
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [149431738,149452163] =>     20426 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     7255] =>      7255 nucs 'mol-32-1f00-163694_7255'

Score:        7255
Aligned:      7255        nucs
Identic:      7255 (100%) nucs =>      2465 (100%)      4790 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [149437428,149439892] EXCISED REGION [149439894,149444683]
 second seq =>  [        1,     2465] EXCISED REGION [     2466,     7255]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [149439893,149439893]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         9 nucs [149439893,149439901] to [149439894,149439902]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

149437428 CCCCTGCTCTACCCTCAAGGGCCACAGAGAAGTTGGAGTCCTCTTCCCCATAACAGCCCT 149437487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCCCTGCTCTACCCTCAAGGGCCACAGAGAAGTTGGAGTCCTCTTCCCCATAACAGCCCT 60

149437488 ACTAGAATTGGGGCATATTCTAGGGCCCCTTGTGCCCTCTCTTCTCTGGACAGTGCCTCA 149437547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTAGAATTGGGGCATATTCTAGGGCCCCTTGTGCCCTCTCTTCTCTGGACAGTGCCTCA 120

149437548 CACCCCTGGCTTCACATTAAAATCACTTCGGGAGCTTTTAGGATCAGGCTAATTACTAAT 149437607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCCCTGGCTTCACATTAAAATCACTTCGGGAGCTTTTAGGATCAGGCTAATTACTAAT 180

149437608 ACTTCAGAAACTCTAGGGACAAAACAGTCATTCACAGATTTAAATCTCCCCAGGTGATCA 149437667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTTCAGAAACTCTAGGGACAAAACAGTCATTCACAGATTTAAATCTCCCCAGGTGATCA 240

149437668 CAAAGTACAGCCTAAGCTGAGGCCCACTGGTCTAGAGCAGTGCTGCTTACGCTGCAACTC 149437727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAAGTACAGCCTAAGCTGAGGCCCACTGGTCTAGAGCAGTGCTGCTTACGCTGCAACTC 300

149437728 ATGTGCAGATAAATCACCCCGGGAATCTCTGCAATGCAGATTTTGAATCAGCAGGCCTGG 149437787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGTGCAGATAAATCACCCCGGGAATCTCTGCAATGCAGATTTTGAATCAGCAGGCCTGG 360

149437788 GTGGATGGGCCTGAGGTGGTGCACTTCCAACAGTCCTCAAGAGATGCCTATGAGAGCACA 149437847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGGATGGGCCTGAGGTGGTGCACTTCCAACAGTCCTCAAGAGATGCCTATGAGAGCACA 420

149437848 CTTGGGGTAGAGAATTTGAGAAGCACTACTGTAGACTGAAGCACTACTGCTCCTAACGTT 149437907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTGGGGTAGAGAATTTGAGAAGCACTACTGTAGACTGAAGCACTACTGCTCCTAACGTT 480

149437908 CCAGCCAGATAGGATTTCTCTCTCCCTCCTGTCCCCTCTGCGCTAGAGATGTGTACCTTG 149437967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCAGCCAGATAGGATTTCTCTCTCCCTCCTGTCCCCTCTGCGCTAGAGATGTGTACCTTG 540

149437968 ACAATGTCCATATTCTAGTGTTCCCAGAAGGAGAAACCGAAAAAACCTTCCGCTCCCTTG 149438027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAATGTCCATATTCTAGTGTTCCCAGAAGGAGAAACCGAAAAAACCTTCCGCTCCCTTG 600

149438028 TAGAAACTATGCTTCCGTTAACAGCCTGGAATCCTTTGACAGAGTTGGTTTACAGGCCAT 149438087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAGAAACTATGCTTCCGTTAACAGCCTGGAATCCTTTGACAGAGTTGGTTTACAGGCCAT 660

149438088 TTGCCCTCGAAATTACCCACTCTGGGAATACTTTCCCCATCTGCGTATTTGAAGATGGAA 149438147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGCCCTCGAAATTACCCACTCTGGGAATACTTTCCCCATCTGCGTATTTGAAGATGGAA 720

149438148 GCTAATACTTTCCTTTGGTGCTCATTTTGATCTGATCTTCAGAGGCCTAGTGTGTGCCAC 149438207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTAATACTTTCCTTTGGTGCTCATTTTGATCTGATCTTCAGAGGCCTAGTGTGTGCCAC 780

149438208 CCTCATAGAAGTGTCAGGGAATCAGAAGAGGAAGTGATGCTGCCAGGCCCCCATTTTTAA 149438267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTCATAGAAGTGTCAGGGAATCAGAAGAGGAAGTGATGCTGCCAGGCCCCCATTTTTAA 840

149438268 GGCCCTGGGTGAAGAGATGGCCTCCTTCTCTTTTGCCTCCCCAGGCGTGGCAGCTGACAG 149438327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCCCTGGGTGAAGAGATGGCCTCCTTCTCTTTTGCCTCCCCAGGCGTGGCAGCTGACAG 900

149438328 TATCTAGGATGAGGGCGCAGTGTACACCCTTCTTGTTCTGATCCTGTCCTGACCCCACAA 149438387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATCTAGGATGAGGGCGCAGTGTACACCCTTCTTGTTCTGATCCTGTCCTGACCCCACAA 960

149438388 GCCCCTGAGACAGAGACCTCCAGGACAGCAGTGTGGCTTGGGTGACTCCTGGACTGGAAG 149438447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCCCCTGAGACAGAGACCTCCAGGACAGCAGTGTGGCTTGGGTGACTCCTGGACTGGAAG 1020

149438448 TCAAGAGAGCAGGATTCTAGTCCAGGCTCCACCTCTAACCCTGACTCATGTGTGACATGA 149438507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCAAGAGAGCAGGATTCTAGTCCAGGCTCCACCTCTAACCCTGACTCATGTGTGACATGA 1080

149438508 ATCTCCCCACTTCCTCTCTTTGGTTCCCCATGTGGCTCTGTCTGTTGGATGGCTCTGTTC 149438567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCTCCCCACTTCCTCTCTTTGGTTCCCCATGTGGCTCTGTCTGTTGGATGGCTCTGTTC 1140

149438568 TGGATGGCTTCCAGGAATCACAGCAACAGGACAACAGAGCCATCTCTCTTTTTTTTTGAG 149438627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGATGGCTTCCAGGAATCACAGCAACAGGACAACAGAGCCATCTCTCTTTTTTTTTGAG 1200

149438628 ACGGAGTTTCATTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTCAGCTCACAGCA 149438687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACGGAGTTTCATTCTTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGTGTGATCTCAGCTCACAGCA 1260

149438688 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCCGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTA 149438747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACCTCTGCCTCCTGGGTTCAAGCAATTCTCCCGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTA 1320

149438748 TAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTGTATATTTAATAGAGACGGGGTTTCACCT 149438807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGGCATGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTGTATATTTAATAGAGACGGGGTTTCACCT 1380

149438808 TGTTGGTAAGGCTGGTCTCGAACTCCCATCCTCAGGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCA 149438867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTTGGTAAGGCTGGTCTCGAACTCCCATCCTCAGGTGATCTGCCCGCCTCAGCCTCCCA 1440

149438868 AAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCCGGCCACATCTGCCCATCTCTTACTA 149438927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGCACCCGGCCACATCTGCCCATCTCTTACTA 1500

149438928 GGGCTCCAGGCACAGATCTTGGTTGATCTTTTACACACACTGGGTGGTGATTTCATTGAT 149438987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGCTCCAGGCACAGATCTTGGTTGATCTTTTACACACACTGGGTGGTGATTTCATTGAT 1560

149438988 GCATATCTCCACCAGATTATGAGCTGCCCATCTTTGCCCTCCACACTCCCAGAACACGGT 149439047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCATATCTCCACCAGATTATGAGCTGCCCATCTTTGCCCTCCACACTCCCAGAACACGGT 1620

149439048 AGGTGTTCAAATATTTGTTGAATGAAGGGGAAAAGGAGTAGAGAAACAAGAGATGGCCAT 149439107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGGTGTTCAAATATTTGTTGAATGAAGGGGAAAAGGAGTAGAGAAACAAGAGATGGCCAT 1680

149439108 AAAACCTGTGGTGGCTACTTCCCATGACACAGGTGGCAGGTGAGGGCTGCATAGCCACCC 149439167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAACCTGTGGTGGCTACTTCCCATGACACAGGTGGCAGGTGAGGGCTGCATAGCCACCC 1740

149439168 ATTCATGAGCCATCCAACCCTGAGCTGGCTTTGAAGACAGACTCGGATCCTGCCTCCCAG 149439227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTCATGAGCCATCCAACCCTGAGCTGGCTTTGAAGACAGACTCGGATCCTGCCTCCCAG 1800

149439228 ACCTGGCCTTTTTCTTGTCCTTTGCCAGGGGCTACCTGCGGACATATTTCTTCTCGAGGT 149439287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACCTGGCCTTTTTCTTGTCCTTTGCCAGGGGCTACCTGCGGACATATTTCTTCTCGAGGT 1860

149439288 GGATGTTCTTATAGTCGACGCCTCCCTCGGGGTCCTGGCCGGGGCTCAGGCTGGGTCCCA 149439347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GGATGTTCTTATAGTCGACGCCTCCCTCGGGGTCCTGGCCGGGGCTCAGGCTGGGTCCCA 1920

149439348 GCATGGCCTCAGCCTTCCTTCGCAGAAAGTTGAGCAGGTCGCCATAGCAACAGTACTCCG 149439407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCATGGCCTCAGCCTTCCTTCGCAGAAAGTTGAGCAGGTCGCCATAGCAACAGTACTCCG 1980

149439408 TGATGACCAGTACAGGGCCTAGAGCAGCCAAGGGTGTGGGGTGAGGGAGGTGCTGAGTGC 149439467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGATGACCAGTACAGGGCCTAGAGCAGCCAAGGGTGTGGGGTGAGGGAGGTGCTGAGTGC 2040

149439468 TCCCCTCCATGAACAGGAGCATGAGACTGGGGGCAGTGAGGCCACTGGACTTGGACTCAG 149439527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCCCCTCCATGAACAGGAGCATGAGACTGGGGGCAGTGAGGCCACTGGACTTGGACTCAG 2100

149439528 CATAGCTGAGTTCTAACCTCGGCTCTGTGAGCAAGTTTCCTTGTGCCTCAGTAGTTCCAT 149439587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CATAGCTGAGTTCTAACCTCGGCTCTGTGAGCAAGTTTCCTTGTGCCTCAGTAGTTCCAT 2160

149439588 TTGTTTAAAACAGATGGCTTTGGCGGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTT 149439647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTGTTTAAAACAGATGGCTTTGGCGGGGCACGGTGGCTCATGCCTGTAATCTCAGCACTT 2220

149439648 TGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATG 149439707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGGGAGGCCAAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACATG 2280

149439708 GTGAAACCCCATCTCTACAAAAATACAAAAAAATCAGCCGGGCATGGTGGCATGTGCCTG 149439767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTGAAACCCCATCTCTACAAAAATACAAAAAAATCAGCCGGGCATGGTGGCATGTGCCTG 2340

149439768 TAGTTCCAACTACTCAGGAGGTTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGT 149439827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAGTTCCAACTACTCAGGAGGTTGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCAGAGGT 2400

149439828 TGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGGCTCCGTC 149439887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGGCTCCGTC 2460

149439888 TCAAG 149439892
          |||||
     2461 TCAAG 2465

EXCISED REGION

149439894 AAAAAAAAACAAAAAATGAAAAAAAAAAGACAACCTTAAAAAAAATGTAGCCCAAGAATT 149439953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 AAAAAAAAACAAAAAATGAAAAAAAAAAGACAACCTTAAAAAAAATGTAGCCCAAGAATT 2525

149439954 ATTTCTTCAAAGGAAAGCTATGGCGGCTCACTGTAGGTCAGAGCTGCTATCAGTGAAGAG 149440013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 ATTTCTTCAAAGGAAAGCTATGGCGGCTCACTGTAGGTCAGAGCTGCTATCAGTGAAGAG 2585

149440014 GATGTGGGGCACTTGGAGTCCCAGCAAAGCCCGGGGCACCTTTGGGGGCCCTGGGGAGAG 149440073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 GATGTGGGGCACTTGGAGTCCCAGCAAAGCCCGGGGCACCTTTGGGGGCCCTGGGGAGAG 2645

149440074 TGTCCAAGCATCCTTGAATGGAAGCTTCATAAGAGGTAGGCGGGGGGCTTCACTCCAGAC 149440133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 TGTCCAAGCATCCTTGAATGGAAGCTTCATAAGAGGTAGGCGGGGGGCTTCACTCCAGAC 2705

149440134 CCAGAGGATCCGGCTCCCTGGAAGCAGGGCCTAGGAGCTTGCACATTCATCTCCTCCTCC 149440193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 CCAGAGGATCCGGCTCCCTGGAAGCAGGGCCTAGGAGCTTGCACATTCATCTCCTCCTCC 2765

149440194 AAGGGCTCCGATGCTCCCTATCAGTCTCTCTTTATACCTCAAGCTGCCCGTGCAGCTCCT 149440253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 AAGGGCTCCGATGCTCCCTATCAGTCTCTCTTTATACCTCAAGCTGCCCGTGCAGCTCCT 2825

149440254 GACTATTCCAGGAGATGGGCCCAGGAGTTTAAGGGATGCTGTGACCGGGATCCCCCTGAC 149440313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 GACTATTCCAGGAGATGGGCCCAGGAGTTTAAGGGATGCTGTGACCGGGATCCCCCTGAC 2885

149440314 ACTTGGAGCAGTAGGATCCTGAGAAGGAGAAGACGGAACAAGGTAGCCCTGGGGCCCTGA 149440373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 ACTTGGAGCAGTAGGATCCTGAGAAGGAGAAGACGGAACAAGGTAGCCCTGGGGCCCTGA 2945

149440374 GATTCCCCAGAGGCCCCAAGACCTTGGCCCCAGGAACCCCAAGGCCCTTACCTCCATGGG 149440433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 GATTCCCCAGAGGCCCCAAGACCTTGGCCCCAGGAACCCCAAGGCCCTTACCTCCATGGG 3005

149440434 TACAGGCTCCCAGAAGGTTGACGATGTTCTCGTGCTGGCCCAGGTGGCTCATGATCTTCA 149440493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 TACAGGCTCCCAGAAGGTTGACGATGTTCTCGTGCTGGCCCAGGTGGCTCATGATCTTCA 3065

149440494 GCTCGGACATGAGGGCCTCCTTCTCATCAGCATGGGCCGTGGCTGGGAGGAAGAACCACA 149440553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 GCTCGGACATGAGGGCCTCCTTCTCATCAGCATGGGCCGTGGCTGGGAGGAAGAACCACA 3125

149440554 GTCCCAAAGACAGGGAGAGGGCAGGACAGAGAGCACCACACAGATACATGGGGACCAAAT 149440613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 GTCCCAAAGACAGGGAGAGGGCAGGACAGAGAGCACCACACAGATACATGGGGACCAAAT 3185

149440614 GCAGAGACCCAGGGGAGAAAGCAGGGCATACCCCAAGACCCGGAGTGACCAGAAGCCAAA 149440673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 GCAGAGACCCAGGGGAGAAAGCAGGGCATACCCCAAGACCCGGAGTGACCAGAAGCCAAA 3245

149440674 AGAAGGAGAAGGAAAAATGCAGACACACAGATGGCAGAGAGAGAGAGAGGAGGGATGAGC 149440733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 AGAAGGAGAAGGAAAAATGCAGACACACAGATGGCAGAGAGAGAGAGAGGAGGGATGAGC 3305

149440734 CTGTCACTGAGCTGGTCTTCAGGTGACAGGAAGCCAAACTGTGGCCAGGCCATGGCCATA 149440793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 CTGTCACTGAGCTGGTCTTCAGGTGACAGGAAGCCAAACTGTGGCCAGGCCATGGCCATA 3365

149440794 GGTGGCCTTTCTGCACCCCCAGACTTTTTGGAGCTCAGTCAGGAGCCCCTTCACAACTAA 149440853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 GGTGGCCTTTCTGCACCCCCAGACTTTTTGGAGCTCAGTCAGGAGCCCCTTCACAACTAA 3425

149440854 AGGGTGACCTAGACCTTCTTGGAGCCGGGAGTCAGAGGGTGCCTGGAGCTCACAAGAAAA 149440913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 AGGGTGACCTAGACCTTCTTGGAGCCGGGAGTCAGAGGGTGCCTGGAGCTCACAAGAAAA 3485

149440914 CCCAAGTCCTCACCCCTGAGCTCTGTCCCCCAGGCTTCAACAGGTTGAAATGTGTGTGAT 149440973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 CCCAAGTCCTCACCCCTGAGCTCTGTCCCCCAGGCTTCAACAGGTTGAAATGTGTGTGAT 3545

149440974 GCCTCTTGTGACACCAGGGCCAGCCCACCCCCAGCATCTACCACCCCCCATCCCTTCCCT 149441033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 GCCTCTTGTGACACCAGGGCCAGCCCACCCCCAGCATCTACCACCCCCCATCCCTTCCCT 3605

149441034 CATCCCCTCCCCTCACTCACACTTCAGCATCTTCACAGCCACCTTCAGGACAGCATCCTC 149441093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 CATCCCCTCCCCTCACTCACACTTCAGCATCTTCACAGCCACCTTCAGGACAGCATCCTC 3665

149441094 CTTGCCCAGACCAAAGGCCGTGGCCTCCACCACCTTCCCAAAGGCTCCAGCTCCGAGGGT 149441153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 CTTGCCCAGACCAAAGGCCGTGGCCTCCACCACCTTCCCAAAGGCTCCAGCTCCGAGGGT 3725

149441154 CTTACCTGCCACGCACACAGGTCCCTTAAGTCCCTGGGCACCAAAGGGCCTCTGTCCAAG 149441213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 CTTACCTGCCACGCACACAGGTCCCTTAAGTCCCTGGGCACCAAAGGGCCTCTGTCCAAG 3785

149441214 GGCCCATGGGCTCCCTGCAACCCCCACAGGCCCTGTGATAGGAAGCTGTGGAGTGATGAG 149441273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 GGCCCATGGGCTCCCTGCAACCCCCACAGGCCCTGTGATAGGAAGCTGTGGAGTGATGAG 3845

149441274 CTGCCATCTCACCAAACTGCAGGTTGTTCCGGGGGAACTCCCACTTCTCGTTGTAAGGCA 149441333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 CTGCCATCTCACCAAACTGCAGGTTGTTCCGGGGGAACTCCCACTTCTCGTTGTAAGGCA 3905

149441334 GCTGCGTGGGGTCGATGAAAGTATAACTGTTGCCCTCATAGCTCTCGATGATCTTCCAGC 149441393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 GCTGCGTGGGGTCGATGAAAGTATAACTGTTGCCCTCATAGCTCTCGATGATCTTCCAGC 3965

149441394 GGACCTGGTACTTGGGCTTCTGCAGAAGAGGAAGGGAGCACGTGGCAGTCGGGGCTGGCA 149441453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 GGACCTGGTACTTGGGCTTCTGCAGAAGAGGAAGGGAGCACGTGGCAGTCGGGGCTGGCA 4025

149441454 GGCAGTTCCTGGACCTTGTTTCTGACCCCCAAGAGCAGGGGTGTGGGCAGTCCCAAGGCG 149441513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 GGCAGTTCCTGGACCTTGTTTCTGACCCCCAAGAGCAGGGGTGTGGGCAGTCCCAAGGCG 4085

149441514 CCCAGTGGGAGAAGGCAGGGCAAGGCCTGCTCTGGGCTGAGAGAGGTCGTCTCATGAACA 149441573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 CCCAGTGGGAGAAGGCAGGGCAAGGCCTGCTCTGGGCTGAGAGAGGTCGTCTCATGAACA 4145

149441574 TAGCACTGAGAGCATGTTCCTGCTTGACTCTGCCTTGTTGTGTGACCTTCCCTTCTCCAA 149441633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 TAGCACTGAGAGCATGTTCCTGCTTGACTCTGCCTTGTTGTGTGACCTTCCCTTCTCCAA 4205

149441634 GCCTGTTTCACTATTTGTGTATTGAAGACCTTGGACAAGACAACCTCTGAGGGCCCTGAT 149441693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 GCCTGTTTCACTATTTGTGTATTGAAGACCTTGGACAAGACAACCTCTGAGGGCCCTGAT 4265

149441694 ATCTCTGATAATCTGGTAATTCCTGAGCCAGGAGGGAGGGTGGAACTTGAGATCTTATCC 149441753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4266 ATCTCTGATAATCTGGTAATTCCTGAGCCAGGAGGGAGGGTGGAACTTGAGATCTTATCC 4325

149441754 ATCCGTTCATCTGTCCATCCATCTACCCATCCATCCACCCACCCAACCTCCCATCCAAAT 149441813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4326 ATCCGTTCATCTGTCCATCCATCTACCCATCCATCCACCCACCCAACCTCCCATCCAAAT 4385

149441814 ATATATATATATTTTAATTGTGATAAAACATACATGAAATTTACCATTTCAACCATTTTT 149441873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4386 ATATATATATATTTTAATTGTGATAAAACATACATGAAATTTACCATTTCAACCATTTTT 4445

149441874 AAGTGTATGGTTCAGTAGTATTAAGTAAATTACATTCTACCTTGTGCAACCAGTTTCCAG 149441933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4446 AAGTGTATGGTTCAGTAGTATTAAGTAAATTACATTCTACCTTGTGCAACCAGTTTCCAG 4505

149441934 AGCTCTTTTCATCTTGCAAAACTGAAATTCTGTTCCTGTTAAAAAGCAACTCCCCTTTCC 149441993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4506 AGCTCTTTTCATCTTGCAAAACTGAAATTCTGTTCCTGTTAAAAAGCAACTCCCCTTTCC 4565

149441994 CTCCTCCAGCCCCTGGCAACCATGATTCTGCTGTCTCTGTGAATTGCACTGCTCTAGGCA 149442053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4566 CTCCTCCAGCCCCTGGCAACCATGATTCTGCTGTCTCTGTGAATTGCACTGCTCTAGGCA 4625

149442054 CTGCACCTCAGTGGACTCACACAGCATGTGTCTATTGAGATTGCCTTATTTCACCCAGCA 149442113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4626 CTGCACCTCAGTGGACTCACACAGCATGTGTCTATTGAGATTGCCTTATTTCACCCAGCA 4685

149442114 TAATGTCTTCAAGGTTCATTCATGCTGCAGCACAGGTCAGAATTCCCTTCCTTTTTAAGG 149442173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4686 TAATGTCTTCAAGGTTCATTCATGCTGCAGCACAGGTCAGAATTCCCTTCCTTTTTAAGG 4745

149442174 CTGAATAATAGTAGCCCATCCACATACTTTCTTGAACATCTATTTGTGTCAGGCACCGCT 149442233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4746 CTGAATAATAGTAGCCCATCCACATACTTTCTTGAACATCTATTTGTGTCAGGCACCGCT 4805

149442234 GATTCAGAGTTGAACAGGACAAAGTCCCTGCCCCTCCATGGAGTTTGCATTCTAGTGGCT 149442293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4806 GATTCAGAGTTGAACAGGACAAAGTCCCTGCCCCTCCATGGAGTTTGCATTCTAGTGGCT 4865

149442294 GAGAGAGGCATTAAACGCAAATAAACATGTATCTAGGAGATTCTCAAGTGGTGCTATGAA 149442353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4866 GAGAGAGGCATTAAACGCAAATAAACATGTATCTAGGAGATTCTCAAGTGGTGCTATGAA 4925

149442354 GAAAATAAAGTAAGATAAGTCAGGGAAGGCCCCTAAAGAGCCCACCATGTGACCATCAGA 149442413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4926 GAAAATAAAGTAAGATAAGTCAGGGAAGGCCCCTAAAGAGCCCACCATGTGACCATCAGA 4985

149442414 GGAAGAATTTTCCAGGAACAGTGCATGGAAATGCTGTATGCTTGACATGGGAATGATCCT 149442473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4986 GGAAGAATTTTCCAGGAACAGTGCATGGAAATGCTGTATGCTTGACATGGGAATGATCCT 5045

149442474 GGCAAGTTTGAGCTATAGGAAGGCAGCCATCATGGCTTGAGGGAAGTGGGGGGCAGATTC 149442533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5046 GGCAAGTTTGAGCTATAGGAAGGCAGCCATCATGGCTTGAGGGAAGTGGGGGGCAGATTC 5105

149442534 CAGAAACAGGAAGGCCTTGAGGGCTATGATAAGGTGAGTGGGTTCCCTTTTGGGATTTTT 149442593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5106 CAGAAACAGGAAGGCCTTGAGGGCTATGATAAGGTGAGTGGGTTCCCTTTTGGGATTTTT 5165

149442594 TTTTTTCCAAGACAGGATCTCTGTCCCCCAGACTGGCATGCAGTGGGGGCAGTCTTGGCT 149442653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5166 TTTTTTCCAAGACAGGATCTCTGTCCCCCAGACTGGCATGCAGTGGGGGCAGTCTTGGCT 5225

149442654 CACTACAGCCTCGACCCCCGAGGTTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGTCTCCCAAGCAGCC 149442713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5226 CACTACAGCCTCGACCCCCGAGGTTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGTCTCCCAAGCAGCC 5285

149442714 GGGACTACAAGCATGTGGCACCACACCTGGCTAATTTTTGTAGAGACGGGGCTTTGTCGC 149442773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5286 GGGACTACAAGCATGTGGCACCACACCTGGCTAATTTTTGTAGAGACGGGGCTTTGTCGC 5345

149442774 AGCCTAGGCTGGTCTTGAACTCGTGAGCTCAAGCAGTTTGCCTGCCTCGGTCTCTCAAAG 149442833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5346 AGCCTAGGCTGGTCTTGAACTCGTGAGCTCAAGCAGTTTGCCTGCCTCGGTCTCTCAAAG 5405

149442834 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCTGGCCGGGCAGTGAGAGACCCTGAGAGTT 149442893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5406 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCTGGCCGGGCAGTGAGAGACCCTGAGAGTT 5465

149442894 TGACACAGGTGAGTCGCCATCTGACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCCTTCACT 149442953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5466 TGACACAGGTGAGTCGCCATCTGACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCCTTCACT 5525

149442954 CATGCCGGAGTGCAGTGGCACGATCATAGCTCACTAGGCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCA 149443013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5526 CATGCCGGAGTGCAGTGGCACGATCATAGCTCACTAGGCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCA 5585

149443014 ATCCTTCTGCCTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCATCGCACCCAGC 149443073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5586 ATCCTTCTGCCTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCATCGCACCCAGC 5645

149443074 CTTGACTTTACCTTTTTGAGAGAGAAAGAGAGACGCTGCCCACTAGATAGATTCTGGAGG 149443133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5646 CTTGACTTTACCTTTTTGAGAGAGAAAGAGAGACGCTGCCCACTAGATAGATTCTGGAGG 5705

149443134 ACCAGCACCTTTGGAAAGACCTGATTTCCTTCCTTAGGCTCTCCATGCTGTTACCACCCA 149443193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5706 ACCAGCACCTTTGGAAAGACCTGATTTCCTTCCTTAGGCTCTCCATGCTGTTACCACCCA 5765

149443194 GCCAGGGGAGGCAAGCCCTGGGATGTGGGGAGGAGGAATGGCTGCCCCTGTTTCTTGCCC 149443253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5766 GCCAGGGGAGGCAAGCCCTGGGATGTGGGGAGGAGGAATGGCTGCCCCTGTTTCTTGCCC 5825

149443254 AGGGGTCAGCTGCTGAGGGGGAGTACCATGCTAAGGGTTGCCCACAAGAAATGCTGATGG 149443313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5826 AGGGGTCAGCTGCTGAGGGGGAGTACCATGCTAAGGGTTGCCCACAAGAAATGCTGATGG 5885

149443314 AAGACCAAGTTGAGGGGGAAAGTGGAAGCTGGGCTGGGGCGGTGGAGGACACTGAGGCCC 149443373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5886 AAGACCAAGTTGAGGGGGAAAGTGGAAGCTGGGCTGGGGCGGTGGAGGACACTGAGGCCC 5945

149443374 TGGGTCAGCAGAGCAACTCTTTCCGGCCAGGCCTTGGGGATGGGACAAGCTTGGCTGTGC 149443433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5946 TGGGTCAGCAGAGCAACTCTTTCCGGCCAGGCCTTGGGGATGGGACAAGCTTGGCTGTGC 6005

149443434 CTGCAGCTGGGCTCCTTCCCTGGGCACCCGAGCTAGAAACTTAAAGGAAGTGTGGACCGG 149443493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6006 CTGCAGCTGGGCTCCTTCCCTGGGCACCCGAGCTAGAAACTTAAAGGAAGTGTGGACCGG 6065

149443494 TGCTAGGGAGGAGGCTGGCCTTTAGCTGCAAGTCCTGGTTGAGAGAGAAGATTCCAGTCA 149443553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6066 TGCTAGGGAGGAGGCTGGCCTTTAGCTGCAAGTCCTGGTTGAGAGAGAAGATTCCAGTCA 6125

149443554 TGTCCTTTGCAGCAACGTGGTGCAGCTGAAGGCCATTATCCTAAGCAAATTAACACCGAA 149443613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6126 TGTCCTTTGCAGCAACGTGGTGCAGCTGAAGGCCATTATCCTAAGCAAATTAACACCGAA 6185

149443614 ACAGAAAACCTACATACCGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGCTAAATATTGAGTGTGC 149443673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6186 ACAGAAAACCTACATACCGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGCTAAATATTGAGTGTGC 6245

149443674 ATGGGCATAAAGATGGCACCAACAGACACTGGGGGCTACTAGAGCAGGGAGGGTGGAAGC 149443733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6246 ATGGGCATAAAGATGGCACCAACAGACACTGGGGGCTACTAGAGCAGGGAGGGTGGAAGC 6305

149443734 GGGCGAGGGTTGAAAAACTATGGGAGCTATGCTCAGTAGCAGGTGATGGGATCCATATTC 149443793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6306 GGGCGAGGGTTGAAAAACTATGGGAGCTATGCTCAGTAGCAGGTGATGGGATCCATATTC 6365

149443794 CAAAGCTCAGCATCACGAAACATACGCATGCAACAAACCTGTACGTCTATCCCCTGAATC 149443853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6366 CAAAGCTCAGCATCACGAAACATACGCATGCAACAAACCTGTACGTCTATCCCCTGAATC 6425

149443854 AAAAATAAAATGTGGACATTTTTAAAGAGAGAGACAGGGAGAAAGCTTCCAGCTAACCAT 149443913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6426 AAAAATAAAATGTGGACATTTTTAAAGAGAGAGACAGGGAGAAAGCTTCCAGCTAACCAT 6485

149443914 CAGGAAGAACTTCTAGCTGGTAGTTAGAGAGAAAAGACTGCAATTAGAAATGAGAAGGAA 149443973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6486 CAGGAAGAACTTCTAGCTGGTAGTTAGAGAGAAAAGACTGCAATTAGAAATGAGAAGGAA 6545

149443974 CTAACTTCCAGGCTCTGATTCGGAAGGGCGGACTGCAGGTGAACTTCAGAGCCTCTGCGT 149444033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6546 CTAACTTCCAGGCTCTGATTCGGAAGGGCGGACTGCAGGTGAACTTCAGAGCCTCTGCGT 6605

149444034 TATAGCTTGGGAGAGAGTCTGAAACGGGACCCAGGGAGAAGAACTTCCCAAGCCTCTGAG 149444093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6606 TATAGCTTGGGAGAGAGTCTGAAACGGGACCCAGGGAGAAGAACTTCCCAAGCCTCTGAG 6665

149444094 GATCCAAATCCTGCCCGTGGGTGCCTTCCCAGCCCAAAAGACAGCAACAAGGCAAGGAGG 149444153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6666 GATCCAAATCCTGCCCGTGGGTGCCTTCCCAGCCCAAAAGACAGCAACAAGGCAAGGAGG 6725

149444154 GGATTCTTCAGCCTCTCCTGGCCACTTCCATCTCTAGGAGCCTCTGTGGCTAAGACTGTT 149444213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6726 GGATTCTTCAGCCTCTCCTGGCCACTTCCATCTCTAGGAGCCTCTGTGGCTAAGACTGTT 6785

149444214 TTTTCTTACCACTTCTTGTTCCTCTGTCCCTCTGCAGCTGGGCTGAGTCAGCCCCTCCCT 149444273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6786 TTTTCTTACCACTTCTTGTTCCTCTGTCCCTCTGCAGCTGGGCTGAGTCAGCCCCTCCCT 6845

149444274 GCCCCCAGCTGGGCAGGGGGCACTGTTGAAAGGGAGGGGATCAAGGAGGATGGAGGTTTG 149444333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6846 GCCCCCAGCTGGGCAGGGGGCACTGTTGAAAGGGAGGGGATCAAGGAGGATGGAGGTTTG 6905

149444334 GCTGGATTCTCAGATTTCTGAATCCTAGGCTCCTAATTTCTGGAAGCGGACCAAGCTGCC 149444393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6906 GCTGGATTCTCAGATTTCTGAATCCTAGGCTCCTAATTTCTGGAAGCGGACCAAGCTGCC 6965

149444394 TTCTGCCTGCCTCAGGAACCCTCCCCTGCCCCTGCTGGGCATGTAAACCTCCCAGGGCAC 149444453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6966 TTCTGCCTGCCTCAGGAACCCTCCCCTGCCCCTGCTGGGCATGTAAACCTCCCAGGGCAC 7025

149444454 CTGTGCCATCCCTGGAAAGGGCTCATGGGCGTCTACCCAGAGGCAGCCTCTCTTCCAAAG 149444513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7026 CTGTGCCATCCCTGGAAAGGGCTCATGGGCGTCTACCCAGAGGCAGCCTCTCTTCCAAAG 7085

149444514 AACTATGAGTGAGAGATCAAGAGGTGGGGATGGGCGAGGCTCCCTGAGAAGGGTGGACGT 149444573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7086 AACTATGAGTGAGAGATCAAGAGGTGGGGATGGGCGAGGCTCCCTGAGAAGGGTGGACGT 7145

149444574 AATTGTCATGATGGCAGCGGGTTCTTCCTGAGCTCTTCCTGGGAGTGGGGCGCTGGGCTA 149444633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7146 AATTGTCATGATGGCAGCGGGTTCTTCCTGAGCTCTTCCTGGGAGTGGGGCGCTGGGCTA 7205

149444634 GATGCTTGAAGCACATCACCCCATTCATTCCTTGCAATGGGCCTAAGCCC 149444683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7206 GATGCTTGAAGCACATCACCCCATTCATTCCTTGCAATGGGCCTAAGCCC 7255

Alignment time is 5.2543 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [149431738,149452163] =>     20426 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     2069] =>      2069 nucs 'mol-32-22d3-006465_2069'

Score:        2057
Aligned:      2068        nucs
Identic:      2067 (100%) nucs =>      1186 (100%)       881 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [149441640,149442825] EXCISED REGION [149442827,149443708]
 second seq =>  [        1,     1186] EXCISED REGION [     1188,     2069]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [149442826,149442826]
 second seq =>         1 nucs [1187,1187]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [1186,1187] to [1187,1188]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [149442825,149442825] to [149442827,149442827]
 second seq =>         1 nucs [1186,1186] to [1188,1188]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

149441640 TTCACTATTTGTGTATTGAAGACCTTGGACAAGACAACCTCTGAGGGCCCTGATATCTCT 149441699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCACTATTTGTGTATTGAAGACCTTGGACAAGACAACCTCTGAGGGCCCTGATATCTCT 60

149441700 GATAATCTGGTAATTCCTGAGCCAGGAGGGAGGGTGGAACTTGAGATCTTATCCATCCGT 149441759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATAATCTGGTAATTCCTGAGCCAGGAGGGAGGGTGGAACTTGAGATCTTATCCATCCGT 120

149441760 TCATCTGTCCATCCATCTACCCATCCATCCACCCACCCAACCTCCCATCCAAATATATAT 149441819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCATCTGTCCATCCATCTACCCATCCATCCACCCACCCAACCTCCCATCCAAATATATAT 180

149441820 ATATATTTTAATTGTGATAAAACATACATGAAATTTACCATTTCAACCATTTTTAAGTGT 149441879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATATTTTAATTGTGATAAAACATACATGAAATTTACCATTTCAACCATTTTTAAGTGT 240

149441880 ATGGTTCAGTAGTATTAAGTAAATTACATTCTACCTTGTGCAACCAGTTTCCAGAGCTCT 149441939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGGTTCAGTAGTATTAAGTAAATTACATTCTACCTTGTGCAACCAGTTTCCAGAGCTCT 300

149441940 TTTCATCTTGCAAAACTGAAATTCTGTTCCTGTTAAAAAGCAACTCCCCTTTCCCTCCTC 149441999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCATCTTGCAAAACTGAAATTCTGTTCCTGTTAAAAAGCAACTCCCCTTTCCCTCCTC 360

149442000 CAGCCCCTGGCAACCATGATTCTGCTGTCTCTGTGAATTGCACTGCTCTAGGCACTGCAC 149442059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGCCCCTGGCAACCATGATTCTGCTGTCTCTGTGAATTGCACTGCTCTAGGCACTGCAC 420

149442060 CTCAGTGGACTCACACAGCATGTGTCTATTGAGATTGCCTTATTTCACCCAGCATAATGT 149442119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCAGTGGACTCACACAGCATGTGTCTATTGAGATTGCCTTATTTCACCCAGCATAATGT 480

149442120 CTTCAAGGTTCATTCATGCTGCAGCACAGGTCAGAATTCCCTTCCTTTTTAAGGCTGAAT 149442179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTCAAGGTTCATTCATGCTGCAGCACAGGTCAGAATTCCCTTCCTTTTTAAGGCTGAAT 540

149442180 AATAGTAGCCCATCCACATACTTTCTTGAACATCTATTTGTGTCAGGCACCGCTGATTCA 149442239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATAGTAGCCCATCCACATACTTTCTTGAACATCTATTTGTGTCAGGCACCGCTGATTCA 600

149442240 GAGTTGAACAGGACAAAGTCCCTGCCCCTCCATGGAGTTTGCATTCTAGTGGCTGAGAGA 149442299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGTTGAACAGGACAAAGTCCCTGCCCCTCCATGGAGTTTGCATTCTAGTGGCTGAGAGA 660

149442300 GGCATTAAACGCAAATAAACATGTATCTAGGAGATTCTCAAGTGGTGCTATGAAGAAAAT 149442359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCATTAAACGCAAATAAACATGTATCTAGGAGATTCTCAAGTGGTGCTATGAAGAAAAT 720

149442360 AAAGTAAGATAAGTCAGGGAAGGCCCCTAAAGAGCCCACCATGTGACCATCAGAGGAAGA 149442419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAGTAAGATAAGTCAGGGAAGGCCCCTAAAGAGCCCACCATGTGACCATCAGAGGAAGA 780

149442420 ATTTTCCAGGAACAGTGCATGGAAATGCTGTATGCTTGACATGGGAATGATCCTGGCAAG 149442479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTTCCAGGAACAGTGCATGGAAATGCTGTATGCTTGACATGGGAATGATCCTGGCAAG 840

149442480 TTTGAGCTATAGGAAGGCAGCCATCATGGCTTGAGGGAAGTGGGGGGCAGATTCCAGAAA 149442539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTGAGCTATAGGAAGGCAGCCATCATGGCTTGAGGGAAGTGGGGGGCAGATTCCAGAAA 900

149442540 CAGGAAGGCCTTGAGGGCTATGATAAGGTGAGTGGGTTCCCTTTTGGGATTTTTTTTTTT 149442599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGGAAGGCCTTGAGGGCTATGATAAGGTGAGTGGGTTCCCTTTTGGGATTTTTTTTTTT 960

149442600 CCAAGACAGGATCTCTGTCCCCCAGACTGGCATGCAGTGGGGGCAGTCTTGGCTCACTAC 149442659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCAAGACAGGATCTCTGTCCCCCAGACTGGCATGCAGTGGGGGCAGTCTTGGCTCACTAC 1020

149442660 AGCCTCGACCCCCGAGGTTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGTCTCCCAAGCAGCCGGGACT 149442719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCCTCGACCCCCGAGGTTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGTCTCCCAAGCAGCCGGGACT 1080

149442720 ACAAGCATGTGGCACCACACCTGGCTAATTTTTGTAGAGACGGGGCTTTGTCGCAGCCTA 149442779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACAAGCATGTGGCACCACACCTGGCTAATTTTTGTAGAGACGGGGCTTTGTCGCAGCCTA 1140

149442780 GGCTGGTCTTGAACTCGTGAGCTCAAGCAGTTTGCCTGCCTCGGTC 149442825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCTGGTCTTGAACTCGTGAGCTCAAGCAGTTTGCCTGCCTCGGTC 1186

EXCISED REGION

149442827 CTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCTGGCCGGGCAGTGAGAGACCCT 149442886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1188 CTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCTGGCCGGGCAGTGAGAGACCCT 1247

149442887 GAGAGTTTGACACAGGTGAGTCGCCATCTGACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTC 149442946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 GAGAGTTTGACACAGGTGAGTCGCCATCTGACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTC 1307

149442947 CTTCACTCATGCCGGAGTGCAGTGGCACGATCATAGCTCACTAGGCTCAAACTCCTGGGC 149443006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 CTTCACTCATGCCGGAGTGCAGTGGCACGATCATAGCTCACTAGGCTCAAACTCCTGGGC 1367

149443007 TCAAGCAATCCTTCTGCCTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCATCGC 149443066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 TCAAGCAATCCTTCTGCCTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCATCGC 1427

149443067 ACCCAGCCTTGACTTTACCTTTTTGAGAGAGAAAGAGAGACGCTGCCCACTAGATAGATT 149443126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 ACCCAGCCTTGACTTTACCTTTTTGAGAGAGAAAGAGAGACGCTGCCCACTAGATAGATT 1487

149443127 CTGGAGGACCAGCACCTTTGGAAAGACCTGATTTCCTTCCTTAGGCTCTCCATGCTGTTA 149443186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 CTGGAGGACCAGCACCTTTGGAAAGACCTGATTTCCTTCCTTAGGCTCTCCATGCTGTTA 1547

149443187 CCACCCAGCCAGGGGAGGCAAGCCCTGGGATGTGGGGAGGAGGAATGGCTGCCCCTGTTT 149443246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 CCACCCAGCCAGGGGAGGCAAGCCCTGGGATGTGGGGAGGAGGAATGGCTGCCCCTGTTT 1607

149443247 CTTGCCCAGGGGTCAGCTGCTGAGGGGGAGTACCATGCTAAGGGTTGCCCACAAGAAATG 149443306
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1608 CTTGCCCAGGGGTCAGCTGCTGAGGGGGAGTACCATGCTAAGGGTTGCCCATAAGAAATG 1667

149443307 CTGATGGAAGACCAAGTTGAGGGGGAAAGTGGAAGCTGGGCTGGGGCGGTGGAGGACACT 149443366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 CTGATGGAAGACCAAGTTGAGGGGGAAAGTGGAAGCTGGGCTGGGGCGGTGGAGGACACT 1727

149443367 GAGGCCCTGGGTCAGCAGAGCAACTCTTTCCGGCCAGGCCTTGGGGATGGGACAAGCTTG 149443426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 GAGGCCCTGGGTCAGCAGAGCAACTCTTTCCGGCCAGGCCTTGGGGATGGGACAAGCTTG 1787

149443427 GCTGTGCCTGCAGCTGGGCTCCTTCCCTGGGCACCCGAGCTAGAAACTTAAAGGAAGTGT 149443486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 GCTGTGCCTGCAGCTGGGCTCCTTCCCTGGGCACCCGAGCTAGAAACTTAAAGGAAGTGT 1847

149443487 GGACCGGTGCTAGGGAGGAGGCTGGCCTTTAGCTGCAAGTCCTGGTTGAGAGAGAAGATT 149443546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 GGACCGGTGCTAGGGAGGAGGCTGGCCTTTAGCTGCAAGTCCTGGTTGAGAGAGAAGATT 1907

149443547 CCAGTCATGTCCTTTGCAGCAACGTGGTGCAGCTGAAGGCCATTATCCTAAGCAAATTAA 149443606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 CCAGTCATGTCCTTTGCAGCAACGTGGTGCAGCTGAAGGCCATTATCCTAAGCAAATTAA 1967

149443607 CACCGAAACAGAAAACCTACATACCGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGCTAAATATTG 149443666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 CACCGAAACAGAAAACCTACATACCGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGCTAAATATTG 2027

149443667 AGTGTGCATGGGCATAAAGATGGCACCAACAGACACTGGGGG 149443708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 AGTGTGCATGGGCATAAAGATGGCACCAACAGACACTGGGGG 2069

Alignment time is 1.53264 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [149431738,149452163] =>     20426 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     3133] =>      3133 nucs 'mol-32-3240-106553_3133'

Score:        3112
Aligned:      3123        nucs
Identic:      3122 (100%) nucs =>      2275 (100%)       847 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [149441023,149443297] EXCISED REGION [149443299,149444146]
 second seq =>  [        1,     2275] EXCISED REGION [     2277,     3124]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [149443298,149443298]
 second seq =>         1 nucs [2276,2276]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [149443297,149443297] to [149443299,149443299]
 second seq =>         1 nucs [2275,2275] to [2277,2277]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

149441023 ATCCCTTCCCTCATCCCCTCCCCTCACTCACACTTCAGCATCTTCACAGCCACCTTCAGG 149441082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCCCTTCCCTCATCCCCTCCCCTCACTCACACTTCAGCATCTTCACAGCCACCTTCAGG 60

149441083 ACAGCATCCTCCTTGCCCAGACCAAAGGCCGTGGCCTCCACCACCTTCCCAAAGGCTCCA 149441142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAGCATCCTCCTTGCCCAGACCAAAGGCCGTGGCCTCCACCACCTTCCCAAAGGCTCCA 120

149441143 GCTCCGAGGGTCTTACCTGCCACGCACACAGGTCCCTTAAGTCCCTGGGCACCAAAGGGC 149441202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTCCGAGGGTCTTACCTGCCACGCACACAGGTCCCTTAAGTCCCTGGGCACCAAAGGGC 180

149441203 CTCTGTCCAAGGGCCCATGGGCTCCCTGCAACCCCCACAGGCCCTGTGATAGGAAGCTGT 149441262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCTGTCCAAGGGCCCATGGGCTCCCTGCAACCCCCACAGGCCCTGTGATAGGAAGCTGT 240

149441263 GGAGTGATGAGCTGCCATCTCACCAAACTGCAGGTTGTTCCGGGGGAACTCCCACTTCTC 149441322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAGTGATGAGCTGCCATCTCACCAAACTGCAGGTTGTTCCGGGGGAACTCCCACTTCTC 300

149441323 GTTGTAAGGCAGCTGCGTGGGGTCGATGAAAGTATAACTGTTGCCCTCATAGCTCTCGAT 149441382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTGTAAGGCAGCTGCGTGGGGTCGATGAAAGTATAACTGTTGCCCTCATAGCTCTCGAT 360

149441383 GATCTTCCAGCGGACCTGGTACTTGGGCTTCTGCAGAAGAGGAAGGGAGCACGTGGCAGT 149441442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATCTTCCAGCGGACCTGGTACTTGGGCTTCTGCAGAAGAGGAAGGGAGCACGTGGCAGT 420

149441443 CGGGGCTGGCAGGCAGTTCCTGGACCTTGTTTCTGACCCCCAAGAGCAGGGGTGTGGGCA 149441502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CGGGGCTGGCAGGCAGTTCCTGGACCTTGTTTCTGACCCCCAAGAGCAGGGGTGTGGGCA 480

149441503 GTCCCAAGGCGCCCAGTGGGAGAAGGCAGGGCAAGGCCTGCTCTGGGCTGAGAGAGGTCG 149441562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTCCCAAGGCGCCCAGTGGGAGAAGGCAGGGCAAGGCCTGCTCTGGGCTGAGAGAGGTCG 540

149441563 TCTCATGAACATAGCACTGAGAGCATGTTCCTGCTTGACTCTGCCTTGTTGTGTGACCTT 149441622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTCATGAACATAGCACTGAGAGCATGTTCCTGCTTGACTCTGCCTTGTTGTGTGACCTT 600

149441623 CCCTTCTCCAAGCCTGTTTCACTATTTGTGTATTGAAGACCTTGGACAAGACAACCTCTG 149441682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCTTCTCCAAGCCTGTTTCACTATTTGTGTATTGAAGACCTTGGACAAGACAACCTCTG 660

149441683 AGGGCCCTGATATCTCTGATAATCTGGTAATTCCTGAGCCAGGAGGGAGGGTGGAACTTG 149441742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGGCCCTGATATCTCTGATAATCTGGTAATTCCTGAGCCAGGAGGGAGGGTGGAACTTG 720

149441743 AGATCTTATCCATCCGTTCATCTGTCCATCCATCTACCCATCCATCCACCCACCCAACCT 149441802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGATCTTATCCATCCGTTCATCTGTCCATCCATCTACCCATCCATCCACCCACCCAACCT 780

149441803 CCCATCCAAATATATATATATATTTTAATTGTGATAAAACATACATGAAATTTACCATTT 149441862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCCATCCAAATATATATATATATTTTAATTGTGATAAAACATACATGAAATTTACCATTT 840

149441863 CAACCATTTTTAAGTGTATGGTTCAGTAGTATTAAGTAAATTACATTCTACCTTGTGCAA 149441922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAACCATTTTTAAGTGTATGGTTCAGTAGTATTAAGTAAATTACATTCTACCTTGTGCAA 900

149441923 CCAGTTTCCAGAGCTCTTTTCATCTTGCAAAACTGAAATTCTGTTCCTGTTAAAAAGCAA 149441982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAGTTTCCAGAGCTCTTTTCATCTTGCAAAACTGAAATTCTGTTCCTGTTAAAAAGCAA 960

149441983 CTCCCCTTTCCCTCCTCCAGCCCCTGGCAACCATGATTCTGCTGTCTCTGTGAATTGCAC 149442042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCCCCTTTCCCTCCTCCAGCCCCTGGCAACCATGATTCTGCTGTCTCTGTGAATTGCAC 1020

149442043 TGCTCTAGGCACTGCACCTCAGTGGACTCACACAGCATGTGTCTATTGAGATTGCCTTAT 149442102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCTCTAGGCACTGCACCTCAGTGGACTCACACAGCATGTGTCTATTGAGATTGCCTTAT 1080

149442103 TTCACCCAGCATAATGTCTTCAAGGTTCATTCATGCTGCAGCACAGGTCAGAATTCCCTT 149442162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCACCCAGCATAATGTCTTCAAGGTTCATTCATGCTGCAGCACAGGTCAGAATTCCCTT 1140

149442163 CCTTTTTAAGGCTGAATAATAGTAGCCCATCCACATACTTTCTTGAACATCTATTTGTGT 149442222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTTTTTAAGGCTGAATAATAGTAGCCCATCCACATACTTTCTTGAACATCTATTTGTGT 1200

149442223 CAGGCACCGCTGATTCAGAGTTGAACAGGACAAAGTCCCTGCCCCTCCATGGAGTTTGCA 149442282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CAGGCACCGCTGATTCAGAGTTGAACAGGACAAAGTCCCTGCCCCTCCATGGAGTTTGCA 1260

149442283 TTCTAGTGGCTGAGAGAGGCATTAAACGCAAATAAACATGTATCTAGGAGATTCTCAAGT 149442342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCTAGTGGCTGAGAGAGGCATTAAACGCAAATAAACATGTATCTAGGAGATTCTCAAGT 1320

149442343 GGTGCTATGAAGAAAATAAAGTAAGATAAGTCAGGGAAGGCCCCTAAAGAGCCCACCATG 149442402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTGCTATGAAGAAAATAAAGTAAGATAAGTCAGGGAAGGCCCCTAAAGAGCCCACCATG 1380

149442403 TGACCATCAGAGGAAGAATTTTCCAGGAACAGTGCATGGAAATGCTGTATGCTTGACATG 149442462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGACCATCAGAGGAAGAATTTTCCAGGAACAGTGCATGGAAATGCTGTATGCTTGACATG 1440

149442463 GGAATGATCCTGGCAAGTTTGAGCTATAGGAAGGCAGCCATCATGGCTTGAGGGAAGTGG 149442522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGAATGATCCTGGCAAGTTTGAGCTATAGGAAGGCAGCCATCATGGCTTGAGGGAAGTGG 1500

149442523 GGGGCAGATTCCAGAAACAGGAAGGCCTTGAGGGCTATGATAAGGTGAGTGGGTTCCCTT 149442582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGGGCAGATTCCAGAAACAGGAAGGCCTTGAGGGCTATGATAAGGTGAGTGGGTTCCCTT 1560

149442583 TTGGGATTTTTTTTTTTCCAAGACAGGATCTCTGTCCCCCAGACTGGCATGCAGTGGGGG 149442642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTGGGATTTTTTTTTTTCCAAGACAGGATCTCTGTCCCCCAGACTGGCATGCAGTGGGGG 1620

149442643 CAGTCTTGGCTCACTACAGCCTCGACCCCCGAGGTTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGTCT 149442702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAGTCTTGGCTCACTACAGCCTCGACCCCCGAGGTTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGTCT 1680

149442703 CCCAAGCAGCCGGGACTACAAGCATGTGGCACCACACCTGGCTAATTTTTGTAGAGACGG 149442762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCCAAGCAGCCGGGACTACAAGCATGTGGCACCACACCTGGCTAATTTTTGTAGAGACGG 1740

149442763 GGCTTTGTCGCAGCCTAGGCTGGTCTTGAACTCGTGAGCTCAAGCAGTTTGCCTGCCTCG 149442822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGCTTTGTCGCAGCCTAGGCTGGTCTTGAACTCGTGAGCTCAAGCAGTTTGCCTGCCTCG 1800

149442823 GTCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCTGGCCGGGCAGTGAGAGA 149442882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTCTCTCAAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCTGGCCGGGCAGTGAGAGA 1860

149442883 CCCTGAGAGTTTGACACAGGTGAGTCGCCATCTGACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTT 149442942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CCCTGAGAGTTTGACACAGGTGAGTCGCCATCTGACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTT 1920

149442943 GCTCCTTCACTCATGCCGGAGTGCAGTGGCACGATCATAGCTCACTAGGCTCAAACTCCT 149443002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTCCTTCACTCATGCCGGAGTGCAGTGGCACGATCATAGCTCACTAGGCTCAAACTCCT 1980

149443003 GGGCTCAAGCAATCCTTCTGCCTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCA 149443062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGGCTCAAGCAATCCTTCTGCCTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCA 2040

149443063 TCGCACCCAGCCTTGACTTTACCTTTTTGAGAGAGAAAGAGAGACGCTGCCCACTAGATA 149443122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCGCACCCAGCCTTGACTTTACCTTTTTGAGAGAGAAAGAGAGACGCTGCCCACTAGATA 2100

149443123 GATTCTGGAGGACCAGCACCTTTGGAAAGACCTGATTTCCTTCCTTAGGCTCTCCATGCT 149443182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATTCTGGAGGACCAGCACCTTTGGAAAGACCTGATTTCCTTCCTTAGGCTCTCCATGCT 2160

149443183 GTTACCACCCAGCCAGGGGAGGCAAGCCCTGGGATGTGGGGAGGAGGAATGGCTGCCCCT 149443242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTTACCACCCAGCCAGGGGAGGCAAGCCCTGGGATGTGGGGAGGAGGAATGGCTGCCCCT 2220

149443243 GTTTCTTGCCCAGGGGTCAGCTGCTGAGGGGGAGTACCATGCTAAGGGTTGCCCA 149443297
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTTTCTTGCCCAGGGGTCAGCTGCTGAGGGGGAGTACCATGCTAAGGGTTGCCCA 2275

EXCISED REGION

149443299 AAGAAATGCTGATGGAAGACCAAGTTGAGGGGGAAAGTGGAAGCTGGGCTGGGGCGGTGG 149443358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 AAGAAATGCTGATGGAAGACCAAGTTGAGGGGGAAAGTGGAAGCTGGGCTGGGGCGGTGG 2336

149443359 AGGACACTGAGGCCCTGGGTCAGCAGAGCAACTCTTTCCGGCCAGGCCTTGGGGATGGGA 149443418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 AGGACACTGAGGCCCTGGGTCAGCAGAGCAACTCTTTCCGGCCAGGCCTTGGGGATGGGA 2396

149443419 CAAGCTTGGCTGTGCCTGCAGCTGGGCTCCTTCCCTGGGCACCCGAGCTAGAAACTTAAA 149443478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 CAAGCTTGGCTGTGCCTGCAGCTGGGCTCCTTCCCTGGGCACCCGAGCTAGAAACTTAAA 2456

149443479 GGAAGTGTGGACCGGTGCTAGGGAGGAGGCTGGCCTTTAGCTGCAAGTCCTGGTTGAGAG 149443538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 GGAAGTGTGGACCGGTGCTAGGGAGGAGGCTGGCCTTTAGCTGCAAGTCCTGGTTGAGAG 2516

149443539 AGAAGATTCCAGTCATGTCCTTTGCAGCAACGTGGTGCAGCTGAAGGCCATTATCCTAAG 149443598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 AGAAGATTCCAGTCATGTCCTTTGCAGCAACGTGGTGCAGCTGAAGGCCATTATCCTAAG 2576

149443599 CAAATTAACACCGAAACAGAAAACCTACATACCGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGCT 149443658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 CAAATTAACACCGAAACAGAAAACCTACATACCGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGCT 2636

149443659 AAATATTGAGTGTGCATGGGCATAAAGATGGCACCAACAGACACTGGGGGCTACTAGAGC 149443718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 AAATATTGAGTGTGCATGGGCATAAAGATGGCACCAACAGACACTGGGGGCTACTAGAGC 2696

149443719 AGGGAGGGTGGAAGCGGGCGAGGGTTGAAAAACTATGGGAGCTATGCTCAGTAGCAGGTG 149443778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 AGGGAGGGTGGAAGCGGGCGAGGGTTGAAAAACTATGGGAGCTATGCTCAGTAGCAGGTG 2756

149443779 ATGGGATCCATATTCCAAAGCTCAGCATCACGAAACATACGCATGCAACAAACCTGTACG 149443838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 ATGGGATCCATATTCCAAAGCTCAGCATCACGAAACATACGCATGCAACAAACCTGTACG 2816

149443839 TCTATCCCCTGAATCAAAAATAAAATGTGGACATTTTTAAAGAGAGAGACAGGGAGAAAG 149443898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 TCTATCCCCTGAATCAAAAATAAAATGTGGACATTTTTAAAGAGAGAGACAGGGAGAAAG 2876

149443899 CTTCCAGCTAACCATCAGGAAGAACTTCTAGCTGGTAGTTAGAGAGAAAAGACTGCAATT 149443958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 CTTCCAGCTAACCATCAGGAAGAACTTCTAGCTGGTAGTTAGAGAGAAAAGACTGCAATT 2936

149443959 AGAAATGAGAAGGAACTAACTTCCAGGCTCTGATTCGGAAGGGCGGACTGCAGGTGAACT 149444018
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2937 AGAAATGAGAAGGAACTAACTTCCAGGCTCTGATTTGGAAGGGCGGACTGCAGGTGAACT 2996

149444019 TCAGAGCCTCTGCGTTATAGCTTGGGAGAGAGTCTGAAACGGGACCCAGGGAGAAGAACT 149444078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TCAGAGCCTCTGCGTTATAGCTTGGGAGAGAGTCTGAAACGGGACCCAGGGAGAAGAACT 3056

149444079 TCCCAAGCCTCTGAGGATCCAAATCCTGCCCGTGGGTGCCTTCCCAGCCCAAAAGACAGC 149444138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TCCCAAGCCTCTGAGGATCCAAATCCTGCCCGTGGGTGCCTTCCCAGCCCAAAAGACAGC 3116

149444139 AACAAGGC 149444146
          ||||||||
     3117 AACAAGGC 3124

Alignment time is 2.29246 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [149431738,149452163] =>     20426 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     3100] =>      3100 nucs 'mol-32-3311-129443_3100'

Score:        3088
Aligned:      3099        nucs
Identic:      3098 (100%) nucs =>      2264 (100%)       834 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [149441034,149443297] EXCISED REGION [149443299,149444133]
 second seq =>  [        1,     2264] EXCISED REGION [     2266,     3100]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [149443298,149443298]
 second seq =>         1 nucs [2265,2265]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [149443297,149443297] to [149443299,149443299]
 second seq =>         1 nucs [2264,2264] to [2266,2266]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

149441034 CATCCCCTCCCCTCACTCACACTTCAGCATCTTCACAGCCACCTTCAGGACAGCATCCTC 149441093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATCCCCTCCCCTCACTCACACTTCAGCATCTTCACAGCCACCTTCAGGACAGCATCCTC 60

149441094 CTTGCCCAGACCAAAGGCCGTGGCCTCCACCACCTTCCCAAAGGCTCCAGCTCCGAGGGT 149441153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTGCCCAGACCAAAGGCCGTGGCCTCCACCACCTTCCCAAAGGCTCCAGCTCCGAGGGT 120

149441154 CTTACCTGCCACGCACACAGGTCCCTTAAGTCCCTGGGCACCAAAGGGCCTCTGTCCAAG 149441213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTACCTGCCACGCACACAGGTCCCTTAAGTCCCTGGGCACCAAAGGGCCTCTGTCCAAG 180

149441214 GGCCCATGGGCTCCCTGCAACCCCCACAGGCCCTGTGATAGGAAGCTGTGGAGTGATGAG 149441273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCCCATGGGCTCCCTGCAACCCCCACAGGCCCTGTGATAGGAAGCTGTGGAGTGATGAG 240

149441274 CTGCCATCTCACCAAACTGCAGGTTGTTCCGGGGGAACTCCCACTTCTCGTTGTAAGGCA 149441333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGCCATCTCACCAAACTGCAGGTTGTTCCGGGGGAACTCCCACTTCTCGTTGTAAGGCA 300

149441334 GCTGCGTGGGGTCGATGAAAGTATAACTGTTGCCCTCATAGCTCTCGATGATCTTCCAGC 149441393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTGCGTGGGGTCGATGAAAGTATAACTGTTGCCCTCATAGCTCTCGATGATCTTCCAGC 360

149441394 GGACCTGGTACTTGGGCTTCTGCAGAAGAGGAAGGGAGCACGTGGCAGTCGGGGCTGGCA 149441453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGACCTGGTACTTGGGCTTCTGCAGAAGAGGAAGGGAGCACGTGGCAGTCGGGGCTGGCA 420

149441454 GGCAGTTCCTGGACCTTGTTTCTGACCCCCAAGAGCAGGGGTGTGGGCAGTCCCAAGGCG 149441513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCAGTTCCTGGACCTTGTTTCTGACCCCCAAGAGCAGGGGTGTGGGCAGTCCCAAGGCG 480

149441514 CCCAGTGGGAGAAGGCAGGGCAAGGCCTGCTCTGGGCTGAGAGAGGTCGTCTCATGAACA 149441573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCCAGTGGGAGAAGGCAGGGCAAGGCCTGCTCTGGGCTGAGAGAGGTCGTCTCATGAACA 540

149441574 TAGCACTGAGAGCATGTTCCTGCTTGACTCTGCCTTGTTGTGTGACCTTCCCTTCTCCAA 149441633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGCACTGAGAGCATGTTCCTGCTTGACTCTGCCTTGTTGTGTGACCTTCCCTTCTCCAA 600

149441634 GCCTGTTTCACTATTTGTGTATTGAAGACCTTGGACAAGACAACCTCTGAGGGCCCTGAT 149441693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCTGTTTCACTATTTGTGTATTGAAGACCTTGGACAAGACAACCTCTGAGGGCCCTGAT 660

149441694 ATCTCTGATAATCTGGTAATTCCTGAGCCAGGAGGGAGGGTGGAACTTGAGATCTTATCC 149441753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCTCTGATAATCTGGTAATTCCTGAGCCAGGAGGGAGGGTGGAACTTGAGATCTTATCC 720

149441754 ATCCGTTCATCTGTCCATCCATCTACCCATCCATCCACCCACCCAACCTCCCATCCAAAT 149441813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATCCGTTCATCTGTCCATCCATCTACCCATCCATCCACCCACCCAACCTCCCATCCAAAT 780

149441814 ATATATATATATTTTAATTGTGATAAAACATACATGAAATTTACCATTTCAACCATTTTT 149441873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATATATATATATTTTAATTGTGATAAAACATACATGAAATTTACCATTTCAACCATTTTT 840

149441874 AAGTGTATGGTTCAGTAGTATTAAGTAAATTACATTCTACCTTGTGCAACCAGTTTCCAG 149441933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGTGTATGGTTCAGTAGTATTAAGTAAATTACATTCTACCTTGTGCAACCAGTTTCCAG 900

149441934 AGCTCTTTTCATCTTGCAAAACTGAAATTCTGTTCCTGTTAAAAAGCAACTCCCCTTTCC 149441993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCTCTTTTCATCTTGCAAAACTGAAATTCTGTTCCTGTTAAAAAGCAACTCCCCTTTCC 960

149441994 CTCCTCCAGCCCCTGGCAACCATGATTCTGCTGTCTCTGTGAATTGCACTGCTCTAGGCA 149442053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCCTCCAGCCCCTGGCAACCATGATTCTGCTGTCTCTGTGAATTGCACTGCTCTAGGCA 1020

149442054 CTGCACCTCAGTGGACTCACACAGCATGTGTCTATTGAGATTGCCTTATTTCACCCAGCA 149442113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGCACCTCAGTGGACTCACACAGCATGTGTCTATTGAGATTGCCTTATTTCACCCAGCA 1080

149442114 TAATGTCTTCAAGGTTCATTCATGCTGCAGCACAGGTCAGAATTCCCTTCCTTTTTAAGG 149442173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAATGTCTTCAAGGTTCATTCATGCTGCAGCACAGGTCAGAATTCCCTTCCTTTTTAAGG 1140

149442174 CTGAATAATAGTAGCCCATCCACATACTTTCTTGAACATCTATTTGTGTCAGGCACCGCT 149442233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTGAATAATAGTAGCCCATCCACATACTTTCTTGAACATCTATTTGTGTCAGGCACCGCT 1200

149442234 GATTCAGAGTTGAACAGGACAAAGTCCCTGCCCCTCCATGGAGTTTGCATTCTAGTGGCT 149442293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATTCAGAGTTGAACAGGACAAAGTCCCTGCCCCTCCATGGAGTTTGCATTCTAGTGGCT 1260

149442294 GAGAGAGGCATTAAACGCAAATAAACATGTATCTAGGAGATTCTCAAGTGGTGCTATGAA 149442353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGAGAGGCATTAAACGCAAATAAACATGTATCTAGGAGATTCTCAAGTGGTGCTATGAA 1320

149442354 GAAAATAAAGTAAGATAAGTCAGGGAAGGCCCCTAAAGAGCCCACCATGTGACCATCAGA 149442413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAAAATAAAGTAAGATAAGTCAGGGAAGGCCCCTAAAGAGCCCACCATGTGACCATCAGA 1380

149442414 GGAAGAATTTTCCAGGAACAGTGCATGGAAATGCTGTATGCTTGACATGGGAATGATCCT 149442473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGAAGAATTTTCCAGGAACAGTGCATGGAAATGCTGTATGCTTGACATGGGAATGATCCT 1440

149442474 GGCAAGTTTGAGCTATAGGAAGGCAGCCATCATGGCTTGAGGGAAGTGGGGGGCAGATTC 149442533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGCAAGTTTGAGCTATAGGAAGGCAGCCATCATGGCTTGAGGGAAGTGGGGGGCAGATTC 1500

149442534 CAGAAACAGGAAGGCCTTGAGGGCTATGATAAGGTGAGTGGGTTCCCTTTTGGGATTTTT 149442593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGAAACAGGAAGGCCTTGAGGGCTATGATAAGGTGAGTGGGTTCCCTTTTGGGATTTTT 1560

149442594 TTTTTTCCAAGACAGGATCTCTGTCCCCCAGACTGGCATGCAGTGGGGGCAGTCTTGGCT 149442653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTTTTCCAAGACAGGATCTCTGTCCCCCAGACTGGCATGCAGTGGGGGCAGTCTTGGCT 1620

149442654 CACTACAGCCTCGACCCCCGAGGTTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGTCTCCCAAGCAGCC 149442713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACTACAGCCTCGACCCCCGAGGTTCAAGCAATCCTCCCACCTCAGTCTCCCAAGCAGCC 1680

149442714 GGGACTACAAGCATGTGGCACCACACCTGGCTAATTTTTGTAGAGACGGGGCTTTGTCGC 149442773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGGACTACAAGCATGTGGCACCACACCTGGCTAATTTTTGTAGAGACGGGGCTTTGTCGC 1740

149442774 AGCCTAGGCTGGTCTTGAACTCGTGAGCTCAAGCAGTTTGCCTGCCTCGGTCTCTCAAAG 149442833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGCCTAGGCTGGTCTTGAACTCGTGAGCTCAAGCAGTTTGCCTGCCTCGGTCTCTCAAAG 1800

149442834 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCTGGCCGGGCAGTGAGAGACCCTGAGAGTT 149442893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGCTGGGATTACAGGCATGAGCTACCATGCCTGGCCGGGCAGTGAGAGACCCTGAGAGTT 1860

149442894 TGACACAGGTGAGTCGCCATCTGACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCCTTCACT 149442953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGACACAGGTGAGTCGCCATCTGACTTTTTTTTTTTGAGACAGAGTCTTGCTCCTTCACT 1920

149442954 CATGCCGGAGTGCAGTGGCACGATCATAGCTCACTAGGCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCA 149443013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CATGCCGGAGTGCAGTGGCACGATCATAGCTCACTAGGCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCA 1980

149443014 ATCCTTCTGCCTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCATCGCACCCAGC 149443073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATCCTTCTGCCTTGGCCTCTCAAAGTGCTGGGATTATAGGCGTGAGCCATCGCACCCAGC 2040

149443074 CTTGACTTTACCTTTTTGAGAGAGAAAGAGAGACGCTGCCCACTAGATAGATTCTGGAGG 149443133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTTGACTTTACCTTTTTGAGAGAGAAAGAGAGACGCTGCCCACTAGATAGATTCTGGAGG 2100

149443134 ACCAGCACCTTTGGAAAGACCTGATTTCCTTCCTTAGGCTCTCCATGCTGTTACCACCCA 149443193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACCAGCACCTTTGGAAAGACCTGATTTCCTTCCTTAGGCTCTCCATGCTGTTACCACCCA 2160

149443194 GCCAGGGGAGGCAAGCCCTGGGATGTGGGGAGGAGGAATGGCTGCCCCTGTTTCTTGCCC 149443253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCCAGGGGAGGCAAGCCCTGGGATGTGGGGAGGAGGAATGGCTGCCCCTGTTTCTTGCCC 2220

149443254 AGGGGTCAGCTGCTGAGGGGGAGTACCATGCTAAGGGTTGCCCA 149443297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGGGGTCAGCTGCTGAGGGGGAGTACCATGCTAAGGGTTGCCCA 2264

EXCISED REGION

149443299 AAGAAATGCTGATGGAAGACCAAGTTGAGGGGGAAAGTGGAAGCTGGGCTGGGGCGGTGG 149443358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 AAGAAATGCTGATGGAAGACCAAGTTGAGGGGGAAAGTGGAAGCTGGGCTGGGGCGGTGG 2325

149443359 AGGACACTGAGGCCCTGGGTCAGCAGAGCAACTCTTTCCGGCCAGGCCTTGGGGATGGGA 149443418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 AGGACACTGAGGCCCTGGGTCAGCAGAGCAACTCTTTCCGGCCAGGCCTTGGGGATGGGA 2385

149443419 CAAGCTTGGCTGTGCCTGCAGCTGGGCTCCTTCCCTGGGCACCCGAGCTAGAAACTTAAA 149443478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 CAAGCTTGGCTGTGCCTGCAGCTGGGCTCCTTCCCTGGGCACCCGAGCTAGAAACTTAAA 2445

149443479 GGAAGTGTGGACCGGTGCTAGGGAGGAGGCTGGCCTTTAGCTGCAAGTCCTGGTTGAGAG 149443538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 GGAAGTGTGGACCGGTGCTAGGGAGGAGGCTGGCCTTTAGCTGCAAGTCCTGGTTGAGAG 2505

149443539 AGAAGATTCCAGTCATGTCCTTTGCAGCAACGTGGTGCAGCTGAAGGCCATTATCCTAAG 149443598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 AGAAGATTCCAGTCATGTCCTTTGCAGCAACGTGGTGCAGCTGAAGGCCATTATCCTAAG 2565

149443599 CAAATTAACACCGAAACAGAAAACCTACATACCGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGCT 149443658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 CAAATTAACACCGAAACAGAAAACCTACATACCGCATGTTCTCACTTATAAGTGGGAGCT 2625

149443659 AAATATTGAGTGTGCATGGGCATAAAGATGGCACCAACAGACACTGGGGGCTACTAGAGC 149443718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 AAATATTGAGTGTGCATGGGCATAAAGATGGCACCAACAGACACTGGGGGCTACTAGAGC 2685

149443719 AGGGAGGGTGGAAGCGGGCGAGGGTTGAAAAACTATGGGAGCTATGCTCAGTAGCAGGTG 149443778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 AGGGAGGGTGGAAGCGGGCGAGGGTTGAAAAACTATGGGAGCTATGCTCAGTAGCAGGTG 2745

149443779 ATGGGATCCATATTCCAAAGCTCAGCATCACGAAACATACGCATGCAACAAACCTGTACG 149443838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 ATGGGATCCATATTCCAAAGCTCAGCATCACGAAACATACGCATGCAACAAACCTGTACG 2805

149443839 TCTATCCCCTGAATCAAAAATAAAATGTGGACATTTTTAAAGAGAGAGACAGGGAGAAAG 149443898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 TCTATCCCCTGAATCAAAAATAAAATGTGGACATTTTTAAAGAGAGAGACAGGGAGAAAG 2865

149443899 CTTCCAGCTAACCATCAGGAAGAACTTCTAGCTGGTAGTTAGAGAGAAAAGACTGCAATT 149443958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 CTTCCAGCTAACCATCAGGAAGAACTTCTAGCTGGTAGTTAGAGAGAAAAGACTGCAATT 2925

149443959 AGAAATGAGAAGGAACTAACTTCCAGGCTCTGATTCGGAAGGGCGGACTGCAGGTGAACT 149444018
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2926 AGAAATGAGAAGGAACTAACTTCCAGGCTCTGATTTGGAAGGGCGGACTGCAGGTGAACT 2985

149444019 TCAGAGCCTCTGCGTTATAGCTTGGGAGAGAGTCTGAAACGGGACCCAGGGAGAAGAACT 149444078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 TCAGAGCCTCTGCGTTATAGCTTGGGAGAGAGTCTGAAACGGGACCCAGGGAGAAGAACT 3045

149444079 TCCCAAGCCTCTGAGGATCCAAATCCTGCCCGTGGGTGCCTTCCCAGCCCAAAAG 149444133
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 TCCCAAGCCTCTGAGGATCCAAATCCTGCCCGTGGGTGCCTTCCCAGCCCAAAAG 3100

Alignment time is 2.24446 s

