
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     3378] =>      3378 nucs 'mol-32-1f58-113437_3378'

Score:        3366
Aligned:      3377        nucs
Identic:      3376 (100%) nucs =>       228 (100%)      3148 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117391158,117391385] EXCISED REGION [117391387,117394535]
 second seq =>  [        1,      228] EXCISED REGION [      230,     3378]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [117391386,117391386]
 second seq =>         1 nucs [229,229]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [229,229] to [230,230]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [117391384,117391385] to [117391387,117391388]
 second seq =>         2 nucs [227,228] to [230,231]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117391158 TCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGAATAAACAAAAAAA 117391217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGAATAAACAAAAAAA 60

117391218 ATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATAAAAAATAAATGGA 117391277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATAAAAAATAAATGGA 120

117391278 GGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAATTAAAGGTCAGTTG 117391337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAATTAAAGGTCAGTTG 180

117391338 ATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAAT 117391385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAAT 228

EXCISED REGION

117391387 ATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCCTA 117391446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      230 ATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCCTA 289

117391447 CTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAAAC 117391506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      290 CTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAAAC 349

117391507 TCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAAGT 117391566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      350 TCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAAGT 409

117391567 TAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTTTC 117391626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      410 TAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTTTC 469

117391627 TTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCAC 117391686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      470 TTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCAC 529

117391687 TTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTAA 117391746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      530 TTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTAA 589

117391747 ATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTGG 117391806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      590 ATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTGG 649

117391807 GATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCTT 117391866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      650 GATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCTT 709

117391867 CGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGTA 117391926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      710 CGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGTA 769

117391927 GTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTGT 117391986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      770 GTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTGT 829

117391987 GTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCTGC 117392046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      830 GTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCTGC 889

117392047 AGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCACA 117392106
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      890 AGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCACG 949

117392107 GAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGA 117392166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 GAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGA 1009

117392167 GGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTG 117392226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 GGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTG 1069

117392227 TCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGAC 117392286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 TCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGAC 1129

117392287 ATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTA 117392346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 ATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTA 1189

117392347 ATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAA 117392406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 ATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAA 1249

117392407 TAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTG 117392466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 TAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTG 1309

117392467 TCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGT 117392526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 TCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGT 1369

117392527 ACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAAT 117392586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 ACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAAT 1429

117392587 GTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTG 117392646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 GTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTG 1489

117392647 AGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTTTT 117392706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 AGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTTTT 1549

117392707 TTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATA 117392766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 TTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATA 1609

117392767 AATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAA 117392826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 AATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAA 1669

117392827 TATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGA 117392886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 TATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGA 1729

117392887 GTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCC 117392946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 GTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCC 1789

117392947 ATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAA 117393006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 ATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAA 1849

117393007 AAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACT 117393066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 AAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACT 1909

117393067 AAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACA 117393126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 AAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACA 1969

117393127 GGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAA 117393186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 GGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAA 2029

117393187 ATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTT 117393246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 ATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTT 2089

117393247 AAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAA 117393306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 AAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAA 2149

117393307 AAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGA 117393366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 AAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGA 2209

117393367 AAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGA 117393426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 AAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGA 2269

117393427 CAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAG 117393486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 CAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAG 2329

117393487 CAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGA 117393546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 CAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGA 2389

117393547 CAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAA 117393606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 CAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAA 2449

117393607 TCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTGGC 117393666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 TCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTGGC 2509

117393667 CTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTC 117393726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 CTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTC 2569

117393727 AGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGG 117393786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 AGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGG 2629

117393787 AGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTA 117393846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 AGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTA 2689

117393847 AGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGC 117393906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 AGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGC 2749

117393907 AACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATT 117393966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 AACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATT 2809

117393967 ACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 117394026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 ACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 2869

117394027 TATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCT 117394086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 TATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCT 2929

117394087 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTT 117394146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTT 2989

117394147 AGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAACCA 117394206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 AGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAACCA 3049

117394207 TTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGAT 117394266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 TTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGAT 3109

117394267 GTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATA 117394326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3110 GTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATA 3169

117394327 TGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCG 117394386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3170 TGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCG 3229

117394387 AAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACC 117394446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3230 AAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACC 3289

117394447 TACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACTTT 117394506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3290 TACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACTTT 3349

117394507 TAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTC 117394535
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3350 TAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTC 3378

Alignment time is 3.19011 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     2185] =>      2185 nucs 'mol-32-2081-108388_2185'

Score:        2185
Aligned:      2185        nucs
Identic:      2185 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117392820,117395004]
 second seq =>  [        1,     2185]

117392820 CCTGCAATATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAA 117392879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTGCAATATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAA 60

117392880 TAACAGAGTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTT 117392939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAACAGAGTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTT 120

117392940 TCAATCCATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAA 117392999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAATCCATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAA 180

117393000 AGAGGAAAAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACG 117393059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAGGAAAAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACG 240

117393060 CAAAACTAAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTA 117393119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAAAACTAAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTA 300

117393120 ACATACAGGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTC 117393179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACATACAGGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTC 360

117393180 CATTGAAATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGAC 117393239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATTGAAATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGAC 420

117393240 AAGTGTTAAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATA 117393299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGTGTTAAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATA 480

117393300 AATGGAAAAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAA 117393359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AATGGAAAAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAA 540

117393360 AAACCGAAAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGA 117393419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAACCGAAAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGA 600

117393420 ATGGAGACAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAA 117393479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGGAGACAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAA 660

117393480 TATCCAGCAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAA 117393539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATCCAGCAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAA 720

117393540 AAAATGACAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAA 117393599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAATGACAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAA 780

117393600 TAAAGAATCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCA 117393659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAAAGAATCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCA 840

117393660 AATTGGCCTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTC 117393719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATTGGCCTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTC 900

117393720 TTCACTCAGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCA 117393779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCACTCAGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCA 960

117393780 AGAGTGGAGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATT 117393839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAGTGGAGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATT 1020

117393840 TTCCTTAAGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGC 117393899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTCCTTAAGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGC 1080

117393900 TCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGC 117393959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGC 1140

117393960 TGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGG 117394019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGG 1200

117394020 GTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCC 117394079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCC 1260

117394080 TTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGA 117394139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGA 1320

117394140 TGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCT 117394199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCT 1380

117394200 TAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAA 117394259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAA 1440

117394260 AGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAAT 117394319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAAT 1500

117394320 CAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTT 117394379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTT 1560

117394380 ACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTAT 117394439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTAT 1620

117394440 TTTTACCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGA 117394499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTTACCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGA 1680

117394500 GTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAAT 117394559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAAT 1740

117394560 CAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAA 117394619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAA 1800

117394620 TTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCT 117394679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCT 1860

117394680 CAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAA 117394739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAA 1920

117394740 ATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATACCTCTCAAATTAAGAAA 117394799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATACCTCTCAAATTAAGAAA 1980

117394800 TAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGATCAGACCATGTCTCTC 117394859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGATCAGACCATGTCTCTC 2040

117394860 AGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGGAAACAACAGTATTATT 117394919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGGAAACAACAGTATTATT 2100

117394920 TTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTCATCCAAATGTGCTAGG 117394979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTCATCCAAATGTGCTAGG 2160

117394980 CATACTTACAGTTTTTTCATTCTTT 117395004
          |||||||||||||||||||||||||
     2161 CATACTTACAGTTTTTTCATTCTTT 2185

Alignment time is 1.80802 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     2057] =>      2057 nucs 'mol-32-208c-080764_2057'

Score:        2002
Aligned:      2057        nucs
Identic:      2052 (100%) nucs =>       613 (100%)      1439 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117386485,117387098] EXCISED REGION [117393884,117395326]
 second seq =>  [        1,      614] EXCISED REGION [      615,     2057]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6785 nucs [117387099,117393883]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387099,117387099] to [117393884,117393884]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387098,117387098] to [117393884,117393884]
 second seq =>         1 nucs [614,614] to [615,615]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117386485 TGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATTGTTCACACAGTCTCAAATGTGAATATTTACA 117386544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATTGTTCACACAGTCTCAAATGTGAATATTTACA 60

117386545 GCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAACATCAACAGGTGAACAGATAAA 117386604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAACATCAACAGGTGAACAGATAAA 120

117386605 CACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCATCAGTAAGAAATATTAAACTA 117386664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCATCAGTAAGAAATATTAAACTA 180

117386665 TTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAACA 117386724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAACA 240

117386725 TTTTATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAGT 117386784
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTATAAAACTACATATTATAAGATCCTATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAGT 300

117386785 AGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTACA 117386844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTACA 360

117386845 AAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGAA 117386904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGAA 420

117386905 TGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGAT 117386964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGAT 480

117386965 TGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAAA 117387024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAAA 540

117387025 ATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATACT 117387084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATACT 600

117387085 GACAGACCTAATCG 117387098
          ||||||||||||||
      601 GACAGACCTAATCG 614

EXCISED REGION

117393884 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 117393943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      615 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 674

117393944 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 117394003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 734

117394004 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 117394063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 794

117394064 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 117394123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      795 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 854

117394124 CTGGCCTACCTGATGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 117394183
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 CTGGCCTACCTGTTGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 914

117394184 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 117394243
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 AATTTTTCTTATTGCTTAAACTATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 974

117394244 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 117394303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 1034

117394304 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 117394363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 1094

117394364 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 117394423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 1154

117394424 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 117394483
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCACTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 1214

117394484 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 117394543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 1274

117394544 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 117394603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 1334

117394604 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 117394663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 1394

117394664 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 117394723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 1454

117394724 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 117394783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 1514

117394784 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 117394843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 1574

117394844 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 117394903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 1634

117394904 AAACAACAGTATTATTTTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 117394963
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 AAACAACAGTATTATTTTGTTTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 1694

117394964 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 117395023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 1754

117395024 TTTAGGCATTTATTTTACTGTTGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAAT 117395083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 TTTAGGCATTTATTTTACTGTTGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAAT 1814

117395084 GAGTAGGGCTGTTTTGAACACTCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTT 117395143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 GAGTAGGGCTGTTTTGAACACTCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTT 1874

117395144 TCTGTTGAGTGTATAAACAGAAGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTG 117395203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 TCTGTTGAGTGTATAAACAGAAGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTG 1934

117395204 TTAATGTATACTGGTAGTTTTGCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATG 117395263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 TTAATGTATACTGGTAGTTTTGCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATG 1994

117395264 TCTATGAATATTGGTTATGCTACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATAC 117395323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 TCTATGAATATTGGTTATGCTACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATAC 2054

117395324 AGT 117395326
          |||
     2055 AGT 2057

Alignment time is 1.97351 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     5070] =>      5070 nucs 'mol-32-22bd-026504_5070'

Score:        5003
Aligned:      5069        nucs
Identic:      5063 (100%) nucs =>       320 (100%)      4743 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117390044,117390363] EXCISED REGION [117390365,117395113]
 second seq =>  [        1,      320] EXCISED REGION [      322,     5070]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [117390364,117390364]
 second seq =>         1 nucs [321,321]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117390364,117390364] to [117390365,117390365]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117390044 GTGAAGAGCAGACTGACATTTGAGTCAGTGGACTGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGT 117390103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGAAGAGCAGACTGACATTTGAGTCAGTGGACTGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGT 60

117390104 GAGTGGGCACCATCCAATGGGCTGCCAGTGCCACTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTG 117390163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGTGGGCACCATCCAATGGGCTGCCAGTGCCACTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTG 120

117390164 GAATAACCTTGCTTGCTTAGTCTTCTGGCTTTCCTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTT 117390223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAATAACCTTGCTTGCTTAGTCTTCTGGCTTTCCTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTT 180

117390224 GCCCTTGGACATAAGAGTCCAGGTTCTTCTGCCTTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGG 117390283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCCTTGGACATAAGAGTCCAGGTTCTTCTGCCTTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGG 240

117390284 TTTGCTGGGGACTCCTGGGCCTTCGGCCACAGACTGAAGTCTGCACTGTCAGCGTCCTTA 117390343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTGCTGGGGACTCCTGGGCCTTCGGCCACAGACTGAAGTCTGCACTGTCAGCGTCCTTA 300

117390344 CTTGTGAGGTTTCTGGACTC 117390363
          ||||||||||||||||||||
      301 CTTGTGAGGTTTCTGGACTC 320

EXCISED REGION

117390365 GACTGAGCCACTACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGGAGTTTACCTT 117390424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      322 GACTGAGCCACTACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGGAGTTTACCTT 381

117390425 GTGATTGTGTGAGCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACATGTATCCTATT 117390484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      382 GTGATTGTGTGAGCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACATGTATCCTATT 441

117390485 CATTCTGTCCCTCTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGATAAACACTGAT 117390544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      442 CATTCTGTCCCTCTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGATAAACACTGAT 501

117390545 TGGACAAAGATTGTGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAATAAGAGTGAC 117390604
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      502 TGGACAAAGATTGCGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAATAAGAGTGAC 561

117390605 ATTGGGAGCTAAATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTAATGCCACAAT 117390664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      562 ATTGGGAGCTAAATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTAATGCCACAAT 621

117390665 AGAGAAATTGATAGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAGCAAACACCAA 117390724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      622 AGAGAAATTGATAGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAGCAAACACCAA 681

117390725 ACACCATACAAAATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAACTGGAGGTAAA 117390784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      682 ACACCATACAAAATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAACTGGAGGTAAA 741

117390785 ATAGTCTGACTAAGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTTAGTTTGATTA 117390844
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      742 ATAGTCTGACTAAGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTTAGTTTTATTA 801

117390845 TTAAATTAGGCACAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATACATAGAATAA 117390904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      802 TTAAATTAGGCACAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATACATAGAATAA 861

117390905 TCTCTACAATGCAAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGTGATTGCTTCT 117390964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      862 TCTCTACAATGCAAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGTGATTGCTTCT 921

117390965 GGGGGCATATTTCTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTTC 117391024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      922 GGGGGCATATTTCTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTTC 981

117391025 CTAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGA 117391084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      982 CTAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGA 1041

117391085 AATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGG 117391144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1042 AATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGG 1101

117391145 AAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGA 117391204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1102 AAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGA 1161

117391205 ATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATA 117391264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1162 ATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATA 1221

117391265 AAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAAT 117391324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1222 AAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAAT 1281

117391325 TAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAA 117391384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1282 TAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAA 1341

117391385 TCATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCC 117391444
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1342 TAATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCC 1401

117391445 TACTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAA 117391504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1402 TACTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAA 1461

117391505 ACTCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAA 117391564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1462 ACTCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAA 1521

117391565 GTTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTT 117391624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1522 GTTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTT 1581

117391625 TCTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGC 117391684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1582 TCTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGC 1641

117391685 ACTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTT 117391744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1642 ACTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTT 1701

117391745 AAATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGT 117391804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 AAATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGT 1761

117391805 GGGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGC 117391864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 GGGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGC 1821

117391865 TTCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAG 117391924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 TTCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAG 1881

117391925 TAGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCT 117391984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 TAGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCT 1941

117391985 GTGTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCT 117392044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 GTGTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCT 2001

117392045 GCAGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCA 117392104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 GCAGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCA 2061

117392105 CAGAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAA 117392164
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 CGGAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAA 2121

117392165 GAGGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACC 117392224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 GAGGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACC 2181

117392225 TGTCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATG 117392284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 TGTCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATG 2241

117392285 ACATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAG 117392344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 ACATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAG 2301

117392345 TAATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTA 117392404
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 TAATTTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTA 2361

117392405 AATAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTC 117392464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 AATAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTC 2421

117392465 TGTCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCG 117392524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 TGTCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCG 2481

117392525 GTACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAA 117392584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 GTACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAA 2541

117392585 ATGTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAAC 117392644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 ATGTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAAC 2601

117392645 TGAGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTT 117392704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 TGAGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTT 2661

117392705 TTTTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGA 117392764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 TTTTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGA 2721

117392765 TAAATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGC 117392824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2722 TAAATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGC 2781

117392825 AATATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACA 117392884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2782 AATATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACA 2841

117392885 GAGTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAAT 117392944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2842 GAGTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAAT 2901

117392945 CCATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGG 117393004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2902 CCATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGG 2961

117393005 AAAAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAA 117393064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2962 AAAAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAA 3021

117393065 CTAAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATA 117393124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3022 CTAAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATA 3081

117393125 CAGGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTG 117393184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3082 CAGGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTG 3141

117393185 AAATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTG 117393244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3142 AAATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTG 3201

117393245 TTAAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGG 117393304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3202 TTAAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGG 3261

117393305 AAAAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACC 117393364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3262 AAAAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACC 3321

117393365 GAAAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGA 117393424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3322 GAAAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGA 3381

117393425 GACAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCC 117393484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3382 GACAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCC 3441

117393485 AGCAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAAT 117393544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3442 AGCAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAAT 3501

117393545 GACAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAG 117393604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3502 GACAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAG 3561

117393605 AATCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTG 117393664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3562 AATCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTG 3621

117393665 GCCTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCAC 117393724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3622 GCCTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCAC 3681

117393725 TCAGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGT 117393784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3682 TCAGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGT 3741

117393785 GGAGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCT 117393844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3742 GGAGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCT 3801

117393845 TAAGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACT 117393904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3802 TAAGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACT 3861

117393905 GCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGA 117393964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3862 GCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGA 3921

117393965 TTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 117394024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3922 TTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 3981

117394025 ACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGC 117394084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3982 ACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGC 4041

117394085 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATT 117394144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     4042 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATAATT 4101

117394145 TTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAAC 117394204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4102 TTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAAC 4161

117394205 CATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGG 117394264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4162 CATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGG 4221

117394265 ATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAA 117394324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4222 ATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAA 4281

117394325 TATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATC 117394384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4282 TATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATC 4341

117394385 CGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTA 117394444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4342 CGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTA 4401

117394445 CCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACT 117394504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4402 CCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACT 4461

117394505 TTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAAT 117394564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4462 TTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAAT 4521

117394565 AAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTT 117394624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4522 AAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTT 4581

117394625 GGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATT 117394684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4582 GGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATT 4641

117394685 TCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAAATCTT 117394744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4642 TCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAAATCTT 4701

117394745 AGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATACCTCTCAAATTAAGAAATAGAA 117394804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4702 AGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATACCTCTCAAATTAAGAAATAGAA 4761

117394805 TACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGATCAGACCATGTCTCTCAGCAT 117394864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4762 TACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGATCAGACCATGTCTCTCAGCAT 4821

117394865 AAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGGAAACAACAGTATTATTTTGTG 117394924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4822 AAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGGAAACAACAGTATTATTTTGTG 4881

117394925 TCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTCATCCAAATGTGCTAGGCATAC 117394984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4882 TCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTCATCCAAATGTGCTAGGCATAC 4941

117394985 TTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAATTTAGGCATTTATTTTACTGT 117395044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4942 TTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAATTTAGGCATTTATTTTACTGT 5001

117395045 TGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAATGAGTAGGGCTGTTTTGAACAC 117395104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5002 TGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAATGAGTAGGGCTGTTTTGAACAC 5061

117395105 TCTTAAATA 117395113
          |||||||||
     5062 TCTTAAATA 5070

Alignment time is 4.73139 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     3461] =>      3461 nucs 'mol-32-2383-083383_3461'

Score:        3460
Aligned:      3460        nucs
Identic:      3460 (100%) nucs =>       464 (100%)      2996 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117391642,117392105] EXCISED REGION [117392107,117395102]
 second seq =>  [        1,      464] EXCISED REGION [      466,     3461]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [117392106,117392106]
 second seq =>         1 nucs [465,465]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [465,465] to [466,466]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117391642 TGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCACTTCTCTCCCATGTCT 117391701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCACTTCTCTCCCATGTCT 60

117391702 GCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTAAATGTCAGAGCCATTC 117391761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTAAATGTCAGAGCCATTC 120

117391762 CTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTGGGATTTGCAAAAGCAG 117391821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTGGGATTTGCAAAAGCAG 180

117391822 GACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCTTCGATTTAACTTTCAA 117391881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCTTCGATTTAACTTTCAA 240

117391882 CACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGTAGTTGAGCTGGGAACA 117391941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGTAGTTGAGCTGGGAACA 300

117391942 ATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTGTGTATATTTGAGTTAT 117392001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTGTGTATATTTGAGTTAT 360

117392002 TGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCTGCAGCCCACTGTGTTAA 117392061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCTGCAGCCCACTGTGTTAA 420

117392062 CTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCAC 117392105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCAC 464

EXCISED REGION

117392107 GAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGA 117392166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      466 GAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGA 525

117392167 GGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTG 117392226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      526 GGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTG 585

117392227 TCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGAC 117392286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      586 TCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGAC 645

117392287 ATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTA 117392346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      646 ATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTA 705

117392347 ATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAA 117392406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      706 ATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAA 765

117392407 TAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTG 117392466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      766 TAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTG 825

117392467 TCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGT 117392526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      826 TCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGT 885

117392527 ACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAAT 117392586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      886 ACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAAT 945

117392587 GTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTG 117392646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      946 GTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTG 1005

117392647 AGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTTTT 117392706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1006 AGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTTTT 1065

117392707 TTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATA 117392766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1066 TTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATA 1125

117392767 AATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAA 117392826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1126 AATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAA 1185

117392827 TATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGA 117392886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1186 TATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGA 1245

117392887 GTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCC 117392946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1246 GTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCC 1305

117392947 ATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAA 117393006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1306 ATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAA 1365

117393007 AAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACT 117393066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1366 AAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACT 1425

117393067 AAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACA 117393126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1426 AAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACA 1485

117393127 GGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAA 117393186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1486 GGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAA 1545

117393187 ATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTT 117393246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1546 ATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTT 1605

117393247 AAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAA 117393306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1606 AAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAA 1665

117393307 AAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGA 117393366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 AAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGA 1725

117393367 AAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGA 117393426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 AAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGA 1785

117393427 CAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAG 117393486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 CAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAG 1845

117393487 CAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGA 117393546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 CAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGA 1905

117393547 CAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAA 117393606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 CAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAA 1965

117393607 TCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTGGC 117393666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 TCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTGGC 2025

117393667 CTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTC 117393726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 CTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTC 2085

117393727 AGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGG 117393786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 AGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGG 2145

117393787 AGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTA 117393846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 AGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTA 2205

117393847 AGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGC 117393906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 AGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGC 2265

117393907 AACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATT 117393966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 AACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATT 2325

117393967 ACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 117394026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 ACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 2385

117394027 TATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCT 117394086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 TATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCT 2445

117394087 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTT 117394146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTT 2505

117394147 AGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAACCA 117394206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 AGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAACCA 2565

117394207 TTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGAT 117394266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 TTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGAT 2625

117394267 GTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATA 117394326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 GTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATA 2685

117394327 TGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCG 117394386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 TGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCG 2745

117394387 AAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACC 117394446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 AAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACC 2805

117394447 TACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACTTT 117394506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 TACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACTTT 2865

117394507 TAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAATAA 117394566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 TAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAATAA 2925

117394567 AATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGG 117394626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 AATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGG 2985

117394627 AGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATTTC 117394686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 AGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATTTC 3045

117394687 CTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAAATCTTAG 117394746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 CTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAAATCTTAG 3105

117394747 GTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATACCTCTCAAATTAAGAAATAGAATA 117394806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 GTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATACCTCTCAAATTAAGAAATAGAATA 3165

117394807 CCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGATCAGACCATGTCTCTCAGCATAA 117394866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 CCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGATCAGACCATGTCTCTCAGCATAA 3225

117394867 GTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGGAAACAACAGTATTATTTTGTGTC 117394926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 GTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGGAAACAACAGTATTATTTTGTGTC 3285

117394927 TGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTCATCCAAATGTGCTAGGCATACTT 117394986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 TGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTCATCCAAATGTGCTAGGCATACTT 3345

117394987 ACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAATTTAGGCATTTATTTTACTGTTG 117395046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 ACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAATTTAGGCATTTATTTTACTGTTG 3405

117395047 ATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAATGAGTAGGGCTGTTTTGAAC 117395102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 ATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAATGAGTAGGGCTGTTTTGAAC 3461

Alignment time is 3.53507 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     2335] =>      2335 nucs 'mol-32-29b3-066412_2335'

Score:        2202
Aligned:      2278        nucs
Identic:      2267 (100%) nucs =>      1599 ( 99%)       668 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117385491,117387098] EXCISED REGION [117393884,117394553]
 second seq =>  [       65,     1665] EXCISED REGION [     1666,     2335]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6785 nucs [117387099,117393883]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387099,117387099] to [117393884,117393884]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387098,117387098] to [117393884,117393884]
 second seq =>         1 nucs [1665,1665] to [1666,1666]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117385491 GGAAATAATAGACTTCATAAATAGACCCACATATTTATTTACTATATAAGTATATATATT 117385550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       65 GGAAATAATAGACTTCATAAATAGACCCACATATTTATTTACTATATAAGTATATATATT 124

117385551 TACCATTCATATGTATATATTTACCATATGTGGGTAAATATACAATGTGAGTCTATATAT 117385610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      125 TACCATTCATATGTATATATTTACCATATGTGGGTAAATATACAATGTGAGTCTATATAT 184

117385611 ATTTACATATATATGTATTTACCACATAAATATTTGCCATATATGTATATATACAGAATA 117385670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      185 ATTTACATATATATGTATTTACCACATAAATATTTGCCATATATGTATATATACAGAATA 244

117385671 TGGTAAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGAGACACATGTATCATATAT 117385730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||
      245 TGGTAAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT------ATGAGACACATGTATCATATAT 298

117385731 ACGGTAAATTTTTTTCAAAAATTGTGTCAAGGAGTTCAACGAAAAGCATTATTTTTAATA 117385790
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      299 ACGGTAAATTTTTTTCAAAAATTGTGTCAAGGAGTTCAACGAAAAACATTATTTTTAATA 358

117385791 ACTGGTGCTGAAACAATTGGATATTCATGTACACACATAACAAAAACCCACAACAAAACT 117385850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 ACTGGTGCTGAAACAATTGGATATTCATGTACACACATAACAAAAACCCACAACAAAACT 418

117385851 AACCTCAATTTTAATATGAGCATAAATGAAAATTTCCTAAAAATGCATCATAAATCTAGT 117385910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 AACCTCAATTTTAATATGAGCATAAATGAAAATTTCCTAAAAATGCATCATAAATCTAGT 478

117385911 TGTAAAACATAAGAAAATAAATCTTAGAAAACATAGTAGAAAATTTTTGTGACTTTTTAG 117385970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 TGTAAAACATAAGAAAATAAATCTTAGAAAACATAGTAGAAAATTTTTGTGACTTTTTAG 538

117385971 GTAAAGATTTCTCAGTACACAAAAAGTAGAAATTATTAAAATAATTGATAATTTGAACTT 117386030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 GTAAAGATTTCTCAGTACACAAAAAGTAGAAATTATTAAAATAATTGATAATTTGAACTT 598

117386031 TATCAAAACTGAAAAATTGCCCTAGGAAAAAAAATAAAATTAAAAAGTGAGCCAAAGATA 117386090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 TATCAAAACTGAAAAATTGCCCTAGGAAAAAAAATAAAATTAAAAAGTGAGCCAAAGATA 658

117386091 GAGTAAATATATTCAAAAAATGTATTCAATAGAGCAATTTTATCCAAAAAATAGAGAACA 117386150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 GAGTAAATATATTCAAAAAATGTATTCAATAGAGCAATTTTATCCAAAAAATAGAGAACA 718

117386151 TTAAAAAAAGACAAATTTAATAAATCTTTTACTAAAGAAGATATGCAAATAGCAAAAAGC 117386210
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 TTAAAAAA-GACAAATTTAATAAATCTTTTACTAAAGAAGATATGCAAATAGCAAAAAGC 777

117386211 ACATGCAAATATGCTTAACATGATTAGTCATTAGGGAAACAAAAATTAAAACCACAATAA 117386270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 ACATGCAAATATGCTTAACATGATTAGTCATTAGGGAAACAAAAATTAAAACCACAATAA 837

117386271 GATACCAATAAACTCCACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAGTGCTG 117386330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 GATACCAATAAACTCCACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAGTGCTG 897

117386331 GCAAGAATGTTGAAAACCTGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAA 117386390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 GCAAGAATGTTGAAAACCTGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAA 957

117386391 TGGTGAAGTCATGTTGGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAATGAACACCTAATACACA 117386450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      958 TGGTGAAGTCATGTTGGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAACGAACACCTAATACACA 1017

117386451 ACTAGCTATTCCCCTCCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAAC 117386510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 ACTAGCTATTCCCCTCCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAAC 1077

117386511 ATTGTTCACACAGTCTCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAA 117386570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 ATTGTTCACACAGTCTCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAA 1137

117386571 TTAGAAACAAAACATCAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAA 117386630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 TTAGAAACAAAACATCAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAA 1197

117386631 ATACTACTATTCATCAGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAA 117386690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 ATACTACTATTCATCAGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAA 1257

117386691 CTTCAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGAT 117386750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 CTTCAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGAT 1317

117386751 TCTATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTAT 117386810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 TCTATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTAT 1377

117386811 CTGAGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGT 117386870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CTGAGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGT 1437

117386871 TGATGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTA 117386930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TGATGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTA 1497

117386931 ACATTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCA 117386990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 ACATTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCA 1557

117386991 ACAAAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTA 117387050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 ACAAAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTA 1617

117387051 ATAAAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCG 117387098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 ATAAAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCG 1665

EXCISED REGION

117393884 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 117393943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1666 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 1725

117393944 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 117394003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 1785

117394004 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 117394063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 1845

117394064 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 117394123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 1905

117394124 CTGGCCTACCTGATGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 117394183
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 CTGGCCTACCTGTTGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 1965

117394184 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 117394243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 2025

117394244 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 117394303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 2085

117394304 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 117394363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 2145

117394364 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 117394423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 2205

117394424 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 117394483
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCACTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 2265

117394484 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 117394543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 2325

117394544 TGCTTTATGT 117394553
          ||||||||||
     2326 TGCTTTATGT 2335

Alignment time is 2.18271 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     6440] =>      6440 nucs 'mol-32-29ea-010406_6440'

Score:        6316
Aligned:      6447        nucs
Identic:      6431 (100%) nucs =>      4656 (100%)      1775 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117382431,117387098] EXCISED REGION [117393884,117395662]
 second seq =>  [        1,     4661] EXCISED REGION [     4662,     6440]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6785 nucs [117387099,117393883]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387099,117387099] to [117393884,117393884]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387098,117387098] to [117393884,117393884]
 second seq =>         1 nucs [4661,4661] to [4662,4662]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117382431 AGGCAGGAAGAGCACTTAAGGCCAGGAGTTTGAAAACAGTCTGGGCAAGGTTAGCAAGAC 117382490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGCAGGAAGAGCACTTAAGGCCAGGAGTTTGAAAACAGTCTGGGCAAGGTTAGCAAGAC 60

117382491 CCCATCTTTAACAAAAACTTTATTTTTTATTAGCTGGGCATAGTGTCAAATGCCTGTAGT 117382550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCATCTTTAACAAAAACTTTATTTTTTATTAGCTGGGCATAGTGTCAAATGCCTGTAGT 120

117382551 CCTAGTTACTCAGGTGGCTGATGCAGAATGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTCCAGGTTATT 117382610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTAGTTACTCAGGTGGCTGATGCAGAATGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTCCAGGTTATT 180

117382611 GAGCTGTGATTATGCCACTGCAACTCCTGACTAGGTAATAAAGTGAGATCCACTTTCTAA 117382670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGCTGTGATTATGCCACTGCAACTCCTGACTAGGTAATAAAGTGAGATCCACTTTCTAA 240

117382671 AAAAATAAAAATAAAAACAAAAAAATGTCATCATTGAGCCAACAAATAGGGTATCTAACA 117382730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAATAAAAATAAAAACAAAAAAATGTCATCATTGAGCCAACAAATAGGGTATCTAACA 300

117382731 GAAAAGTTAACAAAGAAGAAAGTTAAAGAGATTAAAAGGATAATAACAAGTGAAAGTTTC 117382790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAAAAGTTAACAAAGAAGAAAGTTAAAGAGATTAAAAGGATAATAACAAGTGAAAGTTTC 360

117382791 ACTAGATGGGCTCAATGGCAGATTTGAGATGGCAAATGTAAGAAACAATAACAACTAAAA 117382850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTAGATGGGCTCAATGGCAGATTTGAGATGGCAAATGTAAGAAACAATAACAACTAAAA 420

117382851 ATCAGTAGAATTATCCCATCCCAAAACAATGAAAAAATCTTGAAAGTGCCAAGAAAAAGC 117382910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCAGTAGAATTATCCCATCCCAAAACAATGAAAAAATCTTGAAAGTGCCAAGAAAAAGC 480

117382911 ACCACACATCACATACATAGTAACAATAATATAATTAATAAAACAGTTCTAAAAACTCTA 117382970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCACACATCACATACATAGTAACAATAATATAATTAATAAAACAGTTCTAAAAACTCTA 540

117382971 TGTATATGTGCGTGTGTATATATATTTTTTCTTATGCTCTTGAATAATCATATAACTGTT 117383030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      541 TGTATATGTGCGTGTGTATATATATTTTTTCTTATGCTCTTGAATAATCATATAACTGAT 600

117383031 TAAAGAACAAACGATAGCATTGTATTGTCAGGCTTATAACATCGCTAGATAAGGGAAGAA 117383090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAAGAACAAACGATAGCATTGTATTGTCAGGCTTATAACATCGCTAGATAAGGGAAGAA 660

117383091 ACTGAGATACATCATTGTGAAATTAATATATTTTACTGGGACTAAGTCATTATTTGTGGT 117383150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTGAGATACATCATTGTGAAATTAATATATTTTACTGGGACTAAGTCATTATTTGTGGT 720

117383151 CAATAGTGGCAGTTTAAATATGTATATCATAATATCTAGAGCCACTGAAATTGACTAAAA 117383210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAATAGTGGCAGTTTAAATATGTATATCATAATATCTAGAGCCACTGAAATTGACTAAAA 780

117383211 AATTTTTAAACATTCATAAAAGAATTAAAAACTTGTTTAATTTTTTAATAAAGTTGTTTT 117383270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AATTTTTAAACATTCATAAAAGAATTAAAAACTTGTTTAATTTTTTAATAAAGTTGTTTT 840

117383271 TAATTTTGTTCTTTAATAAAGTTATTTAATAAATATTTTTAAACAAATTAGACAAATGGA 117383330
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAATTTTGTTCCTTAATAAAGTTATTTAATAAATATTTTTAAACAAATTAGACAAATGGA 900

117383331 AGATAGATGTGAGACAAATATAAATGGAAGCAACATAGCAGTTCCAATCTTAACCATACC 117383390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGATAGATGTGAGACAAATATAAATGGAAGCAACATAGCAGTTCCAATCTTAACCATACC 960

117383391 AATGATTACATTAAATATGAATTGATTAACTCGAAAGGCAGAGATTGTCGGACGAGATTG 117383450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATGATTACATTAAATATGAATTGATTAACTCGAAAGGCAGAGATTGTCGGACGAGATTG 1020

117383451 AAAAAGCAAAATCCAACTATATGCTATCTAAAAGAGATGAACTTTATATTTAAAGACAAA 117383510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAAAAGCAAAATCCAACTATATGCTATCTAAAAGAGATGAACTTTATATTTAAAGACAAA 1080

117383511 TTCAAATTCAAGCACAATTCAAGTTTATATATATAAATAGGTTGAAATTTAAAAGATAAA 117383570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCAAATTCAAGCACAATTCAAGTTTATATATATAAATAGGTTGAAATTTAAAAGATAAA 1140

117383571 AAAGATATACAAACAATAACCATAAGTGAGCTGGAGTGGGTACTTTAAGCTCACACAAAA 117383630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAGATATACAAACAATAACCATAAGTGAGCTGGAGTGGGTACTTTAAGCTCACACAAAA 1200

117383631 TAGACATGAAAACAAAGGTTAATGCTAGAGACAAGAACATTTTATAATGATGAATGTGTC 117383690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGACATGAAAACAAAGGTTAATGCTAGAGACAAGAACATTTTATAATGATGAATGTGTC 1260

117383691 AATTTATCAGTATAAATTAACATTCATAAATGTATATGCAGCTAACAACAAAGCCTCAAA 117383750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATTTATCAGTATAAATTAACATTCATAAATGTATATGCAGCTAACAACAAAGCCTCAAA 1320

117383751 AATACACAAAGCAAAACTAACTTCTATTAAAAGAAGTAAAGAAAAATTCAATAATTACAG 117383810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AATACACAAAGCAAAACTAACTTCTATTAAAAGAAGTAAAGAAAAATTCAATAATTACAG 1380

117383811 TTAATTTTAACACTTCTGTCTCAGTAATTGATAGGACTAGTAGACAAAAAATTGGTAAGG 117383870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTAATTTTAACACTTCTGTCTCAGTAATTGATAGGACTAGTAGACAAAAAATTGGTAAGG 1440

117383871 AAACTGAATGTAACAATTTTATTAAGCAACAAAACCTATCTGACAAATATAGAACACTCT 117383930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAACTGAATGTAACAATTTTATTAAGCAACAAAACCTATCTGACAAATATAGAACACTCT 1500

117383931 ATTCCACAACAGTAGAATATATTTATTTTCAAGTGCAAATAAAAATATCCCATGGGAATA 117383990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTCCACAACAGTAGAATATATTTATTTTCAAGTGCAAATAAAAATATCCCATGGGAATA 1560

117383991 AAATTTACATTAGACTATAAAACATTTTAAAGAATTGAAATAATGTGTTTTTCTATCCAC 117384050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAATTTACATTAGACTATAAAACATTTTAAAGAATTGAAATAATGTGTTTTTCTATCCAC 1620

117384051 ACTAGAATTAGAAATCAATAACAGAAAAAATCTAGAAAATACTAAAACATGAAAAATCAA 117384110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTAGAATTAGAAATCAATAACAGAAAAAATCTAGAAAATACTAAAACATGAAAAATCAA 1680

117384111 GTAATATATTCCTAAATTAACATGGCTCAAAGAAAAAATATAAATATACGGAAATATATT 117384170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTAATATATTCCTAAATTAACATGGCTCAAAGAAAAAATATAAATATACGGAAATATATT 1740

117384171 AAAAACACAAAATATTGAAACTTTAAATATTTCTTCTAAGAGCAGGAAATGAACTAAAAT 117384230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAAAACACAAAATATTGAAACTTTAAATATTTCTTCTAAGAGCAGGAAATGAACTAAAAT 1800

117384231 CAACTCATATAAGCTTCCAAAATCAACTCATATAAGCTTCCAACTTAAGCTTTTAGAAAA 117384290
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAACTCATATAAGCTTCCAAAATCAACTCGTATAAGCTTCCAACTTAAGCTTTTAGAAAA 1860

117384291 AGAAAAGGAAATCAAATCTAGGTGAGTAGAATGAATAAAATTTTTAAAAAAAATCACAGT 117384350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAAAAGGAAATCAAATCTAGGTGAGTAGAATGAATAAAATTTTTAAAAAAAATCACAGT 1920

117384351 AGAGATCAACACTTTTTTAAGTAAATTACAGATAAGTTCTTTTTTTTCAAGATTTTGTGT 117384410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AGAGATCAACACTTTTTTAAGTAAATTACAGATAAGTTCTTTTTTTTCAAGATTTTGTGT 1980

117384411 GATTTATTTAAATTTCAGATATTGATAAGCCAATCTACAGTGTTATAAATCAGGTAATGA 117384470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GATTTATTTAAATTTCAGATATTGATAAGCCAATCTACAGTGTTATAAATCAGGTAATGA 2040

117384471 GAGCTTGAACTTAAATGGTGGCGGTAAGCCTATATAATCTATACAAAACAGTATTTTATG 117384530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GAGCTTGAACTTAAATGGTGGCGGTAAGCCTATATAATCTATACAAAACAGTATTTTATG 2100

117384531 AAATAAGTACTATTACTATTCCCATTTACACATGAGAAAACAGGTCCAGAGAGGGTAAGT 117384590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAATAAGTACTATTACTATTCCCATTTACACATGAGAAAACAGGTCCAGAGAGGGTAAGT 2160

117384591 AATGTGCTAATTTTCTCAAGAGCACAATGGTAATGGCAAACTCCTAATTCAAATCTAGTC 117384650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AATGTGCTAATTTTCTCAAGAGCACAATGGTAATGGCAAACTCCTAATTCAAATCTAGTC 2220

117384651 TGTTGAGCTCCAGAGCTCCAGTTCTCAGCATATGATAGACAAGAATCAGAAAAAAATGCC 117384710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGTTGAGCTCCAGAGCTCCAGTTCTCAGCATATGATAGACAAGAATCAGAAAAAAATGCC 2280

117384711 CTTTCCATGGAAGACAATGAAGAAATTGTTAACAGGAGAAAGTATTTTCAATCATTAAAT 117384770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTTTCCATGGAAGACAATGAAGAAATTGTTAACAGGAGAAAGTATTTTCAATCATTAAAT 2340

117384771 AATTTTTAAATCAAGGCAAATAAATTGTGACTGCAATCTGCCTAATGGCTATCAAATTAG 117384830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATTTTTAAATCAAGGCAAATAAATTGTGACTGCAATCTGCCTAATGGCTATCAAATTAG 2400

117384831 CTTAAGACTTCCTCTGCAACAGATGTAAGAAAGAGAATGAGTGAAGGGAAATTCGGACAT 117384890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTTAAGACTTCCTCTGCAACAGATGTAAGAAAGAGAATGAGTGAAGGGAAATTCGGACAT 2460

117384891 TTTGAAATAGAGGAAAGAGTTCATATTAGATATTTTTTTCAAGCTCACTCTTCCTTAACC 117384950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTTGAAATAGAGGAAAGAGTTCATATTAGATATTTTTTTCAAGCTCACTCTTCCTTAACC 2520

117384951 ATATTCTTTCTTATCTCCACTATAAAATTGCTCATTAATATTCTCCTTCCCACAGACTCT 117385010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATATTCTTTCTTATCTCCACTATAAAATTGCTCATTAATATTCTCCTTCCCACAGACTCT 2580

117385011 TTATTCTGTGAAATCAAAAGTTATTTATTTAAAAAGAGAAACAAAAGTGAAAAACATTTA 117385070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTATTCTGTGAAATCAAAAGTTATTTATTTAAAAAGAGAAACAAAAGTGAAAAACATTTA 2640

117385071 GCCTGACTCATCAAGAAAAAAGAAAAATTATTAATATCAGGAATTAAAAAGGGAGGAAAT 117385130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCCTGACTCATCAAGAAAAAAGAAAAATTATTAATATCAGGAATTAAAAAGGGAGGAAAT 2700

117385131 AAGTAAAGATACTATATATGGAAAACTATAAAACATGGCTTAGAGAAATTAAAGATCTAA 117385190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAGTAAAGATACTATATATGGAAAACTATAAAACATGGCTTAGAGAAATTAAAGATCTAA 2760

117385191 ATAAATAGAAACATATGCCCTTTTAATGGGCCACAAGATTTAATAGTGCTAACCTGACAA 117385250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATAAATAGAAACATATGCCCTTTTAATGGGCCACAAGATTTAATAGTGCTAACCTGACAA 2820

117385251 TTTATCCTAAATTAATATTTAGACTCACTGTAACCCCAAACACAATCCTAGCAGGGTTTT 117385310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTATCCTAAATTAATATTTAGACTCACTGTAACCCCAAACACAATCCTAGCAGGGTTTT 2880

117385311 CTGTAGGAATTGAAAAGCAGACTTCATAGTATATGTAGAAAACCAAAGGATTAAGAATAG 117385370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTGTAGGAATTGAAAAGCAGACTTCATAGTATATGTAGAAAACCAAAGGATTAAGAATAG 2940

117385371 CCAAAATGACTTTGAAAAAAAAAAGATGAAGATTTTACACTGCTGATTTTAAAACCATTA 117385430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CCAAAATGACTTTGAAAAAAAAAAGATGAAGATTTTACACTGCTGATTTTAAAACCATTA 3000

117385431 TAAAACCACAGTAATCAAAACTGTGTGGTATTGGCTTAAGAAGAGTCATATAAATCAACG 117385490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TAAAACCACAGTAATCAAAACTGTGTGGTATTGGCTTAAGAAGAGTCATATAAATCAACG 3060

117385491 GGAAATAATAGACTTCATAAATAGACCCACATATTTATTTACTATATAAGTATATATATT 117385550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GGAAATAATAGACTTCATAAATAGACCCACATATTTATTTACTATATAAGTATATATATT 3120

117385551 TACCATTCATATGTATATATTTACCATATGTGGGTAAATATACAATGTGAGTCTATATAT 117385610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TACCATTCATATGTATATATTTACCATATGTGGGTAAATATACAATGTGAGTCTATATAT 3180

117385611 ATTTACATATATATGTATTTACCACATAAATATTTGCCATATATGTATATATACAGAATA 117385670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATTTACATATATATGTATTTACCACATAAATATTTGCCATATATGTATATATACAGAATA 3240

117385671 TGGTAAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGAGACACATGTATCATATAT 117385730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||
     3241 TGGTAAATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT------ATGAGACACATGTATCATATAT 3294

117385731 ACGGTAAATTTTTTTCAAAAATTGTGTCAAGGAGTTCAACGAAAAGCATTATTTTTAATA 117385790
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3295 ACGGTAAATTTTTTTCAAAAATTGTGTCAAGGAGTTCAACGAAAAACATTATTTTTAATA 3354

117385791 ACTGGTGCTGAAACAATTGGATATTCATGTACACACATAACAAAAACCCACAACAAAACT 117385850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 ACTGGTGCTGAAACAATTGGATATTCATGTACACACATAACAAAAACCCACAACAAAACT 3414

117385851 AACCTCAATTTTAATATGAGCATAAATGAAAATTTCCTAAAAATGCATCATAAATCTAGT 117385910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 AACCTCAATTTTAATATGAGCATAAATGAAAATTTCCTAAAAATGCATCATAAATCTAGT 3474

117385911 TGTAAAACATAAGAAAATAAATCTTAGAAAACATAGTAGAAAATTTTTGTGACTTTTTAG 117385970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 TGTAAAACATAAGAAAATAAATCTTAGAAAACATAGTAGAAAATTTTTGTGACTTTTTAG 3534

117385971 GTAAAGATTTCTCAGTACACAAAAAGTAGAAATTATTAAAATAATTGATAATTTGAACTT 117386030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 GTAAAGATTTCTCAGTACACAAAAAGTAGAAATTATTAAAATAATTGATAATTTGAACTT 3594

117386031 TATCAAAACTGAAAAATTGCCCTAGGAAAAAAAATAAAATTAAAAAGTGAGCCAAAGATA 117386090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 TATCAAAACTGAAAAATTGCCCTAGGAAAAAAAATAAAATTAAAAAGTGAGCCAAAGATA 3654

117386091 GAGTAAATATATTCAAAAAATGTATTCAATAGAGCAATTTTATCCAAAAAATAGAGAACA 117386150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 GAGTAAATATATTCAAAAAATGTATTCAATAGAGCAATTTTATCCAAAAAATAGAGAACA 3714

117386151 TTAAAAAAAGACAAATTTAATAAATCTTTTACTAAAGAAGATATGCAAATAGCAAAAAGC 117386210
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 TTAAAAAA-GACAAATTTAATAAATCTTTTACTAAAGAAGATATGCAAATAGCAAAAAGC 3773

117386211 ACATGCAAATATGCTTAACATGATTAGTCATTAGGGAAACAAAAATTAAAACCACAATAA 117386270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 ACATGCAAATATGCTTAACATGATTAGTCATTAGGGAAACAAAAATTAAAACCACAATAA 3833

117386271 GATACCAATAAACTCCACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAGTGCTG 117386330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 GATACCAATAAACTCCACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAGTGCTG 3893

117386331 GCAAGAATGTTGAAAACCTGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAA 117386390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 GCAAGAATGTTGAAAACCTGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAA 3953

117386391 TGGTGAAGTCATGTTGGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAATGAACACCTAATACACA 117386450
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     3954 TGGTGAAGTCATGTTGGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAACGAACACCTAATACACA 4013

117386451 ACTAGCTATTCCCCTCCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAAC 117386510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 ACTAGCTATTCCCCTCCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAAC 4073

117386511 ATTGTTCACACAGTCTCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAA 117386570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 ATTGTTCACACAGTCTCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAA 4133

117386571 TTAGAAACAAAACATCAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAA 117386630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 TTAGAAACAAAACATCAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAA 4193

117386631 ATACTACTATTCATCAGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAA 117386690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 ATACTACTATTCATCAGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAA 4253

117386691 CTTCAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGAT 117386750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 CTTCAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGAT 4313

117386751 TCTATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTAT 117386810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 TCTATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTAT 4373

117386811 CTGAGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGT 117386870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 CTGAGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGT 4433

117386871 TGATGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTA 117386930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 TGATGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTA 4493

117386931 ACATTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCA 117386990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 ACATTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCA 4553

117386991 ACAAAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTA 117387050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 ACAAAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTA 4613

117387051 ATAAAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCG 117387098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 ATAAAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCG 4661

EXCISED REGION

117393884 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 117393943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4662 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 4721

117393944 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 117394003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4722 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 4781

117394004 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 117394063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4782 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 4841

117394064 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 117394123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4842 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 4901

117394124 CTGGCCTACCTGATGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 117394183
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4902 CTGGCCTACCTGTTGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 4961

117394184 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 117394243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4962 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 5021

117394244 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 117394303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5022 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 5081

117394304 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 117394363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5082 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 5141

117394364 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 117394423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5142 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 5201

117394424 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 117394483
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5202 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCACTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 5261

117394484 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 117394543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5262 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 5321

117394544 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 117394603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5322 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 5381

117394604 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 117394663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5382 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 5441

117394664 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 117394723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5442 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 5501

117394724 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 117394783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5502 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 5561

117394784 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 117394843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5562 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 5621

117394844 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 117394903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5622 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 5681

117394904 AAACAACAGTATTATTTTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 117394963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5682 AAACAACAGTATTATTTTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 5741

117394964 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 117395023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5742 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 5801

117395024 TTTAGGCATTTATTTTACTGTTGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAAT 117395083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5802 TTTAGGCATTTATTTTACTGTTGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAAT 5861

117395084 GAGTAGGGCTGTTTTGAACACTCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTT 117395143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5862 GAGTAGGGCTGTTTTGAACACTCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTT 5921

117395144 TCTGTTGAGTGTATAAACAGAAGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTG 117395203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5922 TCTGTTGAGTGTATAAACAGAAGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTG 5981

117395204 TTAATGTATACTGGTAGTTTTGCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATG 117395263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5982 TTAATGTATACTGGTAGTTTTGCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATG 6041

117395264 TCTATGAATATTGGTTATGCTACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATAC 117395323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6042 TCTATGAATATTGGTTATGCTACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATAC 6101

117395324 AGTTGTTCATATTTTTCTGTTTTTGGCAATCTGTATATATCACAATATTTAAGTGGTTTT 117395383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6102 AGTTGTTCATATTTTTCTGTTTTTGGCAATCTGTATATATCACAATATTTAAGTGGTTTT 6161

117395384 GGAATTATGTCCTCTTATTTGTCTGAAGTAATTTGTTTTTTCCAACTAGAGCAAGAAAGT 117395443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6162 GGAATTATGTCCTCTTATTTGTCTGAAGTAATTTGTTTTTTCCAACTAGAGCAAGAAAGT 6221

117395444 GATTATTTTAATGTCTAAATCATGTATTGTGTCAACCCTTCTTTTAAAAATAGCTACAAA 117395503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6222 GATTATTTTAATGTCTAAATCATGTATTGTGTCAACCCTTCTTTTAAAAATAGCTACAAA 6281

117395504 AAGTCCAAAGGTTTATCTTTTTTTCTTAGAATAACACCCATACATCTTAATAAGGTCCAT 117395563
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6282 AAGTCCAAAGGTTTATCATTTTTTCTTAGAATAACACCCATACATCTTAATAAGGTCCAT 6341

117395564 AATTTATTGCATGAAATTAGCTCCTTTCAATTCTGTTGCACCCACAATATCTTTACTGCT 117395623
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     6342 AATTTATTGCATGAAATTAGCTCCTTTCAATTCTGTTGCACCCACAATATCTTTATTGCT 6401

117395624 ATTTTCAGGTTACACCAGGTTTTTGTTCTTATAGCTATT 117395662
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6402 ATTTTCAGGTTACACCAGGTTTTTGTTCTTATAGCTATT 6440

Alignment time is 5.95182 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     3206] =>      3206 nucs 'mol-32-2b3f-026947_3206'

Score:        3161
Aligned:      3205        nucs
Identic:      3201 (100%) nucs =>       144 (100%)      3057 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117391242,117391385] EXCISED REGION [117391387,117394447]
 second seq =>  [        1,      144] EXCISED REGION [      146,     3206]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [117391386,117391386]
 second seq =>         1 nucs [145,145]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [145,145] to [146,146]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [117391384,117391385] to [117391387,117391388]
 second seq =>         2 nucs [143,144] to [146,147]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117391242 TTCAGGCACTTAAAAGTAAAATAAAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTAT 117391301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCAGGCACTTAAAAGTAAAATAAAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTAT 60

117391302 TTTACTGAAAAACAAAAAAAAATTAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTC 117391361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTACTGAAAAACAAAAAAAAATTAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTC 120

117391362 AAATTCAGTCAAAAATGAAAGAAT 117391385
          ||||||||||||||||||||||||
      121 AAATTCAGTCAAAAATGAAAGAAT 144

EXCISED REGION

117391387 ATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCCTA 117391446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      146 ATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCCTA 205

117391447 CTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAAAC 117391506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      206 CTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAAAC 265

117391507 TCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAAGT 117391566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      266 TCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAAGT 325

117391567 TAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTTTC 117391626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      326 TAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTTTC 385

117391627 TTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCAC 117391686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      386 TTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCAC 445

117391687 TTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTAA 117391746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      446 TTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTAA 505

117391747 ATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTGG 117391806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      506 ATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTGG 565

117391807 GATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCTT 117391866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      566 GATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCTT 625

117391867 CGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGTA 117391926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      626 CGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGTA 685

117391927 GTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTGT 117391986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      686 GTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTGT 745

117391987 GTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCTGC 117392046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      746 GTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCTGC 805

117392047 AGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCACA 117392106
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      806 AGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCACG 865

117392107 GAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGA 117392166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      866 GAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGA 925

117392167 GGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTG 117392226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      926 GGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTG 985

117392227 TCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGAC 117392286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      986 TCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGAC 1045

117392287 ATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTA 117392346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1046 ATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTA 1105

117392347 ATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAA 117392406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1106 ATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAA 1165

117392407 TAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTG 117392466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1166 TAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTG 1225

117392467 TCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGT 117392526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1226 TCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGT 1285

117392527 ACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAAT 117392586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1286 ACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAAT 1345

117392587 GTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTG 117392646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1346 GTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTG 1405

117392647 AGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTTTT 117392706
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1406 AGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTCTT 1465

117392707 TTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATA 117392766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1466 TTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATA 1525

117392767 AATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAA 117392826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1526 AATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAA 1585

117392827 TATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGA 117392886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1586 TATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGA 1645

117392887 GTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCC 117392946
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1646 GTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGACGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCC 1705

117392947 ATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAA 117393006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1706 ATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAA 1765

117393007 AAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACT 117393066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1766 AAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACT 1825

117393067 AAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACA 117393126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1826 AAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACA 1885

117393127 GGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAA 117393186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1886 GGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAA 1945

117393187 ATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTT 117393246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1946 ATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTT 2005

117393247 AAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAA 117393306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2006 AAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAA 2065

117393307 AAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGA 117393366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2066 AAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGA 2125

117393367 AAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGA 117393426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2126 AAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGA 2185

117393427 CAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAG 117393486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2186 CAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAG 2245

117393487 CAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGA 117393546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2246 CAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGA 2305

117393547 CAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAA 117393606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2306 CAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAA 2365

117393607 TCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTGGC 117393666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2366 TCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTGGC 2425

117393667 CTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTC 117393726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2426 CTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTC 2485

117393727 AGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGG 117393786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2486 AGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGG 2545

117393787 AGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTA 117393846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 AGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTA 2605

117393847 AGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGC 117393906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 AGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGC 2665

117393907 AACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATT 117393966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 AACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATT 2725

117393967 ACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 117394026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 ACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 2785

117394027 TATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCT 117394086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 TATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCT 2845

117394087 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTT 117394146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTT 2905

117394147 AGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAACCA 117394206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2906 AGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCCTAAACCA 2965

117394207 TTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGAT 117394266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 TTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGAT 3025

117394267 GTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATA 117394326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3026 GTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATA 3085

117394327 TGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCG 117394386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 TGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCG 3145

117394387 AAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACC 117394446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 AAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACC 3205

117394447 T 117394447
          |
     3206 T 3206

Alignment time is 3.00293 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     2741] =>      2741 nucs 'mol-32-2b4a-112531_2741'

Score:        2675
Aligned:      2741        nucs
Identic:      2735 (100%) nucs =>       813 (100%)      1922 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117386285,117387098] EXCISED REGION [117393884,117395810]
 second seq =>  [        1,      814] EXCISED REGION [      815,     2741]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6785 nucs [117387099,117393883]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387099,117387099] to [117393884,117393884]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387098,117387098] to [117393884,117393884]
 second seq =>         1 nucs [814,814] to [815,815]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117386285 CCACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAGTGCTGGCAAGAATGTTGAA 117386344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAGTGCTGGCAAGAATGTTGAA 60

117386345 AACCTGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAATGGTGAAGTCATGT 117386404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACCTGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAATGGTGAAGTCATGT 120

117386405 TGGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAATGAACACCTAATACACAACTAGCTATTCCCC 117386464
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAACGAACACCTAATACACAACTAGCTATTCCCC 180

117386465 TCCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATTGTTCACACAGT 117386524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATTGTTCACACAGT 240

117386525 CTCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAACA 117386584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAACA 300

117386585 TCAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCAT 117386644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCAT 360

117386645 CAGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATGT 117386704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATGT 420

117386705 TTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGAA 117386764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGAA 480

117386765 ATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTGT 117386824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTGT 540

117386825 GAGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATTC 117386884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATTC 600

117386885 TAAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAACT 117386944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAACT 660

117386945 GTACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAAA 117387004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAAA 720

117387005 TTCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTCA 117387064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTCA 780

117387065 AAGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCG 117387098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCG 814

EXCISED REGION

117393884 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 117393943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      815 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 874

117393944 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 117394003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      875 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 934

117394004 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 117394063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      935 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 994

117394064 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 117394123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      995 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 1054

117394124 CTGGCCTACCTGATGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 117394183
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1055 CTGGCCTACCTGTTGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 1114

117394184 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 117394243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 1174

117394244 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 117394303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 1234

117394304 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 117394363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 1294

117394364 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 117394423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 1354

117394424 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 117394483
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCACTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 1414

117394484 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 117394543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 1474

117394544 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 117394603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 1534

117394604 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 117394663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 1594

117394664 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 117394723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 1654

117394724 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 117394783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 1714

117394784 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 117394843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 1774

117394844 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 117394903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 1834

117394904 AAACAACAGTATTATTTTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 117394963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 AAACAACAGTATTATTTTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 1894

117394964 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 117395023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 1954

117395024 TTTAGGCATTTATTTTACTGTTGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAAT 117395083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 TTTAGGCATTTATTTTACTGTTGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAAT 2014

117395084 GAGTAGGGCTGTTTTGAACACTCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTT 117395143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 GAGTAGGGCTGTTTTGAACACTCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTT 2074

117395144 TCTGTTGAGTGTATAAACAGAAGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTG 117395203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 TCTGTTGAGTGTATAAACAGAAGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTG 2134

117395204 TTAATGTATACTGGTAGTTTTGCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATG 117395263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 TTAATGTATACTGGTAGTTTTGCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATG 2194

117395264 TCTATGAATATTGGTTATGCTACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATAC 117395323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 TCTATGAATATTGGTTATGCTACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATAC 2254

117395324 AGTTGTTCATATTTTTCTGTTTTTGGCAATCTGTATATATCACAATATTTAAGTGGTTTT 117395383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 AGTTGTTCATATTTTTCTGTTTTTGGCAATCTGTATATATCACAATATTTAAGTGGTTTT 2314

117395384 GGAATTATGTCCTCTTATTTGTCTGAAGTAATTTGTTTTTTCCAACTAGAGCAAGAAAGT 117395443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 GGAATTATGTCCTCTTATTTGTCTGAAGTAATTTGTTTTTTCCAACTAGAGCAAGAAAGT 2374

117395444 GATTATTTTAATGTCTAAATCATGTATTGTGTCAACCCTTCTTTTAAAAATAGCTACAAA 117395503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 GATTATTTTAATGTCTAAATCATGTATTGTGTCAACCCTTCTTTTAAAAATAGCTACAAA 2434

117395504 AAGTCCAAAGGTTTATCTTTTTTTCTTAGAATAACACCCATACATCTTAATAAGGTCCAT 117395563
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 AAGTCCAAAGGTTTATCATTTTTTCTTAGAATAACACCCATACATCTTAATAAGGTCCAT 2494

117395564 AATTTATTGCATGAAATTAGCTCCTTTCAATTCTGTTGCACCCACAATATCTTTACTGCT 117395623
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2495 AATTTATTGCATGAAATTAGCTCCTTTCAATTCTGTTGCACCCACAATATCTTTATTGCT 2554

117395624 ATTTTCAGGTTACACCAGGTTTTTGTTCTTATAGCTATTGTTATTACTTTTCTTTTTTCT 117395683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 ATTTTCAGGTTACACCAGGTTTTTGTTCTTATAGCTATTGTTATTACTTTTCTTTTTTCT 2614

117395684 TATCTCAGAGTCTTTCTTCTGGTTTATTTTAATCCTCTGATTACTGACTGTCCCAGAAAT 117395743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 TATCTCAGAGTCTTTCTTCTGGTTTATTTTAATCCTCTGATTACTGACTGTCCCAGAAAT 2674

117395744 CACATCTCCGTTCAACTGTCATGTAGCAAGAAATGTAAGAGCAAGCCTAATTTTTTTTAG 117395803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2675 CACATCTCCGTTCAACTGTCATGTAGCAAGAAATGTAAAAGCAAGCCTAATTTTTTTTAG 2734

117395804 GCTTCAA 117395810
          |||||||
     2735 GCTTCAA 2741

Alignment time is 2.58015 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     6722] =>      6722 nucs 'mol-32-2e4c-103236_6722'

Score:        6551
Aligned:      6705        nucs
Identic:      6691 (100%) nucs =>       614 (100%)      6077 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117386484,117387098] EXCISED REGION [117393884,117399972]
 second seq =>  [        1,      615] EXCISED REGION [      616,     6704]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6785 nucs [117387099,117393883]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387099,117387099] to [117393884,117393884]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387098,117387098] to [117393884,117393884]
 second seq =>         1 nucs [615,615] to [616,616]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117386484 TTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATTGTTCACACAGTCTCAAATGTGAATATTTAC 117386543
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTCATTACCCAAGAGAAGTAAAAACATTGTTCACACAGTCTCAAATGTGAATATTTAC 60

117386544 AGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAACATCAACAGGTGAACAGATAA 117386603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAACATCAACAGGTGAACAGATAA 120

117386604 ACACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCATCAGTAAGAAATATTAAACT 117386663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCATCAGTAAGAAATATTAAACT 180

117386664 ATTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAAC 117386723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAAC 240

117386724 ATTTTATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAG 117386783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTTTATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAG 300

117386784 TAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTAC 117386843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTAC 360

117386844 AAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGA 117386903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGA 420

117386904 ATGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGA 117386963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGA 480

117386964 TTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAA 117387023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAA 540

117387024 AATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATAC 117387083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATAC 600

117387084 TGACAGACCTAATCG 117387098
          |||||||||||||||
      601 TGACAGACCTAATCG 615

EXCISED REGION

117393884 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 117393943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 675

117393944 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 117394003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 735

117394004 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 117394063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 795

117394064 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 117394123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 855

117394124 CTGGCCTACCTGATGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 117394183
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 CTGGCCTACCTGTTGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 915

117394184 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 117394243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 975

117394244 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 117394303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 1035

117394304 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 117394363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 1095

117394364 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 117394423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 1155

117394424 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 117394483
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCACTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 1215

117394484 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 117394543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 1275

117394544 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 117394603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 1335

117394604 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 117394663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 1395

117394664 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 117394723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 1455

117394724 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 117394783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 1515

117394784 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 117394843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 1575

117394844 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 117394903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 1635

117394904 AAACAACAGTATTATTTTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 117394963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 AAACAACAGTATTATTTTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 1695

117394964 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 117395023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 1755

117395024 TTTAGGCATTTATTTTACTGTTGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAAT 117395083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1756 TTTAGGCATTTATTTTACTGTTGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAGT 1815

117395084 GAGTAGGGCTGTTTTGAACACTCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTT 117395143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 GAGTAGGGCTGTTTTGAACACTCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTT 1875

117395144 TCTGTTGAGTGTATAAACAGAAGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTG 117395203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 TCTGTTGAGTGTATAAACAGAAGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTG 1935

117395204 TTAATGTATACTGGTAGTTTTGCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATG 117395263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 TTAATGTATACTGGTAGTTTTGCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATG 1995

117395264 TCTATGAATATTGGTTATGCTACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATAC 117395323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 TCTATGAATATTGGTTATGCTACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATAC 2055

117395324 AGTTGTTCATATTTTTCTGTTTTTGGCAATCTGTATATATCACAATATTTAAGTGGTTTT 117395383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 AGTTGTTCATATTTTTCTGTTTTTGGCAATCTGTATATATCACAATATTTAAGTGGTTTT 2115

117395384 GGAATTATGTCCTCTTATTTGTCTGAAGTAATTTGTTTTTTCCAACTAGAGCAAGAAAGT 117395443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 GGAATTATGTCCTCTTATTTGTCTGAAGTAATTTGTTTTTTCCAACTAGAGCAAGAAAGT 2175

117395444 GATTATTTTAATGTCTAAATCATGTATTGTGTCAACCCTTCTTTTAAAAATAGCTACAAA 117395503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 GATTATTTTAATGTCTAAATCATGTATTGTGTCAACCCTTCTTTTAAAAATAGCTACAAA 2235

117395504 AAGTCCAAAGGTTTATCTTTTTTTCTTAGAATAACACCCATACATCTTAATAAGGTCCAT 117395563
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 AAGTCCAAAGGTTTATCATTTTTTCTTAGAATAACACCCATACATCTTAATAAGGTCCAT 2295

117395564 AATTTATTGCATGAAATTAGCTCCTTTCAATTCTGTTGCACCCACAATATCTTTACTGCT 117395623
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2296 AATTTATTGCATGAAATTAGCTCCTTTCAATTCTGTTGCACCCACAATATCTTTATTGCT 2355

117395624 ATTTTCAGGTTACACCAGGTTTTTGTTCTTATAGCTATTGTTATTACTTTTCTTTTTTCT 117395683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 ATTTTCAGGTTACACCAGGTTTTTGTTCTTATAGCTATTGTTATTACTTTTCTTTTTTCT 2415

117395684 TATCTCAGAGTCTTTCTTCTGGTTTATTTTAATCCTCTGATTACTGACTGTCCCAGAAAT 117395743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 TATCTCAGAGTCTTTCTTCTGGTTTATTTTAATCCTCTGATTACTGACTGTCCCAGAAAT 2475

117395744 CACATCTCCGTTCAACTGTCATGTAGCAAGAAATGTAAGAGCAAGCCTAATTTTTTTTAG 117395803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2476 CACATCTCCGTTCAACTGTCATGTAGCAAGAAATGTAAAAGCAAGCCTAATTTTTTTTAG 2535

117395804 GCTTCAAAGTTCAACTTATAATTTTGAGGGTTATGTTTATAAATTTTAAAAAGTTGTAAA 117395863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 GCTTCAAAGTTCAACTTATAATTTTGAGGGTTATGTTTATAAATTTTAAAAAGTTGTAAA 2595

117395864 TCATATAAATTTTAATACCACTCAATCACCTTAAACATTTAGTTAAGTAAATCCCTCCAT 117395923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 TCATATAAATTTTAATACCACTCAATCACCTTAAACATTTAGTTAAGTAAATCCCTCCAT 2655

117395924 ATATTCTACCTTATTTAATGTGTTTAATTTCCTTTTAAAATTATTATATTTTAATTGACT 117395983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 ATATTCTACCTTATTTAATGTGTTTAATTTCCTTTTAAAATTATTATATTTTAATTGACT 2715

117395984 AATAAAAACTATAAATATTTATGGTATACAGCATGTTGTTTTGATATATGTATACATTGG 117396043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 AATAAAAACTATAAATATTTATGGTATACAGCATGTTGTTTTGATATATGTATACATTGG 2775

117396044 GAAATAACTATATCAAGCTACTTAACCTATCTATTACCTCGTATAGTTAACACTTTTTTG 117396103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 GAAATAACTATATCAAGCTACTTAACCTATCTATTACCTCGTATAGTTAACACTTTTTTG 2835

117396104 GTTGTGAGAACATTTAAAATCTACTCTCTTAGGAATCTCCAACCATACAATAATATTATT 117396163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 GTTGTGAGAACATTTAAAATCTACTCTCTTAGGAATCTCCAACCATACAATAATATTATT 2895

117396164 AACTATGGTCACCATGTTGTACAATAAATCTTCAAAACTATTCCTCCTGTCTAACTGAAA 117396223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 AACTATGGTCACCATGTTGTACAATAAATCTTCAAAACTATTCCTCCTGTCTAACTGAAA 2955

117396224 CTTTGCATACTGTGACTAATATTTCCTCAATCCCCTACCACCACCACCAACCTCAACTCC 117396283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 CTTTGCATACTGTGACTAATATTTCCTCAATCCCCTACCACCACCACCAACCTCAACTCC 3015

117396284 CAGTAACCTCATTCAACTCAAATGTTTGACATTTTTAAATTCTACATATAACTGTGTTAT 117396343
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3016 CAGTAACCTCATTCAACTCAAATGTTTGACATTTTTAAATTCTACATATAATTGTGTTAT 3075

117396344 ACAGTGTTTGCCTTTTTGTGCCTAGCTTATTTAACAGCATAATGTACTCCACGTTCATCC 117396403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 ACAGTGTTTGCCTTTTTGTGCCTAGCTTATTTAACAGCATAATGTACTCCACGTTCATCC 3135

117396404 ATGTTTACACAAAAGACAAAATTTTGTTTTTTAAAGCTGAATAGTATTCCATTGTGTGTA 117396463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 ATGTTTACACAAAAGACAAAATTTTGTTTTTTAAAGCTGAATAGTATTCCATTGTGTGTA 3195

117396464 TGTATATACACCACATTTTTAATCCATTCATTTGTCAATAGACATACAGGTTATTTTCAG 117396523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3196 TGTATATACACCACATTTTTAATCCATTCATTTGTCAATAGACATACAGGTTATTTTCAG 3255

117396524 ATTGTGGCTAGTTTGTATCACCCTGCAATGAATGTGAGAGTGCAGATATCTCTTCATAAT 117396583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 ATTGTGGCTAGTTTGTATCACCCTGCAATGAATGTGAGAGTGCAGATATCTCTTCATAAT 3315

117396584 CCTAATTTCAATTCCTGTGGATATGTACCTGAAAGTGGGATTGCTGGATGACATATTAGT 117396643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 CCTAATTTCAATTCCTGTGGATATGTACCTGAAAGTGGGATTGCTGGATGACATATTAGT 3375

117396644 TCTATTTTTAATTTTTTAAAGAATCTGCATACAGTTTCCATAATGGCTGTACTAATTCAC 117396703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 TCTATTTTTAATTTTTTAAAGAATCTGCATACAGTTTCCATAATGGCTGTACTAATTCAC 3435

117396704 ATTCCTACCAACAGGGTGCATTGGTTCCCTTTTCTCTACGTACTTCTCAACACTTTTTCT 117396763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 ATTCCTACCAACAGGGTGCATTGGTTCCCTTTTCTCTACGTACTTCTCAACACTTTTTCT 3495

117396764 GGTCTTTATGATAATGGGCATTCTAACAGGTGTGAGGTGGTATCTCATTGTCGTTTTAAT 117396823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 GGTCTTTATGATAATGGGCATTCTAACAGGTGTGAGGTGGTATCTCATTGTCGTTTTAAT 3555

117396824 TTGCATTTCTCTGATAATTAGTAATGTTGAACATTTTTTCACATAATTGGCCATCTGTGT 117396883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 TTGCATTTCTCTGATAATTAGTAATGTTGAACATTTTTTCACATAATTGGCCATCTGTGT 3615

117396884 GTCTTCTTTTAAGAAATGTCTACTCCAGTCCTTGGCCCTTTTTTTTACTTGGGTTACCCA 117396943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3616 GTCTTCTTTTAAGAAATGTCTACTCCAGTCCTTGGCCCTTTTTTTTACTTGGGTTACCCA 3675

117396944 TTTTCTTGCTATTGAGTTGCTTGAGTTCCTTATGTATTTTCGATAATAGCCACTTATCAG 117397003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3676 TTTTCTTGCTATTGAGTTGCTTGAGTTCCTTATGTATTTTCGATAATAGCCACTTATCAG 3735

117397004 ATGTATGGTTTACAAATATTTTATCCTTTTTGGGAGGCTAAAAAATTATTTCTATTTGTC 117397063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3736 ATGTATGGTTTACAAATATTTTATCCTTTTTGGGAGGCTAAAAAATTATTTCTATTTGTC 3795

117397064 TTTCTATCCTTGAGTCTTTATAGAGAAATATCTTATTTTGAGGACATCAAATAGTAATAA 117397123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3796 TTTCTATCCTTGAGTCTTTATAGAGAAATATCTTATTTTGAGGACATCAAATAGTAATAA 3855

117397124 TAGTTATTCCTTACTAGTGAAAATTAGTGGTAGACTCTATCTTTTTGCTTTGAGTAATTT 117397183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3856 TAGTTATTCCTTACTAGTGAAAATTAGTGGTAGACTCTATCTTTTTGCTTTGAGTAATTT 3915

117397184 TACAAAAGCAATAAAATTATTTTTTAATTTCAAATTGTATTTTCCACACAGCAGATATGC 117397243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3916 TACAAAAGCAATAAAATTATTTTTTAATTTCAAATTGTATTTTCCACACAGCAGATATGC 3975

117397244 ATGCATGCAGGTTTGTCACTTGGGTATATTGCACTCAGGTAATAACCGTAGTACCCGACA 117397303
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3976 ATGCATGCAGGTTTGTCACTTGGGTATATTGCACTCAGGTAATAACCATAGTACCCGACA 4035

117397304 AGTAGCTTTTAAACCCATTCCCCCGTCACTACCCCACCCCAGGAGTCCATACTGTTTATA 117397363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4036 AGTAGCTTTTAAACCCATTCCCCCGTCACTACCCCACCCCAGGAGTCCATACTGTTTATA 4095

117397364 TTCTCATGTTTATGTTCATGTATGCTCAATGTTTAGCTCATACTTTTAAGTGATGTCACG 117397423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 TTCTCATGTTTATGTTCATGTATGCTCAATGTTTAGCTCATACTTTTAAGTGATGTCACG 4155

117397424 CAGTATTTGGTTTTTCTCTTCTTGAATGAATTCATTTAAAATTATGGCCTCCAACTGCCA 117397483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4156 CAGTATTTGGTTTTTCTCTTCTTGAATGAATTCATTTAAAATTATGGCCTCCAACTGCCA 4215

117397484 AGGACATGATTTCATTCTTTTTATGGCTGCATAATATTTCATGGTGTATATGTACCACAC 117397543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4216 AGGACATGATTTCATTCTTTTTATGGCTGCATAATATTTCATGGTGTATATGTACCACAC 4275

117397544 TTCATTGATCTAATACACTATTGATGGGCACCTAAGTTGATTCTGTGTCTTTTCTCTTGT 117397603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4276 TTCATTGATCTAATACACTATTGATGGGCACCTAAGTTGATTCTGTGTCTTTTCTCTTGT 4335

117397604 GAATACCACAACAAGGAACATATGAGTTCAAGTGTATTTTAGATATAAAGATCTATTTTC 117397663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4336 GAATACCACAACAAGGAACATATGAGTTCAAGTGTATTTTAGATATAAAGATCTATTTTC 4395

117397664 CTTTAGGTATATACTCGTGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGCTCTGTTTCAAGTTGTTTG 117397723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4396 CTTTAGGTATATACTCGTGGGATTGCTGGGTCAAATGGTAGCTCTGTTTCAAGTTGTTTG 4455

117397724 AGACATCTCCAAACTACTTTCCATAGTGGCTGAAATAATTTACATTCCCACAGACAGTCT 117397783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4456 AGACATCTCCAAACTACTTTCCATAGTGGCTGAAATAATTTACATTCCCACAGACAGTCT 4515

117397784 CCTTTTCCCCACAGCCTTGTGACCATCTGTTGTTTTTCAACTTTTTGATAATAGCTATTC 117397843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4516 CCTTTTCCCCACAGCCTTGTGACCATCTGTTGTTTTTCAACTTTTTGATAATAGCTATTC 4575

117397844 TGACTGGTGTGAAATGATATCTCGTTATGGTTTTCATTTGCATTTTTCTAATGATAAGTG 117397903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4576 TGACTGGTGTGAAATGATATCTCGTTATGGTTTTCATTTGCATTTTTCTAATGATAAGTG 4635

117397904 ATGATGAC-TTTTTTTTTCATATGTTTGCTGTCTACTTGAATGTCTTCTTTTGAGAAGTA 117397962
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4636 ATGATGACTTTTTTTTTTCATATGTTTGCTGTCTACTTGAATGTCTTCTTTTGAGAAGTA 4695

117397963 ACTCCTCATGACCTTTGTCCATTTTTAATGGGGTGATTTGTTTTTTGCTTGTTGATTTAA 117398022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4696 ACTCCTCATGACCTTTGTCCATTTTTAATGGGGTGATTTGTTTTTTGCTTGTTGATTTAA 4755

117398023 GTTGCCTATAGATTTGAGATAGCAGACTAGATATCTACGTATTTGTCTGATACAGAGTTT 117398082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4756 GTTGCCTATAGATTTGAGATAGCAGACTAGATATCTACGTATTTGTCTGATACAGAGTTT 4815

117398083 GTGAATATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGTCTGTTTACTCTATGAATGGTTTCGTTTGCT 117398142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4816 GTGAATATTTTCTCCCATTCTGTAGGTTGTCTGTTTACTCTATGAATGGTTTCGTTTGCT 4875

117398143 GTGAAGAAACTCTTTAGTTTAATGAGGTCCTACTTGTCAGTTTTTGATTTTGTTGCAACT 117398202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4876 GTGAAGAAACTCTTTAGTTTAATGAGGTCCTACTTGTCAGTTTTTGATTTTGTTGCAACT 4935

117398203 GCTTTTGGGTATGTAACCAAAAATTCTTTGCCAAGGGCGATGTCGAGGAGGGTATTTCCT 117398262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4936 GCTTTTGGGTATGTAACCAAAAATTCTTTGCCAAGGGCGATGTCGAGGAGGGTATTTCCT 4995

117398263 CGGTTTTCTTCTACGATTTTTACAGTTTGAGGTCTTACATTTAAATCTTTCTTCCATCTT 117398322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4996 CGGTTTTCTTCTACGATTTTTACAGTTTGAGGTCTTACATTTAAATCTTTCTTCCATCTT 5055

117398323 GAGTTAATTTTTGTATATGTTGAAAGGAAAAGTAAGAGTCTAGCTTCGTTCTTCAGCATA 117398382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5056 GAGTTAATTTTTGTATATGTTGAAAGGAAAAGTAAGAGTCTAGCTTCGTTCTTCAGCATA 5115

117398383 TGGCTAGTCAGTTATCCTGGCACCATATATTGAACAGGGAGTGATTTCCACATTGCTTGC 117398442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5116 TGGCTAGTCAGTTATCCTGGCACCATATATTGAACAGGGAGTGATTTCCACATTGCTTGC 5175

117398443 TTTTGTTGTCCTTTATTGAAGATAAGATAATTGTAGATGTGCAGCTTTACTTCTGAGTTT 117398502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5176 TTTTGTTGTCCTTTATTGAAGATAAGATAATTGTAGATGTGCAGCTTTACTTCTGAGTTT 5235

117398503 TCTATTCTGTTCCATTGGTCTATATGTCTATTTGTTTTTTCCTTGTTGATTTAAGCTGCT 117398562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5236 TCTATTCTGTTCCATTGGTCTATATGTCTATTTGTTTTTTCCTTGTTGATTTAAGCTGCT 5295

117398563 TATAGATTCTAGATATCAGACTAGATATCTATGTACTTGTCAAATACATAGGTTGTGAAT 117398622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5296 TATAGATTCTAGATATCAGACTAGATATCTATGTACTTGTCAAATACATAGGTTGTGAAT 5355

117398623 ATTTTCTCCCATTCTGTTGGTTGGGAAAACTTCTGAGTTTTCTATTCTATTTCATTGGTC 117398682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5356 ATTTTCTCCCATTCTGTTGGTTGGGAAAACTTCTGAGTTTTCTATTCTATTTCATTGGTC 5415

117398683 TATGTGTCTGTTTTATACCACTATCATGCTGTTTTAGTTACTGTAGCCTTATAGTATACT 117398742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5416 TATGTGTCTGTTTTATACCACTATCATGCTGTTTTAGTTACTGTAGCCTTATAGTATACT 5475

117398743 TCAAGGTTTGATGGTGTTATGCCTCCAACTTTGGTTTTTTTTGCTTAGGATTGTTTGGCT 117398802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5476 TCAAGGTTTGATGGTGTTATGCCTCCAACTTTGGTTTTTTTTGCTTAGGATTGTTTGGCT 5535

117398803 ATTTGGGCTCTTTTTTGTTCCATATGAGTTTTAGAATAGTTTTTTTTTCTAATTCTGTGA 117398862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     5536 ATTTGGGCTCTTTTTTGTTCCATATGAGTTTTAGAATAG-TTTTTTTTCTAATTCTGTGA 5594

117398863 AGAATGACATTGGCAGTTTAAGTATAGCATTGAATATGTAGAGTCCTTTGGGCAATATGG 117398922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5595 AGAATGACATTGGCAGTTTAAGTATAGCATTGAATATGTAGAGTCCTTTGGGCAATATGG 5654

117398923 CCATTTTAACAACATTCATTCTTCCAACCCATCAACATGGAATGTTTTTCCATTTACTTT 117398982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5655 CCATTTTAACAACATTCATTCTTCCAACCCATCAACATGGAATGTTTTTCCATTTACTTT 5714

117398983 GTCATCTCTGATTTCTTTTAACATTGTTTTGTAGTTCTCCTCTCAGAGAGCGTTCACCTC 117399042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5715 GTCATCTCTGATTTCTTTTAACATTGTTTTGTAGTTCTCCTCTCAGAGAGCGTTCACCTC 5774

117399043 CTTGCTTAGATGTATTCCTAGGTAATTCATTTGTGTGTGTGTGGCTACTGTGAATGGGAT 117399102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5775 CTTGCTTAGATGTATTCCTAGGTAATTCATTTGTGTGTGTGTGGCTACTGTGAATGGGAT 5834

117399103 TGTGTTCTTGATTTTAATCTCAGTCTGGATGTTATTGGTGTATAGAAATGCTACTCATTT 117399162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5835 TGTGTTCTTGATTTTAATCTCAGTCTGGATGTTATTGGTGTATAGAAATGCTACTCATTT 5894

117399163 TTGTACACTGATTTTGTATCCTGAATCCTTCCTAAAATCATTGATCAGTTCTAGTAACCT 117399222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5895 TTGTACACTGATTTTGTATCCTGAATCCTTCCTAAAATCATTGATCAGTTCTAGTAACCT 5954

117399223 TTTGGGGGTGTCTTCAGAGTTTTCTAAGTATAGAATCATACAGTCAGTGAATAGAGATAA 117399282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5955 TTTGGGGGTGTCTTCAGAGTTTTCTAAGTATAGAATCATACAGTCAGTGAATAGAGATAA 6014

117399283 ACTTCTTTTCCTTTTGGATGCCATTTGTTTATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCAT 117399342
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6015 ACTTCTTTTCCTTTTGGATGCCATTTGTTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCATTCAT 6074

117399343 TCATTTAATTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTTTGCCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGT 117399402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6075 TCATTTAATTTTTTTTTGAGACGGAGTCTTGCTTTGCCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGT 6134

117399403 GTGATCTTGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGCCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGTC 117399462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6135 GTGATCTTGGCTCACTGCAAACTCTGCCTCCCAGGCCCAAGTGATTCTCCTGCCTCAGTC 6194

117399463 TCCCAAGCAGCTGGGATTACAGGTACCCGCTACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTA 117399522
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6195 TCCCAAGCAGCTGGGATTACAGGTACCTGCTACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTA 6254

117399523 GTAGAGATGAGGTTTCACCATTTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTGTGATCC 117399582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6255 GTAGAGATGAGGTTTCACCATTTTGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTTGTGATCC 6314

117399583 ACCCACCTTGGCATCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGTGTGAGCCACCAGGCCCAGCCTAT 117399642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6315 ACCCACCTTGGCATCCCAAAGTGCTGGGACTACAGGTGTGAGCCACCAGGCCCAGCCTAT 6374

117399643 TTATTTCTTTTGCCTGATTACTCATACCAGGACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGAGTGG 117399702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6375 TTATTTCTTTTGCCTGATTACTCATACCAGGACTTCCAGTACTATGTTGAATAGGAGTGG 6434

117399703 TGAGAATGGGCATCTTGCCTTGTTCCAGTTTTCAATGGGAATAGCTCCAGCTTTTGCCCA 117399762
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     6435 TGAGAATGGGCATCTTGCCTTGTTCCAGTTTTCAATGGGAATATCTCCAGCTTTTGCCCA 6494

117399763 TTCAGTATGATGTGGCTTTGAGTTTCTCATAGATGGCTCCTATTGTTTTGAGGTATGTTA 117399822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6495 TTCAGTATGATGTGGCTTTGAGTTTCTCATAGATGGCTCCTATTGTTTTGAGGTATGTTA 6554

117399823 CTTCTTTACCCAGTCTGTTGAGAGTTTTTATCATGAAGGGATGTTGGATTTTATTGAAAG 117399882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6555 CTTCTTTACCCAGTCTGTTGAGAGTTTTTATCATGAAGGGATGTTGGATTTTATTGAAAG 6614

117399883 TCTTTTCTGCATTTATTGAGATAATCATATGATTTTTGCTTTTAATTCTGTTTATGTGAC 117399942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6615 TCTTTTCTGCATTTATTGAGATAATCATATGATTTTTGCTTTTAATTCTGTTTATGTGAC 6674

117399943 AAATCACACTTATTGATTTTGTATGTGTGA 117399972
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     6675 AAATCACACTTATTGATTTTGTATGTGTGA 6704

Alignment time is 6.80053 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     2506] =>      2506 nucs 'mol-32-2ef1-019487_2506'

Score:        2473
Aligned:      2506        nucs
Identic:      2503 (100%) nucs =>       115 (100%)      2388 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117386038,117386152] EXCISED REGION [117386154,117388544]
 second seq =>  [        1,      115] EXCISED REGION [      116,     2506]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [117386153,117386153]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [117386325,117386325]
 second seq =>         1 nucs [287,287]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         6 nucs [117386153,117386158] to [117386154,117386159]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117386038 ACTGAAAAATTGCCCTAGGAAAAAAAATAAAATTAAAAAGTGAGCCAAAGATAGAGTAAA 117386097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTGAAAAATTGCCCTAGGAAAAAAAATAAAATTAAAAAGTGAGCCAAAGATAGAGTAAA 60

117386098 TATATTCAAAAAATGTATTCAATAGAGCAATTTTATCCAAAAAATAGAGAACATT 117386152
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATATTCAAAAAATGTATTCAATAGAGCAATTTTATCCAAAAAATAGAGAACATT 115

EXCISED REGION

117386154 AAAAAAGACAAATTTAATAAATCTTTTACTAAAGAAGATATGCAAATAGCAAAAAGCACA 117386213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      116 AAAAAAGACAAATTTAATAAATCTTTTACTAAAGAAGATATGCAAATAGCAAAAAGCACA 175

117386214 TGCAAATATGCTTAACATGATTAGTCATTAGGGAAACAAAAATTAAAACCACAATAAGAT 117386273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      176 TGCAAATATGCTTAACATGATTAGTCATTAGGGAAACAAAAATTAAAACCACAATAAGAT 235

117386274 ACCAATAAACTCCACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAGTGCTGGCA 117386333
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      236 ACCAATAAACTCCACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAATGCTGGCA 295

117386334 AGAATGTTGAAAACCTGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAATGG 117386393
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      296 AGAATGTTGAAAACATGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAATGG 355

117386394 TGAAGTCATGTTGGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAATGAACACCTAATACACAACT 117386453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      356 TGAAGTCATGTTGGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAACGAACACCTAATACACAACT 415

117386454 AGCTATTCCCCTCCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATT 117386513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      416 AGCTATTCCCCTCCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATT 475

117386514 GTTCACACAGTCTCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTA 117386573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      476 GTTCACACAGTCTCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTA 535

117386574 GAAACAAAACATCAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATA 117386633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 GAAACAAAACATCAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATA 595

117386634 CTACTATTCATCAGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTT 117386693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 CTACTATTCATCAGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTT 655

117386694 CAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGATTCT 117386753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 CAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGATTCT 715

117386754 ATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTG 117386813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 ATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTG 775

117386814 AGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGA 117386873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 AGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGA 835

117386874 TGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACA 117386933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 TGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACA 895

117386934 TTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACA 117386993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      896 TTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACA 955

117386994 AAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATA 117387053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      956 AAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATA 1015

117387054 AAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCGGAGAAAAAGAGAAAA 117387113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1016 AAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCGGAGAAAAAGAGAAAA 1075

117387114 ATACATTCATAATTTGAGATACTAACACCCCTTCTTCATGTTGACAGATTTGGTATACAA 117387173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1076 ATACATTCATAATTTGAGATACTAACACCCCTTCTTCATGTTGACAGATTTGGTATACAA 1135

117387174 AAACATCAGTAGGAATATATTAGATTTGATAGGAATGTTGATTACTTGGTCAATACATTT 117387233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 AAACATCAGTAGGAATATATTAGATTTGATAGGAATGTTGATTACTTGGTCAATACATTT 1195

117387234 GTCAAATTTGTATTGTACCTTCAGGATCTGTTCATTTCCCTACACGGTTTAACAATTAAA 117387293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 GTCAAATTTGTATTGTACCTTCAGGATCTGTTCATTTCCCTACACGGTTTAACAATTAAA 1255

117387294 ATCTGAGTCATTTAATAATGCAATGGAAATAGATAAAAAGAACAGAACAAAGATGATCAT 117387353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1256 ATCTGAGTCATTTAATAATGCAATGGAAATAGATAAAAAGAACAGAACAAAGATGATCAT 1315

117387354 TAGATAGGTATGTCAGTGACAGAGAGTAACAAGTCACAAGGTAGAAAAAGAGCAAATCAA 117387413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 TAGATAGGTATGTCAGTGACAGAGAGTAACAAGTCACAAGGTAGAAAAAGAGCAAATCAA 1375

117387414 ACCCAGATAAGGATTGTAAAGTTTCTAAGCTACTCTTACTTGTCACACTTTCTTGCCGTC 117387473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 ACCCAGATAAGGATTGTAAAGTTTCTAAGCTACTCTTACTTGTCACACTTTCTTGCCGTC 1435

117387474 TATAAAATCATTATATAGTTGAAAGCATTTATGGCATTAACAAAATTTTTATGATTGAAT 117387533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 TATAAAATCATTATATAGTTGAAAGCATTTATGGCATTAACAAAATTTTTATGATTGAAT 1495

117387534 ATCCTTGTTTGGCAAAGATTTCTGGAAAAGATGATTGATTTGATTTCAAAAATAACCCAA 117387593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1496 ATCCTTGTTTGGCAAAGATTTCTGGAAAAGATGATTGATTTGATTTCAAAAATAACCCAA 1555

117387594 AACTTTGATATTACAAAACTACCCTAAACCATTTTACTAATTGAACCTAGTATATTCAGT 117387653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 AACTTTGATATTACAAAACTACCCTAAACCATTTTACTAATTGAACCTAGTATATTCAGT 1615

117387654 TGGTAGGTTGGTAAACTGGAAAACATTTTTGAAGCACAAAACTCAAAAATACCAAAGAGA 117387713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 TGGTAGGTTGGTAAACTGGAAAACATTTTTGAAGCACAAAACTCAAAAATACCAAAGAGA 1675

117387714 AAACAGTTAACCCCAGTAAAAACTGTAAAAATGATACCAATAGAAAAATAATTGCCCATT 117387773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 AAACAGTTAACCCCAGTAAAAACTGTAAAAATGATACCAATAGAAAAATAATTGCCCATT 1735

117387774 ATTGAAAATACATCAAAATATGTTAATCTCAAGAATAATCAAAATATAATAAAAATATAA 117387833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 ATTGAAAATACATCAAAATATGTTAATCTCAAGAATAATCAAAATATAATAAAAATATAA 1795

117387834 TTGCATGACACTGAGATAGTTATTTGTATATTATCTACAGGTTTTTTTATTGTATTTAAA 117387893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 TTGCATGACACTGAGATAGTTATTTGTATATTATCTACAGGTTTTTTTATTGTATTTAAA 1855

117387894 CAGATGGGCATTGTGTTTGTCAGGGTTCTGGAAGCACATAATAAATAATGTGACTTGGCA 117387953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 CAGATGGGCATTGTGTTTGTCAGGGTTCTGGAAGCACATAATAAATAATGTGACTTGGCA 1915

117387954 CTGTTCTAGATGCTGAAGATAGAAGAGTGAACAAACCCTTACACATATGGTGCTATATAT 117388013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 CTGTTCTAGATGCTGAAGATAGAAGAGTGAACAAACCCTTACACATATGGTGCTATATAT 1975

117388014 TCATAAGAGAAAACTAAGGAACATAGATAAAAACGTTCACAGGATCTCTCTGGATGGTAG 117388073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 TCATAAGAGAAAACTAAGGAACATAGATAAAAACGTTCACAGGATCTCTCTGGATGGTAG 2035

117388074 AATTGAGGGTGATGTTTGTTCCTGTCCATTATACTTTTAAAATTATCTTCTTTATGTAAA 117388133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2036 AATTGAGGGTGATGTTTGTTCCTGTCCATTATACTTTTAAAATTATCTTCTTTATGTAAA 2095

117388134 AAAAGACATCATTAAAAATATTTTCTAATTTTTGAAGCATCTTTATAGGGACCCTATAAA 117388193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 AAAAGACATCATTAAAAATATTTTCTAATTTTTGAAGCATCTTTATAGGGACCCTATAAA 2155

117388194 AACCTGTAGGATTCTGATCTGAGCTGTTTCATTCCATAGAAGTCAATCACTGTCAGTGGG 117388253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 AACCTGTAGGATTCTGATCTGAGCTGTTTCATTCCATAGAAGTCAATCACTGTCAGTGGG 2215

117388254 AAACCCCTAGGGAAGTCTAGAGATTAAGAATAAAATCTAAGGAAATATAATTTTAAAATT 117388313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 AAACCCCTAGGGAAGTCTAGAGATTAAGAATAAAATCTAAGGAAATATAATTTTAAAATT 2275

117388314 CACTCATGCTTCTAGCAGCATTGGGAGCAACTGTAAGACTTGCACTCTTTTGATAATTGT 117388373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 CACTCATGCTTCTAGCAGCATTGGGAGCAACTGTAAGACTTGCACTCTTTTGATAATTGT 2335

117388374 AATTCAGCATGTTCCCTGGGGCTGTTCTGAGTCATCTTCAGTAGTGATAGAAGTCTTAGC 117388433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 AATTCAGCATGTTCCCTGGGGCTGTTCTGAGTCATCTTCAGTAGTGATAGAAGTCTTAGC 2395

117388434 CTTGAATTTCTTTTCCATAAAACATCTGACATAGTTCACAATGATGGGAGTGAACTACCT 117388493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 CTTGAATTTCTTTTCCATAAAACATCTGACATAGTTCACAATGATGGGAGTGAACTACCT 2455

117388494 TTTAGAATAGTTAAAGATTGTTAATGAAAATATTATAAATACTTTCAAAGA 117388544
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TTTAGAATAGTTAAAGATTGTTAATGAAAATATTATAAATACTTTCAAAGA 2506

Alignment time is 2.40399 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     2064] =>      2064 nucs 'mol-32-2ef1-069250_2064'

Score:        2031
Aligned:      2064        nucs
Identic:      2061 (100%) nucs =>       912 (100%)      1149 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117386186,117387098] EXCISED REGION [117393884,117395034]
 second seq =>  [        1,      913] EXCISED REGION [      914,     2064]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6785 nucs [117387099,117393883]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387099,117387099] to [117393884,117393884]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387098,117387098] to [117393884,117393884]
 second seq =>         1 nucs [913,913] to [914,914]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117386186 AGAAGATATGCAAATAGCAAAAAGCACATGCAAATATGCTTAACATGATTAGTCATTAGG 117386245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAAGATATGCAAATAGCAAAAAGCACATGCAAATATGCTTAACATGATTAGTCATTAGG 60

117386246 GAAACAAAAATTAAAACCACAATAAGATACCAATAAACTCCACTAGAGAAATTCAAATTA 117386305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAACAAAAATTAAAACCACAATAAGATACCAATAAACTCCACTAGAGAAATTCAAATTA 120

117386306 AAAAGACTAACAACATCAAGTGCTGGCAAGAATGTTGAAAACCTGTAACACCCATTAAAT 117386365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAGACTAACAACATCAAGTGCTGGCAAGAATGTTGAAAACCTGTAACACCCATTAAAT 180

117386366 GATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAATGGTGAAGTCATGTTGGAACACATTACAGAATTTT 117386425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAATGGTGAAGTCATGTTGGAACACATTACAGAATTTT 240

117386426 TGTTTAAATGAACACCTAATACACAACTAGCTATTCCCCTCCTAGATATCCCTAGGTATT 117386485
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTTAAACGAACACCTAATACACAACTAGCTATTCCCCTCCTAGATATCCCTAGGTATT 300

117386486 GTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATTGTTCACACAGTCTCAAATGTGAATATTTACAG 117386545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATTGTTCACACAGTCTCAAATGTGAATATTTACAG 360

117386546 CAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAACATCAACAGGTGAACAGATAAAC 117386605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAACATCAACAGGTGAACAGATAAAC 420

117386606 ACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCATCAGTAAGAAATATTAAACTAT 117386665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCATCAGTAAGAAATATTAAACTAT 480

117386666 TGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAACAT 117386725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAACAT 540

117386726 TTTATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAGTA 117386785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAGTA 600

117386786 GTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTACAA 117386845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTACAA 660

117386846 AGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGAAT 117386905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGAAT 720

117386906 GCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGATT 117386965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGATT 780

117386966 GCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAAAA 117387025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAAAA 840

117387026 TTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATACTG 117387085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATACTG 900

117387086 ACAGACCTAATCG 117387098
          |||||||||||||
      901 ACAGACCTAATCG 913

EXCISED REGION

117393884 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 117393943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      914 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 973

117393944 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 117394003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      974 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 1033

117394004 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 117394063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1034 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 1093

117394064 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 117394123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1094 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 1153

117394124 CTGGCCTACCTGATGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 117394183
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1154 CTGGCCTACCTGTTGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 1213

117394184 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 117394243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1214 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 1273

117394244 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 117394303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1274 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 1333

117394304 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 117394363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1334 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 1393

117394364 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 117394423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 1453

117394424 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 117394483
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCACTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 1513

117394484 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 117394543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 1573

117394544 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 117394603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 1633

117394604 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 117394663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 1693

117394664 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 117394723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 1753

117394724 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 117394783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 1813

117394784 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 117394843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 1873

117394844 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 117394903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 1933

117394904 AAACAACAGTATTATTTTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 117394963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 AAACAACAGTATTATTTTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 1993

117394964 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 117395023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 2053

117395024 TTTAGGCATTT 117395034
          |||||||||||
     2054 TTTAGGCATTT 2064

Alignment time is 1.96259 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     2722] =>      2722 nucs 'mol-32-2efc-035495_2722'

Score:        2667
Aligned:      2722        nucs
Identic:      2717 (100%) nucs =>       872 (100%)      1845 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117386226,117387098] EXCISED REGION [117393884,117395732]
 second seq =>  [        1,      873] EXCISED REGION [      874,     2722]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6785 nucs [117387099,117393883]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387099,117387099] to [117393884,117393884]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387098,117387098] to [117393884,117393884]
 second seq =>         1 nucs [873,873] to [874,874]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117386226 TAACATGATTAGTCATTAGGGAAACAAAAATTAAAACCACAATAAGATACCAATAAACTC 117386285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAACATGATTAGTCATTAGGGAAACAAAAATTAAAACCACAATAAGATACCAATAAACTC 60

117386286 CACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAGTGCTGGCAAGAATGTTGAAA 117386345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAGTGCTGGCAAGAATGTTGAAA 120

117386346 ACCTGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAATGGTGAAGTCATGTT 117386405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCTGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAATGGTGAAGTCATGTT 180

117386406 GGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAATGAACACCTAATACACAACTAGCTATTCCCCT 117386465
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAACGAACACCTAATACACAACTAGCTATTCCCCT 240

117386466 CCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATTGTTCACACAGTC 117386525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATTGTTCACACAGTC 300

117386526 TCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAACAT 117386585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAACAT 360

117386586 CAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCATC 117386645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCATC 420

117386646 AGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATGTT 117386705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATGTT 480

117386706 TAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGAAA 117386765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGAAA 540

117386766 TTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTGTG 117386825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTGTG 600

117386826 AGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATTCT 117386885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATTCT 660

117386886 AAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAACTG 117386945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAACTG 720

117386946 TACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAAAT 117387005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAAAT 780

117387006 TCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTCAA 117387065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTCAA 840

117387066 AGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCG 117387098
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCG 873

EXCISED REGION

117393884 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 117393943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      874 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 933

117393944 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 117394003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      934 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 993

117394004 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 117394063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      994 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 1053

117394064 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 117394123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1054 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 1113

117394124 CTGGCCTACCTGATGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 117394183
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1114 CTGGCCTACCTGTTGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 1173

117394184 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 117394243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1174 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 1233

117394244 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 117394303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1234 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 1293

117394304 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 117394363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1294 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 1353

117394364 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 117394423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1354 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 1413

117394424 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 117394483
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1414 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCACTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 1473

117394484 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 117394543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 1533

117394544 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 117394603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 1593

117394604 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 117394663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 1653

117394664 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 117394723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 1713

117394724 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 117394783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 1773

117394784 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 117394843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 1833

117394844 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 117394903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 1893

117394904 AAACAACAGTATTATTTTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 117394963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 AAACAACAGTATTATTTTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 1953

117394964 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 117395023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 2013

117395024 TTTAGGCATTTATTTTACTGTTGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAAT 117395083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 TTTAGGCATTTATTTTACTGTTGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAAT 2073

117395084 GAGTAGGGCTGTTTTGAACACTCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTT 117395143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 GAGTAGGGCTGTTTTGAACACTCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTT 2133

117395144 TCTGTTGAGTGTATAAACAGAAGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTG 117395203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 TCTGTTGAGTGTATAAACAGAAGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTG 2193

117395204 TTAATGTATACTGGTAGTTTTGCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATG 117395263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 TTAATGTATACTGGTAGTTTTGCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATG 2253

117395264 TCTATGAATATTGGTTATGCTACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATAC 117395323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 TCTATGAATATTGGTTATGCTACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATAC 2313

117395324 AGTTGTTCATATTTTTCTGTTTTTGGCAATCTGTATATATCACAATATTTAAGTGGTTTT 117395383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 AGTTGTTCATATTTTTCTGTTTTTGGCAATCTGTATATATCACAATATTTAAGTGGTTTT 2373

117395384 GGAATTATGTCCTCTTATTTGTCTGAAGTAATTTGTTTTTTCCAACTAGAGCAAGAAAGT 117395443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 GGAATTATGTCCTCTTATTTGTCTGAAGTAATTTGTTTTTTCCAACTAGAGCAAGAAAGT 2433

117395444 GATTATTTTAATGTCTAAATCATGTATTGTGTCAACCCTTCTTTTAAAAATAGCTACAAA 117395503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 GATTATTTTAATGTCTAAATCATGTATTGTGTCAACCCTTCTTTTAAAAATAGCTACAAA 2493

117395504 AAGTCCAAAGGTTTATCTTTTTTTCTTAGAATAACACCCATACATCTTAATAAGGTCCAT 117395563
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 AAGTCCAAAGGTTTATCATTTTTTCTTAGAATAACACCCATACATCTTAATAAGGTCCAT 2553

117395564 AATTTATTGCATGAAATTAGCTCCTTTCAATTCTGTTGCACCCACAATATCTTTACTGCT 117395623
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2554 AATTTATTGCATGAAATTAGCTCCTTTCAATTCTGTTGCACCCACAATATCTTTATTGCT 2613

117395624 ATTTTCAGGTTACACCAGGTTTTTGTTCTTATAGCTATTGTTATTACTTTTCTTTTTTCT 117395683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 ATTTTCAGGTTACACCAGGTTTTTGTTCTTATAGCTATTGTTATTACTTTTCTTTTTTCT 2673

117395684 TATCTCAGAGTCTTTCTTCTGGTTTATTTTAATCCTCTGATTACTGACT 117395732
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 TATCTCAGAGTCTTTCTTCTGGTTTATTTTAATCCTCTGATTACTGACT 2722

Alignment time is 2.59452 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     7759] =>      7759 nucs 'mol-32-2efc-072001_7759'

Score:        7703
Aligned:      7758        nucs
Identic:      7753 (100%) nucs =>      2766 (100%)      4987 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117387598,117390363] EXCISED REGION [117390365,117395356]
 second seq =>  [        1,     2766] EXCISED REGION [     2768,     7759]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [117390364,117390364]
 second seq =>         1 nucs [2767,2767]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117390364,117390364] to [117390365,117390365]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117387598 TTGATATTACAAAACTACCCTAAACCATTTTACTAATTGAACCTAGTATATTCAGTTGGT 117387657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGATATTACAAAACTACCCTAAACCATTTTACTAATTGAACCTAGTATATTCAGTTGGT 60

117387658 AGGTTGGTAAACTGGAAAACATTTTTGAAGCACAAAACTCAAAAATACCAAAGAGAAAAC 117387717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGTTGGTAAACTGGAAAACATTTTTGAAGCACAAAACTCAAAAATACCAAAGAGAAAAC 120

117387718 AGTTAACCCCAGTAAAAACTGTAAAAATGATACCAATAGAAAAATAATTGCCCATTATTG 117387777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTTAACCCCAGTAAAAACTGTAAAAATGATACCAATAGAAAAATAATTGCCCATTATTG 180

117387778 AAAATACATCAAAATATGTTAATCTCAAGAATAATCAAAATATAATAAAAATATAATTGC 117387837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAATACATCAAAATATGTTAATCTCAAGAATAATCAAAATATAATAAAAATATAATTGC 240

117387838 ATGACACTGAGATAGTTATTTGTATATTATCTACAGGTTTTTTTATTGTATTTAAACAGA 117387897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGACACTGAGATAGTTATTTGTATATTATCTACAGGTTTTTTTATTGTATTTAAACAGA 300

117387898 TGGGCATTGTGTTTGTCAGGGTTCTGGAAGCACATAATAAATAATGTGACTTGGCACTGT 117387957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGGCATTGTGTTTGTCAGGGTTCTGGAAGCACATAATAAATAATGTGACTTGGCACTGT 360

117387958 TCTAGATGCTGAAGATAGAAGAGTGAACAAACCCTTACACATATGGTGCTATATATTCAT 117388017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTAGATGCTGAAGATAGAAGAGTGAACAAACCCTTACACATATGGTGCTATATATTCAT 420

117388018 AAGAGAAAACTAAGGAACATAGATAAAAACGTTCACAGGATCTCTCTGGATGGTAGAATT 117388077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGAGAAAACTAAGGAACATAGATAAAAACGTTCACAGGATCTCTCTGGATGGTAGAATT 480

117388078 GAGGGTGATGTTTGTTCCTGTCCATTATACTTTTAAAATTATCTTCTTTATGTAAAAAAA 117388137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGGGTGATGTTTGTTCCTGTCCATTATACTTTTAAAATTATCTTCTTTATGTAAAAAAA 540

117388138 GACATCATTAAAAATATTTTCTAATTTTTGAAGCATCTTTATAGGGACCCTATAAAAACC 117388197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GACATCATTAAAAATATTTTCTAATTTTTGAAGCATCTTTATAGGGACCCTATAAAAACC 600

117388198 TGTAGGATTCTGATCTGAGCTGTTTCATTCCATAGAAGTCAATCACTGTCAGTGGGAAAC 117388257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTAGGATTCTGATCTGAGCTGTTTCATTCCATAGAAGTCAATCACTGTCAGTGGGAAAC 660

117388258 CCCTAGGGAAGTCTAGAGATTAAGAATAAAATCTAAGGAAATATAATTTTAAAATTCACT 117388317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCTAGGGAAGTCTAGAGATTAAGAATAAAATCTAAGGAAATATAATTTTAAAATTCACT 720

117388318 CATGCTTCTAGCAGCATTGGGAGCAACTGTAAGACTTGCACTCTTTTGATAATTGTAATT 117388377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATGCTTCTAGCAGCATTGGGAGCAACTGTAAGACTTGCACTCTTTTGATAATTGTAATT 780

117388378 CAGCATGTTCCCTGGGGCTGTTCTGAGTCATCTTCAGTAGTGATAGAAGTCTTAGCCTTG 117388437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGCATGTTCCCTGGGGCTGTTCTGAGTCATCTTCAGTAGTGATAGAAGTCTTAGCCTTG 840

117388438 AATTTCTTTTCCATAAAACATCTGACATAGTTCACAATGATGGGAGTGAACTACCTTTTA 117388497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATTTCTTTTCCATAAAACATCTGACATAGTTCACAATGATGGGAGTGAACTACCTTTTA 900

117388498 GAATAGTTAAAGATTGTTAATGAAAATATTATAAATACTTTCAAAGATAAAGGTTAGGAA 117388557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAATAGTTAAAGATTGTTAATGAAAATATTATAAATACTTTCAAAGATAAAGGTTAGGAA 960

117388558 CTCTAAAGGGTCATAAAAACCAAGTACAAATTCTTTATTTTGCCAGATTTGGACAATGAA 117388617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTCTAAAGGGTCATAAAAACCAAGTACAAATTCTTTATTTTGCCAGATTTGGACAATGAA 1020

117388618 GCTTAAAAGCATTCAGCAACTTTCCTTAGTTTCATGGTATGAATAACAAAAAGCTGTCTG 117388677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTTAAAAGCATTCAGCAACTTTCCTTAGTTTCATGGTATGAATAACAAAAAGCTGTCTG 1080

117388678 CTGAGTCCTGGTCTAGTGTTTTAGGTATGTAAAAATTAGTTTCAATAAAACAGTTCAAAT 117388737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGAGTCCTGGTCTAGTGTTTTAGGTATGTAAAAATTAGTTTCAATAAAACAGTTCAAAT 1140

117388738 CCCAAACATGTCAATCTGATTGAAACAAAAGAGTTATGTAATAGTGAAAGAAATGAGCTG 117388797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCAAACATGTCAATCTGATTGAAACAAAAGAGTTATGTAATAGTGAAAGAAATGAGCTG 1200

117388798 AATTGGCCATTTAGATTTAATTTGCTCTATGTGTGTGTGCTAATTCAAATTAACGGGTAT 117388857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATTGGCCATTTAGATTTAATTTGCTCTATGTGTGTGTGCTAATTCAAATTAACGGGTAT 1260

117388858 ATATTTTTACATTGCCAATATCAAACTATGCTTGAGAGTTTAGTGTTTCCTCTGTGATAC 117388917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATATTTTTACATTGCCAATATCAAACTATGCTTGAGAGTTTAGTGTTTCCTCTGTGATAC 1320

117388918 CTGAGGGATCAAAGGGAAGGTGTATCAATCTAGGTCCAACCAGGAGAAAGAAACTACATA 117388977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGAGGGATCAAAGGGAAGGTGTATCAATCTAGGTCCAACCAGGAGAAAGAAACTACATA 1380

117388978 GTGATTCAAGCAAGGGAATTTTAATGTAACAAATCATTAAAGTATGATAAAGAGTAACTA 117389037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTGATTCAAGCAAGGGAATTTTAATGTAACAAATCATTAAAGTATGATAAAGAGTAACTA 1440

117389038 TAACATGTAAAGAGAACCTTAAAAGGGCACAGTATGTCTGAGAGAGTATCCAAAGAAGGG 117389097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAACATGTAAAGAGAACCTTAAAAGGGCACAGTATGTCTGAGAGAGTATCCAAAGAAGGG 1500

117389098 CAAACTTGGAAAGGAGGTGTCCTCTCCAAGGGTGAGGTTCAGACCACATTGGAGAAGGCA 117389157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAACTTGGAAAGGAGGTGTCCTCTCCAAGGGTGAGGTTCAGACCACATTGGAGAAGGCA 1560

117389158 TGGCTGCAGCCTGCCGATTGACAGTGAAGTTCACTGAGGTGCCCAAGACAGAGTTGGATC 117389217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGCTGCAGCCTGCCGATTGACAGTGAAGTTCACTGAGGTGCCCAAGACAGAGTTGGATC 1620

117389218 ACAGTAATTAGGCAAGCAGGAAACAAGCCTCTGGAGCACAGGTGAGCCACAGCTGGTGGA 117389277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACAGTAATTAGGCAAGCAGGAAACAAGCCTCTGGAGCACAGGTGAGCCACAGCTGGTGGA 1680

117389278 GAATACACTGCTGGGAAATAGTGCAGATGATGGAACTAACAAGAGAAGCTTTCTCCTTCT 117389337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAATACACTGCTGGGAAATAGTGCAGATGATGGAACTAACAAGAGAAGCTTTCTCCTTCT 1740

117389338 CCATTGCCCCTCCAATGCCCTCTACTGAGAAAGTTTAACATTGTGCTCACTTTAAAGAAG 117389397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCATTGCCCCTCCAATGCCCTCTACTGAGAAAGTTTAACATTGTGCTCACTTTAAAGAAG 1800

117389398 AACAGTTTAAAGGAATTCCATCCACTTTTGCAGAGCAGGTATTAAAAATTAACTTTAGAC 117389457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACAGTTTAAAGGAATTCCATCCACTTTTGCAGAGCAGGTATTAAAAATTAACTTTAGAC 1860

117389458 CTGAGAAGCAATAAACTGATAACTGGAAAAGGAGGCTTATAAGATCAGGTTCTGTGTCCC 117389517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTGAGAAGCAATAAACTGATAACTGGAAAAGGAGGCTTATAAGATCAGGTTCTGTGTCCC 1920

117389518 CACGTCCACCAGAGAAGTTCTGCTCTTCCATGTTTAATAAAGAATGGTTCCCAGCAAAAT 117389577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CACGTCCACCAGAGAAGTTCTGCTCTTCCATGTTTAATAAAGAATGGTTCCCAGCAAAAT 1980

117389578 TTATTTGAAAGCCAAAAACACTGAAAGACATTATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTT 117389637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTATTTGAAAGCCAAAAACACTGAAAGACATTATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTT 2040

117389638 TTAATTTTAGACATAAAAGAAAACTATTAAAAATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATT 117389697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTAATTTTAGACATAAAAGAAAACTATTAAAAATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATT 2100

117389698 CTTACTATATAATAGTACAGGTTAGAGAAGGAAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAA 117389757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTTACTATATAATAGTACAGGTTAGAGAAGGAAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAA 2160

117389758 AATAAGTAGGGCTAATAAATAATTTGCACCAAAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACTAATT 117389817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AATAAGTAGGGCTAATAAATAATTTGCACCAAAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACTAATT 2220

117389818 GTAATATGAGAAATGAGTATCTGAATGAAGCTTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAATAG 117389877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTAATATGAGAAATGAGTATCTGAATGAAGCTTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAATAG 2280

117389878 AAAAGAAGAAACTAATTTTTAATGTTATATAAGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCCTTG 117389937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAAGAAGAAACTAATTTTTAATGTTATATAAGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCCTTG 2340

117389938 ATTCAGTAGTGAAAAATACTTATTGTGATGGTTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGGATC 117389997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTCAGTAGTGAAAAATACTTATTGTGATGGTTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGGATC 2400

117389998 AAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAATTATTGTTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAGACT 117390057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAATTATTGTTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAGACT 2460

117390058 GACATTTGAGTCAGTGGACTGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACCATC 117390117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GACATTTGAGTCAGTGGACTGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACCATC 2520

117390118 CAATGGGCTGCCAGTGCCACTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTGCTT 117390177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CAATGGGCTGCCAGTGCCACTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTGCTT 2580

117390178 GCTTAGTCTTCTGGCTTTCCTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACATAA 117390237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GCTTAGTCTTCTGGCTTTCCTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACATAA 2640

117390238 GAGTCCAGGTTCTTCTGCCTTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGACTC 117390297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GAGTCCAGGTTCTTCTGCCTTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGACTC 2700

117390298 CTGGGCCTTCGGCCACAGACTGAAGTCTGCACTGTCAGCGTCCTTACTTGTGAGGTTTCT 117390357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTGGGCCTTCGGCCACAGACTGAAGTCTGCACTGTCAGCGTCCTTACTTGTGAGGTTTCT 2760

117390358 GGACTC 117390363
          ||||||
     2761 GGACTC 2766

EXCISED REGION

117390365 GACTGAGCCACTACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGGAGTTTACCTT 117390424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 GACTGAGCCACTACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGGAGTTTACCTT 2827

117390425 GTGATTGTGTGAGCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACATGTATCCTATT 117390484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 GTGATTGTGTGAGCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACATGTATCCTATT 2887

117390485 CATTCTGTCCCTCTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGATAAACACTGAT 117390544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 CATTCTGTCCCTCTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGATAAACACTGAT 2947

117390545 TGGACAAAGATTGTGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAATAAGAGTGAC 117390604
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 TGGACAAAGATTGCGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAATAAGAGTGAC 3007

117390605 ATTGGGAGCTAAATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTAATGCCACAAT 117390664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 ATTGGGAGCTAAATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTAATGCCACAAT 3067

117390665 AGAGAAATTGATAGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAGCAAACACCAA 117390724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 AGAGAAATTGATAGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAGCAAACACCAA 3127

117390725 ACACCATACAAAATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAACTGGAGGTAAA 117390784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 ACACCATACAAAATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAACTGGAGGTAAA 3187

117390785 ATAGTCTGACTAAGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTTAGTTTGATTA 117390844
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3188 ATAGTCTGACTAAGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTTAGTTTTATTA 3247

117390845 TTAAATTAGGCACAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATACATAGAATAA 117390904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 TTAAATTAGGCACAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATACATAGAATAA 3307

117390905 TCTCTACAATGCAAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGTGATTGCTTCT 117390964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 TCTCTACAATGCAAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGTGATTGCTTCT 3367

117390965 GGGGGCATATTTCTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTTC 117391024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 GGGGGCATATTTCTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTTC 3427

117391025 CTAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGA 117391084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 CTAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGA 3487

117391085 AATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGG 117391144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 AATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGG 3547

117391145 AAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGA 117391204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 AAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGA 3607

117391205 ATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATA 117391264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 ATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATA 3667

117391265 AAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAAT 117391324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 AAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAAT 3727

117391325 TAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAA 117391384
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 TAAAGGTCGGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAA 3787

117391385 TCATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCC 117391444
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 TAATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCC 3847

117391445 TACTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAA 117391504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 TACTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAA 3907

117391505 ACTCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAA 117391564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 ACTCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAA 3967

117391565 GTTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTT 117391624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 GTTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTT 4027

117391625 TCTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGC 117391684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 TCTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGC 4087

117391685 ACTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTT 117391744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 ACTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTT 4147

117391745 AAATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGT 117391804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 AAATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGT 4207

117391805 GGGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGC 117391864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 GGGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGC 4267

117391865 TTCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAG 117391924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 TTCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAG 4327

117391925 TAGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCT 117391984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 TAGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCT 4387

117391985 GTGTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCT 117392044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 GTGTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCT 4447

117392045 GCAGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCA 117392104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 GCAGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCA 4507

117392105 CAGAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAA 117392164
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 CGGAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAA 4567

117392165 GAGGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACC 117392224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 GAGGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACC 4627

117392225 TGTCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATG 117392284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 TGTCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATG 4687

117392285 ACATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAG 117392344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 ACATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAG 4747

117392345 TAATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTA 117392404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 TAATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTA 4807

117392405 AATAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTC 117392464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 AATAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTC 4867

117392465 TGTCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCG 117392524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 TGTCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCG 4927

117392525 GTACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAA 117392584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 GTACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAA 4987

117392585 ATGTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAAC 117392644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 ATGTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAAC 5047

117392645 TGAGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTT 117392704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 TGAGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTT 5107

117392705 TTTTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGA 117392764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 TTTTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGA 5167

117392765 TAAATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGC 117392824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5168 TAAATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGC 5227

117392825 AATATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACA 117392884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5228 AATATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACA 5287

117392885 GAGTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAAT 117392944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5288 GAGTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAAT 5347

117392945 CCATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGG 117393004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5348 CCATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGG 5407

117393005 AAAAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAA 117393064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5408 AAAAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAA 5467

117393065 CTAAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATA 117393124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5468 CTAAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATA 5527

117393125 CAGGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTG 117393184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5528 CAGGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTG 5587

117393185 AAATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTG 117393244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5588 AAATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTG 5647

117393245 TTAAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGG 117393304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5648 TTAAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGG 5707

117393305 AAAAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACC 117393364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5708 AAAAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACC 5767

117393365 GAAAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGA 117393424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5768 GAAAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGA 5827

117393425 GACAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCC 117393484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5828 GACAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCC 5887

117393485 AGCAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAAT 117393544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5888 AGCAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAAT 5947

117393545 GACAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAG 117393604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5948 GACAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAG 6007

117393605 AATCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTG 117393664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6008 AATCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTG 6067

117393665 GCCTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCAC 117393724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6068 GCCTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCAC 6127

117393725 TCAGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGT 117393784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6128 TCAGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGT 6187

117393785 GGAGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCT 117393844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6188 GGAGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCT 6247

117393845 TAAGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACT 117393904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6248 TAAGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACT 6307

117393905 GCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGA 117393964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6308 GCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGA 6367

117393965 TTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 117394024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6368 TTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 6427

117394025 ACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGC 117394084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6428 ACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGC 6487

117394085 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATT 117394144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6488 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATT 6547

117394145 TTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAAC 117394204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6548 TTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAAC 6607

117394205 CATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGG 117394264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6608 CATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGG 6667

117394265 ATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAA 117394324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6668 ATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAA 6727

117394325 TATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATC 117394384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6728 TATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATC 6787

117394385 CGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTA 117394444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6788 CGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTA 6847

117394445 CCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACT 117394504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6848 CCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACT 6907

117394505 TTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAAT 117394564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6908 TTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAAT 6967

117394565 AAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTT 117394624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6968 AAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTT 7027

117394625 GGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATT 117394684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7028 GGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATT 7087

117394685 TCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAAATCTT 117394744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7088 TCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAAATCTT 7147

117394745 AGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATACCTCTCAAATTAAGAAATAGAA 117394804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7148 AGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATACCTCTCAAATTAAGAAATAGAA 7207

117394805 TACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGATCAGACCATGTCTCTCAGCAT 117394864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7208 TACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGATCAGACCATGTCTCTCAGCAT 7267

117394865 AAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGGAAACAACAGTATTATTTTGTG 117394924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7268 AAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGGAAACAACAGTATTATTTTGTG 7327

117394925 TCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTCATCCAAATGTGCTAGGCATAC 117394984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7328 TCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTCATCCAAATGTGCTAGGCATAC 7387

117394985 TTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAATTTAGGCATTTATTTTACTGT 117395044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7388 TTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAATTTAGGCATTTATTTTACTGT 7447

117395045 TGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAATGAGTAGGGCTGTTTTGAACAC 117395104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7448 TGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAATGAGTAGGGCTGTTTTGAACAC 7507

117395105 TCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTTTCTGTTGAGTGTATAAACAGA 117395164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7508 TCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTTTCTGTTGAGTGTATAAACAGA 7567

117395165 AGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTGTTAATGTATACTGGTAGTTTT 117395224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7568 AGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTGTTAATGTATACTGGTAGTTTT 7627

117395225 GCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATGTCTATGAATATTGGTTATGCT 117395284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7628 GCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATGTCTATGAATATTGGTTATGCT 7687

117395285 ACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATACAGTTGTTCATATTTTTCTGTT 117395344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7688 ACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATACAGTTGTTCATATTTTTCTGTT 7747

117395345 TTTGGCAATCTG 117395356
          ||||||||||||
     7748 TTTGGCAATCTG 7759

Alignment time is 7.08939 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     6720] =>      6720 nucs 'mol-32-2f33-066318_6720'

Score:        6644
Aligned:      6721        nucs
Identic:      6714 (100%) nucs =>      2072 (100%)      4642 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117383605,117385679] EXCISED REGION [117385684,117390329]
 second seq =>  [        1,     2075] EXCISED REGION [     2076,     6720]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [117385680,117385683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [117385680,117385704] to [117385684,117385708]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [117385680,117385681] to [117385682,117385683]
 second seq =>         0 nucs

117383605 AGTGGGTACTTTAAGCTCACACAAAATAGACATGAAAACAAAGGTTAATGCTAGAGACAA 117383664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTGGGTACTTTAAGCTCACACAAAATAGACATGAAAACAAAGGTTAATGCTAGAGACAA 60

117383665 GAACATTTTATAATGATGAATGTGTCAATTTATCAGTATAAATTAACATTCATAAATGTA 117383724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAACATTTTATAATGATGAATGTGTCAATTTATCAGTATAAATTAACATTCATAAATGTA 120

117383725 TATGCAGCTAACAACAAAGCCTCAAAAATACACAAAGCAAAACTAACTTCTATTAAAAGA 117383784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATGCAGCTAACAACAAAGCCTCAAAAATACACAAAGCAAAACTAACTTCTATTAAAAGA 180

117383785 AGTAAAGAAAAATTCAATAATTACAGTTAATTTTAACACTTCTGTCTCAGTAATTGATAG 117383844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTAAAGAAAAATTCAATAATTACAGTTAATTTTAACACTTCTGTCTCAGTAATTGATAG 240

117383845 GACTAGTAGACAAAAAATTGGTAAGGAAACTGAATGTAACAATTTTATTAAGCAACAAAA 117383904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GACTAGTAGACAAAAAATTGGTAAGGAAACTGAATGTAACAATTTTATTAAGCAACAAAA 300

117383905 CCTATCTGACAAATATAGAACACTCTATTCCACAACAGTAGAATATATTTATTTTCAAGT 117383964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTATCTGACAAATATAGAACACTCTATTCCACAACAGTAGAATATATTTATTTTCAAGT 360

117383965 GCAAATAAAAATATCCCATGGGAATAAAATTTACATTAGACTATAAAACATTTTAAAGAA 117384024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCAAATAAAAATATCCCATGGGAATAAAATTTACATTAGACTATAAAACATTTTAAAGAA 420

117384025 TTGAAATAATGTGTTTTTCTATCCACACTAGAATTAGAAATCAATAACAGAAAAAATCTA 117384084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGAAATAATGTGTTTTTCTATCCACACTAGAATTAGAAATCAATAACAGAAAAAATCTA 480

117384085 GAAAATACTAAAACATGAAAAATCAAGTAATATATTCCTAAATTAACATGGCTCAAAGAA 117384144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAAATACTAAAACATGAAAAATCAAGTAATATATTCCTAAATTAACATGGCTCAAAGAA 540

117384145 AAAATATAAATATACGGAAATATATTAAAAACACAAAATATTGAAACTTTAAATATTTCT 117384204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATATAAATATACGGAAATATATTAAAAACACAAAATATTGAAACTTTAAATATTTCT 600

117384205 TCTAAGAGCAGGAAATGAACTAAAATCAACTCATATAAGCTTCCAAAATCAACTCATATA 117384264
          ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      601 TCTAAGAGCAGGAAATTAACTAAAATCAACTCATATAAGCTTCCAAAATCAACTCGTATA 660

117384265 AGCTTCCAACTTAAGCTTTTAGAAAAAGAAAAGGAAATCAAATCTAGGTGAGTAGAATGA 117384324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGCTTCCAACTTAAGCTTTTAGAAAAAGAAAAGGAAATCAAATCTAGGTGAGTAGAATGA 720

117384325 ATAAAATTTTTAAAAAAAATCACAGTAGAGATCAACACTTTTTTAAGTAAATTACAGATA 117384384
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATAAAATTTTAAAAAAAAATCACAGTAGAGATCAACACTTTTTTAAGTAAATTACAGATA 780

117384385 AGTTCTTTTTTTTCAAGATTTTGTGTGATTTATTTAAATTTCAGATATTGATAAGCCAAT 117384444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTTCTTTTTTTTCAAGATTTTGTGTGATTTATTTAAATTTCAGATATTGATAAGCCAAT 840

117384445 CTACAGTGTTATAAATCAGGTAATGAGAGCTTGAACTTAAATGGTGGCGGTAAGCCTATA 117384504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTACAGTGTTATAAATCAGGTAATGAGAGCTTGAACTTAAATGGTGGCGGTAAGCCTATA 900

117384505 TAATCTATACAAAACAGTATTTTATGAAATAAGTACTATTACTATTCCCATTTACACATG 117384564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAATCTATACAAAACAGTATTTTATGAAATAAGTACTATTACTATTCCCATTTACACATG 960

117384565 AGAAAACAGGTCCAGAGAGGGTAAGTAATGTGCTAATTTTCTCAAGAGCACAATGGTAAT 117384624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGAAAACAGGTCCAGAGAGGGTAAGTAATGTGCTAATTTTCTCAAGAGCACAATGGTAAT 1020

117384625 GGCAAACTCCTAATTCAAATCTAGTCTGTTGAGCTCCAGAGCTCCAGTTCTCAGCATATG 117384684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGCAAACTCCTAATTCAAATCTAGTCTGTTGAGCTCCAGAGCTCCAGTTCTCAGCATATG 1080

117384685 ATAGACAAGAATCAGAAAAAAATGCCCTTTCCATGGAAGACAATGAAGAAATTGTTAACA 117384744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATAGACAAGAATCAGAAAAAAATGCCCTTTCCATGGAAGACAATGAAGAAATTGTTAACA 1140

117384745 GGAGAAAGTATTTTCAATCATTAAATAATTTTTAAATCAAGGCAAATAAATTGTGACTGC 117384804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAGAAAGTATTTTCAATCATTAAATAATTTTTAAATCAAGGCAAATAAATTGTGACTGC 1200

117384805 AATCTGCCTAATGGCTATCAAATTAGCTTAAGACTTCCTCTGCAACAGATGTAAGAAAGA 117384864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATCTGCCTAATGGCTATCAAATTAGCTTAAGACTTCCTCTGCAACAGATGTAAGAAAGA 1260

117384865 GAATGAGTGAAGGGAAATTCGGACATTTTGAAATAGAGGAAAGAGTTCATATTAGATATT 117384924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAATGAGTGAAGGGAAATTCGGACATTTTGAAATAGAGGAAAGAGTTCATATTAGATATT 1320

117384925 TTTTTCAAGCTCACTCTTCCTTAACCATATTCTTTCTTATCTCCACTATAAAATTGCTCA 117384984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTTCAAGCTCACTCTTCCTTAACCATATTCTTTCTTATCTCCACTATAAAATTGCTCA 1380

117384985 TTAATATTCTCCTTCCCACAGACTCTTTATTCTGTGAAATCAAAAGTTATTTATTTAAAA 117385044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTAATATTCTCCTTCCCACAGACTCTTTATTCTGTGAAATCAAAAGTTATTTATTTAAAA 1440

117385045 AGAGAAACAAAAGTGAAAAACATTTAGCCTGACTCATCAAGAAAAAAGAAAAATTATTAA 117385104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGAGAAACAAAAGTGAAAAACATTTAGCCTGACTCATCAAGAAAAAAGAAAAATTATTAA 1500

117385105 TATCAGGAATTAAAAAGGGAGGAAATAAGTAAAGATACTATATATGGAAAACTATAAAAC 117385164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATCAGGAATTAAAAAGGGAGGAAATAAGTAAAGATACTATATATGGAAAACTATAAAAC 1560

117385165 ATGGCTTAGAGAAATTAAAGATCTAAATAAATAGAAACATATGCCCTTTTAATGGGCCAC 117385224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATGGCTTAGAGAAATTAAAGATCTAAATAAATAGAAACATATGCCCTTTTAATGGGCCAC 1620

117385225 AAGATTTAATAGTGCTAACCTGACAATTTATCCTAAATTAATATTTAGACTCACTGTAAC 117385284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGATTTAATAGTGCTAACCTGACAATTTATCCTAAATTAATATTTAGACTCACTGTAAC 1680

117385285 CCCAAACACAATCCTAGCAGGGTTTTCTGTAGGAATTGAAAAGCAGACTTCATAGTATAT 117385344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCCAAACACAATCCTAGCAGGGTTTTCTGTAGGAATTGAAAAGCAGACTTCATAGTATAT 1740

117385345 GTAGAAAACCAAAGGATTAAGAATAGCCAAAATGACTTTGAAAAAAAAAAGATGAAGATT 117385404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTAGAAAACCAAAGGATTAAGAATAGCCAAAATGACTTTGAAAAAAAAAAGATGAAGATT 1800

117385405 TTACACTGCTGATTTTAAAACCATTATAAAACCACAGTAATCAAAACTGTGTGGTATTGG 117385464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTACACTGCTGATTTTAAAACCATTATAAAACCACAGTAATCAAAACTGTGTGGTATTGG 1860

117385465 CTTAAGAAGAGTCATATAAATCAACGGGAAATAATAGACTTCATAAATAGACCCACATAT 117385524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTAAGAAGAGTCATATAAATCAACGGGAAATAATAGACTTCATAAATAGACCCACATAT 1920

117385525 TTATTTACTATATAAGTATATATATTTACCATTCATATGTATATATTTACCATATGTGGG 117385584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTATTTACTATATAAGTATATATATTTACCATTCATATGTATATATTTACCATATGTGGG 1980

117385585 TAAATATACAATGTGAGTCTATATATATTTACATATATATGTATTTACCACATAAATATT 117385644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAAATATACAATGTGAGTCTATATATATTTACATATATATGTATTTACCACATAAATATT 2040

117385645 TGCCATATATGTATATATACAGAATATGGTAAATA 117385679
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCCATATATGTATATATACAGAATATGGTAAATA 2075

EXCISED REGION

117385684 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGAGACACATGTATCATATATACGGTAAATTTTT 117385743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGAGACACATGTATCATATATACGGTAAATTTTT 2135

117385744 TTCAAAAATTGTGTCAAGGAGTTCAACGAAAAGCATTATTTTTAATAACTGGTGCTGAAA 117385803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     2136 TTCAAAAATTGTGTCAAGGAGTTCAACGAAAAACATTATTTTTAATAACTGGTGCTGAAA 2195

117385804 CAATTGGATATTCATGTACACACATAACAAAAACCCACAACAAAACTAACCTCAATTTTA 117385863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 CAATTGGATATTCATGTACACACATAACAAAAACCCACAACAAAACTAACCTCAATTTTA 2255

117385864 ATATGAGCATAAATGAAAATTTCCTAAAAATGCATCATAAATCTAGTTGTAAAACATAAG 117385923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 ATATGAGCATAAATGAAAATTTCCTAAAAATGCATCATAAATCTAGTTGTAAAACATAAG 2315

117385924 AAAATAAATCTTAGAAAACATAGTAGAAAATTTTTGTGACTTTTTAGGTAAAGATTTCTC 117385983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 AAAATAAATCTTAGAAAACATAGTAGAAAATTTTTGTGACTTTTTAGGTAAAGATTTCTC 2375

117385984 AGTACACAAAAAGTAGAAATTATTAAAATAATTGATAATTTGAACTTTATCAAAACTGAA 117386043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 AGTACACAAAAAGTAGAAATTATTAAAATAATTGATAATTTGAACTTTATCAAAACTGAA 2435

117386044 AAATTGCCCTAGGAAAAAAAATAAAATTAAAAAGTGAGCCAAAGATAGAGTAAATATATT 117386103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 AAATTGCCCTAGGAAAAAAAATAAAATTAAAAAGTGAGCCAAAGATAGAGTAAATATATT 2495

117386104 CAAAAAATGTATTCAATAGAGCAATTTTATCCAAAAAATAGAGAACATTAAAAAAAGACA 117386163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     2496 CAAAAAATGTATTCAATAGAGCAATTTTATCCAAAAAATAGAGAACATT-AAAAAAGACA 2554

117386164 AATTTAATAAATCTTTTACTAAAGAAGATATGCAAATAGCAAAAAGCACATGCAAATATG 117386223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 AATTTAATAAATCTTTTACTAAAGAAGATATGCAAATAGCAAAAAGCACATGCAAATATG 2614

117386224 CTTAACATGATTAGTCATTAGGGAAACAAAAATTAAAACCACAATAAGATACCAATAAAC 117386283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 CTTAACATGATTAGTCATTAGGGAAACAAAAATTAAAACCACAATAAGATACCAATAAAC 2674

117386284 TCCACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAGTGCTGGCAAGAATGTTGA 117386343
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2675 TCCACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAATGCTGGCAAGAATGTTGA 2734

117386344 AAACCTGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAATGGTGAAGTCATG 117386403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 AAACCTGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAATGGTGAAGTCATG 2794

117386404 TTGGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAATGAACACCTAATACACAACTAGCTATTCCC 117386463
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2795 TTGGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAACGAACACCTAATACACAACTAGCTATTCCC 2854

117386464 CTCCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATTGTTCACACAG 117386523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 CTCCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATTGTTCACACAG 2914

117386524 TCTCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAAC 117386583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 TCTCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAAC 2974

117386584 ATCAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCA 117386643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 ATCAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCA 3034

117386644 TCAGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATG 117386703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 TCAGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATG 3094

117386704 TTTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGA 117386763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 TTTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGA 3154

117386764 AATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTG 117386823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 AATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTG 3214

117386824 TGAGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATT 117386883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 TGAGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATT 3274

117386884 CTAAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAAC 117386943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 CTAAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAAC 3334

117386944 TGTACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAA 117387003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 TGTACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAA 3394

117387004 ATTCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTC 117387063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 ATTCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTC 3454

117387064 AAAGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCGGAGAAAAAGAGAAAAATACATTCAT 117387123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 AAAGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCGGAGAAAAAGAGAAAAATACATTCAT 3514

117387124 AATTTGAGATACTAACACCCCTTCTTCATGTTGACAGATTTGGTATACAAAAACATCAGT 117387183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 AATTTGAGATACTAACACCCCTTCTTCATGTTGACAGATTTGGTATACAAAAACATCAGT 3574

117387184 AGGAATATATTAGATTTGATAGGAATGTTGATTACTTGGTCAATACATTTGTCAAATTTG 117387243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 AGGAATATATTAGATTTGATAGGAATGTTGATTACTTGGTCAATACATTTGTCAAATTTG 3634

117387244 TATTGTACCTTCAGGATCTGTTCATTTCCCTACACGGTTTAACAATTAAAATCTGAGTCA 117387303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 TATTGTACCTTCAGGATCTGTTCATTTCCCTACACGGTTTAACAATTAAAATCTGAGTCA 3694

117387304 TTTAATAATGCAATGGAAATAGATAAAAAGAACAGAACAAAGATGATCATTAGATAGGTA 117387363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 TTTAATAATGCAATGGAAATAGATAAAAAGAACAGAACAAAGATGATCATTAGATAGGTA 3754

117387364 TGTCAGTGACAGAGAGTAACAAGTCACAAGGTAGAAAAAGAGCAAATCAAACCCAGATAA 117387423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 TGTCAGTGACAGAGAGTAACAAGTCACAAGGTAGAAAAAGAGCAAATCAAACCCAGATAA 3814

117387424 GGATTGTAAAGTTTCTAAGCTACTCTTACTTGTCACACTTTCTTGCCGTCTATAAAATCA 117387483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 GGATTGTAAAGTTTCTAAGCTACTCTTACTTGTCACACTTTCTTGCCGTCTATAAAATCA 3874

117387484 TTATATAGTTGAAAGCATTTATGGCATTAACAAAATTTTTATGATTGAATATCCTTGTTT 117387543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 TTATATAGTTGAAAGCATTTATGGCATTAACAAAATTTTTATGATTGAATATCCTTGTTT 3934

117387544 GGCAAAGATTTCTGGAAAAGATGATTGATTTGATTTCAAAAATAACCCAAAACTTTGATA 117387603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 GGCAAAGATTTCTGGAAAAGATGATTGATTTGATTTCAAAAATAACCCAAAACTTTGATA 3994

117387604 TTACAAAACTACCCTAAACCATTTTACTAATTGAACCTAGTATATTCAGTTGGTAGGTTG 117387663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 TTACAAAACTACCCTAAACCATTTTACTAATTGAACCTAGTATATTCAGTTGGTAGGTTG 4054

117387664 GTAAACTGGAAAACATTTTTGAAGCACAAAACTCAAAAATACCAAAGAGAAAACAGTTAA 117387723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 GTAAACTGGAAAACATTTTTGAAGCACAAAACTCAAAAATACCAAAGAGAAAACAGTTAA 4114

117387724 CCCCAGTAAAAACTGTAAAAATGATACCAATAGAAAAATAATTGCCCATTATTGAAAATA 117387783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 CCCCAGTAAAAACTGTAAAAATGATACCAATAGAAAAATAATTGCCCATTATTGAAAATA 4174

117387784 CATCAAAATATGTTAATCTCAAGAATAATCAAAATATAATAAAAATATAATTGCATGACA 117387843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 CATCAAAATATGTTAATCTCAAGAATAATCAAAATATAATAAAAATATAATTGCATGACA 4234

117387844 CTGAGATAGTTATTTGTATATTATCTACAGGTTTTTTTATTGTATTTAAACAGATGGGCA 117387903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 CTGAGATAGTTATTTGTATATTATCTACAGGTTTTTTTATTGTATTTAAACAGATGGGCA 4294

117387904 TTGTGTTTGTCAGGGTTCTGGAAGCACATAATAAATAATGTGACTTGGCACTGTTCTAGA 117387963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 TTGTGTTTGTCAGGGTTCTGGAAGCACATAATAAATAATGTGACTTGGCACTGTTCTAGA 4354

117387964 TGCTGAAGATAGAAGAGTGAACAAACCCTTACACATATGGTGCTATATATTCATAAGAGA 117388023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 TGCTGAAGATAGAAGAGTGAACAAACCCTTACACATATGGTGCTATATATTCATAAGAGA 4414

117388024 AAACTAAGGAACATAGATAAAAACGTTCACAGGATCTCTCTGGATGGTAGAATTGAGGGT 117388083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4415 AAACTAAGGAACATAGATAAAAACGTTCACAGGATCTCTCTGGATGGTAGAATTGAGGGT 4474

117388084 GATGTTTGTTCCTGTCCATTATACTTTTAAAATTATCTTCTTTATGTAAAAAAAGACATC 117388143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4475 GATGTTTGTTCCTGTCCATTATACTTTTAAAATTATCTTCTTTATGTAAAAAAAGACATC 4534

117388144 ATTAAAAATATTTTCTAATTTTTGAAGCATCTTTATAGGGACCCTATAAAAACCTGTAGG 117388203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4535 ATTAAAAATATTTTCTAATTTTTGAAGCATCTTTATAGGGACCCTATAAAAACCTGTAGG 4594

117388204 ATTCTGATCTGAGCTGTTTCATTCCATAGAAGTCAATCACTGTCAGTGGGAAACCCCTAG 117388263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4595 ATTCTGATCTGAGCTGTTTCATTCCATAGAAGTCAATCACTGTCAGTGGGAAACCCCTAG 4654

117388264 GGAAGTCTAGAGATTAAGAATAAAATCTAAGGAAATATAATTTTAAAATTCACTCATGCT 117388323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4655 GGAAGTCTAGAGATTAAGAATAAAATCTAAGGAAATATAATTTTAAAATTCACTCATGCT 4714

117388324 TCTAGCAGCATTGGGAGCAACTGTAAGACTTGCACTCTTTTGATAATTGTAATTCAGCAT 117388383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4715 TCTAGCAGCATTGGGAGCAACTGTAAGACTTGCACTCTTTTGATAATTGTAATTCAGCAT 4774

117388384 GTTCCCTGGGGCTGTTCTGAGTCATCTTCAGTAGTGATAGAAGTCTTAGCCTTGAATTTC 117388443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4775 GTTCCCTGGGGCTGTTCTGAGTCATCTTCAGTAGTGATAGAAGTCTTAGCCTTGAATTTC 4834

117388444 TTTTCCATAAAACATCTGACATAGTTCACAATGATGGGAGTGAACTACCTTTTAGAATAG 117388503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4835 TTTTCCATAAAACATCTGACATAGTTCACAATGATGGGAGTGAACTACCTTTTAGAATAG 4894

117388504 TTAAAGATTGTTAATGAAAATATTATAAATACTTTCAAAGATAAAGGTTAGGAACTCTAA 117388563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4895 TTAAAGATTGTTAATGAAAATATTATAAATACTTTCAAAGATAAAGGTTAGGAACTCTAA 4954

117388564 AGGGTCATAAAAACCAAGTACAAATTCTTTATTTTGCCAGATTTGGACAATGAAGCTTAA 117388623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4955 AGGGTCATAAAAACCAAGTACAAATTCTTTATTTTGCCAGATTTGGACAATGAAGCTTAA 5014

117388624 AAGCATTCAGCAACTTTCCTTAGTTTCATGGTATGAATAACAAAAAGCTGTCTGCTGAGT 117388683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5015 AAGCATTCAGCAACTTTCCTTAGTTTCATGGTATGAATAACAAAAAGCTGTCTGCTGAGT 5074

117388684 CCTGGTCTAGTGTTTTAGGTATGTAAAAATTAGTTTCAATAAAACAGTTCAAATCCCAAA 117388743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5075 CCTGGTCTAGTGTTTTAGGTATGTAAAAATTAGTTTCAATAAAACAGTTCAAATCCCAAA 5134

117388744 CATGTCAATCTGATTGAAACAAAAGAGTTATGTAATAGTGAAAGAAATGAGCTGAATTGG 117388803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5135 CATGTCAATCTGATTGAAACAAAAGAGTTATGTAATAGTGAAAGAAATGAGCTGAATTGG 5194

117388804 CCATTTAGATTTAATTTGCTCTATGTGTGTGTGCTAATTCAAATTAACGGGTATATATTT 117388863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5195 CCATTTAGATTTAATTTGCTCTATGTGTGTGTGCTAATTCAAATTAACGGGTATATATTT 5254

117388864 TTACATTGCCAATATCAAACTATGCTTGAGAGTTTAGTGTTTCCTCTGTGATACCTGAGG 117388923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5255 TTACATTGCCAATATCAAACTATGCTTGAGAGTTTAGTGTTTCCTCTGTGATACCTGAGG 5314

117388924 GATCAAAGGGAAGGTGTATCAATCTAGGTCCAACCAGGAGAAAGAAACTACATAGTGATT 117388983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5315 GATCAAAGGGAAGGTGTATCAATCTAGGTCCAACCAGGAGAAAGAAACTACATAGTGATT 5374

117388984 CAAGCAAGGGAATTTTAATGTAACAAATCATTAAAGTATGATAAAGAGTAACTATAACAT 117389043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5375 CAAGCAAGGGAATTTTAATGTAACAAATCATTAAAGTATGATAAAGAGTAACTATAACAT 5434

117389044 GTAAAGAGAACCTTAAAAGGGCACAGTATGTCTGAGAGAGTATCCAAAGAAGGGCAAACT 117389103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5435 GTAAAGAGAACCTTAAAAGGGCACAGTATGTCTGAGAGAGTATCCAAAGAAGGGCAAACT 5494

117389104 TGGAAAGGAGGTGTCCTCTCCAAGGGTGAGGTTCAGACCACATTGGAGAAGGCATGGCTG 117389163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5495 TGGAAAGGAGGTGTCCTCTCCAAGGGTGAGGTTCAGACCACATTGGAGAAGGCATGGCTG 5554

117389164 CAGCCTGCCGATTGACAGTGAAGTTCACTGAGGTGCCCAAGACAGAGTTGGATCACAGTA 117389223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5555 CAGCCTGCCGATTGACAGTGAAGTTCACTGAGGTGCCCAAGACAGAGTTGGATCACAGTA 5614

117389224 ATTAGGCAAGCAGGAAACAAGCCTCTGGAGCACAGGTGAGCCACAGCTGGTGGAGAATAC 117389283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5615 ATTAGGCAAGCAGGAAACAAGCCTCTGGAGCACAGGTGAGCCACAGCTGGTGGAGAATAC 5674

117389284 ACTGCTGGGAAATAGTGCAGATGATGGAACTAACAAGAGAAGCTTTCTCCTTCTCCATTG 117389343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5675 ACTGCTGGGAAATAGTGCAGATGATGGAACTAACAAGAGAAGCTTTCTCCTTCTCCATTG 5734

117389344 CCCCTCCAATGCCCTCTACTGAGAAAGTTTAACATTGTGCTCACTTTAAAGAAGAACAGT 117389403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5735 CCCCTCCAATGCCCTCTACTGAGAAAGTTTAACATTGTGCTCACTTTAAAGAAGAACAGT 5794

117389404 TTAAAGGAATTCCATCCACTTTTGCAGAGCAGGTATTAAAAATTAACTTTAGACCTGAGA 117389463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5795 TTAAAGGAATTCCATCCACTTTTGCAGAGCAGGTATTAAAAATTAACTTTAGACCTGAGA 5854

117389464 AGCAATAAACTGATAACTGGAAAAGGAGGCTTATAAGATCAGGTTCTGTGTCCCCACGTC 117389523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5855 AGCAATAAACTGATAACTGGAAAAGGAGGCTTATAAGATCAGGTTCTGTGTCCCCACGTC 5914

117389524 CACCAGAGAAGTTCTGCTCTTCCATGTTTAATAAAGAATGGTTCCCAGCAAAATTTATTT 117389583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5915 CACCAGAGAAGTTCTGCTCTTCCATGTTTAATAAAGAATGGTTCCCAGCAAAATTTATTT 5974

117389584 GAAAGCCAAAAACACTGAAAGACATTATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTTTTAATT 117389643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5975 GAAAGCCAAAAACACTGAAAGACATTATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTTTTAATT 6034

117389644 TTAGACATAAAAGAAAACTATTAAAAATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATTCTTACT 117389703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6035 TTAGACATAAAAGAAAACTATTAAAAATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATTCTTACT 6094

117389704 ATATAATAGTACAGGTTAGAGAAGGAAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAAAATAAG 117389763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6095 ATATAATAGTACAGGTTAGAGAAGGAAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAAAATAAG 6154

117389764 TAGGGCTAATAAATAATTTGCACCAAAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACTAATTGTAATA 117389823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6155 TAGGGCTAATAAATAATTTGCACCAAAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACTAATTGTAATA 6214

117389824 TGAGAAATGAGTATCTGAATGAAGCTTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAATAGAAAAGA 117389883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6215 TGAGAAATGAGTATCTGAATGAAGCTTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAATAGAAAAGA 6274

117389884 AGAAACTAATTTTTAATGTTATATAAGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCCTTGATTCAG 117389943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6275 AGAAACTAATTTTTAATGTTATATAAGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCCTTGATTCAG 6334

117389944 TAGTGAAAAATACTTATTGTGATGGTTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGGATCAAAGGA 117390003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6335 TAGTGAAAAATACTTATTGTGATGGTTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGGATCAAAGGA 6394

117390004 TGCCTAGATAGCTGGTAAATTATTGTTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAGACTGACATT 117390063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6395 TGCCTAGATAGCTGGTAAATTATTGTTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAGACTGACATT 6454

117390064 TGAGTCAGTGGACTGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACCATCCAATGG 117390123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6455 TGAGTCAGTGGACTGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACCATCCAATGG 6514

117390124 GCTGCCAGTGCCACTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTGCTTGCTTAG 117390183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6515 GCTGCCAGTGCCACTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTGCTTGCTTAG 6574

117390184 TCTTCTGGCTTTCCTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACATAAGAGTCC 117390243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6575 TCTTCTGGCTTTCCTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACATAAGAGTCC 6634

117390244 AGGTTCTTCTGCCTTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGACTCCTGGGC 117390303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6635 AGGTTCTTCTGCCTTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGACTCCTGGGC 6694

117390304 CTTCGGCCACAGACTGAAGTCTGCAC 117390329
          ||||||||||||||||||||||||||
     6695 CTTCGGCCACAGACTGAAGTCTGCAC 6720

Alignment time is 6.5984 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     2032] =>      2032 nucs 'mol-32-2fb7-200492_2032'

Score:        2010
Aligned:      2032        nucs
Identic:      2030 (100%) nucs =>       490 (100%)      1540 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117386609,117387098] EXCISED REGION [117393884,117395425]
 second seq =>  [        1,      490] EXCISED REGION [      491,     2032]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6785 nucs [117387099,117393883]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387099,117387099] to [117393884,117393884]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387098,117387098] to [117393884,117393884]
 second seq =>         1 nucs [490,490] to [491,491]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117386609 CTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCATCAGTAAGAAATATTAAACTATTGA 117386668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCATCAGTAAGAAATATTAAACTATTGA 60

117386669 TCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTT 117386728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTT 120

117386729 ATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTA 117386788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTA 180

117386789 ACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTACAAAGG 117386848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTACAAAGG 240

117386849 GATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGAATGCT 117386908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGAATGCT 300

117386909 GTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGATTGCT 117386968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGATTGCT 360

117386969 ATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAAAATTT 117387028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAAAATTT 420

117387029 AAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATACTGACA 117387088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATACTGACA 480

117387089 GACCTAATCG 117387098
          ||||||||||
      481 GACCTAATCG 490

EXCISED REGION

117393884 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 117393943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 550

117393944 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 117394003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 610

117394004 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 117394063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 670

117394064 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 117394123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 730

117394124 CTGGCCTACCTGATGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 117394183
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 CTGGCCTACCTGTTGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 790

117394184 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 117394243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      791 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 850

117394244 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 117394303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 910

117394304 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 117394363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 970

117394364 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 117394423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 1030

117394424 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 117394483
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCACTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 1090

117394484 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 117394543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 1150

117394544 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 117394603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 1210

117394604 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 117394663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 1270

117394664 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 117394723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 1330

117394724 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 117394783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 1390

117394784 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 117394843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 1450

117394844 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 117394903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 1510

117394904 AAACAACAGTATTATTTTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 117394963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 AAACAACAGTATTATTTTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 1570

117394964 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 117395023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 1630

117395024 TTTAGGCATTTATTTTACTGTTGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAAT 117395083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 TTTAGGCATTTATTTTACTGTTGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAAT 1690

117395084 GAGTAGGGCTGTTTTGAACACTCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTT 117395143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 GAGTAGGGCTGTTTTGAACACTCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTT 1750

117395144 TCTGTTGAGTGTATAAACAGAAGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTG 117395203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 TCTGTTGAGTGTATAAACAGAAGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTG 1810

117395204 TTAATGTATACTGGTAGTTTTGCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATG 117395263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 TTAATGTATACTGGTAGTTTTGCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATG 1870

117395264 TCTATGAATATTGGTTATGCTACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATAC 117395323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 TCTATGAATATTGGTTATGCTACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATAC 1930

117395324 AGTTGTTCATATTTTTCTGTTTTTGGCAATCTGTATATATCACAATATTTAAGTGGTTTT 117395383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 AGTTGTTCATATTTTTCTGTTTTTGGCAATCTGTATATATCACAATATTTAAGTGGTTTT 1990

117395384 GGAATTATGTCCTCTTATTTGTCTGAAGTAATTTGTTTTTTC 117395425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 GGAATTATGTCCTCTTATTTGTCTGAAGTAATTTGTTTTTTC 2032

Alignment time is 1.96174 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     3392] =>      3392 nucs 'mol-32-301a-171936_3392'

Score:        3348
Aligned:      3392        nucs
Identic:      3388 (100%) nucs =>       331 (100%)      3057 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117391055,117391385] EXCISED REGION [117391387,117394447]
 second seq =>  [        1,      331] EXCISED REGION [      333,     3392]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [117391386,117391386]
 second seq =>         1 nucs [332,332]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [117392703,117392703]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [332,332] to [333,333]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [117391384,117391385] to [117391387,117391388]
 second seq =>         2 nucs [330,331] to [333,334]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117391055 AATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGAAATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCAT 117391114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGAAATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCAT 60

117391115 GAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGGAAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTA 117391174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGGAAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTA 120

117391175 GATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGAATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTC 117391234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGAATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTC 180

117391235 CATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATAAAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAA 117391294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATAAAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAA 240

117391295 GTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAATTAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCT 117391354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAATTAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCT 300

117391355 ATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAAT 117391385
          |||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAAT 331

EXCISED REGION

117391387 ATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCCTA 117391446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      333 ATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCCTA 392

117391447 CTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAAAC 117391506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      393 CTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAAAC 452

117391507 TCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAAGT 117391566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      453 TCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAAGT 512

117391567 TAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTTTC 117391626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      513 TAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTTTC 572

117391627 TTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCAC 117391686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      573 TTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCAC 632

117391687 TTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTAA 117391746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      633 TTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTAA 692

117391747 ATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTGG 117391806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      693 ATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTGG 752

117391807 GATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCTT 117391866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      753 GATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCTT 812

117391867 CGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGTA 117391926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      813 CGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGTA 872

117391927 GTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTGT 117391986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      873 GTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTGT 932

117391987 GTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCTGC 117392046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      933 GTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCTGC 992

117392047 AGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCACA 117392106
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.
      993 AGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACGCAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCACG 1052

117392107 GAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGA 117392166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1053 GAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGA 1112

117392167 GGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTG 117392226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 GGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTG 1172

117392227 TCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGAC 117392286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 TCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGAC 1232

117392287 ATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTA 117392346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 ATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTA 1292

117392347 ATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAA 117392406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 ATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAA 1352

117392407 TAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTG 117392466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 TAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTG 1412

117392467 TCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGT 117392526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 TCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGT 1472

117392527 ACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAAT 117392586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 ACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAAT 1532

117392587 GTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTG 117392646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 GTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTG 1592

117392647 AGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTTTT 117392706
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     1593 AGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTC-TTT 1651

117392707 TTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATA 117392766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 TTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATA 1711

117392767 AATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAA 117392826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 AATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAA 1771

117392827 TATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGA 117392886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 TATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGA 1831

117392887 GTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCC 117392946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 GTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCC 1891

117392947 ATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAA 117393006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 ATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAA 1951

117393007 AAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACT 117393066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 AAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACT 2011

117393067 AAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACA 117393126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 AAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACA 2071

117393127 GGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAA 117393186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 GGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAA 2131

117393187 ATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTT 117393246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 ATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTT 2191

117393247 AAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAA 117393306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 AAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAA 2251

117393307 AAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGA 117393366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 AAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGA 2311

117393367 AAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGA 117393426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 AAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGA 2371

117393427 CAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAG 117393486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 CAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAG 2431

117393487 CAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGA 117393546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 CAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGA 2491

117393547 CAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAA 117393606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 CAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAA 2551

117393607 TCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTGGC 117393666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2552 TCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAACCAATAGGTGAAAATCAAATTGGC 2611

117393667 CTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTC 117393726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 CTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTC 2671

117393727 AGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGG 117393786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 AGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGG 2731

117393787 AGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTA 117393846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 AGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTA 2791

117393847 AGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGC 117393906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 AGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGC 2851

117393907 AACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATT 117393966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 AACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATT 2911

117393967 ACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 117394026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 ACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 2971

117394027 TATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCT 117394086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 TATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCT 3031

117394087 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTT 117394146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTT 3091

117394147 AGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAACCA 117394206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 AGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAACCA 3151

117394207 TTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGAT 117394266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 TTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGAT 3211

117394267 GTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATA 117394326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 GTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATA 3271

117394327 TGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCG 117394386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 TGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCG 3331

117394387 AAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACC 117394446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 AAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACC 3391

117394447 T 117394447
          |
     3392 T 3392

Alignment time is 3.10999 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     5881] =>      5881 nucs 'mol-32-3025-041914_5881'

Score:        5825
Aligned:      5880        nucs
Identic:      5875 (100%) nucs =>       875 (100%)      5000 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117389489,117390363] EXCISED REGION [117390365,117395369]
 second seq =>  [        1,      875] EXCISED REGION [      877,     5881]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [117390364,117390364]
 second seq =>         1 nucs [876,876]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117390364,117390364] to [117390365,117390365]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117389489 GAGGCTTATAAGATCAGGTTCTGTGTCCCCACGTCCACCAGAGAAGTTCTGCTCTTCCAT 117389548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGGCTTATAAGATCAGGTTCTGTGTCCCCACGTCCACCAGAGAAGTTCTGCTCTTCCAT 60

117389549 GTTTAATAAAGAATGGTTCCCAGCAAAATTTATTTGAAAGCCAAAAACACTGAAAGACAT 117389608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTAATAAAGAATGGTTCCCAGCAAAATTTATTTGAAAGCCAAAAACACTGAAAGACAT 120

117389609 TATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTTTTAATTTTAGACATAAAAGAAAACTATTAAA 117389668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTTTTAATTTTAGACATAAAAGAAAACTATTAAA 180

117389669 AATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATTCTTACTATATAATAGTACAGGTTAGAGAAGG 117389728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATTCTTACTATATAATAGTACAGGTTAGAGAAGG 240

117389729 AAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAAAATAAGTAGGGCTAATAAATAATTTGCACCA 117389788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAAAATAAGTAGGGCTAATAAATAATTTGCACCA 300

117389789 AAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACTAATTGTAATATGAGAAATGAGTATCTGAATGAAGC 117389848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACTAATTGTAATATGAGAAATGAGTATCTGAATGAAGC 360

117389849 TTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAATAGAAAAGAAGAAACTAATTTTTAATGTTATATA 117389908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAATAGAAAAGAAGAAACTAATTTTTAATGTTATATA 420

117389909 AGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCCTTGATTCAGTAGTGAAAAATACTTATTGTGATGG 117389968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCCTTGATTCAGTAGTGAAAAATACTTATTGTGATGG 480

117389969 TTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGGATCAAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAATTATTG 117390028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGGATCAAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAATTATTG 540

117390029 TTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAGACTGACATTTGAGTCAGTGGACTGCGTAAGGAAG 117390088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAGACTGACATTTGAGTCAGTGGACTGCGTAAGGAAG 600

117390089 ACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACCATCCAATGGGCTGCCAGTGCCACTAGGACAAAGT 117390148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACCATCCAATGGGCTGCCAGTGCCACTAGGACAAAGT 660

117390149 AGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTGCTTGCTTAGTCTTCTGGCTTTCCTCTTTCTACTA 117390208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTGCTTGCTTAGTCTTCTGGCTTTCCTCTTTCTACTA 720

117390209 TGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACATAAGAGTCCAGGTTCTTCTGCCTTTGGACTCTTG 117390268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACATAAGAGTCCAGGTTCTTCTGCCTTTGGACTCTTG 780

117390269 GACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGACTCCTGGGCCTTCGGCCACAGACTGAAGTCTGCA 117390328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGACTCCTGGGCCTTCGGCCACAGACTGAAGTCTGCA 840

117390329 CTGTCAGCGTCCTTACTTGTGAGGTTTCTGGACTC 117390363
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGTCAGCGTCCTTACTTGTGAGGTTTCTGGACTC 875

EXCISED REGION

117390365 GACTGAGCCACTACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGGAGTTTACCTT 117390424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 GACTGAGCCACTACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGGAGTTTACCTT 936

117390425 GTGATTGTGTGAGCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACATGTATCCTATT 117390484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 GTGATTGTGTGAGCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACATGTATCCTATT 996

117390485 CATTCTGTCCCTCTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGATAAACACTGAT 117390544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 CATTCTGTCCCTCTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGATAAACACTGAT 1056

117390545 TGGACAAAGATTGTGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAATAAGAGTGAC 117390604
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 TGGACAAAGATTGCGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAATAAGAGTGAC 1116

117390605 ATTGGGAGCTAAATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTAATGCCACAAT 117390664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 ATTGGGAGCTAAATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTAATGCCACAAT 1176

117390665 AGAGAAATTGATAGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAGCAAACACCAA 117390724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 AGAGAAATTGATAGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAGCAAACACCAA 1236

117390725 ACACCATACAAAATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAACTGGAGGTAAA 117390784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 ACACCATACAAAATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAACTGGAGGTAAA 1296

117390785 ATAGTCTGACTAAGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTTAGTTTGATTA 117390844
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1297 ATAGTCTGACTAAGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTTAGTTTTATTA 1356

117390845 TTAAATTAGGCACAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATACATAGAATAA 117390904
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 TTAAATTAGACACAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATACATAGAATAA 1416

117390905 TCTCTACAATGCAAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGTGATTGCTTCT 117390964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 TCTCTACAATGCAAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGTGATTGCTTCT 1476

117390965 GGGGGCATATTTCTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTTC 117391024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 GGGGGCATATTTCTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTTC 1536

117391025 CTAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGA 117391084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 CTAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGA 1596

117391085 AATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGG 117391144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 AATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGG 1656

117391145 AAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGA 117391204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 AAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGA 1716

117391205 ATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATA 117391264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 ATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATA 1776

117391265 AAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAAT 117391324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 AAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAAT 1836

117391325 TAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAA 117391384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 TAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAA 1896

117391385 TCATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCC 117391444
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 TAATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCC 1956

117391445 TACTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAA 117391504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 TACTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAA 2016

117391505 ACTCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAA 117391564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 ACTCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAA 2076

117391565 GTTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTT 117391624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 GTTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTT 2136

117391625 TCTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGC 117391684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 TCTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGC 2196

117391685 ACTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTT 117391744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 ACTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTT 2256

117391745 AAATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGT 117391804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 AAATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGT 2316

117391805 GGGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGC 117391864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 GGGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGC 2376

117391865 TTCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAG 117391924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 TTCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAG 2436

117391925 TAGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCT 117391984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 TAGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCT 2496

117391985 GTGTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCT 117392044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 GTGTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCT 2556

117392045 GCAGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCA 117392104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 GCAGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCA 2616

117392105 CAGAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAA 117392164
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 CGGAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAA 2676

117392165 GAGGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACC 117392224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 GAGGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACC 2736

117392225 TGTCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATG 117392284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 TGTCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATG 2796

117392285 ACATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAG 117392344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 ACATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAG 2856

117392345 TAATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTA 117392404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 TAATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTA 2916

117392405 AATAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTC 117392464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 AATAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTC 2976

117392465 TGTCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCG 117392524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 TGTCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCG 3036

117392525 GTACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAA 117392584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 GTACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAA 3096

117392585 ATGTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAAC 117392644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 ATGTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAAC 3156

117392645 TGAGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTT 117392704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 TGAGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTT 3216

117392705 TTTTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGA 117392764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 TTTTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGA 3276

117392765 TAAATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGC 117392824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 TAAATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGC 3336

117392825 AATATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACA 117392884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 AATATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACA 3396

117392885 GAGTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAAT 117392944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 GAGTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAAT 3456

117392945 CCATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGG 117393004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 CCATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGG 3516

117393005 AAAAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAA 117393064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 AAAAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAA 3576

117393065 CTAAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATA 117393124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 CTAAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATA 3636

117393125 CAGGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTG 117393184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 CAGGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTG 3696

117393185 AAATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTG 117393244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 AAATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTG 3756

117393245 TTAAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGG 117393304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 TTAAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGG 3816

117393305 AAAAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACC 117393364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 AAAAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACC 3876

117393365 GAAAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGA 117393424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 GAAAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGA 3936

117393425 GACAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCC 117393484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 GACAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCC 3996

117393485 AGCAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAAT 117393544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 AGCAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAAT 4056

117393545 GACAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAG 117393604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 GACAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAG 4116

117393605 AATCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTG 117393664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 AATCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTG 4176

117393665 GCCTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCAC 117393724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 GCCTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCAC 4236

117393725 TCAGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGT 117393784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 TCAGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGT 4296

117393785 GGAGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCT 117393844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 GGAGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCT 4356

117393845 TAAGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACT 117393904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 TAAGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACT 4416

117393905 GCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGA 117393964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 GCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGA 4476

117393965 TTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 117394024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 TTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 4536

117394025 ACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGC 117394084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 ACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGC 4596

117394085 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATT 117394144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATT 4656

117394145 TTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAAC 117394204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 TTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAAC 4716

117394205 CATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGG 117394264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 CATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGG 4776

117394265 ATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAA 117394324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 ATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAA 4836

117394325 TATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATC 117394384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 TATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATC 4896

117394385 CGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTA 117394444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 CGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTA 4956

117394445 CCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACT 117394504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 CCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACT 5016

117394505 TTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAAT 117394564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 TTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAAT 5076

117394565 AAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTT 117394624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 AAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTT 5136

117394625 GGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATT 117394684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 GGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATT 5196

117394685 TCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAAATCTT 117394744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 TCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAAATCTT 5256

117394745 AGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATACCTCTCAAATTAAGAAATAGAA 117394804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5257 AGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATACCTCTCAAATTAAGAAATAGAA 5316

117394805 TACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGATCAGACCATGTCTCTCAGCAT 117394864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 TACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGATCAGACCATGTCTCTCAGCAT 5376

117394865 AAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGGAAACAACAGTATTATTTTGTG 117394924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5377 AAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGGAAACAACAGTATTATTTTGTG 5436

117394925 TCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTCATCCAAATGTGCTAGGCATAC 117394984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5437 TCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTCATCCAAATGTGCTAGGCATAC 5496

117394985 TTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAATTTAGGCATTTATTTTACTGT 117395044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 TTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAATTTAGGCATTTATTTTACTGT 5556

117395045 TGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAATGAGTAGGGCTGTTTTGAACAC 117395104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5557 TGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAATGAGTAGGGCTGTTTTGAACAC 5616

117395105 TCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTTTCTGTTGAGTGTATAAACAGA 117395164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5617 TCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTTTCTGTTGAGTGTATAAACAGA 5676

117395165 AGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTGTTAATGTATACTGGTAGTTTT 117395224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5677 AGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTGTTAATGTATACTGGTAGTTTT 5736

117395225 GCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATGTCTATGAATATTGGTTATGCT 117395284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5737 GCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATGTCTATGAATATTGGTTATGCT 5796

117395285 ACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATACAGTTGTTCATATTTTTCTGTT 117395344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5797 ACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATACAGTTGTTCATATTTTTCTGTT 5856

117395345 TTTGGCAATCTGTATATATCACAAT 117395369
          |||||||||||||||||||||||||
     5857 TTTGGCAATCTGTATATATCACAAT 5881

Alignment time is 5.60092 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     2155] =>      2155 nucs 'mol-32-3030-289260_2155'

Score:        2116
Aligned:      2149        nucs
Identic:      2146 (100%) nucs =>       414 (100%)      1732 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117386685,117387098] EXCISED REGION [117393884,117395618]
 second seq =>  [        1,      414] EXCISED REGION [      415,     2149]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6785 nucs [117387099,117393883]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387099,117387099] to [117393884,117393884]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117387098,117387098] to [117393884,117393884]
 second seq =>         1 nucs [414,414] to [415,415]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117386685 GAATAACTTCAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTA 117386744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAATAACTTCAAAAACATGTTTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTA 60

117386745 TAAGATTCTATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGT 117386804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAGATTCTATTTATATGAAATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGT 120

117386805 TGTTATCTGAGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTT 117386864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTATCTGAGTTCAGGTGTGAGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTT 180

117386865 TTATGTTGATGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAAC 117386924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTATGTTGATGGAAATATTCTAAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAAC 240

117386925 TTATTAACATTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTAT 117386984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATTAACATTTTTTGAACTGTACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTAT 300

117386985 TCCTCAACAAAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTA 117387044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCCTCAACAAAACTGTTAAATTCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTA 360

117387045 CACCTAATAAAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCG 117387098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CACCTAATAAAAGAGCTTCAAAGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCG 414

EXCISED REGION

117393884 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 117393943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      415 GTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCT 474

117393944 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 117394003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      475 CAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTAT 534

117394004 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 117394063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      535 TTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 594

117394064 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 117394123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      595 AGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACAC 654

117394124 CTGGCCTACCTGATGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 117394183
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      655 CTGGCCTACCTGTTGATGATTTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATA 714

117394184 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 117394243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      715 AATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGC 774

117394244 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 117394303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      775 TTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAA 834

117394304 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 117394363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      835 TATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACT 894

117394364 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 117394423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      895 AATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATT 954

117394424 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 117394483
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      955 CCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCACTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTT 1014

117394484 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 117394543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 ACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGA 1074

117394544 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 117394603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 TGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTG 1134

117394604 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 117394663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 CCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATA 1194

117394664 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 117394723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 CAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAG 1254

117394724 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 117394783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 GCAAAATTATGCATAAATCTTAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATAC 1314

117394784 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 117394843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 CTCTCAAATTAAGAAATAGAATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGA 1374

117394844 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 117394903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TCAGACCATGTCTCTCAGCATAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGG 1434

117394904 AAACAACAGTATTATTTTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 117394963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 AAACAACAGTATTATTTTGTGTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTC 1494

117394964 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 117395023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 ATCCAAATGTGCTAGGCATACTTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAA 1554

117395024 TTTAGGCATTTATTTTACTGTTGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAAT 117395083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 TTTAGGCATTTATTTTACTGTTGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAAT 1614

117395084 GAGTAGGGCTGTTTTGAACACTCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTT 117395143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 GAGTAGGGCTGTTTTGAACACTCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTT 1674

117395144 TCTGTTGAGTGTATAAACAGAAGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTG 117395203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 TCTGTTGAGTGTATAAACAGAAGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTG 1734

117395204 TTAATGTATACTGGTAGTTTTGCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATG 117395263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 TTAATGTATACTGGTAGTTTTGCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATG 1794

117395264 TCTATGAATATTGGTTATGCTACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATAC 117395323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 TCTATGAATATTGGTTATGCTACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATAC 1854

117395324 AGTTGTTCATATTTTTCTGTTTTTGGCAATCTGTATATATCACAATATTTAAGTGGTTTT 117395383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 AGTTGTTCATATTTTTCTGTTTTTGGCAATCTGTATATATCACAATATTTAAGTGGTTTT 1914

117395384 GGAATTATGTCCTCTTATTTGTCTGAAGTAATTTGTTTTTTCCAACTAGAGCAAGAAAGT 117395443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 GGAATTATGTCCTCTTATTTGTCTGAAGTAATTTGTTTTTTCCAACTAGAGCAAGAAAGT 1974

117395444 GATTATTTTAATGTCTAAATCATGTATTGTGTCAACCCTTCTTTTAAAAATAGCTACAAA 117395503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 GATTATTTTAATGTCTAAATCATGTATTGTGTCAACCCTTCTTTTAAAAATAGCTACAAA 2034

117395504 AAGTCCAAAGGTTTATCTTTTTTTCTTAGAATAACACCCATACATCTTAATAAGGTCCAT 117395563
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 AAGTCCAAAGGTTTATCATTTTTTCTTAGAATAACACCCATACATCTTAATAAGGTCCAT 2094

117395564 AATTTATTGCATGAAATTAGCTCCTTTCAATTCTGTTGCACCCACAATATCTTTA 117395618
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 AATTTATTGCATGAAATTAGCTCCTTTCAATTCTGTTGCACCCACAATATCTTTA 2149

Alignment time is 2.00232 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     3700] =>      3700 nucs 'mol-32-3046-261766_3700'

Score:        3670
Aligned:      3692        nucs
Identic:      3690 (100%) nucs =>       392 (100%)      3298 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117390994,117391385] EXCISED REGION [117391387,117394686]
 second seq =>  [        8,      399] EXCISED REGION [      401,     3700]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [117391386,117391386]
 second seq =>         1 nucs [400,400]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [400,400] to [401,401]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [117391384,117391385] to [117391387,117391388]
 second seq =>         2 nucs [398,399] to [401,402]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117390994 ATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTTCCTAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACA 117391053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        8 ATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTTCCTAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACA 67

117391054 TAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGAAATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCA 117391113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       68 TAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGAAATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCA 127

117391114 TGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGGAAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATT 117391173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      128 TGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGGAAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATT 187

117391174 AGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGAATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCT 117391233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      188 AGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGAATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCT 247

117391234 CCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATAAAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATA 117391293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      248 CCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATAAAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATA 307

117391294 AGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAATTAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCC 117391353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 AGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAATTAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCC 367

117391354 TATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAAT 117391385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
      368 TATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAAT 399

EXCISED REGION

117391387 ATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCCTA 117391446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      401 ATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCCTA 460

117391447 CTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAAAC 117391506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      461 CTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAAAC 520

117391507 TCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAAGT 117391566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      521 TCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAAGT 580

117391567 TAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTTTC 117391626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      581 TAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTTTC 640

117391627 TTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCAC 117391686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 TTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCAC 700

117391687 TTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTAA 117391746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 TTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTAA 760

117391747 ATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTGG 117391806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 ATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTGG 820

117391807 GATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCTT 117391866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 GATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCTT 880

117391867 CGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGTA 117391926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 CGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGTA 940

117391927 GTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTGT 117391986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 GTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTGT 1000

117391987 GTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCTGC 117392046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 GTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCTGC 1060

117392047 AGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCACA 117392106
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1061 AGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCACG 1120

117392107 GAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGA 117392166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 GAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGA 1180

117392167 GGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTG 117392226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 GGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTG 1240

117392227 TCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGAC 117392286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 TCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGAC 1300

117392287 ATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTA 117392346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 ATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTA 1360

117392347 ATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAA 117392406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 ATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAA 1420

117392407 TAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTG 117392466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 TAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTG 1480

117392467 TCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGT 117392526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 TCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGT 1540

117392527 ACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAAT 117392586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 ACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAAT 1600

117392587 GTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTG 117392646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 GTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTG 1660

117392647 AGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTTTT 117392706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 AGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTTTT 1720

117392707 TTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATA 117392766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 TTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATA 1780

117392767 AATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAA 117392826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 AATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAA 1840

117392827 TATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGA 117392886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 TATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGA 1900

117392887 GTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCC 117392946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 GTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCC 1960

117392947 ATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAA 117393006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 ATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAA 2020

117393007 AAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACT 117393066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 AAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACT 2080

117393067 AAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACA 117393126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 AAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACA 2140

117393127 GGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAA 117393186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 GGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAA 2200

117393187 ATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTT 117393246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 ATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTT 2260

117393247 AAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAA 117393306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 AAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAA 2320

117393307 AAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGA 117393366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 AAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGA 2380

117393367 AAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGA 117393426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 AAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGA 2440

117393427 CAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAG 117393486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 CAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAG 2500

117393487 CAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGA 117393546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 CAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGA 2560

117393547 CAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAA 117393606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 CAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAA 2620

117393607 TCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTGGC 117393666
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2621 TCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGATGAAAATCAAATTGGC 2680

117393667 CTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTC 117393726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 CTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTC 2740

117393727 AGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGG 117393786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 AGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGG 2800

117393787 AGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTA 117393846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 AGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTA 2860

117393847 AGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGC 117393906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 AGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGC 2920

117393907 AACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATT 117393966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 AACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATT 2980

117393967 ACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 117394026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 ACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 3040

117394027 TATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCT 117394086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 TATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCT 3100

117394087 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTT 117394146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTT 3160

117394147 AGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAACCA 117394206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 AGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAACCA 3220

117394207 TTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGAT 117394266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 TTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGAT 3280

117394267 GTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATA 117394326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 GTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATA 3340

117394327 TGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCG 117394386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 TGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCG 3400

117394387 AAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACC 117394446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 AAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACC 3460

117394447 TACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACTTT 117394506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 TACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACTTT 3520

117394507 TAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAATAA 117394566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 TAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAATAA 3580

117394567 AATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGG 117394626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 AATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGG 3640

117394627 AGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATTTC 117394686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 AGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATTTC 3700

Alignment time is 3.41073 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     4326] =>      4326 nucs 'mol-32-310c-063421_4326'

Score:        4270
Aligned:      4325        nucs
Identic:      4320 (100%) nucs =>       227 (100%)      4093 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117389587,117389813] EXCISED REGION [117389815,117393912]
 second seq =>  [        1,      227] EXCISED REGION [      229,     4326]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [117389814,117389814]
 second seq =>         1 nucs [228,228]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117389814,117389814] to [117389815,117389815]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117389587 AGCCAAAAACACTGAAAGACATTATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTTTTAATTTTA 117389646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCCAAAAACACTGAAAGACATTATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTTTTAATTTTA 60

117389647 GACATAAAAGAAAACTATTAAAAATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATTCTTACTATA 117389706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACATAAAAGAAAACTATTAAAAATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATTCTTACTATA 120

117389707 TAATAGTACAGGTTAGAGAAGGAAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAAAATAAGTAG 117389766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATAGTACAGGTTAGAGAAGGAAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAAAATAAGTAG 180

117389767 GGCTAATAAATAATTTGCACCAAAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACT 117389813
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCTAATAAATAATTTGCACCAAAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACT 227

EXCISED REGION

117389815 ATTGTAATATGAGAAATGAGTATCTGAATGAAGCTTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAA 117389874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      229 ATTGTAATATGAGAAATGAGTATCTGAATGAAGCTTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAA 288

117389875 TAGAAAAGAAGAAACTAATTTTTAATGTTATATAAGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCC 117389934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      289 TAGAAAAGAAGAAACTAATTTTTAATGTTATATAAGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCC 348

117389935 TTGATTCAGTAGTGAAAAATACTTATTGTGATGGTTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGG 117389994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      349 TTGATTCAGTAGTGAAAAATACTTATTGTGATGGTTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGG 408

117389995 ATCAAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAATTATTGTTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAG 117390054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      409 ATCAAAGGATGCCTAGATAGCTGGTAAATTATTGTTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAG 468

117390055 ACTGACATTTGAGTCAGTGGACTGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACC 117390114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      469 ACTGACATTTGAGTCAGTGGACTGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACC 528

117390115 ATCCAATGGGCTGCCAGTGCCACTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTG 117390174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      529 ATCCAATGGGCTGCCAGTGCCACTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTG 588

117390175 CTTGCTTAGTCTTCTGGCTTTCCTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACA 117390234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      589 CTTGCTTAGTCTTCTGGCTTTCCTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACA 648

117390235 TAAGAGTCCAGGTTCTTCTGCCTTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGA 117390294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 TAAGAGTCCAGGTTCTTCTGCCTTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGA 708

117390295 CTCCTGGGCCTTCGGCCACAGACTGAAGTCTGCACTGTCAGCGTCCTTACTTGTGAGGTT 117390354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 CTCCTGGGCCTTCGGCCACAGACTGAAGTCTGCACTGTCAGCGTCCTTACTTGTGAGGTT 768

117390355 TCTGGACTCGGACTGAGCCACTACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGG 117390414
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 TCTGGACTCAGACTGAGCCACTACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGG 828

117390415 AGTTTACCTTGTGATTGTGTGAGCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACAT 117390474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 AGTTTACCTTGTGATTGTGTGAGCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACAT 888

117390475 GTATCCTATTCATTCTGTCCCTCTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGAT 117390534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 GTATCCTATTCATTCTGTCCCTCTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGAT 948

117390535 AAACACTGATTGGACAAAGATTGTGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAA 117390594
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 AAACACTGATTGGACAAAGATTGCGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAA 1008

117390595 TAAGAGTGACATTGGGAGCTAAATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTA 117390654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 TAAGAGTGACATTGGGAGCTAAATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTA 1068

117390655 ATGCCACAATAGAGAAATTGATAGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAG 117390714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 ATGCCACAATAGAGAAATTGATAGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAG 1128

117390715 CAAACACCAAACACCATACAAAATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAAC 117390774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 CAAACACCAAACACCATACAAAATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAAC 1188

117390775 TGGAGGTAAAATAGTCTGACTAAGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTT 117390834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 TGGAGGTAAAATAGTCTGACTAAGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTT 1248

117390835 AGTTTGATTATTAAATTAGGCACAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATA 117390894
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 AGTTTTATTATTAAATTAGGCACAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATA 1308

117390895 CATAGAATAATCTCTACAATGCAAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGT 117390954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 CATAGAATAATCTCTACAATGCAAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGT 1368

117390955 GATTGCTTCTGGGGGCATATTTCTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCAT 117391014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 GATTGCTTCTGGGGGCATATTTCTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCAT 1428

117391015 TCCAAATTTCCTAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAA 117391074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 TCCAAATTTCCTAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAA 1488

117391075 GGTTAAGTGAAATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAA 117391134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 GGTTAAGTGAAATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAA 1548

117391135 ATGAGTGTGGAAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAG 117391194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 ATGAGTGTGGAAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAG 1608

117391195 TACTGAAAGAATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAA 117391254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 TACTGAAAGAATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAA 1668

117391255 AAGTAAAATAAAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAAC 117391314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 AAGTAAAATAAAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAAC 1728

117391315 AAAAAAAAATTAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAA 117391374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 AAAAAAAAATTAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAA 1788

117391375 AATGAAAGAATCATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGC 117391434
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 AATGAAAGAATAATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGC 1848

117391435 TCCCTGCTCCTACTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAG 117391494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 TCCCTGCTCCTACTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAG 1908

117391495 ATTCTTATAAACTCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTT 117391554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 ATTCTTATAAACTCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTT 1968

117391555 TTTCTTAAAAGTTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTA 117391614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 TTTCTTAAAAGTTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTA 2028

117391615 ATGATGACTTTCTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTC 117391674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 ATGATGACTTTCTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTC 2088

117391675 AAAAAAGGGCACTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCT 117391734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 AAAAAAGGGCACTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCT 2148

117391735 AATGAAGCTTAAATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTAC 117391794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 AATGAAGCTTAAATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTAC 2208

117391795 ATGTTTTTGTGGGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGC 117391854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 ATGTTTTTGTGGGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGC 2268

117391855 ATCTTTCCGCTTCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGT 117391914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 ATCTTTCCGCTTCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGT 2328

117391915 GTCTATGAAGTAGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTAC 117391974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 GTCTATGAAGTAGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTAC 2388

117391975 AGTCATGTCTGTGTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAG 117392034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 AGTCATGTCTGTGTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAG 2448

117392035 GATTACTCCTGCAGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGA 117392094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 GATTACTCCTGCAGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGA 2508

117392095 AGAGGTCTCACAGAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCA 117392154
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 AGAGGTCTCACGGAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCA 2568

117392155 GCAAAGAAAAGAGGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCC 117392214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 GCAAAGAAAAGAGGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCC 2628

117392215 AACTCTTACCTGTCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAG 117392274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 AACTCTTACCTGTCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAG 2688

117392275 CAATAGCATGACATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTT 117392334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 CAATAGCATGACATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTT 2748

117392335 AAATTATCAGTAATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTT 117392394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 AAATTATCAGTAATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTT 2808

117392395 ATGAAACCTAAATAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATA 117392454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 ATGAAACCTAAATAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATA 2868

117392455 GCAAGAAGTCTGTCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGT 117392514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 GCAAGAAGTCTGTCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGT 2928

117392515 AATTTTACCGGTACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCA 117392574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 AATTTTACCGGTACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCA 2988

117392575 TCATAAATAAATGTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTT 117392634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 TCATAAATAAATGTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTT 3048

117392635 CTCATAAAACTGAGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGC 117392694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 CTCATAAAACTGAGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGC 3108

117392695 TATGTTTCTTTTTTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCA 117392754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 TATGTTTCTTTTTTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCA 3168

117392755 CCTCAATAGATAAATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAG 117392814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 CCTCAATAGATAAATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAG 3228

117392815 ATGATCCTGCAATATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAA 117392874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 ATGATCCTGCAATATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAA 3288

117392875 GGAAATAACAGAGTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCA 117392934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 GGAAATAACAGAGTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCA 3348

117392935 CTGTTTCAATCCATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCA 117392994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 CTGTTTCAATCCATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCA 3408

117392995 TTTAAAGAGGAAAAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACA 117393054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 TTTAAAGAGGAAAAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACA 3468

117393055 CAACGCAAAACTAAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGAT 117393114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 CAACGCAAAACTAAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGAT 3528

117393115 GAGTAACATACAGGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATT 117393174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 GAGTAACATACAGGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATT 3588

117393175 ATCTCCATTGAAATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAAT 117393234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 ATCTCCATTGAAATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAAT 3648

117393235 GAGACAAGTGTTAAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGG 117393294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 GAGACAAGTGTTAAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGG 3708

117393295 AAATAAATGGAAAAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAA 117393354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 AAATAAATGGAAAAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAA 3768

117393355 AATAAAAACCGAAAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGG 117393414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 AATAAAAACCGAAAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGG 3828

117393415 AAAGAATGGAGACAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACA 117393474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 AAAGAATGGAGACAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACA 3888

117393475 AAGAATATCCAGCAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACA 117393534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 AAGAATATCCAGCAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACA 3948

117393535 GGAAAAAAATGACAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAG 117393594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 GGAAAAAAATGACAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAG 4008

117393595 ATGAATAAAGAATCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAA 117393654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 ATGAATAAAGAATCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAA 4068

117393655 AATCAAATTGGCCTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAAC 117393714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 AATCAAATTGGCCTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAAC 4128

117393715 AGTTCTTCACTCAGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGG 117393774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 AGTTCTTCACTCAGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGG 4188

117393775 GACCAAGAGTGGAGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTA 117393834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 GACCAAGAGTGGAGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTA 4248

117393835 TTATTTTCCTTAAGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATC 117393894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 TTATTTTCCTTAAGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATC 4308

117393895 TCGGCTCACTGCAACCTC 117393912
          ||||||||||||||||||
     4309 TCGGCTCACTGCAACCTC 4326

Alignment time is 3.99624 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,    10770] =>     10770 nucs 'mol-32-310c-094491_10770'

Score:       10639
Aligned:     10771        nucs
Identic:     10759 (100%) nucs =>      1468 (100%)      9291 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117384209,117385679] EXCISED REGION [117385684,117394983]
 second seq =>  [        1,     1471] EXCISED REGION [     1472,    10770]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [117385680,117385683]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        25 nucs [117385680,117385704] to [117385684,117385708]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [117385680,117385681] to [117385682,117385683]
 second seq =>         0 nucs

117384209 AGAGCAGGAAATGAACTAAAATCAACTCATATAAGCTTCCAAAATCAACTCATATAAGCT 117384268
          ||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
        1 AGAGCAGGAAATTAACTAAAATCAACTCATATAAGCTTCCAAAATCAACTCGTATAAGCT 60

117384269 TCCAACTTAAGCTTTTAGAAAAAGAAAAGGAAATCAAATCTAGGTGAGTAGAATGAATAA 117384328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCAACTTAAGCTTTTAGAAAAAGAAAAGGAAATCAAATCTAGGTGAGTAGAATGAATAA 120

117384329 AATTTTTAAAAAAAATCACAGTAGAGATCAACACTTTTTTAAGTAAATTACAGATAAGTT 117384388
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTTTAAAAAAAAATCACAGTAGAGATCAACACTTTTTTAAGTAAATTACAGATAAGTT 180

117384389 CTTTTTTTTCAAGATTTTGTGTGATTTATTTAAATTTCAGATATTGATAAGCCAATCTAC 117384448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTTTTTTTCAAGATTTTGTGTGATTTATTTAAATTTCAGATATTGATAAGCCAATCTAC 240

117384449 AGTGTTATAAATCAGGTAATGAGAGCTTGAACTTAAATGGTGGCGGTAAGCCTATATAAT 117384508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGTTATAAATCAGGTAATGAGAGCTTGAACTTAAATGGTGGCGGTAAGCCTATATAAT 300

117384509 CTATACAAAACAGTATTTTATGAAATAAGTACTATTACTATTCCCATTTACACATGAGAA 117384568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTATACAAAACAGTATTTTATGAAATAAGTACTATTACTATTCCCATTTACACATGAGAA 360

117384569 AACAGGTCCAGAGAGGGTAAGTAATGTGCTAATTTTCTCAAGAGCACAATGGTAATGGCA 117384628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACAGGTCCAGAGAGGGTAAGTAATGTGCTAATTTTCTCAAGAGCACAATGGTAATGGCA 420

117384629 AACTCCTAATTCAAATCTAGTCTGTTGAGCTCCAGAGCTCCAGTTCTCAGCATATGATAG 117384688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACTCCTAATTCAAATCTAGTCTGTTGAGCTCCAGAGCTCCAGTTCTCAGCATATGATAG 480

117384689 ACAAGAATCAGAAAAAAATGCCCTTTCCATGGAAGACAATGAAGAAATTGTTAACAGGAG 117384748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAAGAATCAGAAAAAAATGCCCTTTCCATGGAAGACAATGAAGAAATTGTTAACAGGAG 540

117384749 AAAGTATTTTCAATCATTAAATAATTTTTAAATCAAGGCAAATAAATTGTGACTGCAATC 117384808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAGTATTTTCAATCATTAAATAATTTTTAAATCAAGGCAAATAAATTGTGACTGCAATC 600

117384809 TGCCTAATGGCTATCAAATTAGCTTAAGACTTCCTCTGCAACAGATGTAAGAAAGAGAAT 117384868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCCTAATGGCTATCAAATTAGCTTAAGACTTCCTCTGCAACAGATGTAAGAAAGAGAAT 660

117384869 GAGTGAAGGGAAATTCGGACATTTTGAAATAGAGGAAAGAGTTCATATTAGATATTTTTT 117384928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTGAAGGGAAATTCGGACATTTTGAAATAGAGGAAAGAGTTCATATTAGATATTTTTT 720

117384929 TCAAGCTCACTCTTCCTTAACCATATTCTTTCTTATCTCCACTATAAAATTGCTCATTAA 117384988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAAGCTCACTCTTCCTTAACCATATTCTTTCTTATCTCCACTATAAAATTGCTCATTAA 780

117384989 TATTCTCCTTCCCACAGACTCTTTATTCTGTGAAATCAAAAGTTATTTATTTAAAAAGAG 117385048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTCTCCTTCCCACAGACTCTTTATTCTGTGAAATCAAAAGTTATTTATTTAAAAAGAG 840

117385049 AAACAAAAGTGAAAAACATTTAGCCTGACTCATCAAGAAAAAAGAAAAATTATTAATATC 117385108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAACAAAAGTGAAAAACATTTAGCCTGACTCATCAAGAAAAAAGAAAAATTATTAATATC 900

117385109 AGGAATTAAAAAGGGAGGAAATAAGTAAAGATACTATATATGGAAAACTATAAAACATGG 117385168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGAATTAAAAAGGGAGGAAATAAGTAAAGATACTATATATGGAAAACTATAAAACATGG 960

117385169 CTTAGAGAAATTAAAGATCTAAATAAATAGAAACATATGCCCTTTTAATGGGCCACAAGA 117385228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTAGAGAAATTAAAGATCTAAATAAATAGAAACATATGCCCTTTTAATGGGCCACAAGA 1020

117385229 TTTAATAGTGCTAACCTGACAATTTATCCTAAATTAATATTTAGACTCACTGTAACCCCA 117385288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTAATAGTGCTAACCTGACAATTTATCCTAAATTAATATTTAGACTCACTGTAACCCCA 1080

117385289 AACACAATCCTAGCAGGGTTTTCTGTAGGAATTGAAAAGCAGACTTCATAGTATATGTAG 117385348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AACACAATCCTAGCAGGGTTTTCTGTAGGAATTGAAAAGCAGACTTCATAGTATATGTAG 1140

117385349 AAAACCAAAGGATTAAGAATAGCCAAAATGACTTTGAAAAAAAAAAGATGAAGATTTTAC 117385408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAACCAAAGGATTAAGAATAGCCAAAATGACTTTGAAAAAAAAAAGATGAAGATTTTAC 1200

117385409 ACTGCTGATTTTAAAACCATTATAAAACCACAGTAATCAAAACTGTGTGGTATTGGCTTA 117385468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTGCTGATTTTAAAACCATTATAAAACCACAGTAATCAAAACTGTGTGGTATTGGCTTA 1260

117385469 AGAAGAGTCATATAAATCAACGGGAAATAATAGACTTCATAAATAGACCCACATATTTAT 117385528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAAGAGTCATATAAATCAACGGGAAATAATAGACTTCATAAATAGACCCACATATTTAT 1320

117385529 TTACTATATAAGTATATATATTTACCATTCATATGTATATATTTACCATATGTGGGTAAA 117385588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTACTATATAAGTATATATATTTACCATTCATATGTATATATTTACCATATGTGGGTAAA 1380

117385589 TATACAATGTGAGTCTATATATATTTACATATATATGTATTTACCACATAAATATTTGCC 117385648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATACAATGTGAGTCTATATATATTTACATATATATGTATTTACCACATAAATATTTGCC 1440

117385649 ATATATGTATATATACAGAATATGGTAAATA 117385679
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATATATGTATATATACAGAATATGGTAAATA 1471

EXCISED REGION

117385684 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGAGACACATGTATCATATATACGGTAAATTTTT 117385743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGAGACACATGTATCATATATACGGTAAATTTTT 1531

117385744 TTCAAAAATTGTGTCAAGGAGTTCAACGAAAAGCATTATTTTTAATAACTGGTGCTGAAA 117385803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1532 TTCAAAAATTGTGTCAAGGAGTTCAACGAAAAACATTATTTTTAATAACTGGTGCTGAAA 1591

117385804 CAATTGGATATTCATGTACACACATAACAAAAACCCACAACAAAACTAACCTCAATTTTA 117385863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 CAATTGGATATTCATGTACACACATAACAAAAACCCACAACAAAACTAACCTCAATTTTA 1651

117385864 ATATGAGCATAAATGAAAATTTCCTAAAAATGCATCATAAATCTAGTTGTAAAACATAAG 117385923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 ATATGAGCATAAATGAAAATTTCCTAAAAATGCATCATAAATCTAGTTGTAAAACATAAG 1711

117385924 AAAATAAATCTTAGAAAACATAGTAGAAAATTTTTGTGACTTTTTAGGTAAAGATTTCTC 117385983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1712 AAAATAAATCTTAGAAAACATAGTAGAAAATTTTTGTGACTTTTTAGGTAAAGATTTCTC 1771

117385984 AGTACACAAAAAGTAGAAATTATTAAAATAATTGATAATTTGAACTTTATCAAAACTGAA 117386043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 AGTACACAAAAAGTAGAAATTATTAAAATAATTGATAATTTGAACTTTATCAAAACTGAA 1831

117386044 AAATTGCCCTAGGAAAAAAAATAAAATTAAAAAGTGAGCCAAAGATAGAGTAAATATATT 117386103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 AAATTGCCCTAGGAAAAAAAATAAAATTAAAAAGTGAGCCAAAGATAGAGTAAATATATT 1891

117386104 CAAAAAATGTATTCAATAGAGCAATTTTATCCAAAAAATAGAGAACATTAAAAAAAGACA 117386163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
     1892 CAAAAAATGTATTCAATAGAGCAATTTTATCCAAAAAATAGAGAACATT-AAAAAAGACA 1950

117386164 AATTTAATAAATCTTTTACTAAAGAAGATATGCAAATAGCAAAAAGCACATGCAAATATG 117386223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 AATTTAATAAATCTTTTACTAAAGAAGATATGCAAATAGCAAAAAGCACATGCAAATATG 2010

117386224 CTTAACATGATTAGTCATTAGGGAAACAAAAATTAAAACCACAATAAGATACCAATAAAC 117386283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 CTTAACATGATTAGTCATTAGGGAAACAAAAATTAAAACCACAATAAGATACCAATAAAC 2070

117386284 TCCACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAGTGCTGGCAAGAATGTTGA 117386343
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2071 TCCACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAATGCTGGCAAGAATGTTGA 2130

117386344 AAACCTGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAATGGTGAAGTCATG 117386403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 AAACCTGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAATGGTGAAGTCATG 2190

117386404 TTGGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAATGAACACCTAATACACAACTAGCTATTCCC 117386463
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2191 TTGGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAACGAACACCTAATACACAACTAGCTATTCCC 2250

117386464 CTCCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATTGTTCACACAG 117386523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 CTCCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATTGTTCACACAG 2310

117386524 TCTCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAAC 117386583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 TCTCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAAC 2370

117386584 ATCAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCA 117386643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 ATCAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCA 2430

117386644 TCAGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATG 117386703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 TCAGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATG 2490

117386704 TTTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGA 117386763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 TTTAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGA 2550

117386764 AATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTG 117386823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 AATTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTG 2610

117386824 TGAGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATT 117386883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 TGAGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATT 2670

117386884 CTAAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAAC 117386943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 CTAAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAAC 2730

117386944 TGTACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAA 117387003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 TGTACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAA 2790

117387004 ATTCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTC 117387063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2791 ATTCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTC 2850

117387064 AAAGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCGGAGAAAAAGAGAAAAATACATTCAT 117387123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 AAAGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCGGAGAAAAAGAGAAAAATACATTCAT 2910

117387124 AATTTGAGATACTAACACCCCTTCTTCATGTTGACAGATTTGGTATACAAAAACATCAGT 117387183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 AATTTGAGATACTAACACCCCTTCTTCATGTTGACAGATTTGGTATACAAAAACATCAGT 2970

117387184 AGGAATATATTAGATTTGATAGGAATGTTGATTACTTGGTCAATACATTTGTCAAATTTG 117387243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 AGGAATATATTAGATTTGATAGGAATGTTGATTACTTGGTCAATACATTTGTCAAATTTG 3030

117387244 TATTGTACCTTCAGGATCTGTTCATTTCCCTACACGGTTTAACAATTAAAATCTGAGTCA 117387303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 TATTGTACCTTCAGGATCTGTTCATTTCCCTACACGGTTTAACAATTAAAATCTGAGTCA 3090

117387304 TTTAATAATGCAATGGAAATAGATAAAAAGAACAGAACAAAGATGATCATTAGATAGGTA 117387363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 TTTAATAATGCAATGGAAATAGATAAAAAGAACAGAACAAAGATGATCATTAGATAGGTA 3150

117387364 TGTCAGTGACAGAGAGTAACAAGTCACAAGGTAGAAAAAGAGCAAATCAAACCCAGATAA 117387423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 TGTCAGTGACAGAGAGTAACAAGTCACAAGGTAGAAAAAGAGCAAATCAAACCCAGATAA 3210

117387424 GGATTGTAAAGTTTCTAAGCTACTCTTACTTGTCACACTTTCTTGCCGTCTATAAAATCA 117387483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 GGATTGTAAAGTTTCTAAGCTACTCTTACTTGTCACACTTTCTTGCCGTCTATAAAATCA 3270

117387484 TTATATAGTTGAAAGCATTTATGGCATTAACAAAATTTTTATGATTGAATATCCTTGTTT 117387543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 TTATATAGTTGAAAGCATTTATGGCATTAACAAAATTTTTATGATTGAATATCCTTGTTT 3330

117387544 GGCAAAGATTTCTGGAAAAGATGATTGATTTGATTTCAAAAATAACCCAAAACTTTGATA 117387603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 GGCAAAGATTTCTGGAAAAGATGATTGATTTGATTTCAAAAATAACCCAAAACTTTGATA 3390

117387604 TTACAAAACTACCCTAAACCATTTTACTAATTGAACCTAGTATATTCAGTTGGTAGGTTG 117387663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 TTACAAAACTACCCTAAACCATTTTACTAATTGAACCTAGTATATTCAGTTGGTAGGTTG 3450

117387664 GTAAACTGGAAAACATTTTTGAAGCACAAAACTCAAAAATACCAAAGAGAAAACAGTTAA 117387723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 GTAAACTGGAAAACATTTTTGAAGCACAAAACTCAAAAATACCAAAGAGAAAACAGTTAA 3510

117387724 CCCCAGTAAAAACTGTAAAAATGATACCAATAGAAAAATAATTGCCCATTATTGAAAATA 117387783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 CCCCAGTAAAAACTGTAAAAATGATACCAATAGAAAAATAATTGCCCATTATTGAAAATA 3570

117387784 CATCAAAATATGTTAATCTCAAGAATAATCAAAATATAATAAAAATATAATTGCATGACA 117387843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 CATCAAAATATGTTAATCTCAAGAATAATCAAAATATAATAAAAATATAATTGCATGACA 3630

117387844 CTGAGATAGTTATTTGTATATTATCTACAGGTTTTTTTATTGTATTTAAACAGATGGGCA 117387903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 CTGAGATAGTTATTTGTATATTATCTACAGGTTTTTTTATTGTATTTAAACAGATGGGCA 3690

117387904 TTGTGTTTGTCAGGGTTCTGGAAGCACATAATAAATAATGTGACTTGGCACTGTTCTAGA 117387963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 TTGTGTTTGTCAGGGTTCTGGAAGCACATAATAAATAATGTGACTTGGCACTGTTCTAGA 3750

117387964 TGCTGAAGATAGAAGAGTGAACAAACCCTTACACATATGGTGCTATATATTCATAAGAGA 117388023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 TGCTGAAGATAGAAGAGTGAACAAACCCTTACACATATGGTGCTATATATTCATAAGAGA 3810

117388024 AAACTAAGGAACATAGATAAAAACGTTCACAGGATCTCTCTGGATGGTAGAATTGAGGGT 117388083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 AAACTAAGGAACATAGATAAAAACGTTCACAGGATCTCTCTGGATGGTAGAATTGAGGGT 3870

117388084 GATGTTTGTTCCTGTCCATTATACTTTTAAAATTATCTTCTTTATGTAAAAAAAGACATC 117388143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 GATGTTTGTTCCTGTCCATTATACTTTTAAAATTATCTTCTTTATGTAAAAAAAGACATC 3930

117388144 ATTAAAAATATTTTCTAATTTTTGAAGCATCTTTATAGGGACCCTATAAAAACCTGTAGG 117388203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 ATTAAAAATATTTTCTAATTTTTGAAGCATCTTTATAGGGACCCTATAAAAACCTGTAGG 3990

117388204 ATTCTGATCTGAGCTGTTTCATTCCATAGAAGTCAATCACTGTCAGTGGGAAACCCCTAG 117388263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 ATTCTGATCTGAGCTGTTTCATTCCATAGAAGTCAATCACTGTCAGTGGGAAACCCCTAG 4050

117388264 GGAAGTCTAGAGATTAAGAATAAAATCTAAGGAAATATAATTTTAAAATTCACTCATGCT 117388323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 GGAAGTCTAGAGATTAAGAATAAAATCTAAGGAAATATAATTTTAAAATTCACTCATGCT 4110

117388324 TCTAGCAGCATTGGGAGCAACTGTAAGACTTGCACTCTTTTGATAATTGTAATTCAGCAT 117388383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 TCTAGCAGCATTGGGAGCAACTGTAAGACTTGCACTCTTTTGATAATTGTAATTCAGCAT 4170

117388384 GTTCCCTGGGGCTGTTCTGAGTCATCTTCAGTAGTGATAGAAGTCTTAGCCTTGAATTTC 117388443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4171 GTTCCCTGGGGCTGTTCTGAGTCATCTTCAGTAGTGATAGAAGTCTTAGCCTTGAATTTC 4230

117388444 TTTTCCATAAAACATCTGACATAGTTCACAATGATGGGAGTGAACTACCTTTTAGAATAG 117388503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4231 TTTTCCATAAAACATCTGACATAGTTCACAATGATGGGAGTGAACTACCTTTTAGAATAG 4290

117388504 TTAAAGATTGTTAATGAAAATATTATAAATACTTTCAAAGATAAAGGTTAGGAACTCTAA 117388563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4291 TTAAAGATTGTTAATGAAAATATTATAAATACTTTCAAAGATAAAGGTTAGGAACTCTAA 4350

117388564 AGGGTCATAAAAACCAAGTACAAATTCTTTATTTTGCCAGATTTGGACAATGAAGCTTAA 117388623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4351 AGGGTCATAAAAACCAAGTACAAATTCTTTATTTTGCCAGATTTGGACAATGAAGCTTAA 4410

117388624 AAGCATTCAGCAACTTTCCTTAGTTTCATGGTATGAATAACAAAAAGCTGTCTGCTGAGT 117388683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4411 AAGCATTCAGCAACTTTCCTTAGTTTCATGGTATGAATAACAAAAAGCTGTCTGCTGAGT 4470

117388684 CCTGGTCTAGTGTTTTAGGTATGTAAAAATTAGTTTCAATAAAACAGTTCAAATCCCAAA 117388743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4471 CCTGGTCTAGTGTTTTAGGTATGTAAAAATTAGTTTCAATAAAACAGTTCAAATCCCAAA 4530

117388744 CATGTCAATCTGATTGAAACAAAAGAGTTATGTAATAGTGAAAGAAATGAGCTGAATTGG 117388803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4531 CATGTCAATCTGATTGAAACAAAAGAGTTATGTAATAGTGAAAGAAATGAGCTGAATTGG 4590

117388804 CCATTTAGATTTAATTTGCTCTATGTGTGTGTGCTAATTCAAATTAACGGGTATATATTT 117388863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4591 CCATTTAGATTTAATTTGCTCTATGTGTGTGTGCTAATTCAAATTAACGGGTATATATTT 4650

117388864 TTACATTGCCAATATCAAACTATGCTTGAGAGTTTAGTGTTTCCTCTGTGATACCTGAGG 117388923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4651 TTACATTGCCAATATCAAACTATGCTTGAGAGTTTAGTGTTTCCTCTGTGATACCTGAGG 4710

117388924 GATCAAAGGGAAGGTGTATCAATCTAGGTCCAACCAGGAGAAAGAAACTACATAGTGATT 117388983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4711 GATCAAAGGGAAGGTGTATCAATCTAGGTCCAACCAGGAGAAAGAAACTACATAGTGATT 4770

117388984 CAAGCAAGGGAATTTTAATGTAACAAATCATTAAAGTATGATAAAGAGTAACTATAACAT 117389043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4771 CAAGCAAGGGAATTTTAATGTAACAAATCATTAAAGTATGATAAAGAGTAACTATAACAT 4830

117389044 GTAAAGAGAACCTTAAAAGGGCACAGTATGTCTGAGAGAGTATCCAAAGAAGGGCAAACT 117389103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4831 GTAAAGAGAACCTTAAAAGGGCACAGTATGTCTGAGAGAGTATCCAAAGAAGGGCAAACT 4890

117389104 TGGAAAGGAGGTGTCCTCTCCAAGGGTGAGGTTCAGACCACATTGGAGAAGGCATGGCTG 117389163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4891 TGGAAAGGAGGTGTCCTCTCCAAGGGTGAGGTTCAGACCACATTGGAGAAGGCATGGCTG 4950

117389164 CAGCCTGCCGATTGACAGTGAAGTTCACTGAGGTGCCCAAGACAGAGTTGGATCACAGTA 117389223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4951 CAGCCTGCCGATTGACAGTGAAGTTCACTGAGGTGCCCAAGACAGAGTTGGATCACAGTA 5010

117389224 ATTAGGCAAGCAGGAAACAAGCCTCTGGAGCACAGGTGAGCCACAGCTGGTGGAGAATAC 117389283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5011 ATTAGGCAAGCAGGAAACAAGCCTCTGGAGCACAGGTGAGCCACAGCTGGTGGAGAATAC 5070

117389284 ACTGCTGGGAAATAGTGCAGATGATGGAACTAACAAGAGAAGCTTTCTCCTTCTCCATTG 117389343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5071 ACTGCTGGGAAATAGTGCAGATGATGGAACTAACAAGAGAAGCTTTCTCCTTCTCCATTG 5130

117389344 CCCCTCCAATGCCCTCTACTGAGAAAGTTTAACATTGTGCTCACTTTAAAGAAGAACAGT 117389403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5131 CCCCTCCAATGCCCTCTACTGAGAAAGTTTAACATTGTGCTCACTTTAAAGAAGAACAGT 5190

117389404 TTAAAGGAATTCCATCCACTTTTGCAGAGCAGGTATTAAAAATTAACTTTAGACCTGAGA 117389463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5191 TTAAAGGAATTCCATCCACTTTTGCAGAGCAGGTATTAAAAATTAACTTTAGACCTGAGA 5250

117389464 AGCAATAAACTGATAACTGGAAAAGGAGGCTTATAAGATCAGGTTCTGTGTCCCCACGTC 117389523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5251 AGCAATAAACTGATAACTGGAAAAGGAGGCTTATAAGATCAGGTTCTGTGTCCCCACGTC 5310

117389524 CACCAGAGAAGTTCTGCTCTTCCATGTTTAATAAAGAATGGTTCCCAGCAAAATTTATTT 117389583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5311 CACCAGAGAAGTTCTGCTCTTCCATGTTTAATAAAGAATGGTTCCCAGCAAAATTTATTT 5370

117389584 GAAAGCCAAAAACACTGAAAGACATTATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTTTTAATT 117389643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5371 GAAAGCCAAAAACACTGAAAGACATTATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTTTTAATT 5430

117389644 TTAGACATAAAAGAAAACTATTAAAAATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATTCTTACT 117389703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5431 TTAGACATAAAAGAAAACTATTAAAAATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATTCTTACT 5490

117389704 ATATAATAGTACAGGTTAGAGAAGGAAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAAAATAAG 117389763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5491 ATATAATAGTACAGGTTAGAGAAGGAAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAAAATAAG 5550

117389764 TAGGGCTAATAAATAATTTGCACCAAAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACTAATTGTAATA 117389823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5551 TAGGGCTAATAAATAATTTGCACCAAAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACTAATTGTAATA 5610

117389824 TGAGAAATGAGTATCTGAATGAAGCTTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAATAGAAAAGA 117389883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5611 TGAGAAATGAGTATCTGAATGAAGCTTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAATAGAAAAGA 5670

117389884 AGAAACTAATTTTTAATGTTATATAAGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCCTTGATTCAG 117389943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5671 AGAAACTAATTTTTAATGTTATATAAGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCCTTGATTCAG 5730

117389944 TAGTGAAAAATACTTATTGTGATGGTTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGGATCAAAGGA 117390003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5731 TAGTGAAAAATACTTATTGTGATGGTTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGGATCAAAGGA 5790

117390004 TGCCTAGATAGCTGGTAAATTATTGTTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAGACTGACATT 117390063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5791 TGCCTAGATAGCTGGTAAATTATTGTTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAGACTGACATT 5850

117390064 TGAGTCAGTGGACTGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACCATCCAATGG 117390123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5851 TGAGTCAGTGGACTGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACCATCCAATGG 5910

117390124 GCTGCCAGTGCCACTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTGCTTGCTTAG 117390183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5911 GCTGCCAGTGCCACTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTGCTTGCTTAG 5970

117390184 TCTTCTGGCTTTCCTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACATAAGAGTCC 117390243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5971 TCTTCTGGCTTTCCTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACATAAGAGTCC 6030

117390244 AGGTTCTTCTGCCTTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGACTCCTGGGC 117390303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6031 AGGTTCTTCTGCCTTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGACTCCTGGGC 6090

117390304 CTTCGGCCACAGACTGAAGTCTGCACTGTCAGCGTCCTTACTTGTGAGGTTTCTGGACTC 117390363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6091 CTTCGGCCACAGACTGAAGTCTGCACTGTCAGCGTCCTTACTTGTGAGGTTTCTGGACTC 6150

117390364 GGACTGAGCCACTACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGGAGTTTACCT 117390423
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6151 AGACTGAGCCACTACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGGAGTTTACCT 6210

117390424 TGTGATTGTGTGAGCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACATGTATCCTAT 117390483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6211 TGTGATTGTGTGAGCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACATGTATCCTAT 6270

117390484 TCATTCTGTCCCTCTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGATAAACACTGA 117390543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6271 TCATTCTGTCCCTCTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGATAAACACTGA 6330

117390544 TTGGACAAAGATTGTGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAATAAGAGTGA 117390603
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6331 TTGGACAAAGATTGCGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAATAAGAGTGA 6390

117390604 CATTGGGAGCTAAATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTAATGCCACAA 117390663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6391 CATTGGGAGCTAAATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTAATGCCACAA 6450

117390664 TAGAGAAATTGATAGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAGCAAACACCA 117390723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6451 TAGAGAAATTGATAGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAGCAAACACCA 6510

117390724 AACACCATACAAAATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAACTGGAGGTAA 117390783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6511 AACACCATACAAAATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAACTGGAGGTAA 6570

117390784 AATAGTCTGACTAAGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTTAGTTTGATT 117390843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     6571 AATAGTCTGACTAAGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTTAGTTTTATT 6630

117390844 ATTAAATTAGGCACAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATACATAGAATA 117390903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6631 ATTAAATTAGGCACAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATACATAGAATA 6690

117390904 ATCTCTACAATGCAAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGTGATTGCTTC 117390963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6691 ATCTCTACAATGCAAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGTGATTGCTTC 6750

117390964 TGGGGGCATATTTCTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTT 117391023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6751 TGGGGGCATATTTCTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTT 6810

117391024 CCTAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTG 117391083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6811 CCTAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTG 6870

117391084 AAATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTG 117391143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6871 AAATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTG 6930

117391144 GAAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAG 117391203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6931 GAAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAG 6990

117391204 AATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAAT 117391263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6991 AATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAAT 7050

117391264 AAAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAA 117391323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7051 AAAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAA 7110

117391324 TTAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGA 117391383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7111 TTAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGA 7170

117391384 ATCATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTC 117391443
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7171 ATAATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTC 7230

117391444 CTACTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATA 117391503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7231 CTACTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATA 7290

117391504 AACTCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAA 117391563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7291 AACTCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAA 7350

117391564 AGTTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACT 117391623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7351 AGTTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACT 7410

117391624 TTCTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGG 117391683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7411 TTCTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGG 7470

117391684 CACTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCT 117391743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7471 CACTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCT 7530

117391744 TAAATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTG 117391803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7531 TAAATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTG 7590

117391804 TGGGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCG 117391863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7591 TGGGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCG 7650

117391864 CTTCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAA 117391923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7651 CTTCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAA 7710

117391924 GTAGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTC 117391983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7711 GTAGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTC 7770

117391984 TGTGTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCC 117392043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7771 TGTGTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCC 7830

117392044 TGCAGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTC 117392103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7831 TGCAGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTC 7890

117392104 ACAGAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAA 117392163
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7891 ACGGAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAA 7950

117392164 AGAGGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTAC 117392223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7951 AGAGGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTAC 8010

117392224 CTGTCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCAT 117392283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8011 CTGTCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCAT 8070

117392284 GACATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCA 117392343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8071 GACATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCA 8130

117392344 GTAATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCT 117392403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8131 GTAATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCT 8190

117392404 AAATAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGT 117392463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8191 AAATAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGT 8250

117392464 CTGTCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACC 117392523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8251 CTGTCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACC 8310

117392524 GGTACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATA 117392583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8311 GGTACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATA 8370

117392584 AATGTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAA 117392643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8371 AATGTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAA 8430

117392644 CTGAGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCT 117392703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8431 CTGAGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCT 8490

117392704 TTTTTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAG 117392763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8491 TTTTTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAG 8550

117392764 ATAAATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTG 117392823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8551 ATAAATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTG 8610

117392824 CAATATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAAC 117392883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8611 CAATATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAAC 8670

117392884 AGAGTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAA 117392943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8671 AGAGTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAA 8730

117392944 TCCATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAG 117393003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8731 TCCATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAG 8790

117393004 GAAAAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAA 117393063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8791 GAAAAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAA 8850

117393064 ACTAAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACAT 117393123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8851 ACTAAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACAT 8910

117393124 ACAGGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATT 117393183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8911 ACAGGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATT 8970

117393184 GAAATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGT 117393243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8971 GAAATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGT 9030

117393244 GTTAAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATG 117393303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9031 GTTAAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATG 9090

117393304 GAAAAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAAC 117393363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9091 GAAAAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAAC 9150

117393364 CGAAAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGG 117393423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9151 CGAAAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGG 9210

117393424 AGACAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATC 117393483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9211 AGACAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATC 9270

117393484 CAGCAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAA 117393543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9271 CAGCAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAA 9330

117393544 TGACAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAA 117393603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9331 TGACAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAA 9390

117393604 GAATCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATT 117393663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9391 GAATCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATT 9450

117393664 GGCCTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCA 117393723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9451 GGCCTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCA 9510

117393724 CTCAGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAG 117393783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9511 CTCAGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAG 9570

117393784 TGGAGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCC 117393843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9571 TGGAGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCC 9630

117393844 TTAAGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCAC 117393903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9631 TTAAGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCAC 9690

117393904 TGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAG 117393963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9691 TGCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAG 9750

117393964 ATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTT 117394023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9751 ATTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTT 9810

117394024 CACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGG 117394083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9811 CACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGG 9870

117394084 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGAT 117394143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9871 CCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGAT 9930

117394144 TTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAA 117394203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9931 TTTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAA 9990

117394204 CCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAG 117394263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9991 CCATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAG 10050

117394264 GATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGA 117394323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10051 GATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGA 10110

117394324 ATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACAT 117394383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10111 ATATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACAT 10170

117394384 CCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTT 117394443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10171 CCGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTT 10230

117394444 ACCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTAC 117394503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10231 ACCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTAC 10290

117394504 TTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAA 117394563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10291 TTTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAA 10350

117394564 TAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTT 117394623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10351 TAAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTT 10410

117394624 TGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAAT 117394683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10411 TGGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAAT 10470

117394684 TTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAAATCT 117394743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10471 TTCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAAATCT 10530

117394744 TAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATACCTCTCAAATTAAGAAATAGA 117394803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10531 TAGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATACCTCTCAAATTAAGAAATAGA 10590

117394804 ATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGATCAGACCATGTCTCTCAGCA 117394863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10591 ATACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGATCAGACCATGTCTCTCAGCA 10650

117394864 TAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGGAAACAACAGTATTATTTTGT 117394923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10651 TAAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGGAAACAACAGTATTATTTTGT 10710

117394924 GTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTCATCCAAATGTGCTAGGCATA 117394983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10711 GTCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTCATCCAAATGTGCTAGGCATA 10770

Alignment time is 10.1671 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     9599] =>      9599 nucs 'mol-32-310c-210808_9599'

Score:        9435
Aligned:      9600        nucs
Identic:      9585 (100%) nucs =>      3282 (100%)      6303 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117382393,117385679] EXCISED REGION [117385686,117391998]
 second seq =>  [        1,     3287] EXCISED REGION [     3288,     9599]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [117385680,117385685]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        23 nucs [117385680,117385702] to [117385686,117385708]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [117385680,117385681] to [117385684,117385685]
 second seq =>         0 nucs

117382393 GTGGCTCACATCTGTAATCTCAGGAATTTGAGAGGCCAAGGCAGGAAGAGCACTTAAGGC 117382452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGGCTCACATCTGTAATCTCAGGAATTTGAGAGGCCAAGGCAGGAAGAGCACTTAAGGC 60

117382453 CAGGAGTTTGAAAACAGTCTGGGCAAGGTTAGCAAGACCCCATCTTTAACAAAAACTTTA 117382512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAGGAGTTTGAAAACAGTCTGGGCAAGGTTAGCAAGACCCCATCTTTAACAAAAACTTTA 120

117382513 TTTTTTATTAGCTGGGCATAGTGTCAAATGCCTGTAGTCCTAGTTACTCAGGTGGCTGAT 117382572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTTATTAGCTGGGCATAGTGTCAAATGCCTGTAGTCCTAGTTACTCAGGTGGCTGAT 180

117382573 GCAGAATGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTCCAGGTTATTGAGCTGTGATTATGCCACTGCA 117382632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAGAATGATTGCTTGAGCCCAAGAGTTCCAGGTTATTGAGCTGTGATTATGCCACTGCA 240

117382633 ACTCCTGACTAGGTAATAAAGTGAGATCCACTTTCTAAAAAAATAAAAATAAAAACAAAA 117382692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTCCTGACTAGGTAATAAAGTGAGATCCACTTTCTAAAAAAATAAAAATAAAAACAAAA 300

117382693 AAATGTCATCATTGAGCCAACAAATAGGGTATCTAACAGAAAAGTTAACAAAGAAGAAAG 117382752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATGTCATCATTGAGCCAACAAATAGGGTATCTAACAGAAAAGTTAACAAAGAAGAAAG 360

117382753 TTAAAGAGATTAAAAGGATAATAACAAGTGAAAGTTTCACTAGATGGGCTCAATGGCAGA 117382812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAAAGAGATTAAAAGGATAATAACAAGTGAAAGTTTCACTAGATGGGCTCAATGGCAGA 420

117382813 TTTGAGATGGCAAATGTAAGAAACAATAACAACTAAAAATCAGTAGAATTATCCCATCCC 117382872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTGAGATGGCAAATGTAAGAAACAATAACAACTAAAAATCAGTAGAATTATCCCATCCC 480

117382873 AAAACAATGAAAAAATCTTGAAAGTGCCAAGAAAAAGCACCACACATCACATACATAGTA 117382932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAACAATGAAAAAATCTTGAAAGTGCCAAGAAAAAGCACCACACATCACATACATAGTA 540

117382933 ACAATAATATAATTAATAAAACAGTTCTAAAAACTCTATGTATATGTGCGTGTGTATATA 117382992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAATAATATAATTAATAAAACAGTTCTAAAAACTCTATGTATATGTGCGTGTGTATATA 600

117382993 TATTTTTTCTTATGCTCTTGAATAATCATATAACTGTTTAAAGAACAAACGATAGCATTG 117383052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      601 TATTTTTTCTTATGCTCTTGAATAATCATATAACTGATTAAAGAACAAACGATAGCATTG 660

117383053 TATTGTCAGGCTTATAACATCGCTAGATAAGGGAAGAAACTGAGATACATCATTGTGAAA 117383112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATTGTCAGGCTTATAACATCGCTAGATAAGGGAAGAAACTGAGATACATCATTGTGAAA 720

117383113 TTAATATATTTTACTGGGACTAAGTCATTATTTGTGGTCAATAGTGGCAGTTTAAATATG 117383172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAATATATTTTACTGGGACTAAGTCATTATTTGTGGTCAATAGTGGCAGTTTAAATATG 780

117383173 TATATCATAATATCTAGAGCCACTGAAATTGACTAAAAAATTTTTAAACATTCATAAAAG 117383232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATATCATAATATCTAGAGCCACTGAAATTGACTAAAAAATTTTTAAACATTCATAAAAG 840

117383233 AATTAAAAACTTGTTTAATTTTTTAATAAAGTTGTTTTTAATTTTGTTCTTTAATAAAGT 117383292
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      841 AATTAAAAACTTGTTTAATTTTTTAATAAAGTTGTTTTTAATTTTGTTCCTTAATAAAGT 900

117383293 TATTTAATAAATATTTTTAAACAAATTAGACAAATGGAAGATAGATGTGAGACAAATATA 117383352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTTAATAAATATTTTTAAACAAATTAGACAAATGGAAGATAGATGTGAGACAAATATA 960

117383353 AATGGAAGCAACATAGCAGTTCCAATCTTAACCATACCAATGATTACATTAAATATGAAT 117383412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATGGAAGCAACATAGCAGTTCCAATCTTAACCATACCAATGATTACATTAAATATGAAT 1020

117383413 TGATTAACTCGAAAGGCAGAGATTGTCGGACGAGATTGAAAAAGCAAAATCCAACTATAT 117383472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGATTAACTCGAAAGGCAGAGATTGTCGGACGAGATTGAAAAAGCAAAATCCAACTATAT 1080

117383473 GCTATCTAAAAGAGATGAACTTTATATTTAAAGACAAATTCAAATTCAAGCACAATTCAA 117383532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTATCTAAAAGAGATGAACTTTATATTTAAAGACAAATTCAAATTCAAGCACAATTCAA 1140

117383533 GTTTATATATATAAATAGGTTGAAATTTAAAAGATAAAAAAGATATACAAACAATAACCA 117383592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTTATATATATAAATAGGTTGAAATTTAAAAGATAAAAAAGATATACAAACAATAACCA 1200

117383593 TAAGTGAGCTGGAGTGGGTACTTTAAGCTCACACAAAATAGACATGAAAACAAAGGTTAA 117383652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAGTGAGCTGGAGTGGGTACTTTAAGCTCACACAAAATAGACATGAAAACAAAGGTTAA 1260

117383653 TGCTAGAGACAAGAACATTTTATAATGATGAATGTGTCAATTTATCAGTATAAATTAACA 117383712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGCTAGAGACAAGAACATTTTATAATGATGAATGTGTCAATTTATCAGTATAAATTAACA 1320

117383713 TTCATAAATGTATATGCAGCTAACAACAAAGCCTCAAAAATACACAAAGCAAAACTAACT 117383772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCATAAATGTATATGCAGCTAACAACAAAGCCTCAAAAATACACAAAGCAAAACTAACT 1380

117383773 TCTATTAAAAGAAGTAAAGAAAAATTCAATAATTACAGTTAATTTTAACACTTCTGTCTC 117383832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTATTAAAAGAAGTAAAGAAAAATTCAATAATTACAGTTAATTTTAACACTTCTGTCTC 1440

117383833 AGTAATTGATAGGACTAGTAGACAAAAAATTGGTAAGGAAACTGAATGTAACAATTTTAT 117383892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTAATTGATAGGACTAGTAGACAAAAAATTGGTAAGGAAACTGAATGTAACAATTTTAT 1500

117383893 TAAGCAACAAAACCTATCTGACAAATATAGAACACTCTATTCCACAACAGTAGAATATAT 117383952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TAAGCAACAAAACCTATCTGACAAATATAGAACACTCTATTCCACAACAGTAGAATATAT 1560

117383953 TTATTTTCAAGTGCAAATAAAAATATCCCATGGGAATAAAATTTACATTAGACTATAAAA 117384012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTATTTTCAAGTGCAAATAAAAATATCCCATGGGAATAAAATTTACATTAGACTATAAAA 1620

117384013 CATTTTAAAGAATTGAAATAATGTGTTTTTCTATCCACACTAGAATTAGAAATCAATAAC 117384072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATTTTAAAGAATTGAAATAATGTGTTTTTCTATCCACACTAGAATTAGAAATCAATAAC 1680

117384073 AGAAAAAATCTAGAAAATACTAAAACATGAAAAATCAAGTAATATATTCCTAAATTAACA 117384132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGAAAAAATCTAGAAAATACTAAAACATGAAAAATCAAGTAATATATTCCTAAATTAACA 1740

117384133 TGGCTCAAAGAAAAAATATAAATATACGGAAATATATTAAAAACACAAAATATTGAAACT 117384192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGGCTCAAAGAAAAAATATAAATATACGGAAATATATTAAAAACACAAAATATTGAAACT 1800

117384193 TTAAATATTTCTTCTAAGAGCAGGAAATGAACTAAAATCAACTCATATAAGCTTCCAAAA 117384252
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTAAATATTTCTTCTAAGAGCAGGAAATTAACTAAAATCAACTCATATAAGCTTCCAAAA 1860

117384253 TCAACTCATATAAGCTTCCAACTTAAGCTTTTAGAAAAAGAAAAGGAAATCAAATCTAGG 117384312
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCAACTCGTATAAGCTTCCAACTTAAGCTTTTAGAAAAAGAAAAGGAAATCAAATCTAGG 1920

117384313 TGAGTAGAATGAATAAAATTTTTAAAAAAAATCACAGTAGAGATCAACACTTTTTTAAGT 117384372
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGAGTAGAATGAATAAAATTTTAAAAAAAAATCACAGTAGAGATCAACACTTTTTTAAGT 1980

117384373 AAATTACAGATAAGTTCTTTTTTTTCAAGATTTTGTGTGATTTATTTAAATTTCAGATAT 117384432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAATTACAGATAAGTTCTTTTTTTTCAAGATTTTGTGTGATTTATTTAAATTTCAGATAT 2040

117384433 TGATAAGCCAATCTACAGTGTTATAAATCAGGTAATGAGAGCTTGAACTTAAATGGTGGC 117384492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGATAAGCCAATCTACAGTGTTATAAATCAGGTAATGAGAGCTTGAACTTAAATGGTGGC 2100

117384493 GGTAAGCCTATATAATCTATACAAAACAGTATTTTATGAAATAAGTACTATTACTATTCC 117384552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGTAAGCCTATATAATCTATACAAAACAGTATTTTATGAAATAAGTACTATTACTATTCC 2160

117384553 CATTTACACATGAGAAAACAGGTCCAGAGAGGGTAAGTAATGTGCTAATTTTCTCAAGAG 117384612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CATTTACACATGAGAAAACAGGTCCAGAGAGGGTAAGTAATGTGCTAATTTTCTCAAGAG 2220

117384613 CACAATGGTAATGGCAAACTCCTAATTCAAATCTAGTCTGTTGAGCTCCAGAGCTCCAGT 117384672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CACAATGGTAATGGCAAACTCCTAATTCAAATCTAGTCTGTTGAGCTCCAGAGCTCCAGT 2280

117384673 TCTCAGCATATGATAGACAAGAATCAGAAAAAAATGCCCTTTCCATGGAAGACAATGAAG 117384732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTCAGCATATGATAGACAAGAATCAGAAAAAAATGCCCTTTCCATGGAAGACAATGAAG 2340

117384733 AAATTGTTAACAGGAGAAAGTATTTTCAATCATTAAATAATTTTTAAATCAAGGCAAATA 117384792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAATTGTTAACAGGAGAAAGTATTTTCAATCATTAAATAATTTTTAAATCAAGGCAAATA 2400

117384793 AATTGTGACTGCAATCTGCCTAATGGCTATCAAATTAGCTTAAGACTTCCTCTGCAACAG 117384852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AATTGTGACTGCAATCTGCCTAATGGCTATCAAATTAGCTTAAGACTTCCTCTGCAACAG 2460

117384853 ATGTAAGAAAGAGAATGAGTGAAGGGAAATTCGGACATTTTGAAATAGAGGAAAGAGTTC 117384912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATGTAAGAAAGAGAATGAGTGAAGGGAAATTCGGACATTTTGAAATAGAGGAAAGAGTTC 2520

117384913 ATATTAGATATTTTTTTCAAGCTCACTCTTCCTTAACCATATTCTTTCTTATCTCCACTA 117384972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATATTAGATATTTTTTTCAAGCTCACTCTTCCTTAACCATATTCTTTCTTATCTCCACTA 2580

117384973 TAAAATTGCTCATTAATATTCTCCTTCCCACAGACTCTTTATTCTGTGAAATCAAAAGTT 117385032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAAAATTGCTCATTAATATTCTCCTTCCCACAGACTCTTTATTCTGTGAAATCAAAAGTT 2640

117385033 ATTTATTTAAAAAGAGAAACAAAAGTGAAAAACATTTAGCCTGACTCATCAAGAAAAAAG 117385092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTTATTTAAAAAGAGAAACAAAAGTGAAAAACATTTAGCCTGACTCATCAAGAAAAAAG 2700

117385093 AAAAATTATTAATATCAGGAATTAAAAAGGGAGGAAATAAGTAAAGATACTATATATGGA 117385152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAAAATTATTAATATCAGGAATTAAAAAGGGAGGAAATAAGTAAAGATACTATATATGGA 2760

117385153 AAACTATAAAACATGGCTTAGAGAAATTAAAGATCTAAATAAATAGAAACATATGCCCTT 117385212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAACTATAAAACATGGCTTAGAGAAATTAAAGATCTAAATAAATAGAAACATATGCCCTT 2820

117385213 TTAATGGGCCACAAGATTTAATAGTGCTAACCTGACAATTTATCCTAAATTAATATTTAG 117385272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTAATGGGCCACAAGATTTAATAGTGCTAACCTGACAATTTATCCTAAATTAATATTTAG 2880

117385273 ACTCACTGTAACCCCAAACACAATCCTAGCAGGGTTTTCTGTAGGAATTGAAAAGCAGAC 117385332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACTCACTGTAACCCCAAACACAATCCTAGCAGGGTTTTCTGTAGGAATTGAAAAGCAGAC 2940

117385333 TTCATAGTATATGTAGAAAACCAAAGGATTAAGAATAGCCAAAATGACTTTGAAAAAAAA 117385392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTCATAGTATATGTAGAAAACCAAAGGATTAAGAATAGCCAAAATGACTTTGAAAAAAAA 3000

117385393 AAGATGAAGATTTTACACTGCTGATTTTAAAACCATTATAAAACCACAGTAATCAAAACT 117385452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAGATGAAGATTTTACACTGCTGATTTTAAAACCATTATAAAACCACAGTAATCAAAACT 3060

117385453 GTGTGGTATTGGCTTAAGAAGAGTCATATAAATCAACGGGAAATAATAGACTTCATAAAT 117385512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTGTGGTATTGGCTTAAGAAGAGTCATATAAATCAACGGGAAATAATAGACTTCATAAAT 3120

117385513 AGACCCACATATTTATTTACTATATAAGTATATATATTTACCATTCATATGTATATATTT 117385572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGACCCACATATTTATTTACTATATAAGTATATATATTTACCATTCATATGTATATATTT 3180

117385573 ACCATATGTGGGTAAATATACAATGTGAGTCTATATATATTTACATATATATGTATTTAC 117385632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACCATATGTGGGTAAATATACAATGTGAGTCTATATATATTTACATATATATGTATTTAC 3240

117385633 CACATAAATATTTGCCATATATGTATATATACAGAATATGGTAAATA 117385679
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CACATAAATATTTGCCATATATGTATATATACAGAATATGGTAAATA 3287

EXCISED REGION

117385686 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGAGACACATGTATCATATATACGGTAAATTTTTTT 117385745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3288 TGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGAGACACATGTATCATATATACGGTAAATTTTTTT 3347

117385746 CAAAAATTGTGTCAAGGAGTTCAACGAAAAGCATTATTTTTAATAACTGGTGCTGAAACA 117385805
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3348 CAAAAATTGTGTCAAGGAGTTCAACGAAAAACATTATTTTTAATAACTGGTGCTGAAACA 3407

117385806 ATTGGATATTCATGTACACACATAACAAAAACCCACAACAAAACTAACCTCAATTTTAAT 117385865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 ATTGGATATTCATGTACACACATAACAAAAACCCACAACAAAACTAACCTCAATTTTAAT 3467

117385866 ATGAGCATAAATGAAAATTTCCTAAAAATGCATCATAAATCTAGTTGTAAAACATAAGAA 117385925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 ATGAGCATAAATGAAAATTTCCTAAAAATGCATCATAAATCTAGTTGTAAAACATAAGAA 3527

117385926 AATAAATCTTAGAAAACATAGTAGAAAATTTTTGTGACTTTTTAGGTAAAGATTTCTCAG 117385985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 AATAAATCTTAGAAAACATAGTAGAAAATTTTTGTGACTTTTTAGGTAAAGATTTCTCAG 3587

117385986 TACACAAAAAGTAGAAATTATTAAAATAATTGATAATTTGAACTTTATCAAAACTGAAAA 117386045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 TACACAAAAAGTAGAAATTATTAAAATAATTGATAATTTGAACTTTATCAAAACTGAAAA 3647

117386046 ATTGCCCTAGGAAAAAAAATAAAATTAAAAAGTGAGCCAAAGATAGAGTAAATATATTCA 117386105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 ATTGCCCTAGGAAAAAAAATAAAATTAAAAAGTGAGCCAAAGATAGAGTAAATATATTCA 3707

117386106 AAAAATGTATTCAATAGAGCAATTTTATCCAAAAAATAGAGAACATTAAAAAAAGACAAA 117386165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     3708 AAAAATGTATTCAATAGAGCAATTTTATCCAAAAAATAGAGAACATT-AAAAAAGACAAA 3766

117386166 TTTAATAAATCTTTTACTAAAGAAGATATGCAAATAGCAAAAAGCACATGCAAATATGCT 117386225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3767 TTTAATAAATCTTTTACTAAAGAAGATATGCAAATAGCAAAAAGCACATGCAAATATGCT 3826

117386226 TAACATGATTAGTCATTAGGGAAACAAAAATTAAAACCACAATAAGATACCAATAAACTC 117386285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3827 TAACATGATTAGTCATTAGGGAAACAAAAATTAAAACCACAATAAGATACCAATAAACTC 3886

117386286 CACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAGTGCTGGCAAGAATGTTGAAA 117386345
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3887 CACTAGAGAAATTCAAATTAAAAAGACTAACAACATCAAATGCTGGCAAGAATGTTGAAA 3946

117386346 ACCTGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAATGGTGAAGTCATGTT 117386405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3947 ACCTGTAACACCCATTAAATGATGTTTAGAATGGAAAATGGAAAATGGTGAAGTCATGTT 4006

117386406 GGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAATGAACACCTAATACACAACTAGCTATTCCCCT 117386465
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4007 GGAACACATTACAGAATTTTTGTTTAAACGAACACCTAATACACAACTAGCTATTCCCCT 4066

117386466 CCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATTGTTCACACAGTC 117386525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4067 CCTAGATATCCCTAGGTATTGTCATTACCCAAGAGAAATAAAAACATTGTTCACACAGTC 4126

117386526 TCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAACAT 117386585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4127 TCAAATGTGAATATTTACAGCAGAAATATTCATAATAGCTAAAAATTAGAAACAAAACAT 4186

117386586 CAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCATC 117386645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4187 CAACAGGTGAACAGATAAACACACTGTGGCATATTTAACAATGAAATACTACTATTCATC 4246

117386646 AGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATGTT 117386705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4247 AGTAAGAAATATTAAACTATTGATCCTCACAACAACATGGAATAACTTCAAAAACATGTT 4306

117386706 TAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGAAA 117386765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4307 TAGTGAAAGAAGTTAAACATTTTATAAAACTACATATTATAAGATTCTATTTATATGAAA 4366

117386766 TTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTGTG 117386825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4367 TTTCTAGAAAGACAAAAGTAGTAACAGAAACAAATTAGTTGTTATCTGAGTTCAGGTGTG 4426

117386826 AGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATTCT 117386885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4427 AGACAGGAGATTACTTACAAAGGGATATGAAGGAAGTTTTTATGTTGATGGAAATATTCT 4486

117386886 AAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAACTG 117386945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4487 AAATTTGGATTGAAGTGAATGCTGTACAACTATATAAACTTATTAACATTTTTTGAACTG 4546

117386946 TACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAAAT 117387005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4547 TACATTTAAAATGGATGATTGCTATGGTATATAAACTATTCCTCAACAAAACTGTTAAAT 4606

117387006 TCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTCAA 117387065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4607 TCATCTCTAAGATACAAAAATTTAAAAAAAATGTGTCTACACCTAATAAAAGAGCTTCAA 4666

117387066 AGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCGGAGAAAAAGAGAAAAATACATTCATAA 117387125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4667 AGTACATAAAACCTATACTGACAGACCTAATCGGAGAAAAAGAGAAAAATACATTCATAA 4726

117387126 TTTGAGATACTAACACCCCTTCTTCATGTTGACAGATTTGGTATACAAAAACATCAGTAG 117387185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4727 TTTGAGATACTAACACCCCTTCTTCATGTTGACAGATTTGGTATACAAAAACATCAGTAG 4786

117387186 GAATATATTAGATTTGATAGGAATGTTGATTACTTGGTCAATACATTTGTCAAATTTGTA 117387245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4787 GAATATATTAGATTTGATAGGAATGTTGATTACTTGGTCAATACATTTGTCAAATTTGTA 4846

117387246 TTGTACCTTCAGGATCTGTTCATTTCCCTACACGGTTTAACAATTAAAATCTGAGTCATT 117387305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4847 TTGTACCTTCAGGATCTGTTCATTTCCCTACACGGTTTAACAATTAAAATCTGAGTCATT 4906

117387306 TAATAATGCAATGGAAATAGATAAAAAGAACAGAACAAAGATGATCATTAGATAGGTATG 117387365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4907 TAATAATGCAATGGAAATAGATAAAAAGAACAGAACAAAGATGATCATTAGATAGGTATG 4966

117387366 TCAGTGACAGAGAGTAACAAGTCACAAGGTAGAAAAAGAGCAAATCAAACCCAGATAAGG 117387425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4967 TCAGTGACAGAGAGTAACAAGTCACAAGGTAGAAAAAGAGCAAATCAAACCCAGATAAGG 5026

117387426 ATTGTAAAGTTTCTAAGCTACTCTTACTTGTCACACTTTCTTGCCGTCTATAAAATCATT 117387485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5027 ATTGTAAAGTTTCTAAGCTACTCTTACTTGTCACACTTTCTTGCCGTCTATAAAATCATT 5086

117387486 ATATAGTTGAAAGCATTTATGGCATTAACAAAATTTTTATGATTGAATATCCTTGTTTGG 117387545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5087 ATATAGTTGAAAGCATTTATGGCATTAACAAAATTTTTATGATTGAATATCCTTGTTTGG 5146

117387546 CAAAGATTTCTGGAAAAGATGATTGATTTGATTTCAAAAATAACCCAAAACTTTGATATT 117387605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5147 CAAAGATTTCTGGAAAAGATGATTGATTTGATTTCAAAAATAACCCAAAACTTTGATATT 5206

117387606 ACAAAACTACCCTAAACCATTTTACTAATTGAACCTAGTATATTCAGTTGGTAGGTTGGT 117387665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5207 ACAAAACTACCCTAAACCATTTTACTAATTGAACCTAGTATATTCAGTTGGTAGGTTGGT 5266

117387666 AAACTGGAAAACATTTTTGAAGCACAAAACTCAAAAATACCAAAGAGAAAACAGTTAACC 117387725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5267 AAACTGGAAAACATTTTTGAAGCACAAAACTCAAAAATACCAAAGAGAAAACAGTTAACC 5326

117387726 CCAGTAAAAACTGTAAAAATGATACCAATAGAAAAATAATTGCCCATTATTGAAAATACA 117387785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5327 CCAGTAAAAACTGTAAAAATGATACCAATAGAAAAATAATTGCCCATTATTGAAAATACA 5386

117387786 TCAAAATATGTTAATCTCAAGAATAATCAAAATATAATAAAAATATAATTGCATGACACT 117387845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5387 TCAAAATATGTTAATCTCAAGAATAATCAAAATATAATAAAAATATAATTGCATGACACT 5446

117387846 GAGATAGTTATTTGTATATTATCTACAGGTTTTTTTATTGTATTTAAACAGATGGGCATT 117387905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5447 GAGATAGTTATTTGTATATTATCTACAGGTTTTTTTATTGTATTTAAACAGATGGGCATT 5506

117387906 GTGTTTGTCAGGGTTCTGGAAGCACATAATAAATAATGTGACTTGGCACTGTTCTAGATG 117387965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5507 GTGTTTGTCAGGGTTCTGGAAGCACATAATAAATAATGTGACTTGGCACTGTTCTAGATG 5566

117387966 CTGAAGATAGAAGAGTGAACAAACCCTTACACATATGGTGCTATATATTCATAAGAGAAA 117388025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5567 CTGAAGATAGAAGAGTGAACAAACCCTTACACATATGGTGCTATATATTCATAAGAGAAA 5626

117388026 ACTAAGGAACATAGATAAAAACGTTCACAGGATCTCTCTGGATGGTAGAATTGAGGGTGA 117388085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5627 ACTAAGGAACATAGATAAAAACGTTCACAGGATCTCTCTGGATGGTAGAATTGAGGGTGA 5686

117388086 TGTTTGTTCCTGTCCATTATACTTTTAAAATTATCTTCTTTATGTAAAAAAAGACATCAT 117388145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5687 TGTTTGTTCCTGTCCATTATACTTTTAAAATTATCTTCTTTATGTAAAAAAAGACATCAT 5746

117388146 TAAAAATATTTTCTAATTTTTGAAGCATCTTTATAGGGACCCTATAAAAACCTGTAGGAT 117388205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5747 TAAAAATATTTTCTAATTTTTGAAGCATCTTTATAGGGACCCTATAAAAACCTGTAGGAT 5806

117388206 TCTGATCTGAGCTGTTTCATTCCATAGAAGTCAATCACTGTCAGTGGGAAACCCCTAGGG 117388265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5807 TCTGATCTGAGCTGTTTCATTCCATAGAAGTCAATCACTGTCAGTGGGAAACCCCTAGGG 5866

117388266 AAGTCTAGAGATTAAGAATAAAATCTAAGGAAATATAATTTTAAAATTCACTCATGCTTC 117388325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5867 AAGTCTAGAGATTAAGAATAAAATCTAAGGAAATATAATTTTAAAATTCACTCATGCTTC 5926

117388326 TAGCAGCATTGGGAGCAACTGTAAGACTTGCACTCTTTTGATAATTGTAATTCAGCATGT 117388385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5927 TAGCAGCATTGGGAGCAACTGTAAGACTTGCACTCTTTTGATAATTGTAATTCAGCATGT 5986

117388386 TCCCTGGGGCTGTTCTGAGTCATCTTCAGTAGTGATAGAAGTCTTAGCCTTGAATTTCTT 117388445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5987 TCCCTGGGGCTGTTCTGAGTCATCTTCAGTAGTGATAGAAGTCTTAGCCTTGAATTTCTT 6046

117388446 TTCCATAAAACATCTGACATAGTTCACAATGATGGGAGTGAACTACCTTTTAGAATAGTT 117388505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6047 TTCCATAAAACATCTGACATAGTTCACAATGATGGGAGAGAACTACCTTTTAGAATAGTT 6106

117388506 AAAGATTGTTAATGAAAATATTATAAATACTTTCAAAGATAAAGGTTAGGAACTCTAAAG 117388565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6107 AAAGATTGTTAATGAAAATATTATAAATACTTTCAAAGATAAAGGTTAGGAACTCTAAAG 6166

117388566 GGTCATAAAAACCAAGTACAAATTCTTTATTTTGCCAGATTTGGACAATGAAGCTTAAAA 117388625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6167 GGTCATAAAAACCAAGTACAAATTCTTTATTTTGCCAGATTTGGACAATGAAGCTTAAAA 6226

117388626 GCATTCAGCAACTTTCCTTAGTTTCATGGTATGAATAACAAAAAGCTGTCTGCTGAGTCC 117388685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6227 GCATTCAGCAACTTTCCTTAGTTTCATGGTATGAATAACAAAAAGCTGTCTGCTGAGTCC 6286

117388686 TGGTCTAGTGTTTTAGGTATGTAAAAATTAGTTTCAATAAAACAGTTCAAATCCCAAACA 117388745
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6287 TAGTCTAGTGTTTTAGGTATGTAAAAATTAGTTTCAATAAAACAGTTCAAATCCCAAACA 6346

117388746 TGTCAATCTGATTGAAACAAAAGAGTTATGTAATAGTGAAAGAAATGAGCTGAATTGGCC 117388805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6347 TGTCAATCTGATTGAAACAAAAGAGTTATGTAATAGTGAAAGAAATGAGCTGAATTGGCC 6406

117388806 ATTTAGATTTAATTTGCTCTATGTGTGTGTGCTAATTCAAATTAACGGGTATATATTTTT 117388865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6407 ATTTAGATTTAATTTGCTCTATGTGTGTGTGCTAATTCAAATTAACGGGTATATATTTTT 6466

117388866 ACATTGCCAATATCAAACTATGCTTGAGAGTTTAGTGTTTCCTCTGTGATACCTGAGGGA 117388925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6467 ACATTGCCAATATCAAACTATGCTTGAGAGTTTAGTGTTTCCTCTGTGATACCTGAGGGA 6526

117388926 TCAAAGGGAAGGTGTATCAATCTAGGTCCAACCAGGAGAAAGAAACTACATAGTGATTCA 117388985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6527 TCAAAGGGAAGGTGTATCAATCTAGGTCCAACCAGGAGAAAGAAACTACATAGTGATTCA 6586

117388986 AGCAAGGGAATTTTAATGTAACAAATCATTAAAGTATGATAAAGAGTAACTATAACATGT 117389045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6587 AGCAAGGGAATTTTAATGTAACAAATCATTAAAGTATGATAAAGAGTAACTATAACATGT 6646

117389046 AAAGAGAACCTTAAAAGGGCACAGTATGTCTGAGAGAGTATCCAAAGAAGGGCAAACTTG 117389105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6647 AAAGAGAACCTTAAAAGGGCACAGTATGTCTGAGAGAGTATCCAAAGAAGGGCAAACTTG 6706

117389106 GAAAGGAGGTGTCCTCTCCAAGGGTGAGGTTCAGACCACATTGGAGAAGGCATGGCTGCA 117389165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6707 GAAAGGAGGTGTCCTCTCCAAGGGTGAGGTTCAGACCACATTGGAGAAGGCATGGCTGCA 6766

117389166 GCCTGCCGATTGACAGTGAAGTTCACTGAGGTGCCCAAGACAGAGTTGGATCACAGTAAT 117389225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6767 GCCTGCCGATTGACAGTGAAGTTCACTGAGGTGCCCAAGACAGAGTTGGATCACAGTAAT 6826

117389226 TAGGCAAGCAGGAAACAAGCCTCTGGAGCACAGGTGAGCCACAGCTGGTGGAGAATACAC 117389285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6827 TAGGCAAGCAGGAAACAAGCCTCTGGAGCACAGGTGAGCCACAGCTGGTGGAGAATACAC 6886

117389286 TGCTGGGAAATAGTGCAGATGATGGAACTAACAAGAGAAGCTTTCTCCTTCTCCATTGCC 117389345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6887 TGCTGGGAAATAGTGCAGATGATGGAACTAACAAGAGAAGCTTTCTCCTTCTCCATTGCC 6946

117389346 CCTCCAATGCCCTCTACTGAGAAAGTTTAACATTGTGCTCACTTTAAAGAAGAACAGTTT 117389405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6947 CCTCCAATGCCCTCTACTGAGAAAGTTTAACATTGTGCTCACTTTAAAGAAGAACAGTTT 7006

117389406 AAAGGAATTCCATCCACTTTTGCAGAGCAGGTATTAAAAATTAACTTTAGACCTGAGAAG 117389465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7007 AAAGGAATTCCATCCACTTTTGCAGAGCAGGTATTAAAAATTAACTTTAGACCTGAGAAG 7066

117389466 CAATAAACTGATAACTGGAAAAGGAGGCTTATAAGATCAGGTTCTGTGTCCCCACGTCCA 117389525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7067 CAATAAACTGATAACTGGAAAAGGAGGCTTATAAGATCAGGTTCTGTGTCCCCACGTCCA 7126

117389526 CCAGAGAAGTTCTGCTCTTCCATGTTTAATAAAGAATGGTTCCCAGCAAAATTTATTTGA 117389585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7127 CCAGAGAAGTTCTGCTCTTCCATGTTTAATAAAGAATGGTTCCCAGCAAAATTTATTTGA 7186

117389586 AAGCCAAAAACACTGAAAGACATTATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTTTTAATTTT 117389645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7187 AAGCCAAAAACACTGAAAGACATTATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTTTTAATTTT 7246

117389646 AGACATAAAAGAAAACTATTAAAAATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATTCTTACTAT 117389705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7247 AGACATAAAAGAAAACTATTAAAAATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATTCTTACTAT 7306

117389706 ATAATAGTACAGGTTAGAGAAGGAAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAAAATAAGTA 117389765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7307 ATAATAGTACAGGTTAGAGAAGGAAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAAAATAAGTA 7366

117389766 GGGCTAATAAATAATTTGCACCAAAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACTAATTGTAATATG 117389825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7367 GGGCTAATAAATAATTTGCACCAAAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACTAATTGTAATATG 7426

117389826 AGAAATGAGTATCTGAATGAAGCTTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAATAGAAAAGAAG 117389885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7427 AGAAATGAGTATCTGAATGAAGCTTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAATAGAAAAGAAG 7486

117389886 AAACTAATTTTTAATGTTATATAAGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCCTTGATTCAGTA 117389945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7487 AAACTAATTTTTAATGTTATATAAGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCCTTGATTCAGTA 7546

117389946 GTGAAAAATACTTATTGTGATGGTTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGGATCAAAGGATG 117390005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7547 GTGAAAAATACTTATTGTGATGGTTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGGATCAAAGGATG 7606

117390006 CCTAGATAGCTGGTAAATTATTGTTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAGACTGACATTTG 117390065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7607 CCTAGATAGCTGGTAAATTATTGTTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAGACTGACATTTG 7666

117390066 AGTCAGTGGACTGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACCATCCAATGGGC 117390125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7667 AGTCAGTGGACTGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACCATCCAATGGGC 7726

117390126 TGCCAGTGCCACTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTGCTTGCTTAGTC 117390185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7727 TGCCAGTGCCACTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTGCTTGCTTAGTC 7786

117390186 TTCTGGCTTTCCTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACATAAGAGTCCAG 117390245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7787 TTCTGGCTTTCCTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACATAAGAGTCCAG 7846

117390246 GTTCTTCTGCCTTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGACTCCTGGGCCT 117390305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7847 GTTCTTCTGCCTTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGACTCCTGGGCCT 7906

117390306 TCGGCCACAGACTGAAGTCTGCACTGTCAGCGTCCTTACTTGTGAGGTTTCTGGACTCGG 117390365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     7907 TCGGCCACAGACTGAAGTCTGCACTGTCAGCGTCCTTACTTGTGAGGTTTCTGGACTCAG 7966

117390366 ACTGAGCCACTACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGGAGTTTACCTTG 117390425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7967 ACTGAGCCACTACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGGAGTTTACCTTG 8026

117390426 TGATTGTGTGAGCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACATGTATCCTATTC 117390485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8027 TGATTGTGTGAGCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACATGTATCCTATTC 8086

117390486 ATTCTGTCCCTCTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGATAAACACTGATT 117390545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8087 ATTCTGTCCCTCTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGATAAACACTGATT 8146

117390546 GGACAAAGATTGTGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAATAAGAGTGACA 117390605
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8147 GGACAAAGATTGCGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAATAAGAGTGACA 8206

117390606 TTGGGAGCTAAATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTAATGCCACAATA 117390665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8207 TTGGGAGCTAAATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTAATGCCACAATA 8266

117390666 GAGAAATTGATAGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAGCAAACACCAAA 117390725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8267 GAGAAATTGATAGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAGCAAACACCAAA 8326

117390726 CACCATACAAAATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAACTGGAGGTAAAA 117390785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8327 CACCATACAAAATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAACTGGAGGTAAAA 8386

117390786 TAGTCTGACTAAGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTTAGTTTGATTAT 117390845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     8387 TAGTCTGACTAAGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTTAGTTTTATTAT 8446

117390846 TAAATTAGGCACAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATACATAGAATAAT 117390905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8447 TAAATTAGGCACAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATACATAGAATAAT 8506

117390906 CTCTACAATGCAAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGTGATTGCTTCTG 117390965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8507 CTCTACAATGCAAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGTGATTGCTTCTG 8566

117390966 GGGGCATATTTCTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTTCC 117391025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8567 GGGGCATATTTCTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTTCC 8626

117391026 TAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGAA 117391085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8627 TAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGAA 8686

117391086 ATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGGA 117391145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8687 ATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGGA 8746

117391146 AGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGAA 117391205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8747 AGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGAA 8806

117391206 TAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATAA 117391265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8807 TAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATAA 8866

117391266 AAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAATT 117391325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8867 AAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAATT 8926

117391326 AAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAAT 117391385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8927 AAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAAT 8986

117391386 CATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCCT 117391445
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8987 AATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCCT 9046

117391446 ACTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAAA 117391505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9047 ACTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAAA 9106

117391506 CTCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAAG 117391565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9107 CTCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAAG 9166

117391566 TTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTTT 117391625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9167 TTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTTT 9226

117391626 CTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCA 117391685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9227 CTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCA 9286

117391686 CTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTA 117391745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9287 CTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTA 9346

117391746 AATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTG 117391805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9347 AATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTG 9406

117391806 GGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCT 117391865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9407 GGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCT 9466

117391866 TCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGT 117391925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9467 TCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGT 9526

117391926 AGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTG 117391985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9527 AGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTG 9586

117391986 TGTATATTTGAGT 117391998
          |||||||||||||
     9587 TGTATATTTGAGT 9599

Alignment time is 8.66225 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     6896] =>      6896 nucs 'mol-32-3235-058710_6896'

Score:        6840
Aligned:      6895        nucs
Identic:      6890 (100%) nucs =>       785 (100%)      6105 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117387851,117388635] EXCISED REGION [117388637,117394746]
 second seq =>  [        1,      785] EXCISED REGION [      787,     6896]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [117388636,117388636]
 second seq =>         1 nucs [786,786]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117388635,117388635] to [117388636,117388636]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117387851 AGTTATTTGTATATTATCTACAGGTTTTTTTATTGTATTTAAACAGATGGGCATTGTGTT 117387910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTTATTTGTATATTATCTACAGGTTTTTTTATTGTATTTAAACAGATGGGCATTGTGTT 60

117387911 TGTCAGGGTTCTGGAAGCACATAATAAATAATGTGACTTGGCACTGTTCTAGATGCTGAA 117387970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTCAGGGTTCTGGAAGCACATAATAAATAATGTGACTTGGCACTGTTCTAGATGCTGAA 120

117387971 GATAGAAGAGTGAACAAACCCTTACACATATGGTGCTATATATTCATAAGAGAAAACTAA 117388030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATAGAAGAGTGAACAAACCCTTACACATATGGTGCTATATATTCATAAGAGAAAACTAA 180

117388031 GGAACATAGATAAAAACGTTCACAGGATCTCTCTGGATGGTAGAATTGAGGGTGATGTTT 117388090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAACATAGATAAAAACGTTCACAGGATCTCTCTGGATGGTAGAATTGAGGGTGATGTTT 240

117388091 GTTCCTGTCCATTATACTTTTAAAATTATCTTCTTTATGTAAAAAAAGACATCATTAAAA 117388150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTCCTGTCCATTATACTTTTAAAATTATCTTCTTTATGTAAAAAAAGACATCATTAAAA 300

117388151 ATATTTTCTAATTTTTGAAGCATCTTTATAGGGACCCTATAAAAACCTGTAGGATTCTGA 117388210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATATTTTCTAATTTTTGAAGCATCTTTATAGGGACCCTATAAAAACCTGTAGGATTCTGA 360

117388211 TCTGAGCTGTTTCATTCCATAGAAGTCAATCACTGTCAGTGGGAAACCCCTAGGGAAGTC 117388270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGAGCTGTTTCATTCCATAGAAGTCAATCACTGTCAGTGGGAAACCCCTAGGGAAGTC 420

117388271 TAGAGATTAAGAATAAAATCTAAGGAAATATAATTTTAAAATTCACTCATGCTTCTAGCA 117388330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGAGATTAAGAATAAAATCTAAGGAAATATAATTTTAAAATTCACTCATGCTTCTAGCA 480

117388331 GCATTGGGAGCAACTGTAAGACTTGCACTCTTTTGATAATTGTAATTCAGCATGTTCCCT 117388390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCATTGGGAGCAACTGTAAGACTTGCACTCTTTTGATAATTGTAATTCAGCATGTTCCCT 540

117388391 GGGGCTGTTCTGAGTCATCTTCAGTAGTGATAGAAGTCTTAGCCTTGAATTTCTTTTCCA 117388450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGGCTGTTCTGAGTCATCTTCAGTAGTGATAGAAGTCTTAGCCTTGAATTTCTTTTCCA 600

117388451 TAAAACATCTGACATAGTTCACAATGATGGGAGTGAACTACCTTTTAGAATAGTTAAAGA 117388510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAAAACATCTGACATAGTTCACAATGATGGGAGTGAACTACCTTTTAGAATAGTTAAAGA 660

117388511 TTGTTAATGAAAATATTATAAATACTTTCAAAGATAAAGGTTAGGAACTCTAAAGGGTCA 117388570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGTTAATGAAAATATTATAAATACTTTCAAAGATAAAGGTTAGGAACTCTAAAGGGTCA 720

117388571 TAAAAACCAAGTACAAATTCTTTATTTTGCCAGATTTGGACAATGAAGCTTAAAAGCATT 117388630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAAAAACCAAGTACAAATTCTTTATTTTGCCAGATTTGGACAATGAAGCTTAAAAGCATT 780

117388631 CAGCA 117388635
          |||||
      781 CAGCA 785

EXCISED REGION

117388637 CTTTCCTTAGTTTCATGGTATGAATAACAAAAAGCTGTCTGCTGAGTCCTGGTCTAGTGT 117388696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 CTTTCCTTAGTTTCATGGTATGAATAACAAAAAGCTGTCTGCTGAGTCCTGGTCTAGTGT 846

117388697 TTTAGGTATGTAAAAATTAGTTTCAATAAAACAGTTCAAATCCCAAACATGTCAATCTGA 117388756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 TTTAGGTATGTAAAAATTAGTTTCAATAAAACAGTTCAAATCCCAAACATGTCAATCTGA 906

117388757 TTGAAACAAAAGAGTTATGTAATAGTGAAAGAAATGAGCTGAATTGGCCATTTAGATTTA 117388816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 TTGAAACAAAAGAGTTATGTAATAGTGAAAGAAATGAGCTGAATTGGCCATTTAGATTTA 966

117388817 ATTTGCTCTATGTGTGTGTGCTAATTCAAATTAACGGGTATATATTTTTACATTGCCAAT 117388876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 ATTTGCTCTATGTGTGTGTGCTAATTCAAATTAACGGGTATATATTTTTACATTGCCAAT 1026

117388877 ATCAAACTATGCTTGAGAGTTTAGTGTTTCCTCTGTGATACCTGAGGGATCAAAGGGAAG 117388936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 ATCAAACTATGCTTGAGAGTTTAGTGTTTCCTCTGTGATACCTGAGGGATCAAAGGGAAG 1086

117388937 GTGTATCAATCTAGGTCCAACCAGGAGAAAGAAACTACATAGTGATTCAAGCAAGGGAAT 117388996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 GTGTATCAATCTAGGTCCAACCAGGAGAAAGAAACTACATAGTGATTCAAGCAAGGGAAT 1146

117388997 TTTAATGTAACAAATCATTAAAGTATGATAAAGAGTAACTATAACATGTAAAGAGAACCT 117389056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 TTTAATGTAACAAATCATTAAAGTATGATAAAGAGTAACTATAACATGTAAAGAGAACCT 1206

117389057 TAAAAGGGCACAGTATGTCTGAGAGAGTATCCAAAGAAGGGCAAACTTGGAAAGGAGGTG 117389116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 TAAAAGGGCACAGTATGTCTGAGAGAGTATCCAAAGAAGGGCAAACTTGGAAAGGAGGTG 1266

117389117 TCCTCTCCAAGGGTGAGGTTCAGACCACATTGGAGAAGGCATGGCTGCAGCCTGCCGATT 117389176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 TCCTCTCCAAGGGTGAGGTTCAGACCACATTGGAGAAGGCATGGCTGCAGCCTGCCGATT 1326

117389177 GACAGTGAAGTTCACTGAGGTGCCCAAGACAGAGTTGGATCACAGTAATTAGGCAAGCAG 117389236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 GACAGTGAAGTTCACTGAGGTGCCCAAGACAGAGTTGGATCACAGTAATTAGGCAAGCAG 1386

117389237 GAAACAAGCCTCTGGAGCACAGGTGAGCCACAGCTGGTGGAGAATACACTGCTGGGAAAT 117389296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 GAAACAAGCCTCTGGAGCACAGGTGAGCCACAGCTGGTGGAGAATACACTGCTGGGAAAT 1446

117389297 AGTGCAGATGATGGAACTAACAAGAGAAGCTTTCTCCTTCTCCATTGCCCCTCCAATGCC 117389356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 AGTGCAGATGATGGAACTAACAAGAGAAGCTTTCTCCTTCTCCATTGCCCCTCCAATGCC 1506

117389357 CTCTACTGAGAAAGTTTAACATTGTGCTCACTTTAAAGAAGAACAGTTTAAAGGAATTCC 117389416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 CTCTACTGAGAAAGTTTAACATTGTGCTCACTTTAAAGAAGAACAGTTTAAAGGAATTCC 1566

117389417 ATCCACTTTTGCAGAGCAGGTATTAAAAATTAACTTTAGACCTGAGAAGCAATAAACTGA 117389476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 ATCCACTTTTGCAGAGCAGGTATTAAAAATTAACTTTAGACCTGAGAAGCAATAAACTGA 1626

117389477 TAACTGGAAAAGGAGGCTTATAAGATCAGGTTCTGTGTCCCCACGTCCACCAGAGAAGTT 117389536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 TAACTGGAAAAGGAGGCTTATAAGATCAGGTTCTGTGTCCCCACGTCCACCAGAGAAGTT 1686

117389537 CTGCTCTTCCATGTTTAATAAAGAATGGTTCCCAGCAAAATTTATTTGAAAGCCAAAAAC 117389596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 CTGCTCTTCCATGTTTAATAAAGAATGGTTCCCAGCAAAATTTATTTGAAAGCCAAAAAC 1746

117389597 ACTGAAAGACATTATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTTTTAATTTTAGACATAAAAG 117389656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 ACTGAAAGACATTATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTTTTAATTTTAGACATAAAAG 1806

117389657 AAAACTATTAAAAATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATTCTTACTATATAATAGTACA 117389716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 AAAACTATTAAAAATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATTCTTACTATATAATAGTACA 1866

117389717 GGTTAGAGAAGGAAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAAAATAAGTAGGGCTAATAAA 117389776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 GGTTAGAGAAGGAAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAAAATAAGTAGGGCTAATAAA 1926

117389777 TAATTTGCACCAAAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACTAATTGTAATATGAGAAATGAGTA 117389836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 TAATTTGCACCAAAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACTAATTGTAATATGAGAAATGAGTA 1986

117389837 TCTGAATGAAGCTTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAATAGAAAAGAAGAAACTAATTTT 117389896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 TCTGAATGAAGCTTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAATAGAAAAGAAGAAACTAATTTT 2046

117389897 TAATGTTATATAAGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCCTTGATTCAGTAGTGAAAAATAC 117389956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 TAATGTTATATAAGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCCTTGATTCAGTAGTGAAAAATAC 2106

117389957 TTATTGTGATGGTTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGGATCAAAGGATGCCTAGATAGCT 117390016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 TTATTGTGATGGTTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGGATCAAAGGATGCCTAGATAGCT 2166

117390017 GGTAAATTATTGTTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAGACTGACATTTGAGTCAGTGGAC 117390076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 GGTAAATTATTGTTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAGACTGACATTTGAGTCAGTGGAC 2226

117390077 TGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACCATCCAATGGGCTGCCAGTGCCA 117390136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 TGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACCATCCAATGGGCTGCCAGTGCCA 2286

117390137 CTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTGCTTGCTTAGTCTTCTGGCTTTC 117390196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 CTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTGCTTGCTTAGTCTTCTGGCTTTC 2346

117390197 CTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACATAAGAGTCCAGGTTCTTCTGCC 117390256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 CTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACATAAGAGTCCAGGTTCTTCTGCC 2406

117390257 TTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGACTCCTGGGCCTTCGGCCACAGA 117390316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 TTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGACTCCTGGGCCTTCGGCCACAGA 2466

117390317 CTGAAGTCTGCACTGTCAGCGTCCTTACTTGTGAGGTTTCTGGACTCGGACTGAGCCACT 117390376
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2467 CTGAAGTCTGCACTGTCAGCGTCCTTACTTGTGAGGTTTCTGGACTCAGACTGAGCCACT 2526

117390377 ACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGGAGTTTACCTTGTGATTGTGTGA 117390436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 ACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGGAGTTTACCTTGTGATTGTGTGA 2586

117390437 GCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACATGTATCCTATTCATTCTGTCCCT 117390496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 GCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACATGTATCCTATTCATTCTGTCCCT 2646

117390497 CTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGATAAACACTGATTGGACAAAGATT 117390556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 CTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGATAAACACTGATTGGACAAAGATT 2706

117390557 GTGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAATAAGAGTGACATTGGGAGCTAA 117390616
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 GCGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAATAAGAGTGACATTGGGAGCTAA 2766

117390617 ATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTAATGCCACAATAGAGAAATTGAT 117390676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 ATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTAATGCCACAATAGAGAAATTGAT 2826

117390677 AGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAGCAAACACCAAACACCATACAAA 117390736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 AGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAGCAAACACCAAACACCATACAAA 2886

117390737 ATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAACTGGAGGTAAAATAGTCTGACTA 117390796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 ATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAACTGGAGGTAAAATAGTCTGACTA 2946

117390797 AGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTTAGTTTGATTATTAAATTAGGCA 117390856
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2947 AGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTTAGTTTTATTATTAAATTAGGCA 3006

117390857 CAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATACATAGAATAATCTCTACAATGC 117390916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 CAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATACATAGAATAATCTCTACAATGC 3066

117390917 AAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGTGATTGCTTCTGGGGGCATATTT 117390976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 AAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGTGATTGCTTCTGGGGGCATATTT 3126

117390977 CTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTTCCTAAAATTAGTA 117391036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 CTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTTCCTAAAATTAGTA 3186

117391037 TCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGAAATCATAAGATA 117391096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 TCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGAAATCATAAGATA 3246

117391097 CATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGGAAGGATCATTCC 117391156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 CATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGGAAGGATCATTCC 3306

117391157 ATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGAATAAACAAAAAA 117391216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 ATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGAATAAACAAAAAA 3366

117391217 AATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATAAAAAATAAATGG 117391276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 AATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATAAAAAATAAATGG 3426

117391277 AGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAATTAAAGGTCAGTT 117391336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 AGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAATTAAAGGTCAGTT 3486

117391337 GATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAATCATTCCTTTTC 117391396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3487 GATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAATAATTCCTTTTC 3546

117391397 TGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCCTACTGTCAATAA 117391456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 TGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCCTACTGTCAATAA 3606

117391457 TTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAAACTCCATAACAT 117391516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 TTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAAACTCCATAACAT 3666

117391517 ACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAAGTTAATCTTGTG 117391576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 ACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAAGTTAATCTTGTG 3726

117391577 GATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTTTCTTCTGTAGTA 117391636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 GATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTTTCTTCTGTAGTA 3786

117391637 TTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCACTTCTCTCCCA 117391696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 TTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCACTTCTCTCCCA 3846

117391697 TGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTAAATGTCAGAGC 117391756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 TGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTAAATGTCAGAGC 3906

117391757 CATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTGGGATTTGCAAA 117391816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 CATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTGGGATTTGCAAA 3966

117391817 AGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCTTCGATTTAACT 117391876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 AGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCTTCGATTTAACT 4026

117391877 TTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGTAGTTGAGCTGG 117391936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 TTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGTAGTTGAGCTGG 4086

117391937 GAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTGTGTATATTTGA 117391996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 GAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTGTGTATATTTGA 4146

117391997 GTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCTGCAGCCCACTGT 117392056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 GTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCTGCAGCCCACTGT 4206

117392057 GTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCACAGAGCTATTAA 117392116
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4207 GTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCACGGAGCTATTAA 4266

117392117 CCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGAGGGTTTGAAA 117392176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 CCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGAGGGTTTGAAA 4326

117392177 TGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTGTCATAAATAA 117392236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 TGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTGTCATAAATAA 4386

117392237 AAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGACATTTGTCAGA 117392296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 AAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGACATTTGTCAGA 4446

117392297 CATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTAATGTAAAAAT 117392356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 CATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTAATGTAAAAAT 4506

117392357 AAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAATAATTGACAT 117392416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 AAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAATAATTGACAT 4566

117392417 CTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTGTCAGGCAATT 117392476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 CTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTGTCAGGCAATT 4626

117392477 ATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGTACTCGACAGA 117392536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 ATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGTACTCGACAGA 4686

117392537 GTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAATGTTAACTTTT 117392596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 GTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAATGTTAACTTTT 4746

117392597 GTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTGAGGCCACCCC 117392656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 GTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTGAGGCCACCCC 4806

117392657 CTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTTTTTTTTTTTAAA 117392716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 CTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTTTTTTTTTTTAAA 4866

117392717 TAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATAAATGGAACCC 117392776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 TAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATAAATGGAACCC 4926

117392777 ATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAATATGAGAAAA 117392836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 ATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAATATGAGAAAA 4986

117392837 AAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGAGTTTGTAATA 117392896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 AAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGAGTTTGTAATA 5046

117392897 AAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCCATTCCTCCAC 117392956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 AAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCCATTCCTCCAC 5106

117392957 TTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAAAAAGTGTTAT 117393016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 TTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAAAAAGTGTTAT 5166

117393017 GTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACTAAATCCAAGA 117393076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 GTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACTAAATCCAAGA 5226

117393077 AAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACAGGAAGTATCT 117393136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 AAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACAGGAAGTATCT 5286

117393137 TAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAAATCATGGGCA 117393196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 TAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAAATCATGGGCA 5346

117393197 CCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTTAAGAAAGAGA 117393256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 CCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTTAAGAAAGAGA 5406

117393257 TTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAAAAAATATATA 117393316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 TTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAAAAAATATATA 5466

117393317 TACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGAAAATACAGAC 117393376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 TACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGAAAATACAGAC 5526

117393377 ACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGACAAAAAGACA 117393436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 ACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGACAAAAAGACA 5586

117393437 GAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAGCAAACACTTA 117393496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 GAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAGCAAACACTTA 5646

117393497 CTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGACAGAATACTT 117393556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 CTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGACAGAATACTT 5706

117393557 AAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAATCACACAGGT 117393616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 AAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAATCACACAGGT 5766

117393617 ACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTGGCCTCATTCTTC 117393676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 ACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTGGCCTCATTCTTC 5826

117393677 TCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTCAGTGTTGTCA 117393736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 TCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTCAGTGTTGTCA 5886

117393737 TCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGGAGCCAAGAGG 117393796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 TCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGGAGCCAAGAGG 5946

117393797 ATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTAAGGCAGAGTC 117393856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 ATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTAAGGCAGAGTC 6006

117393857 TCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCC 117393916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 TCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCC 6066

117393917 TCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCT 117393976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 TCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATTACAGGCGCCT 6126

117393977 GCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGG 117394036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 GCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCACTATGTTGAGG 6186

117394037 CCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGC 117394096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 CCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGC 6246

117394097 TGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTTAGCCAACTCT 117394156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 TGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTTAGCCAACTCT 6306

117394157 GGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTC 117394216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 GGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAACCATTGTGATTTC 6366

117394217 AGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTG 117394276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 AGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGATGTAAATGTTG 6426

117394277 TTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAA 117394336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 TTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATATGAAGGTAAA 6486

117394337 GATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAAC 117394396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 GATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCGAAACTCAAAC 6546

117394397 ACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCATTATA 117394456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 ACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACCTACCATTATA 6606

117394457 GAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATG 117394516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 GAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACTTTTAGCAAAATG 6666

117394517 TTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAAT 117394576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 TTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAATAAAATTAATAAT 6726

117394577 TTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTA 117394636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 TTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGGAGATTTGTTA 6786

117394637 TTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACAT 117394696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 TTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATTTCCTTTTCACAT 6846

117394697 TTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAAATCTTAG 117394746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 TTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAAATCTTAG 6896

Alignment time is 6.25061 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     3161] =>      3161 nucs 'mol-32-3306-283745_3161'

Score:        3150
Aligned:      3161        nucs
Identic:      3160 (100%) nucs =>       542 (100%)      2618 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117391564,117392105] EXCISED REGION [117392107,117394725]
 second seq =>  [        1,      542] EXCISED REGION [      544,     3161]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [117392106,117392106]
 second seq =>         1 nucs [543,543]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [117392703,117392703]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [543,543] to [544,544]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117391564 AGTTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACT 117391623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACT 60

117391624 TTCTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGG 117391683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGG 120

117391684 CACTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCT 117391743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCT 180

117391744 TAAATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTG 117391803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTG 240

117391804 TGGGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCG 117391863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCG 300

117391864 CTTCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAA 117391923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAA 360

117391924 GTAGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTC 117391983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTAGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTC 420

117391984 TGTGTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCC 117392043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCC 480

117392044 TGCAGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTC 117392103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCAGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTC 540

117392104 AC 117392105
          ||
      541 AC 542

EXCISED REGION

117392107 GAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGA 117392166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      544 GAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGA 603

117392167 GGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTG 117392226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 GGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTG 663

117392227 TCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGAC 117392286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      664 TCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGAC 723

117392287 ATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTA 117392346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 ATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTA 783

117392347 ATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAA 117392406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      784 ATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAA 843

117392407 TAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTG 117392466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      844 TAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTG 903

117392467 TCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGT 117392526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      904 TCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGT 963

117392527 ACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAAT 117392586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      964 ACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAAT 1023

117392587 GTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTG 117392646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1024 GTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTG 1083

117392647 AGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTTTT 117392706
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
     1084 AGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTC-TTT 1142

117392707 TTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATA 117392766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 TTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATA 1202

117392767 AATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAA 117392826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 AATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAA 1262

117392827 TATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGA 117392886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 TATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGA 1322

117392887 GTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCC 117392946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 GTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCC 1382

117392947 ATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAA 117393006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 ATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAA 1442

117393007 AAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACT 117393066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 AAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACT 1502

117393067 AAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACA 117393126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 AAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACA 1562

117393127 GGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAA 117393186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 GGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAA 1622

117393187 ATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTT 117393246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 ATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTT 1682

117393247 AAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAA 117393306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 AAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAA 1742

117393307 AAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGA 117393366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 AAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGA 1802

117393367 AAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGA 117393426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 AAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGA 1862

117393427 CAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAG 117393486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 CAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAG 1922

117393487 CAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGA 117393546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 CAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGA 1982

117393547 CAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAA 117393606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 CAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAA 2042

117393607 TCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTGGC 117393666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 TCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTGGC 2102

117393667 CTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTC 117393726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 CTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTC 2162

117393727 AGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGG 117393786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 AGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGG 2222

117393787 AGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTA 117393846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 AGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTA 2282

117393847 AGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGC 117393906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 AGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGC 2342

117393907 AACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATT 117393966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 AACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATT 2402

117393967 ACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 117394026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 ACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 2462

117394027 TATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCT 117394086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 TATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCT 2522

117394087 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTT 117394146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTT 2582

117394147 AGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAACCA 117394206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 AGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAACCA 2642

117394207 TTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGAT 117394266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 TTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGAT 2702

117394267 GTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATA 117394326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2703 GTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATA 2762

117394327 TGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCG 117394386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 TGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCG 2822

117394387 AAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACC 117394446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 AAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACC 2882

117394447 TACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACTTT 117394506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 TACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACTTT 2942

117394507 TAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAATAA 117394566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 TAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAATAA 3002

117394567 AATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGG 117394626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 AATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGG 3062

117394627 AGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATTTC 117394686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 AGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATTTC 3122

117394687 CTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGC 117394725
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 CTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGC 3161

Alignment time is 2.87731 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     3291] =>      3291 nucs 'mol-32-3395-181841_3291'

Score:        3268
Aligned:      3290        nucs
Identic:      3288 (100%) nucs =>        35 (100%)      3253 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117391351,117391385] EXCISED REGION [117391387,117394641]
 second seq =>  [        1,       35] EXCISED REGION [       37,     3291]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [117391386,117391386]
 second seq =>         1 nucs [36,36]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [36,36] to [37,37]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [117391384,117391385] to [117391387,117391388]
 second seq =>         2 nucs [34,35] to [37,38]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117391351 TCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAAT 117391385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAAT 35

EXCISED REGION

117391387 ATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCCTA 117391446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       37 ATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCCTA 96

117391447 CTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAAAC 117391506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       97 CTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAAAC 156

117391507 TCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAAGT 117391566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      157 TCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAAGT 216

117391567 TAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTTTC 117391626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      217 TAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTTTC 276

117391627 TTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCAC 117391686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      277 TTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGCAC 336

117391687 TTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTAA 117391746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      337 TTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTTAA 396

117391747 ATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTGG 117391806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      397 ATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGTGG 456

117391807 GATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCTT 117391866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      457 GATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGCTT 516

117391867 CGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGTA 117391926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      517 CGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAGTA 576

117391927 GTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTGT 117391986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      577 GTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCTGT 636

117391987 GTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCTGC 117392046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      637 GTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCTGC 696

117392047 AGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCACA 117392106
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      697 AGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCACG 756

117392107 GAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGA 117392166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      757 GAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAAGA 816

117392167 GGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTG 117392226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      817 GGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACCTG 876

117392227 TCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGAC 117392286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 TCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATGAC 936

117392287 ATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTA 117392346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 ATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAGTA 996

117392347 ATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAA 117392406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 ATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTAAA 1056

117392407 TAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTG 117392466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1057 TAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTCTG 1116

117392467 TCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGT 117392526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 TCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCGGT 1176

117392527 ACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAAT 117392586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 ACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAAAT 1236

117392587 GTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTG 117392646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 GTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAACTG 1296

117392647 AGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTTTT 117392706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 AGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTTTT 1356

117392707 TTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATA 117392766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 TTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGATA 1416

117392767 AATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAA 117392826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1417 AATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGCAA 1476

117392827 TATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGA 117392886
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 TATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAGCAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACAGA 1536

117392887 GTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCC 117392946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 GTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAATCC 1596

117392947 ATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAA 117393006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 ATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGGAA 1656

117393007 AAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACT 117393066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 AAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAACT 1716

117393067 AAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACA 117393126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 AAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATACA 1776

117393127 GGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAA 117393186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 GGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTGAA 1836

117393187 ATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTT 117393246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 ATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTGTT 1896

117393247 AAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAA 117393306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 AAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGGAA 1956

117393307 AAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGA 117393366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 AAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACCGA 2016

117393367 AAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGA 117393426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 AAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGAGA 2076

117393427 CAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAG 117393486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 CAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCCAG 2136

117393487 CAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGA 117393546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 CAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAATGA 2196

117393547 CAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAA 117393606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 CAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAGAA 2256

117393607 TCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTGGC 117393666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 TCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTGGC 2316

117393667 CTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTC 117393726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 CTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCACTC 2376

117393727 AGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGG 117393786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 AGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGTGG 2436

117393787 AGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTA 117393846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 AGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCTTA 2496

117393847 AGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGC 117393906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 AGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACTGC 2556

117393907 AACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATT 117393966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 AACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGATT 2616

117393967 ACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 117394026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 ACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCAC 2676

117394027 TATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCT 117394086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 TATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGCCT 2736

117394087 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTT 117394146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATTTT 2796

117394147 AGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAACCA 117394206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 AGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAACCA 2856

117394207 TTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGAT 117394266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 TTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGGAT 2916

117394267 GTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATA 117394326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 GTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAATA 2976

117394327 TGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCG 117394386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 TGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATCCG 3036

117394387 AAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACC 117394446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 AAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTACC 3096

117394447 TACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACTTT 117394506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 TACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACTTT 3156

117394507 TAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAATAA 117394566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 TAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAATAA 3216

117394567 AATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGG 117394626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 AATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTTGG 3276

117394627 AGATTTGTTATTAAA 117394641
          |||||||||||||||
     3277 AGATTTGTTATTAAA 3291

Alignment time is 3.6541 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [117377098,117403883] =>     26786 nucs '5 dna:chromosome chromosome:GRCh37:5:1:180915260:1'
Second seq [        1,     7507] =>      7507 nucs 'mol-32-340e-018344_7507'

Score:        7451
Aligned:      7506        nucs
Identic:      7501 (100%) nucs =>      2516 (100%)      4985 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [117387848,117390363] EXCISED REGION [117390365,117395354]
 second seq =>  [        1,     2516] EXCISED REGION [     2518,     7507]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [117390364,117390364]
 second seq =>         1 nucs [2517,2517]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [117390364,117390364] to [117390365,117390365]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

117387848 GATAGTTATTTGTATATTATCTACAGGTTTTTTTATTGTATTTAAACAGATGGGCATTGT 117387907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATAGTTATTTGTATATTATCTACAGGTTTTTTTATTGTATTTAAACAGATGGGCATTGT 60

117387908 GTTTGTCAGGGTTCTGGAAGCACATAATAAATAATGTGACTTGGCACTGTTCTAGATGCT 117387967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTTGTCAGGGTTCTGGAAGCACATAATAAATAATGTGACTTGGCACTGTTCTAGATGCT 120

117387968 GAAGATAGAAGAGTGAACAAACCCTTACACATATGGTGCTATATATTCATAAGAGAAAAC 117388027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGATAGAAGAGTGAACAAACCCTTACACATATGGTGCTATATATTCATAAGAGAAAAC 180

117388028 TAAGGAACATAGATAAAAACGTTCACAGGATCTCTCTGGATGGTAGAATTGAGGGTGATG 117388087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAGGAACATAGATAAAAACGTTCACAGGATCTCTCTGGATGGTAGAATTGAGGGTGATG 240

117388088 TTTGTTCCTGTCCATTATACTTTTAAAATTATCTTCTTTATGTAAAAAAAGACATCATTA 117388147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTGTTCCTGTCCATTATACTTTTAAAATTATCTTCTTTATGTAAAAAAAGACATCATTA 300

117388148 AAAATATTTTCTAATTTTTGAAGCATCTTTATAGGGACCCTATAAAAACCTGTAGGATTC 117388207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAATATTTTCTAATTTTTGAAGCATCTTTATAGGGACCCTATAAAAACCTGTAGGATTC 360

117388208 TGATCTGAGCTGTTTCATTCCATAGAAGTCAATCACTGTCAGTGGGAAACCCCTAGGGAA 117388267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGATCTGAGCTGTTTCATTCCATAGAAGTCAATCACTGTCAGTGGGAAACCCCTAGGGAA 420

117388268 GTCTAGAGATTAAGAATAAAATCTAAGGAAATATAATTTTAAAATTCACTCATGCTTCTA 117388327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTCTAGAGATTAAGAATAAAATCTAAGGAAATATAATTTTAAAATTCACTCATGCTTCTA 480

117388328 GCAGCATTGGGAGCAACTGTAAGACTTGCACTCTTTTGATAATTGTAATTCAGCATGTTC 117388387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAGCATTGGGAGCAACTGTAAGACTTGCACTCTTTTGATAATTGTAATTCAGCATGTTC 540

117388388 CCTGGGGCTGTTCTGAGTCATCTTCAGTAGTGATAGAAGTCTTAGCCTTGAATTTCTTTT 117388447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCTGGGGCTGTTCTGAGTCATCTTCAGTAGTGATAGAAGTCTTAGCCTTGAATTTCTTTT 600

117388448 CCATAAAACATCTGACATAGTTCACAATGATGGGAGTGAACTACCTTTTAGAATAGTTAA 117388507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCATAAAACATCTGACATAGTTCACAATGATGGGAGTGAACTACCTTTTAGAATAGTTAA 660

117388508 AGATTGTTAATGAAAATATTATAAATACTTTCAAAGATAAAGGTTAGGAACTCTAAAGGG 117388567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGATTGTTAATGAAAATATTATAAATACTTTCAAAGATAAAGGTTAGGAACTCTAAAGGG 720

117388568 TCATAAAAACCAAGTACAAATTCTTTATTTTGCCAGATTTGGACAATGAAGCTTAAAAGC 117388627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCATAAAAACCAAGTACAAATTCTTTATTTTGCCAGATTTGGACAATGAAGCTTAAAAGC 780

117388628 ATTCAGCAACTTTCCTTAGTTTCATGGTATGAATAACAAAAAGCTGTCTGCTGAGTCCTG 117388687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTCAGCAACTTTCCTTAGTTTCATGGTATGAATAACAAAAAGCTGTCTGCTGAGTCCTG 840

117388688 GTCTAGTGTTTTAGGTATGTAAAAATTAGTTTCAATAAAACAGTTCAAATCCCAAACATG 117388747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCTAGTGTTTTAGGTATGTAAAAATTAGTTTCAATAAAACAGTTCAAATCCCAAACATG 900

117388748 TCAATCTGATTGAAACAAAAGAGTTATGTAATAGTGAAAGAAATGAGCTGAATTGGCCAT 117388807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAATCTGATTGAAACAAAAGAGTTATGTAATAGTGAAAGAAATGAGCTGAATTGGCCAT 960

117388808 TTAGATTTAATTTGCTCTATGTGTGTGTGCTAATTCAAATTAACGGGTATATATTTTTAC 117388867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTAGATTTAATTTGCTCTATGTGTGTGTGCTAATTCAAATTAACGGGTATATATTTTTAC 1020

117388868 ATTGCCAATATCAAACTATGCTTGAGAGTTTAGTGTTTCCTCTGTGATACCTGAGGGATC 117388927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTGCCAATATCAAACTATGCTTGAGAGTTTAGTGTTTCCTCTGTGATACCTGAGGGATC 1080

117388928 AAAGGGAAGGTGTATCAATCTAGGTCCAACCAGGAGAAAGAAACTACATAGTGATTCAAG 117388987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAGGGAAGGTGTATCAATCTAGGTCCAACCAGGAGAAAGAAACTACATAGTGATTCAAG 1140

117388988 CAAGGGAATTTTAATGTAACAAATCATTAAAGTATGATAAAGAGTAACTATAACATGTAA 117389047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAAGGGAATTTTAATGTAACAAATCATTAAAGTATGATAAAGAGTAACTATAACATGTAA 1200

117389048 AGAGAACCTTAAAAGGGCACAGTATGTCTGAGAGAGTATCCAAAGAAGGGCAAACTTGGA 117389107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAGAACCTTAAAAGGGCACAGTATGTCTGAGAGAGTATCCAAAGAAGGGCAAACTTGGA 1260

117389108 AAGGAGGTGTCCTCTCCAAGGGTGAGGTTCAGACCACATTGGAGAAGGCATGGCTGCAGC 117389167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGGAGGTGTCCTCTCCAAGGGTGAGGTTCAGACCACATTGGAGAAGGCATGGCTGCAGC 1320

117389168 CTGCCGATTGACAGTGAAGTTCACTGAGGTGCCCAAGACAGAGTTGGATCACAGTAATTA 117389227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTGCCGATTGACAGTGAAGTTCACTGAGGTGCCCAAGACAGAGTTGGATCACAGTAATTA 1380

117389228 GGCAAGCAGGAAACAAGCCTCTGGAGCACAGGTGAGCCACAGCTGGTGGAGAATACACTG 117389287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGCAAGCAGGAAACAAGCCTCTGGAGCACAGGTGAGCCACAGCTGGTGGAGAATACACTG 1440

117389288 CTGGGAAATAGTGCAGATGATGGAACTAACAAGAGAAGCTTTCTCCTTCTCCATTGCCCC 117389347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGGGAAATAGTGCAGATGATGGAACTAACAAGAGAAGCTTTCTCCTTCTCCATTGCCCC 1500

117389348 TCCAATGCCCTCTACTGAGAAAGTTTAACATTGTGCTCACTTTAAAGAAGAACAGTTTAA 117389407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCCAATGCCCTCTACTGAGAAAGTTTAACATTGTGCTCACTTTAAAGAAGAACAGTTTAA 1560

117389408 AGGAATTCCATCCACTTTTGCAGAGCAGGTATTAAAAATTAACTTTAGACCTGAGAAGCA 117389467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGAATTCCATCCACTTTTGCAGAGCAGGTATTAAAAATTAACTTTAGACCTGAGAAGCA 1620

117389468 ATAAACTGATAACTGGAAAAGGAGGCTTATAAGATCAGGTTCTGTGTCCCCACGTCCACC 117389527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATAAACTGATAACTGGAAAAGGAGGCTTATAAGATCAGGTTCTGTGTCCCCACGTCCACC 1680

117389528 AGAGAAGTTCTGCTCTTCCATGTTTAATAAAGAATGGTTCCCAGCAAAATTTATTTGAAA 117389587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGAGAAGTTCTGCTCTTCCATGTTTAATAAAGAATGGTTCCCAGCAAAATTTATTTGAAA 1740

117389588 GCCAAAAACACTGAAAGACATTATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTTTTAATTTTAG 117389647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCCAAAAACACTGAAAGACATTATAGAGGAAAAGATACAACATAAAACTTTTAATTTTAG 1800

117389648 ACATAAAAGAAAACTATTAAAAATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATTCTTACTATAT 117389707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACATAAAAGAAAACTATTAAAAATAAAAATGTTAGTGACATTGGAAAATTCTTACTATAT 1860

117389708 AATAGTACAGGTTAGAGAAGGAAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAAAATAAGTAGG 117389767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATAGTACAGGTTAGAGAAGGAAAGAGGGTTGCAAGACAGGGCTCTAGAAAATAAGTAGG 1920

117389768 GCTAATAAATAATTTGCACCAAAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACTAATTGTAATATGAG 117389827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTAATAAATAATTTGCACCAAAGTTTTTGAAAAATTAAAAGTACTAATTGTAATATGAG 1980

117389828 AAATGAGTATCTGAATGAAGCTTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAATAGAAAAGAAGAA 117389887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAATGAGTATCTGAATGAAGCTTACAAGTCTATAAAAATCAAGCAAATAGAAAAGAAGAA 2040

117389888 ACTAATTTTTAATGTTATATAAGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCCTTGATTCAGTAGT 117389947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACTAATTTTTAATGTTATATAAGAAGGAAAATAATCACTCTTGGTCCTTGATTCAGTAGT 2100

117389948 GAAAAATACTTATTGTGATGGTTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGGATCAAAGGATGCC 117390007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAAAAATACTTATTGTGATGGTTAATATTAGGTGTCAACTTGATTGGATCAAAGGATGCC 2160

117390008 TAGATAGCTGGTAAATTATTGTTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAGACTGACATTTGAG 117390067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TAGATAGCTGGTAAATTATTGTTTCTGCGTGTGTCTGTGAAGAGCAGACTGACATTTGAG 2220

117390068 TCAGTGGACTGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACCATCCAATGGGCTG 117390127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCAGTGGACTGCGTAAGGAAGACGGACCCTCAATGTGAGTGGGCACCATCCAATGGGCTG 2280

117390128 CCAGTGCCACTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTGCTTGCTTAGTCTT 117390187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCAGTGCCACTAGGACAAAGTAGGCAGAAGAAGGTGGAATAACCTTGCTTGCTTAGTCTT 2340

117390188 CTGGCTTTCCTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACATAAGAGTCCAGGT 117390247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTGGCTTTCCTCTTTCTACTATGCTGGATGCTTCTTGCCCTTGGACATAAGAGTCCAGGT 2400

117390248 TCTTCTGCCTTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGACTCCTGGGCCTTC 117390307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCTTCTGCCTTTGGACTCTTGGACGTACACCAGTGGTTTGCTGGGGACTCCTGGGCCTTC 2460

117390308 GGCCACAGACTGAAGTCTGCACTGTCAGCGTCCTTACTTGTGAGGTTTCTGGACTC 117390363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGCCACAGACTGAAGTCTGCACTGTCAGCGTCCTTACTTGTGAGGTTTCTGGACTC 2516

EXCISED REGION

117390365 GACTGAGCCACTACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGGAGTTTACCTT 117390424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GACTGAGCCACTACTGGTTTCTTTCTTTCTTCCTCATGGCCTATCGTGGGAGTTTACCTT 2577

117390425 GTGATTGTGTGAGCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACATGTATCCTATT 117390484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 GTGATTGTGTGAGCCAATTCTCCCTAATAAACCCCCTTTCATATATACATGTATCCTATT 2637

117390485 CATTCTGTCCCTCTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGATAAACACTGAT 117390544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 CATTCTGTCCCTCTGGAGAGCCCTGACTAAAACACTTAGGTAATCATGATAAACACTGAT 2697

117390545 TGGACAAAGATTGTGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAATAAGAGTGAC 117390604
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TGGACAAAGATTGCGCTGCTATTATATCAGATTATTGATGTAAGACGAAATAAGAGTGAC 2757

117390605 ATTGGGAGCTAAATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTAATGCCACAAT 117390664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 ATTGGGAGCTAAATCTTACCAAAATAACCAGATCAAAGATTCATTATGTAATGCCACAAT 2817

117390665 AGAGAAATTGATAGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAGCAAACACCAA 117390724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 AGAGAAATTGATAGTTGCATACGACTCTCTTTGTTTTAGAAATATGGAAGCAAACACCAA 2877

117390725 ACACCATACAAAATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAACTGGAGGTAAA 117390784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 ACACCATACAAAATGGACAAAAGGTTGCAAATGGCTCTGGCAATTGGAACTGGAGGTAAA 2937

117390785 ATAGTCTGACTAAGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTTAGTTTGATTA 117390844
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2938 ATAGTCTGACTAAGGGAAAATGCTGAATTTCATTAAAAATGTTTTAGCTTAGTTTTATTA 2997

117390845 TTAAATTAGGCACAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATACATAGAATAA 117390904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2998 TTAAATTAGGCACAGATTTGAATTTGATAGGAACAAGCACAAATCTTATACATAGAATAA 3057

117390905 TCTCTACAATGCAAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGTGATTGCTTCT 117390964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3058 TCTCTACAATGCAAAAGTCATAAGAAAAACATTGGAAGAAAATAAAAAGTGATTGCTTCT 3117

117390965 GGGGGCATATTTCTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTTC 117391024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3118 GGGGGCATATTTCTATATGCCATTTAACAATTTCTTGTACATATATTCATTCCAAATTTC 3177

117391025 CTAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGA 117391084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3178 CTAAAATTAGTATCATCTTAAAAAATACATAATGAACAAAGCAAGTGAAAGGTTAAGTGA 3237

117391085 AATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGG 117391144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3238 AATCATAAGATACATGAGAAGAGAAAGCATGAAAGATAAACTAAGTTAAAATGAGTGTGG 3297

117391145 AAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGA 117391204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3298 AAGGATCATTCCATCAAGTAAGCAATATTAGATGACCATTGTGAAGCTAGTACTGAAAGA 3357

117391205 ATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATA 117391264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3358 ATAAACAAAAAAAATGAGTAAAACATTCTCCATTCCTTTCAGGCACTTAAAAGTAAAATA 3417

117391265 AAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAAT 117391324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3418 AAAAATAAATGGAGGAAATAAGTTAGATAAGTTTTATTTTACTGAAAAACAAAAAAAAAT 3477

117391325 TAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAA 117391384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3478 TAAAGGTCAGTTGATAAGCTTAGAGGTCCTATAACTCAAATTCAGTCAAAAATGAAAGAA 3537

117391385 TCATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCC 117391444
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3538 TAATTCCTTTTCTGAGAAGTTCTGCTCTTCTGTGTTTAATAAAGAGTGGCTCCCTGCTCC 3597

117391445 TACTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAA 117391504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3598 TACTGTCAATAATTGTTCACTGTGAATAGCTCTCATATAAAATTTTAAAGATTCTTATAA 3657

117391505 ACTCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAA 117391564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3658 ACTCCATAACATACTATTCAACTTGCAAAATGCAATATTGGACAGAATTTTTTCTTAAAA 3717

117391565 GTTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTT 117391624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3718 GTTAATCTTGTGGATTCTTACGAAATCTGCTCATCCAGATACGAGTTGTAATGATGACTT 3777

117391625 TCTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGC 117391684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3778 TCTTCTGTAGTATTTACTGCTTGCTTGAATTGGTTTTTAAATATTAAGTCAAAAAAGGGC 3837

117391685 ACTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTT 117391744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3838 ACTTCTCTCCCATGTCTGCCTTTTATTCAGGTGTGATTAACCAACATGCTAATGAAGCTT 3897

117391745 AAATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGT 117391804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3898 AAATGTCAGAGCCATTCCTTGCACGGGCCCCCTCTAGCAACTTACTCTACATGTTTTTGT 3957

117391805 GGGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGC 117391864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3958 GGGATTTGCAAAAGCAGGACACTTTAATCAAAATTAGTTAAGACTGCTGCATCTTTCCGC 4017

117391865 TTCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAG 117391924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4018 TTCGATTTAACTTTCAACACACTTCTGTTGTATAGGATCATATTTGGAGTGTCTATGAAG 4077

117391925 TAGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCT 117391984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4078 TAGTTGAGCTGGGAACAATTGAGTTTGATATTGTGGTCCACATGGACTACAGTCATGTCT 4137

117391985 GTGTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCT 117392044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4138 GTGTATATTTGAGTTATTGTTAGCCATCCTGGTATAGGTATGGCTTTCAGGATTACTCCT 4197

117392045 GCAGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCA 117392104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4198 GCAGCCCACTGTGTTAACTCCCTCAGTGTTGAGACACAAAGATACAGAGAAGAGGTCTCA 4257

117392105 CAGAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAA 117392164
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4258 CGGAGCTATTAACCTGTTCTACTGAGGGTGGCACTGGAAGGATACAGGCAGCAAAGAAAA 4317

117392165 GAGGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACC 117392224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4318 GAGGGTTTGAAATGCATTGCATGAGAAGCTAGACTGTGAAAAATTTATCCAACTCTTACC 4377

117392225 TGTCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATG 117392284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4378 TGTCATAAATAAAAGAAACTTTTAATACAACTTCTACTCATATTTGACAGCAATAGCATG 4437

117392285 ACATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAG 117392344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4438 ACATTTGTCAGACATTATAATAGTAAGTTGTGAAGCTAAAAGAATATTTTAAATTATCAG 4497

117392345 TAATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTA 117392404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4498 TAATGTAAAAATAAATTTCAATCAAAAGACTCATTTGCTCTCTAGTTTTTATGAAACCTA 4557

117392405 AATAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTC 117392464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4558 AATAATTGACATCTAAAGTGGCAATCAAAGTTTGAAGTAGGAAAGAAATAGCAAGAAGTC 4617

117392465 TGTCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCG 117392524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4618 TGTCAGGCAATTATTTAATTAAAATAAAATAATTGTCTTCTGGGTTTCGTAATTTTACCG 4677

117392525 GTACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAA 117392584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4678 GTACTCGACAGAGTTTTATAATCTGTAATGTATGGCAATTTATTTTTTCATCATAAATAA 4737

117392585 ATGTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAAC 117392644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4738 ATGTTAACTTTTGTACATAATTTTCTATTTGTAATTTTTATTACCTTTTTCTCATAAAAC 4797

117392645 TGAGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTT 117392704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4798 TGAGGCCACCCCCTGGATTTTTAATTGTTATTTTAAAACATTTTCTATGCTATGTTTCTT 4857

117392705 TTTTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGA 117392764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4858 TTTTTTTTTAAATAAAAGAAGCTTTATGTAGTTGATCTCAGTGTAGATCACCTCAATAGA 4917

117392765 TAAATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGC 117392824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4918 TAAATGGAACCCATTTTTCTCCCTTTTAGCTTCATGAGCAATGAATTGAGATGATCCTGC 4977

117392825 AATATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACA 117392884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4978 AATATGAGAAAAAAAATCCAAGAAATCAACAAAAACTGAAATAAGTCAAAGGAAATAACA 5037

117392885 GAGTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAAT 117392944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5038 GAGTTTGTAATAAAATATTCTGTGCAAAACTTCTGGATGGAAGCTGCCCACTGTTTCAAT 5097

117392945 CCATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGG 117393004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5098 CCATTCCTCCACTTCCACCCACATTAACCTTCAAAAGGTTATTGGCCCCATTTAAAGAGG 5157

117393005 AAAAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAA 117393064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5158 AAAAAGTGTTATGTCCCTCCATAAGAACTACTAAACAGACAAACACAACACAACGCAAAA 5217

117393065 CTAAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATA 117393124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5218 CTAAATCCAAGAAAAAAGGAAAAAGAAAAGAACATACGTAAAAGATGGATGAGTAACATA 5277

117393125 CAGGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTG 117393184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5278 CAGGAAGTATCTTAGAAAATACAGAATGATTGAAAAAATCAATTTCTATTATCTCCATTG 5337

117393185 AAATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTG 117393244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5338 AAATCATGGGCACCTTATTTCTTTGGAAATATGATAATAAGACAAGAAATGAGACAAGTG 5397

117393245 TTAAGAAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGG 117393304
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5398 TTAAGGAAGAGATTTTGATTCAGAGAAGAAACTGGCTGGCAGTATTCAGGAAATAAATGG 5457

117393305 AAAAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACC 117393364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5458 AAAAAATATATATACTACACAGAGTATCCTGTATGATATGGCTTAAACAAAATAAAAACC 5517

117393365 GAAAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGA 117393424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5518 GAAAATACAGACACATTGTAAATGATCTTGAGGAAATGAGAAATGGAAGGAAAGAATGGA 5577

117393425 GACAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCC 117393484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5578 GACAAAAAGACAGAGAAATAAAGAGAGACAGAGGCAGTGATAGGAAAACAAAGAATATCC 5637

117393485 AGCAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAAT 117393544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5638 AGCAAACACTTACTTTTGTCTCTAAAACACAACAAGAAATATCTGAAACAGGAAAAAAAT 5697

117393545 GACAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAG 117393604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5698 GACAGAATACTTAAGAAAAAAGTATATCCTCAGAAAGATGCTGAAATAAGATGAATAAAG 5757

117393605 AATCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTG 117393664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5758 AATCACACAGGTACTGTGGCATAAAAAGTAACTTATAAACAATAGGTGAAAATCAAATTG 5817

117393665 GCCTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCAC 117393724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5818 GCCTCATTCTTCTCAATTCTATACAAGATCAGAGACAAAAAGAAGGAAACAGTTCTTCAC 5877

117393725 TCAGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGT 117393784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5878 TCAGTGTTGTCATCTGAATGTGTCATTTGGAATTGTGGTCATCGTCTTGGGACCAAGAGT 5937

117393785 GGAGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCT 117393844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5938 GGAGCCAAGAGGATAAATCAACATATAATAGAAAAAGCTGATTATTATTATTATTTTCCT 5997

117393845 TAAGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACT 117393904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5998 TAAGGCAGAGTCTCGCTCTGCCACCTAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCGGCTCACT 6057

117393905 GCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGA 117393964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6058 GCAACCTCCGCCTCCCGGATGCAAGTAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCCAGAAGCTGAGA 6117

117393965 TTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 117394024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6118 TTACAGGCGCCTGCCACAATGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 6177

117394025 ACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGC 117394084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6178 ACTATGTTGAGGCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCAGGCAATCTGCCCGCCTTGGC 6237

117394085 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATT 117394144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6238 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACACCTGGCCTACCTGATGATGATT 6297

117394145 TTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAAC 117394204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6298 TTAGCCAACTCTGGATCCCTCCATCACCTTTGGATGATAAATTTTTCTTATTGCTTAAAC 6357

117394205 CATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGG 117394264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6358 CATTGTGATTTCAGTCCTTGGTTACTTGTTATTGAAAGCTTCCTACCTGAAGCAAAGAGG 6417

117394265 ATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAA 117394324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6418 ATGTAAATGTTGTTAAACTTCACCACGTAAAAATAGTAATATAAGTAACACAAATCAGAA 6477

117394325 TATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATC 117394384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6478 TATGAAGGTAAAGATCAGGAAGGTTGGGGAAAGTTTACTAATTTCCTTATCTTTTACATC 6537

117394385 CGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTA 117394444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6538 CGAAACTCAAACACAATCTAAAATTGAAACAGCGCAATTCCACCCTCAAAATTATTTTTA 6597

117394445 CCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACT 117394504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6598 CCTACCATTATAGAAATCATTAAGGAATTGATATTTCTTACAGTGAAGAAATTGAGTACT 6657

117394505 TTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAAT 117394564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6658 TTTAGCAAAATGTTAGCACATTTTTCATTTCACTTTAGATGCTTTATGTTAAAATCAAAT 6717

117394565 AAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTT 117394624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6718 AAAATTAATAATTTTAGAGAAAATCATATATAGTATGTGCCCCTTTTTTTGAAAATTTTT 6777

117394625 GGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATT 117394684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6778 GGAGATTTGTTATTAAAATTAAAATTCCACTTCAAGATACAGCATTTTAAAGCCTCAATT 6837

117394685 TCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAAATCTT 117394744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6838 TCCTTTTCACATTTCCAGCGTATTATTAAAGGGAAAAAGGCAAAATTATGCATAAATCTT 6897

117394745 AGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATACCTCTCAAATTAAGAAATAGAA 117394804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6898 AGGTGCATAAGTTGATTAATTTTCTCAAATTGTATATACCTCTCAAATTAAGAAATAGAA 6957

117394805 TACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGATCAGACCATGTCTCTCAGCAT 117394864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6958 TACCAGCACGGCCTCAGAAATAGTCAATAACACAAAAGATCAGACCATGTCTCTCAGCAT 7017

117394865 AAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGGAAACAACAGTATTATTTTGTG 117394924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7018 AAGTTAATTTTGCCTGTTTTTTGAAACTTATATAAATGGAAACAACAGTATTATTTTGTG 7077

117394925 TCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTCATCCAAATGTGCTAGGCATAC 117394984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7078 TCTGTTTTTTTTTCACGCAACCTTATGTGTGAGAGAGTCATCCAAATGTGCTAGGCATAC 7137

117394985 TTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAATTTAGGCATTTATTTTACTGT 117395044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7138 TTACAGTTTTTTCATTCTTTTTGCATTACTATAGGATAATTTAGGCATTTATTTTACTGT 7197

117395045 TGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAATGAGTAGGGCTGTTTTGAACAC 117395104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7198 TGATGGACATCGAGGTAGTTTCCAGGTTGGGGAAATAATGAGTAGGGCTGTTTTGAACAC 7257

117395105 TCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTTTCTGTTGAGTGTATAAACAGA 117395164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7258 TCTTAAATATATCCACTGATGTATAGATCTGTGTTTGTTTCTGTTGAGTGTATAAACAGA 7317

117395165 AGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTGTTAATGTATACTGGTAGTTTT 117395224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7318 AGTATGTTGCAAAAGTAAAAGCTATACGAATAGGTAGTGTTAATGTATACTGGTAGTTTT 7377

117395225 GCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATGTCTATGAATATTGGTTATGCT 117395284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7378 GCAAACTGGTTGTACCAATTTACACTTCCCAAAGCCATGTCTATGAATATTGGTTATGCT 7437

117395285 ACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATACAGTTGTTCATATTTTTCTGTT 117395344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7438 ACAGTTACCAAAAATTTGCATCTACTTGATGAATAATACAGTTGTTCATATTTTTCTGTT 7497

117395345 TTTGGCAATC 117395354
          ||||||||||
     7498 TTTGGCAATC 7507

Alignment time is 7.32678 s

