
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,  10733] =>     10733 nucs 'mol-32-1e7c-007107_10733'

Score:       10423
Aligned:     10722        nucs
Identic:     10694 (100%) nucs =>      2430 (100%)      8264 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648558,6650994] EXCISED REGION [6651005,6659286]
 second seq =>  [      1,   2439] EXCISED REGION [   2453,  10733]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650995,6651004]
 second seq =>        13 nucs [2440,2452]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2439,2439] to [2452,2452]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648558 TTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGA 6648617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGA 60

  6648618 GCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGA 6648677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGA 120

  6648678 TTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTT 6648737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTT 180

  6648738 CCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATA 6648797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATA 240

  6648798 TGTTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATT 6648857
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATT 300

  6648858 TTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCAC 6648917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCAC 360

  6648918 TGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGG 6648977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGG 420

  6648978 ACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTT 6649037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTT 480

  6649038 TCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGC 6649097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGC 540

  6649098 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTT 6649157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTT 600

  6649158 TTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTT 6649217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTT 660

  6649218 TCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGA 6649277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGA 720

  6649278 TCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTG 6649337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTG 780

  6649338 CTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACT 6649397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACT 840

  6649398 TTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGT 6649457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGT 900

  6649458 ATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGT 6649517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGT 960

  6649518 GACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTC 6649577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTC 1020

  6649578 ATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGA 6649637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGA 1080

  6649638 GAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCC 6649697
          ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGGACAACTGGAAGCCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCC 1140

  6649698 TGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAAC 6649757
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGTTAGCTGATTTTAATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAAC 1200

  6649758 AACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGG 6649817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGG 1260

  6649818 GACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCC 6649877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCC 1320

  6649878 TACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTT 6649937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTT 1380

  6649938 CTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCAC 6649997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCAC 1440

  6649998 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCC 6650057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCC 1500

  6650058 AGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCA 6650117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCA 1560

  6650118 CCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTT--GGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCC 6650175
          |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCC 1620

  6650176 TGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGG 6650235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGG 1680

  6650236 GATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTC 6650295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTC 1740

  6650296 TGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGT 6650355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGT 1800

  6650356 TTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCC 6650415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCC 1860

  6650416 TATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAG 6650475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAG 1920

  6650476 ATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTAC 6650535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTAC 1980

  6650536 TGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTT 6650595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTT 2040

  6650596 GACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGA 6650655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGA 2100

  6650656 ATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACT 6650715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACT 2160

  6650716 GCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTC 6650775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTC 2220

  6650776 AGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATAC 6650835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATAC 2280

  6650836 TACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCT 6650895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCT 2340

  6650896 CATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCTCTGATCTCCCTTG 6650955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     2341 CATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCTCTGATCTCCCTTG 2400

  6650956 CAGGGGTATTAGGGCACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCA 6650994
          ||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGGTGTATTAGGCCACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCA 2439

EXCISED REGION

  6651005 CTACTTATCCCTTGCTAATGTGGGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGC 6651064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 CTACTTATCCCTTGCTAATGTGGGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGC 2512

  6651065 TGAAATAAAACATGTATTGTCTAAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAA 6651124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 TGAAATAAAACATGTATTGTCTAAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAA 2572

  6651125 GATCGACAGGCTTCTGATGGATATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTT 6651184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 GATCGACAGGCTTCTGATGGATATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTT 2632

  6651185 TGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCACCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGA 6651244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 TGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCACCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGA 2692

  6651245 GGTCACCAGTTAGTCTGCCTTTCAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAG 6651304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 GGTCACCAGTTAGTCTGCCTTTCAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAG 2752

  6651305 GATTTTTAGTTGCAGTTAGCAAGAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTA 6651364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 GATTTTTAGTTGCAGTTAGCAAGAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTA 2812

  6651365 AGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTTATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTG 6651424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 AGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTTATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTG 2872

  6651425 GGTCTAATTGCTACTATAGAGTAGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATAT 6651484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 GGTCTAATTGCTACTATAGAGTAGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATAT 2932

  6651485 ATTGGCCTTTTCATAGAATAAAGAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAG 6651544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 ATTGGCCTTTTCATAGAATAAAGAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAG 2992

  6651545 TGTTTTGTGTTTACTGTTAAGTTCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCT 6651604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 TGTTTTGTGTTTACTGTTAAGTTCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCT 3052

  6651605 GCATTTTCAACTACTTGCAGAGCTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAA 6651664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 GCATTTTCAACTACTTGCAGAGCTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAA 3112

  6651665 GGGAACTGTTTGTCTTAGAAATCTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTT 6651724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 GGGAACTGTTTGTCTTAGAAATCTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTT 3172

  6651725 TAACTTGACCACCAACAATCAACATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCA 6651784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 TAACTTGACCACCAACAATCAACATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCA 3232

  6651785 TAAACTTTAGTTACACTAAAATTGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGAT 6651844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 TAAACTTTAGTTACACTAAAATTGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGAT 3292

  6651845 AATTATTCTAGAAAACACAAACCCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCT 6651904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 AATTATTCTAGAAAACACAAACCCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCT 3352

  6651905 TCAAAAAATATGAATACACGCATCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTT 6651964
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 TCAAAAAATATGAATACACGCATCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTT 3412

  6651965 TTGGGGAGAAACTTTGTGGGTGCAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTT 6652024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 TTGGGGAGAAACTTTGTGGGTGCAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTT 3472

  6652025 AAGAGATAGTGGGAGATAAGGAAGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAAC 6652084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 AAGAGATAGTGGGAGATAAGGAAGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAAC 3532

  6652085 CAATTTCTACTCCAAAAACACCCATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTG 6652144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 CAATTTCTACTCCAAAAACACCCATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTG 3592

  6652145 AAAAATAGTTAATATTTTTCCACAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGA 6652204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 AAAAATAGTTAATATTTTTCCACAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGA 3652

  6652205 ACAGCAGTCTGAAAAATGATAAAACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAAT 6652264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 ACAGCAGTCTGAAAAATGATAAAACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAAT 3712

  6652265 TAAAATAGTGAATGAATAGGTGATGTTTTATGTGCTACAATTTCATCTATGAACATCCAT 6652324
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     3713 TAAAATAGTGAATGAATAGGTGATGTTTTATGTGCTACAGTTTCATCTATGAACATCCAT 3772

  6652325 ATTTTGGGACCCATAAAAAGGATAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCA 6652384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 ATTTTGGGACCCATAAAAAGGATAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCA 3832

  6652385 TTGGAAAACACACAAACCCACACTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGT 6652444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 TTGGAAAACACACAAACCCACACTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGT 3892

  6652445 GAATATAATGGCTCAAAAATATTTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTC 6652504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 GAATATAATGGCTCAAAAATATTTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTC 3952

  6652505 TTGTTTCCAACAAATGGTGATGAGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTC 6652564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 TTGTTTCCAACAAATGGTGATGAGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTC 4012

  6652565 ATCACTCCTTTTATAACTACCAGGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCAT 6652624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 ATCACTCCTTTTATAACTACCAGGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCAT 4072

  6652625 TAGTTTGTAATCTTAATATCATCCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTG 6652684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 TAGTTTGTAATCTTAATATCATCCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTG 4132

  6652685 AGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGAAGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAA 6652744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 AGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGAAGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAA 4192

  6652745 TAATTTAGAACTGCACATGAAATTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGT 6652804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 TAATTTAGAACTGCACATGAAATTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGT 4252

  6652805 AGATTTGATTATTGAAAGCACACAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATG 6652864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 AGATTTGATTATTGAAAGCACACAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATG 4312

  6652865 GAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGT 6652924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 GAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGT 4372

  6652925 TTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAG 6652984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 TTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAG 4432

  6652985 CTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAG 6653044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 CTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAG 4492

  6653045 GGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCA 6653104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 GGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCA 4552

  6653105 TGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCT 6653164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 TGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCT 4612

  6653165 CAATGCAGCAATTATTGCCCCTGTGTATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAA 6653224
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 CAATGCAGCAATTATTGCCCCTGTATATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAA 4672

  6653225 GGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGG 6653284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 GGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGG 4732

  6653285 GAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTA 6653344
          |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 GAATTTTC-TTTTTTTTTTTCCATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTA 4791

  6653345 AAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAAT 6653404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4792 AAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAAT 4851

  6653405 TGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATA 6653464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 TGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATA 4911

  6653465 TCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAA 6653524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4912 TCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAA 4971

  6653525 TTTTCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTT 6653584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4972 TTTTCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTT 5031

  6653585 GCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTT 6653644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5032 GCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTT 5091

  6653645 GGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATA 6653704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5092 GGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATA 5151

  6653705 TGACTCCCAACGTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAG 6653764
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5152 TGACTCCCAATGTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAG 5211

  6653765 TGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCT 6653824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5212 TGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCT 5271

  6653825 CCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTC 6653884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5272 CCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTC 5331

  6653885 TGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATA 6653944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5332 TGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATA 5391

  6653945 GTTTTTTACAAACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATT 6654004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5392 GTTTTTTACAAACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATT 5451

  6654005 GTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGAT 6654064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5452 GTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGAT 5511

  6654065 ATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAG 6654124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5512 ATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAG 5571

  6654125 AGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACT 6654184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5572 AGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACT 5631

  6654185 TTGGACATTCATATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGAT 6654244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5632 TTGGACATTCATATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGAT 5691

  6654245 GTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGG 6654304
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     5692 GTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGG 5751

  6654305 TCTGCTGACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTT 6654364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5752 TCTGCTGACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTT 5811

  6654365 ATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAAT 6654424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5812 ATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAAT 5871

  6654425 GAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACT 6654484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5872 GAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACT 5931

  6654485 CATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACAC 6654544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5932 CATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACAC 5991

  6654545 AGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGT 6654604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5992 AGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGT 6051

  6654605 GATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAA 6654664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6052 GATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAA 6111

  6654665 ACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATC 6654724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6112 ACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATC 6171

  6654725 CCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGA 6654784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6172 CCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGA 6231

  6654785 ACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAG 6654844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6232 ACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAG 6291

  6654845 GTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAA 6654904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6292 GTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAA 6351

  6654905 TCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTC 6654964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6352 TCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTC 6411

  6654965 TTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGC 6655024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6412 TTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGC 6471

  6655025 ACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTT 6655084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6472 ACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTT 6531

  6655085 TCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGA 6655144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6532 TCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGA 6591

  6655145 TGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTT 6655204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6592 TGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTT 6651

  6655205 TTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCA 6655264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6652 TTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCA 6711

  6655265 TAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCA 6655324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6712 TAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCA 6771

  6655325 AAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAA 6655384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6772 AAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAA 6831

  6655385 ATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCC 6655444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6832 ATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCC 6891

  6655445 AGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAA 6655504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6892 AGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAA 6951

  6655505 GAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATC 6655564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6952 GAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATC 7011

  6655565 CTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAA 6655624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7012 CTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAA 7071

  6655625 AAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTC 6655684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7072 AAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTC 7131

  6655685 ACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAAC 6655743
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7132 ACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAAC 7191

  6655744 CTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCA 6655803
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7192 CTTTAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCA 7251

  6655804 CTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTT 6655863
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     7252 CTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC-T 7310

  6655864 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTG 6655923
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     7311 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAATG 7370

  6655924 GTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCG 6655983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7371 GTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCG 7430

  6655984 CCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTT 6656043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7431 CCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTT 7490

  6656044 TGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGAT 6656103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7491 TGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGAT 7550

  6656104 CCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCT 6656163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7551 CCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCT 7610

  6656164 TGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAA 6656223
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7611 TGTAGGTAGGCTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAA 7670

  6656224 ATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTAC 6656283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7671 ATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTAC 7730

  6656284 AGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATAC 6656343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7731 AGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATAC 7790

  6656344 ATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACT 6656403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7791 ATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACT 7850

  6656404 TGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACT 6656463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7851 TGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACT 7910

  6656464 ACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATAC 6656523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7911 ACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATAC 7970

  6656524 TGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGC 6656583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7971 TGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGC 8030

  6656584 CTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTA 6656643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8031 CTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTA 8090

  6656644 TTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATA 6656703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8091 TTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATA 8150

  6656704 AAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTT 6656763
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8151 AAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTT 8210

  6656764 ATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATC 6656823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8211 ATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATC 8270

  6656824 TCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTA 6656883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8271 TCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTA 8330

  6656884 AAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTG 6656943
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8331 AAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTG 8390

  6656944 TAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAA 6657003
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     8391 TAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATTATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAA 8450

  6657004 ACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGG 6657063
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     8451 ACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGATCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGG 8510

  6657064 TCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGC 6657123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8511 TCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGC 8570

  6657124 ATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAA 6657183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8571 ATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAA 8630

  6657184 ACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAA 6657243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8631 ACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAA 8690

  6657244 ACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACT 6657303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8691 ACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACT 8750

  6657304 TCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAATT 6657363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8751 TCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAATT 8810

  6657364 TCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTATCATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACAT 6657423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     8811 TCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAACATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACAT 8870

  6657424 CTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGGGAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTT 6657483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8871 CTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGGGAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTT 8930

  6657484 CAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATTGTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGT 6657543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8931 CAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATTGTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGT 8990

  6657544 ATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAAAATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAA 6657603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8991 ATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAAAATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAA 9050

  6657604 ATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCATAATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTT 6657663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9051 ATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCATAATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTT 9110

  6657664 GATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTCTGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAA 6657723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9111 GATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTCTGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAA 9170

  6657724 ACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAACCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTG 6657783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9171 ACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAACCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTG 9230

  6657784 TATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCAGAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGA 6657843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9231 TATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCAGAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGA 9290

  6657844 AACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATAGGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATAT 6657903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9291 AACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATAGGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATAT 9350

  6657904 GATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTTTTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGA 6657963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9351 GATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTTTTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGA 9410

  6657964 TTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAATAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAA 6658023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9411 TTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAATAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAA 9470

  6658024 TTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACATAACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTG 6658083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9471 TTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACATAACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTG 9530

  6658084 TGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAAGCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCA 6658143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9531 TGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAAGCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCA 9590

  6658144 CTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGACAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTA 6658203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9591 CTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGACAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTA 9650

  6658204 TAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAATAGTTGATGCATAGAACGAACTATGAAT 6658263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9651 TAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAATAGTTGATGCATAGAACGAACTATGAAT 9710

  6658264 GAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAGGCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGG 6658323
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9711 CAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAGGCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGG 9770

  6658324 AAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCTGTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAA 6658383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9771 AAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCTGTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAA 9830

  6658384 TCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGGATATTTGAATCATATAAGTCTACATTT 6658443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9831 TCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGGATATTTGAATCATATAAGTCTACATTT 9890

  6658444 GAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGACTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTT 6658503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9891 GAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGACTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTT 9950

  6658504 TCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAATTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTT 6658563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9951 TCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAATTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTT 10010

  6658564 ATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCTTTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTC 6658623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10011 ATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCTTTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTC 10070

  6658624 TACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACAGTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAG 6658683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10071 TACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACAGTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAG 10130

  6658684 ATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGAATTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAG 6658743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
    10131 ATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGAACTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAG 10190

  6658744 ATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAATTCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTT 6658803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10191 ATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAATTCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTT 10250

  6658804 ACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAGTCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTA 6658863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10251 ACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAGTCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTA 10310

  6658864 TGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATAACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAG 6658923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10311 TGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATAACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAG 10370

  6658924 ATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGACCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATT 6658983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10371 ATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGACCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATT 10430

  6658984 AAATGAGATAGTTACATGTAAAATGTTTAGTCCAATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAG 6659043
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10431 AAATGAGATAGTTACATATAAAATGTTTAGTCCAATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAG 10490

  6659044 TATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTTACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAAC 6659103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10491 TATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTTACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAAC 10550

  6659104 TTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGATATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTA 6659163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10551 TTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGATATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTA 10610

  6659164 CATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAGTGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAG 6659223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10611 CATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAGTGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAG 10670

  6659224 AGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGCTTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACTAC 6659283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10671 AGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGCTTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACTAC 10730

  6659284 TTA 6659286
          |||
    10731 TTA 10733

Alignment time is 15.0254 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2641] =>      2641 nucs 'mol-32-1e7c-216092_2641'

Score:        2608
Aligned:      2641        nucs
Identic:      2638 (100%) nucs =>       386 (100%)      2252 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6652803,6653188] EXCISED REGION [6653190,6655444]
 second seq =>  [      1,    386] EXCISED REGION [    388,   2641]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6653189,6653189]
 second seq =>         1 nucs [387,387]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [6653293,6653293]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6653188,6653188] to [6653190,6653190]
 second seq =>         1 nucs [386,386] to [388,388]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6652803 GTAGATTTGATTATTGAAAGCACACAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGA 6652862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAGATTTGATTATTGAAAGCACACAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGA 60

  6652863 TGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATT 6652922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATT 120

  6652923 GTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTC 6652982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTC 180

  6652983 AGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTA 6653042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTA 240

  6653043 AGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTC 6653102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTC 300

  6653103 CATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCC 6653162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCC 360

  6653163 CTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGT 6653188
          ||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGT 386

EXCISED REGION

  6653190 TATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCT 6653249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      388 TATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCT 447

  6653250 GCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATA 6653309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
      448 GCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTC-TTTTTTTTTTTCCATA 506

  6653310 ACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAG 6653369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      507 ACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAG 566

  6653370 GGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAG 6653429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      567 GGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAG 626

  6653430 TGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATT 6653489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      627 TGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATT 686

  6653490 TTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTT 6653549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      687 TTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTT 746

  6653550 TTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACA 6653609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      747 TTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACA 806

  6653610 AGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTT 6653669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      807 AGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTT 866

  6653670 ATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAACTT 6653729
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      867 ATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAACTT 926

  6653730 GCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCA 6653789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      927 GCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCA 986

  6653790 AGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTT 6653849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      987 AGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTT 1046

  6653850 TATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGT 6653909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1047 TATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGT 1106

  6653910 TTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACT 6653969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1107 TTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACT 1166

  6653970 TCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAAT 6654029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1167 TCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAAT 1226

  6654030 AACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTAC 6654089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1227 AACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTAC 1286

  6654090 TAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGG 6654149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1287 TAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGG 1346

  6654150 ATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATA 6654209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1347 ATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATA 1406

  6654210 GAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCC 6654269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1407 GAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCC 1466

  6654270 TGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGA 6654329
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1467 TGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGA 1526

  6654330 TTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGA 6654389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1527 TTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGA 1586

  6654390 GTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAG 6654449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1587 GTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAG 1646

  6654450 ATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGA 6654509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1647 ATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGA 1706

  6654510 TTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATG 6654569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1707 TTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATG 1766

  6654570 ATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGA 6654629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1767 ATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGA 1826

  6654630 TAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTT 6654689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1827 TAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTT 1886

  6654690 GGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAG 6654749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1887 GGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAG 1946

  6654750 CTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCA 6654809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1947 CTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCA 2006

  6654810 GAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAA 6654869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2007 GAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAA 2066

  6654870 GAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAA 6654929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2067 GAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAA 2126

  6654930 CATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAA 6654989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2127 CATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAA 2186

  6654990 TTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGG 6655049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2187 TTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGG 2246

  6655050 GCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGA 6655109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2247 GCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGA 2306

  6655110 ATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCA 6655169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2307 ATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCA 2366

  6655170 ACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCC 6655229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2367 ACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCC 2426

  6655230 TGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCA 6655289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2427 TGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCA 2486

  6655290 AGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATT 6655349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2487 AGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATT 2546

  6655350 ACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGAC 6655409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2547 ACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGAC 2606

  6655410 CTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCC 6655444
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2607 CTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCC 2641

Alignment time is 3.76545 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   4330] =>      4330 nucs 'mol-32-1e87-116585_4330'

Score:        4197
Aligned:      4307        nucs
Identic:      4297 (100%) nucs =>       347 (100%)      3950 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6652842,6653188] EXCISED REGION [6653190,6657148]
 second seq =>  [      1,    347] EXCISED REGION [    349,   4307]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6653189,6653189]
 second seq =>         1 nucs [348,348]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [6655862,6655862]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6653188,6653188] to [6653190,6653190]
 second seq =>         1 nucs [347,347] to [349,349]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6652842 TGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTT 6652901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTT 60

  6652902 ACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGA 6652961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGA 120

  6652962 TCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAA 6653021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAA 180

  6653022 AGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCA 6653081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCA 240

  6653082 AATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGC 6653141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGC 300

  6653142 CTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGT 6653188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGT 347

EXCISED REGION

  6653190 TATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCT 6653249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      349 TATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCT 408

  6653250 GCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATA 6653309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      409 GCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATA 468

  6653310 ACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAG 6653369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      469 ACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAG 528

  6653370 GGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAG 6653429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      529 GGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAG 588

  6653430 TGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATT 6653489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      589 TGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATT 648

  6653490 TTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTT 6653549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 TTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTT 708

  6653550 TTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACA 6653609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 TTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACA 768

  6653610 AGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTT 6653669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 AGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTT 828

  6653670 ATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAACTT 6653729
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      829 ATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAACTT 888

  6653730 GCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCA 6653789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 GCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCA 948

  6653790 AGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTT 6653849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 AGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTT 1008

  6653850 TATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGT 6653909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 TATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGT 1068

  6653910 TTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACT 6653969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 TTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACT 1128

  6653970 TCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAAT 6654029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 TCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAAT 1188

  6654030 AACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTAC 6654089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 AACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTAC 1248

  6654090 TAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGG 6654149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 TAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGG 1308

  6654150 ATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATA 6654209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 ATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATA 1368

  6654210 GAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCC 6654269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 GAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCC 1428

  6654270 TGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGA 6654329
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 TGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGA 1488

  6654330 TTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGA 6654389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 TTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGA 1548

  6654390 GTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAG 6654449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 GTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAG 1608

  6654450 ATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGA 6654509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 ATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGA 1668

  6654510 TTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATG 6654569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 TTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATG 1728

  6654570 ATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGA 6654629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 ATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGA 1788

  6654630 TAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTT 6654689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 TAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTT 1848

  6654690 GGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAG 6654749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 GGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAG 1908

  6654750 CTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCA 6654809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 CTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCA 1968

  6654810 GAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAA 6654869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 GAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAA 2028

  6654870 GAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAA 6654929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 GAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAA 2088

  6654930 CATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAA 6654989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 CATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAA 2148

  6654990 TTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGG 6655049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 TTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGG 2208

  6655050 GCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGA 6655109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 GCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGA 2268

  6655110 ATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCA 6655169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 ATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCA 2328

  6655170 ACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCC 6655229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 ACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCC 2388

  6655230 TGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCA 6655289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 TGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCA 2448

  6655290 AGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATT 6655349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 AGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATT 2508

  6655350 ACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGAC 6655409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 ACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGAC 2568

  6655410 CTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATA 6655469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 CTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATA 2628

  6655470 CCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCT 6655529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 CCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCT 2688

  6655530 AATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACA 6655589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 AATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACA 2748

  6655590 CAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTT 6655649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 CAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTT 2808

  6655650 GGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCC 6655708
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2809 GGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCC 2868

  6655709 ATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTT 6655768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2869 ATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTTAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTT 2928

  6655769 CTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGG 6655828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 CTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGG 2988

  6655829 ATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAA 6655888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     2989 ATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAA 3047

  6655889 GGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCT 6655948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3048 GGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAATGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCT 3107

  6655949 CCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGG 6656008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3108 CCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGG 3167

  6656009 CGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATAT 6656068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3168 CGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATAT 3227

  6656069 TGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTG 6656128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3228 TGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTG 3287

  6656129 CTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTC 6656188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3288 CTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGGCTTTTAAAAGCTTTC 3347

  6656189 AGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTA 6656248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3348 AGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTA 3407

  6656249 TAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACT 6656308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3408 TAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACT 3467

  6656309 GTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGT 6656368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3468 GTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGT 3527

  6656369 TTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAG 6656428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3528 TTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAG 3587

  6656429 CATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAA 6656488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3588 CATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAA 3647

  6656489 ATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAA 6656548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3648 ATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAA 3707

  6656549 GAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTT 6656608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3708 GAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTT 3767

  6656609 TGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTC 6656668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3768 TGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTC 3827

  6656669 TGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGT 6656728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3828 TGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGT 3887

  6656729 AATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCA 6656788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3888 AATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCA 3947

  6656789 GCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTA 6656848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3948 GCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTA 4007

  6656849 GCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCA 6656908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4008 GCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCA 4067

  6656909 GCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCT 6656968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4068 GCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCT 4127

  6656969 CATCATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAG 6657028
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4128 CATTATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAG 4187

  6657029 GGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGAC 6657088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4188 GGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGAC 4247

  6657089 ACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGG 6657148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4248 ACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGG 4307

Alignment time is 6.02883 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2503] =>      2503 nucs 'mol-32-21ec-014735_2503'

Score:        2480
Aligned:      2502        nucs
Identic:      2500 (100%) nucs =>       487 (100%)      2013 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6653228,6653714] EXCISED REGION [6653716,6655729]
 second seq =>  [      1,    487] EXCISED REGION [    489,   2503]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6653715,6653715]
 second seq =>         1 nucs [488,488]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2467,2467]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6653228 CTTGGTCCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAA 6653287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTGGTCCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAA 60

  6653288 TTTTCTTTTTTTTTTTTCCATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAA 6653347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTCTTTTTTTTTTTTCCATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAA 120

  6653348 AGCAAGCTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGT 6653407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCAAGCTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGT 180

  6653408 GCCTGTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCT 6653467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCTGTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCT 240

  6653468 TAGAAGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTT 6653527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGAAGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTT 300

  6653528 TCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCA 6653587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCA 360

  6653588 GTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGC 6653647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGC 420

  6653648 CCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGA 6653707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGA 480

  6653708 CTCCCAA 6653714
          |||||||
      481 CTCCCAA 487

EXCISED REGION

  6653716 GTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTT 6653775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      489 GTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTT 548

  6653776 TTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGAC 6653835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      549 TTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGAC 608

  6653836 CATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAAC 6653895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      609 CATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAAC 668

  6653896 ACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAA 6653955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      669 ACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAA 728

  6653956 ACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAAT 6654015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      729 ACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAAT 788

  6654016 GCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCA 6654075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      789 GCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCA 848

  6654076 GTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTG 6654135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 GTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTG 908

  6654136 TTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCA 6654195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 TTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCA 968

  6654196 TATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTAC 6654255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 TATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTAC 1028

  6654256 CCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAA 6654315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1029 CCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAA 1088

  6654316 ATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGT 6654375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 ATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGT 1148

  6654376 ACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAAT 6654435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 ACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAAT 1208

  6654436 ACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGG 6654495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 ACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGG 1268

  6654496 TTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTC 6654555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 TTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTC 1328

  6654556 AGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGAT 6654615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 AGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGAT 1388

  6654616 GATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGG 6654675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1389 GATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGG 1448

  6654676 AACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGAT 6654735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 AACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGAT 1508

  6654736 CACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTAT 6654795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 CACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTAT 1568

  6654796 TATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTG 6654855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 TATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTG 1628

  6654856 CATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGT 6654915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 CATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGT 1688

  6654916 ATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTG 6654975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 ATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTG 1748

  6654976 TCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGC 6655035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 TCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGC 1808

  6655036 TCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTA 6655095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 TCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTA 1868

  6655096 TTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTG 6655155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 TTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTG 1928

  6655156 AGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACC 6655215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 AGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACC 1988

  6655216 CTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGA 6655275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 CTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGA 2048

  6655276 CTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCAT 6655335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 CTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCAT 2108

  6655336 AAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAA 6655395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 AAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAA 2168

  6655396 GGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAG 6655455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 GGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAG 2228

  6655456 GGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAG 6655515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 GGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAG 2288

  6655516 ACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCA 6655575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 ACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCA 2348

  6655576 ATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATT 6655635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 ATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATT 2408

  6655636 ATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-T 6655694
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     2409 ATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGT 2468

  6655695 ATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGT 6655729
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 ATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGT 2503

Alignment time is 3.57504 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   4408] =>      4408 nucs 'mol-32-2291-107295_4408'

Score:        4272
Aligned:      4340        nucs
Identic:      4333 (100%) nucs =>      1667 (100%)      2666 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648493,6650160] EXCISED REGION [6654638,6657308]
 second seq =>  [      1,   1667] EXCISED REGION [   1739,   4408]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [1668,1738]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1667,1667] to [1738,1738]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1667,1667] to [1739,1739]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648493 AATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACA 6648552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACA 60

  6648553 GCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGT 6648612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGT 120

  6648613 TTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGA 6648672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGA 180

  6648673 TTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATA 6648732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATA 240

  6648733 GTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTAT 6648792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTAT 300

  6648793 TTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTA 6648852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTA 360

  6648853 TTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGG 6648912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGG 420

  6648913 CTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAG 6648972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAG 480

  6648973 CTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACA 6649032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACA 540

  6649033 GGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCT 6649092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCT 600

  6649093 TTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTT 6649152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTT 660

  6649153 TTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAG 6649212
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTTTTTT-AATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAG 719

  6649213 TGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCC 6649272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCC 779

  6649273 TTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTAT 6649332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTAT 839

  6649333 CTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGA 6649392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGA 899

  6649393 GGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCAC 6649452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCAC 959

  6649453 AAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTT 6649512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTT 1019

  6649513 TATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAAT 6649572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAAT 1079

  6649573 GCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCAT 6649632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCAT 1139

  6649633 TAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATC 6649692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATC 1199

  6649693 TCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGT 6649752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGT 1259

  6649753 ATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTC 6649812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTC 1319

  6649813 CTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTA 6649872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 CTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTA 1379

  6649873 TCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCT 6649932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCT 1439

  6649933 CAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGT 6649992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGT 1499

  6649993 CTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAA 6650052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAA 1559

  6650053 CTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTG 6650112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTG 1619

  6650113 TGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 1667

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 1798

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 1858

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 1918

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 1978

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 2038

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 2098

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 2158

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 2218

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 2278

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 2338

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 2398

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 2458

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 2518

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 2578

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 2638

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 2698

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 6655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 2758

  6655658 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 6655716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2759 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 2818

  6655717 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 6655776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 2878

  6655777 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 6655836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 2938

  6655837 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 6655896
          |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 2996

  6655897 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 6655956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 3056

  6655957 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 6656016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 3116

  6656017 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 6656076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 3176

  6656077 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 6656136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 3236

  6656137 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 6656196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 3296

  6656197 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 6656256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 3356

  6656257 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 6656316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 3416

  6656317 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 6656376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 3476

  6656377 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 6656436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 3536

  6656437 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 6656496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 3596

  6656497 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 6656556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 3656

  6656557 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 6656616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 3716

  6656617 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 6656676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 3776

  6656677 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 6656736
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 3836

  6656737 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 6656796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 3896

  6656797 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 6656856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 3956

  6656857 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCA 6656916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3957 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCA 4016

  6656917 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 6656976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 4076

  6656977 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 6657036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 4136

  6657037 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 6657096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 4196

  6657097 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 6657156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 4256

  6657157 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 6657216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 4316

  6657217 TGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 6657276
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 TGAGTAACATTAGCACGCTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 4376

  6657277 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTA 6657308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTA 4408

Alignment time is 6.10422 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   3314] =>      3314 nucs 'mol-32-22b2-071727_3314'

Score:        3280
Aligned:      3313        nucs
Identic:      3310 (100%) nucs =>       100 (100%)      3210 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6652204,6652303] EXCISED REGION [6652305,6655517]
 second seq =>  [      1,    100] EXCISED REGION [    102,   3314]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6652304,6652304]
 second seq =>         1 nucs [101,101]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6652303,6652303] to [6652304,6652304]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6652204 AACAGCAGTCTGAAAAATGATAAAACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAA 6652263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACAGCAGTCTGAAAAATGATAAAACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAA 60

  6652264 TTAAAATAGTGAATGAATAGGTGATGTTTTATGTGCTACA 6652303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAAAATAGTGAATGAATAGGTGATGTTTTATGTGCTACA 100

EXCISED REGION

  6652305 TTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGATAAATTGGTTATTTCTGT 6652364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      102 TTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGATAAATTGGTTATTTCTGT 161

  6652365 TTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACACTTATTTGCTTGTTTCCC 6652424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      162 TTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACACTTATTTGCTTGTTTCCC 221

  6652425 ATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATATTTCCCATCTTCATCAGGG 6652484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      222 ATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATATTTCCCATCTTCATCAGGG 281

  6652485 TAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATGAGCTGTAAATTCTGAAGC 6652544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      282 TAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATGAGCTGTAAATTCTGAAGC 341

  6652545 ACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCAGGAGCAGAGTTTCTATCT 6652604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      342 ACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCAGGAGCAGAGTTTCTATCT 401

  6652605 GCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCATCCATTTAGTTCTCAACAA 6652664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      402 GCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCATCCATTTAGTTCTCAACAA 461

  6652665 GATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGAAGAAAAATGAACATTTTG 6652724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      462 GATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGAAGAAAAATGAACATTTTG 521

  6652725 CATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAATTTTGTTCTTAGAAACTG 6652784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      522 CATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAATTTTGTTCTTAGAAACTG 581

  6652785 CAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACACAATAACAATTGCATTGC 6652844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      582 CAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACACAATAACAATTGCATTGC 641

  6652845 AATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTTACA 6652904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      642 AATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTTACA 701

  6652905 GATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGATCA 6652964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      702 GATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGATCA 761

  6652965 ATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAGA 6653024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      762 ATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAGA 821

  6653025 GTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAAT 6653084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 GTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAAT 881

  6653085 CATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTT 6653144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 CATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTT 941

  6653145 GGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGTGTATCAGATTCTTGAA 6653204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
      942 GGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGTATATCAGATTCTTGAA 1001

  6653205 GAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTC 6653264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 GAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTC 1061

  6653265 CTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATAACATACAAAAGTGCC 6653324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 CTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATAACATACAAAAGTGCC 1121

  6653325 CAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGA 6653384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 CAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGA 1181

  6653385 TTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCC 6653444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 TTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCC 1241

  6653445 CTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTG 6653504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 CTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTG 1301

  6653505 CATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTG 6653564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 CATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTG 1361

  6653565 AAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACA 6653624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 AAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACA 1421

  6653625 TTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTT 6653684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 TTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTT 1481

  6653685 AGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTC 6653744
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1482 AGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTC 1541

  6653745 TAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTG 6653804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 TAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTG 1601

  6653805 TTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATAT 6653864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 TTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATAT 1661

  6653865 TTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGG 6653924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 TTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGG 1721

  6653925 GAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCA 6653984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 GAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCA 1781

  6653985 TTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTA 6654044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 TTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTA 1841

  6654045 AATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTT 6654104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 AATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTT 1901

  6654105 AAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTT 6654164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 AAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTT 1961

  6654165 GCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAAT 6654224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 GCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAAT 2021

  6654225 AATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATG 6654284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 AATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATG 2081

  6654285 GCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATG 6654344
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 GCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATG 2141

  6654345 CCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAAT 6654404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 CCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAAT 2201

  6654405 GAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCA 6654464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 GAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCA 2261

  6654465 ATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACT 6654524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 ATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACT 2321

  6654525 TATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTG 6654584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 TATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTG 2381

  6654585 ATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGA 6654644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 ATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGA 2441

  6654645 TGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACA 6654704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 TGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACA 2501

  6654705 ACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTT 6654764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 ACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTT 2561

  6654765 GTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTT 6654824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 GTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTT 2621

  6654825 GGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAA 6654884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 GGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAA 2681

  6654885 GTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATA 6654944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 GTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATA 2741

  6654945 ACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACA 6655004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 ACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACA 2801

  6655005 TTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTC 6655064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 TTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTC 2861

  6655065 AATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAA 6655124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 AATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAA 2921

  6655125 GACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGA 6655184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 GACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGA 2981

  6655185 AAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCA 6655244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 AAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCA 3041

  6655245 TTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAA 6655304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 TTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAA 3101

  6655305 ACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTC 6655364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 ACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTC 3161

  6655365 CTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCT 6655424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 CTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCT 3221

  6655425 GTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAA 6655484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 GTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAA 3281

  6655485 TGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGAC 6655517
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3282 TGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGAC 3314

Alignment time is 4.90163 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   3646] =>      3646 nucs 'mol-32-22de-026826_3646'

Score:        3580
Aligned:      3646        nucs
Identic:      3640 (100%) nucs =>       367 (100%)      3273 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6651937,6652303] EXCISED REGION [6652305,6655583]
 second seq =>  [      1,    367] EXCISED REGION [    369,   3646]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6652304,6652304]
 second seq =>         1 nucs [368,368]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [6653293,6653293]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6652303,6652303] to [6652304,6652304]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6651937 TGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTGCAGCGTTTAT 6651996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTGCAGCGTTTAT 60

  6651997 CACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGAAGAGTAATTG 6652056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGAAGAGTAATTG 120

  6652057 GACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACCCATGGAGATT 6652116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACCCATGGAGATT 180

  6652117 TTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCACAGTGAATTC 6652176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCACAGTGAATTC 240

  6652177 TGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAAAACAAATGTA 6652236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAAAACAAATGTA 300

  6652237 TTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTGATGTTTTATG 6652296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTGATGTTTTATG 360

  6652297 TGCTACA 6652303
          |||||||
      361 TGCTACA 367

EXCISED REGION

  6652305 TTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGATAAATTGGTTATTTCTGT 6652364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      369 TTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGATAAATTGGTTATTTCTGT 428

  6652365 TTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACACTTATTTGCTTGTTTCCC 6652424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      429 TTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACACTTATTTGCTTGTTTCCC 488

  6652425 ATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATATTTCCCATCTTCATCAGGG 6652484
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      489 ATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAACGGCTCAAAAATATTTCCCATCTTCATCAGGG 548

  6652485 TAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATGAGCTGTAAATTCTGAAGC 6652544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      549 TAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATGAGCTGTAAATTCTGAAGC 608

  6652545 ACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCAGGAGCAGAGTTTCTATCT 6652604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      609 ACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCAGGAGCAGAGTTTCTATCT 668

  6652605 GCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCATCCATTTAGTTCTCAACAA 6652664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      669 GCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCATCCATTTAGTTCTCAACAA 728

  6652665 GATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGAAGAAAAATGAACATTTTG 6652724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      729 GATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGAAGAAAAATGAACATTTTG 788

  6652725 CATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAATTTTGTTCTTAGAAACTG 6652784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      789 CATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAATTTTGTTCTTAGAAACTG 848

  6652785 CAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACACAATAACAATTGCATTGC 6652844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 CAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACACAATAACAATTGCATTGC 908

  6652845 AATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTTACA 6652904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 AATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTTACA 968

  6652905 GATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGATCA 6652964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 GATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGATCA 1028

  6652965 ATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAGA 6653024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1029 ATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAGA 1088

  6653025 GTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAAT 6653084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 GTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAAT 1148

  6653085 CATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTT 6653144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 CATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTT 1208

  6653145 GGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGTGTATCAGATTCTTGAA 6653204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     1209 GGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGTATATCAGATTCTTGAA 1268

  6653205 GAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTC 6653264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 GAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTC 1328

  6653265 CTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATAACATACAAAAGTGCC 6653324
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 CTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTC-TTTTTTTTTTTCCATAACATACAAAAGTGCC 1387

  6653325 CAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGA 6653384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 CAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGA 1447

  6653385 TTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCC 6653444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 TTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCC 1507

  6653445 CTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTG 6653504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 CTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTG 1567

  6653505 CATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTG 6653564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 CATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTG 1627

  6653565 AAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACA 6653624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 AAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACA 1687

  6653625 TTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTT 6653684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1688 TTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTT 1747

  6653685 AGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTC 6653744
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1748 AGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTC 1807

  6653745 TAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTG 6653804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 TAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTG 1867

  6653805 TTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATAT 6653864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 TTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATAT 1927

  6653865 TTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGG 6653924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 TTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGG 1987

  6653925 GAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCA 6653984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 GAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCA 2047

  6653985 TTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTA 6654044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 TTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTA 2107

  6654045 AATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTT 6654104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 AATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTT 2167

  6654105 AAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTT 6654164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 AAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTT 2227

  6654165 GCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAAT 6654224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 GCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAAT 2287

  6654225 AATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATG 6654284
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 AATTGTCTCAAATAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATG 2347

  6654285 GCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATG 6654344
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 GCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATG 2407

  6654345 CCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAAT 6654404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 CCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAAT 2467

  6654405 GAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCA 6654464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 GAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCA 2527

  6654465 ATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACT 6654524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 ATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACT 2587

  6654525 TATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTG 6654584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 TATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTG 2647

  6654585 ATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGA 6654644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 ATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGA 2707

  6654645 TGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACA 6654704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 TGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACA 2767

  6654705 ACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTT 6654764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 ACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTT 2827

  6654765 GTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTT 6654824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 GTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTT 2887

  6654825 GGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAA 6654884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 GGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAA 2947

  6654885 GTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATA 6654944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 GTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATA 3007

  6654945 ACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACA 6655004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 ACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACA 3067

  6655005 TTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTC 6655064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 TTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTC 3127

  6655065 AATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAA 6655124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 AATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAA 3187

  6655125 GACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGA 6655184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 GACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGA 3247

  6655185 AAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCA 6655244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 AAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCA 3307

  6655245 TTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAA 6655304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 TTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAA 3367

  6655305 ACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTC 6655364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 ACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTC 3427

  6655365 CTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCT 6655424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 CTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCT 3487

  6655425 GTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAA 6655484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 GTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAA 3547

  6655485 TGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTC 6655544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 TGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTC 3607

  6655545 TATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATT 6655583
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 TATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATT 3646

Alignment time is 5.35852 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   4563] =>      4563 nucs 'mol-32-2378-037061_4563'

Score:        4439
Aligned:      4553        nucs
Identic:      4541 (100%) nucs =>      2231 (100%)      2310 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648724,6650959] EXCISED REGION [6650970,6653282]
 second seq =>  [      1,   2237] EXCISED REGION [   2248,   4563]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [2238,2247]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [2283,2285]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6648724 TTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAA 6648783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAA 60

  6648784 TATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTA 6648843
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATAATTATTTATATATTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTA 120

  6648844 TTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCG 6648903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCG 180

  6648904 TGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCT 6648963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCT 240

  6648964 CCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTA 6649023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTA 300

  6649024 GTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGAT 6649083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGAT 360

  6649084 CCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCT 6649143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCT 420

  6649144 ATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTA 6649203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTA 480

  6649204 GTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGA 6649263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGA 540

  6649264 GGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGA 6649323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGA 600

  6649324 AAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAAT 6649383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAAT 660

  6649384 CTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTT 6649443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTT 720

  6649444 TGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCC 6649503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCC 780

  6649504 ATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTG 6649563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTG 840

  6649564 GATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCA 6649623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCA 900

  6649624 TTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACC 6649683
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      901 TTATCTCATTAGGAGAGGACAACTGGAAGCCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACC 960

  6649684 CCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACA 6649743
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACA 1020

  6649744 ACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTA 6649803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTA 1080

  6649804 AAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTC 6649863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTC 1140

  6649864 TTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTAT 6649923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTAT 1200

  6649924 TGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGT 6649983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGT 1260

  6649984 AGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGC 6650043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGC 1320

  6650044 AACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACT 6650103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACT 1380

  6650104 ACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTT-GGTAGAAACAGGGTTT 6650162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
     1381 ACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTT 1440

  6650163 CATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCAT 6650222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCAT 1500

  6650223 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGA 6650282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGA 1560

  6650283 TCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATA 6650342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATA 1620

  6650343 GTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTC 6650402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTC 1680

  6650403 TGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTA 6650462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTA 1740

  6650463 AATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTT 6650522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTT 1800

  6650523 TTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCT 6650582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCT 1860

  6650583 TTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACT 6650642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACT 1920

  6650643 GTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGT 6650702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGT 1980

  6650703 GCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGT 6650762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGT 2040

  6650763 TGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGT 6650822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGT 2100

  6650823 GCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGT 6650882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGT 2160

  6650883 TCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCT 6650942
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2161 TCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCT 2220

  6650943 CTGATCTCCCTTGCAGG 6650959
          |||||||||||||||||
     2221 CTGATCTCCCTTGCAGG 2237

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     2248 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 2307

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 2367

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 2427

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 2487

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 2547

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 2607

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 2667

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 2727

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 2787

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 2847

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 2907

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 2967

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 3027

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 3087

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 3147

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 3207

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 3267

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 3327

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 3387

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 3447

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 6652226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 3507

  6652227 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 6652286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 3567

  6652287 ATGTTTTATGTGCTACAATTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 6652346
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 ATGTTTTATGTGCTACAGTTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 3627

  6652347 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 6652406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 3687

  6652407 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 6652466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 3747

  6652467 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 6652526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 3807

  6652527 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 6652586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 3867

  6652587 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 6652646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 3927

  6652647 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 6652706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 3987

  6652707 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 6652766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 4047

  6652767 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 6652826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 4107

  6652827 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 6652886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 4167

  6652887 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 6652946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 4227

  6652947 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 6653006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 4287

  6653007 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 6653066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 4347

  6653067 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 6653126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 4407

  6653127 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 6653186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 4467

  6653187 GTGTATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 6653246
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 GTATATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 4527

  6653247 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATA 6653282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATA 4563

Alignment time is 6.36129 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2188] =>      2188 nucs 'mol-32-2383-038544_2188'

Score:        2154
Aligned:      2187        nucs
Identic:      2184 (100%) nucs =>      1246 (100%)       938 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6654448,6655693] EXCISED REGION [6655694,6656634]
 second seq =>  [      1,   1246] EXCISED REGION [   1248,   2188]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1247,1247]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [6655747,6655747]
 second seq =>         1 nucs [1301,1301]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6655693,6655693] to [6655694,6655694]
 second seq =>         1 nucs [1246,1246] to [1248,1248]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6654448 AGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAAT 6654507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAAT 60

  6654508 GATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGA 6654567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGA 120

  6654568 TGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGAT 6654627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGAT 180

  6654628 GATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGT 6654687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGT 240

  6654688 TTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATA 6654747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATA 300

  6654748 AGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACC 6654807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACC 360

  6654808 CAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTAC 6654867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTAC 420

  6654868 AAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCA 6654927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCA 480

  6654928 AACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTA 6654987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTA 540

  6654988 AATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCA 6655047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCA 600

  6655048 GGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCT 6655107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCT 660

  6655108 GAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAG 6655167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAG 720

  6655168 CAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCT 6655227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCT 780

  6655228 CCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCC 6655287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCC 840

  6655288 CAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAA 6655347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAA 900

  6655348 TTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTG 6655407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTG 960

  6655408 ACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAA 6655467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAA 1020

  6655468 TACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCT 6655527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCT 1080

  6655528 CTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTA 6655587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTA 1140

  6655588 CACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCT 6655647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCT 1200

  6655648 TTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT 6655693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT 1246

EXCISED REGION

  6655694 TATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGT 6655753
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1248 TATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTTAGAGGT 1307

  6655754 CAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTA 6655813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 CAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTA 1367

  6655814 TGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTT 6655873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 TGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTT 1427

  6655874 TTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTT 6655933
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1428 TTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAATGGTGCAATCTT 1487

  6655934 GACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGG 6655993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 GACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGG 1547

  6655994 AGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGAC 6656053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 AGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGAC 1607

  6656054 GGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCT 6656113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 GGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCT 1667

  6656114 CGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGA 6656173
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1668 CGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGG 1727

  6656174 CTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTC 6656233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 CTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTC 1787

  6656234 CATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGC 6656293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 CATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGC 1847

  6656294 CCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAAT 6656353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 CCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAAT 1907

  6656354 GACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGT 6656413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 GACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGT 1967

  6656414 TTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAG 6656473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 TTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAG 2027

  6656474 AGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAA 6656533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 AGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAA 2087

  6656534 ACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGT 6656593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 ACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGT 2147

  6656594 CTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAAC 6656634
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 CTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAAC 2188

Alignment time is 3.03645 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   3321] =>      3321 nucs 'mol-32-2383-108137_3321'

Score:        3228
Aligned:      3250        nucs
Identic:      3248 (100%) nucs =>      2089 (100%)      1159 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648071,6650160] EXCISED REGION [6654638,6655796]
 second seq =>  [      1,   2090] EXCISED REGION [   2162,   3321]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [2091,2161]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [2090,2090] to [2161,2161]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [2090,2090] to [2162,2162]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648071 TTTGCATTGCAATTCATAAAATATATTGGTCTGTAGTTTGTTTATGTTGTACCTTTTGTC 6648130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGCATTGCAATTCATAAAATATATTGGTCTGTAGTTTGTTTATGTTGTACCTTTTGTC 60

  6648131 TCATTTTGCTATCAGAGTAGTTTGCGCTTCATAAAATAACTTGGGAAATGTCTCCCTCTT 6648190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCATTTTGCTATCAGAGTAGTTTGCGCTTCATAAAATAACTTGGGAAATGTCTCCCTCTT 120

  6648191 ATATTCTCTGGAAGAGATTGTGAATAATTGGTGTTAATTATGCTTTAATTGTTTCATTGA 6648250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATTCTCTGGAAGAGATTGTGAATAATTGGTGTTAATTATGCTTTAATTGTTTCATTGA 180

  6648251 ACATTTAGGGGGACGGTTTGTAAATTCAATTCCCTTAATAGTTGTAAGAGTATTCAAATT 6648310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACATTTAGGGGGACGGTTTGTAAATTCAATTCCCTTAATAGTTGTAAGAGTATTCAAATT 240

  6648311 ATCTAGTTTATATTGAGTAAGTTATAGTAGTTTGTGTCTTTTGAGAAACCTTTTCATCTA 6648370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATCTAGTTTATATTGAGTAAGTTATAGTAGTTTGTGTCTTTTGAGAAACCTTTTCATCTA 300

  6648371 AGTTGTCAAATTTATGCATGTAAAGTTGTTTATTAGTTCTCTGTCCAAATCCTTTTATTA 6648430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTTGTCAAATTTATGCATGTAAAGTTGTTTATTAGTTCTCTGTCCAAATCCTTTTATTA 360

  6648431 TCTCTGTGTTCTGCAGTGGTTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTT 6648490
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTCTGTGTTCTGCAGTGATTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTT 420

  6648491 TTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAA 6648550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAA 480

  6648551 CAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCT 6648610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCT 540

  6648611 GTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTT 6648670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTT 600

  6648671 GATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAA 6648730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAA 660

  6648731 TAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATT 6648790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATT 720

  6648791 ATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTAT 6648850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTAT 780

  6648851 TATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTC 6648910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTC 840

  6648911 GGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGT 6648970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGT 900

  6648971 AGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 6649030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGA 960

  6649031 CAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTG 6649090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTG 1020

  6649091 CTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGC 6649150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGC 1080

  6649151 TTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTC 6649210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTC 1140

  6649211 AGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGG 6649270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGG 1200

  6649271 CCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGT 6649330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGT 1260

  6649331 ATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGT 6649390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGT 1320

  6649391 GAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCC 6649450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCC 1380

  6649451 ACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGG 6649510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGG 1440

  6649511 TTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTA 6649570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTA 1500

  6649571 ATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTC 6649630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTC 1560

  6649631 ATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCA 6649690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCA 1620

  6649691 TCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGA 6649750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGA 1680

  6649751 GTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAG 6649810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAG 1740

  6649811 TCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTC 6649870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTC 1800

  6649871 TATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTT 6649930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTT 1860

  6649931 CTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGA 6649990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGA 1920

  6649991 GTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCC 6650050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCC 1980

  6650051 AACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTG 6650110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTG 2040

  6650111 TGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 2090

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 2221

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 2281

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 2341

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 2401

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 2461

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 2521

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 2581

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 2641

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 2701

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2702 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 2761

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2762 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 2821

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2822 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 2881

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2882 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 2941

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 3001

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3002 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 3061

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3062 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 3121

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 6655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3122 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 3181

  6655658 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 6655716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     3182 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 3241

  6655717 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 6655776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3242 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 3301

  6655777 CCAACAAGGCCAAGTCCAAG 6655796
          ||||||||||||||||||||
     3302 CCAACAAGGCCAAGTCCAAG 3321

Alignment time is 4.82705 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   4959] =>      4959 nucs 'mol-32-2383-184550_4959'

Score:        4812
Aligned:      4889        nucs
Identic:      4882 (100%) nucs =>      1780 (100%)      3102 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648380,6650160] EXCISED REGION [6654638,6657744]
 second seq =>  [      1,   1781] EXCISED REGION [   1853,   4959]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [1782,1852]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1781,1781] to [1852,1852]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1781,1781] to [1853,1853]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648380 ATTTATGCATGTAAAGTTGTTTATTAGTTCTCTGTCCAAATCCTTTTATTATCTCTGTGT 6648439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTATGCATGTAAAGTTGTTTATTAGTTCTCTGTCCAAATCCTTTTATTATCTCTGTGT 60

  6648440 TCTGCAGTGGTTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTT 6648499
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTGCAGTGATTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTT 120

  6648500 TTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTT 6648559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTT 180

  6648560 GTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGC 6648619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGC 240

  6648620 TTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATT 6648679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATT 300

  6648680 ATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCC 6648739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCC 360

  6648740 AAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATG 6648799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATG 420

  6648800 TTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTT 6648859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTT 480

  6648860 CAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTG 6648919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTG 540

  6648920 CAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGAC 6648979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGAC 600

  6648980 TACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 6649039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTC 660

  6649040 TCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCT 6649099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCT 720

  6649100 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTT 6649159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTT 780

  6649160 TTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTC 6649219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTC 840

  6649220 TGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATC 6649279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATC 900

  6649280 TAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCT 6649339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCT 960

  6649340 TATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTT 6649399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTT 1020

  6649400 GGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTAT 6649459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTAT 1080

  6649460 CAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGA 6649519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGA 1140

  6649520 CCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCAT 6649579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCAT 1200

  6649580 ATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGA 6649639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGA 1260

  6649640 GGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTG 6649699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTG 1320

  6649700 TTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAA 6649759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAA 1380

  6649760 CTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGA 6649819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGA 1440

  6649820 CCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTA 6649879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTA 1500

  6649880 CATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCT 6649939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCT 1560

  6649940 AATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTC 6649999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTC 1620

  6650000 TGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAG 6650059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAG 1680

  6650060 GTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACC 6650119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACC 1740

  6650120 ACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 1781

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 1912

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 1972

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 2032

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 2092

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 2152

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 2212

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 2272

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 2332

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 2392

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 2452

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 2512

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 2572

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 2632

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 2692

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 2752

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 2812

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 6655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 2872

  6655658 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 6655716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2873 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 2932

  6655717 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 6655776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 2992

  6655777 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 6655836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 3052

  6655837 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 6655896
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 3111

  6655897 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 6655956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3112 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 3171

  6655957 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 6656016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 3231

  6656017 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 6656076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 3291

  6656077 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 6656136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 3351

  6656137 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 6656196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 3411

  6656197 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 6656256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3412 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 3471

  6656257 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 6656316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 3531

  6656317 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 6656376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3532 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 3591

  6656377 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 6656436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 3651

  6656437 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 6656496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 3711

  6656497 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 6656556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 3771

  6656557 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 6656616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3772 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 3831

  6656617 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 6656676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 3891

  6656677 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 6656736
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 3951

  6656737 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 6656796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 4011

  6656797 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 6656856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 4071

  6656857 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCA 6656916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4072 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCA 4131

  6656917 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 6656976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4132 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 4191

  6656977 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 6657036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 4251

  6657037 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 6657096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 4311

  6657097 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 6657156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4312 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 4371

  6657157 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 6657216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4372 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 4431

  6657217 TGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 6657276
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4432 TGAGTAACATTAGCACGCTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 4491

  6657277 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 6657336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4492 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 4551

  6657337 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAT 6657396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4552 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAA 4611

  6657397 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 6657456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4612 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 4671

  6657457 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 6657516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4672 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 4731

  6657517 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 6657576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4732 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 4791

  6657577 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 6657636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4792 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 4851

  6657637 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 6657696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4852 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 4911

  6657697 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAA 6657744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4912 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAA 4959

Alignment time is 6.91153 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   4800] =>      4800 nucs 'mol-32-2399-059828_4800'

Score:        4685
Aligned:      4790        nucs
Identic:      4778 (100%) nucs =>      2083 (100%)      2695 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648873,6650959] EXCISED REGION [6650970,6653667]
 second seq =>  [      1,   2089] EXCISED REGION [   2100,   4800]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [2090,2099]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [2135,2137]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6648873 GCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTC 6648932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTC 60

  6648933 CTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGC 6648992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGC 120

  6648993 CACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCA 6649052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCA 180

  6649053 GGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 6649112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 240

  6649113 GATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTG 6649172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTG 300

  6649173 TTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGT 6649232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGT 360

  6649233 ATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTT 6649292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTT 420

  6649293 GGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCT 6649352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCT 480

  6649353 TAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGA 6649412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGA 540

  6649413 TAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTG 6649472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTG 600

  6649473 CTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATG 6649532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATG 660

  6649533 CTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATA 6649592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATA 720

  6649593 AATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAG 6649652
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      721 AATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTGGAAG 780

  6649653 CCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTA 6649712
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTA 840

  6649713 ATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGT 6649772
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGT 900

  6649773 CTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATT 6649832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATT 960

  6649833 ATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTG 6649892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTG 1020

  6649893 AGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCT 6649952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCT 1080

  6649953 GGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCT 6650012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCT 1140

  6650013 GGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTC 6650072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTC 1200

  6650073 TGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAAT 6650132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAAT 1260

  6650133 TTTTTTTTTTTTTT--GGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAAT 6650190
          ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAAT 1320

  6650191 CTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAG 6650250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAG 1380

  6650251 TCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTG 6650310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTG 1440

  6650311 TTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTT 6650370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTT 1500

  6650371 GAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCAC 6650430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCAC 1560

  6650431 CTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTT 6650490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTT 1620

  6650491 GCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCT 6650550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCT 1680

  6650551 TATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCG 6650610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCG 1740

  6650611 GGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTC 6650670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTC 1800

  6650671 CAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTA 6650730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTA 1860

  6650731 GAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTG 6650790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTG 1920

  6650791 GATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGG 6650850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGG 1980

  6650851 AGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCT 6650910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCT 2040

  6650911 GTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 6650959
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2041 GTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 2089

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     2100 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 2159

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 2219

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 2279

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 2339

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 2399

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 2459

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 2519

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 2579

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 2639

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 2699

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 2759

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 2819

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 2879

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 2939

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 2999

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 3059

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 3119

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 3179

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 3239

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 3299

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 6652226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 3359

  6652227 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 6652286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 3419

  6652287 ATGTTTTATGTGCTACAATTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 6652346
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 ATGTTTTATGTGCTACAGTTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 3479

  6652347 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 6652406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 3539

  6652407 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 6652466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 3599

  6652467 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 6652526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 3659

  6652527 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 6652586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 3719

  6652587 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 6652646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 3779

  6652647 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 6652706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 3839

  6652707 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 6652766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 3899

  6652767 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 6652826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 3959

  6652827 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 6652886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 4019

  6652887 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 6652946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 4079

  6652947 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 6653006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 4139

  6653007 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 6653066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 4199

  6653067 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 6653126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 4259

  6653127 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 6653186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 4319

  6653187 GTGTATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 6653246
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 GTATATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 4379

  6653247 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCC 6653306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCC 4439

  6653307 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 6653366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 4499

  6653367 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 6653426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 4559

  6653427 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 6653486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 4619

  6653487 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 6653546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 4679

  6653547 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 6653606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 4739

  6653607 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 6653666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 4799

  6653667 T 6653667
          |
     4800 T 4800

Alignment time is 6.62689 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2798] =>      2798 nucs 'mol-32-29d4-055475_2798'

Score:        2696
Aligned:      2788        nucs
Identic:      2778 (100%) nucs =>      1604 (100%)      1174 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6649352,6650959] EXCISED REGION [6650970,6652145]
 second seq =>  [      1,   1609] EXCISED REGION [   1620,   2798]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [1610,1619]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [1655,1657]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6649352 TTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAG 6649411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAG 60

  6649412 ATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCT 6649471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCT 120

  6649472 GCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAAT 6649531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAAT 180

  6649532 GCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCAT 6649591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCAT 240

  6649592 AAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAA 6649651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      241 AAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTGGAA 300

  6649652 GCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTT 6649711
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTT 360

  6649712 AATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAG 6649771
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAG 420

  6649772 TCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTAT 6649831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTAT 480

  6649832 TATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATT 6649891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATT 540

  6649892 GAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATC 6649951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATC 600

  6649952 TGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGC 6650011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGC 660

  6650012 TGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATT 6650071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATT 720

  6650072 CTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAA 6650131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAA 780

  6650132 TTTTTTTTTTTTTTT-GGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAAT 6650190
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAAT 840

  6650191 CTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAG 6650250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAG 900

  6650251 TCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTG 6650310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTG 960

  6650311 TTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTT 6650370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTT 1020

  6650371 GAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCAC 6650430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCAC 1080

  6650431 CTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTT 6650490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTT 1140

  6650491 GCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCT 6650550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCT 1200

  6650551 TATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCG 6650610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCG 1260

  6650611 GGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTC 6650670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTC 1320

  6650671 CAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTA 6650730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTA 1380

  6650731 GAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTG 6650790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTG 1440

  6650791 GATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGG 6650850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGG 1500

  6650851 AGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCT 6650910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCT 1560

  6650911 GTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 6650959
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1561 GTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 1609

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     1620 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 1679

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 1739

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 1799

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 1859

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 1919

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 1979

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 2039

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 2099

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 2159

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 2219

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 2279

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 2339

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 2399

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 2459

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 2519

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 CCGTTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 2579

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 2639

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 2699

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 2759

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGA 6652145
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGA 2798

Alignment time is 3.90435 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2642] =>      2642 nucs 'mol-32-2b13-069639_2642'

Score:        2608
Aligned:      2641        nucs
Identic:      2638 (100%) nucs =>       481 (100%)      2157 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6653234,6653714] EXCISED REGION [6653716,6655874]
 second seq =>  [      1,    481] EXCISED REGION [    483,   2642]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6653715,6653715]
 second seq =>         1 nucs [482,482]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2461,2461]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6653234 CCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCT 6653293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCT 60

  6653294 TTTTTTTTTTTCCATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAG 6653353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTTTTTTTCCATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAG 120

  6653354 CTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGT 6653413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGT 180

  6653414 GTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAG 6653473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAG 240

  6653474 TAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAA 6653533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAA 300

  6653534 GGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGT 6653593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGT 360

  6653594 CTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGC 6653653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGC 420

  6653654 TGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCA 6653713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCA 480

  6653714 A 6653714
          |
      481 A 481

EXCISED REGION

  6653716 GTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTT 6653775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      483 GTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTT 542

  6653776 TTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGAC 6653835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      543 TTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGAC 602

  6653836 CATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAAC 6653895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      603 CATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAAC 662

  6653896 ACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAA 6653955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      663 ACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAA 722

  6653956 ACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAAT 6654015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 ACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAAT 782

  6654016 GCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCA 6654075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 GCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCA 842

  6654076 GTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTG 6654135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 GTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTG 902

  6654136 TTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCA 6654195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 TTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCA 962

  6654196 TATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTAC 6654255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 TATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTAC 1022

  6654256 CCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAA 6654315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1023 CCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAA 1082

  6654316 ATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGT 6654375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 ATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGT 1142

  6654376 ACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAAT 6654435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 ACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAAT 1202

  6654436 ACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGG 6654495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 ACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGG 1262

  6654496 TTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTC 6654555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 TTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTC 1322

  6654556 AGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGAT 6654615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 AGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGAT 1382

  6654616 GATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGG 6654675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 GATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGG 1442

  6654676 AACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGAT 6654735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 AACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGAT 1502

  6654736 CACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTAT 6654795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 CACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTAT 1562

  6654796 TATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTG 6654855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 TATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTG 1622

  6654856 CATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGT 6654915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 CATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGT 1682

  6654916 ATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTG 6654975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 ATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTG 1742

  6654976 TCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGC 6655035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 TCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGC 1802

  6655036 TCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTA 6655095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 TCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTA 1862

  6655096 TTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTG 6655155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 TTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTG 1922

  6655156 AGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACC 6655215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 AGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACC 1982

  6655216 CTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGA 6655275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 CTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGA 2042

  6655276 CTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCAT 6655335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 CTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCAT 2102

  6655336 AAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAA 6655395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 AAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAA 2162

  6655396 GGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAG 6655455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 GGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAG 2222

  6655456 GGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAG 6655515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 GGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAG 2282

  6655516 ACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCA 6655575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 ACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCA 2342

  6655576 ATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATT 6655635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 ATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATT 2402

  6655636 ATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-T 6655694
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     2403 ATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGT 2462

  6655695 ATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTC 6655754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2463 ATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTTAGAGGTC 2522

  6655755 AAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTAT 6655814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 AAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTAT 2582

  6655815 GAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTT 6655874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 GAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTT 2642

Alignment time is 3.65798 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2782] =>      2782 nucs 'mol-32-2e20-078601_2782'

Score:        2680
Aligned:      2713        nucs
Identic:      2710 (100%) nucs =>      1470 (100%)      1240 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648689,6650160] EXCISED REGION [6654638,6655877]
 second seq =>  [      1,   1470] EXCISED REGION [   1542,   2782]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [1471,1541]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1470,1470] to [1541,1541]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1470,1470] to [1542,1542]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648689 AAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTAT 6648748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTAT 60

  6648749 CTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATA 6648808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATA 120

  6648809 AATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAG 6648868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAG 180

  6648869 TCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCG 6648928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCG 240

  6648929 CCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCAC 6648988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCAC 300

  6648989 GTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTG 6649048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTG 360

  6649049 GTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTG 6649108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTG 420

  6649109 CTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTC 6649168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
      421 CTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTT-AATTTC 479

  6649169 TCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTAT 6649228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTAT 539

  6649229 TTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGA 6649288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 TTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGA 599

  6649289 TTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGG 6649348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGG 659

  6649349 TCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACAC 6649408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 TCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACAC 719

  6649409 CAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGAC 6649468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 CAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGAC 779

  6649469 TCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACA 6649528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACA 839

  6649529 AATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGC 6649588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 AATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGC 899

  6649589 CATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTA 6649648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTA 959

  6649649 GAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGAT 6649708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGAT 1019

  6649709 TTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCA 6649768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCA 1079

  6649769 GAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAAC 6649828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 GAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAAC 1139

  6649829 TATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCT 6649888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCT 1199

  6649889 ATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCC 6649948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCC 1259

  6649949 ATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCA 6650008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 ATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCA 1319

  6650009 GGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTG 6650068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTG 1379

  6650069 ATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGC 6650128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 ATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGC 1439

  6650129 TAATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||
     1440 TAATTTTTTTTTTTTTT-GGTAGAAACAGGGT 1470

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 1601

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 1661

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 1721

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 1781

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 1841

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 1901

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 1961

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 2021

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 2081

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 2141

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 2201

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 2261

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 2321

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 2381

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 2441

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 2501

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 6655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 2561

  6655658 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 6655716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2562 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 2621

  6655717 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 6655776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 2681

  6655777 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 6655836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 2741

  6655837 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTT 6655877
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTT 2782

Alignment time is 3.89472 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   5691] =>      5691 nucs 'mol-32-2e4c-003913_5691'

Score:        5567
Aligned:      5681        nucs
Identic:      5669 (100%) nucs =>       804 (100%)      4865 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6650155,6650959] EXCISED REGION [6650970,6655841]
 second seq =>  [      1,    805] EXCISED REGION [    816,   5691]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [806,815]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [851,853]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6650155 CAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGT 6650214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGT 60

  6650215 CTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCT 6650274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCT 120

  6650275 TCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTT 6650334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTT 180

  6650335 ATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTT 6650394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTT 240

  6650395 TAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTG 6650454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTG 300

  6650455 TCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCT 6650514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCT 360

  6650515 GGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTG 6650574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTG 420

  6650575 TGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTT 6650634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTT 480

  6650635 GCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTG 6650694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTG 540

  6650695 AGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCC 6650754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCC 600

  6650755 ACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCT 6650814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCT 660

  6650815 CCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCC 6650874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCC 720

  6650875 CTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTT 6650934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTT 780

  6650935 GGCCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 6650959
          |.|||||||||||||||||||||||
      781 GACCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 805

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
      816 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 875

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      876 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 935

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      936 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 995

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 1055

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 1115

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 1175

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 1235

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 1295

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 1355

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1356 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 1415

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 1475

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 1535

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 1595

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 1655

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 1715

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 1775

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 1835

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 1895

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 1955

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 2015

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 6652226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 2075

  6652227 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 6652286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 2135

  6652287 ATGTTTTATGTGCTACAATTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 6652346
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 ATGTTTTATGTGCTACAGTTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 2195

  6652347 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 6652406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 2255

  6652407 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 6652466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 2315

  6652467 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 6652526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2316 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 2375

  6652527 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 6652586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 2435

  6652587 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 6652646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 2495

  6652647 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 6652706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2496 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 2555

  6652707 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 6652766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2556 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 2615

  6652767 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 6652826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2616 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 2675

  6652827 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 6652886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2676 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 2735

  6652887 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 6652946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2736 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 2795

  6652947 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 6653006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2796 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 2855

  6653007 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 6653066
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2856 GAAAGAAAACTTTAAGGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 2915

  6653067 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 6653126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2916 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 2975

  6653127 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 6653186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2976 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 3035

  6653187 GTGTATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 6653246
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3036 GTATATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 3095

  6653247 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCC 6653306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3096 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCC 3155

  6653307 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 6653366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3156 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 3215

  6653367 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 6653426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3216 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 3275

  6653427 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 6653486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3276 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 3335

  6653487 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 6653546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3336 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 3395

  6653547 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 6653606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3396 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 3455

  6653607 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 6653666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3456 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 3515

  6653667 TTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAA 6653726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3516 TTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAA 3575

  6653727 CTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAA 6653786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3576 CTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAA 3635

  6653787 TCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTC 6653846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3636 TCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTC 3695

  6653847 CTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAG 6653906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3696 CTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAG 3755

  6653907 GGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTA 6653966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3756 GGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTA 3815

  6653967 ACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAG 6654026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3816 ACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAG 3875

  6654027 AATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGC 6654086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3876 AATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGC 3935

  6654087 TACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCC 6654146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3936 TACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCC 3995

  6654147 GGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGT 6654206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3996 GGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGT 4055

  6654207 ATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGT 6654266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4056 ATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGT 4115

  6654267 TCCTGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACC 6654326
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4116 TCCTGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACC 4175

  6654327 TGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGAC 6654386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4176 TGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGAC 4235

  6654387 AGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAA 6654446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4236 AGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAA 4295

  6654447 CAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAA 6654506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4296 CAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAA 4355

  6654507 TGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCG 6654566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4356 TGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCG 4415

  6654567 ATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGA 6654626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4416 ATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGA 4475

  6654627 TGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGG 6654686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4476 TGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGG 4535

  6654687 TTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCAT 6654746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4536 TTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCAT 4595

  6654747 AAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAAC 6654806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4596 AAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAAC 4655

  6654807 CCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTA 6654866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4656 CCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTA 4715

  6654867 CAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGC 6654926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4716 CAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGC 4775

  6654927 AAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCT 6654986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4776 AAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCT 4835

  6654987 AAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTC 6655046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4836 AAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTC 4895

  6655047 AGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCC 6655106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4896 AGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCC 4955

  6655107 TGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAA 6655166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4956 TGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAA 5015

  6655167 GCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCC 6655226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5016 GCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCC 5075

  6655227 TCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCC 6655286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5076 TCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCC 5135

  6655287 CCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAA 6655346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5136 CCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAA 5195

  6655347 ATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTT 6655406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5196 ATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTT 5255

  6655407 GACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCA 6655466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5256 GACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCA 5315

  6655467 ATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCC 6655526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5316 ATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCC 5375

  6655527 TCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCT 6655586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5376 TCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCT 5435

  6655587 ACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATC 6655646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5436 ACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATC 5495

  6655647 TTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCT 6655705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     5496 TTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCT 5555

  6655706 CCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTC 6655765
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     5556 CCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTTAGAGGTCAAGTGGAAGTC 5615

  6655766 TTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAA 6655825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5616 TTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAA 5675

  6655826 AGGATTTTGGAGGGGA 6655841
          ||||||||||||||||
     5676 AGGATTTTGGAGGGGA 5691

Alignment time is 7.87465 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   4925] =>      4925 nucs 'mol-32-2edb-139938_4925'

Score:        4764
Aligned:      4856        nucs
Identic:      4846 (100%) nucs =>      1710 (100%)      3136 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648450,6650160] EXCISED REGION [6654638,6657781]
 second seq =>  [      3,   1712] EXCISED REGION [   1784,   4925]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [1713,1783]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1712,1712] to [1783,1783]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1712,1712] to [1784,1784]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648450 TTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGA 6648509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        3 TTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGA 62

  6648510 AATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGA 6648569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       63 AATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGA 122

  6648570 ATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGT 6648629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      123 ATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGT 182

  6648630 CCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAA 6648689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      183 CCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAA 242

  6648690 AACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATC 6648749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      243 AACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATC 302

  6648750 TTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAA 6648809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      303 TTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAA 362

  6648810 ATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGT 6648869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      363 ATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGT 422

  6648870 CTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGC 6648929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      423 CTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGC 482

  6648930 CTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACG 6648989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      483 CTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACG 542

  6648990 TGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGG 6649049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      543 TGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGG 602

  6649050 TCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGC 6649109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      603 TCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGC 662

  6649110 TGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCT 6649169
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
      663 TGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTT-AATTTCT 721

  6649170 CTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATT 6649229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      722 CTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATT 781

  6649230 TGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGAT 6649289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      782 TGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGAT 841

  6649290 TTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGT 6649349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      842 TTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGT 901

  6649350 CCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACC 6649409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      902 CCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACC 961

  6649410 AGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACT 6649469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 AGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACT 1021

  6649470 CTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAA 6649529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 CTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAA 1081

  6649530 ATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCC 6649589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1082 ATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCC 1141

  6649590 ATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAG 6649649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 ATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAG 1201

  6649650 AAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATT 6649709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 AAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATT 1261

  6649710 TTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAG 6649769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1262 TTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAG 1321

  6649770 AGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACT 6649829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 AGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACT 1381

  6649830 ATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTA 6649889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 ATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTA 1441

  6649890 TTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCA 6649949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 TTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCA 1501

  6649950 TCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAG 6650009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 TCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAG 1561

  6650010 GCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGA 6650069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 GCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGA 1621

  6650070 TTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCT 6650129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 TTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCT 1681

  6650130 AATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 AATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 1712

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1784 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 1843

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1844 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 1903

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1904 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 1963

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1964 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 2023

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2024 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 2083

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2084 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 2143

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2144 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 2203

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2204 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 2263

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2264 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 2323

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2324 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 2383

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2384 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 2443

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2444 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 2503

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2504 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 2563

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2564 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 2623

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2624 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 2683

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2684 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 2743

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 6655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2744 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 2803

  6655658 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 6655716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2804 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 2863

  6655717 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 6655776
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2864 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATTAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 2923

  6655777 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 6655836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2924 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 2983

  6655837 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 6655896
          |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2984 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC---TTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 3040

  6655897 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 6655956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 3100

  6655957 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 6656016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 3160

  6656017 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 6656076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 3220

  6656077 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 6656136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 3280

  6656137 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 6656196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 3340

  6656197 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 6656256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 3400

  6656257 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 6656316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 3460

  6656317 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 6656376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 3520

  6656377 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 6656436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 3580

  6656437 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 6656496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 3640

  6656497 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 6656556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 3700

  6656557 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 6656616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 3760

  6656617 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 6656676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 3820

  6656677 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 6656736
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 3880

  6656737 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 6656796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 3940

  6656797 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 6656856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 4000

  6656857 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCA 6656916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4001 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCA 4060

  6656917 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 6656976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 4120

  6656977 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 6657036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 4180

  6657037 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 6657096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 4240

  6657097 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 6657156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 4300

  6657157 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 6657216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 4360

  6657217 TGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 6657276
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 TGAGTAACATTAGCACGCTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 4420

  6657277 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 6657336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 4480

  6657337 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAT 6657396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4481 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAA 4540

  6657397 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 6657456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 4600

  6657457 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 6657516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 4660

  6657517 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 6657576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 4720

  6657577 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 6657636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 4780

  6657637 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 6657696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 4840

  6657697 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAA 6657756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAA 4900

  6657757 CCTGATATTTTCATAGTATTTTTAC 6657781
          |||||||||||||||||||||||||
     4901 CCTGATATTTTCATAGTATTTTTAC 4925

Alignment time is 7.06713 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2868] =>      2868 nucs 'mol-32-2edb-164993_2868'

Score:        2779
Aligned:      2867        nucs
Identic:      2859 (100%) nucs =>      1074 (100%)      1785 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6654620,6655693] EXCISED REGION [6655694,6657486]
 second seq =>  [      1,   1074] EXCISED REGION [   1076,   2868]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1075,1075]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [6655747,6655747]
 second seq =>         1 nucs [1129,1129]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6655693,6655693] to [6655694,6655694]
 second seq =>         1 nucs [1074,1074] to [1076,1076]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6654620 ATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACG 6654679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACG 60

  6654680 TTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACT 6654739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACT 120

  6654740 GATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATT 6654799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATT 180

  6654800 TTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATT 6654859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATT 240

  6654860 AAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAA 6654919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAA 300

  6654920 CTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCC 6654979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCC 360

  6654980 CATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTT 6655039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTT 420

  6655040 TTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTT 6655099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTT 480

  6655100 CCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGAT 6655159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGAT 540

  6655160 TCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCT 6655219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCT 600

  6655220 CCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCC 6655279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCC 660

  6655280 CTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAA 6655339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAA 720

  6655340 CCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAA 6655399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAA 780

  6655400 ATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTC 6655459
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTC 840

  6655460 TGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAG 6655519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAG 900

  6655520 ACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCA 6655579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCA 960

  6655580 TATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTC 6655639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTC 1020

  6655640 TTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT 6655693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT 1074

EXCISED REGION

  6655694 TATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGT 6655753
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1076 TATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTTAGAGGT 1135

  6655754 CAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTA 6655813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1136 CAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTA 1195

  6655814 TGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTT 6655873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1196 TGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTT 1255

  6655874 TTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTT 6655933
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1256 TTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAATGGTGCAATCTT 1315

  6655934 GACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGG 6655993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1316 GACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGG 1375

  6655994 AGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGAC 6656053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1376 AGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGAC 1435

  6656054 GGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCT 6656113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1436 GGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCT 1495

  6656114 CGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGA 6656173
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1496 CGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGG 1555

  6656174 CTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTC 6656233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1556 CTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTC 1615

  6656234 CATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGC 6656293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1616 CATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGC 1675

  6656294 CCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAAT 6656353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1676 CCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAAT 1735

  6656354 GACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGT 6656413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1736 GACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGT 1795

  6656414 TTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAG 6656473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1796 TTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAG 1855

  6656474 AGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAA 6656533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1856 AGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAA 1915

  6656534 ACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGT 6656593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1916 ACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGT 1975

  6656594 CTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATA 6656653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1976 CTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATA 2035

  6656654 CGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACA 6656713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2036 CGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACA 2095

  6656714 AACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTA 6656773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2096 AACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTA 2155

  6656774 AAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCAC 6656833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2156 AAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCAC 2215

  6656834 AGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCT 6656893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2216 AGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCT 2275

  6656894 TCCTTAATGTGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACT 6656953
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2276 TCCTTAATGGGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACT 2335

  6656954 GATGGTAAAACACCTCATCATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTC 6657013
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2336 GATGGTAAAACACCTCATTATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTC 2395

  6657014 ACCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCT 6657073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2396 ACCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCT 2455

  6657074 TGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATT 6657133
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2456 TGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATAAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATT 2515

  6657134 TGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAA 6657193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2516 TGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAA 2575

  6657194 AAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAA 6657253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2576 AAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAA 2635

  6657254 CAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAA 6657313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2636 CAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAA 2695

  6657314 TTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATT 6657373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2696 TTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATT 2755

  6657374 GCCAGAAGTTAGACTTTTATTATCATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTC 6657433
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2756 GCCAGAAGTTAGACTTTTATTAACATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTC 2815

  6657434 CCAAATTACAATTTTATTTTAGGGAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAA 6657486
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2816 CCAAATTACAATTTTATTTTAGGGAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAA 2868

Alignment time is 3.97101 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2833] =>      2833 nucs 'mol-32-2ef1-069191_2833'

Score:        2753
Aligned:      2823        nucs
Identic:      2815 (100%) nucs =>      1186 (100%)      1629 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6649772,6650959] EXCISED REGION [6650970,6652601]
 second seq =>  [      1,   1188] EXCISED REGION [   1199,   2833]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [1189,1198]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [1234,1236]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6649772 TCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTAT 6649831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTAT 60

  6649832 TATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATT 6649891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATT 120

  6649892 GAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATC 6649951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATC 180

  6649952 TGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGC 6650011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGC 240

  6650012 TGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATT 6650071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATT 300

  6650072 CTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAA 6650131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAA 360

  6650132 TTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATC 6650191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATC 420

  6650192 TCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGT 6650251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGT 480

  6650252 CACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGT 6650311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGT 540

  6650312 TTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTG 6650371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTG 600

  6650372 AAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACC 6650431
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      601 AAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACCCCTATCATCTCTGTCACC 660

  6650432 TTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTG 6650491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTG 720

  6650492 CTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTT 6650551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTT 780

  6650552 ATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGG 6650611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGG 840

  6650612 GGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCC 6650671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCC 900

  6650672 AGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAG 6650731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAG 960

  6650732 AGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGG 6650791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGG 1020

  6650792 ATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGA 6650851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGA 1080

  6650852 GAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTG 6650911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTG 1140

  6650912 TTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 6650959
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1141 TTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 1188

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     1199 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 1258

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1259 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 1318

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1319 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 1378

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 1438

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 1498

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 1558

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 1618

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 1678

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 1738

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 1798

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 1858

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 1918

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1919 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACGACCAACAATCAA 1978

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 2038

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 2098

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 2158

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 2218

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 2278

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 2338

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 2398

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 6652226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 2458

  6652227 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 6652286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 2518

  6652287 ATGTTTTATGTGCTACAATTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 6652346
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ATGTTTTATGTGCTACAGTTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 2578

  6652347 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 6652406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 2638

  6652407 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 6652466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 2698

  6652467 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 6652526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 2758

  6652527 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 6652586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 2818

  6652587 GGAGCAGAGTTTCTA 6652601
          |||||||||||||||
     2819 GGAGCAGAGTTTCTA 2833

Alignment time is 3.91262 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2958] =>      2958 nucs 'mol-32-2ef1-069192_2958'

Score:        2902
Aligned:      2957        nucs
Identic:      2952 (100%) nucs =>       289 (100%)      2663 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6652900,6653188] EXCISED REGION [6653190,6655856]
 second seq =>  [      1,    289] EXCISED REGION [    291,   2958]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6653189,6653189]
 second seq =>         1 nucs [290,290]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2795,2795]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6653188,6653188] to [6653190,6653190]
 second seq =>         1 nucs [289,289] to [291,291]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6652900 TTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTA 6652959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTA 60

  6652960 GATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTT 6653019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTT 120

  6653020 AAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTT 6653079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTT 180

  6653080 CAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTT 6653139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTT 240

  6653140 GCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGT 6653188
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGT 289

EXCISED REGION

  6653190 TATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCT 6653249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      291 TATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCT 350

  6653250 GCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATA 6653309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      351 GCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATA 410

  6653310 ACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAG 6653369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      411 ACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAG 470

  6653370 GGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAG 6653429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      471 GGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAG 530

  6653430 TGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATT 6653489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      531 TGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATT 590

  6653490 TTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTT 6653549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      591 TTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTT 650

  6653550 TTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACA 6653609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      651 TTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACA 710

  6653610 AGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTT 6653669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      711 AGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTT 770

  6653670 ATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAACTT 6653729
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      771 ATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAACTT 830

  6653730 GCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCA 6653789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 GCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCA 890

  6653790 AGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTT 6653849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 AGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTT 950

  6653850 TATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGT 6653909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 TATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGT 1010

  6653910 TTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACT 6653969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 TTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACT 1070

  6653970 TCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAAT 6654029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 TCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAAT 1130

  6654030 AACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTAC 6654089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 AACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTAC 1190

  6654090 TAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGG 6654149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 TAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGG 1250

  6654150 ATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATA 6654209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 ATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATA 1310

  6654210 GAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCC 6654269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 GAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCC 1370

  6654270 TGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGA 6654329
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 TGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGA 1430

  6654330 TTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGA 6654389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 TTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGA 1490

  6654390 GTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAG 6654449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 GTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAG 1550

  6654450 ATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGA 6654509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 ATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGA 1610

  6654510 TTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATG 6654569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 TTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATG 1670

  6654570 ATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGA 6654629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 ATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGA 1730

  6654630 TAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTT 6654689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 TAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTT 1790

  6654690 GGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAG 6654749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 GGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAG 1850

  6654750 CTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCA 6654809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 CTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCA 1910

  6654810 GAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAA 6654869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 GAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAA 1970

  6654870 GAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAA 6654929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 GAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAA 2030

  6654930 CATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAA 6654989
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2031 CATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTCCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAA 2090

  6654990 TTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGG 6655049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 TTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGG 2150

  6655050 GCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGA 6655109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 GCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGA 2210

  6655110 ATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCA 6655169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 ATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCA 2270

  6655170 ACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCC 6655229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 ACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCC 2330

  6655230 TGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCA 6655289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 TGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCA 2390

  6655290 AGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATT 6655349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 AGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATT 2450

  6655350 ACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGAC 6655409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 ACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGAC 2510

  6655410 CTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATA 6655469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 CTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATA 2570

  6655470 CCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCT 6655529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 CCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCT 2630

  6655530 AATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACA 6655589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 AATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACA 2690

  6655590 CAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTT 6655649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 CAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTT 2750

  6655650 GGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCC 6655708
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2751 GGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCC 2810

  6655709 ATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTT 6655768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2811 ATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTTAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTT 2870

  6655769 CTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGG 6655828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 CTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGG 2930

  6655829 ATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGG 6655856
          ||||||||||||||||||||||||||||
     2931 ATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGG 2958

Alignment time is 4.45959 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   3624] =>      3624 nucs 'mol-32-2f3e-035137_3624'

Score:        3524
Aligned:      3623        nucs
Identic:      3614 (100%) nucs =>       630 (100%)      2984 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6647254,6647883] EXCISED REGION [6647885,6650876]
 second seq =>  [      1,    630] EXCISED REGION [    632,   3624]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6647884,6647884]
 second seq =>         1 nucs [631,631]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2879,2879]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6647884,6647884] to [6647885,6647885]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6647254 TTAAGAGTTCTTTATATATCCTAAATATCAGTCCTTTGTTGAATATGTGGCTCTTGAATA 6647313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTAAGAGTTCTTTATATATCCTAAATATCAGTCCTTTGTTGAATATGTGGCTCTTGAATA 60

  6647314 TTGTCTCCCATTCTGCAACTTGTCTTTTTATCTCTGAAAGGGATTCTTACTGTGCAAAGT 6647373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGTCTCCCATTCTGCAACTTGTCTTTTTATCTCTGAAAGGGATTCTTACTGTGCAAAGT 120

  6647374 AGCATAATTTTGATGAGGTCAAATTTATCCATTTTTTCGCTTAAGGGTCATGTTTTTGAT 6647433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGCATAATTTTGATGAGGTCAAATTTATCCATTTTTTCGCTTAAGGGTCATGTTTTTGAT 180

  6647434 GTTACGTCCAAGAACTCTTTGCCTAGCTCTCTATCATGAAAATTTGCTTCTGCATTTTGT 6647493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTACGTCCAAGAACTCTTTGCCTAGCTCTCTATCATGAAAATTTGCTTCTGCATTTTGT 240

  6647494 CCTAAATGTTTTATAGTTTTGTGTTTTACATTTAAGTTTGTGATATATTTTGGTTTGCAT 6647553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTAAATGTTTTATAGTTTTGTGTTTTACATTTAAGTTTGTGATATATTTTGGTTTGCAT 300

  6647554 TCAAATTTATTGTGATAAATAAGGCGACATAAAATTTGCCATCTGAATCATTTTTAAGTG 6647613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCAAATTTATTGTGATAAATAAGGCGACATAAAATTTGCCATCTGAATCATTTTTAAGTG 360

  6647614 TGTAGTGCAATGGTGTTAAGCATATTTACATTATTGTAAGACAGATCATCAGAACTTTTT 6647673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTAGTGCAATGGTGTTAAGCATATTTACATTATTGTAAGACAGATCATCAGAACTTTTT 420

  6647674 CTTCTTGAAAATCAGAAATTTTATACCCATTAAACAACTTCTTTTCTGTCCCTCTGCCCA 6647733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTCTTGAAAATCAGAAATTTTATACCCATTAAACAACTTCTTTTCTGTCCCTCTGCCCA 480

  6647734 GCTCCTGGTAACTGTCATTCTACTTTCTGTTTCTAGATTTTGTCAACTTTAGATACCTCA 6647793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCTCCTGGTAACTGTCATTCTACTTTCTGTTTCTAGATTTTGTCAACTTTAGATACCTCA 540

  6647794 TATTTATGGAATTATACAGTATTTGTCTTTTAATACAAAAGATTGGCTTATTTCACTTAA 6647853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATTTATGGAATTATACAGTATTTGTCTTTTAATACAAAAGATTGGCTTATTTCACTTAA 600

  6647854 CATAATGTCATTTTGTTTTCCTTTTGGTAC 6647883
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATAATGTCATTTTGTTTTCCTTTTGGTAC 630

EXCISED REGION

  6647885 AGGTATGAGACTTAGAAAGAGATTATTTTATTAATTGATTGATTTATTGATTGATTATCT 6647944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      632 AGGTATGAGACTTAGAAAGAGATTATTTTATTAATTGATTGATTTATTGATTGATTATCT 691

  6647945 GTGGATATCCAAGTGAACCTGCACCATTTGTTGTAAAAGCTATCTTTCCTGCATTTAATT 6648004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      692 GTGGATATCCAAGTGAACCTGCACCATTTGTTGTAAAAGCTATCTTTCCTGCATTTAATT 751

  6648005 GTTTTTAAACCTTGATCAAATATTAGTTGGGCATATTTGAATAAATCTGTTTCTGGGTTG 6648064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 GTTTTTAAACCTTGATCAAATATTAGTTGGGCATATTTGAATAAATCTGTTTCTGGGTTG 811

  6648065 TAGATTTTTGCATTGCAATTCATAAAATATATTGGTCTGTAGTTTGTTTATGTTGTACCT 6648124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      812 TAGATTTTTGCATTGCAATTCATAAAATATATTGGTCTGTAGTTTGTTTATGTTGTACCT 871

  6648125 TTTGTCTCATTTTGCTATCAGAGTAGTTTGCGCTTCATAAAATAACTTGGGAAATGTCTC 6648184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      872 TTTGTCTCATTTTGCTATCAGAGTAGTTTGCGCTTCATAAAATAACTTGGGAAATGTCTC 931

  6648185 CCTCTTATATTCTCTGGAAGAGATTGTGAATAATTGGTGTTAATTATGCTTTAATTGTTT 6648244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 CCTCTTATATTCTCTGGAAGAGATTGTGAATAATTGGTGTTAATTATGCTTTAATTGTTT 991

  6648245 CATTGAACATTTAGGGGGACGGTTTGTAAATTCAATTCCCTTAATAGTTGTAAGAGTATT 6648304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 CATTGAACATTTAGGGGGACGGTTTGTAAATTCAATTCCCTTAATAGTTGTAAGAGTATT 1051

  6648305 CAAATTATCTAGTTTATATTGAGTAAGTTATAGTAGTTTGTGTCTTTTGAGAAACCTTTT 6648364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 CAAATTATCTAGTTTATATTGAGTAAGTTATAGTAGTTTGTGTCTTTTGAGAAACCTTTT 1111

  6648365 CATCTAAGTTGTCAAATTTATGCATGTAAAGTTGTTTATTAGTTCTCTGTCCAAATCCTT 6648424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 CATCTAAGTTGTCAAATTTATGCATGTAAAGTTGTTTATTAGTTCTCTGTCCAAATCCTT 1171

  6648425 TTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGGTTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTGTG 6648484
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 TTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGATTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTGTG 1231

  6648485 ACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTC 6648544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 ACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTC 1291

  6648545 AAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTA 6648604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 AAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTA 1351

  6648605 AATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTC 6648664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 AATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTC 1411

  6648665 TGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGT 6648724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 TGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGT 1471

  6648725 TATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAAT 6648784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 TATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAAT 1531

  6648785 ATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTAT 6648844
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1532 ATAATTATTTATATATTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTAT 1591

  6648845 TATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGT 6648904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1592 TATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGT 1651

  6648905 GATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTC 6648964
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1652 GATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTC 1711

  6648965 CCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAG 6649024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1712 CCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCGCGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAG 1771

  6649025 TAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATC 6649084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1772 TAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATC 1831

  6649085 CACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTA 6649144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1832 CACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTA 1891

  6649145 TTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAG 6649204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 TTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAG 1951

  6649205 TATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAG 6649264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 TATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAG 2011

  6649265 GTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAA 6649324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 GTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAA 2071

  6649325 AAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATC 6649384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 AAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATC 2131

  6649385 TAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTT 6649444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 TAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTT 2191

  6649445 GGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCA 6649504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 GGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCA 2251

  6649505 TCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGG 6649564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 TCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGG 2311

  6649565 ATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCAT 6649624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 ATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCAT 2371

  6649625 TATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCC 6649684
          |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2372 TATCTCATTAGGAGAGGACAACTGGAAGCCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCC 2431

  6649685 CTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAA 6649744
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2432 CTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAA 2491

  6649745 CCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAA 6649804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 CCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAA 2551

  6649805 AGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCT 6649864
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2552 AGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGGGAGTGGCTGATTCT 2611

  6649865 TTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATT 6649924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 TTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATT 2671

  6649925 GTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTA 6649984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 GTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTA 2731

  6649985 GACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCA 6650044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 GACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCA 2791

  6650045 ACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTA 6650104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 ACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTA 2851

  6650105 CAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAA-TTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTC 6650163
          ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 CAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTC 2911

  6650164 ATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATC 6650223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 ATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATC 2971

  6650224 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGAT 6650283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 CCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGAT 3031

  6650284 CATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAG 6650343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 CATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAG 3091

  6650344 TTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCT 6650403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 TTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCT 3151

  6650404 GCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAA 6650463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 GCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAA 3211

  6650464 ATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTT 6650523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 ATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTT 3271

  6650524 TGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTT 6650583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 TGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTT 3331

  6650584 TCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTG 6650643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 TCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTG 3391

  6650644 TCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTG 6650703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 TCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTG 3451

  6650704 CTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTT 6650763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3452 CTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTT 3511

  6650764 GTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTG 6650823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3512 GTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTG 3571

  6650824 CTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCT 6650876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 CTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCT 3624

Alignment time is 5.04422 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   7589] =>      7589 nucs 'mol-32-2fb7-072478_7589'

Score:        7389
Aligned:      7580        nucs
Identic:      7561 (100%) nucs =>      1950 (100%)      5611 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6649004,6650959] EXCISED REGION [6650970,6656588]
 second seq =>  [      1,   1955] EXCISED REGION [   1966,   7589]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [1956,1965]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [2001,2003]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6649004 GCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCG 6649063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCG 60

  6649064 AATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCG 6649123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCG 120

  6649124 TGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTC 6649183
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
      121 TGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTT-AATTTCTCTGTTTTCTGTTTC 179

  6649184 CTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAA 6649243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 CTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAA 239

  6649244 ATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGC 6649303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 ATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGC 299

  6649304 TCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACC 6649363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 TCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACC 359

  6649364 AAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAA 6649423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 AAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAA 419

  6649424 TGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGA 6649483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGA 479

  6649484 GATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAA 6649543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 GATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAA 539

  6649544 GGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATG 6649603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATG 599

  6649604 GGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTG 6649663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
      600 GGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTGGAAGCCACAGGCTTG 659

  6649664 GAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCT 6649723
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      660 GAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATCTGTATCCT 719

  6649724 TTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTT 6649783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTT 779

  6649784 TCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCA 6649843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCA 839

  6649844 CAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTAC 6649903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTAC 899

  6649904 TGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTT 6649963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 TGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTT 959

  6649964 TATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTG 6650023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTG 1019

  6650024 GTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAG 6650083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAG 1079

  6650084 CCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTT 6650143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTT 1139

  6650144 TTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGT 6650203
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TTTTGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGT 1199

  6650204 GATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGG 6650263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 GATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGG 1259

  6650264 CCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAG 6650323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAG 1319

  6650324 ACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGT 6650383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 ACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGT 1379

  6650384 CATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCA 6650443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 CATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCA 1439

  6650444 TCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTA 6650503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTA 1499

  6650504 ATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTC 6650563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 ATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTC 1559

  6650564 AGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAA 6650623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAA 1619

  6650624 AGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCT 6650683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCT 1679

  6650684 GTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCC 6650743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCC 1739

  6650744 TTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAA 6650803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAA 1799

  6650804 GCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAG 6650863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 GCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAG 1859

  6650864 ATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAG 6650923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 ATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAG 1919

  6650924 CCACCCTACTTGGCCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 6650959
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1920 CCACCCTACTTGACCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 1955

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     1966 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 2025

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 2085

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 2145

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 2205

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 2265

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 2325

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 2385

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 2445

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 2505

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 2565

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 2625

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 2685

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 2745

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2746 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 2805

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 2865

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 2925

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 2985

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2986 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 3045

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3046 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 3105

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3106 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 3165

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 6652226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3166 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 3225

  6652227 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 6652286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3226 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 3285

  6652287 ATGTTTTATGTGCTACAATTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 6652346
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3286 ATGTTTTATGTGCTACAGTTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 3345

  6652347 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 6652406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3346 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 3405

  6652407 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 6652466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3406 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 3465

  6652467 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 6652526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3466 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 3525

  6652527 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 6652586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3526 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 3585

  6652587 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 6652646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3586 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 3645

  6652647 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 6652706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3646 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 3705

  6652707 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 6652766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3706 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 3765

  6652767 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 6652826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3766 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 3825

  6652827 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 6652886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3826 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 3885

  6652887 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 6652946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3886 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 3945

  6652947 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 6653006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3946 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 4005

  6653007 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 6653066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4006 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 4065

  6653067 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 6653126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4066 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 4125

  6653127 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 6653186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4126 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 4185

  6653187 GTGTATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 6653246
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4186 GTATATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 4245

  6653247 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCC 6653306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4246 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCC 4305

  6653307 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 6653366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4306 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 4365

  6653367 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 6653426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4366 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 4425

  6653427 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 6653486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4426 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 4485

  6653487 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 6653546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4486 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 4545

  6653547 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 6653606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4546 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 4605

  6653607 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 6653666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4606 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 4665

  6653667 TTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAA 6653726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4666 TTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAA 4725

  6653727 CTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAA 6653786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4726 CTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAA 4785

  6653787 TCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTC 6653846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4786 TCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTC 4845

  6653847 CTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAG 6653906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4846 CTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAG 4905

  6653907 GGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTA 6653966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4906 GGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTA 4965

  6653967 ACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAG 6654026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4966 ACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAG 5025

  6654027 AATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGC 6654086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5026 AATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGC 5085

  6654087 TACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCC 6654146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5086 TACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCC 5145

  6654147 GGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGT 6654206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5146 GGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGT 5205

  6654207 ATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGT 6654266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5206 ATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGT 5265

  6654267 TCCTGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACC 6654326
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5266 TCCTGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACC 5325

  6654327 TGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGAC 6654386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5326 TGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGAC 5385

  6654387 AGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAA 6654446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5386 AGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAA 5445

  6654447 CAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAA 6654506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5446 CAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAA 5505

  6654507 TGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCG 6654566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5506 TGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCG 5565

  6654567 ATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGA 6654626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5566 ATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGA 5625

  6654627 TGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGG 6654686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5626 TGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGG 5685

  6654687 TTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCAT 6654746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5686 TTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCAT 5745

  6654747 AAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAAC 6654806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5746 AAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAAC 5805

  6654807 CCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTA 6654866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5806 CCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTA 5865

  6654867 CAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGC 6654926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5866 CAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGC 5925

  6654927 AAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCT 6654986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5926 AAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCT 5985

  6654987 AAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTC 6655046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5986 AAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTC 6045

  6655047 AGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCC 6655106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6046 AGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCC 6105

  6655107 TGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAA 6655166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6106 TGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAA 6165

  6655167 GCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCC 6655226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6166 GCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCC 6225

  6655227 TCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCC 6655286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6226 TCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCC 6285

  6655287 CCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAA 6655346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6286 CCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAA 6345

  6655347 ATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTT 6655406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6346 ATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTT 6405

  6655407 GACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCA 6655466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6406 GACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCA 6465

  6655467 ATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCC 6655526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6466 ATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCC 6525

  6655527 TCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCT 6655586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6526 TCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCT 6585

  6655587 ACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATC 6655646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6586 ACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATC 6645

  6655647 TTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCT 6655705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     6646 TTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCT 6705

  6655706 CCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTC 6655765
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     6706 CCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTTAGAGGTCAAGTGGAAGTC 6765

  6655766 TTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAA 6655825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6766 TTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAA 6825

  6655826 AGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG 6655884
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     6826 AGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG 6885

  6655885 AGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCA 6655944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6886 AGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAATGGTGCAATCTTGACTCACTGCA 6945

  6655945 ACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTA 6656004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6946 ACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTA 7005

  6656005 CAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACC 6656064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7006 CAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACC 7065

  6656065 ATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGA 6656124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7066 ATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGA 7125

  6656125 AGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGC 6656184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     7126 AGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGGCTTTTAAAAGC 7185

  6656185 TTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCT 6656244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7186 TTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCT 7245

  6656245 TGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGT 6656304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7246 TGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGT 7305

  6656305 AACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTG 6656364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7306 AACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTG 7365

  6656365 TAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTG 6656424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7366 TAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTG 7425

  6656425 AAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAG 6656484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7426 AAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAG 7485

  6656485 AGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCAT 6656544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7486 AGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCAT 7545

  6656545 CCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCC 6656588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7546 CCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCC 7589

Alignment time is 10.5354 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   9855] =>      9855 nucs 'mol-32-2fd8-006844_9855'

Score:        9542
Aligned:      9786        nucs
Identic:      9763 (100%) nucs =>      2418 (100%)      7345 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6647741,6650160] EXCISED REGION [6654638,6662002]
 second seq =>  [      1,   2420] EXCISED REGION [   2492,   9855]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [2421,2491]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [2420,2420] to [2491,2491]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [2420,2420] to [2492,2492]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6647741 GTAACTGTCATTCTACTTTCTGTTTCTAGATTTTGTCAACTTTAGATACCTCATATTTAT 6647800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAACTGTCATTCTACTTTCTGTTTCTAGATTTTGTCAACTTTAGATACCTCATATTTAT 60

  6647801 GGAATTATACAGTATTTGTCTTTTAATACAAAAGATTGGCTTATTTCACTTAACATAATG 6647860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAATTATACAGTATTTGTCTTTTAATACAAAAGATTGGCTTATTTCACTTAACATAATG 120

  6647861 TCATTTTGTTTTCCTTTTGGTACAAGGTATGAGACTTAGAAAGAGATTATTTTATTAATT 6647920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCATTTTGTTTTCCTTTTGGTACAAGGTATGAGACTTAGAAAGAGATTATTTTATTAATT 180

  6647921 GATTGATTTATTGATTGATTATCTGTGGATATCCAAGTGAACCTGCACCATTTGTTGTAA 6647980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATTGATTTATTGATTGATTATCTGTGGATATCCAAGTGAACCTGCACCATTTGTTGTAA 240

  6647981 AAGCTATCTTTCCTGCATTTAATTGTTTTTAAACCTTGATCAAATATTAGTTGGGCATAT 6648040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCTATCTTTCCTGCATTTAATTGTTTTTAAACCTTGATCAAATATTAGTTGGGCATAT 300

  6648041 TTGAATAAATCTGTTTCTGGGTTGTAGATTTTTGCATTGCAATTCATAAAATATATTGGT 6648100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGAATAAATCTGTTTCTGGGTTGTAGATTTTTGCATTGCAATTCATAAAATATATTGGT 360

  6648101 CTGTAGTTTGTTTATGTTGTACCTTTTGTCTCATTTTGCTATCAGAGTAGTTTGCGCTTC 6648160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGTAGTTTGTTTATGTTGTACCTTTTGTCTCATTTTGCTATCAGAGTAGTTTGCGCTTC 420

  6648161 ATAAAATAACTTGGGAAATGTCTCCCTCTTATATTCTCTGGAAGAGATTGTGAATAATTG 6648220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAAAATAACTTGGGAAATGTCTCCCTCTTATATTCTCTGGAAGAGATTGTGAATAATTG 480

  6648221 GTGTTAATTATGCTTTAATTGTTTCATTGAACATTTAGGGGGACGGTTTGTAAATTCAAT 6648280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGTTAATTATGCTTTAATTGTTTCATTGAACATTTAGGGGGACGGTTTGTAAATTCAAT 540

  6648281 TCCCTTAATAGTTGTAAGAGTATTCAAATTATCTAGTTTATATTGAGTAAGTTATAGTAG 6648340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCCTTAATAGTTGTAAGAGTATTCAAATTATCTAGTTTATATTGAGTAAGTTATAGTAG 600

  6648341 TTTGTGTCTTTTGAGAAACCTTTTCATCTAAGTTGTCAAATTTATGCATGTAAAGTTGTT 6648400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTGTGTCTTTTGAGAAACCTTTTCATCTAAGTTGTCAAATTTATGCATGTAAAGTTGTT 660

  6648401 TATTAGTTCTCTGTCCAAATCCTTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGGTTATCTTGTTT 6648460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      661 TATTAGTTCTCTGTCCAAATCCTTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGATTATCTTGTTT 720

  6648461 TGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACA 6648520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACA 780

  6648521 TTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATT 6648580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATT 840

  6648581 GTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTG 6648640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTG 900

  6648641 TTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTC 6648700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTC 960

  6648701 TTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTT 6648760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTT 1020

  6648761 ATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATT 6648820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATT 1080

  6648821 TATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTT 6648880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTT 1140

  6648881 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTC 6648940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTC 1200

  6648941 AAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGC 6649000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGC 1260

  6649001 CGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTC 6649060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTC 1320

  6649061 TCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 6649120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAG 1380

  6649121 GCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGT 6649180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGT 1440

  6649181 TTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAA 6649240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAA 1500

  6649241 AAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTG 6649300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTG 1560

  6649301 AGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCAC 6649360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCAC 1620

  6649361 ACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAA 6649420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAA 1680

  6649421 TAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTC 6649480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTC 1740

  6649481 TGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAAC 6649540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAAC 1800

  6649541 TAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTC 6649600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTC 1860

  6649601 ATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGT 6649660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGT 1920

  6649661 TTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTAT 6649720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTAT 1980

  6649721 CCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGT 6649780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGT 2040

  6649781 TTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTA 6649840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTA 2100

  6649841 TCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATC 6649900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATC 2160

  6649901 TACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTC 6649960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTC 2220

  6649961 TTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 6650020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCA 2280

  6650021 GTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCT 6650080
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2281 GTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCC 2340

  6650081 CAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTT 6650140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTT 2400

  6650141 TTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          ||||||||||||||||||||
     2401 TTTTTTGGTAGAAACAGGGT 2420

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 2551

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 2611

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 2671

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 2731

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 2791

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 2851

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 2911

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 2971

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 3031

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 3091

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 3151

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 3211

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 3271

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 3331

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 3391

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 3451

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 6655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3452 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 3511

  6655658 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 6655716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     3512 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 3571

  6655717 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 6655776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 3631

  6655777 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 6655836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3632 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 3691

  6655837 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 6655896
          |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||
     3692 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC--TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 3749

  6655897 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 6655956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3750 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 3809

  6655957 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 6656016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3810 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 3869

  6656017 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 6656076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3870 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 3929

  6656077 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 6656136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3930 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 3989

  6656137 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 6656196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3990 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 4049

  6656197 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 6656256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4050 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 4109

  6656257 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 6656316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4110 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 4169

  6656317 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 6656376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4170 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 4229

  6656377 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 6656436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4230 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 4289

  6656437 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 6656496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4290 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 4349

  6656497 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 6656556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4350 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 4409

  6656557 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 6656616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4410 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 4469

  6656617 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 6656676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4470 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 4529

  6656677 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 6656736
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4530 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 4589

  6656737 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 6656796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4590 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 4649

  6656797 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 6656856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4650 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 4709

  6656857 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCA 6656916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4710 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCA 4769

  6656917 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 6656976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4770 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 4829

  6656977 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 6657036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4830 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 4889

  6657037 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 6657096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4890 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 4949

  6657097 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 6657156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4950 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 5009

  6657157 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 6657216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5010 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 5069

  6657217 TGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 6657276
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5070 TGAGTAACATTAGCACGCTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 5129

  6657277 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 6657336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5130 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 5189

  6657337 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAT 6657396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5190 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAA 5249

  6657397 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 6657456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5250 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 5309

  6657457 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 6657516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5310 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 5369

  6657517 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 6657576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5370 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 5429

  6657577 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 6657636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5430 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 5489

  6657637 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 6657696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5490 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 5549

  6657697 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAA 6657756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5550 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAA 5609

  6657757 CCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCA 6657816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5610 CCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCA 5669

  6657817 GAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATA 6657876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5670 GAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATA 5729

  6657877 GGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTT 6657936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5730 GGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTT 5789

  6657937 TTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAA 6657996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5790 TTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAA 5849

  6657997 TAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACAT 6658056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5850 TAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACAT 5909

  6658057 AACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAA 6658116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5910 AACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAA 5969

  6658117 GCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGA 6658176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5970 GCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGA 6029

  6658177 CAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAAT 6658236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6030 CAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAAT 6089

  6658237 AGTTGATGCATAGAACGAACTATGAATGAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAG 6658296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6090 AGTTGATGCATAGAACGAACTATGAATGAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAG 6149

  6658297 GCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCT 6658356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6150 GCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCT 6209

  6658357 GTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGG 6658416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6210 GTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGG 6269

  6658417 ATATTTGAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGA 6658476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6270 ATATTTGAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGA 6329

  6658477 CTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAA 6658536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6330 CTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAA 6389

  6658537 TTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCT 6658596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6390 TTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCT 6449

  6658597 TTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACA 6658656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6450 TTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACA 6509

  6658657 GTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGA 6658716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6510 GTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGA 6569

  6658717 ATTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAAT 6658776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6570 ATTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAAT 6629

  6658777 TCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAG 6658836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6630 TCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAG 6689

  6658837 TCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATA 6658896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6690 TCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATA 6749

  6658897 ACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGA 6658956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6750 ACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGA 6809

  6658957 CCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATGTAAAATGTTTAGTCC 6659016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     6810 CCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATATAAAATGTTTAGTCC 6869

  6659017 AATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTT 6659076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6870 AATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTT 6929

  6659077 ACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGA 6659136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6930 ACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGA 6989

  6659137 TATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAG 6659196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6990 TATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAG 7049

  6659197 TGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGC 6659256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7050 TGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGC 7109

  6659257 TTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTGCCCTTGAGCAATGTTTTCTGGG 6659316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7110 TTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTGCCCTTGAGCAATGTTTTCTGGG 7169

  6659317 ATTTATTTGTTCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGTTATATATATTTAATGTTCAACA 6659376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7170 ATTTATTTGTTCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGTTATATATATTTAATGTTCAACA 7229

  6659377 AGTCTTTAAACACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTTCATTTACTCCCAATTTACAGTA 6659436
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7230 AGTCATTAAACACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTTCATTTACTCCCAATTTACAGTA 7289

  6659437 GTGATTTAAAACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATTCATTGTTGAAGGAGTGTGATGG 6659496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7290 GTGATTTAAAACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATTCATTGTTGAAGGAGTGTGATGG 7349

  6659497 CAAACTATGAAGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAACAATTGTAGTAAAGTCATGAAA 6659556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7350 CAAACTATGAAGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAACAATTGTAGTAAAGTCATGAAA 7409

  6659557 GGTGAATGAAACAATGTAAATATATATATAGTGAGAATGGTACAGGTTGAGCATCCCTTT 6659616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7410 GGTGAATGAAACAATGTAAATATATATATAGTGAGAATGGTACAGGTTGAGCATCCCTTT 7469

  6659617 TCCAAAATGATTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGAATTTTTCAGATTTTGGAATATT 6659676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7470 TCCAAAATGATTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGAATTTTTCAGATTTTGGAATATT 7529

  6659677 TGTTTACATAAGGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAGTCTAAATACATTTATTTGTGTT 6659736
          |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     7530 TGTTTACATAATGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAGTCTAAATACATTTATTTATGTT 7589

  6659737 TTGTTTACACTTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTTATATAATGTTTTAGTAGCTGTG 6659796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7590 TTGTTTACACTTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTTATATAATGTTTTAGTAGCTGTG 7649

  6659797 GGGCATCGTGAAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCTGGACACATGCCATTTTATTACA 6659856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7650 GGGCATCGTGAAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCTGGACACATGCCATTTTATTACA 7709

  6659857 CTCTGCATGTGCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGTGAAAAAGATATATCATAGCTGA 6659916
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     7710 CTCTGGATGTGCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGTGAAAAAGATACATCATAGCTGA 7769

  6659917 AGGGGCCTGGGAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTGAATAAACTGTGTATTGTTCATC 6659976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7770 AGGGGCCTGGGAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTGAATAAACTGTGTATTGTTCATC 7829

  6659977 TGTGATTTGACTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGATGTGGAATTTTCCATTTGTGAC 6660036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7830 TGTGATTTGACTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGATGTGGAATTTTCCATTTGTGAC 7889

  6660037 ATCATGTTGACAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACATCAGATTAGGGAGACTCAGTCT 6660096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7890 ATCATGTTGACAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACATCAGATTAGGGAGACTCAGTCT 7949

  6660097 ATACATTGTGTAATTTTCAGGGGACCAGAGGAATTGAACTTAGTTTAGTTTGTCATATCA 6660156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7950 ATACATTGTGTAATTTTCAGGGGACCAGAGGAATTGAACTTAGTTTAGTTTGTCATATCA 8009

  6660157 GTGGGATTTTCCATGGTGACAAGTGGTAATTATTCTAAGATTATAAACCTTAATACACCT 6660216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8010 GTGGGATTTTCCATGGTGACAAGTGGTAATTATTCTAAGATTATAAACCTTAATACACCT 8069

  6660217 GTTTGTTGTTGTTGTATTTTTATTTTTTACAATTATAAATCTTGAGTATAGTTAAAATTT 6660276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8070 GTTTGTTGTTGTTGTATTTTTATTTTTTACAATTATAAATCTTGAGTATAGTTAAAATTT 8129

  6660277 AGAAAATTTTTTTCAAAGTACTGTGTGGAATCGAAAGATATCTAAGACAATAGTCTTTCA 6660336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8130 AGAAAATTTTTTTCAAAGTACTGTGTGGAATCGAAAGATATCTAAGACAATAGTCTTTCA 8189

  6660337 AAGGTGCAGAAAGTAGATTCAATCTATGCAGAGAAAAGCAGATTTCAAAAAATATAACAG 6660396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8190 AAGGTGCAGAAAGTAGATTCAATCTATGCAGAGAAAAGCAGATTTCAAAAAATATAACAG 8249

  6660397 AAGAAAAACAGTTGGCTGAACTTACTATAAATACATATAGCTAAAAGGGGAAAAAGCAGA 6660456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8250 AAGAAAAACAGTTGGCTGAACTTACTATAAATACATATAGCTAAAAGGGGAAAAAGCAGA 8309

  6660457 GGAGAAACAGTTATCTTCTGGTCTTGTAGAAGTTTAAGGTCTTGGTAGATATTAGGAACA 6660516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     8310 GGAGAAACAGTTATCTTCTGGTCTTGTAGAAGTTTAAGGTCTTGGTAGATATCAGGAACA 8369

  6660517 TGCAAAAGGTAATGTTTGTGTGTTCTCTCTCTCTCTGCCAATGCTTTAAAAATCTCTAGG 6660576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8370 TGCAAAAGGTAATGTTTGTGTGTTCTCTCTCTCTCTGCCAATGCTTTAAAAATCTCTAGG 8429

  6660577 GATATATCAAAGCTGTTTAAATAGAGTTTTAAAAACATGACATGAGTTCATATTTGGGTT 6660636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8430 GATATATCAAAGCTGTTTAAATAGAGTTTTAAAAACATGACATGAGTTCATATTTGGGTT 8489

  6660637 GACACTACTGACAAGTCAGTTTTCTCTTAATACAAATGATAGCAGTAGCAATGTTTGCAT 6660696
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8490 GACACTATTGACAAGTCAGTTTTCTCTTAATACAAATGATAGCAGTAGCAATGTTTGCAT 8549

  6660697 CTATCTATTTGATTGCAAGGAGGAAGAATTGAATAGAATTATTCCAAGGAAAAAATGGCT 6660756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8550 CTATCTATTTGATTGCAAGGAGGAAGAATTGAATAGAATTATTCCAAGGAAAAAATGGCT 8609

  6660757 TTGTTATTGTTATTATTGACATATAAACTTTGATTGGAACTGTAAGCCTAAGCCTAGAGA 6660816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8610 TTGTTATTGTTATTATTGACATATAAACTTTGATTGGAACTGTAAGCCTAAGCCTAGAGA 8669

  6660817 TAAATATTTATCTCTCTCAGTCATTGTTTCTCTGTGACCAGCCATCCTGTTTCTTATTCC 6660876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8670 TAAATATTTATCTCTCTCAGTCATTGTTTCTCTGTGACCAGCCATCCTGTTTCTTATTCC 8729

  6660877 AACCAGTTAAAGTTGTCTCCTTTCCCTTATTTTCTATGTCTTCATTATTCAGCTTGCCCA 6660936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8730 AACCAGTTAAAGTTGTCTCCTTTCCCTTATTTTCTATGTCTTCATTATTCAGCTTGCCCA 8789

  6660937 TTCGTACATTTCATCTTTTCTAGATTATCTTTGTCCCCTTTCTACATCACACAATTTTTC 6660996
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     8790 TTCGTACATTTCATCTTTTCTAGATTATCTTTGTCCCATTTCTACATCACACAATTTTTC 8849

  6660997 TCTAACTGGTATTTTAATCTTATATAAAAAATAGGAATCTTGTCTCTGTGGGAGAAAGAA 6661056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8850 TCTAACTGGTATTTTAATCTTATATAAAAAATAGGAATCTTGTCTCTGTGGGAGAAAGAA 8909

  6661057 GAGCATGCTTCTCTTAGAACAGCTCCTTTATTTGGGAGGACATGACTAATAAGACTGAGG 6661116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8910 GAGCATGCTTCTCTTAGAACAGCTCCTTTATTTGGGAGGACATGACTAATAAGACTGAGG 8969

  6661117 AACTTGAGATTAGGGCTGCTGAGCATCCATCACTCATTCATATTCCGTCTTTGTCTTGTT 6661176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8970 AACTTGAGATTAGGGCTGCTGAGCATCCATCACTCATTCATATTCCGTCTTTGTCTTGTT 9029

  6661177 CTCTTGCTCTTCCTGTTTCTTAATCATTTCAGTTTATAGAGAAAGAAACCTTGATTTTTA 6661236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9030 CTCTTGCTCTTCCTGTTTCTTAATCATTTCAGTTTATAGAGAAAGAAACCTTGATTTTTA 9089

  6661237 ACACCAACTTATTCTGGTTTTGCTAGAATGACAGATTGTTCAACATTCTTTTTTTGATTT 6661296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9090 ACACCAACTTATTCTGGTTTTGCTAGAATGACAGATTGTTCAACATTCTTTTTTTGATTT 9149

  6661297 ATGTGTATGTTTATCTACTACTTTAAGATTCATGGGGTTGTTATTTTTCAACTGTGGGTG 6661356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9150 ATGTGTATGTTTATCTACTACTTTAAGATTCATGGGGTTGTTATTTTTCAACTGTGGGTG 9209

  6661357 ATTTTGGCCCCCCAGAAACATTTGACAGTGTCTTGAAACATTTTTATTGTCAGCACAGGG 6661416
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9210 ATTTTGGCCCCCCAGAAACATCTGACAGTGTCTTGAAACATTTTTATTGTCAGCACAGGG 9269

  6661417 ACATGGGTGCTACTGGCATGTAGAGTCCAGAAATGCTGGGAAACGTCCTACAATGCACAC 6661476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9270 ACATGGGTGCTACTGGCATGTAGAGTCCAGAAATGCTGGGAAACGTCCTACAATGCACAC 9329

  6661477 AACCTCCACATTAAAAAAATAATAATAATAAAATAATTATCTGGCCCTAAATGTCAGTAG 6661536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9330 AACCTCCACATTAAAAAAATAATAATAATAAAATAATTATCTGGCCCTAAATGTCAGTAG 9389

  6661537 TACCAAAGTTGAGAATCTTTGCCATAAGGGAAGTGAAGAGTTTGAGATGAATTATTTTAT 6661596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9390 TACCAAAGTTGAGAATCTTTGCCATAAGGGAAGTGAAGAGTTTGAGATGAATTATTTTAT 9449

  6661597 TTATACTCAGTAAGGTTTTGAGTTTTTGTTTCCTTTTCAAACTGTCTAATCTCTCAAATA 6661656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     9450 TTATACTCAGTAAGGTTTTGAGTTTTTGTTTCCTTTACAAACTGTCTAATCTCTCAAATA 9509

  6661657 CACCCTTCCAGGTTCCCAGAACAAGGCATAATTGGTGAAGCTGATTTTGGGGCCAGGCTC 6661716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||
     9510 CACCCTTCCAGGTTCCCAGAACAAGGCATAATTAGTGAAGCTGATTTTGGGGCCAGACTC 9569

  6661717 CACAAAACATAGAATTCTACCAATGTTTGGATTCAAGTTCCTTAGTCTTGTCTAAGCAGG 6661776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9570 CACAAAACATAGAATTCTACCAATGTTTGGATTCAAGTTCCTTAGTCTTGTCTAAGCAGG 9629

  6661777 TGAATGGGAGAAAAATTAATATCTTTTCCTTACCCATTGCAAGTGTCATGGGTGACACCC 6661836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     9630 TGAATGGGAGAAAAATTAATATCTTTTCCTTATCCATTGCAAGTGTCATGGGTGACACCC 9689

  6661837 CATAAGACAAGACTGATTAACAAGAGAAAAGCATAACAAATTTATTTAACAAAGTTTTAG 6661896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9690 CATAAGACAAGACTGATTAACAAGAGAAAAGCATAACAAATTTATTTAACAAAGTTTTAG 9749

  6661897 ATGGCATGGGACCCTTCAGAAATGAAGACCCAGAGACCCAGGGAAAACTGTATTTTTATG 6661956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9750 ATGGCATGGGACCCTTCAGAAATGAAGACCCAGAGACCCAGGGAAAACTGTATTTTTATG 9809

  6661957 CTTAGGGTCAATGAAGAATGGACAGTCATTGAGAAATGTGATTGAA 6662002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9810 CTTAGGGTCAATGAAGAATGGACAGTCATTGAGAAATGTGATTGAA 9855

Alignment time is 14.0266 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2420] =>      2420 nucs 'mol-32-2fd8-006844_2420'

Score:        2408
Aligned:      2419        nucs
Identic:      2418 (100%) nucs =>       708 (100%)      1710 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6647741,6648448] EXCISED REGION [6648450,6650160]
 second seq =>  [      1,    708] EXCISED REGION [    710,   2420]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6648449,6648449]
 second seq =>         1 nucs [709,709]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6648448,6648448] to [6648449,6648449]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6647741 GTAACTGTCATTCTACTTTCTGTTTCTAGATTTTGTCAACTTTAGATACCTCATATTTAT 6647800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAACTGTCATTCTACTTTCTGTTTCTAGATTTTGTCAACTTTAGATACCTCATATTTAT 60

  6647801 GGAATTATACAGTATTTGTCTTTTAATACAAAAGATTGGCTTATTTCACTTAACATAATG 6647860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAATTATACAGTATTTGTCTTTTAATACAAAAGATTGGCTTATTTCACTTAACATAATG 120

  6647861 TCATTTTGTTTTCCTTTTGGTACAAGGTATGAGACTTAGAAAGAGATTATTTTATTAATT 6647920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCATTTTGTTTTCCTTTTGGTACAAGGTATGAGACTTAGAAAGAGATTATTTTATTAATT 180

  6647921 GATTGATTTATTGATTGATTATCTGTGGATATCCAAGTGAACCTGCACCATTTGTTGTAA 6647980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATTGATTTATTGATTGATTATCTGTGGATATCCAAGTGAACCTGCACCATTTGTTGTAA 240

  6647981 AAGCTATCTTTCCTGCATTTAATTGTTTTTAAACCTTGATCAAATATTAGTTGGGCATAT 6648040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGCTATCTTTCCTGCATTTAATTGTTTTTAAACCTTGATCAAATATTAGTTGGGCATAT 300

  6648041 TTGAATAAATCTGTTTCTGGGTTGTAGATTTTTGCATTGCAATTCATAAAATATATTGGT 6648100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTGAATAAATCTGTTTCTGGGTTGTAGATTTTTGCATTGCAATTCATAAAATATATTGGT 360

  6648101 CTGTAGTTTGTTTATGTTGTACCTTTTGTCTCATTTTGCTATCAGAGTAGTTTGCGCTTC 6648160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGTAGTTTGTTTATGTTGTACCTTTTGTCTCATTTTGCTATCAGAGTAGTTTGCGCTTC 420

  6648161 ATAAAATAACTTGGGAAATGTCTCCCTCTTATATTCTCTGGAAGAGATTGTGAATAATTG 6648220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAAAATAACTTGGGAAATGTCTCCCTCTTATATTCTCTGGAAGAGATTGTGAATAATTG 480

  6648221 GTGTTAATTATGCTTTAATTGTTTCATTGAACATTTAGGGGGACGGTTTGTAAATTCAAT 6648280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGTTAATTATGCTTTAATTGTTTCATTGAACATTTAGGGGGACGGTTTGTAAATTCAAT 540

  6648281 TCCCTTAATAGTTGTAAGAGTATTCAAATTATCTAGTTTATATTGAGTAAGTTATAGTAG 6648340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCCTTAATAGTTGTAAGAGTATTCAAATTATCTAGTTTATATTGAGTAAGTTATAGTAG 600

  6648341 TTTGTGTCTTTTGAGAAACCTTTTCATCTAAGTTGTCAAATTTATGCATGTAAAGTTGTT 6648400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTGTGTCTTTTGAGAAACCTTTTCATCTAAGTTGTCAAATTTATGCATGTAAAGTTGTT 660

  6648401 TATTAGTTCTCTGTCCAAATCCTTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTG 6648448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATTAGTTCTCTGTCCAAATCCTTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTG 708

EXCISED REGION

  6648450 TTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGA 6648509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      710 TTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGA 769

  6648510 AATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGA 6648569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      770 AATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGA 829

  6648570 ATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGT 6648629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      830 ATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGT 889

  6648630 CCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAA 6648689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 CCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAA 949

  6648690 AACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATC 6648749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 AACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATC 1009

  6648750 TTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAA 6648809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 TTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAA 1069

  6648810 ATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGT 6648869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 ATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGT 1129

  6648870 CTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGC 6648929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 CTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGC 1189

  6648930 CTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACG 6648989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 CTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACG 1249

  6648990 TGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGG 6649049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 TGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGG 1309

  6649050 TCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGC 6649109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 TCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGC 1369

  6649110 TGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCT 6649169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 TGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCT 1429

  6649170 CTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATT 6649229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 CTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATT 1489

  6649230 TGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGAT 6649289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1490 TGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGAT 1549

  6649290 TTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGT 6649349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 TTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGT 1609

  6649350 CCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACC 6649409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 CCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACC 1669

  6649410 AGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACT 6649469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 AGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACT 1729

  6649470 CTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAA 6649529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 CTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAA 1789

  6649530 ATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCC 6649589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1790 ATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCC 1849

  6649590 ATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAG 6649649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 ATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAG 1909

  6649650 AAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATT 6649709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 AAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATT 1969

  6649710 TTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAG 6649769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 TTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAG 2029

  6649770 AGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACT 6649829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2030 AGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACT 2089

  6649830 ATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTA 6649889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2090 ATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTA 2149

  6649890 TTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCA 6649949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2150 TTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCA 2209

  6649950 TCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAG 6650009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2210 TCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAG 2269

  6650010 GCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGA 6650069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2270 GCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGA 2329

  6650070 TTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCT 6650129
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2330 TTCTGCTGCCCCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCT 2389

  6650130 AATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2390 AATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 2420

Alignment time is 3.36503 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2251] =>      2251 nucs 'mol-32-2fe3-261960_2251'

Score:        2149
Aligned:      2182        nucs
Identic:      2179 (100%) nucs =>      1172 (100%)      1007 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648986,6650160] EXCISED REGION [6654638,6655644]
 second seq =>  [      1,   1173] EXCISED REGION [   1245,   2251]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [1174,1244]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1173,1173] to [1244,1244]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1173,1173] to [1245,1245]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648986 CACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATG 6649045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATG 60

  6649046 TTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAA 6649105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAA 120

  6649106 GTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAAT 6649165
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
      121 GTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTT-AAT 179

  6649166 TTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGG 6649225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 TTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGG 239

  6649226 TATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTA 6649285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 TATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTA 299

  6649286 AGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTG 6649345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 AGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTG 359

  6649346 GGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCA 6649405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 GGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCA 419

  6649406 CACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTT 6649465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 CACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTT 479

  6649466 GACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAAT 6649525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 GACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAAT 539

  6649526 ACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATAT 6649585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 ACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATAT 599

  6649586 TGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAA 6649645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAA 659

  6649646 CTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCT 6649705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCT 719

  6649706 GATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCA 6649765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCA 779

  6649766 GCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAG 6649825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAG 839

  6649826 AACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCT 6649885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 AACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCT 899

  6649886 GCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATT 6649945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATT 959

  6649946 TCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCAC 6650005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCAC 1019

  6650006 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAA 6650065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAA 1079

  6650066 GTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCT 6650125
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1080 GTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGCGTGCCACCACTTCT 1139

  6650126 GGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     1140 GGCTAATTTTTTTTTTTTTT-GGTAGAAACAGGGT 1173

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 1304

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 1364

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 1424

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 1484

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 1544

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 1604

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 1664

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 1724

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 1784

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 1844

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 1904

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 1964

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 2024

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 2084

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 2144

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 2204

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTA 6655644
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTA 2251

Alignment time is 3.12983 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,  10913] =>     10913 nucs 'mol-32-2fee-172013_10913'

Score:       10594
Aligned:     10914        nucs
Identic:     10880 (100%) nucs =>     10577 (100%)       303 ( 99%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6651806,6662405] EXCISED REGION [6662423,6662727]
 second seq =>  [      1,  10607] EXCISED REGION [  10608,  10913]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        17 nucs [6662406,6662422]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [6662406,6662421] to [6662423,6662438]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6651806 TTGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAA 6651865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAA 60

  6651866 CCCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGC 6651925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGC 120

  6651926 ATCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGT 6651985
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGT 180

  6651986 GCAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGG 6652045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGG 240

  6652046 AAGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACAC 6652105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACAC 300

  6652106 CCATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCC 6652165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCC 360

  6652166 ACAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATA 6652225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATA 420

  6652226 AAACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGT 6652285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGT 480

  6652286 GATGTTTTATGTGCTACAATTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGG 6652345
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATGTTTTATGTGCTACAGTTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGG 540

  6652346 ATAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCAC 6652405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCAC 600

  6652406 ACTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATA 6652465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATA 660

  6652466 TTTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGAT 6652525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGAT 720

  6652526 GAGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACC 6652585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACC 780

  6652586 AGGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCA 6652645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCA 840

  6652646 TCCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGG 6652705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGG 900

  6652706 AAGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAA 6652765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAA 960

  6652766 ATTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCAC 6652825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCAC 1020

  6652826 ACAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTAT 6652885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTAT 1080

  6652886 GTTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAAT 6652945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAAT 1140

  6652946 TATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATT 6653005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATT 1200

  6653006 TGAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCT 6653065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCT 1260

  6653066 GAAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGT 6653125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGT 1320

  6653126 AAATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCC 6653185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCC 1380

  6653186 TGTGTATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATAT 6653245
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTATATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATAT 1440

  6653246 ACCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTC 6653305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTC 1500

  6653306 CATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTAT 6653365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTAT 1560

  6653366 AGAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAA 6653425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAA 1620

  6653426 AAAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAA 6653485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAA 1680

  6653486 GATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATC 6653545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATC 1740

  6653546 CGTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTA 6653605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CGTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTA 1800

  6653606 TACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCAC 6653665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCAC 1860

  6653666 CTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCA 6653725
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     1861 CTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCA 1920

  6653726 ACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAA 6653785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAA 1980

  6653786 ATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGT 6653845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGT 2040

  6653846 CCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCA 6653905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCA 2100

  6653906 GGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGT 6653965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGT 2160

  6653966 AACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAA 6654025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAA 2220

  6654026 GAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGG 6654085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGG 2280

  6654086 CTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTC 6654145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTC 2340

  6654146 CGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTG 6654205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTG 2400

  6654206 TATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAG 6654265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAG 2460

  6654266 TTCCTGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCAC 6654325
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTCCTGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCAC 2520

  6654326 CTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGA 6654385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 CTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGA 2580

  6654386 CAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGA 6654445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGA 2640

  6654446 ACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAA 6654505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 ACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAA 2700

  6654506 ATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATC 6654565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATC 2760

  6654566 GATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTG 6654625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTG 2820

  6654626 ATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAG 6654685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAG 2880

  6654686 GTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCA 6654745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCA 2940

  6654746 TAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAA 6654805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAA 3000

  6654806 CCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTT 6654865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTT 3060

  6654866 ACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATG 6654925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATG 3120

  6654926 CAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTC 6654985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTC 3180

  6654986 TAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCT 6655045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCT 3240

  6655046 CAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTC 6655105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTC 3300

  6655106 CTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAA 6655165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAA 3360

  6655166 AGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCC 6655225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCC 3420

  6655226 CTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTC 6655285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTC 3480

  6655286 CCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAA 6655345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAA 3540

  6655346 AATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATT 6655405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 AATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATT 3600

  6655406 TGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCC 6655465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCC 3660

  6655466 AATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGC 6655525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGC 3720

  6655526 CTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTC 6655585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTC 3780

  6655586 TACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTAT 6655645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTAT 3840

  6655646 CTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTC 6655704
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
     3841 CTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTC 3900

  6655705 TCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGT 6655764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3901 TCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTTAGAGGTCAAGTGGAAGT 3960

  6655765 CTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAA 6655824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAA 4020

  6655825 AAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG 6655884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTG 4080

  6655885 AGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCA 6655944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4081 AGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAATGGTGCAATCTTGACTCACTGCA 4140

  6655945 ACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTA 6656004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTA 4200

  6656005 CAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACC 6656064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACC 4260

  6656065 ATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGA 6656124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGA 4320

  6656125 AGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGC 6656184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4321 AGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGGCTTTTAAAAGC 4380

  6656185 TTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCT 6656244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCT 4440

  6656245 TGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGT 6656304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGT 4500

  6656305 AACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTG 6656364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 AACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTG 4560

  6656365 TAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTG 6656424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTG 4620

  6656425 AAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAG 6656484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAG 4680

  6656485 AGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCAT 6656544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCAT 4740

  6656545 CCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCAC 6656604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 CCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCAC 4800

  6656605 TCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAA 6656664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAA 4860

  6656665 GTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAG 6656724
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4861 GTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAG 4920

  6656725 TGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAA 6656784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 TGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAA 4980

  6656785 TCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAA 6656844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 TCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAA 5040

  6656845 TGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGTG 6656904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     5041 TGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGGG 5100

  6656905 AGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAAC 6656964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAAC 5160

  6656965 ACCTCATCATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAA 6657024
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 ACCTCATTATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAA 5220

  6657025 ACAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGT 6657084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 ACAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGT 5280

  6657085 AGACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACAC 6657144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AGACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACAC 5340

  6657145 CAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCA 6657204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCA 5400

  6657205 TCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTG 6657264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTG 5460

  6657265 TTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGT 6657324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 TTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGT 5520

  6657325 AAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTA 6657384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 AAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTA 5580

  6657385 GACTTTTATTATCATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAA 6657444
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GACTTTTATTAACATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAA 5640

  6657445 TTTTATTTTAGGGAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAA 6657504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 TTTTATTTTAGGGAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAA 5700

  6657505 TTAGCTTTTATTGTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCC 6657564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 TTAGCTTTTATTGTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCC 5760

  6657565 AAAAGGAAGAAAAATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAAT 6657624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 AAAAGGAAGAAAAATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAAT 5820

  6657625 GACTTACAGCATAATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGT 6657684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 GACTTACAGCATAATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGT 5880

  6657685 CTGAGAGCTCTCTGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAA 6657744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 CTGAGAGCTCTCTGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAA 5940

  6657745 TTTTTATAACAACCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATC 6657804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 TTTTTATAACAACCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATC 6000

  6657805 TGCTATGGTCCAGAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATT 6657864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 TGCTATGGTCCAGAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATT 6060

  6657865 TTAAAAGACATAGGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTT 6657924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TTAAAAGACATAGGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTT 6120

  6657925 AAATATTTCGTTTTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTAT 6657984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 AAATATTTCGTTTTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTAT 6180

  6657985 ATGCCTATTAAATAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACT 6658044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 ATGCCTATTAAATAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACT 6240

  6658045 GTATTTGAACATAACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTT 6658104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 GTATTTGAACATAACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTT 6300

  6658105 ACTTTGTGCCAAGCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAA 6658164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 ACTTTGTGCCAAGCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAA 6360

  6658165 ATGATAAAATGACAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGT 6658224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6361 ATGATAAAATGACAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGT 6420

  6658225 TTTCCCGTGAATAGTTGATGCATAGAACGAACTATGAATGAACACTTGCTCAATGTATTT 6658284
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6421 TTTCCCGTGAATAGTTGATGCATAGAACGAACTATGAATCAACACTTGCTCAATGTATTT 6480

  6658285 CAAGGAACTAAGGCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATC 6658344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6481 CAAGGAACTAAGGCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATC 6540

  6658345 AGGAAAATTTCTGTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAG 6658404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6541 AGGAAAATTTCTGTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAG 6600

  6658405 AGAAAAGACTGGATATTTGAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACA 6658464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6601 AGAAAAGACTGGATATTTGAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACA 6660

  6658465 CAAGCTATGTGACTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAA 6658524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6661 CAAGCTATGTGACTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAA 6720

  6658525 ATGAGGTAATAATTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATT 6658584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6721 ATGAGGTAATAATTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATT 6780

  6658585 CCATGCATGCCTTTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCA 6658644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6781 CCATGCATGCCTTTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCA 6840

  6658645 CTTGCAGCTACAGTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGT 6658704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6841 CTTGCAGCTACAGTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGT 6900

  6658705 CTCAGATTTGGAATTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAA 6658764
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6901 CTCAGATTTGGAACTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAA 6960

  6658765 CGGCCGAGCAATTCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGG 6658824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6961 CGGCCGAGCAATTCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGG 7020

  6658825 CCCCAGCCTGAGTCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATT 6658884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7021 CCCCAGCCTGAGTCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATT 7080

  6658885 TAGGTATTTATAACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGC 6658944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7081 TAGGTATTTATAACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGC 7140

  6658945 ATTTAACTCTGACCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATGTAA 6659004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     7141 ATTTAACTCTGACCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATATAA 7200

  6659005 AATGTTTAGTCCAATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCC 6659064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7201 AATGTTTAGTCCAATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCC 7260

  6659065 TTATGATAGTTTACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATT 6659124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7261 TTATGATAGTTTACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATT 7320

  6659125 AAATCATTTTGATATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAG 6659184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7321 AAATCATTTTGATATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAG 7380

  6659185 ACATAGAGATAGTGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAA 6659244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7381 ACATAGAGATAGTGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAA 7440

  6659245 AATGATCTAAGCTTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTGCCCTTGAGCA 6659304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7441 AATGATCTAAGCTTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTGCCCTTGAGCA 7500

  6659305 ATGTTTTCTGGGATTTATTTGTTCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGTTATATATATT 6659364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7501 ATGTTTTCTGGGATTTATTTGTTCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGTTATATATATT 7560

  6659365 TAATGTTCAACAAGTCTTTAAACACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTTCATTTACTCC 6659424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7561 TAATGTTCAACAAGTCTTTAAACACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTTCATTTACTCC 7620

  6659425 CAATTTACAGTAGTGATTTAAAACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATTCATTGTTGAA 6659484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7621 CAATTTACAGTAGTGATTTAAAACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATTCATTGTTGAA 7680

  6659485 GGAGTGTGATGGCAAACTATGAAGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAACAATTGTAGT 6659544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7681 GGAGTGTGATGGCAAACTATGAAGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAACAATTGTAGT 7740

  6659545 AAAGTCATGAAAGGTGAATGAAACAATGTAAATATATATATAGTGAGAATGGTACAGGTT 6659604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7741 AAAGTCATGAAAGGTGAATGAAACAATGTAAATATATATATAGTGAGAATGGTACAGGTT 7800

  6659605 GAGCATCCCTTTTCCAAAATGATTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGAATTTTTCAGA 6659664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7801 GAGCATCCCTTTTCCAAAATGATTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGAATTTTTCAGA 7860

  6659665 TTTTGGAATATTTGTTTACATAAGGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAGTCTAAATACA 6659724
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7861 TTTTGGAATATTTGTTTACATAATGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAGTCTAAATACA 7920

  6659725 TTTATTTGTGTTTTGTTTACACTTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTTATATAATGTT 6659784
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7921 TTTATTTATGTTTTGTTTACACTTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTTATATAATGTT 7980

  6659785 TTAGTAGCTGTGGGGCATCGTGAAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCTGGACACATGC 6659844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7981 TTAGTAGCTGTGGGGCATCGTGAAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCTGGACACATGC 8040

  6659845 CATTTTATTACACTCTGCATGTGCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGTGAAAAAGATA 6659904
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8041 CATTTTATTACACTCTGGATGTGCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGTGAAAAAGATA 8100

  6659905 TATCATAGCTGAAGGGGCCTGGGAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTGAATAAACTGT 6659964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8101 TATCATAGCTGAAGGGGCCTGGGAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTGAATAAACTGT 8160

  6659965 GTATTGTTCATCTGTGATTTGACTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGATGTGGAATTT 6660024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8161 GTATTGTTCATCTGTGATTTGACTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGATGTGGAATTT 8220

  6660025 TCCATTTGTGACATCATGTTGACAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACATCAGATTAGG 6660084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8221 TCCATTTGTGACATCATGTTGACAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACATCAGATTAGG 8280

  6660085 GAGACTCAGTCTATACATTGTGTAATTTTCAGGGGACCAGAGGAATTGAACTTAGTTTAG 6660144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8281 GAGACTCAGTCTATACATTGTGTAATTTTCAGGGGACCAGAGGAATTGAACTTAGTTTAG 8340

  6660145 TTTGTCATATCAGTGGGATTTTCCATGGTGACAAGTGGTAATTATTCTAAGATTATAAAC 6660204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8341 TTTGTCATATCAGTGGGATTTTCCATGGTGACAAGTGGTAATTATTCTAAGATTATAAAC 8400

  6660205 CTTAATACACCTGTTTGTTGTTGTTGTATTTTTATTTTTTACAATTATAAATCTTGAGTA 6660264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8401 CTTAATACACCTGTTTGTTGTTGTTGTATTTTTATTTTTTACAATTATAAATCTTGAGTA 8460

  6660265 TAGTTAAAATTTAGAAAATTTTTTTCAAAGTACTGTGTGGAATCGAAAGATATCTAAGAC 6660324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8461 TAGTTAAAATTTAGAAAATTTTTTTCAAAGTACTGTGTGGAATCGAAAGATATCTAAGAC 8520

  6660325 AATAGTCTTTCAAAGGTGCAGAAAGTAGATTCAATCTATGCAGAGAAAAGCAGATTTCAA 6660384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8521 AATAGTCTTTCAAAGGTGCAGAAAGTAGATTCAATCTATGCAGAGAAAAGCAGATTTCAA 8580

  6660385 AAAATATAACAGAAGAAAAACAGTTGGCTGAACTTACTATAAATACATATAGCTAAAAGG 6660444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8581 AAAATATAACAGAAGAAAAACAGTTGGCTGAACTTACTATAAATACATATAGCTAAAAGG 8640

  6660445 GGAAAAAGCAGAGGAGAAACAGTTATCTTCTGGTCTTGTAGAAGTTTAAGGTCTTGGTAG 6660504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8641 GGAAAAAGCAGAGGAGAAACAGTTATCTTCTGGTCTTGTAGAAGTTTAAGGTCTTGGTAG 8700

  6660505 ATATTAGGAAC--ATGCAAAAGGTAATGTTTGTGTGTTCTCTCTCTCTCTGCCAATGCTT 6660562
          ||||.|||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8701 ATATCAGGAA-GGATGCAAAAGGTAATGTTTGTGTGTTCTCTCTCTCTCTGCCAATGCTT 8759

  6660563 TAAAAATCTCTAGGGATATATCAAAGCTGTTTAAATAGAGTTTTAAAAACATGACATGAG 6660622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8760 TAAAAATCTCTAGGGATATATCAAAGCTGTTTAAATAGAGTTTTAAAAACATGACATGAG 8819

  6660623 TTCATATTTGGGTTGACACTACTGACAAGTCAGTTTTCTCTTAATACAAATGATAGCAGT 6660682
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8820 TTCATATTTGGGTTGACACTATTGACAAGTCAGTTTTCTCTTAATACAAATGATAGCAGT 8879

  6660683 AGCAATGTTTGCATCTATCTATTTGATTGCAAGGAGGAAGAATTGAATAGAATTATTCCA 6660742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8880 AGCAATGTTTGCATCTATCTATTTGATTGCAAGGAGGAAGAATTGAATAGAATTATTCCA 8939

  6660743 AGGAAAAAATGGCTTTGTTATTGTTATTATTGACATATAAACTTTGATTGGAACTGTAAG 6660802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8940 AGGAAAAAATGGCTTTGTTATTGTTATTATTGACATATAAACTTTGATTGGAACTGTAAG 8999

  6660803 CCTAAGCCTAGAGATAAATATTTATCTCTCTCAGTCATTGTTTCTCTGTGACCAGCCATC 6660862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9000 CCTAAGCCTAGAGATAAATATTTATCTCTCTCAGTCATTGTTTCTCTGTGACCAGCCATC 9059

  6660863 CTGTTTCTTATTCCAACCAGTTAAAGTTGTCTCCTTTCCCTTATTTTCTATGTCTTCATT 6660922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9060 CTGTTTCTTATTCCAACCAGTTAAAGTTGTCTCCTTTCCCTTATTTTCTATGTCTTCATT 9119

  6660923 ATTCAGCTTGCCCATTCGTACATTTCATCTTTTCTAGATTATCTTTGTCCCCTTTCTACA 6660982
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9120 ATTCAGCTTGCCCATTCATACATTTCATCTTTTCTAGATTATCTTTGTCCCCTTTCTACA 9179

  6660983 TCACACAATTTTTCTCTAACTGGTATTTTAATCTTATATAAAAAATAGGAATCTTGTCTC 6661042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9180 TCACACAATTTTTCTCTAACTGGTATTTTAATCTTATATAAAAAATAGGAATCTTGTCTC 9239

  6661043 TGTGGGAGAAAGAAGAGCATGCTTCTCTTAGAACAGCTCCTTTATTTGGGAGGACATGAC 6661102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9240 TGTGGGAGAAAGAAGAGCATGCTTCTCTTAGAACAGCTCCTTTATTTGGGAGGACATGAC 9299

  6661103 TAATAAGACTGAGGAACTTGAGATTAGGGCTGCTGAGCATCCATCACTCATTCATATTCC 6661162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9300 TAATAAGACTGAGGAACTTGAGATTAGGGCTGCTGAGCATCCATCACTCATTCATATTCC 9359

  6661163 GTCTTTGTCTTGTTCTCTTGCTCTTCCTGTTTCTTAATCATTTCAGTTTATAGAGAAAGA 6661222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9360 GTCTTTGTCTTGTTCTCTTGCTCTTCCTGTTTCTTAATCATTTCAGTTTATAGAGAAAGA 9419

  6661223 AACCTTGATTTTTAACACCAACTTATTCTGGTTTTGCTAGAATGACAGATTGTTCAACAT 6661282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9420 AACCTTGATTTTTAACACCAACTTATTCTGGTTTTGCTAGAATGACAGATTGTTCAACAT 9479

  6661283 TCTTTTTTTGATTTATGTGTATGTTTATCTACTACTTTAAGATTCATGGGGTTGTTATTT 6661342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9480 TCTTTTTTTGATTTATGTGTATGTTTATCTACTACTTTAAGATTCATGGGGTTGTTATTT 9539

  6661343 TTCAACTGTGGGTGATTTTGGCCCCCCAGAAACATTTGACAGTGTCTTGAAACATTTTTA 6661402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9540 TTCAACTGTGGGTGATTTTGGCCCCCCAGAAACATTTGACAGTGTCTTGAAACATTTTTA 9599

  6661403 TTGTCAGCACAGGGACATGGGTGCTACTGGCATGTAGAGTCCAGAAATGCTGGGAAACGT 6661462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9600 TTGTCAGCACAGGGACATGGGTGCTACTGGCATGTAGAGTCCAGAAATGCTGGGAAACGT 9659

  6661463 CCTACAATGCACACAACCTCCACATTAAAAAAATAATAATAATAAAATAATTATCTGGCC 6661522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9660 CCTACAATGCACACAACCTCCACATTAAAAAAATAATAATAATAAAATAATTATCTGGCC 9719

  6661523 CTAAATGTCAGTAGTACCAAAGTTGAGAATCTTTGCCATAAGGGAAGTGAAGAGTTTGAG 6661582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9720 CTAAATGTCAGTAGTACCAAAGTTGAGAATCTTTGCCATAAGGGAAGTGAAGAGTTTGAG 9779

  6661583 ATGAATTATTTTATTTATACTCAGTAAGGTTTTGAGTTTTTGTTTCCTTTTCAAACTGTC 6661642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9780 ATGAATTATTTTATTTATACTCAGTAAGGTTTTGAGTTTTTGTTTCCTTTTCAAACTGTC 9839

  6661643 TAATCTCTCAAATACACCCTTCCAGGTTCCCAGAACAAGGCATAATTGGTGAAGCTGATT 6661702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9840 TAATCTCTCAAATACACCCTTCCAGGTTCCCAGAACAAGGCATAATTGGTGAAGCTGATT 9899

  6661703 TTGGGGCCAGGCTCCACAAAACATAGAATTCTACCAATGTTTGGATTCAAGTTCCTTAGT 6661762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9900 TTGGGGCCAGGCTCCACAAAACATAGAATTCTACCAATGTTTGGATTCAAGTTCCTTAGT 9959

  6661763 CTTGTCTAAGCAGGTGAATGGGAGAAAAATTAATATCTTTTCCTTACCCATTGCAAGTGT 6661822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9960 CTTGTCTAAGCAGGTGAATGGGAGAAAAATTAATATCTTTTCCTTACCCATTGCAAGTGT 10019

  6661823 CATGGGTGACACCCCATAAGACAAGACTGATTAACAAGAGAAAAGCATAACAAATTTATT 6661882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10020 CATGGGTGACACCCCATAAGACAAGACTGATTAACAAGAGAAAAGCATAACAAATTTATT 10079

  6661883 TAACAAAGTTTTAGATGGCATGGGACCCTTCAGAAATGAAGACCCAGAGACCCAGGGAAA 6661942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10080 TAACAAAGTTTTAGATGGCATGGGACCCTTCAGAAATGAAGACCCAGAGACCCAGGGAAA 10139

  6661943 ACTGTATTTTTATGCTTAGGGTCAATGAAGAATGGACAGTCATTGAGAAATGTGATTGAA 6662002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10140 ACTGTATTTTTATGCTTAGGGTCAATGAAGAATGGACAGTCATTGAGAAATGTGATTGAA 10199

  6662003 CAAAGAAAGGGGTATGATTTAATGGTAGTAAACTGGGAGGAACTCAGCAAATCTTGTTTG 6662062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10200 CAAAGAAAGGGGTATGATTTAATGGTAGTAAACTGGGAGGAACTCAGCAAATCTTGTTTG 10259

  6662063 TTCAGATTCTTCTTGGCCCTTCTGAACAACACTTAATCACCTCTAGGTATGGAGCAGGAA 6662122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10260 TTCAGATTCTTCTTGGCCCTTCTGAACAACACTTAATCACCTCTAGGTATGGAGCAGGAA 10319

  6662123 GCCTCTGGAATGAGGGTCTTATAATCTACGTTTGGGTGAGGGAGGTCAGGTAATTCCTTT 6662182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10320 GCCTCTGGAATGAGGGTCTTATAATCTACGTTTGGGTGAGGGAGGTCAGGTAATTCCTTT 10379

  6662183 ATGACCATGCTTCACACCAGAAAGCCAGGGGAAAGTCACAGTGAACTTCTGGCTTCTGTG 6662242
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
    10380 ATGACCATGCTTCACACCAGAAAGCCAGGAGAAAGTCACAGTGAACTTCTGGCTTCTGTG 10439

  6662243 GCTTTCTCAATTGCCCAAGGTGTCATATGTTGGATTATCATGTCCTGAGCCCTGACACAG 6662302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10440 GCTTTCTCAATTGCCCAAGGTGTCATATGTTGGATTATCATGTCCTGAGCCCTGACACAG 10499

  6662303 ACCGAGCCCTGACACAGATATGGTCCAATACAGCATCAGCTGTGATACATGATATACATA 6662362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10500 ACCGAGCCCTGACACAGATATGGTCCAATACAGCATCAGCTGTGATACATGATATACATA 10559

  6662363 TCATGTGATAGATGTGATACATGA-----TATCCATATCATGTGATAG 6662405
          ||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||
    10560 TCATGTGATAGATGTGATACATGACATGATATCCATATCATGTGATAG 10607

EXCISED REGION

  6662423 ATGTGATACATGATATACAACATGGGCATGTTAACAATCATGTTTTTAAAAGGTGGTGGG 6662482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10608 ATGTGATACATGATATACAACATGGGCATGTTAACAATCATGTTTTTAAAAGGTGGTGGG 10667

  6662483 GAGAGTAATTTTTTTTTTAAAAAATGGATATCATTAGACAGAAATCATAAAATATCTATA 6662542
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10668 GAGAGTAATTTTTTTTTAAAAAAATGGATATCATTAGACAGAAATCATAAAATATCTATA 10727

  6662543 GAACAAAAAAAAGTATAATTACCTCAGTATTTACTACCTTTTTATTGATGAAAAAAAACC 6662602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10728 GAACAAAAAAAAGTATAATTACCTCAGTATTTACTACCTTTTTATTGATGAAAAAAAACC 10787

  6662603 CAAATGGGTCTTGCATCA-TTTTTTTTTATGATGATATTGATACACAATGGCTGGGCTCC 6662661
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
    10788 CAAATGGGTCTTGCATCATTTTTTTTTTATGATGATATTGATACCCAATGGCTGGGCTCC 10847

  6662662 TGGCTAAACTCCATCCCCAAGCCTGGAACCTTGGCTCTAAGTGAAAGCAGCTGACCCCAT 6662721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10848 TGGCTAAACTCCATCCCCAAGCCTGGAACCTTGGCTCTAAGTGAAAGCAGCTGACCCCAT 10907

  6662722 TTTTCC 6662727
          ||||||
    10908 TTTTCC 10913

Alignment time is 15.0833 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2591] =>      2591 nucs 'mol-32-2fee-260830_2591'

Score:        2520
Aligned:      2520        nucs
Identic:      2520 (100%) nucs =>      1588 (100%)       932 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648573,6650160] EXCISED REGION [6654638,6655569]
 second seq =>  [      1,   1588] EXCISED REGION [   1660,   2591]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [1589,1659]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1588,1588] to [1659,1659]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1588,1588] to [1660,1660]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648573 CCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCT 6648632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCT 60

  6648633 TCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAAC 6648692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAAC 120

  6648693 TTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTT 6648752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTT 180

  6648753 TAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATT 6648812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATT 240

  6648813 TCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTC 6648872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTC 300

  6648873 GCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTC 6648932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTC 360

  6648933 CTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGC 6648992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGC 420

  6648993 CACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCA 6649052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCA 480

  6649053 GGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 6649112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 540

  6649113 GATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTG 6649172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTG 600

  6649173 TTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGT 6649232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGT 660

  6649233 ATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTT 6649292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTT 720

  6649293 GGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCT 6649352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCT 780

  6649353 TAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGA 6649412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGA 840

  6649413 TAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTG 6649472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTG 900

  6649473 CTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATG 6649532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATG 960

  6649533 CTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATA 6649592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATA 1020

  6649593 AATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAG 6649652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAG 1080

  6649653 CCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTA 6649712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTA 1140

  6649713 ATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGT 6649772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGT 1200

  6649773 CTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATT 6649832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATT 1260

  6649833 ATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTG 6649892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTG 1320

  6649893 AGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCT 6649952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCT 1380

  6649953 GGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCT 6650012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCT 1440

  6650013 GGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTC 6650072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTC 1500

  6650073 TGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAAT 6650132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAAT 1560

  6650133 TTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          ||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 1588

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 1719

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 1779

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 1839

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 1899

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 1959

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 2019

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 2079

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 2139

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 2199

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 2259

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 2319

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 2379

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 2439

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 2499

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 2559

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTT 6655569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTT 2591

Alignment time is 3.59402 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   5053] =>      5053 nucs 'mol-32-3004-129063_5053'

Score:        4932
Aligned:      5053        nucs
Identic:      5042 (100%) nucs =>       520 (100%)      4522 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6652669,6653188] EXCISED REGION [6653190,6657721]
 second seq =>  [      1,    520] EXCISED REGION [    522,   5053]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6653189,6653189]
 second seq =>         1 nucs [521,521]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [6655862,6655862]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6653188,6653188] to [6653190,6653190]
 second seq =>         1 nucs [520,520] to [522,522]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6652669 TTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGAAGAAAAATGAACATTTTGCATT 6652728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGAAGAAAAATGAACATTTTGCATT 60

  6652729 TTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAATTTTGTTCTTAGAAACTGCAAC 6652788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAATTTTGTTCTTAGAAACTGCAAC 120

  6652789 CAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACACAATAACAATTGCATTGCAATG 6652848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACACAATAACAATTGCATTGCAATG 180

  6652849 TATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTTACAGATC 6652908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTTACAGATC 240

  6652909 AGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGATCAATGA 6652968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGATCAATGA 300

  6652969 AATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAGAGTGC 6653028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAGAGTGC 360

  6653029 AAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAATCATG 6653088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAATCATG 420

  6653089 TTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTTGGAG 6653148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTTGGAG 480

  6653149 TGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGT 6653188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGT 520

EXCISED REGION

  6653190 TATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCT 6653249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      522 TATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCT 581

  6653250 GCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATA 6653309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      582 GCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATA 641

  6653310 ACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAG 6653369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      642 ACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAG 701

  6653370 GGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAG 6653429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      702 GGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAG 761

  6653430 TGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATT 6653489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      762 TGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATT 821

  6653490 TTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTT 6653549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 TTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTT 881

  6653550 TTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACA 6653609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 TTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACA 941

  6653610 AGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTT 6653669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 AGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTT 1001

  6653670 ATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAACTT 6653729
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1002 ATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAACTT 1061

  6653730 GCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCA 6653789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 GCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCA 1121

  6653790 AGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTT 6653849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 AGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTT 1181

  6653850 TATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGT 6653909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 TATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGT 1241

  6653910 TTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACT 6653969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 TTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACT 1301

  6653970 TCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAAT 6654029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 TCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAAT 1361

  6654030 AACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTAC 6654089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 AACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTAC 1421

  6654090 TAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGG 6654149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1422 TAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGG 1481

  6654150 ATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATA 6654209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 ATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATA 1541

  6654210 GAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCC 6654269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 GAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCC 1601

  6654270 TGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGA 6654329
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 TGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGA 1661

  6654330 TTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGA 6654389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1662 TTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGA 1721

  6654390 GTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAG 6654449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1722 GTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAG 1781

  6654450 ATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGA 6654509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1782 ATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGA 1841

  6654510 TTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATG 6654569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1842 TTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATG 1901

  6654570 ATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGA 6654629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1902 ATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGA 1961

  6654630 TAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTT 6654689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1962 TAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTT 2021

  6654690 GGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAG 6654749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2022 GGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAG 2081

  6654750 CTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCA 6654809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2082 CTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCA 2141

  6654810 GAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAA 6654869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2142 GAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAA 2201

  6654870 GAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAA 6654929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2202 GAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAA 2261

  6654930 CATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAA 6654989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2262 CATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAA 2321

  6654990 TTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGG 6655049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2322 TTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGG 2381

  6655050 GCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGA 6655109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2382 GCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGA 2441

  6655110 ATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCA 6655169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2442 ATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCA 2501

  6655170 ACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCC 6655229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2502 ACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCC 2561

  6655230 TGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCA 6655289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2562 TGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCA 2621

  6655290 AGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATT 6655349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 AGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATT 2681

  6655350 ACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGAC 6655409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 ACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGAC 2741

  6655410 CTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATA 6655469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2742 CTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATA 2801

  6655470 CCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCT 6655529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 CCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCT 2861

  6655530 AATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACA 6655589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 AATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACA 2921

  6655590 CAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTT 6655649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 CAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTT 2981

  6655650 GGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCC 6655708
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2982 GGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCC 3041

  6655709 ATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTT 6655768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3042 ATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTTAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTT 3101

  6655769 CTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGG 6655828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 CTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGG 3161

  6655829 ATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAA 6655888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     3162 ATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAA 3220

  6655889 GGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCT 6655948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3221 GGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAATGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCT 3280

  6655949 CCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGG 6656008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 CCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGG 3340

  6656009 CGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATAT 6656068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 CGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATAT 3400

  6656069 TGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTG 6656128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 TGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTG 3460

  6656129 CTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTC 6656188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3461 CTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGGCTTTTAAAAGCTTTC 3520

  6656189 AGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTA 6656248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 AGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTA 3580

  6656249 TAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACT 6656308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 TAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACT 3640

  6656309 GTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGT 6656368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 GTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGT 3700

  6656369 TTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAG 6656428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 TTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAG 3760

  6656429 CATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAA 6656488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 CATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAA 3820

  6656489 ATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAA 6656548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 ATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAA 3880

  6656549 GAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTT 6656608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 GAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTT 3940

  6656609 TGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTC 6656668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 TGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTC 4000

  6656669 TGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGT 6656728
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4001 TGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGT 4060

  6656729 AATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCA 6656788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 AATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCA 4120

  6656789 GCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTA 6656848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 GCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTA 4180

  6656849 GCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCA 6656908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4181 GCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCA 4240

  6656909 GCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCT 6656968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 GCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCT 4300

  6656969 CATCATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAG 6657028
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 CATTATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAG 4360

  6657029 GGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGAC 6657088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 GGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGAC 4420

  6657089 ACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGG 6657148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 ACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGG 4480

  6657149 CAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCA 6657208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 CAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCA 4540

  6657209 GTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGA 6657268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 GTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGA 4600

  6657269 TTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAA 6657328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 TTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAA 4660

  6657329 GCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACT 6657388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 GCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACT 4720

  6657389 TTTATTATCATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTT 6657448
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 TTTATTAACATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTT 4780

  6657449 ATTTTAGGGAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAG 6657508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 ATTTTAGGGAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAG 4840

  6657509 CTTTTATTGTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAA 6657568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4841 CTTTTATTGTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAA 4900

  6657569 GGAAGAAAAATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACT 6657628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 GGAAGAAAAATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACT 4960

  6657629 TACAGCATAATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGA 6657688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 TACAGCATAATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGA 5020

  6657689 GAGCTCTCTGTTACCTGTGACTAATCAGTACAC 6657721
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 GAGCTCTCTGTTACCTGTGACTAATCAGTACAC 5053

Alignment time is 7.08224 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2394] =>      2394 nucs 'mol-32-3004-131067_2394'

Score:        2201
Aligned:      2321        nucs
Identic:      2306 ( 99%) nucs =>        21 (100%)      2285 ( 99%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648881,6648901] EXCISED REGION [6648905,6651198]
 second seq =>  [     73,     93] EXCISED REGION [     97,   2394]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [6648902,6648904]
 second seq =>         3 nucs [94,96]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6648901,6648901] to [6648905,6648905]
 second seq =>         1 nucs [93,93] to [97,97]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648881 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 6648901
          |||||||||||||||||||||
       73 GCCCAGGCTGGAGTGCAGTGG 93

EXCISED REGION

  6648905 GATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTC 6648964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
       97 GATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTC 156

  6648965 CCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGT--GCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTT 6649022
          ||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||
      157 CCGAGTAGCTGGGACTACAGGCAC--CCGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTT 214

  6649023 AGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGA 6649082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      215 AGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGA 274

  6649083 TCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCC 6649142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      275 TCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCC 334

  6649143 TATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTT 6649202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      335 TATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTT 394

  6649203 AGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAG 6649262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      395 AGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAG 454

  6649263 AGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTG 6649322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      455 AGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTG 514

  6649323 AAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAA 6649382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      515 AAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAA 574

  6649383 TCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGT 6649442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      575 TCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGT 634

  6649443 TTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGC 6649502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      635 TTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGC 694

  6649503 CATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCT 6649562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      695 CATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCT 754

  6649563 GGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCC 6649622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      755 GGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCC 814

  6649623 ATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTAC 6649682
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
      815 ATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTGGAAGCCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTAC 874

  6649683 CCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCAC 6649742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      875 CCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCAC 934

  6649743 AACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGT 6649802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      935 AACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGT 994

  6649803 AAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATT 6649862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      995 AAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATT 1054

  6649863 CTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTA 6649922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1055 CTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTA 1114

  6649923 TTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGG 6649982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 TTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGG 1174

  6649983 TAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTG 6650042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 TAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTG 1234

  6650043 CAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCAC 6650102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1235 CAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCAC 1294

  6650103 TACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAA-TTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTT 6650161
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 TACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTT 1354

  6650162 TCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCA 6650221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 TCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCA 1414

  6650222 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAG 6650281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAG 1474

  6650282 ATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAAT 6650341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 ATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAAT 1534

  6650342 AGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCT 6650401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 AGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCT 1594

  6650402 CTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTT 6650461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 CTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTT 1654

  6650462 AAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATT 6650521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 AAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATT 1714

  6650522 TTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTC 6650581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 TTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTC 1774

  6650582 TTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTAC 6650641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 TTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTAC 1834

  6650642 TGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGG 6650701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 TGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGG 1894

  6650702 TGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACG 6650761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 TGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACG 1954

  6650762 TTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAG 6650821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 TTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAG 2014

  6650822 TGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTG 6650881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 TGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTG 2074

  6650882 TTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTC 6650941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2075 TTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTC 2134

  6650942 TCTGATCTCCCTTGCAGGGGTATTAGGGCACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGC 6651001
          ||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 TCTGATCTCCCTTGCAGGTGTATTAGGCCACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGC 2194

  6651002 TCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTGGGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGAT 6651058
          |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 TCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTGGGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGAT 2254

  6651059 GTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCTAAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTT 6651118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 GTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCTAAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTT 2314

  6651119 TGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGATATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTG 6651178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 TGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGATATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTG 2374

  6651179 TATTTTTGAGTTGTTGCCTT 6651198
          ||||||||||||||||||||
     2375 TATTTTTGAGTTGTTGCCTT 2394

Alignment time is 3.31929 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   3244] =>      3244 nucs 'mol-32-3004-165926_3244'

Score:        3154
Aligned:      3235        nucs
Identic:      3226 (100%) nucs =>      1902 (100%)      1324 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6649053,6650959] EXCISED REGION [6650970,6652294]
 second seq =>  [      1,   1906] EXCISED REGION [   1917,   3244]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [1907,1916]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [1952,1954]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6649053 GGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 6649112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGG 60

  6649113 GATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTG 6649172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTG 120

  6649173 TTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGT 6649232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGT 180

  6649233 ATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTT 6649292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTT 240

  6649293 GGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCT 6649352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCT 300

  6649353 TAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGA 6649412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGA 360

  6649413 TAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTG 6649472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTG 420

  6649473 CTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATG 6649532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATG 480

  6649533 CTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATA 6649592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATA 540

  6649593 AATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAG 6649652
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      541 AATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTGGAAG 600

  6649653 CCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTA 6649712
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTA 660

  6649713 ATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGT 6649772
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGT 720

  6649773 CTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATT 6649832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATT 780

  6649833 ATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTG 6649892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTG 840

  6649893 AGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCT 6649952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCT 900

  6649953 GGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCT 6650012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCT 960

  6650013 GGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTC 6650072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTC 1020

  6650073 TGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAAT 6650132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAAT 1080

  6650133 TTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCT 6650192
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTTTTTTTTTTTT-GGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCT 1139

  6650193 CCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTC 6650252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTC 1199

  6650253 ACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTT 6650312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTT 1259

  6650313 TCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGA 6650372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGA 1319

  6650373 AGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCT 6650432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCT 1379

  6650433 TGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGC 6650492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGC 1439

  6650493 TGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTA 6650552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTA 1499

  6650553 TGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGG 6650612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGG 1559

  6650613 GAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCA 6650672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCA 1619

  6650673 GGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGA 6650732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGA 1679

  6650733 GTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGA 6650792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGA 1739

  6650793 TGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAG 6650852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAG 1799

  6650853 AGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGT 6650912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGT 1859

  6650913 TTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 6650959
          |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1860 TTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 1906

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     1917 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 1976

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 2036

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 2096

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 2156

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 2216

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 2276

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 2336

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 2396

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 2456

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 2516

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 2576

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 2636

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 2696

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 2756

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 2816

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 2876

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 2936

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 2996

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 3056

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 3116

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 6652226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 3176

  6652227 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 6652286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 3236

  6652287 ATGTTTTA 6652294
          ||||||||
     3237 ATGTTTTA 3244

Alignment time is 4.49728 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   6579] =>      6579 nucs 'mol-32-3004-362810_6579'

Score:        6332
Aligned:      6494        nucs
Identic:      6476 (100%) nucs =>       311 (100%)      6165 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6649850,6650160] EXCISED REGION [6654638,6660819]
 second seq =>  [     20,    330] EXCISED REGION [    402,   6579]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [331,401]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [330,330] to [401,401]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [330,330] to [402,402]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6649850 AGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGAT 6649909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       20 AGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGAT 79

  6649910 TTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTT 6649969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       80 TTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTT 139

  6649970 TGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGA 6650029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      140 TGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGA 199

  6650030 TCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCT 6650089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      200 TCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCT 259

  6650090 GAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGT 6650149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      260 GAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGT 319

  6650150 AGAAACAGGGT 6650160
          |||||||||||
      320 AGAAACAGGGT 330

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      402 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 461

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      462 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 521

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      522 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 581

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      582 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 641

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      642 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 701

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      702 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 761

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      762 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 821

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      822 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 881

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      882 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 941

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      942 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 1001

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1002 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 1061

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1062 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 1121

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1122 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 1181

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1182 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 1241

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1242 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 1301

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1302 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 1361

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 6655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1362 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 1421

  6655658 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 6655716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     1422 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 1481

  6655717 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 6655776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1482 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 1541

  6655777 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 6655836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1542 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 1601

  6655837 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 6655896
          |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||
     1602 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC-----TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 1656

  6655897 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 6655956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 1716

  6655957 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 6656016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 1776

  6656017 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 6656076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 1836

  6656077 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 6656136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 1896

  6656137 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 6656196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 1956

  6656197 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 6656256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 2016

  6656257 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 6656316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 2076

  6656317 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 6656376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 2136

  6656377 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 6656436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 2196

  6656437 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 6656496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 2256

  6656497 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 6656556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 2316

  6656557 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 6656616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 2376

  6656617 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 6656676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 2436

  6656677 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 6656736
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 2496

  6656737 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 6656796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 2556

  6656797 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 6656856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 2616

  6656857 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCA 6656916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2617 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCA 2676

  6656917 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 6656976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 2736

  6656977 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 6657036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2737 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 2796

  6657037 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 6657096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 2856

  6657097 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 6657156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 2916

  6657157 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 6657216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 2976

  6657217 TGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 6657276
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 TGAGTAACATTAGCACGCTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 3036

  6657277 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 6657336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 3096

  6657337 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAT 6657396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3097 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAA 3156

  6657397 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 6657456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 3216

  6657457 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 6657516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 3276

  6657517 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 6657576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 3336

  6657577 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 6657636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 3396

  6657637 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 6657696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3397 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 3456

  6657697 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAA 6657756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAA 3516

  6657757 CCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCA 6657816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 CCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCA 3576

  6657817 GAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATA 6657876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 GAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATA 3636

  6657877 GGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTT 6657936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 GGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTT 3696

  6657937 TTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAA 6657996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3697 TTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAA 3756

  6657997 TAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACAT 6658056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3757 TAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACAT 3816

  6658057 AACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAA 6658116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3817 AACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAA 3876

  6658117 GCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGA 6658176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3877 GCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGA 3936

  6658177 CAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAAT 6658236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3937 CAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAAT 3996

  6658237 AGTTGATGCATAGAACGAACTATGAATGAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAG 6658296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3997 AGTTGATGCATAGAACGAACTATGAATGAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAG 4056

  6658297 GCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCT 6658356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4057 GCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCT 4116

  6658357 GTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGG 6658416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4117 GTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGG 4176

  6658417 ATATTTGAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGA 6658476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4177 ATATTTGAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGA 4236

  6658477 CTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAA 6658536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4237 CTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAA 4296

  6658537 TTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCT 6658596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4297 TTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCT 4356

  6658597 TTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACA 6658656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4357 TTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACA 4416

  6658657 GTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGA 6658716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 GTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGA 4476

  6658717 ATTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAAT 6658776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 ATTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAAT 4536

  6658777 TCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAG 6658836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 TCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAG 4596

  6658837 TCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATA 6658896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 TCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATA 4656

  6658897 ACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGA 6658956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 ACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGA 4716

  6658957 CCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATGTAAAATGTTTAGTCC 6659016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4717 CCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATATAAAATGTTTAGTCC 4776

  6659017 AATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTT 6659076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 AATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTT 4836

  6659077 ACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGA 6659136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 ACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGA 4896

  6659137 TATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAG 6659196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4897 TATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAG 4956

  6659197 TGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGC 6659256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 TGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGC 5016

  6659257 TTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTGCCCTTGAGCAATGTTTTCTGGG 6659316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5017 TTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTGCCCTTGAGCAATGTTTTCTGGG 5076

  6659317 ATTTATTTGTTCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGTTATATATATTTAATGTTCAACA 6659376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 ATTTATTTGTTCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGTTATATATATTTAATGTTCAACA 5136

  6659377 AGTCTTTAAACACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTTCATTTACTCCCAATTTACAGTA 6659436
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 AGTCATTAAACACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTTCATTTACTCCCAATTTACAGTA 5196

  6659437 GTGATTTAAAACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATTCATTGTTGAAGGAGTGTGATGG 6659496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 GTGATTTAAAACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATTCATTGTTGAAGGAGTGTGATGG 5256

  6659497 CAAACTATGAAGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAACAATTGTAGTAAAGTCATGAAA 6659556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5257 CAAACTATGAAGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAACAATTGTAGTAAAGTCATGAAA 5316

  6659557 GGTGAATGAAACAATGTAAATATATATATAGTGAGAATGGTACAGGTTGAGCATCCCTTT 6659616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 GGTGAATGAAACAATGTAAATATATATATAGTGAGAATGGTACAGGTTGAGCATCCCTTT 5376

  6659617 TCCAAAATGATTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGAATTTTTCAGATTTTGGAATATT 6659676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5377 TCCAAAATGATTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGAATTTTTCAGATTTTGGAATATT 5436

  6659677 TGTTTACATAAGGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAGTCTAAATACATTTATTTGTGTT 6659736
          |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5437 TGTTTACATAATGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAGTCTAAATACATTTATTTATGTT 5496

  6659737 TTGTTTACACTTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTTATATAATGTTTTAGTAGCTGTG 6659796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 TTGTTTACACTTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTTATATAATGTTTTAGTAGCTGTG 5556

  6659797 GGGCATCGTGAAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCTGGACACATGCCATTTTATTACA 6659856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5557 GGGCATCGTGAAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCTGGACACATGCCATTTTATTACA 5616

  6659857 CTCTGCATGTGCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGTGAAAAAGATATATCATAGCTGA 6659916
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5617 CTCTGGATGTGCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGTGAAAAAGATACATCATAGCTGA 5676

  6659917 AGGGGCCTGGGAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTGAATAAACTGTGTATTGTTCATC 6659976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5677 AGGGGCCTGGGAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTGAATAAACTGTGTATTGTTCATC 5736

  6659977 TGTGATTTGACTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGATGTGGAATTTTCCATTTGTGAC 6660036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5737 TGTGATTTGACTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGATGTGGAATTTTCCATTTGTGAC 5796

  6660037 ATCATGTTGACAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACATCAGATTAGGGAGACTCAGTCT 6660096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5797 ATCATGTTGACAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACATCAGATTAGGGAGACTCAGTCT 5856

  6660097 ATACATTGTGTAATTTTCAGGGGACCAGAGGAATTGAACTTAGTTTAGTTTGTCATATCA 6660156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5857 ATACATTGTGTAATTTTCAGGGGACCAGAGGAATTGAACTTAGTTTAGTTTGTCATATCA 5916

  6660157 GTGGGATTTTCCATGGTGACAAGTGGTAATTATTCTAAGATTATAAACCTTAATACACCT 6660216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5917 GTGGGATTTTCCATGGTGACAAGTGGTAATTATTCTAAGATTATAAACCTTAATACACCT 5976

  6660217 GTTTGTTGTTGTTGTATTTTTATTTTTTACAATTATAAATCTTGAGTATAGTTAAAATTT 6660276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5977 GTTTGTTGTTGTTGTATTTTTATTTTTTACAATTATAAATCTTGAGTATAGTTAAAATTT 6036

  6660277 AGAAAATTTTTTTCAAAGTACTGTGTGGAATCGAAAGATATCTAAGACAATAGTCTTTCA 6660336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6037 AGAAAATTTTTTTCAAAGTACTGTGTGGAATCGAAAGATATCTAAGACAATAGTCTTTCA 6096

  6660337 AAGGTGCAGAAAGTAGATTCAATCTATGCAGAGAAAAGCAGATTTCAAAAAATATAACAG 6660396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6097 AAGGTGCAGAAAGTAGATTCAATCTATGCAGAGAAAAGCAGATTTCAAAAAATATAACAG 6156

  6660397 AAGAAAAACAGTTGGCTGAACTTACTATAAATACATATAGCTAAAAGGGGAAAAAGCAGA 6660456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6157 AAGAAAAACAGTTGGCTGAACTTACTATAAATACATATAGCTAAAAGGGGAAAAAGCAGA 6216

  6660457 GGAGAAACAGTTATCTTCTGGTCTTGTAGAAGTTTAAGGTCTTGGTAGATATTAGGAACA 6660516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     6217 GGAGAAACAGTTATCTTCTGGTCTTGTAGAAGTTTAAGGTCTTGGTAGATATCAGGAACA 6276

  6660517 TGCAAAAGGTAATGTTTGTGTGTTCTCTCTCTCTCTGCCAATGCTTTAAAAATCTCTAGG 6660576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6277 TGCAAAAGGTAATGTTTGTGTGTTCTCTCTCTCTCTGCCAATGCTTTAAAAATCTCTAGG 6336

  6660577 GATATATCAAAGCTGTTTAAATAGAGTTTTAAAAACATGACATGAGTTCATATTTGGGTT 6660636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6337 GATATATCAAAGCTGTTTAAATAGAGTTTTAAAAACATGACATGAGTTCATATTTGGGTT 6396

  6660637 GACACTACTGACAAGTCAGTTTTCTCTTAATACAAATGATAGCAGTAGCAATGTTTGCAT 6660696
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6397 GACACTATTGACAAGTCAGTTTTCTCTTAATACAAATGATAGCAGTAGCAATGTTTGCAT 6456

  6660697 CTATCTATTTGATTGCAAGGAGGAAGAATTGAATAGAATTATTCCAAGGAAAAAATGGCT 6660756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6457 CTATCTATTTGATTGCAAGGAGGAAGAATTGAATAGAATTATTCCAAGGAAAAAATGGCT 6516

  6660757 TTGTTATTGTTATTATTGACATATAAACTTTGATTGGAACTGTAAGCCTAAGCCTAGAGA 6660816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6517 TTGTTATTGTTATTATTGACATATAAACTTTGATTGGAACTGTAAGCCTAAGCCTAGAGA 6576

  6660817 TAA 6660819
          |||
     6577 TAA 6579

Alignment time is 9.2928 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2087] =>      2087 nucs 'mol-32-300f-280971_2087'

Score:        1994
Aligned:      2016        nucs
Identic:      2014 (100%) nucs =>       801 (100%)      1213 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6649360,6650160] EXCISED REGION [6654638,6655851]
 second seq =>  [      1,    801] EXCISED REGION [    873,   2087]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [802,872]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [801,801] to [872,872]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [801,801] to [873,873]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6649360 CACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTA 6649419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTA 60

  6649420 ATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGT 6649479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGT 120

  6649480 CTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAA 6649539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAA 180

  6649540 CTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATT 6649599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATT 240

  6649600 CATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGG 6649659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGG 300

  6649660 TTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTA 6649719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTA 360

  6649720 TCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAG 6649779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAG 420

  6649780 TTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGT 6649839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGT 480

  6649840 ATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCAT 6649899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCAT 540

  6649900 CTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTT 6649959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTT 600

  6649960 CTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGC 6650019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGC 660

  6650020 AGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCC 6650079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCC 720

  6650080 TCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTT 6650139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTT 780

  6650140 TTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          |||||||||||||||||||||
      781 TTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 801

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      873 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 932

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      933 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 992

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      993 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 1052

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1053 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 1112

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 1172

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 1232

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 1292

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 1352

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 1412

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 1472

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 1532

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 1592

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 1652

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 1712

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 1772

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 1832

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 6655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 1892

  6655658 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 6655716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     1893 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 1952

  6655717 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 6655776
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 GCTTTTTGTCAGCGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 2012

  6655777 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 6655836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 2072

  6655837 GGGGATGAGTTGTTT 6655851
          |||||||||||||||
     2073 GGGGATGAGTTGTTT 2087

Alignment time is 2.88235 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   8033] =>      8033 nucs 'mol-32-3030-039950_8033'

Score:        7802
Aligned:      8026        nucs
Identic:      8004 (100%) nucs =>      1794 (100%)      6210 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6649161,6650959] EXCISED REGION [6650970,6657192]
 second seq =>  [      1,   1798] EXCISED REGION [   1809,   8033]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [1799,1808]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [1844,1846]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6649161 TTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCT 6649220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCT 60

  6649221 GTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCT 6649280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCT 120

  6649281 AACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTT 6649340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTT 180

  6649341 ATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTG 6649400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTG 240

  6649401 GGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATC 6649460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATC 300

  6649461 AGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGAC 6649520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGAC 360

  6649521 CTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATA 6649580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATA 420

  6649581 TATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAG 6649640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAG 480

  6649641 GACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGT 6649700
          |||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACAACTGGAAGCCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGT 540

  6649701 TAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAAC 6649760
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGCTGATTTTAATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAAC 600

  6649761 TGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGAC 6649820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGAC 660

  6649821 CCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTAC 6649880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTAC 720

  6649881 ATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTA 6649940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTA 780

  6649941 ATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCT 6650000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCT 840

  6650001 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGG 6650060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGG 900

  6650061 TTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCA 6650120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCA 960

  6650121 CTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGAT 6650180
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTT-GGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGAT 1019

  6650181 GGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTA 6650240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 GGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTA 1079

  6650241 CAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTT 6650300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTT 1139

  6650301 AGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTG 6650360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTG 1199

  6650361 TATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCA 6650420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCA 1259

  6650421 TCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATT 6650480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATT 1319

  6650481 TCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGT 6650540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGT 1379

  6650541 TTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACAC 6650600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACAC 1439

  6650601 TGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAG 6650660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAG 1499

  6650661 TCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGA 6650720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGA 1559

  6650721 GTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTT 6650780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTT 1619

  6650781 GTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCA 6650840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCA 1679

  6650841 CAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGA 6650900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGA 1739

  6650901 GGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 6650959
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1740 GGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 1798

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     1809 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 1868

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 1928

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 1988

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 2048

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 2108

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 2168

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 2228

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 2288

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 2348

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 2408

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 2468

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 2528

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 2588

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 2648

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 2708

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2709 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 2768

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 2828

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 2888

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 2948

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 3008

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 6652226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 3068

  6652227 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 6652286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 3128

  6652287 ATGTTTTATGTGCTACAATTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 6652346
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 ATGTTTTATGTGCTACAGTTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 3188

  6652347 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 6652406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 3248

  6652407 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 6652466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 3308

  6652467 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 6652526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 3368

  6652527 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 6652586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3369 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 3428

  6652587 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 6652646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 3488

  6652647 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 6652706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 3548

  6652707 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 6652766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 3608

  6652767 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 6652826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3609 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 3668

  6652827 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 6652886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3669 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 3728

  6652887 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 6652946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3729 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 3788

  6652947 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 6653006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3789 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 3848

  6653007 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 6653066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3849 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 3908

  6653067 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 6653126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3909 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 3968

  6653127 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 6653186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3969 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 4028

  6653187 GTGTATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 6653246
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4029 GTATATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 4088

  6653247 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCC 6653306
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     4089 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTC-TTTTTTTTTTTCC 4147

  6653307 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 6653366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 4207

  6653367 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 6653426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 4267

  6653427 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 6653486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 4327

  6653487 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 6653546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 4387

  6653547 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 6653606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 4447

  6653607 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 6653666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 4507

  6653667 TTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAA 6653726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4508 TTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAA 4567

  6653727 CTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAA 6653786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 CTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAA 4627

  6653787 TCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTC 6653846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 TCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTC 4687

  6653847 CTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAG 6653906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 CTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAG 4747

  6653907 GGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTA 6653966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 GGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTA 4807

  6653967 ACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAG 6654026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 ACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAG 4867

  6654027 AATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGC 6654086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 AATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGC 4927

  6654087 TACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCC 6654146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 TACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCC 4987

  6654147 GGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGT 6654206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 GGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGT 5047

  6654207 ATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGT 6654266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 ATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGT 5107

  6654267 TCCTGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACC 6654326
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 TCCTGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACC 5167

  6654327 TGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGAC 6654386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5168 TGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGAC 5227

  6654387 AGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAA 6654446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5228 AGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAA 5287

  6654447 CAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAA 6654506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5288 CAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAA 5347

  6654507 TGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCG 6654566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5348 TGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCG 5407

  6654567 ATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGA 6654626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5408 ATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGA 5467

  6654627 TGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGG 6654686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5468 TGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGG 5527

  6654687 TTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCAT 6654746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5528 TTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCAT 5587

  6654747 AAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAAC 6654806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5588 AAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAAC 5647

  6654807 CCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTA 6654866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5648 CCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTA 5707

  6654867 CAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGC 6654926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5708 CAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGC 5767

  6654927 AAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCT 6654986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5768 AAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCT 5827

  6654987 AAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTC 6655046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5828 AAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTC 5887

  6655047 AGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCC 6655106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5888 AGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCC 5947

  6655107 TGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAA 6655166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5948 TGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAA 6007

  6655167 GCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCC 6655226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6008 GCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCC 6067

  6655227 TCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCC 6655286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6068 TCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCC 6127

  6655287 CCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAA 6655346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6128 CCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAA 6187

  6655347 ATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTT 6655406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6188 ATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTT 6247

  6655407 GACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCA 6655466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6248 GACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCA 6307

  6655467 ATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCC 6655526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6308 ATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCC 6367

  6655527 TCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCT 6655586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6368 TCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCT 6427

  6655587 ACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATC 6655646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6428 ACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATC 6487

  6655647 TTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCT 6655705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
     6488 TTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCT 6547

  6655706 CCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTC 6655765
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     6548 CCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTTAGAGGTCAAGTGGAAGTC 6607

  6655766 TTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAA 6655825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6608 TTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAA 6667

  6655826 AGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGA 6655885
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     6668 AGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGA 6726

  6655886 GAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAA 6655945
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     6727 GAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAATGGTGCAATCTTGACTCACTGCAA 6786

  6655946 CCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTAC 6656005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 CCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTAC 6846

  6656006 AGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCA 6656065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 AGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCA 6906

  6656066 TATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAA 6656125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6907 TATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAA 6966

  6656126 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCT 6656185
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     6967 GTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGGCTTTTAAAAGCT 7026

  6656186 TTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTT 6656245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7027 TTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTT 7086

  6656246 GTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTA 6656305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7087 GTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTA 7146

  6656306 ACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGT 6656365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7147 ACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGT 7206

  6656366 AGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGA 6656425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7207 AGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGA 7266

  6656426 AAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGA 6656485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7267 AAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGA 7326

  6656486 GAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATC 6656545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7327 GAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATC 7386

  6656546 CAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACT 6656605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 CAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACT 7446

  6656606 CTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAG 6656665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7447 CTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAG 7506

  6656666 TTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAGT 6656725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     7507 TTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAGT 7566

  6656726 GGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAAT 6656785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 GGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAAT 7626

  6656786 CCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAAT 6656845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7627 CCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAAT 7686

  6656846 GTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGTGA 6656905
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     7687 GTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGGGA 7746

  6656906 GCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACA 6656965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7747 GCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACA 7806

  6656966 CCTCATCATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAA 6657025
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7807 CCTCATTATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAA 7866

  6657026 CAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTA 6657085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7867 CAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTA 7926

  6657086 GACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACC 6657145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7927 GACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACC 7986

  6657146 AGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTA 6657192
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7987 AGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTA 8033

Alignment time is 10.9239 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   6580] =>      6580 nucs 'mol-32-303b-153778_6580'

Score:        6402
Aligned:      6571        nucs
Identic:      6554 (100%) nucs =>      1968 (100%)      4586 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648986,6650959] EXCISED REGION [6650970,6655562]
 second seq =>  [      1,   1975] EXCISED REGION [   1986,   6580]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [1976,1985]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [2021,2023]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6648986 CACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATG 6649045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATG 60

  6649046 TTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAA 6649105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAA 120

  6649106 GTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAAT 6649165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAAT 180

  6649166 TTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGG 6649225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGG 240

  6649226 TATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTA 6649285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTA 300

  6649286 AGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTG 6649345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTG 360

  6649346 GGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCA 6649405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCA 420

  6649406 CACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTT 6649465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTT 480

  6649466 GACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAAT 6649525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAAT 540

  6649526 ACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATAT 6649585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATAT 600

  6649586 TGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAA 6649645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAA 660

  6649646 CTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCT 6649705
          ||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTGGAAGCCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCT 720

  6649706 GATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCA 6649765
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GATTTTAATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCA 780

  6649766 GCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAG 6649825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAG 840

  6649826 AACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCT 6649885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCT 900

  6649886 GCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATT 6649945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATT 960

  6649946 TCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCAC 6650005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCAC 1020

  6650006 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAA 6650065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAA 1080

  6650066 GTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCT 6650125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCT 1140

  6650126 GGCTAATTTTTTTTTTTTTTT-GGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTC 6650184
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTC 1200

  6650185 TTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 6650244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 1260

  6650245 CGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGAT 6650304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGAT 1320

  6650305 TTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATG 6650364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATG 1380

  6650365 TTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTC 6650424
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTAAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTC 1440

  6650425 TGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTT 6650484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTT 1500

  6650485 TTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCT 6650544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCT 1560

  6650545 GGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCT 6650604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCT 1620

  6650605 CCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAA 6650664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAA 1680

  6650665 GGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGG 6650724
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCCGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGG 1740

  6650725 AGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTA 6650784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTA 1800

  6650785 CTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAAT 6650844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAAT 1860

  6650845 GCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCA 6650904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCA 1920

  6650905 TTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 6650959
          |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1921 TTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 1975

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     1986 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 2045

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 2105

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 2165

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 2225

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 2285

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 2345

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 2405

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 2465

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 2525

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 2585

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 2645

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 2705

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 2765

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 2825

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 2885

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 2945

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 3005

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 3065

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 3125

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 3185

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 6652226
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3186 CAGTGAATTCTGCTAGCGGGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 3245

  6652227 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 6652286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3246 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 3305

  6652287 ATGTTTTATGTGCTACAATTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 6652346
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3306 ATGTTTTATGTGCTACAGTTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 3365

  6652347 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 6652406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3366 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 3425

  6652407 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 6652466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3426 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 3485

  6652467 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 6652526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3486 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 3545

  6652527 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 6652586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3546 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 3605

  6652587 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 6652646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3606 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 3665

  6652647 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 6652706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3666 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 3725

  6652707 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 6652766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3726 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 3785

  6652767 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 6652826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3786 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 3845

  6652827 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 6652886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3846 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 3905

  6652887 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 6652946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3906 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 3965

  6652947 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 6653006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3966 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 4025

  6653007 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 6653066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4026 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 4085

  6653067 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 6653126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4086 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 4145

  6653127 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 6653186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4146 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 4205

  6653187 GTGTATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 6653246
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4206 GTATATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 4265

  6653247 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCC 6653306
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     4266 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTC-TTTTTTTTTTTCC 4324

  6653307 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 6653366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4325 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 4384

  6653367 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 6653426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4385 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 4444

  6653427 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 6653486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4445 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 4504

  6653487 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 6653546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4505 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 4564

  6653547 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 6653606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4565 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 4624

  6653607 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 6653666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4625 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 4684

  6653667 TTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAA 6653726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4685 TTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAA 4744

  6653727 CTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAA 6653786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4745 CTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAA 4804

  6653787 TCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTC 6653846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4805 TCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTC 4864

  6653847 CTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAG 6653906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4865 CTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAG 4924

  6653907 GGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTA 6653966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4925 GGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTA 4984

  6653967 ACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAG 6654026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4985 ACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAG 5044

  6654027 AATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGC 6654086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5045 AATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGC 5104

  6654087 TACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCC 6654146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5105 TACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCC 5164

  6654147 GGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGT 6654206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5165 GGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGT 5224

  6654207 ATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGT 6654266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5225 ATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGT 5284

  6654267 TCCTGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACC 6654326
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5285 TCCTGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACC 5344

  6654327 TGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGAC 6654386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5345 TGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGAC 5404

  6654387 AGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAA 6654446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5405 AGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAA 5464

  6654447 CAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAA 6654506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5465 CAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAA 5524

  6654507 TGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCG 6654566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5525 TGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCG 5584

  6654567 ATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGA 6654626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5585 ATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGA 5644

  6654627 TGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGG 6654686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5645 TGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGG 5704

  6654687 TTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCAT 6654746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5705 TTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCAT 5764

  6654747 AAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAAC 6654806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5765 AAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAAC 5824

  6654807 CCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTA 6654866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5825 CCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTA 5884

  6654867 CAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGC 6654926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5885 CAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGC 5944

  6654927 AAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCT 6654986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5945 AAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCT 6004

  6654987 AAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTC 6655046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6005 AAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTC 6064

  6655047 AGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCC 6655106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6065 AGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCC 6124

  6655107 TGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAA 6655166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6125 TGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAA 6184

  6655167 GCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCC 6655226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6185 GCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCC 6244

  6655227 TCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCC 6655286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6245 TCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCC 6304

  6655287 CCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAA 6655346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6305 CCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAA 6364

  6655347 ATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTT 6655406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6365 ATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTT 6424

  6655407 GACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCA 6655466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6425 GACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCA 6484

  6655467 ATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCC 6655526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6485 ATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCC 6544

  6655527 TCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATA 6655562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6545 TCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATA 6580

Alignment time is 9.2351 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2465] =>      2465 nucs 'mol-32-3046-025951_2465'

Score:        2246
Aligned:      2290        nucs
Identic:      2286 (100%) nucs =>        10 (100%)      2276 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6649987,6649996] EXCISED REGION [6653511,6655789]
 second seq =>  [      4,     13] EXCISED REGION [    186,   2465]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      3514 nucs [6649997,6653510]
 second seq =>       172 nucs [14,185]
ALTERNATIVE REGION(S): 8
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2369,2369]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6649996,6649996] to [6653510,6653510]
 second seq =>         1 nucs [14,14] to [186,186]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [14,14] to [185,185]

  6649987 CAGAGTCTCA 6649996
          ||||||||||
        4 CAGAGTCTCA 13

EXCISED REGION

  6653511 GTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTGAAACAA 6653570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      186 GTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTGAAACAA 245

  6653571 AAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACATTCAAA 6653630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      246 AAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACATTCAAA 305

  6653631 GCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTG 6653690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 GCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTG 365

  6653691 AAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTT 6653750
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 AAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTT 425

  6653751 TGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCT 6653810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 TGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCT 485

  6653811 CTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCAC 6653870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 CTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCAC 545

  6653871 ATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGT 6653930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 ATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGT 605

  6653931 GTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACT 6653990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 GTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACT 665

  6653991 GCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCG 6654050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 GCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCG 725

  6654051 GTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATA 6654110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 GTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATA 785

  6654111 TCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAG 6654170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 TCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAG 845

  6654171 ATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGT 6654230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 ATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGT 905

  6654231 CTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCAGAT 6654290
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      906 CTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCACAT 965

  6654291 TTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCAC 6654350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 TTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCAC 1025

  6654351 TTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATC 6654410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 TTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATC 1085

  6654411 ATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAAT 6654470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 ATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAAT 1145

  6654471 TCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGAC 6654530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 TCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGAC 1205

  6654531 AATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATG 6654590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 AATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATG 1265

  6654591 GTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGA 6654650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 GTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGA 1325

  6654651 CAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGG 6654710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 CAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGG 1385

  6654711 AGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCA 6654770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 AGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCA 1445

  6654771 TCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAAC 6654830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 TCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAAC 1505

  6654831 TTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGT 6654890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 TTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGT 1565

  6654891 GGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTAT 6654950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 GGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTAT 1625

  6654951 AGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCAC 6655010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 AGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCAC 1685

  6655011 AAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCC 6655070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 AAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCC 1745

  6655071 AACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGA 6655130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 AACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGA 1805

  6655131 ATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCT 6655190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 ATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCT 1865

  6655191 CAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCC 6655250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 CAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCC 1925

  6655251 TCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGA 6655310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGA 1985

  6655311 AACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACT 6655370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 AACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACT 2045

  6655371 TTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGT 6655430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 TTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGT 2105

  6655431 TATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATG 6655490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 TATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATG 2165

  6655491 CTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAG 6655550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 CTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAG 2225

  6655551 AATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAA 6655610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 AATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAA 2285

  6655611 CCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTC 6655670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 CCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTC 2345

  6655671 CCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGT 6655729
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 CCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGT 2405

  6655730 GATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAA 6655789
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 GATTTTAGATAAACCTTTAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAA 2465

Alignment time is 3.4942 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   4979] =>      4979 nucs 'mol-32-3101-086314_4979'

Score:        4818
Aligned:      4914        nucs
Identic:      4902 (100%) nucs =>      1743 (100%)      3159 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648416,6650160] EXCISED REGION [6654638,6657805]
 second seq =>  [      1,   1744] EXCISED REGION [   1816,   4979]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [1745,1815]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1744,1744] to [1815,1815]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1744,1744] to [1816,1816]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648416 CAAATCCTTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGGTTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGA 6648475
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
        1 CAAATCCTTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGATTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGA 60

  6648476 TAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATT 6648535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATT 120

  6648536 AATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAA 6648595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAA 180

  6648596 ATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATT 6648655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATT 240

  6648656 CTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGC 6648715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGC 300

  6648716 ATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTT 6648775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTT 360

  6648776 TTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCT 6648835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCT 420

  6648836 GTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTG 6648895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTG 480

  6648896 CAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGC 6648955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGC 540

  6648956 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTG 6649015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTG 600

  6649016 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCT 6649075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCT 660

  6649076 CAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACG 6649135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACG 720

  6649136 CCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTA 6649195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTA 780

  6649196 TTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCC 6649255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCC 840

  6649256 CGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTC 6649315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTC 900

  6649316 ATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAAC 6649375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAAC 960

  6649376 AATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAG 6649435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAG 1020

  6649436 TAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGT 6649495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGT 1080

  6649496 GAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAG 6649555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAG 1140

  6649556 TTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTAC 6649615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTAC 1200

  6649616 ACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAG 6649675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAG 1260

  6649676 GCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAAT 6649735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAAT 1320

  6649736 AAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTAT 6649795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTAT 1380

  6649796 TAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTG 6649855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTG 1440

  6649856 GCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTT 6649915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTT 1500

  6649916 TCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGG 6649975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGG 1560

  6649976 GGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGG 6650035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGG 1620

  6650036 CAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAG 6650095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAG 1680

  6650096 CTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAAC 6650155
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
     1681 CTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTT-GGTAGAAAC 1739

  6650156 AGGGT 6650160
          |||||
     1740 AGGGT 1744

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 1875

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 1935

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 1995

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 2055

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 2115

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 2175

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 2235

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 2295

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 2355

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 2415

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 2475

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 2535

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 2595

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 2655

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 2715

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 2775

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 6655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 2835

  6655658 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 6655716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2836 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 2895

  6655717 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 6655776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 2955

  6655777 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 6655836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 3015

  6655837 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 6655896
          |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC-----TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 3070

  6655897 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 6655956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3071 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 3130

  6655957 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 6656016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3131 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 3190

  6656017 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 6656076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3191 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 3250

  6656077 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 6656136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3251 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 3310

  6656137 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 6656196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3311 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 3370

  6656197 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 6656256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3371 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 3430

  6656257 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 6656316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3431 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 3490

  6656317 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 6656376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3491 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 3550

  6656377 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 6656436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3551 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 3610

  6656437 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 6656496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3611 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 3670

  6656497 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 6656556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3671 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 3730

  6656557 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 6656616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3731 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 3790

  6656617 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 6656676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3791 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 3850

  6656677 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 6656736
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3851 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 3910

  6656737 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 6656796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3911 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 3970

  6656797 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 6656856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3971 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 4030

  6656857 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCA 6656916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4031 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCA 4090

  6656917 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 6656976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4091 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 4150

  6656977 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 6657036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4151 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 4210

  6657037 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 6657096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4211 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 4270

  6657097 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 6657156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4271 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 4330

  6657157 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 6657216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4331 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 4390

  6657217 TGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 6657276
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4391 TGAGTAACATTAGCACGCTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 4450

  6657277 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 6657336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4451 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 4510

  6657337 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAT 6657396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4511 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAA 4570

  6657397 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 6657456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4571 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 4630

  6657457 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 6657516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4631 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 4690

  6657517 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 6657576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4691 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 4750

  6657577 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 6657636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4751 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 4810

  6657637 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 6657696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4811 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 4870

  6657697 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAA 6657756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4871 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAA 4930

  6657757 CCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCT 6657805
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4931 CCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCT 4979

Alignment time is 7.05342 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   9083] =>      9083 nucs 'mol-32-310c-168901_9083'

Score:        8853
Aligned:      9068        nucs
Identic:      9046 (100%) nucs =>      8582 (100%)       464 ( 99%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6642362,6650959] EXCISED REGION [6650970,6651433]
 second seq =>  [      7,   8606] EXCISED REGION [   8617,   9083]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [8607,8616]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [8652,8654]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6642362 TGGGGCTTATCTCTGAAAATATAGCGTGGAATACTGTAGGACATATGGGTGGAGTATGGA 6642421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        7 TGGGGCTTATCTCTGAAAATATAGCGTGGAATACTGTAGGACATATGGGTGGAGTATGGA 66

  6642422 GACAAGAAGAAAATTGGAGAGACAAATTCAGAAGCTATTACGGTGGCCTAGACTATGCCA 6642481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       67 GACAAGAAGAAAATTGGAGAGACAAATTCAGAAGCTATTACGGTGGCCTAGACTATGCCA 126

  6642482 GTGATTTGACCTAAATTGCTAAAAGAAGAGATAGAAAAAAGTGGATGGATCCCAGTTATA 6642541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      127 GTGATTTGACCTAAATTGCTAAAAGAAGAGATAGAAAAAAGTGGATGGATCCCAGTTATA 186

  6642542 GCTTGGCAGTGGATGTCAGAGTGAGCATGAGGAAAAGGTAGAAGGGAGGCATGTCTCCTA 6642601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      187 GCTTGGCAGTGGATGTCAGAGTGAGCATGAGGAAAAGGTAGAAGGGAGGCATGTCTCCTA 246

  6642602 GATTCCTGGCATTAGAAAGGATGCCAGAGGATGGCGGTATTCTTTTTTGGGATGGAGCAG 6642661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      247 GATTCCTGGCATTAGAAAGGATGCCAGAGGATGGCGGTATTCTTTTTTGGGATGGAGCAG 306

  6642662 AAATGGCATAGGAGTCAAAGATTCCATTTCAGACATGTTTATGGAGGTGCTAGTGAGACA 6642721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      307 AAATGGCATAGGAGTCAAAGATTCCATTTCAGACATGTTTATGGAGGTGCTAGTGAGACA 366

  6642722 TACAGATGGTGAGCTCAAACAGGCAGGGGAATATTTGAGTCTGCAGCTCAGAGCAGAGGG 6642781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      367 TACAGATGGTGAGCTCAAACAGGCAGGGGAATATTTGAGTCTGCAGCTCAGAGCAGAGGG 426

  6642782 CTAGATGGAGACATTTATTTGAAAAGTGGTAACATTAAGATAACCTTGAAGTCTGGAGTA 6642841
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      427 CTAGATGGAGACATTTATTTGAAAAGTGGTAACATAAAGATAACCTTGAAGTCTGGAGTA 486

  6642842 AAAATGAAGTTGCTAAGTAAAGAATATAAATAGAAAATAAAAGTGGCCCAAGAAGTAGCC 6642901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      487 AAAATGAAGTTGCTAAGTAAAGAATATAAATAGAAAATAAAAGTGGCCCAAGAAGTAGCC 546

  6642902 CTTAAAACAACAGCAACAAGATTTAGAGGTCTGGAATGAGAGGAGAAGCAAATAGTGAAA 6642961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 CTTAAAACAACAGCAACAAGATTTAGAGGTCTGGAATGAGAGGAGAAGCAAATAGTGAAA 606

  6642962 CTAAACTCCATCCTTCAGTTCATGCCTATACAAGTTCTAACTACTGTAAATGTCTGAAAC 6643021
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      607 CTAAACTCCATCCTTCAGTTCATGCCTATACCAGTTCTAACTACTGTAAATGTCTGAAAC 666

  6643022 AAGCTCCATGTCTTTTGAATATACCATTCAATTTGTCCACAATTCCTTACCCACTCGTGC 6643081
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 AAGCTCCATGTCTTTTGAAGATACCATTCAATTTGTCCACAATTCCTTACCCACTCGTGC 726

  6643082 CTGTTCTTATTTCATTATTCCCTGTGGACTTGCAGAGGTCTTTCTAGCCCTTCTCTGTTT 6643141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 CTGTTCTTATTTCATTATTCCCTGTGGACTTGCAGAGGTCTTTCTAGCCCTTCTCTGTTT 786

  6643142 CTCTGTATCTTCTCTCTTTTCTTCTTCCTGTTCTTGACTACCCCAGTATTCTCTGTTCTG 6643201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 CTCTGTATCTTCTCTCTTTTCTTCTTCCTGTTCTTGACTACCCCAGTATTCTCTGTTCTG 846

  6643202 CAATCAATACCCAAGAGGAAGTCAACCCATTTATTAGGCTACGTTAATTAGCATTGTTCT 6643261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 CAATCAATACCCAAGAGGAAGTCAACCCATTTATTAGGCTACGTTAATTAGCATTGTTCT 906

  6643262 GATCATAGTGGAGAGCTCTTTGTGACAGGCCACCTCATGAGTCATCCCAGCGTATGGGCG 6643321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 GATCATAGTGGAGAGCTCTTTGTGACAGGCCACCTCATGAGTCATCCCAGCGTATGGGCG 966

  6643322 GTAGCCATTCTATTATAGTTAGTGCTCAATTTCTGCATTACAGTAACCCAGTATCTTTTG 6643381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 GTAGCCATTCTATTATAGTTAGTGCTCAATTTCTGCATTACAGTAACCCAGTATCTTTTG 1026

  6643382 CCTGAGCAAATAAACTGTTTAGCTAGAAGGAGACTTTGAGCATAGCATGTAAGTGATAAA 6643441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 CCTGAGCAAATAAACTGTTTAGCTAGAAGGAGACTTTGAGCATAGCATGTAAGTGATAAA 1086

  6643442 TCTCATAAAATAAATACTTATTGAATTGAAATTATTCAGTCACTTATAGGTGAGTCACCA 6643501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 TCTCATAAAATAAATACTTATTGAATTGAAATTATTCAGTCACTTATAGGTGAGTCACCA 1146

  6643502 TTCTATCTGTACCAACTGACAGCTCTCAGTTTTCTACCCTTCTCTTTTCACCTTTATCAC 6643561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 TTCTATCTGTACCAACTGACAGCTCTCAGTTTTCTACCCTTCTCTTTTCACCTTTATCAC 1206

  6643562 CATTCTGAGAAGTGATTGGTGAGCATCTTTCAGTAGTCTTTGCAGAGATATAGAAAGACA 6643621
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1207 CATTCTGAGAAGTGATTGGTGAGCATCTTTCAGTAGTCTTTGCAGCGATATAGAAAGACA 1266

  6643622 TTGCAGGTAAAATGTGTGTCAGGATACAGGATATGTGAATCAACTAAAAAATTAGCAAGG 6643681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 TTGCAGGTAAAATGTGTGTCAGGATACAGGATATGTGAATCAACTAAAAAATTAGCAAGG 1326

  6643682 AGTTTTTATTTTTGCCAAATTCTCTGTTTCACAATTACATCCAATTACTGTCCCAGGGAT 6643741
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1327 AGTTTTTATTTTTGCCAAATTCTCTGTTTCACAGTTACATCCAATTACTGTCCCAGGGAT 1386

  6643742 TTGCGAATATGGATAAATGAAGGCAGACATGTGTACTTTAATAATGTGGTTACAGGCAAA 6643801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 TTGCGAATATGGATAAATGAAGGCAGACATGTGTACTTTAATAATGTGGTTACAGGCAAA 1446

  6643802 AAAAAACAAAAACAAAATCTGTGGCCCCATTTGTGAGATGGGAGAATTTACTCTCACTTG 6643861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 AAAAAACAAAAACAAAATCTGTGGCCCCATTTGTGAGATGGGAGAATTTACTCTCACTTG 1506

  6643862 TTTTTAACCAATAAGTTTTTACTTTGTTTATTTTTTATTTTTATTTCTACGTATGTATTT 6643921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 TTTTTAACCAATAAGTTTTTACTTTGTTTATTTTTTATTTTTATTTCTACGTATGTATTT 1566

  6643922 ATTTATGACATATAACCTGCTGTTTTGGAGAGTTTCATCTGAAATACTTGGGACAAAAAG 6643981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 ATTTATGACATATAACCTGCTGTTTTGGAGAGTTTCATCTGAAATACTTGGGACAAAAAG 1626

  6643982 AGAATTCAGTTACAGATGAAAATAGTTTTGTTTCCATTATTCTAGATGTGTAGTGACCCA 6644041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 AGAATTCAGTTACAGATGAAAATAGTTTTGTTTCCATTATTCTAGATGTGTAGTGACCCA 1686

  6644042 AAAATTATCTTGTATTATGACAATTATGTTTATAAAGCCACTAACTATCACCAGATGACT 6644101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 AAAATTATCTTGTATTATGACAATTATGTTTATAAAGCCACTAACTATCACCAGATGACT 1746

  6644102 CTGATGTTTGATTGCAGGTTTTGGGGTTTTTTTTGGTGCCATTTTGTGGAGAAAAAGAAA 6644161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 CTGATGTTTGATTGCAGGTTTTGGGGTTTTTTTTGGTGCCATTTTGTGGAGAAAAAGAAA 1806

  6644162 GACATTATTGCATCACTGGTTAGAGTTGGTGGTTCTTCCTTTAAAAAATTATTTGACTCT 6644221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 GACATTATTGCATCACTGGTTAGAGTTGGTGGTTCTTCCTTTAAAAAATTATTTGACTCT 1866

  6644222 ACAATTTAGAACCAAGTCTTTGGCCTGCTGCCAAAAAAACTATGTATAATTATTTTTTCT 6644281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 ACAATTTAGAACCAAGTCTTTGGCCTGCTGCCAAAAAAACTATGTATAATTATTTTTTCT 1926

  6644282 ATCATTTTTTT-CCAACAATGGTATTATAGTCACATTAAGTTCAGAAAAAACAAAATTTG 6644340
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 ATCATTTTTTTTCCAACAATGGTATTATAGTCACATTAAGTTCAGAAAAAACAAAATTTG 1986

  6644341 CATCAGTTTAAATCCTTGCACTATTGTGATGAAAGATAAATTAACCAAAAGTCCCATGTA 6644400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 CATCAGTTTAAATCCTTGCACTATTGTGATGAAAGATAAATTAACCAAAAGTCCCATGTA 2046

  6644401 AGACAATTACATTGCCATCTCCTAGAAAATAATGTTACCTAGTTATGTGTTCTATTGTTC 6644460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 AGACAATTACATTGCCATCTCCTAGAAAATAATGTTACCTAGTTATGTGTTCTATTGTTC 2106

  6644461 TTGTTGTCTATGAATATTTATCCATAAATATTTGACAATTTCAACATATTTTGAATGCTC 6644520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 TTGTTGTCTATGAATATTTATCCATAAATATTTGACAATTTCAACATATTTTGAATGCTC 2166

  6644521 ATTAAATATTAATATATTGTACATTTATTGTGTGATAAATGGAACACAGGTAGATGTTAA 6644580
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     2167 ATTAAATATTAATATATTGTACATTTATTGTGTGATAAATGGAGCACAGGTAGATGTTAA 2226

  6644581 AATCAATACAACTTTCAATTGAAATAAACTACCTGCCAGTCTCATCCAGAAGCTTAGGTT 6644640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 AATCAATACAACTTTCAATTGAAATAAACTACCTGCCAGTCTCATCCAGAAGCTTAGGTT 2286

  6644641 TTATAGATTGCCAATTTAAAAGGGAAAATCTCAGACTGCTTGTGGATTCATGAATGTCGT 6644700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 TTATAGATTGCCAATTTAAAAGGGAAAATCTCAGACTGCTTGTGGATTCATGAATGTCGT 2346

  6644701 GAATTTCACTAGGAAGAACTGTTCAATTACTTCTGCCTGTGGAGTTAATGGTCTGCCTAC 6644760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 GAATTTCACTAGGAAGAACTGTTCAATTACTTCTGCCTGTGGAGTTAATGGTCTGCCTAC 2406

  6644761 TTCTCAACTCCTGCAGTGCCAACCCCTACAGACCCCAGGCTACTGTGTTCACAGAGAGGG 6644820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 TTCTCAACTCCTGCAGTGCCAACCCCTACAGACCCCAGGCTACTGTGTTCACAGAGAGGG 2466

  6644821 TCTTTATGGAACATGTAAGTATACCTTGAGCTCTTGCTGTGGGCAGCCTTGTAATACAAA 6644880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 TCTTTATGGAACATGTAAGTATACCTTGAGCTCTTGCTGTGGGCAGCCTTGTAATACAAA 2526

  6644881 GGCTCTTCCTCAGGCTCAACAAAAGATGCTGCTATAAGGAAAAGTGTTAAGAGGTAGGGG 6644940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 GGCTCTTCCTCAGGCTCAACAAAAGATGCTGCTATAAGGAAAAGTGTTAAGAGGTAGGGG 2586

  6644941 ATCATGGAGTTTGATCCAAAGTTCTTTGAATTTTGGTCATGGTGTTTTTGGGGTTTTATT 6645000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 ATCATGGAGTTTGATCCAAAGTTCTTTGAATTTTGGTCATGGTGTTTTTGGGGTTTTATT 2646

  6645001 GTTTGGCTGTTCTTACATAATAACAGAACTCCTTATTTTCTTTTGGGAACAACTCTTCCA 6645060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 GTTTGGCTGTTCTTACATAATAACAGAACTCCTTATTTTCTTTTGGGAACAACTCTTCCA 2706

  6645061 CCTCTTAGTCATGTGGTTTTTATGTGATCGACACCCACAACTCTGCCTCCCTCTCCCCAG 6645120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 CCTCTTAGTCATGTGGTTTTTATGTGATCGACACCCACAACTCTGCCTCCCTCTCCCCAG 2766

  6645121 TTGCCATCATATGTAGCCATGTGATTCAAACCTGGACATATAGAGCACCACACCACACTG 6645180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 TTGCCATCATATGTAGCCATGTGATTCAAACCTGGACATATAGAGCACCACACCACACTG 2826

  6645181 CCCATAGTGATTAATCCTGGGTGCTTAATCCAAGGTGAAGTTCTATGACACATAGAACTT 6645240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 CCCATAGTGATTAATCCTGGGTGCTTAATCCAAGGTGAAGTTCTATGACACATAGAACTT 2886

  6645241 TGAAATCCCTCAATCCAAAAATGCCTGAAATTGCTCCTGTTTCTCATCATTTCTATTTAT 6645300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 TGAAATCCCTCAATCCAAAAATGCCTGAAATTGCTCCTGTTTCTCATCATTTCTATTTAT 2946

  6645301 TGTATAAGCTCATTTGAGCTTTTGCTGTCACCTGCAGTTGAATGAAGCCTCACTTATACA 6645360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 TGTATAAGCTCATTTGAGCTTTTGCTGTCACCTGCAGTTGAATGAAGCCTCACTTATACA 3006

  6645361 GAAATATTTTGTTATTTCACCTTGAAACAGGATTGAACATGAGCAATATTTTGTCTTCAG 6645420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 GAAATATTTTGTTATTTCACCTTGAAACAGGATTGAACATGAGCAATATTTTGTCTTCAG 3066

  6645421 TTTTAGACTGTTTCCTATTTCAAAATAGTTTCAAATTTGCAAAATTTGCCAAATAAGAAA 6645480
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 TTTTAGACTTTTTCCTATTTCAAAATAGTTTCAAATTTGCAAAATTTGCCAAATAAGAAA 3126

  6645481 AATAGTATGAACAAAAATCATATACAGTTATCCAGATTTTGCCTTTGTGAACATTTTAGT 6645540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 AATAGTATGAACAAAAATCATATACAGTTATCCAGATTTTGCCTTTGTGAACATTTTAGT 3186

  6645541 ACATGGCTTTATCTTCTGTTCTCTGTCTCCCTCTCATTCTCCTCTCCCTCTACTCTCTCT 6645600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 ACATGGCTTTATCTTCTGTTCTCTGTCTCCCTCTCATTCTCCTCTCCCTCTACTCTCTCT 3246

  6645601 CTAATACATATACATATATACATACAGCTAATTTTTTGAACTGTTTCAGGCTAAGTCAGA 6645660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 CTAATACATATACATATATACATACAGCTAATTTTTTGAACTGTTTCAGGCTAAGTCAGA 3306

  6645661 TATGTAGTTGTGGCTCAATGTGTATTTCCTAAGAATACAGATACTCTCTTACATTATCAC 6645720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 TATGTAGTTGTGGCTCAATGTGTATTTCCTAAGAATACAGATACTCTCTTACATTATCAC 3366

  6645721 ATCATTGTACACATAAACTTTACAGATTTACATAAATCTGAGATTTACTCATTTTATCTA 6645780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 ATCATTGTACACATAAACTTTACAGATTTACATAAATCTGAGATTTACTCATTTTATCTA 3426

  6645781 ATCTATAGCCATATTTTATTTTCTTCAATTACAATAATGCCTTTTATAGAATCATGCCAC 6645840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 ATCTATAGCCATATTTTATTTTCTTCAATTACAATAATGCCTTTTATAGAATCATGCCAC 3486

  6645841 CCTACTCCTTCAGGAGCTGGATGGGATTTAGGTATTACACAGGATTTTGCTATGTCTCTT 6645900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 CCTACTCCTTCAGGAGCTGGATGGGATTTAGGTATTACACAGGATTTTGCTATGTCTCTT 3546

  6645901 TAGATTCCCTTTGCCTGAAACAATTCCATGGCCTTTGTTTTCTGGTAACAGTTTTTAACA 6645960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 TAGATTCCCTTTGCCTGAAACAATTCCATGGCCTTTGTTTTCTGGTAACAGTTTTTAACA 3606

  6645961 GTACCAGCCATAACTTGTAATATAAAATTTATTGTTTTTTGCTTGACTAGTGTTTCCTCC 6646020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 GTACCAGCCATAACTTGTAATATAAAATTTATTGTTTTTTGCTTGACTAGTGTTTCCTCC 3666

  6646021 TCATGATTAGATTGAGTTTTCGCATTCTTTGCTGGGATAATACATAGGGATACTGAGTCC 6646080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 TCATGATTAGATTGAGTTTTCGCATTCTTTGCTGGGATAATACATAGGGATACTGAGTCC 3726

  6646081 TTCTCAGCGAATCTCATCCATCACATCTAGAGCCACACACCATCCATCCGAGACGGTGCT 6646140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 TTCTCAGCGAATCTCATCCATCACATCTAGAGCCACACACCATCCATCCGAGACGGTGCT 3786

  6646141 GATAATAATTTTGATCCTCCAGTCAAAAAAGTGTTTCCTGCTTTCTCCAATATGTGCTTT 6646200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 GATAATAATTTTGATCCTCCAGTCAAAAAAGTGTTTCCTGCTTTCTCCAATATGTGCTTT 3846

  6646201 TTTTCCTACCTTGCAATTAATAATCTGTGAGAACATACTCTGAGAACCATAAACATGTCC 6646260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 TTTTCCTACCTTGCAATTAATAATCTGTGAGAACATACTCTGAGAACCATAAACATGTCC 3906

  6646261 TGCTTCTCCTTAAAATTTCCTAGTAAATTTAGCATCTATGAATGACTCTTGCCTCGCTTC 6646320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 TGCTTCTCCTTAAAATTTCCTAGTAAATTTAGCATCTATGAATGACTCTTGCCTCGCTTC 3966

  6646321 CTTCATGTTTAAAAATAAGACTTCTGCATGTAAGTTGCTTATTTTTGTACTTAAATATTT 6646380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 CTTCATGTTTAAAAATAAGACTTCTGCATGTAAGTTGCTTATTTTTGTACTTAAATATTT 4026

  6646381 TAATTTGAGATTAGTGTAGATTAACAAGCAACAGCATGAAATAATACAAAGAGATCATAT 6646440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 TAATTTGAGATTAGTGTAGATTAACAAGCAACAGCATGAAATAATACAAAGAGATCATAT 4086

  6646441 GTACCTTTTACCCAGTTTTCCCTAATAGTAATATCTTCCCAATTATAGTAAGTGTAACAA 6646500
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     4087 GTACCTTTTACCCAGTTTTCCCTAATAGTAACATCTTCCCAATTATAGTAAGTGTAACAA 4146

  6646501 CACGATACTGACATTAACACAATCAAATGAGGCATTTGCATCACAAGGACCTCTCATGTT 6646560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 CACGATACTGACATTAACACAATCAAATGAGGCATTTGCATCACAAGGACCTCTCATGTT 4206

  6646561 GCCTTCTCATAGCCACATCCACTTTGCTTCCATCTGCACACTCTCTTTAAATCCTGGGAG 6646620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 GCCTTCTCATAGCCACATCCACTTTGCTTCCATCTGCACACTCTCTTTAAATCCTGGGAG 4266

  6646621 TCACTCATCTGTTCCCTATTTATATAATTTGGTCATTTCAAGAATGTTATTGAAATGGAA 6646680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 TCACTCATCTGTTCCCTATTTATATAATTTGGTCATTTCAAGAATGTTATTGAAATGGAA 4326

  6646681 ACACATAACATGTAACCTTTCAGGATTGACATATTTACTCAGCATAATTCATATGACTGA 6646740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 ACACATAACATGTAACCTTTCAGGATTGACATATTTACTCAGCATAATTCATATGACTGA 4386

  6646741 GTAGTGTTCCACAGCATGGATTTACCATAGTTTAACTGTTTGCATATTAAAGGATATCTG 6646800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 GTAGTGTTCCACAGCATGGATTTACCATAGTTTAACTGTTTGCATATTAAAGGATATCTG 4446

  6646801 GGCTGTTTCCAGTTTTTTACTATTATGAAAAAAAGCTGCTATATCTCTTCACATACAGAT 6646860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 GGCTGTTTCCAGTTTTTTACTATTATGAAAAAAAGCTGCTATATCTCTTCACATACAGAT 4506

  6646861 ATTTGTGTGAACGTAAGTCTTTATTTCTCTAAGCTGAATGCTTAGAAATGCAATTGCTGA 6646920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 ATTTGTGTGAACGTAAGTCTTTATTTCTCTAAGCTGAATGCTTAGAAATGCAATTGCTGA 4566

  6646921 GTCATATGGTAGATGCATATGTACTTTTTAAATAAACTGTCCAACTTTTGAGAGTGACCA 6646980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 GTCATATGGTAGATGCATATGTACTTTTTAAATAAACTGTCCAACTTTTGAGAGTGACCA 4626

  6646981 TTCCGTTTTACATTCTTACCAGCAATGTGCGAGAGATCCAGTTTCCCTGCATCCTCAGTA 6647040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 TTCCGTTTTACATTCTTACCAGCAATGTGCGAGAGATCCAGTTTCCCTGCATCCTCAGTA 4686

  6647041 GCATTTGGTGTAGTCACTATTGTTATTGTAGCCATTTGCATAGATGTATAGTGATATCTC 6647100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 GCATTTGGTGTAGTCACTATTGTTATTGTAGCCATTTGCATAGATGTATAGTGATATCTC 4746

  6647101 ACTGTGGTTTTAATTTGCATTTCTCTGATGACTCATAACGTTGAATACTTCTTTGTGTGT 6647160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 ACTGTGGTTTTAATTTGCATTTCTCTGATGACTCATAACGTTGAATACTTCTTTGTGTGT 4806

  6647161 TTATTTTCTATCTATATATCTTCTTCAGTGAAATGTCTCTTCCTGTCTTTTGCCCATGCT 6647220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 TTATTTTCTATCTATATATCTTCTTCAGTGAAATGTCTCTTCCTGTCTTTTGCCCATGCT 4866

  6647221 ATAATTAGTTTGCTTGGTTTTTACTATTGGGTTTTAAGAGTTCTTTATATATCCTAAATA 6647280
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 ATAATTAGTTTGCTTGGTTTTTACTATTAGGTTTTAAGAGTTCTTTATATATCCTAAATA 4926

  6647281 TCAGTCCTTTGTTGAATATGTGGCTCTTGAATATTGTCTCCCATTCTGCAACTTGTCTTT 6647340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 TCAGTCCTTTGTTGAATATGTGGCTCTTGAATATTGTCTCCCATTCTGCAACTTGTCTTT 4986

  6647341 TTATCTCTGAAAGGGATTCTTACTGTGCAAAGTAGCATAATTTTGATGAGGTCAAATTTA 6647400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 TTATCTCTGAAAGGGATTCTTACTGTGCAAAGTAGCATAATTTTGATGAGGTCAAATTTA 5046

  6647401 TCCATTTTTTCGCTTAAGGGTCATGTTTTTGATGTTACGTCCAAGAACTCTTTGCCTAGC 6647460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 TCCATTTTTTCGCTTAAGGGTCATGTTTTTGATGTTACGTCCAAGAACTCTTTGCCTAGC 5106

  6647461 TCTCTATCATGAAAATTTGCTTCTGCATTTTGTCCTAAATGTTTTATAGTTTTGTGTTTT 6647520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 TCTCTATCATGAAAATTTGCTTCTGCATTTTGTCCTAAATGTTTTATAGTTTTGTGTTTT 5166

  6647521 ACATTTAAGTTTGTGATATATTTTGGTTTGCATTCAAATTTATTGTGATAAATAAGGCGA 6647580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 ACATTTAAGTTTGTGATATATTTTGGTTTGCATTCAAATTTATTGTGATAAATAAGGCGA 5226

  6647581 CATAAAATTTGCCATCTGAATCATTTTTAAGTGTGTAGTGCAATGGTGTTAAGCATATTT 6647640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 CATAAAATTTGCCATCTGAATCATTTTTAAGTGTGTAGTGCAATGGTGTTAAGCATATTT 5286

  6647641 ACATTATTGTAAGACAGATCATCAGAACTTTTTCTTCTTGAAAATCAGAAATTTTATACC 6647700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 ACATTATTGTAAGACAGATCATCAGAACTTTTTCTTCTTGAAAATCAGAAATTTTATACC 5346

  6647701 CATTAAACAACTTCTTTTCTGTCCCTCTGCCCAGCTCCTGGTAACTGTCATTCTACTTTC 6647760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 CATTAAACAACTTCTTTTCTGTCCCTCTGCCCAGCTCCTGGTAACTGTCATTCTACTTTC 5406

  6647761 TGTTTCTAGATTTTGTCAACTTTAGATACCTCATATTTATGGAATTATACAGTATTTGTC 6647820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 TGTTTCTAGATTTTGTCAACTTTAGATACCTCATATTTATGGAATTATACAGTATTTGTC 5466

  6647821 TTTTAATACAAAAGATTGGCTTATTTCACTTAACATAATGTCATTTTGTTTTCCTTTTGG 6647880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 TTTTAATACAAAAGATTGGCTTATTTCACTTAACATAATGTCATTTTGTTTTCCTTTTGG 5526

  6647881 TACAAGGTATGAGACTTAGAAAGAGATTATTTTATTAATTGATTGATTTATTGATTGATT 6647940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 TACAAGGTATGAGACTTAGAAAGAGATTATTTTATTAATTGATTGATTTATTGATTGATT 5586

  6647941 ATCTGTGGATATCCAAGTGAACCTGCACCATTTGTTGTAAAAGCTATCTTTCCTGCATTT 6648000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 ATCTGTGGATATCCAAGTGAACCTGCACCATTTGTTGTAAAAGCTATCTTTCCTGCATTT 5646

  6648001 AATTGTTTTTAAACCTTGATCAAATATTAGTTGGGCATATTTGAATAAATCTGTTTCTGG 6648060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 AATTGTTTTTAAACCTTGATCAAATATTAGTTGGGCATATTTGAATAAATCTGTTTCTGG 5706

  6648061 GTTGTAGATTTTTGCATTGCAATTCATAAAATATATTGGTCTGTAGTTTGTTTATGTTGT 6648120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 GTTGTAGATTTTTGCATTGCAATTCATAAAATATATTGGTCTGTAGTTTGTTTATGTTGT 5766

  6648121 ACCTTTTGTCTCATTTTGCTATCAGAGTAGTTTGCGCTTCATAAAATAACTTGGGAAATG 6648180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 ACCTTTTGTCTCATTTTGCTATCAGAGTAGTTTGCGCTTCATAAAATAACTTGGGAAATG 5826

  6648181 TCTCCCTCTTATATTCTCTGGAAGAGATTGTGAATAATTGGTGTTAATTATGCTTTAATT 6648240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 TCTCCCTCTTATATTCTCTGGAAGAGATTGTGAATAATTGGTGTTAATTATGCTTTAATT 5886

  6648241 GTTTCATTGAACATTTAGGGGGACGGTTTGTAAATTCAATTCCCTTAATAGTTGTAAGAG 6648300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 GTTTCATTGAACATTTAGGGGGACGGTTTGTAAATTCAATTCCCTTAATAGTTGTAAGAG 5946

  6648301 TATTCAAATTATCTAGTTTATATTGAGTAAGTTATAGTAGTTTGTGTCTTTTGAGAAACC 6648360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 TATTCAAATTATCTAGTTTATATTGAGTAAGTTATAGTAGTTTGTGTCTTTTGAGAAACC 6006

  6648361 TTTTCATCTAAGTTGTCAAATTTATGCATGTAAAGTTGTTTATTAGTTCTCTGTCCAAAT 6648420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 TTTTCATCTAAGTTGTCAAATTTATGCATGTAAAGTTGTTTATTAGTTCTCTGTCCAAAT 6066

  6648421 CCTTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGGTTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATT 6648480
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 CCTTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGATTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATT 6126

  6648481 TGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCT 6648540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 TGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCT 6186

  6648541 TTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTA 6648600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 TTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTA 6246

  6648601 ATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAG 6648660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6247 ATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAG 6306

  6648661 TTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTA 6648720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 TTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTA 6366

  6648721 GTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATT 6648780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 GTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATT 6426

  6648781 TAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTT 6648840
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 TAATATAATTATTTATATATTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTT 6486

  6648841 TTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 6648900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 TTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTG 6546

  6648901 GCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAG 6648960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 GCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAG 6606

  6648961 CCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTT 6649020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 CCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTT 6666

  6649021 TTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGT 6649080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 TTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGT 6726

  6649081 GATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGG 6649140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 GATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGG 6786

  6649141 CCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCC 6649200
          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 CCTATTATGCTTTTTTTTTTT-AATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCC 6845

  6649201 TTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAG 6649260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6846 TTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAG 6905

  6649261 AGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCC 6649320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6906 AGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCC 6965

  6649321 TGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGT 6649380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6966 TGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGT 7025

  6649381 AATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGG 6649440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7026 AATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGG 7085

  6649441 GTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCA 6649500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7086 GTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCA 7145

  6649501 GCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTC 6649560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7146 GCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTC 7205

  6649561 CTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGT 6649620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7206 CTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGT 7265

  6649621 CCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCT 6649680
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
     7266 CCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTGGAAGCCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCT 7325

  6649681 ACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACC 6649740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     7326 ACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACC 7385

  6649741 ACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAAT 6649800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7386 ACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAAT 7445

  6649801 GTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGA 6649860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7446 GTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGA 7505

  6649861 TTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAG 6649920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7506 TTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAG 7565

  6649921 TATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAA 6649980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7566 TATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAA 7625

  6649981 GGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAAC 6650040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7626 GGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAAC 7685

  6650041 TGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTC 6650100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7686 TGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTC 7745

  6650101 ACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTT--GGTAGAAACAGG 6650158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||
     7746 ACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGG 7805

  6650159 GTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCG 6650218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7806 GTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCG 7865

  6650219 GCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTT 6650278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7866 GCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTT 7925

  6650279 AAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTC 6650338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7926 AAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTC 7985

  6650339 AATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAA 6650398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7986 AATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAA 8045

  6650399 TCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTT 6650458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8046 TCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTT 8105

  6650459 TTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGAT 6650518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8106 TTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGAT 8165

  6650519 ATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTT 6650578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8166 ATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTT 8225

  6650579 TTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCAT 6650638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8226 TTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCAT 8285

  6650639 TACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAA 6650698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8286 TACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAA 8345

  6650699 GGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTG 6650758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8346 GGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTG 8405

  6650759 ACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTC 6650818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8406 ACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTC 8465

  6650819 TAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGT 6650878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8466 TAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGT 8525

  6650879 TTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCC 6650938
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     8526 TTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACC 8585

  6650939 TTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 6650959
          |||||||||||||||||||||
     8586 TTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 8606

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     8617 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 8676

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8677 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 8736

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8737 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 8796

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8797 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 8856

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8857 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 8916

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8917 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 8976

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8977 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 9036

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATT 6651433
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9037 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATT 9083

Alignment time is 12.6203 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   6576] =>      6576 nucs 'mol-32-3143-043072_6576'

Score:        6406
Aligned:      6566        nucs
Identic:      6549 (100%) nucs =>      1930 (100%)      4619 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6649025,6650959] EXCISED REGION [6650970,6655595]
 second seq =>  [      1,   1937] EXCISED REGION [   1948,   6576]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [1938,1947]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [1983,1985]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6649025 TAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATC 6649084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATC 60

  6649085 CACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTA 6649144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTA 120

  6649145 TTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAG 6649204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAG 180

  6649205 TATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAG 6649264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAG 240

  6649265 GTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAA 6649324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAA 300

  6649325 AAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATC 6649384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATC 360

  6649385 TAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTT 6649444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTT 420

  6649445 GGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCA 6649504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCA 480

  6649505 TCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGG 6649564
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCCAGGTTTATGTGACCCAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGG 540

  6649565 ATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCAT 6649624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCAT 600

  6649625 TATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCC 6649684
          |||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      601 TATCTCATTAGGAGAGGACAACTGGAAGCCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCC 660

  6649685 CTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAA 6649744
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAA 720

  6649745 CCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAA 6649804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAA 780

  6649805 AGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCT 6649864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCT 840

  6649865 TTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATT 6649924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATT 900

  6649925 GTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTA 6649984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTA 960

  6649985 GACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCA 6650044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCA 1020

  6650045 ACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTA 6650104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTA 1080

  6650105 CAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTT--GGTAGAAACAGGGTTT 6650162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||
     1081 CAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTT 1140

  6650163 CATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCAT 6650222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCAT 1200

  6650223 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGA 6650282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGA 1260

  6650283 TCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATA 6650342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATA 1320

  6650343 GTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTC 6650402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTC 1380

  6650403 TGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTA 6650462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTA 1440

  6650463 AATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTT 6650522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTT 1500

  6650523 TTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCT 6650582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCT 1560

  6650583 TTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACT 6650642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACT 1620

  6650643 GTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGT 6650702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGT 1680

  6650703 GCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGT 6650762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGT 1740

  6650763 TGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGT 6650822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGT 1800

  6650823 GCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGT 6650882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGT 1860

  6650883 TCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCT 6650942
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1861 TCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCT 1920

  6650943 CTGATCTCCCTTGCAGG 6650959
          |||||||||||||||||
     1921 CTGATCTCCCTTGCAGG 1937

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     1948 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 2007

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 2067

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 2127

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 2187

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 2247

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 2307

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 2367

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 2427

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 2487

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 2547

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 2607

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 2667

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 2727

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 2787

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 2847

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 2907

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 2967

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 3027

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 3087

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 3147

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 6652226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 3207

  6652227 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 6652286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 3267

  6652287 ATGTTTTATGTGCTACAATTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 6652346
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 ATGTTTTATGTGCTACAGTTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 3327

  6652347 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 6652406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 3387

  6652407 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 6652466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 3447

  6652467 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 6652526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 3507

  6652527 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 6652586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 3567

  6652587 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 6652646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 3627

  6652647 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 6652706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 3687

  6652707 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 6652766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 3747

  6652767 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 6652826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 3807

  6652827 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 6652886
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATGAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 3867

  6652887 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 6652946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 3927

  6652947 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 6653006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 3987

  6653007 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 6653066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 4047

  6653067 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 6653126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 4107

  6653127 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 6653186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 4167

  6653187 GTGTATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 6653246
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 GTATATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 4227

  6653247 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCC 6653306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCC 4287

  6653307 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 6653366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 4347

  6653367 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 6653426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 4407

  6653427 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 6653486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4408 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 4467

  6653487 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 6653546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 4527

  6653547 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 6653606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 4587

  6653607 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 6653666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 4647

  6653667 TTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAA 6653726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     4648 TTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAA 4707

  6653727 CTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAA 6653786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4708 CTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAA 4767

  6653787 TCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTC 6653846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 TCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTC 4827

  6653847 CTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAG 6653906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 CTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAG 4887

  6653907 GGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTA 6653966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 GGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTA 4947

  6653967 ACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAG 6654026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 ACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAG 5007

  6654027 AATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGC 6654086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 AATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGC 5067

  6654087 TACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCC 6654146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5068 TACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCC 5127

  6654147 GGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGT 6654206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5128 GGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGT 5187

  6654207 ATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGT 6654266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 ATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGT 5247

  6654267 TCCTGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACC 6654326
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 TCCTGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACC 5307

  6654327 TGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGAC 6654386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5308 TGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGAC 5367

  6654387 AGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAA 6654446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5368 AGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAA 5427

  6654447 CAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAA 6654506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5428 CAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAA 5487

  6654507 TGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCG 6654566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5488 TGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCG 5547

  6654567 ATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGA 6654626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5548 ATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGA 5607

  6654627 TGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGG 6654686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5608 TGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGG 5667

  6654687 TTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCAT 6654746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5668 TTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCAT 5727

  6654747 AAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAAC 6654806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5728 AAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAAC 5787

  6654807 CCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTA 6654866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5788 CCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTA 5847

  6654867 CAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGC 6654926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5848 CAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGC 5907

  6654927 AAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCT 6654986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5908 AAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCT 5967

  6654987 AAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTC 6655046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5968 AAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTC 6027

  6655047 AGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCC 6655106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6028 AGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCC 6087

  6655107 TGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAA 6655166
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6088 CGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAA 6147

  6655167 GCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCC 6655226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6148 GCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCC 6207

  6655227 TCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCC 6655286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6208 TCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCC 6267

  6655287 CCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAA 6655346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6268 CCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAA 6327

  6655347 ATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTT 6655406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6328 ATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTT 6387

  6655407 GACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCA 6655466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6388 GACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCA 6447

  6655467 ATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCC 6655526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6448 ATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCC 6507

  6655527 TCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCT 6655586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6508 TCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCT 6567

  6655587 ACACAGCTG 6655595
          |||||||||
     6568 ACACAGCTG 6576

Alignment time is 9.19921 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   8239] =>      8239 nucs 'mol-32-3159-130499_8239'

Score:        7962
Aligned:      8216        nucs
Identic:      8188 (100%) nucs =>      8024 (100%)       164 ( 99%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6654363,6662405] EXCISED REGION [6662423,6662587]
 second seq =>  [     26,   8074] EXCISED REGION [   8075,   8239]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        17 nucs [6662406,6662422]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [6662406,6662421] to [6662423,6662438]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6654363 TTATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAA 6654422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       26 TTATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAA 85

  6654423 ATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAA 6654482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       86 ATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAA 145

  6654483 CTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACAC 6654542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      146 CTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACAC 205

  6654543 ACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATG 6654602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      206 ACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATG 265

  6654603 GTGATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTA 6654662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      266 GTGATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTA 325

  6654663 AAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCA 6654722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      326 AAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCA 385

  6654723 TCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAG 6654782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      386 TCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAG 445

  6654783 GAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAA 6654842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      446 GAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAA 505

  6654843 AGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGA 6654902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      506 AGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGA 565

  6654903 AATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCT 6654962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      566 AATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCT 625

  6654963 TCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAG 6655022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      626 TCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAG 685

  6655023 GCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGT 6655082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      686 GCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGT 745

  6655083 TTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAA 6655142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      746 TTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAA 805

  6655143 GATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAG 6655202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      806 GATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAG 865

  6655203 TTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGC 6655262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      866 TTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGC 925

  6655263 CATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCC 6655322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      926 CATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCC 985

  6655323 CAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAA 6655382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      986 CAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAA 1045

  6655383 AAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCC 6655442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1046 AAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCC 1105

  6655443 CCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCC 6655502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1106 CCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCC 1165

  6655503 AAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATA 6655562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1166 AAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATA 1225

  6655563 TCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAA 6655622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1226 TCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAA 1285

  6655623 AAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACAT 6655682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1286 AAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACAT 1345

  6655683 TCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAA 6655741
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1346 TCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAA 1405

  6655742 ACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAG 6655801
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1406 ACCTTTAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAG 1465

  6655802 CACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC 6655861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1466 CACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC 1525

  6655862 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAG 6655921
          ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1526 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-GAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAA 1584

  6655922 TGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 6655981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 TGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 1644

  6655982 CGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATT 6656041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 CGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATT 1704

  6656042 TTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATG 6656101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 TTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATG 1764

  6656102 ATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGC 6656161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 ATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGC 1824

  6656162 CTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGC 6656221
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 CTTGTAGGTAGGCTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGC 1884

  6656222 AAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATT 6656281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 AAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATT 1944

  6656282 ACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAAT 6656341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 ACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAAT 2004

  6656342 ACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGA 6656401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 ACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGA 2064

  6656402 CTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAA 6656461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 CTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAA 2124

  6656462 CTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCAT 6656521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 CTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCAT 2184

  6656522 ACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAG 6656581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 ACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAG 2244

  6656582 GCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTT 6656641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 GCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTT 2304

  6656642 TATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAA 6656701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 TATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAA 2364

  6656702 TAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGT 6656761
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 TAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGT 2424

  6656762 TTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCA 6656821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 TTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCA 2484

  6656822 TCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATG 6656881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 TCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATG 2544

  6656882 TAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAG 6656941
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 TAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAG 2604

  6656942 TGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGT 6657001
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2605 TGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATTATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGT 2664

  6657002 AAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTT 6657061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 AAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTT 2724

  6657062 GGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACA 6657121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 GGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACA 2784

  6657122 GCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTG 6657181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 GCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTG 2844

  6657182 AAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAA 6657241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 AAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAA 2904

  6657242 AAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAA 6657301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 AAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAA 2964

  6657302 CTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAA 6657361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 CTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAA 3024

  6657362 TTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTATCATGGCATTAACTCAGAAGAGAAAC 6657421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     3025 TTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAACATGGCATTAACTCAGAAGAGAAAC 3084

  6657422 ATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGGGAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAAT 6657481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 ATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGGGAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAAT 3144

  6657482 TTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATTGTTTTACTTTTAAAGTAATATTATT 6657541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 TTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATTGTTTTACTTTTAAAGTAATATTATT 3204

  6657542 GTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAAAATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAA 6657601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 GTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAAAATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAA 3264

  6657602 AAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCATAATTTAAAACAGTTCTAGTGAACAT 6657661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 AAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCATAATTTAAAACAGTTCTAGTGAACAT 3324

  6657662 TTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTCTGTTACCTGTGACTAATCAGTACAC 6657721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 TTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTCTGTTACCTGTGACTAATCAGTACAC 3384

  6657722 AAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAACCTGATATTTTCATAGTATTTTTAC 6657781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 AAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAACCTGATATTTTCATAGTATTTTTAC 3444

  6657782 TGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCAGAGAGGAAAAACATTCTTTAACACA 6657841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 TGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCAGAGAGGAAAAACATTCTTTAACACA 3504

  6657842 GAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATAGGTCTTACTTTCTTAAATGGAACAT 6657901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 GAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATAGGTCTTACTTTCTTAAATGGAACAT 3564

  6657902 ATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTTTTTATTATTTGATTAACTTTTTTCA 6657961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 ATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTTTTTATTATTTGATTAACTTTTTTCA 3624

  6657962 GATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAATAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTA 6658021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 GATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAATAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTA 3684

  6658022 AATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACATAACCTTTCTTACAAACTCATATTTG 6658081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 AATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACATAACCTTTCTTACAAACTCATATTTG 3744

  6658082 TGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAAGCATTGGACTAAGCATTTGATATGT 6658141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 TGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAAGCATTGGACTAAGCATTTGATATGT 3804

  6658142 CACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGACAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCT 6658201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 CACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGACAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCT 3864

  6658202 TATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAATAGTTGATGCATAGAACGAACTATGA 6658261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 TATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAATAGTTGATGCATAGAACGAACTATGA 3924

  6658262 ATGAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAGGCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCT 6658321
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3925 ATCAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAGGCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCT 3984

  6658322 GGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCTGTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGG 6658381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 GGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCTGTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGG 4044

  6658382 AATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGGATATTTGAATCATATAAGTCTACAT 6658441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 AATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGGATATTTGAATCATATAAGTCTACAT 4104

  6658442 TTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGACTTAATTCTGGTCACTTGAACATTC 6658501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 TTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGACTTAATTCTGGTCACTTGAACATTC 4164

  6658502 TTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAATTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCT 6658561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 TTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAATTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCT 4224

  6658562 TTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCTTTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCC 6658621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 TTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCTTTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCC 4284

  6658622 TCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACAGTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGC 6658681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 TCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACAGTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGC 4344

  6658682 AGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGAATTTGGAGTTCCATTTGACTCACGG 6658741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4345 AGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGAACTTGGAGTTCCATTTGACTCACGG 4404

  6658742 AGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAATTCCCTTCCCACACTAGACACAGAAG 6658801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4405 AGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAATTCCCTTCCCACACTAGACACAGAAG 4464

  6658802 TTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAGTCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTC 6658861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 TTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAGTCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTC 4524

  6658862 TATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATAACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTAC 6658921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 TATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATAACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTAC 4584

  6658922 AGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGACCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAA 6658981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 AGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGACCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAA 4644

  6658982 TTAAATGAGATAGTTACATGTAAAATGTTTAGTCCAATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTA 6659041
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 TTAAATGAGATAGTTACATATAAAATGTTTAGTCCAATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTA 4704

  6659042 AGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTTACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGA 6659101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 AGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTTACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGA 4764

  6659102 ACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGATATACTCTTTAATTATGTTGGTGGC 6659161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 ACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGATATACTCTTTAATTATGTTGGTGGC 4824

  6659162 TACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAGTGTGTTATAATGATAGAGACATAGA 6659221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 TACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAGTGTGTTATAATGATAGAGACATAGA 4884

  6659222 AGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGCTTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACT 6659281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 AGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGCTTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACT 4944

  6659282 ACTTAATCATTTGCCCTTGAGCAATGTTTTCTGGGATTTATTTGTTCCATCTGTAATGAG 6659341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4945 ACTTAATCATTTGCCCTTGAGCAATGTTTTCTGGGATTTATTTGTTCCATCTGTAATGAG 5004

  6659342 AGATGGATTAGGTTATATATATTTAATGTTCAACAAGTCTTTAAACACAATTCTGAGACT 6659401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5005 AGATGGATTAGGTTATATATATTTAATGTTCAACAAGTCTTTAAACACAATTCTGAGACT 5064

  6659402 CAAATTCCAGCTTCATTTACTCCCAATTTACAGTAGTGATTTAAAACATGAGGAGTGTTC 6659461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5065 CAAATTCCAGCTTCATTTACTCCCAATTTACAGTAGTGATTTAAAACATGAGGAGTGTTC 5124

  6659462 ACTTTAGATGATTCATTGTTGAAGGAGTGTGATGGCAAACTATGAAGAGACTTTCTTTTA 6659521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5125 ACTTTAGATGATTCATTGTTGAAGGAGTGTGATGGCAAACTATGAAGAGACTTTCTTTTA 5184

  6659522 AAAACGTGCCTAACAATTGTAGTAAAGTCATGAAAGGTGAATGAAACAATGTAAATATAT 6659581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5185 AAAACGTGCCTAACAATTGTAGTAAAGTCATGAAAGGTGAATGAAACAATGTAAATATAT 5244

  6659582 ATATAGTGAGAATGGTACAGGTTGAGCATCCCTTTTCCAAAATGATTGGAGCAAGAAGTG 6659641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5245 ATATAGTGAGAATGGTACAGGTTGAGCATCCCTTTTCCAAAATGATTGGAGCAAGAAGTG 5304

  6659642 TCTTGGATTTTGAATTTTTCAGATTTTGGAATATTTGTTTACATAAGGAGATATCTTGGG 6659701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     5305 TCTTGGATTTTGAATTTTTCAGATTTTGGAATATTTGTTTACATAATGAGATATCTTGGG 5364

  6659702 GATGAGACTCAAGTCTAAATACATTTATTTGTGTTTTGTTTACACTTTATACACATAACC 6659761
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     5365 GATGAGACTCAAGTCTAAATACATTTATTTATGTTTTGTTTACACTTTATACACATAACC 5424

  6659762 TGGAGGTCATTTTATATAATGTTTTAGTAGCTGTGGGGCATCGTGAAGAGCTTGCTGTTG 6659821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5425 TGGAGGTCATTTTATATAATGTTTTAGTAGCTGTGGGGCATCGTGAAGAGCTTGCTGTTG 5484

  6659822 GTGAGACTGGTCTGGACACATGCCATTTTATTACACTCTGCATGTGCTTGCTTGGGGGGA 6659881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5485 GTGAGACTGGTCTGGACACATGCCATTTTATTACACTCTGGATGTGCTTGCTTGGGGGGA 5544

  6659882 TATGGGTACCTGTGAAAAAGATATATCATAGCTGAAGGGGCCTGGGAGGATCTTCTCTCC 6659941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5545 TATGGGTACCTGTGAAAAAGATATATCATAGCTGAAGGGGCCTGGGAGGATCTTCTCTCC 5604

  6659942 TTTAGAGACACTGAATAAACTGTGTATTGTTCATCTGTGATTTGACTGTAACCCATCATC 6660001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5605 TTTAGAGACACTGAATAAACTGTGTATTGTTCATCTGTGATTTGACTGTAACCCATCATC 5664

  6660002 ACATGAGGTCAGATGTGGAATTTTCCATTTGTGACATCATGTTGACAGTCAAAAAGTTTC 6660061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5665 ACATGAGGTCAGATGTGGAATTTTCCATTTGTGACATCATGTTGACAGTCAAAAAGTTTC 5724

  6660062 AAACTTCTGAACATCAGATTAGGGAGACTCAGTCTATACATTGTGTAATTTTCAGGGGAC 6660121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5725 AAACTTCTGAACATCAGATTAGGGAGACTCAGTCTATACATTGTGTAATTTTCAGGGGAC 5784

  6660122 CAGAGGAATTGAACTTAGTTTAGTTTGTCATATCAGTGGGATTTTCCATGGTGACAAGTG 6660181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5785 CAGAGGAATTGAACTTAGTTTAGTTTGTCATATCAGTGGGATTTTCCATGGTGACAAGTG 5844

  6660182 GTAATTATTCTAAGATTATAAACCTTAATACACCTGTTTGTTGTTGTTGTATTTTTATTT 6660241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5845 GTAATTATTCTAAGATTATAAACCTTAATACACCTGTTTGTTGTTGTTGTATTTTTATTT 5904

  6660242 TTTACAATTATAAATCTTGAGTATAGTTAAAATTTAGAAAATTTTTTTCAAAGTACTGTG 6660301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5905 TTTACAATTATAAATCTTGAGTATAGTTAAAATTTAGAAAATTTTTTTCAAAGTACTGTG 5964

  6660302 TGGAATCGAAAGATATCTAAGACAATAGTCTTTCAAAGGTGCAGAAAGTAGATTCAATCT 6660361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5965 TGGAATCGAAAGATATCTAAGACAATAGTCTTTCAAAGGTGCAGAAAGTAGATTCAATCT 6024

  6660362 ATGCAGAGAAAAGCAGATTTCAAAAAATATAACAGAAGAAAAACAGTTGGCTGAACTTAC 6660421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6025 ATGCAGAGAAAAGCAGATTTCAAAAAATATAACAGAAGAAAAACAGTTGGCTGAACTTAC 6084

  6660422 TATAAATACATATAGCTAAAAGGGGAAAAAGCAGAGGAGAAACAGTTATCTTCTGGTCTT 6660481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6085 TATAAATACATATAGCTAAAAGGGGAAAAAGCAGAGGAGAAACAGTTATCTTCTGGTCTT 6144

  6660482 GTAGAAGTTTAAGGTCTTGGTAGATATTAGGAAC--ATGCAAAAGGTAATGTTTGTGTGT 6660539
          |||||||||||||||||||||||||||.|||||   ||||||||||||||||||||||||
     6145 GTAGAAGTTTAAGGTCTTGGTAGATATCAGGAA-GGATGCAAAAGGTAATGTTTGTGTGT 6203

  6660540 TCTCTCTCTCTCTGCCAATGCTTTAAAAATCTCTAGGGATATATCAAAGCTGTTTAAATA 6660599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6204 TCTCTCTCTCTCTGCCAATGCTTTAAAAATCTCTAGGGATATATCAAAGCTGTTTAAATA 6263

  6660600 GAGTTTTAAAAACATGACATGAGTTCATATTTGGGTTGACACTACTGACAAGTCAGTTTT 6660659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     6264 GAGTTTTAAAAACATGACATGAGTTCATATTTGGGTTGACACTATTGACAAGTCAGTTTT 6323

  6660660 CTCTTAATACAAATGATAGCAGTAGCAATGTTTGCATCTATCTATTTGATTGCAAGGAGG 6660719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6324 CTCTTAATACAAATGATAGCAGTAGCAATGTTTGCATCTATCTATTTGATTGCAAGGAGG 6383

  6660720 AAGAATTGAATAGAATTATTCCAAGGAAAAAATGGCTTTGTTATTGTTATTATTGACATA 6660779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6384 AAGAATTGAATAGAATTATTCCAAGGAAAAAATGGCTTTGTTATTGTTATTATTGACATA 6443

  6660780 TAAACTTTGATTGGAACTGTAAGCCTAAGCCTAGAGATAAATATTTATCTCTCTCAGTCA 6660839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6444 TAAACTTTGATTGGAACTGTAAGCCTAAGCCTAGAGATAAATATTTATCTCTCTCAGTCA 6503

  6660840 TTGTTTCTCTGTGACCAGCCATCCTGTTTCTTATTCCAACCAGTTAAAGTTGTCTCCTTT 6660899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6504 TTGTTTCTCTGTGACCAGCCATCCTGTTTCTTATTCCAACCAGTTAAAGTTGTCTCCTTT 6563

  6660900 CCCTTATTTTCTATGTCTTCATTATTCAGCTTGCCCATTCGTACATTTCATCTTTTCTAG 6660959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     6564 CCCTTATTTTCTATGTCTTCATTATTCAGCTTGCCCATTCATACATTTCATCTTTTCTAG 6623

  6660960 ATTATCTTTGTCCCCTTTCTACATCACACAATTTTTCTCTAACTGGTATTTTAATCTTAT 6661019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6624 ATTATCTTTGTCCCCTTTCTACATCACACAATTTTTCTCTAACTGGTATTTTAATCTTAT 6683

  6661020 ATAAAAAATAGGAATCTTGTCTCTGTGGGAGAAAGAAGAGCATGCTTCTCTTAGAACAGC 6661079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6684 ATAAAAAATAGGAATCTTGTCTCTGTGGGAGAAAGAAGAGCATGCTTCTCTTAGAACAGC 6743

  6661080 TCCTTTATTTGGGAGGACATGACTAATAAGACTGAGGAACTTGAGATTAGGGCTGCTGAG 6661139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6744 TCCTTTATTTGGGAGGACATGACTAATAAGACTGAGGAACTTGAGATTAGGGCTGCTGAG 6803

  6661140 CATCCATCACTCATTCATATTCCGTCTTTGTCTTGTTCTCTTGCTCTTCCTGTTTCTTAA 6661199
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6804 CATCCATCACTCATTCATATTCCGTCTTTGTCTTGTTCTCTTGCTCTTCCTGTTTCTTAA 6863

  6661200 TCATTTCAGTTTATAGAGAAAGAAACCTTGATTTTTAACACCAACTTATTCTGGTTTTGC 6661259
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6864 TCATTTCAGTTTATAGAGAAAGAAACCTTGATTTTTAACACCAACTTATTCTGGTTTTGC 6923

  6661260 TAGAATGACAGATTGTTCAACATTCTTTTTTTGATTTATGTGTATGTTTATCTACTACTT 6661319
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6924 TAGAATGACAGATTGTTCAACATTCTTTTTTTGATTTATGTGTATGTTTATCTACTACTT 6983

  6661320 TAAGATTCATGGGGTTGTTATTTTTCAACTGTGGGTGATTTTGGCCCCCCAGAAACATTT 6661379
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6984 TAAGATTCATGGGGTTGTTATTTTTCAACTGTGGGTGATTTTGGCCCCCCAGAAACATTT 7043

  6661380 GACAGTGTCTTGAAACATTTTTATTGTCAGCACAGGGACATGGGTGCTACTGGCATGTAG 6661439
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7044 GACAGTGTCTTGAAACATTTTTATTGTCAGCACAGGGACATGGGTGCTACTGGCATGTAG 7103

  6661440 AGTCCAGAAATGCTGGGAAACGTCCTACAATGCACACAACCTCCACATTAAAAAAATAAT 6661499
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7104 AGTCCAGAAATGCTGGGAAACGTCCTACAATGCACACAACCTCCACATTAAAAAAATAAT 7163

  6661500 AATAATAAAATAATTATCTGGCCCTAAATGTCAGTAGTACCAAAGTTGAGAATCTTTGCC 6661559
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7164 AATAATAAAATAATTATCTGGCCCTAAATGTCAGTAGTACCAAAGTTGAGAATCTTTGCC 7223

  6661560 ATAAGGGAAGTGAAGAGTTTGAGATGAATTATTTTATTTATACTCAGTAAGGTTTTGAGT 6661619
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7224 ATAAGGGAAGTGAAGAGTTTGAGATGAATTATTTTATTTATACTCAGTAAGGTTTTGAGT 7283

  6661620 TTTTGTTTCCTTTTCAAACTGTCTAATCTCTCAAATACACCCTTCCAGGTTCCCAGAACA 6661679
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7284 TTTTGTTTCCTTTTCAAACTGTCTAATCTCTCAAATACACCCTTCCAGGTTCCCAGAACA 7343

  6661680 AGGCATAATTGGTGAAGCTGATTTTGGGGCCAGGCTCCACAAAACATAGAATTCTACCAA 6661739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7344 AGGCATAATTGGTGAAGCTGATTTTGGGGCCAGGCTCCACAAAACATAGAATTCTACCAA 7403

  6661740 TGTTTGGATTCAAGTTCCTTAGTCTTGTCTAAGCAGGTGAATGGGAGAAAAATTAATATC 6661799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7404 TGTTTGGATTCAAGTTCCTTAGTCTTGTCTAAGCAGGTGAATGGGAGAAAAATTAATATC 7463

  6661800 TTTTCCTTACCCATTGCAAGTGTCATGGGTGACACCCCATAAGACAAGACTGATTAACAA 6661859
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7464 TTTTCCTTACCCATTGCAAGTGTCATGGGTGACACCCCATAAGACAAGACTGATTAACAA 7523

  6661860 GAGAAAAGCATAACAAATTTATTTAACAAAGTTTTAGATGGCATGGGACCCTTCAGAAAT 6661919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7524 GAGAAAAGCATAACAAATTTATTTAACAAAGTTTTAGATGGCATGGGACCCTTCAGAAAT 7583

  6661920 GAAGACCCAGAGACCCAGGGAAAACTGTATTTTTATGCTTAGGGTCAATGAAGAATGGAC 6661979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7584 GAAGACCCAGAGACCCAGGGAAAACTGTATTTTTATGCTTAGGGTCAATGAAGAATGGAC 7643

  6661980 AGTCATTGAGAAATGTGATTGAACAAAGAAAGGGGTATGATTTAATGGTAGTAAACTGGG 6662039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7644 AGTCATTGAGAAATGTGATTGAACAAAGAAAGGGGTATGATTTAATGGTAGTAAACTGGG 7703

  6662040 AGGAACTCAGCAAATCTTGTTTGTTCAGATTCTTCTTGGCCCTTCTGAACAACACTTAAT 6662099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7704 AGGAACTCAGCAAATCTTGTTTGTTCAGATTCTTCTTGGCCCTTCTGAACAACACTTAAT 7763

  6662100 CACCTCTAGGTATGGAGCAGGAAGCCTCTGGAATGAGGGTCTTATAATCTACGTTTGGGT 6662159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7764 CACCTCTAGGTATGGAGCAGGAAGCCTCTGGAATGAGGGTCTTATAATCTACGTTTGGGT 7823

  6662160 GAGGGAGGTCAGGTAATTCCTTTATGACCATGCTTCACACCAGAAAGCCAGGGGAAAGTC 6662219
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     7824 GAGGGAGGTCAGGTAATTCCTTTATGACCATGCTTCACACCAGAAAGCCAGGAGAAAGTC 7883

  6662220 ACAGTGAACTTCTGGCTTCTGTGGCTTTCTCAATTGCCCAAGGTGTCATATGTTGGATTA 6662279
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7884 ACAGTGAACTTCTGGCTTCTGTGGCTTTCTCAATTGCCCAAGGTGTCATATGTTGGATTA 7943

  6662280 TCATGTCCTGAGCCCTGACACAGACCGAGCCCTGACACAGATATGGTCCAATACAGCATC 6662339
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7944 TCATGTCCTGAGCCCTGACACAGACCGAGCCCTGACACAGATATGGTCCAATACAGCATC 8003

  6662340 AGCTGTGATACATGATATACATATCATGTGATAGATGTGATACATGA-----TATCCATA 6662394
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||||||
     8004 AGCTGTGATACATGATATACATATCATGTGATAGATGTGATACATGACATGATATCCATA 8063

  6662395 TCATGTGATAG 6662405
          |||||||||||
     8064 TCATGTGATAG 8074

EXCISED REGION

  6662423 ATGTGATACATGATATACAACATGGGCATGTTAACAATCATGTTTTTAAAAGGTGGTGGG 6662482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8075 ATGTGATACATGATATACAACATGGGCATGTTAACAATCATGTTTTTAAAAGGTGGTGGG 8134

  6662483 GAGAGTAATTTTTTTTTTAAAAAATGGATATCATTAGACAGAAATCATAAAATATCTATA 6662542
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8135 GAGAGTAATTTTTTTTTAAAAAAATGGATATCATTAGACAGAAATCATAAAATATCTATA 8194

  6662543 GAACAAAAAAAAGTATAATTACCTCAGTATTTACTACCTTTTTAT 6662587
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8195 GAACAAAAAAAAGTATAATTACCTCAGTATTTACTACCTTTTTAT 8239

Alignment time is 11.9981 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   4043] =>      4043 nucs 'mol-32-317a-121412_4043'

Score:        3909
Aligned:      4034        nucs
Identic:      4021 (100%) nucs =>      2530 (100%)      1491 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648423,6650959] EXCISED REGION [6650970,6652462]
 second seq =>  [      1,   2537] EXCISED REGION [   2548,   4043]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [2538,2547]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [2583,2585]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6648423 TTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGGTTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTG 6648482
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGATTATCTTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTG 60

  6648483 TGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTT 6648542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTT 120

  6648543 TCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAAT 6648602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAAT 180

  6648603 TAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTT 6648662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTT 240

  6648663 TCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGT 6648722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGT 300

  6648723 GTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTA 6648782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTA 360

  6648783 ATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTT 6648842
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATATAATTATTTATATATTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTT 420

  6648843 ATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 6648902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGC 480

  6648903 GTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCC 6648962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCC 540

  6648963 TCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTT 6649022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTT 600

  6649023 AGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGA 6649082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGA 660

  6649083 TCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCC 6649142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCC 720

  6649143 TATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTT 6649202
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATTATGCTTTTTTTTTTT-AATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTT 779

  6649203 AGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAG 6649262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 AGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAG 839

  6649263 AGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTG 6649322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 AGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTG 899

  6649323 AAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAA 6649382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAA 959

  6649383 TCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGT 6649442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGT 1019

  6649443 TTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGC 6649502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGC 1079

  6649503 CATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCT 6649562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 CATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCT 1139

  6649563 GGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCC 6649622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 GGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCC 1199

  6649623 ATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTAC 6649682
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1200 ATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTGGAAGCCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTAC 1259

  6649683 CCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCAC 6649742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1260 CCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCAC 1319

  6649743 AACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGT 6649802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGT 1379

  6649803 AAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATT 6649862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 AAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATT 1439

  6649863 CTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTA 6649922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 CTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTA 1499

  6649923 TTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGG 6649982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGG 1559

  6649983 TAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTG 6650042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 TAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTG 1619

  6650043 CAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCAC 6650102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCAC 1679

  6650103 TACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTT-GGTAGAAACAGGGTT 6650161
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     1680 TACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTT 1739

  6650162 TCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCA 6650221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCA 1799

  6650222 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAG 6650281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAG 1859

  6650282 ATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAAT 6650341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 ATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAAT 1919

  6650342 AGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCT 6650401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 AGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCT 1979

  6650402 CTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTT 6650461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 CTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTT 2039

  6650462 AAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATT 6650521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATT 2099

  6650522 TTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTC 6650581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTC 2159

  6650582 TTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTAC 6650641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTAC 2219

  6650642 TGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGG 6650701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGG 2279

  6650702 TGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACG 6650761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACG 2339

  6650762 TTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAG 6650821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 TTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAG 2399

  6650822 TGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTG 6650881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTG 2459

  6650882 TTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTC 6650941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2460 TTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTC 2519

  6650942 TCTGATCTCCCTTGCAGG 6650959
          ||||||||||||||||||
     2520 TCTGATCTCCCTTGCAGG 2537

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     2548 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 2607

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2608 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 2667

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2668 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 2727

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 2787

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 2847

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 2907

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 2967

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 3027

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 3087

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3088 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 3147

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 3207

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 3267

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 3327

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 3387

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 3447

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 3507

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 3567

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 3627

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 3687

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 3747

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 6652226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 3807

  6652227 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 6652286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 3867

  6652287 ATGTTTTATGTGCTACAATTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 6652346
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 ATGTTTTATGTGCTACAGTTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 3927

  6652347 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 6652406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 3987

  6652407 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAA 6652462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAA 4043

Alignment time is 5.72151 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   3205] =>      3205 nucs 'mol-32-317a-201833_3205'

Score:        3112
Aligned:      3195        nucs
Identic:      3185 (100%) nucs =>      1969 (100%)      1216 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648987,6650959] EXCISED REGION [6650970,6652186]
 second seq =>  [      1,   1975] EXCISED REGION [   1986,   3205]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [1976,1985]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [2021,2023]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6648987 ACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGT 6649046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGT 60

  6649047 TGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAG 6649106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAG 120

  6649107 TGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATT 6649166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATT 180

  6649167 TCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGT 6649226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGT 240

  6649227 ATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAA 6649286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAA 300

  6649287 GATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGG 6649346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGG 360

  6649347 GGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCAC 6649406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCAC 420

  6649407 ACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTG 6649466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTG 480

  6649467 ACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATA 6649526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATA 540

  6649527 CAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATT 6649586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATT 600

  6649587 GCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAAC 6649646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAAC 660

  6649647 TAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTG 6649706
          |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGAAGCCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTG 720

  6649707 ATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAG 6649766
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTTTAATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAG 780

  6649767 CAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGA 6649826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGA 840

  6649827 ACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTG 6649886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTG 900

  6649887 CTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTT 6649946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTT 960

  6649947 CCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACC 6650006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACC 1020

  6650007 CAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAG 6650066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAG 1080

  6650067 TGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTG 6650126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTG 1140

  6650127 GCTAATTTTTTTTTTTTTTT--GGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTC 6650184
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTC 1200

  6650185 TTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 6650244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 1260

  6650245 CGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGAT 6650304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGAT 1320

  6650305 TTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATG 6650364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATG 1380

  6650365 TTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTC 6650424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTC 1440

  6650425 TGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTT 6650484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTT 1500

  6650485 TTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCT 6650544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCT 1560

  6650545 GGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCT 6650604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCT 1620

  6650605 CCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAA 6650664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAA 1680

  6650665 GGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGG 6650724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGG 1740

  6650725 AGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTA 6650784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTA 1800

  6650785 CTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAAT 6650844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAAT 1860

  6650845 GCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCA 6650904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCA 1920

  6650905 TTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 6650959
          |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1921 TTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 1975

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     1986 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 2045

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 2105

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 2165

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 2225

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 2285

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 2345

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 2405

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2406 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 2465

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2466 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 2525

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2526 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 2585

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2586 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 2645

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2646 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 2705

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2706 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 2765

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2766 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 2825

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2826 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 2885

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2886 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 2945

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2946 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 3005

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3006 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 3065

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3066 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 3125

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3126 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 3185

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAG 6652186
          ||||||||||||||||||||
     3186 CAGTGAATTCTGCTAGCGAG 3205

Alignment time is 4.63276 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   4070] =>      4070 nucs 'mol-32-317a-268977_4070'

Score:        3968
Aligned:      4060        nucs
Identic:      4050 (100%) nucs =>      1020 (100%)      3030 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6649939,6650959] EXCISED REGION [6650970,6654004]
 second seq =>  [      1,   1022] EXCISED REGION [   1033,   4070]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [1023,1032]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [1068,1070]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6649939 TAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACT 6649998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACT 60

  6649999 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCA 6650058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCA 120

  6650059 GGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCAC 6650118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCAC 180

  6650119 CACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTT-GGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTG 6650177
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTG 240

  6650178 GATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGA 6650237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGA 300

  6650238 TTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTG 6650297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTG 360

  6650298 CTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTT 6650357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTT 420

  6650358 GTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTA 6650417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTA 480

  6650418 TCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGAT 6650477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGAT 540

  6650478 ATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTG 6650537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTG 600

  6650538 AGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGA 6650597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGA 660

  6650598 CACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAAT 6650657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAAT 720

  6650658 GAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGC 6650717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGC 780

  6650718 TGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAG 6650777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAG 840

  6650778 CTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTA 6650837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTA 900

  6650838 CCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCA 6650897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCA 960

  6650898 TGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCTCTGATCTCCCTTGCA 6650957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      961 TGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCTCTGATCTCCCTTGCA 1020

  6650958 GG 6650959
          ||
     1021 GG 1022

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     1033 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 1092

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1093 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 1152

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1153 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 1212

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1213 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 1272

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1273 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 1332

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1333 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 1392

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1393 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 1452

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1453 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 1512

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1513 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 1572

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1573 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 1632

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1633 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 1692

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1693 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 1752

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1753 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 1812

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1813 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 1872

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1873 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 1932

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1933 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAAGACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 1992

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1993 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 2052

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2053 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 2112

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2113 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 2172

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2173 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 2232

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 6652226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2233 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 2292

  6652227 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 6652286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2293 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 2352

  6652287 ATGTTTTATGTGCTACAATTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 6652346
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2353 ATGTTTTATGTGCTACAGTTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 2412

  6652347 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 6652406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2413 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 2472

  6652407 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 6652466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2473 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 2532

  6652467 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 6652526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2533 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 2592

  6652527 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 6652586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2593 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 2652

  6652587 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 6652646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2653 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 2712

  6652647 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 6652706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2713 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 2772

  6652707 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 6652766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2773 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 2832

  6652767 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 6652826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2833 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 2892

  6652827 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 6652886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2893 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 2952

  6652887 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 6652946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2953 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 3012

  6652947 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 6653006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3013 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 3072

  6653007 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 6653066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3073 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 3132

  6653067 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 6653126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3133 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 3192

  6653127 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 6653186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3193 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 3252

  6653187 GTGTATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 6653246
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3253 GTATATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 3312

  6653247 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCC 6653306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3313 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCC 3372

  6653307 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 6653366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3373 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 3432

  6653367 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 6653426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3433 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 3492

  6653427 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 6653486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3493 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 3552

  6653487 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 6653546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3553 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 3612

  6653547 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 6653606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3613 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 3672

  6653607 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 6653666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3673 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 3732

  6653667 TTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAA 6653726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3733 TTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAA 3792

  6653727 CTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAA 6653786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3793 CTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAA 3852

  6653787 TCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTC 6653846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3853 TCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTC 3912

  6653847 CTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAG 6653906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3913 CTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAG 3972

  6653907 GGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTA 6653966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3973 GGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTA 4032

  6653967 ACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATT 6654004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4033 ACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATT 4070

Alignment time is 5.59626 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   3159] =>      3159 nucs 'mol-32-3190-171191_3159'

Score:        3066
Aligned:      3149        nucs
Identic:      3139 (100%) nucs =>      1864 (100%)      1275 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6649092,6650959] EXCISED REGION [6650970,6652245]
 second seq =>  [      1,   1870] EXCISED REGION [   1881,   3159]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [1871,1880]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [1916,1918]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6649092 TTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCT 6649151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCT 60

  6649152 TTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCA 6649211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCA 120

  6649212 GTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGC 6649271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGC 180

  6649272 CTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTA 6649331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTA 240

  6649332 TCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTG 6649391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTG 300

  6649392 AGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCA 6649451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCA 360

  6649452 CAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGT 6649511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGT 420

  6649512 TTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAA 6649571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAA 480

  6649572 TGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCA 6649631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCA 540

  6649632 TTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCAT 6649691
          ||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTAGGAGAGGACAACTGGAAGCCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCAT 600

  6649692 CTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAG 6649751
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAG 660

  6649752 TATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGT 6649811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGT 720

  6649812 CCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCT 6649871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCT 780

  6649872 ATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTC 6649931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTC 840

  6649932 TCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAG 6649991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAG 900

  6649992 TCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCA 6650051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCA 960

  6650052 ACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGT 6650111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGT 1020

  6650112 GTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTT--GGTAGAAACAGGGTTTCATCTTG 6650169
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||
     1021 GTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTG 1080

  6650170 TTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAG 6650229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAG 1140

  6650230 TGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTT 6650289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTT 1200

  6650290 TTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAG 6650349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAG 1260

  6650350 GTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGA 6650409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGA 1320

  6650410 TACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAA 6650469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAA 1380

  6650470 TTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATT 6650529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATT 1440

  6650530 ATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTT 6650589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTT 1500

  6650590 CTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTAT 6650649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTAT 1560

  6650650 GGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTC 6650709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTC 1620

  6650710 CTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTG 6650769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTG 1680

  6650770 GAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTC 6650829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTC 1740

  6650830 TGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCAC 6650889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCAC 1800

  6650890 TGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCTCTGATCT 6650949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     1801 TGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCTCTGATCT 1860

  6650950 CCCTTGCAGG 6650959
          ||||||||||
     1861 CCCTTGCAGG 1870

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     1881 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 1940

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1941 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 2000

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 2060

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 2120

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 2180

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 2240

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 2300

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 2360

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 2420

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 2480

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 2540

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 2600

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 2660

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 2720

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 2780

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 2840

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 2900

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2901 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 2960

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 3020

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 3080

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 6652226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 3140

  6652227 AACAAATGTATTATTAGAA 6652245
          |||||||||||||||||||
     3141 AACAAATGTATTATTAGAA 3159

Alignment time is 4.78524 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2166] =>      2166 nucs 'mol-32-321f-010502_2166'

Score:        2095
Aligned:      2095        nucs
Identic:      2095 (100%) nucs =>      1182 (100%)       913 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648979,6650160] EXCISED REGION [6654638,6655550]
 second seq =>  [      1,   1182] EXCISED REGION [   1254,   2166]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [1183,1253]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1182,1182] to [1253,1253]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1182,1182] to [1254,1254]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648979 CTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTT 6649038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTT 60

  6649039 CTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCC 6649098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCC 120

  6649099 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTT 6649158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTT 180

  6649159 TTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTT 6649218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTT 240

  6649219 CTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGAT 6649278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGAT 300

  6649279 CTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGC 6649338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGC 360

  6649339 TTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTT 6649398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTT 420

  6649399 TGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTA 6649458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTA 480

  6649459 TCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTG 6649518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTG 540

  6649519 ACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCA 6649578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCA 600

  6649579 TATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAG 6649638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAG 660

  6649639 AGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCT 6649698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCT 720

  6649699 GTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACA 6649758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACA 780

  6649759 ACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGG 6649818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGG 840

  6649819 ACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCT 6649878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCT 900

  6649879 ACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTC 6649938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTC 960

  6649939 TAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACT 6649998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACT 1020

  6649999 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCA 6650058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCA 1080

  6650059 GGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCAC 6650118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCAC 1140

  6650119 CACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 1182

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 1313

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 1373

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 1433

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 1493

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 1553

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 1613

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 1673

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 1733

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 1793

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 1853

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 1913

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 1973

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 2033

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 2093

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 2153

  6655538 TTTAGTCTATTAG 6655550
          |||||||||||||
     2154 TTTAGTCTATTAG 2166

Alignment time is 3.51844 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2222] =>      2222 nucs 'mol-32-321f-086017_2222'

Score:        2140
Aligned:      2151        nucs
Identic:      2150 (100%) nucs =>       981 (100%)      1169 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6649180,6650160] EXCISED REGION [6654638,6655806]
 second seq =>  [      1,    981] EXCISED REGION [   1053,   2222]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [982,1052]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [981,981] to [1052,1052]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [981,981] to [1053,1053]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6649180 TTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAA 6649239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAA 60

  6649240 AAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGT 6649299
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGT 120

  6649300 GAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCA 6649359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCA 180

  6649360 CACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTA 6649419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTA 240

  6649420 ATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGT 6649479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGT 300

  6649480 CTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAA 6649539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAA 360

  6649540 CTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATT 6649599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATT 420

  6649600 CATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGG 6649659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGG 480

  6649660 TTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTA 6649719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTA 540

  6649720 TCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAG 6649779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAG 600

  6649780 TTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGT 6649839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGT 660

  6649840 ATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCAT 6649899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCAT 720

  6649900 CTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTT 6649959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTT 780

  6649960 CTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGC 6650019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGC 840

  6650020 AGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCC 6650079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCC 900

  6650080 TCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTT 6650139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTT 960

  6650140 TTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          |||||||||||||||||||||
      961 TTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 981

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1053 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 1112

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 1172

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 1232

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 1292

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 1352

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 1412

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 1472

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 1532

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 1592

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 1652

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 1712

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 1772

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 1832

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 1892

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 1952

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 2012

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 6655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 2072

  6655658 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 6655716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2073 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 2132

  6655717 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 6655776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 2192

  6655777 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTG 6655806
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTG 2222

Alignment time is 3.75526 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2983] =>      2983 nucs 'mol-32-322a-020798_2983'

Score:        2868
Aligned:      2901        nucs
Identic:      2898 (100%) nucs =>      1653 (100%)      1245 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648506,6650160] EXCISED REGION [6654638,6655882]
 second seq =>  [      1,   1654] EXCISED REGION [   1726,   2971]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [1655,1725]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1654,1654] to [1725,1725]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1654,1654] to [1726,1726]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648506 TAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTA 6648565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGAAATGTTAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTA 60

  6648566 TTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTC 6648625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGAATTCCTCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTC 120

  6648626 ATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGAT 6648685
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATCCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGAT 180

  6648686 ATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAAC 6648745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAAC 240

  6648746 TATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAG 6648805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAG 300

  6648806 ATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACA 6648865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACA 360

  6648866 GAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCT 6648925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCT 420

  6648926 CCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 6648985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGG 480

  6648986 CACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATG 6649045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATG 540

  6649046 TTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAA 6649105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAA 600

  6649106 GTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAAT 6649165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAAT 660

  6649166 TTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGG 6649225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGG 720

  6649226 TATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTA 6649285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTA 780

  6649286 AGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTG 6649345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTG 840

  6649346 GGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCA 6649405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCA 900

  6649406 CACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTT 6649465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTT 960

  6649466 GACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAAT 6649525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAAT 1020

  6649526 ACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATAT 6649585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATAT 1080

  6649586 TGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAA 6649645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAA 1140

  6649646 CTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCT 6649705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCT 1200

  6649706 GATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCA 6649765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCA 1260

  6649766 GCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAG 6649825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAG 1320

  6649826 AACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCT 6649885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCT 1380

  6649886 GCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATT 6649945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATT 1440

  6649946 TCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCAC 6650005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCAC 1500

  6650006 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAA 6650065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAA 1560

  6650066 GTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCT 6650125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCT 1620

  6650126 GGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          |||||||||||||||||||| ||||||||||||||
     1621 GGCTAATTTTTTTTTTTTTT-GGTAGAAACAGGGT 1654

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1726 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 1785

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1786 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 1845

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1846 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 1905

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1906 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 1965

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1966 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 2025

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2026 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 2085

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2086 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 2145

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2146 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 2205

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2206 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 2265

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2266 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 2325

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2326 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 2385

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2386 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 2445

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 2505

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2506 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 2565

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 2625

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2626 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 2685

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 6655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2686 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 2745

  6655658 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 6655716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2746 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 2805

  6655717 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 6655776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2806 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 2865

  6655777 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 6655836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2866 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 2925

  6655837 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 6655882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2926 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 2971

Alignment time is 4.64326 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   6314] =>      6314 nucs 'mol-32-322a-125787_6314'

Score:        6153
Aligned:      6249        nucs
Identic:      6237 (100%) nucs =>      1638 (100%)      4599 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648522,6650160] EXCISED REGION [6654638,6659246]
 second seq =>  [      1,   1638] EXCISED REGION [   1710,   6314]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [1639,1709]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1638,1638] to [1709,1709]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1638,1638] to [1710,1710]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648522 TTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTG 6648581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTG 60

  6648582 TTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGT 6648641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGT 120

  6648642 TTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCT 6648701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCT 180

  6648702 TTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTA 6648761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTA 240

  6648762 TATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATTT 6648821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATTT 300

  6648822 ATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTG 6648881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTG 360

  6648882 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCA 6648941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCA 420

  6648942 AGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCC 6649001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCC 480

  6649002 GGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCT 6649061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCT 540

  6649062 CGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 6649121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 600

  6649122 CGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTT 6649181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTT 660

  6649182 TCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAA 6649241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAA 720

  6649242 AAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGA 6649301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGA 780

  6649302 GCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACA 6649361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACA 840

  6649362 CCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAAT 6649421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAAT 900

  6649422 AATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCT 6649481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCT 960

  6649482 GAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACT 6649541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACT 1020

  6649542 AAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCA 6649601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCA 1080

  6649602 TGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTT 6649661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTT 1140

  6649662 TGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATC 6649721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATC 1200

  6649722 CTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTT 6649781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTT 1260

  6649782 TTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTAT 6649841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTAT 1320

  6649842 CACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCT 6649901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCT 1380

  6649902 ACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCT 6649961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCT 1440

  6649962 TTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAG 6650021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAG 1500

  6650022 TGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTC 6650081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTC 1560

  6650082 AGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTT 6650141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTT 1620

  6650142 TTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          |||| ||||||||||||||
     1621 TTTT-GGTAGAAACAGGGT 1638

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 1769

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 1829

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 1889

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1890 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 1949

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 2009

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 2069

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 2129

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 2189

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 2249

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 2309

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 2369

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 2429

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 2489

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 2549

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 2609

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 2669

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 6655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 2729

  6655658 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 6655716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2730 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 2789

  6655717 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 6655776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 2849

  6655777 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 6655836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 2909

  6655837 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 6655896
          |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC-----TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 2964

  6655897 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 6655956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 3024

  6655957 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 6656016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3025 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 3084

  6656017 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 6656076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3085 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 3144

  6656077 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 6656136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3145 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 3204

  6656137 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 6656196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3205 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 3264

  6656197 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 6656256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3265 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 3324

  6656257 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 6656316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3325 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 3384

  6656317 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 6656376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3385 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 3444

  6656377 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 6656436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3445 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 3504

  6656437 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 6656496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3505 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 3564

  6656497 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 6656556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3565 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 3624

  6656557 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 6656616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3625 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 3684

  6656617 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 6656676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3685 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 3744

  6656677 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 6656736
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3745 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 3804

  6656737 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 6656796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3805 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 3864

  6656797 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 6656856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3865 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 3924

  6656857 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCA 6656916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3925 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCA 3984

  6656917 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 6656976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3985 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 4044

  6656977 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 6657036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4045 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 4104

  6657037 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 6657096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4105 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 4164

  6657097 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 6657156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4165 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 4224

  6657157 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 6657216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4225 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 4284

  6657217 TGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 6657276
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4285 TGAGTAACATTAGCACGCTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 4344

  6657277 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 6657336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4345 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 4404

  6657337 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAT 6657396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4405 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAA 4464

  6657397 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 6657456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4465 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 4524

  6657457 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 6657516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4525 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 4584

  6657517 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 6657576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4585 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 4644

  6657577 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 6657636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4645 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 4704

  6657637 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 6657696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4705 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 4764

  6657697 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAA 6657756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4765 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAA 4824

  6657757 CCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCA 6657816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4825 CCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCA 4884

  6657817 GAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATA 6657876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4885 GAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATA 4944

  6657877 GGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTT 6657936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4945 GGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTT 5004

  6657937 TTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAA 6657996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5005 TTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAA 5064

  6657997 TAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACAT 6658056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5065 TAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACAT 5124

  6658057 AACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAA 6658116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5125 AACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAA 5184

  6658117 GCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGA 6658176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5185 GCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGA 5244

  6658177 CAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAAT 6658236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5245 CAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAAT 5304

  6658237 AGTTGATGCATAGAACGAACTATGAATGAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAG 6658296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5305 AGTTGATGCATAGAACGAACTATGAATGAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAG 5364

  6658297 GCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCT 6658356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5365 GCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCT 5424

  6658357 GTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGG 6658416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5425 GTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGG 5484

  6658417 ATATTTGAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGA 6658476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5485 ATATTTGAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGA 5544

  6658477 CTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAA 6658536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5545 CTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAA 5604

  6658537 TTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCT 6658596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5605 TTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCT 5664

  6658597 TTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACA 6658656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5665 TTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACA 5724

  6658657 GTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGA 6658716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5725 GTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGA 5784

  6658717 ATTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAAT 6658776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5785 ATTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAAT 5844

  6658777 TCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAG 6658836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5845 TCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAG 5904

  6658837 TCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATA 6658896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5905 TCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATA 5964

  6658897 ACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGA 6658956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5965 ACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGA 6024

  6658957 CCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATGTAAAATGTTTAGTCC 6659016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     6025 CCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATATAAAATGTTTAGTCC 6084

  6659017 AATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTT 6659076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6085 AATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTT 6144

  6659077 ACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGA 6659136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6145 ACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGA 6204

  6659137 TATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAG 6659196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6205 TATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAG 6264

  6659197 TGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAA 6659246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6265 TGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAA 6314

Alignment time is 9.28572 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2015] =>      2015 nucs 'mol-32-3240-119303_2015'

Score:        1933
Aligned:      1944        nucs
Identic:      1943 (100%) nucs =>      1752 (100%)       191 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648408,6650160] EXCISED REGION [6654638,6654828]
 second seq =>  [      1,   1753] EXCISED REGION [   1825,   2015]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [1754,1824]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1753,1753] to [1824,1824]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1753,1753] to [1825,1825]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648408 TCTCTGTCCAAATCCTTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGGTTATCTTGTTTTGTTACT 6648467
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
        1 TCTCTGTCCAAATCCTTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGATTATCTTGTTTTGTTACT 60

  6648468 GATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTA 6648527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGACATTTGTTA 120

  6648528 ATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTC 6648587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCATTGTTTTTC 180

  6648588 TGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTT 6648647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTT 240

  6648648 TGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATA 6648707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATA 300

  6648708 ACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTA 6648767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTA 360

  6648768 AACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTT 6648827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTT 420

  6648828 TGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGG 6648887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGG 480

  6648888 CTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGAT 6648947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGAT 540

  6648948 TCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTA 6649007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTA 600

  6649008 ATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATT 6649067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATT 660

  6649068 CCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTG 6649127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTG 720

  6649128 CCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGC 6649187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGC 780

  6649188 TATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTA 6649247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTA 840

  6649248 ACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTA 6649307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTA 900

  6649308 GGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAAT 6649367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAAT 960

  6649368 TGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTG 6649427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTG 1020

  6649428 AATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATT 6649487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATT 1080

  6649488 AGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCT 6649547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCT 1140

  6649548 CAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAG 6649607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAG 1200

  6649608 GAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAAC 6649667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAAC 1260

  6649668 CCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTC 6649727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTC 1320

  6649728 ACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAG 6649787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAG 1380

  6649788 CAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAG 6649847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAG 1440

  6649848 TGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAG 6649907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAG 1500

  6649908 ATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATT 6649967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATT 1560

  6649968 TTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGC 6650027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGC 1620

  6650028 GATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTC 6650087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTC 1680

  6650088 CTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTG 6650147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTG 1740

  6650148 GTAGAAACAGGGT 6650160
          |||||||||||||
     1741 GTAGAAACAGGGT 1753

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 1884

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 1944

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 2004

  6654818 CCCTTTTGGTA 6654828
          |||||||||||
     2005 CCCTTTTGGTA 2015

Alignment time is 3.2243 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   7680] =>      7680 nucs 'mol-32-3306-091521_7680'

Score:        7463
Aligned:      7614        nucs
Identic:      7597 (100%) nucs =>      1825 (100%)      5772 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648335,6650160] EXCISED REGION [6654638,6660424]
 second seq =>  [      1,   1826] EXCISED REGION [   1898,   7680]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [1827,1897]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1826,1826] to [1897,1897]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1826,1826] to [1898,1898]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648335 TAGTAGTTTGTGTCTTTTGAGAAACCTTTTCATCTAAGTTGTCAAATTTATGCATGTAAA 6648394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAGTAGTTTGTGTCTTTTGAGAAACCTTTTCATCTAAGTTGTCAAATTTATGCATGTAAA 60

  6648395 GTTGTTTATTAGTTCTCTGTCCAAATCCTTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGGTTATC 6648454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
       61 GTTGTTTATTAGTTCTCTGTCCAAATCCTTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGATTATC 120

  6648455 TTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGT 6648514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGT 180

  6648515 TAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCC 6648574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCC 240

  6648575 TCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTC 6648634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTC 300

  6648635 CTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTT 6648694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTT 360

  6648695 TCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTA 6648754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTA 420

  6648755 ATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTC 6648814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTC 480

  6648815 ATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGC 6648874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGC 540

  6648875 TCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCT 6648934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCT 600

  6648935 GGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCA 6648994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCA 660

  6648995 CCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGG 6649054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGG 720

  6649055 CTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 6649114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGA 780

  6649115 TTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTT 6649174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTT 840

  6649175 TTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTAT 6649234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTAT 900

  6649235 CGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGG 6649294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGG 960

  6649295 GAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTA 6649354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTA 1020

  6649355 GATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATA 6649414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATA 1080

  6649415 GTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCT 6649474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCT 1140

  6649475 GAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCT 6649534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCT 1200

  6649535 AGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAA 6649594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAA 1260

  6649595 TTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCC 6649654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCC 1320

  6649655 ACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAAT 6649714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAAT 1380

  6649715 TTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCT 6649774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCT 1440

  6649775 GTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTAT 6649834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTAT 1500

  6649835 TTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAG 6649894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAG 1560

  6649895 CCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGG 6649954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGG 1620

  6649955 CTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGG 6650014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGG 1680

  6650015 AGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTG 6650074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTG 1740

  6650075 CTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTT 6650134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTT 1800

  6650135 TTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          ||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 1826

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 1957

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 2017

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 2077

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 2137

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 2197

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 2257

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 2317

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 2377

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 2437

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 2497

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 2557

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 2617

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 2677

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 2737

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 2797

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 2857

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 6655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 2917

  6655658 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 6655716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2918 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 2977

  6655717 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 6655776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 3037

  6655777 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 6655836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 3097

  6655837 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 6655896
          |||||||||||||||||||||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC-----TTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 3152

  6655897 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 6655956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 3212

  6655957 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 6656016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 3272

  6656017 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 6656076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3273 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 3332

  6656077 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 6656136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 3392

  6656137 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 6656196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 3452

  6656197 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 6656256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 3512

  6656257 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 6656316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 3572

  6656317 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 6656376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 3632

  6656377 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 6656436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 3692

  6656437 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 6656496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 3752

  6656497 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 6656556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 3812

  6656557 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 6656616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 3872

  6656617 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 6656676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 3932

  6656677 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 6656736
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 3992

  6656737 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 6656796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 4052

  6656797 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 6656856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 4112

  6656857 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCA 6656916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4113 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCA 4172

  6656917 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 6656976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4173 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 4232

  6656977 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 6657036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4233 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 4292

  6657037 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 6657096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4293 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 4352

  6657097 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 6657156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4353 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 4412

  6657157 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 6657216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4413 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 4472

  6657217 TGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 6657276
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 TGAGTAACATTAGCACGCTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 4532

  6657277 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 6657336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4533 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 4592

  6657337 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAT 6657396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4593 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAA 4652

  6657397 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 6657456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4653 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 4712

  6657457 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 6657516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4713 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 4772

  6657517 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 6657576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4773 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 4832

  6657577 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 6657636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4833 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 4892

  6657637 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 6657696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4893 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 4952

  6657697 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAA 6657756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4953 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAA 5012

  6657757 CCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCA 6657816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5013 CCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCA 5072

  6657817 GAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATA 6657876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5073 GAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATA 5132

  6657877 GGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTT 6657936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5133 GGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTT 5192

  6657937 TTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAA 6657996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5193 TTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAA 5252

  6657997 TAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACAT 6658056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5253 TAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACAT 5312

  6658057 AACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAA 6658116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5313 AACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAA 5372

  6658117 GCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGA 6658176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5373 GCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGA 5432

  6658177 CAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAAT 6658236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5433 CAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAAT 5492

  6658237 AGTTGATGCATAGAACGAACTATGAATGAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAG 6658296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5493 AGTTGATGCATAGAACGAACTATGAATGAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAG 5552

  6658297 GCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCT 6658356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5553 GCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCT 5612

  6658357 GTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGG 6658416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5613 GTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGG 5672

  6658417 ATATTTGAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGA 6658476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5673 ATATTTGAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGA 5732

  6658477 CTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAA 6658536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5733 CTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAA 5792

  6658537 TTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCT 6658596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5793 TTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCT 5852

  6658597 TTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACA 6658656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5853 TTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACA 5912

  6658657 GTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGA 6658716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5913 GTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGA 5972

  6658717 ATTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAAT 6658776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5973 ATTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAAT 6032

  6658777 TCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAG 6658836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6033 TCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAG 6092

  6658837 TCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATA 6658896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6093 TCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATA 6152

  6658897 ACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGA 6658956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6153 ACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGA 6212

  6658957 CCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATGTAAAATGTTTAGTCC 6659016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     6213 CCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATATAAAATGTTTAGTCC 6272

  6659017 AATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTT 6659076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6273 AATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTT 6332

  6659077 ACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGA 6659136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6333 ACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGA 6392

  6659137 TATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAG 6659196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6393 TATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAG 6452

  6659197 TGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGC 6659256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6453 TGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGC 6512

  6659257 TTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTGCCCTTGAGCAATGTTTTCTGGG 6659316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6513 TTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTGCCCTTGAGCAATGTTTTCTGGG 6572

  6659317 ATTTATTTGTTCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGTTATATATATTTAATGTTCAACA 6659376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6573 ATTTATTTGTTCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGTTATATATATTTAATGTTCAACA 6632

  6659377 AGTCTTTAAACACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTTCATTTACTCCCAATTTACAGTA 6659436
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6633 AGTCATTAAACACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTTCATTTACTCCCAATTTACAGTA 6692

  6659437 GTGATTTAAAACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATTCATTGTTGAAGGAGTGTGATGG 6659496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6693 GTGATTTAAAACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATTCATTGTTGAAGGAGTGTGATGG 6752

  6659497 CAAACTATGAAGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAACAATTGTAGTAAAGTCATGAAA 6659556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6753 CAAACTATGAAGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAACAATTGTAGTAAAGTCATGAAA 6812

  6659557 GGTGAATGAAACAATGTAAATATATATATAGTGAGAATGGTACAGGTTGAGCATCCCTTT 6659616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6813 GGTGAATGAAACAATGTAAATATATATATAGTGAGAATGGTACAGGTTGAGCATCCCTTT 6872

  6659617 TCCAAAATGATTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGAATTTTTCAGATTTTGGAATATT 6659676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6873 TCCAAAATGATTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGAATTTTTCAGATTTTGGAATATT 6932

  6659677 TGTTTACATAAGGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAGTCTAAATACATTTATTTGTGTT 6659736
          |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     6933 TGTTTACATAATGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAGTCTAAATACATTTATTTATGTT 6992

  6659737 TTGTTTACACTTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTTATATAATGTTTTAGTAGCTGTG 6659796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6993 TTGTTTACACTTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTTATATAATGTTTTAGTAGCTGTG 7052

  6659797 GGGCATCGTGAAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCTGGACACATGCCATTTTATTACA 6659856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7053 GGGCATCGTGAAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCTGGACACATGCCATTTTATTACA 7112

  6659857 CTCTGCATGTGCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGTGAAAAAGATATATCATAGCTGA 6659916
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     7113 CTCTGGATGTGCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGTGAAAAAGATACATCATAGCTGA 7172

  6659917 AGGGGCCTGGGAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTGAATAAACTGTGTATTGTTCATC 6659976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7173 AGGGGCCTGGGAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTGAATAAACTGTGTATTGTTCATC 7232

  6659977 TGTGATTTGACTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGATGTGGAATTTTCCATTTGTGAC 6660036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7233 TGTGATTTGACTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGATGTGGAATTTTCCATTTGTGAC 7292

  6660037 ATCATGTTGACAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACATCAGATTAGGGAGACTCAGTCT 6660096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7293 ATCATGTTGACAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACATCAGATTAGGGAGACTCAGTCT 7352

  6660097 ATACATTGTGTAATTTTCAGGGGACCAGAGGAATTGAACTTAGTTTAGTTTGTCATATCA 6660156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7353 ATACATTGTGTAATTTTCAGGGGACCAGAGGAATTGAACTTAGTTTAGTTTGTCATATCA 7412

  6660157 GTGGGATTTTCCATGGTGACAAGTGGTAATTATTCTAAGATTATAAACCTTAATACACCT 6660216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7413 GTGGGATTTTCCATGGTGACAAGTGGTAATTATTCTAAGATTATAAACCTTAATACACCT 7472

  6660217 GTTTGTTGTTGTTGTATTTTTATTTTTTACAATTATAAATCTTGAGTATAGTTAAAATTT 6660276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7473 GTTTGTTGTTGTTGTATTTTTATTTTTTACAATTATAAATCTTGAGTATAGTTAAAATTT 7532

  6660277 AGAAAATTTTTTTCAAAGTACTGTGTGGAATCGAAAGATATCTAAGACAATAGTCTTTCA 6660336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7533 AGAAAATTTTTTTCAAAGTACTGTGTGGAATCGAAAGATATCTAAGACAATAGTCTTTCA 7592

  6660337 AAGGTGCAGAAAGTAGATTCAATCTATGCAGAGAAAAGCAGATTTCAAAAAATATAACAG 6660396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7593 AAGGTGCAGAAAGTAGATTCAATCTATGCAGAGAAAAGCAGATTTCAAAAAATATAACAG 7652

  6660397 AAGAAAAACAGTTGGCTGAACTTACTAT 6660424
          ||||||||||||||||||||||||||||
     7653 AAGAAAAACAGTTGGCTGAACTTACTAT 7680

Alignment time is 11.1299 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   6715] =>      6715 nucs 'mol-32-3311-097638_6715'

Score:        6549
Aligned:      6714        nucs
Identic:      6699 (100%) nucs =>       339 (100%)      6360 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6653376,6653714] EXCISED REGION [6653716,6660089]
 second seq =>  [      1,    339] EXCISED REGION [    341,   6715]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6653715,6653715]
 second seq =>         1 nucs [340,340]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2319,2319]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6653376 TGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAG 6653435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAG 60

  6653436 ACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAA 6653495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAA 120

  6653496 TTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACAT 6653555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACAT 180

  6653556 ATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATG 6653615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATG 240

  6653616 AAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACT 6653675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACT 300

  6653676 CACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAA 6653714
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAA 339

EXCISED REGION

  6653716 GTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTT 6653775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      341 GTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTT 400

  6653776 TTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGAC 6653835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      401 TTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGAC 460

  6653836 CATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAAC 6653895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      461 CATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAAC 520

  6653896 ACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAA 6653955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      521 ACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAA 580

  6653956 ACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAAT 6654015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      581 ACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAAT 640

  6654016 GCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCA 6654075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 GCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCA 700

  6654076 GTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTG 6654135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 GTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTG 760

  6654136 TTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCA 6654195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 TTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCA 820

  6654196 TATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTAC 6654255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 TATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTAC 880

  6654256 CCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAA 6654315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      881 CCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAA 940

  6654316 ATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGT 6654375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 ATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGT 1000

  6654376 ACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAAT 6654435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 ACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAAT 1060

  6654436 ACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGG 6654495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 ACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGG 1120

  6654496 TTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTC 6654555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 TTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTC 1180

  6654556 AGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGAT 6654615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 AGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGAT 1240

  6654616 GATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGG 6654675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 GATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGG 1300

  6654676 AACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGAT 6654735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 AACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGAT 1360

  6654736 CACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTAT 6654795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 CACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTAT 1420

  6654796 TATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTG 6654855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 TATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTG 1480

  6654856 CATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGT 6654915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 CATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGT 1540

  6654916 ATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTG 6654975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 ATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTG 1600

  6654976 TCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGC 6655035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 TCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGC 1660

  6655036 TCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTA 6655095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 TCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTA 1720

  6655096 TTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTG 6655155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 TTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTG 1780

  6655156 AGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACC 6655215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 AGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACC 1840

  6655216 CTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGA 6655275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 CTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGA 1900

  6655276 CTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCAT 6655335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 CTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCAT 1960

  6655336 AAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAA 6655395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 AAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAA 2020

  6655396 GGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAG 6655455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 GGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAG 2080

  6655456 GGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAG 6655515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 GGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAG 2140

  6655516 ACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCA 6655575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 ACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCA 2200

  6655576 ATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATT 6655635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 ATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATT 2260

  6655636 ATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-T 6655694
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
     2261 ATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGT 2320

  6655695 ATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTC 6655754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2321 ATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTTAGAGGTC 2380

  6655755 AAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTAT 6655814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 AAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTAT 2440

  6655815 GAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTT 6655874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 GAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTT 2500

  6655875 TTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTG 6655934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2501 TTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAATGGTGCAATCTTG 2560

  6655935 ACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGA 6655994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 ACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGA 2620

  6655995 GCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACG 6656054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 GCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACG 2680

  6656055 GGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTC 6656114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 GGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTC 2740

  6656115 GGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGAC 6656174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     2741 GGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGGC 2800

  6656175 TTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCC 6656234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 TTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCC 2860

  6656235 ATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCC 6656294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 ATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCC 2920

  6656295 CTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATG 6656354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 CTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATG 2980

  6656355 ACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTT 6656414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 ACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTT 3040

  6656415 TTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGA 6656474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 TTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGA 3100

  6656475 GCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAA 6656534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 GCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAA 3160

  6656535 CCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTC 6656594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 CCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTC 3220

  6656595 TTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATAC 6656654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 TTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATAC 3280

  6656655 GTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAA 6656714
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3281 GTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAA 3340

  6656715 ACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAA 6656774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 ACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAA 3400

  6656775 AAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACA 6656834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 AAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACA 3460

  6656835 GACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTT 6656894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 GACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTT 3520

  6656895 CCTTAATGTGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTG 6656954
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 CCTTAATGGGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTG 3580

  6656955 ATGGTAAAACACCTCATCATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCA 6657014
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 ATGGTAAAACACCTCATTATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCA 3640

  6657015 CCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTT 6657074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 CCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTT 3700

  6657075 GCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTT 6657134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 GCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTT 3760

  6657135 GCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAA 6657194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 GCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAA 3820

  6657195 AACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAAC 6657254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3821 AACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAAC 3880

  6657255 AAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAAT 6657314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 AAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAAT 3940

  6657315 TCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTG 6657374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3941 TCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTG 4000

  6657375 CCAGAAGTTAGACTTTTATTATCATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCC 6657434
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4001 CCAGAAGTTAGACTTTTATTAACATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCC 4060

  6657435 CAAATTACAATTTTATTTTAGGGAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATAT 6657494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4061 CAAATTACAATTTTATTTTAGGGAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATAT 4120

  6657495 TGTTTTCAAATTAGCTTTTATTGTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAA 6657554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4121 TGTTTTCAAATTAGCTTTTATTGTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAA 4180

  6657555 GTTTTACTCCAAAAGGAAGAAAAATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAAT 6657614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4181 GTTTTACTCCAAAAGGAAGAAAAATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAAT 4240

  6657615 ATAGAAAAATGACTTACAGCATAATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAG 6657674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4241 ATAGAAAAATGACTTACAGCATAATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAG 4300

  6657675 AGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTCTGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCA 6657734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4301 AGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTCTGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCA 4360

  6657735 GCATTAGGAATTTTTATAACAACCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAA 6657794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4361 GCATTAGGAATTTTTATAACAACCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAA 4420

  6657795 TATTGTCATCTGCTATGGTCCAGAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAA 6657854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4421 TATTGTCATCTGCTATGGTCCAGAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAA 4480

  6657855 ACATTGAATTTTAAAAGACATAGGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAA 6657914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4481 ACATTGAATTTTAAAAGACATAGGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAA 4540

  6657915 ACATTATCTTAAATATTTCGTTTTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAA 6657974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4541 ACATTATCTTAAATATTTCGTTTTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAA 4600

  6657975 AAAGAGGTATATGCCTATTAAATAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGA 6658034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 AAAGAGGTATATGCCTATTAAATAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGA 4660

  6658035 TTCTTTAACTGTATTTGAACATAACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGA 6658094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4661 TTCTTTAACTGTATTTGAACATAACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGA 4720

  6658095 GATTCTTCTTACTTTGTGCCAAGCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTT 6658154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 GATTCTTCTTACTTTGTGCCAAGCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTT 4780

  6658155 AATTATGAAAATGATAAAATGACAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATG 6658214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4781 AATTATGAAAATGATAAAATGACAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATG 4840

  6658215 AGGGCACAGTTTTCCCGTGAATAGTTGATGCATAGAACGAACTATGAATGAACACTTGCT 6658274
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     4841 AGGGCACAGTTTTCCCGTGAATAGTTGATGCATAGAACGAACTATGAATCAACACTTGCT 4900

  6658275 CAATGTATTTCAAGGAACTAAGGCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGG 6658334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4901 CAATGTATTTCAAGGAACTAAGGCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGG 4960

  6658335 TAAAGAAATCAGGAAAATTTCTGTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACAT 6658394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4961 TAAAGAAATCAGGAAAATTTCTGTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACAT 5020

  6658395 TTTGTTGTAGAGAAAAGACTGGATATTTGAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATT 6658454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5021 TTTGTTGTAGAGAAAAGACTGGATATTTGAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATT 5080

  6658455 TCAGCTCACACAAGCTATGTGACTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTT 6658514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5081 TCAGCTCACACAAGCTATGTGACTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTT 5140

  6658515 CTCAATTTAAATGAGGTAATAATTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTT 6658574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5141 CTCAATTTAAATGAGGTAATAATTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTT 5200

  6658575 TCTGACGATTCCATGCATGCCTTTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATT 6658634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5201 TCTGACGATTCCATGCATGCCTTTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATT 5260

  6658635 TCCTGGCTCACTTGCAGCTACAGTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTAC 6658694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5261 TCCTGGCTCACTTGCAGCTACAGTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTAC 5320

  6658695 TCCTTGGAGTCTCAGATTTGGAATTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACA 6658754
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5321 TCCTTGGAGTCTCAGATTTGGAACTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACA 5380

  6658755 AGTGGATCAACGGCCGAGCAATTCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGC 6658814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5381 AGTGGATCAACGGCCGAGCAATTCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGC 5440

  6658815 CCAGGTATGGCCCCAGCCTGAGTCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGC 6658874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5441 CCAGGTATGGCCCCAGCCTGAGTCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGC 5500

  6658875 TTTTCTTATTTAGGTATTTATAACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAA 6658934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5501 TTTTCTTATTTAGGTATTTATAACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAA 5560

  6658935 ACAAGACAGCATTTAACTCTGACCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAG 6658994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5561 ACAAGACAGCATTTAACTCTGACCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAG 5620

  6658995 TTACATGTAAAATGTTTAGTCCAATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCT 6659054
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5621 TTACATATAAAATGTTTAGTCCAATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCT 5680

  6659055 CCTTTTCCCCTTATGATAGTTTACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGA 6659114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5681 CCTTTTCCCCTTATGATAGTTTACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGA 5740

  6659115 TAGAAAAATTAAATCATTTTGATATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTA 6659174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5741 TAGAAAAATTAAATCATTTTGATATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTA 5800

  6659175 ATACAGAAAGACATAGAGATAGTGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATA 6659234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5801 ATACAGAAAGACATAGAGATAGTGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATA 5860

  6659235 TTTAGAGCAAAATGATCTAAGCTTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTG 6659294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5861 TTTAGAGCAAAATGATCTAAGCTTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTG 5920

  6659295 CCCTTGAGCAATGTTTTCTGGGATTTATTTGTTCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGT 6659354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5921 CCCTTGAGCAATGTTTTCTGGGATTTATTTGTTCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGT 5980

  6659355 TATATATATTTAATGTTCAACAAGTCTTTAAACACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTT 6659414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5981 TATATATATTTAATGTTCAACAAGTCTTTAAACACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTT 6040

  6659415 CATTTACTCCCAATTTACAGTAGTGATTTAAAACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATT 6659474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6041 CATTTACTCCCAATTTACAGTAGTGATTTAAAACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATT 6100

  6659475 CATTGTTGAAGGAGTGTGATGGCAAACTATGAAGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAA 6659534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6101 CATTGTTGAAGGAGTGTGATGGCAAACTATGAAGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAA 6160

  6659535 CAATTGTAGTAAAGTCATGAAAGGTGAATGAAACAATGTAAATATATATATAGTGAGAAT 6659594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6161 CAATTGTAGTAAAGTCATGAAAGGTGAATGAAACAATGTAAATATATATATAGTGAGAAT 6220

  6659595 GGTACAGGTTGAGCATCCCTTTTCCAAAATGATTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGA 6659654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6221 GGTACAGGTTGAGCATCCCTTTTCCAAAATGATTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGA 6280

  6659655 ATTTTTCAGATTTTGGAATATTTGTTTACATAAGGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAG 6659714
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     6281 ATTTTTCAGATTTTGGAATATTTGTTTACATAATGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAG 6340

  6659715 TCTAAATACATTTATTTGTGTTTTGTTTACACTTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTT 6659774
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6341 TCTAAATACATTTATTTATGTTTTGTTTACACTTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTT 6400

  6659775 ATATAATGTTTTAGTAGCTGTGGGGCATCGTGAAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCT 6659834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6401 ATATAATGTTTTAGTAGCTGTGGGGCATCGTGAAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCT 6460

  6659835 GGACACATGCCATTTTATTACACTCTGCATGTGCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGT 6659894
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     6461 GGACACATGCCATTTTATTACACTCTGGATGTGCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGT 6520

  6659895 GAAAAAGATATATCATAGCTGAAGGGGCCTGGGAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTG 6659954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6521 GAAAAAGATATATCATAGCTGAAGGGGCCTGGGAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTG 6580

  6659955 AATAAACTGTGTATTGTTCATCTGTGATTTGACTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGA 6660014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6581 AATAAACTGTGTATTGTTCATCTGTGATTTGACTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGA 6640

  6660015 TGTGGAATTTTCCATTTGTGACATCATGTTGACAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACA 6660074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6641 TGTGGAATTTTCCATTTGTGACATCATGTTGACAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACA 6700

  6660075 TCAGATTAGGGAGAC 6660089
          |||||||||||||||
     6701 TCAGATTAGGGAGAC 6715

Alignment time is 9.2595 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,  13075] =>     13075 nucs 'mol-32-3311-135711_13075'

Score:       12712
Aligned:     13078        nucs
Identic:     13039 (100%) nucs =>     11336 (100%)      1703 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6651044,6662405] EXCISED REGION [6662423,6664129]
 second seq =>  [      1,  11367] EXCISED REGION [  11368,  13075]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        17 nucs [6662406,6662422]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        16 nucs [6662406,6662421] to [6662423,6662438]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6651044 TGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCTAAAGTTTCCTGTCTTCT 6651103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCTAAAGTTTCCTGTCTTCT 60

  6651104 TTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGATATTTTTTTGTTTTGTTT 6651163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGATATTTTTTTGTTTTGTTT 120

  6651164 TGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCACCAGGAATGTCACTACC 6651223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCACCAGGAATGTCACTACC 180

  6651224 TTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTTCAGAGTCTTCTTATTTT 6651283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTTCAGAGTCTTCTTATTTT 240

  6651284 TGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAAGAGAAATAAGGAAAATA 6651343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAAGAGAAATAAGGAAAATA 300

  6651344 TATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTTATTTTTAAATGCCTTCC 6651403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTTATTTTTAAATGCCTTCC 360

  6651404 CTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGTAGAGAGTTTTTTGAGTG 6651463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGTAGAGAGTTTTTTGAGTG 420

  6651464 CCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAAGAGGAAATGGATGGACA 6651523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAAGAGGAAATGGATGGACA 480

  6651524 GCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGTTCCAAGAGAGCAGAAAA 6651583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGTTCCAAGAGAGCAGAAAA 540

  6651584 ATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAGCTCCTGGCATGTGGTAG 6651643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAGCTCCTGGCATGTGGTAG 600

  6651644 AAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAATCTCTAAAGACAGAAAAT 6651703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAATCTCTAAAGACAGAAAAT 660

  6651704 GACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAACATTGTCCTATGGTACC 6651763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAACATTGTCCTATGGTACC 720

  6651764 TCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAATTGCCTTTAATGGGTAGA 6651823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAATTGCCTTTAATGGGTAGA 780

  6651824 CTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAACCCATTTCTTCTGTTCTG 6651883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAACCCATTTCTTCTGTTCTG 840

  6651884 AGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCATCGCATGATCTGCTCCA 6651943
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      841 AGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCATCACATGATCTGCTCCA 900

  6651944 CTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTGCAGCGTTTATCACTTCA 6652003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTGCAGCGTTTATCACTTCA 960

  6652004 TTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGAAGAGTAATTGGACATGA 6652063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGAAGAGTAATTGGACATGA 1020

  6652064 TAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACCCATGGAGATTTTTCACA 6652123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACCCATGGAGATTTTTCACA 1080

  6652124 CAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCACAGTGAATTCTGCTAGC 6652183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCACAGTGAATTCTGCTAGC 1140

  6652184 GAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAAAACAAATGTATTATTAG 6652243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAAAACAAATGTATTATTAG 1200

  6652244 AAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTGATGTTTTATGTGCTACA 6652303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTGATGTTTTATGTGCTACA 1260

  6652304 ATTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGATAAATTGGTTATTTCTG 6652363
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GTTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGATAAATTGGTTATTTCTG 1320

  6652364 TTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACACTTATTTGCTTGTTTCC 6652423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACACTTATTTGCTTGTTTCC 1380

  6652424 CATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATATTTCCCATCTTCATCAGG 6652483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATATTTCCCATCTTCATCAGG 1440

  6652484 GTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATGAGCTGTAAATTCTGAAG 6652543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATGAGCTGTAAATTCTGAAG 1500

  6652544 CACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCAGGAGCAGAGTTTCTATC 6652603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCAGGAGCAGAGTTTCTATC 1560

  6652604 TGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCATCCATTTAGTTCTCAACA 6652663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCATCCATTTAGTTCTCAACA 1620

  6652664 AGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGAAGAAAAATGAACATTTT 6652723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGAAGAAAAATGAACATTTT 1680

  6652724 GCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAATTTTGTTCTTAGAAACT 6652783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAATTTTGTTCTTAGAAACT 1740

  6652784 GCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACACAATAACAATTGCATTG 6652843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACACAATAACAATTGCATTG 1800

  6652844 CAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTTAC 6652903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTTAC 1860

  6652904 AGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGATC 6652963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGATC 1920

  6652964 AATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAG 6653023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAG 1980

  6653024 AGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAA 6653083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAA 2040

  6653084 TCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCT 6653143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCT 2100

  6653144 TGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGTGTATCAGATTCTTGA 6653203
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2101 TGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGTATATCAGATTCTTGA 2160

  6653204 AGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTT 6653263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTT 2220

  6653264 CCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATAACATACAAAAGTGC 6653323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATAACATACAAAAGTGC 2280

  6653324 CCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAG 6653383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAG 2340

  6653384 ATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCC 6653443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCC 2400

  6653444 CCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGT 6653503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGT 2460

  6653504 GCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATT 6653563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATT 2520

  6653564 GAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTAC 6653623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTAC 2580

  6653624 ATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGT 6653683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGT 2640

  6653684 TAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCT 6653743
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCT 2700

  6653744 CTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGT 6653803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 CTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGT 2760

  6653804 GTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATA 6653863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATA 2820

  6653864 TTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAG 6653923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAG 2880

  6653924 GGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATC 6653983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATC 2940

  6653984 ATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATT 6654043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATT 3000

  6654044 AAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGT 6654103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGT 3060

  6654104 TAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTT 6654163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTT 3120

  6654164 TGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAA 6654223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAA 3180

  6654224 TAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGAT 6654283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGAT 3240

  6654284 GGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTAT 6654343
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTAT 3300

  6654344 GCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAA 6654403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 GCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAA 3360

  6654404 TGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTC 6654463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTC 3420

  6654464 AATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCAC 6654523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCAC 3480

  6654524 TTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGT 6654583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGT 3540

  6654584 GATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTG 6654643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTG 3600

  6654644 ATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCAC 6654703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCAC 3660

  6654704 AACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGT 6654763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGT 3720

  6654764 TGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTT 6654823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTT 3780

  6654824 TGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTA 6654883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTA 3840

  6654884 AGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAAT 6654943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAAT 3900

  6654944 AACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAAC 6655003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAAC 3960

  6655004 ATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTT 6655063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTT 4020

  6655064 CAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAA 6655123
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CAATGCCAACTGTAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAA 4080

  6655124 AGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATG 6655183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATG 4140

  6655184 AAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCC 6655243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCC 4200

  6655244 ATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGA 6655303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 ATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGA 4260

  6655304 AACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCT 6655363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCT 4320

  6655364 CCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCC 6655423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCC 4380

  6655424 TGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAA 6655483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAA 4440

  6655484 ATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGT 6655543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGT 4500

  6655544 CTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACT 6655603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACT 4560

  6655604 TGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTG 6655663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTG 4620

  6655664 AAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTT 6655722
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTT 4680

  6655723 TGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACA 6655782
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTTAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACA 4740

  6655783 AGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGAT 6655842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGAT 4800

  6655843 GAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTG 6655902
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
     4801 GAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT--GAGAAGGAATCTTGCTCTG 4858

  6655903 TTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTT 6655962
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 TTGCCAGGCTGGAGTACAATGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTT 4918

  6655963 CAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAG 6656022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 CAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAG 4978

  6656023 CCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTC 6656082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 CCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTC 5038

  6656083 TCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGC 6656142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 TCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGC 5098

  6656143 ATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTA 6656202
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     5099 ATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGGCTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTA 5158

  6656203 GGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCA 6656262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 GGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCA 5218

  6656263 ATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGA 6656322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 ATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGA 5278

  6656323 AGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAA 6656382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5279 AGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAA 5338

  6656383 TAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATA 6656442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 TAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATA 5398

  6656443 ATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTA 6656502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 ATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTA 5458

  6656503 TCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACT 6656562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 TCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACT 5518

  6656563 TAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAA 6656622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 TAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAA 5578

  6656623 AAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACA 6656682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 AAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACA 5638

  6656683 GTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCAT 6656742
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 GTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCAT 5698

  6656743 TCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAG 6656802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 TCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAG 5758

  6656803 AGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGC 6656862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 AGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGC 5818

  6656863 TTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCAGAGGTG 6656922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     5819 TTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCAGAGGTG 5878

  6656923 TTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCCTTATGG 6656982
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     5879 TTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATTATCCTTATGG 5938

  6656983 AGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATT 6657042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 AGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATT 5998

  6657043 TCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCA 6657102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 TCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCA 6058

  6657103 TGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAA 6657162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 TGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAA 6118

  6657163 TAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTA 6657222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 TAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTA 6178

  6657223 ACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATG 6657282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 ACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATG 6238

  6657283 GCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGA 6657342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 GCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGA 6298

  6657343 ATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTATCATGGC 6657402
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     6299 ATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAACATGGC 6358

  6657403 ATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGGGAACCC 6657462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 ATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGGGAACCC 6418

  6657463 TTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATTGTTTTA 6657522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 TTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATTGTTTTA 6478

  6657523 CTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAAAATAAA 6657582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 CTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAAAATAAA 6538

  6657583 AAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCATAATTTA 6657642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 AAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCATAATTTA 6598

  6657643 AAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTCTGTTAC 6657702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 AAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTCTGTTAC 6658

  6657703 CTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAACCTGAT 6657762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 CTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAACCTGAT 6718

  6657763 ATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCAGAGAGG 6657822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 ATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCAGAGAGG 6778

  6657823 AAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATAGGTCTT 6657882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 AAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATAGGTCTT 6838

  6657883 ACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTTTTTATT 6657942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 ACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTTTTTATT 6898

  6657943 ATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAATAGTCC 6658002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6899 ATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAATAGTCC 6958

  6658003 AGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACATAACCTT 6658062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6959 AGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACATAACCTT 7018

  6658063 TCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAAGCATTG 6658122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7019 TCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAAGCATTG 7078

  6658123 GACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGACAGCAT 6658182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7079 GACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGACAGCAT 7138

  6658183 GGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAATAGTTGA 6658242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7139 GGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAATAGTTGA 7198

  6658243 TGCATAGAACGAACTATGAATGAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAGGCAGAA 6658302
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7199 TGCATAGAACGAACTATGAATCAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAGGCAGAA 7258

  6658303 AAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCTGTGGTT 6658362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7259 AAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCTGTGGTT 7318

  6658363 TGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGGATATTT 6658422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7319 TGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGGATATTT 7378

  6658423 GAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGACTTAAT 6658482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7379 GAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGACTTAAT 7438

  6658483 TCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAATTGTGG 6658542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7439 TCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAATTGTGG 7498

  6658543 AGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCTTTGTTA 6658602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7499 AGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCTTTGTTA 7558

  6658603 CTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACAGTTCTG 6658662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7559 CTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACAGTTCTG 7618

  6658663 GATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGAATTTGG 6658722
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     7619 GATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGAACTTGG 7678

  6658723 AGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAATTCCCTT 6658782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7679 AGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAATTCCCTT 7738

  6658783 CCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAGTCTGGA 6658842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7739 CCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAGTCTGGA 7798

  6658843 GTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATAACAGAA 6658902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7799 GTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATAACAGAA 7858

  6658903 AAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGACCCATA 6658962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7859 AAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGACCCATA 7918

  6658963 AGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATGTAAAATGTTTAGTCCAATGCT 6659022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     7919 AGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATATAAAATGTTTAGTCCAATGCT 7978

  6659023 TATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTTACATGC 6659082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7979 TATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTTACATGC 8038

  6659083 CTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGATATACT 6659142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8039 CTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGATATACT 8098

  6659143 CTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAGTGTGTT 6659202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8099 CTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAGTGTGTT 8158

  6659203 ATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGCTTATCT 6659262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8159 ATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGCTTATCT 8218

  6659263 AAGTTTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTGCCCTTGAGCAATGTTTTCTGGGATTTAT 6659322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8219 AAGTTTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTGCCCTTGAGCAATGTTTTCTGGGATTTAT 8278

  6659323 TTGTTCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGTTATATATATTTAATGTTCAACAAGTCTT 6659382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8279 TTGTTCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGTTATATATATTTAATGTTCAACAAGTCTT 8338

  6659383 TAAACACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTTCATTTACTCCCAATTTACAGTAGTGATT 6659442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8339 TAAACACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTTCATTTACTCCCAATTTACAGTAGTGATT 8398

  6659443 TAAAACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATTCATTGTTGAAGGAGTGTGATGGCAAACT 6659502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8399 TAAAACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATTCATTGTTGAAGGAGTGTGATGGCAAACT 8458

  6659503 ATGAAGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAACAATTGTAGTAAAGTCATGAAAGGTGAA 6659562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8459 ATGAAGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAACAATTGTAGTAAAGTCATGAAAGGTGAA 8518

  6659563 TGAAACAATGTAAATATATATATAGTGAGAATGGTACAGGTTGAGCATCCCTTTTCCAAA 6659622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8519 TGAAACAATGTAAATATATATATAGTGAGAATGGTACAGGTTGAGCATCCCTTTTCCAAA 8578

  6659623 ATGATTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGAATTTTTCAGATTTTGGAATATTTGTTTA 6659682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8579 ATGATTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGAATTTTTCAGATTTTGGAATATTTGTTTA 8638

  6659683 CATAAGGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAGTCTAAATACATTTATTTGTGTTTTGTTT 6659742
          |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     8639 CATAATGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAGTCTAAATACATTTATTTATGTTTTGTTT 8698

  6659743 ACACTTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTTATATAATGTTTTAGTAGCTGTGGGGCAT 6659802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8699 ACACTTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTTATATAATGTTTTAGTAGCTGTGGGGCAT 8758

  6659803 CGTGAAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCTGGACACATGCCATTTTATTACACTCTGC 6659862
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     8759 CGTGAAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCTGGACACATGCCATTTTATTACACTCTGG 8818

  6659863 ATGTGCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGTGAAAAAGATATATCATAGCTGAAGGGGC 6659922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8819 ATGTGCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGTGAAAAAGATATATCATAGCTGAAGGGGC 8878

  6659923 CTGGGAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTGAATAAACTGTGTATTGTTCATCTGTGAT 6659982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8879 CTGGGAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTGAATAAACTGTGTATTGTTCATCTGTGAT 8938

  6659983 TTGACTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGATGTGGAATTTTCCATTTGTGACATCATG 6660042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8939 TTGACTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGATGTGGAATTTTCCATTTGTGACATCATG 8998

  6660043 TTGACAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACATCAGATTAGGGAGACTCAGTCTATACAT 6660102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8999 TTGACAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACATCAGATTAGGGAGACTCAGTCTATACAT 9058

  6660103 TGTGTAATTTTCAGGGGACCAGAGGAATTGAACTTAGTTTAGTTTGTCATATCAGTGGGA 6660162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9059 TGTGTAATTTTCAGGGGACCAGAGGAATTGAACTTAGTTTAGTTTGTCATATCAGTGGGA 9118

  6660163 TTTTCCATGGTGACAAGTGGTAATTATTCTAAGATTATAAACCTTAATACACCTGTTTGT 6660222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9119 TTTTCCATGGTGACAAGTGGTAATTATTCTAAGATTATAAACCTTAATACACCTGTTTGT 9178

  6660223 TGTTGTTGTATTTTTATTTTTTACAATTATAAATCTTGAGTATAGTTAAAATTTAGAAAA 6660282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9179 TGTTGTTGTATTTTTATTTTTTACAATTATAAATCTTGAGTATAGTTAAAATTTAGAAAA 9238

  6660283 TTTTTTTCAAAGTACTGTGTGGAATCGAAAGATATCTAAGACAATAGTCTTTCAAAGGTG 6660342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9239 TTTTTTTCAAAGTACTGTGTGGAATCGAAAGATATCTAAGACAATAGTCTTTCAAAGGTG 9298

  6660343 CAGAAAGTAGATTCAATCTATGCAGAGAAAAGCAGATTTCAAAAAATATAACAGAAGAAA 6660402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9299 CAGAAAGTAGATTCAATCTATGCAGAGAAAAGCAGATTTCAAAAAATATAACAGAAGAAA 9358

  6660403 AACAGTTGGCTGAACTTACTATAAATACATATAGCTAAAAGGGGAAAAAGCAGAGGAGAA 6660462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9359 AACAGTTGGCTGAACTTACTATAAATACATATAGCTAAAAGGGGAAAAAGCAGAGGAGAA 9418

  6660463 ACAGTTATCTTCTGGTCTTGTAGAAGTTTAAGGTCTTGGTAGATATTAGGAAC--ATGCA 6660520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||   |||||
     9419 ACAGTTATCTTCTGGTCTTGTAGAAGTTTAAGGTCTTGGTAGATATCAGGAA-GGATGCA 9477

  6660521 AAAGGTAATGTTTGTGTGTTCTCTCTCTCTCTGCCAATGCTTTAAAAATCTCTAGGGATA 6660580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9478 AAAGGTAATGTTTGTGTGTTCTCTCTCTCTCTGCCAATGCTTTAAAAATCTCTAGGGATA 9537

  6660581 TATCAAAGCTGTTTAAATAGAGTTTTAAAAACATGACATGAGTTCATATTTGGGTTGACA 6660640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9538 TATCAAAGCTGTTTAAATAGAGTTTTAAAAACATGACATGAGTTCATATTTGGGTTGACA 9597

  6660641 CTACTGACAAGTCAGTTTTCTCTTAATACAAATGATAGCAGTAGCAATGTTTGCATCTAT 6660700
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9598 CTATTGACAAGTCAGTTTTCTCTTAATACAAATGATAGCAGTAGCAATGTTTGCATCTAT 9657

  6660701 CTATTTGATTGCAAGGAGGAAGAATTGAATAGAATTATTCCAAGGAAAAAATGGCTTTGT 6660760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9658 CTATTTGATTGCAAGGAGGAAGAATTGAATAGAATTATTCCAAGGAAAAAATGGCTTTGT 9717

  6660761 TATTGTTATTATTGACATATAAACTTTGATTGGAACTGTAAGCCTAAGCCTAGAGATAAA 6660820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9718 TATTGTTATTATTGACATATAAACTTTGATTGGAACTGTAAGCCTAAGCCTAGAGATAAA 9777

  6660821 TATTTATCTCTCTCAGTCATTGTTTCTCTGTGACCAGCCATCCTGTTTCTTATTCCAACC 6660880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9778 TATTTATCTCTCTCAGTCATTGTTTCTCTGTGACCAGCCATCCTGTTTCTTATTCCAACC 9837

  6660881 AGTTAAAGTTGTCTCCTTTCCCTTATTTTCTATGTCTTCATTATTCAGCTTGCCCATTCG 6660940
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     9838 AGTTAAAGTTGTCTCCTTTCCCTTATTTTCTATGTCTTCATTATTCAGCTTGCCCATTCA 9897

  6660941 TACATTTCATCTTTTCTAGATTATCTTTGTCCCCTTTCTACATCACACAATTTTTCTCTA 6661000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9898 TACATTTCATCTTTTCTAGATTATCTTTGTCCCCTTTCTACATCACACAATTTTTCTCTA 9957

  6661001 ACTGGTATTTTAATCTTATATAAAAAATAGGAATCTTGTCTCTGTGGGAGAAAGAAGAGC 6661060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9958 ACTGGTATTTTAATCTTATATAAAAAATAGGAATCTTGTCTCTGTGGGAGAAAGAAGAGC 10017

  6661061 ATGCTTCTCTTAGAACAGCTCCTTTATTTGGGAGGACATGACTAATAAGACTGAGGAACT 6661120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10018 ATGCTTCTCTTAGAACAGCTCCTTTATTTGGGAGGACATGACTAATAAGACTGAGGAACT 10077

  6661121 TGAGATTAGGGCTGCTGAGCATCCATCACTCATTCATATTCCGTCTTTGTCTTGTTCTCT 6661180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10078 TGAGATTAGGGCTGCTGAGCATCCATCACTCATTCATATTCCGTCTTTGTCTTGTTCTCT 10137

  6661181 TGCTCTTCCTGTTTCTTAATCATTTCAGTTTATAGAGAAAGAAACCTTGATTTTTAACAC 6661240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10138 TGCTCTTCCTGTTTCTTAATCATTTCAGTTTATAGAGAAAGAAACCTTGATTTTTAACAC 10197

  6661241 CAACTTATTCTGGTTTTGCTAGAATGACAGATTGTTCAACATTCTTTTTTTGATTTATGT 6661300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10198 CAACTTATTCTGGTTTTGCTAGAATGACAGATTGTTCAACATTCTTTTTTTGATTTATGT 10257

  6661301 GTATGTTTATCTACTACTTTAAGATTCATGGGGTTGTTATTTTTCAACTGTGGGTGATTT 6661360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10258 GTATGTTTATCTACTACTTTAAGATTCATGGGGTTGTTATTTTTCAACTGTGGGTGATTT 10317

  6661361 TGGCCCCCCAGAAACATTTGACAGTGTCTTGAAACATTTTTATTGTCAGCACAGGGACAT 6661420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10318 TGGCCCCCCAGAAACATTTGACAGTGTCTTGAAACATTTTTATTGTCAGCACAGGGACAT 10377

  6661421 GGGTGCTACTGGCATGTAGAGTCCAGAAATGCTGGGAAACGTCCTACAATGCACACAACC 6661480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10378 GGGTGCTACTGGCATGTAGAGTCCAGAAATGCTGGGAAACGTCCTACAATGCACACAACC 10437

  6661481 TCCACATTAAAAAAATAATAATAATAAAATAATTATCTGGCCCTAAATGTCAGTAGTACC 6661540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10438 TCCACATTAAAAAAATAATAATAATAAAATAATTATCTGGCCCTAAATGTCAGTAGTACC 10497

  6661541 AAAGTTGAGAATCTTTGCCATAAGGGAAGTGAAGAGTTTGAGATGAATTATTTTATTTAT 6661600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10498 AAAGTTGAGAATCTTTGCCATAAGGGAAGTGAAGAGTTTGAGATGAATTATTTTATTTAT 10557

  6661601 ACTCAGTAAGGTTTTGAGTTTTTGTTTCCTTTTCAAACTGTCTAATCTCTCAAATACACC 6661660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10558 ACTCAGTAAGGTTTTGAGTTTTTGTTTCCTTTTCAAACTGTCTAATCTCTCAAATACACC 10617

  6661661 CTTCCAGGTTCCCAGAACAAGGCATAATTGGTGAAGCTGATTTTGGGGCCAGGCTCCACA 6661720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10618 CTTCCAGGTTCCCAGAACAAGGCATAATTGGTGAAGCTGATTTTGGGGCCAGGCTCCACA 10677

  6661721 AAACATAGAATTCTACCAATGTTTGGATTCAAGTTCCTTAGTCTTGTCTAAGCAGGTGAA 6661780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10678 AAACATAGAATTCTACCAATGTTTGGATTCAAGTTCCTTAGTCTTGTCTAAGCAGGTGAA 10737

  6661781 TGGGAGAAAAATTAATATCTTTTCCTTACCCATTGCAAGTGTCATGGGTGACACCCCATA 6661840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10738 TGGGAGAAAAATTAATATCTTTTCCTTACCCATTGCAAGTGTCATGGGTGACACCCCATA 10797

  6661841 AGACAAGACTGATTAACAAGAGAAAAGCATAACAAATTTATTTAACAAAGTTTTAGATGG 6661900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10798 AGACAAGACTGATTAACAAGAGAAAAGCATAACAAATTTATTTAACAAAGTTTTAGATGG 10857

  6661901 CATGGGACCCTTCAGAAATGAAGACCCAGAGACCCAGGGAAAACTGTATTTTTATGCTTA 6661960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10858 CATGGGACCCTTCAGAAATGAAGACCCAGAGACCCAGGGAAAACTGTATTTTTATGCTTA 10917

  6661961 GGGTCAATGAAGAATGGACAGTCATTGAGAAATGTGATTGAACAAAGAAAGGGGTATGAT 6662020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10918 GGGTCAATGAAGAATGGACAGTCATTGAGAAATGTGATTGAACAAAGAAAGGGGTATGAT 10977

  6662021 TTAATGGTAGTAAACTGGGAGGAACTCAGCAAATCTTGTTTGTTCAGATTCTTCTTGGCC 6662080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10978 TTAATGGTAGTAAACTGGGAGGAACTCAGCAAATCTTGTTTGTTCAGATTCTTCTTGGCC 11037

  6662081 CTTCTGAACAACACTTAATCACCTCTAGGTATGGAGCAGGAAGCCTCTGGAATGAGGGTC 6662140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11038 CTTCTGAACAACACTTAATCACCTCTAGGTATGGAGCAGGAAGCCTCTGGAATGAGGGTC 11097

  6662141 TTATAATCTACGTTTGGGTGAGGGAGGTCAGGTAATTCCTTTATGACCATGCTTCACACC 6662200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11098 TTATAATCTACGTTTGGGTGAGGGAGGTCAGGTAATTCCTTTATGACCATGCTTCACACC 11157

  6662201 AGAAAGCCAGGGGAAAGTCACAGTGAACTTCTGGCTTCTGTGGCTTTCTCAATTGCCCAA 6662260
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11158 AGAAAGCCAGGAGAAAGTCACAGTGAACTTCTGGCTTCTGTGGCTTTCTCAATTGCCCAA 11217

  6662261 GGTGTCATATGTTGGATTATCATGTCCTGAGCCCTGACACAGACCGAGCCCTGACACAGA 6662320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11218 GGTGTCATATGTTGGATTATCATGTCCTGAGCCCTGACACAGACCGAGCCCTGACACAGA 11277

  6662321 TATGGTCCAATACAGCATCAGCTGTGATACATGATATACATATCATGTGATAGATGTGAT 6662380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11278 TATGGTCCAATACAGCATCAGCTGTGATACATGATATACATATCATGTGATAGATGTGAT 11337

  6662381 ACATGA-----TATCCATATCATGTGATAG 6662405
          ||||||     |||||||||||||||||||
    11338 ACATGACATGATATCCATATCATGTGATAG 11367

EXCISED REGION

  6662423 ATGTGATACATGATATACAACATGGGCATGTTAACAATCATGTTTTTAAAAGGTGGTGGG 6662482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11368 ATGTGATACATGATATACAACATGGGCATGTTAACAATCATGTTTTTAAAAGGTGGTGGG 11427

  6662483 GAGAGTAATTTTTTTTTTAAAAAATGGATATCATTAGACAGAAATCATAAAATATCTATA 6662542
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11428 GAGAGTAATTTTTTTTTAAAAAAATGGATATCATTAGACAGAAATCATAAAATATCTATA 11487

  6662543 GAACAAAAAAAAGTATAATTACCTCAGTATTTACTACCTTTTTATTGATGAAAAAAAACC 6662602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11488 GAACAAAAAAAAGTATAATTACCTCAGTATTTACTACCTTTTTATTGATGAAAAAAAACC 11547

  6662603 CAAATGGGTCTTGCATCA-TTTTTTTTTATGATGATATTGATACACAATGGCTGGGCTCC 6662661
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
    11548 CAAATGGGTCTTGCATCATTTTTTTTTTATGATGATATTGATACCCAATGGCTGGGCTCC 11607

  6662662 TGGCTAAACTCCATCCCCAAGCCTGGAACCTTGGCTCTAAGTGAAAGCAGCTGACCCCAT 6662721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11608 TGGCTAAACTCCATCCCCAAGCCTGGAACCTTGGCTCTAAGTGAAAGCAGCTGACCCCAT 11667

  6662722 TTTTCCTCCCAAATGACTGTTTTTTGTCCCGTCCTGCCCCCTATCCTGTGCCCATAAAAA 6662781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11668 TTTTCCTCCCAAATGACTGTTTTTTGTCCCGTCCTGCCCCCTATCCTGTGCCCATAAAAA 11727

  6662782 CCAGACAAACTGGCAGAGAAAAAAGAAGAAAAGAGCAACACAAGTGGCTGATTCAAGTGG 6662841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11728 CCAGACAAACTGGCAGAGAAAAAAGAAGAAAAGAGCAACACAAGTGGCTGATTCAAGTGG 11787

  6662842 TTGGGGATGCAAGCTGCTGAGCATTGGGAATACAGGCTGCTGAACACTGGGGATACATGA 6662901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11788 TTGGGGATGCAAGCTGCTGAGCATTGGGAATACAGGCTGCTGAACACTGGGGATACATGA 11847

  6662902 GGCTGAGCATTGGAGACTAGCAATAGTTGTGTCTAACTTCAGACAGTGCGGCTTCAGGGA 6662961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11848 GGCTGAGCATTGGAGACTAGCAATAGTTGTGTCTAACTTCAGACAGTGCGGCTTCAGGGA 11907

  6662962 AAGATGACTTTCTTCCTGCACCATCCCCTTTCCAATTCCCCATCCCACTGAGAGACACTT 6663021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
    11908 AAGATGACTTTCTTCCTGCACCATCCCCTTTCCAATTCCCCAGCCCACTGAGAGACACTT 11967

  6663022 TTATCACCCAATAAAATCCTCCTTTCAAACACTACCCTTCAAATAGTTTGTGTGACCTGA 6663081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    11968 TTATCACCCAATAAAATCCTCCTTTCAAACACTACCCTTCAAATAGTTTGTGTGACCTGA 12027

  6663082 TTCTTCCTGGATACTGAACAAGAACTCAGGTGTCAAAAAGAGCAGGTGCTGGAGGCTGTC 6663141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12028 TTCTTCCTGGATACTGAACAAGAACTCAGGTGTCAAAAAGAGCAGGTGCTGGAGGCTGTC 12087

  6663142 ATCCTGACCCTTCACTGAGCTGTTAACACTTAGCTGTCCATGGACTACAGGATGAGTGAA 6663201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12088 ATCCTGACCCTTCACTGAGCTGTTAACACTTAGCTGTCCATGGACTACAGGATGAGTGAA 12147

  6663202 ACGAACCACTCCAGTTCCTGCCCACAAATGGGTTCAAGGTCAAGGGAATAACCCCATGCC 6663261
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
    12148 ACGAACCACTCCAGTTCCTGCCCACAAATGGGTTCAAGGTCAAGGGAATAACCGCATGCC 12207

  6663262 AATATGACTCAAATTATTTTAGATATTCATTTCTCGTATTTCTGAGAACCTTTCATTTTT 6663321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12208 AATATGACTCAAATTATTTTAGATATTCATTTCTCGTATTTCTGAGAACCTTTCATTTTT 12267

  6663322 ATTAGCTTTGAGAAAAAGGAAAGACAAACAATGTAGTAAATGAATTGGTGACTTTCCTGT 6663381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12268 ATTAGCTTTGAGAAAAAGGAAAGACAAACAATGTAGTAAATGAATTGGTGACTTTCCTGT 12327

  6663382 TCCTTAGGCACCCTGGAGGGCCATGACCCTCATTTCTAGAAACCTTCCAAAGCTTTTTTA 6663441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12328 TCCTTAGGCACCCTGGAGGGCCATGACCCTCATTTCTAGAAACCTTCCAAAGCTTTTTTA 12387

  6663442 CAGAACGAATCTCAGAGCAAGAGTGCAGAGGCAAGGCAAGACATTCTGCTTAGATCCTAA 6663501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12388 CAGAACGAATCTCAGAGCAAGAGTGCAGAGGCAAGGCAAGACATTCTGCTTAGATCCTAA 12447

  6663502 TATTCACTAGAAGAGGAGAAGGGAACTATCTTCCAGGGAGTGAGAAGGAACTTCCAGCTC 6663561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12448 TATTCACTAGAAGAGGAGAAGGGAACTATCTTCCAGGGAGTGAGAAGGAACTTCCAGCTC 12507

  6663562 CTTCCAGTCCTGTAATGACTAATGGAACTGGTGTGTGTTGTTCCCAGTTTACTGCATATT 6663621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12508 CTTCCAGTCCTGTAATGACTAATGGAACTGGTGTGTGTTGTTCCCAGTTTACTGCATATT 12567

  6663622 TGCCCCTGAGAATACAGTGATTAAAATGAATGATGAGCTGGAATTAAAACACTCTACTGT 6663681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12568 TGCCCCTGAGAATACAGTGATTAAAATGAATGATGAGCTGGAATTAAAACACTCTACTGT 12627

  6663682 TTGGTACTATTTGTTTGTTGGGAAACACTTGCTGACTCTAGCCCTCATTTAAATTCTAGC 6663741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12628 TTGGTACTATTTGTTTGTTGGGAAACACTTGCTGACTCTAGCCCTCATTTAAATTCTAGC 12687

  6663742 ACAATTTAAAGCCCATGAGGTATGTGCAAGAGCCCAGAACATGACTTTGGAAAGGATTAC 6663801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12688 ACAATTTAAAGCCCATGAGGTATGTGCAAGAGCCCAGAACATGACTTTGGAAAGGATTAC 12747

  6663802 TTCAGGTCCTTGCTTTCTCCCAGTCTTGGACTATGCAAATAGGGCAAGTCACTTAAGCAT 6663861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12748 TTCAGGTCCTTGCTTTCTCCCAGTCTTGGACTATGCAAATAGGGCAAGTCACTTAAGCAT 12807

  6663862 TTTGGGCTCTAATCTCAATGTCTTTATTTTGAAGGTAATACCTAGTTTTCAGCATTGTGC 6663921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12808 TTTGGGCTCTAATCTCAATGTCTTTATTTTGAAGGTAATACCTAGTTTTCAGCATTGTGC 12867

  6663922 TAAGATTTTTAACAGCTTTTAACTGAGCTTCGATACTTTCTAGTTCTGTGAATGCTGTTT 6663981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12868 TAAGATTTTTAACAGCTTTTAACTGAGCTTCGATACTTTCTAGTTCTGTGAATGCTGTTT 12927

  6663982 TGTTCTGTAATATTATCTGTCTACAGCAGATCAGCGTTATAGTTATATCTACTTATATCT 6664041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12928 TGTTCTGTAATATTATCTGTCTACAGCAGATCAGCGTTATAGTTATATCTACTTATATCT 12987

  6664042 TTAAAAGGTATCTCCATTTGTAAGGATATCACTCTCTCTCTGTACCAGGAAAACACAGAT 6664101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    12988 TTAAAAGGTATCTCCATTTGTAAGGATATCACTCTCTCTCTGTACCAGGAAAACACAGAT 13047

  6664102 GATTCTGCATTGCCAAAGACTCTTATCA 6664129
          ||||||||||||||||||||||||||||
    13048 GATTCTGCATTGCCAAAGACTCTTATCA 13075

Alignment time is 17.9112 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   7220] =>      7220 nucs 'mol-32-3311-263994_7220'

Score:        6975
Aligned:      7140        nucs
Identic:      7125 (100%) nucs =>       353 (100%)      6772 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6649808,6650160] EXCISED REGION [6654638,6661423]
 second seq =>  [     11,    363] EXCISED REGION [    435,   7220]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [364,434]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [363,363] to [434,434]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [363,363] to [435,435]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6649808 TAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTC 6649867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       11 TAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTC 70

  6649868 CTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTG 6649927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       71 CTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTG 130

  6649928 TTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGAC 6649987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      131 TTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGAC 190

  6649988 AGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACT 6650047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      191 AGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACT 250

  6650048 TCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAG 6650107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      251 TCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAG 310

  6650108 GTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      311 GTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 363

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 494

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      495 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 554

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      555 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 614

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      615 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 674

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 734

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 794

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      795 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 854

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 914

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 974

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 1034

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 1094

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 1154

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 1214

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 1274

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 1334

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 1394

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 6655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 1454

  6655658 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 6655716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     1455 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 1514

  6655717 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 6655776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 1574

  6655777 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 6655836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 1634

  6655837 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 6655896
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 1693

  6655897 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 6655956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1694 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 1753

  6655957 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 6656016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1754 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 1813

  6656017 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 6656076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1814 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 1873

  6656077 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 6656136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1874 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 1933

  6656137 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 6656196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1934 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 1993

  6656197 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 6656256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1994 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 2053

  6656257 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 6656316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2054 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 2113

  6656317 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 6656376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2114 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 2173

  6656377 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 6656436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2174 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 2233

  6656437 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 6656496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2234 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 2293

  6656497 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 6656556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2294 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 2353

  6656557 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 6656616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2354 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 2413

  6656617 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 6656676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2414 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 2473

  6656677 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 6656736
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2474 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 2533

  6656737 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 6656796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2534 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 2593

  6656797 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 6656856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2594 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 2653

  6656857 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCA 6656916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2654 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCA 2713

  6656917 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 6656976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2714 GAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCC 2773

  6656977 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 6657036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2774 TTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTG 2833

  6657037 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 6657096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2834 TTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCA 2893

  6657097 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 6657156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2894 TTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCC 2953

  6657157 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 6657216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2954 ACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAA 3013

  6657217 TGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 6657276
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3014 TGAGTAACATTAGCACGCTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTG 3073

  6657277 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 6657336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3074 TTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAA 3133

  6657337 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAT 6657396
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3134 TAATGAATGAAATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAA 3193

  6657397 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 6657456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3194 CATGGCATTAACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGG 3253

  6657457 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 6657516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3254 GAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATT 3313

  6657517 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 6657576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3314 GTTTTACTTTTAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAA 3373

  6657577 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 6657636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3374 AATAAAAAAAAGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCAT 3433

  6657637 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 6657696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3434 AATTTAAAACAGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTC 3493

  6657697 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAA 6657756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3494 TGTTACCTGTGACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAA 3553

  6657757 CCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCA 6657816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3554 CCTGATATTTTCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCA 3613

  6657817 GAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATA 6657876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3614 GAGAGGAAAAACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATA 3673

  6657877 GGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTT 6657936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3674 GGTCTTACTTTCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTT 3733

  6657937 TTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAA 6657996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3734 TTTATTATTTGATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAA 3793

  6657997 TAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACAT 6658056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3794 TAGTCCAGATATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACAT 3853

  6658057 AACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAA 6658116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3854 AACCTTTCTTACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAA 3913

  6658117 GCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGA 6658176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3914 GCATTGGACTAAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGA 3973

  6658177 CAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAAT 6658236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3974 CAGCATGGTGTGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAAT 4033

  6658237 AGTTGATGCATAGAACGAACTATGAATGAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAG 6658296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4034 AGTTGATGCATAGAACGAACTATGAATGAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAG 4093

  6658297 GCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCT 6658356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4094 GCAGAAAAAGCTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCT 4153

  6658357 GTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGG 6658416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4154 GTGGTTTGGATGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGG 4213

  6658417 ATATTTGAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGA 6658476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4214 ATATTTGAATCATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGA 4273

  6658477 CTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAA 6658536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4274 CTTAATTCTGGTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAA 4333

  6658537 TTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCT 6658596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4334 TTGTGGAGGGTCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCT 4393

  6658597 TTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACA 6658656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4394 TTGTTACTTTTGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACA 4453

  6658657 GTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGA 6658716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4454 GTTCTGGATGTGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGA 4513

  6658717 ATTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAAT 6658776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4514 ATTTGGAGTTCCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAAT 4573

  6658777 TCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAG 6658836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4574 TCCCTTCCCACACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAG 4633

  6658837 TCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATA 6658896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4634 TCTGGAGTCTATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATA 4693

  6658897 ACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGA 6658956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4694 ACAGAAAAAAAAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGA 4753

  6658957 CCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATGTAAAATGTTTAGTCC 6659016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4754 CCCATAAGTTGCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATATAAAATGTTTAGTCC 4813

  6659017 AATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTT 6659076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4814 AATGCTTATCACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTT 4873

  6659077 ACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGA 6659136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4874 ACATGCCTAATGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGA 4933

  6659137 TATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAG 6659196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4934 TATACTCTTTAATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAG 4993

  6659197 TGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGC 6659256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4994 TGTGTTATAATGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGC 5053

  6659257 TTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTGCCCTTGAGCAATGTTTTCTGGG 6659316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5054 TTATCTAAGTTTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTGCCCTTGAGCAATGTTTTCTGGG 5113

  6659317 ATTTATTTGTTCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGTTATATATATTTAATGTTCAACA 6659376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5114 ATTTATTTGTTCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGTTATATATATTTAATGTTCAACA 5173

  6659377 AGTCTTTAAACACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTTCATTTACTCCCAATTTACAGTA 6659436
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5174 AGTCATTAAACACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTTCATTTACTCCCAATTTACAGTA 5233

  6659437 GTGATTTAAAACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATTCATTGTTGAAGGAGTGTGATGG 6659496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5234 GTGATTTAAAACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATTCATTGTTGAAGGAGTGTGATGG 5293

  6659497 CAAACTATGAAGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAACAATTGTAGTAAAGTCATGAAA 6659556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5294 CAAACTATGAAGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAACAATTGTAGTAAAGTCATGAAA 5353

  6659557 GGTGAATGAAACAATGTAAATATATATATAGTGAGAATGGTACAGGTTGAGCATCCCTTT 6659616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5354 GGTGAATGAAACAATGTAAATATATATATAGTGAGAATGGTACAGGTTGAGCATCCCTTT 5413

  6659617 TCCAAAATGATTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGAATTTTTCAGATTTTGGAATATT 6659676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5414 TCCAAAATGATTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGAATTTTTCAGATTTTGGAATATT 5473

  6659677 TGTTTACATAAGGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAGTCTAAATACATTTATTTGTGTT 6659736
          |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5474 TGTTTACATAATGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAGTCTAAATACATTTATTTATGTT 5533

  6659737 TTGTTTACACTTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTTATATAATGTTTTAGTAGCTGTG 6659796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5534 TTGTTTACACTTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTTATATAATGTTTTAGTAGCTGTG 5593

  6659797 GGGCATCGTGAAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCTGGACACATGCCATTTTATTACA 6659856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5594 GGGCATCGTGAAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCTGGACACATGCCATTTTATTACA 5653

  6659857 CTCTGCATGTGCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGTGAAAAAGATATATCATAGCTGA 6659916
          |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5654 CTCTGGATGTGCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGTGAAAAAGATACATCATAGCTGA 5713

  6659917 AGGGGCCTGGGAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTGAATAAACTGTGTATTGTTCATC 6659976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5714 AGGGGCCTGGGAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTGAATAAACTGTGTATTGTTCATC 5773

  6659977 TGTGATTTGACTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGATGTGGAATTTTCCATTTGTGAC 6660036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5774 TGTGATTTGACTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGATGTGGAATTTTCCATTTGTGAC 5833

  6660037 ATCATGTTGACAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACATCAGATTAGGGAGACTCAGTCT 6660096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5834 ATCATGTTGACAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACATCAGATTAGGGAGACTCAGTCT 5893

  6660097 ATACATTGTGTAATTTTCAGGGGACCAGAGGAATTGAACTTAGTTTAGTTTGTCATATCA 6660156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5894 ATACATTGTGTAATTTTCAGGGGACCAGAGGAATTGAACTTAGTTTAGTTTGTCATATCA 5953

  6660157 GTGGGATTTTCCATGGTGACAAGTGGTAATTATTCTAAGATTATAAACCTTAATACACCT 6660216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5954 GTGGGATTTTCCATGGTGACAAGTGGTAATTATTCTAAGATTATAAACCTTAATACACCT 6013

  6660217 GTTTGTTGTTGTTGTATTTTTATTTTTTACAATTATAAATCTTGAGTATAGTTAAAATTT 6660276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6014 GTTTGTTGTTGTTGTATTTTTATTTTTTACAATTATAAATCTTGAGTATAGTTAAAATTT 6073

  6660277 AGAAAATTTTTTTCAAAGTACTGTGTGGAATCGAAAGATATCTAAGACAATAGTCTTTCA 6660336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6074 AGAAAATTTTTTTCAAAGTACTGTGTGGAATCGAAAGATATCTAAGACAATAGTCTTTCA 6133

  6660337 AAGGTGCAGAAAGTAGATTCAATCTATGCAGAGAAAAGCAGATTTCAAAAAATATAACAG 6660396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6134 AAGGTGCAGAAAGTAGATTCAATCTATGCAGAGAAAAGCAGATTTCAAAAAATATAACAG 6193

  6660397 AAGAAAAACAGTTGGCTGAACTTACTATAAATACATATAGCTAAAAGGGGAAAAAGCAGA 6660456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6194 AAGAAAAACAGTTGGCTGAACTTACTATAAATACATATAGCTAAAAGGGGAAAAAGCAGA 6253

  6660457 GGAGAAACAGTTATCTTCTGGTCTTGTAGAAGTTTAAGGTCTTGGTAGATATTAGGAACA 6660516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     6254 GGAGAAACAGTTATCTTCTGGTCTTGTAGAAGTTTAAGGTCTTGGTAGATATCAGGAACA 6313

  6660517 TGCAAAAGGTAATGTTTGTGTGTTCTCTCTCTCTCTGCCAATGCTTTAAAAATCTCTAGG 6660576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6314 TGCAAAAGGTAATGTTTGTGTGTTCTCTCTCTCTCTGCCAATGCTTTAAAAATCTCTAGG 6373

  6660577 GATATATCAAAGCTGTTTAAATAGAGTTTTAAAAACATGACATGAGTTCATATTTGGGTT 6660636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6374 GATATATCAAAGCTGTTTAAATAGAGTTTTAAAAACATGACATGAGTTCATATTTGGGTT 6433

  6660637 GACACTACTGACAAGTCAGTTTTCTCTTAATACAAATGATAGCAGTAGCAATGTTTGCAT 6660696
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6434 GACACTATTGACAAGTCAGTTTTCTCTTAATACAAATGATAGCAGTAGCAATGTTTGCAT 6493

  6660697 CTATCTATTTGATTGCAAGGAGGAAGAATTGAATAGAATTATTCCAAGGAAAAAATGGCT 6660756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6494 CTATCTATTTGATTGCAAGGAGGAAGAATTGAATAGAATTATTCCAAGGAAAAAATGGCT 6553

  6660757 TTGTTATTGTTATTATTGACATATAAACTTTGATTGGAACTGTAAGCCTAAGCCTAGAGA 6660816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6554 TTGTTATTGTTATTATTGACATATAAACTTTGATTGGAACTGTAAGCCTAAGCCTAGAGA 6613

  6660817 TAAATATTTATCTCTCTCAGTCATTGTTTCTCTGTGACCAGCCATCCTGTTTCTTATTCC 6660876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6614 TAAATATTTATCTCTCTCAGTCATTGTTTCTCTGTGACCAGCCATCCTGTTTCTTATTCC 6673

  6660877 AACCAGTTAAAGTTGTCTCCTTTCCCTTATTTTCTATGTCTTCATTATTCAGCTTGCCCA 6660936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6674 AACCAGTTAAAGTTGTCTCCTTTCCCTTATTTTCTATGTCTTCATTATTCAGCTTGCCCA 6733

  6660937 TTCGTACATTTCATCTTTTCTAGATTATCTTTGTCCCCTTTCTACATCACACAATTTTTC 6660996
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     6734 TTCGTACATTTCATCTTTTCTAGATTATCTTTGTCCCATTTCTACATCACACAATTTTTC 6793

  6660997 TCTAACTGGTATTTTAATCTTATATAAAAAATAGGAATCTTGTCTCTGTGGGAGAAAGAA 6661056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6794 TCTAACTGGTATTTTAATCTTATATAAAAAATAGGAATCTTGTCTCTGTGGGAGAAAGAA 6853

  6661057 GAGCATGCTTCTCTTAGAACAGCTCCTTTATTTGGGAGGACATGACTAATAAGACTGAGG 6661116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6854 GAGCATGCTTCTCTTAGAACAGCTCCTTTATTTGGGAGGACATGACTAATAAGACTGAGG 6913

  6661117 AACTTGAGATTAGGGCTGCTGAGCATCCATCACTCATTCATATTCCGTCTTTGTCTTGTT 6661176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6914 AACTTGAGATTAGGGCTGCTGAGCATCCATCACTCATTCATATTCCGTCTTTGTCTTGTT 6973

  6661177 CTCTTGCTCTTCCTGTTTCTTAATCATTTCAGTTTATAGAGAAAGAAACCTTGATTTTTA 6661236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6974 CTCTTGCTCTTCCTGTTTCTTAATCATTTCAGTTTATAGAGAAAGAAACCTTGATTTTTA 7033

  6661237 ACACCAACTTATTCTGGTTTTGCTAGAATGACAGATTGTTCAACATTCTTTTTTTGATTT 6661296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7034 ACACCAACTTATTCTGGTTTTGCTAGAATGACAGATTGTTCAACATTCTTTTTTTGATTT 7093

  6661297 ATGTGTATGTTTATCTACTACTTTAAGATTCATGGGGTTGTTATTTTTCAACTGTGGGTG 6661356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7094 ATGTGTATGTTTATCTACTACTTTAAGATTCATGGGGTTGTTATTTTTCAACTGTGGGTG 7153

  6661357 ATTTTGGCCCCCCAGAAACATTTGACAGTGTCTTGAAACATTTTTATTGTCAGCACAGGG 6661416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7154 ATTTTGGCCCCCCAGAAACATTTGACAGTGTCTTGAAACATTTTTATTGTCAGCACAGGG 7213

  6661417 ACATGGG 6661423
          |||||||
     7214 ACATGGG 7220

Alignment time is 10.5385 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   7265] =>      7265 nucs 'mol-32-331c-164995_7265'

Score:        7053
Aligned:      7266        nucs
Identic:      7245 (100%) nucs =>      5665 (100%)      1580 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6650182,6655857] EXCISED REGION [6655862,6657447]
 second seq =>  [      1,   5679] EXCISED REGION [   5680,   7265]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [6655858,6655861]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6655857,6655857] to [6655862,6655862]
 second seq =>         1 nucs [5679,5679] to [5680,5680]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6650182 GTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTAC 6650241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTAC 60

  6650242 AGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTA 6650301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTA 120

  6650302 GATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGT 6650361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGT 180

  6650362 ATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCAT 6650421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCAT 240

  6650422 CTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTT 6650481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTT 300

  6650482 CTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTT 6650541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTT 360

  6650542 TCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACT 6650601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACT 420

  6650602 GCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGT 6650661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGT 480

  6650662 CAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAG 6650721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAG 540

  6650722 TGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTG 6650781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTG 600

  6650782 TTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCAC 6650841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCAC 660

  6650842 AATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAG 6650901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAG 720

  6650902 GCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGGGG 6650961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
      721 GCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGGTG 780

  6650962 TATTAGGGCACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACT---TATCCCTTG 6651018
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||
      781 TATTAGGCCACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTG 840

  6651019 CTAATGTGGGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATG 6651078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTAATGTGGGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATG 900

  6651079 TATTGTCTAAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTC 6651138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTGTCTAAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTC 960

  6651139 TGATGGATATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTT 6651198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGATGGATATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTT 1020

  6651199 CTTTGGCACCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGT 6651258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTTGGCACCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGT 1080

  6651259 CTGCCTTTCAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCA 6651318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGCCTTTCAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCA 1140

  6651319 GTTAGCAAGAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTA 6651378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTTAGCAAGAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTA 1200

  6651379 AGTAAGTTATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTAC 6651438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGTAAGTTATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTAC 1260

  6651439 TATAGAGTAGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCAT 6651498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATAGAGTAGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCAT 1320

  6651499 AGAATAAAGAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTAC 6651558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAATAAAGAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTAC 1380

  6651559 TGTTAAGTTCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTAC 6651618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTTAAGTTCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTAC 1440

  6651619 TTGCAGAGCTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTC 6651678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTGCAGAGCTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTC 1500

  6651679 TTAGAAATCTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCA 6651738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTAGAAATCTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCA 1560

  6651739 ACAATCAACATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTAC 6651798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACAATCAACATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTAC 1620

  6651799 ACTAAAATTGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAA 6651858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTAAAATTGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAA 1680

  6651859 ACACAAACCCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAA 6651918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACACAAACCCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAA 1740

  6651919 TACACGCATCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTT 6651978
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TACACGCATCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTT 1800

  6651979 TGTGGGTGCAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGA 6652038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTGGGTGCAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGA 1860

  6652039 GATAAGGAAGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCA 6652098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATAAGGAAGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCA 1920

  6652099 AAAACACCCATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATA 6652158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAAACACCCATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATA 1980

  6652159 TTTTTCCACAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAA 6652218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTTTTCCACAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAA 2040

  6652219 AATGATAAAACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATG 6652278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATGATAAAACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATG 2100

  6652279 AATAGGTGATGTTTTATGTGCTACAATTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCAT 6652338
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AATAGGTGATGTTTTATGTGCTACAGTTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCAT 2160

  6652339 AAAAAGGATAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACA 6652398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAAAGGATAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACA 2220

  6652399 AACCCACACTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTC 6652458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AACCCACACTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTC 2280

  6652459 AAAAATATTTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAA 6652518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAAAATATTTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAA 2340

  6652519 TGGTGATGAGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTAT 6652578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGGTGATGAGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTAT 2400

  6652579 AACTACCAGGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTT 6652638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AACTACCAGGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTT 2460

  6652639 AATATCATCCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTT 6652698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AATATCATCCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTT 2520

  6652699 TTGGAGGAAGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGC 6652758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTGGAGGAAGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGC 2580

  6652759 ACATGAAATTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTG 6652818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ACATGAAATTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTG 2640

  6652819 AAAGCACACAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAAT 6652878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAAGCACACAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAAT 2700

  6652879 GCTGTATGTTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACC 6652938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCTGTATGTTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACC 2760

  6652939 TGTGAATTATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTG 6652998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TGTGAATTATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTG 2820

  6652999 CTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTG 6653058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTG 2880

  6653059 CCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATAT 6653118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATAT 2940

  6653119 CTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTA 6653178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTA 3000

  6653179 TTGCCCCTGTGTATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTT 6653238
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 TTGCCCCTGTATATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTT 3060

  6653239 GTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTT 6653298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTT 3120

  6653299 TTTTTTCCATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTA 6653358
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTTTT-CCATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTA 3179

  6653359 GAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATG 6653418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATG 3239

  6653419 TACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGAT 6653478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 TACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGAT 3299

  6653479 AGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAAC 6653538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 AGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAAC 3359

  6653539 ATGTATCCGTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTG 6653598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 ATGTATCCGTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTG 3419

  6653599 TAAACTATACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATA 6653658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 TAAACTATACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATA 3479

  6653659 TTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTT 6653718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3480 TTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTT 3539

  6653719 AATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTC 6653778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 AATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTC 3599

  6653779 CTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCAT 6653838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 CTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCAT 3659

  6653839 CATGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACC 6653898
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 CAAGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACC 3719

  6653899 AAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACC 6653958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 AAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACC 3779

  6653959 CACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCT 6654018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 CACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCT 3839

  6654019 TTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTT 6654078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 TTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTT 3899

  6654079 TTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTC 6654138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 TTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTC 3959

  6654139 ACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATAT 6654198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 ACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATAT 4019

  6654199 AGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCT 6654258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 AGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCT 4079

  6654259 ATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATT 6654318
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 ATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATT 4139

  6654319 TTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACC 6654378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACC 4199

  6654379 TACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACT 6654438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 TACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACT 4259

  6654439 GCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTT 6654498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 GCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTT 4319

  6654499 GGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGA 6654558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 GGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGA 4379

  6654559 TATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGAT 6654618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 TATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGAT 4439

  6654619 GATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAAC 6654678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 GATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAAC 4499

  6654679 GTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCAC 6654738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 GTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCAC 4559

  6654739 TGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTAT 6654798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 TGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTAT 4619

  6654799 TTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCAT 6654858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 TTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCAT 4679

  6654859 TAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATA 6654918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 TAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATA 4739

  6654919 ACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCC 6654978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 ACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCC 4799

  6654979 CCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCT 6655038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 CCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCT 4859

  6655039 TTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTT 6655098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 TTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTT 4919

  6655099 TCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGA 6655158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 TCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGA 4979

  6655159 TTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTC 6655218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 TTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTC 5039

  6655219 TCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTC 6655278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 TCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTC 5099

  6655279 CCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAA 6655338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 CCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAA 5159

  6655339 ACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGA 6655398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 ACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGA 5219

  6655399 AATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGT 6655458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 AATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGT 5279

  6655459 CTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACA 6655518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 CTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACA 5339

  6655519 GACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATC 6655578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 GACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATC 5399

  6655579 ATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATT 6655638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 ATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATT 5459

  6655639 CTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATG 6655697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
     5460 CTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATG 5519

  6655698 TCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAG 6655757
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     5520 TCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTTAGAGGTCAAG 5579

  6655758 TGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAA 6655817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 TGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAA 5639

  6655818 GAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGT 6655857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 GAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGT 5679

EXCISED REGION

  6655862 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAG 6655921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5680 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAA 5739

  6655922 TGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 6655981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5740 TGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 5799

  6655982 CGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATT 6656041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5800 CGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATT 5859

  6656042 TTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATG 6656101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5860 TTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATG 5919

  6656102 ATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGC 6656161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5920 ATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGC 5979

  6656162 CTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGC 6656221
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5980 CTTGTAGGTAGGCTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGC 6039

  6656222 AAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATT 6656281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6040 AAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATT 6099

  6656282 ACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAAT 6656341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6100 ACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAAT 6159

  6656342 ACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGA 6656401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6160 ACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGA 6219

  6656402 CTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAA 6656461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6220 CTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAA 6279

  6656462 CTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCAT 6656521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6280 CTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCAT 6339

  6656522 ACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAG 6656581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6340 ACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAG 6399

  6656582 GCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTT 6656641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6400 GCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTT 6459

  6656642 TATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAA 6656701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6460 TATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAA 6519

  6656702 TAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGT 6656761
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6520 TAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGT 6579

  6656762 TTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCA 6656821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6580 TTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCA 6639

  6656822 TCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATG 6656881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6640 TCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATG 6699

  6656882 TAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAG 6656941
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6700 TAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAG 6759

  6656942 TGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGT 6657001
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     6760 TGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATTATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGT 6819

  6657002 AAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTT 6657061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6820 AAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTT 6879

  6657062 GGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACA 6657121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6880 GGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACA 6939

  6657122 GCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTG 6657181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6940 GCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTG 6999

  6657182 AAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAA 6657241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7000 AAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAA 7059

  6657242 AAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAA 6657301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7060 AAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAA 7119

  6657302 CTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAA 6657361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7120 CTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAA 7179

  6657362 TTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTATCATGGCATTAACTCAGAAGAGAAAC 6657421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     7180 TTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAACATGGCATTAACTCAGAAGAGAAAC 7239

  6657422 ATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTT 6657447
          ||||||||||||||||||||||||||
     7240 ATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTT 7265

Alignment time is 10.5041 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   4453] =>      4453 nucs 'mol-32-3403-071751_4453'

Score:        4320
Aligned:      4452        nucs
Identic:      4440 (100%) nucs =>      2745 (100%)      1695 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6653112,6655861] EXCISED REGION [6655862,6657562]
 second seq =>  [      1,   2750] EXCISED REGION [   2753,   4453]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2751,2752]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        22 nucs [2751,2772] to [2753,2774]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2751,2751] to [2752,2752]

  6653112 TTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCA 6653171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCA 60

  6653172 GCAATTATTGCCCCTGTGTATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTG 6653231
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAATTATTGCCCCTGTATATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTG 120

  6653232 GTCCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTT 6653291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTCCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTT 180

  6653292 CTTTTTTTTTTTTCCATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCA 6653351
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTTTTTTTTTTT-CCATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCA 239

  6653352 AGCTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCT 6653411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 AGCTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCT 299

  6653412 GTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGA 6653471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 GTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGA 359

  6653472 AGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCAC 6653531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 AGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCAC 419

  6653532 AAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGA 6653591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 AAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGA 479

  6653592 GTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCT 6653651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 GTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCT 539

  6653652 GCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCC 6653711
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 GCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCC 599

  6653712 CAACGTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTT 6653771
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 CAATGTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTT 659

  6653772 CCTTTTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAA 6653831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CCTTTTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAA 719

  6653832 AGACCATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTAT 6653891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 AGACCATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTAT 779

  6653892 CAACACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTT 6653951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 CAACACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTT 839

  6653952 ACAAACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCT 6654011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 ACAAACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCT 899

  6654012 AAATGCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGA 6654071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 AAATGCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGA 959

  6654072 GTCAGTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTA 6654131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GTCAGTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTA 1019

  6654132 ATTGTTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACA 6654191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ATTGTTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACA 1079

  6654192 TTCATATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCT 6654251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTCATATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCT 1139

  6654252 TTACCCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTG 6654311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1140 TTACCCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTG 1199

  6654312 ACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAA 6654371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAA 1259

  6654372 TAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTA 6654431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTA 1319

  6654432 GAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTG 6654491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTG 1379

  6654492 AGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGT 6654551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 AGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGT 1439

  6654552 ACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATG 6654611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 ACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATG 1499

  6654612 TGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAA 6654671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAA 1559

  6654672 AGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTT 6654731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTT 1619

  6654732 TGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTT 6654791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTT 1679

  6654792 TTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACT 6654851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACT 1739

  6654852 TTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAAT 6654911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAAT 1799

  6654912 ATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTT 6654971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTT 1859

  6654972 CTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTT 6655031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 CTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTT 1919

  6655032 ACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAA 6655091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 ACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAA 1979

  6655092 GGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACT 6655151
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACT 2039

  6655152 GTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCT 6655211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCT 2099

  6655212 GACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAAC 6655271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAAC 2159

  6655272 TAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAG 6655331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAG 2219

  6655332 CCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCC 6655391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCC 2279

  6655392 ATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAG 6655451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 ATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAG 2339

  6655452 AAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAAT 6655511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAAT 2399

  6655512 CCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTG 6655571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 CCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTG 2459

  6655572 TCCAATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAAC 6655631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TCCAATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAAC 2519

  6655632 AATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATT 6655691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 AATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATT 2579

  6655692 TT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGA 6655750
          || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     2580 TTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTTAGA 2639

  6655751 GGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATAT 6655810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 GGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATAT 2699

  6655811 TTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC 6655861
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC 2750

EXCISED REGION

  6655862 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAG 6655921
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     2753 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAA 2812

  6655922 TGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 6655981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 TGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTC 2872

  6655982 CGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATT 6656041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 CGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATT 2932

  6656042 TTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATG 6656101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 TTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATG 2992

  6656102 ATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGC 6656161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 ATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGC 3052

  6656162 CTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGC 6656221
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 CTTGTAGGTAGGCTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGC 3112

  6656222 AAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATT 6656281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 AAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATT 3172

  6656282 ACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAAT 6656341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 ACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAAT 3232

  6656342 ACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGA 6656401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 ACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGA 3292

  6656402 CTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAA 6656461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 CTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAA 3352

  6656462 CTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCAT 6656521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 CTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCAT 3412

  6656522 ACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAG 6656581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 ACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAG 3472

  6656582 GCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTT 6656641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 GCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTT 3532

  6656642 TATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAA 6656701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 TATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAA 3592

  6656702 TAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGT 6656761
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 TAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGT 3652

  6656762 TTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCA 6656821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3653 TTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCA 3712

  6656822 TCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATG 6656881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 TCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATG 3772

  6656882 TAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAG 6656941
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 TAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAG 3832

  6656942 TGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGT 6657001
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3833 TGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATTATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGT 3892

  6657002 AAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTT 6657061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 AAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTT 3952

  6657062 GGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACA 6657121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 GGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACA 4012

  6657122 GCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTG 6657181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 GCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTG 4072

  6657182 AAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAA 6657241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 AAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAA 4132

  6657242 AAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAA 6657301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 AAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAA 4192

  6657302 CTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAA 6657361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 CTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAA 4252

  6657362 TTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTATCATGGCATTAACTCAGAAGAGAAAC 6657421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4253 TTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAACATGGCATTAACTCAGAAGAGAAAC 4312

  6657422 ATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGGGAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAAT 6657481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 ATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGGGAACCCTTTTCCTCCTACTCTGAAT 4372

  6657482 TTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATTGTTTTACTTTTAAAGTAATATTATT 6657541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 TTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATTGTTTTACTTTTAAAGTAATATTATT 4432

  6657542 GTATGCTTTTAAAGTTTTACT 6657562
          |||||||||||||||||||||
     4433 GTATGCTTTTAAAGTTTTACT 4453

Alignment time is 6.60328 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   2119] =>      2119 nucs 'mol-32-3403-131148_2119'

Score:        2037
Aligned:      2109        nucs
Identic:      2100 (100%) nucs =>      1808 (100%)       292 ( 99%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6649148,6650959] EXCISED REGION [6650970,6651261]
 second seq =>  [      1,   1814] EXCISED REGION [   1825,   2119]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [1815,1824]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [1860,1862]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6649148 TGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTAT 6649207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTAT 60

  6649208 TTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTC 6649267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTC 120

  6649268 TGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAG 6649327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAG 180

  6649328 AGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAG 6649387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAG 240

  6649388 AGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGG 6649447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGG 300

  6649448 GCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCC 6649507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCC 360

  6649508 AGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATG 6649567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATG 420

  6649568 GTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTAT 6649627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTAT 480

  6649628 CTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTT 6649687
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCATTAGGAGAGGACAACTGGAAGCCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTT 540

  6649688 GCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCA 6649747
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCA 600

  6649748 TGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGG 6649807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGG 660

  6649808 TAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTC 6649867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTC 720

  6649868 CTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTG 6649927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTG 780

  6649928 TTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGAC 6649987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGAC 840

  6649988 AGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACT 6650047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACT 900

  6650048 TCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAG 6650107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAG 960

  6650108 GTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTT--GGTAGAAACAGGGTTTCAT 6650165
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
      961 GTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCAT 1020

  6650166 CTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCC 6650225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCC 1080

  6650226 AAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCA 6650285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCA 1140

  6650286 TCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTT 6650345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTT 1200

  6650346 TCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGC 6650405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGC 1260

  6650406 CAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAAT 6650465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAAT 1320

  6650466 TTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTG 6650525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTG 1380

  6650526 TATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTC 6650585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTC 1440

  6650586 CTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTC 6650645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTC 1500

  6650646 CTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCT 6650705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCT 1560

  6650706 CCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGT 6650765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGT 1620

  6650766 GGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCT 6650825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCT 1680

  6650826 CTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCT 6650885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCT 1740

  6650886 GCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCTCTG 6650945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1741 GCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCTCTG 1800

  6650946 ATCTCCCTTGCAGG 6650959
          ||||||||||||||
     1801 ATCTCCCTTGCAGG 1814

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     1825 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 1884

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 1944

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 2004

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 2064

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTG 6651261
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTG 2119

Alignment time is 3.52912 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   5907] =>      5907 nucs 'mol-32-3419-040850_5907'

Score:        5720
Aligned:      5907        nucs
Identic:      5890 (100%) nucs =>        26 (100%)      5864 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6654262,6654287] EXCISED REGION [6654289,6660167]
 second seq =>  [      1,     26] EXCISED REGION [     28,   5907]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6654288,6654288]
 second seq =>         1 nucs [27,27]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [6659574,6659574]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6654287,6654287] to [6654289,6654289]
 second seq =>         1 nucs [26,26] to [28,28]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6654262 GTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCA 6654287
          ||||||||||||||||||||||||||
        1 GTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCA 26

EXCISED REGION

  6654289 ATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTC 6654348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       28 ATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTC 87

  6654349 ACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGA 6654408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       88 ACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGA 147

  6654409 TCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTA 6654468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      148 TCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTA 207

  6654469 ATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATG 6654528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      208 ATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATG 267

  6654529 ACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGA 6654588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      268 ACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGA 327

  6654589 TGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAA 6654648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      328 TGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAA 387

  6654649 GACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTG 6654708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      388 GACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTG 447

  6654709 GGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGT 6654768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      448 GGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGT 507

  6654769 CATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTA 6654828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      508 CATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTA 567

  6654829 ACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTA 6654888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      568 ACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTA 627

  6654889 GTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTT 6654948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      628 GTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTT 687

  6654949 ATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTC 6655008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      688 ATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTC 747

  6655009 ACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATG 6655068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      748 ACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATG 807

  6655069 CCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACT 6655128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      808 CCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACT 867

  6655129 GAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGC 6655188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      868 GAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGC 927

  6655189 CTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCT 6655248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      928 CTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCT 987

  6655249 CCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCA 6655308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      988 CCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCA 1047

  6655309 GAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGA 6655368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1048 GAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGA 1107

  6655369 CTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAG 6655428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1108 CTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAG 1167

  6655429 GTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCA 6655488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1168 GTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCA 1227

  6655489 TGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATT 6655548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 TGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATT 1287

  6655549 AGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTG 6655608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1288 AGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTG 1347

  6655609 AACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGC 6655668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 AACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGC 1407

  6655669 TCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCA 6655727
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 TCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCA 1467

  6655728 GTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCC 6655787
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 GTGATTTTAGATAAACCTTTAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCC 1527

  6655788 AAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTT 6655847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 AAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTT 1587

  6655848 GTTTGGAGGTAGAC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGC 6655906
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 GTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGC 1647

  6655907 CAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAG 6655966
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 CAGGCTGGAGTACAATGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAG 1707

  6655967 CGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCA 6656026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 CGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCA 1767

  6656027 GCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGA 6656086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 GCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGA 1827

  6656087 TCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 6656146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 TCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGA 1887

  6656147 GCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCT 6656206
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 GCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGGCTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCT 1947

  6656207 TCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGG 6656266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 TCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGG 2007

  6656267 TAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGA 6656326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 TAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGA 2067

  6656327 ACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGG 6656386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 ACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGG 2127

  6656387 CTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTC 6656446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 CTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTC 2187

  6656447 TTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAG 6656506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 TTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAG 2247

  6656507 CTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAAT 6656566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 CTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAAT 2307

  6656567 AATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGG 6656626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 AATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGG 2367

  6656627 TTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGT 6656686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 TTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGT 2427

  6656687 GAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGA 6656746
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 GAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGA 2487

  6656747 AAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCA 6656806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 AAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCA 2547

  6656807 GCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTG 6656866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2548 GCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTG 2607

  6656867 TTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTA 6656926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2608 TTGCAAGAATGAATGTAAAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTA 2667

  6656927 ATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCCTTATGGAGGT 6656986
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2668 ATCACCTCTTCCAAGTGTAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATTATCCTTATGGAGGT 2727

  6656987 GAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATTTCAT 6657046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2728 GAGAATCATTTACGTAAACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATTTCAT 2787

  6657047 TAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATGAG 6657106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2788 TAAGTGCCAGATTTTGGTCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATGAG 2847

  6657107 TATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAA 6657166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2848 TATTCTAGGAGGACAGCATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAA 2907

  6657167 ATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACAT 6657226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2908 ATGCAACCGCCATTGAAACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACAT 2967

  6657227 TAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAG 6657286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2968 TAGCACACTCTTAAAAAACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAG 3027

  6657287 GTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGA 6657346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3028 GTATCCAAAACCTAACTTCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGA 3087

  6657347 AATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTATCATGGCATTA 6657406
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     3088 AATAAATGAATGTAATTTCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTAACATGGCATTA 3147

  6657407 ACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGGGAACCCTTTT 6657466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3148 ACTCAGAAGAGAAACATCTTACTTTTCCCAAATTACAATTTTATTTTAGGGAACCCTTTT 3207

  6657467 CCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATTGTTTTACTTT 6657526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3208 CCTCCTACTCTGAATTTCAATCTAATATTGTTTTCAAATTAGCTTTTATTGTTTTACTTT 3267

  6657527 TAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAAAATAAAAAAA 6657586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3268 TAAAGTAATATTATTGTATGCTTTTAAAGTTTTACTCCAAAAGGAAGAAAAATAAAAAAA 3327

  6657587 AGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCATAATTTAAAAC 6657646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3328 AGTTGCAGCTTTAAAAAATTTCTAAAATATAGAAAAATGACTTACAGCATAATTTAAAAC 3387

  6657647 AGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTCTGTTACCTGT 6657706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3388 AGTTCTAGTGAACATTTGATTTGTAGAGAGCTTTTGGTCTGAGAGCTCTCTGTTACCTGT 3447

  6657707 GACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAACCTGATATTT 6657766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3448 GACTAATCAGTACACAAACCAAGGGGCAGCATTAGGAATTTTTATAACAACCTGATATTT 3507

  6657767 TCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCAGAGAGGAAAA 6657826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3508 TCATAGTATTTTTACTGTATTTTCCAAATATTGTCATCTGCTATGGTCCAGAGAGGAAAA 3567

  6657827 ACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATAGGTCTTACTT 6657886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3568 ACATTCTTTAACACAGAAACATTAAGAAACATTGAATTTTAAAAGACATAGGTCTTACTT 3627

  6657887 TCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTTTTTATTATTT 6657946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3628 TCTTAAATGGAACATATGATAACTAGAAACATTATCTTAAATATTTCGTTTTTATTATTT 3687

  6657947 GATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAATAGTCCAGAT 6658006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3688 GATTAACTTTTTTCAGATTTTTTCCCAAAAAGAGGTATATGCCTATTAAATAGTCCAGAT 3747

  6658007 ATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACATAACCTTTCTT 6658066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3748 ATTTCAAGTATCTTAAATTAGCCATTGATTCTTTAACTGTATTTGAACATAACCTTTCTT 3807

  6658067 ACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAAGCATTGGACT 6658126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3808 ACAAACTCATATTTGTGTGCTGCTTTGAGATTCTTCTTACTTTGTGCCAAGCATTGGACT 3867

  6658127 AAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGACAGCATGGTG 6658186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3868 AAGCATTTGATATGTCACTATTTGATTTAATTATGAAAATGATAAAATGACAGCATGGTG 3927

  6658187 TGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAATAGTTGATGCA 6658246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3928 TGTTATCTCATGCCTTATAATCAGGATGAGGGCACAGTTTTCCCGTGAATAGTTGATGCA 3987

  6658247 TAGAACGAACTATGAATGAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAGGCAGAAAAAG 6658306
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3988 TAGAACGAACTATGAATCAACACTTGCTCAATGTATTTCAAGGAACTAAGGCAGAAAAAG 4047

  6658307 CTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCTGTGGTTTGGA 6658366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4048 CTGAAATTTAAGCCTGGAAGATGGTGGGTAAAGAAATCAGGAAAATTTCTGTGGTTTGGA 4107

  6658367 TGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGGATATTTGAAT 6658426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4108 TGGGCCAATCAAAGGAATCGAGAAACATTTTGTTGTAGAGAAAAGACTGGATATTTGAAT 4167

  6658427 CATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGACTTAATTCTG 6658486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4168 CATATAAGTCTACATTTGAATACCCATTTCAGCTCACACAAGCTATGTGACTTAATTCTG 4227

  6658487 GTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAATTGTGGAGGG 6658546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4228 GTCACTTGAACATTCTTTCCCACAATTTCTCAATTTAAATGAGGTAATAATTGTGGAGGG 4287

  6658547 TCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCTTTGTTACTTT 6658606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4288 TCATTTGTATTGGCTTTATAACACTCTTTCTGACGATTCCATGCATGCCTTTGTTACTTT 4347

  6658607 TGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACAGTTCTGGATG 6658666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4348 TGAGCCTTCCCAGCCTCTACAGTGCATTTCCTGGCTCACTTGCAGCTACAGTTCTGGATG 4407

  6658667 TGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGAATTTGGAGTT 6658726
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     4408 TGATTTTAGTTTTGCAGATCACATGTACTCCTTGGAGTCTCAGATTTGGAACTTGGAGTT 4467

  6658727 CCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAATTCCCTTCCCA 6658786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4468 CCATTTGACTCACGGAGATCCTGGCACAAGTGGATCAACGGCCGAGCAATTCCCTTCCCA 4527

  6658787 CACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAGTCTGGAGTCT 6658846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4528 CACTAGACACAGAAGTTACCTGGGCAGCCCAGGTATGGCCCCAGCCTGAGTCTGGAGTCT 4587

  6658847 ATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATAACAGAAAAAA 6658906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4588 ATTCCTTTACTTTTCTATGATGATAAGCTTTTCTTATTTAGGTATTTATAACAGAAAAAA 4647

  6658907 AAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTTAACTCTGACCCATAAGTT 6658966
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4648 AAATCTAGTCTCTACAGATGAACCCTAAACAAGACAGCATTCAACTCTGACCCATAAGTT 4707

  6658967 GCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATGTAAAATGTTTAGTCCAATGCTTATC 6659026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     4708 GCATTATTTTGGTAATTAAATGAGATAGTTACATATAAAATGTTTAGTCCAATGCTTATC 4767

  6659027 ACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTTACATGCCTAA 6659086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4768 ACAGAGTAAGAGCTAAGTATTAGCTTCTCCTTTTCCCCTTATGATAGTTTACATGCCTAA 4827

  6659087 TGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGATATACTCTTT 6659146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4828 TGAAGTTTGATGTGAACTTGCCTGAAGATAGAAAAATTAAATCATTTTGATATACTCTTT 4887

  6659147 AATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAGTGTGTTATAA 6659206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4888 AATTATGTTGGTGGCTACATATGACTTAATACAGAAAGACATAGAGATAGTGTGTTATAA 4947

  6659207 TGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGCTTATCTAAGT 6659266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4948 TGATAGAGACATAGAAGAGTGAACAATATTTAGAGCAAAATGATCTAAGCTTATCTAAGT 5007

  6659267 TTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTGCCCTTGAGCAATGTTTTCTGGGATTTATTTGT 6659326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5008 TTAACTCTCAGAACTACTTAATCATTTGCCCTTGAGCAATGTTTTCTGGGATTTATTTGT 5067

  6659327 TCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGTTATATATATTTAATGTTCAACAAGTCTTTAAA 6659386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5068 TCCATCTGTAATGAGAGATGGATTAGGTTATATATATTTAATGTTCAACAAGTCTTTAAA 5127

  6659387 CACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTTCATTTACTCCCAATTTACAGTAGTGATTTAAA 6659446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5128 CACAATTCTGAGACTCAAATTCCAGCTTCATTTACTCCCAATTTACAGTAGTGATTTAAA 5187

  6659447 ACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATTCATTGTTGAAGGAGTGTGATGGCAAACTATGA 6659506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5188 ACATGAGGAGTGTTCACTTTAGATGATTCATTGTTGAAGGAGTGTGATGGCAAACTATGA 5247

  6659507 AGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAACAATTGTAGTAAAGTCATGAAAGGTGAATGAA 6659566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5248 AGAGACTTTCTTTTAAAAACGTGCCTAACAATTGTAGTAAAGTCATGAAAGGTGAATGAA 5307

  6659567 ACAATGTAAATATATATATAGTGAGAATGGTACAGGTTGAGCATCCCTTTTCCAAAATGA 6659626
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5308 ACAATGT-AATATATATATAGTGAGAATGGTACAGGTTGAGCATCCCTTTTCCAAAATGA 5366

  6659627 TTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGAATTTTTCAGATTTTGGAATATTTGTTTACATA 6659686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5367 TTGGAGCAAGAAGTGTCTTGGATTTTGAATTTTTCAGATTTTGGAATATTTGTTTACATA 5426

  6659687 AGGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAGTCTAAATACATTTATTTGTGTTTTGTTTACAC 6659746
          |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     5427 ATGAGATATCTTGGGGATGAGACTCAAGTCTAAATACATTTATTTATGTTTTGTTTACAC 5486

  6659747 TTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTTATATAATGTTTTAGTAGCTGTGGGGCATCGTG 6659806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5487 TTTATACACATAACCTGGAGGTCATTTTATATAATGTTTTAGTAGCTGTGGGGCATCGTG 5546

  6659807 AAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCTGGACACATGCCATTTTATTACACTCTGCATGT 6659866
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5547 AAGAGCTTGCTGTTGGTGAGACTGGTCTGGACACATGCCATTTTATTACACTCTGGATGT 5606

  6659867 GCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGTGAAAAAGATATATCATAGCTGAAGGGGCCTGG 6659926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5607 GCTTGCTTGGGGGGATATGGGTACCTGTGAAAAAGATATATCATAGCTGAAGGGGCCTGG 5666

  6659927 GAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTGAATAAACTGTGTATTGTTCATCTGTGATTTGA 6659986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5667 GAGGATCTTCTCTCCTTTAGAGACACTGAATAAACTGTGTATTGTTCATCTGTGATTTGA 5726

  6659987 CTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGATGTGGAATTTTCCATTTGTGACATCATGTTGA 6660046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5727 CTGTAACCCATCATCACATGAGGTCAGATGTGGAATTTTCCATTTGTGACATCATGTTGA 5786

  6660047 CAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACATCAGATTAGGGAGACTCAGTCTATACATTGTG 6660106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5787 CAGTCAAAAAGTTTCAAACTTCTGAACATCAGATTAGGGAGACTCAGTCTATACATTGTG 5846

  6660107 TAATTTTCAGGGGACCAGAGGAATTGAACTTAGTTTAGTTTGTCATATCAGTGGGATTTT 6660166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5847 TAATTTTCAGGGGACCAGAGGAATTGAACTTAGTTTAGTTTGTCATATCAGTGGGATTTT 5906

  6660167 C 6660167
          |
     5907 C 5907

Alignment time is 8.58018 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   4143] =>      4143 nucs 'mol-32-3419-055035_4143'

Score:        4019
Aligned:      4074        nucs
Identic:      4069 (100%) nucs =>      1819 (100%)      2250 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648340,6650160] EXCISED REGION [6654638,6656889]
 second seq =>  [      1,   1820] EXCISED REGION [   1892,   4143]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      4477 nucs [6650161,6654637]
 second seq =>        71 nucs [1821,1891]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650161,6650161] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1820,1820] to [1891,1891]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6650160,6650160] to [6654638,6654638]
 second seq =>         1 nucs [1820,1820] to [1892,1892]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6648340 GTTTGTGTCTTTTGAGAAACCTTTTCATCTAAGTTGTCAAATTTATGCATGTAAAGTTGT 6648399
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTTGTGTCTTTTGAGAAACCTTTTCATCTAAGTTGTCAAATTTATGCATGTAAAGTTGT 60

  6648400 TTATTAGTTCTCTGTCCAAATCCTTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGGTTATCTTGTT 6648459
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
       61 TTATTAGTTCTCTGTCCAAATCCTTTTATTATCTCTGTGTTCTGCAGTGATTATCTTGTT 120

  6648460 TTGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGAC 6648519
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTTAGAC 180

  6648520 ATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCAT 6648579
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCTCCAT 240

  6648580 TGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCT 6648639
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCT 300

  6648640 GTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCT 6648699
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTTCTCT 360

  6648700 CTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGT 6648759
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAATTGT 420

  6648760 TATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCAT 6648819
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTCATCAT 480

  6648820 TTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGT 6648879
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGT 540

  6648880 TGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTT 6648939
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTT 600

  6648940 CAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACG 6648999
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCACCACG 660

  6649000 CCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGT 6649059
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGT 720

  6649060 CTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 6649119
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACA 780

  6649120 GGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTG 6649179
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTG 840

  6649180 TTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAA 6649239
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAA 900

  6649240 AAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGT 6649299
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AAAA-TTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGGAGGT 959

  6649300 GAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCA 6649359
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCA 1019

  6649360 CACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTA 6649419
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 CACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAGTCTA 1079

  6649420 ATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGT 6649479
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 ATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGT 1139

  6649480 CTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAA 6649539
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTAGAAA 1199

  6649540 CTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATT 6649599
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 CTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAATTATT 1259

  6649600 CATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGG 6649659
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 CATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCACAGG 1319

  6649660 TTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTA 6649719
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTA 1379

  6649720 TCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAG 6649779
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAG 1439

  6649780 TTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGT 6649839
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATTTGGT 1499

  6649840 ATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCAT 6649899
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 ATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGCCCAT 1559

  6649900 CTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTT 6649959
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGCTCTT 1619

  6649960 CTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGC 6650019
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGC 1679

  6650020 AGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCC 6650079
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCC 1739

  6650080 TCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTT 6650139
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTTTTTT 1799

  6650140 TTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 6650160
          |||||||||||||||||||||
     1800 TTTTTTTGGTAGAAACAGGGT 1820

EXCISED REGION

  6654638 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 6654697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1892 TAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGC 1951

  6654698 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 6654757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1952 AAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGA 2011

  6654758 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 6654817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2012 TGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGC 2071

  6654818 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 6654877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2072 CCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTAT 2131

  6654878 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 6654937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2132 CATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTA 2191

  6654938 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 6654997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2192 AAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCT 2251

  6654998 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 6655057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2252 TACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTT 2311

  6655058 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 6655117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2312 GTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTT 2371

  6655118 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 6655177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2372 TTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCC 2431

  6655178 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 6655237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2432 AACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTT 2491

  6655238 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 6655297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2492 AGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGT 2551

  6655298 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 6655357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 CACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACT 2611

  6655358 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 6655417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 AACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTG 2671

  6655418 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 6655477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 TTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAG 2731

  6655478 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 6655537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 GAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACA 2791

  6655538 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 6655597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 TTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGC 2851

  6655598 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 6655657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 CATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTC 2911

  6655658 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 6655716
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     2912 ATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCT 2971

  6655717 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 6655776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 GCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCC 3031

  6655777 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 6655836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 CCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGA 3091

  6655837 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 6655896
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 GGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGAC-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTT 3150

  6655897 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 6655956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 GCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTGGTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCC 3210

  6655957 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 6656016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 TGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCGCCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATC 3270

  6656017 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 6656076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 ACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTTTGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGA 3330

  6656077 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 6656136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 CTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGATCCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATT 3390

  6656137 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 6656196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 ACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCTTGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAG 3450

  6656197 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 6656256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3451 TCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAAATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGT 3510

  6656257 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 6656316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 ATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTACAGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAA 3570

  6656317 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 6656376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 TTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATACATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCA 3630

  6656377 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 6656436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 GCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACTTGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCA 3690

  6656437 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 6656496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 TTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACTACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTC 3750

  6656497 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 6656556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3751 CTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATACTGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTT 3810

  6656557 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 6656616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3811 AATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGCCTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAG 3870

  6656617 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 6656676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3871 GTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTATTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCA 3930

  6656677 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 6656736
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3931 TAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATAAAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGA 3990

  6656737 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 6656796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3991 AGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTTATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAA 4050

  6656797 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 6656856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4051 TGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATCTCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAAC 4110

  6656857 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATA 6656889
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4111 TTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTAAAAATA 4143

Alignment time is 6.18436 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   4544] =>      4544 nucs 'mol-32-3492-067618_4544'

Score:        4426
Aligned:      4536        nucs
Identic:      4526 (100%) nucs =>      2999 (100%)      1527 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6652856,6655858] EXCISED REGION [6655864,6657395]
 second seq =>  [      1,   3004] EXCISED REGION [   3008,   4539]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [6655859,6655863]
 second seq =>         3 nucs [3005,3007]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6652856 ATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGG 6652915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGG 60

  6652916 GCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTT 6652975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTT 120

  6652976 TCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTT 6653035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTT 180

  6653036 ATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAG 6653095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAG 240

  6653096 AAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGT 6653155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGT 300

  6653156 CTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGTGTATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTG 6653215
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGTATATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTG 360

  6653216 CGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCT 6653275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCT 420

  6653276 GACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTT 6653335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTT 480

  6653336 GTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTT 6653395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTT 540

  6653396 TCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAA 6653455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAA 600

  6653456 AGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTAT 6653515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTAT 660

  6653516 TGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAA 6653575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAA 720

  6653576 ATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTC 6653635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTC 780

  6653636 TCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGT 6653695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGT 840

  6653696 GAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTT 6653755
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAACTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTT 900

  6653756 TGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAA 6653815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAA 960

  6653816 TCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATC 6653875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATC 1020

  6653876 CAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGC 6653935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGC 1080

  6653936 ATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAAT 6653995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAAT 1140

  6653996 TACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGA 6654055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGA 1200

  6654056 ACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCA 6654115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCA 1260

  6654116 TATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAA 6654175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAA 1320

  6654176 TTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAA 6654235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAA 1380

  6654236 AAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTA 6654295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1381 AAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCCTGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTA 1440

  6654296 ATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTT 6654355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGATTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTT 1500

  6654356 CATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTAT 6654415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGAGTTGGGAGACTAAATGAGATCATTAT 1560

  6654416 AATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCA 6654475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAGATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCA 1620

  6654476 CTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGC 6654535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGATTTAGGTATAGCACTTATGACAATGC 1680

  6654536 CTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGAT 6654595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATGATGAGGATGATAGTGATGATGGTGAT 1740

  6654596 GATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATT 6654655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGATAATTATGTAATTGATGAAGACAATT 1800

  6654656 ACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATG 6654715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTTGGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATG 1860

  6654716 AAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCAT 6654775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAGCTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCAT 1920

  6654776 AAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTA 6654835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCAGAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTA 1980

  6654836 TATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCT 6654895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAAGAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCT 2040

  6654896 CCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAA 6654955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAACATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAA 2100

  6654956 TATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAA 6655015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAATTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAA 2160

  6655016 TATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTG 6655075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGGGCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTG 2220

  6655076 CAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATT 6655135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGAATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATT 2280

  6655136 CTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAA 6655195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCAACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAA 2340

  6655196 GCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTA 6655255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCCTGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTA 2400

  6655256 GGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACAC 6655315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCAAGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACAC 2460

  6655316 CTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTG 6655375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATTACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTG 2520

  6655376 TGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAA 6655435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGACCTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAA 2580

  6655436 GATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAG 6655495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATACCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAG 2640

  6655496 AGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTA 6655555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCTAATAGACATTTAGTCTATTAGAATTA 2700

  6655556 GATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGA 6655615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACACAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGA 2760

  6655616 GCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATG 6655675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTTGGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATG 2820

  6655676 TACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTT 6655734
          |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCCATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTT 2880

  6655735 TAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCA 6655794
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAGATAAACCTTTAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTTCTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCA 2940

  6655795 AGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGA 6655854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGGATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGA 3000

  6655855 GGTA 6655858
          ||||
     3001 GGTA 3004

EXCISED REGION

  6655864 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAGTG 6655923
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     3008 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGAGAAGGAATCTTGCTCTGTTGCCAGGCTGGAGTACAATG 3067

  6655924 GTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCG 6655983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 GTGCAATCTTGACTCACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCCG 3127

  6655984 CCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTT 6656043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 CCTCCCGAGGAGCTGAGACTACAGGCGCACATCACCAAGCCCAGCTAATTTTTGTATTTT 3187

  6656044 TGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGAT 6656103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 TGGTAGAGACGGGGTTTCACCATATTGGCCAGACTGGTCTCGATCTCTTGACCTCATGAT 3247

  6656104 CCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCT 6656163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 CCACCTGCCTCGGCCTCCTGAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCACTGTGCCCAGCCT 3307

  6656164 TGTAGGTAGACTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAA 6656223
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 TGTAGGTAGGCTTTTAAAAGCTTTCAGGCTCAGTCTTTAGGCTTCATAGCATAAAAGCAA 3367

  6656224 ATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTAC 6656283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 ATAGCTGTTCCATGATTGGCTTGTATAATGAGTATGTCAATGGTAGTCACACCAGATTAC 3427

  6656284 AGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATAC 6656343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 AGTATGAAGCCCTTTCTCTGTAACTGTCCTAAATTAGGAAGGAACTCTGGAACACAATAC 3487

  6656344 ATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACT 6656403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 ATCCAATAATGACAAATGTTGTAGTTTTCATCAGCCCAATAGGCTTTTAAGAATGAGACT 3547

  6656404 TGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACT 6656463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 TGGATTTAGTTTTGTCACCTGAAAGCATAATCATTGATAATTCTTGTATACTCTAAAACT 3607

  6656464 ACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATAC 6656523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 ACATTCACAGAGCTTACCCAGAGAAATTTGGTCCTTTTATCAGCTTTGTCCCTGTCATAC 3667

  6656524 TGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGC 6656583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 TGAGATATAAACCTTAATCATCCAAGAGAGTTTAATACTTAATAATCTGAGCTCCAAGGC 3727

  6656584 CTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTA 6656643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 CTGCCCTTGTCTTATAGCCACTCTTTGGAGGAGGTACAAAAGGTTTTTAACTAATCTTTA 3787

  6656644 TTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATA 6656703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 TTCAAGGATACGTCGTAAAAAGTTCTGGAGGCATAAACAGTGTGAGCTTCCCTGAGAATA 3847

  6656704 AAACAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTT 6656763
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 AAGCAGAACAAACACACTAAGTGGTAATCGAGAAGTCATTCGAAAAAGTTAACTATGTTT 3907

  6656764 ATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATC 6656823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 ATTTTAACTAAAAATTCCAAATCCAGCAATGAATGGTAGAGCAGCAAATGAAACATCATC 3967

  6656824 TCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTA 6656883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 TCGTTGCCACAGACTCCCAAATGTAGCATAAACTTCAGCTTTGTTGCAAGAATGAATGTA 4027

  6656884 AAAATATTCTTCCTTAATGTGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTG 6656943
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 AAAATATTCTTCCTTAATGGGAGCAGCAGACCAGAGGTGTTTAATCACCTCTTCCAAGTG 4087

  6656944 TAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATCATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAA 6657003
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 TAAAATCACTGATGGTAAAACACCTCATTATCCTTATGGAGGTGAGAATCATTTACGTAA 4147

  6657004 ACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGG 6657063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 ACATAAAGTCACCCTTGACAAACAGGGTCTTTGTTGATTTCATTAAGTGCCAGATTTTGG 4207

  6657064 TCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGC 6657123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 TCACCCAGCTTGCCTCTGAGTAGACACACCTCATTTCCATGAGTATTCTAGGAGGACAGC 4267

  6657124 ATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAA 6657183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 ATATGTCATTTGCCAACACACCAGGCAACATCCACATAATAAAATGCAACCGCCATTGAA 4327

  6657184 ACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAA 6657243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 ACTGGGCTAAAAACCAATCCATCCAGTGTTTAATGAGTAACATTAGCACACTCTTAAAAA 4387

  6657244 ACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACT 6657303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 ACACTAATAACAAATTTACTGTTGATTTTAGTGTTGATGGCAGGTATCCAAAACCTAACT 4447

  6657304 TCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAATT 6657363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 TCCTACTAAATTCATTTTAGTAAAAGCAAAAAATAATGAATGAAATAAATGAATGTAATT 4507

  6657364 TCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTA 6657395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 TCAAGTTATTGCCAGAAGTTAGACTTTTATTA 4539

Alignment time is 6.78178 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   3690] =>      3690 nucs 'mol-32-3492-067888_3690'

Score:        3588
Aligned:      3680        nucs
Identic:      3670 (100%) nucs =>      2339 (100%)      1331 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648616,6650959] EXCISED REGION [6650970,6652301]
 second seq =>  [      1,   2345] EXCISED REGION [   2356,   3690]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [2346,2355]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [2391,2393]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6648616 GAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTA 6648675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGCTTTCTCATGTCCTTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTA 60

  6648676 GATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTG 6648735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTATTGATATAAAACTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTG 120

  6648736 TTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTA 6648795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCCAAAAACTATCTTTTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTA 180

  6648796 TATGTTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTA 6648855
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATATTAGAGATAAATTTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTA 240

  6648856 TTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTC 6648915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTTCAGACAGAGTCTCGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTC 300

  6648916 ACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTG 6648975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACTGCAACCTCCGCCTCCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTG 360

  6648976 GGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 6649035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGACTACAGGCACGTGCCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGG 420

  6649036 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTG 6649095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCTCCATGTTGGTCAGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTG 480

  6649096 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTT 6649155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTT 540

  6649156 TTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGG 6649215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTTTTTAATTTCTCTGTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGG 600

  6649216 TTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTT 6649275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTCTGTAGGTATTTGTATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTT 660

  6649276 GATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTT 6649335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GATCTAACTAAGATTTTGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTT 720

  6649336 TGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGA 6649395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGCTTATCTGGGGTCCTTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGA 780

  6649396 CTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAG 6649455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTTGGGCCACACCAGATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAG 840

  6649456 GTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTAT 6649515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GTATCAGCTTGACTCTGCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTAT 900

  6649516 GTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCT 6649575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GTGACCTAATACAAATGCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCT 960

  6649576 TCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAG 6649635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCATATATATTGCCATAAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAG 1020

  6649636 GAGAGGACAACTAGAAGCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCT 6649695
          ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GAGAGGACAACTGGAAGCCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCT 1080

  6649696 CCTGTTAGCTGATTTTAATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATA 6649755
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTGTTAGCTGATTTTAATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATA 1140

  6649756 ACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTG 6649815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ACAACTGTCAGCAGAGTCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTG 1200

  6649816 GGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCC 6649875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGGACCCCAGAACTATTATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCC 1260

  6649876 CCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAG 6649935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTACATTCTGCTATTGAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAG 1320

  6649936 TTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTC 6649995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TTCTAATATTTCCATCTGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTC 1380

  6649996 ACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTC 6650055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ACTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTC 1440

  6650056 CCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGC 6650115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCAGGTTCAAGTGATTCTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGC 1500

  6650116 CACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTT-GGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGC 6650174
          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CACCACTTCTGGCTAATTTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGC 1560

  6650175 CTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTG 6650234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTGGATGGTCTTGAATCTCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTG 1620

  6650235 GGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCT 6650294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGATTACAGGCGTGAGTCACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCT 1680

  6650295 CTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTG 6650354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGCTTAGATTTTCTGTTTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTG 1740

  6650355 TTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTC 6650414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTGTGTATGTTTGTTGAAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTC 1800

  6650415 CTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTA 6650474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTATCATCTCTGTCACCTTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTA 1860

  6650475 GATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTA 6650534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATATTTCTTTTTCTTGCTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTA 1920

  6650535 CTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTT 6650594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTGAGTTTCTGGATCTTATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTT 1980

  6650595 TGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAG 6650654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGACACTGCTCCCCCGGGGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAG 2040

  6650655 AATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCAC 6650714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATGAGTCAAGGTTTCCAGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCAC 2100

  6650715 TGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGT 6650774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGCTGAGTGGAGATTAGAGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGT 2160

  6650775 CAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATA 6650834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGCTTGTTACTGCTGGATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATA 2220

  6650835 CTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACC 6650894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTACCACAATGCAGGGAGAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACC 2280

  6650895 TCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCTCTGATCTCCCTT 6650954
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     2281 TCATGAGGCATTTGCTGTTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCTCTGATCTCCCTT 2340

  6650955 GCAGG 6650959
          |||||
     2341 GCAGG 2345

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     2356 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 2415

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 2475

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 2535

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 2595

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 2655

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 2715

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 2775

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 2835

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 2895

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 2955

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2956 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 3015

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 3075

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 3135

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 3195

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3196 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 3255

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 3315

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 3375

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 3435

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 3495

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 3555

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 6652226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 3615

  6652227 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 6652286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3616 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 3675

  6652287 ATGTTTTATGTGCTA 6652301
          |||||||||||||||
     3676 ATGTTTTATGTGCTA 3690

Alignment time is 5.56216 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   3747] =>      3747 nucs 'mol-32-34a8-176531_3747'

Score:        3634
Aligned:      3737        nucs
Identic:      3726 (100%) nucs =>      2322 (100%)      1404 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648632,6650959] EXCISED REGION [6650970,6652375]
 second seq =>  [      1,   2328] EXCISED REGION [   2339,   3747]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [2329,2338]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [2374,2376]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6648632 TTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAA 6648691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCCTTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAA 60

  6648692 CTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTT 6648751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTTCTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTT 120

  6648752 TTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAAT 6648811
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      121 TTAATTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATATTAGAGATAAAT 180

  6648812 TTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCT 6648871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCATCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCT 240

  6648872 CGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCT 6648931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGCTCTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCT 300

  6648932 CCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTG 6648991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCTGGGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTG 360

  6648992 CCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTC 6649051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCACCACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTC 420

  6649052 AGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTG 6649111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGGCTGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTG 480

  6649112 GGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCT 6649171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGATTACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCT 540

  6649172 GTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTG 6649231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTTTTCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTG 600

  6649232 TATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTT 6649291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TATCGCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTT 660

  6649292 TGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCC 6649351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGGAGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCC 720

  6649352 TTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAG 6649411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAGATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAG 780

  6649412 ATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCT 6649471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAGTCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCT 840

  6649472 GCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAAT 6649531
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GCTGAAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAAT 900

  6649532 GCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCAT 6649591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTAGAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCAT 960

  6649592 AAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAA 6649651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      961 AAATTATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTGGAA 1020

  6649652 GCCACAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTT 6649711
          ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1021 GCCACAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCCGATTTT 1080

  6649712 AATTTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAG 6649771
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATCTGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAG 1140

  6649772 TCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTAT 6649831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TCTGTGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTAT 1200

  6649832 TATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATT 6649891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATTTGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATT 1260

  6649892 GAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATC 6649951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAGCCCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATC 1320

  6649952 TGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGC 6650011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGGCTCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGC 1380

  6650012 TGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATT 6650071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGAGTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATT 1440

  6650072 CTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAA 6650131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGCTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAA 1500

  6650132 TTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATC 6650191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATC 1560

  6650192 TCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGT 6650251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCCTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGT 1620

  6650252 CACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGT 6650311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGT 1680

  6650312 TTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTG 6650371
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTG 1740

  6650372 AAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACC 6650431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AAGCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACC 1800

  6650432 TTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTG 6650491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTG 1860

  6650492 CTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTT 6650551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTGTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTT 1920

  6650552 ATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGG 6650611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATGTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGG 1980

  6650612 GGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCC 6650671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGAAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCC 2040

  6650672 AGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAG 6650731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGGTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAG 2100

  6650732 AGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGG 6650791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGTTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGG 2160

  6650792 ATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGA 6650851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATGACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGA 2220

  6650852 GAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTG 6650911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GAGTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTG 2280

  6650912 TTTACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 6650959
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2281 TTTACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 2328

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     2339 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 2398

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 2458

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 2518

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 2578

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 2638

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 2698

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 2758

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 2818

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 2878

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2879 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 2938

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2939 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 2998

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2999 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 3058

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3059 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 3118

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3119 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 3178

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3179 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 3238

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3239 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 3298

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3299 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 3358

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3359 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 3418

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3419 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 3478

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3479 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 3538

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 6652226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3539 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 3598

  6652227 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 6652286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3599 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 3658

  6652287 ATGTTTTATGTGCTACAATTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 6652346
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3659 ATGTTTTATGTGCTACAGTTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 3718

  6652347 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACC 6652375
          |||||||||||||||||||||||||||||
     3719 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACC 3747

Alignment time is 5.77853 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   3398] =>      3398 nucs 'mol-32-34a8-176532_3398'

Score:        3353
Aligned:      3397        nucs
Identic:      3393 (100%) nucs =>       718 (100%)      2675 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6652471,6653188] EXCISED REGION [6653190,6655867]
 second seq =>  [      1,    718] EXCISED REGION [    720,   3398]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [6653189,6653189]
 second seq =>         1 nucs [719,719]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3224,3224]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [6653188,6653188] to [6653190,6653190]
 second seq =>         1 nucs [718,718] to [720,720]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

  6652471 CATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATGAGCT 6652530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATGAGCT 60

  6652531 GTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCAGGAG 6652590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCAGGAG 120

  6652591 CAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCATCCAT 6652650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCATCCAT 180

  6652651 TTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGAAGAA 6652710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGAAGAA 240

  6652711 AAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAATTTT 6652770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAATTTT 300

  6652771 GTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACACAAT 6652830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACACAAT 360

  6652831 AACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTAC 6652890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATGTTAC 420

  6652891 AGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTG 6652950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATTATTG 480

  6652951 ATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAA 6653010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTTGAAA 540

  6653011 GAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAAC 6653070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTGAAAC 600

  6653071 CTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATA 6653130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTAAATA 660

  6653131 ATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGT 6653188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCTGT 718

EXCISED REGION

  6653190 TATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCT 6653249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATACCT 779

  6653250 GCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATA 6653309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCCATA 839

  6653310 ACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAG 6653369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 ACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATAGAG 899

  6653370 GGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAG 6653429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 GGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAAAAG 959

  6653430 TGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATT 6653489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 TGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAGATT 1019

  6653490 TTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTT 6653549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 TTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCCGTT 1079

  6653550 TTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACA 6653609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTATACA 1139

  6653610 AGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTT 6653669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACCTTT 1199

  6653670 ATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAACTT 6653729
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1200 ATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAACTT 1259

  6653730 GCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCA 6653789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAATCA 1319

  6653790 AGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTT 6653849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 AGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTCCTT 1379

  6653850 TATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGT 6653909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 TATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAGGGT 1439

  6653910 TTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACT 6653969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTAACT 1499

  6653970 TCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAAT 6654029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 TCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAGAAT 1559

  6654030 AACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTAC 6654089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGCTAC 1619

  6654090 TAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGG 6654149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 TAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCCGGG 1679

  6654150 ATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATA 6654209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 ATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGTATA 1739

  6654210 GAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCC 6654269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 GAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGTTCC 1799

  6654270 TGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGA 6654329
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTTATCACCTGA 1859

  6654330 TTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGA 6654389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 TTTAATCTTTCTATGCCTCACTTCTTCATCTAGTTATAATAATAGTACCTACCTGACAGA 1919

  6654390 GTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAG 6654449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GTTGGGAGACTAAATGAGATCATTATAATTTAAATGAGCTTAGAATACTGCCTGGAACAG 1979

  6654450 ATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGA 6654509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 ATTAGTAATATCTCAATTAATTCTCACTGGGAACTCATCTTGAGGGTTTGGTAAAAATGA 2039

  6654510 TTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATG 6654569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 TTTAGGTATAGCACTTATGACAATGCCTGACACACAGTAAGTACTCAGATATCATCGATG 2099

  6654570 ATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGA 6654629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 ATGAGGATGATAGTGATGATGGTGATGATAATGGTGATAATGTGATGATGATGGTGATGA 2159

  6654630 TAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTT 6654689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TAATTATGTAATTGATGAAGACAATTACTACTAAAACTAAAAAGGGAACGTTGAAGGTTT 2219

  6654690 GGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAG 6654749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GGACAAGCAAGCACAACTGGGAGATGAAATCCATCCCACTTTTGATCACTGATCCATAAG 2279

  6654750 CTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCA 6654809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CTTTTGGATGGGGTTGTGTCATCCATAAGAAAGGAACACCTTTTATTATTTTTCAACCCA 2339

  6654810 GAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAA 6654869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 GAGGTTGCCCCTTTTGGTAACTTCTATATTCAAAGGTAAACTTTTGCATTAAACTTACAA 2399

  6654870 GAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAA 6654929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 GAAGGTATCATGTAAGTTAGTGGTCTCCTTAGAAATCACAATATGTATAACTCATGCAAA 2459

  6654930 CATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAA 6654989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 CATGTTTAAAGAATAACTTATAGAAATATCTCTTCTTTCTTTCTTGTCCCCATTTCTAAA 2519

  6654990 TTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGG 6655049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TTCTCCCTTACAACATTTCACAAAAATATAGAGGCACCTCTTACGCTCTTTTGCCTCAGG 2579

  6655050 GCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGA 6655109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 GCAAGTTTGTATTTCAATGCCAACTGCAGGAGTTTTCTGTAAGGTATTTTCCTCTCCTGA 2639

  6655110 ATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCA 6655169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 ATTTTGTTTTTTAAAGACTGAATATTCTGAAAAGATGGTACTGTTGAGATTCAGAAAGCA 2699

  6655170 ACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCC 6655229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 ACATCCCCAACATGAAAGCCTCAGAAGCAAAAGTTTTTCTCTGACCCTCTCCTGCCCTCC 2759

  6655230 TGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCA 6655289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TGTCTCTTAGTCCCATTCTCCTCCTAGGCTAGCCATAGAAACTAGACTCCCTCTTCCCCA 2819

  6655290 AGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATT 6655349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 AGGTGGGTCACAGAAACCAGAAACACCTTTCCCCAAAGCCAGCCATAAAACCTCAAAATT 2879

  6655350 ACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGAC 6655409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 ACTACACTAACTCTCCTGACTTTCTGTGCAAAAAAATTGGCCATAAGGAAATTATTTGAC 2939

  6655410 CTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATA 6655469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 CTATGTTGTTGGCCTGTAGGTTATAAGATTCCCCCAGTCCAGAAAGGGTCTGGCCCAATA 2999

  6655470 CCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCT 6655529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 CCCAGAAGGAAGAAATGCATGCTCAGAGAGGCCAAGAAGAATCCAGACAGACAGGCCTCT 3059

  6655530 AATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACA 6655589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 AATAGACATTTAGTCTATTAGAATTAGATTATATCCTTTTTGTCCAATCATATTTCTACA 3119

  6655590 CAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTT 6655649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 CAGCTGGCCATACTTGTTGAACCTGAGCATAAAAAAAAGAACAATTATTCTTGTATCTTT 3179

  6655650 GGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTT-TATGTCTTTTCTCCC 6655708
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     3180 GGGTCTTCATTTTGAAGGCTCCCATGTACACATTCACAAATTTTGTATGTCTTTTCTCCC 3239

  6655709 ATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTCAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTT 6655768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3240 ATGAATCTGCTTTTTGTCAGTGATTTTAGATAAACCTTTAGAGGTCAAGTGGAAGTCTTT 3299

  6655769 CTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGG 6655828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 CTTTGGCCCCAACAAGGCCAAGTCCAAGTTGAGCACTGATATTTATGAAGAGGCAAAAGG 3359

  6655829 ATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTT 6655867
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 ATTTTGGAGGGGATGAGTTGTTTGGAGGTAGACTTTTTT 3398

Alignment time is 4.72404 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [6640160,6664637] =>     24478 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [      1,   5869] =>      5869 nucs 'mol-32-34c9-185188_5869'

Score:        5711
Aligned:      5860        nucs
Identic:      5844 (100%) nucs =>      2499 (100%)      3345 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [6648456,6650959] EXCISED REGION [6650970,6654320]
 second seq =>  [      1,   2506] EXCISED REGION [   2517,   5869]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [6650960,6650969]
 second seq =>        10 nucs [2507,2516]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [2552,2554]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650958,6650959] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [6650960,6650961] to [6650968,6650969]
 second seq =>         0 nucs

  6648456 TGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTT 6648515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTTTTGTTACTGATTTTGATAATTTGTGACTTTTTTAATCTTTTTTTGTTAGAAATGTT 60

  6648516 AGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCT 6648575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGACATTTGTTAATTTTATTAATCTTTTCAAAAAACAGCCCTTTGTTCTATTGAATTCCT 120

  6648576 CCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCC 6648635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCATTGTTTTTCTGTTTAAAATTTAATTAAATTCTGTTTTGAGCTTTCTCATGTCCTTCC 180

  6648636 TTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTT 6648695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCTGTTTACTTTGGTTATTCTAAGTTTCTGAGTTGATTAGATTATTGATATAAAACTTT 240

  6648696 CTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAA 6648755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTCTCTTTTATAACATATGCATTTAGTGTTATAAATAGTGTTCCAAAAACTATCTTTTAA 300

  6648756 TTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATGTTAGAGATAAATTTCA 6648815
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      301 TTGTTATATTTAAACCATTTTTATTTAATATAATTATTTATATATTAGAGATAAATTTCA 360

  6648816 TCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCT 6648875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCATTTATTTTTTGTTCCCTGTTTTTTATTATTATTATTATTTTCAGACAGAGTCTCGCT 420

  6648876 CTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTG 6648935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTGTTGCCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGTGATCTCGGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCTG 480

  6648936 GGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCAC 6648995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGTTCAAGCGATTCTTCTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACTACAGGCACGTGCCAC 540

  6648996 CACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGC 6649055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACGCCGGGCTAATTTTTTGTATTTTTAGTAGAGACAGGGTTTCTCCATGTTGGTCAGGC 600

  6649056 TGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 6649115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGTCTCGAATTCCTGACCTCAGGTGATCCACCTGCTTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGAT 660

  6649116 TACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTT 6649175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TACAGGCGTGTGCCATCACGCCTGGCCTATTATGCTTTTTTTTTTTTAATTTCTCTGTTT 720

  6649176 TCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATC 6649235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TCTGTTTCCTGCTATTTCTATTTCCTTAGTATTTCAGTGGTTTCTGTAGGTATTTGTATC 780

  6649236 GCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGG 6649295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCAAAAAAATTAACCTTGCCCGAAGAGAGGTCTGGCCTTTGATCTAACTAAGATTTTGGG 840

  6649296 AGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAG 6649355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGTGAGCTCTAGGAATGTCATGCCTGAAAAGAGTATCTTTGCTTATCTGGGGTCCTTAG 900

  6649356 ATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAG 6649415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATCACACCAAATTGTATAACAATGTAATCTAGAGTGAGGACTTTGGGCCACACCAGATAG 960

  6649416 TCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTG 6649475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TCTAATAATGTGAATTAGAGTAGGGGTTTGGGGCCACAAGGTATCAGCTTGACTCTGCTG 1020

  6649476 AAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTA 6649535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AAGTCTGAGATTAGCTGTGTGAGCAGCCATCCAGGTTTATGTGACCTAATACAAATGCTA 1080

  6649536 GAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAAT 6649595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAACTAAGGCTCAGGTGAGTTTTCCTGGATGGTAATGCTTCATATATATTGCCATAAAT 1140

  6649596 TATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTAGAAGCCA 6649655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1141 TATTCATGGGAGGAGTTTACACTGTCCATTATCTCATTAGGAGAGGACAACTGGAAGCCA 1200

  6649656 CAGGTTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATT 6649715
          ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1201 CAGGCTTGGAACCCTTCTAGGCTCTACCCCTTGCATCTCTCCTGTTAGCTGATTTTAATC 1260

  6649716 TGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTG 6649775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTATCCTTTTCACTGTAATAAACCACAACCATGAGTATAACAACTGTCAGCAGAGTCTG 1320

  6649776 TGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATT 6649835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGAGTTTTTCAGCAAATTATTAAATGTAAAGGTAGTCCTGGGGACCCCAGAACTATTATT 1380

  6649836 TGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGC 6649895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGTATCACAAGTGAGAGTGGCTGATTCTTTCCTCTATCCCCTACATTCTGCTATTGAGC 1440

  6649896 CCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGC 6649955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCATCTACTGAGATTTTTTTTCAAGTATTGTGTTTCTCAGTTCTAATATTTCCATCTGGC 1500

  6649956 TCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGA 6650015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TCTTCTTTTATTTTTGAGGGGGCAAGGTAGACAGAGTCTCACTCTGTCACCCAGGCTGGA 1560

  6650016 GTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGC 6650075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTGCAGTGGTGCGATCTTGGCAAACTGCAACTTCCAACTCCCAGGTTCAAGTGATTCTGC 1620

  6650076 TGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTT 6650135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGTCACTACAGGTGTGTGCCACCACTTCTGGCTAATTTT 1680

  6650136 TTTTTTTTTTT--GGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTC 6650193
          |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTTTTTTTTTTGGTAGAAACAGGGTTTCATCTTGTTAGCCTGGATGGTCTTGAATCTC 1740

  6650194 CTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCA 6650253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 CTGACCTTGTGATCCACCTGTCTCGGCATCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGTCA 1800

  6650254 CTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTT 6650313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTGTGCGTGGCCTCTGGCTCTTCTTAAGATCATCTTTTTCTCTGCTTAGATTTTCTGTTT 1860

  6650314 CTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAA 6650373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTTTACTGAGACTTTCTATTTATTCAATAGTTTCAGGTGTGTTTGTGTATGTTTGTTGAA 1920

  6650374 GCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTT 6650433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCATTTTTGTCATGGTTGCTTTAAATCTCTGCCAGATACTCCTATCATCTCTGTCACCTT 1980

  6650434 GGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCT 6650493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGTGTTTGCATCTATCAATTGTCTTTTTAAATTTAATTTTAGATATTTCTTTTTCTTGCT 2040

  6650494 GTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTAT 6650553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GTAATAAGTAATTTTTAGCCTGGATATTTTTGTATTATGTACTGAGTTTCTGGATCTTAT 2100

  6650554 GTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGG 6650613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTATACCTTCAGCTTTAACTGTGTTTTCTTTCCTTTCTTTTTGACACTGCTCCCCCGGGG 2160

  6650614 AAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAG 6650673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAAGGAAAAAGGGCACTGTTGCATTACTGTCCTATGGAAGAATGAGTCAAGGTTTCCAG 2220

  6650674 GTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAG 6650733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTCAACCTCTGTTGACATCTGAGAAGGGTGCTCCTCCTCACTGCTGAGTGGAGATTAGAG 2280

  6650734 TTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGAT 6650793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGGGGTGCCTTATGGTCTCCACTGACGTTGTGGTGGAGGTCAGCTTGTTACTGCTGGAT 2340

  6650794 GACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGA 6650853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GACCGTGAAAGCCTGCACTCTCCTCTAGTGCTCTTCTGATACTACCACAATGCAGGGAGA 2400

  6650854 GTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTT 6650913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 GTTCGTAAAGATCCAGACTCCCTGTTTGTTCTGCACTGACCTCATGAGGCATTTGCTGTT 2460

  6650914 TACTGACCAGCCACCCTACTTGGCCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 6650959
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2461 TACTGACCAGCCACCCTACTTGACCTTCTCTGATCTCCCTTGCAGG 2506

EXCISED REGION

  6650970 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCT---CTACTTATCCCTTGCTAATGTG 6651026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||
     2517 CACCTAAGACCCTCCTGAAGGTGCAATCTGGCTCTCTACTACTTATCCCTTGCTAATGTG 2576

  6651027 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 6651086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 GGTGTGGACAGAGACACTGTTCTTTCTGTGATGTTGGCTGAAATAAAACATGTATTGTCT 2636

  6651087 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 6651146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 AAAGTTTCCTGTCTTCTTTTTTATTGGTCCTTTGACAAGATCGACAGGCTTCTGATGGAT 2696

  6651147 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 6651206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 ATTTTTTTGTTTTGTTTTGTCTGTAGCTGTTGTATTTTTGAGTTGTTGCCTTCTTTGGCA 2756

  6651207 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 6651266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 CCAGGAATGTCACTACCTTAGCTTTTCCCACGTCCCGAGGTCACCAGTTAGTCTGCCTTT 2816

  6651267 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 6651326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 CAGAGTCTTCTTATTTTTGTTTTACATATATCATCCAGGATTTTTAGTTGCAGTTAGCAA 2876

  6651327 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 6651386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 GAGAAATAAGGAAAATATATCTGCTCCATTTGTCTGTAAGTGAAAGTCTCTAAGTAAGTT 2936

  6651387 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 6651446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 ATTTTTAAATGCCTTCCCTAGGTTCACATTTCTGGTTGGGTCTAATTGCTACTATAGAGT 2996

  6651447 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 6651506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 AGAGAGTTTTTTGAGTGCCCTTTGGACTTTTTATATATATTGGCCTTTTCATAGAATAAA 3056

  6651507 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 6651566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 GAGGAAATGGATGGACAGCAGGGTCAGGGATTGCTTAGTGTTTTGTGTTTACTGTTAAGT 3116

  6651567 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 6651626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TCCAAGAGAGCAGAAAAATTTTCTCTTGTGTTTCTGCTGCATTTTCAACTACTTGCAGAG 3176

  6651627 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 6651686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 CTCCTGGCATGTGGTAGAAACTCACAACATGCTTCCAAGGGAACTGTTTGTCTTAGAAAT 3236

  6651687 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 6651746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 CTCTAAAGACAGAAAATGACAATTGTTAGTTGGTTTTTTAACTTGACCACCAACAATCAA 3296

  6651747 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 6651806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 CATTGTCCTATGGTACCTCAAACATGCTTGAAAGGTCATAAACTTTAGTTACACTAAAAT 3356

  6651807 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 6651866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 TGCCTTTAATGGGTAGACTATTCTAATCTCACATGGATAATTATTCTAGAAAACACAAAC 3416

  6651867 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 6651926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 CCATTTCTTCTGTTCTGAGACTATTTTAACACTTGTCTTCAAAAAATATGAATACACGCA 3476

  6651927 TCGCATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 6651986
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 TCACATGATCTGCTCCACTGGGTAATTTAACAGCAGTTTTGGGGAGAAACTTTGTGGGTG 3536

  6651987 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 6652046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 CAGCGTTTATCACTTCATTGCTGGTAATTTCCTGACTTAAGAGATAGTGGGAGATAAGGA 3596

  6652047 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 6652106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 AGAGTAATTGGACATGATAAGACAGGCTGTGTTTAAACCAATTTCTACTCCAAAAACACC 3656

  6652107 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 6652166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 CATGGAGATTTTTCACACAATAAAATTGGAAATAATTGAAAAATAGTTAATATTTTTCCA 3716

  6652167 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 6652226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 CAGTGAATTCTGCTAGCGAGAAAGTACAACTAAAAGGAACAGCAGTCTGAAAAATGATAA 3776

  6652227 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 6652286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 AACAAATGTATTATTAGAAACATGCAATTACAATAAATTAAAATAGTGAATGAATAGGTG 3836

  6652287 ATGTTTTATGTGCTACAATTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 6652346
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 ATGTTTTATGTGCTACAGTTTCATCTATGAACATCCATATTTTGGGACCCATAAAAAGGA 3896

  6652347 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 6652406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 TAAATTGGTTATTTCTGTTTTATTAAACCAGTAAGTCATTGGAAAACACACAAACCCACA 3956

  6652407 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 6652466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 CTTATTTGCTTGTTTCCCATTCATTTGTGAGAGAGGGTGAATATAATGGCTCAAAAATAT 4016

  6652467 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 6652526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 TTCCCATCTTCATCAGGGTAATACATCCTATTGATTTCTTGTTTCCAACAAATGGTGATG 4076

  6652527 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 6652586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 AGCTGTAAATTCTGAAGCACTCTATACCCTATCTCCTCATCACTCCTTTTATAACTACCA 4136

  6652587 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 6652646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 GGAGCAGAGTTTCTATCTGCTTTTGTATTTTTAATCATTAGTTTGTAATCTTAATATCAT 4196

  6652647 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 6652706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 CCATTTAGTTCTCAACAAGATATTGTACGTTCGGTTTGAGGCTTTTCTTTTTTTGGAGGA 4256

  6652707 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 6652766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 AGAAAAATGAACATTTTGCATTTTAAAACTGCACTAAATAATTTAGAACTGCACATGAAA 4316

  6652767 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 6652826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 TTTTGTTCTTAGAAACTGCAACCAAATCCTATATCAGTAGATTTGATTATTGAAAGCACA 4376

  6652827 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 6652886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 CAATAACAATTGCATTGCAATGTATAAACATGCTGATGGAGAACAATAGAATGCTGTATG 4436

  6652887 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 6652946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 TTACAGCTTTGATTTACAGATCAGCGTGGGCAGATTGTTTTTGATCTTGACCTGTGAATT 4496

  6652947 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 6653006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 ATTGATATGCTTAGATCAATGAAATGGTTTCCTTTCAGCTCATCTCAATTTGCTCAATTT 4556

  6653007 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 6653066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 GAAAGAAAACTTTAAAGAGTGCAAGTTTTATTGGTAAGGGCTCCTTTGTCTGCCTGCCTG 4616

  6653067 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 6653126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 AAACCTAGTGGTTCAAATCATGTTAAAAGAAGATTCCATGGCATCTTGATATCTTAGGTA 4676

  6653127 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 6653186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 AATAATACCTGTTGCCTTGGAGTGACAGTCTTTCCCCTCAATGCAGCAATTATTGCCCCT 4736

  6653187 GTGTATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 6653246
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 GTATATCAGATTCTTGAAGAGTCCTGGTGCGTTTATAAGGTCTTGGTCCTTTGTCATATA 4796

  6653247 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTCTTTTTTTTTTTTCC 6653306
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     4797 CCTGCCTTTCTTACTTTCCTTTACCATCTGACAATAGGGAATTTTC-TTTTTTTTTTTCC 4855

  6653307 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 6653366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4856 ATAACATACAAAAGTGCCCAAGATGAGTTGTTAAATTAAAAAGCAAGCTGTAGAGCTATA 4915

  6653367 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 6653426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4916 GAGGGATTTTGGAGTAGATTCACAATTTTTCACAAAATTGTGCCTGTGTATGTACAGAAA 4975

  6653427 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 6653486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4976 AAGTGGAAGACTGTGCCCCTAAATTTAAAAGAATTATATCTTAGAAGTAGATAGAAAAAG 5035

  6653487 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 6653546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5036 ATTTTTTAATTTTTTGTGCATTTAGTTATTGATTGAAATTTTCACAAGGAACATGTATCC 5095

  6653547 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 6653606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5096 GTTTTACATATAACATTGAAACAAAAAAAATGACATTTGCAGTGAGTCTTTGTAAACTAT 5155

  6653607 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 6653666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5156 ACAAGTATGAAATTTACATTCAAAGCCTCTCACAATTTGGCCCCTGCTGATATTTCCACC 5215

  6653667 TTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAACGTTAATTGCAA 6653726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5216 TTTATAACTCACTTTGTTAGGGTGAAGGTGAGGCAATATGACTCCCAATGTTAATTGCAA 5275

  6653727 CTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAA 6653786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5276 CTTGCTTTTATGATTCTCTAACTTTGTTTTGACCAAAGTGATCTTCCTTTTCCTTGAAAA 5335

  6653787 TCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTC 6653846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5336 TCAAGTTAATGTGTAGTGTTCTCTCTGAATCCTGGCCTCCTTTAAAGACCATCATGTGTC 5395

  6653847 CTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAG 6653906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5396 CTTTATCTTTCATCATATTTTCACATATCCAAGAGTTCTGCCTATCAACACCAAGAGCAG 5455

  6653907 GGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTA 6653966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5456 GGTTTACTGAGCTTCAGGGAGAGTGTGGCATCATTATAGTTTTTTACAAACCCACGTGTA 5515

  6653967 ACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAG 6654026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5516 ACTTCTAATATTACATCATTCACTGCAATTACCTCATTGTCTTCTAAATGCTTTTATAAG 5575

  6654027 AATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGC 6654086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5576 AATAACTTTGTATAATTAAATCCGGTGGAACCACGGATATGATGAGTCAGTTTTAATGGC 5635

  6654087 TACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCC 6654146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5636 TACTAGAATAAAACTGTTAAAATATCTCATATGTTAAGAGTGGTAATTGTTCACTGCTCC 5695

  6654147 GGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGT 6654206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5696 GGGATAAAATATCTTTTTGCATAGATGAATTGCCTACTTTGGACATTCATATAGCTTTGT 5755

  6654207 ATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGT 6654266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5756 ATAGAATAACTTTAAAATAATTGTCTCAAAAAATTGATGTCCTCTTTACCCTATAGTAGT 5815

  6654267 TCCTGAGTGTTTGAGATGGCAGATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTT 6654320
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5816 TCCTGAGTGTTTGAGATGGCACATTTTTAATATACAGGTCTGCTGACAAATTTT 5869

Alignment time is 8.77788 s

