
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4807] =>      4807 nucs 'mol-32-1f21-040169_4807'

Score:        4709
Aligned:      4812        nucs
Identic:      4801 (100%) nucs =>      4732 (100%)        69 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29649591,29654333] EXCISED REGION [29654339,29654407]
 second seq =>  [       1,    4738] EXCISED REGION [    4739,    4807]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [29654334,29654338]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [29654334,29654358] to [29654339,29654363]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [29654332,29654333] to [29654339,29654340]
 second seq =>         2 nucs [4737,4738] to [4739,4740]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29649591 TGAGGGGGCGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGACCTCAGCGTGGCCAATATGGCGAAAC 29649650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAGGGGGCGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGACCTCAGCGTGGCCAATATGGCGAAAC 60

 29649651 CTTGTCCCTATTAAAAATACAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCCCA 29649710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTGTCCCTATTAAAAATACAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCCCA 120

 29649711 GCTACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTGAA 29649770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTGAA 180

 29649771 TTACTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTGGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCTAA 29649830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTACTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTGGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCTAA 240

 29649831 CACTTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGG 29649890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACTTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGG 300

 29649891 CAACATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTTGTGGTA 29649950
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      301 CAACATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTGGTGGTA 360

 29649951 CATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAG 29650010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAG 420

 29650011 TTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAG 29650070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAG 480

 29650071 GCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGAC 29650130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGAC 540

 29650131 ATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAG 29650190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAG 600

 29650191 AGTCTCGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTC 29650250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTCTCGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTC 660

 29650251 CAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTAATTTTTTTTTT 29650310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTAATTTTTTTTTT 720

 29650311 TTTTTTTTTTTTTTTAGTACACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACT 29650370
          ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTTTTTTTTT---AGTACACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACT 777

 29650371 CCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCC 29650430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 CCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCC 837

 29650431 ACCGCGCCCGGCTAGAAAAGATTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTAATTATACTGTA 29650490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 ACCGCGCCCGGCTAGAAAAGATTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTAATTATACTGTA 897

 29650491 AGTTTTAGGGTACATATGCACAACATGCCGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGT 29650550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 AGTTTTAGGGTACATATGCACAACATGCCGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGT 957

 29650551 TGGTGTGCTGCACCCATAACTCATCATTTAACATTAGATATATCTCCTAATGCTATCCCT 29650610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 TGGTGTGCTGCACCCATAACTCATCATTTAACATTAGATATATCTCCTAATGCTATCCCT 1017

 29650611 CCCCACTCCCTAGAAAAGATTTCTTGTGGAGTTTTTAAAAAGTCCTTTGAAACAATTCTT 29650670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 CCCCACTCCCTAGAAAAGATTTCTTGTGGAGTTTTTAAAAAGTCCTTTGAAACAATTCTT 1077

 29650671 TTCTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTCGATACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGT 29650730
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 TTCTTTTCCTTTTTTTTTTTTT-CGATACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGT 1136

 29650731 GCAATGGCATGATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTG 29650790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 GCAATGGCATGATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTG 1196

 29650791 CCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCTTGGCTAATTTTGT 29650850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1197 CCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGT 1256

 29650851 ATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGTTCTCGAACTCCCAACCTC 29650910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 ATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGTTCTCGAACTCCCAACCTC 1316

 29650911 AGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCACGC 29650970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 AGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCACGC 1376

 29650971 CCAACTTAACAATTCTTACTTCAAACATGTAAGCATGACGTTCCTCTCCTTCATGCCTTC 29651030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 CCAACTTAACAATTCTTACTTCAAACATGTAAGCATGACGTTCCTCTCCTTCATGCCTTC 1436

 29651031 CTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTTCTTCACCTAGGCT 29651090
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 CTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-GAGACAGAGTCTCGCTTCTTCACCTAGGCT 1495

 29651091 AGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTC 29651150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 AGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTC 1555

 29651151 TCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGACTAAT 29651210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGACTAAT 1615

 29651211 TTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCC 29651270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 TTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCC 1675

 29651271 TGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTAAGCC 29651330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 TGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTAAGCC 1735

 29651331 ACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCTAGTAT 29651390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 ACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCTAGTAT 1795

 29651391 CTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGAAATTA 29651450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 CTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGAAATTA 1855

 29651451 ACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGGGAGTT 29651510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 ACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGGGAGTT 1915

 29651511 GAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGCAACAA 29651570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 GAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGCAACAA 1975

 29651571 CTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATCCATTT 29651630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 CTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATCCATTT 2035

 29651631 GTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATCAGGAA 29651690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 GTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATCAGGAA 2095

 29651691 GATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGTGCATA 29651750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 GATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGTGCATA 2155

 29651751 TTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATTGATGA 29651810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 TTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATTGATGA 2215

 29651811 AAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCTCTGAA 29651870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 AAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCTCTGAA 2275

 29651871 AAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTTGGTAA 29651930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 AAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTTGGTAA 2335

 29651931 TGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAGCCTGA 29651990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 TGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAGCCTGA 2395

 29651991 AGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAAGGCCA 29652050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 AGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAAGGCCA 2455

 29652051 AAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGGGCTGA 29652110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 AAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGGGCTGA 2515

 29652111 GAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAATGGAA 29652170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 GAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAATGGAA 2575

 29652171 CAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACCTCAGC 29652230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 CAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACCTCAGC 2635

 29652231 CACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTCATTTG 29652290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 CACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTCATTTG 2695

 29652291 CAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTCAAGAT 29652350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 CAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTCAAGAT 2755

 29652351 TGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATTTAAAA 29652410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 TGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATTTAAAA 2815

 29652411 TGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAATGTAT 29652470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 TGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAATGTAT 2875

 29652471 TTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTGCTCAG 29652530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 TTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTGCTCAG 2935

 29652531 AACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGATAAAGT 29652590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 AACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGATAAAGT 2995

 29652591 GTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAGTTGTT 29652650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 GTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAGTTGTT 3055

 29652651 ACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCACCGTCA 29652710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 ACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCACCGTCA 3115

 29652711 CAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTATACTGA 29652770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 CAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTATACTGA 3175

 29652771 ATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCGTAAAT 29652830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 ATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCGTAAAT 3235

 29652831 CAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAAGACAA 29652890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 CAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAAGACAA 3295

 29652891 TTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTAAGGGG 29652950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 TTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTAAGGGG 3355

 29652951 CAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATTCAGTG 29653010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 CAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATTCAGTG 3415

 29653011 TACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAACTTCCA 29653070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3416 TACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAACTTCCA 3475

 29653071 GAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCCTATAA 29653130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 GAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCCTATAA 3535

 29653131 TCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACTATCTC 29653190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3536 TCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACTATCTC 3595

 29653191 TGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAACTGAC 29653250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3596 TGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAACTGAC 3655

 29653251 ACAGCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAGCCTCT 29653310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3656 ACAGCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAGCCTCT 3715

 29653311 CCCCAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCTATGCC 29653370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3716 CCCCAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCTATGCC 3775

 29653371 CCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCTCCAAC 29653430
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3776 CCTTTACCTCTAATGTCCCTATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCTCCAAC 3835

 29653431 TCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGAGAGTA 29653490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3836 TCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGAGAGTA 3895

 29653491 GGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGACAGTA 29653550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3896 GGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGACAGTA 3955

 29653551 TGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTCGCTCT 29653610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3956 TGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTCGCTCT 4015

 29653611 GTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCGTGGAT 29653670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4016 GTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCGTGGAT 4075

 29653671 TTGGGAAACACTTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGCGCCCCCTTGGGTACGTT 29653730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4076 TTGGGAAACACTTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGCGCCCCCTTGGGTACGTT 4135

 29653731 GTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGGAGGAG 29653790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4136 GTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGGAGGAG 4195

 29653791 GCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGCTGACCACACACAAGTGCCGATGTTCT 29653850
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4196 GCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGGTGACCACACACAAGTGCCGATGTTCT 4255

 29653851 GCTCTCTTGGATTCTGATTGAGCAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAACTGGAC 29653910
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 GCTCTCTTGGATTCTGATTGAGCAGCCTGTGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAACTGGAC 4315

 29653911 AGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCCCGAAAA 29653970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4316 AGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTCAGCCGCCCGAAAA 4375

 29653971 GTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAATATCC 29654030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4376 GTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAATATCC 4435

 29654031 TTTTAAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCACTTTG 29654090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 TTTTAAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCACTTTG 4495

 29654091 GGAGGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCAATATG 29654150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 GGAGGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCAATATG 4555

 29654151 GAGAAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTCCTGTA 29654210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 GAGAAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTCCTGTA 4615

 29654211 ATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGAGGTTG 29654270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 ATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGAGGTTG 4675

 29654271 CGGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCGTCT 29654330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4676 CGGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCGTCT 4735

 29654331 CAA 29654333
          |||
     4736 CAA 4738

EXCISED REGION

 29654339 AAATCAAATCAAATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAGAAAAGTTGCAAAG 29654398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 AAATCAAATCAAATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAGAAAAGTTGCAAAG 4798

 29654399 ATAGTACAT 29654407
          |||||||||
     4799 ATAGTACAT 4807

Alignment time is 3.42331 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    4786] =>      4786 nucs 'mol-32-208c-104659_4786'

Score:        4630
Aligned:      4785        nucs
Identic:      4766 (100%) nucs =>      3307 (100%)      1459 ( 99%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29651094,29654408] EXCISED REGION [29654416,29655883]
 second seq =>  [       2,    3311] EXCISED REGION [    3319,    4786]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [29654409,29654415]
 second seq =>         7 nucs [3312,3318]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [29654407,29654408] to [29654416,29654417]
 second seq =>         2 nucs [3310,3311] to [3319,3320]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29651094 GTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCG 29651153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        2 GTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCG 61

 29651154 TGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGACTAATTTT 29651213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       62 TGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGACTAATTTT 121

 29651214 TGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGA 29651273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      122 TGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGA 181

 29651274 CCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTAAGCCACC 29651333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      182 CCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTAAGCCACC 241

 29651334 GTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCTAGTATCTG 29651393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      242 GTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCTAGTATCTG 301

 29651394 CAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGAAATTAACA 29651453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      302 CAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGAAATTAACA 361

 29651454 ATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGGGAGTTGAG 29651513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      362 ATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGGGAGTTGAG 421

 29651514 ACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGCAACAACTG 29651573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      422 ACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGCAACAACTG 481

 29651574 TGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATCCATTTGTA 29651633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      482 TGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATCCATTTGTA 541

 29651634 GGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATCAGGAAGAT 29651693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      542 GGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATCAGGAAGAT 601

 29651694 TTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGTGCATATTC 29651753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      602 TTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGTGCATATTC 661

 29651754 AGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATTGATGAAAA 29651813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      662 AGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATTGATGAAAA 721

 29651814 ACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCTCTGAAAAA 29651873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      722 ACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCTCTGAAAAA 781

 29651874 TTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTTGGTAATGG 29651933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      782 TTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTTGGTAATGG 841

 29651934 ATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAGCCTGAAGG 29651993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      842 ATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAGCCTGAAGG 901

 29651994 TGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAAGGCCAAAA 29652053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 TGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAAGGCCAAAA 961

 29652054 CTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGGGCTGAGAA 29652113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 CTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGGGCTGAGAA 1021

 29652114 CACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAATGGAACAG 29652173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 CACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAATGGAACAG 1081

 29652174 AACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACCTCAGCCAC 29652233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1082 AACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACCTCAGCCAC 1141

 29652234 TTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTCATTTGCAG 29652293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 TTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTCATTTGCAG 1201

 29652294 TAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTCAAGATTGC 29652353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 TAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTCAAGATTGC 1261

 29652354 TTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATTTAAAATGG 29652413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 TTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATTTAAAATGG 1321

 29652414 GGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAATGTATTTA 29652473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 GGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAATGTATTTA 1381

 29652474 ATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTGCTCAGAAC 29652533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 ATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTGCTCAGAAC 1441

 29652534 ACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGATAAAGTGTT 29652593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 ACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGATAAAGTGTT 1501

 29652594 GACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAGTTGTTACC 29652653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 GACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAGTTGTTACC 1561

 29652654 ATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCACCGTCACAG 29652713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 ATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCACCGTCACAG 1621

 29652714 AGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTATACTGAATG 29652773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 AGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTATACTGAATG 1681

 29652774 TGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCGTAAATCAG 29652833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 TGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCGTAAATCAG 1741

 29652834 GGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAAGACAATTG 29652893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 GGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAAGACAATTG 1801

 29652894 ACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTAAGGGGCAG 29652953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 ACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTAAGGGGCAG 1861

 29652954 AAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATTCAGTGTAC 29653013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 AAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATTCAGTGTAC 1921

 29653014 CATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAACTTCCAGAA 29653073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 CATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAACTTCCAGAA 1981

 29653074 GCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCCTATAATCA 29653133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 GCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCCTATAATCA 2041

 29653134 CTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACTATCTCTGT 29653193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 CTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACTATCTCTGT 2101

 29653194 AAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAACTGACACA 29653253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 AAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAACTGACACA 2161

 29653254 GCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAGCCTCTCCC 29653313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 GCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAGCCTCTCCC 2221

 29653314 CAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCTATGCCCCT 29653373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 CAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCTATGCCCCT 2281

 29653374 TTATCTCTAATGTCCCTATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCTCCAACTCC 29653433
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 TTACCTCTAATGTCCCTATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCTCCAACTCC 2341

 29653434 CTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGAGAGTAGGG 29653493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 CTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGAGAGTAGGG 2401

 29653494 GTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGACAGTATGT 29653553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 GTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGACAGTATGT 2461

 29653554 TTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTCGCTCTGTC 29653613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 TTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTCGCTCTGTC 2521

 29653614 CCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCGTGGATTTG 29653673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 CCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCGTGGATTTG 2581

 29653674 GGAAACACTTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGCGCCCCCTTGGGTACGTTGTC 29653733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 GGAAACACTTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGCGCCCCCTTGGGTACGTTGTC 2641

 29653734 CTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGGAGGAGGCC 29653793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 CTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGGAGGAGGCC 2701

 29653794 AAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGCTGACCACACACAAGTGCCGATGTTCTGCT 29653853
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2702 AAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGGTGACCACACACAAGTGCCGATGTTCTGCT 2761

 29653854 CTCTTGGATTCTGATTGAGCAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAACTGGACAGA 29653913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2762 CTCTTGGATTCTGATTGAGCAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAACTGGACAGA 2821

 29653914 TATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCCCGAAAAGTA 29653973
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2822 TATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTCAGCCGCCCGAAAAGTA 2881

 29653974 GATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAATATCCTTT 29654033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2882 GATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAATATCCTTT 2941

 29654034 TAAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 29654093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 TAAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCACTTTGGGA 3001

 29654094 GGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCAATATGGAG 29654153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3002 GGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCAATATGGAG 3061

 29654154 AAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTCCTGTAATC 29654213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3062 AAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTCCTGTAATC 3121

 29654214 CCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGAGGTTGCGG 29654273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 CCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGAGGTTGCGG 3181

 29654274 TGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCGTCTCAA 29654333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3182 TGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCGTCTCAA 3241

 29654334 AAATCAAATCAAATCAAATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAGAAAAGTTG 29654393
          |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 AAATCAAATCAAATCAAATCAAATC-----TACAATATTTTTGGATTTACAGAAAAGTTG 3296

 29654394 CAAAGATAGTACATA 29654408
          |||||||||||||||
     3297 CAAAGATAGTACATA 3311

EXCISED REGION

 29654416 TATGTTCCACATTCAGTTTCCTCTATTATTAATGTCTTATTTTATTATACATTTGTGACA 29654475
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 TATGTTCCACATTCAGTTTCCCCTATTATTAATGTCTTATTTTATTATACATTTGTGACA 3378

 29654476 GGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTACTAACTCCTATTTTATTTGGATTTTATTCTT 29654535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 GGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTACTAACTCCTATTTTATTTGGATTTTATTCTT 3438

 29654536 TTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGATCCCATCCAGGATACATTACATTTAGTCCCC 29654595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 TTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGATCCCATCCAGGATACATTACATTTAGTCCCC 3498

 29654596 TTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGTGACAATTTCTCAGACCTCGTTTTTGATAAT 29654655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 TTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGTGACAATTTCTCAGACCTCGTTTTTGATAAT 3558

 29654656 TTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGCATATTGTAAAATGTCCCTTAATTTGAGTGT 29654715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3559 TTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGCATATTGTAAAATGTTCCTTAATTTGAGTGT 3618

 29654716 GGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGAAGAGCACAGAGATGAAATGCAATACTCTCA 29654775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 GGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGAAGAGCACAGAGATGAAATGCAATACTCTCA 3678

 29654776 ATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCAGTTGATGTATCAAATGATTATGTTAACCTC 29654835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3679 ATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCAGTTGATTTATCAAATGATTATGTTAACCTC 3738

 29654836 CATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGTCTATAATATATAATTTTTAATAGCATCCCA 29654895
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3739 CATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGTCTATAATATATAATTTTTAATAGCAGCCCA 3798

 29654896 AAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAAGAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGCCCAAGG 29654955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 AAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAAGAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGCCCAAGG 3858

 29654956 AGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAAAAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCTCAGGTC 29655015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3859 AGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAAAAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCTCAGGTC 3918

 29655016 TATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGGTGTCTCAGACACAAATTGAGCAATCAGAAA 29655075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3919 TATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGGTGTCTCAGACACAAATTGAGCAATCAGAAA 3978

 29655076 AGGCTGGGATGTCTGTGGTCTGAGTTGGGCAGAGGTGGCTGACCCTGGAACCTGACATCA 29655135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3979 AGGCTGGGATGTCTGTGGTCTGAGTTGGGCAGAGGTGGCTGACCCTGGAACCTGACATCA 4038

 29655136 ATAGGGGGATGAAGACAATTTCTGAGCAGCCCCAGTAGTCAGAGGACAAGAGAACTCTGG 29655195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4039 ATAGGGGGATGAAGACAATTTCTGAGCAGCCCCAGTAGTCAGAGGACAAGAGAACTCTGG 4098

 29655196 AGCCCCGCACTGTCTCTGAGGTTCCAATCTTTTCTCCCTCTTCCCAGCCCCTTGATAGGA 29655255
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     4099 AGCCCCGCACTGTCTCTGAGGTTCCAATCTTTTCTCCCTCTTCGCAGCCCCTTGATAGGA 4158

 29655256 AACCCTGGGAAAACTAAAAAGTATACTGTTTTTTCTTTAACTCCCTATTCCTTTCCTCTT 29655315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4159 AACCCTGGGAAAACTAAAAAGTATACTGTTTTTTCTTTAACTCCCTATTCCTTTCCTCTT 4218

 29655316 CTGAGGGTTGTTGTTGTTGTTTT-TTTTTAATAAACTTATTAATTTTAGAATACTTTTAG 29655374
          |||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4219 CTGAGGGTTGTTGTTGTTGTT--GTTTTTAATAAACTTATTAATTTTAGAATACTTTTAG 4276

 29655375 ATTACACAAAAGTTGAAAAGATAATACATAGTTCTCACATATGTCACACTCAGCTCCCCA 29655434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 ATTACACAAAAGTTGAAAAGATAATACATAGTTCTCACATATGTCACACTCAGCTCCCCA 4336

 29655435 TTGTTAACATA-TTTTTTTTTTTTTTGAGGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTG 29655493
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4337 TTGTTAACATATTTTTTTTTTTTTTTGAGGGAGTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTG 4396

 29655494 CAGTGGCACGATTTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCGGGTTTCAAGCCATTCTCCTGC 29655553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 CAGTGGCACGATTTCGGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCGGGTTTCAAGCCATTCTCCTGC 4456

 29655554 CTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGATTACAGGTGCGCGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTGT 29655613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4457 CTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGATTACAGGTGCGTGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTGT 4516

 29655614 AGTTTTAGTAAAGACAGGGTTCCACCACATTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTC 29655673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4517 AGTTTTAGTAAAGACAGGGTTCCACCACATTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTC 4576

 29655674 AGGTGATCTACCCGCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGCATTACAGGTGTGTGCCACTGCCCC 29655733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4577 AGGTGATCTACCCGCTCAGCTTCCCAAAGTGCTGGCATTACAGGTGTGTGCCACTGTCCC 4636

 29655734 CAGCCCCATTGTTAACATCTTATATCACTATTATACATTTTTCACAACCAGTGAGACAAT 29655793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4637 CAGCCCCATTGTTAACATCTTATATCACTATTATACATTTTTCACAACCAGTGAGACAAT 4696

 29655794 ATTAATATAGTATCACTAAACTTTATTTCGATTTCATTAGCTCTTTCTGTTTTGAAACAA 29655853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4697 ATTAATATAGTATCACTAAACTTTATTTCGATTTCATTAGCTCTTTCTGTTTTGAAACAA 4756

 29655854 AGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCCGGAGTGC 29655883
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     4757 AGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCCGGAGTGC 4786

Alignment time is 3.43607 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2501] =>      2501 nucs 'mol-32-23a4-074655_2501'

Score:        2336
Aligned:      2501        nucs
Identic:      2486 ( 99%) nucs =>        28 (100%)      2458 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29650392,29650419] EXCISED REGION [29651086,29653558]
 second seq =>  [       1,      28] EXCISED REGION [      29,    2501]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       666 nucs [29650420,29651085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29650420,29650423] to [29651086,29651089]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29650392 CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 29650419
          ||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 28

EXCISED REGION

 29651086 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 29651145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       29 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 88

 29651146 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGA 29651205
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
       89 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAGCCACATGCCAGCACGTCCGA 148

 29651206 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 29651265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      149 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 208

 29651266 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGT 29651325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|
      209 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAAGCAT 268

 29651326 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 29651385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      269 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 328

 29651386 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 29651445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      329 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 388

 29651446 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 29651505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      389 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 448

 29651506 GAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 29651565
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      449 GAGTTGAGACGTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 508

 29651566 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 29651625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      509 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 568

 29651626 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATC 29651685
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      569 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATT 628

 29651686 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 29651745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      629 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 688

 29651746 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 29651805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      689 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 748

 29651806 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 29651865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      749 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 808

 29651866 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 29651925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      809 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 868

 29651926 GGTAATGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 29651985
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      869 GGTAATGGACGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 928

 29651986 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 29652045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      929 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 988

 29652046 GGCCAAAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 29652105
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      989 GGCCAAAATTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 1048

 29652106 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 29652165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1049 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 1108

 29652166 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 29652225
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1109 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCGATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 1168

 29652226 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 29652285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1169 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 1228

 29652286 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 29652345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 1288

 29652346 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 29652405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 1348

 29652406 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 29652465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 1408

 29652466 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 29652525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 1468

 29652526 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGAT 29652585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1469 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCATTGTATGAT 1528

 29652586 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 29652645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 1588

 29652646 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 29652705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 1648

 29652706 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 29652765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 1708

 29652766 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 29652825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 1768

 29652826 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 29652885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 1828

 29652886 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 29652945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 1888

 29652946 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 29653005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 1948

 29653006 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 29653065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 2008

 29653066 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 29653125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 2068

 29653126 TATAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 29653185
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 TACAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 2128

 29653186 ATCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 29653245
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 GTCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 2188

 29653246 CTGACACAGCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 29653305
          |||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 CTGACACAGCTGTAATTATCATCCATGTGAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 2248

 29653306 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 29653365
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTGATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 2308

 29653366 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 29653425
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2309 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGTTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 2368

 29653426 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 29653485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 2428

 29653486 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 29653545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 2488

 29653546 CAGTATGTTTGTG 29653558
          |||||||||||||
     2489 CAGTATGTTTGTG 2501

Alignment time is 1.82493 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5422] =>      5422 nucs 'mol-32-2af2-079398_5422'

Score:        5267
Aligned:      5426        nucs
Identic:      5405 (100%) nucs =>      4744 (100%)       661 ( 99%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29649649,29654408] EXCISED REGION [29654416,29655080]
 second seq =>  [       1,    4750] EXCISED REGION [    4758,    5422]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [29654409,29654415]
 second seq =>         7 nucs [4751,4757]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [29654407,29654408] to [29654416,29654417]
 second seq =>         2 nucs [4749,4750] to [4758,4759]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29649649 ACCTTGTCCCTATTAAAAATACAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCC 29649708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCTTGTCCCTATTAAAAATACAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCC 60

 29649709 CAGCTACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTG 29649768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGCTACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTG 120

 29649769 AATTACTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTGGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCT 29649828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTACTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTGGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCT 180

 29649829 AACACTTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTG 29649888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACACTTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTG 240

 29649889 GGCAACATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTTGTGG 29649948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      241 GGCAACATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTGGTGG 300

 29649949 TACATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGG 29650008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGG 360

 29650009 AGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTG 29650068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTG 420

 29650069 AGGCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGG 29650128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGG 480

 29650129 ACATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGAC 29650188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGAC 540

 29650189 AGAGTCTCGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACC 29650248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAGTCTCGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACC 600

 29650249 TCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTAATTTTTTTT 29650308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTAATTTTTTTT 660

 29650309 TTTTTTTTTTTTTTTTTAGTACACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAA 29650368
          ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTTTTTTTTTTT---AGTACACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAA 717

 29650369 CTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAG 29650428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 CTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAG 777

 29650429 CCACCGCGCCCGGCTAGAAAAGATTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTT-AATTATACT 29650487
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
      778 CCACCGCGCCCGGCTAGAAAAGATTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAATTATACT 837

 29650488 GTAAGTTTTAGGGTACATATGCACAACATGCCGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCA 29650547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 GTAAGTTTTAGGGTACATATGCACAACATGCCGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCA 897

 29650548 TGTTGGTGTGCTGCACCCATAACTCATCATTTAACATTAGATATATCTCCTAATGCTATC 29650607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 TGTTGGTGTGCTGCACCCATAACTCATCATTTAACATTAGATATATCTCCTAATGCTATC 957

 29650608 CCTCCCCACTCCCTAGAAAAGATTTCTTGTGGAGTTTTTAAAAAGTCCTTTGAAACAATT 29650667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 CCTCCCCACTCCCTAGAAAAGATTTCTTGTGGAGTTTTTAAAAAGTCCTTTGAAACAATT 1017

 29650668 CTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTCGATACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTAG 29650727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 CTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTCGATACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTAG 1077

 29650728 AGTGCAATGGCATGATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTC 29650787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 AGTGCAATGGCATGATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTC 1137

 29650788 CTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCTTGGCTAATTT 29650847
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1138 CTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCCTGGCTAATTT 1197

 29650848 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGTTCTCGAACTCCCAAC 29650907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGTTCTCGAACTCCCAAC 1257

 29650908 CTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCA 29650967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 CTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCA 1317

 29650968 CGCCCAACTTAACAATTCTTACTTCAAACATGTAAGCATGACGTTCCTCTCCTTCATGCC 29651027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 CGCCCAACTTAACAATTCTTACTTCAAACATGTAAGCATGACGTTCCTCTCCTTCATGCC 1377

 29651028 TTCCTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTTCTTCACCTAG 29651087
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
     1378 TTCCTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---GAGACAGAGTCTCGCTTCTTCACCTAG 1434

 29651088 GCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAA 29651147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 GCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAA 1494

 29651148 TTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGACT 29651207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 TTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGACT 1554

 29651208 AATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 29651267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 AATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGAAC 1614

 29651268 TCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTAA 29651327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 TCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTAA 1674

 29651328 GCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCTAG 29651387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 GCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCTAG 1734

 29651388 TATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGAAA 29651447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 TATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGAAA 1794

 29651448 TTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGGGA 29651507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 TTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGGGA 1854

 29651508 GTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGCAA 29651567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 GTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGCAA 1914

 29651568 CAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATCCA 29651627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 CAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATCCA 1974

 29651628 TTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATCAG 29651687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 TTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATCAG 2034

 29651688 GAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGTGC 29651747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 GAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGTGC 2094

 29651748 ATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATTGA 29651807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 ATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATTGA 2154

 29651808 TGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCTCT 29651867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCTCT 2214

 29651868 GAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTTGG 29651927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 GAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTTGG 2274

 29651928 TAATGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAGCC 29651987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 TAATGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAGCC 2334

 29651988 TGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAAGG 29652047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 TGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAAGG 2394

 29652048 CCAAAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGGGC 29652107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 CCAAAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGGGC 2454

 29652108 TGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAATG 29652167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 TGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAATG 2514

 29652168 GAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACCTC 29652227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 GAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACCTC 2574

 29652228 AGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTCAT 29652287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 AGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTCAT 2634

 29652288 TTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTCAA 29652347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 TTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTCAA 2694

 29652348 GATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATTTA 29652407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 GATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATTTA 2754

 29652408 AAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAATG 29652467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 AAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAATG 2814

 29652468 TATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTGCT 29652527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 TATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTGCT 2874

 29652528 CAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGATAA 29652587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 CAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGATAA 2934

 29652588 AGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAGTT 29652647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 AGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAGTT 2994

 29652648 GTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCACCG 29652707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 GTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCACCG 3054

 29652708 TCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTATAC 29652767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 TCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTATAC 3114

 29652768 TGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCGTA 29652827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 TGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCGTA 3174

 29652828 AATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAAGA 29652887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 AATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAAGA 3234

 29652888 CAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTAAG 29652947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 CAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTAAG 3294

 29652948 GGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATTCA 29653007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 GGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATTCA 3354

 29653008 GTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAACTT 29653067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 GTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAACTT 3414

 29653068 CCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCCTA 29653127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 CCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCCTA 3474

 29653128 TAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACTAT 29653187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 TAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACTAT 3534

 29653188 CTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAACT 29653247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 CTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAACT 3594

 29653248 GACACAGCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAGCC 29653307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 GACACAGCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAGCC 3654

 29653308 TCTCCCCAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCTAT 29653367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 TCTCCCCAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCTAT 3714

 29653368 GCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCTCC 29653427
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 GCCCCTTTACCTCTAATGTCCCTATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCTCC 3774

 29653428 AACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGAGA 29653487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 AACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGAGA 3834

 29653488 GTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGACA 29653547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 GTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGACA 3894

 29653548 GTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTCGC 29653607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 GTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTCGC 3954

 29653608 TCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCGTG 29653667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 TCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCGTG 4014

 29653668 GATTTGGGAAACACTTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGCGCCCCCTTGGGTAC 29653727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 GATTTGGGAAACACTTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGCGCCCCCTTGGGTAC 4074

 29653728 GTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGGAG 29653787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 GTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGGAG 4134

 29653788 GAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGCTGACCACACACAAGTGCCGATGT 29653847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4135 GAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGGTGACCACACACAAGTGCCGATGT 4194

 29653848 TCTGCTCTCTTGGATTCTGATTGAGCAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAACTG 29653907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 TCTGCTCTCTTGGATTCTGATTGAGCAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAACTG 4254

 29653908 GACAGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCCCGA 29653967
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4255 GACAGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTCAGCCGCCCGA 4314

 29653968 AAAGTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAATA 29654027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 AAAGTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAATA 4374

 29654028 TCCTTTTAAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCACT 29654087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 TCCTTTTAAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCACT 4434

 29654088 TTGGGAGGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCAAT 29654147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 TTGGGAGGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCAAT 4494

 29654148 ATGGAGAAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTCCT 29654207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 ATGGAGAAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTCCT 4554

 29654208 GTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGAGG 29654267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 GTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGAGG 4614

 29654268 TTGCGGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCG 29654327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4615 TTGCGGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCG 4674

 29654328 TCTCAAAAATCAAATCAAATCAAATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAGAA 29654387
          |||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||
     4675 TCTCAAAAATCAAATCAAATCAAATCAAATC-----TACAATATTTTTGGATTTACAGAA 4729

 29654388 AAGTTGCAAAGATAGTACATA 29654408
          |||||||||||||||||||||
     4730 AAGTTGCAAAGATAGTACATA 4750

EXCISED REGION

 29654416 TATGTTCCACATTCAGTTTCCTCTATTATTAATGTCTTATTTTATTATACATTTGTGACA 29654475
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4758 TATGTTCCACATTCAGTTTCCCCTATTATTAATGTCTTATTTTATTATACATTTGTGACA 4817

 29654476 GGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTACTAACTCCTATTTTATTTGGATTTTATTCTT 29654535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4818 GGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTACTAACTCCTATTTTATTTGGATTTTATTCTT 4877

 29654536 TTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGATCCCATCCAGGATACATTACATTTAGTCCCC 29654595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4878 TTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGATCCCATCCAGGATACATTACATTTAGTCCCC 4937

 29654596 TTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGTGACAATTTCTCAGACCTCGTTTTTGATAAT 29654655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4938 TTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGTGACAATTTCTCAGACCTCGTTTTTGATAAT 4997

 29654656 TTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGCATATTGTAAAATGTCCCTTAATTTGAGTGT 29654715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4998 TTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGCATATTGTAAAATGTTCCTTAATTTGAGTGT 5057

 29654716 GGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGAAGAGCACAGAGATGAAATGCAATACTCTCA 29654775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5058 GGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGAAGAGCACAGAGATGAAATGCAATACTCTCA 5117

 29654776 ATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCAGTTGATGTATCAAATGATTATGTTAACCTC 29654835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     5118 ATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCAGTTGATTTATCAAATGATTATGTTAACCTC 5177

 29654836 CATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGTCTATAATATATAATTTTTAATAGCATCCCA 29654895
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5178 CATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGTCTATAATATATAATTTTTAATAGCAGCCCA 5237

 29654896 AAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAAGAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGCCCAAGG 29654955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 AAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAAGAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGCCCAAGG 5297

 29654956 AGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAAAAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCTCAGGTC 29655015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5298 AGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAAAAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCTCAGGTC 5357

 29655016 TATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGGTGTCTCAGACACAAATTGAGCAATCAGAAA 29655075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5358 TATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGGTGTCTCAGACACAAATTGAGCAATCAGAAA 5417

 29655076 AGGCT 29655080
          |||||
     5418 AGGCT 5422

Alignment time is 3.90382 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2480] =>      2480 nucs 'mol-32-2dff-088524_2480'

Score:        2313
Aligned:      2484        nucs
Identic:      2466 ( 99%) nucs =>       712 ( 99%)      1754 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29649699,29650419] EXCISED REGION [29651086,29652848]
 second seq =>  [       1,     717] EXCISED REGION [     718,    2480]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       666 nucs [29650420,29651085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29650420,29650423] to [29651086,29651089]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29649699 CCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGC 29649758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGC 60

 29649759 ATCTTATCTGAATTACTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTGGGCCCCCGTGGCTCACTC 29649818
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
       61 ATCTTATCTGAATTACTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTAGGCCCCCGTGGCTCACTC 120

 29649819 CTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAA 29649878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAA 180

 29649879 GACCAACCTGGGCAACATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCA 29649938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACCAACCTGGGCAACATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCA 240

 29649939 GGTGTTGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCT 29649998
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTGTGGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCT 300

 29649999 TGAGCTCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGG 29650058
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAGCCCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGG 360

 29650059 CAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACC 29650118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACC 420

 29650119 TTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATT 29650178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATT 480

 29650179 TTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCT 29650238
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCT 540

 29650239 CACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTT 29650298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTT 600

 29650299 AATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTACACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGC 29650358
          |||||||||||||||||||||||    ||||.||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT----AGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGC 656

 29650359 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 29650418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 TGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 716

 29650419 C 29650419
          |
      717 C 717

EXCISED REGION

 29651086 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 29651145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 777

 29651146 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGA 29651205
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      778 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAGCCACATGCCAGCACGTCCGA 837

 29651206 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 29651265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 897

 29651266 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGT 29651325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|
      898 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAAGCAT 957

 29651326 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 29651385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 1017

 29651386 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 29651445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 1077

 29651446 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 29651505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 1137

 29651506 GAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 29651565
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 GAGTTGAGACGTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 1197

 29651566 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 29651625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 1257

 29651626 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATC 29651685
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1258 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATT 1317

 29651686 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 29651745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 1377

 29651746 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 29651805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 1437

 29651806 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 29651865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 1497

 29651866 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 29651925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 1557

 29651926 GGTAATGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 29651985
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 GGTAATGGACGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 1617

 29651986 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 29652045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 1677

 29652046 GGCCAAAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 29652105
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 GGCCAAAATTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 1737

 29652106 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 29652165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 1797

 29652166 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 29652225
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1798 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCGATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 1857

 29652226 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 29652285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 1917

 29652286 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 29652345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 1977

 29652346 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 29652405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 2037

 29652406 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 29652465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 2097

 29652466 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 29652525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 2157

 29652526 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGAT 29652585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2158 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCATTGTATGAT 2217

 29652586 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 29652645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 2277

 29652646 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 29652705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 2337

 29652706 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 29652765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 2397

 29652766 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 29652825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 2457

 29652826 TAAATCAGGGACCATCTGCACCA 29652848
          |||||||||||||||||||||||
     2458 TAAATCAGGGACCATCTGCACCA 2480

Alignment time is 1.79781 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3022] =>      3022 nucs 'mol-32-2e0a-112278_3022'

Score:        2784
Aligned:      3004        nucs
Identic:      2984 ( 99%) nucs =>      2569 ( 99%)       415 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29651086,29653669] EXCISED REGION [29653682,29654101]
 second seq =>  [      19,    2602] EXCISED REGION [    2603,    3022]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        12 nucs [29653670,29653681]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [29653670,29653671] to [29653682,29653683]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29651086 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 29651145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       19 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 78

 29651146 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGA 29651205
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
       79 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAGCCACATGCCAGCACGTCCGA 138

 29651206 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 29651265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      139 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 198

 29651266 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGT 29651325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|
      199 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAAGCAT 258

 29651326 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 29651385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      259 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 318

 29651386 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 29651445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      319 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 378

 29651446 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 29651505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      379 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 438

 29651506 GAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 29651565
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      439 GAGTTGAGACGTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 498

 29651566 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 29651625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      499 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 558

 29651626 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATC 29651685
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      559 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATT 618

 29651686 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 29651745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      619 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 678

 29651746 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 29651805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      679 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 738

 29651806 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 29651865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 798

 29651866 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 29651925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 858

 29651926 GGTAATGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 29651985
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 GGTAATGGACGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 918

 29651986 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 29652045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 978

 29652046 GGCCAAAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 29652105
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 GGCCAAAATTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 1038

 29652106 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 29652165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 1098

 29652166 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 29652225
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1099 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCGATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 1158

 29652226 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 29652285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 1218

 29652286 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 29652345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 1278

 29652346 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 29652405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 1338

 29652406 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 29652465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 1398

 29652466 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 29652525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 1458

 29652526 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGAT 29652585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1459 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCATTGTATGAT 1518

 29652586 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 29652645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 1578

 29652646 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 29652705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 1638

 29652706 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 29652765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 1698

 29652766 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 29652825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 1758

 29652826 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 29652885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 1818

 29652886 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 29652945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 1878

 29652946 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 29653005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 1938

 29653006 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 29653065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 1998

 29653066 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 29653125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 2058

 29653126 TATAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 29653185
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 TACAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 2118

 29653186 ATCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 29653245
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 GTCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 2178

 29653246 CTGACACAGCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 29653305
          |||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 CTGACACAGCTGTAATTATCATCCATGTGAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 2238

 29653306 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 29653365
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTGATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 2298

 29653366 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 29653425
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2299 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGTTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 2358

 29653426 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 29653485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 2418

 29653486 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 29653545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 2478

 29653546 CAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTC 29653605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 CAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTC 2538

 29653606 GCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCG 29653665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 GCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCG 2598

 29653666 TGGA 29653669
          ||||
     2599 TGGA 2602

EXCISED REGION

 29653682 TTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGCGCCCCCTTGGGTACGTTGTCCTGTCCAG 29653741
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2603 TTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGTGCCCCCTTGGGTACGTTGTCCTGTCCAG 2662

 29653742 TTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGGAGGAGGCCAAAAGAGT 29653801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 TTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGGAGGAGGCCAAAAGAGT 2722

 29653802 CCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGCTGACCACACACAAGTGCCGATGTTCTGCTCTCTTGGA 29653861
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 CCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGGTGACCACACACAAGTGCCGATGTTCTGCTCTCTTGGA 2782

 29653862 TTCTGATTGAGCAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAACTGGACAGATATGGCTG 29653921
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 TTCTGATTGAGTAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAACTGGACAGATATGGCTG 2842

 29653922 GTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCCCGAAAAGTAGATAATTT 29653981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2843 GTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCTCGAAAAGTAGATAATTT 2902

 29653982 TTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAATATCCTTTTAAAATCT 29654041
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2903 TTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAATATCCTTTTGAAATCT 2962

 29654042 AAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 29654101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 AAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGG 3022

Alignment time is 2.20349 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    6309] =>      6309 nucs 'mol-32-2f3e-106355_6309'

Score:        5899
Aligned:      6331        nucs
Identic:      6277 ( 99%) nucs =>       883 ( 99%)      5394 ( 99%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29649527,29650419] EXCISED REGION [29651086,29656523]
 second seq =>  [       1,     889] EXCISED REGION [     890,    6309]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       666 nucs [29650420,29651085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29650420,29650423] to [29651086,29651089]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29649527 TTATGATTAAAACACGCGGCTGAGAGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 29649586
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATGATTAAAACACGCGGCCGAGAGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 60

 29649587 AGGCTGAGGGGGCGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGACCTCAGCGTGGCCAATATGGCG 29649646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGCTGAGGGGGCGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGACCTCAGCGTGGCCAATATGGCG 120

 29649647 AAACCTTGTCCCTATTAAAAATACAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAAT 29649706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAACCTTGTCCCTATTAAAAATACAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAAT 180

 29649707 CCCAGCTACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATC 29649766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCAGCTACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATC 240

 29649767 TGAATTACTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTGGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATG 29649826
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAATTACTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTAGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATG 300

 29649827 CTAACACTTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACC 29649886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTAACACTTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACC 360

 29649887 TGGGCAACATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTTGT 29649946
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      361 TGGGCAACATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTGGT 420

 29649947 GGTACATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCA 29650006
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      421 GGTACATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCA 480

 29650007 GGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAG 29650066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAG 540

 29650067 TGAGGCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACA 29650126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAGGCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACA 600

 29650127 GGACATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAG 29650186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGACATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAG 660

 29650187 ACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAA 29650246
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAA 720

 29650247 CCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTAATTTTTT 29650306
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||
      721 CCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTA----TTT 776

 29650307 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTACACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCA 29650366
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCA 836

 29650367 AACTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 29650419
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 AACTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 889

EXCISED REGION

 29651086 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 29651145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 949

 29651146 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGA 29651205
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      950 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAGCCACATGCCAGCACGTCCGA 1009

 29651206 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 29651265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 1069

 29651266 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGT 29651325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|
     1070 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAAGCAT 1129

 29651326 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 29651385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 1189

 29651386 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 29651445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 1249

 29651446 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 29651505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 1309

 29651506 GAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 29651565
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 GAGTTGAGACGTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 1369

 29651566 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 29651625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 1429

 29651626 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATC 29651685
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1430 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATT 1489

 29651686 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 29651745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 1549

 29651746 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 29651805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 1609

 29651806 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 29651865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 1669

 29651866 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 29651925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 1729

 29651926 GGTAATGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 29651985
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 GGTAATGGACGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 1789

 29651986 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 29652045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 1849

 29652046 GGCCAAAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 29652105
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 GGCCAAAATTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 1909

 29652106 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 29652165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 1969

 29652166 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 29652225
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1970 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCGATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 2029

 29652226 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 29652285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 2089

 29652286 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 29652345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 2149

 29652346 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 29652405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 2209

 29652406 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 29652465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 2269

 29652466 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 29652525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 2329

 29652526 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGAT 29652585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2330 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCATTGTATGAT 2389

 29652586 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 29652645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 2449

 29652646 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 29652705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 2509

 29652706 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 29652765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 2569

 29652766 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 29652825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 2629

 29652826 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 29652885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 2689

 29652886 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 29652945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 2749

 29652946 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 29653005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 2809

 29653006 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 29653065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 2869

 29653066 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 29653125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 2929

 29653126 TATAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 29653185
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 TACAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 2989

 29653186 ATCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 29653245
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 GTCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 3049

 29653246 CTGACACAGCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 29653305
          |||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 CTGACACAGCTGTAATTATCATCCATGTGAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 3109

 29653306 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 29653365
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTGATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 3169

 29653366 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 29653425
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3170 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGTTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 3229

 29653426 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 29653485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 3289

 29653486 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 29653545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 3349

 29653546 CAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTC 29653605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 CAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTC 3409

 29653606 GCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCG 29653665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 GCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCG 3469

 29653666 TGGATTTGGGAAACACTTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGCGCCCCCTTGGGT 29653725
          ||||            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3470 TGGA------------TTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGTGCCCCCTTGGGT 3517

 29653726 ACGTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGG 29653785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 ACGTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGG 3577

 29653786 AGGAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGCTGACCACACACAAGTGCCGAT 29653845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3578 AGGAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGGTGACCACACACAAGTGCCGAT 3637

 29653846 GTTCTGCTCTCTTGGATTCTGATTGAGCAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAAC 29653905
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 GTTCTGCTCTCTTGGATTCTGATTGAGTAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAAC 3697

 29653906 TGGACAGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCCC 29653965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3698 TGGACAGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCTC 3757

 29653966 GAAAAGTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAA 29654025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 GAAAAGTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAA 3817

 29654026 TATCCTTTTAAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCA 29654085
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 TATCCTTTTGAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCA 3877

 29654086 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCA 29654145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCA 3937

 29654146 ATATGGAGAAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTC 29654205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 ATATGGAGAAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTC 3997

 29654206 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGA 29654265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGA 4057

 29654266 GGTTGCGGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTC 29654325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 GGTTGCGGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTC 4117

 29654326 CGTCTCAAAAATCAAATCAAATCAAATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAG 29654385
          ||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 CGTCTCAA-----AAATCAAATCAAATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAG 4172

 29654386 AAAAGTTGCAAAGATAGTACATAGTTCTCCTATGTTCCACATTCAGTTTCCTCTATTATT 29654445
          |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||||
     4173 AAAAGTTGCAAAGATAGTACATAATTCTCGTATGTTCCACATTCAGTTTCCCCTATTATT 4232

 29654446 AATGTCTTATTTTATTATACATTTGTGACAGGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTAC 29654505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4233 AATGTCTTATTTTATTATACATTTGTGACAGGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTAC 4292

 29654506 TAACTCCTATTTTATTTGGATTTTATTCTTTTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGAT 29654565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4293 TAACTCCTATTTTATTTGGATTTTATTCTTTTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGAT 4352

 29654566 CCCATCCAGGATACATTACATTTAGTCCCCTTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGT 29654625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4353 CCCATCCAGGATACATTACATTTAGTCCCCTTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGT 4412

 29654626 GACAATTTCTCAGACCTCGTTTTTGATAATTTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGC 29654685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4413 GACAATTTCTCAGACCTCGTTTTTGATAATTTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGC 4472

 29654686 ATATTGTAAAATGTCCCTTAATTTGAGTGTGGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGA 29654745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 ATATTGTAAAATGTCCCTTAATTTGAGTGTGGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGA 4532

 29654746 AGAGCACAGAGATGAAATGCAATACTCTCAATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCA 29654805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4533 AGAGCACAGAGATGAAATGCAATACTCTCAATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCA 4592

 29654806 GTTGATGTATCAAATGATTATGTTAACCTCCATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGT 29654865
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4593 GTTGATTTATCAAATGATTATGTTAACCTCCATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGT 4652

 29654866 CTATAATATATAATTTTTAATAGCATCCCAAAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAA 29654925
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4653 CTATAATATATAATTTTTAATAGCAGCCCAAAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAA 4712

 29654926 GAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGCCCAAGGAGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAA 29654985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4713 GAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGCCCAAGGAGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAA 4772

 29654986 AAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCTCAGGTCTATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGG 29655045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4773 AAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCTCAGGTCTATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGG 4832

 29655046 TGTCTCAGACACAAATTGAGCAATCAGAAAAGGCTGGGATGTCTGTGGTCTGAGTTGGGC 29655105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4833 TGTCTCAGACACAAATTGAGCAATCAGAAAAGGCTGGGATGTCTGTGGTCTGAGTTGGGC 4892

 29655106 AGAGGTGGCTGACCCTGGAACCTGACATCAATAGGGGGATGAAGACAATTTCTGAGCAGC 29655165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4893 AGAGGTGGCTGACCCTGGAACCTGACATCAATAGGGGGATGAAGACAATTTCTGAGCAGC 4952

 29655166 CCCAGTAGTCAGAGGACAAGAGAACTCTGGAGCCCCGCACTGTCTCTGAGGTTCCAATCT 29655225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4953 CCCAGTAGTCAGAGGACAAGAGAACTCTGGAGCCCCGCACTGTCTCTGAGGTTCCAATCT 5012

 29655226 TTTCTCCCTCTTCCCAGCCCCTTGATAGGAAACCCTGGGAAAACTAAAAAGTATACTGTT 29655285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5013 TTTCTCCCTCTTCCCAGCCCCTTGATAGGAAACCCTGGGAAAACTAAAAAGTATACTGTT 5072

 29655286 TTTTCTTTAACTCCCTATTCCTTTCCTCTTCTGAGGGTTGTTGTTGTTGTTTTTTTTTAA 29655345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     5073 TTTTCTTTAACTCCCTATTCCTTTCCTCTTCTGAGGGTTGTTGTTGTTG-TTTTTTTTAA 5131

 29655346 TAAACTTATTAATTTTAGAATACTTTTAGATTACACAAAAGTTGAAAAGATAATACATAG 29655405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 TAAACTTATTAATTTTAGAATACTTTTAGATTACACAAAAGTTGAAAAGATAATACATAG 5191

 29655406 TTCTCACATATGTCACACTCAGCTCCCCATTGTTAACATATTTTTTTTTTTTTTGAGGGA 29655465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5192 TTCTCACATATGTCACACTCAGCTCCCCATTGTTAACATATTTTTTTTTTTTTTGAGGGA 5251

 29655466 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATTTCGGCTCACTGCAACCTCT 29655525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5252 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATTTCGGCTCACTGCAACCTCT 5311

 29655526 GCCTCCGGGTTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGATTACAGGTG 29655585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5312 GCCTCCGGGTTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGATTACAGGTG 5371

 29655586 CGCGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTGTAGTTTTAGTAAAGACAGGGTTCCACCACATTG 29655645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5372 CGCGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTGTAGTTTTAGTAAAGACAGGGTTCCACCACATTG 5431

 29655646 GCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTACCCGCTCAGCTTCCCAAAGTGC 29655705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5432 GCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTACCCGCTCAGCTTCCCAAAGTGC 5491

 29655706 TGGCATTACAGGTGTGTGCCACTGCCCCCAGCCCCATTGTTAACATCTTATATCACTATT 29655765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5492 TGGCATTACAGGTGTGTGCCACTGCCCCCAGCCCCATTGTTAACATCTTATATCACTATT 5551

 29655766 ATACATTTTTCACAACCAGTGAGACAATATTAATATAGTATCACTAAACTTTATTTCGAT 29655825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5552 ATACATTTTTCACAACCAGTGAGACAATATTAATATAGTATCACTAAACTTTATTTCGAT 5611

 29655826 TTCATTAGCTCTTTCTGTTTTGAAACAAAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCCGGAGTGCAA 29655885
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5612 TTTATTAGCTCTTTCTGTTTTGAAACAAAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCCGGAGTGCAA 5671

 29655886 TGGCATGATGTCCACTCACTGCAACCTCCACCTCCCGAGTTCAAATGATTTTCATGCCTC 29655945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5672 TGGCATGATGTCCACTCACTGCAACCTCCACCTCCCGAGTTCAAATGATTTTCATGCCTC 5731

 29655946 AGCCTCCTGAATAGCTGTGACTACAGACACATGCCACCGTGCCTGGCTGATTTCTGTATT 29656005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5732 AGCCTCCTGAATAGCTGTGACTACAGACACATGCCACCGTGCCTGGCTGATTTCTGTATT 5791

 29656006 TTTAGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCTTACTCCTGACCTAAAG 29656065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5792 TTTAGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCTTACTCCTGACCTAAAG 5851

 29656066 TGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCA 29656125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5852 TGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCA 5911

 29656126 GCCAGGTTTCATTAGTTCTTTTAACTTCCTTTTTCTGTCACAGGATTTCATCGAGGATAT 29656185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5912 GCCAGGTTTCATTAGTTCTTTTAACTTCCTTTTTCTGTCACAGGATTTCATCGAGGATAT 5971

 29656186 CACATTGTATTTAGTCCTAATCATGTCTCCTTAAGGCTCCTCCAGGTTGACTTTGTTTTC 29656245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5972 CACATTGTATTTAGTCCTAATCATGTCTCCTTAAGGCTCCTCCAGGTTGACTTTGTTTTC 6031

 29656246 AATGACTGTCTTAGTATGTTGAGTATTACTATAACAGAATAACTTGAAACTGGGTAGTTT 29656305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6032 AATGACTGTCTTAGTATGTTGAGTATTACTATAACAGAATAACTTGAAACTGGGTAGTTT 6091

 29656306 ATAAAGAGAAGATGTTTATTTAGCTCATGATTTTGCAGGCTGGGAAGTTCAACAGGATAG 29656365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6092 ATAAAGAGAAGATGTTTATTTAGCTCATGATTTTGCAGGCTGGGAAGTTCAACAGGATAG 6151

 29656366 TGCTGGATCTGGCAAACTTCTGGTGAAGGCCAAATGTTAGGTCAAAACATTTTGGAGAAG 29656425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6152 TGCTGGATCTGGCAAACTTCTGGTGAAGGCCAAATGTTAGGTCAAAACATTTTGGAGAAG 6211

 29656426 GGGAAAAGTGAGTGGCATGTGCAAAAACATCACATGGGGAGACAGGGAAGCAAGAGAGAG 29656485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6212 GGGAAAAGTGAGTGGCATGTGCAAAAACATCACATGGGGAGACAGGGAAGCAAGAGAGAG 6271

 29656486 TCTAGGAAACCAAACTTGCTTTTATAACAACCTGCTTT 29656523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6272 TCTAGGAAACCAAACTTGCTTTTATAACAACCTGCTTT 6309

Alignment time is 5.30176 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    6082] =>      6082 nucs 'mol-32-2fd8-006690_6082'

Score:        5324
Aligned:      5757        nucs
Identic:      5698 ( 99%) nucs =>       737 ( 98%)      4961 ( 99%)
Gaps:           28 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29649670,29650419] EXCISED REGION [29651086,29656090]
 second seq =>  [       1,     744] EXCISED REGION [     745,    5731]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       666 nucs [29650420,29651085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29650420,29650423] to [29651086,29651089]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29649670 CAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACATTGC 29649729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACATTGC 60

 29649730 CGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTGAATTACTATAGTACTAAAGAA 29649789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTGAATTACTATAGTACTAAAGAA 120

 29649790 TGTCTAGGCTGGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGCTGAGGA 29649849
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      121 TGTCTAGGCTAGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGCTGGGGA 180

 29649850 GGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGGCAACATAGCAAGACCCTTT 29649909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGGCAACATAGCAAGACCCTTT 240

 29649910 CTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTTGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAGGT 29649969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      241 CTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTGGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAGGT 300

 29649970 GCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCT 29650029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      301 GCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCT 360

 29650030 ATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAGAA 29650089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAGAA 420

 29650090 CAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAGAA 29650149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAGAA 480

 29650150 AAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCC 29650209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      481 AAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCC 540

 29650210 GGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGG 29650269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGG 600

 29650270 ATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTA 29650329
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
      601 ATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT------- 653

 29650330 C--ACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTG 29650387
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 -AGACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTG 712

 29650388 CCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 29650419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 CCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 744

EXCISED REGION

 29651086 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 29651145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 804

 29651146 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGA 29651205
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      805 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAGCCACATGCCAGCACGTCCGA 864

 29651206 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 29651265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 924

 29651266 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGT 29651325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|
      925 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAAGCAT 984

 29651326 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 29651385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 1044

 29651386 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 29651445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 1104

 29651446 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 29651505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 1164

 29651506 GAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 29651565
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 GAGTTGAGACGTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 1224

 29651566 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 29651625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 1284

 29651626 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATC 29651685
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1285 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATT 1344

 29651686 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 29651745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 1404

 29651746 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 29651805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 1464

 29651806 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 29651865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 1524

 29651866 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 29651925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 1584

 29651926 GGTAATGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 29651985
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 GGTAATGGACGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 1644

 29651986 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 29652045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 1704

 29652046 GGCCAAAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 29652105
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 GGCCAAAATTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 1764

 29652106 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 29652165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 1824

 29652166 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 29652225
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1825 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCGATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 1884

 29652226 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 29652285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 1944

 29652286 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 29652345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 2004

 29652346 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 29652405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 2064

 29652406 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 29652465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 2124

 29652466 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 29652525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 2184

 29652526 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGAT 29652585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2185 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCATTGTATGAT 2244

 29652586 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 29652645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 2304

 29652646 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 29652705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 2364

 29652706 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 29652765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 2424

 29652766 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 29652825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 2484

 29652826 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 29652885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 2544

 29652886 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 29652945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 2604

 29652946 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 29653005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 2664

 29653006 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 29653065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 2724

 29653066 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 29653125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 2784

 29653126 TATAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 29653185
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 TACAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 2844

 29653186 ATCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 29653245
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 GTCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 2904

 29653246 CTGACACAGCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 29653305
          |||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 CTGACACAGCTGTAATTATCATCCATGTGAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 2964

 29653306 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 29653365
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTGATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 3024

 29653366 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 29653425
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3025 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGTTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 3084

 29653426 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 29653485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 3144

 29653486 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 29653545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 3204

 29653546 CAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTC 29653605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 CAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTC 3264

 29653606 GCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCG 29653665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 GCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCG 3324

 29653666 TGGATTTGGGAAACACTTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGCGCCCCCTTGGGT 29653725
          ||||            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3325 TGGA------------TTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGTGCCCCCTTGGGT 3372

 29653726 ACGTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGG 29653785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 ACGTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGG 3432

 29653786 AGGAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGCTGACCACACACAAGTGCCGAT 29653845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3433 AGGAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGGTGACCACACACAAGTGCCGAT 3492

 29653846 GTTCTGCTCTCTTGGATTCTGATTGAGCAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAAC 29653905
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 GTTCTGCTCTCTTGGATTCTGATTGAGTAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAAC 3552

 29653906 TGGACAGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCCC 29653965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3553 TGGACAGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCTC 3612

 29653966 GAAAAGTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAA 29654025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 GAAAAGTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAA 3672

 29654026 TATCCTTTTAAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCA 29654085
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3673 TATCCTTTTGAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCA 3732

 29654086 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCA 29654145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCA 3792

 29654146 ATATGGAGAAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTC 29654205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 ATATGGAGAAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTC 3852

 29654206 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGA 29654265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGA 3912

 29654266 GGTTGCGGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTC 29654325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3913 GGTTGCGGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTC 3972

 29654326 CGTCTCAAAAATCAAATCAAATCAAATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAG 29654385
          ||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3973 CGTCTCAA-----AAATCAAATCAAATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAG 4027

 29654386 AAAAGTTGCAAAGATAGTACATAGTTCTCCTATGTTCCACATTCAGTTTCCTCTATTATT 29654445
          |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||||
     4028 AAAAGTTGCAAAGATAGTACATAATTCTCGTATGTTCCACATTCAGTTTCCCCTATTATT 4087

 29654446 AATGTCTTATTTTATTATACATTTGTGACAGGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTAC 29654505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 AATGTCTTATTTTATTATACATTTGTGACAGGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTAC 4147

 29654506 TAACTCCTATTTTATTTGGATTTTATTCTTTTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGAT 29654565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 TAACTCCTATTTTATTTGGATTTTATTCTTTTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGAT 4207

 29654566 CCCATCCAGGATACATTACATTTAGTCCCCTTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGT 29654625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 CCCATCCAGGATACATTACATTTAGTCCCCTTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGT 4267

 29654626 GACAATTTCTCAGACCTCGTTTTTGATAATTTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGC 29654685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 GACAATTTCTCAGACCTCGTTTTTGATAATTTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGC 4327

 29654686 ATATTGTAAAATGTCCCTTAATTTGAGTGTGGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGA 29654745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 ATATTGTAAAATGTCCCTTAATTTGAGTGTGGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGA 4387

 29654746 AGAGCACAGAGATGAAATGCAATACTCTCAATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCA 29654805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 AGAGCACAGAGATGAAATGCAATACTCTCAATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCA 4447

 29654806 GTTGATGTATCAAATGATTATGTTAACCTCCATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGT 29654865
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 GTTGATTTATCAAATGATTATGTTAACCTCCATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGT 4507

 29654866 CTATAATATATAATTTTTAATAGCATCCCAAAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAA 29654925
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 CTATAATATATAATTTTTAATAGCAGCCCAAAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAA 4567

 29654926 GAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGCCCAAGGAGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAA 29654985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 GAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGCCCAAGGAGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAA 4627

 29654986 AAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCTCAGGTCTATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGG 29655045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 AAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCTCAGGTCTATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGG 4687

 29655046 TGTCTCAGACACAAATTGAGCAATCAGAAAAGGCTGGGATGTCTGTGGTCTGAGTTGGGC 29655105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 TGTCTCAGACACAAATTGAGCAATCAGAAAAGGCTGGGATGTCTGTGGTCTGAGTTGGGC 4747

 29655106 AGAGGTGGCTGACCCTGGAACCTGACATCAATAGGGGGATGAAGACAATTTCTGAGCAGC 29655165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 AGAGGTGGCTGACCCTGGAACCTGACATCAATAGGGGGATGAAGACAATTTCTGAGCAGC 4807

 29655166 CCCAGTAGTCAGAGGACAAGAGAACTCTGGAGCCCCGCACTGTCTCTGAGGTTCCAATCT 29655225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 CCCAGTAGTCAGAGGACAAGAGAACTCTGGAGCCCCGCACTGTCTCTGAGGTTCCAATCT 4867

 29655226 TTTCTCCCTCTTCCCAGCCCCTTGATAGGAAACCCTGGGAAAACTAAAAAGTATACTGTT 29655285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 TTTCTCCCTCTTCCCAGCCCCTTGATAGGAAACCCTGGGAAAACTAAAAAGTATACTGTT 4927

 29655286 TTTTCTTTAACTCCCTATTCCTTTCCTCTTCTGAGGGTTGTTGTTGTTGTTTTTTTTTAA 29655345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     4928 TTTTCTTTAACTCCCTATTCCTTTCCTCTTCTGAGGGTTGTTGTTGTTG-TTTTTTTTAA 4986

 29655346 TAAACTTATTAATTTTAGAATACTTTTAGATTACACAAAAGTTGAAAAGATAATACATAG 29655405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 TAAACTTATTAATTTTAGAATACTTTTAGATTACACAAAAGTTGAAAAGATAATACATAG 5046

 29655406 TTCTCACATATGTCACACTCAGCTCCCCATTGTTAACATATTTTTTTTTTTTTTGAGGGA 29655465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 TTCTCACATATGTCACACTCAGCTCCCCATTGTTAACATATTTTTTTTTTTTTTGAGGGA 5106

 29655466 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATTTCGGCTCACTGCAACCTCT 29655525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATTTCGGCTCACTGCAACCTCT 5166

 29655526 GCCTCCGGGTTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGATTACAGGTG 29655585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 GCCTCCGGGTTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGATTACAGGTG 5226

 29655586 CGCGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTGTAGTTTTAGTAAAGACAGGGTTCCACCACATTG 29655645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 CGCGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTGTAGTTTTAGTAAAGACAGGGTTCCACCACATTG 5286

 29655646 GCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTACCCGCTCAGCTTCCCAAAGTGC 29655705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 GCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTACCCGCTCAGCTTCCCAAAGTGC 5346

 29655706 TGGCATTACAGGTGTGTGCCACTGCCCCCAGCCCCATTGTTAACATCTTATATCACTATT 29655765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 TGGCATTACAGGTGTGTGCCACTGCCCCCAGCCCCATTGTTAACATCTTATATCACTATT 5406

 29655766 ATACATTTTTCACAACCAGTGAGACAATATTAATATAGTATCACTAAACTTTATTTCGAT 29655825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 ATACATTTTTCACAACCAGTGAGACAATATTAATATAGTATCACTAAACTTTATTTCGAT 5466

 29655826 TTCATTAGCTCTTTCTGTTTTGAAACAAAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCCGGAGTGCAA 29655885
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 TTTATTAGCTCTTTCTGTTTTGAAACAAAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCCGGAGTGCAA 5526

 29655886 TGGCATGATGTCCACTCACTGCAACCTCCACCTCCCGAGTTCAAATGATTTTCATGCCTC 29655945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 TGGCATGATGTCCACTCACTGCAACCTCCACCTCCCGAGTTCAAATGATTTTCATGCCTC 5586

 29655946 AGCCTCCTGAATAGCTGTGACTACAGACACATGCCACCGTGCCTGGCTGATTTCTGTATT 29656005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 AGCCTCCTGAATAGCTGTGACTACAGACACATGCCACCGTGCCTGGCTGATTTCTGTATT 5646

 29656006 TTTAGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCTTACTCCTGACCTAAAG 29656065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 TTTAGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCTTACTCCTGACCTAAAG 5706

 29656066 TGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAA 29656090
          |||||||||||||||||||||||||
     5707 TGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAA 5731

Alignment time is 4.93948 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5268] =>      5268 nucs 'mol-32-303b-074096_5268'

Score:        4966
Aligned:      5275        nucs
Identic:      5242 ( 99%) nucs =>      2111 ( 99%)      3131 ( 99%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29645560,29647683] EXCISED REGION [29647691,29650836]
 second seq =>  [       1,    2121] EXCISED REGION [    2122,    5268]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [29647684,29647690]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [29647684,29647686] to [29647691,29647693]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [29647684,29647686] to [29647688,29647690]
 second seq =>         0 nucs

 29645560 ACACACACACACACAATTCTGTGATCTGGATTTTCAATACATGTAGTAGTTCCCCTTTAT 29645619
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
        1 ACACACACACACACAATTCTGTGATCTGGATTTTCAATACATGTAGTAGTTCCACTTTAT 60

 29645620 CATGGTTTTGCTTTCCAATGCTTCAGTTACCCATGGTCAACCATGGTTCAAAAATATTAA 29645679
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATGGTTTTGCTTTTCAATGCTTCAGTTACCCATGGTCAACCATGGTTCAAAAATATTAA 120

 29645680 ATGAAAAATTCCGGAGGACAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAG 29645739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGAAAAATTCCGGAGGACAGGCACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAG 180

 29645740 GCTGAGGTAGGCAGATCATCTGAGGTCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGGTCAACATGGTGA 29645799
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTGAGGTAGGCAGATCATCTGAGGTCAGGGGTTCGAGATCAGCCTGGTCAACATGGTGA 240

 29645800 AACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAGAAAATAGCTGGGCATAGTGGCACACATCTGT 29645859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAGAAAATAGCTGGGCATAGTGGCACACATCTGT 300

 29645860 AATCCCAGCAACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCTGGAGGTGGACGTT 29645919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATCCCAGCAACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCTGGAGGTGGACGTT 360

 29645920 GCCATGAGCCAAGACTGCGCCACTGCACTCCAGCCTGGGACATAGAGCGAGACTCCGTCT 29645979
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCATGAGCCAAGACTGTGCCACTGCACTCCAGCCTGGGACATAGAGCGAGACTCCGTCT 420

 29645980 CAAAAAAAAATCCAGAGATAAACAATTCCTAAGTTTTAAATTGCTTGACATTCTGAGTAG 29646039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAAAAAAAATCCAGAGATAAACAATTCCTAAGTTTTAAATTGCTTGACATTCTGAGTAG 480

 29646040 TGTGATGAAATCTTGTACCTTTTCTCTCTGGCCTGCCCAGGATGTGAATCATCCCTTTGA 29646099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTGATGAAATCTTGTACCTTTTCTCTCTGGCCTGCCCAGGATGTGAATCATCCCTTTGA 540

 29646100 CTAGCATATCCACACTGCAGACAATACCTGCCCATTAGTTCCTTAGTAGCTAGCCATCTC 29646159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAGCATATCCACACTGCAGACAATACCTGCCCATTAGTTCCTTAGTAGCTAGCCATCTC 600

 29646160 AGTTACCAGGTTGACTACTGTAGTATAGCAGTTGCCTGTGCTCAAGAATGCCTTATTTTA 29646219
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTTATCAGGTTGACTACTGTAGTATAGCAGTTGCCTGTGCTCAAGAATGCCTTATTTTA 660

 29646220 CTTAATAATGACCCAAAAGCACAAGAGTAGAGACGCTGGAAATTCAGATATGCAAAGAGA 29646279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTAATAATGACCCAAAAGCACAAGAGTAGAGACGCTGGAAATTCAGATATGCAAAGAGA 720

 29646280 AGCCATAAAATAAAAAGGTAAAAATTCTTGTCTTAAGGAAAGAAAAAATAATCATATGCT 29646339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCCATAAAATAAAAAGGTAAAAATTCTTGTCTTAAGGAAAGAAAAAATAATCATATGCT 780

 29646340 GAGGTTGCTAAGATTTACAATATAAATTATTTTGAGAGAGATACCACATTCATACAACTT 29646399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGGTTGCTAAGATTTACAATATAAATTATTTTGAGAGAGATACCACATTCATACAACTT 840

 29646400 TTATTACAATATATTGCTGTAATTGTTCTATCTTATTACTAGTTATTGTTGTCAATCTCT 29646459
          |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||
      841 TTATTACAATATATTGCTGTAATTGTTCT----TATTACTAGTTATTGTTGTCAATCTCT 896

 29646460 TACCATGCCTAATTTGTAAATTAAACTTTATCATTATTATGTATGTATAGAAAAAGAAAA 29646519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TACCATGCCTAATTTGTAAATTAAACTTTATCATTATTATGTATGTATAGAAAAAGAAAA 956

 29646520 CCATAGTGTATACAGGGTTTGGTACTATTCATGGTTTCAAAGTATCCACTGGGGTGGGGC 29646579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 CCATAGTGTATACAGGGTTTGGTACTATTCATGGTTTCAAAGTATCCACTGGGGTGGGGC 1016

 29646580 GCGGTGGATCACTTCAGGGCAGGAATTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCG 29646639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 GCGGTGGATCACTTCAGGGCAGGAATTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCG 1076

 29646640 TCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCTGTAGTCCCAGCTGCTC 29646699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 TCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGCACGCTGTAGTCCCAGCTGCTC 1136

 29646700 AGGATGCTGAGGCAGAATTACTTGAACCCGTGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTG 29646759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 AGGATGCTGAGGCAGAATTACTTGAACCCGTGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTG 1196

 29646760 TGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGATTCTGCCTCAAACAACAACAAAAAC 29646819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 TGCCACTGTACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCGAGATTCTGCCTCAAACAACAACAAAAAC 1256

 29646820 -AAAGTATCCACTAGAGCTCTTGGAACATATCACCTGTGGATAAGGGGAACCACTGTATA 29646878
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 CAAAGTATCCACTAGAGCTCTTGGAACATATCACCTGTGGATAAGGGGAACCACTGTATA 1316

 29646879 TACAGATCTTTGTGAAGAATACTGCTAACAACCCAAGAGCAATCACTTATTCAGGGCTCA 29646938
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 CACAGATCTTTGTGAAGAATACTGCTAACAACCCAAGAGCAATCACTTATTCAGGGCTCA 1376

 29646939 CAATGAGCCCAGCACTGGAGTTCCCTGCTCATCCTTGGAAATTTCCTGCTCAGATGCAAA 29646998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 CAATGAGCCCAGCACTGGAGTTCCCTGCTCATCCTTGGAAATTTCCTGCTCAGATGCAAA 1436

 29646999 CATAGCTGAACTCTCACCTTTTCCTGCTGACAGCCACTCACCCACATCTCCCTTACTAGA 29647058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 CATAGCTGAACTCTCACCTTTTCCTGCTGACAGCCACTCACCCACATCTCCCTTACTAGA 1496

 29647059 GATAGAAAGAAAAGAATAAAGACCAAAAAACCCTGTTGACTATTTTTTCCTTTCACTTTT 29647118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 GATAGAAAGAAAAGAATAAAGACCAAAAAACCCTGTTGACTATTTTTTCCTTTCACTTTT 1556

 29647119 TGAGAAGTGTTAATAGAACTGAAAATACCAGCAAGGAAAAACGCCCTCGAGGAATAGAGT 29647178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 TGAGAAGTGTTAATAGAACTGAAAATACCAGCAAGGAAAAACGCCCTCGAGGAATAGAGT 1616

 29647179 TAATTGGATCTCCAAAATGTTGTCATGAAAGGTGCATTCCTGGGATATGAATTTGATTTC 29647238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 TAATTGGATCTCCAAAATGTTGTCATGAAAGGTGCATTCCTGGGATATGAATTTGATTTC 1676

 29647239 CTTCCTTTCTTCCTCTCTCTTTCTTTCCTCTCTCTCCCTTTCCTTTCCTGTCTTTCAAAA 29647298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 CTTCCTTTCTTCCTCTCTCTTTCTTTCCTCTCTCTCCCTTTCCTTTCCTGTCTTTCAAAA 1736

 29647299 CCATTCGCACTCCTTTTATGAGGCATGCAGATCTTGGATTATTCTTCCACTTTCCAGCCA 29647358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 CCATTCGCACTCCTTTTATGAGGCATGCAGATCTTGGATTATTCTTCCACTTTCCAGCCA 1796

 29647359 ACTGCACTTCAAAACAGCCTTAATAAGGCTGGGCACGGTGGCTCAGCCTGTAATCCCAAC 29647418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 ACTGCACTTCAAAACAGCCTTAATAAGGCTGGGCACGGTGGCTCAGCCTGTAATCCCAAC 1856

 29647419 ACTTGGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGACC 29647478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 ACTTGGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGACC 1916

 29647479 AACATGGACCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTATCCCGGCGTGGTGGCGCATGCCTG 29647538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 AACATGGACCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTATCCCGGCGTGGTGGCGCATGCCTG 1976

 29647539 TAATCGTAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGT 29647598
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 TAATCGCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGT 2036

 29647599 TGCGGTGAGCGGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCAGGGAAATGAGAGTGAAACTCCGT 29647658
          |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||
     2037 TGCGGTGAGCGGAGATCGCGCCATTGCACACCAGCCAGGGAAACGAGAGTGAAACTCCGT 2096

 29647659 CTCAAAAACAAACAAACAAACAAAC 29647683
          |||||||||||||||||||||||||
     2097 CTCAAAAACAAACAAACAAACAAAC 2121

EXCISED REGION

 29647691 AAAAAACGCCTTAGTAACAGTGCCCTCAAGAACCTGGCCTTCCAGTTCTCTGGCAGAGAA 29647750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 AAAAAACGCCTTAGTAACAGTGCCCTCAAGAACCTGGCCTTCCAGTTCTCTGGCAGAGAA 2181

 29647751 GACCTACTGCTGCCGCTAGTCCTCAAGATGGCATTTGCTGGAGGCGGTAGGCAGAGGCCC 29647810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 GACCTACTGCTGCCGCTAGTCCTCAAGATGGCATTTGCTGGAGGCGGTAGGCAGAGGCCC 2241

 29647811 TAAGTGTGGATTCTAACCCCCGTGGGGACTGAATCTCTGCGGCTGTTGCTTGCCCAGGCA 29647870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 TAAGTGTGGATTCTAACCCCCGTGGGGACTGAATCTCTGCGGCTGTTGCTTGCCCAGGCA 2301

 29647871 CGTTTGCCTCCCATGAACTTCCTTCATCCACAGGGCCCCAAACCTCATGCCGGCGGGAGG 29647930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 CGTTTGCCTCCCATGAACTTCCTTCATCCACAGGGCCCCAAACCTCATGCCGGCGGGAGG 2361

 29647931 AGGAAGGAGACTGGGCATAACTCATCAGACTTTCGACTGTAAGAGCTGGAGGCCGCCTGC 29647990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 AGGAAGGAGACTGGGCATAACTCATCAGACTTTCGACTGTAAGAGCTGGAGGCCGCCTGC 2421

 29647991 GGGCTTATCTGTACCCGGGCCTGTCCCCACCCTTCCAGAATGTAAATCCTCTGAGGGAAT 29648050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 GGGCTTATCTGTACCCGGGCCTGTCCCCACCCTTCCAGAATGTAAATCCTCTGAGGGAAT 2481

 29648051 GTGTCGTCGCCATCTTTCAGTCCTTTGAGTGCACCCAGTCTCTCTCCAACCCAAAACCCT 29648110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 GTGTCGTCGCCATCTTTCAGTCCTTTGAGTGCACCCAGTCTCTCTCCAACCCAAAACCCT 2541

 29648111 TTATCCACAGCAATTCTGAGAATGATGAGAATCCCCCTCACCCCTCACACCGCAAACAGT 29648170
          ||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 TTATCCACGGCAATTGTGAGAATGATAAGAATCCCCCTCACCCCTCACACCGCAAACAGT 2601

 29648171 TGCAATGCTTAGTGGGATTCACCCTTGTCGTCACCAACCCTGCTACTCCAGCCACGTGAG 29648230
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 TGCAATGCTTAGTGGGATTCACCCTTGTTGTCACCAACCCTGCTACTCCAGCCACGTGAG 2661

 29648231 TTTTCCGCCTGTCAGCCAAGCAAAATGGCCTTCCTGCAGTCGCACGGCCCTTTGGTCTCT 29648290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 TTTTCCGCCTGTCAGCCAAGCAAAATGGCCTTCCTGCAGTCGCACGGCCCTTTGGTCTCT 2721

 29648291 GCTCAGGGCTTCGGGGACCCTTTCCAGCCATTGCCCTGCACCTACCCACCAGATCGCCGC 29648350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 GCTCAGGGCTTCGGGGACCCTTTCCAGCCATTGCCCTGCACCTACCCACCAGATCGCCGC 2781

 29648351 CCTGGTGGGCGCTCCTGGCCCTGTCCTCCGCGCTTAGTTTGTCATTGGGCGCCCAGATCC 29648410
          ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2782 CCTGGTGGGCGCTCCTGGCCCTGTCCCCCGCGCTTAGTTTGTCATTGCGCGCCCAGATCC 2841

 29648411 GGAACCCCAGCCTCGAAGCTTCCGGTGGCCGGGAACAAAGCCGGTTTTGCTCACTGTCGC 29648470
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2842 GGAACCCCAGCCTCGAAGCTTCCGGTGGCCGGGAACAAAGCCGGTTTTGCTCACTGTTGC 2901

 29648471 CTGGCAAAGCAGGCGCTTGTTAGCACCCACTGAATGCGCTTATGTGCTCAGAAACGGTCC 29648530
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2902 CTGGCAAAGCAGGCGCTTGTTAGCACCCACTGAATACGCTTATGTGCTCAGAAACGGTCC 2961

 29648531 CATTGGTTGGGACTACCTTCCCCGATGCCCATCCGCCCAGAATCTTCCTTCTGGGATGCC 29648590
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2962 CATTGGTTGGGACTACCTTCCCCGATGCCCATCTGCCCAGAATCTTCCTTCTGGGATGCC 3021

 29648591 GACTTTTTCAACACGTGCCAGGAGCCCTTCCTCGGCCCGGAATCCCCAGAGTGCCCACAG 29648650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 GACTTTTTCAACACGTGCCAGGAGCCCTTCCTCGGCCCGGAATCCCCAGAGTGCCCACAG 3081

 29648651 TGGACAGGGCACCTGGATACACCCCAGACTAACCCACGTTTCCCCGGAGGACCCCAGAGG 29648710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 TGGACAGGGCACCTGGATACACCCCAGACTAACCCACGTTTCCCCGGAGGACCCCAGAGG 3141

 29648711 TTGGAAGCCCCTCCAAGATTAGGGGCGCAGTGCTCCCCTGGCCTGCGGAAGAGTCAGAGG 29648770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 TTGGAAGCCCCTCCAAGATTAGGGGCGCAGTGCTCCCCTGGCCTGCGGAAGAGTCAGAGG 3201

 29648771 AGTGGGGACAACATCCAACATCAGCCTCTACTACCGCTAGCGCGACTCCCCGCCGCCGCT 29648830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 AGTGGGGACAACATCCAACATCAGCCTCTACTACCGCTAGCGCGACTCCCCGCCGCCGCT 3261

 29648831 CTACTCACCTGACGCGCGCAGTGGACCGCGATTTAGGGGCACAGGGTCTCCCGGGGACCA 29648890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 CTACTCACCTGACGCGCGCAGTGGACCGCGATTTAGGGGCACAGGGTCTCCCGGGGACCA 3321

 29648891 GCGGCTGGAGCGCTCCGGCCGAGCACCCGCAGTCCCGGCGCCGCGGCCCCACCCCGGCCC 29648950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3322 GCGGCTGGAGCGCTCCGGCCGAGCACCCGCAGTCCCGGCGCCGCGGCCCCGCCCCGGCCC 3381

 29648951 CGCCCTCTTCCGCTCCCTCCCAGTCATCAGGCCACCGAGAATGTGCCCCTTGACCCAGAT 29649010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 CGCCCTCTTCCGCTCCCTCCCAGTCATCAGGCCACCGAGAATGTGCCCCTTGACCCAGAT 3441

 29649011 GAGAGGGTGAGCCCGCCAAGGTCAAGCTTCCCATCCTAAGAATCACAGACAGCCCGGCCA 29649070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 GAGAGGGTGAGCCCGCCAAGGTCAAGCTTCCCATCCTAAGAATCACAGACAGCCCGGCCA 3501

 29649071 TGCACCACCACTTCGAGCCTCCGACCAACTGATAGCTGCTGGTCCCAAGTAGCGCTAGGA 29649130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 TGCACCACCACTTCGAGCCTCCGACCAACTGATAGCTGCTGGTCCCAAGTAGCGCTAGGA 3561

 29649131 TTTTCGCTTTCCCAGTCTTAATTGACTCTAAAAGAAGAAGAAAAAAAAGCCTGGGCGCGA 29649190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 TTTTCGCTTTCCCAGTCTTAATTGACTCTAAAAGAAGAAGAAAAAAAAGCCTGGGCGCGA 3621

 29649191 TTGCTCACACCTGTAATTCCGGCACTTTGGGAGGTCGAGGCTGGTGAATTACCTGAAGTC 29649250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 TTGCTCACACCTGTAATTCCGGCACTTTGGGAGGTCGAGGCTGGTGAATTACCTGAAGTC 3681

 29649251 AGGAGTTCAAGACCACCCTGGCCAACATGGCGAAACCTCGTCTCTACTAAAAGTACAAAA 29649310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 AGGAGTTCAAGACCACCCTGGCCAACATGGCGAAACCTCGTCTCTACTAAAAGTACAAAA 3741

 29649311 ATTAGCCAGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAACCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGA 29649370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 ATTAGCCAGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAACCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGA 3801

 29649371 GAATCGCTTGAATCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCCAGATCACGCCACTGCACTCC 29649430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 GAATCGCTTGAATCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCCAGATCACGCCACTGCACTCC 3861

 29649431 AGCCTGGGCAAAAAGAGTGAAACTCCATCTC---AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGA 29649487
          |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||
     3862 AGCCTGGGCAAAAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGA 3921

 29649488 GGAAAGTATTTACGAAAAAAAAAAAAAAAGACCAAAGTATTATGATTAAAACACGCGGCT 29649547
          |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3922 GGAAAGTATTTACG-AAAAAAAAAAAAAAGACCAAAGTATTATGATTAAAACACGCGGCC 3980

 29649548 GAGAGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGGGGCGGATCACC 29649607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3981 GAGAGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGGGGCGGATCACC 4040

 29649608 TGAGGTCAGAAGTTCGACCTCAGCGTGGCCAATATGGCGAAACCTTGTCCCTATTAAAAA 29649667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4041 TGAGGTCAGAAGTTCGACCTCAGCGTGGCCAATATGGCGAAACCTTGTCCCTATTAAAAA 4100

 29649668 TACAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACATT 29649727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4101 TACAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACATT 4160

 29649728 GCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTGAATTACTATAGTACTAAAG 29649787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4161 GCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTGAATTACTATAGTACTAAAG 4220

 29649788 AATGTCTAGGCTGGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGCTGAG 29649847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4221 AATGTCTAGGCTGGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGCTGAG 4280

 29649848 GAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGGCAACATAGCAAGACCCT 29649907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4281 GAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGGCAACATAGCAAGACCCT 4340

 29649908 TTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTTGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAG 29649967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4341 TTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTGGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAG 4400

 29649968 GTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAG 29650027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4401 GTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAG 4460

 29650028 CTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAG 29650087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4461 CTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAG 4520

 29650088 AACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAG 29650147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4521 AACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAG 4580

 29650148 AAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCC 29650207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4581 AAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCC 4640

 29650208 CCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTG 29650267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4641 CCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTG 4700

 29650268 GGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAG 29650327
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     4701 GGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTAA--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAG 4758

 29650328 TACACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTG 29650387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4759 TACACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTG 4818

 29650388 CCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCTAGAA 29650447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4819 CCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCTAGAA 4878

 29650448 AAGATTTCTTTCTTTTTTC-TTTTTTTTTTTTAATTATACTGTAAGTTTTAGGGTACATA 29650506
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4879 AAGATTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAATTATACTGTAAGTTTTAGGGTACATA 4938

 29650507 TGCACAACATGCCGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCA 29650566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4939 TGCACAACATGCCGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCA 4998

 29650567 TAACTCATCATTTAACATTAGATATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCACTCCCTAGAAA 29650626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4999 TAACTCATCATTTAACATTAGATATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCACTCCCTAGAAA 5058

 29650627 AGATTTCTTGTGGAGTTTTTAAAAAGTCCTTTGAAACAATTCTTTTCTTTTCCTTTTTTT 29650686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5059 AGATTTCTTGTGGAGTTTTTAAAAAGTCCTTTGAAACAATTCTTTTCTTTTCCTTTTTTT 5118

 29650687 TTTTTTTCGATACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCATGATCTC 29650746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5119 TTTTTTTCGATACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCATGATCTC 5178

 29650747 GGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGT 29650806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5179 GGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGT 5238

 29650807 AGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGC 29650836
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     5239 AGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGC 5268

Alignment time is 3.78133 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    6218] =>      6218 nucs 'mol-32-3164-033895_6218'

Score:        5832
Aligned:      6240        nucs
Identic:      6189 ( 99%) nucs =>       428 ( 99%)      5761 ( 99%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29649986,29650419] EXCISED REGION [29651086,29656891]
 second seq =>  [       1,     431] EXCISED REGION [     432,    6218]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       666 nucs [29650420,29651085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29650420,29650423] to [29651086,29651089]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29649986 TGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGC 29650045
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGC 60

 29650046 ATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGC 29650105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGC 120

 29650106 CTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTT 29650165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTT 180

 29650166 TTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGG 29650225
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGG 240

 29650226 CGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCC 29650285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCC 300

 29650286 ACCATACCCGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTACACACAGGGTTTCACC 29650345
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||.|||||||||||||||
      301 ACCATACCCGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---AGTAGACACAGGGTTTCACC 357

 29650346 ATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAA 29650405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 ATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAA 417

 29650406 AGTGCTGGGATTAC 29650419
          ||||||||||||||
      418 AGTGCTGGGATTAC 431

EXCISED REGION

 29651086 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 29651145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      432 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 491

 29651146 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGA 29651205
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      492 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAGCCACATGCCAGCACGTCCGA 551

 29651206 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 29651265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      552 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 611

 29651266 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGT 29651325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|
      612 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAAGCAT 671

 29651326 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 29651385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      672 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 731

 29651386 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 29651445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 791

 29651446 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 29651505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 851

 29651506 GAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 29651565
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 GAGTTGAGACGTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 911

 29651566 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 29651625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 971

 29651626 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATC 29651685
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      972 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATT 1031

 29651686 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 29651745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 1091

 29651746 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 29651805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 1151

 29651806 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 29651865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 1211

 29651866 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 29651925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 1271

 29651926 GGTAATGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 29651985
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 GGTAATGGACGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 1331

 29651986 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 29652045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 1391

 29652046 GGCCAAAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 29652105
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 GGCCAAAATTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 1451

 29652106 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 29652165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 1511

 29652166 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 29652225
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1512 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCGATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 1571

 29652226 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 29652285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 1631

 29652286 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 29652345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 1691

 29652346 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 29652405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 1751

 29652406 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 29652465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 1811

 29652466 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 29652525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 1871

 29652526 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGAT 29652585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1872 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCATTGTATGAT 1931

 29652586 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 29652645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 1991

 29652646 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 29652705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 2051

 29652706 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 29652765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 2111

 29652766 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 29652825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 2171

 29652826 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 29652885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 2231

 29652886 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 29652945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 2291

 29652946 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 29653005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 2351

 29653006 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 29653065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 2411

 29653066 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 29653125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 2471

 29653126 TATAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 29653185
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 TACAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 2531

 29653186 ATCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 29653245
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 GTCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 2591

 29653246 CTGACACAGCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 29653305
          |||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 CTGACACAGCTGTAATTATCATCCATGTGAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 2651

 29653306 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 29653365
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTGATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 2711

 29653366 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 29653425
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2712 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGTTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 2771

 29653426 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 29653485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 2831

 29653486 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 29653545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 2891

 29653546 CAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTC 29653605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 CAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTC 2951

 29653606 GCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCG 29653665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 GCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCG 3011

 29653666 TGGATTTGGGAAACACTTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGCGCCCCCTTGGGT 29653725
          ||||            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3012 TGGA------------TTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGTGCCCCCTTGGGT 3059

 29653726 ACGTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGG 29653785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 ACGTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGG 3119

 29653786 AGGAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGCTGACCACACACAAGTGCCGAT 29653845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3120 AGGAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGGTGACCACACACAAGTGCCGAT 3179

 29653846 GTTCTGCTCTCTTGGATTCTGATTGAGCAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAAC 29653905
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GTTCTGCTCTCTTGGATTCTGATTGAGTAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAAC 3239

 29653906 TGGACAGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCCC 29653965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3240 TGGACAGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCTC 3299

 29653966 GAAAAGTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAA 29654025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GAAAAGTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAA 3359

 29654026 TATCCTTTTAAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCA 29654085
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TATCCTTTTGAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCA 3419

 29654086 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCA 29654145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCA 3479

 29654146 ATATGGAGAAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTC 29654205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 ATATGGAGAAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTC 3539

 29654206 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGA 29654265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGA 3599

 29654266 GGTTGCGGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTC 29654325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 GGTTGCGGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTC 3659

 29654326 CGTCTCAAAAATCAAATCAAATCAAATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAG 29654385
          ||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 CGTCTCAA-----AAATCAAATCAAATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAG 3714

 29654386 AAAAGTTGCAAAGATAGTACATAGTTCTCCTATGTTCCACATTCAGTTTCCTCTATTATT 29654445
          |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||||
     3715 AAAAGTTGCAAAGATAGTACATAATTCTCGTATGTTCCACATTCAGTTTCCCCTATTATT 3774

 29654446 AATGTCTTATTTTATTATACATTTGTGACAGGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTAC 29654505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 AATGTCTTATTTTATTATACATTTGTGACAGGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTAC 3834

 29654506 TAACTCCTATTTTATTTGGATTTTATTCTTTTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGAT 29654565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 TAACTCCTATTTTATTTGGATTTTATTCTTTTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGAT 3894

 29654566 CCCATCCAGGATACATTACATTTAGTCCCCTTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGT 29654625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 CCCATCCAGGATACATTACATTTAGTCCCCTTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGT 3954

 29654626 GACAATTTCTCAGACCTCGTTTTTGATAATTTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGC 29654685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 GACAATTTCTCAGACCTCGTTTTTGATAATTTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGC 4014

 29654686 ATATTGTAAAATGTCCCTTAATTTGAGTGTGGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGA 29654745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 ATATTGTAAAATGTCCCTTAATTTGAGTGTGGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGA 4074

 29654746 AGAGCACAGAGATGAAATGCAATACTCTCAATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCA 29654805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 AGAGCACAGAGATGAAATGCAATACTCTCAATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCA 4134

 29654806 GTTGATGTATCAAATGATTATGTTAACCTCCATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGT 29654865
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 GTTGATTTATCAAATGATTATGTTAACCTCCATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGT 4194

 29654866 CTATAATATATAATTTTTAATAGCATCCCAAAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAA 29654925
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 CTATAATATATAATTTTTAATAGCAGCCCAAAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAA 4254

 29654926 GAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGCCCAAGGAGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAA 29654985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 GAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGCCCAAGGAGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAA 4314

 29654986 AAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCTCAGGTCTATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGG 29655045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 AAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCTCAGGTCTATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGG 4374

 29655046 TGTCTCAGACACAAATTGAGCAATCAGAAAAGGCTGGGATGTCTGTGGTCTGAGTTGGGC 29655105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 TGTCTCAGACACAAATTGAGCAATCAGAAAAGGCTGGGATGTCTGTGGTCTGAGTTGGGC 4434

 29655106 AGAGGTGGCTGACCCTGGAACCTGACATCAATAGGGGGATGAAGACAATTTCTGAGCAGC 29655165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 AGAGGTGGCTGACCCTGGAACCTGACATCAATAGGGGGATGAAGACAATTTCTGAGCAGC 4494

 29655166 CCCAGTAGTCAGAGGACAAGAGAACTCTGGAGCCCCGCACTGTCTCTGAGGTTCCAATCT 29655225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 CCCAGTAGTCAGAGGACAAGAGAACTCTGGAGCCCCGCACTGTCTCTGAGGTTCCAATCT 4554

 29655226 TTTCTCCCTCTTCCCAGCCCCTTGATAGGAAACCCTGGGAAAACTAAAAAGTATACTGTT 29655285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 TTTCTCCCTCTTCCCAGCCCCTTGATAGGAAACCCTGGGAAAACTAAAAAGTATACTGTT 4614

 29655286 TTTTCTTTAACTCCCTATTCCTTTCCTCTTCTGAGGGTTGTTGTTGTTGTTTTTTTTTAA 29655345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     4615 TTTTCTTTAACTCCCTATTCCTTTCCTCTTCTGAGGGTTGTTGTTGTTG-TTTTTTTTAA 4673

 29655346 TAAACTTATTAATTTTAGAATACTTTTAGATTACACAAAAGTTGAAAAGATAATACATAG 29655405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 TAAACTTATTAATTTTAGAATACTTTTAGATTACACAAAAGTTGAAAAGATAATACATAG 4733

 29655406 TTCTCACATATGTCACACTCAGCTCCCCATTGTTAACATATTTTTTTTTTTTTTGAGGGA 29655465
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     4734 TTCTCACATATGTCACACTCAGCTCCCCATTGTTAACATA-TTTTTTTTTTTTTGAGGGA 4792

 29655466 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATTTCGGCTCACTGCAACCTCT 29655525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4793 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATTTCGGCTCACTGCAACCTCT 4852

 29655526 GCCTCCGGGTTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGATTACAGGTG 29655585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 GCCTCCGGGTTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGATTACAGGTG 4912

 29655586 CGCGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTGTAGTTTTAGTAAAGACAGGGTTCCACCACATTG 29655645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 CGCGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTGTAGTTTTAGTAAAGACAGGGTTCCACCACATTG 4972

 29655646 GCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTACCCGCTCAGCTTCCCAAAGTGC 29655705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4973 GCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTACCCGCTCAGCTTCCCAAAGTGC 5032

 29655706 TGGCATTACAGGTGTGTGCCACTGCCCCCAGCCCCATTGTTAACATCTTATATCACTATT 29655765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 TGGCATTACAGGTGTGTGCCACTGCCCCCAGCCCCATTGTTAACATCTTATATCACTATT 5092

 29655766 ATACATTTTTCACAACCAGTGAGACAATATTAATATAGTATCACTAAACTTTATTTCGAT 29655825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 ATACATTTTTCACAACCAGTGAGACAATATTAATATAGTATCACTAAACTTTATTTCGAT 5152

 29655826 TTCATTAGCTCTTTCTGTTTTGAAACAAAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCCGGAGTGCAA 29655885
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 TTTATTAGCTCTTTCTGTTTTGAAACAAAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCCGGAGTGCAA 5212

 29655886 TGGCATGATGTCCACTCACTGCAACCTCCACCTCCCGAGTTCAAATGATTTTCATGCCTC 29655945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 TGGCATGATGTCCACTCACTGCAACCTCCACCTCCCGAGTTCAAATGATTTTCATGCCTC 5272

 29655946 AGCCTCCTGAATAGCTGTGACTACAGACACATGCCACCGTGCCTGGCTGATTTCTGTATT 29656005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5273 AGCCTCCTGAATAGCTGTGACTACAGACACATGCCACCGTGCCTGGCTGATTTCTGTATT 5332

 29656006 TTTAGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCTTACTCCTGACCTAAAG 29656065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 TTTAGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCTTACTCCTGACCTAAAG 5392

 29656066 TGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCA 29656125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 TGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCA 5452

 29656126 GCCAGGTTTCATTAGTTCTTTTAACTTCCTTTTTCTGTCACAGGATTTCATCGAGGATAT 29656185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5453 GCCAGGTTTCATTAGTTCTTTTAACTTCCTTTTTCTGTCACAGGATTTCATCGAGGATAT 5512

 29656186 CACATTGTATTTAGTCCTAATCATGTCTCCTTAAGGCTCCTCCAGGTTGACTTTGTTTTC 29656245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5513 CACATTGTATTTAGTCCTAATCATGTCTCCTTAAGGCTCCTCCAGGTTGACTTTGTTTTC 5572

 29656246 AATGACTGTCTTAGTATGTTGAGTATTACTATAACAGAATAACTTGAAACTGGGTAGTTT 29656305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5573 AATGACTGTCTTAGTATGTTGAGTATTACTATAACAGAATAACTTGAAACTGGGTAGTTT 5632

 29656306 ATAAAGAGAAGATGTTTATTTAGCTCATGATTTTGCAGGCTGGGAAGTTCAACAGGATAG 29656365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5633 ATAAAGAGAAGATGTTTATTTAGCTCATGATTTTGCAGGCTGGGAAGTTCAACAGGATAG 5692

 29656366 TGCTGGATCTGGCAAACTTCTGGTGAAGGCCAAATGTTAGGTCAAAACATTTTGGAGAAG 29656425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5693 TGCTGGATCTGGCAAACTTCTGGTGAAGGCCAAATGTTAGGTCAAAACATTTTGGAGAAG 5752

 29656426 GGGAAAAGTGAGTGGCATGTGCAAAAACATCACATGGGGAGACAGGGAAGCAAGAGAGAG 29656485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5753 GGGAAAAGTGAGTGGCATGTGCAAAAACATCACATGGGGAGACAGGGAAGCAAGAGAGAG 5812

 29656486 TCTAGGAAACCAAACTTGCTTTTATAACAACCTGCTTTTTGGTAACTAACCTAGCCCCAA 29656545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5813 TCTAGGAAACCAAACTTGCTTTTATAACAACCTGCTTTTTGGTAACTAACCTAGCCCCAA 5872

 29656546 CAGAGTAATAAATTACTCGCTCATGTGGGAGGACATTAATCTATTCATGAAGGATCTGCT 29656605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5873 CAGAGTAATAAATTACTCGCTCATGTGGGAGGACATTAATCTATTCATGAAGGATCTGCT 5932

 29656606 CCTGATGACCCAAACGCCTCCCACTAAGCCCCACCTCCAACACCACCACCACATTGAGAA 29656665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5933 CCTGATGACCCAAACGCCTCCCACTAAGCCCCACCTCCAACACCACCACCACATTGAGAA 5992

 29656666 CTTTTTTTTTTTTGCCTGAGGTTGGGAGTTTGAGACCAGCCTCACCAACATGGATAAACC 29656725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5993 CTTTTTTTTTTTTGCCTGAGGTTGGGAGTTTGAGACCAGCCTCACCAACATGGATAAACC 6052

 29656726 CTGTCTCTACTAAAAATAGAAAATTAGCCAGGTGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGT 29656785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6053 CTGTCTCTACTAAAAATAGAAAATTAGCCAGGTGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGT 6112

 29656786 TATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAAGTTGCAGTGAGC 29656845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6113 TATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAAGTTGCAGTGAGC 6172

 29656846 CAAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACT 29656891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6173 CAAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACT 6218

Alignment time is 4.6646 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    5628] =>      5628 nucs 'mol-32-3235-120034_5628'

Score:        5196
Aligned:      5634        nucs
Identic:      5586 ( 99%) nucs =>      4743 ( 99%)       843 ( 99%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29645643,29650419] EXCISED REGION [29651086,29651933]
 second seq =>  [       1,    4780] EXCISED REGION [    4781,    5628]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       666 nucs [29650420,29651085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29650420,29650423] to [29651086,29651089]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29645643 CAGTTACCCATGGTCAACCATGGTTCAAAAATATTAAATGAAAAATTCCGGAGGACAGGC 29645702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGTTACCCATGGTCAACCATGGTTCAAAAATATTAAATGAAAAATTCCGGAGGACAGGC 60

 29645703 ACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCTGAGGTAGGCAGATCATCTGA 29645762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCATTTTGGGAGGCTGAGGTAGGCAGATCATCTGA 120

 29645763 GGTCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATAC 29645822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGGTCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATAC 180

 29645823 AAAAAGAAAATAGCTGGGCATAGTGGCACACATCTGTAATCCCAGCAACTCAGGAGGCTG 29645882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAAAGAAAATAGCTGGGCATAGTGGCACACATCTGTAATCCCAGCAACTCAGGAGGCTG 240

 29645883 AGGCAGGAGAATCACTTGAACCCTGGAGGTGGACGTTGCCATGAGCCAAGACTGCGCCAC 29645942
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGACAGGAGAATCACTTGAACCCTGGAGGTGGACGTTGCCATGAGCCAAGACTGCGCCAC 300

 29645943 TGCACTCCAGCCTGGGACATAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAAATCCAGAGATAAAC 29646002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      301 TGCACTCCAGCCTGGGACATAGAGCGAGACTCCGTCTCAAAAAAAACTCCAGAGATAAAC 360

 29646003 AATTCCTAAGTTTTAAATTGCTTGACATTCTGAGTAGTGTGATGAAATCTTGTACCTTTT 29646062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTCCTAAGTTTTAAATTGCTTGACATTCTGAGTAGTGTGATGAAATCTTGTACCTTTT 420

 29646063 CTCTCTGGCCTGCCCAGGATGTGAATCATCCCTTTGACTAGCATATCCACACTGCAGACA 29646122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTCTGGCCTGCCCAGGATGTGAATCATCCCTTTGACTAGCATATCCACACTGCAGACA 480

 29646123 ATACCTGCCCATTAGTTCCTTAGTAGCTAGCCATCTCAGTTACCAGGTTGACTACTGTAG 29646182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      481 ATACCTGCCCATTAGTTCCTTAGTAGCTAGCCATCTCAGTTATCAGGTTGACTACTGTAG 540

 29646183 TATAGCAGTTGCCTGTGCTCAAGAATGCCTTATTTTACTTAATAATGACCCAAAAGCACA 29646242
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATAGCAGTTGCCTGTGCCCAAGAATGCCTTATTTTACTTAATAATGACCCAAAAGCACA 600

 29646243 AGAGTAGAGACGCTGGAAATTCAGATATGCAAAGAGAAGCCATAAAATAAAAAGGTAAAA 29646302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAGTAGAGACGCTGGAAATTCAGATATGCAAAGAGAAGCCATAAAATAAAAAGGTAAAA 660

 29646303 ATTCTTGTCTTAAGGAAAGAAAAAATAATCATATGCTGAGGTTGCTAAGATTTACAATAT 29646362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTCTTGTCTTAAGGAAAGAAAAAATAATCATATGCTGAGGTTGCTAAGATTTACAATAT 720

 29646363 AAATTATTTTGAGAGAGATACCACATTCATACAACTTTTATTACAATATATTGCTGTAAT 29646422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATTATTTTGAGAGAGATACCACATTCATACAACTTTTATTACAATATATTGCTGTAAT 780

 29646423 TGTTCTATCTTATTACTAGTTATTGTTGTCAATCTCTTACCATGCCTAATTTGTAAATTA 29646482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTTCTATCTTATTACTAGTTATTGTTGTCAATCTCTTACCATGCCTAATTTGTAAATTA 840

 29646483 AACTTTATCATTATTATGTATGTATAGAAAAAGAAAACCATAGTGTATACAGGGTTTGGT 29646542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACTTTATCATTATTATGTATGTATAGAAAAAGAAAACCATAGTGTATACAGGGTTTGGT 900

 29646543 ACTATTCATGGTTTCAAAGTATCCACTGGGGTGGGGCGCGGTGGATCACTTCAGGGCAGG 29646602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTATTCATGGTTTCAAAGTATCCACTGGGGTGGGGCGCGGTGGATCACTTCAGGGCAGG 960

 29646603 AATTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTGAAAATACAAAAATT 29646662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTGAAAATACAAAAATT 1020

 29646663 AGCTGGGCGTGGTGGCACGCTGTAGTCCCAGCTGCTCAGGATGCTGAGGCAGAATTACTT 29646722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCTGGGCGTGGTGGCACGCTGTAGTCCCAGCTGCTCAGGATGCTGAGGCAGAATTACTT 1080

 29646723 GAACCCGTGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTGTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGT 29646782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAACCCGTGAGGTGAAGGTTGCAGTGAGCCAAGACTGTGCCACTGTACTCCAGCCTGGGT 1140

 29646783 GACAGAGCGAGATTCTGCCTCAAACAACAACAAAAACAAAGTATCCACTAGAGCTCTTGG 29646842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GACAGAGCGAGATTCTGCCTCAAACAACAACAAAAACAAAGTATCCACTAGAGCTCTTGG 1200

 29646843 AACATATCACCTGTGGATAAGGGGAACCACTGTATATACAGATCTTTGTGAAGAATACTG 29646902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1201 AACATATCACCTGTGGATAAGGGGAACCACTGTATACACAGATCTTTGTGAAGAATACTG 1260

 29646903 CTAACAACCCAAGAGCAATCACTTATTCAGGGCTCACAATGAGCCCAGCACTGGAGTTCC 29646962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTAACAACCCAAGAGCAATCACTTATTCAGGGCTCACAATGAGCCCAGCACTGGAGTTCC 1320

 29646963 CTGCTCATCCTTGGAAATTTCCTGCTCAGATGCAAACATAGCTGAACTCTCACCTTTTCC 29647022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGCTCATCCTTGGAAATTTCCTGCTCAGATGCAAACATAGCTGAACTCTCACCTTTTCC 1380

 29647023 TGCTGACAGCCACTCACCCACATCTCCCTTACTAGAGATAGAAAGAAAAGAATAAAGACC 29647082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCTGACAGCCACTCACCCACATCTCCCTTACTAGAGATAGAAAGAAAAGAATAAAGACC 1440

 29647083 AAAAAACCCTGTTGACTATTTTTTCCTTTCACTTTTTGAGAAGTGTTAATAGAACTGAAA 29647142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAAAAACCCTGTTGACTATTTTTTCCTTTCACTTTTTGAGAAGTGTTAATAGAACTGAAA 1500

 29647143 ATACCAGCAAGGAAAAACGCCCTCGAGGAATAGAGTTAATTGGATCTCCAAAATGTTGTC 29647202
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATACCATCAAGGAAAAACGCCCTCGAGGAATAGAGTTAATTGGATCTCCAAAATGTTGTC 1560

 29647203 ATGAAAGGTGCATTCCTGGGATATGAATTTGATTTCCTTCCTTTCTTCCTCTCTCTTTCT 29647262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGAAAGGTGCATTCCTGGGATATGAATTTGATTTCCTTCCTTTCTTCCTCTCTCTTTCT 1620

 29647263 TTCCTCTCTCTCCCTTTCCTTTCCTGTCTTTCAAAACCATTCGCACTCCTTTTATGAGGC 29647322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCCTCTCTCTCCCTTTCCTTTCCTGTCTTTCAAAACCATTCGCACTCCTTTTATGAGGC 1680

 29647323 ATGCAGATCTTGGATTATTCTTCCACTTTCCAGCCAACTGCACTTCAAAACAGCCTTAAT 29647382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATGCAGATCTTGGATTATTCTTCCACTTTCCAGCCAACTGCACTTCAAAACAGCCTTAAT 1740

 29647383 AAGGCTGGGCACGGTGGCTCAGCCTGTAATCCCAACACTTGGGGAGGCCGAGGCGGGCGG 29647442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGGCTGGGCACGGTGGCTCAGCCTGTAATCCCAACACTTGGGGAGGCCGAGGCGGGCGG 1800

 29647443 ATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGACCTCGTCTCTACTAAA 29647502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGACCTCGTCTCTACTAAA 1860

 29647503 AATACAAAATTATCCCGGCGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCGTAGCTACTAGGGAGGCTG 29647562
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATACAAAATTAACCCGGCGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCGTAGCTACTAGGGAGGCTG 1920

 29647563 AGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCGGAGATCGCGCCAT 29647622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGGCAGGAGAATCGCTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCGGAGATCGCGCCAT 1980

 29647623 TGCACTCCAGCCAGGGAAATGAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAA 29647682
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGCACACCAGCCAGGGAAATGAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAA 2040

 29647683 CAAACAAAAAAAAACGCCTTAGTAACAGTGCCCTCAAGAACCTGGCCTTCCAGTTCTCTG 29647742
          .||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2041 AAAA-AAAAAAAAACGCCTTAGTAACAGTGCCCTCAAGAACCTGACCTTCCAGTTCTCTG 2099

 29647743 GCAGAGAAGACCTACTGCTGCCGCTAGTCCTCAAGATGGCATTTGCTGGAGGCGGTAGGC 29647802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GCAGAGAAGACCTACTGCTGCCGCTAGTCCTCAAGATGGCATTTGCTGGAGGCGGTAGGC 2159

 29647803 AGAGGCCCTAAGTGTGGATTCTAACCCCCGTGGGGACTGAATCTCTGCGGCTGTTGCTTG 29647862
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AGAGGCCCTAAGTGTGGTTTCTAACCCCCGTGGGGACTGAATCTCTGCGGCTGTTGCTTG 2219

 29647863 CCCAGGCACGTTTGCCTCCCATGAACTTCCTTCATCCACAGGGCCCCAAACCTCATGCCG 29647922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CCCAGGCACGTTTGCCTCCCATGAACTTCCTTCATCCACAGGGCCCCAAACCTCATGCCG 2279

 29647923 GCGGGAGGAGGAAGGAGACTGGGCATAACTCATCAGACTTTCGACTGTAAGAGCTGGAGG 29647982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 GCGGGAGGAGGAAGGAGACTGGGCATAACTCATCAGACTTTCGACTGTAAGAGCTGGAGG 2339

 29647983 CCGCCTGCGGGCTTATCTGTACCCGGGCCTGTCCCCACCCTTCCAGAATGTAAATCCTCT 29648042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CCGCCTGCGGGCTTATCTGTACCCGGGCCTGTCCCCACCCTTCCAGAATGTAAATCCTCT 2399

 29648043 GAGGGAATGTGTCGTCGCCATCTTTCAGTCCTTTGAGTGCACCCAGTCTCTCTCCAACCC 29648102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 GAGGGAATGTGTCGTCGCCATCTTTCAGTCCTTTGAGTGCACCCAGTCTCTCTCCAACCC 2459

 29648103 AAAACCCTTTATCCACAGCAATTCTGAGAATGATGAGAATCCCCCTCACCCCTCACACCG 29648162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 AAAACCCTTTATCCACAGCAATTCTGAGAATGATGAGAATCCCCCTCACCCCTCACACCG 2519

 29648163 CAAACAGTTGCAATGCTTAGTGGGATTCACCCTTGTCGTCACCAACCCTGCTACTCCAGC 29648222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CAAACAGTTGCAATGCTTAGTGGGATTCACCCTTGTCGTCACCAACCCTGCTACTCCAGC 2579

 29648223 CACGTGAGTTTTCCGCCTGTCAGCCAAGCAAAATGGCCTTCCTGCAGTCGCACGGCCCTT 29648282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CACGTGAGTTTTCCGCCTGTCAGCCAAGCAAAATGGCCTTCCTGCAGTCGCACGGCCCTT 2639

 29648283 TGGTCTCTGCTCAGGGCTTCGGGGACCCTTTCCAGCCATTGCCCTGCACCTACCCACCAG 29648342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TGGTCTCTGCTCAGGGCTTCGGGGACCCTTTCCAGCCATTGCCCTGCACCTACCCACCAG 2699

 29648343 ATCGCCGCCCTGGTGGGCGCTCCTGGCCCTGTCCTCCGCGCTTAGTTTGTCATTGGGCGC 29648402
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2700 ATCGCCGCCCTGGTGGGCGCTCCTGGCCCTGTCCTCCGCGCTTAGTTTGTCATTGCGCGC 2759

 29648403 CCAGATCCGGAACCCCAGCCTCGAAGCTTCCGGTGGCCGGGAACAAAGCCGGTTTTGCTC 29648462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CCAGATCCGGAACCCCAGCCTCGAAGCTTCCGGTGGCCGGGAACAAAGCCGGTTTTGCTC 2819

 29648463 ACTGTCGCCTGGCAAAGCAGGCGCTTGTTAGCACCCACTGAATGCGCTTATGTGCTCAGA 29648522
          |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2820 ACTGTTGCCTGGCAAAGCAGGCGCTTGTTAGCACCCACTGAATACGCTTATGTGCTCAGA 2879

 29648523 AACGGTCCCATTGGTTGGGACTACCTTCCCCGATGCCCATCCGCCCAGAATCTTCCTTCT 29648582
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2880 AACGGTCCCATTGGTTGGGACTACCTTCCCCGATGCCCATCTGCCCAGAATCTTCCTTCT 2939

 29648583 GGGATGCCGACTTTTTCAACACGTGCCAGGAGCCCTTCCTCGGCCCGGAATCCCCAGAGT 29648642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GGGATGCCGACTTTTTCAACACGTGCCAGGAGCCCTTCCTCGGCCCGGAATCCCCAGAGT 2999

 29648643 GCCCACAGTGGACAGGGCACCTGGATACACCCCAGACTAACCCACGTTTCCCCGGAGGAC 29648702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 GCCCACAGTGGACAGGGCACCTGGATACACCCCAGACTAACCCACGTTTCCCCGGAGGAC 3059

 29648703 CCCAGAGGTTGGAAGCCCCTCCAAGATTAGGGGCGCAGTGCTCCCCTGGCCTGCGGAAGA 29648762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CCCAGAGGTTGGAAGCCCCTCCAAGATTAGGGGCGCAGTGCTCCCCTGGCCTGCGGAAGA 3119

 29648763 GTCAGAGGAGTGGGGACAACATCCAACATCAGCCTCTACTACCGCTAGCGCGACTCCCCG 29648822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GTCAGAGGAGTGGGGACAACATCCAACATCAGCCTCTACTACCGCTAGCGCGACTCCCCG 3179

 29648823 CCGCCGCTCTACTCACCTGACGCGCGCAGTGGACCGCGATTTAGGGGCACAGGGTCTCCC 29648882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CCGCCGCTCTACTCACCTGACGCGCGCAGTGGACCGCGATTTAGGGGCACAGGGTCTCCC 3239

 29648883 GGGGACCAGCGGCTGGAGCGCTCCGGCCGAGCACCCGCAGTCCCGGCGCCGCGGCCCCAC 29648942
          ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|
     3240 GGGGACCAGCGGGTGGAGCGCTCCGGCCGAGCACCCGCAGTCCCGGCGCCGTGGCCCCGC 3299

 29648943 CCCGGCCCCGCCCTCTTCCGCTCCCTCCCAGTCATCAGGCCACCGAGAATGTG--CCCCT 29649000
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
     3300 CCCGGCCCCGCCCTCTTCCGCTCCCTCCCAGTCATCAGGCCACCGAGAATGTGTGCCCCT 3359

 29649001 TGACCCAGATGAGAGGGTGAGCCCGCCAAGGTCAAGCTTCCCATCCTAAGAATCACAGAC 29649060
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3360 TGACCCAGATGAGAGGGTGAGCCCGCCAAGGTCAAGCTTCCCATCCTAAGAATCATAGAC 3419

 29649061 AGCCCGGCCATGCACCACCACTTCGAGCCTCCGACCAACTGATAGCTGCTGGTCCCAAGT 29649120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3420 AGCCCGGCCATGCACCACCACTTCGAGCCTCCGACCAACTGATAACTGCTGGTCCCAAGT 3479

 29649121 AGCGCTAGGATTTTCGCTTTCCCAGTCTTAATTGACTCTAAAAGAAGAAGAAAAAAAAGC 29649180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 AGCGCTAGGATTTTCGCTTTCCCAGTCTTAATTGACTCTAAAAGAAGAAGAAAAAAAAGC 3539

 29649181 CTGGGCGCGATTGCTCACACCTGTAATTCCGGCACTTTGGGAGGTCGAGGCTGGTGAATT 29649240
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3540 CTGGGCGCGGTTGCTCACACCTGTAATTCCGGCACTTTAGGAGGTCGAGGCTGGTGAATT 3599

 29649241 ACCTGAAGTCAGGAGTTCAAGACCACCCTGGCCAACATGGCGAAACCTCGTCTCTACTAA 29649300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ACCTGAAGTCAGGAGTTCAAGACCACCCTGGCCAACATGGCGAAACCTCGTCTCTACTAA 3659

 29649301 AAGTACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAACCCCAGCTACTCAGGAGGC 29649360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 AAGTACAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAACCCCAGCTACTCAGGAGGC 3719

 29649361 TGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCCAGATCACGCC 29649420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TGAGGCAGGAGAATCGCTTGAATCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCCAGATCACGCC 3779

 29649421 ACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 29649480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 ACTGCACTCCAGCCTGGGCAAAAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 3839

 29649481 AAAAAG-------AGGAAAGTATTTACGAAAAAAAAAAAAAAAGACCAAAGTATTATGAT 29649533
          |||||        ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
     3840 AAAAA-AAAAAAAAGGAAAGTATTTACGAAAAAAAAAAAAAA-GACCAAAGTATTATGAT 3897

 29649534 TAAAACACGCGGCTGAGAGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGA 29649593
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 TAAAACACGCGGCCGAGAGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGA 3957

 29649594 GGGGGCGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGACCTCAGCGTGGCCAATATGGCGAAACCTT 29649653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 GGGGGCGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGACCTCAGCGTGGCCAATATGGCGAAACCTT 4017

 29649654 GTCCCTATTAAAAATACAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCCCAGCT 29649713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 GTCCCTATTAAAAATACAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCCCAGCT 4077

 29649714 ACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTGAATTA 29649773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 ACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTGAATTA 4137

 29649774 CTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTGGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCTAACAC 29649833
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 CTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTAGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCTAACAC 4197

 29649834 TTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGGCAA 29649893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 TTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGGCAA 4257

 29649894 CATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTTGTGGTACAT 29649953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4258 CATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTGGTGGTACAT 4317

 29649954 GCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTT 29650013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4318 GCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGTTT 4377

 29650014 GAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCC 29650073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 GAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCC 4437

 29650074 CTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATT 29650133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 CTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATT 4497

 29650134 CATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGT 29650193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 CATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGT 4557

 29650194 CTCGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCCAA 29650253
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 CTTGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCCAA 4617

 29650254 CTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTAATTTTTTTTTTTTT 29650313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 CTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTAATTTTTTTTTTTTT 4677

 29650314 TTTTTTTTTTTTAGTACACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCT 29650373
          |||||||||   ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 TTTTTTTTT---AGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCT 4734

 29650374 GACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 29650419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4735 GACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 4780

EXCISED REGION

 29651086 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 29651145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 4840

 29651146 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGA 29651205
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4841 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAGCCACATGCCAGCACGTCCGA 4900

 29651206 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 29651265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 4960

 29651266 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGT 29651325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|
     4961 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAAGCAT 5020

 29651326 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 29651385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 5080

 29651386 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 29651445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 5140

 29651446 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 29651505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 5200

 29651506 GAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 29651565
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 GAGTTGAGACGTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 5260

 29651566 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 29651625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 5320

 29651626 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATC 29651685
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5321 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATT 5380

 29651686 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 29651745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 5440

 29651746 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 29651805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 5500

 29651806 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 29651865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 5560

 29651866 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 29651925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 5620

 29651926 GGTAATGG 29651933
          ||||||||
     5621 GGTAATGG 5628

Alignment time is 4.00982 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    6864] =>      6864 nucs 'mol-32-331c-037987_6864'

Score:        6455
Aligned:      6887        nucs
Identic:      6833 ( 99%) nucs =>       747 ( 99%)      6086 ( 99%)
Gaps:           23 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29649664,29650419] EXCISED REGION [29651086,29657216]
 second seq =>  [       1,     752] EXCISED REGION [     753,    6864]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       666 nucs [29650420,29651085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29650420,29650423] to [29651086,29651089]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29649664 AAAATACAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGA 29649723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAATACAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGA 60

 29649724 CATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTGAATTACTATAGTACT 29649783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTGAATTACTATAGTACT 120

 29649784 AAAGAATGTCTAGGCTGGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGC 29649843
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGAATGTCTAGGCTAGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGC 180

 29649844 TGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGGCAACATAGCAAGA 29649903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGGCAACATAGCAAGA 240

 29649904 CCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTTGTGGTACATGCCTTTAGTC 29649963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      241 CCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTGGTGGTACATGCCTTTAGTC 300

 29649964 CTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTTGAGGTTACAG 29650023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      301 CTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGTTACAG 360

 29650024 TGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAA 29650083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAA 420

 29650084 ACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGAT 29650143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGAT 480

 29650144 GAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGT 29650203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      481 GAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGT 540

 29650204 TGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTA 29650263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTA 600

 29650264 GCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 29650323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
      601 GCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-- 658

 29650324 TTAGTACACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGA 29650383
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 --AGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGA 716

 29650384 TCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 29650419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 TCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 752

EXCISED REGION

 29651086 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 29651145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      753 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 812

 29651146 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGA 29651205
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      813 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAGCCACATGCCAGCACGTCCGA 872

 29651206 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 29651265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      873 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 932

 29651266 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGT 29651325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|
      933 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAAGCAT 992

 29651326 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 29651385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      993 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 1052

 29651386 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 29651445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1053 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 1112

 29651446 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 29651505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 1172

 29651506 GAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 29651565
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 GAGTTGAGACGTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 1232

 29651566 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 29651625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 1292

 29651626 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATC 29651685
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1293 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATT 1352

 29651686 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 29651745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 1412

 29651746 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 29651805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 1472

 29651806 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 29651865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 1532

 29651866 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 29651925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 1592

 29651926 GGTAATGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 29651985
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 GGTAATGGACGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 1652

 29651986 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 29652045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 1712

 29652046 GGCCAAAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 29652105
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 GGCCAAAATTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 1772

 29652106 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 29652165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 1832

 29652166 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 29652225
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1833 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCGATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 1892

 29652226 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 29652285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 1952

 29652286 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 29652345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 2012

 29652346 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 29652405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 2072

 29652406 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 29652465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 2132

 29652466 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 29652525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 2192

 29652526 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGAT 29652585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2193 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCATTGTATGAT 2252

 29652586 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 29652645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 2312

 29652646 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 29652705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 2372

 29652706 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 29652765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 2432

 29652766 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 29652825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 2492

 29652826 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 29652885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 2552

 29652886 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 29652945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 2612

 29652946 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 29653005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 2672

 29653006 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 29653065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 2732

 29653066 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 29653125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 2792

 29653126 TATAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 29653185
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 TACAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 2852

 29653186 ATCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 29653245
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 GTCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 2912

 29653246 CTGACACAGCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 29653305
          |||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 CTGACACAGCTGTAATTATCATCCATGTGAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 2972

 29653306 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 29653365
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTGATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 3032

 29653366 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 29653425
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3033 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGTTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 3092

 29653426 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 29653485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 3152

 29653486 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 29653545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 3212

 29653546 CAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTC 29653605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 CAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTC 3272

 29653606 GCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCG 29653665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 GCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCG 3332

 29653666 TGGATTTGGGAAACACTTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGCGCCCCCTTGGGT 29653725
          ||||            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3333 TGGA------------TTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGTGCCCCCTTGGGT 3380

 29653726 ACGTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGG 29653785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 ACGTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGG 3440

 29653786 AGGAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGCTGACCACACACAAGTGCCGAT 29653845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3441 AGGAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGGTGACCACACACAAGTGCCGAT 3500

 29653846 GTTCTGCTCTCTTGGATTCTGATTGAGCAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAAC 29653905
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 GTTCTGCTCTCTTGGATTCTGATTGAGTAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAAC 3560

 29653906 TGGACAGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCCC 29653965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3561 TGGACAGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCTC 3620

 29653966 GAAAAGTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAA 29654025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3621 GAAAAGTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAA 3680

 29654026 TATCCTTTTAAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCA 29654085
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3681 TATCCTTTTGAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCA 3740

 29654086 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCA 29654145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCA 3800

 29654146 ATATGGAGAAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTC 29654205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 ATATGGAGAAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTC 3860

 29654206 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGA 29654265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGA 3920

 29654266 GGTTGCGGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTC 29654325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3921 GGTTGCGGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTC 3980

 29654326 CGTCTCAAAAATCAAATCAAATCAAATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAG 29654385
          ||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3981 CGTCTCAA-----AAATCAAATCAAATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAG 4035

 29654386 AAAAGTTGCAAAGATAGTACATAGTTCTCCTATGTTCCACATTCAGTTTCCTCTATTATT 29654445
          |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||||
     4036 AAAAGTTGCAAAGATAGTACATAATTCTCGTATGTTCCACATTCAGTTTCCCCTATTATT 4095

 29654446 AATGTCTTATTTTATTATACATTTGTGACAGGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTAC 29654505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 AATGTCTTATTTTATTATACATTTGTGACAGGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTAC 4155

 29654506 TAACTCCTATTTTATTTGGATTTTATTCTTTTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGAT 29654565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4156 TAACTCCTATTTTATTTGGATTTTATTCTTTTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGAT 4215

 29654566 CCCATCCAGGATACATTACATTTAGTCCCCTTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGT 29654625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4216 CCCATCCAGGATACATTACATTTAGTCCCCTTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGT 4275

 29654626 GACAATTTCTCAGACCTCGTTTTTGATAATTTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGC 29654685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4276 GACAATTTCTCAGACCTCGTTTTTGATAATTTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGC 4335

 29654686 ATATTGTAAAATGTCCCTTAATTTGAGTGTGGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGA 29654745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4336 ATATTGTAAAATGTCCCTTAATTTGAGTGTGGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGA 4395

 29654746 AGAGCACAGAGATGAAATGCAATACTCTCAATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCA 29654805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4396 AGAGCACAGAGATGAAATGCAATACTCTCAATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCA 4455

 29654806 GTTGATGTATCAAATGATTATGTTAACCTCCATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGT 29654865
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4456 GTTGATTTATCAAATGATTATGTTAACCTCCATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGT 4515

 29654866 CTATAATATATAATTTTTAATAGCATCCCAAAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAA 29654925
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4516 CTATAATATATAATTTTTAATAGCAGCCCAAAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAA 4575

 29654926 GAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGCCCAAGGAGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAA 29654985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4576 GAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGCCCAAGGAGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAA 4635

 29654986 AAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCTCAGGTCTATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGG 29655045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4636 AAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCTCAGGTCTATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGG 4695

 29655046 TGTCTCAGACACAAATTGAGCAATCAGAAAAGGCTGGGATGTCTGTGGTCTGAGTTGGGC 29655105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4696 TGTCTCAGACACAAATTGAGCAATCAGAAAAGGCTGGGATGTCTGTGGTCTGAGTTGGGC 4755

 29655106 AGAGGTGGCTGACCCTGGAACCTGACATCAATAGGGGGATGAAGACAATTTCTGAGCAGC 29655165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4756 AGAGGTGGCTGACCCTGGAACCTGACATCAATAGGGGGATGAAGACAATTTCTGAGCAGC 4815

 29655166 CCCAGTAGTCAGAGGACAAGAGAACTCTGGAGCCCCGCACTGTCTCTGAGGTTCCAATCT 29655225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4816 CCCAGTAGTCAGAGGACAAGAGAACTCTGGAGCCCCGCACTGTCTCTGAGGTTCCAATCT 4875

 29655226 TTTCTCCCTCTTCCCAGCCCCTTGATAGGAAACCCTGGGAAAACTAAAAAGTATACTGTT 29655285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4876 TTTCTCCCTCTTCCCAGCCCCTTGATAGGAAACCCTGGGAAAACTAAAAAGTATACTGTT 4935

 29655286 TTTTCTTTAACTCCCTATTCCTTTCCTCTTCTGAGGGTTGTTGTTGTTGTTTTTTTTTAA 29655345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     4936 TTTTCTTTAACTCCCTATTCCTTTCCTCTTCTGAGGGTTGTTGTTGTTG-TTTTTTTTAA 4994

 29655346 TAAACTTATTAATTTTAGAATACTTTTAGATTACACAAAAGTTGAAAAGATAATACATAG 29655405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4995 TAAACTTATTAATTTTAGAATACTTTTAGATTACACAAAAGTTGAAAAGATAATACATAG 5054

 29655406 TTCTCACATATGTCACACTCAGCTCCCCATTGTTAACATATTTTTTTTTTTTTTGAGGGA 29655465
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     5055 TTCTCACATATGTCACACTCAGCTCCCCATTGTTAACATA-TTTTTTTTTTTTTGAGGGA 5113

 29655466 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATTTCGGCTCACTGCAACCTCT 29655525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATTTCGGCTCACTGCAACCTCT 5173

 29655526 GCCTCCGGGTTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGATTACAGGTG 29655585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 GCCTCCGGGTTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGATTACAGGTG 5233

 29655586 CGCGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTGTAGTTTTAGTAAAGACAGGGTTCCACCACATTG 29655645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 CGCGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTGTAGTTTTAGTAAAGACAGGGTTCCACCACATTG 5293

 29655646 GCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTACCCGCTCAGCTTCCCAAAGTGC 29655705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 GCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTACCCGCTCAGCTTCCCAAAGTGC 5353

 29655706 TGGCATTACAGGTGTGTGCCACTGCCCCCAGCCCCATTGTTAACATCTTATATCACTATT 29655765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 TGGCATTACAGGTGTGTGCCACTGCCCCCAGCCCCATTGTTAACATCTTATATCACTATT 5413

 29655766 ATACATTTTTCACAACCAGTGAGACAATATTAATATAGTATCACTAAACTTTATTTCGAT 29655825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 ATACATTTTTCACAACCAGTGAGACAATATTAATATAGTATCACTAAACTTTATTTCGAT 5473

 29655826 TTCATTAGCTCTTTCTGTTTTGAAACAAAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCCGGAGTGCAA 29655885
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 TTTATTAGCTCTTTCTGTTTTGAAACAAAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCCGGAGTGCAA 5533

 29655886 TGGCATGATGTCCACTCACTGCAACCTCCACCTCCCGAGTTCAAATGATTTTCATGCCTC 29655945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 TGGCATGATGTCCACTCACTGCAACCTCCACCTCCCGAGTTCAAATGATTTTCATGCCTC 5593

 29655946 AGCCTCCTGAATAGCTGTGACTACAGACACATGCCACCGTGCCTGGCTGATTTCTGTATT 29656005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 AGCCTCCTGAATAGCTGTGACTACAGACACATGCCACCGTGCCTGGCTGATTTCTGTATT 5653

 29656006 TTTAGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCTTACTCCTGACCTAAAG 29656065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 TTTAGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCTTACTCCTGACCTAAAG 5713

 29656066 TGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCA 29656125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 TGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCA 5773

 29656126 GCCAGGTTTCATTAGTTCTTTTAACTTCCTTTTTCTGTCACAGGATTTCATCGAGGATAT 29656185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 GCCAGGTTTCATTAGTTCTTTTAACTTCCTTTTTCTGTCACAGGATTTCATCGAGGATAT 5833

 29656186 CACATTGTATTTAGTCCTAATCATGTCTCCTTAAGGCTCCTCCAGGTTGACTTTGTTTTC 29656245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 CACATTGTATTTAGTCCTAATCATGTCTCCTTAAGGCTCCTCCAGGTTGACTTTGTTTTC 5893

 29656246 AATGACTGTCTTAGTATGTTGAGTATTACTATAACAGAATAACTTGAAACTGGGTAGTTT 29656305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5894 AATGACTGTCTTAGTATGTTGAGTATTACTATAACAGAATAACTTGAAACTGGGTAGTTT 5953

 29656306 ATAAAGAGAAGATGTTTATTTAGCTCATGATTTTGCAGGCTGGGAAGTTCAACAGGATAG 29656365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5954 ATAAAGAGAAGATGTTTATTTAGCTCATGATTTTGCAGGCTGGGAAGTTCAACAGGATAG 6013

 29656366 TGCTGGATCTGGCAAACTTCTGGTGAAGGCCAAATGTTAGGTCAAAACATTTTGGAGAAG 29656425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6014 TGCTGGATCTGGCAAACTTCTGGTGAAGGCCAAATGTTAGGTCAAAACATTTTGGAGAAG 6073

 29656426 GGGAAAAGTGAGTGGCATGTGCAAAAACATCACATGGGGAGACAGGGAAGCAAGAGAGAG 29656485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6074 GGGAAAAGTGAGTGGCATGTGCAAAAACATCACATGGGGAGACAGGGAAGCAAGAGAGAG 6133

 29656486 TCTAGGAAACCAAACTTGCTTTTATAACAACCTGCTTTTTGGTAACTAACCTAGCCCCAA 29656545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6134 TCTAGGAAACCAAACTTGCTTTTATAACAACCTGCTTTTTGGTAACTAACCTAGCCCCAA 6193

 29656546 CAGAGTAATAAATTACTCGCTCATGTGGGAGGACATTAATCTATTCATGAAGGATCTGCT 29656605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6194 CAGAGTAATAAATTACTCGCTCATGTGGGAGGACATTAATCTATTCATGAAGGATCTGCT 6253

 29656606 CCTGATGACCCAAACGCCTCCCACTAAGCCCCACCTCCAACACCACCACCACATTGAGAA 29656665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6254 CCTGATGACCCAAACGCCTCCCACTAAGCCCCACCTCCAACACCACCACCACATTGAGAA 6313

 29656666 CTTTTTTTTTTTTGCCTGAGGTTGGGAGTTTGAGACCAGCCTCACCAACATGGATAAACC 29656725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6314 CTTTTTTTTTTTTGCCTGAGGTTGGGAGTTTGAGACCAGCCTCACCAACATGGATAAACC 6373

 29656726 CTGTCTCTACTAAAAATAGAAAATTAGCCAGGTGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGT 29656785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6374 CTGTCTCTACTAAAAATAGAAAATTAGCCAGGTGTGATGGCACATGCCTGTAATCCCAGT 6433

 29656786 TATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAAGTTGCAGTGAGC 29656845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6434 TATTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCCGGGAGGTGGAAGTTGCAGTGAGC 6493

 29656846 CAAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAGAAA 29656905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6494 CAAGATCATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGTGAAACTCTGTCTCAAAGAAA 6553

 29656906 AAAAAAAAAGAGTAAACAAAATTTAATTTTCCTAATGGAAAAAATTATGGTGCATTCTAT 29656965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6554 AAAAAAAAAGAGTAAACAAAATTTAATTTTCCTAATGGAAAAAATTATGGTGCATTCTAT 6613

 29656966 AACAATAGAGGACTCACAGAAAACTTTGCAGGTAGATATATCAATAGAGCAATGAAAACA 29657025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6614 AACAATAGAGGACTCACAGAAAACTTTGCAGGTAGATATATCAATAGAGCAATGAAAACA 6673

 29657026 AAGGTATGTAAGTAGTAAATAGAAACTTCAGAGTAAATAGGTAAGAATTCCACAAAACTC 29657085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6674 AAGGTATGTAAGTAGTAAATAGAAACTTCAGAGTAAATAGGTAAGAATTCCACAAAACTC 6733

 29657086 AATGTACTGAAGGTTCATTTTACTCTCTAAAGGAGGAAGAACAGTCGTCTTGATGGGTGT 29657145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6734 AATGTACTGAAGGTTCATTTTACTCTCTAAAGGAGGAAGAACAGTCGTCTTGATGGGTGT 6793

 29657146 GTTTAAGGGGCAATGATTGTGATGGAGTCTCAAATATTTCCTGACAGATTTTCTGATGTG 29657205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6794 GTTTAAGGGGCAATGATTGTGATGGAGTCTCAAATATTTCCTGACAGATTTTCTGATGTG 6853

 29657206 TAACAATTTTC 29657216
          |||||||||||
     6854 TAACAATTTTC 6864

Alignment time is 4.83525 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    8245] =>      8245 nucs 'mol-32-3395-013867_8245'

Score:        7857
Aligned:      8256        nucs
Identic:      8214 ( 99%) nucs =>       464 ( 99%)      7750 ( 99%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29647217,29647683] EXCISED REGION [29647691,29655476]
 second seq =>  [       1,     467] EXCISED REGION [     468,    8245]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [29647684,29647690]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [29647684,29647686] to [29647691,29647693]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [29647684,29647686] to [29647688,29647690]
 second seq =>         0 nucs

 29647217 CCTGGGATATGAATTTGATTTCCTTCCTTTCTTCCTCTCTCTTTCTTTCCTCTCTCTCCC 29647276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGGGATATGAATTTGATTTCCTTCCTTTCTTCCTCTCTCTTTCTTTCCTCTCTCTCCC 60

 29647277 TTTCCTTTCCTGTCTTTCAAAACCATTCGCACTCCTTTTATGAGGCATGCAGATCTTGGA 29647336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTCCTTTCCTGTCTTTCAAAACCATTCGCACTCCTTTTATGAGGCATGCAGATCTTGGA 120

 29647337 TTATTCTTCCACTTTCCAGCCAACTGCACTTCAAAACAGCCTTAATAAGGCTGGGCACGG 29647396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTATTCTTCCACTTTCCAGCCAACTGCACTTCAAAACAGCCTTAATAAGGCTGGGCACGG 180

 29647397 TGGCTCAGCCTGTAATCCCAACACTTGGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCA 29647456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGCTCAGCCTGTAATCCCAACACTTGGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCA 240

 29647457 GGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGACCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTATC 29647516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGACCTCGTCTCTACTAAAAATACAAAATTATC 300

 29647517 CCGGCGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCGTAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCG 29647576
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCGGCGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCGCAGCTACTAGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCG 360

 29647577 CTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCGGAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCAG 29647636
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      361 CTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCGGAGATCGCGCCATTGCACACCAGCCAG 420

 29647637 GGAAATGAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAC 29647683
          |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAAACGAGAGTGAAACTCCGTCTCAAAAACAAACAAACAAACAAAC 467

EXCISED REGION

 29647691 AAAAAACGCCTTAGTAACAGTGCCCTCAAGAACCTGGCCTTCCAGTTCTCTGGCAGAGAA 29647750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      468 AAAAAACGCCTTAGTAACAGTGCCCTCAAGAACCTGGCCTTCCAGTTCTCTGGCAGAGAA 527

 29647751 GACCTACTGCTGCCGCTAGTCCTCAAGATGGCATTTGCTGGAGGCGGTAGGCAGAGGCCC 29647810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      528 GACCTACTGCTGCCGCTAGTCCTCAAGATGGCATTTGCTGGAGGCGGTAGGCAGAGGCCC 587

 29647811 TAAGTGTGGATTCTAACCCCCGTGGGGACTGAATCTCTGCGGCTGTTGCTTGCCCAGGCA 29647870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      588 TAAGTGTGGATTCTAACCCCCGTGGGGACTGAATCTCTGCGGCTGTTGCTTGCCCAGGCA 647

 29647871 CGTTTGCCTCCCATGAACTTCCTTCATCCACAGGGCCCCAAACCTCATGCCGGCGGGAGG 29647930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      648 CGTTTGCCTCCCATGAACTTCCTTCATCCACAGGGCCCCAAACCTCATGCCGGCGGGAGG 707

 29647931 AGGAAGGAGACTGGGCATAACTCATCAGACTTTCGACTGTAAGAGCTGGAGGCCGCCTGC 29647990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      708 AGGAAGGAGACTGGGCATAACTCATCAGACTTTCGACTGTAAGAGCTGGAGGCCGCCTGC 767

 29647991 GGGCTTATCTGTACCCGGGCCTGTCCCCACCCTTCCAGAATGTAAATCCTCTGAGGGAAT 29648050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      768 GGGCTTATCTGTACCCGGGCCTGTCCCCACCCTTCCAGAATGTAAATCCTCTGAGGGAAT 827

 29648051 GTGTCGTCGCCATCTTTCAGTCCTTTGAGTGCACCCAGTCTCTCTCCAACCCAAAACCCT 29648110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      828 GTGTCGTCGCCATCTTTCAGTCCTTTGAGTGCACCCAGTCTCTCTCCAACCCAAAACCCT 887

 29648111 TTATCCACAGCAATTCTGAGAATGATGAGAATCCCCCTCACCCCTCACACCGCAAACAGT 29648170
          ||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      888 TTATCCACGGCAATTGTGAGAATGATAAGAATCCCCCTCACCCCTCACACCGCAAACAGT 947

 29648171 TGCAATGCTTAGTGGGATTCACCCTTGTCGTCACCAACCCTGCTACTCCAGCCACGTGAG 29648230
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      948 TGCAATGCTTAGTGGGATTCACCCTTGTTGTCACCAACCCTGCTACTCCAGCCACGTGAG 1007

 29648231 TTTTCCGCCTGTCAGCCAAGCAAAATGGCCTTCCTGCAGTCGCACGGCCCTTTGGTCTCT 29648290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1008 TTTTCCGCCTGTCAGCCAAGCAAAATGGCCTTCCTGCAGTCGCACGGCCCTTTGGTCTCT 1067

 29648291 GCTCAGGGCTTCGGGGACCCTTTCCAGCCATTGCCCTGCACCTACCCACCAGATCGCCGC 29648350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1068 GCTCAGGGCTTCGGGGACCCTTTCCAGCCATTGCCCTGCACCTACCCACCAGATCGCCGC 1127

 29648351 CCTGGTGGGCGCTCCTGGCCCTGTCCTCCGCGCTTAGTTTGTCATTGGGCGCCCAGATCC 29648410
          ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1128 CCTGGTGGGCGCTCCTGGCCCTGTCCCCCGCGCTTAGTTTGTCATTGCGCGCCCAGATCC 1187

 29648411 GGAACCCCAGCCTCGAAGCTTCCGGTGGCCGGGAACAAAGCCGGTTTTGCTCACTGTCGC 29648470
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1188 GGAACCCCAGCCTCGAAGCTTCCGGTGGCCGGGAACAAAGCCGGTTTTGCTCACTGTTGC 1247

 29648471 CTGGCAAAGCAGGCGCTTGTTAGCACCCACTGAATGCGCTTATGTGCTCAGAAACGGTCC 29648530
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1248 CTGGCAAAGCAGGCGCTTGTTAGCACCCACTGAATACGCTTATGTGCTCAGAAACGGTCC 1307

 29648531 CATTGGTTGGGACTACCTTCCCCGATGCCCATCCGCCCAGAATCTTCCTTCTGGGATGCC 29648590
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1308 CATTGGTTGGGACTACCTTCCCCGATGCCCATCTGCCCAGAATCTTCCTTCTGGGATGCC 1367

 29648591 GACTTTTTCAACACGTGCCAGGAGCCCTTCCTCGGCCCGGAATCCCCAGAGTGCCCACAG 29648650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 GACTTTTTCAACACGTGCCAGGAGCCCTTCCTCGGCCCGGAATCCCCAGAGTGCCCACAG 1427

 29648651 TGGACAGGGCACCTGGATACACCCCAGACTAACCCACGTTTCCCCGGAGGACCCCAGAGG 29648710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 TGGACAGGGCACCTGGATACACCCCAGACTAACCCACGTTTCCCCGGAGGACCCCAGAGG 1487

 29648711 TTGGAAGCCCCTCCAAGATTAGGGGCGCAGTGCTCCCCTGGCCTGCGGAAGAGTCAGAGG 29648770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 TTGGAAGCCCCTCCAAGATTAGGGGCGCAGTGCTCCCCTGGCCTGCGGAAGAGTCAGAGG 1547

 29648771 AGTGGGGACAACATCCAACATCAGCCTCTACTACCGCTAGCGCGACTCCCCGCCGCCGCT 29648830
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 AGCGGGGACAACATCCAACATCAGCCTCTACTACCGCTAGCGCGACTCCCCGCCGCCGCT 1607

 29648831 CTACTCACCTGACGCGCGCAGTGGACCGCGATTTAGGGGCACAGGGTCTCCCGGGGACCA 29648890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 CTACTCACCTGACGCGCGCAGTGGACCGCGATTTAGGGGCACAGGGTCTCCCGGGGACCA 1667

 29648891 GCGGCTGGAGCGCTCCGGCCGAGCACCCGCAGTCCCGGCGCCGCGGCCCCACCCCGGCCC 29648950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1668 GCGGCTGGAGCGCTCCGGCCGAGCACCCGCAGTCCCGGCGCCGCGGCCCCGCCCCGGCCC 1727

 29648951 CGCCCTCTTCCGCTCCCTCCCAGTCATCAGGCCACCGAGAATGTGCCCCTTGACCCAGAT 29649010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 CGCCCTCTTCCGCTCCCTCCCAGTCATCAGGCCACCGAGAATGTGCCCCTTGACCCAGAT 1787

 29649011 GAGAGGGTGAGCCCGCCAAGGTCAAGCTTCCCATCCTAAGAATCACAGACAGCCCGGCCA 29649070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 GAGAGGGTGAGCCCGCCAAGGTCAAGCTTCCCATCCTAAGAATCACAGACAGCCCGGCCA 1847

 29649071 TGCACCACCACTTCGAGCCTCCGACCAACTGATAGCTGCTGGTCCCAAGTAGCGCTAGGA 29649130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 TGCACCACCACTTCGAGCCTCCGACCAACTGATAGCTGCTGGTCCCAAGTAGCGCTAGGA 1907

 29649131 TTTTCGCTTTCCCAGTCTTAATTGACTCTAAAAGAAGAAGAAAAAAAAGCCTGGGCGCGA 29649190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 TTTTCGCTTTCCCAGTCTTAATTGACTCTAAAAGAAGAAGAAAAAAAAGCCTGGGCGCGA 1967

 29649191 TTGCTCACACCTGTAATTCCGGCACTTTGGGAGGTCGAGGCTGGTGAATTACCTGAAGTC 29649250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 TTGCTCACACCTGTAATTCCGGCACTTTGGGAGGTCGAGGCTGGTGAATTACCTGAAGTC 2027

 29649251 AGGAGTTCAAGACCACCCTGGCCAACATGGCGAAACCTCGTCTCTACTAAAAGTACAAAA 29649310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 AGGAGTTCAAGACCACCCTGGCCAACATGGCGAAACCTCGTCTCTACTAAAAGTACAAAA 2087

 29649311 ATTAGCCAGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAACCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGA 29649370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 ATTAGCCAGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGTAACCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGA 2147

 29649371 GAATCGCTTGAATCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCCAGATCACGCCACTGCACTCC 29649430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 GAATCGCTTGAATCCGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCCAGATCACGCCACTGCACTCC 2207

 29649431 AGCCTGGGCAAAAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGA 29649490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 AGCCTGGGCAAAAAGAGTGAAACTCCATCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGGA 2267

 29649491 AAGTATTTACGAAAAAAAAAAAAAAAGACCAAAGTATTATGATTAAAACACGCGGCTGAG 29649550
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2268 AAGTATTTACG-AAAAAAAAAAAAAAGACCAAAGTATTATGATTAAAACACGCGGCCGAG 2326

 29649551 AGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGGGGCGGATCACCTGA 29649610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 AGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGGGGCGGATCACCTGA 2386

 29649611 GGTCAGAAGTTCGACCTCAGCGTGGCCAATATGGCGAAACCTTGTCCCTATTAAAAATAC 29649670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 GGTCAGAAGTTCGACCTCAGCGTGGCCAATATGGCGAAACCTTGTCCCTATTAAAAATAC 2446

 29649671 AAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACATTGCC 29649730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 AAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACATTGCC 2506

 29649731 GTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTGAATTACTATAGTACTAAAGAAT 29649790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 GTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTGAATTACTATAGTACTAAAGAAT 2566

 29649791 GTCTAGGCTGGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGCTGAGGAG 29649850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 GTCTAGGCTGGGCCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGCTGAGGAG 2626

 29649851 GGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGGCAACATAGCAAGACCCTTTC 29649910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 GGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGGCAACATAGCAAGACCCTTTC 2686

 29649911 TCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTTGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAGGTG 29649970
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2687 TCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGCCAGGTGTGGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAGGTG 2746

 29649971 CTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTA 29650030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 CTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTA 2806

 29650031 TGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAGAAC 29650090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 TGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAGAAC 2866

 29650091 AAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAGAAA 29650150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 AAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAGAAA 2926

 29650151 AGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCCG 29650210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 AGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCCG 2986

 29650211 GCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGA 29650270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 GCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGA 3046

 29650271 TTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTAC 29650330
          ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||
     3047 TTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGGTTAA--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTAC 3104

 29650331 ACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTGCCT 29650390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 ACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTGCCT 3164

 29650391 GCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCTAGAAAAG 29650450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 GCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCTAGAAAAG 3224

 29650451 ATTTCTTTCTTTTTTC-TTTTTTTTTTTTAATTATACTGTAAGTTTTAGGGTACATATGC 29650509
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 ATTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTAATTATACTGTAAGTTTTAGGGTACATATGC 3284

 29650510 ACAACATGCCGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATAA 29650569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 ACAACATGCCGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATAA 3344

 29650570 CTCATCATTTAACATTAGATATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCACTCCCTAGAAAAGA 29650629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 CTCATCATTTAACATTAGATATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCACTCCCTAGAAAAGA 3404

 29650630 TTTCTTGTGGAGTTTTTAAAAAGTCCTTTGAAACAATTCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTT 29650689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 TTTCTTGTGGAGTTTTTAAAAAGTCCTTTGAAACAATTCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTT 3464

 29650690 TTTTCGATACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCATGATCTCGGC 29650749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 TTTTCGATACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCATGATCTCGGC 3524

 29650750 TCACCGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGC 29650809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 TCACCGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGC 3584

 29650810 TGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCTTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG 29650869
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 TGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG 3644

 29650870 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGTTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 29650929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGTTCTCGAACTCCCAACCTCAGGTGATCCACCCACCTCG 3704

 29650930 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCACGCCCAACTTAACAATTCTTAC 29650989
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3705 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCACGCCCAACTCAACAATTCTTAC 3764

 29650990 TTCAAACATGTAAGCATGACGTTCCTCTCCTTCATGCCTTCCTGGCCTTTTTTTTTTTTT 29651049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     3765 TTCAAACATGTAAGCATGACGTTCCTCTCCTTCATGCCTTCCTGGCC-TTTTTTTTTTTT 3823

 29651050 TTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTTCTTCACCTAGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATC 29651109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3824 TTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTTCTTCACCTAGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATC 3883

 29651110 TTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCA 29651169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3884 TTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCAATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCA 3943

 29651170 GTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGACTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAG 29651229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3944 GTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGACTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAG 4003

 29651230 ATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCT 29651289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4004 ATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCT 4063

 29651290 CGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTAAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCC 29651349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4064 CGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTAAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCC 4123

 29651350 TATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCTAGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAA 29651409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4124 TATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCTAGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAA 4183

 29651410 AATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGAAATTAACAATAGCTATTGGCAGAG 29651469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4184 AATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGAAATTAACAATAGCTATTGGCAGAG 4243

 29651470 CCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGGGAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAG 29651529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4244 CCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGGGAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAG 4303

 29651530 GAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGCAACAACTGTGCTGCCTTACAGATC 29651589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4304 GAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGCAACAACTGTGCTGCCTTACAGATC 4363

 29651590 AGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATCCATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGT 29651649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4364 AGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATCCATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGT 4423

 29651650 CTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATCAGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAA 29651709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4424 CTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATCAGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAA 4483

 29651710 GATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGTGCATATTCAGCCTCTTAGTACTCT 29651769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4484 GATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGTGCATATTCAGCCTCTTAGTACTCT 4543

 29651770 GGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATTGATGAAAAACAAACTGACCTAAAG 29651829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4544 GGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATTGATGAAAAACAAACTGACCTAAAG 4603

 29651830 AAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCTCTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTAT 29651889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4604 AAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCTCTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTAT 4663

 29651890 GTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTTGGTAATGGATGGAATCCTCCTCAT 29651949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4664 GTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTTGGTAATGGATGGAATCCTCCTCAT 4723

 29651950 TCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAGCCTGAAGGTGCAAACCCCATGGAC 29652009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4724 TCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAGCCTGAAGGTGCAAACCCCATGGAC 4783

 29652010 TCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAAGGCCAAAACTGATGGCATCAGCCA 29652069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4784 TCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAAGGCCAAAACTGATGGCATCAGCCA 4843

 29652070 TCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGGGCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCA 29652129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4844 TCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGGGCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCA 4903

 29652130 TGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAATGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTC 29652189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4904 TGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAATGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTC 4963

 29652190 CATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACCTCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTG 29652249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4964 CATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACCTCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTG 5023

 29652250 ATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTCATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTAC 29652309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5024 ATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTCATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTAC 5083

 29652310 TGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTCAAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCA 29652369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5084 TGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTCAAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCA 5143

 29652370 GTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATTTAAAATGGGGTTATGTTTCAATAA 29652429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5144 GTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATTTAAAATGGGGTTATGTTTCAATAA 5203

 29652430 AACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAATGTATTTAATGCACCTAACCTACT 29652489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5204 AACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAATGTATTTAATGCACCTAACCTACT 5263

 29652490 GAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTGCTCAGAACACATTTGCCTACAGTT 29652549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5264 GAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTGCTCAGAACACATTTGCCTACAGTT 5323

 29652550 GGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGATAAAGTGTTGACTATCTCATGTAAC 29652609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5324 GGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGATAAAGTGTTGACTATCTCATGTAAC 5383

 29652610 TGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAGTTGTTACCATCATAATTGTGTGGC 29652669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5384 TGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAGTTGTTACCATCATAATTGTGTGGC 5443

 29652670 TGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCACCGTCACAGAGTATCATACTCTCTA 29652729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5444 TGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCACCGTCACAGAGTATCATACTCTCTA 5503

 29652730 ACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTATACTGAATGTGTGTTGCTTTCACAT 29652789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5504 ACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTATACTGAATGTGTGTTGCTTTCACAT 5563

 29652790 CATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCGTAAATCAGGGACCATCTGCACCAC 29652849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5564 CATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCGTAAATCAGGGACCATCTGCACCAC 5623

 29652850 TATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAAGACAATTGACCATAAAACAGGTTA 29652909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5624 TATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAAGACAATTGACCATAAAACAGGTTA 5683

 29652910 TCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTAAGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAA 29652969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5684 TCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTAAGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAA 5743

 29652970 AGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATTCAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAA 29653029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5744 AGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATTCAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAA 5803

 29653030 GATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAACTTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTT 29653089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5804 GATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAACTTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTT 5863

 29653090 GGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCCTATAATCACTTCTTCTCCCCTTGT 29653149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5864 GGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCCTATAATCACTTCTTCTCCCCTTGT 5923

 29653150 CTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACTATCTCTGTAAGCACAAAAATTGCC 29653209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5924 CTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACTATCTCTGTAAGCACAAAAATTGCC 5983

 29653210 TAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAACTGACACAGCTATAATTATCATCC 29653269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 TAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAACTGACACAGCTATAATTATCATCC 6043

 29653270 ATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAGCCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTT 29653329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6044 ATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAGCCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTT 6103

 29653330 ATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCTATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCC 29653389
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6104 ATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCTATGCCCCTTTACCTCTAATGTCCC 6163

 29653390 TATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCTCCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTG 29653449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6164 TATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCTCCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTG 6223

 29653450 AGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGAGAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATA 29653509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6224 AGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGAGAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATA 6283

 29653510 AGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGACAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTG 29653569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6284 AGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGACAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTG 6343

 29653570 TAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTCGCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCA 29653629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6344 TAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTCGCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCA 6403

 29653630 CGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCGTGGATTTGGGAAACACTTCAGATT 29653689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6404 CGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCGTGGATTTGGGAAACACTTCAGATT 6463

 29653690 CCGAGCCTAACACGGGACTGGGGCGCCCCCTTGGGTACGTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAA 29653749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6464 CCGAGCCTAACACGGGACTGGGGCGCCCCCTTGGGTACGTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAA 6523

 29653750 AGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGGAGGAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTT 29653809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6524 AGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGGAGGAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTT 6583

 29653810 CTGTTCTCAGCCCGCTGACCACACACAAGTGCCGATGTTCTGCTCTCTTGGATTCTGATT 29653869
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6584 CTGTTCTCAGCCCGGTGACCACACACAAGTGCCGATGTTCTGCTCTCTTGGATTCTGATT 6643

 29653870 GAGCAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAACTGGACAGATATGGCTGGTGTGGAG 29653929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6644 GAGCAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAACTGGACAGATATGGCTGGTGTGGAG 6703

 29653930 GCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCCCGAAAAGTAGATAATTTTTACTTCC 29653989
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6704 GCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTCAGCCGCCCGAAAAGTAGATAATTTTTACTTCC 6763

 29653990 ACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAATATCCTTTTAAAATCTAAAATATT 29654049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6764 ACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAATATCCTTTTAAAATCTAAAATATT 6823

 29654050 GGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGATGGA 29654109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6824 GGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCAGATGGA 6883

 29654110 TTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCAATATGGAGAAATCCTCTCTCTACT 29654169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6884 TTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCAATATGGAGAAATCCTCTCTCTACT 6943

 29654170 AAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGG 29654229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6944 AAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGG 7003

 29654230 CTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGAGGTTGCGGTGAGCCAAGATCGCGC 29654289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7004 CTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGAGGTTGCGGTGAGCCAAGATCGCGC 7063

 29654290 CATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCGTCTCAAAAATCAAATCAAATCA 29654349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||
     7064 CATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCGTCTCAA-----AAATCAAATCA 7118

 29654350 AATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAGAAAAGTTGCAAAGATAGTACATAG 29654409
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     7119 AATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAGAAAAGTTGCAAAGATAGTACATAA 7178

 29654410 TTCTCCTATGTTCCACATTCAGTTTCCTCTATTATTAATGTCTTATTTTATTATACATTT 29654469
          |||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     7179 TTCTCGTATGTTCCACATTCAGTTTCCCCTATTATTAATGTCTTATTTTATTATACATTT 7238

 29654470 GTGACAGGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTACTAACTCCTATTTTATTTGGATTTT 29654529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7239 GTGACAGGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTACTAACTCCTATTTTATTTGGATTTT 7298

 29654530 ATTCTTTTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGATCCCATCCAGGATACATTACATTTA 29654589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7299 ATTCTTTTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGATCCCATCCAGGATACATTACATTTA 7358

 29654590 GTCCCCTTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGTGACAATTTCTCAGACCTCGTTTTT 29654649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7359 GTCCCCTTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGTGACAATTTCTCAGACCTCGTTTTT 7418

 29654650 GATAATTTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGCATATTGTAAAATGTCCCTTAATTT 29654709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     7419 GATAATTTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGCATATTGTAAAATGTTCCTTAATTT 7478

 29654710 GAGTGTGGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGAAGAGCACAGAGATGAAATGCAATA 29654769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7479 GAGTGTGGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGAAGAGCACAGAGATGAAATGCAATA 7538

 29654770 CTCTCAATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCAGTTGATGTATCAAATGATTATGTT 29654829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     7539 CTCTCAATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCAGTTGATTTATCAAATGATTATGTT 7598

 29654830 AACCTCCATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGTCTATAATATATAATTTTTAATAGC 29654889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7599 AACCTCCATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGTCTATAATATATAATTTTTAATAGC 7658

 29654890 ATCCCAAAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAAGAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGC 29654949
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7659 AGCCCAAAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAAGAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGC 7718

 29654950 CCAAGGAGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAAAAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCT 29655009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7719 CCAAGGAGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAAAAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCT 7778

 29655010 CAGGTCTATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGGTGTCTCAGACACAAATTGAGCAAT 29655069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7779 CAGGTCTATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGGTGTCTCAGACACAAATTGAGCAAT 7838

 29655070 CAGAAAAGGCTGGGATGTCTGTGGTCTGAGTTGGGCAGAGGTGGCTGACCCTGGAACCTG 29655129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7839 CAGAAAAGGCTGGGATGTCTGTGGTCTGAGTTGGGCAGAGGTGGCTGACCCTGGAACCTG 7898

 29655130 ACATCAATAGGGGGATGAAGACAATTTCTGAGCAGCCCCAGTAGTCAGAGGACAAGAGAA 29655189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7899 ACATCAATAGGGGGATGAAGACAATTTCTGAGCAGCCCCAGTAGTCAGAGGACAAGAGAA 7958

 29655190 CTCTGGAGCCCCGCACTGTCTCTGAGGTTCCAATCTTTTCTCCCTCTTCCCAGCCCCTTG 29655249
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     7959 CTCTGGAGCCCCGCACTGTCTCTGAGGTTCCAATCTTTTCTCCCTCTTCGCAGCCCCTTG 8018

 29655250 ATAGGAAACCCTGGGAAAACTAAAAAGTATACTGTTTTTTCTTTAACTCCCTATTCCTTT 29655309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8019 ATAGGAAACCCTGGGAAAACTAAAAAGTATACTGTTTTTTCTTTAACTCCCTATTCCTTT 8078

 29655310 CCTCTTCTGAGGGTTGTTGTTGTTGTTTT-TTTTTAATAAACTTATTAATTTTAGAATAC 29655368
          |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||
     8079 CCTCTTCTGAGGGTTGTTGTTGTTGTT--GTTTTTAATAAACTTATTAATTTTAGAATAC 8136

 29655369 TTTTAGATTACACAAAAGTTGAAAAGATAATACATAGTTCTCACATATGTCACACTCAGC 29655428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8137 TTTTAGATTACACAAAAGTTGAAAAGATAATACATAGTTCTCACATATGTCACACTCAGC 8196

 29655429 TCCCCATTGTTAACATA-TTTTTTTTTTTTTTGAGGGAGTCTCACTCTG 29655476
          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     8197 TCCCCATTGTTAACATATTTTTTTTTTTTTTTGAGGGAGTCTCACTCTG 8245

Alignment time is 5.76692 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    6421] =>      6421 nucs 'mol-32-33a0-150369_6421'

Score:        6001
Aligned:      6442        nucs
Identic:      6388 ( 99%) nucs =>       894 ( 99%)      5494 ( 99%)
Gaps:           21 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29649517,29650419] EXCISED REGION [29651086,29656624]
 second seq =>  [       1,     900] EXCISED REGION [     901,    6421]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       666 nucs [29650420,29651085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29650420,29650423] to [29651086,29651089]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29649517 GACCAAAGTATTATGATTAAAACACGCGGCTGAGAGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCA 29649576
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACCAAAGTATTATGATTAAAACACGCGGCCGAGAGCGGTGGCTCACACCTGTAATCCCA 60

 29649577 GCACTTTGGGAGGCTGAGGGGGCGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGACCTCAGCGTGGC 29649636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCACTTTGGGAGGCTGAGGGGGCGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTCGACCTCAGCGTGGC 120

 29649637 CAATATGGCGAAACCTTGTCCCTATTAAAAATACAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCA 29649696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAATATGGCGAAACCTTGTCCCTATTAAAAATACAAAAGTTAGCCGGTGGTGGTGACGCA 180

 29649697 CACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGA 29649756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGA 240

 29649757 GCATCTTATCTGAATTACTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTGGGCCCCCGTGGCTCAC 29649816
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      241 GCATCTTATCTGAATTACTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTAGGCCCCCGTGGCTCAC 300

 29649817 TCCTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTC 29649876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTC 360

 29649877 AAGACCAACCTGGGCAACATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGC 29649936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGACCAACCTGGGCAACATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGC 420

 29649937 CAGGTGTTGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTG 29649996
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGGTGTGGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTG 480

 29649997 CTTGAGCTCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTT 29650056
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTT 540

 29650057 GGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAA 29650116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAA 600

 29650117 CCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTA 29650176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTA 660

 29650177 TTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAG 29650236
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAG 720

 29650237 CTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGG 29650296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGG 780

 29650297 TTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTACACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAG 29650356
          ||||||||||||||||||||||||||   ||||.||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---AGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAG 837

 29650357 GCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 29650416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 GCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 897

 29650417 TAC 29650419
          |||
      898 TAC 900

EXCISED REGION

 29651086 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 29651145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 960

 29651146 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGA 29651205
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      961 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAGCCACATGCCAGCACGTCCGA 1020

 29651206 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 29651265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 1080

 29651266 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGT 29651325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|
     1081 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAAGCAT 1140

 29651326 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 29651385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 1200

 29651386 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 29651445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 1260

 29651446 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 29651505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 1320

 29651506 GAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 29651565
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGTTGAGACGTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 1380

 29651566 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 29651625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 1440

 29651626 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATC 29651685
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1441 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATT 1500

 29651686 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 29651745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 1560

 29651746 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 29651805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 1620

 29651806 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 29651865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 1680

 29651866 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 29651925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 1740

 29651926 GGTAATGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 29651985
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGTAATGGACGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 1800

 29651986 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 29652045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 1860

 29652046 GGCCAAAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 29652105
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGCCAAAATTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 1920

 29652106 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 29652165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 1980

 29652166 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 29652225
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCGATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 2040

 29652226 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 29652285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 2100

 29652286 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 29652345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 2160

 29652346 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 29652405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 2220

 29652406 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 29652465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 2280

 29652466 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 29652525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 2340

 29652526 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGAT 29652585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2341 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCATTGTATGAT 2400

 29652586 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 29652645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 2460

 29652646 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 29652705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 2520

 29652706 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 29652765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 2580

 29652766 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 29652825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 2640

 29652826 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 29652885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 2700

 29652886 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 29652945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 2760

 29652946 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 29653005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 2820

 29653006 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 29653065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 2880

 29653066 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 29653125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 2940

 29653126 TATAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 29653185
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TACAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 3000

 29653186 ATCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 29653245
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 3060

 29653246 CTGACACAGCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 29653305
          |||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTGACACAGCTGTAATTATCATCCATGTGAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 3120

 29653306 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 29653365
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTGATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 3180

 29653366 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 29653425
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGTTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 3240

 29653426 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 29653485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 3300

 29653486 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 29653545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 3360

 29653546 CAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTC 29653605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTC 3420

 29653606 GCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCG 29653665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCG 3480

 29653666 TGGATTTGGGAAACACTTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGCGCCCCCTTGGGT 29653725
          ||||            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3481 TGGA------------TTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGTGCCCCCTTGGGT 3528

 29653726 ACGTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGG 29653785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 ACGTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGG 3588

 29653786 AGGAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGCTGACCACACACAAGTGCCGAT 29653845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3589 AGGAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGGTGACCACACACAAGTGCCGAT 3648

 29653846 GTTCTGCTCTCTTGGATTCTGATTGAGCAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAAC 29653905
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 GTTCTGCTCTCTTGGATTCTGATTGAGTAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAAC 3708

 29653906 TGGACAGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCCC 29653965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3709 TGGACAGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCTC 3768

 29653966 GAAAAGTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAA 29654025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 GAAAAGTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAA 3828

 29654026 TATCCTTTTAAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCA 29654085
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 TATCCTTTTGAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGGCTCACACTTGTAATCCCAGCA 3888

 29654086 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCA 29654145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 CTTTGGGAGGCCGAGGCAGATGGATTACCTGAGGTGGGGGGTTTGAGACCAGCCTGACCA 3948

 29654146 ATATGGAGAAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTC 29654205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 ATATGGAGAAATCCTCTCTCTACTAAAAATACAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGCATTC 4008

 29654206 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGA 29654265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 CTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCTCTTGAGCCTGGGAGGTGGA 4068

 29654266 GGTTGCGGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTC 29654325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 GGTTGCGGTGAGCCAAGATCGCGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTC 4128

 29654326 CGTCTCAAAAATCAAATCAAATCAAATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAG 29654385
          ||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 CGTCTCAA-----AAATCAAATCAAATCAAATCAAATCTACAATATTTTTGGATTTACAG 4183

 29654386 AAAAGTTGCAAAGATAGTACATAGTTCTCCTATGTTCCACATTCAGTTTCCTCTATTATT 29654445
          |||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||.||||||||
     4184 AAAAGTTGCAAAGATAGTACATAATTCTCGTATGTTCCACATTCAGTTTCCCCTATTATT 4243

 29654446 AATGTCTTATTTTATTATACATTTGTGACAGGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTAC 29654505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4244 AATGTCTTATTTTATTATACATTTGTGACAGGTTATGAAACAATATTGATACATTGTTAC 4303

 29654506 TAACTCCTATTTTATTTGGATTTTATTCTTTTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGAT 29654565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4304 TAACTCCTATTTTATTTGGATTTTATTCTTTTCCCTAACATCACTTTTATGTTCCAGGAT 4363

 29654566 CCCATCCAGGATACATTACATTTAGTCCCCTTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGT 29654625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4364 CCCATCCAGGATACATTACATTTAGTCCCCTTTATATCTCCTTAGCCTCCTCTGGTCTGT 4423

 29654626 GACAATTTCTCAGACCTCGTTTTTGATAATTTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGC 29654685
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4424 GACAATTTCTCAGACCTTGTTTTTGATAATTTGGTATTTCTTGAGGAGTACTAGTGAGGC 4483

 29654686 ATATTGTAAAATGTCCCTTAATTTGAGTGTGGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGA 29654745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4484 ATATTGTAAAATGTCCCTTAATTTGAGTGTGGTTGACAGGGCTATAGGTTTGGGGGAAGA 4543

 29654746 AGAGCACAGAGATGAAATGCAATACTCTCAATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCA 29654805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4544 AGAGCACAGAGATGAAATGCAATACTCTCAATACAACATACCAAGAGTGTATATTACCCA 4603

 29654806 GTTGATGTATCAAATGATTATGTTAACCTCCATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGT 29654865
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4604 GTTGATTTATCAAATGATTATGTTAACCTCCATCACTTGGCTAGGGCAGTGTTTCCCAGT 4663

 29654866 CTATAATATATAATTTTTAATAGCATCCCAAAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAA 29654925
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4664 CTATAATATATAATTTTTAATAGCAGCCCAAAAAGACTAAAACACTTGCCCTTGCATGAA 4723

 29654926 GAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGCCCAAGGAGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAA 29654985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4724 GAACCCTGTCTGACTTCTGGGAGCCCAAGGAGACGCAGGGGAGGTCCACAGCGAGAAGAA 4783

 29654986 AAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCTCAGGTCTATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGG 29655045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4784 AAGGGGGCTCAGGTCGTCTGTCCTCAGGTCTATGGCCACTTGGGGGTGGCACCTCTCTGG 4843

 29655046 TGTCTCAGACACAAATTGAGCAATCAGAAAAGGCTGGGATGTCTGTGGTCTGAGTTGGGC 29655105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4844 TGTCTCAGACACAAATTGAGCAATCAGAAAAGGCTGGGATGTCTGTGGTCTGAGTTGGGC 4903

 29655106 AGAGGTGGCTGACCCTGGAACCTGACATCAATAGGGGGATGAAGACAATTTCTGAGCAGC 29655165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4904 AGAGGTGGCTGACCCTGGAACCTGACATCAATAGGGGGATGAAGACAATTTCTGAGCAGC 4963

 29655166 CCCAGTAGTCAGAGGACAAGAGAACTCTGGAGCCCCGCACTGTCTCTGAGGTTCCAATCT 29655225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4964 CCCAGTAGTCAGAGGACAAGAGAACTCTGGAGCCCCGCACTGTCTCTGAGGTTCCAATCT 5023

 29655226 TTTCTCCCTCTTCCCAGCCCCTTGATAGGAAACCCTGGGAAAACTAAAAAGTATACTGTT 29655285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5024 TTTCTCCCTCTTCCCAGCCCCTTGATAGGAAACCCTGGGAAAACTAAAAAGTATACTGTT 5083

 29655286 TTTTCTTTAACTCCCTATTCCTTTCCTCTTCTGAGGGTTGTTGTTGTTGTTTTTTTTTAA 29655345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     5084 TTTTCTTTAACTCCCTATTCCTTTCCTCTTCTGAGGGTTGTTGTTGTTG-TTTTTTTTAA 5142

 29655346 TAAACTTATTAATTTTAGAATACTTTTAGATTACACAAAAGTTGAAAAGATAATACATAG 29655405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5143 TAAACTTATTAATTTTAGAATACTTTTAGATTACACAAAAGTTGAAAAGATAATACATAG 5202

 29655406 TTCTCACATATGTCACACTCAGCTCCCCATTGTTAACATATTTTTTTTTTTTTTGAGGGA 29655465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5203 TTCTCACATATGTCACACTCAGCTCCCCATTGTTAACATATTTTTTTTTTTTTTGAGGGA 5262

 29655466 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATTTCGGCTCACTGCAACCTCT 29655525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5263 GTCTCACTCTGTCGCCCAGGCTGAAGTGCAGTGGCACGATTTCGGCTCACTGCAACCTCT 5322

 29655526 GCCTCCGGGTTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGATTACAGGTG 29655585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5323 GCCTCCGGGTTTCAAGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTAGGATTACAGGTG 5382

 29655586 CGCGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTGTAGTTTTAGTAAAGACAGGGTTCCACCACATTG 29655645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5383 CGCGCCACCATGCCCAGCTAGTTTTTGTAGTTTTAGTAAAGACAGGGTTCCACCACATTG 5442

 29655646 GCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTACCCGCTCAGCTTCCCAAAGTGC 29655705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5443 GCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCTACCCGCTCAGCTTCCCAAAGTGC 5502

 29655706 TGGCATTACAGGTGTGTGCCACTGCCCCCAGCCCCATTGTTAACATCTTATATCACTATT 29655765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5503 TGGCATTACAGGTGTGTGCCACTGCCCCCAGCCCCATTGTTAACATCTTATATCACTATT 5562

 29655766 ATACATTTTTCACAACCAGTGAGACAATATTAATATAGTATCACTAAACTTTATTTCGAT 29655825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5563 ATACATTTTTCACAACCAGTGAGACAATATTAATATAGTATCACTAAACTTTATTTCGAT 5622

 29655826 TTCATTAGCTCTTTCTGTTTTGAAACAAAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCCGGAGTGCAA 29655885
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5623 TTTATTAGCTCTTTCTGTTTTGAAACAAAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCCGGAGTGCAA 5682

 29655886 TGGCATGATGTCCACTCACTGCAACCTCCACCTCCCGAGTTCAAATGATTTTCATGCCTC 29655945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5683 TGGCATGATGTCCACTCACTGCAACCTCCACCTCCCGAGTTCAAATGATTTTCATGCCTC 5742

 29655946 AGCCTCCTGAATAGCTGTGACTACAGACACATGCCACCGTGCCTGGCTGATTTCTGTATT 29656005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5743 AGCCTCCTGAATAGCTGTGACTACAGACACATGCCACCGTGCCTGGCTGATTTCTGTATT 5802

 29656006 TTTAGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCTTACTCCTGACCTAAAG 29656065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5803 TTTAGTAGAGACAGGATTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCTTACTCCTGACCTAAAG 5862

 29656066 TGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCA 29656125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5863 TGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCCA 5922

 29656126 GCCAGGTTTCATTAGTTCTTTTAACTTCCTTTTTCTGTCACAGGATTTCATCGAGGATAT 29656185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5923 GCCAGGTTTCATTAGTTCTTTTAACTTCCTTTTTCTGTCACAGGATTTCATCGAGGATAT 5982

 29656186 CACATTGTATTTAGTCCTAATCATGTCTCCTTAAGGCTCCTCCAGGTTGACTTTGTTTTC 29656245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5983 CACATTGTATTTAGTCCTAATCATGTCTCCTTAAGGCTCCTCCAGGTTGACTTTGTTTTC 6042

 29656246 AATGACTGTCTTAGTATGTTGAGTATTACTATAACAGAATAACTTGAAACTGGGTAGTTT 29656305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6043 AATGACTGTCTTAGTATGTTGAGTATTACTATAACAGAATAACTTGAAACTGGGTAGTTT 6102

 29656306 ATAAAGAGAAGATGTTTATTTAGCTCATGATTTTGCAGGCTGGGAAGTTCAACAGGATAG 29656365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6103 ATAAAGAGAAGATGTTTATTTAGCTCATGATTTTGCAGGCTGGGAAGTTCAACAGGATAG 6162

 29656366 TGCTGGATCTGGCAAACTTCTGGTGAAGGCCAAATGTTAGGTCAAAACATTTTGGAGAAG 29656425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6163 TGCTGGATCTGGCAAACTTCTGGTGAAGGCCAAATGTTAGGTCAAAACATTTTGGAGAAG 6222

 29656426 GGGAAAAGTGAGTGGCATGTGCAAAAACATCACATGGGGAGACAGGGAAGCAAGAGAGAG 29656485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6223 GGGAAAAGTGAGTGGCATGTGCAAAAACATCACATGGGGAGACAGGGAAGCAAGAGAGAG 6282

 29656486 TCTAGGAAACCAAACTTGCTTTTATAACAACCTGCTTTTTGGTAACTAACCTAGCCCCAA 29656545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6283 TCTAGGAAACCAAACTTGCTTTTATAACAACCTGCTTTTTGGTAACTAACCTAGCCCCAA 6342

 29656546 CAGAGTAATAAATTACTCGCTCATGTGGGAGGACATTAATCTATTCATGAAGGATCTGCT 29656605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6343 CAGAGTAATAAATTACTCGCTCATGTGGGAGGACATTAATCTATTCATGAAGGATCTGCT 6402

 29656606 CCTGATGACCCAAACGCCT 29656624
          |||||||||||||||||||
     6403 CCTGATGACCCAAACGCCT 6421

Alignment time is 4.58685 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2687] =>      2687 nucs 'mol-32-3487-010619_2687'

Score:        2644
Aligned:      2688        nucs
Identic:      2684 (100%) nucs =>       538 (100%)      2146 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29650343,29650881] EXCISED REGION [29651249,29653396]
 second seq =>  [       1,     540] EXCISED REGION [     541,    2687]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       367 nucs [29650882,29651248]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [29650882,29650883] to [29651249,29651250]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29650343 ACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCC 29650402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCC 60

 29650403 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCTAGAAAAGATTTCTTTCTTT 29650462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCTAGAAAAGATTTCTTTCTTT 120

 29650463 TTTCTTTTTTTTTTTT-AATTATACTGTAAGTTTTAGGGTACATATGCACAACATGCCGG 29650521
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCTTTTTTTTTTTTTAATTATACTGTAAGTTTTAGGGTACATATGCACAACATGCCGG 180

 29650522 TTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATAACTCATCATTTAA 29650581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATAACTCATCATTTAA 240

 29650582 CATTAGATATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCACTCCCTAGAAAAGATTTCTTGTGGAG 29650641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATTAGATATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCACTCCCTAGAAAAGATTTCTTGTGGAG 300

 29650642 TTTTTAAAAAGTCCTTTGAAACAATTCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTCGATACAG 29650701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTAAAAAGTCCTTTGAAACAATTCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTCGATACAG 360

 29650702 AGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCATGATCTCGGCTCACCGCAACCT 29650761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTAGAGTGCAATGGCATGATCTCGGCTCACCGCAACCT 420

 29650762 CCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGG 29650821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGG 480

 29650822 CATGCACCACCATGCTTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTT 29650881
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATGCACCACCATGCCTGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTT 540

EXCISED REGION

 29651249 GGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGT 29651308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGT 600

 29651309 GCTGGGATTACAAGCGTAAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGAC 29651368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTGGGATTACAAGCGTAAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGAC 660

 29651369 AAAAGTTATTTCATCCTAGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGT 29651428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAAGTTATTTCATCCTAGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGT 720

 29651429 GAATGTGAAAGGAGGGAAATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACT 29651488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAATGTGAAAGGAGGGAAATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACT 780

 29651489 TTAGCTGGATCATCTGGGAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCT 29651548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAGCTGGATCATCTGGGAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCT 840

 29651549 TGTTAAGAAAGAATGGCAACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGC 29651608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTTAAGAAAGAATGGCAACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGC 900

 29651609 GAGCCCAACCTTAGATCCATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGT 29651668
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGCCCAACCTTAGATCCA-TTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGT 959

 29651669 GAGCCCTGACTGCCATCAGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGT 29651728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GAGCCCTGACTGCCATCAGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGT 1019

 29651729 ACTATGGGAAATCAAGTGCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACT 29651788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ACTATGGGAAATCAAGTGCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACT 1079

 29651789 GACGAAGGCGATCCATTGATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTG 29651848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GACGAAGGCGATCCATTGATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTG 1139

 29651849 CAGTCAGCCCTGTTCCTCTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAAC 29651908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CAGTCAGCCCTGTTCCTCTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAAC 1199

 29651909 TTTAAAAATGTTAACTTGGTAATGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCA 29651968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTTAAAAATGTTAACTTGGTAATGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCA 1259

 29651969 AGTCAAGCTCAAGTCAGCCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCT 29652028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 AGTCAAGCTCAAGTCAGCCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCT 1319

 29652029 GTGGGTGCTAGATCCAAGGCCAAAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAA 29652088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GTGGGTGCTAGATCCAAGGCCAAAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAA 1379

 29652089 TATAAAGTATTGGGTGGGCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAG 29652148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TATAAAGTATTGGGTGGGCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAG 1439

 29652149 TAAATGCGTGACTTTAATGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTA 29652208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TAAATGCGTGACTTTAATGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTA 1499

 29652209 GATCCCTTTATCTCACCTCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGT 29652268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GATCCCTTTATCTCACCTCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGT 1559

 29652269 TCTAATGGGATACATTCATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTA 29652328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TCTAATGGGATACATTCATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTA 1619

 29652329 AAGATGCTTTCCCCCTCAAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGT 29652388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AAGATGCTTTCCCCCTCAAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGT 1679

 29652389 ACAGATGCTCTTCAATTTAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAA 29652448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 ACAGATGCTCTTCAATTTAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAA 1739

 29652449 TATTTTCAAGTGGAAAATGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCT 29652508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TATTTTCAAGTGGAAAATGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCT 1799

 29652509 AGCCTACCTTAAATGTGCTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACAC 29652568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AGCCTACCTTAAATGTGCTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACAC 1859

 29652569 AAATCCCCTTGTATGATAAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGT 29652628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AAATCCCCTTGTATGATAAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGT 1919

 29652629 ATAGAGTACAGTATCAGTTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCA 29652688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 ATAGAGTACAGTATCAGTTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCA 1979

 29652689 CTACTGCTGTCCAGCACCGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAA 29652748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CTACTGCTGTCCAGCACCGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAA 2039

 29652749 TTCAAAGTACAGTTTATACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAAC 29652808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TTCAAAGTACAGTTTATACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAAC 2099

 29652809 TGTAAGTTGAGCCATCGTAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGT 29652868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TGTAAGTTGAGCCATCGTAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGT 2159

 29652869 TGTAATTGAAGTCCCAAGACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTA 29652928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TGTAATTGAAGTCCCAAGACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTA 2219

 29652929 ACCACATGAACTCCTTAAGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTC 29652988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 ACCACATGAACTCCTTAAGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTC 2279

 29652989 AAAGCAAAAGAAGTATTCAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGC 29653048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AAAGCAAAAGAAGTATTCAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGC 2339

 29653049 AAAAGAATGCAGGTAACTTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGA 29653108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AAAAGAATGCAGGTAACTTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGA 2399

 29653109 AACAGGAACCTAATTCCTATAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTG 29653168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AACAGGAACCTAATTCCTATAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTG 2459

 29653169 TGTAAGCGCATTATACTATCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTT 29653228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TGTAAGCGCATTATACTATCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTT 2519

 29653229 TCTGATCGCTTGTAAAACTGACACAGCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCC 29653288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TCTGATCGCTTGTAAAACTGACACAGCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCC 2579

 29653289 AGTTAGAAACCTGTGAGCCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATC 29653348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 AGTTAGAAACCTGTGAGCCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATC 2639

 29653349 AGAGCTGATTCCTTTCTATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTG 29653396
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2640 AGAGCTGATTCCTTTCTATGCCCCTTTACCTCTAATGTCCCTATTCTG 2687

Alignment time is 1.96286 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    2787] =>      2787 nucs 'mol-32-3492-014582_2787'

Score:        2744
Aligned:      2790        nucs
Identic:      2785 (100%) nucs =>       737 (100%)      2048 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29649563,29650300] EXCISED REGION [29650307,29652358]
 second seq =>  [       1,     738] EXCISED REGION [     739,    2787]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [29650301,29650306]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [29650301,29650319] to [29650307,29650325]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [29650301,29650303] to [29650304,29650306]
 second seq =>         0 nucs

 29649563 CACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGGGGCGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTC 29649622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGGGGCGGATCACCTGAGGTCAGAAGTTC 60

 29649623 GACCTCAGCGTGGCCAATATGGCGAAACCTTGTCCCTATTAAAAATACAAAAGTTAGCCG 29649682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACCTCAGCGTGGCCAATATGGCGAAACCTTGTCCCTATTAAAAATACAAAAGTTAGCCG 120

 29649683 GTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAA 29649742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGGTGGTGACGCACACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAA 180

 29649743 GTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTGAATTACTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTGGG 29649802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGTTCTTTCAAGAGCATCTTATCTGAATTACTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTGGG 240

 29649803 CCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTG 29649862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCCCGTGGCTCACTCCTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTG 300

 29649863 GAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGGCAACATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAAT 29649922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGGCCAGGAGTTCAAGACCAACCTGGGCAACATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAAT 360

 29649923 GAAAACAACTTGGCCAGGTGTTGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTG 29649982
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAAACAACTTGGCCAGGTGTGGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTG 420

 29649983 AGGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCAC 29650042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGTGGGAGGATTGCTTGAGCTCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCAC 480

 29650043 TGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAA 29650102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCATTCCAGCCTTGGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAA 540

 29650103 TGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTA 29650162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCCTGCTGATAAACCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTA 600

 29650163 TTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAG 29650222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTTTTATTTTTATTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAG 660

 29650223 TGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGT 29650282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGCGCCATCTCAGCTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGT 720

 29650283 GCCACCATACCCGGTTAA 29650300
          ||||||||||||||||||
      721 GCCACCATACCCGGTTAA 738

EXCISED REGION

 29650307 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTACACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCA 29650366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      739 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTACACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCA 798

 29650367 AACTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTG 29650426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      799 AACTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTG 858

 29650427 AGCCACCGCGCCCGGCTAGAAAAGATTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTAATTATAC 29650486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      859 AGCCACCGCGCCCGGCTAGAAAAGATTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTAATTATAC 918

 29650487 TGTAAGTTTTAGGGTACATATGCACAACATGCCGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCC 29650546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      919 TGTAAGTTTTAGGGTACATATGCACAACATGCCGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCC 978

 29650547 ATGTTGGTGTGCTGCACCCATAACTCATCATTTAACATTAGATATATCTCCTAATGCTAT 29650606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      979 ATGTTGGTGTGCTGCACCCATAACTCATCATTTAACATTAGATATATCTCCTAATGCTAT 1038

 29650607 CCCTCCCCACTCCCTAGAAAAGATTTCTTGTGGAGTTTTTAAAAAGTCCTTTGAAACAAT 29650666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1039 CCCTCCCCACTCCCTAGAAAAGATTTCTTGTGGAGTTTTTAAAAAGTCCTTTGAAACAAT 1098

 29650667 TCTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTTTTTCGATACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTA 29650726
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1099 TCTTTTCTTTTCC-TTTTTTTTTTTTTCGATACAGAGTTTTGCTCTTGTTGCCCAGGCTA 1157

 29650727 GAGTGCAATGGCATGATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCT 29650786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1158 GAGTGCAATGGCATGATCTCGGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCGATTCT 1217

 29650787 CCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCTTGGCTAATT 29650846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1218 CCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGATTACAGGCATGCACCACCATGCCTGGCTAATT 1277

 29650847 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGTTCTCGAACTCCCAA 29650906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1278 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGTTCTCGAACTCCCAA 1337

 29650907 CCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACC 29650966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1338 CCTCAGGTGATCCACCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACC 1397

 29650967 ACGCCCAACTTAACAATTCTTACTTCAAACATGTAAGCATGACGTTCCTCTCCTTCATGC 29651026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1398 ACGCCCAACTTAACAATTCTTACTTCAAACATGTAAGCATGACGTTCCTCTCCTTCATGC 1457

 29651027 CTTCCTGGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTTCTTCACCTA 29651086
          ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1458 CTTCCTGGCC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTTCTTCACCTA 1515

 29651087 GGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCA 29651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 GGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGCA 1575

 29651147 ATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGAC 29651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 ATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGAC 1635

 29651207 TAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGAA 29651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 TAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGAA 1695

 29651267 CTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTA 29651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 CTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGTA 1755

 29651327 AGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCTA 29651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 AGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCTA 1815

 29651387 GTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGAA 29651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 GTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGAA 1875

 29651447 ATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGGG 29651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 ATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGGG 1935

 29651507 AGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGCA 29651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 AGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGCA 1995

 29651567 ACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATCC 29651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 ACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATCC 2055

 29651627 ATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATCA 29651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 ATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATCA 2115

 29651687 GGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGTG 29651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 GGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGTG 2175

 29651747 CATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATTG 29651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 CATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATTG 2235

 29651807 ATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCTC 29651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 ATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCTC 2295

 29651867 TGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTTG 29651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 TGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTTG 2355

 29651927 GTAATGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAGC 29651986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 GTAATGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAGC 2415

 29651987 CTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAAG 29652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 CTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAAG 2475

 29652047 GCCAAAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGGG 29652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 GCCAAAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGGG 2535

 29652107 CTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAAT 29652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 CTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAAT 2595

 29652167 GGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACCT 29652226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 GGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACCT 2655

 29652227 CAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTCA 29652286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 CAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTCA 2715

 29652287 TTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTCA 29652346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 TTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTCA 2775

 29652347 AGATTGCTTCCC 29652358
          ||||||||||||
     2776 AGATTGCTTCCC 2787

Alignment time is 2.01868 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [29640419,29661085] =>     20667 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [       1,    3687] =>      3687 nucs 'mol-32-34a8-171302_3687'

Score:        3379
Aligned:      3702        nucs
Identic:      3662 ( 99%) nucs =>       715 ( 99%)      2947 ( 99%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [29649697,29650419] EXCISED REGION [29651086,29654064]
 second seq =>  [       1,     720] EXCISED REGION [     721,    3687]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       666 nucs [29650420,29651085]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [29650420,29650423] to [29651086,29651089]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 29649697 CACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGA 29649756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACCTGTAATCCCAGCTACTTGGGAGACATTGCCGTTACTGGGCAAGTGTTCTTTCAAGA 60

 29649757 GCATCTTATCTGAATTACTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTGGGCCCCCGTGGCTCAC 29649816
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
       61 GCATCTTATCTGAATTACTATAGTACTAAAGAATGTCTAGGCTAGGCCCCCGTGGCTCAC 120

 29649817 TCCTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTC 29649876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCTGGAATGCTAACACTTTGGGAAGCTGAGGAGGGAGGATTGCTGGAGGCCAGGAGTTC 180

 29649877 AAGACCAACCTGGGCAACATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGC 29649936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGACCAACCTGGGCAACATAGCAAGACCCTTTCTCTAGAAAAAATGAAAACAACTTGGC 240

 29649937 CAGGTGTTGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTG 29649996
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAGGTGTGGTGGTACATGCCTTTAGTCCTAGGTGCTTAGGAGGTTGAGGTGGGAGGATTG 300

 29649997 CTTGAGCTCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTT 29650056
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTGAGCCCAGGAGTTTGAGGTTACAGTGAGCTATGATTGCACCACTGCATTCCAGCCTT 360

 29650057 GGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAA 29650116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCAATGGAGTGAGGCCCTATTTCTAAACAGAACAAAAAAAAAGAATGCCTGCTGATAAA 420

 29650117 CCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTA 29650176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTTGTGACAGGACATTCATGAAGGATGAAGAAAAGATTTCTTTTATTTTTTTATTTTTA 480

 29650177 TTTTTTTGAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAG 29650236
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCCGGCTGGAGTGCAGTGGCGCCATCTCAG 540

 29650237 CTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGG 29650296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCACTGCAACCTCCAACTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCGTGCCACCATACCCGG 600

 29650297 TTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAGTACACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAG 29650356
          ||||||||||||||||||||||||||   ||||.||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---AGTAGACACAGGGTTTCACCATGTTGGTCAG 657

 29650357 GCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 29650416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 GCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCATGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 717

 29650417 TAC 29650419
          |||
      718 TAC 720

EXCISED REGION

 29651086 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 29651145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGCTAGCGTGCAATGGTGTGATCTTGGCTCACTGCAACCTCCACCTCCCAGGTTCAAGC 780

 29651146 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAACCACATGCCAGCACGTCCGA 29651205
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      781 AATTCTCGTGCCTCAGCCTCCCCAGTAGCTGGGATTACAGCCACATGCCAGCACGTCCGA 840

 29651206 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 29651265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTAATTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGGTTTCACTATGTAGGCCAGGCTGGTCTCGA 900

 29651266 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCGT 29651325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|
      901 ACTCCTGACCTCAGGTGATCCGCTCGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGACTACAAGCAT 960

 29651326 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 29651385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGCCACCGTGCCTGGCCTGGCCCTATTTTATCTGGGTCTGACAAAAGTTATTTCATCCT 1020

 29651386 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 29651445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTATCTGCAATTTTTCCGCAGAAAATTACAGAGACGCACAGTGAATGTGAAAGGAGGGA 1080

 29651446 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 29651505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTAACAATAGCTATTGGCAGAGCCAAACAAATCATTACACTTTAGCTGGATCATCTGG 1140

 29651506 GAGTTGAGACCTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 29651565
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGTTGAGACGTTGAGGGTATAAGGAGGTAGCATGTCAATGCTTGTTAAGAAAGAATGGC 1200

 29651566 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 29651625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACAACTGTGCTGCCTTACAGATCAGCACCTTCTGCAGTCTGCGAGCCCAACCTTAGATC 1260

 29651626 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATC 29651685
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1261 CATTTGTAGGCAACAGTAAAAGGTCTCATATTTTCATCGCAGTGAGCCCTGACTGCCATT 1320

 29651686 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 29651745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGGAAGATTTGGTCCTCTAGGTAAGATTTCCCTGAGACAAAGTACTATGGGAAATCAAGT 1380

 29651746 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 29651805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCATATTCAGCCTCTTAGTACTCTGGGTTGGTGTTACCGTACTGACGAAGGCGATCCATT 1440

 29651806 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 29651865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATGAAAAACAAACTGACCTAAAGAAATGTAAATAAATGCTTGCAGTCAGCCCTGTTCCT 1500

 29651866 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 29651925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTGAAAAATTCCCCTAGCCCTTATGTTGAAACCTGATGAGAACTTTAAAAATGTTAACTT 1560

 29651926 GGTAATGGATGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 29651985
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTAATGGACGGAATCCTCCTCATTCAAGGTTACCCCTGTGCAAGTCAAGCTCAAGTCAG 1620

 29651986 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 29652045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTGAAGGTGCAAACCCCATGGACTCAGCCAGAGCCTATGGCTGTGGGTGCTAGATCCAA 1680

 29652046 GGCCAAAACTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 29652105
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGCCAAAATTGATGGCATCAGCCATCAGGATGTTTCTGCCCAATATAAAGTATTGGGTGG 1740

 29652106 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 29652165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTGAGAACACTGAAAGCTTGCCATGCAGAAAGAAACTGAAAGTAAATGCGTGACTTTAA 1800

 29652166 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCAATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 29652225
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGGAACAGAACTTGTTTCTCCCTCCATGCTCCCGATCCCTTTAGATCCCTTTATCTCACC 1860

 29652226 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 29652285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCAGCCACTTTAAGACAAAAGGTGATTAGAGGTGTAGAGAAGTTCTAATGGGATACATTC 1920

 29652286 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 29652345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATTTGCAGTAGTCCCCCAAGGTACTGTGATAGGCAGAATTCTAAAGATGCTTTCCCCCTC 1980

 29652346 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 29652405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAGATTGCTTCCCCTGGTTATTCAGTCAAATACTAATCAAAGTACAGATGCTCTTCAATT 2040

 29652406 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 29652465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TAAAATGGGGTTATGTTTCAATAAAACCATTGTAACTGAAAAATATTTTCAAGTGGAAAA 2100

 29652466 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 29652525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGTATTTAATGCACCTAACCTACTGAATATATTAGCTCAGCCTAGCCTACCTTAAATGTG 2160

 29652526 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCCTTGTATGAT 29652585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2161 CTCAGAACACATTTGCCTACAGTTGGGCAAAATCACTTAACACAAATCCCATTGTATGAT 2220

 29652586 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 29652645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAGTGTTGACTATCTCATGTAACTGGTTGCATACAGTACAGTATAGAGTACAGTATCAG 2280

 29652646 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 29652705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGTTACCATCATAATTGTGTGGCTGATGGGAGCTGCAGCTCACTACTGCTGTCCAGCAC 2340

 29652706 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 29652765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CGTCACAGAGTATCATACTCTCTAACCCAGGAAAATATCAAAATTCAAAGTACAGTTTAT 2400

 29652766 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 29652825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACTGAATGTGTGTTGCTTTCACATCATCATAAAGTTGAAAAACTGTAAGTTGAGCCATCG 2460

 29652826 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 29652885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TAAATCAGGGACCATCTGCACCACTATGTAGGGATTATGCTGTTGTAATTGAAGTCCCAA 2520

 29652886 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 29652945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GACAATTGACCATAAAACAGGTTATCTGGTTGGGCCTGATCTAACCACATGAACTCCTTA 2580

 29652946 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 29653005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGGGGCAGAAAAAACAAAGATCAAAGAGAAGTTGGGAAGATTCAAAGCAAAAGAAGTATT 2640

 29653006 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 29653065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CAGTGTACCATGGCTGTGTTTCAAGATGGAGGTGGCCATGAGCAAAAGAATGCAGGTAAC 2700

 29653066 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 29653125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTCCAGAAGCTGAGAGCAACCCTTGGTTGACAGCTAGCAAGGAAACAGGAACCTAATTCC 2760

 29653126 TATAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 29653185
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TACAATCACTTCTTCTCCCCTTGTCTTCTTCCCTTTCTTCGTGTGTAAGCGCATTATACT 2820

 29653186 ATCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 29653245
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTCTCTGTAAGCACAAAAATTGCCTAAAATTTAAGTGTAGTTTTCTGATCGCTTGTAAAA 2880

 29653246 CTGACACAGCTATAATTATCATCCATGTTAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 29653305
          |||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTGACACAGCTGTAATTATCATCCATGTGAAAAACACCATCCCAGTTAGAAACCTGTGAG 2940

 29653306 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTTATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 29653365
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCTCTCCCCAAGCAGAACCCATTGATCCTACACAGGTGTCATCAGAGCTGATTCCTTTCT 3000

 29653366 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGCTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 29653425
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ATGCCCCTTTATCTCTAATGTCCCTATTCTGTTCCTGTTTTCACTTCACCAGCAGCTTCT 3060

 29653426 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 29653485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CCAACTCCCTAGGCCAATGCCCTGAGAATTTCCCTTCCTCTCCCCCATCCTAGGGATGGA 3120

 29653486 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 29653545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAGTAGGGGTTGGTCCCCAGGATAAGCCACATTTATCCCTGGAAGCAGCAGCAGAAGTGA 3180

 29653546 CAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTC 29653605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CAGTATGTTTGTGGGGTCCACTTGTAACCTGGGAACCACTTGTTTTGGCCTGGAAACCTC 3240

 29653606 GCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCG 29653665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GCTCTGTCCCGAGGTCAGAATCCACGGTCACTAGGTGGAGAGGAAACATCTATGTCAGCG 3300

 29653666 TGGATTTGGGAAACACTTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGCGCCCCCTTGGGT 29653725
          ||||            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3301 TGGA------------TTCAGATTCCGAGCCTAACACGGGACTGGGGTGCCCCCTTGGGT 3348

 29653726 ACGTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGG 29653785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 ACGTTGTCCTGTCCAGTTGCTGAAAGCCAAAGGTGACAATGGGGAGGTCTCAACCTGAGG 3408

 29653786 AGGAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGCTGACCACACACAAGTGCCGAT 29653845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3409 AGGAGGCCAAAAGAGTCCGGTCTTCTGTTCTCAGCCCGGTGACCACACACAAGTGCCGAT 3468

 29653846 GTTCTGCTCTCTTGGATTCTGATTGAGCAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAAC 29653905
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 GTTCTGCTCTCTTGGATTCTGATTGAGTAGCCTGGGAGAGGACTGGGCTGCAGTCTAAAC 3528

 29653906 TGGACAGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCCC 29653965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3529 TGGACAGATATGGCTGGTGTGGAGGCTGGCTGTCAATGAGGGAGTGAAGGTAAGCCGCTC 3588

 29653966 GAAAAGTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAA 29654025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 GAAAAGTAGATAATTTTTACTTCCACTTTCTTTTTCTTTCCTGAGCACTAGTTATAAAAA 3648

 29654026 TATCCTTTTAAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGG 29654064
          |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3649 TATCCTTTTGAAATCTAAAATATTGGCCAGGCACGGTGG 3687

Alignment time is 2.63979 s

