
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4274] =>      4274 nucs 'mol-32-1e7c-029621_4274'

Score:        4252
Aligned:      4274        nucs
Identic:      4272 (100%) nucs =>      3554 (100%)       718 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51732555,51736109] EXCISED REGION [51736805,51737522]
 second seq =>  [       1,    3555] EXCISED REGION [    3556,    4274]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51732555 TACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAG 51732614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAG 60

 51732615 ATGCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACAT 51732674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACAT 120

 51732675 ACGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGA 51732734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGA 180

 51732735 ATTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTT 51732794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTT 240

 51732795 CCCAGACAGAGACCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCAC 51732854
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCAGACAGAGATCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCAC 300

 51732855 TAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAA 51732914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAA 360

 51732915 TTGGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGA 51732974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGA 420

 51732975 TGGTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGA 51733034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGA 480

 51733035 AAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTG 51733094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTG 540

 51733095 TGCTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGT 51733154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGT 600

 51733155 CCACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGC 51733214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGC 660

 51733215 ACTATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTA 51733274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTA 720

 51733275 GTAGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAAC 51733334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTAGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAAC 780

 51733335 AAAGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGG 51733394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGG 840

 51733395 GAAATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTA 51733454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTA 900

 51733455 GTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTT 51733514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTT 960

 51733515 ACTATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAA 51733574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAA 1020

 51733575 ATAGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTT 51733634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATAGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTT 1080

 51733635 TCCCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAA 51733694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAA 1140

 51733695 GTATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACA 51733754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACA 1200

 51733755 CATCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAA 51733814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAA 1260

 51733815 AAAAGAAAATAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCC 51733874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAGAAAATAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCC 1320

 51733875 AATAGAGTACATGCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGC 51733934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATAGAGTACATGCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGC 1380

 51733935 AACTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTG 51733994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTG 1440

 51733995 GACTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATA 51734054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATA 1500

 51734055 CTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAA 51734114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAA 1560

 51734115 ACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCAC 51734174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCAC 1620

 51734175 TGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGG 51734234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGG 1680

 51734235 ACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTAT 51734294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTAT 1740

 51734295 ATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAA 51734354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAA 1800

 51734355 AGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGAT 51734414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGAT 1860

 51734415 TTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATT 51734474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATT 1920

 51734475 GCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAA 51734534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAA 1980

 51734535 ACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTA 51734594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTA 2040

 51734595 AAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTG 51734654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTG 2100

 51734655 ATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAA 51734714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAA 2160

 51734715 ATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCT 51734774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCT 2220

 51734775 TACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCAT 51734834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCAT 2280

 51734835 ACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAG 51734894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAG 2340

 51734895 GCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAA 51734954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAA 2400

 51734955 TCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGA 51735014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGA 2460

 51735015 GCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCA 51735074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCA 2520

 51735075 TAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTA 51735134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTA 2580

 51735135 CTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAAT 51735194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAAT 2640

 51735195 CTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTT 51735254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTT 2700

 51735255 GAATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGA 51735314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGA 2760

 51735315 ACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGT 51735374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGT 2820

 51735375 GTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACT 51735434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACT 2880

 51735435 TCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAAT 51735494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAAT 2940

 51735495 ACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAA 51735554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAA 3000

 51735555 ATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTA 51735614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTA 3060

 51735615 GGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAA 51735674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAA 3120

 51735675 AAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTC 51735734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTC 3180

 51735735 AACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCT 51735794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCT 3240

 51735795 ATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTA 51735854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTA 3300

 51735855 TTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGG 51735914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGG 3360

 51735915 CAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGT 51735974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGT 3420

 51735975 ATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAA 51736034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAA 3480

 51736035 CAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATG 51736094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATG 3540

 51736095 GATTAACAAACTGCA 51736109
          |||||||||||||||
     3541 GATTAACAAACTGCA 3555

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 3615

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3616 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 3675

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3676 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 3735

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3736 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 3795

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3796 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 3855

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3856 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 3915

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     3916 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 3975

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3976 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 4035

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4036 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 4095

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 4155

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4156 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 4215

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCA 51737522
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4216 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCA 4274

Alignment time is 5.23639 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4820] =>      4820 nucs 'mol-32-229c-055744_4820'

Score:        4644
Aligned:      4820        nucs
Identic:      4804 (100%) nucs =>        19 (100%)      4785 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51732237,51732255] EXCISED REGION [51732257,51737056]
 second seq =>  [       1,      19] EXCISED REGION [      21,    4820]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51732256,51732256]
 second seq =>         1 nucs [20,20]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [51736811,51736811]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [17,19] to [18,20]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51732237 GCATCAGCAATTGCTTCCC 51732255
          |||||||||||||||||||
        1 GCATCAGCAATTGCTTCCC 19

EXCISED REGION

 51732257 GGAGCATATTGAACACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGG 51732316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       21 GGAGCATATTGAACACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGG 80

 51732317 ACATTTTTAGAATTTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGG 51732376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       81 ACATTTTTAGAATTTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGG 140

 51732377 CTGTAAGTCTTTCTAAGAAGAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTA 51732436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      141 CTGTAAGTCTTTCTAAGAAGAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTA 200

 51732437 TGAGATCTGGTCCAAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCA 51732496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      201 TGAGATCTGGTCCAAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCA 260

 51732497 TACACTCATGATTCAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATA 51732556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      261 TACACTCATGATTCAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATA 320

 51732557 CTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGAT 51732616
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      321 CTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCAACAGCCAGAATAACAGAT 380

 51732617 GCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATAC 51732676
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      381 GCATGCCCATCAGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATAC 440

 51732677 GATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAAT 51732736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      441 GATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAAT 500

 51732737 TGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCC 51732796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      501 TGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCC 560

 51732797 CAGACAGAGACCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTA 51732856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      561 CAGACAGAGACCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTA 620

 51732857 AGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATT 51732916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      621 AGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATT 680

 51732917 GGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATG 51732976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      681 GGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATG 740

 51732977 GTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAA 51733036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      741 GTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAA 800

 51733037 AAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTG 51733096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      801 AAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTG 860

 51733097 CTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCC 51733156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      861 CTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCC 920

 51733157 ACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCAC 51733216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      921 ACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCAC 980

 51733217 TATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGT 51733276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      981 TATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGT 1040

 51733277 AGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAA 51733336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1041 AGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAA 1100

 51733337 AGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGA 51733396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1101 AGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGA 1160

 51733397 AATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGT 51733456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1161 AATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGT 1220

 51733457 CTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTAC 51733516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1221 CTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTAC 1280

 51733517 TATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAAT 51733576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1281 TATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAAT 1340

 51733577 AGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTC 51733636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1341 AGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTC 1400

 51733637 CCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGT 51733696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1401 CCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGT 1460

 51733697 ATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACA 51733756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1461 ATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACA 1520

 51733757 TCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAA 51733816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1521 TCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAA 1580

 51733817 AAGAAAATAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAA 51733876
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1581 AAGAAAAGAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAA 1640

 51733877 TAGAGTACATGCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAA 51733936
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1641 TAGAGTACATGCAGTGAATTAATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAA 1700

 51733937 CTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGA 51733996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1701 CTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGA 1760

 51733997 CTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACT 51734056
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1761 CTTCTTTGTGCTTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACT 1820

 51734057 GTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAAC 51734116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1821 GTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAAC 1880

 51734117 CCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTG 51734176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1881 CCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTTGGCCCCTTCACTG 1940

 51734177 ACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGAC 51734236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1941 ACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGAC 2000

 51734237 ATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATAT 51734296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 ATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATAT 2060

 51734297 TTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAG 51734356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 TTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAG 2120

 51734357 AGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTT 51734416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 AGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTT 2180

 51734417 TTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGC 51734476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 TTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGC 2240

 51734477 GATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAAC 51734536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 GATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAAC 2300

 51734537 TCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGG-AAAAAAAAGTAA 51734595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     2301 TCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAAGTAA 2360

 51734596 AGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGA 51734655
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2361 AGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTAGTGA 2420

 51734656 TTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAA 51734715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 TTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAA 2480

 51734716 TCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTT 51734775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 TCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTT 2540

 51734776 ACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATA 51734835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 ACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATA 2600

 51734836 CATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGG 51734895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 CATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGG 2660

 51734896 CTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAAT 51734955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 CTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAAT 2720

 51734956 CAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAG 51735015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 CAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAG 2780

 51735016 CAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCAT 51735075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 CAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCAT 2840

 51735076 AATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTAC 51735135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 AATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTAC 2900

 51735136 TGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATC 51735195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 TGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATC 2960

 51735196 TTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTG 51735255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 TTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTG 3020

 51735256 AATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAA 51735315
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 AATATTGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAA 3080

 51735316 CAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTG 51735375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 CAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTG 3140

 51735376 TTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTT 51735435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 TTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTT 3200

 51735436 CCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATA 51735495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 CCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATA 3260

 51735496 CAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAA 51735555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 CAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAA 3320

 51735556 TATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAG 51735615
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3321 TATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTCAG 3380

 51735616 GTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAA 51735675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 GTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAA 3440

 51735676 AGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCA 51735735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 AGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCA 3500

 51735736 ACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTA 51735795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 ACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTA 3560

 51735796 TTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTAT 51735855
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3561 TTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGAAT 3620

 51735856 TAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGC 51735915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3621 TAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGC 3680

 51735916 AGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTA 51735975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3681 AGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTA 3740

 51735976 TTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAAC 51736035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 TTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAAC 3800

 51736036 AGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGG 51736095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 AGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGG 3860

 51736096 ATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTA 51736155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 ATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTA 3920

 51736156 ATATTGATATGTGCAACAAGTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCA 51736215
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3921 ATATTGATATGTGCAACAACTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCA 3980

 51736216 GTCCCAAAAGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTA 51736275
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3981 GTCTCAAAAGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTG 4040

 51736276 TAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTA 51736335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4041 TAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTA 4100

 51736336 CAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTG 51736395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4101 CAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTG 4160

 51736396 GTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGT 51736455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4161 GTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGT 4220

 51736456 TTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAA 51736515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4221 TTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAA 4280

 51736516 TAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCT 51736575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4281 TAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCT 4340

 51736576 AGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTG 51736635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4341 AGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTG 4400

 51736636 CAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAG 51736695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4401 CAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAG 4460

 51736696 TGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGA 51736755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4461 TGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGA 4520

 51736756 GAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAA 51736815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     4521 GAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAG-AAAA 4579

 51736816 AAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGAC 51736875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 AAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGAC 4639

 51736876 AAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATA 51736935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4640 AAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATA 4699

 51736936 TTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAA 51736995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 TTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAA 4759

 51736996 ATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCAC 51737055
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 ATAATTGAAGAAAACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCAC 4819

 51737056 T 51737056
          |
     4820 T 4820

Alignment time is 6.11469 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2966] =>      2966 nucs 'mol-32-22b2-009494_2966'

Score:        2845
Aligned:      2966        nucs
Identic:      2955 (100%) nucs =>        21 (100%)      2934 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51733876,51733896] EXCISED REGION [51733898,51736841]
 second seq =>  [       1,      21] EXCISED REGION [      23,    2966]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51733897,51733897]
 second seq =>         1 nucs [22,22]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [51736811,51736811]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [22,22] to [23,23]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [51733894,51733896] to [51733898,51733900]
 second seq =>         3 nucs [19,21] to [23,25]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51733876 ATAGAGTACATGCAGTGAATT 51733896
          |||||||||||||||||||||
        1 ATAGAGTACATGCAGTGAATT 21

EXCISED REGION

 51733898 ATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATAC 51733957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       23 ATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATAC 82

 51733958 CACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAAGC 51734017
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
       83 CACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGCTTTCCCAAGC 142

 51734018 ACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTG 51734077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      143 ACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTG 202

 51734078 CATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTA 51734137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      203 CATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTA 262

 51734138 TGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTA 51734197
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      263 TGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTTGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTA 322

 51734198 CTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATC 51734257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      323 CTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATC 382

 51734258 AAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAA 51734317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      383 AAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAA 442

 51734318 GCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTC 51734377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      443 GCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTC 502

 51734378 AGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATG 51734437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      503 AGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATG 562

 51734438 ATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGA 51734497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      563 ATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGA 622

 51734498 GGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAA 51734557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      623 GGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAA 682

 51734558 ACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGG-AAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATT 51734616
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 ACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATT 742

 51734617 CATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATATT 51734676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      743 CATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTAGTGATTCAAACCACAAGAGCATATT 802

 51734677 TACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACC 51734736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      803 TACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACC 862

 51734737 TCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTA 51734796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      863 TCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTA 922

 51734797 AAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGA 51734856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      923 AAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGA 982

 51734857 AAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATA 51734916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      983 AAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATA 1042

 51734917 CCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCA 51734976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1043 CCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCA 1102

 51734977 TCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGC 51735036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1103 TCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGC 1162

 51735037 CTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCA 51735096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1163 CTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCA 1222

 51735097 CCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTC 51735156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1223 CCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTC 1282

 51735157 TTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATG 51735216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1283 TTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATG 1342

 51735217 ATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCAT 51735276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1343 ATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATTGGCCTTATTTATCAT 1402

 51735277 CTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATG 51735336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 CTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATG 1462

 51735337 GCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCAT 51735396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 GCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCAT 1522

 51735397 CTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAA 51735456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 CTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAA 1582

 51735457 AAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAA 51735516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 AAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAA 1642

 51735517 AAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATG 51735576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 AAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATG 1702

 51735577 ACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAG 51735636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1703 ACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTCAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAG 1762

 51735637 ACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAAT 51735696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 ACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAAT 1822

 51735697 ATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAA 51735756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 ATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAA 1882

 51735757 ATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATA 51735816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 ATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATA 1942

 51735817 CAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGT 51735876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1943 CAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGAATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGT 2002

 51735877 GGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATA 51735936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 GGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATA 2062

 51735937 TGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAA 51735996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 TGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAA 2122

 51735997 CTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAA 51736056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 CTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAA 2182

 51736057 ATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTACATC 51736116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 ATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTACATC 2242

 51736117 TATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACAAGT 51736176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2243 TATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACAACT 2302

 51736177 TAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCCCAAAAGGTTACATACTA 51736236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2303 TAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCTCAAAAGGTTACATACTA 2362

 51736237 TATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTATAGTGACAGAGAATATATTAG 51736296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2363 TATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTGTAGTGACAGAGAATATATTAG 2422

 51736297 TGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTG 51736356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 TGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTG 2482

 51736357 GGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACA 51736416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 GGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACA 2542

 51736417 TGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATT 51736476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 TGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATT 2602

 51736477 TTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCC 51736536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 TTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCC 2662

 51736537 ACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGT 51736596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 ACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGT 2722

 51736597 TAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAA 51736656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 TAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAA 2782

 51736657 ATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAGA 51736716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 ATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAGA 2842

 51736717 AATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTATATCCA 51736776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 AATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTATATCCA 2902

 51736777 TGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAA 51736836
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     2903 TGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAG-AAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAA 2961

 51736837 AAAAG 51736841
          |||||
     2962 AAAAG 2966

Alignment time is 4.0727 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5902] =>      5902 nucs 'mol-32-2895-041401_5902'

Score:        5835
Aligned:      5905        nucs
Identic:      5897 (100%) nucs =>      1396 (100%)      4501 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51734714,51736109] EXCISED REGION [51736805,51741312]
 second seq =>  [       1,    1396] EXCISED REGION [    1397,    5902]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51734714 AATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTC 51734773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTC 60

 51734774 TTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCA 51734833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCA 120

 51734834 TACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAA 51734893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAA 180

 51734894 GGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTA 51734953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTA 240

 51734954 ATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTG 51735013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTG 300

 51735014 AGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACC 51735073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACC 360

 51735074 ATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGT 51735133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGT 420

 51735134 ACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAA 51735193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAA 480

 51735194 TCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACT 51735253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACT 540

 51735254 TGAATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGG 51735313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGG 600

 51735314 AACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTG 51735373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTG 660

 51735374 TGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGAC 51735433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGAC 720

 51735434 TTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAA 51735493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAA 780

 51735494 TACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAA 51735553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAA 840

 51735554 AATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTT 51735613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTT 900

 51735614 AGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCA 51735673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCA 960

 51735674 AAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTT 51735733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTT 1020

 51735734 CAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACC 51735793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACC 1080

 51735794 TATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGT 51735853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGT 1140

 51735854 ATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTG 51735913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTG 1200

 51735914 GCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGG 51735973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGG 1260

 51735974 TATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATA 51736033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATA 1320

 51736034 ACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAAT 51736093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAAT 1380

 51736094 GGATTAACAAACTGCA 51736109
          ||||||||||||||||
     1381 GGATTAACAAACTGCA 1396

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 1456

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 1516

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 1576

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 1636

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 1696

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 1756

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     1757 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 1816

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 1876

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 1936

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 1996

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 2056

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 2116

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 2176

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 2236

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
     2237 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC---TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 2293

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 2353

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 2413

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 2473

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 2533

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 2593

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 2653

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 2713

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 2773

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2774 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 2833

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 2893

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTT 51738363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
     2894 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTTCCCTGTGATTT 2953

 51738364 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 51738423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 3013

 51738424 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 51738483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 3073

 51738484 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 51738543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 3133

 51738544 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 51738603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3134 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 3193

 51738604 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 51738663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 3253

 51738664 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 51738723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3254 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 3313

 51738724 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 51738783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3314 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 3373

 51738784 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 51738843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3374 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 3433

 51738844 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 51738903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 3493

 51738904 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 51738963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3494 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 3553

 51738964 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 51739023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3554 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 3613

 51739024 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 51739083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3614 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 3673

 51739084 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 51739143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 3733

 51739144 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 51739203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3734 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 3793

 51739204 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 51739263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3794 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 3853

 51739264 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 51739323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3854 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 3913

 51739324 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 51739383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3914 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 3973

 51739384 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 51739443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3974 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 4033

 51739444 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 51739503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4034 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 4093

 51739504 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 51739563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4094 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 4153

 51739564 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 51739623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4154 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 4213

 51739624 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCACTAGGGAGTGCCAGACAGTGG 51739683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4214 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCACTAGGGAGTGCCAGACAGTGG 4273

 51739684 GCGCAGGCCAGTGTGTGTGCGCACCGTGCGCGAGCCGAAGCAGGGCGAGGCATTGCCTCA 51739743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4274 GCGCAGGCCAGTGTGTGTGCGCACCGTGCGCGAGCCGAAGCAGGGCGAGGCATTGCCTCA 4333

 51739744 CCTGGGAAGCGCAAGGGGTCAGGGAGTTCCCTTTCCGAGTCAAAGAAAGGGGTGACGGAC 51739803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4334 CCTGGGAAGCGCAAGGGGTCAGGGAGTTCCCTTTCCGAGTCAAAGAAAGGGGTGACGGAC 4393

 51739804 GCACCTGGAAAATCGGGTCACTCCCACCCAAATATTGCGCTTTTCAGACCGGCTTAAGAA 51739863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 GCACCTGGAAAATCGGGTCACTCCCACCCAAATATTGCGCTTTTCAGACCGGCTTAAGAA 4453

 51739864 ACGGCGCACCACGAGACTATATCCCACACCTGGCTCAGAGGGTCCTACGCCCACGGAATC 51739923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4454 ACGGCGCACCACGAGACTATATCCCACACCTGGCTCAGAGGGTCCTACGCCCACGGAATC 4513

 51739924 TCGCTGATTGCTAGCACAGCAGTCTGAGATCAAACGGCAAGGCGGCAACGAGGCTGTGGG 51739983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 TCGCTGATTGCTAGCACAGCAGTCTGAGATCAAACGGCAAGGCGGCAACGAGGCTGTGGG 4573

 51739984 AGGGGCGCCCGCCATTGCCCAGGCTTGCTTAGGTAAACAAAGCAGCTGGGAAGCTCGAAC 51740043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4574 AGGGGCGCCCGCCATTGCCCAGGCTTGCTTAGGTAAACAAAGCAGCCGGGAAGCTCGAAC 4633

 51740044 TGGGTGGAGCCCACCACAGCTCAAGGAGGCCTGCCTGCCTCTGTAGGCTCCACCTCTGGG 51740103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 TGGGTGGAGCCCACCACAGCTCAAGGAGGCCTGCCTGCCTCTGTAGGCTCCACCTCTGGG 4693

 51740104 GGCAGGGCACAGACAAACAAAAAGACAGCAGTAACCTCTGCAGACTTAAGTGTCCCTGTC 51740163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 GGCAGGGCACAGACAAACAAAAAGACAGCAGTAACCTCTGCAGACTTAAGTGTCCCTGTC 4753

 51740164 TGACAGCTTTGAAGAGAGCAGTGGTTCTCCCAGCACGCAGCTGGAGATCTGAGAACGGGC 51740223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4754 TGACAGCTTTGAAGAGAGCAGTGGTTCTCCCAGCACGCAGCTGGAGATCTGAGAACGGGC 4813

 51740224 AGACTGCCTCCTCAAGTGGGTCCCTGACCCCTGACCCCCGAGCAGCCTAACTGGGAGGCA 51740283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 AGACTGCCTCCTCAAGTGGGTCCCTGACCCCTGACCCCCGAGCAGCCTAACTGGGAGGCA 4873

 51740284 CCCCCCAGCAGGGGCACACTGACACCTCACACAGCAGGGTATTCCAACAGACCTGCAGCT 51740343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 CCCCCCAGCAGGGGCACACTGACACCTCACACAGCAGGGTATTCCAACAGACCTGCAGCT 4933

 51740344 GAGGGTCCTGTCTGTTAGAAGGAAAACTAACAACCAGAAAGGACATCTACACCGAAAACC 51740403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 GAGGGTCCTGTCTGTTAGAAGGAAAACTAACAACCAGAAAGGACATCTACACCGAAAACC 4993

 51740404 CATCTGTACATCACCATCATCAAAGACCAAAAGTAGATAAAACCACAAAGATGGGGAAAA 51740463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 CATCTGTACATCACCATCATCAAAGACCAAAAGTAGATAAAACCACAAAGATGGGGAAAA 5053

 51740464 AACAGAACAGAAAAACTGGAAACTCTAAAACGCAGAGCGCCTCTCCTCCTCCAAAGGAAC 51740523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 AACAGAACAGAAAAACTGGAAACTCTAAAACGCAGAGCGCCTCTCCTCCTCCAAAGGAAC 5113

 51740524 GCAGTTCCTCACCAGCAACAGAACAAAGCTGGATGGAGAATGATTTTGACGAGCTGAGAG 51740583
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     5114 GCAGTTCCTCACCAGCAACAGAACAAAGCTGGATGGAGAATGATTTTGATGAGCTGAGAG 5173

 51740584 AAGAAGGCTTCAGACGATCAAATTACTCTGAGCTACGGGAGGACATTCAAACCAAAGGCA 51740643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 AAGAAGGCTTCAGACGATCAAATTACTCTGAGCTACGGGAGGACATTCAAACCAAAGGCA 5233

 51740644 AAGAAGTTGAAAACTTTGAAAAAAATTTAGAAGAATGTATAACTAGAATAACCAATACAG 51740703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 AAGAAGTTGAAAACTTTGAAAAAAATTTAGAAGAATGTATAACTAGAATAACCAATACAG 5293

 51740704 AGAAGTGCTTAAAGGAGCTGATGGAGCTGAAAACCAAGGCTCGAGAACTACGTGAAGAAT 51740763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 AGAAGTGCTTAAAGGAGCTGATGGAGCTGAAAACCAAGGCTCGAGAACTACGTGAAGAAT 5353

 51740764 GCAGAAGCCTCAGGAGCCGATGCGATCAACTGGAAGAAAGGGTATCAGCAATGGAAGATG 51740823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 GCAGAAGCCTCAGGAGCCGATGCGATCAACTGGAAGAAAGGGTATCAGCAATGGAAGATG 5413

 51740824 AAATGAATGAAATGAAGCGAGAAGGGAAGTTTAGAGAAAAAAGAATAAAAAGAAATGAGC 51740883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 AAATGAATGAAATGAAGCGAGAAGGGAAGTTTAGAGAAAAAAGAATAAAAAGAAATGAGC 5473

 51740884 AAAGCCTCCAAGAAATATGGGACTATGTGAAAAGACCAAATCTACGTCTGATTGGTGTAC 51740943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 AAAGCCTCCAAGAAATATGGGACTATGTGAAAAGACCAAATCTACGTCTGATTGGTGTAC 5533

 51740944 CTGAAAGTGATGTGGAGAATGGAACCAAGTTGGAAAACACTCTGCAGGATATTATCCAGG 51741003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 CTGAAAGTGATGTGGAGAATGGAACCAAGTTGGAAAACACTCTGCAGGATATTATCCAGG 5593

 51741004 AGAACTTCCCCAATCTAGCAAGGCAGGCCAACGTTCAGATTCAGGAAATACAGAGAACGC 51741063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 AGAACTTCCCCAATCTAGCAAGGCAGGCCAACGTTCAGATTCAGGAAATACAGAGAACGC 5653

 51741064 CACAAAGATACTCCTCGAGAAGAGCAACTCCAAGACACATAATTGTCAGATTCACCAAAG 51741123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 CACAAAGATACTCCTCGAGAAGAGCAACTCCAAGACACATAATTGTCAGATTCACCAAAG 5713

 51741124 TTGAAATGAAGGAAAAAATGTTAAGGGCAGCCAGAGAGAAAGGTCGGGTTACCCTCAAAG 51741183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 TTGAAATGAAGGAAAAAATGTTAAGGGCAGCCAGAGAGAAAGGTCGGGTTACCCTCAAAG 5773

 51741184 GAAAGCCCATCAGACTAACAGCGGATCTCTTGGCAGAAACCCTACAAGCCAGAAGAGAGT 51741243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 GAAAGCCCATCAGACTAACAGCGGATCTCTTGGCAGAAACCCTACAAGCCAGAAGAGAGT 5833

 51741244 GGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAAGAATTTTCAACCCAGAATTTCATATCCAG 51741303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 GGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAAGAATTTTCAACCCAGAATTTCATATCCAG 5893

 51741304 CCAAACTAA 51741312
          |||||||||
     5894 CCAAACTAA 5902

Alignment time is 7.10944 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2071] =>      2071 nucs 'mol-32-299d-025231_2071'

Score:        2027
Aligned:      2073        nucs
Identic:      2068 (100%) nucs =>       199 (100%)      1869 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51735911,51736109] EXCISED REGION [51736805,51738677]
 second seq =>  [       1,     199] EXCISED REGION [     200,    2071]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51735911 TTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCT 51735970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCT 60

 51735971 AGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTC 51736030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTC 120

 51736031 ATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATG 51736090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATG 180

 51736091 AATGGATTAACAAACTGCA 51736109
          |||||||||||||||||||
      181 AATGGATTAACAAACTGCA 199

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      200 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 259

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      260 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 319

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      320 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 379

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      380 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 439

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      440 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 499

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      500 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 559

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
      560 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 619

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      620 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 679

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      680 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 739

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 799

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 859

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 919

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 979

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 1039

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||
     1040 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 1097

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 1157

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 1217

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 1277

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 1337

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 1397

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 1457

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 1517

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1518 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 1577

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1578 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 1637

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1638 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 1697

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTT 51738363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
     1698 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTTCCCTGTGATTT 1757

 51738364 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 51738423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1758 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 1817

 51738424 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 51738483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 1877

 51738484 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 51738543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1878 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 1937

 51738544 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 51738603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1938 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 1997

 51738604 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 51738663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1998 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 2057

 51738664 AAAAAAACAGAAAC 51738677
          ||||||||||||||
     2058 AAAAAAACAGAAAC 2071

Alignment time is 2.88876 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    6394] =>      6394 nucs 'mol-32-29ea-026398_6394'

Score:        6142
Aligned:      6395        nucs
Identic:      6372 (100%) nucs =>       253 (100%)      6119 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51731051,51731303] EXCISED REGION [51731305,51737445]
 second seq =>  [       1,     253] EXCISED REGION [     255,    6394]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51731304,51731304]
 second seq =>         1 nucs [254,254]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [51736811,51736811]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51731051 CTAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGCCTAGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATT 51731110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGCCTAGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATT 60

 51731111 TGCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAATCCAGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAG 51731170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAATCCAGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAG 120

 51731171 ACCCTTTTGAATCTACTTAGAACACAGTATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGT 51731230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCCTTTTGAATCTACTTAGAACACAGTATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGT 180

 51731231 CCCCAAGTGGTGGGATCATGACCTGCCAAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGAT 51731290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCCAAGTGGTGGGATCATGACCTGCCAAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGAT 240

 51731291 CTCAAAGAGCAAA 51731303
          |||||||||||||
      241 CTCAAAGAGCAAA 253

EXCISED REGION

 51731305 GCTCAAACAAGTTTCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCC 51731364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      255 GCTCAAACAAGTTTCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCC 314

 51731365 AAGAGACAGCCTACCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACG 51731424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      315 AAGAGACAGCCTACCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACG 374

 51731425 CAGAAATAAATATTATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCT 51731484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      375 CAGAAATAAATATTATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCT 434

 51731485 CATTTGATAAAATGCATGTAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCA 51731544
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 CATTTGATAAAATGCATATAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCA 494

 51731545 TTTAAAACATCCTTGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAAT 51731604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      495 TTTAAAACATCCTTGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAAT 554

 51731605 GAAGAAAAAGTCATGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTACAT 51731664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      555 GAAGAAAAAGTCATGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTTCAT 614

 51731665 ATTATTATTTTACTCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAATAATGAATGTCTA 51731724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      615 ATTATTATTTTACTCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTTAGGTAGAATAATGAATGTCTA 674

 51731725 GAAAGCAAAAATGAAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATCGCTAAGGCTTC 51731784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      675 GAAAGCAAAAATGAAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATTGCTAAGGCTTC 734

 51731785 TAAAACAGAATGCCAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATC 51731844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 TAAAACAGAATGCCAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATC 794

 51731845 CTAACCACAATGATTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGT 51731904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      795 CTAACCACAATGATTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGT 854

 51731905 CTGACTGAATTACTTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAA 51731964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 CTGACTGAATTACTTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAA 914

 51731965 ATAAGTGTGGCTAAATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACA 51732024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 ATAAGTGTGGCTAAATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACA 974

 51732025 TTCAGCAATCATTACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAA 51732084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 TTCAGCAATCATTACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAA 1034

 51732085 CAGCCCCGCTGCTGACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAA 51732144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 CAGCCCCGCTGCTGACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAA 1094

 51732145 TATTAATAGGAAATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAA 51732204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 TATTAATAGGAAATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAA 1154

 51732205 CTGGAGTGAAGCAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCTGGAGCATA 51732264
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1155 CTGGAGTGAAGCAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCCGGAGCATA 1214

 51732265 TTGAACACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTT 51732324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 TTGAACACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTT 1274

 51732325 AGAATTTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGT 51732384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 AGAATTTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGT 1334

 51732385 CTTTCTAAGAAGAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCT 51732444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 CTTTCTAAGAAGAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCT 1394

 51732445 GGTCCAAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCA 51732504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 GGTCCAAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCA 1454

 51732505 TGATTCAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAAT 51732564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 TGATTCAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAAT 1514

 51732565 AATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCC 51732624
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1515 AATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCAACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCC 1574

 51732625 ATCGGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAA 51732684
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 ATCAGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAA 1634

 51732685 AGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAA 51732744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 AGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAA 1694

 51732745 CAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGA 51732804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 CAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGA 1754

 51732805 GACCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAA 51732864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 GACCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAA 1814

 51732865 GAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACA 51732924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 GAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACA 1874

 51732925 GAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGG 51732984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 GAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGG 1934

 51732985 ATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGT 51733044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 ATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGT 1994

 51733045 TTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGAT 51733104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 TTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGAT 2054

 51733105 ACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTA 51733164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 ACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTA 2114

 51733165 GGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCA 51733224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 GGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCA 2174

 51733225 ATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAA 51733284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 ATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAA 2234

 51733285 ACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTAT 51733344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 ACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTAT 2294

 51733345 CTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAG 51733404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 CTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAG 2354

 51733405 CAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAAT 51733464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 CAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAAT 2414

 51733465 CTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGT 51733524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 CTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGT 2474

 51733525 TTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAG 51733584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2475 TTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAG 2534

 51733585 TAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACAC 51733644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2535 TAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACAC 2594

 51733645 CACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGT 51733704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2595 CACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGT 2654

 51733705 GATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAG 51733764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2655 GATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAG 2714

 51733765 TACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAAT 51733824
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2715 TACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAAG 2774

 51733825 AAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTAC 51733884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2775 AAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTAC 2834

 51733885 ATGCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTA 51733944
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2835 ATGCAGTGAATTAATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTA 2894

 51733945 TTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTG 51734004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2895 TTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTG 2954

 51734005 TGATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAG 51734064
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2955 TGCTTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAG 3014

 51734065 AAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCA 51734124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3015 AAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCA 3074

 51734125 AGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTT 51734184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3075 AGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTTGGCCCCTTCACTGACTTTGTT 3134

 51734185 GAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTT 51734244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3135 GAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTT 3194

 51734245 TAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCC 51734304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3195 TAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCC 3254

 51734305 CCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTA 51734364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3255 CCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTA 3314

 51734365 GCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCAC 51734424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3315 GCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCAC 3374

 51734425 TGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAA 51734484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3375 TGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAA 3434

 51734485 GCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGC 51734544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3435 GCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGC 3494

 51734545 CACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGG-AAAAAAAAGTAAAGTGGAGA 51734603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     3495 CACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAAGTAAAGTGGAGA 3554

 51734604 CTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACC 51734663
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3555 CTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTAGTGATTCAAACC 3614

 51734664 ACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAG 51734723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3615 ACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAG 3674

 51734724 ATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTC 51734783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3675 ATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTC 3734

 51734784 TGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGC 51734843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3735 TGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGC 3794

 51734844 CCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGC 51734903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3795 CCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGC 3854

 51734904 ATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAAC 51734963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3855 ATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAAC 3914

 51734964 TGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAAT 51735023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3915 TGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAAT 3974

 51735024 ACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAG 51735083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3975 ACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAG 4034

 51735084 AATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAA 51735143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4035 AATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAA 4094

 51735144 CCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACT 51735203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4095 CCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACT 4154

 51735204 GAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGG 51735263
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4155 GAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATTGG 4214

 51735264 CCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGA 51735323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4215 CCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGA 4274

 51735324 ACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACAC 51735383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4275 ACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACAC 4334

 51735384 CATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGA 51735443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4335 CATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGA 4394

 51735444 TTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCAT 51735503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4395 TTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCAT 4454

 51735504 AATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCC 51735563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4455 AATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCC 4514

 51735564 AATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAAC 51735623
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4515 AATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTCAGGTTTCAAC 4574

 51735624 AGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACC 51735683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4575 AGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACC 4634

 51735684 CAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATT 51735743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4635 CAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATT 4694

 51735744 ATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGA 51735803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4695 ATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGA 4754

 51735804 ATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTC 51735863
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4755 ATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGAATTAAAACTC 4814

 51735864 TCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTT 51735923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4815 TCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTT 4874

 51735924 ATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTT 51735983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4875 ATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTT 4934

 51735984 GGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCAT 51736043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4935 GGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCAT 4994

 51736044 TTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAA 51736103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4995 TTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAA 5054

 51736104 ACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGAT 51736163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5055 ACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGAT 5114

 51736164 ATGTGCAACAAGTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCCCAAA 51736223
          |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5115 ATGTGCAACAACTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCTCAAA 5174

 51736224 AGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTATAGTGACA 51736283
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     5175 AGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTGTAGTGACA 5234

 51736284 GAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATG 51736343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5235 GAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATG 5294

 51736344 GAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTAC 51736403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5295 GAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTAC 5354

 51736404 ACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGT 51736463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5355 ACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGT 5414

 51736464 ATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTT 51736523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5415 ATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTT 5474

 51736524 TTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTC 51736583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5475 TTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTC 5534

 51736584 ACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACT 51736643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5535 ACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACT 5594

 51736644 CCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACA 51736703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5595 CCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACA 5654

 51736704 AAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAG 51736763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5655 AAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAG 5714

 51736764 TATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAAAGGAAA 51736823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     5715 TATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAG-AAAAAAAGGAAA 5773

 51736824 TAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGAT 51736883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 TAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGAT 5833

 51736884 GGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATA 51736943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 GGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATA 5893

 51736944 ATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGA 51737003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5894 ATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGA 5953

 51737004 AGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATC 51737063
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5954 AGAAAACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATC 6013

 51737064 TAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACAC 51737123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6014 TAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACAC 6073

 51737124 CAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACGTACAAA 51737183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6074 CAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACATACAAA 6133

 51737184 AATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTG 51737243
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     6134 AATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTG 6192

 51737244 TTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGT 51737303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6193 TTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGT 6252

 51737304 TGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCAC 51737363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6253 TGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCAC 6312

 51737364 ATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGT 51737423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6313 ATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGT 6372

 51737424 CTCCAACCCCTGACCTCAGGTG 51737445
          ||||||||||||||||||||||
     6373 CTCCAACCCCTGACCTCAGGTG 6394

Alignment time is 7.69184 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4365] =>      4365 nucs 'mol-32-2af2-095507_4365'

Score:        4180
Aligned:      4367        nucs
Identic:      4350 (100%) nucs =>      3590 (100%)       760 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51734094,51737695] EXCISED REGION [51737698,51738461]
 second seq =>  [       1,    3601] EXCISED REGION [    3603,    4365]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [51737696,51737697]
 second seq =>         1 nucs [3602,3602]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        22 nucs [51737674,51737695] to [51737676,51737697]
 second seq =>         1 nucs [3602,3602] to [3603,3603]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51737696,51737696] to [51737697,51737697]
 second seq =>         0 nucs

 51734094 AACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGAC 51734153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGAC 60

 51734154 CCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCT 51734213
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCCTTCCTTGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCT 120

 51734214 CTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGA 51734273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGA 180

 51734274 CAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAG 51734333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAG 240

 51734334 ATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAG 51734393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAG 300

 51734394 AGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAG 51734453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAG 360

 51734454 ATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTA 51734513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTA 420

 51734514 TTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTG 51734573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTG 480

 51734574 CCTACATAGGAAAAAAAA-GTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAA 51734632
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTACATAGGAAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAA 540

 51734633 CAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGG 51734692
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAACAATTATCTAAATTAGTGATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGG 600

 51734693 TTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCC 51734752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCC 660

 51734753 ATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAAC 51734812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAAC 720

 51734813 TCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTG 51734872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTG 780

 51734873 AACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCAT 51734932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCAT 840

 51734933 CTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAG 51734992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAG 900

 51734993 CTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGA 51735052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGA 960

 51735053 GTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGG 51735112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGG 1020

 51735113 ACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAG 51735172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAG 1080

 51735173 CAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTG 51735232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTG 1140

 51735233 CCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCA 51735292
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCACTATTTATAATACTGACTTGAATATTGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCA 1200

 51735293 AATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGA 51735352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGA 1260

 51735353 GATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAA 51735412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAA 1320

 51735413 TCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAAT 51735472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAAT 1380

 51735473 AAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAA 51735532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAA 1440

 51735533 GCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATC 51735592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATC 1500

 51735593 CAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAA 51735652
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGAATATAGAAAGAACTCTCAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAA 1560

 51735653 ATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATA 51735712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATA 1620

 51735713 AGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCA 51735772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCA 1680

 51735773 CACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAG 51735832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAG 1740

 51735833 TGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGA 51735892
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCTGATGAGGATGAGAAAGAATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGA 1800

 51735893 CAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGA 51735952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGA 1860

 51735953 CCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAA 51736012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAA 1920

 51736013 AACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCA 51736072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCA 1980

 51736073 AGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACT 51736132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACT 2040

 51736133 ATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACAAGTTAGATGAATCCCAATG 51736192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2041 ATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACAACTTAGATGAATCCCAATG 2100

 51736193 GCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCCCAAAAGGTTACATACTATATGACTCCATTTATA 51736252
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCTCAAAAGGTTACATACTATATGACTCCATTTATA 2160

 51736253 TGACTGTTGAAAAGGCAAAACTATAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTT 51736312
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGACTGTTGAAAAGGCAAAACTGTAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTT 2220

 51736313 AAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGT 51736372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGT 2280

 51736373 TCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATA 51736432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATA 2340

 51736433 GAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAA 51736492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAA 2400

 51736493 AAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGAC 51736552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGAC 2460

 51736553 AAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACA 51736612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACA 2520

 51736613 TTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAA 51736672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAA 2580

 51736673 CAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAA 51736732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAA 2640

 51736733 AAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGC 51736792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGC 2700

 51736793 CTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATAT 51736852
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAA-GGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATAT 2759

 51736853 CATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGA 51736912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGA 2819

 51736913 AAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACA 51736972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACA 2879

 51736973 TAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAA 51737032
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2880 TAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAAGAAAACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAA 2939

 51737033 TTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAG 51737092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAG 2999

 51737093 CAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTT 51737152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTT 3059

 51737153 TCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTG 51737212
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACATACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTG 3119

 51737213 GTTTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGAT 51737272
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GTTTTTTTTTT-GAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGAT 3178

 51737273 CTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCG 51737332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 CTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCG 3238

 51737333 AGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGA 51737392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 AGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGA 3298

 51737393 GACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCA 51737452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 GACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCA 3358

 51737453 CACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTA 51737512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 CACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTA 3418

 51737513 AAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAAT 51737572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAAT 3478

 51737573 TTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGG 51737632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 TTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGG 3538

 51737633 TCTCCATATATAGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 51737692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TCTCCATATATAGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 3598

 51737693 TTT 51737695
          |||
     3599 TTT 3601

EXCISED REGION

 51737698 CAGAAAGTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAG 51737757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 CAGAAAGTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAG 3662

 51737758 ATGTACGAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGAT 51737817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3663 ATGTACGAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGAT 3722

 51737818 AATGTTCAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTA 51737877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3723 AATGTTCAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTA 3782

 51737878 AGCATAAACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAA 51737937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3783 AGCATAAACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAA 3842

 51737938 TTTTACAACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATA 51737997
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3843 TTTTACAACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCATAAGGCATATA 3902

 51737998 GAATAATGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAAC 51738057
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 GAATAAT-CTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAAC 3961

 51738058 CAGGTACAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAA 51738117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3962 CAGGTACAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAA 4021

 51738118 ATTAATCTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGT 51738177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4022 ATTAATCTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGT 4081

 51738178 GGGGTTGAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTAT 51738237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4082 GGGGTTGAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTAT 4141

 51738238 TATTAGTTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCT 51738297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4142 TATTAGTTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCT 4201

 51738298 TAGTTGTATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTA 51738357
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4202 TAGTTGTATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTG 4261

 51738358 TGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGT 51738417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4262 TGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGT 4321

 51738418 AGGACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAA 51738461
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4322 AGAACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAA 4365

Alignment time is 5.58227 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    8778] =>      8778 nucs 'mol-32-2b34-059330_8778'

Score:        8450
Aligned:      8758        nucs
Identic:      8730 (100%) nucs =>      2222 (100%)      6508 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51728612,51730836] EXCISED REGION [51730838,51737369]
 second seq =>  [       1,    2225] EXCISED REGION [    2228,    8758]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51730837,51730837]
 second seq =>         2 nucs [2226,2227]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51728612 AAGGACACTAAAGGAAGATCTGGGGGCAGTCCACTATTTTTTATTTATATTTTTTTACTC 51728671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGGACACTAAAGGAAGATCTGGGGGCAGTCCACTATTTTTTATTTATATTTTTTTACTC 60

 51728672 AACACCAATTTTGTTGAGTTGCTATGTGTTAAACAGAGTTTGGGGCATCATAATACAAAG 51728731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACACCAATTTTGTTGAGTTGCTATGTGTTAAACAGAGTTTGGGGCATCATAATACAAAG 120

 51728732 AAAATCCCTATTTGCCCTCCTTGCCATTTATAAGGACAGACGGACAATTTAGAAAGCTAT 51728791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAATCCCTATTTGCCCTCCTTGCCATTTATAAGGACAGACGGACAATTTAGAAAGCTAT 180

 51728792 GCAGGTGCTATAAGTACTGATTAGAGCAAGTATAAAGAGCTAGCACACAACAGAGATATC 51728851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAGGTGCTATAAGTACTGATTAGAGCAAGTATAAAGAGCTAGCACACAACAGAGATATC 240

 51728852 AAAACCTGCGCAGCATGCTCAGGGAAGCCTAGCAGAGAAAACGACCTCTATGCTGAGTTC 51728911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAACCTGCGCAGCATGCTCAGGGAAGCCTAGCAGAGAAAACGACCTCTATGCTGAGTTC 300

 51728912 ATGGAAGCTGAACATTATGAATTGAAGAGCACAAATAAGTTGAATGTGGCTAAGGGACAG 51728971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGGAAGCTGAACATTATGAATTGAAGAGCACAAATAAGTTGAATGTGGCTAAGGGACAG 360

 51728972 AATGCAGGAAAGGTAGAGCAGAGTGCTGAGAGATAATGCTGGAACCCAAAGCAGACAGCA 51729031
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGCAGGAAAGGTAGAGCAGAGTGCCGAGAGATAATGCTGGAACCCAAAGCAGACAGCA 420

 51729032 GGACACGGAAGCTCCATGACACATTAGGAATGTCAGACTTTCCTTGGAAAGCACTGAGAA 51729091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGACACGGAAGCTCCATGACACATTAGGAATGTCAGACTTTCCTTGGAAAGCACTGAGAA 480

 51729092 TTCTTTAAAAGTTTCACGCAAGGGAATGGATGGCAAGATCAGATCTGCATTTAGAAAGTT 51729151
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTTTAAAAGTTTCATGCAAGGGAATGGATGGCAAGATCAGATCTGCATTTAGAAAGTT 540

 51729152 CAGAGATTGAAACACCGAAAAATGGCAAGCTAAGTGGCTGTTGTGGTTCTACAGGTGAAA 51729211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGAGATTGAAACACCGAAAAATGGCAAGCTAAGTGGCTGTTGTGGTTCTACAGGTGAAA 600

 51729212 AGTAATGGTAGCCCAGACTGGAGAAGGATTTGGGGAAGGAGAGTAGTAGAAAGACTCAAA 51729271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTAATGGTAGCCCAGACTGGAGAAGGATTTGGGGAAGGAGAGTAGTAGAAAGACTCAAA 660

 51729272 AGGGATTTATTAAGGAGGAAAATTGAGCTGATAGGTGATTAGTGTGGGAAATAAGGTACA 51729331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGGATTTATTAAGGAGGAAAATTGAGCTGATAGGTGATTAGTGTGGGAAATAAGGTACA 720

 51729332 AAGATGAGTCAAGGATGACTCCATGTTTCAGGTTTAGACCAGCATTTGCCTCAGTGGGAT 51729391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGATGAGTCAAGGATGACTCCATGTTTCAGGTTTAGACCAGCATTTGCCTCAGTGGGAT 780

 51729392 TCTGAGCACCCAGAGAGAAACAGGTCTACAGAAAAAAATCATAAATCCCATTTTGGCAAG 51729451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGAGCACCCAGAGAGAAACAGGTCTACAGAAAAAAATCATAAATCCCATTTTGGCAAG 840

 51729452 TTGAGTTTTAGAGTAGCCACACTAAAAAGCTCAAAATAAACAAGTTAAATTAATTTTAGT 51729511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGAGTTTTAGAGTAGCCACACTAAAAAGCTCAAAATAAACAAGTTAAATTAATTTTAGT 900

 51729512 AATATATTTAGCCCAATCTATCCAAAATATTATTTCAACATGATCAATATAAACAAATTA 51729571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATATATTTAGCCCAATCTATCCAAAATATTATTTCAACATGATCAATATAAACAAATTA 960

 51729572 TTGAGATATTTTACATTCTTTTTTTCATATTAAGTCTTATCTATATGGTGGGTAATTCAC 51729631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGAGATATTTTACATTCTTTTTTTCATATTAAGTCTTATCTATATGGTGGGTAATTCAC 1020

 51729632 TCTTACGGCACATCACAATTTGGACTAGGGAGATCTAAAAAGAGCACACAAAATCCTACT 51729691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTTACGGCACATCACAATTTGGACTAGGGAGATCTAAAAAGAGCACACAAAATCCTACT 1080

 51729692 GATAATATTGTACTTGTTTCGTGTAATTATTTCTATACAGAAAAAAAAAATGTTTACCTA 51729751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATAATATTGTACTTGTTTCGTGTAATTATTTCTATACAGAAAAAAAAAATGTTTACCTA 1140

 51729752 AAGTTTGGGATAGATAAATCCAAGAACTATGTGGGACATTTTATAATTATGGGACCCTGG 51729811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAGTTTGGGATAGATAAATCCAAGAACTATGTGGGACATTTTATAATTATGGGACCCTGG 1200

 51729812 AGAAAAACTGTCACTGGCATGTGTTTCTGATATGAGGTCCTGACTTACATTGGCAGAACT 51729871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAAAAACTGTCACTGGCATGTGTTTCTGATATGAGGTCCTGACTTACATTGGCAGAACT 1260

 51729872 AACACTACCCCTGTCTCACCAGGAACACTGAGGTTCATAGGGGGAAGCTGGTAGAAACAG 51729931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AACACTACCCCTGTCTCACCAGGAACACTGAGGTTCATAGGGGGAAGCTGGTAGAAACAG 1320

 51729932 AAGCTGGGAAAGGAACGCTATCCAGAATACCTGCGGCTTCTACAGAAAGCATGTTTTCAG 51729991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGCTGGGAAAGGAACGCTATCCAGAATACCTGCGGCTTCTACAGAAAGCATGTTTTCAG 1380

 51729992 AGCTGATGAGAGAGAAAACAATATAAGCAGCACTCACGCAGATCAAGCATGCTGTCATTT 51730051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGCTGATGAGAGAGAAAACAATATAAGCAGCACTCACGCAGATCAAGCATGCTGTCATTT 1440

 51730052 TAACAAAACATAAACTAGACTCTGCCTTGTAGAGTGGCAGTTTTTTCTTCACCCAAATAT 51730111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAACAAAACATAAACTAGACTCTGCCTTGTAGAGTGGCAGTTTTTTCTTCACCCAAATAT 1500

 51730112 TAAATAGTGTGGCCAACTTCAAATATTTAAATACTTCTGTCATCCCAACTGCTGGCTTTG 51730171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAAATAGTGTGGCCAACTTCAAATATTTAAATACTTCTGTCATCCCAACTGCTGGCTTTG 1560

 51730172 AGTCATAGGAACCAATAAAGTAGGAAGTGCCACAAAGGTAAGCACCGTCAGATTTAAGGC 51730231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGTCATAGGAACCAATAAAGTAGGAAGTGCCACAAAGGTAAGCACCGTCAGATTTAAGGC 1620

 51730232 AGTGAGGGACAGGAACAGAAGGTTGCCAATGTCAAACAAATAACTTATAGTGAAAATGGA 51730291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGTGAGGGACAGGAACAGAAGGTTGCCAATGTCAAACAAATAACTTATAGTGAAAATGGA 1680

 51730292 CCAGAGAGGGGGCCTACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAGCTTGGTTCTTAGCAGAAC 51730351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCAGAGAGGGGGCCTACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAGCTTGGTTCTTAGCAGAAC 1740

 51730352 AGGAAGAGGATGTCTTGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCACTCCCTGCCCTCTCTGGAC 51730411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGGAAGAGGATGTCTTGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCACTCCCTGCCCTCTCTGGAC 1800

 51730412 CTCTTACTGAGGGAGGGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAGCAGGGTGCTTATGCCATA 51730471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTCTTACTGAGGGAGGGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAGCAGGGTGCTTATGCCATA 1860

 51730472 TTAGATCTCCATCAACATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGTGAGAGCTTTGTAAATCAA 51730531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTAGATCTCCATCAACATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGTGAGAGCTTTGTAAATCAA 1920

 51730532 CTCTTAGGGTGCTTGCCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTAATCCTTTCTCCATGAAAT 51730591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCTTAGGGTGCTTGCCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTAATCCTTTCTCCATGAAAT 1980

 51730592 GCAGCAAAGTTTGCATCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTAGCTCTGACATGTTCCTAA 51730651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCAGCAAAGTTTGCATCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTAGCTCTGACATGTTCCTAA 2040

 51730652 TGAGGTTATAATGCTTTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCACAAATAGCTAGGGATAGA 51730711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2041 TGAGGTTATAATGCTTTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCACAAATAGCCAGGGATAGA 2100

 51730712 ATCATAGAAAGATAAAATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCTCTCAGACTTTAATACCAA 51730771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATCATAGAAAGATAAAATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCTCTCAGACTTTAATACCAA 2160

 51730772 TCACCTGGGCATTGTAATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTGAGAGTCTGCATTTCTAAA 51730831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCACCTGGGCATTGTAATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTGAGAGTCTGCATTTCTAAA 2220

 51730832 AAAAA 51730836
          |||||
     2221 AAAAA 2225

EXCISED REGION

 51730838 CCCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACAACATTTTGAGCAGCAAGACCTTAGAG 51730897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 CCCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACAACATTTTGAGCAGCAAGACCTTAGAG 2287

 51730898 ATCATCTAATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAGCACATCAGGGCCAAGAGATTTATAAC 51730957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 ATCATCTAATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAGCACATCAGGGCCAAGAGATTTATAAC 2347

 51730958 TGGAAGCACGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTAGGGTCAGTTGAGTATTTGTCCATAGA 51731017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 TGGAAGCACGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTAGGGTCAGTTGAGTATTTGTCCATAGA 2407

 51731018 CCTGTGAGTCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATCTAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGCCT 51731077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 CCTGTGAGTCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATCTAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGCCT 2467

 51731078 AGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTTGCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAATCC 51731137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 AGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTTGCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAATCC 2527

 51731138 AGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGACCCTTTTGAATCTACTTAGAACACAG 51731197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 AGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGACCCTTTTGAATCTACTTAGAACACAG 2587

 51731198 TATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTCCCCAAGTGGTGGGATCATGACCTGCC 51731257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 TATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTCCCCAAGTGGTGGGATCATGACCTGCC 2647

 51731258 AAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAATGCTCAAACAAGTT 51731317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2648 AAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAACGCTCAAACAAGTT 2707

 51731318 TCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCCTA 51731377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 TCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCCTA 2767

 51731378 CCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAAATAAATAT 51731437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 CCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAAATAAATAT 2827

 51731438 TATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCTCATTTGATAAAAT 51731497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 TATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCTCATTTGATAAAAT 2887

 51731498 GCATGTAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAAAACATCCT 51731557
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 GCATATAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAAAACATCCT 2947

 51731558 TGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGTCA 51731617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 TGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGTCA 3007

 51731618 TGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTACATATTATTATTTTAC 51731677
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3008 TGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTTCATATTATTATTTTAC 3067

 51731678 TCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAATG 51731737
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 TCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTTAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAATG 3127

 51731738 AAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATCGCTAAGGCTTCTAAAACAGAATGC 51731797
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3128 AAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATTGCTAAGGCTTCTAAAACAGAATGC 3187

 51731798 CAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAACCACAATGA 51731857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 CAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAACCACAATGA 3247

 51731858 TTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGTCTGACTGAATTAC 51731917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 TTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGTCTGACTGAATTAC 3307

 51731918 TTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTA 51731977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 TTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTA 3367

 51731978 AATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCATT 51732037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 AATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCATT 3427

 51732038 ACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCT 51732097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 ACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCT 3487

 51732098 GACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAA 51732157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 GACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAA 3547

 51732158 TGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCA 51732217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 TGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCA 3607

 51732218 ACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCTGGAGCATATTGAACACTTAAA 51732277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3608 ACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCCGGAGCATATTGAACACTTAAA 3667

 51732278 AAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTAAT 51732337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 AAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTAAT 3727

 51732338 AATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGA 51732397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 AATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGA 3787

 51732398 AGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATAT 51732457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 AGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATAT 3847

 51732458 TGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATTCAGCAGCT 51732517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 TGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATTCAGCAGCT 3907

 51732518 GTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACA 51732577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 GTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACA 3967

 51732578 ATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCTAA 51732637
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3968 ATTTCCCTTCTATAAGCCTCAACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCAGCAAGCTAA 4027

 51732638 AAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTC 51732697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 AAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTC 4087

 51732698 CACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAA 51732757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 CACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAA 4147

 51732758 GGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGACCCATCCAAGT 51732817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 GGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGACCCATCCAAGT 4207

 51732818 CTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACT 51732877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 CTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACT 4267

 51732878 TCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTAC 51732937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 TCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTAC 4327

 51732938 ACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCAT 51732997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 ACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCAT 4387

 51732998 ATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGT 51733057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 ATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGT 4447

 51733058 TTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATA 51733117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 TTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATA 4507

 51733118 ACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTT 51733177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 ACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTT 4567

 51733178 TCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCT 51733237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 TCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCT 4627

 51733238 GTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTG 51733297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 GTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTG 4687

 51733298 CTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATG 51733357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 CTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATG 4747

 51733358 CCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAA 51733417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 CCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAA 4807

 51733418 TTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCA 51733477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 TTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCA 4867

 51733478 TTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATT 51733537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 TTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATT 4927

 51733538 TACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCT 51733597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 TACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCT 4987

 51733598 AAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGA 51733657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 AAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGA 5047

 51733658 CTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTC 51733717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 CTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTC 5107

 51733718 ACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACACATACTACC 51733777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 ACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACACATACTACC 5167

 51733778 ATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAAGA 51733837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     5168 ATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAAGAAAATGAAAAAGA 5227

 51733838 TACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTG 51733897
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5228 TACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTA 5287

 51733898 ATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATAC 51733957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5288 ATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATAC 5347

 51733958 CACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAAGC 51734017
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     5348 CACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGCTTTCCCAAGC 5407

 51734018 ACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTG 51734077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5408 ACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTG 5467

 51734078 CATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTA 51734137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5468 CATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTA 5527

 51734138 TGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTA 51734197
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5528 TGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTTGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTA 5587

 51734198 CTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATC 51734257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5588 CTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATC 5647

 51734258 AAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAA 51734317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5648 AAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAA 5707

 51734318 GCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTC 51734377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5708 GCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTC 5767

 51734378 AGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATG 51734437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5768 AGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATG 5827

 51734438 ATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGA 51734497
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     5828 ATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGACTGCAAGCACTTGTTATGA 5887

 51734498 GGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAA 51734557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5888 GGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAA 5947

 51734558 ACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGG-AAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATT 51734616
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     5948 ACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATT 6007

 51734617 CATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATATT 51734676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     6008 CATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTAGTGATTCAAACCACAAGAGCATATT 6067

 51734677 TACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACC 51734736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6068 TACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACC 6127

 51734737 TCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTA 51734796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6128 TCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTA 6187

 51734797 AAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGA 51734856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6188 AAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGA 6247

 51734857 AAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATA 51734916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6248 AAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATA 6307

 51734917 CCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCA 51734976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6308 CCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCA 6367

 51734977 TCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGC 51735036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6368 TCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGC 6427

 51735037 CTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCA 51735096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6428 CTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCA 6487

 51735097 CCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTC 51735156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6488 CCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTC 6547

 51735157 TTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATG 51735216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6548 TTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATG 6607

 51735217 ATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCAT 51735276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     6608 ATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATTGGCCTTATTTATCAT 6667

 51735277 CTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATG 51735336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6668 CTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATG 6727

 51735337 GCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCAT 51735396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6728 GCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCAT 6787

 51735397 CTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAA 51735456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6788 CTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAA 6847

 51735457 AAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAA 51735516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6848 AAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAA 6907

 51735517 AAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATG 51735576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6908 AAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATG 6967

 51735577 ACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAG 51735636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6968 ACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTCAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAG 7027

 51735637 ACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAAT 51735696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7028 ACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAAT 7087

 51735697 ATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAA 51735756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7088 ATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAA 7147

 51735757 ATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATA 51735816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7148 ATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATA 7207

 51735817 CAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGT 51735876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     7208 CAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGAATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGT 7267

 51735877 GGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATA 51735936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7268 GGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATA 7327

 51735937 TGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAA 51735996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7328 TGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAA 7387

 51735997 CTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAA 51736056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7388 CTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAA 7447

 51736057 ATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTACATC 51736116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7448 ATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTACATC 7507

 51736117 TATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACAAGT 51736176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     7508 TATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACAACT 7567

 51736177 TAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCCCAAAAGGTTACATACTA 51736236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     7568 TAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCTCAAAAGGTTACATACTA 7627

 51736237 TATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTATAGTGACAGAGAATATATTAG 51736296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     7628 TATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTGTAGTGACAGAGAATATATTAG 7687

 51736297 TGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTG 51736356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7688 TGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTG 7747

 51736357 GGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACA 51736416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7748 GGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACA 7807

 51736417 TGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATT 51736476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7808 TGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATT 7867

 51736477 TTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCC 51736536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7868 TTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCC 7927

 51736537 ACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGT 51736596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7928 ACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGT 7987

 51736597 TAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAA 51736656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7988 TAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAA 8047

 51736657 ATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAGA 51736716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8048 ATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAGA 8107

 51736717 AATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTATATCCA 51736776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8108 AATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTATATCCA 8167

 51736777 TGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAA 51736836
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     8168 TGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAG-AAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAA 8226

 51736837 AAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAA 51736896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8227 AAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAA 8286

 51736897 GAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAA 51736956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8287 GAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAA 8346

 51736957 GGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCA 51737016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     8347 GGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAAGAAAACTGTGCA 8406

 51737017 GAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTT 51737076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8407 GAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTT 8466

 51737077 AGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGAC 51737136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8467 AGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGAC 8526

 51737137 AAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCT 51737196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     8527 AAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACATACAAAAATCCTGGAATCT 8586

 51737197 GAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGC 51737256
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8587 GAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGC 8645

 51737257 AGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTC 51737316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8646 AGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTC 8705

 51737317 CTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGG 51737369
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8706 CTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGG 8758

Alignment time is 10.5628 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4305] =>      4305 nucs 'mol-32-2b55-070750_4305'

Score:        4248
Aligned:      4309        nucs
Identic:      4301 (100%) nucs =>       172 (100%)      4129 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51735938,51736109] EXCISED REGION [51736805,51740940]
 second seq =>  [       1,     172] EXCISED REGION [     173,    4305]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51735938 GCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAAC 51735997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAAC 60

 51735998 TTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAA 51736057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAA 120

 51736058 TATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 51736109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 172

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      173 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 232

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      233 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 292

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      293 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 352

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      353 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 412

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      413 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 472

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      473 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 532

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
      533 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 592

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 652

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 712

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 772

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 832

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 892

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 952

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 1012

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
     1013 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 1068

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 1128

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 1188

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 1248

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 1308

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 1368

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 1428

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 1488

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 1548

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 1608

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 1668

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTT 51738363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
     1669 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTTCCCTGTGATTT 1728

 51738364 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 51738423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 1788

 51738424 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 51738483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 1848

 51738484 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 51738543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 1908

 51738544 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 51738603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 1968

 51738604 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 51738663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 2028

 51738664 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 51738723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 2088

 51738724 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 51738783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 2148

 51738784 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 51738843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 2208

 51738844 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 51738903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 2268

 51738904 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 51738963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 2328

 51738964 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 51739023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 2388

 51739024 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 51739083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 2448

 51739084 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 51739143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 2508

 51739144 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 51739203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 2568

 51739204 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 51739263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 2628

 51739264 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 51739323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 2688

 51739324 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 51739383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 2748

 51739384 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 51739443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 2808

 51739444 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 51739503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 2868

 51739504 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 51739563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 2928

 51739564 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 51739623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 2988

 51739624 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCACTAGGGAGTGCCAGACAGTGG 51739683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCACTAGGGAGTGCCAGACAGTGG 3048

 51739684 GCGCAGGCCAGTGTGTGTGCGCACCGTGCGCGAGCCGAAGCAGGGCGAGGCATTGCCTCA 51739743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 GCGCAGGCCAGTGTGTGTGCGCACCGTGCGCGAGCCGAAGCAGGGCGAGGCATTGCCTCA 3108

 51739744 CCTGGGAAGCGCAAGGGGTCAGGGAGTTCCCTTTCCGAGTCAAAGAAAGGGGTGACGGAC 51739803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 CCTGGGAAGCGCAAGGGGTCAGGGAGTTCCCTTTCCGAGTCAAAGAAAGGGGTGACGGAC 3168

 51739804 GCACCTGGAAAATCGGGTCACTCCCACCCAAATATTGCGCTTTTCAGACCGGCTTAAGAA 51739863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 GCACCTGGAAAATCGGGTCACTCCCACCCAAATATTGCGCTTTTCAGACCGGCTTAAGAA 3228

 51739864 ACGGCGCACCACGAGACTATATCCCACACCTGGCTCAGAGGGTCCTACGCCCACGGAATC 51739923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 ACGGCGCACCACGAGACTATATCCCACACCTGGCTCAGAGGGTCCTACGCCCACGGAATC 3288

 51739924 TCGCTGATTGCTAGCACAGCAGTCTGAGATCAAACGGCAAGGCGGCAACGAGGCTGTGGG 51739983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 TCGCTGATTGCTAGCACAGCAGTCTGAGATCAAACGGCAAGGCGGCAACGAGGCTGTGGG 3348

 51739984 AGGGGCGCCCGCCATTGCCCAGGCTTGCTTAGGTAAACAAAGCAGCTGGGAAGCTCGAAC 51740043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3349 AGGGGCGCCCGCCATTGCCCAGGCTTGCTTAGGTAAACAAAGCAGCCGGGAAGCTCGAAC 3408

 51740044 TGGGTGGAGCCCACCACAGCTCAAGGAGGCCTGCCTGCCTCTGTAGGCTCCACCTCTGGG 51740103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 TGGGTGGAGCCCACCACAGCTCAAGGAGGCCTGCCTGCCTCTGTAGGCTCCACCTCTGGG 3468

 51740104 GGCAGGGCACAGACAAACAAAAAGACAGCAGTAACCTCTGCAGACTTAAGTGTCCCTGTC 51740163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 GGCAGGGCACAGACAAACAAAAAGACAGCAGTAACCTCTGCAGACTTAAGTGTCCCTGTC 3528

 51740164 TGACAGCTTTGAAGAGAGCAGTGGTTCTCCCAGCACGCAGCTGGAGATCTGAGAACGGGC 51740223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 TGACAGCTTTGAAGAGAGCAGTGGTTCTCCCAGCACGCAGCTGGAGATCTGAGAACGGGC 3588

 51740224 AGACTGCCTCCTCAAGTGGGTCCCTGACCCCTGACCCCCGAGCAGCCTAACTGGGAGGCA 51740283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 AGACTGCCTCCTCAAGTGGGTCCCTGACCCCTGACCCCCGAGCAGCCTAACTGGGAGGCA 3648

 51740284 CCCCCCAGCAGGGGCACACTGACACCTCACACAGCAGGGTATTCCAACAGACCTGCAGCT 51740343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 CCCCCCAGCAGGGGCACACTGACACCTCACACAGCAGGGTATTCCAACAGACCTGCAGCT 3708

 51740344 GAGGGTCCTGTCTGTTAGAAGGAAAACTAACAACCAGAAAGGACATCTACACCGAAAACC 51740403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 GAGGGTCCTGTCTGTTAGAAGGAAAACTAACAACCAGAAAGGACATCTACACCGAAAACC 3768

 51740404 CATCTGTACATCACCATCATCAAAGACCAAAAGTAGATAAAACCACAAAGATGGGGAAAA 51740463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 CATCTGTACATCACCATCATCAAAGACCAAAAGTAGATAAAACCACAAAGATGGGGAAAA 3828

 51740464 AACAGAACAGAAAAACTGGAAACTCTAAAACGCAGAGCGCCTCTCCTCCTCCAAAGGAAC 51740523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 AACAGAACAGAAAAACTGGAAACTCTAAAACGCAGAGCGCCTCTCCTCCTCCAAAGGAAC 3888

 51740524 GCAGTTCCTCACCAGCAACAGAACAAAGCTGGATGGAGAATGATTTTGACGAGCTGAGAG 51740583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 GCAGTTCCTCACCAGCAACAGAACAAAGCTGGATGGAGAATGATTTTGACGAGCTGAGAG 3948

 51740584 AAGAAGGCTTCAGACGATCAAATTACTCTGAGCTACGGGAGGACATTCAAACCAAAGGCA 51740643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 AAGAAGGCTTCAGACGATCAAATTACTCTGAGCTACGGGAGGACATTCAAACCAAAGGCA 4008

 51740644 AAGAAGTTGAAAACTTTGAAAAAAATTTAGAAGAATGTATAACTAGAATAACCAATACAG 51740703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 AAGAAGTTGAAAACTTTGAAAAAAATTTAGAAGAATGTATAACTAGAATAACCAATACAG 4068

 51740704 AGAAGTGCTTAAAGGAGCTGATGGAGCTGAAAACCAAGGCTCGAGAACTACGTGAAGAAT 51740763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 AGAAGTGCTTAAAGGAGCTGATGGAGCTGAAAACCAAGGCTCGAGAACTACGTGAAGAAT 4128

 51740764 GCAGAAGCCTCAGGAGCCGATGCGATCAACTGGAAGAAAGGGTATCAGCAATGGAAGATG 51740823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 GCAGAAGCCTCAGGAGCCGATGCGATCAACTGGAAGAAAGGGTATCAGCAATGGAAGATG 4188

 51740824 AAATGAATGAAATGAAGCGAGAAGGGAAGTTTAGAGAAAAAAGAATAAAAAGAAATGAGC 51740883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 AAATGAATGAAATGAAGCGAGAAGGGAAGTTTAGAGAAAAAAGAATAAAAAGAAATGAGC 4248

 51740884 AAAGCCTCCAAGAAATATGGGACTATGTGAAAAGACCAAATCTACGTCTGATTGGTG 51740940
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 AAAGCCTCCAAGAAATATGGGACTATGTGAAAAGACCAAATCTACGTCTGATTGGTG 4305

Alignment time is 5.18357 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    7669] =>      7669 nucs 'mol-32-2dff-013046_7669'

Score:        7583
Aligned:      7659        nucs
Identic:      7648 (100%) nucs =>      3561 (100%)      4087 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51732548,51736109] EXCISED REGION [51736805,51740900]
 second seq =>  [      17,    3578] EXCISED REGION [    3579,    7669]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51732548 AGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGA 51732607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       17 AGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGA 76

 51732608 ATAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAA 51732667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       77 ATAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAA 136

 51732668 TAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAA 51732727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      137 TAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAA 196

 51732728 AGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTC 51732787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      197 AGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTC 256

 51732788 TGTTTTTCCCAGACAGAGACCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAA 51732847
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      257 TGTTTTTCCCAGACAGAGATCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAA 316

 51732848 ATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCAC 51732907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      317 ATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCAC 376

 51732908 CTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACT 51732967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      377 CTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACT 436

 51732968 GGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCA 51733027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      437 GGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCA 496

 51733028 TGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGC 51733087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      497 TGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGC 556

 51733088 TCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGT 51733147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      557 TCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGT 616

 51733148 CTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAG 51733207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      617 CTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAG 676

 51733208 ACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTG 51733267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      677 ACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTG 736

 51733268 GCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCC 51733327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      737 GCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCC 796

 51733328 CCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGT 51733387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      797 CCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGT 856

 51733388 CTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTA 51733447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      857 CTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTA 916

 51733448 TGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAAT 51733507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      917 TGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAAT 976

 51733508 ACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACT 51733567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      977 ACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACT 1036

 51733568 TGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGG 51733627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1037 TGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGG 1096

 51733628 CAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAA 51733687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1097 CAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAA 1156

 51733688 AAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACT 51733747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 AAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACT 1216

 51733748 AAGTACACATCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAA 51733807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1217 AAGTACACATCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAA 1276

 51733808 TATAAAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCT 51733867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 TATAAAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCT 1336

 51733868 GCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCAC 51733927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 GCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCAC 1396

 51733928 CTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGT 51733987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 CTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGT 1456

 51733988 CATACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGT 51734047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 CATACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGT 1516

 51734048 GTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACC 51734107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 GTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACC 1576

 51734108 TTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCC 51734167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 TTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCC 1636

 51734168 CCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATA 51734227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 CCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATA 1696

 51734228 GGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGT 51734287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 GGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGT 1756

 51734288 TTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCA 51734347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 TTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCA 1816

 51734348 AATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTA 51734407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 AATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTA 1876

 51734408 GTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTG 51734467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 GTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTG 1936

 51734468 AGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACA 51734527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 AGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACA 1996

 51734528 ATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAA 51734587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 ATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAA 2056

 51734588 AAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAA 51734647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 AAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAA 2116

 51734648 ATTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGA 51734707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 ATTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGA 2176

 51734708 TGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGT 51734767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 TGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGT 2236

 51734768 TATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTT 51734827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 TATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTT 2296

 51734828 TGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTC 51734887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 TGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTC 2356

 51734888 AGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTT 51734947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 AGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTT 2416

 51734948 CATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAA 51735007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 CATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAA 2476

 51735008 ACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACAT 51735067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 ACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACAT 2536

 51735068 AGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGA 51735127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 AGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGA 2596

 51735128 AGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTG 51735187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 AGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTG 2656

 51735188 ATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATA 51735247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 ATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATA 2716

 51735248 CTGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTC 51735307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 CTGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTC 2776

 51735308 CTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAA 51735367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 CTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAA 2836

 51735368 AGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATAC 51735427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 AGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATAC 2896

 51735428 ACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACAC 51735487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 ACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACAC 2956

 51735488 ATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTA 51735547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 ATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTA 3016

 51735548 AGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGA 51735607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 AGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGA 3076

 51735608 ACTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAA 51735667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 ACTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAA 3136

 51735668 CCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAA 51735727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 CCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAA 3196

 51735728 AATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTA 51735787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 AATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTA 3256

 51735788 TGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGA 51735847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 TGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGA 3316

 51735848 GAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAA 51735907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 GAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAA 3376

 51735908 ACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACT 51735967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 ACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACT 3436

 51735968 CCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATG 51736027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3437 CCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATG 3496

 51736028 TTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAA 51736087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3497 TTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAA 3556

 51736088 ATGAATGGATTAACAAACTGCA 51736109
          ||||||||||||||||||||||
     3557 ATGAATGGATTAACAAACTGCA 3578

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3579 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 3638

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3639 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 3698

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3699 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 3758

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3759 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 3818

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3819 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 3878

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3879 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 3938

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     3939 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 3998

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3999 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 4058

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4059 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 4118

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4119 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 4178

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4179 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 4238

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4239 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 4298

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4299 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 4358

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4359 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 4418

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||
     4419 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC------TTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 4472

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 4532

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4533 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 4592

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4593 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 4652

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4653 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 4712

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4713 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 4772

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4773 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 4832

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4833 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 4892

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4893 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 4952

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4953 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 5012

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5013 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 5072

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTT 51738363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
     5073 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTTCCCTGTGATTT 5132

 51738364 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 51738423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5133 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 5192

 51738424 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 51738483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5193 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 5252

 51738484 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 51738543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5253 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 5312

 51738544 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 51738603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5313 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 5372

 51738604 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 51738663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5373 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 5432

 51738664 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 51738723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5433 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 5492

 51738724 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 51738783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5493 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 5552

 51738784 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 51738843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5553 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 5612

 51738844 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 51738903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5613 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 5672

 51738904 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 51738963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5673 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 5732

 51738964 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 51739023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5733 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 5792

 51739024 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 51739083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5793 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 5852

 51739084 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 51739143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5853 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 5912

 51739144 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 51739203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5913 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 5972

 51739204 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 51739263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5973 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 6032

 51739264 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 51739323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6033 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 6092

 51739324 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 51739383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6093 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 6152

 51739384 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 51739443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6153 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 6212

 51739444 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 51739503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6213 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 6272

 51739504 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 51739563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6273 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 6332

 51739564 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 51739623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6333 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 6392

 51739624 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCACTAGGGAGTGCCAGACAGTGG 51739683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6393 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCACTAGGGAGTGCCAGACAGTGG 6452

 51739684 GCGCAGGCCAGTGTGTGTGCGCACCGTGCGCGAGCCGAAGCAGGGCGAGGCATTGCCTCA 51739743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6453 GCGCAGGCCAGTGTGTGTGCGCACCGTGCGCGAGCCGAAGCAGGGCGAGGCATTGCCTCA 6512

 51739744 CCTGGGAAGCGCAAGGGGTCAGGGAGTTCCCTTTCCGAGTCAAAGAAAGGGGTGACGGAC 51739803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6513 CCTGGGAAGCGCAAGGGGTCAGGGAGTTCCCTTTCCGAGTCAAAGAAAGGGGTGACGGAC 6572

 51739804 GCACCTGGAAAATCGGGTCACTCCCACCCAAATATTGCGCTTTTCAGACCGGCTTAAGAA 51739863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6573 GCACCTGGAAAATCGGGTCACTCCCACCCAAATATTGCGCTTTTCAGACCGGCTTAAGAA 6632

 51739864 ACGGCGCACCACGAGACTATATCCCACACCTGGCTCAGAGGGTCCTACGCCCACGGAATC 51739923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6633 ACGGCGCACCACGAGACTATATCCCACACCTGGCTCAGAGGGTCCTACGCCCACGGAATC 6692

 51739924 TCGCTGATTGCTAGCACAGCAGTCTGAGATCAAACGGCAAGGCGGCAACGAGGCTGTGGG 51739983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6693 TCGCTGATTGCTAGCACAGCAGTCTGAGATCAAACGGCAAGGCGGCAACGAGGCTGTGGG 6752

 51739984 AGGGGCGCCCGCCATTGCCCAGGCTTGCTTAGGTAAACAAAGCAGCTGGGAAGCTCGAAC 51740043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     6753 AGGGGCGCCCGCCATTGCCCAGGCTTGCTTAGGTAAACAAAGCAGCCGGGAAGCTCGAAC 6812

 51740044 TGGGTGGAGCCCACCACAGCTCAAGGAGGCCTGCCTGCCTCTGTAGGCTCCACCTCTGGG 51740103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6813 TGGGTGGAGCCCACCACAGCTCAAGGAGGCCTGCCTGCCTCTGTAGGCTCCACCTCTGGG 6872

 51740104 GGCAGGGCACAGACAAACAAAAAGACAGCAGTAACCTCTGCAGACTTAAGTGTCCCTGTC 51740163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6873 GGCAGGGCACAGACAAACAAAAAGACAGCAGTAACCTCTGCAGACTTAAGTGTCCCTGTC 6932

 51740164 TGACAGCTTTGAAGAGAGCAGTGGTTCTCCCAGCACGCAGCTGGAGATCTGAGAACGGGC 51740223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6933 TGACAGCTTTGAAGAGAGCAGTGGTTCTCCCAGCACGCAGCTGGAGATCTGAGAACGGGC 6992

 51740224 AGACTGCCTCCTCAAGTGGGTCCCTGACCCCTGACCCCCGAGCAGCCTAACTGGGAGGCA 51740283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6993 AGACTGCCTCCTCAAGTGGGTCCCTGACCCCTGACCCCCGAGCAGCCTAACTGGGAGGCA 7052

 51740284 CCCCCCAGCAGGGGCACACTGACACCTCACACAGCAGGGTATTCCAACAGACCTGCAGCT 51740343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7053 CCCCCCAGCAGGGGCACACTGACACCTCACACAGCAGGGTATTCCAACAGACCTGCAGCT 7112

 51740344 GAGGGTCCTGTCTGTTAGAAGGAAAACTAACAACCAGAAAGGACATCTACACCGAAAACC 51740403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7113 GAGGGTCCTGTCTGTTAGAAGGAAAACTAACAACCAGAAAGGACATCTACACCGAAAACC 7172

 51740404 CATCTGTACATCACCATCATCAAAGACCAAAAGTAGATAAAACCACAAAGATGGGGAAAA 51740463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7173 CATCTGTACATCACCATCATCAAAGACCAAAAGTAGATAAAACCACAAAGATGGGGAAAA 7232

 51740464 AACAGAACAGAAAAACTGGAAACTCTAAAACGCAGAGCGCCTCTCCTCCTCCAAAGGAAC 51740523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7233 AACAGAACAGAAAAACTGGAAACTCTAAAACGCAGAGCGCCTCTCCTCCTCCAAAGGAAC 7292

 51740524 GCAGTTCCTCACCAGCAACAGAACAAAGCTGGATGGAGAATGATTTTGACGAGCTGAGAG 51740583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7293 GCAGTTCCTCACCAGCAACAGAACAAAGCTGGATGGAGAATGATTTTGACGAGCTGAGAG 7352

 51740584 AAGAAGGCTTCAGACGATCAAATTACTCTGAGCTACGGGAGGACATTCAAACCAAAGGCA 51740643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7353 AAGAAGGCTTCAGACGATCAAATTACTCTGAGCTACGGGAGGACATTCAAACCAAAGGCA 7412

 51740644 AAGAAGTTGAAAACTTTGAAAAAAATTTAGAAGAATGTATAACTAGAATAACCAATACAG 51740703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7413 AAGAAGTTGAAAACTTTGAAAAAAATTTAGAAGAATGTATAACTAGAATAACCAATACAG 7472

 51740704 AGAAGTGCTTAAAGGAGCTGATGGAGCTGAAAACCAAGGCTCGAGAACTACGTGAAGAAT 51740763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7473 AGAAGTGCTTAAAGGAGCTGATGGAGCTGAAAACCAAGGCTCGAGAACTACGTGAAGAAT 7532

 51740764 GCAGAAGCCTCAGGAGCCGATGCGATCAACTGGAAGAAAGGGTATCAGCAATGGAAGATG 51740823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7533 GCAGAAGCCTCAGGAGCCGATGCGATCAACTGGAAGAAAGGGTATCAGCAATGGAAGATG 7592

 51740824 AAATGAATGAAATGAAGCGAGAAGGGAAGTTTAGAGAAAAAAGAATAAAAAGAAATGAGC 51740883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7593 AAATGAATGAAATGAAGCGAGAAGGGAAGTTTAGAGAAAAAAGAATAAAAAGAAATGAGC 7652

 51740884 AAAGCCTCCAAGAAATA 51740900
          |||||||||||||||||
     7653 AAAGCCTCCAAGAAATA 7669

Alignment time is 9.05709 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3564] =>      3564 nucs 'mol-32-2dff-013046_3564'

Score:        3563
Aligned:      3563        nucs
Identic:      3563 (100%) nucs =>       259 (100%)      3304 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51732548,51732806] EXCISED REGION [51732808,51736111]
 second seq =>  [       1,     259] EXCISED REGION [     261,    3564]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51732807,51732807]
 second seq =>         1 nucs [260,260]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51732807,51732808] to [51732808,51732809]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51732548 AGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGA 51732607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGA 60

 51732608 ATAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAA 51732667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAA 120

 51732668 TAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAA 51732727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAA 180

 51732728 AGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTC 51732787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTC 240

 51732788 TGTTTTTCCCAGACAGAGA 51732806
          |||||||||||||||||||
      241 TGTTTTTCCCAGACAGAGA 259

EXCISED REGION

 51732808 CCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAG 51732867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      261 CCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAG 320

 51732868 TTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAA 51732927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      321 TTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAA 380

 51732928 AGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATT 51732987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      381 AGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATT 440

 51732988 TAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTT 51733047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      441 TAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTT 500

 51733048 CTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACT 51733107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      501 CTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACT 560

 51733108 AAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGG 51733167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      561 AAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGG 620

 51733168 CAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATC 51733227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      621 CAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATC 680

 51733228 ATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACC 51733287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      681 ATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACC 740

 51733288 AGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTC 51733347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      741 AGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTC 800

 51733348 ACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAG 51733407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      801 ACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAG 860

 51733408 AAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTT 51733467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      861 AAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTT 920

 51733468 TCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTA 51733527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      921 TCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTA 980

 51733528 TTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAA 51733587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      981 TTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAA 1040

 51733588 TACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCAC 51733647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1041 TACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCAC 1100

 51733648 TGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGAT 51733707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1101 TGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGAT 1160

 51733708 CTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTAC 51733767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1161 CTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTAC 1220

 51733768 ACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAATAAA 51733827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1221 ACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAATAAA 1280

 51733828 ATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATG 51733887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1281 ATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATG 1340

 51733888 CAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTT 51733947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1341 CAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTT 1400

 51733948 CATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGA 51734007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1401 CATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGA 1460

 51734008 TTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAA 51734067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1461 TTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAA 1520

 51734068 TTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGA 51734127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1521 TTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGA 1580

 51734128 ATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAG 51734187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1581 ATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAG 1640

 51734188 TCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAG 51734247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1641 TCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAG 1700

 51734248 TGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCT 51734307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1701 TGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCT 1760

 51734308 AGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCC 51734367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1761 AGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCC 1820

 51734368 AATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGT 51734427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1821 AATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGT 1880

 51734428 CTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCA 51734487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1881 CTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCA 1940

 51734488 CTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCAC 51734547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1941 CTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCAC 2000

 51734548 CCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTG 51734607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 CCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTG 2060

 51734608 TTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAA 51734667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 TTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAA 2120

 51734668 GAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTA 51734727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 GAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTA 2180

 51734728 CTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAG 51734787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 CTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAG 2240

 51734788 ATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTG 51734847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 ATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTG 2300

 51734848 GACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGT 51734907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 GACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGT 2360

 51734908 TAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCC 51734967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 TAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCC 2420

 51734968 TACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACAT 51735027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 TACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACAT 2480

 51735028 GATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATG 51735087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 GATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATG 2540

 51735088 TGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTC 51735147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 TGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTC 2600

 51735148 CAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAA 51735207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 CAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAA 2660

 51735208 GAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTT 51735267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 GAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTT 2720

 51735268 ATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAG 51735327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 ATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAG 2780

 51735328 GTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATC 51735387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 GTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATC 2840

 51735388 AGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTA 51735447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 AGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTA 2900

 51735448 AAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATG 51735507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 AAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATG 2960

 51735508 CATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATC 51735567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 CATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATC 3020

 51735568 ACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCA 51735627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 ACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCA 3080

 51735628 AGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGA 51735687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 AGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGA 3140

 51735688 AAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTC 51735747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 AAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTC 3200

 51735748 ACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAA 51735807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 ACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAA 3260

 51735808 ATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCT 51735867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 ATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCT 3320

 51735868 GTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAA 51735927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 GTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAA 3380

 51735928 AGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAG 51735987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 AGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAG 3440

 51735988 AAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTAT 51736047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 AAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTAT 3500

 51736048 AATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTG 51736107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 AATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTG 3560

 51736108 CATT 51736111
          ||||
     3561 CATT 3564

Alignment time is 4.72553 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2491] =>      2491 nucs 'mol-32-2e20-006283_2491'

Score:        2372
Aligned:      2493        nucs
Identic:      2482 (100%) nucs =>       197 (100%)      2285 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51735978,51736174] EXCISED REGION [51736176,51738471]
 second seq =>  [       1,     197] EXCISED REGION [     199,    2491]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51736175,51736175]
 second seq =>         1 nucs [198,198]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [51736811,51736811]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51735978 TACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAG 51736037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAG 60

 51736038 TTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGAT 51736097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGAT 120

 51736098 TAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAAT 51736157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAAT 180

 51736158 ATTGATATGTGCAACAA 51736174
          |||||||||||||||||
      181 ATTGATATGTGCAACAA 197

EXCISED REGION

 51736176 TTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCCCAAAAGGTTACATACT 51736235
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      199 TTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCTCAAAAGGTTACATACT 258

 51736236 ATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTATAGTGACAGAGAATATATTA 51736295
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      259 ATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTGTAGTGACAGAGAATATATTA 318

 51736296 GTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACT 51736355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      319 GTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACT 378

 51736356 GGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTAC 51736415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      379 GGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTAC 438

 51736416 ATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATAT 51736475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      439 ATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATAT 498

 51736476 TTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTC 51736535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      499 TTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTC 558

 51736536 CACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTG 51736595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      559 CACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTG 618

 51736596 TTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAA 51736655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      619 TTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAA 678

 51736656 AATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAG 51736715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 AATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAG 738

 51736716 AAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTATATCC 51736775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 AAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTATATCC 798

 51736776 ATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGA 51736835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
      799 ATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAG-AAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGA 857

 51736836 AAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTA 51736895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      858 AAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTA 917

 51736896 AGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTA 51736955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      918 AGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTA 977

 51736956 AGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGC 51737015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      978 AGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAAGAAAACTGTGC 1037

 51737016 AGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTT 51737075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1038 AGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTT 1097

 51737076 TAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGA 51737135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 TAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGA 1157

 51737136 CAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATC 51737195
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1158 CAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACATACAAAAATCCTGGAATC 1217

 51737196 TGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTG 51737255
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1218 TGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTG 1276

 51737256 CAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCT 51737315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 CAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCT 1336

 51737316 CCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATT 51737375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 CCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATT 1396

 51737376 TTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTG 51737435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 TTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTG 1456

 51737436 ACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCAC 51737495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 ACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCAC 1516

 51737496 TGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGG 51737555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 TGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGG 1576

 51737556 AATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACA 51737615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 AATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACA 1636

 51737616 ATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTT 51737675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 ATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTT 1696

 51737676 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAAGTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGG 51737735
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGAAAGTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGG 1756

 51737736 AATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAG 51737795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 AATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAG 1816

 51737796 ACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACC 51737855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 ACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACC 1876

 51737856 CTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTA 51737915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 CTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTA 1936

 51737916 AAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCA 51737975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 AAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCA 1996

 51737976 CATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAATGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAA 51738035
          |||||||||||.||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 CATGAAGACCATAAGGCATATAGAATAAT-CTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAA 2055

 51738036 ACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAG 51738095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 ACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAG 2115

 51738096 ACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCC 51738155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 ACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCC 2175

 51738156 CTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAG 51738215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 CTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAG 2235

 51738216 CTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTG 51738275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 CTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTG 2295

 51738276 GCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAA 51738335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 GCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAA 2355

 51738336 AATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCA 51738395
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 AATCCACTGAGCTATTCCCCTGTGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCA 2415

 51738396 TGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGA 51738455
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 TGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGAACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGA 2475

 51738456 GGGTAAGGAAAGAAGC 51738471
          ||||||||||||||||
     2476 GGGTAAGGAAAGAAGC 2491

Alignment time is 3.53288 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    6526] =>      6526 nucs 'mol-32-2edb-043880_6526'

Score:        6282
Aligned:      6524        nucs
Identic:      6502 (100%) nucs =>       683 (100%)      5819 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51730154,51730836] EXCISED REGION [51730838,51736677]
 second seq =>  [       1,     683] EXCISED REGION [     686,    6526]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51730837,51730837]
 second seq =>         2 nucs [684,685]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51730154 TCCCAACTGCTGGCTTTGAGTCATAGGAACCAATAAAGTAGGAAGTGCCACAAAGGTAAG 51730213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCCAACTGCTGGCTTTGAGTCATAGGAACCAATAAAGTAGGAAGTGCCACAAAGGTAAG 60

 51730214 CACCGTCAGATTTAAGGCAGTGAGGGACAGGAACAGAAGGTTGCCAATGTCAAACAAATA 51730273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACCGTCAGATTTAAGGCAGTGAGGGACAGGAACAGAAGGTTGCCAATGTCAAACAAATA 120

 51730274 ACTTATAGTGAAAATGGACCAGAGAGGGGGCCTACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAG 51730333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTTATAGTGAAAATGGACCAGAGAGGGGGCCTACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAG 180

 51730334 CTTGGTTCTTAGCAGAACAGGAAGAGGATGTCTTGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCAC 51730393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTGGTTCTTAGCAGAACAGGAAGAGGATGTCTTGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCAC 240

 51730394 TCCCTGCCCTCTCTGGACCTCTTACTGAGGGAGGGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAG 51730453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCCTGCCCTCTCTGGACCTCTTACTGAGGGAGGGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAG 300

 51730454 CAGGGTGCTTATGCCATATTAGATCTCCATCAACATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGT 51730513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGGGTGCTTATGCCATATTAGATCTCCATCAACATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGT 360

 51730514 GAGAGCTTTGTAAATCAACTCTTAGGGTGCTTGCCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTA 51730573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGAGCTTTGTAAATCAACTCTTAGGGTGCTTGCCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTA 420

 51730574 ATCCTTTCTCCATGAAATGCAGCAAAGTTTGCATCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTA 51730633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCCTTTCTCCATGAAATGCAGCAAAGTTTGCATCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTA 480

 51730634 GCTCTGACATGTTCCTAATGAGGTTATAATGCTTTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCA 51730693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTCTGACATGTTCCTAATGAGGTTATAATGCTTTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCA 540

 51730694 CAAATAGCTAGGGATAGAATCATAGAAAGATAAAATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCT 51730753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAATAGCTAGGGATAGAATCATAGAAAGATAAAATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCT 600

 51730754 CTCAGACTTTAATACCAATCACCTGGGCATTGTAATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTG 51730813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCAGACTTTAATACCAATCACCTGGGCATTGTAATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTG 660

 51730814 AGAGTCTGCATTTCTAAAAAAAA 51730836
          |||||||||||||||||||||||
      661 AGAGTCTGCATTTCTAAAAAAAA 683

EXCISED REGION

 51730838 CCCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACAACATTTTGAGCAGCAAGACCTTAGAG 51730897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      686 CCCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACAACATTTTGAGCAGCAAGACCTTAGAG 745

 51730898 ATCATCTAATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAGCACATCAGGGCCAAGAGATTTATAAC 51730957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      746 ATCATCTAATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAGCACATCAGGGCCAAGAGATTTATAAC 805

 51730958 TGGAAGCACGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTAGGGTCAGTTGAGTATTTGTCCATAGA 51731017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      806 TGGAAGCACGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTAGGGTCAGTTGAGTATTTGTCCATAGA 865

 51731018 CCTGTGAGTCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATCTAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGCCT 51731077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      866 CCTGTGAGTCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATCTAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGCCT 925

 51731078 AGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTTGCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAATCC 51731137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      926 AGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTTGCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAATCC 985

 51731138 AGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGACCCTTTTGAATCTACTTAGAACACAG 51731197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      986 AGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGACCCTTTTGAATCTACTTAGAACACAG 1045

 51731198 TATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTCCCCAAGTGGTGGGATCATGACCTGCC 51731257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1046 TATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTCCCCAAGTGGTGGGATCATGACCTGCC 1105

 51731258 AAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAATGCTCAAACAAGTT 51731317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1106 AAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAACGCTCAAACAAGTT 1165

 51731318 TCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCCTA 51731377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1166 TCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCCTA 1225

 51731378 CCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAAATAAATAT 51731437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1226 CCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAAATAAATAT 1285

 51731438 TATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCTCATTTGATAAAAT 51731497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1286 TATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCTCATTTGATAAAAT 1345

 51731498 GCATGTAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAAAACATCCT 51731557
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1346 GCATATAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAAAACATCCT 1405

 51731558 TGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGTCA 51731617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1406 TGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGTCA 1465

 51731618 TGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTACATATTATTATTTTAC 51731677
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1466 TGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTTCATATTATTATTTTAC 1525

 51731678 TCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAATG 51731737
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1526 TCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTTAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAATG 1585

 51731738 AAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATCGCTAAGGCTTCTAAAACAGAATGC 51731797
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1586 AAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATTGCTAAGGCTTCTAAAACAGAATGC 1645

 51731798 CAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAACCACAATGA 51731857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1646 CAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAACCACAATGA 1705

 51731858 TTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGTCTGACTGAATTAC 51731917
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1706 TTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTGAGAGGCCAATGAGGTCTGACTGAATTAC 1765

 51731918 TTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTA 51731977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 TTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTA 1825

 51731978 AATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCATT 51732037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 AATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCATT 1885

 51732038 ACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCT 51732097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 ACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCT 1945

 51732098 GACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAA 51732157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 GACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAA 2005

 51732158 TGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCA 51732217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 TGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCA 2065

 51732218 ACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCTGGAGCATATTGAACACTTAAA 51732277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2066 ACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCCGGAGCATATTGAACACTTAAA 2125

 51732278 AAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTAAT 51732337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 AAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTAAT 2185

 51732338 AATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGA 51732397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 AATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGA 2245

 51732398 AGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATAT 51732457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 AGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATAT 2305

 51732458 TGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATTCAGCAGCT 51732517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 TGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATTCAGCAGCT 2365

 51732518 GTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACA 51732577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 GTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACA 2425

 51732578 ATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCTAA 51732637
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2426 ATTTCCCTTCTATAAGCCTCAACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCAGCAAGCTAA 2485

 51732638 AAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTC 51732697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 AAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTC 2545

 51732698 CACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAA 51732757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 CACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAA 2605

 51732758 GGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGACCCATCCAAGT 51732817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 GGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGACCCATCCAAGT 2665

 51732818 CTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACT 51732877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 CTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACT 2725

 51732878 TCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTAC 51732937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 TCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTAC 2785

 51732938 ACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCAT 51732997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 ACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCAT 2845

 51732998 ATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGT 51733057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 ATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGT 2905

 51733058 TTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATA 51733117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 TTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATA 2965

 51733118 ACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTT 51733177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 ACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTT 3025

 51733178 TCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCT 51733237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 TCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCT 3085

 51733238 GTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTG 51733297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 GTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTG 3145

 51733298 CTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATG 51733357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 CTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATG 3205

 51733358 CCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAA 51733417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 CCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAA 3265

 51733418 TTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCA 51733477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 TTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCA 3325

 51733478 TTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATT 51733537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 TTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATT 3385

 51733538 TACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCT 51733597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 TACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCT 3445

 51733598 AAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGA 51733657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 AAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGA 3505

 51733658 CTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTC 51733717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 CTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTC 3565

 51733718 ACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACACATACTACC 51733777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 ACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACACATACTACC 3625

 51733778 ATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAAGA 51733837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3626 ATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAAGAAAATGAAAAAGA 3685

 51733838 TACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTG 51733897
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3686 TACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTA 3745

 51733898 ATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATAC 51733957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 ATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATAC 3805

 51733958 CACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAAGC 51734017
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3806 CACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGCTTTCCCAAGC 3865

 51734018 ACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTG 51734077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 ACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTG 3925

 51734078 CATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTA 51734137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 CATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTA 3985

 51734138 TGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTA 51734197
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 TGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTTGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTA 4045

 51734198 CTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATC 51734257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 CTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATC 4105

 51734258 AAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAA 51734317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 AAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAA 4165

 51734318 GCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTC 51734377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 GCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTC 4225

 51734378 AGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATG 51734437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4226 AGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTATGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATG 4285

 51734438 ATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGA 51734497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 ATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGA 4345

 51734498 GGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAA 51734557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 GGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAA 4405

 51734558 ACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGG-AAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATT 51734616
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 ACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATT 4465

 51734617 CATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATATT 51734676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4466 CATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTAGTGATTCAAACCACAAGAGCATATT 4525

 51734677 TACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACC 51734736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 TACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACC 4585

 51734737 TCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTA 51734796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 TCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTA 4645

 51734797 AAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGA 51734856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 AAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGA 4705

 51734857 AAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATA 51734916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 AAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATA 4765

 51734917 CCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCA 51734976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 CCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCA 4825

 51734977 TCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGC 51735036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 TCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGC 4885

 51735037 CTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCA 51735096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 CTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCA 4945

 51735097 CCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTC 51735156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 CCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTC 5005

 51735157 TTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATG 51735216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 TTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATG 5065

 51735217 ATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCAT 51735276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     5066 ATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATTGGCCTTATTTATCAT 5125

 51735277 CTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATG 51735336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 CTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATG 5185

 51735337 GCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCAT 51735396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 GCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCAT 5245

 51735397 CTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAA 51735456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 CTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAA 5305

 51735457 AAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAA 51735516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 AAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAA 5365

 51735517 AAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATG 51735576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 AAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATG 5425

 51735577 ACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAG 51735636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     5426 ACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTCAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAG 5485

 51735637 ACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAAT 51735696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 ACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAAT 5545

 51735697 ATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAA 51735756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 ATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAA 5605

 51735757 ATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATA 51735816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 ATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATA 5665

 51735817 CAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGT 51735876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     5666 CAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGAATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGT 5725

 51735877 GGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATA 51735936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 GGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATA 5785

 51735937 TGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAA 51735996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 TGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAA 5845

 51735997 CTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAA 51736056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 CTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAA 5905

 51736057 ATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTACATC 51736116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 ATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTACATC 5965

 51736117 TATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACAAGT 51736176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5966 TATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACAACT 6025

 51736177 TAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCCCAAAAGGTTACATACTA 51736236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6026 TAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCTCAAAAGGTTACATACTA 6085

 51736237 TATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTATAGTGACAGAGAATATATTAG 51736296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6086 TATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTGTAGTGACAGAGAATATATTAG 6145

 51736297 TGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTG 51736356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 TGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTG 6205

 51736357 GGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACA 51736416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 GGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACA 6265

 51736417 TGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATT 51736476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 TGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATT 6325

 51736477 TTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCC 51736536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6326 TTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCC 6385

 51736537 ACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGT 51736596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 ACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGT 6445

 51736597 TAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAA 51736656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 TAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAA 6505

 51736657 ATGATGAAACAATAAACAAAT 51736677
          |||||||||||||||||||||
     6506 ATGATGAAACAATAAACAAAT 6526

Alignment time is 8.13062 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    9722] =>      9722 nucs 'mol-32-2ef1-049883_9722'

Score:        9353
Aligned:      9726        nucs
Identic:      9688 (100%) nucs =>      9503 (100%)       185 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51730034,51739567] EXCISED REGION [51745607,51745791]
 second seq =>  [       1,    9536] EXCISED REGION [    9538,    9722]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6039 nucs [51739568,51745606]
 second seq =>         1 nucs [9537,9537]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51739567,51739567] to [51745607,51745607]
 second seq =>         1 nucs [9536,9536] to [9538,9538]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51739568,51739568] to [51745606,51745606]
 second seq =>         0 nucs

 51730034 TCAAGCATGCTGTCATTTTAACAAAACATAAACTAGACTCTGCCTTGTAGAGTGGCAGTT 51730093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCAAGCATGCTGTCATTTTAACAAAACATAAACTAGACTCTGCCTTGTAGAGTGGCAGTT 60

 51730094 TTTTCTTCACCCAAATATTAAATAGTGTGGCCAACTTCAAATATTTAAATACTTCTGTCA 51730153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTCTTCACCCAAATATTAAATAGTGTGGCCAACTTCAAATATTTAAATACTTCTGTCA 120

 51730154 TCCCAACTGCTGGCTTTGAGTCATAGGAACCAATAAAGTAGGAAGTGCCACAAAGGTAAG 51730213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCCAACTGCTGGCTTTGAGTCATAGGAACCAATAAAGTAGGAAGTGCCACAAAGGTAAG 180

 51730214 CACCGTCAGATTTAAGGCAGTGAGGGACAGGAACAGAAGGTTGCCAATGTCAAACAAATA 51730273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACCGTCAGATTTAAGGCAGTGAGGGACAGGAACAGAAGGTTGCCAATGTCAAACAAATA 240

 51730274 ACTTATAGTGAAAATGGACCAGAGAGGGGGCCTACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAG 51730333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTTATAGTGAAAATGGACCAGAGAGGGGGCCTACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAG 300

 51730334 CTTGGTTCTTAGCAGAACAGGAAGAGGATGTCTTGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCAC 51730393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTGGTTCTTAGCAGAACAGGAAGAGGATGTCTTGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCAC 360

 51730394 TCCCTGCCCTCTCTGGACCTCTTACTGAGGGAGGGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAG 51730453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCCTGCCCTCTCTGGACCTCTTACTGAGGGAGGGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAG 420

 51730454 CAGGGTGCTTATGCCATATTAGATCTCCATCAACATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGT 51730513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGGGTGCTTATGCCATATTAGATCTCCATCAACATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGT 480

 51730514 GAGAGCTTTGTAAATCAACTCTTAGGGTGCTTGCCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTA 51730573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGAGCTTTGTAAATCAACTCTTAGGGTGCTTGCCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTA 540

 51730574 ATCCTTTCTCCATGAAATGCAGCAAAGTTTGCATCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTA 51730633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCCTTTCTCCATGAAATGCAGCAAAGTTTGCATCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTA 600

 51730634 GCTCTGACATGTTCCTAATGAGGTTATAATGCTTTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCA 51730693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTCTGACATGTTCCTAATGAGGTTATAATGCTTTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCA 660

 51730694 CAAATAGCTAGGGATAGAATCATAGAAAGATAAAATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCT 51730753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAATAGCTAGGGATAGAATCATAGAAAGATAAAATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCT 720

 51730754 CTCAGACTTTAATACCAATCACCTGGGCATTGTAATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTG 51730813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCAGACTTTAATACCAATCACCTGGGCATTGTAATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTG 780

 51730814 AGAGTCTGCATTTCTAAAAAAAAT--CCCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACA 51730871
          |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAGTCTGCATTTCTAAAAAAAA-ACCCCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACA 839

 51730872 ACATTTTGAGCAGCAAGACCTTAGAGATCATCTAATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAG 51730931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 ACATTTTGAGCAGCAAGACCTTAGAGATCATCTAATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAG 899

 51730932 CACATCAGGGCCAAGAGATTTATAACTGGAAGCACGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTA 51730991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CACATCAGGGCCAAGAGATTTATAACTGGAAGCACGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTA 959

 51730992 GGGTCAGTTGAGTATTTGTCCATAGACCTGTGAGTCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATC 51731051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GGGTCAGTTGAGTATTTGTCCATAGACCTGTGAGTCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATC 1019

 51731052 TAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGCCTAGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTT 51731111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGCCTAGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTT 1079

 51731112 GCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAATCCAGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGA 51731171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAATCCAGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGA 1139

 51731172 CCCTTTTGAATCTACTTAGAACACAGTATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTC 51731231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CCCTTTTGAATCTACTTAGAACACAGTATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTC 1199

 51731232 CCCAAGTGGTGGGATCATGACCTGCCAAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATC 51731291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CCCAAGTGGTGGGATCATGACCTGCCAAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATC 1259

 51731292 TCAAAGAGCAAATGCTCAAACAAGTTTCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGA 51731351
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TCAAAGAGCAAACGCTCAAACAAGTTTCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGA 1319

 51731352 CAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCCTACCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGAC 51731411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCCTACCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGAC 1379

 51731412 TATCAGGAACACGCAGAAATAAATATTATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACA 51731471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TATCAGGAACACGCAGAAATAAATATTATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACA 1439

 51731472 AATCTATTTTCCTCATTTGATAAAATGCATGTAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACT 51731531
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AATCTATTTTCCTCATTTGATAAAATGCATATAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACT 1499

 51731532 CTCAAAACACTCATTTAAAACATCCTTGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTG 51731591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CTCAAAACACTCATTTAAAACATCCTTGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTG 1559

 51731592 CATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGTCATGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAA 51731651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGTCATGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAA 1619

 51731652 TATATCCCTACATATTATTATTTTACTCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAA 51731711
          |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1620 TATATCCCTTCATATTATTATTTTACTCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTTAGGTAGAA 1679

 51731712 TAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAATGAAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCA 51731771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAATGAAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCA 1739

 51731772 TCGCTAAGGCTTCTAAAACAGAATGCCAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAG 51731831
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TTGCTAAGGCTTCTAAAACAGAATGCCAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAG 1799

 51731832 AGTTAGTGCAATCCTAACCACAATGATTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAG 51731891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AGTTAGTGCAATCCTAACCACAATGATTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAG 1859

 51731892 AGGCCAATGAGGTCTGACTGAATTACTTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAG 51731951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AGGCCAATGAGGTCTGACTGAATTACTTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAG 1919

 51731952 ACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTAAATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGAC 51732011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 ACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTAAATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGAC 1979

 51732012 AGAACCCTAGACATTCAGCAATCATTACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTAT 51732071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 AGAACCCTAGACATTCAGCAATCATTACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTAT 2039

 51732072 TATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCTGACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGA 51732131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCTGACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGA 2099

 51732132 GTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAA 51732191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAA 2159

 51732192 CAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCT 51732251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 CAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCT 2219

 51732252 TCCCTGGAGCATATTGAACACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAG 51732311
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TCCCCGGAGCATATTGAACACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAG 2279

 51732312 AATGGACATTTTTAGAATTTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCT 51732371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AATGGACATTTTTAGAATTTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCT 2339

 51732372 GTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACA 51732431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACA 2399

 51732432 AGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAAC 51732491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAAC 2459

 51732492 TACCATACACTCATGATTCAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCT 51732551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TACCATACACTCATGATTCAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCT 2519

 51732552 AAATACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAA 51732611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2520 AAATACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCAACAGCCAGAATAA 2579

 51732612 CAGATGCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGA 51732671
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CAGATGCATGCCCATCAGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGA 2639

 51732672 CATACGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCT 51732731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CATACGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCT 2699

 51732732 TGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTT 51732791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTT 2759

 51732792 TTTCCCAGACAGAGACCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGC 51732851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TTTCCCAGACAGAGACCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGC 2819

 51732852 CACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTAT 51732911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTAT 2879

 51732912 AAATTGGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAG 51732971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AAATTGGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAG 2939

 51732972 TGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCA 51733031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCA 2999

 51733032 AGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTG 51733091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 AGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTG 3059

 51733092 GTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTAT 51733151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 GTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTAT 3119

 51733152 AGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACAT 51733211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 AGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACAT 3179

 51733212 GGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAG 51733271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAG 3239

 51733272 CTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCAC 51733331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 CTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCAC 3299

 51733332 AACAAAGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAG 51733391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 AACAAAGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAG 3359

 51733392 TGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGT 51733451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGT 3419

 51733452 TTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCT 51733511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCT 3479

 51733512 CTTACTATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGG 51733571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 CTTACTATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGG 3539

 51733572 CAAATAGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGT 51733631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 CAAATAGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGT 3599

 51733632 CTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGG 51733691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 CTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGG 3659

 51733692 AAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGT 51733751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 AAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGT 3719

 51733752 ACACATCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATA 51733811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 ACACATCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATA 3779

 51733812 AAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAG 51733871
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 AAAAAAAGAAAAGAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAG 3839

 51733872 CCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCT 51733931
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 CCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTAATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCT 3899

 51733932 TGCAACTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATA 51733991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TGCAACTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATA 3959

 51733992 CTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGT 51734051
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CTGGACTTCTTTGTGCTTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGT 4019

 51734052 ATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCC 51734111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 ATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCC 4079

 51734112 TAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTT 51734171
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4080 TAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTTGGCCCCTT 4139

 51734172 CACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCT 51734231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 CACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCT 4199

 51734232 TGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTT 51734291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 TGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTT 4259

 51734292 TATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATG 51734351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 TATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATG 4319

 51734352 AAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGT 51734411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 AAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGT 4379

 51734412 GATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGA 51734471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 GATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGA 4439

 51734472 ATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCC 51734531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 ATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCC 4499

 51734532 TAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAA 51734591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 TAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAA 4559

 51734592 -GTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATT 51734650
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 AGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATT 4619

 51734651 GGTGATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGA 51734710
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 AGTGATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGA 4679

 51734711 TCAAATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTAT 51734770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 TCAAATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTAT 4739

 51734771 TTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGT 51734830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 TTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGT 4799

 51734831 GCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGG 51734890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 GCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGG 4859

 51734891 AAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCAT 51734950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 AAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCAT 4919

 51734951 TTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACT 51735010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 TTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACT 4979

 51735011 CTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGG 51735070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 CTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGG 5039

 51735071 ACCATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGC 51735130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 ACCATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGC 5099

 51735131 TGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATG 51735190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 TGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATG 5159

 51735191 CAATCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTG 51735250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 CAATCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTG 5219

 51735251 ACTTGAATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTT 51735310
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 ACTTGAATATTGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTT 5279

 51735311 GGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGG 51735370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 GGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGG 5339

 51735371 TTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACA 51735430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 TTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACA 5399

 51735431 GACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATG 51735490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 GACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATG 5459

 51735491 AAATACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGA 51735550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 AAATACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGA 5519

 51735551 GAAAATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACT 51735610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 GAAAATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACT 5579

 51735611 CTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCT 51735670
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 CTCAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCT 5639

 51735671 TCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAAT 51735730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 TCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAAT 5699

 51735731 GTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGC 51735790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 GTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGC 5759

 51735791 ACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAA 51735850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 ACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAA 5819

 51735851 AGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACT 51735910
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 AGAATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACT 5879

 51735911 TTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCT 51735970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 TTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCT 5939

 51735971 AGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTC 51736030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 AGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTC 5999

 51736031 ATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATG 51736090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 ATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATG 6059

 51736091 AATGGATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGA 51736150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 AATGGATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGA 6119

 51736151 ATGTAATATTGATATGTGCAACAAGTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGA 51736210
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 ATGTAATATTGATATGTGCAACAACTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGA 6179

 51736211 AGCCAGTCCCAAAAGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAA 51736270
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 AGCCAGTCTCAAAAGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAA 6239

 51736271 AACTATAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGT 51736330
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 AACTGTAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGT 6299

 51736331 GGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCG 51736390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 GGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCG 6359

 51736391 TGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAG 51736450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 TGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAG 6419

 51736451 TCAGTTTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGA 51736510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 TCAGTTTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGA 6479

 51736511 AACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAG 51736570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 AACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAG 6539

 51736571 CTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAAT 51736630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 CTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAAT 6599

 51736631 TTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAA 51736690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 TTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAA 6659

 51736691 CTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCC 51736750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 CTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCC 6719

 51736751 TTGGAGAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAG 51736810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 TTGGAGAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAG 6779

 51736811 AAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAA 51736870
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6780 AAAAAAA-GGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAA 6838

 51736871 AAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCC 51736930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 AAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCC 6898

 51736931 CAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCA 51736990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6899 CAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCA 6958

 51736991 AAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGT 51737050
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6959 AAGAAATAATTGAAGAAAACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGT 7018

 51737051 CCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGA 51737110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7019 CCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGA 7078

 51737111 AATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATA 51737170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7079 AATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATA 7138

 51737171 AGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGACA 51737230
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     7139 AGTTACATACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTT-GAGACA 7197

 51737231 GAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCT 51737290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7198 GAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCT 7257

 51737291 CTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 51737350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7258 CTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 7317

 51737351 TGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGT 51737410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7318 TGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGT 7377

 51737411 TGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAAC 51737470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7378 TGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAAC 7437

 51737471 TGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAG 51737530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7438 TGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAG 7497

 51737531 ACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACT 51737590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7498 ACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACT 7557

 51737591 TCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAG 51737650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7558 TCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAG 7617

 51737651 AACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----CAGAAAGTT 51737706
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||
     7618 AACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGAAAGTT 7677

 51737707 ACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAA 51737766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7678 ACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAA 7737

 51737767 TCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAA 51737826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7738 TCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAA 7797

 51737827 GGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAAC 51737886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7798 GGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAAC 7857

 51737887 TCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAAC 51737946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7858 TCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAAC 7917

 51737947 TTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAATGC 51738006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||| |
     7918 TTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCATAAGGCATATAGAATAAT-C 7976

 51738007 TTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAA 51738066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7977 TTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAA 8036

 51738067 TAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTA 51738126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8037 TAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTA 8096

 51738127 TATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAA 51738186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8097 TATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAA 8156

 51738187 TGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTT 51738246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8157 TGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTT 8216

 51738247 TTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTAT 51738306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8217 TTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTAT 8276

 51738307 ACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTTGTG 51738366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     8277 ACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTGTGATTTGTG 8336

 51738367 CACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACAAAT 51738426
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     8337 CACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGAACAAAT 8396

 51738427 ACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATG 51738486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8397 ACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATG 8456

 51738487 TCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACA 51738546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8457 TCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACA 8516

 51738547 AGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACT 51738606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8517 AGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACT 8576

 51738607 TTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAA 51738666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8577 TTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAA 8636

 51738667 AAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAA 51738726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8637 AAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAA 8696

 51738727 TGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAG 51738786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8697 TGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAG 8756

 51738787 ATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGG 51738846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8757 ATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGG 8816

 51738847 GAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAA 51738906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8817 GAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAA 8876

 51738907 TCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACG 51738966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8877 TCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACG 8936

 51738967 GTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCAT 51739026
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8937 GTATTTTTTAAAGTAACATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCAT 8996

 51739027 CCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTTTTT 51739086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8997 CCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTTTTT 9056

 51739087 TAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTAC 51739146
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9057 -AGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTAC 9115

 51739147 GCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAG 51739206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9116 GCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAG 9175

 51739207 TCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAG 51739266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9176 TCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAG 9235

 51739267 TACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTC 51739326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9236 TACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTC 9295

 51739327 TTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTA 51739386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9296 TTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTA 9355

 51739387 TATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGG 51739446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9356 TATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGG 9415

 51739447 CCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATC 51739506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9416 CCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATC 9475

 51739507 ACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAA 51739566
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9476 ACGAGGTCAGGAGATTGAGACTATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAA 9535

 51739567 A 51739567
          |
     9536 A 9536

EXCISED REGION

 51745607 ACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA 51745666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9538 ACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA 9597

 51745667 GGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACT 51745726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9598 GGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACT 9657

 51745727 GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAGTGTT 51745786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9658 GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAGTGTT 9717

 51745787 AATTC 51745791
          |||||
     9718 AATTC 9722

Alignment time is 11.703 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2419] =>      2419 nucs 'mol-32-2ef1-050735_2419'

Score:        2374
Aligned:      2422        nucs
Identic:      2416 (100%) nucs =>       277 (100%)      2139 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51735833,51736109] EXCISED REGION [51736805,51738948]
 second seq =>  [       1,     277] EXCISED REGION [     278,    2419]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51735833 TGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGA 51735892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGA 60

 51735893 CAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGA 51735952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGA 120

 51735953 CCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAA 51736012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAA 180

 51736013 AACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCA 51736072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCA 240

 51736073 AGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 51736109
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 277

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      278 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 337

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      338 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 397

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      398 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 457

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      458 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 517

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      518 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 577

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      578 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 637

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
      638 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 697

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      698 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 757

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      758 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 817

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      818 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 877

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 937

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      938 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 997

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 1057

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 1117

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
     1118 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC---TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 1174

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 1234

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 1294

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 1354

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 1414

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 1474

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 1534

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 1594

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 1654

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 1714

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 1774

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTT 51738363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
     1775 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTTCCCTGTGATTT 1834

 51738364 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 51738423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 1894

 51738424 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 51738483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 1954

 51738484 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 51738543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 2014

 51738544 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 51738603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 2074

 51738604 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 51738663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 2134

 51738664 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 51738723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 2194

 51738724 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 51738783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 2254

 51738784 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 51738843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 2314

 51738844 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 51738903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 2374

 51738904 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATC 51738948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATC 2419

Alignment time is 3.40557 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5192] =>      5192 nucs 'mol-32-2f1d-107758_5192'

Score:        5137
Aligned:      5192        nucs
Identic:      5187 (100%) nucs =>      4630 (100%)       557 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51731476,51736109] EXCISED REGION [51736805,51737361]
 second seq =>  [       1,    4634] EXCISED REGION [    4635,    5192]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51731476 TATTTTCCTCATTTGATAAAATGCATGTAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCA 51731535
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTTCCTCATTCGATAAAATGCATGTAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCA 60

 51731536 AAACACTCATTTAAAACATCCTTGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATC 51731595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACACTCATTTAAAACATCCTTGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATC 120

 51731596 CCTGAGAATGAAGAAAAAGTCATGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATA 51731655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTGAGAATGAAGAAAAAGTCATGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATA 180

 51731656 TCCCTACATATTATTATTTTACTCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAATAAT 51731715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCCTACATATTATTATTTTACTCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAATAAT 240

 51731716 GAATGTCTAGAAAGCAAAAATGAAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATCGC 51731775
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      241 GAATGTCTAGAAAGCAAAAATGAAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATTGC 300

 51731776 TAAGGCTTCTAAAACAGAATGCCAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTT 51731835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAGGCTTCTAAAACAGAATGCCAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTT 360

 51731836 AGTGCAATCCTAACCACAATGATTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGC 51731895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTGCAATCCTAACCACAATGATTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGC 420

 51731896 CAATGAGGTCTGACTGAATTACTTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAA 51731955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATGAGGTCTGACTGAATTACTTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAA 480

 51731956 AGGAAGAAAATAAGTGTGGCTAAATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAA 51732015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGAAGAAAATAAGTGTGGCTAAATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAA 540

 51732016 CCCTAGACATTCAGCAATCATTACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATG 51732075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCTAGACATTCAGCAATCATTACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATG 600

 51732076 CATTATAAACAGCCCCGCTGCTGACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCC 51732135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATTATAAACAGCCCCGCTGCTGACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCC 660

 51732136 TTGCTCCAATATTAATAGGAAATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAG 51732195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGCTCCAATATTAATAGGAAATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAG 720

 51732196 GAAAATGAACTGGAGTGAAGCAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCC 51732255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAAATGAACTGGAGTGAAGCAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCC 780

 51732256 TGGAGCATATTGAACACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATG 51732315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGAGCATATTGAACACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATG 840

 51732316 GACATTTTTAGAATTTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTG 51732375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GACATTTTTAGAATTTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTG 900

 51732376 GCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCT 51732435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCT 960

 51732436 ATGAGATCTGGTCCAAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACC 51732495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGAGATCTGGTCCAAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACC 1020

 51732496 ATACACTCATGATTCAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAAT 51732555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATACACTCATGATTCAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAAT 1080

 51732556 ACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGA 51732615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGA 1140

 51732616 TGCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATA 51732675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATA 1200

 51732676 CGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAA 51732735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAA 1260

 51732736 TTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTC 51732795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTC 1320

 51732796 CCAGACAGAGACCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACT 51732855
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCAGACAGAGATCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACT 1380

 51732856 AAGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAAT 51732915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAAT 1440

 51732916 TGGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGAT 51732975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGAT 1500

 51732976 GGTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAA 51733035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAA 1560

 51733036 AAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGT 51733095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGT 1620

 51733096 GCTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTC 51733155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTC 1680

 51733156 CACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCA 51733215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCA 1740

 51733216 CTATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAG 51733275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAG 1800

 51733276 TAGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACA 51733335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACA 1860

 51733336 AAGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGG 51733395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGG 1920

 51733396 AAATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAG 51733455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAG 1980

 51733456 TCTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTA 51733515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTA 2040

 51733516 CTATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAA 51733575
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2041 CTATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCGAACTCAATTAATCACTTGGGCAAA 2100

 51733576 TAGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTT 51733635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTT 2160

 51733636 CCCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAG 51733695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAG 2220

 51733696 TATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACAC 51733755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACAC 2280

 51733756 ATCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAA 51733815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAA 2340

 51733816 AAAGAAAATAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCA 51733875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAGAAAATAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCA 2400

 51733876 ATAGAGTACATGCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCA 51733935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATAGAGTACATGCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCA 2460

 51733936 ACTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGG 51733995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGG 2520

 51733996 ACTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATAC 51734055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATAC 2580

 51734056 TGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAA 51734115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAA 2640

 51734116 CCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACT 51734175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACT 2700

 51734176 GACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGA 51734235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGA 2760

 51734236 CATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATA 51734295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATA 2820

 51734296 TTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAA 51734355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAA 2880

 51734356 GAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATT 51734415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATT 2940

 51734416 TTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTG 51734475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTG 3000

 51734476 CGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAA 51734535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAA 3060

 51734536 CTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAA 51734595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAA 3120

 51734596 AGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGA 51734655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGA 3180

 51734656 TTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAA 51734715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAA 3240

 51734716 TCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTT 51734775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTT 3300

 51734776 ACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATA 51734835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATA 3360

 51734836 CATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGG 51734895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGG 3420

 51734896 CTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAAT 51734955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAAT 3480

 51734956 CAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAG 51735015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAG 3540

 51735016 CAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCAT 51735075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCAT 3600

 51735076 AATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTAC 51735135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTAC 3660

 51735136 TGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATC 51735195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATC 3720

 51735196 TTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTG 51735255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTG 3780

 51735256 AATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAA 51735315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAA 3840

 51735316 CAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTG 51735375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTG 3900

 51735376 TTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTT 51735435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTT 3960

 51735436 CCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATA 51735495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATA 4020

 51735496 CAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAA 51735555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAA 4080

 51735556 TATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAG 51735615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAG 4140

 51735616 GTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAA 51735675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAA 4200

 51735676 AGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCA 51735735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCA 4260

 51735736 ACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTA 51735795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTA 4320

 51735796 TTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTAT 51735855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTAT 4380

 51735856 TAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGC 51735915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGC 4440

 51735916 AGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTA 51735975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTA 4500

 51735976 TTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAAC 51736035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAAC 4560

 51736036 AGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGG 51736095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGG 4620

 51736096 ATTAACAAACTGCA 51736109
          ||||||||||||||
     4621 ATTAACAAACTGCA 4634

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4635 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 4694

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4695 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 4754

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4755 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 4814

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4815 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 4874

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4875 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 4934

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4935 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 4994

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     4995 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 5054

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5055 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 5114

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5115 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 5174

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACC 51737361
          ||||||||||||||||||
     5175 CTACAGGTGCTTGCCACC 5192

Alignment time is 6.56743 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3018] =>      3018 nucs 'mol-32-2f3e-100125_3018'

Score:        2972
Aligned:      3022        nucs
Identic:      3015 (100%) nucs =>       162 (100%)      2853 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51735948,51736109] EXCISED REGION [51736805,51739663]
 second seq =>  [       1,     162] EXCISED REGION [     163,    3018]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51735948 TATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTAT 51736007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTAT 60

 51736008 ATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACA 51736067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACA 120

 51736068 AGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 51736109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 162

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      163 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 222

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      223 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 282

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      283 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 342

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      343 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 402

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      403 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 462

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      463 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 522

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
      523 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 582

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      583 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 642

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      643 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 702

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      703 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 762

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      763 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 822

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      823 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 882

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      883 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 942

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      943 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 1002

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
     1003 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 1058

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1059 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 1118

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1119 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 1178

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1179 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 1238

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1239 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 1298

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1299 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 1358

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1359 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 1418

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1419 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 1478

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1479 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 1538

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1539 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 1598

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 1658

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTT 51738363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
     1659 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTTCCCTGTGATTT 1718

 51738364 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 51738423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 1778

 51738424 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 51738483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 1838

 51738484 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 51738543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 1898

 51738544 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 51738603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 1958

 51738604 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 51738663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 2018

 51738664 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 51738723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 2078

 51738724 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 51738783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 2138

 51738784 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 51738843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 2198

 51738844 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 51738903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 2258

 51738904 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 51738963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2259 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 2318

 51738964 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 51739023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 2378

 51739024 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 51739083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 2438

 51739084 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 51739143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2439 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 2498

 51739144 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 51739203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2499 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 2558

 51739204 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 51739263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 2618

 51739264 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 51739323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2619 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 2678

 51739324 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 51739383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2679 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 2738

 51739384 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 51739443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 2798

 51739444 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 51739503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2799 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 2858

 51739504 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 51739563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2859 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 2918

 51739564 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 51739623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2919 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 2978

 51739624 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCAC 51739663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2979 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCAC 3018

Alignment time is 3.93774 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2909] =>      2909 nucs 'mol-32-2fc2-207819_2909'

Score:        2857
Aligned:      2879        nucs
Identic:      2877 (100%) nucs =>      2282 (100%)       595 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51733827,51736109] EXCISED REGION [51736805,51737399]
 second seq =>  [      31,    2313] EXCISED REGION [    2314,    2909]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51733827 AATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACAT 51733886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       31 AATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACAT 90

 51733887 GCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATT 51733946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       91 GCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATT 150

 51733947 TCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTG 51734006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      151 TCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTG 210

 51734007 ATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAA 51734066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      211 ATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAA 270

 51734067 ATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAG 51734126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      271 ATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAG 330

 51734127 AATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGA 51734186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      331 AATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGA 390

 51734187 GTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTA 51734246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      391 GTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTA 450

 51734247 GTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCC 51734306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      451 GTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCC 510

 51734307 TAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGC 51734366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      511 TAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGC 570

 51734367 CAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTG 51734426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      571 CAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTG 630

 51734427 TCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGC 51734486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      631 TCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGC 690

 51734487 ACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCA 51734546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      691 ACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCA 750

 51734547 CCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTT 51734606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      751 CCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTT 810

 51734607 GTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACA 51734666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      811 GTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACA 870

 51734667 AGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATT 51734726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      871 AGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATT 930

 51734727 ACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGA 51734786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      931 ACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGA 990

 51734787 GATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCT 51734846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      991 GATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCT 1050

 51734847 GGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATG 51734906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1051 GGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATG 1110

 51734907 TTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGC 51734966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1111 TTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGC 1170

 51734967 CTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACA 51735026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1171 CTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACA 1230

 51735027 TGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAAT 51735086
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1231 TGATCCCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAAT 1290

 51735087 GTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCT 51735146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1291 GTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCT 1350

 51735147 CCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAA 51735206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 CCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAA 1410

 51735207 AGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCT 51735266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 AGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCT 1470

 51735267 TATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACA 51735326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 TATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACA 1530

 51735327 GGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCAT 51735386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 GGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCAT 1590

 51735387 CAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTT 51735446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 CAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTT 1650

 51735447 AAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAAT 51735506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 AAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAAT 1710

 51735507 GCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAAT 51735566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 GCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAAT 1770

 51735567 CACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGC 51735626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 CACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGC 1830

 51735627 AAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAG 51735686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 AAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAG 1890

 51735687 AAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATT 51735746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 AAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATT 1950

 51735747 CACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATA 51735806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 CACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATA 2010

 51735807 AATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCC 51735866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 AATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCC 2070

 51735867 TGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATA 51735926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 TGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATA 2130

 51735927 AAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGA 51735986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 AAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGA 2190

 51735987 GAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTA 51736046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 GAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTA 2250

 51736047 TAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACT 51736106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 TAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACT 2310

 51736107 GCA 51736109
          |||
     2311 GCA 2313

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 2373

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 2433

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 2493

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 2553

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 2613

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 2673

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     2674 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 2733

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 2793

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 2853

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGG 51737399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGG 2909

Alignment time is 3.85741 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3184] =>      3184 nucs 'mol-32-2fe3-148338_3184'

Score:        3117
Aligned:      3189        nucs
Identic:      3180 (100%) nucs =>       451 (100%)      2729 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51735658,51736109] EXCISED REGION [51736805,51739540]
 second seq =>  [       1,     451] EXCISED REGION [     452,    3184]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51735658 GAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCAC 51735717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCAC 60

 51735718 AGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTA 51735777
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAAAAAAAAA-TGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTA 119

 51735778 AAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTG 51735837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 AAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTG 179

 51735838 ATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCC 51735897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 ATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCC 239

 51735898 ACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAG 51735957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 ACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAG 299

 51735958 CAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCT 51736017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 CAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCT 359

 51736018 GAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGC 51736077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 GAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGC 419

 51736078 ACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 51736109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 ACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 451

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      452 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 511

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      512 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 571

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      572 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 631

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      632 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 691

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      692 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 751

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 811

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
      812 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 871

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      872 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 931

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 991

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 1051

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 1111

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 1171

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 1231

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 1291

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
     1292 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 1347

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 1407

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 1467

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 1527

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 1587

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 1647

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 1707

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 1767

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 1827

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 1887

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 1947

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTT 51738363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
     1948 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTTCCCTGTGATTT 2007

 51738364 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 51738423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 2067

 51738424 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 51738483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 2127

 51738484 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 51738543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 2187

 51738544 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 51738603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 2247

 51738604 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 51738663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 2307

 51738664 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 51738723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 2367

 51738724 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 51738783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 2427

 51738784 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 51738843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 2487

 51738844 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 51738903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 2547

 51738904 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 51738963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 2607

 51738964 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 51739023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 2667

 51739024 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 51739083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 2727

 51739084 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 51739143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 2787

 51739144 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 51739203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 2847

 51739204 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 51739263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 2907

 51739264 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 51739323
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTGAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 2967

 51739324 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 51739383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 3027

 51739384 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 51739443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 3087

 51739444 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 51739503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 3147

 51739504 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAAC 51739540
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAAC 3184

Alignment time is 4.22906 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4268] =>      4268 nucs 'mol-32-2fe3-207885_4268'

Score:        4210
Aligned:      4273        nucs
Identic:      4264 (100%) nucs =>      1682 (100%)      2582 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51734427,51736109] EXCISED REGION [51736805,51739393]
 second seq =>  [       1,    1683] EXCISED REGION [    1684,    4268]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51734427 TCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGC 51734486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGC 60

 51734487 ACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCA 51734546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCA 120

 51734547 CCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTT 51734606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTT 180

 51734607 GTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACA 51734666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACA 240

 51734667 AGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATT 51734726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATT 300

 51734727 ACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGA 51734786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGA 360

 51734787 GATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCT 51734846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCT 420

 51734847 GGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATG 51734906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATG 480

 51734907 TTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGC 51734966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGC 540

 51734967 CTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACA 51735026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      541 CTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGAAAGAAATACA 600

 51735027 TGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAAT 51735086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAAT 660

 51735087 GTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCT 51735146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCT 720

 51735147 CCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAA 51735206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAA 780

 51735207 AGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCT 51735266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCT 840

 51735267 TATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACA 51735326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACA 900

 51735327 GGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCAT 51735386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCAT 960

 51735387 CAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTT 51735446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTT 1020

 51735447 AAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAAT 51735506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAAT 1080

 51735507 GCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAAT 51735566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAAT 1140

 51735567 CACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGC 51735626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGC 1200

 51735627 AAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAG 51735686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAG 1260

 51735687 AAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATT 51735746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATT 1320

 51735747 CACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATA 51735806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATA 1380

 51735807 AATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCC 51735866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCC 1440

 51735867 TGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATA 51735926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATA 1500

 51735927 AAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGA 51735986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGA 1560

 51735987 GAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTA 51736046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTA 1620

 51736047 TAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACT 51736106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACT 1680

 51736107 GCA 51736109
          |||
     1681 GCA 1683

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 1743

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 1803

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 1863

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 1923

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 1983

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 2043

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     2044 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 2103

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 2163

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 2223

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 2283

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 2343

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 2403

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 2463

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 2523

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||
     2524 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC-----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 2578

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 2638

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 2698

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 2758

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 2818

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 2878

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 2938

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 2998

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 3058

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 3118

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 3178

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTT 51738363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
     3179 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTTCCCTGTGATTT 3238

 51738364 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 51738423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 3298

 51738424 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 51738483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 3358

 51738484 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 51738543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 3418

 51738544 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 51738603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 3478

 51738604 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 51738663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 3538

 51738664 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 51738723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 3598

 51738724 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 51738783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 3658

 51738784 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 51738843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 3718

 51738844 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 51738903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 3778

 51738904 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 51738963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 3838

 51738964 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 51739023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 3898

 51739024 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 51739083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 3958

 51739084 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 51739143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 4018

 51739144 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 51739203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 4078

 51739204 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 51739263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 4138

 51739264 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 51739323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 4198

 51739324 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 51739383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 4258

 51739384 TTATATATGA 51739393
          ||||||||||
     4259 TTATATATGA 4268

Alignment time is 5.49895 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5637] =>      5637 nucs 'mol-32-2fee-320855_5637'

Score:        5385
Aligned:      5642        nucs
Identic:      5617 (100%) nucs =>      4995 (100%)       622 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51734552,51739567] EXCISED REGION [51745607,51746229]
 second seq =>  [       1,    5012] EXCISED REGION [    5014,    5637]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6039 nucs [51739568,51745606]
 second seq =>         1 nucs [5013,5013]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51739567,51739567] to [51745607,51745607]
 second seq =>         1 nucs [5012,5012] to [5014,5014]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51739568,51739568] to [51745606,51745606]
 second seq =>         0 nucs

 51734552 ATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAA-GTAAAGTGGAGACTTGTTG 51734610
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
        1 ATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTG 60

 51734611 ATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAAGAG 51734670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
       61 ATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTAGTGATTCAAACCACAAGAG 120

 51734671 CATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTC 51734730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTC 180

 51734731 TCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATG 51734790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATG 240

 51734791 TGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGAC 51734850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGAC 300

 51734851 TGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAG 51734910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAG 360

 51734911 TTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTAC 51734970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTAC 420

 51734971 TAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGAT 51735030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGAT 480

 51735031 CTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGA 51735090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGA 540

 51735091 TAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAG 51735150
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGGCACCATAATAGGAGCAGGACCGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAG 600

 51735151 GATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAG 51735210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAG 660

 51735211 ATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTTATT 51735270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      661 ATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATTGGCCTTATT 720

 51735271 TATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTT 51735330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTT 780

 51735331 CTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGT 51735390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGT 840

 51735391 TCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAA 51735450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAA 900

 51735451 GAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCAT 51735510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCAT 960

 51735511 GAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACA 51735570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACA 1020

 51735571 CATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCAAGA 51735630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1021 CATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTCAGGTTTCAACAGCAAGA 1080

 51735631 AAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAA 51735690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAA 1140

 51735691 GAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACT 51735750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACT 1200

 51735751 AGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATA 51735810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATA 1260

 51735811 AAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTT 51735870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1261 AAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGAATTAAAACTCTCCTGTT 1320

 51735871 TCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGT 51735930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGT 1380

 51735931 TAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAA 51735990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAA 1440

 51735991 TGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAAT 51736050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAAT 1500

 51736051 CACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCAT 51736110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCAT 1560

 51736111 TACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCA 51736170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCA 1620

 51736171 ACAAGTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCCCAAAAGGTTAC 51736230
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1621 ACAACTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCTCAAAAGGTTAC 1680

 51736231 ATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTATAGTGACAGAGAATA 51736290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1681 ATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTGTAGTGACAGAGAATA 1740

 51736291 TATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAG 51736350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAG 1800

 51736351 GAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATG 51736410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATG 1860

 51736411 TGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAA 51736470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAA 1920

 51736471 TATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGA 51736530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGA 1980

 51736531 TTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTC 51736590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTC 2040

 51736591 CATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACA 51736650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACA 2100

 51736651 TGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAG 51736710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAG 2160

 51736711 TCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTA 51736770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTA 2220

 51736771 TATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGA 51736830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     2221 TATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAA-GGAAATAGGAGA 2279

 51736831 GTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAAT 51736890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAAT 2339

 51736891 CAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAATCATAG 51736950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAATCATAG 2399

 51736951 CTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAAGAATAC 51737010
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2400 CTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAAGAAAAC 2459

 51737011 TGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACA 51737070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACA 2519

 51737071 ATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACCAGGGAC 51737130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACCAGGGAC 2579

 51737131 AAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTG 51737190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2580 AAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACATACAAAAATCCTG 2639

 51737191 GAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACA 51737250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     2640 GAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTT-GAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACA 2698

 51737251 GTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTG 51737310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTG 2758

 51737311 ATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGC 51737370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 ATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGC 2818

 51737371 TAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAAC 51737430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 TAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAAC 2878

 51737431 CCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGA 51737490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGA 2938

 51737491 GCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGAT 51737550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGAT 2998

 51737551 GATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAAC 51737610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 GATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAAC 3058

 51737611 CAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTT 51737670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTT 3118

 51737671 TCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-CAGAAAGTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAA 51737729
          |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 TCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT--CCAGAAAGTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAA 3176

 51737730 ATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACT 51737789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 ATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACT 3236

 51737790 AGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTT 51737849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 AGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTT 3296

 51737850 GAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTAT 51737909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTAT 3356

 51737910 CCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCTTATATTCAACAGAAATG 51737969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 CCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCTTATATTCAACAGAAATG 3416

 51737970 CATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAATGCTTATAGCATTATTATTTGTAAAT 51738029
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     3417 CATGCACATGAAGACCATAAGGCATATAGAATAAT-CTTATAGCATTATTATTTGTAAAT 3475

 51738030 AACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTTACATGCTTTATGATTCC 51738089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 AACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTTACATGCTTTATGATTCC 3535

 51738090 ATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGATAGAAGGCTGAATAATG 51738149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 ATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGATAGAAGGCTGAATAATG 3595

 51738150 CTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTA 51738209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 CTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTA 3655

 51738210 GAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTT 51738269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 GAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTT 3715

 51738270 GCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACATATACATGGTTGGTTTGCTT 51738329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 GCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACATATACATGGTTGGTTTGCTT 3775

 51738330 TGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATA 51738389
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 TGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTGTGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATA 3835

 51738390 TTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAG 51738449
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3836 TTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGAACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAG 3895

 51738450 ATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGT 51738509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 ATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGT 3955

 51738510 TTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAG 51738569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 TTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAG 4015

 51738570 GCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAAT 51738629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 GCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAAT 4075

 51738630 ATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATT 51738689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 ATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATT 4135

 51738690 GCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAATGCAAATATATGGGAGACATCAG 51738749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 GCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAATGCAAATATATGGGAGACATCAG 4195

 51738750 CATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTA 51738809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4196 CATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTA 4255

 51738810 TATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTA 51738869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 TATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTA 4315

 51738870 AATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGA 51738929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 AATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGA 4375

 51738930 AGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATC 51738989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4376 AGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAACATCATC 4435

 51738990 TGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCATCCTACAGATACTTCGATAAGTAG 51739049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 TGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCATCCTACAGATACTTCGATAAGTAG 4495

 51739050 GGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTTTTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATT 51739109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     4496 GGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTTTTT-AGTGTGAAAGGGTATGTTAATT 4554

 51739110 AGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTACGCACCCAAACTAGGATATATCGT 51739169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 AGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTACGCACCCAAACTAGGATATATCGT 4614

 51739170 CATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCT 51739229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4615 CATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCT 4674

 51739230 ATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAGTACCAACACACGTACAGGTATGC 51739289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4675 ATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAGTACCAACACACGTACAGGTATGC 4734

 51739290 TTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTT 51739349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 TTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTT 4794

 51739350 AGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAA 51739409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4795 AGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAA 4854

 51739410 TGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTG 51739469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4855 TGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTG 4914

 51739470 TAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCA 51739529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4915 TAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACTA 4974

 51739530 TCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAA 51739567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4975 TCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAA 5012

EXCISED REGION

 51745607 ACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA 51745666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5014 ACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA 5073

 51745667 GGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACT 51745726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5074 GGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACT 5133

 51745727 GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAGTGTT 51745786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5134 GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAGTGTT 5193

 51745787 AATTCCTAAAGGAATGGCAGGCACAAAAGACAGAGGCTAAAATCAGAGTCCCATAACCAC 51745846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5194 AATTCCTAAAGGAATGGCAGGCACAAAAGACAGAGGCTAAAATCAGAGTCCCATAACCAC 5253

 51745847 AGAGGTCAGGAACCCTCTTTTTCTTTC-TTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGGAACAA 51745905
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     5254 AGAGGTCAGGAACCCTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGGAACAA 5313

 51745906 CTGACACCTGGCAACATAGTGGTTCCCAAATAAATCTGAAAAATACTGTGCTAAGTAAAG 51745965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5314 CTGACACCTGGCAACATAGTGGTTCCCAAATAAATCTGAAAAATACTGTGCTAAGTAAAG 5373

 51745966 ATTAATAGATTTTTTTTTGCTTGTTCACTTTAATGCTAGAATTTCTCAGAGCCTTTAGTG 51746025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5374 ATTAATAGATTTTTTTTTGCTTGTTCACTTTAATGCTAGAATTTCTCAGAGCCTTTAGTG 5433

 51746026 TATTTTTTCAATGAATTTTATTCTGTATATTTGAGATTTACAACATATTACAGGGTACAC 51746085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5434 TATTTTTTCAATGAATTTTATTCTGTATATTTGAGATTTACAACATATTACAGGGTACAC 5493

 51746086 ATAGGTTATAGTGAAGCAAATCAACATATCTATTATCTCACAGTTACTTTTCTGTGACAA 51746145
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5494 ATAGATTATAGTGAAGCAAATCAACATATCTATTATCTCACAGTTACTTTTCTGTGACAA 5553

 51746146 GAGCAGCCAAAATCCACTTATTTAACAAAATTCCCTGACACAATACAATTTTATTATCTC 51746205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5554 GAGCAGCCAAAATCCACTTATTTAACAAAATTCCCTGACACAATACAATTTTATTATCTC 5613

 51746206 TAATGCTTATGTTGTACATTACAT 51746229
          ||||||||||||||||||||||||
     5614 TAATGCTTATGTTGTACATTACAT 5637

Alignment time is 6.93335 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    9616] =>      9616 nucs 'mol-32-2ff9-186208_9616'

Score:        9506
Aligned:      9618        nucs
Identic:      9607 (100%) nucs =>      7368 (100%)      2239 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51728737,51736109] EXCISED REGION [51736805,51739047]
 second seq =>  [       1,    7374] EXCISED REGION [    7375,    9616]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51728737 CCCTATTTGCCCTCCTTGCCATTTATAAGGACAGACGGACAATTTAGAAAGCTATGCAGG 51728796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCTATTTGCCCTCCTTGCCATTTATAAGGACAGACGGACAATTTAGAAAGCTATGCAGG 60

 51728797 TGCTATAAGTACTGATTAGAGCAAGTATAAAGAGCTAGCACACAACAGAGATATCAAAAC 51728856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCTATAAGTACTGATTAGAGCAAGTATAAAGAGCTAGCACACAACAGAGATATCAAAAC 120

 51728857 CTGCGCAGCATGCTCAGGGAAGCCTAGCAGAGAAAACGACCTCTATGCTGAGTTCATGGA 51728916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGCGCAGCATGCTCAGGGAAGCCTAGCAGAGAAAACGACCTCTATGCTGAGTTCATGGA 180

 51728917 AGCTGAACATTATGAATTGAAGAGCACAAATAAGTTGAATGTGGCTAAGGGACAGAATGC 51728976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCTGAACATTATGAATTGAAGAGCACAAATAAGTTGAATGTGGCTAAGGGACAGAATGC 240

 51728977 AGGAAAGGTAGAGCAGAGTGCTGAGAGATAATGCTGGAACCCAAAGCAGACAGCAGGACA 51729036
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGAAAGGTAGAGCAGAGTGCCGAGAGATAATGCTGGAACCCAAAGCAGACAGCAGGACA 300

 51729037 CGGAAGCTCCATGACACATTAGGAATGTCAGACTTTCCTTGGAAAGCACTGAGAATTCTT 51729096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGGAAGCTCCATGACACATTAGGAATGTCAGACTTTCCTTGGAAAGCACTGAGAATTCTT 360

 51729097 TAAAAGTTTCACGCAAGGGAATGGATGGCAAGATCAGATCTGCATTTAGAAAGTTCAGAG 51729156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAAAGTTTCACGCAAGGGAATGGATGGCAAGATCAGATCTGCATTTAGAAAGTTCAGAG 420

 51729157 ATTGAAACACCGAAAAATGGCAAGCTAAGTGGCTGTTGTGGTTCTACAGGTGAAAAGTAA 51729216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTGAAACACCGAAAAATGGCAAGCTAAGTGGCTGTTGTGGTTCTACAGGTGAAAAGTAA 480

 51729217 TGGTAGCCCAGACTGGAGAAGGATTTGGGGAAGGAGAGTAGTAGAAAGACTCAAAAGGGA 51729276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGTAGCCCAGACTGGAGAAGGATTTGGGGAAGGAGAGTAGTAGAAAGACTCAAAAGGGA 540

 51729277 TTTATTAAGGAGGAAAATTGAGCTGATAGGTGATTAGTGTGGGAAATAAGGTACAAAGAT 51729336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTATTAAGGAGGAAAATTGAGCTGATAGGTGATTAGTGTGGGAAATAAGGTACAAAGAT 600

 51729337 GAGTCAAGGATGACTCCATGTTTCAGGTTTAGACCAGCATTTGCCTCAGTGGGATTCTGA 51729396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGTCAAGGATGACTCCATGTTTCAGGTTTAGACCAGCATTTGCCTCAGTGGGATTCTGA 660

 51729397 GCACCCAGAGAGAAACAGGTCTACAGAAAAAAATCATAAATCCCATTTTGGCAAGTTGAG 51729456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCACCCAGAGAGAAACAGGTCTACAGAAAAAAATCATAAATCCCATTTTGGCAAGTTGAG 720

 51729457 TTTTAGAGTAGCCACACTAAAAAGCTCAAAATAAACAAGTTAAATTAATTTTAGTAATAT 51729516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTAGAGTAGCCACACTAAAAAGCTCAAAATAAACAAGTTAAATTAATTTTAGTAATAT 780

 51729517 ATTTAGCCCAATCTATCCAAAATATTATTTCAACATGATCAATATAAACAAATTATTGAG 51729576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTAGCCCAATCTATCCAAAATATTATTTCAACATGATCAATATAAACAAATTATTGAG 840

 51729577 ATATTTTACATTCTTTTTTTCATATTAAGTCTTATCTATATGGTGGGTAATTCACTCTTA 51729636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATATTTTACATTCTTTTTTTCATATTAAGTCTTATCTATATGGTGGGTAATTCACTCTTA 900

 51729637 CGGCACATCACAATTTGGACTAGGGAGATCTAAAAAGAGCACACAAAATCCTACTGATAA 51729696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CGGCACATCACAATTTGGACTAGGGAGATCTAAAAAGAGCACACAAAATCCTACTGATAA 960

 51729697 TATTGTACTTGTTTCGTGTAATTATTTCTATACAGAAAAAAAAAATGTTTACCTAAAGTT 51729756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATTGTACTTGTTTCGTGTAATTATTTCTATACAGAAAAAAAAAATGTTTACCTAAAGTT 1020

 51729757 TGGGATAGATAAATCCAAGAACTATGTGGGACATTTTATAATTATGGGACCCTGGAGAAA 51729816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGGATAGATAAATCCAAGAACTATGTGGGACATTTTATAATTATGGGACCCTGGAGAAA 1080

 51729817 AACTGTCACTGGCATGTGTTTCTGATATGAGGTCCTGACTTACATTGGCAGAACTAACAC 51729876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACTGTCACTGGCATGTGTTTCTGATATGAGGTCCTGACTTACATTGGCAGAACTAACAC 1140

 51729877 TACCCCTGTCTCACCAGGAACACTGAGGTTCATAGGGGGAAGCTGGTAGAAACAGAAGCT 51729936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACCCCTGTCTCACCAGGAACACTGAGGTTCATAGGGGGAAGCTGGTAGAAACAGAAGCT 1200

 51729937 GGGAAAGGAACGCTATCCAGAATACCTGCGGCTTCTACAGAAAGCATGTTTTCAGAGCTG 51729996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGGAAAGGAACGCTATCCAGAATACCTGCGGCTTCTACAGAAAGCATGTTTTCAGAGCTG 1260

 51729997 ATGAGAGAGAAAACAATATAAGCAGCACTCACGCAGATCAAGCATGCTGTCATTTTAACA 51730056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGAGAGAGAAAACAATATAAGCAGCACTCACGCAGATCAAGCATGCTGTCATTTTAACA 1320

 51730057 AAACATAAACTAGACTCTGCCTTGTAGAGTGGCAGTTTTTTCTTCACCCAAATATTAAAT 51730116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAACATAAACTAGACTCTGCCTTGTAGAGTGGCAGTTTTTTCTTCACCCAAATATTAAAT 1380

 51730117 AGTGTGGCCAACTTCAAATATTTAAATACTTCTGTCATCCCAACTGCTGGCTTTGAGTCA 51730176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTGTGGCCAACTTCAAATATTTAAATACTTCTGTCATCCCAACTGCTGGCTTTGAGTCA 1440

 51730177 TAGGAACCAATAAAGTAGGAAGTGCCACAAAGGTAAGCACCGTCAGATTTAAGGCAGTGA 51730236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAGGAACCAATAAAGTAGGAAGTGCCACAAAGGTAAGCACCGTCAGATTTAAGGCAGTGA 1500

 51730237 GGGACAGGAACAGAAGGTTGCCAATGTCAAACAAATAACTTATAGTGAAAATGGACCAGA 51730296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGACAGGAACAGAAGGTTGCCAATGTCAAACAAATAACTTATAGTGAAAATGGACCAGA 1560

 51730297 GAGGGGGCCTACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAGCTTGGTTCTTAGCAGAACAGGAA 51730356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGGGGGCCTACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAGCTTGGTTCTTAGCAGAACAGGAA 1620

 51730357 GAGGATGTCTTGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCACTCCCTGCCCTCTCTGGACCTCTT 51730416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAGGATGTCTTGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCACTCCCTGCCCTCTCTGGACCTCTT 1680

 51730417 ACTGAGGGAGGGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAGCAGGGTGCTTATGCCATATTAGA 51730476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTGAGGGAGGGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAGCAGGGTGCTTATGCCATATTAGA 1740

 51730477 TCTCCATCAACATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGTGAGAGCTTTGTAAATCAACTCTT 51730536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTCCATCAACATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGTGAGAGCTTTGTAAATCAACTCTT 1800

 51730537 AGGGTGCTTGCCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTAATCCTTTCTCCATGAAATGCAGC 51730596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGGGTGCTTGCCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTAATCCTTTCTCCATGAAATGCAGC 1860

 51730597 AAAGTTTGCATCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTAGCTCTGACATGTTCCTAATGAGG 51730656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAGTTTGCATCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTAGCTCTGACATGTTCCTAATGAGG 1920

 51730657 TTATAATGCTTTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCACAAATAGCTAGGGATAGAATCAT 51730716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTATAATGCTTTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCACAAATAGCTAGGGATAGAATCAT 1980

 51730717 AGAAAGATAAAATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCTCTCAGACTTTAATACCAATCACC 51730776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGAAAGATAAAATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCTCTCAGACTTTAATACCAATCACC 2040

 51730777 TGGGCATTGTAATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTGAGAGTCTGCATTTCTAAAAAAAA 51730836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGGGCATTGTAATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTGAGAGTCTGCATTTCTAAAAAAAA 2100

 51730837 -TCCCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACAACATTTTGAGCAGCAAGACCTTAG 51730895
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATCCCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACAACATTTTGAGCAGCAAGACCTTAG 2160

 51730896 AGATCATCTAATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAGCACATCAGGGCCAAGAGATTTATA 51730955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGATCATCTAATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAGCACATCAGGGCCAAGAGATTTATA 2220

 51730956 ACTGGAAGCACGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTAGGGTCAGTTGAGTATTTGTCCATA 51731015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACTGGAAGCACGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTAGGGTCAGTTGAGTATTTGTCCATA 2280

 51731016 GACCTGTGAGTCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATCTAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGC 51731075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GACCTGTGAGTCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATCTAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGC 2340

 51731076 CTAGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTTGCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAAT 51731135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTAGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTTGCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAAT 2400

 51731136 CCAGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGACCCTTTTGAATCTACTTAGAACAC 51731195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCAGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGACCCTTTTGAATCTACTTAGAACAC 2460

 51731196 AGTATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTCCCCAAGTGGTGGGATCATGACCTG 51731255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGTATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTCCCCAAGTGGTGGGATCATGACCTG 2520

 51731256 CCAAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAATGCTCAAACAAG 51731315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2521 CCAAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAACGCTCAAACAAG 2580

 51731316 TTTCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCC 51731375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTTCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCC 2640

 51731376 TACCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAAATAAAT 51731435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TACCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAAATAAAT 2700

 51731436 ATTATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCTCATTTGATAAA 51731495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2701 ATTATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTAATTTCCTCATTTGATAAA 2760

 51731496 ATGCATGTAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAAAACATC 51731555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATGCATGTAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAAAACATC 2820

 51731556 CTTGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGT 51731615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTTGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGT 2880

 51731616 CATGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTACATATTATTATTTT 51731675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CATGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTACATATTATTATTTT 2940

 51731676 ACTCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAA 51731735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACTCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAA 3000

 51731736 TGAAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATCGCTAAGGCTTCTAAAACAGAAT 51731795
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3001 TGAAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATTGCTAAGGCTTCTAAAACAGAAT 3060

 51731796 GCCAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAACCACAAT 51731855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GCCAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAACCACAAT 3120

 51731856 GATTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGTCTGACTGAATT 51731915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GATTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGTCTGACTGAATT 3180

 51731916 ACTTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGC 51731975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACTTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGC 3240

 51731976 TAAATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCA 51732035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAAATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCA 3300

 51732036 TTACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTG 51732095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTG 3360

 51732096 CTGACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGA 51732155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTGACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGA 3420

 51732156 AATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAG 51732215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAG 3480

 51732216 CAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCTGGAGCATATTGAACACTTA 51732275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCTGGAGCATATTGAACACTTA 3540

 51732276 AAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTA 51732335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTA 3600

 51732336 ATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAA 51732395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAA 3660

 51732396 GAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGAT 51732455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGAT 3720

 51732456 ATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATTCAGCAG 51732515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATTCAGCAG 3780

 51732516 CTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAA 51732575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAA 3840

 51732576 CAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCT 51732635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCT 3900

 51732636 AAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCC 51732695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCC 3960

 51732696 TCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGA 51732755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGA 4020

 51732756 AAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGACCCATCCAA 51732815
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4021 AAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGATCCATCCAA 4080

 51732816 GTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAA 51732875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAA 4140

 51732876 CTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATT 51732935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATT 4200

 51732936 ACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGC 51732995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGC 4260

 51732996 ATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGT 51733055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGT 4320

 51733056 GTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTA 51733115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTA 4380

 51733116 TAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATT 51733175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATT 4440

 51733176 TTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGG 51733235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGG 4500

 51733236 CTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGC 51733295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGC 4560

 51733296 TGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAA 51733355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAA 4620

 51733356 TGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATT 51733415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATT 4680

 51733416 AATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTT 51733475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTT 4740

 51733476 CATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACA 51733535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACA 4800

 51733536 TTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTT 51733595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTT 4860

 51733596 CTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGT 51733655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGT 4920

 51733656 GACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAAT 51733715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAAT 4980

 51733716 TCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACACATACTA 51733775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACACATACTA 5040

 51733776 CCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAA 51733835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAA 5100

 51733836 GATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAAT 51733895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 GATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAAT 5160

 51733896 TGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGAT 51733955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGAT 5220

 51733956 ACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAA 51734015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAA 5280

 51734016 GCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCT 51734075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCT 5340

 51734076 TGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTC 51734135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTC 5400

 51734136 TATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTAT 51734195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTAT 5460

 51734196 TACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGA 51734255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGA 5520

 51734256 TCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTT 51734315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTT 5580

 51734316 AAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTAT 51734375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTAT 5640

 51734376 TCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAA 51734435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAA 5700

 51734436 TGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTAT 51734495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTAT 5760

 51734496 GAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAA 51734555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAA 5820

 51734556 AAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTAT 51734615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 AAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTAT 5880

 51734616 TCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATAT 51734675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATAT 5940

 51734676 TTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTAC 51734735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTAC 6000

 51734736 CTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTT 51734795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTT 6060

 51734796 AAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTG 51734855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 AAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTG 6120

 51734856 AAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTAT 51734915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 AAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTAT 6180

 51734916 ACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGC 51734975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 ACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGC 6240

 51734976 ATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTG 51735035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 ATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTG 6300

 51735036 CCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGC 51735095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 CCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGC 6360

 51735096 ACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGT 51735155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 ACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGT 6420

 51735156 CTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAAT 51735215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 CTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAAT 6480

 51735216 GATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCA 51735275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 GATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCA 6540

 51735276 TCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAAT 51735335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 TCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAAT 6600

 51735336 GGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCA 51735395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 GGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCA 6660

 51735396 TCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAA 51735455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 TCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAA 6720

 51735456 AAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATA 51735515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 AAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATA 6780

 51735516 AAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATAT 51735575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 AAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATAT 6840

 51735576 GACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATA 51735635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 GACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATA 6900

 51735636 GACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAA 51735695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 GACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAA 6960

 51735696 TATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGA 51735755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 TATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGA 7020

 51735756 AATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAAT 51735815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 AATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAAT 7080

 51735816 ACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAG 51735875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 ACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAG 7140

 51735876 TGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAAT 51735935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 TGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAAT 7200

 51735936 ATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAA 51735995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 ATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAA 7260

 51735996 ACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCA 51736055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 ACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCA 7320

 51736056 AATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 51736109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 AATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 7374

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7375 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 7434

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7435 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 7494

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7495 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 7554

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7555 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 7614

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7615 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 7674

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7675 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 7734

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     7735 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 7794

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7795 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 7854

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7855 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 7914

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7915 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 7974

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7975 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 8034

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8035 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 8094

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8095 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 8154

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8155 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 8214

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||
     8215 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 8272

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8273 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 8332

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8333 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 8392

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8393 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 8452

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8453 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 8512

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8513 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 8572

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8573 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 8632

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8633 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 8692

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8693 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 8752

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8753 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 8812

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8813 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 8872

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTT 51738363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
     8873 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTTCCCTGTGATTT 8932

 51738364 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 51738423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8933 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 8992

 51738424 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 51738483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8993 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 9052

 51738484 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 51738543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9053 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 9112

 51738544 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 51738603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9113 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 9172

 51738604 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 51738663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9173 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 9232

 51738664 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 51738723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9233 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 9292

 51738724 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 51738783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9293 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 9352

 51738784 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 51738843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9353 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 9412

 51738844 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 51738903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9413 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 9472

 51738904 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 51738963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9473 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 9532

 51738964 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 51739023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9533 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 9592

 51739024 CATCCTACAGATACTTCGATAAGT 51739047
          ||||||||||||||||||||||||
     9593 CATCCTACAGATACTTCGATAAGT 9616

Alignment time is 11.632 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2242] =>      2242 nucs 'mol-32-2ff9-186208_2242'

Score:        2214
Aligned:      2238        nucs
Identic:      2235 (100%) nucs =>      1545 (100%)       690 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51736805,51738351] EXCISED REGION [51738358,51739047]
 second seq =>  [       1,    1546] EXCISED REGION [    1553,    2242]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [51738352,51738357]
 second seq =>         6 nucs [1547,1552]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1547,1547] to [1553,1553]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51738351,51738351] to [51738358,51738358]
 second seq =>         1 nucs [1546,1546] to [1553,1553]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 60

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 120

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 180

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 240

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 300

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 360

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 51737224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 420

 51737225 -GAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 480

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 540

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 600

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 660

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 720

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 780

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 840

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||
      841 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT--CAGAAA 898

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 958

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 1018

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 1078

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 1138

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 1198

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 1258

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 1318

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 1378

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 1438

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 1498

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATT 51738351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATT 1546

EXCISED REGION

 51738358 TGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGT 51738417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 TGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGT 1612

 51738418 AGGACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGG 51738477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 AGGACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGG 1672

 51738478 AGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTT 51738537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 AGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTT 1732

 51738538 GTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAA 51738597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 GTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAA 1792

 51738598 TGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAA 51738657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 TGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAA 1852

 51738658 AAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGT 51738717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 AAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGT 1912

 51738718 AGAAATAAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGA 51738777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 AGAAATAAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGA 1972

 51738778 GAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACA 51738837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 GAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACA 2032

 51738838 GAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAA 51738897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 GAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAA 2092

 51738898 AATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGT 51738957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 AATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGT 2152

 51738958 CTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAA 51739017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 CTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAA 2212

 51739018 GACAGCCATCCTACAGATACTTCGATAAGT 51739047
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 GACAGCCATCCTACAGATACTTCGATAAGT 2242

Alignment time is 3.0289 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3932] =>      3932 nucs 'mol-32-3025-175022_3932'

Score:        3742
Aligned:      3939        nucs
Identic:      3917 ( 99%) nucs =>      3854 ( 99%)        63 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51735694,51739567] EXCISED REGION [51745607,51745669]
 second seq =>  [       1,    3868] EXCISED REGION [    3870,    3932]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6039 nucs [51739568,51745606]
 second seq =>         1 nucs [3869,3869]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51739567,51739567] to [51745607,51745607]
 second seq =>         1 nucs [3868,3868] to [3870,3870]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51739568,51739568] to [51745606,51745606]
 second seq =>         0 nucs

 51735694 AATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGG 51735753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGG 60

 51735754 GAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAA 51735813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAA 120

 51735814 ATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCT 51735873
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      121 ATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGAATTAAAACTCTCCTGTTTCT 180

 51735874 AGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAA 51735933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAA 240

 51735934 ATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGA 51735993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGA 300

 51735994 AAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCAC 51736053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCAC 360

 51736054 CAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTAC 51736113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTAC 420

 51736114 ATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACA 51736173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACA 480

 51736174 AGTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCCCAAAAGGTTACATA 51736233
          |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      481 ACTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCTCAAAAGGTTACATA 540

 51736234 CTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTATAGTGACAGAGAATATAT 51736293
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      541 CTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTGTAGTGACAGAGAATATAT 600

 51736294 TAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAA 51736353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAA 660

 51736354 CTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGT 51736413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGT 720

 51736414 ACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATAT 51736473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATAT 780

 51736474 ATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTT 51736533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTT 840

 51736534 TCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCAT 51736593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCAT 900

 51736594 TGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGA 51736653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGA 960

 51736654 AAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCT 51736713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCT 1020

 51736714 AGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTATAT 51736773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTATAT 1080

 51736774 CCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTA 51736833
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     1081 CCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAA-GGAAATAGGAGAGTA 1139

 51736834 GAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAG 51736893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAG 1199

 51736894 TAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTT 51736953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTT 1259

 51736954 TAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGT 51737013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1260 TAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAAGAAAACTGT 1319

 51737014 GCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATG 51737073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATG 1379

 51737074 TTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAG 51737133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAG 1439

 51737134 GACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAA 51737193
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1440 GACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACATACAAAAATCCTGGAA 1499

 51737194 TCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTC 51737253
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTT-GAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTC 1558

 51737254 TGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATT 51737313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATT 1618

 51737314 CTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAA 51737373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 CTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAA 1678

 51737374 TTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCC 51737433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCC 1738

 51737434 TGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCC 51737493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCC 1798

 51737494 ACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGAT 51737553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 ACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGAT 1858

 51737554 GGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAA 51737613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAA 1918

 51737614 CAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC 51737673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC 1978

 51737674 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAAGTTA--CCTTAGGGTATGTTCAAACAAAAT 51737731
          |||||||||||||||||||||||.||||||      ||||||||||||||||||||||||
     1979 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGAAA----TTCCTTAGGGTATGTTCAAACAAAAT 2034

 51737732 GAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAG 51737791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 GAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAG 2094

 51737792 ACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGA 51737851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 ACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGA 2154

 51737852 AACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCC 51737911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 AACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCC 2214

 51737912 ACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCA 51737971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 ACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCA 2274

 51737972 TGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAATGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAA 51738031
          |||||||||||||||.||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     2275 TGCACATGAAGACCATAAGGCATATAGAATAAT-CTTATAGCATTATTATTTGTAAATAA 2333

 51738032 CCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCAT 51738091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 CCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCAT 2393

 51738092 TTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCT 51738151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 TTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCT 2453

 51738152 TGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGA 51738211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 TGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGA 2513

 51738212 GGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGC 51738271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 GGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGC 2573

 51738272 TCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTG 51738331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 TCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTG 2633

 51738332 TAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATT 51738391
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 TAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTGTGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATT 2693

 51738392 TCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGAT 51738451
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 TCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGAACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGAT 2753

 51738452 GAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTT 51738511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 GAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTT 2813

 51738512 AACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGC 51738571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 AACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGC 2873

 51738572 CAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATAT 51738631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 CAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATAT 2933

 51738632 GCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGC 51738691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 GCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGC 2993

 51738692 AAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCA 51738751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 AAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCA 3053

 51738752 TGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATA 51738811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 TGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATA 3113

 51738812 TTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAA 51738871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 TTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAA 3173

 51738872 TTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAG 51738931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 TTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAG 3233

 51738932 AATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTG 51738991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3234 AATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAACATCATCTG 3293

 51738992 CTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGG 51739051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 CTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGG 3353

 51739052 TGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTTTTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAG 51739111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     3354 TGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTTTTT-AGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAG 3412

 51739112 ACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCA 51739171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 ACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCA 3472

 51739172 TGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTAT 51739231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 TGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTAT 3532

 51739232 TCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTT 51739291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 TCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTT 3592

 51739292 AAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAG 51739351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 AAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAG 3652

 51739352 GATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATG 51739411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 GATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATG 3712

 51739412 GACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTA 51739471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 GACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTA 3772

 51739472 ATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATC 51739531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3773 ATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACTATC 3832

 51739532 CTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAA 51739567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 CTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAA 3868

EXCISED REGION

 51745607 ACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA 51745666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3870 ACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA 3929

 51745667 GGC 51745669
          |||
     3930 GGC 3932

Alignment time is 5.28254 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5286] =>      5286 nucs 'mol-32-303b-243216_5286'

Score:        4726
Aligned:      4963        nucs
Identic:      4939 (100%) nucs =>      3745 ( 99%)      1194 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51735804,51739567] EXCISED REGION [51745607,51746804]
 second seq =>  [       1,    3758] EXCISED REGION [    3760,    4957]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6039 nucs [51739568,51745606]
 second seq =>         1 nucs [3759,3759]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51739567,51739567] to [51745607,51745607]
 second seq =>         1 nucs [3758,3758] to [3760,3760]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51739568,51739568] to [51745606,51745606]
 second seq =>         0 nucs

 51735804 ATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTC 51735863
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
        1 ATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGAATTAAAACTC 60

 51735864 TCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTT 51735923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTT 120

 51735924 ATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTT 51735983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTT 180

 51735984 GGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCAT 51736043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCAT 240

 51736044 TTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAA 51736103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAA 300

 51736104 ACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGAT 51736163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGAT 360

 51736164 ATGTGCAACAAGTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCCCAAA 51736223
          |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      361 ATGTGCAACAACTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCTCAAA 420

 51736224 AGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTATAGTGACA 51736283
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      421 AGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTGTAGTGACA 480

 51736284 GAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATG 51736343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATG 540

 51736344 GAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTAC 51736403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTAC 600

 51736404 ACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGT 51736463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGT 660

 51736464 ATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTT 51736523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTT 720

 51736524 TTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTC 51736583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTC 780

 51736584 ACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACT 51736643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACT 840

 51736644 CCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACA 51736703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACA 900

 51736704 AAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAG 51736763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAG 960

 51736764 TATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAAAGGAAA 51736823
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
      961 TATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAA-GGAAA 1019

 51736824 TAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGAT 51736883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGAT 1079

 51736884 GGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATA 51736943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATA 1139

 51736944 ATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGA 51737003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 ATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGA 1199

 51737004 AGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATC 51737063
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 AGAAAACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATC 1259

 51737064 TAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACAC 51737123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACAC 1319

 51737124 CAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACGTACAAA 51737183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1320 CAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACATACAAA 1379

 51737184 AATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTG 51737243
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     1380 AATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTT-GAGACAGAATCTCACTCTG 1438

 51737244 TTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGT 51737303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGT 1498

 51737304 TGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCAC 51737363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCAC 1558

 51737364 ATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGT 51737423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 ATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGT 1618

 51737424 CTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACA 51737483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 CTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACA 1678

 51737484 GGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCT 51737543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 GGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCT 1738

 51737544 ACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATC 51737603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 ACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATC 1798

 51737604 CTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAACTTTCACCTTC 51737663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAACTTTCACCTTC 1858

 51737664 CATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-CAGAAAGTTACCTTAGGGTATGTTC 51737722
          |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||
     1859 CATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---CCAGAAAGTTACCTTAGGGTATGTTC 1915

 51737723 AAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAAACAAGAGTTC 51737782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 AAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAAACAAGAGTTC 1975

 51737783 CAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGATTCTAAGATG 51737842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 CAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGATTCTAAGATG 2035

 51737843 GAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGATTGTTGCTTG 51737902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 GAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGATTGTTGCTTG 2095

 51737903 GCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCTTATATTCAAC 51737962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 GCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCTTATATTCAAC 2155

 51737963 AGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAATGCTTATAGCATTATTATT 51738022
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     2156 AGAAATGCATGCACATGAAGACCATAAGGCATATAGAATAAT-CTTATAGCATTATTATT 2214

 51738023 TGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTTACATGCTTTA 51738082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 TGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTTACATGCTTTA 2274

 51738083 TGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGATAGAAGGCTG 51738142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 TGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGATAGAAGGCTG 2334

 51738143 AATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGGGACAAGAAGA 51738202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 AATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGGGACAAGAAGA 2394

 51738203 GGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTTTTTAGAGACA 51738262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 GGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTTTTTAGAGACA 2454

 51738263 GGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACATATACATGGTTGG 51738322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 GGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACATATACATGGTTGG 2514

 51738323 TTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTTGTGCACATTTCTCCATAAA 51738382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2515 TTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTGTGATTTGTGCACATTTCTCCATAAA 2574

 51738383 TGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACAAATACTAGAGAAAGGTAAC 51738442
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2575 TGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGAACAAATACTAGAGAAAGGTAAC 2634

 51738443 ATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATGTCCTTGCATTACTTAT 51738502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 ATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATGTCCTTGCATTACTTAT 2694

 51738503 GTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAA 51738562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 GTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAA 2754

 51738563 ACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACTTTCAAATGAGTAAATA 51738622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 ACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACTTTCAAATGAGTAAATA 2814

 51738623 TAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAA 51738682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 TAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAA 2874

 51738683 ACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAATGCAAATATATGGGAG 51738742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 ACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAATGCAAATATATGGGAG 2934

 51738743 ACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGA 51738802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 ACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGA 2994

 51738803 GCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAA 51738862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 GCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAA 3054

 51738863 AGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAATCACCCCTAGAGAAAT 51738922
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3055 AGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAATCACCCCCAGAGAAAT 3114

 51738923 AGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAG 51738982
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3115 AGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAA 3174

 51738983 CATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCATCCTACAGATACTTCGA 51739042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 CATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCATCCTACAGATACTTCGA 3234

 51739043 TAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTTTTTTAGTGTGAAAGGGTAT 51739102
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     3235 TAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTTTTT-AGTGTGAAAGGGTAT 3293

 51739103 GTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTACGCACCCAAACTAGGAT 51739162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 GTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTACGCACCCAAACTAGGAT 3353

 51739163 ATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAA 51739222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 ATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAA 3413

 51739223 TTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAGTACCAACACACGTACA 51739282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 TTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAGTACCAACACACGTACA 3473

 51739283 GGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGT 51739342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 GGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGT 3533

 51739343 TTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTATATATGAGTGGAAAGT 51739402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 TTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTATATATGAGTGGAAAGT 3593

 51739403 CTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTC 51739462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 CTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTC 3653

 51739463 ACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATT 51739522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 ACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATT 3713

 51739523 GAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAA 51739567
          |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 GAGACTATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAA 3758

EXCISED REGION

 51745607 ACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA 51745666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3760 ACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA 3819

 51745667 GGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACT 51745726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3820 GGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACT 3879

 51745727 GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAGTGTT 51745786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3880 GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAGTGTT 3939

 51745787 AATTCCTAAAGGAATGGCAGGCACAAAAGACAGAGGCTAAAATCAGAGTCCCATAACCAC 51745846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3940 AATTCCTAAAGGAATGGCAGGCACAAAAGACAGAGGCTAAAATCAGAGTCCCATAACCAC 3999

 51745847 AGAGGTCAGGAACCCTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGGAACAAC 51745906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4000 AGAGGTCAGGAACCCTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGGAACAAC 4059

 51745907 TGACACCTGGCAACATAGTGGTTCCCAAATAAATCTGAAAAATACTGTGCTAAGTAAAGA 51745966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4060 TGACACCTGGCAACATAGTGGTTCCCAAATAAATCTGAAAAATACTGTGCTAAGTAAAGA 4119

 51745967 TTAATAGATTTTTTTTTGCTTGTTCACTTTAATGCTAGAATTTCTCAGAGCCTTTAGTGT 51746026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4120 TTAATAGATTTTTTTTTGCTTGTTCACTTTAATGCTAGAATTTCTCAGAGCCTTTAGTGT 4179

 51746027 ATTTTTTCAATGAATTTTATTCTGTATATTTGAGATTTACAACATATTACAGGGTACACA 51746086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4180 ATTTTTTCAATGAATTTTATTCTGTATATTTGAGATTTACAACATATTACAGGGTACACA 4239

 51746087 TAGGTTATAGTGAAGCAAATCAACATATCTATTATCTCACAGTTACTTTTCTGTGACAAG 51746146
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4240 TAGATTATAGTGAAGCAAATCAACATATCTATTATCTCACAGTTACTTTTCTGTGACAAG 4299

 51746147 AGCAGCCAAAATCCACTTATTTAACAAAATTCCCTGACACAATACAATTTTATTATCTCT 51746206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4300 AGCAGCCAAAATCCACTTATTTAACAAAATTCCCTGACACAATACAATTTTATTATCTCT 4359

 51746207 AATGCTTATGTTGTACATTACATCTCTGGATTTGTTGGAGATTTTGGGAAATAGAGGGTA 51746266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4360 AATGCTTATGTTGTACATTACATCTCTGGATTTGTTGGAGATTTTGGGAAATAGAGGGTA 4419

 51746267 CGGTAAACAGCACAGTATAAATATAATTATAACCAAATAATCTTCTCTTTCCAGACACTA 51746326
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4420 CGGTAAACAGCACCGTATAAATATAATTATAACCAAATAATCTTCTCTTTCCAGACACTA 4479

 51746327 TCTAAGGGCTAGCTTTTCATGAAAAACACTTCAGGGAACATTGGTATGAACACTAATAAA 51746386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4480 TCTAAGGGCTAGCTTTTCATGAAAAACACTTCAGGGAACATTGGTATGAACACTAATAAA 4539

 51746387 TGTCCTTTGCCAAAGCCATTTTCCATGTGCAATTGAAGAATATTTGACCAGGAGTGGGAG 51746446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4540 TGTCCTTTGCCAAAGCCATTTTCCATGTGCAATTGAAGAATATTTGACCAGGAGTGGGAG 4599

 51746447 GATATCAGGGTGGTCCTAGCTCCACAATACTAGGCATGAACCTTAAACTGCCATTCAAGT 51746506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4600 GATATCAGGGTGGTCCTAGCTCCACAATACTAGGCATGAACCTTAAACTGCCATTCAAGT 4659

 51746507 TTCCAAGCCTCCATTTTCCCCTAAGTTCAAGAAGTTAACCAGATCATCTCTTAGGTAATA 51746566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4660 TTCCAAGCCTCCATTTTCCCCTAAGTTCAAGAAGTTAACCAGATCATCTCTTAGGTAATA 4719

 51746567 GTTGGCTCTTTAATTATGTGGTTTTATGATTTGGATAACTAACCAGCATCTAGACATCCC 51746626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4720 GTTGGCTCTTTAATTATGTGGTTTTATGATTTGGATAACTAACCAGCATCTAGACATCCC 4779

 51746627 CTAGAACAAAACTGTTTAACATTTTCCACCAGGGGACTCTTGTCCTGCACTTACTTAAGA 51746686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4780 CTAGAACAAAACTGTTTAACATTTTCCACCAGGGGACTCTTGTCCTGCACTTACTTAAGA 4839

 51746687 GACTGAAAGGCCCTCAGCTGTACTACATTCCTAGTGAATTACACCCCAAGGGTGTGATTA 51746746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4840 GACTGAAAGGCCCTCAGCTGTACTACATTCCTAGTGAATTACACCCCAAGGGTGTGATTA 4899

 51746747 TTTTTGATTATCTCATGATAGCCACCCTTTTGTCATAATTTACATCTTAATTTTTGTC 51746804
          ||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4900 TTTTTGATTACCTCATGATAGGCACCCTTTTGTCATAATTTACATCTTAATTTTTGTC 4957

Alignment time is 6.73017 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    8484] =>      8484 nucs 'mol-32-3046-119823_8484'

Score:        8394
Aligned:      8488        nucs
Identic:      8477 (100%) nucs =>      5816 (100%)      2661 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51730291,51736109] EXCISED REGION [51736805,51739471]
 second seq =>  [       1,    5820] EXCISED REGION [    5821,    8484]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51730291 ACCAGAGAGGGGGCCTACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAGCTTGGTTCTTAGCAGAA 51730350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCAGAGAGGGGGCCTACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAGCTTGGTTCTTAGCAGAA 60

 51730351 CAGGAAGAGGATGTCTTGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCACTCCCTGCCCTCTCTGGA 51730410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGAAGAGGATGTCTTGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCACTCCCTGCCCTCTCTGGA 120

 51730411 CCTCTTACTGAGGGAGGGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAGCAGGGTGCTTATGCCAT 51730470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTCTTACTGAGGGAGGGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAGCAGGGTGCTTATGCCAT 180

 51730471 ATTAGATCTCCATCAACATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGTGAGAGCTTTGTAAATCA 51730530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTAGATCTCCATCAACATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGTGAGAGCTTTGTAAATCA 240

 51730531 ACTCTTAGGGTGCTTGCCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTAATCCTTTCTCCATGAAA 51730590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTCTTAGGGTGCTTGCCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTAATCCTTTCTCCATGAAA 300

 51730591 TGCAGCAAAGTTTGCATCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTAGCTCTGACATGTTCCTA 51730650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGCAGCAAAGTTTGCATCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTAGCTCTGACATGTTCCTA 360

 51730651 ATGAGGTTATAATGCTTTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCACAAATAGCTAGGGATAG 51730710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGAGGTTATAATGCTTTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCACAAATAGCTAGGGATAG 420

 51730711 AATCATAGAAAGATAAAATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCTCTCAGACTTTAATACCA 51730770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATCATAGAAAGATAAAATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCTCTCAGACTTTAATACCA 480

 51730771 ATCACCTGGGCATTGTAATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTGAGAGTCTGCATTTCTAA 51730830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCACCTGGGCATTGTAATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTGAGAGTCTGCATTTCTAA 540

 51730831 AAAAAA-TCCCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACAACATTTTGAGCAGCAAGA 51730889
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAAAATCCCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACAACATTTTGAGCAGCAAGA 600

 51730890 CCTTAGAGATCATCTAATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAGCACATCAGGGCCAAGAGA 51730949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTTAGAGATCATCTAATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAGCACATCAGGGCCAAGAGA 660

 51730950 TTTATAACTGGAAGCACGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTAGGGTCAGTTGAGTATTTG 51731009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTATAACTGGAAGCACGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTAGGGTCAGTTGAGTATTTG 720

 51731010 TCCATAGACCTGTGAGTCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATCTAAGGAGTAGAGTGACCA 51731069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCCATAGACCTGTGAGTCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATCTAAGGAGTAGAGTGACCA 780

 51731070 ATCAGCCTAGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTTGCCTTTTTAAAACAAGAA 51731129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCAGCCTAGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTTGCCTTTTTAAAACAAGAA 840

 51731130 AAAAATCCAGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGACCCTTTTGAATCTACTTA 51731189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAAATCCAGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGACCCTTTTGAATCTACTTA 900

 51731190 GAACACAGTATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTCCCCAAGTGGTGGGATCAT 51731249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAACACAGTATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTCCCCAAGTGGTGGGATCAT 960

 51731250 GACCTGCCAAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAATGCTCA 51731309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      961 GACCTGCCAAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAACGCTCA 1020

 51731310 AACAAGTTTCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAG 51731369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AACAAGTTTCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAG 1080

 51731370 ACAGCCTACCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAA 51731429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACAGCCTACCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAA 1140

 51731430 ATAAATATTATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCTCATTT 51731489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAAATATTATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCTCATTT 1200

 51731490 GATAAAATGCATGTAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAA 51731549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATAAAATGCATGTAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAA 1260

 51731550 AACATCCTTGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGA 51731609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AACATCCTTGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGA 1320

 51731610 AAAAGTCATGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTACATATTAT 51731669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAAGTCATGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTACATATTAT 1380

 51731670 TATTTTACTCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAG 51731729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATTTTACTCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAG 1440

 51731730 CAAAAATGAAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATCGCTAAGGCTTCTAAAA 51731789
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1441 CAAAAATGAAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATTGCTAAGGCTTCTAAAA 1500

 51731790 CAGAATGCCAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAAC 51731849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGAATGCCAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAAC 1560

 51731850 CACAATGATTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGTCTGAC 51731909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACAATGATTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGTCTGAC 1620

 51731910 TGAATTACTTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAG 51731969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAATTACTTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAG 1680

 51731970 TGTGGCTAAATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAG 51732029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGTGGCTAAATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAG 1740

 51732030 CAATCATTACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCC 51732089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAATCATTACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCC 1800

 51732090 CCGCTGCTGACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTA 51732149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCGCTGCTGACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTA 1860

 51732150 ATAGGAAATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGA 51732209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATAGGAAATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGA 1920

 51732210 GTGAAGCAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCTGGAGCATATTGAA 51732269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTGAAGCAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCTGGAGCATATTGAA 1980

 51732270 CACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAAT 51732329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAAT 2040

 51732330 TTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTC 51732389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTC 2100

 51732390 TAAGAAGAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCC 51732449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAAGAAGAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCC 2160

 51732450 AAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATT 51732509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATT 2220

 51732510 CAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCT 51732569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCT 2280

 51732570 AGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCGG 51732629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCGG 2340

 51732630 CAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAAC 51732689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAAC 2400

 51732690 ACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGA 51732749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGA 2460

 51732750 AGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGACCC 51732809
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2461 AGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGATCC 2520

 51732810 ATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTT 51732869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTT 2580

 51732870 TGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAG 51732929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAG 2640

 51732930 ATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTA 51732989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTA 2700

 51732990 AATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCT 51733049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCT 2760

 51733050 GTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAA 51733109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAA 2820

 51733110 GAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCA 51733169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCA 2880

 51733170 GTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCAT 51733229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCAT 2940

 51733230 TTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAG 51733289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAG 3000

 51733290 AGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCAC 51733349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCAC 3060

 51733350 CCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAA 51733409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAA 3120

 51733410 AACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTC 51733469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTC 3180

 51733470 AGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATT 51733529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATT 3240

 51733530 TAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATA 51733589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATA 3300

 51733590 CACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTG 51733649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTG 3360

 51733650 CCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCT 51733709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCT 3420

 51733710 TCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACAC 51733769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACAC 3480

 51733770 ATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAATAAAAT 51733829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAATAAAAT 3540

 51733830 GAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCA 51733889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCA 3600

 51733890 GTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCA 51733949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCA 3660

 51733950 TTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGATT 51734009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGATT 3720

 51734010 TCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATT 51734069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATT 3780

 51734070 CTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAAT 51734129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAAT 3840

 51734130 AACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTC 51734189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTC 3900

 51734190 CTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTG 51734249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTG 3960

 51734250 CCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAG 51734309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAG 4020

 51734310 GTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAA 51734369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAA 4080

 51734370 TACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCT 51734429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCT 4140

 51734430 CATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACT 51734489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACT 4200

 51734490 TGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCC 51734549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCC 4260

 51734550 AAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTT 51734609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTT 4320

 51734610 GATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAAGA 51734669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAAGA 4380

 51734670 GCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACT 51734729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACT 4440

 51734730 CTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGAT 51734789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGAT 4500

 51734790 GTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGA 51734849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGA 4560

 51734850 CTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTA 51734909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTA 4620

 51734910 GTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTA 51734969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTA 4680

 51734970 CTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGA 51735029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGA 4740

 51735030 TCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTG 51735089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTG 4800

 51735090 ATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCA 51735149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCA 4860

 51735150 GGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGA 51735209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGA 4920

 51735210 GATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTTAT 51735269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTTAT 4980

 51735270 TTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGT 51735329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGT 5040

 51735330 TCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAG 51735389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAG 5100

 51735390 TTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAA 51735449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAA 5160

 51735450 AGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCA 51735509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCA 5220

 51735510 TGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCAC 51735569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCAC 5280

 51735570 ACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCAAG 51735629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 ACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCAAG 5340

 51735630 AAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAA 51735689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAA 5400

 51735690 AGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCAC 51735749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCAC 5460

 51735750 TAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAAT 51735809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAAT 5520

 51735810 AAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGT 51735869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGT 5580

 51735870 TTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAG 51735929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAG 5640

 51735930 TTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAA 51735989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAA 5700

 51735990 ATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAA 51736049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 ATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAA 5760

 51736050 TCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 51736109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 5820

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 5880

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 5940

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 6000

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 6060

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 6120

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 6180

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     6181 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 6240

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 6300

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 6360

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 6420

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 6480

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 6540

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 6600

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 6660

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
     6661 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 6716

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 6776

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 6836

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 6896

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 6956

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 7016

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 7076

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 7136

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 7196

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 7256

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 7316

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTT 51738363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
     7317 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTTCCCTGTGATTT 7376

 51738364 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 51738423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 7436

 51738424 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 51738483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 7496

 51738484 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 51738543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 7556

 51738544 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 51738603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7557 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 7616

 51738604 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 51738663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7617 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 7676

 51738664 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 51738723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7677 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 7736

 51738724 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 51738783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7737 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 7796

 51738784 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 51738843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7797 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 7856

 51738844 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 51738903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7857 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 7916

 51738904 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 51738963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7917 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 7976

 51738964 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 51739023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7977 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 8036

 51739024 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 51739083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8037 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 8096

 51739084 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 51739143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8097 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 8156

 51739144 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 51739203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8157 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 8216

 51739204 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 51739263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8217 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 8276

 51739264 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 51739323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8277 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 8336

 51739324 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 51739383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8337 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 8396

 51739384 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 51739443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8397 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 8456

 51739444 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTA 51739471
          ||||||||||||||||||||||||||||
     8457 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTA 8484

Alignment time is 10.3405 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2664] =>      2664 nucs 'mol-32-3046-119823_2664'

Score:        2634
Aligned:      2662        nucs
Identic:      2657 (100%) nucs =>      1543 (100%)      1114 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51736805,51738351] EXCISED REGION [51738358,51739471]
 second seq =>  [       1,    1544] EXCISED REGION [    1551,    2664]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [51738352,51738357]
 second seq =>         6 nucs [1545,1550]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1545,1545] to [1551,1551]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51738351,51738351] to [51738358,51738358]
 second seq =>         1 nucs [1544,1544] to [1551,1551]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 60

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 120

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 180

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 240

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 300

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 360

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 51737224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 420

 51737225 -GAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 480

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 540

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 600

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 660

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 720

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 780

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 840

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||
      841 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----CAGAAA 896

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 956

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 1016

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 1076

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 1136

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 1196

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 1256

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 1316

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 1376

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 1436

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 1496

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATT 51738351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATT 1544

EXCISED REGION

 51738358 TGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGT 51738417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 TGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGT 1610

 51738418 AGGACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGG 51738477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 AGGACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGG 1670

 51738478 AGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTT 51738537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 AGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTT 1730

 51738538 GTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAA 51738597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 GTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAA 1790

 51738598 TGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAA 51738657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 TGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAA 1850

 51738658 AAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGT 51738717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 AAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGT 1910

 51738718 AGAAATAAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGA 51738777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 AGAAATAAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGA 1970

 51738778 GAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACA 51738837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 GAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACA 2030

 51738838 GAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAA 51738897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 GAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAA 2090

 51738898 AATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGT 51738957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 AATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGT 2150

 51738958 CTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAA 51739017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 CTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAA 2210

 51739018 GACAGCCATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGA 51739077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 GACAGCCATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGA 2270

 51739078 CATTTTTTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAA 51739137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 CATTTTTTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAA 2330

 51739138 ACAAACTACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGT 51739197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 ACAAACTACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGT 2390

 51739198 ATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGG 51739257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 ATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGG 2450

 51739258 CTGTGAGAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGAT 51739317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 CTGTGAGAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGAT 2510

 51739318 AAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGC 51739377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 AAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGC 2570

 51739378 CACCAATTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTT 51739437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 CACCAATTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTT 2630

 51739438 AATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTA 51739471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 AATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTA 2664

Alignment time is 3.70323 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4910] =>      4910 nucs 'mol-32-30f6-019733_4910'

Score:        4734
Aligned:      4910        nucs
Identic:      4894 (100%) nucs =>       308 (100%)      4586 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51731948,51732255] EXCISED REGION [51732257,51736857]
 second seq =>  [       1,     308] EXCISED REGION [     310,    4910]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51732256,51732256]
 second seq =>         1 nucs [309,309]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [51736811,51736811]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [306,308] to [307,309]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51731948 TAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTAAATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAA 51732007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTAAATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAA 60

 51732008 AGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCATTACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATC 51732067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCATTACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATC 120

 51732068 CTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCTGACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCA 51732127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCTGACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCA 180

 51732128 AGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAA 51732187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAA 240

 51732188 TTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAAT 51732247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAAT 300

 51732248 TGCTTCCC 51732255
          ||||||||
      301 TGCTTCCC 308

EXCISED REGION

 51732257 GGAGCATATTGAACACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGG 51732316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 GGAGCATATTGAACACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGG 369

 51732317 ACATTTTTAGAATTTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGG 51732376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 ACATTTTTAGAATTTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGG 429

 51732377 CTGTAAGTCTTTCTAAGAAGAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTA 51732436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 CTGTAAGTCTTTCTAAGAAGAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTA 489

 51732437 TGAGATCTGGTCCAAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCA 51732496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 TGAGATCTGGTCCAAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCA 549

 51732497 TACACTCATGATTCAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATA 51732556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 TACACTCATGATTCAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATA 609

 51732557 CTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGAT 51732616
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      610 CTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCAACAGCCAGAATAACAGAT 669

 51732617 GCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATAC 51732676
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      670 GCATGCCCATCAGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATGGACATAC 729

 51732677 GATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAAT 51732736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 GATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAAT 789

 51732737 TGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCC 51732796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 TGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCC 849

 51732797 CAGACAGAGACCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTA 51732856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 CAGACAGAGACCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTA 909

 51732857 AGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATT 51732916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 AGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATT 969

 51732917 GGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATG 51732976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 GGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATG 1029

 51732977 GTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAA 51733036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 GTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAA 1089

 51733037 AAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTG 51733096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 AAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTG 1149

 51733097 CTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCC 51733156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 CTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCC 1209

 51733157 ACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCAC 51733216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 ACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCAC 1269

 51733217 TATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGT 51733276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 TATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGT 1329

 51733277 AGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAA 51733336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 AGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAA 1389

 51733337 AGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGA 51733396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 AGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGA 1449

 51733397 AATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGT 51733456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 AATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGT 1509

 51733457 CTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTAC 51733516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 CTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTAC 1569

 51733517 TATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAAT 51733576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 TATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAAT 1629

 51733577 AGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTC 51733636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 AGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTC 1689

 51733637 CCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGT 51733696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 CCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGT 1749

 51733697 ATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACA 51733756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 ATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACA 1809

 51733757 TCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAA 51733816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 TCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAA 1869

 51733817 AAGAAAATAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAA 51733876
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 AAGAAAAGAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAA 1929

 51733877 TAGAGTACATGCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAA 51733936
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 TAGAGTACATGCAGTGAATTAATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAA 1989

 51733937 CTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGA 51733996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 CTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGA 2049

 51733997 CTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACT 51734056
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 CTTCTTTGTGCTTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACT 2109

 51734057 GTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAAC 51734116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 GTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAAC 2169

 51734117 CCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTG 51734176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2170 CCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTTGGCCCCTTCACTG 2229

 51734177 ACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGAC 51734236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 ACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGAC 2289

 51734237 ATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATAT 51734296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 ATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATAT 2349

 51734297 TTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAG 51734356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 TTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAG 2409

 51734357 AGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTT 51734416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 AGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTT 2469

 51734417 TTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGC 51734476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 TTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGC 2529

 51734477 GATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAAC 51734536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 GATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAAC 2589

 51734537 TCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGG-AAAAAAAAGTAA 51734595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     2590 TCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAAGTAA 2649

 51734596 AGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGA 51734655
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2650 AGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTAGTGA 2709

 51734656 TTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAA 51734715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 TTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAA 2769

 51734716 TCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTT 51734775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 TCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTT 2829

 51734776 ACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATA 51734835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 ACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATA 2889

 51734836 CATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGG 51734895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 CATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGG 2949

 51734896 CTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAAT 51734955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 CTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAAT 3009

 51734956 CAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAG 51735015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 CAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAG 3069

 51735016 CAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCAT 51735075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 CAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCAT 3129

 51735076 AATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTAC 51735135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 AATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTAC 3189

 51735136 TGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATC 51735195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 TGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATC 3249

 51735196 TTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTG 51735255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 TTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTG 3309

 51735256 AATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAA 51735315
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 AATATTGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAA 3369

 51735316 CAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTG 51735375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 CAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTG 3429

 51735376 TTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTT 51735435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 TTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTT 3489

 51735436 CCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATA 51735495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 CCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATA 3549

 51735496 CAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAA 51735555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 CAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAA 3609

 51735556 TATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAG 51735615
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3610 TATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTCAG 3669

 51735616 GTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAA 51735675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 GTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAA 3729

 51735676 AGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCA 51735735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 AGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCA 3789

 51735736 ACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTA 51735795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 ACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTA 3849

 51735796 TTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTAT 51735855
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3850 TTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGAAT 3909

 51735856 TAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGC 51735915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 TAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGC 3969

 51735916 AGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTA 51735975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 AGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTA 4029

 51735976 TTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAAC 51736035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 TTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAAC 4089

 51736036 AGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGG 51736095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 AGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGG 4149

 51736096 ATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTA 51736155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4150 ATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTA 4209

 51736156 ATATTGATATGTGCAACAAGTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCA 51736215
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 ATATTGATATGTGCAACAACTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCA 4269

 51736216 GTCCCAAAAGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTA 51736275
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4270 GTCTCAAAAGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTG 4329

 51736276 TAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTA 51736335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 TAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTA 4389

 51736336 CAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTG 51736395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 CAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTG 4449

 51736396 GTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGT 51736455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4450 GTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGT 4509

 51736456 TTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAA 51736515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4510 TTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAA 4569

 51736516 TAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCT 51736575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4570 TAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCT 4629

 51736576 AGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTG 51736635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4630 AGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTG 4689

 51736636 CAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAG 51736695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4690 CAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAG 4749

 51736696 TGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGA 51736755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4750 TGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGA 4809

 51736756 GAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAA 51736815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     4810 GAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAG-AAAA 4868

 51736816 AAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAG 51736857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4869 AAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAG 4910

Alignment time is 6.30719 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    7139] =>      7139 nucs 'mol-32-30f6-241021_7139'

Score:        7084
Aligned:      7139        nucs
Identic:      7134 (100%) nucs =>      6879 (100%)       255 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51729227,51736109] EXCISED REGION [51736805,51737059]
 second seq =>  [       1,    6884] EXCISED REGION [    6885,    7139]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51729227 GACTGGAGAAGGATTTGGGGAAGGAGAGTAGTAGAAAGACTCAAAAGGGATTTATTAAGG 51729286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACTGGAGAAGGATTTGGGGAAGGAGAGTAGTAGAAAGACTCAAAAGGGATTTATTAAGG 60

 51729287 AGGAAAATTGAGCTGATAGGTGATTAGTGTGGGAAATAAGGTACAAAGATGAGTCAAGGA 51729346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGAAAATTGAGCTGATAGGTGATTAGTGTGGGAAATAAGGTACAAAGATGAGTCAAGGA 120

 51729347 TGACTCCATGTTTCAGGTTTAGACCAGCATTTGCCTCAGTGGGATTCTGAGCACCCAGAG 51729406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGACTCCATGTTTCAGGTTTAGACCAGCATTTGCCTCAGTGGGATTCTGAGCACCCAGAG 180

 51729407 AGAAACAGGTCTACAGAAAAAAATCATAAATCCCATTTTGGCAAGTTGAGTTTTAGAGTA 51729466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAAACAGGTCTACAGAAAAAAATCATAAATCCCATTTTGGCAAGTTGAGTTTTAGAGTA 240

 51729467 GCCACACTAAAAAGCTCAAAATAAACAAGTTAAATTAATTTTAGTAATATATTTAGCCCA 51729526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCACACTAAAAAGCTCAAAATAAACAAGTTAAATTAATTTTAGTAATATATTTAGCCCA 300

 51729527 ATCTATCCAAAATATTATTTCAACATGATCAATATAAACAAATTATTGAGATATTTTACA 51729586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCTATCCAAAATATTATTTCAACATGATCAATATAAACAAATTATTGAGATATTTTACA 360

 51729587 TTCTTTTTTTCATATTAAGTCTTATCTATATGGTGGGTAATTCACTCTTACGGCACATCA 51729646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTTTTTTTCATATTAAGTCTTATCTATATGGTGGGTAATTCACTCTTACGGCACATCA 420

 51729647 CAATTTGGACTAGGGAGATCTAAAAAGAGCACACAAAATCCTACTGATAATATTGTACTT 51729706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATTTGGACTAGGGAGATCTAAAAAGAGCACACAAAATCCTACTGATAATATTGTACTT 480

 51729707 GTTTCGTGTAATTATTTCTATACAGAAAAAAAAAATGTTTACCTAAAGTTTGGGATAGAT 51729766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTTCGTGTAATTATTTCTATACAGAAAAAAAAAATGTTTACCTAAAGTTTGGGATAGAT 540

 51729767 AAATCCAAGAACTATGTGGGACATTTTATAATTATGGGACCCTGGAGAAAAACTGTCACT 51729826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATCCAAGAACTATGTGGGACATTTTATAATTATGGGACCCTGGAGAAAAACTGTCACT 600

 51729827 GGCATGTGTTTCTGATATGAGGTCCTGACTTACATTGGCAGAACTAACACTACCCCTGTC 51729886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCATGTGTTTCTGATATGAGGTCCTGACTTACATTGGCAGAACTAACACTACCCCTGTC 660

 51729887 TCACCAGGAACACTGAGGTTCATAGGGGGAAGCTGGTAGAAACAGAAGCTGGGAAAGGAA 51729946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCACCAGGAACACTGAGGTTCATAGGGGGAAGCTGGTAGAAACAGAAGCTGGGAAAGGAA 720

 51729947 CGCTATCCAGAATACCTGCGGCTTCTACAGAAAGCATGTTTTCAGAGCTGATGAGAGAGA 51730006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGCTATCCAGAATACCTGCGGCTTCTACAGAAAGCATGTTTTCAGAGCTGATGAGAGAGA 780

 51730007 AAACAATATAAGCAGCACTCACGCAGATCAAGCATGCTGTCATTTTAACAAAACATAAAC 51730066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAACAATATAAGCAGCACTCACGCAGATCAAGCATGCTGTCATTTTAACAAAACATAAAC 840

 51730067 TAGACTCTGCCTTGTAGAGTGGCAGTTTTTTCTTCACCCAAATATTAAATAGTGTGGCCA 51730126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGACTCTGCCTTGTAGAGTGGCAGTTTTTTCTTCACCCAAATATTAAATAGTGTGGCCA 900

 51730127 ACTTCAAATATTTAAATACTTCTGTCATCCCAACTGCTGGCTTTGAGTCATAGGAACCAA 51730186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTTCAAATATTTAAATACTTCTGTCATCCCAACTGCTGGCTTTGAGTCATAGGAACCAA 960

 51730187 TAAAGTAGGAAGTGCCACAAAGGTAAGCACCGTCAGATTTAAGGCAGTGAGGGACAGGAA 51730246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAAGTAGGAAGTGCCACAAAGGTAAGCACCGTCAGATTTAAGGCAGTGAGGGACAGGAA 1020

 51730247 CAGAAGGTTGCCAATGTCAAACAAATAACTTATAGTGAAAATGGACCAGAGAGGGGGCCT 51730306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGAAGGTTGCCAATGTCAAACAAATAACTTATAGTGAAAATGGACCAGAGAGGGGGCCT 1080

 51730307 ACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAGCTTGGTTCTTAGCAGAACAGGAAGAGGATGTCT 51730366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAGCTTGGTTCTTAGCAGAACAGGAAGAGGATGTCT 1140

 51730367 TGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCACTCCCTGCCCTCTCTGGACCTCTTACTGAGGGAG 51730426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCACTCCCTGCCCTCTCTGGACCTCTTACTGAGGGAG 1200

 51730427 GGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAGCAGGGTGCTTATGCCATATTAGATCTCCATCAA 51730486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAGCAGGGTGCTTATGCCATATTAGATCTCCATCAA 1260

 51730487 CATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGTGAGAGCTTTGTAAATCAACTCTTAGGGTGCTTG 51730546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGTGAGAGCTTTGTAAATCAACTCTTAGGGTGCTTG 1320

 51730547 CCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTAATCCTTTCTCCATGAAATGCAGCAAAGTTTGCA 51730606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTAATCCTTTCTCCATGAAATGCAGCAAAGTTTGCA 1380

 51730607 TCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTAGCTCTGACATGTTCCTAATGAGGTTATAATGCT 51730666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTAGCTCTGACATGTTCCTAATGAGGTTATAATGCT 1440

 51730667 TTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCACAAATAGCTAGGGATAGAATCATAGAAAGATAA 51730726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCACAAATAGCTAGGGATAGAATCATAGAAAGATAA 1500

 51730727 AATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCTCTCAGACTTTAATACCAATCACCTGGGCATTGT 51730786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCTCTCAGACTTTAATACCAATCACCTGGGCATTGT 1560

 51730787 AATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTGAGAGTCTGCATTTCTAAAAAAAA-TCCCTGGTG 51730845
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     1561 AATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTGAGAGTCTGCATTTCTAAAAAAAAATCCCTGGTG 1620

 51730846 CTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACAACATTTTGAGCAGCAAGACCTTAGAGATCATCTA 51730905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACAACATTTTGAGCAGCAAGACCTTAGAGATCATCTA 1680

 51730906 ATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAGCACATCAGGGCCAAGAGATTTATAACTGGAAGCA 51730965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAGCACATCAGGGCCAAGAGATTTATAACTGGAAGCA 1740

 51730966 CGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTAGGGTCAGTTGAGTATTTGTCCATAGACCTGTGAG 51731025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTAGGGTCAGTTGAGTATTTGTCCATAGACCTGTGAG 1800

 51731026 TCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATCTAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGCCTAGATGACT 51731085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATCTAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGCCTAGATGACT 1860

 51731086 GAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTTGCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAATCCAGGAAAAC 51731145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTTGCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAATCCAGGAAAAC 1920

 51731146 CAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGACCCTTTTGAATCTACTTAGAACACAGTATCAGTA 51731205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGACCCTTTTGAATCTACTTAGAACACAGTATCAGTA 1980

 51731206 TTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTCCCCAAGTGGTGGGATCATGACCTGCCAAGGCAAG 51731265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTCCCCAAGTGGTGGGATCATGACCTGCCAAGGCAAG 2040

 51731266 TACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAATGCTCAAACAAGTTTCAGGCAC 51731325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2041 TACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAACGCTCAAACAAGTTTCAGGCAC 2100

 51731326 TACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCCTACCAGTAGA 51731385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCCTACCAGTAGA 2160

 51731386 TCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAAATAAATATTATAGAAG 51731445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAAATAAATATTATAGAAG 2220

 51731446 CATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCTCATTTGATAAAATGCATGTAA 51731505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCTCATTTGATAAAATGCATGTAA 2280

 51731506 GAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAAAACATCCTTGGTAAAA 51731565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAAAACATCCTTGGTAAAA 2340

 51731566 ACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGTCATGCTCTGC 51731625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGTCATGCTCTGC 2400

 51731626 ACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTACATATTATTATTTTACTCACTGGA 51731685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTACATATTATTATTTTACTCACTGGA 2460

 51731686 ATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAATGAAAAATTT 51731745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAATGAAAAATTT 2520

 51731746 CCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATCGCTAAGGCTTCTAAAACAGAATGCCAAAGCAC 51731805
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATTGCTAAGGCTTCTAAAACAGAATGCCAAAGCAC 2580

 51731806 TGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAACCACAATGATTCTCACT 51731865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAACCACAATGATTCTCACT 2640

 51731866 CCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGTCTGACTGAATTACTTGACTTA 51731925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGTCTGACTGAATTACTTGACTTA 2700

 51731926 ATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTAAATATATA 51731985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTAAATATATA 2760

 51731986 CAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCATTACCTGGAA 51732045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCATTACCTGGAA 2820

 51732046 ATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCTGACTTAAT 51732105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCTGACTTAAT 2880

 51732106 GGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAATGTATTGT 51732165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAATGTATTGT 2940

 51732166 AGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCAACCTTGCA 51732225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCAACCTTGCA 3000

 51732226 AGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCTGGAGCATATTGAACACTTAAAAAGAGCTT 51732285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCTGGAGCATATTGAACACTTAAAAAGAGCTT 3060

 51732286 GGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTAATAATACTTT 51732345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTAATAATACTTT 3120

 51732346 TAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGAAGTTATTA 51732405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGAAGTTATTA 3180

 51732406 GCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATATTGCTAGTT 51732465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATATTGCTAGTT 3240

 51732466 AGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATTCAGCAGCTGTCAAAAT 51732525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATTCAGCAGCTGTCAAAAT 3300

 51732526 TATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCT 51732585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCT 3360

 51732586 TCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAGTATA 51732645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAGTATA 3420

 51732646 GTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCA 51732705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCA 3480

 51732706 CTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCC 51732765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCC 3540

 51732766 ATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGACCCATCCAAGTCTTCCAAA 51732825
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3541 ATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGATCCATCCAAGTCTTCCAAA 3600

 51732826 ATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGG 51732885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGG 3660

 51732886 CTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGC 51732945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGC 3720

 51732946 ACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCT 51733005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCT 3780

 51733006 AGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTACAGT 51733065
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3781 AGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGCTTTACAGT 3840

 51733066 GAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGC 51733125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGC 3900

 51733126 ATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCAT 51733185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCAT 3960

 51733186 GGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAAT 51733245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAAT 4020

 51733246 TGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATAT 51733305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATAT 4080

 51733306 CCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGT 51733365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGT 4140

 51733366 GCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAA 51733425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAA 4200

 51733426 TTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTG 51733485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTG 4260

 51733486 TGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCA 51733545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCA 4320

 51733546 AAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTA 51733605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTA 4380

 51733606 GCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGG 51733665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGG 4440

 51733666 TACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCC 51733725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCC 4500

 51733726 ATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACACATACTACCATACCATA 51733785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACACATACTACCATACCATA 4560

 51733786 ATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAAGATACAAATA 51733845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAAGATACAAATA 4620

 51733846 GAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTGATTCATAC 51733905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTGATTCATAC 4680

 51733906 ATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACC 51733965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACC 4740

 51733966 ACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAACTTA 51734025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAACTTA 4800

 51734026 CTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACC 51734085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACC 4860

 51734086 TTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCT 51734145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCT 4920

 51734146 TGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTC 51734205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTC 4980

 51734206 ATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTC 51734265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 ATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTC 5040

 51734266 CTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCC 51734325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCC 5100

 51734326 TGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAA 51734385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAA 5160

 51734386 GGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAA 51734445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAA 5220

 51734446 TAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTT 51734505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTT 5280

 51734506 TATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTT 51734565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTT 5340

 51734566 TCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATT 51734625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATT 5400

 51734626 AAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAAT 51734685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAAT 5460

 51734686 TACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACC 51734745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACC 5520

 51734746 TTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAG 51734805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAG 5580

 51734806 CAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAA 51734865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 CAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAA 5640

 51734866 GTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATC 51734925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATC 5700

 51734926 TACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCT 51734985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCT 5760

 51734986 GTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAA 51735045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAA 5820

 51735046 GGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAG 51735105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 GGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAG 5880

 51735106 GAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAG 51735165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 GAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAG 5940

 51735166 ATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAA 51735225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 ATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAA 6000

 51735226 GTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGT 51735285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 GTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGT 6060

 51735286 CTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAG 51735345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAG 6120

 51735346 TTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGA 51735405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGA 6180

 51735406 GTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAA 51735465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 GTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAA 6240

 51735466 GCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGA 51735525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 GCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGA 6300

 51735526 TAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGAC 51735585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGAC 6360

 51735586 CTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAA 51735645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 CTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAA 6420

 51735646 TTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATA 51735705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 TTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATA 6480

 51735706 GCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATT 51735765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 GCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATT 6540

 51735766 AAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAA 51735825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 AAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAA 6600

 51735826 TAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAA 51735885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAA 6660

 51735886 AATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTAT 51735945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 AATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTAT 6720

 51735946 CATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTT 51736005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 CATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTT 6780

 51736006 ATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAA 51736065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 ATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAA 6840

 51736066 CAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 51736109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 CAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 6884

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6885 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 6944

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6945 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 7004

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7005 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 7064

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7065 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 7124

 51737045 AAAAGTCCCACTCAG 51737059
          |||||||||||||||
     7125 AAAAGTCCCACTCAG 7139

Alignment time is 8.66446 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3136] =>      3136 nucs 'mol-32-3101-131318_3136'

Score:        3092
Aligned:      3138        nucs
Identic:      3133 (100%) nucs =>       281 (100%)      2852 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51735829,51736109] EXCISED REGION [51736805,51739660]
 second seq =>  [       1,     281] EXCISED REGION [     282,    3136]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51735829 TAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAAT 51735888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAAT 60

 51735889 GAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCAT 51735948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCAT 120

 51735949 ATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATA 51736008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATA 180

 51736009 TAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAA 51736068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAA 240

 51736069 GTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 51736109
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 281

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      282 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 341

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      342 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 401

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      402 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 461

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      462 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 521

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      522 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 581

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      582 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 641

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
      642 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 701

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      702 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 761

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      762 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 821

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 881

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 941

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 1001

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 1061

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 1121

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||
     1122 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 1179

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 1239

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 1299

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 1359

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 1419

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 1479

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 1539

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 1599

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 1659

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 1719

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 1779

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTT 51738363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
     1780 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTTCCCTGTGATTT 1839

 51738364 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 51738423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 1899

 51738424 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 51738483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 1959

 51738484 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 51738543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 2019

 51738544 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 51738603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 2079

 51738604 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 51738663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 2139

 51738664 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 51738723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 2199

 51738724 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 51738783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 2259

 51738784 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 51738843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 2319

 51738844 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 51738903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 2379

 51738904 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 51738963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 2439

 51738964 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 51739023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 2499

 51739024 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 51739083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 2559

 51739084 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 51739143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 2619

 51739144 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 51739203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 2679

 51739204 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 51739263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 2739

 51739264 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 51739323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 2799

 51739324 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 51739383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 2859

 51739384 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 51739443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 2919

 51739444 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 51739503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 2979

 51739504 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 51739563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 3039

 51739564 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 51739623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 3099

 51739624 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCT 51739660
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCT 3136

Alignment time is 4.3386 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    7473] =>      7473 nucs 'mol-32-3101-134355_7473'

Score:        7179
Aligned:      7476        nucs
Identic:      7449 (100%) nucs =>      7396 (100%)        53 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51732146,51739567] EXCISED REGION [51745607,51745659]
 second seq =>  [       1,    7419] EXCISED REGION [    7421,    7473]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6039 nucs [51739568,51745606]
 second seq =>         1 nucs [7420,7420]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51739567,51739567] to [51745607,51745607]
 second seq =>         1 nucs [7419,7419] to [7421,7421]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51739568,51739568] to [51745606,51745606]
 second seq =>         0 nucs

 51732146 ATTAATAGGAAATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAAC 51732205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTAATAGGAAATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAAC 60

 51732206 TGGAGTGAAGCAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCTGGAGCATAT 51732265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
       61 TGGAGTGAAGCAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCCGGAGCATAT 120

 51732266 TGAACACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTA 51732325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAACACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTA 180

 51732326 GAATTTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTC 51732385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATTTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTC 240

 51732386 TTTCTAAGAAGAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTG 51732445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCTAAGAAGAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTG 300

 51732446 GTCCAAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCAT 51732505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCCAAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCAT 360

 51732506 GATTCAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATA 51732565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATTCAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATA 420

 51732566 ATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCA 51732625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCAACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCA 480

 51732626 TCGGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAA 51732685
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAA 540

 51732686 GAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAAC 51732745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAAC 600

 51732746 AAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAG 51732805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAG 660

 51732806 ACCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAG 51732865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAG 720

 51732866 AGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAG 51732925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAG 780

 51732926 AAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGA 51732985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGA 840

 51732986 TTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTT 51733045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTT 900

 51733046 TTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATA 51733105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATA 960

 51733106 CTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAG 51733165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAG 1020

 51733166 GGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAA 51733225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAA 1080

 51733226 TCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAA 51733285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAA 1140

 51733286 CCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATC 51733345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATC 1200

 51733346 TCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGC 51733405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGC 1260

 51733406 AGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATC 51733465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATC 1320

 51733466 TTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTT 51733525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTT 1380

 51733526 TATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGT 51733585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGT 1440

 51733586 AATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACC 51733645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACC 1500

 51733646 ACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTG 51733705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTG 1560

 51733706 ATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGT 51733765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGT 1620

 51733766 ACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAATA 51733825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1621 ACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAAGA 1680

 51733826 AAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACA 51733885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACA 1740

 51733886 TGCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTAT 51733945
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCAGTGAATTAATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTAT 1800

 51733946 TTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGT 51734005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGT 1860

 51734006 GATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGA 51734065
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGA 1920

 51734066 AATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAA 51734125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAA 1980

 51734126 GAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTG 51734185
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1981 GAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTTGGCCCCTTCACTGACTTTGTTG 2040

 51734186 AGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTT 51734245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTT 2100

 51734246 AGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCC 51734305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCC 2160

 51734306 CTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAG 51734365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAG 2220

 51734366 CCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACT 51734425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACT 2280

 51734426 GTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAG 51734485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAG 2340

 51734486 CACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCC 51734545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCC 2400

 51734546 ACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAA-GTAAAGTGGAGAC 51734604
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     2401 ACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAAGTAAAGTGGAGAC 2460

 51734605 TTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCA 51734664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2461 TTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTAGTGATTCAAACCA 2520

 51734665 CAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGA 51734724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGA 2580

 51734725 TTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCT 51734784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCT 2640

 51734785 GAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCC 51734844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCC 2700

 51734845 CTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCA 51734904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCA 2760

 51734905 TGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACT 51734964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACT 2820

 51734965 GCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATA 51735024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATA 2880

 51735025 CATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGA 51735084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGA 2940

 51735085 ATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAAC 51735144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAAC 3000

 51735145 CTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTG 51735204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTG 3060

 51735205 AAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGC 51735264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3061 AAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATTGGC 3120

 51735265 CTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAA 51735324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAA 3180

 51735325 CAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACC 51735384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACC 3240

 51735385 ATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGAT 51735444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGAT 3300

 51735445 TTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATA 51735504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATA 3360

 51735505 ATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCA 51735564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCA 3420

 51735565 ATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACA 51735624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3421 ATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTCAGGTTTCAACA 3480

 51735625 GCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCC 51735684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCC 3540

 51735685 AGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTA 51735744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTA 3600

 51735745 TTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAA 51735804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAA 3660

 51735805 TAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCT 51735864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3661 TAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGAATTAAAACTCT 3720

 51735865 CCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTA 51735924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTA 3780

 51735925 TAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTG 51735984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTG 3840

 51735985 GAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATT 51736044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATT 3900

 51736045 TATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAA 51736104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAA 3960

 51736105 CTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATA 51736164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATA 4020

 51736165 TGTGCAACAAGTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCCCAAAA 51736224
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4021 TGTGCAACAACTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCTCAAAA 4080

 51736225 GGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTATAGTGACAG 51736284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4081 GGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTGTAGTGACAG 4140

 51736285 AGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGG 51736344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGG 4200

 51736345 AGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACA 51736404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACA 4260

 51736405 CAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTA 51736464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTA 4320

 51736465 TATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTT 51736524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTT 4380

 51736525 TCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCA 51736584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCA 4440

 51736585 CTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTC 51736644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTC 4500

 51736645 CCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAA 51736704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAA 4560

 51736705 AGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGT 51736764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 AGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGT 4620

 51736765 ATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAAAGGAAAT 51736824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     4621 ATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAA-GGAAAT 4679

 51736825 AGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATG 51736884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 AGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATG 4739

 51736885 GAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAA 51736944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 GAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAA 4799

 51736945 TCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAA 51737004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 TCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAA 4859

 51737005 GAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCT 51737064
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 GAAAACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCT 4919

 51737065 AGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACC 51737124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 AGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACC 4979

 51737125 AGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACGTACAAAA 51737184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4980 AGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACATACAAAA 5039

 51737185 ATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTGT 51737244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     5040 ATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTT-GAGACAGAATCTCACTCTGT 5098

 51737245 TGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTT 51737304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 TGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTT 5158

 51737305 GAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACA 51737364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 GAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACA 5218

 51737365 TCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGTC 51737424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 TCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGTC 5278

 51737425 TCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAG 51737484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 TCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAG 5338

 51737485 GTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCTA 51737544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 GTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCTA 5398

 51737545 CAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATCC 51737604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 CAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATCC 5458

 51737605 TGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAACTTTCACCTTCC 51737664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 TGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAACTTTCACCTTCC 5518

 51737665 ATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAAGTTACCTTAGGGTATGTTCAA 51737724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     5519 ATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGAAAGTTACCTTAGGGTATGTTCAA 5578

 51737725 ACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAAACAAGAGTTCCA 51737784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 ACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAAACAAGAGTTCCA 5638

 51737785 ATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGATTCTAAGATGGA 51737844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 ATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGATTCTAAGATGGA 5698

 51737845 GCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGATTGTTGCTTGGC 51737904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 GCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGATTGTTGCTTGGC 5758

 51737905 ATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCTTATATTCAACAG 51737964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 ATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCTTATATTCAACAG 5818

 51737965 AAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAATGCTTATAGCATTATTATTTG 51738024
          ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     5819 AAATGCATGCACATGAAGACCATAAGGCATATAGAATAAT-CTTATAGCATTATTATTTG 5877

 51738025 TAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTTACATGCTTTATG 51738084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 TAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTTACATGCTTTATG 5937

 51738085 ATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGATAGAAGGCTGAA 51738144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 ATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGATAGAAGGCTGAA 5997

 51738145 TAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGGGACAAGAAGAGG 51738204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 TAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGGGACAAGAAGAGG 6057

 51738205 CTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTTTTTAGAGACAGG 51738264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 CTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTTTTTAGAGACAGG 6117

 51738265 ATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACATATACATGGTTGGTT 51738324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 ATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACATATACATGGTTGGTT 6177

 51738325 TGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATG 51738384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6178 TGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTGTGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATG 6237

 51738385 TTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACAAATACTAGAGAAAGGTAACAT 51738444
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6238 TTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGAACAAATACTAGAGAAAGGTAACAT 6297

 51738445 AGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGT 51738504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 AGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGT 6357

 51738505 AAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAAC 51738564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 AAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAAC 6417

 51738565 TTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATA 51738624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 TTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATA 6477

 51738625 AAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAAC 51738684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6478 AAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAAC 6537

 51738685 GGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAATGCAAATATATGGGAGAC 51738744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6538 GGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAATGCAAATATATGGGAGAC 6597

 51738745 ATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGC 51738804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6598 ATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGC 6657

 51738805 TAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAG 51738864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6658 TAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAG 6717

 51738865 GTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAG 51738924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6718 GTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAG 6777

 51738925 GAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAGCA 51738984
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     6778 GAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAACA 6837

 51738985 TCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCATCCTACAGATACTTCGATA 51739044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6838 TCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCATCCTACAGATACTTCGATA 6897

 51739045 AGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTTTTTTAGTGTGAAAGGGTATGT 51739104
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     6898 AGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTTTTT-AGTGTGAAAGGGTATGT 6956

 51739105 TAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTACGCACCCAAACTAGGATAT 51739164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 TAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTACGCACCCAAACTAGGATAT 7016

 51739165 ATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAATT 51739224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 ATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAATT 7076

 51739225 ATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAGTACCAACACACGTACAGG 51739284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 ATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAGTACCAACACACGTACAGG 7136

 51739285 TATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGTTT 51739344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 TATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGTTT 7196

 51739345 ATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTATATATGAGTGGAAAGTCT 51739404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 ATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTATATATGAGTGGAAAGTCT 7256

 51739405 AACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCAC 51739464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 AACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCAC 7316

 51739465 GCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGA 51739524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7317 GCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGA 7376

 51739525 GACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAA 51739567
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 GACTATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAA 7419

EXCISED REGION

 51745607 ACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGG 51745659
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7421 ACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGG 7473

Alignment time is 9.28821 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    6841] =>      6841 nucs 'mol-32-321f-193227_6841'

Score:        6752
Aligned:      6844        nucs
Identic:      6834 (100%) nucs =>      3978 (100%)      2856 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51732129,51736109] EXCISED REGION [51736805,51739666]
 second seq =>  [       1,    3981] EXCISED REGION [    3982,    6841]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51732129 GGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAAT 51732188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAATGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAAT 60

 51732189 TAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATT 51732248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCAACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATT 120

 51732249 GCTTCCCTGGAGCATATTGAACACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAAT 51732308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTTCCCTGGAGCATATTGAACACTTAAAAAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAAT 180

 51732309 GAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTC 51732368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTAATAATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTC 240

 51732369 TCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGAAGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTC 51732428
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      241 TCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGAAGTTATTAACCCAAAATGTCAATGAGAGGTC 300

 51732429 ACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAA 51732488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATATTGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAA 360

 51732489 AACTACCATACACTCATGATTCAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGA 51732548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTACCATACACTCATGATTCAGCAGCTGTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGA 420

 51732549 GCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAA 51732608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAA 480

 51732609 TAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAAT 51732668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAAT 540

 51732669 AGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAA 51732728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAA 600

 51732729 GCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCT 51732788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCT 660

 51732789 GTTTTTCCCAGACAGAGACCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAA 51732848
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTTTTTCCCAGACAGAGATCCATCCAAGTCTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAA 720

 51732849 TGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACC 51732908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACC 780

 51732909 TATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTG 51732968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTACACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTG 840

 51732969 GAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCAT 51733028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCATATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCAT 900

 51733029 GCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCT 51733088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCT 960

 51733089 CTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTC 51733148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATAACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTC 1020

 51733149 TATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGA 51733208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGA 1080

 51733209 CATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGG 51733268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGG 1140

 51733269 CAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCC 51733328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCC 1200

 51733329 CACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTC 51733388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATGCCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTC 1260

 51733389 TAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTAT 51733448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAATTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTAT 1320

 51733449 GGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATA 51733508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATA 1380

 51733509 CCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTT 51733568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATTTACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTT 1440

 51733569 GGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGC 51733628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCTAAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGC 1500

 51733629 AGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAA 51733688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGACTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAA 1560

 51733689 AGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTA 51733748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTA 1620

 51733749 AGTACACATCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAAT 51733808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGTACACATCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAAT 1680

 51733809 ATAAAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTG 51733868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAAAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTG 1740

 51733869 CAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACC 51733928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACC 1800

 51733929 TCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTC 51733988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTC 1860

 51733989 ATACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTG 51734048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTG 1920

 51734049 TGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCT 51734108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCT 1980

 51734109 TCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCC 51734168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCC 2040

 51734169 CTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAG 51734228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAG 2100

 51734229 GCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTT 51734288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTT 2160

 51734289 TTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAA 51734348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAA 2220

 51734349 ATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAG 51734408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAG 2280

 51734409 TGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGA 51734468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGA 2340

 51734469 GGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAA 51734528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAA 2400

 51734529 TCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAA 51734588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAA 2460

 51734589 AAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAA 51734648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAA 2520

 51734649 TTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGAT 51734708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGAT 2580

 51734709 GATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTT 51734768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTT 2640

 51734769 ATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTT 51734828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTT 2700

 51734829 GTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCA 51734888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCA 2760

 51734889 GGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTC 51734948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTC 2820

 51734949 ATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAA 51735008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAA 2880

 51735009 CTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATA 51735068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATA 2940

 51735069 GGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAA 51735128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAA 3000

 51735129 GCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGA 51735188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGA 3060

 51735189 TGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATAC 51735248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATAC 3120

 51735249 TGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCC 51735308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCC 3180

 51735309 TTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAA 51735368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAA 3240

 51735369 GGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACA 51735428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACA 3300

 51735429 CAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACA 51735488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACA 3360

 51735489 TGAAATACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAA 51735548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGAAATACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAA 3420

 51735549 GAGAAAATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAA 51735608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GAGAAAATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAA 3480

 51735609 CTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAAC 51735668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAAC 3540

 51735669 CTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAA 51735728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAA 3600

 51735729 ATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTAT 51735788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTAT 3660

 51735789 GCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAG 51735848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAG 3720

 51735849 AAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAA 51735908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAA 3780

 51735909 CTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTC 51735968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTC 3840

 51735969 CTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGT 51736028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGT 3900

 51736029 TCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAA 51736088
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TCACAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAA 3960

 51736089 TGAATGGATTAACAAACTGCA 51736109
          |||||||||||||||||||||
     3961 TGAATGGATTAACAAACTGCA 3981

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 4041

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 4101

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 4161

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 4221

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 4281

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 4341

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     4342 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 4401

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 4461

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 4521

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 4581

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 4641

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 4701

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 4761

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 4821

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
     4822 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC---TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 4878

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 4938

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 4998

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAGCCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 5058

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 5118

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 5178

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5179 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 5238

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 5298

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5299 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 5358

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5359 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 5418

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5419 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 5478

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTT 51738363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
     5479 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTTCCCTGTGATTT 5538

 51738364 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 51738423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5539 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 5598

 51738424 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 51738483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5599 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 5658

 51738484 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 51738543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5659 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 5718

 51738544 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 51738603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5719 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 5778

 51738604 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 51738663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5779 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 5838

 51738664 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 51738723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5839 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 5898

 51738724 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 51738783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5899 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 5958

 51738784 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 51738843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5959 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 6018

 51738844 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 51738903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6019 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 6078

 51738904 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 51738963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6079 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 6138

 51738964 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 51739023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6139 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 6198

 51739024 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 51739083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6199 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 6258

 51739084 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 51739143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6259 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 6318

 51739144 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 51739203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6319 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 6378

 51739204 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 51739263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6379 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 6438

 51739264 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 51739323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6439 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 6498

 51739324 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 51739383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6499 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 6558

 51739384 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 51739443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6559 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 6618

 51739444 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 51739503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6619 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 6678

 51739504 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 51739563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6679 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 6738

 51739564 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 51739623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6739 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 6798

 51739624 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCACTAG 51739666
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6799 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCACTAG 6841

Alignment time is 8.76868 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2860] =>      2860 nucs 'mol-32-321f-193227_2860'

Score:        2820
Aligned:      2857        nucs
Identic:      2852 (100%) nucs =>      1543 (100%)      1309 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51736805,51738351] EXCISED REGION [51738358,51739666]
 second seq =>  [       1,    1545] EXCISED REGION [    1552,    2860]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [51738352,51738357]
 second seq =>         6 nucs [1546,1551]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1546,1546] to [1552,1552]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51738351,51738351] to [51738358,51738358]
 second seq =>         1 nucs [1545,1545] to [1552,1552]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 60

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 120

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 180

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 240

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 300

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 360

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 51737224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 420

 51737225 -GAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 480

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 540

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 600

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 660

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 720

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 780

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 840

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||
      841 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---CAGAAA 897

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 957

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 1017

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAGCCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 1077

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 1137

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 1197

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 1257

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 1317

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 1377

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 1437

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 1497

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATT 51738351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATT 1545

EXCISED REGION

 51738358 TGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGT 51738417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 TGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGT 1611

 51738418 AGGACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGG 51738477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 AGGACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGG 1671

 51738478 AGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTT 51738537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 AGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTT 1731

 51738538 GTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAA 51738597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 GTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAA 1791

 51738598 TGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAA 51738657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 TGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAA 1851

 51738658 AAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGT 51738717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 AAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGT 1911

 51738718 AGAAATAAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGA 51738777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 AGAAATAAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGA 1971

 51738778 GAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACA 51738837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 GAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACA 2031

 51738838 GAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAA 51738897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 GAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAA 2091

 51738898 AATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGT 51738957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 AATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGT 2151

 51738958 CTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAA 51739017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 CTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAA 2211

 51739018 GACAGCCATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGA 51739077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 GACAGCCATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGA 2271

 51739078 CATTTTTTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAA 51739137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 CATTTTTTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAA 2331

 51739138 ACAAACTACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGT 51739197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 ACAAACTACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGT 2391

 51739198 ATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGG 51739257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 ATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGG 2451

 51739258 CTGTGAGAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGAT 51739317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 CTGTGAGAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGAT 2511

 51739318 AAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGC 51739377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 AAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGC 2571

 51739378 CACCAATTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTT 51739437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 CACCAATTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTT 2631

 51739438 AATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGC 51739497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 AATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGC 2691

 51739498 GGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCT 51739557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 GGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCT 2751

 51739558 GTACTAAAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAG 51739617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 GTACTAAAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAG 2811

 51739618 ACGGGTGATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCACTAG 51739666
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 ACGGGTGATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCACTAG 2860

Alignment time is 3.36508 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,   10433] =>     10433 nucs 'mol-32-321f-222271_10433'

Score:        6757
Aligned:      7076        nucs
Identic:      7047 (100%) nucs =>      5854 (100%)      1193 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51733691,51739567] EXCISED REGION [51745607,51746804]
 second seq =>  [       1,    5874] EXCISED REGION [    5876,    7072]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6039 nucs [51739568,51745606]
 second seq =>         1 nucs [5875,5875]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51739567,51739567] to [51745607,51745607]
 second seq =>         1 nucs [5874,5874] to [5876,5876]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51739568,51739568] to [51745606,51745606]
 second seq =>         0 nucs

 51733691 GAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAG 51733750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTCACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAG 60

 51733751 TACACATCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATAT 51733810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACACATCTCCCAGTACACATACTACCATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATAT 120

 51733811 AAAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCA 51733870
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAAAAAGAAAAGAAAATGAAAAAGATACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCA 180

 51733871 GCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTGATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTC 51733930
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTAATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTC 240

 51733931 TTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCAT 51733990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATACCACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCAT 300

 51733991 ACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTG 51734050
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTGGACTTCTTTGTGCTTTCCCAAGCACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTG 360

 51734051 TATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTC 51734110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTC 420

 51734111 CTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCT 51734170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      421 CTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTTGGCCCCT 480

 51734171 TCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGC 51734230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGC 540

 51734231 TTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTT 51734290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTT 600

 51734291 TTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAAT 51734350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAAT 660

 51734351 GAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTG 51734410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTG 720

 51734411 TGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGG 51734470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGG 780

 51734471 AATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATC 51734530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATC 840

 51734531 CTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAA 51734590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAA 900

 51734591 A-GTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAAT 51734649
          | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAAT 960

 51734650 TGGTGATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATG 51734709
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGTGATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATG 1020

 51734710 ATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTA 51734769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTA 1080

 51734770 TTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTG 51734829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTG 1140

 51734830 TGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAG 51734889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAG 1200

 51734890 GAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCA 51734949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCA 1260

 51734950 TTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAAC 51735009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAAC 1320

 51735010 TCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAG 51735069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAG 1380

 51735070 GACCATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAG 51735129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GACCATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAG 1440

 51735130 CTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGAT 51735189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGAT 1500

 51735190 GCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACT 51735249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACT 1560

 51735250 GACTTGAATATGGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCT 51735309
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GACTTGAATATTGGCCTTATTTATCATCTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCT 1620

 51735310 TGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAG 51735369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAG 1680

 51735370 GTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACAC 51735429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACAC 1740

 51735430 AGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACAT 51735489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACAT 1800

 51735490 GAAATACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAG 51735549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAAATACAATTCATAATGCATGAATAAAAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAG 1860

 51735550 AGAAAATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAAC 51735609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAAAATATTTGCCAATCACACATATGACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAAC 1920

 51735610 TCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACC 51735669
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTCAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACC 1980

 51735670 TTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAA 51735729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAA 2040

 51735730 TGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATG 51735789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATG 2100

 51735790 CACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGA 51735849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGA 2160

 51735850 AAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAAC 51735909
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGAATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAAC 2220

 51735910 TTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCC 51735969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCC 2280

 51735970 TAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTT 51736029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTT 2340

 51736030 CATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAAT 51736089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAAT 2400

 51736090 GAATGGATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGG 51736149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAATGGATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGG 2460

 51736150 AATGTAATATTGATATGTGCAACAAGTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGG 51736209
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATGTAATATTGATATGTGCAACAACTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGG 2520

 51736210 AAGCCAGTCCCAAAAGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCA 51736269
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGCCAGTCTCAAAAGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCA 2580

 51736270 AAACTATAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTG 51736329
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAACTGTAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTG 2640

 51736330 TGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTC 51736389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTC 2700

 51736390 GTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAA 51736449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAA 2760

 51736450 GTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAG 51736509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAG 2820

 51736510 AAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAA 51736569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAA 2880

 51736570 GCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAA 51736629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAA 2940

 51736630 TTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAA 51736689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAA 3000

 51736690 ACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGC 51736749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGC 3060

 51736750 CTTGGAGAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTA 51736809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTTGGAGAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTA 3120

 51736810 GAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAA 51736869
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAAAAAAA-GGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAA 3179

 51736870 AAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGC 51736929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 AAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGC 3239

 51736930 CCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATC 51736989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 CCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATC 3299

 51736990 AAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAG 51737049
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 AAAGAAATAATTGAAGAAAACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAG 3359

 51737050 TCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTG 51737109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTG 3419

 51737110 AAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAAT 51737169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 AAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAAT 3479

 51737170 AAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGAC 51737229
          |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     3480 AAGTTACATACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTT-GAGAC 3538

 51737230 AGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACC 51737289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 AGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACC 3598

 51737290 TCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAG 51737349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAG 3658

 51737350 GTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATG 51737409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 GTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATG 3718

 51737410 TTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAA 51737469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAA 3778

 51737470 CTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAA 51737529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 CTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAA 3838

 51737530 GACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAAC 51737589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 GACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAAC 3898

 51737590 TTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCA 51737649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCA 3958

 51737650 GAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAAGTTACC 51737709
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3959 GAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGAAAGTTACC 4018

 51737710 TTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCA 51737769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 TTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCA 4078

 51737770 GAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGG 51737829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 GAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGG 4138

 51737830 AGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCT 51737889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 AGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCT 4198

 51737890 GGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTG 51737949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 GGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTG 4258

 51737950 GCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAATGCTTA 51738009
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||| ||||
     4259 GCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCATAAGGCATATAGAATAAT-CTTA 4317

 51738010 TAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAA 51738069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 TAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAA 4377

 51738070 GTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATAT 51738129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 GTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATAT 4437

 51738130 CGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGG 51738189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGG 4497

 51738190 GGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTA 51738249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 GGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTA 4557

 51738250 TTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACA 51738309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 TTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACA 4617

 51738310 TATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTTGTGCAC 51738369
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     4618 TATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTGTGATTTGTGCAC 4677

 51738370 ATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACAAATACT 51738429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4678 ATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGAACAAATACT 4737

 51738430 AGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATGTCC 51738489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 AGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATGTCC 4797

 51738490 TTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACAAGC 51738549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACAAGC 4857

 51738550 AGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACTTTC 51738609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 AGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACTTTC 4917

 51738610 AAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAAAAA 51738669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 AAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAAAAA 4977

 51738670 ACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAATGC 51738729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 ACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAATGC 5037

 51738730 AAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAGATT 51738789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 AAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAGATT 5097

 51738790 TCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGGGAA 51738849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 TCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGGGAA 5157

 51738850 ACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAATCA 51738909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 ACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAATCA 5217

 51738910 CCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACGGTA 51738969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 CCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACGGTA 5277

 51738970 TTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCATCCT 51739029
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 TTTTTTAAAGTAACATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCATCCT 5337

 51739030 ACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTTTTTTAG 51739089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     5338 ACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTTTTT-AG 5396

 51739090 TGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTACGCA 51739149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 TGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTACGCA 5456

 51739150 CCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAGTCA 51739209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 CCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAGTCA 5516

 51739210 TTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAGTAC 51739269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5517 TTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAGTAC 5576

 51739270 CAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTCTTC 51739329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 CAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTCTTC 5636

 51739330 CAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTATAT 51739389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 CAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTATAT 5696

 51739390 ATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGGCCA 51739449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 ATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGGCCA 5756

 51739450 GGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACG 51739509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 GGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACG 5816

 51739510 AGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAA 51739567
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 AGGTCAGGAGATTGAGACTATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAA 5874

EXCISED REGION

 51745607 ACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA 51745666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5876 ACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA 5935

 51745667 GGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACT 51745726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5936 GGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACT 5995

 51745727 GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAGTGTT 51745786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
     5996 GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTC-AAAAAAAAAAAAAGAAAGTGTT 6054

 51745787 AATTCCTAAAGGAATGGCAGGCACAAAAGACAGAGGCTAAAATCAGAGTCCCATAACCAC 51745846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6055 AATTCCTAAAGGAATGGCAGGCACAAAAGACAGAGGCTAAAATCAGAGTCCCATAACCAC 6114

 51745847 AGAGGTCAGGAACCCTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGGAACAAC 51745906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6115 AGAGGTCAGGAACCCTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGGAACAAC 6174

 51745907 TGACACCTGGCAACATAGTGGTTCCCAAATAAATCTGAAAAATACTGTGCTAAGTAAAGA 51745966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6175 TGACACCTGGCAACATAGTGGTTCCCAAATAAATCTGAAAAATACTGTGCTAAGTAAAGA 6234

 51745967 TTAATAGATTTTTTTTTGCTTGTTCACTTTAATGCTAGAATTTCTCAGAGCCTTTAGTGT 51746026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6235 TTAATAGATTTTTTTTTGCTTGTTCACTTTAATGCTAGAATTTCTCAGAGCCTTTAGTGT 6294

 51746027 ATTTTTTCAATGAATTTTATTCTGTATATTTGAGATTTACAACATATTACAGGGTACACA 51746086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6295 ATTTTTTCAATGAATTTTATTCTGTATATTTGAGATTTACAACATATTACAGGGTACACA 6354

 51746087 TAGGTTATAGTGAAGCAAATCAACATATCTATTATCTCACAGTTACTTTTCTGTGACAAG 51746146
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6355 TAGATTATAGTGAAGCAAATCAACATATCTATTATCTCACAGTTACTTTTCTGTGACAAG 6414

 51746147 AGCAGCCAAAATCCACTTATTTAACAAAATTCCCTGACACAATACAATTTTATTATCTCT 51746206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6415 AGCAGCCAAAATCCACTTATTTAACAAAATTCCCTGACACAATACAATTTTATTATCTCT 6474

 51746207 AATGCTTATGTTGTACATTACATCTCTGGATTTGTTGGAGATTTTGGGAAATAGAGGGTA 51746266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6475 AATGCTTATGTTGTACATTACATCTCTGGATTTGTTGGAGATTTTGGGAAATAGAGGGTA 6534

 51746267 CGGTAAACAGCACAGTATAAATATAATTATAACCAAATAATCTTCTCTTTCCAGACACTA 51746326
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6535 CGGTAAACAGCACCGTATAAATATAATTATAACCAAATAATCTTCTCTTTCCAGACACTA 6594

 51746327 TCTAAGGGCTAGCTTTTCATGAAAAACACTTCAGGGAACATTGGTATGAACACTAATAAA 51746386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6595 TCTAAGGGCTAGCTTTTCATGAAAAACACTTCAGGGAACATTGGTATGAACACTAATAAA 6654

 51746387 TGTCCTTTGCCAAAGCCATTTTCCATGTGCAATTGAAGAATATTTGACCAGGAGTGGGAG 51746446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6655 TGTCCTTTGCCAAAGCCATTTTCCATGTGCAATTGAAGAATATTTGACCAGGAGTGGGAG 6714

 51746447 GATATCAGGGTGGTCCTAGCTCCACAATACTAGGCATGAACCTTAAACTGCCATTCAAGT 51746506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6715 GATATCAGGGTGGTCCTAGCTCCACAATACTAGGCATGAACCTTAAACTGCCATTCAAGT 6774

 51746507 TTCCAAGCCTCCATTTTCCCCTAAGTTCAAGAAGTTAACCAGATCATCTCTTAGGTAATA 51746566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6775 TTCCAAGCCTCCATTTTCCCCTAAGTTCAAGAAGTTAACCAGATCATCTCTTAGGTAATA 6834

 51746567 GTTGGCTCTTTAATTATGTGGTTTTATGATTTGGATAACTAACCAGCATCTAGACATCCC 51746626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6835 GTTGGCTCTTTAATTATGTGGTTTTATGATTTGGATAACTAACCAGCATCTAGACATCCC 6894

 51746627 CTAGAACAAAACTGTTTAACATTTTCCACCAGGGGACTCTTGTCCTGCACTTACTTAAGA 51746686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6895 CTAGAACAAAACTGTTTAACATTTTCCACCAGGGGACTCTTGTCCTGCACTTACTTAAGA 6954

 51746687 GACTGAAAGGCCCTCAGCTGTACTACATTCCTAGTGAATTACACCCCAAGGGTGTGATTA 51746746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6955 GACTGAAAGGCCCTCAGCTGTACTACATTCCTAGTGAATTACACCCCAAGGGTGTGATTA 7014

 51746747 TTTTTGATTATCTCATGATAGCCACCCTTTTGTCATAATTTACATCTTAATTTTTGTC 51746804
          ||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7015 TTTTTGATTACCTCATGATAGGCACCCTTTTGTCATAATTTACATCTTAATTTTTGTC 7072

Alignment time is 12.5 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,   13122] =>     13122 nucs 'mol-32-321f-223293_13122'

Score:       11139
Aligned:     11537        nucs
Identic:     11500 (100%) nucs =>      4717 (100%)      6783 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51726109,51730836] EXCISED REGION [51730838,51737643]
 second seq =>  [    1586,    6315] EXCISED REGION [    6318,   13122]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51730837,51730837]
 second seq =>         2 nucs [6316,6317]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51726109 TAACTCCCTGGTTTTTGTTTACCATTAGCTTACTTTTCCTGAGGGTCCATATCTGTGTAT 51726168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1586 TAACTCCCTGGTTTTTGTTTACCATTAGCTTACTTTTCCTGAGGGTCCATATCTGTGTAT 1645

 51726169 TAAAGACAAGCATTGCACAGAGCTCTAAATGCTCTTGATTTGGAACAGTTGTGAAATAAA 51726228
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1646 TAAAGACAAGCATTGCACTGAGCTCTAAATGCTCTTGATTTGGAACAGTTGTGAAATAAA 1705

 51726229 TCCTCTGTAATTATCCATCTCCTAAGCCAGACACACCACAATACCTAACCTCAAATTGTG 51726288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 TCCTCTGTAATTATCCATCTCCTAAGCCAGACACACCACAATACCTAACCTCAAATTGTG 1765

 51726289 TTGCAAACATCTTCTGAGTATTTGTGCTTGTTGATGTCACTCTCATCTTTTACTGCACAA 51726348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 TTGCAAACATCTTCTGAGTATTTGTGCTTGTTGATGTCACTCTCATCTTTTACTGCACAA 1825

 51726349 AGGGGAAGAAAAATCAAAACTGTGGGCACAGCCAACAAATTTCTGTGGCATGGTTTTGCA 51726408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 AGGGGAAGAAAAATCAAAACTGTGGGCACAGCCAACAAATTTCTGTGGCATGGTTTTGCA 1885

 51726409 TGAGCATCCTTTAAAAATACACCATGCTCATAACAATCCTTGTCACAGCACCACTATTCT 51726468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 TGAGCATCCTTTAAAAATACACCATGCTCATAACAATCCTTGTCACAGCACCACTATTCT 1945

 51726469 ATCTGCTAACACCTGCCACCATTCCGTAATATTTCATTATCATTGTATCATTAAGTTTTT 51726528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 ATCTGCTAACACCTGCCACCATTCCGTAATATTTCATTATCATTGTATCATTAAGTTTTT 2005

 51726529 CCATCCACAGCCTTATGGATTCAGAAACACTTAAATATTTCTCCTCTAAGGAAGTATCTA 51726588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 CCATCCACAGCCTTATGGATTCAGAAACACTTAAATATTTCTCCTCTAAGGAAGTATCTA 2065

 51726589 CAGTTTTTGCAACATAGTTATCTGCTGTTATATTAGGACAATACTTTTTGCCCATTCTAT 51726648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 CAGTTTTTGCAACATAGTTATCTGCTGTTATATTAGGACAATACTTTTTGCCCATTCTAT 2125

 51726649 CTTAATATATGAAGAAAAGCAATAGATGTCCATTATCCTACTTTAGGTGACCATATACCA 51726708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 CTTAATATATGAAGAAAAGCAATAGATGTCCATTATCCTACTTTAGGTGACCATATACCA 2185

 51726709 TTGCATCTCTACTTTTGATCTGCTGAGTCCAATTGGAATGGCTATTTGAGAACACGAGAA 51726768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 TTGCATCTCTACTTTTGATCTGCTGAGTCCAATTGGAATGGCTATTTGAGAACACGAGAA 2245

 51726769 CACTGTTATTGAAGCTATGCAACCAGAAGGTAGACAGGTGGACAACTGCTTGTCAGGGAT 51726828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 CACTGTTATTGAAGCTATGCAACCAGAAGGTAGACAGGTGGACAACTGCTTGTCAGGGAT 2305

 51726829 ATTGAAAAATATTTTATCCAGCAGGTAGGAAGTTAGACTAAGAAGCTTGTCCTCCCATAT 51726888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2306 ATTGAAAAATATTTTATCCAGCAGGTAGGAAGTTAGACTAAGAAGCTTGTCCTCCCTTAT 2365

 51726889 ATATGCATACCAGAGCTGTGATGGGGATGACTGACACTGGCTGGCAGAAGCCCATCATTG 51726948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 ATATGCATACCAGAGCTGTGATGGGGATGACTGACACTGGCTGGCAGAAGCCCATCATTG 2425

 51726949 ACCCTTCTTCCCAACTATATGTTCAGTGCTTTTAGGTTGGAAGCTTAAAATAAGGCATGT 51727008
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 ACCCTTCTTCCCAACTATATGTTCAGTGTTTTTAGGTTGGAAGCTTAAAATAAGGCATGT 2485

 51727009 GAGAGTATTTTCACTATAGAATTAGGCAAATGAAATAAACCAGAGCTTTTTATTCTGGAG 51727068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 GAGAGTATTTTCACTATAGAATTAGGCAAATGAAATAAACCAGAGCTTTTTATTCTGGAG 2545

 51727069 AGCTAGTTGTTAAACATTTACCAGCATACCACTGCAACCTTTTATTATTCATAAAACTTA 51727128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 AGCTAGTTGTTAAACATTTACCAGCATACCACTGCAACCTTTTATTATTCATAAAACTTA 2605

 51727129 ATAACCATGTAATATTGTTGATGATATTCCTCAGTTTGGGGTCCATTGTGATTTTTAGAT 51727188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 ATAACCATGTAATATTGTTGATGATATTCCTCAGTTTGGGGTCCATTGTGATTTTTAGAT 2665

 51727189 CTTTTTCTACTTTAATTCTGTAACCTTTGCTGCCAAGAAAAGATAATACATCTTTGAATT 51727248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 CTTTTTCTACTTTAATTCTGTAACCTTTGCTGCCAAGAAAAGATAATACATCTTTGAATT 2725

 51727249 TTCTTGTCTCACAGGGTTGTTTTTTAAGGACTGAAAAGATACCATTAGTGATGCCATGCC 51727308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 TTCTTGTCTCACAGGGTTGTTTTTTAAGGACTGAAAAGATACCATTAGTGATGCCATGCC 2785

 51727309 TATTTATCCCTAGGAAGGAAAGTCAAGCGATTATTAGAGGAAAAGGTAGGCCAAAATTTC 51727368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 TATTTATCCCTAGGAAGGAAAGTCAAGCGATTATTAGAGGAAAAGGTAGGCCAAAATTTC 2845

 51727369 CATTTGAACTCTTCTTTATTTTTGCATTCACAGAGGCAGGGGGTGACTCGTACTTTGAAC 51727428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 CATTTGAACTCTTCTTTATTTTTGCATTCACAGAGGCAGGGGGTGACTCGTACTTTGAAC 2905

 51727429 ACTGACACCTTAAGAGTGGTTACATAGGTAAAAACTGAACGCAAGCACTACAGGAGAGGA 51727488
          |||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 ACTGACATCTTAAGAGTGGTTATATAGGTAAAAACTGAACGCAAGCACTACAGGAGAGGA 2965

 51727489 TATTAAGCAAGATCTAAGAATCAAGGTGATCAACAAGAACACTAACCTTTTATTTTCCAG 51727548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 TATTAAGCAAGATCTAAGAATCAAGGTGATCAACAAGAACACTAACCTTTTATTTTCCAG 3025

 51727549 GAGAGGTGGGAAGGAAGAAACAGAAGGTACTGGGGCACGATGAATCAAAGTCAACGCCCT 51727608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 GAGAGGTGGGAAGGAAGAAACAGAAGGTACTGGGGCACGATGAATCAAAGTCAACGCCCT 3085

 51727609 GAATGACCTGAGGTTCTACAACCACCTGGGAGGTTTTGCTGGGTCAGTACAACGTCATAT 51727668
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 GAATGACCTCAGGTTCTACAACCACCTGGGAGGTTTTGCTGGGTCAGTACAACGTCATAT 3145

 51727669 GATTATTACAAATTATTCCCTATTTTTCAGGAATTGGATTAAGTTACATTACCTAATTCC 51727728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 GATTATTACAAATTATTCCCTATTTTTCAGGAATTGGATTAAGTTACATTACCTAATTCC 3205

 51727729 CTTGCCAGGCATTTGTTTCTCAGAAACAAAAAATTCTGCAGTAACCTATTCAATTAGTAT 51727788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 CTTGCCAGGCATTTGTTTCTCAGAAACAAAAAATTCTGCAGTAACCTATTCAATTAGTAT 3265

 51727789 TATGCCTATGCGTTGTTTTGTAAATCACAAATGTAAAATAGATATTCTTTAAAGAGTACC 51727848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 TATGCCTATGCGTTGTTTTGTAAATCACAAATGTAAAATAGATATTCTTTAAAGAGTACC 3325

 51727849 TACTACATGTCAAGCAATGACCCTGAGGGATAAATACCATTATACCCATTTTAGTGATGA 51727908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 TACTACATGTCAAGCAATGACCCTGAGGGATAAATACCATTATACCCATTTTAGTGATGA 3385

 51727909 AAGAACTGAAACAAAAAGCGGTAAAGTAACTTGTGCAAAGAAATATACCTAGGAAGTAGA 51727968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3386 AAGAACTGAAACAAAAAGCGGTAAAGTAACTTATGCAAAGAAATATACCTAGGAAGTAGA 3445

 51727969 GGGGATATGACTTGTACCCACAAAGGATTGTTAATTACTTCTCTATTCTTCAGTCTGAAA 51728028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 GGGGATATGACTTGTACCCACAAAGGATTGTTAATTACTTCTCTATTCTTCAGTCTGAAA 3505

 51728029 AATAATTTCAAACATGTACTGTATATAT--GTCTTGACTATTTTATGTACGTCCTGTAAA 51728086
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 AATAATTTCAAACATGTACTGTATATATATGTCTTGACTATTTTATGTACGTCCTGTAAA 3565

 51728087 AACTCAGAAGGACTGGTCAGCCAACCTACAAAATCTTGCAAGCTCTTCTAATCTCCCTCA 51728146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 AACTCAGAAGGACTGGTCAGCCAACCTACAAAATCTTGCAAGCTCTTCTAATCTCCCTCA 3625

 51728147 CACTCAATACAGTCAAAAATTCGAAGACAGAATCAAGGTCTGATCTGTTGATATCTCAAT 51728206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 CACTCAATACAGTCAAAAATTCGAAGACAGAATCAAGGTCTGATCTGTTGATATCTCAAT 3685

 51728207 GAGTCTACGACAAGTGAAGAAGTTATACATTGCTGTAAACAACAATGACAAAAATTTTCG 51728266
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 GAGTCTATGACAAGTGAAGAAGTTATACATTGCTGTAAACAACAATGACAAAAATTTTCG 3745

 51728267 AGAAAATAATTATAAGGGTTGAGCTTACATCCTCTCTATCACAGTTTTATGTACCTATTC 51728326
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 AGAAAATAATTATAAGGGTTGAGTTTACATCCTCTCTATCACAGTTTTATGTACCTATTC 3805

 51728327 CACCAGGACAAGAAAACAATTACAAATAAAGGCAAACTGATGATTGAATGGGGGTAGAGA 51728386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 CACCAGGACAAGAAAACAATTACAAATAAAGGCAAACTGATGATTGAATGGGGGTAGAGA 3865

 51728387 GGGGTTGGATAGAGAAGGAATCAGCAATTAGAATAAATCCTCCAGTCAAATGATTGCCCC 51728446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 GGGGTTGGATAGAGAAGGAATCAGCAATTAGAATAAATCCTCCAGTCAAATGATTGCCCC 3925

 51728447 AGGAAAGTAAAAGCCCAGAGAAGATTATGAAAGAAGATTCTTAAATACTAGATATTCCTA 51728506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 AGGAAAGTAAAAGCCCAGAGAAGATTATGAAAGAAGATTCTTAAATACTAGATATTCCTA 3985

 51728507 GGAATTTTAGAAGACTGGAGATAGCATTTTACTCCTGGGTCTTCTGAAGAAAAGCCGAAT 51728566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 GGAATTTTAGAAGACTGGAGATAGCATTTTACTCCTGGGTCTTCTGAAGAAAAGCCGAAT 4045

 51728567 GCTGTGGACTCCTCATGAACATGTCCTAGGAGAGAAATAGACAATAAGGACACTAAAGGA 51728626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 GCTGTGGACTCCTCATGAACATGTCCTAGGAGAGAAATAGACAATAAGGACACTAAAGGA 4105

 51728627 AGATCTGGGGGCAGTCCACTATTTTTTATTTATATTTTTTTACTCAACACCAATTTTGTT 51728686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 AGATCTGGGGGCAGTCCACTATTTTTTATTTATATTTTTTTACTCAACACCAATTTTGTT 4165

 51728687 GAGTTGCTATGTGTTAAACAGAGTTTGGGGCATCATAATACAAAGAAAATCCCTATTTGC 51728746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 GAGTTGCTATGTGTTAAACAGAGTTTGGGGCATCATAATACAAAGAAAATCCCTATTTGC 4225

 51728747 CCTCCTTGCCATTTATAAGGACAGACGGACAATTTAGAAAGCTATGCAGGTGCTATAAGT 51728806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 CCTCCTTGCCATTTATAAGGACAGACGGACAATTTAGAAAGCTATGCAGGTGCTATAAGT 4285

 51728807 ACTGATTAGAGCAAGTATAAAGAGCTAGCACACAACAGAGATATCAAAACCTGCGCAGCA 51728866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 ACTGATTAGAGCAAGTATAAAGAGCTAGCACACAACAGAGATATCAAAACCTGCGCAGCA 4345

 51728867 TGCTCAGGGAAGCCTAGCAGAGAAAACGACCTCTATGCTGAGTTCATGGAAGCTGAACAT 51728926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 TGCTCAGGGAAGCCTAGCAGAGAAAACGACCTCTATGCTGAGTTCATGGAAGCTGAACAT 4405

 51728927 TATGAATTGAAGAGCACAAATAAGTTGAATGTGGCTAAGGGACAGAATGCAGGAAAGGTA 51728986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 TATGAATTGAAGAGCACAAATAAGTTGAATGTGGCTAAGGGACAGAATGCAGGAAAGGTA 4465

 51728987 GAGCAGAGTGCTGAGAGATAATGCTGGAACCCAAAGCAGACAGCAGGACACGGAAGCTCC 51729046
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 GAGCAGAGTGCCGAGAGATAATGCTGGAACCCAAAGCAGACAGCAGGACACGGAAGCTCC 4525

 51729047 ATGACACATTAGGAATGTCAGACTTTCCTTGGAAAGCACTGAGAATTCTTTAAAAGTTTC 51729106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 ATGACACATTAGGAATGTCAGACTTTCCTTGGAAAGCACTGAGAATTCTTTAAAAGTTTC 4585

 51729107 ACGCAAGGGAATGGATGGCAAGATCAGATCTGCATTTAGAAAGTTCAGAGATTGAAACAC 51729166
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 ATGCAAGGGAATGGATGGCAAGATCAGATCTGCATTTAGAAAGTTCAGAGATTGAAACAC 4645

 51729167 CGAAAAATGGCAAGCTAAGTGGCTGTTGTGGTTCTACAGGTGAAAAGTAATGGTAGCCCA 51729226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 CGAAAAATGGCAAGCTAAGTGGCTGTTGTGGTTCTACAGGTGAAAAGTAATGGTAGCCCA 4705

 51729227 GACTGGAGAAGGATTTGGGGAAGGAGAGTAGTAGAAAGACTCAAAAGGGATTTATTAAGG 51729286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 GACTGGAGAAGGATTTGGGGAAGGAGAGTAGTAGAAAGACTCAAAAGGGATTTATTAAGG 4765

 51729287 AGGAAAATTGAGCTGATAGGTGATTAGTGTGGGAAATAAGGTACAAAGATGAGTCAAGGA 51729346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 AGGAAAATTGAGCTGATAGGTGATTAGTGTGGGAAATAAGGTACAAAGATGAGTCAAGGA 4825

 51729347 TGACTCCATGTTTCAGGTTTAGACCAGCATTTGCCTCAGTGGGATTCTGAGCACCCAGAG 51729406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 TGACTCCATGTTTCAGGTTTAGACCAGCATTTGCCTCAGTGGGATTCTGAGCACCCAGAG 4885

 51729407 AGAAACAGGTCTACAGAAAAAAATCATAAATCCCATTTTGGCAAGTTGAGTTTTAGAGTA 51729466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 AGAAACAGGTCTACAGAAAAAAATCATAAATCCCATTTTGGCAAGTTGAGTTTTAGAGTA 4945

 51729467 GCCACACTAAAAAGCTCAAAATAAACAAGTTAAATTAATTTTAGTAATATATTTAGCCCA 51729526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 GCCACACTAAAAAGCTCAAAATAAACAAGTTAAATTAATTTTAGTAATATATTTAGCCCA 5005

 51729527 ATCTATCCAAAATATTATTTCAACATGATCAATATAAACAAATTATTGAGATATTTTACA 51729586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 ATCTATCCAAAATATTATTTCAACATGATCAATATAAACAAATTATTGAGATATTTTACA 5065

 51729587 TTCTTTTTTTCATATTAAGTCTTATCTATATGGTGGGTAATTCACTCTTACGGCACATCA 51729646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 TTCTTTTTTTCATATTAAGTCTTATCTATATGGTGGGTAATTCACTCTTACGGCACATCA 5125

 51729647 CAATTTGGACTAGGGAGATCTAAAAAGAGCACACAAAATCCTACTGATAATATTGTACTT 51729706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 CAATTTGGACTAGGGAGATCTAAAAAGAGCACACAAAATCCTACTGATAATATTGTACTT 5185

 51729707 GTTTCGTGTAATTATTTCTATACAGAAAAAAAAAATGTTTACCTAAAGTTTGGGATAGAT 51729766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 GTTTCGTGTAATTATTTCTATACAGAAAAAAAAAATGTTTACCTAAAGTTTGGGATAGAT 5245

 51729767 AAATCCAAGAACTATGTGGGACATTTTATAATTATGGGACCCTGGAGAAAAACTGTCACT 51729826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 AAATCCAAGAACTATGTGGGACATTTTATAATTATGGGACCCTGGAGAAAAACTGTCACT 5305

 51729827 GGCATGTGTTTCTGATATGAGGTCCTGACTTACATTGGCAGAACTAACACTACCCCTGTC 51729886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 GGCATGTGTTTCTGATATGAGGTCCTGACTTACATTGGCAGAACTAACACTACCCCTGTC 5365

 51729887 TCACCAGGAACACTGAGGTTCATAGGGGGAAGCTGGTAGAAACAGAAGCTGGGAAAGGAA 51729946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 TCACCAGGAACACTGAGGTTCATAGGGGGAAGCTGGTAGAAACAGAAGCTGGGAAAGGAA 5425

 51729947 CGCTATCCAGAATACCTGCGGCTTCTACAGAAAGCATGTTTTCAGAGCTGATGAGAGAGA 51730006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 CGCTATCCAGAATACCTGCGGCTTCTACAGAAAGCATGTTTTCAGAGCTGATGAGAGAGA 5485

 51730007 AAACAATATAAGCAGCACTCACGCAGATCAAGCATGCTGTCATTTTAACAAAACATAAAC 51730066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 AAACAATATAAGCAGCACTCACGCAGATCAAGCATGCTGTCATTTTAACAAAACATAAAC 5545

 51730067 TAGACTCTGCCTTGTAGAGTGGCAGTTTTTTCTTCACCCAAATATTAAATAGTGTGGCCA 51730126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 TAGACTCTGCCTTGTAGAGTGGCAGTTTTTTCTTCACCCAAATATTAAATAGTGTGGCCA 5605

 51730127 ACTTCAAATATTTAAATACTTCTGTCATCCCAACTGCTGGCTTTGAGTCATAGGAACCAA 51730186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 ACTTCAAATATTTAAATACTTCTGTCATCCCAACTGCTGGCTTTGAGTCATAGGAACCAA 5665

 51730187 TAAAGTAGGAAGTGCCACAAAGGTAAGCACCGTCAGATTTAAGGCAGTGAGGGACAGGAA 51730246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 TAAAGTAGGAAGTGCCACAAAGGTAAGCACCGTCAGATTTAAGGCAGTGAGGGACAGGAA 5725

 51730247 CAGAAGGTTGCCAATGTCAAACAAATAACTTATAGTGAAAATGGACCAGAGAGGGGGCCT 51730306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 CAGAAGGTTGCCAATGTCAAACAAATAACTTATAGTGAAAATGGACCAGAGAGGGGGCCT 5785

 51730307 ACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAGCTTGGTTCTTAGCAGAACAGGAAGAGGATGTCT 51730366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 ACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAGCTTGGTTCTTAGCAGAACAGGAAGAGGATGTCT 5845

 51730367 TGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCACTCCCTGCCCTCTCTGGACCTCTTACTGAGGGAG 51730426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 TGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCACTCCCTGCCCTCTCTGGACCTCTTACTGAGGGAG 5905

 51730427 GGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAGCAGGGTGCTTATGCCATATTAGATCTCCATCAA 51730486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 GGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAGCAGGGTGCTTATGCCATATTAGATCTCCATCAA 5965

 51730487 CATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGTGAGAGCTTTGTAAATCAACTCTTAGGGTGCTTG 51730546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 CATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGTGAGAGCTTTGTAAATCAACTCTTAGGGTGCTTG 6025

 51730547 CCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTAATCCTTTCTCCATGAAATGCAGCAAAGTTTGCA 51730606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6026 CCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTAATCCTTTCTCCATGAAATGCAGCAAAGTTTGCA 6085

 51730607 TCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTAGCTCTGACATGTTCCTAATGAGGTTATAATGCT 51730666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6086 TCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTAGCTCTGACATGTTCCTAATGAGGTTATAATGCT 6145

 51730667 TTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCACAAATAGCTAGGGATAGAATCATAGAAAGATAA 51730726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 TTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCACAAATAGCTAGGGATAGAATCATAGAAAGATAA 6205

 51730727 AATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCTCTCAGACTTTAATACCAATCACCTGGGCATTGT 51730786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 AATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCTCTCAGACTTTAATACCAATCACCTGGGCATTGT 6265

 51730787 AATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTGAGAGTCTGCATTTCTAAAAAAAA 51730836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 AATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTGAGAGTCTGCATTTCTAAAAAAAA 6315

EXCISED REGION

 51730838 CCCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACAACATTTTGAGCAGCAAGACCTTAGAG 51730897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6318 CCCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACAACATTTTGAGCAGCAAGACCTTAGAG 6377

 51730898 ATCATCTAATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAGCACATCAGGGCCAAGAGATTTATAAC 51730957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6378 ATCATCTAATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAGCACATCAGGGCCAAGAGATTTATAAC 6437

 51730958 TGGAAGCACGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTAGGGTCAGTTGAGTATTTGTCCATAGA 51731017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6438 TGGAAGCACGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTAGGGTCAGTTGAGTATTTGTCCATAGA 6497

 51731018 CCTGTGAGTCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATCTAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGCCT 51731077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6498 CCTGTGAGTCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATCTAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGCCT 6557

 51731078 AGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTTGCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAATCC 51731137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6558 AGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTTGCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAATCC 6617

 51731138 AGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGACCCTTTTGAATCTACTTAGAACACAG 51731197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6618 AGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGACCCTTTTGAATCTACTTAGAACACAG 6677

 51731198 TATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTCCCCAAGTGGTGGGATCATGACCTGCC 51731257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6678 TATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTCCCCAAGTGGTGGGATCATGACCTGCC 6737

 51731258 AAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAATGCTCAAACAAGTT 51731317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     6738 AAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAACGCTCAAACAAGTT 6797

 51731318 TCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCCTA 51731377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6798 TCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCCTA 6857

 51731378 CCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAAATAAATAT 51731437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6858 CCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAAATAAATAT 6917

 51731438 TATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCTCATTTGATAAAAT 51731497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6918 TATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCTCATTTGATAAAAT 6977

 51731498 GCATGTAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAAAACATCCT 51731557
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6978 GCATATAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAAAACATCCT 7037

 51731558 TGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGTCA 51731617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7038 TGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGTCA 7097

 51731618 TGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTACATATTATTATTTTAC 51731677
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     7098 TGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTTCATATTATTATTTTAC 7157

 51731678 TCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAATG 51731737
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7158 TCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTTAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAATG 7217

 51731738 AAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATCGCTAAGGCTTCTAAAACAGAATGC 51731797
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7218 AAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATTGCTAAGGCTTCTAAAACAGAATGC 7277

 51731798 CAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAACCACAATGA 51731857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7278 CAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAACCACAATGA 7337

 51731858 TTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGTCTGACTGAATTAC 51731917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7338 TTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGTCTGACTGAATTAC 7397

 51731918 TTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTA 51731977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7398 TTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTA 7457

 51731978 AATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCATT 51732037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7458 AATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCATT 7517

 51732038 ACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCT 51732097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7518 ACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCT 7577

 51732098 GACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAA 51732157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7578 GACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAA 7637

 51732158 TGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCA 51732217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7638 TGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCA 7697

 51732218 ACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCTGGAGCATATTGAACACTTAAA 51732277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     7698 ACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCCGGAGCATATTGAACACTTAAA 7757

 51732278 AAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTAAT 51732337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7758 AAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTAAT 7817

 51732338 AATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGA 51732397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7818 AATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGA 7877

 51732398 AGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATAT 51732457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7878 AGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATAT 7937

 51732458 TGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATTCAGCAGCT 51732517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7938 TGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATTCAGCAGCT 7997

 51732518 GTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACA 51732577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7998 GTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACA 8057

 51732578 ATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCTAA 51732637
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     8058 ATTTCCCTTCTATAAGCCTCAACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCAGCAAGCTAA 8117

 51732638 AAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTC 51732697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8118 AAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTC 8177

 51732698 CACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAA 51732757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8178 CACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAA 8237

 51732758 GGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGACCCATCCAAGT 51732817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8238 GGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGACCCATCCAAGT 8297

 51732818 CTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACT 51732877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8298 CTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACT 8357

 51732878 TCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTAC 51732937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8358 TCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTAC 8417

 51732938 ACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCAT 51732997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8418 ACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCAT 8477

 51732998 ATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGT 51733057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8478 ATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGT 8537

 51733058 TTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATA 51733117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8538 TTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATA 8597

 51733118 ACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTT 51733177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8598 ACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTT 8657

 51733178 TCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCT 51733237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8658 TCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCT 8717

 51733238 GTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTG 51733297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8718 GTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTG 8777

 51733298 CTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATG 51733357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8778 CTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATG 8837

 51733358 CCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAA 51733417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8838 CCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAA 8897

 51733418 TTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCA 51733477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8898 TTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCA 8957

 51733478 TTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATT 51733537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8958 TTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATT 9017

 51733538 TACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCT 51733597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9018 TACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCT 9077

 51733598 AAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGA 51733657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9078 AAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGA 9137

 51733658 CTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTC 51733717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9138 CTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTC 9197

 51733718 ACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACACATACTACC 51733777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9198 ACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACACATACTACC 9257

 51733778 ATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAAGA 51733837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     9258 ATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAAGAAAATGAAAAAGA 9317

 51733838 TACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTG 51733897
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     9318 TACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTA 9377

 51733898 ATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATAC 51733957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9378 ATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATAC 9437

 51733958 CACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAAGC 51734017
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     9438 CACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGCTTTCCCAAGC 9497

 51734018 ACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTG 51734077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9498 ACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTG 9557

 51734078 CATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTA 51734137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9558 CATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTA 9617

 51734138 TGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTA 51734197
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9618 TGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTTGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTA 9677

 51734198 CTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATC 51734257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9678 CTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATC 9737

 51734258 AAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAA 51734317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9738 AAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAA 9797

 51734318 GCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTC 51734377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9798 GCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTC 9857

 51734378 AGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATG 51734437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9858 AGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATG 9917

 51734438 ATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGA 51734497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9918 ATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGA 9977

 51734498 GGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAA 51734557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9978 GGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAA 10037

 51734558 ACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGG-AAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATT 51734616
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
    10038 ACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATT 10097

 51734617 CATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATATT 51734676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
    10098 CATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTAGTGATTCAAACCACAAGAGCATATT 10157

 51734677 TACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACC 51734736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10158 TACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACC 10217

 51734737 TCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTA 51734796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10218 TCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTA 10277

 51734797 AAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGA 51734856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10278 AAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGA 10337

 51734857 AAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATA 51734916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10338 AAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATA 10397

 51734917 CCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCA 51734976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10398 CCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCA 10457

 51734977 TCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGC 51735036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10458 TCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGC 10517

 51735037 CTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCA 51735096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10518 CTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCA 10577

 51735097 CCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTC 51735156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10578 CCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTC 10637

 51735157 TTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATG 51735216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10638 TTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATG 10697

 51735217 ATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCAT 51735276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
    10698 ATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATTGGCCTTATTTATCAT 10757

 51735277 CTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATG 51735336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10758 CTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATG 10817

 51735337 GCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCAT 51735396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10818 GCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCAT 10877

 51735397 CTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAA 51735456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10878 CTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAA 10937

 51735457 AAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAA 51735516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10938 AAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAA 10997

 51735517 AAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATG 51735576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10998 AAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATG 11057

 51735577 ACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAG 51735636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
    11058 ACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTCAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAG 11117

 51735637 ACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAAT 51735696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11118 ACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAAT 11177

 51735697 ATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAA 51735756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11178 ATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAA 11237

 51735757 ATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATA 51735816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11238 ATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATA 11297

 51735817 CAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGT 51735876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
    11298 CAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGAATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGT 11357

 51735877 GGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATA 51735936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11358 GGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATA 11417

 51735937 TGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAA 51735996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11418 TGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAA 11477

 51735997 CTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAA 51736056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11478 CTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAA 11537

 51736057 ATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTACATC 51736116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11538 ATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTACATC 11597

 51736117 TATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACAAGT 51736176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
    11598 TATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACAACT 11657

 51736177 TAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCCCAAAAGGTTACATACTA 51736236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
    11658 TAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCTCAAAAGGTTACATACTA 11717

 51736237 TATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTATAGTGACAGAGAATATATTAG 51736296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
    11718 TATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTGTAGTGACAGAGAATATATTAG 11777

 51736297 TGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTG 51736356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11778 TGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTG 11837

 51736357 GGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACA 51736416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11838 GGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACA 11897

 51736417 TGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATT 51736476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11898 TGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATT 11957

 51736477 TTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCC 51736536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11958 TTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCC 12017

 51736537 ACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGT 51736596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12018 ACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGT 12077

 51736597 TAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAA 51736656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12078 TAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAA 12137

 51736657 ATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAGA 51736716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12138 ATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAGA 12197

 51736717 AATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTATATCCA 51736776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12198 AATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTATATCCA 12257

 51736777 TGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAA 51736836
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
    12258 TGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAG-AAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAA 12316

 51736837 AAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAA 51736896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12317 AAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAA 12376

 51736897 GAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAA 51736956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12377 GAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAA 12436

 51736957 GGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCA 51737016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
    12437 GGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAAGAAAACTGTGCA 12496

 51737017 GAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTT 51737076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12497 GAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTT 12556

 51737077 AGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGAC 51737136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12557 AGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGAC 12616

 51737137 AAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCT 51737196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
    12617 AAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACATACAAAAATCCTGGAATCT 12676

 51737197 GAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGC 51737256
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12677 GAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGC 12735

 51737257 AGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTC 51737316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12736 AGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTC 12795

 51737317 CTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTT 51737376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12796 CTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTT 12855

 51737377 TTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGA 51737436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12856 TTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGA 12915

 51737437 CCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACT 51737496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12916 CCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACT 12975

 51737497 GAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGA 51737556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12976 GAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGA 13035

 51737557 ATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAA 51737616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    13036 ATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAA 13095

 51737617 TCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          |||||||||||||||||||||||||||
    13096 TCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 13122

Alignment time is 15.424 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5067] =>      5067 nucs 'mol-32-32f0-189812_5067'

Score:        3821
Aligned:      4008        nucs
Identic:      3991 (100%) nucs =>      2798 (100%)      1193 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51736758,51739567] EXCISED REGION [51745607,51746804]
 second seq =>  [       1,    2806] EXCISED REGION [    2808,    4005]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6039 nucs [51739568,51745606]
 second seq =>         1 nucs [2807,2807]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51739567,51739567] to [51745607,51745607]
 second seq =>         1 nucs [2806,2806] to [2808,2808]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51739568,51739568] to [51745606,51745606]
 second seq =>         0 nucs

 51736758 AATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAA 51736817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAA 60

 51736818 AGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAA 51736877
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 -GGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAA 119

 51736878 AGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATT 51736937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 AGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATT 179

 51736938 TAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAAT 51736997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 TAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAAT 239

 51736998 AATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTC 51737057
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 AATTGAAGAAAACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTC 299

 51737058 AGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCA 51737117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 AGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCA 359

 51737118 AAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACG 51737177
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      360 AAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACA 419

 51737178 TACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGACAGAATCTC 51737237
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
      420 TACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTT-GAGACAGAATCTC 478

 51737238 ACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTC 51737297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 ACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTC 538

 51737298 CTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGC 51737357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 CTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGC 598

 51737358 CACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAG 51737417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 CACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAG 658

 51737418 GCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGG 51737477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 GCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGG 718

 51737478 ATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAA 51737537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 ATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAA 778

 51737538 GGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCT 51737597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCT 838

 51737598 GGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAACTTTC 51737657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 GGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAACTTTC 898

 51737658 ACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAAGTTACCTTAGGGTA 51737717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      899 ACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGAAAGTTACCTTAGGGTA 958

 51737718 TGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAAACAAG 51737777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 TGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAAACAAG 1018

 51737778 AGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGATTCTA 51737837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 AGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGATTCTA 1078

 51737838 AGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGATTGTT 51737897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 AGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGATTGTT 1138

 51737898 GCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCTTATAT 51737957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 GCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCTTATAT 1198

 51737958 TCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAATGCTTATAGCATTA 51738017
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||| ||||||||||||
     1199 TCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCATAAGGCATATAGAATAAT-CTTATAGCATTA 1257

 51738018 TTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTTACATG 51738077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTTACATG 1317

 51738078 CTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGATAGAA 51738137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 CTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGATAGAA 1377

 51738138 GGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGGGACAA 51738197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 GGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGGGACAA 1437

 51738198 GAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTTTTTAG 51738257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 GAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTTTTTAG 1497

 51738258 AGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACATATACATG 51738317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 AGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACATATACATG 1557

 51738318 GTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTTGTGCACATTTCTCC 51738377
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1558 GTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTGTGATTTGTGCACATTTCTCC 1617

 51738378 ATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACAAATACTAGAGAAAG 51738437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1618 ATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGAACAAATACTAGAGAAAG 1677

 51738438 GTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATGTCCTTGCATTA 51738497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 GTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATGTCCTTGCATTA 1737

 51738498 CTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACAAGCAGGCACAT 51738557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 CTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACAAGCAGGCACAT 1797

 51738558 TAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACTTTCAAATGAGT 51738617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACTTTCAAATGAGT 1857

 51738618 AAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAAAAAACAGAAAC 51738677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 AAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAAAAAACAGAAAC 1917

 51738678 CAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAATGCAAATATAT 51738737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 CAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAATGCAAATATAT 1977

 51738738 GGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAGATTTCTCCCAG 51738797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 GGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAGATTTCTCCCAG 2037

 51738798 GGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGGGAAACAAAAAG 51738857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 GGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGGGAAACAAAAAG 2097

 51738858 ATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAATCACCCCTAGA 51738917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 ATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAATCACCCCTAGA 2157

 51738918 GAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACGGTATTTTTTAA 51738977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 GAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACGGTATTTTTTAA 2217

 51738978 AGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCATCCTACAGATAC 51739037
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 AGTAACATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCATCCTACAGATAC 2277

 51739038 TTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTTTTTTAGTGTGAAAG 51739097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     2278 TTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTTTTT-AGTGTGAAAG 2336

 51739098 GGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTACGCACCCAAACT 51739157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 GGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTACGCACCCAAACT 2396

 51739158 AGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAGTCATTCGTACT 51739217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 AGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAGTCATTCGTACT 2456

 51739218 GAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAGTACCAACACAC 51739277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 GAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAGTACCAACACAC 2516

 51739278 GTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTCTTCCAGAAAGT 51739337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 GTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTCTTCCAGAAAGT 2576

 51739338 AATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTATATATGAGTGG 51739397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 AATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTATATATGAGTGG 2636

 51739398 AAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGGCCAGGCGCAGT 51739457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 AAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGGCCAGGCGCAGT 2696

 51739458 GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGG 51739517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 GGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACGAGGTCAGG 2756

 51739518 AGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAA 51739567
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 AGATTGAGACTATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAA 2806

EXCISED REGION

 51745607 ACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA 51745666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 ACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCAGGTGCCTGTGGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGA 2867

 51745667 GGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACT 51745726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 GGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCAAGATCGCGCCACT 2927

 51745727 GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAGTGTT 51745786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 GCACTCCAGCCTGGGCGACAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGAAAGTGTT 2987

 51745787 AATTCCTAAAGGAATGGCAGGCACAAAAGACAGAGGCTAAAATCAGAGTCCCATAACCAC 51745846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 AATTCCTAAAGGAATGGCAGGCACAAAAGACAGAGGCTAAAATCAGAGTCCCATAACCAC 3047

 51745847 AGAGGTCAGGAACCCTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTTTTTGGAACAAC 51745906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3048 AGAGGTCAGGAACCCTCTTTTTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAACAAC 3107

 51745907 TGACACCTGGCAACATAGTGGTTCCCAAATAAATCTGAAAAATACTGTGCTAAGTAAAGA 51745966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 TGACACCTGGCAACATAGTGGTTCCCAAATAAATCTGAAAAATACTGTGCTAAGTAAAGA 3167

 51745967 TTAATAGATTTTTTTTTGCTTGTTCACTTTAATGCTAGAATTTCTCAGAGCCTTTAGTGT 51746026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 TTAATAGATTTTTTTTTGCTTGTTCACTTTAATGCTAGAATTTCTCAGAGCCTTTAGTGT 3227

 51746027 ATTTTTTCAATGAATTTTATTCTGTATATTTGAGATTTACAACATATTACAGGGTACACA 51746086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 ATTTTTTCAATGAATTTTATTCTGTATATTTGAGATTTACAACATATTACAGGGTACACA 3287

 51746087 TAGGTTATAGTGAAGCAAATCAACATATCTATTATCTCACAGTTACTTTTCTGTGACAAG 51746146
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 TAGATTATAGTGAAGCAAATCAACATATCTATTATCTCACAGTTACTTTTCTGTGACAAG 3347

 51746147 AGCAGCCAAAATCCACTTATTTAACAAAATTCCCTGACACAATACAATTTTATTATCTCT 51746206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 AGCAGCCAAAATCCACTTATTTAACAAAATTCCCTGACACAATACAATTTTATTATCTCT 3407

 51746207 AATGCTTATGTTGTACATTACATCTCTGGATTTGTTGGAGATTTTGGGAAATAGAGGGTA 51746266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 AATGCTTATGTTGTACATTACATCTCTGGATTTGTTGGAGATTTTGGGAAATAGAGGGTA 3467

 51746267 CGGTAAACAGCACAGTATAAATATAATTATAACCAAATAATCTTCTCTTTCCAGACACTA 51746326
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 CGGTAAACAGCACCGTATAAATATAATTATAACCAAATAATCTTCTCTTTCCAGACACTA 3527

 51746327 TCTAAGGGCTAGCTTTTCATGAAAAACACTTCAGGGAACATTGGTATGAACACTAATAAA 51746386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 TCTAAGGGCTAGCTTTTCATGAAAAACACTTCAGGGAACATTGGTATGAACACTAATAAA 3587

 51746387 TGTCCTTTGCCAAAGCCATTTTCCATGTGCAATTGAAGAATATTTGACCAGGAGTGGGAG 51746446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 TGTCCTTTGCCAAAGCCATTTTCCATGTGCAATTGAAGAATATTTGACCAGGAGTGGGAG 3647

 51746447 GATATCAGGGTGGTCCTAGCTCCACAATACTAGGCATGAACCTTAAACTGCCATTCAAGT 51746506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 GATATCAGGGTGGTCCTAGCTCCACAATACTAGGCATGAACCTTAAACTGCCATTCAAGT 3707

 51746507 TTCCAAGCCTCCATTTTCCCCTAAGTTCAAGAAGTTAACCAGATCATCTCTTAGGTAATA 51746566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 TTCCAAGCCTCCATTTTCCCCTAAGTTCAAGAAGTTAACCAGATCATCTCTTAGGTAATA 3767

 51746567 GTTGGCTCTTTAATTATGTGGTTTTATGATTTGGATAACTAACCAGCATCTAGACATCCC 51746626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 GTTGGCTCTTTAATTATGTGGTTTTATGATTTGGATAACTAACCAGCATCTAGACATCCC 3827

 51746627 CTAGAACAAAACTGTTTAACATTTTCCACCAGGGGACTCTTGTCCTGCACTTACTTAAGA 51746686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3828 CTAGAACAAAACTGTTTAACATTTTCCACCAGGGGACTCTTGTCCTGCACTTACTTAAGA 3887

 51746687 GACTGAAAGGCCCTCAGCTGTACTACATTCCTAGTGAATTACACCCCAAGGGTGTGATTA 51746746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 GACTGAAAGGCCCTCAGCTGTACTACATTCCTAGTGAATTACACCCCAAGGGTGTGATTA 3947

 51746747 TTTTTGATTATCTCATGATAGCCACCCTTTTGTCATAATTTACATCTTAATTTTTGTC 51746804
          ||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 TTTTTGATTACCTCATGATAGGCACCCTTTTGTCATAATTTACATCTTAATTTTTGTC 4005

Alignment time is 6.5545 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2457] =>      2457 nucs 'mol-32-3311-066862_2457'

Score:        2349
Aligned:      2459        nucs
Identic:      2449 (100%) nucs =>        32 (100%)      2417 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51735821,51735852] EXCISED REGION [51735854,51738279]
 second seq =>  [       1,      32] EXCISED REGION [      34,    2457]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51735853,51735853]
 second seq =>         1 nucs [33,33]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1876,1876]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [33,33] to [34,34]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51735821 GACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAG 51735852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAG 32

EXCISED REGION

 51735854 ATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTG 51735913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       34 ATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTG 93

 51735914 GCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGG 51735973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       94 GCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGG 153

 51735974 TATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATA 51736033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      154 TATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATA 213

 51736034 ACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAAT 51736093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      214 ACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAAT 273

 51736094 GGATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATG 51736153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      274 GGATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATG 333

 51736154 TAATATTGATATGTGCAACAAGTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGC 51736213
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      334 TAATATTGATATGTGCAACAACTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGC 393

 51736214 CAGTCCCAAAAGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAAC 51736273
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      394 CAGTCTCAAAAGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAAC 453

 51736274 TATAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGC 51736333
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      454 TGTAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGC 513

 51736334 TACAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGG 51736393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      514 TACAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGG 573

 51736394 TGGTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCA 51736453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      574 TGGTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCA 633

 51736454 GTTTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAAC 51736513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      634 GTTTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAAC 693

 51736514 AATAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTG 51736573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      694 AATAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTG 753

 51736574 CTAGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTT 51736633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      754 CTAGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTT 813

 51736634 TGCAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTC 51736693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      814 TGCAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTC 873

 51736694 AGTGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTG 51736753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      874 AGTGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTG 933

 51736754 GAGAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAA 51736813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
      934 GAGAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAG-AA 992

 51736814 AAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAG 51736873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      993 AAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAG 1052

 51736874 ACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAA 51736933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1053 ACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAA 1112

 51736934 TATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAG 51736993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 TATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAG 1172

 51736994 AAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCC 51737053
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 AAATAATTGAAGAAAACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCC 1232

 51737054 ACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAAT 51737113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 ACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAAT 1292

 51737114 TGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGT 51737173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 TGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGT 1352

 51737174 TACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGACAGAA 51737233
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     1353 TACATACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTTGAGACAGAA 1411

 51737234 TCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTG 51737293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 TCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTG 1471

 51737294 CTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 51737353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 CTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 1531

 51737354 TTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGG 51737413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 TTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGG 1591

 51737414 CCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGC 51737473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 CCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGC 1651

 51737474 TGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACC 51737533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 TGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACC 1711

 51737534 AGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCA 51737593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 AGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCA 1771

 51737594 ACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAAC 51737653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 ACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAAC 1831

 51737654 TTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-CAGAAAGTTACCTTA 51737712
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     1832 TTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGAAAGTTACCTTA 1891

 51737713 GGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAA 51737772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 GGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAA 1951

 51737773 ACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGA 51737832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 ACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGA 2011

 51737833 TTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGA 51737892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 TTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGA 2071

 51737893 TTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCT 51737952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 TTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCT 2131

 51737953 TATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAATGCTTATAG 51738012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||| |||||||
     2132 TATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCATAAGGCATATAGAATAAT-CTTATAG 2190

 51738013 CATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTT 51738072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 CATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTT 2250

 51738073 ACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGA 51738132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 ACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGA 2310

 51738133 TAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGG 51738192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 TAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGG 2370

 51738193 GACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTT 51738252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 GACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTT 2430

 51738253 TTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAA 51738279
          |||||||||||||||||||||||||||
     2431 TTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAA 2457

Alignment time is 3.36618 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,   10848] =>     10848 nucs 'mol-32-3311-173441_10848'

Score:       10185
Aligned:     10539        nucs
Identic:     10506 (100%) nucs =>      4717 (100%)      5789 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51726109,51730836] EXCISED REGION [51730838,51736645]
 second seq =>  [     308,    5037] EXCISED REGION [    5040,   10848]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51730837,51730837]
 second seq =>         2 nucs [5038,5039]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51726109 TAACTCCCTGGTTTTTGTTTACCATTAGCTTACTTTTCCTGAGGGTCCATATCTGTGTAT 51726168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 TAACTCCCTGGTTTTTGTTTACCATTAGCTTACTTTTCCTGAGGGTCCATATCTGTGTAT 367

 51726169 TAAAGACAAGCATTGCACAGAGCTCTAAATGCTCTTGATTTGGAACAGTTGTGAAATAAA 51726228
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      368 TAAAGACAAGCATTGCACTGAGCTCTAAATGCTCTTGATTTGGAACAGTTGTGAAATAAA 427

 51726229 TCCTCTGTAATTATCCATCTCCTAAGCCAGACACACCACAATACCTAACCTCAAATTGTG 51726288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 TCCTCTGTAATTATCCATCTCCTAAGCCAGACACACCACAATACCTAACCTCAAATTGTG 487

 51726289 TTGCAAACATCTTCTGAGTATTTGTGCTTGTTGATGTCACTCTCATCTTTTACTGCACAA 51726348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 TTGCAAACATCTTCTGAGTATTTGTGCTTGTTGATGTCACTCTCATCTTTTACTGCACAA 547

 51726349 AGGGGAAGAAAAATCAAAACTGTGGGCACAGCCAACAAATTTCTGTGGCATGGTTTTGCA 51726408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 AGGGGAAGAAAAATCAAAACTGTGGGCACAGCCAACAAATTTCTGTGGCATGGTTTTGCA 607

 51726409 TGAGCATCCTTTAAAAATACACCATGCTCATAACAATCCTTGTCACAGCACCACTATTCT 51726468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 TGAGCATCCTTTAAAAATACACCATGCTCATAACAATCCTTGTCACAGCACCACTATTCT 667

 51726469 ATCTGCTAACACCTGCCACCATTCCGTAATATTTCATTATCATTGTATCATTAAGTTTTT 51726528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      668 ATCTGCTAACACCTGCCACCATTCCGTAATATTTCATTATCATTGTATCATTAAGTTTTT 727

 51726529 CCATCCACAGCCTTATGGATTCAGAAACACTTAAATATTTCTCCTCTAAGGAAGTATCTA 51726588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      728 CCATCCACAGCCTTATGGATTCAGAAACACTTAAATATTTCTCCTCTAAGGAAGTATCTA 787

 51726589 CAGTTTTTGCAACATAGTTATCTGCTGTTATATTAGGACAATACTTTTTGCCCATTCTAT 51726648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      788 CAGTTTTTGCAACATAGTTATCTGCTGTTATATTAGGACAATACTTTTTGCCCATTCTAT 847

 51726649 CTTAATATATGAAGAAAAGCAATAGATGTCCATTATCCTACTTTAGGTGACCATATACCA 51726708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      848 CTTAATATATGAAGAAAAGCAATAGATGTCCATTATCCTACTTTAGGTGACCATATACCA 907

 51726709 TTGCATCTCTACTTTTGATCTGCTGAGTCCAATTGGAATGGCTATTTGAGAACACGAGAA 51726768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      908 TTGCATCTCTACTTTTGATCTGCTGAGTCCAATTGGAATGGCTATTTGAGAACACGAGAA 967

 51726769 CACTGTTATTGAAGCTATGCAACCAGAAGGTAGACAGGTGGACAACTGCTTGTCAGGGAT 51726828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 CACTGTTATTGAAGCTATGCAACCAGAAGGTAGACAGGTGGACAACTGCTTGTCAGGGAT 1027

 51726829 ATTGAAAAATATTTTATCCAGCAGGTAGGAAGTTAGACTAAGAAGCTTGTCCTCCCATAT 51726888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1028 ATTGAAAAATATTTTATCCAGCAGGTAGGAAGTTAGACTAAGAAGCTTGTCCTCCCTTAT 1087

 51726889 ATATGCATACCAGAGCTGTGATGGGGATGACTGACACTGGCTGGCAGAAGCCCATCATTG 51726948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 ATATGCATACCAGAGCTGTGATGGGGATGACTGACACTGGCTGGCAGAAGCCCATCATTG 1147

 51726949 ACCCTTCTTCCCAACTATATGTTCAGTGCTTTTAGGTTGGAAGCTTAAAATAAGGCATGT 51727008
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 ACCCTTCTTCCCAACTATATGTTCAGTGTTTTTAGGTTGGAAGCTTAAAATAAGGCATGT 1207

 51727009 GAGAGTATTTTCACTATAGAATTAGGCAAATGAAATAAACCAGAGCTTTTTATTCTGGAG 51727068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 GAGAGTATTTTCACTATAGAATTAGGCAAATGAAATAAACCAGAGCTTTTTATTCTGGAG 1267

 51727069 AGCTAGTTGTTAAACATTTACCAGCATACCACTGCAACCTTTTATTATTCATAAAACTTA 51727128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 AGCTAGTTGTTAAACATTTACCAGCATACCACTGCAACCTTTTATTATTCATAAAACTTA 1327

 51727129 ATAACCATGTAATATTGTTGATGATATTCCTCAGTTTGGGGTCCATTGTGATTTTTAGAT 51727188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1328 ATAACCATGTAATATTGTTGATGATATTCCTCAGTTTGGGGTCCATTGTGATTTTTAGAT 1387

 51727189 CTTTTTCTACTTTAATTCTGTAACCTTTGCTGCCAAGAAAAGATAATACATCTTTGAATT 51727248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 CTTTTTCTACTTTAATTCTGTAACCTTTGCTGCCAAGAAAAGATAATACATCTTTGAATT 1447

 51727249 TTCTTGTCTCACAGGGTTGTTTTTTAAGGACTGAAAAGATACCATTAGTGATGCCATGCC 51727308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 TTCTTGTCTCACAGGGTTGTTTTTTAAGGACTGAAAAGATACCATTAGTGATGCCATGCC 1507

 51727309 TATTTATCCCTAGGAAGGAAAGTCAAGCGATTATTAGAGGAAAAGGTAGGCCAAAATTTC 51727368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 TATTTATCCCTAGGAAGGAAAGTCAAGCGATTATTAGAGGAAAAGGTAGGCCAAAATTTC 1567

 51727369 CATTTGAACTCTTCTTTATTTTTGCATTCACAGAGGCAGGGGGTGACTCGTACTTTGAAC 51727428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 CATTTGAACTCTTCTTTATTTTTGCATTCACAGAGGCAGGGGGTGACTCGTACTTTGAAC 1627

 51727429 ACTGACACCTTAAGAGTGGTTACATAGGTAAAAACTGAACGCAAGCACTACAGGAGAGGA 51727488
          |||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 ACTGACATCTTAAGAGTGGTTATATAGGTAAAAACTGAACGCAAGCACTACAGGAGAGGA 1687

 51727489 TATTAAGCAAGATCTAAGAATCAAGGTGATCAACAAGAACACTAACCTTTTATTTTCCAG 51727548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 TATTAAGCAAGATCTAAGAATCAAGGTGATCAACAAGAACACTAACCTTTTATTTTCCAG 1747

 51727549 GAGAGGTGGGAAGGAAGAAACAGAAGGTACTGGGGCACGATGAATCAAAGTCAACGCCCT 51727608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 GAGAGGTGGGAAGGAAGAAACAGAAGGTACTGGGGCACGATGAATCAAAGTCAACGCCCT 1807

 51727609 GAATGACCTGAGGTTCTACAACCACCTGGGAGGTTTTGCTGGGTCAGTACAACGTCATAT 51727668
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 GAATGACCTCAGGTTCTACAACCACCTGGGAGGTTTTGCTGGGTCAGTACAACGTCATAT 1867

 51727669 GATTATTACAAATTATTCCCTATTTTTCAGGAATTGGATTAAGTTACATTACCTAATTCC 51727728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 GATTATTACAAATTATTCCCTATTTTTCAGGAATTGGATTAAGTTACATTACCTAATTCC 1927

 51727729 CTTGCCAGGCATTTGTTTCTCAGAAACAAAAAATTCTGCAGTAACCTATTCAATTAGTAT 51727788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 CTTGCCAGGCATTTGTTTCTCAGAAACAAAAAATTCTGCAGTAACCTATTCAATTAGTAT 1987

 51727789 TATGCCTATGCGTTGTTTTGTAAATCACAAATGTAAAATAGATATTCTTTAAAGAGTACC 51727848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 TATGCCTATGCGTTGTTTTGTAAATCACAAATGTAAAATAGATATTCTTTAAAGAGTACC 2047

 51727849 TACTACATGTCAAGCAATGACCCTGAGGGATAAATACCATTATACCCATTTTAGTGATGA 51727908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 TACTACATGTCAAGCAATGACCCTGAGGGATAAATACCATTATACCCATTTTAGTGATGA 2107

 51727909 AAGAACTGAAACAAAAAGCGGTAAAGTAACTTGTGCAAAGAAATATACCTAGGAAGTAGA 51727968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2108 AAGAACTGAAACAAAAAGCGGTAAAGTAACTTATGCAAAGAAATATACCTAGGAAGTAGA 2167

 51727969 GGGGATATGACTTGTACCCACAAAGGATTGTTAATTACTTCTCTATTCTTCAGTCTGAAA 51728028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 GGGGATATGACTTGTACCCACAAAGGATTGTTAATTACTTCTCTATTCTTCAGTCTGAAA 2227

 51728029 AATAATTTCAAACATGTACTGTATATAT--GTCTTGACTATTTTATGTACGTCCTGTAAA 51728086
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 AATAATTTCAAACATGTACTGTATATATATGTCTTGACTATTTTATGTACGTCCTGTAAA 2287

 51728087 AACTCAGAAGGACTGGTCAGCCAACCTACAAAATCTTGCAAGCTCTTCTAATCTCCCTCA 51728146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 AACTCAGAAGGACTGGTCAGCCAACCTACAAAATCTTGCAAGCTCTTCTAATCTCCCTCA 2347

 51728147 CACTCAATACAGTCAAAAATTCGAAGACAGAATCAAGGTCTGATCTGTTGATATCTCAAT 51728206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 CACTCAATACAGTCAAAAATTCGAAGACAGAATCAAGGTCTGATCTGTTGATATCTCAAT 2407

 51728207 GAGTCTACGACAAGTGAAGAAGTTATACATTGCTGTAAACAACAATGACAAAAATTTTCG 51728266
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 GAGTCTATGACAAGTGAAGAAGTTATACATTGCTGTAAACAACAATGACAAAAATTTTCG 2467

 51728267 AGAAAATAATTATAAGGGTTGAGCTTACATCCTCTCTATCACAGTTTTATGTACCTATTC 51728326
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 AGAAAATAATTATAAGGGTTGAGTTTACATCCTCTCTATCACAGTTTTATGTACCTATTC 2527

 51728327 CACCAGGACAAGAAAACAATTACAAATAAAGGCAAACTGATGATTGAATGGGGGTAGAGA 51728386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 CACCAGGACAAGAAAACAATTACAAATAAAGGCAAACTGATGATTGAATGGGGGTAGAGA 2587

 51728387 GGGGTTGGATAGAGAAGGAATCAGCAATTAGAATAAATCCTCCAGTCAAATGATTGCCCC 51728446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 GGGGTTGGATAGAGAAGGAATCAGCAATTAGAATAAATCCTCCAGTCAAATGATTGCCCC 2647

 51728447 AGGAAAGTAAAAGCCCAGAGAAGATTATGAAAGAAGATTCTTAAATACTAGATATTCCTA 51728506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 AGGAAAGTAAAAGCCCAGAGAAGATTATGAAAGAAGATTCTTAAATACTAGATATTCCTA 2707

 51728507 GGAATTTTAGAAGACTGGAGATAGCATTTTACTCCTGGGTCTTCTGAAGAAAAGCCGAAT 51728566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 GGAATTTTAGAAGACTGGAGATAGCATTTTACTCCTGGGTCTTCTGAAGAAAAGCCGAAT 2767

 51728567 GCTGTGGACTCCTCATGAACATGTCCTAGGAGAGAAATAGACAATAAGGACACTAAAGGA 51728626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 GCTGTGGACTCCTCATGAACATGTCCTAGGAGAGAAATAGACAATAAGGACACTAAAGGA 2827

 51728627 AGATCTGGGGGCAGTCCACTATTTTTTATTTATATTTTTTTACTCAACACCAATTTTGTT 51728686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 AGATCTGGGGGCAGTCCACTATTTTTTATTTATATTTTTTTACTCAACACCAATTTTGTT 2887

 51728687 GAGTTGCTATGTGTTAAACAGAGTTTGGGGCATCATAATACAAAGAAAATCCCTATTTGC 51728746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 GAGTTGCTATGTGTTAAACAGAGTTTGGGGCATCATAATACAAAGAAAATCCCTATTTGC 2947

 51728747 CCTCCTTGCCATTTATAAGGACAGACGGACAATTTAGAAAGCTATGCAGGTGCTATAAGT 51728806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 CCTCCTTGCCATTTATAAGGACAGACGGACAATTTAGAAAGCTATGCAGGTGCTATAAGT 3007

 51728807 ACTGATTAGAGCAAGTATAAAGAGCTAGCACACAACAGAGATATCAAAACCTGCGCAGCA 51728866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 ACTGATTAGAGCAAGTATAAAGAGCTAGCACACAACAGAGATATCAAAACCTGCGCAGCA 3067

 51728867 TGCTCAGGGAAGCCTAGCAGAGAAAACGACCTCTATGCTGAGTTCATGGAAGCTGAACAT 51728926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 TGCTCAGGGAAGCCTAGCAGAGAAAACGACCTCTATGCTGAGTTCATGGAAGCTGAACAT 3127

 51728927 TATGAATTGAAGAGCACAAATAAGTTGAATGTGGCTAAGGGACAGAATGCAGGAAAGGTA 51728986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 TATGAATTGAAGAGCACAAATAAGTTGAATGTGGCTAAGGGACAGAATGCAGGAAAGGTA 3187

 51728987 GAGCAGAGTGCTGAGAGATAATGCTGGAACCCAAAGCAGACAGCAGGACACGGAAGCTCC 51729046
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 GAGCAGAGTGCCGAGAGATAATGCTGGAACCCAAAGCAGACAGCAGGACACGGAAGCTCC 3247

 51729047 ATGACACATTAGGAATGTCAGACTTTCCTTGGAAAGCACTGAGAATTCTTTAAAAGTTTC 51729106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 ATGACACATTAGGAATGTCAGACTTTCCTTGGAAAGCACTGAGAATTCTTTAAAAGTTTC 3307

 51729107 ACGCAAGGGAATGGATGGCAAGATCAGATCTGCATTTAGAAAGTTCAGAGATTGAAACAC 51729166
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 ATGCAAGGGAATGGATGGCAAGATCAGATCTGCATTTAGAAAGTTCAGAGATTGAAACAC 3367

 51729167 CGAAAAATGGCAAGCTAAGTGGCTGTTGTGGTTCTACAGGTGAAAAGTAATGGTAGCCCA 51729226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 CGAAAAATGGCAAGCTAAGTGGCTGTTGTGGTTCTACAGGTGAAAAGTAATGGTAGCCCA 3427

 51729227 GACTGGAGAAGGATTTGGGGAAGGAGAGTAGTAGAAAGACTCAAAAGGGATTTATTAAGG 51729286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 GACTGGAGAAGGATTTGGGGAAGGAGAGTAGTAGAAAGACTCAAAAGGGATTTATTAAGG 3487

 51729287 AGGAAAATTGAGCTGATAGGTGATTAGTGTGGGAAATAAGGTACAAAGATGAGTCAAGGA 51729346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 AGGAAAATTGAGCTGATAGGTGATTAGTGTGGGAAATAAGGTACAAAGATGAGTCAAGGA 3547

 51729347 TGACTCCATGTTTCAGGTTTAGACCAGCATTTGCCTCAGTGGGATTCTGAGCACCCAGAG 51729406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 TGACTCCATGTTTCAGGTTTAGACCAGCATTTGCCTCAGTGGGATTCTGAGCACCCAGAG 3607

 51729407 AGAAACAGGTCTACAGAAAAAAATCATAAATCCCATTTTGGCAAGTTGAGTTTTAGAGTA 51729466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 AGAAACAGGTCTACAGAAAAAAATCATAAATCCCATTTTGGCAAGTTGAGTTTTAGAGTA 3667

 51729467 GCCACACTAAAAAGCTCAAAATAAACAAGTTAAATTAATTTTAGTAATATATTTAGCCCA 51729526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 GCCACACTAAAAAGCTCAAAATAAACAAGTTAAATTAATTTTAGTAATATATTTAGCCCA 3727

 51729527 ATCTATCCAAAATATTATTTCAACATGATCAATATAAACAAATTATTGAGATATTTTACA 51729586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 ATCTATCCAAAATATTATTTCAACATGATCAATATAAACAAATTATTGAGATATTTTACA 3787

 51729587 TTCTTTTTTTCATATTAAGTCTTATCTATATGGTGGGTAATTCACTCTTACGGCACATCA 51729646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 TTCTTTTTTTCATATTAAGTCTTATCTATATGGTGGGTAATTCACTCTTACGGCACATCA 3847

 51729647 CAATTTGGACTAGGGAGATCTAAAAAGAGCACACAAAATCCTACTGATAATATTGTACTT 51729706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 CAATTTGGACTAGGGAGATCTAAAAAGAGCACACAAAATCCTACTGATAATATTGTACTT 3907

 51729707 GTTTCGTGTAATTATTTCTATACAGAAAAAAAAAATGTTTACCTAAAGTTTGGGATAGAT 51729766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 GTTTCGTGTAATTATTTCTATACAGAAAAAAAAAATGTTTACCTAAAGTTTGGGATAGAT 3967

 51729767 AAATCCAAGAACTATGTGGGACATTTTATAATTATGGGACCCTGGAGAAAAACTGTCACT 51729826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 AAATCCAAGAACTATGTGGGACATTTTATAATTATGGGACCCTGGAGAAAAACTGTCACT 4027

 51729827 GGCATGTGTTTCTGATATGAGGTCCTGACTTACATTGGCAGAACTAACACTACCCCTGTC 51729886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 GGCATGTGTTTCTGATATGAGGTCCTGACTTACATTGGCAGAACTAACACTACCCCTGTC 4087

 51729887 TCACCAGGAACACTGAGGTTCATAGGGGGAAGCTGGTAGAAACAGAAGCTGGGAAAGGAA 51729946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 TCACCAGGAACACTGAGGTTCATAGGGGGAAGCTGGTAGAAACAGAAGCTGGGAAAGGAA 4147

 51729947 CGCTATCCAGAATACCTGCGGCTTCTACAGAAAGCATGTTTTCAGAGCTGATGAGAGAGA 51730006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 CGCTATCCAGAATACCTGCGGCTTCTACAGAAAGCATGTTTTCAGAGCTGATGAGAGAGA 4207

 51730007 AAACAATATAAGCAGCACTCACGCAGATCAAGCATGCTGTCATTTTAACAAAACATAAAC 51730066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 AAACAATATAAGCAGCACTCACGCAGATCAAGCATGCTGTCATTTTAACAAAACATAAAC 4267

 51730067 TAGACTCTGCCTTGTAGAGTGGCAGTTTTTTCTTCACCCAAATATTAAATAGTGTGGCCA 51730126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 TAGACTCTGCCTTGTAGAGTGGCAGTTTTTTCTTCACCCAAATATTAAATAGTGTGGCCA 4327

 51730127 ACTTCAAATATTTAAATACTTCTGTCATCCCAACTGCTGGCTTTGAGTCATAGGAACCAA 51730186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 ACTTCAAATATTTAAATACTTCTGTCATCCCAACTGCTGGCTTTGAGTCATAGGAACCAA 4387

 51730187 TAAAGTAGGAAGTGCCACAAAGGTAAGCACCGTCAGATTTAAGGCAGTGAGGGACAGGAA 51730246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 TAAAGTAGGAAGTGCCACAAAGGTAAGCACCGTCAGATTTAAGGCAGTGAGGGACAGGAA 4447

 51730247 CAGAAGGTTGCCAATGTCAAACAAATAACTTATAGTGAAAATGGACCAGAGAGGGGGCCT 51730306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 CAGAAGGTTGCCAATGTCAAACAAATAACTTATAGTGAAAATGGACCAGAGAGGGGGCCT 4507

 51730307 ACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAGCTTGGTTCTTAGCAGAACAGGAAGAGGATGTCT 51730366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 ACCAAGGAAGAACTCACACTCCAAGAGCTTGGTTCTTAGCAGAACAGGAAGAGGATGTCT 4567

 51730367 TGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCACTCCCTGCCCTCTCTGGACCTCTTACTGAGGGAG 51730426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 TGTTTATGCAGCTATGTAAAGCCTCACTCCCTGCCCTCTCTGGACCTCTTACTGAGGGAG 4627

 51730427 GGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAGCAGGGTGCTTATGCCATATTAGATCTCCATCAA 51730486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 GGAGTTAAGGGTTGAAAGTGAAGACAGCAGGGTGCTTATGCCATATTAGATCTCCATCAA 4687

 51730487 CATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGTGAGAGCTTTGTAAATCAACTCTTAGGGTGCTTG 51730546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 CATGCAACCCCAAAAGATCATAACTGTGAGAGCTTTGTAAATCAACTCTTAGGGTGCTTG 4747

 51730547 CCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTAATCCTTTCTCCATGAAATGCAGCAAAGTTTGCA 51730606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 CCCCAGGGCAAATAGCACAACAAATTAATCCTTTCTCCATGAAATGCAGCAAAGTTTGCA 4807

 51730607 TCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTAGCTCTGACATGTTCCTAATGAGGTTATAATGCT 51730666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 TCTATGCTGAATTCAAATTGCTCATTAGCTCTGACATGTTCCTAATGAGGTTATAATGCT 4867

 51730667 TTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCACAAATAGCTAGGGATAGAATCATAGAAAGATAA 51730726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 TTGGGACAAAGATCAAGCCACTGAGCACAAATAGCTAGGGATAGAATCATAGAAAGATAA 4927

 51730727 AATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCTCTCAGACTTTAATACCAATCACCTGGGCATTGT 51730786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 AATTAGAAGGACCTTAGAGGAGTGCCTCTCAGACTTTAATACCAATCACCTGGGCATTGT 4987

 51730787 AATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTGAGAGTCTGCATTTCTAAAAAAAA 51730836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 AATTCAGGACATCTGGGGCCCAGTCTGAGAGTCTGCATTTCTAAAAAAAA 5037

EXCISED REGION

 51730838 CCCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACAACATTTTGAGCAGCAAGACCTTAGAG 51730897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 CCCTGGTGCTGCTGCTGCTGCTGGTCCATGGACAACATTTTGAGCAGCAAGACCTTAGAG 5099

 51730898 ATCATCTAATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAGCACATCAGGGCCAAGAGATTTATAAC 51730957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 ATCATCTAATTCAGTTGCCTCTCCTAGAGGTGAGCACATCAGGGCCAAGAGATTTATAAC 5159

 51730958 TGGAAGCACGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTAGGGTCAGTTGAGTATTTGTCCATAGA 51731017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 TGGAAGCACGCTGAGACTTCCAGGTGACTAATTAGGGTCAGTTGAGTATTTGTCCATAGA 5219

 51731018 CCTGTGAGTCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATCTAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGCCT 51731077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 CCTGTGAGTCAACCTGAAAATTTTAAATAGAATCTAAGGAGTAGAGTGACCAATCAGCCT 5279

 51731078 AGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTTGCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAATCC 51731137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 AGATGACTGAGGAAGTTTCCAGAACATGGAATTTGCCTTTTTAAAACAAGAAAAAAATCC 5339

 51731138 AGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGACCCTTTTGAATCTACTTAGAACACAG 51731197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 AGGAAAACCAGGATAAGTTTTTCATCCTGCTAGACCCTTTTGAATCTACTTAGAACACAG 5399

 51731198 TATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTCCCCAAGTGGTGGGATCATGACCTGCC 51731257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 TATCAGTATTACATTTTTCTTGACCTTGTCAGTCCCCAAGTGGTGGGATCATGACCTGCC 5459

 51731258 AAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAATGCTCAAACAAGTT 51731317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     5460 AAGGCAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAACGCTCAAACAAGTT 5519

 51731318 TCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCCTA 51731377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 TCAGGCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCCTA 5579

 51731378 CCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAAATAAATAT 51731437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 CCAGTAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAAATAAATAT 5639

 51731438 TATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCTCATTTGATAAAAT 51731497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 TATAGAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCTCATTTGATAAAAT 5699

 51731498 GCATGTAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAAAACATCCT 51731557
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 GCATATAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAAAACATCCT 5759

 51731558 TGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGTCA 51731617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 TGGTAAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGTCA 5819

 51731618 TGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTACATATTATTATTTTAC 51731677
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5820 TGCTCTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTTCATATTATTATTTTAC 5879

 51731678 TCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAATG 51731737
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 TCACTGGAATTGGGCTCATTAACGTTAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAATG 5939

 51731738 AAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATCGCTAAGGCTTCTAAAACAGAATGC 51731797
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5940 AAAAATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATTGCTAAGGCTTCTAAAACAGAATGC 5999

 51731798 CAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAACCACAATGA 51731857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 CAAAGCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAACCACAATGA 6059

 51731858 TTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGTCTGACTGAATTAC 51731917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 TTCTCACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGTCTGACTGAATTAC 6119

 51731918 TTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTA 51731977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 TTGACTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTA 6179

 51731978 AATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCATT 51732037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 AATATATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCATT 6239

 51732038 ACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCT 51732097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 ACCTGGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCT 6299

 51732098 GACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAA 51732157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 GACTTAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAA 6359

 51732158 TGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCA 51732217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 TGTATTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCA 6419

 51732218 ACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCTGGAGCATATTGAACACTTAAA 51732277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6420 ACCTTGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCCGGAGCATATTGAACACTTAAA 6479

 51732278 AAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTAAT 51732337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 AAGAGCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTAAT 6539

 51732338 AATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGA 51732397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 AATACTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGA 6599

 51732398 AGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATAT 51732457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 AGTTATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATAT 6659

 51732458 TGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATTCAGCAGCT 51732517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 TGCTAGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATTCAGCAGCT 6719

 51732518 GTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACA 51732577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 GTCAAAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACA 6779

 51732578 ATTTCCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCTAA 51732637
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     6780 ATTTCCCTTCTATAAGCCTCAACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCAGCAAGCTAA 6839

 51732638 AAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTC 51732697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6840 AAAGTATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTC 6899

 51732698 CACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAA 51732757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6900 CACAGGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAA 6959

 51732758 GGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGACCCATCCAAGT 51732817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6960 GGGTTTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGACCCATCCAAGT 7019

 51732818 CTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACT 51732877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7020 CTTCCAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACT 7079

 51732878 TCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTAC 51732937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7080 TCAACTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTAC 7139

 51732938 ACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCAT 51732997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7140 ACAATGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCAT 7199

 51732998 ATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGT 51733057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7200 ATTTATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGT 7259

 51733058 TTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATA 51733117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7260 TTTACAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATA 7319

 51733118 ACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTT 51733177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7320 ACTGCAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTT 7379

 51733178 TCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCT 51733237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7380 TCTATCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCT 7439

 51733238 GTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTG 51733297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7440 GTCACAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTG 7499

 51733298 CTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATG 51733357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7500 CTAAATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATG 7559

 51733358 CCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAA 51733417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7560 CCAATAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAA 7619

 51733418 TTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCA 51733477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7620 TTTATTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCA 7679

 51733478 TTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATT 51733537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7680 TTCCTCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATT 7739

 51733538 TACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCT 51733597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7740 TACTTTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCT 7799

 51733598 AAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGA 51733657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7800 AAGTATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGA 7859

 51733658 CTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTC 51733717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7860 CTCATTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTC 7919

 51733718 ACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACACATACTACC 51733777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7920 ACACACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACACATACTACC 7979

 51733778 ATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAAGA 51733837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     7980 ATACCATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAAGAAAATGAAAAAGA 8039

 51733838 TACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTG 51733897
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     8040 TACAAATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTA 8099

 51733898 ATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATAC 51733957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8100 ATTCATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATAC 8159

 51733958 CACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAAGC 51734017
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     8160 CACAAACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGCTTTCCCAAGC 8219

 51734018 ACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTG 51734077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8220 ACAACTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTG 8279

 51734078 CATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTA 51734137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8280 CATATACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTA 8339

 51734138 TGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTA 51734197
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8340 TGAGCTCTTGCCTGACCCCCTTCCTTGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTA 8399

 51734198 CTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATC 51734257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8400 CTGCGTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATC 8459

 51734258 AAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAA 51734317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8460 AAGAGTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAA 8519

 51734318 GCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTC 51734377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8520 GCAGAGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTC 8579

 51734378 AGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATG 51734437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8580 AGTGAAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATG 8639

 51734438 ATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGA 51734497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8640 ATATGAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGA 8699

 51734498 GGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAA 51734557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8700 GGCATTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAA 8759

 51734558 ACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGG-AAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATT 51734616
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     8760 ACAATCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATT 8819

 51734617 CATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATATT 51734676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     8820 CATTTAATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTAGTGATTCAAACCACAAGAGCATATT 8879

 51734677 TACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACC 51734736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8880 TACTTAAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACC 8939

 51734737 TCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTA 51734796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8940 TCTTTCACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTA 8999

 51734797 AAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGA 51734856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9000 AAAAGTGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGA 9059

 51734857 AAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATA 51734916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9060 AAACATTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATA 9119

 51734917 CCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCA 51734976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9120 CCAGGTATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCA 9179

 51734977 TCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGC 51735036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9180 TCTGGCTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGC 9239

 51735037 CTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCA 51735096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9240 CTTTATGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCA 9299

 51735097 CCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTC 51735156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9300 CCATAATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTC 9359

 51735157 TTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATG 51735216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9360 TTTTAGGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATG 9419

 51735217 ATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCAT 51735276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     9420 ATTCACAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATTGGCCTTATTTATCAT 9479

 51735277 CTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATG 51735336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9480 CTGTTCTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATG 9539

 51735337 GCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCAT 51735396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9540 GCCACACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCAT 9599

 51735397 CTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAA 51735456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9600 CTTTTAGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAA 9659

 51735457 AAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAA 51735516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9660 AAGATGAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAA 9719

 51735517 AAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATG 51735576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9720 AAACAAAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATG 9779

 51735577 ACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAG 51735636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     9780 ACAAAGGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTCAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAG 9839

 51735637 ACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAAT 51735696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9840 ACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAAT 9899

 51735697 ATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAA 51735756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9900 ATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAA 9959

 51735757 ATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATA 51735816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9960 ATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATA 10019

 51735817 CAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGT 51735876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
    10020 CAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGAATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGT 10079

 51735877 GGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATA 51735936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10080 GGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATA 10139

 51735937 TGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAA 51735996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10140 TGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAA 10199

 51735997 CTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAA 51736056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10200 CTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAA 10259

 51736057 ATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTACATC 51736116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10260 ATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTACATC 10319

 51736117 TATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACAAGT 51736176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
    10320 TATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACAACT 10379

 51736177 TAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCCCAAAAGGTTACATACTA 51736236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
    10380 TAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCTCAAAAGGTTACATACTA 10439

 51736237 TATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTATAGTGACAGAGAATATATTAG 51736296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
    10440 TATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTGTAGTGACAGAGAATATATTAG 10499

 51736297 TGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTG 51736356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10500 TGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTG 10559

 51736357 GGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACA 51736416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10560 GGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACA 10619

 51736417 TGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATT 51736476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10620 TGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATT 10679

 51736477 TTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCC 51736536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10680 TTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCC 10739

 51736537 ACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGT 51736596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10740 ACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGT 10799

 51736597 TAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCC 51736645
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10800 TAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCC 10848

Alignment time is 12.9613 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3780] =>      3780 nucs 'mol-32-33a0-094957_3780'

Score:        3713
Aligned:      3783        nucs
Identic:      3775 (100%) nucs =>       155 (100%)      3620 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51735955,51736109] EXCISED REGION [51736805,51740431]
 second seq =>  [       1,     155] EXCISED REGION [     156,    3780]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51735955 TAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAA 51736014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAA 60

 51736015 CCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAG 51736074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAG 120

 51736075 TGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 51736109
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 155

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      156 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 215

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      216 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 275

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      276 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 335

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      336 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 395

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      396 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 455

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      456 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 515

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
      516 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 575

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 635

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      636 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 695

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      696 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 755

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 815

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 875

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 935

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 995

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
      996 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC---TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 1052

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1053 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 1112

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 1172

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 1232

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 AGCTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 1292

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 1352

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 1412

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 1472

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 1532

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 1592

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 1652

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTT 51738363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
     1653 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTTCCCTGTGATTT 1712

 51738364 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 51738423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 1772

 51738424 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 51738483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 1832

 51738484 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 51738543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 1892

 51738544 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 51738603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 1952

 51738604 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 51738663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 2012

 51738664 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 51738723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 2072

 51738724 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 51738783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 2132

 51738784 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 51738843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 2192

 51738844 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 51738903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 2252

 51738904 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 51738963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 2312

 51738964 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 51739023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 2372

 51739024 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 51739083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 2432

 51739084 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 51739143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 2492

 51739144 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 51739203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 2552

 51739204 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 51739263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 2612

 51739264 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 51739323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 2672

 51739324 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 51739383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 2732

 51739384 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 51739443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 2792

 51739444 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 51739503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 2852

 51739504 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 51739563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 2912

 51739564 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 51739623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 2972

 51739624 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCACTAGGGAGTGCCAGACAGTGG 51739683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCACTAGGGAGTGCCAGACAGTGG 3032

 51739684 GCGCAGGCCAGTGTGTGTGCGCACCGTGCGCGAGCCGAAGCAGGGCGAGGCATTGCCTCA 51739743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 GCGCAGGCCAGTGTGTGTGCGCACCGTGCGCGAGCCGAAGCAGGGCGAGGCATTGCCTCA 3092

 51739744 CCTGGGAAGCGCAAGGGGTCAGGGAGTTCCCTTTCCGAGTCAAAGAAAGGGGTGACGGAC 51739803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 CCTGGGAAGCGCAAGGGGTCAGGGAGTTCCCTTTCCGAGTCAAAGAAAGGGGTGACGGAC 3152

 51739804 GCACCTGGAAAATCGGGTCACTCCCACCCAAATATTGCGCTTTTCAGACCGGCTTAAGAA 51739863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 GCACCTGGAAAATCGGGTCACTCCCACCCAAATATTGCGCTTTTCAGACCGGCTTAAGAA 3212

 51739864 ACGGCGCACCACGAGACTATATCCCACACCTGGCTCAGAGGGTCCTACGCCCACGGAATC 51739923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 ACGGCGCACCACGAGACTATATCCCACACCTGGCTCAGAGGGTCCTACGCCCACGGAATC 3272

 51739924 TCGCTGATTGCTAGCACAGCAGTCTGAGATCAAACGGCAAGGCGGCAACGAGGCTGTGGG 51739983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 TCGCTGATTGCTAGCACAGCAGTCTGAGATCAAACGGCAAGGCGGCAACGAGGCTGTGGG 3332

 51739984 AGGGGCGCCCGCCATTGCCCAGGCTTGCTTAGGTAAACAAAGCAGCTGGGAAGCTCGAAC 51740043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3333 AGGGGCGCCCGCCATTGCCCAGGCTTGCTTAGGTAAACAAAGCAGCCGGGAAGCTCGAAC 3392

 51740044 TGGGTGGAGCCCACCACAGCTCAAGGAGGCCTGCCTGCCTCTGTAGGCTCCACCTCTGGG 51740103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 TGGGTGGAGCCCACCACAGCTCAAGGAGGCCTGCCTGCCTCTGTAGGCTCCACCTCTGGG 3452

 51740104 GGCAGGGCACAGACAAACAAAAAGACAGCAGTAACCTCTGCAGACTTAAGTGTCCCTGTC 51740163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 GGCAGGGCACAGACAAACAAAAAGACAGCAGTAACCTCTGCAGACTTAAGTGTCCCTGTC 3512

 51740164 TGACAGCTTTGAAGAGAGCAGTGGTTCTCCCAGCACGCAGCTGGAGATCTGAGAACGGGC 51740223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 TGACAGCTTTGAAGAGAGCAGTGGTTCTCCCAGCACGCAGCTGGAGATCTGAGAACGGGC 3572

 51740224 AGACTGCCTCCTCAAGTGGGTCCCTGACCCCTGACCCCCGAGCAGCCTAACTGGGAGGCA 51740283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 AGACTGCCTCCTCAAGTGGGTCCCTGACCCCTGACCCCCGAGCAGCCTAACTGGGAGGCA 3632

 51740284 CCCCCCAGCAGGGGCACACTGACACCTCACACAGCAGGGTATTCCAACAGACCTGCAGCT 51740343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 CCCCCCAGCAGGGGCACACTGACACCTCACACAGCAGGGTATTCCAACAGACCTGCAGCT 3692

 51740344 GAGGGTCCTGTCTGTTAGAAGGAAAACTAACAACCAGAAAGGACATCTACACCGAAAACC 51740403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 GAGGGTCCTGTCTGTTAGAAGGAAAACTAACAACCAGAAAGGACATCTACACCGAAAACC 3752

 51740404 CATCTGTACATCACCATCATCAAAGACC 51740431
          ||||||||||||||||||||||||||||
     3753 CATCTGTACATCACCATCATCAAAGACC 3780

Alignment time is 5.08793 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3971] =>      3971 nucs 'mol-32-33a0-173776_3971'

Score:        3788
Aligned:      3964        nucs
Identic:      3948 (100%) nucs =>        10 (100%)      3938 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51735603,51735612] EXCISED REGION [51735614,51739567]
 second seq =>  [       1,      10] EXCISED REGION [      12,    3961]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51735613,51735613]
 second seq =>         1 nucs [11,11]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [51736811,51736811]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51735612,51735612] to [51735613,51735613]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51735603 AAAGAACTCT 51735612
          ||||||||||
        1 AAAGAACTCT 10

EXCISED REGION

 51735614 AGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCA 51735673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       12 AGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAACGCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCA 71

 51735674 AAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTT 51735733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       72 AAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACAGATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTT 131

 51735734 CAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACC 51735793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      132 CAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACC 191

 51735794 TATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGT 51735853
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      192 TATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGA 251

 51735854 ATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTG 51735913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      252 ATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTG 311

 51735914 GCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGG 51735973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      312 GCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGG 371

 51735974 TATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATA 51736033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      372 TATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATA 431

 51736034 ACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAAT 51736093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      432 ACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAAT 491

 51736094 GGATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATG 51736153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      492 GGATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATGGAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATG 551

 51736154 TAATATTGATATGTGCAACAAGTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGC 51736213
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      552 TAATATTGATATGTGCAACAACTTAGATGAATCCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGC 611

 51736214 CAGTCCCAAAAGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAAC 51736273
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      612 CAGTCTCAAAAGGTTACATACTATATGACTCCATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAAC 671

 51736274 TATAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGC 51736333
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      672 TGTAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCAGTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGC 731

 51736334 TACAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGG 51736393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 TACAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATGCAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGG 791

 51736394 TGGTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCA 51736453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 TGGTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAAGCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCA 851

 51736454 GTTTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAAC 51736513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 GTTTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACTTTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAAC 911

 51736514 AATAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTG 51736573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 AATAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCTCTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTG 971

 51736574 CTAGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTT 51736633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 CTAGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAGTCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTT 1031

 51736634 TGCAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTC 51736693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 TGCAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAACAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTC 1091

 51736694 AGTGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTG 51736753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 AGTGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAGAAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTG 1151

 51736754 GAGAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAA 51736813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     1152 GAGAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAATAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAG-AA 1210

 51736814 AAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAG 51736873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 AAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAG 1270

 51736874 ACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAA 51736933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 ACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAA 1330

 51736934 TATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAG 51736993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 TATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAG 1390

 51736994 AAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCC 51737053
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 AAATAATTGAAGAAAACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCC 1450

 51737054 ACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAAT 51737113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 ACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAAT 1510

 51737114 TGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGT 51737173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 TGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGT 1570

 51737174 TACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGACAGAA 51737233
          |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     1571 TACATACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTTGAGACAGAA 1629

 51737234 TCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTG 51737293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 TCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTG 1689

 51737294 CTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 51737353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 CTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGC 1749

 51737354 TTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGG 51737413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 TTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGG 1809

 51737414 CCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGC 51737473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 CCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGC 1869

 51737474 TGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACC 51737533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 TGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACC 1929

 51737534 AGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCA 51737593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 AGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCA 1989

 51737594 ACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAAC 51737653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 ACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAAC 2049

 51737654 TTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAAGTTACCTTAG 51737713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2050 TTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCAGAAAGTTACCTTAG 2109

 51737714 GGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAAA 51737773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 GGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTACGAATCAGAAA 2169

 51737774 CAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGAT 51737833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 CAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTTCAAGGGAGAT 2229

 51737834 TCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGAT 51737893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 TCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATAAACTCTGGAT 2289

 51737894 TGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCTT 51737953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 TGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTACAACTTGGCTT 2349

 51737954 ATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAATGCTTATAGC 51738013
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||| ||||||||
     2350 ATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCATAAGGCATATAGAATAAT-CTTATAGC 2408

 51738014 ATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTTA 51738073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 ATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTACAATAAGTTA 2468

 51738074 CATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGAT 51738133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 CATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAATCTATATCGAT 2528

 51738134 AGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGGG 51738193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 AGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTTGAATGGGGGG 2588

 51738194 ACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTTT 51738253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 ACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAGTTTTTATTTT 2648

 51738254 TTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACATATA 51738313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 TTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTGTATACATATA 2708

 51738314 CATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTTGTGCACATTT 51738373
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2709 CATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTGTGATTTGTGCACATTT 2768

 51738374 CTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACAAATACTAGAG 51738433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2769 CTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGAACAAATACTAGAG 2828

 51738434 AAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATGTCCTTGC 51738493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 AAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTAATGTCCTTGC 2888

 51738494 ATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACAAGCAGGC 51738553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 ATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAGACAAGCAGGC 2948

 51738554 ACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACTTTCAAAT 51738613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 ACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATAACTTTCAAAT 3008

 51738614 GAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAAAAAACAG 51738673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 GAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAGAAAAAAACAG 3068

 51738674 AAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAATGCAAAT 51738733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 AAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAATAAATGCAAAT 3128

 51738734 ATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAGATTTCTC 51738793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 ATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAATGAGATTTCTC 3188

 51738794 CCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGGGAAACAA 51738853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 CCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTTAGGGAAACAA 3248

 51738854 AAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAATCACCCC 51738913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 AAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGGAAATCACCCC 3308

 51738914 TAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACGGTATTTT 51738973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 TAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAATACGGTATTTT 3368

 51738974 TTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCATCCTACAG 51739033
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 TTAAAGTAACATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGCCATCCTACAG 3428

 51739034 ATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTTTTTTAGTGTG 51739093
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     3429 ATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACA-TTTTTTTAGTGTG 3487

 51739094 AAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTACGCACCCA 51739153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 AAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAACTACGCACCCA 3547

 51739154 AACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAGTCATTCG 51739213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 AACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTTAAGTCATTCG 3607

 51739214 TACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAGTACCAAC 51739273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 TACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGAGAGTACCAAC 3667

 51739274 ACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTCTTCCAGA 51739333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 ACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAGTTCTTCCAGA 3727

 51739334 AAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTATATATGA 51739393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 AAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAATTATATATGA 3787

 51739394 GTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGGCCAGGCG 51739453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 GTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCCTGGCCAGGCG 3847

 51739454 CAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACGAGGT 51739513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 CAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGGATCACGAGGT 3907

 51739514 CAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAA 51739567
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 CAGGAGATTGAGACTATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTAAAAA 3961

Alignment time is 5.13198 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3773] =>      3773 nucs 'mol-32-33b6-046504_3773'

Score:        3621
Aligned:      3775        nucs
Identic:      3761 (100%) nucs =>      1984 (100%)      1777 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51735706,51737697] EXCISED REGION [51737698,51739480]
 second seq =>  [       1,    1990] EXCISED REGION [    1993,    3773]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1991,1992]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51735706 GCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATT 51735765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCAAATT 60

 51735766 AAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAA 51735825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTGACAA 120

 51735826 TAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAA 51735885
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGAATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAATGCAA 180

 51735886 AATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTAT 51735945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCCTTAT 240

 51735946 CATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTT 51736005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTACATTT 300

 51736006 ATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAA 51736065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAA 360

 51736066 CAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATG 51736125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCATTACATCTATCTAATG 420

 51736126 GAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACAAGTTAGATGAAT 51736185
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      421 GAATACTATTCGTCGATAATAAGGAATGTAATATTGATATGTGCAACAACTTAGATGAAT 480

 51736186 CCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCCCAAAAGGTTACATACTATATGACTCC 51736245
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCAATGGCATTCAGGAGTGAAGGAAGCCAGTCTCAAAAGGTTACATACTATATGACTCC 540

 51736246 ATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTATAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCA 51736305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTATATGACTGTTGAAAAGGCAAAACTGTAGTGACAGAGAATATATTAGTGATTGCCA 600

 51736306 GTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATG 51736365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGGTTTAAAGCAAGAGGAGGCTGTGGCTACAAAGATGGAGCAAGGAACTGGGGTGGATG 660

 51736366 CAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAA 51736425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAACTGTTCTGTGTCTTGATTGTCGTGGTGGTTGTTACACAAATGTGTACATGTGTTAAA 720

 51736426 GCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACT 51736485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTCATAGAACTGTACATCAAAAAGTCAGTTTTGCTGTATATTAATATATTTTAAAAACT 780

 51736486 TTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCT 51736545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAACAAAAAGTCTGAAAAGAAAGAAACAATAAGTGTTTTCATGATTTTCCACAAAATCT 840

 51736546 CTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAG 51736605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTTGACAAACACTATCCAATCAAGCTGCTAGTGCCTCACTGTTCCATTGTTAAAAATAG 900

 51736606 TCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAA 51736665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTTACATTTGAGGATTACCAGAATTTTTGCAATCACTCCCAACATGAAAAATGATGAAA 960

 51736666 CAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAG 51736725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAATAAACAAATAGCAGAAAAGAAACTCAGTGGACACAAAGCTAGTCTAGAAATCAGAAG 1020

 51736726 AAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAA 51736785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAACAAAAACTATAATTAATGGCCTTGGAGAAATAAGTATATTATATCCATGAAACAAA 1080

 51736786 TAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAAT 51736845
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGAAGCCTAAAATATTATTTTTAGAAAAAAA-GGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAAT 1139

 51736846 TCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAA 51736905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TCAATATCATAGAAAGTAGAACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAA 1199

 51736906 GATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAG 51736965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GATGAGAAAAACATTCCAGGAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAG 1259

 51736966 GAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAG 51737025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1260 GAAAACATAGGGGAAAGAATTATCAAAGAAATAATTGAAGAAAACTGTGCAGAAGGAAAG 1319

 51737026 GATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGA 51737085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GATATAATTTTCCAGACTGAAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGA 1379

 51737086 GCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTA 51737145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GCCACAGCAAAGTGCATCATATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTA 1439

 51737146 AGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTG 51737205
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AGAGCTTTCAGAGAGAAAAAAAATAAGTTACATACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTG 1499

 51737206 TTTTTTGGTTTTTTTTTTTGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTG 51737265
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TTTTTTGGTTTTTTTTTT-GAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTG 1558

 51737266 GCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAG 51737325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GCATGATCTCGGCTCACTGCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAG 1618

 51737326 CCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTT 51737385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 CCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTT 1678

 51737386 TAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTG 51737445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 TAGTAGAGACAGGGTTTTGCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTG 1738

 51737446 ATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAG 51737505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 ATCTGCACACCTCGGCCTCCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAG 1798

 51737506 TATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCT 51737565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TATCTTAAAACTATTCAGCCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCT 1858

 51737566 TCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAAT 51737625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TCAAAATTTCAATGCAAAATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAAT 1918

 51737626 AAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTT 51737685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 AAAGGGGTCTCCATATATAGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTT 1978

 51737686 TTTTTTTTTTTT 51737697
          ||||||||||||
     1979 TTTTTTTTTTTT 1990

EXCISED REGION

 51737698 CAGAAAGTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAG 51737757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 CAGAAAGTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAG 2052

 51737758 ATGTACGAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGAT 51737817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 ATGTACGAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGAT 2112

 51737818 AATGTTCAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTA 51737877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 AATGTTCAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTA 2172

 51737878 AGCATAAACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAA 51737937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 AGCATAAACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAA 2232

 51737938 TTTTACAACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATA 51737997
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2233 TTTTACAACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCATAAGGCATATA 2292

 51737998 GAATAATGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAAC 51738057
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 GAATAAT-CTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAAC 2351

 51738058 CAGGTACAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAA 51738117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 CAGGTACAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAA 2411

 51738118 ATTAATCTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGT 51738177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 ATTAATCTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGT 2471

 51738178 GGGGTTGAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTAT 51738237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 GGGGTTGAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTAT 2531

 51738238 TATTAGTTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCT 51738297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 TATTAGTTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCT 2591

 51738298 TAGTTGTATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTA 51738357
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2592 TAGTTGTATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTG 2651

 51738358 TGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGT 51738417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 TGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGT 2711

 51738418 AGGACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGG 51738477
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 AGAACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGG 2771

 51738478 AGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTT 51738537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 AGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTT 2831

 51738538 GTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAA 51738597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 GTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAA 2891

 51738598 TGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAA 51738657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 TGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAA 2951

 51738658 AAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGT 51738717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 AAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGT 3011

 51738718 AGAAATAAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGA 51738777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 AGAAATAAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGA 3071

 51738778 GAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACA 51738837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 GAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACA 3131

 51738838 GAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAA 51738897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 GAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAA 3191

 51738898 AATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGT 51738957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 AATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGT 3251

 51738958 CTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAA 51739017
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 CTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAACATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAA 3311

 51739018 GACAGCCATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGA 51739077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 GACAGCCATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGA 3371

 51739078 CATTTTTTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAA 51739137
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 CA-TTTTTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAA 3430

 51739138 ACAAACTACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGT 51739197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 ACAAACTACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGT 3490

 51739198 ATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGG 51739257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 ATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGG 3550

 51739258 CTGTGAGAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGAT 51739317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 CTGTGAGAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGAT 3610

 51739318 AAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGC 51739377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 AAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGC 3670

 51739378 CACCAATTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTT 51739437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 CACCAATTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTT 3730

 51739438 AATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCA 51739480
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 AATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCA 3773

Alignment time is 4.83467 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    7703] =>      7703 nucs 'mol-32-34a8-083916_7703'

Score:        7613
Aligned:      7707        nucs
Identic:      7696 (100%) nucs =>      4844 (100%)      2852 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51731262,51736109] EXCISED REGION [51736805,51739662]
 second seq =>  [       1,    4848] EXCISED REGION [    4849,    7703]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51731262 CAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAATGCTCAAACAAGTTTCAG 51731321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
        1 CAAGTACCTTAATATCCTGTCCCAAAGATCTCAAAGAGCAAACGCTCAAACAAGTTTCAG 60

 51731322 GCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCCTACCAG 51731381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCACTACAGAGCCTTCTAACATCACATTGACAAGTGCCTCTCCAAGAGACAGCCTACCAG 120

 51731382 TAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAAATAAATATTATA 51731441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGATCTCAAAGTAAAGCATGATAAAGGACTATCAGGAACACGCAGAAATAAATATTATA 180

 51731442 GAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCTCATTTGATAAAATGCAT 51731501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAGCATATAATGTTCCTTTTAAGTACACAAATCTATTTTCCTCATTTGATAAAATGCAT 240

 51731502 GTAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAAAACATCCTTGGT 51731561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTAAGAAATAAATCACTAATTTTTATAACTCTCAAAACACTCATTTAAAACATCCTTGGT 300

 51731562 AAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGTCATGCT 51731621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAACACTAAAATAATAAAAATCAGGCTGCATCCCTGAGAATGAAGAAAAAGTCATGCT 360

 51731622 CTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTACATATTATTATTTTACTCAC 51731681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGCACAATCAAAATGATTAGAAATAAAAATATATCCCTACATATTATTATTTTACTCAC 420

 51731682 TGGAATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAATGAAAA 51731741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGAATTGGGCTCATTAACGTCAGGTAGAATAATGAATGTCTAGAAAGCAAAAATGAAAA 480

 51731742 ATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATCGCTAAGGCTTCTAAAACAGAATGCCAAA 51731801
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTCCAGACTATTCAGTGCTACCAGTGCATTGCTAAGGCTTCTAAAACAGAATGCCAAA 540

 51731802 GCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAACCACAATGATTCT 51731861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCACTGATTCCACATGCATTCAAAATACAGAGTTAGTGCAATCCTAACCACAATGATTCT 600

 51731862 CACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGTCTGACTGAATTACTTGA 51731921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACTCCCTGAAGTTTACTTGTTCAAGTAAGAGGCCAATGAGGTCTGACTGAATTACTTGA 660

 51731922 CTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTAAATA 51731981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTAATACTCATGGAGTTAGGACACTTAAGACAAAGGAAGAAAATAAGTGTGGCTAAATA 720

 51731982 TATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCATTACCT 51732041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATACAATGCATTTGGAATAAGTAAAAGACAGAACCCTAGACATTCAGCAATCATTACCT 780

 51732042 GGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCTGACT 51732101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAAATTAAAGAGGGCAGGAGCAATCCTATTATGCATTATAAACAGCCCCGCTGCTGACT 840

 51732102 TAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAATGTA 51732161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAATGGTAGTTTGAGTAGCATAACCAAGGAGTCCTTGCTCCAATATTAATAGGAAATGTA 900

 51732162 TTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCAACCT 51732221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGTAGGAATCCAATAGTTCATGAAATTAACAAGGAAAATGAACTGGAGTGAAGCAACCT 960

 51732222 TGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCTGGAGCATATTGAACACTTAAAAAGA 51732281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCAAGTAATAGGAGGCATCAGCAATTGCTTCCCTGGAGCATATTGAACACTTAAAAAGA 1020

 51732282 GCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTAATAATA 51732341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTTGGGAAGAGTACATGTATATAAATGAGAATGGACATTTTTAGAATTTTTTAATAATA 1080

 51732342 CTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGAAGTT 51732401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTTTAATTTAAATATATTTCAAACTCTCTGTTGGCTGTAAGTCTTTCTAAGAAGAAGTT 1140

 51732402 ATTAGCCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATATTGCT 51732461
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTAACCCAAAATGTCAATGAGAGGTCACAAGCTATGAGATCTGGTCCAAAGATATTGCT 1200

 51732462 AGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATTCAGCAGCTGTCA 51732521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTTAGCTGCCATTTGAGTCAGCTTAAAACTACCATACACTCATGATTCAGCAGCTGTCA 1260

 51732522 AAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTT 51732581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAATTATTCCCATTTCACTTCTTTAGAGCTAAATACTTCAAATAATCTAGAAAACAATTT 1320

 51732582 CCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAG 51732641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCTTCTATAAGCCTCGACAGCCAGAATAACAGATGCATGCCCATCGGCAAGCTAAAAAG 1380

 51732642 TATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACA 51732701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATAGTTAATTCCACTTACAAACCAATAGACATACGATGAAAAAGAACACCTCCTCCACA 1440

 51732702 GGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGT 51732761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGCACTGCCATGGACAACCCGACCAAAGCTTGAATTGACCAAACAAGAAGCTGAAAGGGT 1500

 51732762 TTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGACCCATCCAAGTCTTC 51732821
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1501 TTCCATAGAAGCAAGAATGTGACTTCTGTTTTTCCCAGACAGAGATCCATCCAAGTCTTC 1560

 51732822 CAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAA 51732881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAAAATTGCTGCATGAGGAAATGGAAATGCCACTAAGTTTGAAGAGTTTGTAAACTTCAA 1620

 51732882 CTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTACACAA 51732941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGGCTGGTCTTCACAGTAAATCCACCTATAAATTGGAAAACAGAAAGATTATTACACAA 1680

 51732942 TGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCATATTT 51733001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGGCACAAATAGCAACTAAATTCACTGGAGTGATGGTCTTAGGATTTAAATTGCATATTT 1740

 51733002 ATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTA 51733061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATCTAGTTTTACAATTCACCTATTCATGCAAGAAAAAAAGTGTTTTCTGTGGGTGTTTTA 1800

 51733062 CAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATAACTG 51733121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGTGAGTGTTTACTGTCTACCAAGCTCTGGTGTGCTAGAGATACTAAGAGGTATAACTG 1860

 51733122 CAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTA 51733181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGCATTGGCCCTACCTTCATGCAGTCTATAGTCCACATTGTAGGGCAGTGATTTTTCTA 1920

 51733182 TCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCA 51733241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCATGGTTGATTTTACCTTCCAAGAGACATGGCACTATTTTCAATCATTTTTGGCTGTCA 1980

 51733242 CAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAA 51733301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAATTGGGGAGCTGGCAGTGCTACTGGCAGCTAGTAGGTAGAAACCAGAGATGCTGCTAA 2040

 51733302 ATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATGCCAA 51733361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATATCCTACAATGCACAGGACAATCCCCACAACAAAGAATTATCTCACCCAAAATGCCAA 2100

 51733362 TAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAATTTA 51733421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAGTGCCAAGGGTAAGAAACTCTGGTCTAGTGGGAAATAGAAGCAGAAAACATTAATTTA 2160

 51733422 TTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCC 51733481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTAATTACTAAGCACCAAAGATGCTATGGTTTAGTCTTCCAATCTTTCAGCTTTCATTCC 2220

 51733482 TCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATTTACT 51733541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCTGTGGTGAGTCTAACCCCTCCAATACCTCTTACTATAAGGTTTATTTAAACATTTACT 2280

 51733542 TTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCTAAGT 51733601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTCAAAAGCAAACTCAATTAATCACTTGGGCAAATAGTATTAGTAATACACTTTCTAAGT 2340

 51733602 ATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGACTCA 51733661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTAGCTGTAGGGCCACACTTCTTGGCAGTCTTTCCCCAACACCACTGCCATGTGACTCA 2400

 51733662 TTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTCACAC 51733721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTGGTACTATCAGTCCAATTGCCTAAAAGGAAAGTATGGCAGTGATCTTCTAATTCACAC 2460

 51733722 ACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACACATACTACCATAC 51733781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACCCATGTCATTAAAGGAAGAAAACTAAGTACACATCTCCCAGTACACATACTACCATAC 2520

 51733782 CATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAAGATACA 51733841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CATAATATATTATGTACATTATAAAATATAAAAAAAAGAAAATAAAATGAAAAAGATACA 2580

 51733842 AATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTGATTC 51733901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATAGAGGCTCTAATGTTTTCATTCTGCAGCCCAATAGAGTACATGCAGTGAATTGATTC 2640

 51733902 ATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATACCACA 51733961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATACATGAAAGGCTACACAATTGCACCTCTTGCAACTTCTGTATTTCATTTGATACCACA 2700

 51733962 AACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAA 51734021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AACCACCTGCAGCTCTACATTTCAGTCATACTGGACTTCTTTGTGATTTCCCAAGCACAA 2760

 51734022 CTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATA 51734081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTTACTTCTTGGATTCTATTTTTTGTGTGTATACTGTTCCTAGAAATTCTTCCTTGCATA 2820

 51734082 TACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAG 51734141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TACCTTCTTGCAAACTTCTATTCACCTTCCTAAACCCTACTCAAGAATAACCTCTATGAG 2880

 51734142 CTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGC 51734201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTCTTGCCTGACCCCCTTCCTCGGCCCCTTCACTGACTTTGTTGAGTCCTCTATTACTGC 2940

 51734202 GTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGA 51734261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GTTCATCATGCTCTCTTACAATAATAGGCTTGGACATTTATTTTAGTGCCTAGATCAAGA 3000

 51734262 GTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAG 51734321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTTCCTGGAGGACAGAAACTATGTGTTTTTTATATTTGTACCCCCTAGGTCCTTAAGCAG 3060

 51734322 AGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTG 51734381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGCCTGAAATAGATGGTATTTAAGCAAATGAAAAGAGGGGTTAGCCAATACTATTCAGTG 3120

 51734382 AAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATAT 51734441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAAAGGGATTAGAGTTCATAGGAGTAGTGTGATTTTTTTTCACTGTCTCATGAATGATAT 3180

 51734442 GAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCA 51734501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAAATAGTCAAGATATTAAAGAATTGAGGAATTGCGATTGCAAGCACTTGTTATGAGGCA 3240

 51734502 TTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAA 51734561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTTTATTTCTATTATTATTTCTACAATCCTAAACTCAGATGCCACCCAAATAAAAACAA 3300

 51734562 TCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTT 51734621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCTTTCATTCTGCCTACATAGGAAAAAAAAGTAAAGTGGAGACTTGTTGATTATTCATTT 3360

 51734622 AATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTT 51734681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AATTAAAAAAACAAACAATTATCTAAATTGGTGATTCAAACCACAAGAGCATATTTACTT 3420

 51734682 AAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTT 51734741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAATTACTTGGTTTGGCTGTTTACGATGATCAAATCAACTAGATTACTCTCTACCTCTTT 3480

 51734742 CACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAG 51734801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CACCTTGGCCCATGAGTCCTCCAAGTTATTTCTTACCACCTCTGAGATGTGGTTAAAAAG 3540

 51734802 TGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACA 51734861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGAGCAAGAACTCCTATGTTTCCCTTTGTGCATACATCAAGCCCTGGACTGTTGAAAACA 3600

 51734862 TTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGG 51734921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTAAGTACCTGAACTTTGGCTCCTTCAGGAAAGGCTGTATGCATGTTAGTTTATACCAGG 3660

 51734922 TATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGG 51734981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TATCTACCCATCTAACTCCATTCTTTCATTTAATCAATAAACTGCCTACTAGGCATCTGG 3720

 51734982 CTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTA 51735041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTCTGTGCTAGCTACTAATAATTAAAACTCTGAGCAAGAAATACATGATCTCTGCCTTTA 3780

 51735042 TGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATA 51735101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGAAGGTCAGAGTCCAGCAGAGACATAGGACCATAATGATAGAATGTGATAGGCACCATA 3840

 51735102 ATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTA 51735161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATAGGAGCAGGACAGGGAGCTGCAGAAGCTGTACTGGGAGAACCTCCAGGATGTCTTTTA 3900

 51735162 GGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCA 51735221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GGAGATTTAAGCAACAGTTTCTACTGATGCAATCTTATAACTGAAAGAGATAATGATTCA 3960

 51735222 CAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCATCTGTT 51735281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CAAAGTATTTGCCACTATTTATAATACTGACTTGAATATGGGCCTTATTTATCATCTGTT 4020

 51735282 CTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCAC 51735341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CTGTCTATTCAAATAATTACCTTGTCCTTGGGAACAGTCTGAACAGGTTCTAATGGCCAC 4080

 51735342 ACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTT 51735401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ACAGTTGATGAGATCAAAATTAACAAAGGTTGTGTTAGACACCATCAGTTCCCATCTTTT 4140

 51735402 AGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGAT 51735461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGGAGTTTTAATCCCAGATGACATACACAGACTTCCCTGTGATTTAAAAGAAAAAAAGAT 4200

 51735462 GAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAAAAACA 51735521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GAAAGCAAAATAAGAAAACTGGACACATGAAATACAATTCATAATGCATGAATAAAAACA 4260

 51735522 AAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATGACAAA 51735581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AAGATAAAAAAGCGAGCTATTGACTAAGAGAAAATATTTGCCAATCACACATATGACAAA 4320

 51735582 GGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAAC 51735641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GGACCTATATCCAGAATATAGAAAGAACTCTTAGGTTTCAACAGCAAGAAAATAGACAAC 4380

 51735642 GCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACA 51735701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GCAATTCAAAAATCAGGAAAAAAAAACCTTCAAAAGATAACCCAGAAAAGAAAATATACA 4440

 51735702 GATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCA 51735761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GATAGCAAATAAGCACAGAAAAAAAAAATGTTCAACATCATTATTCACTAGGGAAATGCA 4500

 51735762 AATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTG 51735821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AATTAAGATCACACTAAAATATACTATGCACCTATTGAATGAATAAATAAAAATACAGTG 4560

 51735822 ACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAAT 51735881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ACAATAGTAAGTGCTGATGAGGATGAGAAAGTATTAAAACTCTCCTGTTTCTAGTGGAAT 4620

 51735882 GCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCC 51735941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GCAAAATGAGACAGCCACTGTGGAAAACTTTGGCAGTTTCTTATAAAGTTAAATATGCCC 4680

 51735942 TTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTAC 51736001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TTATCATATGACCTAGCAATTCAACTCCTAGGTATTTACCTTGGAGAAATGAAAACTTAC 4740

 51736002 ATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATG 51736061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATTTATATAAAAACCTGAGACAAATGTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATG 4800

 51736062 GAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 51736109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATAAATGAATGGATTAACAAACTGCA 4848

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 4908

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4909 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 4968

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4969 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 5028

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5029 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 5088

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5089 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 5148

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5149 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 5208

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     5209 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 5268

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5269 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 5328

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5329 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 5388

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5389 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 5448

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5449 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 5508

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5509 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 5568

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5569 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 5628

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5629 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 5688

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||
     5689 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 5744

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5745 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 5804

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5805 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 5864

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5865 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 5924

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5925 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 5984

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5985 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 6044

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6045 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 6104

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6105 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 6164

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6165 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 6224

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6225 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 6284

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6285 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 6344

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTT 51738363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
     6345 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTTCCCTGTGATTT 6404

 51738364 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 51738423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6405 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 6464

 51738424 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 51738483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6465 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 6524

 51738484 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 51738543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6525 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 6584

 51738544 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 51738603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6585 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 6644

 51738604 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 51738663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6645 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 6704

 51738664 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 51738723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6705 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 6764

 51738724 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 51738783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6765 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 6824

 51738784 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 51738843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6825 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 6884

 51738844 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 51738903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6885 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 6944

 51738904 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 51738963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6945 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 7004

 51738964 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 51739023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7005 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 7064

 51739024 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 51739083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7065 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 7124

 51739084 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 51739143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7125 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 7184

 51739144 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 51739203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7185 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 7244

 51739204 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 51739263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7245 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 7304

 51739264 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 51739323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7305 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 7364

 51739324 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 51739383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7365 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 7424

 51739384 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 51739443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7425 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 7484

 51739444 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 51739503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7485 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 7544

 51739504 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 51739563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7545 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 7604

 51739564 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 51739623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7605 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 7664

 51739624 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCA 51739662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7665 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCA 7703

Alignment time is 9.29887 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2855] =>      2855 nucs 'mol-32-34a8-083916_2855'

Score:        2825
Aligned:      2853        nucs
Identic:      2848 (100%) nucs =>      1543 (100%)      1305 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51736805,51738351] EXCISED REGION [51738358,51739662]
 second seq =>  [       1,    1544] EXCISED REGION [    1551,    2855]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [51738352,51738357]
 second seq =>         6 nucs [1545,1550]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1545,1545] to [1551,1551]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51738351,51738351] to [51738358,51738358]
 second seq =>         1 nucs [1544,1544] to [1551,1551]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 60

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 120

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 180

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 240

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 300

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 360

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 51737224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 420

 51737225 -GAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 480

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 540

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 600

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 660

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 720

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 780

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 840

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||
      841 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----CAGAAA 896

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 956

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 1016

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 1076

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 1136

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 1196

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 1256

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 1316

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 1376

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 1436

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 1496

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATT 51738351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATT 1544

EXCISED REGION

 51738358 TGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGT 51738417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 TGATTTGTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGT 1610

 51738418 AGGACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGG 51738477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 AGGACAAATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGG 1670

 51738478 AGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTT 51738537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 AGTTTAATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTT 1730

 51738538 GTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAA 51738597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 GTTAAGACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAA 1790

 51738598 TGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAA 51738657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 TGGATAACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAA 1850

 51738658 AAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGT 51738717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 AAGAAGAAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGT 1910

 51738718 AGAAATAAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGA 51738777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 AGAAATAAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGA 1970

 51738778 GAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACA 51738837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 GAAAATGAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACA 2030

 51738838 GAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAA 51738897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 GAATTTAGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAA 2090

 51738898 AATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGT 51738957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 AATGGGAAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGT 2150

 51738958 CTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAA 51739017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 CTGAATACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAA 2210

 51739018 GACAGCCATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGA 51739077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 GACAGCCATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGA 2270

 51739078 CATTTTTTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAA 51739137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 CATTTTTTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAA 2330

 51739138 ACAAACTACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGT 51739197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 ACAAACTACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGT 2390

 51739198 ATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGG 51739257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 ATATTTAAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGG 2450

 51739258 CTGTGAGAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGAT 51739317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 CTGTGAGAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGAT 2510

 51739318 AAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGC 51739377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 AAAAAGTTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGC 2570

 51739378 CACCAATTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTT 51739437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 CACCAATTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTT 2630

 51739438 AATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGC 51739497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 AATTCCTGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGC 2690

 51739498 GGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCT 51739557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 GGGCGGATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCT 2750

 51739558 GTACTAAAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAG 51739617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 GTACTAAAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAG 2810

 51739618 ACGGGTGATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCA 51739662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 ACGGGTGATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCA 2855

Alignment time is 3.73147 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51726109,51746804] =>     20696 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3507] =>      3507 nucs 'mol-32-34b3-055797_3507'

Score:        3452
Aligned:      3509        nucs
Identic:      3503 (100%) nucs =>        83 (100%)      3420 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51736027,51736109] EXCISED REGION [51736805,51740229]
 second seq =>  [       1,      83] EXCISED REGION [      84,    3507]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       695 nucs [51736110,51736804]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [51736110,51736111] to [51736805,51736806]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51736110,51736110] to [51736804,51736804]
 second seq =>         0 nucs

 51736027 GTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATA 51736086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTCATAACAGTTCCATTTATAATCACCAAATATGGAAACAAGTCAAGTGCACCTCAATA 60

 51736087 AATGAATGGATTAACAAACTGCA 51736109
          |||||||||||||||||||||||
       61 AATGAATGGATTAACAAACTGCA 83

EXCISED REGION

 51736805 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 51736864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       84 TTTTAGAAAAAAAAGGAAATAGGAGAGTAGAAAAAAGGAATTCAATATCATAGAAAGTAG 143

 51736865 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 51736924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      144 AACAAAAAGACAAAGAGATGGAAAATCAGTAAGAACATTAAGATGAGAAAAACATTCCAG 203

 51736925 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 51736984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      204 GAGGCCCAATATTTAAATAATCATAGCTTTAAGGAAAAGAGGAAAACATAGGGGAAAGAA 263

 51736985 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 51737044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      264 TTATCAAAGAAATAATTGAAGAATACTGTGCAGAAGGAAAGGATATAATTTTCCAGACTG 323

 51737045 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 51737104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      324 AAAAGTCCCACTCAGTATCTAGCACAATGTTTAGAAAAAGAGCCACAGCAAAGTGCATCA 383

 51737105 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 51737164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      384 TATTGAAATTGCAAAACACCAGGGACAAGGACAAGTTCCTAAGAGCTTTCAGAGAGAAAA 443

 51737165 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGG-TTTTTTTTTT 51737223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
      444 AAAATAAGTTACGTACAAAAATCCTGGAATCTGAGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTTTTTT 503

 51737224 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 51737283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      504 TGAGACAGAATCTCACTCTGTTGCACAGTCTGCAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACT 563

 51737284 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 51737343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      564 GCAACCTCTGCTTCCTGGGTTGAAGTGATTCTCCTACTTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGA 623

 51737344 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 51737403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      624 CTACAGGTGCTTGCCACCACATCTGGCTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGACAGGGTTTT 683

 51737404 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 51737463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      684 GCCATGTTGGCCAGGCAGGTCTCCAACCCCTGACCTCAGGTGATCTGCACACCTCGGCCT 743

 51737464 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 51737523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      744 CCCAAACTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGAATCTGAGTATCTTAAAACTATTCAG 803

 51737524 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 51737583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      804 CCTCAAGACCAGAAGGAGCTACAAGATGATGGAATATTGCCTTCAAAATTTCAATGCAAA 863

 51737584 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 51737643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      864 ATGAACTTCAACCTGGTATCCTGTAACCAACAATCTACTAATAAAGGGGTCTCCATATAT 923

 51737644 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 51737703
          ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||
      924 AGCTCAGAACTTTCACCTTCCATCGTTTCC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGAAA 981

 51737704 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 51737763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      982 GTTACCTTAGGGTATGTTCAAACAAAATGAGGAATTAAGCCAGAAAAGAAGAAGATGTAC 1041

 51737764 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 51737823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1042 GAATCAGAAACAAGAGTTCCAATACTAGACAGACATGAAGGAAATCTCCAGGATAATGTT 1101

 51737824 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 51737883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1102 CAAGGGAGATTCTAAGATGGAGCTTTGAAACCCTTCTTATACATTGCTGGTGTAAGCATA 1161

 51737884 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 51737943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1162 AACTCTGGATTGTTGCTTGGCATTATCCACTAAAGTTACACGATGATCCAGCAATTTTAC 1221

 51737944 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 51738003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1222 AACTTGGCTTATATTCAACAGAAATGCATGCACATGAAGACCAGAAGGCATATAGAATAA 1281

 51738004 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 51738063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1282 TGCTTATAGCATTATTATTTGTAAATAACCAAACTTACAAATGATGAAAACAACCAGGTA 1341

 51738064 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 51738123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1342 CAATAAGTTACATGCTTTATGATTCCATTTAGACCAACTTAAAAAACAGGAGAAATTAAT 1401

 51738124 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 51738183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1402 CTATATCGATAGAAGGCTGAATAATGCTTGCCCTTTGGCTAGGGCGTGCGGAGTGGGGTT 1461

 51738184 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 51738243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1462 GAATGGGGGGACAAGAAGAGGCTTTAGAGGAGCTGATAATGTTCATTTATTTATTATTAG 1521

 51738244 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 51738303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1522 TTTTTATTTTTTAGAGACAGGATCTTGCTCTGGCAATGTTCTATTTCTTGTTCTTAGTTG 1581

 51738304 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTCCCCTATGATTT 51738363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||
     1582 TATACATATACATGGTTGGTTTGCTTTGTAAAAATCCACTGAGCTATTTCCCTGTGATTT 1641

 51738364 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 51738423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1642 GTGCACATTTCTCCATAAATGTTATATTTCCATGAAACATTTACCTTAAAAAGTAGGACA 1701

 51738424 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 51738483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 AATACTAGAGAAAGGTAACATAGAAGATGAGAGGGTAAGGAAAGAAGCTAAAGGAGTTTA 1761

 51738484 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 51738543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 ATGTCCTTGCATTACTTATGTAAAGTTTAACAGTGCTGATGTAATTTAGACTTTGTTAAG 1821

 51738544 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 51738603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 ACAAGCAGGCACATTAAAAACTTAAGGCCAATAGCTAAAATAATCATAACAGAATGGATA 1881

 51738604 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 51738663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 ACTTTCAAATGAGTAAATATAAAAATATGCAACACAAGACAAATCAAAATAGAAAAGAAG 1941

 51738664 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 51738723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 AAAAAAACAGAAACCAAAAACGGATTGCAAATTGAAAGTGCAAAATAAGATGGTAGAAAT 2001

 51738724 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 51738783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 AAATGCAAATATATGGGAGACATCAGCATGTGGAAGGTAATTGAAACCACTAGAGAAAAT 2061

 51738784 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 51738843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 GAGATTTCTCCCAGGGAGAGCTAGTATATTGAGAAGAAAAGGGGCCCTACAACAGAATTT 2121

 51738844 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 51738903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 AGGGAAACAAAAAGATGAAAGGTCTAAATTGAAGAAGACAAATCCACAAGTGAAAATGGG 2181

 51738904 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 51738963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 AAATCACCCCTAGAGAAATAGGAGGAAGAATGAAGCAACTCCATCAGCATCTGTCTGAAT 2241

 51738964 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 51739023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 ACGGTATTTTTTAAAGTAGCATCATCTGCTCAAATTAATTACAATAACAACGAAGACAGC 2301

 51739024 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 51739083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 CATCCTACAGATACTTCGATAAGTAGGGTGACCGTAATTTAAATTAAAATTAGACATTTT 2361

 51739084 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 51739143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 TTTTAGTGTGAAAGGGTATGTTAATTAGACAGAATGCTGGGACAATAGGTATAAACAAAC 2421

 51739144 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 51739203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 TACGCACCCAAACTAGGATATATCGTCATGCTATATAGCACATGTCTTTCTTGTATATTT 2481

 51739204 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 51739263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 AAGTCATTCGTACTGAAAATTATTCTATTCATCTCAATACAAAGGTAACATTGGCTGTGA 2541

 51739264 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 51739323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 GAGTACCAACACACGTACAGGTATGCTTAAAGGAAAAAAATTCCTTCTGATGATAAAAAG 2601

 51739324 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 51739383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 TTCTTCCAGAAAGTAATGTTTATTTTAGGATGTGACTCACAGATAATTGTATGCCACCAA 2661

 51739384 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 51739443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 TTATATATGAGTGGAAAGTCTAACAATGGACAGGCCAAATTCTTTAAAAGTCTTAATTCC 2721

 51739444 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 51739503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 TGGCCAGGCGCAGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTATGGGAGGCCAAGGCGGGCGG 2781

 51739504 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 51739563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 ATCACGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACATGTTGAAACTCCGTCTGTACTA 2841

 51739564 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 51739623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 AAAACACAAAAAATGAGCTCCGGTCTACAGCTCCCAGCGTGAGCGACGCAGAAGACGGGT 2901

 51739624 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCACTAGGGAGTGCCAGACAGTGG 51739683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 GATTTCTGCATTTCCATCTGAGGTACCGGGTTCATCTCACTAGGGAGTGCCAGACAGTGG 2961

 51739684 GCGCAGGCCAGTGTGTGTGCGCACCGTGCGCGAGCCGAAGCAGGGCGAGGCATTGCCTCA 51739743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 GCGCAGGCCAGTGTGTGTGCGCACCGTGCGCGAGCCGAAGCAGGGCGAGGCATTGCCTCA 3021

 51739744 CCTGGGAAGCGCAAGGGGTCAGGGAGTTCCCTTTCCGAGTCAAAGAAAGGGGTGACGGAC 51739803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 CCTGGGAAGCGCAAGGGGTCAGGGAGTTCCCTTTCCGAGTCAAAGAAAGGGGTGACGGAC 3081

 51739804 GCACCTGGAAAATCGGGTCACTCCCACCCAAATATTGCGCTTTTCAGACCGGCTTAAGAA 51739863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 GCACCTGGAAAATCGGGTCACTCCCACCCAAATATTGCGCTTTTCAGACCGGCTTAAGAA 3141

 51739864 ACGGCGCACCACGAGACTATATCCCACACCTGGCTCAGAGGGTCCTACGCCCACGGAATC 51739923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 ACGGCGCACCACGAGACTATATCCCACACCTGGCTCAGAGGGTCCTACGCCCACGGAATC 3201

 51739924 TCGCTGATTGCTAGCACAGCAGTCTGAGATCAAACGGCAAGGCGGCAACGAGGCTGTGGG 51739983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 TCGCTGATTGCTAGCACAGCAGTCTGAGATCAAACGGCAAGGCGGCAACGAGGCTGTGGG 3261

 51739984 AGGGGCGCCCGCCATTGCCCAGGCTTGCTTAGGTAAACAAAGCAGCTGGGAAGCTCGAAC 51740043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3262 AGGGGCGCCCGCCATTGCCCAGGCTTGCTTAGGTAAACAAAGCAGCCGGGAAGCTCGAAC 3321

 51740044 TGGGTGGAGCCCACCACAGCTCAAGGAGGCCTGCCTGCCTCTGTAGGCTCCACCTCTGGG 51740103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 TGGGTGGAGCCCACCACAGCTCAAGGAGGCCTGCCTGCCTCTGTAGGCTCCACCTCTGGG 3381

 51740104 GGCAGGGCACAGACAAACAAAAAGACAGCAGTAACCTCTGCAGACTTAAGTGTCCCTGTC 51740163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 GGCAGGGCACAGACAAACAAAAAGACAGCAGTAACCTCTGCAGACTTAAGTGTCCCTGTC 3441

 51740164 TGACAGCTTTGAAGAGAGCAGTGGTTCTCCCAGCACGCAGCTGGAGATCTGAGAACGGGC 51740223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 TGACAGCTTTGAAGAGAGCAGTGGTTCTCCCAGCACGCAGCTGGAGATCTGAGAACGGGC 3501

 51740224 AGACTG 51740229
          ||||||
     3502 AGACTG 3507

Alignment time is 4.7901 s

