
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   3823] =>      3823 nucs 'mol-32-1e7c-012743_3823'

Score:        3692
Aligned:      3835        nucs
Identic:      3804 ( 99%) nucs =>       709 (100%)      3095 ( 99%)
Gaps:           25 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1624227,1624936] EXCISED REGION [1624984,1628095]
 second seq =>  [      1,    710] EXCISED REGION [    711,   3823]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        47 nucs [1624937,1624983]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        86 nucs [1624937,1625022] to [1624984,1625069]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1624937,1624937] to [1624983,1624983]
 second seq =>         0 nucs

  1624227 CTCCCCGAGTCCTCAACTGCACGACCCTCAAACTACAACATCTCCTCCTCCCCGAGTCTG 1624286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCCCCGAGTCCTCAACTGCACGACCCTCAAACTACAACATCTCCTCCTCCCCGAGTCTG 60

  1624287 CAGCTGCACGACCATCAATCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTATAAGAAC 1624346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGCTGCACGACCATCAATCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTATAAGAAC 120

  1624347 CTAACCGTAGAAGATCAGCTCCTCCGTGGGTCTGCAGCTGGAAGATCCACTAACTAGAAC 1624406
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAATCGTAGAAGATCAGCTCCTCCGTGGGTCTGCAGCTGGAAGATCCACTAACTAGAAC 180

  1624407 ATCGGCTCCTGTCCAGGTCTCCAGCTCCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCC 1624466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCGGCTCCTGTCCAGGTCTCCAGCTCCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCC 240

  1624467 TGAGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAATGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAG 1624526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAATGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAG 300

  1624527 CTGCATGACCCTCAAATACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCA 1624586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGCATGACCCTCAAATACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCA 360

  1624587 ATCTAGAACATCAGCTCGTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAAGAACCTAAAACTAGAACATCA 1624646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCTAGAACATCAGCTCGTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAAGAACCTAAAACTAGAACATCA 420

  1624647 GCTCCTCCCTGGATCTGCAGCTGGAAGATCCATTAAGTAGAATATCAGCTCCTGTCCGGG 1624706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTCCTCCCTGGATCTGCAGCTGGAAGATCCATTAAGTAGAATATCAGCTCCTGTCCGGG 480

  1624707 TCTCCAGCTCCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAA 1624766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTCCAGCTCCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAA 540

  1624767 GACCCTCAAGGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAACTGCATGACCCTCAAAC 1624826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACCCTCAAGGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAACTGCATGACCCTCAAAC 600

  1624827 TACAACATCTCCTCCCCGAGTCTGCAGCTGCATGCCCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCT 1624886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACAACATCTCCTCCCCGAGTCTGCAGCTGCATGCCCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCT 660

  1624887 CTCCAGGTCTGCAGCTGCACGACCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCTT 1624936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCCAGGTCTGCAGCTGCACGACCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCTT 710

EXCISED REGION

  1624984 CAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCT 1625043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      711 CAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCT 770

  1625044 GCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAA 1625103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 GCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAA 830

  1625104 TCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAGGGCCCTCAAGGTGGAACATCAG 1625163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 TCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAGGGCCCTCAAGGTGGAACATCAG 890

  1625164 CTCCTCCCCAAGCTAGAACACCTCTCCCACCTGGATCTCCAGCTCCACGACCCTCACAGA 1625223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 CTCCTCCCCAAGCTAGAACACCTCTCCCACCTGGATCTCCAGCTCCACGACCCTCACAGA 950

  1625224 ACAATCCCTTCTCATGAAATTCAGCAGTCAAGAAATCTGCAGCGGAAGTAAATGAATAAA 1625283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 ACAATCCCTTCTCATGAAATTCAGCAGTCAAGAAATCTGCAGCGGAAGTAAATGAATAAA 1010

  1625284 TGTTTTGTTTTCAAATCGATATCTCTTTTATGTTCGTGAGTTAACTTTTCTACTTTCCAT 1625343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 TGTTTTGTTTTCAAATCGATATCTCTTTTATGTTCGTGAGTTAACTTTTCTACTTTCCAT 1070

  1625344 TAGCCTTGCAATCTACTTATGTCCAATGTGAAATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTT 1625403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 TAGCCTTGCAATCTACTTATGTCCAATGTGAAATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTT 1130

  1625404 TAAAATCTTAGTAATATTTTTAAATAAAATCATCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTT 1625463
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1131 TAAAATCTTAGTAATATTTTTAAATAAAATTATCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTT 1190

  1625464 CTCTCTGCCTGTGCAGAAATCTTATGAAAATTCGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATT 1625523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 CTCTCTGCCTGTGCAGAAATCTTATGAAAATTCGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATT 1250

  1625524 CCCAGAATACACATTAATCCCAACTGTTACTCCCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCC 1625583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 CCCAGAATACACATTAATCCCAACTGTTACTCCCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCC 1310

  1625584 CATCACCTGAGCATAAATGCCAGCTCCCATCCACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTG 1625643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 CATCACCTGAGCATAAATGCCAGCTCCCATCCACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTG 1370

  1625644 CCCTCTGCCCTGGTCTATGGTCTCCCCTCTTAAATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGT 1625703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 CCCTCTGCCCTGGTCTATGGTCTCCCCTCTTAAATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGT 1430

  1625704 GCCCAGCACA------------GCCCTGCCCTCTGCTCTGGTCTAAGGTCTCTCCCCTGT 1625751
          ||||||||||            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1431 GCCCAGCACAGCCCTGCCCTCTGCCCTGCCCTCTGCTCTGGCCTAAGGTCTCTCCCCTGT 1490

  1625752 GCTGTTCCCTTCCTGCCGGGCAGGCCTCTGTCCGTTCCTCAAACCACACAGGCTCAGGCC 1625811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 GCTGTTCCCTTCCTGCCGGGCAGGCCTCTGTCCGTTCCTCAAACCACACAGGCTCAGGCC 1550

  1625812 TGACTCCAGGCCTTTGCCCTGCTGTGCCCTCTGCCTAGGGTGCCTTTCCCGGGCTCTGCA 1625871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 TGACTCCAGGCCTTTGCCCTGCTGTGCCCTCTGCCTAGGGTGCCTTTCCCGGGCTCTGCA 1610

  1625872 TCCTCCTCTCAACCCGCTGAGCTCCAGCCTGCTGGTCGCCCCTCAGGTGGATGAACACAT 1625931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 TCCTCCTCTCAACCCGCTGAGCTCCAGCCTGCTGGTCGCCCCTCAGGTGGATGAACACAT 1670

  1625932 GGTGTCCTCTCGCCCCGCTGGCTTTTGCACAGGCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCT 1625991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 GGTGTCCTCTCGCCCCGCTGGCTTTTGCACAGGCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCT 1730

  1625992 CTCTATCGGGGTTTACTCTCTAAATACCATTCGTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGC 1626051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 CTCTATCGGGGTTTACTCTCTAAATACCATTCGTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGC 1790

  1626052 TCCCTGCCCACCCCCCTCCCTTGGACTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCT 1626111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 TCCCTGCCCACCCCCCTCCCTTGGACTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCT 1850

  1626112 GACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTCCTAGCACTCGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCAC 1626171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1851 GACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTCCTAGCACTTGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCAC 1910

  1626172 ACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTGGTGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTA 1626231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 ACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTGGTGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTA 1970

  1626232 ATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCCCCG-TTTTTTTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACT 1626290
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 ATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCCCCGTTTTTTTTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACT 2030

  1626291 GCTGCACCAACCTATTAGAATCATTTATATTTATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTA 1626350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 GCTGCACCAACCTATTAGAATCATTTATATTTATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTA 2090

  1626351 GAAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAAGCCAAATCTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACAC 1626410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 GAAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAAGCCAAATCTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACAC 2150

  1626411 ATTGTCAATAATCATTTACCAACTGACTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATG 1626470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 ATTGTCAATAATCATTTACCAACTGACTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATG 2210

  1626471 AGGCACATGACACGCCCCTTTGAAAGTCACTGTCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCAC 1626530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 AGGCACATGACACGCCCCTTTGAAAGTCACTGTCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCAC 2270

  1626531 TGCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGTTTAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTG 1626590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 TGCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGTTTAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTG 2330

  1626591 AGGATGGGAACCATGCCTGCTCCACATGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCC 1626650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 AGGATGGGAACCATGCCTGCTCCACATGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCC 2390

  1626651 TGGGGCACGCACATCTCGTGGGGAAAATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCC 1626710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 TGGGGCACGCACATCTCGTGGGGAAAATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCC 2450

  1626711 ACACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGCCGTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTC 1626770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 ACACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGCCGTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTC 2510

  1626771 ACCCAGCCACGAGCCACACCTATGGGATGGATAAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTG 1626830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 ACCCAGCCACGAGCCACACCTATGGGATGGATAAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTG 2570

  1626831 GCAAGGTTGTGGCTATGTCATACTCTTATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTA 1626890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 GCAAGGTTGTGGCTATGTCATACTCTTATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTA 2630

  1626891 AATCACCCACGCAAGAAATGTCAGCCTCTGTCCCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCC 1626950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 AATCACCCACGCAAGAAATGTCAGCCTCTGTCCCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCC 2690

  1626951 GGTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAATGGTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGT 1627010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2691 GGTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAATGGTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCAT 2750

  1627011 GGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGG 1627070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 GGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGG 2810

  1627071 TGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGGGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGA 1627130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 TGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGGGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGA 2870

  1627131 ACTGTGAGAACTCAGGAAACTTGCATCCCCAGCCCCTCCCGTGCATCCCCAGCCCCTCCC 1627190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 ACTGTGAGAACTCAGGAAACTTGCATCCCCAGCCCCTCCCGTGCATCCCCAGCCCCTCCC 2930

  1627191 CCGTGACCCCAGCACCAGTCCTCTTCCCCTGCTTGCCCCATCTCTGCTTTCTTTTTTTCA 1627250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 CCGTGACCCCAGCACCAGTCCTCTTCCCCTGCTTGCCCCATCTCTGCTTTCTTTTTTTCA 2990

  1627251 TTTTCTTTCTTTCGTTTTTTTTGAGACAGGGTCTGGCTGTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 1627310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 TTTTCTTTCTTTCGTTTTTTTTGAGACAGGGTCTGGCTGTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 3050

  1627311 ATGGCACGATCTCGGCTTACTGCAGCCTTCACCCCCTGGGCTGAAGCAATTCTCCCTCCT 1627370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 ATGGCACGATCTCGGCTTACTGCAGCCTTCACCCCCTGGGCTGAAGCAATTCTCCCTCCT 3110

  1627371 CAGCCTCCCCAGTGGCTGGGACTACAGGTGCATGCCACCATACCCAGCTAATTTTTATTT 1627430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 CAGCCTCCCCAGTGGCTGGGACTACAGGTGCATGCCACCATACCCAGCTAATTTTTATTT 3170

  1627431 TATTTTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGTA 1627490
          ||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 TATT------------TTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTTTGTA 3218

  1627491 GAGACAGGATCTGCCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGTAATCCTC 1627550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3219 GAGACAGGATCTGCCATGTTGCCCAGGCTGGTCTCAAATTCCTGAGCTCAAGTAATCCTC 3278

  1627551 CCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGAGTCCAACCTACTT 1627610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3279 CCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACCGAGTCCAACCTACTT 3338

  1627611 TATTTTTCTCTACAGTACTTGGAACCTTCTAATGTACTAAGGACACGTGTATTTTCTTTC 1627670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3339 TATTTTTCTCTACAGTACTTGGAACCTTCTAATGTACTAAGGACACGTGTATTTTCTTTC 3398

  1627671 TTTTTTGTCTTCCCTAGAACAGGAGCTTAATGTGGGCAGGTATTTTTGTTGATCTCATTT 1627730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3399 TTTTTTGTCTTCCCTAGAACAGGAGCTTAATGTGGGCAGGTATTTTTGTTGATCTCATTT 3458

  1627731 ATCACCCTATCCCCAGTGCCTGGAACAGGGTCTGGCACATGAATGGTGTGTTCTAAATAA 1627790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3459 ATCACCCTATCCCCAGTGCCTGGAACAGGGTCTGGCACATGAATGGTGTGTTCTAAATAA 3518

  1627791 ATATTTTTAATAGATAAATAAATGAAATATCCTACAAGAGAAAGCTAGTATCTGGAACTC 1627850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3519 ATATTTTTAATAGATAAATAAATGAAATATCCTACAAGAGAAAGCTAGTATCTGGAACTC 3578

  1627851 ACCCATCAACAGAACCTAAAAGCCAAAGACCTTTAGCCTGTCTCTGCCTCTGAACACACC 1627910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3579 ACCCATCAACAGAACCTAAAAGCCAAAGACCTTTAGCCTGTCTCTGCCTCTGAACACACC 3638

  1627911 CAACCCCGGAGGAGCCAGCAGAGGAAAAAGAGGAACAAAGGCGGGGAAGGGAGCAGGTGG 1627970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3639 CAACCCCGGAGGAGCCAGCAGAGGAAAAAGAGGAACAAAGGCCGGGAAGGGAGCAGGTGG 3698

  1627971 TGCCCACCAAGTAAGGAACCCTGAGGCTTAGGCCGAACCTGAGCTGGAGAAGGGACTCAT 1628030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3699 TGCCCACCAAGTAAGGAACCCTGAGGCTTAGGCCGAACCTGAGCTGGAGAAGGGACTCAT 3758

  1628031 CTAGGAACTGGGTATGAGATTAAAGTTTAGACTGGTCTGGCCTGGATTTTGTAACACCTA 1628090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3759 CTAGGAACTGGGTATGAGATTAAAGTTTAGACTGGTCTGGCCTGGATTTTGTAACACCTA 3818

  1628091 AACAA 1628095
          |||||
     3819 AACAA 3823

Alignment time is 3.06488 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   2309] =>      2309 nucs 'mol-32-1f58-203334_2309'

Score:        2268
Aligned:      2301        nucs
Identic:      2298 (100%) nucs =>       138 (100%)      2160 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1627002,1627139] EXCISED REGION [1628842,1631004]
 second seq =>  [      1,    138] EXCISED REGION [    147,   2309]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1702 nucs [1627140,1628841]
 second seq =>         8 nucs [139,146]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627139,1627139] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627140,1627140] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs

  1627002 GTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATA 1627061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATA 60

  1627062 TTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGGGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAG 1627121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGGGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAG 120

  1627122 GGGCAGAGAACTGTGAGA 1627139
          ||||||||||||||||||
      121 GGGCAGAGAACTGTGAGA 138

EXCISED REGION

  1628842 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 1628901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      147 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 206

  1628902 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 1628961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      207 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 266

  1628962 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 1629021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      267 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 326

  1629022 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 1629081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      327 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 386

  1629082 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 1629141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      387 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 446

  1629142 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 1629201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      447 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 506

  1629202 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 1629261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      507 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 566

  1629262 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 1629321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      567 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 626

  1629322 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 1629381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      627 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 686

  1629382 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 1629441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      687 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 746

  1629442 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 1629501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 806

  1629502 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 1629561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 866

  1629562 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 1629621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 926

  1629622 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 1629681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 986

  1629682 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 1629741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 1046

  1629742 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 1629801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 1106

  1629802 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 1629861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 1166

  1629862 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTGAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 1629921
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTAAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 1226

  1629922 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 1629981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 1286

  1629982 GAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTA 1630041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 GAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTA 1346

  1630042 TGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGG 1630101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 TGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGG 1406

  1630102 GAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATGTGAATCATGTTGGCTGAGG 1630161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1407 GAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATATGAATCATGTTGGCTGAGG 1466

  1630162 AGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTAC 1630221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 AGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTAC 1526

  1630222 TGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAA 1630281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 TGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAA 1586

  1630282 TCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACA 1630341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 TCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACA 1646

  1630342 CACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAG 1630401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 CACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAG 1706

  1630402 GCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGG 1630461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 GCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGG 1766

  1630462 CCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTC 1630521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 CCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTC 1826

  1630522 ACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCT 1630581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 ACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCT 1886

  1630582 CCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAG 1630641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 CCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAG 1946

  1630642 AGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGA 1630701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 AGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGA 2006

  1630702 GGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCAC 1630761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 GGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCAC 2066

  1630762 AGTGAGAGGGTCCCGACACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCA 1630821
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 AGTGAGAGGGTCCCGATACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCA 2126

  1630822 GGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGAT 1630881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 GGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGAT 2186

  1630882 ATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAG 1630941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 ATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAG 2246

  1630942 CTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATA 1631001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 CTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATA 2306

  1631002 CAG 1631004
          |||
     2307 CAG 2309

Alignment time is 1.84958 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   5401] =>      5401 nucs 'mol-32-1f58-242207_5401'

Score:        5270
Aligned:      5393        nucs
Identic:      5381 (100%) nucs =>      1196 (100%)      4185 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1625943,1627139] EXCISED REGION [1628842,1633035]
 second seq =>  [      1,   1197] EXCISED REGION [   1206,   5401]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1702 nucs [1627140,1628841]
 second seq =>         8 nucs [1198,1205]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627139,1627139] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627140,1627140] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs

  1625943 GCCCCGCTGGCTTTTGCACAGGCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCTCTCTATCGGGG 1626002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCCCGCTGGCTTTTGCACAGGCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCTCTCTATCGGGG 60

  1626003 TTTACTCTCTAAATACCATTCGTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGCTCCCTGCCCAC 1626062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTACTCTCTAAATACCATTCGTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGCTCCCTGCCCAC 120

  1626063 CCCCCTCCCTTGGACTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAA 1626122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCCCTCCCTTGGACTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAA 180

  1626123 GCTAGATGCTCTCCTAGCACTCGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTA 1626182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTAGATGCTCTCCTAGCACTCGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTA 240

  1626183 CTGGGTTAGGTTGGTGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAG 1626242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGGGTTAGGTTGGTGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAG 300

  1626243 CACCGGCTCCTCCCCGTTTTTTTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACC 1626302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACCGGCTCCTCCCCGTTTTTTTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACC 360

  1626303 TATTAGAATCATTTATATTTATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTC 1626362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATTAGAATCATTTATATTTATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTC 420

  1626363 CATGAGAATAGAAGCCAAATCTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAAT 1626422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATGAGAATAGAAGCCAAATCTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAAT 480

  1626423 CATTTACCAACTGACTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACA 1626482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTTACCAACTGACTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACA 540

  1626483 CGCCCCTTTGAAAGTCACTGTCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGT 1626542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGCCCCTTTGAAAGTCACTGTCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGT 600

  1626543 GGCGTGGCTGGGTTTAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTGAGGATGGGAACC 1626602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCGTGGCTGGGTTTAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTGAGGATGGGAACC 660

  1626603 ATGCCTGCTCCACATGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCAC 1626662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGCCTGCTCCACATGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCAC 720

  1626663 ATCTCGTGGGGAAAATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGG 1626722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCTCGTGGGGAAAATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGG 780

  1626723 CTTCTGCTTCTGCCGTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCACCCAGCCACGA 1626782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTCTGCTTCTGCCGTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCACCCAGCCACGA 840

  1626783 GCCACACCTATGGGATGGATAAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGG 1626842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCCACACCTATGGGATGGATAAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGG 900

  1626843 CTATGTCATACTCTTATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGC 1626902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTATGTCATACTCTTATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGC 960

  1626903 AAGAAATGTCAGCCTCTGTCCCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAA 1626962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGAAATGTCAGCCTCTGTCCCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAA 1020

  1626963 TTCCCTTTGCAATGGTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGA 1627022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCCCTTTGCAATGGTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGA 1080

  1627023 AGCCTCAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACC 1627082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCCTCAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACC 1140

  1627083 GCAAGCCCCAGGGGGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 1627139
          |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCAAGCCCCGGGGGGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 1197

EXCISED REGION

  1628842 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 1628901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 1265

  1628902 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 1628961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 1325

  1628962 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 1629021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 1385

  1629022 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 1629081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 1445

  1629082 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 1629141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 1505

  1629142 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 1629201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 1565

  1629202 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 1629261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1566 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGGCAGTGAGAC 1625

  1629262 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 1629321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 1685

  1629322 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 1629381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 1745

  1629382 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 1629441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 1805

  1629442 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 1629501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 1865

  1629502 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 1629561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 1925

  1629562 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 1629621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 1985

  1629622 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 1629681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 2045

  1629682 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 1629741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 2105

  1629742 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 1629801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 2165

  1629802 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 1629861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 2225

  1629862 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTGAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 1629921
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTAAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 2285

  1629922 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 1629981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 2345

  1629982 GAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTA 1630041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 GAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTA 2405

  1630042 TGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGG 1630101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 TGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGG 2465

  1630102 GAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATGTGAATCATGTTGGCTGAGG 1630161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2466 GAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATATGAATCATGTTGGCTGAGG 2525

  1630162 AGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTAC 1630221
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 AGAAAGTGGAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTAC 2585

  1630222 TGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAA 1630281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 TGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAA 2645

  1630282 TCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACA 1630341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 TCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACA 2705

  1630342 CACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAG 1630401
          |||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||
     2706 CACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTAGCCGTCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAG 2765

  1630402 GCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGG 1630461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 GCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGG 2825

  1630462 CCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTC 1630521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 CCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTC 2885

  1630522 ACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCT 1630581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 ACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCT 2945

  1630582 CCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAG 1630641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 CCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAG 3005

  1630642 AGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGA 1630701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 AGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGA 3065

  1630702 GGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCAC 1630761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 GGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCAC 3125

  1630762 AGTGAGAGGGTCCCGACACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCA 1630821
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 AGTGAGAGGGTCCCGATACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCA 3185

  1630822 GGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGAT 1630881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 GGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGAT 3245

  1630882 ATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAG 1630941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 ATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAG 3305

  1630942 CTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATA 1631001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 CTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATA 3365

  1631002 CAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATAATG 1631061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 CAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATAATG 3425

  1631062 CTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGAAAC 1631121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 CTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGAAAC 3485

  1631122 CATCATCACCATCATCAGGTAATGGAAAACCATCAAAGCTTTGAGCTGGCTTGTTAGCCA 1631181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 CATCATCACCATCATCAGGTAATGGAAAACCATCAAAGCTTTGAGCTGGCTTGTTAGCCA 3545

  1631182 AGAATAGTAGCAGTGTATTAGCTACTACTAATACTCACAGCTGACAATTACTGACCACTT 1631241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 AGAATAGTAGCAGTGTATTAGCTACTACTAATACTCACAGCTGACAATTACTGACCACTT 3605

  1631242 GTTCCGTGCCAGGAATCACGGAAGCACCTCGCATGCATTTCCTCAATACTCCCTCCCAGT 1631301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 GTTCCGTGCCAGGAATCACGGAAGCACCTCGCATGCATTTCCTCAATACTCCCTCCCAGT 3665

  1631302 AACAGCAAGGACACAAAACTGGTAGAGCCAGGACTGGAATCCAGGCCGGCCCCAAAGCAC 1631361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 AACAGCAAGGACACAAAACTGGTAGAGCCAGGACTGGAATCCAGGCCGGCCCCAAAGCAC 3725

  1631362 TCCAGTGGAGCCTGCCAAGGTGGGCAGGCTACCATACTAATGCGGTCCAGTATTTGACCA 1631421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 TCCAGTGGAGCCTGCCAAGGTGGGCAGGCTACCATACTAATGCGGTCCAGTATTTGACCA 3785

  1631422 CCACTCCTAGTTGAGCAAGTTTAACAGAAAACCTAAAACTAAACCTAAAATCTAAAAATT 1631481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 CCACTCCTAGTTGAGCAAGTTTAACAGAAAACCTAAAACTAAACCTAAAATCTAAAAATT 3845

  1631482 TGAGCAAATGCATAAAAAGCAGGCTGTTAAAATGGATCATAAATCTTGCATCACTCGCTG 1631541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 TGAGCAAATGCATAAAAAGCAGGCTGTTAAAATGGATCATAAATCTTGCATCACTCGCTG 3905

  1631542 GAAAACCACTCAAAATAAACGTCTCTGAGACATGGCCTCTGAGGAGGGCACTCTGTGTGG 1631601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 GAAAACCACTCAAAATAAACGTCTCTGAGACATGGCCTCTGAGGAGGGCACTCTGTGTGG 3965

  1631602 CTCATATCACCTTGCTGACAAACCACTTGAACCTGGGTGGTCATCTGACCATACTGAACA 1631661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 CTCATATCACCTTGCTGACAAACCACTTGAACCTGGGTGGTCATCTGACCATACTGAACA 4025

  1631662 GACGATGCACAGAGCCATTTGCATCCACTGTGGTCAACATTTAGGAAGTTTTAAGCTAAG 1631721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 GACGATGCACAGAGCCATTTGCATCCACTGTGGTCAACATTTAGGAAGTTTTAAGCTAAG 4085

  1631722 ATTTGCCAAATTGTAGCCTACTGGATTCCGGGTTCTCTTGACATCTCTTTCTAGTCGCCA 1631781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 ATTTGCCAAATTGTAGCCTACTGGATTCCGGGTTCTCTTGACATCTCTTTCTAGTCGCCA 4145

  1631782 TGTCTTGCACTTCCCGAGTATAAATGAACTGAGATGCAAATAAAAAAAGGAGGATTTAAG 1631841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 TGTCTTGCACTTCCCGAGTATAAATGAACTGAGATGCAAATAAAAAAAGGAGGATTTAAG 4205

  1631842 AATAATGAAAAGAGAAAAATCAAGAAAGCACAATCACTAGTGTAGAGATAACAGCATTTC 1631901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 AATAATGAAAAGAGAAAAATCAAGAAAGCACAATCACTAGTGTAGAGATAACAGCATTTC 4265

  1631902 TGAATTCCCTGAAAACAATCTATATAAATGCATGTGAAATAATACACCAGCATCTGTGGC 1631961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 TGAATTCCCTGAAAACAATCTATATAAATGCATGTGAAATAATACACCAGCATCTGTGGC 4325

  1631962 CCACACGCCACATATTAGGAACGGATGTCATAATATAAGGTAAACATGTTACTCTGAAAA 1632021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 CCACACGCCACATATTAGGAACGGATGTCATAATATAAGGTAAACATGTTACTCTGAAAA 4385

  1632022 CACAAATCCTCACAAATCAGGCAGTAAGGCTGAATCCAGCA--CCCCCCCCACCCACAGC 1632079
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||
     4386 CACAAATCCTCACAAATCAGGCAGTAAGGCTGAATCCAGCACCCCCCCCCCACCCACAGC 4445

  1632080 GCAGTGAGGCAGTGTCTAGCAGCCGTAGTGCTCCCCGCGTCCCAGTTCAGTCTCCGGCAA 1632139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4446 GCAGTGAGGCAGTGTCTAGCAGCCGTAGTGCTCCCCGCGTCCCAGTTCAGTCTCTGGCAA 4505

  1632140 CATCAGATACTTCCCACTAATAACGAGGAGCCTTTCAACATTTTCACAACATCTCAAAAC 1632199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4506 CATCAGATACTTCCCACTAATAACGAGGAGCCTTTCAACATTTTCAAAACATCTCAAAAC 4565

  1632200 TGACCCCTTTTCTAGCTTAAATGGCACGGATCTGGAAAGGCAAACTATACACAGAATCTA 1632259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4566 TGACCCCTTTTCTAGCTTAAATGGCACGGATCTGGAAAGGCAAACTATACACAGAATCTA 4625

  1632260 AAGCAGTAGTCAGGTGTTCAATGAAGTAAAATGTATCCAATGATAGCTCAGGGGAGGGGG 1632319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4626 AAGCAGTAGTCAGGTGTTCAATGAAGTAAAATGTATCCAATGATAGCTCAGGGGAGGGGG 4685

  1632320 ATCAATTGAGCTGAAACTGGCAAGAACGTAACTCCAGGGAGCTCACAACACGCAAGGACC 1632379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4686 ATCAATTGAGCTGAAACTGGCAAGAACGTAACTCCAGGGAGCTCACAACACGCAAGGACC 4745

  1632380 CGGATTTCCCGCTGCCTGAACGCCCAGTATTCGCACACTGATAAGAACACCTCCCCATAA 1632439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4746 CGGATTTCCCGCTGCCTGAACGCCCAGTATTCGCACACTGATAAGAACACCTCCCCATAA 4805

  1632440 CTCCCCTGCCAGCGCCTCCAACACCCCCAATCCTTTCCCCAGGAACCCAGTCCCAGTTTC 1632499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4806 CTCCCCTGCCAGCGCCTCCAACACCCCCAATCCTTTCCCCAGGAACCCAGTCCCAGTTTC 4865

  1632500 TGCAGTTCCTGTAACAGCCACGTTCCCACACAAGGGCTGCCTGAGCTCCCCAAGCCCTCC 1632559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4866 TGCAGTTCCTGTAACAGCCACGTTCCCACACAAGGGCTGCCTGAGCTCCCCAAGCCCTCC 4925

  1632560 AACAATCACCCCCCAGTGCCCTCGAAGGTCTATTCAGAGAAGTCACCAAGATGCAGTCAC 1632619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4926 AACAATCACCCCCCAGTGCCCTCGAAGGTCTATTCAGAGAAGTCACCAAGATGCAGTCAC 4985

  1632620 CCAGGAAATTCAAGGACCTCCAACTTACCAAAAGGCTTTCGGCTGTACAGAGCTAAGCTT 1632679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4986 CCAGGAAATTCAAGGACCTCCAACTTACCAAAAGGCTTTCGGCTGTACAGAGCTAAGCTT 5045

  1632680 CCTATTCCCCTCCTAAACCTACAATCTAGTTTTCATTTCTCAAGAAGCCTTTCCCTGTGC 1632739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5046 CCTATTCCCCTCCTAAACCTACAATCTAGTTTTCATTTCTCAAGAAGCCTTTCCCTGTGC 5105

  1632740 TCACGCACGCAGTTGTTACCTGGCTCGGTGAGGCACTCCAAGCAGTAACAGCGGTAGCCA 1632799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5106 TCACGCACGCAGTTGTTACCTGGCTCGGTGAGGCACTCCAAGCAGTAACAGCGGTAGCCA 5165

  1632800 CAAAATAAACCAGAAGCATCTCCACCATGAAGCAGTATTAACAATTTGTCCTAATGATTC 1632859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5166 CAAAATAAACCAGAAGCATCTCCACCATGAAGCAGTATTAACAATTTGTCCTAATGATTC 5225

  1632860 CTTTGTCCTTGGAAAAACAACTTCAGAAAGTTATCCACTGTGAACAGGGCAGGCTCACGG 1632919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5226 CTTTGTCCTTGGAAAAACAACTTCAGAAAGTTATCCACTGTGAACAGGGCAGGCTCACGG 5285

  1632920 CTTCTTGGTCCGGAGACCCAGTTCCCACTGGCCCACTCACCGTTGGAGAGAGCTTGCTGA 1632979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5286 CTTCTTGGTCCGGAGACCCAGTTCCCACTGGCCCACTCACCGTTGGAGAGAGCTTGCTGA 5345

  1632980 AGCTCGGTGTCTGATATCACTCCACTCCTGTCTTTATCGACCCTATAACATCAAGA 1633035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5346 AGCTCGGTGTCTGATATCACTCCACTCCTGTCTTTATCGACCCTATAACATCAAGA 5401

Alignment time is 4.20185 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   2408] =>      2408 nucs 'mol-32-220d-039547_2408'

Score:        2351
Aligned:      2406        nucs
Identic:      2401 (100%) nucs =>      1132 (100%)      1269 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1627464,1628598] EXCISED REGION [1628599,1629869]
 second seq =>  [      1,   1134] EXCISED REGION [   1139,   2408]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1135,1138]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        27 nucs [1135,1161] to [1139,1165]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [1628597,1628598] to [1628599,1628600]
 second seq =>         2 nucs [1133,1134] to [1139,1140]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1627464 TTATTTATTTATTTATTTATTTTTGTAGAGACAGGATCTGCCATGTTGCCCAGGCTGGTC 1627523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATTTATTTATTTATTTATTTTTGTAGAGACAGGATCTGCCATGTTGCCCAGGCTGGTC 60

  1627524 TCAAATTCCTGAGCTCAAGTAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1627583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAAATTCCTGAGCTCAAGTAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 120

  1627584 GCATGAGCCACCGAGTCCAACCTACTTTATTTTTCTCTACAGTACTTGGAACCTTCTAAT 1627643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCATGAGCCACCGAGTCCAACCTACTTTATTTTTCTCTACAGTACTTGGAACCTTCTAAT 180

  1627644 GTACTAAGGACACGTGTATTTTCTTTCTTTTTTGTCTTCCCTAGAACAGGAGCTTAATGT 1627703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTACTAAGGACACGTGTATTTTCTTTCTTTTTTGTCTTCCCTAGAACAGGAGCTTAATGT 240

  1627704 GGGCAGGTATTTTTGTTGATCTCATTTATCACCCTATCCCCAGTGCCTGGAACAGGGTCT 1627763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGCAGGTATTTTTGTTGATCTCATTTATCACCCTATCCCCAGTGCCTGGAACAGGGTCT 300

  1627764 GGCACATGAATGGTGTGTTCTAAATAAATATTTTTAATAGATAAATAAATGAAATATCCT 1627823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGCACATGAATGGTGTGTTCTAAATAAATATTTTTAATAGATAAATAAATGAAATATCCT 360

  1627824 ACAAGAGAAAGCTAGTATCTGGAACTCACCCATCAACAGAACCTAAAAGCCAAAGACCTT 1627883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAAGAGAAAGCTAGTATCTGGAACTCACCCATCAACAGAACCTAAAAGCCAAAGACCTT 420

  1627884 TAGCCTGTCTCTGCCTCTGAACACACCCAACCCCGGAGGAGCCAGCAGAGGAAAAAGAGG 1627943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGCCTGTCTCTGCCTCTGAACACACCCAACCCCGGAGGAGCCAGCAGAGGAAAAAGAGG 480

  1627944 AACAAAGGCGGGGAAGGGAGCAGGTGGTGCCCACCAAGTAAGGAACCCTGAGGCTTAGGC 1628003
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACAAAGGCCGGGAAGGGAGCAGGTGGTGCCCACCAAGTAAGGAACCCTGAGGCTTAGGC 540

  1628004 CGAACCTGAGCTGGAGAAGGGACTCATCTAGGAACTGGGTATGAGATTAAAGTTTAGACT 1628063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGAACCTGAGCTGGAGAAGGGACTCATCTAGGAACTGGGTATGAGATTAAAGTTTAGACT 600

  1628064 GGTCTGGCCTGGATTTTGTAACACCTAAACAAGGGTTAGTCCATTCTTTTTTTGTGTTTT 1628123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGTCTGGCCTGGATTTTGTAACACCTAAACAAGGGTTAGTCCATTCTTTTTTTGTGTTTT 660

  1628124 TTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCG 1628183
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      661 TTTTTTTTTTT-GAGATGGAGTCTCACTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCG 719

  1628184 CAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCACGCCTCAGCCTCCCGAG 1628243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCACGCCTCAGCCTCCCGAG 779

  1628244 TAGCTGGGATTATAGGCGCACACCACCATTCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGAT 1628303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TAGCTGGGATTATAGGCGCACACCACCATTCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAGAGAT 839

  1628304 AGGGTTTCACCATGTTGGCCCCCTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCG 1628363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 AGGGTTTCACCATGTTGGCCCCCTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCG 899

  1628364 AGGTGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCC 1628423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AGGTGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCC 959

  1628424 ATCTCTATTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAGCCTCAGC 1628483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 ATCTCTATTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAGCCTCAGC 1019

  1628484 TACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGATCTCCAGATGCAGAGGTTGTAGTGAGC 1628543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGATCTCCAGATGCAGAGGTTGTAGTGAGC 1079

  1628544 CAAGATCAATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGCCTTCAGCTCAA 1628598
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CAAGATCAATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGCCTTCAGCTCAA 1134

EXCISED REGION

  1628599 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAACCTTCAAATGAATGTAAGAATTATTATTTT 1628658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAACCTTCAAATGAATGTAAGAATTATTATTTT 1198

  1628659 TTAAAGTACAGCTTTAAAAATGCCCCTTACAAATACATCAGTGTTATATTAAGGCAAACC 1628718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 TTAAAGTACAGCTTTAAAAATGCCCCTTACAAATACATCAGTGTTATATTAAGGCAAACC 1258

  1628719 CACTTCAGAAGCACAAAGTTAATTTCTTATAATTCCAAGAAATATGTGAATGTTAAAAAA 1628778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CACTTCAGAAGCACAAAGTTAATTTCTTATAATTCCAAGAAATATGTGAATGTTAAAAAA 1318

  1628779 AACCCAAACACCCGAAAAGGGATCAAACTCAAGATAGTTTGTAACATTTTATTGCAAAAA 1628838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1319 AACCCAAACACCCGAAAAGGGATCAAACTCAAGATAGTTTGTAATATTTTATTGCAAAAA 1378

  1628839 GAAGGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTC 1628898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 GAAGGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTC 1438

  1628899 TCCTGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTG 1628958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TCCTGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTG 1498

  1628959 CGGTTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGG 1629018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 CGGTTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGG 1558

  1629019 CCATTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATA 1629078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 CCATTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATA 1618

  1629079 ATTTAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAA 1629138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 ATTTAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAA 1678

  1629139 ACTAATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTA 1629198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 ACTAATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTA 1738

  1629199 GTAGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGA 1629258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GTAGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGA 1798

  1629259 GACTCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATT 1629318
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 GACTCCATCTCTAC-TTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATT 1857

  1629319 GATATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACC 1629378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 GATATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACC 1917

  1629379 TTCCTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCAC 1629438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TTCCTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCAC 1977

  1629439 GATGAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGA 1629498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 GATGAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGA 2037

  1629499 GCAGCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCT 1629558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 GCAGCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCT 2097

  1629559 GGAGTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCT 1629618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 GGAGTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCT 2157

  1629619 TCCCATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGT 1629678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TCCCATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGT 2217

  1629679 TTTTGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGG 1629738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TTTTGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGG 2277

  1629739 CTTCATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGG 1629798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 CTTCATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGG 2337

  1629799 ACAAGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGC 1629858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 ACAAGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGC 2397

  1629859 AGAGGTGTGGT 1629869
          |||||||||||
     2398 AGAGGTGTGGT 2408

Alignment time is 2.34679 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   3647] =>      3647 nucs 'mol-32-2383-072657_3647'

Score:        3606
Aligned:      3639        nucs
Identic:      3636 (100%) nucs =>      1064 (100%)      2572 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1626076,1627139] EXCISED REGION [1628842,1631416]
 second seq =>  [      1,   1064] EXCISED REGION [   1073,   3647]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1702 nucs [1627140,1628841]
 second seq =>         8 nucs [1065,1072]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627139,1627139] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627140,1627140] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs

  1626076 ACTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTC 1626135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTC 60

  1626136 CTAGCACTCGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTG 1626195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAGCACTCGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTG 120

  1626196 GTGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCC 1626255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCC 180

  1626256 CCGTTTTTTTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACCTATTAGAATCATT 1626315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCGTTTTTTTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACCTATTAGAATCATT 240

  1626316 TATATTTATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAA 1626375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATATTTATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAA 300

  1626376 GCCAAATCTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAATCATTTACCAACTG 1626435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCAAATCTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAATCATTTACCAACTG 360

  1626436 ACTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACACGCCCCTTTGAAA 1626495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACACGCCCCTTTGAAA 420

  1626496 GTCACTGTCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGT 1626555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCACTGTCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGT 480

  1626556 TTAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTGAGGATGGGAACCATGCCTGCTCCAC 1626615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTGAGGATGGGAACCATGCCTGCTCCAC 540

  1626616 ATGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCACATCTCGTGGGGAA 1626675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCACATCTCGTGGGGAA 600

  1626676 AATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGC 1626735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGC 660

  1626736 CGTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCACCCAGCCACGAGCCACACCTATGG 1626795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CGTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCACCCAGCCACGAGCCACACCTATGG 720

  1626796 GATGGATAAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCTATGTCATACTC 1626855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATGGATAAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCTATGTCATACTC 780

  1626856 TTATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGCAAGAAATGTCAGC 1626915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGCAAGAAATGTCAGC 840

  1626916 CTCTGTCCCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAAT 1626975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCTGTCCCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAAT 900

  1626976 GGTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGC 1627035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGC 960

  1627036 CTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGG 1627095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGG 1020

  1627096 GGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 1627139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 1064

EXCISED REGION

  1628842 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 1628901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 1132

  1628902 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 1628961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 1192

  1628962 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 1629021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 1252

  1629022 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 1629081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 1312

  1629082 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 1629141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 1372

  1629142 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 1629201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 1432

  1629202 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 1629261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 1492

  1629262 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 1629321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 1552

  1629322 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 1629381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 1612

  1629382 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 1629441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 1672

  1629442 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 1629501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 1732

  1629502 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 1629561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 1792

  1629562 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 1629621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 1852

  1629622 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 1629681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 1912

  1629682 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 1629741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 1972

  1629742 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 1629801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 2032

  1629802 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 1629861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 2092

  1629862 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTGAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 1629921
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTAAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 2152

  1629922 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 1629981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 2212

  1629982 GAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTA 1630041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 GAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTA 2272

  1630042 TGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGG 1630101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 TGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGG 2332

  1630102 GAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATGTGAATCATGTTGGCTGAGG 1630161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2333 GAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATATGAATCATGTTGGCTGAGG 2392

  1630162 AGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTAC 1630221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 AGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTAC 2452

  1630222 TGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAA 1630281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 TGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAA 2512

  1630282 TCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACA 1630341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 TCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACA 2572

  1630342 CACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAG 1630401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 CACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAG 2632

  1630402 GCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGG 1630461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 GCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGG 2692

  1630462 CCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTC 1630521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 CCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTC 2752

  1630522 ACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCT 1630581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 ACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCT 2812

  1630582 CCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAG 1630641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 CCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAG 2872

  1630642 AGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGA 1630701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 AGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGA 2932

  1630702 GGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCAC 1630761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 GGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCAC 2992

  1630762 AGTGAGAGGGTCCCGACACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCA 1630821
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 AGTGAGAGGGTCCCGATACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCA 3052

  1630822 GGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGAT 1630881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 GGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGAT 3112

  1630882 ATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAG 1630941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 ATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAG 3172

  1630942 CTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATA 1631001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 CTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATA 3232

  1631002 CAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATAATG 1631061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 CAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATAATG 3292

  1631062 CTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGAAAC 1631121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 CTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGAAAC 3352

  1631122 CATCATCACCATCATCAGGTAATGGAAAACCATCAAAGCTTTGAGCTGGCTTGTTAGCCA 1631181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 CATCATCACCATCATCAGGTAATGGAAAACCATCAAAGCTTTGAGCTGGCTTGTTAGCCA 3412

  1631182 AGAATAGTAGCAGTGTATTAGCTACTACTAATACTCACAGCTGACAATTACTGACCACTT 1631241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 AGAATAGTAGCAGTGTATTAGCTACTACTAATACTCACAGCTGACAATTACTGACCACTT 3472

  1631242 GTTCCGTGCCAGGAATCACGGAAGCACCTCGCATGCATTTCCTCAATACTCCCTCCCAGT 1631301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 GTTCCGTGCCAGGAATCACGGAAGCACCTCGCATGCATTTCCTCAATACTCCCTCCCAGT 3532

  1631302 AACAGCAAGGACACAAAACTGGTAGAGCCAGGACTGGAATCCAGGCCGGCCCCAAAGCAC 1631361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 AACAGCAAGGACACAAAACTGGTAGAGCCAGGACTGGAATCCAGGCCGGCCCCAAAGCAC 3592

  1631362 TCCAGTGGAGCCTGCCAAGGTGGGCAGGCTACCATACTAATGCGGTCCAGTATTT 1631416
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 TCCAGTGGAGCCTGCCAAGGTGGGCAGGCTACCATACTAATGCGGTCCAGTATTT 3647

Alignment time is 2.79461 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   4983] =>      4983 nucs 'mol-32-2399-077268_4983'

Score:        4898
Aligned:      4975        nucs
Identic:      4959 (100%) nucs =>      1764 ( 99%)      3195 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1625375,1627139] EXCISED REGION [1628842,1632039]
 second seq =>  [      1,   1777] EXCISED REGION [   1786,   4983]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1702 nucs [1627140,1628841]
 second seq =>         8 nucs [1778,1785]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627139,1627139] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627140,1627140] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs

  1625375 AATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTTTAAAATCTTAGTAATATTTTTAAATAAAATC 1625434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTTTAAAATCTTAGTAATATTTTTAAATAAAATC 60

  1625435 ATCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTTCTCTCTGCCTGTGCAGAAATCTTATGAAAAT 1625494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTTCTCTCTGCCTGTGCAGAAATCTTATGAAAAT 120

  1625495 TCGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATTCCCAGAATACACATTAATCCCAACTGTTACT 1625554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATTCCCAGAATACACATTAATCCCAACTGTTACT 180

  1625555 CCCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCCCATCACCTGAGCATAAATGCCAGCTCCCATC 1625614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCCCATCACCTGAGCATAAATGCCAGCTCCCATC 240

  1625615 CACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTGCCCTCTGCCCTGGTCTATGGTCTCCCCTCTT 1625674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTGCCCTCTGCCCTGGTCTATGGTCTCCCCTCTT 300

  1625675 AAATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGTGCCCAGCACAGCCCTGCCCTCTGC------- 1625727
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
      301 AAATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGTGCCCAGCACAGCCCTGCCCTCTGCCCTGCCC 360

  1625728 -----TCTGGTCTAAGGTCTCTCCCCTGTGCTGTTCCCTTCCTGCCGGGCAGGCCTCTGT 1625782
               |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGCTCTGGCCTAAGGTCTCTCCCCTGTGCTGTTCCCTTCCTGCCGGGCAGGCCTCTGT 420

  1625783 CCGTTCCTCAAACCACACAGGCTCAGGCCTGACTCCAGGCCTTTGCCCTGCTGTGCCCTC 1625842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCGTTCCTCAAACCACACAGGCTCAGGCCTGACTCCAGGCCTTTGCCCTGCTGTGCCCTC 480

  1625843 TGCCTAGGGTGCCTTTCCCGGGCTCTGCATCCTCCTCTCAACCCGCTGAGCTCCAGCCTG 1625902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCCTAGGGTGCCTTTCCCGGGCTCTGCATCCTCCTCTCAACCCGCTGAGCTCCAGCCTG 540

  1625903 CTGGTCGCCCCTCAGGTGGATGAACACATGGTGTCCTCTCGCCCCGCTGGCTTTTGCACA 1625962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGGTCGCCCCTCAGGTGGATGAACACATGGTGTCCTCTCGCCCCGCTGGCTTTTGCACA 600

  1625963 GGCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCTCTCTATCGGGGTTTACTCTCTAAATACCATT 1626022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCTCTCTATCGGGGTTTACTCTCTAAATACCATT 660

  1626023 CGTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGCTCCCTGCCCACCCCCCTCCCTTGGACTTAAC 1626082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CGTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGCTCCCTGCCCACCCCCCTCCCTTGGACTTAAC 720

  1626083 CTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTCCTAGCAC 1626142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTCCTAGCAC 780

  1626143 TCGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTGGTGCACA 1626202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTGGTGCACA 840

  1626203 AGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCCCCGTTTT 1626262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCCCCGTTTT 900

  1626263 TTTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACCTATTAGAATCATTTATATTT 1626322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACCTATTAGAATCATTTATATTT 960

  1626323 ATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAAGCCAAAT 1626382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAAGCCAAAT 1020

  1626383 CTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAATCATTTACCAACTGACTGATA 1626442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAATCATTTACCAACTGACTGATA 1080

  1626443 GAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACACGCCCCTTTGAAAGTCACTG 1626502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACACGCCCCTTTGAAAGTCACTG 1140

  1626503 TCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGTTTAGGCT 1626562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGTTTAGGCT 1200

  1626563 GATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTGAGGATGGGAACCATGCCTGCTCCACATGCCTC 1626622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTGAGGATGGGAACCATGCCTGCTCCACATGCCTC 1260

  1626623 TCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCACATCTCGTGGGGAAAATCAAG 1626682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCACATCTCGTGGGGAAAATCAAG 1320

  1626683 AGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGCCGTGTCT 1626742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGCCGTGTCT 1380

  1626743 GTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCACCCAGCCACGAGCCACACCTATGGGATGGAT 1626802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCACCCAGCCACGAGCCACACCTATGGGATGGAT 1440

  1626803 AAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCTATGTCATACTCTTATGGG 1626862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCTATGTCATACTCTTATGGG 1500

  1626863 GGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGCAAGAAATGTCAGCCTCTGTC 1626922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGCAAGAAATGTCAGCCTCTGTC 1560

  1626923 CCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAATGGTGTCT 1626982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAATGGTGTCT 1620

  1626983 GCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCCTCCATC 1627042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCCTCCATC 1680

  1627043 TGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGGGCCCTT 1627102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGGGCCCTT 1740

  1627103 GTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 1627139
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 1777

EXCISED REGION

  1628842 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 1628901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 1845

  1628902 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 1628961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 1905

  1628962 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 1629021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 1965

  1629022 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 1629081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 2025

  1629082 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 1629141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 2085

  1629142 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 1629201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 2145

  1629202 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 1629261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 2205

  1629262 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 1629321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 2265

  1629322 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 1629381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 2325

  1629382 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 1629441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 2385

  1629442 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 1629501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 2445

  1629502 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 1629561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 2505

  1629562 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 1629621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 2565

  1629622 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 1629681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 2625

  1629682 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 1629741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 2685

  1629742 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 1629801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 2745

  1629802 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 1629861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 2805

  1629862 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTGAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 1629921
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTAAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 2865

  1629922 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 1629981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 2925

  1629982 GAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTA 1630041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 GAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTA 2985

  1630042 TGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGG 1630101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 TGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGG 3045

  1630102 GAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATGTGAATCATGTTGGCTGAGG 1630161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3046 GAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATATGAATCATGTTGGCTGAGG 3105

  1630162 AGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTAC 1630221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 AGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTAC 3165

  1630222 TGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAA 1630281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 TGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAA 3225

  1630282 TCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACA 1630341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 TCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACA 3285

  1630342 CACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAG 1630401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 CACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAG 3345

  1630402 GCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGG 1630461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 GCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGG 3405

  1630462 CCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTC 1630521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 CCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTC 3465

  1630522 ACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCT 1630581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 ACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCT 3525

  1630582 CCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAG 1630641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 CCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAG 3585

  1630642 AGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGA 1630701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 AGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGA 3645

  1630702 GGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCAC 1630761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 GGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCAC 3705

  1630762 AGTGAGAGGGTCCCGACACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCA 1630821
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 AGTGAGAGGGTCCCGATACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCA 3765

  1630822 GGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGAT 1630881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 GGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGAT 3825

  1630882 ATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAG 1630941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 ATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAG 3885

  1630942 CTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATA 1631001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 CTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATA 3945

  1631002 CAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATAATG 1631061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 CAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATAATG 4005

  1631062 CTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGAAAC 1631121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 CTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGAAAC 4065

  1631122 CATCATCACCATCATCAGGTAATGGAAAACCATCAAAGCTTTGAGCTGGCTTGTTAGCCA 1631181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4066 CATCATCACCATCATCAGGTAATGGAAAACCATCAAAGCTTTGAGCTGGCTTGTTAGCCA 4125

  1631182 AGAATAGTAGCAGTGTATTAGCTACTACTAATACTCACAGCTGACAATTACTGACCACTT 1631241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4126 AGAATAGTAGCAGTGTATTAGCTACTACTAATACTCACAGCTGACAATTACTGACCACTT 4185

  1631242 GTTCCGTGCCAGGAATCACGGAAGCACCTCGCATGCATTTCCTCAATACTCCCTCCCAGT 1631301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4186 GTTCCGTGCCAGGAATCACGGAAGCACCTCGCATGCATTTCCTCAATACTCCCTCCCAGT 4245

  1631302 AACAGCAAGGACACAAAACTGGTAGAGCCAGGACTGGAATCCAGGCCGGCCCCAAAGCAC 1631361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4246 AACAGCAAGGACACAAAACTGGTAGAGCCAGGACTGGAATCCAGGCCGGCCCCAAAGCAC 4305

  1631362 TCCAGTGGAGCCTGCCAAGGTGGGCAGGCTACCATACTAATGCGGTCCAGTATTTGACCA 1631421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4306 TCCAGTGGAGCCTGCCAAGGTGGGCAGGCTACCATACTAATGCGGTCCAGTATTTGACCA 4365

  1631422 CCACTCCTAGTTGAGCAAGTTTAACAGAAAACCTAAAACTAAACCTAAAATCTAAAAATT 1631481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4366 CCACTCCTAGTTGAGCAAGTTTAACAGAAAACCTAAAACTAAACCTAAAATCTAAAAATT 4425

  1631482 TGAGCAAATGCATAAAAAGCAGGCTGTTAAAATGGATCATAAATCTTGCATCACTCGCTG 1631541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4426 TGAGCAAATGCATAAAAAGCAGGCTGTTAAAATGGATCATAAATCTTGCATCACTCGCTG 4485

  1631542 GAAAACCACTCAAAATAAACGTCTCTGAGACATGGCCTCTGAGGAGGGCACTCTGTGTGG 1631601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4486 GAAAACCACTCAAAATAAACGTCTCTGAGACATGGCCTCTGAGGAGGGCACTCTGTGTGG 4545

  1631602 CTCATATCACCTTGCTGACAAACCACTTGAACCTGGGTGGTCATCTGACCATACTGAACA 1631661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4546 CTCATATCACCTTGCTGACAAACCACTTGAACCTGGGTGGTCATCTGACCATACTGAACA 4605

  1631662 GACGATGCACAGAGCCATTTGCATCCACTGTGGTCAACATTTAGGAAGTTTTAAGCTAAG 1631721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4606 GACGATGCACAGAGCCATTTGCATCCACTGTGGTCAACATTTAGGAAGTTTTAAGCTAAG 4665

  1631722 ATTTGCCAAATTGTAGCCTACTGGATTCCGGGTTCTCTTGACATCTCTTTCTAGTCGCCA 1631781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4666 ATTTGCCAAATTGTAGCCTACTGGATTCCGGGTTCTCTTGACATCTCTTTCTAGTCGCCA 4725

  1631782 TGTCTTGCACTTCCCGAGTATAAATGAACTGAGATGCAAATAAAAAAAGGAGGATTTAAG 1631841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4726 TGTCTTGCACTTCCCGAGTATAAATGAACTGAGATGCAAATAAAAAAAGGAGGATTTAAG 4785

  1631842 AATAATGAAAAGAGAAAAATCAAGAAAGCACAATCACTAGTGTAGAGATAACAGCATTTC 1631901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4786 AATAATGAAAAGAGAAAAATCAAGAAAGCACAATCACTAGTGTAGAGATAACAGCATTTC 4845

  1631902 TGAATTCCCTGAAAACAATCTATATAAATGCATGTGAAATAATACACCAGCATCTGTGGC 1631961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 TGAATTCCCTGAAAACAATCTATATAAATGCATGTGAAATAATACACCAGCATCTGTGGC 4905

  1631962 CCACACGCCACATATTAGGAACGGATGTCATAATATAAGGTAAACATGTTACTCTGAAAA 1632021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4906 CCACACGCCACATATTAGGAACGGATGTCATAATATAAGGTAAACATGTTACTCTGAAAA 4965

  1632022 CACAAATCCTCACAAATC 1632039
          ||||||||||||||||||
     4966 CACAAATCCTCACAAATC 4983

Alignment time is 3.82232 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   7745] =>      7745 nucs 'mol-32-288a-047386_7745'

Score:        7436
Aligned:      7785        nucs
Identic:      7669 ( 99%) nucs =>      6521 ( 98%)      1148 (100%)
Gaps:          107 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1620563,1627139] EXCISED REGION [1628842,1629990]
 second seq =>  [      1,   6588] EXCISED REGION [   6597,   7745]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1702 nucs [1627140,1628841]
 second seq =>         8 nucs [6589,6596]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627139,1627139] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627140,1627140] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs

  1620563 TCAAGTTAGAACATCAGCTTCTCCCCAAGTCTTCAGCTGTGCGACCCTCAATCTAGAACA 1620622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCAAGTTAGAACATCAGCTTCTCCCCAAGTCTTCAGCTGTGCGACCCTCAATCTAGAACA 60

  1620623 TCAGTTCCTCTCTGGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTGAAACTACATCAGCTTCTCTCTGGG 1620682
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAGTTCCTCTCTGGGTCTGCAGTTGCAAGACCCTGAAACTACATCAGCTTCTCTCTGGG 120

  1620683 TCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTACAACATCAGCTTCCCTCCAGGTCTCCAGTTCCGT 1620742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTACAACATCAGCTTCCCTCCAGGTCTCCAGTTCCGT 180

  1620743 GACCCTAAATCTAGAACATCAGCTCCTCCGAGTCTCCAACTGAAAGACCCACAACGCAAA 1620802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACCCTAAATCTAGAACATCAGCTCCTCCGAGTCTCCAACTGAAAGACCCACAACGCAAA 240

  1620803 CAACTTCAGCTCCTCCACAAGTCTTCAGCTGCACGACGCTCAATCTAGAACATCAGCTCC 1620862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAACTTCAGCTCCTCCACAAGTCTTCAGCTGCACGACGCTCAATCTAGAACATCAGCTCC 300

  1620863 TCTCCGGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTACAACGTCAGCTCCTCTCCGGGTTTTC 1620922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTCCGGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTACAACGTCAGCTCCTCTCCGGGTTTTC 360

  1620923 ACCTCCATGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGACCA 1620982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCTCCATGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGACCA 420

  1620983 TCAAAGTGAACATCATCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCACGATGTTCAATCTAGAA 1621042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCAAAGTGAACATCATCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCACGATGTTCAATCTAGAA 480

  1621043 CATCCGCTCCTGTCTGGTTCTCCAGCTGCACGACCCTCAAACTACAACCTCAGCTCTTCC 1621102
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATCAGCTCCTGTCTGGTTCTCCAGCTGCACGACCCTCAAACTACAACCTCAGCTCTTCC 540

  1621103 CCGAGTCTTCTGCAGCATGATCCTCAATCTAGAACATAAGCTCCTCTCTGGGTGTCCAGC 1621162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCGAGTCTTCTGCAGCATGATCCTCAATCTAGAACATAAGCTCCTCTCTGGGTGTCCAGC 600

  1621163 TGTAGGGACCTCAAATTAGAACGTCACCTCCTCCCAGAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCA 1621222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTAGGGACCTCAAATTAGAACGTCACCTCCTCCCAGAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCA 660

  1621223 ATCTATAACATCAGCTCCTCTCCGGGTTTCCAGCTCCATGACCCTAAAAATACATGAGCA 1621282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCTATAACATCAGCTCCTCTCCGGGTTTCCAGCTCCATGACCCTAAAAATACATGAGCA 720

  1621283 GCTCCTCCCTGAATCTTCAGCTGCACAACCTCAAATTACAACATCAGCTCCTGTCTGCAT 1621342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTCCTCCCTGAATCTTCAGCTGCACAACCTCAAATTACAACATCAGCTCCTGTCTGCAT 780

  1621343 CTCCAGCTGCAGGGCCCTCAAACTAGAATATGAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCACG 1621402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCCAGCTGCAGGGCCCTCAAACTAGAATATGAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCACG 840

  1621403 ACCCTCAAACTAGATCATCAGTTCCTGTACAGATCTCCAACTGTAGGGCCCTCAAACTAG 1621462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCCTCAAACTAGATCATCAGTTCCTGTACAGATCTCCAACTGTAGGGCCCTCAAACTAG 900

  1621463 AACATCAGCTTCTCCCCGAGTTTGCAGCTGCAAGACCCTCAAATTACAACCTCAGCTCCT 1621522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACATCAGCTTCTCCCCGAGTTTGCAGCTGCAAGACCCTCAAATTACAACCTCAGCTCCT 960

  1621523 CCCGGAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCAATCTCGAACATCGGATCCTCTCCGGGTCTGCA 1621582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCGGAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCAATCTCGAACATCGGATCCTCTCCGGGTCTGCA 1020

  1621583 ACTGTAGGGCCCTCAAACTATAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTGTAAGGCTCT 1621642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTGTAGGGCCCTCAAACTATAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTGTAAGGCTCT 1080

  1621643 CAATCTAGAAATTCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCTGCTGCACGACCCTCAACCTAGAACCG 1621702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAATCTAGAAATTCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCTGCTGCACGACCCTCAACCTAGAACCG 1140

  1621703 CAGCTCCTACCCGAGTCTTCAGCTGCATGACCCTCAATCTAGAAAATCAGCTCCTCTCCA 1621762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGCTCCTACCCGAGTCTTCAGCTGCATGACCCTCAATCTAGAAAATCAGCTCCTCTCCA 1200

  1621763 GGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATGACCTTCTCTCCAGGTCTCCAGTTCC 1621822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1201 GGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCACCTTCTCTCCAGGTCTCCAGTTCC 1260

  1621823 ATGACCCTAAATCTAGAACATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAACTGAAAGACCCTCAAGG 1621882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGACCCTAAATCTAGAACATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAACTGAAAGACCCTCAAGG 1320

  1621883 CGAACAACATCACCTCCTCCCCAAGTCTTCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAG 1621942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CGAACAACATCACCTCCTCCCCAAGTCTTCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAG 1380

  1621943 ATCCTCTCCAGGTCAGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGT 1622002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATCCTCTCCAGGTCAGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGT 1440

  1622003 CTGCAGCTGCAAAATACTCAAACGAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTGCAGTTGCAAG 1622062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGCAGCTGCAAAATACTCAAACGAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTGCAGTTGCAAG 1500

  1622063 ACCCTCACACTAGAACATCACCTCCTCTACAGGTCCACAGCTGCAAGACCCTCAATCTAG 1622122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACCCTCACACTAGAACATCACCTCCTCTACAGGTCCACAGCTGCAAGACCCTCAATCTAG 1560

  1622123 AACCTCAGCTCCTCCCCGGGTTTTCAGCTGCAAGACCATCAAACTAGAACCTAAGCTCCT 1622182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AACCTCAGCTCCTCCCCGGGTTTTCAGCTGCAAGACCATCAAACTAGAACCTAAGCTCCT 1620

  1622183 CCCCGAGTCTTCAGCTGCAAGACCCTCAATCTAGAACCTCAGCTCCTCCCTGGGTCTTCA 1622242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCCGAGTCTTCAGCTGCAAGACCCTCAATCTAGAACCTCAGCTCCTCCCTGGGTCTTCA 1680

  1622243 GCTGCATGACCCTCAATCTAGAACCTCAGCTCCTCCCTGGGTCTTCAGCTGCATGACCCT 1622302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCTGCATGACCCTCAATCTAGAACCTCAGCTCCTCCCTGGGTCTTCAGCTGCATGACCCT 1740

  1622303 CAATCTAGAACATCAGCTCCTATCCAGGTCTGCAGCTGCATGTCCCTCAAACTAGAACAT 1622362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAATCTAGAACATCAGCTCCTATCCAGGTCTGCAGCTGCATGTCCCTCAAACTAGAACAT 1800

  1622363 CAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCATGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCCA 1622422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCATGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCCA 1860

  1622423 GGTCTCCAGCAGCATGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCCCCGGGTCTTCAGCTGC 1622482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGTCTCCAGCAGCATGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCCCCGGGTCTTCAGCTGC 1920

  1622483 ATGACTCCAAAATTAGAACCTCAGCTCCTCCCCGAGACTTCAGCTGCACGATCCTCAATC 1622542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATGACTCCAAAATTAGAACCTCAGCTCCTCCCCGAGACTTCAGCTGCACGATCCTCAATC 1980

  1622543 TAGAACATCAGCTCCTATCCAGGTCTGCAGCTGCAAGATTCTCAAATCAGAACATCAGCT 1622602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAGAACATCAGCTCCTATCCAGGTCTGCAGCTGCAAGATTCTCAAATCAGAACATCAGCT 2040

  1622603 CCTCTCCGAGTCTGCAGCTGCACGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCAGGAACT 1622662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCTCTCCGAGTCTGCAGCTGCACGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCAGGAACT 2100

  1622663 GCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAATATCAGCTCCACTCCGGGCCTGCAGCTGCAAGAC 1622722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAATATCAGCTCCACTCCGGGCCTGCAGCTGCAAGAC 2160

  1622723 CCTCAATCTAGAACCTCAGCTCCTCCCCGGGTCTTCAGCTGCATGACCCCCAAATTAGAA 1622782
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCTCAATCTAGAACCTCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCATGACCCCCAAATTAGAA 2220

  1622783 CCTCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCATGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCCTAT 1622842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCTCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCATGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCCTAT 2280

  1622843 CCAGGTCTGCAACTGCACGTCCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGC 1622902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCAGGTCTGCAACTGCACGTCCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGC 2340

  1622903 TGCAAGATTCTCAAATCAGAACATCAGCTCCTCTCCGAGTCTGCAGCTGCATGACCCTCA 1622962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGCAAGATTCTCAAATCAGAACATCAGCTCCTCTCCGAGTCTGCAGCTGCATGACCCTCA 2400

  1622963 AACTAGAACATCAGCTCCTCTCTGGAACTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCA 1623022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AACTAGAACATCAGCTCCTCTCTGGAACTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCA 2460

  1623023 GCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACCTCAGCTTCTCCCCAGG 1623082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACCTCAGCTTCTCCCCAGG 2520

  1623083 TCTTCAGCTGCATGACCCCCAAATTAGAACCTCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCAT 1623142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCTTCAGCTGCATGACCCCCAAATTAGAACCTCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCAT 2580

  1623143 GGCCCTCAACCTAGAACATCAGCTCCTATCCAGGTCTGCAGCTGCACGTCCCTCAAACTA 1623202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GGCCCTCAACCTAGAACATCAGCTCCTATCCAGGTCTGCAGCTGCACGTCCCTCAAACTA 2640

  1623203 GAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCC 1623262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCC 2700

  1623263 TCTCCGGGTCTGCAGCTGCAAGATTCTCAAATCAGAACATTAGCTCCTCTCCGAGTCTGC 1623322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCTCCGGGTCTGCAGCTGCAAGATTCTCAAATCAGAACATTAGCTCCTCTCCGAGTCTGC 2760

  1623323 AGCTGCATGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCTGGAGCTGCAGCTGCAAGACCC 1623382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGCTGCATGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCTGGAGCTGCAGCTGCAAGACCC 2820

  1623383 TCAATCTAGAACCTCAGCTCCTCCCCGGGTCTTCAGCTGCATGACCCCAAAATTAGAACC 1623442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TCAATCTAGAACCTCAGCTCCTCCCCGGGTCTTCAGCTGCATGACCCCAAAATTAGAACC 2880

  1623443 TCAGCTCCTCCCCAAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCCTGTCC 1623502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCAGCTCCTCCCCAAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCCTGTCC 2940

  1623503 AGGTCTGCAGCTGCAAGATTCTCAAATCAGAACATCAGCTCCTCTCCGAGTCTGCAGCTG 1623562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGGTCTGCAGCTGCAAGATTCTCAAATCAGAACATCAGCTCCTCTCCGAGTCTGCAGCTG 3000

  1623563 CACGACCCTCAAACTAGAAACATCAGCTCCTCTCCGGAACTGCAGCTGCAAGACCCTCAA 1623622
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CACGACCCTCAAACTATAAACATCAGCTCCTCTCCGGAACTGCAGCTGCAAGACCCTCAA 3060

  1623623 ACTAGAATATCAGCTCCACTCCGGGTCTGCAGCTGCACTACCCTCAATCTAGAACCTCAG 1623682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACTAGAATATCAGCTCCACTCCGGGTCTGCAGCTGCACTACCCTCAATCTAGAACCTCAG 3120

  1623683 CTCCTCCCTGGATCTTCAGCTGCACGACCCCCAAATTAGAACCTCAGCTCCTCCTCGAGT 1623742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CTCCTCCCTGGATCTTCAGCTGCACGACCCCCAAATTAGAACCTCAGCTCCTCCTCGAGT 3180

  1623743 CTTCAGCTGCTTGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCCTATCCAGGTCTGCAGCTGCACG 1623802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTTCAGCTGCTTGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCCTATCCAGGTCTGCAGCTGCACG 3240

  1623803 TCCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCTGGGTCTGCAGCTGCACGACCCTCAAACTAG 1623862
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTGCACGACCCTCAAACTAG 3300

  1623863 AACATCAGCTCCTCTCCGGAACTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAATATCAGCTCCT 1623922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AACATCAGCTCCTCTCCGGAACTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAATATCAGCTCCT 3360

  1623923 CTCCGGGTCTGCAGCTGCATGGCCCTCAATCTAGAACCTCAGCTCCTCCCCGGGTCTTCA 1623982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CTCCGGGTCTGCAGCTGCATGGCCCTCAATCTAGAACCTCAGCTCCTCCCCGGGTCTTCA 3420

  1623983 GCTGCATGACCCTCAAACGAGAATATCAGCTCCTC------------------------- 1624017
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
     3421 GCTGCATGACCCTCAAACGAGAATATCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCACGACCCT 3480

  1624018 ----------------------TCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAAACTAGAACCT 1624055
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAATCTAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAAACTAGAACCT 3540

  1624056 GCACGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCCCTGGGTCTGCAGCTGGAAGATCCACTA 1624115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GCACGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCCCTGGGTCTGCAGCTGGAAGATCCACTA 3600

  1624116 ACTAGAACATCAGCTCCTGCCGGGTCTGCAGCTCTGTGACCCTCGATCAAGATTACCAGC 1624175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ACTAGAACATCAGCTCCTGCCGGGTCTGCAGCTCTGTGACCCTCGATCAAGATTACCAGC 3660

  1624176 TCTTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAACGTGAACAACATCACCTCCTCCCCGAG 1624235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCTTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAACGTGAACAACATCACCTCCTCCCCGAG 3720

  1624236 TCCTCAACTGCACGACCCTCAAACTACAACATCTCCTCCTCCCCGAGTCTGCAGCTGCAC 1624295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TCCTCAACTGCACGACCCTCAAACTACAACATCTCCTCCTCCCCGAGTCTGCAGCTGCAC 3780

  1624296 GACCATCAATCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTATAAGAACCTAACCGTA 1624355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GACCATCAATCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTATAAGAACCTAACCGTA 3840

  1624356 GAAGATCAGCTCCTCCGTGGGTCTGCAGCTGGAAGATCCACTAACTAGAACATCGGCTCC 1624415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GAAGATCAGCTCCTCCGTGGGTCTGCAGCTGGAAGATCCACTAACTAGAACATCGGCTCC 3900

  1624416 TGTCCAGGTCTCCAGCTCCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCC 1624475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TGTCCAGGTCTCCAGCTCCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCC 3960

  1624476 AGCTGAAAGACCCTCAATGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAGCTGCATGAC 1624535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGCTGAAAGACCCTCAATGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAGCTGCATGAC 4020

  1624536 CCTCAAATACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAAC 1624595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CCTCAAATACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAAC 4080

  1624596 ATCAGCTCGTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAAGAACCTAAAACTAGAACATCAGCTCCTCCC 1624655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATCAGCTCGTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAAGAACCTAAAACTAGAACATCAGCTCCTCCC 4140

  1624656 TGGATCTGCAGCTGGAAGATCCATTAAGTAGAATATCAGCTCCTGTCCGGGTCTCCAGCT 1624715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGGATCTGCAGCTGGAAGATCCATTAAGTAGAATATCAGCTCCTGTCCGGGTCTCCAGCT 4200

  1624716 CCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAA 1624775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAA 4260

  1624776 GGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAACTGCATGACCCTCAAACTACAACATC 1624835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAACTGCATGACCCTCAAACTACAACATC 4320

  1624836 TCCTCCCCGAGTCTGCAGCTGCATGCCCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTC 1624895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 TCCTCCCCGAGTCTGCAGCTGCATGCCCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTC 4380

  1624896 TGCAGCTGCACGACCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCTTCAGGTCTGCAGCTGCAAGA 1624955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGCAGCTGCACGACCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCTTCAGGTCTGCAGCTGCAAGA 4440

  1624956 CCCTCAAACTAGAACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGA 1625015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CCCTCAAACTAGAACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGA 4500

  1625016 ACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTC 1625075
          |||||||                                               ||||||
     4501 ACATCAG-----------------------------------------------CTCCTC 4513

  1625076 TCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAG 1625135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 TCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAG 4573

  1625136 CTGCAGGGCCCTCAAGGTGGAACATCAGCTCCTCCCCAAGCTAGAACACCTCTCCCACCT 1625195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4574 CTGCAGGGCCCTCAAGGTGGAACATCAGCTCCTCCCCAAGCTAGAACACCTCTCCCACCT 4633

  1625196 GGATCTCCAGCTCCACGACCCTCACAGAACAATCCCTTCTCATGAAATTCAGCAGTCAAG 1625255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 GGATCTCCAGCTCCACGACCCTCACAGAACAATCCCTTCTCATGAAATTCAGCAGTCAAG 4693

  1625256 AAATCTGCAGCGGAAGTAAATGAATAAATGTTTTGTTTTCAAATCGATATCTCTTTTATG 1625315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 AAATCTGCAGCGGAAGTAAATGAATAAATGTTTTGTTTTCAAATCGATATCTCTTTTATG 4753

  1625316 TTCGTGAGTTAACTTTTCTACTTTCCATTAGCCTTGCAATCTACTTATGTCCAATGTGAA 1625375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4754 TTCGTGAGTTAACTTTTCTACTTTCCATTAGCCTTGCAATCTACTTATGTCCAATGTGAA 4813

  1625376 ATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTTTAAAATCTTAGTAATATTTTTAAATAAAATCA 1625435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 ATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTTTAAAATCTTAGTAATATTTTTAAATAAAATCA 4873

  1625436 TCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTTCTCTCTGCCTGTGCAGAAATCTTATGAAAATT 1625495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 TCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTTCTCTCTGCCTGTGCAGAAATCTTATGAAAATT 4933

  1625496 CGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATTCCCAGAATACACATTAATCCCAACTGTTACTC 1625555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 CGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATTCCCAGAATACACATTAATCCCAACTGTTACTC 4993

  1625556 CCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCCCATCACCTGAGCATAAATGCCAGCTCCCATCC 1625615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 CCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCCCATCACCTGAGCATAAATGCCAGCTCCCATCC 5053

  1625616 ACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTGCCCTCTGCCCTGGTCTATGGTCTCCCCTCTTA 1625675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 ACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTGCCCTCTGCCCTGGTCTATGGTCTCCCCTCTTA 5113

  1625676 AATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGTGCCCAGCACAGCCCTGCCCTCTGC-------- 1625727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
     5114 AATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGTGCCCAGCACAGCCCTGCCCTCTGCCCTGCCCT 5173

  1625728 ----TCTGGTCTAAGGTCTCTCCCCTGTGCTGTTCCCTTCCTGCCGGGCAGGCCTCTGTC 1625783
              |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 CTGCTCTGGCCTAAGGTCTCTCCCCTGTGCTGTTCCCTTCCTGCCGGGCAGGCCTCTGTC 5233

  1625784 CGTTCCTCAAACCACACAGGCTCAGGCCTGACTCCAGGCCTTTGCCCTGCTGTGCCCTCT 1625843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 CGTTCCTCAAACCACACAGGCTCAGGCCTGACTCCAGGCCTTTGCCCTGCTGTGCCCTCT 5293

  1625844 GCCTAGGGTGCCTTTCCCGGGCTCTGCATCCTCCTCTCAACCCGCTGAGCTCCAGCCTGC 1625903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 GCCTAGGGTGCCTTTCCCGGGCTCTGCATCCTCCTCTCAACCCGCTGAGCTCCAGCCTGC 5353

  1625904 TGGTCGCCCCTCAGGTGGATGAACACATGGTGTCCTCTCGCCCCGCTGGCTTTTGCACAG 1625963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 TGGTCGCCCCTCAGGTGGATGAACACATGGTGTCCTCTCGCCCCGCTGGCTTTTGCACAG 5413

  1625964 GCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCTCTCTATCGGGGTTTACTCTCTAAATACCATTC 1626023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 GCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCTCTCTATCGGGGTTTACTCTCTAAATACCATTC 5473

  1626024 GTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGCTCCCTGCCCACCCCCCTCCCTTGGACTTAACC 1626083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5474 GTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGCTCCCTGCCCACCCCCCTCCCTTGGACTTAACC 5533

  1626084 TTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTCCTAGCACT 1626143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 TTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTCCTAGCACT 5593

  1626144 CGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTGGTGCACAA 1626203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 CGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTGGTGCACAA 5653

  1626204 GTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCCCCGTTTTT 1626263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5654 GTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCCCCGTTTTT 5713

  1626264 TTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACCTATTAGAATCATTTATATTTA 1626323
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 TTTTTTT-GCCATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACCTATTAGAATCATTTATATTTA 5772

  1626324 TTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAAGCCAAATC 1626383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5773 TTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAAGCCAAATC 5832

  1626384 TACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAATCATTTACCAACTGACTGATAG 1626443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5833 TACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAATCATTTACCAACTGACTGATAG 5892

  1626444 AGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACACGCCCCTTTGAAAGTCACTGT 1626503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5893 AGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACACGCCCCTTTGAAAGTCACTGT 5952

  1626504 CATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGTTTAGGCTG 1626563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5953 CATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGTTTAGGCTG 6012

  1626564 ATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTGAGGATGGGAACCATGCCTGCTCCACATGCCTCT 1626623
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6013 ATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGTTGAGGATGGGAACCATGCCTGCTCCACATGCCTCT 6072

  1626624 CATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCACATCTCGTGGGGAAAATCAAGA 1626683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6073 CATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCACATCTCGTGGGGAAAATCAAGA 6132

  1626684 GCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGCCGTGTCTG 1626743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6133 GCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGCCGTGTCTG 6192

  1626744 TGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCACCCAGCCACGAGCCACACCTATGGGATGGATA 1626803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6193 TGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCACCCAGCCACGAGCCACACCTATGGGATGGATA 6252

  1626804 AGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCTATGTCATACTCTTATGGGG 1626863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6253 AGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCTATGTCATACTCTTATGGGG 6312

  1626864 GGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGCAAGAAATGTCAGCCTCTGTCC 1626923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6313 GGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGCAAGAAATGTCAGCCTCTGTCC 6372

  1626924 CCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAATGGTGTCTG 1626983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6373 CCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAATGGTGTCTG 6432

  1626984 CAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCCTCCATCT 1627043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6433 CAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCCTCCATCT 6492

  1627044 GTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGGGCCCTTG 1627103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6493 GTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGGGCCCTTG 6552

  1627104 TGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 1627139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6553 TGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 6588

EXCISED REGION

  1628842 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 1628901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 6656

  1628902 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 1628961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 6716

  1628962 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 1629021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 6776

  1629022 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 1629081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 6836

  1629082 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 1629141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6837 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 6896

  1629142 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 1629201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6897 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 6956

  1629202 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 1629261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6957 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 7016

  1629262 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 1629321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7017 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 7076

  1629322 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 1629381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7077 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 7136

  1629382 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 1629441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7137 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 7196

  1629442 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 1629501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7197 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 7256

  1629502 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 1629561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7257 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 7316

  1629562 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 1629621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7317 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 7376

  1629622 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 1629681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7377 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 7436

  1629682 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 1629741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7437 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 7496

  1629742 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 1629801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7497 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 7556

  1629802 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 1629861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7557 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 7616

  1629862 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTGAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 1629921
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     7617 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTAAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 7676

  1629922 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 1629981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7677 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 7736

  1629982 GAGCTACCG 1629990
          |||||||||
     7737 GAGCTACCG 7745

Alignment time is 5.90894 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   2309] =>      2309 nucs 'mol-32-2e0a-056820_2309'

Score:        2247
Aligned:      2297        nucs
Identic:      2290 (100%) nucs =>       508 (100%)      1782 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1627600,1628108] EXCISED REGION [1628120,1629903]
 second seq =>  [      1,    509] EXCISED REGION [    522,   2309]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        11 nucs [1628109,1628119]
 second seq =>        12 nucs [510,521]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1001,1004]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        10 nucs [508,517] to [520,529]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [1628107,1628108] to [1628120,1628121]
 second seq =>         2 nucs [508,509] to [522,523]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [510,512] to [519,521]

  1627600 CCAACCTACTTTATTTTTCTCTACAGTACTTGGAACCTTCTAATGTACTAAGGACACGTG 1627659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCAACCTACTTTATTTTTCTCTACAGTACTTGGAACCTTCTAATGTACTAAGGACACGTG 60

  1627660 TATTTTCTTTCTTTTTTGTCTTCCCTAGAACAGGAGCTTAATGTGGGCAGGTATTTTTGT 1627719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTTTCTTTCTTTTTTGTCTTCCCTAGAACAGGAGCTTAATGTGGGCAGGTATTTTTGT 120

  1627720 TGATCTCATTTATCACCCTATCCCCAGTGCCTGGAACAGGGTCTGGCACATGAATGGTGT 1627779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGATCTCATTTATCACCCTATCCCCAGTGCCTGGAACAGGGTCTGGCACATGAATGGTGT 180

  1627780 GTTCTAAATAAATATTTTTAATAGATAAATAAATGAAATATCCTACAAGAGAAAGCTAGT 1627839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTCTAAATAAATATTTTTAATAGATAAATAAATGAAATATCCTACAAGAGAAAGCTAGT 240

  1627840 ATCTGGAACTCACCCATCAACAGAACCTAAAAGCCAAAGACCTTTAGCCTGTCTCTGCCT 1627899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCTGGAACTCACCCATCAACAGAACCTAAAAGCCAAAGACCTTTAGCCTGTCTCTGCCT 300

  1627900 CTGAACACACCCAACCCCGGAGGAGCCAGCAGAGGAAAAAGAGGAACAAAGGCGGGGAAG 1627959
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      301 CTGAACACACCCAACCCCGGAGGAGCCAGCAGAGGAAAAAGAGGAACAAAGGCCGGGAAG 360

  1627960 GGAGCAGGTGGTGCCCACCAAGTAAGGAACCCTGAGGCTTAGGCCGAACCTGAGCTGGAG 1628019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAGCAGGTGGTGCCCACCAAGTAAGGAACCCTGAGGCTTAGGCCGAACCTGAGCTGGAG 420

  1628020 AAGGGACTCATCTAGGAACTGGGTATGAGATTAAAGTTTAGACTGGTCTGGCCTGGATTT 1628079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGGGACTCATCTAGGAACTGGGTATGAGATTAAAGTTTAGACTGGTCTGGCCTGGATTT 480

  1628080 TGTAACACCTAAACAAGGGTTAGTCCATT 1628108
          |||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGTAACACCTAAACAAGGGTTAGTCCATT 509

EXCISED REGION

  1628120 TTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCG 1628179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      522 TTTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTCTCACTGTCCCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTG 581

  1628180 ATCGCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCACGCCTCAGCCTCC 1628239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      582 ATCGCAGCTCACTGCAACCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGTGATTCTCACGCCTCAGCCTCC 641

  1628240 CGAGTAGCTGGGATTATAGGCGCACACCACCATTCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAG 1628299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      642 CGAGTAGCTGGGATTATAGGCGCACACCACCATTCCCGGCTAATTTTGTATTTTTAGTAG 701

  1628300 AGATAGGGTTTCACCATGTTGGCCCCCTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 1628359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      702 AGATAGGGTTTCACCATGTTGGCCCCCTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 761

  1628360 GCCGAGGTGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAA 1628419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      762 GCCGAGGTGGGCGGATCATGAGGTCAGGAGATTGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAA 821

  1628420 CCCCATCTCTATTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAGCCT 1628479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 CCCCATCTCTATTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAGCCT 881

  1628480 CAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGATCTCCAGATGCAGAGGTTGTAGT 1628539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 CAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCGCTTGATCTCCAGATGCAGAGGTTGTAGT 941

  1628540 GAGCCAAGATCAATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGCCTTCAGCTCAA- 1628598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
      942 GAGCCAAGATCAATGCCATTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGCAAGCCTTCAGCTCAAA 1001

  1628599 ---AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAACCTTCAAATGAATGTAAGAATTATTAT 1628655
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 AACAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAACCTTCAAATGAATGTAAGAATTATTAT 1061

  1628656 TTTTTAAAGTACAGCTTTAAAAATGCCCCTTACAAATACATCAGTGTTATATTAAGGCAA 1628715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 TTTTTAAAGTACAGCTTTAAAAATGCCCCTTACAAATACATCAGTGTTATATTAAGGCAA 1121

  1628716 ACCCACTTCAGAAGCACAAAGTTAATTTCTTATAATTCCAAGAAATATGTGAATGTTAAA 1628775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 ACCCACTTCAGAAGCACAAAGTTAATTTCTTATAATTCCAAGAAATATGTGAATGTTAAA 1181

  1628776 AAAAACCCAAACACCCGAAAAGGGATCAAACTCAAGATAGTTTGTAACATTTTATTGCAA 1628835
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1182 AAAAACCCAAACACCCGAAAAGGGATCAAACTCAAGATAGTTTGTAATATTTTATTGCAA 1241

  1628836 AAAGAAGGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAG 1628895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 AAAGAAGGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAG 1301

  1628896 CTCTCCTGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCA 1628955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 CTCTCCTGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCA 1361

  1628956 GTGCGGTTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACC 1629015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 GTGCGGTTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACC 1421

  1629016 AGGCCATTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTA 1629075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 AGGCCATTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTA 1481

  1629076 ATAATTTAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGT 1629135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 ATAATTTAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGT 1541

  1629136 CAAACTAATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATA 1629195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 CAAACTAATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATA 1601

  1629196 TTAGTAGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAG 1629255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 TTAGTAGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAG 1661

  1629256 TGAGACTCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGG 1629315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 TGAGACTCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGG 1721

  1629316 ATTGATATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGA 1629375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 ATTGATATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGA 1781

  1629376 ACCTTCCTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCC 1629435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 ACCTTCCTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCC 1841

  1629436 CACGATGAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCA 1629495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 CACGATGAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCA 1901

  1629496 GGAGCAGCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAG 1629555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 GGAGCAGCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAG 1961

  1629556 GCTGGAGTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGA 1629615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 GCTGGAGTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGA 2021

  1629616 TCTTCCCATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTT 1629675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 TCTTCCCATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTT 2081

  1629676 AGTTTTTGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTG 1629735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 AGTTTTTGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTG 2141

  1629736 GGGCTTCATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGG 1629795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 GGGCTTCATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGG 2201

  1629796 AGGACAAGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCA 1629855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 AGGACAAGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCA 2261

  1629856 GGCAGAGGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTGAATGCTCACATG 1629903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 GGCAGAGGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTGAATGCTCACATG 2309

Alignment time is 1.81024 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   2916] =>      2916 nucs 'mol-32-2fee-073409_2916'

Score:        2904
Aligned:      2915        nucs
Identic:      2914 (100%) nucs =>       114 (100%)      2800 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1628709,1628822] EXCISED REGION [1628824,1631624]
 second seq =>  [      1,    114] EXCISED REGION [    116,   2916]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [1628823,1628823]
 second seq =>         1 nucs [115,115]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1628822,1628822] to [1628824,1628824]
 second seq =>         1 nucs [114,114] to [116,116]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1628709 AAGGCAAACCCACTTCAGAAGCACAAAGTTAATTTCTTATAATTCCAAGAAATATGTGAA 1628768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGGCAAACCCACTTCAGAAGCACAAAGTTAATTTCTTATAATTCCAAGAAATATGTGAA 60

  1628769 TGTTAAAAAAAACCCAAACACCCGAAAAGGGATCAAACTCAAGATAGTTTGTAA 1628822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTAAAAAAAACCCAAACACCCGAAAAGGGATCAAACTCAAGATAGTTTGTAA 114

EXCISED REGION

  1628824 ATTTTATTGCAAAAAGAAGGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGT 1628883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      116 ATTTTATTGCAAAAAGAAGGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGT 175

  1628884 AATTTTTAGCAGCTCTCCTGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACA 1628943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      176 AATTTTTAGCAGCTCTCCTGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACA 235

  1628944 AATACCTTCTCAGTGCGGTTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTG 1629003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      236 AATACCTTCTCAGTGCGGTTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTG 295

  1629004 AAGTGAGAAACCAGGCCATTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCT 1629063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      296 AAGTGAGAAACCAGGCCATTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCT 355

  1629064 TGAAATAGCCTAATAATTTAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAAT 1629123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      356 TGAAATAGCCTAATAATTTAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAAT 415

  1629124 TATTATAGAAGTCAAACTAATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCC 1629183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      416 TATTATAGAAGTCAAACTAATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCC 475

  1629184 TAATAATTCATATTAGTAGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCC 1629243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      476 TAATAATTCATATTAGTAGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCC 535

  1629244 TGGGCAAGACAGTGAGACTCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGG 1629303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 TGGGCAAGACAGTGAGACTCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGG 595

  1629304 AGAAGGAAGTGGATTGATATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACA 1629363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 AGAAGGAAGTGGATTGATATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACA 655

  1629364 ACTCAACTATGAACCTTCCTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAA 1629423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 ACTCAACTATGAACCTTCCTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAA 715

  1629424 AACATGAGCCCCCACGATGAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGAT 1629483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 AACATGAGCCCCCACGATGAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGAT 775

  1629484 GATCCAATGGCAGGAGCAGCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGC 1629543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 GATCCAATGGCAGGAGCAGCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGC 835

  1629544 TCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCC 1629603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 TCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCC 895

  1629604 AGGCTCAAGTGATCTTCCCATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCA 1629663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 AGGCTCAAGTGATCTTCCCATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCA 955

  1629664 CTACACTTGTTTAGTTTTTGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCT 1629723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 CTACACTTGTTTAGTTTTTGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCT 1015

  1629724 GAAGGGCGGGTGGGGCTTCATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAA 1629783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 GAAGGGCGGGTGGGGCTTCATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAA 1075

  1629784 GCAAAGGGGTGGAGGACAAGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGT 1629843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 GCAAAGGGGTGGAGGACAAGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGT 1135

  1629844 AGGATGCCACCAGGCAGAGGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTGAATGCTCACATG 1629903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 AGGATGCCACCAGGCAGAGGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTGAATGCTCACATG 1195

  1629904 TGAGGAGCAAACCACCACAGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAAT 1629963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 TGAGGAGCAAACCACCACAGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAAT 1255

  1629964 CGCAGCCCTGCAACTTCAGAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACC 1630023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 CGCAGCCCTGCAACTTCAGAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACC 1315

  1630024 GCCCACTGCCTGAGGCTATGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTA 1630083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 GCCCACTGCCTGAGGCTATGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTA 1375

  1630084 TTCCAGAAAGAATTCAGGGAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATGT 1630143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 TTCCAGAAAGAATTCAGGGAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATGT 1435

  1630144 GAATCATGTTGGCTGAGGAGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCT 1630203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 GAATCATGTTGGCTGAGGAGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCT 1495

  1630204 ACTCTAAACTCTCATTACTGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAA 1630263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 ACTCTAAACTCTCATTACTGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAA 1555

  1630264 TTGAAGAGGAAAATGTAATCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCA 1630323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 TTGAAGAGGAAAATGTAATCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCA 1615

  1630324 CCACAGTTTCTGAGAACACACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCT 1630383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 CCACAGTTTCTGAGAACACACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCT 1675

  1630384 GGGGCTGCCCCACAGCAGGCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTG 1630443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 GGGGCTGCCCCACAGCAGGCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTG 1735

  1630444 ACTACGGGCTTCATGGGGCCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAA 1630503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 ACTACGGGCTTCATGGGGCCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAA 1795

  1630504 TTCAAGGAACAGGGTCTCACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCG 1630563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 TTCAAGGAACAGGGTCTCACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCG 1855

  1630564 ATCCCCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGC 1630623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 ATCCCCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGC 1915

  1630624 CCCGCATGCACTTTATAGAGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCT 1630683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 CCCGCATGCACTTTATAGAGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCT 1975

  1630684 GCAGAGATGAAAGGCAGAGGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAG 1630743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 GCAGAGATGAAAGGCAGAGGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAG 2035

  1630744 CGACTCCATTGGGACCACAGTGAGAGGGTCCCGACACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACAC 1630803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2036 CGACTCCATTGGGACCACAGTGAGAGGGTCCCGATACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACAC 2095

  1630804 TGATTTCAAAGTATCTCAGGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCA 1630863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 TGATTTCAAAGTATCTCAGGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCA 2155

  1630864 AGCAGTCTCCTGGTAGATATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACAC 1630923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 AGCAGTCTCCTGGTAGATATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACAC 2215

  1630924 TTGCTGATGGTTAAAGAGCTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAA 1630983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 TTGCTGATGGTTAAAGAGCTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAA 2275

  1630984 TGCCCTCTGGTGAAAATACAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCC 1631043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TGCCCTCTGGTGAAAATACAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCC 2335

  1631044 AAACCCCAAACAATAATGCTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAG 1631103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 AAACCCCAAACAATAATGCTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAG 2395

  1631104 TGTTCAGTAAGTGGAAACCATCATCACCATCATCAGGTAATGGAAAACCATCAAAGCTTT 1631163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 TGTTCAGTAAGTGGAAACCATCATCACCATCATCAGGTAATGGAAAACCATCAAAGCTTT 2455

  1631164 GAGCTGGCTTGTTAGCCAAGAATAGTAGCAGTGTATTAGCTACTACTAATACTCACAGCT 1631223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 GAGCTGGCTTGTTAGCCAAGAATAGTAGCAGTGTATTAGCTACTACTAATACTCACAGCT 2515

  1631224 GACAATTACTGACCACTTGTTCCGTGCCAGGAATCACGGAAGCACCTCGCATGCATTTCC 1631283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 GACAATTACTGACCACTTGTTCCGTGCCAGGAATCACGGAAGCACCTCGCATGCATTTCC 2575

  1631284 TCAATACTCCCTCCCAGTAACAGCAAGGACACAAAACTGGTAGAGCCAGGACTGGAATCC 1631343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 TCAATACTCCCTCCCAGTAACAGCAAGGACACAAAACTGGTAGAGCCAGGACTGGAATCC 2635

  1631344 AGGCCGGCCCCAAAGCACTCCAGTGGAGCCTGCCAAGGTGGGCAGGCTACCATACTAATG 1631403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 AGGCCGGCCCCAAAGCACTCCAGTGGAGCCTGCCAAGGTGGGCAGGCTACCATACTAATG 2695

  1631404 CGGTCCAGTATTTGACCACCACTCCTAGTTGAGCAAGTTTAACAGAAAACCTAAAACTAA 1631463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 CGGTCCAGTATTTGACCACCACTCCTAGTTGAGCAAGTTTAACAGAAAACCTAAAACTAA 2755

  1631464 ACCTAAAATCTAAAAATTTGAGCAAATGCATAAAAAGCAGGCTGTTAAAATGGATCATAA 1631523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 ACCTAAAATCTAAAAATTTGAGCAAATGCATAAAAAGCAGGCTGTTAAAATGGATCATAA 2815

  1631524 ATCTTGCATCACTCGCTGGAAAACCACTCAAAATAAACGTCTCTGAGACATGGCCTCTGA 1631583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 ATCTTGCATCACTCGCTGGAAAACCACTCAAAATAAACGTCTCTGAGACATGGCCTCTGA 2875

  1631584 GGAGGGCACTCTGTGTGGCTCATATCACCTTGCTGACAAAC 1631624
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2876 GGAGGGCACTCTGTGTGGCTCATATCACCTTGCTGACAAAC 2916

Alignment time is 2.41809 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   5088] =>      5088 nucs 'mol-32-30eb-061636_5088'

Score:        5018
Aligned:      5084        nucs
Identic:      5078 (100%) nucs =>       207 (100%)      4871 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1628392,1628598] EXCISED REGION [1628599,1633475]
 second seq =>  [      1,    207] EXCISED REGION [    212,   5088]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [208,211]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        27 nucs [208,234] to [212,238]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [1628597,1628598] to [1628599,1628600]
 second seq =>         2 nucs [206,207] to [212,213]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1628392 TGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTATTAAAAATACAAAAAATTAGC 1628451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCATCTCTATTAAAAATACAAAAAATTAGC 60

  1628452 TGGGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAGCCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCG 1628511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGCATGGTGGCAGGTGCCTGTAGCCTCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCG 120

  1628512 CTTGATCTCCAGATGCAGAGGTTGTAGTGAGCCAAGATCAATGCCATTGCACTCCAGCCT 1628571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTGATCTCCAGATGCAGAGGTTGTAGTGAGCCAAGATCAATGCCATTGCACTCCAGCCT 180

  1628572 GGGTGACAGAGCAAGCCTTCAGCTCAA 1628598
          |||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGTGACAGAGCAAGCCTTCAGCTCAA 207

EXCISED REGION

  1628599 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAACCTTCAAATGAATGTAAGAATTATTATTTT 1628658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      212 AAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAAAACCTTCAAATGAATGTAAGAATTATTATTTT 271

  1628659 TTAAAGTACAGCTTTAAAAATGCCCCTTACAAATACATCAGTGTTATATTAAGGCAAACC 1628718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      272 TTAAAGTACAGCTTTAAAAATGCCCCTTACAAATACATCAGTGTTATATTAAGGCAAACC 331

  1628719 CACTTCAGAAGCACAAAGTTAATTTCTTATAATTCCAAGAAATATGTGAATGTTAAAAAA 1628778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      332 CACTTCAGAAGCACAAAGTTAATTTCTTATAATTCCAAGAAATATGTGAATGTTAAAAAA 391

  1628779 AACCCAAACACCCGAAAAGGGATCAAACTCAAGATAGTTTGTAACATTTTATTGCAAAAA 1628838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      392 AACCCAAACACCCGAAAAGGGATCAAACTCAAGATAGTTTGTAATATTTTATTGCAAAAA 451

  1628839 GAAGGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTC 1628898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      452 GAAGGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTC 511

  1628899 TCCTGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTG 1628958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      512 TCCTGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTG 571

  1628959 CGGTTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGG 1629018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      572 CGGTTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGG 631

  1629019 CCATTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATA 1629078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      632 CCATTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATA 691

  1629079 ATTTAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAA 1629138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      692 ATTTAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAA 751

  1629139 ACTAATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTA 1629198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 ACTAATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTA 811

  1629199 GTAGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGA 1629258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      812 GTAGAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGA 871

  1629259 GACTCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATT 1629318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      872 GACTCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATT 931

  1629319 GATATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACC 1629378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 GATATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACC 991

  1629379 TTCCTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCAC 1629438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 TTCCTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCAC 1051

  1629439 GATGAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGA 1629498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 GATGAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGA 1111

  1629499 GCAGCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCT 1629558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 GCAGCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCT 1171

  1629559 GGAGTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCT 1629618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 GGAGTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCT 1231

  1629619 TCCCATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGT 1629678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 TCCCATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGT 1291

  1629679 TTTTGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGG 1629738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 TTTTGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGG 1351

  1629739 CTTCATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGG 1629798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 CTTCATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGG 1411

  1629799 ACAAGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGC 1629858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 ACAAGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGC 1471

  1629859 AGAGGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTGAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCAC 1629918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 AGAGGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTGAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCAC 1531

  1629919 CACAGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACT 1629978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 CACAGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACT 1591

  1629979 TCAGAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGG 1630038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 TCAGAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGG 1651

  1630039 CTATGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTC 1630098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 CTATGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTC 1711

  1630099 AGGGAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATGTGAATCATGTTGGCTG 1630158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 AGGGAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATGTGAATCATGTTGGCTG 1771

  1630159 AGGAGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCAT 1630218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 AGGAGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCAT 1831

  1630219 TACTGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATG 1630278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 TACTGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATG 1891

  1630279 TAATCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGA 1630338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 TAATCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGA 1951

  1630339 ACACACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAG 1630398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 ACACACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAG 2011

  1630399 CAGGCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATG 1630458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 CAGGCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATG 2071

  1630459 GGGCCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGT 1630518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 GGGCCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGT 2131

  1630519 CTCACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGG 1630578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 CTCACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGG 2191

  1630579 CCTCCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTA 1630638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 CCTCCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTA 2251

  1630639 TAGAGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGC 1630698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 TAGAGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGC 2311

  1630699 AGAGGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGAC 1630758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 AGAGGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGAC 2371

  1630759 CACAGTGAGAGGGTCCCGACACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATC 1630818
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 CACAGTGAGAGGGTCCCGATACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATC 2431

  1630819 TCAGGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTA 1630878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 TCAGGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTA 2491

  1630879 GATATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAA 1630938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 GATATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAA 2551

  1630939 GAGCTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAA 1630998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 GAGCTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAA 2611

  1630999 ATACAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATA 1631058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 ATACAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATA 2671

  1631059 ATGCTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGA 1631118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 ATGCTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGA 2731

  1631119 AACCATCATCACCATCATCAGGTAATGGAAAACCATCAAAGCTTTGAGCTGGCTTGTTAG 1631178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 AACCATCATCACCATCATCAGGTAATGGAAAACCATCAAAGCTTTGAGCTGGCTTGTTAG 2791

  1631179 CCAAGAATAGTAGCAGTGTATTAGCTACTACTAATACTCACAGCTGACAATTACTGACCA 1631238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 CCAAGAATAGTAGCAGTGTATTAGCTACTACTAATACTCACAGCTGACAATTACTGACCA 2851

  1631239 CTTGTTCCGTGCCAGGAATCACGGAAGCACCTCGCATGCATTTCCTCAATACTCCCTCCC 1631298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 CTTGTTCCGTGCCAGGAATCACGGAAGCACCTCGCATGCATTTCCTCAATACTCCCTCCC 2911

  1631299 AGTAACAGCAAGGACACAAAACTGGTAGAGCCAGGACTGGAATCCAGGCCGGCCCCAAAG 1631358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 AGTAACAGCAAGGACACAAAACTGGTAGAGCCAGGACTGGAATCCAGGCCGGCCCCAAAG 2971

  1631359 CACTCCAGTGGAGCCTGCCAAGGTGGGCAGGCTACCATACTAATGCGGTCCAGTATTTGA 1631418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 CACTCCAGTGGAGCCTGCCAAGGTGGGCAGGCTACCATACTAATGCGGTCCAGTATTTGA 3031

  1631419 CCACCACTCCTAGTTGAGCAAGTTTAACAGAAAACCTAAAACTAAACCTAAAATCTAAAA 1631478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 CCACCACTCCTAGTTGAGCAAGTTTAACAGAAAACCTAAAACTAAACCTAAAATCTAAAA 3091

  1631479 ATTTGAGCAAATGCATAAAAAGCAGGCTGTTAAAATGGATCATAAATCTTGCATCACTCG 1631538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 ATTTGAGCAAATGCATAAAAAGCAGGCTGTTAAAATGGATCATAAATCTTGCATCACTCG 3151

  1631539 CTGGAAAACCACTCAAAATAAACGTCTCTGAGACATGGCCTCTGAGGAGGGCACTCTGTG 1631598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 CTGGAAAACCACTCAAAATAAACGTCTCTGAGACATGGCCTCTGAGGAGGGCACTCTGTG 3211

  1631599 TGGCTCATATCACCTTGCTGACAAACCACTTGAACCTGGGTGGTCATCTGACCATACTGA 1631658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 TGGCTCATATCACCTTGCTGACAAACCACTTGAACCTGGGTGGTCATCTGACCATACTGA 3271

  1631659 ACAGACGATGCACAGAGCCATTTGCATCCACTGTGGTCAACATTTAGGAAGTTTTAAGCT 1631718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 ACAGACGATGCACAGAGCCATTTGCATCCACTGTGGTCAACATTTAGGAAGTTTTAAGCT 3331

  1631719 AAGATTTGCCAAATTGTAGCCTACTGGATTCCGGGTTCTCTTGACATCTCTTTCTAGTCG 1631778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 AAGATTTGCCAAATTGTAGCCTACTGGATTCCGGGTTCTCTTGACATCTCTTTCTAGTCG 3391

  1631779 CCATGTCTTGCACTTCCCGAGTATAAATGAACTGAGATGCAAATAAAAAAAGGAGGATTT 1631838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 CCATGTCTTGCACTTCCCGAGTATAAATGAACTGAGATGCAAATAAAAAAAGGAGGATTT 3451

  1631839 AAGAATAATGAAAAGAGAAAAATCAAGAAAGCACAATCACTAGTGTAGAGATAACAGCAT 1631898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3452 AAGAATAATGAAAAGAGAAAAATCAAGAAAGCACAATCACTAGTGTAGAGATAACAGCAT 3511

  1631899 TTCTGAATTCCCTGAAAACAATCTATATAAATGCATGTGAAATAATACACCAGCATCTGT 1631958
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3512 TTCTGAATTCCCTGAAAACAATCTATATAAATGTATGTGAAATAATACACCAGCATCTGT 3571

  1631959 GGCCCACACGCCACATATTAGGAACGGATGTCATAATATAAGGTAAACATGTTACTCTGA 1632018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 GGCCCACACGCCACATATTAGGAACGGATGTCATAATATAAGGTAAACATGTTACTCTGA 3631

  1632019 AAACACAAATCCTCACAAATCAGGCAGTAAGGCTGAATCCAGCACCCCCCCCACCCACAG 1632078
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3632 AAACACAAATCCTCACAAATCAGGCAGTAAGGCTGAATCCAGCACCCCCCCAACCCACAG 3691

  1632079 CGCAGTGAGGCAGTGTCTAGCAGCCGTAGTGCTCCCCGCGTCCCAGTTCAGTCTCCGGCA 1632138
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3692 CGCAGTGAGGCAGTGTCTAGCAGCCGTAGTGCTCCCCGCGTCCCAGTTCAGTCTCTGGCA 3751

  1632139 ACATCAGATACTTCCCACTAATAACGAGGAGCCTTTCAACATTTTCACAACATCTCAAAA 1632198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3752 ACATCAGATACTTCCCACTAATAACGAGGAGCCTTTCAACATTTTCACAACATCTCAAAA 3811

  1632199 CTGACCCCTTTTCTAGCTTAAATGGCACGGATCTGGAAAGGCAAACTATACACAGAATCT 1632258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3812 CTGACCCCTTTTCTAGCTTAAATGGCACGGATCTGGAAAGGCAAACTATACACAGAATCT 3871

  1632259 AAAGCAGTAGTCAGGTGTTCAATGAAGTAAAATGTATCCAATGATAGCTCAGGGGAGGGG 1632318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3872 AAAGCAGTAGTCAGGTGTTCAATGAAGTAAAATGTATCCAATGATAGCTCAGGGGAGGGG 3931

  1632319 GATCAATTGAGCTGAAACTGGCAAGAACGTAACTCCAGGGAGCTCACAACACGCAAGGAC 1632378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3932 GATCAATTGAGCTGAAACTGGCAAGAACGTAACTCCAGGGAGCTCACAACACGCAAGGAC 3991

  1632379 CCGGATTTCCCGCTGCCTGAACGCCCAGTATTCGCACACTGATAAGAACACCTCCCCATA 1632438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3992 CCGGATTTCCCGCTGCCTGAACGCCCAGTATTCGCACACTGATAAGAACACCTCCCCATA 4051

  1632439 ACTCCCCTGCCAGCGCCTCCAACACCCCCAATCCTTTCCCCAGGAACCCAGTCCCAGTTT 1632498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4052 ACTCCCCTGCCAGCGCCTCCAACACCCCCAATCCTTTCCCCAGGAACCCAGTCCCAGTTT 4111

  1632499 CTGCAGTTCCTGTAACAGCCACGTTCCCACACAAGGGCTGCCTGAGCTCCCCAAGCCCTC 1632558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4112 CTGCAGTTCCTGTAACAGCCACGTTCCCACACAAGGGCTGCCTGAGCTCCCCAAGCCCTC 4171

  1632559 CAACAATCACCCCCCAGTGCCCTCGAAGGTCTATTCAGAGAAGTCACCAAGATGCAGTCA 1632618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4172 CAACAATCACCCCCCAGTGCCCTCGAAGGTCTATTCAGAGAAGTCACCAAGATGCAGTCA 4231

  1632619 CCCAGGAAATTCAAGGACCTCCAACTTACCAAAAGGCTTTCGGCTGTACAGAGCTAAGCT 1632678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4232 CCCAGGAAATTCAAGGACCTCCAACTTACCAAAAGGCTTTCGGCTGTACAGAGCTAAGCT 4291

  1632679 TCCTATTCCCCTCCTAAACCTACAATCTAGTTTTCATTTCTCAAGAAGCCTTTCCCTGTG 1632738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4292 TCCTATTCCCCTCCTAAACCTACAATCTAGTTTTCATTTCTCAAGAAGCCTTTCCCTGTG 4351

  1632739 CTCACGCACGCAGTTGTTACCTGGCTCGGTGAGGCACTCCAAGCAGTAACAGCGGTAGCC 1632798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4352 CTCACGCACGCAGTTGTTACCTGGCTCGGTGAGGCACTCCAAGCAGTAACAGCGGTAGCC 4411

  1632799 ACAAAATAAACCAGAAGCATCTCCACCATGAAGCAGTATTAACAATTTGTCCTAATGATT 1632858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4412 ACAAAATAAACCAGAAGCATCTCCACCATGAAGCAGTATTAACAATTTGTCCTAATGATT 4471

  1632859 CCTTTGTCCTTGGAAAAACAACTTCAGAAAGTTATCCACTGTGAACAGGGCAGGCTCACG 1632918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4472 CCTTTGTCCTTGGAAAAACAACTTCAGAAAGTTATCCACTGTGAACAGGGCAGGCTCACG 4531

  1632919 GCTTCTTGGTCCGGAGACCCAGTTCCCACTGGCCCACTCACCGTTGGAGAGAGCTTGCTG 1632978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4532 GCTTCTTGGTCCGGAGACCCAGTTCCCACTGGCCCACTCACCGTTGGAGAGAGCTTGCTG 4591

  1632979 AAGCTCGGTGTCTGATATCACTCCACTCCTGTCTTTATCGACCCTATAACATCAAGAAGA 1633038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4592 AAGCTCGGTGTCTGATATCACTCCACTCCTGTCTTTATCGACCCTATAACATCAAGAAGA 4651

  1633039 CCAAATAAGCTGGCGATCGAAAGTTCAGGAAAAGCAAAACAAACGTCTCCTGTCAACCCT 1633098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4652 CCAAATAAGCTGGCGATCGAAAGTTCAGGAAAAGCAAAACAAACGTCTCCTGTCAACCCT 4711

  1633099 GCACCGACTCTGGAAGGCTCCCTCCTGGAACCTCCGCCTCTCCCGTCCCGCTGAGGAGTA 1633158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4712 GCACCGACTCTGGAAGGCTCCCTCCTGGAACCTCCGCCTCTCCCGTCCCGCTGAGGAGTA 4771

  1633159 CAGCGGAATCAAGGAAGTGCCCCAGGAGCCGACGTCCAGTGTGGTCTTCCCCTAAGAGGA 1633218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4772 CAGCGGAATCAAGGAAGTGCCCCAGGAGCCGACGTCCAGTGTGGTCTTCCCCTAAGAGGA 4831

  1633219 CAATCATCTTCACCTCAATCCTTCCCTTCCTTCCTCTCCTGGCCTGTCTGAATTCCCATT 1633278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4832 CAATCATCTTCACCTCAATCCTTCCCTTCCTTCCTCTCCTGGCCTGTCTGAATTCCCATT 4891

  1633279 TGCACCAGTTTCCCTTTTTCACAGACAAGAAAAGATTCCCTCAGATAACTAAGCCATTCC 1633338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4892 TGCACCAGTTTCCCTTTTTCACAGACAAGAAAAGATTCCCTCAGATAACTAAGCCATTCC 4951

  1633339 CTGGCCATCAGTCACTACAGTTTCGGACATTCGGTGGAAAAGCGACCAGGGACAGAAGGC 1633398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4952 CTGGCCATCAGTCACTACAGTTTCGGACATTCGGTGGAAAAGCGACCAGGGACAGAAGGC 5011

  1633399 GCCACCATAAAGGTCACCTGGCCCGAGCAGACGCCAGGTCGCTGCTTCTTCCTTGGCTGC 1633458
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5012 GCCGCCATAAAGGTCACCTGGCCCGAGCAGACGCCAGGTCGCTGCTTCTTCCTTGGCTGC 5071

  1633459 TGACATTTTAACAGCGG 1633475
          |||||||||||||||||
     5072 TGACATTTTAACAGCGG 5088

Alignment time is 3.87354 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   4979] =>      4979 nucs 'mol-32-30eb-165451_4979'

Score:        4838
Aligned:      5018        nucs
Identic:      4955 ( 99%) nucs =>      2659 ( 98%)      2296 (100%)
Gaps:           59 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1624433,1627139] EXCISED REGION [1628842,1631140]
 second seq =>  [      1,   2672] EXCISED REGION [   2681,   4979]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1702 nucs [1627140,1628841]
 second seq =>         8 nucs [2673,2680]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627139,1627139] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627140,1627140] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs

  1624433 CCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAA 1624492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAA 60

  1624493 TGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAGCTGCATGACCCTCAAATACAACATCA 1624552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAGCTGCATGACCCTCAAATACAACATCA 120

  1624553 GCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCGTCTCCGGG 1624612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCGTCTCCGGG 180

  1624613 TCTGCAGCTGCAAGAACCTAAAACTAGAACATCAGCTCCTCCCTGGATCTGCAGCTGGAA 1624672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTGCAGCTGCAAGAACCTAAAACTAGAACATCAGCTCCTCCCTGGATCTGCAGCTGGAA 240

  1624673 GATCCATTAAGTAGAATATCAGCTCCTGTCCGGGTCTCCAGCTCCATGACCCTCAATCAA 1624732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATCCATTAAGTAGAATATCAGCTCCTGTCCGGGTCTCCAGCTCCATGACCCTCAATCAA 300

  1624733 GATTATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAAGGCGAACAACATCAGCT 1624792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAAGGCGAACAACATCAGCT 360

  1624793 CCTCCCCGAGTCCTCAACTGCATGACCCTCAAACTACAACATCTCCTCCCCGAGTCTGCA 1624852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCTCCCCGAGTCCTCAACTGCATGACCCTCAAACTACAACATCTCCTCCCCGAGTCTGCA 420

  1624853 GCTGCATGCCCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCACGACCCT 1624912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTGCATGCCCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCACGACCCT 480

  1624913 CAATGTAGAACATCAGCTCCTCTTCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACAT 1624972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAATGTAGAACATCAGCTCCTCTTCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACAT 540

  1624973 CAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGGTCCTCTCCA 1625032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          
      541 CAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAG---------- 590

  1625033 GGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGC 1625092
                                               |||||||||||||||||||||||
      591 -------------------------------------CTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGC 613

  1625093 ACGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAGGGCCCTCAAGG 1625152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      614 ACGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAGGGCCCTCAAGG 673

  1625153 TGGAACATCAGCTCCTCCCCAAGCTAGAACACCTCTCCCACCTGGATCTCCAGCTCCACG 1625212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      674 TGGAACATCAGCTCCTCCCCAAGCTAGAACACCTCTCCCACCTGGATCTCCAGCTCCACG 733

  1625213 ACCCTCACAGAACAATCCCTTCTCATGAAATTCAGCAGTCAAGAAATCTGCAGCGGAAGT 1625272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      734 ACCCTCACAGAACAATCCCTTCTCATGAAATTCAGCAGTCAAGAAATCTGCAGCGGAAGT 793

  1625273 AAATGAATAAATGTTTTGTTTTCAAATCGATATCTCTTTTATGTTCGTGAGTTAACTTTT 1625332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      794 AAATGAATAAATGTTTTGTTTTCAAATCGATATCTCTTTTATGTTCGTGAGTTAACTTTT 853

  1625333 CTACTTTCCATTAGCCTTGCAATCTACTTATGTCCAATGTGAAATAGAAACACACCATTT 1625392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      854 CTACTTTCCATTAGCCTTGCAATCTACTTATGTCCAATGTGAAATAGAAACACACCATTT 913

  1625393 GAAATCACGTTTAAAATCTTAGTAATATTTTTAAATAAAATCATCACACAGCTGTAGACA 1625452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      914 GAAATCACGTTTAAAATCTTAGTAATATTTTTAAATAAAATCATCACACAGCTGTAGACA 973

  1625453 CGATCTTATTTCTCTCTGCCTGTGCAGAAATCTTATGAAAATTCGAACTATGAATTTACT 1625512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      974 CGATCTTATTTCTCTCTGCCTGTGCAGAAATCTTATGAAAATTCGAACTATGAATTTACT 1033

  1625513 TTGTTGAGATTCCCAGAATACACATTAATCCCAACTGTTACTCCCCTCCTTAAAATCTTT 1625572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1034 TTGTTGAGATTCCCAGAATACACATTAATCCCAACTGTTACTCCCCTCCTTAAAATCTTT 1093

  1625573 TAACATATTCCCATCACCTGAGCATAAATGCCAGCTCCCATCCACAGCCCAAAGTGCCCA 1625632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1094 TAACATATTCCCATCACCTGAGCATAAATGCCAGCTCCCATCCACAGCCCAAAGTGCCCA 1153

  1625633 GCACGGCCCTGCCCTCTGCCCTGGTCTATGGTCTCCCCTCTTAAATGCCAGCACCATCCA 1625692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1154 GCACGGCCCTGCCCTCTGCCCTGGTCTATGGTCTCCCCTCTTAAATGCCAGCACCATCCA 1213

  1625693 CAGCCCACAGTGCCCAGCACAGCCCTGCCCTCTGC------------TCTGGTCTAAGGT 1625740
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||.|||||||
     1214 CAGCCCACAGTGCCCAGCACAGCCCTGCCCTCTGCCCTGCCCTCTGCTCTGGCCTAAGGT 1273

  1625741 CTCTCCCCTGTGCTGTTCCCTTCCTGCCGGGCAGGCCTCTGTCCGTTCCTCAAACCACAC 1625800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1274 CTCTCCCCTGTGCTGTTCCCTTCCTGCCGGGCAGGCCTCTGTCCGTTCCTCAAACCACAC 1333

  1625801 AGGCTCAGGCCTGACTCCAGGCCTTTGCCCTGCTGTGCCCTCTGCCTAGGGTGCCTTTCC 1625860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1334 AGGCTCAGGCCTGACTCCAGGCCTTTGCCCTGCTGTGCCCTCTGCCTAGGGTGCCTTTCC 1393

  1625861 CGGGCTCTGCATCCTCCTCTCAACCCGCTGAGCTCCAGCCTGCTGGTCGCCCCTCAGGTG 1625920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 CGGGCTCTGCATCCTCCTCTCAACCCGCTGAGCTCCAGCCTGCTGGTCGCCCCTCAGGTG 1453

  1625921 GATGAACACATGGTGTCCTCTCGCCCCGCTGGCTTTTGCACAGGCTCTTCTCTGTGCCAG 1625980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 GATGAACACATGGTGTCCTCTCGCCCCGCTGGCTTTTGCACAGGCTCTTCTCTGTGCCAG 1513

  1625981 ACACAAACCCTCTCTATCGGGGTTTACTCTCTAAATACCATTCGTCCTTGGAGTCTCCAC 1626040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 ACACAAACCCTCTCTATCGGGGTTTACTCTCTAAATACCATTCGTCCTTGGAGTCTCCAC 1573

  1626041 TGAAATATCGCTCCCTGCCCACCCCCCTCCCTTGGACTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAAC 1626100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 TGAAATATCGCTCCCTGCCCACCCCCCTCCCTTGGACTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAAC 1633

  1626101 CCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTCCTAGCACTCGGAACTTGCCCATCGC 1626160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 CCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTCCTAGCACTCGGAACTTGCCCATCGC 1693

  1626161 CACATTTGCACACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTGGTGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGC 1626220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 CACATTTGCACACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTGGTGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGC 1753

  1626221 CATTACTATTAATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCCCCGTTTTTTTTTTTTTGCCATTACT 1626280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 CATTACTATTAATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCCCCGTTTTTTTTTTTTTGCCATTACT 1813

  1626281 TTTAATGACTGCTGCACCAACCTATTAGAATCATTTATATTTATTCATCCATCATCTGCC 1626340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 TTTAATGACTGCTGCACCAACCTATTAGAATCATTTATATTTATTCATCCATCATCTGCC 1873

  1626341 TTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAAGCCAAATCTACTCAAATCACTCCAC 1626400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 TTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAAGCCAAATCTACTCAAATCACTCCAC 1933

  1626401 CTTCCCACACATTGTCAATAATCATTTACCAACTGACTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGT 1626460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 CTTCCCACACATTGTCAATAATCATTTACCAACTGACTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGT 1993

  1626461 TGCTGGGATGAGGCACATGACACGCCCCTTTGAAAGTCACTGTCATGGACAGTTGGCATT 1626520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 TGCTGGGATGAGGCACATGACACGCCCCTTTGAAAGTCACTGTCATGGACAGTTGGCATT 2053

  1626521 CGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGTTTAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGA 1626580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 CGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGTTTAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGA 2113

  1626581 CTCCAGGCTGAGGATGGGAACCATGCCTGCTCCACATGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGC 1626640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 CTCCAGGCTGAGGATGGGAACCATGCCTGCTCCACATGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGC 2173

  1626641 CGCCGTTCCCTGGGGCACGCACATCTCGTGGGGAAAATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCC 1626700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 CGCCGTTCCCTGGGGCACGCACATCTCGTGGGGAAAATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCC 2233

  1626701 TGGCAGCGCCACACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGCCGTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCA 1626760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 TGGCAGCGCCACACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGCCGTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCA 2293

  1626761 GAAGCAAGTCACCCAGCCACGAGCCACACCTATGGGATGGATAAGTCCATCCACCCTCCC 1626820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 GAAGCAAGTCACCCAGCCACGAGCCACACCTATGGGATGGATAAGTCCATCCACCCTCCC 2353

  1626821 TCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCTATGTCATACTCTTATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGG 1626880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 TCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCTATGTCATACTCTTATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGG 2413

  1626881 CCCAACATTAAATCACCCACGCAAGAAATGTCAGCCTCTGTCCCCACGCTGGAATCATTC 1626940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 CCCAACATTAAATCACCCACGCAAGAAATGTCAGCCTCTGTCCCCACGCTGGAATCATTC 2473

  1626941 TTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAATGGTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGC 1627000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 TTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAATGGTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGC 2533

  1627001 TGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGAT 1627060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 TGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGAT 2593

  1627061 ATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGGGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGA 1627120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 ATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGGGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGA 2653

  1627121 GGGGCAGAGAACTGTGAGA 1627139
          |||||||||||||||||||
     2654 GGGGCAGAGAACTGTGAGA 2672

EXCISED REGION

  1628842 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 1628901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 2740

  1628902 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 1628961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 2800

  1628962 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 1629021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 2860

  1629022 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 1629081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 2920

  1629082 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 1629141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 2980

  1629142 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 1629201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 3040

  1629202 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 1629261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 3100

  1629262 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 1629321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 3160

  1629322 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 1629381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 3220

  1629382 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 1629441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 3280

  1629442 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 1629501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 3340

  1629502 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 1629561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 3400

  1629562 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 1629621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 3460

  1629622 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 1629681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 3520

  1629682 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 1629741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 3580

  1629742 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 1629801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 3640

  1629802 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 1629861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 3700

  1629862 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTGAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 1629921
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTAAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 3760

  1629922 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 1629981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 3820

  1629982 GAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTA 1630041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 GAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTA 3880

  1630042 TGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGG 1630101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 TGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGG 3940

  1630102 GAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATGTGAATCATGTTGGCTGAGG 1630161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3941 GAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATATGAATCATGTTGGCTGAGG 4000

  1630162 AGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTAC 1630221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 AGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTAC 4060

  1630222 TGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAA 1630281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 TGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAA 4120

  1630282 TCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACA 1630341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 TCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACA 4180

  1630342 CACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAG 1630401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 CACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAG 4240

  1630402 GCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGG 1630461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 GCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGG 4300

  1630462 CCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTC 1630521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 CCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTC 4360

  1630522 ACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCT 1630581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 ACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCT 4420

  1630582 CCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAG 1630641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 CCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAG 4480

  1630642 AGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGA 1630701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 AGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGA 4540

  1630702 GGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCAC 1630761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 GGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCAC 4600

  1630762 AGTGAGAGGGTCCCGACACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCA 1630821
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 AGTGAGAGGGTCCCGATACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCA 4660

  1630822 GGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGAT 1630881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 GGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGAT 4720

  1630882 ATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAG 1630941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 ATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAG 4780

  1630942 CTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATA 1631001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 CTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATA 4840

  1631002 CAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATAATG 1631061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 CAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATAATG 4900

  1631062 CTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGAAAC 1631121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 CTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGAAAC 4960

  1631122 CATCATCACCATCATCAGG 1631140
          |||||||||||||||||||
     4961 CATCATCACCATCATCAGG 4979

Alignment time is 3.82309 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   2299] =>      2299 nucs 'mol-32-30eb-165451_2299'

Score:        2276
Aligned:      2298        nucs
Identic:      2296 (100%) nucs =>      1049 (100%)      1247 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1628842,1629890] EXCISED REGION [1629892,1631140]
 second seq =>  [      1,   1049] EXCISED REGION [   1051,   2299]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [1629891,1629891]
 second seq =>         1 nucs [1050,1050]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1050,1051] to [1051,1052]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  1628842 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 1628901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 60

  1628902 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 1628961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 120

  1628962 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 1629021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 180

  1629022 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 1629081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 240

  1629082 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 1629141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 300

  1629142 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 1629201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 360

  1629202 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 1629261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 420

  1629262 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 1629321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 480

  1629322 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 1629381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 540

  1629382 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 1629441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 600

  1629442 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 1629501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 660

  1629502 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 1629561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 720

  1629562 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 1629621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 780

  1629622 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 1629681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 840

  1629682 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 1629741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 900

  1629742 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 1629801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 960

  1629802 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 1629861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 1020

  1629862 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGT 1629890
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGT 1049

EXCISED REGION

  1629892 AATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCACAGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAAT 1629951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1051 AATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCACAGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAAT 1110

  1629952 CAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCAGAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGC 1630011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1111 CAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCAGAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGC 1170

  1630012 ACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTATGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAA 1630071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1171 ACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTATGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAA 1230

  1630072 CAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGGGAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAA 1630131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1231 CAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGGGAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAA 1290

  1630132 TAAAGTAAATGTGAATCATGTTGGCTGAGGAGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATA 1630191
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1291 TAAAGTAAATATGAATCATGTTGGCTGAGGAGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATA 1350

  1630192 AAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTACTGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTT 1630251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 AAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTACTGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTT 1410

  1630252 CTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAATCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAA 1630311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 CTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAATCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAA 1470

  1630312 AGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACACACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGG 1630371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1471 AGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACACACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGG 1530

  1630372 TGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAGGCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCA 1630431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 TGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAGGCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCA 1590

  1630432 GGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGGCCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAAT 1630491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 GGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGGCCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAAT 1650

  1630492 CTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTCACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCC 1630551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 CTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTCACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCC 1710

  1630552 TGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCC 1630611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 TGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCC 1770

  1630612 ACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAGAGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTG 1630671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 ACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAGAGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTG 1830

  1630672 GAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGAGGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGC 1630731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 GAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGAGGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGC 1890

  1630732 GCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCACAGTGAGAGGGTCCCGACACACAGCTTGGGT 1630791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1891 GCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCACAGTGAGAGGGTCCCGATACACAGCTTGGGT 1950

  1630792 TAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCAGGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAA 1630851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 TAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCAGGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAA 2010

  1630852 TTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGATATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGT 1630911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 TTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGATATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGT 2070

  1630912 TCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAGCTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTG 1630971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 TCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAGCTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTG 2130

  1630972 GGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATACAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGG 1631031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 GGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATACAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGG 2190

  1631032 AGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATAATGCTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGC 1631091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 AGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATAATGCTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGC 2250

  1631092 CCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGAAACCATCATCACCATCATCAGG 1631140
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 CCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGAAACCATCATCACCATCATCAGG 2299

Alignment time is 1.79479 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   7008] =>      7008 nucs 'mol-32-316f-233227_7008'

Score:        6807
Aligned:      7048        nucs
Identic:      6977 ( 99%) nucs =>      2922 ( 98%)      4055 (100%)
Gaps:           63 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1624169,1627139] EXCISED REGION [1628842,1632903]
 second seq =>  [      1,   2936] EXCISED REGION [   2945,   7008]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1702 nucs [1627140,1628841]
 second seq =>         8 nucs [2937,2944]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627139,1627139] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627140,1627140] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs

  1624169 TACCAGCTCTTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAACGTGAACAACATCACCTCCT 1624228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACCAGCTCTTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAACGTGAACAACATCACCTCCT 60

  1624229 CCCCGAGTCCTCAACTGCACGACCCTCAAACTACAACATCTCCTCCTCCCCGAGTCTGCA 1624288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCCGAGTCCTCAACTGCACGACCCTCAAACTACAACATCTCCTCCTCCCCGAGTCTGCA 120

  1624289 GCTGCACGACCATCAATCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTATAAGAACCT 1624348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTGCACGACCATCAATCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTATAAGAACCT 180

  1624349 AACCGTAGAAGATCAGCTCCTCCGTGGGTCTGCAGCTGGAAGATCCACTAACTAGAACAT 1624408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACCGTAGAAGATCAGCTCCTCCGTGGGTCTGCAGCTGGAAGATCCACTAACTAGAACAT 240

  1624409 CGGCTCCTGTCCAGGTCTCCAGCTCCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTG 1624468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGGCTCCTGTCCAGGTCTCCAGCTCCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTG 300

  1624469 AGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAATGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAGCT 1624528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAATGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAGCT 360

  1624529 GCATGACCCTCAAATACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCAAT 1624588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATGACCCTCAAATACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCAAT 420

  1624589 CTAGAACATCAGCTCGTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAAGAACCTAAAACTAGAACATCAGC 1624648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTAGAACATCAGCTCGTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAAGAACCTAAAACTAGAACATCAGC 480

  1624649 TCCTCCCTGGATCTGCAGCTGGAAGATCCATTAAGTAGAATATCAGCTCCTGTCCGGGTC 1624708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTCCCTGGATCTGCAGCTGGAAGATCCATTAAGTAGAATATCAGCTCCTGTCCGGGTC 540

  1624709 TCCAGCTCCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGA 1624768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCAGCTCCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGA 600

  1624769 CCCTCAAGGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAACTGCATGACCCTCAAACTA 1624828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCTCAAGGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAACTGCATGACCCTCAAACTA 660

  1624829 CAACATCTCCTCCCCGAGTCTGCAGCTGCATGCCCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCT 1624888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAACATCTCCTCCCCGAGTCTGCAGCTGCATGCCCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCT 720

  1624889 CCAGGTCTGCAGCTGCACGACCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCTTCAGGTCTGCAGC 1624948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAGGTCTGCAGCTGCACGACCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCTTCAGGTCTGCAGC 780

  1624949 TGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCA 1625008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCA 840

  1625009 AACTAGAACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCA 1625068
          ||||||||||||||                                              
      841 AACTAGAACATCAG---------------------------------------------- 854

  1625069 GCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGG 1625128
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 -CTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGG 913

  1625129 TCTGCAGCTGCAGGGCCCTCAAGGTGGAACATCAGCTCCTCCCCAAGCTAGAACACCTCT 1625188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      914 TCTGCAGCTGCAGGGCCCTCAAGGTGGAACATCAGCTCCTCCCCAAGCTAGAACACCTCT 973

  1625189 CCCACCTGGATCTCCAGCTCCACGACCCTCACAGAACAATCCCTTCTCATGAAATTCAGC 1625248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      974 CCCACCTGGATCTCCAGCTCCACGACCCTCACAGAACAATCCCTTCTCATGAAATTCAGC 1033

  1625249 AGTCAAGAAATCTGCAGCGGAAGTAAATGAATAAATGTTTTGTTTTCAAATCGATATCTC 1625308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1034 AGTCAAGAAATCTGCAGCGGAAGTAAATGAATAAATGTTTTGTTTTCAAATCGATATCTC 1093

  1625309 TTTTATGTTCGTGAGTTAACTTTTCTACTTTCCATTAGCCTTGCAATCTACTTATGTCCA 1625368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1094 TTTTATGTTCGTGAGTTAACTTTTCTACTTTCCATTAGCCTTGCAATCTACTTATGTCCA 1153

  1625369 ATGTGAAATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTTTAAAATCTTAGTAATATTTTTAAAT 1625428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1154 ATGTGAAATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTTTAAAATCTTAGTAATATTTTTAAAT 1213

  1625429 AAAATCATCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTTCTCTCTGCCTGTGCAGAAATCTTAT 1625488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1214 AAAATCATCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTTCTCTCTGCCTGTGCAGAAATCTTAT 1273

  1625489 GAAAATTCGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATTCCCAGAATACACATTAATCCCAACT 1625548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1274 GAAAATTCGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATTCCCAGAATACACATTAATCCCAACT 1333

  1625549 GTTACTCCCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCCCATCACCTGAGCATAAATGCCAGCT 1625608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1334 GTTACTCCCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCCCATCACCTGAGCATAAATGCCAGCT 1393

  1625609 CCCATCCACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTGCCCTCTGCCCTGGTCTATGGTCTCC 1625668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 CCCATCCACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTGCCCTCTGCCCTGGTCTATGGTCTCC 1453

  1625669 CCTCTTAAATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGTGCCCAGCACAGCCCTGCCCTCTGC- 1625727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
     1454 CCTCTTAAATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGTGCCCAGCACAGCCCTGCCCTCTGCC 1513

  1625728 -----------TCTGGTCTAAGGTCTCTCCCCTGTGCTGTTCCCTTCCTGCCGGGCAGGC 1625776
                     |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 CTGCCCTCTGCTCTGGCCTAAGGTCTCTCCCCTGTGCTGTTCCCTTCCTGCCGGGCAGGC 1573

  1625777 CTCTGTCCGTTCCTCAAACCACACAGGCTCAGGCCTGACTCCAGGCCTTTGCCCTGCTGT 1625836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 CTCTGTCCGTTCCTCAAACCACACAGGCTCAGGCCTGACTCCAGGCCTTTGCCCTGCTGT 1633

  1625837 GCCCTCTGCCTAGGGTGCCTTTCCCGGGCTCTGCATCCTCCTCTCAACCCGCTGAGCTCC 1625896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 GCCCTCTGCCTAGGGTGCCTTTCCCGGGCTCTGCATCCTCCTCTCAACCCGCTGAGCTCC 1693

  1625897 AGCCTGCTGGTCGCCCCTCAGGTGGATGAACACATGGTGTCCTCTCGCCCCGCTGGCTTT 1625956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 AGCCTGCTGGTCGCCCCTCAGGTGGATGAACACATGGTGTCCTCTCGCCCCGCTGGCTTT 1753

  1625957 TGCACAGGCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCTCTCTATCGGGGTTTACTCTCTAAAT 1626016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 TGCACAGGCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCTCTCTATCGGGGTTTACTCTCTAAAT 1813

  1626017 ACCATTCGTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGCTCCCTGCCCACCCCCCTCCCTTGGA 1626076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 ACCATTCGTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGCTCCCTGCCCACCCCCCTCCCTTGGA 1873

  1626077 CTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTCC 1626136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 CTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTCC 1933

  1626137 TAGCACTCGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTGG 1626196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 TAGCACTCGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTGG 1993

  1626197 TGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCCC 1626256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 TGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCCC 2053

  1626257 CGTTTTTTTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACCTATTAGAATCATTT 1626316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 CGTTTTTTTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACCTATTAGAATCATTT 2113

  1626317 ATATTTATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAAG 1626376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 ATATTTATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAAG 2173

  1626377 CCAAATCTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAATCATTTACCAACTGA 1626436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 CCAAATCTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAATCATTTACCAACTGA 2233

  1626437 CTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACACGCCCCTTTGAAAG 1626496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 CTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACACGCCCCTTTGAAAG 2293

  1626497 TCACTGTCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGTT 1626556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 TCACTGTCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGTT 2353

  1626557 TAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTGAGGATGGGAACCATGCCTGCTCCACA 1626616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 TAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTGAGGATGGGAACCATGCCTGCTCCACA 2413

  1626617 TGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCACATCTCGTGGGGAAA 1626676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 TGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCACATCTCGTGGGGAAA 2473

  1626677 ATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGCC 1626736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 ATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGCC 2533

  1626737 GTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCACCCAGCCACGAGCCACACCTATGGG 1626796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2534 GTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCCCCCAGCCACGAGCCACACCTATGGG 2593

  1626797 ATGGATAAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCTATGTCATACTCT 1626856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 ATGGATAAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCTATGTCATACTCT 2653

  1626857 TATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGCAAGAAATGTCAGCC 1626916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2654 TATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGCAAGAAATGTCAGCC 2713

  1626917 TCTGTCCCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAATG 1626976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 TCTGTCCCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAATG 2773

  1626977 GTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCC 1627036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2774 GTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCC 2833

  1627037 TCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGG 1627096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 TCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGG 2893

  1627097 GCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 1627139
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2894 GCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 2936

EXCISED REGION

  1628842 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 1628901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 3004

  1628902 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 1628961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 3064

  1628962 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 1629021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 3124

  1629022 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 1629081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 3184

  1629082 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 1629141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 3244

  1629142 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 1629201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 3304

  1629202 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 1629261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3305 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 3364

  1629262 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 1629321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 3424

  1629322 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 1629381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 3484

  1629382 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 1629441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3485 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 3544

  1629442 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 1629501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 3604

  1629502 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 1629561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 3664

  1629562 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 1629621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 3724

  1629622 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 1629681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 3784

  1629682 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 1629741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 3844

  1629742 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 1629801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3845 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 3904

  1629802 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 1629861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 3964

  1629862 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTGAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 1629921
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTAAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 4024

  1629922 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 1629981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 4084

  1629982 GAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTA 1630041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 GAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTA 4144

  1630042 TGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGG 1630101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 TGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGG 4204

  1630102 GAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATGTGAATCATGTTGGCTGAGG 1630161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     4205 GAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATATGAATCATGTTGGCTGAGG 4264

  1630162 AGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTAC 1630221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 AGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTAC 4324

  1630222 TGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAA 1630281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 TGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAA 4384

  1630282 TCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACA 1630341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 TCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACA 4444

  1630342 CACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAG 1630401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 CACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAG 4504

  1630402 GCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGG 1630461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 GCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGG 4564

  1630462 CCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTC 1630521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 CCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTC 4624

  1630522 ACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCT 1630581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 ACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCT 4684

  1630582 CCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAG 1630641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4685 CCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAG 4744

  1630642 AGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGA 1630701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 AGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGA 4804

  1630702 GGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCAC 1630761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4805 GGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCAC 4864

  1630762 AGTGAGAGGGTCCCGACACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCA 1630821
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4865 AGTGAGAGGGTCCCGATACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCA 4924

  1630822 GGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGAT 1630881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 GGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGAT 4984

  1630882 ATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAG 1630941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4985 ATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAG 5044

  1630942 CTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATA 1631001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5045 CTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATA 5104

  1631002 CAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATAATG 1631061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 CAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATAATG 5164

  1631062 CTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGAAAC 1631121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5165 CTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGAAAC 5224

  1631122 CATCATCACCATCATCAGGTAATGGAAAACCATCAAAGCTTTGAGCTGGCTTGTTAGCCA 1631181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5225 CATCATCACCATCATCAGGTAATGGAAAACCATCAAAGCTTTGAGCTGGCTTGTTAGCCA 5284

  1631182 AGAATAGTAGCAGTGTATTAGCTACTACTAATACTCACAGCTGACAATTACTGACCACTT 1631241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5285 AGAATAGTAGCAGTGTATTAGCTACTACTAATACTCACAGCTGACAATTACTGACCACTT 5344

  1631242 GTTCCGTGCCAGGAATCACGGAAGCACCTCGCATGCATTTCCTCAATACTCCCTCCCAGT 1631301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5345 GTTCCGTGCCAGGAATCACGGAAGCACCTCGCATGCATTTCCTCAATACTCCCTCCCAGT 5404

  1631302 AACAGCAAGGACACAAAACTGGTAGAGCCAGGACTGGAATCCAGGCCGGCCCCAAAGCAC 1631361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5405 AACAGCAAGGACACAAAACTGGTAGAGCCAGGACTGGAATCCAGGCCGGCCCCAAAGCAC 5464

  1631362 TCCAGTGGAGCCTGCCAAGGTGGGCAGGCTACCATACTAATGCGGTCCAGTATTTGACCA 1631421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5465 TCCAGTGGAGCCTGCCAAGGTGGGCAGGCTACCATACTAATGCGGTCCAGTATTTGACCA 5524

  1631422 CCACTCCTAGTTGAGCAAGTTTAACAGAAAACCTAAAACTAAACCTAAAATCTAAAAATT 1631481
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     5525 CCACTCCTAGTTGAGCAAGTTTAACAGAAAACCAAAAACTAAACCTAAAATCTAAAAATT 5584

  1631482 TGAGCAAATGCATAAAAAGCAGGCTGTTAAAATGGATCATAAATCTTGCATCACTCGCTG 1631541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5585 TGAGCAAATGCATAAAAAGCAGGCTGTTAAAATGGATCATAAATCTTGCATCACTCGCTG 5644

  1631542 GAAAACCACTCAAAATAAACGTCTCTGAGACATGGCCTCTGAGGAGGGCACTCTGTGTGG 1631601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5645 GAAAACCACTCAAAATAAACGTCTCTGAGACATGGCCTCTGAGGAGGGCACTCTGTGTGG 5704

  1631602 CTCATATCACCTTGCTGACAAACCACTTGAACCTGGGTGGTCATCTGACCATACTGAACA 1631661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5705 CTCATATCACCTTGCTGACAAACCACTTGAACCTGGGTGGTCATCTGACCATACTGAACA 5764

  1631662 GACGATGCACAGAGCCATTTGCATCCACTGTGGTCAACATTTAGGAAGTTTTAAGCTAAG 1631721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5765 GACGATGCACAGAGCCATTTGCATCCACTGTGGTCAACATTTAGGAAGTTTTAAGCTAAG 5824

  1631722 ATTTGCCAAATTGTAGCCTACTGGATTCCGGGTTCTCTTGACATCTCTTTCTAGTCGCCA 1631781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5825 ATTTGCCAAATTGTAGCCTACTGGATTCCGGGTTCTCTTGACATCTCTTTCTAGTCGCCA 5884

  1631782 TGTCTTGCACTTCCCGAGTATAAATGAACTGAGATGCAAATAAAAAAAGGAGGATTTAAG 1631841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5885 TGTCTTGCACTTCCCGAGTATAAATGAACTGAGATGCAAATAAAAAAAGGAGGATTTAAG 5944

  1631842 AATAATGAAAAGAGAAAAATCAAGAAAGCACAATCACTAGTGTAGAGATAACAGCATTTC 1631901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5945 AATAATGAAAAGAGAAAAATCAAGAAAGCACAATCACTAGTGTAGAGATAACAGCATTTC 6004

  1631902 TGAATTCCCTGAAAACAATCTATATAAATGCATGTGAAATAATACACCAGCATCTGTGGC 1631961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6005 TGAATTCCCTGAAAACAATCTATATAAATGCATGTGAAATAATACACCAGCATCTGTGGC 6064

  1631962 CCACACGCCACATATTAGGAACGGATGTCATAATATAAGGTAAACATGTTACTCTGAAAA 1632021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6065 CCACACGCCACATATTAGGAACGGATGTCATAATATAAGGTAAACATGTTACTCTGAAAA 6124

  1632022 CACAAATCCTCACAAATCAGGCAGTAAGGCTGAATCCAGCA---CCCCCCCCACCCACAG 1632078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||
     6125 CACAAATCCTCACAAATCAGGCAGTAAGGCTGAATCCAGC-CCCCCCCCCCCACCCACAG 6183

  1632079 CGCAGTGAGGCAGTGTCTAGCAGCCGTAGTGCTCCCCGCGTCCCAGTTCAGTCTCCGGCA 1632138
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     6184 CGCAGTGAGGCAGTGTCTAGCAGCCGTAGTGCTCCCCGCGTCCCAGTTCAGTCTCTGGCA 6243

  1632139 ACATCAGATACTTCCCACTAATAACGAGGAGCCTTTCAACATTTTCACAACATCTCAAAA 1632198
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6244 ACATCAGATACTTCCCACTAATAACGAGGAGCCTTTCAACATTTTCAAAACATCTCAAAA 6303

  1632199 CTGACCCCTTTTCTAGCTTAAATGGCACGGATCTGGAAAGGCAAACTATACACAGAATCT 1632258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6304 CTGACCCCTTTTCTAGCTTAAATGGCACGGATCTGGAAAGGCAAACTATACACAGAATCT 6363

  1632259 AAAGCAGTAGTCAGGTGTTCAATGAAGTAAAATGTATCCAATGATAGCTCAGGGGAGGGG 1632318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6364 AAAGCAGTAGTCAGGTGTTCAATGAAGTAAAATGTATCCAATGATAGCTCAGGGGAGGGG 6423

  1632319 GATCAATTGAGCTGAAACTGGCAAGAACGTAACTCCAGGGAGCTCACAACACGCAAGGAC 1632378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6424 GATCAATTGAGCTGAAACTGGCAAGAACGTAACTCCAGGGAGCTCACAACACGCAAGGAC 6483

  1632379 CCGGATTTCCCGCTGCCTGAACGCCCAGTATTCGCACACTGATAAGAACACCTCCCCATA 1632438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6484 CCGGATTTCCCGCTGCCTGAACGCCCAGTATTCGCACACTGATAAGAACACCTCCCCATA 6543

  1632439 ACTCCCCTGCCAGCGCCTCCAACACCCCCAATCCTTTCCCCAGGAACCCAGTCCCAGTTT 1632498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6544 ACTCCCCTGCCAGCGCCTCCAACACCCCCAATCCTTTCCCCAGGAACCCAGTCCCAGTTT 6603

  1632499 CTGCAGTTCCTGTAACAGCCACGTTCCCACACAAGGGCTGCCTGAGCTCCCCAAGCCCTC 1632558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6604 CTGCAGTTCCTGTAACAGCCACGTTCCCACACAAGGGCTGCCTGAGCTCCCCAAGCCCTC 6663

  1632559 CAACAATCACCCCCCAGTGCCCTCGAAGGTCTATTCAGAGAAGTCACCAAGATGCAGTCA 1632618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6664 CAACAATCACCCCCCAGTGCCCTCGAAGGTCTATTCAGAGAAGTCACCAAGATGCAGTCA 6723

  1632619 CCCAGGAAATTCAAGGACCTCCAACTTACCAAAAGGCTTTCGGCTGTACAGAGCTAAGCT 1632678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6724 CCCAGGAAATTCAAGGACCTCCAACTTACCAAAAGGCTTTCGGCTGTACAGAGCTAAGCT 6783

  1632679 TCCTATTCCCCTCCTAAACCTACAATCTAGTTTTCATTTCTCAAGAAGCCTTTCCCTGTG 1632738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6784 TCCTATTCCCCTCCTAAACCTACAATCTAGTTTTCATTTCTCAAGAAGCCTTTCCCTGTG 6843

  1632739 CTCACGCACGCAGTTGTTACCTGGCTCGGTGAGGCACTCCAAGCAGTAACAGCGGTAGCC 1632798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6844 CTCACGCACGCAGTTGTTACCTGGCTCGGTGAGGCACTCCAAGCAGTAACAGCGGTAGCC 6903

  1632799 ACAAAATAAACCAGAAGCATCTCCACCATGAAGCAGTATTAACAATTTGTCCTAATGATT 1632858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6904 ACAAAATAAACCAGAAGCATCTCCACCATGAAGCAGTATTAACAATTTGTCCTAATGATT 6963

  1632859 CCTTTGTCCTTGGAAAAACAACTTCAGAAAGTTATCCACTGTGAA 1632903
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6964 CCTTTGTCCTTGGAAAAACAACTTCAGAAAGTTATCCACTGTGAA 7008

Alignment time is 5.30501 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   2936] =>      2936 nucs 'mol-32-316f-233227_2936'

Score:        2881
Aligned:      2936        nucs
Identic:      2922 (100%) nucs =>       768 (100%)      2154 ( 99%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1624169,1624936] EXCISED REGION [1624984,1627139]
 second seq =>  [      1,    768] EXCISED REGION [    769,   2936]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        47 nucs [1624937,1624983]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        86 nucs [1624937,1625022] to [1624984,1625069]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1624937,1624937] to [1624983,1624983]
 second seq =>         0 nucs

  1624169 TACCAGCTCTTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAACGTGAACAACATCACCTCCT 1624228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACCAGCTCTTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAACGTGAACAACATCACCTCCT 60

  1624229 CCCCGAGTCCTCAACTGCACGACCCTCAAACTACAACATCTCCTCCTCCCCGAGTCTGCA 1624288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCCGAGTCCTCAACTGCACGACCCTCAAACTACAACATCTCCTCCTCCCCGAGTCTGCA 120

  1624289 GCTGCACGACCATCAATCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTATAAGAACCT 1624348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTGCACGACCATCAATCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTATAAGAACCT 180

  1624349 AACCGTAGAAGATCAGCTCCTCCGTGGGTCTGCAGCTGGAAGATCCACTAACTAGAACAT 1624408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACCGTAGAAGATCAGCTCCTCCGTGGGTCTGCAGCTGGAAGATCCACTAACTAGAACAT 240

  1624409 CGGCTCCTGTCCAGGTCTCCAGCTCCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTG 1624468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGGCTCCTGTCCAGGTCTCCAGCTCCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTG 300

  1624469 AGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAATGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAGCT 1624528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTCTCCAGCTGAAAGACCCTCAATGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAGCT 360

  1624529 GCATGACCCTCAAATACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCAAT 1624588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCATGACCCTCAAATACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCTTCAGCTGCACGACCCTCAAT 420

  1624589 CTAGAACATCAGCTCGTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAAGAACCTAAAACTAGAACATCAGC 1624648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTAGAACATCAGCTCGTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAAGAACCTAAAACTAGAACATCAGC 480

  1624649 TCCTCCCTGGATCTGCAGCTGGAAGATCCATTAAGTAGAATATCAGCTCCTGTCCGGGTC 1624708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTCCCTGGATCTGCAGCTGGAAGATCCATTAAGTAGAATATCAGCTCCTGTCCGGGTC 540

  1624709 TCCAGCTCCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGA 1624768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCAGCTCCATGACCCTCAATCAAGATTATCAGCTCCTCCCTGAGTCTCCAGCTGAAAGA 600

  1624769 CCCTCAAGGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAACTGCATGACCCTCAAACTA 1624828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCTCAAGGCGAACAACATCAGCTCCTCCCCGAGTCCTCAACTGCATGACCCTCAAACTA 660

  1624829 CAACATCTCCTCCCCGAGTCTGCAGCTGCATGCCCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCT 1624888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAACATCTCCTCCCCGAGTCTGCAGCTGCATGCCCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCT 720

  1624889 CCAGGTCTGCAGCTGCACGACCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCTT 1624936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCAGGTCTGCAGCTGCACGACCCTCAATGTAGAACATCAGCTCCTCTT 768

EXCISED REGION

  1624984 CAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCT 1625043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 CAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCT 828

  1625044 GCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAA 1625103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 GCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAA 888

  1625104 TCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAGGGCCCTCAAGGTGGAACATCAG 1625163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 TCTAGAACATCAGCTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAGGGCCCTCAAGGTGGAACATCAG 948

  1625164 CTCCTCCCCAAGCTAGAACACCTCTCCCACCTGGATCTCCAGCTCCACGACCCTCACAGA 1625223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 CTCCTCCCCAAGCTAGAACACCTCTCCCACCTGGATCTCCAGCTCCACGACCCTCACAGA 1008

  1625224 ACAATCCCTTCTCATGAAATTCAGCAGTCAAGAAATCTGCAGCGGAAGTAAATGAATAAA 1625283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 ACAATCCCTTCTCATGAAATTCAGCAGTCAAGAAATCTGCAGCGGAAGTAAATGAATAAA 1068

  1625284 TGTTTTGTTTTCAAATCGATATCTCTTTTATGTTCGTGAGTTAACTTTTCTACTTTCCAT 1625343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 TGTTTTGTTTTCAAATCGATATCTCTTTTATGTTCGTGAGTTAACTTTTCTACTTTCCAT 1128

  1625344 TAGCCTTGCAATCTACTTATGTCCAATGTGAAATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTT 1625403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 TAGCCTTGCAATCTACTTATGTCCAATGTGAAATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTT 1188

  1625404 TAAAATCTTAGTAATATTTTTAAATAAAATCATCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTT 1625463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 TAAAATCTTAGTAATATTTTTAAATAAAATCATCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTT 1248

  1625464 CTCTCTGCCTGTGCAGAAATCTTATGAAAATTCGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATT 1625523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 CTCTCTGCCTGTGCAGAAATCTTATGAAAATTCGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATT 1308

  1625524 CCCAGAATACACATTAATCCCAACTGTTACTCCCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCC 1625583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 CCCAGAATACACATTAATCCCAACTGTTACTCCCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCC 1368

  1625584 CATCACCTGAGCATAAATGCCAGCTCCCATCCACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTG 1625643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 CATCACCTGAGCATAAATGCCAGCTCCCATCCACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTG 1428

  1625644 CCCTCTGCCCTGGTCTATGGTCTCCCCTCTTAAATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGT 1625703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 CCCTCTGCCCTGGTCTATGGTCTCCCCTCTTAAATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGT 1488

  1625704 GCCCAGCACA------------GCCCTGCCCTCTGCTCTGGTCTAAGGTCTCTCCCCTGT 1625751
          ||||||||||            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1489 GCCCAGCACAGCCCTGCCCTCTGCCCTGCCCTCTGCTCTGGCCTAAGGTCTCTCCCCTGT 1548

  1625752 GCTGTTCCCTTCCTGCCGGGCAGGCCTCTGTCCGTTCCTCAAACCACACAGGCTCAGGCC 1625811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 GCTGTTCCCTTCCTGCCGGGCAGGCCTCTGTCCGTTCCTCAAACCACACAGGCTCAGGCC 1608

  1625812 TGACTCCAGGCCTTTGCCCTGCTGTGCCCTCTGCCTAGGGTGCCTTTCCCGGGCTCTGCA 1625871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 TGACTCCAGGCCTTTGCCCTGCTGTGCCCTCTGCCTAGGGTGCCTTTCCCGGGCTCTGCA 1668

  1625872 TCCTCCTCTCAACCCGCTGAGCTCCAGCCTGCTGGTCGCCCCTCAGGTGGATGAACACAT 1625931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 TCCTCCTCTCAACCCGCTGAGCTCCAGCCTGCTGGTCGCCCCTCAGGTGGATGAACACAT 1728

  1625932 GGTGTCCTCTCGCCCCGCTGGCTTTTGCACAGGCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCT 1625991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 GGTGTCCTCTCGCCCCGCTGGCTTTTGCACAGGCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCT 1788

  1625992 CTCTATCGGGGTTTACTCTCTAAATACCATTCGTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGC 1626051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 CTCTATCGGGGTTTACTCTCTAAATACCATTCGTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGC 1848

  1626052 TCCCTGCCCACCCCCCTCCCTTGGACTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCT 1626111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 TCCCTGCCCACCCCCCTCCCTTGGACTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCT 1908

  1626112 GACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTCCTAGCACTCGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCAC 1626171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 GACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTCCTAGCACTCGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCAC 1968

  1626172 ACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTGGTGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTA 1626231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 ACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTGGTGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTA 2028

  1626232 ATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCCCCGTTTTTTTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACTG 1626291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 ATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCCCCGTTTTTTTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACTG 2088

  1626292 CTGCACCAACCTATTAGAATCATTTATATTTATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAG 1626351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 CTGCACCAACCTATTAGAATCATTTATATTTATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAG 2148

  1626352 AAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAAGCCAAATCTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACA 1626411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 AAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAAGCCAAATCTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACA 2208

  1626412 TTGTCAATAATCATTTACCAACTGACTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGA 1626471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 TTGTCAATAATCATTTACCAACTGACTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGA 2268

  1626472 GGCACATGACACGCCCCTTTGAAAGTCACTGTCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACT 1626531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 GGCACATGACACGCCCCTTTGAAAGTCACTGTCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACT 2328

  1626532 GCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGTTTAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTGA 1626591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 GCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGTTTAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTGA 2388

  1626592 GGATGGGAACCATGCCTGCTCCACATGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCT 1626651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 GGATGGGAACCATGCCTGCTCCACATGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCT 2448

  1626652 GGGGCACGCACATCTCGTGGGGAAAATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCA 1626711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 GGGGCACGCACATCTCGTGGGGAAAATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCA 2508

  1626712 CACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGCCGTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCA 1626771
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2509 CACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGCCGTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCC 2568

  1626772 CCCAGCCACGAGCCACACCTATGGGATGGATAAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGG 1626831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 CCCAGCCACGAGCCACACCTATGGGATGGATAAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGG 2628

  1626832 CAAGGTTGTGGCTATGTCATACTCTTATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAA 1626891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 CAAGGTTGTGGCTATGTCATACTCTTATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAA 2688

  1626892 ATCACCCACGCAAGAAATGTCAGCCTCTGTCCCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCG 1626951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 ATCACCCACGCAAGAAATGTCAGCCTCTGTCCCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCG 2748

  1626952 GTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAATGGTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTG 1627011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 GTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAATGGTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTG 2808

  1627012 GAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGT 1627071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 GAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGT 2868

  1627072 GCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGGGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAA 1627131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 GCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGGGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAA 2928

  1627132 CTGTGAGA 1627139
          ||||||||
     2929 CTGTGAGA 2936

Alignment time is 2.3407 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   2814] =>      2814 nucs 'mol-32-3235-142742_2814'

Score:        2752
Aligned:      2807        nucs
Identic:      2793 (100%) nucs =>      2141 ( 99%)       652 (100%)
Gaps:           13 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1624997,1627139] EXCISED REGION [1628842,1629493]
 second seq =>  [      1,   2154] EXCISED REGION [   2163,   2814]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1702 nucs [1627140,1628841]
 second seq =>         8 nucs [2155,2162]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627139,1627139] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627140,1627140] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs

  1624997 GCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAA 1625056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCAAGACCCTCAAACTAGAACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAA 60

  1625057 ACTAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACATCAG 1625116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTAGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACATCAG 120

  1625117 CTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAGGGCCCTCAAGGTGGAACATCAGCTCCTCCCCAAGC 1625176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCCTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAGGGCCCTCAAGGTGGAACATCAGCTCCTCCCCAAGC 180

  1625177 TAGAACACCTCTCCCACCTGGATCTCCAGCTCCACGACCCTCACAGAACAATCCCTTCTC 1625236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGAACACCTCTCCCACCTGGATCTCCAGCTCCACGACCCTCACAGAACAATCCCTTCTC 240

  1625237 ATGAAATTCAGCAGTCAAGAAATCTGCAGCGGAAGTAAATGAATAAATGTTTTGTTTTCA 1625296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGAAATTCAGCAGTCAAGAAATCTGCAGCGGAAGTAAATGAATAAATGTTTTGTTTTCA 300

  1625297 AATCGATATCTCTTTTATGTTCGTGAGTTAACTTTTCTACTTTCCATTAGCCTTGCAATC 1625356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATCGATATCTCTTTTATGTTCGTGAGTTAACTTTTCTACTTTCCATTAGCCTTGCAATC 360

  1625357 TACTTATGTCCAATGTGAAATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTTTAAAATCTTAGTA 1625416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TACTTATGTCCAATGTGAAATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTTTAAAATCTTAGTA 420

  1625417 ATATTTTTAAATAAAATCATCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTTCTCTCTGCCTGTG 1625476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATATTTTTAAATAAAATCATCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTTCTCTCTGCCTGTG 480

  1625477 CAGAAATCTTATGAAAATTCGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATTCCCAGAATACACA 1625536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGAAATCTTATGAAAATTCGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATTCCCAGAATACACA 540

  1625537 TTAATCCCAACTGTTACTCCCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCCCATCACCTGAGCA 1625596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAATCCCAACTGTTACTCCCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCCCATCACCTGAGCA 600

  1625597 TAAATGCCAGCTCCCATCCACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTGCCCTCTGCCCTGG 1625656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAATGCCAGCTCCCATCCACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTGCCCTCTGCCCTGG 660

  1625657 TCTATGGTCTCCCCTCTTAAATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGTGCCCAGCACAGCC 1625716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTATGGTCTCCCCTCTTAAATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGTGCCCAGCACAGCC 720

  1625717 CTGCCCTCTGC------------TCTGGTCTAAGGTCTCTCCCCTGTGCTGTTCCCTTCC 1625764
          |||||||||||            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGCCCTCTGCCCTGCCCTCTGCTCTGGCCTAAGGTCTCTCCCCTGTGCTGTTCCCTTCC 780

  1625765 TGCCGGGCAGGCCTCTGTCCGTTCCTCAAACCACACAGGCTCAGGCCTGACTCCAGGCCT 1625824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGCCGGGCAGGCCTCTGTCCGTTCCTCAAACCACACAGGCTCAGGCCTGACTCCAGGCCT 840

  1625825 TTGCCCTGCTGTGCCCTCTGCCTAGGGTGCCTTTCCCGGGCTCTGCATCCTCCTCTCAAC 1625884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGCCCTGCTGTGCCCTCTGCCTAGGGTGCCTTTCCCGGGCTCTGCATCCTCCTCTCAAC 900

  1625885 CCGCTGAGCTCCAGCCTGCTGGTCGCCCCTCAGGTGGATGAACACATGGTGTCCTCTCGC 1625944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCGCTGAGCTCCAGCCTGCTGGTCGCCCCTCAGGTGGATGAACACATGGTGTCCTCTCGC 960

  1625945 CCCGCTGGCTTTTGCACAGGCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCTCTCTATCGGGGTT 1626004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCGCTGGCTTTTGCACAGGCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCTCTCTATCGGGGTT 1020

  1626005 TACTCTCTAAATACCATTCGTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGCTCCCTGCCCACCC 1626064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACTCTCTAAATACCATTCGTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGCTCCCTGCCCACCC 1080

  1626065 CCCTCCCTTGGACTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGC 1626124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCCTCCCTTGGACTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGC 1140

  1626125 TAGATGCTCTCCTAGCACTCGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTACT 1626184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TAGATGCTCTCCTAGCACTCGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTACT 1200

  1626185 GGGTTAGGTTGGTGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAGCA 1626244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGGTTAGGTTGGTGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAGCA 1260

  1626245 CCGGCTCCTCCCCGTTTTTTTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACCTA 1626304
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCGGCTCCTCCCCGTTTTTTTTTTTT-GCCATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACCTA 1319

  1626305 TTAGAATCATTTATATTTATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCA 1626364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTAGAATCATTTATATTTATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCA 1379

  1626365 TGAGAATAGAAGCCAAATCTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAATCA 1626424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TGAGAATAGAAGCCAAATCTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAATCA 1439

  1626425 TTTACCAACTGACTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACACG 1626484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TTTACCAACTGACTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACACG 1499

  1626485 CCCCTTTGAAAGTCACTGTCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGG 1626544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CCCCTTTGAAAGTCACTGTCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGG 1559

  1626545 CGTGGCTGGGTTTAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTGAGGATGGGAACCAT 1626604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CGTGGCTGGGTTTAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTGAGGATGGGAACCAT 1619

  1626605 GCCTGCTCCACATGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCACAT 1626664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GCCTGCTCCACATGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCACAT 1679

  1626665 CTCGTGGGGAAAATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGGCT 1626724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CTCGTGGGGAAAATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGGCT 1739

  1626725 TCTGCTTCTGCCGTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCACCCAGCCACGAGC 1626784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TCTGCTTCTGCCGTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCACCCAGCCACGAGC 1799

  1626785 CACACCTATGGGATGGATAAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCT 1626844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CACACCTATGGGATGGATAAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCT 1859

  1626845 ATGTCATACTCTTATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGCAA 1626904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 ATGTCATACTCTTATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGCAA 1919

  1626905 GAAATGTCAGCCTCTGTCCCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATT 1626964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GAAATGTCAGCCTCTGTCCCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATT 1979

  1626965 CCCTTTGCAATGGTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAG 1627024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CCCTTTGCAATGGTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAG 2039

  1627025 CCTCAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGC 1627084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 CCTCAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGC 2099

  1627085 AAGCCCCAGGGGGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 1627139
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AAGCCCCAGGGGGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 2154

EXCISED REGION

  1628842 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 1628901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 2222

  1628902 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 1628961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 2282

  1628962 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 1629021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 2342

  1629022 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 1629081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 2402

  1629082 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 1629141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 2462

  1629142 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 1629201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 2522

  1629202 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 1629261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 2582

  1629262 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 1629321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 2642

  1629322 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 1629381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 2702

  1629382 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 1629441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 2762

  1629442 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGG 1629493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGG 2814

Alignment time is 2.22451 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   5384] =>      5384 nucs 'mol-32-34d4-045295_5384'

Score:        5288
Aligned:      5376        nucs
Identic:      5359 (100%) nucs =>      2139 ( 99%)      3220 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1625000,1627139] EXCISED REGION [1628842,1632065]
 second seq =>  [      1,   2152] EXCISED REGION [   2161,   5384]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1702 nucs [1627140,1628841]
 second seq =>         8 nucs [2153,2160]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627139,1627139] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1627140,1627140] to [1628841,1628841]
 second seq =>         0 nucs

  1625000 AGACCCTCAAACTAGAACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACT 1625059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGACCCTCAAACTAGAACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACT 60

  1625060 AGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTC 1625119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTC 120

  1625120 CTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAGGGCCCTCAAGGTGGAACATCAGCTCCTCCCCAAGCTAG 1625179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAGGGCCCTCAAGGTGGAACATCAGCTCCTCCCCAAGCTAG 180

  1625180 AACACCTCTCCCACCTGGATCTCCAGCTCCACGACCCTCACAGAACAATCCCTTCTCATG 1625239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACACCTCTCCCACCTGGATCTCCAGCTCCACGACCCTCACAGAACAATCCCTTCTCATG 240

  1625240 AAATTCAGCAGTCAAGAAATCTGCAGCGGAAGTAAATGAATAAATGTTTTGTTTTCAAAT 1625299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATTCAGCAGTCAAGAAATCTGCAGCGGAAGTAAATGAATAAATGTTTTGTTTTCAAAT 300

  1625300 CGATATCTCTTTTATGTTCGTGAGTTAACTTTTCTACTTTCCATTAGCCTTGCAATCTAC 1625359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGATATCTCTTTTATGTTCGTGAGTTAACTTTTCTACTTTCCATTAGCCTTGCAATCTAC 360

  1625360 TTATGTCCAATGTGAAATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTTTAAAATCTTAGTAATA 1625419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATGTCCAATGTGAAATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTTTAAAATCTTAGTAATA 420

  1625420 TTTTTAAATAAAATCATCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTTCTCTCTGCCTGTGCAG 1625479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTTAAATAAAATCATCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTTCTCTCTGCCTGTGCAG 480

  1625480 AAATCTTATGAAAATTCGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATTCCCAGAATACACATTA 1625539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATCTTATGAAAATTCGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATTCCCAGAATACACATTA 540

  1625540 ATCCCAACTGTTACTCCCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCCCATCACCTGAGCATAA 1625599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCCCAACTGTTACTCCCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCCCATCACCTGAGCATAA 600

  1625600 ATGCCAGCTCCCATCCACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTGCCCTCTGCCCTGGTCT 1625659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGCCAGCTCCCATCCACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTGCCCTCTGCCCTGGTCT 660

  1625660 ATGGTCTCCCCTCTTAAATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGTGCCCAGCACAGCCCTG 1625719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGGTCTCCCCTCTTAAATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGTGCCCAGCACAGCCCTG 720

  1625720 CCCTCTGC------------TCTGGTCTAAGGTCTCTCCCCTGTGCTGTTCCCTTCCTGC 1625767
          ||||||||            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCTCTGCCCTGCCCTCTGCTCTGGCCTAAGGTCTCTCCCCTGTGCTGTTCCCTTCCTGC 780

  1625768 CGGGCAGGCCTCTGTCCGTTCCTCAAACCACACAGGCTCAGGCCTGACTCCAGGCCTTTG 1625827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CGGGCAGGCCTCTGTCCGTTCCTCAAACCACACAGGCTCAGGCCTGACTCCAGGCCTTTG 840

  1625828 CCCTGCTGTGCCCTCTGCCTAGGGTGCCTTTCCCGGGCTCTGCATCCTCCTCTCAACCCG 1625887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCTGCTGTGCCCTCTGCCTAGGGTGCCTTTCCCGGGCTCTGCATCCTCCTCTCAACCCG 900

  1625888 CTGAGCTCCAGCCTGCTGGTCGCCCCTCAGGTGGATGAACACATGGTGTCCTCTCGCCCC 1625947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGAGCTCCAGCCTGCTGGTCGCCCCTCAGGTGGATGAACACATGGTGTCCTCTCGCCCC 960

  1625948 GCTGGCTTTTGCACAGGCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCTCTCTATCGGGGTTTAC 1626007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTGGCTTTTGCACAGGCTCTTCTCTGTGCCAGACACAAACCCTCTCTATCGGGGTTTAC 1020

  1626008 TCTCTAAATACCATTCGTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGCTCCCTGCCCACCCCCC 1626067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTCTAAATACCATTCGTCCTTGGAGTCTCCACTGAAATATCGCTCCCTGCCCACCCCCC 1080

  1626068 TCCCTTGGACTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGCTAG 1626127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCCCTTGGACTTAACCTTGGTTAGGTTGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGCTAG 1140

  1626128 ATGCTCTCCTAGCACTCGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTACTGGG 1626187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGCTCTCCTAGCACTCGGAACTTGCCCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTACTGGG 1200

  1626188 TTAGGTTGGTGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAGCACCG 1626247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTAGGTTGGTGCACAAGTCATCGTGGTTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAGCACCG 1260

  1626248 GCTCCTCCCCGTTTTTTTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACCTATTA 1626307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTCCTCCCCGTTTTTTTTTTTTTGCCATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACCTATTA 1320

  1626308 GAATCATTTATATTTATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCATGA 1626367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAATCATTTATATTTATTCATCCATCATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCATGA 1380

  1626368 GAATAGAAGCCAAATCTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAATCATTT 1626427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAATAGAAGCCAAATCTACTCAAATCACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAATCATTT 1440

  1626428 ACCAACTGACTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACACGCCC 1626487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCAACTGACTGATAGAGAAATGCCTTCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACACGCCC 1500

  1626488 CTTTGAAAGTCACTGTCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGGCGT 1626547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTTGAAAGTCACTGTCATGGACAGTTGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGGCGT 1560

  1626548 GGCTGGGTTTAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTGAGGATGGGAACCATGCC 1626607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGCTGGGTTTAGGCTGATCTAGTCTGGCCTTGACTCCAGGCTGAGGATGGGAACCATGCC 1620

  1626608 TGCTCCACATGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCACATCTC 1626667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGCTCCACATGCCTCTCATCCCACAGCCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCACATCTC 1680

  1626668 GTGGGGAAAATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGGCTTCT 1626727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGGGGAAAATCAAGAGCCTTAGAGGGCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGGCTTCT 1740

  1626728 GCTTCTGCCGTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCACCCAGCCACGAGCCAC 1626787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTTCTGCCGTGTCTGTGAAAATCTCATTGGCAGAAGCAAGTCACCCAGCCACGAGCCAC 1800

  1626788 ACCTATGGGATGGATAAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCTATG 1626847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACCTATGGGATGGATAAGTCCATCCACCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCTATG 1860

  1626848 TCATACTCTTATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGCAAGAA 1626907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCATACTCTTATGGGGGGAGTGAAAAATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGCAAGAA 1920

  1626908 ATGTCAGCCTCTGTCCCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATTCCC 1626967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATGTCAGCCTCTGTCCCCACGCTGGAATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATTCCC 1980

  1626968 TTTGCAATGGTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCT 1627027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTGCAATGGTGTCTGCAGGTTTAGGCCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCT 2040

  1627028 CAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAG 1627087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGAACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAG 2100

  1627088 CCCCAGGGGGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 1627139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCCCAGGGGGCCCTTGTGCCATGAGACAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 2152

EXCISED REGION

  1628842 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 1628901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGGCAGAGAACAGTCTTTTTCTTCGTACCTGTTCACCGCAGTAATTTTTAGCAGCTCTCC 2220

  1628902 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 1628961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGTGCAAAGAAGTCTAATCAATGAATCAGCGTATAGGCCACAAATACCTTCTCAGTGCGG 2280

  1628962 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 1629021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTCACCTAGAATACAAGCACTCAGAAGCACAAATTTAACTGAAGTGAGAAACCAGGCCA 2340

  1629022 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 1629081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTTGTAGCTTCAGTTTTTCTACCAGTAATATATTAATTTCTTGAAATAGCCTAATAATT 2400

  1629082 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 1629141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAGTTCTACTATCAAAACAGAAGCCCAATCTGGGAGAACAATTATTATAGAAGTCAAACT 2460

  1629142 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 1629201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATTTCAATCATATTAGTATACAAATTCATATTAGCATAGCCTAATAATTCATATTAGTA 2520

  1629202 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 1629261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAGGTGGGAGGATCACTTGAGCCTAGGAGTTTGACACCAGCCTGGGCAAGACAGTGAGAC 2580

  1629262 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 1629321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCCATCTCTACTTTTTTTTTTAAATAAAGAAATTCAGAGAGGAGAAGGAAGTGGATTGAT 2640

  1629322 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 1629381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATGTGTCTATCCAAGGACAAATTTTGTGTGCCTGTACATACAACTCAACTATGAACCTTC 2700

  1629382 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 1629441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTTCACACAGCTCACAATCTAGTAGCGAGAGGGAATTACGAAAACATGAGCCCCCACGAT 2760

  1629442 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 1629501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GAGGAAAAAGGCGCATATCAGAGAAAAGAAAAATGCTGCGATGATCCAATGGCAGGAGCA 2820

  1629502 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 1629561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCACGCATCCACTTTCTTTGTTTTTTTGAGATGGGGTTTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGA 2880

  1629562 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 1629621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTGCCGTGGCTTGATCTCAGCTCAATGCAGCCTCAACCTCCCAGGCTCAAGTGATCTTCC 2940

  1629622 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 1629681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CATCTCAGCCTCCCAAGTAGCTGGGAATACAGGCGTGCACCACTACACTTGTTTAGTTTT 3000

  1629682 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 1629741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TGTAGAAACAGGGTCTCACGATGTTGCCAAGGCTGGCATCCTGAAGGGCGGGTGGGGCTT 3060

  1629742 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 1629801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CATCCTACAGAGATGAAAGGCAGAAGAAGCTCAGAGCCCAAAGCAAAGGGGTGGAGGACA 3120

  1629802 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 1629861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGGGCATCTTCAGAACAGAGTGGCTCGGCTGAGACATCCAGTAGGATGCCACCAGGCAGA 3180

  1629862 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTGAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 1629921
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGTGTGGTGGAAAAACACAGGGCCACGGTAAATGCTCACATGTGAGGAGCAAACCACCAC 3240

  1629922 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 1629981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGAACACAACAGAAACACGGTGTACTAAATCAGGCTTCAAATCGCAGCCCTGCAACTTCA 3300

  1629982 GAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTA 1630041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GAGCTACCGCAGGTAACCCAGAAAGGGAGCACGGACAGCACCGCCCACTGCCTGAGGCTA 3360

  1630042 TGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGG 1630101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGAGATGGACCAGAAACCTGTGCTTACTAACAACCTGCCTTATTCCAGAAAGAATTCAGG 3420

  1630102 GAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATGTGAATCATGTTGGCTGAGG 1630161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     3421 GAACACAAAGACACTCACAGTACAGCAAAATAAAGTAAATATGAATCATGTTGGCTGAGG 3480

  1630162 AGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTAC 1630221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGAAAGTGAAGAGTCTAAGACTATGTCATAAAGTTTACCTCTACTCTAAACTCTCATTAC 3540

  1630222 TGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAA 1630281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TGGCGAGCCACCAATCTGACTTTAAGTTTTCTACCAGCTAAATTGAAGAGGAAAATGTAA 3600

  1630282 TCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACA 1630341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCAGGTAAAGGTTTATAAGATGCAAACAAAAGAGAACAGCCACCACAGTTTCTGAGAACA 3660

  1630342 CACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAG 1630401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CACGCAGCTCCAGCTCCAGGAGAAACAGGGTGGCCATCTCCTGGGGCTGCCCCACAGCAG 3720

  1630402 GCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGG 1630461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GCGTGTGAGCCCCAAAGCCAGCGTCTCTCAGGGTGAACGGTGACTACGGGCTTCATGGGG 3780

  1630462 CCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTC 1630521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCACACGCCTCCAGTACAAGCTGAGGAAATCTCCCAGGGCAATTCAAGGAACAGGGTCTC 3840

  1630522 ACAATGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCT 1630581
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ACAATGATGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCCCCTGCCTCGGCCT 3900

  1630582 CCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAG 1630641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CCCAAAGTGTTGGGAGGTCAGATGTGAGCCACTGCATCTGGCCCCGCATGCACTTTATAG 3960

  1630642 AGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGA 1630701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGGAGGGCTTTGCATCCTGAAGGGCGGGTGGAGCTTCATCCTGCAGAGATGAAAGGCAGA 4020

  1630702 GGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCAC 1630761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 GGAAGCTCAGAGCCCAAGGTAAAGGGGGGCGCCTAACAAAAGCGACTCCATTGGGACCAC 4080

  1630762 AGTGAGAGGGTCCCGACACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCA 1630821
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AGTGAGAGGGTCCCGATACACAGCTTGGGTTAAGCCAGACACTGATTTCAAAGTATCTCA 4140

  1630822 GGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGAT 1630881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GGAATGGTGGACTCAGCACCTGTCAGGCAATTCTCTCTCTCAAGCAGTCTCCTGGTAGAT 4200

  1630882 ATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAG 1630941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATTTAGTAGCAGCTGAAATCAAGATTATGTTCTGACTGACACTTGCTGATGGTTAAAGAG 4260

  1630942 CTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATA 1631001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 CTATATATGCTTTGAGGACCAGCTGAACTGGGGCAGGACTAATGCCCTCTGGTGAAAATA 4320

  1631002 CAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATAATG 1631061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CAGGAACCCAAACACACAAGTCAGAGCAGGAGGTGTCTCCCCAAACCCCAAACAATAATG 4380

  1631062 CTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGAAAC 1631121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CTGACCTTGGATTTGGGTTAAGTGCCTAGCCCAGCATGTGAGTGTTCAGTAAGTGGAAAC 4440

  1631122 CATCATCACCATCATCAGGTAATGGAAAACCATCAAAGCTTTGAGCTGGCTTGTTAGCCA 1631181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CATCATCACCATCATCAGGTAATGGAAAACCATCAAAGCTTTGAGCTGGCTTGTTAGCCA 4500

  1631182 AGAATAGTAGCAGTGTATTAGCTACTACTAATACTCACAGCTGACAATTACTGACCACTT 1631241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AGAATAGTAGCAGTGTATTAGCTACTACTAATACTCACAGCTGACAATTACTGACCACTT 4560

  1631242 GTTCCGTGCCAGGAATCACGGAAGCACCTCGCATGCATTTCCTCAATACTCCCTCCCAGT 1631301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GTTCCGTGCCAGGAATCACGGAAGCACCTCGCATGCATTTCCTCAATACTCCCTCCCAGT 4620

  1631302 AACAGCAAGGACACAAAACTGGTAGAGCCAGGACTGGAATCCAGGCCGGCCCCAAAGCAC 1631361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AACAGCAAGGACACAAAACTGGTAGAGCCAGGACTGGAATCCAGGCCGGCCCCAAAGCAC 4680

  1631362 TCCAGTGGAGCCTGCCAAGGTGGGCAGGCTACCATACTAATGCGGTCCAGTATTTGACCA 1631421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TCCAGTGGAGCCTGCCAAGGTGGGCAGGCTACCATACTAATGCGGTCCAGTATTTGACCA 4740

  1631422 CCACTCCTAGTTGAGCAAGTTTAACAGAAAACCTAAAACTAAACCTAAAATCTAAAAATT 1631481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CCACTCCTAGTTGAGCAAGTTTAACAGAAAACCTAAAACTAAACCTAAAATCTAAAAATT 4800

  1631482 TGAGCAAATGCATAAAAAGCAGGCTGTTAAAATGGATCATAAATCTTGCATCACTCGCTG 1631541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TGAGCAAATGCATAAAAAGCAGGCTGTTAAAATGGATCATAAATCTTGCATCACTCGCTG 4860

  1631542 GAAAACCACTCAAAATAAACGTCTCTGAGACATGGCCTCTGAGGAGGGCACTCTGTGTGG 1631601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GAAAACCACTCAAAATAAACGTCTCTGAGACATGGCCTCTGAGGAGGGCACTCTGTGTGG 4920

  1631602 CTCATATCACCTTGCTGACAAACCACTTGAACCTGGGTGGTCATCTGACCATACTGAACA 1631661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CTCATATCACCTTGCTGACAAACCACTTGAACCTGGGTGGTCATCTGACCATACTGAACA 4980

  1631662 GACGATGCACAGAGCCATTTGCATCCACTGTGGTCAACATTTAGGAAGTTTTAAGCTAAG 1631721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GACGATGCACAGAGCCATTTGCATCCACTGTGGTCAACATTTAGGAAGTTTTAAGCTAAG 5040

  1631722 ATTTGCCAAATTGTAGCCTACTGGATTCCGGGTTCTCTTGACATCTCTTTCTAGTCGCCA 1631781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 ATTTGCCAAATTGTAGCCTACTGGATTCCGGGTTCTCTTGACATCTCTTTCTAGTCGCCA 5100

  1631782 TGTCTTGCACTTCCCGAGTATAAATGAACTGAGATGCAAATAAAAAAAGGAGGATTTAAG 1631841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 TGTCTTGCACTTCCCGAGTATAAATGAACTGAGATGCAAATAAAAAAAGGAGGATTTAAG 5160

  1631842 AATAATGAAAAGAGAAAAATCAAGAAAGCACAATCACTAGTGTAGAGATAACAGCATTTC 1631901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 AATAATGAAAAGAGAAAAATCAAGAAAGCACAATCACTAGTGTAGAGATAACAGCATTTC 5220

  1631902 TGAATTCCCTGAAAACAATCTATATAAATGCATGTGAAATAATACACCAGCATCTGTGGC 1631961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TGAATTCCCTGAAAACAATCTATATAAATGCATGTGAAATAATACACCAGCATCTGTGGC 5280

  1631962 CCACACGCCACATATTAGGAACGGATGTCATAATATAAGGTAAACATGTTACTCTGAAAA 1632021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CCACACGCCACATATTAGGAACGGATGTCATAATATAAGGTAAACATGTTACTCTGAAAA 5340

  1632022 CACAAATCCTCACAAATCAGGCAGTAAGGCTGAATCCAGCACCC 1632065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CACAAATCCTCACAAATCAGGCAGTAAGGCTGAATCCAGCACCC 5384

Alignment time is 4.52245 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [1617139,1638841] =>     21703 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [      1,   2152] =>      2152 nucs 'mol-32-34d4-045295_2152'

Score:        2134
Aligned:      2134        nucs
Identic:      2134 (100%) nucs =>       728 (100%)      1406 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [1625000,1625727] EXCISED REGION [1625734,1627139]
 second seq =>  [      1,    728] EXCISED REGION [    747,   2152]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [1625728,1625733]
 second seq =>        18 nucs [729,746]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [727,729] to [745,747]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1625727,1625727] to [1625734,1625734]
 second seq =>         1 nucs [728,728] to [747,747]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [1625728,1625728] to [1625733,1625733]
 second seq =>         1 nucs [729,729] to [746,746]

  1625000 AGACCCTCAAACTAGAACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACT 1625059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGACCCTCAAACTAGAACATCAGGTCCTCTCCAGGTCTGCAGCTGCAAGACCCTCAAACT 60

  1625060 AGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTC 1625119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGAACATCAGCTCCTCTCCAGGTCTCCAGCTGCACGACCCTCAATCTAGAACATCAGCTC 120

  1625120 CTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAGGGCCCTCAAGGTGGAACATCAGCTCCTCCCCAAGCTAG 1625179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCTCCGGGTCTGCAGCTGCAGGGCCCTCAAGGTGGAACATCAGCTCCTCCCCAAGCTAG 180

  1625180 AACACCTCTCCCACCTGGATCTCCAGCTCCACGACCCTCACAGAACAATCCCTTCTCATG 1625239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACACCTCTCCCACCTGGATCTCCAGCTCCACGACCCTCACAGAACAATCCCTTCTCATG 240

  1625240 AAATTCAGCAGTCAAGAAATCTGCAGCGGAAGTAAATGAATAAATGTTTTGTTTTCAAAT 1625299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATTCAGCAGTCAAGAAATCTGCAGCGGAAGTAAATGAATAAATGTTTTGTTTTCAAAT 300

  1625300 CGATATCTCTTTTATGTTCGTGAGTTAACTTTTCTACTTTCCATTAGCCTTGCAATCTAC 1625359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGATATCTCTTTTATGTTCGTGAGTTAACTTTTCTACTTTCCATTAGCCTTGCAATCTAC 360

  1625360 TTATGTCCAATGTGAAATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTTTAAAATCTTAGTAATA 1625419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATGTCCAATGTGAAATAGAAACACACCATTTGAAATCACGTTTAAAATCTTAGTAATA 420

  1625420 TTTTTAAATAAAATCATCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTTCTCTCTGCCTGTGCAG 1625479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTTAAATAAAATCATCACACAGCTGTAGACACGATCTTATTTCTCTCTGCCTGTGCAG 480

  1625480 AAATCTTATGAAAATTCGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATTCCCAGAATACACATTA 1625539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAATCTTATGAAAATTCGAACTATGAATTTACTTTGTTGAGATTCCCAGAATACACATTA 540

  1625540 ATCCCAACTGTTACTCCCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCCCATCACCTGAGCATAA 1625599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATCCCAACTGTTACTCCCCTCCTTAAAATCTTTTAACATATTCCCATCACCTGAGCATAA 600

  1625600 ATGCCAGCTCCCATCCACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTGCCCTCTGCCCTGGTCT 1625659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGCCAGCTCCCATCCACAGCCCAAAGTGCCCAGCACGGCCCTGCCCTCTGCCCTGGTCT 660

  1625660 ATGGTCTCCCCTCTTAAATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGTGCCCAGCACAGCCCTG 1625719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGGTCTCCCCTCTTAAATGCCAGCACCATCCACAGCCCACAGTGCCCAGCACAGCCCTG 720

  1625720 CCCTCTGC 1625727
          ||||||||
      721 CCCTCTGC 728

EXCISED REGION

  1625734 CTAAGGTCTCTCCCCTGTGCTGTTCCCTTCCTGCCGGGCAGGCCTCTGTCCGTTCCTCAA 1625793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 CTAAGGTCTCTCCCCTGTGCTGTTCCCTTCCTGCCGGGCAGGCCTCTGTCCGTTCCTCAA 806

  1625794 ACCACACAGGCTCAGGCCTGACTCCAGGCCTTTGCCCTGCTGTGCCCTCTGCCTAGGGTG 1625853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 ACCACACAGGCTCAGGCCTGACTCCAGGCCTTTGCCCTGCTGTGCCCTCTGCCTAGGGTG 866

  1625854 CCTTTCCCGGGCTCTGCATCCTCCTCTCAACCCGCTGAGCTCCAGCCTGCTGGTCGCCCC 1625913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      867 CCTTTCCCGGGCTCTGCATCCTCCTCTCAACCCGCTGAGCTCCAGCCTGCTGGTCGCCCC 926

  1625914 TCAGGTGGATGAACACATGGTGTCCTCTCGCCCCGCTGGCTTTTGCACAGGCTCTTCTCT 1625973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 TCAGGTGGATGAACACATGGTGTCCTCTCGCCCCGCTGGCTTTTGCACAGGCTCTTCTCT 986

  1625974 GTGCCAGACACAAACCCTCTCTATCGGGGTTTACTCTCTAAATACCATTCGTCCTTGGAG 1626033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 GTGCCAGACACAAACCCTCTCTATCGGGGTTTACTCTCTAAATACCATTCGTCCTTGGAG 1046

  1626034 TCTCCACTGAAATATCGCTCCCTGCCCACCCCCCTCCCTTGGACTTAACCTTGGTTAGGT 1626093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 TCTCCACTGAAATATCGCTCCCTGCCCACCCCCCTCCCTTGGACTTAACCTTGGTTAGGT 1106

  1626094 TGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTCCTAGCACTCGGAACTTGC 1626153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 TGCCAACCCCCGTCTCCTGACTCCGGGAAGCTAGATGCTCTCCTAGCACTCGGAACTTGC 1166

  1626154 CCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTGGTGCACAAGTCATCGTGG 1626213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 CCATCGCCACATTTGCACACCCGTGATTACTGGGTTAGGTTGGTGCACAAGTCATCGTGG 1226

  1626214 TTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCCCCGTTTTTTTTTTTTTGC 1626273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 TTTTTGCCATTACTATTAATGAACTGCAGCACCGGCTCCTCCCCGTTTTTTTTTTTTTGC 1286

  1626274 CATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACCTATTAGAATCATTTATATTTATTCATCCATC 1626333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 CATTACTTTTAATGACTGCTGCACCAACCTATTAGAATCATTTATATTTATTCATCCATC 1346

  1626334 ATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAAGCCAAATCTACTCAAATC 1626393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 ATCTGCCTTCCCCTCTAGAAAGGAAGCTCCATGAGAATAGAAGCCAAATCTACTCAAATC 1406

  1626394 ACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAATCATTTACCAACTGACTGATAGAGAAATGCCT 1626453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 ACTCCACCTTCCCACACATTGTCAATAATCATTTACCAACTGACTGATAGAGAAATGCCT 1466

  1626454 TCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACACGCCCCTTTGAAAGTCACTGTCATGGACAGT 1626513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 TCCCTGTTGCTGGGATGAGGCACATGACACGCCCCTTTGAAAGTCACTGTCATGGACAGT 1526

  1626514 TGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGTTTAGGCTGATCTAGTCTG 1626573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 TGGCATTCGCTCTTCACTGCTGTACCCGTGGCGTGGCTGGGTTTAGGCTGATCTAGTCTG 1586

  1626574 GCCTTGACTCCAGGCTGAGGATGGGAACCATGCCTGCTCCACATGCCTCTCATCCCACAG 1626633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 GCCTTGACTCCAGGCTGAGGATGGGAACCATGCCTGCTCCACATGCCTCTCATCCCACAG 1646

  1626634 CCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCACATCTCGTGGGGAAAATCAAGAGCCTTAGAGG 1626693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 CCAGAGCCGCCGTTCCCTGGGGCACGCACATCTCGTGGGGAAAATCAAGAGCCTTAGAGG 1706

  1626694 GCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGCCGTGTCTGTGAAAATCTC 1626753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 GCAGGCCTGGCAGCGCCACACATTCCAGGCTTCTGCTTCTGCCGTGTCTGTGAAAATCTC 1766

  1626754 ATTGGCAGAAGCAAGTCACCCAGCCACGAGCCACACCTATGGGATGGATAAGTCCATCCA 1626813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 ATTGGCAGAAGCAAGTCACCCAGCCACGAGCCACACCTATGGGATGGATAAGTCCATCCA 1826

  1626814 CCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCTATGTCATACTCTTATGGGGGGAGTGAAAA 1626873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 CCCTCCCTCGGGCCCTGGCAAGGTTGTGGCTATGTCATACTCTTATGGGGGGAGTGAAAA 1886

  1626874 ATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGCAAGAAATGTCAGCCTCTGTCCCCACGCTGGA 1626933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 ATTGAGGCCCAACATTAAATCACCCACGCAAGAAATGTCAGCCTCTGTCCCCACGCTGGA 1946

  1626934 ATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAATGGTGTCTGCAGGTTTAGG 1626993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 ATCATTCTTCACCAGCCGGTTTGCCTGAATTCCCTTTGCAATGGTGTCTGCAGGTTTAGG 2006

  1626994 CCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGA 1627053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 CCAATGCTGTTCCCCGTGGAGGACAGAGAAGCCTCAATGGGCCTCCATCTGTTGGGAAGA 2066

  1627054 ACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGGGCCCTTGTGCCATGAGA 1627113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 ACAAGATATTAGCTTGGTGCAAAACCACCGCAAGCCCCAGGGGGCCCTTGTGCCATGAGA 2126

  1627114 CAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 1627139
          ||||||||||||||||||||||||||
     2127 CAGGAGAGGGGCAGAGAACTGTGAGA 2152

Alignment time is 1.69995 s

