
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     2434] =>      2434 nucs 'mol-32-1f0b-215822_2434'

Score:        2122
Aligned:      2363        nucs
Identic:      2337 ( 99%) nucs =>        86 (100%)      2251 ( 99%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116166822,116166907] EXCISED REGION [116177181,116179452]
 second seq =>  [        1,       86] EXCISED REGION [      163,     2434]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10273 nucs [116166908,116177180]
 second seq =>        76 nucs [87,162]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [87,90] to [163,166]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116166908,116166909] to [116177179,116177180]
 second seq =>         1 nucs [87,87] to [162,162]

116166822 GAATCTATATTATATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGT 116166881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAATCTATATTATATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGT 60

116166882 TAACTATCACTCTACTTGGTTAATTA 116166907
          ||||||||||||||||||||||||||
       61 TAACTATCACTCTACTTGGTTAATTA 86

EXCISED REGION

116177181 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCA 116177240
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
      163 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATATATAATATTGTATATGTTAATTTCCATACCCA 222

116177241 TAGGATTCAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 116177300
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      223 TAGGATTAAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 282

116177301 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 116177360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      283 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 342

116177361 TTTTTATTAATAAACGAATAAATAATCAATTATATTCAAAGG-TTTTATATGAGAATAAA 116177419
          |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||
      343 TTTTTATTAATAAACGAATAAAT----AATTATATTCAAAGGCTTTTATATGAGAATAAA 398

116177420 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 116177479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      399 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 458

116177480 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 116177539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      459 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 518

116177540 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 116177599
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      519 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCACTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 578

116177600 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAA 116177659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
      579 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGATAAACAACAGGAATCATAGAAA 638

116177660 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 116177719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      639 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 698

116177720 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 116177779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      699 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 758

116177780 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 116177839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      759 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 818

116177840 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 116177899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      819 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 878

116177900 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 116177959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      879 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGGAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 938

116177960 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACC---CAGCAACAACAACAAC 116178016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
      939 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAGCAACAACAACAAC 998

116178017 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 116178076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      999 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 1058

116178077 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCT 116178136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
     1059 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATGTAATCGAGAAGTAGGGCT 1118

116178137 TCCTCTCTTAACTCGTCATCCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 116178196
          ||||||| ||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1119 TCCTCTC-TAACTCCTCATTCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 1177

116178197 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCA 116178256
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
     1178 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAGAATGAAAAAATCCTTA 1237

116178257 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAG-AAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 116178315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1238 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAGTAAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 1297

116178316 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 116178375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1298 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 1357

116178376 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 116178435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 1417

116178436 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 116178495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 1477

116178496 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 116178555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 1537

116178556 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTAT 116178615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1538 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTCT 1597

116178616 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 116178675
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAAAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 1657

116178676 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAA 116178735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1658 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATGATAAGGCTATAGTGAACAA 1717

116178736 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 116178795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 1777

116178796 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 116178855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 1837

116178856 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 116178915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 1897

116178916 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 116178975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 1957

116178976 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 116179035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 2017

116179036 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 116179095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 2077

116179096 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 116179155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 2137

116179156 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 116179215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 2197

116179216 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 116179275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 2257

116179276 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 116179335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 2317

116179336 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 116179395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 2377

116179396 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTG 116179452
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTG 2434

Alignment time is 2.90448 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     2057] =>      2057 nucs 'mol-32-2378-076013_2057'

Score:        1787
Aligned:      2006        nucs
Identic:      1982 ( 99%) nucs =>       950 ( 98%)      1032 ( 99%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116177181,116178144] EXCISED REGION [116178157,116179193]
 second seq =>  [       45,     1008] EXCISED REGION [     1020,     2057]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        12 nucs [116178145,116178156]
 second seq =>        11 nucs [1009,1019]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1008,1008] to [1019,1019]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116178143,116178144] to [116178157,116178158]
 second seq =>         2 nucs [1007,1008] to [1020,1021]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116177181 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCA 116177240
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
       45 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATATATAATATTGTATATGTTAATTTCCATACCCA 104

116177241 TAGGATTCAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 116177300
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      105 TAGGATTAAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 164

116177301 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 116177360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      165 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 224

116177361 TTTTTATTAATAAACGAATAAATAATCAATTATATTCAAAGG-TTTTATATGAGAATAAA 116177419
          ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| |||||||||||||||||
      225 TTTTTATTAATAAACGAATAAATAAT----TATATTCAAAGGCTTTTATATGAGAATAAA 280

116177420 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 116177479
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      281 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATTACAGATTGAAAA 340

116177480 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 116177539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      341 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 400

116177540 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 116177599
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      401 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCACTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 460

116177600 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAA 116177659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
      461 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGATAAACAACAGGAATCATAGAAA 520

116177660 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 116177719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      521 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 580

116177720 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 116177779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      581 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 640

116177780 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 116177839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 700

116177840 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 116177899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 760

116177900 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 116177959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      761 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGGAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 820

116177960 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCA---ACAACAACAAC 116178016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||
      821 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAGCAACAACAACAAC 880

116178017 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 116178076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 940

116178077 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCT 116178136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
      941 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATGTAATCGAGAAGTAGGGCT 1000

116178137 TCCTCTCT 116178144
          ||||||||
     1001 TCCTCTCT 1008

EXCISED REGION

116178157 CTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAGGACACAACAGAAGTAGAAAA 116178216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAGGACACAACAGAAGTAGAAAA 1079

116178217 CTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCAACTAACTACTAGCAAAGTAA 116178276
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1080 CTACAGGCCAATATCCCCAATTAGAATGAAAAAATCCTTAACTAACTACTAGCAAAGTAA 1139

116178277 ATACAAGAGCTCAG-AAAAACATAATACCTCAAGACCAAGTGGGATTTATCCAGGGATGC 116178335
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 ATACAAGAGCTCAGTAAAAACATAATACCTCAAGACCAAGTGGGATTTATCCAGGGATGC 1199

116178336 GAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAGCTACAAAATATAAAATACCT 116178395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAGCTACAAAATATAAAATACCT 1259

116178396 AGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAGGAGAACTACATAAGCACTGA 116178455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 AGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAGGAGAACTACATAAGCACTGA 1319

116178456 TGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGATGCTCATGGATGGGAAGAAT 116178515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGATGCTCATGGATGGGAAGAAT 1379

116178516 CAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTACAGGTTTAATGCAATTCCTAT 116178575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTACAGGTTTAATGCAATTCCTAT 1439

116178576 CAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTATAGAATTTATATGAAACCAAA 116178635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1440 CAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTCTAGAATTTATATGAAACCAAA 1499

116178636 AAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAACAAATTCGGAAGCATCACAT 116178695
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AAAAAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAACAAATTCGGAAGCATCACAT 1559

116178696 TACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAAAAGTCCATGGCACTGATACA 116178755
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TACCAGACTTTATAGTATATGATAAGGCTATAGTGAACAAAAGTCCATGGCACTGATACA 1619

116178756 AAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCAGAAATAAAACCACATACTTG 116178815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCAGAAATAAAACCACATACTTG 1679

116178816 AAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAATGGAGAAAGGACACTTTATT 116178875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAATGGAGAAAGGACACTTTATT 1739

116178876 CGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATGAAACTGGGCCACTACCTAAC 116178935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATGAAACTGGGCCACTACCTAAC 1799

116178936 ACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTAAACGCTAGACCTGAAACTAT 116178995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTAAACGCTAGACCTGAAACTAT 1859

116178996 GAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCATATTGGCCTAGGCAAAGAAT 116179055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCATATTGGCCTAGGCAAAGAAT 1919

116179056 TTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATAGAAATATGGGACTTAACTAC 116179115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATAGAAATATGGGACTTAACTAC 1979

116179116 AAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAACAGGGAGCCTGTGCAATAGG 116179175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 AAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAACAGGGAGCCTGTGCAATAGG 2039

116179176 ATAAAATATTTTCTAACT 116179193
          ||||||||||||||||||
     2040 ATAAAATATTTTCTAACT 2057

Alignment time is 2.23497 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     3742] =>      3742 nucs 'mol-32-2848-015261_3742'

Score:        3719
Aligned:      3741        nucs
Identic:      3739 (100%) nucs =>      1507 (100%)      2232 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116175868,116177374] EXCISED REGION [116177376,116179608]
 second seq =>  [        1,     1507] EXCISED REGION [     1509,     3742]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [116177375,116177375]
 second seq =>         1 nucs [1508,1508]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3561,3561]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116175868 CTGAAGTTCATTTTTTAATTAGGTTTCTCAGAATTTTCTTTCAATTGAGTTACTCCTTTT 116175927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTGAAGTTCATTTTTTAATTAGGTTTCTCAGAATTTTCTTTCAATTGAGTTACTCCTTTT 60

116175928 TAGTTATACCTACTGTGTGCTTACTCCATATTTTTAGTGTTTTTCAACTTACAGTTTTAA 116175987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGTTATACCTACTGTGTGCTTACTCCATATTTTTAGTGTTTTTCAACTTACAGTTTTAA 120

116175988 CTTAAAATCTTCCATTAAAAATGCCTATTGCTTACTTATTTATGAAATTCTATTTTCTAT 116176047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTAAAATCTTCCATTAAAAATGCCTATTGCTTACTTATTTATGAAATTCTATTTTCTAT 180

116176048 TCTTTAAATATCCACTCATAGGAATACATATATACACATTTCAGATAATTTTAATATCTG 116176107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTTAAATATCCACTCATAGGAATACATATATACACATTTCAGATAATTTTAATATCTG 240

116176108 AATTACTGAGTAGTCTAAACCTGTTTTTTGTTGAATTAATTCTCATTCATGACATTTGGT 116176167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATTACTGAGTAGTCTAAACCTGTTTTTTGTTGAATTAATTCTCATTCATGACATTTGGT 300

116176168 TTGATTGAATATTAGCTAATTTTTTATATTGAGTCACATGTGATTGATCACAAATTCTGG 116176227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGATTGAATATTAGCTAATTTTTTATATTGAGTCACATGTGATTGATCACAAATTCTGG 360

116176228 AAACTGTGGATGCTAAACTGAATCTGTTTTTCACAGGAGATTTGCTCTTGCCTCTCTGTG 116176287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAACTGTGGATGCTAAACTGAATCTGTTTTTCACAGGAGATTTGCTCTTGCCTCTCTGTG 420

116176288 ATATCAAGTCCAATGAGGATTTCTGATATCTAGCTTCCCACCTTGCTACCAGCAATACCC 116176347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATATCAAGTCCAATGAGGATTTCTGATATCTAGCTTCCCACCTTGCTACCAGCAATACCC 480

116176348 TTAGAGCAACCCTTGCTTTTCTATTTGTTCACTGCTCACCAGTCTAGTTAAGATCACTTC 116176407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTAGAGCAACCCTTGCTTTTCTATTTGTTCACTGCTCACCAGTCTAGTTAAGATCACTTC 540

116176408 TTATTGGCCCCATGGAGTTTTCTCTTCTTTGCTGTGAGCCTAAATTACAATGGCCGCTTC 116176467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTATTGGCCCCATGGAGTTTTCTCTTCTTTGCTGTGAGCCTAAATTACAATGGCCGCTTC 600

116176468 CTGCAAAAGCTGCAGCATGAGGATTCCTTACAGTATCTAGCCCCAAATGCTATATTTTTT 116176527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGCAAAAGCTGCAGCATGAGGATTCCTTACAGTATCTAGCCCCAAATGCTATATTTTTT 660

116176528 ACTTTCACAGTTTGCTTTTAATCAAGGAGTTGATAGATGGAAGTTTTGAGAATTGTTTAA 116176587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTTTCACAGTTTGCTTTTAATCAAGGAGTTGATAGATGGAAGTTTTGAGAATTGTTTAA 720

116176588 ATTCATCTATATAATGTTAATTATTTGATATTTTAATTAGCAAATATGTATGTATATGTT 116176647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTCATCTATATAATGTTAATTATTTGATATTTTAATTAGCAAATATGTATGTATATGTT 780

116176648 TTCATAAAGTTATATGGCCTTTTCATTAAATAAGATATAACAGATGTATAATGATAAAAA 116176707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTCATAAAGTTATATGGCCTTTTCATTAAATAAGATATAACAGATGTATAATGATAAAAA 840

116176708 ACACAGAATAGTAGTTATTTCTTCACTGTCATAATATTTCCTAAAATTTAATTTCTGAAT 116176767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACACAGAATAGTAGTTATTTCTTCACTGTCATAATATTTCCTAAAATTTAATTTCTGAAT 900

116176768 CCATGATGTAGAAAATTTCTTTTCTTTTACCCCCATATACGCCTGATTAAAATTTATTAT 116176827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCATGATGTAGAAAATTTCTTTTCTTTTACCCCCATATACGCCTGATTAAAATTTATTAT 960

116176828 ATTTGTTGTTTTAATAAAATAAGGCACTAAATTTCTAACAAATGCTTTGGAGAGTATTTA 116176887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTGTTGTTTTAATAAAATAAGGCACTAAATTTCTAACAAATGCTTTGGAGAGTATTTA 1020

116176888 TATAATAAGCAAGTCTTCTATCATATACTCCTTTGGTGAATGCAAGAATTTTTTTATTGG 116176947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TATAATAAGCAAGTCTTCTATCATATACTCCTTTGGTGAATGCAAGAATTTTTTTATTGG 1080

116176948 AGGTCATCAGCATCAGCCAAAAAAATCAATTCAAATCAAATCAAAGTGTAGCTGCTCACA 116177007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGGTCATCAGCATCAGCCAAAAAAATCAATTCAAATCAAATCAAAGTGTAGCTGCTCACA 1140

116177008 TTTCAAAATTTTAATATGATTAATATACTTACATTAGGTTTACTCTTAATATATAATTTA 116177067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTCAAAATTTTAATATGATTAATATACTTACATTAGGTTTACTCTTAATATATAATTTA 1200

116177068 AATCTTTAAACAATATGTAGATAAATTTTAATACACAATTTTTACTTATACTTTTATCAA 116177127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AATCTTTAAACAATATGTAGATAAATTTTAATACACAATTTTTACTTATACTTTTATCAA 1260

116177128 AATTACATATATTATGGAGCGCTTTTATCAAAATTACATATATTATGGAGCTTGAATATA 116177187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATTACATATATTATGGAGCGCTTTTATCAAAATTACATATATTATGGAGCTTGAATATA 1320

116177188 ATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCATAGGATT 116177247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCATAGGATT 1380

116177248 CAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAGTATAACC 116177307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAGTATAACC 1440

116177308 CACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGATTTTTAT 116177367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGATTTTTAT 1500

116177368 TAATAAA 116177374
          |||||||
     1501 TAATAAA 1507

EXCISED REGION

116177376 GAATAAATAATCAATTATATTCAAAGGTTTTATATGAGAATAAAACTGTCTCTCCATATT 116177435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 GAATAAATAATCAATTATATTCAAAGGTTTTATATGAGAATAAAACTGTCTCTCCATATT 1568

116177436 CTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAATATTCAAAAATAATTA 116177495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 CTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAATATTCAAAAATAATTA 1628

116177496 AAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGCAGCTAGTGGGTGTCTC 116177555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 AAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGCAGCTAGTGGGTGTCTC 1688

116177556 CCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTCAAGTAGATCATCTAAG 116177615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 CCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTCAAGTAGATCATCTAAG 1748

116177616 AGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAAATAGGAGCGTGAAACC 116177675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 AGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAAATAGGAGCGTGAAACC 1808

116177676 AAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAGCTGGGAGAATCTCCCT 116177735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 AAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAGCTGGGAGAATCTCCCT 1868

116177736 AATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACAATCAGAAATGATAAAA 116177795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 AATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACAATCAGAAATGATAAAA 1928

116177796 GTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGAGACTACTATGAGTACC 116177855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 GTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGAGACTACTATGAGTACC 1988

116177856 TCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTTCTTAAACTATAAAACC 116177915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 TCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTTCTTAAACTATAAAACC 2048

116177916 TCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAATAACAAGTAGTGAGAC 116177975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 TCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAATAACAAGTAGTGAGAC 2108

116177976 TTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACCAAA 116178035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 TTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACCAAA 2168

116178036 AAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAAGAACCATGCAGAAGAATAT 116178095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 AAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAAGAACCATGCAGAAGAATAT 2228

116178096 GTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCTTCCTCTCTTAACTCGTCAT 116178155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 GTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCTTCCTCTCTTAACTCGTCAT 2288

116178156 CCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAGGACACAACAGAAGTAGAAA 116178215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 CCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAGGACACAACAGAAGTAGAAA 2348

116178216 ACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCAACTAACTACTAGCAAAGTA 116178275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 ACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCAACTAACTACTAGCAAAGTA 2408

116178276 AATACAAGAGCTCAGAAAAACATAATACCTCAAGACCAAGTGGGATTTATCCAGGGATGC 116178335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 AATACAAGAGCTCAGAAAAACATAATACCTCAAGACCAAGTGGGATTTATCCAGGGATGC 2468

116178336 GAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAGCTACAAAATATAAAATACCT 116178395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 GAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAGCTACAAAATATAAAATACCT 2528

116178396 AGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAGGAGAACTACATAAGCACTGA 116178455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 AGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAGGAGAACTACATAAGCACTGA 2588

116178456 TGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGATGCTCATGGATGGGAAGAAT 116178515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 TGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGATGCTCATGGATGGGAAGAAT 2648

116178516 CAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTACAGGTTTAATGCAATTCCTAT 116178575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 CAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTACAGGTTTAATGCAATTCCTAT 2708

116178576 CAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTATAGAATTTATATGAAACCAAA 116178635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 CAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTATAGAATTTATATGAAACCAAA 2768

116178636 AAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAACAAATTCGGAAGCATCACAT 116178695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 AAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAACAAATTCGGAAGCATCACAT 2828

116178696 TACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAAAAGTCCATGGCACTGATACA 116178755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 TACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAAAAGTCCATGGCACTGATACA 2888

116178756 AAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCAGAAATAAAACCACATACTTG 116178815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 AAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCAGAAATAAAACCACATACTTG 2948

116178816 AAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAATGGAGAAAGGACACTTTATT 116178875
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 AAACCAGCTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAATGGAGAAAGGACACTTTATT 3008

116178876 CGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATGAAACTGGGCCACTACCTAAC 116178935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 CGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATGAAACTGGGCCACTACCTAAC 3068

116178936 ACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTAAACGCTAGACCTGAAACTAT 116178995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 ACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTAAACGCTAGACCTGAAACTAT 3128

116178996 GAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCATATTGGCCTAGGCAAAGAAT 116179055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 GAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCATATTGGCCTAGGCAAAGAAT 3188

116179056 TTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATAGAAATATGGGACTTAACTAC 116179115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 TTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATAGAAATATGGGACTTAACTAC 3248

116179116 AAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAACAGGGAGCCTGTGCAATAGG 116179175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 AAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAACAGGGAGCCTGTGCAATAGG 3308

116179176 ATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGTATCCAGAATCTAGAATGAAC 116179235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 ATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGTATCCAGAATCTAGAATGAAC 3368

116179236 TCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGGCAAAAGTCATCAACAGACAT 116179295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 TCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGGCAAAAGTCATCAACAGACAT 3428

116179296 TTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTTAAAAATGCTCAACATTACTA 116179355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 TTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTTAAAAATGCTCAACATTACTA 3488

116179356 ATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACCCATCATTTTACACCAGTCAG 116179415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 ATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACCCATCATTTTACACCAGTCAG 3548

116179416 ATGGCTATTTAT-AAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTGAGGATGCAGAAAAAAGGGA 116179474
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 ATGGCTATTTATAAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTGAGGATGCAGAAAAAAGGGA 3608

116179475 ATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCTATGGAAATCATATAGAGAT 116179534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 ATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCTATGGAAATCATATAGAGAT 3668

116179535 TTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAAATTATACTGCTGAGTATCT 116179594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 TTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAAATTATACTGCTGAGTATCT 3728

116179595 ACCCAAAGGAAAAG 116179608
          ||||||||||||||
     3729 ACCCAAAGGAAAAG 3742

Alignment time is 4.07351 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     7936] =>      7936 nucs 'mol-32-29df-042802_7936'

Score:        7897
Aligned:      7932        nucs
Identic:      7928 (100%) nucs =>      7135 (100%)       793 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116161868,116169004] EXCISED REGION [116169005,116169797]
 second seq =>  [        1,     7139] EXCISED REGION [     7144,     7936]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [7140,7143]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        41 nucs [7140,7180] to [7144,7184]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [116169002,116169004] to [116169005,116169007]
 second seq =>         3 nucs [7137,7139] to [7144,7146]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116161868 GATCTGCTGATGCTTAATGAATTTTAAATATATAGCTAGTTGTGTATCTGTGCATATTTA 116161927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GATCTGCTGATGCTTAATGAATTTTAAATATATAGCTAGTTGTGTATCTGTGCATATTTA 60

116161928 TCAGCAGGATAACGAAGGGTTAACAAAACACCTCTCTACTTTGTGTCGTGTACATTTGTG 116161987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCAGCAGGATAACGAAGGGTTAACAAAACACCTCTCTACTTTGTGTCGTGTACATTTGTG 120

116161988 AAGTGCAGGTGTGCTATTTCTGTTGAAGGAGTTAGAAGTGGGTTGCAAGCTGGCTAAAGA 116162047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGTGCAGGTGTGCTATTTCTGTTGAAGGAGTTAGAAGTGGGTTGCAAGCTGGCTAAAGA 180

116162048 AATGTACATTACATTCAAAAATGGCTTTATATTCCCTGGCTGTTCACTCTTTTGAATGCA 116162107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGTACATTACATTCAAAAATGGCTTTATATTCCCTGGCTGTTCACTCTTTTGAATGCA 240

116162108 AAAAGTAGTTTTTGCTAACTCCATTTTGCGGCTCATGGAAAGCTGAAAAATCAATAGCTT 116162167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAAGTAGTTTTTGCTAACTCCATTTTGCGGCTCATGGAAAGCTGAAAAATCAATAGCTT 300

116162168 CAGGTTGATGAAACCTAAATCCATTTGATTCCTTTCCACCATTGCCATTATGCAGACAGT 116162227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGGTTGATGAAACCTAAATCCATTTGATTCCTTTCCACCATTGCCATTATGCAGACAGT 360

116162228 CAAGTGTGATGTATTTAGTTCATGCAGTACTTATTACTCTCAAGCACAGCTTCTCATCAG 116162287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAGTGTGATGTATTTAGTTCATGCAGTACTTATTACTCTCAAGCACAGCTTCTCATCAG 420

116162288 GGAAAAATTAGACCAGATGAGAAGTAATCAAGAAATTCTGGAGAGGTTTCAAAGATCTTC 116162347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAAAAATTAGACCAGATGAGAAGTAATCAAGAAATTCTGGAGAGGTTTCAAAGATCTTC 480

116162348 CTTCTAACTGCTTCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA--GTCTTGCTCT 116162405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||
      481 CTTCTAACTGCTTCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTCTTGCTCT 540

116162406 CTCAGTCTTTTGGAAGAAAAAAAATAAACATCTCTACACTCTACCATAAAGCTCTAGAAA 116162465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCAGTCTTTTGGAAGAAAAAAAATAAACATCTCTACACTCTACCATAAAGCTCTAGAAA 600

116162466 GTTCTGTACAATTGCTTCATGTCACTATTTTCTAACAATAGATAATACTAGCTGAATAAA 116162525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTCTGTACAATTGCTTCATGTCACTATTTTCTAACAATAGATAATACTAGCTGAATAAA 660

116162526 TGCCAAATTAAGGAATTTTTCCCCTTACTAATGGTACCAGAGCCATCACTCTGGCAGAAC 116162585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGCCAAATTAAGGAATTTTTCCCCTTACTAATGGTACCAGAGCCATCACTCTGGCAGAAC 720

116162586 TAATGCCAAAGCAAAAATAATCACAAATCAATCAGGAATCAGAACAAATAAAAAAACTAC 116162645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAATGCCAAAGCAAAAATAATCACAAATCAATCAGGAATCAGAACAAATAAAAAAACTAC 780

116162646 TTAAACTGATTTGGGTATTTCATTTTTACTGAATTGGCTATTTAATAGAAAAATAATGTT 116162705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAAACTGATTTGGGTATTTCATTTTTACTGAATTGGCTATTTAATAGAAAAATAATGTT 840

116162706 AAGTGGTTGTATAATCAAAAGGTTTAGAAGATTTGGCAACGGATTGCAGTGGTTCAAATC 116162765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AAGTGGTTGTATAATCAAAAGGTTTAGAAGATTTGGCAACGGATTGCAGTGGTTCAAATC 900

116162766 ATACTCCTGTTAATTAGTAGCTTTTTTATAAGTCTTAAACACATTATATATCTTTCCTCT 116162825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATACTCCTGTTAATTAGTAGCTTTTTTATAAGTCTTAAACACATTATATATCTTTCCTCT 960

116162826 CTAATTATGAATTTTATCATATGTAAAAGGGAATTATAGCAGAATCAACCTCAAAATTTT 116162885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTAATTATGAATTTTATCATATGTAAAAGGGAATTATAGCAGAATCAACCTCAAAATTTT 1020

116162886 GGTGAGAGAATGAAATGAATAATCAGTATAAAACGTTTAGCATAGTAAATATTCAATATG 116162945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGTGAGAGAATGAAATGAATAATCAGTATAAAACGTTTAGCATAGTAAATATTCAATATG 1080

116162946 GATTAGTTGTTAATCTCTTACATAGCAATAATTATATTTGAATATCTGGCACCTCTTTTC 116163005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GATTAGTTGTTAATCTCTTACATAGCAATAATTATATTTGAATATCTGGCACCTCTTTTC 1140

116163006 TATTTTAGCAATGTTTTGTGACATTCTCATTGAAATTTATAGATACCTAACTGACAAAAT 116163065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATTTTAGCAATGTTTTGTGACATTCTCATTGAAATTTATAGATACCTAACTGACAAAAT 1200

116163066 CTCCTATACCATCCTGCAATAATGGAAATATTATAAAAATTATTGAATGATCATCTAGGC 116163125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCCTATACCATCCTGCAATAATGGAAATATTATAAAAATTATTGAATGATCATCTAGGC 1260

116163126 CAGCATCCTATTTTAGTGTTTGAATCCCTGAAGTGTAAGAGAGTCTAAGTGATTTTTCTG 116163185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGCATCCTATTTTAGTGTTTGAATCCCTGAAGTGTAAGAGAGTCTAAGTGATTTTTCTG 1320

116163186 AAGTCAAACATCTACTCTTGGTGGAGATCCAAGATTAGGATTTGAGTGTTCTGATTTTTT 116163245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGTCAAACATCTACTCTTGGTGGAGATCCAAGATTAGGATTTGAGTGTTCTGATTTTTT 1380

116163246 GAAAGTGTTTTCTTCAGTTTATTTTCACATCTGTGTGTACAACCAAGACTTGTTTTTCGG 116163305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAAAGTGTTTTCTTCAGTTTATTTTCACATCTGTGTGTACAACCAAGACTTGTTTTTCGG 1440

116163306 ACAGGAGTGGAGTAGACAAGTTAACTTCCAGATTGCATATACTAGAATTTAAGATAAGAA 116163365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACAGGAGTGGAGTAGACAAGTTAACTTCCAGATTGCATATACTAGAATTTAAGATAAGAA 1500

116163366 CTTGATCACTAGACTGTGCATAAAGATTATTCTTTCTAGAAATAGTGCAAGTGCCTGACC 116163425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTGATCACTAGACTGTGCATAAAGATTATTCTTTCTAGAAATAGTGCAAGTGCCTGACC 1560

116163426 ACTTGGGATGAGTTAGTAGTTGGCAAATATCATTGTCTCCTTGACCAATGGGGTGAGAGC 116163485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACTTGGGATGAGTTAGTAGTTGGCAAATATCATTGTCTCCTTGACCAATGGGGTGAGAGC 1620

116163486 CATGATGATAAGAAAAGCCAACTGGAAGGTACTGAAATCCCAAGCAGACAAGATAGTCAA 116163545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CATGATGATAAGAAAAGCCAACTGGAAGGTACTGAAATCCCAAGCAGACAAGATAGTCAA 1680

116163546 ATAAAGCAATGTTGAATCTCAGGAAGAAATTAATCTACCATCATAAACCTTTAGGATGTT 116163605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATAAAGCAATGTTGAATCTCAGGAAGAAATTAATCTACCATCATAAACCTTTAGGATGTT 1740

116163606 GGAGATGTGGTCGCTAGTATTTTTATGATCAATTCAACTGTGTTGATTTTGCACAAACCA 116163665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGAGATGTGGTCGCTAGTATTTTTATGATCAATTCAACTGTGTTGATTTTGCACAAACCA 1800

116163666 GATAGTTTGTAACAAAAGATGGTGGATTATCATAATTTTAATCAAACATGAGCCCCAATC 116163725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GATAGTTTGTAACAAAAGATGGTGGATTATCATAATTTTAATCAAACATGAGCCCCAATC 1860

116163726 ACTTTTGCAGTTCTAAATGAGGTACTTTTACCTAAAGATATCAAAACAGGCTTGGAAACT 116163785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACTTTTGCAGTTCTAAATGAGGTACTTTTACCTAAAGATATCAAAACAGGCTTGGAAACT 1920

116163786 TAGTGTGCTTCTATACATATAACAAATGTATCATTTTCACTATTAGTTGAGATGAAAAAA 116163845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TAGTGTGCTTCTATACATATAACAAATGTATCATTTTCACTATTAGTTGAGATGAAAAAA 1980

116163846 ATTGCCTTTTGTGACAAGAATAGGAGGGCAACAATTATTTTATCTAAAGGATATATTAAT 116163905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTGCCTTTTGTGACAAGAATAGGAGGGCAACAATTATTTTATCTAAAGGATATATTAAT 2040

116163906 TTTACTTTTGCCTGTTCAAAGATAATATGAAGTACCTCAATTTGGTGTTCTGCAGAATTT 116163965
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2041 TTTACTTTTGCCTGTTCAAAGATAATATGAAGTACCTCAATTTGGTGTTCTGCGGAATTT 2100

116163966 CACACATTTCATGATTACATGATGAAAAATTGGATCTAGTGAGTAGGCAATGGTATATAT 116164025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CACACATTTCATGATTACATGATGAAAAATTGGATCTAGTGAGTAGGCAATGGTATATAT 2160

116164026 TCATTATGCCATGCTAGGACATGTAAATGACTGTCTATGTGAAATGAACTGTACAAAGAT 116164085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCATTATGCCATGCTAGGACATGTAAATGACTGTCTATGTGAAATGAACTGTACAAAGAT 2220

116164086 TCAGAGACATGCCATATTAATGAAAGGTTTTAAGGGTTGCTCAGCTAGGATGGCTGGTAC 116164145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TCAGAGACATGCCATATTAATGAAAGGTTTTAAGGGTTGCTCAGCTAGGATGGCTGGTAC 2280

116164146 AAAATGGGGGACTGGTGGAGTTTGTCCAGAATTTAAGAGATTCACTGAATTGTCTCTTTG 116164205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAATGGGGGACTGGTGGAGTTTGTCCAGAATTTAAGAGATTCACTGAATTGTCTCTTTG 2340

116164206 CAGTTCTATGCCTGGTGACAGTGGTGAGCAACAATTTTAATGACAGTAGCCTAACAAGGG 116164265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGTTCTATGCCTGGTGACAGTGGTGAGCAACAATTTTAATGACAGTAGCCTAACAAGGG 2400

116164266 AAAGACAACAAAGAGCTTAATTTTGTGAGATGAAAGAAAAATCAACCCACCATGGAAACA 116164325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAAGACAACAAAGAGCTTAATTTTGTGAGATGAAAGAAAAATCAACCCACCATGGAAACA 2460

116164326 AGCTAGACCAGCTGAATTGCTGATCCGGGCTGAAAAAAATCTAGGATGTATAGGTGAAAA 116164385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGCTAGACCAGCTGAATTGCTGATCCGGGCTGAAAAAAATCTAGGATGTATAGGTGAAAA 2520

116164386 AGAAAAATGATAAATATAACAGTGGAGATTATAGTTTGTTTCAGTGACCATTGTATATAG 116164445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGAAAAATGATAAATATAACAGTGGAGATTATAGTTTGTTTCAGTGACCATTGTATATAG 2580

116164446 TCTGCTGTGCTATATACAAAACGAGGCCAGCAATCAATTTGAAAATTCAATGCGATAAAA 116164505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TCTGCTGTGCTATATACAAAACGAGGCCAGCAATCAATTTGAAAATTCAATGCGATAAAA 2640

116164506 GACTAAAATGATGTAAGTGGTAGACGGTATCTGATGCCTCAGTTACCCCACCATACATCT 116164565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GACTAAAATGATGTAAGTGGTAGACGGTATCTGATGCCTCAGTTACCCCACCATACATCT 2700

116164566 TCCTTGCCTCACATATAATTGTACCTCTGGTTTCATGGATAATTCTGCATGTGTTTTGAG 116164625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TCCTTGCCTCACATATAATTGTACCTCTGGTTTCATGGATAATTCTGCATGTGTTTTGAG 2760

116164626 ATGCCTGGTCTTAATAGCATCTTGTTGTCTGTGTCACCTTTTCTCCTGAGCTGCAGACGT 116164685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATGCCTGGTCTTAATAGCATCTTGTTGTCTGTGTCACCTTTTCTCCTGAGCTGCAGACGT 2820

116164686 AAATGGGTGTTACTTCATTATGCTTCATAGTAATCCCAAATCAAAGGGAAATTAATGCCC 116164745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAATGGGTGTTACTTCATTATGCTTCATAGTAATCCCAAATCAAAGGGAAATTAATGCCC 2880

116164746 TTGAGAACAACTCTTAACTCTTAAAGTGGTGGTAGCAGCAGATGCATTAAACCTTAGGTG 116164805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTGAGAACAACTCTTAACTCTTAAAGTGGTGGTAGCAGCAGATGCATTAAACCTTAGGTG 2940

116164806 GGCAATTCTAGGAGACATTCTGCACTCTCCTTTGAATCTCCCAACTGAAATGAAGCCTCA 116164865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGCAATTCTAGGAGACATTCTGCACTCTCCTTTGAATCTCCCAACTGAAATGAAGCCTCA 3000

116164866 GTTGCTCACAACAATGTGTATTATTACAAAGTGACTAGATTTTCCCCCTTACCTCCTTCC 116164925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTTGCTCACAACAATGTGTATTATTACAAAGTGACTAGATTTTCCCCCTTACCTCCTTCC 3060

116164926 TCCTTTCCTCCTTTTCCTCCTTTCTTCAGTTCTTCAAGTATGGAACAAGGATATATATGC 116164985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCCTTTCCTCCTTTTCCTCCTTTCTTCAGTTCTTCAAGTATGGAACAAGGATATATATGC 3120

116164986 AAGCTGCTTTTAGGAAATAATCTCAAGCAGCTTGCATATAAATCTTTGTTCCAAGCTCTA 116165045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AAGCTGCTTTTAGGAAATAATCTCAAGCAGCTTGCATATAAATCTTTGTTCCAAGCTCTA 3180

116165046 CTTCAAGGGTTCCCCAGTCTAAGATATCTTTTGTTCAGTAAATCTTGTTTTATTTTATTA 116165105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CTTCAAGGGTTCCCCAGTCTAAGATATCTTTTGTTCAGTAAATCTTGTTTTATTTTATTA 3240

116165106 AATCCTGCTTGGCTATGAGAAATATATTTTTGTTAGAGCAATTACAAGACAATTTCAATT 116165165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AATCCTGCTTGGCTATGAGAAATATATTTTTGTTAGAGCAATTACAAGACAATTTCAATT 3300

116165166 GATAAGTAAAATAATTTCTTTCCATTTTATGATCCAGGATAGCTCCTATTATTTTTTCCA 116165225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GATAAGTAAAATAATTTCTTTCCATTTTATGATCCAGGATAGCTCCTATTATTTTTTCCA 3360

116165226 CATAACTATCTTTCATAATCAATTTATATACATAAATTGGTGAAAGTTAGGCAAATTTAT 116165285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CATAACTATCTTTCATAATCAATTTATATACATAAATTGGTGAAAGTTAGGCAAATTTAT 3420

116165286 AAGATTCATTCTCTTTTTATGAATCACTACTATACATTTTAAACCAAGTTTCTTTCTTCC 116165345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAGATTCATTCTCTTTTTATGAATCACTACTATACATTTTAAACCAAGTTTCTTTCTTCC 3480

116165346 CTTGGTAGCTAGTTCCACCCATACCACTACCTTCTTTAGTGTAAAAATGACTCTGTCTTT 116165405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CTTGGTAGCTAGTTCCACCCATACCACTACCTTCTTTAGTGTAAAAATGACTCTGTCTTT 3540

116165406 GAAATTAAAAAATATATATAAATATTTGTAAACATCATAAATAAATTACGGAATAATAAA 116165465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GAAATTAAAAAATATATATAAATATTTGTAAACATCATAAATAAATTACGGAATAATAAA 3600

116165466 GAAAAGCCCACTGCTTACAATTGTAGCTCAGGCAGTATGGGGAATTAGATTAGGGAACCT 116165525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GAAAAGCCCACTGCTTACAATTGTAGCTCAGGCAGTATGGGGAATTAGATTAGGGAACCT 3660

116165526 GGGTGGTTTTCTGTTTGAATAATATATTTGTAATGGTATTACATTTAGTAGGATTAGACA 116165585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GGGTGGTTTTCTGTTTGAATAATATATTTGTAATGGTATTACATTTAGTAGGATTAGACA 3720

116165586 CATATGATAATTGTTAAATTCATACACAAATTGACTTTAGTTACCTCTCATGGTGCATTG 116165645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CATATGATAATTGTTAAATTCATACACAAATTGACTTTAGTTACCTCTCATGGTGCATTG 3780

116165646 TTACTGGAAACACTCTTAATATATTTTGAATCTCTGTGGCATGTATTCATTAGCTTCTTT 116165705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTACTGGAAACACTCTTAATATATTTTGAATCTCTGTGGCATGTATTCATTAGCTTCTTT 3840

116165706 TATTGCATTATAGAAAACCAGAAATGCAATTTATATCAATTTGCTTTCCATACTTCTTAA 116165765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TATTGCATTATAGAAAACCAGAAATGCAATTTATATCAATTTGCTTTCCATACTTCTTAA 3900

116165766 AAAATTTGAATAAACACGAAAAAGTACTTCTGAGTTCCTGTATTGTATACTGTAATAGGG 116165825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAAATTTGAATAAACACGAAAAAGTACTTCTGAGTTCCTGTATTGTATACTGTAATAGGG 3960

116165826 ATATATGCCTATACAGATCACTTATTAAATTGTCTAACACTTTCAGATAATTCAGTATAA 116165885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATATATGCCTATACAGATCACTTATTAAATTGTCTAACACTTTCAGATAATTCAGTATAA 4020

116165886 AATTCAGTACAAAATTCTGCATGTAAGACTACCATTTCCTGCCAGATTTACAAATTCACA 116165945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AATTCAGTACAAAATTCTGCATGTAAGACTACCATTTCCTGCCAGATTTACAAATTCACA 4080

116165946 TATTCTAGAATATTATTTATGAATATATATTTACACACATACCTCTTATTTTCTTCTCCA 116166005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TATTCTAGAATATTATTTATGAATATATATTTACACACATACCTCTTATTTTCTTCTCCA 4140

116166006 CACTTTGGAATTTGGAGGATGAGTTGTGGAGAATAAAAAAAAAAGTGGTGGGAAGAAAAC 116166065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CACTTTGGAATTTGGAGGATGAGTTGTGGAGAATAAAAAAAAAAGTGGTGGGAAGAAAAC 4200

116166066 ATTTACTTGTCTGTGTTTATTCTCTGCTGGGTCTTAGTCGGCAAAGCTACCTTTGTAGTA 116166125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATTTACTTGTCTGTGTTTATTCTCTGCTGGGTCTTAGTCGGCAAAGCTACCTTTGTAGTA 4260

116166126 GGTCCTCTTTTCTTTTATCCTTCTTTGTTGTTCTTTCAAACAAAATTTGGAGATGTTACC 116166185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GGTCCTCTTTTCTTTTATCCTTCTTTGTTGTTCTTTCAAACAAAATTTGGAGATGTTACC 4320

116166186 CACTTTGTCCCAGTTTCTGATTCTGGTGAAATCAAAATTCAAATCTTTCTGTCGTTTTAA 116166245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CACTTTGTCCCAGTTTCTGATTCTGGTGAAATCAAAATTCAAATCTTTCTGTCGTTTTAA 4380

116166246 ATTTTAATATTTTCGTGACTATTTTTTTCCTTTTTTGGATGGATTACATTTGGTTTTTGC 116166305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ATTTTAATATTTTCGTGACTATTTTTTTCCTTTTTTGGATGGATTACATTTGGTTTTTGC 4440

116166306 TTCAACAAATTTCTTATTTCGGATTTAGGTACACAATGATTTGTTTGTGAATTGATATCT 116166365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTCAACAAATTTCTTATTTCGGATTTAGGTACACAATGATTTGTTTGTGAATTGATATCT 4500

116166366 TAGACAGTCTTCTGTTGCCTAATGTATTTCATTCCCTCTTTTCACTCTCCAATAAATACA 116166425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 TAGACAGTCTTCTGTTGCCTAATGTATTTCATTCCCTCTTTTCACTCTCCAATAAATACA 4560

116166426 TTTATCATATTATGTTAATGAAAGATAGGCTTCTCCATAACTTTCTAGACTGTATGTACA 116166485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TTTATCATATTATGTTAATGAAAGATAGGCTTCTCCATAACTTTCTAGACTGTATGTACA 4620

116166486 CCGAGAGAAAGAACATCATAAGTTGGATAGTAATGGTGTACATGAAAGACACATAATTAT 116166545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CCGAGAGAAAGAACATCATAAGTTGGATAGTAATGGTGTACATGAAAGACACATAATTAT 4680

116166546 TAAAGATTATTAGTAAATGTGCAAAATCCTATGTCCTTTATAGTATACACTATATATTTG 116166605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TAAAGATTATTAGTAAATGTGCAAAATCCTATGTCCTTTATAGTATACACTATATATTTG 4740

116166606 TTTCTTTAATATGCTGCACATATTTGCTAAAGATATTTATTTTATACCTATACTTATGTA 116166665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TTTCTTTAATATGCTGCACATATTTGCTAAAGATATTTATTTTATACCTATACTTATGTA 4800

116166666 TTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATTCAAAAATATAATTTCACTTTAAACACT 116166725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATTCAAAAATATAATTTCACTTTAAACACT 4860

116166726 GAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAAAGGAATACATTGCATATTATGAGAGAA 116166785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 GAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAAAGGAATACATTGCATATTATGAGAGAA 4920

116166786 AATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATATTGAATCTATATTATATGACTCTATA 116166845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 AATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATATTGAATCTATATTATATGACTCTATA 4980

116166846 CCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCTACTTGGTTAAT 116166905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 CCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCTACTTGGTTAAT 5040

116166906 TATTCTTGTCCAAAGACATGATTTCATATGGAACTATATAGACTATTGTATTCCAAAGGT 116166965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 TATTCTTGTCCAAAGACATGATTTCATATGGAACTATATAGACTATTGTATTCCAAAGGT 5100

116166966 AGGGATTACTGAAAGGCCAACAGACACCTAAAAGTGATCTTTTGCCTTTGATGCTTCTAC 116167025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AGGGATTACTGAAAGGCCAACAGACACCTAAAAGTGATCTTTTGCCTTTGATGCTTCTAC 5160

116167026 ATTTAAATTACATGTGCTATTATTAGCAAAGAGGAATTTGGCAAATTATGAAGCTCTTTC 116167085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ATTTAAATTACATGTGCTATTATTAGCAAAGAGGAATTTGGCAAATTATGAAGCTCTTTC 5220

116167086 AACCCTTGCTAATTAATTCCATCCATTTGCCAGATATTTCCATATTACCAAGAAGTTCTT 116167145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 AACCCTTGCTAATTAATTCCATCCATTTGCCAGATATTTCCATATTACCAAGAAGTTCTT 5280

116167146 CCAAAGGCCTAATATTAAATTGTTGTGGTCTAGGACAATTTTTTCTTAACTGTTCTCTGG 116167205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 CCAAAGGCCTAATATTAAATTGTTGTGGTCTAGGACAATTTTTTCTTAACTGTTCTCTGG 5340

116167206 TTTGTGACAGATATTATGTTATTAATAGAATATAGCATTTGATTCTTATATTATTCCATA 116167265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TTTGTGACAGATATTATGTTATTAATAGAATATAGCATTTGATTCTTATATTATTCCATA 5400

116167266 CACTACCAACTGGTTTACGAAGGAGACCACCAATACAATTCTATTAAAGTCCCTGTCACT 116167325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 CACTACCAACTGGTTTACGAAGGAGACCACCAATACAATTCTATTAAAGTCCCTGTCACT 5460

116167326 TTGTTTGCTATTTAAATTGTTTCTATATTGAATCAAGTTCCTTTTATTAATTAAATATAA 116167385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TTGTTTGCTATTTAAATTGTTTCTATATTGAATCAAGTTCCTTTTATTAATTAAATATAA 5520

116167386 ATTATATTCAGTGGTAATTAAATATTTCAATTATTAATGCTTAGATTTTAACTTTTTTCA 116167445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 ATTATATTCAGTGGTAATTAAATATTTCAATTATTAATGCTTAGATTTTAACTTTTTTCA 5580

116167446 TCTTTTACATGAGAAAATGACTTGTTTTATAAAGTTCAAGATTTAGCAATTATTTGTAAA 116167505
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TCTTTTACATGAGAAAATGTCTTGTTTTATAAAGTTCAAGATTTAGCAATTATTTGTAAA 5640

116167506 CTGTTACTAAATATATATTTTAAAAATACTAAATTGTTCTTTCGATTTAATTTGAATTTT 116167565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CTGTTACTAAATATATATTTTAAAAATACTAAATTGTTCTTTCGATTTAATTTGAATTTT 5700

116167566 TGATTTGGTTAAAAAATCTGAGCAATGCTGATTTATTTTGCCATCCTTCCATTAAGTCAA 116167625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TGATTTGGTTAAAAAATCTGAGCAATGCTGATTTATTTTGCCATCCTTCCATTAAGTCAA 5760

116167626 GTTTTTTTGGTTTTGGTTTTGTTTTCTTAAAAGATGGCTCCTACAAGATAAGACATTTCT 116167685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 GTTTTTTTGGTTTTGGTTTTGTTTTCTTAAAAGATGGCTCCTACAAGATAAGACATTTCT 5820

116167686 TACATGGCCTAATCTGAAGTAAAAATCGCCAAATTGTATATATCACTTTGAGATATTTTA 116167745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 TACATGGCCTAATCTGAAGTAAAAATCGCCAAATTGTATATATCACTTTGAGATATTTTA 5880

116167746 TGGTGTTGCTTGTCACATTGCTAGATAATTAATGCCACTATTTCATCATGTTAAGTTTAT 116167805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TGGTGTTGCTTGTCACATTGCTAGATAATTAATGCCACTATTTCATCATGTTAAGTTTAT 5940

116167806 AAAACAAATTATTTAACATAGCTGTCACCAAAGCTTTATCTATTTTTTTCAGTTCTTCCC 116167865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 AAAACAAATTATTTAACATAGCTGTCACCAAAGCTTTATCTATTTTTTTCAGTTCTTCCC 6000

116167866 TGAAGAAAACCTTATTAATTTAAATCTATGTGAATTCATTAATTTACTTGTTTGTACTTC 116167925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TGAAGAAAACCTTATTAATTTAAATCTATGTGAATTCATTAATTTACTTGTTTGTACTTC 6060

116167926 TCTAGTTCGAATTAACTGTATTTCTACTAAGGGCAGGAACCATCCCTTAATTCATTAAGT 116167985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TCTAGTTCGAATTAACTGTATTTCTACTAAGGGCAGGAACCATCCCTTAATTCATTAAGT 6120

116167986 AATGTCTGTATCTTACTCAACACAGGTTAGTGTGAACTCAAGCCATAGAGTAAAGGGACT 116168045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 AATGTCTGTATCTTACTCAACACAGGTTAGTGTGAACTCAAGCCATAGAGTAAAGGGACT 6180

116168046 GTATAGTATTATTGCAGAAGTAGGGAATATCCTCTCAATTTCTTATATATTTCAGCTTTT 116168105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 GTATAGTATTATTGCAGAAGTAGGGAATATCCTCTCAATTTCTTATATATTTCAGCTTTT 6240

116168106 ATGATCTACTGTTGCTTTATCCTTAATTTACAAATATCCCCAAGTAAATCTCATCTGTAA 116168165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 ATGATCTACTGTTGCTTTATCCTTAATTTACAAATATCCCCAAGTAAATCTCATCTGTAA 6300

116168166 ATCTTCTTTCTGGCCCATGTTCCTTTGTATAAAATATTGTGACTCACTGCTTTAAAAAGC 116168225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 ATCTTCTTTCTGGCCCATGTTCCTTTGTATAAAATATTGTGACTCACTGCTTTAAAAAGC 6360

116168226 ATCTGTATTTACTGTCTCTTCTAATTCCTCATTATTATTCCTTCCACGTGGCTAACCTAA 116168285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 ATCTGTATTTACTGTCTCTTCTAATTCCTCATTATTATTCCTTCCACGTGGCTAACCTAA 6420

116168286 GGGCACATTTTCCATTTGTATTAATTGGCCTCTTTCGTGAGTGAGAATCCTGACCACTCT 116168345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6421 GGGCACATTTTCCATTTGTATTAATTGGCCTCTTTCGTGAGTGAGAATCCTGACCACTCT 6480

116168346 TGCTCCTACAGCAACATTCTACCCTCAGCTTAGCCTGCTTCTCTAGGGAACCCCTTTCAG 116168405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 TGCTCCTACAGCAACATTCTACCCTCAGCTTAGCCTGCTTCTCTAGGGAACCCCTTTCAG 6540

116168406 TCTTTCTCATGAGCTGCTCTTCTGTTTCCTTTCTAGTATTCTGGAAGCTTTTCTGGCTCT 116168465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 TCTTTCTCATGAGCTGCTCTTCTGTTTCCTTTCTAGTATTCTGGAAGCTTTTCTGGCTCT 6600

116168466 GGGGATGTCATGCAATCCTCCCACGGTCTTAACATGACTTGGCCTGCCTTCTGCCCAGTT 116168525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 GGGGATGTCATGCAATCCTCCCACGGTCTTAACATGACTTGGCCTGCCTTCTGCCCAGTT 6660

116168526 CTACAGGCCCTAATTTAACATAATTTTTCCCTCACAACTGCCTCTCTTTGTTATTAATAC 116168585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 CTACAGGCCCTAATTTAACATAATTTTTCCCTCACAACTGCCTCTCTTTGTTATTAATAC 6720

116168586 TTTTGATAAATTGCACCACTTCACATTCAATGAGTCTCCAAGTCCAAATGACAGTCCCTG 116168645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 TTTTGATAAATTGCACCACTTCACATTCAATGAGTCTCCAAGTCCAAATGACAGTCCCTG 6780

116168646 TGATGCTTAATTTTATGTGTCAACCTGGCCAGGCCATGGTACCAAGATATTTGGTCCAAC 116168705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 TGATGCTTAATTTTATGTGTCAACCTGGCCAGGCCATGGTACCAAGATATTTGGTCCAAC 6840

116168706 ACTGTTCTAGATGTTTCTGTGAAGGTATTTTTTGGATAGAATTAACGTTTATATCAGTAG 116168765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 ACTGTTCTAGATGTTTCTGTGAAGGTATTTTTTGGATAGAATTAACGTTTATATCAGTAG 6900

116168766 AATTTTAGTAAAGAGATTTACCTCCATAATGTGGATGGGCCTCATCCAATCAGCTGAAGA 116168825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 AATTTTAGTAAAGAGATTTACCTCCATAATGTGGATGGGCCTCATCCAATCAGCTGAAGA 6960

116168826 CCTTAGAAAAAGACAGATCTACCCTGAAAAATACAGAATTCTGCAAAAGTCTGCCTTCAG 116168885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 CCTTAGAAAAAGACAGATCTACCCTGAAAAATACAGAATTCTGCAAAAGTCTGCCTTCAG 7020

116168886 ACTCTAACTTCACCATCAACTCTCCCCTAAGTCTCAGTCTGCTTGTCTACACTGTAGATT 116168945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 ACTCTAACTTCACCATCAACTCTCCCCTAAGTCTCAGTCTGCTTGTCTACACTGTAGATT 7080

116168946 TTGGACTTGTCAGTCTCCTTAATTGAGTGAGCCAATTTCCCAAAATCAAGAGAGGAAGA 116169004
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 TTGGACTTGTCAGTCTCCTTAATTGAGTGAGCCAATTTCCCAAAATCAAGAGAGGAAGA 7139

EXCISED REGION

116169005 AGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAATAGATAGATAGATAGATG 116169064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7144 AGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAATAGATAGATAGATAGATG 7203

116169065 TTCTGTTGGCTTTGTTTCTCTGGAGAACCCTGATTAATATATTTCCTAGATGCCTCTGAA 116169124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7204 TTCTGTTGGCTTTGTTTCTCTGGAGAACCCTGATTAATATATTTCCTAGATGCCTCTGAA 7263

116169125 CTATGTCCCTCCATTCTATATTGAACTGTTTTTTCCACATTAAATCATATCTCATTTGTT 116169184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7264 CTATGTCCCTCCATTCTATATTGAACTGTTTTTTCCACATTAAATCATATCTCATTTGTT 7323

116169185 AATTGGAAAAAAACCCTGTTGTATGAACTTTAAATTTATCAATTAATAAATTTAAATCTC 116169244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7324 AATTGGAAAAAAACCCTGTTGTATGAACTTTAAATTTATCAATTAATAAATTTAAATCTC 7383

116169245 AAAATAGTTTGATAAGTTAGTAATTATTGTTTCTATTTTACAGGTGTAGAAACTAAGGCA 116169304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7384 AAAATAGTTTGATAAGTTAGTAATTATTGTTTCTATTTTACAGGTGTAGAAACTAAGGCA 7443

116169305 GAGTTAAGTAACTTAGCAAAAGATGGCACAGTTAAAATTCAATGCAGGCAGATCTAGTTT 116169364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7444 GAGTTAAGTAACTTAGCAAAAGATGGCACAGTTAAAATTCAATGCAGGCAGATCTAGTTT 7503

116169365 CAGTGTTGGAGCTCTTACTCTGCTAGCATGTCGTTTTCACTGATTATAGTTCCTCACTCA 116169424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7504 CAGTGTTGGAGCTCTTACTCTGCTAGCATGTCGTTTTCACTGATTATAGTTCCTCACTCA 7563

116169425 TTTCACCAGAATAAAACAAGAATGTTTTTTGTGGTCTCTAACTTCTGTCAGAATTACTGA 116169484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7564 TTTCACCAGAATAAAACAAGAATGTTTTTTGTGGTCTCTAACTTCTGTCAGAATTACTGA 7623

116169485 ATTGATTCAAAAAAATACATTTTTTTTACCAAAAATTATGATTTTTACTAAAGCTTTTAC 116169544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7624 ATTGATTCAAAAAAATACATTTTTTTTACCAAAAATTATGATTTTTACTAAAGCTTTTAC 7683

116169545 TCAAATCTCTAGACTGACAGGCTGCTAAAAAAGCCCATTTTTCACAAAATTGGTGGCAAT 116169604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7684 TCAAATCTCTAGACTGACAGGCTGCTAAAAAAGCCCATTTTTCACAAAATTGGTGGCAAT 7743

116169605 TATTTATTTCCTTTTCTATAGTTCAAAATCTGATAATAAAATATGAACTGAACTTCCTAA 116169664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7744 TATTTATTTCCTTTTCTATAGTTCAAAATCTGATAATAAAATATGAACTGAACTTCCTAA 7803

116169665 AACATAAACTCCTAGCTAGGAAGCATCCAGATTCATTCAATAATATTTATTTTAAAAGAG 116169724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7804 AACATAAACTCCTAGCTAGGAAGCATCCAGATTCATTCAATAATATTTATTTTAAAAGAG 7863

116169725 TATTATCTTATGCGATACTTTTTCAATGTGATTTCAAGTCTAGTATTTCCATCATTATGA 116169784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7864 TATTATCTTATGCGATACTTTTTCAATGTGATTTCAAGTCTAGTATTTCCATCATTATGA 7923

116169785 TATTTAAAAATAT 116169797
          |||||||||||||
     7924 TATTTAAAAATAT 7936

Alignment time is 8.41484 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     4333] =>      4333 nucs 'mol-32-2b13-068652_4333'

Score:        4332
Aligned:      4332        nucs
Identic:      4332 (100%) nucs =>      4314 (100%)        18 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116164729,116169042] EXCISED REGION [116169046,116169063]
 second seq =>  [        1,     4314] EXCISED REGION [     4315,     4332]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [116169043,116169045]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4318,4318]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [116169043,116169045] to [116169046,116169048]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [116169027,116169042] to [116169046,116169061]
 second seq =>        16 nucs [4299,4314] to [4315,4330]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [116169043,116169043] to [116169045,116169045]
 second seq =>         0 nucs

116164729 AAGGGAAATTAATGCCCTTGAGAACAACTCTTAACTCTTAAAGTGGTGGTAGCAGCAGAT 116164788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGGGAAATTAATGCCCTTGAGAACAACTCTTAACTCTTAAAGTGGTGGTAGCAGCAGAT 60

116164789 GCATTAAACCTTAGGTGGGCAATTCTAGGAGACATTCTGCACTCTCCTTTGAATCTCCCA 116164848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCATTAAACCTTAGGTGGGCAATTCTAGGAGACATTCTGCACTCTCCTTTGAATCTCCCA 120

116164849 ACTGAAATGAAGCCTCAGTTGCTCACAACAATGTGTATTATTACAAAGTGACTAGATTTT 116164908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACTGAAATGAAGCCTCAGTTGCTCACAACAATGTGTATTATTACAAAGTGACTAGATTTT 180

116164909 CCCCCTTACCTCCTTCCTCCTTTCCTCCTTTTCCTCCTTTCTTCAGTTCTTCAAGTATGG 116164968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCCCCTTACCTCCTTCCTCCTTTCCTCCTTTTCCTCCTTTCTTCAGTTCTTCAAGTATGG 240

116164969 AACAAGGATATATATGCAAGCTGCTTTTAGGAAATAATCTCAAGCAGCTTGCATATAAAT 116165028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACAAGGATATATATGCAAGCTGCTTTTAGGAAATAATCTCAAGCAGCTTGCATATAAAT 300

116165029 CTTTGTTCCAAGCTCTACTTCAAGGGTTCCCCAGTCTAAGATATCTTTTGTTCAGTAAAT 116165088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTGTTCCAAGCTCTACTTCAAGGGTTCCCCAGTCTAAGATATCTTTTGTTCAGTAAAT 360

116165089 CTTGTTTTATTTTATTAAATCCTGCTTGGCTATGAGAAATATATTTTTGTTAGAGCAATT 116165148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTGTTTTATTTTATTAAATCCTGCTTGGCTATGAGAAATATATTTTTGTTAGAGCAATT 420

116165149 ACAAGACAATTTCAATTGATAAGTAAAATAATTTCTTTCCATTTTATGATCCAGGATAGC 116165208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACAAGACAATTTCAATTGATAAGTAAAATAATTTCTTTCCATTTTATGATCCAGGATAGC 480

116165209 TCCTATTATTTTTTCCACATAACTATCTTTCATAATCAATTTATATACATAAATTGGTGA 116165268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCTATTATTTTTTCCACATAACTATCTTTCATAATCAATTTATATACATAAATTGGTGA 540

116165269 AAGTTAGGCAAATTTATAAGATTCATTCTCTTTTTATGAATCACTACTATACATTTTAAA 116165328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAGTTAGGCAAATTTATAAGATTCATTCTCTTTTTATGAATCACTACTATACATTTTAAA 600

116165329 CCAAGTTTCTTTCTTCCCTTGGTAGCTAGTTCCACCCATACCACTACCTTCTTTAGTGTA 116165388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCAAGTTTCTTTCTTCCCTTGGTAGCTAGTTCCACCCATACCACTACCTTCTTTAGTGTA 660

116165389 AAAATGACTCTGTCTTTGAAATTAAAAAATATATATAAATATTTGTAAACATCATAAATA 116165448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAAATGACTCTGTCTTTGAAATTAAAAAATATATATAAATATTTGTAAACATCATAAATA 720

116165449 AATTACGGAATAATAAAGAAAAGCCCACTGCTTACAATTGTAGCTCAGGCAGTATGGGGA 116165508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATTACGGAATAATAAAGAAAAGCCCACTGCTTACAATTGTAGCTCAGGCAGTATGGGGA 780

116165509 ATTAGATTAGGGAACCTGGGTGGTTTTCTGTTTGAATAATATATTTGTAATGGTATTACA 116165568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTAGATTAGGGAACCTGGGTGGTTTTCTGTTTGAATAATATATTTGTAATGGTATTACA 840

116165569 TTTAGTAGGATTAGACACATATGATAATTGTTAAATTCATACACAAATTGACTTTAGTTA 116165628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTAGTAGGATTAGACACATATGATAATTGTTAAATTCATACACAAATTGACTTTAGTTA 900

116165629 CCTCTCATGGTGCATTGTTACTGGAAACACTCTTAATATATTTTGAATCTCTGTGGCATG 116165688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCTCTCATGGTGCATTGTTACTGGAAACACTCTTAATATATTTTGAATCTCTGTGGCATG 960

116165689 TATTCATTAGCTTCTTTTATTGCATTATAGAAAACCAGAAATGCAATTTATATCAATTTG 116165748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATTCATTAGCTTCTTTTATTGCATTATAGAAAACCAGAAATGCAATTTATATCAATTTG 1020

116165749 CTTTCCATACTTCTTAAAAAATTTGAATAAACACGAAAAAGTACTTCTGAGTTCCTGTAT 116165808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTTCCATACTTCTTAAAAAATTTGAATAAACACGAAAAAGTACTTCTGAGTTCCTGTAT 1080

116165809 TGTATACTGTAATAGGGATATATGCCTATACAGATCACTTATTAAATTGTCTAACACTTT 116165868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGTATACTGTAATAGGGATATATGCCTATACAGATCACTTATTAAATTGTCTAACACTTT 1140

116165869 CAGATAATTCAGTATAAAATTCAGTACAAAATTCTGCATGTAAGACTACCATTTCCTGCC 116165928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGATAATTCAGTATAAAATTCAGTACAAAATTCTGCATGTAAGACTACCATTTCCTGCC 1200

116165929 AGATTTACAAATTCACATATTCTAGAATATTATTTATGAATATATATTTACACACATACC 116165988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGATTTACAAATTCACATATTCTAGAATATTATTTATGAATATATATTTACACACATACC 1260

116165989 TCTTATTTTCTTCTCCACACTTTGGAATTTGGAGGATGAGTTGTGGAGAATAAAAAAAAA 116166048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCTTATTTTCTTCTCCACACTTTGGAATTTGGAGGATGAGTTGTGGAGAATAAAAAAAAA 1320

116166049 AGTGGTGGGAAGAAAACATTTACTTGTCTGTGTTTATTCTCTGCTGGGTCTTAGTCGGCA 116166108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGTGGTGGGAAGAAAACATTTACTTGTCTGTGTTTATTCTCTGCTGGGTCTTAGTCGGCA 1380

116166109 AAGCTACCTTTGTAGTAGGTCCTCTTTTCTTTTATCCTTCTTTGTTGTTCTTTCAAACAA 116166168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAGCTACCTTTGTAGTAGGTCCTCTTTTCTTTTATCCTTCTTTGTTGTTCTTTCAAACAA 1440

116166169 AATTTGGAGATGTTACCCACTTTGTCCCAGTTTCTGATTCTGGTGAAATCAAAATTCAAA 116166228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATTTGGAGATGTTACCCACTTTGTCCCAGTTTCTGATTCTGGTGAAATCAAAATTCAAA 1500

116166229 TCTTTCTGTCGTTTTAAATTTTAATATTTTCGTGACTATTTTTTTCCTTTTTTGGATGGA 116166288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTTCTGTCGTTTTAAATTTTAATATTTTCGTGACTATTTTTTTCCTTTTTTGGATGGA 1560

116166289 TTACATTTGGTTTTTGCTTCAACAAATTTCTTATTTCGGATTTAGGTACACAATGATTTG 116166348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTACATTTGGTTTTTGCTTCAACAAATTTCTTATTTCGGATTTAGGTACACAATGATTTG 1620

116166349 TTTGTGAATTGATATCTTAGACAGTCTTCTGTTGCCTAATGTATTTCATTCCCTCTTTTC 116166408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTGTGAATTGATATCTTAGACAGTCTTCTGTTGCCTAATGTATTTCATTCCCTCTTTTC 1680

116166409 ACTCTCCAATAAATACATTTATCATATTATGTTAATGAAAGATAGGCTTCTCCATAACTT 116166468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACTCTCCAATAAATACATTTATCATATTATGTTAATGAAAGATAGGCTTCTCCATAACTT 1740

116166469 TCTAGACTGTATGTACACCGAGAGAAAGAACATCATAAGTTGGATAGTAATGGTGTACAT 116166528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCTAGACTGTATGTACACCGAGAGAAAGAACATCATAAGTTGGATAGTAATGGTGTACAT 1800

116166529 GAAAGACACATAATTATTAAAGATTATTAGTAAATGTGCAAAATCCTATGTCCTTTATAG 116166588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAAAGACACATAATTATTAAAGATTATTAGTAAATGTGCAAAATCCTATGTCCTTTATAG 1860

116166589 TATACACTATATATTTGTTTCTTTAATATGCTGCACATATTTGCTAAAGATATTTATTTT 116166648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATACACTATATATTTGTTTCTTTAATATGCTGCACATATTTGCTAAAGATATTTATTTT 1920

116166649 ATACCTATACTTATGTATTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATTCAAAAATATA 116166708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATACCTATACTTATGTATTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATTCAAAAATATA 1980

116166709 ATTTCACTTTAAACACTGAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAAAGGAATACAT 116166768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTTCACTTTAAACACTGAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAAAGGAATACAT 2040

116166769 TGCATATTATGAGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATATTGAATCTA 116166828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCATATTATGAGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATATTGAATCTA 2100

116166829 TATTATATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTAT 116166888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATTATATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTAT 2160

116166889 CACTCTACTTGGTTAATTATTCTTGTCCAAAGACATGATTTCATATGGAACTATATAGAC 116166948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CACTCTACTTGGTTAATTATTCTTGTCCAAAGACATGATTTCATATGGAACTATATAGAC 2220

116166949 TATTGTATTCCAAAGGTAGGGATTACTGAAAGGCCAACAGACACCTAAAAGTGATCTTTT 116167008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TATTGTATTCCAAAGGTAGGGATTACTGAAAGGCCAACAGACACCTAAAAGTGATCTTTT 2280

116167009 GCCTTTGATGCTTCTACATTTAAATTACATGTGCTATTATTAGCAAAGAGGAATTTGGCA 116167068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCCTTTGATGCTTCTACATTTAAATTACATGTGCTATTATTAGCAAAGAGGAATTTGGCA 2340

116167069 AATTATGAAGCTCTTTCAACCCTTGCTAATTAATTCCATCCATTTGCCAGATATTTCCAT 116167128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATTATGAAGCTCTTTCAACCCTTGCTAATTAATTCCATCCATTTGCCAGATATTTCCAT 2400

116167129 ATTACCAAGAAGTTCTTCCAAAGGCCTAATATTAAATTGTTGTGGTCTAGGACAATTTTT 116167188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTACCAAGAAGTTCTTCCAAAGGCCTAATATTAAATTGTTGTGGTCTAGGACAATTTTT 2460

116167189 TCTTAACTGTTCTCTGGTTTGTGACAGATATTATGTTATTAATAGAATATAGCATTTGAT 116167248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TCTTAACTGTTCTCTGGTTTGTGACAGATATTATGTTATTAATAGAATATAGCATTTGAT 2520

116167249 TCTTATATTATTCCATACACTACCAACTGGTTTACGAAGGAGACCACCAATACAATTCTA 116167308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCTTATATTATTCCATACACTACCAACTGGTTTACGAAGGAGACCACCAATACAATTCTA 2580

116167309 TTAAAGTCCCTGTCACTTTGTTTGCTATTTAAATTGTTTCTATATTGAATCAAGTTCCTT 116167368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTAAAGTCCCTGTCACTTTGTTTGCTATTTAAATTGTTTCTATATTGAATCAAGTTCCTT 2640

116167369 TTATTAATTAAATATAAATTATATTCAGTGGTAATTAAATATTTCAATTATTAATGCTTA 116167428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTATTAATTAAATATAAATTATATTCAGTGGTAATTAAATATTTCAATTATTAATGCTTA 2700

116167429 GATTTTAACTTTTTTCATCTTTTACATGAGAAAATGACTTGTTTTATAAAGTTCAAGATT 116167488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GATTTTAACTTTTTTCATCTTTTACATGAGAAAATGACTTGTTTTATAAAGTTCAAGATT 2760

116167489 TAGCAATTATTTGTAAACTGTTACTAAATATATATTTTAAAAATACTAAATTGTTCTTTC 116167548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAGCAATTATTTGTAAACTGTTACTAAATATATATTTTAAAAATACTAAATTGTTCTTTC 2820

116167549 GATTTAATTTGAATTTTTGATTTGGTTAAAAAATCTGAGCAATGCTGATTTATTTTGCCA 116167608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GATTTAATTTGAATTTTTGATTTGGTTAAAAAATCTGAGCAATGCTGATTTATTTTGCCA 2880

116167609 TCCTTCCATTAAGTCAAGTTTTTTTGGTTTTGGTTTTGTTTTCTTAAAAGATGGCTCCTA 116167668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TCCTTCCATTAAGTCAAGTTTTTTTGGTTTTGGTTTTGTTTTCTTAAAAGATGGCTCCTA 2940

116167669 CAAGATAAGACATTTCTTACATGGCCTAATCTGAAGTAAAAATCGCCAAATTGTATATAT 116167728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CAAGATAAGACATTTCTTACATGGCCTAATCTGAAGTAAAAATCGCCAAATTGTATATAT 3000

116167729 CACTTTGAGATATTTTATGGTGTTGCTTGTCACATTGCTAGATAATTAATGCCACTATTT 116167788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CACTTTGAGATATTTTATGGTGTTGCTTGTCACATTGCTAGATAATTAATGCCACTATTT 3060

116167789 CATCATGTTAAGTTTATAAAACAAATTATTTAACATAGCTGTCACCAAAGCTTTATCTAT 116167848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CATCATGTTAAGTTTATAAAACAAATTATTTAACATAGCTGTCACCAAAGCTTTATCTAT 3120

116167849 TTTTTTCAGTTCTTCCCTGAAGAAAACCTTATTAATTTAAATCTATGTGAATTCATTAAT 116167908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTTTTTCAGTTCTTCCCTGAAGAAAACCTTATTAATTTAAATCTATGTGAATTCATTAAT 3180

116167909 TTACTTGTTTGTACTTCTCTAGTTCGAATTAACTGTATTTCTACTAAGGGCAGGAACCAT 116167968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TTACTTGTTTGTACTTCTCTAGTTCGAATTAACTGTATTTCTACTAAGGGCAGGAACCAT 3240

116167969 CCCTTAATTCATTAAGTAATGTCTGTATCTTACTCAACACAGGTTAGTGTGAACTCAAGC 116168028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CCCTTAATTCATTAAGTAATGTCTGTATCTTACTCAACACAGGTTAGTGTGAACTCAAGC 3300

116168029 CATAGAGTAAAGGGACTGTATAGTATTATTGCAGAAGTAGGGAATATCCTCTCAATTTCT 116168088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CATAGAGTAAAGGGACTGTATAGTATTATTGCAGAAGTAGGGAATATCCTCTCAATTTCT 3360

116168089 TATATATTTCAGCTTTTATGATCTACTGTTGCTTTATCCTTAATTTACAAATATCCCCAA 116168148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TATATATTTCAGCTTTTATGATCTACTGTTGCTTTATCCTTAATTTACAAATATCCCCAA 3420

116168149 GTAAATCTCATCTGTAAATCTTCTTTCTGGCCCATGTTCCTTTGTATAAAATATTGTGAC 116168208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GTAAATCTCATCTGTAAATCTTCTTTCTGGCCCATGTTCCTTTGTATAAAATATTGTGAC 3480

116168209 TCACTGCTTTAAAAAGCATCTGTATTTACTGTCTCTTCTAATTCCTCATTATTATTCCTT 116168268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCACTGCTTTAAAAAGCATCTGTATTTACTGTCTCTTCTAATTCCTCATTATTATTCCTT 3540

116168269 CCACGTGGCTAACCTAAGGGCACATTTTCCATTTGTATTAATTGGCCTCTTTCGTGAGTG 116168328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CCACGTGGCTAACCTAAGGGCACATTTTCCATTTGTATTAATTGGCCTCTTTCGTGAGTG 3600

116168329 AGAATCCTGACCACTCTTGCTCCTACAGCAACATTCTACCCTCAGCTTAGCCTGCTTCTC 116168388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AGAATCCTGACCACTCTTGCTCCTACAGCAACATTCTACCCTCAGCTTAGCCTGCTTCTC 3660

116168389 TAGGGAACCCCTTTCAGTCTTTCTCATGAGCTGCTCTTCTGTTTCCTTTCTAGTATTCTG 116168448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TAGGGAACCCCTTTCAGTCTTTCTCATGAGCTGCTCTTCTGTTTCCTTTCTAGTATTCTG 3720

116168449 GAAGCTTTTCTGGCTCTGGGGATGTCATGCAATCCTCCCACGGTCTTAACATGACTTGGC 116168508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GAAGCTTTTCTGGCTCTGGGGATGTCATGCAATCCTCCCACGGTCTTAACATGACTTGGC 3780

116168509 CTGCCTTCTGCCCAGTTCTACAGGCCCTAATTTAACATAATTTTTCCCTCACAACTGCCT 116168568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CTGCCTTCTGCCCAGTTCTACAGGCCCTAATTTAACATAATTTTTCCCTCACAACTGCCT 3840

116168569 CTCTTTGTTATTAATACTTTTGATAAATTGCACCACTTCACATTCAATGAGTCTCCAAGT 116168628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTCTTTGTTATTAATACTTTTGATAAATTGCACCACTTCACATTCAATGAGTCTCCAAGT 3900

116168629 CCAAATGACAGTCCCTGTGATGCTTAATTTTATGTGTCAACCTGGCCAGGCCATGGTACC 116168688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CCAAATGACAGTCCCTGTGATGCTTAATTTTATGTGTCAACCTGGCCAGGCCATGGTACC 3960

116168689 AAGATATTTGGTCCAACACTGTTCTAGATGTTTCTGTGAAGGTATTTTTTGGATAGAATT 116168748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AAGATATTTGGTCCAACACTGTTCTAGATGTTTCTGTGAAGGTATTTTTTGGATAGAATT 4020

116168749 AACGTTTATATCAGTAGAATTTTAGTAAAGAGATTTACCTCCATAATGTGGATGGGCCTC 116168808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AACGTTTATATCAGTAGAATTTTAGTAAAGAGATTTACCTCCATAATGTGGATGGGCCTC 4080

116168809 ATCCAATCAGCTGAAGACCTTAGAAAAAGACAGATCTACCCTGAAAAATACAGAATTCTG 116168868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATCCAATCAGCTGAAGACCTTAGAAAAAGACAGATCTACCCTGAAAAATACAGAATTCTG 4140

116168869 CAAAAGTCTGCCTTCAGACTCTAACTTCACCATCAACTCTCCCCTAAGTCTCAGTCTGCT 116168928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CAAAAGTCTGCCTTCAGACTCTAACTTCACCATCAACTCTCCCCTAAGTCTCAGTCTGCT 4200

116168929 TGTCTACACTGTAGATTTTGGACTTGTCAGTCTCCTTAATTGAGTGAGCCAATTTCCCAA 116168988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGTCTACACTGTAGATTTTGGACTTGTCAGTCTCCTTAATTGAGTGAGCCAATTTCCCAA 4260

116168989 AATCAAGAGAGGAAGAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAG 116169042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AATCAAGAGAGGAAGAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAG 4314

EXCISED REGION

116169046 ATAGATAGATAGATAGAT 116169063
          ||||||||||||||||||
     4315 ATAGATAGATAGATAGAT 4332

Alignment time is 4.65487 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     4599] =>      4599 nucs 'mol-32-2b3f-067074_4599'

Score:        4539
Aligned:      4561        nucs
Identic:      4559 (100%) nucs =>        10 (100%)      4549 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116159094,116159103] EXCISED REGION [116163279,116167829]
 second seq =>  [        1,       10] EXCISED REGION [       50,     4599]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4175 nucs [116159104,116163278]
 second seq =>        39 nucs [11,49]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [116164794,116164794]
 second seq =>         1 nucs [1564,1564]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116159094 TTAAATTCTA 116159103
          ||||||||||
        1 TTAAATTCTA 10

EXCISED REGION

116163279 TGTGTACAACCAAGACTTGTTTTTCGGACAGGAGTGGAGTAGACAAGTTAACTTCCAGAT 116163338
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
       50 TGTGTACAACCAAGACTTGTTTTTCGGACAGGAGTGGAGTAGAC-AGTTAACTTCCAGAT 108

116163339 TGCATATACTAGAATTTAAGATAAGAACTTGATCACTAGACTGTGCATAAAGATTATTCT 116163398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      109 TGCATATACTAGAATTTAAGATAAGAACTTGATCACTAGACTGTGCATAAAGATTATTCT 168

116163399 TTCTAGAAATAGTGCAAGTGCCTGACCACTTGGGATGAGTTAGTAGTTGGCAAATATCAT 116163458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      169 TTCTAGAAATAGTGCAAGTGCCTGACCACTTGGGATGAGTTAGTAGTTGGCAAATATCAT 228

116163459 TGTCTCCTTGACCAATGGGGTGAGAGCCATGATGATAAGAAAAGCCAACTGGAAGGTACT 116163518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      229 TGTCTCCTTGACCAATGGGGTGAGAGCCATGATGATAAGAAAAGCCAACTGGAAGGTACT 288

116163519 GAAATCCCAAGCAGACAAGATAGTCAAATAAAGCAATGTTGAATCTCAGGAAGAAATTAA 116163578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      289 GAAATCCCAAGCAGACAAGATAGTCAAATAAAGCAATGTTGAATCTCAGGAAGAAATTAA 348

116163579 TCTACCATCATAAACCTTTAGGATGTTGGAGATGTGGTCGCTAGTATTTTTATGATCAAT 116163638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      349 TCTACCATCATAAACCTTTAGGATGTTGGAGATGTGGTCGCTAGTATTTTTATGATCAAT 408

116163639 TCAACTGTGTTGATTTTGCACAAACCAGATAGTTTGTAACAAAAGATGGTGGATTATCAT 116163698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      409 TCAACTGTGTTGATTTTGCACAAACCAGATAGTTTGTAACAAAAGATGGTGGATTATCAT 468

116163699 AATTTTAATCAAACATGAGCCCCAATCACTTTTGCAGTTCTAAATGAGGTACTTTTACCT 116163758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      469 AATTTTAATCAAACATGAGCCCCAATCACTTTTGCAGTTCTAAATGAGGTACTTTTACCT 528

116163759 AAAGATATCAAAACAGGCTTGGAAACTTAGTGTGCTTCTATACATATAACAAATGTATCA 116163818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      529 AAAGATATCAAAACAGGCTTGGAAACTTAGTGTGCTTCTATACATATAACAAATGTATCA 588

116163819 TTTTCACTATTAGTTGAGATGAAAAAAATTGCCTTTTGTGACAAGAATAGGAGGGCAACA 116163878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      589 TTTTCACTATTAGTTGAGATGAAAAAAATTGCCTTTTGTGACAAGAATAGGAGGGCAACA 648

116163879 ATTATTTTATCTAAAGGATATATTAATTTTACTTTTGCCTGTTCAAAGATAATATGAAGT 116163938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 ATTATTTTATCTAAAGGATATATTAATTTTACTTTTGCCTGTTCAAAGATAATATGAAGT 708

116163939 ACCTCAATTTGGTGTTCTGCAGAATTTCACACATTTCATGATTACATGATGAAAAATTGG 116163998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 ACCTCAATTTGGTGTTCTGCAGAATTTCACACATTTCATGATTACATGATGAAAAATTGG 768

116163999 ATCTAGTGAGTAGGCAATGGTATATATTCATTATGCCATGCTAGGACATGTAAATGACTG 116164058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 ATCTAGTGAGTAGGCAATGGTATATATTCATTATGCCATGCTAGGACATGTAAATGACTG 828

116164059 TCTATGTGAAATGAACTGTACAAAGATTCAGAGACATGCCATATTAATGAAAGGTTTTAA 116164118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 TCTATGTGAAATGAACTGTACAAAGATTCAGAGACATGCCATATTAATGAAAGGTTTTAA 888

116164119 GGGTTGCTCAGCTAGGATGGCTGGTACAAAATGGGGGACTGGTGGAGTTTGTCCAGAATT 116164178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 GGGTTGCTCAGCTAGGATGGCTGGTACAAAATGGGGGACTGGTGGAGTTTGTCCAGAATT 948

116164179 TAAGAGATTCACTGAATTGTCTCTTTGCAGTTCTATGCCTGGTGACAGTGGTGAGCAACA 116164238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 TAAGAGATTCACTGAATTGTCTCTTTGCAGTTCTATGCCTGGTGACAGTGGTGAGCAACA 1008

116164239 ATTTTAATGACAGTAGCCTAACAAGGGAAAGACAACAAAGAGCTTAATTTTGTGAGATGA 116164298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 ATTTTAATGACAGTAGCCTAACAAGGGAAAGACAACAAAGAGCTTAATTTTGTGAGATGA 1068

116164299 AAGAAAAATCAACCCACCATGGAAACAAGCTAGACCAGCTGAATTGCTGATCCGGGCTGA 116164358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 AAGAAAAATCAACCCACCATGGAAACAAGCTAGACCAGCTGAATTGCTGATCCGGGCTGA 1128

116164359 AAAAAATCTAGGATGTATAGGTGAAAAAGAAAAATGATAAATATAACAGTGGAGATTATA 116164418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 AAAAAATCTAGGATGTATAGGTGAAAAAGAAAAATGATAAATATAACAGTGGAGATTATA 1188

116164419 GTTTGTTTCAGTGACCATTGTATATAGTCTGCTGTGCTATATACAAAACGAGGCCAGCAA 116164478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 GTTTGTTTCAGTGACCATTGTATATAGTCTGCTGTGCTATATACAAAACGAGGCCAGCAA 1248

116164479 TCAATTTGAAAATTCAATGCGATAAAAGACTAAAATGATGTAAGTGGTAGACGGTATCTG 116164538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 TCAATTTGAAAATTCAATGCGATAAAAGACTAAAATGATGTAAGTGGTAGACGGTATCTG 1308

116164539 ATGCCTCAGTTACCCCACCATACATCTTCCTTGCCTCACATATAATTGTACCTCTGGTTT 116164598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 ATGCCTCAGTTACCCCACCATACATCTTCCTTGCCTCACATATAATTGTACCTCTGGTTT 1368

116164599 CATGGATAATTCTGCATGTGTTTTGAGATGCCTGGTCTTAATAGCATCTTGTTGTCTGTG 116164658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 CATGGATAATTCTGCATGTGTTTTGAGATGCCTGGTCTTAATAGCATCTTGTTGTCTGTG 1428

116164659 TCACCTTTTCTCCTGAGCTGCAGACGTAAATGGGTGTTACTTCATTATGCTTCATAGTAA 116164718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 TCACCTTTTCTCCTGAGCTGCAGACGTAAATGGGTGTTACTTCATTATGCTTCATAGTAA 1488

116164719 TCCCAAATCAAAGGGAAATTAATGCCCTTGAGAACAACTCTTAACTCTTAAAGTGGTGGT 116164778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 TCCCAAATCAAAGGGAAATTAATGCCCTTGAGAACAACTCTTAACTCTTAAAGTGGTGGT 1548

116164779 AGCAGCAGATGCATTAAACCTTAGGTGGGCAATTCTAGGAGACATTCTGCACTCTCCTTT 116164838
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 AGCAGCAGATGCATTGAACCTTAGGTGGGCAATTCTAGGAGACATTCTGCACTCTCCTTT 1608

116164839 GAATCTCCCAACTGAAATGAAGCCTCAGTTGCTCACAACAATGTGTATTATTACAAAGTG 116164898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 GAATCTCCCAACTGAAATGAAGCCTCAGTTGCTCACAACAATGTGTATTATTACAAAGTG 1668

116164899 ACTAGATTTTCCCCCTTACCTCCTTCCTCCTTTCCTCCTTTTCCTCCTTTCTTCAGTTCT 116164958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 ACTAGATTTTCCCCCTTACCTCCTTCCTCCTTTCCTCCTTTTCCTCCTTTCTTCAGTTCT 1728

116164959 TCAAGTATGGAACAAGGATATATATGCAAGCTGCTTTTAGGAAATAATCTCAAGCAGCTT 116165018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 TCAAGTATGGAACAAGGATATATATGCAAGCTGCTTTTAGGAAATAATCTCAAGCAGCTT 1788

116165019 GCATATAAATCTTTGTTCCAAGCTCTACTTCAAGGGTTCCCCAGTCTAAGATATCTTTTG 116165078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 GCATATAAATCTTTGTTCCAAGCTCTACTTCAAGGGTTCCCCAGTCTAAGATATCTTTTG 1848

116165079 TTCAGTAAATCTTGTTTTATTTTATTAAATCCTGCTTGGCTATGAGAAATATATTTTTGT 116165138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 TTCAGTAAATCTTGTTTTATTTTATTAAATCCTGCTTGGCTATGAGAAATATATTTTTGT 1908

116165139 TAGAGCAATTACAAGACAATTTCAATTGATAAGTAAAATAATTTCTTTCCATTTTATGAT 116165198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 TAGAGCAATTACAAGACAATTTCAATTGATAAGTAAAATAATTTCTTTCCATTTTATGAT 1968

116165199 CCAGGATAGCTCCTATTATTTTTTCCACATAACTATCTTTCATAATCAATTTATATACAT 116165258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 CCAGGATAGCTCCTATTATTTTTTCCACATAACTATCTTTCATAATCAATTTATATACAT 2028

116165259 AAATTGGTGAAAGTTAGGCAAATTTATAAGATTCATTCTCTTTTTATGAATCACTACTAT 116165318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 AAATTGGTGAAAGTTAGGCAAATTTATAAGATTCATTCTCTTTTTATGAATCACTACTAT 2088

116165319 ACATTTTAAACCAAGTTTCTTTCTTCCCTTGGTAGCTAGTTCCACCCATACCACTACCTT 116165378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 ACATTTTAAACCAAGTTTCTTTCTTCCCTTGGTAGCTAGTTCCACCCATACCACTACCTT 2148

116165379 CTTTAGTGTAAAAATGACTCTGTCTTTGAAATTAAAAAATATATATAAATATTTGTAAAC 116165438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 CTTTAGTGTAAAAATGACTCTGTCTTTGAAATTAAAAAATATATATAAATATTTGTAAAC 2208

116165439 ATCATAAATAAATTACGGAATAATAAAGAAAAGCCCACTGCTTACAATTGTAGCTCAGGC 116165498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 ATCATAAATAAATTACGGAATAATAAAGAAAAGCCCACTGCTTACAATTGTAGCTCAGGC 2268

116165499 AGTATGGGGAATTAGATTAGGGAACCTGGGTGGTTTTCTGTTTGAATAATATATTTGTAA 116165558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 AGTATGGGGAATTAGATTAGGGAACCTGGGTGGTTTTCTGTTTGAATAATATATTTGTAA 2328

116165559 TGGTATTACATTTAGTAGGATTAGACACATATGATAATTGTTAAATTCATACACAAATTG 116165618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 TGGTATTACATTTAGTAGGATTAGACACATATGATAATTGTTAAATTCATACACAAATTG 2388

116165619 ACTTTAGTTACCTCTCATGGTGCATTGTTACTGGAAACACTCTTAATATATTTTGAATCT 116165678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 ACTTTAGTTACCTCTCATGGTGCATTGTTACTGGAAACACTCTTAATATATTTTGAATCT 2448

116165679 CTGTGGCATGTATTCATTAGCTTCTTTTATTGCATTATAGAAAACCAGAAATGCAATTTA 116165738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 CTGTGGCATGTATTCATTAGCTTCTTTTATTGCATTATAGAAAACCAGAAATGCAATTTA 2508

116165739 TATCAATTTGCTTTCCATACTTCTTAAAAAATTTGAATAAACACGAAAAAGTACTTCTGA 116165798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 TATCAATTTGCTTTCCATACTTCTTAAAAAATTTGAATAAACACGAAAAAGTACTTCTGA 2568

116165799 GTTCCTGTATTGTATACTGTAATAGGGATATATGCCTATACAGATCACTTATTAAATTGT 116165858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 GTTCCTGTATTGTATACTGTAATAGGGATATATGCCTATACAGATCACTTATTAAATTGT 2628

116165859 CTAACACTTTCAGATAATTCAGTATAAAATTCAGTACAAAATTCTGCATGTAAGACTACC 116165918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 CTAACACTTTCAGATAATTCAGTATAAAATTCAGTACAAAATTCTGCATGTAAGACTACC 2688

116165919 ATTTCCTGCCAGATTTACAAATTCACATATTCTAGAATATTATTTATGAATATATATTTA 116165978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 ATTTCCTGCCAGATTTACAAATTCACATATTCTAGAATATTATTTATGAATATATATTTA 2748

116165979 CACACATACCTCTTATTTTCTTCTCCACACTTTGGAATTTGGAGGATGAGTTGTGGAGAA 116166038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 CACACATACCTCTTATTTTCTTCTCCACACTTTGGAATTTGGAGGATGAGTTGTGGAGAA 2808

116166039 TAAAAAAAAAAGTGGTGGGAAGAAAACATTTACTTGTCTGTGTTTATTCTCTGCTGGGTC 116166098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 TAAAAAAAAAAGTGGTGGGAAGAAAACATTTACTTGTCTGTGTTTATTCTCTGCTGGGTC 2868

116166099 TTAGTCGGCAAAGCTACCTTTGTAGTAGGTCCTCTTTTCTTTTATCCTTCTTTGTTGTTC 116166158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 TTAGTCGGCAAAGCTACCTTTGTAGTAGGTCCTCTTTTCTTTTATCCTTCTTTGTTGTTC 2928

116166159 TTTCAAACAAAATTTGGAGATGTTACCCACTTTGTCCCAGTTTCTGATTCTGGTGAAATC 116166218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 TTTCAAACAAAATTTGGAGATGTTACCCACTTTGTCCCAGTTTCTGATTCTGGTGAAATC 2988

116166219 AAAATTCAAATCTTTCTGTCGTTTTAAATTTTAATATTTTCGTGACTATTTTTTTCCTTT 116166278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 AAAATTCAAATCTTTCTGTCGTTTTAAATTTTAATATTTTCGTGACTATTTTTTTCCTTT 3048

116166279 TTTGGATGGATTACATTTGGTTTTTGCTTCAACAAATTTCTTATTTCGGATTTAGGTACA 116166338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 TTTGGATGGATTACATTTGGTTTTTGCTTCAACAAATTTCTTATTTCGGATTTAGGTACA 3108

116166339 CAATGATTTGTTTGTGAATTGATATCTTAGACAGTCTTCTGTTGCCTAATGTATTTCATT 116166398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 CAATGATTTGTTTGTGAATTGATATCTTAGACAGTCTTCTGTTGCCTAATGTATTTCATT 3168

116166399 CCCTCTTTTCACTCTCCAATAAATACATTTATCATATTATGTTAATGAAAGATAGGCTTC 116166458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 CCCTCTTTTCACTCTCCAATAAATACATTTATCATATTATGTTAATGAAAGATAGGCTTC 3228

116166459 TCCATAACTTTCTAGACTGTATGTACACCGAGAGAAAGAACATCATAAGTTGGATAGTAA 116166518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 TCCATAACTTTCTAGACTGTATGTACACCGAGAGAAAGAACATCATAAGTTGGATAGTAA 3288

116166519 TGGTGTACATGAAAGACACATAATTATTAAAGATTATTAGTAAATGTGCAAAATCCTATG 116166578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 TGGTGTACATGAAAGACACATAATTATTAAAGATTATTAGTAAATGTGCAAAATCCTATG 3348

116166579 TCCTTTATAGTATACACTATATATTTGTTTCTTTAATATGCTGCACATATTTGCTAAAGA 116166638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 TCCTTTATAGTATACACTATATATTTGTTTCTTTAATATGCTGCACATATTTGCTAAAGA 3408

116166639 TATTTATTTTATACCTATACTTATGTATTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATT 116166698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 TATTTATTTTATACCTATACTTATGTATTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATT 3468

116166699 CAAAAATATAATTTCACTTTAAACACTGAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAA 116166758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 CAAAAATATAATTTCACTTTAAACACTGAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAA 3528

116166759 AGGAATACATTGCATATTATGAGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATAT 116166818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 AGGAATACATTGCATATTATGAGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATAT 3588

116166819 ATTGAATCTATATTATATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACAT 116166878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 ATTGAATCTATATTATATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACAT 3648

116166879 GGTTAACTATCACTCTACTTGGTTAATTATTCTTGTCCAAAGACATGATTTCATATGGAA 116166938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 GGTTAACTATCACTCTACTTGGTTAATTATTCTTGTCCAAAGACATGATTTCATATGGAA 3708

116166939 CTATATAGACTATTGTATTCCAAAGGTAGGGATTACTGAAAGGCCAACAGACACCTAAAA 116166998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 CTATATAGACTATTGTATTCCAAAGGTAGGGATTACTGAAAGGCCAACAGACACCTAAAA 3768

116166999 GTGATCTTTTGCCTTTGATGCTTCTACATTTAAATTACATGTGCTATTATTAGCAAAGAG 116167058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 GTGATCTTTTGCCTTTGATGCTTCTACATTTAAATTACATGTGCTATTATTAGCAAAGAG 3828

116167059 GAATTTGGCAAATTATGAAGCTCTTTCAACCCTTGCTAATTAATTCCATCCATTTGCCAG 116167118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 GAATTTGGCAAATTATGAAGCTCTTTCAACCCTTGCTAATTAATTCCATCCATTTGCCAG 3888

116167119 ATATTTCCATATTACCAAGAAGTTCTTCCAAAGGCCTAATATTAAATTGTTGTGGTCTAG 116167178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 ATATTTCCATATTACCAAGAAGTTCTTCCAAAGGCCTAATATTAAATTGTTGTGGTCTAG 3948

116167179 GACAATTTTTTCTTAACTGTTCTCTGGTTTGTGACAGATATTATGTTATTAATAGAATAT 116167238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3949 GACAATTTTTTCTTAACTGTTCTCTGGTTTGTGACAGATATTATGTTATTAATAGAATAT 4008

116167239 AGCATTTGATTCTTATATTATTCCATACACTACCAACTGGTTTACGAAGGAGACCACCAA 116167298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4009 AGCATTTGATTCTTATATTATTCCATACACTACCAACTGGTTTACGAAGGAGACCACCAA 4068

116167299 TACAATTCTATTAAAGTCCCTGTCACTTTGTTTGCTATTTAAATTGTTTCTATATTGAAT 116167358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4069 TACAATTCTATTAAAGTCCCTGTCACTTTGTTTGCTATTTAAATTGTTTCTATATTGAAT 4128

116167359 CAAGTTCCTTTTATTAATTAAATATAAATTATATTCAGTGGTAATTAAATATTTCAATTA 116167418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4129 CAAGTTCCTTTTATTAATTAAATATAAATTATATTCAGTGGTAATTAAATATTTCAATTA 4188

116167419 TTAATGCTTAGATTTTAACTTTTTTCATCTTTTACATGAGAAAATGACTTGTTTTATAAA 116167478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4189 TTAATGCTTAGATTTTAACTTTTTTCATCTTTTACATGAGAAAATGACTTGTTTTATAAA 4248

116167479 GTTCAAGATTTAGCAATTATTTGTAAACTGTTACTAAATATATATTTTAAAAATACTAAA 116167538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4249 GTTCAAGATTTAGCAATTATTTGTAAACTGTTACTAAATATATATTTTAAAAATACTAAA 4308

116167539 TTGTTCTTTCGATTTAATTTGAATTTTTGATTTGGTTAAAAAATCTGAGCAATGCTGATT 116167598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4309 TTGTTCTTTCGATTTAATTTGAATTTTTGATTTGGTTAAAAAATCTGAGCAATGCTGATT 4368

116167599 TATTTTGCCATCCTTCCATTAAGTCAAGTTTTTTTGGTTTTGGTTTTGTTTTCTTAAAAG 116167658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4369 TATTTTGCCATCCTTCCATTAAGTCAAGTTTTTTTGGTTTTGGTTTTGTTTTCTTAAAAG 4428

116167659 ATGGCTCCTACAAGATAAGACATTTCTTACATGGCCTAATCTGAAGTAAAAATCGCCAAA 116167718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4429 ATGGCTCCTACAAGATAAGACATTTCTTACATGGCCTAATCTGAAGTAAAAATCGCCAAA 4488

116167719 TTGTATATATCACTTTGAGATATTTTATGGTGTTGCTTGTCACATTGCTAGATAATTAAT 116167778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4489 TTGTATATATCACTTTGAGATATTTTATGGTGTTGCTTGTCACATTGCTAGATAATTAAT 4548

116167779 GCCACTATTTCATCATGTTAAGTTTATAAAACAAATTATTTAACATAGCTG 116167829
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4549 GCCACTATTTCATCATGTTAAGTTTATAAAACAAATTATTTAACATAGCTG 4599

Alignment time is 4.98951 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     2252] =>      2252 nucs 'mol-32-2e15-189200_2252'

Score:        2230
Aligned:      2252        nucs
Identic:      2250 (100%) nucs =>       229 (100%)      2021 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116177146,116177374] EXCISED REGION [116177376,116179398]
 second seq =>  [        1,      229] EXCISED REGION [      231,     2252]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [116177375,116177375]
 second seq =>         1 nucs [230,230]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [116178633,116178633]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116177146 GCGCTTTTATCAAAATTACATATATTATGGAGCTTGAATATAATTTGCAATGCTTCCTTA 116177205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCGCTTTTATCAAAATTACATATATTATGGAGCTTGAATATAATTTGCAATGCTTCCTTA 60

116177206 ATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCATAGGATTCAGTCTAATATGATGTTT 116177265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCATAGGATTCAGTCTAATATGATGTTT 120

116177266 TATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAGTATAACCCACATATTTTATCAGATA 116177325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAGTATAACCCACATATTTTATCAGATA 180

116177326 GCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGATTTTTATTAATAAA 116177374
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGATTTTTATTAATAAA 229

EXCISED REGION

116177376 GAATAAATAATCAATTATATTCAAAGGTTTTATATGAGAATAAAACTGTCTCTCCATATT 116177435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      231 GAATAAATAATCAATTATATTCAAAGGTTTTATATGAGAATAAAACTGTCTCTCCATATT 290

116177436 CTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAATATTCAAAAATAATTA 116177495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      291 CTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAATATTCAAAAATAATTA 350

116177496 AAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGCAGCTAGTGGGTGTCTC 116177555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      351 AAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGCAGCTAGTGGGTGTCTC 410

116177556 CCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTCAAGTAGATCATCTAAG 116177615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      411 CCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTCAAGTAGATCATCTAAG 470

116177616 AGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAAATAGGAGCGTGAAACC 116177675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      471 AGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAAATAGGAGCGTGAAACC 530

116177676 AAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAGCTGGGAGAATCTCCCT 116177735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      531 AAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAGCTGGGAGAATCTCCCT 590

116177736 AATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACAATCAGAAATGATAAAA 116177795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      591 AATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACAATCAGAAATGATAAAA 650

116177796 GTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGAGACTACTATGAGTACC 116177855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      651 GTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGAGACTACTATGAGTACC 710

116177856 TCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTTCTTAAACTATAAAACC 116177915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      711 TCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTTCTTAAACTATAAAACC 770

116177916 TCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAATAACAAGTAGTGAGAC 116177975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 TCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAATAACAAGTAGTGAGAC 830

116177976 TTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACCAAA 116178035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 TTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACCAAA 890

116178036 AAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAAGAACCATGCAGAAGAATAT 116178095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 AAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAAGAACCATGCAGAAGAATAT 950

116178096 GTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCTTCCTCTCTTAACTCGTCAT 116178155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 GTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCTTCCTCTCTTAACTCGTCAT 1010

116178156 CCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAGGACACAACAGAAGTAGAAA 116178215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 CCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAGGACACAACAGAAGTAGAAA 1070

116178216 ACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCAACTAACTACTAGCAAAGTA 116178275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 ACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCAACTAACTACTAGCAAAGTA 1130

116178276 AATACAAGAGCTCAGAAAAACATAATACCTCAAGACCAAGTGGGATTTATCCAGGGATGC 116178335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 AATACAAGAGCTCAGAAAAACATAATACCTCAAGACCAAGTGGGATTTATCCAGGGATGC 1190

116178336 GAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAGCTACAAAATATAAAATACCT 116178395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 GAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAGCTACAAAATATAAAATACCT 1250

116178396 AGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAGGAGAACTACATAAGCACTGA 116178455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 AGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAGGAGAACTACATAAGCACTGA 1310

116178456 TGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGATGCTCATGGATGGGAAGAAT 116178515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 TGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGATGCTCATGGATGGGAAGAAT 1370

116178516 CAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTACAGGTTTAATGCAATTCCTAT 116178575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 CAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTACAGGTTTAATGCAATTCCTAT 1430

116178576 CAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTATAGAATTTATATGAAACCAAA 116178635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
     1431 CAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTATAGAATTTATATGAAACC-AA 1489

116178636 AAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAACAAATTCGGAAGCATCACAT 116178695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 AAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAACAAATTCGGAAGCATCACAT 1549

116178696 TACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAAAAGTCCATGGCACTGATACA 116178755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 TACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAAAAGTCCATGGCACTGATACA 1609

116178756 AAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCAGAAATAAAACCACATACTTG 116178815
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1610 AAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCAGAAATAAAACCACATACCTG 1669

116178816 AAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAATGGAGAAAGGACACTTTATT 116178875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 AAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAATGGAGAAAGGACACTTTATT 1729

116178876 CGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATGAAACTGGGCCACTACCTAAC 116178935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 CGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATGAAACTGGGCCACTACCTAAC 1789

116178936 ACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTAAACGCTAGACCTGAAACTAT 116178995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 ACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTAAACGCTAGACCTGAAACTAT 1849

116178996 GAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCATATTGGCCTAGGCAAAGAAT 116179055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 GAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCATATTGGCCTAGGCAAAGAAT 1909

116179056 TTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATAGAAATATGGGACTTAACTAC 116179115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 TTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATAGAAATATGGGACTTAACTAC 1969

116179116 AAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAACAGGGAGCCTGTGCAATAGG 116179175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 AAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAACAGGGAGCCTGTGCAATAGG 2029

116179176 ATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGTATCCAGAATCTAGAATGAAC 116179235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 ATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGTATCCAGAATCTAGAATGAAC 2089

116179236 TCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGGCAAAAGTCATCAACAGACAT 116179295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 TCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGGCAAAAGTCATCAACAGACAT 2149

116179296 TTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTTAAAAATGCTCAACATTACTA 116179355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 TTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTTAAAAATGCTCAACATTACTA 2209

116179356 ATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACCCAT 116179398
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 ATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACCCAT 2252

Alignment time is 2.4605 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     2545] =>      2545 nucs 'mol-32-2e57-122596_2545'

Score:        2222
Aligned:      2474        nucs
Identic:      2447 ( 99%) nucs =>        67 (100%)      2380 ( 99%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116166841,116166907] EXCISED REGION [116177181,116179582]
 second seq =>  [        1,       67] EXCISED REGION [      144,     2545]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10273 nucs [116166908,116177180]
 second seq =>        76 nucs [68,143]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [68,71] to [144,147]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116166908,116166909] to [116177179,116177180]
 second seq =>         1 nucs [68,68] to [143,143]

116166841 CTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCTACTTGG 116166900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCTACTTGG 60

116166901 TTAATTA 116166907
          |||||||
       61 TTAATTA 67

EXCISED REGION

116177181 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCA 116177240
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
      144 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATATATAATATTGTATATGTTAATTTCCATACCCA 203

116177241 TAGGATTCAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 116177300
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      204 TAGGATTAAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 263

116177301 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 116177360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      264 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 323

116177361 TTTTTATTAATAAACGAATAAATAATCAATTATATTCAAAGG-TTTTATATGAGAATAAA 116177419
          |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||
      324 TTTTTATTAATAAACGAATAAAT----AATTATATTCAAAGGCTTTTATATGAGAATAAA 379

116177420 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 116177479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      380 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 439

116177480 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 116177539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      440 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 499

116177540 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 116177599
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      500 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCACTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 559

116177600 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAA 116177659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
      560 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGATAAACAACAGGAATCATAGAAA 619

116177660 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 116177719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      620 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 679

116177720 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 116177779
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      680 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGTTCCACACA 739

116177780 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 116177839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 799

116177840 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 116177899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 859

116177900 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 116177959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      860 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGGAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 919

116177960 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACC---CAGCAACAACAACAAC 116178016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
      920 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAGCAACAACAACAAC 979

116178017 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 116178076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 1039

116178077 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCT 116178136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
     1040 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATGTAATCGAGAAGTAGGGCT 1099

116178137 TCCTCTCTTAACTCGTCATCCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 116178196
          ||||||| ||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 TCCTCTC-TAACTCCTCATTCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 1158

116178197 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCA 116178256
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
     1159 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAGAATGAAAAAATCCTTA 1218

116178257 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAG-AAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 116178315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1219 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAGTAAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 1278

116178316 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 116178375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1279 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 1338

116178376 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 116178435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1339 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 1398

116178436 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 116178495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1399 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 1458

116178496 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 116178555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1459 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 1518

116178556 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTAT 116178615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1519 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTCT 1578

116178616 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 116178675
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1579 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAAAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 1638

116178676 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAA 116178735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1639 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATGATAAGGCTATAGTGAACAA 1698

116178736 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 116178795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1699 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 1758

116178796 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 116178855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1759 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 1818

116178856 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 116178915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1819 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 1878

116178916 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 116178975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1879 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 1938

116178976 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 116179035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1939 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 1998

116179036 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 116179095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1999 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 2058

116179096 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 116179155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2059 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 2118

116179156 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 116179215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2119 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 2178

116179216 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 116179275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2179 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 2238

116179276 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 116179335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2239 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 2298

116179336 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 116179395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2299 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 2358

116179396 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTG 116179455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2359 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTG 2418

116179456 AGGATGCAGAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCT 116179515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2419 AGGATGCAGAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCT 2478

116179516 ATGGAAATCATATAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAA 116179575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2479 ATGGAAATCATATAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAA 2538

116179576 ATTATAC 116179582
          |||||||
     2539 ATTATAC 2545

Alignment time is 2.81781 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     2371] =>      2371 nucs 'mol-32-2edb-174767_2371'

Score:        2048
Aligned:      2300        nucs
Identic:      2273 ( 99%) nucs =>        70 (100%)      2203 ( 99%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116166838,116166907] EXCISED REGION [116177181,116179405]
 second seq =>  [        1,       70] EXCISED REGION [      147,     2371]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10273 nucs [116166908,116177180]
 second seq =>        76 nucs [71,146]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [71,74] to [147,150]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116166908,116166909] to [116177179,116177180]
 second seq =>         1 nucs [71,71] to [146,146]

116166838 ACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCTACT 116166897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCTACT 60

116166898 TGGTTAATTA 116166907
          ||||||||||
       61 TGGTTAATTA 70

EXCISED REGION

116177181 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCA 116177240
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
      147 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATATATAATATTGTATATGTTAATTTCCATACCCA 206

116177241 TAGGATTCAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 116177300
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      207 TAGGATTAAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 266

116177301 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 116177360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      267 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 326

116177361 TTTTTATTAATAAACGAATAAATAATCAATTATATTCAAAGG-TTTTATATGAGAATAAA 116177419
          |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||
      327 TTTTTATTAATAAACGAATAAAT----AATTATATTCAAAGGCTTTTATATGAGAATAAA 382

116177420 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 116177479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      383 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 442

116177480 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 116177539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      443 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 502

116177540 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 116177599
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      503 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCACTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 562

116177600 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAA 116177659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
      563 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGATAAACAACAGGAATCATAGAAA 622

116177660 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 116177719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      623 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 682

116177720 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 116177779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 742

116177780 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 116177839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      743 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 802

116177840 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 116177899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      803 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 862

116177900 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 116177959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      863 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGGAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 922

116177960 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACC---CAGCAACAACAACAAC 116178016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
      923 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAGCAACAACAACAAC 982

116178017 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 116178076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      983 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 1042

116178077 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCT 116178136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
     1043 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATGTAATCGAGAAGTAGGGCT 1102

116178137 TCCTCTCTTAACTCGTCATCCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 116178196
          ||||||| ||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1103 TCCTCTC-TAACTCCTCATTCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 1161

116178197 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCA 116178256
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
     1162 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAGAATGAAAAAATCCTTA 1221

116178257 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAG-AAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 116178315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1222 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAGTAAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 1281

116178316 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 116178375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1282 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 1341

116178376 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 116178435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1342 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 1401

116178436 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 116178495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1402 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 1461

116178496 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 116178555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1462 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 1521

116178556 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTAT 116178615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1522 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTCT 1581

116178616 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 116178675
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1582 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAAAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 1641

116178676 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAA 116178735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1642 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATGATAAGGCTATAGTGAACAA 1701

116178736 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 116178795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 1761

116178796 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 116178855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 1821

116178856 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 116178915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 1881

116178916 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 116178975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 1941

116178976 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 116179035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 2001

116179036 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 116179095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 2061

116179096 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 116179155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 2121

116179156 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 116179215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 2181

116179216 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 116179275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 2241

116179276 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 116179335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 2301

116179336 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 116179395
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2302 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATGCC 2361

116179396 CATCATTTTA 116179405
          ||||||||||
     2362 CATCATTTTA 2371

Alignment time is 2.61715 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     2354] =>      2354 nucs 'mol-32-2ef1-098823_2354'

Score:        2042
Aligned:      2283        nucs
Identic:      2257 ( 99%) nucs =>        60 (100%)      2197 ( 99%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116166848,116166907] EXCISED REGION [116177181,116179398]
 second seq =>  [        1,       60] EXCISED REGION [      137,     2354]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10273 nucs [116166908,116177180]
 second seq =>        76 nucs [61,136]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [61,64] to [137,140]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116166908,116166909] to [116177179,116177180]
 second seq =>         1 nucs [61,61] to [136,136]

116166848 AGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCTACTTGGTTAATTA 116166907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCTACTTGGTTAATTA 60

EXCISED REGION

116177181 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCA 116177240
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
      137 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATATATAATATTGTATATGTTAATTTCCATACCCA 196

116177241 TAGGATTCAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 116177300
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      197 TAGGATTAAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 256

116177301 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 116177360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      257 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 316

116177361 TTTTTATTAATAAACGAATAAATAATCAATTATATTCAAAGG-TTTTATATGAGAATAAA 116177419
          |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||
      317 TTTTTATTAATAAACGAATAAAT----AATTATATTCAAAGGCTTTTATATGAGAATAAA 372

116177420 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 116177479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      373 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 432

116177480 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 116177539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      433 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 492

116177540 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 116177599
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      493 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCACTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 552

116177600 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAA 116177659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
      553 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGATAAACAACAGGAATCATAGAAA 612

116177660 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 116177719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      613 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 672

116177720 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 116177779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      673 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 732

116177780 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 116177839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      733 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 792

116177840 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 116177899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      793 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 852

116177900 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 116177959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      853 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGGAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 912

116177960 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACC---CAGCAACAACAACAAC 116178016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
      913 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAGCAACAACAACAAC 972

116178017 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 116178076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      973 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 1032

116178077 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCT 116178136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
     1033 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATGTAATCGAGAAGTAGGGCT 1092

116178137 TCCTCTCTTAACTCGTCATCCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 116178196
          ||||||| ||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 TCCTCTC-TAACTCCTCATTCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 1151

116178197 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCA 116178256
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
     1152 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAGAATGAAAAAATCCTTA 1211

116178257 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAG-AAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 116178315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1212 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAGTAAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 1271

116178316 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 116178375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 1331

116178376 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 116178435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 1391

116178436 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 116178495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 1451

116178496 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 116178555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 1511

116178556 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTAT 116178615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1512 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTCT 1571

116178616 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 116178675
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAAAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 1631

116178676 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAA 116178735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1632 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATGATAAGGCTATAGTGAACAA 1691

116178736 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 116178795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 1751

116178796 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 116178855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 1811

116178856 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 116178915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 1871

116178916 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 116178975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 1931

116178976 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 116179035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 1991

116179036 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 116179095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 2051

116179096 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 116179155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 2111

116179156 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 116179215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 2171

116179216 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 116179275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 2231

116179276 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 116179335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 2291

116179336 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 116179395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 2351

116179396 CAT 116179398
          |||
     2352 CAT 2354

Alignment time is 2.58638 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     4396] =>      4396 nucs 'mol-32-2efc-011094_4396'

Score:        4374
Aligned:      4396        nucs
Identic:      4394 (100%) nucs =>       304 (100%)      4090 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116175440,116175743] EXCISED REGION [116175745,116179835]
 second seq =>  [        1,      304] EXCISED REGION [      305,     4396]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [116175744,116175744]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3988,3988]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        18 nucs [116175744,116175761] to [116175745,116175762]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116175440 ATCAAGCTGTACATCTTAAACATATACCATTTTTCTTTGTCAATTATATTTCAATAATGC 116175499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCAAGCTGTACATCTTAAACATATACCATTTTTCTTTGTCAATTATATTTCAATAATGC 60

116175500 CAAATAATAATGTTCCCTTAGATGTTGGTGTTTCCAATTTCATTTTGATTTATCTGCATG 116175559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAATAATAATGTTCCCTTAGATGTTGGTGTTTCCAATTTCATTTTGATTTATCTGCATG 120

116175560 TGGGTTTTTTTATTCATCTTATTTGGTATATACTGCATTTCTTGTGCCTGTTGTTTTAGA 116175619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGGTTTTTTTATTCATCTTATTTGGTATATACTGCATTTCTTGTGCCTGTTGTTTTAGA 180

116175620 TCTTTCATCCGTTTTGAATAATTTTATTATTTCTCAAATATTGCTTCTCTTCTTTCAAGG 116175679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTTCATCCGTTTTGAATAATTTTATTATTTCTCAAATATTGCTTCTCTTCTTTCAAGG 240

116175680 CTCCACTTCTAAAATGTGGATGAATTACATGTATTTAGAATTTCCTATTCTTTTTCTTTC 116175739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCCACTTCTAAAATGTGGATGAATTACATGTATTTAGAATTTCCTATTCTTTTTCTTTC 300

116175740 TTTC 116175743
          ||||
      301 TTTC 304

EXCISED REGION

116175745 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCG 116175804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      305 TTTTTTTTTTTTTTTTTTGATGGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCG 364

116175805 CGATCTGGGCTCACTGCAAGCTCCATGTCTCTAAACCTCTTTTTTTCTATCGTATTTATC 116175864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      365 CGATCTGGGCTCACTGCAAGCTCCATGTCTCTAAACCTCTTTTTTTCTATCGTATTTATC 424

116175865 TCTCTGAAGTTCATTTTTTAATTAGGTTTCTCAGAATTTTCTTTCAATTGAGTTACTCCT 116175924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      425 TCTCTGAAGTTCATTTTTTAATTAGGTTTCTCAGAATTTTCTTTCAATTGAGTTACTCCT 484

116175925 TTTTAGTTATACCTACTGTGTGCTTACTCCATATTTTTAGTGTTTTTCAACTTACAGTTT 116175984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      485 TTTTAGTTATACCTACTGTGTGCTTACTCCATATTTTTAGTGTTTTTCAACTTACAGTTT 544

116175985 TAACTTAAAATCTTCCATTAAAAATGCCTATTGCTTACTTATTTATGAAATTCTATTTTC 116176044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      545 TAACTTAAAATCTTCCATTAAAAATGCCTATTGCTTACTTATTTATGAAATTCTATTTTC 604

116176045 TATTCTTTAAATATCCACTCATAGGAATACATATATACACATTTCAGATAATTTTAATAT 116176104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      605 TATTCTTTAAATATCCACTCATAGGAATACATATATACACATTTCAGATAATTTTAATAT 664

116176105 CTGAATTACTGAGTAGTCTAAACCTGTTTTTTGTTGAATTAATTCTCATTCATGACATTT 116176164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      665 CTGAATTACTGAGTAGTCTAAACCTGTTTTTTGTTGAATTAATTCTCATTCATGACATTT 724

116176165 GGTTTGATTGAATATTAGCTAATTTTTTATATTGAGTCACATGTGATTGATCACAAATTC 116176224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      725 GGTTTGATTGAATATTAGCTAATTTTTTATATTGAGTCACATGTGATTGATCACAAATTC 784

116176225 TGGAAACTGTGGATGCTAAACTGAATCTGTTTTTCACAGGAGATTTGCTCTTGCCTCTCT 116176284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      785 TGGAAACTGTGGATGCTAAACTGAATCTGTTTTTCACAGGAGATTTGCTCTTGCCTCTCT 844

116176285 GTGATATCAAGTCCAATGAGGATTTCTGATATCTAGCTTCCCACCTTGCTACCAGCAATA 116176344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      845 GTGATATCAAGTCCAATGAGGATTTCTGATATCTAGCTTCCCACCTTGCTACCAGCAATA 904

116176345 CCCTTAGAGCAACCCTTGCTTTTCTATTTGTTCACTGCTCACCAGTCTAGTTAAGATCAC 116176404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      905 CCCTTAGAGCAACCCTTGCTTTTCTATTTGTTCACTGCTCACCAGTCTAGTTAAGATCAC 964

116176405 TTCTTATTGGCCCCATGGAGTTTTCTCTTCTTTGCTGTGAGCCTAAATTACAATGGCCGC 116176464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      965 TTCTTATTGGCCCCATGGAGTTTTCTCTTCTTTGCTGTGAGCCTAAATTACAATGGCCGC 1024

116176465 TTCCTGCAAAAGCTGCAGCATGAGGATTCCTTACAGTATCTAGCCCCAAATGCTATATTT 116176524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1025 TTCCTGCAAAAGCTGCAGCATGAGGATTCCTTACAGTATCTAGCCCCAAATGCTATATTT 1084

116176525 TTTACTTTCACAGTTTGCTTTTAATCAAGGAGTTGATAGATGGAAGTTTTGAGAATTGTT 116176584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1085 TTTACTTTCACAGTTTGCTTTTAATCAAGGAGTTGATAGATGGAAGTTTTGAGAATTGTT 1144

116176585 TAAATTCATCTATATAATGTTAATTATTTGATATTTTAATTAGCAAATATGTATGTATAT 116176644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1145 TAAATTCATCTATATAATGTTAATTATTTGATATTTTAATTAGCAAATATGTATGTATAT 1204

116176645 GTTTTCATAAAGTTATATGGCCTTTTCATTAAATAAGATATAACAGATGTATAATGATAA 116176704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1205 GTTTTCATAAAGTTATATGGCCTTTTCATTAAATAAGATATAACAGATGTATAATGATAA 1264

116176705 AAAACACAGAATAGTAGTTATTTCTTCACTGTCATAATATTTCCTAAAATTTAATTTCTG 116176764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1265 AAAACACAGAATAGTAGTTATTTCTTCACTGTCATAATATTTCCTAAAATTTAATTTCTG 1324

116176765 AATCCATGATGTAGAAAATTTCTTTTCTTTTACCCCCATATACGCCTGATTAAAATTTAT 116176824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1325 AATCCATGATGTAGAAAATTTCTTTTCTTTTACCCCCATATACGCCTGATTAAAATTTAT 1384

116176825 TATATTTGTTGTTTTAATAAAATAAGGCACTAAATTTCTAACAAATGCTTTGGAGAGTAT 116176884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1385 TATATTTGTTGTTTTAATAAAATAAGGCACTAAATTTCTAACAAATGCTTTGGAGAGTAT 1444

116176885 TTATATAATAAGCAAGTCTTCTATCATATACTCCTTTGGTGAATGCAAGAATTTTTTTAT 116176944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1445 TTATATAATAAGCAAGTCTTCTATCATATACTCCTTTGGTGAATGCAAGAATTTTTTTAT 1504

116176945 TGGAGGTCATCAGCATCAGCCAAAAAAATCAATTCAAATCAAATCAAAGTGTAGCTGCTC 116177004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1505 TGGAGGTCATCAGCATCAGCCAAAAAAATCAATTCAAATCAAATCAAAGTGTAGCTGCTC 1564

116177005 ACATTTCAAAATTTTAATATGATTAATATACTTACATTAGGTTTACTCTTAATATATAAT 116177064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1565 ACATTTCAAAATTTTAATATGATTAATATACTTACATTAGGTTTACTCTTAATATATAAT 1624

116177065 TTAAATCTTTAAACAATATGTAGATAAATTTTAATACACAATTTTTACTTATACTTTTAT 116177124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1625 TTAAATCTTTAAACAATATGTAGATAAATTTTAATACACAATTTTTACTTATACTTTTAT 1684

116177125 CAAAATTACATATATTATGGAGCGCTTTTATCAAAATTACATATATTATGGAGCTTGAAT 116177184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1685 CAAAATTACATATATTATGGAGCGCTTTTATCAAAATTACATATATTATGGAGCTTGAAT 1744

116177185 ATAATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCATAGG 116177244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1745 ATAATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCATAGG 1804

116177245 ATTCAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAGTATA 116177304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1805 ATTCAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAGTATA 1864

116177305 ACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGATTTT 116177364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1865 ACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGATTTT 1924

116177365 TATTAATAAACGAATAAATAATCAATTATATTCAAAGGTTTTATATGAGAATAAAACTGT 116177424
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1925 TATTAATAAATGAATAAATAATCAATTATATTCAAAGGTTTTATATGAGAATAAAACTGT 1984

116177425 CTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAATATTC 116177484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1985 CTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAATATTC 2044

116177485 AAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGCAGCTA 116177544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2045 AAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGCAGCTA 2104

116177545 GTGGGTGTCTCCCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTCAAGTA 116177604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2105 GTGGGTGTCTCCCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTCAAGTA 2164

116177605 GATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAAATAGG 116177664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2165 GATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAAATAGG 2224

116177665 AGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAGCTGGG 116177724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2225 AGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAGCTGGG 2284

116177725 AGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACAATCAG 116177784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2285 AGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACAATCAG 2344

116177785 AAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGAGACTA 116177844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2345 AAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGAGACTA 2404

116177845 CTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTTCTTAA 116177904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2405 CTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTTCTTAA 2464

116177905 ACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAATAACA 116177964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2465 ACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAATAACA 2524

116177965 AGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAACAACAACAACAACAACAA 116178024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2525 AGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAACAACAACAACAACAACAA 2584

116178025 CAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAAGAACCATG 116178084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2585 CAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAAGAACCATG 2644

116178085 CAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCTTCCTCTCT 116178144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2645 CAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCTTCCTCTCT 2704

116178145 TAACTCGTCATCCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAGGACACAAC 116178204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2705 TAACTCGTCATCCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAGGACACAAC 2764

116178205 AGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCAACTAACTA 116178264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2765 AGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCAACTAACTA 2824

116178265 CTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAGAAAAACATAATACCTCAAGACCAAGTGGGATTTA 116178324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2825 CTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAGAAAAACATAATACCTCAAGACCAAGTGGGATTTA 2884

116178325 TCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAGCTACAAAAT 116178384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2885 TCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAGCTACAAAAT 2944

116178385 ATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAGGAGAACTAC 116178444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2945 ATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAGGAGAACTAC 3004

116178445 ATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGATGCTCATGG 116178504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3005 ATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGATGCTCATGG 3064

116178505 ATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTACAGGTTTAAT 116178564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3065 ATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTACAGGTTTAAT 3124

116178565 GCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTATAGAATTTAT 116178624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3125 GCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTATAGAATTTAT 3184

116178625 ATGAAACCAAAAAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAACAAATTCGG 116178684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3185 ATGAAACCAAAAAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAACAAATTCGG 3244

116178685 AAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAAAAGTCCATG 116178744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3245 AAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAAAAGTCCATG 3304

116178745 GCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCAGAAATAAAA 116178804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3305 GCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCAGAAATAAAA 3364

116178805 CCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAATGGAGAAAG 116178864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3365 CCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAATGGAGAAAG 3424

116178865 GACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATGAAACTGGGC 116178924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3425 GACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATGAAACTGGGC 3484

116178925 CACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTAAACGCTAGA 116178984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3485 CACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTAAACGCTAGA 3544

116178985 CCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCATATTGGCCT 116179044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3545 CCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCATATTGGCCT 3604

116179045 AGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATAGAAATATGG 116179104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3605 AGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATAGAAATATGG 3664

116179105 GACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAACAGGGAGCC 116179164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3665 GACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAACAGGGAGCC 3724

116179165 TGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGTATCCAGAAT 116179224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3725 TGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGTATCCAGAAT 3784

116179225 CTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGGCAAAAGTCA 116179284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3785 CTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGGCAAAAGTCA 3844

116179285 TCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTTAAAAATGCT 116179344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3845 TCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTTAAAAATGCT 3904

116179345 CAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACCCATCATTTT 116179404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3905 CAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACCCATCATTTT 3964

116179405 ACACCAGTCAGATGGCTATTTAT-AAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTGAGGATGCA 116179463
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3965 ACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTGAGGATGCA 4024

116179464 GAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCTATGGAAAT 116179523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4025 GAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCTATGGAAAT 4084

116179524 CATATAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAAATTATACT 116179583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4085 CATATAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAAATTATACT 4144

116179584 GCTGAGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAATCAATATATTAAAAAAGACACCTGTACTTGTG 116179643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4145 GCTGAGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAATCAATATATTAAAAAAGACACCTGTACTTGTG 4204

116179644 TGTTTATCACAGCACTATTCACAATAGCCAAGATACGGTATCAACCTTGATGTTCATCAA 116179703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4205 TGTTTATCACAGCACTATTCACAATAGCCAAGATACGGTATCAACCTTGATGTTCATCAA 4264

116179704 TGAATGAATGGATTAAGAAAATGTGTTTTATATATATACATAATAGAATACTATGCAGCT 116179763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4265 TGAATGAATGGATTAAGAAAATGTGTTTTATATATATACATAATAGAATACTATGCAGCT 4324

116179764 GTAAAACAGAATGAATCATATATTTTGCAGCAACATGGATGGAGCTAAGGCTATTATTTT 116179823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 GTAAAACAGAATGAATCATATATTTTGCAGCAACATGGATGGAGCTAAGGCTATTATTTT 4384

116179824 AAGTGAAATACC 116179835
          ||||||||||||
     4385 AAGTGAAATACC 4396

Alignment time is 4.72687 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     2606] =>      2606 nucs 'mol-32-2f12-048317_2606'

Score:        2283
Aligned:      2535        nucs
Identic:      2508 ( 99%) nucs =>       128 (100%)      2380 ( 99%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116166780,116166907] EXCISED REGION [116177181,116179582]
 second seq =>  [        1,      128] EXCISED REGION [      205,     2606]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10273 nucs [116166908,116177180]
 second seq =>        76 nucs [129,204]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [129,132] to [205,208]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116166908,116166909] to [116177179,116177180]
 second seq =>         1 nucs [129,129] to [204,204]

116166780 AGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATATTGAATCTATATTATATGAC 116166839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATATTGAATCTATATTATATGAC 60

116166840 TCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCTACTTG 116166899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCTACTTG 120

116166900 GTTAATTA 116166907
          ||||||||
      121 GTTAATTA 128

EXCISED REGION

116177181 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCA 116177240
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
      205 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATATATAATATTGTATATGTTAATTTCCATACCCA 264

116177241 TAGGATTCAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 116177300
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      265 TAGGATTAAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 324

116177301 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 116177360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      325 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 384

116177361 TTTTTATTAATAAACGAATAAATAATCAATTATATTCAAAGG-TTTTATATGAGAATAAA 116177419
          |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||
      385 TTTTTATTAATAAACGAATAAAT----AATTATATTCAAAGGCTTTTATATGAGAATAAA 440

116177420 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 116177479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      441 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 500

116177480 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 116177539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      501 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 560

116177540 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 116177599
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      561 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCACTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 620

116177600 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAA 116177659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
      621 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGATAAACAACAGGAATCATAGAAA 680

116177660 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 116177719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      681 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 740

116177720 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 116177779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      741 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 800

116177780 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 116177839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      801 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 860

116177840 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 116177899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      861 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 920

116177900 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 116177959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      921 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGGAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 980

116177960 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACC---CAGCAACAACAACAAC 116178016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
      981 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAGCAACAACAACAAC 1040

116178017 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 116178076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1041 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 1100

116178077 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCT 116178136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
     1101 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATGTAATCGAGAAGTAGGGCT 1160

116178137 TCCTCTCTTAACTCGTCATCCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 116178196
          ||||||| ||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1161 TCCTCTC-TAACTCCTCATTCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 1219

116178197 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCA 116178256
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
     1220 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAGAATGAAAAAATCCTTA 1279

116178257 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAG-AAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 116178315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1280 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAGTAAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 1339

116178316 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 116178375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 1399

116178376 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 116178435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 1459

116178436 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 116178495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 1519

116178496 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 116178555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 1579

116178556 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTAT 116178615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1580 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTCT 1639

116178616 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 116178675
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAAAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 1699

116178676 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAA 116178735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1700 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATGATAAGGCTATAGTGAACAA 1759

116178736 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 116178795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 1819

116178796 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 116178855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 1879

116178856 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 116178915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 1939

116178916 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 116178975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 1999

116178976 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 116179035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 2059

116179036 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 116179095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 2119

116179096 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 116179155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 2179

116179156 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 116179215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 2239

116179216 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 116179275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 2299

116179276 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 116179335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 2359

116179336 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 116179395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 2419

116179396 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTG 116179455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTG 2479

116179456 AGGATGCAGAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCT 116179515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 AGGATGCAGAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCT 2539

116179516 ATGGAAATCATATAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAA 116179575
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 ATGGAAATCATGTAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAA 2599

116179576 ATTATAC 116179582
          |||||||
     2600 ATTATAC 2606

Alignment time is 3.14214 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     3569] =>      3569 nucs 'mol-32-2fb7-045472_3569'

Score:        3557
Aligned:      3568        nucs
Identic:      3567 (100%) nucs =>      1138 (100%)      2429 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116176237,116177374] EXCISED REGION [116177376,116179804]
 second seq =>  [        1,     1138] EXCISED REGION [     1140,     3569]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [116177375,116177375]
 second seq =>         1 nucs [1139,1139]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3192,3192]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

116176237 ATGCTAAACTGAATCTGTTTTTCACAGGAGATTTGCTCTTGCCTCTCTGTGATATCAAGT 116176296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGCTAAACTGAATCTGTTTTTCACAGGAGATTTGCTCTTGCCTCTCTGTGATATCAAGT 60

116176297 CCAATGAGGATTTCTGATATCTAGCTTCCCACCTTGCTACCAGCAATACCCTTAGAGCAA 116176356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCAATGAGGATTTCTGATATCTAGCTTCCCACCTTGCTACCAGCAATACCCTTAGAGCAA 120

116176357 CCCTTGCTTTTCTATTTGTTCACTGCTCACCAGTCTAGTTAAGATCACTTCTTATTGGCC 116176416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCTTGCTTTTCTATTTGTTCACTGCTCACCAGTCTAGTTAAGATCACTTCTTATTGGCC 180

116176417 CCATGGAGTTTTCTCTTCTTTGCTGTGAGCCTAAATTACAATGGCCGCTTCCTGCAAAAG 116176476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCATGGAGTTTTCTCTTCTTTGCTGTGAGCCTAAATTACAATGGCCGCTTCCTGCAAAAG 240

116176477 CTGCAGCATGAGGATTCCTTACAGTATCTAGCCCCAAATGCTATATTTTTTACTTTCACA 116176536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGCAGCATGAGGATTCCTTACAGTATCTAGCCCCAAATGCTATATTTTTTACTTTCACA 300

116176537 GTTTGCTTTTAATCAAGGAGTTGATAGATGGAAGTTTTGAGAATTGTTTAAATTCATCTA 116176596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTTGCTTTTAATCAAGGAGTTGATAGATGGAAGTTTTGAGAATTGTTTAAATTCATCTA 360

116176597 TATAATGTTAATTATTTGATATTTTAATTAGCAAATATGTATGTATATGTTTTCATAAAG 116176656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATAATGTTAATTATTTGATATTTTAATTAGCAAATATGTATGTATATGTTTTCATAAAG 420

116176657 TTATATGGCCTTTTCATTAAATAAGATATAACAGATGTATAATGATAAAAAACACAGAAT 116176716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATATGGCCTTTTCATTAAATAAGATATAACAGATGTATAATGATAAAAAACACAGAAT 480

116176717 AGTAGTTATTTCTTCACTGTCATAATATTTCCTAAAATTTAATTTCTGAATCCATGATGT 116176776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTAGTTATTTCTTCACTGTCATAATATTTCCTAAAATTTAATTTCTGAATCCATGATGT 540

116176777 AGAAAATTTCTTTTCTTTTACCCCCATATACGCCTGATTAAAATTTATTATATTTGTTGT 116176836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAAAATTTCTTTTCTTTTACCCCCATATACGCCTGATTAAAATTTATTATATTTGTTGT 600

116176837 TTTAATAAAATAAGGCACTAAATTTCTAACAAATGCTTTGGAGAGTATTTATATAATAAG 116176896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTAATAAAATAAGGCACTAAATTTCTAACAAATGCTTTGGAGAGTATTTATATAATAAG 660

116176897 CAAGTCTTCTATCATATACTCCTTTGGTGAATGCAAGAATTTTTTTATTGGAGGTCATCA 116176956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAAGTCTTCTATCATATACTCCTTTGGTGAATGCAAGAATTTTTTTATTGGAGGTCATCA 720

116176957 GCATCAGCCAAAAAAATCAATTCAAATCAAATCAAAGTGTAGCTGCTCACATTTCAAAAT 116177016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCATCAGCCAAAAAAATCAATTCAAATCAAATCAAAGTGTAGCTGCTCACATTTCAAAAT 780

116177017 TTTAATATGATTAATATACTTACATTAGGTTTACTCTTAATATATAATTTAAATCTTTAA 116177076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTAATATGATTAATATACTTACATTAGGTTTACTCTTAATATATAATTTAAATCTTTAA 840

116177077 ACAATATGTAGATAAATTTTAATACACAATTTTTACTTATACTTTTATCAAAATTACATA 116177136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAATATGTAGATAAATTTTAATACACAATTTTTACTTATACTTTTATCAAAATTACATA 900

116177137 TATTATGGAGCGCTTTTATCAAAATTACATATATTATGGAGCTTGAATATAATTTGCAAT 116177196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTATGGAGCGCTTTTATCAAAATTACATATATTATGGAGCTTGAATATAATTTGCAAT 960

116177197 GCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCATAGGATTCAGTCTAAT 116177256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCATAGGATTCAGTCTAAT 1020

116177257 ATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAGTATAACCCACATATTT 116177316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAGTATAACCCACATATTT 1080

116177317 TATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGATTTTTATTAATAAA 116177374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGATTTTTATTAATAAA 1138

EXCISED REGION

116177376 GAATAAATAATCAATTATATTCAAAGGTTTTATATGAGAATAAAACTGTCTCTCCATATT 116177435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GAATAAATAATCAATTATATTCAAAGGTTTTATATGAGAATAAAACTGTCTCTCCATATT 1199

116177436 CTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAATATTCAAAAATAATTA 116177495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAATATTCAAAAATAATTA 1259

116177496 AAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGCAGCTAGTGGGTGTCTC 116177555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 AAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGCAGCTAGTGGGTGTCTC 1319

116177556 CCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTCAAGTAGATCATCTAAG 116177615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTCAAGTAGATCATCTAAG 1379

116177616 AGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAAATAGGAGCGTGAAACC 116177675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 AGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAAATAGGAGCGTGAAACC 1439

116177676 AAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAGCTGGGAGAATCTCCCT 116177735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 AAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAGCTGGGAGAATCTCCCT 1499

116177736 AATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACAATCAGAAATGATAAAA 116177795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 AATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACAATCAGAAATGATAAAA 1559

116177796 GTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGAGACTACTATGAGTACC 116177855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGAGACTACTATGAGTACC 1619

116177856 TCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTTCTTAAACTATAAAACC 116177915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTTCTTAAACTATAAAACC 1679

116177916 TCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAATAACAAGTAGTGAGAC 116177975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAATAACAAGTAGTGAGAC 1739

116177976 TTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACCAAA 116178035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAACAACAACAACAACAACAACAACAACCAAA 1799

116178036 AAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAAGAACCATGCAGAAGAATAT 116178095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAAGAACCATGCAGAAGAATAT 1859

116178096 GTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCTTCCTCTCTTAACTCGTCAT 116178155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCTTCCTCTCTTAACTCGTCAT 1919

116178156 CCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAGGACACAACAGAAGTAGAAA 116178215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAGGACACAACAGAAGTAGAAA 1979

116178216 ACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCAACTAACTACTAGCAAAGTA 116178275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCAACTAACTACTAGCAAAGTA 2039

116178276 AATACAAGAGCTCAGAAAAACATAATACCTCAAGACCAAGTGGGATTTATCCAGGGATGC 116178335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AATACAAGAGCTCAGAAAAACATAATACCTCAAGACCAAGTGGGATTTATCCAGGGATGC 2099

116178336 GAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAGCTACAAAATATAAAATACCT 116178395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAGCTACAAAATATAAAATACCT 2159

116178396 AGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAGGAGAACTACATAAGCACTGA 116178455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 AGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAGGAGAACTACATAAGCACTGA 2219

116178456 TGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGATGCTCATGGATGGGAAGAAT 116178515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGATGCTCATGGATGGGAAGAAT 2279

116178516 CAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTACAGGTTTAATGCAATTCCTAT 116178575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTACAGGTTTAATGCAATTCCTAT 2339

116178576 CAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTATAGAATTTATATGAAACCAAA 116178635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTATAGAATTTATATGAAACCAAA 2399

116178636 AAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAACAAATTCGGAAGCATCACAT 116178695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 AAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAACAAATTCGGAAGCATCACAT 2459

116178696 TACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAAAAGTCCATGGCACTGATACA 116178755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAAAAGTCCATGGCACTGATACA 2519

116178756 AAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCAGAAATAAAACCACATACTTG 116178815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCAGAAATAAAACCACATACTTG 2579

116178816 AAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAATGGAGAAAGGACACTTTATT 116178875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 AAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAATGGAGAAAGGACACTTTATT 2639

116178876 CGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATGAAACTGGGCCACTACCTAAC 116178935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATGAAACTGGGCCACTACCTAAC 2699

116178936 ACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTAAACGCTAGACCTGAAACTAT 116178995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTAAACGCTAGACCTGAAACTAT 2759

116178996 GAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCATATTGGCCTAGGCAAAGAAT 116179055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 GAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCATATTGGCCTAGGCAAAGAAT 2819

116179056 TTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATAGAAATATGGGACTTAACTAC 116179115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATAGAAATATGGGACTTAACTAC 2879

116179116 AAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAACAGGGAGCCTGTGCAATAGG 116179175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 AAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAACAGGGAGCCTGTGCAATAGG 2939

116179176 ATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGTATCCAGAATCTAGAATGAAC 116179235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 ATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGTATCCAGAATCTAGAATGAAC 2999

116179236 TCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGGCAAAAGTCATCAACAGACAT 116179295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 TCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGGCAAAAGTCATCAACAGACAT 3059

116179296 TTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTTAAAAATGCTCAACATTACTA 116179355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTTAAAAATGCTCAACATTACTA 3119

116179356 ATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACCCATCATTTTACACCAGTCAG 116179415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 ATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACCCATCATTTTACACCAGTCAG 3179

116179416 ATGGCTATTTAT-AAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTGAGGATGCAGAAAAAAGGGA 116179474
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 ATGGCTATTTATAAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTGAGGATGCAGAAAAAAGGGA 3239

116179475 ATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCTATGGAAATCATATAGAGAT 116179534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 ATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCTATGGAAATCATATAGAGAT 3299

116179535 TTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAAATTATACTGCTGAGTATCT 116179594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAAATTATACTGCTGAGTATCT 3359

116179595 ACCCAAAGGAAAAGAAATCAATATATTAAAAAAGACACCTGTACTTGTGTGTTTATCACA 116179654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 ACCCAAAGGAAAAGAAATCAATATATTAAAAAAGACACCTGTACTTGTGTGTTTATCACA 3419

116179655 GCACTATTCACAATAGCCAAGATACGGTATCAACCTTGATGTTCATCAATGAATGAATGG 116179714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 GCACTATTCACAATAGCCAAGATACGGTATCAACCTTGATGTTCATCAATGAATGAATGG 3479

116179715 ATTAAGAAAATGTGTTTTATATATATACATAATAGAATACTATGCAGCTGTAAAACAGAA 116179774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 ATTAAGAAAATGTGTTTTATATATATACATAATAGAATACTATGCAGCTGTAAAACAGAA 3539

116179775 TGAATCATATATTTTGCAGCAACATGGATG 116179804
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TGAATCATATATTTTGCAGCAACATGGATG 3569

Alignment time is 3.86187 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     2602] =>      2602 nucs 'mol-32-2fee-119831_2602'

Score:        2290
Aligned:      2531        nucs
Identic:      2505 ( 99%) nucs =>        65 (100%)      2440 ( 99%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116166843,116166907] EXCISED REGION [116177181,116179641]
 second seq =>  [        1,       65] EXCISED REGION [      142,     2602]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10273 nucs [116166908,116177180]
 second seq =>        76 nucs [66,141]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [66,69] to [142,145]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116166908,116166909] to [116177179,116177180]
 second seq =>         1 nucs [66,66] to [141,141]

116166843 ATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCTACTTGGTT 116166902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCTACTTGGTT 60

116166903 AATTA 116166907
          |||||
       61 AATTA 65

EXCISED REGION

116177181 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCA 116177240
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
      142 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATATATAATATTGTATATGTTAATTTCCATACCCA 201

116177241 TAGGATTCAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 116177300
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      202 TAGGATTAAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 261

116177301 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 116177360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      262 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 321

116177361 TTTTTATTAATAAACGAATAAATAATCAATTATATTCAAAGG-TTTTATATGAGAATAAA 116177419
          |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||
      322 TTTTTATTAATAAACGAATAAAT----AATTATATTCAAAGGCTTTTATATGAGAATAAA 377

116177420 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 116177479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      378 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 437

116177480 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 116177539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      438 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 497

116177540 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 116177599
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      498 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCACTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 557

116177600 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAA 116177659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
      558 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGATAAACAACAGGAATCATAGAAA 617

116177660 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 116177719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      618 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 677

116177720 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 116177779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      678 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 737

116177780 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 116177839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      738 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 797

116177840 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 116177899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      798 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 857

116177900 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 116177959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      858 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGGAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 917

116177960 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACC---CAGCAACAACAACAAC 116178016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
      918 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAGCAACAACAACAAC 977

116178017 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 116178076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      978 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 1037

116178077 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCT 116178136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
     1038 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATGTAATCGAGAAGTAGGGCT 1097

116178137 TCCTCTCTTAACTCGTCATCCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 116178196
          ||||||| ||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1098 TCCTCTC-TAACTCCTCATTCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 1156

116178197 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCA 116178256
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
     1157 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAGAATGAAAAAATCCTTA 1216

116178257 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAG-AAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 116178315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1217 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAGTAAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 1276

116178316 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 116178375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 1336

116178376 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 116178435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 1396

116178436 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 116178495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 1456

116178496 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 116178555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 1516

116178556 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTAT 116178615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1517 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTCT 1576

116178616 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 116178675
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAAAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 1636

116178676 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAA 116178735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1637 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATGATAAGGCTATAGTGAACAA 1696

116178736 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 116178795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 1756

116178796 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 116178855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 1816

116178856 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 116178915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 1876

116178916 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 116178975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 1936

116178976 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 116179035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 1996

116179036 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 116179095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 2056

116179096 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 116179155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 2116

116179156 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 116179215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 2176

116179216 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 116179275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 2236

116179276 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 116179335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 2296

116179336 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 116179395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 2356

116179396 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTG 116179455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTG 2416

116179456 AGGATGCAGAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCT 116179515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 AGGATGCAGAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCT 2476

116179516 ATGGAAATCATATAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAA 116179575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 ATGGAAATCATATAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAA 2536

116179576 ATTATACTGCTGAGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAATCAATATATTAAAAAAGACACCTG 116179635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 ATTATACTGCTGAGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAATCAATATATTAAAAAAGACACCTG 2596

116179636 TACTTG 116179641
          ||||||
     2597 TACTTG 2602

Alignment time is 2.83679 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     5635] =>      5635 nucs 'mol-32-30f6-216172_5635'

Score:        5268
Aligned:      5564        nucs
Identic:      5533 ( 99%) nucs =>       552 (100%)      4981 ( 99%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116166355,116166907] EXCISED REGION [116177181,116182185]
 second seq =>  [        1,      553] EXCISED REGION [      630,     5635]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10273 nucs [116166908,116177180]
 second seq =>        76 nucs [554,629]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [554,557] to [630,633]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116166908,116166909] to [116177179,116177180]
 second seq =>         1 nucs [554,554] to [629,629]

116166355 AATTGATATCTTAGACAGTCTTCTGTTGCCTAATGTATTTCATTCCCTCTTTTCACTCTC 116166414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATTGATATCTTAGACAGTCTTCTGTTGCCTAATGTATTTCATTCCCTCTTTTCACTCTC 60

116166415 CAATAAATACATTTATCATATTATGTTAATGAAAGATAGGCTTCTCCATAACTTTCTAGA 116166474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATAAATACATTTATCATATTATGTTAATGAAAGATAGGCTTCTCCATAACTTTCTAGA 120

116166475 CTGTATGTACACCGAGAGAAAGAACATCATAAGTTGGATAGTAATGGTGTACATGAAAGA 116166534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTATGTACACCGAGAGAAAGAACATCATAAGTTGGATAGTAATGGTGTACATGAAAGA 180

116166535 CACATAATTATTAAAGATTATTAGTAAATGTGCAAAATCCTATGTCCTTTATAGTATACA 116166594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACATAATTATTAAAGATTATTAGTAAATGTGCAAAATCCTATGTCCTTTATAGTATACA 240

116166595 CTATATATTTGTTTCTTTAATATGCTGCACATATTTGCTAAAGATATTTATTTTATACCT 116166654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTATATATTTGTTTCTTTAATATGCTGCACATATTTGCTAAAGATATTTATTTTATACCT 300

116166655 ATACTTATGTATTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATTCAAAAATATAATTTCA 116166714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATACTTATGTATTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATTCAAAAATATAATTTCA 360

116166715 CTTTAAACACTGAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAAAGGAATACATTGCATA 116166774
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      361 CTTTAAACACTGAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAAAGGGATACATTGCATA 420

116166775 TTATGAGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATATTGAATCTATATTAT 116166834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATGAGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATATTGAATCTATATTAT 480

116166835 ATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCT 116166894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCT 540

116166895 ACTTGGTTAATTA 116166907
          |||||||||||||
      541 ACTTGGTTAATTA 553

EXCISED REGION

116177181 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCA 116177240
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
      630 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATATATAATATTGTATATGTTAATTTCCATACCCA 689

116177241 TAGGATTCAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 116177300
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 TAGGATTAAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 749

116177301 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 116177360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 809

116177361 TTTTTATTAATAAACGAATAAATAATCAATTATATTCAAAGG-TTTTATATGAGAATAAA 116177419
          |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||
      810 TTTTTATTAATAAACGAATAAAT----AATTATATTCAAAGGCTTTTATATGAGAATAAA 865

116177420 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 116177479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      866 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 925

116177480 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 116177539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      926 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 985

116177540 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 116177599
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      986 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCACTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 1045

116177600 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAA 116177659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
     1046 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGATAAACAACAGGAATCATAGAAA 1105

116177660 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 116177719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1106 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 1165

116177720 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 116177779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1166 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 1225

116177780 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 116177839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1226 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 1285

116177840 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 116177899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1286 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 1345

116177900 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 116177959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1346 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGGAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 1405

116177960 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACC---CAGCAACAACAACAAC 116178016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
     1406 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAGCAACAACAACAAC 1465

116178017 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 116178076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1466 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 1525

116178077 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCT 116178136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
     1526 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATGTAATCGAGAAGTAGGGCT 1585

116178137 TCCTCTCTTAACTCGTCATCCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 116178196
          ||||||| ||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1586 TCCTCTC-TAACTCCTCATTCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 1644

116178197 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCA 116178256
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
     1645 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAGAATGAAAAAATCCTTA 1704

116178257 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAG-AAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 116178315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1705 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAGTAAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 1764

116178316 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 116178375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 1824

116178376 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 116178435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 1884

116178436 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 116178495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 1944

116178496 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 116178555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 2004

116178556 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTAT 116178615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2005 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTCT 2064

116178616 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 116178675
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAAAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 2124

116178676 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAA 116178735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2125 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATGATAAGGCTATAGTGAACAA 2184

116178736 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 116178795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 2244

116178796 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 116178855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 2304

116178856 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 116178915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 2364

116178916 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 116178975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 2424

116178976 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 116179035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 2484

116179036 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 116179095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 2544

116179096 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 116179155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 2604

116179156 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 116179215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 2664

116179216 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 116179275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 2724

116179276 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 116179335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 2784

116179336 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 116179395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 2844

116179396 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTG 116179455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTG 2904

116179456 AGGATGCAGAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCT 116179515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 AGGATGCAGAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCT 2964

116179516 ATGGAAATCATATAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAA 116179575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 ATGGAAATCATATAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAA 3024

116179576 ATTATACTGCTGAGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAATCAATATATTAAAAAAGACACCTG 116179635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 ATTATACTGCTGAGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAATCAATATATTAAAAAAGACACCTG 3084

116179636 TACTTGTGTGTTTATCACAGCACTATTCACAATAGCCAAGATACGGTATCAACCTTGATG 116179695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 TACTTGTGTGTTTATCACAGCACTATTCACAATAGCCAAGATACGGTATCAACCTTGATG 3144

116179696 TTCATCAATGAATGAATGGATTAAGAAAATGTGTTTTATATATATACATAATAGAATACT 116179755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 TTCATCAATGAATGAATGGATTAAGAAAATGTGTTTTATATATATACATAATAGAATACT 3204

116179756 ATGCAGCTGTAAAACAGAATGAATCATATATTTTGCAGCAACATGGATGGAGCTAAGGCT 116179815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 ATGCAGCTGTAAAACAGAATGAATCATATATTTTGCAGCAACATGGATGGAGCTAAGGCT 3264

116179816 ATTATTTTAAGTGAAATACCTCAGAAACAAATCAAATACTGAATGTTTTTACTTATAACT 116179875
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3265 ATTATTTTAAGTGAAATACCTCAGAAACAAATCAAATACTGAATGTTTTTAATTATAACT 3324

116179876 GGGAGAAAAAGAATGGGTACACATGTGCATAAAGATGAAATAATATTAATAGATACTTGA 116179935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 GGGAGAAAAAGAATGGGTACACATGTGCATAAAGATGAAATAATATTAATAGATACTTGA 3384

116179936 GACTCTTAAAGGAAGAAGGGTAGGAGAAGGTTGAGGGTTGAAAAATTACCTATTGAATTC 116179995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 GACTCTTAAAGGAAGAAGGGTAGGAGAAGGTTGAGGGTTGAAAAATTACCTATTGAATTC 3444

116179996 AATGTTCACTATTTGGGTTATGGGTATACTAGAAGCCTGAACCTCACTATTATACAAAAT 116180055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 AATGTTCACTATTTGGGTTATGGGTATACTAGAAGCCTGAACCTCACTATTATACAAAAT 3504

116180056 ATTTATGTAACAAACCTGCACATGTACTCCCTGAATACATAATAAAACAAATAAATAAAT 116180115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 ATTTATGTAACAAACCTGCACATGTACTCCCTGAATACATAATAAAACAAATAAATAAAT 3564

116180116 TACAATAACAATGCAATAATAAAAATAATACAAATAAAAACACAATATAACAATTGACAC 116180175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 TACAATAACAATGCAATAATAAAAATAATACAAATAAAAACACAATATAACAATTGACAC 3624

116180176 AGTATTTCATTAGGCACTATAAATAATCTAGAAATGATTTAAATTATACAGGAGGTTATA 116180235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 AGTATTTCATTAGGCACTATAAATAATCTAGAAATGATTTAAATTATACAGGAGGTTATA 3684

116180236 CGCAAATACTATTCCATTCTATATAAGGGACCTTTGCATCCATAGATTTTGGTGTTTGGA 116180295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 CGCAAATACTATTCCATTCTATATAAGGGACCTTTGCATCCATAGATTTTGGTGTTTGGA 3744

116180296 GGGTACTAGAATCAATCCCATGATTATACCAAGGGAGGACTGTACTCTGCATCTTATAAC 116180355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 GGGTACTAGAATCAATCCCATGATTATACCAAGGGAGGACTGTACTCTGCATCTTATAAC 3804

116180356 TACACAATTTGGTGCATCCTAATACTATGATAATAGTTACAATAAGTGACAACTAATATT 116180415
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 TACACAATTTGGTACATCCTAATACTATGATAATAGTTACAATAAGTGACAACTAATATT 3864

116180416 TATTGCTTTCTTTATCTTTTAGCTATTTGATTGTTAAAGAAGTATGTTAGAGACCCCTGA 116180475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 TATTGCTTTCTTTATCTTTTAGCTATTTGATTGTTAAAGAAGTATGTTAGAGACCCCTGA 3924

116180476 TAACATTTATTACTTTATAGCACTGTAAAAAGGTAAGAATGGTCTTCACCAAACTGTTTT 116180535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 TAACATTTATTACTTTATAGCACTGTAAAAAGGTAAGAATGGTCTTCACCAAACTGTTTT 3984

116180536 TAAAGTCAATGTTGAGTTGATAAATTATGTTGCTATCCTAGTAATTAAACTTATAACCAG 116180595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 TAAAGTCAATGTTGAGTTGATAAATTATGTTGCTATCCTAGTAATTAAACTTATAACCAG 4044

116180596 TCTCCTTGATTTTTTAAGTATAAAGACATTATTTTAGCCTGTAGTGTATCTTTATATTTA 116180655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 TCTCCTTGATTTTTTAAGTATAAAGACATTATTTTAGCCTGTAGTGTATCTTTATATTTA 4104

116180656 AATACTTAAGGGTATTATTTTTCCCCTATAAAAATTCTATTCAGGTCTAGCAGAAATAAG 116180715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 AATACTTAAGGGTATTATTTTTCCCCTATAAAAATTCTATTCAGGTCTAGCAGAAATAAG 4164

116180716 AAAGGCATGTATAATTGATATAGTTTGGAAGTTTGTCCGCTCCAAATCTAGAGTGGGACA 116180775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 AAAGGCATGTATAATTGATATAGTTTGGAAGTTTGTCCGCTCCAAATCTAGAGTGGGACA 4224

116180776 TTGCTATAAATATGTCTGAAAATATGGAAGCCTCTTTGGAAGTAGCTAAGTAACAGGCAG 116180835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 TTGCTATAAATATGTCTGAAAATATGGAAGCCTCTTTGGAAGTAGCTAAGTAACAGGCAG 4284

116180836 AATTTGGAAGAGTTTGGAGGACTCAAAATAAGACAGAGAGATGACAGAGAGCTTGAAACT 116180895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 AATTTGGAAGAGTTTGGAGGACTCAAAATAAGACAGAGAGATGACAGAGAGCTTGAAACT 4344

116180896 TGTTAGAGACTGGTTAAATGGTTGTCATCAAAATTCTGATAGAGACATGGCCAATGAAGT 116180955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 TGTTAGAGACTGGTTAAATGGTTGTCATCAAAATTCTGATAGAGACATGGCCAATGAAGT 4404

116180956 CCAGGCTGAGGAGTTCTCAGACAGAAATGAGGAAGTTACTGGGAATGGGAGTAAAGGTTA 116181015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 CCAGGCTGAGGAGTTCTCAGACAGAAATGAGGAAGTTACTGGGAATGGGAGTAAAGGTTA 4464

116181016 CCTCTGCTGTGCCCTAGCACAAAGCTTGGCTGCATTATGTCCATGTCCATGCTCTGTGGA 116181075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 CCTCTGCTGTGCCCTAGCACAAAGCTTGGCTGCATTATGTCCATGTCCATGCTCTGTGGA 4524

116181076 AGTTGGAACTTAAGCGTGATGATTTAGGGAATCCAGTGGGAGAAATTTCTAAGCAGCGAA 116181135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 AGTTGGAACTTAAGCGTGATGATTTAGGGAATCCAGTGGGAGAAATTTCTAAGCAGCGAA 4584

116181136 GCATTCAGGATGTGAACTGACTGCTTCTAACAGGATAATATCACATATAAAAGGAAATAA 116181195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 GCATTCAGGATGTGAACTGACTGCTTCTAACAGGATAATATCACATATAAAAGGAAATAA 4644

116181196 ATGACTTAAAGTTGGAACTTGTATGTAAAAAGGAAGCAAAGTTTAAAGGTTTGGAAAATC 116181255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 ATGACTTAAAGTTGGAACTTGTATGTAAAAAGGAAGCAAAGTTTAAAGGTTTGGAAAATC 4704

116181256 TACAGCCTGGCCCTGTGTTAGAGGAGGAATACAAGCAGGTTGTGGAGTAACCACTTGCTG 116181315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 TACAGCCTGGCCCTGTGTTAGAGGAGGAATACAAGCAGGTTGTGGAGTAACCACTTGCTG 4764

116181316 AAGAGATTTGTGTAACTAAAAGGAAGCAAAGTACAAATATCCTTGAGAATGTAAAAAAAG 116181375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 AAGAGATTTGTGTAACTAAAAGGAAGCAAAGTACAAATATCCTTGAGAATGTAAAAAAAG 4824

116181376 CCTGAAGGGAATTTCAGAACTCTTCTAGGAAGCATCTCCCATCATAGGCCTAGAAGTCTA 116181435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 CCTGAAGGGAATTTCAGAACTCTTCTAGGAAGCATCTCCCATCATAGGCCTAGAAGTCTA 4884

116181436 GGAGAAGAAAATGGTTTCACCATAGTGCTTTCACTCTATGCCTGGAAAAGCCACAGTGCT 116181495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 GGAGAAGAAAATGGTTTCACCATAGTGCTTTCACTCTATGCCTGGAAAAGCCACAGTGCT 4944

116181496 CACCTCCAATCAGTGGTAATCATCAGGGACATTGCACCTTGCGACACCACAGGGGTGGAG 116181555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4945 CACCTCCAATCAGTGGTAATCATCAGGGACATTGCACCTTGCGACACCACAGGGGTGGAG 5004

116181556 CTGTCCAAGACCTTGAAAGCCTACTTTCTGCACCAGTGTGCCCTGGGTGTGGGACATGGA 116181615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5005 CTGTCCAAGACCTTGAAAGCCTACTTTCTGCACCAGTGTGCCCTGGGTGTGGGACATGGA 5064

116181616 ATCAAAGAAGATACTTTTGGAGCTTTAATTACTGCCCTACTTGGTTTAAGATTGTGTGGG 116181675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5065 ATCAAAGAAGATACTTTTGGAGCTTTAATTACTGCCCTACTTGGTTTAAGATTGTGTGGG 5124

116181676 TCCTGTTACTCCTTTCTTTTGTCTGATTTCTCCCTTTTGGAACAGGAATGTTTACCCAAT 116181735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5125 TCCTGTTACTCCTTTCTTTTGTCTGATTTCTCCCTTTTGGAACAGGAATGTTTACCCAAT 5184

116181736 GCTTGTACCACCATTCATCTTGGGAGTAGATAACTTATTTTGATTTTGCAGGCTGATAGG 116181795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5185 GCTTGTACCACCATTCATCTTGGGAGTAGATAACTTATTTTGATTTTGCAGGCTGATAGG 5244

116181796 TGCAGACAGATGAATTTCAGATGAGATTTAGCACTTTGATACTGAAGAGAGTTAAGACTT 116181855
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5245 TGCAGACAGATGAGTTTCAGATGAGATTTAGCACTTTGATACTGAAGAGAGTTAAGACTT 5304

116181856 TTGGGGGCTATTGAGAGATGATTATATCTTGCATTGTGAGAAGAACATGAGATTTGGGAA 116181915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5305 TTGGGGGCTATTGAGAGATGATTATATCTTGCATTGTGAGAAGAACATGAGATTTGGGAA 5364

116181916 GCCAGGGGTGGAATTATATGGTTTGTATTTTTGTTCCCTCCAAATTTCATGTTGAAATGT 116181975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5365 GCCAGGGGTGGAATTATATGGTTTGTATTTTTGTTCCCTCCAAATTTCATGTTGAAATGT 5424

116181976 AATTCCTTGTGTTGGAAGTAGGGTCTAGTATGAGGTGTTTGTGTCTTTGGTACAGATCGC 116182035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5425 AATTCCTTGTGTTGGAAGTAGGGTCTAGTATGAGGTGTTTGTGTCTTTGGTACAGATCGC 5484

116182036 TCATGAATAGCTTGGTGCTGTCCTTGTGATAGTGAGTTCTCTCAAGATCTGGTTGTTTAA 116182095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5485 TCATGAATAGCTTGGTGCTGTCCTTGTGATAGTGAGTTCTCTCAAGATCTGGTTGTTTAA 5544

116182096 AAGTATGTGGCAACTCCCTACTCTCTCTTTTGCTCCTACTC-TTTTTTTTTTTTTTTTTG 116182154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
     5545 AAGTATGTGGCAACTCCCTACTCTCTCTTTTGCTCCTACTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTG 5604

116182155 AGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGG 116182185
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     5605 AGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGG 5635

Alignment time is 6.04959 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     8537] =>      8537 nucs 'mol-32-310c-137384_8537'

Score:        8125
Aligned:      8470        nucs
Identic:      8428 (100%) nucs =>      1030 (100%)      7398 ( 99%)
Gaps:           19 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116165876,116166907] EXCISED REGION [116177181,116184608]
 second seq =>  [        1,     1032] EXCISED REGION [     1109,     8537]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10273 nucs [116166908,116177180]
 second seq =>        76 nucs [1033,1108]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [1033,1036] to [1109,1112]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116166908,116166909] to [116177179,116177180]
 second seq =>         1 nucs [1033,1033] to [1108,1108]

116165876 TTCAGTATAAAATTCAGTACAAAATTCTGCATGTAAGACTACCATTTCCTGCCAGATTTA 116165935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCAGTATAAAATTCAGTACAAAATTCTGCATGTAAGACTACCATTTCCTGCCAGATTTA 60

116165936 CAAATTCACATATTCTAGAATATTATTTATGAATATATATTTACACACATACCTCTTATT 116165995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAATTCACATATTCTAGAATATTATTTATGAATATATATTTACACACATACCTCTTATT 120

116165996 TTCTTCTCCACACTTTGGAATTTGGAGGATGAGTTGTGGAGAATAAAAAAAAAAGTGGTG 116166055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTTCTCCACACTTTGGAATTTGGAGGATGAGTTGTGGAGAATAAAAAAAAAAGTGGTG 180

116166056 GGAAGAAAACATTTACTTGTCTGTGTTTATTCTCTGCTGGGTCTTAGTCGGCAAAGCTAC 116166115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      181 GGAAGAAAACATTTACTTGTCTGTGTTTATTCTCTGCTGGGTCTTAGTTGGCAAAGCTAC 240

116166116 CTTTGTAGTAGGTCCTCTTTTCTTTTATCCTTCTTTGTTGTTCTTTCAAACAAAATTTGG 116166175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTTTGTAGTAGGTCCTCTTTTCTTTTATCCTTCTTTGTTGTTCTTTCAAACAAAATTTGG 300

116166176 AGATGTTACCCACTTTGTCCCAGTTTCTGATTCTGGTGAAATCAAAATTCAAATCTTTCT 116166235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGATGTTACCCACTTTGTCCCAGTTTCTGATTCTGGTGAAATCAAAATTCAAATCTTTCT 360

116166236 GTCGTTTTAAATTTTAATATTTTCGTGACTATTTTTTTCCTTTTTTGGATGGATTACATT 116166295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCGTTTTAAATTTTAATATTTTCGTGACTATTTTTTTCCTTTTTTGGATGGATTACATT 420

116166296 TGGTTTTTGCTTCAACAAATTTCTTATTTCGGATTTAGGTACACAATGATTTGTTTGTGA 116166355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGTTTTTGCTTCAACAAATTTCTTATTTCGGATTTAGGTACACAATGATTTGTTTGTGA 480

116166356 ATTGATATCTTAGACAGTCTTCTGTTGCCTAATGTATTTCATTCCCTCTTTTCACTCTCC 116166415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATTGATATCTTAGACAGTCTTCTGTTGCCTAATGTATTTCATTCCCTCTTTTCACTCTCC 540

116166416 AATAAATACATTTATCATATTATGTTAATGAAAGATAGGCTTCTCCATAACTTTCTAGAC 116166475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATAAATACATTTATCATATTATGTTAATGAAAGATAGGCTTCTCCATAACTTTCTAGAC 600

116166476 TGTATGTACACCGAGAGAAAGAACATCATAAGTTGGATAGTAATGGTGTACATGAAAGAC 116166535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTATGTACACCGAGAGAAAGAACATCATAAGTTGGATAGTAATGGTGTACATGAAAGAC 660

116166536 ACATAATTATTAAAGATTATTAGTAAATGTGCAAAATCCTATGTCCTTTATAGTATACAC 116166595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACATAATTATTAAAGATTATTAGTAAATGTGCAAAATCCTATGTCCTTTATAGTATACAC 720

116166596 TATATATTTGTTTCTTTAATATGCTGCACATATTTGCTAAAGATATTTATTTTATACCTA 116166655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATATATTTGTTTCTTTAATATGCTGCACATATTTGCTAAAGATATTTATTTTATACCTA 780

116166656 TACTTATGTATTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATTCAAAAATATAATTTCAC 116166715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TACTTATGTATTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATTCAAAAATATAATTTCAC 840

116166716 TTTAAACACTGAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAAAGGAATACATTGCATAT 116166775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
      841 TTTAAACACTGAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAAAGGGATACATTGCATAT 900

116166776 TATGAGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATATTGAATCTATATTATA 116166835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATGAGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATATTGAATCTATATTATA 960

116166836 TGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCTA 116166895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAACTATCACTCTA 1020

116166896 CTTGGTTAATTA 116166907
          ||||||||||||
     1021 CTTGGTTAATTA 1032

EXCISED REGION

116177181 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCA 116177240
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
     1109 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATATATAATATTGTATATGTTAATTTCCATACCCA 1168

116177241 TAGGATTCAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 116177300
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1169 TAGGATTAAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAACGTATTTAAAATCCAG 1228

116177301 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 116177360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 1288

116177361 TTTTTATTAATAAACGAATAAATAATCAATTATATTCAAAGG-TTTTATATGAGAATAAA 116177419
          |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||
     1289 TTTTTATTAATAAACGAATAAAT----AATTATATTCAAAGGCTTTTATATGAGAATAAA 1344

116177420 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 116177479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 1404

116177480 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 116177539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 1464

116177540 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 116177599
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCACTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 1524

116177600 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAA 116177659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
     1525 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGATAAACAACAGGAATCATAGAAA 1584

116177660 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 116177719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 1644

116177720 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 116177779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 1704

116177780 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 116177839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 1764

116177840 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 116177899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 1824

116177900 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 116177959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1825 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGGAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 1884

116177960 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACC---CAGCAACAACAACAAC 116178016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
     1885 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAGCAACAACAACAAC 1944

116178017 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 116178076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 2004

116178077 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCT 116178136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
     2005 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATGTAATCGAGAAGTAGGGCT 2064

116178137 TCCTCTCTTAACTCGTCATCCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 116178196
          ||||||| ||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 TCCTCTC-TAACTCCTCATTCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 2123

116178197 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCA 116178256
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
     2124 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAGAATGAAAAAATCCTTA 2183

116178257 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAG-AAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 116178315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     2184 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAGTAAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 2243

116178316 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 116178375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2244 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 2303

116178376 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 116178435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2304 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 2363

116178436 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 116178495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2364 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 2423

116178496 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 116178555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2424 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 2483

116178556 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTAT 116178615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2484 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTCT 2543

116178616 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 116178675
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2544 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAAAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 2603

116178676 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAA 116178735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2604 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATGATAAGGCTATAGTGAACAA 2663

116178736 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 116178795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2664 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 2723

116178796 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 116178855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2724 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 2783

116178856 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 116178915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2784 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 2843

116178916 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 116178975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2844 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 2903

116178976 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 116179035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2904 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 2963

116179036 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 116179095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2964 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 3023

116179096 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 116179155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3024 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 3083

116179156 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 116179215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3084 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 3143

116179216 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 116179275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3144 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 3203

116179276 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 116179335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3204 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 3263

116179336 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 116179395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3264 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 3323

116179396 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTG 116179455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3324 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTG 3383

116179456 AGGATGCAGAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCT 116179515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3384 AGGATGCAGAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCT 3443

116179516 ATGGAAATCATATAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAA 116179575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3444 ATGGAAATCATATAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAA 3503

116179576 ATTATACTGCTGAGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAATCAATATATTAAAAAAGACACCTG 116179635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3504 ATTATACTGCTGAGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAATCAATATATTAAAAAAGACACCTG 3563

116179636 TACTTGTGTGTTTATCACAGCACTATTCACAATAGCCAAGATACGGTATCAACCTTGATG 116179695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3564 TACTTGTGTGTTTATCACAGCACTATTCACAATAGCCAAGATACGGTATCAACCTTGATG 3623

116179696 TTCATCAATGAATGAATGGATTAAGAAAATGTGTTTTATATATATACATAATAGAATACT 116179755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3624 TTCATCAATGAATGAATGGATTAAGAAAATGTGTTTTATATATATACATAATAGAATACT 3683

116179756 ATGCAGCTGTAAAACAGAATGAATCATATATTTTGCAGCAACATGGATGGAGCTAAGGCT 116179815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3684 ATGCAGCTGTAAAACAGAATGAATCATATATTTTGCAGCAACATGGATGGAGCTAAGGCT 3743

116179816 ATTATTTTAAGTGAAATACCTCAGAAACAAATCAAATACTGAATGTTTTTACTTATAACT 116179875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3744 ATTATTTTAAGTGAAATACCTCAGAAACAAATCAAATACTGAATGTTTTTACTTATAACT 3803

116179876 GGGAGAAAAAGAATGGGTACACATGTGCATAAAGATGAAATAATATTAATAGATACTTGA 116179935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3804 GGGAGAAAAAGAATGGGTACACATGTGCATAAAGATGAAATAATATTAATAGATACTTGA 3863

116179936 GACTCTTAAAGGAAGAAGGGTAGGAGAAGGTTGAGGGTTGAAAAATTACCTATTGAATTC 116179995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3864 GACTCTTAAAGGAAGAAGGGTAGGAGAAGGTTGAGGGTTGAAAAATTACCTATTGAATTC 3923

116179996 AATGTTCACTATTTGGGTTATGGGTATACTAGAAGCCTGAACCTCACTATTATACAAAAT 116180055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3924 AATGTTCACTATTTGGGTTATGGGTATACTAGAAGCCTGAACCTCACTATTATACAAAAT 3983

116180056 ATTTATGTAACAAACCTGCACATGTACTCCCTGAATACATAATAAAACAAATAAATAAAT 116180115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3984 ATTTATGTAACAAACCTGCACATGTACTCCCTGAATACATAATAAAACAAATAAATAAAT 4043

116180116 TACAATAACAATGCAATAATAAAAATAATACAAATAAAAACACAATATAACAATTGACAC 116180175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4044 TACAATAACAATGCAATAATAAAAATAATACAAATAAAAACACAATATAACAATTGACAC 4103

116180176 AGTATTTCATTAGGCACTATAAATAATCTAGAAATGATTTAAATTATACAGGAGGTTATA 116180235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4104 AGTATTTCATTAGGCACTATAAATAATCTAGAAATGATTTAAATTATACAGGAGGTTATA 4163

116180236 CGCAAATACTATTCCATTCTATATAAGGGACCTTTGCATCCATAGATTTTGGTGTTTGGA 116180295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4164 CGCAAATACTATTCCATTCTATATAAGGGACCTTTGCATCCATAGATTTTGGTGTTTGGA 4223

116180296 GGGTACTAGAATCAATCCCATGATTATACCAAGGGAGGACTGTACTCTGCATCTTATAAC 116180355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4224 GGGTACTAGAATCAATCCCATGATTATACCAAGGGAGGACTGTACTCTGCATCTTATAAC 4283

116180356 TACACAATTTGGTGCATCCTAATACTATGATAATAGTTACAATAAGTGACAACTAATATT 116180415
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4284 TACACAATTTGGTACATCCTAATACTATGATAATAGTTACAATAAGTGACAACTAATATT 4343

116180416 TATTGCTTTCTTTATCTTTTAGCTATTTGATTGTTAAAGAAGTATGTTAGAGACCCCTGA 116180475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4344 TATTGCTTTCTTTATCTTTTAGCTATTTGATTGTTAAAGAAGTATGTTAGAGACCCCTGA 4403

116180476 TAACATTTATTACTTTATAGCACTGTAAAAAGGTAAGAATGGTCTTCACCAAACTGTTTT 116180535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4404 TAACATTTATTACTTTATAGCACTGTAAAAAGGTAAGAATGGTCTTCACCAAACTGTTTT 4463

116180536 TAAAGTCAATGTTGAGTTGATAAATTATGTTGCTATCCTAGTAATTAAACTTATAACCAG 116180595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4464 TAAAGTCAATGTTGAGTTGATAAATTATGTTGCTATCCTAGTAATTAAACTTATAACCAG 4523

116180596 TCTCCTTGATTTTTTAAGTATAAAGACATTATTTTAGCCTGTAGTGTATCTTTATATTTA 116180655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4524 TCTCCTTGATTTTTTAAGTATAAAGACATTATTTTAGCCTGTAGTGTATCTTTATATTTA 4583

116180656 AATACTTAAGGGTATTATTTTTCCCCTATAAAAATTCTATTCAGGTCTAGCAGAAATAAG 116180715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4584 AATACTTAAGGGTATTATTTTTCCCCTATAAAAATTCTATTCAGGTCTAGCAGAAATAAG 4643

116180716 AAAGGCATGTATAATTGATATAGTTTGGAAGTTTGTCCGCTCCAAATCTAGAGTGGGACA 116180775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4644 AAAGGCATGTATAATTGATATAGTTTGGAAGTTTGTCCGCTCCAAATCTAGAGTGGGACA 4703

116180776 TTGCTATAAATATGTCTGAAAATATGGAAGCCTCTTTGGAAGTAGCTAAGTAACAGGCAG 116180835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4704 TTGCTATAAATATGTCTGAAAATATGGAAGCCTCTTTGGAAGTAGCTAAGTAACAGGCAG 4763

116180836 AATTTGGAAGAGTTTGGAGGACTCAAAATAAGACAGAGAGATGACAGAGAGCTTGAAACT 116180895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4764 AATTTGGAAGAGTTTGGAGGACTCAAAATAAGACAGAGAGATGACAGAGAGCTTGAAACT 4823

116180896 TGTTAGAGACTGGTTAAATGGTTGTCATCAAAATTCTGATAGAGACATGGCCAATGAAGT 116180955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4824 TGTTAGAGACTGGTTAAATGGTTGTCATCAAAATTCTGATAGAGACATGGCCAATGAAGT 4883

116180956 CCAGGCTGAGGAGTTCTCAGACAGAAATGAGGAAGTTACTGGGAATGGGAGTAAAGGTTA 116181015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4884 CCAGGCTGAGGAGTTCTCAGACAGAAATGAGGAAGTTACTGGGAATGGGAGTAAAGGTTA 4943

116181016 CCTCTGCTGTGCCCTAGCACAAAGCTTGGCTGCATTATGTCCATGTCCATGCTCTGTGGA 116181075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4944 CCTCTGCTGTGCCCTAGCACAAAGCTTGGCTGCATTATGTCCATGTCCATGCTCTGTGGA 5003

116181076 AGTTGGAACTTAAGCGTGATGATTTAGGGAATCCAGTGGGAGAAATTTCTAAGCAGCGAA 116181135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5004 AGTTGGAACTTAAGCGTGATGATTTAGGGAATCCAGTGGGAGAAATTTCTAAGCAGCGAA 5063

116181136 GCATTCAGGATGTGAACTGACTGCTTCTAACAGGATAATATCACATATAAAAGGAAATAA 116181195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5064 GCATTCAGGATGTGAACTGACTGCTTCTAACAGGATAATATCACATATAAAAGGAAATAA 5123

116181196 ATGACTTAAAGTTGGAACTTGTATGTAAAAAGGAAGCAAAGTTTAAAGGTTTGGAAAATC 116181255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5124 ATGACTTAAAGTTGGAACTTGTATGTAAAAAGGAAGCAAAGTTTAAAGGTTTGGAAAATC 5183

116181256 TACAGCCTGGCCCTGTGTTAGAGGAGGAATACAAGCAGGTTGTGGAGTAACCACTTGCTG 116181315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5184 TACAGCCTGGCCCTGTGTTAGAGGAGGAATACAAGCAGGTTGTGGAGTAACCACTTGCTG 5243

116181316 AAGAGATTTGTGTAACTAAAAGGAAGCAAAGTACAAATATCCTTGAGAATGTAAAAAAAG 116181375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5244 AAGAGATTTGTGTAACTAAAAGGAAGCAAAGTACAAATATCCTTGAGAATGTAAAAAAAG 5303

116181376 CCTGAAGGGAATTTCAGAACTCTTCTAGGAAGCATCTCCCATCATAGGCCTAGAAGTCTA 116181435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5304 CCTGAAGGGAATTTCAGAACTCTTCTAGGAAGCATCTCCCATCATAGGCCTAGAAGTCTA 5363

116181436 GGAGAAGAAAATGGTTTCACCATAGTGCTTTCACTCTATGCCTGGAAAAGCCACAGTGCT 116181495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5364 GGAGAAGAAAATGGTTTCACCATAGTGCTTTCACTCTATGCCTGGAAAAGCCACAGTGCT 5423

116181496 CACCTCCAATCAGTGGTAATCATCAGGGACATTGCACCTTGCGACACCACAGGGGTGGAG 116181555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5424 CACCTCCAATCAGTGGTAATCATCAGGGACATTGCACCTTGCGACACCACAGGGGTGGAG 5483

116181556 CTGTCCAAGACCTTGAAAGCCTACTTTCTGCACCAGTGTGCCCTGGGTGTGGGACATGGA 116181615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5484 CTGTCCAAGACCTTGAAAGCCTACTTTCTGCACCAGTGTGCCCTGGGTGTGGGACATGGA 5543

116181616 ATCAAAGAAGATACTTTTGGAGCTTTAATTACTGCCCTACTTGGTTTAAGATTGTGTGGG 116181675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5544 ATCAAAGAAGATACTTTTGGAGCTTTAATTACTGCCCTACTTGGTTTAAGATTGTGTGGG 5603

116181676 TCCTGTTACTCCTTTCTTTTGTCTGATTTCTCCCTTTTGGAACAGGAATGTTTACCCAAT 116181735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5604 TCCTGTTACTCCTTTCTTTTGTCTGATTTCTCCCTTTTGGAACAGGAATGTTTACCCAAT 5663

116181736 GCTTGTACCACCATTCATCTTGGGAGTAGATAACTTATTTTGATTTTGCAGGCTGATAGG 116181795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5664 GCTTGTACCACCATTCATCTTGGGAGTAGATAACTTATTTTGATTTTGCAGGCTGATAGG 5723

116181796 TGCAGACAGATGAATTTCAGATGAGATTTAGCACTTTGATACTGAAGAGAGTTAAGACTT 116181855
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5724 TGCAGACAGATGAGTTTCAGATGAGATTTAGCACTTTGATACTGAAGAGAGTTAAGACTT 5783

116181856 TTGGGGGCTATTGAGAGATGATTATATCTTGCATTGTGAGAAGAACATGAGATTTGGGAA 116181915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5784 TTGGGGGCTATTGAGAGATGATTATATCTTGCATTGTGAGAAGAACATGAGATTTGGGAA 5843

116181916 GCCAGGGGTGGAATTATATGGTTTGTATTTTTGTTCCCTCCAAATTTCATGTTGAAATGT 116181975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5844 GCCAGGGGTGGAATTATATGGTTTGTATTTTTGTTCCCTCCAAATTTCATGTTGAAATGT 5903

116181976 AATTCCTTGTGTTGGAAGTAGGGTCTAGTATGAGGTGTTTGTGTCTTTGGTACAGATCGC 116182035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5904 AATTCCTTGTGTTGGAAGTAGGGTCTAGTATGAGGTGTTTGTGTCTTTGGTACAGATCGC 5963

116182036 TCATGAATAGCTTGGTGCTGTCCTTGTGATAGTGAGTTCTCTCAAGATCTGGTTGTTTAA 116182095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5964 TCATGAATAGCTTGGTGCTGTCCTTGTGATAGTGAGTTCTCTCAAGATCTGGTTGTTTAA 6023

116182096 AAGTATGTGGCAACTCCCTACTCTCTCTTTTGCTCCTACTC-----TTTTTTTTTTTTTT 116182150
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||         ||||||||||||||
     6024 AAGTATGTGGCAACTCCCTACTCTCTCTTTTGCTCCT----CTCTTTTTTTTTTTTTTTT 6079

116182151 TTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGTATTGGTGCGATCTCAGCTCA 116182210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6080 TTTGAGACGGAGTCTCGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGTATTGGTGCGATCTCAGCTCA 6139

116182211 CTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGTTTATGCCATTCTCCCACCTCAGACTCCTGAGTATCTGG 116182270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6140 CTGCAAGCTCTGCCTCCCGGGTTTATGCCATTCTCCCACCTCAGACTCCTGAGTATCTGG 6199

116182271 GATTACAGGCGCCCTCCACCATGCCCAGCTAATTATTTTGTATTATTAGTAGAGATGGGG 116182330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6200 GATTACAGGCGCCCTCCACCATGCCCAGCTAATTATTTTGTATTATTAGTAGAGATGGGG 6259

116182331 TTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCCGCCTTGGC 116182390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6260 TTTCACCGTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCCGCCTTGGC 6319

116182391 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCTGGCCCCTCTTGCTCCTACT 116182450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6320 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACTGCGCCTGGCCCCTCTTGCTCCTACT 6379

116182451 CTCAACATGTGAGATACCTGCTTACCCCTCTTGCTCCTACTCTCAACATGTGAGATACCT 116182510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6380 CTCAACATGTGAGATACCTGCTTACCCCTCTTGCTCCTACTCTCAACATGTGAGATACCT 6439

116182511 GCTTGCCCTTCACCTTCTGCTGTGATTGTAAGCTCCCTGAGGCCCTCACCAGAAGAAGAC 116182570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6440 GCTTGCCCTTCACCTTCTGCTGTGATTGTAAGCTCCCTGAGGCCCTCACCAGAAGAAGAC 6499

116182571 GCTGGCATCAAACTTCCTGTGCAGCGTGCAGAAGTGTAAGCCAATTAAACCTCTTTTATT 116182630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6500 GCTGGCATCAAACTTCCTGTGCAGCGTGCAGAAGTGTAAGCCAATTAAACCTCTTTTATT 6559

116182631 TAAAAATTACTCAGTCTTAGGTATTCCTTTATTGTAATGCAAATGAACTAATACAACCAT 116182690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6560 TAAAAATTACTCAGTCTTAGGTATTCCTTTATTGTAATGCAAATGAACTAATACAACCAT 6619

116182691 CTCTTGAATCTGGAAGGAAAACACTACCATCAACAACAAGATTGTGCCAATATGATATTT 116182750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6620 CTCTTGAATCTGGAAGGAAAACACTACCATCAACAACAAGATTGTGCCAATATGATATTT 6679

116182751 AATAGAGATAACAAACCTAAGAGGGGCACTAGTATTATGACCAGTTTACACCAAGTAAAC 116182810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6680 AATAGAGATAACAAACCTAAGAGGGGCACTAGTATTATGACCAGTTTACACCAAGTAAAC 6739

116182811 ACAATTGCAGCTTCTGCACTTAAAGCTTTCCTGGCTGTGAAAGACAGCATGGTTCTATCT 116182870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6740 ACAATTGCAGCTTCTGCACTTAAAGCTTTCCTGGCTGTGAAAGACAGCATGGTTCTATCT 6799

116182871 CAGCAGAAGTAGCTTCCTTGGCAAGCCACTTTCCTAGGGTGCCTCAGTAGTCTTTCTTGA 116182930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6800 CAGCAGAAGTAGCTTCCTTGGCAAGCCACTTTCCTAGGGTGCCTCAGTAGTCTTTCTTGA 6859

116182931 GAGGTCAGACCAAGTCTCTCCAGTTCTTAAAAACTCCCTTAGGTCACTTAATACACTTTA 116182990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6860 GAGGTCAGACCAAGTCTCTCCAGTTCTTAAAAACTCCCTTAGGTCACTTAATACACTTTA 6919

116182991 ATAAGTTGCTTTCTTCTGAAATCACGAATGGATTATGTTTTCTGTAACTACATTCTGGTG 116183050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6920 ATAAGTTGCTTTCTTCTGAAATCACGAATGGATTATGTTTTCTGTAACTACATTCTGGTG 6979

116183051 TGTAAAACATATAAGAAAATAAAGACAAAGCCACTTCACATGTTTTAGACTTGTTAATTG 116183110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6980 TGTAAAACATATAAGAAAATAAAGACAAAGCCACTTCACATGTTTTAGACTTGTTAATTG 7039

116183111 CAGTCAGAATTTGAATTCAGTTGGTGTGAGTTCAGAGTCTAAAATGTTTACTTATATAGC 116183170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7040 CAGTCAGAATTTGAATTCAGTTGGTGTGAGTTCAGAGTCTAAAATGTTTACTTATATAGC 7099

116183171 CTTTGCCAGTAAAGTATTTTAAGCATATCGAAAATGGACAAACAAGTGACACATTAGGAG 116183230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7100 CTTTGCCAGTAAAGTATTTTAAGCATATCGAAAATGGACAAACAAGTGACACATTAGGAG 7159

116183231 GAGGCCCTTGGGAAATCTCATTGGGACCTAACTGAATTTCAGTAAAGTTCATATGCAATT 116183290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7160 GAGGCCCTTGGGAAATCTCATTGGGACCTAACTGAATTTCAGTAAAGTTCATATGCAATT 7219

116183291 AAATGCAGTGTCACAAAGTTATTCCCAAGTAATCTCAGAAATATAAAAACATATGAAATG 116183350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7220 AAATGCAGTGTCACAAAGTTATTCCCAAGTAATCTCAGAAATATAAAAACATATGAAATG 7279

116183351 TTTTTCAAAAAGATGAATGGACAAAAAACCCTATTTGAAATCACTGTACTTAATATACAG 116183410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7280 TTTTTCAAAAAGATGAATGGACAAAAAACCCTATTTGAAATCACTGTACTTAATATACAG 7339

116183411 TTTTTGAGTTATTTCCCTTTATTATAAGTTCTCATACTAAATAAAATAGTGACAAATTCA 116183470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7340 TTTTTGAGTTATTTCCCTTTATTATAAGTTCTCATACTAAATAAAATAGTGACAAATTCA 7399

116183471 TTAAAATCATTGCTTAGAAATAACCCAGAAGGAACAATAAAGAAACAAAATACAAAGATA 116183530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7400 TTAAAATCATTGCTTAGAAATAACCCAGAAGGAACAATAAAGAAACAAAATACAAAGATA 7459

116183531 ATAAGCAGAGAACATATTTTTAAAGATGGTAAATATAAATCCAAAGATAACTATAAATAC 116183590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7460 ATAAGCAGAGAACATATTTTTAAAGATGGTAAATATAAATCCAAAGATAACTATAAATAC 7519

116183591 ATTGAATGATAAAGGGGTGCCAATTAGAAGTCAGAGATTGTTAGAATATAAAAAGGAAAG 116183650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7520 ATTGAATGATAAAGGGGTGCCAATTAGAAGTCAGAGATTGTTAGAATATAAAAAGGAAAG 7579

116183651 ACCCAATTATAAACCATCTTCAAAATCTGTACTTTAAATGTGAACATATAGATGGCTTGA 116183710
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7580 ACCCAATTATAAACCGTCTTCAAAATCTGTACTTTAAATGTGAACATATAGATGGCTTGA 7639

116183711 ATATAAATGAATGAAAACAGATTTGCCATAAGCATGGAAAAAATCAGGAGGCTGGAGTGG 116183770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7640 ATATAAATGAATGAAAACAGATTTGCCATAAGCATGGAAAAAATCAGGAGGCTGGAGTGG 7699

116183771 TTATACTAATATGATATAATATAGACTTCAAGAGAAAGATTATCTTCAAAGATAAATAGG 116183830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7700 TTATACTAATATGATATAATATAGACTTCAAGAGAAAGATTATCTTCAAAGATAAATAGG 7759

116183831 GACACTTCATTATAATAATAAGTTAATTAGGAAGACACAACAATGATAACATTATTGTTT 116183890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7760 GACACTTCATTATAATAATAAGTTAATTAGGAAGACACAACAATGATAACATTATTGTTT 7819

116183891 TCTAATAACAGACATTCATATTATTACATGAAAAAAGATTAGCAGAATTAAAGAGAGCAA 116183950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7820 TCTAATAACAGACATTCATATTATTACATGAAAAAAGATTAGCAGAATTAAAGAGAGCAA 7879

116183951 AAGACAATTCCTAAACCACAAGAGAGAAAATTAACACCCCTTCATCAACAATTGATAGAA 116184010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7880 AAGACAATTCCTAAACCACAAGAGAGAAAATTAACACCCCTTCATCAACAATTGATAGAA 7939

116184011 CAACCAGATAAAATAATGTAAATAAGTAAAACAATAATAAAGACATAGACAATCTGGACA 116184070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7940 CAACCAGATAAAATAATGTAAATAAGTAAAACAATAATAAAGACATAGACAATCTGGACA 7999

116184071 ACAGTATCAACCATCTTGATCTAATAGGCAATTATAGATACTAACTTTTTCCAGGAAACT 116184130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8000 ACAGTATCAACCATCTTGATCTAATAGGCAATTATAGATACTAACTTTTTCCAGGAAACT 8059

116184131 TCTTTTGTGGAATTTGTATTTAAGGCTTACACTTTGACTTTTATACTAAATGTATAAGGT 116184190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8060 TCTTTTGTGGAATTTGTATTTAAGGCTTACACTTTGACTTTTATACTAAATGTATAAGGT 8119

116184191 TAAATAAGCATAATAGTCTCGGTGTTTACTTCTTAATTTAAACATAAATATAGGAAGTAG 116184250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8120 TAAATAAGCATAATAGTCTCGGTGTTTACTTCTTAATTTAAACATAAATATAGGAAGTAG 8179

116184251 GTTCTTAATTAATAATCTCAAATTCTGACTAGAGGGTAGTAAGTTACAACATATTATGAA 116184310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8180 GTTCTTAATTAATAATCTCAAATTCTGACTAGAGGGTAGTAAGTTACAACATATTATGAA 8239

116184311 GCAGAAAAATGGTCACCCATTTTATATTTACCCTTGCGTAGAAAAAATTATTTCATAAAT 116184370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     8240 GCAGAAAAATGGTCACCCATTTTATATTTACCCTTGAGTAGAAAAAATTATTTCATAAAT 8299

116184371 CTTAGGCAATTTCAGAAATTTCAAAATTTTCTTTTACTTAAAGAATTGGAGGAAACTTGA 116184430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8300 CTTAGGCAATTTCAGAAATTTCAAAATTTTCTTTTACTTAAAGAATTGGAGGAAACTTGA 8359

116184431 TTTTTTGTGAGAACAATTTTCTCATTTTTAAAATTATAGATTCATAGTAAGTTGTCTCTG 116184490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8360 TTTTTTGTGAGAACAATTTTCTCATTTTTAAAATTATAGATTCATAGTAAGTTGTCTCTG 8419

116184491 TAGGACAGATAAGTCTTGCAAACAAACTCTTACAATTTCCCTTAACAGTGGCACATTATA 116184550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8420 TAGGACAGATAAGTCTTGCAAACAAACTCTTACAATTTCCCTTAACAGTGGCACATTATA 8479

116184551 TCACTGTAGTACAACATGAAAACCAGGAAATTGGCATTGGTACTTGTATGGATGTGTG 116184608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8480 TCACTGTAGTACAACATGAAAACCAGGAAATTGGCATTGGTACTTGTATGGATGTGTG 8537

Alignment time is 9.13974 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     2211] =>      2211 nucs 'mol-32-3164-025752_2211'

Score:        1899
Aligned:      2140        nucs
Identic:      2114 ( 99%) nucs =>        36 (100%)      2078 ( 99%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116166872,116166907] EXCISED REGION [116177181,116179279]
 second seq =>  [        1,       36] EXCISED REGION [      113,     2211]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10273 nucs [116166908,116177180]
 second seq =>        76 nucs [37,112]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [37,40] to [113,116]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116166908,116166909] to [116177179,116177180]
 second seq =>         1 nucs [37,37] to [112,112]

116166872 CAGACATGGTTAACTATCACTCTACTTGGTTAATTA 116166907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGACATGGTTAACTATCACTCTACTTGGTTAATTA 36

EXCISED REGION

116177181 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCA 116177240
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
      113 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATATATAATATTGTATATGTTAATTTCCATACCCA 172

116177241 TAGGATTCAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 116177300
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      173 TAGGATTAAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 232

116177301 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 116177360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      233 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 292

116177361 TTTTTATTAATAAACGAATAAATAATCAATTATATTCAAAGG-TTTTATATGAGAATAAA 116177419
          |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||
      293 TTTTTATTAATAAACGAATAAAT----AATTATATTCAAAGGCTTTTATATGAGAATAAA 348

116177420 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 116177479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      349 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 408

116177480 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 116177539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      409 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 468

116177540 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 116177599
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      469 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCACTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 528

116177600 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAA 116177659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
      529 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGATAAACAACAGGAATCATAGAAA 588

116177660 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 116177719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      589 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 648

116177720 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 116177779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 708

116177780 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 116177839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 768

116177840 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 116177899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 828

116177900 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 116177959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      829 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGGAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 888

116177960 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACC---CAGCAACAACAACAAC 116178016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
      889 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAGCAACAACAACAAC 948

116178017 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 116178076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 1008

116178077 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCT 116178136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
     1009 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATGTAATCGAGAAGTAGGGCT 1068

116178137 TCCTCTCTTAACTCGTCATCCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 116178196
          ||||||| ||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 TCCTCTC-TAACTCCTCATTCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 1127

116178197 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCA 116178256
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
     1128 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAGAATGAAAAAATCCTTA 1187

116178257 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAG-AAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 116178315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1188 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAGTAAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 1247

116178316 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 116178375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 1307

116178376 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 116178435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 1367

116178436 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 116178495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 1427

116178496 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 116178555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 1487

116178556 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTAT 116178615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1488 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTCT 1547

116178616 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 116178675
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAAAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 1607

116178676 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAA 116178735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1608 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATGATAAGGCTATAGTGAACAA 1667

116178736 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 116178795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 1727

116178796 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 116178855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 1787

116178856 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 116178915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 1847

116178916 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 116178975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 1907

116178976 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 116179035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 1967

116179036 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 116179095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 2027

116179096 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 116179155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 2087

116179156 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 116179215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 2147

116179216 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 116179275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 2207

116179276 CAAA 116179279
          ||||
     2208 CAAA 2211

Alignment time is 2.40843 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     2581] =>      2581 nucs 'mol-32-321f-043837_2581'

Score:        2269
Aligned:      2510        nucs
Identic:      2484 ( 99%) nucs =>        90 (100%)      2394 ( 99%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116166818,116166907] EXCISED REGION [116177181,116179595]
 second seq =>  [        1,       90] EXCISED REGION [      167,     2581]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10273 nucs [116166908,116177180]
 second seq =>        76 nucs [91,166]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [91,94] to [167,170]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116166908,116166909] to [116177179,116177180]
 second seq =>         1 nucs [91,91] to [166,166]

116166818 TATTGAATCTATATTATATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACA 116166877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATTGAATCTATATTATATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACA 60

116166878 TGGTTAACTATCACTCTACTTGGTTAATTA 116166907
          ||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGTTAACTATCACTCTACTTGGTTAATTA 90

EXCISED REGION

116177181 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCA 116177240
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
      167 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATATATAATATTGTATATGTTAATTTCCATACCCA 226

116177241 TAGGATTCAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 116177300
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      227 TAGGATTAAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 286

116177301 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 116177360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      287 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 346

116177361 TTTTTATTAATAAACGAATAAATAATCAATTATATTCAAAGG-TTTTATATGAGAATAAA 116177419
          |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||
      347 TTTTTATTAATAAACGAATAAAT----AATTATATTCAAAGGCTTTTATATGAGAATAAA 402

116177420 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 116177479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      403 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 462

116177480 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 116177539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      463 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 522

116177540 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 116177599
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      523 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCACTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 582

116177600 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAA 116177659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
      583 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGATAAACAACAGGAATCATAGAAA 642

116177660 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 116177719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      643 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 702

116177720 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 116177779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      703 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 762

116177780 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 116177839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      763 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 822

116177840 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 116177899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      823 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 882

116177900 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 116177959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      883 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGGAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 942

116177960 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACC---CAGCAACAACAACAAC 116178016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
      943 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAGCAACAACAACAAC 1002

116178017 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 116178076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1003 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 1062

116178077 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCT 116178136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
     1063 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATGTAATCGAGAAGTAGGGCT 1122

116178137 TCCTCTCTTAACTCGTCATCCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 116178196
          ||||||| ||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 TCCTCTC-TAACTCCTCATTCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 1181

116178197 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCA 116178256
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
     1182 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAGAATGAAAAAATCCTTA 1241

116178257 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAG-AAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 116178315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1242 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAGTAAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 1301

116178316 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 116178375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 1361

116178376 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 116178435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 1421

116178436 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 116178495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 1481

116178496 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 116178555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 1541

116178556 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTAT 116178615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1542 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTCT 1601

116178616 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 116178675
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAAAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 1661

116178676 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAA 116178735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1662 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATGATAAGGCTATAGTGAACAA 1721

116178736 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 116178795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 1781

116178796 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 116178855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 1841

116178856 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 116178915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 1901

116178916 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 116178975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 1961

116178976 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 116179035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 2021

116179036 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 116179095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 2081

116179096 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 116179155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 2141

116179156 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 116179215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 2201

116179216 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 116179275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 2261

116179276 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 116179335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 2321

116179336 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 116179395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 2381

116179396 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTG 116179455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTG 2441

116179456 AGGATGCAGAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCT 116179515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 AGGATGCAGAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCT 2501

116179516 ATGGAAATCATATAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAA 116179575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 ATGGAAATCATATAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAA 2561

116179576 ATTATACTGCTGAGTATCTA 116179595
          ||||||||||||||||||||
     2562 ATTATACTGCTGAGTATCTA 2581

Alignment time is 2.7613 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     2953] =>      2953 nucs 'mol-32-3240-024572_2953'

Score:        2630
Aligned:      2882        nucs
Identic:      2855 ( 99%) nucs =>       262 (100%)      2593 ( 99%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116166645,116166907] EXCISED REGION [116177181,116179794]
 second seq =>  [        1,      263] EXCISED REGION [      340,     2953]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>     10273 nucs [116166908,116177180]
 second seq =>        76 nucs [264,339]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [264,267] to [340,343]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [116166908,116166909] to [116177179,116177180]
 second seq =>         1 nucs [264,264] to [339,339]

116166645 TTTTATACCTATACTTATGTATTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATTCAAAAA 116166704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTATACCTATACTTATGTATTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATTCAAAAA 60

116166705 TATAATTTCACTTTAAACACTGAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAAAGGAAT 116166764
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
       61 TATAATTTCACTTTAAACACTGAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAAAGGGAT 120

116166765 ACATTGCATATTATGAGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATATTGAA 116166824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACATTGCATATTATGAGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATATTGAA 180

116166825 TCTATATTATATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAA 116166884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTATATTATATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGTTAA 240

116166885 CTATCACTCTACTTGGTTAATTA 116166907
          |||||||||||||||||||||||
      241 CTATCACTCTACTTGGTTAATTA 263

EXCISED REGION

116177181 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATGTATAATATTATATATGTTAATTTCCATACCCA 116177240
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||
      340 GAATATAATTTGCAATGCTTCCTTAATATATAATATTGTATATGTTAATTTCCATACCCA 399

116177241 TAGGATTCAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 116177300
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      400 TAGGATTAAGTCTAATATGATGTTTTATAGTGTAGGGGATAGAATGTATTTAAAATCCAG 459

116177301 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 116177360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      460 TATAACCCACATATTTTATCAGATAGCATTGACAGACCCCATCCAAGGCTAAACACATGA 519

116177361 TTTTTATTAATAAACGAATAAATAATCAATTATATTCAAAGG-TTTTATATGAGAATAAA 116177419
          |||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||||||
      520 TTTTTATTAATAAACGAATAAAT----AATTATATTCAAAGGCTTTTATATGAGAATAAA 575

116177420 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 116177479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      576 ACTGTCTCTCCATATTCTGTGGGTTTCACATCTATGGATTCAAAAATCACAGATTGAAAA 635

116177480 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 116177539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      636 TATTCAAAAATAATTAAAAAATAAAAATAGGGTTCCGGTTGAAGATGGCAGGCTAAAAGC 695

116177540 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCGCTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 116177599
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      696 AGCTAGTGGGTGTCTCCCTCACTGACAAGAATCAAAACAGTGAGTAAATATTAACACTTC 755

116177600 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGACAAACAACAGGAATCACAGAAA 116177659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||
      756 AAGTAGATCATCTAAGAGAGCACATGGAGTTTATCAGATAAACAACAGGAATCATAGAAA 815

116177660 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 116177719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      816 ATAGGAGCGTGAAACCAAGCAGCCCTCTGAGTTTAGCCTGGCATGGAGCTGGGAGAGGAG 875

116177720 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 116177779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 CTGGGAGAATCTCCCTAATGCAGGAAAGGGATGAGTGAGTGACTCCTGGGGCTCCACACA 935

116177780 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 116177839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 ATCAGAAATGATAAAAGTGAAATCATAACTGATACCACAGAAATACAAAAGATCATCAGA 995

116177840 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 116177899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 GACTACTATGAGTACCTCTACATGCACATTCTAGAACACCTACAGGAAATGAATAAATTT 1055

116177900 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGAAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 116177959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     1056 CTTAAACTATAAAACCTCCCAGTACCAAACCAGGGAGAAATAGACTACTGAACAGACCAA 1115

116177960 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACC---CAGCAACAACAACAAC 116178016
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||
     1116 TAACAAGTAGTGAGACTTAGTTGGTAATAAAAAAAATCACCCAGCAGCAACAACAACAAC 1175

116178017 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 116178076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 AACAACAACAACAACCAAAAAAAGCCCAGGACCAGATGTATTCACAGCTGAATTCTACAA 1235

116178077 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATATAATTGAGAAGTAGGGCT 116178136
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||
     1236 GAACCATGCAGAAGAATATGTACCAATCCAAAGTATTGCATGTAATCGAGAAGTAGGGCT 1295

116178137 TCCTCTCTTAACTCGTCATCCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 116178196
          ||||||| ||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 TCCTCTC-TAACTCCTCATTCTAAAGAACCAGTATTATCCTGATAACAAAATCAGGAAAG 1354

116178197 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAAAATGAAAAAATCCTCA 116178256
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
     1355 GACACAACAGAAGTAGAAAACTACAGGCCAATATCCCCAATTAGAATGAAAAAATCCTTA 1414

116178257 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAG-AAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 116178315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
     1415 ACTAACTACTAGCAAAGTAAATACAAGAGCTCAGTAAAAACATAATACCTCAAGACCAAG 1474

116178316 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 116178375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 TGGGATTTATCCAGGGATGCGAGGATGGTTCAACATATGTAACTCTATCACGTTCAATAG 1534

116178376 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 116178435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 CTACAAAATATAAAATACCTAGAAATGTATTTAACCAAGTGAGTAAAAGATCTCTACAAG 1594

116178436 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 116178495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 GAGAACTACATAAGCACTGATGAAAGAAATTGTAGATGACACAAATGAGAAAACATCTGA 1654

116178496 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 116178555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 TGCTCATGGATGGGAAGAATCAATACTGTTAAAATGACCATTTTTCCCAAAGCAATTTAC 1714

116178556 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTAT 116178615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1715 AGGTTTAATGCAATTCCTATCAAAGCTCCAATATTTTTTACATAATTGTAAAAAAATTCT 1774

116178616 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAGAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 116178675
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 AGAATTTATATGAAACCAAAAAAAAGCCTGAATATCCAAATCAATCCTAAGCAAAATGAA 1834

116178676 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATTATAAGGCTATAGTGAACAA 116178735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1835 CAAATTCGGAAGCATCACATTACCAGACTTTATAGTATATGATAAGGCTATAGTGAACAA 1894

116178736 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 116178795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 AAGTCCATGGCACTGATACAAAAAAAGACATATAGAAAAATGGAATAAATATACAACTCA 1954

116178796 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 116178855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 GAAATAAAACCACATACTTGAAACCAACTTATCTTTGGCAAAAGTAACCAAAATAATCAA 2014

116178856 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 116178915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 TGGAGAAAGGACACTTTATTCGATAAATGGTGCTGGGAAAACTGGGAAGCCATTTGAATG 2074

116178916 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 116178975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 AAACTGGGCCACTACCTAACACCATATACAAAAATTAACTCAAGATGGATTGGAATCTTA 2134

116178976 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 116179035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 AACGCTAGACCTGAAACTATGAAAATCCTTGGAAGAAACCTAGGGAGAATTTCATCTGCA 2194

116179036 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 116179095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 TATTGGCCTAGGCAAAGAATTTATGACTAAGTCCTCAATAGCAAATGTAACTAAAAAATA 2254

116179096 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 116179155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 GAAATATGGGACTTAACTACAAAACTTCTGCACAGCAAAAGAAATAATGAACAGAGTAAA 2314

116179156 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 116179215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 CAGGGAGCCTGTGCAATAGGATAAAATATTTTCTAACTATGCATCTGAAAAAAGACTAGT 2374

116179216 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 116179275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 ATCCAGAATCTAGAATGAACTCAATTCAACAAGAAAAATAAAATCCCATAAAAAAGTGGG 2434

116179276 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 116179335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 CAAAAGTCATCAACAGACATTTCACAAAGAAGACATATAAGTAGCCAATAAAAATATTTT 2494

116179336 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 116179395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 AAAAATGCTCAACATTACTAATCATCAAATAAATGCAAGTTGAAACCACAATGAGATACC 2554

116179396 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTG 116179455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 CATCATTTTACACCAGTCAGATGGCTATTTATAAAAAGTAAAAAACAACAGATGTTGGTG 2614

116179456 AGGATGCAGAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCT 116179515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 AGGATGCAGAAAAAAGGGAATATTTGTATGCTAGTTTGGAGGTAAATCTGTACAACCTCT 2674

116179516 ATGGAAATCATATAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAA 116179575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 ATGGAAATCATATAGAGATTTCTCAGAGAACTAAAAATAAACCTCAGTTTTGACCCAGAA 2734

116179576 ATTATACTGCTGAGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAATCAATATATTAAAAAAGACACCTG 116179635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 ATTATACTGCTGAGTATCTACCCAAAGGAAAAGAAATCAATATATTAAAAAAGACACCTG 2794

116179636 TACTTGTGTGTTTATCACAGCACTATTCACAATAGCCAAGATACGGTATCAACCTTGATG 116179695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 TACTTGTGTGTTTATCACAGCACTATTCACAATAGCCAAGATACGGTATCAACCTTGATG 2854

116179696 TTCATCAATGAATGAATGGATTAAGAAAATGTGTTTTATATATATACATAATAGAATACT 116179755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 TTCATCAATGAATGAATGGATTAAGAAAATGTGTTTTATATATATACATAATAGAATACT 2914

116179756 ATGCAGCTGTAAAACAGAATGAATCATATATTTTGCAGC 116179794
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 ATGCAGCTGTAAAACAGAATGAATCATATATTTTGCAGC 2953

Alignment time is 3.19933 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     4741] =>      4741 nucs 'mol-32-34a8-066499_4741'

Score:        4741
Aligned:      4741        nucs
Identic:      4741 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116162681,116167421]
 second seq =>  [        1,     4741]

116162681 GGCTATTTAATAGAAAAATAATGTTAAGTGGTTGTATAATCAAAAGGTTTAGAAGATTTG 116162740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTATTTAATAGAAAAATAATGTTAAGTGGTTGTATAATCAAAAGGTTTAGAAGATTTG 60

116162741 GCAACGGATTGCAGTGGTTCAAATCATACTCCTGTTAATTAGTAGCTTTTTTATAAGTCT 116162800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAACGGATTGCAGTGGTTCAAATCATACTCCTGTTAATTAGTAGCTTTTTTATAAGTCT 120

116162801 TAAACACATTATATATCTTTCCTCTCTAATTATGAATTTTATCATATGTAAAAGGGAATT 116162860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAACACATTATATATCTTTCCTCTCTAATTATGAATTTTATCATATGTAAAAGGGAATT 180

116162861 ATAGCAGAATCAACCTCAAAATTTTGGTGAGAGAATGAAATGAATAATCAGTATAAAACG 116162920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAGCAGAATCAACCTCAAAATTTTGGTGAGAGAATGAAATGAATAATCAGTATAAAACG 240

116162921 TTTAGCATAGTAAATATTCAATATGGATTAGTTGTTAATCTCTTACATAGCAATAATTAT 116162980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTAGCATAGTAAATATTCAATATGGATTAGTTGTTAATCTCTTACATAGCAATAATTAT 300

116162981 ATTTGAATATCTGGCACCTCTTTTCTATTTTAGCAATGTTTTGTGACATTCTCATTGAAA 116163040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTGAATATCTGGCACCTCTTTTCTATTTTAGCAATGTTTTGTGACATTCTCATTGAAA 360

116163041 TTTATAGATACCTAACTGACAAAATCTCCTATACCATCCTGCAATAATGGAAATATTATA 116163100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTATAGATACCTAACTGACAAAATCTCCTATACCATCCTGCAATAATGGAAATATTATA 420

116163101 AAAATTATTGAATGATCATCTAGGCCAGCATCCTATTTTAGTGTTTGAATCCCTGAAGTG 116163160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAATTATTGAATGATCATCTAGGCCAGCATCCTATTTTAGTGTTTGAATCCCTGAAGTG 480

116163161 TAAGAGAGTCTAAGTGATTTTTCTGAAGTCAAACATCTACTCTTGGTGGAGATCCAAGAT 116163220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAGAGAGTCTAAGTGATTTTTCTGAAGTCAAACATCTACTCTTGGTGGAGATCCAAGAT 540

116163221 TAGGATTTGAGTGTTCTGATTTTTTGAAAGTGTTTTCTTCAGTTTATTTTCACATCTGTG 116163280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGGATTTGAGTGTTCTGATTTTTTGAAAGTGTTTTCTTCAGTTTATTTTCACATCTGTG 600

116163281 TGTACAACCAAGACTTGTTTTTCGGACAGGAGTGGAGTAGACAAGTTAACTTCCAGATTG 116163340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTACAACCAAGACTTGTTTTTCGGACAGGAGTGGAGTAGACAAGTTAACTTCCAGATTG 660

116163341 CATATACTAGAATTTAAGATAAGAACTTGATCACTAGACTGTGCATAAAGATTATTCTTT 116163400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATATACTAGAATTTAAGATAAGAACTTGATCACTAGACTGTGCATAAAGATTATTCTTT 720

116163401 CTAGAAATAGTGCAAGTGCCTGACCACTTGGGATGAGTTAGTAGTTGGCAAATATCATTG 116163460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTAGAAATAGTGCAAGTGCCTGACCACTTGGGATGAGTTAGTAGTTGGCAAATATCATTG 780

116163461 TCTCCTTGACCAATGGGGTGAGAGCCATGATGATAAGAAAAGCCAACTGGAAGGTACTGA 116163520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCTCCTTGACCAATGGGGTGAGAGCCATGATGATAAGAAAAGCCAACTGGAAGGTACTGA 840

116163521 AATCCCAAGCAGACAAGATAGTCAAATAAAGCAATGTTGAATCTCAGGAAGAAATTAATC 116163580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATCCCAAGCAGACAAGATAGTCAAATAAAGCAATGTTGAATCTCAGGAAGAAATTAATC 900

116163581 TACCATCATAAACCTTTAGGATGTTGGAGATGTGGTCGCTAGTATTTTTATGATCAATTC 116163640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TACCATCATAAACCTTTAGGATGTTGGAGATGTGGTCGCTAGTATTTTTATGATCAATTC 960

116163641 AACTGTGTTGATTTTGCACAAACCAGATAGTTTGTAACAAAAGATGGTGGATTATCATAA 116163700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACTGTGTTGATTTTGCACAAACCAGATAGTTTGTAACAAAAGATGGTGGATTATCATAA 1020

116163701 TTTTAATCAAACATGAGCCCCAATCACTTTTGCAGTTCTAAATGAGGTACTTTTACCTAA 116163760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTTAATCAAACATGAGCCCCAATCACTTTTGCAGTTCTAAATGAGGTACTTTTACCTAA 1080

116163761 AGATATCAAAACAGGCTTGGAAACTTAGTGTGCTTCTATACATATAACAAATGTATCATT 116163820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGATATCAAAACAGGCTTGGAAACTTAGTGTGCTTCTATACATATAACAAATGTATCATT 1140

116163821 TTCACTATTAGTTGAGATGAAAAAAATTGCCTTTTGTGACAAGAATAGGAGGGCAACAAT 116163880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTCACTATTAGTTGAGATGAAAAAAATTGCCTTTTGTGACAAGAATAGGAGGGCAACAAT 1200

116163881 TATTTTATCTAAAGGATATATTAATTTTACTTTTGCCTGTTCAAAGATAATATGAAGTAC 116163940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATTTTATCTAAAGGATATATTAATTTTACTTTTGCCTGTTCAAAGATAATATGAAGTAC 1260

116163941 CTCAATTTGGTGTTCTGCAGAATTTCACACATTTCATGATTACATGATGAAAAATTGGAT 116164000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCAATTTGGTGTTCTGCAGAATTTCACACATTTCATGATTACATGATGAAAAATTGGAT 1320

116164001 CTAGTGAGTAGGCAATGGTATATATTCATTATGCCATGCTAGGACATGTAAATGACTGTC 116164060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTAGTGAGTAGGCAATGGTATATATTCATTATGCCATGCTAGGACATGTAAATGACTGTC 1380

116164061 TATGTGAAATGAACTGTACAAAGATTCAGAGACATGCCATATTAATGAAAGGTTTTAAGG 116164120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATGTGAAATGAACTGTACAAAGATTCAGAGACATGCCATATTAATGAAAGGTTTTAAGG 1440

116164121 GTTGCTCAGCTAGGATGGCTGGTACAAAATGGGGGACTGGTGGAGTTTGTCCAGAATTTA 116164180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTTGCTCAGCTAGGATGGCTGGTACAAAATGGGGGACTGGTGGAGTTTGTCCAGAATTTA 1500

116164181 AGAGATTCACTGAATTGTCTCTTTGCAGTTCTATGCCTGGTGACAGTGGTGAGCAACAAT 116164240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAGATTCACTGAATTGTCTCTTTGCAGTTCTATGCCTGGTGACAGTGGTGAGCAACAAT 1560

116164241 TTTAATGACAGTAGCCTAACAAGGGAAAGACAACAAAGAGCTTAATTTTGTGAGATGAAA 116164300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTAATGACAGTAGCCTAACAAGGGAAAGACAACAAAGAGCTTAATTTTGTGAGATGAAA 1620

116164301 GAAAAATCAACCCACCATGGAAACAAGCTAGACCAGCTGAATTGCTGATCCGGGCTGAAA 116164360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GAAAAATCAACCCACCATGGAAACAAGCTAGACCAGCTGAATTGCTGATCCGGGCTGAAA 1680

116164361 AAAATCTAGGATGTATAGGTGAAAAAGAAAAATGATAAATATAACAGTGGAGATTATAGT 116164420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAAATCTAGGATGTATAGGTGAAAAAGAAAAATGATAAATATAACAGTGGAGATTATAGT 1740

116164421 TTGTTTCAGTGACCATTGTATATAGTCTGCTGTGCTATATACAAAACGAGGCCAGCAATC 116164480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTGTTTCAGTGACCATTGTATATAGTCTGCTGTGCTATATACAAAACGAGGCCAGCAATC 1800

116164481 AATTTGAAAATTCAATGCGATAAAAGACTAAAATGATGTAAGTGGTAGACGGTATCTGAT 116164540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATTTGAAAATTCAATGCGATAAAAGACTAAAATGATGTAAGTGGTAGACGGTATCTGAT 1860

116164541 GCCTCAGTTACCCCACCATACATCTTCCTTGCCTCACATATAATTGTACCTCTGGTTTCA 116164600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCCTCAGTTACCCCACCATACATCTTCCTTGCCTCACATATAATTGTACCTCTGGTTTCA 1920

116164601 TGGATAATTCTGCATGTGTTTTGAGATGCCTGGTCTTAATAGCATCTTGTTGTCTGTGTC 116164660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TGGATAATTCTGCATGTGTTTTGAGATGCCTGGTCTTAATAGCATCTTGTTGTCTGTGTC 1980

116164661 ACCTTTTCTCCTGAGCTGCAGACGTAAATGGGTGTTACTTCATTATGCTTCATAGTAATC 116164720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACCTTTTCTCCTGAGCTGCAGACGTAAATGGGTGTTACTTCATTATGCTTCATAGTAATC 2040

116164721 CCAAATCAAAGGGAAATTAATGCCCTTGAGAACAACTCTTAACTCTTAAAGTGGTGGTAG 116164780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCAAATCAAAGGGAAATTAATGCCCTTGAGAACAACTCTTAACTCTTAAAGTGGTGGTAG 2100

116164781 CAGCAGATGCATTAAACCTTAGGTGGGCAATTCTAGGAGACATTCTGCACTCTCCTTTGA 116164840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CAGCAGATGCATTAAACCTTAGGTGGGCAATTCTAGGAGACATTCTGCACTCTCCTTTGA 2160

116164841 ATCTCCCAACTGAAATGAAGCCTCAGTTGCTCACAACAATGTGTATTATTACAAAGTGAC 116164900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATCTCCCAACTGAAATGAAGCCTCAGTTGCTCACAACAATGTGTATTATTACAAAGTGAC 2220

116164901 TAGATTTTCCCCCTTACCTCCTTCCTCCTTTCCTCCTTTTCCTCCTTTCTTCAGTTCTTC 116164960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAGATTTTCCCCCTTACCTCCTTCCTCCTTTCCTCCTTTTCCTCCTTTCTTCAGTTCTTC 2280

116164961 AAGTATGGAACAAGGATATATATGCAAGCTGCTTTTAGGAAATAATCTCAAGCAGCTTGC 116165020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGTATGGAACAAGGATATATATGCAAGCTGCTTTTAGGAAATAATCTCAAGCAGCTTGC 2340

116165021 ATATAAATCTTTGTTCCAAGCTCTACTTCAAGGGTTCCCCAGTCTAAGATATCTTTTGTT 116165080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATATAAATCTTTGTTCCAAGCTCTACTTCAAGGGTTCCCCAGTCTAAGATATCTTTTGTT 2400

116165081 CAGTAAATCTTGTTTTATTTTATTAAATCCTGCTTGGCTATGAGAAATATATTTTTGTTA 116165140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGTAAATCTTGTTTTATTTTATTAAATCCTGCTTGGCTATGAGAAATATATTTTTGTTA 2460

116165141 GAGCAATTACAAGACAATTTCAATTGATAAGTAAAATAATTTCTTTCCATTTTATGATCC 116165200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAGCAATTACAAGACAATTTCAATTGATAAGTAAAATAATTTCTTTCCATTTTATGATCC 2520

116165201 AGGATAGCTCCTATTATTTTTTCCACATAACTATCTTTCATAATCAATTTATATACATAA 116165260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AGGATAGCTCCTATTATTTTTTCCACATAACTATCTTTCATAATCAATTTATATACATAA 2580

116165261 ATTGGTGAAAGTTAGGCAAATTTATAAGATTCATTCTCTTTTTATGAATCACTACTATAC 116165320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTGGTGAAAGTTAGGCAAATTTATAAGATTCATTCTCTTTTTATGAATCACTACTATAC 2640

116165321 ATTTTAAACCAAGTTTCTTTCTTCCCTTGGTAGCTAGTTCCACCCATACCACTACCTTCT 116165380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ATTTTAAACCAAGTTTCTTTCTTCCCTTGGTAGCTAGTTCCACCCATACCACTACCTTCT 2700

116165381 TTAGTGTAAAAATGACTCTGTCTTTGAAATTAAAAAATATATATAAATATTTGTAAACAT 116165440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTAGTGTAAAAATGACTCTGTCTTTGAAATTAAAAAATATATATAAATATTTGTAAACAT 2760

116165441 CATAAATAAATTACGGAATAATAAAGAAAAGCCCACTGCTTACAATTGTAGCTCAGGCAG 116165500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CATAAATAAATTACGGAATAATAAAGAAAAGCCCACTGCTTACAATTGTAGCTCAGGCAG 2820

116165501 TATGGGGAATTAGATTAGGGAACCTGGGTGGTTTTCTGTTTGAATAATATATTTGTAATG 116165560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TATGGGGAATTAGATTAGGGAACCTGGGTGGTTTTCTGTTTGAATAATATATTTGTAATG 2880

116165561 GTATTACATTTAGTAGGATTAGACACATATGATAATTGTTAAATTCATACACAAATTGAC 116165620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTATTACATTTAGTAGGATTAGACACATATGATAATTGTTAAATTCATACACAAATTGAC 2940

116165621 TTTAGTTACCTCTCATGGTGCATTGTTACTGGAAACACTCTTAATATATTTTGAATCTCT 116165680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTAGTTACCTCTCATGGTGCATTGTTACTGGAAACACTCTTAATATATTTTGAATCTCT 3000

116165681 GTGGCATGTATTCATTAGCTTCTTTTATTGCATTATAGAAAACCAGAAATGCAATTTATA 116165740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GTGGCATGTATTCATTAGCTTCTTTTATTGCATTATAGAAAACCAGAAATGCAATTTATA 3060

116165741 TCAATTTGCTTTCCATACTTCTTAAAAAATTTGAATAAACACGAAAAAGTACTTCTGAGT 116165800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCAATTTGCTTTCCATACTTCTTAAAAAATTTGAATAAACACGAAAAAGTACTTCTGAGT 3120

116165801 TCCTGTATTGTATACTGTAATAGGGATATATGCCTATACAGATCACTTATTAAATTGTCT 116165860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCCTGTATTGTATACTGTAATAGGGATATATGCCTATACAGATCACTTATTAAATTGTCT 3180

116165861 AACACTTTCAGATAATTCAGTATAAAATTCAGTACAAAATTCTGCATGTAAGACTACCAT 116165920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AACACTTTCAGATAATTCAGTATAAAATTCAGTACAAAATTCTGCATGTAAGACTACCAT 3240

116165921 TTCCTGCCAGATTTACAAATTCACATATTCTAGAATATTATTTATGAATATATATTTACA 116165980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTCCTGCCAGATTTACAAATTCACATATTCTAGAATATTATTTATGAATATATATTTACA 3300

116165981 CACATACCTCTTATTTTCTTCTCCACACTTTGGAATTTGGAGGATGAGTTGTGGAGAATA 116166040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CACATACCTCTTATTTTCTTCTCCACACTTTGGAATTTGGAGGATGAGTTGTGGAGAATA 3360

116166041 AAAAAAAAAGTGGTGGGAAGAAAACATTTACTTGTCTGTGTTTATTCTCTGCTGGGTCTT 116166100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AAAAAAAAAGTGGTGGGAAGAAAACATTTACTTGTCTGTGTTTATTCTCTGCTGGGTCTT 3420

116166101 AGTCGGCAAAGCTACCTTTGTAGTAGGTCCTCTTTTCTTTTATCCTTCTTTGTTGTTCTT 116166160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGTCGGCAAAGCTACCTTTGTAGTAGGTCCTCTTTTCTTTTATCCTTCTTTGTTGTTCTT 3480

116166161 TCAAACAAAATTTGGAGATGTTACCCACTTTGTCCCAGTTTCTGATTCTGGTGAAATCAA 116166220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TCAAACAAAATTTGGAGATGTTACCCACTTTGTCCCAGTTTCTGATTCTGGTGAAATCAA 3540

116166221 AATTCAAATCTTTCTGTCGTTTTAAATTTTAATATTTTCGTGACTATTTTTTTCCTTTTT 116166280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AATTCAAATCTTTCTGTCGTTTTAAATTTTAATATTTTCGTGACTATTTTTTTCCTTTTT 3600

116166281 TGGATGGATTACATTTGGTTTTTGCTTCAACAAATTTCTTATTTCGGATTTAGGTACACA 116166340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGGATGGATTACATTTGGTTTTTGCTTCAACAAATTTCTTATTTCGGATTTAGGTACACA 3660

116166341 ATGATTTGTTTGTGAATTGATATCTTAGACAGTCTTCTGTTGCCTAATGTATTTCATTCC 116166400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATGATTTGTTTGTGAATTGATATCTTAGACAGTCTTCTGTTGCCTAATGTATTTCATTCC 3720

116166401 CTCTTTTCACTCTCCAATAAATACATTTATCATATTATGTTAATGAAAGATAGGCTTCTC 116166460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTCTTTTCACTCTCCAATAAATACATTTATCATATTATGTTAATGAAAGATAGGCTTCTC 3780

116166461 CATAACTTTCTAGACTGTATGTACACCGAGAGAAAGAACATCATAAGTTGGATAGTAATG 116166520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CATAACTTTCTAGACTGTATGTACACCGAGAGAAAGAACATCATAAGTTGGATAGTAATG 3840

116166521 GTGTACATGAAAGACACATAATTATTAAAGATTATTAGTAAATGTGCAAAATCCTATGTC 116166580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GTGTACATGAAAGACACATAATTATTAAAGATTATTAGTAAATGTGCAAAATCCTATGTC 3900

116166581 CTTTATAGTATACACTATATATTTGTTTCTTTAATATGCTGCACATATTTGCTAAAGATA 116166640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTTTATAGTATACACTATATATTTGTTTCTTTAATATGCTGCACATATTTGCTAAAGATA 3960

116166641 TTTATTTTATACCTATACTTATGTATTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATTCA 116166700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTTATTTTATACCTATACTTATGTATTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATTCA 4020

116166701 AAAATATAATTTCACTTTAAACACTGAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAAAG 116166760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAAATATAATTTCACTTTAAACACTGAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAAAG 4080

116166761 GAATACATTGCATATTATGAGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATAT 116166820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GAATACATTGCATATTATGAGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATAT 4140

116166821 TGAATCTATATTATATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGG 116166880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TGAATCTATATTATATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGG 4200

116166881 TTAACTATCACTCTACTTGGTTAATTATTCTTGTCCAAAGACATGATTTCATATGGAACT 116166940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTAACTATCACTCTACTTGGTTAATTATTCTTGTCCAAAGACATGATTTCATATGGAACT 4260

116166941 ATATAGACTATTGTATTCCAAAGGTAGGGATTACTGAAAGGCCAACAGACACCTAAAAGT 116167000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ATATAGACTATTGTATTCCAAAGGTAGGGATTACTGAAAGGCCAACAGACACCTAAAAGT 4320

116167001 GATCTTTTGCCTTTGATGCTTCTACATTTAAATTACATGTGCTATTATTAGCAAAGAGGA 116167060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GATCTTTTGCCTTTGATGCTTCTACATTTAAATTACATGTGCTATTATTAGCAAAGAGGA 4380

116167061 ATTTGGCAAATTATGAAGCTCTTTCAACCCTTGCTAATTAATTCCATCCATTTGCCAGAT 116167120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ATTTGGCAAATTATGAAGCTCTTTCAACCCTTGCTAATTAATTCCATCCATTTGCCAGAT 4440

116167121 ATTTCCATATTACCAAGAAGTTCTTCCAAAGGCCTAATATTAAATTGTTGTGGTCTAGGA 116167180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ATTTCCATATTACCAAGAAGTTCTTCCAAAGGCCTAATATTAAATTGTTGTGGTCTAGGA 4500

116167181 CAATTTTTTCTTAACTGTTCTCTGGTTTGTGACAGATATTATGTTATTAATAGAATATAG 116167240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CAATTTTTTCTTAACTGTTCTCTGGTTTGTGACAGATATTATGTTATTAATAGAATATAG 4560

116167241 CATTTGATTCTTATATTATTCCATACACTACCAACTGGTTTACGAAGGAGACCACCAATA 116167300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CATTTGATTCTTATATTATTCCATACACTACCAACTGGTTTACGAAGGAGACCACCAATA 4620

116167301 CAATTCTATTAAAGTCCCTGTCACTTTGTTTGCTATTTAAATTGTTTCTATATTGAATCA 116167360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CAATTCTATTAAAGTCCCTGTCACTTTGTTTGCTATTTAAATTGTTTCTATATTGAATCA 4680

116167361 AGTTCCTTTTATTAATTAAATATAAATTATATTCAGTGGTAATTAAATATTTCAATTATT 116167420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AGTTCCTTTTATTAATTAAATATAAATTATATTCAGTGGTAATTAAATATTTCAATTATT 4740

116167421 A 116167421
          |
     4741 A 4741

Alignment time is 4.47705 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [116156907,116187180] =>     30274 nucs '4 dna:chromosome chromosome:GRCh37:4:1:191154276:1'
Second seq [        1,     5851] =>      5851 nucs 'mol-32-34a8-129428_5851'

Score:        5851
Aligned:      5851        nucs
Identic:      5851 (100%) nucs
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [116161662,116167512]
 second seq =>  [        1,     5851]

116161662 TATGAATACTATATATTCATAAATATATTCACTAAATATATTTAATATATTTAATTTATT 116161721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATGAATACTATATATTCATAAATATATTCACTAAATATATTTAATATATTTAATTTATT 60

116161722 CAAAATATAATTATAATTTTAAAATGAGAATTTAAAAATATTTAAATGAACATGCAGAGT 116161781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAAAATATAATTATAATTTTAAAATGAGAATTTAAAAATATTTAAATGAACATGCAGAGT 120

116161782 TAAATTGAAGCACATCTTTTACTATATACCTATTTTTCAAAATTATTTCTTCAATTTTCC 116161841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAATTGAAGCACATCTTTTACTATATACCTATTTTTCAAAATTATTTCTTCAATTTTCC 180

116161842 CTGTTCTATTTTTTAAAAAAAGATAAGATCTGCTGATGCTTAATGAATTTTAAATATATA 116161901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGTTCTATTTTTTAAAAAAAGATAAGATCTGCTGATGCTTAATGAATTTTAAATATATA 240

116161902 GCTAGTTGTGTATCTGTGCATATTTATCAGCAGGATAACGAAGGGTTAACAAAACACCTC 116161961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCTAGTTGTGTATCTGTGCATATTTATCAGCAGGATAACGAAGGGTTAACAAAACACCTC 300

116161962 TCTACTTTGTGTCGTGTACATTTGTGAAGTGCAGGTGTGCTATTTCTGTTGAAGGAGTTA 116162021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTACTTTGTGTCGTGTACATTTGTGAAGTGCAGGTGTGCTATTTCTGTTGAAGGAGTTA 360

116162022 GAAGTGGGTTGCAAGCTGGCTAAAGAAATGTACATTACATTCAAAAATGGCTTTATATTC 116162081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAAGTGGGTTGCAAGCTGGCTAAAGAAATGTACATTACATTCAAAAATGGCTTTATATTC 420

116162082 CCTGGCTGTTCACTCTTTTGAATGCAAAAAGTAGTTTTTGCTAACTCCATTTTGCGGCTC 116162141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCTGGCTGTTCACTCTTTTGAATGCAAAAAGTAGTTTTTGCTAACTCCATTTTGCGGCTC 480

116162142 ATGGAAAGCTGAAAAATCAATAGCTTCAGGTTGATGAAACCTAAATCCATTTGATTCCTT 116162201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGGAAAGCTGAAAAATCAATAGCTTCAGGTTGATGAAACCTAAATCCATTTGATTCCTT 540

116162202 TCCACCATTGCCATTATGCAGACAGTCAAGTGTGATGTATTTAGTTCATGCAGTACTTAT 116162261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCACCATTGCCATTATGCAGACAGTCAAGTGTGATGTATTTAGTTCATGCAGTACTTAT 600

116162262 TACTCTCAAGCACAGCTTCTCATCAGGGAAAAATTAGACCAGATGAGAAGTAATCAAGAA 116162321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACTCTCAAGCACAGCTTCTCATCAGGGAAAAATTAGACCAGATGAGAAGTAATCAAGAA 660

116162322 ATTCTGGAGAGGTTTCAAAGATCTTCCTTCTAACTGCTTCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 116162381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTCTGGAGAGGTTTCAAAGATCTTCCTTCTAACTGCTTCCTTAAAAAAAAAAAAAAAAA 720

116162382 AAAAAAAAAAAAAAGTCTTGCTCTCTCAGTCTTTTGGAAGAAAAAAAATAAACATCTCTA 116162441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAAAAAAAAAAAGTCTTGCTCTCTCAGTCTTTTGGAAGAAAAAAAATAAACATCTCTA 780

116162442 CACTCTACCATAAAGCTCTAGAAAGTTCTGTACAATTGCTTCATGTCACTATTTTCTAAC 116162501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CACTCTACCATAAAGCTCTAGAAAGTTCTGTACAATTGCTTCATGTCACTATTTTCTAAC 840

116162502 AATAGATAATACTAGCTGAATAAATGCCAAATTAAGGAATTTTTCCCCTTACTAATGGTA 116162561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATAGATAATACTAGCTGAATAAATGCCAAATTAAGGAATTTTTCCCCTTACTAATGGTA 900

116162562 CCAGAGCCATCACTCTGGCAGAACTAATGCCAAAGCAAAAATAATCACAAATCAATCAGG 116162621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCAGAGCCATCACTCTGGCAGAACTAATGCCAAAGCAAAAATAATCACAAATCAATCAGG 960

116162622 AATCAGAACAAATAAAAAAACTACTTAAACTGATTTGGGTATTTCATTTTTACTGAATTG 116162681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATCAGAACAAATAAAAAAACTACTTAAACTGATTTGGGTATTTCATTTTTACTGAATTG 1020

116162682 GCTATTTAATAGAAAAATAATGTTAAGTGGTTGTATAATCAAAAGGTTTAGAAGATTTGG 116162741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCTATTTAATAGAAAAATAATGTTAAGTGGTTGTATAATCAAAAGGTTTAGAAGATTTGG 1080

116162742 CAACGGATTGCAGTGGTTCAAATCATACTCCTGTTAATTAGTAGCTTTTTTATAAGTCTT 116162801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAACGGATTGCAGTGGTTCAAATCATACTCCTGTTAATTAGTAGCTTTTTTATAAGTCTT 1140

116162802 AAACACATTATATATCTTTCCTCTCTAATTATGAATTTTATCATATGTAAAAGGGAATTA 116162861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAACACATTATATATCTTTCCTCTCTAATTATGAATTTTATCATATGTAAAAGGGAATTA 1200

116162862 TAGCAGAATCAACCTCAAAATTTTGGTGAGAGAATGAAATGAATAATCAGTATAAAACGT 116162921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGCAGAATCAACCTCAAAATTTTGGTGAGAGAATGAAATGAATAATCAGTATAAAACGT 1260

116162922 TTAGCATAGTAAATATTCAATATGGATTAGTTGTTAATCTCTTACATAGCAATAATTATA 116162981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTAGCATAGTAAATATTCAATATGGATTAGTTGTTAATCTCTTACATAGCAATAATTATA 1320

116162982 TTTGAATATCTGGCACCTCTTTTCTATTTTAGCAATGTTTTGTGACATTCTCATTGAAAT 116163041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTGAATATCTGGCACCTCTTTTCTATTTTAGCAATGTTTTGTGACATTCTCATTGAAAT 1380

116163042 TTATAGATACCTAACTGACAAAATCTCCTATACCATCCTGCAATAATGGAAATATTATAA 116163101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTATAGATACCTAACTGACAAAATCTCCTATACCATCCTGCAATAATGGAAATATTATAA 1440

116163102 AAATTATTGAATGATCATCTAGGCCAGCATCCTATTTTAGTGTTTGAATCCCTGAAGTGT 116163161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAATTATTGAATGATCATCTAGGCCAGCATCCTATTTTAGTGTTTGAATCCCTGAAGTGT 1500

116163162 AAGAGAGTCTAAGTGATTTTTCTGAAGTCAAACATCTACTCTTGGTGGAGATCCAAGATT 116163221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAGAGAGTCTAAGTGATTTTTCTGAAGTCAAACATCTACTCTTGGTGGAGATCCAAGATT 1560

116163222 AGGATTTGAGTGTTCTGATTTTTTGAAAGTGTTTTCTTCAGTTTATTTTCACATCTGTGT 116163281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGGATTTGAGTGTTCTGATTTTTTGAAAGTGTTTTCTTCAGTTTATTTTCACATCTGTGT 1620

116163282 GTACAACCAAGACTTGTTTTTCGGACAGGAGTGGAGTAGACAAGTTAACTTCCAGATTGC 116163341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTACAACCAAGACTTGTTTTTCGGACAGGAGTGGAGTAGACAAGTTAACTTCCAGATTGC 1680

116163342 ATATACTAGAATTTAAGATAAGAACTTGATCACTAGACTGTGCATAAAGATTATTCTTTC 116163401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ATATACTAGAATTTAAGATAAGAACTTGATCACTAGACTGTGCATAAAGATTATTCTTTC 1740

116163402 TAGAAATAGTGCAAGTGCCTGACCACTTGGGATGAGTTAGTAGTTGGCAAATATCATTGT 116163461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TAGAAATAGTGCAAGTGCCTGACCACTTGGGATGAGTTAGTAGTTGGCAAATATCATTGT 1800

116163462 CTCCTTGACCAATGGGGTGAGAGCCATGATGATAAGAAAAGCCAACTGGAAGGTACTGAA 116163521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTCCTTGACCAATGGGGTGAGAGCCATGATGATAAGAAAAGCCAACTGGAAGGTACTGAA 1860

116163522 ATCCCAAGCAGACAAGATAGTCAAATAAAGCAATGTTGAATCTCAGGAAGAAATTAATCT 116163581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATCCCAAGCAGACAAGATAGTCAAATAAAGCAATGTTGAATCTCAGGAAGAAATTAATCT 1920

116163582 ACCATCATAAACCTTTAGGATGTTGGAGATGTGGTCGCTAGTATTTTTATGATCAATTCA 116163641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACCATCATAAACCTTTAGGATGTTGGAGATGTGGTCGCTAGTATTTTTATGATCAATTCA 1980

116163642 ACTGTGTTGATTTTGCACAAACCAGATAGTTTGTAACAAAAGATGGTGGATTATCATAAT 116163701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTGTGTTGATTTTGCACAAACCAGATAGTTTGTAACAAAAGATGGTGGATTATCATAAT 2040

116163702 TTTAATCAAACATGAGCCCCAATCACTTTTGCAGTTCTAAATGAGGTACTTTTACCTAAA 116163761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTAATCAAACATGAGCCCCAATCACTTTTGCAGTTCTAAATGAGGTACTTTTACCTAAA 2100

116163762 GATATCAAAACAGGCTTGGAAACTTAGTGTGCTTCTATACATATAACAAATGTATCATTT 116163821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GATATCAAAACAGGCTTGGAAACTTAGTGTGCTTCTATACATATAACAAATGTATCATTT 2160

116163822 TCACTATTAGTTGAGATGAAAAAAATTGCCTTTTGTGACAAGAATAGGAGGGCAACAATT 116163881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCACTATTAGTTGAGATGAAAAAAATTGCCTTTTGTGACAAGAATAGGAGGGCAACAATT 2220

116163882 ATTTTATCTAAAGGATATATTAATTTTACTTTTGCCTGTTCAAAGATAATATGAAGTACC 116163941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 ATTTTATCTAAAGGATATATTAATTTTACTTTTGCCTGTTCAAAGATAATATGAAGTACC 2280

116163942 TCAATTTGGTGTTCTGCAGAATTTCACACATTTCATGATTACATGATGAAAAATTGGATC 116164001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCAATTTGGTGTTCTGCAGAATTTCACACATTTCATGATTACATGATGAAAAATTGGATC 2340

116164002 TAGTGAGTAGGCAATGGTATATATTCATTATGCCATGCTAGGACATGTAAATGACTGTCT 116164061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAGTGAGTAGGCAATGGTATATATTCATTATGCCATGCTAGGACATGTAAATGACTGTCT 2400

116164062 ATGTGAAATGAACTGTACAAAGATTCAGAGACATGCCATATTAATGAAAGGTTTTAAGGG 116164121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATGTGAAATGAACTGTACAAAGATTCAGAGACATGCCATATTAATGAAAGGTTTTAAGGG 2460

116164122 TTGCTCAGCTAGGATGGCTGGTACAAAATGGGGGACTGGTGGAGTTTGTCCAGAATTTAA 116164181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTGCTCAGCTAGGATGGCTGGTACAAAATGGGGGACTGGTGGAGTTTGTCCAGAATTTAA 2520

116164182 GAGATTCACTGAATTGTCTCTTTGCAGTTCTATGCCTGGTGACAGTGGTGAGCAACAATT 116164241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAGATTCACTGAATTGTCTCTTTGCAGTTCTATGCCTGGTGACAGTGGTGAGCAACAATT 2580

116164242 TTAATGACAGTAGCCTAACAAGGGAAAGACAACAAAGAGCTTAATTTTGTGAGATGAAAG 116164301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTAATGACAGTAGCCTAACAAGGGAAAGACAACAAAGAGCTTAATTTTGTGAGATGAAAG 2640

116164302 AAAAATCAACCCACCATGGAAACAAGCTAGACCAGCTGAATTGCTGATCCGGGCTGAAAA 116164361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAAAATCAACCCACCATGGAAACAAGCTAGACCAGCTGAATTGCTGATCCGGGCTGAAAA 2700

116164362 AAATCTAGGATGTATAGGTGAAAAAGAAAAATGATAAATATAACAGTGGAGATTATAGTT 116164421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AAATCTAGGATGTATAGGTGAAAAAGAAAAATGATAAATATAACAGTGGAGATTATAGTT 2760

116164422 TGTTTCAGTGACCATTGTATATAGTCTGCTGTGCTATATACAAAACGAGGCCAGCAATCA 116164481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGTTTCAGTGACCATTGTATATAGTCTGCTGTGCTATATACAAAACGAGGCCAGCAATCA 2820

116164482 ATTTGAAAATTCAATGCGATAAAAGACTAAAATGATGTAAGTGGTAGACGGTATCTGATG 116164541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTTGAAAATTCAATGCGATAAAAGACTAAAATGATGTAAGTGGTAGACGGTATCTGATG 2880

116164542 CCTCAGTTACCCCACCATACATCTTCCTTGCCTCACATATAATTGTACCTCTGGTTTCAT 116164601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCTCAGTTACCCCACCATACATCTTCCTTGCCTCACATATAATTGTACCTCTGGTTTCAT 2940

116164602 GGATAATTCTGCATGTGTTTTGAGATGCCTGGTCTTAATAGCATCTTGTTGTCTGTGTCA 116164661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 GGATAATTCTGCATGTGTTTTGAGATGCCTGGTCTTAATAGCATCTTGTTGTCTGTGTCA 3000

116164662 CCTTTTCTCCTGAGCTGCAGACGTAAATGGGTGTTACTTCATTATGCTTCATAGTAATCC 116164721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCTTTTCTCCTGAGCTGCAGACGTAAATGGGTGTTACTTCATTATGCTTCATAGTAATCC 3060

116164722 CAAATCAAAGGGAAATTAATGCCCTTGAGAACAACTCTTAACTCTTAAAGTGGTGGTAGC 116164781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CAAATCAAAGGGAAATTAATGCCCTTGAGAACAACTCTTAACTCTTAAAGTGGTGGTAGC 3120

116164782 AGCAGATGCATTAAACCTTAGGTGGGCAATTCTAGGAGACATTCTGCACTCTCCTTTGAA 116164841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGCAGATGCATTAAACCTTAGGTGGGCAATTCTAGGAGACATTCTGCACTCTCCTTTGAA 3180

116164842 TCTCCCAACTGAAATGAAGCCTCAGTTGCTCACAACAATGTGTATTATTACAAAGTGACT 116164901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCTCCCAACTGAAATGAAGCCTCAGTTGCTCACAACAATGTGTATTATTACAAAGTGACT 3240

116164902 AGATTTTCCCCCTTACCTCCTTCCTCCTTTCCTCCTTTTCCTCCTTTCTTCAGTTCTTCA 116164961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGATTTTCCCCCTTACCTCCTTCCTCCTTTCCTCCTTTTCCTCCTTTCTTCAGTTCTTCA 3300

116164962 AGTATGGAACAAGGATATATATGCAAGCTGCTTTTAGGAAATAATCTCAAGCAGCTTGCA 116165021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGTATGGAACAAGGATATATATGCAAGCTGCTTTTAGGAAATAATCTCAAGCAGCTTGCA 3360

116165022 TATAAATCTTTGTTCCAAGCTCTACTTCAAGGGTTCCCCAGTCTAAGATATCTTTTGTTC 116165081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TATAAATCTTTGTTCCAAGCTCTACTTCAAGGGTTCCCCAGTCTAAGATATCTTTTGTTC 3420

116165082 AGTAAATCTTGTTTTATTTTATTAAATCCTGCTTGGCTATGAGAAATATATTTTTGTTAG 116165141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AGTAAATCTTGTTTTATTTTATTAAATCCTGCTTGGCTATGAGAAATATATTTTTGTTAG 3480

116165142 AGCAATTACAAGACAATTTCAATTGATAAGTAAAATAATTTCTTTCCATTTTATGATCCA 116165201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGCAATTACAAGACAATTTCAATTGATAAGTAAAATAATTTCTTTCCATTTTATGATCCA 3540

116165202 GGATAGCTCCTATTATTTTTTCCACATAACTATCTTTCATAATCAATTTATATACATAAA 116165261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGATAGCTCCTATTATTTTTTCCACATAACTATCTTTCATAATCAATTTATATACATAAA 3600

116165262 TTGGTGAAAGTTAGGCAAATTTATAAGATTCATTCTCTTTTTATGAATCACTACTATACA 116165321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTGGTGAAAGTTAGGCAAATTTATAAGATTCATTCTCTTTTTATGAATCACTACTATACA 3660

116165322 TTTTAAACCAAGTTTCTTTCTTCCCTTGGTAGCTAGTTCCACCCATACCACTACCTTCTT 116165381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTTTAAACCAAGTTTCTTTCTTCCCTTGGTAGCTAGTTCCACCCATACCACTACCTTCTT 3720

116165382 TAGTGTAAAAATGACTCTGTCTTTGAAATTAAAAAATATATATAAATATTTGTAAACATC 116165441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TAGTGTAAAAATGACTCTGTCTTTGAAATTAAAAAATATATATAAATATTTGTAAACATC 3780

116165442 ATAAATAAATTACGGAATAATAAAGAAAAGCCCACTGCTTACAATTGTAGCTCAGGCAGT 116165501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ATAAATAAATTACGGAATAATAAAGAAAAGCCCACTGCTTACAATTGTAGCTCAGGCAGT 3840

116165502 ATGGGGAATTAGATTAGGGAACCTGGGTGGTTTTCTGTTTGAATAATATATTTGTAATGG 116165561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 ATGGGGAATTAGATTAGGGAACCTGGGTGGTTTTCTGTTTGAATAATATATTTGTAATGG 3900

116165562 TATTACATTTAGTAGGATTAGACACATATGATAATTGTTAAATTCATACACAAATTGACT 116165621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TATTACATTTAGTAGGATTAGACACATATGATAATTGTTAAATTCATACACAAATTGACT 3960

116165622 TTAGTTACCTCTCATGGTGCATTGTTACTGGAAACACTCTTAATATATTTTGAATCTCTG 116165681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 TTAGTTACCTCTCATGGTGCATTGTTACTGGAAACACTCTTAATATATTTTGAATCTCTG 4020

116165682 TGGCATGTATTCATTAGCTTCTTTTATTGCATTATAGAAAACCAGAAATGCAATTTATAT 116165741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGGCATGTATTCATTAGCTTCTTTTATTGCATTATAGAAAACCAGAAATGCAATTTATAT 4080

116165742 CAATTTGCTTTCCATACTTCTTAAAAAATTTGAATAAACACGAAAAAGTACTTCTGAGTT 116165801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CAATTTGCTTTCCATACTTCTTAAAAAATTTGAATAAACACGAAAAAGTACTTCTGAGTT 4140

116165802 CCTGTATTGTATACTGTAATAGGGATATATGCCTATACAGATCACTTATTAAATTGTCTA 116165861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CCTGTATTGTATACTGTAATAGGGATATATGCCTATACAGATCACTTATTAAATTGTCTA 4200

116165862 ACACTTTCAGATAATTCAGTATAAAATTCAGTACAAAATTCTGCATGTAAGACTACCATT 116165921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ACACTTTCAGATAATTCAGTATAAAATTCAGTACAAAATTCTGCATGTAAGACTACCATT 4260

116165922 TCCTGCCAGATTTACAAATTCACATATTCTAGAATATTATTTATGAATATATATTTACAC 116165981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 TCCTGCCAGATTTACAAATTCACATATTCTAGAATATTATTTATGAATATATATTTACAC 4320

116165982 ACATACCTCTTATTTTCTTCTCCACACTTTGGAATTTGGAGGATGAGTTGTGGAGAATAA 116166041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ACATACCTCTTATTTTCTTCTCCACACTTTGGAATTTGGAGGATGAGTTGTGGAGAATAA 4380

116166042 AAAAAAAAGTGGTGGGAAGAAAACATTTACTTGTCTGTGTTTATTCTCTGCTGGGTCTTA 116166101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AAAAAAAAGTGGTGGGAAGAAAACATTTACTTGTCTGTGTTTATTCTCTGCTGGGTCTTA 4440

116166102 GTCGGCAAAGCTACCTTTGTAGTAGGTCCTCTTTTCTTTTATCCTTCTTTGTTGTTCTTT 116166161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 GTCGGCAAAGCTACCTTTGTAGTAGGTCCTCTTTTCTTTTATCCTTCTTTGTTGTTCTTT 4500

116166162 CAAACAAAATTTGGAGATGTTACCCACTTTGTCCCAGTTTCTGATTCTGGTGAAATCAAA 116166221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CAAACAAAATTTGGAGATGTTACCCACTTTGTCCCAGTTTCTGATTCTGGTGAAATCAAA 4560

116166222 ATTCAAATCTTTCTGTCGTTTTAAATTTTAATATTTTCGTGACTATTTTTTTCCTTTTTT 116166281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 ATTCAAATCTTTCTGTCGTTTTAAATTTTAATATTTTCGTGACTATTTTTTTCCTTTTTT 4620

116166282 GGATGGATTACATTTGGTTTTTGCTTCAACAAATTTCTTATTTCGGATTTAGGTACACAA 116166341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GGATGGATTACATTTGGTTTTTGCTTCAACAAATTTCTTATTTCGGATTTAGGTACACAA 4680

116166342 TGATTTGTTTGTGAATTGATATCTTAGACAGTCTTCTGTTGCCTAATGTATTTCATTCCC 116166401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TGATTTGTTTGTGAATTGATATCTTAGACAGTCTTCTGTTGCCTAATGTATTTCATTCCC 4740

116166402 TCTTTTCACTCTCCAATAAATACATTTATCATATTATGTTAATGAAAGATAGGCTTCTCC 116166461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 TCTTTTCACTCTCCAATAAATACATTTATCATATTATGTTAATGAAAGATAGGCTTCTCC 4800

116166462 ATAACTTTCTAGACTGTATGTACACCGAGAGAAAGAACATCATAAGTTGGATAGTAATGG 116166521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 ATAACTTTCTAGACTGTATGTACACCGAGAGAAAGAACATCATAAGTTGGATAGTAATGG 4860

116166522 TGTACATGAAAGACACATAATTATTAAAGATTATTAGTAAATGTGCAAAATCCTATGTCC 116166581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TGTACATGAAAGACACATAATTATTAAAGATTATTAGTAAATGTGCAAAATCCTATGTCC 4920

116166582 TTTATAGTATACACTATATATTTGTTTCTTTAATATGCTGCACATATTTGCTAAAGATAT 116166641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TTTATAGTATACACTATATATTTGTTTCTTTAATATGCTGCACATATTTGCTAAAGATAT 4980

116166642 TTATTTTATACCTATACTTATGTATTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATTCAA 116166701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TTATTTTATACCTATACTTATGTATTTACCTCATAACAGTTACTTAGGTAAAATATTCAA 5040

116166702 AAATATAATTTCACTTTAAACACTGAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAAAGG 116166761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 AAATATAATTTCACTTTAAACACTGAAATGGCCAAAAGTTGAAGAGATGCAAGAAAAAGG 5100

116166762 AATACATTGCATATTATGAGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATATT 116166821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AATACATTGCATATTATGAGAGAAAATTTTGAATTAACAATTTGAAGAAAATAATATATT 5160

116166822 GAATCTATATTATATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGT 116166881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 GAATCTATATTATATGACTCTATACCAGTCAAATTAAATACTTTTAAAACCAGACATGGT 5220

116166882 TAACTATCACTCTACTTGGTTAATTATTCTTGTCCAAAGACATGATTTCATATGGAACTA 116166941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 TAACTATCACTCTACTTGGTTAATTATTCTTGTCCAAAGACATGATTTCATATGGAACTA 5280

116166942 TATAGACTATTGTATTCCAAAGGTAGGGATTACTGAAAGGCCAACAGACACCTAAAAGTG 116167001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TATAGACTATTGTATTCCAAAGGTAGGGATTACTGAAAGGCCAACAGACACCTAAAAGTG 5340

116167002 ATCTTTTGCCTTTGATGCTTCTACATTTAAATTACATGTGCTATTATTAGCAAAGAGGAA 116167061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 ATCTTTTGCCTTTGATGCTTCTACATTTAAATTACATGTGCTATTATTAGCAAAGAGGAA 5400

116167062 TTTGGCAAATTATGAAGCTCTTTCAACCCTTGCTAATTAATTCCATCCATTTGCCAGATA 116167121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TTTGGCAAATTATGAAGCTCTTTCAACCCTTGCTAATTAATTCCATCCATTTGCCAGATA 5460

116167122 TTTCCATATTACCAAGAAGTTCTTCCAAAGGCCTAATATTAAATTGTTGTGGTCTAGGAC 116167181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TTTCCATATTACCAAGAAGTTCTTCCAAAGGCCTAATATTAAATTGTTGTGGTCTAGGAC 5520

116167182 AATTTTTTCTTAACTGTTCTCTGGTTTGTGACAGATATTATGTTATTAATAGAATATAGC 116167241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AATTTTTTCTTAACTGTTCTCTGGTTTGTGACAGATATTATGTTATTAATAGAATATAGC 5580

116167242 ATTTGATTCTTATATTATTCCATACACTACCAACTGGTTTACGAAGGAGACCACCAATAC 116167301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 ATTTGATTCTTATATTATTCCATACACTACCAACTGGTTTACGAAGGAGACCACCAATAC 5640

116167302 AATTCTATTAAAGTCCCTGTCACTTTGTTTGCTATTTAAATTGTTTCTATATTGAATCAA 116167361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 AATTCTATTAAAGTCCCTGTCACTTTGTTTGCTATTTAAATTGTTTCTATATTGAATCAA 5700

116167362 GTTCCTTTTATTAATTAAATATAAATTATATTCAGTGGTAATTAAATATTTCAATTATTA 116167421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GTTCCTTTTATTAATTAAATATAAATTATATTCAGTGGTAATTAAATATTTCAATTATTA 5760

116167422 ATGCTTAGATTTTAACTTTTTTCATCTTTTACATGAGAAAATGACTTGTTTTATAAAGTT 116167481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 ATGCTTAGATTTTAACTTTTTTCATCTTTTACATGAGAAAATGACTTGTTTTATAAAGTT 5820

116167482 CAAGATTTAGCAATTATTTGTAAACTGTTAC 116167512
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CAAGATTTAGCAATTATTTGTAAACTGTTAC 5851

Alignment time is 6.01509 s

