
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   3959] =>      3959 nucs 'mol-32-1e7c-148791_3959'

Score:        3849
Aligned:      3959        nucs
Identic:      3949 (100%) nucs =>      3872 (100%)        77 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6890956,6894837] EXCISED REGION [6896048,6896124]
 second seq =>  [      1,   3882] EXCISED REGION [   3883,   3959]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1210 nucs [6894838,6896047]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        29 nucs [6894838,6894866] to [6896048,6896076]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6894838,6894838] to [6896047,6896047]
 second seq =>         0 nucs

  6890956 AAGACGGGAGCCGGAAGCCACCGCGGAACTAAAGTCTGGGAACCCCCCTTGGGGCGCTCA 6891015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGACGGGAGCCGGAAGCCACCGCGGAACTAAAGTCTGGGAACCCCCCTTGGGGCGCTCA 60

  6891016 GGATTCACCCGCGCATGTGGCTGGGCACAGGCCTGTCCTCCAGGAGACTGCAGGCTGGGG 6891075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGATTCACCCGCGCATGTGGCTGGGCACAGGCCTGTCCTCCAGGAGACTGCAGGCTGGGG 120

  6891076 ACCCAAGGGTGACACCACAGGCTGCCCGCGCTTTGTGCGCAAAGCCAGGAGCGCTCTTCA 6891135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACCCAAGGGTGACACCACAGGCTGCCCGCGCTTTGTGCGCAAAGCCAGGAGCGCTCTTCA 180

  6891136 GTGAAGTGGAGGCGGCACTGCGAGAACCCCGGACTGGGCGCTGCGACCGCAGACTCAAGG 6891195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGAAGTGGAGGCGGCACTGCGAGAACCCCGGACTGGGCGCTGCGACCGCAGACTCAAGG 240

  6891196 TCGCGGCGCCTCAGGGATCACTGGGGGCTTGAGTGAGCCCTGACCCTCTCCTGGGCCTTC 6891255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCGCGGCGCCTCAGGGATCACTGGGGGCTTGAGTGAGCCCTGACCCTCTCCTGGGCCTTC 300

  6891256 CTATGCAGCGAGGGGCCGGACCCTGTGGTGCCTGAGGGCATTGTTTGTGGCTCTACTCTA 6891315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTATGCAGCGAGGGGCCGGACCCTGTGGTGCCTGAGGGCATTGTTTGTGGCTCTACTCTA 360

  6891316 GATCCGATTCCTGGTGATCACATATGTCAAACGTAACCACTTCGACCTCCCACAAACTGC 6891375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATCCGATTCCTGGTGATCACATATGTCAAACGTAACCACTTCGACCTCCCACAAACTGC 420

  6891376 CAGCTGCGAGCCCCTGATAACAGAAGTGGCCGCACTCGCCGGAGCTCCCTCCCTGGCCTG 6891435
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      421 CAGCTGCGAGCCCCTGATAACAGAAGTGGCCGCACTCGCCGGAGCTCCCTCCCTGGCCTA 480

  6891436 CCTGGCACACGCTGGTGGCTTTCCCCGGGCTCTCTGCTCAGGCCTTACCACCACCCTAGA 6891495
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTGGCACACGCTGGTGGCGTTCCCCGGGCTCTCTGCTCAGGCCTTACCACCACCCTAGA 540

  6891496 CTGAGGGACGGGGGAATTGCTCAGACAGACTAGGGACTCTGCGAGGGTGACAAAACGAAC 6891555
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTGAGGGACGGGGGAATTGCTCACACAGACTAGGGACTCTGCGAGGGTGACAAAACGAAC 600

  6891556 TTGCAGGTCCTGGCTGTTAGCTAGAGCATTGCACTGCATTCCTGCGGGTGGTCGCTGCCC 6891615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGCAGGTCCTGGCTGTTAGCTAGAGCATTGCACTGCATTCCTGCGGGTGGTCGCTGCCC 660

  6891616 CCATGCCCTCACTGATCTTAGTGCCACACCCCTCGCCTGGAGGTCCTGCTGCAGCCCTTG 6891675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCATGCCCTCACTGATCTTAGTGCCACACCCCTCGCCTGGAGGTCCTGCTGCAGCCCTTG 720

  6891676 CTGCCCCATAAGACCTTACCAGGGATACGGGGTGAGCCCGGCCCCTCTCTGCCATGACGC 6891735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGCCCCATAAGACCTTACCAGGGATACGGGGTGAGCCCGGCCCCTCTCTGCCATGACGC 780

  6891736 ACGGGTGTTCTGCAGACACCTCGAGGGAGCCTTTGCTGCTCACTTCCCTGCCTCTCCTTC 6891795
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACGGGTGTTCTGCAGACACCTCGAGGGGGCCTTTGCTGCTCACTTCCCTGCCTCTCCTTC 840

  6891796 CCCAGCCCCACCACCCACCTGCCGCTGCCTCTTCCCAAGCTGGGGAGGAAGTGGAGAACC 6891855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCAGCCCCACCACCCACCTGCCGCTGCCTCTTCCCAAGCTGGGGAGGAAGTGGAGAACC 900

  6891856 TGGGCCTCTGAGTGACTGACTTCCTCCTACAGAACTCAATTCCTCCACCTGCAGACGGTT 6891915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGGGCCTCTGAGTGACTGACTTCCTCCTACAGAACTCAATTCCTCCACCTGCAGACGGTT 960

  6891916 TCCCGCCTCTTCCCAGGGTTGGTGGCATCACCCACTGGAGCAGGAGGCCTCGTTTTCCTA 6891975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCCGCCTCTTCCCAGGGTTGGTGGCATCACCCACTGGAGCAGGAGGCCTCGTTTTCCTA 1020

  6891976 CTGACCTGTGCCCTGACCTTCCAGAGTCAACACAGTGGGAATGGAGACAGCTTGGGGTTG 6892035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGACCTGTGCCCTGACCTTCCAGAGTCAACACAGTGGGAATGGAGACAGCTTGGGGTTG 1080

  6892036 TTTGTGATATGGTTTGACTCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATGTTGAATTGTGATCCCCA 6892095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTGTGATATGGTTTGACTCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATGTTGAATTGTGATCCCCA 1140

  6892096 GCGTTGGATGTGGGGCCGGTGGGAGGTGATTGGGCCTTGGGGGTGGTCTCTAATGGTTTA 6892155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCGTTGGATGTGGGGCCGGTGGGAGGTGATTGGGCCTTGGGGGTGGTCTCTAATGGTTTA 1200

  6892156 GCACCATCCAGCACCCTAGTGCTGTTTTGTGATAGAGTTCTCAGGAGATCTGGTTGTTTG 6892215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCACCATCCAGCACCCTAGTGCTGTTTTGTGATAGAGTTCTCAGGAGATCTGGTTGTTTG 1260

  6892216 AAAGTGTGTAGCACCTCCCCCTTCACTGTCTCTCCTGCTGGCCATGTGAAGATGTACCTG 6892275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAAGTGTGTAGCACCTCCCCCTTCACTGTCTCTCCTGCTGGCCATGTGAAGATGTACCTG 1320

  6892276 CTTCCCCTTCACCTTCTGCCATGACTGTAAGTTTCCTGAGGCCTTCCCAGCCATGCTTCC 6892335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTTCCCCTTCACCTTCTGCCATGACTGTAAGTTTCCTGAGGCCTTCCCAGCCATGCTTCC 1380

  6892336 CGTACAGCCTGCAGAACTGTGAGTCAATTAAGCCTCTTTTTTTTTTCATAAATTACCCAG 6892395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CGTACAGCCTGCAGAACTGTGAGTCAATTAAGCCTCTTTTTTTTTTCATAAATTACCCAG 1440

  6892396 TCTCAGTTATATCTTTATAGCAGTGTGAAATGGACTAATACAGGGTGTCTTCATGTTGGC 6892455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTCAGTTATATCTTTATAGCAGTGTGAAATGGACTAATACAGGGTGTCTTCATGTTGGC 1500

  6892456 ATTAACCTGCTAATTAGGAAGAAAAAGAAGTCTCTGGGTCTTGGTCTCCCCAACTGCAAA 6892515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTAACCTGCTAATTAGGAAGAAAAAGAAGTCTCTGGGTCTTGGTCTCCCCAACTGCAAA 1560

  6892516 ATTTGTGGATGGGCCACTGCCATTTCAGAGAGGCCTCCCTCAGCAAGGACAGAGTGAAAG 6892575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTTGTGGATGGGCCACTGCCATTTCAGAGAGGCCTCCCTCAGCAAGGACAGAGTGAAAG 1620

  6892576 TTTGTGGGGTGGTTTCTGGGCTGGGGCACTGGGCCTGTCAACTGGTGGCATCCAGCGTTT 6892635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTGTGGGGTGGTTTCTGGGCTGGGGCACTGGGCCTGTCAACTGGTGGCATCCAGCGTTT 1680

  6892636 ATGGAACAAATGATGCTGGTACCCAGGGATGCCCTGGGACTCCTCCCACCTGGGGTGAAA 6892695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATGGAACAAATGATGCTGGTACCCAGGGATGCCCTGGGACTCCTCCCACCTGGGGTGAAA 1740

  6892696 GTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAGTGCCACCCTGTATTAGGC 6892755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAGTGCCACCCTGTATTAGGC 1800

  6892756 CATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAAAGG 6892815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAAAGG 1860

  6892816 CTTAACTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGCATCTGCTCGGC 6892875
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTAATTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGCATCTGCTCGGC 1920

  6892876 TTTTGGGGAGGCCTCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGGAAGCAGGCATG 6892935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTGGGGAGGCCTCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGGAAGCAGGCATG 1980

  6892936 TCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCATGAT 6892995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCATGAT 2040

  6892996 CTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTG 6893055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTG 2100

  6893056 AGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 6893115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGA 2160

  6893116 GATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGACCCGCC 6893175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGACCCGCC 2220

  6893176 TGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGC 6893235
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGC 2280

  6893236 AGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTT 6893295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTT 2340

  6893296 TTCAACAACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGA 6893355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTCAACAACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGA 2400

  6893356 TCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAA 6893415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAA 2460

  6893416 TTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGT 6893475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGT 2520

  6893476 GTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTT 6893535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTT 2580

  6893536 GAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGC 6893595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGC 2640

  6893596 TGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTCAATAACATATATCAAGGACCTACTACGTA 6893655
          |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
     2641 TGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTCGATAACGTATATCAAGGACCTACTACGTA 2700

  6893656 CTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTTTTCTGAATCAGTCACCCTCCCT 6893715
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAGTACATTTTATTTTTCTGAATCAGTCACCCTCCCT 2760

  6893716 CAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTCCTCTTTAACCTCTCCTAGATAA 6893775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTCCTCTTTAACCTCTCCTAGATAA 2820

  6893776 ACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTCTTTCTCCACTTTTCAGGAGTTT 6893835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTCTTTCTCCACTTTTCAGGAGTTT 2880

  6893836 GAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAAGATGTGTCATTATCTTGCCCCC 6893895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAAGATGTGTCATTATCTTGCCCCC 2940

  6893896 AAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGAAGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCT 6893955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGAAGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCT 3000

  6893956 CTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGAGGGAGGCACAGTCAGGGTTTAT 6894015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGAGGGAGGCACAGTCAGGGTTTAT 3060

  6894016 ACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACGCGTTTCATCTGGAGGAGACACA 6894075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACGCGTTTCATCTGGAGGAGACACA 3120

  6894076 GAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGCCACTGACAGTGTGTGGTTTCCT 6894135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGCCACTGACAGTGTGTGGTTTCCT 3180

  6894136 TCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGATCAAAGAAAGCAGCGGAAACCT 6894195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGATCAAAGAAAGCAGCGGAAACCT 3240

  6894196 CTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAACAGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCT 6894255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAACAGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCT 3300

  6894256 GGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTCAAGCCCCACTCCCAGCCCTGTG 6894315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3301 GGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTCAAGCCCCACTCTCAGCCCTGTG 3360

  6894316 GGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAGTGCCTGGCTCGAAATTAATC 6894375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAGTGCCTGGCTCGAAATTAATC 3420

  6894376 CTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCTCTGCAAGCCACCCTTTTCTC 6894435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCTCTGCAAGCCACCCTTTTCTC 3480

  6894436 CTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGCCTGGCACACATGGGTGCTCC 6894495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGCCTGGCACACATGGGTGCTCC 3540

  6894496 ACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGCTGCTCAAGCCATACCAGAAG 6894555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGCTGCTCAAGCCATACCAGAAG 3600

  6894556 TATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGGTTTGGCTGGGATGGGTATGG 6894615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGGTTTGGCTGGGATGGGTATGG 3660

  6894616 CGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCACCTTGAATGCTTCCTGGCGG 6894675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCACCTTGAATGCTTCCTGGCGG 3720

  6894676 CATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAACGTTGTAAGCAGGGGCACCA 6894735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAACGTTGTAAGCAGGGGCACCA 3780

  6894736 TTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGATTTCAGAATCTGCTGGTGCAT 6894795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGATTTCAGAATCTGCTGGTGCAT 3840

  6894796 TCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 6894837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 3882

EXCISED REGION

  6896048 AGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTG 6896107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 AGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTG 3942

  6896108 CACCACTGGACTCCAGT 6896124
          |||||||||||||||||
     3943 CACCACTGGACTCCAGT 3959

Alignment time is 3.03769 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   4710] =>      4710 nucs 'mol-32-1f0b-076431_4710'

Score:        4633
Aligned:      4705        nucs
Identic:      4696 (100%) nucs =>      1218 (100%)      3478 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6892405,6893626] EXCISED REGION [6893634,6897113]
 second seq =>  [      1,   1222] EXCISED REGION [   1230,   4710]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [6893627,6893633]
 second seq =>         7 nucs [1223,1229]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6893627,6893627] to [6893633,6893633]
 second seq =>         1 nucs [1223,1223] to [1229,1229]

  6892405 TATCTTTATAGCAGTGTGAAATGGACTAATACAGGGTGTCTTCATGTTGGCATTAACCTG 6892464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATCTTTATAGCAGTGTGAAATGGACTAATACAGGGTGTCTTCATGTTGGCATTAACCTG 60

  6892465 CTAATTAGGAAGAAAAAGAAGTCTCTGGGTCTTGGTCTCCCCAACTGCAAAATTTGTGGA 6892524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAATTAGGAAGAAAAAGAAGTCTCTGGGTCTTGGTCTCCCCAACTGCAAAATTTGTGGA 120

  6892525 TGGGCCACTGCCATTTCAGAGAGGCCTCCCTCAGCAAGGACAGAGTGAAAGTTTGTGGGG 6892584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGGCCACTGCCATTTCAGAGAGGCCTCCCTCAGCAAGGACAGAGTGAAAGTTTGTGGGG 180

  6892585 TGGTTTCTGGGCTGGGGCACTGGGCCTGTCAACTGGTGGCATCCAGCGTTTATGGAACAA 6892644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGTTTCTGGGCTGGGGCACTGGGCCTGTCAACTGGTGGCATCCAGCGTTTATGGAACAA 240

  6892645 ATGATGCTGGTACCCAGGGATGCCCTGGGACTCCTCCCACCTGGGGTGAAAGTCATTCAA 6892704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGATGCTGGTACCCAGGGATGCCCTGGGACTCCTCCCACCTGGGGTGAAAGTCATTCAA 300

  6892705 ACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAGTGCCACCCTGTATTAGGCCATTCTCAC 6892764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAGTGCCACCCTGTATTAGGCCATTCTCAC 360

  6892765 ACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAAAGGCTTAACTGG 6892824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      361 ACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAAAGGCTTAATTGG 420

  6892825 CTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGCATCTGCTCGGCTTTTGGGGA 6892884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGCATCTGCTCGGCTTTTGGGGA 480

  6892885 GGCC--TCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGGAAGCAGGCATGTCTTTTT 6892942
          ||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GG--AGTCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGGAAGCAGGCATGTCTTTTT 538

  6892943 TTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCATGATCTCAGCT 6893002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 TTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCATGATCTCAGCT 598

  6893003 CACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCC 6893062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 CACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCC 658

  6893063 GGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG 6893122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 GGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGG 718

  6893123 TTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGACCCGCCTGCCTCG 6893182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 TTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGACCCGCCTGCCTCG 778

  6893183 GCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATG 6893242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATG 838

  6893243 TCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTTTTCAACA 6893302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 TCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTTTTCAACA 898

  6893303 ACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCT 6893362
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 ACCGGATGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCT 958

  6893363 CCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAATTCAACA 6893422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 CCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAATTCAACA 1018

  6893423 AGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTA 6893482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 AGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTA 1078

  6893483 AGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTA 6893542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 AGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTA 1138

  6893543 TTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACA 6893602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACA 1198

  6893603 TACAGGGTTTGGAAACTTTTATTC 6893626
          ||||||||||||||||||||||||
     1199 TACAGGGTTTGGAAACTTTTATTC 1222

EXCISED REGION

  6893634 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 6893693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 1289

  6893694 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 6893753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 1349

  6893754 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 6893813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 1409

  6893814 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 6893873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 1469

  6893874 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 6893933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 1529

  6893934 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 6893993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 1589

  6893994 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 6894053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 1649

  6894054 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 6894113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 1709

  6894114 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 6894173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 1769

  6894174 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 6894233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 1829

  6894234 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 6894293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 1889

  6894294 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 6894353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 1949

  6894354 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 6894413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 2009

  6894414 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 6894473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 2069

  6894474 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 6894533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 2129

  6894534 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 6894593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 2189

  6894594 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 6894653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 2249

  6894654 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 6894713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 2309

  6894714 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 6894773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 2369

  6894774 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 6894833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 2429

  6894834 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 6894893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 2489

  6894894 TGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATG 6894953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 TGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATG 2549

  6894954 CCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCA 6895013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 CCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCA 2609

  6895014 AGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTG 6895073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 AGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTG 2669

  6895074 TCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGA 6895133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 TCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGA 2729

  6895134 ACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAG 6895193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 ACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAG 2789

  6895194 CTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGT 6895253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 CTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGT 2849

  6895254 ACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGAT 6895313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 ACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGAT 2909

  6895314 GGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGG 6895373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 GGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGG 2969

  6895374 AGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCAT 6895433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 AGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCAT 3029

  6895434 GGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACA 6895493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 GGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACA 3089

  6895494 CTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGT 6895553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 CTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGT 3149

  6895554 GGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTA 6895613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 GGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTA 3209

  6895614 GCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACAC 6895673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3210 GCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACAC 3269

  6895674 TTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGA 6895733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3270 TTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGA 3329

  6895734 ACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATAT 6895793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3330 ACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATAT 3389

  6895794 GGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCAT 6895853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3390 GGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCAT 3449

  6895854 TATACTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTTGACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAA 6895913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3450 TATACTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTTGACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAA 3509

  6895914 ATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTC 6895973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3510 ATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTC 3569

  6895974 GAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGA 6896033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3570 GAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGA 3629

  6896034 CATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCA 6896093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3630 CATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCA 3689

  6896094 GTGAGCTATGATTGCACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAA 6896153
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3690 GTGAGCTATGATTGCACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTCAA 3749

  6896154 AAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCA 6896213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 AAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCA 3809

  6896214 ATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTT 6896273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3810 ATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTT 3869

  6896274 GGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGG 6896333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3870 GGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGG 3929

  6896334 GACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAA 6896393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3930 GACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAA 3989

  6896394 TCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACC 6896453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3990 TCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACC 4049

  6896454 GGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAA 6896513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4050 GGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAA 4109

  6896514 ACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGC 6896573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4110 ACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGC 4169

  6896574 TGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCC 6896633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4170 TGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCC 4229

  6896634 CCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGC 6896693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4230 CCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGC 4289

  6896694 CACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTT 6896753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4290 CACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTT 4349

  6896754 ATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCATCCATTTCTGA 6896813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4350 ATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCGTCCATTTCTGA 4409

  6896814 TTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGG 6896873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4410 TTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGG 4469

  6896874 TGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTA 6896933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4470 TGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTA 4529

  6896934 AGGTCAGGAGTACGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATA 6896993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4530 AGGTCAGGAGTACGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATA 4589

  6896994 CAAAAATTAGCTTGGCGTGGCGTACGCCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGG 6897053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4590 CAAAAATTAGCTTGGCGTGGCGTACGCCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGG 4649

  6897054 CG-AATCACTTGCACCTAGAAGGCAGAGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACT 6897112
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4650 CGAAATCACTTGCACCTAGAAGGCAGAGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACT 4709

  6897113 C 6897113
          |
     4710 C 4710

Alignment time is 3.55834 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   4568] =>      4568 nucs 'mol-32-1f16-008064_4568'

Score:        4458
Aligned:      4568        nucs
Identic:      4558 (100%) nucs =>      4221 (100%)       337 ( 99%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6893124,6897349] EXCISED REGION [6900399,6900738]
 second seq =>  [      1,   4227] EXCISED REGION [   4228,   4568]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3049 nucs [6897350,6900398]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        21 nucs [6897350,6897370] to [6900399,6900419]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6893124 TTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGACCCGCCTGCCTCGG 6893183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGACCCGCCTGCCTCGG 60

  6893184 CCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGT 6893243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGT 120

  6893244 CTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTTTTCAACAA 6893303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTTTTCAACAA 180

  6893304 CCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCTC 6893363
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCGGATGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCTC 240

  6893364 CATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAATTCAACAA 6893423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAATTCAACAA 300

  6893424 GAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAA 6893483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAA 360

  6893484 GGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTAT 6893543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTAT 420

  6893544 TTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACAT 6893603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACAT 480

  6893604 ACAGGGTTTGGAAACTTTTATTCAATAACATATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCC 6893663
          |||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAGGGTTTGGAAACTTTTATTCGATAACGTATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCC 540

  6893664 TAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTTTTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTA 6893723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTTTTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTA 600

  6893724 GTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTCCTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGA 6893783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTCCTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGA 660

  6893784 GGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTCTTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATT 6893843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTCTTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATT 720

  6893844 TGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAAGATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCC 6893903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAAGATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCC 780

  6893904 CAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGAAGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTG 6893963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGAAGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTG 840

  6893964 ACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGAGGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAG 6894023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGAGGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAG 900

  6894024 GGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACGCGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTC 6894083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACGCGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTC 960

  6894084 CGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGCCACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCA 6894143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGCCACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCA 1020

  6894144 GCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGATCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGA 6894203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGATCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGA 1080

  6894204 CACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAACAGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACA 6894263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAACAGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACA 1140

  6894264 GAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTCAAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGG 6894323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTCAAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGG 1200

  6894324 GAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCC 6894383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCC 1260

  6894384 CACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAA 6894443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAA 1320

  6894444 AACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGC 6894503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGC 1380

  6894504 CAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCT 6894563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCT 1440

  6894564 ATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGG 6894623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGG 1500

  6894624 GAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGA 6894683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGA 1560

  6894684 TTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTC 6894743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTC 1620

  6894744 CTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTA 6894803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTA 1680

  6894804 CCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAG 6894863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAG 1740

  6894864 CCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACATGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACA 6894923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACATGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACA 1800

  6894924 AAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAG 6894983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAG 1860

  6894984 GTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCA 6895043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCA 1920

  6895044 CCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTGTCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAA 6895103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTGTCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAA 1980

  6895104 TCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGAACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGC 6895163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGAACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGC 2040

  6895164 ATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAGCTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTC 6895223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAGCTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTC 2100

  6895224 TTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGTACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGA 6895283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGTACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGA 2160

  6895284 CTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGATGGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTG 6895343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGATGGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTG 2220

  6895344 CCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGGAGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCA 6895403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGGAGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCA 2280

  6895404 GCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCATGGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACG 6895463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCATGGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACG 2340

  6895464 AGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACACTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTG 6895523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACACTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTG 2400

  6895524 CAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGTGGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTA 6895583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGTGGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTA 2460

  6895584 AAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTAGCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTA 6895643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTAGCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTA 2520

  6895644 TTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACACTTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATG 6895703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACACTTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATG 2580

  6895704 TACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGAACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGA 6895763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGAACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGA 2640

  6895764 ATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATATGGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGA 6895823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATATGGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGA 2700

  6895824 TCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCATTATACTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTT 6895883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCATTATACTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTT 2760

  6895884 GACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAAATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAA 6895943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAAATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAA 2820

  6895944 GGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTC 6896003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTC 2880

  6896004 CTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGACATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAG 6896063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGACATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAG 2940

  6896064 ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCACTGGACTCCAG 6896123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCACTGGACTCCAG 3000

  6896124 TCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGT 6896183
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGT 3060

  6896184 TAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAG 6896243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAG 3120

  6896244 AATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGT 6896303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGT 3180

  6896304 GGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACC 6896363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACC 3240

  6896364 CCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAA 6896423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAA 3300

  6896424 GGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAAT 6896483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAAT 3360

  6896484 AAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGC 6896543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGC 3420

  6896544 CGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCA 6896603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCA 3480

  6896604 CCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCCCCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGG 6896663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCCCCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGG 3540

  6896664 CTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGCCACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCT 6896723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGCCACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCT 3600

  6896724 GTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTTATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATT 6896783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTTATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATT 3660

  6896784 TGAAAATAAATGCCCGCCATCCATTTCTGATTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAG 6896843
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TGAAAATAAATGCCCGCCGTCCATTTCTGATTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAG 3720

  6896844 ATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCACCAC 6896903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCACCAC 3780

  6896904 TTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTAAGGTCAGGAGTACGAGACCAGCCTGGCCAA 6896963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTAAGGTCAGGAGTACGAGACCAGCCTGGCCAA 3840

  6896964 CATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCTTGGCGTGGCGTACGCCTG 6897023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCTTGGCGTGGCGTACGCCTG 3900

  6897024 TAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGGCGAA-TCACTTGCACCTAGAAGGCAGAGGT 6897082
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     3901 TAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGGCGAAATCACTTGCACCTAGAAGGCAGAGGT 3960

  6897083 TGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTTAA 6897142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTTAA 4020

  6897143 AAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGGAAAAAGAAAAGAAAGGCCAGGCGCAGTGGCAC 6897202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGGAAAAAGAAAAGAAAGGCCAGGCGCAGTGGCAC 4080

  6897203 ATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAGCCAAGACTGGCAGATCATCTGAGGTCAGGAGT 6897262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAGCCAAGACTGGCAGATCATCTGAGGTCAGGAGT 4140

  6897263 TTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAATAAAATTA 6897322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAATAAAATTA 4200

  6897323 GCTGGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAA 6897349
          |||||||||||||||||||||||||||
     4201 GCTGGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAA 4227

EXCISED REGION

  6900399 TCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGC 6900458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     4228 TCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGC 4287

  6900459 AGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCGGCCTGGGCAACAGAAAGAGACTCTGTCTCC 6900518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 AGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCGGCCTGGGCAACAGAAAGAGACTCTGTCTCC 4347

  6900519 -AAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAATTAGTAAAAAATAAAATCTCTCACCTAAAGGATGC 6900577
           |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 AAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAATTAATAAAAAATAAAATCTCTCACCTAAAGGATGC 4407

  6900578 TTCACATCATGAGGCAGGGCTGACACTTGGCCACACCTTTACTGGACATTCCAGCTGTTT 6900637
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 TTCACATCACGAGGCAGGGCTGACACTTGGCCACACCTTTACTGGACATTCCAGCTGTTT 4467

  6900638 CCCACTGAAACTCAATAACCACAATCATTTATGCATAAACAAATGCTTTGCAAACCGTCT 6900697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 CCCACTGAAACTCAATAACCACAATCATTTATGCATAAACAAATGCTTTGCAAACCGTCT 4527

  6900698 CAGCCAGATGAGGCGGCTTCCTGGAAGAAACAGGCACATTC 6900738
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 CAGCCAGATGAGGCGGCTTCCTGGAAGAAACAGGCACATTC 4568

Alignment time is 3.49914 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   3121] =>      3121 nucs 'mol-32-2110-063682_3121'

Score:        3066
Aligned:      3116        nucs
Identic:      3109 (100%) nucs =>      1657 (100%)      1452 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6891965,6893626] EXCISED REGION [6893634,6895085]
 second seq =>  [      1,   1662] EXCISED REGION [   1670,   3121]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [6893627,6893633]
 second seq =>         7 nucs [1663,1669]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6893627,6893627] to [6893633,6893633]
 second seq =>         1 nucs [1663,1663] to [1669,1669]

  6891965 TCGTTTTCCTACTGACCTGTGCCCTGACCTTCCAGAGTCAACACAGTGGGAATGGAGACA 6892024
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCGTTTTCCTACTGACCTGTGCCCTGACCTTTCAGAGTCAACACAGTGGGAATGGAGACA 60

  6892025 GCTTGGGGTTGTTTGTGATATGGTTTGACTCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATGTTGAAT 6892084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTTGGGGTTGTTTGTGATATGGTTTGACTCTGTGTCCCCACCCAAATCTCATGTTGAAT 120

  6892085 TGTGATCCCCAGCGTTGGATGTGGGGCCGGTGGGAGGTGATTGGGCCTTGGGGGTGGTCT 6892144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTGATCCCCAGCGTTGGATGTGGGGCCGGTGGGAGGTGATTGGGCCTTGGGGGTGGTCT 180

  6892145 CTAATGGTTTAGCACCATCCAGCACCCTAGTGCTGTTTTGTGATAGAGTTCTCAGGAGAT 6892204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAATGGTTTAGCACCATCCAGCACCCTAGTGCTGTTTTGTGATAGAGTTCTCAGGAGAT 240

  6892205 CTGGTTGTTTGAAAGTGTGTAGCACCTCCCCCTTCACTGTCTCTCCTGCTGGCCATGTGA 6892264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGGTTGTTTGAAAGTGTGTAGCACCTCCCCCTTCACTGTCTCTCCTGCTGGCCATGTGA 300

  6892265 AGATGTACCTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATGACTGTAAGTTTCCTGAGGCCTTCCCA 6892324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGATGTACCTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATGACTGTAAGTTTCCTGAGGCCTTCCCA 360

  6892325 GCCATGCTTCCCGTACAGCCTGCAGAACTGTGAGTCAATTAAGCCTCTTTTTTTTTTCAT 6892384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCATGCTTCCCGTACAGCCTGCAGAACTGTGAGTCAATTAAGCCTCTTTTTTTTTTCAT 420

  6892385 AAATTACCCAGTCTCAGTTATATCTTTATAGCAGTGTGAAATGGACTAATACAGGGTGTC 6892444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAATTACCCAGTCTCAGTTATATCTTTATAGCAGTGTGAAATGGACTAATACAGGGTGTC 480

  6892445 TTCATGTTGGCATTAACCTGCTAATTAGGAAGAAAAAGAAGTCTCTGGGTCTTGGTCTCC 6892504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCATGTTGGCATTAACCTGCTAATTAGGAAGAAAAAGAAGTCTCTGGGTCTTGGTCTCC 540

  6892505 CCAACTGCAAAATTTGTGGATGGGCCACTGCCATTTCAGAGAGGCCTCCCTCAGCAAGGA 6892564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCAACTGCAAAATTTGTGGATGGGCCACTGCCATTTCAGAGAGGCCTCCCTCAGCAAGGA 600

  6892565 CAGAGTGAAAGTTTGTGGGGTGGTTTCTGGGCTGGGGCACTGGGCCTGTCAACTGGTGGC 6892624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGAGTGAAAGTTTGTGGGGTGGTTTCTGGGCTGGGGCACTGGGCCTGTCAACTGGTGGC 660

  6892625 ATCCAGCGTTTATGGAACAAATGATGCTGGTACCCAGGGATGCCCTGGGACTCCTCCCAC 6892684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCCAGCGTTTATGGAACAAATGATGCTGGTACCCAGGGATGCCCTGGGACTCCTCCCAC 720

  6892685 CTGGGGTGAAAGTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAGTGCCACC 6892744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGGGGTGAAAGTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAGTGCCACC 780

  6892745 CTGTATTAGGCCATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAA 6892804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGTATTAGGCCATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAA 840

  6892805 AGAAAAAAAGGCTTAACTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGC 6892864
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAAAAAAAGGCTTAATTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGC 900

  6892865 ATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGGCC--TCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGG 6892922
          ||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGG--AGTCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGG 958

  6892923 GGAAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGT 6892982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 GGAAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGT 1018

  6892983 ACAGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTG 6893042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 ACAGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTG 1078

  6893043 CCTCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTG 6893102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 CCTCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTG 1138

  6893103 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCT 6893162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCT 1198

  6893163 CAGGTGACCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTG 6893222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 CAGGTGACCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTG 1258

  6893223 CCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGAT 6893282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 CCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGAT 1318

  6893283 GTGCCACACACTTTTCAACAACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACC 6893342
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 GTGCCACACACTTTTCAACAACCGGATGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACC 1378

  6893343 AAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGA 6893402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 AAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGA 1438

  6893403 TTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATA 6893462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATA 1498

  6893463 GTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTC 6893522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 GTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTC 1558

  6893523 CATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGG 6893582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 CATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGG 1618

  6893583 TTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTC 6893626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTC 1662

EXCISED REGION

  6893634 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 6893693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 1729

  6893694 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 6893753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 1789

  6893754 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 6893813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 1849

  6893814 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 6893873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 1909

  6893874 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 6893933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 1969

  6893934 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 6893993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 2029

  6893994 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 6894053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 2089

  6894054 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 6894113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 2149

  6894114 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 6894173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 2209

  6894174 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 6894233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 2269

  6894234 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 6894293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 2329

  6894294 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 6894353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 2389

  6894354 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 6894413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 2449

  6894414 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 6894473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2450 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 2509

  6894474 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 6894533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2510 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 2569

  6894534 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 6894593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2570 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 2629

  6894594 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 6894653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2630 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 2689

  6894654 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 6894713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2690 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 2749

  6894714 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 6894773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2750 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 2809

  6894774 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 6894833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2810 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 2869

  6894834 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 6894893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2870 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 2929

  6894894 TGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATG 6894953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2930 TGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATG 2989

  6894954 CCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCA 6895013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2990 CCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCA 3049

  6895014 AGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTG 6895073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3050 AGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTG 3109

  6895074 TCTCTAAATAAA 6895085
          ||||||||||||
     3110 TCTCTAAATAAA 3121

Alignment time is 2.38086 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   4339] =>      4339 nucs 'mol-32-2110-080770_4339'

Score:        4240
Aligned:      4339        nucs
Identic:      4330 (100%) nucs =>      2147 (100%)      2183 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6892685,6894837] EXCISED REGION [6896048,6898233]
 second seq =>  [      1,   2153] EXCISED REGION [   2154,   4339]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1210 nucs [6894838,6896047]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        29 nucs [6894838,6894866] to [6896048,6896076]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6894838,6894838] to [6896047,6896047]
 second seq =>         0 nucs

  6892685 CTGGGGTGAAAGTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAGTGCCACC 6892744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGGGTGAAAGTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAGTGCCACC 60

  6892745 CTGTATTAGGCCATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAA 6892804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGTATTAGGCCATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAA 120

  6892805 AGAAAAAAAGGCTTAACTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGC 6892864
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAAAAAAGGCTTAATTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGC 180

  6892865 ATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGGCCTCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGG 6892924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGGCCTCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGG 240

  6892925 AAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTAC 6892984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTAC 300

  6892985 AGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCC 6893044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCC 360

  6893045 TCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTA 6893104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTA 420

  6893105 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCA 6893164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCA 480

  6893165 GGTGACCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCC 6893224
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTGACCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCC 540

  6893225 CAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGT 6893284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGT 600

  6893285 GCCACACACTTTTCAACAACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAA 6893344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCACACACTTTTCAACAACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAA 660

  6893345 GCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATT 6893404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATT 720

  6893405 GGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGT 6893464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGT 780

  6893465 CCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCA 6893524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCA 840

  6893525 TGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTT 6893584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTT 900

  6893585 AGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTCAATAACATATATCAAGGA 6893644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
      901 AGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTCGATAACGTATATCAAGGA 960

  6893645 CCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTTTTCTGAATCAG 6893704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      961 CCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAGTACATTTTATTTTTCTGAATCAG 1020

  6893705 TCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTCCTCTTTAACCT 6893764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTCCTCTTTAACCT 1080

  6893765 CTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTCTTTCTCCACTT 6893824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTCTTTCTCCACTT 1140

  6893825 TTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAAGATGTGTCATT 6893884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAAGATGTGTCATT 1200

  6893885 ATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGAAGTCAGCAGGC 6893944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGAAGTCAGCAGGC 1260

  6893945 CGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGAGGGAGGCACAG 6894004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGAGGGAGGCACAG 1320

  6894005 TCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACGCGTTTCATCTG 6894064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACGCGTTTCATCTG 1380

  6894065 GAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGCCACTGACAGTG 6894124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGCCACTGACAGTG 1440

  6894125 TGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGATCAAAGAAAGC 6894184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGATCAAAGAAAGC 1500

  6894185 AGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAACAGGGCGTGGCG 6894244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAACAGGGCGTGGCG 1560

  6894245 GGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTCAAGCCCCACTC 6894304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTCAAGCCCCACTC 1620

  6894305 CCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAGTGCCTGGCT 6894364
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAGTGCCTGGCT 1680

  6894365 CGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCTCTGCAAGCC 6894424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCTCTGCAAGCC 1740

  6894425 ACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGCCTGGCACAC 6894484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGCCTGGCACAC 1800

  6894485 ATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGCTGCTCAAGC 6894544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGCTGCTCAAGC 1860

  6894545 CATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGGTTTGGCTGG 6894604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGGTTTGGCTGG 1920

  6894605 GATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCACCTTGAATG 6894664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCACCTTGAATG 1980

  6894665 CTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAACGTTGTAAG 6894724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAACGTTGTAAG 2040

  6894725 CAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGATTTCAGAATC 6894784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGATTTCAGAATC 2100

  6894785 TGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 6894837
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 2153

EXCISED REGION

  6896048 AGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTG 6896107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2154 AGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTG 2213

  6896108 CACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAAAAAAAAAAAGAAAA 6896167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2214 CACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAAAAAAAAAAAGAAAA 2273

  6896168 AAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTC 6896227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2274 AAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTC 2333

  6896228 TAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCA 6896287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2334 TAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCA 2393

  6896288 CCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTAC 6896347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2394 CCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTAC 2453

  6896348 CCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGG 6896407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2454 CCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGG 2513

  6896408 GGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCC 6896467
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2514 GGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCGCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCC 2573

  6896468 ATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCACG 6896527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2574 ATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCACG 2633

  6896528 CCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGGCAGGTGTGGT 6896587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2634 CCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGGCAGGTGTGGT 2693

  6896588 AGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCCCCTGAGCTCCTGCG 6896647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 AGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCCCCTGAGCTCCTGCG 2753

  6896648 GAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGCCACCAGAGTCTCAC 6896707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 GAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGCCACCAGAGTCTCAC 2813

  6896708 TTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTTATGGATGACTTCCT 6896767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 TTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTTATGGATGACTTCCT 2873

  6896768 CCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCATCCATTTCTGATTGAGCCCCAACCT 6896827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2874 CCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCGTCCATTTCTGATTGAGCCCCAACCT 2933

  6896828 CAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACG 6896887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 CAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACG 2993

  6896888 CCTGTAATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTAAGGTCAGGAGTACG 6896947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 CCTGTAATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTAAGGTCAGGAGTACG 3053

  6896948 AGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCTTG 6897007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 AGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCTTG 3113

  6897008 GCGTGGCGTACGCCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGGCGAATCACTTGCAC 6897067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 GCGTGGCGTACGCCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGGCGAATCACTTGCAC 3173

  6897068 CTAGAAGGCAGAGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 6897127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 CTAGAAGGCAGAGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 3233

  6897128 GAGCAAGACTCTTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGGAAAAAGAAAAGAAAGGC 6897187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 GAGCAAGACTCTTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGGAAAAAGAAAAGAAAGGC 3293

  6897188 CAGGCGCAGTGGCACATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAGCCAAGACTGGCAGATCA 6897247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 CAGGCGCAGTGGCACATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAGCCAAGACTGGCAGATCA 3353

  6897248 TCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAA 6897307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 TCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAA 3413

  6897308 AATACAATAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGG 6897367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 AATACAATAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGG 3473

  6897368 CTGTGGCAGGAGAATCGTTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAACCAAGACCGCGA 6897427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3474 CTGTGGCAGGAGAATCGTTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAACCAAGACCGCGA 3533

  6897428 CATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAATCATG 6897487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3534 CATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAATCATG 3593

  6897488 AGGTTTCCCTTGAAGGCTTTTCCTTGCTGTGGTATTCAAGAACATTCCAGGAGGCAGACA 6897547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3594 AGGTTTCCCTTGAAGGCTTTTCCTTGCTGTGGTATTCAAGAACATTCCAGGAGGCAGACA 3653

  6897548 CTCTCCTTCCTCTAAAGATGCCTCATTGAGAAGCTAGACAGTTACTTGCTTGGTACAGCG 6897607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3654 CTCTCCTTCCTCTAAAGATGCCTCATTGAGAAGCTAGACAGTTACTTGCTTGGTACAGCG 3713

  6897608 GACAACCCTGCTGCAGGCTGAGCCCCCACTGCTGCCACTCACAGGAGCTCTGGGCATTTG 6897667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3714 GACAACCCTGCTGCAGGCTGAGCCCCCACTGCTGCCACTCACAGGAGCTCTGGGCATTTG 3773

  6897668 GAAACTGGAATTCCCGAGTTTTCAAGGCGCTCAGCCGTTCTCTGCCCTGCAGTCAGGATG 6897727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3774 GAAACTGGAATTCCCGAGTTTTCAAGGCGCTCAGCCGTTCTCTGCCCTGCAGTCAGGATG 3833

  6897728 ATCTTTGCAAAATGCAAATCTGATCTCATCCCCTCACATCTACCTCCATCTCAGCTCCAA 6897787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3834 ATCTTTGCAAAATGCAAATCTGATCTCATCCCCTCACATCTACCTCCATCTCAGCTCCAA 3893

  6897788 GCAGATAGCTCCTCCTTTATTGCTCCCTGCTGCTATGGCCTAAATGTCTAATCCACTCCC 6897847
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3894 GCAGATAGCTCCTCCTTTATTGCTCCCTGCTGCTATGGCCTAAATGTCTAATCCACTCCA 3953

  6897848 CGCCGCCGCCACCAAATTTATATGTTGAAATCCTAACCCTCACTGTGCTAGTGTTAGGAG 6897907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 CGCCGCCGCCACCAAATTTATATGTTGAAATCCTAACCCTCACTGTGCTAGTGTTAGGAG 4013

  6897908 GTTGGGCTTTGGGGTGGTGATGAGGTCATGAGGGTGGAGCCCTCATAGACGGGATTAGTG 6897967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 GTTGGGCTTTGGGGTGGTGATGAGGTCATGAGGGTGGAGCCCTCATAGACGGGATTAGTG 4073

  6897968 TCCTTATAAAAGAGACTCCAGATGGGCCCCTCACCCTGTCCACCGTGTGAGGACACAATT 6898027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 TCCTTATAAAAGAGACTCCAGATGGGCCCCTCACCCTGTCCACCGTGTGAGGACACAATT 4133

  6898028 GAGAAGGCACCATCTAGGAACCAGGAAGTGAGTCCTCACCAGACACCCAATCTGCTGCTA 6898087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 GAGAAGGCACCATCTAGGAACCAGGAAGTGAGTCCTCACCAGACACCCAATCTGCTGCTA 4193

  6898088 CTTTGATCTTGGACTTCCAGGCTCCAGAACAGTGAGAAATAAATTGTGGTTGTTGATAAG 6898147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 CTTTGATCTTGGACTTCCAGGCTCCAGAACAGTGAGAAATAAATTGTGGTTGTTGATAAG 4253

  6898148 CTCTCCAGTGCACAGTATTGTGTCATGGTAGCCCGCATGGACTAGGACACACCAGCACCA 6898207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 CTCTCCAGTGCACAGTATTGTGTCATGGTAGCCCGCATGGACTAGGACACACCAGCACCA 4313

  6898208 CAGGGCACCCTGTTTTTGCTGCCAAG 6898233
          ||||||||||||||||||||||||||
     4314 CAGGGCACCCTGTTTTTGCTGCCAAG 4339

Alignment time is 3.30378 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   2182] =>      2182 nucs 'mol-32-2110-080770_2182'

Score:        2131
Aligned:      2175        nucs
Identic:      2171 (100%) nucs =>       940 (100%)      1231 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6892685,6893626] EXCISED REGION [6893634,6894866]
 second seq =>  [      1,    942] EXCISED REGION [    950,   2182]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [6893627,6893633]
 second seq =>         7 nucs [943,949]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6893627,6893627] to [6893633,6893633]
 second seq =>         1 nucs [943,943] to [949,949]

  6892685 CTGGGGTGAAAGTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAGTGCCACC 6892744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGGGGTGAAAGTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAGTGCCACC 60

  6892745 CTGTATTAGGCCATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAA 6892804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGTATTAGGCCATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAA 120

  6892805 AGAAAAAAAGGCTTAACTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGC 6892864
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAAAAAAAGGCTTAATTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGC 180

  6892865 ATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGGCCTCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGG 6892924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGGCCTCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGG 240

  6892925 AAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTAC 6892984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTAC 300

  6892985 AGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCC 6893044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCC 360

  6893045 TCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTA 6893104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTA 420

  6893105 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCA 6893164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCA 480

  6893165 GGTGACCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCC 6893224
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTGACCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCC 540

  6893225 CAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGT 6893284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGT 600

  6893285 GCCACACACTTTTCAACAACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAA 6893344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCACACACTTTTCAACAACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAA 660

  6893345 GCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATT 6893404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATT 720

  6893405 GGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGT 6893464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGT 780

  6893465 CCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCA 6893524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCA 840

  6893525 TGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTT 6893584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTT 900

  6893585 AGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTC 6893626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTC 942

EXCISED REGION

  6893634 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 6893693
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      950 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAGTACATTTTATTT 1009

  6893694 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 6893753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 1069

  6893754 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 6893813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 1129

  6893814 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 6893873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 1189

  6893874 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 6893933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 1249

  6893934 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 6893993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 1309

  6893994 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 6894053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 1369

  6894054 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 6894113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 1429

  6894114 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 6894173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 1489

  6894174 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 6894233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 1549

  6894234 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 6894293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 1609

  6894294 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 6894353
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 AAGCCCCACTCTCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 1669

  6894354 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 6894413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 1729

  6894414 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 6894473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 1789

  6894474 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 6894533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 1849

  6894534 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 6894593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 1909

  6894594 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 6894653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 1969

  6894654 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 6894713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 2029

  6894714 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 6894773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 2089

  6894774 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 6894833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 2149

  6894834 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCC 6894866
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCC 2182

Alignment time is 1.93189 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   4193] =>      4193 nucs 'mol-32-2291-087306_4193'

Score:        4127
Aligned:      4188        nucs
Identic:      4180 (100%) nucs =>       841 ( 99%)      3339 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6892782,6893626] EXCISED REGION [6893634,6896974]
 second seq =>  [      1,    845] EXCISED REGION [    853,   4193]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [6893627,6893633]
 second seq =>         7 nucs [846,852]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6893627,6893627] to [6893633,6893633]
 second seq =>         1 nucs [846,846] to [852,852]

  6892782 ACCTGAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAAAGGCTTAACTGGCTCATAGTTCCACAGGC 6892841
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
        1 ACCTGAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAAAGGCTTAATTGGCTCATAGTTCCACAGGC 60

  6892842 TCTACAGGAAGCATGATGCCGGCATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGGCC--TCAGGAAGCTT 6892899
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||
       61 TCTACAGGAAGCATGATGCCGGCATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGG--AGTCAGGAAGCTT 118

  6892900 CCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGGAAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTC 6892959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      119 CCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGGAAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTC 178

  6892960 GCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCT 6893019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 GCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCT 238

  6893020 CCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTG 6893079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 CCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTG 298

  6893080 CCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCA 6893139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 CCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCA 358

  6893140 GGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGACCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAG 6893199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 GGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGACCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAG 418

  6893200 GATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGC 6893259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      419 GATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGC 478

  6893260 AGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTTTTCAACAACCGGCTGGCACTAGAA 6893319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      479 AGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTTTTCAACAACCGGATGGCACTAGAA 538

  6893320 CTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCT 6893379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 CTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCT 598

  6893380 CCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAA 6893439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 CCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAA 658

  6893440 CAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTT 6893499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 CAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTT 718

  6893500 GTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTA 6893559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 GTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTA 778

  6893560 GTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACT 6893619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACT 838

  6893620 TTTATTC 6893626
          |||||||
      839 TTTATTC 845

EXCISED REGION

  6893634 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 6893693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      853 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 912

  6893694 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 6893753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      913 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 972

  6893754 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 6893813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      973 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 1032

  6893814 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 6893873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1033 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 1092

  6893874 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 6893933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 1152

  6893934 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 6893993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 1212

  6893994 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 6894053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 1272

  6894054 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 6894113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 1332

  6894114 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 6894173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 1392

  6894174 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 6894233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 1452

  6894234 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 6894293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1453 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 1512

  6894294 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 6894353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 1572

  6894354 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 6894413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 1632

  6894414 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 6894473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 1692

  6894474 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 6894533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 1752

  6894534 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 6894593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 1812

  6894594 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 6894653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 1872

  6894654 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 6894713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 1932

  6894714 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 6894773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 1992

  6894774 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 6894833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 2052

  6894834 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 6894893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 2112

  6894894 TGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATG 6894953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 TGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATG 2172

  6894954 CCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCA 6895013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 CCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCA 2232

  6895014 AGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTG 6895073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 AGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTG 2292

  6895074 TCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGA 6895133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 TCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGA 2352

  6895134 ACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAG 6895193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 ACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAG 2412

  6895194 CTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGT 6895253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 CTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGT 2472

  6895254 ACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGAT 6895313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 ACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGAT 2532

  6895314 GGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGG 6895373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 GGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGG 2592

  6895374 AGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCAT 6895433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 AGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCAT 2652

  6895434 GGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACA 6895493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 GGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACA 2712

  6895494 CTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGT 6895553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 CTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGT 2772

  6895554 GGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTA 6895613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 GGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTA 2832

  6895614 GCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACAC 6895673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 GCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACAC 2892

  6895674 TTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGA 6895733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 TTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGA 2952

  6895734 ACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATAT 6895793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 ACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATAT 3012

  6895794 GGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCAT 6895853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 GGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCAT 3072

  6895854 TATACTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTTGACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAA 6895913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 TATACTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTTGACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAA 3132

  6895914 ATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTC 6895973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 ATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTC 3192

  6895974 GAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGA 6896033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 GAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGA 3252

  6896034 CATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCA 6896093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3253 CATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCA 3312

  6896094 GTGAGCTATGATTGCACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAA 6896153
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3313 GTGAGCTATGATTGCACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTCAA 3372

  6896154 AAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCA 6896213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 AAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCA 3432

  6896214 ATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTT 6896273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 ATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTT 3492

  6896274 GGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGG 6896333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 GGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGG 3552

  6896334 GACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAA 6896393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3553 GACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAA 3612

  6896394 TCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACC 6896453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 TCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACC 3672

  6896454 GGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAA 6896513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3673 GGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAA 3732

  6896514 ACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGC 6896573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3733 ACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGC 3792

  6896574 TGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCC 6896633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 TGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCC 3852

  6896634 CCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGC 6896693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 CCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGC 3912

  6896694 CACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTT 6896753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3913 CACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTT 3972

  6896754 ATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCATCCATTTCTGA 6896813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3973 ATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCGTCCATTTCTGA 4032

  6896814 TTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGG 6896873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4033 TTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGG 4092

  6896874 TGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTA 6896933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4093 TGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTA 4152

  6896934 AGGTCAGGAGTACGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAT 6896974
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4153 AGGTCAGGAGTACGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAT 4193

Alignment time is 3.24267 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   3691] =>      3691 nucs 'mol-32-29b3-028193_3691'

Score:        3651
Aligned:      3684        nucs
Identic:      3681 (100%) nucs =>       423 (100%)      3258 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6893203,6893626] EXCISED REGION [6893634,6896893]
 second seq =>  [      1,    424] EXCISED REGION [    432,   3691]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [6893627,6893633]
 second seq =>         7 nucs [425,431]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6893627,6893627] to [6893633,6893633]
 second seq =>         1 nucs [425,425] to [431,431]

  6893203 TACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGG 6893262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGG 60

  6893263 AGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTTTTCAACAACCGGCTGGCACTAGAACTC 6893322
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
       61 AGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTTTTCAACAACCGGATGGCACTAGAACTC 120

  6893323 ACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCC 6893382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCC 180

  6893383 ATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAA 6893442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAA 240

  6893443 AATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTT 6893502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTT 300

  6893503 GACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTC 6893562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTC 360

  6893563 ACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTT 6893622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTT 420

  6893623 ATTC 6893626
          ||||
      421 ATTC 424

EXCISED REGION

  6893634 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 6893693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      432 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 491

  6893694 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 6893753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      492 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 551

  6893754 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 6893813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      552 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 611

  6893814 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 6893873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      612 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 671

  6893874 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 6893933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      672 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 731

  6893934 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 6893993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 791

  6893994 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 6894053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 851

  6894054 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 6894113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 911

  6894114 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 6894173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 971

  6894174 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 6894233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 1031

  6894234 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 6894293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 1091

  6894294 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 6894353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 1151

  6894354 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 6894413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 1211

  6894414 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 6894473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 1271

  6894474 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 6894533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 1331

  6894534 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 6894593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 1391

  6894594 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 6894653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 1451

  6894654 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 6894713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 1511

  6894714 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 6894773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 1571

  6894774 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 6894833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 1631

  6894834 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 6894893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 1691

  6894894 TGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATG 6894953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 TGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATG 1751

  6894954 CCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCA 6895013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 CCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCA 1811

  6895014 AGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTG 6895073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 AGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTG 1871

  6895074 TCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGA 6895133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 TCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGA 1931

  6895134 ACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAG 6895193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 ACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAG 1991

  6895194 CTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGT 6895253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 CTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGT 2051

  6895254 ACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGAT 6895313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 ACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGAT 2111

  6895314 GGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGG 6895373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 GGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGG 2171

  6895374 AGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCAT 6895433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 AGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCAT 2231

  6895434 GGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACA 6895493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 GGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACA 2291

  6895494 CTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGT 6895553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 CTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGT 2351

  6895554 GGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTA 6895613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 GGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTA 2411

  6895614 GCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACAC 6895673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 GCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACAC 2471

  6895674 TTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGA 6895733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 TTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGA 2531

  6895734 ACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATAT 6895793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 ACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATAT 2591

  6895794 GGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCAT 6895853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 GGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCAT 2651

  6895854 TATACTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTTGACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAA 6895913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 TATACTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTTGACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAA 2711

  6895914 ATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTC 6895973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 ATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTC 2771

  6895974 GAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGA 6896033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 GAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGA 2831

  6896034 CATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCA 6896093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 CATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCA 2891

  6896094 GTGAGCTATGATTGCACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAA 6896153
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2892 GTGAGCTATGATTGCACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTCAA 2951

  6896154 AAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCA 6896213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 AAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCA 3011

  6896214 ATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTT 6896273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 ATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTT 3071

  6896274 GGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGG 6896333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 GGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGG 3131

  6896334 GACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAA 6896393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 GACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAA 3191

  6896394 TCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACC 6896453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 TCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACC 3251

  6896454 GGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAA 6896513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 GGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAA 3311

  6896514 ACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGC 6896573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 ACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGC 3371

  6896574 TGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCC 6896633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 TGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCC 3431

  6896634 CCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGC 6896693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 CCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGC 3491

  6896694 CACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTT 6896753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 CACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTT 3551

  6896754 ATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCATCCATTTCTGA 6896813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3552 ATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCGTCCATTTCTGA 3611

  6896814 TTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGG 6896873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 TTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGG 3671

  6896874 TGTGGTGGCTCACGCCTGTA 6896893
          ||||||||||||||||||||
     3672 TGTGGTGGCTCACGCCTGTA 3691

Alignment time is 2.82865 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   2516] =>      2516 nucs 'mol-32-2dff-123765_2516'

Score:        2472
Aligned:      2511        nucs
Identic:      2505 (100%) nucs =>      1228 (100%)      1277 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6892395,6893626] EXCISED REGION [6893634,6894910]
 second seq =>  [      1,   1232] EXCISED REGION [   1240,   2516]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [6893627,6893633]
 second seq =>         7 nucs [1233,1239]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6893627,6893627] to [6893633,6893633]
 second seq =>         1 nucs [1233,1233] to [1239,1239]

  6892395 GTCTCAGTTATATCTTTATAGCAGTGTGAAATGGACTAATACAGGGTGTCTTCATGTTGG 6892454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTCAGTTATATCTTTATAGCAGTGTGAAATGGACTAATACAGGGTGTCTTCATGTTGG 60

  6892455 CATTAACCTGCTAATTAGGAAGAAAAAGAAGTCTCTGGGTCTTGGTCTCCCCAACTGCAA 6892514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTAACCTGCTAATTAGGAAGAAAAAGAAGTCTCTGGGTCTTGGTCTCCCCAACTGCAA 120

  6892515 AATTTGTGGATGGGCCACTGCCATTTCAGAGAGGCCTCCCTCAGCAAGGACAGAGTGAAA 6892574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTTGTGGATGGGCCACTGCCATTTCAGAGAGGCCTCCCTCAGCAAGGACAGAGTGAAA 180

  6892575 GTTTGTGGGGTGGTTTCTGGGCTGGGGCACTGGGCCTGTCAACTGGTGGCATCCAGCGTT 6892634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTTGTGGGGTGGTTTCTGGGCTGGGGCACTGGGCCTGTCAACTGGTGGCATCCAGCGTT 240

  6892635 TATGGAACAAATGATGCTGGTACCCAGGGATGCCCTGGGACTCCTCCCACCTGGGGTGAA 6892694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATGGAACAAATGATGCTGGTACCCAGGGATGCCCTGGGACTCCTCCCACCTGGGGTGAA 300

  6892695 AGTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAGTGCCACCCTGTATTAGG 6892754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAGTGCCACCCTGTATTAGG 360

  6892755 CCATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAAAG 6892814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAAAGAAAAAAAG 420

  6892815 GCTTAACTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGCATCTGCTCGG 6892874
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTTAATTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGCATCTGCTCGG 480

  6892875 CTTTTGGGGAGGCC--TCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGGAAGCAGGC 6892932
          ||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTTTGGGGAGG--AGTCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGGAAGCAGGC 538

  6892933 ATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCAT 6892992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 ATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCAT 598

  6892993 GATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTC 6893052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 GATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTC 658

  6893053 CTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGT 6893112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 CTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGT 718

  6893113 AGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGACCC 6893172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 AGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGACCC 778

  6893173 GCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAA 6893232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 GCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAA 838

  6893233 AGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACA 6893292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 AGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACA 898

  6893293 CTTTTCAACAACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAG 6893352
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 CTTTTCAACAACCGGATGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAG 958

  6893353 GGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTA 6893412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 GGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTA 1018

  6893413 CAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGT 6893472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 CAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGT 1078

  6893473 TGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAG 6893532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 TGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAG 1138

  6893533 TTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCA 6893592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 TTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCA 1198

  6893593 AGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTC 6893626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 AGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTC 1232

EXCISED REGION

  6893634 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 6893693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 1299

  6893694 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 6893753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 1359

  6893754 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 6893813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 1419

  6893814 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 6893873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 1479

  6893874 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 6893933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 1539

  6893934 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 6893993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 1599

  6893994 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 6894053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 1659

  6894054 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 6894113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 1719

  6894114 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 6894173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 1779

  6894174 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 6894233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 1839

  6894234 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 6894293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 1899

  6894294 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 6894353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 1959

  6894354 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 6894413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 2019

  6894414 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 6894473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 2079

  6894474 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 6894533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 2139

  6894534 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 6894593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 2199

  6894594 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 6894653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 2259

  6894654 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 6894713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 2319

  6894714 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 6894773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 2379

  6894774 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 6894833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 2439

  6894834 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 6894893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 2499

  6894894 TGGCAAAATCCCATCTC 6894910
          |||||||||||||||||
     2500 TGGCAAAATCCCATCTC 2516

Alignment time is 1.92393 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   3412] =>      3412 nucs 'mol-32-2dff-124055_3412'

Score:        3324
Aligned:      3412        nucs
Identic:      3404 (100%) nucs =>      2428 (100%)       976 ( 99%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6894920,6897349] EXCISED REGION [6900399,6901378]
 second seq =>  [      1,   2431] EXCISED REGION [   2432,   3412]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3049 nucs [6897350,6900398]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        21 nucs [6897350,6897370] to [6900399,6900419]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6894920 TACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGC 6894979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGC 60

  6894980 TGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTC 6895039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTC 120

  6895040 TGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTGTCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAA 6895099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTGTCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAA 180

  6895100 CAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGAACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTG 6895159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGAACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTG 240

  6895160 ATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAGCTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTAT 6895219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAGCTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTAT 300

  6895220 TTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGTACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTG 6895279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGTACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTG 360

  6895280 CTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGATGGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCC 6895339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGATGGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCC 420

  6895340 ACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGGAGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGC 6895399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGGAGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGC 480

  6895400 TCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCATGGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTA 6895459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCATGGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTA 540

  6895460 CACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACACTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCAC 6895519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACACTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCAC 600

  6895520 TGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGTGGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAAC 6895579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGTGGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAAC 660

  6895580 TGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTAGCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGT 6895639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTAGCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGT 720

  6895640 GTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACACTTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGA 6895699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACACTTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGA 780

  6895700 CATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGAACTGACGTATCTGAGATATACTCTAA 6895759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGAACTGACGTATCTGAGATATACTCTAA 840

  6895760 AGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATATGGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATA 6895819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATATGGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATA 900

  6895820 TTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCATTATACTGTTCTCTCTACTATGTATGT 6895879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCATTATACTGTTCTCTCTACTATGTATGT 960

  6895880 ATTTGACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAAATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGT 6895939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTGACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAAATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGT 1020

  6895940 CTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 6895999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAG 1080

  6896000 ACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGACATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAG 6896059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGACATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAG 1140

  6896060 GAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCACTGGACT 6896119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCACTGGACT 1200

  6896120 CCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAA 6896179
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAA 1260

  6896180 ATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAG 6896239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAG 1320

  6896240 GTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCC 6896299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCC 1380

  6896300 TGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGG 6896359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGG 1440

  6896360 AACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCAC 6896419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCAC 1500

  6896420 GCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCC 6896479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCC 1560

  6896480 CAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGG 6896539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGG 1620

  6896540 TTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCT 6896599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCT 1680

  6896600 CCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCCCCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTG 6896659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCCCCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTG 1740

  6896660 AGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGCCACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCA 6896719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGCCACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCA 1800

  6896720 TCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTTATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCA 6896779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTTATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCA 1860

  6896780 AATTTGAAAATAAATGCCCGCCATCCATTTCTGATTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATA 6896839
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATTTGAAAATAAATGCCCGCCGTCCATTTCTGATTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATA 1920

  6896840 CCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCA 6896899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCA 1980

  6896900 CCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTAAGGTCAGGAGTACGAGACCAGCCTGG 6896959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTAAGGTCAGGAGTACGAGACCAGCCTGG 2040

  6896960 CCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCTTGGCGTGGCGTACG 6897019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCTTGGCGTGGCGTACG 2100

  6897020 CCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGGCGAA-TCACTTGCACCTAGAAGGCAG 6897078
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     2101 CCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGGCGAAATCACTTGCACCTAGAAGGCAG 2160

  6897079 AGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTC 6897138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTC 2220

  6897139 TTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGGAAAAAGAAAAGAAAGGCCAGGCGCAGTG 6897198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGGAAAAAGAAAAGAAAGGCCAGGCGCAGTG 2280

  6897199 GCACATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAGCCAAGACTGGCAGATCATCTGAGGTCAG 6897258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCACATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAGCCAAGACTGGCAGATCATCTGAGGTCAG 2340

  6897259 GAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAATAAA 6897318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATACAATAAA 2400

  6897319 ATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAA 6897349
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAA 2431

EXCISED REGION

  6900399 TCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGC 6900458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2432 TCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGC 2491

  6900459 AGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCGGCCTGGGCAACAGAAAGAGACTCTGTCTCC 6900518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 AGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCGGCCTGGGCAACAGAAAGAGACTCTGTCTCC 2551

  6900519 AAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAATTAGTAAAAAATAAAATCTCTCACCTAAAGGATGCT 6900578
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 AAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAATTAATAAAAAATAAAATCTCTCACCTAAAGGATGCT 2611

  6900579 TCACATCATGAGGCAGGGCTGACACTTGGCCACACCTTTACTGGACATTCCAGCTGTTTC 6900638
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 TCACATCACGAGGCAGGGCTGACACTTGGCCACACCTTTACTGGACATTCCAGCTGTTTC 2671

  6900639 CCACTGAAACTCAATAACCACAATCATTTATGCATAAACAAATGCTTTGCAAACCGTCTC 6900698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 CCACTGAAACTCAATAACCACAATCATTTATGCATAAACAAATGCTTTGCAAACCGTCTC 2731

  6900699 AGCCAGATGAGGCGGCTTCCTGGAAGAAACAGGCACATTCGAGAACCTTTACTGTTTGCT 6900758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 AGCCAGATGAGGCGGCTTCCTGGAAGAAACAGGCACATTCGAGAACCTTTACTGTTTGCT 2791

  6900759 ACAGCACAGAACAGGCTGTAGGAGAGGTTCCCAGTGGGTCCTGGGTGGGAGACAATAAAG 6900818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 ACAGCACAGAACAGGCTGTAGGAGAGGTTCCCAGTGGGTCCTGGGTGGGAGACAATAAAG 2851

  6900819 GTGGGTTCTTGGCCTTGGTCTTCCTTCACTCTGTAACTTTTTCTTCCCTGGGCCTCAGTT 6900878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 GTGGGTTCTTGGCCTTGGTCTTCCTTCACTCTGTAACTTTTTCTTCCCTGGGCCTCAGTT 2911

  6900879 TCTCCATCTGGAAAATGAGGAGTTGGCCGTGTGATAGATGTAAATTAATAAACCTACACT 6900938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 TCTCCATCTGGAAAATGAGGAGTTGGCCGTGTGATAGATGTAAATTAATAAACCTACACT 2971

  6900939 CTACTCATCATCACAAAGCAGCCACTACCTGTCCTGGTTGGCTACTAACACTCCAAATTA 6900998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 CTACTCATCATCACAAAGCAGCCACTACCTGTCCTGGTTGGCTACTAACACTCCAAATTA 3031

  6900999 TTCTGTCTCATATAACTTCCACTTAGTCTGTGAGCATTC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTG 6901057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     3032 TTCTGTCTCATATAACTTCCACTTAGTCTGTGAGCATTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG 3091

  6901058 AGACAGGATCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCACAGCTCACTGC 6901117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 AGACAGGATCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCACAATCACAGCTCACTGC 3151

  6901118 AGCCTTGAACTCTGGGGCTCACACAGTCCTCCCACCTCAGCCTCACTAGTAGCTGAGACA 6901177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 AGCCTTGAACTCTGGGGCTCACACAGTCCTCCCACCTCAGCCTCACTAGTAGCTGAGACA 3211

  6901178 ACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGTTACTGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTAGAGATGG 6901237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 ACAGGCATGTGCCACCATGCCTGGTTACTGGTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTAGAGATGG 3271

  6901238 GGTCTCCCTTTGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCTAAAGCCATTTTCCCATCT 6901297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 GGTCTCCCTTTGTTGTCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGAGCTAAAGCCATTTTCCCATCT 3331

  6901298 CAGCCTCCCAGAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGGCCTAGGGAATGTT 6901357
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 CAGCCTCCCGGAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCTGGCCTAGGGAATGTT 3391

  6901358 TTTTAAGCTCCTTTTCAGAGG 6901378
          |||||||||||||||||||||
     3392 TTTTAAGCTCCTTTTCAGAGG 3412

Alignment time is 2.61875 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   2354] =>      2354 nucs 'mol-32-2f28-116219_2354'

Score:        2331
Aligned:      2353        nucs
Identic:      2351 (100%) nucs =>      1325 (100%)      1026 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6894826,6896150] EXCISED REGION [6896152,6897178]
 second seq =>  [      1,   1325] EXCISED REGION [   1327,   2354]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6896151,6896151]
 second seq =>         1 nucs [1326,1326]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2231,2231]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6896150,6896150] to [6896151,6896151]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6894826 CAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCT 6894885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCT 60

  6894886 GGGCAACATGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGT 6894945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGCAACATGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGT 120

  6894946 GGCACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCA 6895005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCA 180

  6895006 GAAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTG 6895065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTG 240

  6895066 AGACCCTGTCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTG 6895125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGACCCTGTCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTG 300

  6895126 CCTGTTGAACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAA 6895185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTGTTGAACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAA 360

  6895186 TTCTGTAGCTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAG 6895245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTCTGTAGCTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAG 420

  6895246 CTCACTGTACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGT 6895305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCACTGTACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGT 480

  6895306 GCAGGGATGGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCC 6895365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAGGGATGGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCC 540

  6895366 TTGTCTGGAGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTAC 6895425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGTCTGGAGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTAC 600

  6895426 TCATTCATGGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTT 6895485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCATTCATGGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTT 660

  6895486 GCAATACACTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTG 6895545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAATACACTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTG 720

  6895546 CGGTATGTGGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACA 6895605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CGGTATGTGGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACA 780

  6895606 CTGGGCTAGCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTAT 6895665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGGGCTAGCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTAT 840

  6895666 GACTACACTTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCT 6895725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GACTACACTTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCT 900

  6895726 TCATGTGAACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGG 6895785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCATGTGAACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGG 960

  6895786 AAGAATATGGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAG 6895845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGAATATGGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAG 1020

  6895846 GGGTTCATTATACTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTTGACATTTTCCATAATAAAACTT 6895905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGGTTCATTATACTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTTGACATTTTCCATAATAAAACTT 1080

  6895906 GTTTGAAAATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCT 6895965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTTGAAAATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCT 1140

  6895966 AGGAATTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACAT 6896025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGAATTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACAT 1200

  6896026 TAGGCAGACATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCA 6896085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGGCAGACATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCA 1260

  6896086 AGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCT 6896145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCT 1320

  6896146 TGTCT 6896150
          |||||
     1321 TGTCT 1325

EXCISED REGION

  6896152 AAAAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAG 6896211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 AAAAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAG 1386

  6896212 CAATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGC 6896271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 CAATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGC 1446

  6896272 TTGGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACA 6896331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 TTGGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACA 1506

  6896332 GGGACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGC 6896391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 GGGACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGC 1566

  6896392 AATCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGA 6896451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 AATCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGA 1626

  6896452 CCGGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGT 6896511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 CCGGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGT 1686

  6896512 AAACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCA 6896571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 AAACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCA 1746

  6896572 GCTGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAG 6896631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 GCTGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAG 1806

  6896632 CCCCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTT 6896691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 CCCCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTT 1866

  6896692 GCCACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCT 6896751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 GCCACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCT 1926

  6896752 TTATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCATCCATTTCT 6896811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1927 TTATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCGTCCATTTCT 1986

  6896812 GATTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTG 6896871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 GATTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTG 2046

  6896872 GGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACT 6896931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 GGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACT 2106

  6896932 TAAGGTCAGGAGTACGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAA 6896991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 TAAGGTCAGGAGTACGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAA 2166

  6896992 TACAAAAATTAGCTTGGCGTGGCGTACGCCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCA 6897051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 TACAAAAATTAGCTTGGCGTGGCGTACGCCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCA 2226

  6897052 GGCG-AATCACTTGCACCTAGAAGGCAGAGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCA 6897110
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 GGCGAAATCACTTGCACCTAGAAGGCAGAGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCA 2286

  6897111 CTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGG 6897170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 CTCCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGG 2346

  6897171 AAAAAGAA 6897178
          ||||||||
     2347 AAAAAGAA 2354

Alignment time is 1.94401 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   2062] =>      2062 nucs 'mol-32-2f28-116650_2062'

Score:        2029
Aligned:      2057        nucs
Identic:      2052 (100%) nucs =>       791 ( 99%)      1261 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6892833,6893626] EXCISED REGION [6893634,6894894]
 second seq =>  [      1,    794] EXCISED REGION [    802,   2062]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [6893627,6893633]
 second seq =>         7 nucs [795,801]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6893627,6893627] to [6893633,6893633]
 second seq =>         1 nucs [795,795] to [801,801]

  6892833 TCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGCATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGGCC--TC 6892890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||
        1 TCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGCATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGG--AGTC 58

  6892891 AGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGGAAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGA 6892950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       59 AGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGGAAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGA 118

  6892951 CAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAA 6893010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      119 CAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAA 178

  6893011 CCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGC 6893070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      179 CCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGC 238

  6893071 AGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCA 6893130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      239 AGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCA 298

  6893131 TATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGACCCGCCTGCCTCGGCCTCCCA 6893190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      299 TATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGACCCGCCTGCCTCGGCCTCCCA 358

  6893191 AAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGT 6893250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      359 AAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGT 418

  6893251 GGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTTTTCAACAACCGGCTG 6893310
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      419 GGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTTTTCAACAACCGGATG 478

  6893311 GCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACC 6893370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      479 GCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACC 538

  6893371 CAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTT 6893430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      539 CAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTT 598

  6893431 GGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTAC 6893490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 GGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTAC 658

  6893491 TTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAG 6893550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 TTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAG 718

  6893551 AATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGT 6893610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 AATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGT 778

  6893611 TTGGAAACTTTTATTC 6893626
          ||||||||||||||||
      779 TTGGAAACTTTTATTC 794

EXCISED REGION

  6893634 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 6893693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      802 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 861

  6893694 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 6893753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      862 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 921

  6893754 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 6893813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      922 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 981

  6893814 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 6893873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      982 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 1041

  6893874 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 6893933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1042 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 1101

  6893934 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 6893993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1102 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 1161

  6893994 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 6894053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1162 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 1221

  6894054 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 6894113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1222 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 1281

  6894114 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 6894173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1282 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 1341

  6894174 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 6894233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1342 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 1401

  6894234 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 6894293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1402 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 1461

  6894294 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 6894353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1462 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 1521

  6894354 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 6894413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1522 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 1581

  6894414 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 6894473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1582 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 1641

  6894474 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 6894533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1642 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 1701

  6894534 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 6894593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 1761

  6894594 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 6894653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 1821

  6894654 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 6894713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 1881

  6894714 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 6894773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 1941

  6894774 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 6894833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 2001

  6894834 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 6894893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 2061

  6894894 T 6894894
          |
     2062 T 2062

Alignment time is 1.81547 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   3645] =>      3645 nucs 'mol-32-2fd8-211589_3645'

Score:        3545
Aligned:      3646        nucs
Identic:      3636 (100%) nucs =>      3033 (100%)       603 ( 99%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6894313,6897349] EXCISED REGION [6900399,6901004]
 second seq =>  [      1,   3037] EXCISED REGION [   3038,   3645]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3049 nucs [6897350,6900398]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        21 nucs [6897350,6897370] to [6900399,6900419]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6894313 GTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAGTGCCTGGCTCGAAATTA 6894372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAGTGCCTGGCTCGAAATTA 60

  6894373 ATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCTCTGCAAGCCACCCTTTT 6894432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCTCTGCAAGCCACCCTTTT 120

  6894433 CTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGCCTGGCACACATGGGTGC 6894492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      121 CTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGCCTGGCACACCTGGGTGC 180

  6894493 TCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGCTGCTCAAGCCATACCAG 6894552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGCTGCTCAAGCCATACCAG 240

  6894553 AAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGGTTTGGCTGGGATGGGTA 6894612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGGTTTGGCTGGGATGGGTA 300

  6894613 TGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCACCTTGAATGCTTCCTGG 6894672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCACCTTGAATGCTTCCTGG 360

  6894673 CGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAACGTTGTAAGCAGGGGCA 6894732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAACGTTGTAAGCAGGGGCA 420

  6894733 CCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGATTTCAGAATCTGCTGGTG 6894792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGATTTCAGAATCTGCTGGTG 480

  6894793 CATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAA 6894852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAA 540

  6894853 GATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACATGGCAAAATCCCATCTCTA 6894912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACATGGCAAAATCCCATCTCTA 600

  6894913 CAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTT 6894972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTT 660

  6894973 GGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCCGTGA 6895032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCCGTGA 720

  6895033 CAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTGTCTCTAAATAAATAAAAAC 6895092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTGTCTCTAAATAAATAAAAAC 780

  6895093 AAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGAACAGGTCTGGGAAAAAAAA 6895152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGAACAGGTCTGGGAAAAAAAA 840

  6895153 TCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAGCTTTTCAAAGAAGATCACC 6895212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAGCTTTTCAAAGAAGATCACC 900

  6895213 ATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGTACAAATGTGAATGGAGCAC 6895272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGTACAAATGTGAATGGAGCAC 960

  6895273 TGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGATGGCTGAGCTGGGGTCCTGT 6895332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGATGGCTGAGCTGGGGTCCTGT 1020

  6895333 GCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGGAGAAAATGGAGATCACCCA 6895392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGGAGAAAATGGAGATCACCCA 1080

  6895393 CCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCATGGAAGGGAAGGCCCTTTGT 6895452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCATGGAAGGGAAGGCCCTTTGT 1140

  6895453 AACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACACTGAAAAAAAAACCAGGTC 6895512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACACTGAAAAAAAAACCAGGTC 1200

  6895513 TCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGTGGCCTTTGGACCCAGATTT 6895572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGTGGCCTTTGGACCCAGATTT 1260

  6895573 AACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTAGCGGGAGATACTGAGGAAT 6895632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTAGCGGGAGATACTGAGGAAT 1320

  6895633 TGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACACTTCCAAAAAAGTCTTTCTT 6895692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACACTTCCAAAAAAGTCTTTCTT 1380

  6895693 CTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGAACTGACGTATCTGAGATAT 6895752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGAACTGACGTATCTGAGATAT 1440

  6895753 ACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATATGGGGAGGAGGTGAGAAGAG 6895812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATATGGGGAGGAGGTGAGAAGAG 1500

  6895813 CAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCATTATACTGTTCTCTCTACTA 6895872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCATTATACTGTTCTCTCTACTA 1560

  6895873 TGTATGTATTTGACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAAATATTTTTTTAAATGGCTT 6895932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTATGTATTTGACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAAATATTTTTTTAAATGGCTT 1620

  6895933 TCGAAGTCTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTCGAGACCAGCCTGGGCAACA 6895992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCGAAGTCTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTCGAGACCAGCCTGGGCAACA 1680

  6895993 TAGTGAGACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGACATGGTGGCTCAGAAGGCT 6896052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAGTGAGACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGACATGGTGGCTCAGAAGGCT 1740

  6896053 GAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCA 6896112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCA 1800

  6896113 CTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAT 6896172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1801 CTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAT 1860

  6896173 TTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTCTAGAG 6896232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTCTAGAG 1920

  6896233 ACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCACCCCT 6896292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCACCCCT 1980

  6896293 CACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTACCCACT 6896352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTACCCACT 2040

  6896353 GCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGGGGTGC 6896412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGGGGTGC 2100

  6896413 TGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCCATCAG 6896472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCCATCAG 2160

  6896473 TGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCACGCCCCT 6896532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCACGCCCCT 2220

  6896533 CCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGGCAGGTGTGGTAGAGG 6896592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGGCAGGTGTGGTAGAGG 2280

  6896593 CACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCCCCTGAGCTCCTGCGGAGAA 6896652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCCCCTGAGCTCCTGCGGAGAA 2340

  6896653 GCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGCCACCAGAGTCTCACTTCCC 6896712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGCCACCAGAGTCTCACTTCCC 2400

  6896713 TGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTTATGGATGACTTCCTCCTTG 6896772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTTATGGATGACTTCCTCCTTG 2460

  6896773 CCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCATCCATTTCTGATTGAGCCCCAACCTCAGTT 6896832
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCGTCCATTTCTGATTGAGCCCCAACCTCAGTT 2520

  6896833 AGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGT 6896892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGT 2580

  6896893 AATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTAAGGTCAGGAGTACGAGACC 6896952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTAAGGTCAGGAGTACGAGACC 2640

  6896953 AGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCTTGGCGTG 6897012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCTTGGCGTG 2700

  6897013 GCGTACGCCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGGCGAA-TCACTTGCACCTAG 6897071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     2701 GCGTACGCCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGGCGAAATCACTTGCACCTAG 2760

  6897072 AAGGCAGAGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGC 6897131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAGGCAGAGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGC 2820

  6897132 AAGACTCTTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGGAAAAAGAAAAGAAAGGCCAGG 6897191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAGACTCTTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGGAAAAAGAAAAGAAAGGCCAGG 2880

  6897192 CGCAGTGGCACATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAGCCAAGACTGGCAGATCATCTG 6897251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CGCAGTGGCACATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAGCCAAGACTGGCAGATCATCTG 2940

  6897252 AGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATA 6897311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATA 3000

  6897312 CAATAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAA 6897349
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAA-AAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAA 3037

EXCISED REGION

  6900399 TCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGC 6900458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     3038 TCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGTCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGTGGAGCTTGC 3097

  6900459 AGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCGGCCTGGGCAACAGAAAGAGACTCTGTCTCC 6900518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 AGTGAGCTGAGATCGCACCACTGCACTCCGGCCTGGGCAACAGAAAGAGACTCTGTCTCC 3157

  6900519 --AAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAATTAGTAAAAAATAAAATCTCTCACCTAAAGGATG 6900576
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAATTAAAATTAATAAAAAATAAAATCTCTCACCTAAAGGATG 3217

  6900577 CTTCACATCATGAGGCAGGGCTGACACTTGGCCACACCTTTACTGGACATTCCAGCTGTT 6900636
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 CTTCACATCACGAGGCAGGGCTGACACTTGGCCACACCTTTACTGGACATTCCAGCTGTT 3277

  6900637 TCCCACTGAAACTCAATAACCACAATCATTTATGCATAAACAAATGCTTTGCAAACCGTC 6900696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 TCCCACTGAAACTCAATAACCACAATCATTTATGCATAAACAAATGCTTTGCAAACCGTC 3337

  6900697 TCAGCCAGATGAGGCGGCTTCCTGGAAGAAACAGGCACATTCGAGAACCTTTACTGTTTG 6900756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 TCAGCCAGATGAGGCGGCTTCCTGGAAGAAACAGGCACATTCGAGAACCTTTACTGTTTG 3397

  6900757 CTACAGCACAGAACAGGCTGTAGGAGAGGTTCCCAGTGGGTCCTGGGTGGGAGACAATAA 6900816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 CTACAGCACAGAACAGGCTGTAGGAGAGGTTCCCAGTGGGTCCTGGGTGGGAGACAATAA 3457

  6900817 AGGTGGGTTCTTGGCCTTGGTCTTCCTTCACTCTGTAACTTTTTCTTCCCTGGGCCTCAG 6900876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 AGGTGGGTTCTTGGCCTTGGTCTTCCTTCACTCTGTAACTTTTTCTTCCCTGGGCCTCAG 3517

  6900877 TTTCTCCATCTGGAAAATGAGGAGTTGGCCGTGTGATAGATGTAAATTAATAAACCTACA 6900936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 TTTCTCCATCTGGAAAATGAGGAGTTGGCCGTGTGATAGATGTAAATTAATAAACCTACA 3577

  6900937 CTCTACTCATCATCACAAAGCAGCCACTACCTGTCCTGGTTGGCTACTAACACTCCAAAT 6900996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 CTCTACTCATCATCACAAAGCAGCCACTACCTGTCCTGGTTGGCTACTAACACTCCAAAT 3637

  6900997 TATTCTGT 6901004
          ||||||||
     3638 TATTCTGT 3645

Alignment time is 2.77399 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   2102] =>      2102 nucs 'mol-32-3143-257616_2102'

Score:        2036
Aligned:      2102        nucs
Identic:      2096 (100%) nucs =>      1637 (100%)       459 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6893196,6894837] EXCISED REGION [6896048,6896507]
 second seq =>  [      1,   1642] EXCISED REGION [   1643,   2102]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1210 nucs [6894838,6896047]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        29 nucs [6894838,6894866] to [6896048,6896076]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6894838,6894838] to [6896047,6896047]
 second seq =>         0 nucs

  6893196 CTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCG 6893255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCG 60

  6893256 GAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTTTTCAACAACCGGCTGGCACT 6893315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTTTTCAACAACCGGCTGGCACT 120

  6893316 AGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAAC 6893375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAAC 180

  6893376 GCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCA 6893435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCA 240

  6893436 GGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCA 6893495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCA 300

  6893496 GCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGA 6893555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGA 360

  6893556 GGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGA 6893615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGA 420

  6893616 AACTTTTATTCAATAACATATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGC 6893675
          |||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACTTTTATTCGATAACGTATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGC 480

  6893676 TGGTAATACATTTTATTTTTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAA 6893735
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGTAGTACATTTTATTTTTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAA 540

  6893736 TGATAGCATCACAACTTCCTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAG 6893795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGATAGCATCACAACTTCCTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAG 600

  6893796 CCTGCCTGCTGCACCCTCTTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCC 6893855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTGCCTGCTGCACCCTCTTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCC 660

  6893856 CCACTCTCTGCATGAGAAGATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGC 6893915
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      661 CCACTCTCTGCATGAGAAGATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAACTCCCCAGCCTGGTGGC 720

  6893916 CCCCCAGGAGCCTCATGAAGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTG 6893975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCCCAGGAGCCTCATGAAGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTG 780

  6893976 GGGCAGGGTGGGCAAGGAGGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTT 6894035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGGCAGGGTGGGCAAGGAGGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTT 840

  6894036 CCTGCAGAATAAGTGACGCGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCC 6894095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCTGCAGAATAAGTGACGCGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCC 900

  6894096 ATGACTCTGCAGATGCGCCACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCT 6894155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGACTCTGCAGATGCGCCACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCT 960

  6894156 CCGGCAAGTGGCTGCAGATCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCA 6894215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCGGCAAGTGGCTGCAGATCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCA 1020

  6894216 GGGACTGTGAAGCTGAACAGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCC 6894275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGGACTGTGAAGCTGAACAGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCC 1080

  6894276 CTCCCCTTTTCCAGGGTCAAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAA 6894335
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTCCCCTTTTCCAGGGTCAAGCCCCACTCTCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAA 1140

  6894336 CCCAGTGTGTGGCGCCAGAGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCC 6894395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCAGTGTGTGGCGCCAGAGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCC 1200

  6894396 TTCGGCAGGTCATTCGCCCTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTT 6894455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCGGCAGGTCATTCGCCCTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTT 1260

  6894456 AGCACCCGGGACTGAGGGGCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCT 6894515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGCACCCGGGACTGAGGGGCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCT 1320

  6894516 CGGTGCCCCCTAAAATCAGCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGA 6894575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CGGTGCCCCCTAAAATCAGCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGA 1380

  6894576 ACTTCAGTGTCACAGCTGGGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGA 6894635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTTCAGTGTCACAGCTGGGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGA 1440

  6894636 ATAGAGGGATGGCTGGGGCACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGA 6894695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATAGAGGGATGGCTGGGGCACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGA 1500

  6894696 GGCAGCAGGGGGCACAAAAACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAG 6894755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GGCAGCAGGGGGCACAAAAACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAG 1560

  6894756 TGGTCTCCGAGGTGAGGGATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACA 6894815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGGTCTCCGAGGTGAGGGATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACA 1620

  6894816 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 6894837
          ||||||||||||||||||||||
     1621 CCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 1642

EXCISED REGION

  6896048 AGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTG 6896107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 AGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTG 1702

  6896108 CACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAAAAAAAAAAAGAAAA 6896167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 CACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAAAAAAAAAAAGAAAA 1762

  6896168 AAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTC 6896227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 AAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTC 1822

  6896228 TAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCA 6896287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 TAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCA 1882

  6896288 CCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTAC 6896347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 CCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTAC 1942

  6896348 CCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGG 6896407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 CCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGG 2002

  6896408 GGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCC 6896467
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 GGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCGCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCC 2062

  6896468 ATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGA 6896507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 ATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGA 2102

Alignment time is 1.60595 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   4436] =>      4436 nucs 'mol-32-314e-102534_4436'

Score:        4359
Aligned:      4425        nucs
Identic:      4419 (100%) nucs =>       686 (100%)      3733 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6892940,6893626] EXCISED REGION [6893634,6897370]
 second seq =>  [      1,    687] EXCISED REGION [    695,   4431]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [6893627,6893633]
 second seq =>         7 nucs [688,694]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6893627,6893627] to [6893633,6893633]
 second seq =>         1 nucs [688,688] to [694,694]

  6892940 TTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCATGATCTCA 6892999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGGCATGATCTCA 60

  6893000 GCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTA 6893059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTA 120

  6893060 GCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATG 6893119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATG 180

  6893120 GGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGACCCGCCTGCC 6893179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAGGTGACCCGCCTGCC 240

  6893180 TCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGC 6893239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGC 300

  6893240 ATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTTTTCA 6893299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTGCCACACACTTTTCA 360

  6893300 ACAACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGATCCA 6893359
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAACCGGATGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAGCCACGAGGGATCCA 420

  6893360 CCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAATTCA 6893419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTGGGGATTACAATTCA 480

  6893420 ACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTA 6893479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTA 540

  6893480 CTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAA 6893539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAA 600

  6893540 GTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTT 6893599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTT 660

  6893600 ACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTC 6893626
          |||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTC 687

EXCISED REGION

  6893634 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 6893693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      695 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 754

  6893694 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 6893753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      755 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 814

  6893754 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 6893813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      815 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 874

  6893814 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 6893873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      875 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 934

  6893874 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 6893933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      935 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 994

  6893934 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 6893993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      995 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 1054

  6893994 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 6894053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1055 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 1114

  6894054 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 6894113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 1174

  6894114 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 6894173
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTCCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 1234

  6894174 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 6894233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 1294

  6894234 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 6894293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 1354

  6894294 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 6894353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 1414

  6894354 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 6894413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 1474

  6894414 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 6894473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 1534

  6894474 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 6894533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 1594

  6894534 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 6894593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 1654

  6894594 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 6894653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 1714

  6894654 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 6894713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 1774

  6894714 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 6894773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 1834

  6894774 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 6894833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 1894

  6894834 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 6894893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 1954

  6894894 TGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATG 6894953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 TGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATG 2014

  6894954 CCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCA 6895013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 CCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCA 2074

  6895014 AGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTG 6895073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 AGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTG 2134

  6895074 TCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGA 6895133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 TCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGA 2194

  6895134 ACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAG 6895193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 ACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAG 2254

  6895194 CTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGT 6895253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 CTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGT 2314

  6895254 ACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGAT 6895313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 ACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGAT 2374

  6895314 GGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGG 6895373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 GGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGG 2434

  6895374 AGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCAT 6895433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 AGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCAT 2494

  6895434 GGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACA 6895493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 GGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACA 2554

  6895494 CTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGT 6895553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 CTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGT 2614

  6895554 GGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTA 6895613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 GGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTA 2674

  6895614 GCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACAC 6895673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 GCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACAC 2734

  6895674 TTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGA 6895733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 TTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGA 2794

  6895734 ACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATAT 6895793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 ACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATAT 2854

  6895794 GGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCAT 6895853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 GGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCAT 2914

  6895854 TATACTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTTGACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAA 6895913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 TATACTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTTGACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAA 2974

  6895914 ATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTC 6895973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 ATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTC 3034

  6895974 GAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGA 6896033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 GAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGA 3094

  6896034 CATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCA 6896093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 CATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCA 3154

  6896094 GTGAGCTATGATTGCACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAA 6896153
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3155 GTGAGCTATGATTGCACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTCAA 3214

  6896154 AAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCA 6896213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 AAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCA 3274

  6896214 ATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTT 6896273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 ATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTT 3334

  6896274 GGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGG 6896333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 GGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGG 3394

  6896334 GACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAA 6896393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 GACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAA 3454

  6896394 TCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACC 6896453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 TCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACC 3514

  6896454 GGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAA 6896513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 GGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAA 3574

  6896514 ACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGC 6896573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 ACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGC 3634

  6896574 TGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCC 6896633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3635 TGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCC 3694

  6896634 CCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGC 6896693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 CCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGC 3754

  6896694 CACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTT 6896753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 CACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTT 3814

  6896754 ATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCATCCATTTCTGA 6896813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3815 ATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCGTCCATTTCTGA 3874

  6896814 TTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGG 6896873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3875 TTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGG 3934

  6896874 TGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTA 6896933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3935 TGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTA 3994

  6896934 AGGTCAGGAGTACGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATA 6896993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3995 AGGTCAGGAGTACGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATA 4054

  6896994 CAAAAATTAGCTTGGCGTGGCGTACGCCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGG 6897053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4055 CAAAAATTAGCTTGGCGTGGCGTACGCCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGG 4114

  6897054 CG-AATCACTTGCACCTAGAAGGCAGAGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACT 6897112
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4115 CGAAATCACTTGCACCTAGAAGGCAGAGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACT 4174

  6897113 CCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGGAA 6897172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4175 CCAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGGAA 4234

  6897173 AAAGAAAAGAAAGGCCAGGCGCAGTGGCACATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAGCC 6897232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4235 AAAGAAAAGAAAGGCCAGGCGCAGTGGCACATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAGCC 4294

  6897233 AAGACTGGCAGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC 6897292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4295 AAGACTGGCAGATCATCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAAC 4354

  6897293 CCCATCTCTACTAAAAATACAATAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAATCC 6897352
          |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4355 CCCATCTCTACTAAAAATACAA-AAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAATCC 4413

  6897353 CAGCTACTCGGGAGGCTG 6897370
          ||||||||||||||||||
     4414 CAGCTACTCGGGAGGCTG 4431

Alignment time is 3.35403 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   2872] =>      2872 nucs 'mol-32-3190-252695_2872'

Score:        2839
Aligned:      2872        nucs
Identic:      2869 (100%) nucs =>      1184 (100%)      1685 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6894313,6895496] EXCISED REGION [6895498,6897184]
 second seq =>  [      1,   1184] EXCISED REGION [   1185,   2872]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6895497,6895497]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2743,2743]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         8 nucs [6895497,6895504] to [6895498,6895505]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6894313 GTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAGTGCCTGGCTCGAAATTA 6894372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAGTGCCTGGCTCGAAATTA 60

  6894373 ATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCTCTGCAAGCCACCCTTTT 6894432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCTCTGCAAGCCACCCTTTT 120

  6894433 CTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGCCTGGCACACATGGGTGC 6894492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGCCTGGCACACATGGGTGC 180

  6894493 TCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGCTGCTCAAGCCATACCAG 6894552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGCTGCTCAAGCCATACCAG 240

  6894553 AAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGGTTTGGCTGGGATGGGTA 6894612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGGTTTGGCTGGGATGGGTA 300

  6894613 TGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCACCTTGAATGCTTCCTGG 6894672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCACCTTGAATGCTTCCTGG 360

  6894673 CGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAACGTTGTAAGCAGGGGCA 6894732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAACGTTGTAAGCAGGGGCA 420

  6894733 CCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGATTTCAGAATCTGCTGGTG 6894792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGATTTCAGAATCTGCTGGTG 480

  6894793 CATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAA 6894852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAA 540

  6894853 GATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACATGGCAAAATCCCATCTCTA 6894912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACATGGCAAAATCCCATCTCTA 600

  6894913 CAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTT 6894972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTT 660

  6894973 GGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCCGTGA 6895032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCAAGGCTGCAGTGAGCCGTGA 720

  6895033 CAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTGTCTCTAAATAAATAAAAAC 6895092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTGTCTCTAAATAAATAAAAAC 780

  6895093 AAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGAACAGGTCTGGGAAAAAAAA 6895152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGAACAGGTCTGGGAAAAAAAA 840

  6895153 TCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAGCTTTTCAAAGAAGATCACC 6895212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAGCTTTTCAAAGAAGATCACC 900

  6895213 ATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGTACAAATGTGAATGGAGCAC 6895272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGTACAAATGTGAATGGAGCAC 960

  6895273 TGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGATGGCTGAGCTGGGGTCCTGT 6895332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGATGGCTGAGCTGGGGTCCTGT 1020

  6895333 GCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGGAGAAAATGGAGATCACCCA 6895392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGGAGAAAATGGAGATCACCCA 1080

  6895393 CCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCATGGAAGGGAAGGCCCTTTGT 6895452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCATGGAAGGGAAGGCCCTTTGT 1140

  6895453 AACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACACTG 6895496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACACTG 1184

EXCISED REGION

  6895498 AAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGTGGCC 6895557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 AAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGTGGCC 1244

  6895558 TTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTAGCGG 6895617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 TTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTAGCGG 1304

  6895618 GAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACACTTCC 6895677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 GAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACACTTCC 1364

  6895678 AAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGAACTG 6895737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 AAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGAACTG 1424

  6895738 ACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATATGGGG 6895797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 ACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATATGGGG 1484

  6895798 AGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCATTATA 6895857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 AGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCATTATA 1544

  6895858 CTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTTGACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAAATAT 6895917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 CTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTTGACATTTTCCATAATAAAACTTGTTTGAAAATAT 1604

  6895918 TTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTCGAGA 6895977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 TTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAAGGCTGGAAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTCGAGA 1664

  6895978 CCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGACATG 6896037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 CCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTCCTATCTCTACAAAAGAAAACATTAGGCAGACATG 1724

  6896038 GTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGA 6896097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 GTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGA 1784

  6896098 GCTATGATTGCACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAAAAAA 6896157
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1785 GCTATGATTGCACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTCAAAAAA 1844

  6896158 AAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGG 6896217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 AAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGG 1904

  6896218 GGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGAT 6896277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 GGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGAT 1964

  6896278 CTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACG 6896337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 CTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACG 2024

  6896338 TTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCC 6896397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 TTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCC 2084

  6896398 CAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACCGGGG 6896457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 CAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACCGGGG 2144

  6896458 AGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTC 6896517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 AGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTC 2204

  6896518 AGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGG 6896577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 AGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGG 2264

  6896578 CAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCCCCTG 6896637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 CAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCCCCTG 2324

  6896638 AGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGCCACC 6896697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 AGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGCCACC 2384

  6896698 AGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTTATGG 6896757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 AGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTTATGG 2444

  6896758 ATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCATCCATTTCTGATTGA 6896817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     2445 ATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCGTCCATTTCTGATTGA 2504

  6896818 GCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGGTGTG 6896877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 GCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGGTGTG 2564

  6896878 GTGGCTCACGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTAAGGT 6896937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 GTGGCTCACGCCTGTAATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTAAGGT 2624

  6896938 CAGGAGTACGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATACAAA 6896997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 CAGGAGTACGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATACAAA 2684

  6896998 AATTAGCTTGGCGTGGCGTACGCCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGGCG-A 6897056
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     2685 AATTAGCTTGGCGTGGCGTACGCCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGGCGAA 2744

  6897057 ATCACTTGCACCTAGAAGGCAGAGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACTCCAG 6897116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 ATCACTTGCACCTAGAAGGCAGAGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACTCCAG 2804

  6897117 CCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGGAAAAAG 6897176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 CCTGGGCAACAGAGCAAGACTCTTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGGAAAAAG 2864

  6897177 AAAAGAAA 6897184
          ||||||||
     2865 AAAAGAAA 2872

Alignment time is 2.17776 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   3046] =>      3046 nucs 'mol-32-338a-116522_3046'

Score:        3002
Aligned:      3046        nucs
Identic:      3042 (100%) nucs =>        12 (100%)      3030 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6888520,6888531] EXCISED REGION [6896048,6899081]
 second seq =>  [      1,     12] EXCISED REGION [     13,   3046]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      7516 nucs [6888532,6896047]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>      1210 nucs [6894838,6896047]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [6888532,6888535] to [6896048,6896051]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6888532,6888532] to [6896047,6896047]
 second seq =>         0 nucs

  6888520 CAGCACTTTGGG 6888531
          ||||||||||||
        1 CAGCACTTTGGG 12

EXCISED REGION

  6896048 AGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTG 6896107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       13 AGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTG 72

  6896108 CACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAAAAAAAAAAAGAAAA 6896167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       73 CACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAAAAAAAAAAAGAAAA 132

  6896168 AAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTC 6896227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      133 AAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTC 192

  6896228 TAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCA 6896287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      193 TAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCA 252

  6896288 CCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTAC 6896347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      253 CCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTAC 312

  6896348 CCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGG 6896407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      313 CCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGG 372

  6896408 GGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCC 6896467
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      373 GGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCGCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCC 432

  6896468 ATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCACG 6896527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      433 ATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCACG 492

  6896528 CCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGGCAGGTGTGGT 6896587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      493 CCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGGCAGGTGTGGT 552

  6896588 AGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCCCCTGAGCTCCTGCG 6896647
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      553 AGAGGCACCTCTCCCACCGTTTCAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCCCCTGAGCCCCTGCG 612

  6896648 GAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGCCACCAGAGTCTCAC 6896707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      613 GAGAAGCAGCTGAGGGCTCCACGGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGCCACCAGAGTCTCAC 672

  6896708 TTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTTATGGATGACTTCCT 6896767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      673 TTCCCTGCGCCATCCTGTATCCGTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTTATGGATGACTTCCT 732

  6896768 CCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCATCCATTTCTGATTGAGCCCCAACCT 6896827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      733 CCTTGCCTGTCAAATTTGAAAATAAATGCCCGCCGTCCATTTCTGATTGAGCCCCAACCT 792

  6896828 CAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACG 6896887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      793 CAGTTAGCAATACCAGATCGTCTCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACG 852

  6896888 CCTGTAATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTAAGGTCAGGAGTACG 6896947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      853 CCTGTAATCCCACCACTTTGGGACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTAAGGTCAGGAGTACG 912

  6896948 AGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCTTG 6897007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      913 AGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAATCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCTTG 972

  6897008 GCGTGGCGTACGCCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGGCGAATCACTTGCAC 6897067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      973 GCGTGGCGTACGCCTGTAGTCCCAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGGCGAATCACTTGCAC 1032

  6897068 CTAGAAGGCAGAGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 6897127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1033 CTAGAAGGCAGAGGTTGCACTGAGCCGAGATTGTACCATTGCACTCCAGCCTGGGCAACA 1092

  6897128 GAGCAAGACTCTTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGGAAAAAGAAAAGAAAGGC 6897187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 GAGCAAGACTCTTAAAAAAAAGAAAAAAAAAGATAAAGAAAGGAAAAAGAAAAGAAAGGC 1152

  6897188 CAGGCGCAGTGGCACATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAGCCAAGACTGGCAGATCA 6897247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 CAGGCGCAGTGGCACATGCCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAAGCCAAGACTGGCAGATCA 1212

  6897248 TCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAA 6897307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 TCTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAA 1272

  6897308 AATACAATAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGG 6897367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 AATACAATAAAATTAGCTGGGCATGGTGGCGGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCGGGAGG 1332

  6897368 CTGTGGCAGGAGAATCGTTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAACCAAGACCGCGA 6897427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 CTGTGGCAGGAGAATCGTTTGAACCAGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAACCAAGACCGCGA 1392

  6897428 CATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAATCATG 6897487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 CATTGCACTCCAGCCTGGGCAACAAGAGCAAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAATCATG 1452

  6897488 AGGTTTCCCTTGAAGGCTTTTCCTTGCTGTGGTATTCAAGAACATTCCAGGAGGCAGACA 6897547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1453 AGGTTTCCCTTGAAGGCTTTTCCTTGCTGTGGTATTCAAGAACATTCCAGGAGGCAGACA 1512

  6897548 CTCTCCTTCCTCTAAAGATGCCTCATTGAGAAGCTAGACAGTTACTTGCTTGGTACAGCG 6897607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 CTCTCCTTCCTCTAAAGATGCCTCATTGAGAAGCTAGACAGTTACTTGCTTGGTACAGCG 1572

  6897608 GACAACCCTGCTGCAGGCTGAGCCCCCACTGCTGCCACTCACAGGAGCTCTGGGCATTTG 6897667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 GACAACCCTGCTGCAGGCTGAGCCCCCACTGCTGCCACTCACAGGAGCTCTGGGCATTTG 1632

  6897668 GAAACTGGAATTCCCGAGTTTTCAAGGCGCTCAGCCGTTCTCTGCCCTGCAGTCAGGATG 6897727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 GAAACTGGAATTCCCGAGTTTTCAAGGCGCTCAGCCGTTCTCTGCCCTGCAGTCAGGATG 1692

  6897728 ATCTTTGCAAAATGCAAATCTGATCTCATCCCCTCACATCTACCTCCATCTCAGCTCCAA 6897787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 ATCTTTGCAAAATGCAAATCTGATCTCATCCCCTCACATCTACCTCCATCTCAGCTCCAA 1752

  6897788 GCAGATAGCTCCTCCTTTATTGCTCCCTGCTGCTATGGCCTAAATGTCTAATCCACTCCC 6897847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 GCAGATAGCTCCTCCTTTATTGCTCCCTGCTGCTATGGCCTAAATGTCTAATCCACTCCC 1812

  6897848 CGCCGCCGCCACCAAATTTATATGTTGAAATCCTAACCCTCACTGTGCTAGTGTTAGGAG 6897907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 CGCCGCCGCCACCAAATTTATATGTTGAAATCCTAACCCTCACTGTGCTAGTGTTAGGAG 1872

  6897908 GTTGGGCTTTGGGGTGGTGATGAGGTCATGAGGGTGGAGCCCTCATAGACGGGATTAGTG 6897967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 GTTGGGCTTTGGGGTGGTGATGAGGTCATGAGGGTGGAGCCCTCATAGACGGGATTAGTG 1932

  6897968 TCCTTATAAAAGAGACTCCAGATGGGCCCCTCACCCTGTCCACCGTGTGAGGACACAATT 6898027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 TCCTTATAAAAGAGACTCCAGATGGGCCCCTCACCCTGTCCACCGTGTGAGGACACAATT 1992

  6898028 GAGAAGGCACCATCTAGGAACCAGGAAGTGAGTCCTCACCAGACACCCAATCTGCTGCTA 6898087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 GAGAAGGCACCATCTAGGAACCAGGAAGTGAGTCCTCACCAGACACCCAATCTGCTGCTA 2052

  6898088 CTTTGATCTTGGACTTCCAGGCTCCAGAACAGTGAGAAATAAATTGTGGTTGTTGATAAG 6898147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 CTTTGATCTTGGACTTCCAGGCTCCAGAACAGTGAGAAATAAATTGTGGTTGTTGATAAG 2112

  6898148 CTCTCCAGTGCACAGTATTGTGTCATGGTAGCCCGCATGGACTAGGACACACCAGCACCA 6898207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 CTCTCCAGTGCACAGTATTGTGTCATGGTAGCCCGCATGGACTAGGACACACCAGCACCA 2172

  6898208 CAGGGCACCCTGTTTTTGCTGCCAAGGGTGTCTTTTCTTTTCAATCCCCCTGACTAACGC 6898267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 CAGGGCACCCTGTTTTTGCTGCCAAGGGTGTCTTTTCTTTTCAATCCCCCTGACTAACGC 2232

  6898268 CAACCAGCCTTCAGGTATCAGCTTCCCTTATGGTGCCAATATAGTATAGTCTGCTGTCAC 6898327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 CAACCAGCCTTCAGGTATCAGCTTCCCTTATGGTGCCAATATAGTATAGTCTGCTGTCAC 2292

  6898328 ACTGCTAATAGAGACATACCTGAGGCTGGGTAATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGAC 6898387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 ACTGCTAATAGAGACATACCTGAGGCTGGGTAATTTATAAAGGAAAGAGGTTTAATTGAC 2352

  6898388 TCATAGTTCAGCATGGCTTGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGCAGAAGGGGAAG 6898447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 TCATAGTTCAGCATGGCTTGGGAGGCCTCAGGAAACTTACAATCATGGCAGAAGGGGAAG 2412

  6898448 CAAACACATCCTTCTTCACATGGCAGCAGCAAGGAGAAGTAGAACAAACAAAAGGGAGAA 6898507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 CAAACACATCCTTCTTCACATGGCAGCAGCAAGGAGAAGTAGAACAAACAAAAGGGAGAA 2472

  6898508 AGCCCCTTATAAAACCATCAGATCTCATGAGAACTCACTATCATGAGGACAGCATGAGGG 6898567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 AGCCCCTTATAAAACCATCAGATCTCATGAGAACTCACTATCATGAGGACAGCATGAGGG 2532

  6898568 TAACCACCCCCATGACTCTATTACCTCCCACCGGGTCCCTCCCATGACACATGGGGATTA 6898627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 TAACCACCCCCATGACTCTATTACCTCCCACCGGGTCCCTCCCATGACACATGGGGATTA 2592

  6898628 TGGGAGCTACAATTCAAGATGAGACTTGGGTGGAGACACAGCCAACCAATCATCTCCTGT 6898687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 TGGGAGCTACAATTCAAGATGAGACTTGGGTGGAGACACAGCCAACCAATCATCTCCTGT 2652

  6898688 GCCCCCAGTGTATTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTTGCC 6898747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2653 GCCCCCAGTGTATTTTTTTTGTTTTTTTGTTTTTTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCC 2712

  6898748 CAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACG 6898807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 CAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCAATCTCGGCTCACTGCAAGCTCCACCTCCTGGGTTCACG 2772

  6898808 CCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGCGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACACCCG 6898867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 CCATTCTCCTGCCTCAGCCTCCTGCGTAGCTGGGACTACAGGCGCCTGCCACCACACCCG 2832

  6898868 GCAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGA 6898927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 GCAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTGTGTTAGCCAGGATGGTCTCGA 2892

  6898928 TCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCATCTCGGCCTCCCAACATTCTGGGATTACCGGCATGA 6898987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 TCTCCTGACCTCGTGATCCGCCCATCTCGGCCTCCCAACATTCTGGGATTACCGGCATGA 2952

  6898988 GCCACCGTACCCAGCCCCCAGTGTATGTTTTTATAACATTTGCCACAGTTGCAGTATCTT 6899047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 GCCACCGTACCCAGCCCCCAGTGTATGTTTTTATAACATTTGCCACAGTTGCAGTATCTT 3012

  6899048 TCTGATTCATGTGAATATTTGATCAGCATCTCCC 6899081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 TCTGATTCATGTGAATATTTGATCAGCATCTCCC 3046

Alignment time is 2.31623 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   2873] =>      2873 nucs 'mol-32-33f8-029195_2873'

Score:        2839
Aligned:      2872        nucs
Identic:      2869 (100%) nucs =>      1421 (100%)      1448 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6894228,6895648] EXCISED REGION [6895650,6897099]
 second seq =>  [      1,   1421] EXCISED REGION [   1423,   2873]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6895649,6895649]
 second seq =>         1 nucs [1422,1422]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2829,2829]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6895648,6895648] to [6895650,6895650]
 second seq =>         1 nucs [1421,1421] to [1423,1423]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6894228 CTGAACAGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCC 6894287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGAACAGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCC 60

  6894288 AGGGTCAAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGG 6894347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGGTCAAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGG 120

  6894348 CGCCAGAGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCA 6894407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CGCCAGAGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCA 180

  6894408 TTCGCCCTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGAC 6894467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCGCCCTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGAC 240

  6894468 TGAGGGGCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTA 6894527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAGGGGCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTA 300

  6894528 AAATCAGCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCA 6894587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAATCAGCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCA 360

  6894588 CAGCTGGGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGG 6894647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGCTGGGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGG 420

  6894648 CTGGGGCACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGG 6894707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGGGGCACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGG 480

  6894708 CACAAAAACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGG 6894767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACAAAAACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGG 540

  6894768 TGAGGGATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCA 6894827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGAGGGATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCA 600

  6894828 GCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGG 6894887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCACTTTGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGG 660

  6894888 GCAACATGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGG 6894947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GCAACATGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGG 720

  6894948 CACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGA 6895007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CACATGCCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGA 780

  6895008 AAGTCAAGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAG 6895067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGTCAAGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAG 840

  6895068 ACCCTGTCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCC 6895127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCCTGTCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCC 900

  6895128 TGTTGAACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATT 6895187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTTGAACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATT 960

  6895188 CTGTAGCTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCT 6895247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGTAGCTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCT 1020

  6895248 CACTGTACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGC 6895307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACTGTACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGC 1080

  6895308 AGGGATGGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTT 6895367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGGATGGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTT 1140

  6895368 GTCTGGAGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTC 6895427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTCTGGAGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTC 1200

  6895428 ATTCATGGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGC 6895487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATTCATGGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGC 1260

  6895488 AATACACTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCG 6895547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATACACTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCG 1320

  6895548 GTATGTGGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACT 6895607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTATGTGGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACT 1380

  6895608 GGGCTAGCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGA 6895648
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGGCTAGCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGA 1421

EXCISED REGION

  6895650 ATGCTGGCAGTATTATGACTACACTTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGA 6895709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 ATGCTGGCAGTATTATGACTACACTTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGA 1482

  6895710 AGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGAACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAG 6895769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 AGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGAACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAG 1542

  6895770 GGAAATTTACAATAGGAAGAATATGGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTG 6895829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 GGAAATTTACAATAGGAAGAATATGGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTG 1602

  6895830 TTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCATTATACTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTTGACATT 6895889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 TTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCATTATACTGTTCTCTCTACTATGTATGTATTTGACATT 1662

  6895890 TTCCATAATAAAACTTGTTTGAAAATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAAGGCTGG 6895949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 TTCCATAATAAAACTTGTTTGAAAATATTTTTTTAAATGGCTTTCGAAGTCTAAGGCTGG 1722

  6895950 AAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTCCTATCT 6896009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 AAGATCTCTTGAGGCTAGGAATTCGAGACCAGCCTGGGCAACATAGTGAGACTCCTATCT 1782

  6896010 CTACAAAAGAAAACATTAGGCAGACATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCT 6896069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 CTACAAAAGAAAACATTAGGCAGACATGGTGGCTCAGAAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCT 1842

  6896070 TGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCACTGGACTCCAGTCTGGG 6896129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 TGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTGCACCACTGGACTCCAGTCTGGG 1902

  6896130 TGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAAAAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGTTAGAGA 6896189
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 TGACAGAGCAAGACCTTGTCTCAAAAAAAAAAAGAAAAAAGATTTTTAAAATGTTAGAGA 1962

  6896190 TGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAGAATCAG 6896249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 TGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTCTAGAGACCCCAGGTAGAATCAG 2022

  6896250 CAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGTGGCCGT 6896309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 CAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCACCCCTCACAGCCTGGTGGCCGT 2082

  6896310 CTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACCCCTGGT 6896369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 CTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTACCCACTGCCTGGGAACCCCTGGT 2142

  6896370 GAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAAGGCAAC 6896429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 GAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGGGGTGCTGAGCACGCAAGGCAAC 2202

  6896430 CCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAATAAAAGG 6896489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 CCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCCATCAGTGCTTCCCAATAAAAGG 2262

  6896490 CCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGCCGGACA 6896549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 CCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCACGCCCCTCCCAGGGTTGCCGGACA 2322

  6896550 CCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCACCGTTT 6896609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 CCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGGCAGGTGTGGTAGAGGCACCTCTCCCACCGTTT 2382

  6896610 CAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCCCCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGGCTCCAC 6896669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 CAGAGCTTGGGCCTCCCACCAGCCCCTGAGCTCCTGCGGAGAAGCAGCTGAGGGCTCCAC 2442

  6896670 GGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGCCACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCTGTATCC 6896729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 GGATCTGCACGGGCCTCCTCTTGCCACCAGAGTCTCACTTCCCTGCGCCATCCTGTATCC 2502

  6896730 GTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTTATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATTTGAAAA 6896789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 GTTGGGGTGCAGCTTAGCACCTTTATGGATGACTTCCTCCTTGCCTGTCAAATTTGAAAA 2562

  6896790 TAAATGCCCGCCATCCATTTCTGATTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAGATCGTC 6896849
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 TAAATGCCCGCCGTCCATTTCTGATTGAGCCCCAACCTCAGTTAGCAATACCAGATCGTC 2622

  6896850 TCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCACCACTTTGGG 6896909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 TCATTAAAAAAAGAATTGGCTGGGTGTGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCACCACTTTGGG 2682

  6896910 ACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTAAGGTCAGGAGTACGAGACCAGCCTGGCCAACATGGT 6896969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 ACGCCGGGGCAGGCGGATTACTTAAGGTCAGGAGTACGAGACCAGCCTGGCCAACATGGT 2742

  6896970 GAAATCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCTTGGCGTGGCGTACGCCTGTAGTCC 6897029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 GAAATCCCATCTCCACTAAAAATACAAAAATTAGCTTGGCGTGGCGTACGCCTGTAGTCC 2802

  6897030 CAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGGCG-AATCACTTGCACCTAGAAGGCAGAGGTTGCACT 6897088
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 CAGCTATGCGGGAGGCGAGGCAGGCGAAATCACTTGCACCTAGAAGGCAGAGGTTGCACT 2862

  6897089 GAGCCGAGATT 6897099
          |||||||||||
     2863 GAGCCGAGATT 2873

Alignment time is 2.20084 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   9515] =>      9515 nucs 'mol-32-349d-181232_9515'

Score:        9250
Aligned:      9513        nucs
Identic:      9485 (100%) nucs =>      3748 (100%)      5737 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6885375,6889131] EXCISED REGION [6889138,6894889]
 second seq =>  [      1,   3758] EXCISED REGION [   3765,   9515]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         6 nucs [6889132,6889137]
 second seq =>         6 nucs [3759,3764]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6889131,6889131] to [6889138,6889138]
 second seq =>         1 nucs [3758,3758] to [3765,3765]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6885375 GTGGATGGTACACAAAGCTCAATCTTTTTGTTTTCTTCTGGGGAAAAAATTAAATCTTTA 6885434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGGATGGTACACAAAGCTCAATCTTTTTGTTTTCTTCTGGGGAAAAAATTAAATCTTTA 60

  6885435 TATGTTAATATGATTGATATTCATTGTGCAAAAAAAATCAGTGTGTTTTTAAAGAAGTAT 6885494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATGTTAATATGATTGATATTCATTGTGCAAAAAAAATCAGTGTGTTTTTAAAGAAGTAT 120

  6885495 AAGGGAAAAGGAAAACTCATATGTCCTTCTGTCACTCTGAGACATACACTGGTAACATCT 6885554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGGGAAAAGGAAAACTCATATGTCCTTCTGTCACTCTGAGACATACACTGGTAACATCT 180

  6885555 GTGCAAGCCCCTTTCCAGGATTCTGAATGTACAGTATATATGAATGCATACACAGAGAAA 6885614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTGCAAGCCCCTTTCCAGGATTCTGAATGTACAGTATATATGAATGCATACACAGAGAAA 240

  6885615 TTTACATTCAAGAGTGTACTATACTTGTTCTTCTATAACATCAGAAATAGGTTTTTACTC 6885674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTACATTCAAGAGTGTACTATACTTGTTCTTCTATAACATCAGAAATAGGTTTTTACTC 300

  6885675 AGATGTCTTCATGTCGGTAATTATAGAACTACATAATTATTTTTATAGCTGTATTATGTA 6885734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGATGTCTTCATGTCGGTAATTATAGAACTACATAATTATTTTTATAGCTGTATTATGTA 360

  6885735 GATTTAACAGGTTCCTCATTGATAAAACAATGTTTTTTTGGTTGTTTATTCAGTATCTGA 6885794
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATTTAACGGGTTCCTCATTGATAAAACAATGTTTTTTTGGTTGTTTATTCAGTATCTGA 420

  6885795 ATAACGTTTCTATGGACATCTGTAAACATGTATGAGGGGACTTTTAAAAGTTCATGGAAA 6885854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAACGTTTCTATGGACATCTGTAAACATGTATGAGGGGACTTTTAAAAGTTCATGGAAA 480

  6885855 ATGGAATTAAAAGAAAAATAAAAAAATATAAACTTTATTTCTCAACATAAGTTCCATCAA 6885914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGGAATTAAAAGAAAAATAAAAAAATATAAACTTTATTTCTCAACATAAGTTCCATCAA 540

  6885915 GTTCAAGATACTACTATAAGACATAATACCAACCATTCAGTCTATCCCTAAAGAACTGAG 6885974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTCAAGATACTACTATAAGACATAATACCAACCATTCAGTCTATCCCTAAAGAACTGAG 600

  6885975 GCTCCTGGAAATTTCACCTTGTCAGTGTAGTCTCTGCATTGTGAACTGAAGAGAAATGGG 6886034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCTCCTGGAAATTTCACCTTGTCAGTGTAGTCTCTGCATTGTGAACTGAAGAGAAATGGG 660

  6886035 TGCCCTTTACAGCTTTTTAAGATTAGGAAACAAAAAGTCAGAAGAAGCCCAATCAGGACT 6886094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCCCTTTACAGCTTTTTAAGATTAGGAAACAAAAAGTCAGAAGAAGCCCAATCAGGACT 720

  6886095 GCAAAGTGGATGCCTGATGATTTCCCATCAAAACTCTTGGAAAATGGCTCTCGTTTGCTG 6886154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCAAAGTGGATGCCTGATGATTTCCCATCAAAACTCTTGGAAAATGGCTCTCGTTTGCTG 780

  6886155 AGAGGAATGAGCAGGAGGAGCACTGTCATGGTGGAAAAGGGCTCTGGTGAAACTTTCCTA 6886214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGAGGAATGAGCAGGAGGAGCACTGTCATGGTGGAAAAGGGCTCTGGTGAAACTTTCCTA 840

  6886215 GGCATTGTTCTGCCACAGCTTTGGCTAACTTTCTCAAAACACTCGTCATAAGCAGATGTT 6886274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCATTGTTCTGCCACAGCTTTGGCTAACTTTCTCAAAACACTCGTCATAAGCAGATGTT 900

  6886275 AACATTCTTTGGGCATCTGGAAAGTCAGCACATACACAGTGCTTTGAGCATCCCAGAAAA 6886334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACATTCTTTGGGCATCTGGAAAGTCAGCACATACACAGTGCTTTGAGCATCCCAGAAAA 960

  6886335 TGGTTGCCTGGCCTCTGCTTTTGACCAGTCTGCATTTGCTATGAGGAGACCCCTCCCACC 6886394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGTTGCCTGGCCTCTGCTTTTGACCAGTCTGCATTTGCTATGAGGAGACCCCTCCCACC 1020

  6886395 TCTCGGTAGCCAGTGCTGTGATCACAATCACATTGTCTTCAGGATTGTGCTGGTAAAGCC 6886454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTCGGTAGCCAGTGCTGTGATCACAATCACATTGTCTTCAGGATTGTGCTGGTAAAGCC 1080

  6886455 ATGTTCCATCTCCTGTTACAGTTCTCAGAGGAAATGCTTTAGGATGTTGATTCCTCTTGT 6886514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGTTCCATCTCCTGTTACAGTTCTCAGAGGAAATGCTTTAGGATGTTGATTCCTCTTGT 1140

  6886515 TGAAAGTTTCCCCTGAAAGCTCTGCTGCTGTCTCCAGCTGATCTGAGTGCAGTGGTTTGG 6886574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAAAGTTTCCCCTGAAAGCTCTGCTGCTGTCTCCAGCTGATCTGAGTGCAGTGGTTTGG 1200

  6886575 TAGCCATTGAGTGGCAAGTTTGCTCAACGTTAATTTTTCAGTCAGATCGTGTAAGCTGAA 6886634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGCCATTGAGTGGCAAGTTTGCTCAACGTTAATTTTTCAGTCAGATCGTGTAAGCTGAA 1260

  6886635 CCATCTGAGGTGTCTGTGGTGTTGGGTGTTGTTTCTGCTGTTAATCATTGGTCCTCTTTG 6886694
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCATCTGAGGTGTCTATGGTGTTGGGTGTTGTTTCTGCTGTTAATCATTGGTCCTCTTTG 1320

  6886695 ATTCAGGCATGAATAAGATTAATTTTTTCCTCACAAATTGATGAGGAGGTCTTCACCATT 6886754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTCAGGCATGAATAAGATTAATTTTTTCCTCACAAATTGATGAGGAGGTCTTCACCATT 1380

  6886755 GTCTCATCCCTTCTTAAAACAAGTTACCCATTGGCAAACCTCTGATTTTGGCTGGGGGCG 6886814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTCTCATCCCTTCTTAAAACAAGTTACCCATTGGCAAACCTCTGATTTTGGCTGGGGGCG 1440

  6886815 GGGCATTGTCCCCATAAGCTTTTTTGTAAAAAAATCATTGATTTTGGGCCAGGTGTGGTG 6886874
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGGCATTGTCCCCATGAGCTTTTTTGTAAAAAAATCATTGATTTTGGGCCAGGTGTGGTG 1500

  6886875 GCTCACGCTTGTATTCCTAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGA 6886934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GCTCACGCTTGTATTCCTAGCACTTTGGGAGGCTGAGGTGGGTGGATCACGAGGTCAGGA 1560

  6886935 GATCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTTTATTAAAAATACAAAAAAAT 6886994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GATCGAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTGTCTTTATTAAAAATACAAAAAAAT 1620

  6886995 TAGCCAGGCGTGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAAGAGA 6887054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1621 TAGCCAGGCGTGGTGGCATGTGCCTGTAGTCCAAGCTACTCAGGAGGCTGAGGCAAGAGA 1680

  6887055 ATTGCTTGAACCTGAGAGGCGGAAGCTGCAGTGAGCCGAGATCACGCCACTGCACTCCAG 6887114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1681 ATTGCTTGAACCTGAGAGGCGGAAGCTGCAGTGAGCCGAGATCACGACACTGCACTCCAG 1740

  6887115 CCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAGG--AAAAAAAAAAAAAAAAATCACTGATCT 6887172
          ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||
     1741 CCTGGGCAACAGAGCGAGACTCTGTCTCAG-AAAAAAAAAAAAAAAAAAATCACTGATCT 1799

  6887173 CACCATTCTTCCACCCAAGCATCACCATAAATTTGATGTCCTTGCTTCCATTTTTAGCAG 6887232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CACCATTCTTCCACCCAAGCATCACCATAAATTTGATGTCCTTGCTTCCATTTTTAGCAG 1859

  6887233 AATTCATGTTGCTCTGATAGGTGCTCTTTTCAAACAGTCATACCCTTCTTAGTGCCTCAA 6887292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AATTCATGTTGCTCTGATAGGTGCTCTTTTCAAACAGTCATACCCTTCTTAGTGCCTCAA 1919

  6887293 AGTAGATCTTAAGACATGTTATAACAAGTTAGTACAAGTTTATTTTGGTGCAAAAAATTT 6887352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGTAGATCTTAAGACATGTTATAACAAGTTAGTACAAGTTTATTTTGGTGCAAAAAATTT 1979

  6887353 TTGAAATCTGTGCATAGCTCCTTTTTGGAGACAGTCTCACTGTGTCACCTAGGCTGGAGT 6887412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TTGAAATCTGTGCATAGCTCCTTTTTGGAGACAGTCTCACTGTGTCACCTAGGCTGGAGT 2039

  6887413 GCAGTGGCATGATCACTGTCATCTCAAACTCCTGGGCCTAGTGATCCTCCTGCCTCAGCC 6887472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GCAGTGGCATGATCACTGTCATCTCAAACTCCTGGGCCTAGTGATCCTCCTGCCTCAGCC 2099

  6887473 TCCCTAATAGCTGGGACTATAAGCACACCTCACCATGCCCAGCTCATTTTTTAATTTTTT 6887532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TCCCTAATAGCTGGGACTATAAGCACACCTCACCATGCCCAGCTCATTTTTTAATTTTTT 2159

  6887533 GTAGGAACAGGGTTGCCCAGGCTGGTCTCAATTACTTGGCCTCAATCCATCCTCCTCACC 6887592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GTAGGAACAGGGTTGCCCAGGCTGGTCTCAATTACTTGGCCTCAATCCATCCTCCTCACC 2219

  6887593 TCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCATTGCACCTGGCAATAGCACAGG 6887652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCCTGAGCCATTGCACCTGGCAATAGCACAGG 2279

  6887653 CCCTAAAGGATGTAGTTGGCCCACCCCCCAACACCATTTTTAAAGTCCTTACCCCACCGA 6887712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CCCTAAAGGATGTAGTTGGCCCACCCCCCAACACCATTTTTAAAGTCCTTACCCCACCGA 2339

  6887713 TTTGCAGGAGTGCAGTGATGTCATCTCGGTTCACTGCAGCCTCCACCTCCCGGAGCTCAG 6887772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TTTGCAGGAGTGCAGTGATGTCATCTCGGTTCACTGCAGCCTCCACCTCCCGGAGCTCAG 2399

  6887773 GCAGTCCTCCCCTCTCGGGCCAGGAATTCTGACACCACAGCTAAGTATTTTTAGAACAGC 6887832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 GCAGTCCTCCCCTCTCGGGCCAGGAATTCTGACACCACAGCTAAGTATTTTTAGAACAGC 2459

  6887833 CCGGGGTGGAGTGTAAAGGCTTCTGCCTTTTTCACTGAAAGTGCTCTGGCCACTGCCCTG 6887892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CCGGGGTGGAGTGTAAAGGCTTCTGCCTTTTTCACTGAAAGTGCTCTGGCCACTGCCCTG 2519

  6887893 TGTGCCTGCTGCTGCTGCCACTACAGATGCCACTCTGGCCATGAGTGGCTGTGGCAGTGC 6887952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TGTGCCTGCTGCTGCTGCCACTACAGATGCCACTCTGGCCATGAGTGGCTGTGGCAGTGC 2579

  6887953 CCAGGAGGCCTGCATCTACCAGCAGTCCAGGAACAGAAAGGAAGCCCCTGCCCCTGGTTC 6888012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CCAGGAGGCCTGCATCTACCAGCAGTCCAGGAACAGAAAGGAAGCCCCTGCCCCTGGTTC 2639

  6888013 CTCTTGAAAGCAGCCAGTCGGATGGCGTCACAAGCTGGCCACTGTTGTGAACGCAGAGAT 6888072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CTCTTGAAAGCAGCCAGTCGGATGGCGTCACAAGCTGGCCACTGTTGTGAACGCAGAGAT 2699

  6888073 TAGGAAATGAGCTGTCGTTTCAGAGCCCGCTGCTAGCCTTGTGCCACTGGTGTGGTTAAT 6888132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TAGGAAATGAGCTGTCGTTTCAGAGCCCGCTGCTAGCCTTGTGCCACTGGTGTGGTTAAT 2759

  6888133 TAATAGCATGTTCAGGGACGGTTGCCTCAATTATCAAGCTGGTAATGATGCTGCCACCTA 6888192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TAATAGCATGTTCAGGGACGGTTGCCTCAATTATCAAGCTGGTAATGATGCTGCCACCTA 2819

  6888193 ACGTTTGGTTGGCGTTGCTATTGTCTGTGCTAGTCATAGTCAACAGCTGACACTGAGGGC 6888252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 ACGTTTGGTTGGCGTTGCTATTGTCTGTGCTAGTCATAGTCAACAGCTGACACTGAGGGC 2879

  6888253 TTACTGGCTGCCACGCATTCTAAGCGCTCTTGAGTGTTAACTAGCAACCCTATGAGGGAG 6888312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 TTACTGGCTGCCACGCATTCTAAGCGCTCTTGAGTGTTAACTAGCAACCCTATGAGGGAG 2939

  6888313 CTACAGCTGCTCTGTTTTACAGATGAGTAAACTGAGGCACAATGGGGCATTAGGCACTTG 6888372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CTACAGCTGCTCTGTTTTACAGATGAGTAAACTGAGGCACAATGGGGCATTAGGCACTTG 2999

  6888373 CAGTCTCACACTTGGTGGATGCTGGAGCCCGAATTCACCTTGGGCACTGACTGCAGAGTC 6888432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CAGTCTCACACTTGGTGGATGCTGGAGCCCGAATTCACCTTGGGCACTGACTGCAGAGTC 3059

  6888433 CATTTAACACTGAAACCTCCATCTCACAAAATCCCACTCATTAAGTTACGTATTGTCTCT 6888492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 CATTTAACACTGAAACCTCCATCTCACAAAATCCCACTCATTAAGTTACGTATTGTCTCT 3119

  6888493 GGGCACGGTGGCTCATGCCTGTTAACCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCAC 6888552
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GGGCACGGTGGCTCATGCCTGTTAACCTAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCGGATCAC 3179

  6888553 CTGAGGTCAGGAGTTCCGAGACCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAA 6888612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CTGAGGTCAGGAGTTCCGAGACCAACCTGGCCAACATGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAA 3239

  6888613 ACTACAAAAATTAGCCAGGCATAATGACAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCCGGAGGCT 6888672
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     3240 ACTACAAAAATTAGCCAGGCATAATGACAGGCGCCTGTAATCCCAGCTACTCCAGAGGCT 3299

  6888673 GAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGTGGTGATCTGAGATCGCGCCA 6888732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 GAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGTGGTGATCTGAGATCGCGCCA 3359

  6888733 CTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAGTTATGTATTGTC 6888792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 CTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAAAAGTTATGTATTGTC 3419

  6888793 TGCGTACTTGCAGGGAGTCCTGCTGTGTCAGCCCCGGCTGTGTGTCCTTGGGCGAGTTAC 6888852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TGCGTACTTGCAGGGAGTCCTGCTGTGTCAGCCCCGGCTGTGTGTCCTTGGGCGAGTTAC 3479

  6888853 TCAGTCTCACACGTTGGTATCTTTAGATGTAAATGGAGATCATAACTGGACCTCTCTCCT 6888912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TCAGTCTCACACGTTGGTATCTTTAGATGTAAATGGAGATCATAACTGGACCTCTCTCCT 3539

  6888913 AAGGGTTGGTTATAAACATAAAATAGTCCATCTGCATAAATACTAGAGTGCAAACTAAAA 6888972
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AAGGGTTGGTTATAAACATGAAATAGTCCATCTGCATAAATACTAGAGTGCAAACTAAAA 3599

  6888973 AGTACCTGAGACAGACCTCAATTAATTTAGAAGTGTATTTTGCCAAGACTCAGGACACAC 6889032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 AGTACCTGAGACAGACCTCAATTAATTTAGAAGTGTATTTTGCCAAGACTCAGGACACAC 3659

  6889033 CTGAGAGAGAGAGGTCTGTGCCTTTCTCCAAAGATGATTTTGAGAGCTTCTGTATTTAAA 6889092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 CTGAGAGAGAGAGGTCTGTGCCTTTCTCCAAAGATGATTTTGAGAGCTTCTGTATTTAAA 3719

  6889093 GGGGAAAAGTGGGCTGGAGGGGGAAGGGGGAGGGTGTGG 6889131
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GGGGAAAAGTGGGCTGGAGGGGGAAGGGGGAGGGTGTGG 3758

EXCISED REGION

  6889138 GACTGAATCCACAGGTTGCGAGAGAAAAGGAGCAGGTAGGGGAGTAGTCAATTAGGTATT 6889197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 GACTGAATCCACAGGTTGCGAGAGAAAAGGAGCAGGTAGGGGAGTAGTCAATTAGGTATT 3824

  6889198 TGACTTGTACGCACTAAATCCTCACTTTACGTAAGATACAGTGAACACAGAGTAGCTACC 6889257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 TGACTTGTACGCACTAAATCCTCACTTTACGTAAGATACAGTGAACACAGAGTAGCTACC 3884

  6889258 TGTGGAGATAGCTGGCCTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTGGACAGGATCTCACGCTTACC 6889317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 TGTGGAGATAGCTGGCCTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTGGACAGGATCTCACGCTTACC 3944

  6889318 CAGGATGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGATCTTGGCTCACTGCAGCCTCAGCCTCCCGAG 6889377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 CAGGATGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGATCTTGGCTCACTGCAGCCTCAGCCTCCCGAG 4004

  6889378 TAGCTGGAACCACAGGTGTGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGACA 6889437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 TAGCTGGAACCACAGGTGTGCGCCACCACACCCAGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGACA 4064

  6889438 GAGGTTTCACCATGCTGCCCAGGCTGGCCGTGAATTCTTGGGCTCAAGCAATGCTTCCAC 6889497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 GAGGTTTCACCATGCTGCCCAGGCTGGCCGTGAATTCTTGGGCTCAAGCAATGCTTCCAC 4124

  6889498 CTCGGCCTTTCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAAGCCACCGTGCCTGGCCTGTCTGGC 6889557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 CTCGGCCTTTCAAAGTGCTGGGATTACAGTCGTGAAGCCACCGTGCCTGGCCTGTCTGGC 4184

  6889558 CCTTTCGCTGTAGCTATCTGCTTAAGAACATAAGGAAACGCAGCTTCTTGCATGAGTCTA 6889617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
     4185 CCTTTCGCTGTAGCTATCTGCTTAAGAACATAAGGAAAC-CAGCTTCTTGCATGAGTCTA 4243

  6889618 TTCTCATCTTAAGTATTTCCTTTTAGCACAGTGAATTACGGTCCCACGTTTTTATTTTCC 6889677
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     4244 TTCTCATCTTAAGTATTTCCTTTTAGGACAGTGAATTACGGTCCCACGTTTTTATTTTCC 4303

  6889678 TTTCACACTGGACTCAAAAAAAGCAAAAACGGAAATGCAAAAGAGAAGTTGCAGCACTGA 6889737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4304 TTTCACACTGGACTCAAAAAAAGCAAAAACGGAAATGCAAAAGAGAAGTTGCAGCACTGA 4363

  6889738 GTCCAGTAACTAAGGAGACAGTTGCCTCTTTGCAGGCGGTCTCTCACTCCCTGCCCTCCC 6889797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4364 GTCCAGTAACTAAGGAGACAGTTGCCTCTTTGCAGGCGGTCTCTCACTCCCTGCCCTCCC 4423

  6889798 CCCTGTGCTAGCAGAGCCCTTTAAGGGCCCTTGTTGGATCTGCAGCTCCAGGCCTGCCTA 6889857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4424 CCCTGTGCTAGCAGAGCCCTTTAAGGGCCCTTGTTGGATCTGCAGCTCCAGGCCTGCCTA 4483

  6889858 GTCAGCGGGGGTCAGCAGGGGTCAGCCCCACAGAGGCCATTCATCCTTGAGTGCTGACCA 6889917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4484 GTCAGCGGGGGTCAGCAGGGGTCAGCCCCACAGAGGCCATTCATCCTTGAGTGCTGACCA 4543

  6889918 CAGTGCTGTCACCATGATCTCGCCCTGAAGGGAGGTCACGCTATCCCTTCGACACAGGAG 6889977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4544 CAGTGCTGTCACCATGATCTCGCCCTGAAGGGAGGTCACGCTATCCCTTCGACACAGGAG 4603

  6889978 ACCAACTCCTTTGGCTGTCCTTGGCTCCCAGTGGTGGCTGAACCAGAGGGCAGGGGCCAG 6890037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4604 ACCAACTCCTTTGGCTGTCCTTGGCTCCCAGTGGTGGCTGAACCAGAGGGCAGGGGCCAG 4663

  6890038 GGCAGCAGCAGAGCCAAGTGTGCCCACTGGGGCCGAGGGCTCTGGCCACCACGTCCGTTG 6890097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4664 GGCAGCAGCAGAGCCAAGTGTGCCCACTGGGGCCGAGGGCTCTGGCCACCACGTCCGTTG 4723

  6890098 GGGAGGATGGTGGGGAGGGCCCTGGCCTTGCAGCGAGGGGGCAGGCACACGGTCTCCCAC 6890157
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4724 GGGAAGATGGTGGGGAGGGCCCTGGCCTTGCAGCGAGGGGGCAGGCACACGGTCTCCCAC 4783

  6890158 TTCCTATCACAGTCCAGGGGTGGGGAGGACCCCACCCTCTGGCCCTGTCACAGGTGGGGA 6890217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4784 TTCCTATCACAGTCCAGGGGTGGGGAGGACCCCACCCTCTGGCCCTGTCACAGGTGGGGA 4843

  6890218 CAGTGACCCTCCCCTTCCAGGTGAGGCTACATTTTGAGGCTGAGGAGCACACGAAATGCT 6890277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4844 CAGTGACCCTCCCCTTCCAGGTGAGGCTACATTTTGAGGCTGAGGAGCACACGAAATGCT 4903

  6890278 GGTCCTCAGCAGCGCTAAGGCCAGGAGCCCCTGATGTGTGAGTTTGTGTGGGGATGTTGC 6890337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4904 GGTCCTCAGCAGCGCTAAGGCCAGGAGCCCCTGATGTGTGAGTTTGTGTGGGGATGTTGC 4963

  6890338 CCCTGAGGAGGGGTGATAGGAAGAGCCCCCTCCTCGTGAGCTGTGACCCTGAGCCAGTGG 6890397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4964 CCCTGAGGAGGGGTGATAGGAAGAGCCCCCTCCTCGTGAGCTGTGACCCTGAGCCAGTGG 5023

  6890398 CTCTCTCAACTGTGAGATGGGGACCCTTCTCCCTCCCAGGGCTAGGGGAGGAGAACTGGC 6890457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5024 CTCTCTCAACTGTGAGATGGGGACCCTTCTCCCTCCCAGGGCTAGGGGAGGAGAACTGGC 5083

  6890458 AGGCAAAGTGTCCGCTCATTTCCCTGAATAGAATACAGGCTCCCTCCTGAGGGTTTCTTG 6890517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5084 AGGCAAAGTGTCCGCTCATTTCCCTGAATAGAATACAGGCTCCCTCCTGAGGGTTTCTTG 5143

  6890518 CCGTCCCCACGTGGTCCCTCCCAGCCCTCACAGTGGGCACCAGCAGTGCTGTCCCTCCTG 6890577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5144 CCGTCCCCACGTGGTCCCTCCCAGCCCTCACAGTGGGCACCAGCAGTGCTGTCCCTCCTG 5203

  6890578 CCCGGGGCCCTAGAGGGAGGAGGAAGACGTGAGTCCTGGGACTGGGCAGGGAGACAGGTC 6890637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5204 CCCGGGGCCCTAGAGGGAGGAGGAAGACGTGAGTCCTGGGACTGGGCAGGGAGACAGGTC 5263

  6890638 AGTCCCCGCTCCACGAGTTCCTGGAGCCCTCGGGTCTACCCTGCTCTGACCGAGCTGCTA 6890697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5264 AGTCCCCGCTCCACGAGTTCCTGGAGCCCTCGGGTCTACCCTGCTCTGACCGAGCTGCTA 5323

  6890698 TGGGTAGAGCAGATCTACCTACGGCCCATCATCTCTGCGTCTTTCCCAGCAGTCTCAGGG 6890757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5324 TGGGTAGAGCAGATCTACCTACGGCCCATCATCTCTGCGTCTTTCCCAGCAGTCTCAGGG 5383

  6890758 TGTCTGTCACCGAGGCTGAGAACCCAAAGTTCTGGCCCAGGAGCACCCGGCAGAGGTGTG 6890817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5384 TGTCTGTCACCGAGGCTGAGAACCCAAAGTTCTGGCCCAGGAGCACCCAGCAGAGGTGTG 5443

  6890818 AGCCGGGGTCTGCCGATGGCTCATCTGATTCCCAAGTGCAGTGCTGCTTTCCCACTACCG 6890877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5444 AGCCGGGGTCTGCCGATGGCTCATCTGATTCCCAAGTGCAGTGCTGCTTTCCCACTACCG 5503

  6890878 TGGCCTCCACAAACCAGCGCTGTGCCCCCGCTACCGCCGCCACTCCCAGGGGGCCAAGTC 6890937
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5504 TGGCCTCCACAAACCAGCGCTGTGCCCCCGCTACCGCCGCCACTCCCAGGGGGCCAAGTT 5563

  6890938 CCACACCTTCAGACCCTCAAGACGGGAGCCGGAAGCCACCGCGGAACTAAAGTCTGGGAA 6890997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5564 CCACACCTTCAGACCCTCAAGACGGGAGCCGGAAGCCACCGCGGAACTAAAGTCTGGGAA 5623

  6890998 CCCCCCTTGGGGCGCTCAGGATTCACCCGCGCATGTGGCTGGGCACAGGCCTGTCCTCCA 6891057
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5624 CCCCCCTTGGGGTGCTCAGGATTCACCCGCGCATGTGGCTGGGCACAGGCCTGTCCTCCA 5683

  6891058 GGAGACTGCAGGCTGGGGACCCAAGGGTGACACCACAGGCTGCCCGCGCTTTGTGCGCAA 6891117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5684 GGAGACTGCAGGCTGGGGACCCAAGGGTGACACCACAGGCTGCCCGCGCTTTGTGCGCAA 5743

  6891118 AGCCAGGAGCGCTCTTCAGTGAAGTGGAGGCGGCACTGCGAGAACCCCGGACTGGGCGCT 6891177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5744 AGCCAGGAGCGCTCTTCAGTGAAGTGGAGGCGGCACTGCGAGAACCCCGGACTGGGCGCT 5803

  6891178 GCGACCGCAGACTCAAGGTCGCGGCGCCTCAGGGATCACTGGGGGCTTGAGTGAGCCCTG 6891237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5804 GCGACCGCAGACTCAAGGTCGCGGCGCCTCAGGGATCACTGGGGGCTTGAGTGAGCCCTG 5863

  6891238 ACCCTCTCCTGGGCCTTCCTATGCAGCGAGGGGCCGGACCCTGTGGTGCCTGAGGGCATT 6891297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5864 ACCCTCTCCTGGGCCTTCCTATGCAGCGAGGGGCCGGACCCTGTGGTGCCTGAGGGCATT 5923

  6891298 GTTTGTGGCTCTACTCTAGATCCGATTCCTGGTGATCACATATGTCAAACGTAACCACTT 6891357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5924 GTTTGTGGCTCTACTCTAGATCCGATTCCTGGTGATCACATATGTCAAACGTAACCACTT 5983

  6891358 CGACCTCCCACAAACTGCCAGCTGCGAGCCCCTGATAACAGAAGTGGCCGCACTCGCCGG 6891417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5984 CGACCTCCCACAAACTGCCAGCTGCGAGCCCCTGATAACAGAAGTGGCCGCACTCGCCGG 6043

  6891418 AGCTCCCTCCCTGGCCTGCCTGGCACACGCTGGTGGCTTTCCCCGGGCTCTCTGCTCAGG 6891477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6044 AGCTCCCTCCCTGGCCTGCCTGGCACACGCTGGTGGCTTTCCCCGGGCTCTCTGCTCAGG 6103

  6891478 CCTTACCACCACCCTAGACTGAGGGACGGGGGAATTGCTCAGACAGACTAGGGACTCTGC 6891537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6104 CCTTACCACCACCCTAGACTGAGGGACGGGGGAATTGCTCAGACAGACTAGGGACTCTGC 6163

  6891538 GAGGGTGACAAAACGAACTTGCAGGTCCTGGCTGTTAGCTAGAGCATTGCACTGCATTCC 6891597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6164 GAGGGTGACAAAACGAACTTGCAGGTCCTGGCTGTTAGCTAGAGCATTGCACTGCATTCC 6223

  6891598 TGCGGGTGGTCGCTGCCCCCATGCCCTCACTGATCTTAGTGCCACACCCCTCGCCTGGAG 6891657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6224 TGCGGGTGGTCGCTGCCCCCATGCCCTCACTGATCTTAGTGCCACACCCCTCGCCTGGAG 6283

  6891658 GTCCTGCTGCAGCCCTTGCTGCCCCATAAGACCTTACCAGGGATACGGGGTGAGCCCGGC 6891717
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6284 GTCCTGCTGCAGCCCTTGCTGACCCATAAGACCTTACCAGGGATACGGGGTGAGCCCGGC 6343

  6891718 CCCTCTCTGCCATGACGCACGGGTGTTCTGCAGACACCTCGAGGGAGCCTTTGCTGCTCA 6891777
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     6344 CCCTCTCTGCCATGACGCACGGGTGTTCTGCAGACACCTCGAGGGGGCCTTTGCTGCTCA 6403

  6891778 CTTCCCTGCCTCTCCTTCCCCAGCCCCACCACCCACCTGCCGCTGCCTCTTCCCAAGCTG 6891837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6404 CTTCCCTGCCTCTCCTTCCCCAGCCCCACCACCCACCTGCCGCTGCCTCTTCCCAAGCTG 6463

  6891838 GGGAGGAAGTGGAGAACCTGGGCCTCTGAGTGACTGACTTCCTCCTACAGAACTCAATTC 6891897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6464 GGGAGGAAGTGGAGAACCTGGGCCTCTGAGTGACTGACTTCCTCCTACAGAACTCAATTC 6523

  6891898 CTCCACCTGCAGACGGTTTCCCGCCTCTTCCCAGGGTTGGTGGCATCACCCACTGGAGCA 6891957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6524 CTCCACCTGCAGACGGTTTCCCGCCTCTTCCCAGGGTTGGTGGCATCACCCACTGGAGCA 6583

  6891958 GGAGGCCTCGTTTTCCTACTGACCTGTGCCCTGACCTTCCAGAGTCAACACAGTGGGAAT 6892017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6584 GGAGGCCTCGTTTTCCTACTGACCTGTGCCCTGACCTTTCAGAGTCAACACAGTGGGAAT 6643

  6892018 GGAGACAGCTTGGGGTTGTTTGTGATATGGTTTGACTCTGTGTCCCCACCCAAATCTCAT 6892077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6644 GGAGACAGCTTGGGGTTGTTTGTGATATGGTTTGACTCTGTGTCCCCACCCAAATCTCAT 6703

  6892078 GTTGAATTGTGATCCCCAGCGTTGGATGTGGGGCCGGTGGGAGGTGATTGGGCCTTGGGG 6892137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6704 GTTGAATTGTGATCCCCAGCGTTGGATGTGGGGCCGGTGGGAGGTGATTGGGCCTTGGGG 6763

  6892138 GTGGTCTCTAATGGTTTAGCACCATCCAGCACCCTAGTGCTGTTTTGTGATAGAGTTCTC 6892197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6764 GTGGTCTCTAATGGTTTAGCACCATCCAGCACCCTAGTGCTGTTTTGTGATAGAGTTCTC 6823

  6892198 AGGAGATCTGGTTGTTTGAAAGTGTGTAGCACCTCCCCCTTCACTGTCTCTCCTGCTGGC 6892257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6824 AGGAGATCTGGTTGTTTGAAAGTGTGTAGCACCTCCCCCTTCACTGTCTCTCCTGCTGGC 6883

  6892258 CATGTGAAGATGTACCTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATGACTGTAAGTTTCCTGAGGC 6892317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6884 CATGTGAAGATGTACCTGCTTCCCCTTCACCTTCTGCCATGACTGTAAGTTTCCTGAGGC 6943

  6892318 CTTCCCAGCCATGCTTCCCGTACAGCCTGCAGAACTGTGAGTCAATTAAGCCTCTTTTTT 6892377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6944 CTTCCCAGCCATGCTTCCCGTACAGCCTGCAGAACTGTGAGTCAATTAAGCCTCTTTTTT 7003

  6892378 TTTTCATAAATTACCCAGTCTCAGTTATATCTTTATAGCAGTGTGAAATGGACTAATACA 6892437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7004 TTTTCATAAATTACCCAGTCTCAGTTATATCTTTATAGCAGTGTGAAATGGACTAATACA 7063

  6892438 GGGTGTCTTCATGTTGGCATTAACCTGCTAATTAGGAAGAAAAAGAAGTCTCTGGGTCTT 6892497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7064 GGGTGTCTTCATGTTGGCATTAACCTGCTAATTAGGAAGAAAAAGAAGTCTCTGGGTCTT 7123

  6892498 GGTCTCCCCAACTGCAAAATTTGTGGATGGGCCACTGCCATTTCAGAGAGGCCTCCCTCA 6892557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7124 GGTCTCCCCAACTGCAAAATTTGTGGATGGGCCACTGCCATTTCAGAGAGGCCTCCCTCA 7183

  6892558 GCAAGGACAGAGTGAAAGTTTGTGGGGTGGTTTCTGGGCTGGGGCACTGGGCCTGTCAAC 6892617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7184 GCAAGGACAGAGTGAAAGTTTGTGGGGTGGTTTCTGGGCTGGGGCACTGGGCCTGTCAAC 7243

  6892618 TGGTGGCATCCAGCGTTTATGGAACAAATGATGCTGGTACCCAGGGATGCCCTGGGACTC 6892677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7244 TGGTGGCATCCAGCGTTTATGGAACAAATGATGCTGGTACCCAGGGATGCCCTGGGACTC 7303

  6892678 CTCCCACCTGGGGTGAAAGTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAG 6892737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7304 CTCCCACCTGGGGTGAAAGTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAG 7363

  6892738 TGCCACCCTGTATTAGGCCATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAA 6892797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7364 TGCCACCCTGTATTAGGCCATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAA 7423

  6892798 TTTATAAAGAAAAAAAGGCTTAACTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGA 6892857
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7424 TTTATAAAGAAAAAAAGGCTTAATTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGA 7483

  6892858 TGCCGGCATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGGCC--TCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAG 6892915
          |||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||
     7484 TGCCGGCATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGG--AGTCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAG 7541

  6892916 GGGAAGGGGAAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGG 6892975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7542 GGGAAGGGGAAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGG 7601

  6892976 CTGGAGTACAGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGAT 6893035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7602 CTGGAGTACAGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGAT 7661

  6893036 TCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTA 6893095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7662 TCTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTA 7721

  6893096 ATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTC 6893155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7722 ATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTC 7781

  6893156 CCGACCTCAGGTGACCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGC 6893215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7782 CCGACCTCAGGTGACCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGC 7841

  6893216 CACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGC 6893275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7842 CACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGC 7901

  6893276 AGGGGATGTGCCACACACTTTTCAACAACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGA 6893335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     7902 AGGGGATGTGCCACACACTTTTCAACAACCGGATGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGA 7961

  6893336 TGGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACC 6893395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7962 TGGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACC 8021

  6893396 TGCAAGATTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTC 6893455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8022 TGCAAGATTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTC 8081

  6893456 TATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAA 6893515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8082 TATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAA 8141

  6893516 GGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTC 6893575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8142 GGAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTC 8201

  6893576 TCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTCAATAACATA 6893635
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
     8202 TCCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTCGATAACGTA 8261

  6893636 TATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTTTT 6893695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8262 TATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTTTT 8321

  6893696 CTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTCCT 6893755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8322 CTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTCCT 8381

  6893756 CTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTCTT 6893815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8382 CTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTCTT 8441

  6893816 TCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAAGA 6893875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8442 TCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAAGA 8501

  6893876 TGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGAAG 6893935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8502 TGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGAAG 8561

  6893936 TCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGAGG 6893995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8562 TCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGAGG 8621

  6893996 GAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACGCG 6894055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8622 GAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACGCG 8681

  6894056 TTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGCCA 6894115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8682 TTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGCCA 8741

  6894116 CTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGATC 6894175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8742 CTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGATC 8801

  6894176 AAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAACAG 6894235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8802 AAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAACAG 8861

  6894236 GGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTCAA 6894295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8862 GGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTCAA 8921

  6894296 GCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAG 6894355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8922 GCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAG 8981

  6894356 TGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCT 6894415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8982 TGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCT 9041

  6894416 CTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGC 6894475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9042 CTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGC 9101

  6894476 CTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGC 6894535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9102 CTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGC 9161

  6894536 TGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGG 6894595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9162 TGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGG 9221

  6894596 TTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCA 6894655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9222 TTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCA 9281

  6894656 CCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAA 6894715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9282 CCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAA 9341

  6894716 CGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGAT 6894775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9342 CGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGAT 9401

  6894776 TTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTG 6894835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9402 TTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTG 9461

  6894836 GGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGC 6894889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9462 GGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGC 9515

Alignment time is 7.16938 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   3613] =>      3613 nucs 'mol-32-34b3-097510_3613'

Score:        3489
Aligned:      3528        nucs
Identic:      3522 (100%) nucs =>      1295 (100%)      2227 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6892328,6893626] EXCISED REGION [6893634,6895860]
 second seq =>  [      1,   1299] EXCISED REGION [   1307,   3533]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [6893627,6893633]
 second seq =>         7 nucs [1300,1306]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6893627,6893627] to [6893633,6893633]
 second seq =>         1 nucs [1300,1300] to [1306,1306]

  6892328 ATGCTTCCCGTACAGCCTGCAGAACTGTGAGTCAATTAAGCCTCTTTTTTTTTTCATAAA 6892387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGCTTCCCGTACAGCCTGCAGAACTGTGAGTCAATTAAGCCTCTTTTTTTTTTCATAAA 60

  6892388 TTACCCAGTCTCAGTTATATCTTTATAGCAGTGTGAAATGGACTAATACAGGGTGTCTTC 6892447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTACCCAGTCTCAGTTATATCTTTATAGCAGTGTGAAATGGACTAATACAGGGTGTCTTC 120

  6892448 ATGTTGGCATTAACCTGCTAATTAGGAAGAAAAAGAAGTCTCTGGGTCTTGGTCTCCCCA 6892507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTTGGCATTAACCTGCTAATTAGGAAGAAAAAGAAGTCTCTGGGTCTTGGTCTCCCCA 180

  6892508 ACTGCAAAATTTGTGGATGGGCCACTGCCATTTCAGAGAGGCCTCCCTCAGCAAGGACAG 6892567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACTGCAAAATTTGTGGATGGGCCACTGCCATTTCAGAGAGGCCTCCCTCAGCAAGGACAG 240

  6892568 AGTGAAAGTTTGTGGGGTGGTTTCTGGGCTGGGGCACTGGGCCTGTCAACTGGTGGCATC 6892627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGAAAGTTTGTGGGGTGGTTTCTGGGCTGGGGCACTGGGCCTGTCAACTGGTGGCATC 300

  6892628 CAGCGTTTATGGAACAAATGATGCTGGTACCCAGGGATGCCCTGGGACTCCTCCCACCTG 6892687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGCGTTTATGGAACAAATGATGCTGGTACCCAGGGATGCCCTGGGACTCCTCCCACCTG 360

  6892688 GGGTGAAAGTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAGTGCCACCCTG 6892747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGTGAAAGTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGAGTGCCACCCTG 420

  6892748 TATTAGGCCATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAAAGA 6892807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTAGGCCATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTAATTTATAAAGA 480

  6892808 AAAAAAGGCTTAACTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGCATC 6892867
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAAAAGGCTTAATTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATGATGCCGGCATC 540

  6892868 TGCTCGGCTTTTGGGGAGGCC--TCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGGA 6892925
          |||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCTCGGCTTTTGGGGAGG--AGTCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGAAGGGGA 598

  6892926 AGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTACA 6892985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      599 AGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGGAGTACA 658

  6892986 GTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCT 6893045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      659 GTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCT 718

  6893046 CAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTAT 6893105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 CAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTAT 778

  6893106 TTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAG 6893165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      779 TTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGACCTCAG 838

  6893166 GTGACCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCC 6893225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      839 GTGACCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACCGTGCCC 898

  6893226 AGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTG 6893285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      899 AGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGGGATGTG 958

  6893286 CCACACACTTTTCAACAACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAG 6893345
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      959 CCACACACTTTTCAACAACCGGATGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGCACCAAG 1018

  6893346 CCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTG 6893405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1019 CCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCAAGATTG 1078

  6893406 GGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTC 6893465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1079 GGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATCATAGTC 1138

  6893466 CAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCAT 6893525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1139 CAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAGTTCCAT 1198

  6893526 GGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTA 6893585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1199 GGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCAGGGTTA 1258

  6893586 GGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTC 6893626
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 GGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTC 1299

EXCISED REGION

  6893634 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 6893693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1307 TATATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTT 1366

  6893694 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 6893753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1367 TTCTGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTC 1426

  6893754 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 6893813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1427 CTCTTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTC 1486

  6893814 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 6893873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1487 TTTCTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAA 1546

  6893874 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 6893933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1547 GATGTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGA 1606

  6893934 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 6893993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1607 AGTCAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGA 1666

  6893994 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 6894053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1667 GGGAGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACG 1726

  6894054 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 6894113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1727 CGTTTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGC 1786

  6894114 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 6894173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1787 CACTGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGA 1846

  6894174 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 6894233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1847 TCAAAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAAC 1906

  6894234 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 6894293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1907 AGGGCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTC 1966

  6894294 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 6894353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1967 AAGCCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAG 2026

  6894354 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 6894413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2027 AGTGCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCC 2086

  6894414 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 6894473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2087 CTCTGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGG 2146

  6894474 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 6894533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2147 GCCTGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCA 2206

  6894534 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 6894593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2207 GCTGCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTG 2266

  6894594 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 6894653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2267 GGTTTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGG 2326

  6894654 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 6894713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2327 CACCTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAA 2386

  6894714 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 6894773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2387 AACGTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGG 2446

  6894774 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 6894833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2447 ATTTCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTT 2506

  6894834 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 6894893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2507 TGGGAGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCGCAAGTTGGAGAGCAGCCTGGGCAACA 2566

  6894894 TGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATG 6894953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2567 TGGCAAAATCCCATCTCTACAAAAAATACAAAAAAATTTAGCTGAGCACGGTGGCACATG 2626

  6894954 CCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCA 6895013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2627 CCTGTAGTCCCAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTACGAGGATCACCTGAGCCCAGAAAGTCA 2686

  6895014 AGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTG 6895073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2687 AGGCTGCAGTGAGCCGTGACAGACTCTGCACCCCAGCCTGGGGGACAGAGTGAGACCCTG 2746

  6895074 TCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGA 6895133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2747 TCTCTAAATAAATAAAAACAAAAAAACAAATCATGATAAAAAAAAAATACTGCCTGTTGA 2806

  6895134 ACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAG 6895193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2807 ACAGGTCTGGGAAAAAAAATCCACTGATGCATAGCAGAGAATCTGCTAGAAATTCTGTAG 2866

  6895194 CTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGT 6895253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2867 CTTTTCAAAGAAGATCACCATGGTATTTTCTTCCTTCTCACAGTTGGATGAGCTCACTGT 2926

  6895254 ACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGAT 6895313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2927 ACAAATGTGAATGGAGCACTGGGCTGCTGACTGGGCATGGGTTTGGCCTGGTGCAGGGAT 2986

  6895314 GGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGG 6895373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2987 GGCTGAGCTGGGGTCCTGTGCAGGCCACTGCCCTCCTCTGCCCTGAGTGTCCTTGTCTGG 3046

  6895374 AGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCAT 6895433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3047 AGAAAATGGAGATCACCCACCCCAGCTCCAGCGTGGCAGTGAGTTTGGTTACTCATTCAT 3106

  6895434 GGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACA 6895493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3107 GGAAGGGAAGGCCCTTTGTAACTGTACACGAGGAATTAGCAAAGTCATCGTTGCAATACA 3166

  6895494 CTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGT 6895553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3167 CTGAAAAAAAAACCAGGTCTCACCACTGTGCAACCCTAACATAAACCACGTGCGGTATGT 3226

  6895554 GGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTA 6895613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3227 GGCCTTTGGACCCAGATTTAACAAACTGTAAAAAGACACTGTTAGAGAAACACTGGGCTA 3286

  6895614 GCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACAC 6895673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3287 GCGGGAGATACTGAGGAATTGTCAGTGTTATTAGATATGCTGGCAGTATTATGACTACAC 3346

  6895674 TTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGA 6895733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3347 TTCCAAAAAAGTCTTTCTTCTAGAGACATGTACAGAAGAAGCTGAAGTATCTTCATGTGA 3406

  6895734 ACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATAT 6895793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3407 ACTGACGTATCTGAGATATACTCTAAAGGAATCCAGGGAAATTTACAATAGGAAGAATAT 3466

  6895794 GGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCAT 6895853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3467 GGGGAGGAGGTGAGAAGAGCAGAATATTGATCACTGTTAGGGTAGGCCTCAGGGGTTCAT 3526

  6895854 TATACTG 6895860
          |||||||
     3527 TATACTG 3533

Alignment time is 2.73577 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   2699] =>      2699 nucs 'mol-32-34be-219944_2699'

Score:        2622
Aligned:      2699        nucs
Identic:      2692 (100%) nucs =>      2155 (100%)       537 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6892677,6894837] EXCISED REGION [6896048,6896585]
 second seq =>  [      1,   2161] EXCISED REGION [   2162,   2699]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1210 nucs [6894838,6896047]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        29 nucs [6894838,6894866] to [6896048,6896076]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6894838,6894838] to [6896047,6896047]
 second seq =>         0 nucs

  6892677 CCTCCCACCTGGGGTGAAAGTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGA 6892736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCCCACCTGGGGTGAAAGTCATTCAAACAATGAGGGGATGCCCCCCAAATTCAACAGA 60

  6892737 GTGCCACCCTGTATTAGGCCATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTA 6892796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTGCCACCCTGTATTAGGCCATTCTCACACTGCTACAAAAAAAATACCTGAGACTGGGTA 120

  6892797 ATTTATAAAGAAAAAAAGGCTTAACTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATG 6892856
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTATAAAGAAAAAAAGGCTTAATTGGCTCATAGTTCCACAGGCTCTACAGGAAGCATG 180

  6892857 ATGCCGGCATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGGCCTCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGG 6892916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGCCGGCATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGGCCTCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGG 240

  6892917 GGAAGGGGAAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGC 6892976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAAGGGGAAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGC 300

  6892977 TGGAGTACAGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATT 6893036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGAGTACAGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATT 360

  6893037 CTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAA 6893096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAA 420

  6893097 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCC 6893156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCC 480

  6893157 CGACCTCAGGTGACCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCC 6893216
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CGACCTCAGGTGACCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCC 540

  6893217 ACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCA 6893276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCGTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCA 600

  6893277 GGGGATGTGCCACACACTTTTCAACAACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGAT 6893336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGGATGTGCCACACACTTTTCAACAACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGAT 660

  6893337 GGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCT 6893396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCACCAAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCT 720

  6893397 GCAAGATTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCT 6893456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCAAGATTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCT 780

  6893457 ATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAG 6893516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAG 840

  6893517 GAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCT 6893576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGTTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCT 900

  6893577 CCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTCAATAACATAT 6893636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
      901 CCAGGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTCGATAACGTAT 960

  6893637 ATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTTTTC 6893696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      961 ATCAAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAGTACATTTTATTTTTC 1020

  6893697 TGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTCCTC 6893756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGAATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTCCTC 1080

  6893757 TTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTCTTT 6893816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTAACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTCTTT 1140

  6893817 CTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAAGAT 6893876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTCCACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAAGAT 1200

  6893877 GTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGAAGT 6893936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTGTCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGAAGT 1260

  6893937 CAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGAGGG 6893996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGCAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGAGGG 1320

  6893997 AGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACGCGT 6894056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGGCACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACGCGT 1380

  6894057 TTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGCCAC 6894116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGCCAC 1440

  6894117 TGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGATCA 6894176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGACAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGATCA 1500

  6894177 AAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAACAGG 6894236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGAAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAACAGG 1560

  6894237 GCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTCAAG 6894296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCGTGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTCAAG 1620

  6894297 CCCCACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAGT 6894356
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCCACTCTCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAGT 1680

  6894357 GCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCTC 6894416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCCTGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCTC 1740

  6894417 TGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGCC 6894476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCAAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGCC 1800

  6894477 TGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGCT 6894536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGGCACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGCT 1860

  6894537 GCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGGT 6894596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCTCAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGGT 1920

  6894597 TTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCAC 6894656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGGCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCAC 1980

  6894657 CTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAAC 6894716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CTTGAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAAC 2040

  6894717 GTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGATT 6894776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTTGTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGATT 2100

  6894777 TCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGG 6894836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCAGAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGG 2160

  6894837 G 6894837
          |
     2161 G 2161

EXCISED REGION

  6896048 AGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTG 6896107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 AGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTG 2221

  6896108 CACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAAAAAAAAAAAGAAAA 6896167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 CACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAAAAAAAAAAAGAAAA 2281

  6896168 AAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTC 6896227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 AAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTC 2341

  6896228 TAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCA 6896287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 TAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCA 2401

  6896288 CCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTAC 6896347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 CCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTAC 2461

  6896348 CCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGG 6896407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 CCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGG 2521

  6896408 GGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCC 6896467
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 GGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCGCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCC 2581

  6896468 ATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCACG 6896527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 ATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCACG 2641

  6896528 CCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGGCAGGTGTG 6896585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 CCCCTCCCAGGGTTGCCGGACACCTTGCTGAACTTAACTTACCAGCTGGGCAGGTGTG 2699

Alignment time is 2.02908 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6884837,6906047] =>     21211 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [      1,   2457] =>      2457 nucs 'mol-32-34c9-050437_2457'

Score:        2380
Aligned:      2457        nucs
Identic:      2450 (100%) nucs =>      1973 (100%)       477 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6892860,6894837] EXCISED REGION [6896048,6896526]
 second seq =>  [      1,   1978] EXCISED REGION [   1979,   2457]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1210 nucs [6894838,6896047]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        29 nucs [6894838,6894866] to [6896048,6896076]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6894838,6894838] to [6896047,6896047]
 second seq =>         0 nucs

  6892860 CCGGCATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGGCCTCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGA 6892919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCGGCATCTGCTCGGCTTTTGGGGAGGCCTCAGGAAGCTTCCAATCATGGCAGAAGGGGA 60

  6892920 AGGGGAAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGG 6892979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGGGAAGCAGGCATGTCTTTTTTTTCGAGACAGAGTTTCGCTCTTGTCACCCAGGCTGG 120

  6892980 AGTACAGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTT 6893039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTACAGTGGCATGATCTCAGCTCACCGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTT 180

  6893040 CTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTT 6893099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCCGGAATTGCAGGCATGTGCCACCACGCCTGGCTAATTT 240

  6893100 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGA 6893159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCTCCATATTGGTCAGGCTGGTCTCAAACTCCCGA 300

  6893160 CCTCAGGTGACCCGCCTGCCTCGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACC 6893219
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTCAGGTGACCCGCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTAGGATTACAGGCATGAGCCACC 360

  6893220 GTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGG 6893279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGCCCAGCCTAAAGCAGGCATGTCTTACGTGGCCGGAGCAGGAGGAAGTGGGGGCAGGG 420

  6893280 GATGTGCCACACACTTTTCAACAACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGC 6893339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATGTGCCACACACTTTTCAACAACCGGCTGGCACTAGAACTCACTATTGCAGAGATGGC 480

  6893340 ACCAAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCA 6893399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACCAAGCCACGAGGGATCCACCTCCATGACCCAAACGCCTCCCATCAGGCCCCACCTGCA 540

  6893400 AGATTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATC 6893459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGATTGGGGATTACAATTCAACAAGAGATTTGGGCAGGAACAAAATGTCCAAACTCTATC 600

  6893460 ATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAG 6893519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATAGTCCAAGGGTTGTGTTACTAAGGTTTACTTTCAGCTTGTTGACTAGGCAGCAAGGAG 660

  6893520 TTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCA 6893579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCCATGGCCCAGTTTGAAAGTATTTAGAAGAATGAGGTAGTCACCGTAGCCCCTCTCCA 720

  6893580 GGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTCAATAACATATATC 6893639
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
      721 GGGTTAGGCCCCAAGCTGTTACATACAGGGTTTGGAAACTTTTATTCGATAACGTATATC 780

  6893640 AAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAATACATTTTATTTTTCTGA 6893699
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      781 AAGGACCTACTACGTACTAGGCCCTAACCCTGATGCTGGTAGTACATTTTATTTTTCTGA 840

  6893700 ATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTCCTCTTT 6893759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCAGTCACCCTCCCTCAGCTCTAGTTCTCTGGCAATGATAGCATCACAACTTCCTCTTT 900

  6893760 AACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTCTTTCTC 6893819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACCTCTCCTAGATAAACTCCAGAGGGCCTCCCCAGCCTGCCTGCTGCACCCTCTTTCTC 960

  6893820 CACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAAGATGTG 6893879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACTTTTCAGGAGTTTGAGGGATTTGGGCTGAAGCCCCACTCTCTGCATGAGAAGATGTG 1020

  6893880 TCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGAAGTCAG 6893939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCATTATCTTGCCCCCAAATTCCCCAGCCTGGTGGCCCCCCAGGAGCCTCATGAAGTCAG 1080

  6893940 CAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGAGGGAGG 6893999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGGCCGCTCCCGGCTCTGTCCTGACCAGCAGCGTGGGGCAGGGTGGGCAAGGAGGGAGG 1140

  6894000 CACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACGCGTTTC 6894059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACAGTCAGGGTTTATACACTCAGGGTGCAGCCCTTCCTGCAGAATAAGTGACGCGTTTC 1200

  6894060 ATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGCCACTGA 6894119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATCTGGAGGAGACACAGAAGGGTCCGTTTCCACCCCATGACTCTGCAGATGCGCCACTGA 1260

  6894120 CAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGATCAAAG 6894179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGTGTGTGGTTTCCTTCTTGGCAGCGTCCAGCTCTCCGGCAAGTGGCTGCAGATCAAAG 1320

  6894180 AAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAACAGGGCG 6894239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAAGCAGCGGAAACCTCTAGGGGACACAGCCTCCCAGGGACTGTGAAGCTGAACAGGGCG 1380

  6894240 TGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTCAAGCCC 6894299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGCGGGAGGAGCCCTGGCTGACAGAAATGCACCCCCTCCCCTTTTCCAGGGTCAAGCCC 1440

  6894300 CACTCCCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAGTGCC 6894359
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACTCTCAGCCCTGTGGGAGGAGGGAGCAGGAAGAACCCAGTGTGTGGCGCCAGAGTGCC 1500

  6894360 TGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCTCTGC 6894419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGCTCGAAATTAATCCTGGTTCCCACTGTGTGGCCTTCGGCAGGTCATTCGCCCTCTGC 1560

  6894420 AAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGCCTGG 6894479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGCCACCCTTTTCTCCTCTGTAAAACTGGAGTTTTAGCACCCGGGACTGAGGGGCCTGG 1620

  6894480 CACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGCTGCT 6894539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACACATGGGTGCTCCACAGGTGCCAGTTTCTTCCTCGGTGCCCCCTAAAATCAGCTGCT 1680

  6894540 CAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGGTTTG 6894599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CAAGCCATACCAGAAGTATGGTCTATCAGAATGTGAACTTCAGTGTCACAGCTGGGTTTG 1740

  6894600 GCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCACCTT 6894659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCTGGGATGGGTATGGCGATGTGGGAAGAAACGAGAATAGAGGGATGGCTGGGGCACCTT 1800

  6894660 GAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAACGTT 6894719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAATGCTTCCTGGCGGCATCTGGATTTCACCCTGGAGGCAGCAGGGGGCACAAAAACGTT 1860

  6894720 GTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGATTTCA 6894779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTAAGCAGGGGCACCATTTGTGTCCTGGGCAAGCAGTGGTCTCCGAGGTGAGGGATTTCA 1920

  6894780 GAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 6894837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAATCTGCTGGTGCATTCTGGGTACCACGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGG 1978

EXCISED REGION

  6896048 AGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTG 6896107
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1979 AGGCTGAGGCAGGAAGATCGCTTGAGCCCAGGAGTTCAAGGCTTCAGTGAGCTATGATTA 2038

  6896108 CACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAAAAAAAAAAAGAAAA 6896167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CACCACTGGACTCCAGTCTGGGTGACAGAGCAAGACCTTGTCTTAAAAAAAAAAAGAAAA 2098

  6896168 AAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTC 6896227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 AAGATTTTTAAAATGTTAGAGATGGAAATAGGTTTTCTGGCCAGCAATGGGGCATAATTC 2158

  6896228 TAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCA 6896287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TAGAGACCCCAGGTAGAATCAGCAGGAAAAGTTGCAGCAGATGCTTGGATCTCATTCTCA 2218

  6896288 CCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTAC 6896347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CCCCTCACAGCCTGGTGGCCGTCTAGGGGAGGGAGGAGGAGACAGGGACGTTGCTGGTAC 2278

  6896348 CCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGG 6896407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 CCACTGCCTGGGAACCCCTGGTGAGTTCTCCAGGATCCCACAGCAATCCCCAGGCTGCGG 2338

  6896408 GGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCCCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCC 6896467
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 GGTGCTGAGCACGCAAGGCAACCCCTCTCGCAGAGGCAGATGGACCGGGGAGGGTTCTCC 2398

  6896468 ATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCAC 6896526
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ATCAGTGCTTCCCAATAAAAGGCCTCCCGCTTCAGAGGGAGTGTAAACTCAGCATCCAC 2457

Alignment time is 1.87379 s

