
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4405] =>      4405 nucs 'mol-32-20fa-123113_4405'

Score:        4190
Aligned:      4458        nucs
Identic:      4387 ( 98%) nucs =>       251 (100%)      4136 ( 98%)
Gaps:           60 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141548373,141548624] EXCISED REGION [141550031,141554235]
 second seq =>  [        1,      252] EXCISED REGION [      255,     4401]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [253,254]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [253,253] to [255,255]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141548373 TATTTGAGATAAAATGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACT 141548432
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTTGAGATAAAACGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACT 60

141548433 ACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTC 141548492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTC 120

141548493 TGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATA 141548552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATA 180

141548553 TTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAG 141548612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAG 240

141548613 AAGTAAAATTTC 141548624
          ||||||||||||
      241 AAGTAAAATTTC 252

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      255 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 314

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      315 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 374

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
      375 GAAAAT------------------------------------------------------ 380

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      381 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 436

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      437 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 496

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      497 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 556

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      557 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 616

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      617 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 676

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      677 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 736

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      737 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 796

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 141550690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      797 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 856

141550691 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 141550750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      857 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 916

141550751 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 141550810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      917 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 976

141550811 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 141550870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      977 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 1036

141550871 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 141550930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1037 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 1096

141550931 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATAAGTCTTAAGCAAATAA 141550990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1097 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATAAGTCTTAAGCAAATAA 1156

141550991 AGAGATATACCATTTGCATGAATCGGAAGAGTCAGCTTAATAAATATTTTAATTATTCTC 141551050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 AGAGATATACCATTTGCATGAATCGGAAGAGTCAGCTTAATAAATATTTTAATTATTCTC 1216

141551051 AAATTAATCTATAAGCTTAACAAAATTCCTATCAAAATCCCACTATGTTACTTTTGTAGA 141551110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1217 AAATTAATCTATAAGCTTAACAAAATTCCTATCAAAATCCCACTATGTTACTTTTGTAGA 1276

141551111 CATTAAAAACAACTTGTTTTAAATTTTATATAGAAAGAAAGAAACCTCAGAATAGCTAAA 141551170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 CATTAAAAACAACTTGTTTTAAATTTTATATAGAAAGAAAGAAACCTCAGAATAGCTAAA 1336

141551171 ACAATCTTGATAAATAGAATAAAGTAAAAGAATGACTCCATCTAACTTTAGTACTTACTT 141551230
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1337 ACAATCTTGATAAATAGAATAAAGTAAAAGAATGACTCCATCTAACTTTAGTATTTACTT 1396

141551231 TATACCTATCGTTATAATTATAGTGCCATATTGATAGATAGACATATAGATCAATAGAGC 141551290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 TATACCTATCGTTATAATTATAGTGCCATATTGATAGATAGACATATAGATCAATAGAGC 1456

141551291 AGAATAGATAACTCGAAAATAGACCCATATAAATATGTCTGATTGATTTTTTACAAAGGA 141551350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 AGAATAGATAACTCGAAAATAGACCCATATAAATATGTCTGATTGATTTTTTACAAAGGA 1516

141551351 GCAAAAGCAATTATATGAGTATGGATATCCTTTTCAATAAATGATGCTAAAATAATTGCA 141551410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 GCAAAAGCAATTATATGAGTATGGATATCCTTTTCAATAAATGATGCTAAAATAATTGCA 1576

141551411 CAGCCATAGGCAAAATAAAATAAAACAAACCTCAATTTAAGTCTCACTTCATTCAAAAAT 141551470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 CAGCCATAGGCAAAATAAAATAAAACAAACCTCAATTTAAGTCTCACTTCATTCAAAAAT 1636

141551471 CAACTCAGGATAGATTAGGGAATTAAATTGTCAAATAGAAAACTACAAAAATCTTAAAAA 141551530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 CAACTCAGGATAGATTAGGGAATTAAATTGTCAAATAGAAAACTACAAAAATCTTAAAAA 1696

141551531 AATAGGAGAAAACCTTCTATATCAAGGACTAGGCAGAGGTTTTAGACTTGACACCAAAAA 141551590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 AATAGGAGAAAACCTTCTATATCAAGGACTAGGCAGAGGTTTTAGACTTGACACCAAAAA 1756

141551591 CACAATCCACTACAAGAAAAATTAGTTAAGTGGACACCATCAAAATTAAAAACTATTAGG 141551650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 CACAATCCACTACAAGAAAAATTAGTTAAGTGGACACCATCAAAATTAAAAACTATTAGG 1816

141551651 ATTAATAAGTTCTGGAGAGTATTGCACAGCATGATGACATAGTTGATAATAATGTTTTGT 141551710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 ATTAATAAGTTCTGGAGAGTATTGCACAGCATGATGACATAGTTGATAATAATGTTTTGT 1876

141551711 ATGTTTGAAAATTGCTAAGAGAGTAGGTCTTAAATGTTCTCATCACATAAAACATACGTG 141551770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 ATGTTTGAAAATTGCTAAGAGAGTAGGTCTTAAATGTTCTCATCACATAAAACATACGTG 1936

141551771 ATGTGATAGA-TTTTTTTTTTTTTTAGACGGAGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGTTGGAGTG 141551829
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 ATGTGATAGATTTTTTTTTTTTTTTAGACGGAGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGTTGGAGTG 1996

141551830 CAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGC 141551889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 CAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGC 2056

141551890 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGACCCCACCACCACGCCCGGCTAATTTTTTA 141551949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGACCCCACCACCACGCCCGGCTAATTTTTTA 2116

141551950 TATTTTTAGTAGTGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCCCCTGACCT 141552009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 TATTTTTAGTAGTGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCCCCTGACCT 2176

141552010 TGTGATCCGACCAAAGTGCTGGGATTGGAAGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCCTAGATATG 141552069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 TGTGATCCGACCAAAGTGCTGGGATTGGAAGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCCTAGATATG 2236

141552070 TTAATTAGCTTGATTTAATCACTTCGCAATGTAAACATATATCAAAACATCAGGCTATAT 141552129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 TTAATTAGCTTGATTTAATCACTTCGCAATGTAAACATATATCAAAACATCAGGCTATAT 2296

141552130 ACCATAAATACATGTAATTTTTGTCAATTACGCCTTCATATACCTGGGTGTATAACCAAA 141552189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 ACCATAAATACATGTAATTTTTGTCAATTACGCCTTCATATACCTGGGTGTATAACCAAA 2356

141552190 CTAACAAACAAAAAAATTAAAAAGAAGAAAACCTATTGCTCTGTGAAAGAACCTGTGAAG 141552249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 CTAACAAACAAAAAAATTAAAAAGAAGAAAACCTATTGCTCTGTGAAAGAACCTGTGAAG 2416

141552250 AGGGAAAAAAAGACAAACTACAAACTGGGAGAAAATGGTTGCAAACCACATATCTGACAA 141552309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 AGGGAAAAAAAGACAAACTACAAACTGGGAGAAAATGGTTGCAAACCACATATCTGACAA 2476

141552310 AGAAATAGTATCTACAGTATAAGAACTATTAAAATTCTTCATTAAAAATTCAACTTAAAA 141552369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 AGAAATAGTATCTACAGTATAAGAACTATTAAAATTCTTCATTAAAAATTCAACTTAAAA 2536

141552370 TGGGAAAATAAACAGACATTTCATCAAAGAAAATCCACATGTTGTGACTAAGCACATGAA 141552429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 TGGGAAAATAAACAGACATTTCATCAAAGAAAATCCACATGTTGTGACTAAGCACATGAA 2596

141552430 AATATACTTAATTCATTAAGTAAAATCAAAACAAGATGTATTTATATATTTAACGGAATG 141552489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 AATATACTTAATTCATTAAGTAAAATCAAAACAAGATGTATTTATATATTTAACGGAATG 2656

141552490 GATAAAATAAAAAATAATGACAGCACCAAATGCTAGTGAGATTGCAGAGAAACCAGATCA 141552549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 GATAAAATAAAAAATAATGACAGCACCAAATGCTAGTGAGATTGCAGAGAAACCAGATCA 2716

141552550 TTCATCAATGCCTGGTGGAAATATAAAATGATATAGCCATTCTGGAAAACAGTTTGGCAG 141552609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 TTCATCAATGCCTGGTGGAAATATAAAATGATATAGCCATTCTGGAAAACAGTTTGGCAG 2776

141552610 TTTCTTATAAAACTAAATACGGAATTACCATAGGATGACACTCAAGCGTTCATCCCAGAG 141552669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 TTTCTTATAAAACTAAATACGGAATTACCATAGGATGACACTCAAGCGTTCATCCCAGAG 2836

141552670 AATTGAAAACTTAAGTTTACATTACAAATCTCTATATGAGTATTTATTGCATTTTTATTA 141552729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 AATTGAAAACTTAAGTTTACATTACAAATCTCTATATGAGTATTTATTGCATTTTTATTA 2896

141552730 ATAGTCAACTAATAGCCCAAACCTGGAAGTACCACGGCTATCCTTCAATATACTAATTAA 141552789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 ATAGTCAACTAATAGCCCAAACCTGGAAGTACCACGGCTATCCTTCAATATACTAATTAA 2956

141552790 ACATGCTGTGGTACATGTATACCATGGAATATGACTCAGCAATACAAAGAAGGAATTATT 141552849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 ACATGCTGTGGTACATGTATACCATGGAATATGACTCAGCAATACAAAGAAGGAATTATT 3016

141552850 GATACATACAACACTTTGAATGTATTTTTAGGGAATATGCTGTGTGGGGGAAAAAAGCAA 141552909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 GATACATACAACACTTTGAATGTATTTTTAGGGAATATGCTGTGTGGGGGAAAAAAGCAA 3076

141552910 TCCCAAAGATTACATACTATATGATTCTATTTAAATAATTTTTTTTTAAAGATAAAATTT 141552969
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     3077 TCCCAAAGATTACATACTATATGATTCTATTTAAATAA-TTTTTTTTAAAGATAAAATTT 3135

141552970 TAGACATAGAAAGCCACTTAGTGGTTGCCAGGGTTTAGGGAGAGGGAGGAACAGGGAATG 141553029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3136 TAGACATAGAAAGCCACTTAGTGGTTGCCAGGGTTTAGGGAGAGGGAGGAACAGGGGATG 3195

141553030 TAACTATGCTGACAAGAGGGCAGTCTGAGAATCCATGTGGTGATACAACTGTTCCTTATC 141553089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3196 TAACTATGCTGACAAGAGGGCAGTCTGAGAATCCATGTGGTGATACAACTGTTCCTTATC 3255

141553090 TTTAATGTGATGGTGGATACACAAATGTACATATGTGACCAAAATGATTGAAACTAACAC 141553149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 TTTAATGTGATGGTGGATACACAAATGTACATATGTGACCAAAATGATTGAAACTAACAC 3315

141553150 ACAAACTCAGCTTTAAGTAAAACTGGAAAATGTGAATAAAATGAGTAGATTGTAGCAATG 141553209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 ACAAACTCAGCTTTAAGTAAAACTGGAAAATGTGAATAAAATGAGTAGATTGTAGCAATG 3375

141553210 TCATTCTTCTGAATGTAATACTCTATTCCAGTTTTTCAAATTGCTACCAATGAGGGATTC 141553269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 TCATTCTTCTGAATGTAATACTCTATTCCAGTTTTTCAAATTGCTACCAATGAGGGATTC 3435

141553270 TAAGTATATGCGATCTTTCTGTGTTGGTTCTTATAAGTGCATGTGAGTCTAAAATAATTT 141553329
          ||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 TAAGTATATGTGATCTTTCTGTGTTGTTTCTTATAAGTGCATGTGAGTCTAAAATAATTT 3495

141553330 TAAAATAAAGAATAACTTTTTAAAAAATCAATGAATTCATATTTACACCCACCCCCATGA 141553389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 TAAAATAAAGAATAACTTTTTAAAAAATCAATGAATTCATATTTACACCCACCCCCATGA 3555

141553390 TCATAATCGATCTCAAAATCTGTTAGTAGATCAACTCAATAATCTGAGTATTGACATTTT 141553449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3556 TCATAATCGATCTCAAAATCTGTTAGTAGATCAACTCAGTAATCTGAGTATTGACATTTT 3615

141553450 TTAAAAAAAGAAACAACTCAAATGGCTTTCCTGAAGAAAATTTTTTCAATGTAAGCAAGA 141553509
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3616 TTAAAAAAAGAAACAACTCAAATGGCTTTCCTGAATAAAATTTTTTCAATGTAAGCAAGA 3675

141553510 AAACTCAGTAAACGATCTTTTTTCATTATAGAAGAATTTTAGCTTAGCTATTCTAATAGG 141553569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3676 AAACTCAGTAAACGATCTTTTTTCATTATAGAAGAATTTTAGCTTAGCTATTCTAATAGG 3735

141553570 TAAATGAGTCATTAGTACTGAGTATTAAAATAGTGACATGAAAAGTTGAAGGTGTATTGA 141553629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3736 TAAATGAGTCATTAGTACTGAGTATTAAAATAGTGACATGAAAAGTTGAAGGTGTATTGA 3795

141553630 ATAATGATCATATTGATAATACCTGGACTTACTGATTAATCTTGGCATCAATAATAGCGG 141553689
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3796 ATAATGATCATATTGATAATACCTGGACTTATTGATTAATCTTGGCATCAATAATAGCGG 3855

141553690 AGAAATACATGTTATGTGTTCTACAACGTGTTGTAATAAAAATGTTATAGAAAAATCTAT 141553749
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3856 AGAAATACATGTTATGTGCTCTACAACGTGTTGTAATAAAAATGTTATAGAAAAATCTAT 3915

141553750 GAAGCCCTTTTGCCTAAAAATTTAAACCTGAATTTAATCGAATATTTATATACATGTCAA 141553809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3916 GAAGCCCTTTTGCCTAAAAATTTAAACCTGAATTTAATCGAATATTTATATACATGTCAA 3975

141553810 TAAACAGGAAATATATAGAATAAAATAAAAATTAAGTCACAATGGAGTATTTGGCTGAAT 141553869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3976 TAAACAGGAAATATATAGAATAAAATAAAAATTAAGTCACAATGGAGTATTTGGCTGAAT 4035

141553870 CCAGGATTTGGTACATTTTACAGAACAAATGTCTTAGTTTCTCTGTGAATATCAATGGCG 141553929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4036 CCAGGATTTGGTACATTTTACAGAACAAATGTCTTAGTTTCTCTGTGAATATCAATGGCG 4095

141553930 AAAATATGCTAAAGAGATGAATGGGACTGTTACAGAAAAAAACAACAAAAACAACAGAGC 141553989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 AAAATATGCTAAAGAGATGAATGGGACTGTTACAGAAAAAAACAACAAAAACAACAGAGC 4155

141553990 CCAAACAACCATTTTTTTGCATCCTAACTGAAACAAATCAACTATAAATATACTGTTTTG 141554049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4156 CCAAACAACCATTTTTTTGCATCCTAACTGAAACAAATCAACTATAAATATACTGTTTTG 4215

141554050 AGACTATTGTTAAAACTTGAATATATTCTAAGTATTTAACTTTTTAAAAAATTTATACAT 141554109
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4216 AGACTATTGTTAAAACTTGAATATATTCTAAGTATTTAACTTTTTAAAAAACTTATACAT 4275

141554110 TTTATTTTTGAGGAAAGGTCTTGCTCTGTCACCTGGGCTGAACACAGTGACGTGACCACA 141554169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4276 TTTATTTTTGAGGAAAGGTCTTGCTCTGTCACCTGGGCTGAACACAGTGACGTGACCACA 4335

141554170 GCTCACTGCAGCCTCAAACTCGGGCTCAAGCAAGCTCTCCCAACCAGCTAGGGCTGCAAG 141554229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4336 GCTCACTGCAGCCTCAAACTCGGGCTCAAGCAAGCTCTCCCAACCAGCTAGGGCTGCAAG 4395

141554230 TGTGCA 141554235
          ||||||
     4396 TGTGCA 4401

Alignment time is 3.34032 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     5112] =>      5112 nucs 'mol-32-21ec-004660_5112'

Score:        4840
Aligned:      5171        nucs
Identic:      5091 ( 98%) nucs =>      4466 (100%)       625 ( 91%)
Gaps:           65 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141544142,141548624] EXCISED REGION [141550031,141550714]
 second seq =>  [        1,     4484] EXCISED REGION [     4487,     5112]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [4485,4486]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4485,4485] to [4487,4487]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141544142 AGGAAAAAGTAAAATTATCTCTGTCCATTAGATGAATGGGAAAAATATTTTCTGATATGG 141544201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGAAAAAGTAAAATTATCTCTGTCCATTAGATGAATGGGAAAAATATTTTCTGATATGG 60

141544202 AATTAATATCCAGAATATATAGAGAACTTATAAAACTCTACAACAACAAAAGCAAACAAC 141544261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTAATATCCAGAATATATAGAGAACTTATAAAACTCTACAACAACAAAAGCAAACAAC 120

141544262 CCAATTCCAAAACTGGCAAAAAACTTGAATAGGCATTTCTCAAAGCAAGATAACGCAAAT 141544321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAATTCCAAAACTGGCAAAAAACTTGAATAGGCATTTCTCAAAGCAAGATAACGCAAAT 180

141544322 GTCCAATAAGTACATGAAAAGATACTCAACATCACTAACTATTAGGAAAATACAGATCAA 141544381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCCAATAAGTACATGAAAAGATACTCAACATCACTAACTATTAGGAAAATACAGATCAA 240

141544382 AACTACAATGAAATACCACTTTGTAAGCATCAGGATGGGTACTATCAAACAAACCAGAAA 141544441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACTACAATGAAATACCACTTTGTAAGCATCAGGATGGGTACTATCAAACAAACCAGAAA 300

141544442 ATAAAAACTGTTGATGAAAACATTGAAAAACTGCAATACTTGGGGAAATTCAAAATGGTA 141544501
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAAAAACTGTTGATGAAAACATTGAGAAACTGCAATACTTGGGGAAATTCAAAATGGTA 360

141544502 CGCTCAATATGAAAACCAGTATGGTGTTTTCTCAAAAAATTAATAATAAATATAATTACC 141544561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGCTCAATATGAAAACCAGTATGGTGTTTTCTCAAAAAATTAATAATAAATATAATTACC 420

141544562 ATAGAATTCAGCAATTTCACTTCTGAGCATATGCCCAAAAGAGTTGAAAGAAAGATCTTG 141544621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAGAATTCAGCAATTTCACTTCTGAGCATATGCCCAAAAGAGTTGAAAGAAAGATCTTG 480

141544622 AAGAGATATTTGTACACCTAATTATCTATAGCAGCATTATTCACAGCAGCCAAAAGATGG 141544681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGAGATATTTGTACACCTAATTATCTATAGCAGCATTATTCACAGCAGCCAAAAGATGG 540

141544682 AACCAAACCAAGTGTCTATTGATGGATTAATGGAAAAGCAAAATGTAGTATGTACATACA 141544741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AACCAAACCAAGTGTCTATTGATGGATTAATGGAAAAGCAAAATGTAGTATGTACATACA 600

141544742 ATGGAACACTATTCAGCCTTAAAAAAGAAGCAAATTTTGACCTATGTTACAACAAGGATG 141544801
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      601 ATGGAACACTATTCAGCCTTAAAAAAGAAGCAAATTTTGACCTATGTTACAACAAGGATC 660

141544802 AACCTTAAGGTCACCTAAGTGAAATAAGCCTGTTATAAATACTGTGTGAGTCCACATATG 141544861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACCTTAAGGTCACCTAAGTGAAATAAGCCTGTTATAAATACTGTGTGAGTCCACATATG 720

141544862 TGAGGTAAATCATAGAGACAGAAAGTTGATTATAGTTTTCAGAGGCTAGGGAGAAGGAAA 141544921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGAGGTAAATCATAGAGACAGAAAGTTGATTATAGTTTTCAGAGGCTAGGGAGAAGGAAA 780

141544922 ATTAGGGAGTATAGAGTTTTGGTTTTATAAGATTAAAAGACTTATAGAGATGAATGGTAG 141544981
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTAGGGAGTATAGAGTTTTAGTTTTATAAGATTAAAAGACTTATAGAGATGAATGGTAG 840

141544982 TGATGGTCGCACAGTAAGAATATATTTACTTTGGGAGGCCGAGACGGGCGGATCACGAGG 141545041
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTATGGTCGCACAGTAAGAATATATTTACTTTGGGAGGCCGAGACGGGCGGATCACGAGG 900

141545042 TCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAA 141545101
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      901 TCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAA 960

141545102 AAATTAGCCGGGCATGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGAAA 141545161
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      961 AAATTAGCCGGGCATGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACATGGGAGGCTGAGGAAA 1020

141545162 AAGAATATATTTAACACCACTGAATTGTACACTTGAGAACAGTTAACATGATACAGTTTA 141545221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGAATATATTTAACACCACTGAATTGTACACTTGAGAACAGTTAACATGATACAGTTTA 1080

141545222 TGATATGTATATTTTACTATAATAAAATCTAGGAAAATAATGTATTTTTAATGGCCAAAA 141545281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGATATGTATATTTTACTATAATAAAATCTAGGAAAATAATGTATTTTTAATGGCCAAAA 1140

141545282 GAAAATTTGCTTCCTTTTTTCAGAATTAAAAGTATTTGACTATATGAGAAGTATACCACT 141545341
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAAAATTTGCTTCCTTTTTTCAGAATTAAAAGTATTTGACTATATGAGAAGTATACCACT 1200

141545342 TTATTTTTTCTTGAGAGAAATGCCAATAAAAATGGACCTCACATGGCTCCTGTTGAATAT 141545401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTATTTTTTCTTGAGAGAAATGCCAATAAAAATGGACCTCACATGGCTCCTGTTGAATAT 1260

141545402 ACCTCCATTTATTTAAGTTTCCACAATCAGTCTGTTTTCTGTGCGTTCATGTCTGTGTTT 141545461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCTCCATTTATTTAAGTTTCCACAATCAGTCTGTTTTCTGTGCGTTCATGTCTGTGTTT 1320

141545462 ATGTGAGGACATGTGTTTGTGTCTACAAGCAGAAGGCTTCGAGTTGAGAAAGCAAATGGT 141545521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGTGAGGACATGTGTTTGTGTCTACAAGCAGAAGGCTTCGAGTTGAGAAAGCAAATGGT 1380

141545522 AAGAAAAACTGCATAAAAATGAATGTGAAGAAAAAAGGTAATAACTGGTTATGAGTGACC 141545581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1381 AAGAAAAACTGCATAAAAATGAATGTGAAGAAAAAAGGTAATAACTAGTTATGAGTGACC 1440

141545582 TATGTTGAAGAGAAATTAAAATGAATTTTCTCCCTAGATTTAATAAGTAATCATTTCCCA 141545641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TATGTTGAAGAGAAATTAAAATGAATTTTCTCCCTAGATTTAATAAGTAATCATTTCCCA 1500

141545642 TATAACAGTATTTGAATAAGTGATCAAACATATGTTCCATTTTATGTGTCTTTGAAAACA 141545701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATAACAGTATTTGAATAAGTGATCAAACATATGTTCCATTTTATGTGTCTTTGAAAACA 1560

141545702 TAAGAATTACATTTCTGCTTTGGTCAGCAGCAGAAAACAAAATAATAACTGTAATTAAAG 141545761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAAGAATTACATTTCTGCTTTGGTCAGCAGCAGAAAACAAAATAATAACTGTAATTAAAG 1620

141545762 TTATATAACCTATATATACAAAAGATAATTTGGTATAAGAACTGAGGCTTTAAATTTATT 141545821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTATATAACCTATATATACAAAAGATAATTTGGTATAAGAACTGAGGCTTTAAATTTATT 1680

141545822 TTCAAAGCATAATACTGGATTTTAAATAAGGTTAATTTCAATGTGTCCACACAGCCTCAA 141545881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCAAAGCATAATACTGGATTTTAAATAAGGTTAATTTCAATGTGTCCACACAGCCTCAA 1740

141545882 GAAAATTGTTTTCAAATAAGTAAAAATATTATATGTGGCTGTGTTTCATTAGCACTTTTT 141545941
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAAAATTGTTTTCAAGTAAGTAAAAATATTATATGTGGCTGTGTTTCATTAGCACTTTTT 1800

141545942 GCCACAAGGCATAATATTGAGCTAATATAAATATGAGCAACACATTTCCTTAAAGATAGG 141546001
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCACAAGGCATAATATTGAGCTAATATAAACATGAGCAACACATTTCCTTAAAGATAGG 1860

141546002 ACAATTGCAGAGAAAAAAGCCTGCATTATAGATATATAATAGTTCGCTTCAAAATAGAAT 141546061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACAATTGCAGAGAAAAAAGCCTGCATTATAGATATATAATAGTTCGCTTCAAAATAGAAT 1920

141546062 TCAATGTCATTAATTTCTGTTTTCATCATATATAAAAAAATTTGTATAGTAAGGAGTGTA 141546121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCAATGTCATTAATTTCTGTTTTCATCATATATAAAAAAATTTGTATAGTAAGGAGTGTA 1980

141546122 ATTGTAATGCATAGGAGTATACAAGACATAGAAAAGGATTTGCTATATACACATATTTTG 141546181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTGTAATGCATAGGAGTATACAAGACATAGAAAAGGATTTGCTATATACACATATTTTG 2040

141546182 ATATTTTTTACACTATTATAAAATGGTCTGTATATGACTTGCTAACTTAGACAAAACAGA 141546241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATATTTTTTACACTATTATAAAATGGTCTGTATATGACTTGCTAACTTAGACAAAACAGA 2100

141546242 ATCTCTACTGATGGATGTCATTTCCCCCAGATTGCAGTTGATACCATATATTTATGTTTG 141546301
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATCTCTACTGATGGATGTCATTTCCCC-AGATTGCAGTTGATACCATATATTTATGTTTG 2159

141546302 ACCAATATTCTTGAGTATACAATTAGTGCCTAGTTGTTTAGCAATCCATTACTTAATTGC 141546361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ACCAATATTCTTGAGTATACAATTAGTGCCTAGTTGTTTAGCAATCCATTACTTAATTGC 2219

141546362 CTGTAGTTTCATTTAAACGAGGTTTTTATTTTTGAATTATTGGCAGCACTCAGTACAATA 141546421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CTGTAGTTTCATTTAAACGAGGTTTTTATTTTTGAATTATTGGCAGCACTCAGTACAATA 2279

141546422 AGAATCTTTTCTTTTAACCCATCTCTGTACCGTTACAAACCTTTCATTCTCTATTACACT 141546481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AGAATCTTTTCTTTTAACCCATCTCTGTACCGTTACAAACCTTTCATTCTCTATTACACT 2339

141546482 TCCTTGAACAAGTTTAAGATCACCCTAGATCCCGCCATACTCGTTCATTTATTCTTCAAT 141546541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TCCTTGAACAAGTTTAAGATCACCCTAGATCCCGCCATACTCGTTCATTTATTCTTCAAT 2399

141546542 CCAAATCAATCTTTTAATATCTCTTCCTGAATCTCAATTTACAATTGGCTTAGTTCACAC 141546601
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2400 CCAAATCAATCTTTTAATATCTCTTCCTGAATCTCAATTTATAATTGGCTTAGTTCACAC 2459

141546602 TTAAATATTTTACCTAAAATGCTAGTGGAATTTCAAATATCTAAATATTAGAAAATTAAT 141546661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTAAATATTTTACCTAAAATGCTAGTGGAATTTCAAATATCTAAATATTAGAAAATTAAT 2519

141546662 ATCAACAAATACATGTTTGTTTCAACAGTGACATAAGAACATGTTTAAACTGTACAATAA 141546721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ATCAACAAATACATGTTTGTTTCAACAGTGACATAAGAACATGTTTAAACTGTACAATAA 2579

141546722 TGAAAAAGCAAATTTTCAAAATATAAGAGGTGCAGTACAAGTAGTAGTTGTAGGAAATGT 141546781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TGAAAAAGCAAATTTTCAAAATATAAGAGGTGCAGTACAAGTAGTAGTTGTAGGAAATGT 2639

141546782 TATATTTTTCTGTGCTGATTTAAATTGAAAAATTTAAAATCAAAGATACAAGCTCTGACA 141546841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TATATTTTTCTGTGCTGATTTAAATTGAAAAATTTAAAATCAAAGATACAAGCTCTGACA 2699

141546842 TTAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAACCCAACTATACCTAACATAAACAAATAGAGGATA 141546901
          ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TTAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAA--CCCAACTATACCTAACATAAACAAATAGAGGATA 2757

141546902 TAGTAAGATAACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTTTTT 141546961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TAGTAAGATAACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTTTTT 2817

141546962 AAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAG 141547021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 AAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAG 2877

141547022 AGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCA 141547081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 AGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCA 2937

141547082 CACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTAC 141547141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 CACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTAC 2997

141547142 TTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAA 141547201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAA 3057

141547202 ATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTA 141547261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 ATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTA 3117

141547262 AAAAGAAAGAAACAAA----AACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATG 141547317
          ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 AAAAGAAAGAAACAAATAAAAACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATG 3177

141547318 AAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTC 141547377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 AAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTC 3237

141547378 TACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATC 141547437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 TACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATC 3297

141547438 TTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGA 141547497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGA 3357

141547498 TCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCA 141547557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCA 3417

141547558 ATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGA 141547617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 ATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGA 3477

141547618 TGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAA 141547677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 TGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAA 3537

141547678 CACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAA 141547737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 CACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAA 3597

141547738 TGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAA 141547797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAA 3657

141547798 GTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTA 141547857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 GTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTA 3717

141547858 GAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCT 141547917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 GAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCT 3777

141547918 GTGTTAATTTCCTCTTCTTATAAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGA 141547977
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 GTGTTAATTTCCTCTTCTTATGAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGA 3837

141547978 CAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTA 141548037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 CAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTA 3897

141548038 GATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAAT 141548097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 GATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAAT 3957

141548098 ACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTC 141548157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 ACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTC 4017

141548158 ATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGT 141548217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 ATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGT 4077

141548218 TAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTT 141548277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTT 4137

141548278 AAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAA 141548337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 AAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAA 4197

141548338 TAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAATGTAATTGTAA 141548397
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4198 TAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAACGTAATTGTAA 4257

141548398 ACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACAT 141548457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 ACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACAT 4317

141548458 ATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGT 141548517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 ATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGT 4377

141548518 CACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATA 141548577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 CACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATA 4437

141548578 AAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 141548624
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 AAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 4484

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4487 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 4546

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4547 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 4606

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     4607 GAAAAT------------------------------------------------------ 4612

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 4668

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 4728

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 4788

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4789 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 4848

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 4908

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4909 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 4968

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4969 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 5028

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 141550690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5029 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 5088

141550691 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTAC 141550714
          ||||||||||||||||||||||||
     5089 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTAC 5112

Alignment time is 3.8702 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     8371] =>      8371 nucs 'mol-32-2874-077980_8371'

Score:        8021
Aligned:      8431        nucs
Identic:      8343 ( 99%) nucs =>      8069 (100%)       274 ( 83%)
Gaps:           66 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141540530,141548624] EXCISED REGION [141550031,141550362]
 second seq =>  [        1,     8095] EXCISED REGION [     8098,     8371]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [8096,8097]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [8096,8096] to [8098,8098]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141540530 GTCTTTCCCTGCAAGAAAAGTTCAAGGGAGTCCTGCAAGATGACATAAAATGGCACCAGA 141540589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTTTCCCTGCAAGAAAAGTTCAAGGGAGTCCTGCAAGATGACATAAAATGGCACCAGA 60

141540590 CAATAACTTGAAGTCATATGAAGAAATAAAGGTATTAGTAAACTTAAGCACACTGGCAGT 141540649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATAACTTGAAGTCATATGAAGAAATAAAGGTATTAGTAAACTTAAGCACACTGGCAGT 120

141540650 TATAAAAGGTAGTATTATTCTAACAATGATTGATAAGTTCACTTTTGTTTTCTACATGAT 141540709
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAAAAGCTAGTATTATTCTAACAATGATTGATAAGTTCACTTTTGTTTTCTACATGAT 180

141540710 TTAAAAGAGACTAATAAAATTTCAAAAAGCAATTATTAGTGTAAAAGCTAGTATTATTAT 141540769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAAAAGAGACTAATAAAATTTCAAAAAGCAATTATTAGTGTAAAAGCTAGTATTATTAT 240

141540770 GACTTTTATCACTAATTCACCATTTTGTTTTCTAAATAATTTTAAAAAACTATAAATTTA 141540829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACTTTTATCACTAATTCACCATTTTGTTTTCTAAATAATTTTAAAAAACTATAAATTTA 300

141540830 AAAATAATTATGTTTATATTTTAGGGGACACAGTGTATAAACATGTCTGGTGACATCAAG 141540889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAATAATTATGTTTATATTTTAGGGGACACAGTGTATAAACATGTCTGGTGACATCAAG 360

141540890 AACCAAAATGAATGGGAATGAAGCTGCTACAATTATTTTTGTATAATAATATACGATAAA 141540949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACCAAAATGAATGGGAATGAAGCTGCTACAATTATTTTTGTATAATAATATACGATAAA 420

141540950 AAATTATTATATAGTATTGAAGTTAAGCTGGCATAAAATTAGGATATAACTTTAGGATGT 141541009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAATTATTATATAGTATTGAAGTTAAGCTGGCATAAAATTAGGATATAACTTTAGGATGT 480

141541010 TAAATTAAATGTAATTTCCATATTAACCACATAGAAATAAACTGTAGAATATATACAAAA 141541069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAATTAAATGTAATTTCCATATTAACCACATAGAAATAAACTGTAGAATATATACAAAA 540

141541070 GGAAATATGAAAGCAATTTAAATGTTTCACTACAGAAAAAATAACAAAACACAAAAGAAG 141541129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAAATATGAAAGCAATTTAAATGTTTCACTACAGAAAAAATAACAAAACACAAAAGAAG 600

141541130 ACAGCAATGCAGGAAATGAAGGACACATAAGCTATAAGCATATAAAAATGTTCTACCAAA 141541189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAGCAATGCAGGAAATGAAGGACACATAAGCTATAAGCATATAAAAATGTTCTACCAAA 660

141541190 CATTGAAAGAAGAATCACCAGCAATCCATCTCAAACTTTTTCTAAAAATTGAGATGTGGG 141541249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATTGAAAGAAGAATCACCAGCAATCCATCTCAAACTTTTTCTAAAAATTGAGATGTGGG 720

141541250 AATACTATCTAACTCATACTATGGGGCCAGCATCTTCCTCTGTATTAGTCCATTTTTACA 141541309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATACTATCTAACTCATACTATGGGGCCAGCATCTTCCTCTGTATTAGTCCATTTTTACA 780

141541310 CTGCTACAGTGATACTACCTGACAAGAAGTAATGTATTTAAAAAAGAGGTTTAACTGACT 141541369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGCTACAGTGATACTACCTGACAAGAAGTAATGTATTTAAAAAAGAGGTTTAACTGACT 840

141541370 CACAGTTCTCTATGGCTGGGAATGTCTCAGGAAACGTTCAATCATGGTGAAAGGTAAAGG 141541429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CACAGTTCTCTATGGCTGGGAATGTCTCAGGAAACGTTCAATCATGGTGAAAGGTAAAGG 900

141541430 GGAAGCAAGTGCCTTCTTCACAAGGTGGCTGCAGACAGAAAGAGAAAAAGGCTGAGGACA 141541489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGAAGCAAGTGCCTTCTTCACAAGGTGGCTGCAGACAGAAAGAGAAAAAGGCTGAGGACA 960

141541490 TTCACCACTTAAAACCATCAGATCTCCTGAGAACTCACTCACTATAATGAGAACAGCAAG 141541549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCACCACTTAAAACCATCAGATCTCCTGAGAACTCACTCACTATAATGAGAACAGCAAG 1020

141541550 GAGGAAACTTCCCCCATTATCCAATCACCAGCCACCAAGTCTCTCCATTGACATGTGGGG 141541609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGGAAACTTCCCCCATTATCCAATCACCAGCCACCAAGTCTCTCCATTGACATGTGGGG 1080

141541610 ATTACAATTAGAGATGAGATTTGGTTGGGAAGACAGAGCCAAACCATATAATTCTGCCCC 141541669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTACAATTAGAGATGAGATTTGGTTGGGAAGACAGAGCCAAACCATATAATTCTGCCCC 1140

141541670 TGGCCCTATCCAAATCTCATGTCCTTCTCACATTTTTAAACACAATTATGCTTTCTCAAC 141541729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGCCCTATCCAAATCTCATGTCCTTCTCACATTTTTAAACACAATTATGCTTTCTCAAC 1200

141541730 AGTCCTCCAAAGTGTTAACTCATTCCAGTATTAACTCAAAAGTCCAAGTTCACAGTCTCA 141541789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTCCTCCAAAGTGTTAACTCATTCCAGTATTAACTCAAAAGTCCAAGTTCACAGTCTCA 1260

141541790 TCTGAGACAAGCCAAGTCCCTTCTGCCTATGAGCCTGTGAAATTAAAAAAAAAATTACTT 141541849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTGAGACAAGCCAAGTCCCTTCTGCCTATGAGCCTGTGAAATTAAAAAAAAAATTACTT 1320

141541850 ACCTCCAAGATACAATGGGGCTACAGGCATTGGGTAAATGTTTTCCTTCCAAAAGGCAGA 141541909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACCTCCAAGATACAATGGGGCTACAGGCATTGGGTAAATGTTTTCCTTCCAAAAGGCAGA 1380

141541910 AATTGACCAAAACAAAGGGGACAAAGGCCCCATTTATGTCCAAAACCCTACTAGGCAGTT 141541969
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATTGACCAAATCAAAGGGGACAAAGGCCCCATTTATGTCCAAAACCCTACTAGGCAGTT 1440

141541970 ATTAAATCTTACAACTTCAAAATCTCCTTTGACTCCATGTGTCACACCCAGGGAATGCTG 141542029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTAAATCTTACAACTTCAAAATCTCCTTTGACTCCATGTGTCACACCCAGGGAATGCTG 1500

141542030 ATGCAAAGGGTAGGCCCCCACAGCCTTGGGCAGCTCTGCCACTATGGTGGTGCAGGGTAC 141542089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGCAAAGGGTAGGCCCCCACAGCCTTGGGCAGCTCTGCCACTATGGTGGTGCAGGGTAC 1560

141542090 AGCCCCTGTGGCTGCTTTCACAAGCTGGCATTTAATGCCTGTGGTTTTTTCATGTACACA 141542149
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1561 AGCCCCTGTGGCTGCTTTCACAAGCTGGCATTTAATGCCTGTGGTTTTTTCATATACACA 1620

141542150 GTGCAAGATGTCAGTGGATCTACCATTCTGTGGTCTGGAGGATGGTAGACCTCTTCTCAC 141542209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTGCAAGATGTCAGTGGATCTACCATTCTGTGGTCTGGAGGATGGTAGACCTCTTCTCAC 1680

141542210 AGCTCCACTAGGCAGTGCCTCAGTGTGAGACTCCAACCCCACTTTTCCCTGCTGCACTAT 141542269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGCTCCACTAGGCAGTGCCTCAGTGTGAGACTCCAACCCCACTTTTCCCTGCTGCACTAT 1740

141542270 CCTATCTGAGGTTCTCCGTAGGGCTCTGCCCTTGCAGCAGACTTCTGCCTGGATATTCAG 141542329
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTATCTGAGGTTCTCCATAGGGCTCTGCCCTTGCAGCAGACTTCTGCCTGGATATTCAG 1800

141542330 GTGTTTCTATACATCCTATGAAACCTAGGTGGAGGTTCCCAAACCTCAACTCTTGTTGTC 141542389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTGTTTCTATACATCCTATGAAACCTAGGTGGAGGTTCCCAAACCTCAACTCTTGTTGTC 1860

141542390 TGTGCATGTGTAGGCTCAACATCACATGGAAGCCTTCGAGGCTTGGGCTTGTACCCTCAG 141542449
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1861 TGTGCATGTGTAGGCTCAACATCACATGGAAGCCTTCAAGGCTTGGGCTTGTACCCTCAG 1920

141542450 AAGCAATGACCCAAGCTGTACCATGGCCCCTTTAGCCATGGCTAGAGTTGGAGCAGTTGG 141542509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAGCAATGACCCAAGCTGTACCATGGCCCCTTTAGCCATGGCTAGAGTTGGAGCAGTTGG 1980

141542510 GATGCAAGATGCCATGTCCAGGGGCAGCACACAGCAGGGGAGGCCTGGGGCCAGCCCAAT 141542569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GATGCAAGATGCCATGTCCAGGGGCAGCACACAGCAGGGGAGGCCTGGGGCCAGCCCAAT 2040

141542570 AACCCATCTTTCCCTCCTAGGCCTCCAACCTTGTTATGGGAGGGGTTGCTGTGAAGATCT 141542629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AACCCATCTTTCCCTCCTAGGCCTCCAACCTTGTTATGGGAGGGGTTGCTGTGAAGATCT 2100

141542630 CTGACATGCCCTGGAGATATTTTCTTCCCATTTTCTTGGCTATTAATATTCGGCTTCTTG 141542689
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTGACATGCCCTGGAGATATTTTCTTGCCATTTTCTTGGCTATTAATATTCGGCTTCTTG 2160

141542690 TTACTTATAAAAATTTCTGCAACCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGTTTTTTCTTT 141542749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTACTTATAAAAATTTCTGCAACCAGCTTGAATTTCTCCCCAGAAAATGGTTTTTTCTTT 2220

141542750 TCTATCACATGGCCAGGCTGCAAGTTTTCAAAAATTTTATGCTCTGCTTCCATTTTAAGC 141542809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCTATCACATGGCCAGGCTGCAAGTTTTCAAAAATTTTATGCTCTGCTTCCATTTTAAGC 2280

141542810 ATAAGTTCCAATTTCACCCCATCCCTTTGTGAGAACATATAACTGTATGCTTTCAGGAAA 141542869
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2281 ATAAGTTCCAATTTCACCCCATCCCTTTGTGAGAACATATAACTGCATGCTTTCAGGAAA 2340

141542870 AGCCAGATCACCTCTTTAATGTTTTGCTGCTTTGAAATTTCTTCTGCCAGATACCCTAAA 141542929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGCCAGATCACCTCTTTAATGTTTTGCTGCTTTGAAATTTCTTCTGCCAGATACCCTAAA 2400

141542930 TACTCTCTCAAGTTCAAAATTTTACAGATCTATAGGGTAGGGACAAAATGCCACCAGTCT 141542989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TACTCTCTCAAGTTCAAAATTTTACAGATCTATAGGGTAGGGACAAAATGCCACCAGTCT 2460

141542990 TTTTGTTAAAGCTTATCAAGAATCACCATTACTCCACTTCCCGATAAGTTCATCTCTATC 141543049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTTGTTAAAGCTTATCAAGAATCACCATTACTCCACTTCCCGATAAGTTCATCTCTATC 2520

141543050 TGAGATCACCTCAGTCTGGACTTCATTATCTGTATCACTGTCAGCATTTTGGTCAAAGTT 141543109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGAGATCACCTCAGTCTGGACTTCATTATCTGTATCACTGTCAGCATTTTGGTCAAAGTT 2580

141543110 ATTCAACAAGTCTCTAGGAAGTTCTAAACTTTTTCACATCTTCCCATCTTCTTCTAAGCC 141543169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTCAACAAGTCTCTAGGAAGTTCTAAACTTTTTCACATCTTCCCATCTTCTTCTAAGCC 2640

141543170 CTCCAAACTGTTGCAACTTCTGCCTGTTACCCAGTTCCAAAGTTGTTTCTACATTTTCAG 141543229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTCCAAACTGTTGCAACTTCTGCCTGTTACCCAGTTCCAAAGTTGTTTCTACATTTTCAG 2700

141543230 TTTATAGAGGTACCGCACTCCTGGTACCAATTTCTATATTAGTCCATTTTCACAATGCTG 141543289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTATAGAGGTACCGCACTCCTGGTACCAATTTCTATATTAGTCCATTTTCACAATGCTG 2760

141543290 TAGAAATATTTCCTGAGACTCCGTAATTTATAAAGGAAAGAAGTTTAATTGACTCACAAT 141543349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAGAAATATTTCCTGAGACTCCGTAATTTATAAAGGAAAGAAGTTTAATTGACTCACAAT 2820

141543350 TCCACATGGCTGGGAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCGTGGCAGAAGGCAAAGGAGAAGC 141543409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCCACATGGCTGGGAAGGCCTCAGGAAACTTACAATCGTGGCAGAAGGCAAAGGAGAAGC 2880

141543410 AAATACCTTCTTCACAAGGCAGCAGACAGAGAGAGAGCACAGGGAAAACTGCCACTTTTA 141543469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAATACCTTCTTCACAAGGCAGCAGACAGAGAGAGAGCACAGGGAAAACTGCCACTTTTA 2940

141543470 AAACCATCAGGTCTCATGAGAACTCCCTCACTATAAAGAGAACAGCGTGGAGGAATCTGC 141543529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAACCATCAGGTCTCATGAGAACTCCCTCACTATAAAGAGAACAGCGTGGAGGAATCTGC 3000

141543530 CCCCATGACCTAATCACCTCTCAACATGTTCTTCCCTCCACATGTGGAGATTAAAATTTG 141543589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCCCATGACCTAATCACCTCTCAACATGTTCTTCCCTCCACATGTGGAGATTAAAATTTG 3060

141543590 AGATGAGATTTGGTTGGGGACACAGAGCCAAACCATAGCACCCTGCTACCAAAATCAATG 141543649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGATGAGATTTGGTTGGGGACACAGAGCCAAACCATAGCACCCTGCTACCAAAATCAATG 3120

141543650 TCACTATAAGAAAACTATACCATTATCTCTTTAAAAATATACATGCAAAATTCCTCAAAA 141543709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCACTATAAGAAAACTATACCATTATCTCTTTAAAAATATACATGCAAAATTCCTCAAAA 3180

141543710 GAGTAATATCAAACTGGAGTTCAGCAGAATATTAAAAGGATTATACACAATGACCAAGGA 141543769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAGTAATATCAAACTGGAGTTCAGCAGAATATTAAAAGGATTATACACAATGACCAAGGA 3240

141543770 GGATTTATTCTGGGAATGCAAGAATGGTTCAACTTACGAAAATCTATAAATGTAGCAACA 141543829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGATTTATTCTGGGAATGCAAGAATGGTTCAACTTACGAAAATCTATAAATGTAGCAACA 3300

141543830 CATAAACAAAATAAATGAAAGAAAAAAACACATAATTATCTTGATTGAGGCAGAAAAAGT 141543889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CATAAACAAAATAAATGAAAGAAAAAAACACATAATTATCTTGATTGAGGCAGAAAAAGT 3360

141543890 CATTTGACAAAATTCAACATCCTGACATGGGAAAAGTACTCAACAAACTATTTTTAGAAG 141543949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CATTTGACAAAATTCAACATCCTGACATGGGAAAAGTACTCAACAAACTATTTTTAGAAG 3420

141543950 GAAACTACCTCAAGTAATAAAGCCATATAGAAAAACATGCAGGGAGCATCATACTCAATG 141544009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GAAACTACCTCAAGTAATAAAGCCATATAGAAAAACATGCAGGGAGCATCATACTCAATG 3480

141544010 AGGAATGTCTAACAACTTTTTCTCTAAGAGGGAACAAGACAAGGCTGCTCACTTTAATCA 141544069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGGAATGTCTAACAACTTTTTCTCTAAGAGGGAACAAGACAAGGCTGCTCACTTTAATCA 3540

141544070 CTTCGAAGCACTAGAAGTTCTAGTCAGAGACATCAGGCAACAAAAATAACCAAAATTGCA 141544129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTTCGAAGCACTAGAAGTTCTAGTCAGAGACATCAGGCAACAAAAATAACCAAAATTGCA 3600

141544130 TTCAAATTGGAAAGGAAAAAGTAAAATTATCTCTGTCCATTAGATGAATGGGAAAAATAT 141544189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTCAAATTGGAAAGGAAAAAGTAAAATTATCTCTGTCCATTAGATGAATGGGAAAAATAT 3660

141544190 TTTCTGATATGGAATTAATATCCAGAATATATAGAGAACTTATAAAACTCTACAACAACA 141544249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTTCTGATATGGAATTAATATCCAGAATATATAGAGAACTTATAAAACTCTACAACAACA 3720

141544250 AAAGCAAACAACCCAATTCCAAAACTGGCAAAAAACTTGAATAGGCATTTCTCAAAGCAA 141544309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAAGCAAACAACCCAATTCCAAAACTGGCAAAAAACTTGAATAGGCATTTCTCAAAGCAA 3780

141544310 GATAACGCAAATGTCCAATAAGTACATGAAAAGATACTCAACATCACTAACTATTAGGAA 141544369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GATAACGCAAATGTCCAATAAGTACATGAAAAGATACTCAACATCACTAACTATTAGGAA 3840

141544370 AATACAGATCAAAACTACAATGAAATACCACTTTGTAAGCATCAGGATGGGTACTATCAA 141544429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AATACAGATCAAAACTACAATGAAATACCACTTTGTAAGCATCAGGATGGGTACTATCAA 3900

141544430 ACAAACCAGAAAATAAAAACTGTTGATGAAAACATTGAAAAACTGCAATACTTGGGGAAA 141544489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3901 ACAAACCAGAAAATAAAAACTGTTGATGAAAACATTGAGAAACTGCAATACTTGGGGAAA 3960

141544490 TTCAAAATGGTACGCTCAATATGAAAACCAGTATGGTGTTTTCTCAAAAAATTAATAATA 141544549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTCAAAATGGTACGCTCAATATGAAAACCAGTATGGTGTTTTCTCAAAAAATTAATAATA 4020

141544550 AATATAATTACCATAGAATTCAGCAATTTCACTTCTGAGCATATGCCCAAAAGAGTTGAA 141544609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AATATAATTACCATAGAATTCAGCAATTTCACTTCTGAGCATATGCCCAAAAGAGTTGAA 4080

141544610 AGAAAGATCTTGAAGAGATATTTGTACACCTAATTATCTATAGCAGCATTATTCACAGCA 141544669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AGAAAGATCTTGAAGAGATATTTGTACACCTAATTATCTATAGCAGCATTATTCACAGCA 4140

141544670 GCCAAAAGATGGAACCAAACCAAGTGTCTATTGATGGATTAATGGAAAAGCAAAATGTAG 141544729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GCCAAAAGATGGAACCAAACCAAGTGTCTATTGATGGATTAATGGAAAAGCAAAATGTAG 4200

141544730 TATGTACATACAATGGAACACTATTCAGCCTTAAAAAAGAAGCAAATTTTGACCTATGTT 141544789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TATGTACATACAATGGAACACTATTCAGCCTTAAAAAAGAAGCAAATTTTGACCTATGTT 4260

141544790 ACAACAAGGATGAACCTTAAGGTCACCTAAGTGAAATAAGCCTGTTATAAATACTGTGTG 141544849
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ACAACAAGGATCAACCTTAAGGTCACCTAAGTGAAATAAGCCTGTTATAAATACTGTGTG 4320

141544850 AGTCCACATATGTGAGGTAAATCATAGAGACAGAAAGTTGATTATAGTTTTCAGAGGCTA 141544909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AGTCCACATATGTGAGGTAAATCATAGAGACAGAAAGTTGATTATAGTTTTCAGAGGCTA 4380

141544910 GGGAGAAGGAAAATTAGGGAGTATAGAGTTTTGGTTTTATAAGATTAAAAGACTTATAGA 141544969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4381 GGGAGAAGGAAAATTAGGGAGTATAGAGTTTTAGTTTTATAAGATTAAAAGACTTATAGA 4440

141544970 GATGAATGGTAGTGATGGTCGCACAGTAAGAATATATTTACTTTGGGAGGCCGAGACGGG 141545029
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GATGAATGGTAGTTATGGTCGCACAGTAAGAATATATTTACTTTGGGAGGCCGAGACGGG 4500

141545030 CGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTA 141545089
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4501 CGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTA 4560

141545090 CTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACACGGG 141545149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||
     4561 CTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACATGGG 4620

141545150 AGGCTGAGGAAAAAGAATATATTTAACACCACTGAATTGTACACTTGAGAACAGTTAACA 141545209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AGGCTGAGGAAAAAGAATATATTTAACACCACTGAATTGTACACTTGAGAACAGTTAACA 4680

141545210 TGATACAGTTTATGATATGTATATTTTACTATAATAAAATCTAGGAAAATAATGTATTTT 141545269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TGATACAGTTTATGATATGTATATTTTACTATAATAAAATCTAGGAAAATAATGTATTTT 4740

141545270 TAATGGCCAAAAGAAAATTTGCTTCCTTTTTTCAGAATTAAAAGTATTTGACTATATGAG 141545329
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TAATGGCCAAAATAAAATTTGCTTCCTTTTTTCAGAATTAAAAGTATTTGACTATATGAG 4800

141545330 AAGTATACCACTTTATTTTTTCTTGAGAGAAATGCCAATAAAAATGGACCTCACATGGCT 141545389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AAGTATACCACTTTATTTTTTCTTGAGAGAAATGCCAATAAAAATGGACCTCACATGGCT 4860

141545390 CCTGTTGAATATACCTCCATTTATTTAAGTTTCCACAATCAGTCTGTTTTCTGTGCGTTC 141545449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CCTGTTGAATATACCTCCATTTATTTAAGTTTCCACAATCAGTCTGTTTTCTGTGCGTTC 4920

141545450 ATGTCTGTGTTTATGTGAGGACATGTGTTTGTGTCTACAAGCAGAAGGCTTCGAGTTGAG 141545509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ATGTCTGTGTTTATGTGAGGACATGTGTTTGTGTCTACAAGCAGAAGGCTTCGAGTTGAG 4980

141545510 AAAGCAAATGGTAAGAAAAACTGCATAAAAATGAATGTGAAGAAAAAAGGTAATAACTGG 141545569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4981 AAAGCAAATGGTAAGAAAAACTGCATAAAAATGAATGTGAAGAAAAAAGGTAATAACTAG 5040

141545570 TTATGAGTGACCTATGTTGAAGAGAAATTAAAATGAATTTTCTCCCTAGATTTAATAAGT 141545629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TTATGAGTGACCTATGTTGAAGAGAAATTAAAATGAATTTTCTCCCTAGATTTAATAAGT 5100

141545630 AATCATTTCCCATATAACAGTATTTGAATAAGTGATCAAACATATGTTCCATTTTATGTG 141545689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AATCATTTCCCATATAACAGTATTTGAATAAGTGATCAAACATATGTTCCATTTTATGTG 5160

141545690 TCTTTGAAAACATAAGAATTACATTTCTGCTTTGGTCAGCAGCAGAAAACAAAATAATAA 141545749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TCTTTGAAAACATAAGAATTACATTTCTGCTTTGGTCAGCAGCAGAAAACAAAATAATAA 5220

141545750 CTGTAATTAAAGTTATATAACCTATATATACAAAAGATAATTTGGTATAAGAACTGAGGC 141545809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CTGTAATTAAAGTTATATAACCTATATATACAAAAGATAATTTGGTATAAGAACTGAGGC 5280

141545810 TTTAAATTTATTTTCAAAGCATAATACTGGATTTTAAATAAGGTTAATTTCAATGTGTCC 141545869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TTTAAATTTATTTTCAAAGCATAATACTGGATTTTAAATAAGGTTAATTTCAATGTGTCC 5340

141545870 ACACAGCCTCAAGAAAATTGTTTTCAAATAAGTAAAAATATTATATGTGGCTGTGTTTCA 141545929
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 ACACAGCCTCAAGAAAATTGTTTTCAAGTAAGTAAAAATATTATATGTGGCTGTGTTTCA 5400

141545930 TTAGCACTTTTTGCCACAAGGCATAATATTGAGCTAATATAAATATGAGCAACACATTTC 141545989
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5401 TTAGCACTTTTTGCCACAAGGCATAATATTGAGCTAATATAAACATGAGCAACACATTTC 5460

141545990 CTTAAAGATAGGACAATTGCAGAGAAAAAAGCCTGCATTATAGATATATAATAGTTCGCT 141546049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 CTTAAAGATAGGACAATTGCAGAGAAAAAAGCCTGCATTATAGATATATAATAGTTCGCT 5520

141546050 TCAAAATAGAATTCAATGTCATTAATTTCTGTTTTCATCATATATAAAAAAATTTGTATA 141546109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TCAAAATAGAATTCAATGTCATTAATTTCTGTTTTCATCATATATAAAAAAATTTGTATA 5580

141546110 GTAAGGAGTGTAATTGTAATGCATAGGAGTATACAAGACATAGAAAAGGATTTGCTATAT 141546169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GTAAGGAGTGTAATTGTAATGCATAGGAGTATACAAGACATAGAAAAGGATTTGCTATAT 5640

141546170 ACACATATTTTGATATTTTTTACACTATTATAAAATGGTCTGTATATGACTTGCTAACTT 141546229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 ACACATATTTTGATATTTTTTACACTATTATAAAATGGTCTGTATATGACTTGCTAACTT 5700

141546230 AGACAAAACAGAATCTCTACTGATGGATGTCATTTCCCCCAGATTGCAGTTGATACCATA 141546289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     5701 AGACAAAACAGAATCTCTACTGATGGATGTCATTTCCCC-AGATTGCAGTTGATACCATA 5759

141546290 TATTTATGTTTGACCAATATTCTTGAGTATACAATTAGTGCCTAGTTGTTTAGCAATCCA 141546349
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5760 TATTTATGTTTGACCAATATTCTTGAGTATACAATTAGTGCCTAGTTGTTTAGCAATCCG 5819

141546350 TTACTTAATTGCCTGTAGTTTCATTTAAACGAGGTTTTTATTTTTGAATTATTGGCAGCA 141546409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 TTACTTAATTGCCTGTAGTTTCATTTAAACGAGGTTTTTATTTTTGAATTATTGGCAGCA 5879

141546410 CTCAGTACAATAAGAATCTTTTCTTTTAACCCATCTCTGTACCGTTACAAACCTTTCATT 141546469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 CTCAGTACAATAAGAATCTTTTCTTTTAACCCATCTCTGTACCGTTACAAACCTTTCATT 5939

141546470 CTCTATTACACTTCCTTGAACAAGTTTAAGATCACCCTAGATCCCGCCATACTCGTTCAT 141546529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 CTCTATTACACTTCCTTGAACAAGTTTAAGATCACCCTAGATCCCGCCATACTCGTTCAT 5999

141546530 TTATTCTTCAATCCAAATCAATCTTTTAATATCTCTTCCTGAATCTCAATTTACAATTGG 141546589
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6000 TTATTCTTCAATCCAAATCAATCTTTTAATATCTCTTCCTGAATCTCAATTTATAATTGG 6059

141546590 CTTAGTTCACACTTAAATATTTTACCTAAAATGCTAGTGGAATTTCAAATATCTAAATAT 141546649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 CTTAGTTCACACTTAAATATTTTACCTAAAATGCTAGTGGAATTTCAAATATCTAAATAT 6119

141546650 TAGAAAATTAATATCAACAAATACATGTTTGTTTCAACAGTGACATAAGAACATGTTTAA 141546709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 TAGAAAATTAATATCAACAAATACATGTTTGTTTCAACAGTGACATAAGAACATGTTTAA 6179

141546710 ACTGTACAATAATGAAAAAGCAAATTTTCAAAATATAAGAGGTGCAGTACAAGTAGTAGT 141546769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 ACTGTACAATAATGAAAAAGCAAATTTTCAAAATATAAGAGGTGCAGTACAAGTAGTAGT 6239

141546770 TGTAGGAAATGTTATATTTTTCTGTGCTGATTTAAATTGAAAAATTTAAAATCAAAGATA 141546829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 TGTAGGAAATGTTATATTTTTCTGTGCTGATTTAAATTGAAAAATTTAAAATCAAAGATA 6299

141546830 CAAGCTCTGACATTAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAACCCAACTATACCTAACATAAAC 141546889
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     6300 CAAGCTCTGACATTAAGAAACCAAAAAAAAAAAAA---CCCAACTATACCTAACATAAAC 6356

141546890 AAATAGAGGATATAGTAAGATAACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAAT 141546949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 AAATAGAGGATATAGTAAGATAACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAAT 6416

141546950 ATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAAT 141547009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 ATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAAT 6476

141547010 CAGATAAACAAGAGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCAC 141547069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 CAGATAAACAAGAGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCAC 6536

141547070 TACAGATCTTCACACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGT 141547129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 TACAGATCTTCACACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGT 6596

141547130 AAATTCTAGTACTTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAA 141547189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 AAATTCTAGTACTTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAA 6656

141547190 ACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTT 141547249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 ACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTT 6716

141547250 AGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAA----AACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTT 141547305
          ||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||
     6717 AGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAATAAAAACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTT 6776

141547306 CATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATG 141547365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 CATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATG 6836

141547366 GAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAG 141547425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 GAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAG 6896

141547426 CAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTAT 141547485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 CAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTAT 6956

141547486 AAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCAC 141547545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 AAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCAC 7016

141547546 CCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGC 141547605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 CCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGC 7076

141547606 TACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAA 141547665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 TACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAA 7136

141547666 GACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCT 141547725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 GACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCT 7196

141547726 GCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATT 141547785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 GCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATT 7256

141547786 CTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTT 141547845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 CTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTT 7316

141547846 CCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCT 141547905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7317 CCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCT 7376

141547906 CTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATAAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGG 141547965
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     7377 CTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATGAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGG 7436

141547966 CCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACA 141548025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 CCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACA 7496

141548026 GCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAAT 141548085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 GCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAAT 7556

141548086 TCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTAC 141548145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7557 TCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTAC 7616

141548146 ATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAA 141548205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7617 ATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAA 7676

141548206 ATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGT 141548265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7677 ATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGT 7736

141548266 TTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATG 141548325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7737 TTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATG 7796

141548326 TATTCATATGAATAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAA 141548385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7797 TATTCATATGAATAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAA 7856

141548386 ATGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACA 141548445
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7857 ACGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACA 7916

141548446 GCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAAC 141548505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7917 GCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAAC 7976

141548506 AATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGAC 141548565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7977 AATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGAC 8036

141548566 AGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 141548624
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8037 AGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 8095

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8098 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 8157

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8158 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 8217

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     8218 GAAAAT------------------------------------------------------ 8223

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8224 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 8279

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8280 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 8339

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTG 141550362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     8340 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTG 8371

Alignment time is 6.68925 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2197] =>      2197 nucs 'mol-32-2874-138400_2197'

Score:        2078
Aligned:      2253        nucs
Identic:      2188 ( 97%) nucs =>      1458 (100%)       730 ( 93%)
Gaps:           62 (  3%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141547165,141548624] EXCISED REGION [141550031,141550819]
 second seq =>  [        1,     1464] EXCISED REGION [     1467,     2197]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [1465,1466]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1465,1465] to [1467,1467]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141547165 TGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAGACACAA 141547224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAGACACAA 60

141547225 TCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAA----AAC 141547280
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||
       61 TCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAATAAAAAC 120

141547281 AAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAA 141547340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAA 180

141547341 TTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACA 141547400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACA 240

141547401 ATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAG 141547460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAG 300

141547461 GGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTC 141547520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTC 360

141547521 ACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACC 141547580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACC 420

141547581 CAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGG 141547640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGG 480

141547641 GGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAA 141547700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAA 540

141547701 CTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAA 141547760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAA 600

141547761 CAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAG 141547820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAG 660

141547821 GGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCT 141547880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCT 720

141547881 CTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATAA 141547940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      721 CTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATGA 780

141547941 GGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAATTACTGA 141548000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAATTACTGA 840

141548001 TTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAA 141548060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAA 900

141548061 CCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACCTGACAA 141548120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACCTGACAA 960

141548121 AGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACT 141548180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACT 1020

141548181 CCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAAT 141548240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAAT 1080

141548241 ATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAACTCATTA 141548300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAACTCATTA 1140

141548301 TTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAATATTTGATA 141548360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAATATTTGATA 1200

141548361 AATCTCAACATTTATTTGAGATAAAATGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTAT 141548420
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATCTCAACATTTATTTGAGATAAAACGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTAT 1260

141548421 TTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAG 141548480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAG 1320

141548481 TTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTAT 141548540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTAT 1380

141548541 GACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAAT 141548600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAAT 1440

141548601 GTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 141548624
          ||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 1464

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 1526

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 1586

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     1587 GAAAAT------------------------------------------------------ 1592

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 1648

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 1708

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 1768

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1769 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 1828

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 1888

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 1948

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 2008

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 141550690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 2068

141550691 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 141550750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 2128

141550751 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 141550810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 2188

141550811 TTTTCACTG 141550819
          |||||||||
     2189 TTTTCACTG 2197

Alignment time is 2.00718 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     5390] =>      5390 nucs 'mol-32-29df-033026_5390'

Score:        5139
Aligned:      5450        nucs
Identic:      5371 ( 99%) nucs =>      3552 ( 99%)      1819 ( 97%)
Gaps:           67 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141545059,141548624] EXCISED REGION [141550031,141551909]
 second seq =>  [        1,     3566] EXCISED REGION [     3569,     5390]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [3567,3568]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3567,3567] to [3569,3569]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141545059 TCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGG 141545118
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCATGG 60

141545119 TGGCGCGCGCCTGTAGTCCCAGCTACACGGGAGGCTGAGGAAAAAGAATATATTTAACAC 141545178
          |||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGCGCGTGCCTGTAGTCCCAGCTACATGGGAGGCTGAGGAAAAAGAATATATTTAACAC 120

141545179 CACTGAATTGTACACTTGAGAACAGTTAACATGATACAGTTTATGATATGTATATTTTAC 141545238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACTGAATTGTACACTTGAGAACAGTTAACATGATACAGTTTATGATATGTATATTTTAC 180

141545239 TATAATAAAATCTAGGAAAATAATGTATTTTTAATGGCCAAAAGAAAATTTGCTTCCTTT 141545298
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      181 TATAATAAAATCTAGGAAAATAATGTATTTTTAATGGCCAAAATAAAATTTGCTTCCTTT 240

141545299 TTTCAGAATTAAAAGTATTTGACTATATGAGAAGTATACCACTTTATTTTTTCTTGAGAG 141545358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCAGAATTAAAAGTATTTGACTATATGAGAAGTATACCACTTTATTTTTTCTTGAGAG 300

141545359 AAATGCCAATAAAAATGGACCTCACATGGCTCCTGTTGAATATACCTCCATTTATTTAAG 141545418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATGCCAATAAAAATGGACCTCACATGGCTCCTGTTGAATATACCTCCATTTATTTAAG 360

141545419 TTTCCACAATCAGTCTGTTTTCTGTGCGTTCATGTCTGTGTTTATGTGAGGACATGTGTT 141545478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTCCACAATCAGTCTGTTTTCTGTGCGTTCATGTCTGTGTTTATGTGAGGACATGTGTT 420

141545479 TGTGTCTACAAGCAGAAGGCTTCGAGTTGAGAAAGCAAATGGTAAGAAAAACTGCATAAA 141545538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGTCTACAAGCAGAAGGCTTCGAGTTGAGAAAGCAAATGGTAAGAAAAACTGCATAAA 480

141545539 AATGAATGTGAAGAAAAAAGGTAATAACTGGTTATGAGTGACCTATGTTGAAGAGAAATT 141545598
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATGAATGTGAAGAAAAAAGGTAATAACTAGTTATGAGTGACCTATGTTGAAGAGAAATT 540

141545599 AAAATGAATTTTCTCCCTAGATTTAATAAGTAATCATTTCCCATATAACAGTATTTGAAT 141545658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATGAATTTTCTCCCTAGATTTAATAAGTAATCATTTCCCATATAACAGTATTTGAAT 600

141545659 AAGTGATCAAACATATGTTCCATTTTATGTGTCTTTGAAAACATAAGAATTACATTTCTG 141545718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGTGATCAAACATATGTTCCATTTTATGTGTCTTTGAAAACATAAGAATTACATTTCTG 660

141545719 CTTTGGTCAGCAGCAGAAAACAAAATAATAACTGTAATTAAAGTTATATAACCTATATAT 141545778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTGGTCAGCAGCAGAAAACAAAATAATAACTGTAATTAAAGTTATATAACCTATATAT 720

141545779 ACAAAAGATAATTTGGTATAAGAACTGAGGCTTTAAATTTATTTTCAAAGCATAATACTG 141545838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACAAAAGATAATTTGGTATAAGAACTGAGGCTTTAAATTTATTTTCAAAGCATAATACTG 780

141545839 GATTTTAAATAAGGTTAATTTCAATGTGTCCACACAGCCTCAAGAAAATTGTTTTCAAAT 141545898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      781 GATTTTAAATAAGGTTAATTTCAATGTGTCCACACAGCCTCAAGAAAATTGTTTTCAAGT 840

141545899 AAGTAAAAATATTATATGTGGCTGTGTTTCATTAGCACTTTTTGCCACAAGGCATAATAT 141545958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGTAAAAATATTATATGTGGCTGTGTTTCATTAGCACTTTTTGCCACAAGGCATAATAT 900

141545959 TGAGCTAATATAAATATGAGCAACACATTTCCTTAAAGATAGGACAATTGCAGAGAAAAA 141546018
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAGCTAATATAAACATGAGCAACACATTTCCTTAAAGATAGGACAATTGCAGAGAAAAA 960

141546019 AGCCTGCATTATAGATATATAATAGTTCGCTTCAAAATAGAATTCAATGTCATTAATTTC 141546078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGCCTGCATTATAGATATATAATAGTTCGCTTCAAAATAGAATTCAATGTCATTAATTTC 1020

141546079 TGTTTTCATCATATATAAAAAAATTTGTATAGTAAGGAGTGTAATTGTAATGCATAGGAG 141546138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTTTTCATCATATATAAAAAAATTTGTATAGTAAGGAGTGTAATTGTAATGCATAGGAG 1080

141546139 TATACAAGACATAGAAAAGGATTTGCTATATACACATATTTTGATATTTTTTACACTATT 141546198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATACAAGACATAGAAAAGGATTTGCTATATACACATATTTTGATATTTTTTACACTATT 1140

141546199 ATAAAATGGTCTGTATATGACTTGCTAACTTAGACAAAACAGAATCTCTACTGATGGATG 141546258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAAAATGGTCTGTATATGACTTGCTAACTTAGACAAAACAGAATCTCTACTGATGGATG 1200

141546259 TCATTTCCCCCAGATTGCAGTTGATACCATATATTTATGTTTGACCAATATTCTTGAGTA 141546318
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCATTTCCCC-AGATTGCAGTTGATACCATATATTTATGTTTGACCAATATTCTTGAGTA 1259

141546319 TACAATTAGTGCCTAGTTGTTTAGCAATCCATTACTTAATTGCCTGTAGTTTCATTTAAA 141546378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TACAATTAGTGCCTAGTTGTTTAGCAATCCATTACTTAATTGCCTGTAGTTTCATTTAAA 1319

141546379 CGAGGTTTTTATTTTTGAATTATTGGCAGCACTCAGTACAATAAGAATCTTTTCTTTTAA 141546438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CGAGGTTTTTATTTTTGAATTATTGGCAGCACTCAGTACAATAAGAATCTTTTCTTTTAA 1379

141546439 CCCATCTCTGTACCGTTACAAACCTTTCATTCTCTATTACACTTCCTTGAACAAGTTTAA 141546498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CCCATCTCTGTACCGTTACAAACCTTTCATTCTCTATTACACTTCCTTGAACAAGTTTAA 1439

141546499 GATCACCCTAGATCCCGCCATACTCGTTCATTTATTCTTCAATCCAAATCAATCTTTTAA 141546558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 GATCACCCTAGATCCCGCCATACTCGTTCATTTATTCTTCAATCCAAATCAATCTTTTAA 1499

141546559 TATCTCTTCCTGAATCTCAATTTACAATTGGCTTAGTTCACACTTAAATATTTTACCTAA 141546618
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TATCTCTTCCTGAATCTCAATTTATAATTGGCTTAGTTCACACTTAAATATTTTACCTAA 1559

141546619 AATGCTAGTGGAATTTCAAATATCTAAATATTAGAAAATTAATATCAACAAATACATGTT 141546678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AATGCTAGTGGAATTTCAAATATCTAAATATTAGAAAATTAATATCAACAAATACATGTT 1619

141546679 TGTTTCAACAGTGACATAAGAACATGTTTAAACTGTACAATAATGAAAAAGCAAATTTTC 141546738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TGTTTCAACAGTGACATAAGAACATGTTTAAACTGTACAATAATGAAAAAGCAAATTTTC 1679

141546739 AAAATATAAGAGGTGCAGTACAAGTAGTAGTTGTAGGAAATGTTATATTTTTCTGTGCTG 141546798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AAAATATAAGAGGTGCAGTACAAGTAGTAGTTGTAGGAAATGTTATATTTTTCTGTGCTG 1739

141546799 ATTTAAATTGAAAAATTTAAAATCAAAGATACAAGCTCTGACATTAAGAAACCAAAAAAA 141546858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 ATTTAAATTGAAAAATTTAAAATCAAAGATACAAGCTCTGACATTAAGAAACCAAAAAAA 1799

141546859 AAAAAAAAACCCAACTATACCTAACATAAACAAATAGAGGATATAGTAAGATAACAATAG 141546918
          ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AAAAAA---CCCAACTATACCTAACATAAACAAATAGAGGATATAGTAAGATAACAATAG 1856

141546919 AAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGGTTC 141546978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 AAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGGTTC 1916

141546979 ATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACACAAATTT 141547038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 ATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACACAAATTT 1976

141547039 ACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGGACAAGC 141547098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 ACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGGACAAGC 2036

141547099 AAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAATGAACAA 141547158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 AAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAATGAACAA 2096

141547159 ATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAG 141547218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 ATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAG 2156

141547219 ACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAA- 141547277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     2157 ACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAAT 2216

141547278 ---AACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACT 141547334
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 AAAAACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACT 2276

141547335 GGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGC 141547394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 GGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGC 2336

141547395 CTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCA 141547454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 CTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCA 2396

141547455 AGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTT 141547514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 AGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTT 2456

141547515 ACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGT 141547574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 ACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGT 2516

141547575 CTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTG 141547634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 CTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTG 2576

141547635 TGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCG 141547694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 TGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCG 2636

141547695 CACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGG 141547754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 CACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGG 2696

141547755 CTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTAC 141547814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 CTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTAC 2756

141547815 CATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCC 141547874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 CATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCC 2816

141547875 CTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTC 141547934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 CTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTC 2876

141547935 TTATAAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAAT 141547994
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TTATGAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAAT 2936

141547995 TACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGA 141548054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 TACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGA 2996

141548055 ATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACC 141548114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 ATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACC 3056

141548115 TGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGT 141548174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGT 3116

141548175 CAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTG 141548234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 CAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTG 3176

141548235 TCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAAC 141548294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAAC 3236

141548295 TCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAATAT 141548354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 TCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAATAT 3296

141548355 TTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAATGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGA 141548414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3297 TTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAACGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGA 3356

141548415 ATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTAT 141548474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 ATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTAT 3416

141548475 TGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATA 141548534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATA 3476

141548535 TTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAAT 141548594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 TTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAAT 3536

141548595 AAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 141548624
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 AAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 3566

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3569 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 3628

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3629 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 3688

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     3689 GAAAAT------------------------------------------------------ 3694

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 3750

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 3810

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 3870

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3871 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 3930

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 3990

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 4050

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 4110

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 141550690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 4170

141550691 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 141550750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 4230

141550751 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 141550810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 4290

141550811 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 141550870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 4350

141550871 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 141550930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 4410

141550931 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATAAGTCTTAAGCAAATAA 141550990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4411 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATAAGTCTTAAGCAAATAA 4470

141550991 AGAGATATACCATTTGCATGAATCGGAAGAGTCAGCTTAATAAATATTTTAATTATTCTC 141551050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4471 AGAGATATACCATTTGCATGAATCGGAAGAGTCAGCTTAATAAATATTTTAATTATTCTC 4530

141551051 AAATTAATCTATAAGCTTAACAAAATTCCTATCAAAATCCCACTATGTTACTTTTGTAGA 141551110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4531 AAATTAATCTATAAGCTTAACAAAATTCCTATCAAAATCCCACTATGTTACTTTTGTAGA 4590

141551111 CATTAAAAACAACTTGTTTTAAATTTTATATAGAAAGAAAGAAACCTCAGAATAGCTAAA 141551170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4591 CATTAAAAACAACTTGTTTTAAATTTTATATAGAAAGAAAGAAACCTCAGAATAGCTAAA 4650

141551171 ACAATCTTGATAAATAGAATAAAGTAAAAGAATGACTCCATCTAACTTTAGTACTTACTT 141551230
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4651 ACAATCTTGATAAATAGAATAAAGTAAAAGAATGACTCCATCTAACTTTAGTATTTACTT 4710

141551231 TATACCTATCGTTATAATTATAGTGCCATATTGATAGATAGACATATAGATCAATAGAGC 141551290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4711 TATACCTATCGTTATAATTATAGTGCCATATTGATAGATAGACATATAGATCAATAGAGC 4770

141551291 AGAATAGATAACTCGAAAATAGACCCATATAAATATGTCTGATTGATTTTTTACAAAGGA 141551350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4771 AGAATAGATAACTCGAAAATAGACCCATATAAATATGTCTGATTGATTTTTTACAAAGGA 4830

141551351 GCAAAAGCAATTATATGAGTATGGATATCCTTTTCAATAAATGATGCTAAAATAATTGCA 141551410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4831 GCAAAAGCAATTATATGAGTATGGATATCCTTTTCAATAAATGATGCTAAAATAATTGCA 4890

141551411 CAGCCATAGGCAAAATAAAATAAAACAAACCTCAATTTAAGTCTCACTTCATTCAAAAAT 141551470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4891 CAGCCATAGGCAAAATAAAATAAAACAAACCTCAATTTAAGTCTCACTTCATTCAAAAAT 4950

141551471 CAACTCAGGATAGATTAGGGAATTAAATTGTCAAATAGAAAACTACAAAAATCTTAAAAA 141551530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4951 CAACTCAGGATAGATTAGGGAATTAAATTGTCAAATAGAAAACTACAAAAATCTTAAAAA 5010

141551531 AATAGGAGAAAACCTTCTATATCAAGGACTAGGCAGAGGTTTTAGACTTGACACCAAAAA 141551590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5011 AATAGGAGAAAACCTTCTATATCAAGGACTAGGCAGAGGTTTTAGACTTGACACCAAAAA 5070

141551591 CACAATCCACTACAAGAAAAATTAGTTAAGTGGACACCATCAAAATTAAAAACTATTAGG 141551650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5071 CACAATCCACTACAAGAAAAATTAGTTAAGTGGACACCATCAAAATTAAAAACTATTAGG 5130

141551651 ATTAATAAGTTCTGGAGAGTATTGCACAGCATGATGACATAGTTGATAATAATGTTTTGT 141551710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5131 ATTAATAAGTTCTGGAGAGTATTGCACAGCATGATGACATAGTTGATAATAATGTTTTGT 5190

141551711 ATGTTTGAAAATTGCTAAGAGAGTAGGTCTTAAATGTTCTCATCACATAAAACATACGTG 141551770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5191 ATGTTTGAAAATTGCTAAGAGAGTAGGTCTTAAATGTTCTCATCACATAAAACATACGTG 5250

141551771 ATGTGATAGA-TTTTTTTTTTTTTTAGACGGAGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGTTGGAGTG 141551829
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5251 ATGTGATAGATTTTTTTTTTTTTTTAGACGGAGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGTTGGAGTG 5310

141551830 CAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGC 141551889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5311 CAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGC 5370

141551890 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTG 141551909
          ||||||||||||||||||||
     5371 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTG 5390

Alignment time is 4.3919 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2267] =>      2267 nucs 'mol-32-2b4a-069454_2267'

Score:        2148
Aligned:      2323        nucs
Identic:      2258 ( 97%) nucs =>      1724 (100%)       534 ( 90%)
Gaps:           62 (  3%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141546899,141548624] EXCISED REGION [141550031,141550623]
 second seq =>  [        1,     1730] EXCISED REGION [     1733,     2267]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [1731,1732]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1731,1731] to [1733,1733]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141546899 ATATAGTAAGATAACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTT 141546958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATAGTAAGATAACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTT 60

141546959 TTTAAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAAC 141547018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTAAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAAC 120

141547019 AAGAGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCT 141547078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGAGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCT 180

141547079 TCACACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAG 141547138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCACACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAG 240

141547139 TACTTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAA 141547198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACTTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAA 300

141547199 GAAATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAAT 141547258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAAATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAAT 360

141547259 TTAAAAAGAAAGAAACAAA----AACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCT 141547314
          |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAAAAAGAAAGAAACAAATAAAAACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCT 420

141547315 ATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACAC 141547374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACAC 480

141547375 TTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCAC 141547434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCAC 540

141547435 ATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATC 141547494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATC 600

141547495 AGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGAT 141547554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGAT 660

141547555 TCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAA 141547614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAA 720

141547615 AGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTA 141547674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTA 780

141547675 TAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACA 141547734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACA 840

141547735 AAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACA 141547794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACA 900

141547795 GAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTT 141547854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTT 960

141547855 GTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTG 141547914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTG 1020

141547915 TCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATAAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAA 141547974
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATGAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAA 1080

141547975 TGACAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATC 141548034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGACAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATC 1140

141548035 TTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCAT 141548094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCAT 1200

141548095 AATACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATT 141548154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATT 1260

141548155 TTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCA 141548214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCA 1320

141548215 TGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGC 141548274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGC 1380

141548275 TTTAAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATAT 141548334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTAAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATAT 1440

141548335 GAATAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAATGTAATTG 141548394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1441 GAATAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAACGTAATTG 1500

141548395 TAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAA 141548454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAA 1560

141548455 CATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCAT 141548514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCAT 1620

141548515 GGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAA 141548574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAA 1680

141548575 ATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 141548624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 1730

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 1792

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 1852

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     1853 GAAAAT------------------------------------------------------ 1858

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 1914

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 1974

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 2034

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2035 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 2094

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 2154

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 2214

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGC 141550623
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGC 2267

Alignment time is 1.73745 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2111] =>      2111 nucs 'mol-32-2dff-062369_2111'

Score:        1998
Aligned:      2167        nucs
Identic:      2105 ( 97%) nucs =>      1295 (100%)       810 ( 93%)
Gaps:           58 (  3%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141547327,141548624] EXCISED REGION [141550031,141550899]
 second seq =>  [        1,     1298] EXCISED REGION [     1301,     2111]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [1299,1300]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1299,1299] to [1301,1301]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141547327 CCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCT 141547386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCT 60

141547387 GGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGT 141547446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGT 120

141547447 GGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGG 141547506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGG 180

141547507 AATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCC 141547566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCC 240

141547567 TGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTG 141547626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTG 300

141547627 TGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTA 141547686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTA 360

141547687 GGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGA 141547746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGA 420

141547747 CTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGAT 141547806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGAT 480

141547807 TAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTG 141547866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTG 540

141547867 TTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATT 141547926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATT 600

141547927 TCCTCTTCTTATAAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTT 141547986
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTCTTCTTATGAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTT 660

141547987 AAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGG 141548046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGG 720

141548047 GGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTA 141548106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTA 780

141548107 AATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAAT 141548166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAAT 840

141548167 TGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACC 141548226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACC 900

141548227 ACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTT 141548286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTT 960

141548287 AATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGA 141548346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGA 1020

141548347 AAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAATGTAATTGTAAACCAGAAAT 141548406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1021 AAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAACGTAATTGTAAACCAGAAAT 1080

141548407 AGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGG 141548466
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAAAGGAATTTATTTTATAAAGAATACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGG 1140

141548467 GGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTC 141548526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTC 1200

141548527 TACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATAC 141548586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATAC 1260

141548587 AAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 141548624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 1298

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 1360

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 1420

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     1421 GAAAAT------------------------------------------------------ 1426

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 1482

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 1542

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 1602

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1603 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 1662

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 1722

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 1782

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 1842

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 141550690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 1902

141550691 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 141550750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 1962

141550751 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 141550810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 2022

141550811 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 141550870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 2082

141550871 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTG 141550899
          |||||||||||||||||||||||||||||
     2083 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTG 2111

Alignment time is 2.57846 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3747] =>      3747 nucs 'mol-32-2e57-060251_3747'

Score:        3526
Aligned:      3734        nucs
Identic:      3666 ( 98%) nucs =>      1740 (100%)      1926 ( 97%)
Gaps:           62 (  2%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141546883,141548624] EXCISED REGION [141550031,141552018]
 second seq =>  [        1,     1746] EXCISED REGION [     1749,     3678]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [1747,1748]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1747,1747] to [1749,1749]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141546883 CATAAACAAATAGAGGATATAGTAAGATAACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGAT 141546942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATAAACAAATAGAGGATATAGTAAGATAACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGAT 60

141546943 TAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACT 141547002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACT 120

141547003 GACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGA 141547062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGA 180

141547063 GCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTA 141547122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTA 240

141547123 TGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATT 141547182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATT 300

141547183 AAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACC 141547242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACC 360

141547243 CACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAA----AACAAAAAAGACTGTATTAAT 141547298
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||
      361 CACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAATAAAAACAAAAAAGACTGTATTAAT 420

141547299 CCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGA 141547358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGA 480

141547359 TTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAA 141547418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAA 540

141547419 GGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGC 141547478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGC 600

141547479 CCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAA 141547538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAA 660

141547539 AACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTA 141547598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTA 720

141547599 TGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCA 141547658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCA 780

141547659 TATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCT 141547718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCT 840

141547719 TAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTT 141547778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTT 900

141547779 TACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGC 141547838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGC 960

141547839 ACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGT 141547898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGT 1020

141547899 CTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATAAGGACATTAGTCATACTTG 141547958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1021 CTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATGAGGACATTAGTCATACTTG 1080

141547959 ATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTT 141548018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTT 1140

141548019 AAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAG 141548078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAG 1200

141548079 ACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCA 141548138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCA 1260

141548139 TATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATG 141548198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATG 1320

141548199 GAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAG 141548258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAG 1380

141548259 AGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATT 141548318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATT 1440

141548319 AAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTG 141548378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTG 1500

141548379 AGATAAAATGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGA 141548438
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGATAAAACGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGA 1560

141548439 AACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAAT 141548498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAAT 1620

141548499 GATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTG 141548558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTG 1680

141548559 CGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAA 141548618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAA 1740

141548619 AATTTC 141548624
          ||||||
     1741 AATTTC 1746

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 1808

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 1868

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     1869 GAAAAT------------------------------------------------------ 1874

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1875 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGTCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 1930

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 1990

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 2050

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2051 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 2110

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 2170

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 2230

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 2290

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 141550690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 2350

141550691 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 141550750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 2410

141550751 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 141550810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 2470

141550811 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 141550870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 2530

141550871 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 141550930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 2590

141550931 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATAAGTCTTAAGCAAATAA 141550990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATAAGTCTTAAGCAAATAA 2650

141550991 AGAGATATACCATTTGCATGAATCGGAAGAGTCAGCTTAATAAATATTTTAATTATTCTC 141551050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 AGAGATATACCATTTGCATGAATCGGAAGAGTCAGCTTAATAAATATTTTAATTATTCTC 2710

141551051 AAATTAATCTATAAGCTTAACAAAATTCCTATCAAAATCCCACTATGTTACTTTTGTAGA 141551110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 AAATTAATCTATAAGCTTAACAAAATTCCTATCAAAATCCCACTATGTTACTTTTGTAGA 2770

141551111 CATTAAAAACAACTTGTTTTAAATTTTATATAGAAAGAAAGAAACCTCAGAATAGCTAAA 141551170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 CATTAAAAACAACTTGTTTTAAATTTTATATAGAAAGAAAGAAACCTCAGAATAGCTAAA 2830

141551171 ACAATCTTGATAAATAGAATAAAGTAAAAGAATGACTCCATCTAACTTTAGTACTTACTT 141551230
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2831 ACAATCTTGATAAATAGAATAAAGTAAAAGAATGACTCCATCTAACTTTAGTATTTACTT 2890

141551231 TATACCTATCGTTATAATTATAGTGCCATATTGATAGATAGACATATAGATCAATAGAGC 141551290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 TATACCTATCGTTATAATTATAGTGCCATATTGATAGATAGACATATAGATCAATAGAGC 2950

141551291 AGAATAGATAACTCGAAAATAGACCCATATAAATATGTCTGATTGATTTTTTACAAAGGA 141551350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 AGAATAGATAACTCGAAAATAGACCCATATAAATATGTCTGATTGATTTTTTACAAAGGA 3010

141551351 GCAAAAGCAATTATATGAGTATGGATATCCTTTTCAATAAATGATGCTAAAATAATTGCA 141551410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 GCAAAAGCAATTATATGAGTATGGATATCCTTTTCAATAAATGATGCTAAAATAATTGCA 3070

141551411 CAGCCATAGGCAAAATAAAATAAAACAAACCTCAATTTAAGTCTCACTTCATTCAAAAAT 141551470
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3071 CAGCCATAGGCAAAATAAAATAAAACAAACCTCAATTTAGGTCTCACTTCATTCAAAAAT 3130

141551471 CAACTCAGGATAGATTAGGGAATTAAATTGTCAAATAGAAAACTACAAAAATCTTAAAAA 141551530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 CAACTCAGGATAGATTAGGGAATTAAATTGTCAAATAGAAAACTACAAAAATCTTAAAAA 3190

141551531 AATAGGAGAAAACCTTCTATATCAAGGACTAGGCAGAGGTTTTAGACTTGACACCAAAAA 141551590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 AATAGGAGAAAACCTTCTATATCAAGGACTAGGCAGAGGTTTTAGACTTGACACCAAAAA 3250

141551591 CACAATCCACTACAAGAAAAATTAGTTAAGTGGACACCATCAAAATTAAAAACTATTAGG 141551650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 CACAATCCACTACAAGAAAAATTAGTTAAGTGGACACCATCAAAATTAAAAACTATTAGG 3310

141551651 ATTAATAAGTTCTGGAGAGTATTGCACAGCATGATGACATAGTTGATAATAATGTTTTGT 141551710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 ATTAATAAGTTCTGGAGAGTATTGCACAGCATGATGACATAGTTGATAATAATGTTTTGT 3370

141551711 ATGTTTGAAAATTGCTAAGAGAGTAGGTCTTAAATGTTCTCATCACATAAAACATACGTG 141551770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3371 ATGTTTGAAAATTGCTAAGAGAGTAGGTCTTAAATGTTCTCATCACATAAAACATACGTG 3430

141551771 ATGTGATAGATTTTTTTTTTTTTTAGACGGAGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGTTGGAGTGC 141551830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 ATGTGATAGATTTTTTTTTTTTTTAGACGGAGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGTTGGAGTGC 3490

141551831 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCC 141551890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCC 3550

141551891 TCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGACCCCACCACCACGCCCGGCTAATTTTTTAT 141551950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 TCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGACCCCACCACCACGCCCGGCTAATTTTTTAT 3610

141551951 ATTTTTAGTAGTGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCCCCTGACCTT 141552010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 ATTTTTAGTAGTGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCCCCTGACCTT 3670

141552011 GTGATCCG 141552018
          ||||||||
     3671 GTGATCCG 3678

Alignment time is 3.1918 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2827] =>      2827 nucs 'mol-32-2efc-035411_2827'

Score:        2708
Aligned:      2883        nucs
Identic:      2818 ( 98%) nucs =>      1688 (100%)      1130 ( 95%)
Gaps:           62 (  2%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141546935,141548624] EXCISED REGION [141550031,141551219]
 second seq =>  [        1,     1694] EXCISED REGION [     1697,     2827]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [1695,1696]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1695,1695] to [1697,1697]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141546935 AGACAGATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCA 141546994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGACAGATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCA 60

141546995 ATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATA 141547054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATA 120

141547055 AATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAA 141547114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAA 180

141547115 CAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACAC 141547174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACAC 240

141547175 AATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATT 141547234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATT 300

141547235 ATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAA----AACAAAAAAGACT 141547290
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||
      301 ATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAATAAAAACAAAAAAGACT 360

141547291 GTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGA 141547350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGA 420

141547351 AAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAG 141547410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAG 480

141547411 AAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGG 141547470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGG 540

141547471 GGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAG 141547530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAG 600

141547531 CATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGT 141547590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGT 660

141547591 GGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAG 141547650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAG 720

141547651 AAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTAT 141547710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTAT 780

141547711 TAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAAT 141547770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAAT 840

141547771 TTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTC 141547830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTC 900

141547831 TTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGG 141547890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGG 960

141547891 TTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATAAGGACATTAGT 141547950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      961 TTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATGAGGACATTAGT 1020

141547951 CATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACT 141548010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACT 1080

141548011 CTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAAT 141548070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAAT 1140

141548071 TGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACA 141548130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACA 1200

141548131 GACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGA 141548190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGA 1260

141548191 ATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTAT 141548250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTAT 1320

141548251 TCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAA 141548310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAA 1380

141548311 AAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACA 141548370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACA 1440

141548371 TTTATTTGAGATAAAATGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGA 141548430
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTATTTGAGATAAAACGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGA 1500

141548431 CTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTG 141548490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTG 1560

141548491 TCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTA 141548550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTA 1620

141548551 TATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAA 141548610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAA 1680

141548611 AGAAGTAAAATTTC 141548624
          ||||||||||||||
     1681 AGAAGTAAAATTTC 1694

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 1756

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 1816

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     1817 GAAAAT------------------------------------------------------ 1822

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 1878

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 1938

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 1998

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1999 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 2058

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 2118

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 2178

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 2238

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 141550690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 2298

141550691 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 141550750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 2358

141550751 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 141550810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 2418

141550811 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 141550870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 2478

141550871 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 141550930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 2538

141550931 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATAAGTCTTAAGCAAATAA 141550990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATAAGTCTTAAGCAAATAA 2598

141550991 AGAGATATACCATTTGCATGAATCGGAAGAGTCAGCTTAATAAATATTTTAATTATTCTC 141551050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 AGAGATATACCATTTGCATGAATCGGAAGAGTCAGCTTAATAAATATTTTAATTATTCTC 2658

141551051 AAATTAATCTATAAGCTTAACAAAATTCCTATCAAAATCCCACTATGTTACTTTTGTAGA 141551110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 AAATTAATCTATAAGCTTAACAAAATTCCTATCAAAATCCCACTATGTTACTTTTGTAGA 2718

141551111 CATTAAAAACAACTTGTTTTAAATTTTATATAGAAAGAAAGAAACCTCAGAATAGCTAAA 141551170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 CATTAAAAACAACTTGTTTTAAATTTTATATAGAAAGAAAGAAACCTCAGAATAGCTAAA 2778

141551171 ACAATCTTGATAAATAGAATAAAGTAAAAGAATGACTCCATCTAACTTT 141551219
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 ACAATCTTGATAAATAGAATAAAGTAAAAGAATGACTCCATCTAACTTT 2827

Alignment time is 2.15857 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4202] =>      4202 nucs 'mol-32-2f28-024458_4202'

Score:        4060
Aligned:      4261        nucs
Identic:      4192 ( 98%) nucs =>      2007 (100%)      2185 ( 97%)
Gaps:           65 (  2%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141546613,141548624] EXCISED REGION [141550031,141552275]
 second seq =>  [        1,     2013] EXCISED REGION [     2016,     4202]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [2014,2015]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2014,2014] to [2016,2016]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141546613 ACCTAAAATGCTAGTGGAATTTCAAATATCTAAATATTAGAAAATTAATATCAACAAATA 141546672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCTAAAATGCTAGTGGAATTTCAAATATCTAAATATTAGAAAATTAATATCAACAAATA 60

141546673 CATGTTTGTTTCAACAGTGACATAAGAACATGTTTAAACTGTACAATAATGAAAAAGCAA 141546732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATGTTTGTTTCAACAGTGACATAAGAACATGTTTAAACTGTACAATAATGAAAAAGCAA 120

141546733 ATTTTCAAAATATAAGAGGTGCAGTACAAGTAGTAGTTGTAGGAAATGTTATATTTTTCT 141546792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTTCAAAATATAAGAGGTGCAGTACAAGTAGTAGTTGTAGGAAATGTTATATTTTTCT 180

141546793 GTGCTGATTTAAATTGAAAAATTTAAAATCAAAGATACAAGCTCTGACATTAAGAAACCA 141546852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGCTGATTTAAATTGAAAAATTTAAAATCAAAGATACAAGCTCTGACATTAAGAAACCA 240

141546853 AAAAAAAAAAAAAAACCCAACTATACCTAACATAAACAAATAGAGGATATAGTAAGATAA 141546912
          ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAAAAAAAAA---CCCAACTATACCTAACATAAACAAATAGAGGATATAGTAAGATAA 297

141546913 CAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGC 141546972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 CAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGC 357

141546973 TGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACAC 141547032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 TGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACAC 417

141547033 AAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGG 141547092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 AAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGG 477

141547093 ACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAAT 141547152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 ACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAAT 537

141547153 GAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCT 141547212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 GAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCT 597

141547213 CAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAA 141547272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 CAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAA 657

141547273 ACAAA----AACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCC 141547328
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 ACAAATAAAAACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCC 717

141547329 AAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGG 141547388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 AAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGG 777

141547389 GGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGG 141547448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 GGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGG 837

141547449 CAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAA 141547508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 CAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAA 897

141547509 TTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTG 141547568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 TTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTG 957

141547569 CTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTG 141547628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 CTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTG 1017

141547629 TGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGG 141547688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 TGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGG 1077

141547689 AGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACT 141547748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 AGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACT 1137

141547749 ATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTA 141547808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 ATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTA 1197

141547809 AGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTT 141547868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 AGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTT 1257

141547869 TTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTC 141547928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTC 1317

141547929 CTCTTCTTATAAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAA 141547988
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 CTCTTCTTATGAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAA 1377

141547989 ATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGG 141548048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 ATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGG 1437

141548049 TGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAA 141548108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAA 1497

141548109 TACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTG 141548168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 TACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTG 1557

141548169 AGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCAC 141548228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 AGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCAC 1617

141548229 GTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAA 141548288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 GTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAA 1677

141548289 TATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAA 141548348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 TATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAA 1737

141548349 AAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAATGTAATTGTAAACCAGAAATAG 141548408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1738 AAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAACGTAATTGTAAACCAGAAATAG 1797

141548409 AAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGG 141548468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 AAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGG 1857

141548469 AATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTA 141548528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 AATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTA 1917

141548529 CTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAA 141548588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 CTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAA 1977

141548589 ACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 141548624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 ACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 2013

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 2075

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 2135

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     2136 GAAAAT------------------------------------------------------ 2141

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 2197

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 2257

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 2317

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2318 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 2377

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 2437

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 2497

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 2557

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 141550690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 2617

141550691 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 141550750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 2677

141550751 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 141550810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 2737

141550811 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 141550870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 2797

141550871 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 141550930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 2857

141550931 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATAAGTCTTAAGCAAATAA 141550990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATAAGTCTTAAGCAAATAA 2917

141550991 AGAGATATACCATTTGCATGAATCGGAAGAGTCAGCTTAATAAATATTTTAATTATTCTC 141551050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 AGAGATATACCATTTGCATGAATCGGAAGAGTCAGCTTAATAAATATTTTAATTATTCTC 2977

141551051 AAATTAATCTATAAGCTTAACAAAATTCCTATCAAAATCCCACTATGTTACTTTTGTAGA 141551110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 AAATTAATCTATAAGCTTAACAAAATTCCTATCAAAATCCCACTATGTTACTTTTGTAGA 3037

141551111 CATTAAAAACAACTTGTTTTAAATTTTATATAGAAAGAAAGAAACCTCAGAATAGCTAAA 141551170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 CATTAAAAACAACTTGTTTTAAATTTTATATAGAAAGAAAGAAACCTCAGAATAGCTAAA 3097

141551171 ACAATCTTGATAAATAGAATAAAGTAAAAGAATGACTCCATCTAACTTTAGTACTTACTT 141551230
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3098 ACAATCTTGATAAATAGAATAAAGTAAAAGAATGACTCCATCTAACTTTAGTATTTACTT 3157

141551231 TATACCTATCGTTATAATTATAGTGCCATATTGATAGATAGACATATAGATCAATAGAGC 141551290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 TATACCTATCGTTATAATTATAGTGCCATATTGATAGATAGACATATAGATCAATAGAGC 3217

141551291 AGAATAGATAACTCGAAAATAGACCCATATAAATATGTCTGATTGATTTTTTACAAAGGA 141551350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 AGAATAGATAACTCGAAAATAGACCCATATAAATATGTCTGATTGATTTTTTACAAAGGA 3277

141551351 GCAAAAGCAATTATATGAGTATGGATATCCTTTTCAATAAATGATGCTAAAATAATTGCA 141551410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 GCAAAAGCAATTATATGAGTATGGATATCCTTTTCAATAAATGATGCTAAAATAATTGCA 3337

141551411 CAGCCATAGGCAAAATAAAATAAAACAAACCTCAATTTAAGTCTCACTTCATTCAAAAAT 141551470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 CAGCCATAGGCAAAATAAAATAAAACAAACCTCAATTTAAGTCTCACTTCATTCAAAAAT 3397

141551471 CAACTCAGGATAGATTAGGGAATTAAATTGTCAAATAGAAAACTACAAAAATCTTAAAAA 141551530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 CAACTCAGGATAGATTAGGGAATTAAATTGTCAAATAGAAAACTACAAAAATCTTAAAAA 3457

141551531 AATAGGAGAAAACCTTCTATATCAAGGACTAGGCAGAGGTTTTAGACTTGACACCAAAAA 141551590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 AATAGGAGAAAACCTTCTATATCAAGGACTAGGCAGAGGTTTTAGACTTGACACCAAAAA 3517

141551591 CACAATCCACTACAAGAAAAATTAGTTAAGTGGACACCATCAAAATTAAAAACTATTAGG 141551650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 CACAATCCACTACAAGAAAAATTAGTTAAGTGGACACCATCAAAATTAAAAACTATTAGG 3577

141551651 ATTAATAAGTTCTGGAGAGTATTGCACAGCATGATGACATAGTTGATAATAATGTTTTGT 141551710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 ATTAATAAGTTCTGGAGAGTATTGCACAGCATGATGACATAGTTGATAATAATGTTTTGT 3637

141551711 ATGTTTGAAAATTGCTAAGAGAGTAGGTCTTAAATGTTCTCATCACATAAAACATACGTG 141551770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 ATGTTTGAAAATTGCTAAGAGAGTAGGTCTTAAATGTTCTCATCACATAAAACATACGTG 3697

141551771 ATGTGATAGATTTTTTTTTTTTTTAGACGGAGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGTTGGAGTGC 141551830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3698 ATGTGATAGATTTTTTTTTTTTTTAGACGGAGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGTTGGAGTGC 3757

141551831 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCC 141551890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 AGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCCATTCTCCTGCC 3817

141551891 TCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGACCCCACCACCACGCCCGGCTAATTTTTTAT 141551950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 TCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGACCCCACCACCACGCCCGGCTAATTTTTTAT 3877

141551951 ATTTTTAGTAGTGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCCCCTGACCTT 141552010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 ATTTTTAGTAGTGACGGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGATCCCCTGACCTT 3937

141552011 GTGATCCGACCAAAGTGCTGGGATTGGAAGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCCTAGATATGT 141552070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 GTGATCCGACCAAAGTGCTGGGATTGGAAGCGTGAGCCACTGCGCCCAGCCTAGATATGT 3997

141552071 TAATTAGCTTGATTTAATCACTTCGCAATGTAAACATATATCAAAACATCAGGCTATATA 141552130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 TAATTAGCTTGATTTAATCACTTCGCAATGTAAACATATATCAAAACATCAGGCTATATA 4057

141552131 CCATAAATACATGTAATTTTTGTCAATTACGCCTTCATATACCTGGGTGTATAACCAAAC 141552190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 CCATAAATACATGTAATTTTTGTCAATTACGCCTTCATATACCTGGGTGTATAACCAAAC 4117

141552191 TAACAAACAAAAAAATTAAAAAGAAGAAAACCTATTGCTCTGTGAAAGAACCTGTGAAGA 141552250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 TAACAAACAAAAAAATTAAAAAGAAGAAAACCTATTGCTCTGTGAAAGAACCTGTGAAGA 4177

141552251 GGGAAAAAAAGACAAACTACAAACT 141552275
          |||||||||||||||||||||||||
     4178 GGGAAAAAAAGACAAACTACAAACT 4202

Alignment time is 3.19196 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2013] =>      2013 nucs 'mol-32-2f28-024458_2013'

Score:        1975
Aligned:      2012        nucs
Identic:      2007 (100%) nucs =>       659 (100%)      1348 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141546613,141547274] EXCISED REGION [141547275,141548624]
 second seq =>  [        1,      659] EXCISED REGION [      664,     2013]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [660,663]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [660,662] to [664,666]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141546613 ACCTAAAATGCTAGTGGAATTTCAAATATCTAAATATTAGAAAATTAATATCAACAAATA 141546672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCTAAAATGCTAGTGGAATTTCAAATATCTAAATATTAGAAAATTAATATCAACAAATA 60

141546673 CATGTTTGTTTCAACAGTGACATAAGAACATGTTTAAACTGTACAATAATGAAAAAGCAA 141546732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATGTTTGTTTCAACAGTGACATAAGAACATGTTTAAACTGTACAATAATGAAAAAGCAA 120

141546733 ATTTTCAAAATATAAGAGGTGCAGTACAAGTAGTAGTTGTAGGAAATGTTATATTTTTCT 141546792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTTCAAAATATAAGAGGTGCAGTACAAGTAGTAGTTGTAGGAAATGTTATATTTTTCT 180

141546793 GTGCTGATTTAAATTGAAAAATTTAAAATCAAAGATACAAGCTCTGACATTAAGAAACCA 141546852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGCTGATTTAAATTGAAAAATTTAAAATCAAAGATACAAGCTCTGACATTAAGAAACCA 240

141546853 AAAAAAAAAAAAAAACCCAACTATACCTAACATAAACAAATAGAGGATATAGTAAGATAA 141546912
          ||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAAAAAAAAA---CCCAACTATACCTAACATAAACAAATAGAGGATATAGTAAGATAA 297

141546913 CAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGC 141546972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 CAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGC 357

141546973 TGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACAC 141547032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 TGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACAC 417

141547033 AAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGG 141547092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 AAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGG 477

141547093 ACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAAT 141547152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 ACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAAT 537

141547153 GAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCT 141547212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 GAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCT 597

141547213 CAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAA 141547272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 CAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAA 657

141547273 AC 141547274
          ||
      658 AC 659

EXCISED REGION

141547275 AAAAACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACT 141547334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 AAAAACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACT 723

141547335 GGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGC 141547394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 GGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGC 783

141547395 CTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCA 141547454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 CTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCA 843

141547455 AGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTT 141547514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 AGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTT 903

141547515 ACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGT 141547574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 ACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGT 963

141547575 CTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTG 141547634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 CTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTG 1023

141547635 TGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCG 141547694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 TGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCG 1083

141547695 CACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGG 141547754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 CACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGG 1143

141547755 CTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTAC 141547814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 CTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTAC 1203

141547815 CATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCC 141547874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 CATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCC 1263

141547875 CTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTC 141547934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 CTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTC 1323

141547935 TTATAAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAAT 141547994
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 TTATGAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAAT 1383

141547995 TACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGA 141548054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 TACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGA 1443

141548055 ATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACC 141548114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 ATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACC 1503

141548115 TGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGT 141548174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 TGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGT 1563

141548175 CAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTG 141548234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 CAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTG 1623

141548235 TCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAAC 141548294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 TCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAAC 1683

141548295 TCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAATAT 141548354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAATAT 1743

141548355 TTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAATGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGA 141548414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1744 TTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAACGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGA 1803

141548415 ATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTAT 141548474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 ATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTAT 1863

141548475 TGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATA 141548534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 TGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATA 1923

141548535 TTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAAT 141548594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAAT 1983

141548595 AAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 141548624
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 AAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 2013

Alignment time is 1.53851 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3418] =>      3418 nucs 'mol-32-2f28-112342_3418'

Score:        3267
Aligned:      3477        nucs
Identic:      3408 ( 98%) nucs =>      2398 (100%)      1010 ( 94%)
Gaps:           65 (  2%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141546221,141548624] EXCISED REGION [141550031,141551099]
 second seq =>  [        1,     2405] EXCISED REGION [     2408,     3418]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [2406,2407]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2406,2406] to [2408,2408]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141546221 TGCTAACTTAGACAAAACAGAATCTCTACTGATGGATGTCATTTCCCCCAGATTGCAGTT 141546280
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
        1 TGCTAACTTAGACAAAACAGAATCTCTACTGATGGATGTCATTTCCCC-AGATTGCAGTT 59

141546281 GATACCATATATTTATGTTTGACCAATATTCTTGAGTATACAATTAGTGCCTAGTTGTTT 141546340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       60 GATACCATATATTTATGTTTGACCAATATTCTTGAGTATACAATTAGTGCCTAGTTGTTT 119

141546341 AGCAATCCATTACTTAATTGCCTGTAGTTTCATTTAAACGAGGTTTTTATTTTTGAATTA 141546400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 AGCAATCCATTACTTAATTGCCTGTAGTTTCATTTAAACGAGGTTTTTATTTTTGAATTA 179

141546401 TTGGCAGCACTCAGTACAATAAGAATCTTTTCTTTTAACCCATCTCTGTACCGTTACAAA 141546460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 TTGGCAGCACTCAGTACAATAAGAATCTTTTCTTTTAACCCATCTCTGTACCGTTACAAA 239

141546461 CCTTTCATTCTCTATTACACTTCCTTGAACAAGTTTAAGATCACCCTAGATCCCGCCATA 141546520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 CCTTTCATTCTCTATTACACTTCCTTGAACAAGTTTAAGATCACCCTAGATCCCGCCATA 299

141546521 CTCGTTCATTTATTCTTCAATCCAAATCAATCTTTTAATATCTCTTCCTGAATCTCAATT 141546580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 CTCGTTCATTTATTCTTCAATCCAAATCAATCTTTTAATATCTCTTCCTGAATCTCAATT 359

141546581 TACAATTGGCTTAGTTCACACTTAAATATTTTACCTAAAATGCTAGTGGAATTTCAAATA 141546640
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 TATAATTGGCTTAGTTCACACTTAAATATTTTACCTAAAATGCTAGTGGAATTTCAAATA 419

141546641 TCTAAATATTAGAAAATTAATATCAACAAATACATGTTTGTTTCAACAGTGACATAAGAA 141546700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TCTAAATATTAGAAAATTAATATCAACAAATACATGTTTGTTTCAACAGTGACATAAGAA 479

141546701 CATGTTTAAACTGTACAATAATGAAAAAGCAAATTTTCAAAATATAAGAGGTGCAGTACA 141546760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 CATGTTTAAACTGTACAATAATGAAAAAGCAAATTTTCAAAATATAAGAGGTGCAGTACA 539

141546761 AGTAGTAGTTGTAGGAAATGTTATATTTTTCTGTGCTGATTTAAATTGAAAAATTTAAAA 141546820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 AGTAGTAGTTGTAGGAAATGTTATATTTTTCTGTGCTGATTTAAATTGAAAAATTTAAAA 599

141546821 TCAAAGATACAAGCTCTGACATTAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAACCCAACTATACCT 141546880
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||
      600 TCAAAGATACAAGCTCTGACATTAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAA--CCCAACTATACCT 657

141546881 AACATAAACAAATAGAGGATATAGTAAGATAACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAG 141546940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 AACATAAACAAATAGAGGATATAGTAAGATAACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAG 717

141546941 ATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAA 141547000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 ATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAA 777

141547001 CTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGAT 141547060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 CTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGAT 837

141547061 GAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTT 141547120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 GAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTT 897

141547121 TATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTA 141547180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 TATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTA 957

141547181 TTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATA 141547240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 TTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATA 1017

141547241 CCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAA----AACAAAAAAGACTGTATTA 141547296
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||
     1018 CCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAATAAAAACAAAAAAGACTGTATTA 1077

141547297 ATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGA 141547356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 ATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGA 1137

141547357 GATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTG 141547416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 GATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTG 1197

141547417 AAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACT 141547476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 AAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACT 1257

141547477 GCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGG 141547536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 GCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGG 1317

141547537 AAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAAT 141547596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAAT 1377

141547597 TATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAAC 141547656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 TATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAAC 1437

141547657 CATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTT 141547716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 CATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTT 1497

141547717 CTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTT 141547776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 CTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTT 1557

141547777 TTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGA 141547836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGA 1617

141547837 GCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTG 141547896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 GCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTG 1677

141547897 GTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATAAGGACATTAGTCATACT 141547956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1678 GTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATGAGGACATTAGTCATACT 1737

141547957 TGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCT 141548016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCT 1797

141548017 TTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGG 141548076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGG 1857

141548077 AGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAAC 141548136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 AGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAAC 1917

141548137 CATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTA 141548196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 CATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTA 1977

141548197 TGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGT 141548256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGT 2037

141548257 AGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAA 141548316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 AGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAA 2097

141548317 TTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATT 141548376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATT 2157

141548377 TGAGATAAAATGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCA 141548436
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TGAGATAAAACGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCA 2217

141548437 GAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGA 141548496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 GAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGA 2277

141548497 ATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAG 141548556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 ATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAG 2337

141548557 TGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGT 141548616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGT 2397

141548617 AAAATTTC 141548624
          ||||||||
     2398 AAAATTTC 2405

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 2467

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 2527

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     2528 GAAAAT------------------------------------------------------ 2533

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 2589

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 2649

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 2709

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2710 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 2769

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 2829

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 2889

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 2949

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 141550690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 3009

141550691 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 141550750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 3069

141550751 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 141550810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 3129

141550811 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 141550870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 3189

141550871 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 141550930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 3249

141550931 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATAAGTCTTAAGCAAATAA 141550990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATAAGTCTTAAGCAAATAA 3309

141550991 AGAGATATACCATTTGCATGAATCGGAAGAGTCAGCTTAATAAATATTTTAATTATTCTC 141551050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 AGAGATATACCATTTGCATGAATCGGAAGAGTCAGCTTAATAAATATTTTAATTATTCTC 3369

141551051 AAATTAATCTATAAGCTTAACAAAATTCCTATCAAAATCCCACTATGTT 141551099
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 AAATTAATCTATAAGCTTAACAAAATTCCTATCAAAATCCCACTATGTT 3418

Alignment time is 2.59766 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2302] =>      2302 nucs 'mol-32-3025-248299_2302'

Score:        2183
Aligned:      2358        nucs
Identic:      2293 ( 97%) nucs =>      1683 (100%)       610 ( 91%)
Gaps:           62 (  3%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141546940,141548624] EXCISED REGION [141550031,141550699]
 second seq =>  [        1,     1689] EXCISED REGION [     1692,     2302]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [1690,1691]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1690,1690] to [1692,1692]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141546940 GATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATA 141546999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATA 60

141547000 ACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGA 141547059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGA 120

141547060 TGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATT 141547119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATT 180

141547120 TTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTT 141547179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTT 240

141547180 ATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAAT 141547239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAAT 300

141547240 ACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAA----AACAAAAAAGACTGTATT 141547295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||
      301 ACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAATAAAAACAAAAAAGACTGTATT 360

141547296 AATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAG 141547355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAG 420

141547356 AGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGT 141547415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGT 480

141547416 GAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAAC 141547475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAAC 540

141547476 TGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGG 141547535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGG 600

141547536 GAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAA 141547595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAA 660

141547596 TTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAA 141547655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAA 720

141547656 CCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTT 141547715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTT 780

141547716 TCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATT 141547775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATT 840

141547776 TTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTG 141547835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTG 900

141547836 AGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTT 141547895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTT 960

141547896 GGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATAAGGACATTAGTCATAC 141547955
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      961 GGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATGAGGACATTAGTCATAC 1020

141547956 TTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATC 141548015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATC 1080

141548016 TTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGG 141548075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGG 1140

141548076 GAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAA 141548135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAA 1200

141548136 CCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATT 141548195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATT 1260

141548196 ATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAG 141548255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAG 1320

141548256 TAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGA 141548315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGA 1380

141548316 ATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTAT 141548375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTAT 1440

141548376 TTGAGATAAAATGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACC 141548435
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGAGATAAAACGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACC 1500

141548436 AGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGG 141548495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGG 1560

141548496 AATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTA 141548555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTA 1620

141548556 GTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAG 141548615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAG 1680

141548616 TAAAATTTC 141548624
          |||||||||
     1681 TAAAATTTC 1689

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 1751

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 1811

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     1812 GAAAAT------------------------------------------------------ 1817

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1818 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 1873

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 1933

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 1993

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1994 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 2053

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 2113

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 2173

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 2233

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 141550690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 2293

141550691 TATTCTTAG 141550699
          |||||||||
     2294 TATTCTTAG 2302

Alignment time is 1.76528 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2500] =>      2500 nucs 'mol-32-3240-079950_2500'

Score:        2344
Aligned:      2534        nucs
Identic:      2466 ( 97%) nucs =>      1907 (100%)       559 ( 90%)
Gaps:           65 (  3%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141546713,141548624] EXCISED REGION [141550031,141550648]
 second seq =>  [        1,     1913] EXCISED REGION [     1916,     2475]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [1914,1915]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1914,1914] to [1916,1916]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141546713 GTACAATAATGAAAAAGCAAATTTTCAAAATATAAGAGGTGCAGTACAAGTAGTAGTTGT 141546772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTACAATAATGAAAAAGCAAATTTTCAAAATATAAGAGGTGCAGTACAAGTAGTAGTTGT 60

141546773 AGGAAATGTTATATTTTTCTGTGCTGATTTAAATTGAAAAATTTAAAATCAAAGATACAA 141546832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGAAATGTTATATTTTTCTGTGCTGATTTAAATTGAAAAATTTAAAATCAAAGATACAA 120

141546833 GCTCTGACATTAAGAAACCAAAAAAAAAAAAAAAACCCAACTATACCTAACATAAACAAA 141546892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||
      121 GCTCTGACATTAAGAAACCAAAAAAAAAAAAA---CCCAACTATACCTAACATAAACAAA 177

141546893 TAGAGGATATAGTAAGATAACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATA 141546952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      178 TAGAGGATATAGTAAGATAACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATA 237

141546953 ATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAG 141547012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 ATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAG 297

141547013 ATAAACAAGAGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTAC 141547072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 ATAAACAAGAGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTAC 357

141547073 AGATCTTCACACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAA 141547132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 AGATCTTCACACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAA 417

141547133 TTCTAGTACTTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACA 141547192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 TTCTAGTACTTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACA 477

141547193 CAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGA 141547252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 CAAGAAGAAATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGA 537

141547253 GAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAA----AACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCAT 141547308
          |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||
      538 GAAAATTTAAAAAGAAAGAAACAAATAAAAACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCAT 597

141547309 ACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAG 141547368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 ACTGCTATGAAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAG 657

141547369 TCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAG 141547428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 TCACACTTCTACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAG 717

141547429 AGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAA 141547488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 AGGCACATCTTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAA 777

141547489 ACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCC 141547548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 ACCATCAGATCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCC 837

141547549 CATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTAC 141547608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 CATGATTCAATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTAC 897

141547609 AATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGAC 141547668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 AATTAAAGATGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGAC 957

141547669 ATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCC 141547728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 ATTTTATAACACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCC 1017

141547729 ATAACAAAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTG 141547788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 ATAACAAAATGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTG 1077

141547789 GAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCT 141547848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GAAACAGAAGTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCT 1137

141547849 TGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTG 141547908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 TGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTG 1197

141547909 TGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATAAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCA 141547968
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTCTTCTTATGAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCA 1257

141547969 ACCCAATGACAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCC 141548028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 ACCCAATGACAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCC 1317

141548029 ACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCA 141548088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 ACAATCTTAGATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCA 1377

141548089 ACCCATAATACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATG 141548148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 ACCCATAATACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATG 1437

141548149 GCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATT 141548208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 GCAATTTTCATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATT 1497

141548209 CTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTG 141548268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 CTGCCATGTTAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTG 1557

141548269 TTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTAT 141548328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TTTAGCTTTAAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTAT 1617

141548329 TCATATGAATAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAATG 141548388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1618 TCATATGAATAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAACG 1677

141548389 TAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCA 141548448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 TAATTGTAAACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCA 1737

141548449 AAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAAT 141548508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 AAAAAACATATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAAT 1797

141548509 GCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGA 141548568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 GCCCATGGTCACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGA 1857

141548569 TTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 141548624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TTAAAAATAAAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 1913

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 1975

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 2035

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     2036 GAAAAT------------------------------------------------------ 2041

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 2097

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 2157

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 2217

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2218 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 2277

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 2337

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 2397

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 2457

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCAC 141550648
          ||||||||||||||||||
     2458 TTTTCTCTCTATGCTCAC 2475

Alignment time is 2.31001 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3516] =>      3516 nucs 'mol-32-32f0-180860_3516'

Score:        3375
Aligned:      3572        nucs
Identic:      3505 ( 98%) nucs =>      1716 (100%)      1789 ( 97%)
Gaps:           63 (  2%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141546907,141548624] EXCISED REGION [141550031,141551879]
 second seq =>  [        1,     1722] EXCISED REGION [     1725,     3516]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [1723,1724]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1723,1723] to [1725,1725]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141546907 AGATAACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTTTTTAAATT 141546966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATAACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTTTTTAAATT 60

141546967 AAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGA 141547026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGGCTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGA 120

141547027 AAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACAC 141547086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACAC 180

141547087 ATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGA 141547146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGA 240

141547147 TAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAA 141547206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAA 300

141547207 ACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAG 141547266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAG 360

141547267 AAAGAAACAAA----AACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAA 141547322
          |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGAAACAAATAAAAACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAA 420

141547323 ATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACAT 141547382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACAT 480

141547383 GGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACA 141547442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACA 540

141547443 TGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTG 141547502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTG 600

141547503 CGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAAT 141547562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAAT 660

141547563 CTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGA 141547622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGA 720

141547623 TTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGT 141547682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGT 780

141547683 TTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCA 141547742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCA 840

141547743 CAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACA 141547802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACA 900

141547803 AGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATG 141547862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATG 960

141547863 GTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTT 141547922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTT 1020

141547923 AATTTCCTCTTCTTATAAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATA 141547982
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTTCCTCTTCTTATGAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATA 1080

141547983 TTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATAC 141548042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATAC 1140

141548043 TAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTG 141548102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTG 1200

141548103 TGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAG 141548162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAG 1260

141548163 TAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGT 141548222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGT 1320

141548223 TACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAA 141548282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAA 1380

141548283 TTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGAT 141548342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGAT 1440

141548343 ATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAATGTAATTGTAAACCAG 141548402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1441 ATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAACGTAATTGTAAACCAG 1500

141548403 AAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATA 141548462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATA 1560

141548463 ACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCA 141548522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCA 1620

141548523 CTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACC 141548582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACC 1680

141548583 ATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 141548624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 1722

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 1784

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 1844

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     1845 GAAAAT------------------------------------------------------ 1850

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 1906

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 1966

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 2026

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2027 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 2086

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 2146

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 2206

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 2266

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 141550690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 2326

141550691 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 141550750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 2386

141550751 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 141550810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 2446

141550811 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 141550870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 2506

141550871 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 141550930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 2566

141550931 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATAAGTCTTAAGCAAATAA 141550990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATAAGTCTTAAGCAAATAA 2626

141550991 AGAGATATACCATTTGCATGAATCGGAAGAGTCAGCTTAATAAATATTTTAATTATTCTC 141551050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 AGAGATATACCATTTGCATGAATCGGAAGAGTCAGCTTAATAAATATTTTAATTATTCTC 2686

141551051 AAATTAATCTATAAGCTTAACAAAATTCCTATCAAAATCCCACTATGTTACTTTTGTAGA 141551110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 AAATTAATCTATAAGCTTAACAAAATTCCTATCAAAATCCCACTATGTTACTTTTGTAGA 2746

141551111 CATTAAAAACAACTTGTTTTAAATTTTATATAGAAAGAAAGAAACCTCAGAATAGCTAAA 141551170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 CATTAAAAACAACTTGTTTTAAATTTTATATAGAAAGAAAGAAACCTCAGAATAGCTAAA 2806

141551171 ACAATCTTGATAAATAGAATAAAGTAAAAGAATGACTCCATCTAACTTTAGTACTTACTT 141551230
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2807 ACAATCTTGATAAATAGAATAAAGTAAAAGAATGACTCCATCTAACTTTAGTATTTACTT 2866

141551231 TATACCTATCGTTATAATTATAGTGCCATATTGATAGATAGACATATAGATCAATAGAGC 141551290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 TATACCTATCGTTATAATTATAGTGCCATATTGATAGATAGACATATAGATCAATAGAGC 2926

141551291 AGAATAGATAACTCGAAAATAGACCCATATAAATATGTCTGATTGATTTTTTACAAAGGA 141551350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 AGAATAGATAACTCGAAAATAGACCCATATAAATATGTCTGATTGATTTTTTACAAAGGA 2986

141551351 GCAAAAGCAATTATATGAGTATGGATATCCTTTTCAATAAATGATGCTAAAATAATTGCA 141551410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 GCAAAAGCAATTATATGAGTATGGATATCCTTTTCAATAAATGATGCTAAAATAATTGCA 3046

141551411 CAGCCATAGGCAAAATAAAATAAAACAAACCTCAATTTAAGTCTCACTTCATTCAAAAAT 141551470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 CAGCCATAGGCAAAATAAAATAAAACAAACCTCAATTTAAGTCTCACTTCATTCAAAAAT 3106

141551471 CAACTCAGGATAGATTAGGGAATTAAATTGTCAAATAGAAAACTACAAAAATCTTAAAAA 141551530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 CAACTCAGGATAGATTAGGGAATTAAATTGTCAAATAGAAAACTACAAAAATCTTAAAAA 3166

141551531 AATAGGAGAAAACCTTCTATATCAAGGACTAGGCAGAGGTTTTAGACTTGACACCAAAAA 141551590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 AATAGGAGAAAACCTTCTATATCAAGGACTAGGCAGAGGTTTTAGACTTGACACCAAAAA 3226

141551591 CACAATCCACTACAAGAAAAATTAGTTAAGTGGACACCATCAAAATTAAAAACTATTAGG 141551650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 CACAATCCACTACAAGAAAAATTAGTTAAGTGGACACCATCAAAATTAAAAACTATTAGG 3286

141551651 ATTAATAAGTTCTGGAGAGTATTGCACAGCATGATGACATAGTTGATAATAATGTTTTGT 141551710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 ATTAATAAGTTCTGGAGAGTATTGCACAGCATGATGACATAGTTGATAATAATGTTTTGT 3346

141551711 ATGTTTGAAAATTGCTAAGAGAGTAGGTCTTAAATGTTCTCATCACATAAAACATACGTG 141551770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 ATGTTTGAAAATTGCTAAGAGAGTAGGTCTTAAATGTTCTCATCACATAAAACATACGTG 3406

141551771 ATGTGATAGA-TTTTTTTTTTTTTTAGACGGAGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGTTGGAGTG 141551829
          |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 ATGTGATAGATTTTTTTTTTTTTTTAGACGGAGTCTTGCTGTGTTGCCCAGGTTGGAGTG 3466

141551830 CAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCC 141551879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 CAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCAAGCC 3516

Alignment time is 3.68044 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2532] =>      2532 nucs 'mol-32-32fb-180981_2532'

Score:        2402
Aligned:      2588        nucs
Identic:      2522 ( 97%) nucs =>      1710 (100%)       812 ( 93%)
Gaps:           62 (  2%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141546912,141548624] EXCISED REGION [141550031,141550901]
 second seq =>  [        1,     1717] EXCISED REGION [     1720,     2532]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [1718,1719]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1718,1718] to [1720,1720]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141546912 ACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGG 141546971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
        1 ACAATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATGATTTTTTTTAAATTAAAGG 60

141546972 CTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACA 141547031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGGTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACA 120

141547032 CAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAG 141547091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAG 180

141547092 GACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAA 141547151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAA 240

141547152 TGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACC 141547211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACC 300

141547212 TCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGA 141547271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGA 360

141547272 AACAAA----AACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACC 141547327
          ||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACAAATAAAAACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACC 420

141547328 CAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTG 141547387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTG 480

141547388 GGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTG 141547447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTG 540

141547448 GCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGA 141547507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGA 600

141547508 ATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCT 141547567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCT 660

141547568 GCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGT 141547627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGT 720

141547628 GTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAG 141547687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAG 780

141547688 GAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGAC 141547747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGAC 840

141547748 TATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATT 141547807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATT 900

141547808 AAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGT 141547867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGT 960

141547868 TTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTT 141547927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTT 1020

141547928 CCTCTTCTTATAAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTA 141547987
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCTCTTCTTATGAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTA 1080

141547988 AATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGG 141548047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGG 1140

141548048 GTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAA 141548107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAA 1200

141548108 ATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATT 141548167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATT 1260

141548168 GAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCA 141548227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCA 1320

141548228 CGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTA 141548287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTA 1380

141548288 ATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAA 141548347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAA 1440

141548348 AAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAATGTAATTGTAAACCAGAAATA 141548407
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1441 AAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAACGTAATTGTAAACCAGAAATA 1500

141548408 GAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGG 141548467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGG 1560

141548468 GAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCT 141548527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCT 1620

141548528 ACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACA 141548587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACA 1680

141548588 AACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 141548624
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 1717

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 1779

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 1839

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     1840 GAAAAT------------------------------------------------------ 1845

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 1901

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 1961

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 2021

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2022 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 2081

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 2141

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 2201

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 2261

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 141550690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 2321

141550691 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 141550750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 2381

141550751 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 141550810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 2441

141550811 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 141550870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 2501

141550871 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTC 141550901
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTC 2532

Alignment time is 2.38326 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2495] =>      2495 nucs 'mol-32-3311-245997_2495'

Score:        2376
Aligned:      2551        nucs
Identic:      2486 ( 97%) nucs =>      1601 (100%)       885 ( 94%)
Gaps:           62 (  2%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141547022,141548624] EXCISED REGION [141550031,141550974]
 second seq =>  [        1,     1607] EXCISED REGION [     1610,     2495]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [1608,1609]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1608,1608] to [1610,1610]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141547022 AGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCA 141547081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGAAAACACAAATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCA 60

141547082 CACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTAC 141547141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACACATAAGGACAAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTAC 120

141547142 TTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAA 141547201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAGATAAAATGAACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAA 180

141547202 ATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTA 141547261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGAAACACCTCAAAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTA 240

141547262 AAAAGAAAGAAACAAA----AACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATG 141547317
          ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAGAAAGAAACAAATAAAAACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATG 300

141547318 AAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTC 141547377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAAATACCCAAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTC 360

141547378 TACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATC 141547437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACATGGCTGGGGAGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATC 420

141547438 TTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGA 141547497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTACATGGTGGCAGGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGA 480

141547498 TCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCA 141547557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTTGCGGGAATTATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCA 540

141547558 ATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGA 141547617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAATCTCCTGCTAGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGA 600

141547618 TGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAA 141547677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAGATTTGTGTGTGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAA 660

141547678 CACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAA 141547737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACGTTTTAGGAGTTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAA 720

141547738 TGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAA 141547797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTCACAGACTATGTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAA 780

141547798 GTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTA 141547857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTACAAGATTAAGGTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTA 840

141547858 GAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCT 141547917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAATGGTTGTTTTCTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCT 900

141547918 GTGTTAATTTCCTCTTCTTATAAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGA 141547977
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGTTAATTTCCTCTTCTTATGAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGA 960

141547978 CAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTA 141548037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAATATTTTAAATTAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTA 1020

141548038 GATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAAT 141548097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATACTAGGGGTGTGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAAT 1080

141548098 ACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTC 141548157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCTGTGTAAATACACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTC 1140

141548158 ATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGT 141548217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATCAGTAATTGAGATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGT 1200

141548218 TAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTT 141548277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAGTTACCACGTAGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTT 1260

141548278 AAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAA 141548337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAATTTTAATATAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAA 1320

141548338 TAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAATGTAATTGTAA 141548397
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1321 TAGATATGAAAAAATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAACGTAATTGTAA 1380

141548398 ACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACAT 141548457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCAGAAATAGAAAGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACAT 1440

141548458 ATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGT 141548517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATATAACGGGGAATTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGT 1500

141548518 CACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATA 141548577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACCACTTCTACTCATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATA 1560

141548578 AAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 141548624
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAACCATACAAACTAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 1607

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 1669

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 1729

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     1730 GAAAAT------------------------------------------------------ 1735

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 1791

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 1851

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 1911

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1912 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 1971

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 2031

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 2091

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 2151

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 141550690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 2211

141550691 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 141550750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 2271

141550751 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 141550810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 2331

141550811 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 141550870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 2391

141550871 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 141550930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 2451

141550931 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATA 141550974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAAATTAAATA 2495

Alignment time is 2.2134 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2593] =>      2593 nucs 'mol-32-3311-276154_2593'

Score:        2474
Aligned:      2649        nucs
Identic:      2584 ( 98%) nucs =>      1707 (100%)       877 ( 94%)
Gaps:           62 (  2%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141546916,141548624] EXCISED REGION [141550031,141550966]
 second seq =>  [        1,     1713] EXCISED REGION [     1716,     2593]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [1714,1715]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1714,1714] to [1716,1716]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141546916 TAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGG 141546975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTGG 60

141546976 TTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACACAAA 141547035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACACAAA 120

141547036 TTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGGACA 141547095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGGACA 180

141547096 AGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAATGAA 141547155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAATGAA 240

141547156 CAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAA 141547215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCAA 300

141547216 AAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACA 141547275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAACA 360

141547276 AA----AACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAG 141547331
          ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATAAAAACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAAG 420

141547332 ACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGA 141547391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGGA 480

141547392 GGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAG 141547451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCAG 540

141547452 GCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTA 141547511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATTA 600

141547512 TTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTA 141547571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCTA 660

141547572 GGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGT 141547631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTGT 720

141547632 GTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGT 141547691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAGT 780

141547692 TCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATG 141547751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTATG 840

141547752 TGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGG 141547811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAGG 900

141547812 TACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTC 141547871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTTC 960

141547872 TCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTC 141547931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCTC 1020

141547932 TTCTTATAAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATT 141547991
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCTTATGAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAATT 1080

141547992 AATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGT 141548051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTGT 1140

141548052 GGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATAC 141548111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATAC 1200

141548112 ACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGA 141548171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAGA 1260

141548172 TGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTA 141548231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGTA 1320

141548232 GTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATAT 141548291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATAT 1380

141548292 AACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAA 141548351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAAA 1440

141548352 TATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAATGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAA 141548411
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1441 TATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAACGTAATTGTAAACCAGAAATAGAAA 1500

141548412 GGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAAT 141548471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAAT 1560

141548472 TATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTC 141548531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACTC 1620

141548532 ATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACT 141548591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAACT 1680

141548592 AATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 141548624
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 1713

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 1775

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 1835

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     1836 GAAAAT------------------------------------------------------ 1841

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 1897

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 1957

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 2017

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2018 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 2077

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 2137

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 2197

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 2257

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 141550690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 2317

141550691 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 141550750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 2377

141550751 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 141550810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 2437

141550811 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 141550870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 2497

141550871 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 141550930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 2557

141550931 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAA 141550966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 TTGTATATGCTGAAAATTACAGAATAGATGACTGAA 2593

Alignment time is 1.97194 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [141538624,141560030] =>     21407 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2627] =>      2627 nucs 'mol-32-34be-067488_2627'

Score:        2499
Aligned:      2674        nucs
Identic:      2609 ( 98%) nucs =>      1768 (100%)       841 ( 93%)
Gaps:           62 (  2%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [141546855,141548624] EXCISED REGION [141550031,141550930]
 second seq =>  [       10,     1783] EXCISED REGION [     1786,     2627]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1406 nucs [141548625,141550030]
 second seq =>         2 nucs [1784,1785]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1784,1784] to [1786,1786]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

141546855 AAAAAAAAAAAAACCCAACTATACCTAACATAAACAAATAGAGGATATAGTAAGATAACA 141546914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       10 AAAAAAAAAAAAACCCAACTATACCTAACATAAACAAATAGAGGATATAGTAAGATAACA 69

141546915 ATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTG 141546974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       70 ATAGAAAACAATAAAATAGAAGACAGATTAATAATATAATTTTTTTTAAATTAAAGGCTG 129

141546975 GTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACACAA 141547034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      130 GTTCATTTAAGAAAAGTCCAATATAACTGACCAATCAGATAAACAAGAGAGAAAACACAA 189

141547035 ATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGGAC 141547094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      190 ATTTACCAAAATTAATAATAAATGATGAGCATCACTACAGATCTTCACACACATAAGGAC 249

141547095 AAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAATGA 141547154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      250 AAGCAAATGGCAATTTGAAACAATTTTATGCAAGTAAATTCTAGTACTTAGATAAAATGA 309

141547155 ACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCA 141547214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 ACAAATTCCATGAAAAACACAATTTATTAAACTAAACACAAGAAGAAATGAAACACCTCA 369

141547215 AAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAAC 141547274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 AAAGACACAATCAAGAGATTATAATACCCACTCTTAGAGAAAATTTAAAAAGAAAGAAAC 429

141547275 AAA----AACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAA 141547330
          |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 AAATAAAAACAAAAAAGACTGTATTAATCCATTTTCATACTGCTATGAAGAAATACCCAA 489

141547331 GACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGG 141547390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 GACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAGAGATTTAATGGAGTCACACTTCTACATGGCTGGGG 549

141547391 AGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCA 141547450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 AGGCCTCACAATCATGGCAGAAAGTGAAGGAGGAGCAGAGGCACATCTTACATGGTGGCA 609

141547451 GGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATT 141547510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 GGCAAGAGAGGGTGTGCAGGGGAACTGCCCTTTATAAAACCATCAGATCTTGCGGGAATT 669

141547511 ATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCT 141547570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 ATTTACTCTCACAAGAACAGCATGGGAAAACCCACCCCCATGATTCAATAATCTCCTGCT 729

141547571 AGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTG 141547630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 AGGTCTCACCCAAGACACGTGGGAATTATGGGAGCTACAATTAAAGATGAGATTTGTGTG 789

141547631 TGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAG 141547690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      790 TGTGTGTTGGGGGGGAACAGAAAAACCATATTAAAGACATTTTATAACACGTTTTAGGAG 849

141547691 TTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTAT 141547750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 TTCGCACGAACTTGCTGTATTAGTTTCTTAGGGCTGCCATAACAAAATGTCACAGACTAT 909

141547751 GTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAG 141547810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 GTGGCTTAAACAACATAAATTTATTTTTTACAATTCTGGAAACAGAAGTACAAGATTAAG 969

141547811 GTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTT 141547870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 GTACCATCAGGGTTGGTTTCTTCTGAGCACTCTTTCCTTGGCTTGTAGAATGGTTGTTTT 1029

141547871 CTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCT 141547930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 CTCCCTTTCTCTTTATACGGTTTTTGGTCTTTCCTCTGTGTGTGTCTGTGTTAATTTCCT 1089

141547931 CTTCTTATAAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAAT 141547990
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 CTTCTTATGAGGACATTAGTCATACTTGATTCGGGCCAACCCAATGACAATATTTTAAAT 1149

141547991 TAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTG 141548050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 TAATTACTGATTTAGAGACTCTATCTTTAAATACAGCCACAATCTTAGATACTAGGGGTG 1209

141548051 TGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATA 141548110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 TGGAATTCAACCTATGAAATTGAGGGAGACACAATTCAACCCATAATACCTGTGTAAATA 1269

141548111 CACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAG 141548170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 CACCTGACAAAGATTTAACAGACAACCATATTTACATGGCAATTTTCATCAGTAATTGAG 1329

141548171 ATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGT 141548230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 ATGTCAAACTCCTGAACAGAATATTATGGAATCAAATTCTGCCATGTTAAGTTACCACGT 1389

141548231 AGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATA 141548290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 AGTGTCCAATATGGGTTTATTCCAGTAGAGTATGTTTGTTTAGCTTTAAAAATTTTAATA 1449

141548291 TAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAA 141548350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 TAACTCATTATTACAATAAAAAGGAATTAAGCATGTATTCATATGAATAGATATGAAAAA 1509

141548351 ATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAATGTAATTGTAAACCAGAAATAGAA 141548410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1510 ATATTTGATAAATCTCAACATTTATTTGAGATAAAACGTAATTGTAAACCAGAAATAGAA 1569

141548411 AGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAA 141548470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1570 AGGAATTTATTTTATAAAGACTACCAGAAACCACAGCAAAAAAACATATATAACGGGGAA 1629

141548471 TTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACT 141548530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 TTATTGAAAGTTTCTTTCTGTCTGGAATGATGAACAATGCCCATGGTCACCACTTCTACT 1689

141548531 CATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAAC 141548590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 CATATTTTATGACATTTCTATATTAGTGCGATGACAGATTAAAAATAAAACCATACAAAC 1749

141548591 TAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 141548624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 TAATAAAAATGTTGTAAAAAAGAAGTAAAATTTC 1783

EXCISED REGION

141550031 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 141550090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 TTTTTCTGTTTCTTCCTGATGCTCCATGCTTCTTTCTTGTATTATTTCCTTTCTGGTTAA 1845

141550091 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 141550150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 AAACCATAATTTAATATTTTGTGGTAGTATGTCTGCTAGTGATATATGTTTCCTTAGAGT 1905

141550151 GAAAATGTCATTTCCCTTCATTCCTGAAGGATAATTTCAATGCATACAGAATTTGCTGTT 141550210
          ||||||                                                      
     1906 GAAAAT------------------------------------------------------ 1911

141550211 AATAGTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 141550270
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 ----GTTCATTTTTTCAGCACTTGAATAATGTGCCATTCCCATTTGGCCACCTGATTGTT 1967

141550271 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 141550330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 GTTGAGAAATTGGTTGCTACTCAAATTGATGTGCCTCTGTAAGTAATGCATCATCTCTCT 2027

141550331 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 141550390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 CTGAATGCTTTCAAATTTTGGTCCCCGTTTTGAGTTCTCAGAAGATTAATTATAATCTGT 2087

141550391 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTGAACCTA 141550450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2088 CTTGGCATGGATTTTTTTTTAGTTTATTCTCTTTGGGGTTTGTTCATTTTCTTAAACCTA 2147

141550451 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 141550510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 TAGATTTATGCCTTTTTACTAAATTGGGGAATATTTCTGCCATTGTTTCATTGAGTACTT 2207

141550511 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 141550570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 TTTTACTCCAGTCTCTTTCTTTGCTATTTTGGGACTCCAGTTATATGAATGTTGGAATTT 2267

141550571 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 141550630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2268 TTGGTAGCTGCCTAACAAATCTCTGAGACTGAGGCTGTGTTTATTTTTCTTGCAATCTGT 2327

141550631 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 141550690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 TTTTCTCTCTATGCTCACATTGAGTAAACTCTATTGATCCAGTCTCCTGCAAACTAATTA 2387

141550691 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 141550750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 TATTCTTAGTAACTTCTACTCTACTGTTGAATGCATCCAGTAAGCTTTTAAAAGTTTTTT 2447

141550751 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 141550810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 TGTGTTTGTTGTATTTTTAGGTTCTATGATTTGCATTTGGTTCCTTTTTACCAGTTCTAT 2507

141550811 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 141550870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 TTTTCACTGAATATAATATTAAATATTTTATTTAATTTAGTATGATTTGTTTTTGAATAC 2567

141550871 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 141550930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 TTGTTATGACAGTTACTTTAAAATTCTTGTCAGATATACACTTAGCAAAATATGTACAGG 2627

Alignment time is 2.66813 s

