
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2674] =>      2674 nucs 'mol-32-1f63-065451_2674'

Score:        2655
Aligned:      2666        nucs
Identic:      2665 (100%) nucs =>       400 (100%)      2265 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21722791,21723190] EXCISED REGION [21723191,21725455]
 second seq =>  [       8,     407] EXCISED REGION [     409,    2674]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [408,408]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        12 nucs [408,419] to [409,420]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 21722791 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGAT 21722850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        8 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGAT 67

 21722851 TGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTG 21722910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       68 TGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTG 127

 21722911 GTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGC 21722970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      128 GTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGC 187

 21722971 CAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAA 21723030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      188 CAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAA 247

 21723031 ATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAA 21723090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      248 ATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAA 307

 21723091 CCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCAT 21723150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      308 CCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCAT 367

 21723151 TTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACG 21723190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      368 TTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACG 407

EXCISED REGION

 21723191 AAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATT 21723250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      409 AAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATT 468

 21723251 TTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGA 21723310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      469 TTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGA 528

 21723311 GGGAAAGAG-AGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAAC 21723369
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      529 GGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAAC 588

 21723370 ATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTAT 21723429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      589 ATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTAT 648

 21723430 GAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTG 21723489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 GAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTG 708

 21723490 ACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCAC 21723549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 ACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCAC 768

 21723550 CAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAG 21723609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 CAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAG 828

 21723610 CAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTG 21723669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 CAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTG 888

 21723670 AATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGA 21723729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 AATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGA 948

 21723730 AGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAAC 21723789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 AGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAAC 1008

 21723790 CTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAG 21723849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 CTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAG 1068

 21723850 GGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAAT 21723909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 GGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAAT 1128

 21723910 TGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCC 21723969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 TGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCC 1188

 21723970 ACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGA 21724029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 ACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGA 1248

 21724030 AAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGG 21724089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 AAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGG 1308

 21724090 AAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAA 21724149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 AAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAA 1368

 21724150 TTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGG 21724209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 TTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGG 1428

 21724210 AGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTT 21724269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 AGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTT 1488

 21724270 TGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCC 21724329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 TGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCC 1548

 21724330 ATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGA 21724389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 ATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGA 1608

 21724390 TAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGA 21724449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 TAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGA 1668

 21724450 GAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACAC 21724509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 GAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACAC 1728

 21724510 AGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAA 21724569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 AGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAA 1788

 21724570 TTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATT 21724629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 TTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATT 1848

 21724630 GAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGT 21724689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 GAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGT 1908

 21724690 CTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTA 21724749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 CTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTA 1968

 21724750 CACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTT 21724809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 CACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTT 2028

 21724810 ATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTG 21724869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 ATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTG 2088

 21724870 GGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGT 21724929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 GGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGT 2148

 21724930 GAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTA 21724989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 GAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTA 2208

 21724990 GTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGC 21725049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 GTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGC 2268

 21725050 AGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCA 21725109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 AGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCA 2328

 21725110 AAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAA 21725169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 AAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAA 2388

 21725170 GAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTG 21725229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 GAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTG 2448

 21725230 AAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAG 21725289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 AAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAG 2508

 21725290 GGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAAC 21725349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 GGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAAC 2568

 21725350 AAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAG 21725409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 AAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAG 2628

 21725410 CCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATA 21725455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 CCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATA 2674

Alignment time is 2.11366 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2267] =>      2267 nucs 'mol-32-20fa-054461_2267'

Score:        2235
Aligned:      2268        nucs
Identic:      2265 (100%) nucs =>       860 (100%)      1405 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21724994,21725853] EXCISED REGION [21725867,21727274]
 second seq =>  [       1,     860] EXCISED REGION [     861,    2267]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        13 nucs [21725854,21725866]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [21725854,21725857] to [21725867,21725870]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21725853,21725853] to [21725867,21725867]
 second seq =>         1 nucs [860,860] to [861,861]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [21725854,21725857] to [21725863,21725866]
 second seq =>         0 nucs

 21724994 CAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTG 21725053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTG 60

 21725054 AGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAA 21725113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAA 120

 21725114 AAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGC 21725173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGC 180

 21725174 ATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGA 21725233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGA 240

 21725234 TCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTG 21725293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTG 300

 21725294 ACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGA 21725353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGA 360

 21725354 ATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAA 21725413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAA 420

 21725414 CATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGAC 21725473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGAC 480

 21725474 TTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTG 21725533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTG 540

 21725534 GTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTA 21725593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTA 600

 21725594 GACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTG 21725653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTG 660

 21725654 TAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGT 21725713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGT 720

 21725714 TTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAG 21725773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAG 780

 21725774 AAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACACTAA 21725833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACACTAA 840

 21725834 AGCCATAAATGGTTAACTGT 21725853
          ||||||||||||||||||||
      841 AGCCATAAATGGTTAACTGT 860

EXCISED REGION

 21725867 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTC 21725926
          ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
      861 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT-CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTC 919

 21725927 TCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATTCTTTACCATCAACTGTGACCCAACCCAGA 21725986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 TCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATTCTTTACCATCAACTGTGACCCAACCCAGA 979

 21725987 CCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAGCCCAAATTCATAAAAGTTCA 21726046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 CCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAGCCCAAATTCATAAAAGTTCA 1039

 21726047 AAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATTAATTTTAAAGCATTACATTTT 21726106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 AAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATTAATTTTAAAGCATTACATTTT 1099

 21726107 CTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGTTTGATTTTTCTGATGTTCTTA 21726166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 CTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGTTTGATTTTTCTGATGTTCTTA 1159

 21726167 TAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCAAGGGTTATTAATCAGAGCAAA 21726226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 TAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCAAGGGTTATTAATCAGAGCAAA 1219

 21726227 GCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTTTATTCTGAACATATTAGCTAG 21726286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 GCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTTTATTCTGAACATATTAGCTAG 1279

 21726287 TTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAAATTAACGATTAATTTTGTTCA 21726346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 TTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAAATTAACGATTAATTTTGTTCA 1339

 21726347 AAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCTTAGGAAAATAGATGACAGGGA 21726406
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 AAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCTTAGGAAAATAGATGACAGGGA 1399

 21726407 TGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGGAAAATTCTAATTTTTAAGCTA 21726466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 TGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGGAAAATTCTAATTTTTAAGCTA 1459

 21726467 ATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCATAAGCTTTATTAAGAATCCAG 21726526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 ATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCATAAGCTTTATTAAGAATCCAG 1519

 21726527 TGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAAAGGAATATACGTTTTTAACGC 21726586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 TGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAAAGGAATATACGTTTTTAACGC 1579

 21726587 TAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTGTTATGGCTTATTATTTCAAAC 21726646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 TAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTGTTATGGCTTATTATTTCAAAC 1639

 21726647 AATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGATTCCTTCTCAATGAACGTAGA 21726706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 AATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGATTCCTTCTCAATGAACGTAGA 1699

 21726707 AAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGAGTGTCTCTGAAGATTTTATGG 21726766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 AAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGAGTGTCTCTGAAGATTTTATGG 1759

 21726767 CTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAAGAATTCAACCTATGCTTGAAA 21726826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 CTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAAGAATTCAACCTATGCTTGAAA 1819

 21726827 CACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGAAACAAACAGAATATGGTACAG 21726886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 CACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGAAACAAACAGAATATGGTACAG 1879

 21726887 CCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCGTAAGCATTTGATATTCAAATC 21726946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 CCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCGTAAGCATTTGATATTCAAATC 1939

 21726947 TCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTTCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTT 21727006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 TCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTTCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTT 1999

 21727007 TGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGCACATGCGGTCTTGCTCCAACA 21727066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 TGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGCACATGCGGTCTTGCTCCAACA 2059

 21727067 AGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATGGATGTTGAAACCAAATGGTCT 21727126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 AGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATGGATGTTGAAACCAAATGGTCT 2119

 21727127 AGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAAAAGACAAAGTACAAACCCATT 21727186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 AGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAAAAGACAAAGTACAAACCCATT 2179

 21727187 AGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTATCCCAGAATTCTGAAAAATCTT 21727246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 AGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTATCCCAGAATTCTGAAAAATCTT 2239

 21727247 TGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCT 21727274
          |||||||||||||||||.||||||||||
     2240 TGTATGGAGCAATACATATGCCTATCCT 2267

Alignment time is 2.44389 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3358] =>      3358 nucs 'mol-32-20fa-123963_3358'

Score:        3220
Aligned:      3339        nucs
Identic:      3320 ( 99%) nucs =>       854 ( 98%)      2466 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21722845,21723705] EXCISED REGION [21725967,21728435]
 second seq =>  [       1,     864] EXCISED REGION [     889,    3358]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2261 nucs [21723706,21725966]
 second seq =>        24 nucs [865,888]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723705,21723705] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [865,865] to [889,889]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723706,21723706] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [865,865] to [888,888]

 21722845 TTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTA 21722904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTA 60

 21722905 CAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTA 21722964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTA 120

 21722965 ATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGAC 21723024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGAC 180

 21723025 TCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAA 21723084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAA 240

 21723085 GGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACAC 21723144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACAC 300

 21723145 ATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAAAAA--- 21723201
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||   
      301 ATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATTAAAAAAAACGAAAAAAAAAAACCA 360

 21723202 -ACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTA 21723260
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTA 420

 21723261 CAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGA 21723320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGA 480

 21723321 -GGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTA---AA 21723376
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||
      481 AGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAAC-----GTGAA 535

 21723377 GAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGG 21723436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 GAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGG 595

 21723437 TCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCAT 21723496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 TCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCAT 655

 21723497 TGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTT 21723556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      656 TGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGGACCAATTTT 715

 21723557 GGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGAT 21723616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 GGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGAT 775

 21723617 ATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTG 21723676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 ATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTG 835

 21723677 GACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 21723705
          |||||||||||||||||||||||||||||
      836 GACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 864

EXCISED REGION

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      889 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAC 948

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 1008

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 1068

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 1128

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 1188

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 1248

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1249 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 1308

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 1368

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 1428

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 1488

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 1548

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 1608

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 1668

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 1728

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 1788

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 1848

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 1908

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 1968

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 2028

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 2088

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 2148

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 2208

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 2268

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 2328

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 2388

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 2448

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 2508

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 2568

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 2628

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 2688

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 2748

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 2808

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 2868

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 2928

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 2988

 21728066 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 21728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2989 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 3048

 21728126 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 21728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 3108

 21728186 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 21728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 3168

 21728246 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 21728305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATATGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 3228

 21728306 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 21728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 3288

 21728366 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 21728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 3348

 21728426 GAGCCTATTT 21728435
          ||||||||||
     3349 GAGCCTATTT 3358

Alignment time is 3.23457 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3011] =>      3011 nucs 'mol-32-2874-078049_3011'

Score:        2862
Aligned:      2992        nucs
Identic:      2972 ( 99%) nucs =>       867 ( 98%)      2105 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21722832,21723705] EXCISED REGION [21725967,21728075]
 second seq =>  [       1,     877] EXCISED REGION [     902,    3011]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2261 nucs [21723706,21725966]
 second seq =>        24 nucs [878,901]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723705,21723705] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [878,878] to [902,902]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723706,21723706] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [878,878] to [901,901]

 21722832 CATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAA 21722891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAA 60

 21722892 GGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGA 21722951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGA 120

 21722952 TAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGG 21723011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGG 180

 21723012 AAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTT 21723071
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTT 240

 21723072 AAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACA 21723131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACA 300

 21723132 CAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGA 21723191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      301 CAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATTAAAAAAAACGA 360

 21723192 AAAAAAAAAA----ACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGT 21723247
          ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAAAAAAACCAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGT 420

 21723248 ATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAA 21723307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAA 480

 21723308 TGAGGGAAAGAGA-GGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAA 21723366
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAA 540

 21723367 AACATGTA---AAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATG 21723423
          |||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAC-----GTGAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATG 595

 21723424 TTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAA 21723483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 TTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAA 655

 21723484 TGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTG 21723543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 TGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTG 715

 21723544 TTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGAT 21723603
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 TTGGACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGAT 775

 21723604 TACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAA 21723663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 TACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAA 835

 21723664 GAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 21723705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 GAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 877

EXCISED REGION

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      902 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAC 961

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      962 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 1021

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1022 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 1081

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1082 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 1141

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1142 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 1201

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1202 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 1261

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1262 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 1321

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1322 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 1381

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1382 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 1441

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1442 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 1501

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1502 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 1561

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1562 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 1621

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1622 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 1681

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1682 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 1741

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1742 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 1801

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1802 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 1861

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1862 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 1921

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1922 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 1981

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1982 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 2041

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2042 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 2101

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2102 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 2161

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2162 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 2221

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2222 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 2281

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2282 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 2341

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2342 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 2401

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2402 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 2461

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2462 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 2521

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2522 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 2581

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2582 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 2641

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2642 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTACACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 2701

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2702 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 2761

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2762 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 2821

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2822 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 2881

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2882 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATGTGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 2941

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2942 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 3001

 21728066 AAATAATAAT 21728075
          ||||||||||
     3002 AAATAATAAT 3011

Alignment time is 2.38739 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    5647] =>      5647 nucs 'mol-32-2874-141030_5647'

Score:        5592
Aligned:      5647        nucs
Identic:      5642 (100%) nucs =>       103 (100%)      5539 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21719904,21720006] EXCISED REGION [21720008,21725548]
 second seq =>  [       1,     103] EXCISED REGION [     105,    5647]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [21720007,21720007]
 second seq =>         1 nucs [104,104]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         1 nucs [21724221,21724221]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21720006,21720006] to [21720008,21720008]
 second seq =>         1 nucs [103,103] to [105,105]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 21719904 TATACAACTCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTTAGACAGTAGAAGTTCGT 21719963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TATACAACTCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTTAGACAGTAGAAGTTCGT 60

 21719964 GAAGTGACCTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAAC 21720006
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAAGTGACCTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAAC 103

EXCISED REGION

 21720008 CAACAACAAATAACCCTAAAAGGAAACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAAT 21720067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      105 CAACAACAAATAACCCTAAAAGGAAACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAAT 164

 21720068 TGGAGTTAGTCCCTTCAAATTCATGGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGT 21720127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      165 TGGAGTTAGTCCCTTCAAATTCATGGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGT 224

 21720128 GCTTTTGAACGGACATTAATCCCAAAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGA 21720187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      225 GCTTTTGAACGGACATTAATCCCAAAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGA 284

 21720188 GCAGGAATGCCTGCTGAGAGGGGAGAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGG 21720247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      285 GCAGGAATGCCTGCTGAGAGGGGAGAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGG 344

 21720248 CCCTGCATTTTCCTGAATGATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATG 21720307
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      345 CCCTGCATTTTCCTGAATGATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATG 404

 21720308 CTTTCCAAGTGCTAAATATTTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGC 21720367
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      405 CTTTCCAAGTGCTAAATATTTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGC 464

 21720368 CTATTTATACAGTTTAATGTCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAA 21720427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      465 CTATTTATACAGTTTAATGTCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAA 524

 21720428 TTTTGTAAATTTATGTTGTTCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGC 21720487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      525 TTTTGTAAATTTATGTTGTTCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGC 584

 21720488 CCTGCCACCCACCCCCCAACCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAA 21720547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      585 CCTGCCACCCACCCCCCAACCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAA 644

 21720548 ACTTCTACAGAATATTCTAAGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATC 21720607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      645 ACTTCTACAGAATATTCTAAGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATC 704

 21720608 CAAATTCCAGTGTTTTCATGTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATA 21720667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      705 CAAATTCCAGTGTTTTCATGTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATA 764

 21720668 AAATAAGAATAACAGCTAAATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGA 21720727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      765 AAATAAGAATAACAGCTAAATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGA 824

 21720728 GTAAATACTAAACTATAGTAACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAAT 21720787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      825 GTAAATACTAAACTATAGTAACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAAT 884

 21720788 GATATGAAATAATGGAATATATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAA 21720847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      885 GATATGAAATAATGGAATATATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAA 944

 21720848 TCATTAATTGGTATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGA 21720907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      945 TCATTAATTGGTATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGA 1004

 21720908 GTTAAGCTTTTGAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTC 21720967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1005 GTTAAGCTTTTGAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTC 1064

 21720968 TAAGAAAGAGTTTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAG 21721027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1065 TAAGAAAGAGTTTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAG 1124

 21721028 ACATTGTTGCTTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAA 21721087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1125 ACATTGTTGCTTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAA 1184

 21721088 TGTCATTAATACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAG 21721147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 TGTCATTAATACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAG 1244

 21721148 GAAACAATATTGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTT 21721207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 GAAACAATATTGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTT 1304

 21721208 GGAGGGAGGGAGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAG 21721267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 GGAGGGAGGGAGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAG 1364

 21721268 CGACTTACTTGATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAA 21721327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 CGACTTACTTGATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAA 1424

 21721328 AATACCCCCAAGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCA 21721387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 AATACCCCCAAGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCA 1484

 21721388 TAGAAGTATATGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACA 21721447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 TAGAAGTATATGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACA 1544

 21721448 AAATATTGTATGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACGTGGTAAGGACTCAAAATATGA 21721507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1545 AAATATTGTATGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACATGGTAAGGACTCAAAATATGA 1604

 21721508 TAGCTGACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATA 21721567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 TAGCTGACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATA 1664

 21721568 GAGTCACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGT 21721627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 GAGTCACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGT 1724

 21721628 CACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCA 21721687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 CACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCA 1784

 21721688 CTCGTTCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACA 21721747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 CTCGTTCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACA 1844

 21721748 CTGGGTAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAA 21721807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 CTGGGTAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAA 1904

 21721808 TAGTGAGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTG 21721867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 TAGTGAGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTG 1964

 21721868 GAATCATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAA 21721927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 GAATCATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAA 2024

 21721928 ACAAGTGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATT 21721987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 ACAAGTGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATT 2084

 21721988 TGTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACAT 21722047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 TGTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACAT 2144

 21722048 GTGATGTTTAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATA 21722107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 GTGATGTTTAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATA 2204

 21722108 TGCTCTACTAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTG 21722167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 TGCTCTACTAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTG 2264

 21722168 TTTATTTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACT 21722227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 TTTATTTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACT 2324

 21722228 GGGGAAATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTA 21722287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 GGGGAAATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTA 2384

 21722288 GTCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTG 21722347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 GTCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTG 2444

 21722348 CTACACAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTC 21722407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 CTACACAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTC 2504

 21722408 AGACAGTCCCTTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGG 21722467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 AGACAGTCCCTTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGG 2564

 21722468 CAGGGAGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGC 21722527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 CAGGGAGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGC 2624

 21722528 CCTTAGCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCA 21722587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 CCTTAGCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCA 2684

 21722588 ATTACAGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTC 21722647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 ATTACAGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTC 2744

 21722648 AGAGTATTATACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAA 21722707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2745 AGAGTATTATACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAA 2804

 21722708 GGTAAACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGC 21722767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 GGTAAACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGC 2864

 21722768 CTATGTGAATATATTCCATCAGT-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTT 21722826
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 CTATGTGAATATATTCCATCAGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTT 2924

 21722827 TGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCT 21722886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 TGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCT 2984

 21722887 GGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATT 21722946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 GGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATT 3044

 21722947 TCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGC 21723006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 TCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGC 3104

 21723007 TTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCA 21723066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 TTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCA 3164

 21723067 CAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTG 21723126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 CAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTG 3224

 21723127 GAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAA 21723186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 GAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAA 3284

 21723187 AACG-AAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGT 21723245
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3285 AACGAAAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGT 3344

 21723246 GTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGA 21723305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3345 GTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGA 3404

 21723306 AATGAGGGAAAGAG-AGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTG 21723364
          |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3405 AATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTG 3464

 21723365 AAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGT 21723424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3465 AAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGT 3524

 21723425 TTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAAT 21723484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3525 TTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAAT 3584

 21723485 GTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGT 21723544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3585 GTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGT 3644

 21723545 TGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATT 21723604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3645 TGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATT 3704

 21723605 ACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAG 21723664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3705 ACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAG 3764

 21723665 AGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAG 21723724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3765 AGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAG 3824

 21723725 TTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTAC 21723784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3825 TTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTAC 3884

 21723785 ACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGA 21723844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3885 ACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGA 3944

 21723845 GTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGAC 21723904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3945 GTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGAC 4004

 21723905 TTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCA 21723964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4005 TTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCA 4064

 21723965 TTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTG 21724024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4065 TTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTG 4124

 21724025 GAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTT 21724084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4125 GAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTT 4184

 21724085 TAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTA 21724144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4185 TAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTA 4244

 21724145 CAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGA 21724204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4245 CAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGA 4304

 21724205 GCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTA 21724264
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4305 GCAGGAGAAGACAAAC-TTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTA 4363

 21724265 AGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAG 21724324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4364 AGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAG 4423

 21724325 CAGCCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTC 21724384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4424 CAGCCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTC 4483

 21724385 TAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGT 21724444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4484 TAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGT 4543

 21724445 CCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAA 21724504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4544 CCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAA 4603

 21724505 GACACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCT 21724564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4604 GACACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCT 4663

 21724565 GCTAATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCAC 21724624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4664 GCTAATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCAC 4723

 21724625 AAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATG 21724684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4724 AAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATG 4783

 21724685 TGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTG 21724744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4784 TGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTG 4843

 21724745 CTGTACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATT 21724804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4844 CTGTACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATT 4903

 21724805 AGGTTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCA 21724864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4904 AGGTTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCA 4963

 21724865 CTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAAC 21724924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4964 CTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAAC 5023

 21724925 ACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCAT 21724984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5024 ACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCAT 5083

 21724985 CTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAG 21725044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5084 CTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAG 5143

 21725045 GTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCA 21725104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5144 GTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCA 5203

 21725105 TCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAA 21725164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5204 TCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAA 5263

 21725165 GCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTG 21725224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5264 GCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTG 5323

 21725225 GCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGC 21725284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5324 GCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGC 5383

 21725285 CCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTG 21725344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5384 CCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTG 5443

 21725345 CTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAG 21725404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5444 CTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAG 5503

 21725405 TCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCT 21725464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5504 TCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCT 5563

 21725465 GTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACC 21725524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5564 GTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACC 5623

 21725525 AAGTTTCTGGTAATTAATTACGCA 21725548
          ||||||||||||||||||||||||
     5624 AAGTTTCTGGTAATTAATTACGCA 5647

Alignment time is 4.369 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    6027] =>      6027 nucs 'mol-32-2b08-101004_6027'

Score:        5971
Aligned:      6026        nucs
Identic:      6021 (100%) nucs =>      4455 (100%)      1566 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21718333,21722790] EXCISED REGION [21722793,21724358]
 second seq =>  [       1,    4458] EXCISED REGION [    4460,    6027]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [21722791,21722792]
 second seq =>         1 nucs [4459,4459]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        24 nucs [21722791,21722814] to [21722793,21722816]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21722791,21722791] to [21722792,21722792]
 second seq =>         0 nucs

 21718333 AAGTCCTGATTTCCACCAAATTGAAAGAACAACTGATAGGAGCAGAAATGTCCTCCAAGG 21718392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAGTCCTGATTTCCACCAAATTGAAAGAACAACTGATAGGAGCAGAAATGTCCTCCAAGG 60

 21718393 AAAGGACCTGCATTTTCACATTCAAATGGCCAGAAGGCAGCAGATATAGGATTTACAAAT 21718452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGGACCTGCATTTTCACATTCAAATGGCCAGAAGGCAGCAGATATAGGATTTACAAAT 120

 21718453 CCAGAAAAAAAGAGAAACTGCTTATAGCCCCAGGTAGAAGAAAGTCCTCATATCAGGGTT 21718512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCAGAAAAAAAGAGAAACTGCTTATAGCCCCAGGTAGAAGAAAGTCCTCATATCAGGGTT 180

 21718513 AAGGAGCTATCACCAATGCAACACATAAGGAAAGGGACATCTATATTATGATAAAAGGAA 21718572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGGAGCTATCACCAATGCAACACATAAGGAAAGGGACATCTATATTATGATAAAAGGAA 240

 21718573 AGACATCGTAAAATAGTGCAGTTAAACACAAGGATTAAAGCTAAACTAACATGAAAGGGA 21718632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGACATCGTAAAATAGTGCAGTTAAACACAAGGATTAAAGCTAAACTAACATGAAAGGGA 300

 21718633 CGCAAATAATCAGTGGGACTTGTCATTGCTGGGGGCCATGTCAGTGGAGATAATGAGCAT 21718692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CGCAAATAATCAGTGGGACTTGTCATTGCTGGGGGCCATGTCAGTGGAGATAATGAGCAT 360

 21718693 TAAAGGCTAAATCTGAGGCAGCTTTTGGGAGGGTCCCTGGGCCCTGAGAATCCCAGCACT 21718752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAAAGGCTAAATCTGAGGCAGCTTTTGGGAGGGTCCCTGGGCCCTGAGAATCCCAGCACT 420

 21718753 GACCAGAAGTCCAAGATCAGAGGCCAAGGTTAATGAGAAAACACAGGTTTTTCTGGTTGA 21718812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACCAGAAGTCCAAGATCAGAGGCCAAGGTTAATGAGAAAACACAGGTTTTTCTGGTTGA 480

 21718813 CATCATCATGTTCTCACCCTCTTGTGAATTGCAGCCTAAATATACAAATCTGGAGCTTGG 21718872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CATCATCATGTTCTCACCCTCTTGTGAATTGCAGCCTAAATATACAAATCTGGAGCTTGG 540

 21718873 CATGAGGCACATATACATCTTGACTTGTACAACTAATTCCCATCCATTTTGCTCAACTCA 21718932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATGAGGCACATATACATCTTGACTTGTACAACTAATTCCCATCCATTTTGCTCAACTCA 600

 21718933 GGCTGAGCCAGAATTAACTAACTAATGCAGAATGCCACAGAAATTGCATCTGATTTTTCT 21718992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGCTGAGCCAGAATTAACTAACTAATGCAGAATGCCACAGAAATTGCATCTGATTTTTCT 660

 21718993 TTGGCTGCAGATTCACTAGAAGCTCATGTTCTTACTATTCCTTAGAATTTGGGAGTCTAG 21719052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTGGCTGCAGATTCACTAGAAGCTCATGTTCTTACTATTCCTTAGAATTTGGGAGTCTAG 720

 21719053 AAAAGCACAGGCCTAAATAAATTTCTAAGAGAGAAATTTAATTTAACAATTAGAGTAAAA 21719112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAAAGCACAGGCCTAAATAAATTTCTAAGAGAGAAATTTAATTTAACAATTAGAGTAAAA 780

 21719113 TATTCTGGTAATGAAATTGTATTCTGCTAGTGTGTGGGGGATCATATAGACTGAATTATT 21719172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TATTCTGGTAATGAAATTGTATTCTGCTAGTGTGTGGGGGATCATATAGACTGAATTATT 840

 21719173 TAAAGCAGTCCTAATTTCAAATAATAATAACCAGTAAAATAATAATAATAACCACTCTAA 21719232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAAGCAGTCCTAATTTCAAATAATAATAACCAGTAAAATAATAATAATAACCACTCTAA 900

 21719233 ATTTTGAGTAGTTCATATATACATAGGCTGTTAATTTTCATAGCAATTCTGTTAGTCCTT 21719292
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTTTGAGTAGTTTATATATACATAGGCTGTTAATTTTCATAGCAATTCTGTTAGTCCTT 960

 21719293 AATAATTTAGTTTTTTAGTTGTGGAAACTGGGGAATCTATGAAATTAAGTACTCTGTAGC 21719352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATAATTTAGTTTTTTAGTTGTGGAAACTGGGGAATCTATGAAATTAAGTACTCTGTAGC 1020

 21719353 AGCTAATTCAACCTATGCGTACATAGGTTGATTGATTTTAATGCTCGTTCTTTGTAAAAA 21719412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGCTAATTCAACCTATGCGTACATAGGTTGATTGATTTTAATGCTCGTTCTTTGTAAAAA 1080

 21719413 TCATATTATCTGTATTGTCCCCATAAGCCAAGTATAAGAATCCATTATACCACTCCCCTT 21719472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCATATTATCTGTATTGTCCCCATAAGCCAAGTATAAGAATCCATTATACCACTCCCCTT 1140

 21719473 CTAGTACTCAGGGCATATATTATTCATCAATTATATTTCCAGTTGGCCTCAGAATCCTCC 21719532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTAGTACTCAGGGCATATATTATTCATCAATTATATTTCCAGTTGGCCTCAGAATCCTCC 1200

 21719533 TTAACACAACATACCAGTATCTAATCCAGTTAATCACAGTTTGCTATCCCCGACACAAAC 21719592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTAACACAACATACCAGTATCTAATCCAGTTAATCACAGTTTGCTATCCCCGACACAAAC 1260

 21719593 CCTCAACATTAGGGCATCCAAACCTCTCTGTAAGTCTTGGAAGACAGACAATAGAATAAT 21719652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCTCAACATTAGGGCATCCAAACCTCTCTGTAAGTCTTGGAAGACAGACAATAGAATAAT 1320

 21719653 GCTGACAGTTTCCTTATACCTCTGGCAAAGTGTCCAATCATCTTTTGGTTAGAATCCAGT 21719712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GCTGACAGTTTCCTTATACCTCTGGCAAAGTGTCCAATCATCTTTTGGTTAGAATCCAGT 1380

 21719713 GAGAGGACTAAGAAAGGCATCTGATTTGTCTGTCAAAGCTTGCCCAGGTTATGAAGATAA 21719772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAGAGGACTAAGAAAGGCATCTGATTTGTCTGTCAAAGCTTGCCCAGGTTATGAAGATAA 1440

 21719773 CTGGAGACCTACATTTGTAACTCAGTAAATGGGAGACTTTCATTCCTGGACATTCTGCAA 21719832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGGAGACCTACATTTGTAACTCAGTAAATGGGAGACTTTCATTCCTGGACATTCTGCAA 1500

 21719833 CAGCCAGTGTTGACCTGGTAAATCTACCTGAGATTCGCTCATGATTCCAATGTGACTGAA 21719892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAGCCAGTGTTGACCTGGTAAATCTACCTGAGATTCGCTCATGATTCCAATGTGACTGAA 1560

 21719893 TGCCTTGAGAATATACAACTCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTTAGACAG 21719952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGCCTTGAGAATATACAACTCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTTAGACAG 1620

 21719953 TAGAAGTTCGTGAAGTGACCTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACGCAACA 21720012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1621 TAGAAGTTCGTGAAGTGACCTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACACAACA 1680

 21720013 ACAAATAACCCTAAAAGGAAACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATTGGAG 21720072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACAAATAACCCTAAAAGGAAACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATTGGAG 1740

 21720073 TTAGTCCCTTCAAATTCATGGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTGCTTT 21720132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTAGTCCCTTCAAATTCATGGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTGCTTT 1800

 21720133 TGAACGGACATTAATCCCAAAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAGCAGG 21720192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGAACGGACATTAATCCCAAAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAGCAGG 1860

 21720193 AATGCCTGCTGAGAGGGGAGAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGCCCTG 21720252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AATGCCTGCTGAGAGGGGAGAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGCCCTG 1920

 21720253 CATTTTCCTGAATGATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGCTTTC 21720312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CATTTTCCTGAATGATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGCTTTC 1980

 21720313 CAAGTGCTAAATATTTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCCTATT 21720372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 CAAGTGCTAAATATTTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCCTATT 2040

 21720373 TATACAGTTTAATGTCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAATTTTG 21720432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TATACAGTTTAATGTCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAATTTTG 2100

 21720433 TAAATTTATGTTGTTCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCCCTGC 21720492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TAAATTTATGTTGTTCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCCCTGC 2160

 21720493 CACCCACCCCCCAACCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAACTTC 21720552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CACCCACCCCCCAACCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAACTTC 2220

 21720553 TACAGAATATTCTAAGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCCAAAT 21720612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TACAGAATATTCTAAGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCCAAAT 2280

 21720613 TCCAGTGTTTTCATGTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAAAATA 21720672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCCAGTGTTTTCATGTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAAAATA 2340

 21720673 AGAATAACAGCTAAATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAGTAAA 21720732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AGAATAACAGCTAAATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAGTAAA 2400

 21720733 TACTAAACTATAGTAACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATGATAT 21720792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TACTAAACTATAGTAACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATGATAT 2460

 21720793 GAAATAATGGAATATATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAATCATT 21720852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAAATAATGGAATATATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAATCATT 2520

 21720853 AATTGGTATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGTTAA 21720912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATTGGTATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGTTAA 2580

 21720913 GCTTTTGAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTAAGA 21720972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GCTTTTGAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTAAGA 2640

 21720973 AAGAGTTTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGACATT 21721032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAGAGTTTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGACATT 2700

 21721033 GTTGCTTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCA 21721092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTTGCTTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCA 2760

 21721093 TTAATACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAAC 21721152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TTAATACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAAC 2820

 21721153 AATATTGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGG 21721212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AATATTGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGG 2880

 21721213 GAGGGAGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACT 21721272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GAGGGAGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACT 2940

 21721273 TACTTGATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATAC 21721332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TACTTGATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATAC 3000

 21721333 CCCCAAGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAA 21721392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CCCCAAGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAA 3060

 21721393 GTATATGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATA 21721452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTATATGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATA 3120

 21721453 TTGTATGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACGTGGTAAGGACTCAAAATATGATAGCT 21721512
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3121 TTGTATGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACATGGTAAGGACTCAAAATATGATAGCT 3180

 21721513 GACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTC 21721572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTC 3240

 21721573 ACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCT 21721632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 ACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCT 3300

 21721633 CTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCGT 21721692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCGT 3360

 21721693 TCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACTGGG 21721752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACTGGG 3420

 21721753 TAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTG 21721812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTG 3480

 21721813 AGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATC 21721872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 AGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATC 3540

 21721873 ATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAG 21721932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAG 3600

 21721933 TGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTGTTC 21721992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTGTTC 3660

 21721993 TTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATGTGAT 21722052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATGTGAT 3720

 21722053 GTTTAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGCTC 21722112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GTTTAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGCTC 3780

 21722113 TACTAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTAT 21722172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TACTAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTAT 3840

 21722173 TTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGA 21722232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGA 3900

 21722233 AATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTA 21722292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTA 3960

 21722293 GCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACA 21722352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACA 4020

 21722353 CAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACA 21722412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 CAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACA 4080

 21722413 GTCCCTTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGG 21722472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GTCCCTTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGG 4140

 21722473 AGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTA 21722532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTA 4200

 21722533 GCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTAC 21722592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 GCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTAC 4260

 21722593 AGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGT 21722652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGT 4320

 21722653 ATTATACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAA 21722712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ATTATACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAA 4380

 21722713 ACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATG 21722772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 ACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATG 4440

 21722773 TGAATATATTCCATCAGT 21722790
          ||||||||||||||||||
     4441 TGAATATATTCCATCAGT 4458

EXCISED REGION

 21722793 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTG 21722852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4460 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTG 4519

 21722853 GCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGT 21722912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4520 GCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGT 4579

 21722913 AAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCA 21722972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4580 AAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCA 4639

 21722973 AAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAAT 21723032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4640 AAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAAT 4699

 21723033 AAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACC 21723092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4700 AAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACC 4759

 21723093 AAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTT 21723152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4760 AAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTT 4819

 21723153 TCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACG-AAAAAAAAAAAACAAACAAAA 21723211
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     4820 TCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAAAAAAACAAACAAAA 4879

 21723212 AAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAA 21723271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4880 AAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAA 4939

 21723272 ATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAG-AGGCAAAGATT 21723330
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
     4940 ATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATT 4999

 21723331 TCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACA 21723390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5000 TCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACA 5059

 21723391 AATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAA 21723450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5060 AATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAA 5119

 21723451 ATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCA 21723510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5120 ATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCA 5179

 21723511 GAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAG 21723570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5180 GAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAG 5239

 21723571 TAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATG 21723630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5240 TAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATG 5299

 21723631 CATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGT 21723690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5300 CATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGT 5359

 21723691 TGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGT 21723750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5360 TGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGT 5419

 21723751 ATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGA 21723810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5420 ATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGA 5479

 21723811 GAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGC 21723870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5480 GAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGC 5539

 21723871 AATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAAC 21723930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5540 AATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAAC 5599

 21723931 TAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCAT 21723990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5600 TAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCAT 5659

 21723991 CAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCT 21724050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5660 CAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCT 5719

 21724051 TTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCAT 21724110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5720 TTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCAT 5779

 21724111 ATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGA 21724170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5780 ATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGA 5839

 21724171 TGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTT 21724230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5840 TGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTT 5899

 21724231 TTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAG 21724290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5900 TTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAG 5959

 21724291 TGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAAT 21724350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5960 TGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAAT 6019

 21724351 GGGCATAC 21724358
          ||||||||
     6020 GGGCATAC 6027

Alignment time is 5.55909 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3852] =>      3852 nucs 'mol-32-2e15-201170_3852'

Score:        3696
Aligned:      3837        nucs
Identic:      3816 ( 99%) nucs =>       844 ( 98%)      2972 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21722855,21723705] EXCISED REGION [21725967,21728943]
 second seq =>  [       1,     854] EXCISED REGION [     875,    3852]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2261 nucs [21723706,21725966]
 second seq =>        20 nucs [855,874]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723705,21723705] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [855,855] to [875,875]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723706,21723706] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [855,855] to [874,874]

 21722855 ATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAA 21722914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAA 60

 21722915 ATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAA 21722974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAA 120

 21722975 GGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAA 21723034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAA 180

 21723035 ATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAA 21723094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAA 240

 21723095 AGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTC 21723154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTC 300

 21723155 TAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAAAAA----ACAAACAAA 21723210
          |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||    |||||||||
      301 TAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATTAAAAAAAACGAAAAAAAAAAACCAAACAAACAAA 360

 21723211 AAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAA 21723270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAA 420

 21723271 AATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGA-GGCAAAGAT 21723329
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
      421 AATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGAT 480

 21723330 TTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTA---AAGAAATGGGAA 21723386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||
      481 TTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAAC-----GTGAAGAAATGGGAA 535

 21723387 AACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTG 21723446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 AACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTG 595

 21723447 AAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGA 21723506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 AAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGA 655

 21723507 CTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAA 21723566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      656 CTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGGACCAATTTTGGAGGAAAAA 715

 21723567 AGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAA 21723626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 AGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAA 775

 21723627 GATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGC 21723686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 GATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGC 835

 21723687 AGGTTGGTTTGTTTTTAGT 21723705
          |||||||||||||||||||
      836 AGGTTGGTTTGTTTTTAGT 854

EXCISED REGION

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      875 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAC 934

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      935 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 994

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      995 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 1054

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1055 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 1114

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1115 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 1174

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1175 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 1234

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1235 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 1294

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1295 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 1354

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1355 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 1414

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1415 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 1474

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1475 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 1534

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1535 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 1594

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1595 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 1654

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1655 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 1714

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1715 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 1774

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1775 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 1834

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1835 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 1894

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1895 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 1954

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1955 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 2014

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2015 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 2074

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 2134

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 2194

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 2254

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 2314

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 2374

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 2434

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2435 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 2494

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 2554

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 2614

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 2674

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 2734

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 2794

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 2854

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 2914

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2915 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 2974

 21728066 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 21728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2975 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 3034

 21728126 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 21728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3035 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 3094

 21728186 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 21728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3095 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 3154

 21728246 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 21728305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3155 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATATGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 3214

 21728306 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 21728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3215 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 3274

 21728366 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 21728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3275 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 3334

 21728426 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 21728485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3335 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 3394

 21728486 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 21728545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3395 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 3454

 21728546 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 21728605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3455 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 3514

 21728606 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 21728665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3515 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 3574

 21728666 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 21728725
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3575 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGAGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 3634

 21728726 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAA 21728785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3635 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAATCCAAA 3694

 21728786 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 21728845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3695 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 3754

 21728846 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 21728905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3755 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 3814

 21728906 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGC 21728943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3815 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGC 3852

Alignment time is 4.47145 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    8756] =>      8756 nucs 'mol-32-2e4c-020044_8756'

Score:        8378
Aligned:      8738        nucs
Identic:      8693 ( 99%) nucs =>      4482 ( 99%)      4211 (100%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21719201,21723705] EXCISED REGION [21725967,21730183]
 second seq =>  [       1,    4514] EXCISED REGION [    4539,    8756]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2261 nucs [21723706,21725966]
 second seq =>        24 nucs [4515,4538]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723705,21723705] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [4515,4515] to [4539,4539]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723706,21723706] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [4515,4515] to [4538,4538]

 21719201 AACCAGTAAAATAATAATAATAACCACTCTAAATTTTGAGTAGTTCATATATACATAGGC 21719260
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
        1 AACCAGTAAAATAATAATAATAACCACTCTAAATTTTGAGTAGTTTATATATACATAGGC 60

 21719261 TGTTAATTTTCATAGCAATTCTGTTAGTCCTTAATAATTTAGTTTTTTAGTTGTGGAAAC 21719320
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTTAATTTTCATAGCAATTCTTTTAGTCCTTAATAATTTAGTTTTTTAGTTGTGGAAAC 120

 21719321 TGGGGAATCTATGAAATTAAGTACTCTGTAGCAGCTAATTCAACCTATGCGTACATAGGT 21719380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGGGAATCTATGAAATTAAGTACTCTGTAGCAGCTAATTCAACCTATGCGTACATAGGT 180

 21719381 TGATTGATTTTAATGCTCGTTCTTTGTAAAAATCATATTATCTGTATTGTCCCCATAAGC 21719440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGATTGATTTTAATGCTCGTTCTTTGTAAAAATCATATTATCTGTATTGTCCCCATAAGC 240

 21719441 CAAGTATAAGAATCCATTATACCACTCCCCTTCTAGTACTCAGGGCATATATTATTCATC 21719500
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      241 CAAGTATAAGAATCCATTATACCACTCCCCTTCTACTACTCAGGGCATATATTATTCATC 300

 21719501 AATTATATTTCCAGTTGGCCTCAGAATCCTCCTTAACACAACATACCAGTATCTAATCCA 21719560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AATTATATTTCCAGTTGGCCTCAGAATCCTCCTTAACACAACATACCAGTATCTAATCCA 360

 21719561 GTTAATCACAGTTTGCTATCCCCGACACAAACCCTCAACATTAGGGCATCCAAACCTCTC 21719620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTTAATCACAGTTTGCTATCCCCGACACAAACCCTCAACATTAGGGCATCCAAACCTCTC 420

 21719621 TGTAAGTCTTGGAAGACAGACAATAGAATAATGCTGACAGTTTCCTTATACCTCTGGCAA 21719680
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTAAGTTTTGGAAGACAGACAATAGAATAATGCTGACAGTTTCCTTATACCTCTGGCAA 480

 21719681 AGTGTCCAATCATCTTTTGGTTAGAATCCAGTGAGAGGACTAAGAAAGGCATCTGATTTG 21719740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTGTCCAATCATCTTTTGGTTAGAATCCAGTGAGAGGACTAAGAAAGGCATCTGATTTG 540

 21719741 TCTGTCAAAGCTTGCCCAGGTTATGAAGATAACTGGAGACCTACATTTGTAACTCAGTAA 21719800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTGTCAAAGCTTGCCCAGGTTATGAAGATAACTGGAGACCTACATTTGTAACTCAGTAA 600

 21719801 ATGGGAGACTTTCATTCCTGGACATTCTGCAACAGCCAGTGTTGACCTGGTAAATCTACC 21719860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATGGGAGACTTTCATTCCTGGACATTCTGCAACAGCCAGTGTTGACCTGGTAAATCTACC 660

 21719861 TGAGATTCGCTCATGATTCCAATGTGACTGAATGCCTTGAGAATATACAACTCCCTCACA 21719920
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGAGATTCCCTCATGATTCCAATGTGACTGAATGCCTTGAGAATATACAACTCCCTCACA 720

 21719921 GCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTTAGACAGTAGAAGTTCGTGAAGTGACCTAATCACT 21719980
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCTATTCTTCTTTATTGATATGCCTTAGACAGTAGAAGTTCGTGAAGTGACCTAATCACT 780

 21719981 GTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACGCAACAACAAATAACCCTAAAAGGAAACTGGAGA 21720040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACGCAACAACAAATAACCCTAAAAGGAAACTGGAGA 840

 21720041 AGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATTGGAGTTAGTCCCTTCAAATTCATGGGCCTGTT 21720100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATTGGAGTTAGTCCCTTCAAATTCATGGGCCTGTT 900

 21720101 TGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTGCTTTTGAACGGACATTAATCCCAAAGGAAGAA 21720160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
      901 TGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTGCTTTTGAAAGGACATTAATCCCAAAGGAAGAA 960

 21720161 CAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAGCAGGAATGCCTGCTGAGAGGGGAGAGAAATTC 21720220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAGCAGGAATGCCTGCTGAGAGGGGAGAGAAATTC 1020

 21720221 TGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGCCCTGCATTTTCCTGAATGATTCTGATCTGTAC 21720280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGCCCTGCATTTTCCTGAATGATTCTGATCTGTAC 1080

 21720281 TGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGCTTTCCAAGTGCTAAATATTTGCTTCCCAAGTT 21720340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGCTTTCCAAGTGCTAAATATTTGCTTCCCAAGTT 1140

 21720341 ATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCCTATTTATACAGTTTAATGTCCTCCTTATAAGC 21720400
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCCTATTTGTACAGTTTAATGTCCTCCTTATAAGC 1200

 21720401 GAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAATTTTGTAAATTTATGTTGTTCTTCAGCTGCTCT 21720460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAATTTTGTAAATTTATGTTGTTCTTCAGCTGCTCT 1260

 21720461 CTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCCCTGCCACCCACCCCCCAACCCCATCCACTTAG 21720520
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1261 CTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCCCTGCCACCCACCCCCCAACTCCATCCACTTAG 1320

 21720521 CATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAACTTCTACAGAATATTCTAAGTGCTTAAGAGGG 21720580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAACTTCTACAGAATATTCTAAGTGCTTAAGAGGG 1380

 21720581 CAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCCAAATTCCAGTGTTTTCATGTCCAAAGGAAATT 21720640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCCAAATTCCAGTGTTTTCATGTCCAAAGGAAATT 1440

 21720641 AACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAAAATAAGAATAACAGCTAAATTCCAGGATTTCT 21720700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAAAATAAGAATAACAGCTAAATTCCAGGATTTCT 1500

 21720701 GTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAGTAAATACTAAACTATAGTAACTATTCTTAATG 21720760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAGTAAATACTAAACTATAGTAACTATTCTTAATG 1560

 21720761 TCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATGATATGAAATAATGGAATATATTTTATTAAATT 21720820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATGATATGAAATAATGGAATATATTTTATTAAATT 1620

 21720821 TTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAATCATTAATTGGTATATCTCTTATGATACTTACA 21720880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAATCATTAATTGGTATATCTCTTATGATACTTACA 1680

 21720881 TTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGTTAAGCTTTTGAAGGGGAGTATTCATGGCTGG 21720940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGTTAAGCTTTTGAAGGGGAGTATTCATGGCTGG 1740

 21720941 GTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTAAGAAAGAGTTTTGAAAATTATAGGCACCCAA 21721000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTAAGAAAGAGTTTTGAAAATTATAGGCACCCAA 1800

 21721001 GTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGACATTGTTGCTTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAA 21721060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGACATTGTTGCTTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAA 1860

 21721061 GAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCATTAATACTATTAGGTACCTGTTTTCAAT 21721120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCATTAATACTATTAGGTACCTGTTTTCAAT 1920

 21721121 GTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAACAATATTGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAA 21721180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAACAATATTGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAA 1980

 21721181 AAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGGGAGGGAGACTAGCAGGGAGGGAAAATAG 21721240
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAGGAAGAGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGGGAGGGAGACTAGCAGGGAGGGAAAATAG 2040

 21721241 CAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACTTACTTGATTGACCTCGATAGAACTGTTA 21721300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACTTACTTGATTGACCTCGATAGAACTGTTA 2100

 21721301 GTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATACCCCCAAGTCATCCTATATGGAAATACCC 21721360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATACCCCCAAGTCATCCTATATGGAAATACCC 2160

 21721361 ACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAAGTATATGTCTTTTAAACTGGAAAGTGAT 21721420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAAGTATATGTCTTTTAAACTGGAAAGTGAT 2220

 21721421 CAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATATTGTATGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCT 21721480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATATTGTATGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCT 2280

 21721481 AATACGTGGTAAGGACTCAAAATATGATAGCTGACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTA 21721540
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATACGTGGTAAGTACTCAAAATATGATAGCTGACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTA 2340

 21721541 ATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTCACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGC 21721600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTCACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGC 2400

 21721601 TTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCA 21721660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCA 2460

 21721661 TTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCGTTCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATT 21721720
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCATTCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATT 2520

 21721721 TATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACTGGGTAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATAT 21721780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACTGGGTAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATAT 2580

 21721781 TAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAG 21721840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAG 2640

 21721841 TTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAAT 21721900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAAT 2700

 21721901 ATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTA 21721960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTA 2760

 21721961 ATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTGTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAA 21722020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTGTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAA 2820

 21722021 CCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATGTGATGTTTAACTAATAATATCGGATATGATGA 21722080
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CCCACTTCTTTTAGCGAGGAGCCACATGTGATGTTTAACTAATAATATCGGATATGATGA 2880

 21722081 CTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGCTCTACTAATCACATGGACTAGAATCATGGC 21722140
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGTTCTACTAATCACATGGACTAGAATCATGGC 2940

 21722141 CATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGC 21722200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGC 3000

 21722201 CAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGT 21722260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGT 3060

 21722261 CTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTT 21722320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTT 3120

 21722321 TCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTC 21722380
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 -CACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTC 3179

 21722381 TCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACAGTCCCTTACATCGCAATGTTACACACAC 21722440
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3180 TCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACAGTCCCTTACGTCGCAATGTTACACACAC 3239

 21722441 AGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTT 21722500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 AGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTT 3299

 21722501 TTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGC 21722560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGC 3359

 21722561 TAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAA 21722620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 TAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAA 3419

 21722621 GGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATTATACTGTTGAAAGACATCT-AAGTC 21722679
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
     3420 GGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATTATACTGTTGAAAGACATCTTAAGTC 3479

 21722680 CTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTA 21722739
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 CTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTA 3539

 21722740 TTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTGAATATATTCCATCAGTAAAAAAAAA 21722799
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTGAATATATTCCATCAGTAAAAAAAAA 3599

 21722800 AAAAAAAAAAAAAAAAA------CCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGG 21722853
          |||||||||||||||||      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGG 3659

 21722854 CATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTA 21722913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 CATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTA 3719

 21722914 AATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAA 21722973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 AATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAA 3779

 21722974 AGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATA 21723033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 AGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATA 3839

 21723034 AATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCA 21723093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 AATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCA 3899

 21723094 AAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTT 21723153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 AAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTT 3959

 21723154 CTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAAAAA----ACAAACAA 21723209
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||    ||||||||
     3960 CTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATTAAAAAAAACGAAAAAAAAAAACCAAACAAACAA 4019

 21723210 AAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGA 21723269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 AAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGA 4079

 21723270 AAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGA-GGCAAAGA 21723328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
     4080 AAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGA 4139

 21723329 TTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTA---AAGAAATGGGA 21723385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||
     4140 TTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAAC-----GTGAAGAAATGGGA 4194

 21723386 AAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGT 21723445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 AAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGT 4254

 21723446 GAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAG 21723505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 GAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAG 4314

 21723506 ACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAA 21723565
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     4315 ACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGGACCAATTTTGGAGGAAAA 4374

 21723566 AAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGA 21723625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 AAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGA 4434

 21723626 AGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGG 21723685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 AGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGG 4494

 21723686 CAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 21723705
          ||||||||||||||||||||
     4495 CAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 4514

EXCISED REGION

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     4539 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAC 4598

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4599 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 4658

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4659 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 4718

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4719 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 4778

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4779 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 4838

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4839 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 4898

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4899 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 4958

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4959 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 5018

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5019 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 5078

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5079 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 5138

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5139 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 5198

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5199 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 5258

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5259 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 5318

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5319 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 5378

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5379 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 5438

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5439 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 5498

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5499 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 5558

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5559 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 5618

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5619 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 5678

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5679 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 5738

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5739 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 5798

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5799 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 5858

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5859 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 5918

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5919 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 5978

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5979 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 6038

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6039 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 6098

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6099 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 6158

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6159 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 6218

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6219 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 6278

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6279 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 6338

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6339 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 6398

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6399 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 6458

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6459 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 6518

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6519 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 6578

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6579 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 6638

 21728066 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 21728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6639 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 6698

 21728126 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 21728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6699 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 6758

 21728186 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 21728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6759 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 6818

 21728246 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 21728305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6819 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATATGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 6878

 21728306 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 21728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6879 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 6938

 21728366 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 21728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6939 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 6998

 21728426 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 21728485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6999 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 7058

 21728486 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 21728545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7059 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 7118

 21728546 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 21728605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7119 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 7178

 21728606 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 21728665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7179 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 7238

 21728666 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 21728725
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7239 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGAGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 7298

 21728726 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAA 21728785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     7299 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAATCCAAA 7358

 21728786 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 21728845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7359 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 7418

 21728846 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 21728905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7419 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 7478

 21728906 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 21728965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7479 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 7538

 21728966 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 21729025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7539 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 7598

 21729026 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 21729085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7599 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 7658

 21729086 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 21729145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7659 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 7718

 21729146 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 21729205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7719 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 7778

 21729206 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 21729265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7779 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 7838

 21729266 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 21729325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7839 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 7898

 21729326 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 21729385
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7899 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCTATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 7958

 21729386 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 21729445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7959 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 8018

 21729446 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 21729505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8019 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 8078

 21729506 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 21729565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8079 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 8138

 21729566 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 21729625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8139 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 8198

 21729626 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 21729685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8199 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 8258

 21729686 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 21729745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8259 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 8318

 21729746 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 21729805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8319 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 8378

 21729806 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 21729865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8379 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 8438

 21729866 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 21729925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8439 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 8498

 21729926 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACACATAATGACAT 21729985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8499 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACACATAATGACAT 8558

 21729986 TATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAAACAAGTCTTTATCACAGCTAGAC 21730045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8559 TATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAAACAAGTCTTTATCACAGCTAGAC 8618

 21730046 ATTAACTACATTCTTTCTGAATCTCAGCTCCTTTAGGTGGTTTTATCAATGTATCTGTTC 21730105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8619 ATTAACTACATTCTTTCTGAATCTCAGCTCCTTTAGGTGGTTTTATCAATGTATCTGTTC 8678

 21730106 CCATAGTGCATGGATATCCAATAAACTGTCTTTTAAATCCATGAATTCTTCCATAAACTA 21730165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8679 CCATAGTGCATGGATATCCAATAAACTGTCTTTTAAATCCATGAATTCTTCCATAAACTA 8738

 21730166 TTGCTGTCTGATGAAATT 21730183
          ||||||||||||||||||
     8739 TTGCTGTCTGATGAAATT 8756

Alignment time is 7.48026 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4218] =>      4218 nucs 'mol-32-2e4c-020044_4218'

Score:        4151
Aligned:      4217        nucs
Identic:      4211 (100%) nucs =>        59 (100%)      4152 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21725967,21726025] EXCISED REGION [21726027,21730183]
 second seq =>  [       1,      59] EXCISED REGION [      61,    4218]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [21726026,21726026]
 second seq =>         1 nucs [60,60]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [72,72]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [60,62] to [61,63]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAA 21726025
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAA 59

EXCISED REGION

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 120

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 180

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 240

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 300

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 360

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      361 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 420

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 480

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 540

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 600

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 660

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 720

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 780

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 840

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 900

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 960

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 1020

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 1080

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 1140

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 1200

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 1260

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 1320

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 1380

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 1440

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 1500

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 1560

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 1620

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 1680

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 1740

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 1800

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 1860

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 1920

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 1980

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 2040

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 2100

 21728066 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 21728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 2160

 21728126 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 21728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 2220

 21728186 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 21728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 2280

 21728246 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 21728305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATATGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 2340

 21728306 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 21728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 2400

 21728366 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 21728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 2460

 21728426 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 21728485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 2520

 21728486 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 21728545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 2580

 21728546 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 21728605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 2640

 21728606 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 21728665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 2700

 21728666 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 21728725
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGAGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 2760

 21728726 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAA 21728785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2761 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAATCCAAA 2820

 21728786 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 21728845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 2880

 21728846 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 21728905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 2940

 21728906 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 21728965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 3000

 21728966 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 21729025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 3060

 21729026 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 21729085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 3120

 21729086 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 21729145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 3180

 21729146 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 21729205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 3240

 21729206 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 21729265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 3300

 21729266 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 21729325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 3360

 21729326 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 21729385
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCTATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 3420

 21729386 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 21729445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 3480

 21729446 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 21729505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 3540

 21729506 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 21729565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 3600

 21729566 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 21729625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 3660

 21729626 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 21729685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 3720

 21729686 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 21729745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 3780

 21729746 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 21729805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 3840

 21729806 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 21729865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 3900

 21729866 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 21729925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 3960

 21729926 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACACATAATGACAT 21729985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACACATAATGACAT 4020

 21729986 TATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAAACAAGTCTTTATCACAGCTAGAC 21730045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAAACAAGTCTTTATCACAGCTAGAC 4080

 21730046 ATTAACTACATTCTTTCTGAATCTCAGCTCCTTTAGGTGGTTTTATCAATGTATCTGTTC 21730105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATTAACTACATTCTTTCTGAATCTCAGCTCCTTTAGGTGGTTTTATCAATGTATCTGTTC 4140

 21730106 CCATAGTGCATGGATATCCAATAAACTGTCTTTTAAATCCATGAATTCTTCCATAAACTA 21730165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CCATAGTGCATGGATATCCAATAAACTGTCTTTTAAATCCATGAATTCTTCCATAAACTA 4200

 21730166 TTGCTGTCTGATGAAATT 21730183
          ||||||||||||||||||
     4201 TTGCTGTCTGATGAAATT 4218

Alignment time is 4.17069 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    8402] =>      8402 nucs 'mol-32-2edb-138402_8402'

Score:        8324
Aligned:      8403        nucs
Identic:      8395 (100%) nucs =>      6361 (100%)      2034 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21719529,21725892] EXCISED REGION [21725905,21727939]
 second seq =>  [       1,    6367] EXCISED REGION [    6368,    8402]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        12 nucs [21725893,21725904]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [21725874,21725892] to [21725905,21725923]
 second seq =>        19 nucs [6349,6367] to [6368,6386]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [21725893,21725895] to [21725902,21725904]
 second seq =>         0 nucs

 21719529 CTCCTTAACACAACATACCAGTATCTAATCCAGTTAATCACAGTTTGCTATCCCCGACAC 21719588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTCCTTAACACAACATACCAGTATCTAATCCAGTTAATCACAGTTTGCTATCCCCGACAC 60

 21719589 AAACCCTCAACATTAGGGCATCCAAACCTCTCTGTAAGTCTTGGAAGACAGACAATAGAA 21719648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACCCTCAACATTAGGGCATCCAAACCTCTCTGTAAGTCTTGGAAGACAGACAATAGAA 120

 21719649 TAATGCTGACAGTTTCCTTATACCTCTGGCAAAGTGTCCAATCATCTTTTGGTTAGAATC 21719708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAATGCTGACAGTTTCCTTATACCTCTGGCAAAGTGTCCAATCATCTTTTGGTTAGAATC 180

 21719709 CAGTGAGAGGACTAAGAAAGGCATCTGATTTGTCTGTCAAAGCTTGCCCAGGTTATGAAG 21719768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CAGTGAGAGGACTAAGAAAGGCATCTGATTTGTCTGTCAAAGCTTGCCCAGGTTATGAAG 240

 21719769 ATAACTGGAGACCTACATTTGTAACTCAGTAAATGGGAGACTTTCATTCCTGGACATTCT 21719828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAACTGGAGACCTACATTTGTAACTCAGTAAATGGGAGACTTTCATTCCTGGACATTCT 300

 21719829 GCAACAGCCAGTGTTGACCTGGTAAATCTACCTGAGATTCGCTCATGATTCCAATGTGAC 21719888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCAACAGCCAGTGTTGACCTGGTAAATCTACCTGAGATTCGCTCATGATTCCAATGTGAC 360

 21719889 TGAATGCCTTGAGAATATACAACTCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTTAG 21719948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGAATGCCTTGAGAATATACAACTCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTTAG 420

 21719949 ACAGTAGAAGTTCGTGAAGTGACCTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACGC 21720008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      421 ACAGTAGAAGTTCGTGAAGTGACCTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACAC 480

 21720009 AACAACAAATAACCCTAAAAGGAAACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATT 21720068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACAACAAATAACCCTAAAAGGAAACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATT 540

 21720069 GGAGTTAGTCCCTTCAAATTCATGGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTG 21720128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGAGTTAGTCCCTTCAAATTCATGGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTG 600

 21720129 CTTTTGAACGGACATTAATCCCAAAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAG 21720188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTTTTGAACGGACATTAATCCCAAAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAG 660

 21720189 CAGGAATGCCTGCTGAGAGGGGAGAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGC 21720248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGGAATGCCTGCTGAGAGGGGAGAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGC 720

 21720249 CCTGCATTTTCCTGAATGATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGC 21720308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCTGCATTTTCCTGAATGATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGC 780

 21720309 TTTCCAAGTGCTAAATATTTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCC 21720368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTCCAAGTGCTAAATATTTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCC 840

 21720369 TATTTATACAGTTTAATGTCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAAT 21720428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATTTATACAGTTTAATGTCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAAT 900

 21720429 TTTGTAAATTTATGTTGTTCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCC 21720488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTGTAAATTTATGTTGTTCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCC 960

 21720489 CTGCCACCCACCCCCCAACCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAA 21720548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTGCCACCCACCCCCCAACCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAA 1020

 21720549 CTTCTACAGAATATTCTAAGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCC 21720608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CTTCTACAGAATATTCTAAGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCC 1080

 21720609 AAATTCCAGTGTTTTCATGTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAA 21720668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATTCCAGTGTTTTCATGTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAA 1140

 21720669 AATAAGAATAACAGCTAAATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAG 21720728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATAAGAATAACAGCTAAATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAG 1200

 21720729 TAAATACTAAACTATAGTAACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATG 21720788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAAATACTAAACTATAGTAACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATG 1260

 21720789 ATATGAAATAATGGAATATATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAAT 21720848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATATGAAATAATGGAATATATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAAT 1320

 21720849 CATTAATTGGTATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAG 21720908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CATTAATTGGTATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAG 1380

 21720909 TTAAGCTTTTGAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCT 21720968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTAAGCTTTTGAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCT 1440

 21720969 AAGAAAGAGTTTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGA 21721028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAGAAAGAGTTTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGA 1500

 21721029 CATTGTTGCTTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAAT 21721088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CATTGTTGCTTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAAT 1560

 21721089 GTCATTAATACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGG 21721148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTCATTAATACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGG 1620

 21721149 AAACAATATTGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTG 21721208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAACAATATTGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTG 1680

 21721209 GAGGGAGGGAGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGC 21721268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GAGGGAGGGAGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGC 1740

 21721269 GACTTACTTGATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAA 21721328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GACTTACTTGATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAA 1800

 21721329 ATACCCCCAAGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCAT 21721388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATACCCCCAAGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCAT 1860

 21721389 AGAAGTATATGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAA 21721448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAAGTATATGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAA 1920

 21721449 AATATTGTATGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACGTGGTAAGGACTCAAAATATGAT 21721508
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1921 AATATTGTATGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACATGGTAAGGACTCAAAATATGAT 1980

 21721509 AGCTGACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAG 21721568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGCTGACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAG 2040

 21721569 AGTCACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTC 21721628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGTCACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTC 2100

 21721629 ACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCAC 21721688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCAC 2160

 21721689 TCGTTCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACAC 21721748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCGTTCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACAC 2220

 21721749 TGGGTAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAAT 21721808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGGGTAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAAT 2280

 21721809 AGTGAGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGG 21721868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGTGAGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGG 2340

 21721869 AATCATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAA 21721928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATCATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAA 2400

 21721929 CAAGTGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTT 21721988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAAGTGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTT 2460

 21721989 GTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATG 21722048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATG 2520

 21722049 TGATGTTTAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATAT 21722108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TGATGTTTAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATAT 2580

 21722109 GCTCTACTAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGT 21722168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GCTCTACTAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGT 2640

 21722169 TTATTTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTG 21722228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTATTTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTG 2700

 21722229 GGGAAATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAG 21722288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGGAAATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAG 2760

 21722289 TCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGC 21722348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGC 2820

 21722349 TACACAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCA 21722408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TACACAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCA 2880

 21722409 GACAGTCCCTTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGC 21722468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GACAGTCCCTTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGC 2940

 21722469 AGGGAGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCC 21722528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AGGGAGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCC 3000

 21722529 CTTAGCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAA 21722588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CTTAGCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAA 3060

 21722589 TTACAGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCA 21722648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTACAGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCA 3120

 21722649 GAGTATTATACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAG 21722708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAGTATTATACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAG 3180

 21722709 GTAAACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCC 21722768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GTAAACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCC 3240

 21722769 TATGTGAATATATTCCATCAGT--AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTT 21722826
          ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TATGTGAATATATTCCATCAGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTT 3300

 21722827 TGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCT 21722886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCT 3360

 21722887 GGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATT 21722946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATT 3420

 21722947 TCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGC 21723006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGC 3480

 21723007 TTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCA 21723066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCA 3540

 21723067 CAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTG 21723126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTG 3600

 21723127 GAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAA 21723186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAA 3660

 21723187 AACGAAAAAAAAAAAA-CAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGT 21723245
          |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AACGAAAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGT 3720

 21723246 GTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGA 21723305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGA 3780

 21723306 AATGAGGGAAAGAGA-GGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTG 21723364
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 AATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTG 3840

 21723365 AAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGT 21723424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGT 3900

 21723425 TTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAAT 21723484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAAT 3960

 21723485 GTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGT 21723544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGT 4020

 21723545 TGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATT 21723604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATT 4080

 21723605 ACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAG 21723664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAG 4140

 21723665 AGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAG 21723724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAG 4200

 21723725 TTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTAC 21723784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTAC 4260

 21723785 ACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGA 21723844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGA 4320

 21723845 GTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGAC 21723904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGAC 4380

 21723905 TTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCA 21723964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCA 4440

 21723965 TTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTG 21724024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTG 4500

 21724025 GAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTT 21724084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTT 4560

 21724085 TAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTA 21724144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 TAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTA 4620

 21724145 CAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGA 21724204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 CAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGA 4680

 21724205 GCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTA 21724264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 GCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTA 4740

 21724265 AGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAG 21724324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAG 4800

 21724325 CAGCCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTC 21724384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 CAGCCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTC 4860

 21724385 TAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGT 21724444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 TAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGT 4920

 21724445 CCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAA 21724504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 CCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAA 4980

 21724505 GACACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCT 21724564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GACACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCT 5040

 21724565 GCTAATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCAC 21724624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 GCTAATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCAC 5100

 21724625 AAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATG 21724684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATG 5160

 21724685 TGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTG 21724744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTG 5220

 21724745 CTGTACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATT 21724804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 CTGTACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATT 5280

 21724805 AGGTTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCA 21724864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 AGGTTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCA 5340

 21724865 CTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAAC 21724924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 CTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAAC 5400

 21724925 ACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCAT 21724984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 ACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCAT 5460

 21724985 CTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAG 21725044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 CTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAG 5520

 21725045 GTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCA 21725104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 GTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCA 5580

 21725105 TCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAA 21725164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 TCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAA 5640

 21725165 GCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTG 21725224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 GCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTG 5700

 21725225 GCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGC 21725284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 GCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGC 5760

 21725285 CCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTG 21725344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 CCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTG 5820

 21725345 CTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAG 21725404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 CTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAG 5880

 21725405 TCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCT 21725464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 TCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCT 5940

 21725465 GTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACC 21725524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 GTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACC 6000

 21725525 AAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGT 21725584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 AAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGT 6060

 21725585 CCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCAC 21725644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 CCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCAC 6120

 21725645 TGTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAA 21725704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 TGTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAA 6180

 21725705 GCGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCT 21725764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 GCGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCT 6240

 21725765 TCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCA 21725824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 TCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCA 6300

 21725825 CCACACTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 21725884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     6301 CCACACTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCTC-TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 6359

 21725885 TCTCTCTC 21725892
          ||||||||
     6360 TCTCTCTC 6367

EXCISED REGION

 21725905 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATTCTTTACC 21725964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6368 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATTCTTTACC 6427

 21725965 ATCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATA 21726024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6428 ATCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATA 6487

 21726025 AGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACAT 21726084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6488 AGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACAT 6547

 21726085 TAATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAG 21726144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6548 TAATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAG 6607

 21726145 TTTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGC 21726204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6608 TTTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGC 6667

 21726205 AAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTT 21726264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6668 AAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTT 6727

 21726265 TTATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAA 21726324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6728 TTATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAA 6787

 21726325 AATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTC 21726384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     6788 AATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTC 6847

 21726385 TTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTG 21726444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6848 TTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTG 6907

 21726445 GAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCC 21726504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6908 GAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCC 6967

 21726505 ATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATA 21726564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6968 ATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATA 7027

 21726565 AAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGT 21726624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7028 AAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGT 7087

 21726625 GTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAG 21726684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7088 GTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAG 7147

 21726685 ATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGG 21726744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7148 ATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGG 7207

 21726745 AGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACA 21726804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7208 AGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACA 7267

 21726805 AGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAG 21726864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7268 AGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAG 7327

 21726865 AAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTC 21726924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7328 AAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTC 7387

 21726925 GTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTT 21726984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7388 GTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTT 7447

 21726985 TCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAG 21727044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7448 TCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAG 7507

 21727045 CACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGAT 21727104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7508 CACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGAT 7567

 21727105 GGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAA 21727164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7568 GGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAA 7627

 21727165 AAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTA 21727224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7628 AAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTA 7687

 21727225 TCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAA 21727284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7688 TCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAA 7747

 21727285 ATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTA 21727344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7748 ATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTA 7807

 21727345 AAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAA 21727404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7808 AAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAA 7867

 21727405 CTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTG 21727464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7868 CTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTG 7927

 21727465 AAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAA 21727524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7928 AAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAA 7987

 21727525 TGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATT 21727584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7988 TGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATT 8047

 21727585 AAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTT 21727644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8048 AAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTT 8107

 21727645 TAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAA 21727704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8108 TAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAA 8167

 21727705 ATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTT 21727764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8168 ATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTT 8227

 21727765 GGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAG 21727824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8228 GGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAG 8287

 21727825 ATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGT 21727884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8288 ATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGT 8347

 21727885 TGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCG 21727939
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8348 TGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCG 8402

Alignment time is 7.22511 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3976] =>      3976 nucs 'mol-32-2ef1-060932_3976'

Score:        3933
Aligned:      3977        nucs
Identic:      3973 (100%) nucs =>      2859 (100%)      1114 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21723033,21725892] EXCISED REGION [21725905,21727019]
 second seq =>  [       1,    2861] EXCISED REGION [    2862,    3976]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        12 nucs [21725893,21725904]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [21725874,21725892] to [21725905,21725923]
 second seq =>        19 nucs [2843,2861] to [2862,2880]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [21725893,21725895] to [21725902,21725904]
 second seq =>         0 nucs

 21723033 AAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACC 21723092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACC 60

 21723093 AAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTT 21723152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTT 120

 21723153 TCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAAAAAA-CAAACAAAA 21723211
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
      121 TCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAAAAAAACAAACAAAA 180

 21723212 AAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAA 21723271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAA 240

 21723272 ATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGA-GGCAAAGATT 21723330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
      241 ATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATT 300

 21723331 TCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACA 21723390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACA 360

 21723391 AATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAA 21723450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAA 420

 21723451 ATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCA 21723510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCA 480

 21723511 GAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAG 21723570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAG 540

 21723571 TAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATG 21723630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATG 600

 21723631 CATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGT 21723690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGT 660

 21723691 TGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGT 21723750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGT 720

 21723751 ATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGA 21723810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGA 780

 21723811 GAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGC 21723870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGC 840

 21723871 AATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAAC 21723930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAAC 900

 21723931 TAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCAT 21723990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCAT 960

 21723991 CAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCT 21724050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCT 1020

 21724051 TTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCAT 21724110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCAT 1080

 21724111 ATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGA 21724170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGA 1140

 21724171 TGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTT 21724230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTT 1200

 21724231 TTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAG 21724290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAG 1260

 21724291 TGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAAT 21724350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAAT 1320

 21724351 GGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGT 21724410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGT 1380

 21724411 TCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTT 21724470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTT 1440

 21724471 AGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTAC 21724530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTAC 1500

 21724531 CCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCC 21724590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCC 1560

 21724591 TAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAA 21724650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAA 1620

 21724651 CACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAA 21724710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAA 1680

 21724711 TTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACACCCTACATCATCTGTAG 21724770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACACCCTACATCATCTGTAG 1740

 21724771 GACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGAC 21724830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGAC 1800

 21724831 TTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATC 21724890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATC 1860

 21724891 ACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAA 21724950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAA 1920

 21724951 ATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTG 21725010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 ATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTG 1980

 21725011 AGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCAC 21725070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCAC 2040

 21725071 TGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCAT 21725130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCAT 2100

 21725131 GTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGC 21725190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGC 2160

 21725191 AGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAA 21725250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAA 2220

 21725251 GGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAG 21725310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAG 2280

 21725311 ACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAG 21725370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAG 2340

 21725371 ATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCC 21725430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 ATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCC 2400

 21725431 TATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACT 21725490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACT 2460

 21725491 ATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGA 21725550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 ATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGA 2520

 21725551 AATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAG 21725610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAG 2580

 21725611 TTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCAC 21725670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCAC 2640

 21725671 GCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCT 21725730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCT 2700

 21725731 TTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAA 21725790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAA 2760

 21725791 GGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACACTAAAGCCATAAATGGTTAAC 21725850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACACTAAAGCCATAAATGGTTAAC 2820

 21725851 TGTTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 21725892
          ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGTTCTC-TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 2861

EXCISED REGION

 21725905 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATTCTTTACC 21725964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2862 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATTCTTTACC 2921

 21725965 ATCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATA 21726024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 ATCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATA 2981

 21726025 AGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACAT 21726084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 AGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACAT 3041

 21726085 TAATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAG 21726144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 TAATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAG 3101

 21726145 TTTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGC 21726204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3102 TTTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGC 3161

 21726205 AAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTT 21726264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3162 AAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTT 3221

 21726265 TTATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAA 21726324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3222 TTATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAA 3281

 21726325 AATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTC 21726384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3282 AATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTC 3341

 21726385 TTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTG 21726444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3342 TTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTG 3401

 21726445 GAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCC 21726504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3402 GAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCC 3461

 21726505 ATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATA 21726564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3462 ATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATA 3521

 21726565 AAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGT 21726624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3522 AAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGT 3581

 21726625 GTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAG 21726684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3582 GTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAG 3641

 21726685 ATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGG 21726744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3642 ATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGG 3701

 21726745 AGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACA 21726804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3702 AGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACA 3761

 21726805 AGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAG 21726864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3762 AGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAG 3821

 21726865 AAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTC 21726924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3822 AAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTC 3881

 21726925 GTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTT 21726984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3882 GTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTT 3941

 21726985 TCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAA 21727019
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3942 TCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAA 3976

Alignment time is 4.13241 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3232] =>      3232 nucs 'mol-32-2ef1-094178_3232'

Score:        3198
Aligned:      3231        nucs
Identic:      3228 (100%) nucs =>       628 (100%)      2600 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21720858,21721485] EXCISED REGION [21721487,21724086]
 second seq =>  [       1,     628] EXCISED REGION [     630,    3232]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [21721486,21721486]
 second seq =>         1 nucs [629,629]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1934,1934]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 21720858 GTATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGTTAAGCTTT 21720917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGTTAAGCTTT 60

 21720918 TGAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTAAGAAAGAG 21720977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTAAGAAAGAG 120

 21720978 TTTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGACATTGTTGC 21721037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGACATTGTTGC 180

 21721038 TTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCATTAAT 21721097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCATTAAT 240

 21721098 ACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAACAATAT 21721157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAACAATAT 300

 21721158 TGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGGGAGGG 21721217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGGGAGGG 360

 21721218 AGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACTTACTT 21721277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACTTACTT 420

 21721278 GATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATACCCCCA 21721337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATACCCCCA 480

 21721338 AGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAAGTATA 21721397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAAGTATA 540

 21721398 TGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATATTGTA 21721457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATATTGTA 600

 21721458 TGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATAC 21721485
          ||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATAC 628

EXCISED REGION

 21721487 TGGTAAGGACTCAAAATATGATAGCTGACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTA 21721546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      630 TGGTAAGGACTCAAAATATGATAGCTGACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTA 689

 21721547 TTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTCACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCC 21721606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      690 TTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTCACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCC 749

 21721607 TCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTC 21721666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      750 TCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTC 809

 21721667 TCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCGTTCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGG 21721726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      810 TCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCGTTCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGG 869

 21721727 TTACTCACTCTCTTGAATACACTGGGTAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCC 21721786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      870 TTACTCACTCTCTTGAATACACTGGGTAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCC 929

 21721787 CTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTG 21721846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      930 CTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTG 989

 21721847 TTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATC 21721906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      990 TTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATC 1049

 21721907 TTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAA 21721966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1050 TTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAA 1109

 21721967 AGACATTGGTAGACCACAATTTGTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACT 21722026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1110 AGACATTGGTAGACCACAATTTGTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACT 1169

 21722027 TCTTTTAGTGAGGAGCCACATGTGATGTTTAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATG 21722086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1170 TCTTTTAGTGAGGAGCCACATGTGATGTTTAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATG 1229

 21722087 CTTTTTTATCAAAAGGTAATATGCTCTACTAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCA 21722146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1230 CTTTTTTATCAAAAGGTAATATGCTCTACTAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCA 1289

 21722147 ATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAAT 21722206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1290 ATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAAT 1349

 21722207 TTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCC 21722266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1350 TTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCC 1409

 21722267 TATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACAT 21722326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1410 TATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACAT 1469

 21722327 ATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACC 21722386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1470 ATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACC 1529

 21722387 CTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACAGTCCCTTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTT 21722446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1530 CTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACAGTCCCTTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTT 1589

 21722447 TCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAA 21722506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1590 TCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAA 1649

 21722507 TGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTC 21722566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1650 TGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTC 1709

 21722567 TCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACT 21722626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1710 TCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACT 1769

 21722627 CAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATTATACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCT 21722686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1770 CAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATTATACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCT 1829

 21722687 GATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAA 21722746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1830 GATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAA 1889

 21722747 TAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTGAATATATTCCATCAGT-AAAAAAAAAAAAAAA 21722805
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     1890 TAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTGAATATATTCCATCAGTGAAAAAAAAAAAAAAA 1949

 21722806 AAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAAT 21722865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1950 AAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAAT 2009

 21722866 TATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGA 21722925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2010 TATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGA 2069

 21722926 TTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAG 21722985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2070 TTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAG 2129

 21722986 GGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTAC 21723045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2130 GGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTAC 2189

 21723046 CAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAA 21723105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2190 CAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAA 2249

 21723106 CAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCC 21723165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2250 CAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCC 2309

 21723166 AGACTAAGAATGATAAAAAAAAACG-AAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAAC 21723224
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2310 AGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAAC 2369

 21723225 AATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGT 21723284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2370 AATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGT 2429

 21723285 AAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAG-AGGCAAAGATTTCATTGATTTACT 21723343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
     2430 AAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACT 2489

 21723344 GATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAA 21723403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2490 GATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAA 2549

 21723404 AGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATA 21723463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 AGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATA 2609

 21723464 GTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATC 21723523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2610 GTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATC 2669

 21723524 AACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGAT 21723583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 AACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGAT 2729

 21723584 GTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAG 21723643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 GTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAG 2789

 21723644 AAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTA 21723703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2790 AAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTA 2849

 21723704 GTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCT 21723763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2850 GTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCT 2909

 21723764 AATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGA 21723823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2910 AATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGA 2969

 21723824 TTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGA 21723883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2970 TTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGA 3029

 21723884 AGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGA 21723943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3030 AGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGA 3089

 21723944 ATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAA 21724003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3090 ATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAA 3149

 21724004 GGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGA 21724063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3150 GGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGA 3209

 21724064 AAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTA 21724086
          |||||||||||||||||||||||
     3210 AAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTA 3232

Alignment time is 3.66844 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    6834] =>      6834 nucs 'mol-32-2efc-106956_6834'

Score:        6796
Aligned:      6841        nucs
Identic:      6832 (100%) nucs =>      2523 (100%)      4309 (100%)
Gaps:            7 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21723331,21725853] EXCISED REGION [21725883,21730200]
 second seq =>  [       1,    2523] EXCISED REGION [    2524,    6834]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        29 nucs [21725854,21725882]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [21725854,21725857] to [21725883,21725886]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21725853,21725853] to [21725883,21725883]
 second seq =>         1 nucs [2523,2523] to [2524,2524]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [21725854,21725857] to [21725879,21725882]
 second seq =>         0 nucs

 21723331 TCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACA 21723390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACA 60

 21723391 AATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAA 21723450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAA 120

 21723451 ATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCA 21723510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCA 180

 21723511 GAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAG 21723570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAG 240

 21723571 TAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATG 21723630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATG 300

 21723631 CATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGT 21723690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGT 360

 21723691 TGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGT 21723750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGT 420

 21723751 ATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGA 21723810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGA 480

 21723811 GAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGC 21723870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGC 540

 21723871 AATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAAC 21723930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAAC 600

 21723931 TAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCAT 21723990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCAT 660

 21723991 CAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCT 21724050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCT 720

 21724051 TTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCAT 21724110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCAT 780

 21724111 ATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGA 21724170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGA 840

 21724171 TGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTT 21724230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTT 900

 21724231 TTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAG 21724290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAG 960

 21724291 TGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAAT 21724350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAAT 1020

 21724351 GGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGT 21724410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGT 1080

 21724411 TCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTT 21724470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTT 1140

 21724471 AGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTAC 21724530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTAC 1200

 21724531 CCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCC 21724590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCC 1260

 21724591 TAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAA 21724650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAA 1320

 21724651 CACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAA 21724710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAA 1380

 21724711 TTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACACCCTACATCATCTGTAG 21724770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACACCCTACATCATCTGTAG 1440

 21724771 GACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGAC 21724830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGAC 1500

 21724831 TTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATC 21724890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATC 1560

 21724891 ACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAA 21724950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAA 1620

 21724951 ATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTG 21725010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTG 1680

 21725011 AGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCAC 21725070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCAC 1740

 21725071 TGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCAT 21725130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCAT 1800

 21725131 GTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGC 21725190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGC 1860

 21725191 AGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAA 21725250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAA 1920

 21725251 GGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAG 21725310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAG 1980

 21725311 ACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAG 21725370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAG 2040

 21725371 ATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCC 21725430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCC 2100

 21725431 TATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACT 21725490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACT 2160

 21725491 ATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGA 21725550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 ATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGA 2220

 21725551 AATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAG 21725610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAG 2280

 21725611 TTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCAC 21725670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCAC 2340

 21725671 GCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCT 21725730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCT 2400

 21725731 TTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAA 21725790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAA 2460

 21725791 GGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACACTAAAGCCATAAATGGTTAAC 21725850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACACTAAAGCCATAAATGGTTAAC 2520

 21725851 TGT 21725853
          |||
     2521 TGT 2523

EXCISED REGION

 21725883 TCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTTTCTT 21725942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||
     2524 TCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT-------CTCTCTCTCTTTCTTTCTT 2576

 21725943 TCGTAGCTTTACATTCTTTACCATCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGA 21726002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 TCGTAGCTTTACATTCTTTACCATCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGA 2636

 21726003 ACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATA 21726062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 ACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATA 2696

 21726063 GTTAAGTATTATAAAGTCACATTAATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGT 21726122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 GTTAAGTATTATAAAGTCACATTAATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGT 2756

 21726123 CTCTGACATGGCATATCCATAGTTTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTAT 21726182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 CTCTGACATGGCATATCCATAGTTTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTAT 2816

 21726183 GGTATAATAAGCACACATTTGCAAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAG 21726242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 GGTATAATAAGCACACATTTGCAAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAG 2876

 21726243 ATTTCCAAAGAATTTTCCATTTTTATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATT 21726302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 ATTTCCAAAGAATTTTCCATTTTTATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATT 2936

 21726303 TTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAAATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATC 21726362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 TTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAAATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATC 2996

 21726363 GTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCTTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTC 21726422
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 TTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCTTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTC 3056

 21726423 AGCAAACTCGTATGGCAATTTGGAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTT 21726482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 AGCAAACTCGTATGGCAATTTGGAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTT 3116

 21726483 AGCAAGGAAACCAATGGGCTCCATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAG 21726542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 AGCAAGGAAACCAATGGGCTCCATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAG 3176

 21726543 CATTTCTAACTTGTATGTGATAAAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTG 21726602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 CATTTCTAACTTGTATGTGATAAAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTG 3236

 21726603 CAAAATCCTGGCCCATACAGGTGTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTT 21726662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 CAAAATCCTGGCCCATACAGGTGTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTT 3296

 21726663 TGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTT 21726722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 TGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTT 3356

 21726723 AATATTCAAGAAATGCAAGAGGAGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGA 21726782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 AATATTCAAGAAATGCAAGAGGAGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGA 3416

 21726783 AACATTACTTGCCTTGGTGACAAGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCA 21726842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 AACATTACTTGCCTTGGTGACAAGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCA 3476

 21726843 AAATATTAAGCTTAACAAAGAGAAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAA 21726902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 AAATATTAAGCTTAACAAAGAGAAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAA 3536

 21726903 AGACAGCAGAAGTGGCAGACTCGTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTT 21726962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 AGACAGCAGAAGTGGCAGACTCGTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTT 3596

 21726963 TTACATCTACATCACAGGTTTTTCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTT 21727022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 TTACATCTACATCACAGGTTTTTCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTT 3656

 21727023 TACTTATCAAACAGACAAGCAGCACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCA 21727082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 TACTTATCAAACAGACAAGCAGCACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCA 3716

 21727083 CCAAAGAGCCGCTTCACCTGATGGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGG 21727142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 CCAAAGAGCCGCTTCACCTGATGGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGG 3776

 21727143 CTCTGAATAGCATGGCTCATAAAAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATT 21727202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 CTCTGAATAGCATGGCTCATAAAAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATT 3836

 21727203 AGTAATTGGCATTACCTAATTATCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACA 21727262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 AGTAATTGGCATTACCTAATTATCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACA 3896

 21727263 TCTGCCTATCCTAATTTAGAAAATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAG 21727322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 TCTGCCTATCCTAATTTAGAAAATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAG 3956

 21727323 GTTTTGGCCAAGAAACACAGTAAAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATT 21727382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3957 GTTTTGGCCAAGAAACACAGTAAAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATT 4016

 21727383 CTCCCAGGCAATAATTCCTCAACTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGA 21727442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4017 CTCCCAGGCAATAATTCCTCAACTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGA 4076

 21727443 AAGAAGAAAGAGAACAATGGTGAAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGT 21727502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4077 AAGAAGAAAGAGAACAATGGTGAAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGT 4136

 21727503 CCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAATGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCA 21727562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4137 CCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAATGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCA 4196

 21727563 TGTGACCTATATAAGAATGATTAAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGG 21727622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4197 TGTGACCTATATAAGAATGATTAAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGG 4256

 21727623 AAATTTAAAAGTAACCTTTTTTTAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGA 21727682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4257 AAATTTAAAAGTAACCTTTTTTTAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGA 4316

 21727683 AAGTGTACAAATGTGTACTCAAATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATA 21727742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4317 AAGTGTACAAATGTGTACTCAAATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATA 4376

 21727743 ACACCAAATTGTTATTGTGTTTGGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCA 21727802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4377 ACACCAAATTGTTATTGTGTTTGGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCA 4436

 21727803 GATTATGCGTAGGTATAAAAAGATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTG 21727862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4437 GATTATGCGTAGGTATAAAAAGATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTG 4496

 21727863 TAAAAAAATAACCATTTGTAGTTGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGA 21727922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4497 TAAAAAAATAACCATTTGTAGTTGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGA 4556

 21727923 GCAATACTGAACTATCGCAATATAATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTT 21727982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4557 GCAATACTGAACTATCGCAATATAATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTT 4616

 21727983 GAATTTCCTAGTAGCCACACCAAAAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATA 21728042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4617 GAATTTCCTAGTAGCCACACCAAAAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATA 4676

 21728043 TTTTATTCAACCCAAATAAAGGCAAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCAT 21728102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4677 TTTTATTCAACCCAAATAAAGGCAAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCAT 4736

 21728103 GTACAAAGCCTTTGAAAACCAGTGTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTG 21728162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4737 GTACAAAGCCTTTGAAAACCAGTGTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTG 4796

 21728163 GACTAGCTAATTTTAAGTGTGCAGTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAG 21728222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4797 GACTAGCTAATTTTAAGTGTGCAGTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAG 4856

 21728223 TGCAGACCTAGAACTTAATGTGCAATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTG 21728282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4857 TGCAGACCTAGAACTTAATGTGCAATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTG 4916

 21728283 AAATTAGTTATAGATTCAAGGTTTAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGG 21728342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4917 AAATTAGTTATAGATTCAAGGTTTAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGG 4976

 21728343 ATCTTACCTTTATATTTCTGGTCATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTT 21728402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4977 ATCTTACCTTTATATTTCTGGTCATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTT 5036

 21728403 GCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGGGAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCT 21728462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5037 GCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGGGAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCT 5096

 21728463 CATAACTTGTCTTGACCAGTGGAATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCC 21728522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5097 CATAACTTGTCTTGACCAGTGGAATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCC 5156

 21728523 AGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCTCCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACA 21728582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5157 AGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCTCCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACA 5216

 21728583 ATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGCTTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCC 21728642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5217 ATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGCTTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCC 5276

 21728643 AGATCCACAGTCAACAGCCAGCAGCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACC 21728702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5277 AGATCCACAGTCAACAGCCAGCAGCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACC 5336

 21728703 TTATAACCCAGGTGACCCACAAGATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGG 21728762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5337 TTATAACCCAGGTGACCCACAAGATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGG 5396

 21728763 CAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAAATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCC 21728822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5397 CAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAAATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCC 5456

 21728823 AGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGTTAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACT 21728882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5457 AGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGTTAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACT 5516

 21728883 CATAATTTTTTTTATTAATAGGCCACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTG 21728942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
     5517 CATAATTTTTTTTATTAATAGGCCACTTTTTGGAACAGTTTTATGTTCATAGCAATATTG 5576

 21728943 CACAGGAAAGCACAGCAATTTCCCATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTC 21729002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5577 CACAGGAAAGCACAGCAATTTCCCATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTC 5636

 21729003 CATTATCAACATCCCCCACCAGAGTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACA 21729062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5637 CATTATCAACATCCCCCACCAGAGTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACA 5696

 21729063 CATCATTATTGTCCAGGGTTCATAGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGG 21729122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5697 CATCATTATTGTCCAGGGTTCATAGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGG 5756

 21729123 TGTTGTACATTCCCTGGGTTTGGACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAAC 21729182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5757 TGTTGTACATTCCCTGGGTTTGGACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAAC 5816

 21729183 AGTTTTATTGCCCTAAAAATTCTCTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTA 21729242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5817 AGTTTTATTGCCCTAAAAATTCTCTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTA 5876

 21729243 AATTCATAGGAAATAAATATAAAAAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTA 21729302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5877 AATTCATAGGAAATAAATATAAAAAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTA 5936

 21729303 CAATTTTGATTTGTTTCATTTGAGAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATT 21729362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5937 CAATTTTGATTTGTTTCATTTGAGAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATT 5996

 21729363 GTAGAAAAGTCTGACAATGTAAACAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTG 21729422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5997 GTAGAAAAGTCTGACAATGTAAACAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTG 6056

 21729423 TCACCCAGGCTTGGAATGCAGTAGCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAG 21729482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6057 TCACCCAGGCTTGGAATGCAGTAGCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAG 6116

 21729483 CTCAAGGGATCCTGCTACCTTAGCCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAA 21729542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6117 CTCAAGGGATCCTGCTACCTTAGCCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAA 6176

 21729543 ATTTTTTTTAAACATCATGGTAACTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGT 21729602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6177 ATTTTTTTTAAACATCATGGTAACTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGT 6236

 21729603 CTCTACTATTATTTTTGGTGCCTCTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGA 21729662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6237 CTCTACTATTATTTTTGGTGCCTCTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGA 6296

 21729663 GGGGAACAAACACATTAGTTTGCAAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTG 21729722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6297 GGGGAACAAACACATTAGTTTGCAAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTG 6356

 21729723 GAATAATTGTATATCTTAAATATACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTC 21729782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6357 GAATAATTGTATATCTTAAATATACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTC 6416

 21729783 TATTTTAGGGATATACCATAACTAGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTA 21729842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6417 TATTTTAGGGATATACCATAACTAGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTA 6476

 21729843 TGTCCAGTATTTATTATAAATAAAGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTT 21729902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6477 TGTCCAGTATTTATTATAAATAAAGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTT 6536

 21729903 ATTTCAAATGAAACAAAATTTAAAGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAA 21729962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6537 ATTTCAAATGAAACAAAATTTAAAGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAA 6596

 21729963 TACTATGAGACACATAATGACATTATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAA 21730022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6597 TACTATGAGACACATAATGACATTATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAA 6656

 21730023 ACAAGTCTTTATCACAGCTAGACATTAACTACATTCTTTCTGAATCTCAGCTCCTTTAGG 21730082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6657 ACAAGTCTTTATCACAGCTAGACATTAACTACATTCTTTCTGAATCTCAGCTCCTTTAGG 6716

 21730083 TGGTTTTATCAATGTATCTGTTCCCATAGTGCATGGATATCCAATAAACTGTCTTTTAAA 21730142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6717 TGGTTTTATCAATGTATCTGTTCCCATAGTGCATGGATATCCAATAAACTGTCTTTTAAA 6776

 21730143 TCCATGAATTCTTCCATAAACTATTGCTGTCTGATGAAATTCTAATATGCATTTAATT 21730200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6777 TCCATGAATTCTTCCATAAACTATTGCTGTCTGATGAAATTCTAATATGCATTTAATT 6834

Alignment time is 6.18222 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    7176] =>      7176 nucs 'mol-32-2fb7-013250_7176'

Score:        7109
Aligned:      7175        nucs
Identic:      7169 (100%) nucs =>      4381 (100%)      2788 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21718407,21722790] EXCISED REGION [21722795,21725583]
 second seq =>  [       1,    4384] EXCISED REGION [    4386,    7176]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         4 nucs [21722791,21722794]
 second seq =>         1 nucs [4385,4385]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        22 nucs [21722791,21722812] to [21722795,21722816]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [21722791,21722792] to [21722793,21722794]
 second seq =>         0 nucs

 21718407 TTCACATTCAAATGGCCAGAAGGCAGCAGATATAGGATTTACAAATCCAGAAAAAAAGAG 21718466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCACATTCAAATGGCCAGAAGGCAGCAGATATAGGATTTACAAATCCAGAAAAAAAGAG 60

 21718467 AAACTGCTTATAGCCCCAGGTAGAAGAAAGTCCTCATATCAGGGTTAAGGAGCTATCACC 21718526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAACTGCTTATAGCCCCAGGTAGAAGAAAGTCCTCATATCAGGGTTAAGGAGCTATCACC 120

 21718527 AATGCAACACATAAGGAAAGGGACATCTATATTATGATAAAAGGAAAGACATCGTAAAAT 21718586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATGCAACACATAAGGAAAGGGACATCTATATTATGATAAAAGGAAAGACATCGTAAAAT 180

 21718587 AGTGCAGTTAAACACAAGGATTAAAGCTAAACTAACATGAAAGGGACGCAAATAATCAGT 21718646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGTGCAGTTAAACACAAGGATTAAAGCTAAACTAACATGAAAGGGACGCAAATAATCAGT 240

 21718647 GGGACTTGTCATTGCTGGGGGCCATGTCAGTGGAGATAATGAGCATTAAAGGCTAAATCT 21718706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGGACTTGTCATTGCTGGGGGCCATGTCAGTGGAGATAATGAGCATTAAAGGCTAAATCT 300

 21718707 GAGGCAGCTTTTGGGAGGGTCCCTGGGCCCTGAGAATCCCAGCACTGACCAGAAGTCCAA 21718766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGGCAGCTTTTGGGAGGGTCCCTGGGCCCTGAGAATCCCAGCACTGACCAGAAGTCCAA 360

 21718767 GATCAGAGGCCAAGGTTAATGAGAAAACACAGGTTTTTCTGGTTGACATCATCATGTTCT 21718826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATCAGAGGCCAAGGTTAATGAGAAAACACAGGTTTTTCTGGTTGACATCATCATGTTCT 420

 21718827 CACCCTCTTGTGAATTGCAGCCTAAATATACAAATCTGGAGCTTGGCATGAGGCACATAT 21718886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACCCTCTTGTGAATTGCAGCCTAAATATACAAATCTGGAGCTTGGCATGAGGCACATAT 480

 21718887 ACATCTTGACTTGTACAACTAATTCCCATCCATTTTGCTCAACTCAGGCTGAGCCAGAAT 21718946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACATCTTGACTTGTACAACTAATTCCCATCCATTTTGCTCAACTCAGGCTGAGCCAGAAT 540

 21718947 TAACTAACTAATGCAGAATGCCACAGAAATTGCATCTGATTTTTCTTTGGCTGCAGATTC 21719006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAACTAACTAATGCAGAATGCCACAGAAATTGCATCTGATTTTTCTTTGGCTGCAGATTC 600

 21719007 ACTAGAAGCTCATGTTCTTACTATTCCTTAGAATTTGGGAGTCTAGAAAAGCACAGGCCT 21719066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACTAGAAGCTCATGTTCTTACTATTCCTTAGAATTTGGGAGTCTAGAAAAGCACAGGCCT 660

 21719067 AAATAAATTTCTAAGAGAGAAATTTAATTTAACAATTAGAGTAAAATATTCTGGTAATGA 21719126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AAATAAATTTCTAAGAGAGAAATTTAATTTAACAATTAGAGTAAAATATTCTGGTAATGA 720

 21719127 AATTGTATTCTGCTAGTGTGTGGGGGATCATATAGACTGAATTATTTAAAGCAGTCCTAA 21719186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AATTGTATTCTGCTAGTGTGTGGGGGATCATATAGACTGAATTATTTAAAGCAGTCCTAA 780

 21719187 TTTCAAATAATAATAACCAGTAAAATAATAATAATAACCACTCTAAATTTTGAGTAGTTC 21719246
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      781 TTTCAAATAATAATAACCAGTAAAATAATAATAATAACCACTCTAAATTTTGAGTAGTTT 840

 21719247 ATATATACATAGGCTGTTAATTTTCATAGCAATTCTGTTAGTCCTTAATAATTTAGTTTT 21719306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATATATACATAGGCTGTTAATTTTCATAGCAATTCTGTTAGTCCTTAATAATTTAGTTTT 900

 21719307 TTAGTTGTGGAAACTGGGGAATCTATGAAATTAAGTACTCTGTAGCAGCTAATTCAACCT 21719366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTAGTTGTGGAAACTGGGGAATCTATGAAATTAAGTACTCTGTAGCAGCTAATTCAACCT 960

 21719367 ATGCGTACATAGGTTGATTGATTTTAATGCTCGTTCTTTGTAAAAATCATATTATCTGTA 21719426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGCGTACATAGGTTGATTGATTTTAATGCTCGTTCTTTGTAAAAATCATATTATCTGTA 1020

 21719427 TTGTCCCCATAAGCCAAGTATAAGAATCCATTATACCACTCCCCTTCTAGTACTCAGGGC 21719486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGTCCCCATAAGCCAAGTATAAGAATCCATTATACCACTCCCCTTCTAGTACTCAGGGC 1080

 21719487 ATATATTATTCATCAATTATATTTCCAGTTGGCCTCAGAATCCTCCTTAACACAACATAC 21719546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATATATTATTCATCAATTATATTTCCAGTTGGCCTCAGAATCCTCCTTAACACAACATAC 1140

 21719547 CAGTATCTAATCCAGTTAATCACAGTTTGCTATCCCCGACACAAACCCTCAACATTAGGG 21719606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGTATCTAATCCAGTTAATCACAGTTTGCTATCCCCGACACAAACCCTCAACATTAGGG 1200

 21719607 CATCCAAACCTCTCTGTAAGTCTTGGAAGACAGACAATAGAATAATGCTGACAGTTTCCT 21719666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATCCAAACCTCTCTGTAAGTCTTGGAAGACAGACAATAGAATAATGCTGACAGTTTCCT 1260

 21719667 TATACCTCTGGCAAAGTGTCCAATCATCTTTTGGTTAGAATCCAGTGAGAGGACTAAGAA 21719726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TATACCTCTGGCAAAGTGTCCAATCATCTTTTGGTTAGAATCCAGTGAGAGGACTAAGAA 1320

 21719727 AGGCATCTGATTTGTCTGTCAAAGCTTGCCCAGGTTATGAAGATAACTGGAGACCTACAT 21719786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGGCATCTGATTTGTCTGTCAAAGCTTGCCCAGGTTATGAAGATAACTGGAGACCTACAT 1380

 21719787 TTGTAACTCAGTAAATGGGAGACTTTCATTCCTGGACATTCTGCAACAGCCAGTGTTGAC 21719846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTGTAACTCAGTAAATGGGAGACTTTCATTCCTGGACATTCTGCAACAGCCAGTGTTGAC 1440

 21719847 CTGGTAAATCTACCTGAGATTCGCTCATGATTCCAATGTGACTGAATGCCTTGAGAATAT 21719906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGGTAAATCTACCTGAGATTCGCTCATGATTCCAATGTGACTGAATGCCTTGAGAATAT 1500

 21719907 ACAACTCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTTAGACAGTAGAAGTTCGTGAA 21719966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACAACTCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTTAGACAGTAGAAGTTCGTGAA 1560

 21719967 GTGACCTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACGCAACAACAAATAACCCTAA 21720026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1561 GTGACCTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACACAACAACAAATAACCCTAA 1620

 21720027 AAGGAAACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATTGGAGTTAGTCCCTTCAAA 21720086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGGAAACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATTGGAGTTAGTCCCTTCAAA 1680

 21720087 TTCATGGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTGCTTTTGAACGGACATTAA 21720146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TTCATGGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTGCTTTTGAACGGACATTAA 1740

 21720147 TCCCAAAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAGCAGGAATGCCTGCTGAGA 21720206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCCAAAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAGCAGGAATGCCTGCTGAGA 1800

 21720207 GGGGAGAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGCCCTGCATTTTCCTGAATG 21720266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GGGGAGAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGCCCTGCATTTTCCTGAATG 1860

 21720267 ATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGCTTTCCAAGTGCTAAATAT 21720326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGCTTTCCAAGTGCTAAATAT 1920

 21720327 TTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCCTATTTATACAGTTTAATG 21720386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCCTATTTATACAGTTTAATG 1980

 21720387 TCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAATTTTGTAAATTTATGTTGT 21720446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAATTTTGTAAATTTATGTTGT 2040

 21720447 TCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCCCTGCCACCCACCCCCCAA 21720506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCCCTGCCACCCACCCCCCAA 2100

 21720507 CCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAACTTCTACAGAATATTCTA 21720566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAACTTCTACAGAATATTCTA 2160

 21720567 AGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCCAAATTCCAGTGTTTTCAT 21720626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCCAAATTCCAGTGTTTTCAT 2220

 21720627 GTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAAAATAAGAATAACAGCTAA 21720686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAAAATAAGAATAACAGCTAA 2280

 21720687 ATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAGTAAATACTAAACTATAGT 21720746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 ATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAGTAAATACTAAACTATAGT 2340

 21720747 AACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATGATATGAAATAATGGAATA 21720806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATGATATGAAATAATGGAATA 2400

 21720807 TATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAATCATTAATTGGTATATCTC 21720866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAATCATTAATTGGTATATCTC 2460

 21720867 TTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGTTAAGCTTTTGAAGGGGA 21720926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGTTAAGCTTTTGAAGGGGA 2520

 21720927 GTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTAAGAAAGAGTTTTGAAAA 21720986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTAAGAAAGAGTTTTGAAAA 2580

 21720987 TTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGACATTGTTGCTTTGAAAGC 21721046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGACATTGTTGCTTTGAAAGC 2640

 21721047 TAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCATTAATACTATTAGG 21721106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCATTAATACTATTAGG 2700

 21721107 TACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAACAATATTGAAAAGAG 21721166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAACAATATTGAAAAGAG 2760

 21721167 AGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGGGAGGGAGACTAGCA 21721226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGGGAGGGAGACTAGCA 2820

 21721227 GGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACTTACTTGATTGACCT 21721286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACTTACTTGATTGACCT 2880

 21721287 CGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATACCCCCAAGTCATCCT 21721346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATACCCCCAAGTCATCCT 2940

 21721347 ATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAAGTATATGTCTTTTA 21721406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAAGTATATGTCTTTTA 3000

 21721407 AACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATATTGTATGAGAGAGA 21721466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATATTGTATGAGAGAGA 3060

 21721467 CTCGCTCAGTGCCTAATACGTGGTAAGGACTCAAAATATGATAGCTGACTTGGAATCTGG 21721526
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 CTCGCTCAGTGCCTAATACATGGTAAGGACTCAAAATATGATAGCTGACTTGGAATCTGG 3120

 21721527 GACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTCACACTAATTCACTT 21721586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTCACACTAATTCACTT 3180

 21721587 CCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCTCTTCTCTCTTGGCT 21721646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 CCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCTCTTCTCTCTTGGCT 3240

 21721647 GCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCGTTCTTTCTCACAAAC 21721706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCGTTCTTTCTCACAAAC 3300

 21721707 ATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACTGGGTAAATTTCAATAAA 21721766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACTGGGTAAATTTCAATAAA 3360

 21721767 AGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGAGAATAAGCAAA 21721826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 AGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGAGAATAAGCAAA 3420

 21721827 ACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATCATTTTCTCTTA 21721886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATCATTTTCTCTTA 3480

 21721887 TTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGCAATTTTCTAAT 21721946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGCAATTTTCTAAT 3540

 21721947 ATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTGTTCTTTCCTGCGTATTT 21722006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTGTTCTTTCCTGCGTATTT 3600

 21722007 TCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATGTGATGTTTAACTAATAAT 21722066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATGTGATGTTTAACTAATAAT 3660

 21722067 ATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGCTCTACTAATCACATGG 21722126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 ATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGCTCTACTAATCACATGG 3720

 21722127 ACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTGCTATGCTTTCA 21722186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTGCTATGCTTTCA 3780

 21722187 CCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAATCTTGATAACAA 21722246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAATCTTGATAACAA 3840

 21722247 CTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCCAAAATTTTAGT 21722306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCCAAAATTTTAGT 3900

 21722307 TGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAGTTCAGCATAGA 21722366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAGTTCAGCATAGA 3960

 21722367 AATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACAGTCCCTTACATCGC 21722426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACAGTCCCTTACATCGC 4020

 21722427 AATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGATGCTTTGGATT 21722486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGATGCTTTGGATT 4080

 21722487 TTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCTACATTTACATT 21722546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 TTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCTACATTTACATT 4140

 21722547 TAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGATCTGAGTGTAA 21722606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 TAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGATCTGAGTGTAA 4200

 21722607 CAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATTATACTGTTGAA 21722666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 CAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATTATACTGTTGAA 4260

 21722667 AGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAACCTTCTGACAAAA 21722726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAACCTTCTGACAAAA 4320

 21722727 AAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTGAATATATTCCAT 21722786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 AAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTGAATATATTCCAT 4380

 21722787 CAGT 21722790
          ||||
     4381 CAGT 4384

EXCISED REGION

 21722795 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGGC 21722854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4386 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGGC 4445

 21722855 ATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAA 21722914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4446 ATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAA 4505

 21722915 ATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAA 21722974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4506 ATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAA 4565

 21722975 GGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAA 21723034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4566 GGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAA 4625

 21723035 ATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAA 21723094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4626 ATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAA 4685

 21723095 AGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTC 21723154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4686 AGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTC 4745

 21723155 TAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACG-AAAAAAAAAAAACAAACAAAAAA 21723213
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
     4746 TAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAAAAAAACAAACAAAAAA 4805

 21723214 GGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAAT 21723273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4806 GGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAAT 4865

 21723274 ATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAG-AGGCAAAGATTTC 21723332
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
     4866 ATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTC 4925

 21723333 ATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACAAA 21723392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4926 ATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACAAA 4985

 21723393 TGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAAT 21723452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4986 TGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAAT 5045

 21723453 ATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGA 21723512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5046 ATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGA 5105

 21723513 AAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTA 21723572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5106 AAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTA 5165

 21723573 ATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCA 21723632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5166 ATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCA 5225

 21723633 TAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTG 21723692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5226 TAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTG 5285

 21723693 GTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTAT 21723752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5286 GTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTAT 5345

 21723753 GTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGA 21723812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5346 GTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGA 5405

 21723813 GACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAA 21723872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5406 GACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAA 5465

 21723873 TGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTA 21723932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5466 TGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTA 5525

 21723933 ACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCA 21723992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5526 ACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCA 5585

 21723993 GAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTT 21724052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5586 GAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTT 5645

 21724053 AATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCATAT 21724112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5646 AATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCATAT 5705

 21724113 TGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATG 21724172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5706 TGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATG 5765

 21724173 AAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTT 21724232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5766 AAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTT 5825

 21724233 CCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTG 21724292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5826 CCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTG 5885

 21724293 CAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAATGG 21724352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5886 CAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAATGG 5945

 21724353 GCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTC 21724412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5946 GCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTC 6005

 21724413 TCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAG 21724472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6006 TCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAG 6065

 21724473 TGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCC 21724532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6066 TGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCC 6125

 21724533 CTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCCTA 21724592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6126 CTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCCTA 6185

 21724593 GGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACA 21724652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6186 GGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACA 6245

 21724653 CAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATT 21724712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6246 CAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATT 6305

 21724713 CTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACACCCTACATCATCTGTAGGA 21724772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6306 CTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACACCCTACATCATCTGTAGGA 6365

 21724773 CTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGACTT 21724832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6366 CTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGACTT 6425

 21724833 CAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCAC 21724892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6426 CAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCAC 6485

 21724893 GAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAAT 21724952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6486 GAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAAT 6545

 21724953 ACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAG 21725012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6546 ACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAG 6605

 21725013 GGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTG 21725072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6606 GGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTG 6665

 21725073 CACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGT 21725132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6666 CACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGT 6725

 21725133 GGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAG 21725192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6726 GGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAG 6785

 21725193 AAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGG 21725252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     6786 AAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCGAGGCCACACGTAAAGG 6845

 21725253 AATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGAC 21725312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6846 AATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGAC 6905

 21725313 CTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAGAT 21725372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6906 CTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAGAT 6965

 21725373 TTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTA 21725432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6966 TTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTA 7025

 21725433 TGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTAT 21725492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7026 TGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTAT 7085

 21725493 AAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAA 21725552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7086 AAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAA 7145

 21725553 TAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATG 21725583
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     7146 TAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATG 7176

Alignment time is 6.55913 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    9234] =>      9234 nucs 'mol-32-2fb7-058835_9234'

Score:        9091
Aligned:      9240        nucs
Identic:      9224 (100%) nucs =>       426 (100%)      8798 (100%)
Gaps:            6 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21725466,21725892] EXCISED REGION [21725905,21734717]
 second seq =>  [       1,     426] EXCISED REGION [     427,    9234]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        12 nucs [21725893,21725904]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [21725874,21725892] to [21725905,21725923]
 second seq =>        19 nucs [408,426] to [427,445]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [21725893,21725895] to [21725902,21725904]
 second seq =>         0 nucs

 21725466 TGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCA 21725525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCA 60

 21725526 AGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTC 21725585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTC 120

 21725586 CCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACT 21725645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACT 180

 21725646 GTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAG 21725705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAG 240

 21725706 CGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTT 21725765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTT 300

 21725766 CTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCAC 21725825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCAC 360

 21725826 CACACTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT 21725885
          |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
      361 CACACTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCTC-TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT 419

 21725886 CTCTCTC 21725892
          |||||||
      420 CTCTCTC 426

EXCISED REGION

 21725905 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATTCTTTACC 21725964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      427 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATTCTTTACC 486

 21725965 ATCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATA 21726024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      487 ATCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATA 546

 21726025 AGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACAT 21726084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 AGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACAT 606

 21726085 TAATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAG 21726144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 TAATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAG 666

 21726145 TTTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGC 21726204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 TTTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGC 726

 21726205 AAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTT 21726264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 AAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTT 786

 21726265 TTATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAA 21726324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 TTATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAA 846

 21726325 AATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTC 21726384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      847 AATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTC 906

 21726385 TTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTG 21726444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 TTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTG 966

 21726445 GAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCC 21726504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 GAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCC 1026

 21726505 ATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATA 21726564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 ATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATA 1086

 21726565 AAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGT 21726624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 AAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGT 1146

 21726625 GTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAG 21726684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 GTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAG 1206

 21726685 ATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGG 21726744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 ATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGG 1266

 21726745 AGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACA 21726804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1267 AGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACA 1326

 21726805 AGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAG 21726864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 AGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAG 1386

 21726865 AAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTC 21726924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 AAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTC 1446

 21726925 GTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTT 21726984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 GTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTT 1506

 21726985 TCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAG 21727044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 TCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAG 1566

 21727045 CACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGAT 21727104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 CACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGAT 1626

 21727105 GGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAA 21727164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 GGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAA 1686

 21727165 AAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTA 21727224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 AAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTA 1746

 21727225 TCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAA 21727284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 TCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAA 1806

 21727285 ATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTA 21727344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 ATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTA 1866

 21727345 AAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAA 21727404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 AAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAA 1926

 21727405 CTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTG 21727464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 CTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTG 1986

 21727465 AAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAA 21727524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 AAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAA 2046

 21727525 TGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATT 21727584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 TGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATT 2106

 21727585 AAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTT 21727644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 AAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTT 2166

 21727645 TAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAA 21727704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 TAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAA 2226

 21727705 ATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTT 21727764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 ATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTT 2286

 21727765 GGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAG 21727824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 GGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAG 2346

 21727825 ATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGT 21727884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 ATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGT 2406

 21727885 TGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATA 21727944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 TGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATA 2466

 21727945 TAATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCA 21728004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 TAATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCA 2526

 21728005 AAAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGG 21728064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 AAAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGG 2586

 21728065 CAAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAG 21728124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 CAAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAG 2646

 21728125 TGTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGC 21728184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 TGTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGC 2706

 21728185 AGTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTG 21728244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 AGTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTG 2766

 21728245 CAATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGT 21728304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 CAATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGT 2826

 21728305 TTAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGT 21728364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 TTAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGT 2886

 21728365 CATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAG 21728424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 CATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAG 2946

 21728425 GGAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGG 21728484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 GGAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGG 3006

 21728485 AATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGC 21728544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 AATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGC 3066

 21728545 TCCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAG 21728604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 TCCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAG 3126

 21728605 CTTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGC 21728664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 CTTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGC 3186

 21728665 AGCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAA 21728724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 AGCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAA 3246

 21728725 GATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAA 21728784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 GATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAA 3306

 21728785 AATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTG 21728844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 AATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTG 3366

 21728845 TTAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGG 21728904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 TTAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGG 3426

 21728905 CCACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTC 21728964
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 CCACTTTTTGGAACAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTC 3486

 21728965 CCATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAG 21729024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 CCATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAG 3546

 21729025 AGTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCA 21729084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 AGTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCA 3606

 21729085 TAGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTG 21729144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 TAGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTG 3666

 21729145 GACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTC 21729204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 GACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTC 3726

 21729205 TCTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAA 21729264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 TCTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAA 3786

 21729265 AAAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTG 21729324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 AAAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTG 3846

 21729325 AGAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAA 21729384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 AGAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAA 3906

 21729385 ACAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGT 21729444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 ACAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGT 3966

 21729445 AGCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTA 21729504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 AGCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTA 4026

 21729505 GCCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTA 21729564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 GCCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTA 4086

 21729565 ACTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCC 21729624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 ACTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCC 4146

 21729625 TCTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTG 21729684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 TCTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTG 4206

 21729685 CAAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATA 21729744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 CAAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATA 4266

 21729745 TACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAAC 21729804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 TACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAAC 4326

 21729805 TAGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATA 21729864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 TAGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATA 4386

 21729865 AAGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTA 21729924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 AAGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTA 4446

 21729925 AAGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACACATAATGACA 21729984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 AAGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACACATAATGACA 4506

 21729985 TTATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAAACAAGTCTTTATCACAGCTAGA 21730044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 TTATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAAACAAGTCTTTATCACAGCTAGA 4566

 21730045 CATTAACTACATTCTTTCTGAATCTCAGCTCCTTTAGGTGGTTTTATCAATGTATCTGTT 21730104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 CATTAACTACATTCTTTCTGAATCTCAGCTCCTTTAGGTGGTTTTATCAATGTATCTGTT 4626

 21730105 CCCATAGTGCATGGATATCCAATAAACTGTCTTTTAAATCCATGAATTCTTCCATAAACT 21730164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 CCCATAGTGCATGGATATCCAATAAACTGTCTTTTAAATCCATGAATTCTTCCATAAACT 4686

 21730165 ATTGCTGTCTGATGAAATTCTAATATGCATTTAATTAACAACTCTAGGAATGCAACATGA 21730224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 ATTGCTGTCTGATGAAATTCTAATATGCATTTAATTAACAACTCTAGGAATGCAACATGA 4746

 21730225 AAACTAAATACCAAGCTCTATAATTTTTAAAATGACACAAAGAGAGATTTCTCAGTTCCC 21730284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 AAACTAAATACCAAGCTCTATAATTTTTAAAATGACACAAAGAGAGATTTCTCAGTTCCC 4806

 21730285 ACTCAACAGCTTTGTATTATACCATATGTTTAGAAAATCAATTAAGAGCACAACAGGATA 21730344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 ACTCAACAGCTTTGTATTATACCATATGTTTAGAAAATCAATTAAGAGCACAACAGGATA 4866

 21730345 TCTGAAAATAGTATGTGCATGCTATGAAATTATTATAATGTGCTTGTGTTTCCAACAACA 21730404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 TCTGAAAATAGTATGTGCATGCTATGAAATTATTATAATGTGCTTGTGTTTCCAACAACA 4926

 21730405 TACTACAATATATATGGAGAGAGACAGTCCTTAACCAAGAAGATTGCCGTCTAGTTAAAT 21730464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 TACTACAATATATATGGAGAGAGACAGTCCTTAACCAAGAAGATTGCCGTCTAGTTAAAT 4986

 21730465 ACATAAGCCAAGAAAACATTCTCAGTGACAAAGTAAGATTACCTGAATATACAAATCTTA 21730524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 ACATAAGCCAAGAAAACATTCTCAGTGACAAAGTAAGATTACCTGAATATACAAATCTTA 5046

 21730525 CATAATTCTTATGGCTGAGACTTGCAATCTGAACATCTAAAGATTTTTCTGATGTAAAAA 21730584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 CATAATTCTTATGGCTGAGACTTGCAATCTGAACATCTAAAGATTTTTCTGATGTAAAAA 5106

 21730585 GATTTAGAATCATCTGTCCTGCCCCACCTTATTGAAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAT 21730644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||
     5107 GATTTAGAATCATCTGTCCTGCCCCACCTTATTGAAGC---AAAAAAAAAAAAAAAAAAT 5163

 21730645 ACTATTCCATTTAAAGACTGAATAGTCGTATCTCAGAGCAGTTAAGCCAAGCTGCCTATG 21730704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5164 ACTATTCCATTTAAAGACTGAATAGTCGTATCTCAGAGCAGTTAAGCCAAGCTGCCTATG 5223

 21730705 CTCTAATAAAATACAGTACTATAACAATAGAGACCAGAGAGAAAGAATTTTGCTGTTTAC 21730764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5224 CTCTAATAAAATACAGTACTATAACAATAGAGACCAGAGAGAAAGAATTTTGCTGTTTAC 5283

 21730765 CTTGTGCATCACCAGCTTTAATGGACCACTAATACTCAGTCACTGAAGAGGTGTGTGCTC 21730824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5284 CTTGTGCATCACCAGCTTTAATGGACCACTAATACTCAGTCACTGAAGAGGTGTGTGCTC 5343

 21730825 TGTTGCGGGGCAGCATAAGCTCGATTCAACTTACAATACCTAGATGAACTGTGGCTCAAA 21730884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5344 TGTTGCGGGGCAGCATAAGCTCGATTCAACTTACAATACCTAGATGAACTGTGGCTCAAA 5403

 21730885 ACGACCCACTTCCCTTTTCTTCCATGCTCACTAAAGAACCTGCAGATTGATTGGGGGTCT 21730944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5404 ACGACCCACTTCCCTTTTCTTCCATGCTCACTAAAGAACCTGCAGATTGATTGGGGGTCT 5463

 21730945 TTAGCAACTTGAAAAGGGTGGACTTGAGGAAAAACTATAAATACAATAGTCACTGGAAAT 21731004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5464 TTAGCAACTTGAAAAGGGTGGACTTGAGGAAAAACTATAAATACAATAGTCACTGGAAAT 5523

 21731005 TCTGTGTAGACTCAACTACACATTAGTAATTAGACACTTAGGTTTAGATTTCATATGCAT 21731064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5524 TCTGTGTAGACTCAACTACACATTAGTAATTAGACACTTAGGTTTAGATTTCATATGCAT 5583

 21731065 TTAGTTCACAGGTATCAATCTTTGAAAACCTGCTTGCTTCTTAGTAATAGCACAGATTAT 21731124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5584 TTAGTTCACAGGTATCAATCTTTGAAAACCTGCTTGCTTCTTAGTAATAGCACAGATTAT 5643

 21731125 GGAGGAGGTCAGTCAGGTAACTGTCTGTGGTTAATCCATATATAAGAAGCTCTAAAGCAG 21731184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5644 GGAGGAGGTCAGTCAGGTAACTGTCTGTGGTTAATCCATATATAAGAAGCTCTAAAGCAG 5703

 21731185 TGATTCTCAGACATCATCAGAAACACCTGTAGGGCTAATTACCACACATTTCTGGGCCTT 21731244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5704 TGATTCTCAGACATCATCAGAAACACCTGTAGGGCTAATTACCACACATTTCTGGGCCTT 5763

 21731245 ACCACCTTAGAATTTCATTTCTAAGAATTGCCCAGGCGATACTGATGCTACTGATTTGGA 21731304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5764 ACCACCTTAGAATTTCATTTCTAAGAATTGCCCAGGCGATACTGATGCTACTGATTTGGA 5823

 21731305 GACCTTGAGGATCACTGCCCTAAAATATTCTCAGATTAAATTGAGAACGTCTTCCAAGAA 21731364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5824 GACCTTGAGGATCACTGCCCTAAAATATTCTCAGATTAAATTGAGAACGTCTTCCAAGAA 5883

 21731365 GGGCGAAAAATTGCAAAAAAAAAAAAAAAAGTAGCAAATAGTTGCCAATGAGAAATATAG 21731424
          ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5884 GGGCGAAAAATTGC--AAAAAAAAAAAAAAGTAGCAAATAGTTGCCAATGAGAAATATAG 5941

 21731425 AAATATATTTTGAATGAGACTTTACAACTCTTAATGAGTGCAAGTGAAACACTAATATTT 21731484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5942 AAATATATTTTGAATGAGACTTTACAACTCTTAATGAGTGCAAGTGAAACACTAATATTT 6001

 21731485 TTGATTGACAGACTGAAATTAAAGATAACAAATATGTTAAAATGTATGGCATGGATTTTA 21731544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6002 TTGATTGACAGACTGAAATTAAAGATAACAAATATGTTAAAATGTATGGCATGGATTTTA 6061

 21731545 TTAAAAAATCCTTTATTCTAGCCGTAAAATGTGTATATAATTTGTATACATGTAACATAT 21731604
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6062 TTAAAAAATCCTTTATTCTAGCTGTAAAATGTGTATATAATTTGTATACATGTAACATAT 6121

 21731605 TTCAGTAAAAAATCCATTTTTCTTGTTCTCACTAAATAAATATAATTTTAATATGAAATA 21731664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6122 TTCAGTAAAAAATCCATTTTTCTTGTTCTCACTAAATAAATATAATTTTAATATGAAATA 6181

 21731665 AATCTGTATATGTTTGTGTTGTGTTTGTGTGTGTGCATATATACATATATACATCCATAC 21731724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6182 AATCTGTATATGTTTGTGTTGTGTTTGTGTGTGTGCATATATACATATATACATCCATAC 6241

 21731725 ACACACACATATTCATATACATCCATATAGACACATATACATCCATATAACGAAAATTCA 21731784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6242 ACACACACATATTCATATACATCCATATAGACACATATACATCCATATAACGAAAATTCA 6301

 21731785 AAGAATATTGATTTGAAGGGGCAATAAATCTGCAAGCTATCTGGAATGCATATGTAATTG 21731844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6302 AAGAATATTGATTTGAAGGGGCAATAAATCTGCAAGCTATCTGGAATGCATATGTAATTG 6361

 21731845 ATACAACCTTGCCTAGGAGTCCTACTATCTGACCCTGCAGACCTACAGTGCCACACCAAA 21731904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6362 ATACAACCTTGCCTAGGAGTCCTACTATCTGACCCTGCAGACCTACAGTGCCACACCAAA 6421

 21731905 GTCTGAACTTTGATTAGGTAAAGTCCTGATTAGATGGTCAACAGGTCAACCTTGCAGAAA 21731964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6422 GTCTGAACTTTGATTAGGTAAAGTCCTGATTAGATGGTCAACAGGTCAACCTTGCAGAAA 6481

 21731965 GCATAAGCTGAGCCCCACCCAACTTAACTTCTTAATTTTACATTCTCCTAGTCATCATCC 21732024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6482 GCATAAGCTGAGCCCCACCCAACTTAACTTCTTAATTTTACATTCTCCTAGTCATCATCC 6541

 21732025 TCTGACCTTCTGCTCATTTCCTCATGTTCTTTGACAATGTTGGCATCTAAACAGAGTCCT 21732084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6542 TCTGACCTTCTGCTCATTTCCTCATGTTCTTTGACAATGTTGGCATCTAAACAGAGTCCT 6601

 21732085 CTTTCTTTATCTTCCACTGTGTATAACACTTACCTTGAAGACCCACTCTCACCATACACT 21732144
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6602 CTTTCTTTATCTTCCACTGTGTATAACACCTACCTTGAAGACCCACTCTCACCATACACT 6661

 21732145 TTTCTCTAGGCTCTACTCCAGTGGTTCTCAAAGTATGATCCCCAGGCCAGCAGCGTCAAC 21732204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6662 TTTCTCTAGGCTCTACTCCAGTGGTTCTCAAAGTATGATCCCCAGGCCAGCAGCGTCAAC 6721

 21732205 ATCAAATGGGATCGTGTTAGATATTCAAATTCACTGGCCCCACCCTAGACCTATGGAATC 21732264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6722 ATCAAATGGGATCGTGTTAGATATTCAAATTCACTGGCCCCACCCTAGACCTATGGAATC 6781

 21732265 AGAAACTCTGAATATTAGGCCTAGTAATGTGTGTTTTAAAGAGTCTCAGATGATTCTGAT 21732324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6782 AGAAACTCTGAATATTAGGCCTAGTAATGTGTGTTTTAAAGAGTCTCAGATGATTCTGAT 6841

 21732325 GCACATTAAAGTTTGGGACCACGCTGCATGTCATCATTCATATCCACTTGCCATCACCCT 21732384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6842 GCACATTAAAGTTTGGGACCACGCTGCATGTCATCATTCATATCCACTTGCCATCACCCT 6901

 21732385 GTGCACCTACGTGATCAATATCTAAAACTGTTCCTCCTTCAAAATCTTGGAACTCTGGCG 21732444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6902 GTGCACCTACGTGATCAATATCTAAAACTGTTCCTCCTTCAAAATCTTGGAACTCTGGCG 6961

 21732445 TTCTACCCTCGGATAGAAATCCCTGTTTACTACCTTTTTCCCTCATTAAAATCTGTGGTC 21732504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6962 TTCTACCCTCGGATAGAAATCCCTGTTTACTACCTTTTTCCCTCATTAAAATCTGTGGTC 7021

 21732505 CCTGAATGTTGTCCAGTCTCTTCTCGGTCTTTCAACCCCTCCTTTTTTCCTTTCTTTCCG 21732564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7022 CCTGAATGTTGTCCAGTCTCTTCTCGGTCTTTCAACCCCTCCTTTTTTCCTTTCTTTCCG 7081

 21732565 CTCTAGCCTGGACCACATGGTCAAACAATTAAATTGTATTGTCAGGAGTACCCTCAATTC 21732624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7082 CTCTAGCCTGGACCACATGGTCAAACAATTAAATTGTATTGTCAGGAGTACCCTCAATTC 7141

 21732625 CCTCAACTCTTTAACTTTTGACCGCAGCTGTCTTGCCAATGCCATACCGTAAATCAATCC 21732684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7142 CCTCAACTCTTTAACTTTTGACCGCAGCTGTCTTGCCAATGCCATACCGTAAATCAATCC 7201

 21732685 AGCTGCCTGTTTCTCCAGGTTGTTTCTGTGTTGCCAAGTACTGCTAGAGAAAATGACATA 21732744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7202 AGCTGCCTGTTTCTCCAGGTTGTTTCTGTGTTGCCAAGTACTGCTAGAGAAAATGACATA 7261

 21732745 GCCACGCTCGCTGGCTCCATTGCAGATTTATCATATCCAACCTTAGCTGCTTCCTCTCTG 21732804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7262 GCCACGCTCGCTGGCTCCATTGCAGATTTATCATATCCAACCTTAGCTGCTTCCTCTCTG 7321

 21732805 CTACTTGGCAATTTTTTTATTCTTCCCCAGTCTACTTCCTTTCCCACCCACAGCAGATGT 21732864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7322 CTACTTGGCAATTTTTTTATTCTTCCCCAGTCTACTTCCTTTCCCACCCACAGCAGATGT 7381

 21732865 TCCACAGTTTTGTAACTTTCCCCATGCCCCTAACCTCACCCTCAACCTCCACATTCATTC 21732924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7382 TCCACAGTTTTGTAACTTTCCCCATGCCCCTAACCTCACCCTCAACCTCCACATTCATTC 7441

 21732925 ACCAAAAGATACAAATCACCCGTCAGACACTCCTTAAATCTCCTTCCCCTCTACCCAAAA 21732984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7442 ACCAAAAGATACAAATCACCCGTCAGACACTCCTTAAATCTCCTTCCCCTCTACCCAAAA 7501

 21732985 ACGGACCCAAATATTTGTGCCCAACCTTTTCTCCTTTCTTTCTTCTAAGAAGAGGTGTCT 21733044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7502 ACGGACCCAAATATTTGTGCCCAACCTTTTCTCCTTTCTTTCTTCTAAGAAGAGGTGTCT 7561

 21733045 TGATTTCCTTTCTTTGGCAAGCCACCCCCTTCTTTTTTCTTTGCTCACACATCCACCAAG 21733104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7562 TGATTTCCTTTCTTTGGCAAGCCACCCCCTTCTTTTTTCTTTGCTCACACATCCACCAAG 7621

 21733105 ATTGTGTGTAGCTATTTCATAATTCTGATCATCATTGCTATAAAACTGCATTATTTGTAT 21733164
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7622 ATTGTGTCTAGCTATTTCATAATTCTGATCATCATTGCTATAAAACTGCATTATTTGTAT 7681

 21733165 TCACTGATCACATTCATTCTCACAATACTGTTTTTTAAGTGATAACATGTTTACATAAAA 21733224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7682 TCACTGATCACATTCATTCTCACAATACTGTTTTTTAAGTGATAACATGTTTACATAAAA 7741

 21733225 TTTACCATTTAAAAATGTTAAGTGTACCATTTAAAAAATGGTAGTGGTATTAACTACACT 21733284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7742 TTTACCATTTAAAAATGTTAAGTGTACCATTTAAAAAATGGTAGTGGTATTAACTACACT 7801

 21733285 CATACTGCCATGCAGCCATCACCACTATGCAAATCCAGAATGTTTTCATCATCCGAAAGT 21733344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7802 CATACTGCCATGCAGCCATCACCACTATGCAAATCCAGAATGTTTTCATCATCCGAAAGT 7861

 21733345 GAAATTCTGTACCCATTATACAATAACTCTCCATTATTCCCTCCCCCAGTCCCTGGTAAC 21733404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7862 GAAATTCTGTACCCATTATACAATAACTCTCCATTATTCCCTCCCCCAGTCCCTGGTAAC 7921

 21733405 CACTATTCTACTTTGTCTCTATGAATCTGACTACTCTAAATATCTCCTAGGCGTGGAGTC 21733464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7922 CACTATTCTACTTTGTCTCTATGAATCTGACTACTCTAAATATCTCCTAGGCGTGGAGTC 7981

 21733465 ATATAACGTTTGTACTTTTGTCTTTACCTTACTCCACTTAGCATAATGTTTTCAAGATCC 21733524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7982 ATATAACGTTTGTACTTTTGTCTTTACCTTACTCCACTTAGCATAATGTTTTCAAGATCC 8041

 21733525 ATCCATGTTGTAGCACATATCAGAATTTCATTCTTTTTTAGGGCTGAATAATGTTCCACT 21733584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8042 ATCCATGTTGTAGCACATATCAGAATTTCATTCTTTTTTAGGGCTGAATAATGTTCCACT 8101

 21733585 GCACATATATATTATAATTTGCTTACCTGTTCATCTGTCAATGAAGATTTGGGTTGTTTC 21733644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8102 GCACATATATATTATAATTTGCTTACCTGTTCATCTGTCAATGAAGATTTGGGTTGTTTC 8161

 21733645 CTCTCACAACACTTTTCTGGGTGGCATATATTTTTAACCACATTTTTGGATGAAGACCCT 21733704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8162 CTCTCACAACACTTTTCTGGGTGGCATATATTTTTAACCACATTTTTGGATGAAGACCCT 8221

 21733705 GAGGTTTAGGGAGGTTAAGGAACTTGTTCATATTCACACAGCTGTTATACAAGTGGAGGA 21733764
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8222 GAGGCTTAGGGAGGTTAAGGAACTTGTTCATATTCACACAGCTGTTATACAAGTGGAGGA 8281

 21733765 GCTGGATTTGAAACTTCTGGCTTTATATTTCTGGCTTTTCCCACTACATTCCTGACTCCA 21733824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8282 GCTGGATTTGAAACTTCTGGCTTTATATTTCTGGCTTTTCCCACTACATTCCTGACTCCA 8341

 21733825 TCTCACACACTCCCACTTTGCTGGATTTTCTAATACATCCATTTCCTACCCTCGGTTAAG 21733884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8342 TCTCACACACTCCCACTTTGCTGGATTTTCTAATACATCCATTTCCTACCCTCGGTTAAG 8401

 21733885 CTTTTCTCTCTCACCAATCACAGTTTTCTAAAATCATGCTCAGTTCTGTCCAACCTCAAA 21733944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8402 CTTTTCTCTCTCACCAATCACAGTTTTCTAAAATCATGCTCAGTTCTGTCCAACCTCAAA 8461

 21733945 ATAATTTGATTTCTCAGTTTGGATTGCTTCCCAAACTCTCCCATATTTGGCCATTAAAAC 21734004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8462 ATAATTTGATTTCTCAGTTTGGATTGCTTCCCAAACTCTCCCATATTTGGCCATTAAAAC 8521

 21734005 TCACCAATGATGTCCTAAGTGCTTCTCAACCCTCCTCTTCCTACTTGACACCAGTCACTT 21734064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8522 TCACCAATGATGTCCTAAGTGCTTCTCAACCCTCCTCTTCCTACTTGACACCAGTCACTT 8581

 21734065 TGTGCCTTCACAATCCAGCGCCAGTGTATTTTTCCAGCTTGAGCTGCTGATCACACCCTT 21734124
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     8582 TGTGCCTTCACAATCCAGCGCCAGTGTATTTTTCCAGCTTGAGCTGCTGATGACACCCTT 8641

 21734125 GCTGCACTCTACGCAGAATGCCACAAGCACGCAGAACACCTATCCCTCCCAAAGAGTGCA 21734184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8642 GCTGCACTCTACGCAGAATGCCACAAGCACGCAGAACACCTATCCCTCCCAAAGAGTGCA 8701

 21734185 TGTCTTCATTCGTCTTCCTATATTCTCCTTAGAAGGTATTCTTTTGCCACCCCTTCTTCT 21734244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8702 TGTCTTCATTCGTCTTCCTATATTCTCCTTAGAAGGTATTCTTTTGCCACCCCTTCTTCT 8761

 21734245 GATACATTTTGTTCAGGCTTAGGTCAGAAGTTGCCTTTGTGAAGTTTTTCAGGCCATCAC 21734304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8762 GATACATTTTGTTCAGGCTTAGGTCAGAAGTTGCCTTTGTGAAGTTTTTCAGGCCATCAC 8821

 21734305 AATTCCCATGTGTCTCAGGCAGAATAACCATGTCTTTGTCTGAGCTACCGATATGGATGC 21734364
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     8822 AATTCCCATGTGTCTCAGGCAGAATAACCATGTCTTTGTCTGAGCTACCGATACGGATGC 8881

 21734365 TACTGTCCAGAATTTTATTATCATTATCCAGACATCTGTCAGCTTCCTCCAATATACTGC 21734424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8882 TACTGTCCAGAATTTTATTATCATTATCCAGACATCTGTCAGCTTCCTCCAATATACTGC 8941

 21734425 TCACTCCTTGAAGGTAATCACTATTTTAAATAAAGTAGAAAATTTATTTATTGGACATTT 21734484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8942 TCACTCCTTGAAGGTAATCACTATTTTAAATAAAGTAGAAAATTTATTTATTGGACATTT 9001

 21734485 ATTGTGAGTTCCTAATAACCTCTTTGCCATCTTTTCCAGTTATATTTGTGGCAACTAGCA 21734544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9002 ATTGTGAGTTCCTAATAACCTCTTTGCCATCTTTTCCAGTTATATTTGTGGCAACTAGCA 9061

 21734545 TCACACAGACAACTTTGTACCCAGAGAACTCCTTGCCTACAATGGGTACAAAGGGTATCT 21734604
          ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     9062 TCACACAGACAACTTTGTACCCCGAGAACTCCTTGCCTACAATGGGTACAAAGGGCATCT 9121

 21734605 CTGACTTTCTTCCCCAGAGCTTTTCTGATACCTCAATGAGGGATAACTATGGAAGCTGAG 21734664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9122 CTGACTTTCTTCCCCAGAGCTTTTCTGATACCTCAATGAGGGATAACTATGGAAGCTGAG 9181

 21734665 TTCACATACATGTGCAAATTTGGATATATTAACATCCTACGGTGACACTCATA 21734717
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9182 TTCACATACATGTGCAAATTTGGATATATTAACATCCTACGGTGACACTCATA 9234

Alignment time is 7.81117 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3961] =>      3961 nucs 'mol-32-2fcd-007030_3961'

Score:        3949
Aligned:      3960        nucs
Identic:      3959 (100%) nucs =>       397 (100%)      3562 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21725966,21726362] EXCISED REGION [21726364,21729926]
 second seq =>  [       1,     397] EXCISED REGION [     399,    3961]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [21726363,21726363]
 second seq =>         1 nucs [398,398]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [398,398] to [399,399]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 21725966 TCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAA 21726025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAA 60

 21726026 GCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 120

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 180

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 240

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 300

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 360

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATC 21726362
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATC 397

EXCISED REGION

 21726364 TAAGTGAAACTGGAGTGCTTCTTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCA 21726423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      399 TAAGTGAAACTGGAGTGCTTCTTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCA 458

 21726424 GCAAACTCGTATGGCAATTTGGAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTA 21726483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      459 GCAAACTCGTATGGCAATTTGGAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTA 518

 21726484 GCAAGGAAACCAATGGGCTCCATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGC 21726543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      519 GCAAGGAAACCAATGGGCTCCATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGC 578

 21726544 ATTTCTAACTTGTATGTGATAAAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGC 21726603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      579 ATTTCTAACTTGTATGTGATAAAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGC 638

 21726604 AAAATCCTGGCCCATACAGGTGTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTT 21726663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      639 AAAATCCTGGCCCATACAGGTGTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTT 698

 21726664 GTCTCAGCAAGAGAGAAATAGATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTA 21726723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      699 GTCTCAGCAAGAGAGAAATAGATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTA 758

 21726724 ATATTCAAGAAATGCAAGAGGAGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAA 21726783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      759 ATATTCAAGAAATGCAAGAGGAGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAA 818

 21726784 ACATTACTTGCCTTGGTGACAAGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAA 21726843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      819 ACATTACTTGCCTTGGTGACAAGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAA 878

 21726844 AATATTAAGCTTAACAAAGAGAAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAA 21726903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      879 AATATTAAGCTTAACAAAGAGAAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAA 938

 21726904 GACAGCAGAAGTGGCAGACTCGTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTT 21726963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      939 GACAGCAGAAGTGGCAGACTCGTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTT 998

 21726964 TACATCTACATCACAGGTTTTTCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTT 21727023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      999 TACATCTACATCACAGGTTTTTCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTT 1058

 21727024 ACTTATCAAACAGACAAGCAGCACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCAC 21727083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1059 ACTTATCAAACAGACAAGCAGCACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCAC 1118

 21727084 CAAAGAGCCGCTTCACCTGATGGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGC 21727143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1119 CAAAGAGCCGCTTCACCTGATGGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGC 1178

 21727144 TCTGAATAGCATGGCTCATAAAAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTA 21727203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1179 TCTGAATAGCATGGCTCATAAAAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTA 1238

 21727204 GTAATTGGCATTACCTAATTATCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACAT 21727263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1239 GTAATTGGCATTACCTAATTATCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACAT 1298

 21727264 CTGCCTATCCTAATTTAGAAAATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGG 21727323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1299 CTGCCTATCCTAATTTAGAAAATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGG 1358

 21727324 TTTTGGCCAAGAAACACAGTAAAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTC 21727383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1359 TTTTGGCCAAGAAACACAGTAAAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTC 1418

 21727384 TCCCAGGCAATAATTCCTCAACTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAA 21727443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1419 TCCCAGGCAATAATTCCTCAACTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAA 1478

 21727444 AGAAGAAAGAGAACAATGGTGAAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTC 21727503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1479 AGAAGAAAGAGAACAATGGTGAAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTC 1538

 21727504 CAGCCTGGCTTTCCCAAAAAATGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCAT 21727563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1539 CAGCCTGGCTTTCCCAAAAAATGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCAT 1598

 21727564 GTGACCTATATAAGAATGATTAAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGA 21727623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 GTGACCTATATAAGAATGATTAAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGA 1658

 21727624 AATTTAAAAGTAACCTTTTTTTAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAA 21727683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 AATTTAAAAGTAACCTTTTTTTAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAA 1718

 21727684 AGTGTACAAATGTGTACTCAAATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAA 21727743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1719 AGTGTACAAATGTGTACTCAAATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAA 1778

 21727744 CACCAAATTGTTATTGTGTTTGGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAG 21727803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 CACCAAATTGTTATTGTGTTTGGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAG 1838

 21727804 ATTATGCGTAGGTATAAAAAGATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGT 21727863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 ATTATGCGTAGGTATAAAAAGATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGT 1898

 21727864 AAAAAAATAACCATTTGTAGTTGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAG 21727923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1899 AAAAAAATAACCATTTGTAGTTGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAG 1958

 21727924 CAATACTGAACTATCGCAATATAATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTG 21727983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1959 CAATACTGAACTATCGCAATATAATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTG 2018

 21727984 AATTTCCTAGTAGCCACACCAAAAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATAT 21728043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2019 AATTTCCTAGTAGCCACACCAAAAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATAT 2078

 21728044 TTTATTCAACCCAAATAAAGGCAAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATG 21728103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 TTTATTCAACCCAAATAAAGGCAAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATG 2138

 21728104 TACAAAGCCTTTGAAAACCAGTGTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGG 21728163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 TACAAAGCCTTTGAAAACCAGTGTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGG 2198

 21728164 ACTAGCTAATTTTAAGTGTGCAGTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGT 21728223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2199 ACTAGCTAATTTTAAGTGTGCAGTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGT 2258

 21728224 GCAGACCTAGAACTTAATGTGCAATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGA 21728283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2259 GCAGACCTAGAACTTAATGTGCAATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGA 2318

 21728284 AATTAGTTATAGATTCAAGGTTTAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGA 21728343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 AATTAGTTATAGATTCAAGGTTTAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGA 2378

 21728344 TCTTACCTTTATATTTCTGGTCATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTG 21728403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2379 TCTTACCTTTATATTTCTGGTCATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTG 2438

 21728404 CTGGTTCTCCCATCCTGAAAGGGAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTC 21728463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2439 CTGGTTCTCCCATCCTGAAAGGGAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTC 2498

 21728464 ATAACTTGTCTTGACCAGTGGAATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCA 21728523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2499 ATAACTTGTCTTGACCAGTGGAATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCA 2558

 21728524 GGCCTCAAGAGACCCTGCAGCTCCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAA 21728583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 GGCCTCAAGAGACCCTGCAGCTCCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAA 2618

 21728584 TAGGTAAGGAAGCCAGACCAGCTTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCA 21728643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2619 TAGGTAAGGAAGCCAGACCAGCTTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCA 2678

 21728644 GATCCACAGTCAACAGCCAGCAGCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCT 21728703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2679 GATCCACAGTCAACAGCCAGCAGCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCT 2738

 21728704 TATAACCCAGGTGACCCACAAGATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGC 21728763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2739 TATAACCCAGGTGACCCACAAGATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGC 2798

 21728764 AGAGGAAGTGCTCAAACCCAAAATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCA 21728823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2799 AGAGGAAGTGCTCAAACCCAAAATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCA 2858

 21728824 GTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGTTAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTC 21728883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2859 GTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGTTAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTC 2918

 21728884 ATAATTTTTTTTATTAATAGGCCACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGC 21728943
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2919 ATAATTTTTTTTATTAATAGGCCACTTTTTGGAACAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGC 2978

 21728944 ACAGGAAAGCACAGCAATTTCCCATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCC 21729003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2979 ACAGGAAAGCACAGCAATTTCCCATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCC 3038

 21729004 ATTATCAACATCCCCCACCAGAGTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACAC 21729063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3039 ATTATCAACATCCCCCACCAGAGTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACAC 3098

 21729064 ATCATTATTGTCCAGGGTTCATAGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGT 21729123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3099 ATCATTATTGTCCAGGGTTCATAGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGT 3158

 21729124 GTTGTACATTCCCTGGGTTTGGACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACA 21729183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3159 GTTGTACATTCCCTGGGTTTGGACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACA 3218

 21729184 GTTTTATTGCCCTAAAAATTCTCTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAA 21729243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3219 GTTTTATTGCCCTAAAAATTCTCTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAA 3278

 21729244 ATTCATAGGAAATAAATATAAAAAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTAC 21729303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3279 ATTCATAGGAAATAAATATAAAAAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTAC 3338

 21729304 AATTTTGATTTGTTTCATTTGAGAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTG 21729363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3339 AATTTTGATTTGTTTCATTTGAGAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTG 3398

 21729364 TAGAAAAGTCTGACAATGTAAACAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGT 21729423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3399 TAGAAAAGTCTGACAATGTAAACAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGT 3458

 21729424 CACCCAGGCTTGGAATGCAGTAGCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGC 21729483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3459 CACCCAGGCTTGGAATGCAGTAGCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGC 3518

 21729484 TCAAGGGATCCTGCTACCTTAGCCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAA 21729543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3519 TCAAGGGATCCTGCTACCTTAGCCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAA 3578

 21729544 TTTTTTTTAAACATCATGGTAACTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTC 21729603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3579 TTTTTTTTAAACATCATGGTAACTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTC 3638

 21729604 TCTACTATTATTTTTGGTGCCTCTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAG 21729663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3639 TCTACTATTATTTTTGGTGCCTCTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAG 3698

 21729664 GGGAACAAACACATTAGTTTGCAAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGG 21729723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3699 GGGAACAAACACATTAGTTTGCAAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGG 3758

 21729724 AATAATTGTATATCTTAAATATACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCT 21729783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3759 AATAATTGTATATCTTAAATATACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCT 3818

 21729784 ATTTTAGGGATATACCATAACTAGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTAT 21729843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3819 ATTTTAGGGATATACCATAACTAGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTAT 3878

 21729844 GTCCAGTATTTATTATAAATAAAGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTA 21729903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3879 GTCCAGTATTTATTATAAATAAAGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTA 3938

 21729904 TTTCAAATGAAACAAAATTTAAA 21729926
          |||||||||||||||||||||||
     3939 TTTCAAATGAAACAAAATTTAAA 3961

Alignment time is 3.82812 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2900] =>      2900 nucs 'mol-32-2fcd-007050_2900'

Score:        2877
Aligned:      2899        nucs
Identic:      2897 (100%) nucs =>       327 (100%)      2570 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21722864,21723190] EXCISED REGION [21723191,21725761]
 second seq =>  [       1,     327] EXCISED REGION [     329,    2900]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [328,328]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [21725455,21725455]
 second seq =>         1 nucs [2594,2594]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        12 nucs [328,339] to [329,340]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 21722864 ATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGT 21722923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGT 60

 21722924 GATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGC 21722983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGC 120

 21722984 AGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTT 21723043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTT 180

 21723044 ACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAG 21723103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAG 240

 21723104 AACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAAT 21723163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAAT 300

 21723164 CCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACG 21723190
          |||||||||||||||||||||||||||
      301 CCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACG 327

EXCISED REGION

 21723191 AAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATT 21723250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      329 AAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATT 388

 21723251 TTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGA 21723310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      389 TTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGA 448

 21723311 GGGAAAGAG-AGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAAC 21723369
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      449 GGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAAC 508

 21723370 ATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTAT 21723429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      509 ATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTAT 568

 21723430 GAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTG 21723489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      569 GAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTG 628

 21723490 ACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCAC 21723549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      629 ACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCAC 688

 21723550 CAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAG 21723609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      689 CAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAG 748

 21723610 CAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTG 21723669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      749 CAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTG 808

 21723670 AATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGA 21723729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      809 AATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGA 868

 21723730 AGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAAC 21723789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      869 AGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAAC 928

 21723790 CTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAG 21723849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      929 CTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAG 988

 21723850 GGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAAT 21723909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      989 GGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAAT 1048

 21723910 TGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCC 21723969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1049 TGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCC 1108

 21723970 ACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGA 21724029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1109 ACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGA 1168

 21724030 AAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGG 21724089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1169 AAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGG 1228

 21724090 AAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAA 21724149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1229 AAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAA 1288

 21724150 TTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGG 21724209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1289 TTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGG 1348

 21724210 AGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTT 21724269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1349 AGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTT 1408

 21724270 TGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCC 21724329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1409 TGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCC 1468

 21724330 ATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGA 21724389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1469 ATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGA 1528

 21724390 TAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGA 21724449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1529 TAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGA 1588

 21724450 GAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACAC 21724509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1589 GAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACAC 1648

 21724510 AGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAA 21724569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1649 AGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAA 1708

 21724570 TTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATT 21724629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1709 TTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATT 1768

 21724630 GAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGT 21724689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1769 GAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGT 1828

 21724690 CTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTA 21724749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1829 CTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTA 1888

 21724750 CACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTT 21724809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1889 CACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTT 1948

 21724810 ATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTG 21724869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1949 ATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTG 2008

 21724870 GGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGT 21724929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2009 GGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGT 2068

 21724930 GAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTA 21724989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2069 GAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTA 2128

 21724990 GTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGC 21725049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2129 GTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGC 2188

 21725050 AGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCA 21725109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2189 AGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCA 2248

 21725110 AAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAA 21725169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2249 AAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAA 2308

 21725170 GAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTG 21725229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2309 GAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTG 2368

 21725230 AAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAG 21725289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2369 AAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAG 2428

 21725290 GGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAAC 21725349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2429 GGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAAC 2488

 21725350 AAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAG 21725409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2489 AAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAG 2548

 21725410 CCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCT 21725469
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2549 CCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATGGCCACATCTGTGCT 2608

 21725470 GGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTT 21725529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2609 GGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTT 2668

 21725530 TCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCAC 21725589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2669 TCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCAC 2728

 21725590 TTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCT 21725649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2729 TTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCT 2788

 21725650 CCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCC 21725709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2789 CCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCC 2848

 21725710 ATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTC 21725761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2849 ATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTC 2900

Alignment time is 3.16631 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    5636] =>      5636 nucs 'mol-32-2fcd-069408_5636'

Score:        5559
Aligned:      5636        nucs
Identic:      5629 (100%) nucs =>      2542 (100%)      3087 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21720247,21722790] EXCISED REGION [21722793,21725882]
 second seq =>  [       1,    2544] EXCISED REGION [    2546,    5636]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         2 nucs [21722791,21722792]
 second seq =>         1 nucs [2545,2545]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        24 nucs [21722791,21722814] to [21722793,21722816]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21722791,21722791] to [21722792,21722792]
 second seq =>         0 nucs

 21720247 GCCCTGCATTTTCCTGAATGATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTAT 21720306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCCTGCATTTTCCTGAATGATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTAT 60

 21720307 GCTTTCCAAGTGCTAAATATTTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTG 21720366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GCTTTCCAAGTGCTAAATATTTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTG 120

 21720367 CCTATTTATACAGTTTAATGTCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAA 21720426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCTATTTATACAGTTTAATGTCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAA 180

 21720427 ATTTTGTAAATTTATGTTGTTCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGG 21720486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTTGTAAATTTATGTTGTTCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGG 240

 21720487 CCCTGCCACCCACCCCCCAACCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCA 21720546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCTGCCACCCACCCCCCAACCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCA 300

 21720547 AACTTCTACAGAATATTCTAAGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCAT 21720606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AACTTCTACAGAATATTCTAAGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCAT 360

 21720607 CCAAATTCCAGTGTTTTCATGTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTAT 21720666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCAAATTCCAGTGTTTTCATGTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTAT 420

 21720667 AAAATAAGAATAACAGCTAAATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAG 21720726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAATAAGAATAACAGCTAAATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAG 480

 21720727 AGTAAATACTAAACTATAGTAACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAA 21720786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGTAAATACTAAACTATAGTAACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAA 540

 21720787 TGATATGAAATAATGGAATATATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAA 21720846
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGATATGAAATAATGAAATATATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAA 600

 21720847 ATCATTAATTGGTATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTG 21720906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCATTAATTGGTATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTG 660

 21720907 AGTTAAGCTTTTGAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGT 21720966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGTTAAGCTTTTGAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGT 720

 21720967 CTAAGAAAGAGTTTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAA 21721026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTAAGAAAGAGTTTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAA 780

 21721027 GACATTGTTGCTTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTA 21721086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GACATTGTTGCTTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTA 840

 21721087 ATGTCATTAATACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATA 21721146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGTCATTAATACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATA 900

 21721147 GGAAACAATATTGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTT 21721206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGAAACAATATTGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTT 960

 21721207 TGGAGGGAGGGAGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAA 21721266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGGAGGGAGGGAGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAA 1020

 21721267 GCGACTTACTTGATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAA 21721326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCGACTTACTTGATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAA 1080

 21721327 AAATACCCCCAAGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCC 21721386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAATACCCCCAAGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCC 1140

 21721387 ATAGAAGTATATGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGAC 21721446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATAGAAGTATATGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGAC 1200

 21721447 AAAATATTGTATGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACGTGGTAAGGACTCAAAATATG 21721506
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1201 AAAATATTGTATGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACATGGTAAGGACTCAAAATATG 1260

 21721507 ATAGCTGACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAAT 21721566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ATAGCTGACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAAT 1320

 21721567 AGAGTCACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTG 21721626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGAGTCACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTG 1380

 21721627 TCACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTC 21721686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTC 1440

 21721687 ACTCGTTCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATAC 21721746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 ACTCGTTCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATAC 1500

 21721747 ACTGGGTAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCA 21721806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTGGGTAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCA 1560

 21721807 ATAGTGAGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTT 21721866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATAGTGAGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTT 1620

 21721867 GGAATCATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAA 21721926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GGAATCATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAA 1680

 21721927 AACAAGTGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAAT 21721986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACAAGTGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAAT 1740

 21721987 TTGTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACA 21722046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTGTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACA 1800

 21722047 TGTGATGTTTAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAAT 21722106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGTGATGTTTAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAAT 1860

 21722107 ATGCTCTACTAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTT 21722166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGCTCTACTAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTT 1920

 21722167 GTTTATTTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCAC 21722226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GTTTATTTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCAC 1980

 21722227 TGGGGAAATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATT 21722286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGGGAAATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATT 2040

 21722287 AGTCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGT 21722346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AGTCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGT 2100

 21722347 GCTACACAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGT 21722406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCTACACAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGT 2160

 21722407 CAGACAGTCCCTTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAG 21722466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CAGACAGTCCCTTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAG 2220

 21722467 GCAGGGAGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTG 21722526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GCAGGGAGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTG 2280

 21722527 CCCTTAGCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCC 21722586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CCCTTAGCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCC 2340

 21722587 AATTACAGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTT 21722646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AATTACAGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTT 2400

 21722647 CAGAGTATTATACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTA 21722706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CAGAGTATTATACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTA 2460

 21722707 AGGTAAACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAG 21722766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AGGTAAACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAG 2520

 21722767 CCTATGTGAATATATTCCATCAGT 21722790
          ||||||||||||||||||||||||
     2521 CCTATGTGAATATATTCCATCAGT 2544

EXCISED REGION

 21722793 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTG 21722852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2546 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTG 2605

 21722853 GCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGT 21722912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2606 GCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGT 2665

 21722913 AAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCA 21722972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2666 AAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCA 2725

 21722973 AAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAAT 21723032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2726 AAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAAT 2785

 21723033 AAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACC 21723092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2786 AAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACC 2845

 21723093 AAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTT 21723152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2846 AAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTT 2905

 21723153 TCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACG-AAAAAAAAAAAACAAACAAAA 21723211
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
     2906 TCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAAAAAAACAAACAAAA 2965

 21723212 AAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAA 21723271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2966 AAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAA 3025

 21723272 ATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAG-AGGCAAAGATT 21723330
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
     3026 ATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATT 3085

 21723331 TCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACA 21723390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3086 TCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACA 3145

 21723391 AATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAA 21723450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3146 AATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAA 3205

 21723451 ATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCA 21723510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3206 ATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCA 3265

 21723511 GAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAG 21723570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3266 GAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAG 3325

 21723571 TAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATG 21723630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3326 TAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATG 3385

 21723631 CATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGT 21723690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3386 CATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGT 3445

 21723691 TGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGT 21723750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3446 TGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGT 3505

 21723751 ATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGA 21723810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3506 ATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGA 3565

 21723811 GAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGC 21723870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3566 GAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGC 3625

 21723871 AATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAAC 21723930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 AATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAAC 3685

 21723931 TAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCAT 21723990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3686 TAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCAT 3745

 21723991 CAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCT 21724050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 CAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCT 3805

 21724051 TTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCAT 21724110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 TTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCAT 3865

 21724111 ATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGA 21724170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3866 ATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGA 3925

 21724171 TGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTT 21724230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 TGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTT 3985

 21724231 TTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAG 21724290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 TTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAG 4045

 21724291 TGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAAT 21724350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 TGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAAT 4105

 21724351 GGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGT 21724410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4106 GGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGT 4165

 21724411 TCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTT 21724470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 TCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTT 4225

 21724471 AGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTAC 21724530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 AGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTAC 4285

 21724531 CCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCC 21724590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 CCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCC 4345

 21724591 TAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAA 21724650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 TAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAA 4405

 21724651 CACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAA 21724710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 CACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAA 4465

 21724711 TTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACACCCTACATCATCTGTAG 21724770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 TTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACACCCTACATCATCTGTAG 4525

 21724771 GACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGAC 21724830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 GACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGAC 4585

 21724831 TTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATC 21724890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 TTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATC 4645

 21724891 ACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAA 21724950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 ACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAA 4705

 21724951 ATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTG 21725010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 ATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTG 4765

 21725011 AGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCAC 21725070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 AGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCAC 4825

 21725071 TGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCAT 21725130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4826 TGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCAT 4885

 21725131 GTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGC 21725190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 GTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGC 4945

 21725191 AGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAA 21725250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 AGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAA 5005

 21725251 GGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAG 21725310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 GGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAG 5065

 21725311 ACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAG 21725370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 ACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAG 5125

 21725371 ATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCC 21725430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 ATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCC 5185

 21725431 TATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACT 21725490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 TATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACT 5245

 21725491 ATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGA 21725550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5246 ATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGA 5305

 21725551 AATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAG 21725610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 AATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAG 5365

 21725611 TTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCAC 21725670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     5366 TTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTGTAACAACTTCCAAGCAC 5425

 21725671 GCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCT 21725730
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     5426 GCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGTTTAGGAGTTGACTCTCT 5485

 21725731 TTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAA 21725790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 TTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAA 5545

 21725791 GGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACACTAAAGCCATAAATGGTTAAC 21725850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 GGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACACTAAAGCCATAAATGGTTAAC 5605

 21725851 TGTTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 21725882
          |||||| |||||||||||||||||||||||||
     5606 TGTTCT-CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 5636

Alignment time is 5.23374 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    8784] =>      8784 nucs 'mol-32-2fd8-158813_8784'

Score:        8651
Aligned:      8785        nucs
Identic:      8772 (100%) nucs =>      4851 (100%)      3921 (100%)
Gaps:            5 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21721038,21725892] EXCISED REGION [21725907,21729832]
 second seq =>  [       1,    4858] EXCISED REGION [    4859,    8784]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        14 nucs [21725893,21725906]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>        17 nucs [21725876,21725892] to [21725907,21725923]
 second seq =>        17 nucs [4842,4858] to [4859,4875]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [21725893,21725895] to [21725904,21725906]
 second seq =>         0 nucs

 21721038 TTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCATTAAT 21721097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCATTAAT 60

 21721098 ACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAACAATAT 21721157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAACAATAT 120

 21721158 TGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGGGAGGG 21721217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGGGAGGG 180

 21721218 AGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACTTACTT 21721277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACTTACTT 240

 21721278 GATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATACCCCCA 21721337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATACCCCCA 300

 21721338 AGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAAGTATA 21721397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAAGTATA 360

 21721398 TGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATATTGTA 21721457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATATTGTA 420

 21721458 TGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACGTGGTAAGGACTCAAAATATGATAGCTGACTT 21721517
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACATGGTAAGGACTCAAAATATGATAGCTGACTT 480

 21721518 GGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTCACACT 21721577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTCACACT 540

 21721578 AATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCTCTTCT 21721637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCTCTTCT 600

 21721638 CTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCGTTCTTT 21721697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCGTTCTTT 660

 21721698 CTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACTGGGTAAAT 21721757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACTGGGTAAAT 720

 21721758 TTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGAGA 21721817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGAGA 780

 21721818 ATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATCAT 21721877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATCAT 840

 21721878 TTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGCAA 21721937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGCAA 900

 21721938 TTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTGTTCTTTCC 21721997
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      901 TTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTGGACCACAATTTGTTCTTTCC 960

 21721998 TGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATGTGATGTTTA 21722057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATGTGATGTTTA 1020

 21722058 ACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGCTCTACTA 21722117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGCTCTACTA 1080

 21722118 ATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTGCT 21722177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTGCT 1140

 21722178 ATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAATCT 21722237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAATCT 1200

 21722238 TGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCCAA 21722297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCCAA 1260

 21722298 AATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAGTT 21722357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAGTT 1320

 21722358 CAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACAGTCCC 21722417
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1321 CAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGTCCATAGTCAGACAGTCCC 1380

 21722418 TTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGATG 21722477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGATG 1440

 21722478 CTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCTAC 21722537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCTAC 1500

 21722538 ATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGATC 21722597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGATC 1560

 21722598 TGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATTAT 21722657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATTAT 1620

 21722658 ACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAACCTT 21722717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAACCTT 1680

 21722718 CTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTGAAT 21722777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTGAAT 1740

 21722778 ATATTCCATCAGT-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGG 21722836
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATATTCCATCAGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGG 1800

 21722837 GAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAA 21722896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAA 1860

 21722897 AGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGC 21722956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGC 1920

 21722957 AAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGC 21723016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 AAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGC 1980

 21723017 TGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGT 21723076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGT 2040

 21723077 GGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAAT 21723136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAAT 2100

 21723137 GTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAA 21723196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAA 2160

 21723197 AAAAAA--CAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTG 21723254
          ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAAAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTG 2220

 21723255 GTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGA 21723314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 GTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGA 2280

 21723315 AAGAGA-GGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGT 21723373
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGT 2340

 21723374 AAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAAC 21723433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAAC 2400

 21723434 TGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACAT 21723493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACAT 2460

 21723494 CATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAAT 21723553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAAT 2520

 21723554 TTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAA 21723613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAA 2580

 21723614 GATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATC 21723673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATC 2640

 21723674 TTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCC 21723733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCC 2700

 21723734 AGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGG 21723793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 AGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGG 2760

 21723794 AAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGA 21723853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 AAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGA 2820

 21723854 AAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCC 21723913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 AAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCC 2880

 21723914 TTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTT 21723973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTT 2940

 21723974 AAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGG 21724033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGG 3000

 21724034 ACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAAT 21724093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 ACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAAT 3060

 21724094 GAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAG 21724153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAG 3120

 21724154 AGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAA 21724213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 AGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAA 3180

 21724214 GACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTG 21724273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 GACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTG 3240

 21724274 AGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAG 21724333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAG 3300

 21724334 ACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGT 21724393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGT 3360

 21724394 CATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGC 21724453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGC 3420

 21724454 ACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGAC 21724513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGAC 3480

 21724514 TTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTG 21724573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTG 3540

 21724574 CATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAA 21724633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 CATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAA 3600

 21724634 ACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCT 21724693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCT 3660

 21724694 AGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACA 21724753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACA 3720

 21724754 CCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGC 21724813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGC 3780

 21724814 GACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 21724873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAG 3840

 21724874 GCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAA 21724933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAA 3900

 21724934 CTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCC 21724993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCC 3960

 21724994 CAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTG 21725053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTG 4020

 21725054 AGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAA 21725113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAA 4080

 21725114 AAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGC 21725173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 AAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGC 4140

 21725174 ATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGA 21725233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 ATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGA 4200

 21725234 TCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTG 21725293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTG 4260

 21725294 ACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGA 21725353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 ACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGA 4320

 21725354 ATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAA 21725413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAA 4380

 21725414 CATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGAC 21725473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 CATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGAC 4440

 21725474 TTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTG 21725533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 TTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTG 4500

 21725534 GTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTA 21725593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 GTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTA 4560

 21725594 GACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTG 21725653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTG 4620

 21725654 TAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGT 21725713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 TAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGT 4680

 21725714 TTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAG 21725773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 TTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAG 4740

 21725774 AAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACACTAA 21725833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACACTAA 4800

 21725834 AGCCATAAATGGTTAACTGTTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 21725892
          |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 AGCCATAAATGGTTAACTGTTCTC-TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 4858

EXCISED REGION

 21725907 CTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATTCTTTACCAT 21725966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4859 CTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATTCTTTACCAT 4918

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4919 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 4978

 21726027 CCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATTA 21726086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4979 CCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATTA 5038

 21726087 ATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGTT 21726146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5039 ATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGTT 5098

 21726147 TGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCAA 21726206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5099 TGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCAA 5158

 21726207 GGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTTT 21726266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5159 GGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTTT 5218

 21726267 ATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAAA 21726326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5219 ATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAAA 5278

 21726327 TTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCTT 21726386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     5279 TTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCTT 5338

 21726387 AGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGGA 21726446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5339 AGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGGA 5398

 21726447 AAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCAT 21726506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5399 AAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCAT 5458

 21726507 AAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAAA 21726566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5459 AAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAAA 5518

 21726567 GGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTGT 21726626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5519 GGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTGT 5578

 21726627 TATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGAT 21726686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5579 TATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGAT 5638

 21726687 TCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGAG 21726746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5639 TCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGAG 5698

 21726747 TGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAAG 21726806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5699 TGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAAG 5758

 21726807 AATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGAA 21726866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5759 AATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGAA 5818

 21726867 ACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCGT 21726926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5819 ACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCGT 5878

 21726927 AAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTTC 21726986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5879 AAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTTC 5938

 21726987 CCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGCA 21727046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5939 CCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGCA 5998

 21727047 CATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATGG 21727106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5999 CATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATGG 6058

 21727107 ATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAAA 21727166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6059 ATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAAA 6118

 21727167 AGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTATC 21727226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6119 AGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTATC 6178

 21727227 CCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAAT 21727286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6179 CCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAAT 6238

 21727287 GAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAAA 21727346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6239 GAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAAA 6298

 21727347 GTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAACT 21727406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6299 GTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAACT 6358

 21727407 GAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGAA 21727466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6359 GAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGAA 6418

 21727467 AACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAATG 21727526
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6419 AACTAAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAATG 6478

 21727527 AGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTAA 21727586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6479 AGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTAA 6538

 21727587 AGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTTA 21727646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6539 AGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTTA 6598

 21727647 ATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAAT 21727706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6599 ATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAAT 6658

 21727707 CGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTGG 21727766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6659 CGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTGG 6718

 21727767 ATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGAT 21727826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6719 ATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGAT 6778

 21727827 ATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTTG 21727886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6779 ATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTTG 6838

 21727887 CTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATATA 21727946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6839 CTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATATA 6898

 21727947 ATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAAA 21728006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6899 ATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAAA 6958

 21728007 AAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGCA 21728066
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6959 AAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGCA 7018

 21728067 AATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGTG 21728126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7019 AATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGTG 7078

 21728127 TGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCAG 21728186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7079 TGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCAG 7138

 21728187 TCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGCA 21728246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     7139 TCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACCTAATGTGCA 7198

 21728247 ATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTTT 21728306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7199 ATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTTT 7258

 21728307 AATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTCA 21728366
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7259 AATTGTCACAAAACACGTTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTCA 7318

 21728367 TCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGGG 21728426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7319 TCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGGG 7378

 21728427 AGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGAA 21728486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7379 AGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGAA 7438

 21728487 TGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCTC 21728546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7439 TGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCTC 7498

 21728547 CTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGCT 21728606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7499 CTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGCT 7558

 21728607 TCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCAG 21728666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7559 TCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCAG 7618

 21728667 CAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAGA 21728726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7619 CAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAGA 7678

 21728727 TAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAAA 21728786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7679 TAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAAA 7738

 21728787 TATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGTT 21728846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7739 TATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGTT 7798

 21728847 AAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGCC 21728906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7799 AAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGCC 7858

 21728907 ACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCCC 21728966
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7859 ACTTTTTGGAACAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCCC 7918

 21728967 ATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGAG 21729026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7919 ATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGAG 7978

 21729027 TGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCATA 21729086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7979 TGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCATA 8038

 21729087 GTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGGA 21729146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8039 GTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGGA 8098

 21729147 CAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCTC 21729206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8099 CAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCTC 8158

 21729207 TTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAAA 21729266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8159 TTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAAA 8218

 21729267 AGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGAG 21729326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8219 AGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGAG 8278

 21729327 AATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAAC 21729386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8279 AATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAAC 8338

 21729387 AAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTAG 21729446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8339 AAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTAG 8398

 21729447 CACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAGC 21729506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8399 CACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAGC 8458

 21729507 CTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAAC 21729566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8459 CTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAAC 8518

 21729567 TTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCTC 21729626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8519 TTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCTC 8578

 21729627 TACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGCA 21729686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8579 TACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGCA 8638

 21729687 AAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATATA 21729746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8639 AAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATATA 8698

 21729747 CTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACTA 21729806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8699 CTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACTA 8758

 21729807 GTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTC 21729832
          ||||||||||||||||||||||||||
     8759 GTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTC 8784

Alignment time is 7.54419 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    8120] =>      8120 nucs 'mol-32-3025-183636_8120'

Score:        7767
Aligned:      8095        nucs
Identic:      8048 ( 99%) nucs =>      3776 ( 99%)      4272 (100%)
Gaps:           28 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21719912,21723705] EXCISED REGION [21725967,21730245]
 second seq =>  [       1,    3809] EXCISED REGION [    3834,    8113]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2261 nucs [21723706,21725966]
 second seq =>        24 nucs [3810,3833]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723705,21723705] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [3810,3810] to [3834,3834]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723706,21723706] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [3810,3810] to [3833,3833]

 21719912 TCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTTAGACAGTAGAAGTTCGTGAAGTGAC 21719971
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGCCTTAGACAGTAGAAGTTCGTGAAGTGAC 60

 21719972 CTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACGCAACAACAAATAACCCTAAAAGGA 21720031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACGCAACAACAAATAACCCTAAAAGGA 120

 21720032 AACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATTGGAGTTAGTCCCTTCAAATTCAT 21720091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATTGGAGTTAGTCCCTTCAAATTCAT 180

 21720092 GGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTGCTTTTGAACGGACATTAATCCCA 21720151
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      181 GGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTGCTTTTGAAAGGACATTAATCCCA 240

 21720152 AAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAGCAGGAATGCCTGCTGAGAGGGGA 21720211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAGCAGGAATGCCTGCTGAGAGGGGA 300

 21720212 GAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGCCCTGCATTTTCCTGAATGATTCT 21720271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGCCCTGCATTTTCCTGAATGATTCT 360

 21720272 GATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGCTTTCCAAGTGCTAAATATTTGCT 21720331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGCTTTCCAAGTGCTAAATATTTGCT 420

 21720332 TCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCCTATTTATACAGTTTAATGTCCTC 21720391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      421 TCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCCTATTTGTACAGTTTAATGTCCTC 480

 21720392 CTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAATTTTGTAAATTTATGTTGTTCTTC 21720451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAATTTTGTAAATTTATGTTGTTCTTC 540

 21720452 AGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCCCTGCCACCCACCCCCCAACCCCA 21720511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      541 AGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCCCTGCCACCCACCCCCCAACTCCA 600

 21720512 TCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAACTTCTACAGAATATTCTAAGTGC 21720571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAACTTCTACAGAATATTCTAAGTGC 660

 21720572 TTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCCAAATTCCAGTGTTTTCATGTCCA 21720631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCCAAATTCCAGTGTTTTCATGTCCA 720

 21720632 AAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAAAATAAGAATAACAGCTAAATTCC 21720691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAAAATAAGAATAACAGCTAAATTCC 780

 21720692 AGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAGTAAATACTAAACTATAGTAACTA 21720751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAGTAAATACTAAACTATAGTAACTA 840

 21720752 TTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATGATATGAAATAATGGAATATATTT 21720811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATGATATGAAATAATGGAATATATTT 900

 21720812 TATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAATCATTAATTGGTATATCTCTTATG 21720871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAATCATTAATTGGTATATCTCTTATG 960

 21720872 ATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGTTAAGCTTTTGAAGGGGAGTATT 21720931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGTTAAGCTTTTGAAGGGGAGTATT 1020

 21720932 CATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTAAGAAAGAGTTTTGAAAATTATA 21720991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTAAGAAAGAGTTTTGAAAATTATA 1080

 21720992 GGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGACATTGTTGCTTTGAAAGCTAATC 21721051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGACATTGTTGCTTTGAAAGCTAATC 1140

 21721052 CAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCATTAATACTATTAGGTACCT 21721111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCATTAATACTATTAGGTACCT 1200

 21721112 GTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAACAATATTGAAAAGAGAGAGA 21721171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAACAATATTGAAAAGAGAGAGA 1260

 21721172 AAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGGGAGGGAGACTAGCAGGGAG 21721231
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGAACAAAAAGGAAGAGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGGGAGGGAGACTAGCAGGGAG 1320

 21721232 GGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACTTACTTGATTGACCTCGATA 21721291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACTTACTTGATTGACCTCGATA 1380

 21721292 GAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATACCCCCAAGTCATCCTATATG 21721351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATACCCCCAAGTCATCCTATATG 1440

 21721352 GAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAAGTATATGTCTTTTAAACTG 21721411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAAGTATATGTCTTTTAAACTG 1500

 21721412 GAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATATTGTATGAGAGAGACTCGC 21721471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATATTGTATGAGAGAGACTCGC 1560

 21721472 TCAGTGCCTAATACGTGGTAAGGACTCAAAATATGATAGCTGACTTGGAATCTGGGACGT 21721531
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCAGTGCCTAATACGTGGTAAGTACTCAAAATATGATAGCTGACTTGGAATCTGGGACGT 1620

 21721532 AAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTCACACTAATTCACTTCCTCC 21721591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTCACACTAATTCACTTCCTCC 1680

 21721592 CTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCT 21721651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCT 1740

 21721652 CATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCGTTCTTTCTCACAAACATTCA 21721711
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1741 CATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCATTCTTTCTCACAAACATTCA 1800

 21721712 TTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACTGGGTAAATTTCAATAAAAGTAA 21721771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACTGGGTAAATTTCAATAAAAGTAA 1860

 21721772 ATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGAGAATAAGCAAAACACT 21721831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGAGAATAAGCAAAACACT 1920

 21721832 TTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATCATTTTCTCTTATTTAA 21721891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATCATTTTCTCTTATTTAA 1980

 21721892 TAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGCAATTTTCTAATATTAT 21721951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGCAATTTTCTAATATTAT 2040

 21721952 CACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTGTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAG 21722011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTGTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAG 2100

 21722012 AGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATGTGATGTTTAACTAATAATATCGG 21722071
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGCGAGGAGCCACATGTGATGTTTAACTAATAATATCGG 2160

 21722072 ATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGCTCTACTAATCACATGGACTAG 21722131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2161 ATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGTTCTACTAATCACATGGACTAG 2220

 21722132 AATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTGCTATGCTTTCACCAAC 21722191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTGCTATGCTTTCACCAAC 2280

 21722192 TACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAATCTTGATAACAACTGTT 21722251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAATCTTGATAACAACTGTT 2340

 21722252 TATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTT 21722311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTT 2400

 21722312 ATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAGTTCAGCATAGAAATAT 21722371
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTTTTTTT-CACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAGTTCAGCATAGAAATAT 2459

 21722372 CCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACAGTCCCTTACATCGCAATGT 21722431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2460 CCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACAGTCCCTTACGTCGCAATGT 2519

 21722432 TACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGATGCTTTGGATTTTATT 21722491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGATGCTTTGGATTTTATT 2579

 21722492 TCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCTACATTTACATTTAGCT 21722551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCTACATTTACATTTAGCT 2639

 21722552 AGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGATCTGAGTGTAACAGAA 21722611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 AGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGATCTGAGTGTAACAGAA 2699

 21722612 TTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATTATACTGTTGAAAGACA 21722671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATTATACTGTTGAAAGACA 2759

 21722672 TCT-AAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAACCTTCTGACAAAAAAAA 21722730
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TCTTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAACCTTCTGACAAAAAAAA 2819

 21722731 TTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTGAATATATTCCATCAGT 21722790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTGAATATATTCCATCAGT 2879

 21722791 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA------------CCTACATTTTTGGCACATGGGA 21722838
          ||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||
     2880 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGA 2939

 21722839 AGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAG 21722898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 AGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAG 2999

 21722899 GCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAA 21722958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 GCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAA 3059

 21722959 GCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTG 21723018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3060 GCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTG 3119

 21723019 GCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGG 21723078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 GCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGG 3179

 21723079 GTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGT 21723138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 GTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGT 3239

 21723139 ACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAA 21723198
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     3240 ACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATTAAAAAAAACGAAAAAAAA 3299

 21723199 AAA----ACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTG 21723254
          |||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 AAACCAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTG 3359

 21723255 GTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGA 21723314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 GTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGA 3419

 21723315 AAGAGA-GGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGT 21723373
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
     3420 AAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAAC---- 3475

 21723374 A---AAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATG 21723430
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3476 -GTGAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATG 3534

 21723431 AACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGA 21723490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 AACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGA 3594

 21723491 CATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACC 21723550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     3595 CATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGGACC 3654

 21723551 AATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGC 21723610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 AATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGC 3714

 21723611 AAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGA 21723670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 AAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGA 3774

 21723671 ATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 21723705
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 ATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 3809

EXCISED REGION

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3834 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAC 3893

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3894 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 3953

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3954 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 4013

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 4073

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 4133

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 4193

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     4194 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 4253

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 4313

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 4373

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 4433

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 4493

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 4553

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 4613

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 4673

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 4733

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 4793

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 4853

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 4913

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 4973

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 5033

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 5093

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 5153

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5154 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 5213

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5214 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 5273

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5274 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 5333

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5334 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 5393

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5394 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 5453

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     5454 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAACAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 5513

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5514 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 5573

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5574 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 5633

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5634 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 5693

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5694 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 5753

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5754 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 5813

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5814 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 5873

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5874 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 5933

 21728066 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 21728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5934 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 5993

 21728126 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 21728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5994 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 6053

 21728186 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 21728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6054 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 6113

 21728246 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 21728305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     6114 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATATGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 6173

 21728306 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 21728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6174 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 6233

 21728366 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 21728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6234 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 6293

 21728426 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 21728485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6294 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 6353

 21728486 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 21728545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6354 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 6413

 21728546 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 21728605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6414 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 6473

 21728606 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 21728665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6474 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 6533

 21728666 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 21728725
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6534 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGAGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 6593

 21728726 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAA 21728785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6594 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAATCCAAA 6653

 21728786 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 21728845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6654 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 6713

 21728846 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 21728905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6714 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 6773

 21728906 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 21728965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6774 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 6833

 21728966 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 21729025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6834 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 6893

 21729026 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 21729085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6894 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 6953

 21729086 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 21729145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6954 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 7013

 21729146 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 21729205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7014 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 7073

 21729206 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 21729265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7074 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 7133

 21729266 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 21729325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7134 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 7193

 21729326 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 21729385
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7194 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCTATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 7253

 21729386 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 21729445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7254 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 7313

 21729446 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 21729505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7314 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 7373

 21729506 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 21729565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7374 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 7433

 21729566 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 21729625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7434 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 7493

 21729626 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 21729685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7494 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 7553

 21729686 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 21729745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7554 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 7613

 21729746 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 21729805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7614 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 7673

 21729806 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 21729865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7674 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 7733

 21729866 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 21729925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7734 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 7793

 21729926 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACACATAATGACAT 21729985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7794 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACACATAATGACAT 7853

 21729986 TATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAAACAAGTCTTTATCACAGCTAGAC 21730045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7854 TATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAAACAAGTCTTTATCACAGCTAGAC 7913

 21730046 ATTAACTACATTCTTTCTGAATCTCAGCTCCTTTAGGTGGTTTTATCAATGTATCTGTTC 21730105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7914 ATTAACTACATTCTTTCTGAATCTCAGCTCCTTTAGGTGGTTTTATCAATGTATCTGTTC 7973

 21730106 CCATAGTGCATGGATATCCAATAAACTGTCTTTTAAATCCATGAATTCTTCCATAAACTA 21730165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7974 CCATAGTGCATGGATATCCAATAAACTGTCTTTTAAATCCATGAATTCTTCCATAAACTA 8033

 21730166 TTGCTGTCTGATGAAATTCTAATATGCATTTAATTAACAACTCTAGGAATGCAACATGAA 21730225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8034 TTGCTGTCTGATGAAATTCTAATATGCATTTAATTAACAACTCTAGGAATGCAACATGAA 8093

 21730226 AACTAAATACCAAGCTCTAT 21730245
          ||||||||||||||||||||
     8094 AACTAAATACCAAGCTCTAT 8113

Alignment time is 7.24669 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3809] =>      3809 nucs 'mol-32-3025-183636_3809'

Score:        3596
Aligned:      3803        nucs
Identic:      3776 ( 99%) nucs =>      2868 (100%)       908 ( 98%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21719912,21722790] EXCISED REGION [21722791,21723705]
 second seq =>  [       1,    2879] EXCISED REGION [    2892,    3809]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        12 nucs [2880,2891]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        26 nucs [2880,2905] to [2892,2917]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         6 nucs [2880,2885] to [2886,2891]

 21719912 TCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTTAGACAGTAGAAGTTCGTGAAGTGAC 21719971
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGCCTTAGACAGTAGAAGTTCGTGAAGTGAC 60

 21719972 CTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACGCAACAACAAATAACCCTAAAAGGA 21720031
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACGCAACAACAAATAACCCTAAAAGGA 120

 21720032 AACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATTGGAGTTAGTCCCTTCAAATTCAT 21720091
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATTGGAGTTAGTCCCTTCAAATTCAT 180

 21720092 GGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTGCTTTTGAACGGACATTAATCCCA 21720151
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      181 GGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTGCTTTTGAAAGGACATTAATCCCA 240

 21720152 AAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAGCAGGAATGCCTGCTGAGAGGGGA 21720211
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAGCAGGAATGCCTGCTGAGAGGGGA 300

 21720212 GAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGCCCTGCATTTTCCTGAATGATTCT 21720271
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGCCCTGCATTTTCCTGAATGATTCT 360

 21720272 GATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGCTTTCCAAGTGCTAAATATTTGCT 21720331
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGCTTTCCAAGTGCTAAATATTTGCT 420

 21720332 TCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCCTATTTATACAGTTTAATGTCCTC 21720391
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
      421 TCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCCTATTTGTACAGTTTAATGTCCTC 480

 21720392 CTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAATTTTGTAAATTTATGTTGTTCTTC 21720451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAATTTTGTAAATTTATGTTGTTCTTC 540

 21720452 AGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCCCTGCCACCCACCCCCCAACCCCA 21720511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      541 AGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCCCTGCCACCCACCCCCCAACTCCA 600

 21720512 TCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAACTTCTACAGAATATTCTAAGTGC 21720571
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAACTTCTACAGAATATTCTAAGTGC 660

 21720572 TTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCCAAATTCCAGTGTTTTCATGTCCA 21720631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCCAAATTCCAGTGTTTTCATGTCCA 720

 21720632 AAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAAAATAAGAATAACAGCTAAATTCC 21720691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAAAATAAGAATAACAGCTAAATTCC 780

 21720692 AGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAGTAAATACTAAACTATAGTAACTA 21720751
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAGTAAATACTAAACTATAGTAACTA 840

 21720752 TTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATGATATGAAATAATGGAATATATTT 21720811
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATGATATGAAATAATGGAATATATTT 900

 21720812 TATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAATCATTAATTGGTATATCTCTTATG 21720871
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAATCATTAATTGGTATATCTCTTATG 960

 21720872 ATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGTTAAGCTTTTGAAGGGGAGTATT 21720931
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGTTAAGCTTTTGAAGGGGAGTATT 1020

 21720932 CATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTAAGAAAGAGTTTTGAAAATTATA 21720991
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTAAGAAAGAGTTTTGAAAATTATA 1080

 21720992 GGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGACATTGTTGCTTTGAAAGCTAATC 21721051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGACATTGTTGCTTTGAAAGCTAATC 1140

 21721052 CAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCATTAATACTATTAGGTACCT 21721111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCATTAATACTATTAGGTACCT 1200

 21721112 GTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAACAATATTGAAAAGAGAGAGA 21721171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAACAATATTGAAAAGAGAGAGA 1260

 21721172 AAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGGGAGGGAGACTAGCAGGGAG 21721231
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGAACAAAAAGGAAGAGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGGGAGGGAGACTAGCAGGGAG 1320

 21721232 GGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACTTACTTGATTGACCTCGATA 21721291
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACTTACTTGATTGACCTCGATA 1380

 21721292 GAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATACCCCCAAGTCATCCTATATG 21721351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATACCCCCAAGTCATCCTATATG 1440

 21721352 GAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAAGTATATGTCTTTTAAACTG 21721411
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAAGTATATGTCTTTTAAACTG 1500

 21721412 GAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATATTGTATGAGAGAGACTCGC 21721471
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATATTGTATGAGAGAGACTCGC 1560

 21721472 TCAGTGCCTAATACGTGGTAAGGACTCAAAATATGATAGCTGACTTGGAATCTGGGACGT 21721531
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TCAGTGCCTAATACGTGGTAAGTACTCAAAATATGATAGCTGACTTGGAATCTGGGACGT 1620

 21721532 AAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTCACACTAATTCACTTCCTCC 21721591
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTCACACTAATTCACTTCCTCC 1680

 21721592 CTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCT 21721651
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCT 1740

 21721652 CATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCGTTCTTTCTCACAAACATTCA 21721711
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1741 CATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCATTCTTTCTCACAAACATTCA 1800

 21721712 TTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACTGGGTAAATTTCAATAAAAGTAA 21721771
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACTGGGTAAATTTCAATAAAAGTAA 1860

 21721772 ATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGAGAATAAGCAAAACACT 21721831
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGAGAATAAGCAAAACACT 1920

 21721832 TTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATCATTTTCTCTTATTTAA 21721891
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATCATTTTCTCTTATTTAA 1980

 21721892 TAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGCAATTTTCTAATATTAT 21721951
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGCAATTTTCTAATATTAT 2040

 21721952 CACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTGTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAG 21722011
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTGTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAG 2100

 21722012 AGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATGTGATGTTTAACTAATAATATCGG 21722071
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGCGAGGAGCCACATGTGATGTTTAACTAATAATATCGG 2160

 21722072 ATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGCTCTACTAATCACATGGACTAG 21722131
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2161 ATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGTTCTACTAATCACATGGACTAG 2220

 21722132 AATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTGCTATGCTTTCACCAAC 21722191
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTGCTATGCTTTCACCAAC 2280

 21722192 TACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAATCTTGATAACAACTGTT 21722251
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAATCTTGATAACAACTGTT 2340

 21722252 TATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTT 21722311
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTT 2400

 21722312 ATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAGTTCAGCATAGAAATAT 21722371
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATTTTTTTT-CACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAGTTCAGCATAGAAATAT 2459

 21722372 CCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACAGTCCCTTACATCGCAATGT 21722431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2460 CCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACAGTCCCTTACGTCGCAATGT 2519

 21722432 TACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGATGCTTTGGATTTTATT 21722491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGATGCTTTGGATTTTATT 2579

 21722492 TCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCTACATTTACATTTAGCT 21722551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 TCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCTACATTTACATTTAGCT 2639

 21722552 AGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGATCTGAGTGTAACAGAA 21722611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 AGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGATCTGAGTGTAACAGAA 2699

 21722612 TTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATTATACTGTTGAAAGACA 21722671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 TTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATTATACTGTTGAAAGACA 2759

 21722672 TCT-AAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAACCTTCTGACAAAAAAAA 21722730
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 TCTTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAACCTTCTGACAAAAAAAA 2819

 21722731 TTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTGAATATATTCCATCAGT 21722790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 TTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTGAATATATTCCATCAGT 2879

EXCISED REGION

 21722791 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGAT 21722850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGAT 2951

 21722851 TGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTG 21722910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 TGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTG 3011

 21722911 GTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGC 21722970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 GTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGC 3071

 21722971 CAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAA 21723030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 CAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAA 3131

 21723031 ATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAA 21723090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 ATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAA 3191

 21723091 CCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCAT 21723150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 CCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCAT 3251

 21723151 TTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAAA----AAACAAA 21723206
          |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||    |||||||
     3252 TTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATTAAAAAAAACGAAAAAAAAAAACCAAACAAA 3311

 21723207 CAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATT 21723266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 CAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATT 3371

 21723267 AGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAG-AGGCAA 21723325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
     3372 AGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAA 3431

 21723326 AGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTA---AAGAAATG 21723382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||
     3432 AGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAAC-----GTGAAGAAATG 3486

 21723383 GGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCC 21723442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 GGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCC 3546

 21723443 AGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGC 21723502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 AGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGC 3606

 21723503 CAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGA 21723562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     3607 CAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGGACCAATTTTGGAGGA 3666

 21723563 AAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTT 21723622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 AAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTT 3726

 21723623 GGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAAT 21723682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 GGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAAT 3786

 21723683 TGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 21723705
          |||||||||||||||||||||||
     3787 TGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 3809

Alignment time is 3.7142 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4605] =>      4605 nucs 'mol-32-3030-103139_4605'

Score:        4423
Aligned:      4586        nucs
Identic:      4563 ( 99%) nucs =>       839 ( 98%)      3724 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21722860,21723705] EXCISED REGION [21725967,21729697]
 second seq =>  [       1,     849] EXCISED REGION [     874,    4605]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2261 nucs [21723706,21725966]
 second seq =>        24 nucs [850,873]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723705,21723705] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [850,850] to [874,874]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723706,21723706] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [850,850] to [873,873]

 21722860 ACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAA 21722919
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAA 60

 21722920 AAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAA 21722979
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAA 120

 21722980 TGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTG 21723039
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTG 180

 21723040 TTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAA 21723099
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAA 240

 21723100 ACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAA 21723159
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAA 300

 21723160 GAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAAAAA----ACAAACAAAAAAGG 21723215
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||    ||||||||||||||
      301 GAATCCAGACTAAGAATGATTAAAAAAAACGAAAAAAAAAAACCAAACAAACAAAAAAGG 360

 21723216 AAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATAT 21723275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATAT 420

 21723276 CAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGA-GGCAAAGATTTCAT 21723334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
      421 CAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCAT 480

 21723335 TGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTA---AAGAAATGGGAAAACAA 21723391
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||||||||
      481 TGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAAC-----GTGAAGAAATGGGAAAACAA 535

 21723392 ATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAA 21723451
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 ATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAA 595

 21723452 TATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAG 21723511
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 TATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAG 655

 21723512 AAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGT 21723571
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      656 AAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGGACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGT 715

 21723572 AATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGC 21723631
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 AATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGC 775

 21723632 ATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTT 21723691
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 ATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTT 835

 21723692 GGTTTGTTTTTAGT 21723705
          ||||||||||||||
      836 GGTTTGTTTTTAGT 849

EXCISED REGION

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      874 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAC 933

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      934 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 993

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      994 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 1053

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1054 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 1113

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1114 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 1173

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1174 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 1233

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1234 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 1293

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1294 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 1353

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1354 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 1413

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1414 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 1473

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1474 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 1533

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1534 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 1593

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1594 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 1653

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1654 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 1713

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1714 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 1773

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1774 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 1833

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1834 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 1893

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1894 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 1953

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1954 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 2013

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2014 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 2073

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2074 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 2133

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2134 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 2193

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2194 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 2253

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2254 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 2313

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2314 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 2373

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 2433

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 2493

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 2553

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 2613

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 2673

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 2733

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 2793

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 2853

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 2913

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 2973

 21728066 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 21728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 3033

 21728126 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 21728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 3093

 21728186 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 21728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 3153

 21728246 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 21728305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATATGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 3213

 21728306 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 21728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3214 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAATTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 3273

 21728366 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 21728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 3333

 21728426 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 21728485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 3393

 21728486 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 21728545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 3453

 21728546 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 21728605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 3513

 21728606 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 21728665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 3573

 21728666 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 21728725
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGAGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 3633

 21728726 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAA 21728785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3634 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAATCCAAA 3693

 21728786 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 21728845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 3753

 21728846 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 21728905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 3813

 21728906 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 21728965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 3873

 21728966 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 21729025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 3933

 21729026 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 21729085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 3993

 21729086 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 21729145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 4053

 21729146 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 21729205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4054 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 4113

 21729206 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 21729265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4114 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 4173

 21729266 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 21729325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4174 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 4233

 21729326 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 21729385
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCTATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 4293

 21729386 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 21729445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4294 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 4353

 21729446 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 21729505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4354 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 4413

 21729506 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 21729565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 4473

 21729566 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 21729625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4474 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 4533

 21729626 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 21729685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4534 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 4593

 21729686 AAAAGCATAAGT 21729697
          ||||||||||||
     4594 AAAAGCATAAGT 4605

Alignment time is 4.68767 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,   10483] =>     10483 nucs 'mol-32-303b-041503_10483'

Score:       10278
Aligned:     10481        nucs
Identic:     10456 (100%) nucs =>      2058 (100%)      8398 (100%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21715417,21717479] EXCISED REGION [21717487,21725896]
 second seq =>  [       1,    2067] EXCISED REGION [    2075,   10481]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         7 nucs [21717480,21717486]
 second seq =>         7 nucs [2068,2074]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         5 nucs [21722791,21722795]
 second seq =>         1 nucs [7378,7378]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         2 nucs [2067,2068] to [2074,2075]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [21717480,21717481] to [21717485,21717486]
 second seq =>         0 nucs

 21715417 AACCTGGCTTACTACATCTGTCTCTCAGGGAAATTTTACCCATGATATCTAGGCTTTGGT 21715476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AACCTGGCTTACTACATCTGTCTCTCAGGGAAATTTTACCCATGATATCTAGGCTTTGGT 60

 21715477 CATCTCACTCTTTAAAAAGAAAAAATAATGCTAAAATCTTGTTACATGGTCTTGTTTACT 21715536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATCTCACTCTTTAAAAAGAAAAAATAATGCTAAAATCTTGTTACATGGTCTTGTTTACT 120

 21715537 CATGATCTGTACCTCTTAACTGAGACTTGCCTGCACGAACTTCTCTGTGCCAGTGGGGCT 21715596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATGATCTGTACCTCTTAACTGAGACTTGCCTGCACGAACTTCTCTGTGCCAGTGGGGCT 180

 21715597 GGGCAAAAGGGAGAGACTGTTTAGAAAAGGAAAGAATGGTCAACATTGTCTCAGGCTGCA 21715656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGGCAAAAGGGAGAGACTGTTTAGAAAAGGAAAGAATGGTCAACATTGTCTCAGGCTGCA 240

 21715657 GAAGGATCAAGTAAGATGGTAATGTCTGATAGATTTAATGTCATGGAGATTTTTGGTGAC 21715716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAAGGATCAAGTAAGATGGTAATGTCTGATAGATTTAATGTCATGGAGATTTTTGGTGAC 300

 21715717 CTTTACGAGCCATTTAAGTGCAGTCATTTATGTGGGTCGCATTACAGAGAAGCCACTTTT 21715776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTACGAGCCATTTAAGTGCAGTCATTTATGTGGGTCGCATTACAGAGAAGCCACTTTT 360

 21715777 GAGGAGGGTGAGGAATGAGTGAGGGTATCATAATGGAGACCAATGGAGACAATTATTTTC 21715836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGGAGGGTGAGGAATGAGTGAGGGTATCATAATGGAGACCAATGGAGACAATTATTTTC 420

 21715837 TCCACTTTGACTGGGAAGGAAAAGTAGAGTGGGACACTATACATATGGGTAAATAAGCCT 21715896
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCCACTTTGACTGGGAAGGAAAAGTAGAGTGGGACACTATACATATGGGTAAATAAGCCT 480

 21715897 GATAGGCATAGAAAGGAACTGATTCAATCCAGAATATCTAATAAAACTCACTTTTGGAAT 21715956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATAGGCATAGAAAGGAACTGATTCAATCCAGAATATCTAATAAAACTCACTTTTGGAAT 540

 21715957 GTCACATTTCAACTAGCAATTTAGACCCCAAAATGTGAATCATAAAATGTAAATTATAAC 21716016
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GTCACATTTCAACTAGCAATTTAGACCCCAAAATGTGAATCATAAAATGTAAATTATAAC 600

 21716017 CCCTGAAAGCATAGTAAGCAATGTAATTTGTGTTATCTAAGTTACATTGCACCCAACTTG 21716076
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCCTGAAAGCATAGTAAGCAATGTAATTTGTGTTATCTAAGTTACATTGCACCCAACTTG 660

 21716077 CTCTTGAAACCTACATCAAAGTATTACTAAGAAAACCAATCATCTATTCCTGGTGCAGGA 21716136
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CTCTTGAAACCTACATCAAAGTATTACTAAGAAAACCAATCATCTATTCCTGGTGCAGGA 720

 21716137 TGCAGCTCAAACACGAGTTACTCTATTCAGTATTTCCTGGACATCTCTGTAGAAAGATCA 21716196
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TGCAGCTCAAACACGAGTTACTCTATTCAGTATTTCCTGGACATCTCTGTAGAAAGATCA 780

 21716197 CTCCCTGGTGCCCTGCTCTGGCCTGCACAGGCTTCCTTCTAGCCAACATTACTAGACTTA 21716256
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      781 CTCCCTGGTGCCCTGCTCTGGCCTGCACAGGCTTCCTTTTAGCCAACATTACTAGACTTA 840

 21716257 CTTGACTTTGTATCTGTCTCCCTATATGAGGAAGCTGTTTGTTAAGAAGAATATCTGTTC 21716316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTGACTTTGTATCTGTCTCCCTATATGAGGAAGCTGTTTGTTAAGAAGAATATCTGTTC 900

 21716317 CATTCATTCTTGACTTCTATATATTAGGAGGTTCCTGGTATCTATTAAGTGACTTGTGTA 21716376
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATTCATTCTTGACTTCTATATATTAGGAGGTTCCTGGTATCTATTAAGTGACTTGTGTA 960

 21716377 TTGTTTTAGAAATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGCATGGATGGA 21716436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGTTTTAGAAATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGCATGGATGGA 1020

 21716437 TGGATGGA----AAAATGAGTGAGCAAACAAATGAATACATGAAGCTGAATCATCACAGC 21716492
          ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGATGGATGGAAAAATGAGTGAGCAAACAAATGAATACATGAAGCTGAATCATCACAGC 1080

 21716493 CTGCTGAGATATTGTACCCATTTTTTTATTGTGTCCAAATTAACAATGGTGTACATTTAC 21716552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CTGCTGAGATATTGTACCCATTTTTTTATTGTGTCCAAATTAACAATGGTGTACATTTAC 1140

 21716553 AAACCAGCAGCTTCTTTGAAGAACTAGAAAAGAAAAGCGGATTAAACTATCAGAGTTTAT 21716612
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAACCAGCAGCTTCTTTGAAGAACTAGATAAGAAAAGCGGATTAAACTATCAGAGTTTAT 1200

 21716613 TGGAGTGTACTGCTAAAAGGTGAGAAACATTTTATCAAAGATTTTTAGTGCAATTAAGCT 21716672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGGAGTGTACTGCTAAAAGGTGAGAAACATTTTATCAAAGATTTTTAGTGCAATTAAGCT 1260

 21716673 CCCATTATTGTTTTCTTCAGAAAAATAAATGGCCCAAACACACTAAGTCCTAGGCTTTTT 21716732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1261 CCCATTATTGTTTTCTTCAGAAAAATAAATGGCCCAAACACACTAAGTCCTAAGCTTTTT 1320

 21716733 ATTTTATTAACATCTTTTCCTCTATCTTTCTTAAACATGGATTTCATTTTTAGGTGTAAA 21716792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTTTATTAACATCTTTTCCTCTATCTTTCTTAAACATGGATTTCATTTTTAGGTGTAAA 1380

 21716793 TTTATGCTATCTCATAAACAACTCCCCTTGATTCCCGTGGCATAAAAGCAATATTATTTC 21716852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTTATGCTATCTCATAAACAACTCCCCTTGATTCCCGTGGCATAAAAGCAATATTATTTC 1440

 21716853 TGCTTCCATACACTGGGTACTGTACTGGGTCCTCTGTAGGATAGCTCCTTTGATCTTTTA 21716912
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TACTTCCATACACTGGGTACTGTACTGGGTCCTCTGTAGGATAGCTCCTTTGATCTTTTA 1500

 21716913 ATAGTCTAGTGAATAAAGAAATGGAGCAGTAGTAAGGTTAAAACAATTGCTCAAGTTCAT 21716972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATAGTCTAGTGAATAAAGAAATGGAGCAGTAGTAAGGTTAAAACAATTGCTCAAGTTCAT 1560

 21716973 GCAGTTAGTAAGTGGTAGAGCCAGGATTTGTCCAAAAACATTCTGCTTCCAGAGTGTAAG 21717032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCAGTTAGTAAGTGGTAGAGCCAGGATTTGTCCAAAAACATTCTGCTTCCAGAGTGTAAG 1620

 21717033 TTCTTATATCTACATTTTGTTCAGAGATTGCCCTTTTTTGATGAAAGGTGGTAGAGAAAA 21717092
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCTTATATCTACATTTTATTCAGAGATTGCCCTTTTTTGATGAAAGGTGGTAGAGAAAA 1680

 21717093 AATGTATAAACAAAAAGCTAGTTTCAATTAAACTTTGCCAGAGCAAGTCAAATCAGTATA 21717152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATGTATAAACAAAAAGCTAGTTTCAATTAAACTTTGCCAGAGCAAGTCAAATCAGTATA 1740

 21717153 TACTAAGAGGCGATCATTTGTAAGGCAAAGGATTATTCAAAAAGCAATTTCATAAGCATC 21717212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TACTAAGAGGCGATCATTTGTAAGGCAAAGGATTATTCAAAAAGCAATTTCATAAGCATC 1800

 21717213 TTGCCTCCACAAGTTTATCATGTTTATAATCCAGTATATTGTAGATTATCCATATGTTGA 21717272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTGCCTCCACAAGTTTATCATGTTTATAATCCAGTATATTGTAGATTATCCATATGTTGA 1860

 21717273 GTCTACCAGATAACCATGTGTTTTTCCATAGGTATTAGATTTGTATTCTTTTTGTATCAA 21717332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GTCTACCAGATAACCATGTGTTTTTCCATAGGTATTAGATTTGTATTCTTTTTGTATCAA 1920

 21717333 CTCATTATTTATTCAATTGTCCCTTTTATTTTGCCTGCATAGTTTAGAAGAACAAAATAG 21717392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTCATTATTTATTCAATTGTCCCTTTTATTTTGCCTGCATAGTTTAGAAGAACAAAATAG 1980

 21717393 AAACTAAGTTTGCATTCAACGTAACTAATTCTACTTAATGATGATAGCTCTAAGAACATT 21717452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAACTAAGTTTGCATTCAACGTAACTAATTCTACTTAATGATGATAGCTCTAAGAACATT 2040

 21717453 CACTTGATTGTGAATGTTTTCACTCAA 21717479
          |||||||||||||||||||||||||||
     2041 CACTTGATTGTGAATGTTTTCACTCAA 2067

EXCISED REGION

 21717487 TTGTGATTTTTTCCACATTTTAATCTAATGTTATTTCATAAAGACCATGGCACAAAATTC 21717546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2075 TTGTGATTTTTTCCACATTTTAATCTAATGTTATTTCATAAAGACCATGGCACAAAATTC 2134

 21717547 CTAGGAAACCTAACTGTTGTTGGCATGTCACTGTCACCAGCATCAAATTAAATAAAATTT 21717606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2135 CTAGGAAACCTAACTGTTGTTGGCATGTCACTGTCACCAGCATCAAATTAAATAAAATTT 2194

 21717607 ATTAAGAACAGTGAATACCACACTGTCACTGTTTTAAGGGCCTATATTTAGCACATCTCT 21717666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2195 ATTAAGAACAGTGAATACCACACTGTCACTGTTTTAAGGGCCTATATTTAGCACATCTCT 2254

 21717667 AGCATTTGCAGTACCCATTAGCTTCCAAGGTTTAGGAACTGTGAGTTCTTGGATTCCATT 21717726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2255 AGCATTTGCAGTACCCATTAGCTTCCAAGGTTTAGGAACTGTGAGTTCTTGGATTCCATT 2314

 21717727 GCTTTGGTGAACATTCTTACAAACTCTATAATACCAAAAAGATACTCTGATTTCAATTTC 21717786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2315 GCTTTGGTGAACATTCTTACAAACTCTATAATACCAAAAAGATACTCTGATTTCAATTTC 2374

 21717787 CTTAAGAACATTCCCTGCGGAGCTGACTTGAGCTCTGTTTAGTCTCGGCCTCAATGTGAT 21717846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2375 CTTAAGAACATTCCCTGCGGAGCTGACTTGAGCTCTGTTTAGTCTCGGCCTCAATGTGAT 2434

 21717847 TGTTTCTTCTGGCAGGTTGTGCTTAAAACAAACCTTACTTTATATTTTCTTTTAATTCTG 21717906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2435 TGTTTCTTCTGGCAGGTTGTGCTTAAAACAAACCTTACTTTACATTTTCTTTTAATTCTG 2494

 21717907 AAACATTTAGTCTTTGGAGAAGATGTAAAATCAGTTCCTAATGGAATTGTAGTAATTGTG 21717966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2495 AAACATTTAGTCTTTGGAGAAGATGTAAAATCAGTTCCTAATGGAATTGTAGTAATTGTG 2554

 21717967 GAATCCCAAAAAGGATTTACTTTAAATGGAAGAGAAATAAAATGCCTATTAAATGATTGT 21718026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2555 GAATCCCAAAAAGGATTTACTTTAAATGGAAGAGAAATAAAATGCCTATTAAATGATTGT 2614

 21718027 AAGCAAGAAGATCCACACAACCATATTTTATTTTTATAAGGAGTCCTGTCCCTTTGAGCC 21718086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2615 AAGCAAGAAGATCCACACAACCATATTTTATTTTTATAAGGAGTCCTGTCCCTTTGAGCC 2674

 21718087 TATATTATGGTCTAGGTTCTTTGCTGGATAACTTTACATACATTATTTGTATAAACAATG 21718146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2675 TATATTATGGTCTAGGTTCTTTGCTGGATAACTTTACATACATTATTTGTATAAACAATG 2734

 21718147 AAGATATCCTTATTTTCATTTTACAGGTGAAGAAAAGGAGGTTTAGCAAGATCATCTTAC 21718206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2735 AAGATATCCTTATTTTCATTTTACAGGTGAAGAAAAGGAGGTTTAGCAAGATCATCTTAC 2794

 21718207 TCAAGATAAACCACTCGCTAAATGGTAGAGCTAGGTAGAATTAGAAACCAGATAGGGATG 21718266
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2795 TCAAGATAAACCACGCGCTAAATGGTAGAGCTAGGTAGAATTAGAAACCAGATAGGGATG 2854

 21718267 ATTTCAAAGCCCATATGTATTTTTTTTTTTATTGTATTATACCTCTCTCCTTTTCAAATA 21718326
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2855 ATTTCAAAGCCCATATGTA-TTTTTTTTTTATTGTATTATACCTCTCTCCTTTTCAAATA 2913

 21718327 TCTACCAAGTCCTGATTTCCACCAAATTGAAAGAACAACTGATAGGAGCAGAAATGTCCT 21718386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 TCTACCAAGTCCTGATTTCCACCAAATTGAAAGAACAACTGATAGGAGCAGAAATGTCCT 2973

 21718387 CCAAGGAAAGGACCTGCATTTTCACATTCAAATGGCCAGAAGGCAGCAGATATAGGATTT 21718446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 CCAAGGAAAGGACCTGCATTTTCACATTCAAATGGCCAGAAGGCAGCAGATATAGGATTT 3033

 21718447 ACAAATCCAGAAAAAAAGAGAAACTGCTTATAGCCCCAGGTAGAAGAAAGTCCTCATATC 21718506
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 ACAAATCCAGAAAAAAAGAGAAACTGCTTATAGCCCCAGGTAGAAGAAAGTCCTCATATC 3093

 21718507 AGGGTTAAGGAGCTATCACCAATGCAACACATAAGGAAAGGGACATCTATATTATGATAA 21718566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 AGGGTTAAGGAGCTATCACCAATGCAACACATAAGGAAAGGGACATCTATATTATGATAA 3153

 21718567 AAGGAAAGACATCGTAAAATAGTGCAGTTAAACACAAGGATTAAAGCTAAACTAACATGA 21718626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 AAGGAAAGACATCGTAAAATAGTGCAGTTAAACACAAGGATTAAAGCTAAACTAACATGA 3213

 21718627 AAGGGACGCAAATAATCAGTGGGACTTGTCATTGCTGGGGGCCATGTCAGTGGAGATAAT 21718686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 AAGGGACGCAAATAATCAGTGGGACTTGTCATTGCTGGGGGCCATGTCAGTGGAGATAAT 3273

 21718687 GAGCATTAAAGGCTAAATCTGAGGCAGCTTTTGGGAGGGTCCCTGGGCCCTGAGAATCCC 21718746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3274 GAGCATTAAAGGCTAAATCTGAGGCAGCTTTTGGGAGGGTCCCTGGGCCCTGAGAATCCC 3333

 21718747 AGCACTGACCAGAAGTCCAAGATCAGAGGCCAAGGTTAATGAGAAAACACAGGTTTTTCT 21718806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 AGCACTGACCAGAAGTCCAAGATCAGAGGCCAAGGTTAATGAGAAAACACAGGTTTTTCT 3393

 21718807 GGTTGACATCATCATGTTCTCACCCTCTTGTGAATTGCAGCCTAAATATACAAATCTGGA 21718866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 GGTTGACATCATCATGTTCTCACCCTCTTGTGAATTGCAGCCTAAATATACAAATCTGGA 3453

 21718867 GCTTGGCATGAGGCACATATACATCTTGACTTGTACAACTAATTCCCATCCATTTTGCTC 21718926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 GCTTGGCATGAGGCACATATACATCTTGACTTGTACAACTAATTCCCATCCATTTTGCTC 3513

 21718927 AACTCAGGCTGAGCCAGAATTAACTAACTAATGCAGAATGCCACAGAAATTGCATCTGAT 21718986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 AACTCAGGCTGAGCCAGAATTAACTAACTAATGCAGAATGCCACAGAAATTGCATCTGAT 3573

 21718987 TTTTCTTTGGCTGCAGATTCACTAGAAGCTCATGTTCTTACTATTCCTTAGAATTTGGGA 21719046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 TTTTCTTTGGCTGCAGATTCACTAGAAGCTCATGTTCTTACTATTCCTTAGAATTTGGGA 3633

 21719047 GTCTAGAAAAGCACAGGCCTAAATAAATTTCTAAGAGAGAAATTTAATTTAACAATTAGA 21719106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 GTCTAGAAAAGCACAGGCCTAAATAAATTTCTAAGAGAGAAATTTAATTTAACAATTAGA 3693

 21719107 GTAAAATATTCTGGTAATGAAATTGTATTCTGCTAGTGTGTGGGGGATCATATAGACTGA 21719166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 GTAAAATATTCTGGTAATGAAATTGTATTCTGCTAGTGTGTGGGGGATCATATAGACTGA 3753

 21719167 ATTATTTAAAGCAGTCCTAATTTCAAATAATAATAACCAGTAAAATAATAATAATAACCA 21719226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 ATTATTTAAAGCAGTCCTAATTTCAAATAATAATAACCAGTAAAATAATAATAATAACCA 3813

 21719227 CTCTAAATTTTGAGTAGTTCATATATACATAGGCTGTTAATTTTCATAGCAATTCTGTTA 21719286
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 CTCTAAATTTTGAGTAGTTTATATATACATAGGCTGTTAATTTTCATAGCAATTCTGTTA 3873

 21719287 GTCCTTAATAATTTAGTTTTTTAGTTGTGGAAACTGGGGAATCTATGAAATTAAGTACTC 21719346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 GTCCTTAATAATTTAGTTTTTTAGTTGTGGAAACTGGGGAATCTATGAAATTAAGTACTC 3933

 21719347 TGTAGCAGCTAATTCAACCTATGCGTACATAGGTTGATTGATTTTAATGCTCGTTCTTTG 21719406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3934 TGTAGCAGCTAATTCAACCTATGCGTACATAGGTTGATTGATTTTAATGCTCGTTCTTTG 3993

 21719407 TAAAAATCATATTATCTGTATTGTCCCCATAAGCCAAGTATAAGAATCCATTATACCACT 21719466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 TAAAAATCATATTATCTGTATTGTCCCCATAAGCCAAGTATAAGAATCCATTATACCACT 4053

 21719467 CCCCTTCTAGTACTCAGGGCATATATTATTCATCAATTATATTTCCAGTTGGCCTCAGAA 21719526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4054 CCCCTTCTAGTACTCAGGGCATATATTATTCATCAATTATATTTCCAGTTGGCCTCAGAA 4113

 21719527 TCCTCCTTAACACAACATACCAGTATCTAATCCAGTTAATCACAGTTTGCTATCCCCGAC 21719586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4114 TCCTCCTTAACACAACATACCAGTATCTAATCCAGTTAATCACAGTTTGCTATCCCCGAC 4173

 21719587 ACAAACCCTCAACATTAGGGCATCCAAACCTCTCTGTAAGTCTTGGAAGACAGACAATAG 21719646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4174 ACAAACCCTCAACATTAGGGCATCCAAACCTCTCTGTAAGTCTTGGAAGACAGACAATAG 4233

 21719647 AATAATGCTGACAGTTTCCTTATACCTCTGGCAAAGTGTCCAATCATCTTTTGGTTAGAA 21719706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 AATAATGCTGACAGTTTCCTTATACCTCTGGCAAAGTGTCCAATCATCTTTTGGTTAGAA 4293

 21719707 TCCAGTGAGAGGACTAAGAAAGGCATCTGATTTGTCTGTCAAAGCTTGCCCAGGTTATGA 21719766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4294 TCCAGTGAGAGGACTAAGAAAGGCATCTGATTTGTCTGTCAAAGCTTGCCCAGGTTATGA 4353

 21719767 AGATAACTGGAGACCTACATTTGTAACTCAGTAAATGGGAGACTTTCATTCCTGGACATT 21719826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4354 AGATAACTGGAGACCTACATTTGTAACTCAGTAAATGGGAGACTTTCATTCCTGGACATT 4413

 21719827 CTGCAACAGCCAGTGTTGACCTGGTAAATCTACCTGAGATTCGCTCATGATTCCAATGTG 21719886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 CTGCAACAGCCAGTGTTGACCTGGTAAATCTACCTGAGATTCGCTCATGATTCCAATGTG 4473

 21719887 ACTGAATGCCTTGAGAATATACAACTCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTT 21719946
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4474 ACTGAATGCCTTGAGAATATACAACTCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTT 4533

 21719947 AGACAGTAGAAGTTCGTGAAGTGACCTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAAC 21720006
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4534 AGACAGTAGAAGTTCGTGAAGTGACCTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAAC 4593

 21720007 GCAACAACAAATAACCCTAAAAGGAAACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAA 21720066
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4594 ACAACAACAAATAACCCTAAAAGGAAACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAA 4653

 21720067 TTGGAGTTAGTCCCTTCAAATTCATGGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTG 21720126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4654 TTGGAGTTAGTCCCTTCAAATTCATGGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTG 4713

 21720127 TGCTTTTGAACGGACATTAATCCCAAAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTG 21720186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4714 TGCTTTTGAACGGACATTAATCCCAAAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTG 4773

 21720187 AGCAGGAATGCCTGCTGAGAGGGGAGAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTG 21720246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4774 AGCAGGAATGCCTGCTGAGAGGGGAGAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTG 4833

 21720247 GCCCTGCATTTTCCTGAATGATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTAT 21720306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4834 GCCCTGCATTTTCCTGAATGATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTAT 4893

 21720307 GCTTTCCAAGTGCTAAATATTTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTG 21720366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4894 GCTTTCCAAGTGCTAAATATTTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTG 4953

 21720367 CCTATTTATACAGTTTAATGTCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAA 21720426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4954 CCTATTTATACAGTTTAATGTCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAA 5013

 21720427 ATTTTGTAAATTTATGTTGTTCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGG 21720486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5014 ATTTTGTAAATTTATGTTGTTCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGG 5073

 21720487 CCCTGCCACCCACCCCCCAACCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCA 21720546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5074 CCCTGCCACCCACCCCCCAACCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCA 5133

 21720547 AACTTCTACAGAATATTCTAAGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCAT 21720606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5134 AACTTCTACAGAATATTCTAAGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCAT 5193

 21720607 CCAAATTCCAGTGTTTTCATGTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTAT 21720666
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5194 CCAAATTCCAGTGTTTTCATGTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTAT 5253

 21720667 AAAATAAGAATAACAGCTAAATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAG 21720726
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5254 AAAATAAGAATAACAGCTAAATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAG 5313

 21720727 AGTAAATACTAAACTATAGTAACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAA 21720786
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5314 AGTAAATACTAAACTATAGTAACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAA 5373

 21720787 TGATATGAAATAATGGAATATATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAA 21720846
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5374 TGATATGAAATAATGGAATATATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAA 5433

 21720847 ATCATTAATTGGTATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTG 21720906
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5434 ATCATTAATTGGTATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTG 5493

 21720907 AGTTAAGCTTTTGAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGT 21720966
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5494 AGTTAAGCTTTTGAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGT 5553

 21720967 CTAAGAAAGAGTTTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAA 21721026
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5554 CTAAGAAAGAGTTTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAA 5613

 21721027 GACATTGTTGCTTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTA 21721086
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5614 GACATTGTTGCTTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTA 5673

 21721087 ATGTCATTAATACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATA 21721146
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5674 ATGTCATTAATACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATA 5733

 21721147 GGAAACAATATTGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTT 21721206
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5734 GGAAACAATATTGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTT 5793

 21721207 TGGAGGGAGGGAGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAA 21721266
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5794 TGGAGGGAGGGAGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAA 5853

 21721267 GCGACTTACTTGATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAA 21721326
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5854 GCGACTTACTTGATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAA 5913

 21721327 AAATACCCCCAAGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCC 21721386
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5914 AAATACCCCCAAGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCC 5973

 21721387 ATAGAAGTATATGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGAC 21721446
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5974 ATAGAAGTATATGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGAC 6033

 21721447 AAAATATTGTATGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACGTGGTAAGGACTCAAAATATG 21721506
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     6034 AAAATATTGTATGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACATGGTAAGGACTCAAAATATG 6093

 21721507 ATAGCTGACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAAT 21721566
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6094 ATAGCTGACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAAT 6153

 21721567 AGAGTCACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTG 21721626
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6154 AGAGTCACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTG 6213

 21721627 TCACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTC 21721686
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6214 TCACCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTC 6273

 21721687 ACTCGTTCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATAC 21721746
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6274 ACTCGTTCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATAC 6333

 21721747 ACTGGGTAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCA 21721806
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6334 ACTGGGTAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCA 6393

 21721807 ATAGTGAGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTT 21721866
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6394 ATAGTGAGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTT 6453

 21721867 GGAATCATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAA 21721926
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6454 GGAATCATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAA 6513

 21721927 AACAAGTGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAAT 21721986
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6514 AACAAGTGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAAT 6573

 21721987 TTGTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACA 21722046
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6574 TTGTTCTTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACA 6633

 21722047 TGTGATGTTTAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAAT 21722106
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6634 TGTGATGTTTAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAAT 6693

 21722107 ATGCTCTACTAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTT 21722166
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6694 ATGCTCTACTAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTT 6753

 21722167 GTTTATTTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCAC 21722226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6754 GTTTATTTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCAC 6813

 21722227 TGGGGAAATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATT 21722286
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6814 TGGGGAAATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATT 6873

 21722287 AGTCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGT 21722346
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6874 AGTCTAGCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGT 6933

 21722347 GCTACACAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGT 21722406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6934 GCTACACAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGT 6993

 21722407 CAGACAGTCCCTTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAG 21722466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6994 CAGACAGTCCCTTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAG 7053

 21722467 GCAGGGAGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTG 21722526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7054 GCAGGGAGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTG 7113

 21722527 CCCTTAGCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCC 21722586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7114 CCCTTAGCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCC 7173

 21722587 AATTACAGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTT 21722646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7174 AATTACAGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTT 7233

 21722647 CAGAGTATTATACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTA 21722706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7234 CAGAGTATTATACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTA 7293

 21722707 AGGTAAACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAG 21722766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7294 AGGTAAACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAG 7353

 21722767 CCTATGTGAATATATTCCATCAGTAAAAA-AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTT 21722825
          ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||
     7354 CCTATGTGAATATATTCCATCAGT-----GAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTT 7408

 21722826 TTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTC 21722885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7409 TTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTC 7468

 21722886 TGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATAT 21722945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7469 TGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATAT 7528

 21722946 TTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAG 21723005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7529 TTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAG 7588

 21723006 CTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATC 21723065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7589 CTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATC 7648

 21723066 ACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTT 21723125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7649 ACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTT 7708

 21723126 GGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAA 21723185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7709 GGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAA 7768

 21723186 AAACG-AAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATG 21723244
          ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7769 AAACGAAAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATG 7828

 21723245 TGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATG 21723304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7829 TGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATG 7888

 21723305 AAATGAGGGAAAGAG-AGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATT 21723363
          ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7889 AAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATT 7948

 21723364 GAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATG 21723423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7949 GAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATG 8008

 21723424 TTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAA 21723483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8009 TTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAA 8068

 21723484 TGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTG 21723543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8069 TGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTG 8128

 21723544 TTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGAT 21723603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8129 TTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGAT 8188

 21723604 TACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAA 21723663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8189 TACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAA 8248

 21723664 GAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAA 21723723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8249 GAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAA 8308

 21723724 GTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTA 21723783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8309 GTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTA 8368

 21723784 CACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAG 21723843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8369 CACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAG 8428

 21723844 AGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGA 21723903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8429 AGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGA 8488

 21723904 CTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTC 21723963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8489 CTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTC 8548

 21723964 ATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCT 21724023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8549 ATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCT 8608

 21724024 GGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTT 21724083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8609 GGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTT 8668

 21724084 TTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGT 21724143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8669 TTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGT 8728

 21724144 ACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTG 21724203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8729 ACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTG 8788

 21724204 AGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTT 21724263
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8789 AGCAGGAGAAGACAAAC-TTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTT 8847

 21724264 AAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAA 21724323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8848 AAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAA 8907

 21724324 GCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTT 21724383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8908 GCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTT 8967

 21724384 CTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGG 21724443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8968 CTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGG 9027

 21724444 TCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTA 21724503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9028 TCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTA 9087

 21724504 AGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGC 21724563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9088 AGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGC 9147

 21724564 TGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCA 21724623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9148 TGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCA 9207

 21724624 CAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGAT 21724683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9208 CAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGAT 9267

 21724684 GTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCT 21724743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9268 GTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCT 9327

 21724744 GCTGTACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGAT 21724803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9328 GCTGTACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGAT 9387

 21724804 TAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGC 21724863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9388 TAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGC 9447

 21724864 ACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAA 21724923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9448 ACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAA 9507

 21724924 CACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCA 21724983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9508 CACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCA 9567

 21724984 TCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAA 21725043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9568 TCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAA 9627

 21725044 GGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCC 21725103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9628 GGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCC 9687

 21725104 ATCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAA 21725163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9688 ATCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAA 9747

 21725164 AGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACT 21725223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9748 AGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACT 9807

 21725224 GGCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAG 21725283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9808 GGCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAG 9867

 21725284 CCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCT 21725343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9868 CCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCT 9927

 21725344 GCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCA 21725403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9928 GCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCA 9987

 21725404 GTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATC 21725463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9988 GTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATC 10047

 21725464 TGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCAC 21725523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10048 TGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCAC 10107

 21725524 CAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATG 21725583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10108 CAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATG 10167

 21725584 TCCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCA 21725643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10168 TCCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCA 10227

 21725644 CTGTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAA 21725703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10228 CTGTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAA 10287

 21725704 AGCGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTC 21725763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10288 AGCGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTC 10347

 21725764 TTCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTC 21725823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10348 TTCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTC 10407

 21725824 ACCACACTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCTC-CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 21725882
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
    10408 ACCACACTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 10467

 21725883 TCTCTCTCTCTCTC 21725896
          ||||||||||||||
    10468 TCTCTCTCTCTCTC 10481

Alignment time is 8.82983 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2537] =>      2537 nucs 'mol-32-30eb-159104_2537'

Score:        2526
Aligned:      2537        nucs
Identic:      2536 (100%) nucs =>      1013 (100%)      1523 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21723359,21724371] EXCISED REGION [21724373,21725896]
 second seq =>  [       1,    1013] EXCISED REGION [    1015,    2537]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [21724372,21724372]
 second seq =>         1 nucs [1014,1014]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [21725857,21725857]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21724371,21724371] to [21724372,21724372]
 second seq =>         1 nucs [1014,1014] to [1015,1015]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 21723359 GTATTGAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGA 21723418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTATTGAAAACATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGA 60

 21723419 GTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATG 21723478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATG 120

 21723479 ACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCT 21723538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCT 180

 21723539 AACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGA 21723598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGA 240

 21723599 TGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATA 21723658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATA 300

 21723659 AAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCT 21723718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCT 360

 21723719 TTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAG 21723778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAG 420

 21723779 ATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAA 21723838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAA 480

 21723839 GTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAG 21723898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAG 540

 21723899 GGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGT 21723958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGT 600

 21723959 TCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCA 21724018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCA 660

 21724019 TGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAAT 21724078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAAT 720

 21724079 CTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAA 21724138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAA 780

 21724139 GCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACT 21724198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACT 840

 21724199 TCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAA 21724258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAA 900

 21724259 TATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTG 21724318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTG 960

 21724319 TGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTA 21724371
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTA 1013

EXCISED REGION

 21724373 GATTTTACTTTCTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTG 21724432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1015 GATTTTACTTTCTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTG 1074

 21724433 GCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAG 21724492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1075 GCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAG 1134

 21724493 AGGGCTTATTAAGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTC 21724552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1135 AGGGCTTATTAAGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTC 1194

 21724553 TGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGG 21724612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1195 TGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGG 1254

 21724613 TACATGATCCACAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTC 21724672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1255 TACATGATCCACAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTC 1314

 21724673 CAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATT 21724732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1315 CAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATT 1374

 21724733 TCCTGCTTCCTGCTGTACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATT 21724792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 TCCTGCTTCCTGCTGTACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATT 1434

 21724793 ACTTTTGTGATTAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTT 21724852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 ACTTTTGTGATTAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTT 1494

 21724853 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACC 21724912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 GTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACC 1554

 21724913 ATCCTGGCTAACACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCAC 21724972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 ATCCTGGCTAACACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCAC 1614

 21724973 GGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACC 21725032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 GGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACC 1674

 21725033 TGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAG 21725092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 TGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAG 1734

 21725093 AGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATG 21725152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 AGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATG 1794

 21725153 AGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAAT 21725212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 AGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAAT 1854

 21725213 GTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGA 21725272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 GTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGA 1914

 21725273 GCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGG 21725332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 GCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGG 1974

 21725333 AACTAAATTCTGCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTG 21725392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1975 AACTAAATTCTGCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTG 2034

 21725393 ATGAGGACTCAGTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAAC 21725452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 ATGAGGACTCAGTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAAC 2094

 21725453 ATAGCCACATCTGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATG 21725512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 ATAGCCACATCTGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATG 2154

 21725513 TTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAG 21725572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAG 2214

 21725573 TGTGGTATATGTCCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACT 21725632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 TGTGGTATATGTCCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACT 2274

 21725633 GCCAAACATCACTGTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCT 21725692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 GCCAAACATCACTGTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCT 2334

 21725693 TTAGTTTATAAAGCGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCAC 21725752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 TTAGTTTATAAAGCGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCAC 2394

 21725753 TGCTGACTCTCTTCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTT 21725812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 TGCTGACTCTCTTCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTT 2454

 21725813 TGACAAACTTCACCACACTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCTCCTCTCTCTCTCTCTC 21725872
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
     2455 TGACAAACTTCACCACACTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCT-CTCTCTCTCTCTCTC 2513

 21725873 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 21725896
          ||||||||||||||||||||||||
     2514 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 2537

Alignment time is 3.06138 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2367] =>      2367 nucs 'mol-32-3143-154338_2367'

Score:        2367
Aligned:      2367        nucs
Identic:      2367 (100%) nucs =>      2349 (100%)        18 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21723505,21725853] EXCISED REGION [21725859,21725876]
 second seq =>  [       1,    2349] EXCISED REGION [    2350,    2367]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [21725854,21725858]
 second seq =>         0 nucs
ALTERNATIVE REGION(S): 19
 first  seq =>         7 nucs [21725858,21725864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [21725854,21725857] to [21725859,21725862]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21725853,21725853] to [21725859,21725859]
 second seq =>         1 nucs [2349,2349] to [2350,2350]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 21723505 GACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAA 21723564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAA 60

 21723565 AAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGG 21723624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGG 120

 21723625 AAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTG 21723684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTG 180

 21723685 GCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGG 21723744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGG 240

 21723745 CTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAA 21723804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAA 300

 21723805 AGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGT 21723864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGT 360

 21723865 ACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTT 21723924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTT 420

 21723925 AAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAA 21723984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAA 480

 21723985 AGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCA 21724044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCA 540

 21724045 GGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAA 21724104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAA 600

 21724105 TCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGA 21724164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGA 660

 21724165 ACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTT 21724224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTT 720

 21724225 TTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTT 21724284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTT 780

 21724285 CTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAA 21724344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAA 840

 21724345 ACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGTCATCAGCCAGA 21724404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGTCATCAGCCAGA 900

 21724405 TTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACTGGCCCTCA 21724464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACTGGCCCTCA 960

 21724465 AACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGACTTCTGATGTCT 21724524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGACTTCTGATGTCT 1020

 21724525 TCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCATTACTTACT 21724584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCATTACTTACT 1080

 21724585 AATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAAACACTGAGGCC 21724644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAAACACTGAGGCC 1140

 21724645 AGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGGCATATTTA 21724704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGGCATATTTA 1200

 21724705 GCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACACCCTACATCAT 21724764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACACCCTACATCAT 1260

 21724765 CTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGCGACGTGATACA 21724824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGCGACGTGATACA 1320

 21724825 GTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTTGGG 21724884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTTGGG 1380

 21724885 TGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACTCCGTCTCTA 21724944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACTCCGTCTCTA 1440

 21724945 CTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCGA 21725004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCGA 1500

 21725005 AGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCG 21725064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCG 1560

 21725065 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAGATT 21725124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAGATT 1620

 21725125 GTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATTCTCCGGCT 21725184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATTCTCCGGCT 1680

 21725185 GGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCGAGGCCACA 21725244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCGAGGCCACA 1740

 21725245 TGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACAGCAAGGAA 21725304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACAGCAAGGAA 1800

 21725305 AGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGAATGAATTTGAG 21725364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGAATGAATTTGAG 1860

 21725365 AAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAACATCTTCATTT 21725424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAACATCTTCATTT 1920

 21725425 CAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGACTTCTGACCTAC 21725484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGACTTCTGACCTAC 1980

 21725485 AAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTAATTAATTA 21725544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTAATTAATTA 2040

 21725545 CGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTAGACCTAAAGCT 21725604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTAGACCTAAAGCT 2100

 21725605 CCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTGTAACAACTTTC 21725664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTGTAACAACTTTC 2160

 21725665 AAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGTTTAGGAGTTGT 21725724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGTTTAGGAGTTGT 2220

 21725725 CTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAGAAGCTCTGGGA 21725784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAGAAGCTCTGGGA 2280

 21725785 AATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACACTAAAGCCATAAATG 21725844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACACTAAAGCCATAAATG 2340

 21725845 GTTAACTGT 21725853
          |||||||||
     2341 GTTAACTGT 2349

EXCISED REGION

 21725859 TCTCTCTCTCTCTCTCTC 21725876
          ||||||||||||||||||
     2350 TCTCTCTCTCTCTCTCTC 2367

Alignment time is 2.93682 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3074] =>      3074 nucs 'mol-32-316f-041736_3074'

Score:        3062
Aligned:      3073        nucs
Identic:      3072 (100%) nucs =>       434 (100%)      2638 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21725929,21726362] EXCISED REGION [21726364,21729002]
 second seq =>  [       1,     434] EXCISED REGION [     436,    3074]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [21726363,21726363]
 second seq =>         1 nucs [435,435]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [435,435] to [436,436]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 21725929 TCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATTCTTTACCATCAACTGTGACCCAACCCAGACC 21725988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATTCTTTACCATCAACTGTGACCCAACCCAGACC 60

 21725989 ATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAA 21726048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAA 120

 21726049 AAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATTAATTTTAAAGCATTACATTTTCT 21726108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATTAATTTTAAAGCATTACATTTTCT 180

 21726109 GACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGTTTGATTTTTCTGATGTTCTTATA 21726168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGTTTGATTTTTCTGATGTTCTTATA 240

 21726169 AAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCAAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGC 21726228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCAAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGC 300

 21726229 TGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTTTATTCTGAACATATTAGCTAGTT 21726288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTTTATTCTGAACATATTAGCTAGTT 360

 21726289 AAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAAATTAACGATTAATTTTGTTCAAA 21726348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAAATTAACGATTAATTTTGTTCAAA 420

 21726349 GGGATGTCTTCATC 21726362
          ||||||||||||||
      421 GGGATGTCTTCATC 434

EXCISED REGION

 21726364 TAAGTGAAACTGGAGTGCTTCTTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCA 21726423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 TAAGTGAAACTGGAGTGCTTCTTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCA 495

 21726424 GCAAACTCGTATGGCAATTTGGAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTA 21726483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      496 GCAAACTCGTATGGCAATTTGGAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTA 555

 21726484 GCAAGGAAACCAATGGGCTCCATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGC 21726543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      556 GCAAGGAAACCAATGGGCTCCATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGC 615

 21726544 ATTTCTAACTTGTATGTGATAAAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGC 21726603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 ATTTCTAACTTGTATGTGATAAAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGC 675

 21726604 AAAATCCTGGCCCATACAGGTGTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTT 21726663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 AAAATCCTGGCCCATACAGGTGTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTT 735

 21726664 GTCTCAGCAAGAGAGAAATAGATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTA 21726723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 GTCTCAGCAAGAGAGAAATAGATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTA 795

 21726724 ATATTCAAGAAATGCAAGAGGAGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAA 21726783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 ATATTCAAGAAATGCAAGAGGAGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAA 855

 21726784 ACATTACTTGCCTTGGTGACAAGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAA 21726843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 ACATTACTTGCCTTGGTGACAAGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAA 915

 21726844 AATATTAAGCTTAACAAAGAGAAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAA 21726903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 AATATTAAGCTTAACAAAGAGAAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAA 975

 21726904 GACAGCAGAAGTGGCAGACTCGTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTT 21726963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 GACAGCAGAAGTGGCAGACTCGTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTT 1035

 21726964 TACATCTACATCACAGGTTTTTCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTT 21727023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 TACATCTACATCACAGGTTTTTCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTT 1095

 21727024 ACTTATCAAACAGACAAGCAGCACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCAC 21727083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 ACTTATCAAACAGACAAGCAGCACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCAC 1155

 21727084 CAAAGAGCCGCTTCACCTGATGGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGC 21727143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1156 CAAAGAGCCGCTTCACCTGATGGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGC 1215

 21727144 TCTGAATAGCATGGCTCATAAAAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTA 21727203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 TCTGAATAGCATGGCTCATAAAAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTA 1275

 21727204 GTAATTGGCATTACCTAATTATCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACAT 21727263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 GTAATTGGCATTACCTAATTATCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACAT 1335

 21727264 CTGCCTATCCTAATTTAGAAAATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGG 21727323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 CTGCCTATCCTAATTTAGAAAATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGG 1395

 21727324 TTTTGGCCAAGAAACACAGTAAAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTC 21727383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 TTTTGGCCAAGAAACACAGTAAAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTC 1455

 21727384 TCCCAGGCAATAATTCCTCAACTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAA 21727443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 TCCCAGGCAATAATTCCTCAACTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAA 1515

 21727444 AGAAGAAAGAGAACAATGGTGAAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTC 21727503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 AGAAGAAAGAGAACAATGGTGAAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTC 1575

 21727504 CAGCCTGGCTTTCCCAAAAAATGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCAT 21727563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 CAGCCTGGCTTTCCCAAAAAATGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCAT 1635

 21727564 GTGACCTATATAAGAATGATTAAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGA 21727623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 GTGACCTATATAAGAATGATTAAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGA 1695

 21727624 AATTTAAAAGTAACCTTTTTTTAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAA 21727683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 AATTTAAAAGTAACCTTTTTTTAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAA 1755

 21727684 AGTGTACAAATGTGTACTCAAATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAA 21727743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 AGTGTACAAATGTGTACTCAAATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAA 1815

 21727744 CACCAAATTGTTATTGTGTTTGGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAG 21727803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 CACCAAATTGTTATTGTGTTTGGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAG 1875

 21727804 ATTATGCGTAGGTATAAAAAGATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGT 21727863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 ATTATGCGTAGGTATAAAAAGATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGT 1935

 21727864 AAAAAAATAACCATTTGTAGTTGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAG 21727923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 AAAAAAATAACCATTTGTAGTTGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAG 1995

 21727924 CAATACTGAACTATCGCAATATAATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTG 21727983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 CAATACTGAACTATCGCAATATAATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTG 2055

 21727984 AATTTCCTAGTAGCCACACCAAAAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATAT 21728043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 AATTTCCTAGTAGCCACACCAAAAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATAT 2115

 21728044 TTTATTCAACCCAAATAAAGGCAAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATG 21728103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2116 TTTATTCAACCCAAATAAAGGCAAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATG 2175

 21728104 TACAAAGCCTTTGAAAACCAGTGTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGG 21728163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2176 TACAAAGCCTTTGAAAACCAGTGTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGG 2235

 21728164 ACTAGCTAATTTTAAGTGTGCAGTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGT 21728223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2236 ACTAGCTAATTTTAAGTGTGCAGTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGT 2295

 21728224 GCAGACCTAGAACTTAATGTGCAATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGA 21728283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2296 GCAGACCTAGAACTTAATGTGCAATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGA 2355

 21728284 AATTAGTTATAGATTCAAGGTTTAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGA 21728343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2356 AATTAGTTATAGATTCAAGGTTTAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGA 2415

 21728344 TCTTACCTTTATATTTCTGGTCATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTG 21728403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2416 TCTTACCTTTATATTTCTGGTCATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTG 2475

 21728404 CTGGTTCTCCCATCCTGAAAGGGAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTC 21728463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2476 CTGGTTCTCCCATCCTGAAAGGGAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTC 2535

 21728464 ATAACTTGTCTTGACCAGTGGAATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCA 21728523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2536 ATAACTTGTCTTGACCAGTGGAATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCA 2595

 21728524 GGCCTCAAGAGACCCTGCAGCTCCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAA 21728583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 GGCCTCAAGAGACCCTGCAGCTCCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAA 2655

 21728584 TAGGTAAGGAAGCCAGACCAGCTTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCA 21728643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2656 TAGGTAAGGAAGCCAGACCAGCTTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCA 2715

 21728644 GATCCACAGTCAACAGCCAGCAGCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCT 21728703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 GATCCACAGTCAACAGCCAGCAGCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCT 2775

 21728704 TATAACCCAGGTGACCCACAAGATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGC 21728763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2776 TATAACCCAGGTGACCCACAAGATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGC 2835

 21728764 AGAGGAAGTGCTCAAACCCAAAATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCA 21728823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2836 AGAGGAAGTGCTCAAACCCAAAATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCA 2895

 21728824 GTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGTTAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTC 21728883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2896 GTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGTTAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTC 2955

 21728884 ATAATTTTTTTTATTAATAGGCCACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGC 21728943
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2956 ATAATTTTTTTTATTAATAGGCCACTTTTTGGAACAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGC 3015

 21728944 ACAGGAAAGCACAGCAATTTCCCATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTC 21729002
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 ACAGGAAAGCACAGCAATTTCCCATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTC 3074

Alignment time is 3.31707 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    6482] =>      6482 nucs 'mol-32-316f-042125_6482'

Score:        6416
Aligned:      6482        nucs
Identic:      6476 (100%) nucs =>      6424 (100%)        52 (100%)
Gaps:            3 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21719470,21725896] EXCISED REGION [21725905,21725956]
 second seq =>  [       1,    6430] EXCISED REGION [    6431,    6482]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         8 nucs [21725897,21725904]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [21725897,21725915] to [21725905,21725923]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [21725878,21725896] to [21725905,21725923]
 second seq =>        19 nucs [6412,6430] to [6431,6449]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [21725897,21725900] to [21725901,21725904]
 second seq =>         0 nucs

 21719470 CTTCTAGTACTCAGGGCATATATTATTCATCAATTATATTTCCAGTTGGCCTCAGAATCC 21719529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CTTCTAGTACTCAGGGCATATATTATTCATCAATTATATTTCCAGTTGGCCTCAGAATCC 60

 21719530 TCCTTAACACAACATACCAGTATCTAATCCAGTTAATCACAGTTTGCTATCCCCGACACA 21719589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCTTAACACAACATACCAGTATCTAATCCAGTTAATCACAGTTTGCTATCCCCGACACA 120

 21719590 AACCCTCAACATTAGGGCATCCAAACCTCTCTGTAAGTCTTGGAAGACAGACAATAGAAT 21719649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACCCTCAACATTAGGGCATCCAAACCTCTCTGTAAGTCTTGGAAGACAGACAATAGAAT 180

 21719650 AATGCTGACAGTTTCCTTATACCTCTGGCAAAGTGTCCAATCATCTTTTGGTTAGAATCC 21719709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATGCTGACAGTTTCCTTATACCTCTGGCAAAGTGTCCAATCATCTTTTGGTTAGAATCC 240

 21719710 AGTGAGAGGACTAAGAAAGGCATCTGATTTGTCTGTCAAAGCTTGCCCAGGTTATGAAGA 21719769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGAGAGGACTAAGAAAGGCATCTGATTTGTCTGTCAAAGCTTGCCCAGGTTATGAAGA 300

 21719770 TAACTGGAGACCTACATTTGTAACTCAGTAAATGGGAGACTTTCATTCCTGGACATTCTG 21719829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAACTGGAGACCTACATTTGTAACTCAGTAAATGGGAGACTTTCATTCCTGGACATTCTG 360

 21719830 CAACAGCCAGTGTTGACCTGGTAAATCTACCTGAGATTCGCTCATGATTCCAATGTGACT 21719889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CAACAGCCAGTGTTGACCTGGTAAATCTACCTGAGATTCGCTCATGATTCCAATGTGACT 420

 21719890 GAATGCCTTGAGAATATACAACTCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTTAGA 21719949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAATGCCTTGAGAATATACAACTCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTTAGA 480

 21719950 CAGTAGAAGTTCGTGAAGTGACCTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACGCA 21720009
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      481 CAGTAGAAGTTCGTGAAGTGACCTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACACA 540

 21720010 ACAACAAATAACCCTAAAAGGAAACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATTG 21720069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ACAACAAATAACCCTAAAAGGAAACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATTG 600

 21720070 GAGTTAGTCCCTTCAAATTCATGGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTGC 21720129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GAGTTAGTCCCTTCAAATTCATGGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTGC 660

 21720130 TTTTGAACGGACATTAATCCCAAAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAGC 21720189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTTGAACGGACATTAATCCCAAAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAGC 720

 21720190 AGGAATGCCTGCTGAGAGGGGAGAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGCC 21720249
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGGAATGCCTGCTGAGAGGGGAGAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGCC 780

 21720250 CTGCATTTTCCTGAATGATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGCT 21720309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGCATTTTCCTGAATGATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGCT 840

 21720310 TTCCAAGTGCTAAATATTTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCCT 21720369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TTCCAAGTGCTAAATATTTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCCT 900

 21720370 ATTTATACAGTTTAATGTCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAATT 21720429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ATTTATACAGTTTAATGTCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAATT 960

 21720430 TTGTAAATTTATGTTGTTCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCCC 21720489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTGTAAATTTATGTTGTTCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCCC 1020

 21720490 TGCCACCCACCCCCCAACCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAAC 21720549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGCCACCCACCCCCCAACCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAAC 1080

 21720550 TTCTACAGAATATTCTAAGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCCA 21720609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTCTACAGAATATTCTAAGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCCA 1140

 21720610 AATTCCAGTGTTTTCATGTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAAA 21720669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AATTCCAGTGTTTTCATGTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAAA 1200

 21720670 ATAAGAATAACAGCTAAATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAGT 21720729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATAAGAATAACAGCTAAATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAGT 1260

 21720730 AAATACTAAACTATAGTAACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATGA 21720789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAATACTAAACTATAGTAACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATGA 1320

 21720790 TATGAAATAATGGAATATATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAATC 21720849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATGAAATAATGGAATATATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAATC 1380

 21720850 ATTAATTGGTATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGT 21720909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATTAATTGGTATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGT 1440

 21720910 TAAGCTTTTGAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTA 21720969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAAGCTTTTGAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTA 1500

 21720970 AGAAAGAGTTTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGAC 21721029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGAAAGAGTTTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGAC 1560

 21721030 ATTGTTGCTTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATG 21721089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTGTTGCTTTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATG 1620

 21721090 TCATTAATACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGA 21721149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCATTAATACTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGA 1680

 21721150 AACAATATTGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTGG 21721209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AACAATATTGAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTGG 1740

 21721210 AGGGAGGGAGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCG 21721269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGGGAGGGAGACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCG 1800

 21721270 ACTTACTTGATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAA 21721329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ACTTACTTGATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAA 1860

 21721330 TACCCCCAAGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATA 21721389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TACCCCCAAGTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATA 1920

 21721390 GAAGTATATGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAA 21721449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GAAGTATATGTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAA 1980

 21721450 ATATTGTATGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACGTGGTAAGGACTCAAAATATGATA 21721509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1981 ATATTGTATGAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACATGGTAAGGACTCAAAATATGATA 2040

 21721510 GCTGACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGA 21721569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GCTGACTTGGAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGA 2100

 21721570 GTCACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCA 21721629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTCACACTAATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCA 2160

 21721630 CCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACT 21721689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCTCTTCTCTCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACT 2220

 21721690 CGTTCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACT 21721749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CGTTCTTTCTCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACT 2280

 21721750 GGGTAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATA 21721809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GGGTAAATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATA 2340

 21721810 GTGAGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGA 21721869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GTGAGAGAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGA 2400

 21721870 ATCATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAAC 21721929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATCATCATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAAC 2460

 21721930 AAGTGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTG 21721989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAGTGCAATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTG 2520

 21721990 TTCTTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATGT 21722049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTCTTTCCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATGT 2580

 21722050 GATGTTTAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATG 21722109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 GATGTTTAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATG 2640

 21722110 CTCTACTAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTT 21722169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CTCTACTAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTT 2700

 21722170 TATTTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGG 21722229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TATTTGCTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGG 2760

 21722230 GGAAATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGT 21722289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GGAAATCTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGT 2820

 21722290 CTAGCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCT 21722349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CTAGCCAAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCT 2880

 21722350 ACACAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAG 21722409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 ACACAGTTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAG 2940

 21722410 ACAGTCCCTTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCA 21722469
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACAGTCCCTTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCA 3000

 21722470 GGGAGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCC 21722529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGGAGATGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCC 3060

 21722530 TTAGCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAAT 21722589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TTAGCTACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAAT 3120

 21722590 TACAGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAG 21722649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TACAGATCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAG 3180

 21722650 AGTATTATACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGG 21722709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AGTATTATACTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGG 3240

 21722710 TAAACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCT 21722769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAAACCTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCT 3300

 21722770 ATGTGAATATATTCCATCAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGG 21722829
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATGTGAATATATTCCATCAGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGG 3360

 21722830 CACATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGA 21722889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 CACATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGA 3420

 21722890 AAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCA 21722949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 AAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCA 3480

 21722950 GATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTA 21723009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTA 3540

 21723010 GGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAG 21723069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAG 3600

 21723070 TTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAA 21723129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAA 3660

 21723130 CACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAAC 21723189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAAC 3720

 21723190 GAAAAAAAAAAAA-CAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTA 21723248
          ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 GAAAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTA 3780

 21723249 TTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAAT 21723308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAAT 3840

 21723309 GAGGGAAAGAGA-GGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAA 21723367
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAA 3900

 21723368 ACATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTT 21723427
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 ACATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTT 3960

 21723428 ATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTT 21723487
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 ATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTT 4020

 21723488 TGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGC 21723547
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGC 4080

 21723548 ACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACA 21723607
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACA 4140

 21723608 AGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGC 21723667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 AGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGC 4200

 21723668 TGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTA 21723727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 TGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTA 4260

 21723728 GAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACA 21723787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACA 4320

 21723788 ACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTA 21723847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 ACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTA 4380

 21723848 AGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTA 21723907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 AGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTA 4440

 21723908 ATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTT 21723967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 ATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTT 4500

 21723968 CCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAA 21724027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAA 4560

 21724028 GAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAG 21724087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 GAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAG 4620

 21724088 GGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAA 21724147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 GGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAA 4680

 21724148 AATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCA 21724207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 AATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCA 4740

 21724208 GGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGC 21724267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 GGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGC 4800

 21724268 TTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAG 21724327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4801 TTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAG 4860

 21724328 CCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAA 21724387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4861 CCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAA 4920

 21724388 GATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCA 21724447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4921 GATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCA 4980

 21724448 GAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGAC 21724507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4981 GAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGAC 5040

 21724508 ACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCT 21724567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5041 ACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCT 5100

 21724568 AATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAA 21724627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5101 AATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAA 5160

 21724628 TTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGT 21724687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5161 TTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGT 5220

 21724688 GTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTG 21724747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5221 GTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTG 5280

 21724748 TACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGG 21724807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5281 TACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGG 5340

 21724808 TTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTT 21724867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5341 TTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTT 5400

 21724868 TGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACT 21724927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5401 TGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACT 5460

 21724928 GTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTG 21724987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5461 GTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTG 5520

 21724988 TAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTT 21725047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5521 TAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTT 5580

 21725048 GCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCT 21725107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5581 GCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCT 5640

 21725108 CAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCG 21725167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5641 CAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCG 5700

 21725168 AAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCC 21725227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5701 AAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCC 5760

 21725228 TGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCC 21725287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5761 TGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCC 5820

 21725288 AGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTA 21725347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5821 AGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTA 5880

 21725348 ACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCC 21725407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5881 ACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCC 5940

 21725408 AGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTG 21725467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5941 AGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTG 6000

 21725468 CTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAG 21725527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6001 CTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAG 6060

 21725528 TTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCC 21725587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6061 TTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCC 6120

 21725588 ACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGT 21725647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6121 ACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGT 6180

 21725648 CTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCG 21725707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6181 CTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCG 6240

 21725708 CCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCT 21725767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6241 CCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCT 6300

 21725768 GGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCA 21725827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6301 GGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCA 6360

 21725828 CACTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCTC-CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 21725886
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     6361 CACTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 6420

 21725887 TCTCTCTCTC 21725896
          ||||||||||
     6421 TCTCTCTCTC 6430

EXCISED REGION

 21725905 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACAT 21725956
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6431 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACAT 6482

Alignment time is 5.51948 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4783] =>      4783 nucs 'mol-32-317a-255484_4783'

Score:        4612
Aligned:      4764        nucs
Identic:      4742 (100%) nucs =>       866 ( 98%)      3876 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21722833,21723705] EXCISED REGION [21725967,21729848]
 second seq =>  [       1,     876] EXCISED REGION [     901,    4783]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2261 nucs [21723706,21725966]
 second seq =>        24 nucs [877,900]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723705,21723705] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [877,877] to [901,901]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723706,21723706] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [877,877] to [900,900]

 21722833 ATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAG 21722892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAG 60

 21722893 GTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGAT 21722952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGAT 120

 21722953 AAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGA 21723012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGA 180

 21723013 AAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTA 21723072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTA 240

 21723073 AAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACAC 21723132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACAC 300

 21723133 AAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAA 21723192
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      301 AAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATTAAAAAAAACGAA 360

 21723193 AAAAAAAAA----ACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTA 21723248
          |||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAAAAAACCAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTA 420

 21723249 TTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAAT 21723308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAAT 480

 21723309 GAGGGAAAGAGA-GGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAA 21723367
          |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAA 540

 21723368 ACATGTA---AAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGT 21723424
          ||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AC-----GTGAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGT 595

 21723425 TTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAAT 21723484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 TTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAAT 655

 21723485 GTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGT 21723544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 GTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGT 715

 21723545 TGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATT 21723604
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 TGGACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATT 775

 21723605 ACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAG 21723664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 ACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAG 835

 21723665 AGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 21723705
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 AGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 876

EXCISED REGION

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      901 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAC 960

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 1020

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 1080

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 1140

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 1200

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 1260

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1261 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 1320

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 1380

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 1440

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 1500

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 1560

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 1620

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 1680

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 1740

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 1800

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 1860

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 1920

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 1980

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 2040

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 2100

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 2160

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 2220

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 2280

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 2340

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 2400

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 2460

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 2520

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 2580

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 2640

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 2700

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 2760

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 2820

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 2880

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 2940

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 3000

 21728066 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 21728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 3060

 21728126 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 21728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 3120

 21728186 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 21728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 3180

 21728246 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 21728305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATATGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 3240

 21728306 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 21728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 3300

 21728366 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 21728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 3360

 21728426 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 21728485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 3420

 21728486 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 21728545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 3480

 21728546 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 21728605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 3540

 21728606 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 21728665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 3600

 21728666 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 21728725
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGAGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 3660

 21728726 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAA 21728785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3661 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAATCCAAA 3720

 21728786 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 21728845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 3780

 21728846 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 21728905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 3840

 21728906 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 21728965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 3900

 21728966 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 21729025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 3960

 21729026 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 21729085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 4020

 21729086 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 21729145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 4080

 21729146 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 21729205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 4140

 21729206 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 21729265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 4200

 21729266 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 21729325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 4260

 21729326 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 21729385
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCTATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 4320

 21729386 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 21729445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 4380

 21729446 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 21729505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 4440

 21729506 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 21729565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 4500

 21729566 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 21729625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 4560

 21729626 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 21729685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4561 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 4620

 21729686 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 21729745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 4680

 21729746 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 21729805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 4740

 21729806 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCA 21729848
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCA 4783

Alignment time is 4.45393 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4522] =>      4522 nucs 'mol-32-322a-154734_4522'

Score:        4379
Aligned:      4503        nucs
Identic:      4486 (100%) nucs =>       483 ( 98%)      4003 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21723217,21723705] EXCISED REGION [21725967,21729975]
 second seq =>  [       1,     488] EXCISED REGION [     513,    4522]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2261 nucs [21723706,21725966]
 second seq =>        24 nucs [489,512]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723705,21723705] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [489,489] to [513,513]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723706,21723706] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [489,489] to [512,512]

 21723217 AATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATC 21723276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATC 60

 21723277 AAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGA-GGCAAAGATTTCATT 21723335
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
       61 AAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATT 120

 21723336 GATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTA---AAGAAATGGGAAAACAAA 21723392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||
      121 GATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAAC-----GTGAAGAAATGGGAAAACAAA 175

 21723393 TGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAAT 21723452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      176 TGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAAT 235

 21723453 ATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGA 21723512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      236 ATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGA 295

 21723513 AAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTA 21723572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      296 AAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGGACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTA 355

 21723573 ATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCA 21723632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      356 ATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCA 415

 21723633 TAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTG 21723692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      416 TAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTG 475

 21723693 GTTTGTTTTTAGT 21723705
          |||||||||||||
      476 GTTTGTTTTTAGT 488

EXCISED REGION

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      513 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAC 572

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      573 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 632

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      633 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 692

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      693 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 752

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      753 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 812

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      813 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 872

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      873 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 932

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      933 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 992

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      993 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 1052

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1053 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 1112

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1113 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 1172

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1173 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 1232

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1233 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 1292

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1293 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 1352

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1353 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 1412

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1413 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 1472

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1473 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 1532

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1533 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 1592

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1593 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 1652

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1653 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 1712

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1713 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 1772

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1773 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 1832

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1833 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 1892

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1893 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 1952

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1953 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 2012

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2013 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 2072

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2073 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 2132

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2133 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 2192

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2193 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 2252

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2253 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 2312

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2313 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 2372

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2373 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 2432

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2433 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 2492

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2493 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 2552

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2553 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 2612

 21728066 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 21728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2613 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 2672

 21728126 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 21728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2673 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 2732

 21728186 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 21728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2733 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 2792

 21728246 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 21728305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2793 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATATGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 2852

 21728306 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 21728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2853 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 2912

 21728366 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 21728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 2972

 21728426 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 21728485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2973 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 3032

 21728486 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 21728545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 3092

 21728546 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 21728605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3093 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 3152

 21728606 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 21728665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3153 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 3212

 21728666 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 21728725
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3213 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGAGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 3272

 21728726 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAA 21728785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3273 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAATCCAAA 3332

 21728786 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 21728845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3333 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 3392

 21728846 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 21728905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3393 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 3452

 21728906 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 21728965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3453 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 3512

 21728966 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 21729025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3513 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 3572

 21729026 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 21729085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3573 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 3632

 21729086 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 21729145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3633 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 3692

 21729146 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 21729205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3693 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 3752

 21729206 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 21729265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3753 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 3812

 21729266 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 21729325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3813 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 3872

 21729326 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 21729385
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3873 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCTATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 3932

 21729386 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 21729445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3933 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 3992

 21729446 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 21729505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3993 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 4052

 21729506 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 21729565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4053 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 4112

 21729566 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 21729625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4113 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 4172

 21729626 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 21729685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4173 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 4232

 21729686 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 21729745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4233 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 4292

 21729746 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 21729805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4293 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 4352

 21729806 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 21729865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4353 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 4412

 21729866 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 21729925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4413 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 4472

 21729926 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACAC 21729975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACAC 4522

Alignment time is 4.37971 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3373] =>      3373 nucs 'mol-32-3240-069495_3373'

Score:        3235
Aligned:      3354        nucs
Identic:      3335 ( 99%) nucs =>       817 ( 98%)      2518 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21722882,21723705] EXCISED REGION [21725967,21728487]
 second seq =>  [       1,     827] EXCISED REGION [     852,    3373]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2261 nucs [21723706,21725966]
 second seq =>        24 nucs [828,851]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723705,21723705] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [828,828] to [852,852]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723706,21723706] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [828,828] to [851,851]

 21722882 TTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAG 21722941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAG 60

 21722942 ATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGG 21723001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGG 120

 21723002 AGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATA 21723061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATA 180

 21723062 CATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATAT 21723121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATAT 240

 21723122 ATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAA 21723181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      241 ATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATTA 300

 21723182 AAAAAAACGAAAAAAAAAAA----ACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAA 21723237
          ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAAAACGAAAAAAAAAAACCAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAA 360

 21723238 AATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAA 21723297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAA 420

 21723298 TGTGATGAAATGAGGGAAAGAGA-GGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTC 21723356
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTC 480

 21723357 AGGTATTGAAAACATGTA---AAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATAC 21723413
          |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGTATTGAAAAC-----GTGAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATAC 535

 21723414 CTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCA 21723473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 CTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCA 595

 21723474 TCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTA 21723533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 TCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTA 655

 21723534 AGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACA 21723593
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 AGTCTAACTGTTGGACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACA 715

 21723594 TTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACA 21723653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 TTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACA 775

 21723654 AAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 21723705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 AAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 827

EXCISED REGION

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      852 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAC 911

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 971

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 1031

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 1091

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 1151

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 1211

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1212 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 1271

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 1331

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 1391

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 1451

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 1511

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 1571

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 1631

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 1691

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 1751

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 1811

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 1871

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 1931

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 1991

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 2051

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 2111

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 2171

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 2231

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 2291

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 2351

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 2411

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 2471

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 2531

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 2591

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 2651

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 2711

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 2771

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 2831

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 2891

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 2951

 21728066 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 21728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 3011

 21728126 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 21728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 3071

 21728186 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 21728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 3131

 21728246 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 21728305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATATGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 3191

 21728306 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 21728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 3251

 21728366 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 21728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 3311

 21728426 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 21728485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 3371

 21728486 AT 21728487
          ||
     3372 AT 3373

Alignment time is 3.62395 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4813] =>      4813 nucs 'mol-32-3240-305409_4813'

Score:        4634
Aligned:      4797        nucs
Identic:      4774 (100%) nucs =>       905 ( 98%)      3869 (100%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21722794,21723705] EXCISED REGION [21725967,21729842]
 second seq =>  [       1,     915] EXCISED REGION [     938,    4813]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2261 nucs [21723706,21725966]
 second seq =>        22 nucs [916,937]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723705,21723705] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [916,916] to [938,938]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723706,21723706] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [916,916] to [937,937]

 21722794 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGG 21722853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGG 60

 21722854 CATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTA 21722913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTA 120

 21722914 AATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAA 21722973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAA 180

 21722974 AGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATA 21723033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATA 240

 21723034 AATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCA 21723093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCA 300

 21723094 AAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTT 21723153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTT 360

 21723154 CTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAAAAA----ACAAACAA 21723209
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||    ||||||||
      361 CTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATTAAAAAAAACGAAAAAAAAAAACCAAACAAACAA 420

 21723210 AAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGA 21723269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGA 480

 21723270 AAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGA-GGCAAAGA 21723328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
      481 AAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGA 540

 21723329 TTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTA---AAGAAATGGGA 21723385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |||||||||||
      541 TTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAAC-----GTGAAGAAATGGGA 595

 21723386 AAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGT 21723445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 AAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGT 655

 21723446 GAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAG 21723505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 GAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAG 715

 21723506 ACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAA 21723565
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      716 ACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGGACCAATTTTGGAGGAAAA 775

 21723566 AAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGA 21723625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 AAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGA 835

 21723626 AGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGG 21723685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 AGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGG 895

 21723686 CAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 21723705
          ||||||||||||||||||||
      896 CAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 915

EXCISED REGION

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      938 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAC 997

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      998 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 1057

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1058 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 1117

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1118 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 1177

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1178 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 1237

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1238 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 1297

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1298 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 1357

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1358 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 1417

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1418 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 1477

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1478 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 1537

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1538 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 1597

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1598 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 1657

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1658 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 1717

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1718 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 1777

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1778 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 1837

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1838 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 1897

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1898 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 1957

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1958 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 2017

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2018 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 2077

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2078 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 2137

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2138 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 2197

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2198 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 2257

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2258 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 2317

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2318 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 2377

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2378 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 2437

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2438 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 2497

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2498 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 2557

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2558 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 2617

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2618 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 2677

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2678 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 2737

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2738 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 2797

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2798 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 2857

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2858 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 2917

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2918 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 2977

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2978 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 3037

 21728066 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 21728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3038 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 3097

 21728126 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 21728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3098 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 3157

 21728186 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 21728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3158 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 3217

 21728246 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 21728305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3218 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATATGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 3277

 21728306 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 21728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3278 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 3337

 21728366 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 21728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3338 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 3397

 21728426 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 21728485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3398 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 3457

 21728486 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 21728545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3458 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 3517

 21728546 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 21728605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3518 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 3577

 21728606 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 21728665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3578 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 3637

 21728666 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 21728725
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3638 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGAGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 3697

 21728726 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAA 21728785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3698 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAATCCAAA 3757

 21728786 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 21728845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3758 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 3817

 21728846 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 21728905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3818 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 3877

 21728906 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 21728965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3878 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 3937

 21728966 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 21729025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3938 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 3997

 21729026 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 21729085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3998 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 4057

 21729086 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 21729145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4058 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 4117

 21729146 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 21729205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4118 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 4177

 21729206 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 21729265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4178 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 4237

 21729266 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 21729325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4238 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 4297

 21729326 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 21729385
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4298 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCTATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 4357

 21729386 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 21729445
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4358 CAAAATCTG-TTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 4416

 21729446 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 21729505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4417 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 4476

 21729506 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 21729565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4477 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 4536

 21729566 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 21729625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4537 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 4596

 21729626 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 21729685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4597 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 4656

 21729686 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 21729745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4657 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 4716

 21729746 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 21729805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4717 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 4776

 21729806 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTA 21729842
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTA 4813

Alignment time is 4.3987 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4916] =>      4916 nucs 'mol-32-32f0-002331_4916'

Score:        4745
Aligned:      4897        nucs
Identic:      4875 (100%) nucs =>       822 ( 98%)      4053 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21722877,21723705] EXCISED REGION [21725967,21730025]
 second seq =>  [       1,     832] EXCISED REGION [     857,    4916]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2261 nucs [21723706,21725966]
 second seq =>        24 nucs [833,856]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723705,21723705] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [833,833] to [857,857]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723706,21723706] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [833,833] to [856,856]

 21722877 TTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTA 21722936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTA 60

 21722937 ATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCA 21722996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCA 120

 21722997 AGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAA 21723056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAA 180

 21723057 ATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTG 21723116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTG 240

 21723117 CATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAAT 21723176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAAT 300

 21723177 GATAAAAAAAAACGAAAAAAAAAAA----ACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACC 21723232
          |||.|||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GATTAAAAAAAACGAAAAAAAAAAACCAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACC 360

 21723233 AAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAA 21723292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAA 420

 21723293 CTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGA-GGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATT 21723351
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATT 480

 21723352 GGCTCAGGTATTGAAAACATGTA---AAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTG 21723408
          ||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGCTCAGGTATTGAAAAC-----GTGAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTG 535

 21723409 GATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAA 21723468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 GATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAA 595

 21723469 AACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCA 21723528
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 AACCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCA 655

 21723529 CAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAG 21723588
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 CAGTAAGTCTAACTGTTGGACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAG 715

 21723589 CCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATC 21723648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 CCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATC 775

 21723649 TAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 21723705
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 TAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 832

EXCISED REGION

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      857 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAC 916

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      917 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 976

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      977 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 1036

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1037 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 1096

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1097 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 1156

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 1216

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1217 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 1276

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1277 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 1336

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 1396

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 1456

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 1516

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 1576

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 1636

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 1696

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 1756

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 1816

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 1876

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 1936

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1937 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 1996

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 2056

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 2116

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 2176

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 2236

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 2296

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 2356

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 2416

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 2476

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 2536

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 2596

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 2656

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 2716

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 2776

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 2836

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 2896

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 2956

 21728066 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 21728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 3016

 21728126 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 21728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 3076

 21728186 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 21728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 3136

 21728246 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 21728305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATATGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 3196

 21728306 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 21728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 3256

 21728366 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 21728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 3316

 21728426 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 21728485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 3376

 21728486 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 21728545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 3436

 21728546 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 21728605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3437 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 3496

 21728606 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 21728665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3497 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 3556

 21728666 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 21728725
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3557 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGAGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 3616

 21728726 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAA 21728785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3617 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAATCCAAA 3676

 21728786 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 21728845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3677 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 3736

 21728846 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 21728905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3737 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 3796

 21728906 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 21728965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3797 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 3856

 21728966 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 21729025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 3916

 21729026 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 21729085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 3976

 21729086 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 21729145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3977 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 4036

 21729146 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 21729205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 4096

 21729206 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 21729265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 4156

 21729266 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 21729325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 4216

 21729326 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 21729385
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCTATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 4276

 21729386 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 21729445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 4336

 21729446 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 21729505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4337 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 4396

 21729506 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 21729565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 4456

 21729566 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 21729625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4457 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 4516

 21729626 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 21729685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4517 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 4576

 21729686 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 21729745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4577 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 4636

 21729746 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 21729805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4637 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 4696

 21729806 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 21729865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4697 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 4756

 21729866 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 21729925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4757 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 4816

 21729926 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACACATAATGACAT 21729985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4817 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACACATAATGACAT 4876

 21729986 TATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAAACA 21730025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4877 TATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAAACA 4916

Alignment time is 4.63632 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3897] =>      3897 nucs 'mol-32-3306-059492_3897'

Score:        3874
Aligned:      3896        nucs
Identic:      3894 (100%) nucs =>       401 (100%)      3493 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21725962,21726362] EXCISED REGION [21726364,21729858]
 second seq =>  [       1,     401] EXCISED REGION [     403,    3897]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [21726363,21726363]
 second seq =>         1 nucs [402,402]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [402,402] to [403,403]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 21725962 ACCATCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTA 21726021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCATCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTA 60

 21726022 ATAAGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCA 21726081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATAAGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCA 120

 21726082 CATTAATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCA 21726141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATTAATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCA 180

 21726142 TAGTTTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATT 21726201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGTTTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATT 240

 21726202 TGCAAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCA 21726261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGCAAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCA 300

 21726262 TTTTTATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAA 21726321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTTATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAA 360

 21726322 AAAAATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATC 21726362
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAAATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATC 401

EXCISED REGION

 21726364 TAAGTGAAACTGGAGTGCTTCTTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCA 21726423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      403 TAAGTGAAACTGGAGTGCTTCTTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCA 462

 21726424 GCAAACTCGTATGGCAATTTGGAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTA 21726483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      463 GCAAACTCGTATGGCAATTTGGAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTA 522

 21726484 GCAAGGAAACCAATGGGCTCCATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGC 21726543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      523 GCAAGGAAACCAATGGGCTCCATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGC 582

 21726544 ATTTCTAACTTGTATGTGATAAAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGC 21726603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      583 ATTTCTAACTTGTATGTGATAAAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGC 642

 21726604 AAAATCCTGGCCCATACAGGTGTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTT 21726663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      643 AAAATCCTGGCCCATACAGGTGTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTT 702

 21726664 GTCTCAGCAAGAGAGAAATAGATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTA 21726723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      703 GTCTCAGCAAGAGAGAAATAGATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTA 762

 21726724 ATATTCAAGAAATGCAAGAGGAGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAA 21726783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      763 ATATTCAAGAAATGCAAGAGGAGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAA 822

 21726784 ACATTACTTGCCTTGGTGACAAGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAA 21726843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      823 ACATTACTTGCCTTGGTGACAAGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAA 882

 21726844 AATATTAAGCTTAACAAAGAGAAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAA 21726903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      883 AATATTAAGCTTAACAAAGAGAAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAA 942

 21726904 GACAGCAGAAGTGGCAGACTCGTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTT 21726963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      943 GACAGCAGAAGTGGCAGACTCGTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTT 1002

 21726964 TACATCTACATCACAGGTTTTTCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTT 21727023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1003 TACATCTACATCACAGGTTTTTCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTT 1062

 21727024 ACTTATCAAACAGACAAGCAGCACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCAC 21727083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1063 ACTTATCAAACAGACAAGCAGCACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCAC 1122

 21727084 CAAAGAGCCGCTTCACCTGATGGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGC 21727143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 CAAAGAGCCGCTTCACCTGATGGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGC 1182

 21727144 TCTGAATAGCATGGCTCATAAAAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTA 21727203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1183 TCTGAATAGCATGGCTCATAAAAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTA 1242

 21727204 GTAATTGGCATTACCTAATTATCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACAT 21727263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1243 GTAATTGGCATTACCTAATTATCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACAT 1302

 21727264 CTGCCTATCCTAATTTAGAAAATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGG 21727323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 CTGCCTATCCTAATTTAGAAAATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGG 1362

 21727324 TTTTGGCCAAGAAACACAGTAAAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTC 21727383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1363 TTTTGGCCAAGAAACACAGTAAAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTC 1422

 21727384 TCCCAGGCAATAATTCCTCAACTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAA 21727443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 TCCCAGGCAATAATTCCTCAACTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAA 1482

 21727444 AGAAGAAAGAGAACAATGGTGAAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTC 21727503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 AGAAGAAAGAGAACAATGGTGAAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTC 1542

 21727504 CAGCCTGGCTTTCCCAAAAAATGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCAT 21727563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 CAGCCTGGCTTTCCCAAAAAATGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCAT 1602

 21727564 GTGACCTATATAAGAATGATTAAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGA 21727623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 GTGACCTATATAAGAATGATTAAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGA 1662

 21727624 AATTTAAAAGTAACCTTTTTTTAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAA 21727683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 AATTTAAAAGTAACCTTTTTTTAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAA 1722

 21727684 AGTGTACAAATGTGTACTCAAATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAA 21727743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 AGTGTACAAATGTGTACTCAAATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAA 1782

 21727744 CACCAAATTGTTATTGTGTTTGGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAG 21727803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 CACCAAATTGTTATTGTGTTTGGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAG 1842

 21727804 ATTATGCGTAGGTATAAAAAGATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGT 21727863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 ATTATGCGTAGGTATAAAAAGATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGT 1902

 21727864 AAAAAAATAACCATTTGTAGTTGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAG 21727923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 AAAAAAATAACCATTTGTAGTTGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAG 1962

 21727924 CAATACTGAACTATCGCAATATAATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTG 21727983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 CAATACTGAACTATCGCAATATAATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTG 2022

 21727984 AATTTCCTAGTAGCCACACCAAAAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATAT 21728043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 AATTTCCTAGTAGCCACACCAAAAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATAT 2082

 21728044 TTTATTCAACCCAAATAAAGGCAAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATG 21728103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 TTTATTCAACCCAAATAAAGGCAAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATG 2142

 21728104 TACAAAGCCTTTGAAAACCAGTGTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGG 21728163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 TACAAAGCCTTTGAAAACCAGTGTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGG 2202

 21728164 ACTAGCTAATTTTAAGTGTGCAGTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGT 21728223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 ACTAGCTAATTTTAAGTGTGCAGTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGT 2262

 21728224 GCAGACCTAGAACTTAATGTGCAATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGA 21728283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 GCAGACCTAGAACTTAATGTGCAATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGA 2322

 21728284 AATTAGTTATAGATTCAAGGTTTAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGA 21728343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 AATTAGTTATAGATTCAAGGTTTAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGA 2382

 21728344 TCTTACCTTTATATTTCTGGTCATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTG 21728403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 TCTTACCTTTATATTTCTGGTCATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTG 2442

 21728404 CTGGTTCTCCCATCCTGAAAGGGAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTC 21728463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 CTGGTTCTCCCATCCTGAAAGGGAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTC 2502

 21728464 ATAACTTGTCTTGACCAGTGGAATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCA 21728523
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 ATAACTTGTCTTGACCAGTGGAATGCGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCA 2562

 21728524 GGCCTCAAGAGACCCTGCAGCTCCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAA 21728583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 GGCCTCAAGAGACCCTGCAGCTCCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAA 2622

 21728584 TAGGTAAGGAAGCCAGACCAGCTTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCA 21728643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 TAGGTAAGGAAGCCAGACCAGCTTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCA 2682

 21728644 GATCCACAGTCAACAGCCAGCAGCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCT 21728703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2683 GATCCACAGTCAACAGCCAGCAGCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCT 2742

 21728704 TATAACCCAGGTGACCCACAAGATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGC 21728763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 TATAACCCAGGTGACCCACAAGATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGC 2802

 21728764 AGAGGAAGTGCTCAAACCCAAAATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCA 21728823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 AGAGGAAGTGCTCAAACCCAAAATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCA 2862

 21728824 GTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGTTAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTC 21728883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 GTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGTTAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTC 2922

 21728884 ATAATTTTTTTTATTAATAGGCCACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGC 21728943
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2923 ATAATTTTTTTTATTAATAGGCCACTTTTTGGAACAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGC 2982

 21728944 ACAGGAAAGCACAGCAATTTCCCATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCC 21729003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 ACAGGAAAGCACAGCAATTTCCCATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCC 3042

 21729004 ATTATCAACATCCCCCACCAGAGTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACAC 21729063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 ATTATCAACATCCCCCACCAGAGTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACAC 3102

 21729064 ATCATTATTGTCCAGGGTTCATAGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGT 21729123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 ATCATTATTGTCCAGGGTTCATAGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGT 3162

 21729124 GTTGTACATTCCCTGGGTTTGGACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACA 21729183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 GTTGTACATTCCCTGGGTTTGGACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACA 3222

 21729184 GTTTTATTGCCCTAAAAATTCTCTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAA 21729243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 GTTTTATTGCCCTAAAAATTCTCTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAA 3282

 21729244 ATTCATAGGAAATAAATATAAAAAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTAC 21729303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 ATTCATAGGAAATAAATATAAAAAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTAC 3342

 21729304 AATTTTGATTTGTTTCATTTGAGAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTG 21729363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 AATTTTGATTTGTTTCATTTGAGAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTG 3402

 21729364 TAGAAAAGTCTGACAATGTAAACAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGT 21729423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 TAGAAAAGTCTGACAATGTAAACAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGT 3462

 21729424 CACCCAGGCTTGGAATGCAGTAGCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGC 21729483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 CACCCAGGCTTGGAATGCAGTAGCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGC 3522

 21729484 TCAAGGGATCCTGCTACCTTAGCCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAA 21729543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 TCAAGGGATCCTGCTACCTTAGCCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAA 3582

 21729544 TTTTTTTTAAACATCATGGTAACTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTC 21729603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 TTTTTTTTAAACATCATGGTAACTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTC 3642

 21729604 TCTACTATTATTTTTGGTGCCTCTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAG 21729663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 TCTACTATTATTTTTGGTGCCTCTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAG 3702

 21729664 GGGAACAAACACATTAGTTTGCAAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGG 21729723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 GGGAACAAACACATTAGTTTGCAAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGG 3762

 21729724 AATAATTGTATATCTTAAATATACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCT 21729783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 AATAATTGTATATCTTAAATATACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCT 3822

 21729784 ATTTTAGGGATATACCATAACTAGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTAT 21729843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 ATTTTAGGGATATACCATAACTAGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTAT 3882

 21729844 GTCCAGTATTTATTA 21729858
          |||||||||||||||
     3883 GTCCAGTATTTATTA 3897

Alignment time is 3.68688 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4841] =>      4841 nucs 'mol-32-3306-172226_4841'

Score:        4670
Aligned:      4822        nucs
Identic:      4800 (100%) nucs =>       817 ( 98%)      3983 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21722882,21723705] EXCISED REGION [21725967,21729955]
 second seq =>  [       1,     827] EXCISED REGION [     852,    4841]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2261 nucs [21723706,21725966]
 second seq =>        24 nucs [828,851]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723705,21723705] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [828,828] to [852,852]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723706,21723706] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [828,828] to [851,851]

 21722882 TTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAG 21722941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAG 60

 21722942 ATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGG 21723001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGG 120

 21723002 AGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATA 21723061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATA 180

 21723062 CATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATAT 21723121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATAT 240

 21723122 ATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAA 21723181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      241 ATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATTA 300

 21723182 AAAAAAACGAAAAAAAAAAA----ACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAA 21723237
          ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAAAAAACGAAAAAAAAAAACCAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAA 360

 21723238 AATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAA 21723297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAA 420

 21723298 TGTGATGAAATGAGGGAAAGAGA-GGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTC 21723356
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTC 480

 21723357 AGGTATTGAAAACATGTA---AAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATAC 21723413
          |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGGTATTGAAAAC-----GTGAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATAC 535

 21723414 CTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCA 21723473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 CTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCA 595

 21723474 TCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTA 21723533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 TCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTA 655

 21723534 AGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACA 21723593
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      656 AGTCTAACTGTTGGACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACA 715

 21723594 TTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACA 21723653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 TTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACA 775

 21723654 AAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 21723705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 AAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 827

EXCISED REGION

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      852 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAC 911

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      912 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 971

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 1031

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 1091

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 1151

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 1211

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1212 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 1271

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 1331

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 1391

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 1451

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 1511

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 1571

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 1631

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 1691

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 1751

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 1811

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 1871

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 1931

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 1991

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 2051

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 2111

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 2171

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 2231

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 2291

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 2351

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 2411

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 2471

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 2531

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 2591

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 2651

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 2711

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 2771

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 2831

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 2891

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 2951

 21728066 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 21728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 3011

 21728126 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 21728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 3071

 21728186 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 21728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 3131

 21728246 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 21728305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATATGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 3191

 21728306 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 21728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 3251

 21728366 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 21728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 3311

 21728426 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 21728485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 3371

 21728486 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 21728545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 3431

 21728546 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 21728605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 3491

 21728606 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 21728665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 3551

 21728666 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 21728725
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGAGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 3611

 21728726 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAA 21728785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3612 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAATCCAAA 3671

 21728786 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 21728845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 3731

 21728846 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 21728905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 3791

 21728906 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 21728965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3792 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 3851

 21728966 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 21729025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 3911

 21729026 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 21729085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 3971

 21729086 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 21729145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 4031

 21729146 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 21729205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 4091

 21729206 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 21729265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4092 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 4151

 21729266 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 21729325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 4211

 21729326 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 21729385
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCTATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 4271

 21729386 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 21729445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4272 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 4331

 21729446 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 21729505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4332 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 4391

 21729506 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 21729565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4392 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 4451

 21729566 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 21729625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4452 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 4511

 21729626 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 21729685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4512 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 4571

 21729686 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 21729745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4572 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 4631

 21729746 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 21729805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4632 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 4691

 21729806 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 21729865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4692 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 4751

 21729866 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 21729925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4752 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 4811

 21729926 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGA 21729955
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     4812 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGA 4841

Alignment time is 4.75987 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4774] =>      4774 nucs 'mol-32-331c-015386_4774'

Score:        4603
Aligned:      4755        nucs
Identic:      4733 (100%) nucs =>       858 ( 98%)      3875 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21722841,21723705] EXCISED REGION [21725967,21729847]
 second seq =>  [       1,     868] EXCISED REGION [     893,    4774]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2261 nucs [21723706,21725966]
 second seq =>        24 nucs [869,892]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723705,21723705] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [869,869] to [893,893]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723706,21723706] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [869,869] to [892,892]

 21722841 TAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGC 21722900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGC 60

 21722901 TGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGC 21722960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGC 120

 21722961 TTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGC 21723020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGC 180

 21723021 TGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGT 21723080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGT 240

 21723081 AGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTAC 21723140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTAC 300

 21723141 ACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAAAA 21723200
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      301 ACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATTAAAAAAAACGAAAAAAAAAA 360

 21723201 A----ACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGT 21723256
          |    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ACCAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGT 420

 21723257 GCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAA 21723316
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAA 480

 21723317 GAGA-GGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTA- 21723374
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
      481 GAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAAC-----G 535

 21723375 --AAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAA 21723432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      536 TGAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAA 595

 21723433 CTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACA 21723492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      596 CTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACA 655

 21723493 TCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAA 21723552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      656 TCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGGACCAA 715

 21723553 TTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAA 21723612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      716 TTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAA 775

 21723613 AGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAAT 21723672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      776 AGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAAT 835

 21723673 CTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 21723705
          |||||||||||||||||||||||||||||||||
      836 CTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 868

EXCISED REGION

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      893 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAC 952

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      953 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 1012

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1013 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 1072

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 1132

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 1192

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 1252

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1253 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 1312

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 1372

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 1432

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 1492

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 1552

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 1612

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 1672

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1673 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 1732

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1733 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 1792

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1793 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 1852

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1853 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 1912

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1913 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 1972

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1973 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 2032

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2033 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 2092

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2093 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 2152

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2153 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 2212

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2213 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 2272

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2273 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 2332

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2333 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 2392

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2393 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 2452

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2453 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 2512

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2513 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 2572

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2573 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 2632

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2633 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 2692

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2693 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 2752

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2753 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 2812

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2813 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 2872

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2873 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 2932

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2933 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 2992

 21728066 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 21728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2993 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 3052

 21728126 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 21728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3053 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 3112

 21728186 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 21728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3113 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 3172

 21728246 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 21728305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3173 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATATGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 3232

 21728306 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 21728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3233 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 3292

 21728366 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 21728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3293 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 3352

 21728426 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 21728485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3353 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 3412

 21728486 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 21728545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3413 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 3472

 21728546 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 21728605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3473 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 3532

 21728606 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 21728665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3533 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 3592

 21728666 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 21728725
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3593 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGAGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 3652

 21728726 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAA 21728785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3653 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAATCCAAA 3712

 21728786 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 21728845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3713 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 3772

 21728846 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 21728905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3773 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 3832

 21728906 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 21728965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3833 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 3892

 21728966 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 21729025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3893 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 3952

 21729026 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 21729085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3953 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 4012

 21729086 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 21729145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4013 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 4072

 21729146 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 21729205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4073 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 4132

 21729206 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 21729265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4133 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 4192

 21729266 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 21729325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4193 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 4252

 21729326 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 21729385
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4253 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCTATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 4312

 21729386 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 21729445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4313 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 4372

 21729446 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 21729505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4373 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 4432

 21729506 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 21729565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4433 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 4492

 21729566 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 21729625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4493 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 4552

 21729626 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 21729685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4553 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 4612

 21729686 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 21729745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4613 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 4672

 21729746 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 21729805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4673 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 4732

 21729806 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCC 21729847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4733 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCC 4774

Alignment time is 4.50765 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    4910] =>      4910 nucs 'mol-32-3327-091373_4910'

Score:        4728
Aligned:      4891        nucs
Identic:      4868 (100%) nucs =>       518 ( 97%)      4350 (100%)
Gaps:           14 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21723182,21723705] EXCISED REGION [21725967,21730324]
 second seq =>  [       1,     527] EXCISED REGION [     552,    4910]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2261 nucs [21723706,21725966]
 second seq =>        24 nucs [528,551]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723705,21723705] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [528,528] to [552,552]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723706,21723706] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [528,528] to [551,551]

 21723182 AAAAAAACGAAAAAAAAAAA----ACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAA 21723237
          ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAAACGAAAAAAAAAAACCAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAA 60

 21723238 AATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAA 21723297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAA 120

 21723298 TGTGATGAAATGAGGGAAAGAGA-GGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTC 21723356
          ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTC 180

 21723357 AGGTATTGAAAACATGTA---AAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATAC 21723413
          |||||||||||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGTATTGAAAAC-----GTGAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATAC 235

 21723414 CTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCA 21723473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      236 CTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCA 295

 21723474 TCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTA 21723533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      296 TCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTA 355

 21723534 AGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACA 21723593
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      356 AGTCTAACTGTTGGACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACA 415

 21723594 TTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACA 21723653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      416 TTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACA 475

 21723654 AAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 21723705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      476 AAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 527

EXCISED REGION

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      552 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAC 611

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      612 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 671

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      672 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 731

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      732 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 791

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      792 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 851

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      852 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 911

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      912 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 971

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      972 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 1031

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1032 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 1091

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1092 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 1151

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1152 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 1211

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1212 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 1271

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1272 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 1331

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1332 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 1391

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1392 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 1451

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1452 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 1511

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1512 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 1571

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1572 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 1631

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1632 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 1691

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1692 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 1751

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1752 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 1811

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1812 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 1871

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1872 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 1931

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1932 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 1991

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1992 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 2051

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2052 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 2111

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 2171

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 2231

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 2291

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 2351

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 2411

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 2471

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 2531

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 2591

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 2651

 21728066 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 21728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 2711

 21728126 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 21728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 2771

 21728186 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 21728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 2831

 21728246 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 21728305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATATGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 2891

 21728306 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 21728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2892 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 2951

 21728366 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 21728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 3011

 21728426 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 21728485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3012 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 3071

 21728486 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 21728545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 3131

 21728546 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 21728605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 3191

 21728606 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 21728665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 3251

 21728666 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 21728725
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3252 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGAGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 3311

 21728726 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAA 21728785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3312 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAATCCAAA 3371

 21728786 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 21728845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3372 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 3431

 21728846 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 21728905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 3491

 21728906 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 21728965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 3551

 21728966 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 21729025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 3611

 21729026 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 21729085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 3671

 21729086 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 21729145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3672 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 3731

 21729146 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 21729205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3732 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 3791

 21729206 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 21729265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3792 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 3851

 21729266 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 21729325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 3911

 21729326 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 21729385
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCTATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 3971

 21729386 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 21729445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 4031

 21729446 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 21729505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 4091

 21729506 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 21729565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4092 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 4151

 21729566 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 21729625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 4211

 21729626 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 21729685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 4271

 21729686 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 21729745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4272 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 4331

 21729746 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 21729805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4332 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 4391

 21729806 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 21729865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4392 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 4451

 21729866 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 21729925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4452 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 4511

 21729926 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACACATAATGACAT 21729985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4512 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACACATAATGACAT 4571

 21729986 TATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAAACAAGTCTTTATCACAGCTAGAC 21730045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4572 TATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAAACAAGTCTTTATCACAGCTAGAC 4631

 21730046 ATTAACTACATTCTTTCTGAATCTCAGCTCCTTTAGGTGGTTTTATCAATGTATCTGTTC 21730105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4632 ATTAACTACATTCTTTCTGAATCTCAGCTCCTTTAGGTGGTTTTATCAATGTATCTGTTC 4691

 21730106 CCATAGTGCATGGATATCCAATAAACTGTCTTTTAAATCCATGAATTCTTCCATAAACTA 21730165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4692 CCATAGTGCATGGATATCCAATAAACTGTCTTTTAAATCCATGAATTCTTCCATAAACTA 4751

 21730166 TTGCTGTCTGATGAAATTCTAATATGCATTTAATTAACAACTCTAGGAATGCAACATGAA 21730225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4752 TTGCTGTCTGATGAAATTCTAATATGCATTTAATTAACAACTCTAGGAATGCAACATGAA 4811

 21730226 AACTAAATACCAAGCTCTATAATTTTTAAAATGACACAAAGAGAGATTTCTCAGTTCCCA 21730285
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
     4812 AACTAAATACCAAGCTCTATTATTTTTAAAATGACACAAAGAGAAATTTCTCAGTTCCCA 4871

 21730286 CTCAACAGCTTTGTATTATACCATATGTTTAGAAAATCA 21730324
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4872 CTCAACAGCTTTGTATTATACCATATGTTTAGAAAATCA 4910

Alignment time is 4.50164 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    6214] =>      6214 nucs 'mol-32-3332-177460_6214'

Score:        6182
Aligned:      6215        nucs
Identic:      6212 (100%) nucs =>      2286 (100%)      3926 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21723608,21725894] EXCISED REGION [21725905,21729832]
 second seq =>  [       1,    2286] EXCISED REGION [    2287,    6214]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        10 nucs [21725895,21725904]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>        19 nucs [21725876,21725894] to [21725905,21725923]
 second seq =>        19 nucs [2268,2286] to [2287,2305]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21725895,21725895] to [21725904,21725904]
 second seq =>         0 nucs

 21723608 AGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGC 21723667
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGC 60

 21723668 TGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTA 21723727
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTA 120

 21723728 GAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACA 21723787
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACA 180

 21723788 ACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTA 21723847
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTA 240

 21723848 AGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTA 21723907
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTA 300

 21723908 ATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTT 21723967
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTT 360

 21723968 CCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAA 21724027
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAA 420

 21724028 GAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAG 21724087
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAG 480

 21724088 GGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAA 21724147
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAA 540

 21724148 AATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCA 21724207
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCA 600

 21724208 GGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGC 21724267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGC 660

 21724268 TTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAG 21724327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAG 720

 21724328 CCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAA 21724387
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAA 780

 21724388 GATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCA 21724447
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCA 840

 21724448 GAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGAC 21724507
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGAC 900

 21724508 ACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCT 21724567
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 ACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCT 960

 21724568 AATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAA 21724627
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAA 1020

 21724628 TTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGT 21724687
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGT 1080

 21724688 GTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTG 21724747
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTG 1140

 21724748 TACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGG 21724807
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGG 1200

 21724808 TTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTT 21724867
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTT 1260

 21724868 TGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACT 21724927
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACT 1320

 21724928 GTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTG 21724987
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTG 1380

 21724988 TAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTT 21725047
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTT 1440

 21725048 GCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCT 21725107
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCT 1500

 21725108 CAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCG 21725167
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCG 1560

 21725168 AAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCC 21725227
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCC 1620

 21725228 TGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCC 21725287
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCC 1680

 21725288 AGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTA 21725347
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTA 1740

 21725348 ACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCC 21725407
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCC 1800

 21725408 AGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTG 21725467
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTG 1860

 21725468 CTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAG 21725527
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAG 1920

 21725528 TTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCC 21725587
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCC 1980

 21725588 ACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGT 21725647
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGT 2040

 21725648 CTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCG 21725707
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCG 2100

 21725708 CCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCT 21725767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCT 2160

 21725768 GGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCA 21725827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCA 2220

 21725828 CACTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT 21725887
          |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CACTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCTC-TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT 2279

 21725888 CTCTCTC 21725894
          |||||||
     2280 CTCTCTC 2286

EXCISED REGION

 21725905 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATTCTTTACC 21725964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 CTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATTCTTTACC 2346

 21725965 ATCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATA 21726024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 ATCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATA 2406

 21726025 AGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACAT 21726084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 AGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACAT 2466

 21726085 TAATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAG 21726144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 TAATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAG 2526

 21726145 TTTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGC 21726204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 TTTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGC 2586

 21726205 AAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTT 21726264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 AAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTT 2646

 21726265 TTATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAA 21726324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 TTATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAA 2706

 21726325 AATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTC 21726384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2707 AATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTC 2766

 21726385 TTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTG 21726444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 TTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTG 2826

 21726445 GAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCC 21726504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 GAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCC 2886

 21726505 ATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATA 21726564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 ATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATA 2946

 21726565 AAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGT 21726624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 AAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGT 3006

 21726625 GTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAG 21726684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 GTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAG 3066

 21726685 ATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGG 21726744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 ATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGG 3126

 21726745 AGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACA 21726804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 AGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACA 3186

 21726805 AGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAG 21726864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 AGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAG 3246

 21726865 AAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTC 21726924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 AAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTC 3306

 21726925 GTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTT 21726984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 GTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTT 3366

 21726985 TCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAG 21727044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 TCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAG 3426

 21727045 CACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGAT 21727104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 CACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGAT 3486

 21727105 GGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAA 21727164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 GGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAA 3546

 21727165 AAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTA 21727224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 AAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTA 3606

 21727225 TCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAA 21727284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 TCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAA 3666

 21727285 ATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTA 21727344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 ATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTA 3726

 21727345 AAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAA 21727404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 AAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAA 3786

 21727405 CTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTG 21727464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 CTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTG 3846

 21727465 AAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAA 21727524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 AAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAA 3906

 21727525 TGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATT 21727584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 TGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATT 3966

 21727585 AAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTT 21727644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 AAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTT 4026

 21727645 TAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAA 21727704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 TAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAA 4086

 21727705 ATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTT 21727764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 ATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTT 4146

 21727765 GGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAG 21727824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 GGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAG 4206

 21727825 ATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGT 21727884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 ATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGT 4266

 21727885 TGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATA 21727944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 TGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATA 4326

 21727945 TAATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCA 21728004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 TAATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCA 4386

 21728005 AAAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGG 21728064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 AAAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGG 4446

 21728065 CAAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAG 21728124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 CAAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAG 4506

 21728125 TGTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGC 21728184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 TGTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGC 4566

 21728185 AGTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTG 21728244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 AGTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTG 4626

 21728245 CAATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGT 21728304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 CAATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGT 4686

 21728305 TTAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGT 21728364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 TTAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGT 4746

 21728365 CATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAG 21728424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 CATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAG 4806

 21728425 GGAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGG 21728484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 GGAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGG 4866

 21728485 AATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGC 21728544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 AATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGC 4926

 21728545 TCCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAG 21728604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 TCCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAG 4986

 21728605 CTTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGC 21728664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 CTTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGC 5046

 21728665 AGCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAA 21728724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 AGCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAA 5106

 21728725 GATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAA 21728784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 GATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAA 5166

 21728785 AATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTG 21728844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 AATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTG 5226

 21728845 TTAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGG 21728904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 TTAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGG 5286

 21728905 CCACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTC 21728964
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 CCACTTTTTGGAACAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTC 5346

 21728965 CCATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAG 21729024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 CCATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAG 5406

 21729025 AGTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCA 21729084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 AGTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCA 5466

 21729085 TAGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTG 21729144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 TAGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTG 5526

 21729145 GACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTC 21729204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 GACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTC 5586

 21729205 TCTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAA 21729264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 TCTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAA 5646

 21729265 AAAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTG 21729324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 AAAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTG 5706

 21729325 AGAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAA 21729384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 AGAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAA 5766

 21729385 ACAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGT 21729444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 ACAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGT 5826

 21729445 AGCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTA 21729504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 AGCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTA 5886

 21729505 GCCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTA 21729564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 GCCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTA 5946

 21729565 ACTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCC 21729624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 ACTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCC 6006

 21729625 TCTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTG 21729684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 TCTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTG 6066

 21729685 CAAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATA 21729744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 CAAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATA 6126

 21729745 TACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAAC 21729804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 TACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAAC 6186

 21729805 TAGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTC 21729832
          ||||||||||||||||||||||||||||
     6187 TAGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTC 6214

Alignment time is 5.47723 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2324] =>      2324 nucs 'mol-32-33ab-138881_2324'

Score:        2309
Aligned:      2320        nucs
Identic:      2319 (100%) nucs =>      2301 (100%)        18 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21723525,21725826] EXCISED REGION [21725832,21725849]
 second seq =>  [       1,    2301] EXCISED REGION [    2307,    2324]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         5 nucs [21725827,21725831]
 second seq =>         5 nucs [2302,2306]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21725827,21725827] to [21725832,21725832]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 21723525 ACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATG 21723584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATG 60

 21723585 TAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGA 21723644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGA 120

 21723645 AATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAG 21723704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAG 180

 21723705 TTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTA 21723764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTA 240

 21723765 ATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGAT 21723824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGAT 300

 21723825 TAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAA 21723884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAA 360

 21723885 GAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAA 21723944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAA 420

 21723945 TGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAG 21724004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAG 480

 21724005 GATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAA 21724064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAA 540

 21724065 AGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTG 21724124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTG 600

 21724125 GGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAA 21724184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAA 660

 21724185 TCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAG 21724244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAG 720

 21724245 GGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGT 21724304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGT 780

 21724305 CTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGT 21724364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGT 840

 21724365 ACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGC 21724424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGC 900

 21724425 TGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAA 21724484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAA 960

 21724485 ATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTT 21724544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTT 1020

 21724545 TTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGAT 21724604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGAT 1080

 21724605 GCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAAC 21724664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAAC 1140

 21724665 CTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCC 21724724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCC 1200

 21724725 CCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTG 21724784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTG 1260

 21724785 TGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAG 21724844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAG 1320

 21724845 ATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGA 21724904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGA 1380

 21724905 TCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAG 21724964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAG 1440

 21724965 CTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTG 21725024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTG 1500

 21725025 CTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTG 21725084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 CTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTG 1560

 21725085 GGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTA 21725144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAAA-GAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTA 1619

 21725145 AGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAG 21725204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 AGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAG 1679

 21725205 GATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGT 21725264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 GATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGT 1739

 21725265 CTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACA 21725324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 CTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACA 1799

 21725325 ACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGA 21725384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 ACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGA 1859

 21725385 GTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAA 21725444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAA 1919

 21725445 CAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAAT 21725504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAAT 1979

 21725505 GTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGAC 21725564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGAC 2039

 21725565 ACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACA 21725624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 ACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACA 2099

 21725625 TATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCC 21725684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 TATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCC 2159

 21725685 TGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATAC 21725744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 TGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATAC 2219

 21725745 TTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCT 21725804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCT 2279

 21725805 CGTATGTTTGACAAACTTCACC 21725826
          ||||||||||||||||||||||
     2280 CGTATGTTTGACAAACTTCACC 2301

EXCISED REGION

 21725832 AAAGCCATAAATGGTTAA 21725849
          ||||||||||||||||||
     2307 AAAGCCATAAATGGTTAA 2324

Alignment time is 2.73849 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    2458] =>      2458 nucs 'mol-32-3403-162428_2458'

Score:        2447
Aligned:      2458        nucs
Identic:      2457 (100%) nucs =>       304 (100%)      2153 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21723418,21723721] EXCISED REGION [21723723,21725876]
 second seq =>  [       1,     304] EXCISED REGION [     306,    2458]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [21723722,21723722]
 second seq =>         1 nucs [305,305]
ALTERNATIVE REGION(S): 16
 first  seq =>         7 nucs [21725858,21725864]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723722,21723722] to [21723723,21723723]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 21723418 AGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCAT 21723477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCAT 60

 21723478 GACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTC 21723537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTC 120

 21723538 TAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTG 21723597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTG 180

 21723598 ATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAAT 21723657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAAT 240

 21723658 AAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCC 21723717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCC 300

 21723718 TTTT 21723721
          ||||
      301 TTTT 304

EXCISED REGION

 21723723 AGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGT 21723782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      306 AGTTAGAAGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGT 365

 21723783 ACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAA 21723842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      366 ACACAACCTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAA 425

 21723843 GAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTG 21723902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      426 GAGTAAGGGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTG 485

 21723903 ACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTT 21723962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      486 ACTTAATTGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTT 545

 21723963 CATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTC 21724022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      546 CATTTCCACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTC 605

 21724023 TGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTT 21724082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      606 TGGAAGAAAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTT 665

 21724083 TTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTG 21724142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      666 TTTAGGGAAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTG 725

 21724143 TACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCT 21724202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      726 TACAAAATTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCT 785

 21724203 GAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATT 21724262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      786 GAGCAGGAGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATT 845

 21724263 TAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAA 21724322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      846 TAAGCTTTGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAA 905

 21724323 AGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTT 21724382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      906 AGCAGCCATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTT 965

 21724383 TCTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTG 21724442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      966 TCTAAGATAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTG 1025

 21724443 GTCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATT 21724502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1026 GTCCAGAGAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATT 1085

 21724503 AAGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAG 21724562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1086 AAGACACAGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAG 1145

 21724563 CTGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCC 21724622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1146 CTGCTAATTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCC 1205

 21724623 ACAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGA 21724682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1206 ACAAATTGAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGA 1265

 21724683 TGTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCC 21724742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1266 TGTGTGTCTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCC 1325

 21724743 TGCTGTACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGA 21724802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1326 TGCTGTACACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGA 1385

 21724803 TTAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAG 21724862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1386 TTAGGTTATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAG 1445

 21724863 CACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTA 21724922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1446 CACTTTGGGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTA 1505

 21724923 ACACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGC 21724982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1506 ACACTGTGAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGC 1565

 21724983 ATCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGA 21725042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1566 ATCTGTAGTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGA 1625

 21725043 AGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTC 21725102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1626 AGGTTGCAGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTC 1685

 21725103 CATCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAA 21725162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1686 CATCTCAAAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAA 1745

 21725163 AAGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTAC 21725222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1746 AAGCGAAGAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTAC 1805

 21725223 TGGCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTA 21725282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1806 TGGCCTGAAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTA 1865

 21725283 GCCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTC 21725342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1866 GCCCCAGGGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTC 1925

 21725343 TGCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTC 21725402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1926 TGCTAACAAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTC 1985

 21725403 AGTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACAT 21725462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1986 AGTCCAGCCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACAT 2045

 21725463 CTGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCA 21725522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2046 CTGTGCTGGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCA 2105

 21725523 CCAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATAT 21725582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2106 CCAAGTTTCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATAT 2165

 21725583 GTCCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATC 21725642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2166 GTCCCACTTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATC 2225

 21725643 ACTGTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATA 21725702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2226 ACTGTCTCCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATA 2285

 21725703 AAGCGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCT 21725762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2286 AAGCGCCATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCT 2345

 21725763 CTTCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTT 21725822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2346 CTTCTGGTTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTT 2405

 21725823 CACCACACTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 21725876
          |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
     2406 CACCACACTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCT-CTCTCTCTCTCTCTCTCTC 2458

Alignment time is 3.02935 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    6064] =>      6064 nucs 'mol-32-3419-047201_6064'

Score:        5791
Aligned:      6053        nucs
Identic:      6003 ( 99%) nucs =>      1932 ( 98%)      4071 (100%)
Gaps:           39 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21721756,21723705] EXCISED REGION [21725967,21730043]
 second seq =>  [       1,    1962] EXCISED REGION [    1987,    6064]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      2261 nucs [21723706,21725966]
 second seq =>        24 nucs [1963,1986]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723705,21723705] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [1963,1963] to [1987,1987]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21723706,21723706] to [21725966,21725966]
 second seq =>         1 nucs [1963,1963] to [1986,1986]

 21721756 ATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGA 21721815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATTTCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGA 60

 21721816 GAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATC 21721875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GAATAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATC 120

 21721876 ATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGC 21721935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGC 180

 21721936 AATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTGTTCTTT 21721995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATTTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTGTTCTTT 240

 21721996 CCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATGTGATGTT 21722055
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
      241 CCTGCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGCGAGGAGCCACATGTGATGTT 300

 21722056 TAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGCTCTAC 21722115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      301 TAACTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGTTCTAC 360

 21722116 TAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTG 21722175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TAATCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTG 420

 21722176 CTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAAT 21722235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTATGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAAT 480

 21722236 CTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCC 21722295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTGATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCC 540

 21722296 AAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAG 21722355
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAATTTTAGTTGGTTATTTTTTTT-CACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAG 599

 21722356 TTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACAGTC 21722415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TTCAGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACAGTC 659

 21722416 CCTTACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGA 21722475
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 CCTTACGTCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGA 719

 21722476 TGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCT 21722535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TGCTTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCT 779

 21722536 ACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGA 21722595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 ACATTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGA 839

 21722596 TCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATT 21722655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TCTGAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATT 899

 21722656 ATACTGTTGAAAGACATCT-AAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAAC 21722714
          ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 ATACTGTTGAAAGACATCTTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAAC 959

 21722715 CTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTG 21722774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 CTTCTGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTG 1019

 21722775 AATATATTCCATCAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACAT----------- 21722823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                  
     1020 AATATATTCCATCAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA-------AAAAAAAAACC 1072

 21722824 -----TTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATT 21722878
               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1073 CAATTTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATT 1132

 21722879 ATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAAT 21722938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1133 ATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAAT 1192

 21722939 GAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAG 21722998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1193 GAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAG 1252

 21722999 GGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAAT 21723058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1253 GGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAAT 1312

 21723059 ATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCA 21723118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1313 ATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCA 1372

 21723119 TATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGA 21723178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1373 TATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGA 1432

 21723179 TAAAAAAAAACGAAAAAAAAAAA----ACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAA 21723234
          |.|||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1433 TTAAAAAAAACGAAAAAAAAAAACCAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAA 1492

 21723235 AAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACT 21723294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1493 AAAAATCATGTGTATTTTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACT 1552

 21723295 TAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGA-GGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGG 21723353
          |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1553 TAATGTGATGAAATGAGGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGG 1612

 21723354 CTCAGGTATTGAAAACATGTA---AAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGA 21723410
          ||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1613 CTCAGGTATTGAAAAC-----GTGAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGA 1667

 21723411 TACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAA 21723470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 TACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAA 1727

 21723471 CCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACA 21723530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 CCATCATGACAAATGTTTGACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACA 1787

 21723531 GTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCC 21723590
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 GTAAGTCTAACTGTTGGACCAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCC 1847

 21723591 ACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTA 21723650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 ACATTTGATGGATTACAAGCAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTA 1907

 21723651 ACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 21723705
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 ACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGT 1962

EXCISED REGION

 21725967 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAG 21726026
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1987 CAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATCTTTAATAAC 2046

 21726027 CCCAAATTCAT-AAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 21726085
          ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 CCCAAATTCATAAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAAGTCACATT 2106

 21726086 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 21726145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 AATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATATCCATAGT 2166

 21726146 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 21726205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 TTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACACATTTGCA 2226

 21726206 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 21726265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 AGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTTTCCATTTT 2286

 21726266 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 21726325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 TATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTTGGAAAAAA 2346

 21726326 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 21726385
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     2347 ATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGAGTGCTTCT 2406

 21726386 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 21726445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 TAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGGCAATTTGG 2466

 21726446 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 21726505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 AAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAATGGGCTCCA 2526

 21726506 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 21726565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 TAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTATGTGATAA 2586

 21726566 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 21726625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2587 AGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCATACAGGTG 2646

 21726626 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 21726685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 TTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGAGAAATAGA 2706

 21726686 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 21726745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 TTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATGCAAGAGGA 2766

 21726746 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 21726805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 GTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTTGGTGACAA 2826

 21726806 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 21726865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 GAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAACAAAGAGA 2886

 21726866 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 21726925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 AACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGGCAGACTCG 2946

 21726926 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 21726985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 TAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCACAGGTTTTT 3006

 21726986 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 21727045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 CCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGACAAGCAGC 3066

 21727046 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 21727105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 ACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTCACCTGATG 3126

 21727106 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 21727165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 GATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGGCTCATAAA 3186

 21727166 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 21727225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 AAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTACCTAATTAT 3246

 21727226 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 21727285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 CCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAATTTAGAAAA 3306

 21727286 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 21727345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 TGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAACACAGTAA 3366

 21727346 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 21727405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 AGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAATTCCTCAAC 3426

 21727406 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 21727465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 TGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAACAATGGTGA 3486

 21727466 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 21727525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 AAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCCCAAAAAAT 3546

 21727526 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 21727585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 GAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAGAATGATTA 3606

 21727586 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 21727645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 AAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAACCTTTTTTT 3666

 21727646 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 21727705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 AATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTGTACTCAAA 3726

 21727706 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 21727765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 TCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTATTGTGTTTG 3786

 21727766 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 21727825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 GATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTATAAAAAGA 3846

 21727826 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 21727885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 TATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCATTTGTAGTT 3906

 21727886 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 21727945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 GCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAATACTGAACTATCGCAATAT 3966

 21727946 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 21728005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 AATGTGAGCCATAGAAATGAGTCACATATGCATTTTTGAATTTCCTAGTAGCCACACCAA 4026

 21728006 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 21728065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 AAAGTAAAAATAGGTGAAATTAATTTAATAATATATATTTTATTCAACCCAAATAAAGGC 4086

 21728066 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 21728125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 AAATAATAATAAAGGAATATTTTACACTCTTTTTCATGTACAAAGCCTTTGAAAACCAGT 4146

 21728126 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 21728185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 GTGTATTTTGCACTTACATACAGCACACCTCAATCTGGACTAGCTAATTTTAAGTGTGCA 4206

 21728186 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 21728245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 GTCGCCACATGTGGCTAGTGGCTATTGTGTTTGTCAGTGCAGACCTAGAACTTAATGTGC 4266

 21728246 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATACGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 21728305
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 AATAGTTTTTAAGGAATATTATTTTCATATGAAATTGAAATTAGTTATAGATTCAAGGTT 4326

 21728306 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 21728365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 TAATTGTCACAAAACACATTTTATCCACAACTGTGGGATCTTACCTTTATATTTCTGGTC 4386

 21728366 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 21728425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 ATCCCCTGGGACAAGTTAAATACAGCCACTAGTACTTGCTGGTTCTCCCATCCTGAAAGG 4446

 21728426 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 21728485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 GAGCCTATTTTCCCATCCTATGAGTTATCACTGGCCTCATAACTTGTCTTGACCAGTGGA 4506

 21728486 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 21728545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 ATGTGGCATAAGAGACACCATGTGCTTTCCAGAGCCCAGGCCTCAAGAGACCCTGCAGCT 4566

 21728546 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 21728605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 CCTGCCCTGGCTCTCTGGTAATATTGTCTGGAGAACAATAGGTAAGGAAGCCAGACCAGC 4626

 21728606 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 21728665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 TTCTGGGAGAGTAAGAGGTTATACAAACGGAGAACCCAGATCCACAGTCAACAGCCAGCA 4686

 21728666 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGGGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 21728725
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 GCAACCTCCAGAAACATGCGTGAGGTCATCTTAGACCTTATAACCCAGGTGACCCACAAG 4746

 21728726 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAACCCAAA 21728785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4747 ATAAATGCCGCTATATGAATGAGCCAGATAAAATAGGCAGAGGAAGTGCTCAAATCCAAA 4806

 21728786 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 21728845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 ATATATTATGAAAAATAACATTGTTATCGTGTAAGCCAGTTGCTTTTGGAGTTCGTTTGT 4866

 21728846 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 21728905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 TAAGTAGCAATAGACAATAAAACGAATATGTATAACTCATAATTTTTTTTATTAATAGGC 4926

 21728906 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 21728965
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 CACTTTTTGGAGCAGTTTTATGTTCATAGCAATATTGCACAGGAAAGCACAGCAATTTCC 4986

 21728966 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 21729025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 CATATACCCTCGGCCGCTACACATGTATAGCTTTTTCCATTATCAACATCCCCCACCAGA 5046

 21729026 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 21729085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 GTGTTCATTTGTTACCACTGATGAACCTACATCAACACATCATTATTGTCCAGGGTTCAT 5106

 21729086 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 21729145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 AGTTTACATTAAGGTTTACATTAAGGCTCACTCTTGGTGTTGTACATTCCCTGGGTTTGG 5166

 21729146 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 21729205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 ACAAATGTATAATGATATATATAGTATCATAAAGAACAGTTTTATTGCCCTAAAAATTCT 5226

 21729206 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 21729265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 CTTAATATGTTTTTGACTAAGGCAAAAGGTGGATCTAAATTCATAGGAAATAAATATAAA 5286

 21729266 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 21729325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 AAGAAAAAACCGATGATTCACCAGTGATGATCATGTACAATTTTGATTTGTTTCATTTGA 5346

 21729326 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCCATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 21729385
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 GAATAGCTGAATGGCTTAATAAAGCTATATGGTTATTGTAGAAAAGTCTGACAATGTAAA 5406

 21729386 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 21729445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 CAAAATCTGTTTTTTTTTTAGACAGAGTCTTGATCTGTCACCCAGGCTTGGAATGCAGTA 5466

 21729446 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 21729505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 GCACGGTCACAGCTTACTGCAAGCTCGAGCTCCTAAGCTCAAGGGATCCTGCTACCTTAG 5526

 21729506 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 21729565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 CCTCCCATAGTGTTGGGATTACGGGCATGGCCAGAAAATTTTTTTTAAACATCATGGTAA 5586

 21729566 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 21729625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5587 CTTCAGTACCATAACTCACCTCTATTATTTTTGGTGTCTCTACTATTATTTTTGGTGCCT 5646

 21729626 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 21729685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 CTACTGCTTTCTTTTTTTAAAAAAACTATGTATTTGAGGGGAACAAACACATTAGTTTGC 5706

 21729686 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 21729745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 AAAAGCATAAGTGCTTGAAACCGCCTTTGTTCTGTTGGAATAATTGTATATCTTAAATAT 5766

 21729746 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 21729805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 ACTTCTAAAACATAATTTTAAATTCTGACAAGTACTCTATTTTAGGGATATACCATAACT 5826

 21729806 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 21729865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 AGTTTAAACAATGCCCCATCATTGGTCATTATTGGTATGTCCAGTATTTATTATAAATAA 5886

 21729866 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 21729925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 AGCTGACATATAGCAATTTTATAATTATAAATAAGTTATTTCAAATGAAACAAAATTTAA 5946

 21729926 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACACATAATGACAT 21729985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 AGGTAATTAATAATTTAGGGAAGGAAAAGATCATGAATACTATGAGACACATAATGACAT 6006

 21729986 TATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAAACAAGTCTTTATCACAGCTAG 21730043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 TATTCATTAATTATCTTTATTTAACAAAACTTAGAAAACAAGTCTTTATCACAGCTAG 6064

Alignment time is 5.70128 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,    3092] =>      3092 nucs 'mol-32-3419-145549_3092'

Score:        3045
Aligned:      3089        nucs
Identic:      3085 (100%) nucs =>       381 (100%)      2704 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21722810,21723190] EXCISED REGION [21723191,21725896]
 second seq =>  [       1,     381] EXCISED REGION [     383,    3090]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [382,382]
ALTERNATIVE REGION(S): 2
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [3051,3053]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        12 nucs [382,393] to [383,394]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

 21722810 AAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATG 21722869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGAAGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATG 60

 21722870 TTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTAT 21722929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAGGCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTAT 120

 21722930 TTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCA 21722989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAAGCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCA 180

 21722990 TACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAA 21723049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTGGCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAA 240

 21723050 AGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAAT 21723109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGGGTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAAT 300

 21723110 AGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGAC 21723169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGTACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGAC 360

 21723170 TAAGAATGATAAAAAAAAACG 21723190
          |||||||||||||||||||||
      361 TAAGAATGATAAAAAAAAACG 381

EXCISED REGION

 21723191 AAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATT 21723250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      383 AAAAAAAAAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATT 442

 21723251 TTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGA 21723310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      443 TTTGGTGCTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGA 502

 21723311 GGGAAAGAG-AGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAAC 21723369
          ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      503 GGGAAAGAGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAAC 562

 21723370 ATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTAT 21723429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      563 ATGTAAAGAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTAT 622

 21723430 GAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTG 21723489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      623 GAACTGGTCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTG 682

 21723490 ACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCAC 21723549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      683 ACATCATTGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCAC 742

 21723550 CAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAG 21723609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      743 CAATTTTGGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAG 802

 21723610 CAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTG 21723669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      803 CAAAGATATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTG 862

 21723670 AATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGA 21723729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      863 AATCTTGGACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGA 922

 21723730 AGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAAC 21723789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      923 AGCCAGAAAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAAC 982

 21723790 CTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAG 21723849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      983 CTGGAAAATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAG 1042

 21723850 GGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAAT 21723909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1043 GGGAAAGCTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAAT 1102

 21723910 TGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCC 21723969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1103 TGCCTTCAAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCC 1162

 21723970 ACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGA 21724029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1163 ACTTAAGACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGA 1222

 21724030 AAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGG 21724089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1223 AAGGACACATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGG 1282

 21724090 AAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAA 21724149
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1283 AAATGAGCCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATACACATGGAAGCTGTACAAAA 1342

 21724150 TTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGG 21724209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1343 TTAGAGCAAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGG 1402

 21724210 AGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTT 21724269
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1403 AGAAGACAAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTT 1462

 21724270 TGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCC 21724329
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1463 TGTGAGCTATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCC 1522

 21724330 ATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGA 21724389
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1523 ATAGACAGTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGA 1582

 21724390 TAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGA 21724449
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1583 TAGTCATCAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGA 1642

 21724450 GAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACAC 21724509
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1643 GAGCACTGGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACAC 1702

 21724510 AGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAA 21724569
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1703 AGACTTCTGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAA 1762

 21724570 TTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATT 21724629
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1763 TTTGCATTACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATT 1822

 21724630 GAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGT 21724689
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1823 GAAAACACTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGT 1882

 21724690 CTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTA 21724749
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1883 CTCTAGGCATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTA 1942

 21724750 CACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTT 21724809
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1943 CACACCCTACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTT 2002

 21724810 ATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTG 21724869
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2003 ATGCGACGTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTG 2062

 21724870 GGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGT 21724929
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2063 GGAGGCCGAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGT 2122

 21724930 GAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTA 21724989
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2123 GAAACTCCGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTA 2182

 21724990 GTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGC 21725049
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2183 GTCCCAGCTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGC 2242

 21725050 AGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCA 21725109
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2243 AGTGAGCCGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCA 2302

 21725110 AAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAA 21725169
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2303 AAAAAAAAAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAA 2362

 21725170 GAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTG 21725229
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2363 GAGCATTCTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTG 2422

 21725230 AAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAG 21725289
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2423 AAGATCGAGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAG 2482

 21725290 GGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAAC 21725349
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2483 GGTGACAGCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAAC 2542

 21725350 AAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAG 21725409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2543 AAGAATGAATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAG 2602

 21725410 CCAACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCT 21725469
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2603 CCGACATCTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCT 2662

 21725470 GGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTT 21725529
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2663 GGACTTCTGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTT 2722

 21725530 TCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCAC 21725589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2723 TCTGGTAATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCAC 2782

 21725590 TTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCT 21725649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2783 TTTAGACCTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCT 2842

 21725650 CCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCC 21725709
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2843 CCTGTAACAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCC 2902

 21725710 ATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGG 21725769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2903 ATGTTTAGGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGG 2962

 21725770 TTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACA 21725829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2963 TTAGAAGCTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACA 3022

 21725830 CTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCTC-CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 21725888
          |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
     3023 CTAAAGCCATAAATGGTTAACTGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC 3082

 21725889 TCTCTCTC 21725896
          ||||||||
     3083 TCTCTCTC 3090

Alignment time is 3.42995 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [21713705,21735966] =>     22262 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [       1,   10984] =>     10984 nucs 'mol-32-34d4-027882_10984'

Score:       10854
Aligned:     10986        nucs
Identic:     10974 (100%) nucs =>      8947 (100%)      2027 (100%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [21716899,21725853] EXCISED REGION [21725898,21727926]
 second seq =>  [       1,    8956] EXCISED REGION [    8957,   10984]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>        44 nucs [21725854,21725897]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [21725854,21725857] to [21725898,21725901]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [21725853,21725853] to [21725898,21725898]
 second seq =>         1 nucs [8956,8956] to [8957,8957]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [21725854,21725858] to [21725893,21725897]
 second seq =>         0 nucs

 21716899 CCTTTGATCTTTTAATAGTCTAGTGAATAAAGAAATGGAGCAGTAGTAAGGTTAAAACAA 21716958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTTTGATCTTTTAATAGTCTAGTGAATAAAGAAATGGAGCAGTAGTAAGGTTAAAACAA 60

 21716959 TTGCTCAAGTTCATGCAGTTAGTAAGTGGTAGAGCCAGGATTTGTCCAAAAACATTCTGC 21717018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTGCTCAAGTTCATGCAGTTAGTAAGTGGTAGAGCCAGGATTTGTCCAAAAACATTCTGC 120

 21717019 TTCCAGAGTGTAAGTTCTTATATCTACATTTTGTTCAGAGATTGCCCTTTTTTGATGAAA 21717078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCCAGAGTGTAAGTTCTTATATCTACATTTTATTCAGAGATTGCCCTTTTTTGATGAAA 180

 21717079 GGTGGTAGAGAAAAAATGTATAAACAAAAAGCTAGTTTCAATTAAACTTTGCCAGAGCAA 21717138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGTGGTAGAGAAAAAATGTATAAACAAAAAGCTAGTTTCAATTAAACTTTGCCAGAGCAA 240

 21717139 GTCAAATCAGTATATACTAAGAGGCGATCATTTGTAAGGCAAAGGATTATTCAAAAAGCA 21717198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTCAAATCAGTATATACTAAGAGGCGATCATTTGTAAGGCAAAGGATTATTCAAAAAGCA 300

 21717199 ATTTCATAAGCATCTTGCCTCCACAAGTTTATCATGTTTATAATCCAGTATATTGTAGAT 21717258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTTCATAAGCATCTTGCCTCCACAAGTTTATCATGTTTATAATCCAGTATATTGTAGAT 360

 21717259 TATCCATATGTTGAGTCTACCAGATAACCATGTGTTTTTCCATAGGTATTAGATTTGTAT 21717318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATCCATATGTTGAGTCTACCAGATAACCATGTGTTTTTCCATAGGTATTAGATTTGTAT 420

 21717319 TCTTTTTGTATCAACTCATTATTTATTCAATTGTCCCTTTTATTTTGCCTGCATAGTTTA 21717378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTTTTGTATCAACTCATTATTTATTCAATTGTCCCTTTTATTTTGCCTGCATAGTTTA 480

 21717379 GAAGAACAAAATAGAAACTAAGTTTGCATTCAACGTAACTAATTCTACTTAATGATGATA 21717438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAGAACAAAATAGAAACTAAGTTTGCATTCAACGTAACTAATTCTACTTAATGATGATA 540

 21717439 GCTCTAAGAACATTCACTTGATTGTGAATGTTTTCACTCAACGTTCCGTTGTGATTTTTT 21717498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
      541 GCTCTAAGAACATTCACTTGATTGTGAATGTTTTCACTCAATGTTCCATTGTGATTTTTT 600

 21717499 CCACATTTTAATCTAATGTTATTTCATAAAGACCATGGCACAAAATTCCTAGGAAACCTA 21717558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCACATTTTAATCTAATGTTATTTCATAAAGACCATGGCACAAAATTCCTAGGAAACCTA 660

 21717559 ACTGTTGTTGGCATGTCACTGTCACCAGCATCAAATTAAATAAAATTTATTAAGAACAGT 21717618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ACTGTTGTTGGCATGTCACTGTCACCAGCATCAAATTAAATAAAATTTATTAAGAACAGT 720

 21717619 GAATACCACACTGTCACTGTTTTAAGGGCCTATATTTAGCACATCTCTAGCATTTGCAGT 21717678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAATACCACACTGTCACTGTTTTAAGGGCCTATATTTAGCACATCTCTAGCATTTGCAGT 780

 21717679 ACCCATTAGCTTCCAAGGTTTAGGAACTGTGAGTTCTTGGATTCCATTGCTTTGGTGAAC 21717738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACCCATTAGCTTCCAAGGTTTAGGAACTGTGAGTTCTTGGATTCCATTGCTTTGGTGAAC 840

 21717739 ATTCTTACAAACTCTATAATACCAAAAAGATACTCTGATTTCAATTTCCTTAAGAACATT 21717798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATTCTTACAAACTCTATAATACCAAAAAGATACTCTGATTTCAATTTCCTTAAGAACATT 900

 21717799 CCCTGCGGAGCTGACTTGAGCTCTGTTTAGTCTCGGCCTCAATGTGATTGTTTCTTCTGG 21717858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CCCTGCGGAGCTGACTTGAGCTCTGTTTAGTCTCGGCCTCAATGTGATTGTTTCTTCTGG 960

 21717859 CAGGTTGTGCTTAAAACAAACCTTACTTTATATTTTCTTTTAATTCTGAAACATTTAGTC 21717918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAGGTTGTGCTTAAAACAAACCTTACTTTATATTTTCTTTTAATTCTGAAACATTTAGTC 1020

 21717919 TTTGGAGAAGATGTAAAATCAGTTCCTAATGGAATTGTAGTAATTGTGGAATCCCAAAAA 21717978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTGGAGAAGATGTAAAATCAGTTCCTAATGGAATTGTAGTAATTGTGGAATCCCAAAAA 1080

 21717979 GGATTTACTTTAAATGGAAGAGAAATAAAATGCCTATTAAATGATTGTAAGCAAGAAGAT 21718038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGATTTACTTTAAATGGAAGAGAAATAAAATGCCTATTAAATGATTGTAAGCAAGAAGAT 1140

 21718039 CCACACAACCATATTTTATTTTTATAAGGAGTCCTGTCCCTTTGAGCCTATATTATGGTC 21718098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCACACAACCATATTTTATTTTTATAAGGAGTCCTGTCCCTTTGAGCCTATATTATGGTC 1200

 21718099 TAGGTTCTTTGCTGGATAACTTTACATACATTATTTGTATAAACAATGAAGATATCCTTA 21718158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TAGGTTCTTTGCTGGATAACTTTACATACATTATTTGTATAAACAATGAAGATATCCTTA 1260

 21718159 TTTTCATTTTACAGGTGAAGAAAAGGAGGTTTAGCAAGATCATCTTACTCAAGATAAACC 21718218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTTTCATTTTACAGGTGAAGAAAAGGAGGTTTAGCAAGATCATCTTACTCAAGATAAACC 1320

 21718219 ACTCGCTAAATGGTAGAGCTAGGTAGAATTAGAAACCAGATAGGGATGATTTCAAAGCCC 21718278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACTCGCTAAATGGTAGAGCTAGGTAGAATTAGAAACCAGATAGGGATGATTTCAAAGCCC 1380

 21718279 ATATGTATTTTTTTTTTTATTGTATTATACCTCTCTCCTTTTCAAATATCTACCAAGTCC 21718338
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 ATATGTATTTTTTTTTT-ATTGTATTATACCTCTCTCCTTTTCAAATATCTACCAAGTCC 1439

 21718339 TGATTTCCACCAAATTGAAAGAACAACTGATAGGAGCAGAAATGTCCTCCAAGGAAAGGA 21718398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 TGATTTCCACCAAATTGAAAGAACAACTGATAGGAGCAGAAATGTCCTCCAAGGAAAGGA 1499

 21718399 CCTGCATTTTCACATTCAAATGGCCAGAAGGCAGCAGATATAGGATTTACAAATCCAGAA 21718458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CCTGCATTTTCACATTCAAATGGCCAGAAGGCAGCAGATATAGGATTTACAAATCCAGAA 1559

 21718459 AAAAAGAGAAACTGCTTATAGCCCCAGGTAGAAGAAAGTCCTCATATCAGGGTTAAGGAG 21718518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 AAAAAGAGAAACTGCTTATAGCCCCAGGTAGAAGAAAGTCCTCATATCAGGGTTAAGGAG 1619

 21718519 CTATCACCAATGCAACACATAAGGAAAGGGACATCTATATTATGATAAAAGGAAAGACAT 21718578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CTATCACCAATGCAACACATAAGGAAAGGGACATCTATATTATGATAAAAGGAAAGACAT 1679

 21718579 CGTAAAATAGTGCAGTTAAACACAAGGATTAAAGCTAAACTAACATGAAAGGGACGCAAA 21718638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 CGTAAAATAGTGCAGTTAAACACAAGGATTAAAGCTAAACTAACATGAAAGGGACGCAAA 1739

 21718639 TAATCAGTGGGACTTGTCATTGCTGGGGGCCATGTCAGTGGAGATAATGAGCATTAAAGG 21718698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TAATCAGTGGGACTTGTCATTGCTGGGGGCCATGTCAGTGGAGATAATGAGCATTAAAGG 1799

 21718699 CTAAATCTGAGGCAGCTTTTGGGAGGGTCCCTGGGCCCTGAGAATCCCAGCACTGACCAG 21718758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 CTAAATCTGAGGCAGCTTTTGGGAGGGTCCCTGGGCCCTGAGAATCCCAGCACTGACCAG 1859

 21718759 AAGTCCAAGATCAGAGGCCAAGGTTAATGAGAAAACACAGGTTTTTCTGGTTGACATCAT 21718818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AAGTCCAAGATCAGAGGCCAAGGTTAATGAGAAAACACAGGTTTTTCTGGTTGACATCAT 1919

 21718819 CATGTTCTCACCCTCTTGTGAATTGCAGCCTAAATATACAAATCTGGAGCTTGGCATGAG 21718878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 CATGTTCTCACCCTCTTGTGAATTGCAGCCTAAATATACAAATCTGGAGCTTGGCATGAG 1979

 21718879 GCACATATACATCTTGACTTGTACAACTAATTCCCATCCATTTTGCTCAACTCAGGCTGA 21718938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 GCACATATACATCTTGACTTGTACAACTAATTCCCATCCATTTTGCTCAACTCAGGCTGA 2039

 21718939 GCCAGAATTAACTAACTAATGCAGAATGCCACAGAAATTGCATCTGATTTTTCTTTGGCT 21718998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 GCCAGAATTAACTAACTAATGCAGAATGCCACAGAAATTGCATCTGATTTTTCTTTGGCT 2099

 21718999 GCAGATTCACTAGAAGCTCATGTTCTTACTATTCCTTAGAATTTGGGAGTCTAGAAAAGC 21719058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 GCAGATTCACTAGAAGCTCATGTTCTTACTATTCCTTAGAATTTGGGAGTCTAGAAAAGC 2159

 21719059 ACAGGCCTAAATAAATTTCTAAGAGAGAAATTTAATTTAACAATTAGAGTAAAATATTCT 21719118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 ACAGGCCTAAATAAATTTCTAAGAGAGAAATTTAATTTAACAATTAGAGTAAAATATTCT 2219

 21719119 GGTAATGAAATTGTATTCTGCTAGTGTGTGGGGGATCATATAGACTGAATTATTTAAAGC 21719178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 GGTAATGAAATTGTATTCTGCTAGTGTGTGGGGGATCATATAGACTGAATTATTTAAAGC 2279

 21719179 AGTCCTAATTTCAAATAATAATAACCAGTAAAATAATAATAATAACCACTCTAAATTTTG 21719238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 AGTCCTAATTTCAAATAATAATAACCAGTAAAATAATAATAATAACCACTCTAAATTTTG 2339

 21719239 AGTAGTTCATATATACATAGGCTGTTAATTTTCATAGCAATTCTGTTAGTCCTTAATAAT 21719298
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2340 AGTAGTTTATATATACATAGGCTGTTAATTTTCATAGCAATTCTGTTAGTCCTTAATAAT 2399

 21719299 TTAGTTTTTTAGTTGTGGAAACTGGGGAATCTATGAAATTAAGTACTCTGTAGCAGCTAA 21719358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TTAGTTTTTTAGTTGTGGAAACTGGGGAATCTATGAAATTAAGTACTCTGTAGCAGCTAA 2459

 21719359 TTCAACCTATGCGTACATAGGTTGATTGATTTTAATGCTCGTTCTTTGTAAAAATCATAT 21719418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 TTCAACCTATGCGTACATAGGTTGATTGATTTTAATGCTCGTTCTTTGTAAAAATCATAT 2519

 21719419 TATCTGTATTGTCCCCATAAGCCAAGTATAAGAATCCATTATACCACTCCCCTTCTAGTA 21719478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2520 TATCTGTATTGTCCCCATAAGCCAAGTATAAGAATCCATTATACCACTCCCCTTCTAGTA 2579

 21719479 CTCAGGGCATATATTATTCATCAATTATATTTCCAGTTGGCCTCAGAATCCTCCTTAACA 21719538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2580 CTCAGGGCATATATTATTCATCAATTATATTTCCAGTTGGCCTCAGAATCCTCCTTAACA 2639

 21719539 CAACATACCAGTATCTAATCCAGTTAATCACAGTTTGCTATCCCCGACACAAACCCTCAA 21719598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2640 CAACATACCAGTATCTAATCCAGTTAATCACAGTTTGCTATCCCCGACACAAACCCTCAA 2699

 21719599 CATTAGGGCATCCAAACCTCTCTGTAAGTCTTGGAAGACAGACAATAGAATAATGCTGAC 21719658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2700 CATTAGGGCATCCAAACCTCTCTGTAAGTCTTGGAAGACAGACAATAGAATAATGCTGAC 2759

 21719659 AGTTTCCTTATACCTCTGGCAAAGTGTCCAATCATCTTTTGGTTAGAATCCAGTGAGAGG 21719718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2760 AGTTTCCTTATACCTCTGGCAAAGTGTCCAATCATCTTTTGGTTAGAATCCAGTGAGAGG 2819

 21719719 ACTAAGAAAGGCATCTGATTTGTCTGTCAAAGCTTGCCCAGGTTATGAAGATAACTGGAG 21719778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2820 ACTAAGAAAGGCATCTGATTTGTCTGTCAAAGCTTGCCCAGGTTATGAAGATAACTGGAG 2879

 21719779 ACCTACATTTGTAACTCAGTAAATGGGAGACTTTCATTCCTGGACATTCTGCAACAGCCA 21719838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2880 ACCTACATTTGTAACTCAGTAAATGGGAGACTTTCATTCCTGGACATTCTGCAACAGCCA 2939

 21719839 GTGTTGACCTGGTAAATCTACCTGAGATTCGCTCATGATTCCAATGTGACTGAATGCCTT 21719898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2940 GTGTTGACCTGGTAAATCTACCTGAGATTCGCTCATGATTCCAATGTGACTGAATGCCTT 2999

 21719899 GAGAATATACAACTCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTTAGACAGTAGAAG 21719958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3000 GAGAATATACAACTCCCTCACAGCTATTCTTCTTTATTGATATGTCTTAGACAGTAGAAG 3059

 21719959 TTCGTGAAGTGACCTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACGCAACAACAAAT 21720018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3060 TTCGTGAAGTGACCTAATCACTGTAAACCCAAACGTTTTGTAGAAAACACAACAACAAAT 3119

 21720019 AACCCTAAAAGGAAACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATTGGAGTTAGTC 21720078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3120 AACCCTAAAAGGAAACTGGAGAAGGGGCTCTGATCACAGCCTCAGGAATTGGAGTTAGTC 3179

 21720079 CCTTCAAATTCATGGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTGCTTTTGAACG 21720138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3180 CCTTCAAATTCATGGGCCTGTTTGACTTAAATTGTAAAGATTATTTTGTGCTTTTGAACG 3239

 21720139 GACATTAATCCCAAAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAGCAGGAATGCC 21720198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3240 GACATTAATCCCAAAGGAAGAACAAACAGAATGAGTCAAATTGCTTTGAGCAGGAATGCC 3299

 21720199 TGCTGAGAGGGGAGAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGCCCTGCATTTT 21720258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3300 TGCTGAGAGGGGAGAGAAATTCTGTAAGAAGCACGGCTTCTGAAATTGGCCCTGCATTTT 3359

 21720259 CCTGAATGATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGCTTTCCAAGTG 21720318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3360 CCTGAATGATTCTGATCTGTACTGCATATAGTTTTCAAAAGTCATTATGCTTTCCAAGTG 3419

 21720319 CTAAATATTTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCCTATTTATACA 21720378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3420 CTAAATATTTGCTTCCCAAGTTATCAGTGTCATTATGACCTTTGCTTGCCTATTTATACA 3479

 21720379 GTTTAATGTCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAATTTTGTAAATT 21720438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3480 GTTTAATGTCCTCCTTATAAGCGAAGATAAGAAAACTACTTTTTAAAAATTTTGTAAATT 3539

 21720439 TATGTTGTTCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCCCTGCCACCCA 21720498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3540 TATGTTGTTCTTCAGCTGCTCTCTGCCCTTCAAGGTTCAGCTGAAAGGCCCTGCCACCCA 3599

 21720499 CCCCCCAACCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAACTTCTACAGA 21720558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3600 CCCCCCAACCCCATCCACTTAGCATGATAGTCAATTTTCCCTTTTGCAAACTTCTACAGA 3659

 21720559 ATATTCTAAGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCCAAATTCCAGT 21720618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3660 ATATTCTAAGTGCTTAAGAGGGCAGGCTTTGTCATCAGAAACCTGCATCCAAATTCCAGT 3719

 21720619 GTTTTCATGTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAAAATAAGAATA 21720678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3720 GTTTTCATGTCCAAAGGAAATTAACAGCTATTTCGGTTCTCCTTCTATAAAATAAGAATA 3779

 21720679 ACAGCTAAATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAGTAAATACTAA 21720738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3780 ACAGCTAAATTCCAGGATTTCTGTAAGGCTTACAGGGAGAAATAATAGAGTAAATACTAA 3839

 21720739 ACTATAGTAACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATGATATGAAATA 21720798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3840 ACTATAGTAACTATTCTTAATGTCTTTTTTACTCATTTTTTATCAAAATGATATGAAATA 3899

 21720799 ATGGAATATATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAATCATTAATTGG 21720858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3900 ATGGAATATATTTTATTAAATTTTTATTTTATTAGCATTATTGCTTAAATCATTAATTGG 3959

 21720859 TATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGTTAAGCTTTT 21720918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3960 TATATCTCTTATGATACTTACATTTTGTTTGCTAGTAATTTGATTCTGAGTTAAGCTTTT 4019

 21720919 GAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTAAGAAAGAGT 21720978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4020 GAAGGGGAGTATTCATGGCTGGGTCATCTTAATTTTTTTCTATGGTGTCTAAGAAAGAGT 4079

 21720979 TTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGACATTGTTGCT 21721038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4080 TTTGAAAATTATAGGCACCCAAGTACTTTTCAGTGAATGAATAAATAAGACATTGTTGCT 4139

 21721039 TTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCATTAATA 21721098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4140 TTGAAAGCTAATCCAGAGAGAAGAAATGAAAATGGCAAACTATACTTAATGTCATTAATA 4199

 21721099 CTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAACAATATT 21721158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4200 CTATTAGGTACCTGTTTTCAATGTGCTCATTGTGAGATGGTAGGCATAGGAAACAATATT 4259

 21721159 GAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGGGAGGGA 21721218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4260 GAAAAGAGAGAGAAAGAACAAAAAGGAAGGGATGGAAGGAAGGAGGTTTGGAGGGAGGGA 4319

 21721219 GACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACTTACTTG 21721278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4320 GACTAGCAGGGAGGGAAAATAGCAATTTGGAGAAATAATTATATCCAAGCGACTTACTTG 4379

 21721279 ATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATACCCCCAA 21721338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4380 ATTGACCTCGATAGAACTGTTAGTGAGGCAGCCTGTGAGTAGCACTAAAAATACCCCCAA 4439

 21721339 GTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAAGTATAT 21721398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4440 GTCATCCTATATGGAAATACCCACTCTTAAATGATCTCATGGTAACCCATAGAAGTATAT 4499

 21721399 GTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATATTGTAT 21721458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4500 GTCTTTTAAACTGGAAAGTGATCAACCAAGAGTGTGGCATTATCTGACAAAATATTGTAT 4559

 21721459 GAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACGTGGTAAGGACTCAAAATATGATAGCTGACTTG 21721518
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4560 GAGAGAGACTCGCTCAGTGCCTAATACATGGTAAGGACTCAAAATATGATAGCTGACTTG 4619

 21721519 GAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTCACACTA 21721578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4620 GAATCTGGGACGTAAATATTTAATATTATTTATGGTCAGTGGAAAAATAGAGTCACACTA 4679

 21721579 ATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCTCTTCTC 21721638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4680 ATTCACTTCCTCCCTTTTCAGCTTGTCCTCAGTTTGTTACCTGTTCTGTCACCTCTTCTC 4739

 21721639 TCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCGTTCTTTC 21721698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4740 TCTTGGCTGCCCTCATCTTTCATTCCTCTCAGATTTACTTCTTGGCTCACTCGTTCTTTC 4799

 21721699 TCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACTGGGTAAATT 21721758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4800 TCACAAACATTCATTCAATATTTATTGGTTACTCACTCTCTTGAATACACTGGGTAAATT 4859

 21721759 TCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGAGAA 21721818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4860 TCAATAAAAGTAAATGTGATATTAAGCCCTTTAAAGCAAGGTAAAGCAATAGTGAGAGAA 4919

 21721819 TAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATCATT 21721878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4920 TAAGCAAAACACTTTTTTTAAGTTCTTGTTCTTGCCGGCTTCTCCTTTGGAATCATCATT 4979

 21721879 TTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGCAAT 21721938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4980 TTCTCTTATTTAATAAAATAATATTATCTTTCCTAACCATCAACTAAAAACAAGTGCAAT 5039

 21721939 TTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTGTTCTTTCCT 21721998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5040 TTTCTAATATTATCACATAGTAATAAAAAGACATTGGTAGACCACAATTTGTTCTTTCCT 5099

 21721999 GCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATGTGATGTTTAA 21722058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5100 GCGTATTTTCAAGAGTTTGCAACCCACTTCTTTTAGTGAGGAGCCACATGTGATGTTTAA 5159

 21722059 CTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGCTCTACTAA 21722118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5160 CTAATAATATCGGATATGATGACTGATGCTTTTTTATCAAAAGGTAATATGCTCTACTAA 5219

 21722119 TCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTGCTA 21722178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5220 TCACATGGACTAGAATCATGGCCATTCAATTTTATAAGTGGCTTTCTTGTTTATTTGCTA 5279

 21722179 TGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAATCTT 21722238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5280 TGCTTTCACCAACTACTCCAGCCAAAATTTTAGATGGCATATTGGCACTGGGGAAATCTT 5339

 21722239 GATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCCAAA 21722298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5340 GATAACAACTGTTTATGGCAGTCTTGCCTATAGCTTAAGAATTCCATTAGTCTAGCCAAA 5399

 21722299 ATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAGTTC 21722358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5400 ATTTTAGTTGGTTATTTTTTTTTCACATATCCTAGCTAAATCTTAAGTGCTACACAGTTC 5459

 21722359 AGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACAGTCCCT 21722418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5460 AGCATAGAAATATCCTTTCTTCTCTACCCTTGTAGGCAAGCCCATAGTCAGACAGTCCCT 5519

 21722419 TACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGATGC 21722478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5520 TACATCGCAATGTTACACACACAGCCTTTCAACGGCTGCTGCCACAAGGCAGGGAGATGC 5579

 21722479 TTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCTACA 21722538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5580 TTTGGATTTTATTTCTGTATTTTTAAAATGTTGTCTTCCATTGAATTGCCCTTAGCTACA 5639

 21722539 TTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGATCT 21722598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5640 TTTACATTTAGCTAGTCTGGGCTAGGTCTCAACTGACTGGTAAATTCCAATTACAGATCT 5699

 21722599 GAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATTATA 21722658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5700 GAGTGTAACAGAATTGTTTCAAGGAACTCAGAGTCTCCTATCACATTTCAGAGTATTATA 5759

 21722659 CTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAACCTTC 21722718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5760 CTGTTGAAAGACATCTAAGTCCTTCCCTGATAACGTAGGAATATGGTAAGGTAAACCTTC 5819

 21722719 TGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTGAATA 21722778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5820 TGACAAAAAAAATTATTTTTATTTTAAATAAGTCATAGATTCAGAAAGCCTATGTGAATA 5879

 21722779 TATTCCATCAGTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGA 21722838
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5880 TATTCCATCAGTGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACCTACATTTTTGGCACATGGGA 5939

 21722839 AGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAG 21722898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5940 AGTAAATTTGATTGGCATGAAACAAATTATGTTATTCATTATGTTTCTGGAAAGGTAAAG 5999

 21722899 GCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAA 21722958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6000 GCTGTACAATTGGTAAATTAAAAGTGATTATTTCAGTAATGAGATATTTCAGATAAGCAA 6059

 21722959 GCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTG 21723018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6060 GCTTTAATCTGCCAAAGGAAATGGCAGGGCATACCTCAAGGGGAGAGCTTAGGAAAGCTG 6119

 21723019 GCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGG 21723078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6120 GCTGACTCTCAAATAAATCTGTTTTACCAAAAGCACAAATATACATCACAGTTAAAGTGG 6179

 21723079 GTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGT 21723138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6180 GTAGAAGGGAAACCAAAGGAAACAGAACAATAGAGCTGCATATATTTGGAACACAAATGT 6239

 21723139 ACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAA 21723198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6240 ACACACATGCATTTTCTAAAAGAATCCAGACTAAGAATGATAAAAAAAAACGAAAAAAAA 6299

 21723199 AAAA-CAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTG 21723257
          |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6300 AAAAACAAACAAAAAAGGAAATAAAACAATCAACCAAAAAAATCATGTGTATTTTTGGTG 6359

 21723258 CTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAG 21723317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6360 CTACAGATTAGAAAATATCAAGACTGTAAATCAAACTTAATGTGATGAAATGAGGGAAAG 6419

 21723318 AGA-GGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTAAA 21723376
          ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6420 AGAAGGCAAAGATTTCATTGATTTACTGATCCATTGGCTCAGGTATTGAAAACATGTAAA 6479

 21723377 GAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGG 21723436
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6480 GAAATGGGAAAACAAATGTAAAATGAAAGTTGGATACCTGGAGTATGTTTTATGAACTGG 6539

 21723437 TCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCAT 21723496
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6540 TCAGCCAGTGAAAAATATCAGATGATAGTGAAAACCATCATGACAAATGTTTGACATCAT 6599

 21723497 TGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTT 21723556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6600 TGAGGCCAGACTCAGAAAGTGAGAATCAACCACAGTAAGTCTAACTGTTGCACCAATTTT 6659

 21723557 GGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGAT 21723616
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6660 GGAGGAAAAAAGAGTAATGTAAAGGATGTAAGCCACATTTGATGGATTACAAGCAAAGAT 6719

 21723617 ATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTG 21723676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6720 ATGGTTGGAAGATGCATAATTACATAGAAATCTAACAAAATAAAGAAGAGCTGAATCTTG 6779

 21723677 GACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGA 21723736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6780 GACAATTGGCAGGTTGGTTTGTTTTTAGTTTAGCTTTGTCCTTTTAAGTTAGAAGCCAGA 6839

 21723737 AAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAA 21723796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6840 AAGATTGGCTAAGTATGTTGAAAATCTAATAACTTATGAAAGATGTACACAACCTGGAAA 6899

 21723797 ATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAG 21723856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6900 ATAGCCAAAGCAGAGAGACAGACATGATTAAAGGACAGGCAAGTAAGAGTAAGGGGAAAG 6959

 21723857 CTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTC 21723916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6960 CTAAAGGTACTGGCAATGTTTTTGTGAAGAGAAGAGACTCAGGGTGACTTAATTGCCTTC 7019

 21723917 AAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAG 21723976
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7020 AAATATTTAAAAACTAACATAGAAAGAATGGTGAACAGATGTTCTTCATTTCCACTTAAG 7079

 21723977 ACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACA 21724036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7080 ACAGAAAAAGCCATCAGAGGACTGAAAGGATAGTTGCAGTCATGTCTGGAAGAAAGGACA 7139

 21724037 CATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAG 21724096
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7140 CATTTTCAGGTCCTTTAATAGAAATGAAAGTCAAGGGTTAATCTTTTTTAGGGAAATGAG 7199

 21724097 CCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGC 21724156
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7200 CCTCTAAATCTCATATTGCAATTTTGTGGGATTCACATGGAAGCTGTACAAAATTAGAGC 7259

 21724157 AAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGAC 21724216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7260 AAGTTAGAACTGGATGAAACCTTAGCAATCAAGTAATCTACTTCCTGAGCAGGAGAAGAC 7319

 21724217 AAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGC 21724276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7320 AAACTTTTTTTTTTTTCCTTTGGGAAAGGGCCAGATAATTAATATTTAAGCTTTGTGAGC 7379

 21724277 TATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACA 21724336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7380 TATCAGTTCTATAGTGCAACTGCTAAGTCTGCCATTGTAGTGTGAAAGCAGCCATAGACA 7439

 21724337 GTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGTCAT 21724396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7440 GTATGTAAACAAATGGGCATACCTATGTACCAGTAAGATTTTACTTTCTAAGATAGTCAT 7499

 21724397 CAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACT 21724456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7500 CAGCCAGATTTGGTTCTCTGGCACCAGCTGTTGTTGGCTGACCCTGGTCCAGAGAGCACT 7559

 21724457 GGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGACTTC 21724516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7560 GGCCCTCAAACTTTAGTGAGCATCAGAAATGCCTAGAGGGCTTATTAAGACACAGACTTC 7619

 21724517 TGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCAT 21724576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7620 TGATGTCTTCCTACCCCTACTTCAAGTTTTGATTTCTGAGTGGGAGCTGCTAATTTGCAT 7679

 21724577 TACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAAACA 21724636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7680 TACTTACTAATTCCTAGGTAATGCTGATGCTATTGGTACATGATCCACAAATTGAAAACA 7739

 21724637 CTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGG 21724696
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7740 CTGAGGCCAGAGAACACAAATGATAAACCTAAAGTCCAGTTAAGGATGTGTGTCTCTAGG 7799

 21724697 CATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACACCC 21724756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7800 CATATTTAGCAGAATTCTATGACAACCCCCAAGATTTCCTGCTTCCTGCTGTACACACCC 7859

 21724757 TACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGCGAC 21724816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7860 TACATCATCTGTAGGACTATTAATTTTGTGGATATTACTTTTGTGATTAGGTTATGCGAC 7919

 21724817 GTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 21724876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7920 GTGATACAGTTGACTTCAAAAAGAAGAGATTCATTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCC 7979

 21724877 GAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACTC 21724936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7980 GAGTTGGGTGGATCACGAGGTCAGGAGATCAAGACCATCCTGGCTAACACTGTGAAACTC 8039

 21724937 CGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAG 21724996
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8040 CGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGTCACGGTGTTGTGCATCTGTAGTCCCAG 8099

 21724997 CTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGC 21725056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8100 CTACTCGAAGGCTGAGGGAAGAGAATTGCTTGAACCTGGGAGGCGAAGGTTGCAGTGAGC 8159

 21725057 CGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAA 21725116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8160 CGAGATCGCACCACTGCACTCCAGCCTGGGTGAGAGAGTGAGACTCCATCTCAAAAAAAA 8219

 21725117 AAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATT 21725176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8220 AAGAGATTGTTCATGTGGGTGTGAACTAAGCACATGAGCTGTTCAAAAGCGAAGAGCATT 8279

 21725177 CTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCG 21725236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8280 CTCCGGCTGGTTGCAGAAGCAACAGAAGGATTCAATGTGCCCTTACTGGCCTGAAGATCG 8339

 21725237 AGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACA 21725296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8340 AGGCCACATGTAAAGGAATGCAGATGGTCTCTGGGAGCTAAGAGTAGCCCCAGGGTGACA 8399

 21725297 GCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGAATG 21725356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8400 GCAAGGAAAGCAAGACCTTCATTCTACAACCACAGGAACTAAATTCTGCTAACAAGAATG 8459

 21725357 AATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAACAT 21725416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8460 AATTTGAGAAACAGATTTTTAACACAGAGTGTCCTGATGAGGACTCAGTCCAGCCAACAT 8519

 21725417 CTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGACTTC 21725476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8520 CTTCATTTCAGCCCTATGATACCCTGAACAGAGAACATAGCCACATCTGTGCTGGACTTC 8579

 21725477 TGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTA 21725536
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8580 TGACCTACAAAACTATAAGCTAATAAATGTGTGATGTTTTAAGGCACCAAGTTTCTGGTA 8639

 21725537 ATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTAGAC 21725596
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8640 ATTAATTACGCAGAAATAGAACTCTGACACTGTGAGTGTGGTATATGTCCCACTTTAGAC 8699

 21725597 CTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTGTAA 21725656
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8700 CTAAAGCTCCCTAGTTGAACTGGTTACATATCCACTGCCAAACATCACTGTCTCCTGTAA 8759

 21725657 CAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGTTTA 21725716
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8760 CAACTTTCAAGCACGCTCTTTTTACTCCTGGCCCCTTTAGTTTATAAAGCGCCATGTTTA 8819

 21725717 GGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAGAAG 21725776
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8820 GGAGTTGTCTCTCTTTAACTGAGAATACTTTCCCACTGCTGACTCTCTTCTGGTTAGAAG 8879

 21725777 CTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACACTAAAGC 21725836
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8880 CTCTGGGAAATGAAGGTAATAAATATCTCGTATGTTTGACAAACTTCACCACACTAAAGC 8939

 21725837 CATAAATGGTTAACTGT 21725853
          |||||||||||||||||
     8940 CATAAATGGTTAACTGT 8956

EXCISED REGION

 21725898 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATT 21725957
          ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8957 TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT-CTCTCTCTCTTTCTTTCTTTCGTAGCTTTACATT 9015

 21725958 CTTTACCATCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATC 21726017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9016 CTTTACCATCAACTGTGACCCAACCCAGACCATTTCAATAACGGAACCCTTTAAAAAATC 9075

 21726018 TTTAATAAGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAA 21726077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9076 TTTAATAAGCCCAAATTCATAAAAGTTCAAAAAATACCCTCAATAGTTAAGTATTATAAA 9135

 21726078 GTCACATTAATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATA 21726137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9136 GTCACATTAATTTTAAAGCATTACATTTTCTGACATTTAAAAAGTCTCTGACATGGCATA 9195

 21726138 TCCATAGTTTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACA 21726197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9196 TCCATAGTTTGATTTTTCTGATGTTCTTATAAAGGTCATGTTTATGGTATAATAAGCACA 9255

 21726198 CATTTGCAAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTT 21726257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9256 CATTTGCAAGGGTTATTAATCAGAGCAAAGCTGGGTGGCAAACAGATTTCCAAAGAATTT 9315

 21726258 TCCATTTTTATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTT 21726317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9316 TCCATTTTTATTCTGAACATATTAGCTAGTTAAGAATGTCACATTTTTAAGAGCCTACTT 9375

 21726318 GGAAAAAAATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCGTAAGTGAAACTGGA 21726377
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     9376 GGAAAAAAATTAACGATTAATTTTGTTCAAAGGGATGTCTTCATCTTAAGTGAAACTGGA 9435

 21726378 GTGCTTCTTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGG 21726437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9436 GTGCTTCTTAGGAAAATAGATGACAGGGATGCATTTTGCTAGTTCAGCAAACTCGTATGG 9495

 21726438 CAATTTGGAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAAT 21726497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9496 CAATTTGGAAAATTCTAATTTTTAAGCTAATGCTTTAGAGCAGTTAGCAAGGAAACCAAT 9555

 21726498 GGGCTCCATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTA 21726557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9556 GGGCTCCATAAGCTTTATTAAGAATCCAGTGGGTATTGGCAAAAGCATTTCTAACTTGTA 9615

 21726558 TGTGATAAAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCA 21726617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9616 TGTGATAAAGGAATATACGTTTTTAACGCTAAGAAAAAAATACTGCAAAATCCTGGCCCA 9675

 21726618 TACAGGTGTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGA 21726677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9676 TACAGGTGTTATGGCTTATTATTTCAAACAATTTCCTTTCTATTTTGTCTCAGCAAGAGA 9735

 21726678 GAAATAGATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATG 21726737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9736 GAAATAGATTCCTTCTCAATGAACGTAGAAAAGTAGATTTGCTTTAATATTCAAGAAATG 9795

 21726738 CAAGAGGAGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTT 21726797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9796 CAAGAGGAGTGTCTCTGAAGATTTTATGGCTACTGGCTATTTGGAAACATTACTTGCCTT 9855

 21726798 GGTGACAAGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAA 21726857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9856 GGTGACAAGAATTCAACCTATGCTTGAAACACAAGCACACTTTCAAAATATTAAGCTTAA 9915

 21726858 CAAAGAGAAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGG 21726917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9916 CAAAGAGAAACAAACAGAATATGGTACAGCCTAAGAGTTCATAAAAGACAGCAGAAGTGG 9975

 21726918 CAGACTCGTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCAC 21726977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9976 CAGACTCGTAAGCATTTGATATTCAAATCTCTACATCTCTCTTTTTTACATCTACATCAC 10035

 21726978 AGGTTTTTCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGA 21727037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10036 AGGTTTTTCCCTGTGAGTTTCTCAAGCTTTGTCTGTGATTAATTTTACTTATCAAACAGA 10095

 21727038 CAAGCAGCACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTC 21727097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10096 CAAGCAGCACATGCGGTCTTGCTCCAACAAGAGGAAGTATTGGCACCAAAGAGCCGCTTC 10155

 21727098 ACCTGATGGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGG 21727157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10156 ACCTGATGGATGTTGAAACCAAATGGTCTAGACAAATCTCAAGGGCTCTGAATAGCATGG 10215

 21727158 CTCATAAAAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTAC 21727217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10216 CTCATAAAAAGACAAAGTACAAACCCATTAGAAAATAATGAAATTAGTAATTGGCATTAC 10275

 21727218 CTAATTATCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAAT 21727277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10276 CTAATTATCCCAGAATTCTGAAAAATCTTTGTATGGAGCAATACATCTGCCTATCCTAAT 10335

 21727278 TTAGAAAATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAA 21727337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10336 TTAGAAAATGAAGTGCTGGAGGTACAAATGATTAGCTACCTTGAGGTTTTGGCCAAGAAA 10395

 21727338 CACAGTAAAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAAT 21727397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10396 CACAGTAAAGTAATAAGCCACGCATGAAAGCAAGACAGGTGAATTCTCCCAGGCAATAAT 10455

 21727398 TCCTCAACTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAAC 21727457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10456 TCCTCAACTGAGACAATCAGAGCAGGGAGAATGGGTGAACCGGGAAAGAAGAAAGAGAAC 10515

 21727458 AATGGTGAAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCC 21727517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10516 AATGGTGAAAACTGAGGGGCAGGCAGCTTTGGTGGTCACAGATGTCCAGCCTGGCTTTCC 10575

 21727518 CAAAAAATGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAG 21727577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10576 CAAAAAATGAGAGACAAAGGCAAATTGAAACAGTCTAGGCTTTCATGTGACCTATATAAG 10635

 21727578 AATGATTAAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAAC 21727637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10636 AATGATTAAAGATTAATAATAGAGAAAAAAGAAATAGCACAGTGGAAATTTAAAAGTAAC 10695

 21727638 CTTTTTTTAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTG 21727697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10696 CTTTTTTTAATGTCAGATGATTTGTTAGTTGTAGATATTTTAGGAAAGTGTACAAATGTG 10755

 21727698 TACTCAAATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTAT 21727757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10756 TACTCAAATCGTAATGTTTCATTTCTAAATCTCTTCACTGTTATAACACCAAATTGTTAT 10815

 21727758 TGTGTTTGGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTA 21727817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10816 TGTGTTTGGATTTTTAGGTTGCTATAATTATTTTTGGCAAGTGCAGATTATGCGTAGGTA 10875

 21727818 TAAAAAGATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCAT 21727877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10876 TAAAAAGATATAAATATTGTACTTTGTTCCCTAGCCACGGAATTGTAAAAAAATAACCAT 10935

 21727878 TTGTAGTTGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAA 21727926
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10936 TTGTAGTTGCTGTGAGAAACTGTATGAAAAGCATCAGTGTATAGAGCAA 10984

Alignment time is 9.14231 s

