
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    4466] =>      4466 nucs 'mol-32-1e66-086385_4466'

Score:        4466
Aligned:      4466        nucs
Identic:      4466 (100%) nucs =>      3279 (100%)      1187 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86113397,86116675] EXCISED REGION [86116677,86117863]
 second seq =>  [       1,    3279] EXCISED REGION [    3280,    4466]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [86116676,86116676]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [86116676,86116693] to [86116677,86116694]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 86113397 GTTGATTCCAAGTAAATATTGTATGACAGATCTCCAAAGCTTATTCATCTTATTTAACTG 86113456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGATTCCAAGTAAATATTGTATGACAGATCTCCAAAGCTTATTCATCTTATTTAACTG 60

 86113457 AAATTTTGTGCCTGTTGATTAATAACTCATTTCTCTCTCCCTCTGTAGTTCTTGGTAACA 86113516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATTTTGTGCCTGTTGATTAATAACTCATTTCTCTCTCCCTCTGTAGTTCTTGGTAACA 120

 86113517 ACCATTCCAGTCCTTGATGTTATTAATTTCACTATTTTGGAAGGAATTGAAACTCTATCA 86113576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCATTCCAGTCCTTGATGTTATTAATTTCACTATTTTGGAAGGAATTGAAACTCTATCA 180

 86113577 CCCCCCTCCCCTTTCCCTCCAATAGTAAGGCTTTCACTGTTTGTTTTTATTGGGAAGTGA 86113636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCCCCTCCCCTTTCCCTCCAATAGTAAGGCTTTCACTGTTTGTTTTTATTGGGAAGTGA 240

 86113637 GTTATTTCTTTTGTCCTGGTTTTCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGACTAAATTAC 86113696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTATTTCTTTTGTCCTGGTTTTCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGACTAAATTAC 300

 86113697 AAATTCTATTAAAGAAAAGATGAATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCCTCCATGAT 86113756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATTCTATTAAAGAAAAGATGAATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCCTCCATGAT 360

 86113757 GTTTTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTA 86113816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTTTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTA 420

 86113817 AATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATT 86113876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATT 480

 86113877 CCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAA 86113936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAA 540

 86113937 TCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAGA 86113996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAGA 600

 86113997 TGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTTAA 86114056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTTAA 660

 86114057 ATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTT 86114116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTT 720

 86114117 GTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTT 86114176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTT 780

 86114177 TATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAAT 86114236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAAT 840

 86114237 AGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAG 86114296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAG 900

 86114297 ATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAAC 86114356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAAC 960

 86114357 CAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGAT 86114416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGAT 1020

 86114417 TTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCT 86114476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCT 1080

 86114477 TTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCAC 86114536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCAC 1140

 86114537 TAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTT 86114596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTT 1200

 86114597 TAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAA 86114656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAA 1260

 86114657 ATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCC 86114716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCC 1320

 86114717 ACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGT 86114776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGT 1380

 86114777 AGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTT 86114836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTT 1440

 86114837 AATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAAT 86114896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAAT 1500

 86114897 ATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATT 86114956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATT 1560

 86114957 GCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAA 86115016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAA 1620

 86115017 ATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGT 86115076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGT 1680

 86115077 GCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTT 86115136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTT 1740

 86115137 TAAAATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACATG 86115196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAAAATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACATG 1800

 86115197 TAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGA 86115256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGA 1860

 86115257 AGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAG 86115316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAG 1920

 86115317 TGCAGACAGCCTAATGCAAGCATGCCTAGGTGCAACCCTCGCCCTGCTCCTTATTAGCTT 86115376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGCAGACAGCCTAATGCAAGCATGCCTAGGTGCAACCCTCGCCCTGCTCCTTATTAGCTT 1980

 86115377 GGTGATGTTAGACAACATACCACCCTGTGCTCATTCTTCAATTTTTAATAAATACTACTT 86115436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGTGATGTTAGACAACATACCACCCTGTGCTCATTCTTCAATTTTTAATAAATACTACTT 2040

 86115437 TTCTTATGGAGTAGTTATAAGAATTAAATGATTAAATGGCAATAGTAAGCACTTTAGGAA 86115496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTCTTATGGAGTAGTTATAAGAATTAAATGATTAAATGGCAATAGTAAGCACTTTAGGAA 2100

 86115497 AGAAAGCAAGTGAAGTATTTTTATTAGTAGAGTTGCATGAAAATATAATTTCTTAAGAAA 86115556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGAAAGCAAGTGAAGTATTTTTATTAGTAGAGTTGCATGAAAATATAATTTCTTAAGAAA 2160

 86115557 TATTACAGAATCTTCTTTCAGAATAAAATAAGACAAAAATAAAGGGATCTATCACACCTG 86115616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TATTACAGAATCTTCTTTCAGAATAAAATAAGACAAAAATAAAGGGATCTATCACACCTG 2220

 86115617 AAATTATAATAGTAAAGTTTACCCTTAAGACTCTACATAAAATTATTTGTACGTATGGTT 86115676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAATTATAATAGTAAAGTTTACCCTTAAGACTCTACATAAAATTATTTGTACGTATGGTT 2280

 86115677 AGTATATCAGTAAGTGGCTATTTTCTGGGAAATTTCCAGTTATTTATCATGCTGATTTCC 86115736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGTATATCAGTAAGTGGCTATTTTCTGGGAAATTTCCAGTTATTTATCATGCTGATTTCC 2340

 86115737 TTTGTTTCAAAGCATGTGAGTAAATCATTCTTTGAATTTCTACACACCTTTCTCTTAAAG 86115796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTGTTTCAAAGCATGTGAGTAAATCATTCTTTGAATTTCTACACACCTTTCTCTTAAAG 2400

 86115797 TTCTTAAAATTTTTTTAAACAAGCTCATTTATTCCCAACACATTGCTCACCAAATATAAC 86115856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTCTTAAAATTTTTTTAAACAAGCTCATTTATTCCCAACACATTGCTCACCAAATATAAC 2460

 86115857 TACCCACCCGTCCCCAAATCTTAACAGGGTTTCTTCTAAATGTCATCTACATTAATGCCA 86115916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TACCCACCCGTCCCCAAATCTTAACAGGGTTTCTTCTAAATGTCATCTACATTAATGCCA 2520

 86115917 TTTTACACTTCTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTCTAGCTCTGTC 86115976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTTACACTTCTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTCTAGCTCTGTC 2580

 86115977 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCCGCTCACTGCAAGCTCAGCCTCCCGGGTTC 86116036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCCGCTCACTGCAAGCTCAGCCTCCCGGGTTC 2640

 86116037 ACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGC 86116096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGC 2700

 86116097 CCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTGGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTC 86116156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTGGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTC 2760

 86116157 TTGTTCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 86116216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTGTTCTCCTGACCTCGTGATCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGC 2820

 86116217 GTGAGCCACCGCGCCTGGCCTACGCTTCTCTTTCTATGTAAAGTCATACATCACACAGTA 86116276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GTGAGCCACCGCGCCTGGCCTACGCTTCTCTTTCTATGTAAAGTCATACATCACACAGTA 2880

 86116277 CATAGAAACATGAGGTAACAACTTCTAGTTACTGCTTTTCACCATCAAGTAAGGCTGGAA 86116336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CATAGAAACATGAGGTAACAACTTCTAGTTACTGCTTTTCACCATCAAGTAAGGCTGGAA 2940

 86116337 ATGCAATTATTAGGTTGGGGCAAATGTAATTGCGGTTTTTGCATTTAAAAGTATTTGCGG 86116396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATGCAATTATTAGGTTGGGGCAAATGTAATTGCGGTTTTTGCATTTAAAAGTATTTGCGG 3000

 86116397 CCGGGCACGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATC 86116456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCGGGCACGGTGGCTCACGTCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATC 3060

 86116457 ACCTGAGGTCGCAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTGAA 86116516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACCTGAGGTCGCAGTTTGAGACCAGCCTGACCAACATGGAGAAACCCCATCTCTACTGAA 3120

 86116517 AATACAAACATAACCGGGCGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTG 86116576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATACAAACATAACCGGGCGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTG 3180

 86116577 AGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCCAAGATCGTGCCAT 86116636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGGGAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCCAAGATCGTGCCAT 3240

 86116637 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCGTCTC 86116675
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAAACTCCGTCTC 3279

EXCISED REGION

 86116677 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGTTTGCAAAAACCGCAATTACTTTAACACCAGCCTAATAC 86116736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3280 AAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGTTTGCAAAAACCGCAATTACTTTAACACCAGCCTAATAC 3339

 86116737 AATGCTCAAAGAATGTGTTAGCCAAAGGAGTGCCCAGGATTTTACTAGAAACCTGTGACT 86116796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3340 AATGCTCAAAGAATGTGTTAGCCAAAGGAGTGCCCAGGATTTTACTAGAAACCTGTGACT 3399

 86116797 AGACATTAGTTCCCCCCCCCCAGGAAGGTCATCTTTGACATGATACCAAAATGGAACATT 86116856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3400 AGACATTAGTTCCCCCCCCCCAGGAAGGTCATCTTTGACATGATACCAAAATGGAACATT 3459

 86116857 ATGGTTAAGAAATCAAATTCCCTGGTTATTAGAGAATTAAAACAAAAGAAAATATGAGTG 86116916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3460 ATGGTTAAGAAATCAAATTCCCTGGTTATTAGAGAATTAAAACAAAAGAAAATATGAGTG 3519

 86116917 ACTAATTTTTAAAGTTAAAATAAAAACATACTTCACAGAAAAATTCTACTGAAAGTGCAT 86116976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3520 ACTAATTTTTAAAGTTAAAATAAAAACATACTTCACAGAAAAATTCTACTGAAAGTGCAT 3579

 86116977 AAATTTTTAATTTGATATTCAGAGGACACTGGCATCTTTTAGTGGCAAGAGTCACAGTTG 86117036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3580 AAATTTTTAATTTGATATTCAGAGGACACTGGCATCTTTTAGTGGCAAGAGTCACAGTTG 3639

 86117037 TGTATAACTATTGTCAAAAAATCAGCAAAGAGTACAAAGTCTTTGTCTTATTCACACATG 86117096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3640 TGTATAACTATTGTCAAAAAATCAGCAAAGAGTACAAAGTCTTTGTCTTATTCACACATG 3699

 86117097 AAGTCTTGGAATGGAAGGGGGATTTTTCTCCTGTTCTCAATTGAAGTCATGGTTTTGTGT 86117156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3700 AAGTCTTGGAATGGAAGGGGGATTTTTCTCCTGTTCTCAATTGAAGTCATGGTTTTGTGT 3759

 86117157 TCACAGTGGTATCATGCACCTTCTTTGGAAACTGAGATTTAAGCTGAAGTTTGAGAGATG 86117216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3760 TCACAGTGGTATCATGCACCTTCTTTGGAAACTGAGATTTAAGCTGAAGTTTGAGAGATG 3819

 86117217 ATTAAGGACTATAAGATTAGTAATCTCTGATGAGGAGACACCTAATGTGGATCTCTGTAT 86117276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3820 ATTAAGGACTATAAGATTAGTAATCTCTGATGAGGAGACACCTAATGTGGATCTCTGTAT 3879

 86117277 CACATCCTCTTGCTCTCCATGAGCACTGCCAGTTTCTTGGTTTGGGTGCTCTTCATCTCT 86117336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3880 CACATCCTCTTGCTCTCCATGAGCACTGCCAGTTTCTTGGTTTGGGTGCTCTTCATCTCT 3939

 86117337 CATTTGGACTTTTTTTTCAAAGTCTTCTAAGCAATTTATTTGCCTCCAGTGATGTTCAGT 86117396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3940 CATTTGGACTTTTTTTTCAAAGTCTTCTAAGCAATTTATTTGCCTCCAGTGATGTTCAGT 3999

 86117397 CTCTGTCTATCTTCTAATTGTCATGAAAATTATTCTGAAATGCAAAAGATATTAATATCT 86117456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4000 CTCTGTCTATCTTCTAATTGTCATGAAAATTATTCTGAAATGCAAAAGATATTAATATCT 4059

 86117457 ATGCTTTAGAAAGAGCTTTTACAGATTAATTAAAAACTCTATAGGATAATAGGCAAATAA 86117516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4060 ATGCTTTAGAAAGAGCTTTTACAGATTAATTAAAAACTCTATAGGATAATAGGCAAATAA 4119

 86117517 TATTAATAGGAAACTGACAGATGAGTAATCCAAATAACCAATGCATATATATACAAAATG 86117576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4120 TATTAATAGGAAACTGACAGATGAGTAATCCAAATAACCAATGCATATATATACAAAATG 4179

 86117577 ATGCCCAATTCTAGTAGCAGTGAGGGGAAAAAAAGCAAATTAAAGGAATGTTAGGATCCA 86117636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4180 ATGCCCAATTCTAGTAGCAGTGAGGGGAAAAAAAGCAAATTAAAGGAATGTTAGGATCCA 4239

 86117637 TTTATCCCTTATAAGATTCACAAAAAGTGAAAAGAATGATACCTATAGGCTACAATCATA 86117696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4240 TTTATCCCTTATAAGATTCACAAAAAGTGAAAAGAATGATACCTATAGGCTACAATCATA 4299

 86117697 AGAGGAAAAGGTACTGTCATACATTTCTACTACAATACGAATTGCTGCAACCATTTCTAA 86117756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4300 AGAGGAAAAGGTACTGTCATACATTTCTACTACAATACGAATTGCTGCAACCATTTCTAA 4359

 86117757 AAAGAAATTTAGCGATATCTATTCAAATTAAAAGTGAACTTACAATTTAACACATAATTC 86117816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4360 AAAGAAATTTAGCGATATCTATTCAAATTAAAAGTGAACTTACAATTTAACACATAATTC 4419

 86117817 CCTCTCTTAAGAATCTTGTCTATGAATTACCACTGATGAATAAAGAT 86117863
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4420 CCTCTCTTAAGAATCTTGTCTATGAATTACCACTGATGAATAAAGAT 4466

Alignment time is 3.64024 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    2067] =>      2067 nucs 'mol-32-1f16-090224_2067'

Score:        2066
Aligned:      2066        nucs
Identic:      2066 (100%) nucs =>      1401 (100%)       665 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86113816,86115216] EXCISED REGION [86115218,86115882]
 second seq =>  [       1,    1401] EXCISED REGION [    1403,    2067]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [86115217,86115217]
 second seq =>         1 nucs [1402,1402]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1401,1404] to [1402,1405]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115216,86115216] to [86115218,86115218]
 second seq =>         1 nucs [1401,1401] to [1403,1403]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 86113816 AAATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTAT 86113875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTAT 60

 86113876 TCCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAA 86113935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAA 120

 86113936 ATCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAG 86113995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAG 180

 86113996 ATGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTTA 86114055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTTA 240

 86114056 AATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTT 86114115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTT 300

 86114116 TGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGT 86114175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGT 360

 86114176 TTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAA 86114235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAA 420

 86114236 TAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGA 86114295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGA 480

 86114296 GATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAA 86114355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAA 540

 86114356 CCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGA 86114415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGA 600

 86114416 TTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTC 86114475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTC 660

 86114476 TTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCA 86114535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCA 720

 86114536 CTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTT 86114595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTT 780

 86114596 TTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTA 86114655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTA 840

 86114656 AATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGC 86114715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGC 900

 86114716 CACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGG 86114775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGG 960

 86114776 TAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGT 86114835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGT 1020

 86114836 TAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAA 86114895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAA 1080

 86114896 TATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCAT 86114955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCAT 1140

 86114956 TGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACA 86115015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACA 1200

 86115016 AATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAG 86115075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAG 1260

 86115076 TGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATT 86115135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATT 1320

 86115136 TTAAAATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACAT 86115195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTAAAATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACAT 1380

 86115196 GTAATGCCTTTGCTGGTGGAC 86115216
          |||||||||||||||||||||
     1381 GTAATGCCTTTGCTGGTGGAC 1401

EXCISED REGION

 86115218 CCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCAGGAAT 86115277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 CCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCAGGAAT 1462

 86115278 GGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGC 86115337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 GGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGC 1522

 86115338 ATGCCTAGGTGCAACCCTCGCCCTGCTCCTTATTAGCTTGGTGATGTTAGACAACATACC 86115397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 ATGCCTAGGTGCAACCCTCGCCCTGCTCCTTATTAGCTTGGTGATGTTAGACAACATACC 1582

 86115398 ACCCTGTGCTCATTCTTCAATTTTTAATAAATACTACTTTTCTTATGGAGTAGTTATAAG 86115457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 ACCCTGTGCTCATTCTTCAATTTTTAATAAATACTACTTTTCTTATGGAGTAGTTATAAG 1642

 86115458 AATTAAATGATTAAATGGCAATAGTAAGCACTTTAGGAAAGAAAGCAAGTGAAGTATTTT 86115517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 AATTAAATGATTAAATGGCAATAGTAAGCACTTTAGGAAAGAAAGCAAGTGAAGTATTTT 1702

 86115518 TATTAGTAGAGTTGCATGAAAATATAATTTCTTAAGAAATATTACAGAATCTTCTTTCAG 86115577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 TATTAGTAGAGTTGCATGAAAATATAATTTCTTAAGAAATATTACAGAATCTTCTTTCAG 1762

 86115578 AATAAAATAAGACAAAAATAAAGGGATCTATCACACCTGAAATTATAATAGTAAAGTTTA 86115637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 AATAAAATAAGACAAAAATAAAGGGATCTATCACACCTGAAATTATAATAGTAAAGTTTA 1822

 86115638 CCCTTAAGACTCTACATAAAATTATTTGTACGTATGGTTAGTATATCAGTAAGTGGCTAT 86115697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 CCCTTAAGACTCTACATAAAATTATTTGTACGTATGGTTAGTATATCAGTAAGTGGCTAT 1882

 86115698 TTTCTGGGAAATTTCCAGTTATTTATCATGCTGATTTCCTTTGTTTCAAAGCATGTGAGT 86115757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 TTTCTGGGAAATTTCCAGTTATTTATCATGCTGATTTCCTTTGTTTCAAAGCATGTGAGT 1942

 86115758 AAATCATTCTTTGAATTTCTACACACCTTTCTCTTAAAGTTCTTAAAATTTTTTTAAACA 86115817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 AAATCATTCTTTGAATTTCTACACACCTTTCTCTTAAAGTTCTTAAAATTTTTTTAAACA 2002

 86115818 AGCTCATTTATTCCCAACACATTGCTCACCAAATATAACTACCCACCCGTCCCCAAATCT 86115877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 AGCTCATTTATTCCCAACACATTGCTCACCAAATATAACTACCCACCCGTCCCCAAATCT 2062

 86115878 TAACA 86115882
          |||||
     2063 TAACA 2067

Alignment time is 1.70017 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    3109] =>      3109 nucs 'mol-32-208c-102731_3109'

Score:        1614
Aligned:      1625        nucs
Identic:      1624 (100%) nucs =>      1609 (100%)        15 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86114028,86115637] EXCISED REGION [86117851,86117865]
 second seq =>  [       1,    1610] EXCISED REGION [    2971,    2985]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2213 nucs [86115638,86117850]
 second seq =>      1360 nucs [1611,2970]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 86114028 GGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACA 86114087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACA 60

 86114088 ACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGAT 86114147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGAT 120

 86114148 CTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTT 86114207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTT 180

 86114208 TTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCT 86114267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCT 240

 86114268 TAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGC 86114327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGC 300

 86114328 ATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAG 86114387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAG 360

 86114388 TGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCT 86114447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCT 420

 86114448 CAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATC 86114507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATC 480

 86114508 AACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTT 86114567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTT 540

 86114568 TCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATG 86114627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATG 600

 86114628 CCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAAC 86114687
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGGGTTTTAAATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAAC 660

 86114688 ATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTT 86114747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTT 720

 86114748 GTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGG 86114807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGG 780

 86114808 TAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGG 86114867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGG 840

 86114868 GAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAAT 86114927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAAT 900

 86114928 CATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCT 86114987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCT 960

 86114988 TTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGT 86115047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGT 1020

 86115048 ATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTA 86115107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTA 1080

 86115108 AATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTTTAAAATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTT 86115167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTTTAAAATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTT 1140

 86115168 ACATTACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGC 86115227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACATTACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGC 1200

 86115228 ATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCA 86115287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCA 1260

 86115288 CTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGCATGCCTAGGT 86115347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGCATGCCTAGGT 1320

 86115348 GCAACCCTCGCCCTGCTCCTTATTAGCTTGGTGATGTTAGACAACATACCACCCTGTGCT 86115407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCAACCCTCGCCCTGCTCCTTATTAGCTTGGTGATGTTAGACAACATACCACCCTGTGCT 1380

 86115408 CATTCTTCAATTTTTAATAAATACTACTTTTCTTATGGAGTAGTTATAAGAATTAAATGA 86115467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATTCTTCAATTTTTAATAAATACTACTTTTCTTATGGAGTAGTTATAAGAATTAAATGA 1440

 86115468 TTAAATGGCAATAGTAAGCACTTTAGGAAAGAAAGCAAGTGAAGTATTTTTATTAGTAGA 86115527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTAAATGGCAATAGTAAGCACTTTAGGAAAGAAAGCAAGTGAAGTATTTTTATTAGTAGA 1500

 86115528 GTTGCATGAAAATATAATTTCTTAAGAAATATTACAGAATCTTCTTTCAGAATAAAATAA 86115587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTTGCATGAAAATATAATTTCTTAAGAAATATTACAGAATCTTCTTTCAGAATAAAATAA 1560

 86115588 GACAAAAATAAAGGGATCTATCACACCTGAAATTATAATAGTAAAGTTTA 86115637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GACAAAAATAAAGGGATCTATCACACCTGAAATTATAATAGTAAAGTTTA 1610

EXCISED REGION

 86117851 GATGAATAAAGATAT 86117865
          |||||||||||||||
     2971 GATGAATAAAGATAT 2985

Alignment time is 2.54995 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    2468] =>      2468 nucs 'mol-32-20fa-030259_2468'

Score:        2457
Aligned:      2468        nucs
Identic:      2467 (100%) nucs =>       134 (100%)      2333 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86116542,86116675] EXCISED REGION [86116676,86119009]
 second seq =>  [       1,     134] EXCISED REGION [     136,    2468]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [135,135]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [86118628,86118628]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        19 nucs [135,153] to [136,154]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 86116542 GCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGG 86116601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCTGG 60

 86116602 GAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCCAAGATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAG 86116661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGGCAGAGGTTGCGGTGAGCCAAGATCGTGCCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAG 120

 86116662 CAAAACTCCGTCTC 86116675
          ||||||||||||||
      121 CAAAACTCCGTCTC 134

EXCISED REGION

 86116676 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGTTTGCAAAAACCGCAATTACTTTAACACCAGCCTAATA 86116735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      136 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTGTTTGCAAAAACCGCAATTACTTTAACACCAGCCTAATA 195

 86116736 CAATGCTCAAAGAATGTGTTAGCCAAAGGAGTGCCCAGGATTTTACTAGAAACCTGTGAC 86116795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      196 CAATGCTCAAAGAATGTGTTAGCCAAAGGAGTGCCCAGGATTTTACTAGAAACCTGTGAC 255

 86116796 TAGACATTAGTTCCCCCCCCCCAGGAAGGTCATCTTTGACATGATACCAAAATGGAACAT 86116855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      256 TAGACATTAGTTCCCCCCCCCCAGGAAGGTCATCTTTGACATGATACCAAAATGGAACAT 315

 86116856 TATGGTTAAGAAATCAAATTCCCTGGTTATTAGAGAATTAAAACAAAAGAAAATATGAGT 86116915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      316 TATGGTTAAGAAATCAAATTCCCTGGTTATTAGAGAATTAAAACAAAAGAAAATATGAGT 375

 86116916 GACTAATTTTTAAAGTTAAAATAAAAACATACTTCACAGAAAAATTCTACTGAAAGTGCA 86116975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      376 GACTAATTTTTAAAGTTAAAATAAAAACATACTTCACAGAAAAATTCTACTGAAAGTGCA 435

 86116976 TAAATTTTTAATTTGATATTCAGAGGACACTGGCATCTTTTAGTGGCAAGAGTCACAGTT 86117035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 TAAATTTTTAATTTGATATTCAGAGGACACTGGCATCTTTTAGTGGCAAGAGTCACAGTT 495

 86117036 GTGTATAACTATTGTCAAAAAATCAGCAAAGAGTACAAAGTCTTTGTCTTATTCACACAT 86117095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      496 GTGTATAACTATTGTCAAAAAATCAGCAAAGAGTACAAAGTCTTTGTCTTATTCACACAT 555

 86117096 GAAGTCTTGGAATGGAAGGGGGATTTTTCTCCTGTTCTCAATTGAAGTCATGGTTTTGTG 86117155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      556 GAAGTCTTGGAATGGAAGGGGGATTTTTCTCCTGTTCTCAATTGAAGTCATGGTTTTGTG 615

 86117156 TTCACAGTGGTATCATGCACCTTCTTTGGAAACTGAGATTTAAGCTGAAGTTTGAGAGAT 86117215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 TTCACAGTGGTATCATGCACCTTCTTTGGAAACTGAGATTTAAGCTGAAGTTTGAGAGAT 675

 86117216 GATTAAGGACTATAAGATTAGTAATCTCTGATGAGGAGACACCTAATGTGGATCTCTGTA 86117275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 GATTAAGGACTATAAGATTAGTAATCTCTGATGAGGAGACACCTAATGTGGATCTCTGTA 735

 86117276 TCACATCCTCTTGCTCTCCATGAGCACTGCCAGTTTCTTGGTTTGGGTGCTCTTCATCTC 86117335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 TCACATCCTCTTGCTCTCCATGAGCACTGCCAGTTTCTTGGTTTGGGTGCTCTTCATCTC 795

 86117336 TCATTTGGACTTTTTTTTCAAAGTCTTCTAAGCAATTTATTTGCCTCCAGTGATGTTCAG 86117395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 TCATTTGGACTTTTTTTTCAAAGTCTTCTAAGCAATTTATTTGCCTCCAGTGATGTTCAG 855

 86117396 TCTCTGTCTATCTTCTAATTGTCATGAAAATTATTCTGAAATGCAAAAGATATTAATATC 86117455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 TCTCTGTCTATCTTCTAATTGTCATGAAAATTATTCTGAAATGCAAAAGATATTAATATC 915

 86117456 TATGCTTTAGAAAGAGCTTTTACAGATTAATTAAAAACTCTATAGGATAATAGGCAAATA 86117515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 TATGCTTTAGAAAGAGCTTTTACAGATTAATTAAAAACTCTATAGGATAATAGGCAAATA 975

 86117516 ATATTAATAGGAAACTGACAGATGAGTAATCCAAATAACCAATGCATATATATACAAAAT 86117575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 ATATTAATAGGAAACTGACAGATGAGTAATCCAAATAACCAATGCATATATATACAAAAT 1035

 86117576 GATGCCCAATTCTAGTAGCAGTGAGGGGAAAAAAAGCAAATTAAAGGAATGTTAGGATCC 86117635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 GATGCCCAATTCTAGTAGCAGTGAGGGGAAAAAAAGCAAATTAAAGGAATGTTAGGATCC 1095

 86117636 ATTTATCCCTTATAAGATTCACAAAAAGTGAAAAGAATGATACCTATAGGCTACAATCAT 86117695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 ATTTATCCCTTATAAGATTCACAAAAAGTGAAAAGAATGATACCTATAGGCTACAATCAT 1155

 86117696 AAGAGGAAAAGGTACTGTCATACATTTCTACTACAATACGAATTGCTGCAACCATTTCTA 86117755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 AAGAGGAAAAGGTACTGTCATACATTTCTACTACAATACGAATTGCTGCAACCATTTCTA 1215

 86117756 AAAAGAAATTTAGCGATATCTATTCAAATTAAAAGTGAACTTACAATTTAACACATAATT 86117815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 AAAAGAAATTTAGCGATATCTATTCAAATTAAAAGTGAACTTACAATTTAACACATAATT 1275

 86117816 CCCTCTCTTAAGAATCTTGTCTATGAATTACCACTGATGAATAAAGATATATTTACAAGG 86117875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 CCCTCTCTTAAGAATCTTGTCTATGAATTACCACTGATGAATAAAGATATATTTACAAGG 1335

 86117876 AAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACACATTAAATTCCCATCAA 86117935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 AAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACACATTAAATTCCCATCAA 1395

 86117936 TAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAGATATACAGCCATTAAAA 86117995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 TAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAGATATACAGCCATTAAAA 1455

 86117996 AGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTACAATATGTTGCTCAGTG 86118055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 AGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTACAATATGTTGCTCAGTG 1515

 86118056 GGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTCAAATAATGGCAAAAATA 86118115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 GGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTCAAATAATGGCAAAAATA 1575

 86118116 TCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATTATTTATATGGGACTTAG 86118175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 TCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATTATTTATATGGGACTTAG 1635

 86118176 AAAAAGAAATGGATGAGTAAGTAGGAAGAGAAAATAAGTGTTTACATAATAGAAATAGAA 86118235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 AAAAAGAAATGGATGAGTAAGTAGGAAGAGAAAATAAGTGTTTACATAATAGAAATAGAA 1695

 86118236 TATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCACATTTCACATCTATGAGTGTATAT 86118295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 TATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCACATTTCACATCTATGAGTGTATAT 1755

 86118296 AATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGGTGGTATCTCAAGCTGTTGGGATT 86118355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 AATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGGTGGTATCTCAAGCTGTTGGGATT 1815

 86118356 TTAGGACACTTTAAAACTTTTTACTTTCTATACCTTTTGTTTTTATAATTTTTCTATGTT 86118415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 TTAGGACACTTTAAAACTTTTTACTTTCTATACCTTTTGTTTTTATAATTTTTCTATGTT 1875

 86118416 TTAAATTTTACACAATGAATGCGTACTATTTATATCATTTGGAAAAAAATAAATTCTGCC 86118475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 TTAAATTTTACACAATGAATGCGTACTATTTATATCATTTGGAAAAAAATAAATTCTGCC 1935

 86118476 TTTGAATAAAAGTACACATCTTATTACTTCTTAATAAGTACTGCTTAAACCCAAATAATT 86118535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 TTTGAATAAAAGTACACATCTTATTACTTCTTAATAAGTACTGCTTAAACCCAAATAATT 1995

 86118536 CCCCATGACCTATAAAATCCAACCCATAGAATGAAGCAGAAGTTTTTTTGTGATCTGATC 86118595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 CCCCATGACCTATAAAATCCAACCCATAGAATGAAGCAGAAGTTTTTTTGTGATCTGATC 2055

 86118596 CTGACTTGTTTAAAGTTTATTTCTTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTAGTTTTAAAAGATA 86118655
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
     2056 CTGACTTGTTTAAAGTTTATTTCTTTTTTTTC-TTTTTTTTTTTTTAGTTTTAAAAGATA 2114

 86118656 CGATTTTATTGTTGTTTACTTCATTTTTTTTAACTTTTATCTAAACTTCAGGAGCACATG 86118715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 CGATTTTATTGTTGTTTACTTCATTTTTTTTAACTTTTATCTAAACTTCAGGAGCACATG 2174

 86118716 TGCAGGTTTGTTACATAGGTAAACTTGTGTGATGGGGGTTTGTTTTTTTTTATTATTTAA 86118775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 TGCAGGTTTGTTACATAGGTAAACTTGTGTGATGGGGGTTTGTTTTTTTTTATTATTTAA 2234

 86118776 GTTTTACGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTT 86118835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 GTTTTACGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTTGTTACATATGTATACATGTGCCATGTT 2294

 86118836 GGTGTGCTGCACCCATTAACTCGTCATTTAACGTTACGTATATCTCCTAATGCTATCCCT 86118895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 GGTGTGCTGCACCCATTAACTCGTCATTTAACGTTACGTATATCTCCTAATGCTATCCCT 2354

 86118896 CCCCCCTCCCCCCACCCCACAACAGGCCCTGGTGTGTGATGTTCCCCTTCCTGTGTCCAT 86118955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 CCCCCCTCCCCCCACCCCACAACAGGCCCTGGTGTGTGATGTTCCCCTTCCTGTGTCCAT 2414

 86118956 GTGTTCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTT 86119009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2415 GTGTTCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAACATGCGGTGTTTGGTTT 2468

Alignment time is 2.01459 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    3511] =>      3511 nucs 'mol-32-20fa-055399_3511'

Score:        3399
Aligned:      3527        nucs
Identic:      3499 ( 99%) nucs =>      2988 ( 99%)       511 ( 99%)
Gaps:           22 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86112329,86115337] EXCISED REGION [86117859,86118370]
 second seq =>  [       1,    2993] EXCISED REGION [    2994,    3511]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2521 nucs [86115338,86117858]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117859,86117859]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117858,86117858]
 second seq =>         0 nucs

 86112329 TGATCTAAAGGTATATTAACTTCTATTGTTCCTGATATTTTATGTCTAGATATTCTGATA 86112388
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
        1 TGATCTAAAGGTATATTAACTTCTATTGTTCCTGATATTTTATATCTAGATATTCTGATA 60

 86112389 GCTAGAATGGCATTAGGGATAGTATTTCTTTACTTTGAATTGGTTAGATCTTACCAGGAT 86112448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTAGAATGGCATTAGGGATAGTATTTCTTTACTTTGAATTGGTTAGATCTTACCAGGAT 120

 86112449 GATTTTTGAAAGATAGGAGAATGGTAAAGTGAACTTCACTTCATGTCATTTGAGCAGTGG 86112508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATTTTTGAAAGATAGGAGAATGGTAAAGTGAACTTCACTTCATGTCATTTGAGCAGTGG 180

 86112509 TTGAGGAAACCTATCATGCCTGGAGAAATATAATTGCTCCCCTCAGATATTTAAGGAGCT 86112568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGAGGAAACCTATCATGCCTGGAGAAATATAATTGCTCCCCTCAGATATTTAAGGAGCT 240

 86112569 ATTATATGGAAGATGAATTTTGTTTTTTTTTCTATATAAGTAACTCTCAAAGTTAGGCCT 86112628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTATATGGAAGATGAATTTTGTTTTTTTTTCTATATAAGTAACTCTCAAAGTTAGGCCT 300

 86112629 GCTAGCTACAAGTTATTTTACCTGATTGTAGTCTAATTTCCTGCTCAACAGACTACAAAC 86112688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTAGCTACAAGTTATTTTACCTGATTGTAGTCTAATTTCCTGCTCAACAGACTACAAAC 360

 86112689 CTAGACTTTCCAAGCAAATGAAAATCTAAACAAATACTAACAGAAAATTGGTATAACTCT 86112748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAGACTTTCCAAGCAAATGAAAATCTAAACAAATACTAACAGAAAATTGGTATAACTCT 420

 86112749 TTCACTTTTATTCATCTTAAAAGTGTTGTTACCTTTTACAGAAAACCTTTAGGAATGTGC 86112808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCACTTTTATTCATCTTAAAAGTGTTGTTACCTTTTACAGAAAACCTTTAGGAATGTGC 480

 86112809 TAAAATCGTTTACAGTACTTATTAAACTTTCTTCTGCCTCTAACTCTGTGCATAGGATTC 86112868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAAATCGTTTACAGTACTTATTAAACTTTCTTCTGCCTCTAACTCTGTGCATAGGATTC 540

 86112869 TGTTATAGACCAAACTTCATTACCTCAAAGTAAAATACCAGTTACTACTGCTGATACAGT 86112928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTTATAGACCAAACTTCATTACCTCAAAGTAAAATACCAGTTACTACTGCTGATACAGT 600

 86112929 AGGTGTACCTTAGAACTGTTGAGTCTCAGAGTTGTTAAGAATGGACTATTGATGAATCAG 86112988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGTGTACCTTAGAACTGTTGAGTCTCAGAGTTGTTAAGAATGGACTATTGATGAATCAG 660

 86112989 ATAACAGATTTTGGTGGAGATAAAGCTAAAGTTTTTTCTTGCCTTTTTATTTCCATCTTA 86113048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATAACAGATTTTGGTGGAGATAAAGCTAAAGTTTTTTCTTGCCTTTTTATTTCCATCTTA 720

 86113049 ACTTTAATATAACTTTGGAAGGAGTAGGTCCTTTTTCTCTCTAATAGATAATAGAAAAAC 86113108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTTTAATATAACTTTGGAAGGAGTAGGTCCTTTTTCTCTCTAATAGATAATAGAAAAAC 780

 86113109 ACCATTATCTACAAAACATATGACATTTTTTCATTAGGGAATTTATATTGTTATTTTAAT 86113168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACCATTATCTACAAAACATATGACATTTTTTCATTAGGGAATTTATATTGTTATTTTAAT 840

 86113169 ACAAACAGTGAGAAGAGCTATAGGTCAATTGTTCCACAATTAATGCCATCATTTTGGGTA 86113228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAAACAGTGAGAAGAGCTATAGGTCAATTGTTCCACAATTAATGCCATCATTTTGGGTA 900

 86113229 GGCACATCTCAGCTTTTAACTGCTTTATAGCTGAATAATTCGATACAACAAATCACCTTA 86113288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCACATCTCAGCTTTTAACTGCTTTATAGCTGAATAATTCGATACAACAAATCACCTTA 960

 86113289 ATGTCACCTATAGGTACATTTAGAAATCAGTGTATTTTTTAATTGTGGTAAGGATATTTA 86113348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGTCACCTATAGGTACATTTAGAAATCAGTGTATTTTTTAATTGTGGTAAGGATATTTA 1020

 86113349 ATATGAGATTTGTCCTCTTAACAAATTTTAGGTGTACAATATATTATCGTTGATTCCAAG 86113408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1021 ATATGAGATTTGTCCTCTTAACAAATTTTAGGTGTACAATATATTATCGTTGATTCCAGG 1080

 86113409 TAAATATTGTATGACAGATCTCCAAAGCTTATTCATCTTATTTAACTGAAATTTTGTGCC 86113468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAATATTGTATGACAGATCTCCAAAGCTTATTCATCTTATTTAACTGAAATTTTGTGCC 1140

 86113469 TGTTGATTAATAACTCATTTCTCTCTCCCTCTGTAGTTCTTGGTAACAACCATTCCAGTC 86113528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTTGATTAATAACTCATTTCTCTCTCCCTCTGTAGTTCTTGGTAACAACCATTCCAGTC 1200

 86113529 CTTGATGTTATTAATTTCACTATTTTGGAAGGAATTGAAACTCTATCACCCCCCTCCCCT 86113588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTGATGTTATTAATTTCACTATTTTGGAAGGAATTGAAACTCTATCACCCCCCTCCCCT 1260

 86113589 TTCCCTCCAATAGTAAGGCTTTCACTGTTTGTTTTTATTGGGAAGTGAGTTATTTCTTTT 86113648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCCCTCCAATAGTAAGGCTTTCACTGTTTGTTTTTATTGGGAAGTGAGTTATTTCTTTT 1320

 86113649 GTCCTGGTTTTCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGACTAAATTACAAATTCTATTAA 86113708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1321 GTCCTGGTTTTCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGACTAAATTACAAGTTCTATTAA 1380

 86113709 AGAAAAGATGAATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCCTCCATGATGTTTTTCAAAAG 86113768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGAAAAGATGAATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCCTCCATGATGTTTTTCAAAAG 1440

 86113769 GTAACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTAAATAATTGGTAA 86113828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTAACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTAAATAATTGGTAA 1500

 86113829 CAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATTCCCCAAAGAACA 86113888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATTCCCCAAAGAACA 1560

 86113889 ACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCCAAATGACAG 86113948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCCAAATGACAG 1620

 86113949 GTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGATATCTGTCC 86114008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGATATCTGTCC 1680

 86114009 ATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGT 86114068
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACACTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGT 1740

 86114069 GAATGATTTTAGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACC 86114128
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAATGATTTTAGGCTGACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACC 1800

 86114129 CCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAAC 86114188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAAC 1860

 86114189 ACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAAT 86114248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAAT 1920

 86114249 GACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGA 86114308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGA 1980

 86114309 AGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCT 86114368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCT 2040

 86114369 TACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTC 86114428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTC 2100

 86114429 ACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCAT 86114488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCAT 2160

 86114489 CCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACT 86114548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACT 2220

 86114549 GTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTC 86114608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTC 2280

 86114609 TCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATGTATGTTCAC 86114668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATGTATGTTCAC 2340

 86114669 CACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAA 86114728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAA 2400

 86114729 AGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCA 86114788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCA 2460

 86114789 TTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATT 86114848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATT 2520

 86114849 CTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAAT 86114908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAAT 2580

 86114909 TCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTG 86114968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTG 2640

 86114969 CCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAG 86115028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAG 2700

 86115029 CAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGT 86115088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGT 2760

 86115089 ACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTTTAAAATCAGATG 86115148
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
     2761 ACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTTT----------- 2809

 86115149 ACATTGAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGC 86115208
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 -----GAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGC 2864

 86115209 TGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCAC 86115268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 TGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCAC 2924

 86115269 AGCAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCT 86115328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 AGCAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCT 2984

 86115329 AATGCAAGC 86115337
          |||||||||
     2985 AATGCAAGC 2993

EXCISED REGION

 86117859 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 86117918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 3053

 86117919 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 86117978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 3113

 86117979 ATATACAGCCATTAAAAAGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTA 86118038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 ATATACAGCCATTAAAAAGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTA 3173

 86118039 CAATATGTTGCTCAGTGGGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTC 86118098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 CAATATGTTGCTCAGTGGGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTC 3233

 86118099 AAATAATGGCAAAAATATCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATT 86118158
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 AAATAATGGCAAAAATCTCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATT 3293

 86118159 ATTTATATGGGACTTAGAAAAAGAAATGGATGAGT------AAGTAGGAAGAGAAAATAA 86118212
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||
     3294 ATTTATATGGGACTTAGAAAAAGAAATGGATGAGTAAGTTAAAGTAGGAAGAGAAAATAA 3353

 86118213 GTGTTTACATAATAGAAATAGAATATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCAC 86118272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 GTGTTTACATAATAGAAATAGAATATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCAC 3413

 86118273 ATTTCACATCTATGAGTGTATATAATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGG 86118332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 ATTTCACATCTATGAGTGTATATAATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGG 3473

 86118333 TGGTATCTCAAGCTGTTGGGATTTTAGGACACTTTAAA 86118370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 TGGTATCTCAAGCTGTTGGGATTTTAGGACACTTTAAA 3511

Alignment time is 2.87553 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    4386] =>      4386 nucs 'mol-32-2895-106293_4386'

Score:        4241
Aligned:      4402        nucs
Identic:      4371 ( 99%) nucs =>      3622 ( 99%)       749 ( 99%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86111692,86115337] EXCISED REGION [86117859,86118608]
 second seq =>  [       1,    3630] EXCISED REGION [    3631,    4386]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2521 nucs [86115338,86117858]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117859,86117859]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117858,86117858]
 second seq =>         0 nucs

 86111692 ATAATAATGTGTCAGTACAGGTTTATCAGTTGTACTATTCTAGTGGGGGATGGTGATATT 86111751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATAATAATGTGTCAGTACAGGTTTATCAGTTGTACTATTCTAGTGGGGGATGGTGATATT 60

 86111752 GGAAATAGCTACGCATGAGTAGGGGCAGGGGATAGATGAGAAATCTCTGTACCTCCCTGT 86111811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAAATAGCTACGCATGAGTAGGGGCAGGGGATAGATGAGAAATCTCTGTACCTCCCTGT 120

 86111812 CAATCTTGTTGTCAATCTAAAACTGCTCAAAAATTTAAAAACATTCTTTAAAAATCTGTA 86111871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAATCTTGTTGTCAATCTAAAACTGCTCAAAAATTTAAAAACATTCTTTAAAAATCTGTA 180

 86111872 ATTTATATTATTAACTGTTGAAACTATTATGACTAAAGATTCTGGTTATTTAAAATTGAT 86111931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTATATTATTAACTGTTGAAACTATTATGACTAAAGATTCTGGTTATTTAAAATTGAT 240

 86111932 AATAATTGTGAAACAATGATCAGATATTATATGACAAGACACCATATCTACACTTGTCCT 86111991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATAATTGTGAAACAATGATCAGATATTATATGACAAGACACCATATCTACACTTGTCCT 300

 86111992 ATTTAACATTTATATCAATAACTTAGATGAAGCAAATGCTTGGGGCATGCTTTGCAAATG 86112051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTAACATTTATATCAATAACTTAGATGAAGCAAATGCTTGGGGCATGCTTTGCAAATG 360

 86112052 TGACGACAACAGTAAAAAGCCAGAAAGGACAGCAAATACAGTGATGTTAAAATCTGAATC 86112111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGACGACAACAGTAAAAAGCCAGAAAGGACAGCAAATACAGTGATGTTAAAATCTGAATC 420

 86112112 CAAAAGGATAGTAGAAGACATGAAACAAGGAAAGCTCACAATGAAATTTGACAGATTATT 86112171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAAAGGATAGTAGAAGACATGAAACAAGGAAAGCTCACAATGAAATTTGACAGATTATT 480

 86112172 ACAGGTCTTGCACTACAATCCGAAGGCACAACTTTGGATCAAAGACAAATGGAGAAAATT 86112231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAGGTCTTGCACTACAATCCGAAGGCACAACTTTGGATCAAAGACAAATGGAGAAAATT 540

 86112232 GGTTTAGAGGCAGCCTGTATGAGAAAGAATTACAGGATTAGTTGAATTCAAATTCAGTGT 86112291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTTTAGAGGCAGCCTGTATGAGAAAGAATTACAGGATTAGTTGAATTCAAATTCAGTGT 600

 86112292 GACTCAACAATGAGATTTGTTTGCCAAGGAACTAATGTGATCTAAAGGTATATTAACTTC 86112351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACTCAACAATGAGATTTGTTTGCCAAGGAACTAATGTGATCTAAAGGTATATTAACTTC 660

 86112352 TATTGTTCCTGATATTTTATGTCTAGATATTCTGATAGCTAGAATGGCATTAGGGATAGT 86112411
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATTGTTCCTGATATTTTATATCTAGATATTCTGATAGCTAGAATGGCATTAGGGATAGT 720

 86112412 ATTTCTTTACTTTGAATTGGTTAGATCTTACCAGGATGATTTTTGAAAGATAGGAGAATG 86112471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTCTTTACTTTGAATTGGTTAGATCTTACCAGGATGATTTTTGAAAGATAGGAGAATG 780

 86112472 GTAAAGTGAACTTCACTTCATGTCATTTGAGCAGTGGTTGAGGAAACCTATCATGCCTGG 86112531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTAAAGTGAACTTCACTTCATGTCATTTGAGCAGTGGTTGAGGAAACCTATCATGCCTGG 840

 86112532 AGAAATATAATTGCTCCCCTCAGATATTTAAGGAGCTATTATATGGAAGATGAATTTTGT 86112591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      841 AGAAATATAATTGCTCCCCTCAGATATTTAAGGAGCTATTCTATGGAAGATGAATTTTGT 900

 86112592 TTTTTTTTCTATATAAGTAACTCTCAAAGTTAGGCCTGCTAGCTACAAGTTATTTTACCT 86112651
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTTTCTCTATATAAGTAACTCTCAAAGTTAGGCCTGCTAGCTACAAGTTATTTTACCT 960

 86112652 GATTGTAGTCTAATTTCCTGCTCAACAGACTACAAACCTAGACTTTCCAAGCAAATGAAA 86112711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GATTGTAGTCTAATTTCCTGCTCAACAGACTACAAACCTAGACTTTCCAAGCAAATGAAA 1020

 86112712 ATCTAAACAAATACTAACAGAAAATTGGTATAACTCTTTCACTTTTATTCATCTTAAAAG 86112771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATCTAAACAAATACTAACAGAAAATTGGTATAACTCTTTCACTTTTATTCATCTTAAAAG 1080

 86112772 TGTTGTTACCTTTTACAGAAAACCTTTAGGAATGTGCTAAAATCGTTTACAGTACTTATT 86112831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTTGTTACCTTTTACAGAAAACCTTTAGGAATGTGCTAAAATCGTTTACAGTACTTATT 1140

 86112832 AAACTTTCTTCTGCCTCTAACTCTGTGCATAGGATTCTGTTATAGACCAAACTTCATTAC 86112891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAACTTTCTTCTGCCTCTAACTCTGTGCATAGGATTCTGTTATAGACCAAACTTCATTAC 1200

 86112892 CTCAAAGTAAAATACCAGTTACTACTGCTGATACAGTAGGTGTACCTTAGAACTGTTGAG 86112951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCAAAGTAAAATACCAGTTACTACTGCTGATACAGTAGGTGTACCTTAGAACTGTTGAG 1260

 86112952 TCTCAGAGTTGTTAAGAATGGACTATTGATGAATCAGATAACAGATTTTGGTGGAGATAA 86113011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTCAGAGTTGTTAAGAATGGACTATTGATGAATCAGATAACAGATTTTGGTGGAGATAA 1320

 86113012 AGCTAAAGTTTTTTCTTGCCTTTTTATTTCCATCTTAACTTTAATATAACTTTGGAAGGA 86113071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCTAAAGTTTTTTCTTGCCTTTTTATTTCCATCTTAACTTTAATATAACTTTGGAAGGA 1380

 86113072 GTAGGTCCTTTTTCTCTCTAATAGATAATAGAAAAACACCATTATCTACAAAACATATGA 86113131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTAGGTCCTTTTTCTCTCTAATAGATAATAGAAAAACACCATTATCTACAAAACATATGA 1440

 86113132 CATTTTTTCATTAGGGAATTTATATTGTTATTTTAATACAAACAGTGAGAAGAGCTATAG 86113191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATTTTTTCATTAGGGAATTTATATTGTTATTTTAATACAAACAGTGAGAAGAGCTATAG 1500

 86113192 GTCAATTGTTCCACAATTAATGCCATCATTTTGGGTAGGCACATCTCAGCTTTTAACTGC 86113251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTCAATTGTTCCACAATTAATGCCATCATTTTGGGTAGGCACATCTCAGCTTTTAACTGC 1560

 86113252 TTTATAGCTGAATAATTCGATACAACAAATCACCTTAATGTCACCTATAGGTACATTTAG 86113311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTATAGCTGAATAATTCGATACAACAAATCACCTTAATGTCACCTATAGGTACATTTAG 1620

 86113312 AAATCAGTGTATTTTTTAATTGTGGTAAGGATATTTAATATGAGATTTGTCCTCTTAACA 86113371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATCAGTGTATTTTTTAATTGTGGTAAGGATATTTAATATGAGATTTGTCCTCTTAACA 1680

 86113372 AATTTTAGGTGTACAATATATTATCGTTGATTCCAAGTAAATATTGTATGACAGATCTCC 86113431
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1681 AATTTTAGGTGTACAATATATTATCGTTGATTCCAGGTAAATATTGTATGACAGATCTCC 1740

 86113432 AAAGCTTATTCATCTTATTTAACTGAAATTTTGTGCCTGTTGATTAATAACTCATTTCTC 86113491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAGCTTATTCATCTTATTTAACTGAAATTTTGTGCCTGTTGATTAATAACTCATTTCTC 1800

 86113492 TCTCCCTCTGTAGTTCTTGGTAACAACCATTCCAGTCCTTGATGTTATTAATTTCACTAT 86113551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTCCCTCTGTAGTTCTTGGTAACAACCATTCCAGTCCTTGATGTTATTAATTTCACTAT 1860

 86113552 TTTGGAAGGAATTGAAACTCTATCACCCCCCTCCCCTTTCCCTCCAATAGTAAGGCTTTC 86113611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTGGAAGGAATTGAAACTCTATCACCCCCCTCCCCTTTCCCTCCAATAGTAAGGCTTTC 1920

 86113612 ACTGTTTGTTTTTATTGGGAAGTGAGTTATTTCTTTTGTCCTGGTTTTCCATATTCTATG 86113671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACTGTTTGTTTTTATTGGGAAGTGAGTTATTTCTTTTGTCCTGGTTTTCCATATTCTATG 1980

 86113672 ACATTCATTTATAAGACTAAATTACAAATTCTATTAAAGAAAAGATGAATTAACTTTATC 86113731
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACATTCATTTATAAGACTAAATTACAAGTTCTATTAAAGAAAAGATGAATTAACTTTATC 2040

 86113732 AATTCATCTTTGTCTCCTCCATGATGTTTTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTT 86113791
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATTCGTCTTTGTCTCCTCCATGATGTTTTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTT 2100

 86113792 ACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTAAATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAAT 86113851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTAAATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAAT 2160

 86113852 TTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATTCCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGAT 86113911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATTCCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGAT 2220

 86113912 AAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAA 86113971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAA 2280

 86113972 GAATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGT 86114031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGT 2340

 86114032 ACATTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACAACTG 86114091
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2341 ACACTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTGACAACTG 2400

 86114092 GAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTT 86114151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTT 2460

 86114152 CTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCA 86114211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCA 2520

 86114212 TCTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGG 86114271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGG 2580

 86114272 GGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTC 86114331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTC 2640

 86114332 ATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGA 86114391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGA 2700

 86114392 AAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAAT 86114451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAAT 2760

 86114452 GAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACT 86114511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACT 2820

 86114512 TCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTG 86114571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTG 2880

 86114572 TCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCT 86114631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCT 2940

 86114632 TAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTG 86114691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTG 3000

 86114692 AAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGT 86114751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGT 3060

 86114752 TGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAA 86114811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAA 3120

 86114812 TCAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAA 86114871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAA 3180

 86114872 GAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATC 86114931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATC 3240

 86114932 TTTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTT 86114991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTT 3300

 86114992 GTTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTG 86115051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GTTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTG 3360

 86115052 TGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATT 86115111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATT 3420

 86115112 TCTGAAGGGAATTACAATCTTATTTTAAAATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTTACAT 86115171
          ||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||||||||||
     3421 TCTGAAGGGAATTACAATCTTATTTT----------------GAAAAATTCAAGTTACAT 3464

 86115172 TACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGG 86115231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 TACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGG 3524

 86115232 TCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGT 86115291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 TCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGT 3584

 86115292 CAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGC 86115337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 CAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGC 3630

EXCISED REGION

 86117859 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 86117918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 3690

 86117919 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 86117978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 3750

 86117979 ATATACAGCCATTAAAAAGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTA 86118038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 ATATACAGCCATTAAAAAGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTA 3810

 86118039 CAATATGTTGCTCAGTGGGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTC 86118098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 CAATATGTTGCTCAGTGGGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTC 3870

 86118099 AAATAATGGCAAAAATATCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATT 86118158
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 AAATAATGGCAAAAATCTCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATT 3930

 86118159 ATTTATATGGGACTTAGAAAAAGAAATGGATGAGT------AAGTAGGAAGAGAAAATAA 86118212
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||
     3931 ATTTATATGGGACTTAGAAAAAGAAATGGATGAGTAAGTTAAAGTAGGAAGAGAAAATAA 3990

 86118213 GTGTTTACATAATAGAAATAGAATATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCAC 86118272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 GTGTTTACATAATAGAAATAGAATATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCAC 4050

 86118273 ATTTCACATCTATGAGTGTATATAATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGG 86118332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 ATTTCACATCTATGAGTGTATATAATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGG 4110

 86118333 TGGTATCTCAAGCTGTTGGGATTTTAGGACACTTTAAAACTTTTTACTTTCTATACCTTT 86118392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 TGGTATCTCAAGCTGTTGGGATTTTAGGACACTTTAAAACTTTTTACTTTCTATACCTTT 4170

 86118393 TGTTTTTATAATTTTTCTATGTTTTAAATTTTACACAATGAATGCGTACTATTTATATCA 86118452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 TGTTTTTATAATTTTTCTATGTTTTAAATTTTACACAATGAATGCGTACTATTTATATCA 4230

 86118453 TTTGGAAAAAAATAAATTCTGCCTTTGAATAAAAGTACACATCTTATTACTTCTTAATAA 86118512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 TTTGGAAAAAAATAAATTCTGCCTTTGAATAAAAGTACACATCTTATTACTTCTTAATAA 4290

 86118513 GTACTGCTTAAACCCAAATAATTCCCCATGACCTATAAAATCCAACCCATAGAATGAAGC 86118572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 GTACTGCTTAAACCCAAATAATTCCCCATGACCTATAAAATCCAACCCATAGAATGAAGC 4350

 86118573 AGAAGTTTTTTTGTGATCTGATCCTGACTTGTTTAA 86118608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 AGAAGTTTTTTTGTGATCTGATCCTGACTTGTTTAA 4386

Alignment time is 3.53719 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    8005] =>      8005 nucs 'mol-32-2afd-040153_8005'

Score:        7828
Aligned:      8022        nucs
Identic:      7988 (100%) nucs =>      7002 (100%)       986 ( 99%)
Gaps:           24 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86108312,86115337] EXCISED REGION [86117859,86118847]
 second seq =>  [       1,    7011] EXCISED REGION [    7012,    8005]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2521 nucs [86115338,86117858]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117859,86117859]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117858,86117858]
 second seq =>         0 nucs

 86108312 GTGCAGGTTGGGTTATCAGTGTCATGATTATGATTAACATTATGGAAGTCTTAATGTAAA 86108371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGCAGGTTGGGTTATCAGTGTCATGATTATGATTAACATTATGGAAGTCTTAATGTAAA 60

 86108372 TCATGCCCTTTGTCGAGTACTTAATCTCTGGATCAGTCAAGATCCAATCAAAAACCACAA 86108431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCATGCCCTTTGTCGAGTACTTAATCTCTGGATCAGTCAAGATCCAATCAAAAACCACAA 120

 86108432 CAATTATTTTAACAACAAAAAAATTTAATGTAAATAATTTTGAACTATCTTTTAAAAACT 86108491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAATTATTTTAACAACAAAAAAATTTAATGTAAATAATTTTGAACTATCTTTTAAAAACT 180

 86108492 GAAAGCCAGACAGTAAAACAATAAAGTATCATGAAAATAGAAACTGCAGGAAGCAGCTAC 86108551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAAGCCAGACAGTAAAACAATAAAGTATCATGAAAATAGAAACTGCAGGAAGCAGCTAC 240

 86108552 CATCCTTAGGGAACAAACGAAAAATGTAGGAATTACTAAAACTTTGTTGTTTGGTGGAGA 86108611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATCCTTAGGGAACAAACGAAAAATGTAGGAATTACTAAAACTTTGTTGTTTGGTGGAGA 300

 86108612 AACCTCGCAGAGCTCAGACCTCTGAGTGCTACCAGCTGGTGCTAGCATCTCTAAGGGGCA 86108671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACCTCGCAGAGCTCAGACCTCTGAGTGCTACCAGCTGGTGCTAGCATCTCTAAGGGGCA 360

 86108672 CCATCAGGCTGACTCTTTGATGTGTTAGAGAACGAAAACCTGGACTTGCTGCTACCAGGG 86108731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCATCAGGCTGACTCTTTGATGTGTTAGAGAACGAAAACCTGGACTTGCTGCTACCAGGG 420

 86108732 TGAAGAAGTGTGGCTGATGTGATGCTCACAGGAGCTGGAAAAAATAAAAGAGCAAGACAG 86108791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAAGAAGTGTGGCTGATGTGATGCTCACAGGAGCTGGAAAAAATAAAAGAGCAAGACAG 480

 86108792 CATGAAGCTGGCAGGGAAAAGTCCCTCATTTCTCCTTTAGCCTCCCAGGCTCTCTCTAGT 86108851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATGAAGCTGGCAGGGAAAAGTCCCTCATTTCTCCTTTAGCCTCCCAGGCTCTCTCTAGT 540

 86108852 GCCCCTTACACAGATTGTCTAGCAAATGAAAAGCAGTTTCAAAAATCCCAGCCCCACAAT 86108911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCCCTTACACAGATTGTCTAGCAAATGAAAAGCAGTTTCAAAAATCCCAGCCCCACAAT 600

 86108912 CCCAAAGCTAAGAGGAGTGGATTTGAGACTGAGAGACCATTATCTTCATAACTGGTATAG 86108971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCAAAGCTAAGAGGAGTGGATTTGAGACTGAGAGACCATTATCTTCATAACTGGTATAG 660

 86108972 TGTCTTTTAACATAAAAGATCCTTCACCCCAACTTAACGGTAAATCCTTAAGTTACATTT 86109031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTCTTTTAACATAAAAGATCCTTCACCCCAACTTAACGGTAAATCCTTAAGTTACATTT 720

 86109032 ACCTTAAGGGTAAATTTAAATCCATGTGCTCTAATTCATTTCTCTGAGAAAGAACAAAGA 86109091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCTTAAGGGTAAATTTAAATCCATGTGCTCTAATTCATTTCTCTGAGAAAGAACAAAGA 780

 86109092 GTCTCCTTAATATCATCACTCTAATCCTTGGAAACATTAAGGTGTTGTTGACATCTTACC 86109151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTCTCCTTAATATCATCACTCTAATCCTTGGAAACATTAAGGTGTTGTTGACATCTTACC 840

 86109152 TGGTGCTCTCTGTATCACTTGCACAGCATATATTATGCTCTTAACAAATATTAGTTGAAT 86109211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGTGCTCTCTGTATCACTTGCACAGCATATATTATGCTCTTAACAAATATTAGTTGAAT 900

 86109212 GAATGTGTAAAAGTATATTCTCAGCATAACTCTGACTTCTGAATTCTCTTTAAACAATGC 86109271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAATGTGTAAAAGTATATTCTCAGCATAACTCTGACTTCTGAATTCTCTTTAAACAATGC 960

 86109272 ATTTTTCATCCCCTTTATCACTGGACTAGGATATAAATATTTATACTGTAAAAACTATAG 86109331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTTTCATCCCCTTTATCACTGGACTAGGATATAAATATTTATACTGTAAAAACTATAG 1020

 86109332 CACCACAGAAATATGACTTCACAATTTCAGAAGCTCTGATGTTTCTTAAGACAGTTAATA 86109391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACCACAGAAATATGACTTCACAATTTCAGAAGCTCTGATGTTTCTTAAGACAGTTAATA 1080

 86109392 TAGATTTTGCATGTTTCTCTCAAACTACAGAGGGAATGAGGAAATAAAATAGAATTCCTT 86109451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAGATTTTGCATGTTTCTCTCAAACTACAGAGGGAATGAGGAAATAAAATAGAATTCCTT 1140

 86109452 TGATTTCCTCTAAGGTTGAATCTTCCTTCCCAAAATCCCAATGATGCATCAGGCTACTCT 86109511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGATTTCCTCTAAGGTTGAATCTTCCTTCCCAAAATCCCAATGATGCATCAGGCTACTCT 1200

 86109512 TCGGATTCTCCGTATCACATGAAAGATACAGGTGAGCCATTCAGCTTTTGTATAAAAGAA 86109571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCGGATTCTCCGTATCACATGAAAGATACAGGTGAGCCATTCAGCTTTTGTATAAAAGAA 1260

 86109572 ATAAGAGATGATCTTATCTTATTTTGGGCCTCAGTCACCTCAATTTACCCTCAATCTCTC 86109631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATAAGAGATGATCTTATCTTATTTTGGGCCTCAGTCACCTCAATTTACCCTCAATCTCTC 1320

 86109632 TTGGGTGCTGTAGTATCTTCCAGGCATAAAGTGTTCAATCGTATGCAGTAAATAAATTAT 86109691
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGGGTGCTGTAGTACCTTCCAGGCATAAAGTGTTCAATCGTATGCAGTAAATAAATTAT 1380

 86109692 TTTAGAGATAGTCCTATTAAAGTATGTTTAAAAAAATAAGATTTATGTTTACAAAATTCA 86109751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTAGAGATAGTCCTATTAAAGTATGTTTAAAAAAATAAGATTTATGTTTACAAAATTCA 1440

 86109752 TTCACTTTACATAGTTACATGTTTAGTTTTGTTTATGGCAATTCAATATGTTGTCACTAA 86109811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCACTTTACATAGTTACATGTTTAGTTTTGTTTATGGCAATTCAATATGTTGTCACTAA 1500

 86109812 ATATTTTTTTTCAAAATCAGATAACATAAACTTAAATATGATAGAAGAGGAGAGAATTGA 86109871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATATTTTTTTTCAAAATCAGATAACATAAACTTAAATATGATAGAAGAGGAGAGAATTGA 1560

 86109872 TTCATTGAAACAGTGGCCTTCAAAACTCCTTTTTCTCAAAAAAAAAA-TATTTGAAGGGG 86109930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     1561 TTCATTGAAACAGTGGCCTTCAAAACTCCTTTTTCTCAAAAAAAAAAATATTTGAAGGGG 1620

 86109931 TGATGTAAAACCTTTTGTTTTTCTTATGACAGCATTCCAAGTCTTTCTCAAATATATTCG 86109990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGATGTAAAACCTTTTGTTTTTCTTATGACAGCATTCCAAGTCTTTCTCAAATATATTCG 1680

 86109991 AGGACTTTATTTTGTAGACACTTTAGAAGTTGGATTTTTTTCAAGAAACATCTGTAAATA 86110050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGACTTTATTTTGTAGACACTTTAGAAGTTGGATTTTTTTCAAGAAACATCTGTAAATA 1740

 86110051 TTAGAAAAACAGTTCAAATCTTAAGAACAAGATGTATAAACAAGTTGTATAAACACATTT 86110110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTAGAAAAACAGTTCAAATCTTAAGAACAAGATGTATAAACAAGTTGTATAAACACATTT 1800

 86110111 TAGTGCATTATGTGGTCAACCCAATATTTAATCATGGTTATCCATTATGTTTTATAAAAC 86110170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAGTGCATTATGTGGTCAACCCAATATTTAATCATGGTTATCCATTATGTTTTATAAAAC 1860

 86110171 ATGTTACACTGTTTTTCCTGACATTAATTGCATTATTAAGATATTATGGAAGGATGTATT 86110230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGTTACACTGTTTTTCCTGACATTAATTGCATTATTAAGATATTATGGAAGGATGTATT 1920

 86110231 TGTTATTTGTTTATGACTTTCTTTGTCATTCATCAAAAGTATGCTATTGTACCATGAAGA 86110290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGTTATTTGTTTATGACTTTCTTTGTCATTCATCAAAAGTATGCTATTGTACCATGAAGA 1980

 86110291 GCAATCTCTGCTGACCAGGCTGTTTACAAGTATCAGAAGAAATGCAATGTCAGGCTTTTG 86110350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCAATCTCTGCTGACCAGGCTGTTTACAAGTATCAGAAGAAATGCAATGTCAGGCTTTTG 2040

 86110351 GTACTATAATTCCATGGGCAGTCTCTTGATTTTCCACATAAAATAGATCTACTTTATACA 86110410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTACTATAATTCCATGGGCAGTCTCTTGATTTTCCACATAAAATAGATCTACTTTATACA 2100

 86110411 AGGCACTTTTCTCTTAGAATTTTTTTTAAGTTTAGTTTTAAAATCTAAAGCTAATTCTAA 86110470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGGCACTTTTCTCTTAGAATTTTTTTTAAGTTTAGTTTTAAAATCTAAAGCTAATTCTAA 2160

 86110471 ATAAATGCTGTCCTGTGCACTGTAAGATTTAGTAATATCTGTGGCCTTTTCGTACTAGAT 86110530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATAAATGCTGTCCTGTGCACTGTAAGATTTAGTAATATCTGTGGCCTTTTCGTACTAGAT 2220

 86110531 GACAGTTGCACCCCACCAAACTTGGACACTAAAATTATCTCCCAAGGAGCAAAACTGCCC 86110590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GACAGTTGCACCCCACCAAACTTGGACACTAAAATTATCTCCCAAGGAGCAAAACTGCCC 2280

 86110591 CCAGTTGAGAACCACTGCTTTGGAACTTGACTGTTTCCCTTCCATTCTTTCTGTTTTTCT 86110650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCAGTTGAGAACCACTGCTTTGGAACTTGACTGTTTCCCTTCCATTCTTTCTGTTTTTCT 2340

 86110651 TGTCTCCTCTTTTGGGGCCCATTATAAAATATAGGGTTGAAATGTTCCTCTTTCTAAATT 86110710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGTCTCCTCTTTTGGGGCCCATTATAAAATATAGGGTTGAAATGTTCCTCTTTCTAAATT 2400

 86110711 ACTTATTGGGCTGCTTATTCTGGAAGATTGACCTAGGGTTAATCACAAGGCAAGACCTGG 86110770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ACTTATTGGGCTGCTTATTCTGGAAGATTGACCTAGGGTTAATCACAAGGCAAGACCTGG 2460

 86110771 TTTAGAATCAGTGAGATGACCCTTACTGGAAATGATGATTGCATGGTAATTTTAAGTATG 86110830
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTGGAATCAGTGAGATGACCCTTACTGGAAATGATGATTGCATGGTAATTTTAAGTATG 2520

 86110831 CTAGCTTTTTATGTGAGGGTGATACTAAGGATGTACTGTACTACAAACATATGATACTGA 86110890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTAGCTTTTTATGTGAGGGTGATACTAAGGATGTACTGTACTACAAACATATGATACTGA 2580

 86110891 AAGGTGTTTATGTGAAAGTAGTCATAGGGTGAACTAAATTTTACAGGAAGATTTAATGTA 86110950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AAGGTGTTTATGTGAAAGTAGTCATAGGGTGAACTAAATTTTACAGGAAGATTTAATGTA 2640

 86110951 ATTTGAGCTAAAGCTTTAGGAGAGAATGTTAGAAGGATCACTGGACACAGGAACTGAGTC 86111010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTTGAGCTAAAGCTTTAGGAGAGAATGTTAGAAGGATCACTGGACACAGGAACTGAGTC 2700

 86111011 ATTTAATAAGAAACATTTCCAATATTCTAGATCATCCAAATTATATAACTAAGAAAAAAA 86111070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATTTAATAAGAAACATTTCCAATATTCTAGATCATCCAAATTATATAACTAAGAAAAAAA 2760

 86111071 TATATATATTTCTCATCATATAAAAATAAACTGTTATGACTAGCAAAATAAAATTTATTG 86111130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TATATATATTTCTCATCATATAAAAATAAACTGTTATGACTAGCAAAATAAAATTTATTG 2820

 86111131 CTATAATTATAATTACTACAATTATACTAAAAAGATACACAATCTTTAATAACCATAAGC 86111190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTATAATTATAATTACTACAATTATACTAAAAAGATACACAATCTTTAATAACCATAAGC 2880

 86111191 TCATTAATCCTCATATTAATATGTAATAGTTGCTCATCACAACTGTTACCCAACCTTGAA 86111250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCATTAATCCTCATATTAATATGTAATAGTTGCTCATCACAACTGTTACCCAACCTTGAA 2940

 86111251 AATGGAACTTATAGATCTTTTATTTTGTCCACGTATAAGACAAATTTAAACTCTAAAAGC 86111310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AATGGAACTTATAGATCTTTTATTTTGTCCACGTATAAGACAAATTTAAACTCTAAAAGC 3000

 86111311 AATTTATTTGTTGCAGTTAACAAAGACTTGTGATTTCTACTGGAAAAGAAAGGAAAACAA 86111370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AATTTATTTGTTGCAGTTAACAAAGACTTGTGATTTCTACTGGAAAAGAAAGGAAAACAA 3060

 86111371 ATTTTTGGAAGTGCTAACTTAAATTAGTGTGTTTTTATTATTTTTCTTGTTTTTATGTCT 86111430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATTTTTGGAAGTGCTAACTTAAATTAGTGTGTTTTTATTATTTTTCTTGTTTTTATGTCT 3120

 86111431 GTCTTCATAACCAAACATTTCTAATGAAAGGGCTACAACTTTCAATCAATTAATAATCTG 86111490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTCTTCATAACCAAACATTTCTAATGAAAGGGCTACAACTTTCAATCAATTAATAATCTG 3180

 86111491 AATTATAAATCAGGAAAAAGTCGCAGACAACATGTAACTGAAATTCATCAAAGCATAAGA 86111550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AATTATAAATCAGGAAAAAGTCGCAGACAACATGTAACTGAAATTCATCAAAGCATAAGA 3240

 86111551 TAAGATAGCACATAATATATTGTCAGAATATTTTTTAAAATATTAGTCATTTACACATGT 86111610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAAGATAGCACATAATATATTGTCAGAATATTTTTTAAAATATTAGTCATTTACACATGT 3300

 86111611 ATATATATCATTATTTATCCAAACCTATAAAATGTGCAACATCAAAAGTGAATCCTAATG 86111670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATATATATCATTATTTATCCAAACCTATAAAATGTGCAACATCAAAAGTGAATCCTAATG 3360

 86111671 TTAAACTATGAACTTTTCGTGATAATAATGTGTCAGTACAGGTTTATCAGTTGTACTATT 86111730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTAAACTATGAACTTTTCGTGATAATAATGTGTCAGTACAGGTTTATCAGTTGTACTATT 3420

 86111731 CTAGTGGGGGATGGTGATATTGGAAATAGCTACGCATGAGTAGGGGCAGGGGATAGATGA 86111790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTAGTGGGGGATGGTGATATTGGAAATAGCTACGCATGAGTAGGGGCAGGGGATAGATGA 3480

 86111791 GAAATCTCTGTACCTCCCTGTCAATCTTGTTGTCAATCTAAAACTGCTCAAAAATTTAAA 86111850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GAAATCTCTGTACCTCCCTGTCAATCTTGTTGTCAATCTAAAACTGCTCAAAAATTTAAA 3540

 86111851 AACATTCTTTAAAAATCTGTAATTTATATTATTAACTGTTGAAACTATTATGACTAAAGA 86111910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AACATTCTTTAAAAATCTGTAATTTATATTATTAACTGTTGAAACTATTATGACTAAAGA 3600

 86111911 TTCTGGTTATTTAAAATTGATAATAATTGTGAAACAATGATCAGATATTATATGACAAGA 86111970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTCTGGTTATTTAAAATTGATAATAATTGTGAAACAATGATCAGATATTATATGACAAGA 3660

 86111971 CACCATATCTACACTTGTCCTATTTAACATTTATATCAATAACTTAGATGAAGCAAATGC 86112030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CACCATATCTACACTTGTCCTATTTAACATTTATATCAATAACTTAGATGAAGCAAATGC 3720

 86112031 TTGGGGCATGCTTTGCAAATGTGACGACAACAGTAAAAAGCCAGAAAGGACAGCAAATAC 86112090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TTGGGGCATGCTTTGCAAATGTGACGACAACAGTAAAAAGCCAGAAAGGACAGCAAATAC 3780

 86112091 AGTGATGTTAAAATCTGAATCCAAAAGGATAGTAGAAGACATGAAACAAGGAAAGCTCAC 86112150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AGTGATGTTAAAATCTGAATCCAAAAGGATAGTAGAAGACATGAAACAAGGAAAGCTCAC 3840

 86112151 AATGAAATTTGACAGATTATTACAGGTCTTGCACTACAATCCGAAGGCACAACTTTGGAT 86112210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AATGAAATTTGACAGATTATTACAGGTCTTGCACTACAATCCGAAGGCACAACTTTGGAT 3900

 86112211 CAAAGACAAATGGAGAAAATTGGTTTAGAGGCAGCCTGTATGAGAAAGAATTACAGGATT 86112270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CAAAGACAAATGGAGAAAATTGGTTTAGAGGCAGCCTGTATGAGAAAGAATTACAGGATT 3960

 86112271 AGTTGAATTCAAATTCAGTGTGACTCAACAATGAGATTTGTTTGCCAAGGAACTAATGTG 86112330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGTTGAATTCAAATTCAGTGTGACTCAACAATGAGATTTGTTTGCCAAGGAACTAATGTG 4020

 86112331 ATCTAAAGGTATATTAACTTCTATTGTTCCTGATATTTTATGTCTAGATATTCTGATAGC 86112390
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4021 ATCTAAAGGTATATTAACTTCTATTGTTCCTGATATTTTATATCTAGATATTCTGATAGC 4080

 86112391 TAGAATGGCATTAGGGATAGTATTTCTTTACTTTGAATTGGTTAGATCTTACCAGGATGA 86112450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TAGAATGGCATTAGGGATAGTATTTCTTTACTTTGAATTGGTTAGATCTTACCAGGATGA 4140

 86112451 TTTTTGAAAGATAGGAGAATGGTAAAGTGAACTTCACTTCATGTCATTTGAGCAGTGGTT 86112510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTTTTGAAAGATAGGAGAATGGTAAAGTGAACTTCACTTCATGTCATTTGAGCAGTGGTT 4200

 86112511 GAGGAAACCTATCATGCCTGGAGAAATATAATTGCTCCCCTCAGATATTTAAGGAGCTAT 86112570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GAGGAAACCTATCATGCCTGGAGAAATATAATTGCTCCCCTCAGATATTTAAGGAGCTAT 4260

 86112571 TATATGGAAGATGAATTTTGTTTTTTTTTCTATATAAGTAACTCTCAAAGTTAGGCCTGC 86112630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TATATGGAAGATGAATTTTGTTTTTTTTTCTATATAAGTAACTCTCAAAGTTAGGCCTGC 4320

 86112631 TAGCTACAAGTTATTTTACCTGATTGTAGTCTAATTTCCTGCTCAACAGACTACAAACCT 86112690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TAGCTACAAGTTATTTTACCTGATTGTAGTCTAATTTCCTGCTCAACAGACTACAAACCT 4380

 86112691 AGACTTTCCAAGCAAATGAAAATCTAAACAAATACTAACAGAAAATTGGTATAACTCTTT 86112750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGACTTTCCAAGCAAATGAAAATCTAAACAAATACTAACAGAAAATTGGTATAACTCTTT 4440

 86112751 CACTTTTATTCATCTTAAAAGTGTTGTTACCTTTTACAGAAAACCTTTAGGAATGTGCTA 86112810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CACTTTTATTCATCTTAAAAGTGTTGTTACCTTTTACAGAAAACCTTTAGGAATGTGCTA 4500

 86112811 AAATCGTTTACAGTACTTATTAAACTTTCTTCTGCCTCTAACTCTGTGCATAGGATTCTG 86112870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AAATCGTTTACAGTACTTATTAAACTTTCTTCTGCCTCTAACTCTGTGCATAGGATTCTG 4560

 86112871 TTATAGACCAAACTTCATTACCTCAAAGTAAAATACCAGTTACTACTGCTGATACAGTAG 86112930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TTATAGACCAAACTTCATTACCTCAAAGTAAAATACCAGTTACTACTGCTGATACAGTAG 4620

 86112931 GTGTACCTTAGAACTGTTGAGTCTCAGAGTTGTTAAGAATGGACTATTGATGAATCAGAT 86112990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GTGTACCTTAGAACTGTTGAGTCTCAGAGTTGTTAAGAATGGACTATTGATGAATCAGAT 4680

 86112991 AACAGATTTTGGTGGAGATAAAGCTAAAGTTTTTTCTTGCCTTTTTATTTCCATCTTAAC 86113050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AACAGATTTTGGTGGAGATAAAGCTAAAGTTTTTTCTTGCCTTTTTATTTCCATCTTAAC 4740

 86113051 TTTAATATAACTTTGGAAGGAGTAGGTCCTTTTTCTCTCTAATAGATAATAGAAAAACAC 86113110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTTAATATAACTTTGGAAGGAGTAGGTCCTTTTTCTCTCTAATAGATAATAGAAAAACAC 4800

 86113111 CATTATCTACAAAACATATGACATTTTTTCATTAGGGAATTTATATTGTTATTTTAATAC 86113170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CATTATCTACAAAACATATGACATTTTTTCATTAGGGAATTTATATTGTTATTTTAATAC 4860

 86113171 AAACAGTGAGAAGAGCTATAGGTCAATTGTTCCACAATTAATGCCATCATTTTGGGTAGG 86113230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 AAACAGTGAGAAGAGCTATAGGTCAATTGTTCCACAATTAATGCCATCATTTTGGGTAGG 4920

 86113231 CACATCTCAGCTTTTAACTGCTTTATAGCTGAATAATTCGATACAACAAATCACCTTAAT 86113290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CACATCTCAGCTTTTAACTGCTTTATAGCTGAATAATTCGATACAACAAATCACCTTAAT 4980

 86113291 GTCACCTATAGGTACATTTAGAAATCAGTGTATTTTTTAATTGTGGTAAGGATATTTAAT 86113350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GTCACCTATAGGTACATTTAGAAATCAGTGTATTTTTTAATTGTGGTAAGGATATTTAAT 5040

 86113351 ATGAGATTTGTCCTCTTAACAAATTTTAGGTGTACAATATATTATCGTTGATTCCAAGTA 86113410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     5041 ATGAGATTTGTCCTCTTAACAAATTTTAGGTGTACAATATATTATCGTTGATTCCAGGTA 5100

 86113411 AATATTGTATGACAGATCTCCAAAGCTTATTCATCTTATTTAACTGAAATTTTGTGCCTG 86113470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AATATTGTATGACAGATCTCCAAAGCTTATTCATCTTATTTAACTGAAATTTTGTGCCTG 5160

 86113471 TTGATTAATAACTCATTTCTCTCTCCCTCTGTAGTTCTTGGTAACAACCATTCCAGTCCT 86113530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTGATTAATAACTCATTTCTCTCTCCCTCTGTAGTTCTTGGTAACAACCATTCCAGTCCT 5220

 86113531 TGATGTTATTAATTTCACTATTTTGGAAGGAATTGAAACTCTATCACCCCCCTCCCCTTT 86113590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TGATGTTATTAATTTCACTATTTTGGAAGGAATTGAAACTCTATCACCCCCCTCCCCTTT 5280

 86113591 CCCTCCAATAGTAAGGCTTTCACTGTTTGTTTTTATTGGGAAGTGAGTTATTTCTTTTGT 86113650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CCCTCCAATAGTAAGGCTTTCACTGTTTGTTTTTATTGGGAAGTGAGTTATTTCTTTTGT 5340

 86113651 CCTGGTTTTCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGACTAAATTACAAATTCTATTAAAG 86113710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5341 CCTGGTTTTCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGACTAAATTACAAGTTCTATTAAAG 5400

 86113711 AAAAGATGAATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCCTCCATGATGTTTTTCAAAAGGT 86113770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AAAAGATGAATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCCTCCATGATGTTTTTCAAAAGGT 5460

 86113771 AACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTAAATAATTGGTAACA 86113830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 AACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTAAATAATTGGTAACA 5520

 86113831 AGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATTCCCCAAAGAACAAC 86113890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATTCCCCAAAGAACAAC 5580

 86113891 TTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCCAAATGACAGGT 86113950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCCAAATGACAGGT 5640

 86113951 AAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGATATCTGTCCAT 86114010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 AAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGATATCTGTCCAT 5700

 86114011 AGTTAATCATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGTGA 86114070
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AGTTAATCATTTATCTAGGGTACACTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGTGA 5760

 86114071 ATGATTTTAGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACCCC 86114130
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 ATGATTTTAGGCTGACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACCCC 5820

 86114131 ATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAACAC 86114190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 ATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAACAC 5880

 86114191 TCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAATGA 86114250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAATGA 5940

 86114251 CAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGAAG 86114310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 CAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGAAG 6000

 86114311 CTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCTTA 86114370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCTTA 6060

 86114371 CTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTCAC 86114430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTCAC 6120

 86114431 TGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCATCC 86114490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCATCC 6180

 86114491 TGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACTGT 86114550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACTGT 6240

 86114551 TGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTCTC 86114610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTCTC 6300

 86114611 TTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATGTATGTTCACCA 86114670
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 TTCACTGGTTACCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATGTATGTTCACCA 6360

 86114671 CTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAAAG 86114730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 CTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAAAG 6420

 86114731 TAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCATT 86114790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 TAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCATT 6480

 86114791 CATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATTCT 86114850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATTCT 6540

 86114851 CTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAATTC 86114910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 CTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAATTC 6600

 86114911 CTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTGCC 86114970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 CTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTGCC 6660

 86114971 TACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAGCA 86115030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 TACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAGCA 6720

 86115031 ACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGTAC 86115090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 ACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGTAC 6780

 86115091 ATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTTTAAAATCAGATGAC 86115150
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
     6781 ATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTTT------------- 6827

 86115151 ATTGAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGCTG 86115210
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6828 ---GAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGCTG 6884

 86115211 GTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAG 86115270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6885 GTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAG 6944

 86115271 CAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAA 86115330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6945 CAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAA 7004

 86115331 TGCAAGC 86115337
          |||||||
     7005 TGCAAGC 7011

EXCISED REGION

 86117859 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 86117918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7012 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 7071

 86117919 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 86117978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7072 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 7131

 86117979 ATATACAGCCATTAAAAAGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTA 86118038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7132 ATATACAGCCATTAAAAAGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTA 7191

 86118039 CAATATGTTGCTCAGTGGGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTC 86118098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7192 CAATATGTTGCTCAGTGGGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTC 7251

 86118099 AAATAATGGCAAAAATATCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATT 86118158
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7252 AAATAATGGCAAAAATCTCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATT 7311

 86118159 ATTTATATGGGACTTAGAAAAAGAAATGGATGAGT------AAGTAGGAAGAGAAAATAA 86118212
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||
     7312 ATTTATATGGGACTTAGAAAAAGAAATGGATGAGTAAGTTAAAGTAGGAAGAGAAAATAA 7371

 86118213 GTGTTTACATAATAGAAATAGAATATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCAC 86118272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7372 GTGTTTACATAATAGAAATAGAATATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCAC 7431

 86118273 ATTTCACATCTATGAGTGTATATAATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGG 86118332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7432 ATTTCACATCTATGAGTGTATATAATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGG 7491

 86118333 TGGTATCTCAAGCTGTTGGGATTTTAGGACACTTTAAAACTTTTTACTTTCTATACCTTT 86118392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7492 TGGTATCTCAAGCTGTTGGGATTTTAGGACACTTTAAAACTTTTTACTTTCTATACCTTT 7551

 86118393 TGTTTTTATAATTTTTCTATGTTTTAAATTTTACACAATGAATGCGTACTATTTATATCA 86118452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7552 TGTTTTTATAATTTTTCTATGTTTTAAATTTTACACAATGAATGCGTACTATTTATATCA 7611

 86118453 TTTGGAAAAAAATAAATTCTGCCTTTGAATAAAAGTACACATCTTATTACTTCTTAATAA 86118512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7612 TTTGGAAAAAAATAAATTCTGCCTTTGAATAAAAGTACACATCTTATTACTTCTTAATAA 7671

 86118513 GTACTGCTTAAACCCAAATAATTCCCCATGACCTATAAAATCCAACCCATAGAATGAAGC 86118572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7672 GTACTGCTTAAACCCAAATAATTCCCCATGACCTATAAAATCCAACCCATAGAATGAAGC 7731

 86118573 AGAAGTTTTTTTGTGATCTGATCCTGACTTGTTTAAAGTTTATTTCTTTTTTTTCTTTTT 86118632
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||| |||||
     7732 AGAAGTTTTTTTGTGATCTGATCCTGACTTGTTTAAAGTTTTTTTCTTTTTTTT-TTTTT 7790

 86118633 TTTTTTTTTAGTTTTAAAAGATACGATTTTATTGTTGTTTACTTCATTTTTTTTAACTTT 86118692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7791 TTTTTTTTTAGTTTTAAAAGATACGATTTTATTGTTGTTTACTTCATTTTTTTTAACTTT 7850

 86118693 TATCTAAACTTCAGGAGCACATGTGCAGGTTTGTTACATAGGTAAACTTGTGTGATGGGG 86118752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7851 TATCTAAACTTCAGGAGCACATGTGCAGGTTTGTTACATAGGTAAACTTGTGTGATGGGG 7910

 86118753 GTTTGTTTTTTTTTATTATTTAAGTTTTACGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTTGTTA 86118812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7911 GTTTGTTTTTTTTTATTATTTAAGTTTTACGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTTGTTA 7970

 86118813 CATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCAC 86118847
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7971 CATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCAC 8005

Alignment time is 6.33808 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    2165] =>      2165 nucs 'mol-32-2b08-089546_2165'

Score:        2086
Aligned:      2181        nucs
Identic:      2156 ( 99%) nucs =>      1407 ( 99%)       749 ( 99%)
Gaps:           22 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86113913,86115337] EXCISED REGION [86117859,86118608]
 second seq =>  [       1,    1409] EXCISED REGION [    1410,    2165]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2521 nucs [86115338,86117858]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117859,86117859]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117858,86117858]
 second seq =>         0 nucs

 86113913 AGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAG 86113972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAG 60

 86113973 AATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTA 86114032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTA 120

 86114033 CATTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACAACTGG 86114092
          ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      121 CACTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTGACAACTGG 180

 86114093 AAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTC 86114152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTC 240

 86114153 TGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCAT 86114212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCAT 300

 86114213 CTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGG 86114272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGG 360

 86114273 GTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCA 86114332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCA 420

 86114333 TTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAA 86114392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAA 480

 86114393 AGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATG 86114452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATG 540

 86114453 AAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTT 86114512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTT 600

 86114513 CAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGT 86114572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGT 660

 86114573 CTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTT 86114632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTT 720

 86114633 AAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGA 86114692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGA 780

 86114693 AAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTT 86114752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTT 840

 86114753 GTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAAT 86114812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAAT 900

 86114813 CAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAG 86114872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAG 960

 86114873 AGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCT 86114932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCT 1020

 86114933 TTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTG 86114992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTG 1080

 86114993 TTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGT 86115052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGT 1140

 86115053 GGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTT 86115112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTT 1200

 86115113 CTGAAGGGAATTACAATCTTATTTTAAAATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTTACATT 86115172
          |||||||||||||||||||||||||                |||||||||||||||||||
     1201 CTGAAGGGAATTACAATCTTATTTT----------------GAAAAATTCAAGTTACATT 1244

 86115173 ACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGT 86115232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 ACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGT 1304

 86115233 CAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTC 86115292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 CAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTC 1364

 86115293 AGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGC 86115337
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 AGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGC 1409

EXCISED REGION

 86117859 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 86117918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 1469

 86117919 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 86117978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 1529

 86117979 ATATACAGCCATTAAAAAGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTA 86118038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 ATATACAGCCATTAAAAAGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTA 1589

 86118039 CAATATGTTGCTCAGTGGGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTC 86118098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 CAATATGTTGCTCAGTGGGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTC 1649

 86118099 AAATAATGGCAAAAATATCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATT 86118158
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 AAATAATGGCAAAAATCTCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATT 1709

 86118159 ATTTATATGGGACTTAGAAAAAGAAATGGATGAGT------AAGTAGGAAGAGAAAATAA 86118212
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||
     1710 ATTTATATGGGACTTAGAAAAAGAAATGGATGAGTAAGTTAAAGTAGGAAGAGAAAATAA 1769

 86118213 GTGTTTACATAATAGAAATAGAATATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCAC 86118272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 GTGTTTACATAATAGAAATAGAATATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCAC 1829

 86118273 ATTTCACATCTATGAGTGTATATAATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGG 86118332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 ATTTCACATCTATGAGTGTATATAATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGG 1889

 86118333 TGGTATCTCAAGCTGTTGGGATTTTAGGACACTTTAAAACTTTTTACTTTCTATACCTTT 86118392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 TGGTATCTCAAGCTGTTGGGATTTTAGGACACTTTAAAACTTTTTACTTTCTATACCTTT 1949

 86118393 TGTTTTTATAATTTTTCTATGTTTTAAATTTTACACAATGAATGCGTACTATTTATATCA 86118452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 TGTTTTTATAATTTTTCTATGTTTTAAATTTTACACAATGAATGCGTACTATTTATATCA 2009

 86118453 TTTGGAAAAAAATAAATTCTGCCTTTGAATAAAAGTACACATCTTATTACTTCTTAATAA 86118512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 TTTGGAAAAAAATAAATTCTGCCTTTGAATAAAAGTACACATCTTATTACTTCTTAATAA 2069

 86118513 GTACTGCTTAAACCCAAATAATTCCCCATGACCTATAAAATCCAACCCATAGAATGAAGC 86118572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 GTACTGCTTAAACCCAAATAATTCCCCATGACCTATAAAATCCAACCCATAGAATGAAGC 2129

 86118573 AGAAGTTTTTTTGTGATCTGATCCTGACTTGTTTAA 86118608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 AGAAGTTTTTTTGTGATCTGATCCTGACTTGTTTAA 2165

Alignment time is 1.75994 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    2718] =>      2718 nucs 'mol-32-2b4a-085935_2718'

Score:        2606
Aligned:      2734        nucs
Identic:      2706 ( 99%) nucs =>      1982 ( 99%)       724 ( 99%)
Gaps:           22 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86113335,86115337] EXCISED REGION [86117859,86118583]
 second seq =>  [       1,    1987] EXCISED REGION [    1988,    2718]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2521 nucs [86115338,86117858]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117859,86117859]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117858,86117858]
 second seq =>         0 nucs

 86113335 GGTAAGGATATTTAATATGAGATTTGTCCTCTTAACAAATTTTAGGTGTACAATATATTA 86113394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTAAGGATATTTAATATGAGATTTGTCCTCTTAACAAATTTTAGGTGTACAATATATTA 60

 86113395 TCGTTGATTCCAAGTAAATATTGTATGACAGATCTCCAAAGCTTATTCATCTTATTTAAC 86113454
          ||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCGTTGATTCCAGGTAAATATTGTACGACAGATCTCCAAAGCTTATTCATCTTATTTAAC 120

 86113455 TGAAATTTTGTGCCTGTTGATTAATAACTCATTTCTCTCTCCCTCTGTAGTTCTTGGTAA 86113514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAAATTTTGTGCCTGTTGATTAATAACTCATTTCTCTCTCCCTCTGTAGTTCTTGGTAA 180

 86113515 CAACCATTCCAGTCCTTGATGTTATTAATTTCACTATTTTGGAAGGAATTGAAACTCTAT 86113574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAACCATTCCAGTCCTTGATGTTATTAATTTCACTATTTTGGAAGGAATTGAAACTCTAT 240

 86113575 CACCCCCCTCCCCTTTCCCTCCAATAGTAAGGCTTTCACTGTTTGTTTTTATTGGGAAGT 86113634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACCCCCCTCCCCTTTCCCTCCAATAGTAAGGCTTTCACTGTTTGTTTTTATTGGGAAGT 300

 86113635 GAGTTATTTCTTTTGTCCTGGTTTTCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGACTAAATT 86113694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGTTATTTCTTTTGTCCTGGTTTTCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGACTAAATT 360

 86113695 ACAAATTCTATTAAAGAAAAGATGAATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCCTCCATG 86113754
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAAGTTCTATTAAAGAAAAGATGAATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCCTCCATG 420

 86113755 ATGTTTTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATT 86113814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTTTTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATT 480

 86113815 TAAATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTA 86113874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTA 540

 86113875 TTCCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCA 86113934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCA 600

 86113935 AATCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCA 86113994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCA 660

 86113995 GATGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTT 86114054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      661 GATGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACACTGTCCACCTTGGTCCACTT 720

 86114055 AAATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTT 86114114
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTGACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTT 780

 86114115 TTGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGG 86114174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGG 840

 86114175 TTTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACA 86114234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACA 900

 86114235 ATAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAG 86114294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAG 960

 86114295 AGATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGA 86114354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGA 1020

 86114355 ACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTG 86114414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTG 1080

 86114415 ATTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTT 86114474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTT 1140

 86114475 CTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGC 86114534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGC 1200

 86114535 ACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTT 86114594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTT 1260

 86114595 TTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTT 86114654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTT 1320

 86114655 AAATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTG 86114714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTG 1380

 86114715 CCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAG 86114774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAG 1440

 86114775 GTAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATG 86114834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATG 1500

 86114835 TTAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTA 86114894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTA 1560

 86114895 ATATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCA 86114954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCA 1620

 86114955 TTGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAAC 86115014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAAC 1680

 86115015 AAATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCA 86115074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCA 1740

 86115075 GTGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTAT 86115134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTAT 1800

 86115135 TTTAAAATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACA 86115194
          |||                |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTT----------------GAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACA 1844

 86115195 TGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAG 86115254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 TGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAG 1904

 86115255 GAAGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACA 86115314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 GAAGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACA 1964

 86115315 AGTGCAGACAGCCTAATGCAAGC 86115337
          |||||||||||||||||||||||
     1965 AGTGCAGACAGCCTAATGCAAGC 1987

EXCISED REGION

 86117859 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 86117918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 2047

 86117919 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 86117978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 2107

 86117979 ATATACAGCCATTAAAAAGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTA 86118038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 ATATACAGCCATTAAAAAGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTA 2167

 86118039 CAATATGTTGCTCAGTGGGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTC 86118098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 CAATATGTTGCTCAGTGGGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTC 2227

 86118099 AAATAATGGCAAAAATATCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATT 86118158
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 AAATAATGGCAAAAATCTCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATT 2287

 86118159 ATTTATATGGGACTTAGAAAAAGAAATGGATGAGT------AAGTAGGAAGAGAAAATAA 86118212
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||
     2288 ATTTATATGGGACTTAGAAAAAGAAATGGATGAGTAAGTTAAAGTAGGAAGAGAAAATAA 2347

 86118213 GTGTTTACATAATAGAAATAGAATATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCAC 86118272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 GTGTTTACATAATAGAAATAGAATATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCAC 2407

 86118273 ATTTCACATCTATGAGTGTATATAATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGG 86118332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 ATTTCACATCTATGAGTGTATATAATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGG 2467

 86118333 TGGTATCTCAAGCTGTTGGGATTTTAGGACACTTTAAAACTTTTTACTTTCTATACCTTT 86118392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 TGGTATCTCAAGCTGTTGGGATTTTAGGACACTTTAAAACTTTTTACTTTCTATACCTTT 2527

 86118393 TGTTTTTATAATTTTTCTATGTTTTAAATTTTACACAATGAATGCGTACTATTTATATCA 86118452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 TGTTTTTATAATTTTTCTATGTTTTAAATTTTACACAATGAATGCGTACTATTTATATCA 2587

 86118453 TTTGGAAAAAAATAAATTCTGCCTTTGAATAAAAGTACACATCTTATTACTTCTTAATAA 86118512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 TTTGGAAAAAAATAAATTCTGCCTTTGAATAAAAGTACACATCTTATTACTTCTTAATAA 2647

 86118513 GTACTGCTTAAACCCAAATAATTCCCCATGACCTATAAAATCCAACCCATAGAATGAAGC 86118572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 GTACTGCTTAAACCCAAATAATTCCCCATGACCTATAAAATCCAACCCATAGAATGAAGC 2707

 86118573 AGAAGTTTTTT 86118583
          |||||||||||
     2708 AGAAGTTTTTT 2718

Alignment time is 2.21842 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    2734] =>      2734 nucs 'mol-32-2ef1-098991_2734'

Score:        2633
Aligned:      2750        nucs
Identic:      2723 ( 99%) nucs =>      2025 ( 99%)       698 ( 99%)
Gaps:           22 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86113293,86115337] EXCISED REGION [86117859,86118557]
 second seq =>  [       1,    2029] EXCISED REGION [    2030,    2734]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2521 nucs [86115338,86117858]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117859,86117859]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117858,86117858]
 second seq =>         0 nucs

 86113293 CACCTATAGGTACATTTAGAAATCAGTGTATTTTTTAATTGTGGTAAGGATATTTAATAT 86113352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACCTATAGGTACATTTAGAAATCAGTGTATTTTTTAATTGTGGTAAGGATATTTAATAT 60

 86113353 GAGATTTGTCCTCTTAACAAATTTTAGGTGTACAATATATTATCGTTGATTCCAAGTAAA 86113412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
       61 GAGATTTGTCCTCTTAACAAATTTTAGGTGTACAATATATTATCGTTGATTCCAGGTAAA 120

 86113413 TATTGTATGACAGATCTCCAAAGCTTATTCATCTTATTTAACTGAAATTTTGTGCCTGTT 86113472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATTGTATGACAGATCTCCAAAGCTTATTCATCTTATTTAACTGAAATTTTGTGCCTGTT 180

 86113473 GATTAATAACTCATTTCTCTCTCCCTCTGTAGTTCTTGGTAACAACCATTCCAGTCCTTG 86113532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATTAATAACTCATTTCTCTCTCCCTCTGTAGTTCTTGGTAACAACCATTCCAGTCCTTG 240

 86113533 ATGTTATTAATTTCACTATTTTGGAAGGAATTGAAACTCTATCACCCCCCTCCCCTTTCC 86113592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTTATTAATTTCACTATTTTGGAAGGAATTGAAACTCTATCACCCCCCTCCCCTTTCC 300

 86113593 CTCCAATAGTAAGGCTTTCACTGTTTGTTTTTATTGGGAAGTGAGTTATTTCTTTTGTCC 86113652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCCAATAGTAAGGCTTTCACTGTTTGTTTTTATTGGGAAGTGAGTTATTTCTTTTGTCC 360

 86113653 TGGTTTTCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGACTAAATTACAAATTCTATTAAAGAA 86113712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      361 TGGTTTTCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGACTAAATTACAAGTTCTATTAAAGAA 420

 86113713 AAGATGAATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCCTCCATGATGTTTTTCAAAAGGTAA 86113772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGATGAATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCCTCCATGATGTTTTTCAAAAGGTAA 480

 86113773 CTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTAAATAATTGGTAACAAG 86113832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTAAATAATTGGTAACAAG 540

 86113833 AAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATTCCCCAAAGAACAACTT 86113892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATTCCCCAAAGAACAACTT 600

 86113893 ATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCCAAATGACAGGTAA 86113952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCCAAATGACAGGTAA 660

 86113953 ATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGATATCTGTCCATAG 86114012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGATATCTGTCCATAG 720

 86114013 TTAATCATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGTGAAT 86114072
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAATCATTTATCTAGGGTACACTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGTGAAT 780

 86114073 GATTTTAGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACCCCAT 86114132
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GATTTTAGGCTGACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACCCCAT 840

 86114133 CAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAACACTC 86114192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAACACTC 900

 86114193 AAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAATGACA 86114252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAATGACA 960

 86114253 AATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGAAGCT 86114312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGAAGCT 1020

 86114313 TAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCTTACT 86114372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCTTACT 1080

 86114373 TTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTCACTG 86114432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTCACTG 1140

 86114433 AACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCATCCTG 86114492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCATCCTG 1200

 86114493 CATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACTGTTG 86114552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACTGTTG 1260

 86114553 CAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTCTCTT 86114612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTCTCTT 1320

 86114613 CACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATGTATGTTCACCACT 86114672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATGTATGTTCACCACT 1380

 86114673 TTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAAAGTA 86114732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAAAGTA 1440

 86114733 AGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCATTCA 86114792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCATTCA 1500

 86114793 TATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATTCTCT 86114852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATTCTCT 1560

 86114853 ATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAATTCCT 86114912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAATTCCT 1620

 86114913 ACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTGCCTA 86114972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTGCCTA 1680

 86114973 CTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAGCAAC 86115032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAGCAAC 1740

 86115033 TACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGTACAT 86115092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGTACAT 1800

 86115093 ATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTTTAAAATCAGATGACAT 86115152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
     1801 ATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTTT--------------- 1845

 86115153 TGAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGCTGGT 86115212
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 -GAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGCTGGT 1904

 86115213 GGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCA 86115272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 GGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCA 1964

 86115273 GGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAATG 86115332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 GGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAATG 2024

 86115333 CAAGC 86115337
          |||||
     2025 CAAGC 2029

EXCISED REGION

 86117859 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 86117918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 2089

 86117919 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 86117978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 2149

 86117979 ATATACAGCCATTAAAAAGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTA 86118038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 ATATACAGCCATTAAAAAGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTA 2209

 86118039 CAATATGTTGCTCAGTGGGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTC 86118098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 CAATATGTTGCTCAGTGGGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTC 2269

 86118099 AAATAATGGCAAAAATATCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATT 86118158
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 AAATAATGGCAAAAATCTCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATT 2329

 86118159 ATTTATATGGGACTTAGAAAAAGAAATGGATGAGT------AAGTAGGAAGAGAAAATAA 86118212
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||
     2330 ATTTATATGGGACTTAGAAAAAGAAATGGATGAGTAAGTTAAAGTAGGAAGAGAAAATAA 2389

 86118213 GTGTTTACATAATAGAAATAGAATATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCAC 86118272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 GTGTTTACATAATAGAAATAGAATATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCAC 2449

 86118273 ATTTCACATCTATGAGTGTATATAATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGG 86118332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 ATTTCACATCTATGAGTGTATATAATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGG 2509

 86118333 TGGTATCTCAAGCTGTTGGGATTTTAGGACACTTTAAAACTTTTTACTTTCTATACCTTT 86118392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 TGGTATCTCAAGCTGTTGGGATTTTAGGACACTTTAAAACTTTTTACTTTCTATACCTTT 2569

 86118393 TGTTTTTATAATTTTTCTATGTTTTAAATTTTACACAATGAATGCGTACTATTTATATCA 86118452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 TGTTTTTATAATTTTTCTATGTTTTAAATTTTACACAATGAATGCGTACTATTTATATCA 2629

 86118453 TTTGGAAAAAAATAAATTCTGCCTTTGAATAAAAGTACACATCTTATTACTTCTTAATAA 86118512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 TTTGGAAAAAAATAAATTCTGCCTTTGAATAAAAGTACACATCTTATTACTTCTTAATAA 2689

 86118513 GTACTGCTTAAACCCAAATAATTCCCCATGACCTATAAAATCCAA 86118557
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 GTACTGCTTAAACCCAAATAATTCCCCATGACCTATAAAATCCAA 2734

Alignment time is 2.20233 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    7771] =>      7771 nucs 'mol-32-2f33-099949_7771'

Score:        5893
Aligned:      5932        nucs
Identic:      5926 (100%) nucs =>      5899 (100%)        27 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86110253,86116157] EXCISED REGION [86116199,86116225]
 second seq =>  [       1,    5901] EXCISED REGION [    5943,    5969]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        41 nucs [86116158,86116198]
 second seq =>        41 nucs [5902,5942]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 86110253 TTGTCATTCATCAAAAGTATGCTATTGTACCATGAAGAGCAATCTCTGCTGACCAGGCTG 86110312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTCATTCATCAAAAGTATGCTATTGTACCATGAAGAGCAATCTCTGCTGACCAGGCTG 60

 86110313 TTTACAAGTATCAGAAGAAATGCAATGTCAGGCTTTTGGTACTATAATTCCATGGGCAGT 86110372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTACAAGTATCAGAAGAAATGCAATGTCAGGCTTTTGGTACTATAATTCCATGGGCAGT 120

 86110373 CTCTTGATTTTCCACATAAAATAGATCTACTTTATACAAGGCACTTTTCTCTTAGAATTT 86110432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTTGATTTTCCACATAAAATAGATCTACTTTATACAAGGCACTTTTCTCTTAGAATTT 180

 86110433 TTTTTAAGTTTAGTTTTAAAATCTAAAGCTAATTCTAAATAAATGCTGTCCTGTGCACTG 86110492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTTAAGTTTAGTTTTAAAATCTAAAGCTAATTCTAAATAAATGCTGTCCTGTGCACTG 240

 86110493 TAAGATTTAGTAATATCTGTGGCCTTTTCGTACTAGATGACAGTTGCACCCCACCAAACT 86110552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAGATTTAGTAATATCTGTGGCCTTTTCGTACTAGATGACAGTTGCACCCCACCAAACT 300

 86110553 TGGACACTAAAATTATCTCCCAAGGAGCAAAACTGCCCCCAGTTGAGAACCACTGCTTTG 86110612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGACACTAAAATTATCTCCCAAGGAGCAAAACTGCCCCCAGTTGAGAACCACTGCTTTG 360

 86110613 GAACTTGACTGTTTCCCTTCCATTCTTTCTGTTTTTCTTGTCTCCTCTTTTGGGGCCCAT 86110672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAACTTGACTGTTTCCCTTCCATTCTTTCTGTTTTTCTTGTCTCCTCTTTTGGGGCCCAT 420

 86110673 TATAAAATATAGGGTTGAAATGTTCCTCTTTCTAAATTACTTATTGGGCTGCTTATTCTG 86110732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATAAAATATAGGGTTGAAATGTTCCTCTTTCTAAATTACTTATTGGGCTGCTTATTCTG 480

 86110733 GAAGATTGACCTAGGGTTAATCACAAGGCAAGACCTGGTTTAGAATCAGTGAGATGACCC 86110792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAGATTGACCTAGGGTTAATCACAAGGCAAGACCTGGTTTAGAATCAGTGAGATGACCC 540

 86110793 TTACTGGAAATGATGATTGCATGGTAATTTTAAGTATGCTAGCTTTTTATGTGAGGGTGA 86110852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTACTGGAAATGATGATTGCATGGTAATTTTAAGTATGCTAGCTTTTTATGTGAGGGTGA 600

 86110853 TACTAAGGATGTACTGTACTACAAACATATGATACTGAAAGGTGTTTATGTGAAAGTAGT 86110912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACTAAGGATGTACTGTACTACAAACATATGATACTGAAAGGTGTTTATGTGAAAGTAGT 660

 86110913 CATAGGGTGAACTAAATTTTACAGGAAGATTTAATGTAATTTGAGCTAAAGCTTTAGGAG 86110972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATAGGGTGAACTAAATTTTACAGGAAGATTTAATGTAATTTGAGCTAAAGCTTTAGGAG 720

 86110973 AGAATGTTAGAAGGATCACTGGACACAGGAACTGAGTCATTTAATAAGAAACATTTCCAA 86111032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAATGTTAGAAGGATCACTGGACACAGGAACTGAGTCATTTAATAAGAAACATTTCCAA 780

 86111033 TATTCTAGATCATCCAAATTATATAACTAAGAAAAAAATATATATATTTCTCATCATATA 86111092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTCTAGATCATCCAAATTATATAACTAAGAAAAAAATATATATATTTCTCATCATATA 840

 86111093 AAAATAAACTGTTATGACTAGCAAAATAAAATTTATTGCTATAATTATAATTACTACAAT 86111152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAAATAAACTGTTATGACTAGCAAAATAAAATTTATTGCTATAATTATAATTACTACAAT 900

 86111153 TATACTAAAAAGATACACAATCTTTAATAACCATAAGCTCATTAATCCTCATATTAATAT 86111212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATACTAAAAAGATACACAATCTTTAATAACCATAAGCTCATTAATCCTCATATTAATAT 960

 86111213 GTAATAGTTGCTCATCACAACTGTTACCCAACCTTGAAAATGGAACTTATAGATCTTTTA 86111272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTAATAGTTGCTCATCACAACTGTTACCCAACCTTGAAAATGGAACTTATAGATCTTTTA 1020

 86111273 TTTTGTCCACGTATAAGACAAATTTAAACTCTAAAAGCAATTTATTTGTTGCAGTTAACA 86111332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTGTCCACGTATAAGACAAATTTAAACTCTAAAAGCAATTTATTTGTTGCAGTTAACA 1080

 86111333 AAGACTTGTGATTTCTACTGGAAAAGAAAGGAAAACAAATTTTTGGAAGTGCTAACTTAA 86111392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGACTTGTGATTTCTACTGGAAAAGAAAGGAAAACAAATTTTTGGAAGTGCTAACTTAA 1140

 86111393 ATTAGTGTGTTTTTATTATTTTTCTTGTTTTTATGTCTGTCTTCATAACCAAACATTTCT 86111452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTAGTGTGTTTTTATTATTTTTCTTGTTTTTATGTCTGTCTTCATAACCAAACATTTCT 1200

 86111453 AATGAAAGGGCTACAACTTTCAATCAATTAATAATCTGAATTATAAATCAGGAAAAAGTC 86111512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATGAAAGGGCTACAACTTTCAATCAATTAATAATCTGAATTATAAATCAGGAAAAAGTC 1260

 86111513 GCAGACAACATGTAACTGAAATTCATCAAAGCATAAGATAAGATAGCACATAATATATTG 86111572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCAGACAACATGTAACTGAAATTCATCAAAGCATAAGATAAGATAGCACATAATATATTG 1320

 86111573 TCAGAATATTTTTTAAAATATTAGTCATTTACACATGTATATATATCATTATTTATCCAA 86111632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAGAATATTTTTTAAAATATTAGTCATTTACACATGTATATATATCATTATTTATCCAA 1380

 86111633 ACCTATAAAATGTGCAACATCAAAAGTGAATCCTAATGTTAAACTATGAACTTTTCGTGA 86111692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACCTATAAAATGTGCAACATCAAAAGTGAATCCTAATGTTAAACTATGAACTTTTCGTGA 1440

 86111693 TAATAATGTGTCAGTACAGGTTTATCAGTTGTACTATTCTAGTGGGGGATGGTGATATTG 86111752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAATAATGTGTCAGTACAGGTTTATCAGTTGTACTATTCTAGTGGGGGATGGTGATATTG 1500

 86111753 GAAATAGCTACGCATGAGTAGGGGCAGGGGATAGATGAGAAATCTCTGTACCTCCCTGTC 86111812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAATAGCTACGCATGAGTAGGGGCAGGGGATAGATGAGAAATCTCTGTACCTCCCTGTC 1560

 86111813 AATCTTGTTGTCAATCTAAAACTGCTCAAAAATTTAAAAACATTCTTTAAAAATCTGTAA 86111872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATCTTGTTGTCAATCTAAAACTGCTCAAAAATTTAAAAACATTCTTTAAAAATCTGTAA 1620

 86111873 TTTATATTATTAACTGTTGAAACTATTATGACTAAAGATTCTGGTTATTTAAAATTGATA 86111932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTATATTATTAACTGTTGAAACTATTATGACTAAAGATTCTGGTTATTTAAAATTGATA 1680

 86111933 ATAATTGTGAAACAATGATCAGATATTATATGACAAGACACCATATCTACACTTGTCCTA 86111992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAATTGTGAAACAATGATCAGATATTATATGACAAGACACCATATCTACACTTGTCCTA 1740

 86111993 TTTAACATTTATATCAATAACTTAGATGAAGCAAATGCTTGGGGCATGCTTTGCAAATGT 86112052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTAACATTTATATCAATAACTTAGATGAAGCAAATGCTTGGGGCATGCTTTGCAAATGT 1800

 86112053 GACGACAACAGTAAAAAGCCAGAAAGGACAGCAAATACAGTGATGTTAAAATCTGAATCC 86112112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GACGACAACAGTAAAAAGCCAGAAAGGACAGCAAATACAGTGATGTTAAAATCTGAATCC 1860

 86112113 AAAAGGATAGTAGAAGACATGAAACAAGGAAAGCTCACAATGAAATTTGACAGATTATTA 86112172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAAGGATAGTAGAAGACATGAAACAAGGAAAGCTCACAATGAAATTTGACAGATTATTA 1920

 86112173 CAGGTCTTGCACTACAATCCGAAGGCACAACTTTGGATCAAAGACAAATGGAGAAAATTG 86112232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGGTCTTGCACTACAATCCGAAGGCACAACTTTGGATCAAAGACAAATGGAGAAAATTG 1980

 86112233 GTTTAGAGGCAGCCTGTATGAGAAAGAATTACAGGATTAGTTGAATTCAAATTCAGTGTG 86112292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTTTAGAGGCAGCCTGTATGAGAAAGAATTACAGGATTAGTTGAATTCAAATTCAGTGTG 2040

 86112293 ACTCAACAATGAGATTTGTTTGCCAAGGAACTAATGTGATCTAAAGGTATATTAACTTCT 86112352
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTCAACAATGAGATTTGCTTGCCAAGGAACTAATGTGATCTAAAGGTATATTAACTTCT 2100

 86112353 ATTGTTCCTGATATTTTATGTCTAGATATTCTGATAGCTAGAATGGCATTAGGGATAGTA 86112412
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTGTTCCTGATATTTTATATCTAGATATTCTGATAGCTAGAATGGCATTAGGGATAGTA 2160

 86112413 TTTCTTTACTTTGAATTGGTTAGATCTTACCAGGATGATTTTTGAAAGATAGGAGAATGG 86112472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTCTTTACTTTGAATTGGTTAGATCTTACCAGGATGATTTTTGAAAGATAGGAGAATGG 2220

 86112473 TAAAGTGAACTTCACTTCATGTCATTTGAGCAGTGGTTGAGGAAACCTATCATGCCTGGA 86112532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAAAGTGAACTTCACTTCATGTCATTTGAGCAGTGGTTGAGGAAACCTATCATGCCTGGA 2280

 86112533 GAAATATAATTGCTCCCCTCAGATATTTAAGGAGCTATTATATGGAAGATGAATTTTGTT 86112592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GAAATATAATTGCTCCCCTCAGATATTTAAGGAGCTATTATATGGAAGATGAATTTTGTT 2340

 86112593 TTTTTTTCTATATAAGTAACTCTCAAAGTTAGGCCTGCTAGCTACAAGTTATTTTACCTG 86112652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTTTTTCTATATAAGTAACTCTCAAAGTTAGGCCTGCTAGCTACAAGTTATTTTACCTG 2400

 86112653 ATTGTAGTCTAATTTCCTGCTCAACAGACTACAAACCTAGACTTTCCAAGCAAATGAAAA 86112712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTGTAGTCTAATTTCCTGCTCAACAGACTACAAACCTAGACTTTCCAAGCAAATGAAAA 2460

 86112713 TCTAAACAAATACTAACAGAAAATTGGTATAACTCTTTCACTTTTATTCATCTTAAAAGT 86112772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTAAACAAATACTAACAGAAAATTGGTATAACTCTTTCACTTTTATTCATCTTAAAAGT 2520

 86112773 GTTGTTACCTTTTACAGAAAACCTTTAGGAATGTGCTAAAATCGTTTACAGTACTTATTA 86112832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTTGTTACCTTTTACAGAAAACCTTTAGGAATGTGCTAAAATCGTTTACAGTACTTATTA 2580

 86112833 AACTTTCTTCTGCCTCTAACTCTGTGCATAGGATTCTGTTATAGACCAAACTTCATTACC 86112892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AACTTTCTTCTGCCTCTAACTCTGTGCATAGGATTCTGTTATAGACCAAACTTCATTACC 2640

 86112893 TCAAAGTAAAATACCAGTTACTACTGCTGATACAGTAGGTGTACCTTAGAACTGTTGAGT 86112952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCAAAGTAAAATACCAGTTACTACTGCTGATACAGTAGGTGTACCTTAGAACTGTTGAGT 2700

 86112953 CTCAGAGTTGTTAAGAATGGACTATTGATGAATCAGATAACAGATTTTGGTGGAGATAAA 86113012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTCAGAGTTGTTAAGAATGGACTATTGATGAATCAGATAACAGATTTTGGTGGAGATAAA 2760

 86113013 GCTAAAGTTTTTTCTTGCCTTTTTATTTCCATCTTAACTTTAATATAACTTTGGAAGGAG 86113072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCTAAAGTTTTTTCTTGCCTTTTTATTTCCATCTTAACTTTAATATAACTTTGGAAGGAG 2820

 86113073 TAGGTCCTTTTTCTCTCTAATAGATAATAGAAAAACACCATTATCTACAAAACATATGAC 86113132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TAGGTCCTTTTTCTCTCTAATAGATAATAGAAAAACACCATTATCTACAAAACATATGAC 2880

 86113133 ATTTTTTCATTAGGGAATTTATATTGTTATTTTAATACAAACAGTGAGAAGAGCTATAGG 86113192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTTTTTCATTAGGGAATTTATATTGTTATTTTAATACAAACAGTGAGAAGAGCTATAGG 2940

 86113193 TCAATTGTTCCACAATTAATGCCATCATTTTGGGTAGGCACATCTCAGCTTTTAACTGCT 86113252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TCAATTGTTCCACAATTAATGCCATCATTTTGGGTAGGCACATCTCAGCTTTTAACTGCT 3000

 86113253 TTATAGCTGAATAATTCGATACAACAAATCACCTTAATGTCACCTATAGGTACATTTAGA 86113312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTATAGCTGAATAATTCGATACAACAAATCACCTTAATGTCACCTATAGGTACATTTAGA 3060

 86113313 AATCAGTGTATTTTTTAATTGTGGTAAGGATATTTAATATGAGATTTGTCCTCTTAACAA 86113372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AATCAGTGTATTTTTTAATTGTGGTAAGGATATTTAATATGAGATTTGTCCTCTTAACAA 3120

 86113373 ATTTTAGGTGTACAATATATTATCGTTGATTCCAAGTAAATATTGTATGACAGATCTCCA 86113432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 ATTTTAGGTGTACAATATATTATCGTTGATTCCAAGTAAATATTGTATGACAGATCTCCA 3180

 86113433 AAGCTTATTCATCTTATTTAACTGAAATTTTGTGCCTGTTGATTAATAACTCATTTCTCT 86113492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AAGCTTATTCATCTTATTTAACTGAAATTTTGTGCCTGTTGATTAATAACTCATTTCTCT 3240

 86113493 CTCCCTCTGTAGTTCTTGGTAACAACCATTCCAGTCCTTGATGTTATTAATTTCACTATT 86113552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTCCCTCTGTAGTTCTTGGTAACAACCATTCCAGTCCTTGATGTTATTAATTTCACTATT 3300

 86113553 TTGGAAGGAATTGAAACTCTATCACCCCCCTCCCCTTTCCCTCCAATAGTAAGGCTTTCA 86113612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TTGGAAGGAATTGAAACTCTATCACCCCCCTCCCCTTTCCCTCCAATAGTAAGGCTTTCA 3360

 86113613 CTGTTTGTTTTTATTGGGAAGTGAGTTATTTCTTTTGTCCTGGTTTTCCATATTCTATGA 86113672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTGTTTGTTTTTATTGGGAAGTGAGTTATTTCTTTTGTCCTGGTTTTCCATATTCTATGA 3420

 86113673 CATTCATTTATAAGACTAAATTACAAATTCTATTAAAGAAAAGATGAATTAACTTTATCA 86113732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CATTCATTTATAAGACTAAATTACAAATTCTATTAAAGAAAAGATGAATTAACTTTATCA 3480

 86113733 ATTCATCTTTGTCTCCTCCATGATGTTTTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTTA 86113792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ATTCATCTTTGTCTCCTCCATGATGTTTTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTTA 3540

 86113793 CTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTAAATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATT 86113852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTAAATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATT 3600

 86113853 TTGGATGGGAACTTAAGGTTTATTCCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATA 86113912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTGGATGGGAACTTAAGGTTTATTCCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATA 3660

 86113913 AGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAG 86113972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAG 3720

 86113973 AATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTA 86114032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTA 3780

 86114033 CATTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACAACTGG 86114092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CATTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACAACTGG 3840

 86114093 AAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTC 86114152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTC 3900

 86114153 TGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCAT 86114212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCAT 3960

 86114213 CTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGG 86114272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGG 4020

 86114273 GTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCA 86114332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCA 4080

 86114333 TTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAA 86114392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAA 4140

 86114393 AGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATG 86114452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATG 4200

 86114453 AAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTT 86114512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTT 4260

 86114513 CAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGT 86114572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGT 4320

 86114573 CTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTT 86114632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTT 4380

 86114633 AAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGA 86114692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGA 4440

 86114693 AAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTT 86114752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 AAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTT 4500

 86114753 GTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAAT 86114812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAAT 4560

 86114813 CAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAG 86114872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAG 4620

 86114873 AGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCT 86114932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCT 4680

 86114933 TTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTG 86114992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTG 4740

 86114993 TTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGT 86115052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGT 4800

 86115053 GGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTT 86115112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 GGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTT 4860

 86115113 CTGAAGGGAATTACAATCTTATTTTAAAATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTTACATT 86115172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CTGAAGGGAATTACAATCTTATTTTAAAATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTTACATT 4920

 86115173 ACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGT 86115232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 ACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGT 4980

 86115233 CAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTC 86115292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTC 5040

 86115293 AGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGCATGCCTAGGTGCAAC 86115352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGCATGCCTAGGTGCAAC 5100

 86115353 CCTCGCCCTGCTCCTTATTAGCTTGGTGATGTTAGACAACATACCACCCTGTGCTCATTC 86115412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 CCTCGCCCTGCTCCTTATTAGCTTGGTGATGTTAGACAACATACCACCCTGTGCTCATTC 5160

 86115413 TTCAATTTTTAATAAATACTACTTTTCTTATGGAGTAGTTATAAGAATTAAATGATTAAA 86115472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTCAATTTTTAATAAATACTACTTTTCTTATGGAGTAGTTATAAGAATTAAATGATTAAA 5220

 86115473 TGGCAATAGTAAGCACTTTAGGAAAGAAAGCAAGTGAAGTATTTTTATTAGTAGAGTTGC 86115532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TGGCAATAGTAAGCACTTTAGGAAAGAAAGCAAGTGAAGTATTTTTATTAGTAGAGTTGC 5280

 86115533 ATGAAAATATAATTTCTTAAGAAATATTACAGAATCTTCTTTCAGAATAAAATAAGACAA 86115592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 ATGAAAATATAATTTCTTAAGAAATATTACAGAATCTTCTTTCAGAATAAAATAAGACAA 5340

 86115593 AAATAAAGGGATCTATCACACCTGAAATTATAATAGTAAAGTTTACCCTTAAGACTCTAC 86115652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 AAATAAAGGGATCTATCACACCTGAAATTATAATAGTAAAGTTTACCCTTAAGACTCTAC 5400

 86115653 ATAAAATTATTTGTACGTATGGTTAGTATATCAGTAAGTGGCTATTTTCTGGGAAATTTC 86115712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ATAAAATTATTTGTACGTATGGTTAGTATATCAGTAAGTGGCTATTTTCTGGGAAATTTC 5460

 86115713 CAGTTATTTATCATGCTGATTTCCTTTGTTTCAAAGCATGTGAGTAAATCATTCTTTGAA 86115772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 CAGTTATTTATCATGCTGATTTCCTTTGTTTCAAAGCATGTGAGTAAATCATTCTTTGAA 5520

 86115773 TTTCTACACACCTTTCTCTTAAAGTTCTTAAAATTTTTTTAAACAAGCTCATTTATTCCC 86115832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TTTCTACACACCTTTCTCTTAAAGTTCTTAAAATTTTTTTAAACAAGCTCATTTATTCCC 5580

 86115833 AACACATTGCTCACCAAATATAACTACCCACCCGTCCCCAAATCTTAACAGGGTTTCTTC 86115892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AACACATTGCTCACCAAATATAACTACCCACCCGTCCCCAAATCTTAACAGGGTTTCTTC 5640

 86115893 TAAATGTCATCTACATTAATGCCATTTTACACTTCTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 86115952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TAAATGTCATCTACATTAATGCCATTTTACACTTCTCTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 5700

 86115953 TTTGAGACTGAGTCTAGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCCGCTCA 86116012
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 ----AGACTGAGTCTAGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCCGCTCA 5756

 86116013 CTGCAAGCTCAGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 86116072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 CTGCAAGCTCAGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGG 5816

 86116073 GACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTGGAGACAGGGT 86116132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 GACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTGGAGACAGGGT 5876

 86116133 TTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCT 86116157
          |||||||||||||||||||||||||
     5877 TTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCT 5901

EXCISED REGION

 86116199 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC 86116225
          |||||||||||||||||||||||||||
     5943 AGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCAC 5969

Alignment time is 6.20895 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    8779] =>      8779 nucs 'mol-32-310c-119065_8779'

Score:        8655
Aligned:      8795        nucs
Identic:      8770 (100%) nucs =>      8644 (100%)       126 (100%)
Gaps:           17 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86106670,86115337] EXCISED REGION [86117859,86117984]
 second seq =>  [       1,    8653] EXCISED REGION [    8654,    8779]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2521 nucs [86115338,86117858]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117859,86117859]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117858,86117858]
 second seq =>         0 nucs

 86106670 TAATTATATAAAAAAGTGGTCTTTAGCTAAGTATCACAGCCCTAGCCTCAGTGAATAACT 86106729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATTATATAAAAAAGTGGTCTTTAGCTAAGTATCACAGCCCTAGCCTCAGTGAATAACT 60

 86106730 AAAATTAGTATTTTTCTACAAATGGACCAGGCATCTTTTCTCACTTTTGATAATTTTTAC 86106789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAATTAGTATTTTTCTACAAATGGACCAGGCATCTTTTCTCACTTTTGATAATTTTTAC 120

 86106790 CAAGCCCACAAGAAAAGACTATTTCTTTTGAGTTTCATTCAGAAAAGGAAATGCTGCATT 86106849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAGCCCACAAGAAAAGACTATTTCTTTTGAGTTTCATTCAGAAAAGGAAATGCTGCATT 180

 86106850 CTATTTTTAATGTCAACTAGAAAACTTAAATATTTTTTGGATTTAAAATAATCCAGGAAA 86106909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTATTTTTAATGTCAACTAGAAAACTTAAATATTTTTTGGATTTAAAATAATCCAGGAAA 240

 86106910 CATCTGTGAAGGTCTTTGTCATACAATACTTGTCATTTTAAAGTAACATGTAGAACTTCT 86106969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATCTGTGAAGGTCTTTGTCATACAATACTTGTCATTTTAAAGTAACATGTAGAACTTCT 300

 86106970 GAGCTTATAGGGATAATTAGACCATACCTTATTAGTAAATTCTAAACCAACGTAAATAAT 86107029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGCTTATAGGGATAATTAGACCATACCTTATTAGTAAATTCTAAACCAACGTAAATAAT 360

 86107030 AGGTCACCAGGATATATACCTATAACTTGTTTAATATTAATGGAAATTTGTCTACAGGAT 86107089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGTCACCAGGATATATACCTATAACTTGTTTAATATTAATGGAAATTTGTCTACAGGAT 420

 86107090 TATTGTCTAAGGATTTGGTGTATTAATATACATCTGTCTGATAATTAGGAAGAAACTCTT 86107149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTGTCTAAGGATTTGGTGTATTAATATACATCTGTCTGATAATTAGGAAGAAACTCTT 480

 86107150 CATGTAACTAAACAATTGTGAAACCTATCAATAGCTAACTGAGAGCAAACAATGGGGTTC 86107209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATGTAACTAAACAATTGTGAAACCTATCAATAGCTAACTGAGAGCAAACAATGGGGTTC 540

 86107210 ATAAACTTGCCAGTAATGTTTATGTTATTAAACTTTATGGCACTCTAGAAAAAATTCACA 86107269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAAACTTGCCAGTAATGTTTATGTTATTAAACTTTATGGCACTCTAGAAAAAATTCACA 600

 86107270 GTTGTGGAGAACGTGATACATACAACATGTGATGGCTTAGAAGCCATTGATTTCAGAATT 86107329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTGTGGAGAACGTGATACATACAACATGTGATGGCTTAGAAGCCATTGATTTCAGAATT 660

 86107330 CCATGGTATCTGGTACAAACCTATAAATATATTAAAAGTTCAACCAATTCTGATTTCAGA 86107389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCATGGTATCTGGTACAAACCTATAAATATATTAAAAGTTCAACCAATTCTGATTTCAGA 720

 86107390 TCAAGATGTGAAGAAAGAGATGTATGTTTTAGGATTCAGAACCCTCTAGAAAAAAAATAG 86107449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAAGATGTGAAGAAAGAGATGTATGTTTTAGGATTCAGAACCCTCTAGAAAAAAAATAG 780

 86107450 TTCAATATGAATATGAGTTAACTAAATGTATATCAAGCTAGCATTTAAAAAGCGCCATTA 86107509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCAATATGAATATGAGTTAACTAAATGTATATCAAGCTAGCATTTAAAAAGCGCCATTA 840

 86107510 TTTATGAAGAAAGTACATTTTTGCATGGAAAAGGTCCTAACTGTAAACCATGGACAGCAG 86107569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTATGAAGAAAGTACATTTTTGCATGGAAAAGGTCCTAACTGTAAACCATGGACAGCAG 900

 86107570 AGAAGATATAAGACAAAAAACATGGAATTTGCCAATTGGTTACAGAAATATTCCTCCTAT 86107629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGAAGATATAAGACAAAAAACATGGAATTTGCCAATTGGTTACAGAAATATTCCTCCTAT 960

 86107630 AATAGCTATAAGAAGAGATACCTGTAAAAATGAGTATTTGTTGTTGGATGCACTTTGGGG 86107689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATAGCTATAAGAAGAGATACCTGTAAAAATGAGTATTTGTTGTTGGATGCACTTTGGGG 1020

 86107690 AGACTTGTAGCAGATATAGAATTGCTATAAATATTTATAGAGTACCACCATACATGCAGA 86107749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGACTTGTAGCAGATATAGAATTGCTATAAATATTTATAGAGTACCACCATACATGCAGA 1080

 86107750 AGAACAGTGATACATTTTCTATCATTTATTTTTATTTTGTCTTTTTGATCTTATATAACA 86107809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGAACAGTGATACATTTTCTATCATTTATTTTTATTTTGTCTTTTTGATCTTATATAACA 1140

 86107810 AATATATACATACACATACCTAAATACATACACAACAAACATATACACACATACATGTAA 86107869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATATATACATACACATACCTAAATACATACACAACAAACATATACACACATACATGTAA 1200

 86107870 ATATACCTACCTACCTATATACATATGTACACACACAGACATAATGTCTGTGTGTGTGAC 86107929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATATACCTACCTACCTATATACATATGTACACACACAGACATAATGTCTGTGTGTGTGAC 1260

 86107930 ACACACTCACACCTATATAGTTTTCTCCAATTGCCATGCACTGTTCTAAATGTTTTACAA 86107989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACACACTCACACCTATATAGTTTTCTCCAATTGCCATGCACTGTTCTAAATGTTTTACAA 1320

 86107990 ATACTAACGCACTTAAGACAATTATATTCACTTAAATAATGTACCACATATAATTACTAC 86108049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATACTAACGCACTTAAGACAATTATATTCACTTAAATAATGTACCACATATAATTACTAC 1380

 86108050 AAAAAAAATTGTTTTTGAGATAGAGCCTCACTCTGTTGCCCAAGCTGGGGAGCAGTGGCA 86108109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAAAAAATTGTTTTTGAGATAGAGCCTCACTCTGTTGCCCAAGCTGGGGAGCAGTGGCA 1440

 86108110 CAATCACAACTCACTGCACCCTTGAACTCCCAGGCTCACTTAATCCCCCAACCTCAGTCT 86108169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CAATCACAACTCACTGCACCCTTGAACTCCCAGGCTCACTTAATCCCCCAACCTCAGTCT 1500

 86108170 CCTGAGTGGCTGGGGCTACAGGCGTGTGCCGCCATGCCCAGTAAGTTTTGGTAATTTCCG 86108229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCTGAGTGGCTGGGGCTACAGGCGTGTGCCGCCATGCCCAGTAAGTTTTGGTAATTTCCG 1560

 86108230 TAGAGGCAGGATTTCACTATGTTGCCTAGGCTTCAAAATTTTATCAAAAGAACTTTAGTG 86108289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGAGGCAGGATTTCACTATGTTGCCTAGGCTTCAAAATTTTATCAAAAGAACTTTAGTG 1620

 86108290 CTCTGCCTCTGAATATTACAGAGTGCAGGTTGGGTTATCAGTGTCATGATTATGATTAAC 86108349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTCTGCCTCTGAATATTACAGAGTGCAGGTTGGGTTATCAGTGTCATGATTATGATTAAC 1680

 86108350 ATTATGGAAGTCTTAATGTAAATCATGCCCTTTGTCGAGTACTTAATCTCTGGATCAGTC 86108409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATTATGGAAGTCTTAATGTAAATCATGCCCTTTGTCGAGTACTTAATCTCTGGATCAGTC 1740

 86108410 AAGATCCAATCAAAAACCACAACAATTATTTTAACAACAAAAAAATTTAATGTAAATAAT 86108469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGATCCAATCAAAAACCACAACAATTATTTTAACAACAAAAAAATTTAATGTAAATAAT 1800

 86108470 TTTGAACTATCTTTTAAAAACTGAAAGCCAGACAGTAAAACAATAAAGTATCATGAAAAT 86108529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTGAACTATCTTTTAAAAACTGAAAGCCAGACAGTAAAACAATAAAGTATCATGAAAAT 1860

 86108530 AGAAACTGCAGGAAGCAGCTACCATCCTTAGGGAACAAACGAAAAATGTAGGAATTACTA 86108589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAAACTGCAGGAAGCAGCTACCATCCTTAGGGAACAAACGAAAAATGTAGGAATTACTA 1920

 86108590 AAACTTTGTTGTTTGGTGGAGAAACCTCGCAGAGCTCAGACCTCTGAGTGCTACCAGCTG 86108649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAACTTTGTTGTTTGGTGGAGAAACCTCGCAGAGCTCAGACCTCTGAGTGCTACCAGCTG 1980

 86108650 GTGCTAGCATCTCTAAGGGGCACCATCAGGCTGACTCTTTGATGTGTTAGAGAACGAAAA 86108709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTGCTAGCATCTCTAAGGGGCACCATCAGGCTGACTCTTTGATGTGTTAGAGAACGAAAA 2040

 86108710 CCTGGACTTGCTGCTACCAGGGTGAAGAAGTGTGGCTGATGTGATGCTCACAGGAGCTGG 86108769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCTGGACTTGCTGCTACCAGGGTGAAGAAGTGTGGCTGATGTGATGCTCACAGGAGCTGG 2100

 86108770 AAAAAATAAAAGAGCAAGACAGCATGAAGCTGGCAGGGAAAAGTCCCTCATTTCTCCTTT 86108829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAAAATAAAAGAGCAAGACAGCATGAAGCTGGCAGGGAAAAGTCCCTCATTTCTCCTTT 2160

 86108830 AGCCTCCCAGGCTCTCTCTAGTGCCCCTTACACAGATTGTCTAGCAAATGAAAAGCAGTT 86108889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGCCTCCCAGGCTCTCTCTAGTGCCCCTTACACAGATTGTCTAGCAAATGAAAAGCAGTT 2220

 86108890 TCAAAAATCCCAGCCCCACAATCCCAAAGCTAAGAGGAGTGGATTTGAGACTGAGAGACC 86108949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCAAAAATCCCAGCCCCACAATCCCAAAGCTAAGAGGAGTGGATTTGAGACTGAGAGACC 2280

 86108950 ATTATCTTCATAACTGGTATAGTGTCTTTTAACATAAAAGATCCTTCACCCCAACTTAAC 86109009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATTATCTTCATAACTGGTATAGTGTCTTTTAACATAAAAGATCCTTCACCCCAACTTAAC 2340

 86109010 GGTAAATCCTTAAGTTACATTTACCTTAAGGGTAAATTTAAATCCATGTGCTCTAATTCA 86109069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GGTAAATCCTTAAGTTACATTTACCTTAAGGGTAAATTTAAATCCATGTGCTCTAATTCA 2400

 86109070 TTTCTCTGAGAAAGAACAAAGAGTCTCCTTAATATCATCACTCTAATCCTTGGAAACATT 86109129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTTCTCTGAGAAAGAACAAAGAGTCTCCTTAATATCATCACTCTAATCCTTGGAAACATT 2460

 86109130 AAGGTGTTGTTGACATCTTACCTGGTGCTCTCTGTATCACTTGCACAGCATATATTATGC 86109189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAGGTGTTGTTGACATCTTACCTGGTGCTCTCTGTATCACTTGCACAGCATATATTATGC 2520

 86109190 TCTTAACAAATATTAGTTGAATGAATGTGTAAAAGTATATTCTCAGCATAACTCTGACTT 86109249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCTTAACAAATATTAGTTGAATGAATGTGTAAAAGTATATTCTCAGCATAACTCTGACTT 2580

 86109250 CTGAATTCTCTTTAAACAATGCATTTTTCATCCCCTTTATCACTGGACTAGGATATAAAT 86109309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CTGAATTCTCTTTAAACAATGCATTTTTCATCCCCTTTATCACTGGACTAGGATATAAAT 2640

 86109310 ATTTATACTGTAAAAACTATAGCACCACAGAAATATGACTTCACAATTTCAGAAGCTCTG 86109369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTTATACTGTAAAAACTATAGCACCACAGAAATATGACTTCACAATTTCAGAAGCTCTG 2700

 86109370 ATGTTTCTTAAGACAGTTAATATAGATTTTGCATGTTTCTCTCAAACTACAGAGGGAATG 86109429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATGTTTCTTAAGACAGTTAATATAGATTTTGCATGTTTCTCTCAAACTACAGAGGGAATG 2760

 86109430 AGGAAATAAAATAGAATTCCTTTGATTTCCTCTAAGGTTGAATCTTCCTTCCCAAAATCC 86109489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGGAAATAAAATAGAATTCCTTTGATTTCCTCTAAGGTTGAATCTTCCTTCCCAAAATCC 2820

 86109490 CAATGATGCATCAGGCTACTCTTCGGATTCTCCGTATCACATGAAAGATACAGGTGAGCC 86109549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAATGATGCATCAGGCTACTCTTCGGATTCTCCGTATCACATGAAAGATACAGGTGAGCC 2880

 86109550 ATTCAGCTTTTGTATAAAAGAAATAAGAGATGATCTTATCTTATTTTGGGCCTCAGTCAC 86109609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATTCAGCTTTTGTATAAAAGAAATAAGAGATGATCTTATCTTATTTTGGGCCTCAGTCAC 2940

 86109610 CTCAATTTACCCTCAATCTCTCTTGGGTGCTGTAGTATCTTCCAGGCATAAAGTGTTCAA 86109669
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2941 CTCAATTTACCCTCAATCTCTCTTGGGTGCTGTAGTACCTTCCAGGCATAAAGTGTTCAA 3000

 86109670 TCGTATGCAGTAAATAAATTATTTTAGAGATAGTCCTATTAAAGTATGTTTAAAAAAATA 86109729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCGTATGCAGTAAATAAATTATTTTAGAGATAGTCCTATTAAAGTATGTTTAAAAAAATA 3060

 86109730 AGATTTATGTTTACAAAATTCATTCACTTTACATAGTTACATGTTTAGTTTTGTTTATGG 86109789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGATTTATGTTTACAAAATTCATTCACTTTACATAGTTACATGTTTAGTTTTGTTTATGG 3120

 86109790 CAATTCAATATGTTGTCACTAAATATTTTTTTTCAAAATCAGATAACATAAACTTAAATA 86109849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAATTCAATATGTTGTCACTAAATATTTTTTTTCAAAATCAGATAACATAAACTTAAATA 3180

 86109850 TGATAGAAGAGGAGAGAATTGATTCATTGAAACAGTGGCCTTCAAAACTCCTTTTTCTCA 86109909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TGATAGAAGAGGAGAGAATTGATTCATTGAAACAGTGGCCTTCAAAACTCCTTTTTCTCA 3240

 86109910 AAAAAAAAA-TATTTGAAGGGGTGATGTAAAACCTTTTGTTTTTCTTATGACAGCATTCC 86109968
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AAAAAAAAAATATTTGAAGGGGTGATGTAAAACCTTTTGTTTTTCTTATGACAGCATTCC 3300

 86109969 AAGTCTTTCTCAAATATATTCGAGGACTTTATTTTGTAGACACTTTAGAAGTTGGATTTT 86110028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAGTCTTTCTCAAATATATTCGAGGACTTTATTTTGTAGACACTTTAGAAGTTGGATTTT 3360

 86110029 TTTCAAGAAACATCTGTAAATATTAGAAAAACAGTTCAAATCTTAAGAACAAGATGTATA 86110088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TTTCAAGAAACATCTGTAAATATTAGAAAAACAGTTCAAATCTTAAGAACAAGATGTATA 3420

 86110089 AACAAGTTGTATAAACACATTTTAGTGCATTATGTGGTCAACCCAATATTTAATCATGGT 86110148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AACAAGTTGTATAAACACATTTTAGTGCATTATGTGGTCAACCCAATATTTAATCATGGT 3480

 86110149 TATCCATTATGTTTTATAAAACATGTTACACTGTTTTTCCTGACATTAATTGCATTATTA 86110208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TATCCATTATGTTTTATAAAACATGTTACACTGTTTTTCCTGACATTAATTGCATTATTA 3540

 86110209 AGATATTATGGAAGGATGTATTTGTTATTTGTTTATGACTTTCTTTGTCATTCATCAAAA 86110268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AGATATTATGGAAGGATGTATTTGTTATTTGTTTATGACTTTCTTTGTCATTCATCAAAA 3600

 86110269 GTATGCTATTGTACCATGAAGAGCAATCTCTGCTGACCAGGCTGTTTACAAGTATCAGAA 86110328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTATGCTATTGTACCATGAAGAGCAATCTCTGCTGACCAGGCTGTTTACAAGTATCAGAA 3660

 86110329 GAAATGCAATGTCAGGCTTTTGGTACTATAATTCCATGGGCAGTCTCTTGATTTTCCACA 86110388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GAAATGCAATGTCAGGCTTTTGGTACTATAATTCCATGGGCAGTCTCTTGATTTTCCACA 3720

 86110389 TAAAATAGATCTACTTTATACAAGGCACTTTTCTCTTAGAATTTTTTTTAAGTTTAGTTT 86110448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TAAAATAGATCTACTTTATACAAGGCACTTTTCTCTTAGAATTTTTTTTAAGTTTAGTTT 3780

 86110449 TAAAATCTAAAGCTAATTCTAAATAAATGCTGTCCTGTGCACTGTAAGATTTAGTAATAT 86110508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TAAAATCTAAAGCTAATTCTAAATAAATGCTGTCCTGTGCACTGTAAGATTTAGTAATAT 3840

 86110509 CTGTGGCCTTTTCGTACTAGATGACAGTTGCACCCCACCAAACTTGGACACTAAAATTAT 86110568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTGTGGCCTTTTCGTACTAGATGACAGTTGCACCCCACCAAACTTGGACACTAAAATTAT 3900

 86110569 CTCCCAAGGAGCAAAACTGCCCCCAGTTGAGAACCACTGCTTTGGAACTTGACTGTTTCC 86110628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTCCCAAGGAGCAAAACTGCCCCCAGTTGAGAACCACTGCTTTGGAACTTGACTGTTTCC 3960

 86110629 CTTCCATTCTTTCTGTTTTTCTTGTCTCCTCTTTTGGGGCCCATTATAAAATATAGGGTT 86110688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTTCCATTCTTTCTGTTTTTCTTGTCTCCTCTTTTGGGGCCCATTATAAAATATAGGGTT 4020

 86110689 GAAATGTTCCTCTTTCTAAATTACTTATTGGGCTGCTTATTCTGGAAGATTGACCTAGGG 86110748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GAAATGTTCCTCTTTCTAAATTACTTATTGGGCTGCTTATTCTGGAAGATTGACCTAGGG 4080

 86110749 TTAATCACAAGGCAAGACCTGGTTTAGAATCAGTGAGATGACCCTTACTGGAAATGATGA 86110808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTAATCACAAGGCAAGACCTGGTTTAGAATCAGTGAGATGACCCTTACTGGAAATGATGA 4140

 86110809 TTGCATGGTAATTTTAAGTATGCTAGCTTTTTATGTGAGGGTGATACTAAGGATGTACTG 86110868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTGCATGGTAATTTTAAGTATGCTAGCTTTTTATGTGAGGGTGATACTAAGGATGTACTG 4200

 86110869 TACTACAAACATATGATACTGAAAGGTGTTTATGTGAAAGTAGTCATAGGGTGAACTAAA 86110928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TACTACAAACATATGATACTGAAAGGTGTTTATGTGAAAGTAGTCATAGGGTGAACTAAA 4260

 86110929 TTTTACAGGAAGATTTAATGTAATTTGAGCTAAAGCTTTAGGAGAGAATGTTAGAAGGAT 86110988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TTTTACAGGAAGATTTAATGTAATTTGAGCTAAAGCTTTAGGAGAGAATGTTAGAAGGAT 4320

 86110989 CACTGGACACAGGAACTGAGTCATTTAATAAGAAACATTTCCAATATTCTAGATCATCCA 86111048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CACTGGACACAGGAACTGAGTCATTTAATAAGAAACATTTCCAATATTCTAGATCATCCA 4380

 86111049 AATTATATAACTAAGAAAAAAATATATATATTTCTCATCATATAAAAATAAACTGTTATG 86111108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AATTATATAACTAAGAAAAAAATATATATATTTCTCATCATATAAAAATAAACTGTTATG 4440

 86111109 ACTAGCAAAATAAAATTTATTGCTATAATTATAATTACTACAATTATACTAAAAAGATAC 86111168
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     4441 ACTAGCAAAATAAAATTTATTGCTATAATTATAATTACTGCAATTATACTAAAAAGATAC 4500

 86111169 ACAATCTTTAATAACCATAAGCTCATTAATCCTCATATTAATATGTAATAGTTGCTCATC 86111228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ACAATCTTTAATAACCATAAGCTCATTAATCCTCATATTAATATGTAATAGTTGCTCATC 4560

 86111229 ACAACTGTTACCCAACCTTGAAAATGGAACTTATAGATCTTTTATTTTGTCCACGTATAA 86111288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ACAACTGTTACCCAACCTTGAAAATGGAACTTATAGATCTTTTATTTTGTCCACGTATAA 4620

 86111289 GACAAATTTAAACTCTAAAAGCAATTTATTTGTTGCAGTTAACAAAGACTTGTGATTTCT 86111348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GACAAATTTAAACTCTAAAAGCAATTTATTTGTTGCAGTTAACAAAGACTTGTGATTTCT 4680

 86111349 ACTGGAAAAGAAAGGAAAACAAATTTTTGGAAGTGCTAACTTAAATTAGTGTGTTTTTAT 86111408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ACTGGAAAAGAAAGGAAAACAAATTTTTGGAAGTGCTAACTTAAATTAGTGTGTTTTTAT 4740

 86111409 TATTTTTCTTGTTTTTATGTCTGTCTTCATAACCAAACATTTCTAATGAAAGGGCTACAA 86111468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TATTTTTCTTGTTTTTATGTCTGTCTTCATAACCAAACATTTCTAATGAAAGGGCTACAA 4800

 86111469 CTTTCAATCAATTAATAATCTGAATTATAAATCAGGAAAAAGTCGCAGACAACATGTAAC 86111528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CTTTCAATCAATTAATAATCTGAATTATAAATCAGGAAAAAGTCGCAGACAACATGTAAC 4860

 86111529 TGAAATTCATCAAAGCATAAGATAAGATAGCACATAATATATTGTCAGAATATTTTTTAA 86111588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TGAAATTCATCAAAGCATAAGATAAGATAGCACATAATATATTGTCAGAATATTTTTTAA 4920

 86111589 AATATTAGTCATTTACACATGTATATATATCATTATTTATCCAAACCTATAAAATGTGCA 86111648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AATATTAGTCATTTACACATGTATATATATCATTATTTATCCAAACCTATAAAATGTGCA 4980

 86111649 ACATCAAAAGTGAATCCTAATGTTAAACTATGAACTTTTCGTGATAATAATGTGTCAGTA 86111708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 ACATCAAAAGTGAATCCTAATGTTAAACTATGAACTTTTCGTGATAATAATGTGTCAGTA 5040

 86111709 CAGGTTTATCAGTTGTACTATTCTAGTGGGGGATGGTGATATTGGAAATAGCTACGCATG 86111768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 CAGGTTTATCAGTTGTACTATTCTAGTGGGGGATGGTGATATTGGAAATAGCTACGCATG 5100

 86111769 AGTAGGGGCAGGGGATAGATGAGAAATCTCTGTACCTCCCTGTCAATCTTGTTGTCAATC 86111828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AGTAGGGGCAGGGGATAGATGAGAAATCTCTGTACCTCCCTGTCAATCTTGTTGTCAATC 5160

 86111829 TAAAACTGCTCAAAAATTTAAAAACATTCTTTAAAAATCTGTAATTTATATTATTAACTG 86111888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TAAAACTGCTCAAAAATTTAAAAACATTCTTTAAAAATCTGTAATTTATATTATTAACTG 5220

 86111889 TTGAAACTATTATGACTAAAGATTCTGGTTATTTAAAATTGATAATAATTGTGAAACAAT 86111948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TTGAAACTATTATGACTAAAGATTCTGGTTATTTAAAATTGATAATAATTGTGAAACAAT 5280

 86111949 GATCAGATATTATATGACAAGACACCATATCTACACTTGTCCTATTTAACATTTATATCA 86112008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 GATCAGATATTATATGACAAGACACCATATCTACACTTGTCCTATTTAACATTTATATCA 5340

 86112009 ATAACTTAGATGAAGCAAATGCTTGGGGCATGCTTTGCAAATGTGACGACAACAGTAAAA 86112068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 ATAACTTAGATGAAGCAAATGCTTGGGGCATGCTTTGCAAATGTGACGACAACAGTAAAA 5400

 86112069 AGCCAGAAAGGACAGCAAATACAGTGATGTTAAAATCTGAATCCAAAAGGATAGTAGAAG 86112128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 AGCCAGAAAGGACAGCAAATACAGTGATGTTAAAATCTGAATCCAAAAGGATAGTAGAAG 5460

 86112129 ACATGAAACAAGGAAAGCTCACAATGAAATTTGACAGATTATTACAGGTCTTGCACTACA 86112188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 ACATGAAACAAGGAAAGCTCACAATGAAATTTGACAGATTATTACAGGTCTTGCACTACA 5520

 86112189 ATCCGAAGGCACAACTTTGGATCAAAGACAAATGGAGAAAATTGGTTTAGAGGCAGCCTG 86112248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 ATCCGAAGGCACAACTTTGGATCAAAGACAAATGGAGAAAATTGGTTTAGAGGCAGCCTG 5580

 86112249 TATGAGAAAGAATTACAGGATTAGTTGAATTCAAATTCAGTGTGACTCAACAATGAGATT 86112308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TATGAGAAAGAATTACAGGATTAGTTGAATTCAAATTCAGTGTGACTCAACAATGAGATT 5640

 86112309 TGTTTGCCAAGGAACTAATGTGATCTAAAGGTATATTAACTTCTATTGTTCCTGATATTT 86112368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TGTTTGCCAAGGAACTAATGTGATCTAAAGGTATATTAACTTCTATTGTTCCTGATATTT 5700

 86112369 TATGTCTAGATATTCTGATAGCTAGAATGGCATTAGGGATAGTATTTCTTTACTTTGAAT 86112428
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TATATCTAGATATTCTGATAGCTAGAATGGCATTAGGGATAGTATTTCTTTACTTTGAAT 5760

 86112429 TGGTTAGATCTTACCAGGATGATTTTTGAAAGATAGGAGAATGGTAAAGTGAACTTCACT 86112488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TGGTTAGATCTTACCAGGATGATTTTTGAAAGATAGGAGAATGGTAAAGTGAACTTCACT 5820

 86112489 TCATGTCATTTGAGCAGTGGTTGAGGAAACCTATCATGCCTGGAGAAATATAATTGCTCC 86112548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TCATGTCATTTGAGCAGTGGTTGAGGAAACCTATCATGCCTGGAGAAATATAATTGCTCC 5880

 86112549 CCTCAGATATTTAAGGAGCTATTATATGGAAGATGAATTTTGTTTTTTTTTCTATATAAG 86112608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CCTCAGATATTTAAGGAGCTATTATATGGAAGATGAATTTTGTTTTTTTTTCTATATAAG 5940

 86112609 TAACTCTCAAAGTTAGGCCTGCTAGCTACAAGTTATTTTACCTGATTGTAGTCTAATTTC 86112668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TAACTCTCAAAGTTAGGCCTGCTAGCTACAAGTTATTTTACCTGATTGTAGTCTAATTTC 6000

 86112669 CTGCTCAACAGACTACAAACCTAGACTTTCCAAGCAAATGAAAATCTAAACAAATACTAA 86112728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CTGCTCAACAGACTACAAACCTAGACTTTCCAAGCAAATGAAAATCTAAACAAATACTAA 6060

 86112729 CAGAAAATTGGTATAACTCTTTCACTTTTATTCATCTTAAAAGTGTTGTTACCTTTTACA 86112788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CAGAAAATTGGTATAACTCTTTCACTTTTATTCATCTTAAAAGTGTTGTTACCTTTTACA 6120

 86112789 GAAAACCTTTAGGAATGTGCTAAAATCGTTTACAGTACTTATTAAACTTTCTTCTGCCTC 86112848
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 GAAAACCTTCAGGAATGTGCTAAAATCGTTTACAGTACTTATTAAACTTTCTTCTGCCTC 6180

 86112849 TAACTCTGTGCATAGGATTCTGTTATAGACCAAACTTCATTACCTCAAAGTAAAATACCA 86112908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 TAACTCTGTGCATAGGATTCTGTTATAGACCAAACTTCATTACCTCAAAGTAAAATACCA 6240

 86112909 GTTACTACTGCTGATACAGTAGGTGTACCTTAGAACTGTTGAGTCTCAGAGTTGTTAAGA 86112968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 GTTACTACTGCTGATACAGTAGGTGTACCTTAGAACTGTTGAGTCTCAGAGTTGTTAAGA 6300

 86112969 ATGGACTATTGATGAATCAGATAACAGATTTTGGTGGAGATAAAGCTAAAGTTTTTTCTT 86113028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 ATGGACTATTGATGAATCAGATAACAGATTTTGGTGGAGATAAAGCTAAAGTTTTTTCTT 6360

 86113029 GCCTTTTTATTTCCATCTTAACTTTAATATAACTTTGGAAGGAGTAGGTCCTTTTTCTCT 86113088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 GCCTTTTTATTTCCATCTTAACTTTAATATAACTTTGGAAGGAGTAGGTCCTTTTTCTCT 6420

 86113089 CTAATAGATAATAGAAAAACACCATTATCTACAAAACATATGACATTTTTTCATTAGGGA 86113148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 CTAATAGATAATAGAAAAACACCATTATCTACAAAACATATGACATTTTTTCATTAGGGA 6480

 86113149 ATTTATATTGTTATTTTAATACAAACAGTGAGAAGAGCTATAGGTCAATTGTTCCACAAT 86113208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 ATTTATATTGTTATTTTAATACAAACAGTGAGAAGAGCTATAGGTCAATTGTTCCACAAT 6540

 86113209 TAATGCCATCATTTTGGGTAGGCACATCTCAGCTTTTAACTGCTTTATAGCTGAATAATT 86113268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 TAATGCCATCATTTTGGGTAGGCACATCTCAGCTTTTAACTGCTTTATAGCTGAATAATT 6600

 86113269 CGATACAACAAATCACCTTAATGTCACCTATAGGTACATTTAGAAATCAGTGTATTTTTT 86113328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 CGATACAACAAATCACCTTAATGTCACCTATAGGTACATTTAGAAATCAGTGTATTTTTT 6660

 86113329 AATTGTGGTAAGGATATTTAATATGAGATTTGTCCTCTTAACAAATTTTAGGTGTACAAT 86113388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 AATTGTGGTAAGGATATTTAATATGAGATTTGTCCTCTTAACAAATTTTAGGTGTACAAT 6720

 86113389 ATATTATCGTTGATTCCAAGTAAATATTGTATGACAGATCTCCAAAGCTTATTCATCTTA 86113448
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 ATATTATCGTTGATTCCAGGTAAATATTGTATGACAGATCTCCAAAGCTTATTCATCTTA 6780

 86113449 TTTAACTGAAATTTTGTGCCTGTTGATTAATAACTCATTTCTCTCTCCCTCTGTAGTTCT 86113508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 TTTAACTGAAATTTTGTGCCTGTTGATTAATAACTCATTTCTCTCTCCCTCTGTAGTTCT 6840

 86113509 TGGTAACAACCATTCCAGTCCTTGATGTTATTAATTTCACTATTTTGGAAGGAATTGAAA 86113568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 TGGTAACAACCATTCCAGTCCTTGATGTTATTAATTTCACTATTTTGGAAGGAATTGAAA 6900

 86113569 CTCTATCACCCCCCTCCCCTTTCCCTCCAATAGTAAGGCTTTCACTGTTTGTTTTTATTG 86113628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 CTCTATCACCCCCCTCCCCTTTCCCTCCAATAGTAAGGCTTTCACTGTTTGTTTTTATTG 6960

 86113629 GGAAGTGAGTTATTTCTTTTGTCCTGGTTTTCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGAC 86113688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 GGAAGTGAGTTATTTCTTTTGTCCTGGTTTTCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGAC 7020

 86113689 TAAATTACAAATTCTATTAAAGAAAAGATGAATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCC 86113748
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 TAAATTACAAGTTCTATTAAAGAAAAGATGAATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCC 7080

 86113749 TCCATGATGTTTTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTT 86113808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 TCCATGATGTTTTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTT 7140

 86113809 CTAATTTAAATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAA 86113868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 CTAATTTAAATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAA 7200

 86113869 GGTTTATTCCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGT 86113928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 GGTTTATTCCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGT 7260

 86113929 TCCTCAAATCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAAT 86113988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 TCCTCAAATCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAAT 7320

 86113989 TGATCAGATGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGT 86114048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     7321 TGATCAGATGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACACTGTCCACCTTGGT 7380

 86114049 CCACTTAAATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAA 86114108
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     7381 CCACTTAAATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTGACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAA 7440

 86114109 TTACTTTTGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACC 86114168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 TTACTTTTGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACC 7500

 86114169 AAATGGTTTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAA 86114228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 AAATGGTTTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAA 7560

 86114229 TATACAATAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAG 86114288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 TATACAATAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAG 7620

 86114289 TGCAAGAGATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGA 86114348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 TGCAAGAGATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGA 7680

 86114349 GCATGAACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAAC 86114408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 GCATGAACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAAC 7740

 86114409 AAAGTGATTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGT 86114468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 AAAGTGATTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGT 7800

 86114469 GTTTTTCTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCA 86114528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 GTTTTTCTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCA 7860

 86114529 TTTGGCACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAA 86114588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 TTTGGCACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAA 7920

 86114589 ATTTTTTTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTG 86114648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 ATTTTTTTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTG 7980

 86114649 AGTTTTAAATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCC 86114708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 AGTTTTAAATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCC 8040

 86114709 TCTGTGCCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGT 86114768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 TCTGTGCCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGT 8100

 86114769 GTTTAGGTAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTG 86114828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 GTTTAGGTAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTG 8160

 86114829 TAAATGTTAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAA 86114888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 TAAATGTTAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAA 8220

 86114889 GAGCTAATATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGG 86114948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 GAGCTAATATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGG 8280

 86114949 TAACCATTGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATC 86115008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 TAACCATTGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATC 8340

 86115009 ATTAACAAATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTG 86115068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 ATTAACAAATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTG 8400

 86115069 CAACCAGTGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAA 86115128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 CAACCAGTGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAA 8460

 86115129 TCTTATTTTAAAATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGG 86115188
          |||||||||                |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 TCTTATTTT----------------GAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGG 8504

 86115189 TGGACATGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAA 86115248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8505 TGGACATGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAA 8564

 86115249 TGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAG 86115308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8565 TGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAG 8624

 86115309 CGGACAAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGC 86115337
          |||||||||||||||||||||||||||||
     8625 CGGACAAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGC 8653

EXCISED REGION

 86117859 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 86117918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8654 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 8713

 86117919 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 86117978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8714 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 8773

 86117979 ATATAC 86117984
          ||||||
     8774 ATATAC 8779

Alignment time is 7.03642 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    2724] =>      2724 nucs 'mol-32-3185-065205_2724'

Score:        2724
Aligned:      2724        nucs
Identic:      2724 (100%) nucs =>      2177 (100%)       547 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86113757,86115933] EXCISED REGION [86115937,86116483]
 second seq =>  [       1,    2177] EXCISED REGION [    2178,    2724]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [86115934,86115936]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [86115934,86115952] to [86115937,86115955]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115934,86115934] to [86115936,86115936]
 second seq =>         0 nucs

 86113757 GTTTTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTA 86113816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTTTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTA 60

 86113817 AATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATT 86113876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATT 120

 86113877 CCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAA 86113936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAA 180

 86113937 TCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAGA 86113996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAGA 240

 86113997 TGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTTAA 86114056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTTAA 300

 86114057 ATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTT 86114116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTT 360

 86114117 GTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTT 86114176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTT 420

 86114177 TATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAAT 86114236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAAT 480

 86114237 AGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAG 86114296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAG 540

 86114297 ATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAAC 86114356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAAC 600

 86114357 CAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGAT 86114416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGAT 660

 86114417 TTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCT 86114476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCT 720

 86114477 TTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCAC 86114536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCAC 780

 86114537 TAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTT 86114596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTT 840

 86114597 TAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAA 86114656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAA 900

 86114657 ATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCC 86114716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCC 960

 86114717 ACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGT 86114776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGT 1020

 86114777 AGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTT 86114836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTT 1080

 86114837 AATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAAT 86114896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAAT 1140

 86114897 ATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATT 86114956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATT 1200

 86114957 GCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAA 86115016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAA 1260

 86115017 ATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGT 86115076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGT 1320

 86115077 GCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTT 86115136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTT 1380

 86115137 TAAAATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACATG 86115196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAAATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACATG 1440

 86115197 TAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGA 86115256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGA 1500

 86115257 AGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAG 86115316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAG 1560

 86115317 TGCAGACAGCCTAATGCAAGCATGCCTAGGTGCAACCCTCGCCCTGCTCCTTATTAGCTT 86115376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGCAGACAGCCTAATGCAAGCATGCCTAGGTGCAACCCTCGCCCTGCTCCTTATTAGCTT 1620

 86115377 GGTGATGTTAGACAACATACCACCCTGTGCTCATTCTTCAATTTTTAATAAATACTACTT 86115436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGTGATGTTAGACAACATACCACCCTGTGCTCATTCTTCAATTTTTAATAAATACTACTT 1680

 86115437 TTCTTATGGAGTAGTTATAAGAATTAAATGATTAAATGGCAATAGTAAGCACTTTAGGAA 86115496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCTTATGGAGTAGTTATAAGAATTAAATGATTAAATGGCAATAGTAAGCACTTTAGGAA 1740

 86115497 AGAAAGCAAGTGAAGTATTTTTATTAGTAGAGTTGCATGAAAATATAATTTCTTAAGAAA 86115556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGAAAGCAAGTGAAGTATTTTTATTAGTAGAGTTGCATGAAAATATAATTTCTTAAGAAA 1800

 86115557 TATTACAGAATCTTCTTTCAGAATAAAATAAGACAAAAATAAAGGGATCTATCACACCTG 86115616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATTACAGAATCTTCTTTCAGAATAAAATAAGACAAAAATAAAGGGATCTATCACACCTG 1860

 86115617 AAATTATAATAGTAAAGTTTACCCTTAAGACTCTACATAAAATTATTTGTACGTATGGTT 86115676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAATTATAATAGTAAAGTTTACCCTTAAGACTCTACATAAAATTATTTGTACGTATGGTT 1920

 86115677 AGTATATCAGTAAGTGGCTATTTTCTGGGAAATTTCCAGTTATTTATCATGCTGATTTCC 86115736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGTATATCAGTAAGTGGCTATTTTCTGGGAAATTTCCAGTTATTTATCATGCTGATTTCC 1980

 86115737 TTTGTTTCAAAGCATGTGAGTAAATCATTCTTTGAATTTCTACACACCTTTCTCTTAAAG 86115796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTGTTTCAAAGCATGTGAGTAAATCATTCTTTGAATTTCTACACACCTTTCTCTTAAAG 2040

 86115797 TTCTTAAAATTTTTTTAAACAAGCTCATTTATTCCCAACACATTGCTCACCAAATATAAC 86115856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTCTTAAAATTTTTTTAAACAAGCTCATTTATTCCCAACACATTGCTCACCAAATATAAC 2100

 86115857 TACCCACCCGTCCCCAAATCTTAACAGGGTTTCTTCTAAATGTCATCTACATTAATGCCA 86115916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TACCCACCCGTCCCCAAATCTTAACAGGGTTTCTTCTAAATGTCATCTACATTAATGCCA 2160

 86115917 TTTTACACTTCTCTTTC 86115933
          |||||||||||||||||
     2161 TTTTACACTTCTCTTTC 2177

EXCISED REGION

 86115937 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTCTAGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 86115996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2178 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACTGAGTCTAGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 2237

 86115997 GCGCGATCTCCGCTCACTGCAAGCTCAGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAG 86116056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2238 GCGCGATCTCCGCTCACTGCAAGCTCAGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCCTGCCTCAG 2297

 86116057 CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTT 86116116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2298 CCTCCCAAGTAGCTGGGACTACAGGCGCCCGCCACTACGCCCGGCTAATTTTTTGTATTT 2357

 86116117 TTAGTGGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTTGTTCTCCTGACCTCGTGA 86116176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2358 TTAGTGGAGACAGGGTTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTTGTTCTCCTGACCTCGTGA 2417

 86116177 TCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCC 86116236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2418 TCTGCCCTCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCTGGCC 2477

 86116237 TACGCTTCTCTTTCTATGTAAAGTCATACATCACACAGTACATAGAAACATGAGGTAACA 86116296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2478 TACGCTTCTCTTTCTATGTAAAGTCATACATCACACAGTACATAGAAACATGAGGTAACA 2537

 86116297 ACTTCTAGTTACTGCTTTTCACCATCAAGTAAGGCTGGAAATGCAATTATTAGGTTGGGG 86116356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2538 ACTTCTAGTTACTGCTTTTCACCATCAAGTAAGGCTGGAAATGCAATTATTAGGTTGGGG 2597

 86116357 CAAATGTAATTGCGGTTTTTGCATTTAAAAGTATTTGCGGCCGGGCACGGTGGCTCACGT 86116416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2598 CAAATGTAATTGCGGTTTTTGCATTTAAAAGTATTTGCGGCCGGGCACGGTGGCTCACGT 2657

 86116417 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCGCAGTTTGAG 86116476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2658 CTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCGGATCACCTGAGGTCGCAGTTTGAG 2717

 86116477 ACCAGCC 86116483
          |||||||
     2718 ACCAGCC 2724

Alignment time is 2.21914 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    9434] =>      9434 nucs 'mol-32-33b6-057938_9434'

Score:        9300
Aligned:      9450        nucs
Identic:      9420 (100%) nucs =>      8761 (100%)       659 ( 99%)
Gaps:           23 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86106555,86115337] EXCISED REGION [86117859,86118518]
 second seq =>  [       1,    8768] EXCISED REGION [    8769,    9434]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2521 nucs [86115338,86117858]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117859,86117859]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [86115338,86115338] to [86117858,86117858]
 second seq =>         0 nucs

 86106555 CTTCCTCCTCTGTAAACTTCTACATAAAAAGTTGGTTTGAATTTACAGGATATTAAAAAA 86106614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTCCTCCTCTGTAAACTTCTACATAAAAAGTTGGTTTGAATTTACAGGATATTAAAAAA 60

 86106615 TAGTAAGTTATGAAAAAATCAAAAGAAATGAGAGTTCTTTCAAGATCACGATACATAATT 86106674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGTAAGTTATGAAAAAATCAAAAGAAATGAGAGTTCTTTCAAGATCACGATACATAATT 120

 86106675 ATATAAAAAAGTGGTCTTTAGCTAAGTATCACAGCCCTAGCCTCAGTGAATAACTAAAAT 86106734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATAAAAAAGTGGTCTTTAGCTAAGTATCACAGCCCTAGCCTCAGTGAATAACTAAAAT 180

 86106735 TAGTATTTTTCTACAAATGGACCAGGCATCTTTTCTCACTTTTGATAATTTTTACCAAGC 86106794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGTATTTTTCTACAAATGGACCAGGCATCTTTTCTCACTTTTGATAATTTTTACCAAGC 240

 86106795 CCACAAGAAAAGACTATTTCTTTTGAGTTTCATTCAGAAAAGGAAATGCTGCATTCTATT 86106854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCACAAGAAAAGACTATTTCTTTTGAGTTTCATTCAGAAAAGGAAATGCTGCATTCTATT 300

 86106855 TTTAATGTCAACTAGAAAACTTAAATATTTTTTGGATTTAAAATAATCCAGGAAACATCT 86106914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTAATGTCAACTAGAAAACTTAAATATTTTTTGGATTTAAAATAATCCAGGAAACATCT 360

 86106915 GTGAAGGTCTTTGTCATACAATACTTGTCATTTTAAAGTAACATGTAGAACTTCTGAGCT 86106974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGAAGGTCTTTGTCATACAATACTTGTCATTTTAAAGTAACATGTAGAACTTCTGAGCT 420

 86106975 TATAGGGATAATTAGACCATACCTTATTAGTAAATTCTAAACCAACGTAAATAATAGGTC 86107034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATAGGGATAATTAGACCATACCTTATTAGTAAATTCTAAACCAACGTAAATAATAGGTC 480

 86107035 ACCAGGATATATACCTATAACTTGTTTAATATTAATGGAAATTTGTCTACAGGATTATTG 86107094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCAGGATATATACCTATAACTTGTTTAATATTAATGGAAATTTGTCTACAGGATTATTG 540

 86107095 TCTAAGGATTTGGTGTATTAATATACATCTGTCTGATAATTAGGAAGAAACTCTTCATGT 86107154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTAAGGATTTGGTGTATTAATATACATCTGTCTGATAATTAGGAAGAAACTCTTCATGT 600

 86107155 AACTAAACAATTGTGAAACCTATCAATAGCTAACTGAGAGCAAACAATGGGGTTCATAAA 86107214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AACTAAACAATTGTGAAACCTATCAATAGCTAACTGAGAGCAAACAATGGGGTTCATAAA 660

 86107215 CTTGCCAGTAATGTTTATGTTATTAAACTTTATGGCACTCTAGAAAAAATTCACAGTTGT 86107274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTGCCAGTAATGTTTATGTTATTAAACTTTATGGCACTCTAGAAAAAATTCACAGTTGT 720

 86107275 GGAGAACGTGATACATACAACATGTGATGGCTTAGAAGCCATTGATTTCAGAATTCCATG 86107334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGAGAACGTGATACATACAACATGTGATGGCTTAGAAGCCATTGATTTCAGAATTCCATG 780

 86107335 GTATCTGGTACAAACCTATAAATATATTAAAAGTTCAACCAATTCTGATTTCAGATCAAG 86107394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTATCTGGTACAAACCTATAAATATATTAAAAGTTCAACCAATTCTGATTTCAGATCAAG 840

 86107395 ATGTGAAGAAAGAGATGTATGTTTTAGGATTCAGAACCCTCTAGAAAAAAAATAGTTCAA 86107454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGTGAAGAAAGAGATGTATGTTTTAGGATTCAGAACCCTCTAGAAAAAAAATAGTTCAA 900

 86107455 TATGAATATGAGTTAACTAAATGTATATCAAGCTAGCATTTAAAAAGCGCCATTATTTAT 86107514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATGAATATGAGTTAACTAAATGTATATCAAGCTAGCATTTAAAAAGCGCCATTATTTAT 960

 86107515 GAAGAAAGTACATTTTTGCATGGAAAAGGTCCTAACTGTAAACCATGGACAGCAGAGAAG 86107574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAAGAAAGTACATTTTTGCATGGAAAAGGTCCTAACTGTAAACCATGGACAGCAGAGAAG 1020

 86107575 ATATAAGACAAAAAACATGGAATTTGCCAATTGGTTACAGAAATATTCCTCCTATAATAG 86107634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATATAAGACAAAAAACATGGAATTTGCCAATTGGTTACAGAAATATTCCTCCTATAATAG 1080

 86107635 CTATAAGAAGAGATACCTGTAAAAATGAGTATTTGTTGTTGGATGCACTTTGGGGAGACT 86107694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTATAAGAAGAGATACCTGTAAAAATGAGTATTTGTTGTTGGATGCACTTTGGGGAGACT 1140

 86107695 TGTAGCAGATATAGAATTGCTATAAATATTTATAGAGTACCACCATACATGCAGAAGAAC 86107754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTAGCAGATATAGAATTGCTATAAATATTTATAGAGTACCACCATACATGCAGAAGAAC 1200

 86107755 AGTGATACATTTTCTATCATTTATTTTTATTTTGTCTTTTTGATCTTATATAACAAATAT 86107814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTGATACATTTTCTATCATTTATTTTTATTTTGTCTTTTTGATCTTATATAACAAATAT 1260

 86107815 ATACATACACATACCTAAATACATACACAACAAACATATACACACATACATGTAAATATA 86107874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATACATACACATACCTAAATACATACACAACAAACATATACACACATACATGTAAATATA 1320

 86107875 CCTACCTACCTATATACATATGTACACACACAGACATAATGTCTGTGTGTGTGACACACA 86107934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCTACCTACCTATATACATATGTACACACACAGACATAATGTCTGTGTGTGTGACACACA 1380

 86107935 CTCACACCTATATAGTTTTCTCCAATTGCCATGCACTGTTCTAAATGTTTTACAAATACT 86107994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTCACACCTATATAGTTTTCTCCAATTGCCATGCACTGTTCTAAATGTTTTACAAATACT 1440

 86107995 AACGCACTTAAGACAATTATATTCACTTAAATAATGTACCACATATAATTACTACAAAAA 86108054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACGCACTTAAGACAATTATATTCACTTAAATAATGTACCACATATAATTACTACAAAAA 1500

 86108055 AAATTGTTTTTGAGATAGAGCCTCACTCTGTTGCCCAAGCTGGGGAGCAGTGGCACAATC 86108114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAATTGTTTTTGAGATAGAGCCTCACTCTGTTGCCCAAGCTGGGGAGCAGTGGCACAATC 1560

 86108115 ACAACTCACTGCACCCTTGAACTCCCAGGCTCACTTAATCCCCCAACCTCAGTCTCCTGA 86108174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAACTCACTGCACCCTTGAACTCCCAGGCTCACTTAATCCCCCAACCTCAGTCTCCTGA 1620

 86108175 GTGGCTGGGGCTACAGGCGTGTGCCGCCATGCCCAGTAAGTTTTGGTAATTTCCGTAGAG 86108234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTGGCTGGGGCTACAGGCGTGTGCCGCCATGCCCAGTAAGTTTTGGTAATTTCCGTAGAG 1680

 86108235 GCAGGATTTCACTATGTTGCCTAGGCTTCAAAATTTTATCAAAAGAACTTTAGTGCTCTG 86108294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCAGGATTTCACTATGTTGCCTAGGCTTCAAAATTTTATCAAAAGAACTTTAGTGCTCTG 1740

 86108295 CCTCTGAATATTACAGAGTGCAGGTTGGGTTATCAGTGTCATGATTATGATTAACATTAT 86108354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTCTGAATATTACAGAGTGCAGGTTGGGTTATCAGTGTCATGATTATGATTAACATTAT 1800

 86108355 GGAAGTCTTAATGTAAATCATGCCCTTTGTCGAGTACTTAATCTCTGGATCAGTCAAGAT 86108414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGAAGTCTTAATGTAAATCATGCCCTTTGTCGAGTACTTAATCTCTGGATCAGTCAAGAT 1860

 86108415 CCAATCAAAAACCACAACAATTATTTTAACAACAAAAAAATTTAATGTAAATAATTTTGA 86108474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCAATCAAAAACCACAACAATTATTTTAACAACAAAAAAATTTAATGTAAATAATTTTGA 1920

 86108475 ACTATCTTTTAAAAACTGAAAGCCAGACAGTAAAACAATAAAGTATCATGAAAATAGAAA 86108534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACTATCTTTTAAAAACTGAAAGCCAGACAGTAAAACAATAAAGTATCATGAAAATAGAAA 1980

 86108535 CTGCAGGAAGCAGCTACCATCCTTAGGGAACAAACGAAAAATGTAGGAATTACTAAAACT 86108594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTGCAGGAAGCAGCTACCATCCTTAGGGAACAAACGAAAAATGTAGGAATTACTAAAACT 2040

 86108595 TTGTTGTTTGGTGGAGAAACCTCGCAGAGCTCAGACCTCTGAGTGCTACCAGCTGGTGCT 86108654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTGTTGTTTGGTGGAGAAACCTCGCAGAGCTCAGACCTCTGAGTGCTACCAGCTGGTGCT 2100

 86108655 AGCATCTCTAAGGGGCACCATCAGGCTGACTCTTTGATGTGTTAGAGAACGAAAACCTGG 86108714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGCATCTCTAAGGGGCACCATCAGGCTGACTCTTTGATGTGTTAGAGAACGAAAACCTGG 2160

 86108715 ACTTGCTGCTACCAGGGTGAAGAAGTGTGGCTGATGTGATGCTCACAGGAGCTGGAAAAA 86108774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTTGCTGCTACCAGGGTGAAGAAGTGTGGCTGATGTGATGCTCACAGGAGCTGGAAAAA 2220

 86108775 ATAAAAGAGCAAGACAGCATGAAGCTGGCAGGGAAAAGTCCCTCATTTCTCCTTTAGCCT 86108834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATAAAAGAGCAAGACAGCATGAAGCTGGCAGGGAAAAGTCCCTCATTTCTCCTTTAGCCT 2280

 86108835 CCCAGGCTCTCTCTAGTGCCCCTTACACAGATTGTCTAGCAAATGAAAAGCAGTTTCAAA 86108894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCCAGGCTCTCTCTAGTGCCCCTTACACAGATTGTCTAGCAAATGAAAAGCAGTTTCAAA 2340

 86108895 AATCCCAGCCCCACAATCCCAAAGCTAAGAGGAGTGGATTTGAGACTGAGAGACCATTAT 86108954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATCCCAGCCCCACAATCCCAAAGCTAAGAGGAGTGGATTTGAGACTGAGAGACCATTAT 2400

 86108955 CTTCATAACTGGTATAGTGTCTTTTAACATAAAAGATCCTTCACCCCAACTTAACGGTAA 86109014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTTCATAACTGGTATAGTGTCTTTTAACATAAAAGATCCTTCACCCCAACTTAACGGTAA 2460

 86109015 ATCCTTAAGTTACATTTACCTTAAGGGTAAATTTAAATCCATGTGCTCTAATTCATTTCT 86109074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATCCTTAAGTTACATTTACCTTAAGGGTAAATTTAAATCCATGTGCTCTAATTCATTTCT 2520

 86109075 CTGAGAAAGAACAAAGAGTCTCCTTAATATCATCACTCTAATCCTTGGAAACATTAAGGT 86109134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGAGAAAGAACAAAGAGTCTCCTTAATATCATCACTCTAATCCTTGGAAACATTAAGGT 2580

 86109135 GTTGTTGACATCTTACCTGGTGCTCTCTGTATCACTTGCACAGCATATATTATGCTCTTA 86109194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GTTGTTGACATCTTACCTGGTGCTCTCTGTATCACTTGCACAGCATATATTATGCTCTTA 2640

 86109195 ACAAATATTAGTTGAATGAATGTGTAAAAGTATATTCTCAGCATAACTCTGACTTCTGAA 86109254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACAAATATTAGTTGAATGAATGTGTAAAAGTATATTCTCAGCATAACTCTGACTTCTGAA 2700

 86109255 TTCTCTTTAAACAATGCATTTTTCATCCCCTTTATCACTGGACTAGGATATAAATATTTA 86109314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTCTCTTTAAACAATGCATTTTTCATCCCCTTTATCACTGGACTAGGATATAAATATTTA 2760

 86109315 TACTGTAAAAACTATAGCACCACAGAAATATGACTTCACAATTTCAGAAGCTCTGATGTT 86109374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TACTGTAAAAACTATAGCACCACAGAAATATGACTTCACAATTTCAGAAGCTCTGATGTT 2820

 86109375 TCTTAAGACAGTTAATATAGATTTTGCATGTTTCTCTCAAACTACAGAGGGAATGAGGAA 86109434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCTTAAGACAGTTAATATAGATTTTGCATGTTTCTCTCAAACTACAGAGGGAATGAGGAA 2880

 86109435 ATAAAATAGAATTCCTTTGATTTCCTCTAAGGTTGAATCTTCCTTCCCAAAATCCCAATG 86109494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ATAAAATAGAATTCCTTTGATTTCCTCTAAGGTTGAATCTTCCTTCCCAAAATCCCAATG 2940

 86109495 ATGCATCAGGCTACTCTTCGGATTCTCCGTATCACATGAAAGATACAGGTGAGCCATTCA 86109554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATGCATCAGGCTACTCTTCGGATTCTCCGTATCACATGAAAGATACAGGTGAGCCATTCA 3000

 86109555 GCTTTTGTATAAAAGAAATAAGAGATGATCTTATCTTATTTTGGGCCTCAGTCACCTCAA 86109614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCTTTTGTATAAAAGAAATAAGAGATGATCTTATCTTATTTTGGGCCTCAGTCACCTCAA 3060

 86109615 TTTACCCTCAATCTCTCTTGGGTGCTGTAGTATCTTCCAGGCATAAAGTGTTCAATCGTA 86109674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTTACCCTCAATCTCTCTTGGGTGCTGTAGTACCTTCCAGGCATAAAGTGTTCAATCGTA 3120

 86109675 TGCAGTAAATAAATTATTTTAGAGATAGTCCTATTAAAGTATGTTTAAAAAAATAAGATT 86109734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGCAGTAAATAAATTATTTTAGAGATAGTCCTATTAAAGTATGTTTAAAAAAATAAGATT 3180

 86109735 TATGTTTACAAAATTCATTCACTTTACATAGTTACATGTTTAGTTTTGTTTATGGCAATT 86109794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TATGTTTACAAAATTCATTCACTTTACATAGTTACATGTTTAGTTTTGTTTATGGCAATT 3240

 86109795 CAATATGTTGTCACTAAATATTTTTTTTCAAAATCAGATAACATAAACTTAAATATGATA 86109854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CAATATGTTGTCACTAAATATTTTTTTTCAAAATCAGATAACATAAACTTAAATATGATA 3300

 86109855 GAAGAGGAGAGAATTGATTCATTGAAACAGTGGCCTTCAAAACTCCTTTTTCTCAAAAAA 86109914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAAGAGGAGAGAATTGATTCATTGAAACAGTGGCCTTCAAAACTCCTTTTTCTCAAAAAA 3360

 86109915 AAAA-TATTTGAAGGGGTGATGTAAAACCTTTTGTTTTTCTTATGACAGCATTCCAAGTC 86109973
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAAAATATTTGAAGGGGTGATGTAAAACCTTTTGTTTTTCTTATGACAGCATTCCAAGTC 3420

 86109974 TTTCTCAAATATATTCGAGGACTTTATTTTGTAGACACTTTAGAAGTTGGATTTTTTTCA 86110033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TTTCTCAAATATATTCGAGGACTTTATTTTGTAGACACTTTAGAAGTTGGATTTTTTTCA 3480

 86110034 AGAAACATCTGTAAATATTAGAAAAACAGTTCAAATCTTAAGAACAAGATGTATAAACAA 86110093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGAAACATCTGTAAATATTAGAAAAACAGTTCAAATCTTAAGAACAAGATGTATAAACAA 3540

 86110094 GTTGTATAAACACATTTTAGTGCATTATGTGGTCAACCCAATATTTAATCATGGTTATCC 86110153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTTGTATAAACACATTTTAGTGCATTATGTGGTCAACCCAATATTTAATCATGGTTATCC 3600

 86110154 ATTATGTTTTATAAAACATGTTACACTGTTTTTCCTGACATTAATTGCATTATTAAGATA 86110213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATTATGTTTTATAAAACATGTTACACTGTTTTTCCTGACATTAATTGCATTATTAAGATA 3660

 86110214 TTATGGAAGGATGTATTTGTTATTTGTTTATGACTTTCTTTGTCATTCATCAAAAGTATG 86110273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTATGGAAGGATGTATTTGTTATTTGTTTATGACTTTCTTTGTCATTCATCAAAAGTATG 3720

 86110274 CTATTGTACCATGAAGAGCAATCTCTGCTGACCAGGCTGTTTACAAGTATCAGAAGAAAT 86110333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTATTGTACCATGAAGAGCAATCTCTGCTGACCAGGCTGTTTACAAGTATCAGAAGAAAT 3780

 86110334 GCAATGTCAGGCTTTTGGTACTATAATTCCATGGGCAGTCTCTTGATTTTCCACATAAAA 86110393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GCAATGTCAGGCTTTTGGTACTATAATTCCATGGGCAGTCTCTTGATTTTCCACATAAAA 3840

 86110394 TAGATCTACTTTATACAAGGCACTTTTCTCTTAGAATTTTTTTTAAGTTTAGTTTTAAAA 86110453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TAGATCTACTTTATACAAGGCACTTTTCTCTTAGAATTTTTTTTAAGTTTAGTTTTAAAA 3900

 86110454 TCTAAAGCTAATTCTAAATAAATGCTGTCCTGTGCACTGTAAGATTTAGTAATATCTGTG 86110513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TCTAAAGCTAATTCTAAATAAATGCTGTCCTGTGCACTGTAAGATTTAGTAATATCTGTG 3960

 86110514 GCCTTTTCGTACTAGATGACAGTTGCACCCCACCAAACTTGGACACTAAAATTATCTCCC 86110573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GCCTTTTCGTACTAGATGACAGTTGCACCCCACCAAACTTGGACACTAAAATTATCTCCC 4020

 86110574 AAGGAGCAAAACTGCCCCCAGTTGAGAACCACTGCTTTGGAACTTGACTGTTTCCCTTCC 86110633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAGGAGCAAAACTGCCCCCAGTTGAGAACCACTGCTTTGGAACTTGACTGTTTCCCTTCC 4080

 86110634 ATTCTTTCTGTTTTTCTTGTCTCCTCTTTTGGGGCCCATTATAAAATATAGGGTTGAAAT 86110693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATTCTTTCTGTTTTTCTTGTCTCCTCTTTTGGGGCCCATTATAAAATATAGGGTTGAAAT 4140

 86110694 GTTCCTCTTTCTAAATTACTTATTGGGCTGCTTATTCTGGAAGATTGACCTAGGGTTAAT 86110753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GTTCCTCTTTCTAAATTACTTATTGGGCTGCTTATTCTGGAAGATTGACCTAGGGTTAAT 4200

 86110754 CACAAGGCAAGACCTGGTTTAGAATCAGTGAGATGACCCTTACTGGAAATGATGATTGCA 86110813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CACAAGGCAAGACCTGGTTTAGAATCAGTGAGATGACCCTTACTGGAAATGATGATTGCA 4260

 86110814 TGGTAATTTTAAGTATGCTAGCTTTTTATGTGAGGGTGATACTAAGGATGTACTGTACTA 86110873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TGGTAATTTTAAGTATGCTAGCTTTTTATGTGAGGGTGATACTAAGGATGTACTGTACTA 4320

 86110874 CAAACATATGATACTGAAAGGTGTTTATGTGAAAGTAGTCATAGGGTGAACTAAATTTTA 86110933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CAAACATATGATACTGAAAGGTGTTTATGTGAAAGTAGTCATAGGGTGAACTAAATTTTA 4380

 86110934 CAGGAAGATTTAATGTAATTTGAGCTAAAGCTTTAGGAGAGAATGTTAGAAGGATCACTG 86110993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CAGGAAGATTTAATGTAATTTGAGCTAAAGCTTTAGGAGAGAATGTTAGAAGGATCACTG 4440

 86110994 GACACAGGAACTGAGTCATTTAATAAGAAACATTTCCAATATTCTAGATCATCCAAATTA 86111053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GACACAGGAACTGAGTCATTTAATAAGAAACATTTCCAATATTCTAGATCATCCAAATTA 4500

 86111054 TATAACTAAGAAAAAAATATATATATTTCTCATCATATAAAAATAAACTGTTATGACTAG 86111113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TATAACTAAGAAAAAAATATATATATTTCTCATCATATAAAAATAAACTGTTATGACTAG 4560

 86111114 CAAAATAAAATTTATTGCTATAATTATAATTACTACAATTATACTAAAAAGATACACAAT 86111173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CAAAATAAAATTTATTGCTATAATTATAATTACTACAATTATACTAAAAAGATACACAAT 4620

 86111174 CTTTAATAACCATAAGCTCATTAATCCTCATATTAATATGTAATAGTTGCTCATCACAAC 86111233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CTTTAATAACCATAAGCTCATTAATCCTCATATTAATATGTAATAGTTGCTCATCACAAC 4680

 86111234 TGTTACCCAACCTTGAAAATGGAACTTATAGATCTTTTATTTTGTCCACGTATAAGACAA 86111293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TGTTACCCAACCTTGAAAATGGAACTTATAGATCTTTTATTTTGTCCACGTATAAGACAA 4740

 86111294 ATTTAAACTCTAAAAGCAATTTATTTGTTGCAGTTAACAAAGACTTGTGATTTCTACTGG 86111353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 ATTTAAACTCTAAAAGCAATTTATTTGTTGCAGTTAACAAAGACTTGTGATTTCTACTGG 4800

 86111354 AAAAGAAAGGAAAACAAATTTTTGGAAGTGCTAACTTAAATTAGTGTGTTTTTATTATTT 86111413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AAAAGAAAGGAAAACAAATTTTTGGAAGTGCTAACTTAAATTAGTGTGTTTTTATTATTT 4860

 86111414 TTCTTGTTTTTATGTCTGTCTTCATAACCAAACATTTCTAATGAAAGGGCTACAACTTTC 86111473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TTCTTGTTTTTATGTCTGTCTTCATAACCAAACATTTCTAATGAAAGGGCTACAACTTTC 4920

 86111474 AATCAATTAATAATCTGAATTATAAATCAGGAAAAAGTCGCAGACAACATGTAACTGAAA 86111533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AATCAATTAATAATCTGAATTATAAATCAGGAAAAAGTCGCAGACAACATGTAACTGAAA 4980

 86111534 TTCATCAAAGCATAAGATAAGATAGCACATAATATATTGTCAGAATATTTTTTAAAATAT 86111593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TTCATCAAAGCATAAGATAAGATAGCACATAATATATTGTCAGAATATTTTTTAAAATAT 5040

 86111594 TAGTCATTTACACATGTATATATATCATTATTTATCCAAACCTATAAAATGTGCAACATC 86111653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TAGTCATTTACACATGTATATATATCATTATTTATCCAAACCTATAAAATGTGCAACATC 5100

 86111654 AAAAGTGAATCCTAATGTTAAACTATGAACTTTTCGTGATAATAATGTGTCAGTACAGGT 86111713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AAAAGTGAATCCTAATGTTAAACTATGAACTTTTCGTGATAATAATGTGTCAGTACAGGT 5160

 86111714 TTATCAGTTGTACTATTCTAGTGGGGGATGGTGATATTGGAAATAGCTACGCATGAGTAG 86111773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTATCAGTTGTACTATTCTAGTGGGGGATGGTGATATTGGAAATAGCTACGCATGAGTAG 5220

 86111774 GGGCAGGGGATAGATGAGAAATCTCTGTACCTCCCTGTCAATCTTGTTGTCAATCTAAAA 86111833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GGGCAGGGGATAGATGAGAAATCTCTGTACCTCCCTGTCAATCTTGTTGTCAATCTAAAA 5280

 86111834 CTGCTCAAAAATTTAAAAACATTCTTTAAAAATCTGTAATTTATATTATTAACTGTTGAA 86111893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CTGCTCAAAAATTTAAAAACATTCTTTAAAAATCTGTAATTTATATTATTAACTGTTGAA 5340

 86111894 ACTATTATGACTAAAGATTCTGGTTATTTAAAATTGATAATAATTGTGAAACAATGATCA 86111953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 ACTATTATGACTAAAGATTCTGGTTATTTAAAATTGATAATAATTGTGAAACAATGATCA 5400

 86111954 GATATTATATGACAAGACACCATATCTACACTTGTCCTATTTAACATTTATATCAATAAC 86112013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 GATATTATATGACAAGACACCATATCTACACTTGTCCTATTTAACATTTATATCAATAAC 5460

 86112014 TTAGATGAAGCAAATGCTTGGGGCATGCTTTGCAAATGTGACGACAACAGTAAAAAGCCA 86112073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TTAGATGAAGCAAATGCTTGGGGCATGCTTTGCAAATGTGACGACAACAGTAAAAAGCCA 5520

 86112074 GAAAGGACAGCAAATACAGTGATGTTAAAATCTGAATCCAAAAGGATAGTAGAAGACATG 86112133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GAAAGGACAGCAAATACAGTGATGTTAAAATCTGAATCCAAAAGGATAGTAGAAGACATG 5580

 86112134 AAACAAGGAAAGCTCACAATGAAATTTGACAGATTATTACAGGTCTTGCACTACAATCCG 86112193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 AAACAAGGAAAGCTCACAATGAAATTTGACAGATTATTACAGGTCTTGCACTACAATCCG 5640

 86112194 AAGGCACAACTTTGGATCAAAGACAAATGGAGAAAATTGGTTTAGAGGCAGCCTGTATGA 86112253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 AAGGCACAACTTTGGATCAAAGACAAATGGAGAAAATTGGTTTAGAGGCAGCCTGTATGA 5700

 86112254 GAAAGAATTACAGGATTAGTTGAATTCAAATTCAGTGTGACTCAACAATGAGATTTGTTT 86112313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GAAAGAATTACAGGATTAGTTGAATTCAAATTCAGTGTGACTCAACAATGAGATTTGTTT 5760

 86112314 GCCAAGGAACTAATGTGATCTAAAGGTATATTAACTTCTATTGTTCCTGATATTTTATGT 86112373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5761 GCCAAGGAACTAATGTGATCTAAAGGTATATTAACTTCTATTGTTCCTGATATTTTATAT 5820

 86112374 CTAGATATTCTGATAGCTAGAATGGCATTAGGGATAGTATTTCTTTACTTTGAATTGGTT 86112433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CTAGATATTCTGATAGCTAGAATGGCATTAGGGATAGTATTTCTTTACTTTGAATTGGTT 5880

 86112434 AGATCTTACCAGGATGATTTTTGAAAGATAGGAGAATGGTAAAGTGAACTTCACTTCATG 86112493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 AGATCTTACCAGGATGATTTTTGAAAGATAGGAGAATGGTAAAGTGAACTTCACTTCATG 5940

 86112494 TCATTTGAGCAGTGGTTGAGGAAACCTATCATGCCTGGAGAAATATAATTGCTCCCCTCA 86112553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TCATTTGAGCAGTGGTTGAGGAAACCTATCATGCCTGGAGAAATATAATTGCTCCCCTCA 6000

 86112554 GATATTTAAGGAGCTATTATATGGAAGATGAATTTTGTTTTTTTTTCTATATAAGTAACT 86112613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 GATATTTAAGGAGCTATTATATGGAAGATGAATTTTGTTTTTTTTTCTATATAAGTAACT 6060

 86112614 CTCAAAGTTAGGCCTGCTAGCTACAAGTTATTTTACCTGATTGTAGTCTAATTTCCTGCT 86112673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CTCAAAGTTAGGCCTGCTAGCTACAAGTTATTTTACCTGATTGTAGTCTAATTTCCTGCT 6120

 86112674 CAACAGACTACAAACCTAGACTTTCCAAGCAAATGAAAATCTAAACAAATACTAACAGAA 86112733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 CAACAGACTACAAACCTAGACTTTCCAAGCAAATGAAAATCTAAACAAATACTAACAGAA 6180

 86112734 AATTGGTATAACTCTTTCACTTTTATTCATCTTAAAAGTGTTGTTACCTTTTACAGAAAA 86112793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 AATTGGTATAACTCTTTCACTTTTATTCATCTTAAAAGTGTTGTTACCTTTTACAGAAAA 6240

 86112794 CCTTTAGGAATGTGCTAAAATCGTTTACAGTACTTATTAAACTTTCTTCTGCCTCTAACT 86112853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CCTTTAGGAATGTGCTAAAATCGTTTACAGTACTTATTAAACTTTCTTCTGCCTCTAACT 6300

 86112854 CTGTGCATAGGATTCTGTTATAGACCAAACTTCATTACCTCAAAGTAAAATACCAGTTAC 86112913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 CTGTGCATAGGATTCTGTTATAGACCAAACTTCATTACCTCAAAGTAAAATACCAGTTAC 6360

 86112914 TACTGCTGATACAGTAGGTGTACCTTAGAACTGTTGAGTCTCAGAGTTGTTAAGAATGGA 86112973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 TACTGCTGATACAGTAGGTGTACCTTAGAACTGTTGAGTCTCAGAGTTGTTAAGAATGGA 6420

 86112974 CTATTGATGAATCAGATAACAGATTTTGGTGGAGATAAAGCTAAAGTTTTTTCTTGCCTT 86113033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 CTATTGATGAATCAGATAACAGATTTTGGTGGAGATAAAGCTAAAGTTTTTTCTTGCCTT 6480

 86113034 TTTATTTCCATCTTAACTTTAATATAACTTTGGAAGGAGTAGGTCCTTTTTCTCTCTAAT 86113093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 TTTATTTCCATCTTAACTTTAATATAACTTTGGAAGGAGTAGGTCCTTTTTCTCTCTAAT 6540

 86113094 AGATAATAGAAAAACACCATTATCTACAAAACATATGACATTTTTTCATTAGGGAATTTA 86113153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 AGATAATAGAAAAACACCATTATCTACAAAACATATGACATTTTTTCATTAGGGAATTTA 6600

 86113154 TATTGTTATTTTAATACAAACAGTGAGAAGAGCTATAGGTCAATTGTTCCACAATTAATG 86113213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 TATTGTTATTTTAATACAAACAGTGAGAAGAGCTATAGGTCAATTGTTCCACAATTAATG 6660

 86113214 CCATCATTTTGGGTAGGCACATCTCAGCTTTTAACTGCTTTATAGCTGAATAATTCGATA 86113273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 CCATCATTTTGGGTAGGCACATCTCAGCTTTTAACTGCTTTATAGCTGAATAATTCGATA 6720

 86113274 CAACAAATCACCTTAATGTCACCTATAGGTACATTTAGAAATCAGTGTATTTTTTAATTG 86113333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 CAACAAATCACCTTAATGTCACCTATAGGTACATTTAGAAATCAGTGTATTTTTTAATTG 6780

 86113334 TGGTAAGGATATTTAATATGAGATTTGTCCTCTTAACAAATTTTAGGTGTACAATATATT 86113393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 TGGTAAGGATATTTAATATGAGATTTGTCCTCTTAACAAATTTTAGGTGTACAATATATT 6840

 86113394 ATCGTTGATTCCAAGTAAATATTGTATGACAGATCTCCAAAGCTTATTCATCTTATTTAA 86113453
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 ATCGTTGATTCCAGGTAAATATTGTATGACAGATCTCCAAAGCTTATTCATCTTATTTAA 6900

 86113454 CTGAAATTTTGTGCCTGTTGATTAATAACTCATTTCTCTCTCCCTCTGTAGTTCTTGGTA 86113513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 CTGAAATTTTGTGCCTGTTGATTAATAACTCATTTCTCTCTCCCTCTGTAGTTCTTGGTA 6960

 86113514 ACAACCATTCCAGTCCTTGATGTTATTAATTTCACTATTTTGGAAGGAATTGAAACTCTA 86113573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 ACAACCATTCCAGTCCTTGATGTTATTAATTTCACTATTTTGGAAGGAATTGAAACTCTA 7020

 86113574 TCACCCCCCTCCCCTTTCCCTCCAATAGTAAGGCTTTCACTGTTTGTTTTTATTGGGAAG 86113633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 TCACCCCCCTCCCCTTTCCCTCCAATAGTAAGGCTTTCACTGTTTGTTTTTATTGGGAAG 7080

 86113634 TGAGTTATTTCTTTTGTCCTGGTTTTCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGACTAAAT 86113693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 TGAGTTATTTCTTTTGTCCTGGTTTTCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGACTAAAT 7140

 86113694 TACAAATTCTATTAAAGAAAAGATGAATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCCTCCAT 86113753
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7141 TACAAGTTCTATTAAAGAAAAGATGAATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCCTCCAT 7200

 86113754 GATGTTTTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAAT 86113813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 GATGTTTTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAAT 7260

 86113814 TTAAATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTT 86113873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 TTAAATAATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTT 7320

 86113874 ATTCCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTC 86113933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 ATTCCCCAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTC 7380

 86113934 AAATCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATC 86113993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 AAATCCAAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATC 7440

 86113994 AGATGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACT 86114053
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     7441 AGATGATATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACACTGTCCACCTTGGTCCACT 7500

 86114054 TAAATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACT 86114113
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     7501 TAAATTGTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTGACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACT 7560

 86114114 TTTGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATG 86114173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 TTTGTTAGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATG 7620

 86114174 GTTTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATAC 86114233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 GTTTATACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATAC 7680

 86114234 AATAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAA 86114293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 AATAGAGCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAA 7740

 86114294 GAGATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATG 86114353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 GAGATCAAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATG 7800

 86114354 AACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGT 86114413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 AACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGT 7860

 86114414 GATTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTT 86114473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 GATTTCAGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTT 7920

 86114474 TCTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGG 86114533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 TCTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGG 7980

 86114534 CACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTT 86114593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 CACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTT 8040

 86114594 TTTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTT 86114653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 TTTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTT 8100

 86114654 TAAATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGT 86114713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 TAAATGTATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGT 8160

 86114714 GCCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTA 86114773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 GCCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTA 8220

 86114774 GGTAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAAT 86114833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 GGTAGAACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAAT 8280

 86114834 GTTAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCT 86114893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 GTTAATAACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCT 8340

 86114894 AATATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACC 86114953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 AATATGCATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACC 8400

 86114954 ATTGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAA 86115013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 ATTGCATATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAA 8460

 86115014 CAAATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACC 86115073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 CAAATACTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACC 8520

 86115074 AGTGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTA 86115133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8521 AGTGCTATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTA 8580

 86115134 TTTTAAAATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGAC 86115193
          ||||                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 TTTT----------------GAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGAC 8624

 86115194 ATGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAA 86115253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8625 ATGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAA 8684

 86115254 GGAAGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGAC 86115313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8685 GGAAGAAGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGAC 8744

 86115314 AAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGC 86115337
          ||||||||||||||||||||||||
     8745 AAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGC 8768

EXCISED REGION

 86117859 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 86117918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8769 AAGATATATTTACAAGGAAGTTTGCTACGCCATAGTTACTAGTTTCAAAAACTAAAAACA 8828

 86117919 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 86117978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8829 CATTAAATTCCCATCAATAGAGAAATGGTTGAATAATTTGTAGTACATTTATACTATAAG 8888

 86117979 ATATACAGCCATTAAAAAGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTA 86118038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8889 ATATACAGCCATTAAAAAGGCTGAGTTGTCTTTATACTAGTTGAACTGGAGGAATTTTTA 8948

 86118039 CAATATGTTGCTCAGTGGGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTC 86118098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8949 CAATATGTTGCTCAGTGGGAAAAGCTAAATGAAGAAAGAAGTATATGACTGATTTTTCTC 9008

 86118099 AAATAATGGCAAAAATATCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATT 86118158
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9009 AAATAATGGCAAAAATCTCACATATACATGATTATTGATGTGTAACCACATGTTAATATT 9068

 86118159 ATTTATATGGGACTTAGAAAAAGAAATGGATGAGT------AAGTAGGAAGAGAAAATAA 86118212
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||||||||||||
     9069 ATTTATATGGGACTTAGAAAAAGAAATGGATGAGTAAGTTAAAGTAGGAAGAGAAAATAA 9128

 86118213 GTGTTTACATAATAGAAATAGAATATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCAC 86118272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9129 GTGTTTACATAATAGAAATAGAATATATGATTCAGTTTATGTACAATGTAGTATGTGCAC 9188

 86118273 ATTTCACATCTATGAGTGTATATAATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGG 86118332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9189 ATTTCACATCTATGAGTGTATATAATGTGATGCACTAAAAGATAGTCATCAAATTAATGG 9248

 86118333 TGGTATCTCAAGCTGTTGGGATTTTAGGACACTTTAAAACTTTTTACTTTCTATACCTTT 86118392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9249 TGGTATCTCAAGCTGTTGGGATTTTAGGACACTTTAAAACTTTTTACTTTCTATACCTTT 9308

 86118393 TGTTTTTATAATTTTTCTATGTTTTAAATTTTACACAATGAATGCGTACTATTTATATCA 86118452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9309 TGTTTTTATAATTTTTCTATGTTTTAAATTTTACACAATGAATGCGTACTATTTATATCA 9368

 86118453 TTTGGAAAAAAATAAATTCTGCCTTTGAATAAAAGTACACATCTTATTACTTCTTAATAA 86118512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9369 TTTGGAAAAAAATAAATTCTGCCTTTGAATAAAAGTACACATCTTATTACTTCTTAATAA 9428

 86118513 GTACTG 86118518
          ||||||
     9429 GTACTG 9434

Alignment time is 7.53482 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    2304] =>      2304 nucs 'mol-32-34b3-169928_2304'

Score:        2304
Aligned:      2304        nucs
Identic:      2304 (100%) nucs =>      2295 (100%)         9 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86113659,86115953] EXCISED REGION [86120928,86120936]
 second seq =>  [       1,    2295] EXCISED REGION [    2296,    2304]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4974 nucs [86115954,86120927]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>     10426 nucs [86115956,86126381]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [86115954,86115955] to [86120928,86120929]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [86115950,86115953] to [86120928,86120931]
 second seq =>         4 nucs [2292,2295] to [2296,2299]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 86113659 TCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGACTAAATTACAAATTCTATTAAAGAAAAGATG 86113718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCATATTCTATGACATTCATTTATAAGACTAAATTACAAATTCTATTAAAGAAAAGATG 60

 86113719 AATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCCTCCATGATGTTTTTCAAAAGGTAACTATTC 86113778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTAACTTTATCAATTCATCTTTGTCTCCTCCATGATGTTTTTCAAAAGGTAACTATTC 120

 86113779 ATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTAAATAATTGGTAACAAGAAAAAT 86113838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTAAATAATTGGTAACAAGAAAAAT 180

 86113839 GCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATTCCCCAAAGAACAACTTATTATC 86113898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATTCCCCAAAGAACAACTTATTATC 240

 86113899 ACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCCAAATGACAGGTAAATGTTT 86113958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCCAAATGACAGGTAAATGTTT 300

 86113959 GGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGATATCTGTCCATAGTTAATC 86114018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGATATCTGTCCATAGTTAATC 360

 86114019 ATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGTGAATGATTTT 86114078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATTGTATTTTGTGAATGATTTT 420

 86114079 AGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACCCCATCAACCC 86114138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTTAGCCAGACCCCATCAACCC 480

 86114139 TGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAACACTCAAAAGA 86114198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTATACATAGAACACTCAAAAGA 540

 86114199 GATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAATGACAAATGCC 86114258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGAGCAACAAATGACAAATGCC 600

 86114259 ATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGAAGCTTAAAAT 86114318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATCAAATCTGGAAGCTTAAAAT 660

 86114319 AAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTC 86114378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAAGTAATTGCTTACTTTTTTC 720

 86114379 AGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTCACTGAACAAT 86114438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTCAGCTTTGTCACTGAACAAT 780

 86114439 AAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAA 86114498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTTTTTTGCCATCCTGCATAAA 840

 86114499 ACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGT 86114558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAAGTTGGCACTGTTGCAAAGT 900

 86114559 GGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGG 86114618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAATGGCTGTTCTCTTCACTGG 960

 86114619 TTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATGTATGTTCACCACTTTCAGG 86114678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATGTATGTTCACCACTTTCAGG 1020

 86114679 TTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGA 86114738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACACCTGAGGAAAGTAAGGAGA 1080

 86114739 ATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCATTCATATAAA 86114798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGAACACGTCCATTCATATAAA 1140

 86114799 GGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATTCTCTATAAAT 86114858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAATAACCAAATTCTCTATAAAT 1200

 86114859 ATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAATTCCTACTATG 86114918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATGCATTTGAATTCCTACTATG 1260

 86114919 TGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTGCCTACTTCCC 86114978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCATATAATTTGCCTACTTCCC 1320

 86114979 TAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAGCAACTACTCT 86115038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATACTTATTGAGCAACTACTCT 1380

 86115039 GAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGTACATATTAAA 86115098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCTATACAATGTACATATTAAA 1440

 86115099 AATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTTTAAAATCAGATGACATTGAAAA 86115158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTTTAAAATCAGATGACATTGAAAA 1500

 86115159 ATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTC 86115218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACATGTAATGCCTTTGCTGGTGGACTC 1560

 86115219 CCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCAGGAATG 86115278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGAAGACTCCACAGCAGGAATG 1620

 86115279 GTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGCA 86115338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGCAGACAGCCTAATGCAAGCA 1680

 86115339 TGCCTAGGTGCAACCCTCGCCCTGCTCCTTATTAGCTTGGTGATGTTAGACAACATACCA 86115398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCCTAGGTGCAACCCTCGCCCTGCTCCTTATTAGCTTGGTGATGTTAGACAACATACCA 1740

 86115399 CCCTGTGCTCATTCTTCAATTTTTAATAAATACTACTTTTCTTATGGAGTAGTTATAAGA 86115458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCCTGTGCTCATTCTTCAATTTTTAATAAATACTACTTTTCTTATGGAGTAGTTATAAGA 1800

 86115459 ATTAAATGATTAAATGGCAATAGTAAGCACTTTAGGAAAGAAAGCAAGTGAAGTATTTTT 86115518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATTAAATGATTAAATGGCAATAGTAAGCACTTTAGGAAAGAAAGCAAGTGAAGTATTTTT 1860

 86115519 ATTAGTAGAGTTGCATGAAAATATAATTTCTTAAGAAATATTACAGAATCTTCTTTCAGA 86115578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTAGTAGAGTTGCATGAAAATATAATTTCTTAAGAAATATTACAGAATCTTCTTTCAGA 1920

 86115579 ATAAAATAAGACAAAAATAAAGGGATCTATCACACCTGAAATTATAATAGTAAAGTTTAC 86115638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATAAAATAAGACAAAAATAAAGGGATCTATCACACCTGAAATTATAATAGTAAAGTTTAC 1980

 86115639 CCTTAAGACTCTACATAAAATTATTTGTACGTATGGTTAGTATATCAGTAAGTGGCTATT 86115698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCTTAAGACTCTACATAAAATTATTTGTACGTATGGTTAGTATATCAGTAAGTGGCTATT 2040

 86115699 TTCTGGGAAATTTCCAGTTATTTATCATGCTGATTTCCTTTGTTTCAAAGCATGTGAGTA 86115758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTCTGGGAAATTTCCAGTTATTTATCATGCTGATTTCCTTTGTTTCAAAGCATGTGAGTA 2100

 86115759 AATCATTCTTTGAATTTCTACACACCTTTCTCTTAAAGTTCTTAAAATTTTTTTAAACAA 86115818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATCATTCTTTGAATTTCTACACACCTTTCTCTTAAAGTTCTTAAAATTTTTTTAAACAA 2160

 86115819 GCTCATTTATTCCCAACACATTGCTCACCAAATATAACTACCCACCCGTCCCCAAATCTT 86115878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCTCATTTATTCCCAACACATTGCTCACCAAATATAACTACCCACCCGTCCCCAAATCTT 2220

 86115879 AACAGGGTTTCTTCTAAATGTCATCTACATTAATGCCATTTTACACTTCTCTTTCTTTTT 86115938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AACAGGGTTTCTTCTAAATGTCATCTACATTAATGCCATTTTACACTTCTCTTTCTTTTT 2280

 86115939 TTTTTTTTTTTTTTT 86115953
          |||||||||||||||
     2281 TTTTTTTTTTTTTTT 2295

EXCISED REGION

 86120928 TTTTATCTT 86120936
          |||||||||
     2296 TTTTATCTT 2304

Alignment time is 1.85376 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [86105337,86127858] =>     22522 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [       1,    2139] =>      2139 nucs 'mol-32-34be-011450_2139'

Score:        2138
Aligned:      2138        nucs
Identic:      2138 (100%) nucs =>      1773 (100%)       365 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [86113760,86115532] EXCISED REGION [86115534,86115898]
 second seq =>  [       1,    1773] EXCISED REGION [    1775,    2139]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [86115533,86115533]
 second seq =>         1 nucs [1774,1774]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 86113760 TTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTAAAT 86113819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCAAAAGGTAACTATTCATGATACATATTTACTGAGTAAAGAGAGTTCTAATTTAAAT 60

 86113820 AATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATTCCC 86113879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTGGTAACAAGAAAAATGCTTAACCATAATTTTGGATGGGAACTTAAGGTTTATTCCC 120

 86113880 CAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCC 86113939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAAGAACAACTTATTATCACATAAAATTGATAAGACAAAACAATAAGTTCCTCAAATCC 180

 86113940 AAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGA 86113999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATGACAGGTAAATGTTTGGTTTCTTGGAAAGAATGGAATCAAGAAATTGATCAGATGA 240

 86114000 TATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATT 86114059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATCTGTCCATAGTTAATCATTTATCTAGGGTACATTGTCCACCTTGGTCCACTTAAATT 300

 86114060 GTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTT 86114119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTATTTTGTGAATGATTTTAGGCTAACAACTGGAAAGGGAAGTCTAAAATTACTTTTGTT 360

 86114120 AGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTAT 86114179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGCCAGACCCCATCAACCCTGAGCAGATCTTTCTGCTGTAGCTATTACCAAATGGTTTAT 420

 86114180 ACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGA 86114239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACATAGAACACTCAAAAGAGATTTATTTTTCATCTGGAGCTTAGAGAAATATACAATAGA 480

 86114240 GCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATC 86114299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAACAAATGACAAATGCCATAATTGCTTAGGGGTATTATCATTCCTAGTGCAAGAGATC 540

 86114300 AAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAA 86114359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAATCTGGAAGCTTAAAATAAACTAAGCATTCATTCACTTTGCTAAAGAGCATGAACCAA 600

 86114360 GTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTC 86114419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTAATTGCTTACTTTTTTCAGAGTTCAGTGGAAAGTCAACTGTTAGAACAAAGTGATTTC 660

 86114420 AGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTT 86114479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCTTTGTCACTGAACAATAAATGTGCTCAATGAAGCTTGACTGGTTGTGTTTTTCTTTT 720

 86114480 TTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAA 86114539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTGCCATCCTGCATAAAACAAAGATCAACTTCAGAGCACAAGTGGCATTTGGCACTAA 780

 86114540 GTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAA 86114599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTTGGCACTGTTGCAAAGTGGAATTTTTTCTGTCTACTTTGACAGGAAAATTTTTTTTAA 840

 86114600 TGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATG 86114659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGCTGTTCTCTTCACTGGTTATCAATGCCCTTAAAGTCAAAAGGTGTGAGTTTTAAATG 900

 86114660 TATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACA 86114719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATGTTCACCACTTTCAGGTTATGGAACATTGAAAACAACACTTGTCCCTCTGTGCCACA 960

 86114720 CCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGA 86114779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTGAGGAAAGTAAGGAGAATGATATTTGTGTTGTCTGTCTCAAAACGTGTTTAGGTAGA 1020

 86114780 ACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAAT 86114839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACACGTCCATTCATATAAAGGAAACTGGTAAATCAGCAAATCATGATTGTAAATGTTAAT 1080

 86114840 AACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATG 86114899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACCAAATTCTCTATAAATATACTTGGGGAAAGAGTCATAAGGAAATAAGAGCTAATATG 1140

 86114900 CATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCA 86114959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATTTGAATTCCTACTATGTGTCAAAATCATCTTTGAATATCACTGAGGTAACCATTGCA 1200

 86114960 TATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATA 86115019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATAATTTGCCTACTTCCCTAAATTTCTTTTTGTTGTTGTTGTTATATCATTAACAAATA 1260

 86115020 CTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCT 86115079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTATTGAGCAACTACTCTGAGCAAAGTATTGTGGTTTGGCCCTCTGTGCAACCAGTGCT 1320

 86115080 ATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTTTAA 86115139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATACAATGTACATATTAAAAATTCCCTAAATTTCTGAAGGGAATTACAATCTTATTTTAA 1380

 86115140 AATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACATGTAA 86115199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AATCAGATGACATTGAAAAATTCAAGTTACATTACCACCATATATATGGTGGACATGTAA 1440

 86115200 TGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGA 86115259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGCCTTTGCTGGTGGACTCCCTGCCTGCATGGTCAATGGAAAATGCTAATGGAAGGAAGA 1500

 86115260 AGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGC 86115319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGACTCCACAGCAGGAATGGTGTAACCACTGTCAGATGTTGTTATATAGCGGACAAGTGC 1560

 86115320 AGACAGCCTAATGCAAGCATGCCTAGGTGCAACCCTCGCCCTGCTCCTTATTAGCTTGGT 86115379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGACAGCCTAATGCAAGCATGCCTAGGTGCAACCCTCGCCCTGCTCCTTATTAGCTTGGT 1620

 86115380 GATGTTAGACAACATACCACCCTGTGCTCATTCTTCAATTTTTAATAAATACTACTTTTC 86115439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATGTTAGACAACATACCACCCTGTGCTCATTCTTCAATTTTTAATAAATACTACTTTTC 1680

 86115440 TTATGGAGTAGTTATAAGAATTAAATGATTAAATGGCAATAGTAAGCACTTTAGGAAAGA 86115499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTATGGAGTAGTTATAAGAATTAAATGATTAAATGGCAATAGTAAGCACTTTAGGAAAGA 1740

 86115500 AAGCAAGTGAAGTATTTTTATTAGTAGAGTTGC 86115532
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGCAAGTGAAGTATTTTTATTAGTAGAGTTGC 1773

EXCISED REGION

 86115534 TGAAAATATAATTTCTTAAGAAATATTACAGAATCTTCTTTCAGAATAAAATAAGACAAA 86115593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 TGAAAATATAATTTCTTAAGAAATATTACAGAATCTTCTTTCAGAATAAAATAAGACAAA 1834

 86115594 AATAAAGGGATCTATCACACCTGAAATTATAATAGTAAAGTTTACCCTTAAGACTCTACA 86115653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 AATAAAGGGATCTATCACACCTGAAATTATAATAGTAAAGTTTACCCTTAAGACTCTACA 1894

 86115654 TAAAATTATTTGTACGTATGGTTAGTATATCAGTAAGTGGCTATTTTCTGGGAAATTTCC 86115713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 TAAAATTATTTGTACGTATGGTTAGTATATCAGTAAGTGGCTATTTTCTGGGAAATTTCC 1954

 86115714 AGTTATTTATCATGCTGATTTCCTTTGTTTCAAAGCATGTGAGTAAATCATTCTTTGAAT 86115773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 AGTTATTTATCATGCTGATTTCCTTTGTTTCAAAGCATGTGAGTAAATCATTCTTTGAAT 2014

 86115774 TTCTACACACCTTTCTCTTAAAGTTCTTAAAATTTTTTTAAACAAGCTCATTTATTCCCA 86115833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 TTCTACACACCTTTCTCTTAAAGTTCTTAAAATTTTTTTAAACAAGCTCATTTATTCCCA 2074

 86115834 ACACATTGCTCACCAAATATAACTACCCACCCGTCCCCAAATCTTAACAGGGTTTCTTCT 86115893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 ACACATTGCTCACCAAATATAACTACCCACCCGTCCCCAAATCTTAACAGGGTTTCTTCT 2134

 86115894 AAATG 86115898
          |||||
     2135 AAATG 2139

Alignment time is 1.73041 s

