
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3177] =>      3177 nucs 'mol-32-1e66-028509_3177'

Score:        3064
Aligned:      3174        nucs
Identic:      3164 (100%) nucs =>      1728 (100%)      1436 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112200,132113933] EXCISED REGION [132113934,132115373]
 second seq =>  [        1,     1734] EXCISED REGION [     1739,     3177]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1735,1738]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1735,1736] to [1739,1740]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132113933,132113933] to [132113934,132113934]
 second seq =>         1 nucs [1734,1734] to [1739,1739]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112200 CCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTG 132112259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTG 60

132112260 GGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGT 132112319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGT 120

132112320 ATGAGAATCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAA 132112379
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGAGAATCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAA 180

132112380 GTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTT 132112439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTT 240

132112440 TAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTA 132112499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTA 300

132112500 ATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTT 132112559
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTT 360

132112560 TTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAAT 132112619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAAT 420

132112620 CTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTC 132112679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTC 480

132112680 TAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGG 132112739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGG 540

132112740 CGAAGCGCTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTG 132112799
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGAAGCACTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTG 600

132112800 GCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCT 132112859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCT 660

132112860 TGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAAT 132112919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAAT 720

132112920 ATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGC 132112979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGC 780

132112980 ATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAAC 132113039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAAC 840

132113040 CAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTT 132113099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTT 900

132113100 AAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGA 132113159
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGA 960

132113160 CAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGC 132113219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGC 1020

132113220 TTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGG 132113279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGG 1080

132113280 TCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTA 132113339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTA 1140

132113340 CTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAG 132113399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAG 1200

132113400 CTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTC 132113459
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTACGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTC 1260

132113460 AGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATT 132113519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATT 1320

132113520 AGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAG 132113579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAG 1380

132113580 GAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACT 132113639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACT 1440

132113640 ATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTT 132113699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTT 1500

132113700 CATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCAC 132113759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCAC 1560

132113760 TGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTG 132113819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1561 TGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTG 1620

132113820 TTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTA 132113879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTA 1680

132113880 TAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 132113933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 1734

EXCISED REGION

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 1798

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 1858

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 1918

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 1978

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 2038

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 132114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 2098

132114294 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 132114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 2158

132114354 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 132114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 2218

132114414 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 132114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 2278

132114474 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 132114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 2338

132114534 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 132114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 2398

132114594 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTC 132114653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2399 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTC 2457

132114654 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGC 132114713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2458 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGC 2517

132114714 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 132114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 2577

132114774 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 132114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 2637

132114834 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 132114893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 2697

132114894 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 132114953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 2757

132114954 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 132115013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 2817

132115014 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTTT 132115073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2818 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTTT 2877

132115074 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 132115133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 2937

132115134 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 132115193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 2997

132115194 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 132115253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 3057

132115254 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 132115313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 3117

132115314 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 132115373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 3177

Alignment time is 2.7681 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4041] =>      4041 nucs 'mol-32-1e66-028704_4041'

Score:        4018
Aligned:      4040        nucs
Identic:      4038 (100%) nucs =>       651 (100%)      3387 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132116053,132116703] EXCISED REGION [132116705,132120093]
 second seq =>  [        1,      651] EXCISED REGION [      653,     4041]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132116704,132116704]
 second seq =>         1 nucs [652,652]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [132116703,132116705] to [132116704,132116706]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132116703,132116703] to [132116705,132116705]
 second seq =>         1 nucs [651,651] to [653,653]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132116053 TTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGCCATCCATCCGCCTCAG 132116112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGCCATCCATCCGCCTCAG 60

132116113 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTT 132116172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTT 120

132116173 CTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCA 132116232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCA 180

132116233 TGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAA 132116292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAA 240

132116293 AAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTA 132116352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTA 300

132116353 AATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAG 132116412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAG 360

132116413 TGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTT 132116472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTT 420

132116473 GTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACT 132116532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACT 480

132116533 ACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGAT 132116592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGAT 540

132116593 GTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAG 132116652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAG 600

132116653 GGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 132116703
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 651

EXCISED REGION

132116705 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 132116764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 712

132116765 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 132116824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 772

132116825 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 132116884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 832

132116885 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 132116944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 892

132116945 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 132117004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 952

132117005 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 132117064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 1012

132117065 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 132117124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 1072

132117125 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 132117184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 1132

132117185 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 132117244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 1192

132117245 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 132117304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 1252

132117305 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 132117364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 1312

132117365 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 132117424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 1372

132117425 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 132117484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 1432

132117485 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 132117544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 1492

132117545 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 132117604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 1552

132117605 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAACGTAG 132117664
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1553 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAATGTAG 1612

132117665 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 132117724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 1672

132117725 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 132117784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 1732

132117785 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 132117844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 1792

132117845 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 132117904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 1852

132117905 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 132117964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 1912

132117965 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 132118024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 1972

132118025 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 132118084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 2032

132118085 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 132118144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 2092

132118145 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 132118204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 2152

132118205 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 132118264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 2212

132118265 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 132118324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 2272

132118325 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 132118384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 2332

132118385 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 132118444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 2392

132118445 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 132118504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 2452

132118505 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 132118564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 2512

132118565 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 132118624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 2572

132118625 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 132118684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 2632

132118685 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 132118744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 2692

132118745 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 132118804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 2752

132118805 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 132118864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 2812

132118865 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 132118924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 2872

132118925 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 132118984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 2932

132118985 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 132119044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 2992

132119045 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 132119104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 3052

132119105 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 132119164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 3112

132119165 TATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTG 132119224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 TATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTG 3172

132119225 GCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATA 132119284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 GCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATA 3232

132119285 ATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGT 132119344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 ATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGT 3292

132119345 TCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGG 132119404
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 TCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGG 3352

132119405 GACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTT 132119464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 GACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTT 3412

132119465 TTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAA 132119524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 TTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAA 3472

132119525 AAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTA 132119584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 AAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTA 3532

132119585 AAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAA 132119644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 AAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAA 3592

132119645 CACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCT 132119704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 CACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCT 3652

132119705 GAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAG 132119764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 GAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAG 3712

132119765 GGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGA 132119824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 GGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGA 3772

132119825 CAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTA 132119884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 CAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTA 3832

132119885 TAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATT 132119944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 TAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATT 3892

132119945 GTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATACATGT 132120004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 GTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATACATGT 3952

132120005 GTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCTATGA 132120064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 GTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCTATGA 4012

132120065 TTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAG 132120093
          |||||||||||||||||||||||||||||
     4013 TTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAG 4041

Alignment time is 3.46982 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     8138] =>      8138 nucs 'mol-32-1e66-076661_8138'

Score:        8094
Aligned:      8138        nucs
Identic:      8134 (100%) nucs =>       748 (100%)      7386 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132116912,132117659] EXCISED REGION [132117661,132125050]
 second seq =>  [        1,      748] EXCISED REGION [      750,     8138]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132117660,132117660]
 second seq =>         1 nucs [749,749]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [132121537,132121537]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132116912 TCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGA 132116971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGA 60

132116972 CAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCT 132117031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCT 120

132117032 AGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTG 132117091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTG 180

132117092 GTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTT 132117151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTT 240

132117152 CATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAG 132117211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAG 300

132117212 CCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAA 132117271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAA 360

132117272 TGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTAT 132117331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTAT 420

132117332 TTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCT 132117391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCT 480

132117392 TGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAA 132117451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAA 540

132117452 ATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTT 132117511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTT 600

132117512 ATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGT 132117571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGT 660

132117572 TTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCAT 132117631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCAT 720

132117632 TTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAA 132117659
          ||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAA 748

EXCISED REGION

132117661 GTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAG 132117720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 GTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAG 809

132117721 CTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGA 132117780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 CTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGA 869

132117781 AAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGC 132117840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 AAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGC 929

132117841 TTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGA 132117900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 TTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGA 989

132117901 AGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAA 132117960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 AGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAA 1049

132117961 AAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTA 132118020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 AAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTA 1109

132118021 TGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGA 132118080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 TGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGA 1169

132118081 AGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGAC 132118140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 AGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGAC 1229

132118141 GAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTG 132118200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 GAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTG 1289

132118201 TCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGC 132118260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 TCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGC 1349

132118261 AATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATT 132118320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 AATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATT 1409

132118321 GGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAA 132118380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 GGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAA 1469

132118381 TTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGC 132118440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 TTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGC 1529

132118441 TGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAA 132118500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 TGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAA 1589

132118501 GAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGG 132118560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 GAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGG 1649

132118561 GACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAA 132118620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 GACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAA 1709

132118621 GAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTG 132118680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 GAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTG 1769

132118681 CCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATA 132118740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 CCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATA 1829

132118741 ATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATG 132118800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 ATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATG 1889

132118801 ATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGA 132118860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 ATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGA 1949

132118861 TGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGAT 132118920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 TGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGAT 2009

132118921 TTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATG 132118980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 TTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATG 2069

132118981 CCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCAT 132119040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 CCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCAT 2129

132119041 GGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGA 132119100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 GGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGA 2189

132119101 ACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAAT 132119160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 ACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAAT 2249

132119161 TATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACAT 132119220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 TATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACAT 2309

132119221 TTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGA 132119280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 TTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGA 2369

132119281 GATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTA 132119340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 GATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTA 2429

132119341 CAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCT 132119400
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 CAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCT 2489

132119401 TAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTT 132119460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 TAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTT 2549

132119461 TTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATT 132119520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 TTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATT 2609

132119521 GAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAA 132119580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 GAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAA 2669

132119581 GTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCA 132119640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 GTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCA 2729

132119641 ACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTAC 132119700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 ACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTAC 2789

132119701 TCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACT 132119760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 TCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACT 2849

132119761 GTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAA 132119820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 GTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAA 2909

132119821 GTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTT 132119880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 GTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTT 2969

132119881 GTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGG 132119940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 GTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGG 3029

132119941 TATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATAC 132120000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 TATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATAC 3089

132120001 ATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCT 132120060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 ATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCT 3149

132120061 ATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACGACAGTAAT 132120120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 ATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACGACAGTAAT 3209

132120121 AACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCA 132120180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 AACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCA 3269

132120181 GAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATGGAAAATACATATTGTAACTCCT 132120240
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3270 GAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATTGAAAATACATATTGTAACTCCT 3329

132120241 AGAACAATGACTAATGACTAGAAAATAACTTTTAAAAAAGCTAAAATTCAACAGAGAAAT 132120300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 AGAACAATGACTAATGACTAGAAAATAACTTTTAAAAAAGCTAAAATTCAACAGAGAAAT 3389

132120301 GAATATGGTATAATAAAAAGCATTTTTAATACATTCAAAGAAGTAAAGGAGGAAGAGAGA 132120360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 GAATATGGTATAATAAAAAGCATTTTTAATACATTCAAAGAAGTAAAGGAGGAAGAGAGA 3449

132120361 GACAAGAAATTAGATATAACAAATAGCAAAGTGGCAGGCATAAATTGGAACATCAATCAC 132120420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 GACAAGAAATTAGATATAACAAATAGCAAAGTGGCAGGCATAAATTGGAACATCAATCAC 3509

132120421 TACATTAAATATGAATGATTAAATACTCAATTTAAAAGGCAGAGATTGTCAGACTAACCA 132120480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 TACATTAAATATGAATGATTAAATACTCAATTTAAAAGGCAGAGATTGTCAGACTAACCA 3569

132120481 AAAGCAAGATTTTAGATTTAAAGTAAAAGAATAAGAAAAGATATATTATGTAAATGGTAA 132120540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 AAAGCAAGATTTTAGATTTAAAGTAAAAGAATAAGAAAAGATATATTATGTAAATGGTAA 3629

132120541 CCATAAGAGAGCTGGATAAGCTAAACTAAAATGAGAAAAAAATCAGTTTTAAGACAAGAA 132120600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 CCATAAGAGAGCTGGATAAGCTAAACTAAAATGAGAAAAAAATCAGTTTTAAGACAAGAA 3689

132120601 ATAGAACACTAGAAAATTTAGGCTAAAAAAATATCAGCATAGAGATGAAAGATGACACTT 132120660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3690 ATAGAACACTAGAAAATTTAGGCTAAAAAAATATCAGCATAGAGATGAAAGATGACACTT 3749

132120661 CTTAATGATTAAATGGATAATACATCAGGAAGATTTAAAAATTACAAACATATACCTACC 132120720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 CTTAATGATTAAATGGATAATACATCAGGAAGATTTAAAAATTACAAACATATACCTACC 3809

132120721 CAACAGTAAACAGCAAAATAAACCTAATTGAAAGGACAAATAGACACCTCAACAATTATA 132120780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3810 CAACAGTAAACAGCAAAATAAACCTAATTGAAAGGACAAATAGACACCTCAACAATTATA 3869

132120781 GTTAGAGATTTCAAGACTCCTCTTTCAGCAATTACTTTTTAAAAAACTAAACAGAAAATT 132120840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3870 GTTAGAGATTTCAAGACTCCTCTTTCAGCAATTACTTTTTAAAAAACTAAACAGAAAATT 3929

132120841 GCTAAGGATATAGACCTACACAGTGCTATCGACCAACTTGACCTAATTAGCATACACAGA 132120900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3930 GCTAAGGATATAGACCTACACAGTGCTATCGACCAACTTGACCTAATTAGCATACACAGA 3989

132120901 ACATTCTACTCGACAACAGCAGAATTGACATTCCTTCCTGGAGTACCTAGAACATTATTT 132120960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3990 ACATTCTACTCGACAACAGCAGAATTGACATTCCTTCCTGGAGTACCTAGAACATTATTT 4049

132120961 GGGAATAGAATATGCTAGCTATAAATTTCTGTCTAATATTATATGTATAATATTGATTTC 132121020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4050 GGGAATAGAATATGCTAGCTATAAATTTCTGTCTAATATTATATGTATAATATTGATTTC 4109

132121021 AGATCTATTATATATAATATCTATCTAATACATCTATTAATATATAACATTACATATTAG 132121080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4110 AGATCTATTATATATAATATCTATCTAATACATCTATTAATATATAACATTACATATTAG 4169

132121081 AAGGAAATGTATAGTTTTAAATGCTTACATTACAAAAGAATAAAGATCTGAAACCAATCA 132121140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4170 AAGGAAATGTATAGTTTTAAATGCTTACATTACAAAAGAATAAAGATCTGAAACCAATCA 4229

132121141 TATAAATTATCACTTTAAGAAGCTAGAAAATTATTAGCATATCAAACAAAGTAAGTAGAA 132121200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4230 TATAAATTATCACTTTAAGAAGCTAGAAAATTATTAGCATATCAAACAAAGTAAGTAGAA 4289

132121201 GAGGGAGAAAAATAAAAAACAGAATAAAAACCAGTGAAATGAAAAACAAAAAATAATAGA 132121260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4290 GAGGGAGAAAAATAAAAAACAGAATAAAAACCAGTGAAATGAAAAACAAAAAATAATAGA 4349

132121261 AAAATCCATTAAACTAAAAGTTGGTTCTTTGAAAAGGTTAACAAAACTGACAAACTTTTA 132121320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4350 AAAATCCATTAAACTAAAAGTTGGTTCTTTGAAAAGGTTAACAAAACTGACAAACTTTTA 4409

132121321 GTTGGTCTAGGCAACATGAAAAGAGAGAAGACAGAAATCTCCATCAAAACCAGAAACAAT 132121380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4410 GTTGGTCTAGGCAACATGAAAAGAGAGAAGACAGAAATCTCCATCAAAACCAGAAACAAT 4469

132121381 GGAAGGGGCATAAGTATATATATTATAGAAGTTAAAAATATCATAAGACAATATTATGAA 132121440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4470 GGAAGGGGCATAAGTATATATATTATAGAAGTTAAAAATATCATAAGACAATATTATGAA 4529

132121441 CAACTTTATGTACAAAATGATGGAATGGAAAAATTCCTAGAAATTACAAAAAAACTGACC 132121500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4530 CAACTTTATGTACAAAATGATGGAATGGAAAAATTCCTAGAAATTACAAAAAAACTGACC 4589

132121501 TAGGAAAAGAATACTATATCAAGTAAAGCAATTAACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG 132121560
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     4590 TAGGAAAAGAATACTATATCAAGTAAAGCAATTAAC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG 4648

132121561 AGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCCGGCTGGAGTGCAGTGGTGTCATCTCAGCTCACTGT 132121620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4649 AGACAGGGTCTCACTCTGTCACCCCGGCTGGAGTGCAGTGGTGTCATCTCAGCTCACTGT 4708

132121621 AGCCTTGACTACCTGGGCTCAGGTGATTTTTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAC 132121680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4709 AGCCTTGACTACCTGGGCTCAGGTGATTTTTCCCACCTCAGCCTCCTGAATAGCTGGGAC 4768

132121681 TACAGGCAGTACCAGCATACCCAGCTAATTATGTTTTTACTGTAGAGACAGGGTTTCATC 132121740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4769 TACAGGCAGTACCAGCATACCCAGCTAATTATGTTTTTACTGTAGAGACAGGGTTTCATC 4828

132121741 ATGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCTGAGGCTCAAGCAATTCACTGGCCTTGGCCTCCC 132121800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4829 ATGTTGCCCAGGCTAGTCTTGAACTCTGAGGCTCAAGCAATTCACTGGCCTTGGCCTCCC 4888

132121801 AAATTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTTGCCACAATAGGCTTTATAATTAA 132121860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4889 AAATTGCTGGGATTATAGGCATGAGCCACCATGCCTTGCCACAATAGGCTTTATAATTAA 4948

132121861 AATTCTTTCCATGAGGAAAGCCCAGGCCTGAATGGCTTCATCTCAATAATTCTAACAAAC 132121920
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4949 AATTCTTTCCACGAGGAAAGCCCAGGCCTGAATGGCTTCATCTCAATAATTCTAACAAAC 5008

132121921 ACTTAAGGAAGACTGAATACCAGTCCTACACAAACTCTTTTGGAAAGTAGACAAGGGAAA 132121980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5009 ACTTAAGGAAGACTGAATACCAGTCCTACACAAACTCTTTTGGAAAGTAGACAAGGGAAA 5068

132121981 AGAAACACTTTCTGAGCTAATTTTATATGGTCAGTATTATAGCTGACACAAAAGGCAAAT 132122040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5069 AGAAACACTTTCTGAGCTAATTTTATATGGTCAGTATTATAGCTGACACAAAAGGCAAAT 5128

132122041 AAACATCATAATAAAAGGAAATTAAAGACCAAGGAAATATAGATTGGAAGGGAAAAAGTA 132122100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5129 AAACATCATAATAAAAGGAAATTAAAGACCAAGGAAATATAGATTGGAAGGGAAAAAGTA 5188

132122101 AACCTGTCATTATTTGCAGATGACATGATCTTGCATTTGGAAAATTCTTAGGAATCTACC 132122160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5189 AACCTGTCATTATTTGCAGATGACATGATCTTGCATTTGGAAAATTCTTAGGAATCTACC 5248

132122161 AAACCAAATCAAACCAAACTATTAGAACTAATAAGCAAGTTTAGCAAGGTCACAGGATAC 132122220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5249 AAACCAAATCAAACCAAACTATTAGAACTAATAAGCAAGTTTAGCAAGGTCACAGGATAC 5308

132122221 AAGATAAACATACAAAAAACTAATTGTATTATAGTATATTGATAATGAACAAATAATGTG 132122280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5309 AAGATAAACATACAAAAAACTAATTGTATTATAGTATATTGATAATGAACAAATAATGTG 5368

132122281 AAATTAAGAAAATTATTCCATTCATAATATCATCAAAAACATAAAATATTTAGGAGTAAA 132122340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5369 AAATTAAGAAAATTATTCCATTCATAATATCATCAAAAACATAAAATATTTAGGAGTAAA 5428

132122341 TATGACAAAAGAAACCAAGACCTGTAGGGTGAGGATACACACTGCTGAAAAAAATTAAAG 132122400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5429 TATGACAAAAGAAACCAAGACCTGTAGGGTGAGGATACACACTGCTGAAAAAAATTAAAG 5488

132122401 TCAATCTAAATAAATAAAGTGATATCCCATATTCATAAATTATAAGACTAAATATTGTTA 132122460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5489 TCAATCTAAATAAATAAAGTGATATCCCATATTCATAAATTATAAGACTAAATATTGTTA 5548

132122461 AGATGGCAATTGTTCTCAATTTGATTTATAGGTTAAACATAATCCTATGAAAAAATGTAG 132122520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5549 AGATGGCAATTGTTCTCAATTTGATTTATAGGTTAAACATAATCCTATGAAAAAATGTAG 5608

132122521 ACTTTTTTAAGATAGAAATTGACAATGTAATTCTAACATTGTATGGAAATGCAAAGGCCT 132122580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5609 ACTTTTTTAAGATAGAAATTGACAATGTAATTCTAACATTGTATGGAAATGCAAAGGCCT 5668

132122581 ATAATAGCTAAAATAATTTTGAAAAGAAACAAAGTTGGAGGTATGCTAACTTATTTCAAA 132122640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5669 ATAATAGCTAAAATAATTTTGAAAAGAAACAAAGTTGGAGGTATGCTAACTTATTTCAAA 5728

132122641 AATCACTATAAAGCCACAGCAATAAAAAAATGTGGTATTTGCATAAGCATATACACATAA 132122700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5729 AATCACTATAAAGCCACAGCAATAAAAAAATGTGGTATTTGCATAAGCATATACACATAA 5788

132122701 ATTAATGAAACACAACAGAGTTCAGAAATAATGTTAAGTGAAATAAGACAGGTACCTAAA 132122760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5789 ATTAATGAAACACAACAGAGTTCAGAAATAATGTTAAGTGAAATAAGACAGGTACCTAAA 5848

132122761 GACAAATACCATATGATTTCACTTACATGTGGACAAATTTGAACTTACAGACATAGAAAG 132122820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5849 GACAAATACCATATGATTTCACTTACATGTGGACAAATTTGAACTTACAGACATAGAAAG 5908

132122821 TAGAATGGTGGTAACCAGGGGCTGGTGTGGGGTGTGGTGTGGTTGGGGAAATGCTCATCA 132122880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5909 TAGAATGGTGGTAACCAGGGGCTGGTGTGGGGTGTGGTGTGGTTGGGGAAATGCTCATCA 5968

132122881 TAGGGCCAATCACCATAGGAATGAACTTCAACATTTATGGTAAATTAAATTTTGACATAG 132122940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5969 TAGGGCCAATCACCATAGGAATGAACTTCAACATTTATGGTAAATTAAATTTTGACATAG 6028

132122941 CTGCCAAGGTAATTCAATGGAGAAATGAGTCTTCAACAATTGGTGCTGGAACCATTGGGT 132123000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6029 CTGCCAAGGTAATTCAATGGAGAAATGAGTCTTCAACAATTGGTGCTGGAACCATTGGGT 6088

132123001 ATCCATGTGTACAACAATGAATTTAGACCCTTATCTCACACATTACACAAAAATTAACTC 132123060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6089 ATCCATGTGTACAACAATGAATTTAGACCCTTATCTCACACATTACACAAAAATTAACTC 6148

132123061 AGAATGGTCCTAGACCCAAATATAAGGGCTAAAATTACAACACTTTAGAAGAAAACATAG 132123120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6149 AGAATGGTCCTAGACCCAAATATAAGGGCTAAAATTACAACACTTTAGAAGAAAACATAG 6208

132123121 GAGAAACTTCTGTGGCTTTGGGTGAGTCAGAGATTTCCTATATATGATACCAAAATCAGG 132123180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6209 GAGAAACTTCTGTGGCTTTGGGTGAGTCAGAGATTTCCTATATATGATACCAAAATCAGG 6268

132123181 TTCCATAGGAGAAAATATTGATAAATTGGATTTTATAAAAATAATTTTAAAAACTTGTTT 132123240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6269 TTCCATAGGAGAAAATATTGATAAATTGGATTTTATAAAAATAATTTTAAAAACTTGTTT 6328

132123241 TTTAAAAGACAACATTAAGAAAAAGAAATTGGATAAAATATTTGCAAATCATAAATATGA 132123300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6329 TTTAAAAGACAACATTAAGAAAAAGAAATTGGATAAAATATTTGCAAATCATAAATATGA 6388

132123301 TAAAAGACTTGTGTCCAAAATATATAAAAAAGTTTATAACTCAATAATCAGATGAGAAAC 132123360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6389 TAAAAGACTTGTGTCCAAAATATATAAAAAAGTTTATAACTCAATAATCAGATGAGAAAC 6448

132123361 AAATCTGATAAAAATGGGCAAGAGATTTGAGTAGGCATTTCATCAAAGAAGACATATAGA 132123420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6449 AAATCTGATAAAAATGGGCAAGAGATTTGAGTAGGCATTTCATCAAAGAAGACATATAGA 6508

132123421 TGACAGATAAGCACATGAAAAGGTGTTCAACATAATTCGTCATTAGGGAAATGCAAATAA 132123480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6509 TGACAGATAAGCACATGAAAAGGTGTTCAACATAATTCGTCATTAGGGAAATGCAAATAA 6568

132123481 AAGCCACTTTGAGGTACCACCAAACACCTATTCAAATGGCTATTATAAAAGACTGAGAAT 132123540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6569 AAGCCACTTTGAGGTACCACCAAACACCTATTCAAATGGCTATTATAAAAGACTGAGAAT 6628

132123541 AGGAAGTATTGCAAAGTATGTGGACTCCTTACCCACTGATATACTGTGAATAGTAAGTGT 132123600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6629 AGGAAGTATTGCAAAGTATGTGGACTCCTTACCCACTGATATACTGTGAATAGTAAGTGT 6688

132123601 AGGAGGGGCATATGGACTCCTTACATGTTGCTGGCAGGAATGTACAATGGTACAGCCACA 132123660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6689 AGGAGGGGCATATGGACTCCTTACATGTTGCTGGCAGGAATGTACAATGGTACAGCCACA 6748

132123661 TTGGGAAACAGTTTCTCTGTTTCTCAAAAATTTAAATATACGCTTTGCATATGACTTAAC 132123720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6749 TTGGGAAACAGTTTCTCTGTTTCTCAAAAATTTAAATATACGCTTTGCATATGACTTAAC 6808

132123721 AATGAAACTCCCAGTTATCTACCCAAGGGAAATGAAAATGCAGATTCACACAAAGACATG 132123780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6809 AATGAAACTCCCAGTTATCTACCCAAGGGAAATGAAAATGCAGATTCACACAAAGACATG 6868

132123781 TACATGAATGTTCATAGAAGCATTATTTATAATAGCTCAAGCTGGAAATAATACGAATGT 132123840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6869 TACATGAATGTTCATAGAAGCATTATTTATAATAGCTCAAGCTGGAAATAATACGAATGT 6928

132123841 CCAGCAACTGGTGAAAAGATAAAATATGATATATCCATACAATAAATTACTACTATGTAT 132123900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6929 CCAGCAACTGGTGAAAAGATAAAATATGATATATCCATACAATAAATTACTACTATGTAT 6988

132123901 AAAAAGGGACTACTGATATTTGCATCAGCATGGATGAACTTCAAAACATTATGCTAAGTG 132123960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6989 AAAAAGGGACTACTGATATTTGCATCAGCATGGATGAACTTCAAAACATTATGCTAAGTG 7048

132123961 AAAGAAGACAGACACAAAAGACAACTTAGTATAATACCATTTAAATGAATTTTCTAGAAA 132124020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7049 AAAGAAGACAGACACAAAAGACAACTTAGTATAATACCATTTAAATGAATTTTCTAGAAA 7108

132124021 AGGCAAAGCTACAGACAGAAAGCAGAGAAGTCTTTGGTTGGGACTGGAATGGGAGTTTTT 132124080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7109 AGGCAAAGCTACAGACAGAAAGCAGAGAAGTCTTTGGTTGGGACTGGAATGGGAGTTTTT 7168

132124081 GATTATACATGTGCAGAAACAAACTTTTTGAAGTGATGAAATTGTTCCAAAACTGGATCA 132124140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7169 GATTATACATGTGCAGAAACAAACTTTTTGAAGTGATGAAATTGTTCCAAAACTGGATCA 7228

132124141 TATTAATAGTTGCACAACTGTATAAATTATTAAAAATCACTGAACTGTATGCATATAATG 132124200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7229 TATTAATAGTTGCACAACTGTATAAATTATTAAAAATCACTGAACTGTATGCATATAATG 7288

132124201 GGTAGATATGATAATAGGTAAATTGTACTTTAATCAAACTTAAAATTCAGGTTACCTGGC 132124260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7289 GGTAGATATGATAATAGGTAAATTGTACTTTAATCAAACTTAAAATTCAGGTTACCTGGC 7348

132124261 AACCCTACATTTTGTTTGAAATAGAAGTGTAAGAGATAATGAAGGAGTGGCAGATACCGT 132124320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7349 AACCCTACATTTTGTTTGAAATAGAAGTGTAAGAGATAATGAAGGAGTGGCAGATACCGT 7408

132124321 GGTTAACAAAAAGTGAAGGACTAGAAACCAACTTCCTGTAGCAGGTAATCAGCGACAATC 132124380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7409 GGTTAACAAAAAGTGAAGGACTAGAAACCAACTTCCTGTAGCAGGTAATCAGCGACAATC 7468

132124381 TGGGGCCAGTGGTGTGGGGGTAAAAAGAATTTATGAAGATACTTGTAGGTAAAGAAAGTC 132124440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7469 TGGGGCCAGTGGTGTGGGGGTAAAAAGAATTTATGAAGATACTTGTAGGTAAAGAAAGTC 7528

132124441 ATATTTATTAGAGCACGTATGAAAATGTGTTGCAAGGGAACAATGGGCAGGCCAGCAAGA 132124500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7529 ATATTTATTAGAGCACGTATGAAAATGTGTTGCAAGGGAACAATGGGCAGGCCAGCAAGA 7588

132124501 GAGGAGCTGACTGCAAGGAGACGAAGGCTTGCTGGGGATGTTCTAGAATGGTGCTTGTGC 132124560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7589 GAGGAGCTGACTGCAAGGAGACGAAGGCTTGCTGGGGATGTTCTAGAATGGTGCTTGTGC 7648

132124561 TGTGTGCTGAAGAGGGCTTTGTGCAGTACTGATAACACCGAGGTTGCAGTGAATTAGCTT 132124620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7649 TGTGTGCTGAAGAGGGCTTTGTGCAGTACTGATAACACCGAGGTTGCAGTGAATTAGCTT 7708

132124621 GCATTTTTTTTTAATCACCCGAGGGTCTGATGATAGCTGAGTGCAGGAAGATTGTGAGTT 132124680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7709 GCATTTTTTTTTAATCACCCGAGGGTCTGATGATAGCTGAGTGCAGGAAGATTGTGAGTT 7768

132124681 ATTTGTGCAAGAGGGCTACATGTTCTGGACCACAAAGCAAGGCAGACTTACAGCTTATCT 132124740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7769 ATTTGTGCAAGAGGGCTACATGTTCTGGACCACAAAGCAAGGCAGACTTACAGCTTATCT 7828

132124741 GCTTTATATTTTTGCTTTCCCTCGGTCCCGCCATCCTGACTCCTTTTCCCTAATTAGAAC 132124800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7829 GCTTTATATTTTTGCTTTCCCTCGGTCCCGCCATCCTGACTCCTTTTCCCTAATTAGAAC 7888

132124801 CCCACACTCTCTTTGGATGGTACATGCGTTTTCCATTTTCCCAGGTTCTATTACTCTCCT 132124860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7889 CCCACACTCTCTTTGGATGGTACATGCGTTTTCCATTTTCCCAGGTTCTATTACTCTCCT 7948

132124861 TTGGATCTTACACTTCTGAATTCTCTCTATTCGTTTTGTTACCTAACTGATCCCTGTAGG 132124920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7949 TTGGATCTTACACTTCTGAATTCTCTCTATTCGTTTTGTTACCTAACTGATCCCTGTAGG 8008

132124921 CATCTCTCCTTCATCCCAGAGCAGCAAGAATCCTTTCCTTACCCTCTTTGTAGATGCAGG 132124980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8009 CATCTCTCCTTCATCCCAGAGCAGCAAGAATCCTTTCCTTACCCTCTTTGTAGATGCAGG 8068

132124981 CCCAATAACAGGTCTCAAACCTTCCCAGAGATTATATATAAACCATGCATAATATAGGAG 132125040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8069 CCCAATAACAGGTCTCAAACCTTCCCAGAGATTATATATAAACCATGCATAATATAGGAG 8128

132125041 AAAATTAAAT 132125050
          ||||||||||
     8129 AAAATTAAAT 8138

Alignment time is 7.18281 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     8016] =>      8016 nucs 'mol-32-1eea-060730_8016'

Score:        7833
Aligned:      8015        nucs
Identic:      7996 (100%) nucs =>       745 (100%)      7251 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132113187,132113933] EXCISED REGION [132113934,132121197]
 second seq =>  [        1,      747] EXCISED REGION [      752,     8016]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [748,751]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [748,749] to [752,753]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132113933,132113933] to [132113934,132113934]
 second seq =>         1 nucs [747,747] to [752,752]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132113187 GTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCT 132113246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCT 60

132113247 CTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGG 132113306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGG 120

132113307 TTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCT 132113366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCT 180

132113367 TTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCA 132113426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      181 TTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTACGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCA 240

132113427 ACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTG 132113486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTG 300

132113487 GATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGG 132113546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGG 360

132113547 ATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACA 132113606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACA 420

132113607 GGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCT 132113666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCT 480

132113667 TTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAA 132113726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAA 540

132113727 TTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGG 132113786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGG 600

132113787 GCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGT 132113846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGT 660

132113847 GTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATAT 132113906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATAT 720

132113907 TATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 132113933
          |||||||||||||||||||||||||||
      721 TATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 747

EXCISED REGION

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 811

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      812 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 871

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      872 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 931

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 991

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      992 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 1051

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 132114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 1111

132114294 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 132114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 1171

132114354 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 132114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 1231

132114414 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 132114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 1291

132114474 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 132114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 1351

132114534 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 132114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 1411

132114594 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTC 132114653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     1412 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTC 1470

132114654 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGC 132114713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1471 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGC 1530

132114714 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 132114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 1590

132114774 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 132114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 1650

132114834 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 132114893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 1710

132114894 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 132114953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 1770

132114954 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 132115013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 1830

132115014 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTTT 132115073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1831 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTTT 1890

132115074 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 132115133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 1950

132115134 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 132115193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 2010

132115194 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 132115253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 2070

132115254 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 132115313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 2130

132115314 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 132115373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 2190

132115374 TGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGC 132115433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 TGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGC 2250

132115434 TGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCGAGGTGGGTGAATGAC 132115493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||  
     2251 TGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCAAGGTGGGTGAATG-- 2308

132115494 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCCCACCTCTACAA- 132115552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||| 
     2309 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCCGACCTCTACAAT 2368

132115553 --TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCA 132115610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCA 2428

132115611 GCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCA 132115670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 GCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCA 2488

132115671 TGATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACAC 132115730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 TGATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACAC 2548

132115731 AAATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTC 132115790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 AAATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTC 2608

132115791 TGCACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCT 132115850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 TGCACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCT 2668

132115851 CTCTCC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGT 132115909
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 CTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGT 2728

132115910 GCAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTA 132115969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 GCAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTA 2788

132115970 CCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTT 132116029
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2789 CCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACTATGCCCAGCTAATTTTTT 2848

132116030 TGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGG 132116089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2849 TGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGG 2908

132116090 CTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCA 132116149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2909 CTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCA 2968

132116150 CACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGAC 132116209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2969 CACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGAC 3028

132116210 TTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATA 132116269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3029 TTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATA 3088

132116270 CTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACT 132116329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3089 CTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACT 3148

132116330 TTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGA 132116389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 TTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGA 3208

132116390 ATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCT 132116449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3209 ATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCT 3268

132116450 GAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCA 132116509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3269 GAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCA 3328

132116510 TTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTA 132116569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 TTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTA 3388

132116570 ATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTA 132116629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3389 ATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTA 3448

132116630 CAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGA 132116689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3449 CAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGA 3508

132116690 GAGTGAAGGGGGAGGGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCAC 132116749
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3509 GAGTGAAGGGGGAGCGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCAC 3568

132116750 TGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGT 132116809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3569 TGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGT 3628

132116810 CCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCA 132116869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3629 CCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCA 3688

132116870 AACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTT 132116929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3689 AACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTT 3748

132116930 AAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGAT 132116989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3749 AAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGAT 3808

132116990 TCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTT 132117049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3809 TCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTT 3868

132117050 TAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTC 132117109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3869 TAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTC 3928

132117110 TATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAAT 132117169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 TATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAAT 3988

132117170 GGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAAT 132117229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 GGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAAT 4048

132117230 CCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTT 132117289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 CCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTT 4108

132117290 TTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCC 132117349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4109 TTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCC 4168

132117350 TAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCAT 132117409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4169 TAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCAT 4228

132117410 GATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGG 132117469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4229 GATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGG 4288

132117470 TGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAG 132117529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4289 TGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAG 4348

132117530 GGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTC 132117589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4349 GGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTC 4408

132117590 CTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGG 132117649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4409 CTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGG 4468

132117650 AGGGAGATAACGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATT 132117709
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4469 AGGGAGATAATGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATT 4528

132117710 ATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCT 132117769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4529 ATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCT 4588

132117770 GTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACG 132117829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4589 GTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACG 4648

132117830 GTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGAT 132117889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4649 GTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGAT 4708

132117890 GCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTG 132117949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4709 GCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTG 4768

132117950 GAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATG 132118009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4769 GAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATG 4828

132118010 CCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGT 132118069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4829 CCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGT 4888

132118070 AGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGA 132118129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4889 AGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGA 4948

132118130 GACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGC 132118189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4949 GACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGC 5008

132118190 TGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGT 132118249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5009 TGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGT 5068

132118250 AGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGT 132118309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5069 AGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGT 5128

132118310 TGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCA 132118369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5129 TGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCA 5188

132118370 GAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAG 132118429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5189 GAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAG 5248

132118430 GTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTT 132118489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5249 GTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTT 5308

132118490 GATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGA 132118549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5309 GATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGA 5368

132118550 AAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATG 132118609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5369 AAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATG 5428

132118610 AAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTG 132118669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5429 AAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTG 5488

132118670 TCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGA 132118729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5489 TCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGA 5548

132118730 AAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAA 132118789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5549 AAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAA 5608

132118790 GTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTT 132118849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5609 GTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTT 5668

132118850 ACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGA 132118909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5669 ACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGA 5728

132118910 AATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAA 132118969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5729 AATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAA 5788

132118970 CAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGG 132119029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5789 CAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGG 5848

132119030 AAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGA 132119089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5849 AAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGA 5908

132119090 AATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAAC 132119149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5909 AATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAAC 5968

132119150 AACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCA 132119209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5969 AACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCA 6028

132119210 GCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAG 132119269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6029 GCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAG 6088

132119270 AAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAA 132119329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6089 AAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAA 6148

132119330 TTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAAC 132119389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6149 TTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAAC 6208

132119390 TGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACA 132119449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6209 TGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACA 6268

132119450 GGTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAAT 132119509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6269 GGTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAAT 6328

132119510 ATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTT 132119569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6329 ATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTT 6388

132119570 CAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAA 132119629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6389 CAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAA 6448

132119630 CAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTG 132119689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6449 CAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTG 6508

132119690 GCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGC 132119749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6509 GCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGC 6568

132119750 TTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACT 132119809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6569 TTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACT 6628

132119810 GCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAG 132119869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6629 GCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAG 6688

132119870 AATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCA 132119929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6689 AATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCA 6748

132119930 TGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATA 132119989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6749 TGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATA 6808

132119990 TATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGAT 132120049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6809 TATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGAT 6868

132120050 TATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATAT 132120109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6869 TATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATAT 6928

132120110 ACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCT 132120169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6929 ACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCT 6988

132120170 ATATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATGGAAAATACATA 132120229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6989 ATATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATTGAAAATACATA 7048

132120230 TTGTAACTCCTAGAACAATGACTAATGACTAGAAAATAACTTTTAAAAAAGCTAAAATTC 132120289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7049 TTGTAACTCCTAGAACAATGACTAATGACTAGAAAATAACTTTTAAAAAAGCTAAAATTC 7108

132120290 AACAGAGAAATGAATATGGTATAATAAAAAGCATTTTTAATACATTCAAAGAAGTAAAGG 132120349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7109 AACAGAGAAATGAATATGGTATAATAAAAAGCATTTTTAATACATTCAAAGAAGTAAAGG 7168

132120350 AGGAAGAGAGAGACAAGAAATTAGATATAACAAATAGCAAAGTGGCAGGCATAAATTGGA 132120409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7169 AGGAAGAGAGAGACAAGAAATTAGATATAACAAATAGCAAAGTGGCAGGCATAAATTGGA 7228

132120410 ACATCAATCACTACATTAAATATGAATGATTAAATACTCAATTTAAAAGGCAGAGATTGT 132120469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7229 ACATCAATCACTACATTAAATATGAATGATTAAATACTCAATTTAAAAGGCAGAGATTGT 7288

132120470 CAGACTAACCAAAAGCAAGATTTTAGATTTAAAGTAAAAGAATAAGAAAAGATATATTAT 132120529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7289 CAGACTAACCAAAAGCAAGATTTTAGATTTAAAGTAAAAGAATAAGAAAAGATATATTAT 7348

132120530 GTAAATGGTAACCATAAGAGAGCTGGATAAGCTAAACTAAAATGAGAAAAAAATCAGTTT 132120589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7349 GTAAATGGTAACCATAAGAGAGCTGGATAAGCTAAACTAAAATGAGAAAAAAATCAGTTT 7408

132120590 TAAGACAAGAAATAGAACACTAGAAAATTTAGGCTAAAAAAATATCAGCATAGAGATGAA 132120649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7409 TAAGACAAGAAATAGAACACTAGAAAATTTAGGCTAAAAAAATATCAGCATAGAGATGAA 7468

132120650 AGATGACACTTCTTAATGATTAAATGGATAATACATCAGGAAGATTTAAAAATTACAAAC 132120709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7469 AGATGACACTTCTTAATGATTAAATGGATAATACATCAGGAAGATTTAAAAATTACAAAC 7528

132120710 ATATACCTACCCAACAGTAAACAGCAAAATAAACCTAATTGAAAGGACAAATAGACACCT 132120769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7529 ATATACCTACCCAACAGTAAACAGCAAAATAAACCTAATTGAAAGGACAAATAGACACCT 7588

132120770 CAACAATTATAGTTAGAGATTTCAAGACTCCTCTTTCAGCAATTACTTTTTAAAAAACTA 132120829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7589 CAACAATTATAGTTAGAGATTTCAAGACTCCTCTTTCAGCAATTACTTTTTAAAAAACTA 7648

132120830 AACAGAAAATTGCTAAGGATATAGACCTACACAGTGCTATCGACCAACTTGACCTAATTA 132120889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7649 AACAGAAAATTGCTAAGGATATAGACCTACACAGTGCTATCGACCAACTTGACCTAATTA 7708

132120890 GCATACACAGAACATTCTACTCGACAACAGCAGAATTGACATTCCTTCCTGGAGTACCTA 132120949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7709 GCATACACAGAACATTCTACTCGACAACAGCAGAATTGACATTCCTTCCTGGAGTACCTA 7768

132120950 GAACATTATTTGGGAATAGAATATGCTAGCTATAAATTTCTGTCTAATATTATATGTATA 132121009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7769 GAACATTATTTGGGAATAGAATATGCTAGCTATAAATTTCTGTCTAATATTATATGTATA 7828

132121010 ATATTGATTTCAGATCTATTATATATAATATCTATCTAATACATCTATTAATATATAACA 132121069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7829 ATATTGATTTCAGATCTATTATATATAATATCTATCTAATACATCTATTAATATATAACA 7888

132121070 TTACATATTAGAAGGAAATGTATAGTTTTAAATGCTTACATTACAAAAGAATAAAGATCT 132121129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7889 TTACATATTAGAAGGAAATGTATAGTTTTAAATGCTTACATTACAAAAGAATAAAGATCT 7948

132121130 GAAACCAATCATATAAATTATCACTTTAAGAAGCTAGAAAATTATTAGCATATCAAACAA 132121189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7949 GAAACCAATCATATAAATTATCACTTTAAGAAGCTAGAAAATTATTAGCATATCAAACAA 8008

132121190 AGTAAGTA 132121197
          ||||||||
     8009 AGTAAGTA 8016

Alignment time is 7.1481 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3250] =>      3250 nucs 'mol-32-1ef5-066196_3250'

Score:        3205
Aligned:      3249        nucs
Identic:      3245 (100%) nucs =>       302 (100%)      2943 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132116207,132116508] EXCISED REGION [132116510,132119456]
 second seq =>  [        1,      302] EXCISED REGION [      304,     3250]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132116509,132116509]
 second seq =>         1 nucs [303,303]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132116207 GACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATT 132116266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATT 60

132116267 ATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTT 132116326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTT 120

132116327 ACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGA 132116386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGA 180

132116387 AGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGG 132116446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGG 240

132116447 TCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGT 132116506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGT 300

132116507 CC 132116508
          ||
      301 CC 302

EXCISED REGION

132116510 TTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTA 132116569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 TTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTA 363

132116570 ATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTA 132116629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 ATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTA 423

132116630 CAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGA 132116689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 CAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGA 483

132116690 GAGTGAAGGGGGAGGGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCAC 132116749
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 GAGTGAAGGGGGAGCGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCAC 543

132116750 TGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGT 132116809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 TGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGT 603

132116810 CCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCA 132116869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 CCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCA 663

132116870 AACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTT 132116929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 AACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTT 723

132116930 AAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGAT 132116989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 AAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGAT 783

132116990 TCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTT 132117049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 TCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTT 843

132117050 TAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTC 132117109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 TAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTC 903

132117110 TATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAAT 132117169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 TATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAAT 963

132117170 GGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAAT 132117229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 GGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAAT 1023

132117230 CCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTT 132117289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 CCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTT 1083

132117290 TTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCC 132117349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 TTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCC 1143

132117350 TAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCAT 132117409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 TAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCAT 1203

132117410 GATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGG 132117469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 GATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGG 1263

132117470 TGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAG 132117529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 TGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAG 1323

132117530 GGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTC 132117589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 GGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTC 1383

132117590 CTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGG 132117649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 CTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGG 1443

132117650 AGGGAGATAACGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATT 132117709
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 AGGGAGATAATGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATT 1503

132117710 ATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCT 132117769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 ATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCT 1563

132117770 GTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACG 132117829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 GTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACG 1623

132117830 GTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGAT 132117889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 GTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGAT 1683

132117890 GCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTG 132117949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 GCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTG 1743

132117950 GAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATG 132118009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 GAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATG 1803

132118010 CCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGT 132118069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 CCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGT 1863

132118070 AGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGA 132118129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 AGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGA 1923

132118130 GACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGC 132118189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 GACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGC 1983

132118190 TGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGT 132118249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGT 2043

132118250 AGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGT 132118309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 AGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGT 2103

132118310 TGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCA 132118369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 TGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCA 2163

132118370 GAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAG 132118429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 GAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAG 2223

132118430 GTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTT 132118489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 GTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTT 2283

132118490 GATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGA 132118549
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2284 GATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGACGATACAAGTGGA 2343

132118550 AAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATG 132118609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 AAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATG 2403

132118610 AAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTG 132118669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 AAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTG 2463

132118670 TCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGA 132118729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGA 2523

132118730 AAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAA 132118789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 AAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAA 2583

132118790 GTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTT 132118849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 GTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTT 2643

132118850 ACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGA 132118909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 ACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGA 2703

132118910 AATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAA 132118969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 AATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAA 2763

132118970 CAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGG 132119029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 CAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGG 2823

132119030 AAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGA 132119089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 AAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGA 2883

132119090 AATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAAC 132119149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 AATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAAC 2943

132119150 AACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCA 132119209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 AACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCA 3003

132119210 GCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAG 132119269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 GCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAG 3063

132119270 AAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAA 132119329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 AAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAA 3123

132119330 TTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAAC 132119389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3124 TTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAAC 3183

132119390 TGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACA 132119449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 TGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACA 3243

132119450 GGTACTT 132119456
          |||||||
     3244 GGTACTT 3250

Alignment time is 2.7605 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4583] =>      4583 nucs 'mol-32-1f21-111152_4583'

Score:        4546
Aligned:      4579        nucs
Identic:      4576 (100%) nucs =>       376 (100%)      4200 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132115635,132116010] EXCISED REGION [132116012,132120214]
 second seq =>  [        4,      379] EXCISED REGION [      381,     4583]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132116011,132116011]
 second seq =>         1 nucs [380,380]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132116010,132116010] to [132116011,132116011]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132115635 GAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATGATCTGTCCACTGCACTTCAGCC 132115694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        4 GAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATGATCTGTCCACTGCACTTCAGCC 63

132115695 TGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACACAAATCTTTTGATATTATTGATTTC 132115754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       64 TGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACACAAATCTTTTGATATTATTGATTTC 123

132115755 TCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTCTGCACTTTTCTTGTATTATTTTCT 132115814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 TCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTCTGCACTTTTCTTGTATTATTTTCT 183

132115815 TCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCTCTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 132115874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      184 TCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCTCTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTT 243

132115875 GTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGCAGTGGCATGATCCTTGCTCACTG 132115934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      244 GTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGCAGTGGCATGATCCTTGCTCACTG 303

132115935 CAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGAC 132115994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      304 CAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGAC 363

132115995 TACAGGCATGTGCCAC 132116010
          ||||||||||||||||
      364 TACAGGCATGTGCCAC 379

EXCISED REGION

132116012 ATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGC 132116071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      381 ATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGC 440

132116072 TGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 132116131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      441 TGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 500

132116132 TACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTC 132116191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      501 TACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTC 560

132116192 TTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATT 132116251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      561 TTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATT 620

132116252 TGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAAC 132116311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      621 TGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAAC 680

132116312 ATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGT 132116371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      681 ATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGT 740

132116372 TTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATAT 132116431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      741 TTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATAT 800

132116432 TCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTC 132116491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      801 TCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTC 860

132116492 ACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTT 132116551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      861 ACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTT 920

132116552 ATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGG 132116611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      921 ATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGG 980

132116612 CAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTC 132116671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      981 CAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTC 1040

132116672 ACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAGGGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTC 132116731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1041 ACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAGCGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTC 1100

132116732 TCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTC 132116791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1101 TCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTC 1160

132116792 AGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTG 132116851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1161 AGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTG 1220

132116852 GGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTT 132116911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1221 GGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTT 1280

132116912 TCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGA 132116971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1281 TCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGA 1340

132116972 CAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCT 132117031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1341 CAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCT 1400

132117032 AGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTG 132117091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1401 AGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTG 1460

132117092 GTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTT 132117151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1461 GTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTT 1520

132117152 CATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAG 132117211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1521 CATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAG 1580

132117212 CCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAA 132117271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1581 CCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAA 1640

132117272 TGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTAT 132117331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1641 TGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTAT 1700

132117332 TTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCT 132117391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1701 TTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCT 1760

132117392 TGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAA 132117451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1761 TGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAA 1820

132117452 ATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTT 132117511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1821 ATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTT 1880

132117512 ATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGT 132117571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1881 ATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGT 1940

132117572 TTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCAT 132117631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1941 TTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCAT 2000

132117632 TTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAACGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATA 132117691
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 TTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAATGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATA 2060

132117692 TACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTAC 132117751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 TACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTAC 2120

132117752 CCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACA 132117811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 CCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACA 2180

132117812 AGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTT 132117871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 AGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTT 2240

132117872 AGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTT 132117931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 AGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTT 2300

132117932 GACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAA 132117991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 GACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAA 2360

132117992 TTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAA 132118051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 TTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAA 2420

132118052 GTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATT 132118111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 GTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATT 2480

132118112 GGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTA 132118171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 GGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTA 2540

132118172 CTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAG 132118231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 CTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAG 2600

132118232 CTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTC 132118291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 CTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTC 2660

132118292 TATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGA 132118351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 TATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGA 2720

132118352 TAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGA 132118411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 TAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGA 2780

132118412 ATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTAT 132118471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 ATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTAT 2840

132118472 AAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATC 132118531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 AAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATC 2900

132118532 TCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTG 132118591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 TCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTG 2960

132118592 ATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCAC 132118651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 ATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCAC 3020

132118652 ACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAA 132118711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 ACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAA 3080

132118712 GATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTA 132118771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 GATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTA 3140

132118772 TCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTA 132118831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 TCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTA 3200

132118832 CCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTA 132118891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 CCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTA 3260

132118892 TATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTC 132118951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 TATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTC 3320

132118952 AGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTAT 132119011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 AGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTAT 3380

132119012 AGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACA 132119071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 AGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACA 3440

132119072 ATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAA 132119131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 ATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAA 3500

132119132 CTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACC 132119191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 CTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACC 3560

132119192 ATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTG 132119251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3561 ATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTG 3620

132119252 AGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGAC 132119311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3621 AGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGAC 3680

132119312 ATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTA 132119371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3681 ATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTA 3740

132119372 ATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAA 132119431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 ATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAA 3800

132119432 GGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAAT 132119491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 GGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAAT 3860

132119492 ACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAA 132119551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 ACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAA 3920

132119552 AAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAA 132119611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3921 AAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAA 3980

132119612 TGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGA 132119671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3981 TGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGA 4040

132119672 TCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACA 132119731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4041 TCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACA 4100

132119732 ACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATA 132119791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4101 ACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATA 4160

132119792 GTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAA 132119851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4161 GTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAA 4220

132119852 AAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTC 132119911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4221 AAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTC 4280

132119912 AACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAG 132119971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4281 AACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAG 4340

132119972 TGTGTGTATGCAGATATATATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTT 132120031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4341 TGTGTGTATGCAGATATATATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTT 4400

132120032 CTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACA 132120091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4401 CTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACA 4460

132120092 AGACATATAGATTAATATACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATG 132120151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4461 AGACATATAGATTAATATACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATG 4520

132120152 TATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTG 132120211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4521 TATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTG 4580

132120212 ATA 132120214
          |||
     4581 ATA 4583

Alignment time is 3.80302 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3607] =>      3607 nucs 'mol-32-1f63-080042_3607'

Score:        3551
Aligned:      3606        nucs
Identic:      3601 (100%) nucs =>        86 (100%)      3515 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132115925,132116010] EXCISED REGION [132116012,132119531]
 second seq =>  [        1,       86] EXCISED REGION [       88,     3607]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132116011,132116011]
 second seq =>         1 nucs [87,87]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132116010,132116010] to [132116011,132116011]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132115925 TTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTACCTCAGCCTCCCAAG 132115984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTACCTCAGCCTCCCAAG 60

132115985 TAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCAC 132116010
          ||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCAC 86

EXCISED REGION

132116012 ATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGC 132116071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       88 ATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGC 147

132116072 TGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 132116131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      148 TGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 207

132116132 TACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTC 132116191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      208 TACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTC 267

132116192 TTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATT 132116251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      268 TTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATT 327

132116252 TGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAAC 132116311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      328 TGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAAC 387

132116312 ATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGT 132116371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      388 ATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGT 447

132116372 TTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATAT 132116431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      448 TTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATAT 507

132116432 TCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTC 132116491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      508 TCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTC 567

132116492 ACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTT 132116551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      568 ACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTT 627

132116552 ATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGG 132116611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      628 ATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGG 687

132116612 CAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTC 132116671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      688 CAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTC 747

132116672 ACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAGGGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTC 132116731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      748 ACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAGCGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTC 807

132116732 TCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTC 132116791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      808 TCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTC 867

132116792 AGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTG 132116851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      868 AGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTG 927

132116852 GGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTT 132116911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      928 GGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTT 987

132116912 TCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGA 132116971
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      988 TCTCTATCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGA 1047

132116972 CAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCT 132117031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1048 CAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCT 1107

132117032 AGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTG 132117091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1108 AGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTG 1167

132117092 GTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTT 132117151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1168 GTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTT 1227

132117152 CATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAG 132117211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 CATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAG 1287

132117212 CCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAA 132117271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 CCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAA 1347

132117272 TGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTAT 132117331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 TGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTAT 1407

132117332 TTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCT 132117391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 TTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCT 1467

132117392 TGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAA 132117451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 TGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAA 1527

132117452 ATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTT 132117511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 ATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTT 1587

132117512 ATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGT 132117571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 ATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGT 1647

132117572 TTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCAT 132117631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 TTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCAT 1707

132117632 TTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAACGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATA 132117691
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 TTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAATGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATA 1767

132117692 TACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTAC 132117751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 TACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTAC 1827

132117752 CCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACA 132117811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 CCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACA 1887

132117812 AGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTT 132117871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 AGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTT 1947

132117872 AGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTT 132117931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 AGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTT 2007

132117932 GACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAA 132117991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 GACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAA 2067

132117992 TTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAA 132118051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 TTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAA 2127

132118052 GTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATT 132118111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 GTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATT 2187

132118112 GGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTA 132118171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 GGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTA 2247

132118172 CTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAG 132118231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 CTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAG 2307

132118232 CTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTC 132118291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 CTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTC 2367

132118292 TATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGA 132118351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 TATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGA 2427

132118352 TAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGA 132118411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 TAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGA 2487

132118412 ATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTAT 132118471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 ATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTAT 2547

132118472 AAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATC 132118531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 AAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATC 2607

132118532 TCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTG 132118591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 TCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTG 2667

132118592 ATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCAC 132118651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 ATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCAC 2727

132118652 ACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAA 132118711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 ACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAA 2787

132118712 GATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTA 132118771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 GATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTA 2847

132118772 TCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTA 132118831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 TCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTA 2907

132118832 CCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTA 132118891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 CCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTA 2967

132118892 TATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTC 132118951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 TATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTC 3027

132118952 AGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTAT 132119011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 AGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTAT 3087

132119012 AGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACA 132119071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 AGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACA 3147

132119072 ATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAA 132119131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 ATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAA 3207

132119132 CTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACC 132119191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 CTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACC 3267

132119192 ATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTG 132119251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 ATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTG 3327

132119252 AGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGAC 132119311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 AGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGAC 3387

132119312 ATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTA 132119371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3388 ATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTA 3447

132119372 ATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAA 132119431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 ATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAA 3507

132119432 GGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAAT 132119491
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3508 GGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGGGTTTTTAAAAAT 3567

132119492 ACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAAAAAATCT 132119531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 ACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAAAAAATCT 3607

Alignment time is 3.03672 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3454] =>      3454 nucs 'mol-32-1f63-080043_3454'

Score:        3331
Aligned:      3452        nucs
Identic:      3441 (100%) nucs =>      1913 (100%)      1528 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112015,132113933] EXCISED REGION [132113934,132115466]
 second seq =>  [        1,     1919] EXCISED REGION [     1924,     3454]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1920,1923]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1920,1921] to [1924,1925]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132113933,132113933] to [132113934,132113934]
 second seq =>         1 nucs [1919,1919] to [1924,1924]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112015 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCC 132112074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCC 60

132112075 CTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGG 132112134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGG 120

132112135 CACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGT 132112194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGT 180

132112195 GTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAG 132112254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAG 240

132112255 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAA 132112314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAA 300

132112315 AAAGTATGAGAATCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATA 132112374
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGTATGAGAATCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATA 360

132112375 ATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTT 132112434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTT 420

132112435 GATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTA 132112494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTA 480

132112495 CATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGG 132112554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      481 CATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGG 540

132112555 CTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTG 132112614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTG 600

132112615 TAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAA 132112674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAA 660

132112675 CTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGG 132112734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGG 720

132112735 GTGGGCGAAGCGCTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACAT 132112794
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGGGCGAAGCACTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACAT 780

132112795 TTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCA 132112854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCA 840

132112855 GGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCT 132112914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCT 900

132112915 GAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCT 132112974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCT 960

132112975 CAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAA 132113034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAA 1020

132113035 GAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAA 132113094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAA 1080

132113095 TATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGG 132113154
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGG 1140

132113155 CCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTC 132113214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTC 1200

132113215 CGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAG 132113274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAG 1260

132113275 CATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGT 132113334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGT 1320

132113335 CATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCT 132113394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCT 1380

132113395 TCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAA 132113454
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCAGCTACGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAA 1440

132113455 ACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTC 132113514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTC 1500

132113515 AAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCT 132113574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCT 1560

132113575 GTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAA 132113634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAA 1620

132113635 GGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTT 132113694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTT 1680

132113695 TCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTC 132113754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTC 1740

132113755 CCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCC 132113814
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1741 CCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCG 1800

132113815 TATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATT 132113874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATT 1860

132113875 CAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 132113933
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 1919

EXCISED REGION

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 1983

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 2043

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 2103

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 2163

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 2223

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 132114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 2283

132114294 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 132114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 2343

132114354 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 132114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 2403

132114414 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 132114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 2463

132114474 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 132114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 2523

132114534 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 132114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 2583

132114594 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTC 132114653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2584 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTC 2642

132114654 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGC 132114713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2643 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGC 2702

132114714 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 132114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 2762

132114774 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 132114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 2822

132114834 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 132114893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 2882

132114894 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 132114953
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCT-AAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 2941

132114954 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 132115013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 3001

132115014 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTTT 132115073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3002 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTTT 3061

132115074 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 132115133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3062 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 3121

132115134 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 132115193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 3181

132115194 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 132115253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3182 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 3241

132115254 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 132115313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 3301

132115314 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 132115373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3302 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 3361

132115374 TGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGC 132115433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3362 TGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGC 3421

132115434 TGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCA 132115466
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3422 TGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCA 3454

Alignment time is 3.4063 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2773] =>      2773 nucs 'mol-32-2105-087364_2773'

Score:        2750
Aligned:      2772        nucs
Identic:      2770 (100%) nucs =>       305 (100%)      2465 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132116399,132116703] EXCISED REGION [132116705,132119171]
 second seq =>  [        1,      305] EXCISED REGION [      307,     2773]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132116704,132116704]
 second seq =>         1 nucs [306,306]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [132116703,132116705] to [132116704,132116706]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132116703,132116703] to [132116705,132116705]
 second seq =>         1 nucs [305,305] to [307,307]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132116399 AATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTC 132116458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTC 60

132116459 TTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACAC 132116518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACAC 120

132116519 TGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCT 132116578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCT 180

132116579 CAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTG 132116638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTG 240

132116639 CTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGG 132116698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGG 300

132116699 GGGAG 132116703
          |||||
      301 GGGAG 305

EXCISED REGION

132116705 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 132116764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      307 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 366

132116765 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 132116824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      367 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 426

132116825 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 132116884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      427 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 486

132116885 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 132116944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      487 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 546

132116945 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 132117004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 606

132117005 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 132117064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 666

132117065 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 132117124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 726

132117125 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 132117184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 786

132117185 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 132117244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 846

132117245 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 132117304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 906

132117305 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 132117364
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      907 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAGAG 966

132117365 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 132117424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 1026

132117425 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 132117484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 1086

132117485 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 132117544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 1146

132117545 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 132117604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 1206

132117605 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAACGTAG 132117664
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1207 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAATGTAG 1266

132117665 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 132117724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 1326

132117725 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 132117784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 1386

132117785 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 132117844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 1446

132117845 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 132117904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 1506

132117905 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 132117964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 1566

132117965 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 132118024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 1626

132118025 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 132118084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 1686

132118085 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 132118144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 1746

132118145 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 132118204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 1806

132118205 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 132118264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 1866

132118265 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 132118324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 1926

132118325 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 132118384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 1986

132118385 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 132118444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 2046

132118445 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 132118504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 2106

132118505 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 132118564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 2166

132118565 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 132118624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 2226

132118625 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 132118684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 2286

132118685 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 132118744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 2346

132118745 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 132118804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 2406

132118805 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 132118864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 2466

132118865 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 132118924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 2526

132118925 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 132118984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 2586

132118985 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 132119044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 2646

132119045 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 132119104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 2706

132119105 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 132119164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 2766

132119165 TATTGAG 132119171
          |||||||
     2767 TATTGAG 2773

Alignment time is 2.3153 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3218] =>      3218 nucs 'mol-32-22bd-034181_3218'

Score:        3078
Aligned:      3216        nucs
Identic:      3201 (100%) nucs =>      2208 (100%)       993 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112015,132114228] EXCISED REGION [132118551,132119548]
 second seq =>  [        1,     2218] EXCISED REGION [     2221,     3218]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4322 nucs [132114229,132118550]
 second seq =>         2 nucs [2219,2220]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2218,2219] to [2220,2221]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112015 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCC 132112074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCC 60

132112075 CTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGG 132112134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGG 120

132112135 CACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGT 132112194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGT 180

132112195 GTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAG 132112254
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAG 240

132112255 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAA 132112314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAA 300

132112315 AAAGTATGAGAATCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATA 132112374
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGTATGAGAATCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATA 360

132112375 ATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTT 132112434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTT 420

132112435 GATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTA 132112494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTA 480

132112495 CATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGG 132112554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      481 CATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGG 540

132112555 CTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTG 132112614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTG 600

132112615 TAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAA 132112674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAA 660

132112675 CTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGG 132112734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGG 720

132112735 GTGGGCGAAGCGCTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACAT 132112794
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGGGCGAAGCACTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACAT 780

132112795 TTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCA 132112854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCA 840

132112855 GGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCT 132112914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCT 900

132112915 GAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCT 132112974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCT 960

132112975 CAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAA 132113034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAA 1020

132113035 GAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAA 132113094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAA 1080

132113095 TATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGG 132113154
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGG 1140

132113155 CCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTC 132113214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTC 1200

132113215 CGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAG 132113274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAG 1260

132113275 CATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGT 132113334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGT 1320

132113335 CATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCT 132113394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCT 1380

132113395 TCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAA 132113454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAA 1440

132113455 ACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTC 132113514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTC 1500

132113515 AAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCT 132113574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCT 1560

132113575 GTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAA 132113634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAA 1620

132113635 GGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTT 132113694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTT 1680

132113695 TCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTC 132113754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTC 1740

132113755 CCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCC 132113814
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1741 CCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCG 1800

132113815 TATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATT 132113874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATT 1860

132113875 CAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATT 132113934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATT 1920

132113935 A----TATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCT 132113990
          |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAATATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCT 1980

132113991 CTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAA 132114050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAA 2040

132114051 GAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTT 132114110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTT 2100

132114111 AAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACT 132114170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACT 2160

132114171 ACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 132114228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 2218

EXCISED REGION

132118551 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 132118610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 2280

132118611 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 132118670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 2340

132118671 CCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 132118730
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCACCTCCTGCCAATAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 2400

132118731 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 132118790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 2460

132118791 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 132118850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 2520

132118851 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 132118910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 2580

132118911 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 132118970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 2640

132118971 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 132119030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 2700

132119031 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 132119090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 2760

132119091 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 132119150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 2820

132119151 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 132119210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 2880

132119211 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 132119270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 2940

132119271 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 132119330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 3000

132119331 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 132119390
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3001 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 3060

132119391 GGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 132119450
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGTACACCTTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 3120

132119451 GTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATA 132119510
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3121 GTACATTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGATTCATTTGTCAATA 3180

132119511 TTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATT 132119548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATT 3218

Alignment time is 2.68924 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4839] =>      4839 nucs 'mol-32-22e9-032306_4839'

Score:        4805
Aligned:      4838        nucs
Identic:      4835 (100%) nucs =>       514 (100%)      4321 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132116190,132116703] EXCISED REGION [132116705,132121028]
 second seq =>  [        1,      514] EXCISED REGION [      516,     4839]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132116704,132116704]
 second seq =>         1 nucs [515,515]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [132116703,132116705] to [132116704,132116706]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132116703,132116703] to [132116705,132116705]
 second seq =>         1 nucs [514,514] to [516,516]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132116190 TCTTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCA 132116249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCA 60

132116250 TTTGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAA 132116309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAA 120

132116310 ACATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATC 132116369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATC 180

132116370 GTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATAT 132116429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATAT 240

132116430 ATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTT 132116489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTT 300

132116490 TCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAAT 132116549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAAT 360

132116550 TTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCA 132116609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCA 420

132116610 GGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCT 132116669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCT 480

132116670 TCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 132116703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 514

EXCISED REGION

132116705 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 132116764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      516 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 575

132116765 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 132116824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 635

132116825 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 132116884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      636 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 695

132116885 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 132116944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      696 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 755

132116945 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 132117004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 815

132117005 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 132117064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 875

132117065 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 132117124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 935

132117125 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 132117184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 995

132117185 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 132117244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 1055

132117245 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 132117304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 1115

132117305 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 132117364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 1175

132117365 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 132117424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 1235

132117425 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 132117484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 1295

132117485 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 132117544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 1355

132117545 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 132117604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 1415

132117605 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAACGTAG 132117664
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1416 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAATGTAG 1475

132117665 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 132117724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 1535

132117725 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 132117784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 1595

132117785 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 132117844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 1655

132117845 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 132117904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 1715

132117905 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 132117964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 1775

132117965 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 132118024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 1835

132118025 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 132118084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 1895

132118085 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 132118144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 1955

132118145 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 132118204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 2015

132118205 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 132118264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 2075

132118265 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 132118324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 2135

132118325 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 132118384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 2195

132118385 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 132118444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 2255

132118445 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 132118504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 2315

132118505 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 132118564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 2375

132118565 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 132118624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 2435

132118625 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 132118684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 2495

132118685 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 132118744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 2555

132118745 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 132118804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 2615

132118805 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 132118864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 2675

132118865 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 132118924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 2735

132118925 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 132118984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 2795

132118985 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 132119044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 2855

132119045 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 132119104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 2915

132119105 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 132119164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 2975

132119165 TATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTG 132119224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 TATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTG 3035

132119225 GCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATA 132119284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 GCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATA 3095

132119285 ATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGT 132119344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 ATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGT 3155

132119345 TCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGG 132119404
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 TCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGG 3215

132119405 GACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTT 132119464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 GACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTT 3275

132119465 TTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAA 132119524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 TTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAA 3335

132119525 AAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTA 132119584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 AAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTA 3395

132119585 AAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAA 132119644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 AAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAA 3455

132119645 CACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCT 132119704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 CACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCT 3515

132119705 GAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAG 132119764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 GAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAG 3575

132119765 GGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGA 132119824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 GGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGA 3635

132119825 CAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTA 132119884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 CAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTA 3695

132119885 TAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATT 132119944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 TAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATT 3755

132119945 GTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATACATGT 132120004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 GTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATACATGT 3815

132120005 GTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCTATGA 132120064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 GTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCTATGA 3875

132120065 TTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACGACAGTAATAACA 132120124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 TTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACGACAGTAATAACA 3935

132120125 GAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCAGAAT 132120184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 GAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCAGAAT 3995

132120185 TAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATGGAAAATACATATTGTAACTCCTAGAA 132120244
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3996 TAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATTGAAAATACATATTGTAACTCCTAGAA 4055

132120245 CAATGACTAATGACTAGAAAATAACTTTTAAAAAAGCTAAAATTCAACAGAGAAATGAAT 132120304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 CAATGACTAATGACTAGAAAATAACTTTTAAAAAAGCTAAAATTCAACAGAGAAATGAAT 4115

132120305 ATGGTATAATAAAAAGCATTTTTAATACATTCAAAGAAGTAAAGGAGGAAGAGAGAGACA 132120364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 ATGGTATAATAAAAAGCATTTTTAATACATTCAAAGAAGTAAAGGAGGAAGAGAGAGACA 4175

132120365 AGAAATTAGATATAACAAATAGCAAAGTGGCAGGCATAAATTGGAACATCAATCACTACA 132120424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 AGAAATTAGATATAACAAATAGCAAAGTGGCAGGCATAAATTGGAACATCAATCACTACA 4235

132120425 TTAAATATGAATGATTAAATACTCAATTTAAAAGGCAGAGATTGTCAGACTAACCAAAAG 132120484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 TTAAATATGAATGATTAAATACTCAATTTAAAAGGCAGAGATTGTCAGACTAACCAAAAG 4295

132120485 CAAGATTTTAGATTTAAAGTAAAAGAATAAGAAAAGATATATTATGTAAATGGTAACCAT 132120544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4296 CAAGATTTTAGATTTAAAGTAAAAGAATAAGAAAAGATATATTATGTAAATGGTAACCAT 4355

132120545 AAGAGAGCTGGATAAGCTAAACTAAAATGAGAAAAAAATCAGTTTTAAGACAAGAAATAG 132120604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4356 AAGAGAGCTGGATAAGCTAAACTAAAATGAGAAAAAAATCAGTTTTAAGACAAGAAATAG 4415

132120605 AACACTAGAAAATTTAGGCTAAAAAAATATCAGCATAGAGATGAAAGATGACACTTCTTA 132120664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4416 AACACTAGAAAATTTAGGCTAAAAAAATATCAGCATAGAGATGAAAGATGACACTTCTTA 4475

132120665 ATGATTAAATGGATAATACATCAGGAAGATTTAAAAATTACAAACATATACCTACCCAAC 132120724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 ATGATTAAATGGATAATACATCAGGAAGATTTAAAAATTACAAACATATACCTACCCAAC 4535

132120725 AGTAAACAGCAAAATAAACCTAATTGAAAGGACAAATAGACACCTCAACAATTATAGTTA 132120784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 AGTAAACAGCAAAATAAACCTAATTGAAAGGACAAATAGACACCTCAACAATTATAGTTA 4595

132120785 GAGATTTCAAGACTCCTCTTTCAGCAATTACTTTTTAAAAAACTAAACAGAAAATTGCTA 132120844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 GAGATTTCAAGACTCCTCTTTCAGCAATTACTTTTTAAAAAACTAAACAGAAAATTGCTA 4655

132120845 AGGATATAGACCTACACAGTGCTATCGACCAACTTGACCTAATTAGCATACACAGAACAT 132120904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 AGGATATAGACCTACACAGTGCTATCGACCAACTTGACCTAATTAGCATACACAGAACAT 4715

132120905 TCTACTCGACAACAGCAGAATTGACATTCCTTCCTGGAGTACCTAGAACATTATTTGGGA 132120964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 TCTACTCGACAACAGCAGAATTGACATTCCTTCCTGGAGTACCTAGAACATTATTTGGGA 4775

132120965 ATAGAATATGCTAGCTATAAATTTCTGTCTAATATTATATGTATAATATTGATTTCAGAT 132121024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4776 ATAGAATATGCTAGCTATAAATTTCTGTCTAATATTATATGTATAATATTGATTTCAGAT 4835

132121025 CTAT 132121028
          ||||
     4836 CTAT 4839

Alignment time is 4.01234 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2359] =>      2359 nucs 'mol-32-23af-032705_2359'

Score:        2261
Aligned:      2359        nucs
Identic:      2346 ( 99%) nucs =>       655 ( 99%)      1691 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132113573,132114228] EXCISED REGION [132118551,132120248]
 second seq =>  [        1,      660] EXCISED REGION [      663,     2359]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4322 nucs [132114229,132118550]
 second seq =>         2 nucs [661,662]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [660,661] to [662,663]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132113573 CTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAA 132113632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAA 60

132113633 AAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTAT 132113692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTAT 120

132113693 TTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCC 132113752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCC 180

132113753 TCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATC 132113812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATC 240

132113813 CCTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTA 132113872
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTA 300

132113873 TTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAA 132113932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAA 360

132113933 TTA----TATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGG 132113988
          |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAAATATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGG 420

132113989 CTCTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGG 132114048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGG 480

132114049 AAGAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTC 132114108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTC 540

132114109 TTAAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAA 132114168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAA 600

132114169 CTACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 132114228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 660

EXCISED REGION

132118551 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 132118610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      663 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 722

132118611 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 132118670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 782

132118671 CCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 132118730
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 CCACCTCCTGCCAATAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 842

132118731 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 132118790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 902

132118791 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 132118850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 962

132118851 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 132118910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 1022

132118911 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 132118970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 1082

132118971 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 132119030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 1142

132119031 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 132119090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 1202

132119091 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 132119150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 1262

132119151 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 132119210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 1322

132119211 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 132119270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 1382

132119271 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 132119330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 1442

132119331 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 132119390
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1443 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 1502

132119391 GGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 132119450
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 GGTACACCTTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 1562

132119451 GTACTT-TTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAAT 132119509
          ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1563 GTAC--ATTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGATTCATTTGTCAAT 1620

132119510 ATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTT 132119569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTT 1680

132119570 CAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAA 132119629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAA 1740

132119630 CAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTG 132119689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTG 1800

132119690 GCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGC 132119749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGC 1860

132119750 TTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACT 132119809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACT 1920

132119810 GCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAG 132119869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAG 1980

132119870 AATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCA 132119929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCA 2040

132119930 TGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATA 132119989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATA 2100

132119990 TATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGAT 132120049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGAT 2160

132120050 TATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATAT 132120109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATAT 2220

132120110 ACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCT 132120169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCT 2280

132120170 ATATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATGGAAAATACATA 132120229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2281 ATATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATTGAAAATACATA 2340

132120230 TTGTAACTCCTAGAACAAT 132120248
          |||||||||||||||||||
     2341 TTGTAACTCCTAGAACAAT 2359

Alignment time is 1.99829 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2274] =>      2274 nucs 'mol-32-287f-048698_2274'

Score:        2182
Aligned:      2270        nucs
Identic:      2262 (100%) nucs =>      1916 (100%)       346 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112011,132113933] EXCISED REGION [132113934,132114280]
 second seq =>  [        1,     1923] EXCISED REGION [     1928,     2274]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1924,1927]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1924,1925] to [1928,1929]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132113933,132113933] to [132113934,132113934]
 second seq =>         1 nucs [1923,1923] to [1928,1928]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112011 GACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCA 132112070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCA 60

132112071 AGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTA 132112130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTA 120

132112131 CAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCA 132112190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCA 180

132112191 CTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCC 132112250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCC 240

132112251 ATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAA 132112310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAA 300

132112311 AGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGC 132112370
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGC 360

132112371 TATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATT 132112430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATT 420

132112431 ACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCAT 132112490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      421 ACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTGCATTCAT 480

132112491 CTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTG 132112550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      481 CTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTG 540

132112551 GAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATT 132112610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATT 600

132112611 CCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGC 132112670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGC 660

132112671 CAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGAT 132112730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGAT 720

132112731 ACGGGTGGGCGAAGCGCTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGA 132112790
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACGGGTGGGCGAAGCACTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGA 780

132112791 ACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCAC 132112850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCAC 840

132112851 TGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCA 132112910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCA 900

132112911 TCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATT 132112970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATT 960

132112971 CGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAAT 132113030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAAT 1020

132113031 AAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAA 132113090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAA 1080

132113091 GAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCT 132113150
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCT 1140

132113151 AGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTC 132113210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTC 1200

132113211 GCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGC 132113270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGC 1260

132113271 ACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTT 132113330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTT 1320

132113331 TTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATG 132113390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATG 1380

132113391 ATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAA 132113450
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCTTCCAGCTACGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAA 1440

132113451 GGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCT 132113510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCT 1500

132113511 GTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGT 132113570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGT 1560

132113571 GGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTC 132113630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTC 1620

132113631 AAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGT 132113690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGT 1680

132113691 ATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGT 132113750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGT 1740

132113751 CCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTA 132113810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTA 1800

132113811 TCCCTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTAT 132113870
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCGTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTAT 1860

132113871 TATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATT 132113930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATT 1920

132113931 AAT 132113933
          |||
     1921 AAT 1923

EXCISED REGION

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 1987

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 2047

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 2107

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 2167

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 2227

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCT 132114280
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCT 2274

Alignment time is 2.26533 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3190] =>      3190 nucs 'mol-32-299d-097176_3190'

Score:        3145
Aligned:      3189        nucs
Identic:      3185 (100%) nucs =>       614 (100%)      2571 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132117046,132117659] EXCISED REGION [132117661,132120235]
 second seq =>  [        1,      614] EXCISED REGION [      616,     3190]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132117660,132117660]
 second seq =>         1 nucs [615,615]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132117046 TTTTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAG 132117105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAG 60

132117106 TGTCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCA 132117165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCA 120

132117166 AAATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTA 132117225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTA 180

132117226 GAATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTT 132117285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTT 240

132117286 CTTTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATT 132117345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATT 300

132117346 CTCCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTC 132117405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTC 360

132117406 CCATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATA 132117465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATA 420

132117466 TTGGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTA 132117525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTA 480

132117526 GCAGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGT 132117585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGT 540

132117586 TTTCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCAT 132117645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCAT 600

132117646 GGGGAGGGAGATAA 132117659
          ||||||||||||||
      601 GGGGAGGGAGATAA 614

EXCISED REGION

132117661 GTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAG 132117720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 GTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAG 675

132117721 CTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGA 132117780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      676 CTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGTAAGGTGCTGTTAAGAGAGA 735

132117781 AAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGC 132117840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 AAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGC 795

132117841 TTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGA 132117900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 TTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGA 855

132117901 AGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAA 132117960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 AGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAA 915

132117961 AAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTA 132118020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 AAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTA 975

132118021 TGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGA 132118080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 TGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGA 1035

132118081 AGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGAC 132118140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 AGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGAC 1095

132118141 GAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTG 132118200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 GAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTG 1155

132118201 TCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGC 132118260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 TCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGC 1215

132118261 AATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATT 132118320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 AATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATT 1275

132118321 GGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAA 132118380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 GGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAA 1335

132118381 TTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGC 132118440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 TTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGC 1395

132118441 TGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAA 132118500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 TGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAA 1455

132118501 GAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGG 132118560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 GAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGG 1515

132118561 GACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAA 132118620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 GACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAA 1575

132118621 GAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTG 132118680
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 GAGAAGCAAGCCAGTGCAGGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTG 1635

132118681 CCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATA 132118740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 CCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATA 1695

132118741 ATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATG 132118800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 ATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATG 1755

132118801 ATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGA 132118860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 ATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGA 1815

132118861 TGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGAT 132118920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 TGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGAT 1875

132118921 TTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATG 132118980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 TTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATG 1935

132118981 CCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCAT 132119040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 CCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCAT 1995

132119041 GGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGA 132119100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 GGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGA 2055

132119101 ACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAAT 132119160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 ACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAAT 2115

132119161 TATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACAT 132119220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 TATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACAT 2175

132119221 TTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGA 132119280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 TTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGA 2235

132119281 GATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTA 132119340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 GATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTA 2295

132119341 CAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCT 132119400
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 CAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCT 2355

132119401 TAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTT 132119460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 TAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTT 2415

132119461 TTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATT 132119520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 TTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATT 2475

132119521 GAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAA 132119580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 GAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAA 2535

132119581 GTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCA 132119640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 GTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCA 2595

132119641 ACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTAC 132119700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 ACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTAC 2655

132119701 TCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACT 132119760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 TCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACT 2715

132119761 GTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAA 132119820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 GTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAA 2775

132119821 GTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTT 132119880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 GTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTT 2835

132119881 GTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGG 132119940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 GTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGG 2895

132119941 TATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATAC 132120000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 TATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATAC 2955

132120001 ATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCT 132120060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 ATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCT 3015

132120061 ATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACGACAGTAAT 132120120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 ATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACGACAGTAAT 3075

132120121 AACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCA 132120180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 AACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCA 3135

132120181 GAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATGGAAAATACATATTGTAA 132120235
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3136 GAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATTGAAAATACATATTGTAA 3190

Alignment time is 2.71643 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     8039] =>      8039 nucs 'mol-32-29b3-072266_8039'

Score:        7783
Aligned:      8032        nucs
Identic:      8002 (100%) nucs =>      3502 ( 99%)      4500 (100%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112027,132115541] EXCISED REGION [132115553,132120061]
 second seq =>  [        1,     3517] EXCISED REGION [     3533,     8039]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        11 nucs [132115542,132115552]
 second seq =>        15 nucs [3518,3532]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112027 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGT 132112086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGT 60

132112087 TTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCA 132112146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCA 120

132112147 TGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAA 132112206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAA 180

132112207 GGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTAC 132112266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTAC 240

132112267 AGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAA 132112326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAA 300

132112327 TCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATC 132112386
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATC 360

132112387 TTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCT 132112446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCT 420

132112447 ACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTT 132112506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTT 480

132112507 AAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCC 132112566
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCC 540

132112567 ATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTC 132112626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTC 600

132112627 CTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAAT 132112686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAAT 660

132112687 CTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCG 132112746
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      661 CTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCA 720

132112747 CTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTC 132112806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTC 780

132112807 TCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGA 132112866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGA 840

132112867 AGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCT 132112926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCT 900

132112927 TCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTT 132112986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTT 960

132112987 TCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAA 132113046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAA 1020

132113047 AATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCC 132113106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCC 1080

132113107 AAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAG 132113166
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAG 1140

132113167 GTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTT 132113226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTT 1200

132113227 TCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCT 132113286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCT 1260

132113287 AAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAA 132113346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAA 1320

132113347 CTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTC 132113406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1321 CTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTACGTC 1380

132113407 TGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCA 132113466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCA 1440

132113467 GCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATG 132113526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATG 1500

132113527 GGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATA 132113586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATA 1560

132113587 GGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTC 132113646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTC 1620

132113647 TTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCT 132113706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCT 1680

132113707 GTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTA 132113766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTA 1740

132113767 GAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAA 132113826
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1741 GAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAA 1800

132113827 TACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACAT 132113886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACAT 1860

132113887 TTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTA----TATTAAT 132113942
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||
     1861 TTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTAAATATATTAAT 1920

132113943 ATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTT 132114002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTT 1980

132114003 TCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCA 132114062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCA 2040

132114063 CCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTC 132114122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTC 2100

132114123 AACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGC 132114182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGC 2160

132114183 TCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTCTCACCCAGG 132114242
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTCTCACCCAGG 2220

132114243 CAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 132114302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAAT 2280

132114303 TCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTACACCCAGCTA 132114362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTACACCCAGCTA 2340

132114363 ATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGTCTCAAACTC 132114422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGTCTCAAACTC 2400

132114423 CTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCA 132114482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCA 2460

132114483 CTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGGTTAAACTTT 132114542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGGTTAAACTTT 2520

132114543 CTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAATATTCTATTA 132114602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAATATTCTATTA 2580

132114603 ATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTCTGGCATGGT 132114662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     2581 ATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAA-CCAGGTCTGGCATGGT 2639

132114663 GGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGCTTGAAGCTA 132114722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2640 GGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGCTTGAAGCTA 2699

132114723 GGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGGTGCATTGGC 132114782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 GGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGGTGCATTGGC 2759

132114783 TTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTGAGCCCAGGA 132114842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTGAGCCCAGGA 2819

132114843 TTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGGGTGACAACA 132114902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGGGTGACAACA 2879

132114903 GAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TCAAGAAAGTGAATATAAGTGTGTA 132114961
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     2880 GAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATAAGTGTGTA 2939

132114962 TGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTTTTATTTTA 132115021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTTTTATTTTA 2999

132115022 AAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTTTAGGTGTAC 132115081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3000 AAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTTTAGGTGTAC 3059

132115082 TATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCACTAGAGCCA 132115141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCACTAGAGCCA 3119

132115142 CTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATCATGACCTC 132115201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 CTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATCATGACCTC 3179

132115202 TTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTAGTTGTGGT 132115261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTAGTTGTGGT 3239

132115262 TTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCTGTAGTGTT 132115321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCTGTAGTGTT 3299

132115322 TGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCCTGATGGGT 132115381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCCTGATGGGT 3359

132115382 ATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGCTGGGCATA 132115441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 ATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGCTGGGCATA 3419

132115442 GGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCGAGGTGGGTGAATGACACTTGAGC 132115501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||  ||||||
     3420 GGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCAAGGTGGGTGAATGAC--TTGAGC 3477

132115502 CCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCC 132115541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 CCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCC 3517

EXCISED REGION

132115553 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCAGC 132115612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCAGC 3592

132115613 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATG 132115672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATG 3652

132115673 ATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACACAA 132115732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 ATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACACAA 3712

132115733 ATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTCTG 132115792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 ATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTCTG 3772

132115793 CACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCTCT 132115852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 CACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCTCT 3832

132115853 CTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTG---ACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGT 132115909
          ||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 CTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTT---TTTACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGT 3889

132115910 GCAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTA 132115969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3890 GCAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTA 3949

132115970 CCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTT 132116029
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3950 CCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACTATGCCCAGCTAATTTTTT 4009

132116030 TGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGG 132116089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4010 TGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGG 4069

132116090 CTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCA 132116149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4070 CTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCA 4129

132116150 CACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGAC 132116209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4130 CACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGAC 4189

132116210 TTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATA 132116269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4190 TTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATA 4249

132116270 CTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACT 132116329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4250 CTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACT 4309

132116330 TTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGA 132116389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4310 TTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGA 4369

132116390 ATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCT 132116449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4370 ATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCT 4429

132116450 GAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCA 132116509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4430 GAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCA 4489

132116510 TTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTA 132116569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4490 TTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTA 4549

132116570 ATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTA 132116629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4550 ATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTA 4609

132116630 CAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGA 132116689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4610 CAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGA 4669

132116690 GAGTGAAGGGGGAGGGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCAC 132116749
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4670 GAGTGAAGGGGGAGCGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCAC 4729

132116750 TGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGT 132116809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4730 TGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGT 4789

132116810 CCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCA 132116869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4790 CCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCA 4849

132116870 AACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTT 132116929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4850 AACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTT 4909

132116930 AAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGAT 132116989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4910 AAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGAT 4969

132116990 TCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTT 132117049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4970 TCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTT 5029

132117050 TAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTC 132117109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5030 TAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTC 5089

132117110 TATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAAT 132117169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5090 TATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAAT 5149

132117170 GGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAAT 132117229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5150 GGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAAT 5209

132117230 CCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTT 132117289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5210 CCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTT 5269

132117290 TTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCC 132117349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5270 TTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCC 5329

132117350 TAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCAT 132117409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5330 TAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCAT 5389

132117410 GATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGG 132117469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5390 GATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGG 5449

132117470 TGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAG 132117529
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5450 TGAA-TTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAG 5508

132117530 GGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTC 132117589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5509 GGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTC 5568

132117590 CTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGG 132117649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5569 CTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGG 5628

132117650 AGGGAGATAACGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATT 132117709
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5629 AGGGAGATAATGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATT 5688

132117710 ATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCT 132117769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5689 ATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCT 5748

132117770 GTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACG 132117829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5749 GTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACG 5808

132117830 GTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGAT 132117889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5809 GTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGAT 5868

132117890 GCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTG 132117949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5869 GCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTG 5928

132117950 GAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATG 132118009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5929 GAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATG 5988

132118010 CCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGT 132118069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5989 CCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGT 6048

132118070 AGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGA 132118129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6049 AGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGA 6108

132118130 GACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGC 132118189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6109 GACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGC 6168

132118190 TGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGT 132118249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6169 TGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGT 6228

132118250 AGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGT 132118309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6229 AGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGT 6288

132118310 TGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCA 132118369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6289 TGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCA 6348

132118370 GAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAG 132118429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6349 GAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAG 6408

132118430 GTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTT 132118489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6409 GTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTT 6468

132118490 GATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGA 132118549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6469 GATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGA 6528

132118550 AAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATG 132118609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6529 AAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATG 6588

132118610 AAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTG 132118669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6589 AAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTG 6648

132118670 TCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGA 132118729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6649 TCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGA 6708

132118730 AAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAA 132118789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6709 AAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAA 6768

132118790 GTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTT 132118849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6769 GTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTT 6828

132118850 ACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGA 132118909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6829 ACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGA 6888

132118910 AATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAA 132118969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6889 AATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAA 6948

132118970 CAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGG 132119029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6949 CAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGG 7008

132119030 AAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGA 132119089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7009 AAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGA 7068

132119090 AATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAAC 132119149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7069 AATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAAC 7128

132119150 AACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCA 132119209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7129 AACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCA 7188

132119210 GCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAG 132119269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7189 GCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAG 7248

132119270 AAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAA 132119329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7249 AAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAA 7308

132119330 TTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAAC 132119389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     7309 TTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAAC 7368

132119390 TGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACA 132119449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7369 TGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACA 7428

132119450 GGTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAAT 132119509
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7429 GGTAC-TTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAAT 7487

132119510 ATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTT 132119569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7488 ATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTT 7547

132119570 CAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAA 132119629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7548 CAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAA 7607

132119630 CAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTG 132119689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7608 CAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTG 7667

132119690 GCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGC 132119749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7668 GCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGC 7727

132119750 TTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACT 132119809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7728 TTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACT 7787

132119810 GCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAG 132119869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7788 GCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAG 7847

132119870 AATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCA 132119929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7848 AATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCA 7907

132119930 TGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATA 132119989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7908 TGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATA 7967

132119990 TATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGAT 132120049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7968 TATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGAT 8027

132120050 TATTTAAAGCTA 132120061
          ||||||||||||
     8028 TATTTAAAGCTA 8039

Alignment time is 6.68597 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3492] =>      3492 nucs 'mol-32-29be-032134_3492'

Score:        3350
Aligned:      3490        nucs
Identic:      3474 (100%) nucs =>      2166 (100%)      1308 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112027,132114198] EXCISED REGION [132114204,132115517]
 second seq =>  [        1,     2176] EXCISED REGION [     2182,     3492]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [132114199,132114203]
 second seq =>         5 nucs [2177,2181]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132114199,132114199] to [132114204,132114204]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [132114199,132114200] to [132114202,132114203]
 second seq =>         0 nucs

132112027 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGT 132112086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGT 60

132112087 TTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCA 132112146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCA 120

132112147 TGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAA 132112206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAA 180

132112207 GGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTAC 132112266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTAC 240

132112267 AGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAA 132112326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAA 300

132112327 TCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATC 132112386
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATC 360

132112387 TTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCT 132112446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCT 420

132112447 ACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTT 132112506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTT 480

132112507 AAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCC 132112566
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCC 540

132112567 ATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTC 132112626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTC 600

132112627 CTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAAT 132112686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAAT 660

132112687 CTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCG 132112746
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      661 CTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCA 720

132112747 CTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTC 132112806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTC 780

132112807 TCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGA 132112866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGA 840

132112867 AGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCT 132112926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCT 900

132112927 TCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTT 132112986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTT 960

132112987 TCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAA 132113046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAA 1020

132113047 AATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCC 132113106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCC 1080

132113107 AAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAG 132113166
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAG 1140

132113167 GTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTT 132113226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTT 1200

132113227 TCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCT 132113286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCT 1260

132113287 AAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAA 132113346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAA 1320

132113347 CTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTC 132113406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1321 CTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTACGTC 1380

132113407 TGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCA 132113466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCA 1440

132113467 GCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATG 132113526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATG 1500

132113527 GGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATA 132113586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATA 1560

132113587 GGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTC 132113646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTC 1620

132113647 TTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCT 132113706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCT 1680

132113707 GTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTA 132113766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTA 1740

132113767 GAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAA 132113826
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1741 GAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAA 1800

132113827 TACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACAT 132113886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACAT 1860

132113887 TTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTA----TATTAAT 132113942
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||
     1861 TTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTAAATATATTAAT 1920

132113943 ATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTT 132114002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTT 1980

132114003 TCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCA 132114062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCA 2040

132114063 CCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTC 132114122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTC 2100

132114123 AACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGC 132114182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGC 2160

132114183 TCAACCTGGTTGCATC 132114198
          ||||||||||||||||
     2161 TCAACCTGGTTGCATC 2176

EXCISED REGION

132114204 TGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTCTCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATC 132114263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 TGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTCTCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATC 2241

132114264 TCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGA 132114323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 TCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGA 2301

132114324 GTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAG 132114383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 GTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAG 2361

132114384 ACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCAC 132114443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 ACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCAC 2421

132114444 CTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGC 132114503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 CTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGC 2481

132114504 ATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGGTTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATT 132114563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 ATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGGTTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATT 2541

132114564 ACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAATATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATG 132114623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 ACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAATATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATG 2601

132114624 GATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTCTGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAG 132114683
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 GATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTCTGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAG 2660

132114684 CACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGCTTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTG 132114743
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 CACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGCTTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTG 2720

132114744 TCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGGTGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTA 132114803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 TCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGGTGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTA 2780

132114804 CTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTGAGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGAT 132114863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 CTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTGAGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGAT 2840

132114864 ATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGGGTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAA 132114923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 ATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGGGTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAA 2900

132114924 AAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATAAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCC 132114983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 AAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATAAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCC 2960

132114984 CAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTTTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTA 132115043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 CAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTTTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTA 3020

132115044 TATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTTTAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTAT 132115103
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 TATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTTTAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTAT 3080

132115104 ATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCACTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCC 132115163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 ATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCACTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCC 3140

132115164 TTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATCATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATC 132115223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 TTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATCATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATC 3200

132115224 ACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTAGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAG 132115283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 ACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTAGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAG 3260

132115284 TTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCTGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACA 132115343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 TTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCTGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACA 3320

132115344 ACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCCTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTT 132115403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 ACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCCTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTT 3380

132115404 TATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGCTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCA 132115463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 TATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGCTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCA 3440

132115464 GCACTTTACAGGCCGAGGTGGGTGAATGACACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATC 132115517
          ||||||||||||||.|||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
     3441 GCACTTTACAGGCCAAGGTGGGTGAATG--ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATC 3492

Alignment time is 3.78132 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2118] =>      2118 nucs 'mol-32-29c9-016742_2118'

Score:        2085
Aligned:      2118        nucs
Identic:      2115 (100%) nucs =>       435 (100%)      1680 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132118117,132118551] EXCISED REGION [132118553,132120235]
 second seq =>  [        1,      435] EXCISED REGION [      437,     2118]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132118552,132118552]
 second seq =>         1 nucs [436,436]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [132119455,132119455]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [433,435] to [434,436]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132118117 TCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCC 132118176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCC 60

132118177 AGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCA 132118236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCA 120

132118237 TTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGG 132118296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGG 180

132118297 TAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAG 132118356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAG 240

132118357 TTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTG 132118416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTG 300

132118417 GCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAG 132118476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAG 360

132118477 ACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGA 132118536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGA 420

132118537 GGATACAAGTGGAAA 132118551
          |||||||||||||||
      421 GGATACAAGTGGAAA 435

EXCISED REGION

132118553 TTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAG 132118612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      437 TTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAG 496

132118613 AACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCC 132118672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      497 AACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCC 556

132118673 ACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAA 132118732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      557 ACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAA 616

132118733 CAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTA 132118792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      617 CAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTA 676

132118793 TTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACC 132118852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      677 TTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACC 736

132118853 CAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAAT 132118912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      737 CAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAAT 796

132118913 GTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAG 132118972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      797 GTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAG 856

132118973 ACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAA 132119032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      857 ACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAA 916

132119033 CTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAAT 132119092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      917 CTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAAT 976

132119093 TCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAAC 132119152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      977 TCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAAC 1036

132119153 ATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCT 132119212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1037 ATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCT 1096

132119213 CAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAA 132119272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1097 CAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAA 1156

132119273 GGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTC 132119332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 GGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTC 1216

132119333 CTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGG 132119392
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1217 CTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGG 1276

132119393 TACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGT 132119452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 TACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGT 1336

132119453 ACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATT 132119512
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 AC-TTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATT 1395

132119513 TAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAG 132119572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 TAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAG 1455

132119573 ATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAA 132119632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 ATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAA 1515

132119633 TACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCC 132119692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 TACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCC 1575

132119693 ATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTT 132119752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 ATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTT 1635

132119753 TAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCT 132119812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 TAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCT 1695

132119813 TTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAAT 132119872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 TTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAAT 1755

132119873 TCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGC 132119932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 TCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGC 1815

132119933 AAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATAT 132119992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 AAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATAT 1875

132119993 ACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTAT 132120052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 ACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTAT 1935

132120053 TTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACG 132120112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 TTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACG 1995

132120113 ACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTATA 132120172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 ACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTATA 2055

132120173 TTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATGGAAAATACATATTG 132120232
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2056 TTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATTGAAAATACATATTG 2115

132120233 TAA 132120235
          |||
     2116 TAA 2118

Alignment time is 2.6169 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2766] =>      2766 nucs 'mol-32-2b55-164212_2766'

Score:        2744
Aligned:      2766        nucs
Identic:      2764 (100%) nucs =>       416 (100%)      2348 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132117244,132117659] EXCISED REGION [132117661,132120010]
 second seq =>  [        1,      416] EXCISED REGION [      418,     2766]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132117660,132117660]
 second seq =>         1 nucs [417,417]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [132118815,132118815]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132117244 GCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTT 132117303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTT 60

132117304 CTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAA 132117363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAA 120

132117364 GGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACC 132117423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACC 180

132117424 AGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAA 132117483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAA 240

132117484 TTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGT 132117543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGT 300

132117544 AAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATT 132117603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATT 360

132117604 TGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAA 132117659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAA 416

EXCISED REGION

132117661 GTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAG 132117720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 GTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAG 477

132117721 CTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGA 132117780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 CTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGA 537

132117781 AAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGC 132117840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 AAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGC 597

132117841 TTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGA 132117900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 TTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGA 657

132117901 AGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAA 132117960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 AGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAA 717

132117961 AAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTA 132118020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 AAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTA 777

132118021 TGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGA 132118080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 TGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGA 837

132118081 AGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGAC 132118140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 AGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGAC 897

132118141 GAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTG 132118200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 GAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTG 957

132118201 TCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGC 132118260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 TCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGC 1017

132118261 AATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATT 132118320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 AATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATT 1077

132118321 GGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAA 132118380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 GGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAA 1137

132118381 TTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGC 132118440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 TTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGC 1197

132118441 TGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAA 132118500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAA 1257

132118501 GAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGG 132118560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 GAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGG 1317

132118561 GACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAA 132118620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 GACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAA 1377

132118621 GAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTG 132118680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 GAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTG 1437

132118681 CCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATA 132118740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 CCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATA 1497

132118741 ATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATG 132118800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 ATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATG 1557

132118801 ATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGA 132118860
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 ATATGATCTCATTT-CCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGA 1616

132118861 TGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGAT 132118920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 TGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGAT 1676

132118921 TTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATG 132118980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 TTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATG 1736

132118981 CCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCAT 132119040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 CCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCAT 1796

132119041 GGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGA 132119100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 GGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGA 1856

132119101 ACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAAT 132119160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 ACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAAT 1916

132119161 TATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACAT 132119220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACAT 1976

132119221 TTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGA 132119280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 TTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGA 2036

132119281 GATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTA 132119340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 GATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTA 2096

132119341 CAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCT 132119400
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 CAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCT 2156

132119401 TAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTT 132119460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 TAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTT 2216

132119461 TTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATT 132119520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 TTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATT 2276

132119521 GAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAA 132119580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 GAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAA 2336

132119581 GTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCA 132119640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 GTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCA 2396

132119641 ACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTAC 132119700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 ACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTAC 2456

132119701 TCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACT 132119760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACT 2516

132119761 GTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAA 132119820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 GTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAA 2576

132119821 GTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTT 132119880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 GTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTT 2636

132119881 GTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGG 132119940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 GTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGG 2696

132119941 TATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATAC 132120000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 TATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATAC 2756

132120001 ATGTGTGTAT 132120010
          ||||||||||
     2757 ATGTGTGTAT 2766

Alignment time is 3.26621 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2313] =>      2313 nucs 'mol-32-2e15-026444_2313'

Score:        2217
Aligned:      2311        nucs
Identic:      2300 (100%) nucs =>      1784 ( 99%)       516 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112439,132114228] EXCISED REGION [132118551,132119067]
 second seq =>  [        1,     1794] EXCISED REGION [     1797,     2313]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4322 nucs [132114229,132118550]
 second seq =>         2 nucs [1795,1796]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1794,1795] to [1796,1797]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112439 TTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATT 132112498
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTAGATCTACATGGAAAATTTGCAGCTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATT 60

132112499 AATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGT 132112558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||
       61 AATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTCGGAGGCTGT 120

132112559 TTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAA 132112618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAA 180

132112619 TCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTT 132112678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTT 240

132112679 CTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGG 132112738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGG 300

132112739 GCGAAGCGCTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCT 132112798
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCGAAGCACTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCT 360

132112799 GGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTC 132112858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTC 420

132112859 TTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAA 132112918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAA 480

132112919 TATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGG 132112978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGG 540

132112979 CATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAA 132113038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAA 600

132113039 CCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATT 132113098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATT 660

132113099 TAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCG 132113158
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCG 720

132113159 ACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTG 132113218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTG 780

132113219 CTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATG 132113278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATG 840

132113279 GTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATT 132113338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATT 900

132113339 ACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCA 132113398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCA 960

132113399 GCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCT 132113458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCT 1020

132113459 CAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAAT 132113518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAAT 1080

132113519 TAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCA 132113578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCA 1140

132113579 GGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGAC 132113638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGAC 1200

132113639 TATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTT 132113698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTT 1260

132113699 TCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCA 132113758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCA 1320

132113759 CTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATT 132113818
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1321 CTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATT 1380

132113819 GTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGT 132113878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGT 1440

132113879 ATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTA--- 132113935
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
     1441 ATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTAAAT 1500

132113936 -TATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGG 132113994
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGG 1560

132113995 TTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGA 132114054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGA 1620

132114055 CACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAAC 132114114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAAC 1680

132114115 AGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCT 132114174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCT 1740

132114175 GGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 132114228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 1794

EXCISED REGION

132118551 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 132118610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 1856

132118611 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 132118670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 1916

132118671 CCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 132118730
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 CCACCTCCTGCCAATAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 1976

132118731 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 132118790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 2036

132118791 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 132118850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 2096

132118851 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 132118910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 2156

132118911 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 132118970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 2216

132118971 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 132119030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 2276

132119031 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTC 132119067
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTC 2313

Alignment time is 2.79837 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4092] =>      4092 nucs 'mol-32-2e15-080172_4092'

Score:        4059
Aligned:      4092        nucs
Identic:      4089 (100%) nucs =>       596 (100%)      3493 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132116108,132116703] EXCISED REGION [132116705,132120200]
 second seq =>  [        1,      596] EXCISED REGION [      598,     4092]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132116704,132116704]
 second seq =>         1 nucs [597,597]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [132119455,132119455]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [132116703,132116705] to [132116704,132116706]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132116703,132116703] to [132116705,132116705]
 second seq =>         1 nucs [596,596] to [598,598]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132116108 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAG 132116167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAG 60

132116168 TAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAA 132116227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAA 120

132116228 TCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAAT 132116287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAAT 180

132116288 GAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAG 132116347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAG 240

132116348 ATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTT 132116407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTT 300

132116408 CATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATA 132116467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATA 360

132116468 TCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAA 132116527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAA 420

132116528 GAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCAC 132116587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCAC 480

132116588 AGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGC 132116647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGC 540

132116648 AAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 132116703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 596

EXCISED REGION

132116705 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 132116764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 657

132116765 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 132116824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 717

132116825 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 132116884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 777

132116885 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 132116944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 837

132116945 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 132117004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 897

132117005 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 132117064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 957

132117065 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 132117124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 1017

132117125 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 132117184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 1077

132117185 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 132117244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 1137

132117245 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 132117304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 1197

132117305 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 132117364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 1257

132117365 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 132117424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 1317

132117425 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 132117484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 1377

132117485 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 132117544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 1437

132117545 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 132117604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 1497

132117605 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAACGTAG 132117664
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1498 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAATGTAG 1557

132117665 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 132117724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 1617

132117725 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 132117784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 1677

132117785 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 132117844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 1737

132117845 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 132117904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 1797

132117905 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 132117964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 1857

132117965 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 132118024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 1917

132118025 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 132118084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 1977

132118085 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 132118144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 2037

132118145 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 132118204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 2097

132118205 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 132118264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 2157

132118265 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 132118324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 2217

132118325 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 132118384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 2277

132118385 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 132118444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 2337

132118445 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 132118504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 2397

132118505 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 132118564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 2457

132118565 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 132118624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 2517

132118625 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 132118684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 2577

132118685 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 132118744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 2637

132118745 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 132118804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 2697

132118805 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 132118864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 2757

132118865 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 132118924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 2817

132118925 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 132118984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 2877

132118985 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 132119044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 2937

132119045 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 132119104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 2997

132119105 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 132119164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 3057

132119165 TATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTG 132119224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 TATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTG 3117

132119225 GCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATA 132119284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 GCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATA 3177

132119285 ATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGT 132119344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 ATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGT 3237

132119345 TCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGG 132119404
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 TCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGG 3297

132119405 GACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTT 132119464
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     3298 GACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTAC-TTTTTTTTT 3356

132119465 TTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAA 132119524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 TTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAA 3416

132119525 AAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTA 132119584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 AAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTA 3476

132119585 AAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAA 132119644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 AAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAA 3536

132119645 CACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCT 132119704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 CACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCT 3596

132119705 GAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAG 132119764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 GAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAG 3656

132119765 GGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGA 132119824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 GGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGA 3716

132119825 CAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTA 132119884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 CAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTA 3776

132119885 TAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATT 132119944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATT 3836

132119945 GTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATACATGT 132120004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 GTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATACATGT 3896

132120005 GTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCTATGA 132120064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 GTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCTATGA 3956

132120065 TTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACGACAGTAATAACA 132120124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 TTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACGACAGTAATAACA 4016

132120125 GAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCAGAAT 132120184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 GAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCAGAAT 4076

132120185 TAAGTCAGTTTCAATC 132120200
          ||||||||||||||||
     4077 TAAGTCAGTTTCAATC 4092

Alignment time is 4.19526 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2645] =>      2645 nucs 'mol-32-2e20-096927_2645'

Score:        2549
Aligned:      2643        nucs
Identic:      2632 (100%) nucs =>       889 ( 99%)      1743 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132113339,132114228] EXCISED REGION [132118551,132120299]
 second seq =>  [        1,      894] EXCISED REGION [      897,     2645]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4322 nucs [132114229,132118550]
 second seq =>         2 nucs [895,896]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [894,895] to [896,897]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132113339 ACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCA 132113398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCA 60

132113399 GCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCT 132113458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCT 120

132113459 CAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAAT 132113518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAAT 180

132113519 TAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCA 132113578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCA 240

132113579 GGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGAC 132113638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGAC 300

132113639 TATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTT 132113698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTT 360

132113699 TCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCA 132113758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCA 420

132113759 CTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATT 132113818
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      421 CTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATT 480

132113819 GTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGT 132113878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGT 540

132113879 ATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTA--- 132113935
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
      541 ATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTAAAT 600

132113936 -TATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGG 132113994
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGG 660

132113995 TTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGA 132114054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGA 720

132114055 CACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAAC 132114114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAAC 780

132114115 AGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCT 132114174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCT 840

132114175 GGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 132114228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 894

EXCISED REGION

132118551 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 132118610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 956

132118611 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 132118670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 1016

132118671 CCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 132118730
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 CCACCTCCTGCCAATAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 1076

132118731 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 132118790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 1136

132118791 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 132118850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 1196

132118851 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 132118910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 1256

132118911 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 132118970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 1316

132118971 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 132119030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 1376

132119031 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 132119090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 1436

132119091 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 132119150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 1496

132119151 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 132119210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 1556

132119211 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 132119270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 1616

132119271 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 132119330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 1676

132119331 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 132119390
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1677 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 1736

132119391 GGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 132119450
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 GGTACACCTTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 1796

132119451 GTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATA 132119510
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1797 GTACATTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGATTCATTTGTCAATA 1856

132119511 TTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTC 132119570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTC 1916

132119571 AGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAAC 132119630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 AGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAAC 1976

132119631 AATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGG 132119690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 AATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGG 2036

132119691 CCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCT 132119750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 CCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCT 2096

132119751 TTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTG 132119810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTG 2156

132119811 CTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGA 132119870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 CTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGA 2216

132119871 ATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCAT 132119930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 ATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCAT 2276

132119931 GCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATAT 132119990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 GCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATAT 2336

132119991 ATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATT 132120050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 ATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATT 2396

132120051 ATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATA 132120110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 ATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATA 2456

132120111 CGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTA 132120170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 CGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTA 2516

132120171 TATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATGGAAAATACATAT 132120230
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2517 TATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATTGAAAATACATAT 2576

132120231 TGTAACTCCTAGAACAATGACTAATGACTAGAAAATAACTTTTAAAAAAGCTAAAATTCA 132120290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 TGTAACTCCTAGAACAATGACTAATGACTAGAAAATAACTTTTAAAAAAGCTAAAATTCA 2636

132120291 ACAGAGAAA 132120299
          |||||||||
     2637 ACAGAGAAA 2645

Alignment time is 2.93099 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2847] =>      2847 nucs 'mol-32-2e4c-022410_2847'

Score:        2745
Aligned:      2844        nucs
Identic:      2835 (100%) nucs =>      1891 (100%)       944 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112037,132113933] EXCISED REGION [132113934,132114880]
 second seq =>  [        1,     1897] EXCISED REGION [     1902,     2847]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1898,1901]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1898,1899] to [1902,1903]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132113933,132113933] to [132113934,132113934]
 second seq =>         1 nucs [1897,1897] to [1902,1902]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112037 CTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACCAT 132112096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACCAT 60

132112097 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTA 132112156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTA 120

132112157 ATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATC 132112216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATC 180

132112217 TTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGC 132112276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGC 240

132112277 CACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAGT 132112336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      241 CACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAAT 300

132112337 ATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTG 132112396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTG 360

132112397 ATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAA 132112456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAA 420

132112457 TTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTT 132112516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTT 480

132112517 TACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAA 132112576
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAA 540

132112577 TTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAA 132112636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAA 600

132112637 GTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATC 132112696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATC 660

132112697 TTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCGCTAACTTAAT 132112756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      661 TTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCACTAACTTAAT 720

132112757 CACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGC 132112816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGC 780

132112817 TGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTG 132112876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTG 840

132112877 TCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTAT 132112936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTAT 900

132112937 TCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAA 132112996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAA 960

132112997 GTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCA 132113056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCA 1020

132113057 TGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTA 132113116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTA 1080

132113117 GGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCAT 132113176
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCAT 1140

132113177 GTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATG 132113236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATG 1200

132113237 GCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTT 132113296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTT 1260

132113297 TTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAAC 132113356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAAC 1320

132113357 CACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAGAA 132113416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1321 CACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTACGTCTGCTGCAGAA 1380

132113417 TTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAA 132113476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAA 1440

132113477 TGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCC 132113536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCC 1500

132113537 ATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAA 132113596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAA 1560

132113597 AGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGA 132113656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGA 1620

132113657 ATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACAC 132113716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACAC 1680

132113717 TGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTT 132113776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTT 1740

132113777 GTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAATACAGTCCTT 132113836
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1741 GTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAATACAGTCCTT 1800

132113837 GGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGA 132113896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGA 1860

132113897 TTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 132113933
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 1897

EXCISED REGION

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 1961

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 2021

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 2081

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 2141

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 2201

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 132114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 2261

132114294 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 132114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 2321

132114354 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 132114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 2381

132114414 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 132114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 2441

132114474 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 132114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 2501

132114534 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 132114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 2561

132114594 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTC 132114653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2562 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTC 2620

132114654 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGC 132114713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2621 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGC 2680

132114714 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 132114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 2740

132114774 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 132114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 2800

132114834 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCA 132114880
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCA 2847

Alignment time is 3.11435 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     5067] =>      5067 nucs 'mol-32-2edb-067592_5067'

Score:        4962
Aligned:      5054        nucs
Identic:      5044 (100%) nucs =>       491 ( 99%)      4553 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132115047,132115541] EXCISED REGION [132115553,132120109]
 second seq =>  [        1,      493] EXCISED REGION [      509,     5067]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        11 nucs [132115542,132115552]
 second seq =>        15 nucs [494,508]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [505,508]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132115047 TTTATATACACAAAATGTTTTGATTTTAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATA 132115106
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTATATACACCAAATGTTTTGATTTTAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATA 60

132115107 TAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCACTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTT 132115166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCACTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTT 120

132115167 CTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATCATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACA 132115226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATCATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACA 180

132115227 TCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTAGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTA 132115286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTAGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTA 240

132115287 TGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCTGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACA 132115346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCTGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACA 300

132115347 TTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCCTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTAT 132115406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCCTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTAT 360

132115407 TAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGCTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCA 132115466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGCTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCA 420

132115467 CTTTACAGGCCGAGGTGGGTGAATGACACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGC 132115526
          |||||||||||.|||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTTACAGGCCAAGGTGGGTGAATGAC--TTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGC 478

132115527 AACATAGTGGGACCC 132115541
          |||||||||||||||
      479 AACATAGTGGGACCC 493

EXCISED REGION

132115553 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCAGC 132115612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      509 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCAGC 568

132115613 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATG 132115672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      569 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATG 628

132115673 ATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACACAA 132115732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      629 ATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACACAA 688

132115733 ATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTCTG 132115792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      689 ATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTCTG 748

132115793 CACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCTCT 132115852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      749 CACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCTCT 808

132115853 CTCC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTG 132115910
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      809 CTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTG 868

132115911 CAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTAC 132115970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      869 CAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTAC 928

132115971 CTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTT 132116030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      929 CTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACTATGCCCAGCTAATTTTTTT 988

132116031 GTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGC 132116090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      989 GTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGC 1048

132116091 TCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCAC 132116150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1049 TCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCAC 1108

132116151 ACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACT 132116210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1109 ACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACT 1168

132116211 TTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATAC 132116270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1169 TTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATAC 1228

132116271 TTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTT 132116330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 TTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTT 1288

132116331 TTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAA 132116390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 TTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAA 1348

132116391 TCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTG 132116450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 TCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTG 1408

132116451 AATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCAT 132116510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 AATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCAT 1468

132116511 TCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAA 132116570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 TCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAA 1528

132116571 TTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTAC 132116630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 TTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTAC 1588

132116631 AATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAG 132116690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 AATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAG 1648

132116691 AGTGAAGGGGGAGGGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACT 132116750
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 AGTGAAGGGGGAGCGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACT 1708

132116751 GTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTC 132116810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 GTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTC 1768

132116811 CCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAA 132116870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 CCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAA 1828

132116871 ACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTA 132116930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 ACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTA 1888

132116931 AAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATT 132116990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 AAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATT 1948

132116991 CTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTT 132117050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 CTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTT 2008

132117051 AAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCT 132117110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 AAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCT 2068

132117111 ATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATG 132117170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 ATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATG 2128

132117171 GAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATC 132117230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 GAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATC 2188

132117231 CTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTT 132117290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 CTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTT 2248

132117291 TGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCT 132117350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 TGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCT 2308

132117351 AGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATG 132117410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 AGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATG 2368

132117411 ATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGT 132117470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 ATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGT 2428

132117471 GAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGG 132117530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 GAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGG 2488

132117531 GGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCC 132117590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 GGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCC 2548

132117591 TGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGA 132117650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 TGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGA 2608

132117651 GGGAGATAACGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTA 132117710
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 GGGAGATAATGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTA 2668

132117711 TTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTG 132117770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 TTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTG 2728

132117771 TTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGG 132117830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 TTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGG 2788

132117831 TCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATG 132117890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 TCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATG 2848

132117891 CTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGG 132117950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2849 CTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGG 2908

132117951 AGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGC 132118010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2909 AGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGC 2968

132118011 CTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTA 132118070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2969 CTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTA 3028

132118071 GAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAG 132118130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3029 GAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAG 3088

132118131 ACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCT 132118190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3089 ACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCT 3148

132118191 GTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTA 132118250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 GTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTA 3208

132118251 GGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTT 132118310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3209 GGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTT 3268

132118311 GAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAG 132118370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3269 GAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAG 3328

132118371 AGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGG 132118430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3329 AGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGG 3388

132118431 TGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTG 132118490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3389 TGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTG 3448

132118491 ATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAA 132118550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3449 ATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAA 3508

132118551 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 132118610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3509 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 3568

132118611 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 132118670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3569 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 3628

132118671 CCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 132118730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3629 CCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 3688

132118731 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 132118790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3689 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 3748

132118791 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 132118850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3749 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 3808

132118851 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 132118910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3809 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 3868

132118911 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 132118970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3869 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 3928

132118971 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 132119030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3929 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 3988

132119031 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 132119090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3989 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 4048

132119091 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 132119150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4049 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 4108

132119151 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 132119210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4109 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 4168

132119211 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 132119270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4169 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 4228

132119271 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 132119330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4229 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 4288

132119331 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 132119390
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4289 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 4348

132119391 GGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 132119450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4349 GGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 4408

132119451 GTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATA 132119510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4409 GTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATA 4468

132119511 TTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTC 132119570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4469 TTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTC 4528

132119571 AGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAAC 132119630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4529 AGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAAC 4588

132119631 AATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGG 132119690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4589 AATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGG 4648

132119691 CCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCT 132119750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4649 CCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCT 4708

132119751 TTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTG 132119810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4709 TTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTG 4768

132119811 CTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGA 132119870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4769 CTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGA 4828

132119871 ATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCAT 132119930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4829 ATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCAT 4888

132119931 GCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATAT 132119990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4889 GCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATAT 4948

132119991 ATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATT 132120050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4949 ATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATT 5008

132120051 ATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATAT 132120109
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5009 ATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATAT 5067

Alignment time is 4.79227 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3148] =>      3148 nucs 'mol-32-2edb-162183_3148'

Score:        3126
Aligned:      3148        nucs
Identic:      3146 (100%) nucs =>       664 (100%)      2482 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132116996,132117659] EXCISED REGION [132117661,132120144]
 second seq =>  [        1,      664] EXCISED REGION [      666,     3148]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132117660,132117660]
 second seq =>         1 nucs [665,665]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [132119455,132119455]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132116996 CTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAA 132117055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAA 60

132117056 TACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCT 132117115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCT 120

132117116 GCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAA 132117175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAA 180

132117176 GTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAAT 132117235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAAT 240

132117236 ACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTC 132117295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTC 300

132117296 TTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTA 132117355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTA 360

132117356 GGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGT 132117415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGT 420

132117416 ACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATT 132117475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATT 480

132117476 TTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCAT 132117535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCAT 540

132117536 AAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGT 132117595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGT 600

132117596 GTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAG 132117655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAG 660

132117656 ATAA 132117659
          ||||
      661 ATAA 664

EXCISED REGION

132117661 GTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAG 132117720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 GTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAG 725

132117721 CTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGA 132117780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 CTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGA 785

132117781 AAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGC 132117840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 AAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGC 845

132117841 TTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGA 132117900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 TTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGA 905

132117901 AGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAA 132117960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 AGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAA 965

132117961 AAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTA 132118020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 AAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTA 1025

132118021 TGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGA 132118080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 TGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGA 1085

132118081 AGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGAC 132118140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 AGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGAC 1145

132118141 GAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTG 132118200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 GAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTG 1205

132118201 TCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGC 132118260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 TCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGC 1265

132118261 AATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATT 132118320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 AATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATT 1325

132118321 GGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAA 132118380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 GGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAA 1385

132118381 TTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGC 132118440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 TTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGC 1445

132118441 TGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAA 132118500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 TGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAA 1505

132118501 GAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGG 132118560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 GAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGG 1565

132118561 GACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAA 132118620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 GACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAA 1625

132118621 GAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTG 132118680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 GAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTG 1685

132118681 CCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATA 132118740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 CCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATA 1745

132118741 ATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATG 132118800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 ATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATG 1805

132118801 ATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGA 132118860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 ATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGA 1865

132118861 TGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGAT 132118920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 TGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGAT 1925

132118921 TTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATG 132118980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATG 1985

132118981 CCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCAT 132119040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 CCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCAT 2045

132119041 GGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGA 132119100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 GGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGA 2105

132119101 ACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAAT 132119160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 ACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAAT 2165

132119161 TATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACAT 132119220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 TATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACAT 2225

132119221 TTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGA 132119280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 TTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGA 2285

132119281 GATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTA 132119340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 GATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTA 2345

132119341 CAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCT 132119400
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 CAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCT 2405

132119401 TAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTT 132119460
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     2406 TAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTAC-TTTTT 2464

132119461 TTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATT 132119520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 TTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATT 2524

132119521 GAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAA 132119580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 GAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAA 2584

132119581 GTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCA 132119640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 GTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCA 2644

132119641 ACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTAC 132119700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 ACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTAC 2704

132119701 TCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACT 132119760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 TCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACT 2764

132119761 GTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAA 132119820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 GTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAA 2824

132119821 GTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTT 132119880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 GTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTT 2884

132119881 GTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGG 132119940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 GTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGG 2944

132119941 TATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATAC 132120000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 TATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATAC 3004

132120001 ATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCT 132120060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 ATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCT 3064

132120061 ATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACGACAGTAAT 132120120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 ATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACGACAGTAAT 3124

132120121 AACAGAAAAGAGGGATGAATAAAT 132120144
          ||||||||||||||||||||||||
     3125 AACAGAAAAGAGGGATGAATAAAT 3148

Alignment time is 3.6908 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     6865] =>      6865 nucs 'mol-32-2ef1-030995_6865'

Score:        6664
Aligned:      6864        nucs
Identic:      6845 (100%) nucs =>      1859 (100%)      4986 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112069,132113933] EXCISED REGION [132113934,132118931]
 second seq =>  [        1,     1865] EXCISED REGION [     1870,     6865]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1866,1869]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1866,1867] to [1870,1871]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132113933,132113933] to [132113934,132113934]
 second seq =>         1 nucs [1865,1865] to [1870,1870]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112069 CAAGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGAC 132112128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGAC 60

132112129 TACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 132112188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTT 120

132112189 CACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTC 132112248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTC 180

132112249 CCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCT 132112308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCT 240

132112309 AAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTAT 132112368
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTAT 300

132112369 GCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAA 132112428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAA 360

132112429 TTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTC 132112488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTC 420

132112489 ATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTT 132112548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      421 ATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTT 480

132112549 TGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTA 132112608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTA 540

132112609 TTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTT 132112668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTT 600

132112669 GCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAG 132112728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAG 660

132112729 ATACGGGTGGGCGAAGCGCTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCT 132112788
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATACGGGTGGGCGAAGCACTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCT 720

132112789 GAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGC 132112848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGC 780

132112849 ACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTT 132112908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTT 840

132112909 CATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGA 132112968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGA 900

132112969 TTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTA 132113028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTA 960

132113029 ATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATA 132113088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATA 1020

132113089 AAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGG 132113148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1021 AAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGG 1080

132113149 CTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGC 132113208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGC 1140

132113209 TCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACA 132113268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACA 1200

132113269 GCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGT 132113328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGT 1260

132113329 TTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCA 132113388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCA 1320

132113389 TGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCC 132113448
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGATCTTCCAGCTACGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCC 1380

132113449 AAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCT 132113508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCT 1440

132113509 CTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTA 132113568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTA 1500

132113569 GTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGG 132113628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGG 1560

132113629 TCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATT 132113688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATT 1620

132113689 GTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCT 132113748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCT 1680

132113749 GTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTT 132113808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTT 1740

132113809 TATCCCTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATT 132113868
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATCCGTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATT 1800

132113869 ATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAA 132113928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAA 1860

132113929 TTAAT 132113933
          |||||
     1861 TTAAT 1865

EXCISED REGION

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 1929

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 1989

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 2049

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 2109

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 2169

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 132114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 2229

132114294 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 132114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 2289

132114354 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 132114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 2349

132114414 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 132114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 2409

132114474 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 132114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 2469

132114534 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 132114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 2529

132114594 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTC 132114653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2530 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTC 2588

132114654 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGC 132114713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2589 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGC 2648

132114714 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 132114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 2708

132114774 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 132114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 2768

132114834 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 132114893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 2828

132114894 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 132114953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 2888

132114954 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 132115013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 2948

132115014 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTTT 132115073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2949 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTTT 3008

132115074 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 132115133
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCCATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 3068

132115134 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 132115193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 3128

132115194 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 132115253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 3188

132115254 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 132115313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 3248

132115314 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 132115373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 3308

132115374 TGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGC 132115433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 TGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGC 3368

132115434 TGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCGAGGTGGGTGAATGAC 132115493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||  
     3369 TGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCAAGGTGGGTGAATG-- 3426

132115494 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCCCACCTCTACAA- 132115552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||| 
     3427 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCCGACCTCTACAAT 3486

132115553 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCAGC 132115612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCAGC 3546

132115613 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATG 132115672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATG 3606

132115673 ATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACACAA 132115732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 ATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACACAA 3666

132115733 ATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTCTG 132115792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 ATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTCTG 3726

132115793 CACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCTCT 132115852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 CACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCTCT 3786

132115853 CTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGCA 132115912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 CTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGCA 3846

132115913 GTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTACCT 132115972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 GTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTACCT 3906

132115973 CAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGT 132116032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3907 CAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACTATGCCCAGCTAATTTTTTTGT 3966

132116033 ATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGCTC 132116092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 ATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGCTC 4026

132116093 AAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCACAC 132116152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 AAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCACAC 4086

132116153 CTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTT 132116212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 CTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTT 4146

132116213 TGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTT 132116272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 TGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTT 4206

132116273 TAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTT 132116332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 TAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTT 4266

132116333 TATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATC 132116392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 TATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATC 4326

132116393 TCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAA 132116452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 TCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAA 4386

132116453 TATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTC 132116512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 TATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTC 4446

132116513 TCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATT 132116572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 TCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATT 4506

132116573 GACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAA 132116632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 GACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAA 4566

132116633 TCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAG 132116692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 TCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAG 4626

132116693 TGAAGGGGGAGGGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGT 132116752
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 TGAAGGGGGAGCGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGT 4686

132116753 CATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCC 132116812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 CATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCC 4746

132116813 TTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAAC 132116872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 TTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAAC 4806

132116873 TACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAA 132116932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 TACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAA 4866

132116933 GATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCT 132116992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 GATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCT 4926

132116993 TATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAA 132117052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 TATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAA 4986

132117053 AAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTAT 132117112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 AAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTAT 5046

132117113 TCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGA 132117172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 TCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGA 5106

132117173 AAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCT 132117232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 AAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCT 5166

132117233 AATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTG 132117292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 AATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTG 5226

132117293 GTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAG 132117352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 GTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAG 5286

132117353 GTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGAT 132117412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 GTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGAT 5346

132117413 CGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGA 132117472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 CGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGA 5406

132117473 ATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGG 132117532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 ATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGG 5466

132117533 CATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTG 132117592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 CATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTG 5526

132117593 TGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGG 132117652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 TGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGG 5586

132117653 GAGATAACGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATT 132117712
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 GAGATAATGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATT 5646

132117713 ATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTT 132117772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 ATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTT 5706

132117773 AAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTC 132117832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 AAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTC 5766

132117833 TGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCT 132117892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 TGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCT 5826

132117893 GTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAG 132117952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 GTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAG 5886

132117953 TGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCT 132118012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 TGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCT 5946

132118013 TTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGA 132118072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 TTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGA 6006

132118073 AAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGAC 132118132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 AAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGAC 6066

132118133 TGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGT 132118192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 TGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGT 6126

132118193 GCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGG 132118252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 GCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGG 6186

132118253 AAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGA 132118312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 AAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGA 6246

132118313 GAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAG 132118372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 GAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAG 6306

132118373 AGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTG 132118432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 AGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTG 6366

132118433 TCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGAT 132118492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 TCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGAT 6426

132118493 GAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAG 132118552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 GAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAG 6486

132118553 TTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAG 132118612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 TTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAG 6546

132118613 AACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCC 132118672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 AACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCC 6606

132118673 ACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAA 132118732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 ACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAA 6666

132118733 CAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTA 132118792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 CAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTA 6726

132118793 TTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACC 132118852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 TTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACC 6786

132118853 CAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAAT 132118912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 CAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAAT 6846

132118913 GTGTAGATTTTTGTCTTTT 132118931
          |||||||||||||||||||
     6847 GTGTAGATTTTTGTCTTTT 6865

Alignment time is 6.73004 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3784] =>      3784 nucs 'mol-32-2f33-013546_3784'

Score:        3761
Aligned:      3783        nucs
Identic:      3781 (100%) nucs =>       505 (100%)      3276 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132116199,132116703] EXCISED REGION [132116705,132119982]
 second seq =>  [        1,      505] EXCISED REGION [      507,     3784]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132116704,132116704]
 second seq =>         1 nucs [506,506]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [132116703,132116705] to [132116704,132116706]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132116703,132116703] to [132116705,132116705]
 second seq =>         1 nucs [505,505] to [507,507]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132116199 GTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCA 132116258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCA 60

132116259 ATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATA 132116318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATA 120

132116319 ATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTT 132116378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTT 180

132116379 CTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGT 132116438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGT 240

132116439 TTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGT 132116498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGT 300

132116499 GTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGA 132116558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGA 360

132116559 AAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCT 132116618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCT 420

132116619 CAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGC 132116678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGC 480

132116679 GACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 132116703
          |||||||||||||||||||||||||
      481 GACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 505

EXCISED REGION

132116705 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 132116764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      507 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 566

132116765 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 132116824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      567 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 626

132116825 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 132116884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      627 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 686

132116885 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 132116944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      687 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 746

132116945 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 132117004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 806

132117005 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 132117064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 866

132117065 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 132117124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 926

132117125 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 132117184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 986

132117185 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 132117244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 1046

132117245 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 132117304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 1106

132117305 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 132117364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 1166

132117365 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 132117424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 1226

132117425 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 132117484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 1286

132117485 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 132117544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 1346

132117545 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 132117604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 1406

132117605 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAACGTAG 132117664
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1407 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAATGTAG 1466

132117665 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 132117724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 1526

132117725 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 132117784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 1586

132117785 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 132117844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 1646

132117845 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 132117904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 1706

132117905 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 132117964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 1766

132117965 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 132118024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 1826

132118025 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 132118084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 1886

132118085 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 132118144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 1946

132118145 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 132118204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 2006

132118205 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 132118264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 2066

132118265 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 132118324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 2126

132118325 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 132118384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 2186

132118385 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 132118444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 2246

132118445 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 132118504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 2306

132118505 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 132118564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 2366

132118565 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 132118624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 2426

132118625 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 132118684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 2486

132118685 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 132118744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 2546

132118745 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 132118804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 2606

132118805 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 132118864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 2666

132118865 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 132118924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2667 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 2726

132118925 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 132118984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2727 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 2786

132118985 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 132119044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 2846

132119045 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 132119104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 2906

132119105 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 132119164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 2966

132119165 TATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTG 132119224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 TATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTG 3026

132119225 GCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATA 132119284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 GCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATA 3086

132119285 ATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGT 132119344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 ATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGT 3146

132119345 TCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGG 132119404
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 TCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGG 3206

132119405 GACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTT 132119464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 GACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTT 3266

132119465 TTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAA 132119524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 TTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAA 3326

132119525 AAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTA 132119584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 AAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTA 3386

132119585 AAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAA 132119644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 AAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAA 3446

132119645 CACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCT 132119704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 CACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCT 3506

132119705 GAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAG 132119764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 GAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAG 3566

132119765 GGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGA 132119824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 GGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGA 3626

132119825 CAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTA 132119884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 CAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTA 3686

132119885 TAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATT 132119944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 TAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATT 3746

132119945 GTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGC 132119982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 GTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGC 3784

Alignment time is 4.08268 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3770] =>      3770 nucs 'mol-32-2fb7-085695_3770'

Score:        3715
Aligned:      3770        nucs
Identic:      3765 (100%) nucs =>       656 (100%)      3109 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132116048,132116703] EXCISED REGION [132116705,132119818]
 second seq =>  [        1,      656] EXCISED REGION [      658,     3770]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132116704,132116704]
 second seq =>         1 nucs [657,657]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [132119455,132119455]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [132116703,132116705] to [132116704,132116706]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132116703,132116703] to [132116705,132116705]
 second seq =>         1 nucs [656,656] to [658,658]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132116048 AGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGCCATCCATCCGC 132116107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGCCATCCATCCGC 60

132116108 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAG 132116167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAG 120

132116168 TAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAA 132116227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAA 180

132116228 TCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAAT 132116287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAAT 240

132116288 GAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAG 132116347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAG 300

132116348 ATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTT 132116407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTT 360

132116408 CATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATA 132116467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATA 420

132116468 TCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAA 132116527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAA 480

132116528 GAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCAC 132116587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCAC 540

132116588 AGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGC 132116647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGC 600

132116648 AAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 132116703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 656

EXCISED REGION

132116705 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 132116764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 717

132116765 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 132116824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 777

132116825 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 132116884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 837

132116885 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 132116944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 897

132116945 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 132117004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 957

132117005 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 132117064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 1017

132117065 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 132117124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 1077

132117125 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 132117184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 1137

132117185 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 132117244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 1197

132117245 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 132117304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 1257

132117305 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 132117364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 1317

132117365 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 132117424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 1377

132117425 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 132117484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 1437

132117485 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 132117544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 1497

132117545 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 132117604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 1557

132117605 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAACGTAG 132117664
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1558 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCGTTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAATGTAG 1617

132117665 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 132117724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 1677

132117725 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 132117784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 1737

132117785 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 132117844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 1797

132117845 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 132117904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 1857

132117905 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 132117964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1858 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGAAAAAAGA 1917

132117965 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 132118024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 1977

132118025 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 132118084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 2037

132118085 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 132118144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 2097

132118145 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 132118204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 2157

132118205 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 132118264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 2217

132118265 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 132118324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 2277

132118325 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 132118384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 2337

132118385 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 132118444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 2397

132118445 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 132118504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 2457

132118505 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 132118564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 2517

132118565 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 132118624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 2577

132118625 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 132118684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 2637

132118685 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 132118744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 2697

132118745 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 132118804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 2757

132118805 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 132118864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 2817

132118865 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 132118924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 2877

132118925 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 132118984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 2937

132118985 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 132119044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 2997

132119045 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 132119104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 3057

132119105 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 132119164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 3117

132119165 TATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTG 132119224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 TATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTG 3177

132119225 GCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATA 132119284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 GCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATA 3237

132119285 ATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGT 132119344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 ATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGT 3297

132119345 TCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGG 132119404
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 TCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGG 3357

132119405 GACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTT 132119464
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     3358 GACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTAC-TTTTTTTTT 3416

132119465 TTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAA 132119524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAA 3476

132119525 AAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTA 132119584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 AAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTA 3536

132119585 AAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAA 132119644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 AAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAA 3596

132119645 CACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCT 132119704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 CACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCT 3656

132119705 GAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAG 132119764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 GAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAG 3716

132119765 GGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAA 132119818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 GGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAA 3770

Alignment time is 4.00283 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3368] =>      3368 nucs 'mol-32-2fe3-128219_3368'

Score:        3244
Aligned:      3365        nucs
Identic:      3354 (100%) nucs =>      1901 (100%)      1453 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112027,132113933] EXCISED REGION [132113934,132115390]
 second seq =>  [        1,     1907] EXCISED REGION [     1912,     3368]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1908,1911]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1908,1909] to [1912,1913]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132113933,132113933] to [132113934,132113934]
 second seq =>         1 nucs [1907,1907] to [1912,1912]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112027 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGT 132112086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGT 60

132112087 TTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCA 132112146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCA 120

132112147 TGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAA 132112206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAA 180

132112207 GGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTAC 132112266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTAC 240

132112267 AGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAA 132112326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAA 300

132112327 TCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATC 132112386
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATC 360

132112387 TTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCT 132112446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCT 420

132112447 ACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTT 132112506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTT 480

132112507 AAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCC 132112566
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCC 540

132112567 ATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTC 132112626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTC 600

132112627 CTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAAT 132112686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAAT 660

132112687 CTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCG 132112746
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      661 CTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCA 720

132112747 CTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTC 132112806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTC 780

132112807 TCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGA 132112866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGA 840

132112867 AGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCT 132112926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCT 900

132112927 TCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTT 132112986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTT 960

132112987 TCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAA 132113046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAA 1020

132113047 AATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCC 132113106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCC 1080

132113107 AAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAG 132113166
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAG 1140

132113167 GTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTT 132113226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTT 1200

132113227 TCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCT 132113286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCT 1260

132113287 AAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAA 132113346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAA 1320

132113347 CTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTC 132113406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1321 CTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTACGTC 1380

132113407 TGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCA 132113466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCA 1440

132113467 GCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATG 132113526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATG 1500

132113527 GGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATA 132113586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATA 1560

132113587 GGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTC 132113646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTC 1620

132113647 TTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCT 132113706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCT 1680

132113707 GTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTA 132113766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTA 1740

132113767 GAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAA 132113826
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1741 GAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAA 1800

132113827 TACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACAT 132113886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACAT 1860

132113887 TTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 132113933
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 1907

EXCISED REGION

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 1971

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 2031

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 2091

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 2151

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 2211

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 132114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 2271

132114294 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 132114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 2331

132114354 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 132114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 2391

132114414 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 132114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 2451

132114474 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 132114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 2511

132114534 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 132114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 2571

132114594 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTC 132114653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2572 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTC 2630

132114654 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGC 132114713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2631 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGC 2690

132114714 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 132114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 2750

132114774 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 132114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 2810

132114834 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 132114893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 2870

132114894 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCT-AAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATAT 132114952
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATAT 2930

132114953 AAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTT 132115012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 AAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTT 2990

132115013 TTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTT 132115072
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2991 TTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTT 3050

132115073 TAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCA 132115132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 TAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCA 3110

132115133 CTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTAT 132115192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 CTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTAT 3170

132115193 CATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGT 132115252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 CATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGT 3230

132115253 AGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATC 132115312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 AGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATC 3290

132115313 TGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTC 132115372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 TGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTC 3350

132115373 CTGATGGGTATGATTAGA 132115390
          ||||||||||||||||||
     3351 CTGATGGGTATGATTAGA 3368

Alignment time is 3.78904 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     6316] =>      6316 nucs 'mol-32-2fe3-257682_6316'

Score:        6130
Aligned:      6297        nucs
Identic:      6281 (100%) nucs =>      1601 (100%)      4680 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132113934,132115541] EXCISED REGION [132115553,132120240]
 second seq =>  [       10,     1615] EXCISED REGION [     1630,     6316]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        11 nucs [132115542,132115552]
 second seq =>        14 nucs [1616,1629]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [1627,1629]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       10 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 69

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       70 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 129

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      130 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 189

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      190 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 249

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      250 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 309

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 132114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      310 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 369

132114294 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 132114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      370 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 429

132114354 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 132114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      430 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 489

132114414 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 132114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      490 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 549

132114474 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 132114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 609

132114534 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 132114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 669

132114594 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTC 132114653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
      670 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAA-CCAGGTC 728

132114654 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGC 132114713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      729 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGC 788

132114714 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 132114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      789 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 848

132114774 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 132114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 908

132114834 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 132114893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 968

132114894 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TCAAGAAAGTGAATAT 132114952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
      969 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATAT 1028

132114953 AAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTT 132115012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 AAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTT 1088

132115013 TTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTT 132115072
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1089 TTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTT 1148

132115073 TAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCA 132115132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 TAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCA 1208

132115133 CTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTAT 132115192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 CTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTAT 1268

132115193 CATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGT 132115252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 CATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGT 1328

132115253 AGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATC 132115312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 AGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATC 1388

132115313 TGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTC 132115372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 TGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTC 1448

132115373 CTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTG 132115432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 CTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTG 1508

132115433 CTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCGAGGTGGGTGAATGA 132115492
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1509 CTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCAAGGTGGGTGAATGA 1568

132115493 CACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCC 132115541
          |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 C--TTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCC 1615

EXCISED REGION

132115553 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCAGC 132115612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCAGC 1689

132115613 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATG 132115672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATG 1749

132115673 ATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACACAA 132115732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 ATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACACAA 1809

132115733 ATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTCTG 132115792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 ATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTCTG 1869

132115793 CACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCTCT 132115852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 CACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCTCT 1929

132115853 CTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGCA 132115912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1930 CTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGCA 1989

132115913 GTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTACCT 132115972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 GTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTACCT 2049

132115973 CAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGT 132116032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2050 CAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACTATGCCCAGCTAATTTTTTTGT 2109

132116033 ATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGCTC 132116092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 ATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGCTC 2169

132116093 AAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCACAC 132116152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 AAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCACAC 2229

132116153 CTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTT 132116212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 CTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTT 2289

132116213 TGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTT 132116272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 TGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTT 2349

132116273 TAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTT 132116332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 TAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTT 2409

132116333 TATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATC 132116392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 TATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATC 2469

132116393 TCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAA 132116452
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2470 TCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGTGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAA 2529

132116453 TATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTC 132116512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 TATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTC 2589

132116513 TCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATT 132116572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 TCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATT 2649

132116573 GACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAA 132116632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 GACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAA 2709

132116633 TCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAG 132116692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 TCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAG 2769

132116693 TGAAGGGGGAGGGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGT 132116752
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 TGAAGGGGGAGCGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGT 2829

132116753 CATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCC 132116812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 CATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCC 2889

132116813 TTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAAC 132116872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 TTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAAC 2949

132116873 TACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAA 132116932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 TACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAA 3009

132116933 GATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCT 132116992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 GATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCT 3069

132116993 TATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAA 132117052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 TATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAA 3129

132117053 AAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTAT 132117112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 AAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTAT 3189

132117113 TCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGA 132117172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 TCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGA 3249

132117173 AAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCT 132117232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 AAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCT 3309

132117233 AATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTG 132117292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 AATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTG 3369

132117293 GTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAG 132117352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3370 GTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAG 3429

132117353 GTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGAT 132117412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 GTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGAT 3489

132117413 CGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGA 132117472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 CGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGA 3549

132117473 ATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGG 132117532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3550 ATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGG 3609

132117533 CATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTG 132117592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3610 CATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTG 3669

132117593 TGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGG 132117652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3670 TGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGG 3729

132117653 GAGATAACGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATT 132117712
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3730 GAGATAATGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATT 3789

132117713 ATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTT 132117772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3790 ATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTT 3849

132117773 AAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTC 132117832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3850 AAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTC 3909

132117833 TGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCT 132117892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3910 TGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCT 3969

132117893 GTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAG 132117952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3970 GTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAG 4029

132117953 TGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCT 132118012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4030 TGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCT 4089

132118013 TTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGA 132118072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4090 TTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGA 4149

132118073 AAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGAC 132118132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4150 AAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGAC 4209

132118133 TGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGT 132118192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4210 TGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGT 4269

132118193 GCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGG 132118252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4270 GCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGG 4329

132118253 AAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGA 132118312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4330 AAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGA 4389

132118313 GAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAG 132118372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4390 GAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAG 4449

132118373 AGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTG 132118432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4450 AGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTG 4509

132118433 TCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGAT 132118492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4510 TCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGAT 4569

132118493 GAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAG 132118552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4570 GAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAG 4629

132118553 TTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAG 132118612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4630 TTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAG 4689

132118613 AACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCC 132118672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4690 AACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCC 4749

132118673 ACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAA 132118732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4750 ACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAA 4809

132118733 CAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTA 132118792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4810 CAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTA 4869

132118793 TTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACC 132118852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4870 TTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACC 4929

132118853 CAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAAT 132118912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4930 CAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAAT 4989

132118913 GTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAG 132118972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4990 GTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAG 5049

132118973 ACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAA 132119032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5050 ACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAA 5109

132119033 CTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAAT 132119092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5110 CTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAAT 5169

132119093 TCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAAC 132119152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5170 TCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAAC 5229

132119153 ATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCT 132119212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5230 ATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCT 5289

132119213 CAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAA 132119272
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5290 CAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGGTAGAAA 5349

132119273 GGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTC 132119332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5350 GGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTC 5409

132119333 CTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGG 132119392
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5410 CTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGG 5469

132119393 TACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGT 132119452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5470 TACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGT 5529

132119453 ACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATT 132119512
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5530 AC-TTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATT 5588

132119513 TAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAG 132119572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5589 TAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAG 5648

132119573 ATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAA 132119632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5649 ATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAA 5708

132119633 TACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCC 132119692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5709 TACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCC 5768

132119693 ATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTT 132119752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5769 ATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTT 5828

132119753 TAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCT 132119812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5829 TAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCT 5888

132119813 TTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAAT 132119872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5889 TTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAAT 5948

132119873 TCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGC 132119932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5949 TCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGC 6008

132119933 AAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATAT 132119992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6009 AAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATAT 6068

132119993 ACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTAT 132120052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6069 ACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTAT 6128

132120053 TTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACG 132120112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6129 TTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACG 6188

132120113 ACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTATA 132120172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6189 ACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTATA 6248

132120173 TTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATGGAAAATACATATTG 132120232
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     6249 TTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATTGAAAATACATATTG 6308

132120233 TAACTCCT 132120240
          ||||||||
     6309 TAACTCCT 6316

Alignment time is 6.0899 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3149] =>      3149 nucs 'mol-32-2fee-306611_3149'

Score:        3025
Aligned:      3148        nucs
Identic:      3136 (100%) nucs =>      1539 (100%)      1597 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112390,132113933] EXCISED REGION [132113934,132115537]
 second seq =>  [        1,     1544] EXCISED REGION [     1549,     3149]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1545,1548]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1545,1546] to [1549,1550]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132113933,132113933] to [132113934,132113934]
 second seq =>         1 nucs [1544,1544] to [1549,1549]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112390 ATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACA 132112449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACA 60

132112450 TGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAA 132112509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAA 120

132112510 ATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATT 132112569
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATT 180

132112570 GGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTG 132112629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTG 240

132112630 GAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTT 132112689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTT 300

132112690 ATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCGCTA 132112749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      301 ATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCACTA 360

132112750 ACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCT 132112809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCT 420

132112810 GTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGC 132112869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGC 480

132112870 AACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCT 132112929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCT 540

132112930 CTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCT 132112989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCT 600

132112990 TTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAAT 132113049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAAT 660

132113050 TAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAA 132113109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAA 720

132113110 GACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTC 132113169
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTC 780

132113170 ACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCT 132113229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCT 840

132113230 GTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAG 132113289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAG 900

132113290 CCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTG 132113349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTG 960

132113350 TAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTCTGC 132113409
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      961 TAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTACGTCTGC 1020

132113410 TGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCT 132113469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCT 1080

132113470 GAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGG 132113529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGG 1140

132113530 CAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGT 132113589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGT 1200

132113590 TTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTA 132113649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTA 1260

132113650 ATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTT 132113709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTT 1320

132113710 AACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAA 132113769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAA 1380

132113770 GTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAATAC 132113829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1381 GTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAATAC 1440

132113830 AGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTG 132113889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTG 1500

132113890 CAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 132113933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 1544

EXCISED REGION

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 1608

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 1668

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 1728

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 1788

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 1848

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 132114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 1908

132114294 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 132114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 1968

132114354 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 132114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 2028

132114414 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 132114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 2088

132114474 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 132114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 2148

132114534 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 132114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 2208

132114594 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTC 132114653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2209 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTC 2267

132114654 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGC 132114713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2268 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGC 2327

132114714 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 132114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2328 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 2387

132114774 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 132114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2388 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 2447

132114834 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 132114893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 2507

132114894 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 132114953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 2567

132114954 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 132115013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 2627

132115014 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTTT 132115073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2628 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTTT 2687

132115074 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 132115133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2688 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 2747

132115134 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 132115193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 2807

132115194 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 132115253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 2867

132115254 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 132115313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 2927

132115314 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 132115373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 2987

132115374 TGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGC 132115433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 TGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGC 3047

132115434 TGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCGAGGTGGGTGAATGAC 132115493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||  
     3048 TGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCAAGGTGGGTGAATG-- 3105

132115494 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGG 132115537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGG 3149

Alignment time is 3.76046 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3637] =>      3637 nucs 'mol-32-2ff9-279229_3637'

Score:        3614
Aligned:      3636        nucs
Identic:      3634 (100%) nucs =>       532 (100%)      3102 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132116172,132116703] EXCISED REGION [132116705,132119808]
 second seq =>  [        1,      532] EXCISED REGION [      534,     3637]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132116704,132116704]
 second seq =>         1 nucs [533,533]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [132116703,132116705] to [132116704,132116706]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132116703,132116703] to [132116705,132116705]
 second seq =>         1 nucs [532,532] to [534,534]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132116172 TCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCC 132116231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCC 60

132116232 ATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGA 132116291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGA 120

132116292 AAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCT 132116351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCT 180

132116352 AAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATA 132116411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATA 240

132116412 GTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTT 132116471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTT 300

132116472 TGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAAC 132116531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAAC 360

132116532 TACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGA 132116591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGA 420

132116592 TGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAA 132116651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAA 480

132116652 GGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 132116703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 532

EXCISED REGION

132116705 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 132116764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      534 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 593

132116765 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 132116824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      594 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 653

132116825 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 132116884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 713

132116885 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 132116944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 773

132116945 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 132117004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 833

132117005 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 132117064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 893

132117065 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 132117124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 953

132117125 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 132117184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 1013

132117185 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 132117244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 1073

132117245 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 132117304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 1133

132117305 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 132117364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 1193

132117365 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 132117424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 1253

132117425 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 132117484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 1313

132117485 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 132117544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 1373

132117545 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 132117604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 1433

132117605 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAACGTAG 132117664
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1434 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAATGTAG 1493

132117665 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 132117724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 1553

132117725 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 132117784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 1613

132117785 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 132117844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 1673

132117845 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 132117904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 1733

132117905 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 132117964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 1793

132117965 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 132118024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 1853

132118025 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 132118084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 1913

132118085 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 132118144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 1973

132118145 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 132118204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 2033

132118205 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 132118264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 2093

132118265 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 132118324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 2153

132118325 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 132118384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 2213

132118385 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 132118444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 2273

132118445 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 132118504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 2333

132118505 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 132118564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 2393

132118565 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 132118624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 2453

132118625 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 132118684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 2513

132118685 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 132118744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 2573

132118745 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 132118804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 2633

132118805 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 132118864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 2693

132118865 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 132118924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 2753

132118925 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 132118984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 2813

132118985 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 132119044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 2873

132119045 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 132119104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 2933

132119105 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 132119164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 2993

132119165 TATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTG 132119224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 TATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTG 3053

132119225 GCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATA 132119284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 GCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATA 3113

132119285 ATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGT 132119344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 ATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGT 3173

132119345 TCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGG 132119404
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 TCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGG 3233

132119405 GACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTT 132119464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 GACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTT 3293

132119465 TTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAA 132119524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 TTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAA 3353

132119525 AAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTA 132119584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 AAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTA 3413

132119585 AAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAA 132119644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 AAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAA 3473

132119645 CACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCT 132119704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 CACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCT 3533

132119705 GAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAG 132119764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 GAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAG 3593

132119765 GGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACAC 132119808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 GGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACAC 3637

Alignment time is 3.80767 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3403] =>      3403 nucs 'mol-32-2ff9-279598_3403'

Score:        3231
Aligned:      3387        nucs
Identic:      3372 (100%) nucs =>      1741 (100%)      1631 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112187,132113933] EXCISED REGION [132113934,132115573]
 second seq =>  [        1,     1747] EXCISED REGION [     1752,     3387]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1748,1751]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1748,1749] to [1752,1753]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132113933,132113933] to [132113934,132113934]
 second seq =>         1 nucs [1747,1747] to [1752,1752]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112187 TTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCC 132112246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCC 60

132112247 TCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTT 132112306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTT 120

132112307 CTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTT 132112366
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTT 180

132112367 ATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAG 132112426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAG 240

132112427 AATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCAT 132112486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCAT 300

132112487 TCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATT 132112546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      301 TCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATT 360

132112547 TTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTAT 132112606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTAT 420

132112607 TATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGC 132112666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGC 480

132112667 TTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCA 132112726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCA 540

132112727 AGATACGGGTGGGCGAAGCGCTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAG 132112786
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGATACGGGTGGGCGAAGCACTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAG 600

132112787 CTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTT 132112846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTT 660

132112847 GCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTC 132112906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTC 720

132112907 TTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAA 132112966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAA 780

132112967 GATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATG 132113026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATG 840

132113027 TAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAA 132113086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAA 900

132113087 TAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGG 132113146
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      901 TAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGG 960

132113147 GGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAA 132113206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAA 1020

132113207 GCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCA 132113266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCA 1080

132113267 CAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCG 132113326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCG 1140

132113327 GTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGT 132113386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGT 1200

132113387 CATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAG 132113446
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATGATCTTCCAGCTACGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAG 1260

132113447 CCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCT 132113506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCT 1320

132113507 CTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTC 132113566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTC 1380

132113567 TAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGAT 132113626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGAT 1440

132113627 GGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACA 132113686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACA 1500

132113687 TTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCT 132113746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCT 1560

132113747 CTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTC 132113806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTC 1620

132113807 TTTATCCCTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATA 132113866
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTATCCGTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATA 1680

132113867 TTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTT 132113926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTT 1740

132113927 AATTAAT 132113933
          |||||||
     1741 AATTAAT 1747

EXCISED REGION

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 1811

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 1871

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 1931

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 1991

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 2051

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 132114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 2111

132114294 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 132114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 2171

132114354 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 132114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 2231

132114414 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 132114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 2291

132114474 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 132114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 2351

132114534 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 132114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 2411

132114594 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTC 132114653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2412 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTC 2470

132114654 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGC 132114713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2471 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGC 2530

132114714 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 132114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 2590

132114774 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 132114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 2650

132114834 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 132114893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 2710

132114894 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 132114953
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCT-AAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 2769

132114954 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 132115013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 2829

132115014 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTTT 132115073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2830 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTTT 2889

132115074 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 132115133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 2949

132115134 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 132115193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 3009

132115194 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 132115253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 3069

132115254 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 132115313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 3129

132115314 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 132115373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 3189

132115374 TGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGC 132115433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 TGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGC 3249

132115434 TGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCGAGGTGGGTGAATGAC 132115493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||  
     3250 TGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCAAGGTGGGTGAATG-- 3307

132115494 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCCCACCTCTACAAT 132115553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3308 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCCGACCTCTACAAT 3367

132115554 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 132115573
          ||||||||||||||||||||
     3368 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 3387

Alignment time is 3.85679 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3433] =>      3433 nucs 'mol-32-303b-012112_3433'

Score:        3309
Aligned:      3430        nucs
Identic:      3419 (100%) nucs =>      1913 (100%)      1506 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112015,132113933] EXCISED REGION [132113934,132115443]
 second seq =>  [        1,     1919] EXCISED REGION [     1924,     3433]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1920,1923]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1920,1921] to [1924,1925]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132113933,132113933] to [132113934,132113934]
 second seq =>         1 nucs [1919,1919] to [1924,1924]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112015 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCC 132112074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCC 60

132112075 CTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGG 132112134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGG 120

132112135 CACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGT 132112194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGT 180

132112195 GTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAG 132112254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAG 240

132112255 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAA 132112314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAA 300

132112315 AAAGTATGAGAATCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATA 132112374
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGTATGAGAATCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATA 360

132112375 ATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTT 132112434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTT 420

132112435 GATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTA 132112494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTA 480

132112495 CATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGG 132112554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      481 CATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGG 540

132112555 CTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTG 132112614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTG 600

132112615 TAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAA 132112674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAA 660

132112675 CTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGG 132112734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGG 720

132112735 GTGGGCGAAGCGCTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACAT 132112794
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGGGCGAAGCACTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACAT 780

132112795 TTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCA 132112854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCA 840

132112855 GGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCT 132112914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCT 900

132112915 GAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCT 132112974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCT 960

132112975 CAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAA 132113034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAA 1020

132113035 GAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAA 132113094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAA 1080

132113095 TATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGG 132113154
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGG 1140

132113155 CCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTC 132113214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTC 1200

132113215 CGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAG 132113274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAG 1260

132113275 CATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGT 132113334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGT 1320

132113335 CATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCT 132113394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCT 1380

132113395 TCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAA 132113454
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCAGCTACGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAA 1440

132113455 ACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTC 132113514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTC 1500

132113515 AAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCT 132113574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCT 1560

132113575 GTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAA 132113634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAA 1620

132113635 GGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTT 132113694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTT 1680

132113695 TCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTC 132113754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTC 1740

132113755 CCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCC 132113814
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1741 CCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCG 1800

132113815 TATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATT 132113874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATT 1860

132113875 CAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 132113933
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 1919

EXCISED REGION

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 1983

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 2043

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 2103

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 2163

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 2223

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 132114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 2283

132114294 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 132114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 2343

132114354 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 132114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 2403

132114414 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 132114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 2463

132114474 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 132114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 2523

132114534 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 132114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 2583

132114594 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTC 132114653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2584 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTC 2642

132114654 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGC 132114713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2643 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGC 2702

132114714 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 132114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 2762

132114774 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 132114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 2822

132114834 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 132114893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 2882

132114894 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCT-AAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATAT 132114952
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATAT 2942

132114953 AAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTT 132115012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 AAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTT 3002

132115013 TTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTT 132115072
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3003 TTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTT 3062

132115073 TAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCA 132115132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 TAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCA 3122

132115133 CTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTAT 132115192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 CTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTAT 3182

132115193 CATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGT 132115252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 CATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGT 3242

132115253 AGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATC 132115312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 AGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATC 3302

132115313 TGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTC 132115372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 TGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTC 3362

132115373 CTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTG 132115432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 CTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTG 3422

132115433 CTGGGCATAGG 132115443
          |||||||||||
     3423 CTGGGCATAGG 3433

Alignment time is 3.98977 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     5467] =>      5467 nucs 'mol-32-303b-019135_5467'

Score:        5315
Aligned:      5466        nucs
Identic:      5449 (100%) nucs =>       130 ( 99%)      5319 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132113803,132113933] EXCISED REGION [132113934,132119263]
 second seq =>  [        1,      131] EXCISED REGION [      136,     5467]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [132,135]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>        11 nucs [132115542,132115552]
 second seq =>        15 nucs [1742,1756]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [132,133] to [136,137]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132113933,132113933] to [132113934,132113934]
 second seq =>         1 nucs [131,131] to [136,136]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132113803 TTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGA 132113862
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGA 60

132113863 TATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATA 132113922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATA 120

132113923 TGTTAATTAAT 132113933
          |||||||||||
      121 TGTTAATTAAT 131

EXCISED REGION

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      136 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 195

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      196 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 255

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      256 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 315

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      316 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 375

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      376 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 435

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 132114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 495

132114294 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 132114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      496 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 555

132114354 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 132114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      556 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 615

132114414 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 132114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 675

132114474 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 132114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 735

132114534 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 132114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 795

132114594 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTC 132114653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
      796 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTC 854

132114654 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGC 132114713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      855 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGC 914

132114714 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 132114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 974

132114774 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 132114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 1034

132114834 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 132114893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 1094

132114894 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCT-AAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATAT 132114952
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATAT 1154

132114953 AAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTT 132115012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 AAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTT 1214

132115013 TTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTT 132115072
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1215 TTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTT 1274

132115073 TAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCA 132115132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 TAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCA 1334

132115133 CTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTAT 132115192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 CTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTAT 1394

132115193 CATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGT 132115252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 CATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGT 1454

132115253 AGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATC 132115312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 AGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATC 1514

132115313 TGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTC 132115372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 TGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTC 1574

132115373 CTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTG 132115432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 CTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTG 1634

132115433 CTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCGAGGTGGGTGAATGA 132115492
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||| 
     1635 CTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCAAGGTGGGTGAATG- 1693

132115493 CACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCCCACCTCTACAA 132115552
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1694 -ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCCGACCTCTACAA 1752

132115553 ----TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCC 132115608
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCC 1812

132115609 CAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGC 132115668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 CAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGC 1872

132115669 CATGATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAAC 132115728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 CATGATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAAC 1932

132115729 ACAAATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATT 132115788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 ACAAATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATT 1992

132115789 TCTGCACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCT 132115848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 TCTGCACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCT 2052

132115849 CTCTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAG 132115908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 CTCTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAG 2112

132115909 TGCAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGT 132115968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 TGCAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGT 2172

132115969 ACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTT 132116028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2173 ACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACTATGCCCAGCTAATTTTT 2232

132116029 TTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGG 132116088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 TTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGG 2292

132116089 GCTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACC 132116148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 GCTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACC 2352

132116149 ACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGA 132116208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 ACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGA 2412

132116209 CTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTAT 132116268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 CTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTAT 2472

132116269 ACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTAC 132116328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 ACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTAC 2532

132116329 TTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAG 132116388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 TTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAG 2592

132116389 AATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTC 132116448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 AATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTC 2652

132116449 TGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCC 132116508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 TGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCC 2712

132116509 ATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTT 132116568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 ATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTT 2772

132116569 AATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTT 132116628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 AATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTT 2832

132116629 ACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAG 132116688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 ACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAG 2892

132116689 AGAGTGAAGGGGGAGGGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCA 132116748
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 AGAGTGAAGGGGGAGCGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCA 2952

132116749 CTGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGG 132116808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 CTGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGG 3012

132116809 TCCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCC 132116868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 TCCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCC 3072

132116869 AAACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTT 132116928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 AAACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTT 3132

132116929 TAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGA 132116988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 TAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGA 3192

132116989 TTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTT 132117048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 TTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTT 3252

132117049 TTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGT 132117108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3253 TTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGT 3312

132117109 CTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAA 132117168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 CTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAA 3372

132117169 TGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAA 132117228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 TGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAA 3432

132117229 TCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTT 132117288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 TCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTT 3492

132117289 TTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTC 132117348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 TTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTC 3552

132117349 CTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCA 132117408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3553 CTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCA 3612

132117409 TGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTG 132117468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 TGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTG 3672

132117469 GTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCA 132117528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3673 GTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCA 3732

132117529 GGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTT 132117588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 GGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTT 3792

132117589 CCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGG 132117648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 CCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGG 3852

132117649 GAGGGAGATAACGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAAT 132117708
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 GAGGGAGATAATGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAAT 3912

132117709 TATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGC 132117768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3913 TATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGC 3972

132117769 TGTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTAC 132117828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3973 TGTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTAC 4032

132117829 GGTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGA 132117888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4033 GGTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGA 4092

132117889 TGCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGT 132117948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4093 TGCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGT 4152

132117949 GGAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGAT 132118008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4153 GGAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGAT 4212

132118009 GCCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGG 132118068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4213 GCCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGG 4272

132118069 TAGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGG 132118128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4273 TAGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGG 4332

132118129 AGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAG 132118188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4333 AGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAG 4392

132118189 CTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTG 132118248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4393 CTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTG 4452

132118249 TAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAG 132118308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4453 TAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAG 4512

132118309 TTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCC 132118368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4513 TTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCC 4572

132118369 AGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGA 132118428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4573 AGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGA 4632

132118429 GGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCT 132118488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4633 GGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCT 4692

132118489 TGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGG 132118548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4693 TGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGG 4752

132118549 AAAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAAT 132118608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4753 AAAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAAT 4812

132118609 GAAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCT 132118668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4813 GAAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCT 4872

132118669 GTCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAG 132118728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4873 GTCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAG 4932

132118729 AAAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAA 132118788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4933 AAAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAA 4992

132118789 AGTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCT 132118848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4993 AGTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCT 5052

132118849 TACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAG 132118908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5053 TACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAG 5112

132118909 AAATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGA 132118968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5113 AAATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGA 5172

132118969 ACAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAG 132119028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5173 ACAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAG 5232

132119029 GAAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTG 132119088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5233 GAAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTG 5292

132119089 AAATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAA 132119148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5293 AAATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAA 5352

132119149 CAACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTC 132119208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5353 CAACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTC 5412

132119209 AGCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAA 132119263
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5413 AGCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAA 5467

Alignment time is 5.38634 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2661] =>      2661 nucs 'mol-32-3046-096373_2661'

Score:        2565
Aligned:      2659        nucs
Identic:      2648 (100%) nucs =>      2198 (100%)       450 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112025,132114228] EXCISED REGION [132118551,132119001]
 second seq =>  [        1,     2208] EXCISED REGION [     2211,     2661]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4322 nucs [132114229,132118550]
 second seq =>         2 nucs [2209,2210]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2208,2209] to [2210,2211]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112025 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCG 132112084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCG 60

132112085 GTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCAC 132112144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCAC 120

132112145 CATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGG 132112204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGG 180

132112205 AAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATT 132112264
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGGTCTCAATCTTCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATT 240

132112265 ACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAG 132112324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAG 300

132112325 AATCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAA 132112384
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAA 360

132112385 TCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGAT 132112444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGAT 420

132112445 CTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTC 132112504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTC 480

132112505 TTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTC 132112564
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTC 540

132112565 CCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTC 132112624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTC 600

132112625 TCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTA 132112684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTA 660

132112685 ATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAG 132112744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAG 720

132112745 CGCTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTC 132112804
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTC 780

132112805 TCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAA 132112864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAA 840

132112865 GAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTAT 132112924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTAT 900

132112925 CTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCAC 132112984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCAC 960

132112985 TTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACT 132113044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACT 1020

132113045 AAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAAC 132113104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAAC 1080

132113105 CCAAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATC 132113164
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCAAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATC 1140

132113165 AGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCC 132113224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCC 1200

132113225 TTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCC 132113284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCC 1260

132113285 CTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTT 132113344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTT 1320

132113345 AACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATG 132113404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATG 1380

132113405 TCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCC 132113464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCC 1440

132113465 CAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCA 132113524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCA 1500

132113525 TGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAA 132113584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAA 1560

132113585 TAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGC 132113644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGC 1620

132113645 TCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAG 132113704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAG 1680

132113705 CTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGC 132113764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGC 1740

132113765 TAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCT 132113824
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1741 TAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCT 1800

132113825 AATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAAC 132113884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAAC 1860

132113885 ATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTA----TATTA 132113940
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
     1861 ATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTAAATATATTA 1920

132113941 ATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTAT 132114000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTAT 1980

132114001 TTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGT 132114060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGT 2040

132114061 CACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTT 132114120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTT 2100

132114121 TCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCA 132114180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCA 2160

132114181 GCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 132114228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 2208

EXCISED REGION

132118551 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 132118610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 2270

132118611 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 132118670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 2330

132118671 CCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 132118730
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 CCACCTCCTGCCAATAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 2390

132118731 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 132118790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 2450

132118791 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 132118850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 2510

132118851 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 132118910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 2570

132118911 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 132118970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 2630

132118971 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGT 132119001
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGT 2661

Alignment time is 2.27428 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2771] =>      2771 nucs 'mol-32-3046-155089_2771'

Score:        2748
Aligned:      2770        nucs
Identic:      2768 (100%) nucs =>       448 (100%)      2320 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132116256,132116703] EXCISED REGION [132116705,132119026]
 second seq =>  [        1,      448] EXCISED REGION [      450,     2771]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132116704,132116704]
 second seq =>         1 nucs [449,449]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [132116703,132116705] to [132116704,132116706]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132116703,132116703] to [132116705,132116705]
 second seq =>         1 nucs [448,448] to [450,450]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132116256 TCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTT 132116315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTT 60

132116316 ATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTC 132116375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTC 120

132116376 CTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTC 132116435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTC 180

132116436 TGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTG 132116495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTG 240

132116496 GGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGA 132116555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGA 300

132116556 AGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGG 132116615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGG 360

132116616 CCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACAT 132116675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACAT 420

132116676 GGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 132116703
          ||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 448

EXCISED REGION

132116705 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 132116764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      450 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 509

132116765 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 132116824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      510 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 569

132116825 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 132116884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      570 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 629

132116885 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 132116944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      630 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 689

132116945 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 132117004
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      690 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCACGATTCTTATCTTTTTACC 749

132117005 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 132117064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 809

132117065 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 132117124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 869

132117125 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 132117184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 929

132117185 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 132117244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 989

132117245 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 132117304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 1049

132117305 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 132117364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 1109

132117365 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 132117424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 1169

132117425 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 132117484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 1229

132117485 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 132117544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 1289

132117545 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 132117604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 1349

132117605 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAACGTAG 132117664
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1350 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAATGTAG 1409

132117665 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 132117724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 1469

132117725 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 132117784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 1529

132117785 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 132117844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 1589

132117845 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 132117904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 1649

132117905 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 132117964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 1709

132117965 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 132118024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 1769

132118025 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 132118084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 1829

132118085 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 132118144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 1889

132118145 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 132118204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 1949

132118205 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 132118264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 2009

132118265 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 132118324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 2069

132118325 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 132118384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 2129

132118385 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 132118444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 2189

132118445 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 132118504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 2249

132118505 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 132118564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 2309

132118565 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 132118624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 2369

132118625 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 132118684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 2429

132118685 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 132118744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 2489

132118745 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 132118804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 2549

132118805 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 132118864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 2609

132118865 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 132118924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 2669

132118925 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 132118984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 2729

132118985 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAG 132119026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAG 2771

Alignment time is 2.30374 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4114] =>      4114 nucs 'mol-32-3143-170257_4114'

Score:        3903
Aligned:      4112        nucs
Identic:      4075 ( 99%) nucs =>      2569 ( 99%)      1506 (100%)
Gaps:           25 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132111653,132114228] EXCISED REGION [132118551,132120061]
 second seq =>  [        1,     2601] EXCISED REGION [     2604,     4114]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4322 nucs [132114229,132118550]
 second seq =>         2 nucs [2602,2603]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2601,2602] to [2603,2604]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132111653 TGGACACATATATGTACACATACACATATATGGACACATATATGTACACATACACATATA 132111712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGACACATATATGTACACATACACATATATGGACACATATATGTACACATACACATATA 60

132111713 TGGACACACATATATGTACATGTACACATATATATGTACATGTACATATATATGTGTACA 132111772
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGACACACATATATGTACATGTACACATATATGTGTACATGTACATATATATGTGTACA 120

132111773 TGTACACATATATGT--------------------ATTTATACGTATATATATTTTTTTG 132111812
          |||||||||||||||                    |||||||||||||||||||||||||
      121 TGTACACATATATGTGTACATGTACACATATATGTATTTATACGTATATATATTTTTTTG 180

132111813 CCTTGATTTTCTAAATCGATTTACTAAAAGAGTTAATTTTTAATGTTCATTTTTTTCCTA 132111872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCTTGATTTTCTAAATCGATTTACTAAAAGAGTTAATTTTTAATGTTCATTTTTTTCCTA 240

132111873 GTCAGGAAATACATTACCAATAGTAAACAAAGTTATTGAAACATTTTTCAATCTTCAAAT 132111932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCAGGAAATACATTACCAATAGTAAACAAAGTTATTGAAACATTTTTCAATCTTCAAAT 300

132111933 TTCATTTTAATTTGAATATATTTTAATAAAATTATTGCAGTTTAAACACTTCGTTTCTTT 132111992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCATTTTAATTTGAATATATTTTAATAAAATTATTGCAGTTTAAACACTTCGTTTCTTT 360

132111993 TTTTTTTTTTTTTTTT-GAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 132112051
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 420

132112052 ACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCC 132112111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCC 480

132112112 TCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTT 132112171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTT 540

132112172 TAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGAT 132112231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      541 TAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTTGTGAT 600

132112232 CCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTG 132112291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTG 660

132112292 CAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTT 132112351
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      661 CAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAATATGGGAGATTTCTTT 720

132112352 ATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTG 132112411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTG 780

132112412 ATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACG 132112471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACG 840

132112472 TAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGA 132112531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGA 900

132112532 GACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAAT 132112591
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAAT 960

132112592 ATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATC 132112651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATC 1020

132112652 CTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTA 132112711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTA 1080

132112712 GAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCGCTAACTTAATCACCTCATTCATTCA 132112771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCACTAACTTAATCACCTCATTCATTCA 1140

132112772 GTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAG 132112831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAG 1200

132112832 TGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATC 132112891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATC 1260

132112892 TGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCT 132112951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCT 1320

132112952 TGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCC 132113011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCC 1380

132113012 AGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGG 132113071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGG 1440

132113072 ACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAG 132113131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1441 ACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAG 1500

132113132 AGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTC 132113191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTC 1560

132113192 CGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCT 132113251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCT 1620

132113252 GACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGC 132113311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGC 1680

132113312 ACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGC 132113371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGC 1740

132113372 GCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGA 132113431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGA 1800

132113432 AAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTT 132113491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTT 1860

132113492 CTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTG 132113551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTG 1920

132113552 TGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATA 132113611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATA 1980

132113612 GGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCG 132113671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCG 2040

132113672 ACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAAC 132113731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAAC 2100

132113732 TATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCAC 132113791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCAC 2160

132113792 TCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTT 132113851
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTT 2220

132113852 CAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTA 132113911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTA 2280

132113912 TGGTAATGATATGTTAATTAATTA----TATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTC 132113967
          ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TGGTAATGATATGTTAATTAATTAAATATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTC 2340

132113968 TGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCC 132114027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCC 2400

132114028 AGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATA 132114087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATA 2460

132114088 ATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCC 132114147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCC 2520

132114148 TACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTG 132114207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTG 2580

132114208 TGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 132114228
          |||||||||||||||||||||
     2581 TGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 2601

EXCISED REGION

132118551 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 132118610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2604 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 2663

132118611 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 132118670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 2723

132118671 CCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 132118730
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 CCACCTCCTGCCAATAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 2783

132118731 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 132118790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 2843

132118791 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 132118850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 2903

132118851 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 132118910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 2963

132118911 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 132118970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 3023

132118971 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 132119030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 3083

132119031 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 132119090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 3143

132119091 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 132119150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 3203

132119151 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 132119210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 3263

132119211 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 132119270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 3323

132119271 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 132119330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 3383

132119331 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 132119390
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3384 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 3443

132119391 GGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 132119450
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 GGTACACCTTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 3503

132119451 GTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATA 132119510
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3504 GTACATTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGATTCATTTGTCAATA 3563

132119511 TTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTC 132119570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 TTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTC 3623

132119571 AGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAAC 132119630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 AGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAAC 3683

132119631 AATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGG 132119690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 AATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGG 3743

132119691 CCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCT 132119750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 CCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCT 3803

132119751 TTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTG 132119810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3804 TTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTG 3863

132119811 CTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGA 132119870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 CTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGA 3923

132119871 ATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCAT 132119930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 ATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCAT 3983

132119931 GCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATAT 132119990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 GCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATAT 4043

132119991 ATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATT 132120050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 ATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATT 4103

132120051 ATTTAAAGCTA 132120061
          |||||||||||
     4104 ATTTAAAGCTA 4114

Alignment time is 3.44144 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2913] =>      2913 nucs 'mol-32-3143-200619_2913'

Score:        2795
Aligned:      2911        nucs
Identic:      2898 (100%) nucs =>      2010 (100%)       888 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112213,132114228] EXCISED REGION [132118551,132119441]
 second seq =>  [        1,     2020] EXCISED REGION [     2023,     2913]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4322 nucs [132114229,132118550]
 second seq =>         2 nucs [2021,2022]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2020,2021] to [2022,2023]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112213 AATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCAT 132112272
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATCTTCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCAT 60

132112273 GAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAA 132112332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAA 120

132112333 TAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATA 132112392
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATA 180

132112393 TTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGG 132112452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGG 240

132112453 AAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATG 132112512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATG 300

132112513 ATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGA 132112572
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGA 360

132112573 ATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAA 132112632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAA 420

132112633 CCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATT 132112692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATT 480

132112693 TATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCGCTAACT 132112752
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      481 TATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCACTAACT 540

132112753 TAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTC 132112812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTC 600

132112813 CAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAAC 132112872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAAC 660

132112873 ACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTC 132112932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTC 720

132112933 TTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTA 132112992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTA 780

132112993 GGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAG 132113052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAG 840

132113053 ATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGAC 132113112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGAC 900

132113113 AGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACT 132113172
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACT 960

132113173 TCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTG 132113232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTG 1020

132113233 TATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCC 132113292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCC 1080

132113293 CTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAA 132113352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAA 1140

132113353 AAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGC 132113412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGC 1200

132113413 AGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAG 132113472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAG 1260

132113473 TCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAG 132113532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAG 1320

132113533 TGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTT 132113592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTT 1380

132113593 CCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATT 132113652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATT 1440

132113653 TGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAAC 132113712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAAC 1500

132113713 ACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTT 132113772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTT 1560

132113773 TCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAATACAGT 132113832
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1561 TCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAATACAGT 1620

132113833 CCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAA 132113892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAA 1680

132113893 TTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTA----TATTAATATGGTA 132113948
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||
     1681 TTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTAAATATATTAATATGGTA 1740

132113949 ATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTTTCTTCA 132114008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTTTCTTCA 1800

132114009 TCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCACCAGCT 132114068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCACCAGCT 1860

132114069 GCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTCAACCAA 132114128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTCAACCAA 1920

132114129 CTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACC 132114188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACC 1980

132114189 TGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 132114228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 2020

EXCISED REGION

132118551 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 132118610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 2082

132118611 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 132118670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 2142

132118671 CCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 132118730
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 CCACCTCCTGCCAATAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 2202

132118731 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 132118790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 2262

132118791 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 132118850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 2322

132118851 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 132118910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 2382

132118911 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 132118970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 2442

132118971 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 132119030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 2502

132119031 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 132119090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 2562

132119091 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 132119150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 2622

132119151 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 132119210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 2682

132119211 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 132119270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 2742

132119271 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 132119330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 2802

132119331 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 132119390
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2803 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 2862

132119391 GGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCA 132119441
          ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 GGTACACCTTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCA 2913

Alignment time is 2.44182 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     6085] =>      6085 nucs 'mol-32-3159-099249_6085'

Score:        5904
Aligned:      6073        nucs
Identic:      6056 (100%) nucs =>      1380 ( 99%)      4676 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132114155,132115541] EXCISED REGION [132115553,132120235]
 second seq =>  [        1,     1385] EXCISED REGION [     1402,     6085]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        11 nucs [132115542,132115552]
 second seq =>        16 nucs [1386,1401]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         5 nucs [1397,1401]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132114155 ATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGT 132114214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
        1 ATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGT 60

132114215 GTGAGATGGAGTCTCACTCTCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTG 132114274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGAGATGGAGTCTCACTCTCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTG 120

132114275 TAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGAT 132114334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGAT 180

132114335 TAAACGCGCCTGCCACTACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCA 132114394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAACGCGCCTGCCACTACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCA 240

132114395 CCATGTCGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCA 132114454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCATGTCGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCA 300

132114455 AAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGT 132114514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGT 360

132114515 CTCCACTTCTGTTTTAGGGTTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCC 132114574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCCACTTCTGTTTTAGGGTTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCC 420

132114575 ATTTGTTTGTCCATCTAATATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCT 132114634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTGTTTGTCCATCTAATATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCT 480

132114635 TTTAAAAAAAAACCAGGTCTGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAG 132114694
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTAAAAAAAA-CCAGGTCTGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAG 539

132114695 GCCAAGGCAGGAGGATTGCTTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAA 132114754
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GCCAAGGCTGGAGGATTGCTTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAA 599

132114755 AATTAAAAAATTAGCCAGGTGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCT 132114814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 AATTAAAAAATTAGCCAGGTGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCT 659

132114815 AGGGTGGGAGCATCACCTGAGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACC 132114874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 AGGGTGGGAGCATCACCTGAGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACC 719

132114875 ACTGCACTCAAGAGTCTGGGTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAA 132114934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 ACTGCACTCAAGAGTCTGGGTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAA 779

132114935 AA-TCAAGAAAGTGAATATAAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCC 132114993
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 AAATCAAGAAAGTGAATATAAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCC 839

132114994 TGTTTGCAATAATTCATTTTTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATAT 132115053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TGTTTGCAATAATTCATTTTTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATAT 899

132115054 ACACAAAATGTTTTGATTTTAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCAT 132115113
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 ACACCAAATGTTTTGATTTTAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCAT 959

132115114 TCAATATTCCAGTTTCTCACTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTAC 132115173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TCAATATTCCAGTTTCTCACTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTAC 1019

132115174 TCTTGTTCTTTGACATTATCATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCA 132115233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TCTTGTTCTTTGACATTATCATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCA 1079

132115234 TGTCTTAACCTCATTCAGTAGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAA 132115293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TGTCTTAACCTCATTCAGTAGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAA 1139

132115294 GTCCCAAATCTGTAGGATCTGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAA 132115353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GTCCCAAATCTGTAGGATCTGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAA 1199

132115354 TTTGTGACTTCTTTTTTTCCTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTT 132115413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTTGTGACTTCTTTTTTTCCTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTT 1259

132115414 TTCAAAGAAACATCTTTTGCTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACA 132115473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TTCAAAGAAACATCTTTTGCTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACA 1319

132115474 GGCCGAGGTGGGTGAATGACACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAG 132115533
          ||||.|||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GGCCAAGGTGGGTGAATGAC--TTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAG 1377

132115534 TGGGACCC 132115541
          ||||||||
     1378 TGGGACCC 1385

EXCISED REGION

132115553 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCAGC 132115612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1402 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCAGC 1461

132115613 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATG 132115672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1462 TACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATG 1521

132115673 ATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACACAA 132115732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1522 ATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACACAA 1581

132115733 ATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTCTG 132115792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1582 ATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTCTG 1641

132115793 CACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCTCT 132115852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1642 CACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCTCT 1701

132115853 CTCC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTG 132115910
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 CTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTG 1761

132115911 CAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTAC 132115970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 CAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTAC 1821

132115971 CTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTT 132116030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1822 CTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACTATGCCCAGCTAATTTTTTT 1881

132116031 GTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGC 132116090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 GTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGC 1941

132116091 TCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCAC 132116150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 TCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCAC 2001

132116151 ACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACT 132116210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 ACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACT 2061

132116211 TTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATAC 132116270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 TTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATAC 2121

132116271 TTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTT 132116330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 TTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTT 2181

132116331 TTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAA 132116390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 TTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAA 2241

132116391 TCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTG 132116450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 TCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTG 2301

132116451 AATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCAT 132116510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 AATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCAT 2361

132116511 TCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAA 132116570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 TCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAA 2421

132116571 TTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTAC 132116630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 TTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTAC 2481

132116631 AATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAG 132116690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 AATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAG 2541

132116691 AGTGAAGGGGGAGGGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACT 132116750
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 AGTGAAGGGGGAGCGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACT 2601

132116751 GTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTC 132116810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 GTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTC 2661

132116811 CCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAA 132116870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 CCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAA 2721

132116871 ACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTA 132116930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 ACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTA 2781

132116931 AAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATT 132116990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 AAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATT 2841

132116991 CTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTT 132117050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 CTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTT 2901

132117051 AAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCT 132117110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 AAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCT 2961

132117111 ATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATG 132117170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 ATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATG 3021

132117171 GAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATC 132117230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 GAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATC 3081

132117231 CTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTT 132117290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 CTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTT 3141

132117291 TGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCT 132117350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 TGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCT 3201

132117351 AGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATG 132117410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 AGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATG 3261

132117411 ATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGT 132117470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 ATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGT 3321

132117471 GAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGG 132117530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 GAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGG 3381

132117531 GGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCC 132117590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 GGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCC 3441

132117591 TGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGA 132117650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 TGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGA 3501

132117651 GGGAGATAACGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTA 132117710
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 GGGAGATAATGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTA 3561

132117711 TTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTG 132117770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 TTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTG 3621

132117771 TTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGG 132117830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 TTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGG 3681

132117831 TCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATG 132117890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 TCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATG 3741

132117891 CTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGG 132117950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 CTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGG 3801

132117951 AGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGC 132118010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 AGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGC 3861

132118011 CTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTA 132118070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 CTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTA 3921

132118071 GAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAG 132118130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 GAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAG 3981

132118131 ACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCT 132118190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 ACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCT 4041

132118191 GTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTA 132118250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 GTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTA 4101

132118251 GGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTT 132118310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 GGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTT 4161

132118311 GAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAG 132118370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 GAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAG 4221

132118371 AGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGG 132118430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 AGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGG 4281

132118431 TGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTG 132118490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 TGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTG 4341

132118491 ATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAA 132118550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 ATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAA 4401

132118551 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 132118610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 4461

132118611 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 132118670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 4521

132118671 CCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 132118730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 CCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 4581

132118731 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 132118790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 4641

132118791 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 132118850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 4701

132118851 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 132118910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 4761

132118911 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 132118970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 4821

132118971 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 132119030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 4881

132119031 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 132119090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 4941

132119091 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 132119150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 5001

132119151 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 132119210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 5061

132119211 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 132119270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5062 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 5121

132119271 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 132119330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5122 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 5181

132119331 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 132119390
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     5182 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 5241

132119391 GGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 132119450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5242 GGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 5301

132119451 GTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATA 132119510
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5302 GTAC-TTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATA 5360

132119511 TTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTC 132119570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5361 TTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTC 5420

132119571 AGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAAC 132119630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5421 AGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAAC 5480

132119631 AATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGG 132119690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5481 AATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGG 5540

132119691 CCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCT 132119750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5541 CCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCT 5600

132119751 TTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTG 132119810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5601 TTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTG 5660

132119811 CTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGA 132119870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5661 CTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGA 5720

132119871 ATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCAT 132119930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5721 ATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCAT 5780

132119931 GCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATAT 132119990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5781 GCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATAT 5840

132119991 ATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATT 132120050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5841 ATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATT 5900

132120051 ATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATA 132120110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5901 ATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATA 5960

132120111 CGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTA 132120170
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5961 CGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGAAGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCTA 6020

132120171 TATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATGGAAAATACATAT 132120230
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6021 TATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATTGAAAATACATAT 6080

132120231 TGTAA 132120235
          |||||
     6081 TGTAA 6085

Alignment time is 5.58276 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2504] =>      2504 nucs 'mol-32-317a-181443_2504'

Score:        2408
Aligned:      2502        nucs
Identic:      2491 (100%) nucs =>      2198 (100%)       293 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112025,132114228] EXCISED REGION [132118551,132118844]
 second seq =>  [        1,     2208] EXCISED REGION [     2211,     2504]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4322 nucs [132114229,132118550]
 second seq =>         2 nucs [2209,2210]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2208,2209] to [2210,2211]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112025 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCG 132112084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCG 60

132112085 GTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCAC 132112144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCAC 120

132112145 CATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGG 132112204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGG 180

132112205 AAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATT 132112264
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGGTCTCAATCTTCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATT 240

132112265 ACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAG 132112324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAG 300

132112325 AATCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAA 132112384
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAA 360

132112385 TCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGAT 132112444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGAT 420

132112445 CTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTC 132112504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTC 480

132112505 TTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTC 132112564
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTC 540

132112565 CCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTC 132112624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTC 600

132112625 TCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTA 132112684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTA 660

132112685 ATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAG 132112744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAG 720

132112745 CGCTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTC 132112804
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTC 780

132112805 TCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAA 132112864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAA 840

132112865 GAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTAT 132112924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTAT 900

132112925 CTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCAC 132112984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCAC 960

132112985 TTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACT 132113044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACT 1020

132113045 AAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAAC 132113104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAAC 1080

132113105 CCAAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATC 132113164
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCAAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATC 1140

132113165 AGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCC 132113224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCC 1200

132113225 TTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCC 132113284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCC 1260

132113285 CTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTT 132113344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTT 1320

132113345 AACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATG 132113404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATG 1380

132113405 TCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCC 132113464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCC 1440

132113465 CAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCA 132113524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCA 1500

132113525 TGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAA 132113584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAA 1560

132113585 TAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGC 132113644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGC 1620

132113645 TCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAG 132113704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAG 1680

132113705 CTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGC 132113764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGC 1740

132113765 TAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCT 132113824
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1741 TAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCT 1800

132113825 AATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAAC 132113884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAAC 1860

132113885 ATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTA----TATTA 132113940
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||
     1861 ATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTAAATATATTA 1920

132113941 ATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTAT 132114000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTAT 1980

132114001 TTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGT 132114060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGT 2040

132114061 CACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTT 132114120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTT 2100

132114121 TCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCA 132114180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCA 2160

132114181 GCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 132114228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 2208

EXCISED REGION

132118551 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 132118610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 2270

132118611 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 132118670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 2330

132118671 CCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 132118730
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 CCACCTCCTGCCAATAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 2390

132118731 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 132118790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 2450

132118791 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCC 132118844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCC 2504

Alignment time is 2.75661 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2878] =>      2878 nucs 'mol-32-3190-130958_2878'

Score:        2776
Aligned:      2875        nucs
Identic:      2866 (100%) nucs =>      1901 (100%)       965 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112027,132113933] EXCISED REGION [132113934,132114901]
 second seq =>  [        1,     1907] EXCISED REGION [     1912,     2878]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1908,1911]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1908,1909] to [1912,1913]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132113933,132113933] to [132113934,132113934]
 second seq =>         1 nucs [1907,1907] to [1912,1912]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112027 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGT 132112086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGT 60

132112087 TTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCA 132112146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCA 120

132112147 TGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAA 132112206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAA 180

132112207 GGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTAC 132112266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTAC 240

132112267 AGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAA 132112326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAA 300

132112327 TCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATC 132112386
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATC 360

132112387 TTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCT 132112446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCT 420

132112447 ACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTT 132112506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTT 480

132112507 AAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCC 132112566
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCC 540

132112567 ATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTC 132112626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTC 600

132112627 CTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAAT 132112686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAAT 660

132112687 CTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCG 132112746
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      661 CTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCA 720

132112747 CTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTC 132112806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTC 780

132112807 TCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGA 132112866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGA 840

132112867 AGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCT 132112926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCT 900

132112927 TCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTT 132112986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTT 960

132112987 TCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAA 132113046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAA 1020

132113047 AATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCC 132113106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCC 1080

132113107 AAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAG 132113166
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAG 1140

132113167 GTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTT 132113226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTT 1200

132113227 TCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCT 132113286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCT 1260

132113287 AAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAA 132113346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAA 1320

132113347 CTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTC 132113406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1321 CTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTACGTC 1380

132113407 TGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCA 132113466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCA 1440

132113467 GCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATG 132113526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATG 1500

132113527 GGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATA 132113586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATA 1560

132113587 GGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTC 132113646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTC 1620

132113647 TTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCT 132113706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCT 1680

132113707 GTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTA 132113766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTA 1740

132113767 GAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAA 132113826
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1741 GAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAA 1800

132113827 TACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACAT 132113886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACAT 1860

132113887 TTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 132113933
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 1907

EXCISED REGION

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 1971

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 2031

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 2091

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 2151

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 2211

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 132114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 2271

132114294 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 132114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 2331

132114354 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 132114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 2391

132114414 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 132114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 2451

132114474 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 132114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 2511

132114534 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 132114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 2571

132114594 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTC 132114653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2572 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTC 2630

132114654 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGC 132114713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2631 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGC 2690

132114714 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 132114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 2750

132114774 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 132114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 2810

132114834 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 132114893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 2870

132114894 GTGACAAC 132114901
          ||||||||
     2871 GTGACAAC 2878

Alignment time is 3.23559 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2939] =>      2939 nucs 'mol-32-3190-131632_2939'

Score:        2916
Aligned:      2938        nucs
Identic:      2936 (100%) nucs =>       340 (100%)      2596 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132116364,132116703] EXCISED REGION [132116705,132119302]
 second seq =>  [        1,      340] EXCISED REGION [      342,     2939]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132116704,132116704]
 second seq =>         1 nucs [341,341]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [132116703,132116705] to [132116704,132116706]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132116703,132116703] to [132116705,132116705]
 second seq =>         1 nucs [340,340] to [342,342]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132116364 GGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGG 132116423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGG 60

132116424 GGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAG 132116483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAG 120

132116484 ACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTA 132116543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTA 180

132116544 GATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGC 132116603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGC 240

132116604 ATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCA 132116663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCA 300

132116664 CCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 132116703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAG 340

EXCISED REGION

132116705 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 132116764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      342 GGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGC 401

132116765 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 132116824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      402 AAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACT 461

132116825 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 132116884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      462 AGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGG 521

132116885 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 132116944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      522 TAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCA 581

132116945 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 132117004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      582 TTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACC 641

132117005 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 132117064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      642 CTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTT 701

132117065 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 132117124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      702 TCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCAT 761

132117125 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 132117184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      762 TTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTC 821

132117185 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 132117244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 CATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATG 881

132117245 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 132117304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 CTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTC 941

132117305 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 132117364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 TCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAG 1001

132117365 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 132117424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 GAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCA 1061

132117425 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 132117484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 GCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAAT 1121

132117485 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 132117544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 TGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTA 1181

132117545 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 132117604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 AAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTT 1241

132117605 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAACGTAG 132117664
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1242 GATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAATGTAG 1301

132117665 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 132117724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 GGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTT 1361

132117725 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 132117784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 CTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAAT 1421

132117785 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 132117844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 TATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGA 1481

132117845 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 132117904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 ATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTC 1541

132117905 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 132117964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 TCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGA 1601

132117965 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 132118024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 GTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGT 1661

132118025 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 132118084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 AAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTA 1721

132118085 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 132118144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 CAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAAT 1781

132118145 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 132118204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 GTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTA 1841

132118205 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 132118264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 AGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATC 1901

132118265 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 132118324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 CAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAG 1961

132118325 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 132118384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 TAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAA 2021

132118385 AGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 132118444
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 ATAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTA 2081

132118445 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 132118504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 CCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAA 2141

132118505 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 132118564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 ACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACC 2201

132118565 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 132118624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 ATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGA 2261

132118625 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 132118684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 AGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAG 2321

132118685 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 132118744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 TAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGA 2381

132118745 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 132118804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 ACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATAT 2441

132118805 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 132118864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 GATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAA 2501

132118865 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 132118924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 GGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTT 2561

132118925 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 132118984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 GTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCA 2621

132118985 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 132119044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 CAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 2681

132119045 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 132119104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 ACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACAT 2741

132119105 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 132119164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 TTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATA 2801

132119165 TATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTG 132119224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 TATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTG 2861

132119225 GCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATA 132119284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 GCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATA 2921

132119285 ATGTGATTTAGTATTTAT 132119302
          ||||||||||||||||||
     2922 ATGTGATTTAGTATTTAT 2939

Alignment time is 3.39088 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2792] =>      2792 nucs 'mol-32-3235-184741_2792'

Score:        2678
Aligned:      2772        nucs
Identic:      2761 (100%) nucs =>       128 (100%)      2633 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132111619,132111746] EXCISED REGION [132111747,132114386]
 second seq =>  [        1,      128] EXCISED REGION [      149,     2792]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        20 nucs [129,148]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        32 nucs [129,160] to [149,180]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [129,130] to [147,148]

132111619 TATGTACACACATATATGTACACATACACATATATGGACACATATATGTACACATACACA 132111678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGTACACACATATATGTACACATACACATATATGGACACATATATGTACACATACACA 60

132111679 TATATGGACACATATATGTACACATACACATATATGGACACACATATATGTACATGTACA 132111738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATATGGACACATATATGTACACATACACATATATGGACACACATATATGTACATGTACA 120

132111739 CATATATA 132111746
          ||||||||
      121 CATATATA 128

EXCISED REGION

132111747 TGTACATGTACATATATATGTGTACATGTACACATATATGTATTTATACGTATATATATT 132111806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      149 TGTACATGTACATATATATGTGTACATGTACACATATATGTATTTATACGTATATATATT 208

132111807 TTTTTGCCTTGATTTTCTAAATCGATTTACTAAAAGAGTTAATTTTTAATGTTCATTTTT 132111866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      209 TTTTTGCCTTGATTTTCTAAATCGATTTACTAAAAGAGTTAATTTTTAATGTTCATTTTT 268

132111867 TTCCTAGTCAGGAAATACATTACCAATAGTAAACAAAGTTATTGAAACATTTTTCAATCT 132111926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      269 TTCCTAGTCAGGAAATACATTACCAATAGTAAACAAAGTTATTGAAACATTTTTCAATCT 328

132111927 TCAAATTTCATTTTAATTTGAATATATTTTAATAAAATTATTGCAGTTTAAACACTTCGT 132111986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      329 TCAAATTTCATTTTAATTTGAATATATTTTAATAAAATTATTGCAGTTTAAACACTTCGT 388

132111987 TTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 132112046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      389 TTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 448

132112047 GTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCT 132112106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      449 GTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCT 508

132112107 CAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGT 132112166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      509 CAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGT 568

132112167 ACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTC 132112226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      569 ACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTC 628

132112227 GTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCC 132112286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      629 GTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCC 688

132112287 GGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAGTATGGGAGATT 132112346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      689 GGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAATATGGGAGATT 748

132112347 TCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTT 132112406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      749 TCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTT 808

132112407 TGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTT 132112466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      809 TGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTT 868

132112467 GTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGT 132112526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      869 GTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGT 928

132112527 TCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACAT 132112586
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      929 TCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACAT 988

132112587 AGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAAC 132112646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      989 AGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAAC 1048

132112647 TCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGAC 132112706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1049 TCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGAC 1108

132112707 TTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCGCTAACTTAATCACCTCATTC 132112766
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1109 TTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCACTAACTTAATCACCTCATTC 1168

132112767 ATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGC 132112826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1169 ATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGC 1228

132112827 TTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTAT 132112886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 TTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTAT 1288

132112887 GAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTA 132112946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 GAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTA 1348

132112947 AATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATG 132113006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 AATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATG 1408

132113007 ACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAG 132113066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 ACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAG 1468

132113067 GAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAG 132113126
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1469 GAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAA 1528

132113127 AGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCT 132113186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 AGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCT 1588

132113187 GTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCT 132113246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 GTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCT 1648

132113247 CTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGG 132113306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 CTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGG 1708

132113307 TTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCT 132113366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 TTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCT 1768

132113367 TTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCA 132113426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1769 TTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTACGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCA 1828

132113427 ACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTG 132113486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 ACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTG 1888

132113487 GATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGG 132113546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 GATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGG 1948

132113547 ATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACA 132113606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 ATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACA 2008

132113607 GGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCT 132113666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 GGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCT 2068

132113667 TTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAA 132113726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 TTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAA 2128

132113727 TTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGG 132113786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 TTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGG 2188

132113787 GCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGT 132113846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 GCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGT 2248

132113847 GTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATAT 132113906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 GTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATAT 2308

132113907 TATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT----TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTC 132113962
          |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||
     2309 TATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTAAATATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTC 2368

132113963 TGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCA 132114022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 TGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCA 2428

132114023 CCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAA 132114082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 CCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAA 2488

132114083 AAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCT 132114142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 AAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCT 2548

132114143 AGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTT 132114202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 AGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTT 2608

132114203 TTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTCTCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGAT 132114262
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 GTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTCTCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGAT 2668

132114263 CTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCG 132114322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 CTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCG 2728

132114323 AGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 132114382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 AGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 2788

132114383 GACA 132114386
          ||||
     2789 GACA 2792

Alignment time is 3.05932 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4538] =>      4538 nucs 'mol-32-3240-175221_4538'

Score:        4494
Aligned:      4538        nucs
Identic:      4534 (100%) nucs =>       284 (100%)      4250 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132115573,132115856] EXCISED REGION [132115860,132120113]
 second seq =>  [        1,      284] EXCISED REGION [      285,     4538]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [132115857,132115859]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        15 nucs [132115857,132115871] to [132115860,132115874]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132115857,132115857] to [132115859,132115859]
 second seq =>         0 nucs

132115573 TAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGG 132115632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGG 60

132115633 GAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATGATCTGTCCACTGCACTTCAG 132115692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATGATCTGTCCACTGCACTTCAG 120

132115693 CCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACACAAATCTTTTGATATTATTGATT 132115752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACACAAATCTTTTGATATTATTGATT 180

132115753 TCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTCTGCACTTTTCTTGTATTATTTT 132115812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTCTGCACTTTTCTTGTATTATTTT 240

132115813 CTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCTCTCTCC 132115856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCTCTCTCC 284

EXCISED REGION

132115860 TTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGCAGTGGCAT 132115919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      285 TTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGCAGTGGCAT 344

132115920 GATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTACCTCAGCCTC 132115979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      345 GATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTACCTCAGCCTC 404

132115980 CCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTA 132116039
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      405 CCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACTATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTA 464

132116040 GTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGCCAT 132116099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      465 GTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGCCAT 524

132116100 CCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTT 132116159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      525 CCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTT 584

132116160 AACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTAT 132116219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      585 AACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTAT 644

132116220 GTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAG 132116279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      645 GTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAG 704

132116280 ATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTT 132116339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      705 ATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTT 764

132116340 TTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTA 132116399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      765 TTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTA 824

132116400 ATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCT 132116459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      825 ATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCT 884

132116460 TTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACT 132116519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      885 TTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACT 944

132116520 GCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTC 132116579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      945 GCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTC 1004

132116580 AGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGC 132116639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1005 AGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGC 1064

132116640 TGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGG 132116699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1065 TGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGG 1124

132116700 GGAGGGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGA 132116759
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1125 GGAGCGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGA 1184

132116760 CCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCA 132116819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 CCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCA 1244

132116820 ACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCA 132116879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 ACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCA 1304

132116880 CTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCA 132116939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 CTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCA 1364

132116940 CTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTT 132116999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 CTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTT 1424

132117000 TTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACT 132117059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 TTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACT 1484

132117060 CTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTT 132117119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 CTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTT 1544

132117120 GGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGT 132117179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 GGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGT 1604

132117180 TATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACAC 132117239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 TATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACAC 1664

132117240 GTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTAT 132117299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 GTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTAT 1724

132117300 TTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTG 132117359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 TTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTG 1784

132117360 AAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACAT 132117419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 AAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACAT 1844

132117420 AACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTT 132117479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 AACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTT 1904

132117480 TAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGT 132117539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 TAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGT 1964

132117540 GAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGT 132117599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 GAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGT 2024

132117600 GATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAA 132117659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 GATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAA 2084

132117660 CGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTA 132117719
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 TGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTA 2144

132117720 GCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAG 132117779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 GCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAG 2204

132117780 AAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGG 132117839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 AAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGG 2264

132117840 CTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGG 132117899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 CTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGG 2324

132117900 AAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAA 132117959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 AAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAA 2384

132117960 AAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTT 132118019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 AAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTT 2444

132118020 ATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTG 132118079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 ATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTG 2504

132118080 AAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGA 132118139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 AAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGA 2564

132118140 CGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGT 132118199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 CGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGT 2624

132118200 GTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAG 132118259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 GTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAG 2684

132118260 CAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCAT 132118319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 CAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCAT 2744

132118320 TGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAA 132118379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 TGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAA 2804

132118380 ATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTG 132118439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 ATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTG 2864

132118440 CTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTA 132118499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 CTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTA 2924

132118500 AGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAG 132118559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 AGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAG 2984

132118560 GGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAA 132118619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 GGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAA 3044

132118620 AGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCT 132118679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 AGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCT 3104

132118680 GCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAAT 132118739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 GCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAAT 3164

132118740 AATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGAT 132118799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 AATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGAT 3224

132118800 GATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGG 132118859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 GATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGG 3284

132118860 ATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGA 132118919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 ATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGA 3344

132118920 TTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGAT 132118979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 TTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGAT 3404

132118980 GCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCA 132119039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 GCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCA 3464

132119040 TGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTG 132119099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 TGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTG 3524

132119100 AACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAA 132119159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 AACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAA 3584

132119160 TTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACA 132119219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 TTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACA 3644

132119220 TTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTG 132119279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 TTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTG 3704

132119280 AGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCT 132119339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 AGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCT 3764

132119340 ACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCC 132119399
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 ACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCC 3824

132119400 TTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTT 132119459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 TTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTT 3884

132119460 TTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAAT 132119519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 TTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAAT 3944

132119520 TGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAA 132119579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 TGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAA 4004

132119580 AGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTC 132119639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 AGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTC 4064

132119640 AACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTA 132119699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 AACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTA 4124

132119700 CTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCAC 132119759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 CTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCAC 4184

132119760 TGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAA 132119819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 TGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAA 4244

132119820 AGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGT 132119879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 AGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGT 4304

132119880 TGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAG 132119939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 TGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAG 4364

132119940 GTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATA 132119999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4365 GTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATA 4424

132120000 CATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGC 132120059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4425 CATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGC 4484

132120060 TATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACGA 132120113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4485 TATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATATACGA 4538

Alignment time is 4.56316 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3840] =>      3840 nucs 'mol-32-3240-175222_3840'

Score:        3662
Aligned:      3835        nucs
Identic:      3816 (100%) nucs =>        17 (100%)      3799 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132111722,132111738] EXCISED REGION [132111747,132115560]
 second seq =>  [        2,       18] EXCISED REGION [       27,     3840]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [132111739,132111746]
 second seq =>         8 nucs [19,26]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132111738,132111738] to [132111746,132111746]
 second seq =>         1 nucs [19,19] to [27,27]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>        12 nucs [132111727,132111738] to [132111747,132111758]
 second seq =>        12 nucs [7,18] to [27,38]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132111722 ATATATGTACATGTACA 132111738
          |||||||||||||||||
        2 ATATATGTACATGTACA 18

EXCISED REGION

132111747 TGTACATGTACATATATATGTGTACATGTACACATATATGTATTTATACGTATATATATT 132111806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       27 TGTACATGTACATATATATGTGTACATGTACACATATATGTATTTATACGTATATATATT 86

132111807 TTTTTGCCTTGATTTTCTAAATCGATTTACTAAAAGAGTTAATTTTTAATGTTCATTTTT 132111866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       87 TTTTTGCCTTGATTTTCTAAATCGATTTACTAAAAGAGTTAATTTTTAATGTTCATTTTT 146

132111867 TTCCTAGTCAGGAAATACATTACCAATAGTAAACAAAGTTATTGAAACATTTTTCAATCT 132111926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      147 TTCCTAGTCAGGAAATACATTACCAATAGTAAACAAAGTTATTGAAACATTTTTCAATCT 206

132111927 TCAAATTTCATTTTAATTTGAATATATTTTAATAAAATTATTGCAGTTTAAACACTTCGT 132111986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      207 TCAAATTTCATTTTAATTTGAATATATTTTAATAAAATTATTGCAGTTTAAACACTTCGT 266

132111987 TTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 132112046
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      267 TTC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 325

132112047 GTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCT 132112106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      326 GTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCT 385

132112107 CAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGT 132112166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      386 CAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGT 445

132112167 ACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTC 132112226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      446 ACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTC 505

132112227 GTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCC 132112286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      506 GTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCC 565

132112287 GGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAGTATGGGAGATT 132112346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      566 GGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAATATGGGAGATT 625

132112347 TCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTT 132112406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      626 TCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTT 685

132112407 TGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTT 132112466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      686 TGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTT 745

132112467 GTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGT 132112526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      746 GTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGT 805

132112527 TCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACAT 132112586
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      806 TCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACAT 865

132112587 AGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAAC 132112646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      866 AGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAAC 925

132112647 TCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGAC 132112706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      926 TCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGAC 985

132112707 TTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCGCTAACTTAATCACCTCATTC 132112766
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      986 TTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCACTAACTTAATCACCTCATTC 1045

132112767 ATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGC 132112826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1046 ATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGC 1105

132112827 TTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTAT 132112886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1106 TTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTAT 1165

132112887 GAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTA 132112946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1166 GAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTA 1225

132112947 AATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATG 132113006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1226 AATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATG 1285

132113007 ACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAG 132113066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1286 ACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAG 1345

132113067 GAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAG 132113126
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1346 GAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAA 1405

132113127 AGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCT 132113186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1406 AGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCT 1465

132113187 GTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCT 132113246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1466 GTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCT 1525

132113247 CTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGG 132113306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1526 CTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGG 1585

132113307 TTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCT 132113366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1586 TTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCT 1645

132113367 TTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCA 132113426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1646 TTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTACGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCA 1705

132113427 ACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTG 132113486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 ACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTG 1765

132113487 GATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGG 132113546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 GATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGG 1825

132113547 ATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACA 132113606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 ATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACA 1885

132113607 GGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCT 132113666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 GGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCT 1945

132113667 TTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAA 132113726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 TTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAA 2005

132113727 TTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGG 132113786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 TTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGG 2065

132113787 GCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGT 132113846
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 GCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGT 2125

132113847 GTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATAT 132113906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 GTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATAT 2185

132113907 TATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT----TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTC 132113962
          |||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||
     2186 TATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTAAATATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTC 2245

132113963 TGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCA 132114022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 TGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCA 2305

132114023 CCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAA 132114082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 CCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAA 2365

132114083 AAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCT 132114142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 AAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCT 2425

132114143 AGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTT 132114202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 AGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTT 2485

132114203 TTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTCTCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGAT 132114262
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 GTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTCTCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGAT 2545

132114263 CTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCG 132114322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 CTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCG 2605

132114323 AGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 132114382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 AGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 2665

132114383 GACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCA 132114442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 GACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCA 2725

132114443 CCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTG 132114502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 CCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTG 2785

132114503 CATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGGTTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAAT 132114562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 CATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGGTTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAAT 2845

132114563 TACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAATATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTAT 132114622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 TACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAATATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTAT 2905

132114623 GGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTCTGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCA 132114682
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 GGATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTCTGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCA 2964

132114683 GCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGCTTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCT 132114742
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 GCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGCTTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCT 3024

132114743 GTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGGTGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACT 132114802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 GTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGGTGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACT 3084

132114803 ACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTGAGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGA 132114862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 ACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTGAGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGA 3144

132114863 TATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGGGTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAA 132114922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 TATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGGGTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAA 3204

132114923 AAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATAAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTC 132114982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 AAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATAAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTC 3264

132114983 CCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTTTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGT 132115042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 CCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTTTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGT 3324

132115043 ATATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTTTAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTA 132115102
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 ATATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTTTAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTA 3384

132115103 TATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCACTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTC 132115162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 TATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCACTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTC 3444

132115163 CTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATCATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTAT 132115222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 CTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATCATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTAT 3504

132115223 CACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTAGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAA 132115282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 CACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTAGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAA 3564

132115283 GTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCTGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCAC 132115342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 GTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCTGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCAC 3624

132115343 AACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCCTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATT 132115402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 AACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCCTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATT 3684

132115403 TTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGCTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCC 132115462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 TTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGCTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCC 3744

132115463 AGCACTTTACAGGCCGAGGTGGGTGAATGACACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCT 132115522
          |||||||||||||||.|||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
     3745 AGCACTTTACAGGCCAAGGTGGGTGAATG--ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCT 3802

132115523 GGGCAACATAGTGGGACCCCACCTCTACAATTTTTTTT 132115560
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3803 GGGCAACATAGTGGGACCCGACCTCTACAATTTTTTTT 3840

Alignment time is 3.78586 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     6767] =>      6767 nucs 'mol-32-3240-224536_6767'

Score:        6524
Aligned:      6768        nucs
Identic:      6736 (100%) nucs =>      3820 ( 99%)      2916 (100%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112015,132115849] EXCISED REGION [132115857,132118775]
 second seq =>  [        1,     3846] EXCISED REGION [     3849,     6767]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [132115850,132115856]
 second seq =>         2 nucs [3847,3848]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [132115849,132115850] to [132115856,132115857]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112015 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCC 132112074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCC 60

132112075 CTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGG 132112134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGG 120

132112135 CACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGT 132112194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGT 180

132112195 GTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAG 132112254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAG 240

132112255 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAA 132112314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAA 300

132112315 AAAGTATGAGAATCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATA 132112374
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAGTATGAGAATCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATA 360

132112375 ATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTT 132112434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTT 420

132112435 GATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTA 132112494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTA 480

132112495 CATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGG 132112554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      481 CATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGG 540

132112555 CTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTG 132112614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTG 600

132112615 TAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAA 132112674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAA 660

132112675 CTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGG 132112734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGG 720

132112735 GTGGGCGAAGCGCTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACAT 132112794
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGGGCGAAGCACTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACAT 780

132112795 TTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCA 132112854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCA 840

132112855 GGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCT 132112914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCT 900

132112915 GAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCT 132112974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCT 960

132112975 CAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAA 132113034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAA 1020

132113035 GAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAA 132113094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAA 1080

132113095 TATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGG 132113154
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGG 1140

132113155 CCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTC 132113214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTC 1200

132113215 CGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAG 132113274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAG 1260

132113275 CATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGT 132113334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGT 1320

132113335 CATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCT 132113394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCT 1380

132113395 TCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAA 132113454
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCAGCTACGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAA 1440

132113455 ACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTC 132113514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTC 1500

132113515 AAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCT 132113574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCT 1560

132113575 GTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAA 132113634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAA 1620

132113635 GGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTT 132113694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTT 1680

132113695 TCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTC 132113754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTC 1740

132113755 CCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCC 132113814
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1741 CCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAGGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCG 1800

132113815 TATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATT 132113874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATT 1860

132113875 CAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATT 132113934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATT 1920

132113935 A----TATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCT 132113990
          |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAATATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCT 1980

132113991 CTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAA 132114050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAA 2040

132114051 GAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTT 132114110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTT 2100

132114111 AAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACT 132114170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACT 2160

132114171 ACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCA 132114230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCA 2220

132114231 CTCTCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCA 132114290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTCTCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCA 2280

132114291 GGTTCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCAC 132114350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGTTCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCAC 2340

132114351 TACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCT 132114410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCT 2400

132114411 GGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTAC 132114470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTAC 2460

132114471 AGGTGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTA 132114530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGGTGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTA 2520

132114531 GGGTTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCT 132114590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGGTTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCT 2580

132114591 AATATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAG 132114650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     2581 AATATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAA-CCAG 2639

132114651 GTCTGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGAT 132114710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2640 GTCTGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGAT 2699

132114711 TGCTTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCC 132114770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TGCTTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCC 2759

132114771 AGGTGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCAC 132114830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 AGGTGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCAC 2819

132114831 CTGAGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTC 132114890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CTGAGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTC 2879

132114891 TGGGTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAA-TCAAGAAAGTGAA 132114949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     2880 TGGGTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAA 2939

132114950 TATAAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCA 132115009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TATAAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCA 2999

132115010 TTTTTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACAAAATGTTTTGA 132115069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3000 TTTTTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACCAAATGTTTTGA 3059

132115070 TTTTAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTC 132115129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TTTTAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTC 3119

132115130 TCACTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACAT 132115189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 TCACTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACAT 3179

132115190 TATCATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTC 132115249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 TATCATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTC 3239

132115250 AGTAGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGG 132115309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 AGTAGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGG 3299

132115310 ATCTGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTT 132115369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 ATCTGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTT 3359

132115370 TTCCTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTT 132115429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TTCCTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTT 3419

132115430 TTGCTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCGAGGTGGGTGAA 132115489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3420 TTGCTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCAAGGTGGGTGAA 3479

132115490 TGACACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCCCACCTCTA 132115549
          ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3480 TGAC--TTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCCGACCTCTA 3537

132115550 CAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT---------AATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCC 132115600
          ||||||||||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||||||||
     3538 CAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCC 3597

132115601 TTTGGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAG 132115660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TTTGGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAG 3657

132115661 GCTGCAGCCATGATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTC 132115720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 GCTGCAGCCATGATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTC 3717

132115721 AAACAAACACAAATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTT 132115780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 AAACAAACACAAATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTT 3777

132115781 CATTAATTTCTGCACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTT 132115840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 CATTAATTTCTGCACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTT 3837

132115841 GTTCATCTC 132115849
          |||||||||
     3838 GTTCATCTC 3846

EXCISED REGION

132115857 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGCAGTGG 132115916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGCAGTGG 3908

132115917 CATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTACCTCAGC 132115976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 CATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTGTACCTCAGC 3968

132115977 CTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTT 132116036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3969 CTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACTATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTT 4028

132116037 TTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGC 132116096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 TTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGC 4088

132116097 CATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCACACCTGG 132116156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4089 CATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCACCACACCTGG 4148

132116157 CTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTG 132116216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4149 CTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTG 4208

132116217 TATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTTTAAA 132116276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4209 TATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTATACTTTAAA 4268

132116277 GAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTTTATT 132116336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4269 GAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTACTTTTTATT 4328

132116337 CTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCT 132116396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4329 CTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCT 4388

132116397 TTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATG 132116456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4389 TTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATG 4448

132116457 TCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCAC 132116516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4449 TCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCAC 4508

132116517 ACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACT 132116576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4509 ACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACT 4568

132116577 CTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCAT 132116636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4569 CTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCAT 4628

132116637 TGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAA 132116696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4629 TGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAA 4688

132116697 GGGGGAGGGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATG 132116756
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4689 GGGGGAGCGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATG 4748

132116757 AGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCC 132116816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4749 AGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCC 4808

132116817 CCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACA 132116876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4809 CCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACA 4868

132116877 TCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATA 132116936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4869 TCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATA 4928

132116937 TCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATC 132116996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4929 TCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATC 4988

132116997 TTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAAT 132117056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4989 TTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAAT 5048

132117057 ACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTG 132117116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5049 ACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTG 5108

132117117 CTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAG 132117176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5109 CTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAG 5168

132117177 TGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATA 132117236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5169 TGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATA 5228

132117237 CACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCT 132117296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5229 CACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCT 5288

132117297 TATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAG 132117356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5289 TATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAG 5348

132117357 GTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTA 132117416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5349 GTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTA 5408

132117417 CATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTT 132117476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5409 CATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTT 5468

132117477 TTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATA 132117536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5469 TTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATA 5528

132117537 AGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTG 132117596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5529 AGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTG 5588

132117597 TGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGA 132117656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5589 TGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGA 5648

132117657 TAACGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTG 132117716
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5649 TAATGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTG 5708

132117717 TTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGA 132117776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5709 TTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGA 5768

132117777 GAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAA 132117836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5769 GAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAA 5828

132117837 AGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTAC 132117896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5829 AGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTAC 5888

132117897 AGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTG 132117956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5889 AGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTG 5948

132117957 GAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTAC 132118016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5949 GAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTAC 6008

132118017 TTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGC 132118076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6009 TTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGC 6068

132118077 CTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTT 132118136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6069 CTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTT 6128

132118137 GGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCA 132118196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6129 GGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCA 6188

132118197 CGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGA 132118256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6189 CGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGA 6248

132118257 GAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGT 132118316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6249 GAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGT 6308

132118317 CATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCC 132118376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6309 CATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCC 6368

132118377 AAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTG 132118436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6369 AAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTG 6428

132118437 CTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAG 132118496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6429 CTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAG 6488

132118497 CTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCC 132118556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6489 CTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCC 6548

132118557 CAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACT 132118616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6549 CAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACT 6608

132118617 CAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCT 132118676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6609 CAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCT 6668

132118677 CCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGG 132118736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6669 CCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGG 6728

132118737 AATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCAC 132118775
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6729 AATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCAC 6767

Alignment time is 6.43042 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3395] =>      3395 nucs 'mol-32-3306-069104_3395'

Score:        3251
Aligned:      3385        nucs
Identic:      3372 (100%) nucs =>      1771 (100%)      1601 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112157,132113933] EXCISED REGION [132113934,132115541]
 second seq =>  [        1,     1777] EXCISED REGION [     1782,     3386]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1778,1781]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1778,1779] to [1782,1783]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132113933,132113933] to [132113934,132113934]
 second seq =>         1 nucs [1777,1777] to [1782,1782]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112157 ATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATC 132112216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATC 60

132112217 TTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGC 132112276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGC 120

132112277 CACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAGT 132112336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      121 CACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAAT 180

132112337 ATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTG 132112396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTG 240

132112397 ATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAA 132112456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAA 300

132112457 TTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTT 132112516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTT 360

132112517 TACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAA 132112576
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAA 420

132112577 TTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAA 132112636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAA 480

132112637 GTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATC 132112696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATC 540

132112697 TTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCGCTAACTTAAT 132112756
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      541 TTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCACTAACTTAAT 600

132112757 CACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGC 132112816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGC 660

132112817 TGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTG 132112876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTG 720

132112877 TCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTAT 132112936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTAT 780

132112937 TCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAA 132112996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAA 840

132112997 GTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCA 132113056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCA 900

132113057 TGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTA 132113116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTA 960

132113117 GGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCAT 132113176
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCAT 1020

132113177 GTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATG 132113236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATG 1080

132113237 GCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTT 132113296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTT 1140

132113297 TTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAAC 132113356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAAC 1200

132113357 CACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAGAA 132113416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1201 CACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTACGTCTGCTGCAGAA 1260

132113417 TTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAA 132113476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAA 1320

132113477 TGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCC 132113536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCC 1380

132113537 ATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAA 132113596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAA 1440

132113597 AGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGA 132113656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGA 1500

132113657 ATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACAC 132113716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACAC 1560

132113717 TGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTT 132113776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTT 1620

132113777 GTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAATACAGTCCTT 132113836
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1621 GTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAATACAGTCCTT 1680

132113837 GGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGA 132113896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGA 1740

132113897 TTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 132113933
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 1777

EXCISED REGION

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 1841

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 1901

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 1961

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 2021

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 2081

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 132114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 2141

132114294 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 132114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 2201

132114354 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 132114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 2261

132114414 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 132114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 2321

132114474 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 132114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 2381

132114534 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 132114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 2441

132114594 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTC 132114653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2442 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTC 2500

132114654 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGC 132114713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2501 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGC 2560

132114714 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 132114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 2620

132114774 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 132114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 2680

132114834 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 132114893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 2740

132114894 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 132114953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 2800

132114954 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 132115013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 2860

132115014 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTTT 132115073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2861 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTTT 2920

132115074 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 132115133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 2980

132115134 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 132115193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 3040

132115194 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 132115253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 3100

132115254 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 132115313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 3160

132115314 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 132115373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 3220

132115374 TGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGC 132115433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 TGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGC 3280

132115434 TGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCGAGGTGGGTGAATGAC 132115493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||  
     3281 TGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCAAGGTGGGTGAATG-- 3338

132115494 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCC 132115541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3339 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCC 3386

Alignment time is 3.85058 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4573] =>      4573 nucs 'mol-32-3306-069105_4573'

Score:        4524
Aligned:      4568        nucs
Identic:      4564 (100%) nucs =>       362 (100%)      4202 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132115649,132116010] EXCISED REGION [132116012,132120217]
 second seq =>  [        1,      362] EXCISED REGION [      364,     4568]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132116011,132116011]
 second seq =>         1 nucs [363,363]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [132119455,132119455]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132116010,132116010] to [132116011,132116011]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132115649 CAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATGATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTA 132115708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCATGATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTA 60

132115709 AGATCCTATCTCAAACAAACACAAATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTT 132115768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGATCCTATCTCAAACAAACACAAATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTT 120

132115769 TGCTTTCAATTTCATTAATTTCTGCACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATC 132115828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCTTTCAATTTCATTAATTTCTGCACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATC 180

132115829 TGAATTTAATTTGTTCATCTCTCTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTG 132115888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAATTTAATTTGTTCATCTCTCTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTG 240

132115889 CTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGCAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCC 132115948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCTGTTGCCCAGGCTTGAGTGCAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCC 300

132115949 TGGGCCCAAGTGATTCTTGTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCC 132116008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGGCCCAAGTGATTCTTGTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCC 360

132116009 AC 132116010
          ||
      361 AC 362

EXCISED REGION

132116012 ATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGC 132116071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      364 ATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGC 423

132116072 TGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 132116131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      424 TGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 483

132116132 TACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTC 132116191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      484 TACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTC 543

132116192 TTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATT 132116251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 TTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATT 603

132116252 TGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAAC 132116311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 TGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAAC 663

132116312 ATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGT 132116371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 ATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGT 723

132116372 TTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATAT 132116431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 TTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATAT 783

132116432 TCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTC 132116491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 TCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTC 843

132116492 ACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTT 132116551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 ACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTT 903

132116552 ATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGG 132116611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 ATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGG 963

132116612 CAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTC 132116671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 CAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTC 1023

132116672 ACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAGGGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTC 132116731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1024 ACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAGCGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTC 1083

132116732 TCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTC 132116791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1084 TCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTC 1143

132116792 AGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTG 132116851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1144 AGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTG 1203

132116852 GGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTT 132116911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1204 GGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTT 1263

132116912 TCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGA 132116971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1264 TCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGA 1323

132116972 CAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCT 132117031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1324 CAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCT 1383

132117032 AGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTG 132117091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1384 AGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTG 1443

132117092 GTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTT 132117151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1444 GTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTT 1503

132117152 CATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAG 132117211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1504 CATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAG 1563

132117212 CCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAA 132117271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1564 CCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAA 1623

132117272 TGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTAT 132117331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1624 TGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTAT 1683

132117332 TTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCT 132117391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1684 TTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCT 1743

132117392 TGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAA 132117451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1744 TGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAA 1803

132117452 ATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTT 132117511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1804 ATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTT 1863

132117512 ATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGT 132117571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1864 ATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGT 1923

132117572 TTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCAT 132117631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1924 TTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCAT 1983

132117632 TTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAACGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATA 132117691
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1984 TTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAATGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATA 2043

132117692 TACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTAC 132117751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2044 TACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTAC 2103

132117752 CCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACA 132117811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2104 CCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACA 2163

132117812 AGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTT 132117871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2164 AGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTT 2223

132117872 AGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTT 132117931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2224 AGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTT 2283

132117932 GACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAA 132117991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2284 GACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAA 2343

132117992 TTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAA 132118051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2344 TTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAA 2403

132118052 GTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATT 132118111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2404 GTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATT 2463

132118112 GGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTA 132118171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2464 GGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTA 2523

132118172 CTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAG 132118231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2524 CTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAG 2583

132118232 CTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTC 132118291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2584 CTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTC 2643

132118292 TATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGA 132118351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2644 TATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGA 2703

132118352 TAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGA 132118411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2704 TAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGA 2763

132118412 ATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTAT 132118471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2764 ATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTAT 2823

132118472 AAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATC 132118531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2824 AAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATC 2883

132118532 TCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTG 132118591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2884 TCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTG 2943

132118592 ATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCAC 132118651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2944 ATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCAC 3003

132118652 ACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAA 132118711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3004 ACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAA 3063

132118712 GATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTA 132118771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3064 GATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTA 3123

132118772 TCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTA 132118831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3124 TCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTA 3183

132118832 CCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTA 132118891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3184 CCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTA 3243

132118892 TATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTC 132118951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3244 TATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTC 3303

132118952 AGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTAT 132119011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3304 AGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTAT 3363

132119012 AGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACA 132119071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3364 AGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACA 3423

132119072 ATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAA 132119131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3424 ATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAA 3483

132119132 CTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACC 132119191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3484 CTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACC 3543

132119192 ATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTG 132119251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3544 ATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTG 3603

132119252 AGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGAC 132119311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3604 AGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGAC 3663

132119312 ATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTA 132119371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3664 ATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTA 3723

132119372 ATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAA 132119431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3724 ATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAA 3783

132119432 GGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAAT 132119491
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3784 GGATAAGTCAGTCTCACAGGTAC-TTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAAT 3842

132119492 ACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAA 132119551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3843 ACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAA 3902

132119552 AAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAA 132119611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3903 AAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAA 3962

132119612 TGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGA 132119671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3963 TGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGA 4022

132119672 TCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACA 132119731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4023 TCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACA 4082

132119732 ACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATA 132119791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4083 ACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATA 4142

132119792 GTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAA 132119851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4143 GTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAA 4202

132119852 AAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTC 132119911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4203 AAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTC 4262

132119912 AACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAG 132119971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4263 AACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAG 4322

132119972 TGTGTGTATGCAGATATATATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTT 132120031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4323 TGTGTGTATGCAGATATATATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTT 4382

132120032 CTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACA 132120091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4383 CTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACA 4442

132120092 AGACATATAGATTAATATACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATG 132120151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4443 AGACATATAGATTAATATACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATG 4502

132120152 TATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTG 132120211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4503 TATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTG 4562

132120212 ATAAAT 132120217
          ||||||
     4563 ATAAAT 4568

Alignment time is 4.90068 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3282] =>      3282 nucs 'mol-32-338a-169904_3282'

Score:        3142
Aligned:      3280        nucs
Identic:      3265 (100%) nucs =>      1976 (100%)      1289 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112248,132114228] EXCISED REGION [132118551,132119845]
 second seq =>  [        1,     1985] EXCISED REGION [     1988,     3282]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4322 nucs [132114229,132118550]
 second seq =>         2 nucs [1986,1987]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1985,1986] to [1987,1988]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112248 CCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTC 132112307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTC 60

132112308 TAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTA 132112367
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTA 120

132112368 TGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGA 132112427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGA 180

132112428 ATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATT 132112487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATT 240

132112488 CATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTT 132112547
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      241 CATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTT 300

132112548 TTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATT 132112607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATT 360

132112608 ATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCT 132112667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCT 420

132112668 TGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAA 132112727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAA 480

132112728 GATACGGGTGGGCGAAGCGCTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGC 132112787
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATACGGGTGGGCGAAGCACTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGC 540

132112788 TGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTG 132112847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTG 600

132112848 CACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCT 132112907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCT 660

132112908 TCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAG 132112967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAG 720

132112968 ATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGT 132113027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGT 780

132113028 AATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAAT 132113087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAAT 840

132113088 AAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGG 132113147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      841 AAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGG 900

132113148 GCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAG 132113207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAG 960

132113208 CTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCAC 132113267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCAC 1020

132113268 AGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGG 132113327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGG 1080

132113328 TTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTC 132113387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTC 1140

132113388 ATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGC 132113447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGC 1200

132113448 CAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTC 132113507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTC 1260

132113508 TCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCT 132113567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCT 1320

132113568 AGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATG 132113627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATG 1380

132113628 GTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACAT 132113687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACAT 1440

132113688 TGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTC 132113747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTC 1500

132113748 TGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCT 132113807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCT 1560

132113808 TTATCCCTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATAT 132113867
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTATCCGTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATAT 1620

132113868 TATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTA 132113927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTA 1680

132113928 ATTAATTA----TATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCC 132113983
          ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTAATTAAATATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCC 1740

132113984 AAGGGCTCTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAA 132114043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGGGCTCTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAA 1800

132114044 AAGGGAAGAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACA 132114103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAGGGAAGAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACA 1860

132114104 GCTTCTTAAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAA 132114163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTTCTTAAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAA 1920

132114164 CAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGG 132114223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGG 1980

132114224 AGTCT 132114228
          |||||
     1981 AGTCT 1985

EXCISED REGION

132118551 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 132118610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 2047

132118611 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 132118670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 2107

132118671 CCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 132118730
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 CCACCTCCTGCCAATAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 2167

132118731 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 132118790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 2227

132118791 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 132118850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 2287

132118851 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 132118910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 2347

132118911 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 132118970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 2407

132118971 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 132119030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 2467

132119031 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 132119090
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2468 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCGACAATAAATAGGAACCAGTGAA 2527

132119091 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 132119150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 2587

132119151 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 132119210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 2647

132119211 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 132119270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 2707

132119271 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 132119330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 2767

132119331 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 132119390
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2768 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 2827

132119391 GGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 132119450
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 GGTACACCTTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 2887

132119451 GTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAATA 132119510
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2888 GTACATTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGATTCATTTGTCAATA 2947

132119511 TTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTC 132119570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 TTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTTC 3007

132119571 AGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAAC 132119630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 AGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAAC 3067

132119631 AATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGG 132119690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 AATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGG 3127

132119691 CCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCT 132119750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 CCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCT 3187

132119751 TTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTG 132119810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 TTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACTG 3247

132119811 CTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACT 132119845
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 CTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACT 3282

Alignment time is 3.57073 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2568] =>      2568 nucs 'mol-32-33a0-118344_2568'

Score:        2556
Aligned:      2567        nucs
Identic:      2566 (100%) nucs =>      1705 (100%)       861 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132117661,132119365] EXCISED REGION [132119367,132120228]
 second seq =>  [        1,     1705] EXCISED REGION [     1707,     2568]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132119366,132119366]
 second seq =>         1 nucs [1706,1706]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1702,1705] to [1703,1706]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132117661 GTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAG 132117720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAG 60

132117721 CTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGA 132117780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGA 120

132117781 AAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGC 132117840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGC 180

132117841 TTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGA 132117900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGA 240

132117901 AGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAA 132117960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAA 300

132117961 AAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTA 132118020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTA 360

132118021 TGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGA 132118080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGA 420

132118081 AGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGAC 132118140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGAC 480

132118141 GAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTG 132118200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTG 540

132118201 TCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGC 132118260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGC 600

132118261 AATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATT 132118320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATT 660

132118321 GGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAA 132118380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAA 720

132118381 TTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGC 132118440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGC 780

132118441 TGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAA 132118500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAA 840

132118501 GAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGG 132118560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGG 900

132118561 GACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAA 132118620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAA 960

132118621 GAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTG 132118680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTG 1020

132118681 CCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATA 132118740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATA 1080

132118741 ATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATG 132118800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATG 1140

132118801 ATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGA 132118860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGA 1200

132118861 TGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGAT 132118920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGAT 1260

132118921 TTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATG 132118980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATG 1320

132118981 CCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCAT 132119040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCAT 1380

132119041 GGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGA 132119100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGA 1440

132119101 ACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAAT 132119160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAAT 1500

132119161 TATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACAT 132119220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACAT 1560

132119221 TTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGA 132119280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGA 1620

132119281 GATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTA 132119340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTA 1680

132119341 CAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAA 132119365
          |||||||||||||||||||||||||
     1681 CAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAA 1705

EXCISED REGION

132119367 TTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAG 132119426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 TTTTAATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAG 1766

132119427 CCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTA 132119486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 CCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTA 1826

132119487 AAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTA 132119546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 AAAATACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTA 1886

132119547 TTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCA 132119606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 TTTAAAAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCA 1946

132119607 CAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAA 132119666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 CAAAATGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAA 2006

132119667 ATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGA 132119726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 ATTGATCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGA 2066

132119727 TAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAA 132119786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 TAACAACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAA 2126

132119787 TCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTA 132119846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 TCATAGTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTA 2186

132119847 ACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAG 132119906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 ACGAAAAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAG 2246

132119907 TTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAA 132119966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 TTTTCAACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAA 2306

132119967 ATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTT 132120026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 ATTAGTGTGTGTATGCAGATATATATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTT 2366

132120027 AATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACT 132120086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 AATTTCTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACT 2426

132120087 TTACAAGACATATAGATTAATATACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAG 132120146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 TTACAAGACATATAGATTAATATACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAG 2486

132120147 ATATGTATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGT 132120206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 ATATGTATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGT 2546

132120207 AGGTGATAAATGGAAAATACAT 132120228
          |||||||||||.||||||||||
     2547 AGGTGATAAATTGAAAATACAT 2568

Alignment time is 2.79553 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3538] =>      3538 nucs 'mol-32-33b6-032405_3538'

Score:        3348
Aligned:      3535        nucs
Identic:      3500 ( 99%) nucs =>      2566 ( 99%)       934 (100%)
Gaps:           24 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132111656,132114228] EXCISED REGION [132118551,132119488]
 second seq =>  [        2,     2598] EXCISED REGION [     2601,     3538]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4322 nucs [132114229,132118550]
 second seq =>         2 nucs [2599,2600]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2598,2599] to [2600,2601]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132111656 ACACATATATGTACACATACACATATATGGACACATATATGTACACATACACATATATGG 132111715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        2 ACACATATATGTACACATACACATATATGGACACATATATGTACACATACACATATATGG 61

132111716 ACACACATATATGTACATGTACACATATATATGTACATGTACATATATATGTGTACATGT 132111775
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
       62 ACACACATATATGTACATGTACACATATATGTGTACATGTACATATATATGTGTACATGT 121

132111776 ACACATATATGT--------------------ATTTATACGTATATATATTTTTTTGCCT 132111815
          ||||||||||||                    ||||||||||||||||||||||||||||
      122 ACACATATATGTGTACATGTACACATATATGTATTTATACGTATATATATTTTTTTGCCT 181

132111816 TGATTTTCTAAATCGATTTACTAAAAGAGTTAATTTTTAATGTTCATTTTTTTCCTAGTC 132111875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      182 TGATTTTCTAAATCGATTTACTAAAAGAGTTAATTTTTAATGTTCATTTTTTTCCTAGTC 241

132111876 AGGAAATACATTACCAATAGTAAACAAAGTTATTGAAACATTTTTCAATCTTCAAATTTC 132111935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      242 AGGAAATACATTACCAATAGTAAACAAAGTTATTGAAACATTTTTCAATCTTCAAATTTC 301

132111936 ATTTTAATTTGAATATATTTTAATAAAATTATTGCAGTTTAAACACTTCGTTTCTTTTTT 132111995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      302 ATTTTAATTTGAATATATTTTAATAAAATTATTGCAGTTTAAACACTTCGTTTCTTTTTT 361

132111996 TTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCA 132112055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      362 TTTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCA 421

132112056 TCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 132112115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      422 TCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCC 481

132112116 CAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGT 132112175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      482 CAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGT 541

132112176 AGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGC 132112235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      542 AGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTTGTGATCCGC 601

132112236 CTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGT 132112295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      602 CTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGT 661

132112296 TTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATAT 132112355
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      662 TTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATAT 721

132112356 TTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAG 132112415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      722 TTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAG 781

132112416 CAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAAT 132112475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      782 CAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAAT 841

132112476 TACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACA 132112535
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      842 TACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCA 901

132112536 ATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTT 132112595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 ATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTT 961

132112596 ACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGT 132112655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 ACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGT 1021

132112656 CTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAA 132112715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 CTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAA 1081

132112716 AGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCGCTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGC 132112775
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1082 AGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCACTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGC 1141

132112776 CTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCA 132112835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 CTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCA 1201

132112836 TTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTG 132112895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 TTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTG 1261

132112896 TATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGG 132112955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 TATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGG 1321

132112956 GGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTA 132113015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 GGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTA 1381

132113016 CTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACAT 132113075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 CTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACAT 1441

132113076 TGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCC 132113135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1442 TGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCC 1501

132113136 ACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTT 132113195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 ACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTT 1561

132113196 TCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACT 132113255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 TCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACT 1621

132113256 CACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAA 132113315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 CACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAA 1681

132113316 AAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCA 132113375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 AAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCA 1741

132113376 GCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAAC 132113435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 GCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAAC 1801

132113436 CTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGT 132113495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 CTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGT 1861

132113496 GAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGG 132113555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 GAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGG 1921

132113556 ACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTG 132113615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 ACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTG 1981

132113616 TAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGG 132113675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 TAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGG 2041

132113676 ACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATT 132113735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 ACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATT 2101

132113736 AATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTT 132113795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 AATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTT 2161

132113796 TTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAA 132113855
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 TTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAA 2221

132113856 GGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGT 132113915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 GGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGT 2281

132113916 AATGATATGTTAATTAATTA----TATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGA 132113971
          ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 AATGATATGTTAATTAATTAAATATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGA 2341

132113972 ATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTT 132114031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 ATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTT 2401

132114032 TTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCT 132114091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 TTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCT 2461

132114092 GGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACC 132114151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 GGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACC 2521

132114152 TTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTG 132114211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 TTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTG 2581

132114212 TGTGTGAGATGGAGTCT 132114228
          |||||||||||||||||
     2582 TGTGTGAGATGGAGTCT 2598

EXCISED REGION

132118551 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 132118610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 2660

132118611 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 132118670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 2720

132118671 CCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 132118730
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 CCACCTCCTGCCAATAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 2780

132118731 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 132118790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 2840

132118791 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 132118850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 2900

132118851 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 132118910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 2960

132118911 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 132118970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 3020

132118971 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 132119030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 3080

132119031 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 132119090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 3140

132119091 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 132119150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 3200

132119151 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 132119210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 3260

132119211 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 132119270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 3320

132119271 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 132119330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 3380

132119331 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 132119390
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3381 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 3440

132119391 GGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 132119450
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 GGTACACCTTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 3500

132119451 GTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAA 132119488
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 GTACATTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAA 3538

Alignment time is 3.45927 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     7753] =>      7753 nucs 'mol-32-3419-023474_7753'

Score:        7535
Aligned:      7752        nucs
Identic:      7729 (100%) nucs =>      1535 (100%)      6194 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112394,132113933] EXCISED REGION [132113934,132120139]
 second seq =>  [        1,     1540] EXCISED REGION [     1545,     7753]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1541,1544]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1541,1542] to [1545,1546]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132113933,132113933] to [132113934,132113934]
 second seq =>         1 nucs [1540,1540] to [1545,1545]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112394 TTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGA 132112453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGA 60

132112454 AAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGA 132112513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGA 120

132112514 TTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAA 132112573
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAA 180

132112574 TAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAAC 132112633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAAC 240

132112634 CAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTT 132112693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTT 300

132112694 ATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCGCTAACTT 132112753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      301 ATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCACTAACTT 360

132112754 AATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCC 132112813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCC 420

132112814 AGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACA 132112873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACA 480

132112874 CTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCT 132112933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCT 540

132112934 TATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAG 132112993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAG 600

132112994 GAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGA 132113053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGA 660

132113054 TCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACA 132113113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACA 720

132113114 GTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTT 132113173
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTT 780

132113174 CATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGT 132113233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGT 840

132113234 ATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCC 132113293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCC 900

132113294 TTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAA 132113353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAA 960

132113354 AACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCA 132113413
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      961 AACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTACGTCTGCTGCA 1020

132113414 GAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGT 132113473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGT 1080

132113474 CAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGT 132113533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGT 1140

132113534 GCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTC 132113593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTC 1200

132113594 CAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTT 132113653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTT 1260

132113654 GGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACA 132113713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACA 1320

132113714 CACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTT 132113773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTT 1380

132113774 CTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAATACAGTC 132113833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1381 CTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAATACAGTC 1440

132113834 CTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAAT 132113893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAAT 1500

132113894 TGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 132113933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 1540

EXCISED REGION

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 1604

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 1664

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 1724

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 1784

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 1844

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 132114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 1904

132114294 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 132114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 1964

132114354 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 132114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 2024

132114414 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 132114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 2084

132114474 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 132114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 2144

132114534 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 132114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 2204

132114594 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTC 132114653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2205 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTC 2263

132114654 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGC 132114713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2264 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGC 2323

132114714 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 132114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 2383

132114774 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 132114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 2443

132114834 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 132114893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 2503

132114894 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCT-AAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATAT 132114952
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATAT 2563

132114953 AAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTT 132115012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 AAGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTT 2623

132115013 TTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTT 132115072
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2624 TTTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTT 2683

132115073 TAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCA 132115132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 TAGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCA 2743

132115133 CTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTAT 132115192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 CTAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTAT 2803

132115193 CATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGT 132115252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 CATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGT 2863

132115253 AGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATC 132115312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 AGTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATC 2923

132115313 TGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTC 132115372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 TGTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTC 2983

132115373 CTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTG 132115432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 CTGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTG 3043

132115433 CTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCGAGGTGGGTGAATGA 132115492
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||| 
     3044 CTGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCAAGGTGGGTGAATG- 3102

132115493 CACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCCCACCTCTACAA 132115552
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3103 -ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTGGGACCCGACCTCTACAA 3161

132115553 --TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCA 132115610
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTAGCAGGGCATGGTGGTGAGCGCCTTTGGTCCCA 3221

132115611 GCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCA 132115670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 GCTACTTGGGAGGCTGAGGTGGGAGAATTGCTTGAGCCCAGGAAGTCAAGGCTGCAGCCA 3281

132115671 TGATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACAC 132115730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 TGATCTGTCCACTGCACTTCAGCCTGGGTGACAGAGTAAGATCCTATCTCAAACAAACAC 3341

132115731 AAATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTC 132115790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 AAATCTTTTGATATTATTGATTTCTCTGCTGTTTTTTTTGCTTTCAATTTCATTAATTTC 3401

132115791 TGCACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCT 132115850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 TGCACTTTTCTTGTATTATTTTCTTCCCTTTGCTTATCTGAATTTAATTTGTTCATCTCT 3461

132115851 CTCTCC---TTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGA 132115907
          ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 CTCTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTGACAGAGTCTTGCTCTGTTGCCCAGGCTTGA 3521

132115908 GTGCAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTG 132115967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 GTGCAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAAGTGATTCTTG 3581

132115968 TACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTT 132116027
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3582 TACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCACTATGCCCAGCTAATTTT 3641

132116028 TTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGG 132116087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 TTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGCTGGTCTTCAACTCTGG 3701

132116088 GGCTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCAC 132116147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 GGCTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAAGCATGAGTCAC 3761

132116148 CACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTG 132116207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 CACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTCTTATGCTGTGTGTCTG 3821

132116208 ACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTA 132116267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 ACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATTTGGCTCAATTGAATTA 3881

132116268 TACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTA 132116327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 TACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAACATTTATAATTTCCTTA 3941

132116328 CTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAA 132116387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 CTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGTTTTCCTTCTGCCTGAA 4001

132116388 GAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGT 132116447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 GAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATATTCTCTGTTTTGTTGGT 4061

132116448 CTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTC 132116507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 CTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTCACTGGGTGTGTAAGTC 4121

132116508 CATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTT 132116567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 CATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTTATGAAGAAAAGAGGTT 4181

132116568 TAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACT 132116627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 TAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACT 4241

132116628 TACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGA 132116687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 TACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTCACATGGCGACAGCAGA 4301

132116688 GAGAGTGAAGGGGGAGGGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTC 132116747
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 GAGAGTGAAGGGGGAGCGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTCTCATGAGAACTCACTC 4361

132116748 ACTGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAG 132116807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 ACTGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTCAGTCACCTCCTACCAG 4421

132116808 GTCCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGC 132116867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 GTCCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTGGGTGGAGACACAGAGC 4481

132116868 CAAACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACT 132116927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 CAAACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACT 4541

132116928 TTAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATG 132116987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 TTAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGACAAGAAGTCTTCCATG 4601

132116988 ATTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATT 132117047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 ATTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATT 4661

132117048 TTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTG 132117107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 TTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTG 4721

132117108 TCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAA 132117167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 TCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAA 4781

132117168 ATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGA 132117227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 ATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGA 4841

132117228 ATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCT 132117287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4842 ATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAATGCTCTGCTAATTTCT 4901

132117288 TTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCT 132117347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4902 TTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTATTTGTAGCAAATATTCT 4961

132117348 CCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCC 132117407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4962 CCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCC 5021

132117408 ATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATT 132117467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5022 ATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAAATTGACATCCCATATT 5081

132117468 GGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGC 132117527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5082 GGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTTATGGTCGTATACTAGC 5141

132117528 AGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTT 132117587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5142 AGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTT 5201

132117588 TCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGG 132117647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5202 TCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCATTTGCCTCAGAGCATGG 5261

132117648 GGAGGGAGATAACGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAA 132117707
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5262 GGAGGGAGATAATGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATATACAAAAAAAAAGAAA 5321

132117708 TTATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTG 132117767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 TTATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTG 5381

132117768 CTGTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTA 132117827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5382 CTGTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACAAGCATTATTAAGAGTA 5441

132117828 CGGTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAG 132117887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5442 CGGTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAG 5501

132117888 ATGCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTG 132117947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5502 ATGCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTG 5561

132117948 TGGAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGA 132118007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5562 TGGAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAATTACACATCTTTATGA 5621

132118008 TGCCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTG 132118067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5622 TGCCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTG 5681

132118068 GTAGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAG 132118127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5682 GTAGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATTGGACCTCATGGAGGAG 5741

132118128 GAGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACA 132118187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5742 GAGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTACTTCCAGGAATAAACA 5801

132118188 GCTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCT 132118247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5802 GCTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCT 5861

132118248 GTAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGA 132118307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5862 GTAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGA 5921

132118308 GTTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACC 132118367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5922 GTTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGATAAAGTTATCCTAACC 5981

132118368 CAGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAG 132118427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5982 CAGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGAATGTGGCTGTATTCAG 6041

132118428 AGGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCC 132118487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6042 AGGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCC 6101

132118488 TTGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTG 132118547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6102 TTGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATCTCAGAGGATACAAGTG 6161

132118548 GAAAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAA 132118607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6162 GAAAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAA 6221

132118608 TGAAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCC 132118667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6222 TGAAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCC 6281

132118668 TGTCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGA 132118727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6282 TGTCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGA 6341

132118728 GAAAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAA 132118787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6342 GAAAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAA 6401

132118788 AAGTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTC 132118847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6402 AAGTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTC 6461

132118848 TTACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTA 132118907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6462 TTACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTA 6521

132118908 GAAATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAG 132118967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6522 GAAATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAG 6581

132118968 AACAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGA 132119027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6582 AACAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGA 6641

132119028 GGAAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGT 132119087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6642 GGAAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGT 6701

132119088 GAAATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGA 132119147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6702 GAAATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGA 6761

132119148 ACAACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACT 132119207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6762 ACAACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACT 6821

132119208 CAGCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGAT 132119267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6822 CAGCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGAT 6881

132119268 AGAAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGG 132119327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6882 AGAAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGG 6941

132119328 AATTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATA 132119387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6942 AATTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATA 7001

132119388 ACTGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCA 132119447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7002 ACTGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCA 7061

132119448 CAGGTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCA 132119507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7062 CAGGTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCA 7121

132119508 ATATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATT 132119567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7122 ATATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATT 7181

132119568 TTCAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATA 132119627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7182 TTCAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATA 7241

132119628 AACAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGC 132119687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7242 AACAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGC 7301

132119688 TGGCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTA 132119747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7302 TGGCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTA 7361

132119748 GCTTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACA 132119807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7362 GCTTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACA 7421

132119808 CTGCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATC 132119867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7422 CTGCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATC 7481

132119868 AGAATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATT 132119927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7482 AGAATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATT 7541

132119928 CATGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATA 132119987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7542 CATGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATA 7601

132119988 TATATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAG 132120047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7602 TATATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAG 7661

132120048 ATTATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAAT 132120107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7662 ATTATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAAT 7721

132120108 ATACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAA 132120139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     7722 ATACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAA 7753

Alignment time is 6.4255 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3517] =>      3517 nucs 'mol-32-3487-058449_3517'

Score:        3382
Aligned:      3516        nucs
Identic:      3503 (100%) nucs =>      1908 (100%)      1595 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112020,132113933] EXCISED REGION [132113934,132115535]
 second seq =>  [        1,     1914] EXCISED REGION [     1919,     3517]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1915,1918]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1915,1916] to [1919,1920]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132113933,132113933] to [132113934,132113934]
 second seq =>         1 nucs [1914,1914] to [1919,1919]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112020 TTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCC 132112079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCC 60

132112080 TCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCC 132112139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCCGGTTTCACACCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCC 120

132112140 GCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAG 132112199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCACCATGCCCAGCTAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAG 180

132112200 CCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTG 132112259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAGGAAGGTCTCAATCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTG 240

132112260 GGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGT 132112319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGATTACAGGCATGAGCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGT 300

132112320 ATGAGAATCCAAATAGTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAA 132112379
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGAGAATCCAAATAATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAA 360

132112380 GTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTT 132112439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCAATCTTAATATTTGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTT 420

132112440 TAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTA 132112499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGATCTACATGGAAAATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTA 480

132112500 ATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTT 132112559
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTCTTAAAATGATTTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTT 540

132112560 TTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAAT 132112619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTCCCATTGGAATAATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAAT 600

132112620 CTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTC 132112679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTTCTCCTGGAACCAAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTC 660

132112680 TAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGG 132112739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGTAATCTTATTTATCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGG 720

132112740 CGAAGCGCTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTG 132112799
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGAAGCACTAACTTAATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTG 780

132112800 GCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCT 132112859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCTCTCTCTGTCCAGCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCT 840

132112860 TGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAAT 132112919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGAAGAAGCAACACTGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAAT 900

132112920 ATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGC 132112979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTATCTTCTCTCTTATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGC 960

132112980 ATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAAC 132113039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATCACTTTCTTTAGGAAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAAC 1020

132113040 CAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTT 132113099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAACTAAAATTAGATCATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTT 1080

132113100 AAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGA 132113159
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAACCCAAAGACAGTAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGA 1140

132113160 CAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGC 132113219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAATCAGGTCACTTCATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGC 1200

132113220 TTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGG 132113279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGCCTTTCTGTGTATGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGG 1260

132113280 TCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTA 132113339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTCCCTAAGCCCCTTTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTA 1320

132113340 CTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAG 132113399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTTTAACTGTAAAAACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAG 1380

132113400 CTATGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTC 132113459
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTACGTCTGCTGCAGAATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTC 1440

132113460 AGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATT 132113519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTCCCAGCTGAGTCAATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATT 1500

132113520 AGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAG 132113579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTCATGGGGCAGTGCCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAG 1560

132113580 GAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACT 132113639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGAATAGGTTTTCCAAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACT 1620

132113640 ATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTT 132113699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATGGCTCTTAATTTGGAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTT 1680

132113700 CATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCAC 132113759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CATAGCTGTTAACACACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCAC 1740

132113760 TGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTG 132113819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1741 TGGGCTAGAAGTTTCTTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTG 1800

132113820 TTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTA 132113879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTCTAATACAGTCCTTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTA 1860

132113880 TAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 132113933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAAACATTTGCAATTGATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAAT 1914

EXCISED REGION

132113934 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 132113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TATATTAATATGGTAATGTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTG 1978

132113994 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 132114053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 GTTTTATTTTCTTCATCGACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAG 2038

132114054 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 132114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 ACACAGTCACCAGCTGCATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAA 2098

132114114 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 132114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CAGATTTTCAACCAACTCTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACC 2158

132114174 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 132114233
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TGGTGCAGCTCAACCTGGTTGCATCTTTTGTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCTCACTC 2218

132114234 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 132114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TCACCCAGGCAGGAGAGCAGTGGCACGATCTCGGCTCACTGTAACCTCTGCCTCCCAGGT 2278

132114294 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 132114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TCAAGCAATTCCCCTGCCTCAGCCTTCCGAGTAGCTGGGATTAAACGCGCCTGCCACTAC 2338

132114354 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 132114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 ACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGTGTTTCACCATGTCGGCCAGGCTGGT 2398

132114414 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 132114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CTCAAACTCCTGACCTCGTGGTTTGCCCACCTCGGCCTCCAAAAGTGCTGGGATTACAGG 2458

132114474 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 132114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TGTGAGCCACTGGGCCTGGCCCCTGGTTGCATTTTGACTGTCTCCACTTCTGTTTTAGGG 2518

132114534 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 132114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TTAAACTTTCTTGGGTCTCCTAAAGCAATTACCAAGTGTCCATTTGTTTGTCCATCTAAT 2578

132114594 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTTAAAAAAAAACCAGGTC 132114653
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2579 ATTCTATTAATCACCCTCTTTGTCTTTATGGATCTATGTCTTTT-AAAAAAAACCAGGTC 2637

132114654 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCAGGAGGATTGC 132114713
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     2638 TGGCATGGTGGCTCATACCTGTTATCCCAGCACATCGGGAGGCCAAGGCTGGAGGATTGC 2697

132114714 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 132114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TTGAAGCTAGGGCAACAAAGCAAAACCCTGTCTCTACCAAAAATTAAAAAATTAGCCAGG 2757

132114774 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 132114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TGCATTGGCTTTCACCTGTAGTTCCAACTACTTGGCAGGCTAGGGTGGGAGCATCACCTG 2817

132114834 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 132114893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 AGCCCAGGATTTGAAGGCTGTATTGAGGATATGATTGTACCACTGCACTCAAGAGTCTGG 2877

132114894 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 132114953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 GTGACAACAGAAAGATACTGTCTCTAAAAAAAAAAAAAAAAAATCAAGAAAGTGAATATA 2937

132114954 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 132115013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2938 AGTGTGTATGGTAGATCCATCCTCTTTTCCCAGAAGTCCCTGTTTGCAATAATTCATTTT 2997

132115014 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACAAAATGTTTTGATTTT 132115073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2998 TTATTTTAAAAATTTTCCATTAGTGAGGTATATTTTATATACACCAAATGTTTTGATTTT 3057

132115074 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 132115133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 AGGTGTACTATTCAACAGGTATTGACCTATATATAGGCATTCAATATTCCAGTTTCTCAC 3117

132115134 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 132115193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 TAGAGCCACTTATTCCTTCAACCACCCTCCTTTCTACTACTCTTGTTCTTTGACATTATC 3177

132115194 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 132115253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 ATGACCTCTTTTCTTTTCTCCCAGTTTATCACATCCACCATGTCTTAACCTCATTCAGTA 3237

132115254 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 132115313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 GTTGTGGTTTGAATTGTGTTCCCCAAAAAGTTATGTTGAAGTCCCAAATCTGTAGGATCT 3297

132115314 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 132115373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 GTAGTGTTTGTGTCACCTGTTTCATTCACAACATTGGGAATTTGTGACTTCTTTTTTTCC 3357

132115374 TGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGC 132115433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 TGATGGGTATGATTAGAAGTTTATCAATTTTATTAAGCTTTTCAAAGAAACATCTTTTGC 3417

132115434 TGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCGAGGTGGGTGAATGAC 132115493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||  
     3418 TGGGCATAGGGGCTCAGGCCTGTAATCCCAGCACTTTACAGGCCAAGGTGGGTGAATG-- 3475

132115494 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTG 132115535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 ACTTGAGCCCAGGAGTTTGTGATCAGCCTGGGCAACATAGTG 3517

Alignment time is 2.98269 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2913] =>      2913 nucs 'mol-32-3487-097642_2913'

Score:        2890
Aligned:      2912        nucs
Identic:      2910 (100%) nucs =>       411 (100%)      2499 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132116132,132116542] EXCISED REGION [132116544,132119044]
 second seq =>  [        1,      411] EXCISED REGION [      413,     2913]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132116543,132116543]
 second seq =>         1 nucs [412,412]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [412,412] to [413,413]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132116132 TACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTC 132116191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTC 60

132116192 TTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATT 132116251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATT 120

132116252 TGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAAC 132116311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAAC 180

132116312 ATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGT 132116371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGT 240

132116372 TTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATAT 132116431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATAT 300

132116432 TCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTC 132116491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTC 360

132116492 ACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACT 132116542
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACT 411

EXCISED REGION

132116544 GATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGC 132116603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      413 GATAATTTATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGC 472

132116604 ATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCA 132116663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      473 ATAGCAGGCAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCA 532

132116664 CCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAGGGGCCACACACTTTTAAGCC 132116723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      533 CCTTCTTCACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAGCGGCCACACACTTTTAAGCC 592

132116724 ATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCC 132116783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 ATCAGTTCTCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCC 652

132116784 CATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACAC 132116843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 CATGATTCAGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACAC 712

132116844 GAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGAT 132116903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 GAGATTTGGGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGAT 772

132116904 AAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATG 132116963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 AAATGTTTTCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATG 832

132116964 CATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCT 132117023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 CATTCGGACAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCT 892

132117024 TTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAG 132117083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 TTTTGTCTAGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAG 952

132117084 ATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATC 132117143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 ATGCCTTGGTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATC 1012

132117144 TGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATT 132117203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 TGTTGGTTCATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATT 1072

132117204 GTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAG 132117263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 GTTTCTAGCCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAG 1132

132117264 GTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCT 132117323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 GTACCTAATGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCT 1192

132117324 TAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCT 132117383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 TAGTTTATTTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCT 1252

132117384 CTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGT 132117443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 CTCTGGCTTGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGT 1312

132117444 AGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATA 132117503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 AGAAAAAAATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATA 1372

132117504 TACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATG 132117563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 TACATGTTATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATG 1432

132117564 ATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAA 132117623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 ATGAGAGTTTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAA 1492

132117624 TTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAACGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTAT 132117683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1493 TTATCCATTTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAATGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTAT 1552

132117684 GCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACT 132117743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 GCCAAATATACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACT 1612

132117744 TTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAA 132117803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 TTAATTACCCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAA 1672

132117804 CTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAA 132117863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 CTCCCACAAGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAA 1732

132117864 CCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAG 132117923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 CCCTGGTTAGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAG 1792

132117924 AGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGA 132117983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 AGAAAGTTGACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGA 1852

132117984 GCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTT 132118043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 GCTCCCAATTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTT 1912

132118044 GGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCA 132118103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 GGGGCTAAGTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCA 1972

132118104 TTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGC 132118163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 TTTTGATTGGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGC 2032

132118164 AGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCA 132118223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 AGGTGCTACTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCA 2092

132118224 CTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACA 132118283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 CTTCGAAGCTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACA 2152

132118284 TTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACA 132118343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 TTTGGGTCTATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACA 2212

132118344 GTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTT 132118403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 GTTAAAGATAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTT 2272

132118404 TATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGT 132118463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 TATGGAGAATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGT 2332

132118464 TTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCA 132118523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 TTAGCTATAAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCA 2392

132118524 GAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGA 132118583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 GAGGCATCTCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGA 2452

132118584 GCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCC 132118643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 GCACATTGATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCC 2512

132118644 CATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATC 132118703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 CATCTCACACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATC 2572

132118704 CTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACA 132118763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 CTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACA 2632

132118764 CTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCC 132118823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 CTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCC 2692

132118824 TACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGA 132118883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 TACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGA 2752

132118884 CCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCC 132118943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 CCATTGTATATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCC 2812

132118944 TAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGG 132119003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 TAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGG 2872

132119004 CCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 132119044
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 CCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAA 2913

Alignment time is 2.4666 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4342] =>      4342 nucs 'mol-32-349d-163532_4342'

Score:        4287
Aligned:      4342        nucs
Identic:      4337 (100%) nucs =>       113 (100%)      4224 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132115898,132116010] EXCISED REGION [132116012,132120240]
 second seq =>  [        1,      113] EXCISED REGION [      115,     4342]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [132116011,132116011]
 second seq =>         1 nucs [114,114]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [132119455,132119455]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [132116010,132116010] to [132116011,132116011]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132115898 CCAGGCTTGAGTGCAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAA 132115957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAGGCTTGAGTGCAGTGGCATGATCCTTGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGCCCAA 60

132115958 GTGATTCTTGTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCAC 132116010
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGATTCTTGTACCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGCGACTACAGGCATGTGCCAC 113

EXCISED REGION

132116012 ATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGC 132116071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      115 ATGCCCAGCTAATTTTTTTGTATTTTTAGTAGAAACAGGGTTTTACCATGTTGCCCAGGC 174

132116072 TGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 132116131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      175 TGGTCTTCAACTCTGGGGCTCAAGCCATCCATCCGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 234

132116132 TACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTC 132116191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      235 TACAAGCATGAGTCACCACACCTGGCTTAACTGGAGTAGTTCTAATTCCATTTCACCCTC 294

132116192 TTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATT 132116251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      295 TTATGCTGTGTGTCTGACTTTTGTGTATGTTACAAATCCCATGATAAATTCACATTCATT 354

132116252 TGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAAC 132116311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      355 TGGCTCAATTGAATTATACTTTAAAGAGATAAAAATGAGAAAAATCATATTTATTCAAAC 414

132116312 ATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGT 132116371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      415 ATTTATAATTTCCTTACTTTTTATTCTTTTTTATAGATCTAAATTTTAGCCTGGTATCGT 474

132116372 TTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATAT 132116431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      475 TTTCCTTCTGCCTGAAGAATCTCCTTTAATATTTTTCATAGTGCAATTCCGGGGATATAT 534

132116432 TCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTC 132116491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      535 TCTCTGTTTTGTTGGTCTGAATATGTCTTTATTATATCTTTGTTTTTTAAAGACATTTTC 594

132116492 ACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTT 132116551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      595 ACTGGGTGTGTAAGTCCATTCTCACACTGCTACAAAGAACTACCTGAAACTAGATAATTT 654

132116552 ATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGG 132116611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      655 ATGAAGAAAAGAGGTTTAATTGACTCTCAGTTCCACAGGATGTACATGAAGCATAGCAGG 714

132116612 CAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTC 132116671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 CAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATTGCTGAAGGGCAAAAGGGAAGCAAGCACCTTCTTC 774

132116672 ACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAGGGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTC 132116731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      775 ACATGGCGACAGCAGAGAGAGTGAAGGGGGAGCGGCCACACACTTTTAAGCCATCAGTTC 834

132116732 TCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTC 132116791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      835 TCATGAGAACTCACTCACTGTCATGAGACCAGCAAGGGGGAAAATCTGCCCCCATGATTC 894

132116792 AGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTG 132116851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 AGTCACCTCCTACCAGGTCCCTTCCCCAACACTAGGAATTACAATTCAACACGAGATTTG 954

132116852 GGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTT 132116911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 GGTGGAGACACAGAGCCAAACTACATCACTGGGTAAAGAATTAAAGTTTGATAAATGTTT 1014

132116912 TCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGA 132116971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 TCTCTCTCTCTGTACTTTAAAGATATCACTCCATTTTCTTTTGGTTCAAATGCATTCGGA 1074

132116972 CAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCT 132117031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 CAAGAAGTCTTCCATGATTCTTATCTTTTTACCCTTTGTATACAATGTATCTTTTTGTCT 1134

132117032 AGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTG 132117091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 AGCTGCTTTTAAGATTTTTAAAAATACTCTTTTTCAGCAGTTTGACTATGAGATGCCTTG 1194

132117092 GTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTT 132117151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 GTGTGGTCTTTCAGTGTCTATTCTGCTTGGCATTTGTTAAAATTCTGGAATCTGTTGGTT 1254

132117152 CATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAG 132117211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 CATAGTTTTCTTCAAAATGGAAAAGTGTTATTCCATTATTCTTTCAGATATTGTTTCTAG 1314

132117212 CCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAA 132117271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 CCATCGTTTTTGTAGAATCCTAATACACGTATGCTAATTATATGTCCCTTAGGTACCTAA 1374

132117272 TGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTAT 132117331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TGCTCTGCTAATTTCTTTTTGGTCTTATTTTTCTCTGTGTGCTTATTTTGCTTAGTTTAT 1434

132117332 TTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCT 132117391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 TTGTAGCAAATATTCTCCTAGGTAGGTGAAAAGGAAGGCCATGTTCTTGCCTCTCTGGCT 1494

132117392 TGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAA 132117451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 TGGCTTTCTGCTTCCCATGATCGTACATAACCAGCTTTGATGATTTATCAGTAGAAAAAA 1554

132117452 ATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTT 132117511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 ATTGACATCCCATATTGGTGAATTTTTTTAAATTGTTAAGATTTTTTATATATACATGTT 1614

132117512 ATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGT 132117571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 ATGGTCGTATACTAGCAGGGGCATAAGTGAGTAAAAATTTTTGAAAAGAATGATGAGAGT 1674

132117572 TTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCAT 132117631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 TTCTTTGGTTTTGTTTTCCTGTGTGTGTGATTTGATCCCTAATCAACCAGAATTATCCAT 1734

132117632 TTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAACGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATA 132117691
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 TTGCCTCAGAGCATGGGGAGGGAGATAATGTAGGGAGGCTTGGCTTCTTTATGCCAAATA 1794

132117692 TACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTAC 132117751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 TACAAAAAAAAAGAAATTATTATTGTTAGCTTTCTGCTGCAAAAATATAACTTTAATTAC 1854

132117752 CCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACA 132117811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 CCAGCAAAGCAAGGTGCTGTTAAGAGAGAAAATTATTTCTAAACTTCTTAAACTCCCACA 1914

132117812 AGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTT 132117871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 AGCATTATTAAGAGTACGGTCTGAAAGGCTTGAATATTCAGTTTACTATAAACCCTGGTT 1974

132117872 AGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTT 132117931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 AGAAAAAAGTCAGGAGATGCTGTACAGGAAGTCTCTGCTACCCGGGAATGAGAGAAAGTT 2034

132117932 GACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAA 132117991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 GACTCTTTTGACTCTGTGGAGTGTGGAAAAAGAGTGAAAAGAGTTAAGGGGAGCTCCCAA 2094

132117992 TTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAA 132118051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 TTACACATCTTTATGATGCCTTTACTTTATGGTAAGCTGAAATCTTAGATTTGGGGCTAA 2154

132118052 GTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATT 132118111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 GTGTTGGGTAAGGTTGGTAGAAAGCCTGAAGTACAGATGTTTGTACCCTGCATTTTGATT 2214

132118112 GGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTA 132118171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 GGACCTCATGGAGGAGGAGACTGTTGGACGAATGTTCCCCTCATCAATACGCAGGTGCTA 2274

132118172 CTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAG 132118231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 CTTCCAGGAATAAACAGCTGTGCCACGTGTCTAAGCAGAATCCAAGGTAGCACTTCGAAG 2334

132118232 CTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTC 132118291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 CTTCATTGACTCTCCTGTAGGAAGAGAGCAATCCAGAAGCTACCCCATGACATTTGGGTC 2394

132118292 TATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGA 132118351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 TATGGTAGGTACCTGAGTTGAGAGTCATTGGAGTAATACTGTGGACCTCACAGTTAAAGA 2454

132118352 TAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGA 132118411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 TAAAGTTATCCTAACCCAGAGAGCCAAAATTAAAGAGCTTAGATCATGGCTTTATGGAGA 2514

132118412 ATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTAT 132118471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 ATGTGGCTGTATTCAGAGGTGTCTGCTGCTGTACCATGAACTGAGGTAGAGTTTAGCTAT 2574

132118472 AAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATC 132118531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 AAAAGACCTCTGAGCCTTGATGAAGCTAAGAAAACAAGTCAGAAATTTGCCAGAGGCATC 2634

132118532 TCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTG 132118591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 TCAGAGGATACAAGTGGAAAGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTG 2694

132118592 ATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCAC 132118651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 ATCAGCAAGGACATAATGAAGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCAC 2754

132118652 ACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAA 132118711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 ACTGCCACAACAACCCTGTCCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAA 2814

132118712 GATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTA 132118771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 GATTAAAGGCAGCAGAGAAAACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTA 2874

132118772 TCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTA 132118831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 TCACAAAGATACTGAAAAGTATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTA 2934

132118832 CCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTA 132118891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 CCATCTCAATCCCTTCTTACCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTA 2994

132118892 TATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTC 132118951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 TATACACATCTGACTAGAAATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTC 3054

132118952 AGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTAT 132119011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 AGAATAATATCCAAAGAACAGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTAT 3114

132119012 AGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACA 132119071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 AGCAATTTGTCTCAGAGGAAACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACA 3174

132119072 ATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAA 132119131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 ATAAATAGGAACCAGTGAAATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAA 3234

132119132 CTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACC 132119191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 CTCCCTTTCTTTTGGAACAACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACC 3294

132119192 ATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTG 132119251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 ATCTTAAACCTTAACTCAGCTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTG 3354

132119252 AGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGAC 132119311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 AGTTATCCAAAAGGATAGAAAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGAC 3414

132119312 ATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTA 132119371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3415 ATTGGTATAGATAGGGAATTCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTA 3474

132119372 ATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAA 132119431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 ATCCTTTGCAGACATAACTGGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAA 3534

132119432 GGATAAGTCAGTCTCACAGGTACTTTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAAT 132119491
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 GGATAAGTCAGTCTCACAGGTAC-TTTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAAT 3593

132119492 ACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAA 132119551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 ACTGACTCATTTGTCAATATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAA 3653

132119552 AAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAA 132119611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 AAATCTGGGATAGATTTTCAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAA 3713

132119612 TGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGA 132119671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 TGAAAGTATTAAAATAAACAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGA 3773

132119672 TCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACA 132119731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 TCATAGGCAGTCAAGCTGGCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACA 3833

132119732 ACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATA 132119791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 ACAGTGGGAGTTTGTAGCTTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATA 3893

132119792 GTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAA 132119851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 GTGCAGTGTGAAAACACTGCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAA 3953

132119852 AAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTC 132119911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 AAACAGAAAAATAATCAGAATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTC 4013

132119912 AACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAG 132119971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 AACTAAAACTACAATTCATGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAG 4073

132119972 TGTGTGTATGCAGATATATATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTT 132120031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 TGTGTGTATGCAGATATATATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTT 4133

132120032 CTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACA 132120091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 CTTTAAAAAGCATAAGATTATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACA 4193

132120092 AGACATATAGATTAATATACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATG 132120151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 AGACATATAGATTAATATACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATG 4253

132120152 TATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTG 132120211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 TATTACATGAAAATTGCTATATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTG 4313

132120212 ATAAATGGAAAATACATATTGTAACTCCT 132120240
          ||||||.||||||||||||||||||||||
     4314 ATAAATTGAAAATACATATTGTAACTCCT 4342

Alignment time is 3.67005 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [132104228,132128550] =>     24323 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3896] =>      3896 nucs 'mol-32-34b3-177331_3896'

Score:        3743
Aligned:      3896        nucs
Identic:      3878 (100%) nucs =>      2188 (100%)      1690 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [132112035,132114228] EXCISED REGION [132118551,132120247]
 second seq =>  [        1,     2198] EXCISED REGION [     2201,     3896]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4322 nucs [132114229,132118550]
 second seq =>         2 nucs [2199,2200]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2198,2199] to [2200,2201]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

132112035 GGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACC 132112094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTGGAGTGCAGTGGCACCATCTTGGCTCACTGCAAGCCCTGCCTCCCGGTTTCACACC 60

132112095 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGC 132112154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGCAGCTGGGACTACAGGCACCCGCCACCATGCCCAGC 120

132112155 TAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAA 132112214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATTTTTTTGTACTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGAAGGTCTCAA 180

132112215 TCTTCTGACCTCGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 132112274
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTCTGACCTTGTGATCCGCCTGCCTCGGCCTCCCATAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 240

132112275 GCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATA 132112334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCACTGCGTCCGGCTGCAGTTTAAACACTTTCTAAAGAAAAAGTATGAGAATCCAAATA 300

132112335 GTATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATT 132112394
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATATGGGAGATTTCTTTATATTTAATGTTTTTATGCTATAATAAAGTCAATCTTAATATT 360

132112395 TGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAA 132112454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATCCTCAGTTTGTTGATAGCAAGTTCTCAGAATTACTTGATTTTAGATCTACATGGAA 420

132112455 AATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGAT 132112514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATTTGCAACTTGTACGTAATTACCATTCCATTCATCTTACATTAATTTCTTAAAATGAT 480

132112515 TTTACTTATAGTTCAGAGACAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAAT 132112574
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTACTTATAGTTCAGAGGCAATGAAGATATTTTTGGAGGCTGTTTTCTCCCATTGGAAT 540

132112575 AATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACC 132112634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATTTTGTACATAGAATATTTACACATAGTATTATTCCTGTAAATCTTTCTCCTGGAACC 600

132112635 AAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTA 132112694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAGTATCACAACTCATCCTGTCTTTAATTGGCTTGCCAAACTTTCTAGTAATCTTATTTA 660

132112695 TCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCGCTAACTTA 132112754
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      661 TCTTTTTCTGACTTGTAGAAAAGAATTTTCCAAGATACGGGTGGGCGAAGCACTAACTTA 720

132112755 ATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCA 132112814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCACCTCATTCATTCAGTGCCTAGATGTCAGCTGAACATTTCTGGCCTCTCTCTGTCCA 780

132112815 GCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACAC 132112874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTGTGATGAGCTTCAGTGCATTCGAGTGCTTGCACTGCAGGTCTTGGAAGAAGCAACAC 840

132112875 TGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTT 132112934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTCATGCCTATGAATCTGTGTATGTGGCTTCTTCATCCTGAAATATTATCTTCTCTCTT 900

132112935 ATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGG 132112994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTCTTTGCCTAAATCTTGGGGGGTCCTTCAAGATTCGCTCAGGCATCACTTTCTTTAGG 960

132112995 AAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGAT 132113054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGTCTTCTATGACCCCAGTACTTTTTGTATGTAATAAAAGAAACCAACTAAAATTAGAT 1020

132113055 CATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAG 132113114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATGACAAAAAGGAGGGACATTGTTTTAAGAATAAAGAAATATTTAAAACCCAAAGACAG 1080

132113115 TAGGTGAGGGAGAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTC 132113174
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGGTGAGGGAAAGTAGAGCCACGCAGGTGGGGGCTAGGGCCCGACAATCAGGTCACTTC 1140

132113175 ATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTA 132113234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGTTCCCTCCTGTCTCCGTTTCTTTCCAAAAGCTCGCTCCGTGCTTGCCTTTCTGTGTA 1200

132113235 TGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCT 132113294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGGCAGATTCCTCTGCTGACTCACCTTGCGCACAGCACAGCATGGTCTCCCTAAGCCCCT 1260

132113295 TTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAA 132113354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTCTATTAGGTTGGCACAAAAGTAATCGCGGTTTTTGTCATTACTTTTAACTGTAAAA 1320

132113355 ACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAG 132113414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACCACGGTTGCTTTTGCGCCAGCCTAATACGTCATGATCTTCCAGCTATGTCTGCTGCAG 1380

132113415 AATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTC 132113474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATTCTCAAGCAACAGAAAACCTCAAACCAAGCCAAGGAAACCTCAGTCCCAGCTGAGTC 1440

132113475 AATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTG 132113534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATGGGTTGCTGGATTTCTGTGAGGCCTCCCTCTCTGTTCAAATTAGTCATGGGGCAGTG 1500

132113535 CCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCC 132113594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCATGTCCCAGGATCTGTGGGACTTCCCCTTCTAGTGGCTGTCAGGAGAATAGGTTTTCC 1560

132113595 AAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTG 132113654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAGTGGACACAGGATAGGTGTAAACAATGATGGTCAAAAGGACTATGGCTCTTAATTTG 1620

132113655 GAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACAC 132113714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAATTGGTACCTTTCCGACGGACTCCAATACATTGTATTTTCTTTCATAGCTGTTAACAC 1680

132113715 ACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTC 132113774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTGAATTGCAATTAACTATTAATATATTTCTCTGTCCTCCCCACTGGGCTAGAAGTTTC 1740

132113775 TTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCCTATTGTTTCTAATACAGTCC 132113834
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1741 TTGTAAGAATGGGCCACTCTTTTTTTCTTTTCTTTATCCGTATTGTTTCTAATACAGTCC 1800

132113835 TTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATT 132113894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGGTATACAGTGTGTTCAAAGGACGGATATATTATTATTCAGTATAAACATTTGCAATT 1860

132113895 GATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTA----TATTAATATGGTAAT 132113950
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||
     1861 GATTTTCCATATTATTATGGTAATGATATGTTAATTAATTAAATATATTAATATGGTAAT 1920

132113951 GTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTTTCTTCATC 132114010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTTTTGCTTCTCTGTTCTGGAATCCTAGAGTCCAAGGGCTCTGGTTTTATTTTCTTCATC 1980

132114011 GACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCACCAGCTGC 132114070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GACTAGACCTCACCTCCAGTTTTCTCTTGATAAAAGGGAAGAGACACAGTCACCAGCTGC 2040

132114071 ATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTCAACCAACT 132114130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATGGAGGCAGAAAAATAATCTGGCCTTCTAACAGCTTCTTAAACAGATTTTCAACCAACT 2100

132114131 CTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACCTG 132114190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTCTTGTTTTCTAGTCCTACCTTCATCCTCTAACAGAACTACCTGGTGCAGCTCAACCTG 2160

132114191 GTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 132114228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTTGCATCTTTTTTGTGTGTGTGTGTGAGATGGAGTCT 2198

EXCISED REGION

132118551 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 132118610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 AGTTCCCAGGGACCATATCAGACCAGACACTGAGCACATTGATCAGCAAGGACATAATGA 2260

132118611 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 132118670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 AGAACTCAAAGAGAAGCAAGCCAGTGCAAGGCCCATCTCACACTGCCACAACAACCCTGT 2320

132118671 CCACCTCCTGCCAGTAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 132118730
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 CCACCTCCTGCCAATAAACATCCAGACACAATCCTGGGAAAGATTAAAGGCAGCAGAGAA 2380

132118731 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 132118790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 AACAGGAATAATGAACACATCTATCTCCAAACACTGAGTTATCACAAAGATACTGAAAAG 2440

132118791 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 132118850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 TATTGAGATGATATGATCTCATTTCCCCTCCCCTACCCCTACCATCTCAATCCCTTCTTA 2500

132118851 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 132118910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 CCCAGTGGGATGAAGGCTTATAAGGACACTGGACCATTGTATATACACATCTGACTAGAA 2560

132118911 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 132118970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 ATGTGTAGATTTTTGTCTTTTCCATACATTTCCTAAAATTCAGAATAATATCCAAAGAAC 2620

132118971 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 132119030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 AGACATGATGCCCACAATAAGTAGAAGGAGTGGCCCTTTATAGCAATTTGTCTCAGAGGA 2680

132119031 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 132119090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 AACTGCCCATGGAAACTTCATAATTTTAGAGAATTTCAACAATAAATAGGAACCAGTGAA 2740

132119091 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 132119150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 ATTCTGGTGAACATTTGTTATCTTTGCTATCCAGCATGAAACTCCCTTTCTTTTGGAACA 2800

132119151 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 132119210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 ACATATCAATTATATATTGAGGATCCAGCCCCTTCTTAACCATCTTAAACCTTAACTCAG 2860

132119211 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 132119270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 CTCAACACATTTTGGCTCTTTCTATACTACGCCAATCACTGAGTTATCCAAAAGGATAGA 2920

132119271 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 132119330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 AAGGGATTGAGATAATGTGATTTAGTATTTATAGAGTAGACATTGGTATAGATAGGGAAT 2980

132119331 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAGTTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 132119390
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2981 TCCTAGCCTACAGTTCAAATGAAGGCTGAGGAAAAATTTTAATCCTTTGCAGACATAACT 3040

132119391 GGTACACCCTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 132119450
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 GGTACACCTTTAGGGACAGAGTTTGCAAATTAGAAGCCTAAGGATAAGTCAGTCTCACAG 3100

132119451 GTACTT-TTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGACTCATTTGTCAAT 132119509
          ||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3101 GTAC--ATTTTTTTTTTTGGCTTCCATGGTGTTTTTAAAAATACTGATTCATTTGTCAAT 3158

132119510 ATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTT 132119569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3159 ATTTAAAAATTGAAAAAAATCTAGTTTCCAGTACTTATTTAAAAATCTGGGATAGATTTT 3218

132119570 CAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAA 132119629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3219 CAGATATGAAAGTTAAAAGAGTGGCAAATTCATTCCACAAAATGAAAGTATTAAAATAAA 3278

132119630 CAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTG 132119689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3279 CAATACTCTCAACAACACCCATTTCAGGGTTATGTAAATTGATCATAGGCAGTCAAGCTG 3338

132119690 GCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGC 132119749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3339 GCCATTTTTACTCCTGAAAAACTGCTGGAGCTTTAGATAACAACAGTGGGAGTTTGTAGC 3398

132119750 TTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACT 132119809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3399 TTTTAGCCACTGTAGGGATAGACTTAATTTGATAGAATCATAGTGCAGTGTGAAAACACT 3458

132119810 GCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAG 132119869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3459 GCTTTGTAAAAGTGACAACACTGGTAAAAACAAACTAACGAAAAACAGAAAAATAATCAG 3518

132119870 AATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCA 132119929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3519 AATTCAGAGTTGTTATAACATATATTTGAAAGTCAAGTTTTCAACTAAAACTACAATTCA 3578

132119930 TGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATA 132119989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3579 TGCAAAGAAGGTATTGTGACTCATACGCAGGGAAAAAATTAGTGTGTGTATGCAGATATA 3638

132119990 TATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGAT 132120049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3639 TATACATATACATGTGTGTATATATATACCTAATCTTAATTTCTTTAAAAAGCATAAGAT 3698

132120050 TATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATAT 132120109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3699 TATTTAAAGCTATGATTGTAACACTGCAACACTGACTTTACAAGACATATAGATTAATAT 3758

132120110 ACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCT 132120169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3759 ACGACAGTAATAACAGAAAAGAGGGATGAATAAATAGATATGTATTACATGAAAATTGCT 3818

132120170 ATATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATGGAAAATACATA 132120229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3819 ATATTTTACCAGAATTAAGTCAGTTTCAATCTGAAGTAGGTGATAAATTGAAAATACATA 3878

132120230 TTGTAACTCCTAGAACAA 132120247
          ||||||||||||||||||
     3879 TTGTAACTCCTAGAACAA 3896

Alignment time is 3.29838 s

