
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3356] =>      3356 nucs 'mol-32-1e7c-191844_3356'

Score:        3257
Aligned:      3356        nucs
Identic:      3347 (100%) nucs =>       269 (100%)      3078 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131417700,131417968] EXCISED REGION [131417970,131421056]
 second seq =>  [        1,      269] EXCISED REGION [      271,     3356]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [131417969,131417969]
 second seq =>         1 nucs [270,270]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [131419610,131419610]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [270,270] to [271,271]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131417700 AAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGG 131417759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGG 60

131417760 GCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAA 131417819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAA 120

131417820 TTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAG 131417879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAG 180

131417880 CAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAA 131417939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAA 240

131417940 ACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCT 131417968
          |||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCT 269

EXCISED REGION

131417970 GCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAA 131418029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      271 GCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAA 330

131418030 AGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAG 131418089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      331 AGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAG 390

131418090 CTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTAC 131418149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      391 CTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTAC 450

131418150 ACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGA 131418209
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      451 ACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGA 510

131418210 GATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAG 131418269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      511 GATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAG 570

131418270 ACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCAT 131418329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      571 ACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCAT 630

131418330 TACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATA 131418389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      631 TACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATA 690

131418390 TGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAA 131418449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      691 TGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAA 750

131418450 TAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAA 131418509
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      751 TAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAA 810

131418510 AAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAA 131418569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      811 AAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAA 870

131418570 ACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAAT 131418629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      871 ACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAAT 930

131418630 GGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGG 131418689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      931 GGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGG 990

131418690 AGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGT 131418749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      991 AGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGT 1050

131418750 TATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCAC 131418809
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1051 CATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCAC 1110

131418810 ATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTG 131418869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1111 ATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTG 1170

131418870 TTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGC 131418929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1171 TTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGC 1230

131418930 ACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTA 131418989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1231 ACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTA 1290

131418990 ATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAAT 131419049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1291 ATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAAT 1350

131419050 AAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTG 131419109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 AAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTG 1410

131419110 GCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCT 131419169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 GCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCT 1470

131419170 CTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAG 131419229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 CTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAG 1530

131419230 TTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGC 131419289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 TTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGC 1590

131419290 ATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTT 131419349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1591 ATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTT 1650

131419350 CCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTG 131419409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 CCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTG 1710

131419410 CACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACT 131419469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 CACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACT 1770

131419470 GGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACT 131419529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 GGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACT 1830

131419530 TGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTT 131419589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 TGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTT 1890

131419590 CAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCC 131419649
          |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 CAGGTTTTTCTTTCTTTTTC-TTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCC 1949

131419650 AGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGA 131419709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 AGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGA 2009

131419710 GATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGG 131419769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 GATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGG 2069

131419770 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAA 131419829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 CTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAA 2129

131419830 CTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTG 131419889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 CTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTG 2189

131419890 AGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGACT 131419949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 AGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGACT 2249

131419950 TCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGCTT 131420009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 TCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGCTT 2309

131420010 TATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTACCT 131420069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 TATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTACCT 2369

131420070 TTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAGTCTGTAAAATAGTGCATAG 131420129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2370 TTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAATCTGTAAAATAGTGCATAG 2429

131420130 GATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGATTGG 131420189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 GATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGATTGG 2489

131420190 AGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATTCCTT 131420249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 AGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATTCCTT 2549

131420250 TTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGAAG 131420309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 TTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGAAG 2609

131420310 AACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTGAC 131420369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 AACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTGAC 2669

131420370 CTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATTAT 131420429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 CTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATTAT 2729

131420430 TCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTATTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGC 131420489
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 TCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGC 2789

131420490 GGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCATCT 131420549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 GGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCATCT 2849

131420550 GTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGTGT 131420609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 GTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGTGT 2909

131420610 ATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCATG 131420669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 ATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCATG 2969

131420670 ACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTAGA 131420729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 ACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTAGA 3029

131420730 ATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATATTT 131420789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 ATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATATTT 3089

131420790 CTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAATTTAC 131420849
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3090 CTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAACTTAC 3149

131420850 ATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTGAC 131420909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 ATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTGAC 3209

131420910 TTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTAGC 131420969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 TTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTAGC 3269

131420970 ATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAAATG 131421029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 ATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAAATG 3329

131421030 TCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATA 131421056
          |||||||||||||||||||||||||||
     3330 TCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATA 3356

Alignment time is 2.5328 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     6721] =>      6721 nucs 'mol-32-1f00-018089_6721'

Score:        6573
Aligned:      6722        nucs
Identic:      6706 (100%) nucs =>      1230 (100%)      5476 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131413677,131414908] EXCISED REGION [131414944,131420430]
 second seq =>  [        1,     1232] EXCISED REGION [     1234,     6721]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        35 nucs [131414909,131414943]
 second seq =>         1 nucs [1233,1233]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [131414906,131414908] to [131414944,131414946]
 second seq =>         3 nucs [1230,1232] to [1234,1236]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [131414909,131414919] to [131414933,131414943]
 second seq =>         0 nucs

131413677 GGGTGTCATTATACTACTCTGTCTGCTTTGGGGTATGCTTGAAATTTTATAACTTTTTTA 131413736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGTGTCATTATACTACTCTGTCTGCTTTGGGGTATGCTTGAAATTTTATAACTTTTTTA 60

131413737 ACACAAGCATTTAACAGCTATATAACATAAATTTTAAAAAGTAAGAATGTGACCATTATG 131413796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACACAAGCATTTAACAGCTATATAACATAAATTTTAAAAAGTAAGAATGTGACCATTATG 120

131413797 TGCCTCTGATTATAGTTTTTAAATTCCAAATAAAAAAGTGAATATAAGAAAAAAAAATCT 131413856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCCTCTGATTATAGTTTTTAAATTCCAAATAAAAAAGTGAATATAAGAAAAAAAAATCT 180

131413857 TAAAGGCAGCTACAAAGTGAAGTCCATTAGAGAAACAGCAGGCCTCTCAGCTGAAACCCT 131413916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAAGGCAGCTACAAAGTGAAGTCCATTAGAGAAACAGCAGGCCTCTCAGCTGAAACCCT 240

131413917 ACAAGCCAGAAAAGATTGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAAGAGGCTGGTCATG 131413976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAAGCCAGAAAAGATTGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAAGAGGCTGGTCATG 300

131413977 GTGGCTCATACCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACCTGACAT 131414036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGGCTCATACCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACCTGACAT 360

131414037 CAGGAGTTCGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTACAAATACAAA 131414096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGGAGTTCGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTACAAATACAAA 420

131414097 ATTAGCCGGGCGTGGTGGTATGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGTGGCTGTGGCAGGA 131414156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTAGCCGGGCGTGGTGGTATGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGTGGCTGTGGCAGGA 480

131414157 GAATTGCTTCAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCC 131414216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAATTGCTTCAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCC 540

131414217 AGCCCAGGTGACATAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAA 131414276
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCCCAGGTGACAGAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAA 600

131414277 AATTCCAACCTAGAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTTTCAAAAAAGCAAAT 131414336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATTCCAACCTAGAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTTTCAAAAAAGCAAAT 660

131414337 GCTCAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTGAAGAAAGTACTAAA 131414396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCTCAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTGAAGAAAGTACTAAA 720

131414397 CATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAAGTACACAGATCAGT 131414456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAAGTACACAGATCAGT 780

131414457 GACACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGTAACATCATGATGAA 131414516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGTAACATCATGATGAA 840

131414517 CAGAACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCCCCAAT 131414576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAGAACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCCCCAAT 900

131414577 TAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGTCTTCT 131414636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGTCTTCT 960

131414637 TTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTTGCATA 131414696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTTGCATA 1020

131414697 TCTCACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAAACATCTACCAAGC 131414756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTCACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAAACATCTACCAAGC 1080

131414757 AAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTA 131414816
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTA 1140

131414817 AACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCA 131414876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCA 1200

131414877 ACAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 131414908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 1232

EXCISED REGION

131414944 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 131415003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1234 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 1293

131415004 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 131415063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1294 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 1353

131415064 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 131415123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1354 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 1413

131415124 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 131415183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1414 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 1473

131415184 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 131415243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 1533

131415244 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 131415303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 1593

131415304 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 131415363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 1653

131415364 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 131415423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 1713

131415424 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 131415483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 1773

131415484 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 131415543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 1833

131415544 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 131415603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 1893

131415604 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 131415663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 1953

131415664 TT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 131415721
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 --GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 2011

131415722 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 131415781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 2071

131415782 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTC-AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 131415840
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 2131

131415841 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 131415900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 2191

131415901 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 131415960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 2251

131415961 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 131416020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 2311

131416021 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 131416080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 2371

131416081 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 131416140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 2431

131416141 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 131416200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 2491

131416201 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 131416260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 2551

131416261 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 131416320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 2611

131416321 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 131416380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 2671

131416381 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 131416440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 2731

131416441 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 131416500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 2791

131416501 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 131416560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 2851

131416561 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 131416620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 2911

131416621 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 131416680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 2971

131416681 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 131416740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 3031

131416741 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 131416800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 3091

131416801 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 131416860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 3151

131416861 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 131416920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 3211

131416921 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 131416980
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 3271

131416981 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 131417040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 3331

131417041 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 131417100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 3391

131417101 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 131417160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 3451

131417161 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 131417220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3452 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 3511

131417221 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 131417280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3512 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 3571

131417281 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 131417340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 3631

131417341 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 131417400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3632 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 3691

131417401 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 131417460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3692 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 3751

131417461 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGT 131417520
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3752 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGG 3811

131417521 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 131417580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3812 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 3871

131417581 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 131417640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3872 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 3931

131417641 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 131417700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3932 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 3991

131417701 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 131417760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3992 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 4051

131417761 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 131417820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4052 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 4111

131417821 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 131417880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4112 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 4171

131417881 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 131417940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4172 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 4231

131417941 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 131418000
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4232 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 4291

131418001 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 131418060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4292 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 4351

131418061 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 131418120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4352 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 4411

131418121 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAA 131418180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4412 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAA 4471

131418181 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 131418240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4472 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 4531

131418241 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 131418300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4532 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 4591

131418301 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 131418360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4592 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 4651

131418361 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 131418420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4652 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 4711

131418421 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 131418480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4712 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 4771

131418481 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 131418540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4772 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 4831

131418541 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 131418600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4832 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 4891

131418601 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 131418660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4892 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 4951

131418661 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 131418720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4952 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 5011

131418721 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 131418780
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5012 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 5071

131418781 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 131418840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5072 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 5131

131418841 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 131418900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 5191

131418901 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 131418960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5192 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 5251

131418961 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 131419020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5252 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 5311

131419021 ACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 131419080
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5312 ATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 5371

131419081 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 131419140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5372 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 5431

131419141 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 131419200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5432 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 5491

131419201 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 131419260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5492 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 5551

131419261 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 131419320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5552 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 5611

131419321 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 131419380
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5612 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 5671

131419381 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 131419440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5672 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 5731

131419441 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 131419500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5732 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 5791

131419501 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCC 131419560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5792 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCC 5851

131419561 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT 131419620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5852 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT 5911

131419621 TTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTC 131419680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5912 TTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTC 5971

131419681 ATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTG 131419740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5972 ATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTG 6031

131419741 GGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGT 131419800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6032 GGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGT 6091

131419801 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAG 131419860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6092 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAG 6151

131419861 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTT 131419920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6152 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTT 6211

131419921 ATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAAC 131419980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6212 ATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAAC 6271

131419981 CATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATAT 131420040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6272 CATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATAT 6331

131420041 ATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCT 131420100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6332 ATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCT 6391

131420101 TAATACCTAGTCTGTAAAATAGTGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACAT 131420160
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6392 TAATACCTAATCTGTAAAATAGTGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACAT 6451

131420161 ACATGTCAAACCAACAAATGAATGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTA 131420220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6452 ACATGTCAAACCAACAAATGAATGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTA 6511

131420221 TCCATATGCCTATGGGACACATATTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTT 131420280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6512 TCCATATGCCTATGGGACACATATTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTT 6571

131420281 TAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTG 131420340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6572 TAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTG 6631

131420341 TGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCC 131420400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6632 TGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCC 6691

131420401 AACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATTATT 131420430
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     6692 AACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATTATT 6721

Alignment time is 5.35171 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4242] =>      4242 nucs 'mol-32-1f00-117010_4242'

Score:        3916
Aligned:      4037        nucs
Identic:      4026 (100%) nucs =>      1015 (100%)      3011 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131416987,131418002] EXCISED REGION [131418988,131422008]
 second seq =>  [      191,     1206] EXCISED REGION [     1222,     4242]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       985 nucs [131418003,131418987]
 second seq =>        15 nucs [1207,1221]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1207,1207] to [1222,1222]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131416987 GCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGC 131417046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      191 GCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGC 250

131417047 CCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCA 131417106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      251 CCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCA 310

131417107 CACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAA 131417166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      311 CACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAA 370

131417167 CAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACAT 131417226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      371 CAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACAT 430

131417227 TCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAAT 131417286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      431 TCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAAT 490

131417287 TCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAA 131417346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 TCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAA 550

131417347 AAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTA 131417406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 AAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTA 610

131417407 AGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCT 131417466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 AGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCT 670

131417467 ACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTATAGAG 131417526
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      671 ACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGATAGAG 730

131417527 AACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAAC 131417586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 AACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAAC 790

131417587 ACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATA 131417646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 ACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATA 850

131417647 TGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGG 131417706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 TGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGG 910

131417707 ATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATAC 131417766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 ATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATAC 970

131417767 CATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAAC 131417826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 CATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAAC 1030

131417827 AGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATA 131417886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 AGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATA 1090

131417887 AACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACAC 131417946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 AACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACAC 1150

131417947 ATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAA 131418002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 ATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAA 1206

EXCISED REGION

131418988 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 131419047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1222 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 1281

131419048 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 131419107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1282 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 1341

131419108 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 131419167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1342 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 1401

131419168 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 131419227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1402 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 1461

131419228 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 131419287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1462 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 1521

131419288 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCT 131419347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1522 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTT 1581

131419348 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 131419407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1582 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 1641

131419408 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 131419467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1642 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 1701

131419468 CTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 131419527
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 CTGGTCCTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 1761

131419528 CTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 131419587
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 CTTGCCGAATCCTTTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 1821

131419588 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCAC 131419647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCAC 1881

131419648 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCA 131419707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCA 1941

131419708 GAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCC 131419767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 GAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCC 2001

131419768 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCG 131419827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCG 2061

131419828 AACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTG 131419887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 AACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTG 2121

131419888 TGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGA 131419947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 TGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGA 2181

131419948 CTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGC 131420007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 CTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGC 2241

131420008 TTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTAC 131420067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 TTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTAC 2301

131420068 CTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAGTCTGTAAAATAGTGCAT 131420127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2302 CTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAATCTGTAAAATAGTGCAT 2361

131420128 AGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGATT 131420187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 AGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGATT 2421

131420188 GGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATTCC 131420247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 GGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATTCC 2481

131420248 TTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGA 131420307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 TTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGA 2541

131420308 AGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTG 131420367
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 AGAACGAACAGGCTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTG 2601

131420368 ACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATT 131420427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 ACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATT 2661

131420428 ATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTATTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACAT 131420487
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2662 ATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACAT 2721

131420488 GCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCAT 131420547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 GCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCAT 2781

131420548 CTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGT 131420607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 CTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGT 2841

131420608 GTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCA 131420667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 GTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCA 2901

131420668 TGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTA 131420727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 TGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTA 2961

131420728 GAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATAT 131420787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 GAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATAT 3021

131420788 TTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAATTT 131420847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 TTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAATTT 3081

131420848 ACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTG 131420907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 ACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTG 3141

131420908 ACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTA 131420967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 ACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTA 3201

131420968 GCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAAA 131421027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 GCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAAA 3261

131421028 TGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTTG 131421087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 TGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTTG 3321

131421088 CTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCAG 131421147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 CTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCAG 3381

131421148 ATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATAG 131421207
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 ATGGATAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATAG 3441

131421208 TTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACTT 131421267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 TTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACTT 3501

131421268 TTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTGAA 131421327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 TTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTGAA 3561

131421328 TGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCTT 131421387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 TGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCTT 3621

131421388 TAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTTG 131421447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 TAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTTG 3681

131421448 TGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCATT 131421507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 TGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCATT 3741

131421508 GCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCTG 131421567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 GCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCTG 3801

131421568 AGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTT 131421627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 AGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTT 3861

131421628 TAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTTC 131421687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 TAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTTC 3921

131421688 TTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTAAA 131421747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 TTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTAAA 3981

131421748 GTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAATCT 131421807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 GTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAATCT 4041

131421808 ATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAGGA 131421867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4042 ATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAGGA 4101

131421868 TGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATCGCTTCT 131421927
          |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4102 TGGAATGTTTTTCCATTTGCTTACGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATAGCTTCT 4161

131421928 TTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAATGT 131421987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 TTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAATGT 4221

131421988 AGCCCTCTAACTATTGAAGAT 131422008
          |||||||||||||||||||||
     4222 AGCCCTCTAACTATTGAAGAT 4242

Alignment time is 3.3056 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4879] =>      4879 nucs 'mol-32-22a7-029720_4879'

Score:        4758
Aligned:      4879        nucs
Identic:      4868 (100%) nucs =>       708 (100%)      4160 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131416235,131416942] EXCISED REGION [131416944,131421114]
 second seq =>  [        1,      708] EXCISED REGION [      710,     4879]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [131416943,131416943]
 second seq =>         1 nucs [709,709]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [131419610,131419610]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131416942,131416942] to [131416943,131416943]
 second seq =>         1 nucs [709,709] to [710,710]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131416235 GGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAA 131416294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAA 60

131416295 TAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGAT 131416354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGAT 120

131416355 GTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGG 131416414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGG 180

131416415 ATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACA 131416474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACA 240

131416475 ACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAAC 131416534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAAC 300

131416535 AAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTA 131416594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTA 360

131416595 GTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCAT 131416654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCAT 420

131416655 CACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCT 131416714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCT 480

131416715 TTTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGG 131416774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGG 540

131416775 ACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGA 131416834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGA 600

131416835 AGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATC 131416894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATC 660

131416895 CAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATC 131416942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATC 708

EXCISED REGION

131416944 TATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCA 131417003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      710 TATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCA 769

131417004 GCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCA 131417063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      770 GCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCA 829

131417064 AGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAAT 131417123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      830 AGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAAT 889

131417124 ACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACAC 131417183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 ACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACAC 949

131417184 TGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAG 131417243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 TGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAG 1009

131417244 GATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTA 131417303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 GATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTA 1069

131417304 TTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTC 131417363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 TTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTC 1129

131417364 ATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGC 131417423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 ATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGC 1189

131417424 TGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGC 131417483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 TGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGC 1249

131417484 ATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCT 131417543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1250 ATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCT 1309

131417544 GCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGA 131417603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 GCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGA 1369

131417604 TTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACT 131417663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 TTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACT 1429

131417664 GGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGT 131417723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 GGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGT 1489

131417724 AAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAA 131417783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 AAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAA 1549

131417784 CAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACA 131417843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 CAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACA 1609

131417844 AATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGA 131417903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 AATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGA 1669

131417904 ACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAA 131417963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 ACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAA 1729

131417964 TGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGT 131418023
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 TGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGT 1789

131418024 GGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAA 131418083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 GGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAA 1849

131418084 AAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCA 131418143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 AAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCA 1909

131418144 TCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGT 131418203
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 TCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGT 1969

131418204 TGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTG 131418263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 TGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTG 2029

131418264 TGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAA 131418323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 TGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAA 2089

131418324 TCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCA 131418383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 TCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCA 2149

131418384 TGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCC 131418443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 TGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCC 2209

131418444 CATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAG 131418503
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 CATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAG 2269

131418504 CCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCT 131418563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 CCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCT 2329

131418564 TAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAG 131418623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 TAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAG 2389

131418624 TTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGA 131418683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 TTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGA 2449

131418684 GGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATT 131418743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 GGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATT 2509

131418744 ATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAAT 131418803
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 ATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAAT 2569

131418804 TTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTA 131418863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 TTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTA 2629

131418864 GTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCC 131418923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 GTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCC 2689

131418924 TCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCA 131418983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 TCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCA 2749

131418984 TCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACAC 131419043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2750 TCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACAC 2809

131419044 TTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAG 131419103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 TTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAG 2869

131419104 ACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCT 131419163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 ACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCT 2929

131419164 ACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCT 131419223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 ACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCT 2989

131419224 AACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTA 131419283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 AACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTA 3049

131419284 TCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGT 131419343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 TCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGT 3109

131419344 AGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTC 131419403
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 AGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTC 3169

131419404 CATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATC 131419463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 CATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATC 3229

131419464 CTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTT 131419523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 CTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTT 3289

131419524 TGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTT 131419583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 TGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTT 3349

131419584 CTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTG 131419643
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 CTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTC-TTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTG 3408

131419644 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGT 131419703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGT 3468

131419704 TCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCAT 131419763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 TCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCAT 3528

131419764 GCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGT 131419823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 GCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGT 3588

131419824 ATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 131419883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 ATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 3648

131419884 GGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAG 131419943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 GGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAG 3708

131419944 AAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCT 131420003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 AAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCT 3768

131420004 CTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGT 131420063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 CTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGT 3828

131420064 TTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAGTCTGTAAAATAGT 131420123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3829 TTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAATCTGTAAAATAGT 3888

131420124 GCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAAT 131420183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 GCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAAT 3948

131420184 GATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATA 131420243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 GATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATA 4008

131420244 TTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACAT 131420303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 TTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACAT 4068

131420304 GTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCT 131420363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 GTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCT 4128

131420364 TTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTG 131420423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 TTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTG 4188

131420424 TATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTATTCAACTCCCACTTATGAGTGAGA 131420483
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     4189 TATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGA 4248

131420484 ACATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCT 131420543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 ACATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCT 4308

131420544 TCATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCG 131420603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 TCATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCG 4368

131420604 TGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGT 131420663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 TGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGT 4428

131420664 TCCATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTAT 131420723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 TCCATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTAT 4488

131420724 AGTAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATC 131420783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4489 AGTAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATC 4548

131420784 ATATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTA 131420843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 ATATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTA 4608

131420844 ATTTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTT 131420903
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4609 ACTTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTT 4668

131420904 CTTGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTC 131420963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4669 CTTGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTC 4728

131420964 AGTAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACA 131421023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4729 AGTAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACA 4788

131421024 TAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTG 131421083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4789 TAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTG 4848

131421084 TTTGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTT 131421114
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     4849 TTTGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTT 4879

Alignment time is 3.75847 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4840] =>      4840 nucs 'mol-32-2383-130473_4840'

Score:        4678
Aligned:      4827        nucs
Identic:      4811 (100%) nucs =>      2367 (100%)      2444 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131415631,131418002] EXCISED REGION [131418988,131421439]
 second seq =>  [        1,     2372] EXCISED REGION [     2388,     4840]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       985 nucs [131418003,131418987]
 second seq =>        15 nucs [2373,2387]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2373,2373] to [2388,2388]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131415631 CCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGGTT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCC 131415688
          |||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||
        1 CCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG--GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCC 58

131415689 CAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGCTTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGT 131415748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       59 CAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGCTTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGT 118

131415749 GAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAA 131415808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      119 GAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAA 178

131415809 AAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAAAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTA 131415868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 AAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAAAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTA 238

131415869 CATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGA 131415928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 CATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGA 298

131415929 AGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAA 131415988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 AGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAA 358

131415989 GATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGATAAA 131416048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 GATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGATAAA 418

131416049 CTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTAC 131416108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 CTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTAC 478

131416109 CACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACA 131416168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 CACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACA 538

131416169 TAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACT 131416228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 TAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACT 598

131416229 GAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGT 131416288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 GAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGT 658

131416289 AATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTA 131416348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 AATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTA 718

131416349 CCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAA 131416408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 CCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAA 778

131416409 GGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGG 131416468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGG 838

131416469 GAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATT 131416528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 GAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATT 898

131416529 CTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGAC 131416588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 CTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGAC 958

131416589 AAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGG 131416648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 AAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGG 1018

131416649 ATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAA 131416708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 ATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAA 1078

131416709 AATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATC 131416768
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1079 AATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATT 1138

131416769 GAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAA 131416828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 GAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAA 1198

131416829 GCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAAT 131416888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 GCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAAT 1258

131416889 AGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATAT 131416948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1259 AGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATAT 1318

131416949 TCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAA 131417008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAA 1378

131417009 ATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTG 131417068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 ATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTG 1438

131417069 AGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTA 131417128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 AGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTA 1498

131417129 GGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTC 131417188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTC 1558

131417189 AAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGG 131417248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 AAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGG 1618

131417249 ATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCT 131417308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 ATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCT 1678

131417309 ATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATG 131417368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 ATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATG 1738

131417369 GAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAG 131417428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAG 1798

131417429 ACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGT 131417488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 ACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGT 1858

131417489 ACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACA 131417548
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1859 ACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACA 1918

131417549 CCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCC 131417608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCC 1978

131417609 TATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATC 131417668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATC 2038

131417669 CCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAAC 131417728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAAC 2098

131417729 CCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGC 131417788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGC 2158

131417789 AAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAG 131417848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAG 2218

131417849 GAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGA 131417908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 GAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGA 2278

131417909 CAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCT 131417968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 CAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCT 2338

131417969 AGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAA 131418002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAA 2372

EXCISED REGION

131418988 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 131419047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2388 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 2447

131419048 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 131419107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2448 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 2507

131419108 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 131419167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2508 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 2567

131419168 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 131419227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2568 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 2627

131419228 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 131419287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2628 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 2687

131419288 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCT 131419347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2688 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTT 2747

131419348 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 131419407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2748 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 2807

131419408 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 131419467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2808 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 2867

131419468 CTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 131419527
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2868 CTGGTCCTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 2927

131419528 CTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 131419587
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2928 CTTGCCGAATCCTTTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 2987

131419588 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTC-TTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCA 131419646
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2988 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCA 3047

131419647 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCC 131419706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3048 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCC 3107

131419707 AGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCC 131419766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 AGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCC 3167

131419767 CGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATC 131419826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 CGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATC 3227

131419827 GAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGT 131419886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 GAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGT 3287

131419887 GTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAG 131419946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 GTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAG 3347

131419947 ACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTG 131420006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 ACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTG 3407

131420007 CTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTA 131420066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 CTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTA 3467

131420067 CCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAGTCTGTAAAATAGTGCA 131420126
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3468 CCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAATCTGTAAAATAGTGCA 3527

131420127 TAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGAT 131420186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 TAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGAT 3587

131420187 TGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATTC 131420246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 TGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATTC 3647

131420247 CTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTG 131420306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 CTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTG 3707

131420307 AAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTT 131420366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 AAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTT 3767

131420367 GACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTAT 131420426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 GACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTAT 3827

131420427 TATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTATTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACA 131420486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3828 TATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACA 3887

131420487 TGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCA 131420546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 TGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCA 3947

131420547 TCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGG 131420606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 TCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGG 4007

131420607 TGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCC 131420666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4008 TGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCC 4067

131420667 ATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGT 131420726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 ATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGT 4127

131420727 AGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATA 131420786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 AGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATA 4187

131420787 TTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAATT 131420846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 TTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAATT 4247

131420847 TACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTT 131420906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4248 TACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTT 4307

131420907 GACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGT 131420966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4308 GACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGT 4367

131420967 AGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAA 131421026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4368 AGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAA 4427

131421027 ATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTT 131421086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 ATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTT 4487

131421087 GCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCA 131421146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4488 GCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCA 4547

131421147 GATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATA 131421206
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4548 GATGGATAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGACA 4607

131421207 GTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACT 131421266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4608 GTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACT 4667

131421267 TTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTGA 131421326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4668 TTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTGA 4727

131421327 ATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCT 131421386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4728 ATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCT 4787

131421387 TTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTT 131421439
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4788 TTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTT 4840

Alignment time is 3.71108 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2372] =>      2372 nucs 'mol-32-2383-130473_2372'

Score:        2337
Aligned:      2370        nucs
Identic:      2367 (100%) nucs =>        33 (100%)      2334 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131415631,131415663] EXCISED REGION [131415666,131418002]
 second seq =>  [        1,       33] EXCISED REGION [       36,     2372]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [131415664,131415665]
 second seq =>         2 nucs [34,35]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131415664,131415664] to [131415665,131415665]
 second seq =>         0 nucs

131415631 CCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 131415663
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 33

EXCISED REGION

131415666 ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGCTTGA 131415725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       36 ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGCTTGA 95

131415726 ACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGA 131415785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       96 ACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGA 155

131415786 CAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAAAGAT 131415845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      156 CAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAAAGAT 215

131415846 CTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAAC 131415905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      216 CTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAAC 275

131415906 CAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATT 131415965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      276 CAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATT 335

131415966 GAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAAAATT 131416025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      336 GAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAAAATT 395

131416026 AATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACACAACC 131416085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      396 AATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACACAACC 455

131416086 AGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAGAGAA 131416145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      456 AGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAGAGAA 515

131416146 TACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTG 131416205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      516 TACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTG 575

131416206 GACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACCAATA 131416265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 GACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACCAATA 635

131416266 ATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCA 131416325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      636 ATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCA 695

131416326 AACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTT 131416385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      696 AACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTT 755

131416386 AAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGT 131416445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      756 AAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGT 815

131416446 ATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCT 131416505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 ATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCT 875

131416506 TGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACA 131416565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 TGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACA 935

131416566 TCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCA 131416625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 TCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCA 995

131416626 ACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACA 131416685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 ACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACA 1055

131416686 TAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAA 131416745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 TAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAA 1115

131416746 AAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCC 131416805
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 AAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCC 1175

131416806 AACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAA 131416865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 AACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAA 1235

131416866 TCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCC 131416925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 TCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCC 1295

131416926 TGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTA 131416985
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 TGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTA 1355

131416986 AGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAG 131417045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 AGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAG 1415

131417046 CCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCC 131417105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 CCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCC 1475

131417106 ACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACA 131417165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 ACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACA 1535

131417166 ACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACA 131417225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 ACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACA 1595

131417226 TTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAA 131417285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 TTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAA 1655

131417286 TTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAA 131417345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 TTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAA 1715

131417346 AAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCT 131417405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 AAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCT 1775

131417406 AAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTC 131417465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 AAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTC 1835

131417466 TACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTATAGA 131417525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1836 TACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGATAGA 1895

131417526 GAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAA 131417585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 GAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAA 1955

131417586 CACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACAT 131417645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 CACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACAT 2015

131417646 ATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATG 131417705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 ATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATG 2075

131417706 GATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATA 131417765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 GATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATA 2135

131417766 CCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAA 131417825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 CCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAA 2195

131417826 CAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAAT 131417885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 CAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAAT 2255

131417886 AAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACA 131417945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 AAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACA 2315

131417946 CATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAA 131418002
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 CATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAA 2372

Alignment time is 1.80907 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3688] =>      3688 nucs 'mol-32-2afd-033334_3688'

Score:        3559
Aligned:      3675        nucs
Identic:      3662 (100%) nucs =>      3057 (100%)       605 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131414939,131418002] EXCISED REGION [131418988,131419596]
 second seq =>  [        1,     3064] EXCISED REGION [     3080,     3688]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       985 nucs [131418003,131418987]
 second seq =>        15 nucs [3065,3079]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3065,3065] to [3080,3080]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131414939 TATATATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAA 131414998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATATATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAA 60

131414999 GAGATGGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGA 131415058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGATGGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGA 120

131415059 TCATGAAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATG 131415118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCATGAAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATG 180

131415119 GACCTGATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCA 131415178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACCTGATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCA 240

131415179 CTGCTATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCA 131415238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGCTATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCA 300

131415239 AACGCAAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAG 131415298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACGCAAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAG 360

131415299 AAATCGAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGC 131415358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATCGAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGC 420

131415359 TTCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAA 131415418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCTGAATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAA 480

131415419 CTAAAGAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAA 131415478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTAAAGAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAA 540

131415479 GAGGGAAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGC 131415538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGGGAAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGC 600

131415539 CTCACACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGG 131415598
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCACACCTGTTATCACAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGG 660

131415599 AGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 131415658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTA 720

131415659 GCTGGTT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGG 131415716
          |||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTGG--GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGG 778

131415717 ATTGCTTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAG 131415776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 ATTGCTTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAG 838

131415777 CCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAA 131415836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 CCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAA 898

131415837 CAGAAAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCA 131415896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 CAGAAAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCA 958

131415897 AGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTG 131415956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 AGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTG 1018

131415957 AAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTT 131416016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 AAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTT 1078

131416017 GAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGA 131416076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 GAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGA 1138

131416077 AACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACC 131416136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 AACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACC 1198

131416137 ATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGAT 131416196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 ATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGAT 1258

131416197 AGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAAC 131416256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 AGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAAC 1318

131416257 ACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTC 131416316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 ACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTC 1378

131416317 TCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCA 131416376
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1379 TCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACTAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCA 1438

131416377 TTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGT 131416436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGT 1498

131416437 GAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGC 131416496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGC 1558

131416497 CAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCC 131416556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 CAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCC 1618

131416557 AGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAG 131416616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 AGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAG 1678

131416617 GTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACA 131416676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 GTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACA 1738

131416677 AAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACT 131416736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACT 1798

131416737 TCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTG 131416796
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTG 1858

131416797 CCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGC 131416856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGC 1918

131416857 ACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCA 131416916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCA 1978

131416917 AACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAA 131416976
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAA 2038

131416977 AGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAA 131417036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAA 2098

131417037 AATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTC 131417096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 AATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTC 2158

131417097 AAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAG 131417156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAG 2218

131417157 ATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAAT 131417216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 ATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAAT 2278

131417217 GGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGC 131417276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 GGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGC 2338

131417277 CCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACG 131417336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACG 2398

131417337 GAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAA 131417396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAA 2458

131417397 GGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATA 131417456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATA 2518

131417457 CTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAA 131417516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 CTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAA 2578

131417517 CAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACC 131417576
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACC 2638

131417577 TGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTG 131417636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTG 2698

131417637 GCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAA 131417696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAA 2758

131417697 CACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATC 131417756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 CACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATC 2818

131417757 TGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAG 131417816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 TGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAG 2878

131417817 CAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCA 131417876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCA 2938

131417877 CAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTG 131417936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 CAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTG 2998

131417937 CAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAA 131417996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 CAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAA 3058

131417997 GAAAAA 131418002
          ||||||
     3059 GAAAAA 3064

EXCISED REGION

131418988 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 131419047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3080 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 3139

131419048 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 131419107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 3199

131419108 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 131419167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 3259

131419168 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 131419227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 3319

131419228 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 131419287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 3379

131419288 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCT 131419347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3380 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTT 3439

131419348 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 131419407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 3499

131419408 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 131419467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 3559

131419468 CTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 131419527
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 CTGGTCCTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 3619

131419528 CTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 131419587
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 CTTGCCGAATCCTTTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 3679

131419588 TTCAGGTTT 131419596
          |||||||||
     3680 TTCAGGTTT 3688

Alignment time is 2.77984 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4609] =>      4609 nucs 'mol-32-2b08-047349_4609'

Score:        4505
Aligned:      4610        nucs
Identic:      4598 (100%) nucs =>       625 (100%)      3973 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131414283,131414908] EXCISED REGION [131414944,131418924]
 second seq =>  [        1,      626] EXCISED REGION [      628,     4609]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        35 nucs [131414909,131414943]
 second seq =>         1 nucs [627,627]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [131414906,131414908] to [131414944,131414946]
 second seq =>         3 nucs [624,626] to [628,630]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [131414909,131414919] to [131414933,131414943]
 second seq =>         0 nucs

131414283 AACCTAGAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTTTCAAAAAAGCAAATGCTCAA 131414342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACCTAGAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTTTCAAAAAAGCAAATGCTCAA 60

131414343 GGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTGAAGAAAGTACTAAACATGGA 131414402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTGAAGAAAGTACTAAACATGGA 120

131414403 AAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAAGTACACAGATCAGTGACACT 131414462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAAGTACACAGATCAGTGACACT 180

131414463 ATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGTAACATCATGATGAACAGAAC 131414522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGTAACATCATGATGAACAGAAC 240

131414523 AAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCCCCAATTAAAAG 131414582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCCCCAATTAAAAG 300

131414583 ACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGTCTTCTTTATCC 131414642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGTCTTCTTTATCC 360

131414643 AGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTTGCATATCTCAC 131414702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTTGCATATCTCAC 420

131414703 ATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAAACATCTACCAAGCAAATTG 131414762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      421 ATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAAACATCTACCAAGCGAATTG 480

131414763 AAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTAAACCAA 131414822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTAAACCAA 540

131414823 CAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCAACAAGA 131414882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCAACAAGA 600

131414883 AAATCTTACTATCATATATATATATA 131414908
          ||||||||||||||||||||||||||
      601 AAATCTTACTATCATATATATATATA 626

EXCISED REGION

131414944 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 131415003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      628 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 687

131415004 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 131415063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      688 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 747

131415064 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 131415123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      748 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 807

131415124 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 131415183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      808 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 867

131415184 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 131415243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      868 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 927

131415244 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 131415303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      928 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 987

131415304 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 131415363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      988 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 1047

131415364 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 131415423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1048 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 1107

131415424 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 131415483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1108 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 1167

131415484 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 131415543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1168 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 1227

131415544 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 131415603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 1287

131415604 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 131415663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 1347

131415664 TT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 131415721
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 --GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 1405

131415722 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 131415781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1406 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 1465

131415782 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTC-AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 131415840
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1466 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 1525

131415841 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 131415900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1526 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 1585

131415901 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 131415960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1586 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 1645

131415961 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 131416020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1646 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 1705

131416021 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 131416080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 1765

131416081 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 131416140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 1825

131416141 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 131416200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 1885

131416201 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 131416260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 1945

131416261 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 131416320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 2005

131416321 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 131416380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 2065

131416381 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 131416440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 2125

131416441 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 131416500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 2185

131416501 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 131416560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 2245

131416561 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 131416620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 2305

131416621 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 131416680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 2365

131416681 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 131416740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 2425

131416741 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 131416800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 2485

131416801 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 131416860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 2545

131416861 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 131416920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 2605

131416921 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 131416980
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 2665

131416981 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 131417040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 2725

131417041 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 131417100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 2785

131417101 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 131417160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 2845

131417161 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 131417220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 2905

131417221 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 131417280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2906 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 2965

131417281 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 131417340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 3025

131417341 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 131417400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 3085

131417401 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 131417460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 3145

131417461 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGT 131417520
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3146 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGG 3205

131417521 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 131417580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 3265

131417581 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 131417640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 3325

131417641 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 131417700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 3385

131417701 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 131417760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 3445

131417761 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 131417820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 3505

131417821 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 131417880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 3565

131417881 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 131417940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 3625

131417941 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 131418000
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 3685

131418001 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 131418060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 3745

131418061 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 131418120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 3805

131418121 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAA 131418180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3806 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAA 3865

131418181 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 131418240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 3925

131418241 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 131418300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 3985

131418301 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 131418360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 4045

131418361 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 131418420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 4105

131418421 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 131418480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4106 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 4165

131418481 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 131418540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 4225

131418541 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 131418600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 4285

131418601 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 131418660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 4345

131418661 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 131418720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 4405

131418721 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 131418780
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 4465

131418781 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 131418840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 4525

131418841 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 131418900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 4585

131418901 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCT 131418924
          ||||||||||||||||||||||||
     4586 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCT 4609

Alignment time is 3.55564 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     7893] =>      7893 nucs 'mol-32-2b3f-071503_7893'

Score:        7730
Aligned:      7898        nucs
Identic:      7877 (100%) nucs =>      3334 (100%)      4543 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131411568,131414908] EXCISED REGION [131414944,131419496]
 second seq =>  [        1,     3338] EXCISED REGION [     3340,     7893]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        35 nucs [131414909,131414943]
 second seq =>         1 nucs [3339,3339]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [131414906,131414908] to [131414944,131414946]
 second seq =>         3 nucs [3336,3338] to [3340,3342]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [131414909,131414919] to [131414933,131414943]
 second seq =>         0 nucs

131411568 TCACCACTCCTATTCAACATAGTGTTGGAAGTTCTGGCCAGGGCAATCAGGCAGGAGAAA 131411627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCACCACTCCTATTCAACATAGTGTTGGAAGTTCTGGCCAGGGCAATCAGGCAGGAGAAA 60

131411628 GAAATAAAAGTATTCAATTGCGAAAAGAGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCGGTTGACA 131411687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAATAAAAGTATTCAATTGCGAAAAGAGGAAGTCAAATTGTCCCTGTTTGCGGTTGACA 120

131411688 TGACTGTATATTTAGAAAACCCCATTGTCTCAGCCCCAAAGCAACTTAAGCTGATAAACA 131411747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGACTGTATATTTAGAAAACCCCATTGTCTCAGCCCCAAAGCAACTTAAGCTGATAAACA 180

131411748 ACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCCATGTGCAAAAATCACAAGCATTCCTATACA 131411807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTTCAGCAAAGTCTCAGGATACAAAATCCATGTGCAAAAATCACAAGCATTCCTATACA 240

131411808 CCAATAACAGACAAACAGAGAGCCAAATCATGAGAGAACTCCCATTCACAATTGCTTCAA 131411867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAATAACAGACAAACAGAGAGCCAAATCATGAGAGAACTCCCATTCACAATTGCTTCAA 300

131411868 AGAGAATAAAATACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGACATGAAGGACCTCTTCAAGGAGA 131411927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAGAATAAAATACCTAGGAATCCAACTTACAAGGGACATGAAGGACCTCTTCAAGGAGA 360

131411928 ACTACAAACCACTGCTCAATGAAATAAAAGAGGACACAAACAAATGGAAGAACATTCCAT 131411987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTACAAACCACTGCTCAATGAAATAAAAGAGGACACAAACAAATGGAAGAACATTCCAT 420

131411988 GCTCATGGATAGGAAGAATCAATATCGTGAAAATGGCCATACTGCCCAAGGTAATTTATA 131412047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTCATGGATAGGAAGAATCAATATCGTGAAAATGGCCATACTGCCCAAGGTAATTTATA 480

131412048 GATTCAATGCCATCCCCATCAAGCTACCAATGACTTTCTTCACAGAATTGGAAAAAATTA 131412107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATTCAATGCCATCCCCATCAAGCTACCAATGACTTTCTTCACAGAATTGGAAAAAATTA 540

131412108 CTTTAAAGTTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCACATTGCCAAGACAATCCTAAGCCAAA 131412167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTTAAAGTTCATATGGAACCAAAAAAGAGCCCACATTGCCAAGACAATCCTAAGCCAAA 600

131412168 AGAACAAAGCTGGAGGCATCACGCTAGCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAA 131412227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAACAAAGCTGGAGGCATCACGCTAGCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAGTAA 660

131412228 CCAAAACAGCATGGTACTGGTACCAAAACAGAGATATAGACCAATGGAACAGAAAAGAGC 131412287
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCAAAACAGCATGGTACAGGTACCAAAACAGAGATATAGACCAATGGAACAGAAAAGAGC 720

131412288 CCTCAGAAATAATACCACACATCTAGAACCATCTGCTCTTTGACAAACCTGACAAAACCA 131412347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCAGAAATAATACCACACATCTAGAACCATCTGCTCTTTGACAAACCTGACAAAACCA 780

131412348 AGAAATGGGGAAAGGATTCCCTGTTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCATAT 131412407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAAATGGGGAAAGGATTCCCTGTTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCATAT 840

131412408 GTAGAAAGCTGAAACTGGACCCTTCCTCACACCTTATACAAAAATTAATTCAAGTTGGAT 131412467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTAGAAAGCTGAAACTGGACCCTTCCTCACACCTTATACAAAAATTAATTCAAGTTGGAT 900

131412468 GAAAGACTTAAATGTTAGACCTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCTAGGCAATAC 131412527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAAGACTTAAATGTTAGACCTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCTAGGCAATAC 960

131412528 CATTCAGGACATAGGCATGGGCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGCAAC 131412587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATTCAGGACATAGGCATGGGCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGGCAAC 1020

131412588 AAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGA 131412647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGA 1080

131412648 AACCACCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTACAATCTACTA 131412707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACCACCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTACAATCTACTA 1140

131412708 ATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAAAGAACTTAAACAAGTTTACAAGAAAAA 131412767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAAAGAACTTAAACAAGTTTACAAGAAAAA 1200

131412768 ATCAAACAACCCCATCAAAAGGTGGGCGAAGGATATGAACAGACACTTCTCCAAAGAAGA 131412827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATCAAACAACCCCATCAAAAGGTGGGCGAAGGATATGAACAGACACTTCTCCAAAGAAGA 1260

131412828 CAGTTATGCAGCCAACAGACACATGAAAAAATGCTCGTCATCACTGGCCGTCAGAGAATG 131412887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGTTATGCAGCCAACAGACACATGAAAAAATGCTCGTCATCACTGGCCGTCAGAGAATG 1320

131412888 CAAATCAGAACCACAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGTGATCATTAAAAAG 131412947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAAATCAGAACCACAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGTGATCATTAAAAAG 1380

131412948 TCAGGAAAAAACAGATGCTGGAGAGAATGTGGAGAAATAGGAACACTTTTACACTGCTGG 131413007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCAGGAAAAAACAGATGCTGGAGAGAATGTGGAGAAATAGGAACACTTTTACACTGCTGG 1440

131413008 TGGGACTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGCAGTGATTCCTCAAGGATCTA 131413067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGGACTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGCAGTGATTCCTCAAGGATCTA 1500

131413068 GAACTAGAAATACCATTTAACCCAGCCATCCCATTGCTGGGCATATACCCAAAGGATTAT 131413127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAACTAGAAATACCATTTAACCCAGCCATCCCATTGCTGGGCATATACCCAAAGGATTAT 1560

131413128 AAATCATGCTGCTATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCACTATTCACAATA 131413187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAATCATGCTGCTATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCACTATTCACAATA 1620

131413188 GCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCGTCAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGG 131413247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCGTCAATGATAGACTGGATTAAGAAAATGTGG 1680

131413248 CACATATACACCATGGAATACTATTCAGCCATCAAAAAGGATGAGTTCATGTCCTTTGTA 131413307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CACATATACACCATGGAATACTATTCAGCCATCAAAAAGGATGAGTTCATGTCCTTTGTA 1740

131413308 GGGACATGAATGAAGCTGGAAACCATCATTCTGAGCAAACTATCGCAAGGACAGAAAACC 131413367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGACATGAATGAAGCTGGAAACCATCATTCTGAGCAAACTATCGCAAGGACAGAAAACC 1800

131413368 AAACACCGCATATTCTCACTCATTGGTGGGAATTGAATAATGAGAACACTTGGACACAGG 131413427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAACACCGCATATTCTCACTCATTGGTGGGAATTGAATAATGAGAACACTTGGACACAGG 1860

131413428 ATGGGGAACATCATACAACGAGGCCTGTCGTGGGGTGGGGGGAGGTGGTAGGGATAGCAT 131413487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGGGGAACATCATACAACGAGGCCTGTCGTGGGGTGGGGGGAGGTGGTAGGGATAGCAT 1920

131413488 TAGGAGATATACCTAATGTAAATGACGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGGCACAT 131413547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGGAGATATACCTAATGTAAATGACGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGGCACAT 1980

131413548 GTATACATATGTAACAAACCTGTACCCTAGAACTTAAAGTATATATAAAAAAAAGATGGA 131413607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTATACATATGTAACAAACCTGTACCCTAGAACTTAAAGTATATATAAAAAAAAGATGGA 2040

131413608 AGGATAGATAGGGGATACAAGAAACAAGACTGACAAGACATTAATTGTTCAAATGCATGA 131413667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGGATAGATAGGGGATACAAGAAACAAGACTGACAAGACATTAATTGTTCAAATGCATGA 2100

131413668 CGAATATATGGGTGTCATTATACTACTCTGTCTGCTTTGGGGTATGCTTGAAATTTTATA 131413727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CGAATATATGGGTGTCATTATACTACTCTGTCTGCTTTGGGGTATGCTTGAAATTTTATA 2160

131413728 ACTTTTTTAACACAAGCATTTAACAGCTATATAACATAAATTTTAAAAAGTAAGAATGTG 131413787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTTTTTTAACACAAGCATTTAACAGCTATATAACATAAATTTTAAAAAGTAAGAATGTG 2220

131413788 ACCATTATGTGCCTCTGATTATAGTTTTTAAATTCCAAATAAAAAAGTGAATATAAGAAA 131413847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ACCATTATGTGCCTCTGATTATAGTTTTTAAATTCCAAATAAAAAAGTGAATATAAGAAA 2280

131413848 AAAAAATCTTAAAGGCAGCTACAAAGTGAAGTCCATTAGAGAAACAGCAGGCCTCTCAGC 131413907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAAAATCTTAAAGGCAGCTACAAAGTGAAGTCCATTAGAGAAACAGCAGGCCTCTCAGC 2340

131413908 TGAAACCCTACAAGCCAGAAAAGATTGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAAGAGG 131413967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGAAACCCTACAAGCCAGAAAAGATTGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAAGAGG 2400

131413968 CTGGTCATGGTGGCTCATACCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATC 131414027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTGGTCATGGTGGCTCATACCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATC 2460

131414028 ACCTGACATCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAC 131414087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ACCTGACATCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTAC 2520

131414088 AAATACAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTATGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGTGGCT 131414147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAATACAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTATGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGTGGCT 2580

131414148 GTGGCAGGAGAATTGCTTCAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATTGCACCA 131414207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTGGCAGGAGAATTGCTTCAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATTGCACCA 2640

131414208 CTGCACTCCAGCCCAGGTGACATAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 131414267
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||    
     2641 CTGCACTCCAGCCCAGGTGACAGAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAA---- 2696

131414268 -GGAAAGAAAAATTCCAACCTAGAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTTTCAA 131414326
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 GGGAAAGAAAAATTCCAACCTAGAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTTTCAA 2756

131414327 AAAAGCAAATGCTCAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTGAAGA 131414386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 AAAAGCAAATGCTCAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTGAAGA 2816

131414387 AAGTACTAAACATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAAGTAC 131414446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 AAGTACTAAACATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAAGTAC 2876

131414447 ACAGATCAGTGACACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGTAACA 131414506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 ACAGATCAGTGACACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGTAACA 2936

131414507 TCATGATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAA 131414566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 TCATGATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAA 2996

131414567 ATGCCCCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGGTAT 131414626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 ATGCCCCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGGTAT 3056

131414627 GCTGTCTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCC 131414686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 GCTGTCTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCC 3116

131414687 AACTTGCATATCTCACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAAACA 131414746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 AACTTGCATATCTCACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAAACA 3176

131414747 TCTACCAAGCAAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAA 131414806
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TCTACCAAGCGAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAA 3236

131414807 ACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGA 131414866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 ACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGA 3296

131414867 GTTCAATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 131414908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GTTCAATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 3338

EXCISED REGION

131414944 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 131415003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3340 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 3399

131415004 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 131415063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3400 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 3459

131415064 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 131415123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3460 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 3519

131415124 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 131415183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3520 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 3579

131415184 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 131415243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3580 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 3639

131415244 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 131415303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3640 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 3699

131415304 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 131415363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3700 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 3759

131415364 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 131415423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3760 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 3819

131415424 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 131415483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3820 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 3879

131415484 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 131415543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3880 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 3939

131415544 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 131415603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3940 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 3999

131415604 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 131415663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4000 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 4059

131415664 TT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 131415721
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4060 --GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 4117

131415722 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 131415781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 4177

131415782 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTC-AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 131415840
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4178 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 4237

131415841 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 131415900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4238 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 4297

131415901 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 131415960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4298 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 4357

131415961 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 131416020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4358 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 4417

131416021 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 131416080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4418 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 4477

131416081 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 131416140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4478 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 4537

131416141 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 131416200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4538 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 4597

131416201 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 131416260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4598 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 4657

131416261 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 131416320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4658 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 4717

131416321 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 131416380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4718 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 4777

131416381 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 131416440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4778 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 4837

131416441 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 131416500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4838 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 4897

131416501 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 131416560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4898 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 4957

131416561 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 131416620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4958 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 5017

131416621 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 131416680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5018 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 5077

131416681 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 131416740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5078 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 5137

131416741 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 131416800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5138 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 5197

131416801 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 131416860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5198 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 5257

131416861 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 131416920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5258 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 5317

131416921 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 131416980
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5318 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 5377

131416981 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 131417040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5378 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 5437

131417041 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 131417100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5438 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 5497

131417101 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 131417160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5498 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 5557

131417161 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 131417220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5558 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 5617

131417221 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 131417280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5618 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 5677

131417281 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 131417340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5678 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 5737

131417341 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 131417400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5738 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 5797

131417401 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 131417460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5798 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 5857

131417461 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGT 131417520
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5858 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGG 5917

131417521 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 131417580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5918 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 5977

131417581 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 131417640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5978 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 6037

131417641 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 131417700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6038 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 6097

131417701 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 131417760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6098 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 6157

131417761 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 131417820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6158 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 6217

131417821 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 131417880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6218 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 6277

131417881 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 131417940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6278 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 6337

131417941 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 131418000
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     6338 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 6397

131418001 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 131418060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6398 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 6457

131418061 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 131418120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6458 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 6517

131418121 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAA 131418180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     6518 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAA 6577

131418181 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 131418240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6578 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 6637

131418241 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 131418300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6638 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 6697

131418301 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 131418360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6698 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 6757

131418361 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 131418420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6758 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 6817

131418421 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 131418480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6818 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 6877

131418481 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 131418540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6878 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 6937

131418541 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 131418600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6938 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 6997

131418601 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 131418660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6998 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 7057

131418661 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 131418720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7058 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 7117

131418721 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 131418780
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     7118 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 7177

131418781 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 131418840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7178 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 7237

131418841 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 131418900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7238 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 7297

131418901 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 131418960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7298 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 7357

131418961 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 131419020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7358 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 7417

131419021 ACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 131419080
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7418 ATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 7477

131419081 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 131419140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7478 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 7537

131419141 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 131419200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7538 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 7597

131419201 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 131419260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7598 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 7657

131419261 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 131419320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7658 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 7717

131419321 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 131419380
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7718 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 7777

131419381 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 131419440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7778 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 7837

131419441 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACAC 131419496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7838 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACAC 7893

Alignment time is 5.87054 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2931] =>      2931 nucs 'mol-32-2e0a-046949_2931'

Score:        2817
Aligned:      2916        nucs
Identic:      2907 (100%) nucs =>      2289 (100%)       618 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131415709,131418002] EXCISED REGION [131418988,131419609]
 second seq =>  [        1,     2294] EXCISED REGION [     2310,     2931]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       985 nucs [131418003,131418987]
 second seq =>        15 nucs [2295,2309]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2295,2295] to [2310,2310]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131415709 GCATGAGGATTGCTTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTG 131415768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCATGAGGATTGCTTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTG 60

131415769 CACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAG 131415828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAG 120

131415829 AAAAAAAACAGAAAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATA 131415888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAAAAACAGAAAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATA 180

131415889 GAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAG 131415948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAG 240

131415949 CTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACT 131416008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACT 300

131416009 GGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGA 131416068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGA 360

131416069 TTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATAC 131416128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATAC 420

131416129 AAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAG 131416188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAG 480

131416189 AAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAAT 131416248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAAT 540

131416249 CTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCA 131416308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCA 600

131416309 AAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGC 131416368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGC 660

131416369 TGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACT 131416428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACT 720

131416429 CATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAA 131416488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAA 780

131416489 CTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAA 131416548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAA 840

131416549 CCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGA 131416608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGA 900

131416609 GATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAAC 131416668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAAC 960

131416669 TAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTA 131416728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTA 1020

131416729 ACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAAT 131416788
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1021 ACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAAGGACGTAGCTCAAAAT 1080

131416789 AATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGA 131416848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGA 1140

131416849 AAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGA 131416908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGA 1200

131416909 GGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTT 131416968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1201 GGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTT 1260

131416969 GGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAA 131417028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAA 1320

131417029 TGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAA 131417088
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1321 TGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAAAGCCAAATTGGAATGAAA 1380

131417089 TCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGA 131417148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGA 1440

131417149 GGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCAC 131417208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCAC 1500

131417209 AAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGT 131417268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGT 1560

131417269 CATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATT 131417328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATT 1620

131417329 TTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAA 131417388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAA 1680

131417389 ATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTC 131417448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTC 1740

131417449 AAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGAC 131417508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGAC 1800

131417509 CAATGGAACAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTT 131417568
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAATGGAACAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTT 1860

131417569 GACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGT 131417628
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GACAAACCAGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGT 1920

131417629 GAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACA 131417688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACA 1980

131417689 AAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGA 131417748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGA 2040

131417749 AGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAAT 131417808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAAT 2100

131417809 GCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAA 131417868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAA 2160

131417869 CTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAA 131417928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAA 2220

131417929 AAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAA 131417988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAA 2280

131417989 ATTTACAAGAAAAA 131418002
          ||||||||||||||
     2281 ATTTACAAGAAAAA 2294

EXCISED REGION

131418988 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 131419047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2310 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 2369

131419048 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 131419107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 2429

131419108 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 131419167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 2489

131419168 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 131419227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 2549

131419228 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 131419287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 2609

131419288 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCT 131419347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2610 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTT 2669

131419348 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 131419407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 2729

131419408 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 131419467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 2789

131419468 CTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 131419527
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 CTGGTCCTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 2849

131419528 CTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 131419587
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 CTTGCCGAATCCTTTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 2909

131419588 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTC 131419609
          ||||||||||||||||||||||
     2910 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTC 2931

Alignment time is 2.26511 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     5305] =>      5305 nucs 'mol-32-2f07-005784_5305'

Score:        5136
Aligned:      5290        nucs
Identic:      5276 (100%) nucs =>      2183 (100%)      3093 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131415816,131418002] EXCISED REGION [131418988,131422089]
 second seq =>  [        1,     2187] EXCISED REGION [     2203,     5305]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       985 nucs [131418003,131418987]
 second seq =>        15 nucs [2188,2202]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2188,2188] to [2203,2203]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131415816 GAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAAAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACA 131415875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAAAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACA 60

131415876 ACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGA 131415935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGA 120

131415936 ATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAAT 131415995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAAT 180

131415996 GAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAA 131416055
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATCCATGAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAA 240

131416056 AGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGAT 131416115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGAT 300

131416116 CCCACAGACATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCA 131416175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCACAGACATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCA 360

131416176 GAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAG 131416235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAG 420

131416236 GAAGAAATTGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAAT 131416295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAGAAATTGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAAT 480

131416296 AAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATG 131416355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATG 540

131416356 TACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGA 131416415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGA 600

131416416 TTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAA 131416475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAA 660

131416476 CAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACA 131416535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACA 720

131416536 AAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAG 131416595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAG 780

131416596 TCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATC 131416655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATC 840

131416656 ACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTT 131416715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTT 900

131416716 TTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGA 131416775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      901 TTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAAGGA 960

131416776 CGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAA 131416835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAA 1020

131416836 GCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCC 131416895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCC 1080

131416896 AAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAA 131416955
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1081 AAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAA 1140

131416956 ACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAG 131417015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAG 1200

131417016 GATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCA 131417075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCA 1260

131417076 AATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATAC 131417135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATAC 1320

131417136 AGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAA 131417195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAA 1380

131417196 TCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATG 131417255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATG 1440

131417256 TTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAAC 131417315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAAC 1500

131417316 TATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTA 131417375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTA 1560

131417376 AAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCAC 131417435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCAC 1620

131417436 ACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTA 131417495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTA 1680

131417496 CAAAAACATAGACCAATGGAACAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAA 131417555
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAAAACATAGACCAATGGAACAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAA 1740

131417556 CTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAA 131417615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAA 1800

131417616 TAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCT 131417675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCT 1860

131417676 TACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAAT 131417735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAAT 1920

131417736 TAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATT 131417795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATT 1980

131417796 TGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAA 131417855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAA 2040

131417856 TTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTA 131417915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTA 2100

131417916 CAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCC 131417975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCC 2160

131417976 ATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAA 131418002
          |||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAA 2187

EXCISED REGION

131418988 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 131419047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2203 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 2262

131419048 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 131419107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 2322

131419108 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 131419167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 2382

131419168 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 131419227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 2442

131419228 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 131419287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 2502

131419288 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCT 131419347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2503 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTT 2562

131419348 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 131419407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 2622

131419408 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 131419467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 2682

131419468 CTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 131419527
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 CTGGTCCTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 2742

131419528 CTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 131419587
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 CTTGCCGAATCCTTTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 2802

131419588 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTC-TTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCA 131419646
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCA 2862

131419647 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCC 131419706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCC 2922

131419707 AGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCC 131419766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 AGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCC 2982

131419767 CGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATC 131419826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 CGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATC 3042

131419827 GAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGT 131419886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 GAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGT 3102

131419887 GTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAG 131419946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 GTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAG 3162

131419947 ACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTG 131420006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 ACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTG 3222

131420007 CTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTA 131420066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 CTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTA 3282

131420067 CCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAGTCTGTAAAATAGTGCA 131420126
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3283 CCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAATCTGTAAAATAGTGCA 3342

131420127 TAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGAT 131420186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 TAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGAT 3402

131420187 TGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATTC 131420246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 TGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATTC 3462

131420247 CTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTG 131420306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 CTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTG 3522

131420307 AAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTT 131420366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 AAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTT 3582

131420367 GACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTAT 131420426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 GACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTAT 3642

131420427 TATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTATTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACA 131420486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3643 TATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACA 3702

131420487 TGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCA 131420546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 TGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCA 3762

131420547 TCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGG 131420606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 TCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGG 3822

131420607 TGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCC 131420666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 TGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCC 3882

131420667 ATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGT 131420726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 ATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGT 3942

131420727 AGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATA 131420786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 AGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATA 4002

131420787 TTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAATT 131420846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 TTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAATT 4062

131420847 TACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTT 131420906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 TACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTT 4122

131420907 GACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGT 131420966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 GACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGT 4182

131420967 AGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAA 131421026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 AGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAA 4242

131421027 ATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTT 131421086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4243 ATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTT 4302

131421087 GCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCA 131421146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 GCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCA 4362

131421147 GATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATA 131421206
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 GATGGATAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATA 4422

131421207 GTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACT 131421266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 GTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACT 4482

131421267 TTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTGA 131421326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4483 TTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTGA 4542

131421327 ATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCT 131421386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 ATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCT 4602

131421387 TTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTT 131421446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 TTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTT 4662

131421447 GTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCAT 131421506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4663 GTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCAT 4722

131421507 TGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCT 131421566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 TGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCT 4782

131421567 GAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTT 131421626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 GAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTT 4842

131421627 TTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTT 131421686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4843 TTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTT 4902

131421687 CTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTAA 131421746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4903 CTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTAA 4962

131421747 AGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAATC 131421806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4963 AGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAATC 5022

131421807 TATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAGG 131421866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5023 TATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAGG 5082

131421867 ATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATCGCTTC 131421926
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     5083 ATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTACGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATAGCTTC 5142

131421927 TTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAATG 131421986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5143 TTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAATG 5202

131421987 TAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAGA 131422046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5203 TAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAGA 5262

131422047 AGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAAGCAAGGTGC 131422089
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5263 AGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAAGCAAGGTGC 5305

Alignment time is 3.96528 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2187] =>      2187 nucs 'mol-32-2f07-005784_2187'

Score:        2153
Aligned:      2186        nucs
Identic:      2183 (100%) nucs =>       187 (100%)      1996 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131415816,131416002] EXCISED REGION [131416004,131418002]
 second seq =>  [        1,      187] EXCISED REGION [      189,     2187]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [131416003,131416003]
 second seq =>         1 nucs [188,188]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131416003,131416003] to [131416004,131416004]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131415816 GAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAAAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACA 131415875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAAAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACA 60

131415876 ACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGA 131415935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGA 120

131415936 ATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAAT 131415995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAAT 180

131415996 GAATCCA 131416002
          |||||||
      181 GAATCCA 187

EXCISED REGION

131416004 GAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAA 131416063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      189 GAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAA 248

131416064 AAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGA 131416123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      249 AAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGA 308

131416124 CATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCT 131416183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      309 CATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCT 368

131416184 AGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAAT 131416243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      369 AGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAAT 428

131416244 TGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACC 131416303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      429 TGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACC 488

131416304 AACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGA 131416363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      489 AACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGA 548

131416364 AGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCC 131416423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      549 AGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCC 608

131416424 AGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAA 131416483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      609 AGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAA 668

131416484 AGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTG 131416543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      669 AGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTG 728

131416544 GCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATC 131416603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      729 GCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATC 788

131416604 TATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAAC 131416663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      789 TATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAAC 848

131416664 AGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAA 131416723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 AGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAA 908

131416724 ATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTC 131416783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      909 ATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATTGAAAGGACGTAGCTC 968

131416784 AAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTC 131416843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 AAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTC 1028

131416844 CTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGA 131416903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 CTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGA 1088

131416904 AGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATA 131416963
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1089 AGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATA 1148

131416964 GTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAA 131417023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 GTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAA 1208

131417024 ATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAA 131417083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 ATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAA 1268

131417084 TGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACC 131417143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 TGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACC 1328

131417144 AGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGAT 131417203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 AGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGAT 1388

131417204 GGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAA 131417263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 GGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAA 1448

131417264 ATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATG 131417323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 ATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATG 1508

131417324 ACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAG 131417383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 ACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAG 1568

131417384 CCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCA 131417443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 CCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCA 1628

131417444 GCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACA 131417503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 GCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACA 1688

131417504 TAGACCAATGGAACAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGA 131417563
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 TAGACCAATGGAACAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGA 1748

131417564 TCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGT 131417623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 TCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGT 1808

131417624 ACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCAT 131417683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 ACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCAT 1868

131417684 ATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACC 131417743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 ATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACC 1928

131417744 CTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATG 131417803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 CTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATG 1988

131417804 AAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTA 131417863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 AAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTA 2048

131417864 AAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGG 131417923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 AAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGG 2108

131417924 GAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAA 131417983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 GAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAA 2168

131417984 CTTAAATTTACAAGAAAAA 131418002
          |||||||||||||||||||
     2169 CTTAAATTTACAAGAAAAA 2187

Alignment time is 1.79697 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     6685] =>      6685 nucs 'mol-32-2f33-021404_6685'

Score:        6526
Aligned:      6688        nucs
Identic:      6670 (100%) nucs =>      1902 (100%)      4768 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131413003,131414908] EXCISED REGION [131414944,131419722]
 second seq =>  [        1,     1904] EXCISED REGION [     1906,     6685]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        35 nucs [131414909,131414943]
 second seq =>         1 nucs [1905,1905]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [131414906,131414908] to [131414944,131414946]
 second seq =>         3 nucs [1902,1904] to [1906,1908]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [131414909,131414919] to [131414933,131414943]
 second seq =>         0 nucs

131413003 GCTGGTGGGACTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGCAGTGATTCCTCAAGG 131413062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTGGTGGGACTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGCAGTGATTCCTCAAGG 60

131413063 ATCTAGAACTAGAAATACCATTTAACCCAGCCATCCCATTGCTGGGCATATACCCAAAGG 131413122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCTAGAACTAGAAATACCATTTAACCCAGCCATCCCATTGCTGGGCATATACCCAAAGG 120

131413123 ATTATAAATCATGCTGCTATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCACTATTCA 131413182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTATAAATCATGCTGCTATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCACTATTCA 180

131413183 CAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCGTCAATGATAGACTGGATTAAGAAAA 131413242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCGTCAATGATAGACTGGATTAAGAAAA 240

131413243 TGTGGCACATATACACCATGGAATACTATTCAGCCATCAAAAAGGATGAGTTCATGTCCT 131413302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTGGCACATATACACCATGGAATACTATTCAGCCATCAAAAAGGATGAGTTCATGTCCT 300

131413303 TTGTAGGGACATGAATGAAGCTGGAAACCATCATTCTGAGCAAACTATCGCAAGGACAGA 131413362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGTAGGGACATGAATGAAGCTGGAAACCATCATTCTGAGCAAACTATCGCAAGGACAGA 360

131413363 AAACCAAACACCGCATATTCTCACTCATTGGTGGGAATTGAATAATGAGAACACTTGGAC 131413422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAACCAAACACCGCATATTCTCACTCATTGGTGGGAATTGAATAATGAGAACACTTGGAC 420

131413423 ACAGGATGGGGAACATCATACAACGAGGCCTGTCGTGGGGTGGGGGGAGGTGGTAGGGAT 131413482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAGGATGGGGAACATCATACAACGAGGCCTGTCGTGGGGTGGGGGGAGGTGGTAGGGAT 480

131413483 AGCATTAGGAGATATACCTAATGTAAATGACGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGG 131413542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCATTAGGAGATATACCTAATGTAAATGACGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGG 540

131413543 CACATGTATACATATGTAACAAACCTGTACCCTAGAACTTAAAGTATATATAAAAAAAAG 131413602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACATGTATACATATGTAACAAACCTGTACCCTAGAACTTAAAGTATATATAAAAAAAAG 600

131413603 ATGGAAGGATAGATAGGGGATACAAGAAACAAGACTGACAAGACATTAATTGTTCAAATG 131413662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGGAAGGATAGATAGGGGATACAAGAAACAAGACTGACAAGACATTAATTGTTCAAATG 660

131413663 CATGACGAATATATGGGTGTCATTATACTACTCTGTCTGCTTTGGGGTATGCTTGAAATT 131413722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATGACGAATATATGGGTGTCATTATACTACTCTGTCTGCTTTGGGGTATGCTTGAAATT 720

131413723 TTATAACTTTTTTAACACAAGCATTTAACAGCTATATAACATAAATTTTAAAAAGTAAGA 131413782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTATAACTTTTTTAACACAAGCATTTAACAGCTATATAACATAAATTTTAAAAAGTAAGA 780

131413783 ATGTGACCATTATGTGCCTCTGATTATAGTTTTTAAATTCCAAATAAAAAAGTGAATATA 131413842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGTGACCATTATGTGCCTCTGATTATAGTTTTTAAATTCCAAATAAAAAAGTGAATATA 840

131413843 AGAAAAAAAAATCTTAAAGGCAGCTACAAAGTGAAGTCCATTAGAGAAACAGCAGGCCTC 131413902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAAAAAAAAATCTTAAAGGCAGCTACAAAGTGAAGTCCATTAGAGAAACAGCAGGCCTC 900

131413903 TCAGCTGAAACCCTACAAGCCAGAAAAGATTGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAA 131413962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAGCTGAAACCCTACAAGCCAGAAAAGATTGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAA 960

131413963 AGAGGCTGGTCATGGTGGCTCATACCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGC 131414022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAGGCTGGTCATGGTGGCTCATACCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGC 1020

131414023 AGATCACCTGACATCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCT 131414082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGATCACCTGACATCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCT 1080

131414083 ACTACAAATACAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTATGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGG 131414142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTACAAATACAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTATGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGG 1140

131414143 TGGCTGTGGCAGGAGAATTGCTTCAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATTG 131414202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGCTGTGGCAGGAGAATTGCTTCAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATTG 1200

131414203 CACCACTGCACTCCAGCCCAGGTGACATAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAA 131414262
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACCACTGCACTCCAGCCCAGGTGACAGAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAA 1260

131414263 AAAAAGGAAAGAAAAATTCCAACCTAGAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTT 131414322
          |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAA--GGAAAGAAAAATTCCAACCTAGAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTT 1318

131414323 TCAAAAAAGCAAATGCTCAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTG 131414382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 TCAAAAAAGCAAATGCTCAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTG 1378

131414383 AAGAAAGTACTAAACATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAA 131414442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 AAGAAAGTACTAAACATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAA 1438

131414443 GTACACAGATCAGTGACACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGT 131414502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 GTACACAGATCAGTGACACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGT 1498

131414503 AACATCATGATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGG 131414562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 AACATCATGATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGG 1558

131414563 CTAAATGCCCCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTG 131414622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 CTAAATGCCCCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTG 1618

131414623 GTATGCTGTCTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTT 131414682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 GTATGCTGTCTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTT 1678

131414683 ATCCAACTTGCATATCTCACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATA 131414742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 ATCCAACTTGCATATCTCACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATA 1738

131414743 AACATCTACCAAGCAAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGA 131414802
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 AACATCTACCAAGCGAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGA 1798

131414803 CAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTG 131414862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTG 1858

131414863 AAGAGTTCAATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 131414908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 AAGAGTTCAATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 1904

EXCISED REGION

131414944 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 131415003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 1965

131415004 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 131415063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 2025

131415064 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 131415123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 2085

131415124 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 131415183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 2145

131415184 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 131415243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 2205

131415244 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 131415303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 2265

131415304 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 131415363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 2325

131415364 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 131415423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 2385

131415424 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 131415483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 2445

131415484 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 131415543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 2505

131415544 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 131415603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 2565

131415604 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 131415663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 2625

131415664 TT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 131415721
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 --GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 2683

131415722 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 131415781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 2743

131415782 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTC-AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 131415840
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 2803

131415841 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 131415900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 2863

131415901 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 131415960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 2923

131415961 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 131416020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 2983

131416021 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 131416080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 3043

131416081 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 131416140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 3103

131416141 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 131416200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 3163

131416201 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 131416260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3164 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACGCAC 3223

131416261 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 131416320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 3283

131416321 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 131416380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 3343

131416381 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 131416440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 3403

131416441 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 131416500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 3463

131416501 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 131416560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 3523

131416561 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 131416620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 3583

131416621 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 131416680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 3643

131416681 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 131416740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 3703

131416741 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 131416800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 3763

131416801 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 131416860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3764 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 3823

131416861 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 131416920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3824 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 3883

131416921 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 131416980
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3884 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 3943

131416981 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 131417040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3944 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 4003

131417041 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 131417100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4004 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 4063

131417101 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 131417160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4064 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 4123

131417161 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 131417220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4124 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 4183

131417221 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 131417280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4184 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 4243

131417281 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 131417340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4244 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 4303

131417341 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 131417400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4304 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 4363

131417401 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 131417460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4364 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 4423

131417461 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGT 131417520
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4424 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGG 4483

131417521 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 131417580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4484 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 4543

131417581 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 131417640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4544 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 4603

131417641 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 131417700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4604 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 4663

131417701 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 131417760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4664 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 4723

131417761 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 131417820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4724 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 4783

131417821 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 131417880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4784 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 4843

131417881 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 131417940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4844 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 4903

131417941 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 131418000
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4904 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 4963

131418001 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 131418060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4964 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 5023

131418061 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 131418120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5024 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 5083

131418121 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAA 131418180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5084 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAA 5143

131418181 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 131418240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5144 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 5203

131418241 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 131418300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5204 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 5263

131418301 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 131418360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5264 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 5323

131418361 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 131418420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5324 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 5383

131418421 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 131418480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     5384 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 5443

131418481 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 131418540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5444 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 5503

131418541 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 131418600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5504 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 5563

131418601 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 131418660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5564 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 5623

131418661 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 131418720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5624 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 5683

131418721 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 131418780
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5684 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 5743

131418781 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 131418840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5744 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 5803

131418841 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 131418900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5804 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 5863

131418901 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 131418960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5864 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 5923

131418961 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 131419020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5924 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 5983

131419021 ACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 131419080
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 ATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 6043

131419081 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 131419140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6044 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 6103

131419141 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 131419200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6104 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 6163

131419201 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 131419260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6164 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 6223

131419261 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 131419320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6224 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 6283

131419321 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 131419380
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6284 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 6343

131419381 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 131419440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6344 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 6403

131419441 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 131419500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6404 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 6463

131419501 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCC 131419560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6464 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCC 6523

131419561 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT 131419620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6524 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT 6583

131419621 TTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTC 131419680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6584 TTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTC 6643

131419681 ATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCC 131419722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6644 ATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCC 6685

Alignment time is 5.01676 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     7276] =>      7276 nucs 'mol-32-2fb7-145793_7276'

Score:        7034
Aligned:      7276        nucs
Identic:      7254 (100%) nucs =>       282 (100%)      6972 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131415975,131416256] EXCISED REGION [131416258,131423250]
 second seq =>  [        1,      282] EXCISED REGION [      284,     7276]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [131416257,131416257]
 second seq =>         1 nucs [283,283]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [7033,7033]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131416256,131416256] to [131416258,131416258]
 second seq =>         1 nucs [282,282] to [284,284]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131415975 AAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATA 131416034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATA 60

131416035 GACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTC 131416094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTC 120

131416095 AAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAA 131416154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAA 180

131416155 CACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAA 131416214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAA 240

131416215 ATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAAC 131416256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAAC 282

EXCISED REGION

131416258 CACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCT 131416317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      284 CACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCT 343

131416318 CGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCAT 131416377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      344 CGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCAT 403

131416378 TCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTG 131416437
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      404 TCCTGCTTAAACTAGCCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTG 463

131416438 AGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCC 131416497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      464 AGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCC 523

131416498 AATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCA 131416557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      524 AATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAGCCTAATCCA 583

131416558 GCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGG 131416617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      584 GCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGG 643

131416618 TTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAA 131416677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      644 TTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAA 703

131416678 AACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTT 131416737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      704 AACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTT 763

131416738 CATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGC 131416797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      764 CATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGC 823

131416798 CCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCA 131416857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      824 CCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCA 883

131416858 CAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAA 131416917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      884 CAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAA 943

131416918 ACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAA 131416977
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      944 ACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAA 1003

131416978 GCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAA 131417037
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1004 GCTTCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAA 1063

131417038 ATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCA 131417097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 ATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCA 1123

131417098 AAATTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGA 131417157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 AAATTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGA 1183

131417158 TCTCTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATG 131417217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 TCTCTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATG 1243

131417218 GAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCC 131417277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 GAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCC 1303

131417278 CAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGG 131417337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 CAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGG 1363

131417338 AAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAG 131417397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 AAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAG 1423

131417398 GCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATAC 131417457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 GCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATAC 1483

131417458 TACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAAC 131417517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 TACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAAC 1543

131417518 AGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCT 131417577
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 AGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCT 1603

131417578 GACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGG 131417637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1604 GACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGG 1663

131417638 CCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAAC 131417697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 CCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAAC 1723

131417698 ACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCT 131417757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 ACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCT 1783

131417758 GGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGC 131417817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 GGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGC 1843

131417818 AATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCAC 131417877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 AATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCAC 1903

131417878 AGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGC 131417937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 AGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGC 1963

131417938 AAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAG 131417997
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1964 AAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAG 2023

131417998 AAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGAC 131418057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 AAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGAC 2083

131418058 ATACATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATG 131418117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 ATACATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATG 2143

131418118 CAAATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACAC 131418177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2144 CAAATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACAC 2203

131418178 CAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGT 131418237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 CAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGT 2263

131418238 AGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAA 131418297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 AGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAA 2323

131418298 AAACAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAA 131418357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 AAACAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAA 2383

131418358 ATCATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGC 131418417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 ATCATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGC 2443

131418418 AAAGACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTA 131418477
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2444 AAAGACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTA 2503

131418478 CATATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATA 131418537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 CATATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATA 2563

131418538 TGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATAC 131418597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 TGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATAC 2623

131418598 TGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGA 131418657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 TGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGA 2683

131418658 AACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAA 131418717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 AACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAA 2743

131418718 AAATAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCA 131418777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2744 AAATAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCA 2803

131418778 TGACACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTT 131418837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 TGACACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTT 2863

131418838 TTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAG 131418897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 TTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAG 2923

131418898 ATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCT 131418957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 ATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCT 2983

131418958 AACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATT 131419017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 AACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATT 3043

131419018 TCAACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTT 131419077
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 TCAATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTT 3103

131419078 TTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTC 131419137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3104 TTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTC 3163

131419138 CAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTT 131419197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 CAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTT 3223

131419198 CTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATC 131419257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 CTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATC 3283

131419258 CCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCAT 131419317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 CCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCAT 3343

131419318 GTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTC 131419377
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 GTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTC 3403

131419378 CTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTA 131419437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 CTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTA 3463

131419438 CTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACA 131419497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 CTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACA 3523

131419498 TTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTT 131419557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 TTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTT 3583

131419558 CCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTT 131419617
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
     3584 CCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTC-TTTTTTT 3642

131419618 TTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAG 131419677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 TTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAG 3702

131419678 CTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAG 131419737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 CTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAG 3762

131419738 CTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAG 131419797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 CTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAG 3822

131419798 GGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTT 131419857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 GGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTT 3882

131419858 CAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTC 131419917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 CAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTC 3942

131419918 TTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGT 131419977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 TTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGT 4002

131419978 AACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGA 131420037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 AACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGA 4062

131420038 TATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGT 131420097
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 TATATCAATCTATATAGTTTAGTTGTTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGT 4122

131420098 CCTTAATACCTAGTCTGTAAAATAGTGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATA 131420157
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 CCTTAATACCTAATCTGTAAAATAGTGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATA 4182

131420158 CATACATGTCAAACCAACAAATGAATGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTAT 131420217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 CATACATGTCAAACCAACAAATGAATGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTAT 4242

131420218 TTATCCATATGCCTATGGGACACATATTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTG 131420277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4243 TTATCCATATGCCTATGGGACACATATTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTG 4302

131420278 TTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATAC 131420337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 TTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATAC 4362

131420338 CTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCC 131420397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 CTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCC 4422

131420398 CCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCAT 131420457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 CCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCAT 4482

131420458 TATTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAG 131420517
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4483 TGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAG 4542

131420518 TTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATC 131420577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 TTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATC 4602

131420578 CTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTC 131420637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 CTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTC 4662

131420638 TATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAAT 131420697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4663 TATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAAT 4722

131420698 AAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAAC 131420757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 AAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAAC 4782

131420758 CAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCA 131420817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 CAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCA 4842

131420818 TACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAATTTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTAT 131420877
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4843 TACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAACTTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTAT 4902

131420878 TTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCA 131420937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4903 TTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCA 4962

131420938 TGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGC 131420997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4963 TGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGC 5022

131420998 TTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATAT 131421057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5023 TTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATAT 5082

131421058 CCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTTGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCT 131421117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5083 CCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTTGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCT 5142

131421118 CGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATT 131421177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5143 CGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATT 5202

131421178 CTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTT 131421237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5203 CTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTT 5262

131421238 TAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACTTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCA 131421297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5263 TAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACTTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCA 5322

131421298 TGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTGAATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTT 131421357
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5323 TGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTGCTGAATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTT 5382

131421358 TTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCTTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAG 131421417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5383 TTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCTTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAG 5442

131421418 GTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTTGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACT 131421477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5443 GTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTTGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACT 5502

131421478 ATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCATTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCA 131421537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5503 ATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCATTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCA 5562

131421538 GATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCTGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATAT 131421597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5563 GATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCTGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATAT 5622

131421598 GTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAA 131421657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5623 GTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAA 5682

131421658 GTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTTCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGG 131421717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5683 GTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTTCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGG 5742

131421718 GGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATC 131421777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5743 GGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATC 5802

131421778 AAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAATCTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTT 131421837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5803 AAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAATCTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTT 5862

131421838 CACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAGGATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACA 131421897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5863 CACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAGGATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACA 5922

131421898 GGACATATTTTCTTGGGCAACATCGCTTCTTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTAT 131421957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5923 GGACATATTTTCTTGGGCAACATCGCTTCTTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTAT 5982

131421958 AGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAATGTAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGG 131422017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5983 AGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAATGTAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGG 6042

131422018 AAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAGAAGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGA 131422077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6043 AAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAGAAGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGA 6102

131422078 AAAGCAAGGTGCCAGTCTCTGACCACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 131422137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6103 AAAGCAAGGTGCCAGTCTCTGACCACACACACACACACACACACACACACACACACACAC 6162

131422138 ACACACACATATACACACAGTGAGGCCGCTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAA 131422197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6163 ACACACACATATACACACAGTGAGGCCGCTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAA 6222

131422198 GATGGGATCCTCAACCACTTAGCACTTAGGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGAAGACA 131422257
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     6223 GATGGGATCCTCAACCACTTAGCACTTAGGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGATGACA 6282

131422258 GAGTATTCATCACAAAAGTCTCTTCACTTTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTG 131422317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6283 GAGTATTCATCACAAAAGTCTCTTCACTTTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTG 6342

131422318 AAAGGGAATTTCATCACAGGAGAGCTGAAGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTAT 131422377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6343 AAAGGGAATTTCATCACAGGAGAGCTGAAGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTAT 6402

131422378 AAACTTGAATGTTTTAGACAACTTCTGTCTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAA 131422437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6403 AAACTTGAATGTTTTAGACAACTTCTGTCTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAA 6462

131422438 ATTTTTTTGTAACATAAAATCTCATCTGCAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGC 131422497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6463 ATTTTTTTGTAACATAAAATCTCATCTGCAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGC 6522

131422498 ATCCCCATGTCCCTGAGAGTAAGAAGGTTAAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAA 131422557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6523 ATCCCCATGTCCCTGAGAGTAAGAAGGTTAAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAA 6582

131422558 TACCACTGAGTTGTAACTGAAAAGCTGTTTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACT 131422617
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6583 TACCATTGAGTTGTAACTGAAAAGCTGTTTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACT 6642

131422618 CTTTTTCTCATTACATTCATTATAATTTCTGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCA 131422677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6643 CTTTTTCTCATTACATTCATTATAATTTCTGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCA 6702

131422678 TGTGAGAGAGAGGCAGAAAGAGAGAAATGAAGGTACAAGAAACAGATTAGGCTGGGTGCG 131422737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6703 TGTGAGAGAGAGGCAGAAAGAGAGAAATGAAGGTACAAGAAACAGATTAGGCTGGGTGCG 6762

131422738 GTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCA 131422797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6763 GTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCA 6822

131422798 AGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGATGAAACCCCGACTCTACTAAAAATACAAAAA 131422857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6823 AGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGATGAAACCCCGACTCTACTAAAAATACAAAAA 6882

131422858 TTTAGCCAGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGA 131422917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6883 TTTAGCCAGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGA 6942

131422918 GAATGGCGTGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGCGCTGAGCAGAGATTGCGCCACCGCACTAC 131422977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6943 GAATGGCGTGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGCGCTGAGCAGAGATTGCGCCACCGCACTAC 7002

131422978 AGTCTGGGAGACAGAGTGATACTCCGTCTC-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAA 131423036
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     7003 AGTCTGGGAGACAGAGTGATACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAA 7062

131423037 CAGATTAATCACGTTAATAGCAAGCAAAGAAAGAGAGGTATTATCCAAATTTGAAAGGAG 131423096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     7063 CAGATTAATCACGTTAATAGCAAGCAAAGAAAGAGAGGCATTATCCAAATTTGAAAGGAG 7122

131423097 TAAAATTTTGCATAAGTTGACAGTCAGACAGGAAAAAGGGAGCTGGTAACAGTTAATCTA 131423156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7123 TAAAATTTTGCATAAGTTGACAGTCAGACAGGAAAAAGGGAGCTGGTAACAGTTAATCTA 7182

131423157 CAGGAAGGCCTTTTCACCTAGAATTATCTTAAAACATGCAGTCCTTACTGCCACTAAAAG 131423216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7183 CAGGAAGGCCTTTTCACCTAGAATTATCTTAAAACATGCAGTCCTTACTGCCACTAAAAG 7242

131423217 ACTAATTATGTGATTTCCTTCAATCTGAACAAAT 131423250
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     7243 ACTAATTATGTGATTTTCTTCAATCTGAACAAAT 7276

Alignment time is 5.36671 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     6146] =>      6146 nucs 'mol-32-2fe3-055654_6146'

Score:        5999
Aligned:      6148        nucs
Identic:      6132 (100%) nucs =>      1646 (100%)      4486 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131413260,131414908] EXCISED REGION [131414944,131419439]
 second seq =>  [        1,     1648] EXCISED REGION [     1650,     6146]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        35 nucs [131414909,131414943]
 second seq =>         1 nucs [1649,1649]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [131414906,131414908] to [131414944,131414946]
 second seq =>         3 nucs [1646,1648] to [1650,1652]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [131414909,131414919] to [131414933,131414943]
 second seq =>         0 nucs

131413260 ATGGAATACTATTCAGCCATCAAAAAGGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGAATG 131413319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGGAATACTATTCAGCCATCAAAAAGGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGAATG 60

131413320 AAGCTGGAAACCATCATTCTGAGCAAACTATCGCAAGGACAGAAAACCAAACACCGCATA 131413379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGCTGGAAACCATCATTCTGAGCAAACTATCGCAAGGACAGAAAACCAAACACCGCATA 120

131413380 TTCTCACTCATTGGTGGGAATTGAATAATGAGAACACTTGGACACAGGATGGGGAACATC 131413439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTCACTCATTGGTGGGAATTGAATAATGAGAACACTTGGACACAGGATGGGGAACATC 180

131413440 ATACAACGAGGCCTGTCGTGGGGTGGGGGGAGGTGGTAGGGATAGCATTAGGAGATATAC 131413499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATACAACGAGGCCTGTCGTGGGGTGGGGGGAGGTGGTAGGGATAGCATTAGGAGATATAC 240

131413500 CTAATGTAAATGACGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGGCACATGTATACATATGT 131413559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAATGTAAATGACGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGGCACATGTATACATATGT 300

131413560 AACAAACCTGTACCCTAGAACTTAAAGTATATATAAAAAAAAGATGGAAGGATAGATAGG 131413619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACAAACCTGTACCCTAGAACTTAAAGTATATATAAAAAAAAGATGGAAGGATAGATAGG 360

131413620 GGATACAAGAAACAAGACTGACAAGACATTAATTGTTCAAATGCATGACGAATATATGGG 131413679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGATACAAGAAACAAGACTGACAAGACATTAATTGTTCAAATGCATGACGAATATATGGG 420

131413680 TGTCATTATACTACTCTGTCTGCTTTGGGGTATGCTTGAAATTTTATAACTTTTTTAACA 131413739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTCATTATACTACTCTGTCTGCTTTGGGGTATGCTTGAAATTTTATAACTTTTTTAACA 480

131413740 CAAGCATTTAACAGCTATATAACATAAATTTTAAAAAGTAAGAATGTGACCATTATGTGC 131413799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAGCATTTAACAGCTATATAACATAAATTTTAAAAAGTAAGAATGTGACCATTATGTGC 540

131413800 CTCTGATTATAGTTTTTAAATTCCAAATAAAAAAGTGAATATAAGAAAAAAAAATCTTAA 131413859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCTGATTATAGTTTTTAAATTCCAAATAAAAAAGTGAATATAAGAAAAAAAAATCTTAA 600

131413860 AGGCAGCTACAAAGTGAAGTCCATTAGAGAAACAGCAGGCCTCTCAGCTGAAACCCTACA 131413919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGCAGCTACAAAGTGAAGTCCATTAGAGAAACAGCAGGCCTCTCAGCTGAAACCCTACA 660

131413920 AGCCAGAAAAGATTGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAAGAGGCTGGTCATGGTG 131413979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCCAGAAAAGATTGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAAGAGGCTGGTCATGGTG 720

131413980 GCTCATACCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACCTGACATCAG 131414039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTCATACCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACCTGACATCAG 780

131414040 GAGTTCGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTACAAATACAAAATT 131414099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGTTCGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTACAAATACAAAATT 840

131414100 AGCCGGGCGTGGTGGTATGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGTGGCTGTGGCAGGAGAA 131414159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCCGGGCGTGGTGGTATGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGTGGCTGTGGCAGGAGAA 900

131414160 TTGCTTCAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGC 131414219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGCTTCAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGC 960

131414220 CCAGGTGACATAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAAAAT 131414279
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
      961 CCAGGTGACAGAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-GGAAAGAAAAAT 1019

131414280 TCCAACCTAGAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTTTCAAAAAAGCAAATGCT 131414339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TCCAACCTAGAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTTTCAAAAAAGCAAATGCT 1079

131414340 CAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTGAAGAAAGTACTAAACAT 131414399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTGAAGAAAGTACTAAACAT 1139

131414400 GGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAAGTACACAGATCAGTGAC 131414459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAAGTACACAGATCAGTGAC 1199

131414460 ACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGTAACATCATGATGAACAG 131414519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGTAACATCATGATGAACAG 1259

131414520 AACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCCCCAATTAA 131414579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 AACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCCCCAATTAA 1319

131414580 AAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGTCTTCTTTA 131414639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGTCTTCTTTA 1379

131414640 TCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTTGCATATCT 131414699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTTGCATATCT 1439

131414700 CACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAAACATCTACCAAGCAAA 131414759
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1440 CACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAAACATCTACCAAGCGAA 1499

131414760 TTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTAAAC 131414819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTAAAC 1559

131414820 CAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCAACA 131414879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCAACA 1619

131414880 AGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 131414908
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 1648

EXCISED REGION

131414944 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 131415003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 1709

131415004 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 131415063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 1769

131415064 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 131415123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 1829

131415124 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 131415183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 1889

131415184 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 131415243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 1949

131415244 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 131415303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 2009

131415304 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 131415363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 2069

131415364 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 131415423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 2129

131415424 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 131415483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 2189

131415484 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 131415543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 2249

131415544 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 131415603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 2309

131415604 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 131415663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 2369

131415664 TT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 131415721
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 --GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 2427

131415722 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 131415781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 2487

131415782 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTC-AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 131415840
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 2547

131415841 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 131415900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 2607

131415901 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 131415960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 2667

131415961 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 131416020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 2727

131416021 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 131416080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 2787

131416081 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 131416140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 2847

131416141 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 131416200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 2907

131416201 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 131416260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 2967

131416261 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 131416320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 3027

131416321 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 131416380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 3087

131416381 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 131416440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 3147

131416441 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 131416500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 3207

131416501 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 131416560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 3267

131416561 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 131416620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 3327

131416621 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 131416680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 3387

131416681 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 131416740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 3447

131416741 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 131416800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 3507

131416801 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 131416860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 3567

131416861 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 131416920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 3627

131416921 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 131416980
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 3687

131416981 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 131417040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 3747

131417041 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 131417100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 3807

131417101 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 131417160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 3867

131417161 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 131417220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 3927

131417221 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 131417280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 3987

131417281 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 131417340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 4047

131417341 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 131417400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 4107

131417401 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 131417460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 4167

131417461 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGT 131417520
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4168 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGG 4227

131417521 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 131417580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 4287

131417581 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 131417640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 4347

131417641 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 131417700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 4407

131417701 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 131417760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 4467

131417761 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 131417820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 4527

131417821 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 131417880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 4587

131417881 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 131417940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 4647

131417941 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 131418000
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4648 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 4707

131418001 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 131418060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 4767

131418061 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 131418120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 4827

131418121 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAA 131418180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4828 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAA 4887

131418181 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 131418240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 4947

131418241 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 131418300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 5007

131418301 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 131418360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 5067

131418361 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 131418420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5068 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 5127

131418421 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 131418480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     5128 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 5187

131418481 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 131418540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 5247

131418541 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 131418600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 5307

131418601 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 131418660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5308 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 5367

131418661 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 131418720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5368 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 5427

131418721 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 131418780
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5428 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 5487

131418781 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 131418840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5488 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 5547

131418841 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 131418900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5548 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 5607

131418901 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 131418960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5608 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 5667

131418961 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 131419020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5668 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 5727

131419021 ACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 131419080
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5728 ATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 5787

131419081 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 131419140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5788 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 5847

131419141 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 131419200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5848 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 5907

131419201 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 131419260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5908 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 5967

131419261 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 131419320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5968 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 6027

131419321 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 131419380
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6028 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 6087

131419381 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACT 131419439
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6088 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACT 6146

Alignment time is 4.72755 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3389] =>      3389 nucs 'mol-32-2fe3-258398_3389'

Score:        3322
Aligned:      3388        nucs
Identic:      3382 (100%) nucs =>      1074 (100%)      2308 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131415869,131416942] EXCISED REGION [131416944,131419257]
 second seq =>  [        1,     1074] EXCISED REGION [     1076,     3389]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [131416943,131416943]
 second seq =>         1 nucs [1075,1075]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131416942,131416942] to [131416943,131416943]
 second seq =>         1 nucs [1075,1075] to [1076,1076]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131415869 CATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGA 131415928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGA 60

131415929 AGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAA 131415988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAA 120

131415989 GATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGATAAA 131416048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGATAAA 180

131416049 CTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTAC 131416108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTAC 240

131416109 CACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACA 131416168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACA 300

131416169 TAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACT 131416228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACT 360

131416229 GAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGT 131416288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGT 420

131416289 AATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTA 131416348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTA 480

131416349 CCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAA 131416408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAA 540

131416409 GGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGG 131416468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGG 600

131416469 GAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATT 131416528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATT 660

131416529 CTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGAC 131416588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGAC 720

131416589 AAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGG 131416648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGG 780

131416649 ATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAA 131416708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAA 840

131416709 AATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATC 131416768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATC 900

131416769 GAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAA 131416828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAA 960

131416829 GCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAAT 131416888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAAT 1020

131416889 AGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATC 131416942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATC 1074

EXCISED REGION

131416944 TATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCA 131417003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 TATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCA 1135

131417004 GCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCA 131417063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 GCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCA 1195

131417064 AGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAAT 131417123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 AGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAAT 1255

131417124 ACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACAC 131417183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 ACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACAC 1315

131417184 TGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAG 131417243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 TGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAG 1375

131417244 GATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTA 131417303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 GATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTA 1435

131417304 TTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTC 131417363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTC 1495

131417364 ATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGC 131417423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 ATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGC 1555

131417424 TGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGC 131417483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGC 1615

131417484 ATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCT 131417543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1616 ATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCT 1675

131417544 GCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGA 131417603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 GCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGA 1735

131417604 TTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACT 131417663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 TTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACT 1795

131417664 GGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGT 131417723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 GGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGT 1855

131417724 AAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAA 131417783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 AAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAA 1915

131417784 CAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACA 131417843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 CAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACA 1975

131417844 AATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGA 131417903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 AATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGA 2035

131417904 ACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAA 131417963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 ACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAA 2095

131417964 TGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGT 131418023
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 TGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGT 2155

131418024 GGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAA 131418083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 GGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAA 2215

131418084 AAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCA 131418143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 AAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCA 2275

131418144 TCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGT 131418203
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGT 2335

131418204 TGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTG 131418263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 TGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTG 2395

131418264 TGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAA 131418323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAA 2455

131418324 TCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCA 131418383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCA 2515

131418384 TGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCC 131418443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 TGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCC 2575

131418444 CATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAG 131418503
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 CATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAG 2635

131418504 CCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCT 131418563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 CCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCT 2695

131418564 TAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAG 131418623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 TAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAG 2755

131418624 TTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGA 131418683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 TTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGA 2815

131418684 GGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATT 131418743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 GGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATT 2875

131418744 ATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAAT 131418803
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 ATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAAT 2935

131418804 TTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTA 131418863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 TTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTA 2995

131418864 GTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCC 131418923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 GTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCC 3055

131418924 TCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCA 131418983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 TCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCA 3115

131418984 TCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACAC 131419043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3116 TCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACAC 3175

131419044 TTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAG 131419103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 TTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAG 3235

131419104 ACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCT 131419163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3236 ACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCT 3295

131419164 ACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCT 131419223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3296 ACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCT 3355

131419224 AACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATC 131419257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3356 AACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATC 3389

Alignment time is 2.57995 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3604] =>      3604 nucs 'mol-32-2fe3-340770_3604'

Score:        3504
Aligned:      3603        nucs
Identic:      3594 (100%) nucs =>       338 (100%)      3256 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131416605,131416942] EXCISED REGION [131416944,131420207]
 second seq =>  [        1,      338] EXCISED REGION [      340,     3604]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [131416943,131416943]
 second seq =>         1 nucs [339,339]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3007,3007]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131416942,131416942] to [131416943,131416943]
 second seq =>         1 nucs [339,339] to [340,340]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131416605 ATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACA 131416664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACA 60

131416665 GAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAA 131416724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAA 120

131416725 TTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCA 131416784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCA 180

131416785 AAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCC 131416844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCC 240

131416845 TTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAA 131416904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAA 300

131416905 GAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATC 131416942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATC 338

EXCISED REGION

131416944 TATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCA 131417003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      340 TATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCA 399

131417004 GCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCA 131417063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      400 GCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCA 459

131417064 AGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAAT 131417123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      460 AGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAAT 519

131417124 ACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACAC 131417183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      520 ACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACAC 579

131417184 TGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAG 131417243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      580 TGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAG 639

131417244 GATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTA 131417303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      640 GATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTA 699

131417304 TTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTC 131417363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      700 TTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTC 759

131417364 ATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGC 131417423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      760 ATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGC 819

131417424 TGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGC 131417483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 TGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGC 879

131417484 ATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCT 131417543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      880 ATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCT 939

131417544 GCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGA 131417603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 GCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGA 999

131417604 TTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACT 131417663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 TTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACT 1059

131417664 GGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGT 131417723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 GGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGT 1119

131417724 AAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAA 131417783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 AAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAA 1179

131417784 CAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACA 131417843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 CAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACA 1239

131417844 AATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGA 131417903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 AATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGA 1299

131417904 ACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAA 131417963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 ACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAA 1359

131417964 TGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGT 131418023
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 TGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGT 1419

131418024 GGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAA 131418083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 GGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAA 1479

131418084 AAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCA 131418143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 AAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCA 1539

131418144 TCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGT 131418203
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 TCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGT 1599

131418204 TGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTG 131418263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 TGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTG 1659

131418264 TGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAA 131418323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 TGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAA 1719

131418324 TCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCA 131418383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 TCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCA 1779

131418384 TGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCC 131418443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 TGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCC 1839

131418444 CATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAG 131418503
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 CATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAG 1899

131418504 CCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCT 131418563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 CCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCT 1959

131418564 TAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAG 131418623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 TAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAG 2019

131418624 TTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGA 131418683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 TTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGA 2079

131418684 GGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATT 131418743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 GGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATT 2139

131418744 ATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAAT 131418803
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 ATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAAT 2199

131418804 TTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTA 131418863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 TTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTA 2259

131418864 GTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCC 131418923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 GTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCC 2319

131418924 TCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCA 131418983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 TCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCA 2379

131418984 TCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACAC 131419043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2380 TCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACAC 2439

131419044 TTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAG 131419103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 TTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAG 2499

131419104 ACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCT 131419163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 ACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCT 2559

131419164 ACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCT 131419223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 ACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCT 2619

131419224 AACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTA 131419283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 AACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTA 2679

131419284 TCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGT 131419343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 TCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGT 2739

131419344 AGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTC 131419403
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 AGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTC 2799

131419404 CATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATC 131419463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 CATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATC 2859

131419464 CTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTT 131419523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 CTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTT 2919

131419524 TGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTT 131419583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 TGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTT 2979

131419584 CTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCT-TTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCT 131419642
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 CTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCT 3039

131419643 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGG 131419702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGG 3099

131419703 TTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCA 131419762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 TTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCA 3159

131419763 TGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 131419822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 TGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGG 3219

131419823 TATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 131419882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 TATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAC 3279

131419883 AGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGA 131419942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3280 AGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGA 3339

131419943 GAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTC 131420002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3340 GAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTC 3399

131420003 TCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTG 131420062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3400 TCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTG 3459

131420063 TTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAGTCTGTAAAATAG 131420122
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3460 TTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAATCTGTAAAATAG 3519

131420123 TGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAA 131420182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3520 TGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAA 3579

131420183 TGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTC 131420207
          |||||||||||||||||||||||||
     3580 TGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTC 3604

Alignment time is 2.75848 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4835] =>      4835 nucs 'mol-32-2fee-102079_4835'

Score:        4699
Aligned:      4831        nucs
Identic:      4819 (100%) nucs =>      4451 (100%)       368 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131418567,131423027] EXCISED REGION [131423034,131423403]
 second seq =>  [        1,     4461] EXCISED REGION [     4466,     4835]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [131423028,131423033]
 second seq =>         4 nucs [4462,4465]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        23 nucs [4442,4464] to [4446,4468]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [131423025,131423027] to [131423034,131423036]
 second seq =>         3 nucs [4459,4461] to [4466,4468]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131423028,131423028] to [131423033,131423033]
 second seq =>         2 nucs [4462,4463] to [4464,4465]

131418567 CAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTA 131418626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTA 60

131418627 AATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGG 131418686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGG 120

131418687 TGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATTATG 131418746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATTATG 180

131418747 GGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAATTTG 131418806
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAATTTG 240

131418807 CACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTA 131418866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTA 300

131418867 CTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCC 131418926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCC 360

131418927 TGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCT 131418986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCT 420

131418987 GTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACACTTC 131419046
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      421 GTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACACTTC 480

131419047 AATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACA 131419106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACA 540

131419107 TTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACC 131419166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACC 600

131419167 GCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAAC 131419226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAAC 660

131419227 TAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCC 131419286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCC 720

131419287 AGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGC 131419346
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      721 AGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGT 780

131419347 TTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCAT 131419406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCAT 840

131419407 CTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTC 131419466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTC 900

131419467 ACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGT 131419526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGT 960

131419527 ACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTC 131419586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTC 1020

131419587 CTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCA 131419646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCA 1080

131419647 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCC 131419706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCC 1140

131419707 AGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCC 131419766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCC 1200

131419767 CGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATC 131419826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATC 1260

131419827 GAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGT 131419886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGT 1320

131419887 GTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAG 131419946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAG 1380

131419947 ACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTG 131420006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTG 1440

131420007 CTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTA 131420066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTA 1500

131420067 CCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAGTCTGTAAAATAGTGCA 131420126
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1501 CCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAATCTGTAAAATAGTGCA 1560

131420127 TAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGAT 131420186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGAT 1620

131420187 TGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATTC 131420246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATTC 1680

131420247 CTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTG 131420306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTG 1740

131420307 AAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTT 131420366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTT 1800

131420367 GACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTAT 131420426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTAT 1860

131420427 TATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTATTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACA 131420486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACA 1920

131420487 TGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCA 131420546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCA 1980

131420547 TCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGG 131420606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGG 2040

131420607 TGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCC 131420666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCC 2100

131420667 ATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGT 131420726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGT 2160

131420727 AGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATA 131420786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATA 2220

131420787 TTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAATT 131420846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2221 TTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAACT 2280

131420847 TACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTT 131420906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTT 2340

131420907 GACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGT 131420966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGT 2400

131420967 AGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAA 131421026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAA 2460

131421027 ATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTT 131421086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTT 2520

131421087 GCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCA 131421146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCA 2580

131421147 GATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATA 131421206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATA 2640

131421207 GTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACT 131421266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACT 2700

131421267 TTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTGA 131421326
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2701 TTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTGCTGA 2760

131421327 ATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCT 131421386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCT 2820

131421387 TTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTT 131421446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTT 2880

131421447 GTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCAT 131421506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCAT 2940

131421507 TGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCT 131421566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCT 3000

131421567 GAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTT 131421626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTT 3060

131421627 TTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTT 131421686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTT 3120

131421687 CTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTAA 131421746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTAA 3180

131421747 AGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAATC 131421806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAATC 3240

131421807 TATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAGG 131421866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAGG 3300

131421867 ATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATCGCTTC 131421926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATCGCTTC 3360

131421927 TTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAATG 131421986
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTTGTGAAAATTGATTCTGATGTACAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAATG 3420

131421987 TAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAGA 131422046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAGA 3480

131422047 AGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAAGCAAGGTGCCAGTCTCTGACCACACA 131422106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAAGCAAGGTGCCAGTCTCTGACCACACA 3540

131422107 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACAGTGAGGCCGC 131422166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACAGTGAGGCCGC 3600

131422167 TATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGATGGGATCCTCAACCACTTAGCACTTAG 131422226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGATGGGATCCTCAACCACTTAGCACTTAG 3660

131422227 GGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGAAGACAGAGTATTCATCACAAAAGTCTCTTCACTT 131422286
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGATGACAGAGTATTCATCACAAAAGTCTCTTCACTT 3720

131422287 TGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAAGGGAATTTCATCACAGGAGAGCTGAA 131422346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAAGGGAATTTCATCACAGGAGAGCTGAA 3780

131422347 GGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAACTTGAATGTTTTAGACAACTTCTGTC 131422406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAACTTGAATGTTTTAGACAACTTCTGTC 3840

131422407 TCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATTTTTTTGTAACATAAAATCTCATCTGC 131422466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATTTTTTTGTAACATAAAATCTCATCTGC 3900

131422467 AGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATCCCCATGTCCCTGAGAGTAAGAAGGTT 131422526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATCCCCATGTCCCTGAGAGTAAGAAGGTT 3960

131422527 AAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAATACCACTGAGTTGTAACTGAAAAGCTGTT 131422586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3961 AAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAATACCATTGAGTTGTAACTGAAAAGCTGTT 4020

131422587 TGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTTTTTCTCATTACATTCATTATAATTTC 131422646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTTTTTCTCATTACATTCATTATAATTTC 4080

131422647 TGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCATGTGAGAGAGAGGCAGAAAGAGAGAAATG 131422706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCATGTGAGAGAGAGGCAGAAAGAGAGAAATG 4140

131422707 AAGGTACAAGAAACAGATTAGGCTGGGTGCGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTT 131422766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AAGGTACAAGAAACAGATTAGGCTGGGTGCGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTT 4200

131422767 GGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGA 131422826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGA 4260

131422827 TGAAACCCCGACTCTACTAAAAATACAAAAATTTAGCCAGGCATGGTGGCGGGCGCCTGT 131422886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TGAAACCCCGACTCTACTAAAAATACAAAAATTTAGCCAGGCATGGTGGCGGGCGCCTGT 4320

131422887 AGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGTGGAGCTT 131422946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGTGGAGCTT 4380

131422947 GCGCTGAGCAGAGATTGCGCCACCGCACTACAGTCTGGGAGACAGAGTGATACTCCGTCT 131423006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GCGCTGAGCAGAGATTGCGCCACCGCACTACAGTCTGGGAGACAGAGTGATACTCCGTCT 4440

131423007 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 131423027
          |||||||||||||||||||||
     4441 CAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 4461

EXCISED REGION

131423034 AAACAGATTAATCACGTTAATAGCAAGCAAAGAAAGAGAGGTATTATCCAAATTTGAAAG 131423093
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4466 AAACAGATTAATCACGTTAATAGCAAGCAAAGAAAGAGAGGCATTATCCAAATTTGAAAG 4525

131423094 GAGTAAAATTTTGCATAAGTTGACAGTCAGACAGGAAAAAGGGAGCTGGTAACAGTTAAT 131423153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 GAGTAAAATTTTGCATAAGTTGACAGTCAGACAGGAAAAAGGGAGCTGGTAACAGTTAAT 4585

131423154 CTACAGGAAGGCCTTTTCACCTAGAATTATCTTAAAACATGCAGTCCTTACTGCCACTAA 131423213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 CTACAGGAAGGCCTTTTCACCTAGAATTATCTTAAAACATGCAGTCCTTACTGCCACTAA 4645

131423214 AAGACTAATTATGTGATTTCCTTCAATCTGAACAAATCCTTTTTTATACTGCTCTTTATG 131423273
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 AAGACTAATTATGTGATTTTCTTCAATCTGAACAAATCCTTTTTTATACTGCTCTTTATG 4705

131423274 GCAGACTATAGTGTGAGTCAGAAATTCCAAAAGCATGATAATCTCCATCCTTTACAGCAC 131423333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 GCAGACTATAGTGTGAGTCAGAAATTCCAAAAGCATGATAATCTCCATCCTTTACAGCAC 4765

131423334 CTGTCCCAACGTTATGTTAATCATTAGTTGATAATCTTTAAAGCTGAGGGCTACACACCC 131423393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 CTGTCCCAACGTTATGTTAATCATTAGTTGATAATCTTTAAAGCTGAGGGCTACACACCC 4825

131423394 TCTACTATTG 131423403
          ||||||||||
     4826 TCTACTATTG 4835

Alignment time is 3.72377 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     5502] =>      5502 nucs 'mol-32-2ff9-105405_5502'

Score:        5369
Aligned:      5501        nucs
Identic:      5489 (100%) nucs =>       160 (100%)      5329 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131417360,131417519] EXCISED REGION [131417521,131422861]
 second seq =>  [        1,      160] EXCISED REGION [      162,     5502]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [131417520,131417520]
 second seq =>         1 nucs [161,161]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [160,160] to [161,161]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131417360 ATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACA 131417419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACA 60

131417420 AAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAA 131417479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAA 120

131417480 CAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAG 131417519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAG 160

EXCISED REGION

131417521 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 131417580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      162 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 221

131417581 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 131417640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      222 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 281

131417641 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 131417700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      282 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 341

131417701 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 131417760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      342 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 401

131417761 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 131417820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      402 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 461

131417821 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 131417880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      462 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 521

131417881 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 131417940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      522 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 581

131417941 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 131418000
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      582 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 641

131418001 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 131418060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      642 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 701

131418061 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 131418120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      702 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 761

131418121 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAA 131418180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      762 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAA 821

131418181 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 131418240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 881

131418241 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 131418300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 941

131418301 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 131418360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 1001

131418361 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 131418420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 1061

131418421 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 131418480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1062 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 1121

131418481 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 131418540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 1181

131418541 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 131418600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 1241

131418601 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 131418660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 1301

131418661 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 131418720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 1361

131418721 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 131418780
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 1421

131418781 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 131418840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 1481

131418841 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 131418900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 1541

131418901 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 131418960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 1601

131418961 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 131419020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 1661

131419021 ACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 131419080
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 ATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 1721

131419081 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 131419140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 1781

131419141 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 131419200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 1841

131419201 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 131419260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 1901

131419261 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 131419320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 1961

131419321 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 131419380
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 2021

131419381 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 131419440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 2081

131419441 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 131419500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 2141

131419501 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCC 131419560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCC 2201

131419561 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT 131419620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT 2261

131419621 TTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTC 131419680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 TTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTC 2321

131419681 ATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTG 131419740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 ATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTG 2381

131419741 GGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGT 131419800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 GGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGT 2441

131419801 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAG 131419860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAG 2501

131419861 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTT 131419920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTT 2561

131419921 ATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAAC 131419980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 ATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAAC 2621

131419981 CATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATAT 131420040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 CATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATAT 2681

131420041 ATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCT 131420100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 ATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCT 2741

131420101 TAATACCTAGTCTGTAAAATAGTGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACAT 131420160
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 TAATACCTAATCTGTAAAATAGTGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACAT 2801

131420161 ACATGTCAAACCAACAAATGAATGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTA 131420220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 ACATGTCAAACCAACAAATGAATGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTA 2861

131420221 TCCATATGCCTATGGGACACATATTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTT 131420280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 TCCATATGCCTATGGGACACATATTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTT 2921

131420281 TAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTG 131420340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 TAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTG 2981

131420341 TGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCC 131420400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 TGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCC 3041

131420401 AACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTAT 131420460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3042 AACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGT 3101

131420461 TCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTT 131420520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 TCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTT 3161

131420521 GCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTT 131420580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 GCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTT 3221

131420581 TTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTAT 131420640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 TTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTAT 3281

131420641 CATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAA 131420700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 CATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAA 3341

131420701 CATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAG 131420760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 CATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAG 3401

131420761 TAATGGGATTGCTGGGTCACATCATATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATAC 131420820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 TAATGGGATTGCTGGGTCACATCATATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATAC 3461

131420821 TGTCTTCCATAATGGTTGAACTAATTTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTC 131420880
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 TGTCTTCCATAATGGTTGAACTAACTTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTC 3521

131420881 AGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGA 131420940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 AGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGA 3581

131420941 GATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTT 131421000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 GATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTT 3641

131421001 TTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCT 131421060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 TTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCT 3701

131421061 TTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTTGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGT 131421120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 TTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTTGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGT 3761

131421121 AAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTG 131421180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 AAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTG 3821

131421181 TAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAA 131421240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 TAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAA 3881

131421241 CTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACTTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGA 131421300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 CTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACTTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGA 3941

131421301 AGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTGAATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTA 131421360
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 AGTCTTTGCCCATGCCTATGTGCTGAATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTA 4001

131421361 TGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCTTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTG 131421420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4002 TGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCTTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTG 4061

131421421 TAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTTGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATT 131421480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4062 TAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTTGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATT 4121

131421481 TATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCATTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGAT 131421540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4122 TATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCATTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGAT 4181

131421541 AGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCTGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTC 131421600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4182 AGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCTGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTC 4241

131421601 TGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTC 131421660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4242 TGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTC 4301

131421661 AGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTTCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGT 131421720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4302 AGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTTCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGT 4361

131421721 CTTCTTTGATTCCATATGAAATTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAA 131421780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4362 CTTCTTTGATTCCATATGAAATTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAA 4421

131421781 TATCTTGATGGGAATAGCACTGAATCTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCAC 131421840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4422 TATCTTGATGGGAATAGCACTGAATCTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCAC 4481

131421841 AATATTGATTCTTCCTATCCATGAGGATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGA 131421900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4482 AATATTGATTCTTCCTATCCATGAGGATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGA 4541

131421901 CATATTTTCTTGGGCAACATCGCTTCTTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGC 131421960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4542 CATATTTTCTTGGGCAACATCGCTTCTTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGC 4601

131421961 CCATAGGAAAACACCTTCTCAAAATGTAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAG 131422020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4602 CCATAGGAAAACACCTTCTCAAAATGTAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAG 4661

131422021 CAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAGAAGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAA 131422080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 CAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAGAAGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAA 4721

131422081 GCAAGGTGCCAGTCTCTGACCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA 131422140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 GCAAGGTGCCAGTCTCTGACCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA 4781

131422141 CACACATATACACACAGTGAGGCCGCTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGAT 131422200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 CACACATATACACACAGTGAGGCCGCTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGAT 4841

131422201 GGGATCCTCAACCACTTAGCACTTAGGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGAAGACAGAG 131422260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4842 GGGATCCTCAACCACTTAGCACTTAGGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGATGACAGAG 4901

131422261 TATTCATCACAAAAGTCTCTTCACTTTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAA 131422320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4902 TATTCATCACAAAAGTCTCTTCACTTTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAA 4961

131422321 GGGAATTTCATCACAGGAGAGCTGAAGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAA 131422380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4962 GGGAATTTCATCACAGGAGAGCTGAAGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAA 5021

131422381 CTTGAATGTTTTAGACAACTTCTGTCTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATT 131422440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5022 CTTGAATGTTTTAGACAACTTCTGTCTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATT 5081

131422441 TTTTTGTAACATAAAATCTCATCTGCAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATC 131422500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5082 TTTTTGTAACATAAAATCTCATCTGCAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATC 5141

131422501 CCCATGTCCCTGAGAGTAAGAAGGTTAAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAATAC 131422560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5142 CCCATGTCCCTGAGAGTAAGAAGGTTAAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAATAC 5201

131422561 CACTGAGTTGTAACTGAAAAGCTGTTTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTT 131422620
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5202 CATTGAGTTGTAACTGAAAAGCTGTTTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTT 5261

131422621 TTTCTCATTACATTCATTATAATTTCTGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCATGT 131422680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5262 TTTCTCATTACATTCATTATAATTTCTGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCATGT 5321

131422681 GAGAGAGAGGCAGAAAGAGAGAAATGAAGGTACAAGAAACAGATTAGGCTGGGTGCGGTG 131422740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 GAGAGAGAGGCAGAAAGAGAGAAATGAAGGTACAAGAAACAGATTAGGCTGGGTGCGGTG 5381

131422741 GCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAAGA 131422800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5382 GCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAAGA 5441

131422801 GATTGAGACCATCCTGGCTAACACGATGAAACCCCGACTCTACTAAAAATACAAAAATTT 131422860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5442 GATTGAGACCATCCTGGCTAACACGATGAAACCCCGACTCTACTAAAAATACAAAAATTT 5501

131422861 A 131422861
          |
     5502 A 5502

Alignment time is 4.29643 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     8602] =>      8602 nucs 'mol-32-3004-017232_8602'

Score:        8389
Aligned:      8604        nucs
Identic:      8582 (100%) nucs =>      1646 (100%)      6936 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131413260,131414908] EXCISED REGION [131414944,131421896]
 second seq =>  [        1,     1648] EXCISED REGION [     1650,     8602]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        35 nucs [131414909,131414943]
 second seq =>         1 nucs [1649,1649]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [131414906,131414908] to [131414944,131414946]
 second seq =>         3 nucs [1646,1648] to [1650,1652]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [131414909,131414919] to [131414933,131414943]
 second seq =>         0 nucs

131413260 ATGGAATACTATTCAGCCATCAAAAAGGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGAATG 131413319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGGAATACTATTCAGCCATCAAAAAGGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGAATG 60

131413320 AAGCTGGAAACCATCATTCTGAGCAAACTATCGCAAGGACAGAAAACCAAACACCGCATA 131413379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGCTGGAAACCATCATTCTGAGCAAACTATCGCAAGGACAGAAAACCAAACACCGCATA 120

131413380 TTCTCACTCATTGGTGGGAATTGAATAATGAGAACACTTGGACACAGGATGGGGAACATC 131413439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTCACTCATTGGTGGGAATTGAATAATGAGAACACTTGGACACAGGATGGGGAACATC 180

131413440 ATACAACGAGGCCTGTCGTGGGGTGGGGGGAGGTGGTAGGGATAGCATTAGGAGATATAC 131413499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATACAACGAGGCCTGTCGTGGGGTGGGGGGAGGTGGTAGGGATAGCATTAGGAGATATAC 240

131413500 CTAATGTAAATGACGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGGCACATGTATACATATGT 131413559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAATGTAAATGACGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGGCACATGTATACATATGT 300

131413560 AACAAACCTGTACCCTAGAACTTAAAGTATATATAAAAAAAAGATGGAAGGATAGATAGG 131413619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACAAACCTGTACCCTAGAACTTAAAGTATATATAAAAAAAAGATGGAAGGATAGATAGG 360

131413620 GGATACAAGAAACAAGACTGACAAGACATTAATTGTTCAAATGCATGACGAATATATGGG 131413679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGATACAAGAAACAAGACTGACAAGACATTAATTGTTCAAATGCATGACGAATATATGGG 420

131413680 TGTCATTATACTACTCTGTCTGCTTTGGGGTATGCTTGAAATTTTATAACTTTTTTAACA 131413739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTCATTATACTACTCTGTCTGCTTTGGGGTATGCTTGAAATTTTATAACTTTTTTAACA 480

131413740 CAAGCATTTAACAGCTATATAACATAAATTTTAAAAAGTAAGAATGTGACCATTATGTGC 131413799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAGCATTTAACAGCTATATAACATAAATTTTAAAAAGTAAGAATGTGACCATTATGTGC 540

131413800 CTCTGATTATAGTTTTTAAATTCCAAATAAAAAAGTGAATATAAGAAAAAAAAATCTTAA 131413859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCTGATTATAGTTTTTAAATTCCAAATAAAAAAGTGAATATAAGAAAAAAAAATCTTAA 600

131413860 AGGCAGCTACAAAGTGAAGTCCATTAGAGAAACAGCAGGCCTCTCAGCTGAAACCCTACA 131413919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGCAGCTACAAAGTGAAGTCCATTAGAGAAACAGCAGGCCTCTCAGCTGAAACCCTACA 660

131413920 AGCCAGAAAAGATTGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAAGAGGCTGGTCATGGTG 131413979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCCAGAAAAGATTGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAAGAGGCTGGTCATGGTG 720

131413980 GCTCATACCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACCTGACATCAG 131414039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTCATACCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACCTGACATCAG 780

131414040 GAGTTCGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTACAAATACAAAATT 131414099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGTTCGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTACAAATACAAAATT 840

131414100 AGCCGGGCGTGGTGGTATGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGTGGCTGTGGCAGGAGAA 131414159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCCGGGCGTGGTGGTATGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGTGGCTGTGGCAGGAGAA 900

131414160 TTGCTTCAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGC 131414219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGCTTCAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGC 960

131414220 CCAGGTGACATAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAAAAT 131414279
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
      961 CCAGGTGACAGAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-GGAAAGAAAAAT 1019

131414280 TCCAACCTAGAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTTTCAAAAAAGCAAATGCT 131414339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TCCAACCTAGAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTTTCAAAAAAGCAAATGCT 1079

131414340 CAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTGAAGAAAGTACTAAACAT 131414399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTGAAGAAAGTACTAAACAT 1139

131414400 GGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAAGTACACAGATCAGTGAC 131414459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAAGTACACAGATCAGTGAC 1199

131414460 ACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGTAACATCATGATGAACAG 131414519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGTAACATCATGATGAACAG 1259

131414520 AACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCCCCAATTAA 131414579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 AACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCCCCAATTAA 1319

131414580 AAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGTCTTCTTTA 131414639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGTCTTCTTTA 1379

131414640 TCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTTGCATATCT 131414699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTTGCATATCT 1439

131414700 CACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAAACATCTACCAAGCAAA 131414759
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1440 CACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAAACATCTACCAAGCGAA 1499

131414760 TTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTAAAC 131414819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTAAAC 1559

131414820 CAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCAACA 131414879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCAACA 1619

131414880 AGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 131414908
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 1648

EXCISED REGION

131414944 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 131415003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 1709

131415004 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 131415063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 1769

131415064 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 131415123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 1829

131415124 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 131415183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 1889

131415184 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 131415243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 1949

131415244 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 131415303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 2009

131415304 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 131415363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 2069

131415364 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 131415423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 2129

131415424 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 131415483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 2189

131415484 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 131415543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 2249

131415544 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 131415603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 2309

131415604 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 131415663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 2369

131415664 TT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 131415721
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 --GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 2427

131415722 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 131415781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 2487

131415782 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAA 131415841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAA 2547

131415842 AGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGC 131415901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 AGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGC 2607

131415902 AAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGA 131415961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 AAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGA 2667

131415962 GATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAA 131416021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 GATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAA 2727

131416022 AATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACAC 131416081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 AATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACAC 2787

131416082 AACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAG 131416141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 AACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAG 2847

131416142 AGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATT 131416201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 AGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATT 2907

131416202 TCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACC 131416261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 TCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACC 2967

131416262 AATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGG 131416321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 AATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGG 3027

131416322 ACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCT 131416381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 ACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCT 3087

131416382 GCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGC 131416441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 GCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGC 3147

131416442 CAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATA 131416501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 CAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATA 3207

131416502 TCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAG 131416561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 TCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAG 3267

131416562 CACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGG 131416621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 CACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGG 3327

131416622 GTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACC 131416681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3328 GTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCGCATAAACAGAACTAAAGACAAAACC 3387

131416682 CACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATG 131416741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 CACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATG 3447

131416742 TTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCAC 131416801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 TTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCAC 3507

131416802 AGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAG 131416861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 AGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAG 3567

131416862 ACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTA 131416921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 ACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTA 3627

131416922 TTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTC 131416981
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 TTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTC 3687

131416982 CTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTA 131417041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 CTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTA 3747

131417042 CTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAAT 131417101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 CTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAAT 3807

131417102 TGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTC 131417161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 TGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTC 3867

131417162 TACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAA 131417221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 TACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAA 3927

131417222 AACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAA 131417281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 AACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAA 3987

131417282 GCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGT 131417341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 GCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGT 4047

131417342 AGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAA 131417401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 AGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAA 4107

131417402 TCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACA 131417461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 TCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACA 4167

131417462 GTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTA 131417521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4168 GTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGA 4227

131417522 TAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACA 131417581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 TAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACA 4287

131417582 AAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAG 131417641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 AAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAG 4347

131417642 ACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAA 131417701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 ACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAA 4407

131417702 GATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGC 131417761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 GATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGC 4467

131417762 CATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATT 131417821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 CATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATT 4527

131417822 GCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCA 131417881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 GCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCA 4587

131417882 AAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAAC 131417941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 AAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAAC 4647

131417942 TACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAA 131418001
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4648 TACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAA 4707

131418002 AAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATAC 131418061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 AAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATAC 4767

131418062 ATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAA 131418121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 ATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAA 4827

131418122 TCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAAA 131418181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4828 TCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAAA 4887

131418182 AAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGA 131418241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 AAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGA 4947

131418242 GCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAAC 131418301
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 GCGTAAATTAGTTAAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAAC 5007

131418302 AGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCA 131418361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 AGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCA 5067

131418362 TTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAG 131418421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5068 TTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAG 5127

131418422 ACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATA 131418481
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     5128 ACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATA 5187

131418482 TACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCA 131418541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 TACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCA 5247

131418542 TGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCA 131418601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 TGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCA 5307

131418602 TGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACA 131418661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5308 TGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACA 5367

131418662 ACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAAT 131418721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5368 ACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAAT 5427

131418722 AACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGAC 131418781
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5428 AACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGAC 5487

131418782 ACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCT 131418841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5488 ACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCT 5547

131418842 TTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCT 131418901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5548 TTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCT 5607

131418902 GGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACC 131418961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5608 GGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACC 5667

131418962 TCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAA 131419021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5668 TCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAA 5727

131419022 CTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGC 131419081
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5728 TTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGC 5787

131419082 TCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGA 131419141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5788 TCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGA 5847

131419142 TATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCA 131419201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5848 TATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCA 5907

131419202 CCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCT 131419261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5908 CCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCT 5967

131419262 TCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCA 131419321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5968 TCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCA 6027

131419322 GACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTG 131419381
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6028 GACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTG 6087

131419382 CAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTC 131419441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6088 CAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTC 6147

131419442 CATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCA 131419501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6148 CATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCA 6207

131419502 CAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCT 131419561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6208 CAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCT 6267

131419562 CGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTT 131419621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6268 CGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTT 6327

131419622 TTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCA 131419681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6328 TTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCA 6387

131419682 TTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGG 131419741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6388 TTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGG 6447

131419742 GATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTT 131419801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6448 GATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTT 6507

131419802 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGC 131419861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6508 TCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGC 6567

131419862 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTA 131419921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6568 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTA 6627

131419922 TTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACC 131419981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6628 TTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACC 6687

131419982 ATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATA 131420041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6688 ATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATA 6747

131420042 TCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTT 131420101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6748 TCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTT 6807

131420102 AATACCTAGTCTGTAAAATAGTGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATA 131420161
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6808 AATACCTAATCTGTAAAATAGTGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATA 6867

131420162 CATGTCAAACCAACAAATGAATGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTAT 131420221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6868 CATGTCAAACCAACAAATGAATGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTAT 6927

131420222 CCATATGCCTATGGGACACATATTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTT 131420281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6928 CCATATGCCTATGGGACACATATTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTT 6987

131420282 AATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGT 131420341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6988 AATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGT 7047

131420342 GCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCA 131420401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7048 GCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCA 7107

131420402 ACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTATT 131420461
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     7108 ACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGTT 7167

131420462 CAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTG 131420521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7168 CAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTG 7227

131420522 CTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTT 131420581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7228 CTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTT 7287

131420582 TTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATC 131420641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7288 TTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATC 7347

131420642 ATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAAC 131420701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7348 ATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAAC 7407

131420702 ATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGT 131420761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7408 ATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGT 7467

131420762 AATGGGATTGCTGGGTCACATCATATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACT 131420821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7468 AATGGGATTGCTGGGTCACATCATATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACT 7527

131420822 GTCTTCCATAATGGTTGAACTAATTTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCA 131420881
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7528 GTCTTCCATAATGGTTGAACTAACTTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCA 7587

131420882 GCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAG 131420941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7588 GCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAG 7647

131420942 ATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTT 131421001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7648 ATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTT 7707

131421002 TTTCATATGTTTGTTGGCCACATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTT 131421061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7708 TTTCATATGTTTGTTGGCCACATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTT 7767

131421062 TGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTTGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTA 131421121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7768 TGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTTGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTA 7827

131421122 AATTCTGGATATTAGACCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGT 131421181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7828 AATTCTGGATATTAGACCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGT 7887

131421182 AGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAAC 131421241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7888 AGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAAC 7947

131421242 TAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACTTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAA 131421301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7948 TAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACTTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAA 8007

131421302 GTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTGAATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTAT 131421361
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8008 GTCTTTGCCCATGCCTATGTGCTGAATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTAT 8067

131421362 GGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCTTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGT 131421421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8068 GGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCTTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGT 8127

131421422 AAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTTGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTT 131421481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8128 AAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTTGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTT 8187

131421482 ATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCATTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATA 131421541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8188 ATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCATTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATA 8247

131421542 GCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCTGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCT 131421601
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8248 GCTGTAGATGTGTGGTATTATTTCTGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCT 8307

131421602 GTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCA 131421661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8308 GTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCA 8367

131421662 GGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTTCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTC 131421721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8368 GGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTTCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTC 8427

131421722 TTCTTTGATTCCATATGAAATTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAAT 131421781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8428 TTCTTTGATTCCATATGAAATTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAAT 8487

131421782 ATCTTGATGGGAATAGCACTGAATCTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACA 131421841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8488 ATCTTGATGGGAATAGCACTGAATCTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACA 8547

131421842 ATATTGATTCTTCCTATCCATGAGGATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTAC 131421896
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8548 ATATTGATTCTTCCTATCCATGAGGATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTAC 8602

Alignment time is 6.54311 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     7579] =>      7579 nucs 'mol-32-300f-257557_7579'

Score:        7376
Aligned:      7582        nucs
Identic:      7560 (100%) nucs =>      2736 (100%)      4824 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131412165,131414908] EXCISED REGION [131414944,131419777]
 second seq =>  [        1,     2743] EXCISED REGION [     2745,     7579]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        35 nucs [131414909,131414943]
 second seq =>         1 nucs [2744,2744]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [131414906,131414908] to [131414944,131414946]
 second seq =>         3 nucs [2741,2743] to [2745,2747]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [131414909,131414919] to [131414933,131414943]
 second seq =>         0 nucs

131412165 AAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACGCTAGCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAG 131412224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAGAACAAAGCTGGAGGCATCACGCTAGCTGACTTCAAACTATACTACAAGGCTACAG 60

131412225 TAACCAAAACAGCATGGTACTGGTACCAAAACAGAGATATAGACCAATGGAACAGAAAAG 131412284
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAACCAAAACAGCATGGTACAGGTACCAAAACAGAGATATAGACCAATGGAACAGAAAAG 120

131412285 AGCCCTCAGAAATAATACCACACATCTAGAACCATCTGCTCTTTGACAAACCTGACAAAA 131412344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCCCTCAGAAATAATACCACACATCTAGAACCATCTGCTCTTTGACAAACCTGACAAAA 180

131412345 CCAAGAAATGGGGAAAGGATTCCCTGTTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCA 131412404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAAGAAATGGGGAAAGGATTCCCTGTTTAATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGCTAGCCA 240

131412405 TATGTAGAAAGCTGAAACTGGA-CCCTTCCTCACACCTTATACAAAAATTAATTCAAGTT 131412463
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      241 TATGTAGAAAGCTGAAACTGGATCCCTTCCTCACACCTTATACAAAAATTAATTCAAGAT 300

131412464 GGATGAAAGACTTAAATGTTAGACCTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCTAGGCA 131412523
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGATTAAAGACTTAAATGTTAGACCTAAAACCATAAAAACCCTAGAAGAAAACCTAGGCA 360

131412524 ATACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGG 131412583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATACCATTCAGGACATAGGCATGGGCAAGGACTTCATGTCTAAAACACCAAAAGCAATGG 420

131412584 CAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAA 131412643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAACAAAAGCCAAAATTGACAAATGGGATCTAATTAAACTAAAGAGCTTCTGCACAGCAA 480

131412644 AAGAAACCACCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTACAATCT 131412703
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGAAACTACCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGGGAGAAAATTTTTACAATCT 540

131412704 ACTAATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAAAGAACTTAAACAAGTTTACAAGA 131412763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACTAATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAAAGAACTTAAACAAGTTTACAAGA 600

131412764 AAAAATCAAACAACCCCATCAAAAGGTGGGCGAAGGATATGAACAGACACTTCTCCAAAG 131412823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAATCAAACAACCCCATCAAAAGGTGGGCGAAGGATATGAACAGACACTTCTCCAAAG 660

131412824 AAGACAGTTATGCAGCCAACAGACACATGAAAAAATGCTCGTCATCACTGGCCGTCAGAG 131412883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAGACAGTTATGCAGCCAACAGACACATGAAAAAATGCTCGTCATCACTGGCCGTCAGAG 720

131412884 AATGCAAATCAGAACCACAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGTGATCATTAA 131412943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATGCAAATCAGAACCACAATGAGATACCATCTCACACCAGTTAGAATGGTGATCATTAA 780

131412944 AAAGTCAGGAAAAAACAGATGCTGGAGAGAATGTGGAGAAATAGGAACACTTTTACACTG 131413003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGTCAGGAAAAAACAGATGCTGGAGAGAATGTGGAGAAATAGGAACACTTTTACACTG 840

131413004 CTGGTGGGACTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGCAGTGATTCCTCAAGGA 131413063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGGTGGGACTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAGTGCAGTGATTCCTCAAGGA 900

131413064 TCTAGAACTAGAAATACCATTTAACCCAGCCATCCCATTGCTGGGCATATACCCAAAGGA 131413123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTAGAACTAGAAATACCATTTAACCCAGCCATCCCATTGCTGGGCATATACCCAAAGGA 960

131413124 TTATAAATCATGCTGCTATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCACTATTCAC 131413183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTATAAATCATGCTGCTATAAAGACACATGCACACGTATGTTTATTGCGGCACTATTCAC 1020

131413184 AATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCGTCAATGATAGACTGGATTAAGAAAAT 131413243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCGTCAATGATAGACTGGATTAAGAAAAT 1080

131413244 GTGGCACATATACACCATGGAATACTATTCAGCCATCAAAAAGGATGAGTTCATGTCCTT 131413303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTGGCACATATACACCATGGAATACTATTCAGCCATCAAAAAGGATGAGTTCATGTCCTT 1140

131413304 TGTAGGGACATGAATGAAGCTGGAAACCATCATTCTGAGCAAACTATCGCAAGGACAGAA 131413363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTAGGGACATGAATGAAGCTGGAAACCATCATTCTGAGCAAACTATCGCAAGGACAGAA 1200

131413364 AACCAAACACCGCATATTCTCACTCATTGGTGGGAATTGAATAATGAGAACACTTGGACA 131413423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACCAAACACCGCATATTCTCACTCATTGGTGGGAATTGAATAATGAGAACACTTGGACA 1260

131413424 CAGGATGGGGAACATCATACAACGAGGCCTGTCGTGGGGTGGGGGGAGGTGGTAGGGATA 131413483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGGATGGGGAACATCATACAACGAGGCCTGTCGTGGGGTGGGGGGAGGTGGTAGGGATA 1320

131413484 GCATTAGGAGATATACCTAATGTAAATGACGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGGC 131413543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCATTAGGAGATATACCTAATGTAAATGACGAGTTAATGGGTGCAGCACACCAACATGGC 1380

131413544 ACATGTATACATATGTAACAAACCTGTACCCTAGAACTTAAAGTATATATAAAAAAAAGA 131413603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACATGTATACATATGTAACAAACCTGTACCCTAGAACTTAAAGTATATATAAAAAAAAGA 1440

131413604 TGGAAGGATAGATAGGGGATACAAGAAACAAGACTGACAAGACATTAATTGTTCAAATGC 131413663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGAAGGATAGATAGGGGATACAAGAAACAAGACTGACAAGACATTAATTGTTCAAATGC 1500

131413664 ATGACGAATATATGGGTGTCATTATACTACTCTGTCTGCTTTGGGGTATGCTTGAAATTT 131413723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGACGAATATATGGGTGTCATTATACTACTCTGTCTGCTTTGGGGTATGCTTGAAATTT 1560

131413724 TATAACTTTTTTAACACAAGCATTTAACAGCTATATAACATAAATTTTAAAAAGTAAGAA 131413783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TATAACTTTTTTAACACAAGCATTTAACAGCTATATAACATAAATTTTAAAAAGTAAGAA 1620

131413784 TGTGACCATTATGTGCCTCTGATTATAGTTTTTAAATTCCAAATAAAAAAGTGAATATAA 131413843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTGACCATTATGTGCCTCTGATTATAGTTTTTAAATTCCAAATAAAAAAGTGAATATAA 1680

131413844 GAAAAAAAAATCTTAAAGGCAGCTACAAAGTGAAGTCCATTAGAGAAACAGCAGGCCTCT 131413903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAAAAAAAAATCTTAAAGGCAGCTACAAAGTGAAGTCCATTAGAGAAACAGCAGGCCTCT 1740

131413904 CAGCTGAAACCCTACAAGCCAGAAAAGATTGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAA 131413963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAGCTGAAACCCTACAAGCCAGAAAAGATTGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAA 1800

131413964 GAGGCTGGTCATGGTGGCTCATACCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCA 131414023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAGGCTGGTCATGGTGGCTCATACCTGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCA 1860

131414024 GATCACCTGACATCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTA 131414083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATCACCTGACATCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTA 1920

131414084 CTACAAATACAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTATGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGT 131414143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTACAAATACAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTATGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGT 1980

131414144 GGCTGTGGCAGGAGAATTGCTTCAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATTGC 131414203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGCTGTGGCAGGAGAATTGCTTCAACCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATTGC 2040

131414204 ACCACTGCACTCCAGCCCAGGTGACATAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAA 131414263
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACCACTGCACTCCAGCCCAGGTGACAGAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAA 2100

131414264 AAAAGGAAAGAAAAATTCCAACCTAGAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTTT 131414323
          ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AA--GGAAAGAAAAATTCCAACCTAGAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTTT 2158

131414324 CAAAAAAGCAAATGCTCAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTGA 131414383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 CAAAAAAGCAAATGCTCAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTGA 2218

131414384 AGAAAGTACTAAACATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAAG 131414443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 AGAAAGTACTAAACATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAAG 2278

131414444 TACACAGATCAGTGACACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGTA 131414503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TACACAGATCAGTGACACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGTA 2338

131414504 ACATCATGATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGC 131414563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 ACATCATGATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGC 2398

131414564 TAAATGCCCCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGG 131414623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TAAATGCCCCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGG 2458

131414624 TATGCTGTCTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTA 131414683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TATGCTGTCTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTA 2518

131414684 TCCAACTTGCATATCTCACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAA 131414743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TCCAACTTGCATATCTCACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAA 2578

131414744 ACATCTACCAAGCAAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGAC 131414803
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ACATCTACCAAGCGAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGAC 2638

131414804 AAAACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGA 131414863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 AAAACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGA 2698

131414864 AGAGTTCAATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 131414908
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 AGAGTTCAATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 2743

EXCISED REGION

131414944 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 131415003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 2804

131415004 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 131415063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 2864

131415064 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 131415123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 2924

131415124 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 131415183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 2984

131415184 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 131415243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 3044

131415244 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 131415303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 3104

131415304 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 131415363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 3164

131415364 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 131415423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 3224

131415424 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 131415483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 3284

131415484 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 131415543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 3344

131415544 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 131415603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 3404

131415604 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 131415663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 3464

131415664 TT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 131415721
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 --GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 3522

131415722 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 131415781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 3582

131415782 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTC-AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 131415840
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 3642

131415841 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 131415900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 3702

131415901 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 131415960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 3762

131415961 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 131416020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 3822

131416021 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 131416080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 3882

131416081 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 131416140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 3942

131416141 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 131416200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 4002

131416201 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 131416260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 4062

131416261 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 131416320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 4122

131416321 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 131416380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 4182

131416381 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 131416440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 4242

131416441 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 131416500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4243 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 4302

131416501 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 131416560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 4362

131416561 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 131416620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 4422

131416621 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 131416680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 4482

131416681 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 131416740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4483 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 4542

131416741 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 131416800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 4602

131416801 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 131416860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 4662

131416861 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 131416920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4663 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 4722

131416921 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 131416980
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 4782

131416981 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 131417040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 4842

131417041 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 131417100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4843 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 4902

131417101 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 131417160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4903 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 4962

131417161 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 131417220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4963 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 5022

131417221 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 131417280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5023 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 5082

131417281 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 131417340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5083 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 5142

131417341 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 131417400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5143 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 5202

131417401 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 131417460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5203 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 5262

131417461 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGT 131417520
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5263 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGG 5322

131417521 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 131417580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5323 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 5382

131417581 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 131417640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5383 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 5442

131417641 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 131417700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5443 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 5502

131417701 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 131417760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5503 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 5562

131417761 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 131417820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5563 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 5622

131417821 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 131417880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5623 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 5682

131417881 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 131417940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5683 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 5742

131417941 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 131418000
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5743 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 5802

131418001 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 131418060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5803 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 5862

131418061 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 131418120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5863 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 5922

131418121 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAA 131418180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5923 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAA 5982

131418181 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 131418240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5983 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 6042

131418241 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 131418300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6043 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 6102

131418301 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 131418360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6103 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 6162

131418361 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 131418420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6163 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 6222

131418421 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 131418480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     6223 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 6282

131418481 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 131418540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6283 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 6342

131418541 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 131418600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6343 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 6402

131418601 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 131418660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6403 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 6462

131418661 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 131418720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6463 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 6522

131418721 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 131418780
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6523 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 6582

131418781 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 131418840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6583 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 6642

131418841 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 131418900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6643 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 6702

131418901 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 131418960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6703 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 6762

131418961 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 131419020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6763 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 6822

131419021 ACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 131419080
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6823 ATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 6882

131419081 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 131419140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6883 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 6942

131419141 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 131419200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6943 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 7002

131419201 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 131419260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7003 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 7062

131419261 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 131419320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7063 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 7122

131419321 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 131419380
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7123 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 7182

131419381 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 131419440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7183 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 7242

131419441 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 131419500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7243 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 7302

131419501 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCC 131419560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7303 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCC 7362

131419561 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT 131419620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7363 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT 7422

131419621 TTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTC 131419680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7423 TTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTC 7482

131419681 ATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTG 131419740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7483 ATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTG 7542

131419741 GGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTT 131419777
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7543 GGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTT 7579

Alignment time is 5.59012 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4803] =>      4803 nucs 'mol-32-301a-014578_4803'

Score:        4660
Aligned:      4803        nucs
Identic:      4790 (100%) nucs =>      4244 (100%)       546 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131417847,131422100] EXCISED REGION [131422103,131422650]
 second seq =>  [        1,     4255] EXCISED REGION [     4256,     4803]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [131422101,131422102]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        44 nucs [131422101,131422144] to [131422103,131422146]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131422100,131422100] to [131422103,131422103]
 second seq =>         1 nucs [4255,4255] to [4256,4256]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131417847 AGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACA 131417906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACA 60

131417907 GACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGT 131417966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGT 120

131417967 CTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGG 131418026
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGG 180

131418027 CAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAA 131418086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAA 240

131418087 AAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCATCT 131418146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCATCT 300

131418147 TACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGT 131418206
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGT 360

131418207 GGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGG 131418266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGG 420

131418267 AAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAATCC 131418326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAATCC 480

131418327 CATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCATGC 131418386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCATGC 540

131418387 ATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCCCAT 131418446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCCCAT 600

131418447 CAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAGCCC 131418506
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAGCCC 660

131418507 TAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAG 131418566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAG 720

131418567 CAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTA 131418626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTA 780

131418627 AATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGG 131418686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGG 840

131418687 TGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATTATG 131418746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATTATG 900

131418747 GGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAATTTG 131418806
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAATTTG 960

131418807 CACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTA 131418866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTA 1020

131418867 CTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCC 131418926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCC 1080

131418927 TGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCT 131418986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCT 1140

131418987 GTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACACTTC 131419046
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1141 GTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACACTTC 1200

131419047 AATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACA 131419106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACA 1260

131419107 TTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACC 131419166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACC 1320

131419167 GCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAAC 131419226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAAC 1380

131419227 TAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCC 131419286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCC 1440

131419287 AGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGC 131419346
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1441 AGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGT 1500

131419347 TTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCAT 131419406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCAT 1560

131419407 CTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTC 131419466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTC 1620

131419467 ACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGT 131419526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGT 1680

131419527 ACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTC 131419586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTC 1740

131419587 CTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTT-GACATGGAATCTTACTCTGTC 131419645
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     1741 CTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTC 1800

131419646 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTC 131419705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTC 1860

131419706 CAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGC 131419765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGC 1920

131419766 CCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTAT 131419825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTAT 1980

131419826 CGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 131419885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 2040

131419886 TGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAA 131419945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAA 2100

131419946 GACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCT 131420005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCT 2160

131420006 GCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTT 131420065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTT 2220

131420066 ACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAGTCTGTAAAATAGTGC 131420125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2221 ACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAATCTGTAAAATAGTGC 2280

131420126 ATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGA 131420185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGA 2340

131420186 TTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATT 131420245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATT 2400

131420246 CCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGT 131420305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGT 2460

131420306 GAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTT 131420365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTT 2520

131420366 TGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTA 131420425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTA 2580

131420426 TTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTATTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAAC 131420485
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAAC 2640

131420486 ATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTC 131420545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTC 2700

131420546 ATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTG 131420605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTG 2760

131420606 GTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTC 131420665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTC 2820

131420666 CATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAG 131420725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAG 2880

131420726 TAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCAT 131420785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCAT 2940

131420786 ATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAAT 131420845
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2941 ATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAAC 3000

131420846 TTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCT 131420905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCT 3060

131420906 TGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAG 131420965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAG 3120

131420966 TAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATA 131421025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATA 3180

131421026 AATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTT 131421085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTT 3240

131421086 TGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTC 131421145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTC 3300

131421146 AGATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGAT 131421205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGAT 3360

131421206 AGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTAC 131421265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTAC 3420

131421266 TTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTG 131421325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3421 TTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTGCTG 3480

131421326 AATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTC 131421385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTC 3540

131421386 TTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTT 131421445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTT 3600

131421446 TGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCA 131421505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCA 3660

131421506 TTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTC 131421565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTC 3720

131421566 TGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGT 131421625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGT 3780

131421626 TTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGT 131421685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGT 3840

131421686 TCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTA 131421745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTA 3900

131421746 AAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAAT 131421805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAAT 3960

131421806 CTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAG 131421865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAG 4020

131421866 GATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATCGCTT 131421925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATCGCTT 4080

131421926 CTTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAAT 131421985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAAT 4140

131421986 GTAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAG 131422045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GTAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAG 4200

131422046 AAGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAAGCAAGGTGCCAGTCTCTGAC 131422100
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAAGCAAGGTGCCAGTCTCTGAC 4255

EXCISED REGION

131422103 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACAGTGAGG 131422162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4256 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACAGTGAGG 4315

131422163 CCGCTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGATGGGATCCTCAACCACTTAGCAC 131422222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4316 CCGCTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGATGGGATCCTCAACCACTTAGCAC 4375

131422223 TTAGGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGAAGACAGAGTATTCATCACAAAAGTCTCTTC 131422282
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4376 TTAGGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGATGACAGAGTATTCATCACAAAAGTCTCTTC 4435

131422283 ACTTTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAAGGGAATTTCATCACAGGAGAGC 131422342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4436 ACTTTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAAGGGAATTTCATCACAGGAGAGC 4495

131422343 TGAAGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAACTTGAATGTTTTAGACAACTTC 131422402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4496 TGAAGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAACTTGAATGTTTTAGACAACTTC 4555

131422403 TGTCTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATTTTTTTGTAACATAAAATCTCAT 131422462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4556 TGTCTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATTTTTTTGTAACATAAAATCTCAT 4615

131422463 CTGCAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATCCCCATGTCCCTGAGAGTAAGAA 131422522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4616 CTGCAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATCCCCATGTCCCTGAGAGTAAGAA 4675

131422523 GGTTAAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAATACCACTGAGTTGTAACTGAAAAGC 131422582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4676 GGTTAAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAATACCATTGAGTTGTAACTGAAAAGC 4735

131422583 TGTTTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTTTTTCTCATTACATTCATTATAA 131422642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4736 TGTTTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTTTTTCTCATTACATTCATTATAA 4795

131422643 TTTCTGAG 131422650
          ||||||||
     4796 TTTCTGAG 4803

Alignment time is 3.85695 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4763] =>      4763 nucs 'mol-32-3046-232967_4763'

Score:        4648
Aligned:      4764        nucs
Identic:      4751 (100%) nucs =>       589 (100%)      4162 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131414319,131414908] EXCISED REGION [131414944,131419114]
 second seq =>  [        1,      590] EXCISED REGION [      592,     4763]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        35 nucs [131414909,131414943]
 second seq =>         1 nucs [591,591]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [131414906,131414908] to [131414944,131414946]
 second seq =>         3 nucs [588,590] to [592,594]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [131414909,131414919] to [131414933,131414943]
 second seq =>         0 nucs

131414319 CTTTTCAAAAAAGCAAATGCTCAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCT 131414378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTTTCAAAAAAGCAAATGCTCAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCT 60

131414379 CCTGAAGAAAGTACTAAACATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACAC 131414438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTGAAGAAAGTACTAAACATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACAC 120

131414439 TGAAGTACACAGATCAGTGACACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACC 131414498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAAGTACACAGATCAGTGACACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACC 180

131414499 ATGTAACATCATGATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAA 131414558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTAACATCATGATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAA 240

131414559 TTGGCTAAATGCCCCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCC 131414618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGGCTAAATGCCCCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCC 300

131414619 ATTGGTATGCTGTCTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTG 131414678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTGGTATGCTGTCTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTG 360

131414679 CTTTATCCAACTTGCATATCTCACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATG 131414738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTTATCCAACTTGCATATCTCACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATG 420

131414739 CATAAACATCTACCAAGCAAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTT 131414798
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATAAACATCTACCAAGCGAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTT 480

131414799 CAGACAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAAT 131414858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGACAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAAT 540

131414859 GGTGAAGAGTTCAATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 131414908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTGAAGAGTTCAATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 590

EXCISED REGION

131414944 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 131415003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 651

131415004 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 131415063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      652 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 711

131415064 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 131415123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 771

131415124 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 131415183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 831

131415184 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 131415243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 891

131415244 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 131415303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 951

131415304 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 131415363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      952 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 1011

131415364 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 131415423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 1071

131415424 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 131415483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 1131

131415484 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 131415543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 1191

131415544 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 131415603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 1251

131415604 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 131415663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 1311

131415664 TT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 131415721
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1312 --GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 1369

131415722 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 131415781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 1429

131415782 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTC-AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 131415840
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 1489

131415841 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 131415900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 1549

131415901 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 131415960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 1609

131415961 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 131416020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 1669

131416021 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 131416080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 1729

131416081 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 131416140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 1789

131416141 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 131416200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 1849

131416201 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 131416260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 1909

131416261 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 131416320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 1969

131416321 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 131416380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 2029

131416381 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 131416440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 2089

131416441 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 131416500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 2149

131416501 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 131416560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 2209

131416561 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 131416620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 2269

131416621 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 131416680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 2329

131416681 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 131416740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 2389

131416741 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 131416800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 2449

131416801 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 131416860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 2509

131416861 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 131416920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 2569

131416921 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 131416980
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 2629

131416981 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 131417040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 2689

131417041 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 131417100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 2749

131417101 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 131417160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 2809

131417161 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 131417220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 2869

131417221 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 131417280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 2929

131417281 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 131417340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 2989

131417341 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 131417400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 3049

131417401 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 131417460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 3109

131417461 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGT 131417520
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3110 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGG 3169

131417521 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 131417580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 3229

131417581 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 131417640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 3289

131417641 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 131417700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 3349

131417701 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 131417760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3350 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 3409

131417761 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 131417820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3410 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 3469

131417821 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 131417880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3470 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 3529

131417881 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 131417940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3530 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 3589

131417941 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 131418000
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3590 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 3649

131418001 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 131418060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 3709

131418061 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 131418120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3710 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 3769

131418121 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAA 131418180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3770 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAA 3829

131418181 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 131418240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3830 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 3889

131418241 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 131418300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3890 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 3949

131418301 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 131418360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3950 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 4009

131418361 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 131418420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4010 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 4069

131418421 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 131418480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4070 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 4129

131418481 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 131418540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4130 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 4189

131418541 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 131418600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4190 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 4249

131418601 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 131418660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4250 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 4309

131418661 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 131418720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4310 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 4369

131418721 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 131418780
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4370 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 4429

131418781 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 131418840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4430 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 4489

131418841 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 131418900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4490 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 4549

131418901 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 131418960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4550 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 4609

131418961 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 131419020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4610 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 4669

131419021 ACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 131419080
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4670 ATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 4729

131419081 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTA 131419114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4730 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTA 4763

Alignment time is 3.5593 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     7034] =>      7034 nucs 'mol-32-3046-253794_7034'

Score:        6863
Aligned:      7038        nucs
Identic:      7018 (100%) nucs =>      1155 (100%)      5863 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131413749,131414908] EXCISED REGION [131414944,131420818]
 second seq =>  [        1,     1157] EXCISED REGION [     1159,     7034]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        35 nucs [131414909,131414943]
 second seq =>         1 nucs [1158,1158]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [131414906,131414908] to [131414944,131414946]
 second seq =>         3 nucs [1155,1157] to [1159,1161]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [131414909,131414919] to [131414933,131414943]
 second seq =>         0 nucs

131413749 AACAGCTATATAACATAAATTTTAAAAAGTAAGAATGTGACCATTATGTGCCTCTGATTA 131413808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACAGCTATATAACATAAATTTTAAAAAGTAAGAATGTGACCATTATGTGCCTCTGATTA 60

131413809 TAGTTTTTAAATTCCAAATAAAAAAGTGAATATAAGAAAAAAAAATCTTAAAGGCAGCTA 131413868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGTTTTTAAATTCCAAATAAAAAAGTGAATATAAGAAAAAAAAATCTTAAAGGCAGCTA 120

131413869 CAAAGTGAAGTCCATTAGAGAAACAGCAGGCCTCTCAGCTGAAACCCTACAAGCCAGAAA 131413928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAAGTGAAGTCCATTAGAGAAACAGCAGGCCTCTCAGCTGAAACCCTACAAGCCAGAAA 180

131413929 AGATTGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAAGAGGCTGGTCATGGTGGCTCATACC 131413988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGATTGGGGCCAATATTCAACATTCTTAAAGAAAAGAGGCTGGTCATGGTGGCTCATACC 240

131413989 TGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACCTGACATCAGGAGTTCGAG 131414048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACCTGACATCAGGAGTTCGAG 300

131414049 ATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTACAAATACAAAATTAGCCGGGCG 131414108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCAGCCTGACCAACATGGTGAAACCCTGTCTCTACTACAAATACAAAATTAGCCGGGCG 360

131414109 TGGTGGTATGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGTGGCTGTGGCAGGAGAATTGCTTCAA 131414168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTGGTATGCACCTGTAATCCCAGCTACTAGGGTGGCTGTGGCAGGAGAATTGCTTCAA 420

131414169 CCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCCAGGTGAC 131414228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCGGGAGGCGGAGGTTGCAGCAAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCCAGGTGAC 480

131414229 ATAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAAAATTCCAACCTA 131414288
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||
      481 AGAGCAAGATTCTGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA---GGAAAGAAAAATTCCAACCTA 537

131414289 GAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTTTCAAAAAAGCAAATGCTCAAGGAATT 131414348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 GAATTTCTTAAGTGAGGAAGAAATAAGATCCTTTTCAAAAAAGCAAATGCTCAAGGAATT 597

131414349 CATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTGAAGAAAGTACTAAACATGGAAAGGAA 131414408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 CATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGCTCCTGAAGAAAGTACTAAACATGGAAAGGAA 657

131414409 AGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAAGTACACAGATCAGTGACACTATAAAG 131414468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 AGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACACTGAAGTACACAGATCAGTGACACTATAAAG 717

131414469 CAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGTAACATCATGATGAACAGAACAAATCC 131414528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 CAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAACCATGTAACATCATGATGAACAGAACAAATCC 777

131414529 ACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCCCCAATTAAAAGACATGG 131414588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 ACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCCCCAATTAAAAGACATGG 837

131414589 AGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGTCTTCTTTATCCAGTCTC 131414648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 AGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGTCTTCTTTATCCAGTCTC 897

131414649 TTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTTGCATATCTCACATGCAG 131414708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 TTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTTGCATATCTCACATGCAG 957

131414709 TGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAAACATCTACCAAGCAAATTGAAACAC 131414768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      958 TGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAAACATCTACCAAGCGAATTGAAACAC 1017

131414769 AGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGA 131414828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 AGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGA 1077

131414829 TCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCAACAAGAAAATCT 131414888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 TCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCAACAAGAAAATCT 1137

131414889 TACTATCATATATATATATA 131414908
          ||||||||||||||||||||
     1138 TACTATCATATATATATATA 1157

EXCISED REGION

131414944 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 131415003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1159 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 1218

131415004 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 131415063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1219 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 1278

131415064 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 131415123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 1338

131415124 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 131415183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 1398

131415184 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 131415243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 1458

131415244 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 131415303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 1518

131415304 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 131415363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1519 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 1578

131415364 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 131415423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 1638

131415424 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 131415483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1639 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 1698

131415484 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 131415543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 1758

131415544 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 131415603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 1818

131415604 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 131415663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 1878

131415664 TT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 131415721
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 --GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 1936

131415722 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 131415781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 1996

131415782 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTC-AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 131415840
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 2056

131415841 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 131415900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 2116

131415901 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 131415960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 2176

131415961 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 131416020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 2236

131416021 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 131416080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 2296

131416081 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 131416140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 2356

131416141 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 131416200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 2416

131416201 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 131416260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 2476

131416261 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 131416320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 2536

131416321 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 131416380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 2596

131416381 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 131416440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 2656

131416441 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 131416500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 2716

131416501 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 131416560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 2776

131416561 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 131416620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 2836

131416621 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 131416680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 2896

131416681 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 131416740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 2956

131416741 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 131416800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 3016

131416801 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 131416860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 3076

131416861 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 131416920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 3136

131416921 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 131416980
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 3196

131416981 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 131417040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 3256

131417041 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 131417100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 3316

131417101 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 131417160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 3376

131417161 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 131417220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 3436

131417221 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 131417280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3437 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 3496

131417281 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 131417340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3497 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 3556

131417341 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 131417400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3557 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 3616

131417401 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 131417460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3617 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 3676

131417461 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGT 131417520
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3677 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGG 3736

131417521 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 131417580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3737 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 3796

131417581 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 131417640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3797 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 3856

131417641 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 131417700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 3916

131417701 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 131417760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 3976

131417761 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 131417820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3977 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 4036

131417821 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 131417880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 4096

131417881 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 131417940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 4156

131417941 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 131418000
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 4216

131418001 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 131418060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 4276

131418061 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 131418120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 4336

131418121 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAA 131418180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4337 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAA 4396

131418181 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 131418240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 4456

131418241 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 131418300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4457 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 4516

131418301 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 131418360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4517 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 4576

131418361 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 131418420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4577 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 4636

131418421 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 131418480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4637 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 4696

131418481 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 131418540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4697 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 4756

131418541 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 131418600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4757 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 4816

131418601 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 131418660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4817 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 4876

131418661 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 131418720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4877 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 4936

131418721 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 131418780
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4937 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 4996

131418781 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 131418840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4997 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 5056

131418841 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 131418900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5057 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 5116

131418901 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 131418960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5117 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 5176

131418961 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 131419020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5177 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 5236

131419021 ACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 131419080
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5237 ATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 5296

131419081 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 131419140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5297 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 5356

131419141 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 131419200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5357 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 5416

131419201 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 131419260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5417 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 5476

131419261 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 131419320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5477 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 5536

131419321 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 131419380
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5537 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 5596

131419381 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 131419440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5597 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 5656

131419441 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 131419500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5657 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 5716

131419501 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCC 131419560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5717 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCC 5776

131419561 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT 131419620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5777 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT 5836

131419621 TTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTC 131419680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5837 TTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTC 5896

131419681 ATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTG 131419740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5897 ATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTG 5956

131419741 GGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGT 131419800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5957 GGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGT 6016

131419801 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAG 131419860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6017 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAG 6076

131419861 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTT 131419920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6077 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTT 6136

131419921 ATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAAC 131419980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6137 ATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAAC 6196

131419981 CATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATAT 131420040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6197 CATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATAT 6256

131420041 ATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCT 131420100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6257 ATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCT 6316

131420101 TAATACCTAGTCTGTAAAATAGTGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACAT 131420160
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6317 TAATACCTAATCTGTAAAATAGTGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACAT 6376

131420161 ACATGTCAAACCAACAAATGAATGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTA 131420220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6377 ACATGTCAAACCAACAAATGAATGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTA 6436

131420221 TCCATATGCCTATGGGACACATATTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTT 131420280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6437 TCCATATGCCTATGGGACACATATTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTT 6496

131420281 TAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTG 131420340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6497 TAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTG 6556

131420341 TGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCC 131420400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6557 TGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCC 6616

131420401 AACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTAT 131420460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     6617 AACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGT 6676

131420461 TCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTT 131420520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6677 TCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTT 6736

131420521 GCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTT 131420580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6737 GCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTT 6796

131420581 TTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTAT 131420640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6797 TTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTAT 6856

131420641 CATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAA 131420700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6857 CATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAA 6916

131420701 CATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAG 131420760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6917 CATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAG 6976

131420761 TAATGGGATTGCTGGGTCACATCATATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCAT 131420818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6977 TAATGGGATTGCTGGGTCACATCATATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCAT 7034

Alignment time is 5.12155 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     5765] =>      5765 nucs 'mol-32-3164-275567_5765'

Score:        5303
Aligned:      5463        nucs
Identic:      5446 (100%) nucs =>       590 (100%)      4856 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131414318,131414908] EXCISED REGION [131414944,131419813]
 second seq =>  [        1,      591] EXCISED REGION [      593,     5460]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        35 nucs [131414909,131414943]
 second seq =>         1 nucs [592,592]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [131414906,131414908] to [131414944,131414946]
 second seq =>         3 nucs [589,591] to [593,595]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [131414909,131414919] to [131414933,131414943]
 second seq =>         0 nucs

131414318 CCTTTTCAAAAAAGCAAATGCTCAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGC 131414377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTTTTCAAAAAAGCAAATGCTCAAGGAATTCATTGCCATTAAACCTGCCTTACAAGAGC 60

131414378 TCCTGAAGAAAGTACTAAACATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACA 131414437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCTGAAGAAAGTACTAAACATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCTCTACAAAAACACA 120

131414438 CTGAAGTACACAGATCAGTGACACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAAC 131414497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGAAGTACACAGATCAGTGACACTATAAAGCAACCATGTAAACAAGTCTGCAAAATAAC 180

131414498 CATGTAACATCATGATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAA 131414557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATGTAACATCATGATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAA 240

131414558 ATTGGCTAAATGCCCCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACC 131414617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTGGCTAAATGCCCCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACC 300

131414618 CATTGGTATGCTGTCTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGT 131414677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATTGGTATGCTGTCTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGT 360

131414678 GCTTTATCCAACTTGCATATCTCACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGAT 131414737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCTTTATCCAACTTGCATATCTCACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGAT 420

131414738 GCATAAACATCTACCAAGCAAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTT 131414797
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCATAAACATCTACCAAGCGAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTT 480

131414798 TCAGACAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAA 131414857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAGACAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAA 540

131414858 TGGTGAAGAGTTCAATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 131414908
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGTGAAGAGTTCAATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 591

EXCISED REGION

131414944 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 131415003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 652

131415004 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 131415063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 712

131415064 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 131415123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 772

131415124 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 131415183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 832

131415184 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 131415243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 892

131415244 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 131415303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 952

131415304 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 131415363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 1012

131415364 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 131415423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 1072

131415424 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 131415483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 1132

131415484 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 131415543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 1192

131415544 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 131415603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 1252

131415604 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 131415663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 1312

131415664 TT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 131415721
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 --GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 1370

131415722 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 131415781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 1430

131415782 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAA 131415841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAA 1490

131415842 AGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGC 131415901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 AGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGC 1550

131415902 AAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGA 131415961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 AAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGA 1610

131415962 GATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAA 131416021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 GATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAA 1670

131416022 AATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACAC 131416081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 AATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACAC 1730

131416082 AACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAG 131416141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 AACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAG 1790

131416142 AGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATT 131416201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 AGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATT 1850

131416202 TCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACC 131416261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 TCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACC 1910

131416262 AATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGG 131416321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 AATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGG 1970

131416322 ACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCT 131416381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 ACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCT 2030

131416382 GCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGC 131416441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 GCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGC 2090

131416442 CAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATA 131416501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 CAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATA 2150

131416502 TCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAG 131416561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 TCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAG 2210

131416562 CACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGG 131416621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 CACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGG 2270

131416622 GTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACC 131416681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 GTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACC 2330

131416682 CACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATG 131416741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 CACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATG 2390

131416742 TTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCAC 131416801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 TTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCAC 2450

131416802 AGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAG 131416861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 AGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAG 2510

131416862 ACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTA 131416921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 ACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTA 2570

131416922 TTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTC 131416981
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 TTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTC 2630

131416982 CTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTA 131417041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 CTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTA 2690

131417042 CTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAAT 131417101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 CTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAAT 2750

131417102 TGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTC 131417161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 TGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTC 2810

131417162 TACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAA 131417221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 TACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAA 2870

131417222 AACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAA 131417281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 AACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAA 2930

131417282 GCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGT 131417341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 GCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGT 2990

131417342 AGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAA 131417401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 AGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAA 3050

131417402 TCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACA 131417461
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 TCCTAAGTAAAAAGAGCAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACA 3110

131417462 GTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTA 131417521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     3111 GTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGA 3170

131417522 TAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACA 131417581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 TAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACA 3230

131417582 AAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAG 131417641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 AAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAG 3290

131417642 ACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAA 131417701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 ACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAA 3350

131417702 GATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGC 131417761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 GATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGC 3410

131417762 CATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATT 131417821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3411 CATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATT 3470

131417822 GCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCA 131417881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 GCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCA 3530

131417882 AAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAAC 131417941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 AAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAAC 3590

131417942 TACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAA 131418001
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 TACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAA 3650

131418002 AAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATAC 131418061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 AAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATAC 3710

131418062 ATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAA 131418121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 ATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAA 3770

131418122 TCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAAA 131418181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3771 TCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAAA 3830

131418182 AAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGA 131418241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 AAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGA 3890

131418242 GCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAAC 131418301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 GCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAAC 3950

131418302 AGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCA 131418361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 AGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCA 4010

131418362 TTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAG 131418421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 TTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAG 4070

131418422 ACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATA 131418481
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4071 ACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATA 4130

131418482 TACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCA 131418541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 TACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCA 4190

131418542 TGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCA 131418601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 TGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCA 4250

131418602 TGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACA 131418661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 TGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACA 4310

131418662 ACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAAT 131418721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 ACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAAT 4370

131418722 AACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGAC 131418781
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 AACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGAC 4430

131418782 ACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCT 131418841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 ACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCT 4490

131418842 TTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCT 131418901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 TTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCT 4550

131418902 GGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACC 131418961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 GGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACC 4610

131418962 TCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAA 131419021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 TCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAA 4670

131419022 CTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGC 131419081
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 TTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGC 4730

131419082 TCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGA 131419141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 TCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGA 4790

131419142 TATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCA 131419201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 TATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCA 4850

131419202 CCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCT 131419261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 CCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCT 4910

131419262 TCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCA 131419321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4911 TCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCA 4970

131419322 GACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTG 131419381
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 GACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTG 5030

131419382 CAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTC 131419441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 CAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTC 5090

131419442 CATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCA 131419501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 CATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCA 5150

131419502 CAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCT 131419561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5151 CAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCT 5210

131419562 CGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTT 131419621
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
     5211 CGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTC-TTTTTTTTTTT 5269

131419622 TTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCA 131419681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5270 TTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCA 5329

131419682 TTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGG 131419741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5330 TTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGG 5389

131419742 GATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTT 131419801
          |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||.||||||||||||||||
     5390 GATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAA-TTTTGTATTTGTAGTAGAGACAGGGTT 5448

131419802 TCACCATGTTGG 131419813
          ||||||||||||
     5449 TCACCATGTTGG 5460

Alignment time is 4.24888 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2455] =>      2455 nucs 'mol-32-316f-025916_2455'

Score:        2366
Aligned:      2454        nucs
Identic:      2446 (100%) nucs =>       173 (100%)      2273 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131417347,131417519] EXCISED REGION [131417521,131419800]
 second seq =>  [        1,      173] EXCISED REGION [      175,     2455]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [131417520,131417520]
 second seq =>         1 nucs [174,174]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2266,2266]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [173,173] to [174,174]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131417347 AAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTA 131417406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTA 60

131417407 AGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCT 131417466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCT 120

131417467 ACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAG 131417519
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAG 173

EXCISED REGION

131417521 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 131417580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      175 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 234

131417581 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 131417640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      235 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 294

131417641 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 131417700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      295 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 354

131417701 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 131417760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      355 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 414

131417761 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 131417820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      415 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 474

131417821 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 131417880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      475 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 534

131417881 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 131417940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      535 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 594

131417941 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 131418000
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      595 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 654

131418001 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 131418060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      655 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 714

131418061 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 131418120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 774

131418121 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAA 131418180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      775 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAA 834

131418181 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 131418240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      835 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 894

131418241 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 131418300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 954

131418301 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 131418360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      955 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 1014

131418361 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 131418420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 1074

131418421 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 131418480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1075 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 1134

131418481 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 131418540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 1194

131418541 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 131418600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 1254

131418601 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 131418660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 1314

131418661 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 131418720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 1374

131418721 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 131418780
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 1434

131418781 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 131418840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 1494

131418841 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 131418900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 1554

131418901 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 131418960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 1614

131418961 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 131419020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 1674

131419021 ACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 131419080
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 ATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 1734

131419081 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 131419140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 1794

131419141 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 131419200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 1854

131419201 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 131419260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 1914

131419261 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 131419320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 1974

131419321 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 131419380
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 2034

131419381 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 131419440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 2094

131419441 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 131419500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 2154

131419501 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCC 131419560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2155 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAAGGTTCTTCCC 2214

131419561 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTT-TTTTTTTT 131419619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     2215 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTCTTTTTTTT 2274

131419620 TTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCT 131419679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 TTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCT 2334

131419680 CATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCT 131419739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 CATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCT 2394

131419740 GGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 131419799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 GGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 2454

131419800 T 131419800
          |
     2455 T 2455

Alignment time is 1.82664 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3253] =>      3253 nucs 'mol-32-3190-178481_3253'

Score:        3175
Aligned:      3252        nucs
Identic:      3245 (100%) nucs =>       818 (100%)      2427 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131416125,131416942] EXCISED REGION [131416944,131419377]
 second seq =>  [        1,      818] EXCISED REGION [      820,     3253]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [131416943,131416943]
 second seq =>         1 nucs [819,819]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131416942,131416942] to [131416943,131416943]
 second seq =>         1 nucs [819,819] to [820,820]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131416125 ATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTA 131416184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTA 60

131416185 GCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATT 131416244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATT 120

131416245 GAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCA 131416304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCA 180

131416305 ACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAA 131416364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAA 240

131416365 GAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCA 131416424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCA 300

131416425 GACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAA 131416484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAA 360

131416485 GAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGG 131416544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGG 420

131416545 CAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCT 131416604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCT 480

131416605 ATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACA 131416664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACA 540

131416665 GAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAA 131416724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAA 600

131416725 TTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCA 131416784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCA 660

131416785 AAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCC 131416844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCC 720

131416845 TTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAA 131416904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAA 780

131416905 GAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATC 131416942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATC 818

EXCISED REGION

131416944 TATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCA 131417003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 TATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCA 879

131417004 GCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCA 131417063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 GCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCA 939

131417064 AGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAAT 131417123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 AGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAAT 999

131417124 ACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACAC 131417183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 ACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACAC 1059

131417184 TGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAG 131417243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 TGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAG 1119

131417244 GATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTA 131417303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 GATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTA 1179

131417304 TTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTC 131417363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 TTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTC 1239

131417364 ATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGC 131417423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 ATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGC 1299

131417424 TGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGC 131417483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 TGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGC 1359

131417484 ATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCT 131417543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1360 ATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCT 1419

131417544 GCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGA 131417603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 GCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGA 1479

131417604 TTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACT 131417663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 TTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACT 1539

131417664 GGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGT 131417723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 GGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGT 1599

131417724 AAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAA 131417783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 AAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAA 1659

131417784 CAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACA 131417843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 CAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACA 1719

131417844 AATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGA 131417903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 AATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGA 1779

131417904 ACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAA 131417963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 ACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAA 1839

131417964 TGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGT 131418023
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 TGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGT 1899

131418024 GGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAA 131418083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 GGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAA 1959

131418084 AAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCA 131418143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 AAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCA 2019

131418144 TCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGT 131418203
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 TCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGT 2079

131418204 TGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTG 131418263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 TGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTG 2139

131418264 TGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAA 131418323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 TGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAA 2199

131418324 TCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCA 131418383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 TCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCA 2259

131418384 TGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCC 131418443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 TGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCC 2319

131418444 CATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAG 131418503
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 CATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAG 2379

131418504 CCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCT 131418563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 CCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCT 2439

131418564 TAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAG 131418623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 TAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAG 2499

131418624 TTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGA 131418683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 TTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGA 2559

131418684 GGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATT 131418743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 GGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATT 2619

131418744 ATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAAT 131418803
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 ATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAAT 2679

131418804 TTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTA 131418863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 TTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTA 2739

131418864 GTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCC 131418923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 GTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCC 2799

131418924 TCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCA 131418983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2800 TCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCA 2859

131418984 TCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACAC 131419043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2860 TCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACAC 2919

131419044 TTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAG 131419103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 TTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAG 2979

131419104 ACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCT 131419163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 ACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCT 3039

131419164 ACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCT 131419223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 ACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCT 3099

131419224 AACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTA 131419283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 AACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTA 3159

131419284 TCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGT 131419343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 TCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGT 3219

131419344 AGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTC 131419377
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 AGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTC 3253

Alignment time is 2.46942 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3879] =>      3879 nucs 'mol-32-3235-071422_3879'

Score:        3768
Aligned:      3878        nucs
Identic:      3868 (100%) nucs =>       369 (100%)      3499 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131416574,131416942] EXCISED REGION [131416944,131420452]
 second seq =>  [        1,      369] EXCISED REGION [      371,     3879]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [131416943,131416943]
 second seq =>         1 nucs [370,370]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131416942,131416942] to [131416943,131416943]
 second seq =>         1 nucs [370,370] to [371,371]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131416574 TTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAAC 131416633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAAC 60

131416634 AAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTC 131416693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTC 120

131416694 TCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTC 131416753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTC 180

131416754 AATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCAT 131416813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCAT 240

131416814 ACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAA 131416873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAA 300

131416874 AAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCA 131416933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCA 360

131416934 GACATGATC 131416942
          |||||||||
      361 GACATGATC 369

EXCISED REGION

131416944 TATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCA 131417003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      371 TATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCA 430

131417004 GCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCA 131417063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      431 GCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCA 490

131417064 AGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAAT 131417123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 AGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAAT 550

131417124 ACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACAC 131417183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 ACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACAC 610

131417184 TGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAG 131417243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 TGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAG 670

131417244 GATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTA 131417303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 GATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTA 730

131417304 TTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTC 131417363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 TTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTC 790

131417364 ATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGC 131417423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 ATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGC 850

131417424 TGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGC 131417483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 TGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGC 910

131417484 ATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCT 131417543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      911 ATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCT 970

131417544 GCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGA 131417603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 GCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGA 1030

131417604 TTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACT 131417663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 TTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACT 1090

131417664 GGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGT 131417723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 GGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGT 1150

131417724 AAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAA 131417783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 AAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAA 1210

131417784 CAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACA 131417843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 CAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACA 1270

131417844 AATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGA 131417903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 AATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGA 1330

131417904 ACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAA 131417963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 ACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAA 1390

131417964 TGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGT 131418023
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 TGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGT 1450

131418024 GGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAA 131418083
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 GGACAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAA 1510

131418084 AAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCA 131418143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 AAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCA 1570

131418144 TCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGT 131418203
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 TCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGT 1630

131418204 TGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTG 131418263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 TGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTG 1690

131418264 TGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAA 131418323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 TGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAA 1750

131418324 TCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCA 131418383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 TCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCA 1810

131418384 TGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCC 131418443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 TGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCC 1870

131418444 CATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAG 131418503
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 CATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAG 1930

131418504 CCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCT 131418563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 CCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCT 1990

131418564 TAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAG 131418623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 TAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAG 2050

131418624 TTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGA 131418683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 TTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGA 2110

131418684 GGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATT 131418743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 GGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATT 2170

131418744 ATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAAT 131418803
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 ATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAAT 2230

131418804 TTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTA 131418863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 TTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTA 2290

131418864 GTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCC 131418923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 GTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCC 2350

131418924 TCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCA 131418983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 TCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCA 2410

131418984 TCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACAC 131419043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2411 TCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACAC 2470

131419044 TTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAG 131419103
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2471 TTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGTTCATCCCTTATTGTATCCATAG 2530

131419104 ACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCT 131419163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 ACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCT 2590

131419164 ACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCT 131419223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 ACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCT 2650

131419224 AACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTA 131419283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 AACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTA 2710

131419284 TCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGT 131419343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2711 TCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGT 2770

131419344 AGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTC 131419403
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2771 AGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTC 2830

131419404 CATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATC 131419463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2831 CATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATC 2890

131419464 CTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTT 131419523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2891 CTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTT 2950

131419524 TGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTT 131419583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2951 TGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTT 3010

131419584 CTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTG 131419643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3011 CTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTG 3070

131419644 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGT 131419703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGT 3130

131419704 TCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCAT 131419763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 TCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCAT 3190

131419764 GCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGT 131419823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 GCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGT 3250

131419824 ATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 131419883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 ATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 3310

131419884 GGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAG 131419943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 GGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAG 3370

131419944 AAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCT 131420003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3371 AAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCT 3430

131420004 CTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGT 131420063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 CTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGT 3490

131420064 TTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAGTCTGTAAAATAGT 131420123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3491 TTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAATCTGTAAAATAGT 3550

131420124 GCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAAT 131420183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 GCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAAT 3610

131420184 GATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATA 131420243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 GATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATA 3670

131420244 TTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACAT 131420303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 TTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACAT 3730

131420304 GTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCT 131420363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 GTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCT 3790

131420364 TTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTG 131420423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3791 TTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTG 3850

131420424 TATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATT 131420452
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3851 TATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATT 3879

Alignment time is 3.21896 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     5051] =>      5051 nucs 'mol-32-32fb-168627_5051'

Score:        4925
Aligned:      5052        nucs
Identic:      5038 (100%) nucs =>       396 (100%)      4642 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131414512,131414908] EXCISED REGION [131414944,131419596]
 second seq =>  [        1,      397] EXCISED REGION [      399,     5051]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        35 nucs [131414909,131414943]
 second seq =>         1 nucs [398,398]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [131414906,131414908] to [131414944,131414946]
 second seq =>         3 nucs [395,397] to [399,401]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [131414909,131414919] to [131414933,131414943]
 second seq =>         0 nucs

131414512 ATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCC 131414571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATACTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCC 60

131414572 CCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGT 131414631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATAAAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGT 120

131414632 CTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTT 131414691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTT 180

131414692 GCATATCTCACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAAACATCTAC 131414751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCATATCTCACATGCAGTGACACACATACACTCAAAATAAAGGGATGCATAAACATCTAC 240

131414752 CAAGCAAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGA 131414811
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAGCGAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGA 300

131414812 CTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCA 131414871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCA 360

131414872 ATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 131414908
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 397

EXCISED REGION

131414944 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 131415003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      399 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 458

131415004 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 131415063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      459 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 518

131415064 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 131415123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      519 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 578

131415124 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 131415183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      579 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 638

131415184 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 131415243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      639 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 698

131415244 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 131415303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      699 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 758

131415304 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 131415363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      759 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 818

131415364 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 131415423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      819 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 878

131415424 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 131415483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      879 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 938

131415484 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 131415543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      939 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 998

131415544 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 131415603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      999 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 1058

131415604 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 131415663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1059 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 1118

131415664 TT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 131415721
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1119 --GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 1176

131415722 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 131415781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 1236

131415782 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAA 131415841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAA 1296

131415842 AGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGC 131415901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 AGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGC 1356

131415902 AAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGA 131415961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 AAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGA 1416

131415962 GATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAA 131416021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 GATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAA 1476

131416022 AATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACAC 131416081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 AATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACAC 1536

131416082 AACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAG 131416141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 AACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAG 1596

131416142 AGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATT 131416201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 AGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATT 1656

131416202 TCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACC 131416261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 TCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACC 1716

131416262 AATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGG 131416321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 AATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGG 1776

131416322 ACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCT 131416381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 ACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCT 1836

131416382 GCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGC 131416441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 GCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGC 1896

131416442 CAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATA 131416501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 CAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATA 1956

131416502 TCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAG 131416561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 TCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAG 2016

131416562 CACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGG 131416621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 CACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGG 2076

131416622 GTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACC 131416681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 GTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACC 2136

131416682 CACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATG 131416741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 CACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATG 2196

131416742 TTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCAC 131416801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 TTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCAC 2256

131416802 AGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAG 131416861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 AGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAG 2316

131416862 ACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTA 131416921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 ACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTA 2376

131416922 TTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTC 131416981
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 TTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTC 2436

131416982 CTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTA 131417041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 CTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTA 2496

131417042 CTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAAT 131417101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 CTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAAT 2556

131417102 TGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTC 131417161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 TGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTC 2616

131417162 TACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAA 131417221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 TACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAA 2676

131417222 AACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAA 131417281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 AACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAA 2736

131417282 GCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGT 131417341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 GCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGT 2796

131417342 AGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAA 131417401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 AGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAA 2856

131417402 TCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACA 131417461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 TCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACA 2916

131417462 GTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTA 131417521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2917 GTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGA 2976

131417522 TAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACA 131417581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 TAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACA 3036

131417582 AAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAG 131417641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 AAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAG 3096

131417642 ACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAA 131417701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 ACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAA 3156

131417702 GATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGC 131417761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 GATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGC 3216

131417762 CATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATT 131417821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 CATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATT 3276

131417822 GCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCA 131417881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 GCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCA 3336

131417882 AAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAAC 131417941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 AAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAAC 3396

131417942 TACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAA 131418001
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 TACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAA 3456

131418002 AAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATAC 131418061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 AAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATAC 3516

131418062 ATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAA 131418121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 ATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAA 3576

131418122 TCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAAA 131418181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3577 TCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAAA 3636

131418182 AAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGA 131418241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 AAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGA 3696

131418242 GCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAAC 131418301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 GCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAAC 3756

131418302 AGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCA 131418361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 AGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCA 3816

131418362 TTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAG 131418421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 TTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAG 3876

131418422 ACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATA 131418481
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3877 ACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATA 3936

131418482 TACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCA 131418541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 TACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCA 3996

131418542 TGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCA 131418601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 TGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCA 4056

131418602 TGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACA 131418661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 TGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACA 4116

131418662 ACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAAT 131418721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 ACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAAT 4176

131418722 AACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGAC 131418781
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 AACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGAC 4236

131418782 ACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCT 131418841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 ACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCT 4296

131418842 TTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCT 131418901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 TTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCT 4356

131418902 GGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACC 131418961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 GGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACC 4416

131418962 TCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAA 131419021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 TCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAA 4476

131419022 CTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGC 131419081
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 TTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGC 4536

131419082 TCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGA 131419141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 TCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGA 4596

131419142 TATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCA 131419201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 TATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCA 4656

131419202 CCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCT 131419261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 CCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCT 4716

131419262 TCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCA 131419321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 TCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCA 4776

131419322 GACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTG 131419381
          ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4777 GACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCCTG 4836

131419382 CAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTC 131419441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 CAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTC 4896

131419442 CATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCA 131419501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 CATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCA 4956

131419502 CAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCT 131419561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 CAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCT 5016

131419562 CGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTT 131419596
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 CGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTT 5051

Alignment time is 3.75903 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     6205] =>      6205 nucs 'mol-32-3306-009252_6205'

Score:        5310
Aligned:      5481        nucs
Identic:      5463 (100%) nucs =>       605 (100%)      4858 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131414302,131414908] EXCISED REGION [131414944,131419813]
 second seq =>  [        1,      607] EXCISED REGION [      609,     5479]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        35 nucs [131414909,131414943]
 second seq =>         1 nucs [608,608]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [131414906,131414908] to [131414944,131414946]
 second seq =>         3 nucs [605,607] to [609,611]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [131414909,131414919] to [131414933,131414943]
 second seq =>         0 nucs

131414302 GAGGAAGAAATAAGATCCTTTTCAAAAAAGCAAATGCTCAAGGAATTCATTGCCATTAAA 131414361
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
        1 GAGGAAGAAATAAGATCCTTTTCAAAAAAGCAAATGCTCAAGGGATTCATTGCCATTAAA 60

131414362 CCTGCCTTACAAGAGCTCCTGAAGAAAGTACTAAACATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAG 131414421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTGCCTTACAAGAGCTCCTGAAGAAAGTACTAAACATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAG 120

131414422 CCTCTACAAAAACACACTGAAGTACACAGATCAGTGACACTATAAAGCAACCATGTAAAC 131414481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTCTACAAAAACACACTGAAGTACACAGATCAGTGACACTATAAAGCAACCATGTAAAC 180

131414482 AAGTCTGCAAAATAACCATGTAACATCATGATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATA 131414541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGTCTGCAAAATAACCATGTAACATCATGATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATA 240

131414542 CTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCCCCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGG 131414601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCCCCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGG 300

131414602 ATAAAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGTCTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCAC 131414661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAAAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGTCTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCAC 360

131414662 ACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTTGCATATCTCACATGCAGTGACACACATACA 131414721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCAGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTTGCATATCTCACATGCAGTGACACACATACA 420

131414722 CTCAAAATAAAGGGATGCATAAACATCTACCAAGCAAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGA 131414781
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      421 CTCAAAATAAAGGGATGCATAAACATCTACCAAGCGAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGA 480

131414782 GGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAA 131414841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAA 540

131414842 GAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATAT 131414901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATAT 600

131414902 ATATATA 131414908
          |||||||
      601 ATATATA 607

EXCISED REGION

131414944 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 131415003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      609 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 668

131415004 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 131415063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      669 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 728

131415064 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 131415123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      729 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 788

131415124 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 131415183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      789 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 848

131415184 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 131415243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 908

131415244 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 131415303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 968

131415304 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 131415363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 1028

131415364 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 131415423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 1088

131415424 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 131415483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 1148

131415484 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 131415543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 1208

131415544 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 131415603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 1268

131415604 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 131415663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 1328

131415664 TT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 131415721
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 --GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 1386

131415722 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 131415781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 1446

131415782 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTC-AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 131415840
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 1506

131415841 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 131415900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 1566

131415901 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 131415960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 1626

131415961 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 131416020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 1686

131416021 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 131416080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 1746

131416081 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 131416140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 1806

131416141 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 131416200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 1866

131416201 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 131416260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 1926

131416261 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 131416320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 1986

131416321 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 131416380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 2046

131416381 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 131416440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 2106

131416441 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 131416500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 2166

131416501 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 131416560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 2226

131416561 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 131416620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 2286

131416621 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 131416680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 2346

131416681 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 131416740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 2406

131416741 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 131416800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 2466

131416801 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 131416860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 2526

131416861 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 131416920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 2586

131416921 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 131416980
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 2646

131416981 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 131417040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 2706

131417041 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 131417100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 2766

131417101 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 131417160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 2826

131417161 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 131417220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 2886

131417221 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 131417280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 2946

131417281 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 131417340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 3006

131417341 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 131417400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 3066

131417401 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 131417460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 3126

131417461 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGT 131417520
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3127 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGG 3186

131417521 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 131417580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 3246

131417581 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 131417640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 3306

131417641 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 131417700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 3366

131417701 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 131417760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 3426

131417761 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 131417820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 3486

131417821 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 131417880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 3546

131417881 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 131417940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 3606

131417941 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 131418000
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 3666

131418001 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 131418060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 3726

131418061 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 131418120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 3786

131418121 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAA 131418180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3787 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAA 3846

131418181 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 131418240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 3906

131418241 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 131418300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 3966

131418301 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 131418360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 4026

131418361 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 131418420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 4086

131418421 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 131418480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     4087 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 4146

131418481 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 131418540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 4206

131418541 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 131418600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 4266

131418601 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 131418660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 4326

131418661 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 131418720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 4386

131418721 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 131418780
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 4446

131418781 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 131418840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 4506

131418841 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 131418900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 4566

131418901 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 131418960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 4626

131418961 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 131419020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 4686

131419021 ACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 131419080
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 ATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 4746

131419081 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 131419140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 4806

131419141 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 131419200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 4866

131419201 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 131419260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 4926

131419261 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 131419320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 4986

131419321 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 131419380
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 5046

131419381 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 131419440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 5106

131419441 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 131419500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 5166

131419501 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCC 131419560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCC 5226

131419561 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTC-TTTTTTTTTT 131419619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     5227 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT 5286

131419620 TTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCT 131419679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 TTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCT 5346

131419680 CATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCT 131419739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 CATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCT 5406

131419740 GGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 131419799
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||.||||||||||||||
     5407 GGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAA-TTTTGTATTTGTAGTAGAGACAGGG 5465

131419800 TTTCACCATGTTGG 131419813
          ||||||||||||||
     5466 TTTCACCATGTTGG 5479

Alignment time is 4.6513 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3836] =>      3836 nucs 'mol-32-3306-255312_3836'

Score:        3747
Aligned:      3835        nucs
Identic:      3827 (100%) nucs =>        55 (100%)      3772 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131415750,131415804] EXCISED REGION [131415805,131419584]
 second seq =>  [        1,       55] EXCISED REGION [       57,     3836]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [56,56]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [131416943,131416943]
 second seq =>         1 nucs [1195,1195]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        11 nucs [56,66] to [57,67]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131415750 AGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTC 131415804
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTC 55

EXCISED REGION

131415805 AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAAAGATCTCAATTTACCAACCTATT 131415864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       57 AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAAAGATCTCAATTTACCAACCTATT 116

131415865 ATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAA 131415924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      117 ATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAA 176

131415925 GAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTC 131415984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      177 GAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTC 236

131415985 AAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGA 131416044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      237 AAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGA 296

131416045 TAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATA 131416104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      297 TAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATA 356

131416105 TTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAG 131416164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 TTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAG 416

131416165 CACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAA 131416224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 CACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAA 476

131416225 GACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGT 131416284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 GACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGT 536

131416285 CAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAAT 131416344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 CAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAAT 596

131416345 TTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTG 131416404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 TTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTG 656

131416405 AGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCT 131416464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 AGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCT 716

131416465 GGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAA 131416524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 GGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAA 776

131416525 AATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCA 131416584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 AATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCA 836

131416585 TGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAA 131416644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAA 896

131416645 TAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGC 131416704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGC 956

131416705 AGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGG 131416764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 AGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGG 1016

131416765 TATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGC 131416824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 TATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGC 1076

131416825 AAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAAT 131416884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 AAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAAT 1136

131416885 AAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCCT 131416944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1137 AAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCTT 1196

131416945 ATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAG 131417004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 ATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAG 1256

131417005 CAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAA 131417064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 CAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAA 1316

131417065 GCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATA 131417124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 GCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATA 1376

131417125 CCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACT 131417184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 CCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACT 1436

131417185 GCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGG 131417244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 GCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGG 1496

131417245 ATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTAT 131417304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 ATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTAT 1556

131417305 TCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCA 131417364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 TCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCA 1616

131417365 TATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCT 131417424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 TATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCT 1676

131417425 GGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCA 131417484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 GGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCA 1736

131417485 TGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTG 131417544
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1737 TGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTG 1796

131417545 CACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGAT 131417604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 CACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGAT 1856

131417605 TCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTG 131417664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTG 1916

131417665 GATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTA 131417724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 GATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTA 1976

131417725 AAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAAC 131417784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 AAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAAC 2036

131417785 AGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAA 131417844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 AGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAA 2096

131417845 ATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAA 131417904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 ATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAA 2156

131417905 CAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAAT 131417964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 CAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAAT 2216

131417965 GTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGTG 131418024
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 GTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGTG 2276

131418025 GGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAAA 131418084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 GGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAAA 2336

131418085 AAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCAT 131418144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 AAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCAT 2396

131418145 CTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGTT 131418204
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 CTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGTT 2456

131418205 GTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTGT 131418264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 GTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTGT 2516

131418265 GGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAAT 131418324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 GGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAAT 2576

131418325 CCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCAT 131418384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 CCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCAT 2636

131418385 GCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCCC 131418444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 GCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCCC 2696

131418445 ATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAGC 131418504
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 ATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAGC 2756

131418505 CCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTT 131418564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 CCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTT 2816

131418565 AGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGT 131418624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 AGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGT 2876

131418625 TAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAG 131418684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAG 2936

131418685 GGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATTA 131418744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 GGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATTA 2996

131418745 TGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAATT 131418804
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAATT 3056

131418805 TGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAG 131418864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAG 3116

131418865 TACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCT 131418924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCT 3176

131418925 CCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCAT 131418984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 CCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCAT 3236

131418985 CTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACACT 131419044
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3237 CTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACACT 3296

131419045 TCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGA 131419104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 TCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGA 3356

131419105 CATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTA 131419164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 CATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTA 3416

131419165 CCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTA 131419224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 CCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTA 3476

131419225 ACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTAT 131419284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 ACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTAT 3536

131419285 CCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTA 131419344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 CCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTA 3596

131419345 GCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCC 131419404
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 GTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCC 3656

131419405 ATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCC 131419464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 ATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCC 3716

131419465 TCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTT 131419524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 TCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTT 3776

131419525 GTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTC 131419584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 GTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTC 3836

Alignment time is 2.82294 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3788] =>      3788 nucs 'mol-32-3395-006798_3788'

Score:        3708
Aligned:      3785        nucs
Identic:      3778 (100%) nucs =>      1062 (100%)      2716 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131415881,131416942] EXCISED REGION [131416944,131419666]
 second seq =>  [        1,     1062] EXCISED REGION [     1064,     3786]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [131416943,131416943]
 second seq =>         1 nucs [1063,1063]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131416942,131416942] to [131416943,131416943]
 second seq =>         1 nucs [1063,1063] to [1064,1064]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131415881 AAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAA 131415940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAA 60

131415941 AATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATC 131416000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATC 120

131416001 CAGGAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAG 131416060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGGAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAG 180

131416061 AAAAAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCAC 131416120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAAAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCAC 240

131416121 AGACATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAA 131416180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGACATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAA 300

131416181 TCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGA 131416240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGA 360

131416241 AATTGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCT 131416300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCT 420

131416301 ACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAA 131416360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAA 480

131416361 AGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTT 131416420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTT 540

131416421 TCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAA 131416480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAA 600

131416481 AAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATA 131416540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATA 660

131416541 CTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTT 131416600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTT 720

131416601 ATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATA 131416660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATA 780

131416661 AACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGAT 131416720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGAT 840

131416721 AAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAG 131416780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAG 900

131416781 CTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATT 131416840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATT 960

131416841 TTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATA 131416900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATA 1020

131416901 GGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATC 131416942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATC 1062

EXCISED REGION

131416944 TATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCA 131417003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1064 TATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCA 1123

131417004 GCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCA 131417063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1124 GCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCA 1183

131417064 AGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAAT 131417123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1184 AGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAAT 1243

131417124 ACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACAC 131417183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1244 ACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACAC 1303

131417184 TGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAG 131417243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1304 TGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAG 1363

131417244 GATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTA 131417303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1364 GATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTA 1423

131417304 TTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTC 131417363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1424 TTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTC 1483

131417364 ATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGC 131417423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1484 ATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGC 1543

131417424 TGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGC 131417483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1544 TGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGC 1603

131417484 ATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCT 131417543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1604 ATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCT 1663

131417544 GCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGA 131417603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1664 GCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGA 1723

131417604 TTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACT 131417663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1724 TTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACT 1783

131417664 GGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGT 131417723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 GGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGT 1843

131417724 AAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAA 131417783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 AAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAA 1903

131417784 CAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACA 131417843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 CAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACA 1963

131417844 AATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGA 131417903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 AATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGA 2023

131417904 ACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAA 131417963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 ACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAA 2083

131417964 TGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGT 131418023
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 TGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGT 2143

131418024 GGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAA 131418083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 GGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAA 2203

131418084 AAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCA 131418143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 AAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCA 2263

131418144 TCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGT 131418203
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 TCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGT 2323

131418204 TGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTG 131418263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 TGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTG 2383

131418264 TGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAA 131418323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 TGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAA 2443

131418324 TCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCA 131418383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 TCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCA 2503

131418384 TGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCC 131418443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 TGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCC 2563

131418444 CATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAG 131418503
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 CATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAG 2623

131418504 CCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCT 131418563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 CCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCT 2683

131418564 TAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAG 131418623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 TAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAG 2743

131418624 TTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGA 131418683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 TTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGA 2803

131418684 GGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATT 131418743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2804 GGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATT 2863

131418744 ATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAAT 131418803
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 ATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAAT 2923

131418804 TTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTA 131418863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 TTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTA 2983

131418864 GTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCC 131418923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 GTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCC 3043

131418924 TCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCA 131418983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3044 TCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCA 3103

131418984 TCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACAC 131419043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3104 TCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACAC 3163

131419044 TTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAG 131419103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3164 TTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAG 3223

131419104 ACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCT 131419163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3224 ACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCT 3283

131419164 ACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCT 131419223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3284 ACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCT 3343

131419224 AACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTA 131419283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3344 AACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTA 3403

131419284 TCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGT 131419343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3404 TCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGT 3463

131419344 AGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTC 131419403
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3464 AGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTC 3523

131419404 CATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATC 131419463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3524 CATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATC 3583

131419464 CTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTT 131419523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3584 CTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTT 3643

131419524 TGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTT 131419583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3644 TGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTT 3703

131419584 CTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTG 131419643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3704 CTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTG 3763

131419644 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 131419666
          |||||||||||||||||||||||
     3764 TCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 3786

Alignment time is 2.77725 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     8600] =>      8600 nucs 'mol-32-33a0-140439_8600'

Score:        8385
Aligned:      8602        nucs
Identic:      8579 (100%) nucs =>       151 (100%)      8428 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131414758,131414908] EXCISED REGION [131414944,131423391]
 second seq =>  [        2,      152] EXCISED REGION [      154,     8600]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        35 nucs [131414909,131414943]
 second seq =>         1 nucs [153,153]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [131414906,131414908] to [131414944,131414946]
 second seq =>         3 nucs [150,152] to [154,156]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [131414909,131414919] to [131414933,131414943]
 second seq =>         0 nucs

131414758 AATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTAA 131414817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        2 AATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGATGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTAA 61

131414818 ACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCAA 131414877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       62 ACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAAGGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCAA 121

131414878 CAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 131414908
          |||||||||||||||||||||||||||||||
      122 CAAGAAAATCTTACTATCATATATATATATA 152

EXCISED REGION

131414944 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 131415003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      154 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 213

131415004 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 131415063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      214 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 273

131415064 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 131415123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      274 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 333

131415124 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 131415183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      334 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 393

131415184 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 131415243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      394 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 453

131415244 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 131415303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      454 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 513

131415304 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 131415363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      514 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 573

131415364 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 131415423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      574 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 633

131415424 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 131415483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      634 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 693

131415484 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 131415543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      694 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 753

131415544 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 131415603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      754 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 813

131415604 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 131415663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      814 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 873

131415664 TT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 131415721
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      874 --GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 931

131415722 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 131415781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 991

131415782 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTC-AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 131415840
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 1051

131415841 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 131415900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 1111

131415901 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 131415960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 1171

131415961 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 131416020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 1231

131416021 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 131416080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 1291

131416081 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 131416140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 1351

131416141 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 131416200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 1411

131416201 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 131416260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 1471

131416261 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 131416320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 1531

131416321 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 131416380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 1591

131416381 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 131416440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 1651

131416441 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 131416500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 1711

131416501 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 131416560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 1771

131416561 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 131416620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 1831

131416621 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 131416680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 1891

131416681 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 131416740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 1951

131416741 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 131416800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 2011

131416801 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 131416860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 2071

131416861 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 131416920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 2131

131416921 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 131416980
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 2191

131416981 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 131417040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 2251

131417041 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 131417100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 2311

131417101 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 131417160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 2371

131417161 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 131417220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 2431

131417221 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 131417280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 2491

131417281 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 131417340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 2551

131417341 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 131417400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 2611

131417401 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 131417460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 2671

131417461 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGT 131417520
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2672 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGG 2731

131417521 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 131417580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 2791

131417581 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 131417640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 2851

131417641 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 131417700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 2911

131417701 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 131417760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 2971

131417761 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 131417820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 3031

131417821 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 131417880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 3091

131417881 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 131417940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 3151

131417941 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 131418000
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 3211

131418001 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 131418060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 3271

131418061 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 131418120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 3331

131418121 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAA 131418180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3332 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAA 3391

131418181 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 131418240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 3451

131418241 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 131418300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3452 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 3511

131418301 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 131418360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3512 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 3571

131418361 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 131418420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 3631

131418421 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 131418480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3632 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 3691

131418481 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 131418540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3692 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 3751

131418541 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 131418600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3752 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 3811

131418601 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 131418660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3812 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 3871

131418661 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 131418720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3872 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 3931

131418721 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 131418780
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3932 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 3991

131418781 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 131418840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3992 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 4051

131418841 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 131418900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4052 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 4111

131418901 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 131418960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4112 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 4171

131418961 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 131419020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4172 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCA 4231

131419021 ACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 131419080
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4232 ATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTG 4291

131419081 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 131419140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4292 CTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAG 4351

131419141 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 131419200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4352 ATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTC 4411

131419201 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 131419260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4412 ACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCC 4471

131419261 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 131419320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4472 TTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTC 4531

131419321 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 131419380
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4532 AGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTT 4591

131419381 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 131419440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4592 GCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTT 4651

131419441 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 131419500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4652 CCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTC 4711

131419501 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCC 131419560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4712 ACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCC 4771

131419561 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT 131419620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4772 TCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTT 4831

131419621 TTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTC 131419680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4832 TTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTC 4891

131419681 ATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTG 131419740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4892 ATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTG 4951

131419741 GGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGT 131419800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4952 GGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGT 5011

131419801 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAG 131419860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5012 TTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAG 5071

131419861 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTT 131419920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5072 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTT 5131

131419921 ATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAAC 131419980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 ATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAAC 5191

131419981 CATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATAT 131420040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5192 CATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATAT 5251

131420041 ATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCT 131420100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5252 ATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCT 5311

131420101 TAATACCTAGTCTGTAAAATAGTGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACAT 131420160
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5312 TAATACCTAATCTGTAAAATAGTGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACAT 5371

131420161 ACATGTCAAACCAACAAATGAATGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTA 131420220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5372 ACATGTCAAACCAACAAATGAATGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTA 5431

131420221 TCCATATGCCTATGGGACACATATTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTT 131420280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5432 TCCATATGCCTATGGGACACATATTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTT 5491

131420281 TAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTG 131420340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5492 TAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTG 5551

131420341 TGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCC 131420400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5552 TGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCC 5611

131420401 AACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTAT 131420460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5612 AACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGT 5671

131420461 TCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTT 131420520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5672 TCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTT 5731

131420521 GCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTT 131420580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5732 GCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTT 5791

131420581 TTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTAT 131420640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5792 TTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTAT 5851

131420641 CATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAA 131420700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5852 CATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAA 5911

131420701 CATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAG 131420760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5912 CATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAG 5971

131420761 TAATGGGATTGCTGGGTCACATCATATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATAC 131420820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5972 TAATGGGATTGCTGGGTCACATCATATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATAC 6031

131420821 TGTCTTCCATAATGGTTGAACTAATTTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTC 131420880
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6032 TGTCTTCCATAATGGTTGAACTAACTTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTC 6091

131420881 AGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGA 131420940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6092 AGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGA 6151

131420941 GATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTT 131421000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6152 GATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTT 6211

131421001 TTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCT 131421060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6212 TTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCT 6271

131421061 TTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTTGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGT 131421120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6272 TTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTTGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGT 6331

131421121 AAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTG 131421180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6332 AAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCAGATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTG 6391

131421181 TAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAA 131421240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6392 TAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAA 6451

131421241 CTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACTTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGA 131421300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6452 CTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACTTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGA 6511

131421301 AGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTGAATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTA 131421360
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6512 AGTCTTTGCCCATGCCTATGTGCTGAATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTA 6571

131421361 TGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCTTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTG 131421420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6572 TGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCTTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTG 6631

131421421 TAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTTGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATT 131421480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6632 TAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTTGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATT 6691

131421481 TATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCATTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGAT 131421540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6692 TATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCATTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGAT 6751

131421541 AGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCTGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTC 131421600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6752 AGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCTGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTC 6811

131421601 TGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTC 131421660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6812 TGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTC 6871

131421661 AGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTTCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGT 131421720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6872 AGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTTCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGT 6931

131421721 CTTCTTTGATTCCATATGAAATTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAA 131421780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6932 CTTCTTTGATTCCATATGAAATTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAA 6991

131421781 TATCTTGATGGGAATAGCACTGAATCTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCAC 131421840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6992 TATCTTGATGGGAATAGCACTGAATCTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCAC 7051

131421841 AATATTGATTCTTCCTATCCATGAGGATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGA 131421900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7052 AATATTGATTCTTCCTATCCATGAGGATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGA 7111

131421901 CATATTTTCTTGGGCAACATCGCTTCTTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGC 131421960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7112 CATATTTTCTTGGGCAACATCGCTTCTTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGC 7171

131421961 CCATAGGAAAACACCTTCTCAAAATGTAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAG 131422020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7172 CCATAGGAAAACACCTTCTCAAAATGTAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAG 7231

131422021 CAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAGAAGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAA 131422080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7232 CAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAGAAGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAA 7291

131422081 GCAAGGTGCCAGTCTCTGACCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA 131422140
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7292 GCAAGGTGCCAGTCTCTGAC--CACACACACACACACACACACACACACACACACACACA 7349

131422141 CACACATATACACACAGTGAGGCCGCTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGAT 131422200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7350 CACACATATACACACAGTGAGGCCGCTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGAT 7409

131422201 GGGATCCTCAACCACTTAGCACTTAGGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGAAGACAGAG 131422260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     7410 GGGATCCTCAACCACTTAGCACTTAGGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGATGACAGAG 7469

131422261 TATTCATCACAAAAGTCTCTTCACTTTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAA 131422320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7470 TATTCATCACAAAAGTCTCTTCACTTTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAA 7529

131422321 GGGAATTTCATCACAGGAGAGCTGAAGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAA 131422380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7530 GGGAATTTCATCACAGGAGAGCTGAAGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAA 7589

131422381 CTTGAATGTTTTAGACAACTTCTGTCTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATT 131422440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7590 CTTGAATGTTTTAGACAACTTCTGTCTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATT 7649

131422441 TTTTTGTAACATAAAATCTCATCTGCAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATC 131422500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7650 TTTTTGTAACATAAAATCTCATCTGCAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATC 7709

131422501 CCCATGTCCCTGAGAGTAAGAAGGTTAAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAATAC 131422560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7710 CCCATGTCCCTGAGAGTAAGAAGGTTAAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAATAC 7769

131422561 CACTGAGTTGTAACTGAAAAGCTGTTTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTT 131422620
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7770 CATTGAGTTGTAACTGAAAAGCTGTTTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTT 7829

131422621 TTTCTCATTACATTCATTATAATTTCTGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCATGT 131422680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7830 TTTCTCATTACATTCATTATAATTTCTGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCATGT 7889

131422681 GAGAGAGAGGCAGAAAGAGAGAAATGAAGGTACAAGAAACAGATTAGGCTGGGTGCGGTG 131422740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7890 GAGAGAGAGGCAGAAAGAGAGAAATGAAGGTACAAGAAACAGATTAGGCTGGGTGCGGTG 7949

131422741 GCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAAGA 131422800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7950 GCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAAGA 8009

131422801 GATTGAGACCATCCTGGCTAACACGATGAAACCCCGACTCTACTAAAAATACAAAAATTT 131422860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8010 GATTGAGACCATCCTGGCTAACACGATGAAACCCCGACTCTACTAAAAATACAAAAATTT 8069

131422861 AGCCAGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 131422920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8070 AGCCAGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAA 8129

131422921 TGGCGTGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGCGCTGAGCAGAGATTGCGCCACCGCACTACAGT 131422980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8130 TGGCGTGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGCGCTGAGCAGAGATTGCGCCACCGCACTACAGT 8189

131422981 CTGGGAGACAGAGTGATACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAACAGA 131423040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8190 CTGGGAGACAGAGTGATACTCCGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAACAGA 8249

131423041 TTAATCACGTTAATAGCAAGCAAAGAAAGAGAGGTATTATCCAAATTTGAAAGGAGTAAA 131423100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     8250 TTAATCACGTTAATAGCAAGCAAAGAAAGAGAGGCATTATCCAAATTTGAAAGGAGTAAA 8309

131423101 ATTTTGCATAAGTTGACAGTCAGACAGGAAAAAGGGAGCTGGTAACAGTTAATCTACAGG 131423160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8310 ATTTTGCATAAGTTGACAGTCAGACAGGAAAAAGGGAGCTGGTAACAGTTAATCTACAGG 8369

131423161 AAGGCCTTTTCACCTAGAATTATCTTAAAACATGCAGTCCTTACTGCCACTAAAAGACTA 131423220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8370 AAGGCCTTTTCACCTAGAATTATCTTAAAACATGCAGTCCTTACTGCCACTAAAAGACTA 8429

131423221 ATTATGTGATTTCCTTCAATCTGAACAAATCCTTTTTTATACTGCTCTTTATGGCAGACT 131423280
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8430 ATTATGTGATTTTCTTCAATCTGAACAAATCCTTTTTTATACTGCTCTTTATGGCAGACT 8489

131423281 ATAGTGTGAGTCAGAAATTCCAAAAGCATGATAATCTCCATCCTTTACAGCACCTGTCCC 131423340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8490 ATAGTGTGAGTCAGAAATTCCAAAAGCATGATAATCTCCATCCTTTACAGCACCTGTCCC 8549

131423341 AACGTTATGTTAATCATTAGTTGATAATCTTTAAAGCTGAGGGCTACACAC 131423391
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8550 AACGTTATGTTAATCATTAGTTGATAATCTTTAAAGCTGAGGGCTACACAC 8600

Alignment time is 6.25024 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     2079] =>      2079 nucs 'mol-32-3492-100578_2079'

Score:        2009
Aligned:      2075        nucs
Identic:      2069 (100%) nucs =>      2041 (100%)        28 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131417559,131419605] EXCISED REGION [131419612,131419639]
 second seq =>  [        1,     2047] EXCISED REGION [     2052,     2079]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [131419606,131419611]
 second seq =>         4 nucs [2048,2051]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [131419600,131419608] to [131419606,131419614]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [131419604,131419605] to [131419612,131419613]
 second seq =>         2 nucs [2046,2047] to [2052,2053]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [131419606,131419607] to [131419610,131419611]
 second seq =>         1 nucs [2048,2048] to [2051,2051]

131417559 GCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAA 131417618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAA 60

131417619 ATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTAC 131417678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTAC 120

131417679 ACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAA 131417738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAA 180

131417739 AAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGA 131417798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGA 240

131417799 TGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTA 131417858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTA 300

131417859 AACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAG 131417918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAG 360

131417919 AATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATA 131417978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      361 AATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATA 420

131417979 AATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGA 131418038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGA 480

131418039 ACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATC 131418098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATC 540

131418099 ACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAG 131418158
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      541 ACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAA 600

131418159 AATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGA 131418218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGA 660

131418219 ACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGG 131418278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGG 720

131418279 TGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTA 131418338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTA 780

131418339 TATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTG 131418398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTG 840

131418399 CAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACT 131418458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      841 CAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACT 900

131418459 GGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGA 131418518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGA 960

131418519 TATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACA 131418578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACA 1020

131418579 GGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAAT 131418638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAAT 1080

131418639 ACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGA 131418698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGA 1140

131418699 GAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATA 131418758
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1141 GAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATA 1200

131418759 ATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCC 131418818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCC 1260

131418819 TTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGT 131418878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGT 1320

131418879 ATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGT 131418938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGT 1380

131418939 GACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGC 131418998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGC 1440

131418999 ATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAG 131419058
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCAATAAGACCCAG 1500

131419059 TCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAA 131419118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACATTGGCTTATTAA 1560

131419119 CTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTG 131419178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCGCTCTTATCTTG 1620

131419179 TTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGT 131419238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACTAGTTTCGATGT 1680

131419239 TTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTT 131419298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCAGCATGAACTTT 1740

131419299 AAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCTTTCCATGTTAC 131419358
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1741 AAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTTTTCCATGTTAC 1800

131419359 TTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCT 131419418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATCTGCACTTCTCT 1860

131419419 GTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTT 131419478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCACTGGTCTTCTT 1920

131419479 GCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATC 131419538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTACTTGCCGAATC 1980

131419539 CTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTT 131419598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCCTTCAGGTTTTT 2040

131419599 CTTTCTT 131419605
          |||||||
     2041 CTTTCTT 2047

EXCISED REGION

131419612 TTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTAC 131419639
          ||||||||||||||||||||||||||||
     2052 TTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTAC 2079

Alignment time is 1.53222 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3902] =>      3902 nucs 'mol-32-34a8-003257_3902'

Score:        3813
Aligned:      3901        nucs
Identic:      3893 (100%) nucs =>        96 (100%)      3797 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131415709,131415804] EXCISED REGION [131415805,131419609]
 second seq =>  [        1,       96] EXCISED REGION [       98,     3902]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [97,97]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [131416943,131416943]
 second seq =>         1 nucs [1236,1236]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        11 nucs [97,107] to [98,108]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131415709 GCATGAGGATTGCTTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTG 131415768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCATGAGGATTGCTTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTG 60

131415769 CACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTC 131415804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACCCTGTCTC 96

EXCISED REGION

131415805 AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAAAGATCTCAATTTACCAACCTATT 131415864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       98 AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGAAAGATCTCAATTTACCAACCTATT 157

131415865 ATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAA 131415924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      158 ATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAGCAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAA 217

131415925 GAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTC 131415984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      218 GAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGGAGATTGAGACACACAAAACTATTC 277

131415985 AAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGA 131416044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      278 AAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAAAAATTAATAATATAGACCACTAGA 337

131416045 TAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATA 131416104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      338 TAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACACAACCAGAAATGTCAAGGGGGATA 397

131416105 TTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAG 131416164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      398 TTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCAGAGAATACTATGAACACCTCTAAG 457

131416165 CACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAA 131416224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      458 CACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGATTTCTGGACATATAAATCCTTCCAA 517

131416225 GACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGT 131416284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      518 GACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACACCAATAATGAGCTCTGAAATTGAGT 577

131416285 CAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAAT 131416344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      578 CAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGGGACCAAACAGATTCACAGCTGAAT 637

131416345 TTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTG 131416404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      638 TTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCCTGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTG 697

131416405 AGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCT 131416464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      698 AGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGGCCAGTATTATCCTGATACCAACCT 757

131416465 GGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAA 131416524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      758 GGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAATATCCTTGATGAACATTGATGCAAA 817

131416525 AATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCA 131416584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      818 AATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCAGCACATCAAAAAGTTTTTCCACCA 877

131416585 TGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAA 131416644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      878 TGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTGGGTCAACATAAACAAATTGATAAA 937

131416645 TAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGC 131416704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      938 TAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAACCCACATAATTGTCTCAATAGATGC 997

131416705 AGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGG 131416764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 AGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCATGTTAAAAACTCTCAATAAACTAGG 1057

131416765 TATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGC 131416824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 TATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGC 1117

131416825 AAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAAT 131416884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 AAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAAT 1177

131416885 AAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCCT 131416944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1178 AAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCTT 1237

131416945 ATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAG 131417004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 ATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAG 1297

131417005 CAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAA 131417064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 CAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAA 1357

131417065 GCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATA 131417124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 GCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATA 1417

131417125 CCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACT 131417184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 CCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACT 1477

131417185 GCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGG 131417244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 GCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGG 1537

131417245 ATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTAT 131417304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 ATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTAT 1597

131417305 TCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCA 131417364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 TCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCA 1657

131417365 TATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCT 131417424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCT 1717

131417425 GGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCA 131417484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 GGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCA 1777

131417485 TGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTG 131417544
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1778 TGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTG 1837

131417545 CACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGAT 131417604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 CACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGAT 1897

131417605 TCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTG 131417664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 TCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTG 1957

131417665 GATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTA 131417724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 GATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTA 2017

131417725 AAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAAC 131417784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 AAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAAC 2077

131417785 AGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAA 131417844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 AGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAA 2137

131417845 ATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAA 131417904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 ATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAA 2197

131417905 CAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAAT 131417964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 CAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAAT 2257

131417965 GTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGTG 131418024
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 GTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGTG 2317

131418025 GGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAAA 131418084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 GGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAAA 2377

131418085 AAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCAT 131418144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 AAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCAT 2437

131418145 CTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGTT 131418204
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 CTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGTT 2497

131418205 GTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTGT 131418264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 GTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTGT 2557

131418265 GGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAAT 131418324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 GGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAAT 2617

131418325 CCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCAT 131418384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 CCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCAT 2677

131418385 GCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCCC 131418444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 GCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCCC 2737

131418445 ATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAGC 131418504
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 ATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAGC 2797

131418505 CCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTT 131418564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 CCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTT 2857

131418565 AGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGT 131418624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 AGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGT 2917

131418625 TAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAG 131418684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 TAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAG 2977

131418685 GGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATTA 131418744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 GGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATTA 3037

131418745 TGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAATT 131418804
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 TGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAATT 3097

131418805 TGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAG 131418864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 TGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAG 3157

131418865 TACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCT 131418924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 TACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCT 3217

131418925 CCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCAT 131418984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 CCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCAT 3277

131418985 CTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACACT 131419044
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3278 CTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACACT 3337

131419045 TCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGA 131419104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 TCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGA 3397

131419105 CATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTA 131419164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 CATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTA 3457

131419165 CCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTA 131419224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 CCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTA 3517

131419225 ACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTAT 131419284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 ACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTAT 3577

131419285 CCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTA 131419344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 CCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTA 3637

131419345 GCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCC 131419404
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 GTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCC 3697

131419405 ATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCC 131419464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3698 ATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCC 3757

131419465 TCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTT 131419524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 TCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTT 3817

131419525 GTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTC 131419584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 GTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTC 3877

131419585 TCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTC 131419609
          |||||||||||||||||||||||||
     3878 TCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTC 3902

Alignment time is 2.87592 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     3249] =>      3249 nucs 'mol-32-34a8-160483_3249'

Score:        3118
Aligned:      3228        nucs
Identic:      3218 (100%) nucs =>      1232 (100%)      1986 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131416769,131418002] EXCISED REGION [131418988,131420981]
 second seq =>  [        7,     1240] EXCISED REGION [     1256,     3249]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       985 nucs [131418003,131418987]
 second seq =>        15 nucs [1241,1255]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1241,1241] to [1256,1256]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131416769 GAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAA 131416828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        7 GAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCACAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAA 66

131416829 GCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAAT 131416888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       67 GCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAAGACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAAT 126

131416889 AGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATAT 131416948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      127 AGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACTATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATAT 186

131416949 TCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAA 131417008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      187 TCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCTCCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAA 246

131417009 ATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTG 131417068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      247 ATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATTACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTG 306

131417069 AGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTA 131417128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      307 AGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAATTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTA 366

131417129 GGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTC 131417188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      367 GGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCTCTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTC 426

131417189 AAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGG 131417248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      427 AAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAAAAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGG 486

131417249 ATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCT 131417308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      487 ATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCT 546

131417309 ATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATG 131417368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 ATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATG 606

131417369 GAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAG 131417428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 GAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAG 666

131417429 ACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGT 131417488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 ACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGT 726

131417489 ACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACA 131417548
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      727 ACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACA 786

131417549 CCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCC 131417608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 CCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCC 846

131417609 TATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATC 131417668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 TATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATC 906

131417669 CCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAAC 131417728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 CCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAAC 966

131417729 CCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGC 131417788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 CCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGC 1026

131417789 AAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAG 131417848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 AAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAG 1086

131417849 GAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGA 131417908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 GAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGA 1146

131417909 CAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCT 131417968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 CAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCT 1206

131417969 AGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAA 131418002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 AGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAA 1240

EXCISED REGION

131418988 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 131419047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1256 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 1315

131419048 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 131419107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 1375

131419108 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 131419167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 1435

131419168 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 131419227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 1495

131419228 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 131419287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 1555

131419288 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCT 131419347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1556 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTT 1615

131419348 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 131419407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 1675

131419408 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 131419467
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 TGCACTCCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 1735

131419468 CTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 131419527
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 CTGGTCCTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 1795

131419528 CTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 131419587
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 CTTGCCGAATCCTTTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 1855

131419588 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCAC 131419647
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1856 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTACATGGAATCTTACTCTGTCAC 1915

131419648 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCA 131419707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCA 1975

131419708 GAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCC 131419767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 GAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCC 2035

131419768 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCG 131419827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCG 2095

131419828 AACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTG 131419887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 AACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTG 2155

131419888 TGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGA 131419947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 TGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGA 2215

131419948 CTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGC 131420007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 CTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGC 2275

131420008 TTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTAC 131420067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTAC 2335

131420068 CTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAGTCTGTAAAATAGTGCAT 131420127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2336 CTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAATCTGTAAAATAGTGCAT 2395

131420128 AGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGATT 131420187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 AGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGATT 2455

131420188 GGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATTCC 131420247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 GGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATTCC 2515

131420248 TTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGA 131420307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 TTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGA 2575

131420308 AGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTG 131420367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 AGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTG 2635

131420368 ACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATT 131420427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 ACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATT 2695

131420428 ATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTATTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACAT 131420487
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2696 ATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACAT 2755

131420488 GCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCAT 131420547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 GCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCAT 2815

131420548 CTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGT 131420607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 CTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGT 2875

131420608 GTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCA 131420667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 GTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCA 2935

131420668 TGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTA 131420727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2936 TGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTA 2995

131420728 GAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATAT 131420787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2996 GAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATAT 3055

131420788 TTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAATTT 131420847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3056 TTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAATTT 3115

131420848 ACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTG 131420907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3116 ACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTG 3175

131420908 ACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTA 131420967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3176 ACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTA 3235

131420968 GCATTTCTCTAATG 131420981
          ||||||||||||||
     3236 GCATTTCTCTAATG 3249

Alignment time is 2.38503 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     5468] =>      5468 nucs 'mol-32-34b3-026499_5468'

Score:        5315
Aligned:      5469        nucs
Identic:      5455 (100%) nucs =>      4841 (100%)       614 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131417248,131422100] EXCISED REGION [131422103,131422718]
 second seq =>  [        1,     4852] EXCISED REGION [     4853,     5468]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [131422101,131422102]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        44 nucs [131422101,131422144] to [131422103,131422146]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131422100,131422100] to [131422103,131422103]
 second seq =>         1 nucs [4852,4852] to [4853,4853]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131417248 GATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCC 131417307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCC 60

131417308 TATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATAT 131417367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATAT 120

131417368 GGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGA 131417427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGA 180

131417428 GACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGG 131417487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGG 240

131417488 TACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCAC 131417547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      241 TACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCAC 300

131417548 ACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCC 131417607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCC 360

131417608 CTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGAT 131417667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGAT 420

131417668 CCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAA 131417727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAA 480

131417728 CCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGG 131417787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGG 540

131417788 CAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATA 131417847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATA 600

131417848 GGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAG 131417907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAG 660

131417908 ACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTC 131417967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTC 720

131417968 TAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGC 131418027
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGC 780

131418028 AAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAA 131418087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAA 840

131418088 AGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCATCTT 131418147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATACCATCTT 900

131418148 ACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTG 131418207
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTG 960

131418208 GAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGA 131418267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGA 1020

131418268 AGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCC 131418327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCC 1080

131418328 ATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCATGCA 131418387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATGCATGCA 1140

131418388 TATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCCCATC 131418447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTGCCCATC 1200

131418448 AATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAGCCCT 131418507
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGCAGCCCT 1260

131418508 AAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGC 131418567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGC 1320

131418568 AAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAA 131418627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAA 1380

131418628 ATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGT 131418687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGT 1440

131418688 GGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATTATGG 131418747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGATTATGG 1500

131418748 GTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAATTTGC 131418807
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAAATTTGC 1560

131418808 ACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTAC 131418867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTAC 1620

131418868 TGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCT 131418927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCT 1680

131418928 GCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTG 131418987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTG 1740

131418988 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 131419047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1741 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 1800

131419048 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 131419107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 1860

131419108 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 131419167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 1920

131419168 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 131419227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 1980

131419228 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 131419287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 2040

131419288 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCT 131419347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2041 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTT 2100

131419348 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 131419407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 2160

131419408 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 131419467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 2220

131419468 CTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 131419527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 2280

131419528 CTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 131419587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 2340

131419588 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTCAC 131419647
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2341 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTT-GACATGGAATCTTACTCTGTCAC 2399

131419648 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCA 131419707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTCCA 2459

131419708 GAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCC 131419767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGCCC 2519

131419768 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCG 131419827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 GGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTATCG 2579

131419828 AACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTG 131419887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 AACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTG 2639

131419888 TGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGA 131419947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 TGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAAGA 2699

131419948 CTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGC 131420007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCTGC 2759

131420008 TTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTAC 131420067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTTAC 2819

131420068 CTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAGTCTGTAAAATAGTGCAT 131420127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2820 CTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAATCTGTAAAATAGTGCAT 2879

131420128 AGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGATT 131420187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGATT 2939

131420188 GGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATTCC 131420247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATTCC 2999

131420248 TTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGA 131420307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGTGA 3059

131420308 AGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTG 131420367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTTTG 3119

131420368 ACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATT 131420427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 ACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTATT 3179

131420428 ATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTATTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACAT 131420487
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     3180 ATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAACAT 3239

131420488 GCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCAT 131420547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTCAT 3299

131420548 CTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGT 131420607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 CTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTGGT 3359

131420608 GTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCA 131420667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTCCA 3419

131420668 TGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTA 131420727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAGTA 3479

131420728 GAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATAT 131420787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCATAT 3539

131420788 TTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAATTT 131420847
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3540 TTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAACTT 3599

131420848 ACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTG 131420907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 ACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCTTG 3659

131420908 ACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTA 131420967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 ACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAGTA 3719

131420968 GCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAAA 131421027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATAAA 3779

131421028 TGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTTG 131421087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 TGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTTTG 3839

131421088 CTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCAG 131421147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 CTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTCAG 3899

131421148 ATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATAG 131421207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 ATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGATAG 3959

131421208 TTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACTT 131421267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTACTT 4019

131421268 TTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTGAA 131421327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4020 TTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTGCTGAA 4079

131421328 TGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCTT 131421387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 TGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTCTT 4139

131421388 TAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTTG 131421447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTTTG 4199

131421448 TGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCATT 131421507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 TGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCATT 4259

131421508 GCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCTG 131421567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 GCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTCTG 4319

131421568 AGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTT 131421627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 AGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGTTT 4379

131421628 TAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTTC 131421687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 TAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGTTC 4439

131421688 TTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTAAA 131421747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTAAA 4499

131421748 GTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAATCT 131421807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 GTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAATCT 4559

131421808 ATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAGGA 131421867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 ATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAGGA 4619

131421868 TGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATCGCTTCT 131421927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 TGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATCGCTTCT 4679

131421928 TTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAATGT 131421987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 TTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAATGT 4739

131421988 AGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAGAA 131422047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 AGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAGAA 4799

131422048 GTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAAGCAAGGTGCCAGTCTCTGAC 131422100
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 GTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAAGCAAGGTGCCAGTCTCTGAC 4852

EXCISED REGION

131422103 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACAGTGAGG 131422162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4853 CACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACAGTGAGG 4912

131422163 CCGCTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGATGGGATCCTCAACCACTTAGCAC 131422222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4913 CCGCTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGATGGGATCCTCAACCACTTAGCAC 4972

131422223 TTAGGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGAAGACAGAGTATTCATCACAAAAGTCTCTTC 131422282
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     4973 TTAGGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGATGACAGAGTATTCATCACAAAAGTCTCTTC 5032

131422283 ACTTTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAAGGGAATTTCATCACAGGAGAGC 131422342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5033 ACTTTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAAGGGAATTTCATCACAGGAGAGC 5092

131422343 TGAAGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAACTTGAATGTTTTAGACAACTTC 131422402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5093 TGAAGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAACTTGAATGTTTTAGACAACTTC 5152

131422403 TGTCTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATTTTTTTGTAACATAAAATCTCAT 131422462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5153 TGTCTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATTTTTTTGTAACATAAAATCTCAT 5212

131422463 CTGCAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATCCCCATGTCCCTGAGAGTAAGAA 131422522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5213 CTGCAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATCCCCATGTCCCTGAGAGTAAGAA 5272

131422523 GGTTAAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAATACCACTGAGTTGTAACTGAAAAGC 131422582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5273 GGTTAAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAATACCATTGAGTTGTAACTGAAAAGC 5332

131422583 TGTTTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTTTTTCTCATTACATTCATTATAA 131422642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5333 TGTTTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTTTTTCTCATTACATTCATTATAA 5392

131422643 TTTCTGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCATGTGAGAGAGAGGCAGAAAGAGAGA 131422702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5393 TTTCTGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCATGTGAGAGAGAGGCAGAAAGAGAGA 5452

131422703 AATGAAGGTACAAGAA 131422718
          ||||||||||||||||
     5453 AATGAAGGTACAAGAA 5468

Alignment time is 4.051 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     4371] =>      4371 nucs 'mol-32-34b3-033564_4371'

Score:        4195
Aligned:      4374        nucs
Identic:      4343 ( 99%) nucs =>       474 (100%)      3869 ( 99%)
Gaps:           20 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131417529,131418002] EXCISED REGION [131418988,131422885]
 second seq =>  [        1,      474] EXCISED REGION [      490,     4371]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       985 nucs [131418003,131418987]
 second seq =>        15 nucs [475,489]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [475,475] to [490,490]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131417529 CCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAC 131417588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGACAAAAACAC 60

131417589 ACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATG 131417648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCAGACATATG 120

131417649 CAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGAT 131417708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGAT 180

131417709 TAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCA 131417768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCA 240

131417769 TTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAG 131417828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAG 300

131417829 AAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAA 131417888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAA 360

131417889 CTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACAT 131417948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACAT 420

131417949 CTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAA 131418002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAA 474

EXCISED REGION

131418988 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 131419047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      490 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 549

131419048 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 131419107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      550 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 609

131419108 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 131419167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      610 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 669

131419168 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 131419227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      670 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 729

131419228 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 131419287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      730 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 789

131419288 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCT 131419347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      790 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTT 849

131419348 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 131419407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      850 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 909

131419408 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 131419467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      910 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 969

131419468 CTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 131419527
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      970 CTGGTCCTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 1029

131419528 CTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 131419587
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1030 CTTGCCGAATCCTTTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 1089

131419588 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTC--TTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTC 131419645
          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1090 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTC 1149

131419646 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTC 131419705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1150 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTC 1209

131419706 CAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGC 131419765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1210 CAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGC 1269

131419766 CCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTAT 131419825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1270 CCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTAT 1329

131419826 CGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 131419885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1330 CGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 1389

131419886 TGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAA 131419945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1390 TGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAA 1449

131419946 GACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCT 131420005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1450 GACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCT 1509

131420006 GCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTT 131420065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1510 GCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTT 1569

131420066 ACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAGTCTGTAAAATAGTGC 131420125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1570 ACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAATCTGTAAAATAGTGC 1629

131420126 ATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGA 131420185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1630 ATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGA 1689

131420186 TTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATT 131420245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1690 TTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATT 1749

131420246 CCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGT 131420305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1750 CCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGT 1809

131420306 GAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTT 131420365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1810 GAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTT 1869

131420366 TGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTA 131420425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1870 TGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTA 1929

131420426 TTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTATTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAAC 131420485
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1930 TTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAAC 1989

131420486 ATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTC 131420545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1990 ATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTC 2049

131420546 ATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTG 131420605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2050 ATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTG 2109

131420606 GTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTC 131420665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2110 GTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTC 2169

131420666 CATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAG 131420725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2170 CATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAG 2229

131420726 TAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCAT 131420785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2230 TAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCAT 2289

131420786 ATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAAT 131420845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2290 ATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAAT 2349

131420846 TTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCT 131420905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2350 TTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCT 2409

131420906 TGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAG 131420965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2410 TGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAG 2469

131420966 TAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATA 131421025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2470 TAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATA 2529

131421026 AATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTT 131421085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2530 AATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTT 2589

131421086 TGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTC 131421145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2590 TGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTC 2649

131421146 AGATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGAT 131421205
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2650 AGATGGATAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGAT 2709

131421206 AGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTAC 131421265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2710 AGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTAC 2769

131421266 TTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTG 131421325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2770 TTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTG 2829

131421326 AATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTC 131421385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2830 AATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTC 2889

131421386 TTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTT 131421445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2890 TTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTT 2949

131421446 TGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCA 131421505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2950 TGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCA 3009

131421506 TTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTC 131421565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3010 TTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTC 3069

131421566 TGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGT 131421625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3070 TGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGT 3129

131421626 TTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGT 131421685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3130 TTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGT 3189

131421686 TCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTA 131421745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3190 TCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTA 3249

131421746 AAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAAT 131421805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3250 AAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAAT 3309

131421806 CTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAG 131421865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3310 CTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAG 3369

131421866 GATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATCGCTT 131421925
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3370 GATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTACGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATAGCTT 3429

131421926 CTTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAAT 131421985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3430 CTTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAAT 3489

131421986 GTAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAG 131422045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3490 GTAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAG 3549

131422046 AAGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAAGCAAGGTGCCAGTCTCTGACCACAC 131422105
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
     3550 AAGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAAGCAAGGTGCCAGTCTCTGAC----- 3604

131422106 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACAGTGAGGCCG 131422165
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 -------------CACACACACACACACACACACACACACATATACACACAGTGAGGCCG 3651

131422166 CTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGATGGGATCCTCAACCACTTAGCACTTA 131422225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 CTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGATGGGATCCTCAACCACTTAGCACTTA 3711

131422226 GGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGAAGACAGAGTATTCATCACAAAAGTCTCTTCACT 131422285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 GGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGAAGACAGAGTATTCATCACAAAAGTCTCTTCACT 3771

131422286 TTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAAGGGAATTTCATCACAGGAGAGCTGA 131422345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 TTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAAGGGAATTTCATCACAGGAGAGCTGA 3831

131422346 AGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAACTTGAATGTTTTAGACAACTTCTGT 131422405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 AGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAACTTGAATGTTTTAGACAACTTCTGT 3891

131422406 CTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATTTTTTTGTAACATAAAATCTCATCTG 131422465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 CTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATTTTTTTGTAACATAAAATCTCATCTG 3951

131422466 CAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATCCCCATGTCCCTGAGAGTAAGAAGGT 131422525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 CAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATCCCCATGTCCCTGAGAGTAAGAAGGT 4011

131422526 TAAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAATACCACTGAGTTGTAACTGAAAAGCTGT 131422585
          |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4012 TAAGAATTGTTGACATAAATGCCATCATGTAATACCATTGAGTTGTAACTGAAAAGCTGT 4071

131422586 TTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTTTTTCTCATTACATTCATTATAATTT 131422645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 TTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTTTTTCTCATTACATTCATTATAATTT 4131

131422646 CTGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCATGTGAGAGAGAGGCAGAAAGAGAGAAAT 131422705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4132 CTGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCATGTGAGAGAGAGGCAGAAAGAGAGAAAT 4191

131422706 GAAGGTACAAGAAACAGATTAGGCTGGGTGCGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTT 131422765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 GAAGGTACAAGAAACAGATTAGGCTGGGTGCGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTT 4251

131422766 TGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACG 131422825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 TGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACG 4311

131422826 ATGAAACCCCGACTCTACTAAAAATACAAAAATTTAGCCAGGCATGGTGGCGGGCGCCTG 131422885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4312 ATGAAACCCCGACTCTACTAAAAATACAAAAATTTAGCCAGGCATGGTGGCGGGCGCCTG 4371

Alignment time is 3.40696 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,     6351] =>      6351 nucs 'mol-32-34b3-080534_6351'

Score:        6212
Aligned:      6356        nucs
Identic:      6338 (100%) nucs =>      2278 (100%)      4060 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131412625,131414908] EXCISED REGION [131414944,131419012]
 second seq =>  [        1,     2280] EXCISED REGION [     2282,     6351]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        35 nucs [131414909,131414943]
 second seq =>         1 nucs [2281,2281]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [131414906,131414908] to [131414944,131414946]
 second seq =>         3 nucs [2278,2280] to [2282,2284]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>        11 nucs [131414909,131414919] to [131414933,131414943]
 second seq =>         0 nucs

131412625 AAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACCACCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGG 131412684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGAGCTTCTGCACAGCAAAAGAAACCACCATCAGAGTGAACAGGCAACCTACAGAATGG 60

131412685 GAGAAAATTTTTACAATCTACTAATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAAAGAA 131412744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGAAAATTTTTACAATCTACTAATCTGACAAAGGGCTAATATCCAGAATCTACAAAGAA 120

131412745 CTTAAACAAGTTTACAAGAAAAAATCAAACAACCCCATCAAAAGGTGGGCGAAGGATATG 131412804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTAAACAAGTTTACAAGAAAAAATCAAACAACCCCATCAAAAGGTGGGCGAAGGATATG 180

131412805 AACAGACACTTCTCCAAAGAAGACAGTTATGCAGCCAACAGACACATGAAAAAATGCTCG 131412864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACAGACACTTCTCCAAAGAAGACAGTTATGCAGCCAACAGACACATGAAAAAATGCTCG 240

131412865 TCATCACTGGCCGTCAGAGAATGCAAATCAGAACCACAATGAGATACCATCTCACACCAG 131412924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCATCACTGGCCGTCAGAGAATGCAAATCAGAACCACAATGAGATACCATCTCACACCAG 300

131412925 TTAGAATGGTGATCATTAAAAAGTCAGGAAAAAACAGATGCTGGAGAGAATGTGGAGAAA 131412984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTAGAATGGTGATCATTAAAAAGTCAGGAAAAAACAGATGCTGGAGAGAATGTGGAGAAA 360

131412985 TAGGAACACTTTTACACTGCTGGTGGGACTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAG 131413044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGGAACACTTTTACACTGCTGGTGGGACTGTAAACTAGTTCAACCATTGTGGAAGACAG 420

131413045 TGCAGTGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTAACCCAGCCATCCCATTGC 131413104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCAGTGATTCCTCAAGGATCTAGAACTAGAAATACCATTTAACCCAGCCATCCCATTGC 480

131413105 TGGGCATATACCCAAAGGATTATAAATCATGCTGCTATAAAGACACATGCACACGTATGT 131413164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGGCATATACCCAAAGGATTATAAATCATGCTGCTATAAAGACACATGCACACGTATGT 540

131413165 TTATTGCGGCACTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCGTCAATGA 131413224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTATTGCGGCACTATTCACAATAGCAAAGACTTGGAACCAACCCAAATGTCCGTCAATGA 600

131413225 TAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATTCAGCCATCAAAA 131413284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGACTGGATTAAGAAAATGTGGCACATATACACCATGGAATACTATTCAGCCATCAAAA 660

131413285 AGGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGAATGAAGCTGGAAACCATCATTCTGAGCA 131413344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGAATGAAGCTGGAAACCATCATTCTGAGCA 720

131413345 AACTATCGCAAGGACAGAAAACCAAACACCGCATATTCTCACTCATTGGTGGGAATTGAA 131413404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACTATCGCAAGGACAGAAAACCAAACACCGCATATTCTCACTCATTGGTGGGAATTGAA 780

131413405 TAATGAGAACACTTGGACACAGGATGGGGAACATCATACAACGAGGCCTGTCGTGGGGTG 131413464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAATGAGAACACTTGGACACAGGATGGGGAACATCATACAACGAGGCCTGTCGTGGGGTG 840

131413465 GGGGGAGGTGGTAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGTAAATGACGAGTTAATGGG 131413524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGGGAGGTGGTAGGGATAGCATTAGGAGATATACCTAATGTAAATGACGAGTTAATGGG 900

131413525 TGCAGCACACCAACATGGCACATGTATACATATGTAACAAACCTGTACCCTAGAACTTAA 131413584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCAGCACACCAACATGGCACATGTATACATATGTAACAAACCTGTACCCTAGAACTTAA 960

131413585 AGTATATATAAAAAAAAGATGGAAGGATAGATAGGGGATACAAGAAACAAGACTGACAAG 131413644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTATATATAAAAAAAAGATGGAAGGATAGATAGGGGATACAAGAAACAAGACTGACAAG 1020

131413645 ACATTAATTGTTCAAATGCATGACGAATATATGGGTGTCATTATACTACTCTGTCTGCTT 131413704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACATTAATTGTTCAAATGCATGACGAATATATGGGTGTCATTATACTACTCTGTCTGCTT 1080

131413705 TGGGGTATGCTTGAAATTTTATAACTTTTTTAACACAAGCATTTAACAGCTATATAACAT 131413764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGGGTATGCTTGAAATTTTATAACTTTTTTAACACAAGCATTTAACAGCTATATAACAT 1140

131413765 AAATTTTAAAAAGTAAGAATGTGACCATTATGTGCCTCTGATTATAGTTTTTAAATTCCA 131413824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATTTTAAAAAGTAAGAATGTGACCATTATGTGCCTCTGATTATAGTTTTTAAATTCCA 1200

131413825 AATAAAAAAGTGAATATAAGAAAAAAAAATCTTAAAGGCAGCTACAAAGTGAAGTCCATT 131413884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATAAAAAAGTGAATATAAGAAAAAAAAATCTTAAAGGCAGCTACAAAGTGAAGTCCATT 1260

131413885 AGAGAAACAGCAGGCCTCTCAGCTGAAACCCTACAAGCCAGAAAAGATTGGGGCCAATAT 131413944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAGAAACAGCAGGCCTCTCAGCTGAAACCCTACAAGCCAGAAAAGATTGGGGCCAATAT 1320

131413945 TCAACATTCTTAAAGAAAAGAGGCTGGTCATGGTGGCTCATACCTGCAATCCCAGCACTT 131414004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAACATTCTTAAAGAAAAGAGGCTGGTCATGGTGGCTCATACCTGCAATCCCAGCACTT 1380

131414005 TGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACCTGACATCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGACCAACA 131414064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGGAGGCTGAGGCAGGCAGATCACCTGACATCAGGAGTTCGAGATCAGCCTGACCAACA 1440

131414065 TGGTGAAACCCTGTCTCTACTACAAATACAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTATGCACCTG 131414124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGTGAAACCCTGTCTCTACTACAAATACAAAATTAGCCGGGCGTGGTGGTATGCACCTG 1500

131414125 TAATCCCAGCTACTAGGGTGGCTGTGGCAGGAGAATTGCTTCAACCCGGGAGGCGGAGGT 131414184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAATCCCAGCTACTAGGGTGGCTGTGGCAGGAGAATTGCTTCAACCCGGGAGGCGGAGGT 1560

131414185 TGCAGCAAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCCAGGTGACATAGCAAGATTCTGTC 131414244
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1561 TGCAGCAAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCCAGGTGACAGAGCAAGATTCTGTC 1620

131414245 TCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGAAAGAAAAATTCCAACCTAGAATTTCTTAAGTGAG 131414304
          |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCAAAAAAAAAAAAAAAAA----GGAAAGAAAAATTCCAACCTAGAATTTCTTAAGTGAG 1676

131414305 GAAGAAATAAGATCCTTTTCAAAAAAGCAAATGCTCAAGGAATTCATTGCCATTAAACCT 131414364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 GAAGAAATAAGATCCTTTTCAAAAAAGCAAATGCTCAAGGAATTCATTGCCATTAAACCT 1736

131414365 GCCTTACAAGAGCTCCTGAAGAAAGTACTAAACATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCT 131414424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 GCCTTACAAGAGCTCCTGAAGAAAGTACTAAACATGGAAAGGAAAGACTGTTACCAGCCT 1796

131414425 CTACAAAAACACACTGAAGTACACAGATCAGTGACACTATAAAGCAACCATGTAAACAAG 131414484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 CTACAAAAACACACTGAAGTACACAGATCAGTGACACTATAAAGCAACCATGTAAACAAG 1856

131414485 TCTGCAAAATAACCATGTAACATCATGATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATACTA 131414544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TCTGCAAAATAACCATGTAACATCATGATGAACAGAACAAATCCACATATATCAATACTA 1916

131414545 ACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCCCCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATA 131414604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 ACCTTGAATGTAAATTGGCTAAATGCCCCAATTAAAAGACATGGAGTGGCCCACTGGATA 1976

131414605 AAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGTCTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACC 131414664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 AAGAACGGAGACCCATTGGTATGCTGTCTTCTTTATCCAGTCTCTTGAAGACAGCACACC 2036

131414665 AGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTTGCATATCTCACATGCAGTGACACACATACACTC 131414724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 AGCAGGTCTTGGTGCTTTATCCAACTTGCATATCTCACATGCAGTGACACACATACACTC 2096

131414725 AAAATAAAGGGATGCATAAACATCTACCAAGCAAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGA 131414784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2097 AAAATAAAGGGATGCATAAACATCTACCAAGCGAATTGAAACACAGAAAAAAGCAGAGGA 2156

131414785 TGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAA 131414844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 TGCAATCCTACTTTCAGACAAAACAGACTTTAAACCAACAAAGATCAAAAACACAAAGAA 2216

131414845 GGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATATATA 131414904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 GGTCATTACATAATGGTGAAGAGTTCAATTCAACAAGAAAATCTTACTATCATATATATA 2276

131414905 TATA 131414908
          ||||
     2277 TATA 2280

EXCISED REGION

131414944 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 131415003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 ATACCCAACGCAAGAGCACCCAGATTCATAAAGCAAGTTCTTAGAGACCTTCAAAGAGAT 2341

131415004 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 131415063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 GGAGACTCCCACAATAATGGGAGACTTTAACACCCCACTGTCAATATTAGACAGATCATG 2401

131415064 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 131415123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 AAGATAGAAAATTAACAAAGATATTCAGGACCTGAACTCAGCGCTGGATCAAATGGACCT 2461

131415124 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 131415183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 GATAGACGTCTACAGAACTCTCCATCCCAAAACAAGAGAATATACCTTCTTCTCACTGCT 2521

131415184 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 131415243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 ATTTGGCACTTACTCTAAAATCGATCACATAATCAGAAGTAAACCCTCCTCAGCAAACGC 2581

131415244 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 131415303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 AAAAAAACTGAAATCATAACAAACAATCTCTTGGACCACAGCACAAACAAATTAGAAATC 2641

131415304 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 131415363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 GAGACCAAGAAATTCCCTCAGAACCATACAATTACTTGGAAATTGAATAACCTGCTTCTG 2701

131415364 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 131415423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2702 AATGACTTTTGGGTAAATAATAAAATTACGGCAGACATCAAGATGTTCTTTGAAACTAAA 2761

131415424 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 131415483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2762 GAGGACAAAGAAACAACACACCAGAATCTCGGGGACACAGCTAAGGCAGTGTTAAGAGGG 2821

131415484 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 131415543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2822 AAATTTATGGCACTAAATGACCAATAAAAAAGTTAGAAAGGGCTGGGCATGGTGCCTCAC 2881

131415544 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 131415603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2882 ACCTGTTATCCCAGCATTTTGGGAGGCCAAGGTGAGTGAATCACCTAAGGTCAGGAGTTT 2941

131415604 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 131415663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 GAGACCAGCCTGGCCAATAAGGCAAAACCCACCTCTACTAAAAATACAAAAATTAGCTGG 3001

131415664 TT--ATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 131415721
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3002 --GCATGGTGGGGTACACCTGCAGTCCCAGCCACTCAGGAGGAAGAGGCATGAGGATTGC 3059

131415722 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 131415781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TTGAACTGGGGAGGTAGAGGTTACAGTGAGCCAAGATTGCACCACTGCACTCCAGCCTGG 3119

131415782 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTC-AAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 131415840
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GTGACAGAGTGAGACCCTGTCTCAAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAGAAAAAAAACAGA 3179

131415841 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 131415900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 AAGATCTCAATTTACCAACCTATTATTACATCACAACTAAAAGAAATAGAGAACCAAGAG 3239

131415901 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 131415960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 CAAACCAATCCCAAGCTAGCAAAAGAGAAGAAAGAATCAAAATGAGAGCTGAATTGAAGG 3299

131415961 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 131416020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 AGATTGAGACACACAAAACTATTCAAAAGATCAATGAATCCAGGAACTGGTTTTTTGAAA 3359

131416021 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 131416080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 AAATTAATAATATAGACCACTAGATAAACTAAGAAAGAAGAAAAAAGATTCACAGAAACA 3419

131416081 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 131416140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 CAACCAGAAATGTCAAGGGGGATATTACCACTGATCCCACAGACATACAAATAACCATCA 3479

131416141 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 131416200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GAGAATACTATGAACACCTCTAAGCACATAAACCAGAAAATCTAGCAGAAATGGATAGAT 3539

131416201 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 131416260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TTCTGGACATATAAATCCTTCCAAGACTGAACAAGGAAGAAATTGAATCTGCAAACACAC 3599

131416261 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 131416320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 CAATAATGAGCTCTGAAATTGAGTCAGTAATAAATAAGCTACCAACCAAAAAATTCTCGG 3659

131416321 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 131416380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 GACCAAACAGATTCACAGCTGAATTTTACCAGATGTACAAAGAAGAGCTGATGCCATTCC 3719

131416381 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 131416440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 TGCTTAAACTAGTCCAAAAAATTGAGAAGGAGGGATTTTTTCCAGACTCATTCTGTGAGG 3779

131416441 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 131416500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 CCAGTATTATCCTGATACCAACCTGGGGGAGACAACAAAAAAAAGAAACTTCAGGCCAAT 3839

131416501 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 131416560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 ATCCTTGATGAACATTGATGCAAAAATTCTCAACAAAATACTGGCAAACCTAATCCAGCA 3899

131416561 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 131416620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 GCACATCAAAAAGTTTTTCCACCATGACAAAGTAGTCTTTATCTATGAGATGCAAGGTTG 3959

131416621 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 131416680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 GGTCAACATAAACAAATTGATAAATAGGATTCATCACATAAACAGAACTAAAGACAAAAC 4019

131416681 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 131416740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 CCACATAATTGTCTCAATAGATGCAGAAAATGCTTTTGATAAAATTTAACACCACTTCAT 4079

131416741 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 131416800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 GTTAAAAACTCTCAATAAACTAGGTATCGAAAGGACGTAGCTCAAAATAATAAGTGCCCA 4139

131416801 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 131416860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 CAGCCAACATCATACTGAATGGGCAAAAGCTAGAAGCATTTTCCTTGAAAACCAGCACAA 4199

131416861 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 131416920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 GACAATCAAGCAAAAGAAAGAAATAAATAGTATCCAAATAGGAAGAGAGGAAGTCAAACT 4259

131416921 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCCTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 131416980
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 ATTCCTGTTTTCAGACATGATCTTATATTCAGAAAACCCCATAGTCTTGGTCCAAAAGCT 4319

131416981 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 131417040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 CCTTAAGCTGACAAACAACTTCAGCAAAATTTCAGGATACTAAATCAATGTGCAAAAATT 4379

131417041 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 131417100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 ACTAGCCCTCCTATACACAGTCAAGCTGAGAGCCAAATTGGAATGAAATCCCATTCAAAA 4439

131417101 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 131417160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 TTGCCACACACTCAAAATAAAATACCTAGGAATACAGCTAACCAGGGAGGTGAAAGATCT 4499

131417161 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 131417220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 CTACAACAAGAACTACAAAACACTGCTCAAAGAAATCAGAGATGGCACAAACAAATGGAA 4559

131417221 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 131417280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 AAACATTCCATGCTCATGGATAGGATGGATCAATGTTGTTAAAATGGTCATTCTGCCCAA 4619

131417281 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 131417340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 AGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAATGACATTTTTTCACGGAAG 4679

131417341 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 131417400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4680 TAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTGAAAAAGAGCCCAAATAGCCAAGGCA 4739

131417401 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 131417460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 ATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCCAGCTTCAAACTATACTAC 4799

131417461 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGT 131417520
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4800 AGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAACATAGACCAATGGAACAGG 4859

131417521 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 131417580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 ATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTGATCTTTGACAAACCTGAC 4919

131417581 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 131417640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 AAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGGTACTGTGAAAACTGGCCA 4979

131417641 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 131417700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 GACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACA 5039

131417701 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 131417760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 AGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGG 5099

131417761 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 131417820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 CCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAAT 5159

131417821 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 131417880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 TGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGC 5219

131417881 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 131417940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 AAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAA 5279

131417941 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 131418000
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 CTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAA 5339

131418001 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 131418060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 AAAAACCAACCCCATTAAAAAGTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATA 5399

131418061 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 131418120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 CATGAGGCCAACAGTCATATGAAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAA 5459

131418121 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAA 131418180
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     5460 ATCAAAACCACAATGAGATACCATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAA 5519

131418181 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 131418240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 AAAATAACAGACACTTGTGAGGTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGG 5579

131418241 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 131418300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 AGCGTAAATTAGTTCAACCACTGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAA 5639

131418301 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 131418360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 CAGGAATATCATTCAACCAGCAATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATC 5699

131418361 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 131418420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 ATTCTATTATAAACAAACATGCATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAA 5759

131418421 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 131418480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     5760 GACATAGAATCAACCTAACTGCCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACAT 5819

131418481 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 131418540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 ATACACCACGGAATACTATGCAGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGC 5879

131418541 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 131418600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 ATGGAGCTAGAGGCCATTATCCTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGC 5939

131418601 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 131418660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 ATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAAC 5999

131418661 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 131418720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 AACACACGCTGAGGCCTATTGGAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAA 6059

131418721 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 131418780
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 TAACTAATAGGTACCCATAGATTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGA 6119

131418781 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 131418840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 CACAACTTTCCTATATAACAAATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTC 6179

131418841 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 131418900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 TTTAAAAAGTATGTTATTAAGTAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATC 6239

131418901 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 131418960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 TGGGTTTAAACCTTGCTTCCTCCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAAC 6299

131418961 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTAT 131419012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 CTCTCTGAACTTCTGTTTTCTCATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTAT 6351

Alignment time is 4.66987 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,    10345] =>     10345 nucs 'mol-32-34b3-083625_10345'

Score:       10000
Aligned:     10348        nucs
Identic:     10291 ( 99%) nucs =>       739 (100%)      9552 ( 99%)
Gaps:           35 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131417263,131418002] EXCISED REGION [131418988,131428578]
 second seq =>  [        1,      740] EXCISED REGION [      756,    10345]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       985 nucs [131418003,131418987]
 second seq =>        15 nucs [741,755]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [741,741] to [756,756]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

131417263 AATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAAT 131417322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATGGTCATTCTGCCCAAAGCAATTCATAGATTCAGTGCTATTCCTATTAAACTATCAAT 60

131417323 GACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGA 131417382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACATTTTTTCACGGAAGTAGAAAAAACTATTTTAAAATTCATATGGAACCTAAAAAAGA 120

131417383 GCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCC 131417442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCCAAATAGCCAAGGCAATCCTAAGTAAAAAGAACAAAGCTGGAGACATCACACTACCC 180

131417443 AGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAAC 131417502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCTTCAAACTATACTACAGTTCTACAGTAATCAAAACAGCATGGTACGGGTACAAAAAC 240

131417503 ATAGACCAATGGAACAGTATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTG 131417562
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAGACCAATGGAACAGGATAGAGAACCCAGAACTAAGGCTGCACACCTACAACTAGCTG 300

131417563 ATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGG 131417622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATCTTTGACAAACCTGACAAAAACACACAATGAGGAAAGGATTCCCTATTCAATAAATGG 360

131417623 TACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCA 131417682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACTGTGAAAACTGGCCAGACATATGCAGAAGAGTGAAACTGGATCCCTTCCTTACACCA 420

131417683 TATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAAC 131417742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAATGTAAAACCCCAAATTAAAAAC 480

131417743 CCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGAT 131417802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGGAACAGGCAAAGATTTGATGAT 540

131417803 GAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACT 131417862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAACAAATAGGAGCTAATTAAACT 600

131417863 AAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATG 131417922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGTGAACAGACAGCCTACAGAATG 660

131417923 GGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATA 131417982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCTAATGTCTAGCATCCATAAATA 720

131417983 ACTTAAATTTACAAGAAAAA 131418002
          ||||||||||||||||||||
      721 ACTTAAATTTACAAGAAAAA 740

EXCISED REGION

131418988 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 131419047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      756 TAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAACACTTCA 815

131419048 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 131419107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 ATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCATAGACAT 875

131419108 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 131419167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 TGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCTCTACCG 935

131419168 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 131419227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 CTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTCCTAACT 995

131419228 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 131419287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 AGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTGTATCCA 1055

131419288 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGCT 131419347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1056 GCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTTGTAGTT 1115

131419348 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 131419407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 TTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTGTCCATC 1175

131419408 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 131419467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 TGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTATCCTCA 1235

131419468 CTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 131419527
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 CTGGTCCTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCCTTTGTA 1295

131419528 CTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 131419587
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 CTTGCCGAATCCTTTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTCTTCTCC 1355

131419588 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTC--TTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTC 131419645
          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 TTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTCTGTC 1415

131419646 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTC 131419705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGGGTTC 1475

131419706 CAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGC 131419765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 CAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACCATGC 1535

131419766 CCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTAT 131419825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 CCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTGGTAT 1595

131419826 CGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 131419885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 CGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 1655

131419886 TGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAA 131419945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 TGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAGAGAA 1715

131419946 GACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCT 131420005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 GACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTTCTCT 1775

131420006 GCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTT 131420065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 GCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTTGTTT 1835

131420066 ACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAGTCTGTAAAATAGTGC 131420125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1836 ACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAATCTGTAAAATAGTGC 1895

131420126 ATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGA 131420185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 ATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGAATGA 1955

131420186 TTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATT 131420245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 TTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACATATT 2015

131420246 CCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGT 131420305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 CCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATACATGT 2075

131420306 GAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTT 131420365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 GAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCACCTTT 2135

131420366 TGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTA 131420425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 TGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTGTGTA 2195

131420426 TTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTATTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAAC 131420485
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2196 TTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGAGAAC 2255

131420486 ATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTC 131420545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 ATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAGCTTC 2315

131420546 ATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTG 131420605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 ATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTTCGTG 2375

131420606 GTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTC 131420665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 GTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTGGTTC 2435

131420666 CATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAG 131420725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 CATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTTATAG 2495

131420726 TAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCAT 131420785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 TAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACATCAT 2555

131420786 ATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAAT 131420845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 ATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAACTAAT 2615

131420846 TTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCT 131420905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 TTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGTTTCT 2675

131420906 TGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAG 131420965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 TGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTTTCAG 2735

131420966 TAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATA 131421025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 TAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATA 2795

131421026 AATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTT 131421085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 AATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGTTGTT 2855

131421086 TGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTC 131421145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 TGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTTTGTC 2915

131421146 AGATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGAT 131421205
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 AGATGGATAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGATGAT 2975

131421206 AGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTAC 131421265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 AGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTTTTAC 3035

131421266 TTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTG 131421325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 TTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGTCCTG 3095

131421326 AATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTC 131421385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 AATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTAAGTC 3155

131421386 TTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTT 131421445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 TTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTAGTTT 3215

131421446 TGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCA 131421505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 TGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTTCCCA 3275

131421506 TTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTC 131421565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 TTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTATTTC 3335

131421566 TGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGT 131421625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 TGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATGCTGT 3395

131421626 TTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGT 131421685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 TTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGTTTGT 3455

131421686 TCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTA 131421745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 TCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAATTTA 3515

131421746 AAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAAT 131421805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3516 AAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACTGAAT 3575

131421806 CTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAG 131421865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 CTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCATGAG 3635

131421866 GATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATCGCTT 131421925
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3636 GATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTACGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATAGCTT 3695

131421926 CTTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAAT 131421985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 CTTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCAAAAT 3755

131421986 GTAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAG 131422045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 GTAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTCCTAG 3815

131422046 AAGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAAGCAAGGTGCCAGTCTCTGACCACAC 131422105
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
     3816 AAGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAAGCAAGGTGCCAGTCTCTGAC----- 3870

131422106 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACAGTGAGGCCG 131422165
                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 -------------CACACACACACACACACACACACACACATATACACACAGTGAGGCCG 3917

131422166 CTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGATGGGATCCTCAACCACTTAGCACTTA 131422225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3918 CTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGATGGGATCCTCAACCACTTAGCACTTA 3977

131422226 GGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGAAGACAGAGTATTCATCACAAAAGTCTCTTCACT 131422285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3978 GGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGAAGACAGAGTATTCATCACAAAAGTCTCTTCACT 4037

131422286 TTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAAGGGAATTTCATCACAGGAGAGCTGA 131422345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4038 TTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAAGGGAATTTCATCACAGGAGAGCTGA 4097

131422346 AGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAACTTGAATGTTTTAGACAACTTCTGT 131422405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4098 AGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAACTTGAATGTTTTAGACAACTTCTGT 4157

131422406 CTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATTTTTTTGTAACATAAAATCTCATCTG 131422465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4158 CTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATTTTTTTGTAACATAAAATCTCATCTG 4217

131422466 CAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATCCCCATGTCCCTGAGAGTAAGAAGGT 131422525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4218 CAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATCCCCATGTCCCTGAGAGTAAGAAGGT 4277

131422526 TAAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAATACCACTGAGTTGTAACTGAAAAGCTGT 131422585
          |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4278 TAAGAATTGTTGACATAAATGCCATCATGTAATACCATTGAGTTGTAACTGAAAAGCTGT 4337

131422586 TTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTTTTTCTCATTACATTCATTATAATTT 131422645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4338 TTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTTTTTCTCATTACATTCATTATAATTT 4397

131422646 CTGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCATGTGAGAGAGAGGCAGAAAGAGAGAAAT 131422705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4398 CTGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCATGTGAGAGAGAGGCAGAAAGAGAGAAAT 4457

131422706 GAAGGTACAAGAAACAGATTAGGCTGGGTGCGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTT 131422765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4458 GAAGGTACAAGAAACAGATTAGGCTGGGTGCGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGCACTT 4517

131422766 TGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACG 131422825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4518 TGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACG 4577

131422826 ATGAAACCCCGACTCTACTAAAAATACAAAAATTTAGCCAGGCATGGTGGCGGGCGCCTG 131422885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4578 ATGAAACCCCGACTCTACTAAAAATACAAAAATTTAGCCAGGCATGGTGGCGGGCGCCTG 4637

131422886 TAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGTGGAGCT 131422945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4638 TAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGTGGAGCT 4697

131422946 TGCGCTGAGCAGAGATTGCGCCACCGCACTACAGTCTGGGAGACAGAGTGATACTCCGTC 131423005
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4698 TGCGCTGAGCAGAGATTGCGCCACTGCACTACAGTCTGGGAGACAGAGTGATACTCCGTC 4757

131423006 TC---AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAACAGATTAATCACGTTAATAGCAAGCA 131423062
          ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4758 TCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAACAGATTAATCACGTTAATAGCAAGCA 4817

131423063 AAGAAAGAGAGGTATTATCCAAATTTGAAAGGAGTAAAATTTTGCATAAGTTGACAGTCA 131423122
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4818 AAGAAAGAGAGGCATTATCCAAATTTGAAAGGAGTAAAATTTTGCATAAGTTGACAGTCA 4877

131423123 GACAGGAAAAAGGGAGCTGGTAACAGTTAATCTACAGGAAGGCCTTTTCACCTAGAATTA 131423182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4878 GACAGGAAAAAGGGAGCTGGTAACAGTTAATCTACAGGAAGGCCTTTTCACCTAGAATTA 4937

131423183 TCTTAAAACATGCAGTCCTTACTGCCACTAAAAGACTAATTATGTGATTTCCTTCAATCT 131423242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4938 TCTTAAAACATGCAGTCCTTACTGCCACTAAAAGACTAATTATGTGATTTTCTTCAATCT 4997

131423243 GAACAAATCCTTTTTTATACTGCTCTTTATGGCAGACTATAGTGTGAGTCAGAAATTCCA 131423302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4998 GAACAAATCCTTTTTTATACTGCTCTTTATGGCAGACTATAGTGTGAGTCAGAAATTCCA 5057

131423303 AAAGCATGATAATCTCCATCCTTTACAGCACCTGTCCCAACGTTATGTTAATCATTAGTT 131423362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5058 AAAGCATGATAATCTCCATCCTTTACAGCACCTGTCCCAACGTTATGTTAATCATTAGTT 5117

131423363 GATAATCTTTAAAGCTGAGGGCTACACACCCTCTACTATTGTATCTACAACTCTGGAGTT 131423422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5118 GATAATCTTTAAAGCTGAGGGCTACACACCCTCTACTATTGTATCTACAACTCTGGAGTT 5177

131423423 ATGATACCAGATTAAGTTGATCAGATCATCATTACTTTTATTATTTTCAAACATTAATTT 131423482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5178 ATGATACCAGATTAAGTTGATCAGATCATCATTACTTTTATTATTTTCAAACATTAATTT 5237

131423483 CGATGTCAAAAAATTTAGAAAAGTAAATTCCAAACCGAAAGCACTGTTTTTTTTTCTTTT 131423542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5238 CGATGTCAAAAAATTTAGAAAAGTAAATTCCAAACCGAAAGCACTGTTTTTTTTTCTTTT 5297

131423543 AAAGGGCTTAAACATACTTACTGTTATTTAAATATTTATCACACTGAAAAATGTCCTGCA 131423602
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5298 AAAGGGCTTAAACATACTTACTGATATTTAAATATTTATCACACTGAAAAATGTCCTGCA 5357

131423603 AGTACATCGTTTTATAGTGACTTCAGACTGATGATACATTCCAAAAACATTCATTAAATG 131423662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5358 AGTACATCGTTTTATAGTGACTTCAGACTGATGATACATTCCAAAAACATTCATTAAATG 5417

131423663 AGGTTTCTCTTTCACTGTTACCAACTTACCTTTTACTCTCAGTGGTATGATAACCCTCAG 131423722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5418 AGGTTTCTCTTTCACTGTTACCAACTTACCTTTTACTCTCAGTGGTATGATAACCCTCAG 5477

131423723 AACTACAGAACAGCTTCAATCTTCGTTCAGAACTATCATACCTGAAAAGAGGAGGTTTTG 131423782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5478 AACTACAGAACAGCTTCAATCTTCGTTCAGAACTATCATACCTGAAAAGAGGAGGTTTTG 5537

131423783 TTTTATTGTGGTAAAATATACATAAAATAAAATTTACCATTCTAACTGTACAATTCAGTG 131423842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5538 TTTTATTGTGGTAAAATATACATAAAATAAAATTTACCATTCTAACTGTACAATTCAGTG 5597

131423843 GCATTAAGTATTAGGTTGGTGCCAAGGTAATTGTGGATTTTGCCATTGAAAGTAATGTAA 131423902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5598 GCATTAAGTATTAGGTTGGTGCCAAGGTAATTGTGGATTTTGCCATTGAAAGTAATGTAA 5657

131423903 TACTTTCTGCTATTTTTCTATCATCACTAACAGAAACTCTGTACTCACTAAACACCAACT 131423962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5658 TACTTTCTGCTATTTTTCTATCATCACTAACAGAAACTCTGTACTCACTAAACACCAACT 5717

131423963 GTCCATTATCCCATCCACTCCCTATTACCCACCAGCTCCTGGTAACCTCTAATCTACTTT 131424022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5718 GTCCATTATCCCATCCACTCCCTATTACCCACCAGCTCCTGGTAACCTCTAATCTACTTT 5777

131424023 CTGTTTCTATGAATTTGCCTATTCCGGGTACCTCATATAAGTGGAGTGGAATCATACAAT 131424082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5778 CTGTTTCTATGAATTTGCCTATTCCGGGTACCTCATATAAGTGGAGTGGAATCATACAAT 5837

131424083 ATTTGTCCTTTTGTATCTGGCTTATTTCGCTCAGCACAATGTTTCAAGGTTGATGAATGC 131424142
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5838 ATTTGTCCTTTTGTATCTGGCTTATTTCACTCAGCACAATGTTTCAAGGTTGATGAATGC 5897

131424143 TGTAGATGTATCAGAATTTCCTTCTGTTTTAAGGTTGAGCAATATTCTATTGTATGTATG 131424202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5898 TGTAGATGTATCAGAATTTCCTTCTGTTTTAAGGTTGAGCAATATTCTATTGTATGTATG 5957

131424203 TACTACATTTTGGTTATCCTTTCATCCATCGATGGACATTTGGATTTCTCCCACCTTCTG 131424262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5958 TACTACATTTTGGTTATCCTTTCATCCATCGATGGACATTTGGATTTCTCCCACCTTCTG 6017

131424263 GTTACTGTACAAAATGCTTCACTGAACATTGGTGTACAATGTTTTTTTTTCAATGTTATC 131424322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6018 GTTACTGTACAAAATGCTTCACTGAACATTGGTGTACAATGTTTTTTTTTCAATGTTATC 6077

131424323 GTACTTACTTTCTCCTGAGTGATTGGAAGAACTTTTACAATTAACCGTTGCCTGGACTCT 131424382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6078 GTACTTACTTTCTCCTGAGTGATTGGAAGAACTTTTACAATTAACCGTTGCCTGGACTCT 6137

131424383 TGATAAATCCAGCCCCAAATTACTTAAGAGTATTTAGTAAGTCATTTTCAAAGGTCACTG 131424442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6138 TGATAAATCCAGCCCCAAATTACTTAAGAGTATTTAGTAAGTCATTTTCAAAGGTCACTG 6197

131424443 TTTGTCAAGTAGGAAAACTCGCAGTGAGCAGTGAGCAGTTTGTATAGGCCCACACAGGGC 131424502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6198 TTTGTCAAGTAGGAAAACTCGCAGTGAGCAGTGAGCAGTTTGTATAGGCCCACACAGGGC 6257

131424503 AGTGACCTATATTCTGAGCCTGCACGTTAGAATTAAAACCTTCTGAGTCTTCAATCCCTG 131424562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6258 AGTGACCTATATTCTGAGCCTGCACGTTAGAATTAAAACCTTCTGAGTCTTCAATCCCTG 6317

131424563 CACCAGAACAACTATATCAGACTTTGGATGTGGGATCAGACCTTGTTATTTTTCCAAACC 131424622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6318 CACCAGAACAACTATATCAGACTTTGGATGTGGGATCAGACCTTGTTATTTTTCCAAACC 6377

131424623 TCCCCTGCTGATTCTGTTATGCAGCCAGGATCTAGAACCTCTGACGTGGGCAAATGTGGT 131424682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6378 TCCCCTGCTGATTCTGTTATGCAGCCAGGATCTAGAACCTCTGACGTGGGCAAATGTGGT 6437

131424683 ATCAGTCATCAGAGCTGCAAGTAAAACCACTGAGGCCCTCAGAGAACTAAGAGGGAATCT 131424742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6438 ATCAGTCATCAGAGCTGCAAGTAAAACCACTGAGGCCCTCAGAGAACTAAGAGGGAATCT 6497

131424743 TTTTTACAGCCTGTATTGTACATATAATATTAGCGTGGCTAACCTATAATTGGCCATATG 131424802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6498 TTTTTACAGCCTGTATTGTACATATAATATTAGCGTGGCTAACCTATAATTGGCCATATG 6557

131424803 TTCAATAATTAATTGAACATATAATTGATAATTGGTAATATCACTGAGATTGTCCAAGGA 131424862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6558 TTCAATAATTAATTGAACATATAATTGATAATTGGTAATATCACTGAGATTGTCCAAGGA 6617

131424863 TATAACTAAAGGGATTCATTTCCCTGATTATGACTACCAACACCAAGATTGGATCAGAGC 131424922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6618 TATAACTAAAGGGATTCATTTCCCTGATTATGACTACCAACACCAAGATTGGATCAGAGC 6677

131424923 ACTAAAGGATGCATAGTGGCTCCTGAGGCTGGATATTTGAGCCAGTAAAAACAAGAGAGT 131424982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6678 ACTAAAGGATGCATAGTGGCTCCTGAGGCTGGATATTTGAGCCAGTAAAAACAAGAGAGT 6737

131424983 AATTCCCCACGGTAAAGGTGAATGTCGTACACTATGTTATGGGCTGAATGTTTGCGTCCT 131425042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6738 AATTCCCCACGGTAAAGGTGAATGTCGTACACTATGTTATGGGCTGAATGTTTGCGTCCT 6797

131425043 CCAGTATGGTGAAGCTTGAATCCCCAATGTCATAGTACTGGAGATGGGGCCTTAGAGAGG 131425102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6798 CCAGTATGGTGAAGCTTGAATCCCCAATGTCATAGTACTGGAGATGGGGCCTTAGAGAGG 6857

131425103 TAATTAGAGTTAGATGAGTTTATGGGAGTTGGGCCCTGGTCCAATGAGATGAATGCCCTT 131425162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6858 TAATTAGAGTTAGATGAGTTTATGGGAGTTGGGCCCTGGTCCAATGAGATGAATGCCCTT 6917

131425163 ACTAGAAAAGATACCAGAGGACTTCCTCTCTTCTCAGTGTCTCTGAGGAAAGGCCATGTG 131425222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6918 ACTAGAAAAGATACCAGAGGACTTCCTCTCTTCTCAGTGTCTCTGAGGAAAGGCCATGTG 6977

131425223 AGGGCACAGCAACACTGCAGCTGTCTACAAGCCAGAAAGAAGACCTTTACTAGGAACCAG 131425282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6978 AGGGCACAGCAACACTGCAGCTGTCTACAAGCCAGAAAGAAGACCTTTACTAGGAACCAG 7037

131425283 CCCTATTGGACCTTGATCTACAACTCCTGCCTTCATAATGACAAGAATCTAAATTTCTGT 131425342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7038 CCCTATTGGACCTTGATCTACAACTCCTGCCTTCATAATGACAAGAATCTAAATTTCTGT 7097

131425343 TGTTTAAGCCACCTATGATCCTTTGTTACGGCAGTCTGAGCAGACTAAGACACTCTGGAT 131425402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7098 TGTTTAAGCCACCTATGATCCTTTGTTACGGCAGTCTGAGCAGACTAAGACACTCTGGAT 7157

131425403 ACCTGTGATATAATAAGAAGTACATACTTAGTTTAGACCCCAGTTACTGACACAGAAT-- 131425460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
     7158 ACCTGTGATATAATAAGAAGTACATACTTAGTTTAGACCCCAGTTACTGACACAGAATTG 7217

131425461 ----------TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACAGGGTCTCACTCTGTAGCCC 131425510
                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7218 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACAGGGTCTCACTCTGTAGCCC 7277

131425511 AGGCTGGAATGCAGTGACGCGATCATGGCTCACTGCAGTCTCCACCTCCTGGGCTCAAAT 131425570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7278 AGGCTGGAATGCAGTGACGCGATCATGGCTCACTGCAGTCTCCACCTCCTGGGCTCAAAT 7337

131425571 GACCTTTCCGCCTAAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGTGTGCCACCATGCCCAG 131425630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7338 GACCTTTCCGCCTAAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGTGTGCCACCATGCCCAG 7397

131425631 CTAATTTTTAAATTTTTTGTGGAGAATAGTTCTTGCTTTGCTGTCCAGACTGGCTTGAAT 131425690
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     7398 CTAATTTTTAAATTTTTTGTGGAGAACAGTTCTTGCTTTGCTGTCCAGACTGGCTTGAAT 7457

131425691 CCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTTGACCTACAAAAGTGCTAGGATTACAGACGTGA 131425750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7458 CCCTGGGCTCAAGCAATCCTCCCACCTTGACCTACAAAAGTGCTAGGATTACAGACGTGA 7517

131425751 GCTACTGCACCCAGTCCTTGTTGGGCCCCTAGATAGCTTTAGGATGGGAGCTGGTTGCCA 131425810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7518 GCTACTGCACCCAGTCCTTGTTGGGCCCCTAGATAGCTTTAGGATGGGAGCTGGTTGCCA 7577

131425811 GAGGAATTAACCATGTGATTAAAGGGTTGGAAATTTCAGCCCCATTCCTAGATCTCTGAG 131425870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7578 GAGGAATTAACCATGTGATTAAAGGGTTGGAAATTTCAGCCCCATTCCTAGATCTCTGAG 7637

131425871 GAGGGGAGAGGGGCTGGAGATTGAGTTCAATTACCAATGGCCAAAATTTAATCAATCATG 131425930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7638 GAGGGGAGAGGGGCTGGAGATTGAGTTCAATTACCAATGGCCAAAATTTAATCAATCATG 7697

131425931 CCTACATGATGGAACCTCCATAAAACCCCTAAACAATACGATTCAGACAGTTTCAGGGTT 131425990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7698 CCTACATGATGGAACCTCCATAAAACCCCTAAACAATACGATTCAGACAGTTTCAGGGTT 7757

131425991 GTAGAACACATCTACATGCTGAGAGGGAGGCACACCCCAATTCCACGGGGACAGAAGTTC 131426050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7758 GTAGAACACATCTACATGCTGAGAGGGAGGCACACCCCAATTCCACGGGGACAGAAGTTC 7817

131426051 CTGTGCTCAGGACTCTTCAAGATCTCTCCCTGTGTATCTCCTCAGCTGCCTGTTCATTTC 131426110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7818 CTGTGCTCAGGACTCTTCAAGATCTCTCCCTGTGTATCTCCTCAGCTGCCTGTTCATTTC 7877

131426111 TCTCCTTTAGTAATTAGCAGTGATAATAAATAAAGTCTTTTCCCAAGTTTTATCAACCAT 131426170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7878 TCTCCTTTAGTAATTAGCAGTGATAATAAATAAAGTCTTTTCCCAAGTTTTATCAACCAT 7937

131426171 TCTAGCAAATTATAAAACCTGAGGAAGGGGTCATAGGAACCTGTGATTAATAGTCAGTTG 131426230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7938 TCTAGCAAATTATAAAACCTGAGGAAGGGGTCATAGGAACCTGTGATTAATAGTCAGTTG 7997

131426231 GTCAGAAGTACTGATGGAAGCAAGATACTTGCAACTGGCATCTGAAACGAAGGCAGTTTT 131426290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7998 GTCAGAAGTACTGATGGAAGCAAGATACTTGCAACTGGCATCTGAAACGAAGGCAGTTTT 8057

131426291 GTGGGAGTGAGTCTGCGGAATCTGACACGACTCCAGTTAGTTACTGTAGGAATTGAATTC 131426350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8058 GTGGGAGTGAGTCTGCGGAATCTGACACGACTCCAGTTAGTTACTGTAGGAATTGAATTC 8117

131426351 AATTGTAGGATACCCAGTTGGTATCTGGAAGGTTGGAGAACTGGTTGTTGGCATGGAAAC 131426410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8118 AATTGTAGGATACCCAGTTGGTATCTGGAAGGTTGGAGAACTGGTTGTTGGCATGGAAAC 8177

131426411 AACCCACACATTTGGTGCCAAAAGTATTATGAGTAAAAACAGCTTGGAATATTAAACTGA 131426470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8178 AACCCACACATTTGGTGCCAAAAGTATTATGAGTAAAAACAGCTTGGAATATTAAACTGA 8237

131426471 CCCTCAAAGGAAAAAAAAAGCCAATAAAAGGATGCTATCTTGCCAGGACCTTCCAAGGAG 131426530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8238 CCCTCAAAGGAAAAAAAAAGCCAATAAAAGGATGCTATCTTGCCAGGACCTTCCAAGGAG 8297

131426531 CCTCAGAATTGTCTGTTAAGGGAAGGAAAAGGGGAACATTTGATTGACTCACTATCTCCT 131426590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     8298 CCTCAGAATTGTCTGTTAAGGGAAGGAAAAGGGGAACATTTGATCGACTCACTATCTCCT 8357

131426591 GTCCCAACCAGGCAAGGGGACTGTCCATGGGGCACTGATTCCCTCACACTTCCAGTGTGC 131426650
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8358 GTCCCAACCAGTCAAGGGGACTGTCCATGGGGCACTGATTCCCTCACACTTCCAGTGTGC 8417

131426651 ACTCGCTTGAATGCCAGGTAGGTCTCTGCAGACATCCCACCTTATGCTATCCCAGGATAG 131426710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8418 ACTCGCTTGAATGCCAGGTAGGTCTCTGCAGACATCCCACCTTATGCTATCCCAGGATAG 8477

131426711 GATAGTCCCAGGATAAAACATGAGAGTTAAACAGTTCAACTGGACCGAGCTCGATGGCTC 131426770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8478 GATAGTCCCAGGATAAAACATGAGAGTTAAACAGTTCAACTGGACCGAGCTCGATGGCTC 8537

131426771 ACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGTTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAGT 131426830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8538 ACGCCTGTAATCCCAACACTTTGGGAGGTTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAGT 8597

131426831 TCAAGACCAAGCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAACAACAACAACAACAA 131426890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8598 TCAAGACCAAGCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAACAACAACAACAACAA 8657

131426891 AAACAAAAACAAACAAACAAACAAGAAAACCCAAAAACTAACTGGATGTGGTGGTGGTGC 131426950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8658 AAACAAAAACAAACAAACAAACAAGAAAACCCAAAAACTAACTGGATGTGGTGGTGGTGC 8717

131426951 ACGCTTGCAGTCTTAGCTACTCTGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGG 131427010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8718 ACGCTTGCAGTCTTAGCTACTCTGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGG 8777

131427011 CTGAGGTTGCAGACAGCCATGGTGGCACCATTGCCCTCCAGCCTGGGCAAGAGAGTGAGA 131427070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8778 CTGAGGTTGCAGACAGCCATGGTGGCACCATTGCCCTCCAGCCTGGGCAAGAGAGTGAGA 8837

131427071 CCCTGTCTCAAAAATAAAAAGCAATAATAAATAAATAAATAAAACTGAGGAAAGTTGTTC 131427130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8838 CCCTGTCTCAAAAATAAAAAGCAATAATAAATAAATAAATAAAACTGAGGAAAGTTGTTC 8897

131427131 TTGGGTGATAAGACATGAAGCTGTTTCCAACAGGAGTAATAACTAAACTAAAGACAGGCA 131427190
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     8898 TTGGGTGATAAGACATGAAGCTGTTTCCAACAGGAGTAATAACTAGACTAAAGACAGGCA 8957

131427191 AAAGGATGTGAGGCCAGGCACAGGAGATGGTCAACGTGGGGAGCTTCTAGAGACTCCAAT 131427250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8958 AAAGGATGTGAGGCCAGGCACAGGAGATGGTCAACGTGGGGAGCTTCTAGAGACTCCAAT 9017

131427251 CAGGTCTGTGAGTTCCAGTCCCCACTCCTAGCTCTAGTCACAGTCTTCACTTGAACACCC 131427310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9018 CAGGTCTGTGAGTTCCAGTCCCCACTCCTAGCTCTAGTCACAGTCTTCACTTGAACACCC 9077

131427311 TACCTCCATTCTAAACCTTGATGGCTAGAGTTTGATTTTATTAAGAGAGCTTATCAAGAG 131427370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9078 TACCTCCATTCTAAACCTTGATGGCTAGAGTTTGATTTTATTAAGAGAGCTTATCAAGAG 9137

131427371 GTTTCTTGTAATATACCATTTCTCCTTTGTCTACCATACTTTCTGCAAGTAACACATAGT 131427430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9138 GTTTCTTGTAATATACCATTTCTCCTTTGTCTACCATACTTTCTGCAAGTAACACATAGT 9197

131427431 TTTGGAAATTCAGGTCAGTTATTTAAAAAACAAAAATAGTAGCTAAGTACAGAGGGTTGT 131427490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9198 TTTGGAAATTCAGGTCAGTTATTTAAAAAACAAAAATAGTAGCTAAGTACAGAGGGTTGT 9257

131427491 GTGGGAAGCACTTCAACTTCCAGACAACATAAGGCTAAGCGCTGTGACACATTTGAAAAT 131427550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9258 GTGGGAAGCACTTCAACTTCCAGACAACATAAGGCTAAGCGCTGTGACACATTTGAAAAT 9317

131427551 AAGTCCTTATTTTTTATCTTTTAGAATGCAGTCATTTGGAGTCCTTCTCTACCGATGGCT 131427610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9318 AAGTCCTTATTTTTTATCTTTTAGAATGCAGTCATTTGGAGTCCTTCTCTACCGATGGCT 9377

131427611 GAAATTACTCATCTAAGGAGAGCCAAATCTGCTCCATCCAGAAATGAAACCCACATAACA 131427670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9378 GAAATTACTCATCTAAGGAGAGCCAAATCTGCTCCATCCAGAAATGAAACCCACATAACA 9437

131427671 CTTTATCATCTTTCAGACTCTTGACATTAACATATTTTAAATATTTACCTTTTAGTTTTA 131427730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9438 CTTTATCATCTTTCAGACTCTTGACATTAACATATTTTAAATATTTACCTTTTAGTTTTA 9497

131427731 TATTTATTTTGACATTTTATTATATTGCCTGCATGTCCTTTCTGTTCATCTACAACTATA 131427790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9498 TATTTATTTTGACATTTTATTATATTGCCTGCATGTCCTTTCTGTTCATCTACAACTATA 9557

131427791 TTTTCTTTTTTCCTTAGATCAGGGATTAGCAAATGATGATCCACTGCCTTGTTTTTGTAT 131427850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9558 TTTTCTTTTTTCCTTAGATCAGGGATTAGCAAATGATGATCCACTGCCTTGTTTTTGTAT 9617

131427851 GATTTGCAAGATGAGAATGGTTTTCACATTTTAAGTGGTTTCTAGAATGTCAAAAAAGTA 131427910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9618 GATTTGCAAGATGAGAATGGTTTTCACATTTTAAGTGGTTTCTAGAATGTCAAAAAAGTA 9677

131427911 ATATTTTGTGTTACATGAAAACTATGTGAAATTCAAATTTAAGCCCATCAGTAAAGTTTC 131427970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9678 ATATTTTGTGTTACATGAAAACTATGTGAAATTCAAATTTAAGCCCATCAGTAAAGTTTC 9737

131427971 ATGGGAACATGGCCATGTTCATTCATTCACATACTTTGTATGGTTGCTTTTGCACTGCAA 131428030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9738 ATGGGAACATGGCCATGTTCATTCATTCACATACTTTGTATGGTTGCTTTTGCACTGCAA 9797

131428031 GGGAGATTTAAGTCATTGCAACAAAGACCATATGGCCCTAAAATCCTAAAATGTTCACAA 131428090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9798 GGGAGATTTAAGTCATTGCAACAAAGACCATATGGCCCTAAAATCCTAAAATGTTCACAA 9857

131428091 TCTGGCCCTTCACAGAAAAGTTTGCTGACCCCTGCCCTGAATGACAAAAGGATGCTTGTT 131428150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9858 TCTGGCCCTTCACAGAAAAGTTTGCTGACCCCTGCCCTGAATGACAAAAGGATGCTTGTT 9917

131428151 TAGTTTCCTTCATGTATTACCTAGCCTTAGGGTTCCAGGCACTTGAAACTGCTTTCTAAT 131428210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9918 TAGTTTCCTTCATGTATTACCTAGCCTTAGGGTTCCAGGCACTTGAAACTGCTTTCTAAT 9977

131428211 GAAGATAATAATTCATATGTGTCACTAGAATTGGTTTTGACAAGGCCACTCAAAATCTAT 131428270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9978 GAAGATAATAATTCATATGTGTCACTAGAATTGGTTTTGACAAGGCCACTCAAAATCTAT 10037

131428271 TAGATAGGAAATGGTTTTACTAAAGTTGTTTTATAATCTACAAATCAAGTACATAGTGTA 131428330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10038 TAGATAGGAAATGGTTTTACTAAAGTTGTTTTATAATCTACAAATCAAGTACATAGTGTA 10097

131428331 TGTAAAATAAATGTTTATCAGATAAATTAATGAGTGAATAACTCTGGCAAATCTGGTAGT 131428390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10098 TGTAAAATAAATGTTTATCAGATAAATTAATGAGTGAATAACTCTGGCAAATCTGGTAGT 10157

131428391 GTGTGACCTCAGCAAGAAGCCAAGGAAAAGCATACTTGTTTCTGCCTCACATTTGCACAG 131428450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10158 GTGTGACCTCAGCAAGAAGCCAAGGAAAAGCATACTTGTTTCTGCCTCACATTTGCACAG 10217

131428451 AGCTTGATGACACATACTTCAAAAAGCATATTCTTATCTGAGATTACAAAGTCTTTCACA 131428510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10218 AGCTTGATGACACATACTTCAAAAAGCATATTCTTATCTGAGATTACAAAGTCTTTCACA 10277

131428511 ATGACTGTATAGGAGATAAAGTGGAGGGAAAAACACCCTCTTCCTAGAGGGAGTATCATA 131428570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
    10278 ATGACTGTATAGGAGATAAAGTGGAGGGAAAAACACCCCCTTCCTAGAGGGAGTATCATA 10337

131428571 GAATAACA 131428578
          ||||||||
    10338 GAATAACA 10345

Alignment time is 7.63364 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [131408002,131428987] =>     20986 nucs '6 dna:chromosome chromosome:GRCh37:6:1:171115067:1'
Second seq [        1,    10223] =>     10223 nucs 'mol-32-34be-056232_10223'

Score:        9963
Aligned:     10209        nucs
Identic:     10185 (100%) nucs =>      7778 (100%)      2407 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [131417662,131425460] EXCISED REGION [131425461,131427870]
 second seq =>  [        1,     7795] EXCISED REGION [     7814,    10223]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        18 nucs [7796,7813]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        28 nucs [7796,7823] to [7814,7841]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [131425460,131425460] to [131425461,131425461]
 second seq =>         1 nucs [7795,7795] to [7814,7814]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         8 nucs [7796,7803] to [7806,7813]

131417662 CTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAAT 131417721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGATCCCTTCCTTACACCATATACAAAAATTAACACAAGATGGATTAAAGACTGAAAT 60

131417722 GTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGG 131417781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTAAAACCCCAAATTAAAAACCCTGGAAGACAATCTGGGCCATACCATTGTGGGCATAGG 120

131417782 AACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAA 131417841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACAGGCAAAGATTTGATGATGAAAATGCCAAAAGCAATTGCAACAGAAGCAAAAATTAA 180

131417842 CAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGT 131417901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAATAGGAGCTAATTAAACTAAAGAACTTATGCACAGCAAAATAAACTATCAACAGAGT 240

131417902 GAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCT 131417961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAACAGACAGCCTACAGAATGGGAGAAAAAATTTGCAAACTACACATCTGGCATAGGTCT 300

131417962 AATGTCTAGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAA 131418021
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATGTCTGGCATCCATAAATAACTTAAATTTACAAGAAAAAAAACCAACCCCATTAAAAA 360

131418022 GTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATG 131418081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGGGCAAAGGGCACGAACACTTTTCAAAAGAAGACATACATGAGGCCAACAGTCATATG 420

131418082 AAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATAC 131418141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAAAAGCTTAGCATCACTGATCATTAGAGGAATGCAAATCAAAACCACAATGAGATAC 480

131418142 CATCTTACACTAGTCAGAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAG 131418201
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATCTTACACTAGTCAAAATGGCTATTATAAAACACCAAAAAATAACAGACACTTGTGAG 540

131418202 GTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCAC 131418261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTGTGGAGATAAAGGAACGCTTATACACTGTTGGTAGGAGCGTAAATTAGTTCAACCAC 600

131418262 TGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGC 131418321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTGGAAGACAGTGTGGTGATTTCTCAAAGGCCTAAAAACAGGAATATCATTCAACCAGC 660

131418322 AATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATG 131418381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATCCCATTACTGAGTATATACCCAAAGAAATATAAATCATTCTATTATAAACAAACATG 720

131418382 CATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTG 131418441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATGCATATGTTCATTGCAGCACTATTCACAATAGCAAAGACATAGAATCAACCTAACTG 780

131418442 CCCATCAATAGAAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGC 131418501
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCATCAATAGTAGACTGGATAAAGAAAATTTGGTACATATACACCACGGAATACTATGC 840

131418502 AGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATC 131418561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCCCTAAAAAGAATGATATGTTCTTTGCAGAAATATGCATGGAGCTAGAGGCCATTATC 900

131418562 CTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGG 131418621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTTAGCAAACTAACACAGGAACAGAAAACCAAATACTGCATGTTCTCACTTATAAGTGGG 960

131418622 AGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTG 131418681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTTAAATGGTGAGAATACATGGGCACATAGATGGAAACAACACACGCTGAGGCCTATTG 1020

131418682 GAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGA 131418741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGGGTGGAGTGTGGGAGAAGGGAGAGGATCAGGAAAAATAACTAATAGGTACCCATAGA 1080

131418742 TTATGGGTTATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAA 131418801
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTATGGGTCATGACATAATCTATACAACAAATCCCATGACACAACTTTCCTATATAACAA 1140

131418802 ATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAG 131418861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTTGCACATGTAACCCTTAACTTAAAATAAAAGTTTTCTTTAAAAAGTATGTTATTAAG 1200

131418862 TAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCT 131418921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGTACTGTTTAAAAGTATGGATTCTGATCAAATAGATCTGGGTTTAAACCTTGCTTCCT 1260

131418922 CCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCT 131418981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTCCTGCACCCTGCGTGACTGTAGGTGAATTACCTAACCTCTCTGAACTTCTGTTTTCT 1320

131418982 CATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAACTGGAGATTGACACTGCAAC 131419041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1321 CATCTGTAATCATAAGCATTATTGATAGTATAGATTTCAATTGGAGATTGACACTGCAAC 1380

131419042 ACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCAT 131419101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTTCAATAAGACCCAGTCATCTCAACGCTATTTTTTTGCTCATCCCTTATTGTATCCAT 1440

131419102 AGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCT 131419161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGACATTGGCTTATTAACTTGACTTTCACATATTTCCAGATATATTTCCTTTCATCATCT 1500

131419162 CTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTC 131419221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTACCGCTCTTATCTTGTTCTAAACAACCCTGATTTCTCACCTATTATTGCAATAACCTC 1560

131419222 CTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTG 131419281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTAACTAGTTTCGATGTTTCTACTCTCACCCACATCCCCTTCAGACTTTTCTCAATACTG 1620

131419282 TATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTT 131419341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TATCCAGCATGAACTTTAAAATAAAAGTCAGATCATGTCAGACATCTGCTCAAATCCCTT 1680

131419342 GTAGCTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTG 131419401
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTAGTTTTCCATGTTACTTAGAGCAGAACCGAAGTCCTTGCAATTTTTTCATAGGGTTTG 1740

131419402 TCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTA 131419461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCATCTGCACTTCTCTGTCCTCATTCCCTAATGTACTTCCATTCTTTTATTGTACTCTA 1800

131419462 TCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCC 131419521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCTCACTGGTCTTCTTGCTCTTCCTGGAACACACATTCACAACTACCTTAGGTAGATCC 1860

131419522 TTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTC 131419581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTGTACTTGCCGAATCCTCTGCCTGGAATGTTCTTCCCTCGGTTTCATGCAAGACTTTC 1920

131419582 TTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTC 131419641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTCTCCTTCAGGTTTTTCTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGACATGGAATCTTACTC 1980

131419642 TGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGG 131419701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACGATCTCAGCTCATTGCAACCTCCATCTCCTGG 2040

131419702 GTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACC 131419761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTTCCAGAGATTCTCCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGTGCTCACCACC 2100

131419762 ATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG 131419821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACCATGTTGGCCAGGCTG 2160

131419822 GTATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 131419881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTATCGAACTCCTGACCACAAGTGATCCTCCTGCTTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA 2220

131419882 CAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAG 131419941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAGGTGTGAGCCACCATGCCTGGCCTCCTTCAGGTCTTTATTAAAATGTTATCTCCTCAG 2280

131419942 AGAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTT 131420001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGAAGACTTCTCTCACCACCCTATCTAACATAGCGTAACCATTCTTCCTTACTCTGCCTT 2340

131420002 CTCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTT 131420061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTCTGCTTTATTATTTTTTCTCGGATGTTTCTTGGATATATCACTCTATATAGTTTAGTT 2400

131420062 GTTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAGTCTGTAAAATA 131420121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2401 GTTTACCTTTTTAACTGTCCCCACTAGAATAAGAGTCCTTAATACCTAATCTGTAAAATA 2460

131420122 GTGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGA 131420181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTGCATAGGATATAGCAGTCATTTGATAAATAAATACATACATGTCAAACCAACAAATGA 2520

131420182 ATGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACA 131420241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATGATTGGAGAGCCACAATGTAGCTCAACTGTGTATTTATCCATATGCCTATGGGACACA 2580

131420242 TATTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATAC 131420301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TATTCCTTTTTCTTAATATTTCCTTTTCTATTTTTGTTTTAATTTTAAGCTCTGGGATAC 2640

131420302 ATGTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCAC 131420361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGTGAAGAACGAACAGGTTTGTTACATAGGTATACCTGTGCCATGGTGGTTTGCTGCAC 2700

131420362 CTTTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTG 131420421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTTTTGACCTGTCCTCTTAGTTTCCTTCCCTCACCCCCCAACCCCTAACAGGCCCTGGTG 2760

131420422 TGTATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTATTCAACTCCCACTTATGAGTGA 131420481
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2761 TGTATTATTCACCTACCTGTGTCCATGTATTCTCATTGTTCAACTCCCACTTATGAGTGA 2820

131420482 GAACATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAG 131420541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAACATGCGGTGTTTGGTTTTCTGTTCCTGTGTTAGTTTGCTGAGGATGATGGCTTCTAG 2880

131420542 CTTCATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTT 131420601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTTCATCTGTGTCCCTGCAAAGGGCATGAACTCATCCTTTTTTATGGCTGCATAGTATTT 2940

131420602 CGTGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTG 131420661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CGTGGTGTATATGTGCCACATTTTCTTTATCCAGTCTATCATTGATGGGCAGTTGGGTTG 3000

131420662 GTTCCATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTT 131420721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTTCCATGACTTTGCTATTGTAAATAGTGCTACAATAAACATATGTGTGCATGTGTCTTT 3060

131420722 ATAGTAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACA 131420781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATAGTAGAATGATTTATATTCCTTTTGGTATATAACCAGTAATGGGATTGCTGGGTCACA 3120

131420782 TCATATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAAC 131420841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCATATTTCTGGTTCAAGATCCTTGAGGAATCACCATACTGTCTTCCATAATGGTTGAAC 3180

131420842 TAATTTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGT 131420901
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TAACTTACATTCCCAATAGTGTAAAAGCATTCCTATTTCAGCCTCCCTAGCATCTATTGT 3240

131420902 TTCTTGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTT 131420961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTCTTGACTTTTTAATAATTGCCATTCTGACTGGCATGAGATGGTATCTCATTATGGTTT 3300

131420962 TCAGTAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCA 131421021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TCAGTAGCATTTCTCTAATGATCAGTGATGTTGAGCTTTTTTTCATATGTTTGTTGGCCA 3360

131421022 CATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGT 131421081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CATAAATGTCTTCTTTTGAGAAGTGTTTGTTCATATCCTTTGCCCACTTTTTGATGCGGT 3420

131421082 TGTTTGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTT 131421141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TGTTTGCTTTTTTCTTGTAAATTTGTTTAAGTTCCTCGTAAATTCTGGATATTAGACCTT 3480

131421142 TGTCAGATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGA 131421201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TGTCAGATGGGTAGATTGCCAAAATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGCCTGTTCTCCCTGA 3540

131421202 TGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTT 131421261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGATAGTTTCTTTTGCTGTGCAGAAGCTCTTTAGTTTAACTAGACTCCATTTGTCCGTTT 3600

131421262 TTACTTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGT 131421321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTACTTTTGTTGCAATTGCTTTTGGCATTTTTGTCATGAAGTCTTTGCCCATGCCTATGT 3660

131421322 CCTGAATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTA 131421381
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GCTGAATGAAATTGCCTAGGTTTTCTTCTAGGGGTTTTATGGTTTTGGGTTTTACATTTA 3720

131421382 AGTCTTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTA 131421441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AGTCTTTAATCCATCCTCAGTTAATTTTTGTATAAGGTGTAAGGAACGGGTCCAGTTTTA 3780

131421442 GTTTTGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTT 131421501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GTTTTGTGCATATGGCTAGCCAGTTTTCCCAGGACTATTTATTGAATAGGAAATCCTTTT 3840

131421502 CCCATTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTA 131421561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CCCATTGCTTGTTTTTGTCAGGTTTGTTGAAGATCAGATAGCTGTAGATGTGTGGTGTTA 3900

131421562 TTTCTGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATG 131421621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTTCTGAGGTCTCTGTTCTGTTCCATTTGTCTATATGTCTGTTTTGGTACCAGTACCATG 3960

131421622 CTGTTTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGT 131421681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTGTTTTAGTTACTGTAGCCTGGTAGTATAGTCGAAGTCAGGTAGTGTGATGCCTCTGGT 4020

131421682 TTGTTCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAA 131421741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TTGTTCTTTTCGCTTAGGATTCTCTTGGCTATATGGGGTCTTCTTTGATTCCATATGAAA 4080

131421742 TTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACT 131421801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTTAAAGTAGTTTTTTCTAATTCTGTGAAGAATATCAAATATCTTGATGGGAATAGCACT 4140

131421802 GAATCTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCA 131421861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GAATCTATAAATTACTTTGGGCAGTATGGCCATTTTCACAATATTGATTCTTCCTATCCA 4200

131421862 TGAGGATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATC 131421921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGAGGATGGAATGTTTTTCCATTTGCTTATGCTACAGGACATATTTTCTTGGGCAACATC 4260

131421922 GCTTCTTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCA 131421981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GCTTCTTTGTGAAAATTGATTCTGATGTTCAACTATAGCCCATAGGAAAACACCTTCTCA 4320

131421982 AAATGTAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTC 131422041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AAATGTAGCCCTCTAACTATTGAAGATTCCCTAAGGAAGCAGGGAAGGAAAGGGAAGCTC 4380

131422042 CTAGAAGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAAGCAAGGTGCCAGTCTCTGACC 131422101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CTAGAAGTCCTCAGTCAAATTAGAAGGCAGGGAGGAAAAGCAAGGTGCCAGTCTCTGACC 4440

131422102 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACATATACACACAGTGAG 131422161
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||
     4441 ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACA--TATACACACAGTGAG 4498

131422162 GCCGCTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGATGGGATCCTCAACCACTTAGCA 131422221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 GCCGCTATTGGTAGGCAAGGAACAAAAATTGGGTAAGATGGGATCCTCAACCACTTAGCA 4558

131422222 CTTAGGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGAAGACAGAGTATTCATCACAAAAGTCTCTT 131422281
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4559 CTTAGGGATAAGGAAATTCCTTTCTGAATGATGACAGAGTATTCATCACAAAAGTCTCTT 4618

131422282 CACTTTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAAGGGAATTTCATCACAGGAGAG 131422341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4619 CACTTTGAGACAAGTTGTCGTTATGTGAGAGATGTGAAAGGGAATTTCATCACAGGAGAG 4678

131422342 CTGAAGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAACTTGAATGTTTTAGACAACTT 131422401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4679 CTGAAGGACTCCAGGACATTCTGTAAATGTCTTTATAAACTTGAATGTTTTAGACAACTT 4738

131422402 CTGTCTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATTTTTTTGTAACATAAAATCTCA 131422461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4739 CTGTCTCTTCTCTTTATTCATTCATTCAACTCTGAAATTTTTTTGTAACATAAAATCTCA 4798

131422462 TCTGCAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATCCCCATGTCCCTGAGAGTAAGA 131422521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4799 TCTGCAGGAGAGTTTAGTAAACATCTGGAGAAGAGCATCCCCATGTCCCTGAGAGTAAGA 4858

131422522 AGGTTAAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAATACCACTGAGTTGTAACTGAAAAG 131422581
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4859 AGGTTAAGAATTGTTGACATAAACGCCATCATGTAATACCATTGAGTTGTAACTGAAAAG 4918

131422582 CTGTTTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTTTTTCTCATTACATTCATTATA 131422641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 CTGTTTGCAAAGAAAACATTGAAATGATGAGTTACTCTTTTTCTCATTACATTCATTATA 4978

131422642 ATTTCTGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCATGTGAGAGAGAGGCAGAAAGAGAG 131422701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 ATTTCTGAGAATATGGTACCATGGAAAAAGACTTCATGTGAGAGAGAGGCAGAAAGAGAG 5038

131422702 AAATGAAGGTACAAGAAACAGATTAGGCTGGGTGCGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGC 131422761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 AAATGAAGGTACAAGAAACAGATTAGGCTGGGTGCGGTGGCTCAAGCCTGTAATCCCAGC 5098

131422762 ACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGCTAA 131422821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 ACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGCGGATCACGAGGTCAAGAGATTGAGACCATCCTGGCTAA 5158

131422822 CACGATGAAACCCCGACTCTACTAAAAATACAAAAATTTAGCCAGGCATGGTGGCGGGCG 131422881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 CACGATGAAACCCCGACTCTACTAAAAATACAAAAATTTAGCCAGGCATGGTGGCGGGCG 5218

131422882 CCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGTGG 131422941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 CCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGTGG 5278

131422942 AGCTTGCGCTGAGCAGAGATTGCGCCACCGCACTACAGTCTGGGAGACAGAGTGATACTC 131423001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 AGCTTGCGCTGAGCAGAGATTGCGCCACCGCACTACAGTCTGGGAGACAGAGTGATACTC 5338

131423002 CGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAGAAACAGATTAATCACGTTAATAGCAAGC 131423061
          ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 CGTCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAA--GAAAAGAAACAGATTAATCACGTTAATAGCAAGC 5396

131423062 AAAGAAAGAGAGGTATTATCCAAATTTGAAAGGAGTAAAATTTTGCATAAGTTGACAGTC 131423121
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 AAAGAAAGAGAGGCATTATCCAAATTTGAAAGGAGTAAAATTTTGCATAAGTTGACAGTC 5456

131423122 AGACAGGAAAAAGGGAGCTGGTAACAGTTAATCTACAGGAAGGCCTTTTCACCTAGAATT 131423181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 AGACAGGAAAAAGGGAGCTGGTAACAGTTAATCTACAGGAAGGCCTTTTCACCTAGAATT 5516

131423182 ATCTTAAAACATGCAGTCCTTACTGCCACTAAAAGACTAATTATGTGATTTCCTTCAATC 131423241
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     5517 ATCTTAAAACATGCAGTCCTTACTGCCACTAAAAGACTAATTATGTGATTTTCTTCAATC 5576

131423242 TGAACAAATCCTTTTTTATACTGCTCTTTATGGCAGACTATAGTGTGAGTCAGAAATTCC 131423301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 TGAACAAATCCTTTTTTATACTGCTCTTTATGGCAGACTATAGTGTGAGTCAGAAATTCC 5636

131423302 AAAAGCATGATAATCTCCATCCTTTACAGCACCTGTCCCAACGTTATGTTAATCATTAGT 131423361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 AAAAGCATGATAATCTCCATCCTTTACAGCACCTGTCCCAACGTTATGTTAATCATTAGT 5696

131423362 TGATAATCTTTAAAGCTGAGGGCTACACACCCTCTACTATTGTATCTACAACTCTGGAGT 131423421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 TGATAATCTTTAAAGCTGAGGGCTACACACCCTCTACTATTGTATCTACAACTCTGGAGT 5756

131423422 TATGATACCAGATTAAGTTGATCAGATCATCATTACTTTTATTATTTTCAAACATTAATT 131423481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 TATGATACCAGATTAAGTTGATCAGATCATCATTACTTTTATTATTTTCAAACATTAATT 5816

131423482 TCGATGTCAAAAAATTTAGAAAAGTAAATTCCAAACCGAAAGCACTGTTTTTTTTTCTTT 131423541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 TCGATGTCAAAAAATTTAGAAAAGTAAATTCCAAACCGAAAGCACTGTTTTTTTTTCTTT 5876

131423542 TAAAGGGCTTAAACATACTTACTGTTATTTAAATATTTATCACACTGAAAAATGTCCTGC 131423601
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 TAAAGGGCTTAAACATACTTACTGATATTTAAATATTTATCACACTGAAAAATGTCCTGC 5936

131423602 AAGTACATCGTTTTATAGTGACTTCAGACTGATGATACATTCCAAAAACATTCATTAAAT 131423661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 AAGTACATCGTTTTATAGTGACTTCAGACTGATGATACATTCCAAAAACATTCATTAAAT 5996

131423662 GAGGTTTCTCTTTCACTGTTACCAACTTACCTTTTACTCTCAGTGGTATGATAACCCTCA 131423721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 GAGGTTTCTCTTTCACTGTTACCAACTTACCTTTTACTCTCAGTGGTATGATAACCCTCA 6056

131423722 GAACTACAGAACAGCTTCAATCTTCGTTCAGAACTATCATACCTGAAAAGAGGAGGTTTT 131423781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 GAACTACAGAACAGCTTCAATCTTCGTTCAGAACTATCATACCTGAAAAGAGGAGGTTTT 6116

131423782 GTTTTATTGTGGTAAAATATACATAAAATAAAATTTACCATTCTAACTGTACAATTCAGT 131423841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 GTTTTATTGTGGTAAAATATACATAAAATAAAATTTACCATTCTAACTGTACAATTCAGT 6176

131423842 GGCATTAAGTATTAGGTTGGTGCCAAGGTAATTGTGGATTTTGCCATTGAAAGTAATGTA 131423901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 GGCATTAAGTATTAGGTTGGTGCCAAGGTAATTGTGGATTTTGCCATTGAAAGTAATGTA 6236

131423902 ATACTTTCTGCTATTTTTCTATCATCACTAACAGAAACTCTGTACTCACTAAACACCAAC 131423961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 ATACTTTCTGCTATTTTTCTATCATCACTAACAGAAACTCTGTACTCACTAAACACCAAC 6296

131423962 TGTCCATTATCCCATCCACTCCCTATTACCCACCAGCTCCTGGTAACCTCTAATCTACTT 131424021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 TGTCCATTATCCCATCCACTCCCTATTACCCACCAGCTCCTGGTAACCTCTAATCTACTT 6356

131424022 TCTGTTTCTATGAATTTGCCTATTCCGGGTACCTCATATAAGTGGAGTGGAATCATACAA 131424081
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 TCTGTTTCTGTGAATTTGCCTATTCCGGGTACCTCATATAAGTGGAGTGGAATCATACAA 6416

131424082 TATTTGTCCTTTTGTATCTGGCTTATTTCGCTCAGCACAATGTTTCAAGGTTGATGAATG 131424141
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 TATTTGTCCTTTTGTATCTGGCTTATTTCACTCAGCACAATGTTTCAAGGTTGATGAATG 6476

131424142 CTGTAGATGTATCAGAATTTCCTTCTGTTTTAAGGTTGAGCAATATTCTATTGTATGTAT 131424201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 CTGTAGATGTATCAGAATTTCCTTCTGTTTTAAGGTTGAGCAATATTCTATTGTATGTAT 6536

131424202 GTACTACATTTTGGTTATCCTTTCATCCATCGATGGACATTTGGATTTCTCCCACCTTCT 131424261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 GTACTACATTTTGGTTATCCTTTCATCCATCGATGGACATTTGGATTTCTCCCACCTTCT 6596

131424262 GGTTACTGTACAAAATGCTTCACTGAACATTGGTGTACAATGTTTTTTTTTCAATGTTAT 131424321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 GGTTACTGTACAAAATGCTTCACTGAACATTGGTGTACAATGTTTTTTTTTCAATGTTAT 6656

131424322 CGTACTTACTTTCTCCTGAGTGATTGGAAGAACTTTTACAATTAACCGTTGCCTGGACTC 131424381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 CGTACTTACTTTCTCCTGAGTGATTGGAAGAACTTTTACAATTAACCGTTGCCTGGACTC 6716

131424382 TTGATAAATCCAGCCCCAAATTACTTAAGAGTATTTAGTAAGTCATTTTCAAAGGTCACT 131424441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 TTGATAAATCCAGCCCCAAATTACTTAAGAGTATTTAGTAAGTCATTTTCAAAGGTCACT 6776

131424442 GTTTGTCAAGTAGGAAAACTCGCAGTGAGCAGTGAGCAGTTTGTATAGGCCCACACAGGG 131424501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 GTTTGTCAAGTAGGAAAACTCGCAGTGAGCAGTGAGCAGTTTGTATAGGCCCACACAGGG 6836

131424502 CAGTGACCTATATTCTGAGCCTGCACGTTAGAATTAAAACCTTCTGAGTCTTCAATCCCT 131424561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 CAGTGACCTATATTCTGAGCCTGCACGTTAGAATTAAAACCTTCTGAGTCTTCAATCCCT 6896

131424562 GCACCAGAACAACTATATCAGACTTTGGATGTGGGATCAGACCTTGTTATTTTTCCAAAC 131424621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 GCACCAGAACAACTATATCAGACTTTGGATGTGGGATCAGACCTTGTTATTTTTCCAAAC 6956

131424622 CTCCCCTGCTGATTCTGTTATGCAGCCAGGATCTAGAACCTCTGACGTGGGCAAATGTGG 131424681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 CTCCCCTGCTGATTCTGTTATGCAGCCAGGATCTAGAACCTCTGACGTGGGCAAATGTGG 7016

131424682 TATCAGTCATCAGAGCTGCAAGTAAAACCACTGAGGCCCTCAGAGAACTAAGAGGGAATC 131424741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 TATCAGTCATCAGAGCTGCAAGTAAAACCACTGAGGCCCTCAGAGAACTAAGAGGGAATC 7076

131424742 TTTTTTACAGCCTGTATTGTACATATAATATTAGCGTGGCTAACCTATAATTGGCCATAT 131424801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 TTTTTTACAGCCTGTATTGTACATATAATATTAGCGTGGCTAACCTATAATTGGCCATAT 7136

131424802 GTTCAATAATTAATTGAACATATAATTGATAATTGGTAATATCACTGAGATTGTCCAAGG 131424861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 GTTCAATAATTAATTGAACATATAATTGATAATTGGTAATATCACTGAGATTGTCCAAGG 7196

131424862 ATATAACTAAAGGGATTCATTTCCCTGATTATGACTACCAACACCAAGATTGGATCAGAG 131424921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 ATATAACTAAAGGGATTCATTTCCCTGATTATGACTACCAACACCAAGATTGGATCAGAG 7256

131424922 CACTAAAGGATGCATAGTGGCTCCTGAGGCTGGATATTTGAGCCAGTAAAAACAAGAGAG 131424981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 CACTAAAGGATGCATAGTGGCTCCTGAGGCTGGATATTTGAGCCAGTAAAAACAAGAGAG 7316

131424982 TAATTCCCCACGGTAAAGGTGAATGTCGTACACTATGTTATGGGCTGAATGTTTGCGTCC 131425041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7317 TAATTCCCCACGGTAAAGGTGAATGTCGTACACTATGTTATGGGCTGAATGTTTGCGTCC 7376

131425042 TCCAGTATGGTGAAGCTTGAATCCCCAATGTCATAGTACTGGAGATGGGGCCTTAGAGAG 131425101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 TCCAGTATGGTGAAGCTTGAATCCCCAATGTCATAGTACTGGAGATGGGGCCTTAGAGAG 7436

131425102 GTAATTAGAGTTAGATGAGTTTATGGGAGTTGGGCCCTGGTCCAATGAGATGAATGCCCT 131425161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 GTAATTAGAGTTAGATGAGTTTATGGGAGTTGGGCCCTGGTCCAATGAGATGAATGCCCT 7496

131425162 TACTAGAAAAGATACCAGAGGACTTCCTCTCTTCTCAGTGTCTCTGAGGAAAGGCCATGT 131425221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 TACTAGAAAAGATACCAGAGGACTTCCTCTCTTCTCAGTGTCTCTGAGGAAAGGCCATGT 7556

131425222 GAGGGCACAGCAACACTGCAGCTGTCTACAAGCCAGAAAGAAGACCTTTACTAGGAACCA 131425281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7557 GAGGGCACAGCAACACTGCAGCTGTCTACAAGCCAGAAAGAAGACCTTTACTAGGAACCA 7616

131425282 GCCCTATTGGACCTTGATCTACAACTCCTGCCTTCATAATGACAAGAATCTAAATTTCTG 131425341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7617 GCCCTATTGGACCTTGATCTACAACTCCTGCCTTCATAATGACAAGAATCTAAATTTCTG 7676

131425342 TTGTTTAAGCCACCTATGATCCTTTGTTACGGCAGTCTGAGCAGACTAAGACACTCTGGA 131425401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7677 TTGTTTAAGCCACCTATGATCCTTTGTTACGGCAGTCTGAGCAGACTAAGACACTCTGGA 7736

131425402 TACCTGTGATATAATAAGAAGTACATACTTAGTTTAGACCCCAGTTACTGACACAGAAT 131425460
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7737 TACCTGTGATATAATAAGAAGTACATACTTAGTTTAGACCCCAGTTACTGACACAGAAT 7795

EXCISED REGION

131425461 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACAGGGTCTCACTCTGTAGCCCAGGCTGGAAT 131425520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7814 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGACAGGGTCTCACTCTGTAGCCCAGGCTGGAAT 7873

131425521 GCAGTGACGCGATCATGGCTCACTGCAGTCTCCACCTCCTGGGCTCAAATGACCTTTCCG 131425580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7874 GCAGTGACGCGATCATGGCTCACTGCAGTCTCCACCTCCTGGGCTCAAATGACCTTTCCG 7933

131425581 CCTAAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTA 131425640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7934 CCTAAGCCTCCTGAATAGCTGGGACCACAGGTGTGTGCCACCATGCCCAGCTAATTTTTA 7993

131425641 AATTTTTTGTGGAGAATAGTTCTTGCTTTGCTGTCCAGACTGGCTTGAATCCCTGGGCTC 131425700
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7994 AATTTTTTGTGGAGAACAGTTCTTGCTTTGCTGTCCAGACTGGCTTGAATCCCTGGGCTC 8053

131425701 AAGCAATCCTCCCACCTTGACCTACAAAAGTGCTAGGATTACAGACGTGAGCTACTGCAC 131425760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8054 AAGCAATCCTCCCACCTTGACCTACAAAAGTGCTAGGATTACAGACGTGAGCTACTGCAC 8113

131425761 CCAGTCCTTGTTGGGCCCCTAGATAGCTTTAGGATGGGAGCTGGTTGCCAGAGGAATTAA 131425820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8114 CCAGTCCTTGTTGGGCCCCTAGATAGCTTTAGGATGGGAGCTGGTTGCCAGAGGAATTAA 8173

131425821 CCATGTGATTAAAGGGTTGGAAATTTCAGCCCCATTCCTAGATCTCTGAGGAGGGGAGAG 131425880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8174 CCATGTGATTAAAGGGTTGGAAATTTCAGCCCCATTCCTAGATCTCTGAGGAGGGGAGAG 8233

131425881 GGGCTGGAGATTGAGTTCAATTACCAATGGCCAAAATTTAATCAATCATGCCTACATGAT 131425940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8234 GGGCTGGAGATTGAGTTCAATTACCAATGGCCAAAATTTAATCAATCATGCCTACATGAT 8293

131425941 GGAACCTCCATAAAACCCCTAAACAATACGATTCAGACAGTTTCAGGGTTGTAGAACACA 131426000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8294 GGAACCTCCATAAAACCCCTAAACAATACGATTCAGACAGTTTCAGGGTTGTAGAACACA 8353

131426001 TCTACATGCTGAGAGGGAGGCACACCCCAATTCCACGGGGACAGAAGTTCCTGTGCTCAG 131426060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8354 TCTACATGCTGAGAGGGAGGCACACCCCAATTCCACGGGGACAGAAGTTCCTGTGCTCAG 8413

131426061 GACTCTTCAAGATCTCTCCCTGTGTATCTCCTCAGCTGCCTGTTCATTTCTCTCCTTTAG 131426120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8414 GACTCTTCAAGATCTCTCCCTGTGTATCTCCTCAGCTGCCTGTTCATTTCTCTCCTTTAG 8473

131426121 TAATTAGCAGTGATAATAAATAAAGTCTTTTCCCAAGTTTTATCAACCATTCTAGCAAAT 131426180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8474 TAATTAGCAGTGATAATAAATAAAGTCTTTTCCCAAGTTTTATCAACCATTCTAGCAAAT 8533

131426181 TATAAAACCTGAGGAAGGGGTCATAGGAACCTGTGATTAATAGTCAGTTGGTCAGAAGTA 131426240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8534 TATAAAACCTGAGGAAGGGGTCATAGGAACCTGTGATTAATAGTCAGTTGGTCAGAAGTA 8593

131426241 CTGATGGAAGCAAGATACTTGCAACTGGCATCTGAAACGAAGGCAGTTTTGTGGGAGTGA 131426300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8594 CTGATGGAAGCAAGATACTTGCAACTGGCATCTGAAACGAAGGCAGTTTTGTGGGAGTGA 8653

131426301 GTCTGCGGAATCTGACACGACTCCAGTTAGTTACTGTAGGAATTGAATTCAATTGTAGGA 131426360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8654 GTCTGCGGAATCTGACACGACTCCAGTTAGTTACTGTAGGAATTGAATTCAATTGTAGGA 8713

131426361 TACCCAGTTGGTATCTGGAAGGTTGGAGAACTGGTTGTTGGCATGGAAACAACCCACACA 131426420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8714 TACCCAGTTGGTATCTGGAAGGTTGGAGAACTGGTTGTTGGCATGGAAACAACCCACACA 8773

131426421 TTTGGTGCCAAAAGTATTATGAGTAAAAACAGCTTGGAATATTAAACTGACCCTCAAAGG 131426480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8774 TTTGGTGCCAAAAGTATTATGAGTAAAAACAGCTTGGAATATTAAACTGACCCTCAAAGG 8833

131426481 AAAAAAAAAGCCAATAAAAGGATGCTATCTTGCCAGGACCTTCCAAGGAGCCTCAGAATT 131426540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8834 AAAAAAAAAGCCAATAAAAGGATGCTATCTTGCCAGGACCTTCCAAGGAGCCTCAGAATT 8893

131426541 GTCTGTTAAGGGAAGGAAAAGGGGAACATTTGATTGACTCACTATCTCCTGTCCCAACCA 131426600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     8894 GTCTGTTAAGGGAAGGAAAAGGGGAACATTTGATCGACTCACTATCTCCTGTCCCAACCA 8953

131426601 GGCAAGGGGACTGTCCATGGGGCACTGATTCCCTCACACTTCCAGTGTGCACTCGCTTGA 131426660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8954 GGCAAGGGGACTGTCCATGGGGCACTGATTCCCTCACACTTCCAGTGTGCACTCGCTTGA 9013

131426661 ATGCCAGGTAGGTCTCTGCAGACATCCCACCTTATGCTATCCCAGGATAGGATAGTCCCA 131426720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9014 ATGCCAGGTAGGTCTCTGCAGACATCCCACCTTATGCTATCCCAGGATAGGATAGTCCCA 9073

131426721 GGATAAAACATGAGAGTTAAACAGTTCAACTGGACCGAGCTCGATGGCTCACGCCTGTAA 131426780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9074 GGATAAAACATGAGAGTTAAACAGTTCAACTGGACCGAGCTCGATGGCTCACGCCTGTAA 9133

131426781 TCCCAACACTTTGGGAGGTTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAA 131426840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9134 TCCCAACACTTTGGGAGGTTGAGGTGGGAGGATCACTTGAGGCCAGGAGTTCAAGACCAA 9193

131426841 GCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAACAACAACAACAACAAAAACAAAAAC 131426900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9194 GCTGGGCAACATAGCGAGACCCTGTCTCTACAAAACAACAACAACAACAAAAACAAAAAC 9253

131426901 AAACAAACAAACAAGAAAACCCAAAAACTAACTGGATGTGGTGGTGGTGCACGCTTGCAG 131426960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9254 AAACAAACAAACAAGAAAACCCAAAAACTAACTGGATGTGGTGGTGGTGCACGCTTGCAG 9313

131426961 TCTTAGCTACTCTGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGGCTGAGGTTGC 131427020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9314 TCTTAGCTACTCTGGAGGCTGAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCCAGGAGGCTGAGGTTGC 9373

131427021 AGACAGCCATGGTGGCACCATTGCCCTCCAGCCTGGGCAAGAGAGTGAGACCCTGTCTCA 131427080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9374 AGACAGCCATGGTGGCACCATTGCCCTCCAGCCTGGGCAAGAGAGTGAGACCCTGTCTCA 9433

131427081 AAAATAAAAAGCAATAATAAATAAATAAATAAAACTGAGGAAAGTTGTTCTTGGGTGATA 131427140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9434 AAAATAAAAAGCAATAATAAATAAATAAATAAAACTGAGGAAAGTTGTTCTTGGGTGATA 9493

131427141 AGACATGAAGCTGTTTCCAACAGGAGTAATAACTAAACTAAAGACAGGCAAAAGGATGTG 131427200
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     9494 AGACATGAAGCTGTTTCCAACAGGAGTAATAACTAGACTAAAGACAGGCAAAAGGATGTG 9553

131427201 AGGCCAGGCACAGGAGATGGTCAACGTGGGGAGCTTCTAGAGACTCCAATCAGGTCTGTG 131427260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9554 AGGCCAGGCACAGGAGATGGTCAACGTGGGGAGCTTCTAGAGACTCCAATCAGGTCTGTG 9613

131427261 AGTTCCAGTCCCCACTCCTAGCTCTAGTCACAGTCTTCACTTGAACACCCTACCTCCATT 131427320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9614 AGTTCCAGTCCCCACTCCTAGCTCTAGTCACAGTCTTCACTTGAACACCCTACCTCCATT 9673

131427321 CTAAACCTTGATGGCTAGAGTTTGATTTTATTAAGAGAGCTTATCAAGAGGTTTCTTGTA 131427380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9674 CTAAACCTTGATGGCTAGAGTTTGATTTTATTAAGAGAGCTTATCAAGAGGTTTCTTGTA 9733

131427381 ATATACCATTTCTCCTTTGTCTACCATACTTTCTGCAAGTAACACATAGTTTTGGAAATT 131427440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9734 ATATACCATTTCTCCTTTGTCTACCATACTTTCTGCAAGTAACACATAGTTTTGGAAATT 9793

131427441 CAGGTCAGTTATTTAAAAAACAAAAATAGTAGCTAAGTACAGAGGGTTGTGTGGGAAGCA 131427500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9794 CAGGTCAGTTATTTAAAAAACAAAAATAGTAGCTAAGTACAGAGGGTTGTGTGGGAAGCA 9853

131427501 CTTCAACTTCCAGACAACATAAGGCTAAGCGCTGTGACACATTTGAAAATAAGTCCTTAT 131427560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9854 CTTCAACTTCCAGACAACATAAGGCTAAGCGCTGTGACACATTTGAAAATAAGTCCTTAT 9913

131427561 TTTTTATCTTTTAGAATGCAGTCATTTGGAGTCCTTCTCTACCGATGGCTGAAATTACTC 131427620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9914 TTTTTATCTTTTAGAATGCAGTCATTTGGAGTCCTTCTCTACCGATGGCTGAAATTACTC 9973

131427621 ATCTAAGGAGAGCCAAATCTGCTCCATCCAGAAATGAAACCCACATAACACTTTATCATC 131427680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9974 ATCTAAGGAGAGCCAAATCTGCTCCATCCAGAAATGAAACCCACATAACACTTTATCATC 10033

131427681 TTTCAGACTCTTGACATTAACATATTTTAAATATTTACCTTTTAGTTTTATATTTATTTT 131427740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10034 TTTCAGACTCTTGACATTAACATATTTTAAATATTTACCTTTTAGTTTTATATTTATTTT 10093

131427741 GACATTTTATTATATTGCCTGCATGTCCTTTCTGTTCATCTACAACTATATTTTCTTTTT 131427800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10094 GACATTTTATTATATTGCCTGCATGTCCTTTCTGTTCATCTACAACTATATTTTCTTTTT 10153

131427801 TCCTTAGATCAGGGATTAGCAAATGATGATCCACTGCCTTGTTTTTGTATGATTTGCAAG 131427860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10154 TCCTTAGATCAGGGATTAGCAAATGATGATCCACTGCCTTGTTTTTGTATGATTTGCAAG 10213

131427861 ATGAGAATGG 131427870
          ||||||||||
    10214 ATGAGAATGG 10223

Alignment time is 7.52981 s

