
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51189472,51210122] =>     20651 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3559] =>      3559 nucs 'mol-32-1ef5-022237_3559'

Score:        3559
Aligned:      3559        nucs
Identic:      3559 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51198877,51202435]
 second seq =>  [       1,    3559]

 51198877 ATGTGGCACATATACACCATGGAATACTGTGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCC 51198936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTGGCACATATACACCATGGAATACTGTGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCC 60

 51198937 TTCGTAGGGACATGGATGAATTTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCACAAGAACAA 51198996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCGTAGGGACATGGATGAATTTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCACAAGAACAA 120

 51198997 AAAAACAAACACTGCATGTTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGGGAACACATGGA 51199056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAACAAACACTGCATGTTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGGGAACACATGGA 180

 51199057 CACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTGTGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGA 51199116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTGTGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGA 240

 51199117 TAGCATTAGGAGATATACCTAATGTTAAATGATGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCAT 51199176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGCATTAGGAGATATACCTAATGTTAAATGATGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCAT 300

 51199177 GGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCACATTGCGCACATGTACTCTAAAACTTAAA 51199236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCACATTGCGCACATGTACTCTAAAACTTAAA 360

 51199237 GTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACAGTCTCTCTTTCTTTGTCCTCCTTCTCCTC 51199296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACAGTCTCTCTTTCTTTGTCCTCCTTCTCCTC 420

 51199297 CTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTT 51199356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTT 480

 51199357 CTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTCCTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTC 51199416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTCCTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTC 540

 51199417 TTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTCTTTAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTC 51199476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTCTTTAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTC 600

 51199477 TTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTACCTACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAA 51199536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTACCTACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAA 660

 51199537 ATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAATGTACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCC 51199596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAATGTACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCC 720

 51199597 TCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACAGCTATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCA 51199656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACAGCTATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCA 780

 51199657 ATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGGATTTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCT 51199716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGGATTTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCT 840

 51199717 TTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAATTTGTTCTTAAGACAAATTTGGTCCTTTC 51199776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAATTTGTTCTTAAGACAAATTTGGTCCTTTC 900

 51199777 ACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATGGAGGAGAAACTTTCCATTCCACTGAGGCA 51199836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATGGAGGAGAAACTTTCCATTCCACTGAGGCA 960

 51199837 GCTGGTGACAGGGACTATCCTGATATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTGGTCACCCTTTCT 51199896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGGTGACAGGGACTATCCTGATATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTGGTCACCCTTTCT 1020

 51199897 ATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAGAAAATGAAACTA 51199956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAGAAAATGAAACTA 1080

 51199957 GACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACAAATAAGGGGAAA 51200016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACAAATAAGGGGAAA 1140

 51200017 AAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAAAAAGCAAACCTG 51200076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAAAAAGCAAACCTG 1200

 51200077 AAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTTTCATTGAAGGTA 51200136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTTTCATTGAAGGTA 1260

 51200137 ATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAATAAAACATGAAAT 51200196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAATAAAACATGAAAT 1320

 51200197 ATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAATGCTTAGACTAAG 51200256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAATGCTTAGACTAAG 1380

 51200257 AATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACTTCATGGATTATC 51200316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACTTCATGGATTATC 1440

 51200317 TGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATTTTTGTAAAAAGA 51200376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATTTTTGTAAAAAGA 1500

 51200377 GTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGGGTTAAGAACTCT 51200436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGGGTTAAGAACTCT 1560

 51200437 AGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTTATCTTCATGTTG 51200496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTTATCTTCATGTTG 1620

 51200497 CACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTAGAGAAATGTTGA 51200556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTAGAGAAATGTTGA 1680

 51200557 CTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGCCAAGGCCTGTGT 51200616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGCCAAGGCCTGTGT 1740

 51200617 CTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGAGTGTGGGAGTTT 51200676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGAGTGTGGGAGTTT 1800

 51200677 TCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCATTTTTCCTGAAC 51200736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCATTTTTCCTGAAC 1860

 51200737 ATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCTAAAATTAGTTGC 51200796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCTAAAATTAGTTGC 1920

 51200797 TGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACCTCAAGACACTTT 51200856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACCTCAAGACACTTT 1980

 51200857 GTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTGAATGGTTCATCA 51200916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTGAATGGTTCATCA 2040

 51200917 CAACTCATTCCTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATA 51200976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAACTCATTCCTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATA 2100

 51200977 CTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTT 51201036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTT 2160

 51201037 GATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATC 51201096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATC 2220

 51201097 CCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAG 51201156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAG 2280

 51201157 TTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCT 51201216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCT 2340

 51201217 GTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGATTTATATT 51201276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGATTTATATT 2400

 51201277 AGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACT 51201336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACT 2460

 51201337 CTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAA 51201396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAA 2520

 51201397 AATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTGAAAGATGG 51201456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTGAAAGATGG 2580

 51201457 GAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATATTATCTAA 51201516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATATTATCTAA 2640

 51201517 ACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAAAAAATTTA 51201576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAAAAAATTTA 2700

 51201577 TCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCATGGATATATTGCA 51201636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCATGGATATATTGCA 2760

 51201637 TAGTGGTGAAGTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACAATGCTAACAAAA 51201696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAGTGGTGAAGTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACAATGCTAACAAAA 2820

 51201697 ACACAGTGGGGAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAATTGGGATCACCAT 51201756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACACAGTGGGGAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAATTGGGATCACCAT 2880

 51201757 ATGCAGAAGACTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAATAAACTCAAGATG 51201816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATGCAGAAGACTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAATAAACTCAAGATG 2940

 51201817 GATTAGAGACTTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGAAAATCTAGGGAA 51201876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GATTAGAGACTTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGAAAATCTAGGGAA 3000

 51201877 ATCTCTTCTGGACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTCAAAAGCATAGAC 51201936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATCTCTTCTGGACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTCAAAAGCATAGAC 3060

 51201937 AACTGAAACAAAAATAGACAATGAGACATACTTAAGCTAAAAAGCTTCTGCACAGCACAT 51201996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AACTGAAACAAAAATAGACAATGAGACATACTTAAGCTAAAAAGCTTCTGCACAGCACAT 3120

 51201997 ATGATTTTTTTATATCAGGATCATAGTTAACAATTAACAAAATATATGAAAGACTACATC 51202056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATGATTTTTTTATATCAGGATCATAGTTAACAATTAACAAAATATATGAAAGACTACATC 3180

 51202057 TTAAATAAATGAGGACTTTGATTTTCATACTTCAGAAGTGTATAAGTGAGCCATCCATGG 51202116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTAAATAAATGAGGACTTTGATTTTCATACTTCAGAAGTGTATAAGTGAGCCATCCATGG 3240

 51202117 CTAGTGTGGTGGCTCAAATGTGCCATCAGGGTCCAGCCTCCTTCTGTCTTCATCTTTTGC 51202176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTAGTGTGGTGGCTCAAATGTGCCATCAGGGTCCAGCCTCCTTCTGTCTTCATCTTTTGC 3300

 51202177 CATTCTTAGCCTATTCTGCCTTCATATTCATAAAATAATGACTGTACCTCTGGCCGTTGT 51202236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CATTCTTAGCCTATTCTGCCTTCATATTCATAAAATAATGACTGTACCTCTGGCCGTTGT 3360

 51202237 TTTCATGTTCCAAGAGGGCAAAGGACAAAGATCAAATAGAGAACTGGGACCATGGCAGCC 51202296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTTCATGTTCCAAGAGGGCAAAGGACAAAGATCAAATAGAGAACTGGGACCATGGCAGCC 3420

 51202297 AGGTCTGCCCTGGTGCCAGTCACACAGCCATTCCTAGCTGTAAGGGAAACTGGGGAGTGT 51202356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGGTCTGCCCTGGTGCCAGTCACACAGCCATTCCTAGCTGTAAGGGAAACTGGGGAGTGT 3480

 51202357 TGTTTCTGAGCACATTGCCATTGAAAACAAAGATGAGGCTATGCCAGTAAGGAAGAAGAG 51202416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGTTTCTGAGCACATTGCCATTGAAAACAAAGATGAGGCTATGCCAGTAAGGAAGAAGAG 3540

 51202417 GCGTATAGTTATTGGGCAG 51202435
          |||||||||||||||||||
     3541 GCGTATAGTTATTGGGCAG 3559

Alignment time is 3.91973 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51189472,51210122] =>     20651 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5314] =>      5314 nucs 'mol-32-1f00-064681_5314'

Score:        5314
Aligned:      5314        nucs
Identic:      5314 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51199088,51204401]
 second seq =>  [       1,    5314]

 51199088 TGTTGTGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGTTAAATG 51199147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTTGTGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGTTAAATG 60

 51199148 ATGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCA 51199207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCA 120

 51199208 CATTGCGCACATGTACTCTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACA 51199267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATTGCGCACATGTACTCTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACA 180

 51199268 GTCTCTCTTTCTTTGTCCTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTC 51199327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCTCTCTTTCTTTGTCCTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTC 240

 51199328 TTTTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTT 51199387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTT 300

 51199388 TCCTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTC 51199447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTC 360

 51199448 TTTAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTAC 51199507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTAC 420

 51199508 CTACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAAT 51199567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAAT 480

 51199568 GTACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACA 51199627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACA 540

 51199628 GCTATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGG 51199687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCTATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGG 600

 51199688 ATTTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAA 51199747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAA 660

 51199748 TTTGTTCTTAAGACAAATTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATG 51199807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTGTTCTTAAGACAAATTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATG 720

 51199808 GAGGAGAAACTTTCCATTCCACTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCTGATATAAGAG 51199867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGGAGAAACTTTCCATTCCACTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCTGATATAAGAG 780

 51199868 TAAAGCAGGAGGTTGTGGTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGG 51199927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAAAGCAGGAGGTTGTGGTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGG 840

 51199928 CCTCTCACCATCTTAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCC 51199987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTCTCACCATCTTAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCC 900

 51199988 TACTGCCACCTCCTACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAA 51200047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACTGCCACCTCCTACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAA 960

 51200048 TTATCCCCATTCTGTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAG 51200107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTATCCCCATTCTGTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAG 1020

 51200108 TCTAGCAAGTCGGGCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCT 51200167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTAGCAAGTCGGGCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCT 1080

 51200168 GCAAAACTTTTAGAAATAAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATA 51200227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCAAAACTTTTAGAAATAAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATA 1140

 51200228 AAAAAAGAAGATTGAATGCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGT 51200287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAAAGAAGATTGAATGCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGT 1200

 51200288 AGGTGTATGAATTGACTTCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGT 51200347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGGTGTATGAATTGACTTCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGT 1260

 51200348 GGCTCTATGCATGCATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGC 51200407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGCTCTATGCATGCATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGC 1320

 51200408 TCTAAAACTTCAAAAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAA 51200467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCTAAAACTTCAAAAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAA 1380

 51200468 TAAGGGTTATCTTTTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATA 51200527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAGGGTTATCTTTTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATA 1440

 51200528 ACTTGGCATCATGGCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTG 51200587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTTGGCATCATGGCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTG 1500

 51200588 TAGGAGTACGAAGTGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACT 51200647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAGGAGTACGAAGTGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACT 1560

 51200648 TTTCTTGCGTTGAATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACA 51200707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTCTTGCGTTGAATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACA 1620

 51200708 TCCAATAGTGGCCATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTT 51200767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCCAATAGTGGCCATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTT 1680

 51200768 CCATCAGACCCTTCTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATT 51200827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCATCAGACCCTTCTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATT 1740

 51200828 TCATCTCAGGCATTACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAG 51200887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCATCTCAGGCATTACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAG 1800

 51200888 GATGAGGCTAGACAGTGAATGGTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAGACCTACTAAC 51200947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GATGAGGCTAGACAGTGAATGGTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAGACCTACTAAC 1860

 51200948 AGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATAT 51201007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATAT 1920

 51201008 TAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTT 51201067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTT 1980

 51201068 TCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAG 51201127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAG 2040

 51201128 TGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACA 51201187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACA 2100

 51201188 GAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAA 51201247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAA 2160

 51201248 CGTTCTGTGGCAGTATAATGATTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTGTTTAT 51201307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CGTTCTGTGGCAGTATAATGATTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTGTTTAT 2220

 51201308 CCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAAACATA 51201367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAAACATA 2280

 51201368 AACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAAATGAT 51201427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAAATGAT 2340

 51201428 GAGTTGTAAACATAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTA 51201487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAGTTGTAAACATAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTA 2400

 51201488 CTGTGAAATACGACATGGATATTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATA 51201547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGTGAAATACGACATGGATATTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATA 2460

 51201548 CATATTCTTTAAAATTTTTAAAAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCA 51201607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CATATTCTTTAAAATTTTTAAAAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCA 2520

 51201608 TGTAGTCAATGTTGCATGGATATATTGCATAGTGGTGAAGTCAAAGCTCTTAATGTCTCC 51201667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGTAGTCAATGTTGCATGGATATATTGCATAGTGGTGAAGTCAAAGCTCTTAATGTCTCC 2580

 51201668 ATCACTAATTTTTGACAATGCTAACAAAAACACAGTGGGGAAAGGACACTCTTTTCAGCA 51201727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATCACTAATTTTTGACAATGCTAACAAAAACACAGTGGGGAAAGGACACTCTTTTCAGCA 2640

 51201728 AATAGTGCTAGGAAAATTGGGATCACCATATGCAGAAGACTGAAACCTGACCCCTATCTC 51201787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AATAGTGCTAGGAAAATTGGGATCACCATATGCAGAAGACTGAAACCTGACCCCTATCTC 2700

 51201788 TCACCATATACAAAAATAAACTCAAGATGGATTAGAGACTTAAATGTATGACCTGAGACT 51201847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCACCATATACAAAAATAAACTCAAGATGGATTAGAGACTTAAATGTATGACCTGAGACT 2760

 51201848 ATAAAAATATCAGAAGAAAATCTAGGGAAATCTCTTCTGGACATTGGTCCAAGCAAAGAG 51201907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATAAAAATATCAGAAGAAAATCTAGGGAAATCTCTTCTGGACATTGGTCCAAGCAAAGAG 2820

 51201908 TTTATGACTAAGACCTCAAAAGCATAGACAACTGAAACAAAAATAGACAATGAGACATAC 51201967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTATGACTAAGACCTCAAAAGCATAGACAACTGAAACAAAAATAGACAATGAGACATAC 2880

 51201968 TTAAGCTAAAAAGCTTCTGCACAGCACATATGATTTTTTTATATCAGGATCATAGTTAAC 51202027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTAAGCTAAAAAGCTTCTGCACAGCACATATGATTTTTTTATATCAGGATCATAGTTAAC 2940

 51202028 AATTAACAAAATATATGAAAGACTACATCTTAAATAAATGAGGACTTTGATTTTCATACT 51202087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AATTAACAAAATATATGAAAGACTACATCTTAAATAAATGAGGACTTTGATTTTCATACT 3000

 51202088 TCAGAAGTGTATAAGTGAGCCATCCATGGCTAGTGTGGTGGCTCAAATGTGCCATCAGGG 51202147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCAGAAGTGTATAAGTGAGCCATCCATGGCTAGTGTGGTGGCTCAAATGTGCCATCAGGG 3060

 51202148 TCCAGCCTCCTTCTGTCTTCATCTTTTGCCATTCTTAGCCTATTCTGCCTTCATATTCAT 51202207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCCAGCCTCCTTCTGTCTTCATCTTTTGCCATTCTTAGCCTATTCTGCCTTCATATTCAT 3120

 51202208 AAAATAATGACTGTACCTCTGGCCGTTGTTTTCATGTTCCAAGAGGGCAAAGGACAAAGA 51202267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAAATAATGACTGTACCTCTGGCCGTTGTTTTCATGTTCCAAGAGGGCAAAGGACAAAGA 3180

 51202268 TCAAATAGAGAACTGGGACCATGGCAGCCAGGTCTGCCCTGGTGCCAGTCACACAGCCAT 51202327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCAAATAGAGAACTGGGACCATGGCAGCCAGGTCTGCCCTGGTGCCAGTCACACAGCCAT 3240

 51202328 TCCTAGCTGTAAGGGAAACTGGGGAGTGTTGTTTCTGAGCACATTGCCATTGAAAACAAA 51202387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCCTAGCTGTAAGGGAAACTGGGGAGTGTTGTTTCTGAGCACATTGCCATTGAAAACAAA 3300

 51202388 GATGAGGCTATGCCAGTAAGGAAGAAGAGGCGTATAGTTATTGGGCAGAAGGCTATAGGA 51202447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GATGAGGCTATGCCAGTAAGGAAGAAGAGGCGTATAGTTATTGGGCAGAAGGCTATAGGA 3360

 51202448 GCAGCAACAGTTCACAAACGTAAGCAGCCTCAAGGCAATTCAGGGGAAGCTCCCATTTCT 51202507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GCAGCAACAGTTCACAAACGTAAGCAGCCTCAAGGCAATTCAGGGGAAGCTCCCATTTCT 3420

 51202508 CTAGCTGAAAGTCAGTGTTGTCACCTTAGCTACATCACTCCATTACACAAACCCTGGGGT 51202567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTAGCTGAAAGTCAGTGTTGTCACCTTAGCTACATCACTCCATTACACAAACCCTGGGGT 3480

 51202568 AAAACATAGCTGGGGCCTGCGTTATGTACAACCCCCAGGTTTCTGTTGTGTGCTGTCCCA 51202627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AAAACATAGCTGGGGCCTGCGTTATGTACAACCCCCAGGTTTCTGTTGTGTGCTGTCCCA 3540

 51202628 GATACAAAGGACTCACTGAGAAACTGTGCTCAGTGCTATACAACTGAAAAAGCATGGGCT 51202687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GATACAAAGGACTCACTGAGAAACTGTGCTCAGTGCTATACAACTGAAAAAGCATGGGCT 3600

 51202688 CGGATTCAAAAGACCAGAGTTCAAGTCTTTCATCTGCCATTTACCACCAGTGTGACCTTA 51202747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CGGATTCAAAAGACCAGAGTTCAAGTCTTTCATCTGCCATTTACCACCAGTGTGACCTTA 3660

 51202748 GGCAAATCATCAGCCTCAAGTTCTTCATGTGTAAAGTGTAGATGATAACACTGTCTTAGG 51202807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGCAAATCATCAGCCTCAAGTTCTTCATGTGTAAAGTGTAGATGATAACACTGTCTTAGG 3720

 51202808 AAATAAGGTTTCTGGGAAGTTTAAATGAGATGATGTTTATAAAAACACCTTATGGGAAAT 51202867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAATAAGGTTTCTGGGAAGTTTAAATGAGATGATGTTTATAAAAACACCTTATGGGAAAT 3780

 51202868 TAAGTATAAATACCACCTATGATTATGATGATTTTCAATTGAGCACTCAATTTGTTCATT 51202927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TAAGTATAAATACCACCTATGATTATGATGATTTTCAATTGAGCACTCAATTTGTTCATT 3840

 51202928 TACTTTATTTTATTATAGGGTCACTTCATTTTAATAATTGTATATTCAAGCCTTTGCTCT 51202987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TACTTTATTTTATTATAGGGTCACTTCATTTTAATAATTGTATATTCAAGCCTTTGCTCT 3900

 51202988 ACACCAGGGGATTCCAGTCTTTTGACTTCCCTGGAACACACTGGAAGAATTGTCTTGGGC 51203047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ACACCAGGGGATTCCAGTCTTTTGACTTCCCTGGAACACACTGGAAGAATTGTCTTGGGC 3960

 51203048 CACACATAAAATACACTAACACTAACAATAGCTGATGGGCTAGAAAAAAAATACAAAAAA 51203107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CACACATAAAATACACTAACACTAACAATAGCTGATGGGCTAGAAAAAAAATACAAAAAA 4020

 51203108 AAAATCTTGTAATGTTTTAAGAAAATTTACAAATTTGTATTGGGCTGCATTCAGAGCCAT 51203167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAAATCTTGTAATGTTTTAAGAAAATTTACAAATTTGTATTGGGCTGCATTCAGAGCCAT 4080

 51203168 CCTGGGCTGCATGCAACCCACAGGCTGTGAGTTGGACAAGTTTGCTCTACATGAATCATC 51203227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CCTGGGCTGCATGCAACCCACAGGCTGTGAGTTGGACAAGTTTGCTCTACATGAATCATC 4140

 51203228 ATGCTATGCACTGATGCTACAGAAAAAAATATGTAGAGGTATGGAAAGCATCCTTATGGT 51203287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ATGCTATGCACTGATGCTACAGAAAAAAATATGTAGAGGTATGGAAAGCATCCTTATGGT 4200

 51203288 GCTCACACCTCACAATGCCTGTCTCCCTTTCAGATATGCCCTTCCCCATCTTCTTCTTTA 51203347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GCTCACACCTCACAATGCCTGTCTCCCTTTCAGATATGCCCTTCCCCATCTTCTTCTTTA 4260

 51203348 GAATAATTTCTCTGTGAAACTCAGCACTCAGCTCAGAAGCATCTTCAGGGCCTTCCCCAA 51203407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GAATAATTTCTCTGTGAAACTCAGCACTCAGCTCAGAAGCATCTTCAGGGCCTTCCCCAA 4320

 51203408 GCTCTCTGTGGTCCTTTGGCTTCCACAACATTGCACTTTCCTGGTTCTTCTCAAATTGTT 51203467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GCTCTCTGTGGTCCTTTGGCTTCCACAACATTGCACTTTCCTGGTTCTTCTCAAATTGTT 4380

 51203468 CTTCCCTTTTGTTTTTACTTTTTCCTCTTGTCTCTTTCATATTTGGACTACAGACACTCT 51203527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CTTCCCTTTTGTTTTTACTTTTTCCTCTTGTCTCTTTCATATTTGGACTACAGACACTCT 4440

 51203528 CAGGTTCTCTGTGCCTCAGTCATGACTCTTCTTAATTGGCAAGTCCTATGGGTTAACCTC 51203587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CAGGTTCTCTGTGCCTCAGTCATGACTCTTCTTAATTGGCAAGTCCTATGGGTTAACCTC 4500

 51203588 AGACACATTCATGCTTCCTGCTATTTCAGTGTGCTGACGACTATCTAATCTGTATAAGTG 51203647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AGACACATTCATGCTTCCTGCTATTTCAGTGTGCTGACGACTATCTAATCTGTATAAGTG 4560

 51203648 ATTCGGACCTGTGTCCCAAGCATCAGAACCATATATCTGACAGTTTGCTAGACATTGCCA 51203707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATTCGGACCTGTGTCCCAAGCATCAGAACCATATATCTGACAGTTTGCTAGACATTGCCA 4620

 51203708 GCAGATATCCCAAACCACTTCAAGTGCAAAATGTTCAAAATGAACTCTTCCTCATCCTGT 51203767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GCAGATATCCCAAACCACTTCAAGTGCAAAATGTTCAAAATGAACTCTTCCTCATCCTGT 4680

 51203768 GGACTGTGATCCCAATTCTATATTCTCTATTTCAGGTAGCCTTACTATCTACCTACCTGT 51203827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GGACTGTGATCCCAATTCTATATTCTCTATTTCAGGTAGCCTTACTATCTACCTACCTGT 4740

 51203828 CTGAGCTAGAATACTTTGAGTAAATCCTCATTCTCTCTGTTTTCTGTTCCACATCCAACC 51203887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CTGAGCTAGAATACTTTGAGTAAATCCTCATTCTCTCTGTTTTCTGTTCCACATCCAACC 4800

 51203888 ATTTATGAAGTTTTTCCTTAGCTCTAATATATTTTTCTCTTCTTCCTCATGACCACCACT 51203947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ATTTATGAAGTTTTTCCTTAGCTCTAATATATTTTTCTCTTCTTCCTCATGACCACCACT 4860

 51203948 GTTGATTTGAAAGCTTCAATCGCCCCCTGTATGAAGGATCTTAACAACATCCTATCTCAC 51204007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GTTGATTTGAAAGCTTCAATCGCCCCCTGTATGAAGGATCTTAACAACATCCTATCTCAC 4920

 51204008 TCCAATGCCAGCCTACTGGTCTCAGATGCTGGCGTGAACGACCTCACCAAAACAAAACTG 51204067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TCCAATGCCAGCCTACTGGTCTCAGATGCTGGCGTGAACGACCTCACCAAAACAAAACTG 4980

 51204068 ACCAAATCACTCCTCTTCAAAGCCATTGACAGCTCCCTATGGTGTCTCCCACTGAGCATT 51204127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 ACCAAATCACTCCTCTTCAAAGCCATTGACAGCTCCCTATGGTGTCTCCCACTGAGCATT 5040

 51204128 TCTACTGCTCACTCTCCAAGGCAGAGACTTTTACTCAGCATATCCATGAGTTGCCTGAGG 51204187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TCTACTGCTCACTCTCCAAGGCAGAGACTTTTACTCAGCATATCCATGAGTTGCCTGAGG 5100

 51204188 ACTCATCCAGCATGGGGACCTCTCTATTTTGGCCTGTGTGCACATGTATGTAATGAAGTC 51204247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 ACTCATCCAGCATGGGGACCTCTCTATTTTGGCCTGTGTGCACATGTATGTAATGAAGTC 5160

 51204248 TCCCCACAGCTCCATGGAATTCATATTCTTCAGTCAAGCACTGAATTTGCTGGACTGCAC 51204307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TCCCCACAGCTCCATGGAATTCATATTCTTCAGTCAAGCACTGAATTTGCTGGACTGCAC 5220

 51204308 TCATTATTCTATGTATATTTTTGTTTTATGGTTTAGATTGATTATACTGACATTAGCAGT 51204367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TCATTATTCTATGTATATTTTTGTTTTATGGTTTAGATTGATTATACTGACATTAGCAGT 5280

 51204368 TAAAAAATTGGGAACCATTTTAACACTTAAATGA 51204401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TAAAAAATTGGGAACCATTTTAACACTTAAATGA 5314

Alignment time is 5.65783 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51189472,51210122] =>     20651 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4701] =>      4701 nucs 'mol-32-1f16-100638_4701'

Score:        4668
Aligned:      4701        nucs
Identic:      4698 (100%) nucs =>       135 (100%)      4563 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51199089,51199223] EXCISED REGION [51199225,51203790]
 second seq =>  [       1,     135] EXCISED REGION [     137,    4701]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51199224,51199224]
 second seq =>         1 nucs [136,136]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [51199847,51199847]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [135,136] to [136,137]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51199223,51199223] to [51199225,51199225]
 second seq =>         1 nucs [135,135] to [137,137]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51199089 GTTGTGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGTTAAATGA 51199148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGTGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGTTAAATGA 60

 51199149 TGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCAC 51199208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCAC 120

 51199209 ATTGCGCACATGTAC 51199223
          |||||||||||||||
      121 ATTGCGCACATGTAC 135

EXCISED REGION

 51199225 CTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACAGTCTCTCTTTCTTTGTC 51199284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      137 CTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACAGTCTCTCTTTCTTTGTC 196

 51199285 CTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTA 51199344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      197 CTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTA 256

 51199345 CTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTCCTCCTTCTTCTCCAC 51199404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      257 CTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTCCTCCTTCTTCTCCAC 316

 51199405 CTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTCTTTAATGTTAAGCTCTG 51199464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      317 CTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTCTTTAATGTTAAGCTCTG 376

 51199465 TTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTACCTACTTTATAGGGTTGT 51199524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      377 TTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTACCTACTTTATAGGGTTGT 436

 51199525 TATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAATGTACATGGTGTGTAGTA 51199584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      437 TATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAATGTACATGGTGTGTAGTA 496

 51199585 ACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACAGCTATTTGATTATGTTT 51199644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      497 ACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACAGCTATTTGATTATGTTT 556

 51199645 ATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGGATTTCTATCTCCTGTTT 51199704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      557 ATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGGATTTCTATCTCCTGTTT 616

 51199705 TCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAATTTGTTCTTAAGACAAA 51199764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      617 TCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAATTTGTTCTTAAGACAAA 676

 51199765 TTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATGGAGGAGAAACTTTCCAT 51199824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      677 TTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATGGAGGAGAAACTTTCCAT 736

 51199825 TCCACTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCTGATATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTG 51199884
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      737 TCCACTGAGGCAGCTGGTGACA-GGACTATCCTGATATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTG 795

 51199885 GTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAG 51199944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 GTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAG 855

 51199945 AAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACA 51200004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 AAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACA 915

 51200005 AATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAA 51200064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 AATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAA 975

 51200065 AAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTT 51200124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 AAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTT 1035

 51200125 TCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAAT 51200184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 TCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAAT 1095

 51200185 AAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAAT 51200244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 AAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAAT 1155

 51200245 GCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACT 51200304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 GCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACT 1215

 51200305 TCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATT 51200364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 TCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATT 1275

 51200365 TTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGG 51200424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 TTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGG 1335

 51200425 GTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTT 51200484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 GTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTT 1395

 51200485 ATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTA 51200544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 ATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTA 1455

 51200545 GAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGC 51200604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 GAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGC 1515

 51200605 CAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGA 51200664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 CAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGA 1575

 51200665 GTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCA 51200724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 GTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCA 1635

 51200725 TTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCT 51200784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 TTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCT 1695

 51200785 AAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACC 51200844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 AAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACC 1755

 51200845 TCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTG 51200904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 TCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTG 1815

 51200905 AATGGTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGC 51200964
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 AATGGTTCATCACAACTCATTTCTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGC 1875

 51200965 ATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGT 51201024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 ATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGT 1935

 51201025 GAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGT 51201084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 GAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGT 1995

 51201085 AACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAG 51201144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 AACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAG 2055

 51201145 AGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGC 51201204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 AGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGC 2115

 51201205 ATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGGCAGTATA 51201264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2116 ATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGTCAGTATA 2175

 51201265 ATGATTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAA 51201324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 ATGATTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAA 2235

 51201325 AGACATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTC 51201384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 AGACATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTC 2295

 51201385 CATGACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGAT 51201444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 CATGACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGAT 2355

 51201445 ACTGAAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATG 51201504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 ACTGAAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATG 2415

 51201505 GATATTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTT 51201564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 GATATTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTT 2475

 51201565 TTAAAAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCAT 51201624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 TTAAAAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCAT 2535

 51201625 GGATATATTGCATAGTGGTGAAGTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACA 51201684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 GGATATATTGCATAGTGGTGAAGTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACA 2595

 51201685 ATGCTAACAAAAACACAGTGGGGAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAAT 51201744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 ATGCTAACAAAAACACAGTGGGGAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAAT 2655

 51201745 TGGGATCACCATATGCAGAAGACTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAAT 51201804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 TGGGATCACCATATGCAGAAGACTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAAT 2715

 51201805 AAACTCAAGATGGATTAGAGACTTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGA 51201864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 AAACTCAAGATGGATTAGAGACTTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGA 2775

 51201865 AAATCTAGGGAAATCTCTTCTGGACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTC 51201924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 AAATCTAGGGAAATCTCTTCTGGACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTC 2835

 51201925 AAAAGCATAGACAACTGAAACAAAAATAGACAATGAGACATACTTAAGCTAAAAAGCTTC 51201984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 AAAAGCATAGACAACTGAAACAAAAATAGACAATGAGACATACTTAAGCTAAAAAGCTTC 2895

 51201985 TGCACAGCACATATGATTTTTTTATATCAGGATCATAGTTAACAATTAACAAAATATATG 51202044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 TGCACAGCACATATGATTTTTTTATATCAGGATCATAGTTAACAATTAACAAAATATATG 2955

 51202045 AAAGACTACATCTTAAATAAATGAGGACTTTGATTTTCATACTTCAGAAGTGTATAAGTG 51202104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 AAAGACTACATCTTAAATAAATGAGGACTTTGATTTTCATACTTCAGAAGTGTATAAGTG 3015

 51202105 AGCCATCCATGGCTAGTGTGGTGGCTCAAATGTGCCATCAGGGTCCAGCCTCCTTCTGTC 51202164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 AGCCATCCATGGCTAGTGTGGTGGCTCAAATGTGCCATCAGGGTCCAGCCTCCTTCTGTC 3075

 51202165 TTCATCTTTTGCCATTCTTAGCCTATTCTGCCTTCATATTCATAAAATAATGACTGTACC 51202224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 TTCATCTTTTGCCATTCTTAGCCTATTCTGCCTTCATATTCATAAAATAATGACTGTACC 3135

 51202225 TCTGGCCGTTGTTTTCATGTTCCAAGAGGGCAAAGGACAAAGATCAAATAGAGAACTGGG 51202284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 TCTGGCCGTTGTTTTCATGTTCCAAGAGGGCAAAGGACAAAGATCAAATAGAGAACTGGG 3195

 51202285 ACCATGGCAGCCAGGTCTGCCCTGGTGCCAGTCACACAGCCATTCCTAGCTGTAAGGGAA 51202344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3196 ACCATGGCAGCCAGGTCTGCCCTGGTGCCAGTCACACAGCCATTCCTAGCTGTAAGGGAA 3255

 51202345 ACTGGGGAGTGTTGTTTCTGAGCACATTGCCATTGAAAACAAAGATGAGGCTATGCCAGT 51202404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 ACTGGGGAGTGTTGTTTCTGAGCACATTGCCATTGAAAACAAAGATGAGGCTATGCCAGT 3315

 51202405 AAGGAAGAAGAGGCGTATAGTTATTGGGCAGAAGGCTATAGGAGCAGCAACAGTTCACAA 51202464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 AAGGAAGAAGAGGCGTATAGTTATTGGGCAGAAGGCTATAGGAGCAGCAACAGTTCACAA 3375

 51202465 ACGTAAGCAGCCTCAAGGCAATTCAGGGGAAGCTCCCATTTCTCTAGCTGAAAGTCAGTG 51202524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 ACGTAAGCAGCCTCAAGGCAATTCAGGGGAAGCTCCCATTTCTCTAGCTGAAAGTCAGTG 3435

 51202525 TTGTCACCTTAGCTACATCACTCCATTACACAAACCCTGGGGTAAAACATAGCTGGGGCC 51202584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 TTGTCACCTTAGCTACATCACTCCATTACACAAACCCTGGGGTAAAACATAGCTGGGGCC 3495

 51202585 TGCGTTATGTACAACCCCCAGGTTTCTGTTGTGTGCTGTCCCAGATACAAAGGACTCACT 51202644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 TGCGTTATGTACAACCCCCAGGTTTCTGTTGTGTGCTGTCCCAGATACAAAGGACTCACT 3555

 51202645 GAGAAACTGTGCTCAGTGCTATACAACTGAAAAAGCATGGGCTCGGATTCAAAAGACCAG 51202704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 GAGAAACTGTGCTCAGTGCTATACAACTGAAAAAGCATGGGCTCGGATTCAAAAGACCAG 3615

 51202705 AGTTCAAGTCTTTCATCTGCCATTTACCACCAGTGTGACCTTAGGCAAATCATCAGCCTC 51202764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3616 AGTTCAAGTCTTTCATCTGCCATTTACCACCAGTGTGACCTTAGGCAAATCATCAGCCTC 3675

 51202765 AAGTTCTTCATGTGTAAAGTGTAGATGATAACACTGTCTTAGGAAATAAGGTTTCTGGGA 51202824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3676 AAGTTCTTCATGTGTAAAGTGTAGATGATAACACTGTCTTAGGAAATAAGGTTTCTGGGA 3735

 51202825 AGTTTAAATGAGATGATGTTTATAAAAACACCTTATGGGAAATTAAGTATAAATACCACC 51202884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3736 AGTTTAAATGAGATGATGTTTATAAAAACACCTTATGGGAAATTAAGTATAAATACCACC 3795

 51202885 TATGATTATGATGATTTTCAATTGAGCACTCAATTTGTTCATTTACTTTATTTTATTATA 51202944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3796 TATGATTATGATGATTTTCAATTGAGCACTCAATTTGTTCATTTACTTTATTTTATTATA 3855

 51202945 GGGTCACTTCATTTTAATAATTGTATATTCAAGCCTTTGCTCTACACCAGGGGATTCCAG 51203004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3856 GGGTCACTTCATTTTAATAATTGTATATTCAAGCCTTTGCTCTACACCAGGGGATTCCAG 3915

 51203005 TCTTTTGACTTCCCTGGAACACACTGGAAGAATTGTCTTGGGCCACACATAAAATACACT 51203064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3916 TCTTTTGACTTCCCTGGAACACACTGGAAGAATTGTCTTGGGCCACACATAAAATACACT 3975

 51203065 AACACTAACAATAGCTGATGGGCTAGAAAAAAAATACAAAAAAAAAATCTTGTAATGTTT 51203124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3976 AACACTAACAATAGCTGATGGGCTAGAAAAAAAATACAAAAAAAAAATCTTGTAATGTTT 4035

 51203125 TAAGAAAATTTACAAATTTGTATTGGGCTGCATTCAGAGCCATCCTGGGCTGCATGCAAC 51203184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4036 TAAGAAAATTTACAAATTTGTATTGGGCTGCATTCAGAGCCATCCTGGGCTGCATGCAAC 4095

 51203185 CCACAGGCTGTGAGTTGGACAAGTTTGCTCTACATGAATCATCATGCTATGCACTGATGC 51203244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 CCACAGGCTGTGAGTTGGACAAGTTTGCTCTACATGAATCATCATGCTATGCACTGATGC 4155

 51203245 TACAGAAAAAAATATGTAGAGGTATGGAAAGCATCCTTATGGTGCTCACACCTCACAATG 51203304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4156 TACAGAAAAAAATATGTAGAGGTATGGAAAGCATCCTTATGGTGCTCACACCTCACAATG 4215

 51203305 CCTGTCTCCCTTTCAGATATGCCCTTCCCCATCTTCTTCTTTAGAATAATTTCTCTGTGA 51203364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4216 CCTGTCTCCCTTTCAGATATGCCCTTCCCCATCTTCTTCTTTAGAATAATTTCTCTGTGA 4275

 51203365 AACTCAGCACTCAGCTCAGAAGCATCTTCAGGGCCTTCCCCAAGCTCTCTGTGGTCCTTT 51203424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4276 AACTCAGCACTCAGCTCAGAAGCATCTTCAGGGCCTTCCCCAAGCTCTCTGTGGTCCTTT 4335

 51203425 GGCTTCCACAACATTGCACTTTCCTGGTTCTTCTCAAATTGTTCTTCCCTTTTGTTTTTA 51203484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4336 GGCTTCCACAACATTGCACTTTCCTGGTTCTTCTCAAATTGTTCTTCCCTTTTGTTTTTA 4395

 51203485 CTTTTTCCTCTTGTCTCTTTCATATTTGGACTACAGACACTCTCAGGTTCTCTGTGCCTC 51203544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4396 CTTTTTCCTCTTGTCTCTTTCATATTTGGACTACAGACACTCTCAGGTTCTCTGTGCCTC 4455

 51203545 AGTCATGACTCTTCTTAATTGGCAAGTCCTATGGGTTAACCTCAGACACATTCATGCTTC 51203604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4456 AGTCATGACTCTTCTTAATTGGCAAGTCCTATGGGTTAACCTCAGACACATTCATGCTTC 4515

 51203605 CTGCTATTTCAGTGTGCTGACGACTATCTAATCTGTATAAGTGATTCGGACCTGTGTCCC 51203664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4516 CTGCTATTTCAGTGTGCTGACGACTATCTAATCTGTATAAGTGATTCGGACCTGTGTCCC 4575

 51203665 AAGCATCAGAACCATATATCTGACAGTTTGCTAGACATTGCCAGCAGATATCCCAAACCA 51203724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4576 AAGCATCAGAACCATATATCTGACAGTTTGCTAGACATTGCCAGCAGATATCCCAAACCA 4635

 51203725 CTTCAAGTGCAAAATGTTCAAAATGAACTCTTCCTCATCCTGTGGACTGTGATCCCAATT 51203784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4636 CTTCAAGTGCAAAATGTTCAAAATGAACTCTTCCTCATCCTGTGGACTGTGATCCCAATT 4695

 51203785 CTATAT 51203790
          ||||||
     4696 CTATAT 4701

Alignment time is 5.70463 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51189472,51210122] =>     20651 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3821] =>      3821 nucs 'mol-32-1f16-122333_3821'

Score:        3798
Aligned:      3820        nucs
Identic:      3818 (100%) nucs =>       985 (100%)      2833 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51199941,51200925] EXCISED REGION [51200927,51203761]
 second seq =>  [       1,     985] EXCISED REGION [     987,    3821]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51200926,51200926]
 second seq =>         1 nucs [986,986]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51200926,51200926] to [51200927,51200927]
 second seq =>         2 nucs [984,985] to [985,986]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51199941 TAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCC 51200000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCC 60

 51200001 TACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCT 51200060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCT 120

 51200061 GTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGG 51200120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGG 180

 51200121 GCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAG 51200180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAG 240

 51200181 AAATAAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATT 51200240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATAAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATT 300

 51200241 GAATGCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATT 51200300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAATGCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATT 360

 51200301 GACTTCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATG 51200360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GACTTCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATG 420

 51200361 CATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAA 51200420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAA 480

 51200421 AAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTT 51200480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTT 540

 51200481 TTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATG 51200540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATG 600

 51200541 GCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAG 51200600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAG 660

 51200601 TGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGA 51200660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGA 720

 51200661 ATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCC 51200720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCC 780

 51200721 ATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTT 51200780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTT 840

 51200781 CTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCAT 51200840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCAT 900

 51200841 TACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGAC 51200900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGAC 960

 51200901 AGTGAATGGTTCATCACAACTCATT 51200925
          |||||||||||||||||||||||||
      961 AGTGAATGGTTCATCACAACTCATT 985

EXCISED REGION

 51200927 CTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAG 51200986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 CTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAG 1046

 51200987 AAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCA 51201046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 AAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCA 1106

 51201047 AACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAA 51201106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 AACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAA 1166

 51201107 AATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGG 51201166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 AATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGG 1226

 51201167 TAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTC 51201226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 TAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTC 1286

 51201227 AAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGATTTATATTAGATTGTAAA 51201286
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1287 AAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGTCAGTATAATGATTTATATTAGATTGTAAA 1346

 51201287 GTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTT 51201346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 GTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTT 1406

 51201347 AAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAAAATGAATACT 51201406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 AAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAAAATGAATACT 1466

 51201407 CCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAG 51201466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 CCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAG 1526

 51201467 AGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATATTATCTAAACATTTGTTA 51201526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 AGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATATTATCTAAACATTTGTTA 1586

 51201527 TGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAAAAAATTTATCCATGTAAC 51201586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 TGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAAAAAATTTATCCATGTAAC 1646

 51201587 TAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCATGGATATATTGCATAGTGGTGAA 51201646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 TAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCATGGATATATTGCATAGTGGTGAA 1706

 51201647 GTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACAATGCTAACAAAAACACAGTGGG 51201706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 GTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACAATGCTAACAAAAACACAGTGGG 1766

 51201707 GAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAATTGGGATCACCATATGCAGAAGA 51201766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 GAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAATTGGGATCACCATATGCAGAAGA 1826

 51201767 CTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAATAAACTCAAGATGGATTAGAGAC 51201826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 CTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAATAAACTCAAGATGGATTAGAGAC 1886

 51201827 TTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGAAAATCTAGGGAAATCTCTTCTG 51201886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 TTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGAAAATCTAGGGAAATCTCTTCTG 1946

 51201887 GACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTCAAAAGCATAGACAACTGAAACA 51201946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 GACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTCAAAAGCATAGACAACTGAAACA 2006

 51201947 AAAATAGACAATGAGACATACTTAAGCTAAAAAGCTTCTGCACAGCACATATGATTTTTT 51202006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 AAAATAGACAATGAGACATACTTAAGCTAAAAAGCTTCTGCACAGCACATATGATTTTTT 2066

 51202007 TATATCAGGATCATAGTTAACAATTAACAAAATATATGAAAGACTACATCTTAAATAAAT 51202066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 TATATCAGGATCATAGTTAACAATTAACAAAATATATGAAAGACTACATCTTAAATAAAT 2126

 51202067 GAGGACTTTGATTTTCATACTTCAGAAGTGTATAAGTGAGCCATCCATGGCTAGTGTGGT 51202126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 GAGGACTTTGATTTTCATACTTCAGAAGTGTATAAGTGAGCCATCCATGGCTAGTGTGGT 2186

 51202127 GGCTCAAATGTGCCATCAGGGTCCAGCCTCCTTCTGTCTTCATCTTTTGCCATTCTTAGC 51202186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 GGCTCAAATGTGCCATCAGGGTCCAGCCTCCTTCTGTCTTCATCTTTTGCCATTCTTAGC 2246

 51202187 CTATTCTGCCTTCATATTCATAAAATAATGACTGTACCTCTGGCCGTTGTTTTCATGTTC 51202246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 CTATTCTGCCTTCATATTCATAAAATAATGACTGTACCTCTGGCCGTTGTTTTCATGTTC 2306

 51202247 CAAGAGGGCAAAGGACAAAGATCAAATAGAGAACTGGGACCATGGCAGCCAGGTCTGCCC 51202306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 CAAGAGGGCAAAGGACAAAGATCAAATAGAGAACTGGGACCATGGCAGCCAGGTCTGCCC 2366

 51202307 TGGTGCCAGTCACACAGCCATTCCTAGCTGTAAGGGAAACTGGGGAGTGTTGTTTCTGAG 51202366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 TGGTGCCAGTCACACAGCCATTCCTAGCTGTAAGGGAAACTGGGGAGTGTTGTTTCTGAG 2426

 51202367 CACATTGCCATTGAAAACAAAGATGAGGCTATGCCAGTAAGGAAGAAGAGGCGTATAGTT 51202426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 CACATTGCCATTGAAAACAAAGATGAGGCTATGCCAGTAAGGAAGAAGAGGCGTATAGTT 2486

 51202427 ATTGGGCAGAAGGCTATAGGAGCAGCAACAGTTCACAAACGTAAGCAGCCTCAAGGCAAT 51202486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 ATTGGGCAGAAGGCTATAGGAGCAGCAACAGTTCACAAACGTAAGCAGCCTCAAGGCAAT 2546

 51202487 TCAGGGGAAGCTCCCATTTCTCTAGCTGAAAGTCAGTGTTGTCACCTTAGCTACATCACT 51202546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 TCAGGGGAAGCTCCCATTTCTCTAGCTGAAAGTCAGTGTTGTCACCTTAGCTACATCACT 2606

 51202547 CCATTACACAAACCCTGGGGTAAAACATAGCTGGGGCCTGCGTTATGTACAACCCCCAGG 51202606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 CCATTACACAAACCCTGGGGTAAAACATAGCTGGGGCCTGCGTTATGTACAACCCCCAGG 2666

 51202607 TTTCTGTTGTGTGCTGTCCCAGATACAAAGGACTCACTGAGAAACTGTGCTCAGTGCTAT 51202666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 TTTCTGTTGTGTGCTGTCCCAGATACAAAGGACTCACTGAGAAACTGTGCTCAGTGCTAT 2726

 51202667 ACAACTGAAAAAGCATGGGCTCGGATTCAAAAGACCAGAGTTCAAGTCTTTCATCTGCCA 51202726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 ACAACTGAAAAAGCATGGGCTCGGATTCAAAAGACCAGAGTTCAAGTCTTTCATCTGCCA 2786

 51202727 TTTACCACCAGTGTGACCTTAGGCAAATCATCAGCCTCAAGTTCTTCATGTGTAAAGTGT 51202786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 TTTACCACCAGTGTGACCTTAGGCAAATCATCAGCCTCAAGTTCTTCATGTGTAAAGTGT 2846

 51202787 AGATGATAACACTGTCTTAGGAAATAAGGTTTCTGGGAAGTTTAAATGAGATGATGTTTA 51202846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 AGATGATAACACTGTCTTAGGAAATAAGGTTTCTGGGAAGTTTAAATGAGATGATGTTTA 2906

 51202847 TAAAAACACCTTATGGGAAATTAAGTATAAATACCACCTATGATTATGATGATTTTCAAT 51202906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 TAAAAACACCTTATGGGAAATTAAGTATAAATACCACCTATGATTATGATGATTTTCAAT 2966

 51202907 TGAGCACTCAATTTGTTCATTTACTTTATTTTATTATAGGGTCACTTCATTTTAATAATT 51202966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 TGAGCACTCAATTTGTTCATTTACTTTATTTTATTATAGGGTCACTTCATTTTAATAATT 3026

 51202967 GTATATTCAAGCCTTTGCTCTACACCAGGGGATTCCAGTCTTTTGACTTCCCTGGAACAC 51203026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 GTATATTCAAGCCTTTGCTCTACACCAGGGGATTCCAGTCTTTTGACTTCCCTGGAACAC 3086

 51203027 ACTGGAAGAATTGTCTTGGGCCACACATAAAATACACTAACACTAACAATAGCTGATGGG 51203086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 ACTGGAAGAATTGTCTTGGGCCACACATAAAATACACTAACACTAACAATAGCTGATGGG 3146

 51203087 CTAGAAAAAAAATACAAAAAAAAAATCTTGTAATGTTTTAAGAAAATTTACAAATTTGTA 51203146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 CTAGAAAAAAAATACAAAAAAAAAATCTTGTAATGTTTTAAGAAAATTTACAAATTTGTA 3206

 51203147 TTGGGCTGCATTCAGAGCCATCCTGGGCTGCATGCAACCCACAGGCTGTGAGTTGGACAA 51203206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 TTGGGCTGCATTCAGAGCCATCCTGGGCTGCATGCAACCCACAGGCTGTGAGTTGGACAA 3266

 51203207 GTTTGCTCTACATGAATCATCATGCTATGCACTGATGCTACAGAAAAAAATATGTAGAGG 51203266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 GTTTGCTCTACATGAATCATCATGCTATGCACTGATGCTACAGAAAAAAATATGTAGAGG 3326

 51203267 TATGGAAAGCATCCTTATGGTGCTCACACCTCACAATGCCTGTCTCCCTTTCAGATATGC 51203326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 TATGGAAAGCATCCTTATGGTGCTCACACCTCACAATGCCTGTCTCCCTTTCAGATATGC 3386

 51203327 CCTTCCCCATCTTCTTCTTTAGAATAATTTCTCTGTGAAACTCAGCACTCAGCTCAGAAG 51203386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 CCTTCCCCATCTTCTTCTTTAGAATAATTTCTCTGTGAAACTCAGCACTCAGCTCAGAAG 3446

 51203387 CATCTTCAGGGCCTTCCCCAAGCTCTCTGTGGTCCTTTGGCTTCCACAACATTGCACTTT 51203446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 CATCTTCAGGGCCTTCCCCAAGCTCTCTGTGGTCCTTTGGCTTCCACAACATTGCACTTT 3506

 51203447 CCTGGTTCTTCTCAAATTGTTCTTCCCTTTTGTTTTTACTTTTTCCTCTTGTCTCTTTCA 51203506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 CCTGGTTCTTCTCAAATTGTTCTTCCCTTTTGTTTTTACTTTTTCCTCTTGTCTCTTTCA 3566

 51203507 TATTTGGACTACAGACACTCTCAGGTTCTCTGTGCCTCAGTCATGACTCTTCTTAATTGG 51203566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 TATTTGGACTACAGACACTCTCAGGTTCTCTGTGCCTCAGTCATGACTCTTCTTAATTGG 3626

 51203567 CAAGTCCTATGGGTTAACCTCAGACACATTCATGCTTCCTGCTATTTCAGTGTGCTGACG 51203626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 CAAGTCCTATGGGTTAACCTCAGACACATTCATGCTTCCTGCTATTTCAGTGTGCTGACG 3686

 51203627 ACTATCTAATCTGTATAAGTGATTCGGACCTGTGTCCCAAGCATCAGAACCATATATCTG 51203686
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3687 ACTATCTAATCTGTATAAGTGATTCGGACCTGTGTCCCAAGCATCAGAACCATATATTTG 3746

 51203687 ACAGTTTGCTAGACATTGCCAGCAGATATCCCAAACCACTTCAAGTGCAAAATGTTCAAA 51203746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 ACAGTTTGCTAGACATTGCCAGCAGATATCCCAAACCACTTCAAGTGCAAAATGTTCAAA 3806

 51203747 ATGAACTCTTCCTCA 51203761
          |||||||||||||||
     3807 ATGAACTCTTCCTCA 3821

Alignment time is 4.93228 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51189472,51210122] =>     20651 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3096] =>      3096 nucs 'mol-32-1f21-024487_3096'

Score:        3096
Aligned:      3096        nucs
Identic:      3096 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51198838,51201933]
 second seq =>  [       1,    3096]

 51198838 CAACCCAAATGTCCAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATG 51198897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAACCCAAATGTCCAACAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATG 60

 51198898 GAATACTGTGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTCGTAGGGACATGGATGAAT 51198957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAATACTGTGCAGCCATAAAAAATGATGAGTTCATGTCCTTCGTAGGGACATGGATGAAT 120

 51198958 TTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCACAAGAACAAAAAAACAAACACTGCATGTTC 51199017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGGAAATCATCATTCTCAGTAAACTATCACAAGAACAAAAAAACAAACACTGCATGTTC 180

 51199018 TCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGGGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACA 51199077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCACTCATAGGTGGGAATTGAACAATGGGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACA 240

 51199078 CTCTGGGGACTGTTGTGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTA 51199137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCTGGGGACTGTTGTGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTA 300

 51199138 ATGTTAAATGATGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAA 51199197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGTTAAATGATGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAA 360

 51199198 TTAACCTGCACATTGCGCACATGTACTCTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAA 51199257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAACCTGCACATTGCGCACATGTACTCTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAA 420

 51199258 AAAGAAAACAGTCTCTCTTTCTTTGTCCTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTC 51199317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAGAAAACAGTCTCTCTTTCTTTGTCCTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTC 480

 51199318 CACCTCCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTC 51199377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACCTCCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTC 540

 51199378 CTCCACCTTTTCCTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTT 51199437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCCACCTTTTCCTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTT 600

 51199438 TAATAAATTCTTTAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATA 51199497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAATAAATTCTTTAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATA 660

 51199498 GCAACAGTACCTACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATT 51199557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAACAGTACCTACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATT 720

 51199558 GCTTAAGAATGTACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGAT 51199617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTTAAGAATGTACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGAT 780

 51199618 TAATATTACAGCTATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATG 51199677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAATATTACAGCTATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATG 840

 51199678 AGAATGCAGGATTTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCT 51199737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAATGCAGGATTTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCT 900

 51199738 TAAGACAAAATTTGTTCTTAAGACAAATTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAA 51199797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAGACAAAATTTGTTCTTAAGACAAATTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAA 960

 51199798 AGCTGCCATGGAGGAGAAACTTTCCATTCCACTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCT 51199857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGCTGCCATGGAGGAGAAACTTTCCATTCCACTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCT 1020

 51199858 GATATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTGGTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAAT 51199917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTGGTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAAT 1080

 51199918 AAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGC 51199977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGC 1140

 51199978 CAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAA 51200037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAA 1200

 51200038 ATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGC 51200097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGC 1260

 51200098 ATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTT 51200157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTT 1320

 51200158 GTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAATAAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGAC 51200217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAATAAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGAC 1380

 51200218 AACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAATGCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTG 51200277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAATGCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTG 1440

 51200278 AATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACTTCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAG 51200337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACTTCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAG 1500

 51200338 CAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATG 51200397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATG 1560

 51200398 TTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTA 51200457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTA 1620

 51200458 CATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCA 51200517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCA 1680

 51200518 CTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCA 51200577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCA 1740

 51200578 ACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGG 51200637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGG 1800

 51200638 TCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCT 51200697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCT 1860

 51200698 GGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATT 51200757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATT 1920

 51200758 CTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAA 51200817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAA 1980

 51200818 GTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGG 51200877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGG 2040

 51200878 TCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTGAATGGTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAG 51200937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTGAATGGTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAG 2100

 51200938 ACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCT 51200997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCT 2160

 51200998 TTCTTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACA 51201057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTCTTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACA 2220

 51201058 CTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGA 51201117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGA 2280

 51201118 TGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTA 51201177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTA 2340

 51201178 GCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGC 51201237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGC 2400

 51201238 TCTTAACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGATTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAG 51201297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCTTAACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGATTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAG 2460

 51201298 TTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTC 51201357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTC 2520

 51201358 CCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTC 51201417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTC 2580

 51201418 TCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGG 51201477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGG 2640

 51201478 CTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATATTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGT 51201537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATATTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGT 2700

 51201538 TTATGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAAAAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAA 51201597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTATGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAAAAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAA 2760

 51201598 AATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCATGGATATATTGCATAGTGGTGAAGTCAAAGCTCT 51201657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCATGGATATATTGCATAGTGGTGAAGTCAAAGCTCT 2820

 51201658 TAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACAATGCTAACAAAAACACAGTGGGGAAAGGACACT 51201717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACAATGCTAACAAAAACACAGTGGGGAAAGGACACT 2880

 51201718 CTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAATTGGGATCACCATATGCAGAAGACTGAAACCTGA 51201777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAATTGGGATCACCATATGCAGAAGACTGAAACCTGA 2940

 51201778 CCCCTATCTCTCACCATATACAAAAATAAACTCAAGATGGATTAGAGACTTAAATGTATG 51201837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCCCTATCTCTCACCATATACAAAAATAAACTCAAGATGGATTAGAGACTTAAATGTATG 3000

 51201838 ACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGAAAATCTAGGGAAATCTCTTCTGGACATTGGTCC 51201897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGAAAATCTAGGGAAATCTCTTCTGGACATTGGTCC 3060

 51201898 AAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTCAAAAGCATA 51201933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTCAAAAGCATA 3096

Alignment time is 3.59074 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51189472,51210122] =>     20651 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2079] =>      2079 nucs 'mol-32-220d-029429_2079'

Score:        2067
Aligned:      2078        nucs
Identic:      2077 (100%) nucs =>      1038 (100%)      1039 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51199888,51200925] EXCISED REGION [51200927,51201966]
 second seq =>  [       1,    1038] EXCISED REGION [    1040,    2079]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51200926,51200926]
 second seq =>         1 nucs [1039,1039]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51200926,51200926] to [51200927,51200927]
 second seq =>         2 nucs [1037,1038] to [1038,1039]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51199888 ACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAGAAA 51199947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAGAAA 60

 51199948 ATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACAAAT 51200007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACAAAT 120

 51200008 AAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAAAAA 51200067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAAAAA 180

 51200068 GCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTTTCA 51200127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTTTCA 240

 51200128 TTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAATAAA 51200187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAATAAA 300

 51200188 ACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAATGCT 51200247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAATGCT 360

 51200248 TAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACTTCA 51200307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACTTCA 420

 51200308 TGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATTTTT 51200367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATTTTT 480

 51200368 GTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGGGTT 51200427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGGGTT 540

 51200428 AAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTTATC 51200487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTTATC 600

 51200488 TTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTAGAG 51200547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTAGAG 660

 51200548 AAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGCCAA 51200607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGCCAA 720

 51200608 GGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGAGTG 51200667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGAGTG 780

 51200668 TGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCATTT 51200727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCATTT 840

 51200728 TTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCTAAA 51200787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCTAAA 900

 51200788 ATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACCTCA 51200847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACCTCA 960

 51200848 AGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTGAAT 51200907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTGAAT 1020

 51200908 GGTTCATCACAACTCATT 51200925
          ||||||||||||||||||
     1021 GGTTCATCACAACTCATT 1038

EXCISED REGION

 51200927 CTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAG 51200986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 CTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAG 1099

 51200987 AAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCA 51201046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 AAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCA 1159

 51201047 AACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAA 51201106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 AACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAA 1219

 51201107 AATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGG 51201166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 AATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGG 1279

 51201167 TAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTC 51201226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 TAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTC 1339

 51201227 AAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGATTTATATTAGATTGTAAA 51201286
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1340 AAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGTCAGTATAATGATTTATATTAGATTGTAAA 1399

 51201287 GTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTT 51201346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 GTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTT 1459

 51201347 AAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAAAATGAATACT 51201406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 AAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAAAATGAATACT 1519

 51201407 CCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAG 51201466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 CCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAG 1579

 51201467 AGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATATTATCTAAACATTTGTTA 51201526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 AGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATATTATCTAAACATTTGTTA 1639

 51201527 TGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAAAAAATTTATCCATGTAAC 51201586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 TGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAAAAAATTTATCCATGTAAC 1699

 51201587 TAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCATGGATATATTGCATAGTGGTGAA 51201646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 TAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCATGGATATATTGCATAGTGGTGAA 1759

 51201647 GTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACAATGCTAACAAAAACACAGTGGG 51201706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 GTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACAATGCTAACAAAAACACAGTGGG 1819

 51201707 GAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAATTGGGATCACCATATGCAGAAGA 51201766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 GAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAATTGGGATCACCATATGCAGAAGA 1879

 51201767 CTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAATAAACTCAAGATGGATTAGAGAC 51201826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 CTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAATAAACTCAAGATGGATTAGAGAC 1939

 51201827 TTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGAAAATCTAGGGAAATCTCTTCTG 51201886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 TTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGAAAATCTAGGGAAATCTCTTCTG 1999

 51201887 GACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTCAAAAGCATAGACAACTGAAACA 51201946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 GACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTCAAAAGCATAGACAACTGAAACA 2059

 51201947 AAAATAGACAATGAGACATA 51201966
          ||||||||||||||||||||
     2060 AAAATAGACAATGAGACATA 2079

Alignment time is 2.82722 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51189472,51210122] =>     20651 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2465] =>      2465 nucs 'mol-32-2f1d-064748_2465'

Score:        2465
Aligned:      2465        nucs
Identic:      2465 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51199160,51201624]
 second seq =>  [       1,    2465]

 51199160 GTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCACATTGCGCACAT 51199219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCACATTGCGCACAT 60

 51199220 GTACTCTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACAGTCTCTCTTTCT 51199279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTACTCTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACAGTCTCTCTTTCT 120

 51199280 TTGTCCTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTTTTTCTCCTCT 51199339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTCCTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTTTTTCTCCTCT 180

 51199340 TCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTCCTCCTTCTTC 51199399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTCCTCCTTCTTC 240

 51199400 TCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTCTTTAATGTTAAG 51199459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTCTTTAATGTTAAG 300

 51199460 CTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTACCTACTTTATAGG 51199519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTACCTACTTTATAGG 360

 51199520 GTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAATGTACATGGTGTG 51199579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAATGTACATGGTGTG 420

 51199580 TAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACAGCTATTTGATTA 51199639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACAGCTATTTGATTA 480

 51199640 TGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGGATTTCTATCTCC 51199699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGGATTTCTATCTCC 540

 51199700 TGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAATTTGTTCTTAAG 51199759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAATTTGTTCTTAAG 600

 51199760 ACAAATTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATGGAGGAGAAACTT 51199819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAAATTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATGGAGGAGAAACTT 660

 51199820 TCCATTCCACTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCTGATATAAGAGTAAAGCAGGAGG 51199879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCATTCCACTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCTGATATAAGAGTAAAGCAGGAGG 720

 51199880 TTGTGGTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATC 51199939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGTGGTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATC 780

 51199940 TTAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTC 51199999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTC 840

 51200000 CTACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTC 51200059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTC 900

 51200060 TGTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCG 51200119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCG 960

 51200120 GGCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTA 51200179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTA 1020

 51200180 GAAATAAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGAT 51200239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAATAAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGAT 1080

 51200240 TGAATGCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAAT 51200299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGAATGCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAAT 1140

 51200300 TGACTTCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCAT 51200359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGACTTCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCAT 1200

 51200360 GCATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCA 51200419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCA 1260

 51200420 AAAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCT 51200479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCT 1320

 51200480 TTTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCAT 51200539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCAT 1380

 51200540 GGCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAA 51200599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAA 1440

 51200600 GTGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTG 51200659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTG 1500

 51200660 AATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGC 51200719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGC 1560

 51200720 CATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCT 51200779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCT 1620

 51200780 TCTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCA 51200839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCA 1680

 51200840 TTACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGA 51200899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGA 1740

 51200900 CAGTGAATGGTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGA 51200959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAGTGAATGGTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGA 1800

 51200960 AGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCA 51201019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCA 1860

 51201020 TTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATC 51201079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATC 1920

 51201080 CCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCT 51201139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCT 1980

 51201140 CACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGT 51201199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGT 2040

 51201200 AATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGGCA 51201259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGGCA 2100

 51201260 GTATAATGATTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATT 51201319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTATAATGATTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATT 2160

 51201320 TTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCAT 51201379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCAT 2220

 51201380 AGTTCCATGACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACA 51201439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGTTCCATGACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACA 2280

 51201440 TAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACG 51201499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACG 2340

 51201500 ACATGGATATTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAA 51201559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ACATGGATATTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAA 2400

 51201560 AATTTTTAAAAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGT 51201619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AATTTTTAAAAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGT 2460

 51201620 TGCAT 51201624
          |||||
     2461 TGCAT 2465

Alignment time is 2.99147 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51189472,51210122] =>     20651 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4850] =>      4850 nucs 'mol-32-2fb7-106223_4850'

Score:        4849
Aligned:      4849        nucs
Identic:      4849 (100%) nucs =>       618 (100%)      4231 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51199150,51199767] EXCISED REGION [51199769,51203999]
 second seq =>  [       1,     618] EXCISED REGION [     620,    4850]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51199768,51199768]
 second seq =>         1 nucs [619,619]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51199768,51199768] to [51199769,51199769]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51199150 GAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCACA 51199209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCACA 60

 51199210 TTGCGCACATGTACTCTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACAGT 51199269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGCGCACATGTACTCTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACAGT 120

 51199270 CTCTCTTTCTTTGTCCTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTT 51199329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTCTTTCTTTGTCCTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTT 180

 51199330 TTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTC 51199389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTC 240

 51199390 CTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTCTT 51199449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTCTT 300

 51199450 TAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTACCT 51199509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTACCT 360

 51199510 ACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAATGT 51199569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAATGT 420

 51199570 ACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACAGC 51199629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACAGC 480

 51199630 TATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGGAT 51199689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGGAT 540

 51199690 TTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAATT 51199749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAATT 600

 51199750 TGTTCTTAAGACAAATTT 51199767
          ||||||||||||||||||
      601 TGTTCTTAAGACAAATTT 618

EXCISED REGION

 51199769 GTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATGGAGGAGAAACTTTCCATTCCA 51199828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      620 GTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATGGAGGAGAAACTTTCCATTCCA 679

 51199829 CTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCTGATATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTGGTCA 51199888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      680 CTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCTGATATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTGGTCA 739

 51199889 CCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAGAAAA 51199948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 CCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAGAAAA 799

 51199949 TGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACAAATA 51200008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 TGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACAAATA 859

 51200009 AGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAAAAAG 51200068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 AGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAAAAAG 919

 51200069 CAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTTTCAT 51200128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 CAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTTTCAT 979

 51200129 TGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAATAAAA 51200188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 TGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAATAAAA 1039

 51200189 CATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAATGCTT 51200248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 CATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAATGCTT 1099

 51200249 AGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACTTCAT 51200308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 AGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACTTCAT 1159

 51200309 GGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATTTTTG 51200368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 GGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATTTTTG 1219

 51200369 TAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGGGTTA 51200428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 TAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGGGTTA 1279

 51200429 AGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTTATCT 51200488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 AGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTTATCT 1339

 51200489 TCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTAGAGA 51200548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 TCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTAGAGA 1399

 51200549 AATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGCCAAG 51200608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 AATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGCCAAG 1459

 51200609 GCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGAGTGT 51200668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 GCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGAGTGT 1519

 51200669 GGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCATTTT 51200728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 GGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCATTTT 1579

 51200729 TCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCTAAAA 51200788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 TCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCTAAAA 1639

 51200789 TTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACCTCAA 51200848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 TTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACCTCAA 1699

 51200849 GACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTGAATG 51200908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 GACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTGAATG 1759

 51200909 GTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATAT 51200968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 GTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATAT 1819

 51200969 GTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAG 51201028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 GTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAG 1879

 51201029 GTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACA 51201088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 GTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACA 1939

 51201089 ACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGAT 51201148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 ACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGAT 1999

 51201149 TAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGT 51201208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 TAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGT 2059

 51201209 TGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGA 51201268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 TGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGA 2119

 51201269 TTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGAC 51201328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 TTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGAC 2179

 51201329 ATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATG 51201388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 ATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATG 2239

 51201389 ACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTG 51201448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 ACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTG 2299

 51201449 AAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATA 51201508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 AAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATA 2359

 51201509 TTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAA 51201568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 TTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAA 2419

 51201569 AAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCATGGAT 51201628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 AAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCATGGAT 2479

 51201629 ATATTGCATAGTGGTGAAGTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACAATGC 51201688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 ATATTGCATAGTGGTGAAGTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACAATGC 2539

 51201689 TAACAAAAACACAGTGGGGAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAATTGGG 51201748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 TAACAAAAACACAGTGGGGAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAATTGGG 2599

 51201749 ATCACCATATGCAGAAGACTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAATAAAC 51201808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 ATCACCATATGCAGAAGACTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAATAAAC 2659

 51201809 TCAAGATGGATTAGAGACTTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGAAAAT 51201868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 TCAAGATGGATTAGAGACTTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGAAAAT 2719

 51201869 CTAGGGAAATCTCTTCTGGACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTCAAAA 51201928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 CTAGGGAAATCTCTTCTGGACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTCAAAA 2779

 51201929 GCATAGACAACTGAAACAAAAATAGACAATGAGACATACTTAAGCTAAAAAGCTTCTGCA 51201988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 GCATAGACAACTGAAACAAAAATAGACAATGAGACATACTTAAGCTAAAAAGCTTCTGCA 2839

 51201989 CAGCACATATGATTTTTTTATATCAGGATCATAGTTAACAATTAACAAAATATATGAAAG 51202048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 CAGCACATATGATTTTTTTATATCAGGATCATAGTTAACAATTAACAAAATATATGAAAG 2899

 51202049 ACTACATCTTAAATAAATGAGGACTTTGATTTTCATACTTCAGAAGTGTATAAGTGAGCC 51202108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 ACTACATCTTAAATAAATGAGGACTTTGATTTTCATACTTCAGAAGTGTATAAGTGAGCC 2959

 51202109 ATCCATGGCTAGTGTGGTGGCTCAAATGTGCCATCAGGGTCCAGCCTCCTTCTGTCTTCA 51202168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 ATCCATGGCTAGTGTGGTGGCTCAAATGTGCCATCAGGGTCCAGCCTCCTTCTGTCTTCA 3019

 51202169 TCTTTTGCCATTCTTAGCCTATTCTGCCTTCATATTCATAAAATAATGACTGTACCTCTG 51202228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 TCTTTTGCCATTCTTAGCCTATTCTGCCTTCATATTCATAAAATAATGACTGTACCTCTG 3079

 51202229 GCCGTTGTTTTCATGTTCCAAGAGGGCAAAGGACAAAGATCAAATAGAGAACTGGGACCA 51202288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 GCCGTTGTTTTCATGTTCCAAGAGGGCAAAGGACAAAGATCAAATAGAGAACTGGGACCA 3139

 51202289 TGGCAGCCAGGTCTGCCCTGGTGCCAGTCACACAGCCATTCCTAGCTGTAAGGGAAACTG 51202348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 TGGCAGCCAGGTCTGCCCTGGTGCCAGTCACACAGCCATTCCTAGCTGTAAGGGAAACTG 3199

 51202349 GGGAGTGTTGTTTCTGAGCACATTGCCATTGAAAACAAAGATGAGGCTATGCCAGTAAGG 51202408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 GGGAGTGTTGTTTCTGAGCACATTGCCATTGAAAACAAAGATGAGGCTATGCCAGTAAGG 3259

 51202409 AAGAAGAGGCGTATAGTTATTGGGCAGAAGGCTATAGGAGCAGCAACAGTTCACAAACGT 51202468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 AAGAAGAGGCGTATAGTTATTGGGCAGAAGGCTATAGGAGCAGCAACAGTTCACAAACGT 3319

 51202469 AAGCAGCCTCAAGGCAATTCAGGGGAAGCTCCCATTTCTCTAGCTGAAAGTCAGTGTTGT 51202528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 AAGCAGCCTCAAGGCAATTCAGGGGAAGCTCCCATTTCTCTAGCTGAAAGTCAGTGTTGT 3379

 51202529 CACCTTAGCTACATCACTCCATTACACAAACCCTGGGGTAAAACATAGCTGGGGCCTGCG 51202588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 CACCTTAGCTACATCACTCCATTACACAAACCCTGGGGTAAAACATAGCTGGGGCCTGCG 3439

 51202589 TTATGTACAACCCCCAGGTTTCTGTTGTGTGCTGTCCCAGATACAAAGGACTCACTGAGA 51202648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 TTATGTACAACCCCCAGGTTTCTGTTGTGTGCTGTCCCAGATACAAAGGACTCACTGAGA 3499

 51202649 AACTGTGCTCAGTGCTATACAACTGAAAAAGCATGGGCTCGGATTCAAAAGACCAGAGTT 51202708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 AACTGTGCTCAGTGCTATACAACTGAAAAAGCATGGGCTCGGATTCAAAAGACCAGAGTT 3559

 51202709 CAAGTCTTTCATCTGCCATTTACCACCAGTGTGACCTTAGGCAAATCATCAGCCTCAAGT 51202768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 CAAGTCTTTCATCTGCCATTTACCACCAGTGTGACCTTAGGCAAATCATCAGCCTCAAGT 3619

 51202769 TCTTCATGTGTAAAGTGTAGATGATAACACTGTCTTAGGAAATAAGGTTTCTGGGAAGTT 51202828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 TCTTCATGTGTAAAGTGTAGATGATAACACTGTCTTAGGAAATAAGGTTTCTGGGAAGTT 3679

 51202829 TAAATGAGATGATGTTTATAAAAACACCTTATGGGAAATTAAGTATAAATACCACCTATG 51202888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 TAAATGAGATGATGTTTATAAAAACACCTTATGGGAAATTAAGTATAAATACCACCTATG 3739

 51202889 ATTATGATGATTTTCAATTGAGCACTCAATTTGTTCATTTACTTTATTTTATTATAGGGT 51202948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 ATTATGATGATTTTCAATTGAGCACTCAATTTGTTCATTTACTTTATTTTATTATAGGGT 3799

 51202949 CACTTCATTTTAATAATTGTATATTCAAGCCTTTGCTCTACACCAGGGGATTCCAGTCTT 51203008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 CACTTCATTTTAATAATTGTATATTCAAGCCTTTGCTCTACACCAGGGGATTCCAGTCTT 3859

 51203009 TTGACTTCCCTGGAACACACTGGAAGAATTGTCTTGGGCCACACATAAAATACACTAACA 51203068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 TTGACTTCCCTGGAACACACTGGAAGAATTGTCTTGGGCCACACATAAAATACACTAACA 3919

 51203069 CTAACAATAGCTGATGGGCTAGAAAAAAAATACAAAAAAAAAATCTTGTAATGTTTTAAG 51203128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 CTAACAATAGCTGATGGGCTAGAAAAAAAATACAAAAAAAAAATCTTGTAATGTTTTAAG 3979

 51203129 AAAATTTACAAATTTGTATTGGGCTGCATTCAGAGCCATCCTGGGCTGCATGCAACCCAC 51203188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 AAAATTTACAAATTTGTATTGGGCTGCATTCAGAGCCATCCTGGGCTGCATGCAACCCAC 4039

 51203189 AGGCTGTGAGTTGGACAAGTTTGCTCTACATGAATCATCATGCTATGCACTGATGCTACA 51203248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4040 AGGCTGTGAGTTGGACAAGTTTGCTCTACATGAATCATCATGCTATGCACTGATGCTACA 4099

 51203249 GAAAAAAATATGTAGAGGTATGGAAAGCATCCTTATGGTGCTCACACCTCACAATGCCTG 51203308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 GAAAAAAATATGTAGAGGTATGGAAAGCATCCTTATGGTGCTCACACCTCACAATGCCTG 4159

 51203309 TCTCCCTTTCAGATATGCCCTTCCCCATCTTCTTCTTTAGAATAATTTCTCTGTGAAACT 51203368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4160 TCTCCCTTTCAGATATGCCCTTCCCCATCTTCTTCTTTAGAATAATTTCTCTGTGAAACT 4219

 51203369 CAGCACTCAGCTCAGAAGCATCTTCAGGGCCTTCCCCAAGCTCTCTGTGGTCCTTTGGCT 51203428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4220 CAGCACTCAGCTCAGAAGCATCTTCAGGGCCTTCCCCAAGCTCTCTGTGGTCCTTTGGCT 4279

 51203429 TCCACAACATTGCACTTTCCTGGTTCTTCTCAAATTGTTCTTCCCTTTTGTTTTTACTTT 51203488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4280 TCCACAACATTGCACTTTCCTGGTTCTTCTCAAATTGTTCTTCCCTTTTGTTTTTACTTT 4339

 51203489 TTCCTCTTGTCTCTTTCATATTTGGACTACAGACACTCTCAGGTTCTCTGTGCCTCAGTC 51203548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4340 TTCCTCTTGTCTCTTTCATATTTGGACTACAGACACTCTCAGGTTCTCTGTGCCTCAGTC 4399

 51203549 ATGACTCTTCTTAATTGGCAAGTCCTATGGGTTAACCTCAGACACATTCATGCTTCCTGC 51203608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4400 ATGACTCTTCTTAATTGGCAAGTCCTATGGGTTAACCTCAGACACATTCATGCTTCCTGC 4459

 51203609 TATTTCAGTGTGCTGACGACTATCTAATCTGTATAAGTGATTCGGACCTGTGTCCCAAGC 51203668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 TATTTCAGTGTGCTGACGACTATCTAATCTGTATAAGTGATTCGGACCTGTGTCCCAAGC 4519

 51203669 ATCAGAACCATATATCTGACAGTTTGCTAGACATTGCCAGCAGATATCCCAAACCACTTC 51203728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4520 ATCAGAACCATATATCTGACAGTTTGCTAGACATTGCCAGCAGATATCCCAAACCACTTC 4579

 51203729 AAGTGCAAAATGTTCAAAATGAACTCTTCCTCATCCTGTGGACTGTGATCCCAATTCTAT 51203788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 AAGTGCAAAATGTTCAAAATGAACTCTTCCTCATCCTGTGGACTGTGATCCCAATTCTAT 4639

 51203789 ATTCTCTATTTCAGGTAGCCTTACTATCTACCTACCTGTCTGAGCTAGAATACTTTGAGT 51203848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4640 ATTCTCTATTTCAGGTAGCCTTACTATCTACCTACCTGTCTGAGCTAGAATACTTTGAGT 4699

 51203849 AAATCCTCATTCTCTCTGTTTTCTGTTCCACATCCAACCATTTATGAAGTTTTTCCTTAG 51203908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 AAATCCTCATTCTCTCTGTTTTCTGTTCCACATCCAACCATTTATGAAGTTTTTCCTTAG 4759

 51203909 CTCTAATATATTTTTCTCTTCTTCCTCATGACCACCACTGTTGATTTGAAAGCTTCAATC 51203968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 CTCTAATATATTTTTCTCTTCTTCCTCATGACCACCACTGTTGATTTGAAAGCTTCAATC 4819

 51203969 GCCCCCTGTATGAAGGATCTTAACAACATCC 51203999
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     4820 GCCCCCTGTATGAAGGATCTTAACAACATCC 4850

Alignment time is 6.05771 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51189472,51210122] =>     20651 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2214] =>      2214 nucs 'mol-32-2fd8-106722_2214'

Score:        2181
Aligned:      2214        nucs
Identic:      2211 (100%) nucs =>       186 (100%)      2025 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51199038,51199223] EXCISED REGION [51199225,51201252]
 second seq =>  [       1,     186] EXCISED REGION [     188,    2214]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51199224,51199224]
 second seq =>         1 nucs [187,187]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [51199847,51199847]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [186,187] to [187,188]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51199223,51199223] to [51199225,51199225]
 second seq =>         1 nucs [186,186] to [188,188]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51199038 AACAATGGGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTGTGGGG 51199097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACAATGGGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTGTGGGG 60

 51199098 TGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGTTAAATGATGAGTTAAT 51199157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGTTAAATGATGAGTTAAT 120

 51199158 GGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCACATTGCGCAC 51199217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCACATTGCGCAC 180

 51199218 ATGTAC 51199223
          ||||||
      181 ATGTAC 186

EXCISED REGION

 51199225 CTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACAGTCTCTCTTTCTTTGTC 51199284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      188 CTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACAGTCTCTCTTTCTTTGTC 247

 51199285 CTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTA 51199344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      248 CTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTA 307

 51199345 CTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTCCTCCTTCTTCTCCAC 51199404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 CTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTCCTCCTTCTTCTCCAC 367

 51199405 CTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTCTTTAATGTTAAGCTCTG 51199464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      368 CTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTCTTTAATGTTAAGCTCTG 427

 51199465 TTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTACCTACTTTATAGGGTTGT 51199524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 TTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTACCTACTTTATAGGGTTGT 487

 51199525 TATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAATGTACATGGTGTGTAGTA 51199584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      488 TATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAATGTAGATGGTGTGTAGTA 547

 51199585 ACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACAGCTATTTGATTATGTTT 51199644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 ACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACAGCTATTTGATTATGTTT 607

 51199645 ATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGGATTTCTATCTCCTGTTT 51199704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 ATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGGATTTCTATCTCCTGTTT 667

 51199705 TCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAATTTGTTCTTAAGACAAA 51199764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      668 TCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAATTTGTTCTTAAGACAAA 727

 51199765 TTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATGGAGGAGAAACTTTCCAT 51199824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      728 TTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATGGAGGAGAAACTTTCCAT 787

 51199825 TCCACTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCTGATATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTG 51199884
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      788 TCCACTGAGGCAGCTGGTGACA-GGACTATCCTGATATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTG 846

 51199885 GTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAG 51199944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 GTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAG 906

 51199945 AAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACA 51200004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 AAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACA 966

 51200005 AATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAA 51200064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 AATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAA 1026

 51200065 AAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTT 51200124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 AAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTT 1086

 51200125 TCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAAT 51200184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 TCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAAT 1146

 51200185 AAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAAT 51200244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 AAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAAT 1206

 51200245 GCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACT 51200304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 GCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACT 1266

 51200305 TCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATT 51200364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 TCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATT 1326

 51200365 TTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGG 51200424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 TTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGG 1386

 51200425 GTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTT 51200484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 GTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTT 1446

 51200485 ATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTA 51200544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 ATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTA 1506

 51200545 GAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGC 51200604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 GAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGC 1566

 51200605 CAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGA 51200664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 CAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGA 1626

 51200665 GTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCA 51200724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 GTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCA 1686

 51200725 TTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCT 51200784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 TTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCT 1746

 51200785 AAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACC 51200844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 AAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACC 1806

 51200845 TCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTG 51200904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 TCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTG 1866

 51200905 AATGGTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGC 51200964
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 AATGGTTCATCACAACTCATTTCTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGC 1926

 51200965 ATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGT 51201024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 ATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGT 1986

 51201025 GAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGT 51201084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 GAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGT 2046

 51201085 AACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAG 51201144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 AACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAG 2106

 51201145 AGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGC 51201204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 AGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGC 2166

 51201205 ATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTC 51201252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 ATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTC 2214

Alignment time is 3.02774 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51189472,51210122] =>     20651 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2837] =>      2837 nucs 'mol-32-3185-136975_2837'

Score:        2836
Aligned:      2836        nucs
Identic:      2836 (100%) nucs =>      2296 (100%)       540 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51199143,51201438] EXCISED REGION [51201440,51201979]
 second seq =>  [       1,    2296] EXCISED REGION [    2298,    2837]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51201439,51201439]
 second seq =>         1 nucs [2297,2297]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51199143 AAATGATGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAAC 51199202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATGATGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAAC 60

 51199203 CTGCACATTGCGCACATGTACTCTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGA 51199262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGCACATTGCGCACATGTACTCTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGA 120

 51199263 AAACAGTCTCTCTTTCTTTGTCCTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCT 51199322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAACAGTCTCTCTTTCTTTGTCCTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCT 180

 51199323 CCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCA 51199382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCA 240

 51199383 CCTTTTCCTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATA 51199442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTTTCCTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATA 300

 51199443 AATTCTTTAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAAC 51199502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTCTTTAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAAC 360

 51199503 AGTACCTACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTA 51199562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTACCTACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTA 420

 51199563 AGAATGTACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATA 51199622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAATGTACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATA 480

 51199623 TTACAGCTATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAAT 51199682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTACAGCTATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAAT 540

 51199683 GCAGGATTTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGA 51199742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCAGGATTTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGA 600

 51199743 CAAAATTTGTTCTTAAGACAAATTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTG 51199802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAAATTTGTTCTTAAGACAAATTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTG 660

 51199803 CCATGGAGGAGAAACTTTCCATTCCACTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCTGATAT 51199862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCATGGAGGAGAAACTTTCCATTCCACTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCTGATAT 720

 51199863 AAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTGGTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAG 51199922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTGGTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAG 780

 51199923 GCTGGCCTCTCACCATCTTAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAA 51199982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTGGCCTCTCACCATCTTAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAA 840

 51199983 AATCCTACTGCCACCTCCTACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAAT 51200042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATCCTACTGCCACCTCCTACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAAT 900

 51200043 AAAAATTATCCCCATTCTGTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTC 51200102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAAATTATCCCCATTCTGTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTC 960

 51200103 CGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTT 51200162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTT 1020

 51200163 ACTCTGCAAAACTTTTAGAAATAAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAA 51200222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTCTGCAAAACTTTTAGAAATAAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAA 1080

 51200223 ATATAAAAAAAGAAGATTGAATGCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCC 51200282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATATAAAAAAAGAAGATTGAATGCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCC 1140

 51200283 ATAGTAGGTGTATGAATTGACTTCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAAT 51200342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAGTAGGTGTATGAATTGACTTCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAAT 1200

 51200343 TTAGTGGCTCTATGCATGCATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAA 51200402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTAGTGGCTCTATGCATGCATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAA 1260

 51200403 AGAGCTCTAAAACTTCAAAAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTT 51200462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAGCTCTAAAACTTCAAAAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTT 1320

 51200463 ATAAATAAGGGTTATCTTTTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTA 51200522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATAAATAAGGGTTATCTTTTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTA 1380

 51200523 CAATAACTTGGCATCATGGCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGG 51200582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAATAACTTGGCATCATGGCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGG 1440

 51200583 AACTGTAGGAGTACGAAGTGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGT 51200642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACTGTAGGAGTACGAAGTGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGT 1500

 51200643 TAACTTTTCTTGCGTTGAATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAA 51200702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAACTTTTCTTGCGTTGAATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAA 1560

 51200703 AAACATCCAATAGTGGCCATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCC 51200762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAACATCCAATAGTGGCCATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCC 1620

 51200763 CACTTCCATCAGACCCTTCTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCT 51200822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACTTCCATCAGACCCTTCTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCT 1680

 51200823 CCATTTCATCTCAGGCATTACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCA 51200882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCATTTCATCTCAGGCATTACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCA 1740

 51200883 AGGAGGATGAGGCTAGACAGTGAATGGTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAGACCTA 51200942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGGAGGATGAGGCTAGACAGTGAATGGTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAGACCTA 1800

 51200943 CTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTT 51201002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTT 1860

 51201003 AATATTAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTA 51201062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATATTAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTA 1920

 51201063 TATTTTCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAG 51201122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATTTTCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAG 1980

 51201123 ATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAA 51201182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAA 2040

 51201183 TAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTA 51201242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTA 2100

 51201243 ACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGATTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTG 51201302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGATTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTG 2160

 51201303 TTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAA 51201362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAA 2220

 51201363 ACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAA 51201422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAA 2280

 51201423 ATGATGAGTTGTAAAC 51201438
          ||||||||||||||||
     2281 ATGATGAGTTGTAAAC 2296

EXCISED REGION

 51201440 TAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACG 51201499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 TAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACG 2357

 51201500 ACATGGATATTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAA 51201559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 ACATGGATATTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAA 2417

 51201560 AATTTTTAAAAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGT 51201619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 AATTTTTAAAAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGT 2477

 51201620 TGCATGGATATATTGCATAGTGGTGAAGTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTT 51201679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 TGCATGGATATATTGCATAGTGGTGAAGTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTT 2537

 51201680 TGACAATGCTAACAAAAACACAGTGGGGAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGG 51201739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 TGACAATGCTAACAAAAACACAGTGGGGAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGG 2597

 51201740 AAAATTGGGATCACCATATGCAGAAGACTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACA 51201799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 AAAATTGGGATCACCATATGCAGAAGACTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACA 2657

 51201800 AAAATAAACTCAAGATGGATTAGAGACTTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCA 51201859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 AAAATAAACTCAAGATGGATTAGAGACTTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCA 2717

 51201860 GAAGAAAATCTAGGGAAATCTCTTCTGGACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAG 51201919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2718 GAAGAAAATCTAGGGAAATCTCTTCTGGACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAG 2777

 51201920 ACCTCAAAAGCATAGACAACTGAAACAAAAATAGACAATGAGACATACTTAAGCTAAAAA 51201979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2778 ACCTCAAAAGCATAGACAACTGAAACAAAAATAGACAATGAGACATACTTAAGCTAAAAA 2837

Alignment time is 3.71855 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51189472,51210122] =>     20651 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2872] =>      2872 nucs 'mol-32-3235-168380_2872'

Score:        2839
Aligned:      2872        nucs
Identic:      2869 (100%) nucs =>        54 (100%)      2815 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51199170,51199223] EXCISED REGION [51199225,51202042]
 second seq =>  [       1,      54] EXCISED REGION [      56,    2872]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51199224,51199224]
 second seq =>         1 nucs [55,55]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [51199847,51199847]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [54,55] to [55,56]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51199223,51199223] to [51199225,51199225]
 second seq =>         1 nucs [54,54] to [56,56]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51199170 CCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCACATTGCGCACATGTAC 51199223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCACATTGCGCACATGTAC 54

EXCISED REGION

 51199225 CTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACAGTCTCTCTTTCTTTGTC 51199284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       56 CTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACAGTCTCTCTTTCTTTGTC 115

 51199285 CTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTA 51199344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      116 CTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTA 175

 51199345 CTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTCCTCCTTCTTCTCCAC 51199404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      176 CTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTCCTCCTTCTTCTCCAC 235

 51199405 CTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTCTTTAATGTTAAGCTCTG 51199464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      236 CTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTCTTTAATGTTAAGCTCTG 295

 51199465 TTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTACCTACTTTATAGGGTTGT 51199524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      296 TTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTACCTACTTTATAGGGTTGT 355

 51199525 TATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAATGTACATGGTGTGTAGTA 51199584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      356 TATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAATGTACATGGTGTGTAGTA 415

 51199585 ACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACAGCTATTTGATTATGTTT 51199644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      416 ACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACAGCTATTTGATTATGTTT 475

 51199645 ATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGGATTTCTATCTCCTGTTT 51199704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      476 ATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGGATTTCTATCTCCTGTTT 535

 51199705 TCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAATTTGTTCTTAAGACAAA 51199764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 TCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAATTTGTTCTTAAGACAAA 595

 51199765 TTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATGGAGGAGAAACTTTCCAT 51199824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 TTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATGGAGGAGAAACTTTCCAT 655

 51199825 TCCACTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCTGATATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTG 51199884
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 TCCACTGAGGCAGCTGGTGACA-GGACTATCCTGATATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTG 714

 51199885 GTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAG 51199944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 GTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAG 774

 51199945 AAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACA 51200004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 AAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACA 834

 51200005 AATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAA 51200064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      835 AATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAA 894

 51200065 AAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTT 51200124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 AAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTT 954

 51200125 TCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAAT 51200184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 TCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAAT 1014

 51200185 AAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAAT 51200244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 AAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAAT 1074

 51200245 GCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACT 51200304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 GCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACT 1134

 51200305 TCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATT 51200364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 TCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATT 1194

 51200365 TTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGG 51200424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 TTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGG 1254

 51200425 GTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTT 51200484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 GTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTT 1314

 51200485 ATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTA 51200544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 ATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTA 1374

 51200545 GAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGC 51200604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 GAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGC 1434

 51200605 CAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGA 51200664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 CAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGA 1494

 51200665 GTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCA 51200724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 GTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCA 1554

 51200725 TTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCT 51200784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 TTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCT 1614

 51200785 AAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACC 51200844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 AAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACC 1674

 51200845 TCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTG 51200904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 TCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTG 1734

 51200905 AATGGTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGC 51200964
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 AATGGTTCATCACAACTCATTTCTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGC 1794

 51200965 ATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGT 51201024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 ATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGT 1854

 51201025 GAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGT 51201084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 GAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGT 1914

 51201085 AACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAG 51201144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 AACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAG 1974

 51201145 AGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGC 51201204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 AGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGC 2034

 51201205 ATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGGCAGTATA 51201264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2035 ATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGTCAGTATA 2094

 51201265 ATGATTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAA 51201324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 ATGATTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAA 2154

 51201325 AGACATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTC 51201384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 AGACATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTC 2214

 51201385 CATGACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGAT 51201444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 CATGACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGAT 2274

 51201445 ACTGAAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATG 51201504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 ACTGAAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATG 2334

 51201505 GATATTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTT 51201564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 GATATTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTT 2394

 51201565 TTAAAAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCAT 51201624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 TTAAAAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCAT 2454

 51201625 GGATATATTGCATAGTGGTGAAGTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACA 51201684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 GGATATATTGCATAGTGGTGAAGTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACA 2514

 51201685 ATGCTAACAAAAACACAGTGGGGAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAAT 51201744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 ATGCTAACAAAAACACAGTGGGGAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAAT 2574

 51201745 TGGGATCACCATATGCAGAAGACTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAAT 51201804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 TGGGATCACCATATGCAGAAGACTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAAT 2634

 51201805 AAACTCAAGATGGATTAGAGACTTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGA 51201864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 AAACTCAAGATGGATTAGAGACTTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGA 2694

 51201865 AAATCTAGGGAAATCTCTTCTGGACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTC 51201924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 AAATCTAGGGAAATCTCTTCTGGACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTC 2754

 51201925 AAAAGCATAGACAACTGAAACAAAAATAGACAATGAGACATACTTAAGCTAAAAAGCTTC 51201984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 AAAAGCATAGACAACTGAAACAAAAATAGACAATGAGACATACTTAAGCTAAAAAGCTTC 2814

 51201985 TGCACAGCACATATGATTTTTTTATATCAGGATCATAGTTAACAATTAACAAAATATA 51202042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 TGCACAGCACATATGATTTTTTTATATCAGGATCATAGTTAACAATTAACAAAATATA 2872

Alignment time is 3.85894 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51189472,51210122] =>     20651 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5723] =>      5723 nucs 'mol-32-32f0-086120_5723'

Score:        5722
Aligned:      5722        nucs
Identic:      5722 (100%) nucs =>      2664 (100%)      3058 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51199307,51201970] EXCISED REGION [51201972,51205029]
 second seq =>  [       1,    2664] EXCISED REGION [    2666,    5723]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51201971,51201971]
 second seq =>         1 nucs [2665,2665]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51201970,51201970] to [51201971,51201971]
 second seq =>         1 nucs [2665,2665] to [2666,2666]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51199307 TCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTC 51199366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTC 60

 51199367 TTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTCCTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTC 51199426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTCCTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTC 120

 51199427 CTCATCTTCTTTAATAAATTCTTTAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATA 51199486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCATCTTCTTTAATAAATTCTTTAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATA 180

 51199487 ATATGTGCATAGCAACAGTACCTACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAAT 51199546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATGTGCATAGCAACAGTACCTACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAAT 240

 51199547 CCATCTTAATTGCTTAAGAATGTACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATT 51199606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCATCTTAATTGCTTAAGAATGTACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATT 300

 51199607 TTATCAGGGATTAATATTACAGCTATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGG 51199666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATCAGGGATTAATATTACAGCTATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGG 360

 51199667 AAGTATGCATGAGAATGCAGGATTTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAG 51199726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGTATGCATGAGAATGCAGGATTTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAG 420

 51199727 GAATTTTGTCTTAAGACAAAATTTGTTCTTAAGACAAATTTGGTCCTTTCACAACAGGGC 51199786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAATTTTGTCTTAAGACAAAATTTGTTCTTAAGACAAATTTGGTCCTTTCACAACAGGGC 480

 51199787 ACAGCATGAAAAGCTGCCATGGAGGAGAAACTTTCCATTCCACTGAGGCAGCTGGTGACA 51199846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAGCATGAAAAGCTGCCATGGAGGAGAAACTTTCCATTCCACTGAGGCAGCTGGTGACA 540

 51199847 GGGACTATCCTGATATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTGGTCACCCTTTCTATTCAAAGTT 51199906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGACTATCCTGATATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTGGTCACCCTTTCTATTCAAAGTT 600

 51199907 GACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTA 51199966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACCCAGTAATAAGAGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTA 660

 51199967 CCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAA 51200026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTTGGACTGCCAGAAAATCCTACTGCCACCTCCTACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAA 720

 51200027 AAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATT 51200086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGAAGAAAAAATAATAAAAATTATCCCCATTCTGTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATT 780

 51200087 TGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGT 51200146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTTTCACCGCATTTCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGT 840

 51200147 AGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAATAAAACATGAAATATTGGGCCTC 51200206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTTCATTGTTGTCTTACTCTGCAAAACTTTTAGAAATAAAACATGAAATATTGGGCCTC 900

 51200207 TGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAATGCTTAGACTAAGAATTATTTAC 51200266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGACTAATGACAACAAATATAAAAAAAGAAGATTGAATGCTTAGACTAAGAATTATTTAC 960

 51200267 CTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACTTCATGGATTATCTGAAAACTCT 51200326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGTGCCCGTGAATCCATAGTAGGTGTATGAATTGACTTCATGGATTATCTGAAAACTCT 1020

 51200327 AAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACT 51200386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAATTATAAGCAAATTTAGTGGCTCTATGCATGCATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACT 1080

 51200387 TTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACA 51200446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCATCTGATGTTCAAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACA 1140

 51200447 GCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAG 51200506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCAATATGCTACATTTATAAATAAGGGTTATCTTTTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAG 1200

 51200507 TTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTT 51200566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGCAAAAGCACTCTACAATAACTTGGCATCATGGCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTT 1260

 51200567 ACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTC 51200626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACTGAGAGCCAACAGGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTC 1320

 51200627 CATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTG 51200686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATTGAGGAGGTCAGTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTG 1380

 51200687 TCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGC 51200746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCTAGACTCTGGAAAAAACATCCAATAGTGGCCATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGC 1440

 51200747 TTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCC 51200806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTTCAGAATTCTTCCCACTTCCATCAGACCCTTCTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCC 1500

 51200807 ATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCC 51200866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTCATCTCAGGCATTACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCC 1560

 51200867 CCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTGAATGGTTCATCACAACTCATTC 51200926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCATCCACTGGTCCCAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTGAATGGTTCATCACAACTCATTC 1620

 51200927 CTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAG 51200986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAG 1680

 51200987 AAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCA 51201046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCA 1740

 51201047 AACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAA 51201106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAA 1800

 51201107 AATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGG 51201166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGG 1860

 51201167 TAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTC 51201226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTC 1920

 51201227 AAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGATTTATATTAGATTGTAAA 51201286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGATTTATATTAGATTGTAAA 1980

 51201287 GTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTT 51201346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTT 2040

 51201347 AAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAAAATGAATACT 51201406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAAAATGAATACT 2100

 51201407 CCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAG 51201466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAG 2160

 51201467 AGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATATTATCTAAACATTTGTTA 51201526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATATTATCTAAACATTTGTTA 2220

 51201527 TGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAAAAAATTTATCCATGTAAC 51201586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAAAAAATTTATCCATGTAAC 2280

 51201587 TAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCATGGATATATTGCATAGTGGTGAA 51201646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCATGGATATATTGCATAGTGGTGAA 2340

 51201647 GTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACAATGCTAACAAAAACACAGTGGG 51201706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACAATGCTAACAAAAACACAGTGGG 2400

 51201707 GAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAATTGGGATCACCATATGCAGAAGA 51201766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAATTGGGATCACCATATGCAGAAGA 2460

 51201767 CTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAATAAACTCAAGATGGATTAGAGAC 51201826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAATAAACTCAAGATGGATTAGAGAC 2520

 51201827 TTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGAAAATCTAGGGAAATCTCTTCTG 51201886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGAAAATCTAGGGAAATCTCTTCTG 2580

 51201887 GACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTCAAAAGCATAGACAACTGAAACA 51201946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTCAAAAGCATAGACAACTGAAACA 2640

 51201947 AAAATAGACAATGAGACATACTTA 51201970
          ||||||||||||||||||||||||
     2641 AAAATAGACAATGAGACATACTTA 2664

EXCISED REGION

 51201972 GCTAAAAAGCTTCTGCACAGCACATATGATTTTTTTATATCAGGATCATAGTTAACAATT 51202031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 GCTAAAAAGCTTCTGCACAGCACATATGATTTTTTTATATCAGGATCATAGTTAACAATT 2725

 51202032 AACAAAATATATGAAAGACTACATCTTAAATAAATGAGGACTTTGATTTTCATACTTCAG 51202091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 AACAAAATATATGAAAGACTACATCTTAAATAAATGAGGACTTTGATTTTCATACTTCAG 2785

 51202092 AAGTGTATAAGTGAGCCATCCATGGCTAGTGTGGTGGCTCAAATGTGCCATCAGGGTCCA 51202151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 AAGTGTATAAGTGAGCCATCCATGGCTAGTGTGGTGGCTCAAATGTGCCATCAGGGTCCA 2845

 51202152 GCCTCCTTCTGTCTTCATCTTTTGCCATTCTTAGCCTATTCTGCCTTCATATTCATAAAA 51202211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 GCCTCCTTCTGTCTTCATCTTTTGCCATTCTTAGCCTATTCTGCCTTCATATTCATAAAA 2905

 51202212 TAATGACTGTACCTCTGGCCGTTGTTTTCATGTTCCAAGAGGGCAAAGGACAAAGATCAA 51202271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 TAATGACTGTACCTCTGGCCGTTGTTTTCATGTTCCAAGAGGGCAAAGGACAAAGATCAA 2965

 51202272 ATAGAGAACTGGGACCATGGCAGCCAGGTCTGCCCTGGTGCCAGTCACACAGCCATTCCT 51202331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 ATAGAGAACTGGGACCATGGCAGCCAGGTCTGCCCTGGTGCCAGTCACACAGCCATTCCT 3025

 51202332 AGCTGTAAGGGAAACTGGGGAGTGTTGTTTCTGAGCACATTGCCATTGAAAACAAAGATG 51202391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 AGCTGTAAGGGAAACTGGGGAGTGTTGTTTCTGAGCACATTGCCATTGAAAACAAAGATG 3085

 51202392 AGGCTATGCCAGTAAGGAAGAAGAGGCGTATAGTTATTGGGCAGAAGGCTATAGGAGCAG 51202451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 AGGCTATGCCAGTAAGGAAGAAGAGGCGTATAGTTATTGGGCAGAAGGCTATAGGAGCAG 3145

 51202452 CAACAGTTCACAAACGTAAGCAGCCTCAAGGCAATTCAGGGGAAGCTCCCATTTCTCTAG 51202511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 CAACAGTTCACAAACGTAAGCAGCCTCAAGGCAATTCAGGGGAAGCTCCCATTTCTCTAG 3205

 51202512 CTGAAAGTCAGTGTTGTCACCTTAGCTACATCACTCCATTACACAAACCCTGGGGTAAAA 51202571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 CTGAAAGTCAGTGTTGTCACCTTAGCTACATCACTCCATTACACAAACCCTGGGGTAAAA 3265

 51202572 CATAGCTGGGGCCTGCGTTATGTACAACCCCCAGGTTTCTGTTGTGTGCTGTCCCAGATA 51202631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 CATAGCTGGGGCCTGCGTTATGTACAACCCCCAGGTTTCTGTTGTGTGCTGTCCCAGATA 3325

 51202632 CAAAGGACTCACTGAGAAACTGTGCTCAGTGCTATACAACTGAAAAAGCATGGGCTCGGA 51202691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 CAAAGGACTCACTGAGAAACTGTGCTCAGTGCTATACAACTGAAAAAGCATGGGCTCGGA 3385

 51202692 TTCAAAAGACCAGAGTTCAAGTCTTTCATCTGCCATTTACCACCAGTGTGACCTTAGGCA 51202751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 TTCAAAAGACCAGAGTTCAAGTCTTTCATCTGCCATTTACCACCAGTGTGACCTTAGGCA 3445

 51202752 AATCATCAGCCTCAAGTTCTTCATGTGTAAAGTGTAGATGATAACACTGTCTTAGGAAAT 51202811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 AATCATCAGCCTCAAGTTCTTCATGTGTAAAGTGTAGATGATAACACTGTCTTAGGAAAT 3505

 51202812 AAGGTTTCTGGGAAGTTTAAATGAGATGATGTTTATAAAAACACCTTATGGGAAATTAAG 51202871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 AAGGTTTCTGGGAAGTTTAAATGAGATGATGTTTATAAAAACACCTTATGGGAAATTAAG 3565

 51202872 TATAAATACCACCTATGATTATGATGATTTTCAATTGAGCACTCAATTTGTTCATTTACT 51202931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 TATAAATACCACCTATGATTATGATGATTTTCAATTGAGCACTCAATTTGTTCATTTACT 3625

 51202932 TTATTTTATTATAGGGTCACTTCATTTTAATAATTGTATATTCAAGCCTTTGCTCTACAC 51202991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 TTATTTTATTATAGGGTCACTTCATTTTAATAATTGTATATTCAAGCCTTTGCTCTACAC 3685

 51202992 CAGGGGATTCCAGTCTTTTGACTTCCCTGGAACACACTGGAAGAATTGTCTTGGGCCACA 51203051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 CAGGGGATTCCAGTCTTTTGACTTCCCTGGAACACACTGGAAGAATTGTCTTGGGCCACA 3745

 51203052 CATAAAATACACTAACACTAACAATAGCTGATGGGCTAGAAAAAAAATACAAAAAAAAAA 51203111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 CATAAAATACACTAACACTAACAATAGCTGATGGGCTAGAAAAAAAATACAAAAAAAAAA 3805

 51203112 TCTTGTAATGTTTTAAGAAAATTTACAAATTTGTATTGGGCTGCATTCAGAGCCATCCTG 51203171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 TCTTGTAATGTTTTAAGAAAATTTACAAATTTGTATTGGGCTGCATTCAGAGCCATCCTG 3865

 51203172 GGCTGCATGCAACCCACAGGCTGTGAGTTGGACAAGTTTGCTCTACATGAATCATCATGC 51203231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 GGCTGCATGCAACCCACAGGCTGTGAGTTGGACAAGTTTGCTCTACATGAATCATCATGC 3925

 51203232 TATGCACTGATGCTACAGAAAAAAATATGTAGAGGTATGGAAAGCATCCTTATGGTGCTC 51203291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 TATGCACTGATGCTACAGAAAAAAATATGTAGAGGTATGGAAAGCATCCTTATGGTGCTC 3985

 51203292 ACACCTCACAATGCCTGTCTCCCTTTCAGATATGCCCTTCCCCATCTTCTTCTTTAGAAT 51203351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 ACACCTCACAATGCCTGTCTCCCTTTCAGATATGCCCTTCCCCATCTTCTTCTTTAGAAT 4045

 51203352 AATTTCTCTGTGAAACTCAGCACTCAGCTCAGAAGCATCTTCAGGGCCTTCCCCAAGCTC 51203411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 AATTTCTCTGTGAAACTCAGCACTCAGCTCAGAAGCATCTTCAGGGCCTTCCCCAAGCTC 4105

 51203412 TCTGTGGTCCTTTGGCTTCCACAACATTGCACTTTCCTGGTTCTTCTCAAATTGTTCTTC 51203471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 TCTGTGGTCCTTTGGCTTCCACAACATTGCACTTTCCTGGTTCTTCTCAAATTGTTCTTC 4165

 51203472 CCTTTTGTTTTTACTTTTTCCTCTTGTCTCTTTCATATTTGGACTACAGACACTCTCAGG 51203531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 CCTTTTGTTTTTACTTTTTCCTCTTGTCTCTTTCATATTTGGACTACAGACACTCTCAGG 4225

 51203532 TTCTCTGTGCCTCAGTCATGACTCTTCTTAATTGGCAAGTCCTATGGGTTAACCTCAGAC 51203591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 TTCTCTGTGCCTCAGTCATGACTCTTCTTAATTGGCAAGTCCTATGGGTTAACCTCAGAC 4285

 51203592 ACATTCATGCTTCCTGCTATTTCAGTGTGCTGACGACTATCTAATCTGTATAAGTGATTC 51203651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 ACATTCATGCTTCCTGCTATTTCAGTGTGCTGACGACTATCTAATCTGTATAAGTGATTC 4345

 51203652 GGACCTGTGTCCCAAGCATCAGAACCATATATCTGACAGTTTGCTAGACATTGCCAGCAG 51203711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 GGACCTGTGTCCCAAGCATCAGAACCATATATCTGACAGTTTGCTAGACATTGCCAGCAG 4405

 51203712 ATATCCCAAACCACTTCAAGTGCAAAATGTTCAAAATGAACTCTTCCTCATCCTGTGGAC 51203771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 ATATCCCAAACCACTTCAAGTGCAAAATGTTCAAAATGAACTCTTCCTCATCCTGTGGAC 4465

 51203772 TGTGATCCCAATTCTATATTCTCTATTTCAGGTAGCCTTACTATCTACCTACCTGTCTGA 51203831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 TGTGATCCCAATTCTATATTCTCTATTTCAGGTAGCCTTACTATCTACCTACCTGTCTGA 4525

 51203832 GCTAGAATACTTTGAGTAAATCCTCATTCTCTCTGTTTTCTGTTCCACATCCAACCATTT 51203891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 GCTAGAATACTTTGAGTAAATCCTCATTCTCTCTGTTTTCTGTTCCACATCCAACCATTT 4585

 51203892 ATGAAGTTTTTCCTTAGCTCTAATATATTTTTCTCTTCTTCCTCATGACCACCACTGTTG 51203951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 ATGAAGTTTTTCCTTAGCTCTAATATATTTTTCTCTTCTTCCTCATGACCACCACTGTTG 4645

 51203952 ATTTGAAAGCTTCAATCGCCCCCTGTATGAAGGATCTTAACAACATCCTATCTCACTCCA 51204011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 ATTTGAAAGCTTCAATCGCCCCCTGTATGAAGGATCTTAACAACATCCTATCTCACTCCA 4705

 51204012 ATGCCAGCCTACTGGTCTCAGATGCTGGCGTGAACGACCTCACCAAAACAAAACTGACCA 51204071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 ATGCCAGCCTACTGGTCTCAGATGCTGGCGTGAACGACCTCACCAAAACAAAACTGACCA 4765

 51204072 AATCACTCCTCTTCAAAGCCATTGACAGCTCCCTATGGTGTCTCCCACTGAGCATTTCTA 51204131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 AATCACTCCTCTTCAAAGCCATTGACAGCTCCCTATGGTGTCTCCCACTGAGCATTTCTA 4825

 51204132 CTGCTCACTCTCCAAGGCAGAGACTTTTACTCAGCATATCCATGAGTTGCCTGAGGACTC 51204191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 CTGCTCACTCTCCAAGGCAGAGACTTTTACTCAGCATATCCATGAGTTGCCTGAGGACTC 4885

 51204192 ATCCAGCATGGGGACCTCTCTATTTTGGCCTGTGTGCACATGTATGTAATGAAGTCTCCC 51204251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 ATCCAGCATGGGGACCTCTCTATTTTGGCCTGTGTGCACATGTATGTAATGAAGTCTCCC 4945

 51204252 CACAGCTCCATGGAATTCATATTCTTCAGTCAAGCACTGAATTTGCTGGACTGCACTCAT 51204311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 CACAGCTCCATGGAATTCATATTCTTCAGTCAAGCACTGAATTTGCTGGACTGCACTCAT 5005

 51204312 TATTCTATGTATATTTTTGTTTTATGGTTTAGATTGATTATACTGACATTAGCAGTTAAA 51204371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 TATTCTATGTATATTTTTGTTTTATGGTTTAGATTGATTATACTGACATTAGCAGTTAAA 5065

 51204372 AAATTGGGAACCATTTTAACACTTAAATGAACTACACTTAAATCTGGGTGTGTGAAGGGT 51204431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 AAATTGGGAACCATTTTAACACTTAAATGAACTACACTTAAATCTGGGTGTGTGAAGGGT 5125

 51204432 AGGTCTTTTTTGCCCTTATATTCTATAAACCCTGCATCACCTTCCGAAGTGGAATCAAGA 51204491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 AGGTCTTTTTTGCCCTTATATTCTATAAACCCTGCATCACCTTCCGAAGTGGAATCAAGA 5185

 51204492 AAGAATGTGACAGTTGGAAAATTGATCAGAACTCCTGAGCAGTTACTTGGACTCCGTCTA 51204551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 AAGAATGTGACAGTTGGAAAATTGATCAGAACTCCTGAGCAGTTACTTGGACTCCGTCTA 5245

 51204552 GATTTTTTTTTTCCCTCACTGATGTAGCAGAGCCCATTAATATGGAAGAACCTGAGTAGT 51204611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 GATTTTTTTTTTCCCTCACTGATGTAGCAGAGCCCATTAATATGGAAGAACCTGAGTAGT 5305

 51204612 CAAAATTAGTCCCTCCCTGAGACTGCACGTAGGAAAAGCATGTCCTTTGATGTTAACCTT 51204671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 CAAAATTAGTCCCTCCCTGAGACTGCACGTAGGAAAAGCATGTCCTTTGATGTTAACCTT 5365

 51204672 CCTAAAAGGTTCAGATACTCTAACTACAGGCATGGTGACGTCACCCCTTTGTGTTTGTGT 51204731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 CCTAAAAGGTTCAGATACTCTAACTACAGGCATGGTGACGTCACCCCTTTGTGTTTGTGT 5425

 51204732 GAATGGGCTAGATTAAGGAGATTAAAAAAGGAGTGGGTCAGAGGTAAATGTGGTTGAATG 51204791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 GAATGGGCTAGATTAAGGAGATTAAAAAAGGAGTGGGTCAGAGGTAAATGTGGTTGAATG 5485

 51204792 GCAGTGGAAGGGGTGGGGCAGCAAATCCTCACCATCTTAAGAAAACAGTCTTCATTCACG 51204851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 GCAGTGGAAGGGGTGGGGCAGCAAATCCTCACCATCTTAAGAAAACAGTCTTCATTCACG 5545

 51204852 TCTTTACATGCATTTGAAAGCAGAGCAGCAGGTAGATTTTCGAATCACAACCTCTGCTCT 51204911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 TCTTTACATGCATTTGAAAGCAGAGCAGCAGGTAGATTTTCGAATCACAACCTCTGCTCT 5605

 51204912 AGGCTCTGTGTTCAATTTTTAGCTCTGGCTCTAGCAAACGGAGGACAAGGCTCATTACTG 51204971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 AGGCTCTGTGTTCAATTTTTAGCTCTGGCTCTAGCAAACGGAGGACAAGGCTCATTACTG 5665

 51204972 CATACATGAGGTTTTGTTTGCTTTTCAATCGAAGAGGAAGAATCATTAGGTCGTTCTC 51205029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 CATACATGAGGTTTTGTTTGCTTTTCAATCGAAGAGGAAGAATCATTAGGTCGTTCTC 5723

Alignment time is 6.6665 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51189472,51210122] =>     20651 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2489] =>      2489 nucs 'mol-32-3395-124549_2489'

Score:        2489
Aligned:      2489        nucs
Identic:      2489 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51199081,51201569]
 second seq =>  [       1,    2489]

 51199081 TGGGGACTGTTGTGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATG 51199140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGGACTGTTGTGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATG 60

 51199141 TTAAATGATGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTA 51199200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAAATGATGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTA 120

 51199201 ACCTGCACATTGCGCACATGTACTCTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAA 51199260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCTGCACATTGCGCACATGTACTCTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAA 180

 51199261 GAAAACAGTCTCTCTTTCTTTGTCCTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCAC 51199320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAAACAGTCTCTCTTTCTTTGTCCTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCAC 240

 51199321 CTCCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTC 51199380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCTTCTTTTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTC 300

 51199381 CACCTTTTCCTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAA 51199440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACCTTTTCCTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAA 360

 51199441 TAAATTCTTTAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCA 51199500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAATTCTTTAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCA 420

 51199501 ACAGTACCTACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCT 51199560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGTACCTACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCT 480

 51199561 TAAGAATGTACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAA 51199620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAGAATGTACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAA 540

 51199621 TATTACAGCTATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGA 51199680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTACAGCTATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGA 600

 51199681 ATGCAGGATTTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAA 51199740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGCAGGATTTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAA 660

 51199741 GACAAAATTTGTTCTTAAGACAAATTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGC 51199800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GACAAAATTTGTTCTTAAGACAAATTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGC 720

 51199801 TGCCATGGAGGAGAAACTTTCCATTCCACTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCTGAT 51199860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGCCATGGAGGAGAAACTTTCCATTCCACTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCTGAT 780

 51199861 ATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTGGTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAG 51199920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAAGAGTAAAGCAGGAGGTTGTGGTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAG 840

 51199921 AGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAG 51199980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGCTGGCCTCTCACCATCTTAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAG 900

 51199981 AAAATCCTACTGCCACCTCCTACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATA 51200040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAATCCTACTGCCACCTCCTACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATA 960

 51200041 ATAAAAATTATCCCCATTCTGTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATT 51200100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATAAAAATTATCCCCATTCTGTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATT 1020

 51200101 TCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTC 51200160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCGAAGTCTAGCAAGTCGGGCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTC 1080

 51200161 TTACTCTGCAAAACTTTTAGAAATAAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAAC 51200220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTACTCTGCAAAACTTTTAGAAATAAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAAC 1140

 51200221 AAATATAAAAAAAGAAGATTGAATGCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAAT 51200280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATATAAAAAAAGAAGATTGAATGCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAAT 1200

 51200281 CCATAGTAGGTGTATGAATTGACTTCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAA 51200340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCATAGTAGGTGTATGAATTGACTTCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAA 1260

 51200341 ATTTAGTGGCTCTATGCATGCATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTC 51200400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTTAGTGGCTCTATGCATGCATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTC 1320

 51200401 AAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACAT 51200460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAGAGCTCTAAAACTTCAAAAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACAT 1380

 51200461 TTATAAATAAGGGTTATCTTTTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTC 51200520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTATAAATAAGGGTTATCTTTTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTC 1440

 51200521 TACAATAACTTGGCATCATGGCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACA 51200580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACAATAACTTGGCATCATGGCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACA 1500

 51200581 GGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCA 51200640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGAACTGTAGGAGTACGAAGTGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCA 1560

 51200641 GTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGA 51200700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTTAACTTTTCTTGCGTTGAATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGA 1620

 51200701 AAAAACATCCAATAGTGGCCATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTT 51200760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAAACATCCAATAGTGGCCATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTT 1680

 51200761 CCCACTTCCATCAGACCCTTCTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTT 51200820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCCACTTCCATCAGACCCTTCTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTT 1740

 51200821 CTCCATTTCATCTCAGGCATTACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCC 51200880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTCCATTTCATCTCAGGCATTACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCC 1800

 51200881 CAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTGAATGGTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAGACC 51200940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAAGGAGGATGAGGCTAGACAGTGAATGGTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAGACC 1860

 51200941 TACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTC 51201000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATATGTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTC 1920

 51201001 TTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTT 51201060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAGGTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTT 1980

 51201061 TATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGC 51201120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACAACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGC 2040

 51201121 AGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCA 51201180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGATTAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCA 2100

 51201181 AATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCT 51201240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGTTGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCT 2160

 51201241 TAACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGATTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTT 51201300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGATTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTT 2220

 51201301 TGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCT 51201360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGACATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCT 2280

 51201361 AAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCT 51201420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATGACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCT 2340

 51201421 AAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTA 51201480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTGAAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTA 2400

 51201481 GCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATATTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTA 51201540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATATTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTA 2460

 51201541 TGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAAA 51201569
          |||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAAA 2489

Alignment time is 2.54714 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [51189472,51210122] =>     20651 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    6129] =>      6129 nucs 'mol-32-33f8-091191_6129'

Score:        6128
Aligned:      6128        nucs
Identic:      6128 (100%) nucs =>      1818 (100%)      4310 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [51199090,51200907] EXCISED REGION [51200909,51205218]
 second seq =>  [       1,    1818] EXCISED REGION [    1820,    6129]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [51200908,51200908]
 second seq =>         1 nucs [1819,1819]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [51200908,51200908] to [51200909,51200909]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 51199090 TTGTGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGTTAAATGAT 51199149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTGGGGTGGGGGGAGGGGGGAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGTTAAATGAT 60

 51199150 GAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCACA 51199209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGTTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCGCATGTATACATATATAATTAACCTGCACA 120

 51199210 TTGCGCACATGTACTCTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACAGT 51199269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGCGCACATGTACTCTAAAACTTAAAGTATGATAATAATAATAAAAAAAAGAAAACAGT 180

 51199270 CTCTCTTTCTTTGTCCTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTT 51199329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCTCTTTCTTTGTCCTCCTTCTCCTCCTCTTCCTTCTCCTCCTCCTCCACCTCCTTCTT 240

 51199330 TTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTC 51199389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCTCCTCTTCCTACTCCTTATCCTTCTCATACTTCTTCTTCTCCTCCTCCACCTTTTC 300

 51199390 CTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTCTT 51199449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCCTTCTTCTCCACCTCCTCCTCCTCTTCCTTCTTCCTCATCTTCTTTAATAAATTCTT 360

 51199450 TAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTACCT 51199509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAATGTTAAGCTCTGTTCCTCAGTTTCTTCAGCTATAATATGTGCATAGCAACAGTACCT 420

 51199510 ACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAATGT 51199569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTTTATAGGGTTGTTATGAAGATTAAATGAGGCAATCCATCTTAATTGCTTAAGAATGT 480

 51199570 ACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACAGC 51199629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACATGGTGTGTAGTAACACAGCACTCCTCAATTGATTTTATCAGGGATTAATATTACAGC 540

 51199630 TATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGGAT 51199689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTTGATTATGTTTATGCACGTTGCAATCTGGTGGGAAGTATGCATGAGAATGCAGGAT 600

 51199690 TTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAATT 51199749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTCTATCTCCTGTTTTCACTTTTGTCTTTAAGTATAGGAATTTTGTCTTAAGACAAAATT 660

 51199750 TGTTCTTAAGACAAATTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATGGA 51199809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTTCTTAAGACAAATTTGGTCCTTTCACAACAGGGCACAGCATGAAAAGCTGCCATGGA 720

 51199810 GGAGAAACTTTCCATTCCACTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCTGATATAAGAGTA 51199869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGAGAAACTTTCCATTCCACTGAGGCAGCTGGTGACAGGGACTATCCTGATATAAGAGTA 780

 51199870 AAGCAGGAGGTTGTGGTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCC 51199929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGCAGGAGGTTGTGGTCACCCTTTCTATTCAAAGTTGACCCAGTAATAAGAGGCTGGCC 840

 51199930 TCTCACCATCTTAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTA 51199989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTCACCATCTTAAGAAAATGAAACTAGACAACTGTACCTTGGACTGCCAGAAAATCCTA 900

 51199990 CTGCCACCTCCTACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATT 51200049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGCCACCTCCTACAAATAAGGGGAAAAAATCTGAAAAAGAAGAAAAAATAATAAAAATT 960

 51200050 ATCCCCATTCTGTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTC 51200109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCCCCATTCTGTAAAAAGCAAACCTGAAACAGGATTTGTTTCACCGCATTTCCGAAGTC 1020

 51200110 TAGCAAGTCGGGCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGC 51200169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGCAAGTCGGGCTTTCATTGAAGGTAATGAATGGGTAGTTCATTGTTGTCTTACTCTGC 1080

 51200170 AAAACTTTTAGAAATAAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAA 51200229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAACTTTTAGAAATAAAACATGAAATATTGGGCCTCTGACTAATGACAACAAATATAAA 1140

 51200230 AAAAGAAGATTGAATGCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAG 51200289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAAGAAGATTGAATGCTTAGACTAAGAATTATTTACCTGTGCCCGTGAATCCATAGTAG 1200

 51200290 GTGTATGAATTGACTTCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGG 51200349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGTATGAATTGACTTCATGGATTATCTGAAAACTCTAAAATTATAAGCAAATTTAGTGG 1260

 51200350 CTCTATGCATGCATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTC 51200409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCTATGCATGCATTTTTGTAAAAAGAGTTCTGAACTTTCATCTGATGTTCAAAGAGCTC 1320

 51200410 TAAAACTTCAAAAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATA 51200469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAAACTTCAAAAGGGTTAAGAACTCTAGATTAGACAGCAATATGCTACATTTATAAATA 1380

 51200470 AGGGTTATCTTTTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAAC 51200529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGGGTTATCTTTTTTATCTTCATGTTGCACAAGAAAGTTGCAAAAGCACTCTACAATAAC 1440

 51200530 TTGGCATCATGGCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTA 51200589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGGCATCATGGCTAGAGAAATGTTGACTCTTGCTTTACTGAGAGCCAACAGGAACTGTA 1500

 51200590 GGAGTACGAAGTGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTT 51200649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGAGTACGAAGTGGCCAAGGCCTGTGTCTTTGGCTTCCATTGAGGAGGTCAGTTAACTTT 1560

 51200650 TCTTGCGTTGAATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATC 51200709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTTGCGTTGAATGAGTGTGGGAGTTTTCTGGTTCTGTCCTAGACTCTGGAAAAAACATC 1620

 51200710 CAATAGTGGCCATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCC 51200769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAATAGTGGCCATCATTTTTCCTGAACATGATGTGGCTTTTCAGAATTCTTCCCACTTCC 1680

 51200770 ATCAGACCCTTCTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTC 51200829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATCAGACCCTTCTCTAAAATTAGTTGCTGTAGAGGCCATGAGCTTGAAGTTCTCCATTTC 1740

 51200830 ATCTCAGGCATTACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGA 51200889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATCTCAGGCATTACCTCAAGACACTTTGTGTCTCTCCCCATCCACTGGTCCCAAGGAGGA 1800

 51200890 TGAGGCTAGACAGTGAAT 51200907
          ||||||||||||||||||
     1801 TGAGGCTAGACAGTGAAT 1818

EXCISED REGION

 51200909 GTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATAT 51200968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 GTTCATCACAACTCATTCCTATCCTGGAGACCTACTAACAGTGAGTTAGGAAGGGCATAT 1879

 51200969 GTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAG 51201028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 GTCTTATACTGTAAGTAGAAAGATAATCTTTCTTAATATTAATATCTATCATTAGTGAAG 1939

 51201029 GTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACA 51201088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 GTTTTCTTGATTGTTCCAAACAGTAGACACTTTATATTTTCACACTTAATCCCTGTAACA 1999

 51201089 ACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGAT 51201148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 ACCGTATCCCAGTGTTAAAATTATCAGGATGCAGATAAGTGAATTAGGGCTCACAGAGAT 2059

 51201149 TAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGT 51201208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 TAAGCAAGTTGTCCCAGGTAACACAGCTAGCAAATAACAGAGTTGAGTTGTAATGCATGT 2119

 51201209 TGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGA 51201268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 TGCAGTCTGTATGACTTCAAAGTTCAAGCTCTTAACTAACGTTCTGTGGCAGTATAATGA 2179

 51201269 TTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGAC 51201328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 TTTATATTAGATTGTAAAGTATCGTACAGTTTTGTTTATCCCTAGTTTATTTTGAAAGAC 2239

 51201329 ATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATG 51201388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 ATTCAACTCTTTGGTTTTAAACGATCTTCCCTAAACATAAACTTCCTGCATAGTTCCATG 2299

 51201389 ACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTG 51201448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 ACTGATAAAATGAATACTCCTTCTATGTCTCTAAATGATGAGTTGTAAACATAGATACTG 2359

 51201449 AAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATA 51201508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 AAAGATGGGAGACACAAGAGTGAAGTAGGCTAGCTGGTACTGTGAAATACGACATGGATA 2419

 51201509 TTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAA 51201568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 TTATCTAAACATTTGTTATGCATGTCAGTTTATGGCATACATATTCTTTAAAATTTTTAA 2479

 51201569 AAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCATGGAT 51201628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 AAAATTTATCCATGTAACTAATGTTTTAAAATGTATCCATGTAGTCAATGTTGCATGGAT 2539

 51201629 ATATTGCATAGTGGTGAAGTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACAATGC 51201688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 ATATTGCATAGTGGTGAAGTCAAAGCTCTTAATGTCTCCATCACTAATTTTTGACAATGC 2599

 51201689 TAACAAAAACACAGTGGGGAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAATTGGG 51201748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 TAACAAAAACACAGTGGGGAAAGGACACTCTTTTCAGCAAATAGTGCTAGGAAAATTGGG 2659

 51201749 ATCACCATATGCAGAAGACTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAATAAAC 51201808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 ATCACCATATGCAGAAGACTGAAACCTGACCCCTATCTCTCACCATATACAAAAATAAAC 2719

 51201809 TCAAGATGGATTAGAGACTTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGAAAAT 51201868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 TCAAGATGGATTAGAGACTTAAATGTATGACCTGAGACTATAAAAATATCAGAAGAAAAT 2779

 51201869 CTAGGGAAATCTCTTCTGGACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTCAAAA 51201928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 CTAGGGAAATCTCTTCTGGACATTGGTCCAAGCAAAGAGTTTATGACTAAGACCTCAAAA 2839

 51201929 GCATAGACAACTGAAACAAAAATAGACAATGAGACATACTTAAGCTAAAAAGCTTCTGCA 51201988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 GCATAGACAACTGAAACAAAAATAGACAATGAGACATACTTAAGCTAAAAAGCTTCTGCA 2899

 51201989 CAGCACATATGATTTTTTTATATCAGGATCATAGTTAACAATTAACAAAATATATGAAAG 51202048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 CAGCACATATGATTTTTTTATATCAGGATCATAGTTAACAATTAACAAAATATATGAAAG 2959

 51202049 ACTACATCTTAAATAAATGAGGACTTTGATTTTCATACTTCAGAAGTGTATAAGTGAGCC 51202108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 ACTACATCTTAAATAAATGAGGACTTTGATTTTCATACTTCAGAAGTGTATAAGTGAGCC 3019

 51202109 ATCCATGGCTAGTGTGGTGGCTCAAATGTGCCATCAGGGTCCAGCCTCCTTCTGTCTTCA 51202168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 ATCCATGGCTAGTGTGGTGGCTCAAATGTGCCATCAGGGTCCAGCCTCCTTCTGTCTTCA 3079

 51202169 TCTTTTGCCATTCTTAGCCTATTCTGCCTTCATATTCATAAAATAATGACTGTACCTCTG 51202228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 TCTTTTGCCATTCTTAGCCTATTCTGCCTTCATATTCATAAAATAATGACTGTACCTCTG 3139

 51202229 GCCGTTGTTTTCATGTTCCAAGAGGGCAAAGGACAAAGATCAAATAGAGAACTGGGACCA 51202288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 GCCGTTGTTTTCATGTTCCAAGAGGGCAAAGGACAAAGATCAAATAGAGAACTGGGACCA 3199

 51202289 TGGCAGCCAGGTCTGCCCTGGTGCCAGTCACACAGCCATTCCTAGCTGTAAGGGAAACTG 51202348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 TGGCAGCCAGGTCTGCCCTGGTGCCAGTCACACAGCCATTCCTAGCTGTAAGGGAAACTG 3259

 51202349 GGGAGTGTTGTTTCTGAGCACATTGCCATTGAAAACAAAGATGAGGCTATGCCAGTAAGG 51202408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 GGGAGTGTTGTTTCTGAGCACATTGCCATTGAAAACAAAGATGAGGCTATGCCAGTAAGG 3319

 51202409 AAGAAGAGGCGTATAGTTATTGGGCAGAAGGCTATAGGAGCAGCAACAGTTCACAAACGT 51202468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 AAGAAGAGGCGTATAGTTATTGGGCAGAAGGCTATAGGAGCAGCAACAGTTCACAAACGT 3379

 51202469 AAGCAGCCTCAAGGCAATTCAGGGGAAGCTCCCATTTCTCTAGCTGAAAGTCAGTGTTGT 51202528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 AAGCAGCCTCAAGGCAATTCAGGGGAAGCTCCCATTTCTCTAGCTGAAAGTCAGTGTTGT 3439

 51202529 CACCTTAGCTACATCACTCCATTACACAAACCCTGGGGTAAAACATAGCTGGGGCCTGCG 51202588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 CACCTTAGCTACATCACTCCATTACACAAACCCTGGGGTAAAACATAGCTGGGGCCTGCG 3499

 51202589 TTATGTACAACCCCCAGGTTTCTGTTGTGTGCTGTCCCAGATACAAAGGACTCACTGAGA 51202648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 TTATGTACAACCCCCAGGTTTCTGTTGTGTGCTGTCCCAGATACAAAGGACTCACTGAGA 3559

 51202649 AACTGTGCTCAGTGCTATACAACTGAAAAAGCATGGGCTCGGATTCAAAAGACCAGAGTT 51202708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 AACTGTGCTCAGTGCTATACAACTGAAAAAGCATGGGCTCGGATTCAAAAGACCAGAGTT 3619

 51202709 CAAGTCTTTCATCTGCCATTTACCACCAGTGTGACCTTAGGCAAATCATCAGCCTCAAGT 51202768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 CAAGTCTTTCATCTGCCATTTACCACCAGTGTGACCTTAGGCAAATCATCAGCCTCAAGT 3679

 51202769 TCTTCATGTGTAAAGTGTAGATGATAACACTGTCTTAGGAAATAAGGTTTCTGGGAAGTT 51202828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 TCTTCATGTGTAAAGTGTAGATGATAACACTGTCTTAGGAAATAAGGTTTCTGGGAAGTT 3739

 51202829 TAAATGAGATGATGTTTATAAAAACACCTTATGGGAAATTAAGTATAAATACCACCTATG 51202888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 TAAATGAGATGATGTTTATAAAAACACCTTATGGGAAATTAAGTATAAATACCACCTATG 3799

 51202889 ATTATGATGATTTTCAATTGAGCACTCAATTTGTTCATTTACTTTATTTTATTATAGGGT 51202948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 ATTATGATGATTTTCAATTGAGCACTCAATTTGTTCATTTACTTTATTTTATTATAGGGT 3859

 51202949 CACTTCATTTTAATAATTGTATATTCAAGCCTTTGCTCTACACCAGGGGATTCCAGTCTT 51203008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 CACTTCATTTTAATAATTGTATATTCAAGCCTTTGCTCTACACCAGGGGATTCCAGTCTT 3919

 51203009 TTGACTTCCCTGGAACACACTGGAAGAATTGTCTTGGGCCACACATAAAATACACTAACA 51203068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 TTGACTTCCCTGGAACACACTGGAAGAATTGTCTTGGGCCACACATAAAATACACTAACA 3979

 51203069 CTAACAATAGCTGATGGGCTAGAAAAAAAATACAAAAAAAAAATCTTGTAATGTTTTAAG 51203128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 CTAACAATAGCTGATGGGCTAGAAAAAAAATACAAAAAAAAAATCTTGTAATGTTTTAAG 4039

 51203129 AAAATTTACAAATTTGTATTGGGCTGCATTCAGAGCCATCCTGGGCTGCATGCAACCCAC 51203188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4040 AAAATTTACAAATTTGTATTGGGCTGCATTCAGAGCCATCCTGGGCTGCATGCAACCCAC 4099

 51203189 AGGCTGTGAGTTGGACAAGTTTGCTCTACATGAATCATCATGCTATGCACTGATGCTACA 51203248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 AGGCTGTGAGTTGGACAAGTTTGCTCTACATGAATCATCATGCTATGCACTGATGCTACA 4159

 51203249 GAAAAAAATATGTAGAGGTATGGAAAGCATCCTTATGGTGCTCACACCTCACAATGCCTG 51203308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4160 GAAAAAAATATGTAGAGGTATGGAAAGCATCCTTATGGTGCTCACACCTCACAATGCCTG 4219

 51203309 TCTCCCTTTCAGATATGCCCTTCCCCATCTTCTTCTTTAGAATAATTTCTCTGTGAAACT 51203368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4220 TCTCCCTTTCAGATATGCCCTTCCCCATCTTCTTCTTTAGAATAATTTCTCTGTGAAACT 4279

 51203369 CAGCACTCAGCTCAGAAGCATCTTCAGGGCCTTCCCCAAGCTCTCTGTGGTCCTTTGGCT 51203428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4280 CAGCACTCAGCTCAGAAGCATCTTCAGGGCCTTCCCCAAGCTCTCTGTGGTCCTTTGGCT 4339

 51203429 TCCACAACATTGCACTTTCCTGGTTCTTCTCAAATTGTTCTTCCCTTTTGTTTTTACTTT 51203488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4340 TCCACAACATTGCACTTTCCTGGTTCTTCTCAAATTGTTCTTCCCTTTTGTTTTTACTTT 4399

 51203489 TTCCTCTTGTCTCTTTCATATTTGGACTACAGACACTCTCAGGTTCTCTGTGCCTCAGTC 51203548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4400 TTCCTCTTGTCTCTTTCATATTTGGACTACAGACACTCTCAGGTTCTCTGTGCCTCAGTC 4459

 51203549 ATGACTCTTCTTAATTGGCAAGTCCTATGGGTTAACCTCAGACACATTCATGCTTCCTGC 51203608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 ATGACTCTTCTTAATTGGCAAGTCCTATGGGTTAACCTCAGACACATTCATGCTTCCTGC 4519

 51203609 TATTTCAGTGTGCTGACGACTATCTAATCTGTATAAGTGATTCGGACCTGTGTCCCAAGC 51203668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4520 TATTTCAGTGTGCTGACGACTATCTAATCTGTATAAGTGATTCGGACCTGTGTCCCAAGC 4579

 51203669 ATCAGAACCATATATCTGACAGTTTGCTAGACATTGCCAGCAGATATCCCAAACCACTTC 51203728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 ATCAGAACCATATATCTGACAGTTTGCTAGACATTGCCAGCAGATATCCCAAACCACTTC 4639

 51203729 AAGTGCAAAATGTTCAAAATGAACTCTTCCTCATCCTGTGGACTGTGATCCCAATTCTAT 51203788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4640 AAGTGCAAAATGTTCAAAATGAACTCTTCCTCATCCTGTGGACTGTGATCCCAATTCTAT 4699

 51203789 ATTCTCTATTTCAGGTAGCCTTACTATCTACCTACCTGTCTGAGCTAGAATACTTTGAGT 51203848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 ATTCTCTATTTCAGGTAGCCTTACTATCTACCTACCTGTCTGAGCTAGAATACTTTGAGT 4759

 51203849 AAATCCTCATTCTCTCTGTTTTCTGTTCCACATCCAACCATTTATGAAGTTTTTCCTTAG 51203908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 AAATCCTCATTCTCTCTGTTTTCTGTTCCACATCCAACCATTTATGAAGTTTTTCCTTAG 4819

 51203909 CTCTAATATATTTTTCTCTTCTTCCTCATGACCACCACTGTTGATTTGAAAGCTTCAATC 51203968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4820 CTCTAATATATTTTTCTCTTCTTCCTCATGACCACCACTGTTGATTTGAAAGCTTCAATC 4879

 51203969 GCCCCCTGTATGAAGGATCTTAACAACATCCTATCTCACTCCAATGCCAGCCTACTGGTC 51204028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 GCCCCCTGTATGAAGGATCTTAACAACATCCTATCTCACTCCAATGCCAGCCTACTGGTC 4939

 51204029 TCAGATGCTGGCGTGAACGACCTCACCAAAACAAAACTGACCAAATCACTCCTCTTCAAA 51204088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4940 TCAGATGCTGGCGTGAACGACCTCACCAAAACAAAACTGACCAAATCACTCCTCTTCAAA 4999

 51204089 GCCATTGACAGCTCCCTATGGTGTCTCCCACTGAGCATTTCTACTGCTCACTCTCCAAGG 51204148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5000 GCCATTGACAGCTCCCTATGGTGTCTCCCACTGAGCATTTCTACTGCTCACTCTCCAAGG 5059

 51204149 CAGAGACTTTTACTCAGCATATCCATGAGTTGCCTGAGGACTCATCCAGCATGGGGACCT 51204208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5060 CAGAGACTTTTACTCAGCATATCCATGAGTTGCCTGAGGACTCATCCAGCATGGGGACCT 5119

 51204209 CTCTATTTTGGCCTGTGTGCACATGTATGTAATGAAGTCTCCCCACAGCTCCATGGAATT 51204268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5120 CTCTATTTTGGCCTGTGTGCACATGTATGTAATGAAGTCTCCCCACAGCTCCATGGAATT 5179

 51204269 CATATTCTTCAGTCAAGCACTGAATTTGCTGGACTGCACTCATTATTCTATGTATATTTT 51204328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5180 CATATTCTTCAGTCAAGCACTGAATTTGCTGGACTGCACTCATTATTCTATGTATATTTT 5239

 51204329 TGTTTTATGGTTTAGATTGATTATACTGACATTAGCAGTTAAAAAATTGGGAACCATTTT 51204388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5240 TGTTTTATGGTTTAGATTGATTATACTGACATTAGCAGTTAAAAAATTGGGAACCATTTT 5299

 51204389 AACACTTAAATGAACTACACTTAAATCTGGGTGTGTGAAGGGTAGGTCTTTTTTGCCCTT 51204448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5300 AACACTTAAATGAACTACACTTAAATCTGGGTGTGTGAAGGGTAGGTCTTTTTTGCCCTT 5359

 51204449 ATATTCTATAAACCCTGCATCACCTTCCGAAGTGGAATCAAGAAAGAATGTGACAGTTGG 51204508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5360 ATATTCTATAAACCCTGCATCACCTTCCGAAGTGGAATCAAGAAAGAATGTGACAGTTGG 5419

 51204509 AAAATTGATCAGAACTCCTGAGCAGTTACTTGGACTCCGTCTAGATTTTTTTTTTCCCTC 51204568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5420 AAAATTGATCAGAACTCCTGAGCAGTTACTTGGACTCCGTCTAGATTTTTTTTTTCCCTC 5479

 51204569 ACTGATGTAGCAGAGCCCATTAATATGGAAGAACCTGAGTAGTCAAAATTAGTCCCTCCC 51204628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5480 ACTGATGTAGCAGAGCCCATTAATATGGAAGAACCTGAGTAGTCAAAATTAGTCCCTCCC 5539

 51204629 TGAGACTGCACGTAGGAAAAGCATGTCCTTTGATGTTAACCTTCCTAAAAGGTTCAGATA 51204688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5540 TGAGACTGCACGTAGGAAAAGCATGTCCTTTGATGTTAACCTTCCTAAAAGGTTCAGATA 5599

 51204689 CTCTAACTACAGGCATGGTGACGTCACCCCTTTGTGTTTGTGTGAATGGGCTAGATTAAG 51204748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5600 CTCTAACTACAGGCATGGTGACGTCACCCCTTTGTGTTTGTGTGAATGGGCTAGATTAAG 5659

 51204749 GAGATTAAAAAAGGAGTGGGTCAGAGGTAAATGTGGTTGAATGGCAGTGGAAGGGGTGGG 51204808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5660 GAGATTAAAAAAGGAGTGGGTCAGAGGTAAATGTGGTTGAATGGCAGTGGAAGGGGTGGG 5719

 51204809 GCAGCAAATCCTCACCATCTTAAGAAAACAGTCTTCATTCACGTCTTTACATGCATTTGA 51204868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5720 GCAGCAAATCCTCACCATCTTAAGAAAACAGTCTTCATTCACGTCTTTACATGCATTTGA 5779

 51204869 AAGCAGAGCAGCAGGTAGATTTTCGAATCACAACCTCTGCTCTAGGCTCTGTGTTCAATT 51204928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5780 AAGCAGAGCAGCAGGTAGATTTTCGAATCACAACCTCTGCTCTAGGCTCTGTGTTCAATT 5839

 51204929 TTTAGCTCTGGCTCTAGCAAACGGAGGACAAGGCTCATTACTGCATACATGAGGTTTTGT 51204988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5840 TTTAGCTCTGGCTCTAGCAAACGGAGGACAAGGCTCATTACTGCATACATGAGGTTTTGT 5899

 51204989 TTGCTTTTCAATCGAAGAGGAAGAATCATTAGGTCGTTCTCATAAGATGACACAGAAAGC 51205048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5900 TTGCTTTTCAATCGAAGAGGAAGAATCATTAGGTCGTTCTCATAAGATGACACAGAAAGC 5959

 51205049 TTATTGAAATGCCTTTGCAGATAGTGAGGGAAAATGTTGTTACCTAAATTTAATGATTAA 51205108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5960 TTATTGAAATGCCTTTGCAGATAGTGAGGGAAAATGTTGTTACCTAAATTTAATGATTAA 6019

 51205109 GTGCATGACATATTAAACCACCCTCCTCTGGGACTTACATGCTAATGAATAGTTCTAGCA 51205168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6020 GTGCATGACATATTAAACCACCCTCCTCTGGGACTTACATGCTAATGAATAGTTCTAGCA 6079

 51205169 TTCATTTCAGGTTTTCAGGTACCTAAGGCAAAATGATGCACACCCTATAG 51205218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6080 TTCATTTCAGGTTTTCAGGTACCTAAGGCAAAATGATGCACACCCTATAG 6129

Alignment time is 7.30458 s

