
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162043250,162063660] =>     20411 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     3167] =>      3167 nucs 'mol-32-2081-084689_3167'

Score:        3047
Aligned:      3080        nucs
Identic:      3077 (100%) nucs =>      1469 (100%)      1608 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162050169,162051640] EXCISED REGION [162051643,162053250]
 second seq =>  [        1,     1472] EXCISED REGION [     1473,     3080]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [162051641,162051642]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162051641,162051644] to [162051643,162051646]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [162051641,162051641] to [162051642,162051642]
 second seq =>         0 nucs

162050169 AGCTTGTTGGGGAAAAACATGAGAGCTTAACTGATATTTTTATTGCGTTTTTCACTAAAT 162050228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCTTGTTGGGGAAAAACATGAGAGCTTAACTGATATTTTTATTGCGTTTTTCACTAAAT 60

162050229 GACAATTTAAATGGAGAGTAGTCTTAACACTGAAAAATTTGCTTCCTATTTCTTTTCTTG 162050288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACAATTTAAATGGAGAGTAGTCTTAACACTGAAAAATTTGCTTCCTATTTCTTTTCTTG 120

162050289 TTGTTTTTTTGCTTCTTGGTTCTTTTTTGCAGCCAGCGTTTCTGTTAAGAAGTTTCCCTT 162050348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTTTTTTTGCTTCTTGGTTCTTTTTTGCAGCCAGCGTTTCTGTTAAGAAGTTTCCCTT 180

162050349 TCTCAATGTGATTTTTGATCCACAGTTATTACAAATTTATCAAAGTGTAGATATGGTATT 162050408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      181 TCTCAATGTGATTTTTGATCCACAGTTATTACAAATTTCTCAAAGTGTAGATATGGTATT 240

162050409 TTTTGGTGACCTGTTGACACATTATGAATTGTTTCAATGTGTGATTTTAAAATCATTCTT 162050468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTGGTGACCTGTTGACACATTATGAATTGTTTCAATGTGTGATTTTAAAATCATTCTT 300

162050469 TGATTATGGAAAATATGCCACCACTACTATTTTCTCCCTTCTATTTGCTTATCTTTCCTT 162050528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGATTATGGAAAATATGCCACCACTACTATTTTCTCCCTTCTATTTGCTTATCTTTCCTT 360

162050529 CCGGTATTCCTATTATTGAGATTTTAATACTTGTAATCTCCATGCCTCTTAGCAACATTT 162050588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      361 CCGGTATTCCTATTATTGAGATTTTAATACTTGTAACCTCCATGCCTCTTAGCAACATTT 420

162050589 TCTTAAAATTATTTATTTATGAAAGCTTTCTAATGAGTTTTATGAGAATTCTTCATTCTA 162050648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTAAAATTATTTATTTATGAAAGCTTTCTAATGAGTTTTATGAGAATTCTTCATTCTA 480

162050649 ATTCTTTAGCTCAGTAGTATACTCTTCCAATGTATTTGTTCCAGTACTCTTCATTATGCC 162050708
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      481 ATTCTTTAGCTCAGTAGTATACTCTTCCAATGTATCTGTTCCAGTACTCTTCATTATGCC 540

162050709 TTTGCATTTAATTATTATGTTTTTCAAGATAATCTCAATATGTCTATCCCAACAATTCTA 162050768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTGCATTTAATTATTATGTTTTTCAAGATAATCTCAATATGTCTATCCCAACAATTCTA 600

162050769 CTTTGGTGATCTCTTTGAACTTTATCTTTATTTTATGGCAATGCTCTTCCAGCTTAGACC 162050828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTTGGTGATCTCTTTGAACTTTATCTTTATTTTATGGCAATGCTCTTCCAGCTTAGACC 660

162050829 CATCTTCCTCTAGAGACATTAGTCTCCTTCTTAGGTAATGAGTATTGGTGATGGATCCAA 162050888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATCTTCCTCTAGAGACATTAGTCTCCTTCTTAGGTAATGAGTATTGGTGATGGATCCAA 720

162050889 ACCACATGCTTTAGTTTATAGTGCACCTGGTAAGTTTAAAGAAAGAGAAAACTATGTGGT 162050948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACCACATGCTTTAGTTTATAGTGCACCTGGTAAGTTTAAAGAAAGAGAAAACTATGTGGT 780

162050949 GAGAACAGAGCTCCAGGTATCATAAAGCCACATTTCACTATTTATGCTGATTGTTTACTG 162051008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGAACAGAGCTCCAGGTATCATAAAGCCACATTTCACTATTTATGCTGATTGTTTACTG 840

162051009 CCACTCAACCATGTATTTATTCTCATTAGTAATATAAGAATATTCACTTTCCTTAAATTC 162051068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCACTCAACCATGTATTTATTCTCATTAGTAATATAAGAATATTCACTTTCCTTAAATTC 900

162051069 ATTCAAAGGTAGCTTCCCTGAAGCAGCAGCAGCACCACCACAATTGATATTTGTATAGCA 162051128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTCAAAGGTAGCTTCCCTGAAGCAGCAGCAGCACCACCACAATTGATATTTGTATAGCA 960

162051129 TATGCTATGTGACAAGGACTTATGTGTGTGTATGTTCATTTAATCCCAACAGCAATCCTA 162051188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATGCTATGTGACAAGGACTTATGTGTGTGTATGTTCATTTAATCCCAACAGCAATCCTA 1020

162051189 CAGAATGTGTACTATCACGAGCTCACTTTACAGACAGGAAAACTGACATAAAGAGAAGTG 162051248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGAATGTGTACTATCACGAGCTCACTTTACAGACAGGAAAACTGACATAAAGAGAAGTG 1080

162051249 ATGTCTACTGAGTCTGGCCCAGAATGTTGGCAGTTGAGATTTTACCTAGTTTTCAAATTA 162051308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATGTCTACTGAGTCTGGCCCAGAATGTTGGCAGTTGAGATTTTACCTAGTTTTCAAATTA 1140

162051309 GAACTGCAGTTTAAATATTGATGAGTATTATAGTTACACTATGCAGACTTTTAAAAAAAT 162051368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAACTGCAGTTTAAATATTGATGAGTATTATAGTTACACTATGCAGACTTTTAAAAAAAT 1200

162051369 TTTTCCATAAAAAGGCCTTATGAATATATTAAAGTTAATCAGTTTATTTTTACAACTATG 162051428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTTCCATAAAAAGGCCTTATGAATATATTAAAGTTAATCAGTTTATTTTTACAACTATG 1260

162051429 ATTTCAATAATCTGGGAATTTGATTTGCATAGTGTACTGAAAAGTAATAAGCAGATAAAA 162051488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTTCAATAATCTGGGAATTTGATTTGCATAGTGTACTGAAAAGTAATAAGCAGATAAAA 1320

162051489 TATTTTATAAACAAAGGAATTTGGAAAACATCTTAAACTCTATATATTTAATCTTATAAA 162051548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATTTTATAAACAAAGGAATTTGGAAAACATCTTAAACTCTATATATTTAATCTTATAAA 1380

162051549 GTAAAGAAAATGTATCTAACAAATTAGAGATTGACATTAACTTTTGCAAGAACAAAGAAT 162051608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GTAAAGAAAATGTATCTAACAAATTAGAGATTGACATTAACTTTTGCAAGAACAAAGAAT 1440

162051609 GTTAAGATATTAAAAATGCATGTTTTCAAAAT 162051640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTAAGATATTAAAAATGCATGTTTTCAAAAT 1472

EXCISED REGION

162051643 AAAAGAATGAAGATTAAAAAAAGAAAGTTTAGCAGAAAGGATTTTTTTTAAGTAGAAGAA 162051702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 AAAAGAATGAAGATTAAAAAAAGAAAGTTTAGCAGAAAGGATTTTTTTTAAGTAGAAGAA 1532

162051703 AAAAGTAAGAGCATGTACATAAGAGTATCAGCTGGGAAATGAGTTTAGTTTGAATTAAGA 162051762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 AAAAGTAAGAGCATGTACATAAGAGTATCAGCTGGGAAATGAGTTTAGTTTGAATTAAGA 1592

162051763 TCATTCACCAGATTGAGGAGGAATCAAACAATGCAAATTAGAAACATGATATTGCATTTC 162051822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 TCATTCACCAGATTGAGGAGGAATCAAACAATGCAAATTAGAAACATGATATTGCATTTC 1652

162051823 AAAAGAATGTTTCCTCACAGATGTTGTAGCTGAATGTAGTTTCTATTCTTACCTTTCCTT 162051882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 AAAAGAATGTTTCCTCACAGATGTTGTAGCTGAATGTAGTTTCTATTCTTACCTTTCCTT 1712

162051883 TAGATGGTAGGGCAACAGATGAGTACAGAGAAAAGGAAGCAGCATTTAACTTAAAGTGAA 162051942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 TAGATGGTAGGGCAACAGATGAGTACAGAGAAAAGGAAGCAGCATTTAACTTAAAGTGAA 1772

162051943 AAGAGAGAAATCACTATTATCTGGACCAATTATTATTTAACAAAAGAACTTGATTTACTG 162052002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 AAGAGAGAAATCACTATTATCTGGACCAATTATTATTTAACAAAAGAACTTGATTTACTG 1832

162052003 TAAAAAATAGTCTTTAAAATGTGTCCTTTTCTGTGTTCTTTATATTCTTTTGGGGACTTT 162052062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 TAAAAAATAGTCTTTAAAATGTGTCCTTTTCTGTGTTCTTTATATTCTTTTGGGGACTTT 1892

162052063 GTATTGGTCAAGGAACAGATTCTACTATACACAATTTGAATAGAAGGGGATGTATTAAAA 162052122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 GTATTGGTCAAGGAACAGATTCTACTATACACAATTTGAATAGAAGGGGATGTATTAAAA 1952

162052123 AGTATGTCAAATGGCTTACAGAATTGAGATGGCTGAAGGAGATTCTACAATGAAATTCCA 162052182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 AGTATGTCAAATGGCTTACAGAATTGAGATGGCTGAAGGAGATTCTACAATGAAATTCCA 2012

162052183 GAATCTGCTCTTAGGTCTGTGCTGCAGAACCAAACTGCAAAAGGAGTTGTTTCTTTTGCC 162052242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 GAATCTGCTCTTAGGTCTGTGCTGCAGAACCAAACTGCAAAAGGAGTTGTTTCTTTTGCC 2072

162052243 ATGATCAAGAAGCTGCTGGTCAAATCAGGAGGCATTCTTCATTGAGTATACAAATATTAG 162052302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 ATGATCAAGAAGCTGCTGGTCAAATCAGGAGGCATTCTTCATTGAGTATACAAATATTAG 2132

162052303 AACTATCTCCATTCTGAGCTGCATAAATTAGCTGTAGTTACTGCTTCCAAAAGGCACTCT 162052362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 AACTATCTCCATTCTGAGCTGCATAAATTAGCTGTAGTTACTGCTTCCAAAAGGCACTCT 2192

162052363 GTCCTCCCATCAGGAAACATCATGTGCAAAATCAAGAAGCTGCTATTATAGCTGCAGAAG 162052422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 GTCCTCCCATCAGGAAACATCATGTGCAAAATCAAGAAGCTGCTATTATAGCTGCAGAAG 2252

162052423 TCTATACCATGCCACATTTTCTACTATCAAGAAGCCATCTCTGCCAAATCAGCTAGCCTC 162052482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 TCTATACCATGCCACATTTTCTACTATCAAGAAGCCATCTCTGCCAAATCAGCTAGCCTC 2312

162052483 AGAGACAAATTTTGGCTCCAGAACCATGCCACATTTGCTACAATCCACATTGATAATATA 162052542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 AGAGACAAATTTTGGCTCCAGAACCATGCCACATTTGCTACAATCCACATTGATAATATA 2372

162052543 TCTGCACCATATCCTATATATCTCCATTCAAATTTCAAATTTCAATGTGTTTGTCTCTGA 162052602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 TCTGCACCATATCCTATATATCTCCATTCAAATTTCAAATTTCAATGTGTTTGTCTCTGA 2432

162052603 TGTGGGACCTAAATCACATTTACGTTATCAAATGAAAATGAATTGGAGAAATTTCCCTTA 162052662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 TGTGGGACCTAAATCACATTTACGTTATCAAATGAAAATGAATTGGAGAAATTTCCCTTA 2492

162052663 TAGTTTTCTGCCCTCTACAGAAAAGGAAAGTCACATCAGAAGAAAATTTGAATAGGTGTT 162052722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 TAGTTTTCTGCCCTCTACAGAAAAGGAAAGTCACATCAGAAGAAAATTTGAATAGGTGTT 2552

162052723 TTAAGCCAAACCAGAATAACTGCATTAGACTTCACTCTTACTTTATATCTCTGCTTTTAT 162052782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 TTAAGCCAAACCAGAATAACTGCATTAGACTTCACTCTTACTTTATATCTCTGCTTTTAT 2612

162052783 TTTTAAAAATTTCTTATATTTTCACACATGGAATTTACATTTGATCCATCTTTGAGCATA 162052842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 TTTTAAAAATTTCTTATATTTTCACACATGGAATTTACATTTGATCCATCTTTGAGCATA 2672

162052843 GTCTCAGAGTCTGAAACATTCCAGCTATGAAGTAAGTACTTAAATGGCTGTTCAATAAAT 162052902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 GTCTCAGAGTCTGAAACATTCCAGCTATGAAGTAAGTACTTAAATGGCTGTTCAATAAAT 2732

162052903 TAATATGAGCTACTTTCTGATAATTAAAAAATCTTTTTTATAAGAATACAATAGGAAAAC 162052962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 TAATATGAGCTACTTTCTGATAATTAAAAAATCTTTTTTATAAGAATACAATAGGAAAAC 2792

162052963 ATTGGATTTACTGCTCATTTTTTTTATGGTATAAGCACATCTAATCCTGTATATGAAAGA 162053022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 ATTGGATTTACTGCTCATTTTTTTTATGGTATAAGCACATCTAATCCTGTATATGAAAGA 2852

162053023 GTACCAGCTGGAGCCTTATCTGAAATTTCTACACATCTGGGAAAATTCGTTAAAGGTTGA 162053082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 GTACCAGCTGGAGCCTTATCTGAAATTTCTACACATCTGGGAAAATTCGTTAAAGGTTGA 2912

162053083 GCTAGATTGAATATATTAAACAACTCTATTGGTATAAAAAAGTAGAAAATACAAAAGACA 162053142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 GCTAGATTGAATATATTAAACAACTCTATTGGTATAAAAAAGTAGAAAATACAAAAGACA 2972

162053143 GAAATATTTCTAAAAGATAAGATAGCCTGAACAATGCAATTAATCAAAAAATGATCTTCA 162053202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 GAAATATTTCTAAAAGATAAGATAGCCTGAACAATGCAATTAATCAAAAAATGATCTTCA 3032

162053203 GTTATCAAAATTGGGTAGTGATTGTGACTATATTCTGGTGGCTATAAT 162053250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 GTTATCAAAATTGGGTAGTGATTGTGACTATATTCTGGTGGCTATAAT 3080

Alignment time is 2.82133 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162043250,162063660] =>     20411 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     3082] =>      3082 nucs 'mol-32-22a7-053071_3082'

Score:        3031
Aligned:      3075        nucs
Identic:      3071 (100%) nucs =>      2062 (100%)      1009 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162053661,162055725] EXCISED REGION [162055726,162056734]
 second seq =>  [        6,     2071] EXCISED REGION [     2074,     3082]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2072,2073]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        13 nucs [2072,2084] to [2074,2086]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2072,2072] to [2073,2073]

162053661 GAAAAGAGTACTTAGCAAGATTTTTAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTT 162053720
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        6 GAAAAGAGTACTTAGCAAGATTTCTAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTT 65

162053721 TTGTTTTATTTAAAAACAACATTTATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTT 162053780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       66 TTGTTTTATTTAAAAACAACATTTATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTT 125

162053781 ACAGGTAAACTTGTGTCACAGAAGTTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAA 162053840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      126 ACAGGTAAACTTGTGTCACAGAAGTTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAA 185

162053841 GACTACTACCCGTTCGTTATTTTTCCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTG 162053900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 GACTACTACCCGTTCGTTATTTTTCCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTG 245

162053901 AAAGGCCCCAGTGTATGGTTTCCTTCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCAC 162053960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 AAAGGCCCCAGTGTATGGTTTCCTTCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCAC 305

162053961 TTATAAGTGAGAAGATGCGGTATTTGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAA 162054020
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 TTATAAGTGAGAAGATGCGGTATTCGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAA 365

162054021 AGGCCTCCACCTCCACTCATGTCTGTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGC 162054080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 AGGCCTCCACCTCCACTCATGTCTGTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGC 425

162054081 TGCATACCATTCCACGGTGTAGATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTG 162054140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 TGCATACCATTCCACGGTGTAGATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTG 485

162054141 GCATTTAGGTTGATTCCGTATCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACAT 162054200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 GCATTTAGGTTGATTCCGTATCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACAT 545

162054201 GCATGTGTCTTTATGGTACAAAGATTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGAT 162054260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 GCATGTGTCTTTATGGTACAAAGATTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGAT 605

162054261 TGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGCTTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCA 162054320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 TGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGCTTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCA 665

162054321 CAATGGTTGAACTAATTTTCACTTCTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAAC 162054380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 CAATGGTTGAACTAATTTTCACTTCTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAAC 725

162054381 TTCACCAGCATCTGTTAATTATTGACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGAT 162054440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 TTCACCAGCATCTGTTAATTATTGACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGAT 785

162054441 GGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTT 162054500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 GGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTT 845

162054501 TCATA-GTTTGTTGGCCACATTTATGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAA 162054559
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 TCATATGTTTGTTGGCCACATTTATGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAA 905

162054560 TTATTAATGGAGTTGTTTTTTTCTTATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTT 162054619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 TTATTAATGGAGTTGTTTTTTTCTTATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTT 965

162054620 TGTCAGATGTATAGTTTGCAAAAACTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTAC 162054679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 TGTCAGATGTATAGTTTGCAAAAACTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTAC 1025

162054680 TGATAGTTTCTTTTGCTTTGCAAAAGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTT 162054739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 TGATAGTTTCTTTTGCTTTGCAAAAGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTT 1085

162054740 TTGCTCCTGTTGCAAATGATTTTGGCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATA 162054799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 TTGCTCCTGTTGCAAATGATTTTGGCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATA 1145

162054800 TCTAACCTGCAACAGTTCCACCATATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATA 162054859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 TCTAACCTGCAACAGTTCCACCATATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATA 1205

162054860 ACTGACTAATATCCACAAGTGTTTTACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCC 162054919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 ACTGACTAATATCCACAAGTGTTTTACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCC 1265

162054920 TCCAGACTTGACATCACCAATGAGCCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGA 162054979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 TCCAGACTTGACATCACCAATGAGCCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGA 1325

162054980 ACAAACCTTTGCTCCCTGTTGTAAATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTT 162055039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 ACAAACCTTTGCTCCCTGTTGTAAATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTT 1385

162055040 CAGGCACAGTAGGAAATGTAATATAATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTT 162055099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 CAGGCACAGTAGGAAATGTAATATAATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTT 1445

162055100 CTTCATGGCCATCTGGAACCCATTAAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATG 162055159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 CTTCATGGCCATCTGGAACCCATTAAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATG 1505

162055160 TATTGGATTTTTGGGGATCTGTTAATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTA 162055219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 TATTGGATTTTTGGGGATCTGTTAATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTA 1565

162055220 GGTTGAAGAAGAGACAACAGAATGACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAAC 162055279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 GGTTGAAGAAGAGACAACAGAATGACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAAC 1625

162055280 TGTTCTTAAAATTTAATTACACTTTTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTATTCT 162055339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 TGTTCTTAAAATTTAATTACACTTTTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTATTCT 1685

162055340 TCTAGATAACAAAATGCTACTGGGTCACATGATTTACATGGCTAGTCATATCAGATAATG 162055399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 TCTAGATAACAAAATGCTACTGGGTCACATGATTTACATGGCTAGTCATATCAGATAATG 1745

162055400 TTAAATTTATGATAGGCTGCTCAAGTCTCCCTTTTCCTGAAAGCAAGTTTTTTTTAGTAT 162055459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 TTAAATTTATGATAGGCTGCTCAAGTCTCCCTTTTCCTGAAAGCAAGTTTTTTTTAGTAT 1805

162055460 CTTTCAGAGAGTGATAGCTAGAGCTATTTTTAAAAGGTGTCTTTTTCACTTATTTTACCT 162055519
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 CTTTCAGAGAGTAATAGCTAGAGCTATTTTTAAAAGGTGTCTTTTTCACTTATTTTACCT 1865

162055520 TTACTCCAAAAATTCAGAGGCCATGACTACGATTTTCTTATTGTGACTTGTTATGGTTTG 162055579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 TTACTCCAAAAATTCAGAGGCCATGACTACGATTTTCTTATTGTGACTTGTTATGGTTTG 1925

162055580 TAAAAAATTTTACAGACAGTTTAATCCAGTGGATAATTATAAAGACTTAACTGTAAAACT 162055639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TAAAAAATTTTACAGACAGTTTAATCCAGTGGATAATTATAAAGACTTAACTGTAAAACT 1985

162055640 ATTGTCTCCTTAGTCCACCTAGAAAGCATCTTCTCTTAATCTGAGCCATATGGAAAGCTG 162055699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 ATTGTCTCCTTAGTCCACCTAGAAAGCATCTTCTCTTAATCTGAGCCATATGGAAAGCTG 2045

162055700 ACAGGTTTGAGGGAATACAGGAAATG 162055725
          ||||||||||||||||||||||||||
     2046 ACAGGTTTGAGGGAATACAGGAAATG 2071

EXCISED REGION

162055726 AAAAAAAAAAAAACAGGACAGCAAAATATCACAATTTTTGCCTTCATAATTCAAAGAGGT 162055785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 AAAAAAAAAAAAACAGGACAGCAAAATATCACAATTTTTGCCTTCATAATTCAAAGAGGT 2133

162055786 CCACCATGCTGTGTCCCTTTCTTAGTATTAGGGAGCATAAAGCTCAGCAATGTGTTCATT 162055845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 CCACCATGCTGTGTCCCTTTCTTAGTATTAGGGAGCATAAAGCTCAGCAATGTGTTCATT 2193

162055846 ACTTTAAAGGAGTAACTTCATATTACTTAATGCCACAAAATTCCACAAATTATGCAATAT 162055905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 ACTTTAAAGGAGTAACTTCATATTACTTAATGCCACAAAATTCCACAAATTATGCAATAT 2253

162055906 AGTTGGTAATATTTGTTAAAAACCTAGTTGCTGCTATAATAACGTTTTCCTTTTAAAAAT 162055965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 AGTTGGTAATATTTGTTAAAAACCTAGTTGCTGCTATAATAACGTTTTCCTTTTAAAAAT 2313

162055966 ACATATATAAAATGTAAGCACAATACATTAGGAAGTGAAAAATAATAATATCTATTTTTA 162056025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 ACATATATAAAATGTAAGCACAATACATTAGGAAGTGAAAAATAATAATATCTATTTTTA 2373

162056026 AAGGAGGTGTACTAAGCTGTCAGTGAGCTTAATAAACATGTTTCTATACAGTTAAGCAAT 162056085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 AAGGAGGTGTACTAAGCTGTCAGTGAGCTTAATAAACATGTTTCTATACAGTTAAGCAAT 2433

162056086 AACTGCTCCCAAATACTAATGAAACAATATCCATGGTATTGCTGCAATGCTGTCTTTATT 162056145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 AACTGCTCCCAAATACTAATGAAACAATATCCATGGTATTGCTGCAATGCTGTCTTTATT 2493

162056146 TACTGTGTGTGCCTCTTGACCAACAGATCCTAAGAGTACTACTGGTCACTGTTAGTTTTA 162056205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 TACTGTGTGTGCCTCTTGACCAACAGATCCTAAGAGTACTACTGGTCACTGTTAGTTTTA 2553

162056206 AACCGATATTGGTTTTTATAAAAGAGAAGGGTGAATAAACTTTAAAAGTGGAAAACAAGA 162056265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 AACCGATATTGGTTTTTATAAAAGAGAAGGGTGAATAAACTTTAAAAGTGGAAAACAAGA 2613

162056266 AATCTTGGCAAATTAGTTAAAAGCTAGGGGGAAGAAAAAAGACACTTAATGCTTGAAAGA 162056325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 AATCTTGGCAAATTAGTTAAAAGCTAGGGGGAAGAAAAAAGACACTTAATGCTTGAAAGA 2673

162056326 GCTTTCTAAATAGTGCCCAAATTATGATTAGCATTCCTATAGCACTTTCAAAAGGTATTT 162056385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 GCTTTCTAAATAGTGCCCAAATTATGATTAGCATTCCTATAGCACTTTCAAAAGGTATTT 2733

162056386 TATAGTGATCTCTCTGATGGAAAAATATTCTATAAAAAGCATGAGATTGAGGCAAACATA 162056445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 TATAGTGATCTCTCTGATGGAAAAATATTCTATAAAAAGCATGAGATTGAGGCAAACATA 2793

162056446 CAACTTTTAAAAGTAATTATACAAAACCAAACATTGCTCTGAGAAACTTGAGGAAAATAC 162056505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 CAACTTTTAAAAGTAATTATACAAAACCAAACATTGCTCTGAGAAACTTGAGGAAAATAC 2853

162056506 AAACAGCAAGAAACAAAGCCAAAAGATGTTCTATCTGACATTTCTTGGAGGTTGGGTTTT 162056565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 AAACAGCAAGAAACAAAGCCAAAAGATGTTCTATCTGACATTTCTTGGAGGTTGGGTTTT 2913

162056566 CTGCAGTTCCAAAATCAATGAAATTGATTGTTCCTTCTATTTATTTTGCCTACCCCACTG 162056625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 CTGCAGTTCCAAAATCAATGAAATTGATTGTTCCTTCTATTTATTTTGCCTACCCCACTG 2973

162056626 CATATATTAAACATTTCCCACATTTAAAATTCTGATAAACCCAACTGCAGAACAAAATAC 162056685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 CATATATTAAACATTTCCCACATTTAAAATTCTGATAAACCCAACTGCAGAACAAAATAC 3033

162056686 TGTTAATTACAATTTATTTTAGGTAAAAGAAGTTATGCATGGCAAATCT 162056734
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 TGTTAATTACAATTTATTTTAGGTAAAAGAAGTTATGCATGGCAAATCT 3082

Alignment time is 2.76552 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162043250,162063660] =>     20411 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     3854] =>      3854 nucs 'mol-32-2399-035089_3854'

Score:        3666
Aligned:      3701        nucs
Identic:      3697 (100%) nucs =>      2023 (100%)      1674 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162051226,162053250] EXCISED REGION [162053662,162055336]
 second seq =>  [       16,     2038] EXCISED REGION [     2179,     3854]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       411 nucs [162053251,162053661]
 second seq =>       140 nucs [2039,2178]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2039,2039] to [2179,2179]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2039,2039] to [2178,2178]

162051226 GAAAACTGACATAAAGAGAAGTGATGTCTACTGAGTCTGGCCCAGAATGTTGGCAGTTGA 162051285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       16 GAAAACTGACATAAAGAGAAGTGATGTCTACTGAGTCTGGCCCAGAATGTTGGCAGTTGA 75

162051286 GATTTTACCTAGTTTTCAAATTAGAACTGCAGTTTAAATATTGATGAGTATTATAGTTAC 162051345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       76 GATTTTACCTAGTTTTCAAATTAGAACTGCAGTTTAAATATTGATGAGTATTATAGTTAC 135

162051346 ACTATGCAGACTTTTAAAAAAATTTTTCCATAAAAAGGCCTTATGAATATATTAAAGTTA 162051405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      136 ACTATGCAGACTTTTAAAAAAATTTTTCCATAAAAAGGCCTTATGAATATATTAAAGTTA 195

162051406 ATCAGTTTATTTTTACAACTATGATTTCAATAATCTGGGAATTTGATTTGCATAGTGTAC 162051465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      196 ATCAGTTTATTTTTACAACTATGATTTCAATAATCTGGGAATTTGATTTGCATAGTGTAC 255

162051466 TGAAAAGTAATAAGCAGATAAAATATTTTATAAACAAAGGAATTTGGAAAACATCTTAAA 162051525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      256 TGAAAAGTAATAAGCAGATAAAATATTTTATAAACAAAGGAATTTGGAAAACATCTTAAA 315

162051526 CTCTATATATTTAATCTTATAAAGTAAAGAAAATGTATCTAACAAATTAGAGATTGACAT 162051585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      316 CTCTATATATTTAATCTTATAAAGTAAAGAAAATGTATCTAACAAATTAGAGATTGACAT 375

162051586 TAACTTTTGCAAGAACAAAGAATGTTAAGATATTAAAAATGCATGTTTTCAAAATAAAAA 162051645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
      376 TAACTTTTGCAAGAACAAAGAATGTTAAGATATTAAAAATGCATGTTTTCAAAATAAAA- 434

162051646 AGAATGAAGATTAAAAAAAGAAAGTTTAGCAGAAAGGATTTTTTTTAAGTAGAAGAAAAA 162051705
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 -GAATGAAGATTAAAAAAAGAAAGTTTAGCAGAAAGGATTTTTTTTAAGTAGAAGAAAAA 493

162051706 AGTAAGAGCATGTACATAAGAGTATCAGCTGGGAAATGAGTTTAGTTTGAATTAAGATCA 162051765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      494 AGTAAGAGCATGTACATAAGAGTATCAGCTGGGAAATGAGTTTAGTTTGAATTAAGATCA 553

162051766 TTCACCAGATTGAGGAGGAATCAAACAATGCAAATTAGAAACATGATATTGCATTTCAAA 162051825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      554 TTCACCAGATTGAGGAGGAATCAAACAATGCAAATTAGAAACATGATATTGCATTTCAAA 613

162051826 AGAATGTTTCCTCACAGATGTTGTAGCTGAATGTAGTTTCTATTCTTACCTTTCCTTTAG 162051885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      614 AGAATGTTTCCTCACAGATGTTGTAGCTGAATGTAGTTTCTATTCTTACCTTTCCTTTAG 673

162051886 ATGGTAGGGCAACAGATGAGTACAGAGAAAAGGAAGCAGCATTTAACTTAAAGTGAAAAG 162051945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      674 ATGGTAGGGCAACAGATGAGTACAGAGAAAAGGAAGCAGCATTTAACTTAAAGTGAAAAG 733

162051946 AGAGAAATCACTATTATCTGGACCAATTATTATTTAACAAAAGAACTTGATTTACTGTAA 162052005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      734 AGAGAAATCACTATTATCTGGACCAATTATTATTTAACAAAAGAACTTGATTTACTGTAA 793

162052006 AAAATAGTCTTTAAAATGTGTCCTTTTCTGTGTTCTTTATATTCTTTTGGGGACTTTGTA 162052065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      794 AAAATAGTCTTTAAAATGTGTCCTTTTCTGTGTTCTTTATATTCTTTTGGGGACTTTGTA 853

162052066 TTGGTCAAGGAACAGATTCTACTATACACAATTTGAATAGAAGGGGATGTATTAAAAAGT 162052125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      854 TTGGTCAAGGAACAGATTCTACTATACACAATTTGAATAGAAGGGGATGTATTAAAAAGT 913

162052126 ATGTCAAATGGCTTACAGAATTGAGATGGCTGAAGGAGATTCTACAATGAAATTCCAGAA 162052185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      914 ATGTCAAATGGCTTACAGAATTGAGATGGCTGAAGGAGATTCTACAATGAAATTCCAGAA 973

162052186 TCTGCTCTTAGGTCTGTGCTGCAGAACCAAACTGCAAAAGGAGTTGTTTCTTTTGCCATG 162052245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      974 TCTGCTCTTAGGTCTGTGCTGCAGAACCAAACTGCAAAAGGAGTTGTTTCTTTTGCCATG 1033

162052246 ATCAAGAAGCTGCTGGTCAAATCAGGAGGCATTCTTCATTGAGTATACAAATATTAGAAC 162052305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1034 ATCAAGAAGCTGCTGGTCAAATCAGGAGGCATTCTTCATTGAGTATACAAATATTAGAAC 1093

162052306 TATCTCCATTCTGAGCTGCATAAATTAGCTGTAGTTACTGCTTCCAAAAGGCACTCTGTC 162052365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1094 TATCTCCATTCTGAGCTGCATAAATTAGCTGTAGTTACTGCTTCCAAAAGGCACTCTGTC 1153

162052366 CTCCCATCAGGAAACATCATGTGCAAAATCAAGAAGCTGCTATTATAGCTGCAGAAGTCT 162052425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1154 CTCCCATCAGGAAACATCATGTGCAAAATCAAGAAGCTGCTATTATAGCTGCAGAAGTCT 1213

162052426 ATACCATGCCACATTTTCTACTATCAAGAAGCCATCTCTGCCAAATCAGCTAGCCTCAGA 162052485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1214 ATACCATGCCACATTTTCTACTATCAAGAAGCCATCTCTGCCAAATCAGCTAGCCTCAGA 1273

162052486 GACAAATTTTGGCTCCAGAACCATGCCACATTTGCTACAATCCACATTGATAATATATCT 162052545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1274 GACAAATTTTGGCTCCAGAACCATGCCACATTTGCTACAATCCACATTGATAATATATCT 1333

162052546 GCACCATATCCTATATATCTCCATTCAAATTTCAAATTTCAATGTGTTTGTCTCTGATGT 162052605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1334 GCACCATATCCTATATATCTCCATTCAAATTTCAAATTTCAATGTGTTTGTCTCTGATGT 1393

162052606 GGGACCTAAATCACATTTACGTTATCAAATGAAAATGAATTGGAGAAATTTCCCTTATAG 162052665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1394 GGGACCTAAATCACATTTACGTTATCAAATGAAAATGAATTGGAGAAATTTCCCTTATAG 1453

162052666 TTTTCTGCCCTCTACAGAAAAGGAAAGTCACATCAGAAGAAAATTTGAATAGGTGTTTTA 162052725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1454 TTTTCTGCCCTCTACAGAAAAGGAAAGTCACATCAGAAGAAAATTTGAATAGGTGTTTTA 1513

162052726 AGCCAAACCAGAATAACTGCATTAGACTTCACTCTTACTTTATATCTCTGCTTTTATTTT 162052785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1514 AGCCAAACCAGAATAACTGCATTAGACTTCACTCTTACTTTATATCTCTGCTTTTATTTT 1573

162052786 TAAAAATTTCTTATATTTTCACACATGGAATTTACATTTGATCCATCTTTGAGCATAGTC 162052845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1574 TAAAAATTTCTTATATTTTCACACATGGAATTTACATTTGATCCATCTTTGAGCATAGTC 1633

162052846 TCAGAGTCTGAAACATTCCAGCTATGAAGTAAGTACTTAAATGGCTGTTCAATAAATTAA 162052905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1634 TCAGAGTCTGAAACATTCCAGCTATGAAGTAAGTACTTAAATGGCTGTTCAATAAATTAA 1693

162052906 TATGAGCTACTTTCTGATAATTAAAAAATCTTTTTTATAAGAATACAATAGGAAAACATT 162052965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 TATGAGCTACTTTCTGATAATTAAAAAATCTTTTTTATAAGAATACAATAGGAAAACATT 1753

162052966 GGATTTACTGCTCATTTTTTTTATGGTATAAGCACATCTAATCCTGTATATGAAAGAGTA 162053025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 GGATTTACTGCTCATTTTTTTTATGGTATAAGCACATCTAATCCTGTATATGAAAGAGTA 1813

162053026 CCAGCTGGAGCCTTATCTGAAATTTCTACACATCTGGGAAAATTCGTTAAAGGTTGAGCT 162053085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 CCAGCTGGAGCCTTATCTGAAATTTCTACACATCTGGGAAAATTCGTTAAAGGTTGAGCT 1873

162053086 AGATTGAATATATTAAACAACTCTATTGGTATAAAAAAGTAGAAAATACAAAAGACAGAA 162053145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 AGATTGAATATATTAAACAACTCTATTGGTATAAAAAAGTAGAAAATACAAAAGACAGAA 1933

162053146 ATATTTCTAAAAGATAAGATAGCCTGAACAATGCAATTAATCAAAAAATGATCTTCAGTT 162053205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 ATATTTCTAAAAGATAAGATAGCCTGAACAATGCAATTAATCAAAAAATGATCTTCAGTT 1993

162053206 ATCAAAATTGGGTAGTGATTGTGACTATATTCTGGTGGCTATAAT 162053250
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 ATCAAAATTGGGTAGTGATTGTGACTATATTCTGGTGGCTATAAT 2038

EXCISED REGION

162053662 AAAAGAGTACTTAGCAAGATTTTTAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTTT 162053721
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 AAAAGAGTACTTAGCAAGATTTCTAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTTT 2238

162053722 TGTTTTATTTAAAAACAACATTTATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTTA 162053781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 TGTTTTATTTAAAAACAACATTTATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTTA 2298

162053782 CAGGTAAACTTGTGTCACAGAAGTTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAAG 162053841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 CAGGTAAACTTGTGTCACAGAAGTTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAAG 2358

162053842 ACTACTACCCGTTCGTTATTTTTCCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTGA 162053901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 ACTACTACCCGTTCGTTATTTTTCCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTGA 2418

162053902 AAGGCCCCAGTGTATGGTTTCCTTCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCACT 162053961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 AAGGCCCCAGTGTATGGTTTCCTTCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCACT 2478

162053962 TATAAGTGAGAAGATGCGGTATTTGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAAA 162054021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 TATAAGTGAGAAGATGCGGTATTTGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAAA 2538

162054022 GGCCTCCACCTCCACTCATGTCTGTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGCT 162054081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2539 GGCCTCCACCTCCACTCATGTCTGTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGCT 2598

162054082 GCATACCATTCCACGGTGTAGATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTGG 162054141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2599 GCATACCATTCCACGGTGTAGATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTGG 2658

162054142 CATTTAGGTTGATTCCGTATCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACATG 162054201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2659 CATTTAGGTTGATTCCGTATCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACATG 2718

162054202 CATGTGTCTTTATGGTACAAAGATTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGATT 162054261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 CATGTGTCTTTATGGTACAAAGATTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGATT 2778

162054262 GCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGCTTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCAC 162054321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 GCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGCTTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCAC 2838

162054322 AATGGTTGAACTAATTTTCACTTCTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAACT 162054381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 AATGGTTGAACTAATTTTCACTTCTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAACT 2898

162054382 TCACCAGCATCTGTTAATTATTGACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGATG 162054441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 TCACCAGCATCTGTTAATTATTGACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGATG 2958

162054442 GTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTTT 162054501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 GTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTTT 3018

162054502 CATA-GTTTGTTGGCCACATTTATGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAAT 162054560
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 CATATGTTTGTTGGCCACATTTATGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAAT 3078

162054561 TATTAATGGAGTTGTTTTTTTCTTATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTTT 162054620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 TATTAATGGAGTTGTTTTTTTCTTATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTTT 3138

162054621 GTCAGATGTATAGTTTGCAAAAACTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTACT 162054680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 GTCAGATGTATAGTTTGCAAAAACTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTACT 3198

162054681 GATAGTTTCTTTTGCTTTGCAAAAGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTTT 162054740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 GATAGTTTCTTTTGCTTTGCAAAAGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTTT 3258

162054741 TGCTCCTGTTGCAAATGATTTTGGCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATAT 162054800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 TGCTCCTGTTGCAAATGATTTTGGCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATAT 3318

162054801 CTAACCTGCAACAGTTCCACCATATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATAA 162054860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 CTAACCTGCAACAGTTCCACCATATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATAA 3378

162054861 CTGACTAATATCCACAAGTGTTTTACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCCT 162054920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 CTGACTAATATCCACAAGTGTTTTACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCCT 3438

162054921 CCAGACTTGACATCACCAATGAGCCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGAA 162054980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 CCAGACTTGACATCACCAATGAGCCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGAA 3498

162054981 CAAACCTTTGCTCCCTGTTGTAAATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTTC 162055040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 CAAACCTTTGCTCCCTGTTGTAAATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTTC 3558

162055041 AGGCACAGTAGGAAATGTAATATAATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTTC 162055100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 AGGCACAGTAGGAAATGTAATATAATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTTC 3618

162055101 TTCATGGCCATCTGGAACCCATTAAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATGT 162055160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 TTCATGGCCATCTGGAACCCATTAAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATGT 3678

162055161 ATTGGATTTTTGGGGATCTGTTAATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTAG 162055220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 ATTGGATTTTTGGGGATCTGTTAATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTAG 3738

162055221 GTTGAAGAAGAGACAACAGAATGACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAACT 162055280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 GTTGAAGAAGAGACAACAGAATGACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAACT 3798

162055281 GTTCTTAAAATTTAATTACACTTTTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTAT 162055336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 GTTCTTAAAATTTAATTACACTTTTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTAT 3854

Alignment time is 3.37923 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162043250,162063660] =>     20411 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     6880] =>      6880 nucs 'mol-32-2895-080772_6880'

Score:        6631
Aligned:      6743        nucs
Identic:      6732 (100%) nucs =>      4587 (100%)      2145 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162048657,162053250] EXCISED REGION [162053661,162055807]
 second seq =>  [        1,     4592] EXCISED REGION [     4732,     6880]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       410 nucs [162053251,162053660]
 second seq =>       139 nucs [4593,4731]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [162053250,162053250] to [162053660,162053660]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [162053251,162053251] to [162053660,162053660]
 second seq =>         1 nucs [4593,4593] to [4731,4731]

162048657 CCTCAGACAGGGAAAACTAAAGTGAAACAGGAAAGTAGTGGAAGCAAATGCAAGACGGCA 162048716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCAGACAGGGAAAACTAAAGTGAAACAGGAAAGTAGTGGAAGCAAATGCAAGACGGCA 60

162048717 CTTTATTTTTTTATTTTATTTTATTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGTCCCGCTGG 162048776
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
       61 CTTTATTTTTTTATTTTATTTTATTTTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCCGCTGG 120

162048777 AGTGCAATGGCGGGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCACCTTCCAGTTTCAAGCGATTCTC 162048836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGTGCAATGGCGGGATCTTGGTTCACTGCAACCTCCACCTTCCAGTTTCAAGCGATTCTC 180

162048837 CTGCCTGTCTCCCGAGTGGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCATGCTGGCTAATTTTTG 162048896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGCCTGTCTCCCGAGTGGCTGGGATTACAGGTGCCCACCACCATGCTGGCTAATTTTTG 240

162048897 TATTTTTAGTAGATACGGGTTTCACCATGTTGGCCAGTCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 162048956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATTTTTAGTAGATACGGGTTTCACCATGTTGGCCAGTCTGGTCTCAAACTCCTGACCTC 300

162048957 GTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTTGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCC 162049016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCAAAGTGCTTGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCC 360

162049017 GGCCAATGGCAGCTTATTGAGTTGACCAGAGCTTCAGAAGAAAACACAGGAAGTGAACCA 162049076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGCCAATGGCAGCTTATTGAGTTGACCAGAGCTTCAGAAGAAAACACAGGAAGTGAACCA 420

162049077 ATATGTCTAATAGATGTCCATCAAGGGAGAAATAAGAATACTCCATTCACTTTCTTCTTC 162049136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATATGTCTAATAGATGTCCATCAAGGGAGAAATAAGAATACTCCATTCACTTTCTTCTTC 480

162049137 ATTTCTTCTGCCTCTTATATTTGAATATTGCCTCATGTTGTGTTAACTCTTCTGTGTGTT 162049196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTTCTTCTGCCTCTTATATTTGAATATTGCCTCATGTTGTGTTAACTCTTCTGTGTGTT 540

162049197 GATCATGTGTCACTTGGTCCAAATGAGCTGCCTCTGGGGTGTTGGATCTCATGACTCCTG 162049256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATCATGTGTCACTTGGTCCAAATGAGCTGCCTCTGGGGTGTTGGATCTCATGACTCCTG 600

162049257 GTGTGGTGCTGCATCAGAATCAGGACCTGGCAAAAGAATCCAGGTACTCTGTGAGTCCGA 162049316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGTGGTGCTGCATCAGAATCAGGACCTGGCAAAAGAATCCAGGTACTCTGTGAGTCCGA 660

162049317 ATGATGAGAGCAGGGTAACAGAGCTACTGAAATGTCTAATATGGCAGATCTCATGGAAGC 162049376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATGATGAGAGCAGGGTAACAGAGCTACTGAAATGTCTAATATGGCAGATCTCATGGAAGC 720

162049377 TGCACCAAAAGCTAGGTTCCAGTCTTGGGTAGCAAGTGACAGTTGGTGATATTAGATGAT 162049436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGCACCAAAAGCTAGGTTCCAGTCTTGGGTAGCAAGTGACAGTTGGTGATATTAGATGAT 780

162049437 GAGGCAAGTTGCTAGAAGTAAGTGCTCTCTTTCGAGCAAGTGGTGGAAACCCAGGGGACA 162049496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGGCAAGTTGCTAGAAGTAAGTGCTCTCTTTCGAGCAAGTGGTGGAAACCCAGGGGACA 840

162049497 AGTGGGGTACAGTGTACCAAAGAAAGAGCAAAAATTAAGCCATTATAATTCTACTTTGTT 162049556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTGGGGTACAGTGTACCAAAGAAAGAGCAAAAATTAAGCCATTATAATTCTACTTTGTT 900

162049557 CTCCATACCCAGCTTTAAAATATTATTTCTATTTTTCACATGCACATTCTTCAACTTTTA 162049616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCCATACCCAGCTTTAAAATATTATTTCTATTTTTCACATGCACATTCTTCAACTTTTA 960

162049617 TTTTCATAATTTCTATATATTATTTTAAAAGTGTCTCTTGTAAGCAACAAATTAGTAATT 162049676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTCATAATTTCTATATATTATTTTAAAAGTGTCTCTTGTAAGCAACAAATTAGTAATT 1020

162049677 ATTTTTGTGAATTTAAGTTTCCACCCTTTCATTGATATATTTAAGCCATATTTTCATTAC 162049736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTTTGTGAATTTAAGTTTCCACCCTTTCATTGATATATTTAAGCCATATTTTCATTAC 1080

162049737 TTTAAACTTTTTTCTATGATACTGTTTCATCTTTTCCATTTACGTACTTTATTTTTCTTG 162049796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTAAACTTTTTTCTATGATACTGTTTCATCTTTTCCATTTACGTACTTTATTTTTCTTG 1140

162049797 CCTGCTTTCACTTGTATATGTATGTGTTTATCATTTGCATATGTTAAATTTCCTCCTGCT 162049856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTGCTTTCACTTGTATATGTATGTGTTTATCATTTGCATATGTTAAATTTCCTCCTGCT 1200

162049857 GAATATAAATTTACATATGTTGTAATTCTTTGGAAACTAGATAAGACACATATTTGAGCC 162049916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAATATAAATTTACATATGTTGTAATTCTTTGGAAACTAGATAAGACACATATTTGAGCC 1260

162049917 CTTTTTACAACTATTGATTTATAAAATTGATCAGAATATATACATTTTCAAAGGAAGACA 162049976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTTTTTACAACTATTGATTTATAAAATTGATCAGAATATATACATTTTCAAAGGAAGACA 1320

162049977 AGAGCATTAGTATAGTTTTTCAATATGTTATCTTATCTCTGCCCAACACCATATTGGCAT 162050036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAGCATTAGTATAGTTTTTCAATATGTTATCTTATCTCTGCCCAACACCATATTGGCAT 1380

162050037 TTTCTACAACTTTATATTGGATTTTTCAGATACATATATTTTAATTTACATTTGTTTGGC 162050096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTCTACAACTTTATATTGGATTTTTCAGATACATATATTTTAATTTACATTTGTTTGGC 1440

162050097 TCTCTGATTATGTTTAATTTGCCTATGTTCATCTTTCAATTTTCAACTTTTCTCCAAAAT 162050156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTCTGATTATGTTTAATTTGCCTATGTTCATCTTTCAATTTTCAACTTTTCTCCAAAAT 1500

162050157 TTCTTTCAAGTCAGCTTGTTGGGGAAAAACATGAGAGCTTAACTGATATTTTTATTGCGT 162050216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCTTTCAAGTCAGCTTGTTGGGGAAAAACATGAGAGCTTAACTGATATTTTTATTGCGT 1560

162050217 TTTTCACTAAATGACAATTTAAATGGAGAGTAGTCTTAACACTGAAAAATTTGCTTCCTA 162050276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTTCACTAAATGACAATTTAAATGGAGAGTAGTCTTAACACTGAAAAATTTGCTTCCTA 1620

162050277 TTTCTTTTCTTGTTGTTTTTTTGCTTCTTGGTTCTTTTTTGCAGCCAGCGTTTCTGTTAA 162050336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTCTTTTCTTGTTGTTTTTTTGCTTCTTGGTTCTTTTTTGCAGCCAGCGTTTCTGTTAA 1680

162050337 GAAGTTTCCCTTTCTCAATGTGATTTTTGATCCACAGTTATTACAAATTTATCAAAGTGT 162050396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1681 GAAGTTTCCCTTTCTCAATGTGATTTTTGATCCACAGTTATTACAAATTTCTCAAAGTGT 1740

162050397 AGATATGGTATTTTTTGGTGACCTGTTGACACATTATGAATTGTTTCAATGTGTGATTTT 162050456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGATATGGTATTTTTTGGTGACCTGTTGACACATTATGAATTGTTTCAATGTGTGATTTT 1800

162050457 AAAATCATTCTTTGATTATGGAAAATATGCCACCACTACTATTTTCTCCCTTCTATTTGC 162050516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AAAATCATTCTTTGATTATGGAAAATATGCCACCACTACTATTTTCTCCCTTCTATTTGC 1860

162050517 TTATCTTTCCTTCCGGTATTCCTATTATTGAGATTTTAATACTTGTAATCTCCATGCCTC 162050576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1861 TTATCTTTCCTTCCGGTATTCCTATTATTGAGATTTTAATACTTGTAACCTCCATGCCTC 1920

162050577 TTAGCAACATTTTCTTAAAATTATTTATTTATGAAAGCTTTCTAATGAGTTTTATGAGAA 162050636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTAGCAACATTTTCTTAAAATTATTTATTTATGAAAGCTTTCTAATGAGTTTTATGAGAA 1980

162050637 TTCTTCATTCTAATTCTTTAGCTCAGTAGTATACTCTTCCAATGTATTTGTTCCAGTACT 162050696
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1981 TTCTTCATTCTAATTCTTTAGCTCAGTAGTATACTCTTCCAATGTATCTGTTCCAGTACT 2040

162050697 CTTCATTATGCCTTTGCATTTAATTATTATGTTTTTCAAGATAATCTCAATATGTCTATC 162050756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTTCATTATGCCTTTGCATTTAATTATTATGTTTTTCAAGATAATCTCAATATGTCTATC 2100

162050757 CCAACAATTCTACTTTGGTGATCTCTTTGAACTTTATCTTTATTTTATGGCAATGCTCTT 162050816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCAACAATTCTACTTTGGTGATCTCTTTGAACTTTATCTTTATTTTATGGCAATGCTCTT 2160

162050817 CCAGCTTAGACCCATCTTCCTCTAGAGACATTAGTCTCCTTCTTAGGTAATGAGTATTGG 162050876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCAGCTTAGACCCATCTTCCTCTAGAGACATTAGTCTCCTTCTTAGGTAATGAGTATTGG 2220

162050877 TGATGGATCCAAACCACATGCTTTAGTTTATAGTGCACCTGGTAAGTTTAAAGAAAGAGA 162050936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGATGGATCCAAACCACATGCTTTAGTTTATAGTGCACCTGGTAAGTTTAAAGAAAGAGA 2280

162050937 AAACTATGTGGTGAGAACAGAGCTCCAGGTATCATAAAGCCACATTTCACTATTTATGCT 162050996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAACTATGTGGTGAGAACAGAGCTCCAGGTATCATAAAGCCACATTTCACTATTTATGCT 2340

162050997 GATTGTTTACTGCCACTCAACCATGTATTTATTCTCATTAGTAATATAAGAATATTCACT 162051056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GATTGTTTACTGCCACTCAACCATGTATTTATTCTCATTAGTAATATAAGAATATTCACT 2400

162051057 TTCCTTAAATTCATTCAAAGGTAGCTTCCCTGAAGCAGCAGCAGCACCACCACAATTGAT 162051116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTCCTTAAATTCATTCAAAGGTAGCTTCCCTGAAGCAGCAGCAGCACCACCACAATTGAT 2460

162051117 ATTTGTATAGCATATGCTATGTGACAAGGACTTATGTGTGTGTATGTTCATTTAATCCCA 162051176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATTTGTATAGCATATGCTATGTGACAAGGACTTATGTGTGTGTATGTTCATTTAATCCCA 2520

162051177 ACAGCAATCCTACAGAATGTGTACTATCACGAGCTCACTTTACAGACAGGAAAACTGACA 162051236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ACAGCAATCCTACAGAATGTGTACTATCACGAGCTCACTTTACAGACAGGAAAACTGACA 2580

162051237 TAAAGAGAAGTGATGTCTACTGAGTCTGGCCCAGAATGTTGGCAGTTGAGATTTTACCTA 162051296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAAAGAGAAGTGATGTCTACTGAGTCTGGCCCAGAATGTTGGCAGTTGAGATTTTACCTA 2640

162051297 GTTTTCAAATTAGAACTGCAGTTTAAATATTGATGAGTATTATAGTTACACTATGCAGAC 162051356
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GTTTTCAAATTAGAACTGCAGTTTAAATATCGATGAGTATTATAGTTACACTATGCAGAC 2700

162051357 TTTTAAAAAAATTTTTCCATAAAAAGGCCTTATGAATATATTAAAGTTAATCAGTTTATT 162051416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTTAAAAAAATTTTTCCATAAAAAGGCCTTATGAATATATTAAAGTTAATCAGTTTATT 2760

162051417 TTTACAACTATGATTTCAATAATCTGGGAATTTGATTTGCATAGTGTACTGAAAAGTAAT 162051476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTTACAACTATGATTTCAATAATCTGGGAATTTGATTTGCATAGTGTACTGAAAAGTAAT 2820

162051477 AAGCAGATAAAATATTTTATAAACAAAGGAATTTGGAAAACATCTTAAACTCTATATATT 162051536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAGCAGATAAAATATTTTATAAACAAAGGAATTTGGAAAACATCTTAAACTCTATATATT 2880

162051537 TAATCTTATAAAGTAAAGAAAATGTATCTAACAAATTAGAGATTGACATTAACTTTTGCA 162051596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAATCTTATAAAGTAAAGAAAATGTATCTAACAAATTAGAGATTGACATTAACTTTTGCA 2940

162051597 AGAACAAAGAATGTTAAGATATTAAAAATGCATGTTTTCAAAATAAAAAAGAATGAAGAT 162051656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||
     2941 AGAACAAAGAATGTTAAGATATTAAAAATGCATGTTTTCAAAATAAAA--GAATGAAGAT 2998

162051657 TAAAAAAAGAAAGTTTAGCAGAAAGGATTTTTTTTAAGTAGAAGAAAAAAGTAAGAGCAT 162051716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 TAAAAAAAGAAAGTTTAGCAGAAAGGATTTTTTTTAAGTAGAAGAAAAAAGTAAGAGCAT 3058

162051717 GTACATAAGAGTATCAGCTGGGAAATGAGTTTAGTTTGAATTAAGATCATTCACCAGATT 162051776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 GTACATAAGAGTATCAGCTGGGAAATGAGTTTAGTTTGAATTAAGATCATTCACCAGATT 3118

162051777 GAGGAGGAATCAAACAATGCAAATTAGAAACATGATATTGCATTTCAAAAGAATGTTTCC 162051836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 GAGGAGGAATCAAACAATGCAAATTAGAAACATGATATTGCATTTCAAAAGAATGTTTCC 3178

162051837 TCACAGATGTTGTAGCTGAATGTAGTTTCTATTCTTACCTTTCCTTTAGATGGTAGGGCA 162051896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TCACAGATGTTGTAGCTGAATGTAGTTTCTATTCTTACCTTTCCTTTAGATGGTAGGGCA 3238

162051897 ACAGATGAGTACAGAGAAAAGGAAGCAGCATTTAACTTAAAGTGAAAAGAGAGAAATCAC 162051956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 ACAGATGAGTACAGAGAAAAGGAAGCAGCATTTAACTTAAAGTGAAAAGAGAGAAATCAC 3298

162051957 TATTATCTGGACCAATTATTATTTAACAAAAGAACTTGATTTACTGTAAAAAATAGTCTT 162052016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TATTATCTGGACCAATTATTATTTAACAAAAGAACTTGATTTACTGTAAAAAATAGTCTT 3358

162052017 TAAAATGTGTCCTTTTCTGTGTTCTTTATATTCTTTTGGGGACTTTGTATTGGTCAAGGA 162052076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TAAAATGTGTCCTTTTCTGTGTTCTTTATATTCTTTTGGGGACTTTGTATTGGTCAAGGA 3418

162052077 ACAGATTCTACTATACACAATTTGAATAGAAGGGGATGTATTAAAAAGTATGTCAAATGG 162052136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 ACAGATTCTACTATACACAATTTGAATAGAAGGGGATGTATTAAAAAGTATGTCAAATGG 3478

162052137 CTTACAGAATTGAGATGGCTGAAGGAGATTCTACAATGAAATTCCAGAATCTGCTCTTAG 162052196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 CTTACAGAATTGAGATGGCTGAAGGAGATTCTACAATGAAATTCCAGAATCTGCTCTTAG 3538

162052197 GTCTGTGCTGCAGAACCAAACTGCAAAAGGAGTTGTTTCTTTTGCCATGATCAAGAAGCT 162052256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 GTCTGTGCTGCAGAACCAAACTGCAAAAGGAGTTGTTTCTTTTGCCATGATCAAGAAGCT 3598

162052257 GCTGGTCAAATCAGGAGGCATTCTTCATTGAGTATACAAATATTAGAACTATCTCCATTC 162052316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 GCTGGTCAAATCAGGAGGCATTCTTCATTGAGTATACAAATATTAGAACTATCTCCATTC 3658

162052317 TGAGCTGCATAAATTAGCTGTAGTTACTGCTTCCAAAAGGCACTCTGTCCTCCCATCAGG 162052376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 TGAGCTGCATAAATTAGCTGTAGTTACTGCTTCCAAAAGGCACTCTGTCCTCCCATCAGG 3718

162052377 AAACATCATGTGCAAAATCAAGAAGCTGCTATTATAGCTGCAGAAGTCTATACCATGCCA 162052436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 AAACATCATGTGCAAAATCAAGAAGCTGCTATTATAGCTGCAGAAGTCTATACCATGCCA 3778

162052437 CATTTTCTACTATCAAGAAGCCATCTCTGCCAAATCAGCTAGCCTCAGAGACAAATTTTG 162052496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 CATTTTCTACTATCAAGAAGCCATCTCTGCCAAATCAGCTAGCCTCAGAGACAAATTTTG 3838

162052497 GCTCCAGAACCATGCCACATTTGCTACAATCCACATTGATAATATATCTGCACCATATCC 162052556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 GCTCCAGAACCATGCCACATTTGCTACAATCCACATTGATAATATATCTGCACCATATCC 3898

162052557 TATATATCTCCATTCAAATTTCAAATTTCAATGTGTTTGTCTCTGATGTGGGACCTAAAT 162052616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 TATATATCTCCATTCAAATTTCAAATTTCAATGTGTTTGTCTCTGATGTGGGACCTAAAT 3958

162052617 CACATTTACGTTATCAAATGAAAATGAATTGGAGAAATTTCCCTTATAGTTTTCTGCCCT 162052676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 CACATTTACGTTATCAAATGAAAATGAATTGGAGAAATTTCCCTTATAGTTTTCTGCCCT 4018

162052677 CTACAGAAAAGGAAAGTCACATCAGAAGAAAATTTGAATAGGTGTTTTAAGCCAAACCAG 162052736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4019 CTACAGAAAAGGAAAGTCACATCAGAAGAAAATTTGAATAGGTGTTTTAAGCCAAACCAG 4078

162052737 AATAACTGCATTAGACTTCACTCTTACTTTATATCTCTGCTTTTATTTTTAAAAATTTCT 162052796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4079 AATAACTGCATTAGACTTCACTCTTACTTTATATCTCTGCTTTTATTTTTAAAAATTTCT 4138

162052797 TATATTTTCACACATGGAATTTACATTTGATCCATCTTTGAGCATAGTCTCAGAGTCTGA 162052856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4139 TATATTTTCACACATGGAATTTACATTTGATCCATCTTTGAGCATAGTCTCAGAGTCTGA 4198

162052857 AACATTCCAGCTATGAAGTAAGTACTTAAATGGCTGTTCAATAAATTAATATGAGCTACT 162052916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4199 AACATTCCAGCTATGAAGTAAGTACTTAAATGGCTGTTCAATAAATTAATATGAGCTACT 4258

162052917 TTCTGATAATTAAAAAATCTTTTTTATAAGAATACAATAGGAAAACATTGGATTTACTGC 162052976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4259 TTCTGATAATTAAAAAATCTTTTTTATAAGAATACAATAGGAAAACATTGGATTTACTGC 4318

162052977 TCATTTTTTTTATGGTATAAGCACATCTAATCCTGTATATGAAAGAGTACCAGCTGGAGC 162053036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4319 TCATTTTTTTTATGGTATAAGCACATCTAATCCTGTATATGAAAGAGTACCAGCTGGAGC 4378

162053037 CTTATCTGAAATTTCTACACATCTGGGAAAATTCGTTAAAGGTTGAGCTAGATTGAATAT 162053096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4379 CTTATCTGAAATTTCTACACATCTGGGAAAATTCGTTAAAGGTTGAGCTAGATTGAATAT 4438

162053097 ATTAAACAACTCTATTGGTATAAAAAAGTAGAAAATACAAAAGACAGAAATATTTCTAAA 162053156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4439 ATTAAACAACTCTATTGGTATAAAAAAGTAGAAAATACAAAAGACAGAAATATTTCTAAA 4498

162053157 AGATAAGATAGCCTGAACAATGCAATTAATCAAAAAATGATCTTCAGTTATCAAAATTGG 162053216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4499 AGATAAGATAGCCTGAACAATGCAATTAATCAAAAAATGATCTTCAGTTATCAAAATTGG 4558

162053217 GTAGTGATTGTGACTATATTCTGGTGGCTATAAT 162053250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4559 GTAGTGATTGTGACTATATTCTGGTGGCTATAAT 4592

EXCISED REGION

162053661 GAAAAGAGTACTTAGCAAGATTTTTAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTT 162053720
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 GAAAAGAGTACTTAGCAAGATTTCTAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTT 4791

162053721 TTGTTTTATTTAAAAACAACATTTATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTT 162053780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4792 TTGTTTTATTTAAAAACAACATTTATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTT 4851

162053781 ACAGGTAAACTTGTGTCACAGAAGTTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAA 162053840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 ACAGGTAAACTTGTGTCACAGAAGTTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAA 4911

162053841 GACTACTACCCGTTCGTTATTTTTCCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTG 162053900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4912 GACTACTACCCGTTCGTTATTTTTCCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTG 4971

162053901 AAAGGCCCCAGTGTATGGTTTCCTTCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCAC 162053960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4972 AAAGGCCCCAGTGTATGGTTTCCTTCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCAC 5031

162053961 TTATAAGTGAGAAGATGCGGTATTTGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAA 162054020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5032 TTATAAGTGAGAAGATGCGGTATTTGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAA 5091

162054021 AGGCCTCCACCTCCACTCATGTCTGTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGC 162054080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5092 AGGCCTCCACCTCCACTCATGTCTGTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGC 5151

162054081 TGCATACCATTCCACGGTGTAGATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTG 162054140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5152 TGCATACCATTCCACGGTGTAGATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTG 5211

162054141 GCATTTAGGTTGATTCCGTATCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACAT 162054200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5212 GCATTTAGGTTGATTCCGTATCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACAT 5271

162054201 GCATGTGTCTTTATGGTACAAAGATTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGAT 162054260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5272 GCATGTGTCTTTATGGTACAAAGATTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGAT 5331

162054261 TGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGCTTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCA 162054320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5332 TGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGCTTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCA 5391

162054321 CAATGGTTGAACTAATTTTCACTTCTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAAC 162054380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5392 CAATGGTTGAACTAATTTTCACTTCTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAAC 5451

162054381 TTCACCAGCATCTGTTAATTATTGACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGAT 162054440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5452 TTCACCAGCATCTGTTAATTATTGACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGAT 5511

162054441 GGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTT 162054500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5512 GGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTT 5571

162054501 TCATA-GTTTGTTGGCCACATTTATGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAA 162054559
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5572 TCATATGTTTGTTGGCCACATTTATGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAA 5631

162054560 TTATTAATGGAGTTGTTTTTTTCTTATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTT 162054619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5632 TTATTAATGGAGTTGTTTTTTTCTTATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTT 5691

162054620 TGTCAGATGTATAGTTTGCAAAAACTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTAC 162054679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5692 TGTCAGATGTATAGTTTGCAAAAACTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTAC 5751

162054680 TGATAGTTTCTTTTGCTTTGCAAAAGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTT 162054739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5752 TGATAGTTTCTTTTGCTTTGCAAAAGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTT 5811

162054740 TTGCTCCTGTTGCAAATGATTTTGGCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATA 162054799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5812 TTGCTCCTGTTGCAAATGATTTTGGCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATA 5871

162054800 TCTAACCTGCAACAGTTCCACCATATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATA 162054859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5872 TCTAACCTGCAACAGTTCCACCATATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATA 5931

162054860 ACTGACTAATATCCACAAGTGTTTTACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCC 162054919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5932 ACTGACTAATATCCACAAGTGTTTTACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCC 5991

162054920 TCCAGACTTGACATCACCAATGAGCCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGA 162054979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5992 TCCAGACTTGACATCACCAATGAGCCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGA 6051

162054980 ACAAACCTTTGCTCCCTGTTGTAAATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTT 162055039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6052 ACAAACCTTTGCTCCCTGTTGTAAATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTT 6111

162055040 CAGGCACAGTAGGAAATGTAATATAATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTT 162055099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6112 CAGGCACAGTAGGAAATGTAATATAATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTT 6171

162055100 CTTCATGGCCATCTGGAACCCATTAAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATG 162055159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6172 CTTCATGGCCATCTGGAACCCATTAAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATG 6231

162055160 TATTGGATTTTTGGGGATCTGTTAATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTA 162055219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6232 TATTGGATTTTTGGGGATCTGTTAATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTA 6291

162055220 GGTTGAAGAAGAGACAACAGAATGACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAAC 162055279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6292 GGTTGAAGAAGAGACAACAGAATGACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAAC 6351

162055280 TGTTCTTAAAATTTAATTACACTTTTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTATTCT 162055339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6352 TGTTCTTAAAATTTAATTACACTTTTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTATTCT 6411

162055340 TCTAGATAACAAAATGCTACTGGGTCACATGATTTACATGGCTAGTCATATCAGATAATG 162055399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6412 TCTAGATAACAAAATGCTACTGGGTCACATGATTTACATGGCTAGTCATATCAGATAATG 6471

162055400 TTAAATTTATGATAGGCTGCTCAAGTCTCCCTTTTCCTGAAAGCAAGTTTTTTTTAGTAT 162055459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6472 TTAAATTTATGATAGGCTGCTCAAGTCTCCCTTTTCCTGAAAGCAAGTTTTTTTTAGTAT 6531

162055460 CTTTCAGAGAGTGATAGCTAGAGCTATTTTTAAAAGGTGTCTTTTTCACTTATTTTACCT 162055519
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6532 CTTTCAGAGAGTAATAGCTAGAGCTATTTTTAAAAGGTGTCTTTTTCACTTATTTTACCT 6591

162055520 TTACTCCAAAAATTCAGAGGCCATGACTACGATTTTCTTATTGTGACTTGTTATGGTTTG 162055579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6592 TTACTCCAAAAATTCAGAGGCCATGACTACGATTTTCTTATTGTGACTTGTTATGGTTTG 6651

162055580 TAAAAAATTTTACAGACAGTTTAATCCAGTGGATAATTATAAAGACTTAACTGTAAAACT 162055639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6652 TAAAAAATTTTACAGACAGTTTAATCCAGTGGATAATTATAAAGACTTAACTGTAAAACT 6711

162055640 ATTGTCTCCTTAGTCCACCTAGAAAGCATCTTCTCTTAATCTGAGCCATATGGAAAGCTG 162055699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6712 ATTGTCTCCTTAGTCCACCTAGAAAGCATCTTCTCTTAATCTGAGCCATATGGAAAGCTG 6771

162055700 ACAGGTTTGAGGGAATACAGGAAATG-AAAAAAAAAAAAACAGGACAGCAAAATATCACA 162055758
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     6772 ACAGGTTTGAGGGAATACAGGAAATGAAAAAAAAAAAAAACAGGACAGCAAAATATCACA 6831

162055759 ATTTTTGCCTTCATAATTCAAAGAGGTCCACCATGCTGTGTCCCTTTCT 162055807
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6832 ATTTTTGCCTTCATAATTCAAAGAGGTCCACCATGCTGTGTCCCTTTCT 6880

Alignment time is 6.02027 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162043250,162063660] =>     20411 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     2149] =>      2149 nucs 'mol-32-2895-080772_2149'

Score:        2115
Aligned:      2148        nucs
Identic:      2145 (100%) nucs =>        23 (100%)      2122 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162053661,162053683] EXCISED REGION [162053685,162055807]
 second seq =>  [        1,       23] EXCISED REGION [       25,     2149]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [162053684,162053684]
 second seq =>         1 nucs [24,24]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [846,846]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162053681,162053684] to [162053682,162053685]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [162053683,162053683] to [162053685,162053685]
 second seq =>         1 nucs [23,23] to [25,25]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

162053661 GAAAAGAGTACTTAGCAAGATTT 162053683
          |||||||||||||||||||||||
        1 GAAAAGAGTACTTAGCAAGATTT 23

EXCISED REGION

162053685 TAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTTTTGTTTTATTTAAAAACAACATTT 162053744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       25 TAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTTTTGTTTTATTTAAAAACAACATTT 84

162053745 ATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTTACAGGTAAACTTGTGTCACAGAAG 162053804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       85 ATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTTACAGGTAAACTTGTGTCACAGAAG 144

162053805 TTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAAGACTACTACCCGTTCGTTATTTTT 162053864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      145 TTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAAGACTACTACCCGTTCGTTATTTTT 204

162053865 CCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTGAAAGGCCCCAGTGTATGGTTTCCT 162053924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      205 CCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTGAAAGGCCCCAGTGTATGGTTTCCT 264

162053925 TCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCACTTATAAGTGAGAAGATGCGGTATT 162053984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      265 TCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCACTTATAAGTGAGAAGATGCGGTATT 324

162053985 TGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAAAGGCCTCCACCTCCACTCATGTCT 162054044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      325 TGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAAAGGCCTCCACCTCCACTCATGTCT 384

162054045 GTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGCTGCATACCATTCCACGGTGTAGAT 162054104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 GTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGCTGCATACCATTCCACGGTGTAGAT 444

162054105 GTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTGGCATTTAGGTTGATTCCGTATCTT 162054164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 GTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTGGCATTTAGGTTGATTCCGTATCTT 504

162054165 TGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACATGCATGTGTCTTTATGGTACAAAGA 162054224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 TGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACATGCATGTGTCTTTATGGTACAAAGA 564

162054225 TTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGC 162054284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 TTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGC 624

162054285 TTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCACAATGGTTGAACTAATTTTCACTT 162054344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 TTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCACAATGGTTGAACTAATTTTCACTT 684

162054345 CTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAACTTCACCAGCATCTGTTAATTATTG 162054404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 CTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAACTTCACCAGCATCTGTTAATTATTG 744

162054405 ACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTT 162054464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 ACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGATGGTATCTCATTGTGGTTTTGATTT 804

162054465 GCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTTTCATA-GTTTGTTGGCCACATTTA 162054523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
      805 GCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTTTCATATGTTTGTTGGCCACATTTA 864

162054524 TGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAATTATTAATGGAGTTGTTTTTTTCT 162054583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 TGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAATTATTAATGGAGTTGTTTTTTTCT 924

162054584 TATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTTTGTCAGATGTATAGTTTGCAAAAA 162054643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 TATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTTTGTCAGATGTATAGTTTGCAAAAA 984

162054644 CTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTACTGATAGTTTCTTTTGCTTTGCAAA 162054703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 CTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTACTGATAGTTTCTTTTGCTTTGCAAA 1044

162054704 AGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTTTTGCTCCTGTTGCAAATGATTTTG 162054763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 AGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTTTTGCTCCTGTTGCAAATGATTTTG 1104

162054764 GCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATATCTAACCTGCAACAGTTCCACCAT 162054823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 GCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATATCTAACCTGCAACAGTTCCACCAT 1164

162054824 ATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATAACTGACTAATATCCACAAGTGTTT 162054883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 ATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATAACTGACTAATATCCACAAGTGTTT 1224

162054884 TACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCCTCCAGACTTGACATCACCAATGAG 162054943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 TACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCCTCCAGACTTGACATCACCAATGAG 1284

162054944 CCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGAACAAACCTTTGCTCCCTGTTGTAA 162055003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 CCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGAACAAACCTTTGCTCCCTGTTGTAA 1344

162055004 ATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTTCAGGCACAGTAGGAAATGTAATAT 162055063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 ATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTTCAGGCACAGTAGGAAATGTAATAT 1404

162055064 AATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTTCTTCATGGCCATCTGGAACCCATT 162055123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 AATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTTCTTCATGGCCATCTGGAACCCATT 1464

162055124 AAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATGTATTGGATTTTTGGGGATCTGTTA 162055183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 AAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATGTATTGGATTTTTGGGGATCTGTTA 1524

162055184 ATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTAGGTTGAAGAAGAGACAACAGAATG 162055243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 ATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTAGGTTGAAGAAGAGACAACAGAATG 1584

162055244 ACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAACTGTTCTTAAAATTTAATTACACTT 162055303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 ACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAACTGTTCTTAAAATTTAATTACACTT 1644

162055304 TTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTATTCTTCTAGATAACAAAATGCTACTGGG 162055363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 TTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTATTCTTCTAGATAACAAAATGCTACTGGG 1704

162055364 TCACATGATTTACATGGCTAGTCATATCAGATAATGTTAAATTTATGATAGGCTGCTCAA 162055423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 TCACATGATTTACATGGCTAGTCATATCAGATAATGTTAAATTTATGATAGGCTGCTCAA 1764

162055424 GTCTCCCTTTTCCTGAAAGCAAGTTTTTTTTAGTATCTTTCAGAGAGTGATAGCTAGAGC 162055483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1765 GTCTCCCTTTTCCTGAAAGCAAGTTTTTTTTAGTATCTTTCAGAGAGTAATAGCTAGAGC 1824

162055484 TATTTTTAAAAGGTGTCTTTTTCACTTATTTTACCTTTACTCCAAAAATTCAGAGGCCAT 162055543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 TATTTTTAAAAGGTGTCTTTTTCACTTATTTTACCTTTACTCCAAAAATTCAGAGGCCAT 1884

162055544 GACTACGATTTTCTTATTGTGACTTGTTATGGTTTGTAAAAAATTTTACAGACAGTTTAA 162055603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 GACTACGATTTTCTTATTGTGACTTGTTATGGTTTGTAAAAAATTTTACAGACAGTTTAA 1944

162055604 TCCAGTGGATAATTATAAAGACTTAACTGTAAAACTATTGTCTCCTTAGTCCACCTAGAA 162055663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 TCCAGTGGATAATTATAAAGACTTAACTGTAAAACTATTGTCTCCTTAGTCCACCTAGAA 2004

162055664 AGCATCTTCTCTTAATCTGAGCCATATGGAAAGCTGACAGGTTTGAGGGAATACAGGAAA 162055723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 AGCATCTTCTCTTAATCTGAGCCATATGGAAAGCTGACAGGTTTGAGGGAATACAGGAAA 2064

162055724 TG-AAAAAAAAAAAAACAGGACAGCAAAATATCACAATTTTTGCCTTCATAATTCAAAGA 162055782
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 TGAAAAAAAAAAAAAACAGGACAGCAAAATATCACAATTTTTGCCTTCATAATTCAAAGA 2124

162055783 GGTCCACCATGCTGTGTCCCTTTCT 162055807
          |||||||||||||||||||||||||
     2125 GGTCCACCATGCTGTGTCCCTTTCT 2149

Alignment time is 2.66916 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162043250,162063660] =>     20411 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     6835] =>      6835 nucs 'mol-32-2f12-042323_6835'

Score:        6596
Aligned:      6686        nucs
Identic:      6677 (100%) nucs =>      3985 (100%)      2692 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162049261,162053250] EXCISED REGION [162053673,162056366]
 second seq =>  [        1,     3988] EXCISED REGION [     4140,     6835]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       422 nucs [162053251,162053672]
 second seq =>       151 nucs [3989,4139]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>       411 nucs [162053251,162053661]
 second seq =>       141 nucs [3989,4129]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [162053250,162053251] to [162053672,162053673]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [162053250,162053250] to [162053673,162053673]
 second seq =>         1 nucs [3988,3988] to [4140,4140]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [162053251,162053251] to [162053672,162053672]
 second seq =>         0 nucs

162049261 GGTGCTGCATCAGAATCAGGACCTGGCAAAAGAATCCAGGTACTCTGTGAGTCCGAATGA 162049320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTGCTGCATCAGAATCAGGACCTGGCAAAAGAATCCAGGTACTCTGTGAGTCCGAATGA 60

162049321 TGAGAGCAGGGTAACAGAGCTACTGAAATGTCTAATATGGCAGATCTCATGGAAGCTGCA 162049380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAGAGCAGGGTAACAGAGCTACTGAAATGTCTAATATGGCAGATCTCATGGAAGCTGCA 120

162049381 CCAAAAGCTAGGTTCCAGTCTTGGGTAGCAAGTGACAGTTGGTGATATTAGATGATGAGG 162049440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAAAAGCTAGGTTCCAGTCTTGGGTAGCAAGTGACAGTTGGTGATATTAGATGATGAGG 180

162049441 CAAGTTGCTAGAAGTAAGTGCTCTCTTTCGAGCAAGTGGTGGAAACCCAGGGGACAAGTG 162049500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAGTTGCTAGAAGTAAGTGCTCTCTTTCGAGCAAGTGGTGGAAACCCAGGGGACAAGTG 240

162049501 GGGTACAGTGTACCAAAGAAAGAGCAAAAATTAAGCCATTATAATTCTACTTTGTTCTCC 162049560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGTACAGTGTACCAAAGAAAGAGCAAAAATTAAGCCATTATAATTCTACTTTGTTCTCC 300

162049561 ATACCCAGCTTTAAAATATTATTTCTATTTTTCACATGCACATTCTTCAACTTTTATTTT 162049620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATACCCAGCTTTAAAATATTATTTCTATTTTTCACATGCACATTCTTCAACTTTTATTTT 360

162049621 CATAATTTCTATATATTATTTTAAAAGTGTCTCTTGTAAGCAACAAATTAGTAATTATTT 162049680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATAATTTCTATATATTATTTTAAAAGTGTCTCTTGTAAGCAACAAATTAGTAATTATTT 420

162049681 TTGTGAATTTAAGTTTCCACCCTTTCATTGATATATTTAAGCCATATTTTCATTACTTTA 162049740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGTGAATTTAAGTTTCCACCCTTTCATTGATATATTTAAGCCATATTTTCATTACTTTA 480

162049741 AACTTTTTTCTATGATACTGTTTCATCTTTTCCATTTACGTACTTTATTTTTCTTGCCTG 162049800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACTTTTTTCTATGATACTGTTTCATCTTTTCCATTTACGTACTTTATTTTTCTTGCCTG 540

162049801 CTTTCACTTGTATATGTATGTGTTTATCATTTGCATATGTTAAATTTCCTCCTGCTGAAT 162049860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTTTCACTTGTATATGTATGTGTTTATCATTTGCATATGTTAAATTTCCTCCTGCTGAAT 600

162049861 ATAAATTTACATATGTTGTAATTCTTTGGAAACTAGATAAGACACATATTTGAGCCCTTT 162049920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATAAATTTACATATGTTGTAATTCTTTGGAAACTAGATAAGACACATATTTGAGCCCTTT 660

162049921 TTACAACTATTGATTTATAAAATTGATCAGAATATATACATTTTCAAAGGAAGACAAGAG 162049980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTACAACTATTGATTTATAAAATTGATCAGAATATATACATTTTCAAAGGAAGACAAGAG 720

162049981 CATTAGTATAGTTTTTCAATATGTTATCTTATCTCTGCCCAACACCATATTGGCATTTTC 162050040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CATTAGTATAGTTTTTCAATATGTTATCTTATCTCTGCCCAACACCATATTGGCATTTTC 780

162050041 TACAACTTTATATTGGATTTTTCAGATACATATATTTTAATTTACATTTGTTTGGCTCTC 162050100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACAACTTTATATTGGATTTTTCAGATACATATATTTTAATTTACATTTGTTTGGCTCTC 840

162050101 TGATTATGTTTAATTTGCCTATGTTCATCTTTCAATTTTCAACTTTTCTCCAAAATTTCT 162050160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGATTATGTTTAATTTGCCTATGTTCATCTTTCAATTTTCAACTTTTCTCCAAAATTTCT 900

162050161 TTCAAGTCAGCTTGTTGGGGAAAAACATGAGAGCTTAACTGATATTTTTATTGCGTTTTT 162050220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCAAGTCAGCTTGTTGGGGAAAAACATGAGAGCTTAACTGATATTTTTATTGCGTTTTT 960

162050221 CACTAAATGACAATTTAAATGGAGAGTAGTCTTAACACTGAAAAATTTGCTTCCTATTTC 162050280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CACTAAATGACAATTTAAATGGAGAGTAGTCTTAACACTGAAAAATTTGCTTCCTATTTC 1020

162050281 TTTTCTTGTTGTTTTTTTGCTTCTTGGTTCTTTTTTGCAGCCAGCGTTTCTGTTAAGAAG 162050340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTCTTGTTGTTTTTTTGCTTCTTGGTTCTTTTTTGCAGCCAGCGTTTCTGTTAAGAAG 1080

162050341 TTTCCCTTTCTCAATGTGATTTTTGATCCACAGTTATTACAAATTTATCAAAGTGTAGAT 162050400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1081 TTTCCCTTTCTCAATGTGATTTTTGATCCACAGTTATTACAAATTTCTCAAAGTGTAGAT 1140

162050401 ATGGTATTTTTTGGTGACCTGTTGACACATTATGAATTGTTTCAATGTGTGATTTTAAAA 162050460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGGTATTTTTTGGTGACCTGTTGACACATTATGAATTGTTTCAATGTGTGATTTTAAAA 1200

162050461 TCATTCTTTGATTATGGAAAATATGCCACCACTACTATTTTCTCCCTTCTATTTGCTTAT 162050520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCATTCTTTGATTATGGAAAATATGCCACCACTACTATTTTCTCCCTTCTATTTGCTTAT 1260

162050521 CTTTCCTTCCGGTATTCCTATTATTGAGATTTTAATACTTGTAATCTCCATGCCTCTTAG 162050580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1261 CTTTCCTTCCGGTATTCCTATTATTGAGATTTTAATACTTGTAACCTCCATGCCTCTTAG 1320

162050581 CAACATTTTCTTAAAATTATTTATTTATGAAAGCTTTCTAATGAGTTTTATGAGAATTCT 162050640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAACATTTTCTTAAAATTATTTATTTATGAAAGCTTTCTAATGAGTTTTATGAGAATTCT 1380

162050641 TCATTCTAATTCTTTAGCTCAGTAGTATACTCTTCCAATGTATTTGTTCCAGTACTCTTC 162050700
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1381 TCATTCTAATTCTTTAGCTCAGTAGTATACTCTTCCAATGTATCTGTTCCAGTACTCTTC 1440

162050701 ATTATGCCTTTGCATTTAATTATTATGTTTTTCAAGATAATCTCAATATGTCTATCCCAA 162050760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATTATGCCTTTGCATTTAATTATTATGTTTTTCAAGATAATCTCAATATGTCTATCCCAA 1500

162050761 CAATTCTACTTTGGTGATCTCTTTGAACTTTATCTTTATTTTATGGCAATGCTCTTCCAG 162050820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAATTCTACTTTGGTGATCTCTTTGAACTTTATCTTTATTTTATGGCAATGCTCTTCCAG 1560

162050821 CTTAGACCCATCTTCCTCTAGAGACATTAGTCTCCTTCTTAGGTAATGAGTATTGGTGAT 162050880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTTAGACCCATCTTCCTCTAGAGACATTAGTCTCCTTCTTAGGTAATGAGTATTGGTGAT 1620

162050881 GGATCCAAACCACATGCTTTAGTTTATAGTGCACCTGGTAAGTTTAAAGAAAGAGAAAAC 162050940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGATCCAAACCACATGCTTTAGTTTATAGTGCACCTGGTAAGTTTAAAGAAAGAGAAAAC 1680

162050941 TATGTGGTGAGAACAGAGCTCCAGGTATCATAAAGCCACATTTCACTATTTATGCTGATT 162051000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATGTGGTGAGAACAGAGCTCCAGGTATCATAAAGCCACATTTCACTATTTATGCTGATT 1740

162051001 GTTTACTGCCACTCAACCATGTATTTATTCTCATTAGTAATATAAGAATATTCACTTTCC 162051060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTTTACTGCCACTCAACCATGTATTTATTCTCATTAGTAATATAAGAATATTCACTTTCC 1800

162051061 TTAAATTCATTCAAAGGTAGCTTCCCTGAAGCAGCAGCAGCACCACCACAATTGATATTT 162051120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTAAATTCATTCAAAGGTAGCTTCCCTGAAGCAGCAGCAGCACCACCACAATTGATATTT 1860

162051121 GTATAGCATATGCTATGTGACAAGGACTTATGTGTGTGTATGTTCATTTAATCCCAACAG 162051180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTATAGCATATGCTATGTGACAAGGACTTATGTGTGTGTATGTTCATTTAATCCCAACAG 1920

162051181 CAATCCTACAGAATGTGTACTATCACGAGCTCACTTTACAGACAGGAAAACTGACATAAA 162051240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAATCCTACAGAATGTGTACTATCACGAGCTCACTTTACAGACAGGAAAACTGACATAAA 1980

162051241 GAGAAGTGATGTCTACTGAGTCTGGCCCAGAATGTTGGCAGTTGAGATTTTACCTAGTTT 162051300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GAGAAGTGATGTCTACTGAGTCTGGCCCAGAATGTTGGCAGTTGAGATTTTACCTAGTTT 2040

162051301 TCAAATTAGAACTGCAGTTTAAATATTGATGAGTATTATAGTTACACTATGCAGACTTTT 162051360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCAAATTAGAACTGCAGTTTAAATATTGATGAGTATTATAGTTACACTATGCAGACTTTT 2100

162051361 AAAAAAATTTTTCCATAAAAAGGCCTTATGAATATATTAAAGTTAATCAGTTTATTTTTA 162051420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAAAAAATTTTTCCATAAAAAGGCCTTATGAATATATTAAAGTTAATCAGTTTATTTTTA 2160

162051421 CAACTATGATTTCAATAATCTGGGAATTTGATTTGCATAGTGTACTGAAAAGTAATAAGC 162051480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAACTATGATTTCAATAATCTGGGAATTTGATTTGCATAGTGTACTGAAAAGTAATAAGC 2220

162051481 AGATAAAATATTTTATAAACAAAGGAATTTGGAAAACATCTTAAACTCTATATATTTAAT 162051540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGATAAAATATTTTATAAACAAAGGAATTTGGAAAACATCTTAAACTCTATATATTTAAT 2280

162051541 CTTATAAAGTAAAGAAAATGTATCTAACAAATTAGAGATTGACATTAACTTTTGCAAGAA 162051600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTTATAAAGTAAAGAAAATGTATCTAACAAATTAGAGATTGACATTAACTTTTGCAAGAA 2340

162051601 CAAAGAATGTTAAGATATTAAAAATGCATGTTTTCAAAATAAAAAAGAATGAAGATTAAA 162051660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||
     2341 CAAAGAATGTTAAGATATTAAAAATGCATGTTTTCAAAATAAAA--GAATGAAGATTAAA 2398

162051661 AAAAGAAAGTTTAGCAGAAAGGATTTTTTTTAAGTAGAAGAAAAAAGTAAGAGCATGTAC 162051720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 AAAAGAAAGTTTAGCAGAAAGGATTTTTTTTAAGTAGAAGAAAAAAGTAAGAGCATGTAC 2458

162051721 ATAAGAGTATCAGCTGGGAAATGAGTTTAGTTTGAATTAAGATCATTCACCAGATTGAGG 162051780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 ATAAGAGTATCAGCTGGGAAATGAGTTTAGTTTGAATTAAGATCATTCACCAGATTGAGG 2518

162051781 AGGAATCAAACAATGCAAATTAGAAACATGATATTGCATTTCAAAAGAATGTTTCCTCAC 162051840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 AGGAATCAAACAATGCAAATTAGAAACATGATATTGCATTTCAAAAGAATGTTTCCTCAC 2578

162051841 AGATGTTGTAGCTGAATGTAGTTTCTATTCTTACCTTTCCTTTAGATGGTAGGGCAACAG 162051900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 AGATGTTGTAGCTGAATGTAGTTTCTATTCTTACCTTTCCTTTAGATGGTAGGGCAACAG 2638

162051901 ATGAGTACAGAGAAAAGGAAGCAGCATTTAACTTAAAGTGAAAAGAGAGAAATCACTATT 162051960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 ATGAGTACAGAGAAAAGGAAGCAGCATTTAACTTAAAGTGAAAAGAGAGAAATCACTATT 2698

162051961 ATCTGGACCAATTATTATTTAACAAAAGAACTTGATTTACTGTAAAAAATAGTCTTTAAA 162052020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 ATCTGGACCAATTATTATTTAACAAAAGAACTTGATTTACTGTAAAAAATAGTCTTTAAA 2758

162052021 ATGTGTCCTTTTCTGTGTTCTTTATATTCTTTTGGGGACTTTGTATTGGTCAAGGAACAG 162052080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 ATGTGTCCTTTTCTGTGTTCTTTATATTCTTTTGGGGACTTTGTATTGGTCAAGGAACAG 2818

162052081 ATTCTACTATACACAATTTGAATAGAAGGGGATGTATTAAAAAGTATGTCAAATGGCTTA 162052140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 ATTCTACTATACACAATTTGAATAGAAGGGGATGTATTAAAAAGTATGTCAAATGGCTTA 2878

162052141 CAGAATTGAGATGGCTGAAGGAGATTCTACAATGAAATTCCAGAATCTGCTCTTAGGTCT 162052200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CAGAATTGAGATGGCTGAAGGAGATTCTACAATGAAATTCCAGAATCTGCTCTTAGGTCT 2938

162052201 GTGCTGCAGAACCAAACTGCAAAAGGAGTTGTTTCTTTTGCCATGATCAAGAAGCTGCTG 162052260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GTGCTGCAGAACCAAACTGCAAAAGGAGTTGTTTCTTTTGCCATGATCAAGAAGCTGCTG 2998

162052261 GTCAAATCAGGAGGCATTCTTCATTGAGTATACAAATATTAGAACTATCTCCATTCTGAG 162052320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 GTCAAATCAGGAGGCATTCTTCATTGAGTATACAAATATTAGAACTATCTCCATTCTGAG 3058

162052321 CTGCATAAATTAGCTGTAGTTACTGCTTCCAAAAGGCACTCTGTCCTCCCATCAGGAAAC 162052380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CTGCATAAATTAGCTGTAGTTACTGCTTCCAAAAGGCACTCTGTCCTCCCATCAGGAAAC 3118

162052381 ATCATGTGCAAAATCAAGAAGCTGCTATTATAGCTGCAGAAGTCTATACCATGCCACATT 162052440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 ATCATGTGCAAAATCAAGAAGCTGCTATTATAGCTGCAGAAGTCTATACCATGCCACATT 3178

162052441 TTCTACTATCAAGAAGCCATCTCTGCCAAATCAGCTAGCCTCAGAGACAAATTTTGGCTC 162052500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TTCTACTATCAAGAAGCCATCTCTGCCAAATCAGCTAGCCTCAGAGACAAATTTTGGCTC 3238

162052501 CAGAACCATGCCACATTTGCTACAATCCACATTGATAATATATCTGCACCATATCCTATA 162052560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CAGAACCATGCCACATTTGCTACAATCCACATTGATAATATATCTGCACCATATCCTATA 3298

162052561 TATCTCCATTCAAATTTCAAATTTCAATGTGTTTGTCTCTGATGTGGGACCTAAATCACA 162052620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TATCTCCATTCAAATTTCAAATTTCAATGTGTTTGTCTCTGATGTGGGACCTAAATCACA 3358

162052621 TTTACGTTATCAAATGAAAATGAATTGGAGAAATTTCCCTTATAGTTTTCTGCCCTCTAC 162052680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 TTTACGTTATCAAATGAAAATGAATTGGAGAAATTTCCCTTATAGTTTTCTGCCCTCTAC 3418

162052681 AGAAAAGGAAAGTCACATCAGAAGAAAATTTGAATAGGTGTTTTAAGCCAAACCAGAATA 162052740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AGAAAAGGAAAGTCACATCAGAAGAAAATTTGAATAGGTGTTTTAAGCCAAACCAGAATA 3478

162052741 ACTGCATTAGACTTCACTCTTACTTTATATCTCTGCTTTTATTTTTAAAAATTTCTTATA 162052800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 ACTGCATTAGACTTCACTCTTACTTTATATCTCTGCTTTTATTTTTAAAAATTTCTTATA 3538

162052801 TTTTCACACATGGAATTTACATTTGATCCATCTTTGAGCATAGTCTCAGAGTCTGAAACA 162052860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 TTTTCACACATGGAATTTACATTTGATCCATCTTTGAGCATAGTCTCAGAGTCTGAAACA 3598

162052861 TTCCAGCTATGAAGTAAGTACTTAAATGGCTGTTCAATAAATTAATATGAGCTACTTTCT 162052920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 TTCCAGCTATGAAGTAAGTACTTAAATGGCTGTTCAATAAATTAATATGAGCTACTTTCT 3658

162052921 GATAATTAAAAAATCTTTTTTATAAGAATACAATAGGAAAACATTGGATTTACTGCTCAT 162052980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 GATAATTAAAAAATCTTTTTTATAAGAATACAATAGGAAAACATTGGATTTACTGCTCAT 3718

162052981 TTTTTTTATGGTATAAGCACATCTAATCCTGTATATGAAAGAGTACCAGCTGGAGCCTTA 162053040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TTTTTTTATGGTATAAGCACATCTAATCCTGTATATGAAAGAGTACCAGCTGGAGCCTTA 3778

162053041 TCTGAAATTTCTACACATCTGGGAAAATTCGTTAAAGGTTGAGCTAGATTGAATATATTA 162053100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3779 TCTGAAATTTCTACACATCTGGGAAAATTCGTTAAAGGTTGAGCTAGATTGAATATATTA 3838

162053101 AACAACTCTATTGGTATAAAAAAGTAGAAAATACAAAAGACAGAAATATTTCTAAAAGAT 162053160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3839 AACAACTCTATTGGTATAAAAAAGTAGAAAATACAAAAGACAGAAATATTTCTAAAAGAT 3898

162053161 AAGATAGCCTGAACAATGCAATTAATCAAAAAATGATCTTCAGTTATCAAAATTGGGTAG 162053220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3899 AAGATAGCCTGAACAATGCAATTAATCAAAAAATGATCTTCAGTTATCAAAATTGGGTAG 3958

162053221 TGATTGTGACTATATTCTGGTGGCTATAAT 162053250
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TGATTGTGACTATATTCTGGTGGCTATAAT 3988

EXCISED REGION

162053673 TAGCAAGATTTTTAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTTTTGTTTTATTTA 162053732
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TAGCAAGATTTCTAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTTTTGTTTTATTTA 4199

162053733 AAAACAACATTTATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTTACAGGTAAACTT 162053792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 AAAACAACATTTATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTTACAGGTAAACTT 4259

162053793 GTGTCACAGAAGTTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAAGACTACTACCCG 162053852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 GTGTCACAGAAGTTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAAGACTACTACCCG 4319

162053853 TTCGTTATTTTTCCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTGAAAGGCCCCAGT 162053912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 TTCGTTATTTTTCCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTGAAAGGCCCCAGT 4379

162053913 GTATGGTTTCCTTCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCACTTATAAGTGAGA 162053972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 GTATGGTTTCCTTCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCACTTATAAGTGAGA 4439

162053973 AGATGCGGTATTTGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAAAGGCCTCCACCT 162054032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 AGATGCGGTATTTGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAAAGGCCTCCACCT 4499

162054033 CCACTCATGTCTGTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGCTGCATACCATTC 162054092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 CCACTCATGTCTGTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGCTGCATACCATTC 4559

162054093 CACGGTGTAGATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTGGCATTTAGGTTG 162054152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 CACGGTGTAGATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTGGCATTTAGGTTG 4619

162054153 ATTCCGTATCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACATGCATGTGTCTTT 162054212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 ATTCCGTATCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACATGCATGTGTCTTT 4679

162054213 ATGGTACAAAGATTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCAAA 162054272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 ATGGTACAAAGATTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCAAA 4739

162054273 TGGTAGTTCTGCTTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCACAATGGTTGAAC 162054332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 TGGTAGTTCTGCTTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCACAATGGTTGAAC 4799

162054333 TAATTTTCACTTCTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAACTTCACCAGCATC 162054392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 TAATTTTCACTTCTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAACTTCACCAGCATC 4859

162054393 TGTTAATTATTGACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGATGGTATCTCATTG 162054452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 TGTTAATTATTGACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGATGGTATCTCATTG 4919

162054453 TGGTTTTGATTTGCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTTTCATA-GTTTGT 162054511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     4920 TGGTTTTGATTTGCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTTTCATATGTTTGT 4979

162054512 TGGCCACATTTATGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAATTATTAATGGAG 162054571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 TGGCCACATTTATGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAATTATTAATGGAG 5039

162054572 TTGTTTTTTTCTTATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTTTGTCAGATGTAT 162054631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 TTGTTTTTTTCTTATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTTTGTCAGATGTAT 5099

162054632 AGTTTGCAAAAACTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTACTGATAGTTTCTT 162054691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 AGTTTGCAAAAACTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTACTGATAGTTTCTT 5159

162054692 TTGCTTTGCAAAAGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTTTTGCTCCTGTTG 162054751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 TTGCTTTGCAAAAGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTTTTGCTCCTGTTG 5219

162054752 CAAATGATTTTGGCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATATCTAACCTGCAA 162054811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 CAAATGATTTTGGCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATATCTAACCTGCAA 5279

162054812 CAGTTCCACCATATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATAACTGACTAATAT 162054871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 CAGTTCCACCATATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATAACTGACTAATAT 5339

162054872 CCACAAGTGTTTTACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCCTCCAGACTTGAC 162054931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 CCACAAGTGTTTTACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCCTCCAGACTTGAC 5399

162054932 ATCACCAATGAGCCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGAACAAACCTTTGC 162054991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 ATCACCAATGAGCCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGAACAAACCTTTGC 5459

162054992 TCCCTGTTGTAAATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTTCAGGCACAGTAG 162055051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 TCCCTGTTGTAAATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTTCAGGCACAGTAG 5519

162055052 GAAATGTAATATAATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTTCTTCATGGCCAT 162055111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 GAAATGTAATATAATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTTCTTCATGGCCAT 5579

162055112 CTGGAACCCATTAAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATGTATTGGATTTTT 162055171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 CTGGAACCCATTAAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATGTATTGGATTTTT 5639

162055172 GGGGATCTGTTAATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTAGGTTGAAGAAGA 162055231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 GGGGATCTGTTAATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTAGGTTGAAGAAGA 5699

162055232 GACAACAGAATGACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAACTGTTCTTAAAAT 162055291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 GACAACAGAATGACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAACTGTTCTTAAAAT 5759

162055292 TTAATTACACTTTTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTATTCTTCTAGATAACAA 162055351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 TTAATTACACTTTTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTATTCTTCTAGATAACAA 5819

162055352 AATGCTACTGGGTCACATGATTTACATGGCTAGTCATATCAGATAATGTTAAATTTATGA 162055411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 AATGCTACTGGGTCACATGATTTACATGGCTAGTCATATCAGATAATGTTAAATTTATGA 5879

162055412 TAGGCTGCTCAAGTCTCCCTTTTCCTGAAAGCAAGTTTTTTTTAGTATCTTTCAGAGAGT 162055471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 TAGGCTGCTCAAGTCTCCCTTTTCCTGAAAGCAAGTTTTTTTTAGTATCTTTCAGAGAGT 5939

162055472 GATAGCTAGAGCTATTTTTAAAAGGTGTCTTTTTCACTTATTTTACCTTTACTCCAAAAA 162055531
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 AATAGCTAGAGCTATTTTTAAAAGGTGTCTTTTTCACTTATTTTACCTTTACTCCAAAAA 5999

162055532 TTCAGAGGCCATGACTACGATTTTCTTATTGTGACTTGTTATGGTTTGTAAAAAATTTTA 162055591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 TTCAGAGGCCATGACTACGATTTTCTTATTGTGACTTGTTATGGTTTGTAAAAAATTTTA 6059

162055592 CAGACAGTTTAATCCAGTGGATAATTATAAAGACTTAACTGTAAAACTATTGTCTCCTTA 162055651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 CAGACAGTTTAATCCAGTGGATAATTATAAAGACTTAACTGTAAAACTATTGTCTCCTTA 6119

162055652 GTCCACCTAGAAAGCATCTTCTCTTAATCTGAGCCATATGGAAAGCTGACAGGTTTGAGG 162055711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 GTCCACCTAGAAAGCATCTTCTCTTAATCTGAGCCATATGGAAAGCTGACAGGTTTGAGG 6179

162055712 GAATACAGGAAATG-AAAAAAAAAAAAACAGGACAGCAAAATATCACAATTTTTGCCTTC 162055770
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 GAATACAGGAAATGAAAAAAAAAAAAAACAGGACAGCAAAATATCACAATTTTTGCCTTC 6239

162055771 ATAATTCAAAGAGGTCCACCATGCTGTGTCCCTTTCTTAGTATTAGGGAGCATAAAGCTC 162055830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 ATAATTCAAAGAGGTCCACCATGCTGTGTCCCTTTCTTAGTATTAGGGAGCATAAAGCTC 6299

162055831 AGCAATGTGTTCATTACTTTAAAGGAGTAACTTCATATTACTTAATGCCACAAAATTCCA 162055890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 AGCAATGTGTTCATTACTTTAAAGGAGTAACTTCATATTACTTAATGCCACAAAATTCCA 6359

162055891 CAAATTATGCAATATAGTTGGTAATATTTGTTAAAAACCTAGTTGCTGCTATAATAACGT 162055950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 CAAATTATGCAATATAGTTGGTAATATTTGTTAAAAACCTAGTTGCTGCTATAATAACGT 6419

162055951 TTTCCTTTTAAAAATACATATATAAAATGTAAGCACAATACATTAGGAAGTGAAAAATAA 162056010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 TTTCCTTTTAAAAATACATATATAAAATGTAAGCACAATACATTAGGAAGTGAAAAATAA 6479

162056011 TAATATCTATTTTTAAAGGAGGTGTACTAAGCTGTCAGTGAGCTTAATAAACATGTTTCT 162056070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 TAATATCTATTTTTAAAGGAGGTGTACTAAGCTGTCAGTGAGCTTAATAAACATGTTTCT 6539

162056071 ATACAGTTAAGCAATAACTGCTCCCAAATACTAATGAAACAATATCCATGGTATTGCTGC 162056130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 ATACAGTTAAGCAATAACTGCTCCCAAATACTAATGAAACAATATCCATGGTATTGCTGC 6599

162056131 AATGCTGTCTTTATTTACTGTGTGTGCCTCTTGACCAACAGATCCTAAGAGTACTACTGG 162056190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 AATGCTGTCTTTATTTACTGTGTGTGCCTCTTGACCAACAGATCCTAAGAGTACTACTGG 6659

162056191 TCACTGTTAGTTTTAAACCGATATTGGTTTTTATAAAAGAGAAGGGTGAATAAACTTTAA 162056250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 TCACTGTTAGTTTTAAACCGATATTGGTTTTTATAAAAGAGAAGGGTGAATAAACTTTAA 6719

162056251 AAGTGGAAAACAAGAAATCTTGGCAAATTAGTTAAAAGCTAGGGGGAAGAAAAAAGACAC 162056310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 AAGTGGAAAACAAGAAATCTTGGCAAATTAGTTAAAAGCTAGGGGGAAGAAAAAAGACAC 6779

162056311 TTAATGCTTGAAAGAGCTTTCTAAATAGTGCCCAAATTATGATTAGCATTCCTATA 162056366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6780 TTAATGCTTGAAAGAGCTTTCTAAATAGTGCCCAAATTATGATTAGCATTCCTATA 6835

Alignment time is 6.72795 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162043250,162063660] =>     20411 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     2706] =>      2706 nucs 'mol-32-2f12-042323_2706'

Score:        2662
Aligned:      2706        nucs
Identic:      2702 (100%) nucs =>        10 (100%)      2692 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162053662,162053671] EXCISED REGION [162053673,162056366]
 second seq =>  [        1,       10] EXCISED REGION [       11,     2706]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [162053672,162053672]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 3
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [844,844]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [162053672,162053672] to [162053673,162053673]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

162053662 AAAAGAGTAC 162053671
          ||||||||||
        1 AAAAGAGTAC 10

EXCISED REGION

162053673 TAGCAAGATTTTTAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTTTTGTTTTATTTA 162053732
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       11 TAGCAAGATTTCTAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTTTTGTTTTATTTA 70

162053733 AAAACAACATTTATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTTACAGGTAAACTT 162053792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       71 AAAACAACATTTATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTTACAGGTAAACTT 130

162053793 GTGTCACAGAAGTTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAAGACTACTACCCG 162053852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      131 GTGTCACAGAAGTTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAAGACTACTACCCG 190

162053853 TTCGTTATTTTTCCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTGAAAGGCCCCAGT 162053912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      191 TTCGTTATTTTTCCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTGAAAGGCCCCAGT 250

162053913 GTATGGTTTCCTTCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCACTTATAAGTGAGA 162053972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      251 GTATGGTTTCCTTCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCACTTATAAGTGAGA 310

162053973 AGATGCGGTATTTGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAAAGGCCTCCACCT 162054032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      311 AGATGCGGTATTTGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAAAGGCCTCCACCT 370

162054033 CCACTCATGTCTGTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGCTGCATACCATTC 162054092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      371 CCACTCATGTCTGTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGCTGCATACCATTC 430

162054093 CACGGTGTAGATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTGGCATTTAGGTTG 162054152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      431 CACGGTGTAGATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTGGCATTTAGGTTG 490

162054153 ATTCCGTATCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACATGCATGTGTCTTT 162054212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      491 ATTCCGTATCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACATGCATGTGTCTTT 550

162054213 ATGGTACAAAGATTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCAAA 162054272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      551 ATGGTACAAAGATTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGATTGCTGGGTCAAA 610

162054273 TGGTAGTTCTGCTTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCACAATGGTTGAAC 162054332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      611 TGGTAGTTCTGCTTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCACAATGGTTGAAC 670

162054333 TAATTTTCACTTCTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAACTTCACCAGCATC 162054392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      671 TAATTTTCACTTCTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAACTTCACCAGCATC 730

162054393 TGTTAATTATTGACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGATGGTATCTCATTG 162054452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      731 TGTTAATTATTGACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGATGGTATCTCATTG 790

162054453 TGGTTTTGATTTGCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTTTCATA-GTTTGT 162054511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
      791 TGGTTTTGATTTGCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTTTCATATGTTTGT 850

162054512 TGGCCACATTTATGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAATTATTAATGGAG 162054571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      851 TGGCCACATTTATGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAATTATTAATGGAG 910

162054572 TTGTTTTTTTCTTATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTTTGTCAGATGTAT 162054631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      911 TTGTTTTTTTCTTATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTTTGTCAGATGTAT 970

162054632 AGTTTGCAAAAACTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTACTGATAGTTTCTT 162054691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      971 AGTTTGCAAAAACTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTACTGATAGTTTCTT 1030

162054692 TTGCTTTGCAAAAGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTTTTGCTCCTGTTG 162054751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1031 TTGCTTTGCAAAAGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTTTTGCTCCTGTTG 1090

162054752 CAAATGATTTTGGCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATATCTAACCTGCAA 162054811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1091 CAAATGATTTTGGCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATATCTAACCTGCAA 1150

162054812 CAGTTCCACCATATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATAACTGACTAATAT 162054871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1151 CAGTTCCACCATATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATAACTGACTAATAT 1210

162054872 CCACAAGTGTTTTACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCCTCCAGACTTGAC 162054931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1211 CCACAAGTGTTTTACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCCTCCAGACTTGAC 1270

162054932 ATCACCAATGAGCCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGAACAAACCTTTGC 162054991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1271 ATCACCAATGAGCCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGAACAAACCTTTGC 1330

162054992 TCCCTGTTGTAAATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTTCAGGCACAGTAG 162055051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1331 TCCCTGTTGTAAATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTTCAGGCACAGTAG 1390

162055052 GAAATGTAATATAATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTTCTTCATGGCCAT 162055111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1391 GAAATGTAATATAATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTTCTTCATGGCCAT 1450

162055112 CTGGAACCCATTAAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATGTATTGGATTTTT 162055171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1451 CTGGAACCCATTAAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATGTATTGGATTTTT 1510

162055172 GGGGATCTGTTAATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTAGGTTGAAGAAGA 162055231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1511 GGGGATCTGTTAATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTAGGTTGAAGAAGA 1570

162055232 GACAACAGAATGACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAACTGTTCTTAAAAT 162055291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1571 GACAACAGAATGACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAACTGTTCTTAAAAT 1630

162055292 TTAATTACACTTTTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTATTCTTCTAGATAACAA 162055351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1631 TTAATTACACTTTTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTATTCTTCTAGATAACAA 1690

162055352 AATGCTACTGGGTCACATGATTTACATGGCTAGTCATATCAGATAATGTTAAATTTATGA 162055411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1691 AATGCTACTGGGTCACATGATTTACATGGCTAGTCATATCAGATAATGTTAAATTTATGA 1750

162055412 TAGGCTGCTCAAGTCTCCCTTTTCCTGAAAGCAAGTTTTTTTTAGTATCTTTCAGAGAGT 162055471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1751 TAGGCTGCTCAAGTCTCCCTTTTCCTGAAAGCAAGTTTTTTTTAGTATCTTTCAGAGAGT 1810

162055472 GATAGCTAGAGCTATTTTTAAAAGGTGTCTTTTTCACTTATTTTACCTTTACTCCAAAAA 162055531
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1811 AATAGCTAGAGCTATTTTTAAAAGGTGTCTTTTTCACTTATTTTACCTTTACTCCAAAAA 1870

162055532 TTCAGAGGCCATGACTACGATTTTCTTATTGTGACTTGTTATGGTTTGTAAAAAATTTTA 162055591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1871 TTCAGAGGCCATGACTACGATTTTCTTATTGTGACTTGTTATGGTTTGTAAAAAATTTTA 1930

162055592 CAGACAGTTTAATCCAGTGGATAATTATAAAGACTTAACTGTAAAACTATTGTCTCCTTA 162055651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1931 CAGACAGTTTAATCCAGTGGATAATTATAAAGACTTAACTGTAAAACTATTGTCTCCTTA 1990

162055652 GTCCACCTAGAAAGCATCTTCTCTTAATCTGAGCCATATGGAAAGCTGACAGGTTTGAGG 162055711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1991 GTCCACCTAGAAAGCATCTTCTCTTAATCTGAGCCATATGGAAAGCTGACAGGTTTGAGG 2050

162055712 GAATACAGGAAATG-AAAAAAAAAAAAACAGGACAGCAAAATATCACAATTTTTGCCTTC 162055770
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2051 GAATACAGGAAATGAAAAAAAAAAAAAACAGGACAGCAAAATATCACAATTTTTGCCTTC 2110

162055771 ATAATTCAAAGAGGTCCACCATGCTGTGTCCCTTTCTTAGTATTAGGGAGCATAAAGCTC 162055830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2111 ATAATTCAAAGAGGTCCACCATGCTGTGTCCCTTTCTTAGTATTAGGGAGCATAAAGCTC 2170

162055831 AGCAATGTGTTCATTACTTTAAAGGAGTAACTTCATATTACTTAATGCCACAAAATTCCA 162055890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2171 AGCAATGTGTTCATTACTTTAAAGGAGTAACTTCATATTACTTAATGCCACAAAATTCCA 2230

162055891 CAAATTATGCAATATAGTTGGTAATATTTGTTAAAAACCTAGTTGCTGCTATAATAACGT 162055950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2231 CAAATTATGCAATATAGTTGGTAATATTTGTTAAAAACCTAGTTGCTGCTATAATAACGT 2290

162055951 TTTCCTTTTAAAAATACATATATAAAATGTAAGCACAATACATTAGGAAGTGAAAAATAA 162056010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2291 TTTCCTTTTAAAAATACATATATAAAATGTAAGCACAATACATTAGGAAGTGAAAAATAA 2350

162056011 TAATATCTATTTTTAAAGGAGGTGTACTAAGCTGTCAGTGAGCTTAATAAACATGTTTCT 162056070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2351 TAATATCTATTTTTAAAGGAGGTGTACTAAGCTGTCAGTGAGCTTAATAAACATGTTTCT 2410

162056071 ATACAGTTAAGCAATAACTGCTCCCAAATACTAATGAAACAATATCCATGGTATTGCTGC 162056130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2411 ATACAGTTAAGCAATAACTGCTCCCAAATACTAATGAAACAATATCCATGGTATTGCTGC 2470

162056131 AATGCTGTCTTTATTTACTGTGTGTGCCTCTTGACCAACAGATCCTAAGAGTACTACTGG 162056190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2471 AATGCTGTCTTTATTTACTGTGTGTGCCTCTTGACCAACAGATCCTAAGAGTACTACTGG 2530

162056191 TCACTGTTAGTTTTAAACCGATATTGGTTTTTATAAAAGAGAAGGGTGAATAAACTTTAA 162056250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2531 TCACTGTTAGTTTTAAACCGATATTGGTTTTTATAAAAGAGAAGGGTGAATAAACTTTAA 2590

162056251 AAGTGGAAAACAAGAAATCTTGGCAAATTAGTTAAAAGCTAGGGGGAAGAAAAAAGACAC 162056310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2591 AAGTGGAAAACAAGAAATCTTGGCAAATTAGTTAAAAGCTAGGGGGAAGAAAAAAGACAC 2650

162056311 TTAATGCTTGAAAGAGCTTTCTAAATAGTGCCCAAATTATGATTAGCATTCCTATA 162056366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2651 TTAATGCTTGAAAGAGCTTTCTAAATAGTGCCCAAATTATGATTAGCATTCCTATA 2706

Alignment time is 3.32327 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162043250,162063660] =>     20411 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     2278] =>      2278 nucs 'mol-32-3004-326797_2278'

Score:        2193
Aligned:      2204        nucs
Identic:      2203 (100%) nucs =>       595 (100%)      1608 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162051045,162051640] EXCISED REGION [162051643,162053250]
 second seq =>  [        1,      596] EXCISED REGION [      597,     2204]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [162051641,162051642]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162051641,162051644] to [162051643,162051646]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [162051641,162051641] to [162051642,162051642]
 second seq =>         0 nucs

162051045 AGAATATTCACTTTCCTTAAATTCATTCAAAGGTAGCTTCCCTGAAGCAGCAGCAGCACC 162051104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAATATTCACTTTCCTTAAATTCATTCAAAGGTAGCTTCCCTGAAGCAGCAGCAGCACC 60

162051105 ACCACAATTGATATTTGTATAGCATATGCTATGTGACAAGGACTTATGTGTGTGTATGTT 162051164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACCACAATTGATATTTGTATAGCATATGCTATGTGACAAGGACTTATGTGTGTGTATGTT 120

162051165 CATTTAATCCCAACAGCAATCCTACAGAATGTGTACTATCACGAGCTCACTTTACAGACA 162051224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATTTAATCCCAACAGCAATCCTACAGAATGTGTACTATCACGAGCTCACTTTACAGACA 180

162051225 GGAAAACTGACATAAAGAGAAGTGATGTCTACTGAGTCTGGCCCAGAATGTTGGCAGTTG 162051284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGAAAACTGACATAAAGAGAAGTGATGTCTACTGAGTCTGGCCCAGAATGTTGGCAGTTG 240

162051285 AGATTTTACCTAGTTTTCAAATTAGAACTGCAGTTTAAATATTGATGAGTATTATAGTTA 162051344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGATTTTACCTAGTTTTCAAATTAGAACTGCAGTTTAAATATTGATGAGTATTATAGTTA 300

162051345 CACTATGCAGACTTTTAAAAAAATTTTTCCATAAAAAGGCCTTATGAATATATTAAAGTT 162051404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      301 CACTATGCAGACTTTTAAAAAAATTTTTCCATAAAAAGGCCTTATGAATACATTAAAGTT 360

162051405 AATCAGTTTATTTTTACAACTATGATTTCAATAATCTGGGAATTTGATTTGCATAGTGTA 162051464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATCAGTTTATTTTTACAACTATGATTTCAATAATCTGGGAATTTGATTTGCATAGTGTA 420

162051465 CTGAAAAGTAATAAGCAGATAAAATATTTTATAAACAAAGGAATTTGGAAAACATCTTAA 162051524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGAAAAGTAATAAGCAGATAAAATATTTTATAAACAAAGGAATTTGGAAAACATCTTAA 480

162051525 ACTCTATATATTTAATCTTATAAAGTAAAGAAAATGTATCTAACAAATTAGAGATTGACA 162051584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTCTATATATTTAATCTTATAAAGTAAAGAAAATGTATCTAACAAATTAGAGATTGACA 540

162051585 TTAACTTTTGCAAGAACAAAGAATGTTAAGATATTAAAAATGCATGTTTTCAAAAT 162051640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAACTTTTGCAAGAACAAAGAATGTTAAGATATTAAAAATGCATGTTTTCAAAAT 596

EXCISED REGION

162051643 AAAAGAATGAAGATTAAAAAAAGAAAGTTTAGCAGAAAGGATTTTTTTTAAGTAGAAGAA 162051702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 AAAAGAATGAAGATTAAAAAAAGAAAGTTTAGCAGAAAGGATTTTTTTTAAGTAGAAGAA 656

162051703 AAAAGTAAGAGCATGTACATAAGAGTATCAGCTGGGAAATGAGTTTAGTTTGAATTAAGA 162051762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 AAAAGTAAGAGCATGTACATAAGAGTATCAGCTGGGAAATGAGTTTAGTTTGAATTAAGA 716

162051763 TCATTCACCAGATTGAGGAGGAATCAAACAATGCAAATTAGAAACATGATATTGCATTTC 162051822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 TCATTCACCAGATTGAGGAGGAATCAAACAATGCAAATTAGAAACATGATATTGCATTTC 776

162051823 AAAAGAATGTTTCCTCACAGATGTTGTAGCTGAATGTAGTTTCTATTCTTACCTTTCCTT 162051882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 AAAAGAATGTTTCCTCACAGATGTTGTAGCTGAATGTAGTTTCTATTCTTACCTTTCCTT 836

162051883 TAGATGGTAGGGCAACAGATGAGTACAGAGAAAAGGAAGCAGCATTTAACTTAAAGTGAA 162051942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TAGATGGTAGGGCAACAGATGAGTACAGAGAAAAGGAAGCAGCATTTAACTTAAAGTGAA 896

162051943 AAGAGAGAAATCACTATTATCTGGACCAATTATTATTTAACAAAAGAACTTGATTTACTG 162052002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 AAGAGAGAAATCACTATTATCTGGACCAATTATTATTTAACAAAAGAACTTGATTTACTG 956

162052003 TAAAAAATAGTCTTTAAAATGTGTCCTTTTCTGTGTTCTTTATATTCTTTTGGGGACTTT 162052062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 TAAAAAATAGTCTTTAAAATGTGTCCTTTTCTGTGTTCTTTATATTCTTTTGGGGACTTT 1016

162052063 GTATTGGTCAAGGAACAGATTCTACTATACACAATTTGAATAGAAGGGGATGTATTAAAA 162052122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 GTATTGGTCAAGGAACAGATTCTACTATACACAATTTGAATAGAAGGGGATGTATTAAAA 1076

162052123 AGTATGTCAAATGGCTTACAGAATTGAGATGGCTGAAGGAGATTCTACAATGAAATTCCA 162052182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 AGTATGTCAAATGGCTTACAGAATTGAGATGGCTGAAGGAGATTCTACAATGAAATTCCA 1136

162052183 GAATCTGCTCTTAGGTCTGTGCTGCAGAACCAAACTGCAAAAGGAGTTGTTTCTTTTGCC 162052242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 GAATCTGCTCTTAGGTCTGTGCTGCAGAACCAAACTGCAAAAGGAGTTGTTTCTTTTGCC 1196

162052243 ATGATCAAGAAGCTGCTGGTCAAATCAGGAGGCATTCTTCATTGAGTATACAAATATTAG 162052302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 ATGATCAAGAAGCTGCTGGTCAAATCAGGAGGCATTCTTCATTGAGTATACAAATATTAG 1256

162052303 AACTATCTCCATTCTGAGCTGCATAAATTAGCTGTAGTTACTGCTTCCAAAAGGCACTCT 162052362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 AACTATCTCCATTCTGAGCTGCATAAATTAGCTGTAGTTACTGCTTCCAAAAGGCACTCT 1316

162052363 GTCCTCCCATCAGGAAACATCATGTGCAAAATCAAGAAGCTGCTATTATAGCTGCAGAAG 162052422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 GTCCTCCCATCAGGAAACATCATGTGCAAAATCAAGAAGCTGCTATTATAGCTGCAGAAG 1376

162052423 TCTATACCATGCCACATTTTCTACTATCAAGAAGCCATCTCTGCCAAATCAGCTAGCCTC 162052482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TCTATACCATGCCACATTTTCTACTATCAAGAAGCCATCTCTGCCAAATCAGCTAGCCTC 1436

162052483 AGAGACAAATTTTGGCTCCAGAACCATGCCACATTTGCTACAATCCACATTGATAATATA 162052542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 AGAGACAAATTTTGGCTCCAGAACCATGCCACATTTGCTACAATCCACATTGATAATATA 1496

162052543 TCTGCACCATATCCTATATATCTCCATTCAAATTTCAAATTTCAATGTGTTTGTCTCTGA 162052602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 TCTGCACCATATCCTATATATCTCCATTCAAATTTCAAATTTCAATGTGTTTGTCTCTGA 1556

162052603 TGTGGGACCTAAATCACATTTACGTTATCAAATGAAAATGAATTGGAGAAATTTCCCTTA 162052662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 TGTGGGACCTAAATCACATTTACGTTATCAAATGAAAATGAATTGGAGAAATTTCCCTTA 1616

162052663 TAGTTTTCTGCCCTCTACAGAAAAGGAAAGTCACATCAGAAGAAAATTTGAATAGGTGTT 162052722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 TAGTTTTCTGCCCTCTACAGAAAAGGAAAGTCACATCAGAAGAAAATTTGAATAGGTGTT 1676

162052723 TTAAGCCAAACCAGAATAACTGCATTAGACTTCACTCTTACTTTATATCTCTGCTTTTAT 162052782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 TTAAGCCAAACCAGAATAACTGCATTAGACTTCACTCTTACTTTATATCTCTGCTTTTAT 1736

162052783 TTTTAAAAATTTCTTATATTTTCACACATGGAATTTACATTTGATCCATCTTTGAGCATA 162052842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 TTTTAAAAATTTCTTATATTTTCACACATGGAATTTACATTTGATCCATCTTTGAGCATA 1796

162052843 GTCTCAGAGTCTGAAACATTCCAGCTATGAAGTAAGTACTTAAATGGCTGTTCAATAAAT 162052902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 GTCTCAGAGTCTGAAACATTCCAGCTATGAAGTAAGTACTTAAATGGCTGTTCAATAAAT 1856

162052903 TAATATGAGCTACTTTCTGATAATTAAAAAATCTTTTTTATAAGAATACAATAGGAAAAC 162052962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TAATATGAGCTACTTTCTGATAATTAAAAAATCTTTTTTATAAGAATACAATAGGAAAAC 1916

162052963 ATTGGATTTACTGCTCATTTTTTTTATGGTATAAGCACATCTAATCCTGTATATGAAAGA 162053022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 ATTGGATTTACTGCTCATTTTTTTTATGGTATAAGCACATCTAATCCTGTATATGAAAGA 1976

162053023 GTACCAGCTGGAGCCTTATCTGAAATTTCTACACATCTGGGAAAATTCGTTAAAGGTTGA 162053082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 GTACCAGCTGGAGCCTTATCTGAAATTTCTACACATCTGGGAAAATTCGTTAAAGGTTGA 2036

162053083 GCTAGATTGAATATATTAAACAACTCTATTGGTATAAAAAAGTAGAAAATACAAAAGACA 162053142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 GCTAGATTGAATATATTAAACAACTCTATTGGTATAAAAAAGTAGAAAATACAAAAGACA 2096

162053143 GAAATATTTCTAAAAGATAAGATAGCCTGAACAATGCAATTAATCAAAAAATGATCTTCA 162053202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 GAAATATTTCTAAAAGATAAGATAGCCTGAACAATGCAATTAATCAAAAAATGATCTTCA 2156

162053203 GTTATCAAAATTGGGTAGTGATTGTGACTATATTCTGGTGGCTATAAT 162053250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 GTTATCAAAATTGGGTAGTGATTGTGACTATATTCTGGTGGCTATAAT 2204

Alignment time is 2.97455 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162043250,162063660] =>     20411 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     4729] =>      4729 nucs 'mol-32-30f6-124178_4729'

Score:        4583
Aligned:      4627        nucs
Identic:      4623 (100%) nucs =>      3015 (100%)      1608 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162048622,162051640] EXCISED REGION [162051643,162053250]
 second seq =>  [        1,     3019] EXCISED REGION [     3020,     4627]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [162051641,162051642]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>      4717 nucs [162053251,162057967]
 second seq =>        87 nucs [4628,4714]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162051641,162051644] to [162051643,162051646]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [162051641,162051641] to [162051642,162051642]
 second seq =>         0 nucs

162048622 GCGTATGTATATATAATTTTATTTGGAGGTACAATCCTCAGACAGGGAAAACTAAAGTGA 162048681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCGTATGTATATATAATTTTATTTGGAGGTACAATCCTCAGACAGGGAAAACTAAAGTGA 60

162048682 AACAGGAAAGTAGTGGAAGCAAATGCAAGACGGCACTTTATTTTTTTATTTTATTTTATT 162048741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACAGGAAAGTAGTGGAAGCAAATGCAAGACGGCACTTTATTTTTTTATTTTATTTTATT 120

162048742 TTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGTCCCGCTGGAGTGCAATGGCGGGATCTTGGTTCA 162048801
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGAGACAGAGTTTCACTCTTGTTGCCCCGCTGGAGTGCAATGGCGGGATCTTGGTTCA 180

162048802 CTGCAACCTCCACCTTCCAGTTTCAAGCGATTCTCCTGCCTGTCTCCCGAGTGGCTGGGA 162048861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGCAACCTCCACCTTCCAGTTTCAAGCGATTCTCCTGCCTGTCTCCCGAGTGGCTGGGA 240

162048862 TTACAGGTGCCCACCACCATGCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGATACGGGTTTCAC 162048921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTACAGGTGCCCACCACCATGCTGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGATACGGGTTTCAC 300

162048922 CATGTTGGCCAGTCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCA 162048981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATGTTGGCCAGTCTGGTCTCAAACTCCTGACCTCGTGATCTGCCCACCTCGGCCTCCCA 360

162048982 AAGTGCTTGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCAATGGCAGCTTATTGAGTTGA 162049041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGTGCTTGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCAATGGCAGCTTATTGAGTTGA 420

162049042 CCAGAGCTTCAGAAGAAAACACAGGAAGTGAACCAATATGTCTAATAGATGTCCATCAAG 162049101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCAGAGCTTCAGAAGAAAACACAGGAAGTGAACCAATATGTCTAATAGATGTCCATCAAG 480

162049102 GGAGAAATAAGAATACTCCATTCACTTTCTTCTTCATTTCTTCTGCCTCTTATATTTGAA 162049161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGAGAAATAAGAATACTCCATTCACTTTCTTCTTCATTTCTTCTGCCTCTTATATTTGAA 540

162049162 TATTGCCTCATGTTGTGTTAACTCTTCTGTGTGTTGATCATGTGTCACTTGGTCCAAATG 162049221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTGCCTCATGTTGTGTTAACTCTTCTGTGTGTTGATCATGTGTCACTTGGTCCAAATG 600

162049222 AGCTGCCTCTGGGGTGTTGGATCTCATGACTCCTGGTGTGGTGCTGCATCAGAATCAGGA 162049281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGCTGCCTCTGGGGTGTTGGATCTCATGACTCCTGGTGTGGTGCTGCATCAGAATCAGGA 660

162049282 CCTGGCAAAAGAATCCAGGTACTCTGTGAGTCCGAATGATGAGAGCAGGGTAACAGAGCT 162049341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGGCAAAAGAATCCAGGTACTCTGTGAGTCCGAATGATGAGAGCAGGGTAACAGAGCT 720

162049342 ACTGAAATGTCTAATATGGCAGATCTCATGGAAGCTGCACCAAAAGCTAGGTTCCAGTCT 162049401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTGAAATGTCTAATATGGCAGATCTCATGGAAGCTGCACCAAAAGCTAGGTTCCAGTCT 780

162049402 TGGGTAGCAAGTGACAGTTGGTGATATTAGATGATGAGGCAAGTTGCTAGAAGTAAGTGC 162049461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGGTAGCAAGTGACAGTTGGTGATATTAGATGATGAGGCAAGTTGCTAGAAGTAAGTGC 840

162049462 TCTCTTTCGAGCAAGTGGTGGAAACCCAGGGGACAAGTGGGGTACAGTGTACCAAAGAAA 162049521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTCTTTCGAGCAAGTGGTGGAAACCCAGGGGACAAGTGGGGTACAGTGTACCAAAGAAA 900

162049522 GAGCAAAAATTAAGCCATTATAATTCTACTTTGTTCTCCATACCCAGCTTTAAAATATTA 162049581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAGCAAAAATTAAGCCATTATAATTCTACTTTGTTCTCCATACCCAGCTTTAAAATATTA 960

162049582 TTTCTATTTTTCACATGCACATTCTTCAACTTTTATTTTCATAATTTCTATATATTATTT 162049641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTCTATTTTTCACATGCACATTCTTCAACTTTTATTTTCATAATTTCTATATATTATTT 1020

162049642 TAAAAGTGTCTCTTGTAAGCAACAAATTAGTAATTATTTTTGTGAATTTAAGTTTCCACC 162049701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAAAGTGTCTCTTGTAAGCAACAAATTAGTAATTATTTTTGTGAATTTAAGTTTCCACC 1080

162049702 CTTTCATTGATATATTTAAGCCATATTTTCATTACTTTAAACTTTTTTCTATGATACTGT 162049761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTTCATTGATATATTTAAGCCATATTTTCATTACTTTAAACTTTTTTCTATGATACTGT 1140

162049762 TTCATCTTTTCCATTTACGTACTTTATTTTTCTTGCCTGCTTTCACTTGTATATGTATGT 162049821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCATCTTTTCCATTTACGTACTTTATTTTTCTTGCCTGCTTTCACTTGTATATGTATGT 1200

162049822 GTTTATCATTTGCATATGTTAAATTTCCTCCTGCTGAATATAAATTTACATATGTTGTAA 162049881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTTATCATTTGCATATGTTAAATTTCCTCCTGCTGAATATAAATTTACATATGTTGTAA 1260

162049882 TTCTTTGGAAACTAGATAAGACACATATTTGAGCCCTTTTTACAACTATTGATTTATAAA 162049941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTCTTTGGAAACTAGATAAGACACATATTTGAGCCCTTTTTACAACTATTGATTTATAAA 1320

162049942 ATTGATCAGAATATATACATTTTCAAAGGAAGACAAGAGCATTAGTATAGTTTTTCAATA 162050001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTGATCAGAATATATACATTTTCAAAGGAAGACAAGAGCATTAGTATAGTTTTTCAATA 1380

162050002 TGTTATCTTATCTCTGCCCAACACCATATTGGCATTTTCTACAACTTTATATTGGATTTT 162050061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTTATCTTATCTCTGCCCAACACCATATTGGCATTTTCTACAACTTTATATTGGATTTT 1440

162050062 TCAGATACATATATTTTAATTTACATTTGTTTGGCTCTCTGATTATGTTTAATTTGCCTA 162050121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCAGATACATATATTTTAATTTACATTTGTTTGGCTCTCTGATTATGTTTAATTTGCCTA 1500

162050122 TGTTCATCTTTCAATTTTCAACTTTTCTCCAAAATTTCTTTCAAGTCAGCTTGTTGGGGA 162050181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGTTCATCTTTCAATTTTCAACTTTTCTCCAAAATTTCTTTCAAGTCAGCTTGTTGGGGA 1560

162050182 AAAACATGAGAGCTTAACTGATATTTTTATTGCGTTTTTCACTAAATGACAATTTAAATG 162050241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAACATGAGAGCTTAACTGATATTTTTATTGCGTTTTTCACTAAATGACAATTTAAATG 1620

162050242 GAGAGTAGTCTTAACACTGAAAAATTTGCTTCCTATTTCTTTTCTTGTTGTTTTTTTGCT 162050301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAGAGTAGTCTTAACACTGAAAAATTTGCTTCCTATTTCTTTTCTTGTTGTTTTTTTGCT 1680

162050302 TCTTGGTTCTTTTTTGCAGCCAGCGTTTCTGTTAAGAAGTTTCCCTTTCTCAATGTGATT 162050361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTTGGTTCTTTTTTGCAGCCAGCGTTTCTGTTAAGAAGTTTCCCTTTCTCAATGTGATT 1740

162050362 TTTGATCCACAGTTATTACAAATTTATCAAAGTGTAGATATGGTATTTTTTGGTGACCTG 162050421
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTGATCCACAGTTATTACAAATTTCTCAAAGTGTAGATATGGTATTTTTTGGTGACCTG 1800

162050422 TTGACACATTATGAATTGTTTCAATGTGTGATTTTAAAATCATTCTTTGATTATGGAAAA 162050481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGACACATTATGAATTGTTTCAATGTGTGATTTTAAAATCATTCTTTGATTATGGAAAA 1860

162050482 TATGCCACCACTACTATTTTCTCCCTTCTATTTGCTTATCTTTCCTTCCGGTATTCCTAT 162050541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATGCCACCACTACTATTTTCTCCCTTCTATTTGCTTATCTTTCCTTCCGGTATTCCTAT 1920

162050542 TATTGAGATTTTAATACTTGTAATCTCCATGCCTCTTAGCAACATTTTCTTAAAATTATT 162050601
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TATTGAGATTTTAATACTTGTAACCTCCATGCCTCTTAGCAACATTTTCTTAAAATTATT 1980

162050602 TATTTATGAAAGCTTTCTAATGAGTTTTATGAGAATTCTTCATTCTAATTCTTTAGCTCA 162050661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATTTATGAAAGCTTTCTAATGAGTTTTATGAGAATTCTTCATTCTAATTCTTTAGCTCA 2040

162050662 GTAGTATACTCTTCCAATGTATTTGTTCCAGTACTCTTCATTATGCCTTTGCATTTAATT 162050721
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTAGTATACTCTTCCAATGTATCTGTTCCAGTACTCTTCATTATGCCTTTGCATTTAATT 2100

162050722 ATTATGTTTTTCAAGATAATCTCAATATGTCTATCCCAACAATTCTACTTTGGTGATCTC 162050781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATTATGTTTTTCAAGATAATCTCAATATGTCTATCCCAACAATTCTACTTTGGTGATCTC 2160

162050782 TTTGAACTTTATCTTTATTTTATGGCAATGCTCTTCCAGCTTAGACCCATCTTCCTCTAG 162050841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TTTGAACTTTATCTTTATTTTATGGCAATGCTCTTCCAGCTTAGACCCATCTTCCTCTAG 2220

162050842 AGACATTAGTCTCCTTCTTAGGTAATGAGTATTGGTGATGGATCCAAACCACATGCTTTA 162050901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGACATTAGTCTCCTTCTTAGGTAATGAGTATTGGTGATGGATCCAAACCACATGCTTTA 2280

162050902 GTTTATAGTGCACCTGGTAAGTTTAAAGAAAGAGAAAACTATGTGGTGAGAACAGAGCTC 162050961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GTTTATAGTGCACCTGGTAAGTTTAAAGAAAGAGAAAACTATGTGGTGAGAACAGAGCTC 2340

162050962 CAGGTATCATAAAGCCACATTTCACTATTTATGCTGATTGTTTACTGCCACTCAACCATG 162051021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGGTATCATAAAGCCACATTTCACTATTTATGCTGATTGTTTACTGCCACTCAACCATG 2400

162051022 TATTTATTCTCATTAGTAATATAAGAATATTCACTTTCCTTAAATTCATTCAAAGGTAGC 162051081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATTTATTCTCATTAGTAATATAAGAATATTCACTTTCCTTAAATTCATTCAAAGGTAGC 2460

162051082 TTCCCTGAAGCAGCAGCAGCACCACCACAATTGATATTTGTATAGCATATGCTATGTGAC 162051141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTCCCTGAAGCAGCAGCAGCACCACCACAATTGATATTTGTATAGCATATGCTATGTGAC 2520

162051142 AAGGACTTATGTGTGTGTATGTTCATTTAATCCCAACAGCAATCCTACAGAATGTGTACT 162051201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGGACTTATGTGTGTGTATGTTCATTTAATCCCAACAGCAATCCTACAGAATGTGTACT 2580

162051202 ATCACGAGCTCACTTTACAGACAGGAAAACTGACATAAAGAGAAGTGATGTCTACTGAGT 162051261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATCACGAGCTCACTTTACAGACAGGAAAACTGACATAAAGAGAAGTGATGTCTACTGAGT 2640

162051262 CTGGCCCAGAATGTTGGCAGTTGAGATTTTACCTAGTTTTCAAATTAGAACTGCAGTTTA 162051321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTGGCCCAGAATGTTGGCAGTTGAGATTTTACCTAGTTTTCAAATTAGAACTGCAGTTTA 2700

162051322 AATATTGATGAGTATTATAGTTACACTATGCAGACTTTTAAAAAAATTTTTCCATAAAAA 162051381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AATATTGATGAGTATTATAGTTACACTATGCAGACTTTTAAAAAAATTTTTCCATAAAAA 2760

162051382 GGCCTTATGAATATATTAAAGTTAATCAGTTTATTTTTACAACTATGATTTCAATAATCT 162051441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGCCTTATGAATATATTAAAGTTAATCAGTTTATTTTTACAACTATGATTTCAATAATCT 2820

162051442 GGGAATTTGATTTGCATAGTGTACTGAAAAGTAATAAGCAGATAAAATATTTTATAAACA 162051501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGGAATTTGATTTGCATAGTGTACTGAAAAGTAATAAGCAGATAAAATATTTTATAAACA 2880

162051502 AAGGAATTTGGAAAACATCTTAAACTCTATATATTTAATCTTATAAAGTAAAGAAAATGT 162051561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAGGAATTTGGAAAACATCTTAAACTCTATATATTTAATCTTATAAAGTAAAGAAAATGT 2940

162051562 ATCTAACAAATTAGAGATTGACATTAACTTTTGCAAGAACAAAGAATGTTAAGATATTAA 162051621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATCTAACAAATTAGAGATTGACATTAACTTTTGCAAGAACAAAGAATGTTAAGATATTAA 3000

162051622 AAATGCATGTTTTCAAAAT 162051640
          |||||||||||||||||||
     3001 AAATGCATGTTTTCAAAAT 3019

EXCISED REGION

162051643 AAAAGAATGAAGATTAAAAAAAGAAAGTTTAGCAGAAAGGATTTTTTTTAAGTAGAAGAA 162051702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 AAAAGAATGAAGATTAAAAAAAGAAAGTTTAGCAGAAAGGATTTTTTTTAAGTAGAAGAA 3079

162051703 AAAAGTAAGAGCATGTACATAAGAGTATCAGCTGGGAAATGAGTTTAGTTTGAATTAAGA 162051762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 AAAAGTAAGAGCATGTACATAAGAGTATCAGCTGGGAAATGAGTTTAGTTTGAATTAAGA 3139

162051763 TCATTCACCAGATTGAGGAGGAATCAAACAATGCAAATTAGAAACATGATATTGCATTTC 162051822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 TCATTCACCAGATTGAGGAGGAATCAAACAATGCAAATTAGAAACATGATATTGCATTTC 3199

162051823 AAAAGAATGTTTCCTCACAGATGTTGTAGCTGAATGTAGTTTCTATTCTTACCTTTCCTT 162051882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 AAAAGAATGTTTCCTCACAGATGTTGTAGCTGAATGTAGTTTCTATTCTTACCTTTCCTT 3259

162051883 TAGATGGTAGGGCAACAGATGAGTACAGAGAAAAGGAAGCAGCATTTAACTTAAAGTGAA 162051942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 TAGATGGTAGGGCAACAGATGAGTACAGAGAAAAGGAAGCAGCATTTAACTTAAAGTGAA 3319

162051943 AAGAGAGAAATCACTATTATCTGGACCAATTATTATTTAACAAAAGAACTTGATTTACTG 162052002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3320 AAGAGAGAAATCACTATTATCTGGACCAATTATTATTTAACAAAAGAACTTGATTTACTG 3379

162052003 TAAAAAATAGTCTTTAAAATGTGTCCTTTTCTGTGTTCTTTATATTCTTTTGGGGACTTT 162052062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3380 TAAAAAATAGTCTTTAAAATGTGTCCTTTTCTGTGTTCTTTATATTCTTTTGGGGACTTT 3439

162052063 GTATTGGTCAAGGAACAGATTCTACTATACACAATTTGAATAGAAGGGGATGTATTAAAA 162052122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3440 GTATTGGTCAAGGAACAGATTCTACTATACACAATTTGAATAGAAGGGGATGTATTAAAA 3499

162052123 AGTATGTCAAATGGCTTACAGAATTGAGATGGCTGAAGGAGATTCTACAATGAAATTCCA 162052182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3500 AGTATGTCAAATGGCTTACAGAATTGAGATGGCTGAAGGAGATTCTACAATGAAATTCCA 3559

162052183 GAATCTGCTCTTAGGTCTGTGCTGCAGAACCAAACTGCAAAAGGAGTTGTTTCTTTTGCC 162052242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3560 GAATCTGCTCTTAGGTCTGTGCTGCAGAACCAAACTGCAAAAGGAGTTGTTTCTTTTGCC 3619

162052243 ATGATCAAGAAGCTGCTGGTCAAATCAGGAGGCATTCTTCATTGAGTATACAAATATTAG 162052302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3620 ATGATCAAGAAGCTGCTGGTCAAATCAGGAGGCATTCTTCATTGAGTATACAAATATTAG 3679

162052303 AACTATCTCCATTCTGAGCTGCATAAATTAGCTGTAGTTACTGCTTCCAAAAGGCACTCT 162052362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3680 AACTATCTCCATTCTGAGCTGCATAAATTAGCTGTAGTTACTGCTTCCAAAAGGCACTCT 3739

162052363 GTCCTCCCATCAGGAAACATCATGTGCAAAATCAAGAAGCTGCTATTATAGCTGCAGAAG 162052422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3740 GTCCTCCCATCAGGAAACATCATGTGCAAAATCAAGAAGCTGCTATTATAGCTGCAGAAG 3799

162052423 TCTATACCATGCCACATTTTCTACTATCAAGAAGCCATCTCTGCCAAATCAGCTAGCCTC 162052482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3800 TCTATACCATGCCACATTTTCTACTATCAAGAAGCCATCTCTGCCAAATCAGCTAGCCTC 3859

162052483 AGAGACAAATTTTGGCTCCAGAACCATGCCACATTTGCTACAATCCACATTGATAATATA 162052542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3860 AGAGACAAATTTTGGCTCCAGAACCATGCCACATTTGCTACAATCCACATTGATAATATA 3919

162052543 TCTGCACCATATCCTATATATCTCCATTCAAATTTCAAATTTCAATGTGTTTGTCTCTGA 162052602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3920 TCTGCACCATATCCTATATATCTCCATTCAAATTTCAAATTTCAATGTGTTTGTCTCTGA 3979

162052603 TGTGGGACCTAAATCACATTTACGTTATCAAATGAAAATGAATTGGAGAAATTTCCCTTA 162052662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3980 TGTGGGACCTAAATCACATTTACGTTATCAAATGAAAATGAATTGGAGAAATTTCCCTTA 4039

162052663 TAGTTTTCTGCCCTCTACAGAAAAGGAAAGTCACATCAGAAGAAAATTTGAATAGGTGTT 162052722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4040 TAGTTTTCTGCCCTCTACAGAAAAGGAAAGTCACATCAGAAGAAAATTTGAATAGGTGTT 4099

162052723 TTAAGCCAAACCAGAATAACTGCATTAGACTTCACTCTTACTTTATATCTCTGCTTTTAT 162052782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4100 TTAAGCCAAACCAGAATAACTGCATTAGACTTCACTCTTACTTTATATCTCTGCTTTTAT 4159

162052783 TTTTAAAAATTTCTTATATTTTCACACATGGAATTTACATTTGATCCATCTTTGAGCATA 162052842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4160 TTTTAAAAATTTCTTATATTTTCACACATGGAATTTACATTTGATCCATCTTTGAGCATA 4219

162052843 GTCTCAGAGTCTGAAACATTCCAGCTATGAAGTAAGTACTTAAATGGCTGTTCAATAAAT 162052902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4220 GTCTCAGAGTCTGAAACATTCCAGCTATGAAGTAAGTACTTAAATGGCTGTTCAATAAAT 4279

162052903 TAATATGAGCTACTTTCTGATAATTAAAAAATCTTTTTTATAAGAATACAATAGGAAAAC 162052962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4280 TAATATGAGCTACTTTCTGATAATTAAAAAATCTTTTTTATAAGAATACAATAGGAAAAC 4339

162052963 ATTGGATTTACTGCTCATTTTTTTTATGGTATAAGCACATCTAATCCTGTATATGAAAGA 162053022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4340 ATTGGATTTACTGCTCATTTTTTTTATGGTATAAGCACATCTAATCCTGTATATGAAAGA 4399

162053023 GTACCAGCTGGAGCCTTATCTGAAATTTCTACACATCTGGGAAAATTCGTTAAAGGTTGA 162053082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4400 GTACCAGCTGGAGCCTTATCTGAAATTTCTACACATCTGGGAAAATTCGTTAAAGGTTGA 4459

162053083 GCTAGATTGAATATATTAAACAACTCTATTGGTATAAAAAAGTAGAAAATACAAAAGACA 162053142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 GCTAGATTGAATATATTAAACAACTCTATTGGTATAAAAAAGTAGAAAATACAAAAGACA 4519

162053143 GAAATATTTCTAAAAGATAAGATAGCCTGAACAATGCAATTAATCAAAAAATGATCTTCA 162053202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4520 GAAATATTTCTAAAAGATAAGATAGCCTGAACAATGCAATTAATCAAAAAATGATCTTCA 4579

162053203 GTTATCAAAATTGGGTAGTGATTGTGACTATATTCTGGTGGCTATAAT 162053250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 GTTATCAAAATTGGGTAGTGATTGTGACTATATTCTGGTGGCTATAAT 4627

Alignment time is 4.82409 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162043250,162063660] =>     20411 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     5619] =>      5619 nucs 'mol-32-3403-164892_5619'

Score:        5379
Aligned:      5482        nucs
Identic:      5471 (100%) nucs =>      2820 (100%)      2651 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162050426,162053250] EXCISED REGION [162053661,162056314]
 second seq =>  [        1,     2822] EXCISED REGION [     2963,     5619]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       410 nucs [162053251,162053660]
 second seq =>       140 nucs [2823,2962]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [162053250,162053250] to [162053660,162053660]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [162053251,162053251] to [162053660,162053660]
 second seq =>         1 nucs [2823,2823] to [2962,2962]

162050426 CACATTATGAATTGTTTCAATGTGTGATTTTAAAATCATTCTTTGATTATGGAAAATATG 162050485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACATTATGAATTGTTTCAATGTGTGATTTTAAAATCATTCTTTGATTATGGAAAATATG 60

162050486 CCACCACTACTATTTTCTCCCTTCTATTTGCTTATCTTTCCTTCCGGTATTCCTATTATT 162050545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCACCACTACTATTTTCTCCCTTCTATTTGCTTATCTTTCCTTCCGGTATTCCTATTATT 120

162050546 GAGATTTTAATACTTGTAATCTCCATGCCTCTTAGCAACATTTTCTTAAAATTATTTATT 162050605
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGATTTTAATACTTGTAACCTCCATGCCTCTTAGCAACATTTTCTTAAAATTATTTATT 180

162050606 TATGAAAGCTTTCTAATGAGTTTTATGAGAATTCTTCATTCTAATTCTTTAGCTCAGTAG 162050665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATGAAAGCTTTCTAATGAGTTTTATGAGAATTCTTCATTCTAATTCTTTAGCTCAGTAG 240

162050666 TATACTCTTCCAATGTATTTGTTCCAGTACTCTTCATTATGCCTTTGCATTTAATTATTA 162050725
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATACTCTTCCAATGTATCTGTTCCAGTACTCTTCATTATGCCTTTGCATTTAATTATTA 300

162050726 TGTTTTTCAAGATAATCTCAATATGTCTATCCCAACAATTCTACTTTGGTGATCTCTTTG 162050785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTTTTTCAAGATAATCTCAATATGTCTATCCCAACAATTCTACTTTGGTGATCTCTTTG 360

162050786 AACTTTATCTTTATTTTATGGCAATGCTCTTCCAGCTTAGACCCATCTTCCTCTAGAGAC 162050845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACTTTATCTTTATTTTATGGCAATGCTCTTCCAGCTTAGACCCATCTTCCTCTAGAGAC 420

162050846 ATTAGTCTCCTTCTTAGGTAATGAGTATTGGTGATGGATCCAAACCACATGCTTTAGTTT 162050905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTAGTCTCCTTCTTAGGTAATGAGTATTGGTGATGGATCCAAACCACATGCTTTAGTTT 480

162050906 ATAGTGCACCTGGTAAGTTTAAAGAAAGAGAAAACTATGTGGTGAGAACAGAGCTCCAGG 162050965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATAGTGCACCTGGTAAGTTTAAAGAAAGAGAAAACTATGTGGTGAGAACAGAGCTCCAGG 540

162050966 TATCATAAAGCCACATTTCACTATTTATGCTGATTGTTTACTGCCACTCAACCATGTATT 162051025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATCATAAAGCCACATTTCACTATTTATGCTGATTGTTTACTGCCACTCAACCATGTATT 600

162051026 TATTCTCATTAGTAATATAAGAATATTCACTTTCCTTAAATTCATTCAAAGGTAGCTTCC 162051085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTCTCATTAGTAATATAAGAATATTCACTTTCCTTAAATTCATTCAAAGGTAGCTTCC 660

162051086 CTGAAGCAGCAGCAGCACCACCACAATTGATATTTGTATAGCATATGCTATGTGACAAGG 162051145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGAAGCAGCAGCAGCACCACCACAATTGATATTTGTATAGCATATGCTATGTGACAAGG 720

162051146 ACTTATGTGTGTGTATGTTCATTTAATCCCAACAGCAATCCTACAGAATGTGTACTATCA 162051205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACTTATGTGTGTGTATGTTCATTTAATCCCAACAGCAATCCTACAGAATGTGTACTATCA 780

162051206 CGAGCTCACTTTACAGACAGGAAAACTGACATAAAGAGAAGTGATGTCTACTGAGTCTGG 162051265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CGAGCTCACTTTACAGACAGGAAAACTGACATAAAGAGAAGTGATGTCTACTGAGTCTGG 840

162051266 CCCAGAATGTTGGCAGTTGAGATTTTACCTAGTTTTCAAATTAGAACTGCAGTTTAAATA 162051325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCCAGAATGTTGGCAGTTGAGATTTTACCTAGTTTTCAAATTAGAACTGCAGTTTAAATA 900

162051326 TTGATGAGTATTATAGTTACACTATGCAGACTTTTAAAAAAATTTTTCCATAAAAAGGCC 162051385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGATGAGTATTATAGTTACACTATGCAGACTTTTAAAAAAATTTTTCCATAAAAAGGCC 960

162051386 TTATGAATATATTAAAGTTAATCAGTTTATTTTTACAACTATGATTTCAATAATCTGGGA 162051445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTATGAATATATTAAAGTTAATCAGTTTATTTTTACAACTATGATTTCAATAATCTGGGA 1020

162051446 ATTTGATTTGCATAGTGTACTGAAAAGTAATAAGCAGATAAAATATTTTATAAACAAAGG 162051505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTTGATTTGCATAGTGTACTGAAAAGTAATAAGCAGATAAAATATTTTATAAACAAAGG 1080

162051506 AATTTGGAAAACATCTTAAACTCTATATATTTAATCTTATAAAGTAAAGAAAATGTATCT 162051565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTTGGAAAACATCTTAAACTCTATATATTTAATCTTATAAAGTAAAGAAAATGTATCT 1140

162051566 AACAAATTAGAGATTGACATTAACTTTTGCAAGAACAAAGAATGTTAAGATATTAAAAAT 162051625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AACAAATTAGAGATTGACATTAACTTTTGCAAGAACAAAGAATGTTAAGATATTAAAAAT 1200

162051626 GCATGTTTTCAAAATAAAAAAGAATGAAGATTAAAAAAAGAAAGTTTAGCAGAAAGGATT 162051685
          |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCATGTTTTCAAAATAAAA--GAATGAAGATTAAAAAAAGAAAGTTTAGCAGAAAGGATT 1258

162051686 TTTTTTAAGTAGAAGAAAAAAGTAAGAGCATGTACATAAGAGTATCAGCTGGGAAATGAG 162051745
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 TTTTT-AAGTAGAAGAAAAAAGTAAGAGCATGTACATAAGAGTATCAGCTGGGAAATGAG 1317

162051746 TTTAGTTTGAATTAAGATCATTCACCAGATTGAGGAGGAATCAAACAATGCAAATTAGAA 162051805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 TTTAGTTTGAATTAAGATCATTCACCAGATTGAGGAGGAATCAAACAATGCAAATTAGAA 1377

162051806 ACATGATATTGCATTTCAAAAGAATGTTTCCTCACAGATGTTGTAGCTGAATGTAGTTTC 162051865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 ACATGATATTGCATTTCAAAAGAATGTTTCCTCACAGATGTTGTAGCTGAATGTAGTTTC 1437

162051866 TATTCTTACCTTTCCTTTAGATGGTAGGGCAACAGATGAGTACAGAGAAAAGGAAGCAGC 162051925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TATTCTTACCTTTCCTTTAGATGGTAGGGCAACAGATGAGTACAGAGAAAAGGAAGCAGC 1497

162051926 ATTTAACTTAAAGTGAAAAGAGAGAAATCACTATTATCTGGACCAATTATTATTTAACAA 162051985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 ATTTAACTTAAAGTGAAAAGAGAGAAATCACTATTATCTGGACCAATTATTATTTAACAA 1557

162051986 AAGAACTTGATTTACTGTAAAAAATAGTCTTTAAAATGTGTCCTTTTCTGTGTTCTTTAT 162052045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 AAGAACTTGATTTACTGTAAAAAATAGTCTTTAAAATGTGTCCTTTTCTGTGTTCTTTAT 1617

162052046 ATTCTTTTGGGGACTTTGTATTGGTCAAGGAACAGATTCTACTATACACAATTTGAATAG 162052105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 ATTCTTTTGGGGACTTTGTATTGGTCAAGGAACAGATTCTACTATACACAATTTGAATAG 1677

162052106 AAGGGGATGTATTAAAAAGTATGTCAAATGGCTTACAGAATTGAGATGGCTGAAGGAGAT 162052165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 AAGGGGATGTATTAAAAAGTATGTCAAATGGCTTACAGAATTGAGATGGCTGAAGGAGAT 1737

162052166 TCTACAATGAAATTCCAGAATCTGCTCTTAGGTCTGTGCTGCAGAACCAAACTGCAAAAG 162052225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TCTACAATGAAATTCCAGAATCTGCTCTTAGGTCTGTGCTGCAGAACCAAACTGCAAAAG 1797

162052226 GAGTTGTTTCTTTTGCCATGATCAAGAAGCTGCTGGTCAAATCAGGAGGCATTCTTCATT 162052285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 GAGTTGTTTCTTTTGCCATGATCAAGAAGCTGCTGGTCAAATCAGGAGGCATTCTTCATT 1857

162052286 GAGTATACAAATATTAGAACTATCTCCATTCTGAGCTGCATAAATTAGCTGTAGTTACTG 162052345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 GAGTATACAAATATTAGAACTATCTCCATTCTGAGCTGCATAAATTAGCTGTAGTTACTG 1917

162052346 CTTCCAAAAGGCACTCTGTCCTCCCATCAGGAAACATCATGTGCAAAATCAAGAAGCTGC 162052405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 CTTCCAAAAGGCACTCTGTCCTCCCATCAGGAAACATCATGTGCAAAATCAAGAAGCTGC 1977

162052406 TATTATAGCTGCAGAAGTCTATACCATGCCACATTTTCTACTATCAAGAAGCCATCTCTG 162052465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TATTATAGCTGCAGAAGTCTATACCATGCCACATTTTCTACTATCAAGAAGCCATCTCTG 2037

162052466 CCAAATCAGCTAGCCTCAGAGACAAATTTTGGCTCCAGAACCATGCCACATTTGCTACAA 162052525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 CCAAATCAGCTAGCCTCAGAGACAAATTTTGGCTCCAGAACCATGCCACATTTGCTACAA 2097

162052526 TCCACATTGATAATATATCTGCACCATATCCTATATATCTCCATTCAAATTTCAAATTTC 162052585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TCCACATTGATAATATATCTGCACCATATCCTATATATCTCCATTCAAATTTCAAATTTC 2157

162052586 AATGTGTTTGTCTCTGATGTGGGACCTAAATCACATTTACGTTATCAAATGAAAATGAAT 162052645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 AATGTGTTTGTCTCTGATGTGGGACCTAAATCACATTTACGTTATCAAATGAAAATGAAT 2217

162052646 TGGAGAAATTTCCCTTATAGTTTTCTGCCCTCTACAGAAAAGGAAAGTCACATCAGAAGA 162052705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TGGAGAAATTTCCCTTATAGTTTTCTGCCCTCTACAGAAAAGGAAAGTCACATCAGAAGA 2277

162052706 AAATTTGAATAGGTGTTTTAAGCCAAACCAGAATAACTGCATTAGACTTCACTCTTACTT 162052765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 AAATTTGAATAGGTGTTTTAAGCCAAACCAGAATAACTGCATTAGACTTCACTCTTACTT 2337

162052766 TATATCTCTGCTTTTATTTTTAAAAATTTCTTATATTTTCACACATGGAATTTACATTTG 162052825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 TATATCTCTGCTTTTATTTTTAAAAATTTCTTATATTTTCACACATGGAATTTACATTTG 2397

162052826 ATCCATCTTTGAGCATAGTCTCAGAGTCTGAAACATTCCAGCTATGAAGTAAGTACTTAA 162052885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 ATCCATCTTTGAGCATAGTCTCAGAGTCTGAAACATTCCAGCTATGAAGTAAGTACTTAA 2457

162052886 ATGGCTGTTCAATAAATTAATATGAGCTACTTTCTGATAATTAAAAAATCTTTTTTATAA 162052945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 ATGGCTGTTCAATAAATTAATATGAGCTACTTTCTGATAATTAAAAAATCTTTTTTATAA 2517

162052946 GAATACAATAGGAAAACATTGGATTTACTGCTCATTTTTTTTATGGTATAAGCACATCTA 162053005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 GAATACAATAGGAAAACATTGGATTTACTGCTCATTTTTTTTATGGTATAAGCACATCTA 2577

162053006 ATCCTGTATATGAAAGAGTACCAGCTGGAGCCTTATCTGAAATTTCTACACATCTGGGAA 162053065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 ATCCTGTATATGAAAGAGTACCAGCTGGAGCCTTATCTGAAATTTCTACACATCTGGGAA 2637

162053066 AATTCGTTAAAGGTTGAGCTAGATTGAATATATTAAACAACTCTATTGGTATAAAAAAGT 162053125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 AATTCGTTAAAGGTTGAGCTAGATTGAATATATTAAACAACTCTATTGGTATAAAAAAGT 2697

162053126 AGAAAATACAAAAGACAGAAATATTTCTAAAAGATAAGATAGCCTGAACAATGCAATTAA 162053185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 AGAAAATACAAAAGACAGAAATATTTCTAAAAGATAAGATAGCCTGAACAATGCAATTAA 2757

162053186 TCAAAAAATGATCTTCAGTTATCAAAATTGGGTAGTGATTGTGACTATATTCTGGTGGCT 162053245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 TCAAAAAATGATCTTCAGTTATCAAAATTGGGTAGTGATTGTGACTATATTCTGGTGGCT 2817

162053246 ATAAT 162053250
          |||||
     2818 ATAAT 2822

EXCISED REGION

162053661 GAAAAGAGTACTTAGCAAGATTTTTAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTT 162053720
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 GAAAAGAGTACTTAGCAAGATTTCTAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTT 3022

162053721 TTGTTTTATTTAAAAACAACATTTATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTT 162053780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3023 TTGTTTTATTTAAAAACAACATTTATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTT 3082

162053781 ACAGGTAAACTTGTGTCACAGAAGTTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAA 162053840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3083 ACAGGTAAACTTGTGTCACAGAAGTTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAA 3142

162053841 GACTACTACCCGTTCGTTATTTTTCCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTG 162053900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3143 GACTACTACCCGTTCGTTATTTTTCCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTG 3202

162053901 AAAGGCCCCAGTGTATGGTTTCCTTCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCAC 162053960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3203 AAAGGCCCCAGTGTATGGTTTCCTTCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCAC 3262

162053961 TTATAAGTGAGAAGATGCGGTATTTGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAA 162054020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3263 TTATAAGTGAGAAGATGCGGTATTTGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAA 3322

162054021 AGGCCTCCACCTCCACTCATGTCTGTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGC 162054080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3323 AGGCCTCCACCTCCACTCATGTCTGTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGC 3382

162054081 TGCATACCATTCCACGGTGTAGATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTG 162054140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3383 TGCATACCATTCCACGGTGTAGATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTG 3442

162054141 GCATTTAGGTTGATTCCGTATCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACAT 162054200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3443 GCATTTAGGTTGATTCCGTATCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACAT 3502

162054201 GCATGTGTCTTTATGGTACAAAGATTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGAT 162054260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3503 GCATGTGTCTTTATGGTACAAAGATTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGAT 3562

162054261 TGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGCTTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCA 162054320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3563 TGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGCTTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCA 3622

162054321 CAATGGTTGAACTAATTTTCACTTCTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAAC 162054380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3623 CAATGGTTGAACTAATTTTCACTTCTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAAC 3682

162054381 TTCACCAGCATCTGTTAATTATTGACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGAT 162054440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3683 TTCACCAGCATCTGTTAATTATTGACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGAT 3742

162054441 GGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTT 162054500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3743 GGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTT 3802

162054501 TCATA-GTTTGTTGGCCACATTTATGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAA 162054559
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3803 TCATATGTTTGTTGGCCACATTTATGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAA 3862

162054560 TTATTAATGGAGTTGTTTTTTTCTTATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTT 162054619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3863 TTATTAATGGAGTTGTTTTTTTCTTATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTT 3922

162054620 TGTCAGATGTATAGTTTGCAAAAACTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTAC 162054679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3923 TGTCAGATGTATAGTTTGCAAAAACTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTAC 3982

162054680 TGATAGTTTCTTTTGCTTTGCAAAAGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTT 162054739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3983 TGATAGTTTCTTTTGCTTTGCAAAAGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTT 4042

162054740 TTGCTCCTGTTGCAAATGATTTTGGCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATA 162054799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4043 TTGCTCCTGTTGCAAATGATTTTGGCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATA 4102

162054800 TCTAACCTGCAACAGTTCCACCATATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATA 162054859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4103 TCTAACCTGCAACAGTTCCACCATATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATA 4162

162054860 ACTGACTAATATCCACAAGTGTTTTACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCC 162054919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4163 ACTGACTAATATCCACAAGTGTTTTACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCC 4222

162054920 TCCAGACTTGACATCACCAATGAGCCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGA 162054979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4223 TCCAGACTTGACATCACCAATGAGCCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGA 4282

162054980 ACAAACCTTTGCTCCCTGTTGTAAATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTT 162055039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4283 ACAAACCTTTGCTCCCTGTTGTAAATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTT 4342

162055040 CAGGCACAGTAGGAAATGTAATATAATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTT 162055099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4343 CAGGCACAGTAGGAAATGTAATATAATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTT 4402

162055100 CTTCATGGCCATCTGGAACCCATTAAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATG 162055159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4403 CTTCATGGCCATCTGGAACCCATTAAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATG 4462

162055160 TATTGGATTTTTGGGGATCTGTTAATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTA 162055219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4463 TATTGGATTTTTGGGGATCTGTTAATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTA 4522

162055220 GGTTGAAGAAGAGACAACAGAATGACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAAC 162055279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4523 GGTTGAAGAAGAGACAACAGAATGACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAAC 4582

162055280 TGTTCTTAAAATTTAATTACACTTTTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTATTCT 162055339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4583 TGTTCTTAAAATTTAATTACACTTTTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTATTCT 4642

162055340 TCTAGATAACAAAATGCTACTGGGTCACATGATTTACATGGCTAGTCATATCAGATAATG 162055399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4643 TCTAGATAACAAAATGCTACTGGGTCACATGATTTACATGGCTAGTCATATCAGATAATG 4702

162055400 TTAAATTTATGATAGGCTGCTCAAGTCTCCCTTTTCCTGAAAGCAAGTTTTTTTTAGTAT 162055459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4703 TTAAATTTATGATAGGCTGCTCAAGTCTCCCTTTTCCTGAAAGCAAGTTTTTTTTAGTAT 4762

162055460 CTTTCAGAGAGTGATAGCTAGAGCTATTTTTAAAAGGTGTCTTTTTCACTTATTTTACCT 162055519
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4763 CTTTCAGAGAGTAATAGCTAGAGCTATTTTTAAAAGGTGTCTTTTTCACTTATTTTACCT 4822

162055520 TTACTCCAAAAATTCAGAGGCCATGACTACGATTTTCTTATTGTGACTTGTTATGGTTTG 162055579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4823 TTACTCCAAAAATTCAGAGGCCATGACTACGATTTTCTTATTGTGACTTGTTATGGTTTG 4882

162055580 TAAAAAATTTTACAGACAGTTTAATCCAGTGGATAATTATAAAGACTTAACTGTAAAACT 162055639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4883 TAAAAAATTTTACAGACAGTTTAATCCAGTGGATAATTATAAAGACTTAACTGTAAAACT 4942

162055640 ATTGTCTCCTTAGTCCACCTAGAAAGCATCTTCTCTTAATCTGAGCCATATGGAAAGCTG 162055699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4943 ATTGTCTCCTTAGTCCACCTAGAAAGCATCTTCTCTTAATCTGAGCCATATGGAAAGCTG 5002

162055700 ACAGGTTTGAGGGAATACAGGAAATG--AAAAAAAAAAAAACAGGACAGCAAAATATCAC 162055757
          ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||
     5003 ACAGGTTTGAGGGAATACAGGAAATGAAAAAAAAAAAAAAACAGGACAGCAAAATATCAC 5062

162055758 AATTTTTGCCTTCATAATTCAAAGAGGTCCACCATGCTGTGTCCCTTTCTTAGTATTAGG 162055817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5063 AATTTTTGCCTTCATAATTCAAAGAGGTCCACCATGCTGTGTCCCTTTCTTAGTATTAGG 5122

162055818 GAGCATAAAGCTCAGCAATGTGTTCATTACTTTAAAGGAGTAACTTCATATTACTTAATG 162055877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5123 GAGCATAAAGCTCAGCAATGTGTTCATTACTTTAAAGGAGTAACTTCATATTACTTAATG 5182

162055878 CCACAAAATTCCACAAATTATGCAATATAGTTGGTAATATTTGTTAAAAACCTAGTTGCT 162055937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5183 CCACAAAATTCCACAAATTATGCAATATAGTTGGTAATATTTGTTAAAAACCTAGTTGCT 5242

162055938 GCTATAATAACGTTTTCCTTTTAAAAATACATATATAAAATGTAAGCACAATACATTAGG 162055997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5243 GCTATAATAACGTTTTCCTTTTAAAAATACATATATAAAATGTAAGCACAATACATTAGG 5302

162055998 AAGTGAAAAATAATAATATCTATTTTTAAAGGAGGTGTACTAAGCTGTCAGTGAGCTTAA 162056057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5303 AAGTGAAAAATAATAATATCTATTTTTAAAGGAGGTGTACTAAGCTGTCAGTGAGCTTAA 5362

162056058 TAAACATGTTTCTATACAGTTAAGCAATAACTGCTCCCAAATACTAATGAAACAATATCC 162056117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5363 TAAACATGTTTCTATACAGTTAAGCAATAACTGCTCCCAAATACTAATGAAACAATATCC 5422

162056118 ATGGTATTGCTGCAATGCTGTCTTTATTTACTGTGTGTGCCTCTTGACCAACAGATCCTA 162056177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5423 ATGGTATTGCTGCAATGCTGTCTTTATTTACTGTGTGTGCCTCTTGACCAACAGATCCTA 5482

162056178 AGAGTACTACTGGTCACTGTTAGTTTTAAACCGATATTGGTTTTTATAAAAGAGAAGGGT 162056237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5483 AGAGTACTACTGGTCACTGTTAGTTTTAAACCGATATTGGTTTTTATAAAAGAGAAGGGT 5542

162056238 GAATAAACTTTAAAAGTGGAAAACAAGAAATCTTGGCAAATTAGTTAAAAGCTAGGGGGA 162056297
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     5543 GAATAAACTTTAAAAGTGGAAAACAAGAGATCTTGGCAAATTAGTTAAAAGCTAGGGGGA 5602

162056298 AGAAAAAAGACACTTAA 162056314
          |||||||||||||||||
     5603 AGAAAAAAGACACTTAA 5619

Alignment time is 4.8551 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162043250,162063660] =>     20411 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     2657] =>      2657 nucs 'mol-32-3403-164892_2657'

Score:        2611
Aligned:      2655        nucs
Identic:      2651 (100%) nucs =>      2063 (100%)       588 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162053661,162055725] EXCISED REGION [162055726,162056314]
 second seq =>  [        1,     2066] EXCISED REGION [     2069,     2657]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2067,2068]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        13 nucs [2067,2079] to [2069,2081]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2067,2067] to [2068,2068]

162053661 GAAAAGAGTACTTAGCAAGATTTTTAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTT 162053720
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAAGAGTACTTAGCAAGATTTCTAACCAAGTTAGCTTGGTGAATAGAAGACCATATTT 60

162053721 TTGTTTTATTTAAAAACAACATTTATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTT 162053780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTTTTATTTAAAAACAACATTTATTTTAAGTTCAGGGGTACCTGTGCAGGTTTGTTTT 120

162053781 ACAGGTAAACTTGTGTCACAGAAGTTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAA 162053840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGGTAAACTTGTGTCACAGAAGTTTGTTATACAGATTATTTTGTCACTCAGGTATTAA 180

162053841 GACTACTACCCGTTCGTTATTTTTCCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTG 162053900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACTACTACCCGTTCGTTATTTTTCCTGATCCTCTCCCTCCTTGTAACCTCCACCCTCTG 240

162053901 AAAGGCCCCAGTGTATGGTTTCCTTCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCAC 162053960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGGCCCCAGTGTATGGTTTCCTTCTATGTGCCCGTGTGTTCTCATCATTAACTCCCAC 300

162053961 TTATAAGTGAGAAGATGCGGTATTTGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAA 162054020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATAAGTGAGAAGATGCGGTATTTGCTTTTCTGCTCCTGTGTTAGATTGCTAAGGATAA 360

162054021 AGGCCTCCACCTCCACTCATGTCTGTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGC 162054080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGCCTCCACCTCCACTCATGTCTGTCTGCAAAGGAAATGATCTCATTCTTTATTATGGC 420

162054081 TGCATACCATTCCACGGTGTAGATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTG 162054140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCATACCATTCCACGGTGTAGATGTACCACATTTTCTTTATCCAGTCCACCACTGACTG 480

162054141 GCATTTAGGTTGATTCCGTATCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACAT 162054200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCATTTAGGTTGATTCCGTATCTTTGCTATTGTGAATAGTGCTGCAATAAACATATACAT 540

162054201 GCATGTGTCTTTATGGTACAAAGATTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGAT 162054260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCATGTGTCTTTATGGTACAAAGATTTATATTCCTTTGTGTATATATCCAGTAATGAGAT 600

162054261 TGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGCTTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCA 162054320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCTGGGTCAAATGGTAGTTCTGCTTTTAGCTCTTAGAGGCATCACCACACTGTTTTCCA 660

162054321 CAATGGTTGAACTAATTTTCACTTCTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAAC 162054380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAATGGTTGAACTAATTTTCACTTCTACCAGCAGTGTATAGCATTATTTTTGTCTGCAAC 720

162054381 TTCACCAGCATCTGTTAATTATTGACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGAT 162054440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCACCAGCATCTGTTAATTATTGACTTTTTAATAATAGCTATTCTGACTGGTATGAGAT 780

162054441 GGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTT 162054500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGTATCTCATTGTGGTTTTGATTTGCATTTCTCATATGATCAGCAATGTTGAGCTATTTT 840

162054501 TCATA-GTTTGTTGGCCACATTTATGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAA 162054559
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCATATGTTTGTTGGCCACATTTATGTCTTCTTTAGAAAGTGTTAAAGTCCTTTGCCCAA 900

162054560 TTATTAATGGAGTTGTTTTTTTCTTATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTT 162054619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTATTAATGGAGTTGTTTTTTTCTTATAAATTTAAGTTCCTTATAGATGCTAATGACTTT 960

162054620 TGTCAGATGTATAGTTTGCAAAAACTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTAC 162054679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTCAGATGTATAGTTTGCAAAAACTTTCTCCCATTCTGTAGGTTCTCTGTTTACTTTAC 1020

162054680 TGATAGTTTCTTTTGCTTTGCAAAAGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTT 162054739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGATAGTTTCTTTTGCTTTGCAAAAGCTCTTTAGTTTAATGAAATCCCGTTTGTCAATTT 1080

162054740 TTGCTCCTGTTGCAAATGATTTTGGCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATA 162054799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGCTCCTGTTGCAAATGATTTTGGCGTGAAGAATATGTTTTTAAACTCATGGTTAAATA 1140

162054800 TCTAACCTGCAACAGTTCCACCATATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATA 162054859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTAACCTGCAACAGTTCCACCATATCCACTTCATGAGACTGATAGGGAAGCCCTTGATA 1200

162054860 ACTGACTAATATCCACAAGTGTTTTACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCC 162054919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTGACTAATATCCACAAGTGTTTTACTGTGTTCATTTTCCCCAGTAATAAAGGGCCTCC 1260

162054920 TCCAGACTTGACATCACCAATGAGCCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGA 162054979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCCAGACTTGACATCACCAATGAGCCTTACAATGGACAAACACGCTTTCAATCTTTCAGA 1320

162054980 ACAAACCTTTGCTCCCTGTTGTAAATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTT 162055039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACAAACCTTTGCTCCCTGTTGTAAATTGTAAGAGATCTATTTTTTTAGTGTTTCTCCTTT 1380

162055040 CAGGCACAGTAGGAAATGTAATATAATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTT 162055099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGGCACAGTAGGAAATGTAATATAATAGTTGAAGTTCTGCCCACGGTGGAGTTTTCCTT 1440

162055100 CTTCATGGCCATCTGGAACCCATTAAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATG 162055159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTCATGGCCATCTGGAACCCATTAAGCCAGGACCAACGCCATGCTACACAGAAATCATG 1500

162055160 TATTGGATTTTTGGGGATCTGTTAATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTA 162055219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TATTGGATTTTTGGGGATCTGTTAATTGTCACAAAAAACACACATAAAATCTTAGATGTA 1560

162055220 GGTTGAAGAAGAGACAACAGAATGACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAAC 162055279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTTGAAGAAGAGACAACAGAATGACAAGATTGGAAAGATAGGTTGGAAGATGAGCAAAC 1620

162055280 TGTTCTTAAAATTTAATTACACTTTTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTATTCT 162055339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTTCTTAAAATTTAATTACACTTTTCCAAATGTGTTAAGGTCTTTTGTATAACTATTCT 1680

162055340 TCTAGATAACAAAATGCTACTGGGTCACATGATTTACATGGCTAGTCATATCAGATAATG 162055399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTAGATAACAAAATGCTACTGGGTCACATGATTTACATGGCTAGTCATATCAGATAATG 1740

162055400 TTAAATTTATGATAGGCTGCTCAAGTCTCCCTTTTCCTGAAAGCAAGTTTTTTTTAGTAT 162055459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTAAATTTATGATAGGCTGCTCAAGTCTCCCTTTTCCTGAAAGCAAGTTTTTTTTAGTAT 1800

162055460 CTTTCAGAGAGTGATAGCTAGAGCTATTTTTAAAAGGTGTCTTTTTCACTTATTTTACCT 162055519
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTTCAGAGAGTAATAGCTAGAGCTATTTTTAAAAGGTGTCTTTTTCACTTATTTTACCT 1860

162055520 TTACTCCAAAAATTCAGAGGCCATGACTACGATTTTCTTATTGTGACTTGTTATGGTTTG 162055579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTACTCCAAAAATTCAGAGGCCATGACTACGATTTTCTTATTGTGACTTGTTATGGTTTG 1920

162055580 TAAAAAATTTTACAGACAGTTTAATCCAGTGGATAATTATAAAGACTTAACTGTAAAACT 162055639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAAAAAATTTTACAGACAGTTTAATCCAGTGGATAATTATAAAGACTTAACTGTAAAACT 1980

162055640 ATTGTCTCCTTAGTCCACCTAGAAAGCATCTTCTCTTAATCTGAGCCATATGGAAAGCTG 162055699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTGTCTCCTTAGTCCACCTAGAAAGCATCTTCTCTTAATCTGAGCCATATGGAAAGCTG 2040

162055700 ACAGGTTTGAGGGAATACAGGAAATG 162055725
          ||||||||||||||||||||||||||
     2041 ACAGGTTTGAGGGAATACAGGAAATG 2066

EXCISED REGION

162055726 AAAAAAAAAAAAACAGGACAGCAAAATATCACAATTTTTGCCTTCATAATTCAAAGAGGT 162055785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 AAAAAAAAAAAAACAGGACAGCAAAATATCACAATTTTTGCCTTCATAATTCAAAGAGGT 2128

162055786 CCACCATGCTGTGTCCCTTTCTTAGTATTAGGGAGCATAAAGCTCAGCAATGTGTTCATT 162055845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 CCACCATGCTGTGTCCCTTTCTTAGTATTAGGGAGCATAAAGCTCAGCAATGTGTTCATT 2188

162055846 ACTTTAAAGGAGTAACTTCATATTACTTAATGCCACAAAATTCCACAAATTATGCAATAT 162055905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 ACTTTAAAGGAGTAACTTCATATTACTTAATGCCACAAAATTCCACAAATTATGCAATAT 2248

162055906 AGTTGGTAATATTTGTTAAAAACCTAGTTGCTGCTATAATAACGTTTTCCTTTTAAAAAT 162055965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 AGTTGGTAATATTTGTTAAAAACCTAGTTGCTGCTATAATAACGTTTTCCTTTTAAAAAT 2308

162055966 ACATATATAAAATGTAAGCACAATACATTAGGAAGTGAAAAATAATAATATCTATTTTTA 162056025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 ACATATATAAAATGTAAGCACAATACATTAGGAAGTGAAAAATAATAATATCTATTTTTA 2368

162056026 AAGGAGGTGTACTAAGCTGTCAGTGAGCTTAATAAACATGTTTCTATACAGTTAAGCAAT 162056085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 AAGGAGGTGTACTAAGCTGTCAGTGAGCTTAATAAACATGTTTCTATACAGTTAAGCAAT 2428

162056086 AACTGCTCCCAAATACTAATGAAACAATATCCATGGTATTGCTGCAATGCTGTCTTTATT 162056145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 AACTGCTCCCAAATACTAATGAAACAATATCCATGGTATTGCTGCAATGCTGTCTTTATT 2488

162056146 TACTGTGTGTGCCTCTTGACCAACAGATCCTAAGAGTACTACTGGTCACTGTTAGTTTTA 162056205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 TACTGTGTGTGCCTCTTGACCAACAGATCCTAAGAGTACTACTGGTCACTGTTAGTTTTA 2548

162056206 AACCGATATTGGTTTTTATAAAAGAGAAGGGTGAATAAACTTTAAAAGTGGAAAACAAGA 162056265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2549 AACCGATATTGGTTTTTATAAAAGAGAAGGGTGAATAAACTTTAAAAGTGGAAAACAAGA 2608

162056266 AATCTTGGCAAATTAGTTAAAAGCTAGGGGGAAGAAAAAAGACACTTAA 162056314
          .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 GATCTTGGCAAATTAGTTAAAAGCTAGGGGGAAGAAAAAAGACACTTAA 2657

Alignment time is 2.92508 s

