [55846528,55851406]
 second seq =>  [       1,    1511] EXCISED REGION [    1515,    6392]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [1512,1514]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [1512,1512] to [1514,1514]

 55845014 CACTTCAAATTTTTTTCCAAGCAGCACAGTTATTCTAATGTTATTTGATAAATAGGCTAA 55845073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACTTCAAATTTTTTTCCAAGCAGCACAGTTATTCTAATGTTATTTGATAAATAGGCTAA 60

 55845074 TAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGTAACTGTAATTTTTTTAGTT 55845133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGTAACTGTAATTTTTTTAGTT 120

 55845134 CTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCACGGTTTTCATACTACGGTA 55845193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCACGGTTTTCATACTACGGTA 180

 55845194 TCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTGTATTTTGTTGAAAGCCTCC 55845253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTGTATTTTGTTGAAAGCCTCC 240

 55845254 TCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTCATGTTTATTTATTCTGA 55845313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTCATGTTTATTTATTCTGA 300

 55845314 TAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTATTAGAACTGGTTCTGC 55845373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTATTAGAACTGGTTCTGC 360

 55845374 AATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTTTGCTCAATTTTATTTT 55845433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTTTGCTCAATTTTATTTT 420

 55845434 AACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAATAAGTAGAACAAC 55845493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAATAAGTAGAACAAC 480

 55845494 AAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGACCCCTAGATCTT 55845553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGACCCCTAGATCTT 540

 55845554 TTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGCTTTTCAAACCAC 55845613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGCTTTTCAAACCAC 600

 55845614 CAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAAAGCCCAAAGTTT 55845673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAAAGCCCAAAGTTT 660

 55845674 CCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCATTTTAAACTCTGA 55845733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCATTTTAAACTCTGA 720

 55845734 AATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTATAATACTTAGAG 55845793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTATAATACTTAGAG 780

 55845794 AATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATTATAGTCTGCCTG 55845853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATTATAGTCTGCCTG 840

 55845854 CCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTATGAATGAGAATT 55845913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTATGAATGAGAATT 900

 55845914 CCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGACAGGACTC 55845973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGACAGGACTC 960

 55845974 AGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATTTGTAGTCT 55846033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATTTGTAGTCT 1020

 55846034 CGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATGAGCTATTG 55846093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATGAGCTATTG 1080

 55846094 CTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGCCTCTTCCA 55846153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGCCTCTTCCA 1140

 55846154 GCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATGCAATAGGG 55846213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATGCAATAGGG 1200

 55846214 CTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCCCTGTGTAG 55846273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCCCTGTGTAG 1260

 55846274 TTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGCACAGGGCA 55846333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGCACAGGGCA 1320

 55846334 GACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATTTTATTGTG 55846393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATTTTATTGTG 1380

 55846394 CAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTCTTCCTTAT 55846453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTCTTCCTTAT 1440

 55846454 GTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTTTTAAAACA 55846513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTTTTAAAACA 1500

 55846514 CAGAGAGAAAG 55846524
          |||||||||||
     1501 CAGAGAGAAAG 1511

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 1574

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 1634

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 1694

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 1754

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 1814

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 1874

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 1934

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 1994

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 2054

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 2114

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 2174

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 2234

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 2294

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 2354

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 2414

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 2474

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 2534

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 2594

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 2654

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTG 55847727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2655 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTG 2713

 55847728 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 55847787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 2773

 55847788 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 55847847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2774 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 2833

 55847848 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 55847907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 2893

 55847908 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 55847967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2894 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 2953

 55847968 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 55848027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 3013

 55848028 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 55848087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 3073

 55848088 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAAC 55848147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3074 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAAC 3133

 55848148 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 55848207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3134 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 3193

 55848208 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 55848267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 3253

 55848268 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 55848327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3254 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 3313

 55848328 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 55848387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3314 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 3373

 55848388 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 55848447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3374 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 3433

 55848448 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 55848507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 3493

 55848508 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 55848567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3494 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 3553

 55848568 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 55848627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3554 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 3613

 55848628 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 55848687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3614 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 3673

 55848688 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 55848747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 3733

 55848748 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 55848807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3734 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 3793

 55848808 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 55848867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3794 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 3853

 55848868 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 55848927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3854 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 3913

 55848928 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 55848987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3914 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 3973

 55848988 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 55849047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3974 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 4033

 55849048 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 55849107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4034 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 4093

 55849108 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 55849167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4094 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 4153

 55849168 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 55849227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4154 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 4213

 55849228 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 55849287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4214 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 4273

 55849288 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 55849347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4274 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 4333

 55849348 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 55849407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4334 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 4393

 55849408 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 55849467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 4453

 55849468 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 55849527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4454 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 4513

 55849528 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 55849587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 4573

 55849588 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 55849647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4574 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 4633

 55849648 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCA 55849707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCA 4693

 55849708 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 55849767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 4753

 55849768 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 55849827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4754 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 4813

 55849828 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 55849887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 4873

 55849888 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 55849947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 4933

 55849948 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 55850007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 4993

 55850008 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 55850067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 5053

 55850068 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 55850127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 5113

 55850128 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 55850187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 5173

 55850188 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATT 55850247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATT 5233

 55850248 TGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACA 55850307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 TGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACA 5293

 55850308 GTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGAT 55850367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 GTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGAT 5353

 55850368 GTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGC 55850427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 GTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGC 5413

 55850428 AGAAAACTGCATAGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAG 55850487
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 AGAAAACTGCATGGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAG 5473

 55850488 TTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAG 55850547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 TTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAG 5533

 55850548 CCTCCAACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAA 55850607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 CCTCCAACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAA 5593

 55850608 GGAACGCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGA 55850667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 GGAACGCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGA 5653

 55850668 GCCTATATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAA 55850727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 GCCTATATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAA 5713

 55850728 ATTTCTCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTA 55850787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 ATTTCTCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTA 5773

 55850788 TTGACCTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATC 55850847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 TTGACCTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATC 5833

 55850848 TATCCCTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTT 55850907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 TATCCCTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTT 5893

 55850908 GAGCTGTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGA 55850967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5894 GAGCTGTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGA 5953

 55850968 TTAATGCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAACTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTT 55851027
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     5954 TTAATGCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAGCTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTT 6013

 55851028 TTTCAAACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTG 55851087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6014 TTTCAAACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTG 6073

 55851088 CATATCAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCT 55851147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6074 CATATCAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCT 6133

 55851148 CTGACTTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTT 55851207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6134 CTGACTTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTT 6193

 55851208 CTGTGAGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGTATGGAGGGCATGCTTTAAAAGAGCA 55851267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6194 CTGTGAGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGTATGGAGGGCATGCTTTAAAAGAGCA 6253

 55851268 AAGTTACCACCCTATGAAACAAAATATGGGGTGATAACACCTGTAGTAATAAGAAAATGT 55851327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6254 AAGTTACCACCCTATGAAACAAAATATGGGGTGATAACACCTGTAGTAATAAGAAAATGT 6313

 55851328 TTTTGCATTAGCACATGCCATTCCACCTTATGAGACACAGGACATCCTCAGACTAACAGC 55851387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6314 TTTTGCATTAGCACATGCCATTCCACCTTATGAGACACAGGACATCCTCAGACTAACAGC 6373

 55851388 CTCTCTGTATCTTAAACTA 55851406
          |||||||||||||||||||
     6374 CTCTCTGTATCTTAAACTA 6392

Alignment time is 15.6167 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4309] =>      4309 nucs 'mol-32-310c-083040_4309'

Score:        4244
Aligned:      4310        nucs
Identic:      4304 (100%) nucs =>      2477 (100%)      1827 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55821975,55824451] EXCISED REGION [55824453,55826285]
 second seq =>  [       1,    2477] EXCISED REGION [    2479,    4309]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55824452,55824452]
 second seq =>         1 nucs [2478,2478]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [55824940,55824940]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55824452,55824452] to [55824453,55824453]
 second seq =>         1 nucs [2477,2477] to [2478,2478]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55821975 CAGCTGGGCTGAGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTT 55822034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGCTGGGCTGAGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTT 60

 55822035 TGCCTCACGCCGATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCA 55822094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCCTCACGCCGATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCA 120

 55822095 GAGAGTTAAATAGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGA 55822154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAGTTAAATAGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGA 180

 55822155 GGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGG 55822214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGG 240

 55822215 CAGGCAGGAACAGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATT 55822274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGGCAGGAACAGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATT 300

 55822275 TGCATAGGGCCCAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAA 55822334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCATAGGGCCCAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAA 360

 55822335 TTGGCCCTCTCACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATA 55822394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGGCCCTCTCACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATA 420

 55822395 TGTGGGGTTATCTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGG 55822454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGGGGTTATCTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGG 480

 55822455 CGGAATCGCCGTATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTT 55822514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CGGAATCGCCGTATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTT 540

 55822515 GCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTT 55822574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTT 600

 55822575 AAAAGAAAAAAAAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAAT 55822634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAGAAAAAAAAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAAT 660

 55822635 TTCTTAATAATTCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGT 55822694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTTAATAATTCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGT 720

 55822695 CTCAGACATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAG 55822754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCAGACATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAG 780

 55822755 TGTACTGATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGG 55822814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTACTGATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGG 840

 55822815 AAATTGATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAAT 55822874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATTGATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAAT 900

 55822875 GGAAAATGATGTCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTG 55822934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGAAAATGATGTCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTG 960

 55822935 TTGACAATCCATGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAAT 55822994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGACAATCCATGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAAT 1020

 55822995 AGTTTGGCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCA 55823054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTTTGGCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCA 1080

 55823055 CAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTC 55823114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTC 1140

 55823115 TGAAATCAGCTGAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCA 55823174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAAATCAGCTGAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCA 1200

 55823175 GAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGG 55823234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGG 1260

 55823235 AGAGATCCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGC 55823294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAGATCCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGC 1320

 55823295 TGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTC 55823354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTC 1380

 55823355 ATGTAACTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTC 55823414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGTAACTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTC 1440

 55823415 TCTAAAAATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTA 55823474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTAAAAATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTA 1500

 55823475 GAGAAAGACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACA 55823534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAGAAAGACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACA 1560

 55823535 AGGGGCACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCA 55823594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGGGCACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCA 1620

 55823595 AATAGGAAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAA 55823654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATAGGAAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAA 1680

 55823655 AGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCA 55823714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCA 1740

 55823715 CCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTA 55823774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTA 1800

 55823775 ATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAA 55823834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAA 1860

 55823835 ACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATAC 55823894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATAC 1920

 55823895 TCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGG 55823954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGG 1980

 55823955 ACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTT 55824014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTT 2040

 55824015 TATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTG 55824074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTG 2100

 55824075 CATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACT 55824134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACT 2160

 55824135 GAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTC 55824194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTC 2220

 55824195 ATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTG 55824254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTG 2280

 55824255 TTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTT 55824314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTT 2340

 55824315 ATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTA 55824374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTA 2400

 55824375 TTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAA 55824434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAA 2460

 55824435 GGCTGAAGTCTGCCTTC 55824451
          |||||||||||||||||
     2461 GGCTGAAGTCTGCCTTC 2477

EXCISED REGION

 55824453 TACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGC 55824512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 TACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGC 2538

 55824513 TAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTG 55824572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 TAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTG 2598

 55824573 ACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTT 55824632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 ACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTT 2658

 55824633 AAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGC 55824692
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2659 AAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGC 2718

 55824693 ACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGC 55824752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 ACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGC 2778

 55824753 AACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCAC 55824812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 AACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCAC 2838

 55824813 ACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTG 55824872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 ACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTG 2898

 55824873 GAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACC 55824932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 GAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACC 2958

 55824933 CTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTC 55824992
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 CTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTC 3017

 55824993 TCACAAGTAAGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTG 55825052
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3018 TCACAAGTAAGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTG 3077

 55825053 ACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTAT 55825112
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3078 ACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTAT 3137

 55825113 CATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGG 55825172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3138 CATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGG 3197

 55825173 ACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAAT 55825232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3198 ACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAAT 3257

 55825233 CCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATT 55825292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3258 CCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATT 3317

 55825293 ATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGT 55825352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3318 ATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGT 3377

 55825353 TTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCA 55825412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3378 TTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCA 3437

 55825413 TTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAG 55825472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3438 TTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAG 3497

 55825473 GCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAA 55825532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3498 GCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAA 3557

 55825533 ATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCT 55825592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3558 ATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCT 3617

 55825593 AAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTT 55825652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3618 AAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTT 3677

 55825653 TCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGA 55825712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3678 TCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGA 3737

 55825713 ACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACT 55825772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3738 ACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACT 3797

 55825773 TTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACA 55825832
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3798 TTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACA 3857

 55825833 ACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTAC 55825892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3858 ACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTAC 3917

 55825893 TGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAAT 55825952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3918 TGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAAT 3977

 55825953 GAAATGATCTACTTTTATAATATATATAAAATTATATTATTTTTGTAATATATATAAAAA 55826012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3978 GAAATGATCTACTTTTATAATATATATAAAATTATATTATTTTTGTAATATATATAAAAA 4037

 55826013 ATATGATTTTATATATAAAAAGATCTATTTTTATAATATATATAAAAATAGATTATTTTA 55826072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     4038 ATATGATTTTATATATAAAAAGATCTATTTTTATAATATATAT-AAAATAGATTATTTTA 4096

 55826073 TCACATGATATATAAAATAGATGGTTTTGTCCTCTCTCATATAATTCGTACTTACACAGG 55826132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 TCACATGATATATAAAATAGATGGTTTTGTCCTCTCTCATATAATTCGTACTTACACAGG 4156

 55826133 CTCTATAATTCTTCTAGGCTGTAAAATATCCTTTGTAGAAAGAGCTAAATATTAGTACAT 55826192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 CTCTATAATTCTTCTAGGCTGTAAAATATCCTTTGTAGAAAGAGCTAAATATTAGTACAT 4216

 55826193 GGAAATATTTTCAGCTCCTTATTAAAATATGAGACTGCTGAAAAACAATAATTAGACTTC 55826252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 GGAAATATTTTCAGCTCCTTATTAAAATATGAGACTGCTGAAAAACAATAATTAGACTTC 4276

 55826253 AATATTTAGGAGCTTTTGCATACTTTAAATGCT 55826285
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 AATATTTAGGAGCTTTTGCATACTTTAAATGCT 4309

Alignment time is 10.4509 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5485] =>      5485 nucs 'mol-32-310c-179216_5485'

Score:        5420
Aligned:      5486        nucs
Identic:      5480 (100%) nucs =>      3425 (100%)      2055 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55821027,55824451] EXCISED REGION [55824453,55826513]
 second seq =>  [       1,    3425] EXCISED REGION [    3427,    5485]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55824452,55824452]
 second seq =>         1 nucs [3426,3426]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [55824940,55824940]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55824452,55824452] to [55824453,55824453]
 second seq =>         1 nucs [3425,3425] to [3426,3426]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55821027 GTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAA 55821086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAA 60

 55821087 AAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGG 55821146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGG 120

 55821147 AAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGT 55821206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGT 180

 55821207 AAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGG 55821266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGG 240

 55821267 AGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAA 55821326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAA 300

 55821327 AATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGA 55821386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGA 360

 55821387 ATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGG 55821446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGG 420

 55821447 GTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAG 55821506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAG 480

 55821507 TTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTA 55821566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTA 540

 55821567 AGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATA 55821626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATA 600

 55821627 ACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGA 55821686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGA 660

 55821687 ATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTT 55821746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTT 720

 55821747 TTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTAT 55821806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTAT 780

 55821807 TATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAG 55821866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAG 840

 55821867 GCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTG 55821926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTG 900

 55821927 CTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGA 55821986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGA 960

 55821987 GCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCG 55822046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCG 1020

 55822047 ATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATA 55822106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATA 1080

 55822107 GGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAG 55822166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAG 1140

 55822167 CCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACA 55822226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACA 1200

 55822227 GGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCC 55822286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCC 1260

 55822287 AGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCA 55822346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCA 1320

 55822347 CCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATC 55822406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATC 1380

 55822407 TGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGT 55822466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGT 1440

 55822467 ATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCC 55822526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCC 1500

 55822527 CTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAA 55822586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAA 1560

 55822587 AAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATT 55822646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATT 1620

 55822647 CCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGA 55822706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGA 1680

 55822707 AGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGAT 55822766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGAT 1740

 55822767 GGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAG 55822826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAG 1800

 55822827 ATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGT 55822886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGT 1860

 55822887 CTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCAT 55822946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCAT 1920

 55822947 GCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAAT 55823006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAAT 1980

 55823007 GTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTC 55823066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTC 2040

 55823067 AGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTG 55823126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTG 2100

 55823127 AATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGG 55823186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGG 2160

 55823187 CTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACT 55823246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACT 2220

 55823247 GAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAG 55823306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAG 2280

 55823307 CTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGT 55823366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGT 2340

 55823367 TAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTT 55823426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTT 2400

 55823427 AAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCT 55823486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCT 2460

 55823487 TTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAAT 55823546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAAT 2520

 55823547 GATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAA 55823606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAA 2580

 55823607 TGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATA 55823666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATA 2640

 55823667 CCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAAT 55823726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAAT 2700

 55823727 GACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAG 55823786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAG 2760

 55823787 TGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGA 55823846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGA 2820

 55823847 ATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCA 55823906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCA 2880

 55823907 CAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCT 55823966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCT 2940

 55823967 TTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATT 55824026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATT 3000

 55824027 AATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAAT 55824086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAAT 3060

 55824087 TTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGT 55824146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGT 3120

 55824147 CCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATT 55824206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATT 3180

 55824207 AAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATAT 55824266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATAT 3240

 55824267 ATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTT 55824326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTT 3300

 55824327 GTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAG 55824386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAG 3360

 55824387 AAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTG 55824446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTG 3420

 55824447 CCTTC 55824451
          |||||
     3421 CCTTC 3425

EXCISED REGION

 55824453 TACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGC 55824512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 TACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGC 3486

 55824513 TAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTG 55824572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 TAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTG 3546

 55824573 ACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTT 55824632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 ACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTT 3606

 55824633 AAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGC 55824692
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3607 AAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGC 3666

 55824693 ACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGC 55824752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 ACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGC 3726

 55824753 AACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCAC 55824812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 AACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCAC 3786

 55824813 ACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTG 55824872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 ACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTG 3846

 55824873 GAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACC 55824932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 GAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACC 3906

 55824933 CTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTC 55824992
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 CTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTC 3965

 55824993 TCACAAGTAAGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTG 55825052
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 TCACAAGTAAGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTG 4025

 55825053 ACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTAT 55825112
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4026 ACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTAT 4085

 55825113 CATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGG 55825172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 CATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGG 4145

 55825173 ACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAAT 55825232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 ACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAAT 4205

 55825233 CCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATT 55825292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 CCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATT 4265

 55825293 ATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGT 55825352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 ATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGT 4325

 55825353 TTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCA 55825412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 TTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCA 4385

 55825413 TTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAG 55825472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4386 TTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAG 4445

 55825473 GCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAA 55825532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4446 GCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAA 4505

 55825533 ATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCT 55825592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4506 ATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCT 4565

 55825593 AAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTT 55825652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4566 AAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTT 4625

 55825653 TCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGA 55825712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4626 TCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGA 4685

 55825713 ACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACT 55825772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4686 ACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACT 4745

 55825773 TTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACA 55825832
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4746 TTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACA 4805

 55825833 ACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTAC 55825892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4806 ACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTAC 4865

 55825893 TGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAAT 55825952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4866 TGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAAT 4925

 55825953 GAAATGATCTACTTTTATAATATATATAAAATTATATTATTTTTGTAATATATATAAAAA 55826012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4926 GAAATGATCTACTTTTATAATATATATAAAATTATATTATTTTTGTAATATATATAAAAA 4985

 55826013 ATATGATTTTATATATAAAAAGATCTATTTTTATAATATATATAAAAATAGATTATTTTA 55826072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     4986 ATATGATTTTATATATAAAAAGATCTATTTTTATAATATATAT-AAAATAGATTATTTTA 5044

 55826073 TCACATGATATATAAAATAGATGGTTTTGTCCTCTCTCATATAATTCGTACTTACACAGG 55826132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5045 TCACATGATATATAAAATAGATGGTTTTGTCCTCTCTCATATAATTCGTACTTACACAGG 5104

 55826133 CTCTATAATTCTTCTAGGCTGTAAAATATCCTTTGTAGAAAGAGCTAAATATTAGTACAT 55826192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 CTCTATAATTCTTCTAGGCTGTAAAATATCCTTTGTAGAAAGAGCTAAATATTAGTACAT 5164

 55826193 GGAAATATTTTCAGCTCCTTATTAAAATATGAGACTGCTGAAAAACAATAATTAGACTTC 55826252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5165 GGAAATATTTTCAGCTCCTTATTAAAATATGAGACTGCTGAAAAACAATAATTAGACTTC 5224

 55826253 AATATTTAGGAGCTTTTGCATACTTTAAATGCTATGGTTTATTTTTAATATTTTCAAGAT 55826312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5225 AATATTTAGGAGCTTTTGCATACTTTAAATGCTATGGTTTATTTTTAATATTTTCAAGAT 5284

 55826313 TTTATTTTTGAAGATCATAAACCTTAATTATAATTGCAAATAATAAAAAAAGCAGTGGCC 55826372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5285 TTTATTTTTGAAGATCATAAACCTTAATTATAATTGCAAATAATAAAAAAAGCAGTGGCC 5344

 55826373 AGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCATATCAT 55826432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5345 AGGCATGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCATATCAT 5404

 55826433 CTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAAACCCGTCTCTACTCAAA 55826492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5405 CTGAGGTCAGGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAAACCCGTCTCTACTCAAA 5464

 55826493 ATACAAAATGAGCTGGGTGTA 55826513
          |||||||||||||||||||||
     5465 ATACAAAATGAGCTGGGTGTA 5485

Alignment time is 13.3422 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    7946] =>      7946 nucs 'mol-32-3143-144094_7946'

Score:        7846
Aligned:      7945        nucs
Identic:      7936 (100%) nucs =>      6005 (100%)      1931 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55819946,55825957] EXCISED REGION [55846713,55848645]
 second seq =>  [       1,    6011] EXCISED REGION [    6015,    7946]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [6012,6014]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [6011,6011] to [6014,6014]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55819946 CTGTAGTCATCCCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAA 55820005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTAGTCATCCCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAA 60

 55820006 TTTTCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACT 55820065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACT 120

 55820066 GATATCTTGACAGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGG 55820125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATATCTTGACAGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGG 180

 55820126 TGAAGAAAGTAGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTA 55820185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAAGAAAGTAGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTA 240

 55820186 TGTTTTCTTCTTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAG 55820245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTTTCTTCTTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAG 300

 55820246 GCACATGATCTGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAA 55820305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCACATGATCTGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAA 360

 55820306 GTTACAAACAGAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAA 55820365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTACAAACAGAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAA 420

 55820366 GGCAGAAAATTTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAAC 55820425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCAGAAAATTTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAAC 480

 55820426 ACTTAGGTAATGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGA 55820485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTTAGGTAATGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGA 540

 55820486 GCTTTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAG 55820545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTTTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAG 600

 55820546 TTGGAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGG 55820605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGGAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGG 660

 55820606 CAATTGAGACTTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACA 55820665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAATTGAGACTTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACA 720

 55820666 AAGGGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAG 55820725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGGGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAG 780

 55820726 ACAGTCCACATGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTT 55820785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAGTCCACATGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTT 840

 55820786 CTGCTCTTTCAAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTT 55820845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGCTCTTTCAAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTT 900

 55820846 TGTTTATAAGTATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGG 55820905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTTTATAAGTATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGG 960

 55820906 ATTTCTAGGCACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTA 55820965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTCTAGGCACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTA 1020

 55820966 GGCATTTTTATTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCA 55821025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGCATTTTTATTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCA 1080

 55821026 AGTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAA 55821085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAA 1140

 55821086 AAAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGG 55821145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGG 1200

 55821146 GAAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTG 55821205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTG 1260

 55821206 TAAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATG 55821265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATG 1320

 55821266 GAGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTA 55821325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTA 1380

 55821326 AAATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTG 55821385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTG 1440

 55821386 AATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTG 55821445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTG 1500

 55821446 GGTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAA 55821505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAA 1560

 55821506 GTTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTT 55821565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1561 GTTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAATTATTTCTT 1620

 55821566 AAGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAAT 55821625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAAT 1680

 55821626 AACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGG 55821685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGG 1740

 55821686 AATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATT 55821745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATT 1800

 55821746 TTTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTA 55821805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTA 1860

 55821806 TTATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAA 55821865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAA 1920

 55821866 GGCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTT 55821925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTT 1980

 55821926 GCTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTG 55821985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTG 2040

 55821986 AGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCC 55822045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCC 2100

 55822046 GATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAAT 55822105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAAT 2160

 55822106 AGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAA 55822165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAA 2220

 55822166 GCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAAC 55822225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAAC 2280

 55822226 AGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCC 55822285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCC 2340

 55822286 CAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTC 55822345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTC 2400

 55822346 ACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTAT 55822405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTAT 2460

 55822406 CTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCG 55822465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCG 2520

 55822466 TATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGC 55822525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGC 2580

 55822526 CCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAA 55822585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAA 2640

 55822586 AAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAAT 55822645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAAT 2700

 55822646 TCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAG 55822705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAG 2760

 55822706 AAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGA 55822765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGA 2820

 55822766 TGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGA 55822825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGA 2880

 55822826 GATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATG 55822885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATG 2940

 55822886 TCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCA 55822945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCA 3000

 55822946 TGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAA 55823005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAA 3060

 55823006 TGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCT 55823065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCT 3120

 55823066 CAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCT 55823125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCT 3180

 55823126 GAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAG 55823185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAG 3240

 55823186 GCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTAC 55823245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTAC 3300

 55823246 TGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACA 55823305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACA 3360

 55823306 GCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGG 55823365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGG 3420

 55823366 TTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTT 55823425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTT 3480

 55823426 TAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCC 55823485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCC 3540

 55823486 TTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAA 55823545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAA 3600

 55823546 TGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCA 55823605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCA 3660

 55823606 ATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAAT 55823665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAAT 3720

 55823666 ACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAA 55823725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAA 3780

 55823726 TGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAA 55823785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAA 3840

 55823786 GTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATG 55823845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATG 3900

 55823846 AATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGC 55823905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGC 3960

 55823906 ACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACC 55823965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACC 4020

 55823966 TTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAAT 55824025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAAT 4080

 55824026 TAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAA 55824085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAA 4140

 55824086 TTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTG 55824145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTG 4200

 55824146 TCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCAT 55824205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCAT 4260

 55824206 TAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATA 55824265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATA 4320

 55824266 TATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTT 55824325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTT 4380

 55824326 TGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCA 55824385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCA 4440

 55824386 GAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCT 55824445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCT 4500

 55824446 GCCTTCTTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACA 55824505
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GCCTTCCTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACA 4560

 55824506 GCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAA 55824565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAA 4620

 55824566 GATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTA 55824625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTA 4680

 55824626 TTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAA 55824685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4681 TTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAA 4740

 55824686 TCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAA 55824745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAA 4800

 55824746 CCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGT 55824805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGT 4860

 55824806 GATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTG 55824865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTG 4920

 55824866 GGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAG 55824925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAG 4980

 55824926 CAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTT 55824985
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAA-TTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTT 5039

 55824986 AAGAGTCTCACAAGTAAGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAA 55825045
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 AAGAGTCTCACAAGTAAGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAA 5099

 55825046 ACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCA 55825105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     5100 ACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCA 5159

 55825106 CTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGC 55825165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 CTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGC 5219

 55825166 TTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCA 55825225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 TTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCA 5279

 55825226 AAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGA 55825285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 AAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGA 5339

 55825286 TTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTC 55825345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 TTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTC 5399

 55825346 TTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTA 55825405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 TTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTA 5459

 55825406 ATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGAT 55825465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 ATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGAT 5519

 55825466 ATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGA 55825525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 ATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGA 5579

 55825526 GGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCA 55825585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 GGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCA 5639

 55825586 CGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGAC 55825645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 CGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGAC 5699

 55825646 ACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAA 55825705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 ACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAA 5759

 55825706 CAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGT 55825765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 CAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGT 5819

 55825766 TTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTA 55825825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     5820 TTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTA 5879

 55825826 TTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACA 55825885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 TTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACA 5939

 55825886 GCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATT 55825945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 GCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATT 5999

 55825946 TCATAATGAAAT 55825957
          ||||||||||||
     6000 TCATAATGAAAT 6011

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6015 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 6074

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6075 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 6134

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6135 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 6194

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6195 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 6254

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6255 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 6314

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6315 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 6374

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6375 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 6434

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6435 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 6494

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6495 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 6554

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6555 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 6614

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6615 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 6674

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6675 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 6734

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6735 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 6794

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6795 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 6854

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6855 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 6914

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6915 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 6974

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 55847732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     6975 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 7033

 55847733 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 55847792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7034 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 7093

 55847793 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 55847852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7094 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 7153

 55847853 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 55847912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7154 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 7213

 55847913 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 55847972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7214 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 7273

 55847973 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 55848032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7274 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 7333

 55848033 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 55848092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7334 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 7393

 55848093 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 55848152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7394 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 7453

 55848153 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 55848212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7454 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 7513

 55848213 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 55848272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7514 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 7573

 55848273 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 55848332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7574 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 7633

 55848333 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 55848392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7634 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 7693

 55848393 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 55848452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7694 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 7753

 55848453 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 55848512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7754 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 7813

 55848513 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 55848572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7814 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 7873

 55848573 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 55848632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7874 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 7933

 55848633 GGTGGATCCCTTA 55848645
          |||||||||||||
     7934 GGTGGATCCCTTA 7946

Alignment time is 18.882 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    6128] =>      6128 nucs 'mol-32-314e-076059_6128'

Score:        6082
Aligned:      6126        nucs
Identic:      6122 (100%) nucs =>      1287 (100%)      4835 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55845238,55846524] EXCISED REGION [55846528,55851366]
 second seq =>  [       1,    1287] EXCISED REGION [    1291,    6128]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [1288,1290]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [1288,1288] to [1290,1290]

 55845238 TTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTCA 55845297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTCA 60

 55845298 TGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTA 55845357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTA 120

 55845358 TTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTT 55845417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTT 180

 55845418 TGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAG 55845477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAG 240

 55845478 GAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACA 55845537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACA 300

 55845538 AAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACA 55845597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACA 360

 55845598 GTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAA 55845657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAA 420

 55845658 CTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGT 55845717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGT 480

 55845718 TCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTA 55845777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTA 540

 55845778 TTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAA 55845837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAA 600

 55845838 TATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTC 55845897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTC 660

 55845898 TGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTG 55845957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTG 720

 55845958 TACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAAT 55846017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAAT 780

 55846018 AAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATT 55846077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATT 840

 55846078 ACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTC 55846137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTC 900

 55846138 ATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCAT 55846197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCAT 960

 55846198 GGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCAC 55846257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCAC 1020

 55846258 TGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAAT 55846317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAAT 1080

 55846318 GGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGG 55846377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGG 1140

 55846378 ACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTT 55846437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTT 1200

 55846438 TCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTG 55846497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTG 1260

 55846498 TATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 55846524
          |||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 1287

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1291 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 1350

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 1410

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 1470

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 1530

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 1590

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 1650

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 1710

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 1770

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 1830

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 1890

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 1950

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 2010

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 2070

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 2130

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 2190

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 2250

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 2310

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 2370

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 2430

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTG 55847727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2431 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTG 2489

 55847728 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 55847787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 2549

 55847788 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 55847847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 2609

 55847848 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 55847907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 2669

 55847908 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 55847967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 2729

 55847968 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 55848027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 2789

 55848028 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 55848087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 2849

 55848088 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAAC 55848147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2850 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAAC 2909

 55848148 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 55848207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 2969

 55848208 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 55848267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 3029

 55848268 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 55848327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 3089

 55848328 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 55848387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 3149

 55848388 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 55848447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 3209

 55848448 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 55848507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 3269

 55848508 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 55848567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 3329

 55848568 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 55848627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 3389

 55848628 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 55848687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 3449

 55848688 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 55848747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 3509

 55848748 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 55848807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 3569

 55848808 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 55848867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 3629

 55848868 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 55848927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 3689

 55848928 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 55848987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3690 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 3749

 55848988 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 55849047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 3809

 55849048 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 55849107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3810 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 3869

 55849108 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 55849167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3870 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 3929

 55849168 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 55849227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3930 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 3989

 55849228 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 55849287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3990 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 4049

 55849288 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 55849347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4050 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 4109

 55849348 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 55849407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4110 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 4169

 55849408 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 55849467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4170 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 4229

 55849468 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 55849527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4230 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 4289

 55849528 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 55849587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4290 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 4349

 55849588 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 55849647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4350 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 4409

 55849648 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCA 55849707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4410 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCA 4469

 55849708 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 55849767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4470 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 4529

 55849768 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 55849827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4530 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 4589

 55849828 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 55849887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4590 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 4649

 55849888 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 55849947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4650 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 4709

 55849948 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 55850007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4710 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 4769

 55850008 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 55850067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4770 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 4829

 55850068 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 55850127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4830 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 4889

 55850128 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 55850187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4890 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 4949

 55850188 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATT 55850247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4950 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATT 5009

 55850248 TGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACA 55850307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5010 TGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACA 5069

 55850308 GTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGAT 55850367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5070 GTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGAT 5129

 55850368 GTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGC 55850427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5130 GTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGC 5189

 55850428 AGAAAACTGCATAGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAG 55850487
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5190 AGAAAACTGCATGGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAG 5249

 55850488 TTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAG 55850547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5250 TTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAG 5309

 55850548 CCTCCAACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAA 55850607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5310 CCTCCAACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAA 5369

 55850608 GGAACGCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGA 55850667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5370 GGAACGCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGA 5429

 55850668 GCCTATATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAA 55850727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5430 GCCTATATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAA 5489

 55850728 ATTTCTCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTA 55850787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5490 ATTTCTCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTA 5549

 55850788 TTGACCTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATC 55850847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5550 TTGACCTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATC 5609

 55850848 TATCCCTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTT 55850907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5610 TATCCCTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTT 5669

 55850908 GAGCTGTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGA 55850967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5670 GAGCTGTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGA 5729

 55850968 TTAATGCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAACTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTT 55851027
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     5730 TTAATGCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAGCTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTT 5789

 55851028 TTTCAAACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTG 55851087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5790 TTTCAAACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTG 5849

 55851088 CATATCAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCT 55851147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5850 CATATCAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCT 5909

 55851148 CTGACTTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTT 55851207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5910 CTGACTTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTT 5969

 55851208 CTGTGAGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGTATGGAGGGCATGCTTTAAAAGAGCA 55851267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5970 CTGTGAGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGTATGGAGGGCATGCTTTAAAAGAGCA 6029

 55851268 AAGTTACCACCCTATGAAACAAAATATGGGGTGATAACACCTGTAGTAATAAGAAAATGT 55851327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6030 AAGTTACCACCCTATGAAACAAAATATGGGGTGATAACACCTGTAGTAATAAGAAAATGT 6089

 55851328 TTTTGCATTAGCACATGCCATTCCACCTTATGAGACACA 55851366
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6090 TTTTGCATTAGCACATGCCATTCCACCTTATGAGACACA 6128

Alignment time is 14.9655 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3558] =>      3558 nucs 'mol-32-317a-063499_3558'

Score:        3534
Aligned:      3556        nucs
Identic:      3554 (100%) nucs =>      1223 (100%)      2331 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55845302,55846524] EXCISED REGION [55846528,55848860]
 second seq =>  [       1,    1223] EXCISED REGION [    1227,    3558]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [1224,1226]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [1224,1224] to [1226,1226]

 55845302 TATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTATTAG 55845361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTATTAG 60

 55845362 AACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTTTGCT 55845421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTTTGCT 120

 55845422 CAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAAT 55845481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAAT 180

 55845482 AAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGA 55845541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGA 240

 55845542 CCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGC 55845601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGC 300

 55845602 TTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAA 55845661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAA 360

 55845662 AGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCAT 55845721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCAT 420

 55845722 TTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTA 55845781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTA 480

 55845782 TAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATT 55845841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATT 540

 55845842 ATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTA 55845901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTA 600

 55845902 TGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACA 55845961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACA 660

 55845962 TGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAAT 55846021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAAT 720

 55846022 GATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACAC 55846081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACAC 780

 55846082 TATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCT 55846141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCT 840

 55846142 GGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGC 55846201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGC 900

 55846202 AATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAA 55846261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAA 960

 55846262 GCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGT 55846321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGT 1020

 55846322 GTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAG 55846381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAG 1080

 55846382 AATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTC 55846441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTC 1140

 55846442 TTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATT 55846501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATT 1200

 55846502 GTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 55846524
          |||||||||||||||||||||||
     1201 GTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 1223

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 1286

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 1346

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 1406

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 1466

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 1526

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 1586

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 1646

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 1706

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 1766

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 1826

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 1886

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 1946

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 2006

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 2066

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 2126

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 2186

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 2246

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 2306

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 2366

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTG 55847727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2367 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTG 2425

 55847728 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 55847787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 2485

 55847788 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 55847847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 2545

 55847848 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 55847907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 2605

 55847908 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 55847967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 2665

 55847968 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 55848027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 2725

 55848028 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 55848087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 2785

 55848088 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAAC 55848147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2786 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAAC 2845

 55848148 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 55848207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 2905

 55848208 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 55848267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 2965

 55848268 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 55848327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 3025

 55848328 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 55848387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 3085

 55848388 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 55848447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 3145

 55848448 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 55848507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 3205

 55848508 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 55848567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 3265

 55848568 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 55848627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 3325

 55848628 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 55848687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 3385

 55848688 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 55848747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 3445

 55848748 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 55848807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 3505

 55848808 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGA 55848860
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGA 3558

Alignment time is 9.02841 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5549] =>      5549 nucs 'mol-32-317a-078812_5549'

Score:        5503
Aligned:      5547        nucs
Identic:      5543 (100%) nucs =>       454 (100%)      5089 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55846071,55846524] EXCISED REGION [55846528,55851620]
 second seq =>  [       1,     454] EXCISED REGION [     458,    5549]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [455,457]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [455,455] to [457,457]

 55846071 CTGCATTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCT 55846130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGCATTACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCT 60

 55846131 GCACTTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCC 55846190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCACTTCATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCC 120

 55846191 TTCCCATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACA 55846250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCCCATGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACA 180

 55846251 GATTCACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATT 55846310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATTCACTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATT 240

 55846311 ATGTAATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGG 55846370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTAATGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGG 300

 55846371 GCTGTGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGA 55846430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTGTGGACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGA 360

 55846431 ATTTTTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTA 55846490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTTTTTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTA 420

 55846491 TTACTTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 55846524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTACTTGTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 454

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      458 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 517

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      518 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 577

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      578 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 637

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      638 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 697

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      698 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 757

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      758 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 817

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      818 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 877

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 937

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      938 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 997

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 1057

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 1117

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 1177

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 1237

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 1297

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 1357

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 1417

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 1477

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 1537

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 1597

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTG 55847727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     1598 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTG 1656

 55847728 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 55847787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 1716

 55847788 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 55847847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 1776

 55847848 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 55847907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 1836

 55847908 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 55847967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 1896

 55847968 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 55848027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 1956

 55848028 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 55848087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 2016

 55848088 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAAC 55848147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2017 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAAC 2076

 55848148 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 55848207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 2136

 55848208 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 55848267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 2196

 55848268 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 55848327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 2256

 55848328 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 55848387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 2316

 55848388 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 55848447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 2376

 55848448 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 55848507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 2436

 55848508 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 55848567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 2496

 55848568 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 55848627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 2556

 55848628 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 55848687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 2616

 55848688 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 55848747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 2676

 55848748 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 55848807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 2736

 55848808 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 55848867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 2796

 55848868 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 55848927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 2856

 55848928 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 55848987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 2916

 55848988 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 55849047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 2976

 55849048 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 55849107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 3036

 55849108 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 55849167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 3096

 55849168 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 55849227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 3156

 55849228 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 55849287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 3216

 55849288 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 55849347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 3276

 55849348 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 55849407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 3336

 55849408 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 55849467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 3396

 55849468 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 55849527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 3456

 55849528 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 55849587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 3516

 55849588 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 55849647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 3576

 55849648 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCA 55849707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCA 3636

 55849708 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 55849767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 3696

 55849768 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 55849827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 3756

 55849828 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 55849887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 3816

 55849888 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 55849947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 3876

 55849948 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 55850007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 3936

 55850008 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 55850067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 3996

 55850068 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 55850127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 4056

 55850128 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 55850187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 4116

 55850188 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATT 55850247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATT 4176

 55850248 TGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACA 55850307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 TGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACA 4236

 55850308 GTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGAT 55850367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 GTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGAT 4296

 55850368 GTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGC 55850427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 GTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGC 4356

 55850428 AGAAAACTGCATAGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAG 55850487
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 AGAAAACTGCATGGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAG 4416

 55850488 TTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAG 55850547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 TTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAG 4476

 55850548 CCTCCAACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAA 55850607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 CCTCCAACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAA 4536

 55850608 GGAACGCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGA 55850667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 GGAACGCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGA 4596

 55850668 GCCTATATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAA 55850727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 GCCTATATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAA 4656

 55850728 ATTTCTCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTA 55850787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 ATTTCTCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTA 4716

 55850788 TTGACCTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATC 55850847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 TTGACCTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATC 4776

 55850848 TATCCCTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTT 55850907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 TATCCCTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTT 4836

 55850908 GAGCTGTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGA 55850967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 GAGCTGTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGA 4896

 55850968 TTAATGCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAACTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTT 55851027
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4897 TTAATGCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAGCTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTT 4956

 55851028 TTTCAAACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTG 55851087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 TTTCAAACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTG 5016

 55851088 CATATCAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCT 55851147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 CATATCAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCT 5076

 55851148 CTGACTTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTT 55851207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 CTGACTTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTT 5136

 55851208 CTGTGAGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGTATGGAGGGCATGCTTTAAAAGAGCA 55851267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 CTGTGAGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGTATGGAGGGCATGCTTTAAAAGAGCA 5196

 55851268 AAGTTACCACCCTATGAAACAAAATATGGGGTGATAACACCTGTAGTAATAAGAAAATGT 55851327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 AAGTTACCACCCTATGAAACAAAATATGGGGTGATAACACCTGTAGTAATAAGAAAATGT 5256

 55851328 TTTTGCATTAGCACATGCCATTCCACCTTATGAGACACAGGACATCCTCAGACTAACAGC 55851387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5257 TTTTGCATTAGCACATGCCATTCCACCTTATGAGACACAGGACATCCTCAGACTAACAGC 5316

 55851388 CTCTCTGTATCTTAAACTATCTCAAACACTAAGAGTTACCTCTTAGGATTCATGGAAATT 55851447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 CTCTCTGTATCTTAAACTATCTCAAACACTAAGAGTTACCTCTTAGGATTCATGGAAATT 5376

 55851448 AAAACACATTAAAGATGTTCATTGTGGTGAGTAACATATTCTGATTATCAGAGGCCATTA 55851507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5377 AAAACACATTAAAGATGTTCATTGTGGTGAGTAACATATTCTGATTATCAGAGGCCATTA 5436

 55851508 GAACAACTCTGCCTATAGCCAGTAACTTCCAAATTGACCTTCCACTAAAAATCACAAATT 55851567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5437 GAACAACTCTGCCTATAGCCAGTAACTTCCAAATTGACCTTCCACTAAAAATCACAAATT 5496

 55851568 TACACACACACACACATATACACACATATATATCTATATAAATACATATATAC 55851620
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 TACACACACACACACATATACACACATATATATCTATATAAATACATATATAC 5549

Alignment time is 13.3598 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    9709] =>      9709 nucs 'mol-32-322a-137270_9709'

Score:        9619
Aligned:      9709        nucs
Identic:      9700 (100%) nucs =>      6698 (100%)      3002 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55819253,55825957] EXCISED REGION [55846713,55849716]
 second seq =>  [       1,    6703] EXCISED REGION [    6707,    9709]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [6704,6706]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [6703,6703] to [6706,6706]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55819253 GCAATCACAACATTCAGCTTCCTTCATGAAGTCCAGAAGAGAACTGAACATATTGCCCAA 55819312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCAATCACAACATTCAGCTTCCTTCATGAAGTCCAGAAGAGAACTGAACATATTGCCCAA 60

 55819313 GTGCCCAGAGGGCCCTAAAATATAGATGTGTGTTCATTAGGCTAATTGGAGACAGGTAGA 55819372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGCCCAGAGGGCCCTAAAATATAGATGTGTGTTCATTAGGCTAATTGGAGACAGGTAGA 120

 55819373 CAAAAATCCTCCTTTGAAATTTGTCCTCATAGGCAATGGCATTATTCCCAGGCTTATCAA 55819432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAAAATCCTCCTTTGAAATTTGTCCTCATAGGCAATGGCATTATTCCCAGGCTTATCAA 180

 55819433 GTTCTTTCCCTTGGCAGATCTCTGTGGTCCATCTGCTGAACTTAAATGCTGAAATGGTCT 55819492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTCTTTCCCTTGGCAGATCTCTGTGGTCCATCTGCTGAACTTAAATGCTGAAATGGTCT 240

 55819493 CAATGTGAACATGCCTAATGGACATCTTTATTCTGAGTGGCTATACCAGCACAATCCATA 55819552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAATGTGAACATGCCTAATGGACATCTTTATTCTGAGTGGCTATACCAGCACAATCCATA 300

 55819553 AATCTGAGCTATTTCAGATTACAAATGGAATTGTTCTCCACAGTGTTCCATTGCCTTATA 55819612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATCTGAGCTATTTCAGATTACAAATGGAATTGTTCTCCACAGTGTTCCATTGCCTTATA 360

 55819613 GATAATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTCTAAGAGTTCAATTGATA 55819672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATAATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTCTAAGAGTTCAATTGATA 420

 55819673 TTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATATATCTGAACTCATTCAT 55819732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATATATCTGAACTCATTCAT 480

 55819733 TTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACTCCATCTACTTTGTGGTT 55819792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACTCCATCTACTTTGTGGTT 540

 55819793 TTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGTTTTCATTTTTCTTACAG 55819852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGTTTTCATTTTTCTTACAG 600

 55819853 TTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATCAAGCATTAAGTTTCTCGTGGCACACA 55819912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATCAAGCATTAAGTTTCTCGTGGCACACA 660

 55819913 CTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCATCCCAGTCTATGATTAGA 55819972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCATCCCAGTCTATGATTAGA 720

 55819973 TAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCC 55820032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCC 780

 55820033 ACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTGATATCTTGACAGGCCTGACACTTGTG 55820092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTGATATCTTGACAGGCCTGACACTTGTG 840

 55820093 TCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGTAGCATAAGTTATTATTA 55820152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGTAGCATAAGTTATTATTA 900

 55820153 GCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGTTTTCTTCTTTTCATCTATTGCTAC 55820212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGTTTTCTTCTTTTCATCTATTGCTAC 960

 55820213 TGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATCTGTGAAATATACTGCTT 55820272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATCTGTGAAATATACTGCTT 1020

 55820273 CTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACAGAACCAATCAGTATGAA 55820332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACAGAACCAATCAGTATGAA 1080

 55820333 ATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAATTTTAAATAATTATATAA 55820392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAATTTTAAATAATTATATAA 1140

 55820393 AATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAATGAGATTCATAATAATG 55820452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAATGAGATTCATAATAATG 1200

 55820453 TGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGG 55820512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGG 1260

 55820513 ATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAAT 55820572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAAT 1320

 55820573 CAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGACTTCACAAGGAATGACAG 55820632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGACTTCACAAGGAATGACAG 1380

 55820633 TCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACA 55820692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACA 1440

 55820693 GCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACATGTCACACAGTCAAATT 55820752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACATGTCACACAGTCAAATT 1500

 55820753 GGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTCAAAACAGATATTTGTTT 55820812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTCAAAACAGATATTTGTTT 1560

 55820813 ATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAGTATACTTAGGGCCAAAC 55820872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAGTATACTTAGGGCCAAAC 1620

 55820873 CTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGCACTAATGTTCAAATTGC 55820932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGCACTAATGTTCAAATTGC 1680

 55820933 CCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTATTCTAACACCTACTTTG 55820992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTATTCTAACACCTACTTTG 1740

 55820993 GTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTT 55821052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTT 1800

 55821053 CTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCA 55821112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCA 1860

 55821113 GGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGG 55821172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGG 1920

 55821173 ATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTTTAATATATAGCATTACA 55821232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTTTAATATATAGCATTACA 1980

 55821233 TATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTA 55821292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTA 2040

 55821293 AGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTACATGAATGTAGATCAGTC 55821352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTACATGAATGTAGATCAGTC 2100

 55821353 TGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTA 55821412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTA 2160

 55821413 CCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAA 55821472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAA 2220

 55821473 CAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATA 55821532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATA 2280

 55821533 AATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCATTCACACTTTATATAAT 55821592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCATTCACACTTTATATAAT 2340

 55821593 AAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAAC 55821652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAAC 2400

 55821653 GACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTG 55821712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTG 2460

 55821713 ACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGA 55821772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGA 2520

 55821773 CTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACATTTTATTTCTGCTCAGC 55821832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACATTTTATTTCTGCTCAGC 2580

 55821833 TAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAA 55821892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAA 2640

 55821893 GCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAG 55821952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAG 2700

 55821953 AAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGA 55822012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGA 2760

 55822013 CTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATAAAAGAATATGGGACACA 55822072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATAAAAGAATATGGGACACA 2820

 55822073 CATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCT 55822132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCT 2880

 55822133 CCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGG 55822192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGG 2940

 55822193 GGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGG 55822252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGG 3000

 55822253 CTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTC 55822312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTC 3060

 55822313 ATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCA 55822372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCA 3120

 55822373 GGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACA 55822432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACA 3180

 55822433 GGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGC 55822492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGC 3240

 55822493 CTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAA 55822552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAA 3300

 55822553 GAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATC 55822612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATC 3360

 55822613 CTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAG 55822672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAG 3420

 55822673 CAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAA 55822732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAA 3480

 55822733 TTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTA 55822792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTA 3540

 55822793 GGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTA 55822852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTA 3600

 55822853 CTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAA 55822912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAA 3660

 55822913 AAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGG 55822972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGG 3720

 55822973 ATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAA 55823032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAA 3780

 55823033 AGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATC 55823092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATC 3840

 55823093 CACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGA 55823152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGA 3900

 55823153 GGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATA 55823212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATA 3960

 55823213 GAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAG 55823272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAG 4020

 55823273 ACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAAC 55823332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 ACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAAC 4080

 55823333 CTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAG 55823392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAG 4140

 55823393 CCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCCATACAT 55823452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCCATACAT 4200

 55823453 TTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATA 55823512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATA 4260

 55823513 TAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCA 55823572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCA 4320

 55823573 TGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGG 55823632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGG 4380

 55823633 AAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCT 55823692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCT 4440

 55823693 GATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTA 55823752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTA 4500

 55823753 TTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTC 55823812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTC 4560

 55823813 ATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCC 55823872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCC 4620

 55823873 TGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAA 55823932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAA 4680

 55823933 AATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGT 55823992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGT 4740

 55823993 TCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAAT 55824052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAAT 4800

 55824053 AACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACA 55824112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACA 4860

 55824113 GTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTT 55824172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTT 4920

 55824173 TACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATAT 55824232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATAT 4980

 55824233 CGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCA 55824292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCA 5040

 55824293 GTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTT 55824352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTT 5100

 55824353 GTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTT 55824412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTT 5160

 55824413 GTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCTTACCATTTATTTTGTGCACC 55824472
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5161 GTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCCTACCATTTATTTTGTGCACC 5220

 55824473 TTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCA 55824532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCA 5280

 55824533 GTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAA 55824592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAA 5340

 55824593 ATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTA 55824652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 ATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTA 5400

 55824653 ACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAG 55824712
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAG 5460

 55824713 GCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCT 55824772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCT 5520

 55824773 CTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTT 55824832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 CTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTT 5580

 55824833 AGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGA 55824892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGA 5640

 55824893 TCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAA 55824952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAA 5700

 55824953 AAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGATGTAAAC 55825012
          |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     5701 A--TTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGCTGTAAAC 5758

 55825013 TTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTC 55825072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 TTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTC 5818

 55825073 TAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTT 55825132
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 TAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTT 5878

 55825133 CTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAA 55825192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 CTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAA 5938

 55825193 ATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCA 55825252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 ATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCA 5998

 55825253 TGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAG 55825312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 TGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAG 6058

 55825313 TCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAAC 55825372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 TCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAAC 6118

 55825373 AAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGAT 55825432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 AAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGAT 6178

 55825433 TCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAG 55825492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 TCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAG 6238

 55825493 GTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTG 55825552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 GTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTG 6298

 55825553 CCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGC 55825612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 CCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGC 6358

 55825613 ATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACA 55825672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 ATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACA 6418

 55825673 GTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCAC 55825732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 GTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCAC 6478

 55825733 ATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAA 55825792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 ATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAA 6538

 55825793 AGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATG 55825852
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 AGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATG 6598

 55825853 CTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGA 55825912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 CTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGA 6658

 55825913 GAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 55825957
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 GAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 6703

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6707 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 6766

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6767 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 6826

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6827 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 6886

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6887 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 6946

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6947 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 7006

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7007 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 7066

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7067 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 7126

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7127 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 7186

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7187 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 7246

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7247 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 7306

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7307 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 7366

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7367 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 7426

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7427 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 7486

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7487 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 7546

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7547 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 7606

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7607 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 7666

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 55847732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     7667 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 7725

 55847733 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 55847792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7726 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 7785

 55847793 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 55847852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7786 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 7845

 55847853 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 55847912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7846 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 7905

 55847913 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 55847972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7906 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 7965

 55847973 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 55848032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7966 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 8025

 55848033 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 55848092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8026 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 8085

 55848093 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 55848152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     8086 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 8145

 55848153 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 55848212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8146 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 8205

 55848213 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 55848272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8206 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 8265

 55848273 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 55848332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8266 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 8325

 55848333 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 55848392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8326 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 8385

 55848393 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 55848452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8386 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 8445

 55848453 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 55848512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8446 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 8505

 55848513 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 55848572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8506 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 8565

 55848573 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 55848632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8566 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 8625

 55848633 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 55848692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8626 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 8685

 55848693 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 55848752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8686 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 8745

 55848753 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 55848812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8746 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 8805

 55848813 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 55848872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8806 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 8865

 55848873 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 55848932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8866 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 8925

 55848933 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 55848992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8926 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 8985

 55848993 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 55849052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8986 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 9045

 55849053 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 55849112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9046 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 9105

 55849113 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 55849172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9106 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 9165

 55849173 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 55849232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9166 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 9225

 55849233 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 55849292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9226 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 9285

 55849293 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 55849352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9286 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 9345

 55849353 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 55849412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9346 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 9405

 55849413 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 55849472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9406 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 9465

 55849473 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 55849532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9466 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 9525

 55849533 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 55849592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9526 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 9585

 55849593 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 55849652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9586 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 9645

 55849653 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 55849712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9646 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 9705

 55849713 GAGA 55849716
          ||||
     9706 GAGA 9709

Alignment time is 23.0622 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3003] =>      3003 nucs 'mol-32-322a-137270_3003'

Score:        2992
Aligned:      3003        nucs
Identic:      3002 (100%) nucs =>       997 (100%)      2005 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55846713,55847709] EXCISED REGION [55847711,55849716]
 second seq =>  [       1,     997] EXCISED REGION [     998,    3003]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55847710,55847710]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [55848128,55848128]
 second seq =>         1 nucs [1415,1415]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 60

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 120

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 180

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 240

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 300

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 360

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 420

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 480

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 540

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 600

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 660

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 720

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 780

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 840

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 900

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 960

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA 55847709
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA 997

EXCISED REGION

 55847711 GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCT 55847770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCT 1057

 55847771 TCTTACAACTAAATTTGTAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTT 55847830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 TCTTACAACTAAATTTGTAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTT 1117

 55847831 TCATGGATTTATTATTGGTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTT 55847890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 TCATGGATTTATTATTGGTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTT 1177

 55847891 TCCTCTGGCATATACTGCAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACA 55847950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 TCCTCTGGCATATACTGCAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACA 1237

 55847951 CCCAGCTTGAACCATCAGCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGAC 55848010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 CCCAGCTTGAACCATCAGCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGAC 1297

 55848011 ACTGCTGTCTTTATGTAGATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATT 55848070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 ACTGCTGTCTTTATGTAGATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATT 1357

 55848071 TTAAAGTCCAAGAAAGGAACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAA 55848130
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1358 TTAAAGTCCAAGAAAGGAACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAA 1417

 55848131 GCACTCTCCAAAACAACGCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTG 55848190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 GCACTCTCCAAAACAACGCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTG 1477

 55848191 AAACTCCATTTGCTTCTCATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAG 55848250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 AAACTCCATTTGCTTCTCATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAG 1537

 55848251 CACAGTGCCCTAAATCCGATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGG 55848310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 CACAGTGCCCTAAATCCGATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGG 1597

 55848311 GACAGTCAACAATATGACTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATG 55848370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 GACAGTCAACAATATGACTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATG 1657

 55848371 TGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGG 55848430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGG 1717

 55848431 GTTCCCAGCTGCAGGAAGACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCA 55848490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 GTTCCCAGCTGCAGGAAGACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCA 1777

 55848491 GACAGCATAGCTTGAACCCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTG 55848550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 GACAGCATAGCTTGAACCCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTG 1837

 55848551 CTTCGTAATTTGGGAGGCACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAG 55848610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 CTTCGTAATTTGGGAGGCACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAG 1897

 55848611 AGCAGTAATTGTACGTCTCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATT 55848670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 AGCAGTAATTGTACGTCTCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATT 1957

 55848671 GTTCTACCAAGTCCTTAATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGG 55848730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 GTTCTACCAAGTCCTTAATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGG 2017

 55848731 CGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAG 55848790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 CGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAG 2077

 55848791 GAAGAAAATCCAAAATTCATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACA 55848850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 GAAGAAAATCCAAAATTCATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACA 2137

 55848851 GTCTTGATGAGCCATCTGTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGG 55848910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 GTCTTGATGAGCCATCTGTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGG 2197

 55848911 TGAGCAAGAGATACGTTTTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATG 55848970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TGAGCAAGAGATACGTTTTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATG 2257

 55848971 ATTCAAGGTATCCTAAAGGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTAT 55849030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 ATTCAAGGTATCCTAAAGGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTAT 2317

 55849031 TTGACTGTCTTGCTGTAGTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATA 55849090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 TTGACTGTCTTGCTGTAGTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATA 2377

 55849091 AGACGTGGGTTCCTGCCTAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTG 55849150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 AGACGTGGGTTCCTGCCTAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTG 2437

 55849151 ACTAGTGCTGTGATAGAATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTG 55849210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 ACTAGTGCTGTGATAGAATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTG 2497

 55849211 AAGAAATCAGAGATAGCTTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAA 55849270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 AAGAAATCAGAGATAGCTTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAA 2557

 55849271 AGGAGTAAGCATTATTGTAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGC 55849330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 AGGAGTAAGCATTATTGTAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGC 2617

 55849331 CAAGGAAGATAAAAGCCTCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACT 55849390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 CAAGGAAGATAAAAGCCTCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACT 2677

 55849391 AGAATGCAAGGTTTAATGTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGC 55849450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 AGAATGCAAGGTTTAATGTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGC 2737

 55849451 AGAGATGTTTATTTTGTTTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATT 55849510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 AGAGATGTTTATTTTGTTTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATT 2797

 55849511 TGATCCGTTAAGTTCAGAAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCT 55849570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 TGATCCGTTAAGTTCAGAAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCT 2857

 55849571 ATGAAGACACTACCCAAGACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAG 55849630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 ATGAAGACACTACCCAAGACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAG 2917

 55849631 TTCCACATGGCTGGCAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCA 55849690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 TTCCACATGGCTGGCAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCA 2977

 55849691 CATCTTACATGGCAGCAGGCAAGAGA 55849716
          ||||||||||||||||||||||||||
     2978 CATCTTACATGGCAGCAGGCAAGAGA 3003

Alignment time is 7.18006 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,   10832] =>     10832 nucs 'mol-32-3235-210212_10832'

Score:       10753
Aligned:     10830        nucs
Identic:     10823 (100%) nucs =>      8002 (100%)      2821 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55817951,55825957] EXCISED REGION [55846713,55849535]
 second seq =>  [       1,    8007] EXCISED REGION [    8011,   10832]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [8008,8010]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [8007,8007] to [8010,8010]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55817951 TGGAATGTATTAGGGGAAATAGATATGATAGAGGCACTATCAAAAAGTCCAGCTGTTGAG 55818010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGAATGTATTAGGGGAAATAGATATGATAGAGGCACTATCAAAAAGTCCAGCTGTTGAG 60

 55818011 GAGGTACAGCAATAGACCTTTGTTCCTGATACTTAATATTGTGTTAAGGGTGGGCGAGAC 55818070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGTACAGCAATAGACCTTTGTTCCTGATACTTAATATTGTGTTAAGGGTGGGCGAGAC 120

 55818071 GGAGGAAGGATTCAAGAATACCTCCTAGGTTTATGAGTTGGGAAGCCAGGATGATTGCAA 55818130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAGGAAGGATTCAAGAATACCTCCTAGGTTTATGAGTTGGGAAGCCAGGATGATTGCAA 180

 55818131 TGAAAATAACTGTCCTAGAAAACACAGAAAAAAGCAAAGATTTGGGAGCATGCCAGATAA 55818190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAAAATAACTGTCCTAGAAAACACAGAAAAAAGCAAAGATTTGGGAGCATGCCAGATAA 240

 55818191 AACGGGAATGATTTTAAAGGTCGTGTACAAATCTAAGATGCTATAGTTTATTTATGGAAA 55818250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACGGGAATGATTTTAAAGGTCGTGTACAAATCTAAGATGCTATAGTTTATTTATGGAAA 300

 55818251 CTACCTTCATCTGTGGCAGAGGCTATTTCAAAATACTCACATCTATTTAATGTCACTTAA 55818310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTACCTTCATCTGTGGCAGAGGCTATTTCAAAATACTCACATCTATTTAATGTCACTTAA 360

 55818311 TGAATCACGGAATTTTGCAGTGCTATGAAATCCCTTAAATCAAACTAACTAGCACACTTA 55818370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAATCACGGAATTTTGCAGTGCTATGAAATCCCTTAAATCAAACTAACTAGCACACTTA 420

 55818371 TGAAACCAGAGTACTATCTTACTATGCCAGAGTATTCTTTTCGTATTCTGCCATCTAGTG 55818430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAAACCAGAGTACTATCTTACTATGCCAGAGTATTCTTTTCGTATTCTGCCATCTAGTG 480

 55818431 AACAACAATCATTTGTACAACCTGGCTTGTAAATTGCTTCTTCCAAATTTAAAATAAACA 55818490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACAACAATCATTTGTACAACCTGGCTTGTAAATTGCTTCTTCCAAATTTAAAATAAACA 540

 55818491 CACACGCACACGCACACGCACCCCTTCATTTTATGCTTTCTCATTATATATACTGGCAAA 55818550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACACGCACACGCACACGCACCCCTTCATTTTATGCTTTCTCATTATATATACTGGCAAA 600

 55818551 ATATTCTTTCATGATATTTTACAAACAAAATTCCTAAACATAGAGGAAAGAATAGAGTTC 55818610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATATTCTTTCATGATATTTTACAAACAAAATTCCTAAACATAGAGGAAAGAATAGAGTTC 660

 55818611 ATCAGCTGAATCTGCACATTTCACCTTGGGCTCATTTTGAAATTTATATTTTTAAAGTCA 55818670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCAGCTGAATCTGCACATTTCACCTTGGGCTCATTTTGAAATTTATATTTTTAAAGTCA 720

 55818671 AGGGAAATTCACAAGTTTCCTTTACATTATGCCATCTCCTTTTATCATTAAAAACAACAA 55818730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGGAAATTCACAAGTTTCCTTTACATTATGCCATCTCCTTTTATCATTAAAAACAACAA 780

 55818731 AAACAAAACATTTACTTGTCAGCAACTTTCTTCTCTGTAATAAAATACCTTTATATAAAT 55818790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAACAAAACATTTACTTGTCAGCAACTTTCTTCTCTGTAATAAAATACCTTTATATAAAT 840

 55818791 TATCTTTCTCCTGCAATGAGCATTGTTTAATATTATCAAAAGTTTTTTATCTCAAAAATT 55818850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATCTTTCTCCTGCAATGAGCATTGTTTAATATTATCAAAAGTTTTTTATCTCAAAAATT 900

 55818851 ATTGTACATGATACACTAGAGATATTATTTGAATGTTGTGGAAGTACCTTGTACAAATTT 55818910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTGTACATGATACACTAGAGATATTATTTGAATGTTGTGGAAGTACCTTGTACAAATTT 960

 55818911 ATTTTCTTGATATTTAGTTCTATAAAAGCTTCCCTGATTTCTCCTAAGGTGGTCACTTAT 55818970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTTCTTGATATTTAGTTCTATAAAAGCTTCCCTGATTTCTCCTAAGGTGGTCACTTAT 1020

 55818971 TTTGTGCTGTTAGCGTACCTTTGTGTCACTAGTATTGTGGTAGTATTATACTATATTTTA 55819030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGTGCTGTTAGCGTACCTTTGTGTCACTAGTATTGTGGTAGTATTATACTATATTTTA 1080

 55819031 AATATTCATTTTCAAGCCTATCTTTGCAAAGGGCTCATGAATTTCCTGATTAAAGGGACT 55819090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATATTCATTTTCAAGCCTATCTTTGCAAAGGGCTCATGAATTTCCTGATTAAAGGGACT 1140

 55819091 ATGTAATATTCAGTTTTATGTCTCCAATAACTCTCATGATGTATGGTATCTATTAGTTTT 55819150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGTAATATTCAGTTTTATGTCTCCAATAACTCTCATGATGTATGGTATCTATTAGTTTT 1200

 55819151 CAATAAATGTTAACGAATGATTTAAAATGATTGAACTGAATTATTGACAGATGTTTGAAA 55819210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAATAAATGTTAACGAATGATTTAAAATGATTGAACTGAATTATTGACAGATGTTTGAAA 1260

 55819211 CTTGACTAATTTTTATTCAAGTTGAAATAATATGTAAAGTAAGCAATCACAACATTCAGC 55819270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTGACTAATTTTTATTCAAGTTGAAATAATATGTAAAGTAAGCAATCACAACATTCAGC 1320

 55819271 TTCCTTCATGAAGTCCAGAAGAGAACTGAACATATTGCCCAAGTGCCCAGAGGGCCCTAA 55819330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCCTTCATGAAGTCCAGAAGAGAACTGAACATATTGCCCAAGTGCCCAGAGGGCCCTAA 1380

 55819331 AATATAGATGTGTGTTCATTAGGCTAATTGGAGACAGGTAGACAAAAATCCTCCTTTGAA 55819390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATATAGATGTGTGTTCATTAGGCTAATTGGAGACAGGTAGACAAAAATCCTCCTTTGAA 1440

 55819391 ATTTGTCCTCATAGGCAATGGCATTATTCCCAGGCTTATCAAGTTCTTTCCCTTGGCAGA 55819450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTTGTCCTCATAGGCAATGGCATTATTCCCAGGCTTATCAAGTTCTTTCCCTTGGCAGA 1500

 55819451 TCTCTGTGGTCCATCTGCTGAACTTAAATGCTGAAATGGTCTCAATGTGAACATGCCTAA 55819510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTCTGTGGTCCATCTGCTGAACTTAAATGCTGAAATGGTCTCAATGTGAACATGCCTAA 1560

 55819511 TGGACATCTTTATTCTGAGTGGCTATACCAGCACAATCCATAAATCTGAGCTATTTCAGA 55819570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGACATCTTTATTCTGAGTGGCTATACCAGCACAATCCATAAATCTGAGCTATTTCAGA 1620

 55819571 TTACAAATGGAATTGTTCTCCACAGTGTTCCATTGCCTTATAGATAATAATTTTGGATGA 55819630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTACAAATGGAATTGTTCTCCACAGTGTTCCATTGCCTTATAGATAATAATTTTGGATGA 1680

 55819631 AAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTCTAAGAGTTCAATTGATATTAGCAATGTACATTGCT 55819690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTCTAAGAGTTCAATTGATATTAGCAATGTACATTGCT 1740

 55819691 TGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATATATCTGAACTCATTCATTTTACTATTTCCAAGCTA 55819750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATATATCTGAACTCATTCATTTTACTATTTCCAAGCTA 1800

 55819751 ATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACTCCATCTACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGC 55819810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACTCCATCTACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGC 1860

 55819811 AAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGTTTTCATTTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTT 55819870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGTTTTCATTTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTT 1920

 55819871 TTAAGAACTAATCATCAAGCATTAAGTTTCTCGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGGGGT 55819930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTAAGAACTAATCATCAAGCATTAAGTTTCTCGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGGGGT 1980

 55819931 GGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCATCCCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGA 55819990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCATCCCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGA 2040

 55819991 AGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTT 55820050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTT 2100

 55820051 ATCTGTAATAAGACTGATATCTTGACAGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAAT 55820110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATCTGTAATAAGACTGATATCTTGACAGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAAT 2160

 55820111 TCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGTAGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAAC 55820170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGTAGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAAC 2220

 55820171 ATATAACATTAATTATGTTTTCTTCTTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTT 55820230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATATAACATTAATTATGTTTTCTTCTTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTT 2280

 55820231 CTCAATTATCATGAGGCACATGATCTGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAA 55820290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTCAATTATCATGAGGCACATGATCTGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAA 2340

 55820291 TGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACAGAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCA 55820350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACAGAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCA 2400

 55820351 AGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAATTTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTT 55820410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAATTTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTT 2460

 55820411 TTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAATGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTG 55820470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAATGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTG 2520

 55820471 TTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAA 55820530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAA 2580

 55820531 GAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACA 55820590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACA 2640

 55820591 ATAAAATACACCTGGCAATTGAGACTTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAG 55820650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATAAAATACACCTGGCAATTGAGACTTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAG 2700

 55820651 GCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTT 55820710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTT 2760

 55820711 TTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACATGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGG 55820770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACATGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGG 2820

 55820771 TAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTCAAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAAT 55820830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTCAAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAAT 2880

 55820831 CTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAGTATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCC 55820890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAGTATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCC 2940

 55820891 TGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGCACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATG 55820950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGCACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATG 3000

 55820951 CCATTATTCTATTTAGGCATTTTTATTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGT 55821010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCATTATTCTATTTAGGCATTTTTATTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGT 3060

 55821011 CCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGT 55821070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGT 3120

 55821071 TGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAA 55821130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAA 3180

 55821131 AATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAG 55821190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAG 3240

 55821191 TGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCT 55821250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCT 3300

 55821251 AGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAA 55821310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAA 3360

 55821311 ACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAG 55821370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAG 3420

 55821371 CATCAGCATCACCTGAATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTAC 55821430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CATCAGCATCACCTGAATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTAC 3480

 55821431 CAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATT 55821490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATT 3540

 55821491 CTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCAT 55821550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCAT 3600

 55821551 CCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATT 55821610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATT 3660

 55821611 TGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATA 55821670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATA 3720

 55821671 TTAATTACAAGTTGGAATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAA 55821730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTAATTACAAGTTGGAATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAA 3780

 55821731 GGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAG 55821790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAG 3840

 55821791 ATAATAGAACTAGTATTATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTC 55821850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATAATAGAACTAGTATTATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTC 3900

 55821851 AGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATC 55821910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATC 3960

 55821911 AAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAA 55821970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAA 4020

 55821971 TCAACAGCTGGGCTGAGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGT 55822030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TCAACAGCTGGGCTGAGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGT 4080

 55822031 CCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGG 55822090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGG 4140

 55822091 TGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGA 55822150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGA 4200

 55822151 TGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCA 55822210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCA 4260

 55822211 GGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCT 55822270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCT 4320

 55822271 GATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAA 55822330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAA 4380

 55822331 AAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTG 55822390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTG 4440

 55822391 CATATGTGGGGTTATCTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAG 55822450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CATATGTGGGGTTATCTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAG 4500

 55822451 AGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAA 55822510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAA 4560

 55822511 GCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTG 55822570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTG 4620

 55822571 CTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAA 55822630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAA 4680

 55822631 TAATTTCTTAATAATTCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAG 55822690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TAATTTCTTAATAATTCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAG 4740

 55822691 AAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATT 55822750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATT 4800

 55822751 GCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGG 55822810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGG 4860

 55822811 AAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGA 55822870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGA 4920

 55822871 AAATGGAAAATGATGTCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAG 55822930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AAATGGAAAATGATGTCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAG 4980

 55822931 ACTGTTGACAATCCATGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGAT 55822990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 ACTGTTGACAATCCATGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGAT 5040

 55822991 AAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATC 55823050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATC 5100

 55823051 TGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATG 55823110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATG 5160

 55823111 ACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGG 55823170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGG 5220

 55823171 TGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAA 55823230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAA 5280

 55823231 ATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTC 55823290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 ATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTC 5340

 55823291 TTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCA 55823350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCA 5400

 55823351 GTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTG 55823410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTG 5460

 55823411 CTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGG 55823470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 CTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGG 5520

 55823471 TTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGA 55823530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGA 5580

 55823531 GACAAGGGGCACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGC 55823590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GACAAGGGGCACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGC 5640

 55823591 CCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGG 55823650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGG 5700

 55823651 TGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTT 55823710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTT 5760

 55823711 ATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGAT 55823770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 ATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGAT 5820

 55823771 GGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCC 55823830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 GGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCC 5880

 55823831 AGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTC 55823890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 AGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTC 5940

 55823891 ATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGT 55823950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 ATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGT 6000

 55823951 TGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTT 55824010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTT 6060

 55824011 AGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAG 55824070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 AGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAG 6120

 55824071 ATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATAC 55824130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 ATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATAC 6180

 55824131 TACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTC 55824190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTC 6240

 55824191 TTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATT 55824250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATT 6300

 55824251 TTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAG 55824310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAG 6360

 55824311 ATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATT 55824370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 ATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATT 6420

 55824371 TTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTG 55824430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 TTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTG 6480

 55824431 CAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCTTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCC 55824490
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCCTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCC 6540

 55824491 AATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATT 55824550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 AATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATT 6600

 55824551 ACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTT 55824610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 ACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTT 6660

 55824611 AAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTA 55824670
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     6661 AAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTG 6720

 55824671 CGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTA 55824730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 CGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTA 6780

 55824731 GGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAA 55824790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 GGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAA 6840

 55824791 TTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAG 55824850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 TTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAG 6900

 55824851 GATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTG 55824910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 GATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTG 6960

 55824911 GCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTC 55824970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 GCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTC 7020

 55824971 TTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATT 55825030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     7021 TTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATT 7080

 55825031 CAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACT 55825090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 CAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACT 7140

 55825091 ACCATGCAGCACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATA 55825150
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 ACCATGCAGAACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATA 7200

 55825151 CTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTT 55825210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 CTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTT 7260

 55825211 CACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTT 55825270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 CACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTT 7320

 55825271 TAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACC 55825330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 TAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACC 7380

 55825331 CAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGA 55825390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 CAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGA 7440

 55825391 CTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGAT 55825450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 CTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGAT 7500

 55825451 TAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGC 55825510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 TAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGC 7560

 55825511 AAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCG 55825570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 AAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCG 7620

 55825571 TGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATAT 55825630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 TGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATAT 7680

 55825631 TCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAAT 55825690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 TCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAAT 7740

 55825691 GTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCC 55825750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 GTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCC 7800

 55825751 ACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGT 55825810
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     7801 ACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGT 7860

 55825811 GACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCA 55825870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 GACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCA 7920

 55825871 AGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAA 55825930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 AGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAA 7980

 55825931 AATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 55825957
          |||||||||||||||||||||||||||
     7981 AATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 8007

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8011 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 8070

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8071 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 8130

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8131 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 8190

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8191 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 8250

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8251 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 8310

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8311 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 8370

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8371 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 8430

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8431 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 8490

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8491 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 8550

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8551 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 8610

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8611 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 8670

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8671 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 8730

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8731 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 8790

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8791 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 8850

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8851 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 8910

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8911 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 8970

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 55847732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     8971 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 9029

 55847733 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 55847792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9030 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 9089

 55847793 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 55847852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9090 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 9149

 55847853 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 55847912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9150 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 9209

 55847913 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 55847972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9210 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 9269

 55847973 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 55848032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9270 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 9329

 55848033 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 55848092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9330 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 9389

 55848093 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 55848152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     9390 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 9449

 55848153 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 55848212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9450 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 9509

 55848213 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 55848272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9510 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 9569

 55848273 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 55848332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9570 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 9629

 55848333 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 55848392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9630 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 9689

 55848393 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 55848452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9690 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 9749

 55848453 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 55848512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9750 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 9809

 55848513 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 55848572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9810 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 9869

 55848573 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 55848632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9870 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 9929

 55848633 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 55848692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9930 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 9989

 55848693 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 55848752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9990 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 10049

 55848753 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 55848812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10050 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 10109

 55848813 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 55848872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10110 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 10169

 55848873 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 55848932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10170 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 10229

 55848933 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 55848992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10230 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 10289

 55848993 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 55849052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10290 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 10349

 55849053 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 55849112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10350 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 10409

 55849113 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 55849172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10410 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 10469

 55849173 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 55849232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10470 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 10529

 55849233 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 55849292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10530 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 10589

 55849293 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 55849352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10590 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 10649

 55849353 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 55849412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10650 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 10709

 55849413 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 55849472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10710 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 10769

 55849473 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 55849532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10770 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 10829

 55849533 TTA 55849535
          |||
    10830 TTA 10832

Alignment time is 25.7158 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2822] =>      2822 nucs 'mol-32-3235-210212_2822'

Score:        2811
Aligned:      2822        nucs
Identic:      2821 (100%) nucs =>       997 (100%)      1824 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55846713,55847709] EXCISED REGION [55847711,55849535]
 second seq =>  [       1,     997] EXCISED REGION [     998,    2822]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55847710,55847710]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [55848128,55848128]
 second seq =>         1 nucs [1415,1415]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 60

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 120

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 180

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 240

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 300

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 360

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 420

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 480

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 540

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 600

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 660

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 720

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 780

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 840

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 900

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 960

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA 55847709
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA 997

EXCISED REGION

 55847711 GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCT 55847770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCT 1057

 55847771 TCTTACAACTAAATTTGTAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTT 55847830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 TCTTACAACTAAATTTGTAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTT 1117

 55847831 TCATGGATTTATTATTGGTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTT 55847890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 TCATGGATTTATTATTGGTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTT 1177

 55847891 TCCTCTGGCATATACTGCAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACA 55847950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 TCCTCTGGCATATACTGCAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACA 1237

 55847951 CCCAGCTTGAACCATCAGCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGAC 55848010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 CCCAGCTTGAACCATCAGCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGAC 1297

 55848011 ACTGCTGTCTTTATGTAGATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATT 55848070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 ACTGCTGTCTTTATGTAGATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATT 1357

 55848071 TTAAAGTCCAAGAAAGGAACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAA 55848130
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1358 TTAAAGTCCAAGAAAGGAACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAA 1417

 55848131 GCACTCTCCAAAACAACGCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTG 55848190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 GCACTCTCCAAAACAACGCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTG 1477

 55848191 AAACTCCATTTGCTTCTCATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAG 55848250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 AAACTCCATTTGCTTCTCATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAG 1537

 55848251 CACAGTGCCCTAAATCCGATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGG 55848310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 CACAGTGCCCTAAATCCGATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGG 1597

 55848311 GACAGTCAACAATATGACTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATG 55848370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 GACAGTCAACAATATGACTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATG 1657

 55848371 TGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGG 55848430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGG 1717

 55848431 GTTCCCAGCTGCAGGAAGACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCA 55848490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 GTTCCCAGCTGCAGGAAGACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCA 1777

 55848491 GACAGCATAGCTTGAACCCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTG 55848550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 GACAGCATAGCTTGAACCCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTG 1837

 55848551 CTTCGTAATTTGGGAGGCACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAG 55848610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 CTTCGTAATTTGGGAGGCACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAG 1897

 55848611 AGCAGTAATTGTACGTCTCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATT 55848670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 AGCAGTAATTGTACGTCTCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATT 1957

 55848671 GTTCTACCAAGTCCTTAATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGG 55848730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 GTTCTACCAAGTCCTTAATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGG 2017

 55848731 CGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAG 55848790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 CGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAG 2077

 55848791 GAAGAAAATCCAAAATTCATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACA 55848850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 GAAGAAAATCCAAAATTCATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACA 2137

 55848851 GTCTTGATGAGCCATCTGTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGG 55848910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 GTCTTGATGAGCCATCTGTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGG 2197

 55848911 TGAGCAAGAGATACGTTTTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATG 55848970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TGAGCAAGAGATACGTTTTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATG 2257

 55848971 ATTCAAGGTATCCTAAAGGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTAT 55849030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 ATTCAAGGTATCCTAAAGGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTAT 2317

 55849031 TTGACTGTCTTGCTGTAGTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATA 55849090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 TTGACTGTCTTGCTGTAGTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATA 2377

 55849091 AGACGTGGGTTCCTGCCTAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTG 55849150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 AGACGTGGGTTCCTGCCTAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTG 2437

 55849151 ACTAGTGCTGTGATAGAATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTG 55849210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 ACTAGTGCTGTGATAGAATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTG 2497

 55849211 AAGAAATCAGAGATAGCTTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAA 55849270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 AAGAAATCAGAGATAGCTTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAA 2557

 55849271 AGGAGTAAGCATTATTGTAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGC 55849330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 AGGAGTAAGCATTATTGTAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGC 2617

 55849331 CAAGGAAGATAAAAGCCTCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACT 55849390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 CAAGGAAGATAAAAGCCTCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACT 2677

 55849391 AGAATGCAAGGTTTAATGTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGC 55849450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 AGAATGCAAGGTTTAATGTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGC 2737

 55849451 AGAGATGTTTATTTTGTTTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATT 55849510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 AGAGATGTTTATTTTGTTTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATT 2797

 55849511 TGATCCGTTAAGTTCAGAAATTTTA 55849535
          |||||||||||||||||||||||||
     2798 TGATCCGTTAAGTTCAGAAATTTTA 2822

Alignment time is 6.70768 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    7365] =>      7365 nucs 'mol-32-3240-155445_7365'

Score:        7310
Aligned:      7365        nucs
Identic:      7360 (100%) nucs =>      6330 (100%)      1030 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55818608,55824939] EXCISED REGION [55824942,55825974]
 second seq =>  [       1,    6332] EXCISED REGION [    6333,    7365]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55824940,55824941]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [55824940,55824953] to [55824942,55824955]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55824940,55824940] to [55824941,55824941]
 second seq =>         0 nucs

 55818608 TTCATCAGCTGAATCTGCACATTTCACCTTGGGCTCATTTTGAAATTTATATTTTTAAAG 55818667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCATCAGCTGAATCTGCACATTTCACCTTGGGCTCATTTTGAAATTTATATTTTTAAAG 60

 55818668 TCAAGGGAAATTCACAAGTTTCCTTTACATTATGCCATCTCCTTTTATCATTAAAAACAA 55818727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAAGGGAAATTCACAAGTTTCCTTTACATTATGCCATCTCCTTTTATCATTAAAAACAA 120

 55818728 CAAAAACAAAACATTTACTTGTCAGCAACTTTCTTCTCTGTAATAAAATACCTTTATATA 55818787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAAAACAAAACATTTACTTGTCAGCAACTTTCTTCTCTGTAATAAAATACCTTTATATA 180

 55818788 AATTATCTTTCTCCTGCAATGAGCATTGTTTAATATTATCAAAAGTTTTTTATCTCAAAA 55818847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTATCTTTCTCCTGCAATGAGCATTGTTTAATATTATCAAAAGTTTTTTATCTCAAAA 240

 55818848 ATTATTGTACATGATACACTAGAGATATTATTTGAATGTTGTGGAAGTACCTTGTACAAA 55818907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTATTGTACATGATACACTAGAGATATTATTTGAATGTTGTGGAAGTACCTTGTACAAA 300

 55818908 TTTATTTTCTTGATATTTAGTTCTATAAAAGCTTCCCTGATTTCTCCTAAGGTGGTCACT 55818967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTATTTTCTTGATATTTAGTTCTATAAAAGCTTCCCTGATTTCTCCTAAGGTGGTCACT 360

 55818968 TATTTTGTGCTGTTAGCGTACCTTTGTGTCACTAGTATTGTGGTAGTATTATACTATATT 55819027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATTTTGTGCTGTTAGCGTACCTTTGTGTCACTAGTATTGTGGTAGTATTATACTATATT 420

 55819028 TTAAATATTCATTTTCAAGCCTATCTTTGCAAAGGGCTCATGAATTTCCTGATTAAAGGG 55819087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAAATATTCATTTTCAAGCCTATCTTTGCAAAGGGCTCATGAATTTCCTGATTAAAGGG 480

 55819088 ACTATGTAATATTCAGTTTTATGTCTCCAATAACTCTCATGATGTATGGTATCTATTAGT 55819147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTATGTAATATTCAGTTTTATGTCTCCAATAACTCTCATGATGTATGGTATCTATTAGT 540

 55819148 TTTCAATAAATGTTAACGAATGATTTAAAATGATTGAACTGAATTATTGACAGATGTTTG 55819207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTCAATAAATGTTAACGAATGATTTAAAATGATTGAACTGAATTATTGACAGATGTTTG 600

 55819208 AAACTTGACTAATTTTTATTCAAGTTGAAATAATATGTAAAGTAAGCAATCACAACATTC 55819267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAACTTGACTAATTTTTATTCAAGTTGAAATAATATGTAAAGTAAGCAATCACAACATTC 660

 55819268 AGCTTCCTTCATGAAGTCCAGAAGAGAACTGAACATATTGCCCAAGTGCCCAGAGGGCCC 55819327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCTTCCTTCATGAAGTCCAGAAGAGAACTGAACATATTGCCCAAGTGCCCAGAGGGCCC 720

 55819328 TAAAATATAGATGTGTGTTCATTAGGCTAATTGGAGACAGGTAGACAAAAATCCTCCTTT 55819387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAAAATATAGATGTGTGTTCATTAGGCTAATTGGAGACAGGTAGACAAAAATCCTCCTTT 780

 55819388 GAAATTTGTCCTCATAGGCAATGGCATTATTCCCAGGCTTATCAAGTTCTTTCCCTTGGC 55819447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAATTTGTCCTCATAGGCAATGGCATTATTCCCAGGCTTATCAAGTTCTTTCCCTTGGC 840

 55819448 AGATCTCTGTGGTCCATCTGCTGAACTTAAATGCTGAAATGGTCTCAATGTGAACATGCC 55819507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGATCTCTGTGGTCCATCTGCTGAACTTAAATGCTGAAATGGTCTCAATGTGAACATGCC 900

 55819508 TAATGGACATCTTTATTCTGAGTGGCTATACCAGCACAATCCATAAATCTGAGCTATTTC 55819567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAATGGACATCTTTATTCTGAGTGGCTATACCAGCACAATCCATAAATCTGAGCTATTTC 960

 55819568 AGATTACAAATGGAATTGTTCTCCACAGTGTTCCATTGCCTTATAGATAATAATTTTGGA 55819627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGATTACAAATGGAATTGTTCTCCACAGTGTTCCATTGCCTTATAGATAATAATTTTGGA 1020

 55819628 TGAAAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTCTAAGAGTTCAATTGATATTAGCAATGTACATT 55819687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGAAAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTCTAAGAGTTCAATTGATATTAGCAATGTACATT 1080

 55819688 GCTTGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATATATCTGAACTCATTCATTTTACTATTTCCAAG 55819747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTTGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATATATCTGAACTCATTCATTTTACTATTTCCAAG 1140

 55819748 CTAATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACTCCATCTACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTT 55819807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTAATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACTCCATCTACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTT 1200

 55819808 AGCAAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGTTTTCATTTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAA 55819867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGCAAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGTTTTCATTTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAA 1260

 55819868 GTTTTAAGAACTAATCATCAAGCATTAAGTTTCTCGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGG 55819927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTTTTAAGAACTAATCATCAAGCATTAAGTTTCTCGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGG 1320

 55819928 GGTGGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCATCCCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTT 55819987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTGGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCATCCCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTT 1380

 55819988 AGAAGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAA 55820047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAAGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAA 1440

 55820048 TTTATCTGTAATAAGACTGATATCTTGACAGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATT 55820107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTATCTGTAATAAGACTGATATCTTGACAGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATT 1500

 55820108 AATTCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGTAGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACC 55820167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATTCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGTAGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACC 1560

 55820168 AACATATAACATTAATTATGTTTTCTTCTTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGAT 55820227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACATATAACATTAATTATGTTTTCTTCTTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGAT 1620

 55820228 TTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATCTGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTA 55820287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATCTGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTA 1680

 55820288 CAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACAGAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGAC 55820347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACAGAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGAC 1740

 55820348 TCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAATTTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAA 55820407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAATTTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAA 1800

 55820408 CTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAATGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGAC 55820467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAATGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGAC 1860

 55820468 GTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCC 55820527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCC 1920

 55820528 CAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAG 55820587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAG 1980

 55820588 ACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGACTTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTA 55820647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGACTTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTA 2040

 55820648 AAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAA 55820707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAA 2100

 55820708 TTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACATGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACT 55820767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACATGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACT 2160

 55820768 AGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTCAAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTG 55820827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTCAAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTG 2220

 55820828 AATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAGTATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGC 55820887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAGTATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGC 2280

 55820888 TCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGCACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAAC 55820947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGCACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAAC 2340

 55820948 ATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTATTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGT 55821007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTATTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGT 2400

 55821008 TGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAAT 55821067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAAT 2460

 55821068 TGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTA 55821127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTA 2520

 55821128 GAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCT 55821187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCT 2580

 55821188 TAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGAT 55821247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGAT 2640

 55821248 TCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATG 55821307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATG 2700

 55821308 CAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAG 55821367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAG 2760

 55821368 CAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATC 55821427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATC 2820

 55821428 TACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTG 55821487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTG 2880

 55821488 ATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATT 55821547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATT 2940

 55821548 CATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGA 55821607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGA 3000

 55821608 ATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTG 55821667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTG 3060

 55821668 ATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTT 55821727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTT 3120

 55821728 GAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAG 55821787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAG 3180

 55821788 CAGATAATAGAACTAGTATTATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAA 55821847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CAGATAATAGAACTAGTATTATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAA 3240

 55821848 GTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAA 55821907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAA 3300

 55821908 ATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAG 55821967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAG 3360

 55821968 AAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAG 55822027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAG 3420

 55822028 GGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTA 55822087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTA 3480

 55822088 AGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGAC 55822147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGAC 3540

 55822148 GGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAG 55822207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAG 3600

 55822208 GCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATG 55822267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATG 3660

 55822268 TCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGC 55822327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGC 3720

 55822328 CAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTC 55822387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTC 3780

 55822388 CTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAG 55822447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAG 3840

 55822448 AAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATC 55822507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATC 3900

 55822508 AAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAG 55822567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAG 3960

 55822568 CTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTA 55822627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTA 4020

 55822628 AAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGC 55822687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGC 4080

 55822688 CAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATA 55822747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATA 4140

 55822748 ATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATA 55822807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATA 4200

 55822808 AGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTG 55822867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTG 4260

 55822868 AGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATA 55822927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATA 4320

 55822928 CAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACA 55822987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACA 4380

 55822988 GATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAAC 55823047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAAC 4440

 55823048 ATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGC 55823107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGC 4500

 55823108 ATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTA 55823167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTA 4560

 55823168 AGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCAC 55823227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCAC 4620

 55823228 GAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAG 55823287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAG 4680

 55823288 GTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATT 55823347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATT 4740

 55823348 CCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATA 55823407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATA 4800

 55823408 TTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGT 55823467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGT 4860

 55823468 TGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCT 55823527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCT 4920

 55823528 GGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAA 55823587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAA 4980

 55823588 AGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATT 55823647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 AGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATT 5040

 55823648 TGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCC 55823707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCC 5100

 55823708 TTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAA 55823767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAA 5160

 55823768 GATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCA 55823827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCA 5220

 55823828 GCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTA 55823887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTA 5280

 55823888 TTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTG 55823947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTG 5340

 55823948 AGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAAT 55824007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAAT 5400

 55824008 GTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATT 55824067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATT 5460

 55824068 GAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAA 55824127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAA 5520

 55824128 TACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGT 55824187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGT 5580

 55824188 CTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATT 55824247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATT 5640

 55824248 ATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATG 55824307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 ATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATG 5700

 55824308 AAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGT 55824367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGT 5760

 55824368 ATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACAT 55824427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 ATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACAT 5820

 55824428 CTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCTTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAA 55824487
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCCTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAA 5880

 55824488 GCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTC 55824547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTC 5940

 55824548 ATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAAT 55824607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 ATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAAT 6000

 55824608 TTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAG 55824667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAG 6060

 55824668 GTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGC 55824727
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 GTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGC 6120

 55824728 CTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAA 55824787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 CTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAA 6180

 55824788 AAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAG 55824847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 AAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAG 6240

 55824848 GAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACT 55824907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 GAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACT 6300

 55824908 CTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTC 55824939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 CTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTC 6332

EXCISED REGION

 55824942 AAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTA 55825001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6333 AAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTA 6392

 55825002 AGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACAT 55825061
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6393 AGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACAT 6452

 55825062 TGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTATCATCCCGAA 55825121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6453 TGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTATCATCCCGAA 6512

 55825122 TTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGC 55825181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6513 TTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGC 6572

 55825182 AGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTT 55825241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6573 AGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTT 6632

 55825242 GCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACC 55825301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6633 GCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACC 6692

 55825302 AAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGT 55825361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6693 AAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGT 6752

 55825362 GACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCA 55825421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6753 GACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCA 6812

 55825422 GTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATT 55825481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6813 GTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATT 6872

 55825482 TCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATA 55825541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6873 TCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATA 6932

 55825542 TAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAAC 55825601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6933 TAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAAC 6992

 55825602 ACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAAC 55825661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6993 ACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAAC 7052

 55825662 AGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTA 55825721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7053 AGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTA 7112

 55825722 CTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTA 55825781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7113 CTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTA 7172

 55825782 AAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAA 55825841
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7173 AAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAA 7232

 55825842 TTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCC 55825901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7233 TTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCC 7292

 55825902 ATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAATGATC 55825961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7293 ATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAATGATC 7352

 55825962 TACTTTTATAATA 55825974
          |||||||||||||
     7353 TACTTTTATAATA 7365

Alignment time is 17.4791 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4590] =>      4590 nucs 'mol-32-3327-103011_4590'

Score:        4544
Aligned:      4588        nucs
Identic:      4584 (100%) nucs =>       868 (100%)      3716 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55825088,55825957] EXCISED REGION [55846713,55850430]
 second seq =>  [       1,     870] EXCISED REGION [     874,    4590]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [871,873]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [870,870] to [873,873]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55825088 ACTACCATGCAGCACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATA 55825147
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTACCATGCAGAACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATA 60

 55825148 ATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTT 55825207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTT 120

 55825208 TTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATT 55825267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATT 180

 55825268 TTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTAT 55825327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTAT 240

 55825328 ACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCT 55825387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCT 300

 55825388 GGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTA 55825447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTA 360

 55825448 GATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTT 55825507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTT 420

 55825508 TGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGA 55825567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGA 480

 55825568 CCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGA 55825627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGA 540

 55825628 TATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGT 55825687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGT 600

 55825688 AATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAAC 55825747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAAC 660

 55825748 TCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTA 55825807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      661 TCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTA 720

 55825808 AGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCA 55825867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCA 780

 55825868 TCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAAC 55825927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAAC 840

 55825928 AAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 55825957
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 870

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      874 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 933

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      934 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 993

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      994 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 1053

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1054 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 1113

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1114 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 1173

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1174 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 1233

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1234 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 1293

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1294 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 1353

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1354 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 1413

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1414 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 1473

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 1533

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 1593

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 1653

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 1713

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 1773

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 1833

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 55847732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     1834 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 1892

 55847733 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 55847792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 1952

 55847793 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 55847852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 2012

 55847853 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 55847912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 2072

 55847913 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 55847972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 2132

 55847973 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 55848032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 2192

 55848033 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 55848092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 2252

 55848093 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 55848152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2253 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 2312

 55848153 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 55848212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 2372

 55848213 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 55848272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 2432

 55848273 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 55848332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 2492

 55848333 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 55848392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 2552

 55848393 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 55848452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 2612

 55848453 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 55848512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 2672

 55848513 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 55848572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 2732

 55848573 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 55848632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 2792

 55848633 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 55848692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 2852

 55848693 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 55848752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 2912

 55848753 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 55848812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 2972

 55848813 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 55848872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 3032

 55848873 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 55848932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 3092

 55848933 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 55848992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 3152

 55848993 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 55849052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 3212

 55849053 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 55849112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 3272

 55849113 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 55849172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 3332

 55849173 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 55849232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 3392

 55849233 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 55849292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 3452

 55849293 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 55849352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 3512

 55849353 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 55849412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 3572

 55849413 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 55849472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 3632

 55849473 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 55849532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 3692

 55849533 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 55849592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 3752

 55849593 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 55849652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 3812

 55849653 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 55849712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 3872

 55849713 GAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCATGAGAA 55849772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 GAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCATGAGAA 3932

 55849773 CTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCACCTCC 55849832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 CTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCACCTCC 3992

 55849833 CACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAGATTTG 55849892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 CACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAGATTTG 4052

 55849893 GGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGCGCTCA 55849952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 GGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGCGCTCA 4112

 55849953 GAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTTATTTT 55850012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4113 GAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTTATTTT 4172

 55850013 AGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATACGCTA 55850072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4173 AGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATACGCTA 4232

 55850073 CACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGATTAAA 55850132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4233 CACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGATTAAA 4292

 55850133 GATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGTTTTTA 55850192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4293 GATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGTTTTTA 4352

 55850193 TCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATTTGTCA 55850252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4353 TCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATTTGTCA 4412

 55850253 TGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACAGTTTT 55850312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4413 TGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACAGTTTT 4472

 55850313 GAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGATGTTTT 55850372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 GAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGATGTTTT 4532

 55850373 TCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGCAGA 55850430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4533 TCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGCAGA 4590

Alignment time is 10.8709 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    8319] =>      8319 nucs 'mol-32-3332-008438_8319'

Score:        8264
Aligned:      8319        nucs
Identic:      8314 (100%) nucs =>      6815 (100%)      1499 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55817637,55824451] EXCISED REGION [55824453,55825956]
 second seq =>  [       1,    6815] EXCISED REGION [    6817,    8319]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55824452,55824452]
 second seq =>         1 nucs [6816,6816]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [55824940,55824940]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55824452,55824452] to [55824453,55824453]
 second seq =>         1 nucs [6815,6815] to [6816,6816]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55817637 AAAGTGCTCATCATAAATAAAAATGTTTAATAGCTTTACCATCACGAGAGTGTCTATTAC 55817696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAGTGCTCATCATAAATAAAAATGTTTAATAGCTTTACCATCACGAGAGTGTCTATTAC 60

 55817697 CTGCACATTCTTGGCGACGTCAAGTTTTCATCAAATTTTGTTTTTAAATGTTTTGCCCAT 55817756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGCACATTCTTGGCGACGTCAAGTTTTCATCAAATTTTGTTTTTAAATGTTTTGCCCAT 120

 55817757 CTGACGAGTAAAAAGTGAACCCTGTAGCATTTTTTAAATAGCTCGATGTGATGAAAACGG 55817816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGACGAGTAAAAAGTGAACCCTGTAGCATTTTTTAAATAGCTCGATGTGATGAAAACGG 180

 55817817 GGTTTTGGAAAGCTCATGCTGAGACAATATGGAGTTTAGCTTGGTCACACCAAGACTCAA 55817876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTTTTGGAAAGCTCATGCTGAGACAATATGGAGTTTAGCTTGGTCACACCAAGACTCAA 240

 55817877 TGCAGAAGAGATGGAGAGGAGACAATTACAATAGACTGTGTAACAGATGAAGACAGCTTA 55817936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCAGAAGAGATGGAGAGGAGACAATTACAATAGACTGTGTAACAGATGAAGACAGCTTA 300

 55817937 ACTGGGGCAGTGCCTGGAATGTATTAGGGGAAATAGATATGATAGAGGCACTATCAAAAA 55817996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTGGGGCAGTGCCTGGAATGTATTAGGGGAAATAGATATGATAGAGGCACTATCAAAAA 360

 55817997 GTCCAGCTGTTGAGGAGGTACAGCAATAGACCTTTGTTCCTGATACTTAATATTGTGTTA 55818056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCCAGCTGTTGAGGAGGTACAGCAATAGACCTTTGTTCCTGATACTTAATATTGTGTTA 420

 55818057 AGGGTGGGCGAGACGGAGGAAGGATTCAAGAATACCTCCTAGGTTTATGAGTTGGGAAGC 55818116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGGTGGGCGAGACGGAGGAAGGATTCAAGAATACCTCCTAGGTTTATGAGTTGGGAAGC 480

 55818117 CAGGATGATTGCAATGAAAATAACTGTCCTAGAAAACACAGAAAAAAGCAAAGATTTGGG 55818176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGGATGATTGCAATGAAAATAACTGTCCTAGAAAACACAGAAAAAAGCAAAGATTTGGG 540

 55818177 AGCATGCCAGATAAAACGGGAATGATTTTAAAGGTCGTGTACAAATCTAAGATGCTATAG 55818236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCATGCCAGATAAAACGGGAATGATTTTAAAGGTCGTGTACAAATCTAAGATGCTATAG 600

 55818237 TTTATTTATGGAAACTACCTTCATCTGTGGCAGAGGCTATTTCAAAATACTCACATCTAT 55818296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTATTTATGGAAACTACCTTCATCTGTGGCAGAGGCTATTTCAAAATACTCACATCTAT 660

 55818297 TTAATGTCACTTAATGAATCACGGAATTTTGCAGTGCTATGAAATCCCTTAAATCAAACT 55818356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAATGTCACTTAATGAATCACGGAATTTTGCAGTGCTATGAAATCCCTTAAATCAAACT 720

 55818357 AACTAGCACACTTATGAAACCAGAGTACTATCTTACTATGCCAGAGTATTCTTTTCGTAT 55818416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACTAGCACACTTATGAAACCAGAGTACTATCTTACTATGCCAGAGTATTCTTTTCGTAT 780

 55818417 TCTGCCATCTAGTGAACAACAATCATTTGTACAACCTGGCTTGTAAATTGCTTCTTCCAA 55818476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGCCATCTAGTGAACAACAATCATTTGTACAACCTGGCTTGTAAATTGCTTCTTCCAA 840

 55818477 ATTTAAAATAAACACACACGCACACGCACACGCACCCCTTCATTTTATGCTTTCTCATTA 55818536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTTAAAATAAACACACACGCACACGCACACGCACCCCTTCATTTTATGCTTTCTCATTA 900

 55818537 TATATACTGGCAAAATATTCTTTCATGATATTTTACAAACAAAATTCCTAAACATAGAGG 55818596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATATACTGGCAAAATATTCTTTCATGATATTTTACAAACAAAATTCCTAAACATAGAGG 960

 55818597 AAAGAATAGAGTTCATCAGCTGAATCTGCACATTTCACCTTGGGCTCATTTTGAAATTTA 55818656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAGAATAGAGTTCATCAGCTGAATCTGCACATTTCACCTTGGGCTCATTTTGAAATTTA 1020

 55818657 TATTTTTAAAGTCAAGGGAAATTCACAAGTTTCCTTTACATTATGCCATCTCCTTTTATC 55818716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATTTTTAAAGTCAAGGGAAATTCACAAGTTTCCTTTACATTATGCCATCTCCTTTTATC 1080

 55818717 ATTAAAAACAACAAAAACAAAACATTTACTTGTCAGCAACTTTCTTCTCTGTAATAAAAT 55818776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTAAAAACAACAAAAACAAAACATTTACTTGTCAGCAACTTTCTTCTCTGTAATAAAAT 1140

 55818777 ACCTTTATATAAATTATCTTTCTCCTGCAATGAGCATTGTTTAATATTATCAAAAGTTTT 55818836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACCTTTATATAAATTATCTTTCTCCTGCAATGAGCATTGTTTAATATTATCAAAAGTTTT 1200

 55818837 TTATCTCAAAAATTATTGTACATGATACACTAGAGATATTATTTGAATGTTGTGGAAGTA 55818896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTATCTCAAAAATTATTGTACATGATACACTAGAGATATTATTTGAATGTTGTGGAAGTA 1260

 55818897 CCTTGTACAAATTTATTTTCTTGATATTTAGTTCTATAAAAGCTTCCCTGATTTCTCCTA 55818956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTTGTACAAATTTATTTTCTTGATATTTAGTTCTATAAAAGCTTCCCTGATTTCTCCTA 1320

 55818957 AGGTGGTCACTTATTTTGTGCTGTTAGCGTACCTTTGTGTCACTAGTATTGTGGTAGTAT 55819016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGGTGGTCACTTATTTTGTGCTGTTAGCGTACCTTTGTGTCACTAGTATTGTGGTAGTAT 1380

 55819017 TATACTATATTTTAAATATTCATTTTCAAGCCTATCTTTGCAAAGGGCTCATGAATTTCC 55819076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATACTATATTTTAAATATTCATTTTCAAGCCTATCTTTGCAAAGGGCTCATGAATTTCC 1440

 55819077 TGATTAAAGGGACTATGTAATATTCAGTTTTATGTCTCCAATAACTCTCATGATGTATGG 55819136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGATTAAAGGGACTATGTAATATTCAGTTTTATGTCTCCAATAACTCTCATGATGTATGG 1500

 55819137 TATCTATTAGTTTTCAATAAATGTTAACGAATGATTTAAAATGATTGAACTGAATTATTG 55819196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATCTATTAGTTTTCAATAAATGTTAACGAATGATTTAAAATGATTGAACTGAATTATTG 1560

 55819197 ACAGATGTTTGAAACTTGACTAATTTTTATTCAAGTTGAAATAATATGTAAAGTAAGCAA 55819256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAGATGTTTGAAACTTGACTAATTTTTATTCAAGTTGAAATAATATGTAAAGTAAGCAA 1620

 55819257 TCACAACATTCAGCTTCCTTCATGAAGTCCAGAAGAGAACTGAACATATTGCCCAAGTGC 55819316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCACAACATTCAGCTTCCTTCATGAAGTCCAGAAGAGAACTGAACATATTGCCCAAGTGC 1680

 55819317 CCAGAGGGCCCTAAAATATAGATGTGTGTTCATTAGGCTAATTGGAGACAGGTAGACAAA 55819376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCAGAGGGCCCTAAAATATAGATGTGTGTTCATTAGGCTAATTGGAGACAGGTAGACAAA 1740

 55819377 AATCCTCCTTTGAAATTTGTCCTCATAGGCAATGGCATTATTCCCAGGCTTATCAAGTTC 55819436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATCCTCCTTTGAAATTTGTCCTCATAGGCAATGGCATTATTCCCAGGCTTATCAAGTTC 1800

 55819437 TTTCCCTTGGCAGATCTCTGTGGTCCATCTGCTGAACTTAAATGCTGAAATGGTCTCAAT 55819496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTCCCTTGGCAGATCTCTGTGGTCCATCTGCTGAACTTAAATGCTGAAATGGTCTCAAT 1860

 55819497 GTGAACATGCCTAATGGACATCTTTATTCTGAGTGGCTATACCAGCACAATCCATAAATC 55819556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTGAACATGCCTAATGGACATCTTTATTCTGAGTGGCTATACCAGCACAATCCATAAATC 1920

 55819557 TGAGCTATTTCAGATTACAAATGGAATTGTTCTCCACAGTGTTCCATTGCCTTATAGATA 55819616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGAGCTATTTCAGATTACAAATGGAATTGTTCTCCACAGTGTTCCATTGCCTTATAGATA 1980

 55819617 ATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTCTAAGAGTTCAATTGATATTAG 55819676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTCTAAGAGTTCAATTGATATTAG 2040

 55819677 CAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATATATCTGAACTCATTCATTTTA 55819736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATATATCTGAACTCATTCATTTTA 2100

 55819737 CTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACTCCATCTACTTTGTGGTTTTTG 55819796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACTCCATCTACTTTGTGGTTTTTG 2160

 55819797 AAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGTTTTCATTTTTCTTACAGTTTT 55819856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGTTTTCATTTTTCTTACAGTTTT 2220

 55819857 AGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATCAAGCATTAAGTTTCTCGTGGCACACACTGT 55819916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATCAAGCATTAAGTTTCTCGTGGCACACACTGT 2280

 55819917 GATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCATCCCAGTCTATGATTAGATAGT 55819976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCATCCCAGTCTATGATTAGATAGT 2340

 55819977 AATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCCACAG 55820036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTGGCCCCCTGTTCCCATCCACAG 2400

 55820037 TTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTGATATCTTGACAGGCCTGACACTTGTGTCTT 55820096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTGATATCTTGACAGGCCTGACACTTGTGTCTT 2460

 55820097 AGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGTAGCATAAGTTATTATTAGCTT 55820156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGTAGCATAAGTTATTATTAGCTT 2520

 55820157 CCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGTTTTCTTCTTTTCATCTATTGCTACTGAG 55820216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGTTTTCTTCTTTTCATCTATTGCTACTGAG 2580

 55820217 CTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATCTGTGAAATATACTGCTTCTAT 55820276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATCTGTGAAATATACTGCTTCTAT 2640

 55820277 TATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACAGAACCAATCAGTATGAAATAG 55820336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACAGAACCAATCAGTATGAAATAG 2700

 55820337 AAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAATTTTAAATAATTATATAAAATA 55820396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAATTTTAAATAATTATATAAAATA 2760

 55820397 ATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAATGAGATTCATAATAATGTGAA 55820456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAATGAGATTCATAATAATGTGAA 2820

 55820457 AGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGGATAA 55820516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTTGCAGAAAAAAAACTGGGATAA 2880

 55820517 TAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAATCAGC 55820576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAATTCGTGGTTTTAAAGAATCAGC 2940

 55820577 AGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGACTTCACAAGGAATGACAGTCAA 55820636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGACTTCACAAGGAATGACAGTCAA 3000

 55820637 GCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACAGCTT 55820696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGTAGAGCCTTGCAAGGACAGCTT 3060

 55820697 CTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACATGTCACACAGTCAAATTGGAC 55820756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACATGTCACACAGTCAAATTGGAC 3120

 55820757 ACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTCAAAACAGATATTTGTTTATAG 55820816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTCAAAACAGATATTTGTTTATAG 3180

 55820817 CTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAGTATACTTAGGGCCAAACCTTC 55820876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAGTATACTTAGGGCCAAACCTTC 3240

 55820877 CTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGCACTAATGTTCAAATTGCCCAG 55820936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGCACTAATGTTCAAATTGCCCAG 3300

 55820937 CAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTATTCTAACACCTACTTTGGTAT 55820996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTATTCTAACACCTACTTTGGTAT 3360

 55820997 TTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTT 55821056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAGTTTTTGATACTGCAGTTCTTT 3420

 55821057 CAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAG 55821116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCCTGATCTAATGTTCATCAGGAG 3480

 55821117 TTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCA 55821176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCA 3540

 55821177 GGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATA 55821236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATA 3600

 55821237 AAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTG 55821296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTG 3660

 55821297 AAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGAT 55821356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGAT 3720

 55821357 CCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCC 55821416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCC 3780

 55821417 CTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAG 55821476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAG 3840

 55821477 GCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATA 55821536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATA 3900

 55821537 AGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAAT 55821596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAAT 3960

 55821597 GAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACT 55821656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACT 4020

 55821657 GACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACAT 55821716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACAT 4080

 55821717 ACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGT 55821776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGT 4140

 55821777 CTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAA 55821836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAA 4200

 55821837 CTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTA 55821896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTA 4260

 55821897 ACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGA 55821956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGA 4320

 55821957 ACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGG 55822016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGG 4380

 55822017 AGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATG 55822076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATG 4440

 55822077 GAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCC 55822136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCC 4500

 55822137 CATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTG 55822196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTG 4560

 55822197 GTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGG 55822256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGG 4620

 55822257 AGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTC 55822316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTC 4680

 55822317 ACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGT 55822376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGT 4740

 55822377 GCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGG 55822436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGG 4800

 55822437 GTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGC 55822496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGC 4860

 55822497 ATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAA 55822556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 ATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAA 4920

 55822557 TGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTT 55822616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTT 4980

 55822617 CTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAA 55822676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAA 5040

 55822677 CCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAA 55822736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAA 5100

 55822737 AGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGG 55822796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGG 5160

 55822797 CATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAG 55822856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 CATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAG 5220

 55822857 CCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAG 55822916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAG 5280

 55822917 AGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGA 55822976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGA 5340

 55822977 ATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCT 55823036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 ATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCT 5400

 55823037 TGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACG 55823096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACG 5460

 55823097 AGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAG 55823156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAG 5520

 55823157 GGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGG 55823216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGG 5580

 55823217 ATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAA 55823276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 ATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAA 5640

 55823277 TCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGC 55823336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGC 5700

 55823337 ATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCC 55823396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 ATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCC 5760

 55823397 ATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTT 55823456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 ATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTT 5820

 55823457 TACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAA 55823516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAA 5880

 55823517 CGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGAT 55823576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGAT 5940

 55823577 AATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAAC 55823636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 AATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAAC 6000

 55823637 AAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATA 55823696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 AAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATA 6060

 55823697 GTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCT 55823756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 GTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCT 6120

 55823757 GCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTA 55823816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 GCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTA 6180

 55823817 AGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGAT 55823876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 AGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGAT 6240

 55823877 CCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATA 55823936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATA 6300

 55823937 TTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTG 55823996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTG 6360

 55823997 TATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACC 55824056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 TATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACC 6420

 55824057 TTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGT 55824116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 TTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGT 6480

 55824117 TAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACT 55824176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 TAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACT 6540

 55824177 TTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGT 55824236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 TTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGT 6600

 55824237 AGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAA 55824296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 AGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAA 6660

 55824297 TTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAA 55824356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 TTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAA 6720

 55824357 TCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGT 55824416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 TCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGT 6780

 55824417 AATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTC 55824451
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 AATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTC 6815

EXCISED REGION

 55824453 TACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGC 55824512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6817 TACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGC 6876

 55824513 TAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTG 55824572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6877 TAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTG 6936

 55824573 ACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTT 55824632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6937 ACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTT 6996

 55824633 AAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGC 55824692
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     6997 AAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGC 7056

 55824693 ACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGC 55824752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7057 ACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGC 7116

 55824753 AACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCAC 55824812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7117 AACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCAC 7176

 55824813 ACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTG 55824872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7177 ACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTG 7236

 55824873 GAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACC 55824932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7237 GAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACC 7296

 55824933 CTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTC 55824992
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7297 CTGTCTC-AAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTC 7355

 55824993 TCACAAGTAAGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTG 55825052
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7356 TCACAAGTAAGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTG 7415

 55825053 ACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTAT 55825112
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     7416 ACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTAT 7475

 55825113 CATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGG 55825172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7476 CATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGG 7535

 55825173 ACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAAT 55825232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7536 ACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAAT 7595

 55825233 CCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATT 55825292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7596 CCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATT 7655

 55825293 ATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGT 55825352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7656 ATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGT 7715

 55825353 TTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCA 55825412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7716 TTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCA 7775

 55825413 TTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAG 55825472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7776 TTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAG 7835

 55825473 GCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAA 55825532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7836 GCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAA 7895

 55825533 ATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCT 55825592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7896 ATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCT 7955

 55825593 AAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTT 55825652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7956 AAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTT 8015

 55825653 TCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGA 55825712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8016 TCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGA 8075

 55825713 ACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACT 55825772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8076 ACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACT 8135

 55825773 TTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACA 55825832
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8136 TTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACA 8195

 55825833 ACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTAC 55825892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8196 ACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTAC 8255

 55825893 TGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAAT 55825952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8256 TGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAAT 8315

 55825953 GAAA 55825956
          ||||
     8316 GAAA 8319

Alignment time is 19.7245 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    8244] =>      8244 nucs 'mol-32-3332-111170_8244'

Score:        8154
Aligned:      8244        nucs
Identic:      8235 (100%) nucs =>      6349 (100%)      1886 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55819602,55825957] EXCISED REGION [55846713,55848600]
 second seq =>  [       1,    6354] EXCISED REGION [    6358,    8244]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [6355,6357]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [6354,6354] to [6357,6357]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55819602 ATTGCCTTATAGATAATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTCTAAGAG 55819661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTGCCTTATAGATAATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTCTAAGAG 60

 55819662 TTCAATTGATATTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATATATCTG 55819721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCAATTGATATTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATATATCTG 120

 55819722 AACTCATTCATTTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACTCCATCT 55819781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACTCATTCATTTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACTCCATCT 180

 55819782 ACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGTTTTCAT 55819841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGTTTTCAT 240

 55819842 TTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATCAAGCATTAAGTTTCT 55819901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATCAAGCATTAAGTTTCT 300

 55819902 CGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCATCCCAGT 55819961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCATCCCAGT 360

 55819962 CTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTGGCCCCC 55820021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTGGCCCCC 420

 55820022 TGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTGATATCTTGACAGGCC 55820081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTGATATCTTGACAGGCC 480

 55820082 TGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGTAGCATA 55820141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGTAGCATA 540

 55820142 AGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGTTTTCTTCTTTTCA 55820201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGTTTTCTTCTTTTCA 600

 55820202 TCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATCTGTGAA 55820261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATCTGTGAA 660

 55820262 ATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACAGAACCA 55820321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACAGAACCA 720

 55820322 ATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAATTTTAAA 55820381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAATTTTAAA 780

 55820382 TAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAATGAGAT 55820441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAATGAGAT 840

 55820442 TCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTTGCAGAA 55820501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTTGCAGAA 900

 55820502 AAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAATTCGTGG 55820561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAATTCGTGG 960

 55820562 TTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGACTTCACA 55820621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGACTTCACA 1020

 55820622 AGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGTAGAGCC 55820681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGTAGAGCC 1080

 55820682 TTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACATGTCAC 55820741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACATGTCAC 1140

 55820742 ACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTCAAAACA 55820801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTCAAAACA 1200

 55820802 GATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAGTATACT 55820861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAGTATACT 1260

 55820862 TAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGCACTAAT 55820921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGCACTAAT 1320

 55820922 GTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTATTCTAA 55820981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTATTCTAA 1380

 55820982 CACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAGTTTTTG 55821041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAGTTTTTG 1440

 55821042 ATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCCTGATCT 55821101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCCTGATCT 1500

 55821102 AATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAATTGGAAT 55821161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAATTGGAAT 1560

 55821162 ATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTTTAATAT 55821221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTTTAATAT 1620

 55821222 ATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTGGTGAAA 55821281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTGGTGAAA 1680

 55821282 TTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTACATGAAT 55821341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTACATGAAT 1740

 55821342 GTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTGAAATGC 55821401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTGAAATGC 1800

 55821402 AAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCCAGCAGT 55821461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCCAGCAGT 1860

 55821462 CAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAACCACTGG 55821521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAACCACTGG 1920

 55821522 CATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCATTCACA 55821581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCATTCACA 1980

 55821582 CTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTAAACAGC 55821641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTAAACAGC 2040

 55821642 CACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAGTGAATT 55821701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAGTGAATT 2100

 55821702 ATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATCTCTTAA 55821761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATCTCTTAA 2160

 55821762 GTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACATTTTAT 55821821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACATTTTAT 2220

 55821822 TTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAATTCCTTT 55821881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAATTCCTTT 2280

 55821882 AATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAGAAAATA 55821941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAGAAAATA 2340

 55821942 TCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATACTGATAA 55822001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATACTGATAA 2400

 55822002 GGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATAAAAGAA 55822061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATAAAAGAA 2460

 55822062 TATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAATAAAGA 55822121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAATAAAGA 2520

 55822122 AGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAGAAACC 55822181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAGAAACC 2580

 55822182 CCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTATATTAGG 55822241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTATATTAGG 2640

 55822242 ATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTGGTTTGA 55822301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTGGTTTGA 2700

 55822302 CCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCTTTAAAT 55822361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCTTTAAAT 2760

 55822362 ATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAGCCATGA 55822421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAGCCATGA 2820

 55822422 TGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGGACCCAG 55822481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGGACCCAG 2880

 55822482 TTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTT 55822541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTT 2940

 55822542 CTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTACCAAGG 55822601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTACCAAGG 3000

 55822602 GAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATAATACTC 55822661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATAATACTC 3060

 55822662 AGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACTTACAA 55822721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACTTACAA 3120

 55822722 AATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCTACTGA 55822781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCTACTGA 3180

 55822782 CTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAATTCAG 55822841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAATTCAG 3240

 55822842 CCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCACAGATAA 55822901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCACAGATAA 3300

 55822902 AAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCATGACCC 55822961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCATGACCC 3360

 55822962 GCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTTCCTTT 55823021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTTCCTTT 3420

 55823022 CAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAGATCC 55823081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAGATCC 3480

 55823082 TTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAGCCTAT 55823141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAGCCTAT 3540

 55823142 ATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGA 55823201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGA 3600

 55823202 TTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGATTGCTC 55823261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGATTGCTC 3660

 55823262 GTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTGCGTA 55823321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTGCGTA 3720

 55823322 GCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAAACGCT 55823381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAAACGCT 3780

 55823382 GTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAGATCTA 55823441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAGATCTA 3840

 55823442 TCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACATTTGAT 55823501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACATTTGAT 3900

 55823502 GTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATTTTTAAA 55823561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATTTTTAAA 3960

 55823562 AAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAAGAGAG 55823621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAAGAGAG 4020

 55823622 AGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAAT 55823681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAGGAAT 4080

 55823682 ACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTG 55823741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAAACTG 4140

 55823742 GAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCT 55823801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAGATCT 4200

 55823802 GTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCT 55823861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGACTCT 4260

 55823862 GTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTC 55823921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTTTCTC 4320

 55823922 CCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTC 55823981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCATCTTC 4380

 55823982 TTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTT 55824041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTTGCTT 4440

 55824042 TCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTAT 55824101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAAGTAT 4500

 55824102 AAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTAT 55824161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAAGTAT 4560

 55824162 GTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGC 55824221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTATAGC 4620

 55824222 TATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTAT 55824281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATTTTAT 4680

 55824282 ATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACT 55824341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAATAACT 4740

 55824342 TACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCAT 55824401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCAT 4800

 55824402 GTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCTTACCATTTA 55824461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4801 GTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCCTACCATTTA 4860

 55824462 TTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGA 55824521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGA 4920

 55824522 TAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAAT 55824581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAAT 4980

 55824582 TTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTT 55824641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTT 5040

 55824642 GACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 55824701
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 5100

 55824702 AGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCG 55824761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCG 5160

 55824762 AAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAAT 55824821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAAT 5220

 55824822 CCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCA 55824881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCA 5280

 55824882 GTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAA 55824941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTCAA 5340

 55824942 AAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTA 55825001
          ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AAAAAAAAAAAA--TTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTA 5398

 55825002 AGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACAT 55825061
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 AGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACAT 5458

 55825062 TGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTATCATCCCGAA 55825121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5459 TGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTATCATCCCGAA 5518

 55825122 TTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGC 55825181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 TTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGC 5578

 55825182 AGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTT 55825241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 AGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTT 5638

 55825242 GCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACC 55825301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 GCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACC 5698

 55825302 AAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGT 55825361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 AAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGT 5758

 55825362 GACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCA 55825421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 GACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCA 5818

 55825422 GTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATT 55825481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 GTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATT 5878

 55825482 TCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATA 55825541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 TCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATA 5938

 55825542 TAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAAC 55825601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 TAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAAC 5998

 55825602 ACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAAC 55825661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 ACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAAC 6058

 55825662 AGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTA 55825721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 AGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTA 6118

 55825722 CTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTA 55825781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 CTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTA 6178

 55825782 AAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAA 55825841
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 AAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAA 6238

 55825842 TTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCC 55825901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 TTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCC 6298

 55825902 ATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 55825957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 ATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 6354

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 6417

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 6477

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6478 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 6537

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6538 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 6597

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6598 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 6657

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6658 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 6717

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6718 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 6777

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6778 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 6837

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6838 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 6897

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6898 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 6957

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6958 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 7017

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7018 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 7077

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7078 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 7137

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7138 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 7197

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7198 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 7257

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7258 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 7317

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 55847732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     7318 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 7376

 55847733 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 55847792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 7436

 55847793 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 55847852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 7496

 55847853 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 55847912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 7556

 55847913 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 55847972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7557 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 7616

 55847973 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 55848032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7617 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 7676

 55848033 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 55848092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7677 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 7736

 55848093 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 55848152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7737 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 7796

 55848153 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 55848212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7797 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 7856

 55848213 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 55848272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7857 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 7916

 55848273 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 55848332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7917 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 7976

 55848333 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 55848392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7977 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 8036

 55848393 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 55848452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8037 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 8096

 55848453 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 55848512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8097 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 8156

 55848513 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 55848572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8157 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 8216

 55848573 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAA 55848600
          ||||||||||||||||||||||||||||
     8217 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAA 8244

Alignment time is 19.5762 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    9348] =>      9348 nucs 'mol-32-33a0-145162_9348'

Score:        9227
Aligned:      9348        nucs
Identic:      9337 (100%) nucs =>      4811 (100%)      4526 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55821140,55825957] EXCISED REGION [55846713,55851242]
 second seq =>  [       1,    4816] EXCISED REGION [    4820,    9348]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [4817,4819]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [4816,4816] to [4819,4819]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55821140 TTCTGGGAAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTAT 55821199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCTGGGAAAAGGAATTGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTAT 60

 55821200 GTGTTGTAAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAG 55821259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGTTGTAAAGAGCTTTAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAG 120

 55821260 GAAATGGAGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATG 55821319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAATGGAGTATGTTGGTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATG 180

 55821320 TTAGTAAAATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCAT 55821379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAGTAAAATTCTTACATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCAT 240

 55821380 CACCTGAATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAA 55821439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACCTGAATCTATTTGAAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAA 300

 55821440 ACTGTGGGTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAAT 55821499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTGTGGGTGGGATCCAGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAAT 360

 55821500 AGTAAAGTTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTA 55821559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTAAAGTTTGCAAACCACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTA 420

 55821560 TTTCTTAAGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAA 55821619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCTTAAGAATCTCATTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAA 480

 55821620 AGAAATAACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACA 55821679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAAATAACAAGTTTAAACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACA 540

 55821680 AGTTGGAATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAG 55821739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTTGGAATTGACAAGTGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAG 600

 55821740 AGTATTTTTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAA 55821799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTATTTTTAAACATCTCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAA 660

 55821800 CTAGTATTATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATT 55821859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTAGTATTATATTACATTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATT 720

 55821860 TTCAAAGGCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAA 55821919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCAAAGGCAACAAATTCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAA 780

 55821920 TCCTTTGCTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCT 55821979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCCTTTGCTTGAGAAGAAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCT 840

 55821980 GGGCTGAGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCT 55822039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGCTGAGCAACATACTGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCT 900

 55822040 CACGCCGATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAG 55822099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACGCCGATTTAGATAAAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAG 960

 55822100 TTAAATAGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGG 55822159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAAATAGGCAAAAAATAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGG 1020

 55822160 CTCCAAGCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGC 55822219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTCCAAGCCCAGAGAAGAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGC 1080

 55822220 AGGAACAGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCAT 55822279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGAACAGGCGGTTATATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCAT 1140

 55822280 AGGGCCCAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGC 55822339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGGCCCAGGGGATTGGTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGC 1200

 55822340 CCTCTCACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGG 55822399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTCTCACCCTAGCCTTTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGG 1260

 55822400 GGTTATCTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAA 55822459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGTTATCTGGGGACAGCCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAA 1320

 55822460 TCGCCGTATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAG 55822519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCGCCGTATTGGATGGACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAG 1380

 55822520 CCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAG 55822579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCTGGCCCTTCAAGCTGCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAG 1440

 55822580 AAAAAAAAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTT 55822639
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAAAAAAAA-CCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTT 1499

 55822640 AATAATTCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAG 55822699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AATAATTCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAG 1559

 55822700 ACATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTAC 55822759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ACATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTAC 1619

 55822760 TGATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATT 55822819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TGATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATT 1679

 55822820 GATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAA 55822879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAA 1739

 55822880 ATGATGTCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGAC 55822939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ATGATGTCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGAC 1799

 55822940 AATCCATGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTT 55822999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AATCCATGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTT 1859

 55823000 GGCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACT 55823059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GGCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACT 1919

 55823060 TTGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAA 55823119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TTGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAA 1979

 55823120 TCAGCTGAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAA 55823179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TCAGCTGAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAA 2039

 55823180 GAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGA 55823239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GAGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGA 2099

 55823240 TCCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTT 55823299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TCCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTT 2159

 55823300 TTCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTA 55823359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TTCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTA 2219

 55823360 ACTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAA 55823419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 ACTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAA 2279

 55823420 AAATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAA 55823479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AAATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAA 2339

 55823480 AGACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGG 55823539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AGACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGG 2399

 55823540 CACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAG 55823599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAG 2459

 55823600 GAAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGA 55823659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GAAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGA 2519

 55823660 GAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAA 55823719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GAAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAA 2579

 55823720 CCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTG 55823779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CCTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTG 2639

 55823780 CATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACA 55823839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACA 2699

 55823840 CTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAG 55823899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CTTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAG 2759

 55823900 TAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTAC 55823959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TAAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTAC 2819

 55823960 TGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTT 55824019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TGTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTT 2879

 55824020 TCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTA 55824079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TCAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTA 2939

 55824080 TAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTC 55824139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TAAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTC 2999

 55824140 TTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCC 55824199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TTCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCC 3059

 55824200 TTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCT 55824259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TTTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCT 3119

 55824260 ACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATT 55824319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 ACAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATT 3179

 55824320 TCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTT 55824379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TCTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTT 3239

 55824380 AGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTG 55824439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 AGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTG 3299

 55824440 AAGTCTGCCTTCTTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCT 55824499
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 AAGTCTGCCTTCCTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCT 3359

 55824500 GGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAA 55824559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAA 3419

 55824560 GAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTA 55824619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 GAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTA 3479

 55824620 CTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGC 55824679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3480 CTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGC 3539

 55824680 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGA 55824739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGA 3599

 55824740 CACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGG 55824799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 CACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGG 3659

 55824800 CATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTG 55824859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 CATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTG 3719

 55824860 AACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATG 55824919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 AACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATG 3779

 55824920 ACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATA 55824979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     3780 ACAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAA-TTCATATGCTTTTTCTTCTTTATA 3838

 55824980 GATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAG 55825039
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 GATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAG 3898

 55825040 ATACAAACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAG 55825099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 ATACAAACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAG 3958

 55825100 CACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTT 55825159
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 AACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTT 4018

 55825160 GCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAG 55825219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 GCTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAG 4078

 55825220 GCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAAT 55825279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 GCTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAAT 4138

 55825280 AATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAA 55825339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAA 4198

 55825340 CGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACA 55825399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 CGGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACA 4258

 55825400 TGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAG 55825459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TGAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAG 4318

 55825460 AAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCAC 55825519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 AAAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCAC 4378

 55825520 AGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAA 55825579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 AGAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAA 4438

 55825580 TAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTC 55825639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 TAAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTC 4498

 55825640 TGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTA 55825699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 TGAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTA 4558

 55825700 AGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAG 55825759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 AGTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAG 4618

 55825760 AGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCC 55825819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4619 AGGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCC 4678

 55825820 TGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGA 55825879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 TGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGA 4738

 55825880 GATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAG 55825939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 GATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAG 4798

 55825940 AGAATTTCATAATGAAAT 55825957
          ||||||||||||||||||
     4799 AGAATTTCATAATGAAAT 4816

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4820 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 4879

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 4939

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4940 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 4999

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5000 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 5059

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5060 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 5119

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5120 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 5179

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5180 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 5239

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5240 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 5299

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5300 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 5359

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5360 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 5419

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5420 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 5479

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5480 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 5539

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5540 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 5599

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5600 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 5659

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5660 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 5719

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5720 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 5779

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 55847732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     5780 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 5838

 55847733 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 55847792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 5898

 55847793 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 55847852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 5958

 55847853 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 55847912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 6018

 55847913 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 55847972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6019 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 6078

 55847973 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 55848032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6079 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 6138

 55848033 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 55848092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6139 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 6198

 55848093 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 55848152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6199 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 6258

 55848153 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 55848212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6259 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 6318

 55848213 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 55848272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6319 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 6378

 55848273 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 55848332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 6438

 55848333 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 55848392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 6498

 55848393 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 55848452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 6558

 55848453 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 55848512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 6618

 55848513 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 55848572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6619 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 6678

 55848573 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 55848632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6679 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 6738

 55848633 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 55848692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6739 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 6798

 55848693 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 55848752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6799 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 6858

 55848753 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 55848812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6859 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 6918

 55848813 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 55848872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6919 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 6978

 55848873 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 55848932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6979 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 7038

 55848933 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 55848992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7039 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 7098

 55848993 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 55849052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7099 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 7158

 55849053 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 55849112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7159 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 7218

 55849113 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 55849172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7219 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 7278

 55849173 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 55849232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7279 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 7338

 55849233 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 55849292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7339 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 7398

 55849293 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 55849352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7399 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 7458

 55849353 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 55849412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7459 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 7518

 55849413 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 55849472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7519 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 7578

 55849473 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 55849532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7579 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 7638

 55849533 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 55849592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7639 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 7698

 55849593 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 55849652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7699 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 7758

 55849653 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 55849712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7759 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 7818

 55849713 GAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCATGAGAA 55849772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7819 GAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCATGAGAA 7878

 55849773 CTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCACCTCC 55849832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7879 CTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCACCTCC 7938

 55849833 CACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAGATTTG 55849892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7939 CACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAGATTTG 7998

 55849893 GGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGCGCTCA 55849952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7999 GGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGCGCTCA 8058

 55849953 GAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTTATTTT 55850012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8059 GAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTTATTTT 8118

 55850013 AGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATACGCTA 55850072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8119 AGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATACGCTA 8178

 55850073 CACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGATTAAA 55850132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8179 CACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGATTAAA 8238

 55850133 GATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGTTTTTA 55850192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8239 GATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGTTTTTA 8298

 55850193 TCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATTTGTCA 55850252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8299 TCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATTTGTCA 8358

 55850253 TGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACAGTTTT 55850312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8359 TGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACAGTTTT 8418

 55850313 GAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGATGTTTT 55850372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8419 GAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGATGTTTT 8478

 55850373 TCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGCAGAAA 55850432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8479 TCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGCAGAAA 8538

 55850433 ACTGCATAGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAGTTCCC 55850492
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8539 ACTGCATGGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAGTTCCC 8598

 55850493 ACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAGCCTCC 55850552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8599 ACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAGCCTCC 8658

 55850553 AACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAAGGAAC 55850612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8659 AACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAAGGAAC 8718

 55850613 GCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGAGCCTA 55850672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8719 GCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGAGCCTA 8778

 55850673 TATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAAATTTC 55850732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8779 TATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAAATTTC 8838

 55850733 TCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTATTGAC 55850792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8839 TCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTATTGAC 8898

 55850793 CTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATCTATCC 55850852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8899 CTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATCTATCC 8958

 55850853 CTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTTGAGCT 55850912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8959 CTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTTGAGCT 9018

 55850913 GTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGATTAAT 55850972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9019 GTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGATTAAT 9078

 55850973 GCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAACTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTTTTTCA 55851032
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9079 GCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAGCTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTTTTTCA 9138

 55851033 AACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTGCATAT 55851092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9139 AACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTGCATAT 9198

 55851093 CAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCTCTGAC 55851152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9199 CAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCTCTGAC 9258

 55851153 TTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTTCTGTG 55851212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9259 TTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTTCTGTG 9318

 55851213 AGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGT 55851242
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     9319 AGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGT 9348

Alignment time is 21.8476 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4529] =>      4529 nucs 'mol-32-33a0-145162_4529'

Score:        4496
Aligned:      4529        nucs
Identic:      4526 (100%) nucs =>       997 (100%)      3529 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55846713,55847709] EXCISED REGION [55847711,55851242]
 second seq =>  [       1,     997] EXCISED REGION [     998,    4529]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55847710,55847710]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [55848128,55848128]
 second seq =>         1 nucs [1415,1415]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 60

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 120

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 180

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 240

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 300

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 360

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 420

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 480

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 540

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 600

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 660

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 720

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 780

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 840

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 900

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 960

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA 55847709
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA 997

EXCISED REGION

 55847711 GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCT 55847770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCT 1057

 55847771 TCTTACAACTAAATTTGTAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTT 55847830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 TCTTACAACTAAATTTGTAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTT 1117

 55847831 TCATGGATTTATTATTGGTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTT 55847890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 TCATGGATTTATTATTGGTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTT 1177

 55847891 TCCTCTGGCATATACTGCAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACA 55847950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 TCCTCTGGCATATACTGCAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACA 1237

 55847951 CCCAGCTTGAACCATCAGCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGAC 55848010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 CCCAGCTTGAACCATCAGCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGAC 1297

 55848011 ACTGCTGTCTTTATGTAGATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATT 55848070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 ACTGCTGTCTTTATGTAGATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATT 1357

 55848071 TTAAAGTCCAAGAAAGGAACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAA 55848130
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1358 TTAAAGTCCAAGAAAGGAACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAA 1417

 55848131 GCACTCTCCAAAACAACGCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTG 55848190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 GCACTCTCCAAAACAACGCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTG 1477

 55848191 AAACTCCATTTGCTTCTCATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAG 55848250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 AAACTCCATTTGCTTCTCATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAG 1537

 55848251 CACAGTGCCCTAAATCCGATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGG 55848310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 CACAGTGCCCTAAATCCGATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGG 1597

 55848311 GACAGTCAACAATATGACTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATG 55848370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 GACAGTCAACAATATGACTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATG 1657

 55848371 TGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGG 55848430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGG 1717

 55848431 GTTCCCAGCTGCAGGAAGACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCA 55848490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 GTTCCCAGCTGCAGGAAGACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCA 1777

 55848491 GACAGCATAGCTTGAACCCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTG 55848550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 GACAGCATAGCTTGAACCCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTG 1837

 55848551 CTTCGTAATTTGGGAGGCACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAG 55848610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 CTTCGTAATTTGGGAGGCACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAG 1897

 55848611 AGCAGTAATTGTACGTCTCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATT 55848670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 AGCAGTAATTGTACGTCTCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATT 1957

 55848671 GTTCTACCAAGTCCTTAATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGG 55848730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 GTTCTACCAAGTCCTTAATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGG 2017

 55848731 CGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAG 55848790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 CGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAG 2077

 55848791 GAAGAAAATCCAAAATTCATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACA 55848850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 GAAGAAAATCCAAAATTCATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACA 2137

 55848851 GTCTTGATGAGCCATCTGTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGG 55848910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 GTCTTGATGAGCCATCTGTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGG 2197

 55848911 TGAGCAAGAGATACGTTTTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATG 55848970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TGAGCAAGAGATACGTTTTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATG 2257

 55848971 ATTCAAGGTATCCTAAAGGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTAT 55849030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 ATTCAAGGTATCCTAAAGGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTAT 2317

 55849031 TTGACTGTCTTGCTGTAGTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATA 55849090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 TTGACTGTCTTGCTGTAGTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATA 2377

 55849091 AGACGTGGGTTCCTGCCTAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTG 55849150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 AGACGTGGGTTCCTGCCTAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTG 2437

 55849151 ACTAGTGCTGTGATAGAATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTG 55849210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 ACTAGTGCTGTGATAGAATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTG 2497

 55849211 AAGAAATCAGAGATAGCTTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAA 55849270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 AAGAAATCAGAGATAGCTTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAA 2557

 55849271 AGGAGTAAGCATTATTGTAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGC 55849330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 AGGAGTAAGCATTATTGTAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGC 2617

 55849331 CAAGGAAGATAAAAGCCTCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACT 55849390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 CAAGGAAGATAAAAGCCTCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACT 2677

 55849391 AGAATGCAAGGTTTAATGTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGC 55849450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 AGAATGCAAGGTTTAATGTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGC 2737

 55849451 AGAGATGTTTATTTTGTTTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATT 55849510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 AGAGATGTTTATTTTGTTTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATT 2797

 55849511 TGATCCGTTAAGTTCAGAAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCT 55849570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 TGATCCGTTAAGTTCAGAAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCT 2857

 55849571 ATGAAGACACTACCCAAGACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAG 55849630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 ATGAAGACACTACCCAAGACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAG 2917

 55849631 TTCCACATGGCTGGCAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCA 55849690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 TTCCACATGGCTGGCAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCA 2977

 55849691 CATCTTACATGGCAGCAGGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATA 55849750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 CATCTTACATGGCAGCAGGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATA 3037

 55849751 AAACCGTCAGATCTCATGAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGC 55849810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 AAACCGTCAGATCTCATGAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGC 3097

 55849811 TCCTTATGATCCAATCACCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGA 55849870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 TCCTTATGATCCAATCACCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGA 3157

 55849871 TTACAATTTGAGATGAGATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGG 55849930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 TTACAATTTGAGATGAGATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGG 3217

 55849931 GGATTTGGGCTGCTGGCGCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTT 55849990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 GGATTTGGGCTGCTGGCGCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTT 3277

 55849991 TTCTTTATAAACTTTTTATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTA 55850050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 TTCTTTATAAACTTTTTATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTA 3337

 55850051 CAGAGAGTTCTCACATACGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTA 55850110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 CAGAGAGTTCTCACATACGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTA 3397

 55850111 TCATATATTTGTTACGATTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTT 55850170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 TCATATATTTGTTACGATTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTT 3457

 55850171 ATTCAGATTTCCTTAGTTTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGAT 55850230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 ATTCAGATTTCCTTAGTTTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGAT 3517

 55850231 ACCACATTACATTTATTTGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGG 55850290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 ACCACATTACATTTATTTGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGG 3577

 55850291 TTTTGATGACCTTGACAGTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACA 55850350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 TTTTGATGACCTTGACAGTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACA 3637

 55850351 GTTTGGGTTTGTCTGATGTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGA 55850410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 GTTTGGGTTTGTCTGATGTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGA 3697

 55850411 TGTATAAACTCTTAAGCAGAAAACTGCATAGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAA 55850470
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3698 TGTATAAACTCTTAAGCAGAAAACTGCATGGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAA 3757

 55850471 TTGAAAAGTGGGTACAGTTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTT 55850530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 TTGAAAAGTGGGTACAGTTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTT 3817

 55850531 TCTCTCCACTTCCCCAGCCTCCAACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCT 55850590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 TCTCTCCACTTCCCCAGCCTCCAACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCT 3877

 55850591 CTCAGGTTCTTCCCTAAGGAACGCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCT 55850650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 CTCAGGTTCTTCCCTAAGGAACGCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCT 3937

 55850651 CACTAGCTCACTTAAGAGCCTATATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATG 55850710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 CACTAGCTCACTTAAGAGCCTATATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATG 3997

 55850711 CTACTCTTTACCTAGAAATTTCTCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCAT 55850770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 CTACTCTTTACCTAGAAATTTCTCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCAT 4057

 55850771 TCCATTCTACACCCCTATTGACCTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCT 55850830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 TCCATTCTACACCCCTATTGACCTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCT 4117

 55850831 TCCCGAGGAAGACCATCTATCCCTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTC 55850890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 TCCCGAGGAAGACCATCTATCCCTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTC 4177

 55850891 TACTCTTAGGGAAGCTTGAGCTGTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATG 55850950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4178 TACTCTTAGGGAAGCTTGAGCTGTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATG 4237

 55850951 CTCATGTGATTCTGTGATTAATGCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAACTGTATGAGGGC 55851010
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4238 CTCATGTGATTCTGTGATTAATGCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAGCTGTATGAGGGC 4297

 55851011 AGAAAATATTTCTATTTTTTCAAACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAG 55851070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4298 AGAAAATATTTCTATTTTTTCAAACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAG 4357

 55851071 CCATTAGACATGCACTGCATATCAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAA 55851130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4358 CCATTAGACATGCACTGCATATCAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAA 4417

 55851131 AACACCAGCTTGGTTCTCTGACTTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGC 55851190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4418 AACACCAGCTTGGTTCTCTGACTTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGC 4477

 55851191 AGTGTAACTTCAGTTTTCTGTGAGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGT 55851242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4478 AGTGTAACTTCAGTTTTCTGTGAGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGT 4529

Alignment time is 10.9011 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5046] =>      5046 nucs 'mol-32-33ab-035665_5046'

Score:        4991
Aligned:      5035        nucs
Identic:      5031 (100%) nucs =>       159 (100%)      4872 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55825799,55825957] EXCISED REGION [55846713,55851588]
 second seq =>  [      10,     168] EXCISED REGION [     172,    5046]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [169,171]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [168,168] to [171,171]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55825799 AAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACAT 55825858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       10 AAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACAT 69

 55825859 GTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATG 55825918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       70 GTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATG 129

 55825919 AGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 55825957
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      130 AGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 168

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      172 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 231

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      232 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 291

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      292 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 351

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      352 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 411

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      412 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 471

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      472 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 531

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      532 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 591

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 651

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      652 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 711

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 771

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 831

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 891

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 951

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 1011

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 1071

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 1131

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 55847732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     1132 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 1190

 55847733 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 55847792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 1250

 55847793 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 55847852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 1310

 55847853 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 55847912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 1370

 55847913 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 55847972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 1430

 55847973 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 55848032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 1490

 55848033 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 55848092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 1550

 55848093 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 55848152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1551 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 1610

 55848153 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 55848212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 1670

 55848213 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 55848272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 1730

 55848273 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 55848332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 1790

 55848333 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 55848392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 1850

 55848393 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 55848452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 1910

 55848453 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 55848512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 1970

 55848513 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 55848572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 2030

 55848573 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 55848632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 2090

 55848633 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 55848692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 2150

 55848693 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 55848752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 2210

 55848753 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 55848812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 2270

 55848813 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 55848872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 2330

 55848873 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 55848932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 2390

 55848933 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 55848992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 2450

 55848993 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 55849052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 2510

 55849053 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 55849112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 2570

 55849113 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 55849172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 2630

 55849173 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 55849232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 2690

 55849233 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 55849292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 2750

 55849293 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 55849352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 2810

 55849353 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 55849412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 2870

 55849413 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 55849472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 2930

 55849473 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 55849532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 2990

 55849533 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 55849592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 3050

 55849593 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 55849652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 3110

 55849653 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 55849712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 3170

 55849713 GAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCATGAGAA 55849772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 GAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCATGAGAA 3230

 55849773 CTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCACCTCC 55849832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 CTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCACCTCC 3290

 55849833 CACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAGATTTG 55849892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 CACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAGATTTG 3350

 55849893 GGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGCGCTCA 55849952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 GGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGCGCTCA 3410

 55849953 GAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTTATTTT 55850012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 GAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTTATTTT 3470

 55850013 AGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATACGCTA 55850072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 AGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATACGCTA 3530

 55850073 CACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGATTAAA 55850132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 CACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGATTAAA 3590

 55850133 GATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGTTTTTA 55850192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 GATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGTTTTTA 3650

 55850193 TCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATTTGTCA 55850252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 TCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATTTGTCA 3710

 55850253 TGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACAGTTTT 55850312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 TGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACAGTTTT 3770

 55850313 GAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGATGTTTT 55850372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 GAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGATGTTTT 3830

 55850373 TCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGCAGAAA 55850432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 TCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGCAGAAA 3890

 55850433 ACTGCATAGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAGTTCCC 55850492
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 ACTGCATGGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAGTTCCC 3950

 55850493 ACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAGCCTCC 55850552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 ACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAGCCTCC 4010

 55850553 AACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAAGGAAC 55850612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 AACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAAGGAAC 4070

 55850613 GCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGAGCCTA 55850672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 GCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGAGCCTA 4130

 55850673 TATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAAATTTC 55850732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 TATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAAATTTC 4190

 55850733 TCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTATTGAC 55850792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 TCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTATTGAC 4250

 55850793 CTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATCTATCC 55850852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 CTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATCTATCC 4310

 55850853 CTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTTGAGCT 55850912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 CTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTTGAGCT 4370

 55850913 GTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGATTAAT 55850972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 GTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGATTAAT 4430

 55850973 GCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAACTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTTTTTCA 55851032
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 GCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAGCTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTTTTTCA 4490

 55851033 AACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTGCATAT 55851092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 AACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTGCATAT 4550

 55851093 CAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCTCTGAC 55851152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 CAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCTCTGAC 4610

 55851153 TTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTTCTGTG 55851212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 TTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTTCTGTG 4670

 55851213 AGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGTATGGAGGGCATGCTTTAAAAGAGCAAAGTT 55851272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 AGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGTATGGAGGGCATGCTTTAAAAGAGCAAAGTT 4730

 55851273 ACCACCCTATGAAACAAAATATGGGGTGATAACACCTGTAGTAATAAGAAAATGTTTTTG 55851332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 ACCACCCTATGAAACAAAATATGGGGTGATAACACCTGTAGTAATAAGAAAATGTTTTTG 4790

 55851333 CATTAGCACATGCCATTCCACCTTATGAGACACAGGACATCCTCAGACTAACAGCCTCTC 55851392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 CATTAGCACATGCCATTCCACCTTATGAGACACAGGACATCCTCAGACTAACAGCCTCTC 4850

 55851393 TGTATCTTAAACTATCTCAAACACTAAGAGTTACCTCTTAGGATTCATGGAAATTAAAAC 55851452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 TGTATCTTAAACTATCTCAAACACTAAGAGTTACCTCTTAGGATTCATGGAAATTAAAAC 4910

 55851453 ACATTAAAGATGTTCATTGTGGTGAGTAACATATTCTGATTATCAGAGGCCATTAGAACA 55851512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4911 ACATTAAAGATGTTCATTGTGGTGAGTAACATATTCTGATTATCAGAGGCCATTAGAACA 4970

 55851513 ACTCTGCCTATAGCCAGTAACTTCCAAATTGACCTTCCACTAAAAATCACAAATTTACAC 55851572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 ACTCTGCCTATAGCCAGTAACTTCCAAATTGACCTTCCACTAAAAATCACAAATTTACAC 5030

 55851573 ACACACACACATATAC 55851588
          ||||||||||||||||
     5031 ACACACACACATATAC 5046

Alignment time is 12.0921 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    9997] =>      9997 nucs 'mol-32-340e-033813_9997'

Score:        9897
Aligned:      9974        nucs
Identic:      9967 (100%) nucs =>        72 (100%)      9895 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55815985,55816056] EXCISED REGION [55816057,55825958]
 second seq =>  [       1,      72] EXCISED REGION [      97,    9997]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        24 nucs [73,96]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        64 nucs [73,136] to [97,160]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55815985 TGATTGTAAATACACCAATCAGCACTCTGTGTCTAGCTCAGGGATTGTAAATGCACCAAT 55816044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGATTGTAAATACACCAATCAGCACTCTGTGTCTAGCTCAGGGATTGTAAATGCACCAAT 60

 55816045 CAGCACCCTGTC 55816056
          ||||||||||||
       61 CAGCACCCTGTC 72

EXCISED REGION

 55816057 AAAATGGACCAATCAGCTCTCTGTAAAATGGACCAATCAGCTCTCTGTAAAATGGACCAA 55816116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       97 AAAATGGACCAATCAGCTCTCTGTAAAATGGACCAATCAGCTCTCTGTAAAATGGACCAA 156

 55816117 TCAGTTCTCTGTAAAATGGACCAATCAGCAGGATGTGGGTGGGGTCAGATAAGGGAATAA 55816176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      157 TCAGTTCTCTGTAAAATGGACCAATCAGCAGGATGTGGGTGGGGTCAGATAAGGGAATAA 216

 55816177 AAGCAGGCTGCCTGAGCCAGCAGCAGCAACCTACTCCGTTTGGCTTCCACACTGTGGAAG 55816236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      217 AAGCAGGCTGCCTGAGCCAGCAGCAGCAACCTACTCCGTTTGGCTTCCACACTGTGGAAG 276

 55816237 CTTTGTTCTTTTGCTGTTTGCAATAAATCTTGGTGCTGCTCACTCTTTCGGTCTGCACTG 55816296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      277 CTTTGTTCTTTTGCTGTTTGCAATAAATCTTGGTGCTGCTCACTCTTTCGGTCTGCACTG 336

 55816297 CCTTTATGAGCTATAACACTCACTGCGAAGGTCTGCAGCTTCACTCATGAGGCCAGGGAA 55816356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      337 CCTTTATGAGCTATAACACTCACTGCGAAGGTCTGCAGCTTCACTCATGAGGCCAGGGAA 396

 55816357 ATCACAAACCTACCAAGAGGAATGAACAATTCCAGACAGCAGTAACGAACACTCCAGATG 55816416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      397 ATCACAAACCTACCAAGAGGAATGAACAATTCCAGACAGCAGTAACGAACACTCCAGATG 456

 55816417 CACCGCCTTAAGAGCTGTAACATTCACTGCGAAGGTCTGCCGCTTCGCTCCTGAAGCCAG 55816476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      457 CACCGCCTTAAGAGCTGTAACATTCACTGCGAAGGTCTGCCGCTTCGCTCCTGAAGCCAG 516

 55816477 AGAGACCACGAACCCACCAGAAGGAAGAAACTGTGAACACATCCGAACATCAGAAGGAAG 55816536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      517 AGAGACCACGAACCCACCAGAAGGAAGAAACTGTGAACACATCCGAACATCAGAAGGAAG 576

 55816537 AAACTCCGGACACACTATCTTTAAGAACTGTAACACTCACCATGAGGGTCTGTGGCTTCA 55816596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      577 AAACTCCGGACACACTATCTTTAAGAACTGTAACACTCACCATGAGGGTCTGTGGCTTCA 636

 55816597 TCCTTGAAGTGGGTGAGACGAAGAACCCACCAATTCTGGACACACTTGCACGTCACTCAG 55816656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      637 TCCTTGAAGTGGGTGAGACGAAGAACCCACCAATTCTGGACACACTTGCACGTCACTCAG 696

 55816657 AAGTCTGAAGGAGGGAGAGGCAGGTTGTCAGAATGTCTGAAGAACATCATAGATTCAAAC 55816716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      697 AAGTCTGAAGGAGGGAGAGGCAGGTTGTCAGAATGTCTGAAGAACATCATAGATTCAAAC 756

 55816717 AATGTTGAATGAGGCGTGTGATATAGCATAGGGGAGTGACAAGCTGAAGCTGAACAAGGA 55816776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      757 AATGTTGAATGAGGCGTGTGATATAGCATAGGGGAGTGACAAGCTGAAGCTGAACAAGGA 816

 55816777 GACAACTATGGTCATGAAAGGCATTTCACGATATGCCCATTAATATGAAATTCTTCCTGA 55816836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      817 GACAACTATGGTCATGAAAGGCATTTCACGATATGCCCATTAATATGAAATTCTTCCTGA 876

 55816837 AGCATTGGAGAACCACTGAAGGCTTTTAAAAAGCTACCCCTTTTTATTATTATTAAAATA 55816896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 AGCATTGGAGAACCACTGAAGGCTTTTAAAAAGCTACCCCTTTTTATTATTATTAAAATA 936

 55816897 GTATTTTTGCATTATTTTTAATGAAAAGATTAATTAGCCCTTTGACTTACCTTCCAGAAA 55816956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 GTATTTTTGCATTATTTTTAATGAAAAGATTAATTAGCCCTTTGACTTACCTTCCAGAAA 996

 55816957 CAAGTTGATTAATGTACAAATTTATAGAAAACAGTAATACAGATCTTAGTGTATGCCAAA 55817016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 CAAGTTGATTAATGTACAAATTTATAGAAAACAGTAATACAGATCTTAGTGTATGCCAAA 1056

 55817017 TGCTGTTCAAAGTAAGTTATATTTATTAACCCATTTAATCTTCACAGCAGCCCTATTACG 55817076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 TGCTGTTCAAAGTAAGTTATATTTATTAACCCATTTAATCTTCACAGCAGCCCTATTACG 1116

 55817077 TAGTTATGATTATAGTTTTCATTTAACAAAGAGAAAACGGAAGCTCAGAAAGACTAACTG 55817136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 TAGTTATGATTATAGTTTTCATTTAACAAAGAGAAAACGGAAGCTCAGAAAGACTAACTG 1176

 55817137 GCACGGGGTCCTAGAGCTTGTTAAAGTGGTGGAGTTAGGCTTTCAACCTAGCAATTATGG 55817196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 GCACGGGGTCCTAGAGCTTGTTAAAGTGGTGGAGTTAGGCTTTCAACCTAGCAATTATGG 1236

 55817197 CTCCATGACCTATATTCTTAACAACTTGGCTACAGTGCTTCATGTATCTACATATGTTGT 55817256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 CTCCATGACCTATATTCTTAACAACTTGGCTACAGTGCTTCATGTATCTACATATGTTGT 1296

 55817257 ATGCATGTGTGGGAAAATGACCTATGCTGTTGAAAACTATGCTACAGTGCTACATATATT 55817316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 ATGCATGTGTGGGAAAATGACCTATGCTGTTGAAAACTATGCTACAGTGCTACATATATT 1356

 55817317 TACATGTGTTTGTATGTGTGTAAAAAAATGAAACAAATATTCTAATACAAATTACATACT 55817376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 TACATGTGTTTGTATGTGTGTAAAAAAATGAAACAAATATTCTAATACAAATTACATACT 1416

 55817377 CTACATTTTATTCTGCACCCTTTCCTTCCAATTAGTCATATACCTTGAAGATATTTTCTT 55817436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 CTACATTTTATTCTGCACCCTTTCCTTCCAATTAGTCATATACCTTGAAGATATTTTCTT 1476

 55817437 AACAACACAACTTGATTCTTAGGGACTGCAAAGTATTCCATTATGTGAACATTCCAAACT 55817496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 AACAACACAACTTGATTCTTAGGGACTGCAAAGTATTCCATTATGTGAACATTCCAAACT 1536

 55817497 GGAAGGAGATATTTGTATATTTCTATAGTGATAAATGTTTAGGTTATTTACAGGTTTGGG 55817556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 GGAAGGAGATATTTGTATATTTCTATAGTGATAAATGTTTAGGTTATTTACAGGTTTGGG 1596

 55817557 TCTTTGAAATAATGCTGCAACAAAACCAGTACCAGTGGAATTGTTCAAAGGAAACATTTC 55817616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 TCTTTGAAATAATGCTGCAACAAAACCAGTACCAGTGGAATTGTTCAAAGGAAACATTTC 1656

 55817617 TAATATTGAAAAATAACACAAAAGTGCTCATCATAAATAAAAATGTTTAATAGCTTTACC 55817676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 TAATATTGAAAAATAACACAAAAGTGCTCATCATAAATAAAAATGTTTAATAGCTTTACC 1716

 55817677 ATCACGAGAGTGTCTATTACCTGCACATTCTTGGCGACGTCAAGTTTTCATCAAATTTTG 55817736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 ATCACGAGAGTGTCTATTACCTGCACATTCTTGGCGACGTCAAGTTTTCATCAAATTTTG 1776

 55817737 TTTTTAAATGTTTTGCCCATCTGACGAGTAAAAAGTGAACCCTGTAGCATTTTTTAAATA 55817796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 TTTTTAAATGTTTTGCCCATCTGACGAGTAAAAAGTGAACCCTGTAGCATTTTTTAAATA 1836

 55817797 GCTCGATGTGATGAAAACGGGGTTTTGGAAAGCTCATGCTGAGACAATATGGAGTTTAGC 55817856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 GCTCGATGTGATGAAAACGGGGTTTTGGAAAGCTCATGCTGAGACAATATGGAGTTTAGC 1896

 55817857 TTGGTCACACCAAGACTCAATGCAGAAGAGATGGAGAGGAGACAATTACAATAGACTGTG 55817916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 TTGGTCACACCAAGACTCAATGCAGAAGAGATGGAGAGGAGACAATTACAATAGACTGTG 1956

 55817917 TAACAGATGAAGACAGCTTAACTGGGGCAGTGCCTGGAATGTATTAGGGGAAATAGATAT 55817976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 TAACAGATGAAGACAGCTTAACTGGGGCAGTGCCTGGAATGTATTAGGGGAAATAGATAT 2016

 55817977 GATAGAGGCACTATCAAAAAGTCCAGCTGTTGAGGAGGTACAGCAATAGACCTTTGTTCC 55818036
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2017 GATAGAGGCACTATCAAAAAGTCCAGCTGTTGAGGAGGTACAGCAATAGACCTCTGTTCC 2076

 55818037 TGATACTTAATATTGTGTTAAGGGTGGGCGAGACGGAGGAAGGATTCAAGAATACCTCCT 55818096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 TGATACTTAATATTGTGTTAAGGGTGGGCGAGACGGAGGAAGGATTCAAGAATACCTCCT 2136

 55818097 AGGTTTATGAGTTGGGAAGCCAGGATGATTGCAATGAAAATAACTGTCCTAGAAAACACA 55818156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 AGGTTTATGAGTTGGGAAGCCAGGATGATTGCAATGAAAATAACTGTCCTAGAAAACACA 2196

 55818157 GAAAAAAGCAAAGATTTGGGAGCATGCCAGATAAAACGGGAATGATTTTAAAGGTCGTGT 55818216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 GAAAAAAGCAAAGATTTGGGAGCATGCCAGATAAAACGGGAATGATTTTAAAGGTCGTGT 2256

 55818217 ACAAATCTAAGATGCTATAGTTTATTTATGGAAACTACCTTCATCTGTGGCAGAGGCTAT 55818276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 ACAAATCTAAGATGCTATAGTTTATTTATGGAAACTACCTTCATCTGTGGCAGAGGCTAT 2316

 55818277 TTCAAAATACTCACATCTATTTAATGTCACTTAATGAATCACGGAATTTTGCAGTGCTAT 55818336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 TTCAAAATACTCACATCTATTTAATGTCACTTAATGAATCACGGAATTTTGCAGTGCTAT 2376

 55818337 GAAATCCCTTAAATCAAACTAACTAGCACACTTATGAAACCAGAGTACTATCTTACTATG 55818396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 GAAATCCCTTAAATCAAACTAACTAGCACACTTATGAAACCAGAGTACTATCTTACTATG 2436

 55818397 CCAGAGTATTCTTTTCGTATTCTGCCATCTAGTGAACAACAATCATTTGTACAACCTGGC 55818456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 CCAGAGTATTCTTTTCGTATTCTGCCATCTAGTGAACAACAATCATTTGTACAACCTGGC 2496

 55818457 TTGTAAATTGCTTCTTCCAAATTTAAAATAAACACACACGCACACGCACACGCACCCCTT 55818516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 TTGTAAATTGCTTCTTCCAAATTTAAAATAAACACACACGCACACGCACACGCACCCCTT 2556

 55818517 CATTTTATGCTTTCTCATTATATATACTGGCAAAATATTCTTTCATGATATTTTACAAAC 55818576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 CATTTTATGCTTTCTCATTATATATACTGGCAAAATATTCTTTCATGATATTTTACAAAC 2616

 55818577 AAAATTCCTAAACATAGAGGAAAGAATAGAGTTCATCAGCTGAATCTGCACATTTCACCT 55818636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 AAAATTCCTAAACATAGAGGAAAGAATAGAGTTCATCAGCTGAATCTGCACATTTCACCT 2676

 55818637 TGGGCTCATTTTGAAATTTATATTTTTAAAGTCAAGGGAAATTCACAAGTTTCCTTTACA 55818696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 TGGGCTCATTTTGAAATTTATATTTTTAAAGTCAAGGGAAATTCACAAGTTTCCTTTACA 2736

 55818697 TTATGCCATCTCCTTTTATCATTAAAAACAACAAAAACAAAACATTTACTTGTCAGCAAC 55818756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 TTATGCCATCTCCTTTTATCATTAAAAACAACAAAAACAAAACATTTACTTGTCAGCAAC 2796

 55818757 TTTCTTCTCTGTAATAAAATACCTTTATATAAATTATCTTTCTCCTGCAATGAGCATTGT 55818816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 TTTCTTCTCTGTAATAAAATACCTTTATATAAATTATCTTTCTCCTGCAATGAGCATTGT 2856

 55818817 TTAATATTATCAAAAGTTTTTTATCTCAAAAATTATTGTACATGATACACTAGAGATATT 55818876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 TTAATATTATCAAAAGTTTTTTATCTCAAAAATTATTGTACATGATACACTAGAGATATT 2916

 55818877 ATTTGAATGTTGTGGAAGTACCTTGTACAAATTTATTTTCTTGATATTTAGTTCTATAAA 55818936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 ATTTGAATGTTGTGGAAGTACCTTGTACAAATTTATTTTCTTGATATTTAGTTCTATAAA 2976

 55818937 AGCTTCCCTGATTTCTCCTAAGGTGGTCACTTATTTTGTGCTGTTAGCGTACCTTTGTGT 55818996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 AGCTTCCCTGATTTCTCCTAAGGTGGTCACTTATTTTGTGCTGTTAGCGTACCTTTGTGT 3036

 55818997 CACTAGTATTGTGGTAGTATTATACTATATTTTAAATATTCATTTTCAAGCCTATCTTTG 55819056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 CACTAGTATTGTGGTAGTATTATACTATATTTTAAATATTCATTTTCAAGCCTATCTTTG 3096

 55819057 CAAAGGGCTCATGAATTTCCTGATTAAAGGGACTATGTAATATTCAGTTTTATGTCTCCA 55819116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 CAAAGGGCTCATGAATTTCCTGATTAAAGGGACTATGTAATATTCAGTTTTATGTCTCCA 3156

 55819117 ATAACTCTCATGATGTATGGTATCTATTAGTTTTCAATAAATGTTAACGAATGATTTAAA 55819176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 ATAACTCTCATGATGTATGGTATCTATTAGTTTTCAATAAATGTTAACGAATGATTTAAA 3216

 55819177 ATGATTGAACTGAATTATTGACAGATGTTTGAAACTTGACTAATTTTTATTCAAGTTGAA 55819236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 ATGATTGAACTGAATTATTGACAGATGTTTGAAACTTGACTAATTTTTATTCAAGTTGAA 3276

 55819237 ATAATATGTAAAGTAAGCAATCACAACATTCAGCTTCCTTCATGAAGTCCAGAAGAGAAC 55819296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 ATAATATGTAAAGTAAGCAATCACAACATTCAGCTTCCTTCATGAAGTCCAGAAGAGAAC 3336

 55819297 TGAACATATTGCCCAAGTGCCCAGAGGGCCCTAAAATATAGATGTGTGTTCATTAGGCTA 55819356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 TGAACATATTGCCCAAGTGCCCAGAGGGCCCTAAAATATAGATGTGTGTTCATTAGGCTA 3396

 55819357 ATTGGAGACAGGTAGACAAAAATCCTCCTTTGAAATTTGTCCTCATAGGCAATGGCATTA 55819416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 ATTGGAGACAGGTAGACAAAAATCCTCCTTTGAAATTTGTCCTCATAGGCAATGGCATTA 3456

 55819417 TTCCCAGGCTTATCAAGTTCTTTCCCTTGGCAGATCTCTGTGGTCCATCTGCTGAACTTA 55819476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 TTCCCAGGCTTATCAAGTTCTTTCCCTTGGCAGATCTCTGTGGTCCATCTGCTGAACTTA 3516

 55819477 AATGCTGAAATGGTCTCAATGTGAACATGCCTAATGGACATCTTTATTCTGAGTGGCTAT 55819536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 AATGCTGAAATGGTCTCAATGTGAACATGCCTAATGGACATCTTTATTCTGAGTGGCTAT 3576

 55819537 ACCAGCACAATCCATAAATCTGAGCTATTTCAGATTACAAATGGAATTGTTCTCCACAGT 55819596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 ACCAGCACAATCCATAAATCTGAGCTATTTCAGATTACAAATGGAATTGTTCTCCACAGT 3636

 55819597 GTTCCATTGCCTTATAGATAATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTCT 55819656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 GTTCCATTGCCTTATAGATAATAATTTTGGATGAAAGCCCAAACTCATGAAATTAGCTCT 3696

 55819657 AAGAGTTCAATTGATATTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATAT 55819716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 AAGAGTTCAATTGATATTAGCAATGTACATTGCTTGCAAGTCCTCTTAATTCATCTATAT 3756

 55819717 ATCTGAACTCATTCATTTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACTC 55819776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 ATCTGAACTCATTCATTTTACTATTTCCAAGCTAATTCTATGGAGTTCAAGTAAAGACTC 3816

 55819777 CATCTACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGTT 55819836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 CATCTACTTTGTGGTTTTTGAAAATCCTGTTAGCAAATTCTGTTCTTTTAGGTAACTGTT 3876

 55819837 TTCATTTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATCAAGCATTAAG 55819896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 TTCATTTTTCTTACAGTTTTAGCAACTCCAAGTTTTAAGAACTAATCATCAAGCATTAAG 3936

 55819897 TTTCTCGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCATC 55819956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 TTTCTCGTGGCACACACTGTGATGAAGCTGGGGTGGGTGAGGAATGAAGCTGTAGTCATC 3996

 55819957 CCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTGG 55820016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 CCAGTCTATGATTAGATAGTAATTTAAACTTAGAAGGGGAAATTAGAAATTTTCATTTGG 4056

 55820017 CCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTGATATCTTGAC 55820076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 CCCCCTGTTCCCATCCACAGTTCCTATTAAATTTATCTGTAATAAGACTGATATCTTGAC 4116

 55820077 AGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGTA 55820136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 AGGCCTGACACTTGTGTCTTAGTTCTCAATTAATTCTGAACTTTGGAGGTGAAGAAAGTA 4176

 55820137 GCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGTTTTCTTCT 55820196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 GCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGTTTTCTTCT 4236

 55820197 TTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATCT 55820256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 TTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATCT 4296

 55820257 GTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACAG 55820316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 GTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACAG 4356

 55820317 AACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAATT 55820376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 AACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAATT 4416

 55820377 TTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAAT 55820436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 TTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAAT 4476

 55820437 GAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTTG 55820496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 GAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTTG 4536

 55820497 CAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAATT 55820556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 CAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAATT 4596

 55820557 CGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGACT 55820616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 CGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGACT 4656

 55820617 TCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGTA 55820676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 TCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGTA 4716

 55820677 GAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACAT 55820736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 GAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACAT 4776

 55820737 GTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTCA 55820796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 GTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTCA 4836

 55820797 AAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAGT 55820856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 AAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAGT 4896

 55820857 ATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGCA 55820916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 ATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGCA 4956

 55820917 CTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTAT 55820976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 CTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTAT 5016

 55820977 TCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAGT 55821036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 TCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAGT 5076

 55821037 TTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCCT 55821096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 TTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCCT 5136

 55821097 GATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAATT 55821156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 GATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAATT 5196

 55821157 GGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTTT 55821216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 GGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTTT 5256

 55821217 AATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTGG 55821276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5257 AATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTGG 5316

 55821277 TGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTACA 55821336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 TGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTACA 5376

 55821337 TGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTGA 55821396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5377 TGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTGA 5436

 55821397 AATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCCA 55821456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5437 AATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCCA 5496

 55821457 GCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAACC 55821516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 GCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAACC 5556

 55821517 ACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCAT 55821576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5557 ACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCAT 5616

 55821577 TCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTAA 55821636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5617 TCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTAA 5676

 55821637 ACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAGT 55821696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5677 ACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAGT 5736

 55821697 GAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATCT 55821756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5737 GAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATCT 5796

 55821757 CTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACAT 55821816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5797 CTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACAT 5856

 55821817 TTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAATT 55821876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5857 TTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAATT 5916

 55821877 CCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAGA 55821936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5917 CCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAGA 5976

 55821937 AAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATACT 55821996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5977 AAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATACT 6036

 55821997 GATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATAA 55822056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6037 GATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATAA 6096

 55822057 AAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAAT 55822116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6097 AAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAAT 6156

 55822117 AAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAG 55822176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6157 AAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAAG 6216

 55822177 AAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTATA 55822236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6217 AAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTATA 6276

 55822237 TTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTGG 55822296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6277 TTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTGG 6336

 55822297 TTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCTT 55822356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6337 TTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCTT 6396

 55822357 TAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAGC 55822416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6397 TAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAGC 6456

 55822417 CATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGGA 55822476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6457 CATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGGA 6516

 55822477 CCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTG 55822536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6517 CCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCTG 6576

 55822537 CTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTAC 55822596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6577 CTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTAC 6636

 55822597 CAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATAA 55822656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6637 CAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATAA 6696

 55822657 TACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACT 55822716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6697 TACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACT 6756

 55822717 TACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCT 55822776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6757 TACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCT 6816

 55822777 ACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAA 55822836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6817 ACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAA 6876

 55822837 TTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCACA 55822896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6877 TTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCACA 6936

 55822897 GATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCAT 55822956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6937 GATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCAT 6996

 55822957 GACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTT 55823016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6997 GACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTT 7056

 55823017 CCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGA 55823076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7057 CCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGA 7116

 55823077 GATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAG 55823136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7117 GATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAG 7176

 55823137 CCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCA 55823196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7177 CCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCA 7236

 55823197 GAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGAT 55823256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7237 GAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGAT 7296

 55823257 TGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGT 55823316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7297 TGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGT 7356

 55823317 GCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAA 55823376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7357 GCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAA 7416

 55823377 ACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAG 55823436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7417 ACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAG 7476

 55823437 ATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACAT 55823496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7477 ATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACAT 7536

 55823497 TTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATTT 55823556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7537 TTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATTT 7596

 55823557 TTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAA 55823616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7597 TTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAA 7656

 55823617 GAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAA 55823676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7657 GAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAA 7716

 55823677 GGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATA 55823736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7717 GGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATA 7776

 55823737 AACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTA 55823796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7777 AACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTA 7836

 55823797 GATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGG 55823856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7837 GATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGG 7896

 55823857 ACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGT 55823916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7897 ACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGT 7956

 55823917 TTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCA 55823976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7957 TTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCA 8016

 55823977 TCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTT 55824036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8017 TCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTT 8076

 55824037 TGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGA 55824096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8077 TGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGA 8136

 55824097 AGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAA 55824156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8137 AGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAA 8196

 55824157 AGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTT 55824216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8197 AGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTT 8256

 55824217 ATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCAT 55824276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8257 ATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCAT 8316

 55824277 TTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAA 55824336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8317 TTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAA 8376

 55824337 TAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTT 55824396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8377 TAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTT 8436

 55824397 CTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCTTACC 55824456
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     8437 CTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCCTACC 8496

 55824457 ATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAAT 55824516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8497 ATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAAT 8556

 55824517 AATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTT 55824576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8557 AATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTT 8616

 55824577 TTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGA 55824636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8617 TTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGA 8676

 55824637 TTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTT 55824696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     8677 TTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTT 8736

 55824697 TGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACA 55824756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8737 TGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACA 8796

 55824757 TGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCT 55824816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8797 TGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCT 8856

 55824817 GTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGG 55824876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8857 GTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGG 8916

 55824877 TTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGT 55824936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8917 TTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGT 8976

 55824937 CTCAAAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCAC 55824996
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8977 CTC-AAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCAC 9035

 55824997 AAGTAAGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAA 55825056
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9036 AAGTAAGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAA 9095

 55825057 CACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTATCATC 55825116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     9096 CACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTATCATC 9155

 55825117 CCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAG 55825176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9156 CCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAG 9215

 55825177 GGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCAT 55825236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9216 GGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCAT 9275

 55825237 GACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTC 55825296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9276 GACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTC 9335

 55825297 TTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTA 55825356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9336 TTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTA 9395

 55825357 CCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAA 55825416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9396 CCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAA 9455

 55825417 TTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAG 55825476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9456 TTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAG 9515

 55825477 AAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATAT 55825536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9516 AAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATAT 9575

 55825537 AAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGG 55825596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9576 AAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGG 9635

 55825597 CAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAA 55825656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9636 CAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAA 9695

 55825657 TAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCA 55825716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9696 TAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCA 9755

 55825717 TTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCA 55825776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9756 TTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCA 9815

 55825777 TTCTAAAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACAT 55825836
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9816 TTCTAAAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACAT 9875

 55825837 AATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTT 55825896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9876 AATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTT 9935

 55825897 AAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAA 55825956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9936 AAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAA 9995

 55825957 TG 55825958
          ||
     9996 TG 9997

Alignment time is 23.6258 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    6337] =>      6337 nucs 'mol-32-3487-024085_6337'

Score:        6291
Aligned:      6335        nucs
Identic:      6331 (100%) nucs =>      1274 (100%)      5057 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55845251,55846524] EXCISED REGION [55846528,55851588]
 second seq =>  [       1,    1274] EXCISED REGION [    1278,    6337]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [1275,1277]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [1275,1275] to [1277,1277]

 55845251 TCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTCATGTTTATTTATTC 55845310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTCATGTTTATTTATTC 60

 55845311 TGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTATTAGAACTGGTTC 55845370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTATTAGAACTGGTTC 120

 55845371 TGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTTTGCTCAATTTTAT 55845430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTTTGCTCAATTTTAT 180

 55845431 TTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAATAAGTAGAAC 55845490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAATAAGTAGAAC 240

 55845491 AACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGACCCCTAGAT 55845550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGACCCCTAGAT 300

 55845551 CTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGCTTTTCAAAC 55845610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGCTTTTCAAAC 360

 55845611 CACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAAAGCCCAAAG 55845670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAAAGCCCAAAG 420

 55845671 TTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCATTTTAAACTC 55845730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCATTTTAAACTC 480

 55845731 TGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTATAATACTTA 55845790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTATAATACTTA 540

 55845791 GAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATTATAGTCTGC 55845850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATTATAGTCTGC 600

 55845851 CTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTATGAATGAGA 55845910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTATGAATGAGA 660

 55845911 ATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGACAGGA 55845970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGACAGGA 720

 55845971 CTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATTTGTAG 55846030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATTTGTAG 780

 55846031 TCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATGAGCTA 55846090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATGAGCTA 840

 55846091 TTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGCCTCTT 55846150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGCCTCTT 900

 55846151 CCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATGCAATA 55846210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATGCAATA 960

 55846211 GGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCCCTGTG 55846270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCCCTGTG 1020

 55846271 TAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGCACAGG 55846330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGCACAGG 1080

 55846331 GCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATTTTATT 55846390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATTTTATT 1140

 55846391 GTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTCTTCCT 55846450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTCTTCCT 1200

 55846451 TATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTTTTAAA 55846510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTTTTAAA 1260

 55846511 ACACAGAGAGAAAG 55846524
          ||||||||||||||
     1261 ACACAGAGAGAAAG 1274

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 1337

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 1397

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 1457

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 1517

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 1577

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 1637

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 1697

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 1757

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 1817

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 1877

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 1937

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 1997

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 2057

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2058 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 2117

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 2177

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 2237

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 2297

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 2357

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 2417

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTG 55847727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2418 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTG 2476

 55847728 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 55847787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 2536

 55847788 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 55847847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 2596

 55847848 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 55847907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 2656

 55847908 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 55847967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 2716

 55847968 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 55848027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 2776

 55848028 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 55848087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 2836

 55848088 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAAC 55848147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2837 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAAC 2896

 55848148 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 55848207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 2956

 55848208 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 55848267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 3016

 55848268 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 55848327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 3076

 55848328 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 55848387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGA 3136

 55848388 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 55848447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 AAGTGGGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAA 3196

 55848448 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 55848507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 GACCTCAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAAC 3256

 55848508 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 55848567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 CCATAAGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGG 3316

 55848568 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 55848627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 CACCTCTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTC 3376

 55848628 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 55848687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 TCAAGGGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTA 3436

 55848688 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 55848747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3437 ATAAACTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAA 3496

 55848748 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 55848807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3497 GGGGGTGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATT 3556

 55848808 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 55848867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3557 CATTGTGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCT 3616

 55848868 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 55848927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3617 GTTTTTGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTT 3676

 55848928 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 55848987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3677 TTTAGATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAA 3736

 55848988 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 55849047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3737 GGGATTACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTA 3796

 55849048 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 55849107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3797 GTCATGGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCC 3856

 55849108 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 55849167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 TAGGAGCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGA 3916

 55849168 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 55849227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 ATGAGGCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGC 3976

 55849228 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 55849287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3977 TTCTAGAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTG 4036

 55849288 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 55849347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 TAGCCCAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCC 4096

 55849348 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 55849407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 TCAGATAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAAT 4156

 55849408 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 55849467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 GTAAGTAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGT 4216

 55849468 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 55849527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 TTAAGGAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAG 4276

 55849528 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 55849587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 AAATTTTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAA 4336

 55849588 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 55849647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4337 GACTTGGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAA 4396

 55849648 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCA 55849707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 GGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCA 4456

 55849708 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 55849767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4457 GGCAAGAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCAT 4516

 55849768 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 55849827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4517 GAGAACTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCA 4576

 55849828 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 55849887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4577 CCTCCCACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAG 4636

 55849888 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 55849947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4637 ATTTGGGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGC 4696

 55849948 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 55850007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4697 GCTCAGAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTT 4756

 55850008 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 55850067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4757 ATTTTAGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATA 4816

 55850068 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 55850127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4817 CGCTACACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGA 4876

 55850128 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 55850187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4877 TTAAAGATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGT 4936

 55850188 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATT 55850247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4937 TTTTATCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATT 4996

 55850248 TGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACA 55850307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4997 TGTCATGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACA 5056

 55850308 GTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGAT 55850367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5057 GTTTTGAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGAT 5116

 55850368 GTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGC 55850427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5117 GTTTTTCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGC 5176

 55850428 AGAAAACTGCATAGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAG 55850487
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5177 AGAAAACTGCATGGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAG 5236

 55850488 TTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAG 55850547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5237 TTCCCACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAG 5296

 55850548 CCTCCAACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAA 55850607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5297 CCTCCAACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAA 5356

 55850608 GGAACGCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGA 55850667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5357 GGAACGCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGA 5416

 55850668 GCCTATATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAA 55850727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5417 GCCTATATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAA 5476

 55850728 ATTTCTCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTA 55850787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5477 ATTTCTCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTA 5536

 55850788 TTGACCTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATC 55850847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5537 TTGACCTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATC 5596

 55850848 TATCCCTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTT 55850907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5597 TATCCCTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTT 5656

 55850908 GAGCTGTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGA 55850967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5657 GAGCTGTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGA 5716

 55850968 TTAATGCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAACTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTT 55851027
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     5717 TTAATGCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAGCTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTT 5776

 55851028 TTTCAAACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTG 55851087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5777 TTTCAAACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTG 5836

 55851088 CATATCAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCT 55851147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5837 CATATCAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCT 5896

 55851148 CTGACTTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTT 55851207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5897 CTGACTTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTT 5956

 55851208 CTGTGAGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGTATGGAGGGCATGCTTTAAAAGAGCA 55851267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5957 CTGTGAGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGTATGGAGGGCATGCTTTAAAAGAGCA 6016

 55851268 AAGTTACCACCCTATGAAACAAAATATGGGGTGATAACACCTGTAGTAATAAGAAAATGT 55851327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6017 AAGTTACCACCCTATGAAACAAAATATGGGGTGATAACACCTGTAGTAATAAGAAAATGT 6076

 55851328 TTTTGCATTAGCACATGCCATTCCACCTTATGAGACACAGGACATCCTCAGACTAACAGC 55851387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6077 TTTTGCATTAGCACATGCCATTCCACCTTATGAGACACAGGACATCCTCAGACTAACAGC 6136

 55851388 CTCTCTGTATCTTAAACTATCTCAAACACTAAGAGTTACCTCTTAGGATTCATGGAAATT 55851447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6137 CTCTCTGTATCTTAAACTATCTCAAACACTAAGAGTTACCTCTTAGGATTCATGGAAATT 6196

 55851448 AAAACACATTAAAGATGTTCATTGTGGTGAGTAACATATTCTGATTATCAGAGGCCATTA 55851507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6197 AAAACACATTAAAGATGTTCATTGTGGTGAGTAACATATTCTGATTATCAGAGGCCATTA 6256

 55851508 GAACAACTCTGCCTATAGCCAGTAACTTCCAAATTGACCTTCCACTAAAAATCACAAATT 55851567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6257 GAACAACTCTGCCTATAGCCAGTAACTTCCAAATTGACCTTCCACTAAAAATCACAAATT 6316

 55851568 TACACACACACACACATATAC 55851588
          |||||||||||||||||||||
     6317 TACACACACACACACATATAC 6337

Alignment time is 14.9779 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5904] =>      5904 nucs 'mol-32-3492-177794_5904'

Score:        5839
Aligned:      5905        nucs
Identic:      5899 (100%) nucs =>      4801 (100%)      1098 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55820136,55824939] EXCISED REGION [55824942,55826042]
 second seq =>  [       1,    4803] EXCISED REGION [    4804,    5904]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55824940,55824941]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [55824940,55824953] to [55824942,55824955]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55824940,55824940] to [55824941,55824941]
 second seq =>         0 nucs

 55820136 AGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGTTTTCTTC 55820195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCATAAGTTATTATTAGCTTCCTTAGATACCAACATATAACATTAATTATGTTTTCTTC 60

 55820196 TTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATC 55820255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTCATCTATTGCTACTGAGCTGGCTTTGATTTTCTCAATTATCATGAGGCACATGATC 120

 55820256 TGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACA 55820315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTGAAATATACTGCTTCTATTATCATCTTTACAATGAAAAGCTTGAAAAGTTACAAACA 180

 55820316 GAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAAT 55820375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAACCAATCAGTATGAAATAGAAAAATAAGACTCAAGCATTTTTTTAAAAGGCAGAAAAT 240

 55820376 TTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAA 55820435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTAAATAATTATATAAAATAATTAAAAGGAACTTTTAAAAAGATTCAACACTTAGGTAA 300

 55820436 TGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTT 55820495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAGATTCATAATAATGTGAAAGAGGACAGACGTGTTAAAAAGAAAAGGAGCTTTGTCTT 360

 55820496 GCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAAT 55820555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCAGAAAAAAAACTGGGATAATAGAACTCCCCCAAGAGAACCATGGGAAGTTGGAGGAAT 420

 55820556 TCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGAC 55820615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCGTGGTTTTAAAGAATCAGCAGGTTCTCAAGACAATAAAATACACCTGGCAATTGAGAC 480

 55820616 TTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGT 55820675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCACAAGGAATGACAGTCAAGCCATTGCCTAAAGGCTTCCTGGATGACAAAGGGCCAGT 540

 55820676 AGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACA 55820735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAGCCTTGCAAGGACAGCTTCTGGTGTCCAATTTTTCTCTAGAGAGAAGACAGTCCACA 600

 55820736 TGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTC 55820795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTCACACAGTCAAATTGGACACTGACTCACTAGGTAAGGCCAAAGTCTTCTGCTCTTTC 660

 55820796 AAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAG 55820855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAACAGATATTTGTTTATAGCTATTGCTTTGAATCTGTAGGATTATCTTTGTTTATAAG 720

 55820856 TATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGC 55820915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATACTTAGGGCCAAACCTTCCTCAACTCAGCTCCTGGGTGACTTCCTGGATTTCTAGGC 780

 55820916 ACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTA 55820975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTAATGTTCAAATTGCCCAGCAACTTCAAACATGCCATTATTCTATTTAGGCATTTTTA 840

 55820976 TTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAG 55821035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTAACACCTACTTTGGTATTTATCCTTTGTTGTCCTCTTTTATTCCCAAGTATTAGAG 900

 55821036 TTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCC 55821095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTTGATACTGCAGTTCTTTCAGATACCAATTGTTGCCCTAGATGATAAAAAACCAGCC 960

 55821096 TGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAAT 55821155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGATCTAATGTTCATCAGGAGTTCTGAGGGTAGAAAATGTTTGTTTCTGGGAAAAGGAAT 1020

 55821156 TGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTT 55821215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGAATATGTAAAGAGGATCAGGAACACGTCTTAGTGTATGTATGTGTTGTAAAGAGCTT 1080

 55821216 TAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTG 55821275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAATATATAGCATTACATATAAAACATCAGATTCTAGAACTTAGGAAATGGAGTATGTTG 1140

 55821276 GTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTAC 55821335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGAAATTTTAAAACTAAGTGAAATAAAGATGCAAACAAAAATGTTAGTAAAATTCTTAC 1200

 55821336 ATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTG 55821395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGAATGTAGATCAGTCTGATCCTCAGACCAGCAGCATCAGCATCACCTGAATCTATTTG 1260

 55821396 AAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCC 55821455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAATGCAAATTCTTCTACCCCCTCCCCTGATCTACCAGATAGAAACTGTGGGTGGGATCC 1320

 55821456 AGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAAC 55821515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCAGTCAGGGTTAGAACAAGGCCTTCAGGTGATTCTGATAAATAGTAAAGTTTGCAAAC 1380

 55821516 CACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCA 55821575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CACTGGCATAGTCTATAAATAAGTTAAAAATTCATCCCAAGTTATTTCTTAAGAATCTCA 1440

 55821576 TTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTA 55821635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCACACTTTATATAATAAATGAATGCTGGGAATTTGAAATGAAAGAAATAACAAGTTTA 1500

 55821636 AACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAG 55821695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AACAGCCACATGGTAACGACTGACAACATTTGATATTAATTACAAGTTGGAATTGACAAG 1560

 55821696 TGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATC 55821755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAATTATTTGTAATTGACATACATTAAGTTTGAAGGAAGCTAGAGTATTTTTAAACATC 1620

 55821756 TCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACA 55821815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTTAAGTGTATAGAGACTGTCTTCTAAATAGCAGATAATAGAACTAGTATTATATTACA 1680

 55821816 TTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAAT 55821875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTATTTCTGCTCAGCTAAACTTATAAGGAAGTCAGTAAAATTTTCAAAGGCAACAAAT 1740

 55821876 TCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAG 55821935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCTTTAATGAAGCCAAGCTAACAAAGAGAAAATCAAATAAAAATCCTTTGCTTGAGAAG 1800

 55821936 AAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATAC 55821995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAATATCAGATGTAAGAAGAACACAGAAGAGAAATCAACAGCTGGGCTGAGCAACATAC 1860

 55821996 TGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATA 55822055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGATAAGGCTCCGATGACTGGAGGAACACCAGGGTCCTTTGCCTCACGCCGATTTAGATA 1920

 55822056 AAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAA 55822115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAGAATATGGGACACACATGGAGTGGTTTTAAGGTGCAGAGAGTTAAATAGGCAAAAAA 1980

 55822116 TAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAA 55822175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAAAGAAGGAAGAAGCTCCCCCATACAGAGACGGATGGAGGGGGCTCCAAGCCCAGAGAA 2040

 55822176 GAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTAT 55822235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAAACCCCGAGTGCTGGGGTGGTAGGGGGCAGGCAGGGGCAGGCAGGAACAGGCGGTTAT 2100

 55822236 ATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTG 55822295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTAGGATACTAGGAGGCTGGAGAAGGTGATGTCTGATTTGCATAGGGCCCAGGGGATTG 2160

 55822296 GTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCT 55822355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTTTGACCAGGTATGTCATTCACGTAGCCAGCCAAAAAATTGGCCCTCTCACCCTAGCCT 2220

 55822356 TTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAG 55822415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTAAATATGCAAATGCAGGGTGCCGTGATGTCCTGCATATGTGGGGTTATCTGGGGACAG 2280

 55822416 CCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGG 55822475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCATGATGGTTGCCACAGGGGGTGACAAGGAGAAGAGGGCGGAATCGCCGTATTGGATGG 2340

 55822476 ACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCT 55822535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACCCAGTTTCTAATGGCCTGCATTCGCTTATCAAAGCTTGCCAGCCTGGCCCTTCAAGCT 2400

 55822536 GCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAAACCTTA 55822595
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     2401 GCTTTTCTGCTAGACAAGAAATGTTTCTGGAGCTGCTTTAAAAGAAAAAAAAAA-CCTTA 2459

 55822596 CCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATA 55822655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATA 2519

 55822656 ATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCAC 55822715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCAC 2579

 55822716 TTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGC 55822775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGC 2639

 55822776 TACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAA 55822835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAA 2699

 55822836 ATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCAC 55822895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCAC 2759

 55822896 AGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCA 55822955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 AGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCA 2819

 55822956 TGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTT 55823015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTT 2879

 55823016 TCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTG 55823075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTG 2939

 55823076 AGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGA 55823135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 AGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGA 2999

 55823136 GCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGC 55823195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 GCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGC 3059

 55823196 AGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGA 55823255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGA 3119

 55823256 TTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGG 55823315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGG 3179

 55823316 TGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACA 55823375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACA 3239

 55823376 AACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAA 55823435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 AACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAA 3299

 55823436 GATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACA 55823495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACA 3359

 55823496 TTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATT 55823555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATT 3419

 55823556 TTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAA 55823615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAA 3479

 55823616 AGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAA 55823675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 AGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAA 3539

 55823676 AGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAAT 55823735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAAT 3599

 55823736 AAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATT 55823795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 AAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATT 3659

 55823796 AGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTG 55823855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 AGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTG 3719

 55823856 GACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAG 55823915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAG 3779

 55823916 TTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTC 55823975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTC 3839

 55823976 ATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACT 55824035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 ATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACT 3899

 55824036 TTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGG 55824095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGG 3959

 55824096 AAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCA 55824155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 AAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCA 4019

 55824156 AAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTT 55824215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 AAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTT 4079

 55824216 TATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCA 55824275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 TATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCA 4139

 55824276 TTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGA 55824335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGA 4199

 55824336 ATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGT 55824395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 ATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGT 4259

 55824396 TCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCTTAC 55824455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4260 TCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCCTAC 4319

 55824456 CATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAA 55824515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 CATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAA 4379

 55824516 TAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACT 55824575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 TAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACT 4439

 55824576 TTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAG 55824635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAG 4499

 55824636 ATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACT 55824695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4500 ATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACT 4559

 55824696 TTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAAC 55824755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 TTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAAC 4619

 55824756 ATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACC 55824815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 ATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACC 4679

 55824816 TGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAG 55824875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 TGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAG 4739

 55824876 GTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTG 55824935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 GTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTG 4799

 55824936 TCTC 55824939
          ||||
     4800 TCTC 4803

EXCISED REGION

 55824942 AAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTA 55825001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4804 AAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTA 4863

 55825002 AGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACAT 55825061
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4864 AGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACAT 4923

 55825062 TGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTATCATCCCGAA 55825121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4924 TGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTATCATCCCGAA 4983

 55825122 TTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGC 55825181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4984 TTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGC 5043

 55825182 AGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTT 55825241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5044 AGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTT 5103

 55825242 GCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACC 55825301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5104 GCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACC 5163

 55825302 AAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGT 55825361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5164 AAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGT 5223

 55825362 GACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCA 55825421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5224 GACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCA 5283

 55825422 GTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATT 55825481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5284 GTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATT 5343

 55825482 TCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATA 55825541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5344 TCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATA 5403

 55825542 TAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAAC 55825601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5404 TAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAAC 5463

 55825602 ACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAAC 55825661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5464 ACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAAC 5523

 55825662 AGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTA 55825721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5524 AGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTA 5583

 55825722 CTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTA 55825781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5584 CTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTA 5643

 55825782 AAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAA 55825841
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5644 AAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAA 5703

 55825842 TTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCC 55825901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5704 TTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCC 5763

 55825902 ATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAATGATC 55825961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5764 ATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAATGATC 5823

 55825962 TACTTTTATAATATATATAAAATTATATTATTTTTGTAATATATATAAAAAATATGATTT 55826021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5824 TACTTTTATAATATATATAAAATTATATTATTTTTGTAATATATATAAAAAATATGATTT 5883

 55826022 TATATATAAAAAGATCTATTT 55826042
          |||||||||||||||||||||
     5884 TATATATAAAAAGATCTATTT 5904

Alignment time is 13.741 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3599] =>      3599 nucs 'mol-32-349d-129120_3599'

Score:        3575
Aligned:      3597        nucs
Identic:      3595 (100%) nucs =>      1768 (100%)      1827 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55844757,55846524] EXCISED REGION [55846528,55848356]
 second seq =>  [       1,    1768] EXCISED REGION [    1772,    3599]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [55846525,55846527]
 second seq =>         3 nucs [1769,1771]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846524,55846524] to [55846527,55846527]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55846525,55846525] to [55846527,55846527]
 second seq =>         1 nucs [1769,1769] to [1771,1771]

 55844757 TTTTCCATCATATATTGCAGTTTTTTCTGTTCTGTGCATTTGCTTTTAATGCCATACACT 55844816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTCCATCATATATTGCAGTTTTTTCTGTTCTGTGCATTTGCTTTTAATGCCATACACT 60

 55844817 ATATTACTTATTATCAATATATTTTATTATTTATGTAACAAACCAACAAAAATTTTCCTC 55844876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATTACTTATTATCAATATATTTTATTATTTATGTAACAAACCAACAAAAATTTTCCTC 120

 55844877 TTAGTTTGTGATTTTGATGTCATTTCAAAGGCCATTAACAACCCAAGACAACATAATTAT 55844936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAGTTTGTGATTTTGATGTCATTTCAAAGGCCATTAACAACCCAAGACAACATAATTAT 180

 55844937 TTCTCTGTAATATTCCTAGTTTTATTTTTTTCTTTAAACTTCAACATATCAAGTGTTTTA 55844996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTCTGTAATATTCCTAGTTTTATTTTTTTCTTTAAACTTCAACATATCAAGTGTTTTA 240

 55844997 ATGTAAGCTTGAAGTATCACTTCAAATTTTTTTCCAAGCAGCACAGTTATTCTAATGTTA 55845056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTAAGCTTGAAGTATCACTTCAAATTTTTTTCCAAGCAGCACAGTTATTCTAATGTTA 300

 55845057 TTTGATAAATAGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGTAA 55845116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGATAAATAGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGTAA 360

 55845117 CTGTAATTTTTTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCACG 55845176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGTAATTTTTTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCACG 420

 55845177 GTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTGTA 55845236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTTTCATACTACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTGTA 480

 55845237 TTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTC 55845296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTGTTGAAAGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTC 540

 55845297 ATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTT 55845356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGTTTATTTATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTT 600

 55845357 ATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATT 55845416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTAGAACTGGTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATT 660

 55845417 TTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAA 55845476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGCTCAATTTTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAA 720

 55845477 GGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAAC 55845536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGAATAAGTAGAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAAC 780

 55845537 AAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAAC 55845596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGACCCCTAGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAAC 840

 55845597 AGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGA 55845656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTGCTTTTCAAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGA 900

 55845657 ACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGG 55845716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTAAAGCCCAAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGG 960

 55845717 TTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTT 55845776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCATTTTAAACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTT 1020

 55845777 ATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTA 55845836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTATAATACTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTA 1080

 55845837 ATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTT 55845896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATATTATAGTCTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTT 1140

 55845897 CTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCT 55845956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGTATGAATGAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCT 1200

 55845957 GTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAA 55846016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTACATGGACAGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAA 1260

 55846017 TAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCAT 55846076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAAATGATTTGTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCAT 1320

 55846077 TACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTT 55846136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TACACTATGAGCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTT 1380

 55846137 CATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCA 55846196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATCTGGGCCTCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCA 1440

 55846197 TGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCA 55846256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGGCAATGCAATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCA 1500

 55846257 CTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAA 55846316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGAAGCCCCTGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAA 1560

 55846317 TGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTG 55846376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGGTGTGCACAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTG 1620

 55846377 GACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTT 55846436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GACAGAATTTTATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTT 1680

 55846437 TTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTT 55846496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCTCTTTCTTCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTT 1740

 55846497 GTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 55846524
          ||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTATTGTTTTTAAAACACAGAGAGAAAG 1768

EXCISED REGION

 55846528 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 55846587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGGATCTACAGAATGATGGGACAACTG 1831

 55846588 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 55846647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 ACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAACAACACTATCATCAAATGAAATTT 1891

 55846648 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 55846707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 GCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGCATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAG 1951

 55846708 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 55846767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 AACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGA 2011

 55846768 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 55846827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 AATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGT 2071

 55846828 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 55846887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 CTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAA 2131

 55846888 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 55846947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 TAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAG 2191

 55846948 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 55847007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 AGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAG 2251

 55847008 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 55847067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 GAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATAC 2311

 55847068 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 55847127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 AATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGA 2371

 55847128 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 55847187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 GATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAA 2431

 55847188 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 55847247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 GAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGA 2491

 55847248 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 55847307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 TGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAG 2551

 55847308 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 55847367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 AAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCAT 2611

 55847368 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 55847427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 TGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCA 2671

 55847428 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 55847487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 ACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCC 2731

 55847488 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 55847547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 TGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCT 2791

 55847548 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 55847607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 TTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACA 2851

 55847608 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 55847667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 ATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGA 2911

 55847668 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTG 55847727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2912 ATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTG 2970

 55847728 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 55847787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 TTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTG 3030

 55847788 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 55847847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 TAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTG 3090

 55847848 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 55847907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 GTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTG 3150

 55847908 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 55847967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 CAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCA 3210

 55847968 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 55848027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 GCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTA 3270

 55848028 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 55848087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 GATGTCCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGG 3330

 55848088 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAAC 55848147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3331 AACCCTAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAAC 3390

 55848148 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 55848207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 GCCTTTCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCT 3450

 55848208 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 55848267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 CATGATATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCC 3510

 55848268 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 55848327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 GATTCATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGA 3570

 55848328 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCA 55848356
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3571 CTAATGAGGAACATGACCCTCCTTTCCCA 3599

Alignment time is 8.53422 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2217] =>      2217 nucs 'mol-32-34b3-055873_2217'

Score:        2130
Aligned:      2218        nucs
Identic:      2210 (100%) nucs =>       564 ( 99%)      1646 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55824373,55824939] EXCISED REGION [55824942,55826592]
 second seq =>  [       1,     567] EXCISED REGION [     568,    2217]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [55824940,55824941]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        14 nucs [55824940,55824953] to [55824942,55824955]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55824940,55824940] to [55824941,55824941]
 second seq =>         0 nucs

 55824373 TATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCA 55824432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCA 60

 55824433 AAGGCTGAAGTCTGCCTTCTTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAA 55824492
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGGCTGAAGTCTGCCTTCCTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAA 120

 55824493 TATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTAC 55824552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTAC 180

 55824553 AACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAA 55824612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAA 240

 55824613 ATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACG 55824672
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      241 ATTACTACTTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCG 300

 55824673 GTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGG 55824732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGG 360

 55824733 TGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATT 55824792
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      361 TGTTTGACACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCGGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATT 420

 55824793 AGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGA 55824852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCCGGGCATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGA 480

 55824853 TTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGC 55824912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGC 540

 55824913 CTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTC 55824939
          |||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTCTC 567

EXCISED REGION

 55824942 AAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTA 55825001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      568 AAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACAAGTA 627

 55825002 AGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACAT 55825061
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      628 AGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAACACAT 687

 55825062 TGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTATCATCCCGAA 55825121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      688 TGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTATCATCCCGAA 747

 55825122 TTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGC 55825181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      748 TTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGGGAGC 807

 55825182 AGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTT 55825241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      808 AGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATGACTT 867

 55825242 GCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACC 55825301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      868 GCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCTTACC 927

 55825302 AAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGT 55825361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      928 AAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTACCAGT 987

 55825362 GACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCA 55825421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      988 GACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAATTTCA 1047

 55825422 GTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATT 55825481
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1048 GTCCCGCAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGAAATT 1107

 55825482 TCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATA 55825541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1108 TCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATAAATA 1167

 55825542 TAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAAC 55825601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1168 TAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGCAAAC 1227

 55825602 ACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAAC 55825661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 ACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAATAAAC 1287

 55825662 AGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTA 55825721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 AGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCATTTTA 1347

 55825722 CTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTA 55825781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 CTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCATTCTA 1407

 55825782 AAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAA 55825841
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 AAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATAATAA 1467

 55825842 TTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCC 55825901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 TTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTAAGCC 1527

 55825902 ATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAATGATC 55825961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 ATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAATGATC 1587

 55825962 TACTTTTATAATATATATAAAATTATATTATTTTTGTAATATATATAAAAAATATGATTT 55826021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 TACTTTTATAATATATATAAAATTATATTATTTTTGTAATATATATAAAAAATATGATTT 1647

 55826022 TATATATAAAAAGATCTATTTTTATAATATATATAAAAATAGATTATTTTATCACATGAT 55826081
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1648 TATATATAAAAAGATCTATTTTTATAATATATAT-AAAATAGATTATTTTATCACATGAT 1706

 55826082 ATATAAAATAGATGGTTTTGTCCTCTCTCATATAATTCGTACTTACACAGGCTCTATAAT 55826141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 ATATAAAATAGATGGTTTTGTCCTCTCTCATATAATTCGTACTTACACAGGCTCTATAAT 1766

 55826142 TCTTCTAGGCTGTAAAATATCCTTTGTAGAAAGAGCTAAATATTAGTACATGGAAATATT 55826201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 TCTTCTAGGCTGTAAAATATCCTTTGTAGAAAGAGCTAAATATTAGTACATGGAAATATT 1826

 55826202 TTCAGCTCCTTATTAAAATATGAGACTGCTGAAAAACAATAATTAGACTTCAATATTTAG 55826261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 TTCAGCTCCTTATTAAAATATGAGACTGCTGAAAAACAATAATTAGACTTCAATATTTAG 1886

 55826262 GAGCTTTTGCATACTTTAAATGCTATGGTTTATTTTTAATATTTTCAAGATTTTATTTTT 55826321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 GAGCTTTTGCATACTTTAAATGCTATGGTTTATTTTTAATATTTTCAAGATTTTATTTTT 1946

 55826322 GAAGATCATAAACCTTAATTATAATTGCAAATAATAAAAAAAGCAGTGGCCAGGCATGGT 55826381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 GAAGATCATAAACCTTAATTATAATTGCAAATAATAAAAAAAGCAGTGGCCAGGCATGGT 2006

 55826382 GGCTCACACCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCATATCATCTGAGGTCA 55826441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 GGCTCACACCTGTAATCCCAGTACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCATATCATCTGAGGTCA 2066

 55826442 GGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAAACCCGTCTCTACTCAAAATACAAAAT 55826501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 GGAGTTCAAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAAACCCGTCTCTACTCAAAATACAAAAT 2126

 55826502 GAGCTGGGTGTAGTAGCACGTGCCTGTCATCCCAGCTGCTTGGTAGGCTTAGGCAGGACA 55826561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 GAGCTGGGTGTAGTAGCACGTGCCTGTCATCCCAGCTGCTTGGTAGGCTTAGGCAGGACA 2186

 55826562 ATCACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAG 55826592
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 ATCACTTGAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAG 2217

Alignment time is 5.52285 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    8330] =>      8330 nucs 'mol-32-34c9-065604_8330'

Score:        8184
Aligned:      8329        nucs
Identic:      8315 (100%) nucs =>      3370 (100%)      4945 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55822581,55825957] EXCISED REGION [55846713,55851662]
 second seq =>  [       1,    3376] EXCISED REGION [    3380,    8330]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     20755 nucs [55825958,55846712]
 second seq =>         3 nucs [3377,3379]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55825958,55825958] to [55846713,55846713]
 second seq =>         1 nucs [3376,3376] to [3379,3379]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55822581 AAAAAAAAAACCTTACCAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTA 55822640
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAAAAAACCTTACTAAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTA 60

 55822641 ATAATTCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGA 55822700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAATTCCTATAATAATACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGA 120

 55822701 CATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACT 55822760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATAGAAGTTTTCACTTACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACT 180

 55822761 GATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTG 55822820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATGATGGGGGTTGCTACTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTG 240

 55822821 ATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAA 55822880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGGAGATGGAATAAATTCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAA 300

 55822881 TGATGTCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACA 55822940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGATGTCTATCTCACAGATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACA 360

 55822941 ATCCATGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTG 55823000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCCATGCTGACTCATGACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTG 420

 55823001 GCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTT 55823060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAAATGTCACTTTTTCCTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTT 480

 55823061 TGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAAT 55823120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCCTCAGGAAGTTGAGATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAAT 540

 55823121 CAGCTGAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAG 55823180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGCTGAATCATGGAGCCTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAG 600

 55823181 AGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGAT 55823240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCAGGCTTAAAGGCAGAGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGAT 660

 55823241 CCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTT 55823300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTACTGAAACCAGATTGCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTT 720

 55823301 TCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAA 55823360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCACAGCTCTTAAGGTGCGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAA 780

 55823361 CTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAA 55823420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTGGTTAATTGACAAACGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAA 840

 55823421 AATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAA 55823480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATTTTAAACAAAAAGATCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAA 900

 55823481 GACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGC 55823540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GACCCTTTGAGTACATTTGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGC 960

 55823541 ACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGG 55823600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACAAATGATTGCATTTTTAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGG 1020

 55823601 AAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAG 55823660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGCAATGGATTAAAAGAGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAG 1080

 55823661 AAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAAC 55823720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAATACCTACACAAAGGAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAAC 1140

 55823721 CTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGC 55823780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTAAATGACCTAAATAAACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGC 1200

 55823781 ATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACAC 55823840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATCAAGTGAGTGATTAGATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACAC 1260

 55823841 TTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGT 55823900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTATGAATATTTCTGGACTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGT 1320

 55823901 AAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACT 55823960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAGCACAGTTTTAGTTTCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACT 1380

 55823961 GTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTT 55824020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTACCTTTATTATTCATCTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTT 1440

 55824021 CAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTAT 55824080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAAATTAATATCACTTTGCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTAT 1500

 55824081 AAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCT 55824140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAAATTTATTAAGGAAGTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCT 1560

 55824141 TCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCT 55824200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTTGTCCAGGAGCAAAGTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCT 1620

 55824201 TTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTA 55824260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCATTAAAGTTTTTTATAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTA 1680

 55824261 CAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTT 55824320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAATATATTATTCCATTTTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTT 1740

 55824321 CTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTA 55824380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTTTTTGTTTTCTGAATAACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTA 1800

 55824381 GTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGA 55824440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTTCAGAAAACATGTTCTCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGA 1860

 55824441 AGTCTGCCTTCTTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTG 55824500
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGTCTGCCTTCCTACCATTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTG 1920

 55824501 GAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAG 55824560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAACAGCCTGGCTAATAATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAG 1980

 55824561 AGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTAC 55824620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGAAAGATGCTGACTTTTAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTAC 2040

 55824621 TTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCC 55824680
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2041 TTCTATTTTGTTAAGATTGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCC 2100

 55824681 TGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGAC 55824740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTAATCCCAGCACTTTGGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGAC 2160

 55824741 ACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGC 55824800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACCAACCTGAGCAACATGGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGC 2220

 55824801 ATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGA 55824860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATGGTGATGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGA 2280

 55824861 ACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGA 55824920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACCTGGGAAGTGGAGGTTGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGA 2340

 55824921 CAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAG 55824980
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGAGCAAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAA-TTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAG 2399

 55824981 ATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGA 55825040
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 ATCTTAAGAGTCTCACAAGTAAGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGA 2459

 55825041 TACAAACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGC 55825100
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2460 TACAAACCAGTGACAACACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGA 2519

 55825101 ACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTG 55825160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ACCCACTACTATCATCCCGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTG 2579

 55825161 CTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGG 55825220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CTTGCTTAGAGGACAGGGAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGG 2639

 55825221 CTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATA 55825280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CTGCAAAAGAATCCATGACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATA 2699

 55825281 ATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAAC 55825340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ATTGATTAAATTATTCTTACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAAC 2759

 55825341 GGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACAT 55825400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 GGGTCTTGAAGTTTTACCAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACAT 2819

 55825401 GAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGA 55825460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 GAGTAATTTCCATTAATTTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGA 2879

 55825461 AAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACA 55825520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AAGATATTGAAGGCAGAAATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACA 2939

 55825521 GAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAAT 55825580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GAAGAGGGGTAAATATAAATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAAT 2999

 55825581 AAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCT 55825640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 AAGCACGGCTCTAAGGCAAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCT 3059

 55825641 GAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAA 55825700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 GAGACACCTTTTTCAATAAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAA 3119

 55825701 GTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGA 55825760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GTAAACAGAGGAACCATTTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGA 3179

 55825761 GGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCT 55825820
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3180 GGGGTTTTAACTTTCATTCTAAAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCT 3239

 55825821 GTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAG 55825880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GTTTATTGTACAACATAATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAG 3299

 55825881 ATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGA 55825940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 ATACAGCATTACTGTTAAGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGA 3359

 55825941 GAATTTCATAATGAAAT 55825957
          |||||||||||||||||
     3360 GAATTTCATAATGAAAT 3376

EXCISED REGION

 55846713 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 55846772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 GTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGTGCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTT 3439

 55846773 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 55846832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 TTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACTAGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATG 3499

 55846833 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 55846892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 TATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAAAAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGA 3559

 55846893 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 55846952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 CCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGA 3619

 55846953 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 55847012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 AGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGAAGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAA 3679

 55847013 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 55847072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 GTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTCAAATGGAACAGAAAAATCATATACAATAC 3739

 55847073 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 55847132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 ATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCATCAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAG 3799

 55847133 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 55847192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 TCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAGAGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAG 3859

 55847193 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 55847252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 GTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACCTTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATA 3919

 55847253 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 55847312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 AGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTTGATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCT 3979

 55847313 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 55847372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 GTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAATGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAA 4039

 55847373 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 55847432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4040 ACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTTTCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATC 4099

 55847433 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 55847492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 CATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAAGATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCA 4159

 55847493 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 55847552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4160 ACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTAACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGA 4219

 55847553 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 55847612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4220 TCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTGAAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGA 4279

 55847613 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 55847672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4280 CAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCTGATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAG 4339

 55847673 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 55847732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     4340 AAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAAAAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTA 4398

 55847733 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 55847792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4399 GTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAACTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGT 4458

 55847793 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 55847852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4459 AATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCATGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTA 4518

 55847853 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 55847912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4519 ATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGAGTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGAC 4578

 55847913 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 55847972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4579 TTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTCTCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCAT 4638

 55847973 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 55848032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4639 TGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTGAGTGGACACTGCTGTCTTTATGTAGATGT 4698

 55848033 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 55848092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4699 CCACAGGAAACAAGGCTGTGAACTAAATCTGATACATTTTAAAGTCCAAGAAAGGAACCC 4758

 55848093 TAAGAAATTGAATCCCATTCCCTTCTTAACTGTTTCAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 55848152
          |||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4759 TAAGAAATTGAATCCGATTCCCTTCTTAACTGTTTTAAGCACTCTCCAAAACAACGCCTT 4818

 55848153 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 55848212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 TCTGAGCTCTTCTGTGAGACTCTCCACTCTACTTTTTGAAACTCCATTTGCTTCTCATGA 4878

 55848213 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 55848272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 TATCCCACCACCCTCTCTACCCACGCCCATCCTTCTAGCACAGTGCCCTAAATCCGATTC 4938

 55848273 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 55848332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 ATTCCATCCATTTAATACTCTGGGGCTGGGGACCAAGGGACAGTCAACAATATGACTAAT 4998

 55848333 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 55848392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 GAGGAACATGACCCTCCTTTCCCAAAATAAATGCTATGTGAGTTGGGGAAAAGGAAAGTG 5058

 55848393 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 55848452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 GGTACTACAAGCCTCACAGGGCCCTTAGAATGCTTTGGGTTCCCAGCTGCAGGAAGACCT 5118

 55848453 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 55848512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 CAAAGGACACACCTCTAGAGGACAAAGAAAAATTGTCAGACAGCATAGCTTGAACCCATA 5178

 55848513 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 55848572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5179 AGGAAGCATGAAATAGTTTCCCAGCTGCCTCCAAGCTGCTTCGTAATTTGGGAGGCACCT 5238

 55848573 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 55848632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 CTGCCTCCTCTGATACAGTGAGTCACAAGATTAAATAGAGCAGTAATTGTACGTCTCAAG 5298

 55848633 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 55848692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 GGTGGATCCCTTAAGAAAAAATAAGTTTGGAGATAATTGTTCTACCAAGTCCTTAATAAA 5358

 55848693 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 55848752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 CTTCTTTGCCAAATACCCTTGTTCTCAATTTCCATTGGCGGGGGGTGGGGCAGAAGGGGG 5418

 55848753 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 55848812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 TGGTTTATGCTCCACTGACTTCTGCTTATTTCATTTAGGAAGAAAATCCAAAATTCATTG 5478

 55848813 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 55848872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5479 TGATGTGATGCCCAGGATACCAACTGACCCATTTGACAGTCTTGATGAGCCATCTGTTTT 5538

 55848873 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 55848932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 TGTTGTAGCCAAAATCTTCTCATCACAGCATCCTATGGTGAGCAAGAGATACGTTTTTAG 5598

 55848933 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 55848992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 ATGTTATCCTTGTGCATTTATACAGTACCTGTGATATGATTCAAGGTATCCTAAAGGGAT 5658

 55848993 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 55849052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 TACCAACACTTGTTCAGTTATTCATTTAACCAAACTATTTGACTGTCTTGCTGTAGTCAT 5718

 55849053 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 55849112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5719 GGGAATTGTGACTGATATTGGGAATATCACATTGAATAAGACGTGGGTTCCTGCCTAGGA 5778

 55849113 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 55849172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 GCTTACAGAAAGTAAATAATTAGCCCTGAAATAGTGTGACTAGTGCTGTGATAGAATGAG 5838

 55849173 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 55849232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 GCAAAAGGAGCGACGGGGAAAGAAAGGAAACACACTTGAAGAAATCAGAGATAGCTTCTA 5898

 55849233 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 55849292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 GAAGGAACTATCACTAAAGCTTGGCAGGCATACCAAAAAGGAGTAAGCATTATTGTAGCC 5958

 55849293 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 55849352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 CAGAAAAAACAAAAGTATATTCTAGTAGTGGGATCAGCCAAGGAAGATAAAAGCCTCAGA 6018

 55849353 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 55849412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6019 TAACCTGGTTAGAGAATTTAAAAAGGCTTATTATGACTAGAATGCAAGGTTTAATGTAAG 6078

 55849413 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 55849472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6079 TAATTTTACTTTCATCAAACAAATTCAGAATGTGTGGCAGAGATGTTTATTTTGTTTAAG 6138

 55849473 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 55849532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6139 GAAGAAAGTGGTGGAATCTTCAATAGAATTATTGTATTTGATCCGTTAAGTTCAGAAATT 6198

 55849533 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 55849592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6199 TTAGCATATATAGTTTATTAGTGTGTTTTCACACTGCTATGAAGACACTACCCAAGACTT 6258

 55849593 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 55849652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6259 GGTAATTGACAAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCACAGTTCCACATGGCTGGCAAGGCCT 6318

 55849653 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 55849712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6319 CAGGAAACTTACAATCATGGAGGAAGGGAAAGCAGGCACATCTTACATGGCAGCAGGCAA 6378

 55849713 GAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCATGAGAA 55849772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 GAGAGAGAATGTCAAGGAAGAACTGTCAAACACTTATAAAACCGTCAGATCTCATGAGAA 6438

 55849773 CTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCACCTCC 55849832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 CTCACTCACTATCATGAGAACAGCATGAGGGAAACTGCTCCTTATGATCCAATCACCTCC 6498

 55849833 CACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAGATTTG 55849892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 CACCATGTCCTTCCCTGAACACATGGGGATTATGGAGATTACAATTTGAGATGAGATTTG 6558

 55849893 GGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGCGCTCA 55849952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 GGTGGGGACACAGAACCAAATCATATCATATAGTTTGGGGATTTGGGCTGCTGGCGCTCA 6618

 55849953 GAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTTATTTT 55850012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6619 GAAACCCTCAAAATTCATTTTCTGAATTACGAGAACTTTTCTTTATAAACTTTTTATTTT 6678

 55850013 AGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATACGCTA 55850072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6679 AGAATAATTGTAGATTTACAGAAAAGTGCAAGATTGTACAGAGAGTTCTCACATACGCTA 6738

 55850073 CACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGATTAAA 55850132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6739 CACTCAGTTTTCCCTATTATTAACACCTTGCAATAGTATCATATATTTGTTACGATTAAA 6798

 55850133 GATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGTTTTTA 55850192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6799 GATCCTAAATTGATATTACTAAGTAAAGTCCATACTTTATTCAGATTTCCTTAGTTTTTA 6858

 55850193 TCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATTTGTCA 55850252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6859 TCTAATGTCCTGTTCTGTTCCAGGATCTTGTCCAGGATACCACATTACATTTATTTGTCA 6918

 55850253 TGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACAGTTTT 55850312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6919 TGTGCTTCTGGGCTCTGAGTGTCTCAGATTTTACATGGTTTTGATGACCTTGACAGTTTT 6978

 55850313 GAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGATGTTTT 55850372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6979 GAGAAGTAGTTGTCAGGTATTTTGTAAAATCTGCCACAGTTTGGGTTTGTCTGATGTTTT 7038

 55850373 TCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGCAGAAA 55850432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7039 TCTCATGATTAATCTGAGGTTATGGGTTTGTGGGAGGATGTATAAACTCTTAAGCAGAAA 7098

 55850433 ACTGCATAGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAGTTCCC 55850492
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7099 ACTGCATGGGTGTAAGGGAAGGCTGTCCTTAGGCAAAATTGAAAAGTGGGTACAGTTCCC 7158

 55850493 ACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAGCCTCC 55850552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7159 ACTAGACAACCATTTCCCCACTACATCCATGCACATTTTCTCTCCACTTCCCCAGCCTCC 7218

 55850553 AACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAAGGAAC 55850612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7219 AACATGCAGTGCTGTCTCTTGTCCATTTCTCCATGCCTCTCAGGTTCTTCCCTAAGGAAC 7278

 55850613 GCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGAGCCTA 55850672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7279 GCTTCCTCTACCTTTCCCTCACTGTCTGCATTGGGGCTCACTAGCTCACTTAAGAGCCTA 7338

 55850673 TATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAAATTTC 55850732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7339 TATTATGCCTCCCTCAATCCCCAGAGCTATTACACATGCTACTCTTTACCTAGAAATTTC 7398

 55850733 TCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTATTGAC 55850792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7399 TCCGGAATATTCCCTACACCTCTAAATGGCCACTCCATTCCATTCTACACCCCTATTGAC 7458

 55850793 CTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATCTATCC 55850852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7459 CTCCCTTTCATACTTCCTGTCTCAGACAAACATCACCTTCCCGAGGAAGACCATCTATCC 7518

 55850853 CTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTTGAGCT 55850912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7519 CTTGGCCACACCTTGCCTCTTGGAAAGTCAGATCCTTCTACTCTTAGGGAAGCTTGAGCT 7578

 55850913 GTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGATTAAT 55850972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7579 GTATTTTCATAGTATTTGTCTCAGGTTCTGATCAGATGCTCATGTGATTCTGTGATTAAT 7638

 55850973 GCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAACTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTTTTTCA 55851032
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7639 GCCTACTTTGTCCTATTATTTGTAAGCTGTATGAGGGCAGAAAATATTTCTATTTTTTCA 7698

 55851033 AACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTGCATAT 55851092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7699 AACCGAATATTGTCGGTGCTTTGCACAGGCCCTGACAGCCATTAGACATGCACTGCATAT 7758

 55851093 CAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCTCTGAC 55851152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7759 CAGTTAGAGGGAGGAAAGGAGAGATAAAGACAATAGAAAACACCAGCTTGGTTCTCTGAC 7818

 55851153 TTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTTCTGTG 55851212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7819 TTGATTAATCTGCGTTCTGGGATCTTAAAGACTATAGCAGTGTAACTTCAGTTTTCTGTG 7878

 55851213 AGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGTATGGAGGGCATGCTTTAAAAGAGCAAAGTT 55851272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7879 AGCATGGTAAGAAGCATTCCAAGGTAAAGTATGGAGGGCATGCTTTAAAAGAGCAAAGTT 7938

 55851273 ACCACCCTATGAAACAAAATATGGGGTGATAACACCTGTAGTAATAAGAAAATGTTTTTG 55851332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7939 ACCACCCTATGAAACAAAATATGGGGTGATAACACCTGTAGTAATAAGAAAATGTTTTTG 7998

 55851333 CATTAGCACATGCCATTCCACCTTATGAGACACAGGACATCCTCAGACTAACAGCCTCTC 55851392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7999 CATTAGCACATGCCATTCCACCTTATGAGACACAGGACATCCTCAGACTAACAGCCTCTC 8058

 55851393 TGTATCTTAAACTATCTCAAACACTAAGAGTTACCTCTTAGGATTCATGGAAATTAAAAC 55851452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8059 TGTATCTTAAACTATCTCAAACACTAAGAGTTACCTCTTAGGATTCATGGAAATTAAAAC 8118

 55851453 ACATTAAAGATGTTCATTGTGGTGAGTAACATATTCTGATTATCAGAGGCCATTAGAACA 55851512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8119 ACATTAAAGATGTTCATTGTGGTGAGTAACATATTCTGATTATCAGAGGCCATTAGAACA 8178

 55851513 ACTCTGCCTATAGCCAGTAACTTCCAAATTGACCTTCCACTAAAAATCACAAATTTACAC 55851572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8179 ACTCTGCCTATAGCCAGTAACTTCCAAATTGACCTTCCACTAAAAATCACAAATTTACAC 8238

 55851573 ACACACACACATATACACACATATATATCTATATAAATACATATATACACATATATATC- 55851631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     8239 ACACACACACATATACACACATATATATCTATATAAATACATATATACACATATATATCT 8298

 55851632 -TATATATATACACATATATATATCTATATAT 55851662
           |||||||||||||||||||||||||||||||
     8299 ATATATATATACACATATATATATCTATATAT 8330

Alignment time is 19.256 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3376] =>      3376 nucs 'mol-32-34c9-065604_3376'

Score:        3310
Aligned:      3376        nucs
Identic:      3370 (100%) nucs =>        16 (100%)      3354 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55822581,55822596] EXCISED REGION [55822598,55825957]
 second seq =>  [       1,      16] EXCISED REGION [      18,    3376]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [55822597,55822597]
 second seq =>         1 nucs [17,17]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [55824940,55824940]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55822596,55822596] to [55822597,55822597]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55822581 AAAAAAAAAACCTTAC 55822596
          ||||||||||||||||
        1 AAAAAAAAAACCTTAC 16

EXCISED REGION

 55822598 AAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATAAT 55822657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       18 AAGGGAACCCTTATCCTTTCTATCTGCCTAAAATAATTTCTTAATAATTCCTATAATAAT 77

 55822658 ACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACTT 55822717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       78 ACTCAGGTCAGTGAGCAAACCAAACTAAGCCAGAAGTCTCAGACATAGAAGTTTTCACTT 137

 55822718 ACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCTA 55822777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      138 ACAAAATGTTTGAAATTAAAGTTCTGAATAATTGCAGTGTACTGATGATGGGGGTTGCTA 197

 55822778 CTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAAT 55822837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      198 CTGACTCTGAATCTAGGGGCATGTGTAATAAGGAAGGAAATTGATGGAGATGGAATAAAT 257

 55822838 TCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCACAG 55822897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      258 TCAGCCAATGGAGTACTAGCCACTGGTGTGAGAAAATGGAAAATGATGTCTATCTCACAG 317

 55822898 ATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCATG 55822957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      318 ATAAAAACTTAATAAAAAGAGTTTAAGATACAGACTGTTGACAATCCATGCTGACTCATG 377

 55822958 ACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTTC 55823017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      378 ACCCGCCATCTAAGGATGAATTAAAAGACAGATAAATAGTTTGGCAAATGTCACTTTTTC 437

 55823018 CTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAG 55823077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      438 CTTTCAGTTGACCAAAGCTTGATGAAAAACATCTGCACAACTTTGCCTCAGGAAGTTGAG 497

 55823078 ATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAGC 55823137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      498 ATCCTTAAGAAAATCCACGAGCAAACAGGCATGACTCTGAAATCAGCTGAATCATGGAGC 557

 55823138 CTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAG 55823197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      558 CTATATACTGGAAGAGGAGGGAAGGCTGTAAGGTGCAGAGAAGAGCAGGCTTAAAGGCAG 617

 55823198 AGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGATT 55823257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      618 AGGATTTAAGAGATAGAGGATGAGTTGCACGAAATGGAGAGATCCTACTGAAACCAGATT 677

 55823258 GCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTG 55823317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      678 GCTCGTCTTCTGAAGACAATCTTTGCCAAGGTCTTGCTGTTTTTCACAGCTCTTAAGGTG 737

 55823318 CGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAAA 55823377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      738 CGTAGCACAGGAAACCTGCATGTTTTCATTCCAGTTCATGTAACTTGGTTAATTGACAAA 797

 55823378 CGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAGA 55823437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      798 CGCTGTAAAATTAAGCCCCATAAAAATATATTGCTTCTCTAAAAATTTTAAACAAAAAGA 857

 55823438 TCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACATT 55823497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      858 TCTATCCCCATACATTTTTTACCTATATGTTGGTTTAGAGAAAGACCCTTTGAGTACATT 917

 55823498 TGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATTTT 55823557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      918 TGATGTCTTTTAATATAAACGTTTGGTCCTGGAGACAAGGGGCACAAATGATTGCATTTT 977

 55823558 TAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAAG 55823617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 TAAAAAACAACTCCATGATAATGGTAGAAAAGCCCCAAATAGGAAGCAATGGATTAAAAG 1037

 55823618 AGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAG 55823677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 AGAGAGAGGGAGAGGAAACAAATTTAGATTTGGTGAAAGAGAGAAAATACCTACACAAAG 1097

 55823678 GAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAA 55823737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 GAATACAGGGAGGCTGATAGTAGCTCTTCCTTTATCACCAAACCTAAATGACCTAAATAA 1157

 55823738 ACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAG 55823797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 ACTGGAACCAGTTTATTCTGCTGCAATGAAGATGGTAATTTGCATCAAGTGAGTGATTAG 1217

 55823798 ATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGA 55823857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 ATCTGTTCTGATTTCATTAAGTCGCTCTCAGCCAGAAACACACTTATGAATATTTCTGGA 1277

 55823858 CTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTT 55823917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 CTCTGTTCTCTTTCCTGATCCATCTGCTTATTCATACTCCAGTAAAGCACAGTTTTAGTT 1337

 55823918 TCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCAT 55823977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 TCTCCCACATTATAAAATATTGTAACACTGAGTTGGGACTACTGTACCTTTATTATTCAT 1397

 55823978 CTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTT 55824037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 CTTCTTAGAAATAGTTCTGTATATTTTAATGTTAGTTTATTTTCAAATTAATATCACTTT 1457

 55824038 GCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAA 55824097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 GCTTTCACTAAAAATAACCTTGTTTTTATTGAGATTGCATTATAAAAATTTATTAAGGAA 1517

 55824098 GTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAA 55824157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 GTATAAATTAAGACAGTGTTAATAACTTAATACTACTGAGTCTTCTTGTCCAGGAGCAAA 1577

 55824158 GTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTA 55824217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 GTATGTCTTCATCTTTACTTTCACTTCAGTCTCTTTCATGCCTTTCATTAAAGTTTTTTA 1637

 55824218 TAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATT 55824277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 TAGCTATCTTGATATCGGTAGTGCACAATTATTTTTGTTTCTACAATATATTATTCCATT 1697

 55824278 TTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAAT 55824337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1698 TTATATTTTTATCCAGTAATTATTTGGATGAAGATTTATATTTCTTTTTGTTTTCTGAAT 1757

 55824338 AACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTC 55824397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 AACTTACTCACTTTTGTAATCACGTTTAGTATTTTTATTTTTAGTTCAGAAAACATGTTC 1817

 55824398 TCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCTTACCA 55824457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1818 TCATGTTTTCCAGTTGTGTAATTTTAACATCTGCAAAGGCTGAAGTCTGCCTTCCTACCA 1877

 55824458 TTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATA 55824517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 TTTATTTTGTGCACCTTCCTAACTGCATAAGCCAATATTTCTGGAACAGCCTGGCTAATA 1937

 55824518 ATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTT 55824577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 ATGATAATAATGGCAGTTTTTATACCATTCATTACAACTGAAGAGAAAGATGCTGACTTT 1997

 55824578 TAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGAT 55824637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 TAATTTGAAACATAAATTTTACTATCAAATTTTAAATTACTACTTCTATTTTGTTAAGAT 2057

 55824638 TGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTACGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTT 55824697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2058 TGTTGACTTTTATTAACAATTTCTGGCCAGGTGCGGTGGTGCCTGTAATCCCAGCACTTT 2117

 55824698 GGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACAT 55824757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2118 GGGAAGCTGAGGCAGGCAGATCACTTGAGCCTAGGTGTTTGACACCAACCTGAGCAACAT 2177

 55824758 GGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTG 55824817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 GGCGAAACCCAGTCTCTAGCAAAAATATAAAAATTAGCCGGGCATGGTGATGCACACCTG 2237

 55824818 TAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGT 55824877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 TAATCCCAGCTACTTAGGAGGCTGAGGCAGGAGGATTGCTTGAACCTGGGAAGTGGAGGT 2297

 55824878 TGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTC 55824937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 TGCAGTGACCTGAGATCACACCACTGGACTCTGGCCTGGATGACAGAGCAAGACCCTGTC 2357

 55824938 TCAAAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACA 55824997
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 TC-AAAAAAAAAAAAAAATTCATATGCTTTTTCTTCTTTATAGATCTTAAGAGTCTCACA 2416

 55824998 AGTAAGGATGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAAC 55825057
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 AGTAAGGCTGTAAACTTCAAGTTATGAAATATTCAATGCCAGATACAAACCAGTGACAAC 2476

 55825058 ACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGCACCCACTACTATCATCC 55825117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2477 ACATTGGTCAACTTCTAGTTCTAAATCAAAACTACCATGCAGAACCCACTACTATCATCC 2536

 55825118 CGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGG 55825177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 CGAATTCTCTAAGTTCTGCCGTGCCAAATAATACTTAACCTTGCTTGCTTAGAGGACAGG 2596

 55825178 GAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATG 55825237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 GAGCAGAGCTCTGAAATTGAGCTGCGTCTTTTTCACAATTAGGCTGCAAAAGAATCCATG 2656

 55825238 ACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCT 55825297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 ACTTGCTCCATGTCATGATAAATAGGTATTTTTTAACAAAATAATTGATTAAATTATTCT 2716

 55825298 TACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTAC 55825357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 TACCAAGCACATTAGTCATACCTGATTTATACCCAGAAGAAACGGGTCTTGAAGTTTTAC 2776

 55825358 CAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAAT 55825417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 CAGTGACAGGGAAACAAAAGTCAGGAATCTGGACTAATAACATGAGTAATTTCCATTAAT 2836

 55825418 TTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGA 55825477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 TTCAGTCCCACAGATTCTCCCATAAATTTAGATTAGGAAAAGAAAGATATTGAAGGCAGA 2896

 55825478 AATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATA 55825537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 AATTTCCCATGACAGGTCGCATATTCATTTTGCAAATATCACAGAAGAGGGGTAAATATA 2956

 55825538 AATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGC 55825597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 AATATAAATCAAGTGCCTATTATGACAAGACCGTGTGCTCAATAAGCACGGCTCTAAGGC 3016

 55825598 AAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAAT 55825657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 AAACACAAGAATTGCATCTCTGGTAAAAGATATTCTTCATTCTGAGACACCTTTTTCAAT 3076

 55825658 AAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCAT 55825717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 AAACAGAACTCAACAGTCCTAAGGCTGAGTAATGTCAAACTAAGTAAACAGAGGAACCAT 3136

 55825718 TTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCAT 55825777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 TTTACTTCAAAGCACATTTCATCCAAGAACTCCACATGCTAGAGGGGTTTTAACTTTCAT 3196

 55825778 TCTAAAGAATAGAAAAGGCCAAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATA 55825837
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 TCTAAAGAATAGAAAAGGCCGAAGAAGTTAAGTGACTTTCCCTGTTTATTGTACAACATA 3256

 55825838 ATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTA 55825897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 ATAATTATTTAGATGCTACATGTCAAGTCATCAAGTTTTAGAGATACAGCATTACTGTTA 3316

 55825898 AGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 55825957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 AGCCATATATGATGAGAAATGAGAAAAAACAAAAATCTATAGAGAATTTCATAATGAAAT 3376

Alignment time is 8.13432 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [55815957,55856712] =>     40756 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    9974] =>      9974 nucs 'mol-32-34c9-110338_9974'

Score:        9856
Aligned:      9977        nucs
Identic:      9957 (100%) nucs =>      4983 (100%)      4974 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [55838025,55843013] EXCISED REGION [55843027,55848004]
 second seq =>  [       1,    4996] EXCISED REGION [    4998,    9974]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        13 nucs [55843014,55843026]
 second seq =>         1 nucs [4997,4997]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55843014,55843014] to [55843027,55843027]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [55843013,55843013] to [55843027,55843027]
 second seq =>         1 nucs [4996,4996] to [4998,4998]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 55838025 CAGAGACTATATCCTACTCACTTTCCCTTCCTCATTACCTAAAAGAGTGTGTGGAATTTA 55838084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGAGACTATATCCTACTCACTTTCCCTTCCTCATTACCTAAAAGAGTGTGTGGAATTTA 60

 55838085 GCAACAGTTCAATAAATGTATCTCGAATAAATGCATGCATGGAAAATGCCTATACTAACA 55838144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAACAGTTCAATAAATGTATCTCGAATAAATGCATGCATGGAAAATGCCTATACTAACA 120

 55838145 GAAATCTAAAAATATAAAGAAAGCATAATTTAAAAAATCTTGGTCTGGTGCTGTGTATGT 55838204
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAATTTAAAAATATAAAGAAAGCATAATTTAAAAAATCTTGGTCTGGTGCTGTGTATGT 180

 55838205 CAAACCTCAATTCCAAAAGATTATACATTTTCCCTATATCAGATATTTTTAATTTTGTAA 55838264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAACCTCAATTCCAAAAGATTATACATTTTCCCTATATCAGATATTTTTAATTTTGTAA 240

 55838265 AATACTATTACATTTTCAAATGTGACAACTTGATACATGGAAAATCACTAAACAGAGAAA 55838324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATACTATTACATTTTCAAATGTGACAACTTGATACATGGAAAATCACTAAACAGAGAAA 300

 55838325 CAGGGTGATACATGAATTATTTGAATTCATCTGACTGAAGTGAACCTGATTAGAATTATA 55838384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGGGTGATACATGAATTATTTGAATTCATCTGACTGAAGTGAACCTGATTAGAATTATA 360

 55838385 AACTGTAATTGAATTATTTTCCCAGCAAGCTACTGAAAAAAGGTGTGAATACTACACAAA 55838444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTGTAATTGAATTATTTTCCCAGCAAGCTACTGAAAAAAGGTGTGAATACTACACAAA 420

 55838445 TACTCTTTATTTATTGCAAATTAAGCTTAACTGAAGTTTGTTCATTTTCATTGCTTCAGA 55838504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACTCTTTATTTATTGCAAATTAAGCTTAACTGAAGTTTGTTCATTTTCATTGCTTCAGA 480

 55838505 ACTCTTACTGTTGCTATTGACAACCAACTATCGGTTCATTCTACAGATAGATACAGAGAT 55838564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTCTTACTGTTGCTATTGACAACCAACTATCGGTTCATTCTACAGATAGATACAGAGAT 540

 55838565 AAAATAACTTATACAGATAAATAATTTTTATAATTCATTCTAAAAATGGGTGGAAAGTTA 55838624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATAACTTATACAGATAAATAATTTTTATAATTCATTCTAAAAATGGGTGGAAAGTTA 600

 55838625 AAGGATAGGGAAATACTTATAGTATAGGGATGTAGAAGTAAATGCAGTATGCTAGGGTTT 55838684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGGATAGGGAAATACTTATAGTATAGGGATGTAGAAGTAAATGCAGTATGCTAGGGTTT 660

 55838685 TGTTTTCATAATGTCCATGCATCCAAGAAAACACTGTAGTTGTTAATCTTATATAAAAGA 55838744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTTTTCATAATGTCCATGCATCCAAGAAAACACTGTAGTTGTTAATCTTATATAAAAGA 720

 55838745 GAAAGCAGATTTAAGGTTGATTTATTTAATGTTATAAAGAAAAGTGATTTTTAAATAGTG 55838804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAAGCAGATTTAAGGTTGATTTATTTAATGTTATAAAGAAAAGTGATTTTTAAATAGTG 780

 55838805 ATATGGAAAAAATTATATTACTTTCCCACTTGATATAAAATAGTATTATGAGAAATAGTG 55838864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATATGGAAAAAATTATATTACTTTCCCACTTGATATAAAATAGTATTATGAGAAATAGTG 840

 55838865 ATTTTTTAAAAGAGAAAGGGTGTTCAAGTTATAAATATGATTTGTTTTTATAGTTCTGTA 55838924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTTTTTAAAAGAGAAAGGGTGTTCAAGTTATAAATATGATTTGTTTTTATAGTTCTGTA 900

 55838925 TCAACTAGATGTAAGTTCTTTGGAATCAGGAACTATATCATTCACCTTTTTATCTCCAGG 55838984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAACTAGATGTAAGTTCTTTGGAATCAGGAACTATATCATTCACCTTTTTATCTCCAGG 960

 55838985 ACATAGTCTAGTGTCAATAATTAATTGACAAATGAATGAACAGATCCCATCATTAACAAG 55839044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACATAGTCTAGTGTCAATAATTAATTGACAAATGAATGAACAGATCCCATCATTAACAAG 1020

 55839045 AGCTACATTCATGATGTATTATACTAATCTATTGAGTATGTATTTATGATAGACTTATTC 55839104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCTACATTCATGATGTATTATACTAATCTATTGAGTATGTATTTATGATAGACTTATTC 1080

 55839105 CTTATAAGAAACACTAAATCAATTTGTGTGTTAAAACATATTAAAATAAATCAGAATTGA 55839164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTATAAGAAACACTAAATCAATTTGTGTGTTAAAACATATTAAAATAAATCAGAATTGA 1140

 55839165 ATAAAGTAGTGTTTGAATACTTCCCTCCCAATCCTTCCTCCTCCCTCCCTAGAGTCATTA 55839224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAAAGTAGTGTTTGAATACTTCCCTCCCAATCCTTCCTCCTCCCTCCCTAGAGTCATTA 1200

 55839225 ACAATTTCCTGAATGTATATAGTCCCATCTTTTTCTATGCTTATTTAAATACATATACAT 55839284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACAATTTCCTGAATGTATATAGTCCCATCTTTTTCTATGCTTATTTAAATACATATACAT 1260

 55839285 ATATTTAAACAAATTATAGATATTTAAACACATAGATATATATGTACTTTTAAACAAAAA 55839344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1261 ATATTTAAACAAATTATAGATATTTAAACACATAGACATATATGTACTTTTAAACAAAAA 1320

 55839345 TTGAATCTTGTTACACATAATGCTTTTTTAATTTTATTGAGAATAAATTCATATACCATA 55839404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGAATCTTGTTACACATAATGCTTTTTTAATTTTATTGAGAATAAATTCATATACCATA 1380

 55839405 ACATTTATTCATTTTTAAAATCATTGGTTCTTAGTGATTGTACAGTTTTATACAACCATT 55839464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACATTTATTCATTTTTAAAATCATTGGTTCTTAGTGATTGTACAGTTTTATACAACCATT 1440

 55839465 ATCACATTCAAAGTTTAGAACATTTTTATCCACTGAAAAAGAAACCTTAGCAGTCATTTC 55839524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCACATTCAAAGTTTAGAACATTTTTATCCACTGAAAAAGAAACCTTAGCAGTCATTTC 1500

 55839525 CTCTTCCCCCAGCCCCCACCCCCAAGTCATAGGCAACCACTAATCTATTTCCTGTCTCTG 55839584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTCTTCCCCCAGCCCCCACCCCCAAGTCATAGGCAACCACTAATCTATTTCCTGTCTCTG 1560

 55839585 TAGGTTTTCCTAGTCTGGACATTTTTTAAATGGAATCATGCAATATGTGGTCTTTTGTGT 55839644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGGTTTTCCTAGTCTGGACATTTTTTAAATGGAATCATGCAATATGTGGTCTTTTGTGT 1620

 55839645 CTGGCTTCTTTCACTTAGAACGTTTTGGAAGTTTATCCATTTTGCTGCATGTATCAGTAC 55839704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGGCTTCTTTCACTTAGAACGTTTTGGAAGTTTATCCATTTTGCTGCATGTATCAGTAC 1680

 55839705 TTCCTTTCCTTTTATTATCCAATATTATTTCATTATATGGGTATAATATATTTTGTTTAT 55839764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCCTTTCCTTTTATTATCCAATATTATTTCATTATATGGGTATAATATATTTTGTTTAT 1740

 55839765 CCATTCATCAGTTAATGGACATTTGGGTAGTTTCCACTTTTTGTTTCATGTGAATAATTC 55839824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1741 CCATTCATCAGTTAATGGACATTTGGGTAGTTTCCACTTTTTGTTTCATGTGAATAATGC 1800

 55839825 TGCTATGAACATTTGTGCACAAGTCTTTTATGGACATTTGTTTTCATTCCTCTTGGATAG 55839884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1801 TGCTATGAACATTTGTGCACAAGTCTTTTATGGACATTTGTTTTCATTTCTCTTGGATAG 1860

 55839885 ATACCTAGAAGTGGAATTGCTGGGCCATATGGTAACTTTATGTTTAACATTGACAAACTG 55839944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATACCTAGAAGTGGAATTGCTGGGCCATATGGTAACTTTATGTTTAACATTGACAAACTG 1920

 55839945 CCAAACTATTTTCTAAAGTGGCTACACCATTTTACATTCTCAGCAAACTTAAGAGTTCTA 55840004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCAAACTATTTTCTAAAGTGGCTACACCATTTTACATTCTCAGCAAACTTAAGAGTTCTA 1980

 55840005 ATTTTTTCATATGCTAATCAATACTTGCTTTTGTCTATACTTAATATTACTGTCATTTTA 55840064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTTTTTCATATGCTAATCAATACTTGCTTTTGTCTATACTTAATATTACTGTCATTTTA 2040

 55840065 CTGGTTATAAAGAGGTATTTCATTATGGTTTTGATGTGCATTTCCCTAATGTCTAATGAT 55840124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTGGTTATAAAGAGGTATTTCATTATGGTTTTGATGTGCATTTCCCTAATGTCTAATGAT 2100

 55840125 GATGAACATCTACTAGTGTGCATATGGAATATTCTTTTATCTTCTTGGAAGAAATATCTA 55840184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATGAACATCTACTAGTGTGCATATGGAATATTCTTTTATCTTCTTGGAAGAAATATCTA 2160

 55840185 TTTCAAATCGTTTGACTATTTTTAATTGGATTATATTTGCTTTCCAGTTATTGAGTTATA 55840244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTCAAATCGTTTGACTATTTTTAATTGGATTATATTTGCTTTCCAGTTATTGAGTTATA 2220

 55840245 GGAATTCTTTATATATTCTGGATACAAATTCCATATTAGATACATGATTTCCAAGTATTT 55840304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGAATTCTTTATATATTCTGGATACAAATTCCATATTAGATACATGATTTCCAAGTATTT 2280

 55840305 TATCCCAGTCTGTAGATGGGATACCACTTCATGTAGATGGTGTTGTCTGAAGCAAAAATT 55840364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TATCCCAGTCTGTAGATGGGATACCACTTCATGTAGATGGTGTTGTCTGAAGCAAAAATT 2340

 55840365 TTTAATTGTAATGAAGTTCAACTTGTTAATTATTTTTCTTTTATCATTTGTGGTTTTGGT 55840424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTAATTGTAATGAAGTTCAACTTGTTAATTATTTTTCTTTTATCATTTGTGGTTTTGGT 2400

 55840425 TTCATATATAAGACGTCCTTGGCTAATCCAAGGTCATGAAGATTTGTTCCTATGTTTTGT 55840484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTCATATATAAGACGTCCTTGGCTAATCCAAGGTCATGAAGATTTGTTCCTATGTTTTGT 2460

 55840485 TTTGTTTTTTTTCCCTAGGAGTTTTATGTTTTGACTCTTACATTTTGTTCATTGGTTCAT 55840544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTGTTTTTTTTCCCTAGGAGTTTTATGTTTTGACTCTTACATTTTGTTCATTGGTTCAT 2520

 55840545 TTTGAGTACATTTTTGGATATAATGCGAGATAAGGCTCCAAATTCATTCTTCTGAATGTG 55840604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTGAGTACATTTTTGGATATAATGCGAGATAAGGCTCCAAATTCATTCTTCTGAATGTG 2580

 55840605 GATATCTAGTTGTCCCAACATCATTTGTGGAAAAGAATATTTCTCCCACTGAATTGCTTT 55840664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GATATCTAGTTGTCCCAACATCATTTGTGGAAAAGAATATTTCTCCCACTGAATTGCTTT 2640

 55840665 ATTATCTTGTTGAAAATCAATTGACTACTAAAGTAAAGGTTTATTTTTGGGCTCTATATT 55840724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2641 ATTATCTTGTTGAAAATCAATTGACTACTAAAGTAAAGGTTTATTTCTGGGCTCTATATT 2700

 55840725 ATATTATTATGTTGATCTACATGTCTATATTTTTGCCATCACCACACTGTCTAGATTATT 55840784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATATTATTATGTTGATCTACATGTCTATATTTTTGCCATCACCACACTGTCTAGATTATT 2760

 55840785 AAAGCTTTACAGTAAGTTTTAAAAGTAGATGGCAGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATC 55840844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAAGCTTTACAGTAAGTTTTAAAAGTAGATGGCAGGGTGCAGTGGCTCATGCCTGTAATC 2820

 55840845 CTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGCGGTTCAAGACCAGCC 55840904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGGTGGATCACCTGAGGTCAGCGGTTCAAGACCAGCC 2880

 55840905 TGGCCAACAAGGCAAAACACCCATCTCTACTAAATGTACAAAAAAATTAAGCAGGTGTGG 55840964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TGGCCAACAAGGCAAAACACCCATCTCTACTAAATGTACAAAAAAATTAAGCAGGTGTGG 2940

 55840965 TGGCACGCACCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCGGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCT 55841024
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGGCACGCGCCTGTAATCCCAGCTTCTTGGGAGGCGGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCT 3000

 55841025 GGGAGGTGGAGGTTACAGTGAGGTGAGATGGTGTCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATAGA 55841084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGGAGGTGGAGGTTACAGTGAGGTGAGATGGTGTCACTGCACTCCAGCCTGGGTGATAGA 3060

 55841085 GCTAGACTCTGTCTCAATAAAATAAAAAATAAAATTAGAAAGTGTGAGTTCTCCAATTTT 55841144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GCTAGACTCTGTCTCAATAAAATAAAAAATAAAATTAGAAAGTGTGAGTTCTCCAATTTT 3120

 55841145 ATTTCCATTTTCAAGAATTTTTTGGCCATTCTGGGTCCCTTACATTTCCATATGAATTTT 55841204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATTTCCATTTTCAAGAATTTTTTGGCCATTCTGGGTCCCTTACATTTCCATATGAATTTT 3180

 55841205 AGGATAAGCTAGTCAATTTCTAGGGGAAAAAAATCCAACTGGTATTTTGGTAAGGATTGT 55841264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGGATAAGCTAGTCAATTTCTAGGGGAAAAAAATCCAACTGGTATTTTGGTAAGGATTGT 3240

 55841265 ATTGAATCTACAGATCAATTTGAAAAATGTTGCTATTTCAACAATATTAAGTCTTCTGAC 55841324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATTGAATCTACAGATCAATTTGAAAAATGTTGCTATTTCAACAATATTAAGTCTTCTGAC 3300

 55841325 CTGATTCATGAACTTGAAATGCTTTTCCATTTATTTAGATCTTCTTCAACTTTTTCAACT 55841384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTGATTCATGAACTTGAAATGCTTTTCCATTTATTTAGATCTTCTTCAACTTTTTCAACT 3360

 55841385 ATGTTTTGTAGTTTTTATGGTACAAGTCTTGAAGTTTTATTGGTAAATTTATTCCCTAGT 55841444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATGTTTTGTAGTTTTTATGGTACAAGTCTTGAAGTTTTATTGGTAAATTTATTCCCTAGT 3420

 55841445 ATGTTTATTCCTTTTGATGCCATTGTGAATGAAATTATTGTGGCAATTTTATTTTTAGAT 55841504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATGTTTATTCCTTTTGATGCCATTGTGAATGAAATTATTGTGGCAATTTTATTTTTAGAT 3480

 55841505 TGTTAGTTGTTACTGTATAGAAATGTGATTAATATTTGAATATTAATTTTGTGTCCTGCC 55841564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGTTAGTTGTTACTGTATAGAAATGTGATTAATATTTGAATATTAATTTTGTGTCCTGCC 3540

 55841565 ATCTTGCTGAACTCATTTATTATGTCAAGAATTTTTAATTAATACATATTTTCAAAATTC 55841624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATCTTGCTGAACTCATTTATTATGTCAAGAATTTTTAATTAATACATATTTTCAAAATTC 3600

 55841625 CTTTTTTTCACTTCACAGTATATGGATATGTCTGTCTTTACAAGTCAGTTCATATACGCC 55841684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTTTTTTTCACTTCACAGTATATGGATATGTCTGTCTTTACAAGTCAGTTCATATACGCC 3660

 55841685 TTTTTAATTTCCATTTTAATAGTTGTCTGGTATTTCACATTATGATATAACAAAATATAT 55841744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTTTTAATTTCCATTTTAATAGTTGTCTGGTATTTCACATTATGATATAACAAAATATAT 3720

 55841745 TTATCCATTCTTCTATTGATAAGCCTTTATACTGATTTTTCTTATTTTTTGTTTTGCTAT 55841804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTATCCATTCTTCTATTGATAAGCCTTTATACTGATTTTTCTTATTTTTTGTTTTGCTAT 3780

 55841805 CACAAAAAAACTAAAATAAACATTTTTAATTATACCTGTAACTACTCACTTGTCCTTATC 55841864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CACAAAAAAACTAAAATAAACATTTTTAATTATACCTGTAACTACTCACTTGTCCTTATC 3840

 55841865 TTTTTATAGGTCAGACTCCTGAAAACAGAATTGACTGGTCGTAGTATACATTTATCTAAA 55841924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTTTTATAGGTCAGACTCCTGAAAACAGAATTGACTGGTCGTAGTATACATTTATCTAAA 3900

 55841925 ATTTTAGCAATTGTTCCAAAATTGTTCCTCAAAAGAGTCCAGATTTTTCTCTCATCAAAA 55841984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ATTTTAGCAATTGTTCCAAAATTGTTCCTCAAAAGAGTCCAGATTTTTCTCTCATCAAAA 3960

 55841985 GACATGGTAGATTCATTAAGAATGAATATCAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAA 55842044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GACATGGTAGATTCATTAAGAATGAATATCAAGGCCGGGCGCGGTGGCTCACGCCTGTAA 4020

 55842045 TCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCATGAGGTCAGGATATCGAGACCATCC 55842104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCATGAGGTCAGGATATCGAGACCATCC 4080

 55842105 TGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAGTTAGCTGGGCAT 55842164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAAAAGTTAGCTGGGCAT 4140

 55842165 GGTGGCTGGCGACTGTAGTCCCAGCTACTAAGGAGGCTGAGGCGGGAGAATGGCGTGAAC 55842224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GGTGGCTGGCGACTGTAGTCCCAGCTACTAAGGAGGCTGAGGCGGGAGAATGGCGTGAAC 4200

 55842225 CCGAGAGGCGGAGCTTGCAGTGATCCGAGATTGCGCCGCTGCACTCCAGCCTGGGGGAAA 55842284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CCGAGAGGCGGAGCTTGCAGTGATCCGAGATTGCGCCGCTGCACTCCAGCCTGGGGGAAA 4260

 55842285 GAGAGGGACTCCGTCTCAAAACAAAAGAATGACCATCAAAAAGTGAGCAATTCCTCATAA 55842344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GAGAGGGACTCCGTCTCAAAACAAAAGAATGACCATCAAAAAGTGAGCAATTCCTCATAA 4320

 55842345 TTGTCCTTTAGCTGGGTTTAAAAGGTCCTCTCCAAAACAGCAGCAAGACCTCTTCTGTGA 55842404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTGTCCTTTAGCTGGGTTTAAAAGGTCCTCTCCAAAACAGCAGCAAGACCTCTTCTGTGA 4380

 55842405 TAGTTA-------AAGTATAGATATTCAGTATTGCTGGTGAAGGCATCTTTCTTTTTAAA 55842457
          ||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TAGTTAGAGTGTTAAGTATAGATATTCAGTATTGCTGGTGAAGGCATCTTTCTTTTTAAA 4440

 55842458 CACTTTTAACTAGAAATAACAGAGAGGAACTAACATGCTGAGAAGCTTTCTGACACTTTT 55842517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CACTTTTAACTAGAAATAACAGAGAGGAACTAACATGCTGAGAAGCTTTCTGACACTTTT 4500

 55842518 GCTAGCAGATTCTTAGGGGAATGTGGTTCACTAGGTCTCAAAATATAAAGCACATGTTTG 55842577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GCTAGCAGATTCTTAGGGGAATGTGGTTCACTAGGTCTCAAAATATAAAGCACATGTTTG 4560

 55842578 CAATTCAGAAACACTTGCAAACTGGGTATAGCTGTATACTCAACAAGGACTTCTCAAAAT 55842637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CAATTCAGAAACACTTGCAAACTGGGTATAGCTGTATACTCAACAAGGACTTCTCAAAAT 4620

 55842638 AAATGATTACTCGAGTTTGTATATACCTACAAACTGATACATATGTCATCTATGTGAATT 55842697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AAATGATTACTCGAGTTTGTATATACCTACAAACTGATACATATGTCATCTATGTGAATT 4680

 55842698 TTGGTGTAAAATGGTTAAACCCTCTTGCTGCTGCCAAAGGAGGTGTATTTTAATCGTATT 55842757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TTGGTGTAAAATGGTTAAACCCTCTTGCTGCTGCCAAAGGAGGTGTATTTTAATCGTATT 4740

 55842758 CCAAAGAAAGTATGATGGTGTCACCCACCAGGAAATGTCTGTTAGTTTACACCCCTGCTT 55842817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CCAAAGAAAGTATGATGGTGTCACCCACCAGGAAATGTCTGTTAGTTTACACCCCTGCTT 4800

 55842818 CTAAAGAGAGTTTTGAAGTACTTCTCCATTGCCTCACCAAATTCCCATACTTTGTAGAAT 55842877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CTAAAGAGAGTTTTGAAGTACTTCTCCATTGCCTCACCAAATTCCCATACTTTGTAGAAT 4860

 55842878 TGTGCAGAAAAAAAACAGAATGGGAACAAAATGTTTGATAGGAATTACTTAACAAAGACT 55842937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TGTGCAGAAAAAAAACAGAATGGGAACAAAATGTTTGATAGGAATTACTTAACAAAGACT 4920

 55842938 ATATGCTGAGTAAGTATATTAGCAAAAACTAAGATCTTTCTGCCTTATTAATAAGAAGGA 55842997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ATATGCTGAGTAAGTATATTAGCAAAAACTAAGATCTTTCTGCCTTATTAATAAGAAGGA 4980

 55842998 AGAAGTGAACTGAACC 55843013
          ||||||||||||||||
     4981 AGAAGTGAACTGAACC 4996

EXCISED REGION

 55843027 CACTGGGAAATGAGAAATGCAGGCCATCCCAGCTCAGAACTTAGAAACTTTGCCACTAGA 55843086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4998 CACTGGGAAATGAGAAATGCAGGCCATCCCAGCTCAGAACTTAGAAACTTTGCCACTAGA 5057

 55843087 TTCAGGTTTATCAGTGATTTTGTTTTTATTGAGAAAGAACTAACTAAAAGCAGAATTCAA 55843146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5058 TTCAGGTTTATCAGTGATTTTGTTTTTATTGAGAAAGAACTAACTAAAAGCAGAATTCAA 5117

 55843147 GGTACAGGATTTCTAGTTGAAATGTATGTATTTGGGGCTAAATTAACACTAGAGTGAAAA 55843206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5118 GGTACAGGATTTCTAGTTGAAATGTATGTATTTGGGGCTAAATTAACACTAGAGTGAAAA 5177

 55843207 CTGAATTGCTTACAATTTGTCAAGATTTCTTTGTTCTTAATCCAAAATGTGTTTTTAGCT 55843266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5178 CTGAATTGCTTACAATTTGTCAAGATTTCTTTGTTCTTAATCCAAAATGTGTTTTTAGCT 5237

 55843267 TTCATCTCAGCTCCAAAGCACATAACTGCTAAACAATTTCCATATGGAAGCCATTGCGTT 55843326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 TTCATCTCAGCTCCAAAGCACATAACTGCTAAACAATTTCCATATGGAAGCCATTGCGTT 5297

 55843327 AAGAGTTCTGGACAAAATAATGATACATGGTTGCCTTAAAGGAGTTTACTGTACAGTTGG 55843386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5298 AAGAGTTCTGGACAAAATAATGATACATGGTTGCCTTAAAGGAGTTTACTGTACAGTTGG 5357

 55843387 AAAGATAGGCATGCAGATACAAAGATATAACACAAGGTCCTATAAAAATCTATAGCTCAT 55843446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5358 AAAGATAGGCATGCAGATACAAAGATATAACACAAGGTCCTATAAAAATCTATAGCTCAT 5417

 55843447 TGTTTGCAGAGATTTTTCATGCATTCTACATTTAATAGAATCTCTATTCTACAAACAATA 55843506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5418 TGTTTGCAGAGATTTTTCATGCATTCTACATTTAATAGAATCTCTATTCTACAAACAATA 5477

 55843507 TAAAGCTGTAATTAACCCTTTAAAGCTATTTGCCAAAGTAAATGTAAGTAATTACATTGC 55843566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5478 TAAAGCTGTAATTAACCCTTTAAAGCTATTTGCCAAAGTAAATGTAAGTAATTACATTGC 5537

 55843567 TTTACTTAATTTTTAAAGTAGCAAAGAAAACTCTTCCAACTAAGTGGATTCATCTTGTTC 55843626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5538 TTTACTTAATTTTTAAAGTAGCAAAGAAAACTCTTCCAACTAAGTGGATTCATCTTGTTC 5597

 55843627 ATTGTACCTCCAGCATTTATCACGACACTTGTTATAGTAAGGATTCACTATTCCTCATAA 55843686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5598 ATTGTACCTCCAGCATTTATCACGACACTTGTTATAGTAAGGATTCACTATTCCTCATAA 5657

 55843687 ATATATAATATATACAGTAATGGCACCACATAACAATGTTTTGGTTAACAATGAACCAAT 55843746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5658 ATATATAATATATACAGTAATGGCACCACATAACAATGTTTTGGTTAACAATGAACCAAT 5717

 55843747 ATGCAACAGTGGTCTCATGACATTATAATGAAGCTGAAAAATTACTATTGCCTAGTGGGC 55843806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5718 ATGCAACAGTGGTCTCATGACATTATAATGAAGCTGAAAAATTACTATTGCCTAGTGGGC 5777

 55843807 TAGTTATTATAACATCATAGAGCATAACCTATTCTAAGTTTAGATTTGTGTAGATACACA 55843866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5778 TAGTTATTATAACATCATAGAGCATAACCTATTCTAAGTTTAGATTTGTGTAGATACACA 5837

 55843867 AATTGTGTAGTAATTGCCTACAGTATTCAGTCACATGCTGAACAGGTTTTTAGCCTAGAG 55843926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5838 AATTGTGTAGTAATTGCCTACAGTATTCAGTCACATGCTGAACAGGTTTTTAGCCTAGAG 5897

 55843927 GCAATAGGCTATAGCATATAATCCGGTTGTGTAGTAGACTATGCCATCTAGGTTTATAAA 55843986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5898 GCAATAGGCTATAGCATATAATCCGGTTGTGTAGTAGACTATGCCATCTAGGTTTATAAA 5957

 55843987 GTAGTTACATAAAGCCTAGATGGCATAGCTGACTACACAGTGTACTTACATAGCCTACTA 55844046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5958 GTAGTTACATAAAGCCTAGATGGCATAGCTGACTACACAGTGTACTTACATAGCCTACTA 6017

 55844047 CACAGTGCCCTAAAGTTTATGTAAATACACTGTACTTATATAACCTACTACACACTGTAC 55844106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6018 CACAGTGCCCTAAAGTTTATGTAAATACACTGTACTTATATAACCTACTACACACTGTAC 6077

 55844107 TTTCATAACCTACTATACAGTATACTTACAGTTTATAGTACTTAGTACACTGTACTTACA 55844166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6078 TTTCATAACCTACTATACAGTATACTTACAGTTTATAGTACTTAGTACACTGTACTTACA 6137

 55844167 TACTATGCCTAAAGATATATAATCCCCTAAGGTTACATTTCTTAGAAGAAATCCCTGTCA 55844226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6138 TACTATGCCTAAAGATATATAATCCCCTAAGGTTACATTTCTTAGAAGAAATCCCTGTCA 6197

 55844227 TTAGGTGACACATGAATAAAATTATTATTTGTCAATTCCATGAAAATTTTAAAAGATTAG 55844286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6198 TTAGGTGACACATGAATAAAATTATTATTTGTCAATTCCATGAAAATTTTAAAAGATTAG 6257

 55844287 TGGAAATAATTTTTAAAATTCAGACTAATGTATAAAAACATAAAATAGAAGATAAAGATG 55844346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6258 TGGAAATAATTTTTAAAATTCAGACTAATGTATAAAAACATAAAATAGAAGATAAAGATG 6317

 55844347 ACACAAAATTCAACCAGCTTTGTAAACAATCTAAAAGTACATTGTTTTGCTCAGATTTGT 55844406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6318 ACACAAAATTCAACCAGCTTTGTAAACAATCTAAAAGTACATTGTTTTGCTCAGATTTGT 6377

 55844407 GATGGCATTCTTAGAAAATTATTGTAATTGGAATTGCTATGTTTGAAGTATATTTTCATG 55844466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6378 GATGGCATTCTTAGAAAATTATTGTAATTGGAATTGCTATGTTTGAAGTATATTTTCATG 6437

 55844467 TTGCACTGCAATACTACTCTCAAAAAAGCTGACATTGCTTTACACTTCATTCACAAGTAT 55844526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6438 TTGCACTGCAATACTACTCTCAAAAAAGCTGACATTGCTTTACACTTCATTCACAAGTAT 6497

 55844527 ATGAAATTCCTATTTCCCCAAAATGACCCAGAACTTTGTCAATGCTTCCTTTTTGGTCAA 55844586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6498 ATGAAATTCCTATTTCCCCAAAATGACCCAGAACTTTGTCAATGCTTCCTTTTTGGTCAA 6557

 55844587 CCTGATATGTGACAAATAATCTTGCATTGCTATTTTCACTTGCATTCCTGTGATTACAAA 55844646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6558 CCTGATATGTGACAAATAATCTTGCATTGCTATTTTCACTTGCATTCCTGTGATTACAAA 6617

 55844647 ATAAAGCATTTTCTGTTCATTTTCCTTTAATACTTCTTTATGAATTGGCTCTTCTTGAAA 55844706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6618 ATAAAGCATTTTCTGTTCATTTTCCTTTAATACTTCTTTATGAATTGGCTCTTCTTGAAA 6677

 55844707 TTTTTCTCATGAATATGTAAGTTCTTTATACAGCACTATTATATAGTACCTTTTCCATCA 55844766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6678 TTTTTCTCATGAATATGTAAGTTCTTTATACAGCACTATTATATAGTACCTTTTCCATCA 6737

 55844767 TATATTGCAGTTTTTTCTGTTCTGTGCATTTGCTTTTAATGCCATACACTATATTACTTA 55844826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6738 TATATTGCAGTTTTTTCTGTTCTGTGCATTTGCTTTTAATGCCATACACTATATTACTTA 6797

 55844827 TTATCAATATATTTTATTATTTATGTAACAAACCAACAAAAATTTTCCTCTTAGTTTGTG 55844886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6798 TTATCAATATATTTTATTATTTATGTAACAAACCAACAAAAATTTTCCTCTTAGTTTGTG 6857

 55844887 ATTTTGATGTCATTTCAAAGGCCATTAACAACCCAAGACAACATAATTATTTCTCTGTAA 55844946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6858 ATTTTGATGTCATTTCAAAGGCCATTAACAACCCAAGACAACATAATTATTTCTCTGTAA 6917

 55844947 TATTCCTAGTTTTATTTTTTTCTTTAAACTTCAACATATCAAGTGTTTTAATGTAAGCTT 55845006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6918 TATTCCTAGTTTTATTTTTTTCTTTAAACTTCAACATATCAAGTGTTTTAATGTAAGCTT 6977

 55845007 GAAGTATCACTTCAAATTTTTTTCCAAGCAGCACAGTTATTCTAATGTTATTTGATAAAT 55845066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6978 GAAGTATCACTTCAAATTTTTTTCCAAGCAGCACAGTTATTCTAATGTTATTTGATAAAT 7037

 55845067 AGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGTAACTGTAATTTT 55845126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7038 AGGCTAATAGCCTTGAAATGCTACATTTTTAAGACCAAAAAAAATTGTAACTGTAATTTT 7097

 55845127 TTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCACGGTTTTCATAC 55845186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7098 TTTAGTTCTATGTTATTTATCATTATGTCTATTTTGACAGTAGTTCCACGGTTTTCATAC 7157

 55845187 TACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTGTATTTTGTTGAA 55845246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7158 TACGGTATCTTTATAATATCTTTTGTATTATAATACTTTTTGTATTTGTATTTTGTTGAA 7217

 55845247 AGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTCATGTTTATTT 55845306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7218 AGCCTCCTCTCTTTTAGGTGAGCATTGCAGAGTTTCTGGACCATTCTTTCATGTTTATTT 7277

 55845307 ATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTATTAGAACTG 55845366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7278 ATTCTGATAAATCTTAAAATGTTTTAACGAGGTATTTCTCTCCAAATCTTATTAGAACTG 7337

 55845367 GTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTTTGCTCAATT 55845426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7338 GTTCTGCAATTCTCAGAATGTTGTTTACAATTCTCCATGAGGTAGTTATTTTGCTCAATT 7397

 55845427 TTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAATAAGTA 55845486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7398 TTATTTTAACATAATTTGAATAAGTATGGAAGTCTTTGCAAGAAAAAAAAGGAATAAGTA 7457

 55845487 GAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGACCCCT 55845546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7458 GAACAACAAATCTGAATGAGAAAATTCACAATGTCAAAAATCTTGTCAACAAAGACCCCT 7517

 55845547 AGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGCTTTTC 55845606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7518 AGATCTTTTCTTTCCAGGGAGCCTTAGGGAAAACCAACAAAAATGAAAACAGTGCTTTTC 7577

 55845607 AAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAAAGCCC 55845666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7578 AAACCACCAGAGGGCAGTGCACTCAAAATAATGGATATCAGCAATCCTGAACTAAAGCCC 7637

 55845667 AAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCATTTTAA 55845726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7638 AAAGTTTCCCTTCTCTTAAAGATAAAATTTACATAACAATAGACTCTTGGTTCATTTTAA 7697

 55845727 ACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTATAATA 55845786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7698 ACTCTGAAATAATTACAGTCCTTAAATCTGATATTAGCAATATGACATTTATTTATAATA 7757

 55845787 CTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATTATAGT 55845846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7758 CTTAGAGAATATTCACAGAAATATAGTCACCACTGAATTTTTCCATATTAATATTATAGT 7817

 55845847 CTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTATGAAT 55845906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7818 CTGCCTGCCCAACCACTTTGCTAAAGATCTACATAAAACCTTAAGGTGTTCTGTATGAAT 7877

 55845907 GAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGAC 55845966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7878 GAGAATTCCTTGAAAACAGGAATTGTGCTTTCTCACCAGTCGTTTCTTCTGTACATGGAC 7937

 55845967 AGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATTT 55846026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7938 AGGACTCAGTTTATTGTAATAACTCAATATCTAATGAATAAAAAACAAAATAAATGATTT 7997

 55846027 GTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATGA 55846086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7998 GTAGTCTCGGCCCTACTCAATTTCTGCATTAATTCAAATGAAACCTGCATTACACTATGA 8057

 55846087 GCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGCC 55846146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8058 GCTATTGCTACCCTTAGGCAAGTGGGTTCTCTGCCCTGAGCCCTGCACTTCATCTGGGCC 8117

 55846147 TCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATGC 55846206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8118 TCTTCCAGCAACAACCCTTCTCCCTCTGGCCAGGATTACTCTCCTTCCCATGGGCAATGC 8177

 55846207 AATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCCC 55846266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8178 AATAGGGCTACCTTTCACATCATACTCTGGGTGTCTCAGACACAGATTCACTGAAGCCCC 8237

 55846267 TGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGCA 55846326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8238 TGTGTAGTTCTACTTCTCTAGGCCCATCTTACCCAGAGTAGATTATGTAATGGGTGTGCA 8297

 55846327 CAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATTT 55846386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8298 CAGGGCAGACCCAAAGAGTGGCTGAAGGGGTGCTATTTCTTTGGGCTGTGGACAGAATTT 8357

 55846387 TATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTCT 55846446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8358 TATTGTGCAATCTGGGATTTATGGACCAGACAGATTCAAGGAGAATTTTTTTCTCTTTCT 8417

 55846447 TCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTTT 55846506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8418 TCCTTATGTTTCTGGGTCATATAATTTTTAACAATAATTACCTATTACTTGTATTGTTTT 8477

 55846507 TAAAACACAGAGAGAAAGGTG---TAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGG 55846563
          ||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8478 TAAAACACAGAGAGAAAG---ATATAGAAGTAAAATCCACTTCACTTGGGGACAGATTGG 8534

 55846564 ATCTACAGAATGATGGGACAACTGACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAA 55846623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8535 ATCTACAGAATGATGGGACAACTGACCTTGTATATCTTTCTGGCATGGGGACTGGTTAAA 8594

 55846624 CAACACTATCATCAAATGAAATTTGCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGC 55846683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8595 CAACACTATCATCAAATGAAATTTGCAATTCTAGAAAAGGAATAGATTTATGCACATGGC 8654

 55846684 ATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAGAACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGT 55846743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8655 ATAAGAATGCTAAATTCTGTGAAGAACAAGTTGTATTGAAGACCTGTGTAATATCTATGT 8714

 55846744 GCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACT 55846803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8715 GCAACTATCTAGAAAGCAGTCAGAAATTTTTGTGGAGATCTCAAAAGGAAGGTTTTGACT 8774

 55846804 AGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAA 55846863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8775 AGATCATGCATTTTTGAGAGGGGTCTATGTATAGCTAACAAGCAAAAAATCTACTGAGAA 8834

 55846864 AAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAG 55846923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8835 AAAGTGTAGAAGATACAAAAAGAATAAGACCAAAGTCAGTACCATTTTAGAATAAGAGAG 8894

 55846924 AAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGA 55846983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8895 AAGAAAATGACATGTTAGAATAAGAGAGAAGAAAATGACAAAGAGCATTCACTCAGGAGA 8954

 55846984 AGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTC 55847043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8955 AGGATCAGAAAAGCAGAAACAAAGGAAAAGTTTCAACAAATACAAAGACTTCTTGATGTC 9014

 55847044 AAATGGAACAGAAAAATCATATACAATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCAT 55847103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9015 AAATGGAACAGAAAAATCATATACAATACATTCTTGCAAGCACTGTCTGGATTTGTTCAT 9074

 55847104 CAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAG 55847163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9075 CAGGAGGTCACATGTGACCTTGGAGATAGTCATGTCAGTGAACTGTCAGAGTGAAGTCAG 9134

 55847164 AGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACC 55847223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9135 AGAGCTGTAGGCAGAAAAAGGAAAGAGAGGTAGAGAAATAAAGCTAATGGAAGGTCTACC 9194

 55847224 TTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTT 55847283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9195 TTTTCAAGACTTCTTCCCTGGAGATGATAAGGAGAGAAAGAGTGCAATACCTTCCAGCTT 9254

 55847284 GATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAA 55847343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9255 GATGGAAGAGGCTACTTTCAGAAGAAGCTGTAGGTTAATAATAAGCAAATCTGAAAAAAA 9314

 55847344 TGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTT 55847403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9315 TGTCACCTGAAAAACTGCTCCCATTGGAAACACAAATGCAACCTCTATCTCTGCTATTTT 9374

 55847404 TCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAA 55847463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9375 TCTGTTCTTGACTCCCATCCAGCAACATCCATCATCAAGTGGTATCAATTAGAAATCAAA 9434

 55847464 GATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTA 55847523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9435 GATTAAAATAAAAGAACTAATTCCTGTCAACAAGGTAGAGTTTCTCTTCCATGAAGATTA 9494

 55847524 ACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTG 55847583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9495 ACAATAATCTTTTATTCATCATCTTTTGATCATTTTCTTGGAATGTAACTCTGGTAATTG 9554

 55847584 AAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCT 55847643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9555 AAATCTCAATTTATTAACAAGACAATAGACAACAGGGTTCTAAGCAGTAAGTAGTAAGCT 9614

 55847644 GATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAA 55847703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9615 GATACGCAAATTTGCTAATGCAGAATCAGAAGCTAGTATAAGAATCCTTAAGGAAGTCAA 9674

 55847704 AAAAAATGTAGGCTGACTAAAGTGTTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAA 55847763
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9675 AAAAAA-GTAGGCTGACTAAAGTGTTTTAGTTTCCTTTGGCATTTTCATCTTGGCTTTAA 9733

 55847764 CTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCA 55847823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9734 CTTCTCTTCTTACAACTAAATTTGTAAGTAATGAAGATTTAGTATTGATTTGTGCCAGCA 9793

 55847824 TGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGA 55847883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9794 TGGATTTTCATGGATTTATTATTGGTCTAATTCAAACACCACTTCTTGGCTCTTACCAGA 9853

 55847884 GTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTC 55847943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9854 GTCACTTTCCTCTGGCATATACTGCAGACTTCCCCTGCCCTGCTCCTCATTGTTCTCTTC 9913

 55847944 TCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTG 55848003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9914 TCTCACACCCAGCTTGAACCATCAGCCATTGCTAATTGAGCAGTTTACATCTTGCCGCTG 9973

 55848004 A 55848004
          |
     9974 A 9974

Alignment time is 23.5412 s

