
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     5520] =>      5520 nucs 'mol-32-1e7c-066951_5520'

Score:        5245
Aligned:      5523        nucs
Identic:      5483 ( 99%) nucs =>      5130 ( 99%)       353 (100%)
Gaps:           22 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194550497,194555650] EXCISED REGION [194556285,194556638]
 second seq =>  [        1,     5162] EXCISED REGION [     5167,     5520]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       634 nucs [194555651,194556284]
 second seq =>         4 nucs [5163,5166]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [5163,5163] to [5166,5166]

194550497 TGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAG 194550556
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCGGGAGGCAGAG 60

194550557 CTTGCAGTGAGACGAGATCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGAGAGCGAGACTCCTTC 194550616
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTTGCAGTGAGACGAGTTCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGAGAGCGAGACTCCTTC 120

194550617 TCAAAACAAACAAACAAACAAAAAACTGCTGCGGCAGCTTCTAGGACAAATCTGAAACTA 194550676
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCAAAACAAACAAACAAACAAAAAACTGCTGCGGCAGCTTCTAGGACAAATCTGAAACTA 180

194550677 AATCCGCACTTCGATACTGCATCAGATGCGGGACGCAGAGACAGAGAGGAAGGAACCTGG 194550736
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AATCCGCACTTCGATACTGCATCAGATGCGGGACGCAGAGACAGAGAGGAAGGAACCTGG 240

194550737 TAGGCAGTTCCAGCTGAGCCAGCAGAAACCAGCAATGTAGCAAGCTCTCTACAAATCAGG 194550796
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      241 TAGGCAGTTCCAGCTGAGCCAGCAGAAACCAGCAATGTAGCAAGCTCTCTACGAATCAGG 300

194550797 GCAGAAGTTCTTCTGAGATAGGTGAACAAATTGTAAACAGACAACAAGAAGTCAGAGCCA 194550856
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCAGAAGTTCTTCTGAGATAGGTGAACAAATTGTAAACAGACAACAAGAAGTCAGAGCCA 360

194550857 AGGTTAAGGACCCCTAAGGTAACCCAGACCCCTAAGGGAACCCACCTGATAGGCTATTTA 194550916
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGTTAAGGACCCCTAAGGTAACCCAGACCCCTAAGGGAACCCACCTGATAGGCTATTTA 420

194550917 AGAAAGTAAGCATTGTCTTAGAAACGGGAAATCGCTGGTGCAGCCAGCACTTGAGTAAGG 194550976
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      421 AGAAAGTAAGCATTGTCTTAGAAACGGGAAATCGCTGGTGCAGCCAGAACTTGAGTAAGG 480

194550977 CAGTCCCCCGAGGGCAGAGACCATCCTGCATGTTGCCTGCCAGGCACACAGGGGATGTGA 194551036
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAGTCCCCCGAGGGCAGAGACCATCCTGCATGTTGCCTGCCAGGCACACAGGGGATGTGA 540

194551037 AATGCAGATGAATGAAATGCAGATGAATGAATAACGAATCAATTGATTGTAAATACTCCA 194551096
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATGCAGATGAATGAAATGCAGATGAATGAACAACGAATCAATTGATTGTAAATACTCCA 600

194551097 TTTCTTGGCTTTGACCGTATGGAAGTTGTGGAACAGTTCTTGGGGGGAGTGGGTACAGGT 194551156
          |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
      601 TTTCTTGGCTTTGGCCGTATGGAAGTTGTGGAACAGTTCTTGGGGG-AGTGGGTACAGGT 659

194551157 ATGTGTTCTGATGGGCCAGGTATGCTGGACAGAGCCCTTGGTGCTGAAGGAATGCATCTG 194551216
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      660 ATGTGTTCTGATGGGCCAGGTATGCTGGACAGAGCCCTTGGTGCTGAAGGAATGCATCCG 719

194551217 TGATCTCCTGGGAACACTTCCAAGCTTCTGGAGGGCTGCAGTTCGGGCCAACCAGTCCAA 194551276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 TGATCTCCTGGGAACACTTCCAAGCTTCTGGAGGGCTGCAGTTCGGGCCAACCAGTCCAA 779

194551277 GACGACCTGAGAGAAATCCCAAGGCTCCTGCATTCCTGGATCCTGTAAGGAAGATGCGCT 194551336
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GACGACCTGAGAGAAATCCCAAGGCTCCTGCATTCCTGGATCCTGTAAGGAAGATGCGCT 839

194551337 GAAAAGGGCCCCTCTGGGCATCCATCAGCGTTCCAGCAGGACACCTGGCAACGTGTACTA 194551396
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 GAAAAGGGCCCCTCTGGGCATCCATCAGCGTTCCAGCAGGACACCTGGCAACGTGTACTA 899

194551397 CATACCTCCCTGGAAGGAGCTCCATTGTGTCTGAATGTGGCTGTGGGTGAGGGAGCAAGA 194551456
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CATACCTCCCTGGAAGGAGCTCCATTGTGTCTGAATGTGGCTGTGGGTGAGGGAGCAAGA 959

194551457 GGCAGCAGGGTGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTGTGCACGCACATGCATCTGCAGGGTTT 194551516
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
      960 GGCAGCAGGGTGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTGTGCATGCACATGCATCTGCAGGGTTT 1019

194551517 AGACTGTGATGAATGAATATACCAAAAATAAGGATTCTATGTCTATTAGAAGTTTTATTT 194551576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 AGACTGTGATGAATGAATATACCAAAAATAAGGATTCTATGTCTATTAGAAGTTTTATTT 1079

194551577 AAATTTCCTTCCTTGAGGTCCTTCGTTGAAAAAGGTGGTCATCATTTAATGGAGTTTGGC 194551636
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 AAATTTCCTTCCTTGAGGTCCTTCGTTGAAAAAGGTGGTCATCATTTAATGGAGTTTGGC 1139

194551637 AGCACATTTTCCCAGCAACAAAACAAATTAATCATCTGTAGGCTTGGGGAGCAGATCTTC 194551696
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 AGCACATTTTCCCAGCAACAAAATAAATTAATCATCTGTAGGCTTGGGGAGCAGATCTTC 1199

194551697 ATCCCTATTAGGAGTGTGGGAAAATAGAAAATATTGCTCTGAGTGGAAGCCCAAAGGCCA 194551756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 ATCCCTATTAGGAGTGTGGGAAAATAGAAAATATTGCTCTGAGTGGAAGCCCAAAGGCCA 1259

194551757 GAATCTCCCAGTTTGGAGCTCATTGCAGAGGACTTTTTGCTTCTTTCTGGCTTCTCGGCT 194551816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 GAATCTCCCAGTTTGGAGCTCATTGCAGAGGACTTTTTGCTTCTTTCTGGCTTCTCGGCT 1319

194551817 GCATTCTGAGTAGAAGAGGGTGTGAGACAATGTCCTTCAGATAAACAAGATGTCACTGTG 194551876
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 GCATTCTGAGTAGAAGAGGGTGTGAGACAATGTCCTTCAGATAAACAAGATGTCACTGTG 1379

194551877 GTGGGGAAATAATGTGAACACATAGAAATTGCTCAAGAAATGAGCACAGATGGAGGGAAT 194551936
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GTGGGGAAATAATGTGAACACATAGAAATTGCTCAAGAAATGAGCACAGATGGAGGGAAT 1439

194551937 GGAGTCAAGGAAGGAGGGAGGGAGTCCATATCATATTTGAAAGACATCTAATCTTTGTTG 194551996
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1440 GGAGTCAAGGAAGGAGGGAGGGAGTCCATATCATATTTGAAAGACATCTAATCTTGGTTG 1499

194551997 GAAGGGCACATGTGGGTGGAAAGAATTCAAGGAAGCCTCATTCATTCATTATTTATTAAT 194552056
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GAAGGGCACATGTGGGTGGAAAGAATTCAAGGAAGCCTCATTCATTCATTATTTATTAAT 1559

194552057 CCTTTACAAAACTCCATTTAATAGACTTTGGTGCCTGCCATGTGGCAGGTACTGAGCTGG 194552116
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 CCTTTACAAAACTCCATTTAATAGACTTTGGTGCCTGCCATGTGGCAGGTACTGAGCTGG 1619

194552117 GAGCTGGTCATACAGCCAGAGACAACACATGTATGGCCCTTGCCCTCATGGAGCTTATAG 194552176
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 GAGCTGGTCATACAGCCAGAGACAACACATGTATGGCCCTTGCCCTCATGGAGCTTATAG 1679

194552177 TCTAGTGGAGAGGAGAGGCCGCCACTGATTAAGACCGCAAGTGCTGTGAAGAAAAAGAAC 194552236
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 TCTAGTGGAGAGGAGAGGCCGCCACTGATTAAGACCGCAAGTGCTGTGAAGAAAAAGAAC 1739

194552237 AAGCAGAAGCAAGCATAATAGGGGAGGCCCGCTTAGGACTAGGGAAGGTGACATTTAAGC 194552296
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 AAGCAGAAGCAAGCATAATAGGGGAGGCCCGCTTAGGACTAGGGAAGGTGACATTTAAGC 1799

194552297 AGAAGGCTGAAAAACGAGCAGGATTCCATCCTGTGAAGAGCTCGGGGAAGGGCATGCCGG 194552356
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AGAAGGCTGAAAAACGAGCAGGATTCCATCCTGTGAAGAGCTCGGGGAAGGGCATGCCGG 1859

194552357 GTAGAGGGAGCTGCATCTGCAAGGGCCTAAGGCAGTGAGGAACTTGGCTCTGGGAGAAAT 194552416
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 GTAGAGGGAGCTGCATCTGCAAGGGCCTAAGGCAGTGAGGAACTTGGCTCTGGGAGAAAT 1919

194552417 GGAAAGGAGAGGACAGTGTGTCTAGAGGGTGGAAGGCAGAGACACAGGAAATGAAACAGG 194552476
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 GGAAAGGAGAGGACAGTGTGTCTAGAGGGTGGAAGGCAGAGACACAGGAAATGAAACAGG 1979

194552477 AGACATAGGAGGGGCCAGATTCTGTAAGGCCTTGTAGGCCTCAGGACACAGAGAGGC--- 194552533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||      
     1980 AGACATAGGAGGGGCCAGATTCTGTAAGGCCTTGTAGGCCTCAGAACACAGAGA---TGA 2036

194552534 GCTTGAGTTGCATTTTGAGGGCAATGGGAAGTTGCTGGTGGGTTTGAATCGGGGCTTAGG 194552593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 GCTTGAGTTGCATTTTGAGGGCAATGGGAAGTTGCTGGTGGGTTTGAATCGGGGCTTAGG 2096

194552594 GTTTTTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTG------------AGAAGGAGTCTGGCTCTGT 194552641
          |||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||
     2097 GTTTTTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGAAGGAGTCTGGCTCTGT 2156

194552642 CACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTT 194552701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2157 CACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTT 2216

194552702 CACGCCATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGGTGCTCACCACCACG 194552761
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 CACGCCATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGTGCTCACCACCACG 2276

194552762 CCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGACGG 194552821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 CCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGACGG 2336

194552822 GGGCTTAGGTTTTTAAGCAGTCTGGATGCTCTGTGAGGTAAGGATTGGAAGAGGCAAGAG 194552881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 GGGCTTAGGTTTTTAAGCAGTCTGGATGCTCTGTGAGGTAAGGATTGGAAGAGGCAAGAG 2396

194552882 TGGAGGGAGTGAGAACAGAGCGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGGTGGGGGAAG 194552941
          ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 TGGAGGGAGTGAGAACAGAGTGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGGTGGGGGAAG 2456

194552942 TGGGGTTGCAGGGAAGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCGGGG 194553001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TGGGGTTGCAGGGAAGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCGGGG 2516

194553002 CTGCTAGATGTGGGGATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAAATT 194553061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 CTGCTAGATGTGGGGATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAAATT 2576

194553062 TGGAAAACTATTTATTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGGAGA 194553121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 TGGAAAACTATTTATTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGGAGA 2636

194553122 AAAGGAGGAATAAGATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCACCCT 194553181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 AAAGGAGGAATAAGATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCACCCT 2696

194553182 CTGCCACAGATGAGGAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTTTGC 194553241
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 TTGCCACAGATGAGGAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTTTGC 2756

194553242 TGGGGTTATTGCGCTGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAATTGAGCAAT 194553301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2757 TGGGGTTATTGCGCTGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAATCGAGCAAT 2816

194553302 TGCTTCTGCCTCAGGAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAATAATGATTGAATAAGAAATGA 194553361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2817 TGCTTCTGCCTCAGGAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAGTAATGATTGAATAAGAAATGA 2876

194553362 GATGGGTTGTTATTTTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAAAAGATCA 194553421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 GATGGGTTGTTATTTTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAAAAGATCA 2936

194553422 TTGCATGATCAAATTTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAGGCAAAGA 194553481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 TTGCATGATCAAATTTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAGGCAAAGA 2996

194553482 ACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGGAAAATGG 194553541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 ACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGGAAAATGG 3056

194553542 AAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGGCCT 194553601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 AAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGGCCT 3116

194553602 GGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTCAGG 194553661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 GGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTCAGG 3176

194553662 TGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAAGGT 194553721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 TGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAAGGT 3236

194553722 AGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCCACA 194553781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 AGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCCACA 3296

194553782 GCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTCACT 194553841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 GCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTCACT 3356

194553842 GGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCTCAC 194553901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 GGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCTCAC 3416

194553902 CCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCCT 194553961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 CCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCCT 3476

194553962 CACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCAT 194554021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 CACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCAT 3536

194554022 CATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGAG 194554081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 CATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGAG 3596

194554082 CACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCACCC 194554141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 CACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCACCC 3656

194554142 AGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTCT 194554201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 AGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTCT 3716

194554202 AATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAGG 194554261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 AATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAGG 3776

194554262 AAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAGT 194554321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 AAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAGT 3836

194554322 GGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTACA 194554381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 GGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTACA 3896

194554382 GCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACAG 194554441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 GCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACAG 3956

194554442 GAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAG 194554501
          ||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||
     3957 GAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGT---GTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAG 4013

194554502 ATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCC 194554561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4014 ATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCC 4073

194554562 CTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACA 194554621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4074 CTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACA 4133

194554622 CTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATC 194554681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4134 CTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATC 4193

194554682 TCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAA 194554741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4194 TCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAA 4253

194554742 GAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTAT 194554801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4254 GAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTAT 4313

194554802 ACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAA 194554861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4314 ACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAA 4373

194554862 AGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAA 194554921
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4374 AGATCAATAAGCAGAATTTCTGTACTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAA 4433

194554922 ACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGA 194554981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4434 ACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGA 4493

194554982 AAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACA 194555041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4494 AAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACA 4553

194555042 AGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCT 194555101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4554 AGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCT 4613

194555102 ATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAA 194555161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4614 ATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAA 4673

194555162 AGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCC 194555221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4674 AGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCC 4733

194555222 TTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCA 194555281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4734 TTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCA 4793

194555282 TGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCC 194555341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4794 TGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCC 4853

194555342 CAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGG 194555401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4854 CAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGG 4913

194555402 CCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTG 194555461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4914 CCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTG 4973

194555462 TGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAG 194555521
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4974 TGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAG 5033

194555522 GTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGA 194555581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5034 GTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGA 5093

194555582 CTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTAC 194555641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5094 CTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTAC 5153

194555642 TTGCTCCAT 194555650
          |||||||||
     5154 TTGCTCCAT 5162

EXCISED REGION

194556285 CACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 194556344
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 CACTACAGCCTGGATGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 5226

194556345 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 194556404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 5286

194556405 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 194556464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 5346

194556465 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 194556524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 5406

194556525 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 194556584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 5466

194556585 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAA 194556638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAA 5520

Alignment time is 4.23356 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,    10172] =>     10172 nucs 'mol-32-1e87-208330_10172'

Score:        9952
Aligned:     10178        nucs
Identic:     10137 (100%) nucs =>      3823 ( 99%)      6314 (100%)
Gaps:           29 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194551813,194555650] EXCISED REGION [194556285,194562605]
 second seq =>  [        1,     3847] EXCISED REGION [     3852,    10172]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       634 nucs [194555651,194556284]
 second seq =>         4 nucs [3848,3851]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [3848,3848] to [3851,3851]

194551813 GGCTGCATTCTGAGTAGAAGAGGGTGTGAGACAATGTCCTTCAGATAAACAAGATGTCAC 194551872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTGCATTCTGAGTAGAAGAGGGTGTGAGACAATGTCCTTCAGATAAACAAGATGTCAC 60

194551873 TGTGGTGGGGAAATAATGTGAACACATAGAAATTGCTCAAGAAATGAGCACAGATGGAGG 194551932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTGGTGGGGAAATAATGTGAACACATAGAAATTGCTCAAGAAATGAGCACAGATGGAGG 120

194551933 GAATGGAGTCAAGGAAGGAGGGAGGGAGTCCATATCATATTTGAAAGACATCTAATCTTT 194551992
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      121 GAATGGAGTCAAGGAAGGAGGGAGGGAGTCCATATCATATTTGAAAGACATCTAATCTTG 180

194551993 GTTGGAAGGGCACATGTGGGTGGAAAGAATTCAAGGAAGCCTCATTCATTCATTATTTAT 194552052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTGGAAGGGCACATGTGGGTGGAAAGAATTCAAGGAAGCCTCATTCATTCATTATTTAT 240

194552053 TAATCCTTTACAAAACTCCATTTAATAGACTTTGGTGCCTGCCATGTGGCAGGTACTGAG 194552112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAATCCTTTACAAAACTCCATTTAATAGACTTTGGTGCCTGCCATGTGGCAGGTACTGAG 300

194552113 CTGGGAGCTGGTCATACAGCCAGAGACAACACATGTATGGCCCTTGCCCTCATGGAGCTT 194552172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGGGAGCTGGTCATACAGCCAGAGACAACACATGTATGGCCCTTGCCCTCATGGAGCTT 360

194552173 ATAGTCTAGTGGAGAGGAGAGGCCGCCACTGATTAAGACCGCAAGTGCTGTGAAGAAAAA 194552232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAGTCTAGTGGAGAGGAGAGGCCGCCACTGATTAAGACCGCAAGTGCTGTGAAGAAAAA 420

194552233 GAACAAGCAGAAGCAAGCATAATAGGGGAGGCCCGCTTAGGACTAGGGAAGGTGACATTT 194552292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAACAAGCAGAAGCAAGCATAATAGGGGAGGCCCGCTTAGGACTAGGGAAGGTGACATTT 480

194552293 AAGCAGAAGGCTGAAAAACGAGCAGGATTCCATCCTGTGAAGAGCTCGGGGAAGGGCATG 194552352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCAGAAGGCTGAAAAACGAGCAGGATTCCATCCTGTGAAGAGCTCGGGGAAGGGCATG 540

194552353 CCGGGTAGAGGGAGCTGCATCTGCAAGGGCCTAAGGCAGTGAGGAACTTGGCTCTGGGAG 194552412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCGGGTAGAGGGAGCTGCATCTGCAAGGGCCTAAGGCAGTGAGGAACTTGGCTCTGGGAG 600

194552413 AAATGGAAAGGAGAGGACAGTGTGTCTAGAGGGTGGAAGGCAGAGACACAGGAAATGAAA 194552472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAATGGAAAGGAGAGGACAGTGTGTCTAGAGGGTGGAAGGCAGAGACACAGGAAATGAAA 660

194552473 CAGGAGACATAGGAGGGGCCAGATTCTGTAAGGCCTTGTAGGCCTCAGGACACAGAGAGG 194552532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||  
      661 CAGGAGACATAGGAGGGGCCAGATTCTGTAAGGCCTTGTAGGCCTCAGAACACAGAGA-- 718

194552533 C---GCTTGAGTTGCATTTTGAGGGCAATGGGAAGTTGCTGGTGGGTTTGAATCGGGGCT 194552589
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 -TGAGCTTGAGTTGCATTTTGAGGGCAATGGGAAGTTGCTGGTGGGTTTGAATCGGGGCT 777

194552590 TAGGGTTTTTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTG------------AGAAGGAGTCTGGCT 194552637
          |||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||
      778 TAGGGTTTTTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGAAGGAGTCTGGCT 837

194552638 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCG 194552697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      838 CTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTG 897

194552698 GGTTCACGCCATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGGTGCTCACCAC 194552757
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
      898 GGTTCACGCCATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGTGCTCACCAC 957

194552758 CACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGG 194552817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 CACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGG 1017

194552818 ACGGGGGCTTAGGTTTTTAAGCAGTCTGGATGCTCTGTGAGGTAAGGATTGGAAGAGGCA 194552877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 ACGGGGGCTTAGGTTTTTAAGCAGTCTGGATGCTCTGTGAGGTAAGGATTGGAAGAGGCA 1077

194552878 AGAGTGGAGGGAGTGAGAACAGAGCGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGGTGGGG 194552937
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 AGAGTGGAGGGAGTGAGAACAGAGTGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGGTGGGG 1137

194552938 GAAGTGGGGTTGCAGGGAAGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTC 194552997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 GAAGTGGGGTTGCAGGGAAGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTC 1197

194552998 GGGGCTGCTAGATGTGGGGATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCA 194553057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 GGGGCTGCTAGATGTGGGGATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCA 1257

194553058 AATTTGGAAAACTATTTATTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTG 194553117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 AATTTGGAAAACTATTTATTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTG 1317

194553118 GAGAAAAGGAGGAATAAGATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCA 194553177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 GAGAAAAGGAGGAATAAGATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCA 1377

194553178 CCCTCTGCCACAGATGAGGAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGT 194553237
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 CCCTTTGCCACAGATGAGGAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGT 1437

194553238 TTGCTGGGGTTATTGCGCTGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAATTGAG 194553297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1438 TTGCTGGGGTTATTGCGCTGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAATCGAG 1497

194553298 CAATTGCTTCTGCCTCAGGAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAATAATGATTGAATAAGAA 194553357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1498 CAATTGCTTCTGCCTCAGGAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAGTAATGATTGAATAAGAA 1557

194553358 ATGAGATGGGTTGTTATTTTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAAAAG 194553417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 ATGAGATGGGTTGTTATTTTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAAAAG 1617

194553418 ATCATTGCATGATCAAATTTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAGGCA 194553477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 ATCATTGCATGATCAAATTTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAGGCA 1677

194553478 AAGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGGAAA 194553537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 AAGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGGAAA 1737

194553538 ATGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGG 194553597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 ATGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGG 1797

194553598 GCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTT 194553657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 GCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTT 1857

194553658 CAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAA 194553717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 CAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAA 1917

194553718 AGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTC 194553777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 AGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTC 1977

194553778 CACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGT 194553837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 CACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGT 2037

194553838 CACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCC 194553897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 CACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCC 2097

194553898 TCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTC 194553957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 TCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTC 2157

194553958 TCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCA 194554017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 TCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCA 2217

194554018 TCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCA 194554077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 TCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCA 2277

194554078 TGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTC 194554137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 TGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTC 2337

194554138 ACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGT 194554197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 ACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGT 2397

194554198 GTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGT 194554257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 GTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGT 2457

194554258 CAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGG 194554317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 CAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGG 2517

194554318 AAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGAC 194554377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 AAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGAC 2577

194554378 TACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTC 194554437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 TACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTC 2637

194554438 ACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCA 194554497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||
     2638 ACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGT---GTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCA 2694

194554498 ATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAA 194554557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 ATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAA 2754

194554558 GCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCAT 194554617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 GCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCAT 2814

194554618 CACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAA 194554677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 CACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAA 2874

194554678 AATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCA 194554737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 AATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCA 2934

194554738 GCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAAT 194554797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 GCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAAT 2994

194554798 TTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAA 194554857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 TTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAA 3054

194554858 ACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTAC 194554917
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 ACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTACTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTAC 3114

194554918 ACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTG 194554977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 ACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTG 3174

194554978 TGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTT 194555037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 TGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTT 3234

194555038 TACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTG 194555097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 TACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTG 3294

194555098 GCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAG 194555157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 GCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAG 3354

194555158 AGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGG 194555217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 AGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGG 3414

194555218 TGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGG 194555277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 TGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGG 3474

194555278 GCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTA 194555337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 GCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTA 3534

194555338 ATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATC 194555397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 ATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATC 3594

194555398 CTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGT 194555457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 CTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGT 3654

194555458 GGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTG 194555517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 GGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTG 3714

194555518 GAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGC 194555577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 GAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGC 3774

194555578 AAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTC 194555637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 AAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTC 3834

194555638 CTACTTGCTCCAT 194555650
          |||||||||||||
     3835 CTACTTGCTCCAT 3847

EXCISED REGION

194556285 CACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 194556344
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3852 CACTACAGCCTGGATGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 3911

194556345 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 194556404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3912 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 3971

194556405 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 194556464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3972 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 4031

194556465 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 194556524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4032 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 4091

194556525 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 194556584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4092 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 4151

194556585 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 194556644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4152 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 4211

194556645 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 194556704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4212 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 4271

194556705 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 194556764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4272 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 4331

194556765 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 194556824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4332 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 4391

194556825 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 194556884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4392 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 4451

194556885 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 194556944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4452 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 4511

194556945 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 194557004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4512 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 4571

194557005 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 194557064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4572 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 4631

194557065 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCA----TTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 194557120
          ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||
     4632 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGT----GGCGTTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 4687

194557121 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 194557180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 4747

194557181 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 194557240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 4807

194557241 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 194557300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 4867

194557301 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 194557360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 4927

194557361 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 194557420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 4987

194557421 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 194557480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 5047

194557481 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 194557540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 5107

194557541 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 194557600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 5167

194557601 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 194557660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5168 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 5227

194557661 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 194557720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5228 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 5287

194557721 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 194557780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5288 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 5347

194557781 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 194557840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5348 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 5407

194557841 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 194557900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5408 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 5467

194557901 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 194557960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5468 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 5527

194557961 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 194558020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5528 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 5587

194558021 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 194558080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5588 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 5647

194558081 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 194558140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5648 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 5707

194558141 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 194558200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5708 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 5767

194558201 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAA 194558260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5768 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAA 5827

194558261 ACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGA 194558320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5828 ACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGA 5887

194558321 GCTGGTCCCGCGTGTAGGTGGTTGGGGGAGGGCTGGGGTGGCAGGGAGGGCATGCAGGAG 194558380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5888 GCTGGTCCCGCGTGTAGGTGGTTGGGGGAGGGCTGGGGTGGCAGGGAGGGCATGCAGGAG 5947

194558381 GGGCATGCCTGAGAAGTCAGCTGAAGGCCTGGGCTCCTCTGGTGCTGGCGCTTCCGGGTT 194558440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5948 GGGCATGCCTGAGAAGTCAGCTGAAGGCCTGGGCTCCTCTGGTGCTGGCGCTTCCGGGTT 6007

194558441 TGCAGCTGCACTTCTGGGTGTTTCAGCACACGTCTCTGAATCTAGACTGGGCTGATTTCA 194558500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6008 TGCAGCTGCACTTCTGGGTGTTTCAGCACACGTCTCTGAATCTAGACTGGGCTGATTTCA 6067

194558501 AGGAGATGGGTAGGAGGAAGAAATGCACAACCAGGTCTTGCTGAGGAAAAAAAGAGATGT 194558560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     6068 AGGAGATGGGTAGGAGGAAGAAATGCACAACCAGGTTTTGCTGAGGAAAAAAAGAGATGT 6127

194558561 CCATAGTGAGGGCTGTCTGCTCGGATTACAGACAAGGAGCCTTGGGGATGGGAGGATAAG 194558620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6128 CCATAGTGAGGGCTGTCTGCTCGGATTACAGACAAGGAGCCTTGGGGATGGGAGGATAAG 6187

194558621 GGCTGACCTCACAGGGACAGAGCCTCTTTTGGGCTGCCCTGAGGCCTCTAAACCACAGCC 194558680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6188 GGCTGACCTCACAGGGACAGAGCCTCTTTTGGGCTGCCCTGAGGCCTCTAAACCACAGCC 6247

194558681 AGCCATGGAGAGCAGAAGGCTCATCTTTAATTGGTACCAGTTTTTCTGGCAAGCTCAATT 194558740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6248 AGCCATGGAGAGCAGAAGGCTCATCTTTAATTGGTACCAGTTTTTCTGGCAAGCTCAATT 6307

194558741 TAAAGATTCAGCTCAATTGCAATCAACGGGGTAAGCCAACCAGAAAATCAGAAAATCAGT 194558800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6308 TAAAGATTCAGCTCAATTGCAATCAACGGGGTAAGCCAACCAGAAAATCAGAAAATCAGT 6367

194558801 TGCTCCTCTTGGTGCAATGAGGAGCATCAGCAACCCCAAAGGCATCAGAACATTGGCAGG 194558860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6368 TGCTCCTCTTGGTGCAATGAGGAGCATCAGCAACCCCAAAGGCATCAGAACATTGGCAGG 6427

194558861 CCTTCACTGGGGAACAGGGTCTCTGCTCCTCTGTCCTCAGCCTGAACTAAGGTAGTCTCC 194558920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6428 CCTTCACTGGGGAACAGGGTCTCTGCTCCTCTGTCCTCAGCCTGAACTAAGGTAGTCTCC 6487

194558921 ACCTAGGAGAGCACCTTCCCAGTGCACCCATTCCCCTCGGTGCTCTTGGTAAGGCAACAG 194558980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6488 ACCTAGGAGAGCACCTTCCCAGTGCACCCATTCCCCTCGGTGCTCTTGGTAAGGCAACAG 6547

194558981 CTTTCCGAGCCGTCGTTGAAAGACACTGGGCCGAAGTGAGAAGGCCTGGGTTCTAGTCCT 194559040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6548 CTTTCCGAGCCGTCGTTGAAAGACACTGGGCCGAAGTGAGAAGGCCTGGGTTCTAGTCCT 6607

194559041 GTGTCTGCTCTACTACCTGCTGGATGGCCGTGGGCAAGTCACTTCTCCTGGCGCTGCAGT 194559100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6608 GTGTCTGCTCTACTACCTGCTGGATGGCCGTGGGCAAGTCACTTCTCCTGGCGCTGCAGT 6667

194559101 TTTCTCATCCTCAAAAGGGAAGGGGAGCAGGGAATAAGCCCTGCTGCACCTACTTTACAG 194559160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6668 TTTCTCATCCTCAAAAGGGAAGGGGAGCAGGGAATAAGCCCTGCTGCACCTACTTTACAG 6727

194559161 GGTGATTATGAAGCTCAGATAAGATAATGGCTGTAAAAGCTGTTTTTGGACATTACAGGA 194559220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6728 GGTGATTATGAAGCTCAGATAAGATAATGGCTGTAAAAGCTGTTTTTGGACATTACAGGA 6787

194559221 CATTGAGCAGATGCTCCTCTCTCGGGGTAATGGTGATGATGGCAATGATGGTAATGGTGG 194559280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6788 CATTGAGCAGATGCTCCTCTCTCGGGGTAATGGTGATGATGGCAATGATGGTAATGGTGG 6847

194559281 CTGAGTTACTTTTTATGTGCAACTCCTATAAATATCACACGAAGAGATGAATTCCTGGTT 194559340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6848 CTGAGTTACTTTTTATGTGCAACTCCTATAAATATCACACGAAGAGATGAATTCCTGGTT 6907

194559341 TTAGCGGCCTAACTGTATCCACTTCATTCATCCCTGGGTTCTCACCCTAGCTCTGAGGGA 194559400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6908 TTAGCGGCCTAACTGTATCCACTTCATTCATCCCTGGGTTCTCACCCTAGCTCTGAGGGA 6967

194559401 TTCATGTGTAGCTTTGTGAGAGAGTTGGAATGGAATGTCTCAGCGCATCCTTCTCCCTCT 194559460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6968 TTCATGTGTAGCTTTGTGAGAGAGTTGGAATGGAATGTCTCAGCGCATCCTTCTCCCTCT 7027

194559461 GCAGAGTCCAGCGGTCCCTCTTACATGTCCTCCTCCAAGCATCAGGAAATTAGACCGTCG 194559520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7028 GCAGAGTCCAGCGGTCCCTCTTACATGTCCTCCTCCAAGCATCAGGAAATTAGACCGTCG 7087

194559521 GTACCCACATTGAGGTCAAGCTCTCTCTGGTTTCACCTGGAAGAAGGGAGCAGCTGGTGA 194559580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7088 GTACCCACATTGAGGTCAAGCTCTCTCTGGTTTCACCTGGAAGAAGGGAGCAGCTGGTGA 7147

194559581 CCTTAAGTCTTTGCAAGGTATCAGGTGCTAAAACCTAGAACATTCTTTTAACACCCCAGC 194559640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7148 CCTTAAGTCTTTGCAAGGTATCAGGTGCTAAAACCTAGAACATTCTTTTAACACCCCAGC 7207

194559641 TACCTATCTACTCTTATTCAAGCCAGAAAGAAAGGACTCAAAGAGAGGGCTAGGTAGGTC 194559700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7208 TACCTATCTACTCTTATTCAAGCCAGAAAGAAAGGACTCAAAGAGAGGGCTAGGTAGGTC 7267

194559701 ACACCTCTATCTTGTAGGAGAGTATGACTTTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 194559760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7268 ACACCTCTATCTTGTAGGAGAGTATGACTTTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 7327

194559761 TTTACACATATGGTGGGTAAACTTTCATGAATTGCAATTCTGGTTCTGAGAGTCTATATT 194559820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7328 TTTACACATATGGTGGGTAAACTTTCATGAATTGCAATTCTGGTTCTGAGAGTCTATATT 7387

194559821 CTGCCTACCACTTGCCTCTCTCCATAGAATATCCAATAGTCCAAAGGTTATTCTAACTGT 194559880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7388 CTGCCTACCACTTGCCTCTCTCCATAGAATATCCAATAGTCCAAAGGTTATTCTAACTGT 7447

194559881 TACTATTCAAAATAATGTCCATTTATGCCTATCTTAGATAGAACACTATTTCGCAGAAAA 194559940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7448 TACTATTCAAAATAATGTCCATTTATGCCTATCTTAGATAGAACACTATTTCGCAGAAAA 7507

194559941 GGAAGCTGAGGCAATGATAAAGTAAGTTGATAATGGTTACTGAGAGATACTCTGGGCTTC 194560000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7508 GGAAGCTGAGGCAATGATAAAGTAAGTTGATAATGGTTACTGAGAGATACTCTGGGCTTC 7567

194560001 AGGGATCATAATCCCTAATCACCAACTTCTCAGACCTTTTCTGAACACACAGAGGAGCCA 194560060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7568 AGGGATCATAATCCCTAATCACCAACTTCTCAGACCTTTTCTGAACACACAGAGGAGCCA 7627

194560061 GTGCCCTTGTCTGAAGTGAGCTTGCAGCCTGGTCCTAGGTGCAGACGGCTGCTGTTTGCT 194560120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7628 GTGCCCTTGTCTGAAGTGAGCTTGCAGCCTGGTCCTAGGTGCAGACGGCTGCTGTTTGCT 7687

194560121 GTGGAGCAATGGAGCAGGAGGAAGGGAGCGAGGCGGGCTCCCTCGCCAGTCTTAGAATCT 194560180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7688 GTGGAGCAATGGAGCAGGAGGAAGGGAGCGAGGCGGGCTCCCTCGCCAGTCTTAGAATCT 7747

194560181 TAGAATCTTAGAGCTGGATGGATCACTGGGTTTCAAGGGACCTGCAATGTGCTTACCACC 194560240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7748 TAGAATCTTAGAGCTGGATGGATCACTGGGTTTCAAGGGACCTGCAATGTGCTTACCACC 7807

194560241 AGAAACATTTCAAAAGCCATACTTCATGCTGGCCTACATTTAGAACAATTTTGTATGAAG 194560300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7808 AGAAACATTTCAAAAGCCATACTTCATGCTGGCCTACATTTAGAACAATTTTGTATGAAG 7867

194560301 AAAACTAAATATGTTAAAAATTTCTTTTCCTGTGATTTATTAAAGAAATATATGGGCCAG 194560360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7868 AAAACTAAATATGTTAAAAATTTCTTTTCCTGTGATTTATTAAAGAAATATATGGGCCAG 7927

194560361 GCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACCAAGTCGCAGATCACGAGG 194560420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7928 GCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACCAAGTCGCAGATCACGAGG 7987

194560421 TCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAA 194560480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7988 TCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACAA 8047

194560481 AAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA 194560540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8048 AAAATTAGCCAGGCGTGGTGGTGGGCGCCTGTAGTCCCAGCTACTCGGGAGGCTGAGGCA 8107

194560541 GGAGAATGGTGTGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCAGAGATCGCGCCACTGCAC 194560600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8108 GGAGAATGGTGTGAACCTGGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCAGAGATCGCGCCACTGCAC 8167

194560601 TCCAGCCTGGGTGACACAGCGAGACTCAGTCTCAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAGGAAAAA 194560660
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8168 TCCAGCCTGGGTGACACAGTGAGACTCAGTCTCAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAGGAAAAA 8227

194560661 AGAAATATACGGCTGTTGATAGGGGTTTCTAATGAACACGAGAGTCCCAATTTATGACAT 194560720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8228 AGAAATATACGGCTGTTGATAGGGGTTTCTAATGAACACGAGAGTCCCAATTTATGACAT 8287

194560721 CTACACAATGCTAGTCAAAAGCAATGGAGTTGGGCTCTTTAGTCAACTCAGCCCCTTCGT 194560780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8288 CTACACAATGCTAGTCAAAAGCAATGGAGTTGGGCTCTTTAGTCAACTCAGCCCCTTCGT 8347

194560781 TGTGAAATGTACATTTTCATCAGGCTATTTGGAATCACAGAAACCATTGCTATCTTTGAG 194560840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8348 TGTGAAATGTACATTTTCATCAGGCTATTTGGAATCACAGAAACCATTGCTATCTTTGAG 8407

194560841 GATTTCTGGTAGACTAGGGCCCAAAAGTTAGAGCTTCTGGACTAGACTGACTATGAGCAT 194560900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8408 GATTTCTGGTAGACTAGGGCCCAAAAGTTAGAGCTTCTGGACTAGACTGACTATGAGCAT 8467

194560901 TTTACAGACAAGGAAAGTGGAGCCCAGAGGGAAAAGCAGCTTGTCCAAAGCCACACAGAG 194560960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8468 TTTACAGACAAGGAAAGTGGAGCCCAGAGGGAAAAGCAGCTTGTCCAAAGCCACACAGAG 8527

194560961 CATCAGTAGCAGGTCTGGGACTAGAAGCAGGTCTCCCATTCGCTTCCCTGGGTCCTTTCT 194561020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8528 CATCAGTAGCAGGTCTGGGACTAGAAGCAGGTCTCCCATTCGCTTCCCTGGGTCCTTTCT 8587

194561021 TCAGCACTTGGACACCCGTTAGTTCTTAAGCTGGAAAGCAGGAGAAGCACATAGGACCCT 194561080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8588 TCAGCACTTGGACACCCGTTAGTTCTTAAGCTGGAAAGCAGGAGAAGCACATAGGACCCT 8647

194561081 TTCACAGAACCTCAGCTGTCTGGACCTGCTGATGCTTTTACAGATCCAGACCTAAGCAGG 194561140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8648 TTCACAGAACCTCAGCTGTCTGGACCTGCTGATGCTTTTACAGATCCAGACCTAAGCAGG 8707

194561141 AATGGGGAGTGACAGCTTATCGCTCCCGCCATAGTGAGAGGTGAAGCCGGCTGGGCTTCT 194561200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8708 AATGGGGAGTGACAGCTTATCGCTCCCGCCATAGTGAGAGGTGAAGCCGGCTGGGCTTCT 8767

194561201 GGGTCAGGTGAGGACTTGGAGAACTTTTCTGTCTAGCTAAGGGATTGTAAATGCACCAAT 194561260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8768 GGGTCAGGTGAGGACTTGGAGAACTTTTCTGTCTAGCTAAGGGATTGTAAATGCACCAAT 8827

194561261 CAGCGCTCTGTGTCTAGCTAAAGGTTTGTAAACACACCAATCAGCACTCTGTAAAAACGC 194561320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8828 CAGCGCTCTGTGTCTAGCTAAAGGTTTGTAAACACACCAATCAGCACTCTGTAAAAACGC 8887

194561321 ACCAATCGGCACTCTGTGTCTAGCTAATCAGGTGGGGACCTAGAGAACTTTTCTGTCTAG 194561380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8888 ACCAATCGGCACTCTGTGTCTAGCTAATCAGGTGGGGACCTAGAGAACTTTTCTGTCTAG 8947

194561381 CTAAAGATTGTAAATACACCAATCAGCACTCTGTAAAAACACACCAATCAGCGCTCTGTA 194561440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8948 CTAAAGATTGTAAATACACCAATCAGCACTCTGTAAAAACACACCAATCAGCGCTCTGTA 9007

194561441 AAATGGACCAATCAGCTCTCTGTAAAATGGACCAATCAGCTCTCTGTAAAATGGACCAAT 194561500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9008 AAATGGACCAATCAGCTCTCTGTAAAATGGACCAATCAGCTCTCTGTAAAATGGACCAAT 9067

194561501 TAGCAGGATGTGGGTGGGGCCAAATAAGGGAATAAACGCAGGCCACCCGAGCCGGCATCG 194561560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9068 TAGCAGGATGTGGGTGGGGCCAAATAAGGGAATAAACGCAGGCCACCCGAGCCGGCATCG 9127

194561561 GGAATCCAGTCGGGTCCCTTTCCAGGCTCAGTAAGCTGTGTTCTTTTGCTCTTGGCAGTA 194561620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9128 GGAATCCAGTCGGGTCCCTTTCCAGGCTCAGTAAGCTGTGTTCTTTTGCTCTTGGCAGTA 9187

194561621 AATCTTGCTGCTGTTCACGCTTTGGGTCCACACTACCTTTAAGAGCTGTAACATTGACTG 194561680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9188 AATCTTGCTGCTGTTCACGCTTTGGGTCCACACTACCTTTAAGAGCTGTAACATTGACTG 9247

194561681 TGAAGGTCTGCGGCTTCACTCCTCAAGTCAGCAAGACCACGAACCCACCAGAAGGAAGAA 194561740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9248 TGAAGGTCTGCGGCTTCACTCCTCAAGTCAGCAAGACCACGAACCCACCAGAAGGAAGAA 9307

194561741 ACTCCGGACACACCATCTTTAAGAACTGTAACACTCACCTCGAGGGTCTGTGGCTTCATT 194561800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9308 ACTCCGGACACACCATCTTTAAGAACTGTAACACTCACCTCGAGGGTCTGTGGCTTCATT 9367

194561801 CTTGAAGTCAGAAAGAACAAGAACCCACCAATTCCAGACACAATAGAATCCAAGTTCTGC 194561860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9368 CTTGAAGTCAGAAAGAACAAGAACCCACCAATTCCAGACACAATAGAATCCAAGTTCTGC 9427

194561861 CAAGTGTGGTAACACCCAGCTCACGAATGACTGCGACTCTTATCTTCGAGGTGACTCATC 194561920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9428 CAAGTGTGGTAACACCCAGCTCACGAATGACTGCGACTCTTATCTTCGAGGTGACTCATC 9487

194561921 CTGGCAGCAGAATGAGCTCCGGCCAAAGGCACAGTGACATCCTAAAGCCCGCCCTCACTG 194561980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9488 CTGGCAGCAGAATGAGCTCCGGCCAAAGGCACAGTGACATCCTAAAGCCCGCCCTCACTG 9547

194561981 TCTCTCTCCATCTCATGTTTAGCCAGAAAAGGCAAAAGCCAGTCCTTTCGTGAAATCAAA 194562040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9548 TCTCTCTCCATCTCATGTTTAGCCAGAAAAGGCAAAAGCCAGTCCTTTCGTGAAATCAAA 9607

194562041 CAGGCAAGTATCCCTCAGGGCTCTCTTGGCTCTGGCTAAAGTTGCTGGGACTCACGGGTT 194562100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9608 CAGGCAAGTATCCCTCAGGGCTCTCTTGGCTCTGGCTAAAGTTGCTGGGACTCACGGGTT 9667

194562101 AGAAGAGACCCTACAGAGGCTTGTTACAGAGGCCTATCACCGAGGAAACACAGAACACTG 194562160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9668 AGAAGAGACCCTACAGAGGCTTGTTACAGAGGCCTATCACCGAGGAAACACAGAACACTG 9727

194562161 GTAATGTAGGAGCCATGGGGCATTTGCTGCACAAGGTGAATTCTGTTTTACTGTTTAAAC 194562220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9728 GTAATGTAGGAGCCATGGGGCATTTGCTGCACAAGGTGAATTCTGTTTTACTGTTTAAAC 9787

194562221 GATGGCACTGCGATATCTTTGATCTTTTTTCTTCCTCAGGGAAGTGGGTGATGGAAATGT 194562280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9788 GATGGCACTGCGATATCTTTGATCTTTTTTCTTCCTCAGGGAAGTGGGTGATGGAAATGT 9847

194562281 CGGTTCTTTGTTATTGTAAGTTAAACTGCCTTTGGCTAAGCCCTGTGGTAACCCTGCTAC 194562340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9848 CGGTTCTTTGTTATTGTAAGTTAAACTGCCTTTGGCTAAGCCCTGTGGTAACCCTGCTAC 9907

194562341 TGTGCGGTAGGGCACTCACACCTCTGGTGTCTCATCATTAGGTCTTAATTCTGACATTAT 194562400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9908 TGTGCGGTAGGGCACTCACACCTCTGGTGTCTCATCATTAGGTCTTAATTCTGACATTAT 9967

194562401 ACATGCCCATGCTCCTTCCTGCAGAGATGTGAGAAAACCAGAAGCTTTAAAAAATCAAGT 194562460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     9968 ACATGCCCATGCTCCTTCCTGCAGAGATGTGAGAAAACCAGAAGCTTTAAAAAATCAAGT 10027

194562461 AAGTTTAAATTTGGGGCTCCCCAAGTCAACCTTCCAGGTAAATTCTCCTTTGTTAATGAC 194562520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10028 AAGTTTAAATTTGGGGCTCCCCAAGTCAACCTTCCAGGTAAATTCTCCTTTGTTAATGAC 10087

194562521 ACACTGTGCAGACAGCAGGCCTCATCCATTCCTTCAATAAACATTGAGTGGTGCTGCGAA 194562580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
    10088 ACACTGTGCAGACAGCAGGCCTCATCCATTCCTTCAATAAACATTGAGTGGTGCTGCGAA 10147

194562581 TCCAGGCTTTGTGTGAGGACCCGGG 194562605
          |||||||||||||||||||||||||
    10148 TCCAGGCTTTGTGTGAGGACCCGGG 10172

Alignment time is 7.58747 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3847] =>      3847 nucs 'mol-32-1e87-208330_3847'

Score:        3706
Aligned:      3841        nucs
Identic:      3823 (100%) nucs =>       784 ( 99%)      3039 (100%)
Gaps:            9 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194551813,194552601] EXCISED REGION [194552602,194555650]
 second seq =>  [        1,      789] EXCISED REGION [      802,     3847]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        12 nucs [790,801]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        21 nucs [790,810] to [802,822]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [194552601,194552601] to [194552602,194552602]
 second seq =>         1 nucs [789,789] to [802,802]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         4 nucs [790,793] to [798,801]

194551813 GGCTGCATTCTGAGTAGAAGAGGGTGTGAGACAATGTCCTTCAGATAAACAAGATGTCAC 194551872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGCTGCATTCTGAGTAGAAGAGGGTGTGAGACAATGTCCTTCAGATAAACAAGATGTCAC 60

194551873 TGTGGTGGGGAAATAATGTGAACACATAGAAATTGCTCAAGAAATGAGCACAGATGGAGG 194551932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGTGGTGGGGAAATAATGTGAACACATAGAAATTGCTCAAGAAATGAGCACAGATGGAGG 120

194551933 GAATGGAGTCAAGGAAGGAGGGAGGGAGTCCATATCATATTTGAAAGACATCTAATCTTT 194551992
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
      121 GAATGGAGTCAAGGAAGGAGGGAGGGAGTCCATATCATATTTGAAAGACATCTAATCTTG 180

194551993 GTTGGAAGGGCACATGTGGGTGGAAAGAATTCAAGGAAGCCTCATTCATTCATTATTTAT 194552052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTGGAAGGGCACATGTGGGTGGAAAGAATTCAAGGAAGCCTCATTCATTCATTATTTAT 240

194552053 TAATCCTTTACAAAACTCCATTTAATAGACTTTGGTGCCTGCCATGTGGCAGGTACTGAG 194552112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAATCCTTTACAAAACTCCATTTAATAGACTTTGGTGCCTGCCATGTGGCAGGTACTGAG 300

194552113 CTGGGAGCTGGTCATACAGCCAGAGACAACACATGTATGGCCCTTGCCCTCATGGAGCTT 194552172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGGGAGCTGGTCATACAGCCAGAGACAACACATGTATGGCCCTTGCCCTCATGGAGCTT 360

194552173 ATAGTCTAGTGGAGAGGAGAGGCCGCCACTGATTAAGACCGCAAGTGCTGTGAAGAAAAA 194552232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAGTCTAGTGGAGAGGAGAGGCCGCCACTGATTAAGACCGCAAGTGCTGTGAAGAAAAA 420

194552233 GAACAAGCAGAAGCAAGCATAATAGGGGAGGCCCGCTTAGGACTAGGGAAGGTGACATTT 194552292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAACAAGCAGAAGCAAGCATAATAGGGGAGGCCCGCTTAGGACTAGGGAAGGTGACATTT 480

194552293 AAGCAGAAGGCTGAAAAACGAGCAGGATTCCATCCTGTGAAGAGCTCGGGGAAGGGCATG 194552352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AAGCAGAAGGCTGAAAAACGAGCAGGATTCCATCCTGTGAAGAGCTCGGGGAAGGGCATG 540

194552353 CCGGGTAGAGGGAGCTGCATCTGCAAGGGCCTAAGGCAGTGAGGAACTTGGCTCTGGGAG 194552412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCGGGTAGAGGGAGCTGCATCTGCAAGGGCCTAAGGCAGTGAGGAACTTGGCTCTGGGAG 600

194552413 AAATGGAAAGGAGAGGACAGTGTGTCTAGAGGGTGGAAGGCAGAGACACAGGAAATGAAA 194552472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAATGGAAAGGAGAGGACAGTGTGTCTAGAGGGTGGAAGGCAGAGACACAGGAAATGAAA 660

194552473 CAGGAGACATAGGAGGGGCCAGATTCTGTAAGGCCTTGTAGGCCTCAGGACACAGAGAGG 194552532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||  
      661 CAGGAGACATAGGAGGGGCCAGATTCTGTAAGGCCTTGTAGGCCTCAGAACACAGAGA-- 718

194552533 C---GCTTGAGTTGCATTTTGAGGGCAATGGGAAGTTGCTGGTGGGTTTGAATCGGGGCT 194552589
              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      719 -TGAGCTTGAGTTGCATTTTGAGGGCAATGGGAAGTTGCTGGTGGGTTTGAATCGGGGCT 777

194552590 TAGGGTTTTTTG 194552601
          ||||||||||||
      778 TAGGGTTTTTTG 789

EXCISED REGION

194552602 GTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGAAGGAGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGT 194552661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      802 GTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGAAGGAGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGT 861

194552662 GGCGCGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCTTGCCTCA 194552721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
      862 GGCGCGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGGGTTCACGCCATTCTCTTGCCTCA 921

194552722 GCCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGGTGCTCACCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTAT 194552781
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      922 GCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGTGCTCACCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTAT 981

194552782 TTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGACGGGGGCTTAGGTTTTTAAGCAG 194552841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      982 TTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGACGGGGGCTTAGGTTTTTAAGCAG 1041

194552842 TCTGGATGCTCTGTGAGGTAAGGATTGGAAGAGGCAAGAGTGGAGGGAGTGAGAACAGAG 194552901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1042 TCTGGATGCTCTGTGAGGTAAGGATTGGAAGAGGCAAGAGTGGAGGGAGTGAGAACAGAG 1101

194552902 CGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGGTGGGGGAAGTGGGGTTGCAGGGAAGGGCC 194552961
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1102 TGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGGTGGGGGAAGTGGGGTTGCAGGGAAGGGCC 1161

194552962 CTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCGGGGCTGCTAGATGTGGGGATTAG 194553021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1162 CTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCGGGGCTGCTAGATGTGGGGATTAG 1221

194553022 GAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTATTTGTT 194553081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1222 GAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTATTTGTT 1281

194553082 TACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAGATAATT 194553141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1282 TACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAGATAATT 1341

194553142 TCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCACCCTCTGCCACAGATGAGGAAAGG 194553201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1342 TCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCACCCTTTGCCACAGATGAGGAAAGG 1401

194553202 TTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGCTGCCTT 194553261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1402 TTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGCTGCCTT 1461

194553262 TCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAATTGAGCAATTGCTTCTGCCTCAGGAAAAG 194553321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1462 TCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAATCGAGCAATTGCTTCTGCCTCAGGAAAAG 1521

194553322 AAATCATGTCCTGAGTGAATAATGATTGAATAAGAAATGAGATGGGTTGTTATTTTAAAC 194553381
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1522 AAATCATGTCCTGAGTGAGTAATGATTGAATAAGAAATGAGATGGGTTGTTATTTTAAAC 1581

194553382 TAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAAAAGATCATTGCATGATCAAATTTGGGA 194553441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1582 TAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAAAAGATCATTGCATGATCAAATTTGGGA 1641

194553442 GCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAGGCAAAGAACATAAATTTCCACAGTGGG 194553501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1642 GCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAGGCAAAGAACATAAATTTCCACAGTGGG 1701

194553502 CAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGGAAAATGGAAAGATAATCTCAGAGACAA 194553561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1702 CAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGGAAAATGGAAAGATAATCTCAGAGACAA 1761

194553562 AAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCT 194553621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1762 AAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCT 1821

194553622 GGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAA 194553681
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1822 GGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAA 1881

194553682 ATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGG 194553741
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1882 ATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGG 1941

194553742 GTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGAT 194553801
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1942 GTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGAT 2001

194553802 CTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGA 194553861
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2002 CTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGA 2061

194553862 GGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCC 194553921
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2062 GGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCC 2121

194553922 TCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCT 194553981
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2122 TCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCT 2181

194553982 CCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTGATGAGC 194554041
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2182 CCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTGATGAGC 2241

194554042 TGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTA 194554101
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2242 TGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTA 2301

194554102 CACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCAT 194554161
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2302 CACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCAT 2361

194554162 GAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAG 194554221
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2362 GAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAG 2421

194554222 GCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACA 194554281
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2422 GCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACA 2481

194554282 CAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGC 194554341
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2482 CAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGC 2541

194554342 CTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCT 194554401
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2542 CTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCT 2601

194554402 GAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTG 194554461
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2602 GAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTG 2661

194554462 TGTGTTGTCGTGTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATA 194554521
          ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2662 TGTGTT---GTGTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATA 2718

194554522 GGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATAC 194554581
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2719 GGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATAC 2778

194554582 CAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCAC 194554641
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2779 CAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCAC 2838

194554642 CAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAA 194554701
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2839 CAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAA 2898

194554702 GGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGG 194554761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2899 GGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGG 2958

194554762 AGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGT 194554821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2959 AGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGT 3018

194554822 CCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTC 194554881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3019 CCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTC 3078

194554882 TGTCCTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCA 194554941
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3079 TGTACTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCA 3138

194554942 CGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACAT 194555001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3139 CGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACAT 3198

194555002 TCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGT 194555061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3199 TCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGT 3258

194555062 TGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGAC 194555121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3259 TGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGAC 3318

194555122 TTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCT 194555181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3319 TTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCT 3378

194555182 GCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAG 194555241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3379 GCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAG 3438

194555242 TCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAA 194555301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3439 TCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAA 3498

194555302 GGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAG 194555361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3499 GGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAG 3558

194555362 GCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGT 194555421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3559 GCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGT 3618

194555422 CTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTA 194555481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3619 CTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTA 3678

194555482 CTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAG 194555541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3679 CTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAG 3738

194555542 AGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACA 194555601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3739 AGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACA 3798

194555602 AACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 194555650
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3799 AACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 3847

Alignment time is 2.87572 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     5049] =>      5049 nucs 'mol-32-211b-011547_5049'

Score:        4979
Aligned:      5052        nucs
Identic:      5038 (100%) nucs =>      1945 (100%)      3093 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194553702,194555650] EXCISED REGION [194556285,194559383]
 second seq =>  [        1,     1946] EXCISED REGION [     1951,     5049]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       634 nucs [194555651,194556284]
 second seq =>         4 nucs [1947,1950]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1947,1947] to [1950,1950]

194553702 GTTGTCTCAGGGTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACC 194553761
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTTGTCTCAGGGTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACC 60

194553762 AAGGTCACTGCCAGTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGA 194553821
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGGTCACTGCCAGTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGA 120

194553822 CTGAGACTCCTTTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGC 194553881
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGAGACTCCTTTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGC 180

194553882 ACCCCTCTCCCCACCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCA 194553941
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ACCCCTCTCCCCACCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCA 240

194553942 CCCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCT 194554001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCT 300

194554002 CCCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAG 194554061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAG 360

194554062 GGAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGA 194554121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGA 420

194554122 CTATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGG 194554181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CTATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGG 480

194554182 ACTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGG 194554241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGG 540

194554242 CTAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCC 194554301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCC 600

194554302 ACCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCC 194554361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCC 660

194554362 TGGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCG 194554421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCG 720

194554422 CCTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGT 194554481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||
      721 CCTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGT---GTTTGCGGT 777

194554482 GATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTG 194554541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 GATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTG 837

194554542 AGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGG 194554601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 AGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGG 897

194554602 CTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGA 194554661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 CTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGA 957

194554662 ACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGC 194554721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 ACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGC 1017

194554722 AAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAG 194554781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 AAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAG 1077

194554782 ATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTT 194554841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 ATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTT 1137

194554842 CCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTG 194554901
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1138 CCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTACTTAGGAAGCTCACTG 1197

194554902 GTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCT 194554961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 GTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCT 1257

194554962 CGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGG 194555021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 CGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGG 1317

194555022 TTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTC 194555081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 TTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTC 1377

194555082 ACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTC 194555141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 ACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTC 1437

194555142 TGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGA 194555201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 TGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGA 1497

194555202 GTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGG 194555261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGG 1557

194555262 AGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATG 194555321
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 AGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATG 1617

194555322 GTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCA 194555381
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 GTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCA 1677

194555382 AGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAA 194555441
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 AGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAA 1737

194555442 ATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGA 194555501
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 ATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGA 1797

194555502 GAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCC 194555561
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 GAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCC 1857

194555562 AGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATG 194555621
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 AGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATG 1917

194555622 AACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 194555650
          |||||||||||||||||||||||||||||
     1918 AACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 1946

EXCISED REGION

194556285 CACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 194556344
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 CACTACAGCCTGGATGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 2010

194556345 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 194556404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 2070

194556405 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 194556464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 2130

194556465 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 194556524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 2190

194556525 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 194556584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 2250

194556585 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 194556644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 2310

194556645 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 194556704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 2370

194556705 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 194556764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 2430

194556765 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 194556824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 2490

194556825 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 194556884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 2550

194556885 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 194556944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 2610

194556945 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 194557004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 2670

194557005 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 194557064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 2730

194557065 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCA----TTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 194557120
          ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||
     2731 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGT----GGCGTTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 2786

194557121 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 194557180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2787 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 2846

194557181 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 194557240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2847 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 2906

194557241 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 194557300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2907 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 2966

194557301 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 194557360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2967 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 3026

194557361 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 194557420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3027 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 3086

194557421 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 194557480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3087 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 3146

194557481 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 194557540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3147 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 3206

194557541 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 194557600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3207 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 3266

194557601 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 194557660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3267 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 3326

194557661 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 194557720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3327 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 3386

194557721 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 194557780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3387 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 3446

194557781 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 194557840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3447 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 3506

194557841 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 194557900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3507 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 3566

194557901 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 194557960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3567 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 3626

194557961 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 194558020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3627 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 3686

194558021 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 194558080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3687 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 3746

194558081 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 194558140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3747 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 3806

194558141 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 194558200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3807 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 3866

194558201 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAA 194558260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3867 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAA 3926

194558261 ACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGA 194558320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3927 ACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGA 3986

194558321 GCTGGTCCCGCGTGTAGGTGGTTGGGGGAGGGCTGGGGTGGCAGGGAGGGCATGCAGGAG 194558380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3987 GCTGGTCCCGCGTGTAGGTGGTTGGGGGAGGGCTGGGGTGGCAGGGAGGGCATGCAGGAG 4046

194558381 GGGCATGCCTGAGAAGTCAGCTGAAGGCCTGGGCTCCTCTGGTGCTGGCGCTTCCGGGTT 194558440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4047 GGGCATGCCTGAGAAGTCAGCTGAAGGCCTGGGCTCCTCTGGTGCTGGCGCTTCCGGGTT 4106

194558441 TGCAGCTGCACTTCTGGGTGTTTCAGCACACGTCTCTGAATCTAGACTGGGCTGATTTCA 194558500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4107 TGCAGCTGCACTTCTGGGTGTTTCAGCACACGTCTCTGAATCTAGACTGGGCTGATTTCA 4166

194558501 AGGAGATGGGTAGGAGGAAGAAATGCACAACCAGGTCTTGCTGAGGAAAAAAAGAGATGT 194558560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4167 AGGAGATGGGTAGGAGGAAGAAATGCACAACCAGGTTTTGCTGAGGAAAAAAAGAGATGT 4226

194558561 CCATAGTGAGGGCTGTCTGCTCGGATTACAGACAAGGAGCCTTGGGGATGGGAGGATAAG 194558620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4227 CCATAGTGAGGGCTGTCTGCTCGGATTACAGACAAGGAGCCTTGGGGATGGGAGGATAAG 4286

194558621 GGCTGACCTCACAGGGACAGAGCCTCTTTTGGGCTGCCCTGAGGCCTCTAAACCACAGCC 194558680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4287 GGCTGACCTCACAGGGACAGAGCCTCTTTTGGGCTGCCCTGAGGCCTCTAAACCACAGCC 4346

194558681 AGCCATGGAGAGCAGAAGGCTCATCTTTAATTGGTACCAGTTTTTCTGGCAAGCTCAATT 194558740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4347 AGCCATGGAGAGCAGAAGGCTCATCTTTAATTGGTACCAGTTTTTCTGGCAAGCTCAATT 4406

194558741 TAAAGATTCAGCTCAATTGCAATCAACGGGGTAAGCCAACCAGAAAATCAGAAAATCAGT 194558800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4407 TAAAGATTCAGCTCAATTGCAATCAACGGGGTAAGCCAACCAGAAAATCAGAAAATCAGT 4466

194558801 TGCTCCTCTTGGTGCAATGAGGAGCATCAGCAACCCCAAAGGCATCAGAACATTGGCAGG 194558860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4467 TGCTCCTCTTGGTGCAATGAGGAGCATCAGCAACCCCAAAGGCATCAGAACATTGGCAGG 4526

194558861 CCTTCACTGGGGAACAGGGTCTCTGCTCCTCTGTCCTCAGCCTGAACTAAGGTAGTCTCC 194558920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4527 CCTTCACTGGGGAACAGGGTCTCTGCTCCTCTGTCCTCAGCCTGAACTAAGGTAGTCTCC 4586

194558921 ACCTAGGAGAGCACCTTCCCAGTGCACCCATTCCCCTCGGTGCTCTTGGTAAGGCAACAG 194558980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4587 ACCTAGGAGAGCACCTTCCCAGTGCACCCATTCCCCTCGGTGCTCTTGGTAAGGCAACAG 4646

194558981 CTTTCCGAGCCGTCGTTGAAAGACACTGGGCCGAAGTGAGAAGGCCTGGGTTCTAGTCCT 194559040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4647 CTTTCCGAGCCGTCGTTGAAAGACACTGGGCCGAAGTGAGAAGGCCTGGGTTCTAGTCCT 4706

194559041 GTGTCTGCTCTACTACCTGCTGGATGGCCGTGGGCAAGTCACTTCTCCTGGCGCTGCAGT 194559100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4707 GTGTCTGCTCTACTACCTGCTGGATGGCCGTGGGCAAGTCACTTCTCCTGGCGCTGCAGT 4766

194559101 TTTCTCATCCTCAAAAGGGAAGGGGAGCAGGGAATAAGCCCTGCTGCACCTACTTTACAG 194559160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4767 TTTCTCATCCTCAAAAGGGAAGGGGAGCAGGGAATAAGCCCTGCTGCACCTACTTTACAG 4826

194559161 GGTGATTATGAAGCTCAGATAAGATAATGGCTGTAAAAGCTGTTTTTGGACATTACAGGA 194559220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4827 GGTGATTATGAAGCTCAGATAAGATAATGGCTGTAAAAGCTGTTTTTGGACATTACAGGA 4886

194559221 CATTGAGCAGATGCTCCTCTCTCGGGGTAATGGTGATGATGGCAATGATGGTAATGGTGG 194559280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4887 CATTGAGCAGATGCTCCTCTCTCGGGGTAATGGTGATGATGGCAATGATGGTAATGGTGG 4946

194559281 CTGAGTTACTTTTTATGTGCAACTCCTATAAATATCACACGAAGAGATGAATTCCTGGTT 194559340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4947 CTGAGTTACTTTTTATGTGCAACTCCTATAAATATCACACGAAGAGATGAATTCCTGGTT 5006

194559341 TTAGCGGCCTAACTGTATCCACTTCATTCATCCCTGGGTTCTC 194559383
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5007 TTAGCGGCCTAACTGTATCCACTTCATTCATCCCTGGGTTCTC 5049

Alignment time is 3.79504 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2611] =>      2611 nucs 'mol-32-23c5-023192_2611'

Score:        2599
Aligned:      2610        nucs
Identic:      2609 (100%) nucs =>      1373 (100%)      1236 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194554942,194556314] EXCISED REGION [194556316,194557552]
 second seq =>  [        1,     1373] EXCISED REGION [     1375,     2611]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [194556315,194556315]
 second seq =>         1 nucs [1374,1374]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1373,1373] to [1374,1374]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

194554942 CGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACAT 194555001
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACAT 60

194555002 TCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGT 194555061
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGT 120

194555062 TGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGAC 194555121
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGAC 180

194555122 TTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCT 194555181
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCT 240

194555182 GCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAG 194555241
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAG 300

194555242 TCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAA 194555301
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAA 360

194555302 GGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAG 194555361
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAG 420

194555362 GCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGT 194555421
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGT 480

194555422 CTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTA 194555481
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTA 540

194555482 CTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAG 194555541
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAG 600

194555542 AGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACA 194555601
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACA 660

194555602 AACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCATTCAGCCAAATG 194555661
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCATTCAGCCAAATG 720

194555662 GCACACGCTGCACACCTGTGTGCCTCCCGGGCCAGAAGGGAAAAGGATCTGGCTCCAGGG 194555721
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GCACACGCTGCACACCTGTGTGCCTCCCGGGCCAGAAGGGAAAAGGATCTGGCTCCAGGG 780

194555722 GCCTACCCCTGCAATTCCTCATCGAAAACCAACAGTGATTGCCCATCCACCCCCGGCTCA 194555781
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCCTACCCCTGCAATTCCTCATCGAAAACCAACAGTGATTGCCCATCCACCCCCGGCTCA 840

194555782 CAAGCAGTCCTGCAGAGGGGCCTGATGGTTCCACGTCTCACGCCAGCCAGTTTCCAGGTC 194555841
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAGCAGTCCTGCAGAGGGGCCTGATGGTTCCACGTCTCACGCCAGCCAGTTTCCAGGTC 900

194555842 TGCGAATGAAGCGGTAGGGCCTGGTGCCCTTCACGGTCCTTTTTGCTCCTACGGTCTGGC 194555901
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCGAATGAAGCGGTAGGGCCTGGTGCCCTTCACGGTCCTTTTTGCTCCTACGGTCTGGC 960

194555902 CTTCTGAGTCTGCGTGCTCTGGGCAGATGTGAATCATGTGTTGGCATCCTCCACAAGGTC 194555961
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CTTCTGAGTCTGCGTGCTCTGGGCAGATGTGAATCATGTGTTGGCATCCTCCACAAGGTC 1020

194555962 CACACCAGTGGAAGCTCAAAGAGCCTTTATTGACTCAGGTGGAAAAATCCAGCATGATCT 194556021
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CACACCAGTGGAAGCTCAAAGAGCCTTTATTGACTCAGGTGGAAAAATCCAGCATGATCT 1080

194556022 GGCCCTGTGCACCACTGGTGGTGGAAAGGATAAAAAGTTCTGCAGGGTAGTGAAAGGACT 194556081
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GGCCCTGTGCACCACTGGTGGTGGAAAGGATAAAAAGTTCTGCAGGGTAGTGAAAGGACT 1140

194556082 GGTGGATATCATTTTTTAAAGTCTAAAATGTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAAT 194556141
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GGTGGATATCATTTTTTAAAGTCTAAAATGTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAAT 1200

194556142 CCCAGCACTTCAGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGC 194556201
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CCCAGCACTTCAGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGC 1260

194556202 CTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCCCTACTAAAACTACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTG 194556261
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCCCTACTAAAACTACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTG 1320

194556262 GTGGATGCCGGTAATCCCAGCTACACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTC 194556314
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGGATGCCGGTAATCCCAGCTACACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTC 1373

EXCISED REGION

194556316 GTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAATAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCA 194556375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1375 GTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAATAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCA 1434

194556376 GCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAATCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACT 194556435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1435 GCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAATCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACT 1494

194556436 CACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGATGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAAT 194556495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1495 CACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGATGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAAT 1554

194556496 GCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACTCAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGG 194556555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1555 GCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACTCAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGG 1614

194556556 CCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGCAACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAAC 194556615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1615 CCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGCAACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAAC 1674

194556616 TGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTTTCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTG 194556675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1675 TGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTTTCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTG 1734

194556676 TAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAAATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGA 194556735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1735 TAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAAATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGA 1794

194556736 AGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGACTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGAT 194556795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1795 AGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGACTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGAT 1854

194556796 TATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACCTTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACA 194556855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1855 TATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACCTTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACA 1914

194556856 GCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAAATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAG 194556915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1915 GCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAAATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAG 1974

194556916 CAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAGTCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAG 194556975
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1975 CAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAGTCCCTGCCCTCCAACTCACAGCGCAGTGGAG 2034

194556976 ACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAGCAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAA 194557035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2035 ACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAGCAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAA 2094

194557036 AACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGTTGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCAT 194557095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2095 AACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGTTGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCAT 2154

194557096 TTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGTAGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCA 194557155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGTAGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCA 2214

194557156 TTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGGCAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTG 194557215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 TTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGGCAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTG 2274

194557216 GAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGCATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGC 194557275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2275 GAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGCATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGC 2334

194557276 CAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACATTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTG 194557335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 CAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACATTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTG 2394

194557336 AAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAGCCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGA 194557395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2395 AAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAGCCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGA 2454

194557396 GCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAGGCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAG 194557455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 GCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAGGCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAG 2514

194557456 GACATATTGAGGGCCTGAACTGATAGGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAG 194557515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 GACATATTGAGGGCCTGAACTGATAGGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAG 2574

194557516 AGCTGAAATCTGCACAAGCATATTTTTGAAGTTGTGA 194557552
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 AGCTGAAATCTGCACAAGCATATTTTTGAAGTTGTGA 2611

Alignment time is 1.92643 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2548] =>      2548 nucs 'mol-32-2895-015230_2548'

Score:        2512
Aligned:      2548        nucs
Identic:      2539 (100%) nucs =>       747 (100%)      1792 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194554904,194555650] EXCISED REGION [194556285,194558081]
 second seq =>  [        1,      747] EXCISED REGION [      752,     2548]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       634 nucs [194555651,194556284]
 second seq =>         4 nucs [748,751]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [748,748] to [751,751]

194554904 GTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCG 194554963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCG 60

194554964 AGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTT 194555023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTT 120

194555024 GAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCAC 194555083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCAC 180

194555084 CTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTG 194555143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTG 240

194555144 AGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGT 194555203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGT 300

194555204 TGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAG 194555263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAG 360

194555264 AGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGT 194555323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGT 420

194555324 GGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAG 194555383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAG 480

194555384 AGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 194555443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAAT 540

194555444 TAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGA 194555503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGA 600

194555504 ATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAG 194555563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAG 660

194555564 CCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAA 194555623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAA 720

194555624 CTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 194555650
          |||||||||||||||||||||||||||
      721 CTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 747

EXCISED REGION

194556285 CACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 194556344
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      752 CACTACAGCCTGGATGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 811

194556345 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 194556404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      812 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 871

194556405 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 194556464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      872 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 931

194556465 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 194556524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      932 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 991

194556525 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 194556584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      992 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 1051

194556585 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 194556644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1052 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 1111

194556645 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 194556704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1112 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 1171

194556705 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 194556764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1172 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 1231

194556765 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 194556824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1232 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 1291

194556825 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 194556884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1292 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 1351

194556885 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 194556944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1352 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 1411

194556945 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 194557004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1412 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 1471

194557005 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 194557064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1472 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 1531

194557065 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCA----TTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 194557120
          ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||
     1532 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGT----GGCGTTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 1587

194557121 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 194557180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 1647

194557181 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 194557240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 1707

194557241 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 194557300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 1767

194557301 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 194557360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 1827

194557361 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 194557420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 1887

194557421 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 194557480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 1947

194557481 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 194557540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 2007

194557541 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 194557600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 2067

194557601 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 194557660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 2127

194557661 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 194557720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2128 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 2187

194557721 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 194557780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2188 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 2247

194557781 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 194557840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2248 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 2307

194557841 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 194557900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2308 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 2367

194557901 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 194557960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2368 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 2427

194557961 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 194558020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2428 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 2487

194558021 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 194558080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2488 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 2547

194558081 G 194558081
          |
     2548 G 2548

Alignment time is 1.91734 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3011] =>      3011 nucs 'mol-32-2f1d-054346_3011'

Score:        2999
Aligned:      3010        nucs
Identic:      3009 (100%) nucs =>       323 (100%)      2686 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194552971,194553293] EXCISED REGION [194553295,194555981]
 second seq =>  [        1,      323] EXCISED REGION [      325,     3011]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [194553294,194553294]
 second seq =>         1 nucs [324,324]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [194553293,194553293] to [194553294,194553294]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

194552971 TGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCGGGGCTGCTAGATGTGGGGATTAGGAGGAGAGA 194553030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCGGGGCTGCTAGATGTGGGGATTAGGAGGAGAGA 60

194553031 AAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTATTTGTTTACATCATG 194553090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTATTTGTTTACATCATG 120

194553091 GAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAGATAATTTCACCAATA 194553150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAGATAATTTCACCAATA 180

194553151 ATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCACCCTCTGCCACAGATGAGGAAAGGTTAAACAAG 194553210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCACCCTCTGCCACAGATGAGGAAAGGTTAAACAAG 240

194553211 ACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGCTGCCTTTCTGTTTAC 194553270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGCTGCCTTTCTGTTTAC 300

194553271 TGGACTGATAAAGAAAATAAAAT 194553293
          |||||||||||||||||||||||
      301 TGGACTGATAAAGAAAATAAAAT 323

EXCISED REGION

194553295 GAGCAATTGCTTCTGCCTCAGGAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAATAATGATTGAATAA 194553354
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      325 GAGCAATTGCTTCTGCCTCAGGAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAGTAATGATTGAATAA 384

194553355 GAAATGAGATGGGTTGTTATTTTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAA 194553414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      385 GAAATGAGATGGGTTGTTATTTTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAA 444

194553415 AAGATCATTGCATGATCAAATTTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAG 194553474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      445 AAGATCATTGCATGATCAAATTTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAG 504

194553475 GCAAAGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGG 194553534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      505 GCAAAGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGG 564

194553535 AAAATGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGA 194553594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      565 AAAATGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGA 624

194553595 AGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGA 194553654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      625 AGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGA 684

194553655 GTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGT 194553714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 GTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGT 744

194553715 GAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCA 194553774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 GAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCA 804

194553775 GTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTT 194553834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 GTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTT 864

194553835 GGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCA 194553894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 GGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCA 924

194553895 CCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAA 194553954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 CCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAA 984

194553955 CTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACA 194554014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 CTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACA 1044

194554015 TCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCC 194554074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 TCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCC 1104

194554075 GCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGG 194554134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 GCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGG 1164

194554135 CTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGA 194554194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 CTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGA 1224

194554195 AGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGA 194554254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 AGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGA 1284

194554255 AGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCT 194554314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 AGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCT 1344

194554315 TGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTT 194554374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 TGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTT 1404

194554375 GACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGA 194554434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 GACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGA 1464

194554435 CTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTGATTTGTAACACA 194554494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1465 CTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTGATTTGTAACACA 1524

194554495 GCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCAT 194554554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1525 GCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCAT 1584

194554555 GAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCAC 194554614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1585 GAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCAC 1644

194554615 CATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGG 194554674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1645 CATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGG 1704

194554675 GAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAG 194554734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1705 GAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAG 1764

194554735 TCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAG 194554794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1765 TCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAG 1824

194554795 AATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATA 194554854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1825 AATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATA 1884

194554855 GAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAG 194554914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1885 GAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAG 1944

194554915 TACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGA 194554974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1945 TACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGA 2004

194554975 CTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGAT 194555034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2005 CTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGAT 2064

194555035 CTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCA 194555094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2065 CTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCA 2124

194555095 CTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGAT 194555154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2125 CTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGAT 2184

194555155 TAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGA 194555214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2185 TAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGA 2244

194555215 AGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGC 194555274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2245 AGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGC 2304

194555275 CGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCT 194555334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2305 CGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCT 2364

194555335 GTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACC 194555394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2365 GTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACC 2424

194555395 ATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGT 194555454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2425 ATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGT 2484

194555455 GGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAAC 194555514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2485 GGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAAC 2544

194555515 CTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAG 194555574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2545 CTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAG 2604

194555575 AGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAG 194555634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2605 AGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAG 2664

194555635 CTCCTACTTGCTCCATTCAGCCAAATGGCACACGCTGCACACCTGTGTGCCTCCCGGGCC 194555694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2665 CTCCTACTTGCTCCATTCAGCCAAATGGCACACGCTGCACACCTGTGTGCCTCCCGGGCC 2724

194555695 AGAAGGGAAAAGGATCTGGCTCCAGGGGCCTACCCCTGCAATTCCTCATCGAAAACCAAC 194555754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2725 AGAAGGGAAAAGGATCTGGCTCCAGGGGCCTACCCCTGCAATTCCTCATCGAAAACCAAC 2784

194555755 AGTGATTGCCCATCCACCCCCGGCTCACAAGCAGTCCTGCAGAGGGGCCTGATGGTTCCA 194555814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2785 AGTGATTGCCCATCCACCCCCGGCTCACAAGCAGTCCTGCAGAGGGGCCTGATGGTTCCA 2844

194555815 CGTCTCACGCCAGCCAGTTTCCAGGTCTGCGAATGAAGCGGTAGGGCCTGGTGCCCTTCA 194555874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2845 CGTCTCACGCCAGCCAGTTTCCAGGTCTGCGAATGAAGCGGTAGGGCCTGGTGCCCTTCA 2904

194555875 CGGTCCTTTTTGCTCCTACGGTCTGGCCTTCTGAGTCTGCGTGCTCTGGGCAGATGTGAA 194555934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2905 CGGTCCTTTTTGCTCCTACGGTCTGGCCTTCTGAGTCTGCGTGCTCTGGGCAGATGTGAA 2964

194555935 TCATGTGTTGGCATCCTCCACAAGGTCCACACCAGTGGAAGCTCAAA 194555981
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2965 TCATGTGTTGGCATCCTCCACAAGGTCCACACCAGTGGAAGCTCAAA 3011

Alignment time is 2.29488 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     4839] =>      4839 nucs 'mol-32-3046-170143_4839'

Score:        4779
Aligned:      4839        nucs
Identic:      4827 (100%) nucs =>       680 (100%)      4147 (100%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194554971,194555650] EXCISED REGION [194556285,194560437]
 second seq =>  [        1,      680] EXCISED REGION [      685,     4839]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       634 nucs [194555651,194556284]
 second seq =>         4 nucs [681,684]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [681,681] to [684,684]

194554971 GAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGA 194555030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGA 60

194555031 GGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACC 194555090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACC 120

194555091 CCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGAC 194555150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGAC 180

194555151 CGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAG 194555210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAG 240

194555211 TAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTC 194555270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTC 300

194555271 ATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTT 194555330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTT 360

194555331 GCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTA 194555390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTA 420

194555391 GACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGG 194555450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGG 480

194555451 GTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTT 194555510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTT 540

194555511 GAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAG 194555570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAG 600

194555571 ACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATT 194555630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATT 660

194555631 TCAGCTCCTACTTGCTCCAT 194555650
          ||||||||||||||||||||
      661 TCAGCTCCTACTTGCTCCAT 680

EXCISED REGION

194556285 CACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 194556344
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      685 CACTACAGCCTGGATGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 744

194556345 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 194556404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      745 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 804

194556405 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 194556464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      805 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 864

194556465 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 194556524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      865 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 924

194556525 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 194556584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      925 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 984

194556585 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 194556644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      985 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 1044

194556645 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 194556704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1045 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 1104

194556705 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 194556764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1105 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 1164

194556765 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 194556824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1165 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 1224

194556825 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 194556884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1225 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 1284

194556885 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 194556944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1285 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 1344

194556945 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 194557004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1345 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 1404

194557005 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 194557064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1405 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 1464

194557065 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCA----TTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 194557120
          ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||
     1465 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGT----GGCGTTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 1520

194557121 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 194557180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1521 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 1580

194557181 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 194557240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1581 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 1640

194557241 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 194557300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1641 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 1700

194557301 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 194557360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1701 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 1760

194557361 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 194557420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1761 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 1820

194557421 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 194557480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1821 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 1880

194557481 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 194557540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1881 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 1940

194557541 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 194557600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1941 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 2000

194557601 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 194557660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2001 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 2060

194557661 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 194557720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2061 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 2120

194557721 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 194557780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2121 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 2180

194557781 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 194557840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2181 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 2240

194557841 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 194557900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2241 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 2300

194557901 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 194557960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2301 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 2360

194557961 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 194558020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2361 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 2420

194558021 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 194558080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 2480

194558081 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 194558140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2481 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 2540

194558141 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 194558200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 2600

194558201 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAA 194558260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2601 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAA 2660

194558261 ACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGA 194558320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2661 ACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGA 2720

194558321 GCTGGTCCCGCGTGTAGGTGGTTGGGGGAGGGCTGGGGTGGCAGGGAGGGCATGCAGGAG 194558380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2721 GCTGGTCCCGCGTGTAGGTGGTTGGGGGAGGGCTGGGGTGGCAGGGAGGGCATGCAGGAG 2780

194558381 GGGCATGCCTGAGAAGTCAGCTGAAGGCCTGGGCTCCTCTGGTGCTGGCGCTTCCGGGTT 194558440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2781 GGGCATGCCTGAGAAGTCAGCTGAAGGCCTGGGCTCCTCTGGTGCTGGCGCTTCCGGGTT 2840

194558441 TGCAGCTGCACTTCTGGGTGTTTCAGCACACGTCTCTGAATCTAGACTGGGCTGATTTCA 194558500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2841 TGCAGCTGCACTTCTGGGTGTTTCAGCACACGTCTCTGAATCTAGACTGGGCTGATTTCA 2900

194558501 AGGAGATGGGTAGGAGGAAGAAATGCACAACCAGGTCTTGCTGAGGAAAAAAAGAGATGT 194558560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     2901 AGGAGATGGGTAGGAGGAAGAAATGCACAACCAGGTTTTGCTGAGGAAAAAAAGAGATGT 2960

194558561 CCATAGTGAGGGCTGTCTGCTCGGATTACAGACAAGGAGCCTTGGGGATGGGAGGATAAG 194558620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2961 CCATAGTGAGGGCTGTCTGCTCGGATTACAGACAAGGAGCCTTGGGGATGGGAGGATAAG 3020

194558621 GGCTGACCTCACAGGGACAGAGCCTCTTTTGGGCTGCCCTGAGGCCTCTAAACCACAGCC 194558680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3021 GGCTGACCTCACAGGGACAGAGCCTCTTTTGGGCTGCCCTGAGGCCTCTAAACCACAGCC 3080

194558681 AGCCATGGAGAGCAGAAGGCTCATCTTTAATTGGTACCAGTTTTTCTGGCAAGCTCAATT 194558740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3081 AGCCATGGAGAGCAGAAGGCTCATCTTTAATTGGTACCAGTTTTTCTGGCAAGCTCAATT 3140

194558741 TAAAGATTCAGCTCAATTGCAATCAACGGGGTAAGCCAACCAGAAAATCAGAAAATCAGT 194558800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3141 TAAAGATTCAGCTCAATTGCAATCAACGGGGTAAGCCAACCAGAAAATCAGAAAATCAGT 3200

194558801 TGCTCCTCTTGGTGCAATGAGGAGCATCAGCAACCCCAAAGGCATCAGAACATTGGCAGG 194558860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3201 TGCTCCTCTTGGTGCAATGAGGAGCATCAGCAACCCCAAAGGCATCAGAACATTGGCAGG 3260

194558861 CCTTCACTGGGGAACAGGGTCTCTGCTCCTCTGTCCTCAGCCTGAACTAAGGTAGTCTCC 194558920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3261 CCTTCACTGGGGAACAGGGTCTCTGCTCCTCTGTCCTCAGCCTGAACTAAGGTAGTCTCC 3320

194558921 ACCTAGGAGAGCACCTTCCCAGTGCACCCATTCCCCTCGGTGCTCTTGGTAAGGCAACAG 194558980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3321 ACCTAGGAGAGCACCTTCCCAGTGCACCCATTCCCCTCGGTGCTCTTGGTAAGGCAACAG 3380

194558981 CTTTCCGAGCCGTCGTTGAAAGACACTGGGCCGAAGTGAGAAGGCCTGGGTTCTAGTCCT 194559040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3381 CTTTCCGAGCCGTCGTTGAAAGACACTGGGCCGAAGTGAGAAGGCCTGGGTTCTAGTCCT 3440

194559041 GTGTCTGCTCTACTACCTGCTGGATGGCCGTGGGCAAGTCACTTCTCCTGGCGCTGCAGT 194559100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3441 GTGTCTGCTCTACTACCTGCTGGATGGCCGTGGGCAAGTCACTTCTCCTGGCGCTGCAGT 3500

194559101 TTTCTCATCCTCAAAAGGGAAGGGGAGCAGGGAATAAGCCCTGCTGCACCTACTTTACAG 194559160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3501 TTTCTCATCCTCAAAAGGGAAGGGGAGCAGGGAATAAGCCCTGCTGCACCTACTTTACAG 3560

194559161 GGTGATTATGAAGCTCAGATAAGATAATGGCTGTAAAAGCTGTTTTTGGACATTACAGGA 194559220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3561 GGTGATTATGAAGCTCAGATAAGATAATGGCTGTAAAAGCTGTTTTTGGACATTACAGGA 3620

194559221 CATTGAGCAGATGCTCCTCTCTCGGGGTAATGGTGATGATGGCAATGATGGTAATGGTGG 194559280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3621 CATTGAGCAGATGCTCCTCTCTCGGGGTAATGGTGATGATGGCAATGATGGTAATGGTGG 3680

194559281 CTGAGTTACTTTTTATGTGCAACTCCTATAAATATCACACGAAGAGATGAATTCCTGGTT 194559340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3681 CTGAGTTACTTTTTATGTGCAACTCCTATAAATATCACACGAAGAGATGAATTCCTGGTT 3740

194559341 TTAGCGGCCTAACTGTATCCACTTCATTCATCCCTGGGTTCTCACCCTAGCTCTGAGGGA 194559400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3741 TTAGCGGCCTAACTGTATCCACTTCATTCATCCCTGGGTTCTCACCCTAGCTCTGAGGGA 3800

194559401 TTCATGTGTAGCTTTGTGAGAGAGTTGGAATGGAATGTCTCAGCGCATCCTTCTCCCTCT 194559460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3801 TTCATGTGTAGCTTTGTGAGAGAGTTGGAATGGAATGTCTCAGCGCATCCTTCTCCCTCT 3860

194559461 GCAGAGTCCAGCGGTCCCTCTTACATGTCCTCCTCCAAGCATCAGGAAATTAGACCGTCG 194559520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3861 GCAGAGTCCAGCGGTCCCTCTTACATGTCCTCCTCCAAGCATCAGGAAATTAGACCGTCG 3920

194559521 GTACCCACATTGAGGTCAAGCTCTCTCTGGTTTCACCTGGAAGAAGGGAGCAGCTGGTGA 194559580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3921 GTACCCACATTGAGGTCAAGCTCTCTCTGGTTTCACCTGGAAGAAGGGAGCAGCTGGTGA 3980

194559581 CCTTAAGTCTTTGCAAGGTATCAGGTGCTAAAACCTAGAACATTCTTTTAACACCCCAGC 194559640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3981 CCTTAAGTCTTTGCAAGGTATCAGGTGCTAAAACCTAGAACATTCTTTTAACACCCCAGC 4040

194559641 TACCTATCTACTCTTATTCAAGCCAGAAAGAAAGGACTCAAAGAGAGGGCTAGGTAGGTC 194559700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4041 TACCTATCTACTCTTATTCAAGCCAGAAAGAAAGGACTCAAAGAGAGGGCTAGGTAGGTC 4100

194559701 ACACCTCTATCTTGTAGGAGAGTATGACTTTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 194559760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4101 ACACCTCTATCTTGTAGGAGAGTATGACTTTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 4160

194559761 TTTACACATATGGTGGGTAAACTTTCATGAATTGCAATTCTGGTTCTGAGAGTCTATATT 194559820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4161 TTTACACATATGGTGGGTAAACTTTCATGAATTGCAATTCTGGTTCTGAGAGTCTATATT 4220

194559821 CTGCCTACCACTTGCCTCTCTCCATAGAATATCCAATAGTCCAAAGGTTATTCTAACTGT 194559880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4221 CTGCCTACCACTTGCCTCTCTCCATAGAATATCCAATAGTCCAAAGGTTATTCTAACTGT 4280

194559881 TACTATTCAAAATAATGTCCATTTATGCCTATCTTAGATAGAACACTATTTCGCAGAAAA 194559940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4281 TACTATTCAAAATAATGTCCATTTATGCCTATCTTAGATAGAACACTATTTCGCAGAAAA 4340

194559941 GGAAGCTGAGGCAATGATAAAGTAAGTTGATAATGGTTACTGAGAGATACTCTGGGCTTC 194560000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4341 GGAAGCTGAGGCAATGATAAAGTAAGTTGATAATGGTTACTGAGAGATACTCTGGGCTTC 4400

194560001 AGGGATCATAATCCCTAATCACCAACTTCTCAGACCTTTTCTGAACACACAGAGGAGCCA 194560060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4401 AGGGATCATAATCCCTAATCACCAACTTCTCAGACCTTTTCTGAACACACAGAGGAGCCA 4460

194560061 GTGCCCTTGTCTGAAGTGAGCTTGCAGCCTGGTCCTAGGTGCAGACGGCTGCTGTTTGCT 194560120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4461 GTGCCCTTGTCTGAAGTGAGCTTGCAGCCTGGTCCTAGGTGCAGACGGCTGCTGTTTGCT 4520

194560121 GTGGAGCAATGGAGCAGGAGGAAGGGAGCGAGGCGGGCTCCCTCGCCAGTCTTAGAATCT 194560180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4521 GTGGAGCAATGGAGCAGGAGGAAGGGAGCGAGGCGGGCTCCCTCGCCAGTCTTAGAATCT 4580

194560181 TAGAATCTTAGAGCTGGATGGATCACTGGGTTTCAAGGGACCTGCAATGTGCTTACCACC 194560240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4581 TAGAATCTTAGAGCTGGATGGATCACTGGGTTTCAAGGGACCTGCAATGTGCTTACCACC 4640

194560241 AGAAACATTTCAAAAGCCATACTTCATGCTGGCCTACATTTAGAACAATTTTGTATGAAG 194560300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4641 AGAAACATTTCAAAAGCCATACTTCATGCTGGCCTACATTTAGAACAATTTTGTATGAAG 4700

194560301 AAAACTAAATATGTTAAAAATTTCTTTTCCTGTGATTTATTAAAGAAATATATGGGCCAG 194560360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4701 AAAACTAAATATGTTAAAAATTTCTTTTCCTGTGATTTATTAAAGAAATATATGGGCCAG 4760

194560361 GCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACCAAGTC--GCAGATCACGA 194560418
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||
     4761 GCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACCAAGTCGGGCAGATCACGA 4820

194560419 GGTCAGGAGATCGAGACCA 194560437
          |||||||||||||||||||
     4821 GGTCAGGAGATCGAGACCA 4839

Alignment time is 3.54161 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2405] =>      2405 nucs 'mol-32-3101-217774_2405'

Score:        2371
Aligned:      2404        nucs
Identic:      2401 (100%) nucs =>       313 (100%)      2088 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194555679,194555991] EXCISED REGION [194555993,194558083]
 second seq =>  [        1,      313] EXCISED REGION [      315,     2405]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [194555992,194555992]
 second seq =>         1 nucs [314,314]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [194555991,194555991] to [194555992,194555992]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

194555679 GTGTGCCTCCCGGGCCAGAAGGGAAAAGGATCTGGCTCCAGGGGCCTACCCCTGCAATTC 194555738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTGTGCCTCCCGGGCCAGAAGGGAAAAGGATCTGGCTCCAGGGGCCTACCCCTGCAATTC 60

194555739 CTCATCGAAAACCAACAGTGATTGCCCATCCACCCCCGGCTCACAAGCAGTCCTGCAGAG 194555798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CTCATCGAAAACCAACAGTGATTGCCCATCCACCCCCGGCTCACAAGCAGTCCTGCAGAG 120

194555799 GGGCCTGATGGTTCCACGTCTCACGCCAGCCAGTTTCCAGGTCTGCGAATGAAGCGGTAG 194555858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGCCTGATGGTTCCACGTCTCACGCCAGCCAGTTTCCAGGTCTGCGAATGAAGCGGTAG 180

194555859 GGCCTGGTGCCCTTCACGGTCCTTTTTGCTCCTACGGTCTGGCCTTCTGAGTCTGCGTGC 194555918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGCCTGGTGCCCTTCACGGTCCTTTTTGCTCCTACGGTCTGGCCTTCTGAGTCTGCGTGC 240

194555919 TCTGGGCAGATGTGAATCATGTGTTGGCATCCTCCACAAGGTCCACACCAGTGGAAGCTC 194555978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TCTGGGCAGATGTGAATCATGTGTTGGCATCCTCCACAAGGTCCACACCAGTGGAAGCTC 300

194555979 AAAGAGCCTTTAT 194555991
          |||||||||||||
      301 AAAGAGCCTTTAT 313

EXCISED REGION

194555993 GACTCAGGTGGAAAAATCCAGCATGATCTGGCCCTGTGCACCACTGGTGGTGGAAAGGAT 194556052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      315 GACTCAGGTGGAAAAATCCAGCATGATCTGGCCCTGTGCACCACTGGTGGTGGAAAGGAT 374

194556053 AAAAAGTTCTGCAGGGTAGTGAAAGGACTGGTGGATATCATTTTTTAAAGTCTAAAATGT 194556112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      375 AAAAAGTTCTGCAGGGTAGTGAAAGGACTGGTGGATATCATTTTTTAAAGTCTAAAATGT 434

194556113 GGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTCAGGAGGCCGAGGCGGGTGGA 194556172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      435 GGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTCAGGAGGCCGAGGCGGGTGGA 494

194556173 TCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCCCTACT 194556232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      495 TCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCCCTACT 554

194556233 AAAACTACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGATGCCGGTAATCCCAGCTACACTACAG 194556292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      555 AAAACTACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGATGCCGGTAATCCCAGCTACACTACAG 614

194556293 CCTGGACGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAATAGAATAA 194556352
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      615 CCTGGACGACAGAATGAGACTCCGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAATAGAATAA 674

194556353 TGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAATCTGTGGC 194556412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      675 TGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAATCTGTGGC 734

194556413 AGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGATGGGAACG 194556472
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      735 AGCCTGGTTGGCTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGATGGGAACG 794

194556473 GACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACTCAGGCTAG 194556532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      795 GACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACTCAGGCTAG 854

194556533 TTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGCAACCCACT 194556592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      855 TTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGCAACCCACT 914

194556593 TTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTTTCTAGGTC 194556652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      915 TTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTTTCTAGGTC 974

194556653 TGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAAATTCTGCC 194556712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      975 TGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAAATTCTGCC 1034

194556713 TGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGACTGGGTTC 194556772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1035 TGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGACTGGGTTC 1094

194556773 ATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACCTTGACAAC 194556832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1095 ATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACCTTGACAAC 1154

194556833 CCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAAATGCTCAC 194556892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1155 CCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAAATGCTCAC 1214

194556893 CATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAGTCCCTGCC 194556952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1215 CATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAGTCCCTGCC 1274

194556953 CTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAGCAGAGTTA 194557012
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1275 CTCCAACTCACAGCGCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAGCAGAGTTA 1334

194557013 GGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGTTGAGTAAG 194557072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1335 GGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGTTGAGTAAG 1394

194557073 AAGGCTTCATGGAAAGGTAGCATTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGTAGCATTTCTGCA 194557132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1395 AAGGCTTCATGGAAAGGTAGCATTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGTAGCATTTCTGCA 1454

194557133 GGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGGCAAACACAATGC 194557192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1455 GGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGGCAAACACAATGC 1514

194557193 ATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGCATGGTGGGTATA 194557252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1515 ATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGCATGGTGGGTATA 1574

194557253 AGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACATTTGCAGCTGGT 194557312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1575 AGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACATTTGCAGCTGGT 1634

194557313 ACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAGCCACTAAAGGTT 194557372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1635 ACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAGCCACTAAAGGTT 1694

194557373 TTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAGGCTAGCATATGA 194557432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1695 TTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAGGCTAGCATATGA 1754

194557433 AGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATAGGAAAAAACAGA 194557492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1755 AGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATAGGAAAAAACAGA 1814

194557493 GCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTTTTGAAGTTGTGA 194557552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1815 GCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTTTTGAAGTTGTGA 1874

194557553 ATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAATCCTCAGTCTGT 194557612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1875 ATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAATCCTCAGTCTGT 1934

194557613 TTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTAGCATCAGCACCA 194557672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1935 TTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTAGCATCAGCACCA 1994

194557673 GACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCAAGAGAAGAGAAT 194557732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1995 GACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCAAGAGAAGAGAAT 2054

194557733 CATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCCAGGCCAGTAGCT 194557792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2055 CATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCCAGGCCAGTAGCT 2114

194557793 GTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACGCACTCCCTTAAG 194557852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2115 GTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACGCACTCCCTTAAG 2174

194557853 CATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCCAGCCTCTGTTAG 194557912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2175 CATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCCAGCCTCTGTTAG 2234

194557913 GGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTCCACCTAGGACAG 194557972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2235 GGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTCCACCTAGGACAG 2294

194557973 ATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAACTACGCAAGGCCC 194558032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2295 ATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAACTACGCAAGGCCC 2354

194558033 CTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACAGAG 194558083
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2355 CTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACAGAG 2405

Alignment time is 1.81005 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     4442] =>      4442 nucs 'mol-32-310c-033406_4442'

Score:        4254
Aligned:      4444        nucs
Identic:      4412 ( 99%) nucs =>      4121 ( 99%)       291 (100%)
Gaps:           21 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194551514,194555650] EXCISED REGION [194556285,194556576]
 second seq =>  [        1,     4146] EXCISED REGION [     4151,     4442]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       634 nucs [194555651,194556284]
 second seq =>         4 nucs [4147,4150]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4147,4147] to [4150,4150]

194551514 TTTAGACTGTGATGAATGAATATACCAAAAATAAGGATTCTATGTCTATTAGAAGTTTTA 194551573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTAGACTGTGATGAATGAATATACCAAAAATAAGGATTCTATGTCTATTAGAAGTTTTA 60

194551574 TTTAAATTTCCTTCCTTGAGGTCCTTCGTTGAAAAAGGTGGTCATCATTTAATGGAGTTT 194551633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTAAATTTCCTTCCTTGAGGTCCTTCGTTGAAAAAGGTGGTCATCATTTAATGGAGTTT 120

194551634 GGCAGCACATTTTCCCAGCAACAAAACAAATTAATCATCTGTAGGCTTGGGGAGCAGATC 194551693
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGCAGCACATTTTCCCAGCAACAAAATAAATTAATCATCTGTAGGCTTGGGGAGCAGATC 180

194551694 TTCATCCCTATTAGGAGTGTGGGAAAATAGAAAATATTGCTCTGAGTGGAAGCCCAAAGG 194551753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTCATCCCTATTAGGAGTGTGGGAAAATAGAAAATATTGCTCTGAGTGGAAGCCCAAAGG 240

194551754 CCAGAATCTCCCAGTTTGGAGCTCATTGCAGAGGACTTTTTGCTTCTTTCTGGCTTCTCG 194551813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCAGAATCTCCCAGTTTGGAGCTCATTGCAGAGGACTTTTTGCTTCTTTCTGGCTTCTCG 300

194551814 GCTGCATTCTGAGTAGAAGAGGGTGTGAGACAATGTCCTTCAGATAAACAAGATGTCACT 194551873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTGCATTCTGAGTAGAAGAGGGTGTGAGACAATGTCCTTCAGATAAACAAGATGTCACT 360

194551874 GTGGTGGGGAAATAATGTGAACACATAGAAATTGCTCAAGAAATGAGCACAGATGGAGGG 194551933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGGTGGGGAAATAATGTGAACACATAGAAATTGCTCAAGAAATGAGCACAGATGGAGGG 420

194551934 AATGGAGTCAAGGAAGGAGGGAGGGAGTCCATATCATATTTGAAAGACATCTAATCTTTG 194551993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      421 AATGGAGTCAAGGAAGGAGGGAGGGAGTCCATATCATATTTGAAAGACATCTAATCTTGG 480

194551994 TTGGAAGGGCACATGTGGGTGGAAAGAATTCAAGGAAGCCTCATTCATTCATTATTTATT 194552053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTGGAAGGGCACATGTGGGTGGAAAGAATTCAAGGAAGCCTCATTCATTCATTATTTATT 540

194552054 AATCCTTTACAAAACTCCATTTAATAGACTTTGGTGCCTGCCATGTGGCAGGTACTGAGC 194552113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AATCCTTTACAAAACTCCATTTAATAGACTTTGGTGCCTGCCATGTGGCAGGTACTGAGC 600

194552114 TGGGAGCTGGTCATACAGCCAGAGACAACACATGTATGGCCCTTGCCCTCATGGAGCTTA 194552173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGGGAGCTGGTCATACAGCCAGAGACAACACATGTATGGCCCTTGCCCTCATGGAGCTTA 660

194552174 TAGTCTAGTGGAGAGGAGAGGCCGCCACTGATTAAGACCGCAAGTGCTGTGAAGAAAAAG 194552233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAGTCTAGTGGAGAGGAGAGGCCGCCACTGATTAAGACCGCAAGTGCTGTGAAGAAAAAG 720

194552234 AACAAGCAGAAGCAAGCATAATAGGGGAGGCCCGCTTAGGACTAGGGAAGGTGACATTTA 194552293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AACAAGCAGAAGCAAGCATAATAGGGGAGGCCCGCTTAGGACTAGGGAAGGTGACATTTA 780

194552294 AGCAGAAGGCTGAAAAACGAGCAGGATTCCATCCTGTGAAGAGCTCGGGGAAGGGCATGC 194552353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGCAGAAGGCTGAAAAACGAGCAGGATTCCATCCTGTGAAGAGCTCGGGGAAGGGCATGC 840

194552354 CGGGTAGAGGGAGCTGCATCTGCAAGGGCCTAAGGCAGTGAGGAACTTGGCTCTGGGAGA 194552413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CGGGTAGAGGGAGCTGCATCTGCAAGGGCCTAAGGCAGTGAGGAACTTGGCTCTGGGAGA 900

194552414 AATGGAAAGGAGAGGACAGTGTGTCTAGAGGGTGGAAGGCAGAGACACAGGAAATGAAAC 194552473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AATGGAAAGGAGAGGACAGTGTGTCTAGAGGGTGGAAGGCAGAGACACAGGAAATGAAAC 960

194552474 AGGAGACATAGGAGGGGCCAGATTCTGTAAGGCCTTGTAGGCCTCAGGACACAGAGAGGC 194552533
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||   
      961 AGGAGACATAGGAGGGGCCAGATTCTGTAAGGCCTTGTAGGCCTCAGAACACAGAGA--- 1017

194552534 ---GCTTGAGTTGCATTTTGAGGGCAATGGGAAGTTGCTGGTGGGTTTGAATCGGGGCTT 194552590
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 TGAGCTTGAGTTGCATTTTGAGGGCAATGGGAAGTTGCTGGTGGGTTTGAATCGGGGCTT 1077

194552591 AGGGTTTTTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTG------------AGAAGGAGTCTGGCTC 194552638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||
     1078 AGGGTTTTTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGAAGGAGTCTGGCTC 1137

194552639 TGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGG 194552698
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1138 TGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCTGG 1197

194552699 GTTCACGCCATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGGTGCTCACCACC 194552758
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 GTTCACGCCATTCTCTTGCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTGGGACCACAGGTGCTCACCACC 1257

194552759 ACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGA 194552818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 ACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGA 1317

194552819 CGGGGGCTTAGGTTTTTAAGCAGTCTGGATGCTCTGTGAGGTAAGGATTGGAAGAGGCAA 194552878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 CGGGGGCTTAGGTTTTTAAGCAGTCTGGATGCTCTGTGAGGTAAGGATTGGAAGAGGCAA 1377

194552879 GAGTGGAGGGAGTGAGAACAGAGCGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGGTGGGGG 194552938
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 GAGTGGAGGGAGTGAGAACAGAGTGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGGTGGGGG 1437

194552939 AAGTGGGGTTGCAGGGAAGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCG 194552998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 AAGTGGGGTTGCAGGGAAGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCG 1497

194552999 GGGCTGCTAGATGTGGGGATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAA 194553058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GGGCTGCTAGATGTGGGGATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAA 1557

194553059 ATTTGGAAAACTATTTATTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGG 194553118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 ATTTGGAAAACTATTTATTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGG 1617

194553119 AGAAAAGGAGGAATAAGATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCAC 194553178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 AGAAAAGGAGGAATAAGATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCAC 1677

194553179 CCTCTGCCACAGATGAGGAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTT 194553238
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CCTTTGCCACAGATGAGGAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTT 1737

194553239 TGCTGGGGTTATTGCGCTGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAATTGAGC 194553298
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     1738 TGCTGGGGTTATTGCGCTGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAATCGAGC 1797

194553299 AATTGCTTCTGCCTCAGGAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAATAATGATTGAATAAGAAA 194553358
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1798 AATTGCTTCTGCCTCAGGAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAGTAATGATTGAATAAGAAA 1857

194553359 TGAGATGGGTTGTTATTTTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAAAAGA 194553418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 TGAGATGGGTTGTTATTTTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAAAAGA 1917

194553419 TCATTGCATGATCAAATTTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAGGCAA 194553478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TCATTGCATGATCAAATTTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAGGCAA 1977

194553479 AGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGGAAAA 194553538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 AGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGGAAAA 2037

194553539 TGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGG 194553598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 TGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGG 2097

194553599 CCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTC 194553658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 CCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTC 2157

194553659 AGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAA 194553718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 AGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAA 2217

194553719 GGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCC 194553778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 GGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCC 2277

194553779 ACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTC 194553838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 ACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTC 2337

194553839 ACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCT 194553898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 ACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCT 2397

194553899 CACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCT 194553958
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 CACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCT 2457

194553959 CCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCAT 194554018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 CCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCAT 2517

194554019 CATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCAT 194554078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 CATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCAT 2577

194554079 GAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCA 194554138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 GAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCA 2637

194554139 CCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTG 194554198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 CCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTG 2697

194554199 TCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTC 194554258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2698 TCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTC 2757

194554259 AGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGA 194554318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2758 AGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGA 2817

194554319 AGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACT 194554378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2818 AGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACT 2877

194554379 ACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCA 194554438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2878 ACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCA 2937

194554439 CAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAA 194554498
          |||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||
     2938 CAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGT---GTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAA 2994

194554499 TAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAG 194554558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 TAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAG 3054

194554559 CCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATC 194554618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 CCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATC 3114

194554619 ACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAA 194554678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 ACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAA 3174

194554679 ATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAG 194554738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 ATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAG 3234

194554739 CAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATT 194554798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 CAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATT 3294

194554799 TATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAA 194554858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 TATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAA 3354

194554859 CAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACA 194554918
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 CAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTACTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACA 3414

194554919 CAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGT 194554978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3415 CAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGT 3474

194554979 GGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTT 194555038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 GGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTT 3534

194555039 ACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGG 194555098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 ACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGG 3594

194555099 CCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGA 194555158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 CCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGA 3654

194555159 GAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGT 194555218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 GAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGT 3714

194555219 GCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGG 194555278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 GCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGG 3774

194555279 CCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAA 194555338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 CCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAA 3834

194555339 TCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCC 194555398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 TCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCC 3894

194555399 TGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTG 194555458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 TGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTG 3954

194555459 GTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGG 194555518
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 GTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGG 4014

194555519 AAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCA 194555578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 AAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCA 4074

194555579 AGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCC 194555638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 AGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCC 4134

194555639 TACTTGCTCCAT 194555650
          ||||||||||||
     4135 TACTTGCTCCAT 4146

EXCISED REGION

194556285 CACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 194556344
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4151 CACTACAGCCTGGATGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 4210

194556345 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 194556404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4211 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 4270

194556405 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 194556464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4271 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 4330

194556465 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 194556524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4331 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 4390

194556525 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAAC 194556576
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4391 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAAC 4442

Alignment time is 3.34475 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3296] =>      3296 nucs 'mol-32-314e-276791_3296'

Score:        3273
Aligned:      3295        nucs
Identic:      3293 (100%) nucs =>       518 (100%)      2775 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194552776,194553293] EXCISED REGION [194553295,194556071]
 second seq =>  [        1,      518] EXCISED REGION [      520,     3296]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [194553294,194553294]
 second seq =>         1 nucs [519,519]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [194553293,194553293] to [194553294,194553294]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

194552776 TTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGACGGGGGCTTAGGTTTTT 194552835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGACGGGGGCTTAGGTTTTT 60

194552836 AAGCAGTCTGGATGCTCTGTGAGGTAAGGATTGGAAGAGGCAAGAGTGGAGGGAGTGAGA 194552895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGCAGTCTGGATGCTCTGTGAGGTAAGGATTGGAAGAGGCAAGAGTGGAGGGAGTGAGA 120

194552896 ACAGAGCGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGGTGGGGGAAGTGGGGTTGCAGGGA 194552955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAGAGCGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGGTGGGGGAAGTGGGGTTGCAGGGA 180

194552956 AGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCGGGGCTGCTAGATGTGGG 194553015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCGGGGCTGCTAGATGTGGG 240

194553016 GATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTA 194553075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTA 300

194553076 TTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAG 194553135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAG 360

194553136 ATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCACCCTCTGCCACAGATGAG 194553195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCACCCTCTGCCACAGATGAG 420

194553196 GAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGC 194553255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGC 480

194553256 TGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAAT 194553293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAAT 518

EXCISED REGION

194553295 GAGCAATTGCTTCTGCCTCAGGAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAATAATGATTGAATAA 194553354
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
      520 GAGCAATTGCTTCTGCCTCAGGAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAGTAATGATTGAATAA 579

194553355 GAAATGAGATGGGTTGTTATTTTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAA 194553414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      580 GAAATGAGATGGGTTGTTATTTTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAA 639

194553415 AAGATCATTGCATGATCAAATTTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAG 194553474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      640 AAGATCATTGCATGATCAAATTTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAG 699

194553475 GCAAAGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGG 194553534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      700 GCAAAGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGG 759

194553535 AAAATGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGA 194553594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      760 AAAATGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGA 819

194553595 AGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGA 194553654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      820 AGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGA 879

194553655 GTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGT 194553714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      880 GTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGT 939

194553715 GAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCA 194553774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      940 GAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCA 999

194553775 GTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTT 194553834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1000 GTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTT 1059

194553835 GGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCA 194553894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1060 GGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCA 1119

194553895 CCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAA 194553954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1120 CCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAA 1179

194553955 CTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACA 194554014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1180 CTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACA 1239

194554015 TCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCC 194554074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1240 TCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCC 1299

194554075 GCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGG 194554134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1300 GCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGG 1359

194554135 CTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGA 194554194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1360 CTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGA 1419

194554195 AGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGA 194554254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1420 AGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGA 1479

194554255 AGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCT 194554314
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1480 AGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCT 1539

194554315 TGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTT 194554374
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1540 TGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTT 1599

194554375 GACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGA 194554434
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1600 GACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGA 1659

194554435 CTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTGATTTGTAACACA 194554494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1660 CTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTGATTTGTAACACA 1719

194554495 GCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCAT 194554554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1720 GCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCAT 1779

194554555 GAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCAC 194554614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1780 GAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCAC 1839

194554615 CATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGG 194554674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1840 CATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGG 1899

194554675 GAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAG 194554734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1900 GAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAG 1959

194554735 TCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAG 194554794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1960 TCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAG 2019

194554795 AATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATA 194554854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2020 AATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATA 2079

194554855 GAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAG 194554914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2080 GAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAG 2139

194554915 TACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGA 194554974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2140 TACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGA 2199

194554975 CTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGAT 194555034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2200 CTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGAT 2259

194555035 CTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCA 194555094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2260 CTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCA 2319

194555095 CTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGAT 194555154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2320 CTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGAT 2379

194555155 TAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGA 194555214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2380 TAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGA 2439

194555215 AGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGC 194555274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2440 AGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGC 2499

194555275 CGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCT 194555334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2500 CGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCT 2559

194555335 GTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACC 194555394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2560 GTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACC 2619

194555395 ATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGT 194555454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2620 ATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGT 2679

194555455 GGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAAC 194555514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2680 GGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAAC 2739

194555515 CTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAG 194555574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2740 CTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAG 2799

194555575 AGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAG 194555634
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     2800 AGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTAGATTTCAG 2859

194555635 CTCCTACTTGCTCCATTCAGCCAAATGGCACACGCTGCACACCTGTGTGCCTCCCGGGCC 194555694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2860 CTCCTACTTGCTCCATTCAGCCAAATGGCACACGCTGCACACCTGTGTGCCTCCCGGGCC 2919

194555695 AGAAGGGAAAAGGATCTGGCTCCAGGGGCCTACCCCTGCAATTCCTCATCGAAAACCAAC 194555754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2920 AGAAGGGAAAAGGATCTGGCTCCAGGGGCCTACCCCTGCAATTCCTCATCGAAAACCAAC 2979

194555755 AGTGATTGCCCATCCACCCCCGGCTCACAAGCAGTCCTGCAGAGGGGCCTGATGGTTCCA 194555814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2980 AGTGATTGCCCATCCACCCCCGGCTCACAAGCAGTCCTGCAGAGGGGCCTGATGGTTCCA 3039

194555815 CGTCTCACGCCAGCCAGTTTCCAGGTCTGCGAATGAAGCGGTAGGGCCTGGTGCCCTTCA 194555874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3040 CGTCTCACGCCAGCCAGTTTCCAGGTCTGCGAATGAAGCGGTAGGGCCTGGTGCCCTTCA 3099

194555875 CGGTCCTTTTTGCTCCTACGGTCTGGCCTTCTGAGTCTGCGTGCTCTGGGCAGATGTGAA 194555934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3100 CGGTCCTTTTTGCTCCTACGGTCTGGCCTTCTGAGTCTGCGTGCTCTGGGCAGATGTGAA 3159

194555935 TCATGTGTTGGCATCCTCCACAAGGTCCACACCAGTGGAAGCTCAAAGAGCCTTTATTGA 194555994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3160 TCATGTGTTGGCATCCTCCACAAGGTCCACACCAGTGGAAGCTCAAAGAGCCTTTATTGA 3219

194555995 CTCAGGTGGAAAAATCCAGCATGATCTGGCCCTGTGCACCACTGGTGGTGGAAAGGATAA 194556054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3220 CTCAGGTGGAAAAATCCAGCATGATCTGGCCCTGTGCACCACTGGTGGTGGAAAGGATAA 3279

194556055 AAAGTTCTGCAGGGTAG 194556071
          |||||||||||||||||
     3280 AAAGTTCTGCAGGGTAG 3296

Alignment time is 2.48055 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     5486] =>      5486 nucs 'mol-32-3185-007204_5486'

Score:        5441
Aligned:      5485        nucs
Identic:      5481 (100%) nucs =>       169 (100%)      5312 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194552873,194553041] EXCISED REGION [194553043,194558358]
 second seq =>  [        1,      169] EXCISED REGION [      171,     5486]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [194553042,194553042]
 second seq =>         1 nucs [170,170]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [194553041,194553041] to [194553043,194553043]
 second seq =>         1 nucs [169,169] to [171,171]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

194552873 AGGCAAGAGTGGAGGGAGTGAGAACAGAGCGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGG 194552932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGCAAGAGTGGAGGGAGTGAGAACAGAGCGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGG 60

194552933 TGGGGGAAGTGGGGTTGCAGGGAAGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAG 194552992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGGGGAAGTGGGGTTGCAGGGAAGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAG 120

194552993 GACTCGGGGCTGCTAGATGTGGGGATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAG 194553041
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GACTCGGGGCTGCTAGATGTGGGGATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAG 169

EXCISED REGION

194553043 GACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTATTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTC 194553102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      171 GACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTATTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTC 230

194553103 ATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAGATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTA 194553162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      231 ATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAGATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTA 290

194553163 ATGCTCACCCTATCACCCTCTGCCACAGATGAGGAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTT 194553222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      291 ATGCTCACCCTATCACCCTCTGCCACAGATGAGGAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTT 350

194553223 CCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGCTGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAA 194553282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      351 CCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGCTGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAA 410

194553283 GAAAATAAAATTGAGCAATTGCTTCTGCCTCAGGAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAATA 194553342
          |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
      411 GAAAATAAAATCGAGCAATTGCTTCTGCCTCAGGAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAGTA 470

194553343 ATGATTGAATAAGAAATGAGATGGGTTGTTATTTTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGA 194553402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      471 ATGATTGAATAAGAAATGAGATGGGTTGTTATTTTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGA 530

194553403 AATCGTGGGGAAAAGATCATTGCATGATCAAATTTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGAT 194553462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      531 AATCGTGGGGAAAAGATCATTGCATGATCAAATTTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGAT 590

194553463 ACGATTAGCTAGGCAAAGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTC 194553522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      591 ACGATTAGCTAGGCAAAGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTC 650

194553523 ACAACAGGGAGGAAAATGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAAT 194553582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      651 ACAACAGGGAGGAAAATGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAAT 710

194553583 GAGTTAAGAGGAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTG 194553642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      711 GAGTTAAGAGGAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTG 770

194553643 GCTCAACCAGGAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTG 194553702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      771 GCTCAACCAGGAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTG 830

194553703 TTGTCTCAGGGTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCA 194553762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      831 TTGTCTCAGGGTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCA 890

194553763 AGGTCACTGCCAGTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGAC 194553822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      891 AGGTCACTGCCAGTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGAC 950

194553823 TGAGACTCCTTTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCA 194553882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      951 TGAGACTCCTTTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCA 1010

194553883 CCCCTCTCCCCACCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCAC 194553942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1011 CCCCTCTCCCCACCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCAC 1070

194553943 CCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTC 194554002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1071 CCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTC 1130

194554003 CCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGG 194554062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1131 CCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGG 1190

194554063 GAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGAC 194554122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1191 GAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGAC 1250

194554123 TATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGA 194554182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1251 TATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGA 1310

194554183 CTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGC 194554242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1311 CTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGC 1370

194554243 TAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCA 194554302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1371 TAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCA 1430

194554303 CCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCT 194554362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1431 CCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCT 1490

194554363 GGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGC 194554422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1491 GGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGC 1550

194554423 CTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTG 194554482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1551 CTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTG 1610

194554483 ATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGA 194554542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1611 ATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGA 1670

194554543 GATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGC 194554602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1671 GATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGC 1730

194554603 TGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAA 194554662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1731 TGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAA 1790

194554663 CCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCA 194554722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1791 CCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCA 1850

194554723 AGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGA 194554782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1851 AGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGA 1910

194554783 TGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTC 194554842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1911 TGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTC 1970

194554843 CCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGG 194554902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1971 CCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGG 2030

194554903 TGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTC 194554962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2031 TGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTC 2090

194554963 GAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGT 194555022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2091 GAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGT 2150

194555023 TGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCA 194555082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2151 TGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCA 2210

194555083 CCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCT 194555142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2211 CCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCT 2270

194555143 GAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAG 194555202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2271 GAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAG 2330

194555203 TTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGA 194555262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2331 TTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGA 2390

194555263 GAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGG 194555322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2391 GAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGG 2450

194555323 TGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAA 194555382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2451 TGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAA 2510

194555383 GAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA 194555442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2511 GAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA 2570

194555443 TTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAG 194555502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2571 TTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAG 2630

194555503 AATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCA 194555562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2631 AATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCA 2690

194555563 GCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGA 194555622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2691 GCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGA 2750

194555623 ACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCATTCAGCCAAATGGCACACGCTGCACACCTGTGT 194555682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2751 ACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCATTCAGCCAAATGGCACACGCTGCACACCTGTGT 2810

194555683 GCCTCCCGGGCCAGAAGGGAAAAGGATCTGGCTCCAGGGGCCTACCCCTGCAATTCCTCA 194555742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2811 GCCTCCCGGGCCAGAAGGGAAAAGGATCTGGCTCCAGGGGCCTACCCCTGCAATTCCTCA 2870

194555743 TCGAAAACCAACAGTGATTGCCCATCCACCCCCGGCTCACAAGCAGTCCTGCAGAGGGGC 194555802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2871 TCGAAAACCAACAGTGATTGCCCATCCACCCCCGGCTCACAAGCAGTCCTGCAGAGGGGC 2930

194555803 CTGATGGTTCCACGTCTCACGCCAGCCAGTTTCCAGGTCTGCGAATGAAGCGGTAGGGCC 194555862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2931 CTGATGGTTCCACGTCTCACGCCAGCCAGTTTCCAGGTCTGCGAATGAAGCGGTAGGGCC 2990

194555863 TGGTGCCCTTCACGGTCCTTTTTGCTCCTACGGTCTGGCCTTCTGAGTCTGCGTGCTCTG 194555922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2991 TGGTGCCCTTCACGGTCCTTTTTGCTCCTACGGTCTGGCCTTCTGAGTCTGCGTGCTCTG 3050

194555923 GGCAGATGTGAATCATGTGTTGGCATCCTCCACAAGGTCCACACCAGTGGAAGCTCAAAG 194555982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3051 GGCAGATGTGAATCATGTGTTGGCATCCTCCACAAGGTCCACACCAGTGGAAGCTCAAAG 3110

194555983 AGCCTTTATTGACTCAGGTGGAAAAATCCAGCATGATCTGGCCCTGTGCACCACTGGTGG 194556042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3111 AGCCTTTATTGACTCAGGTGGAAAAATCCAGCATGATCTGGCCCTGTGCACCACTGGTGG 3170

194556043 TGGAAAGGATAAAAAGTTCTGCAGGGTAGTGAAAGGACTGGTGGATATCATTTTTTAAAG 194556102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3171 TGGAAAGGATAAAAAGTTCTGCAGGGTAGTGAAAGGACTGGTGGATATCATTTTTTAAAG 3230

194556103 TCTAAAATGTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTCAGGAGGCCGA 194556162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3231 TCTAAAATGTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTCAGGAGGCCGA 3290

194556163 GGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCC 194556222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3291 GGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCC 3350

194556223 CGTCCCTACTAAAACTACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGATGCCGGTAATCCCAGC 194556282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3351 CGTCCCTACTAAAACTACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGATGCCGGTAATCCCAGC 3410

194556283 TACACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAA 194556342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     3411 TACACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCCGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAA 3470

194556343 AATAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGG 194556402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3471 AATAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGG 3530

194556403 AATCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTT 194556462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3531 AATCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTT 3590

194556463 GATGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCA 194556522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3591 GATGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCA 3650

194556523 CTCAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCAC 194556582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3651 CTCAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCAC 3710

194556583 GCAACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATG 194556642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3711 GCAACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATG 3770

194556643 TTTCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGG 194556702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3771 TTTCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGG 3830

194556703 AAATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGA 194556762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3831 AAATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGA 3890

194556763 GACTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAA 194556822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3891 GACTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAA 3950

194556823 CCTTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAAC 194556882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3951 CCTTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAAC 4010

194556883 AAATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCA 194556942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4011 AAATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCA 4070

194556943 AGTCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAA 194557002
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4071 AGTCCCTGCCCTCCAACTCACAGCGCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAA 4130

194557003 AGCAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGG 194557062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4131 AGCAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGG 4190

194557063 GTTGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCATTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGTAG 194557122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4191 GTTGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCATTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGTAG 4250

194557123 CATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGGCA 194557182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4251 CATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGGCA 4310

194557183 AACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGCAT 194557242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4311 AACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGCAT 4370

194557243 GGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACATT 194557302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4371 GGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACATT 4430

194557303 TGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAGCC 194557362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4431 TGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAGCC 4490

194557363 ACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAGGC 194557422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4491 ACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAGGC 4550

194557423 TAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATAGG 194557482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4551 TAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATAGG 4610

194557483 AAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTTTT 194557542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4611 AAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTTTT 4670

194557543 GAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAATC 194557602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4671 GAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAATC 4730

194557603 CTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTAGC 194557662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4731 CTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTAGC 4790

194557663 ATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCAAG 194557722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4791 ATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCAAG 4850

194557723 AGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCCAG 194557782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4851 AGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCCAG 4910

194557783 GCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACGCA 194557842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4911 GCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACGCA 4970

194557843 CTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCCAG 194557902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4971 CTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCCAG 5030

194557903 CCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTCCA 194557962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5031 CCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTCCA 5090

194557963 CCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAACTA 194558022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5091 CCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAACTA 5150

194558023 CGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACAGA 194558082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5151 CGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACAGA 5210

194558083 GGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAACC 194558142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5211 GGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAACC 5270

194558143 GTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGTTA 194558202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5271 GTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGTTA 5330

194558203 AAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAAAC 194558262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5331 AAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAAAC 5390

194558263 CAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGAGC 194558322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5391 CAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGAGC 5450

194558323 TGGTCCCGCGTGTAGGTGGTTGGGGGAGGGCTGGGG 194558358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5451 TGGTCCCGCGTGTAGGTGGTTGGGGGAGGGCTGGGG 5486

Alignment time is 4.05715 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     5982] =>      5982 nucs 'mol-32-3235-012669_5982'

Score:        5912
Aligned:      5985        nucs
Identic:      5971 (100%) nucs =>      2174 (100%)      3797 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194553473,194555650] EXCISED REGION [194556285,194560087]
 second seq =>  [        1,     2175] EXCISED REGION [     2180,     5982]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       634 nucs [194555651,194556284]
 second seq =>         4 nucs [2176,2179]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2176,2176] to [2179,2179]

194553473 AGGCAAAGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGA 194553532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGCAAAGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGA 60

194553533 GGAAAATGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAG 194553592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAAAATGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAG 120

194553593 GAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAG 194553652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAG 180

194553653 GAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGG 194553712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGG 240

194553713 GTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGC 194553772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGC 300

194553773 CAGTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCT 194553832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCT 360

194553833 TTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCC 194553892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCC 420

194553893 CACCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGG 194553952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGG 480

194553953 AACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGA 194554012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGA 540

194554013 CATCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGG 194554072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGG 600

194554073 CCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAA 194554132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAA 660

194554133 GGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCA 194554192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCA 720

194554193 GAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAA 194554252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAA 780

194554253 GAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAG 194554312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAG 840

194554313 CTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCC 194554372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCC 900

194554373 TTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCT 194554432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCT 960

194554433 GACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTGATTTGTAACA 194554492
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||
      961 GACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGT---GTTTGCGGTGATTTGTAACA 1017

194554493 CAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTC 194554552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 CAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTC 1077

194554553 ATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATC 194554612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 ATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATC 1137

194554613 ACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTG 194554672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 ACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTG 1197

194554673 GGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAG 194554732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 GGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAG 1257

194554733 AGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGT 194554792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 AGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGT 1317

194554793 AGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTA 194554852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTA 1377

194554853 TAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGA 194554912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1378 TAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTACTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGA 1437

194554913 AGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGA 194554972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 AGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGA 1497

194554973 GACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGG 194555032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGG 1557

194555033 ATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCC 194555092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 ATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCC 1617

194555093 CACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCG 194555152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 CACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCG 1677

194555153 ATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTA 194555212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 ATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTA 1737

194555213 GAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCAT 194555272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 GAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCAT 1797

194555273 GCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGC 194555332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 GCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGC 1857

194555333 CTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGA 194555392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 CTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGA 1917

194555393 CCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGT 194555452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 CCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGT 1977

194555453 GTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGA 194555512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 GTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGA 2037

194555513 ACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGAC 194555572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 ACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGAC 2097

194555573 AGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTC 194555632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 AGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTC 2157

194555633 AGCTCCTACTTGCTCCAT 194555650
          ||||||||||||||||||
     2158 AGCTCCTACTTGCTCCAT 2175

EXCISED REGION

194556285 CACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 194556344
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 CACTACAGCCTGGATGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 2239

194556345 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 194556404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 2299

194556405 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 194556464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 2359

194556465 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 194556524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 2419

194556525 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 194556584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 2479

194556585 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 194556644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2480 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 2539

194556645 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 194556704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 2599

194556705 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 194556764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 2659

194556765 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 194556824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 2719

194556825 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 194556884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 2779

194556885 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 194556944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 2839

194556945 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 194557004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 2899

194557005 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 194557064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 2959

194557065 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCA----TTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 194557120
          ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||
     2960 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGT----GGCGTTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 3015

194557121 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 194557180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3016 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 3075

194557181 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 194557240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3076 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 3135

194557241 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 194557300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3136 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 3195

194557301 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 194557360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3196 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 3255

194557361 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 194557420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3256 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 3315

194557421 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 194557480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3316 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 3375

194557481 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 194557540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3376 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 3435

194557541 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 194557600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3436 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 3495

194557601 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 194557660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3496 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 3555

194557661 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 194557720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3556 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 3615

194557721 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 194557780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3616 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 3675

194557781 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 194557840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3676 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 3735

194557841 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 194557900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3736 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 3795

194557901 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 194557960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3796 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 3855

194557961 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 194558020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3856 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 3915

194558021 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 194558080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3916 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 3975

194558081 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 194558140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3976 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 4035

194558141 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 194558200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4036 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 4095

194558201 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAA 194558260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4096 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAA 4155

194558261 ACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGA 194558320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4156 ACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGA 4215

194558321 GCTGGTCCCGCGTGTAGGTGGTTGGGGGAGGGCTGGGGTGGCAGGGAGGGCATGCAGGAG 194558380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4216 GCTGGTCCCGCGTGTAGGTGGTTGGGGGAGGGCTGGGGTGGCAGGGAGGGCATGCAGGAG 4275

194558381 GGGCATGCCTGAGAAGTCAGCTGAAGGCCTGGGCTCCTCTGGTGCTGGCGCTTCCGGGTT 194558440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4276 GGGCATGCCTGAGAAGTCAGCTGAAGGCCTGGGCTCCTCTGGTGCTGGCGCTTCCGGGTT 4335

194558441 TGCAGCTGCACTTCTGGGTGTTTCAGCACACGTCTCTGAATCTAGACTGGGCTGATTTCA 194558500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4336 TGCAGCTGCACTTCTGGGTGTTTCAGCACACGTCTCTGAATCTAGACTGGGCTGATTTCA 4395

194558501 AGGAGATGGGTAGGAGGAAGAAATGCACAACCAGGTCTTGCTGAGGAAAAAAAGAGATGT 194558560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4396 AGGAGATGGGTAGGAGGAAGAAATGCACAACCAGGTTTTGCTGAGGAAAAAAAGAGATGT 4455

194558561 CCATAGTGAGGGCTGTCTGCTCGGATTACAGACAAGGAGCCTTGGGGATGGGAGGATAAG 194558620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4456 CCATAGTGAGGGCTGTCTGCTCGGATTACAGACAAGGAGCCTTGGGGATGGGAGGATAAG 4515

194558621 GGCTGACCTCACAGGGACAGAGCCTCTTTTGGGCTGCCCTGAGGCCTCTAAACCACAGCC 194558680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4516 GGCTGACCTCACAGGGACAGAGCCTCTTTTGGGCTGCCCTGAGGCCTCTAAACCACAGCC 4575

194558681 AGCCATGGAGAGCAGAAGGCTCATCTTTAATTGGTACCAGTTTTTCTGGCAAGCTCAATT 194558740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4576 AGCCATGGAGAGCAGAAGGCTCATCTTTAATTGGTACCAGTTTTTCTGGCAAGCTCAATT 4635

194558741 TAAAGATTCAGCTCAATTGCAATCAACGGGGTAAGCCAACCAGAAAATCAGAAAATCAGT 194558800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4636 TAAAGATTCAGCTCAATTGCAATCAACGGGGTAAGCCAACCAGAAAATCAGAAAATCAGT 4695

194558801 TGCTCCTCTTGGTGCAATGAGGAGCATCAGCAACCCCAAAGGCATCAGAACATTGGCAGG 194558860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4696 TGCTCCTCTTGGTGCAATGAGGAGCATCAGCAACCCCAAAGGCATCAGAACATTGGCAGG 4755

194558861 CCTTCACTGGGGAACAGGGTCTCTGCTCCTCTGTCCTCAGCCTGAACTAAGGTAGTCTCC 194558920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4756 CCTTCACTGGGGAACAGGGTCTCTGCTCCTCTGTCCTCAGCCTGAACTAAGGTAGTCTCC 4815

194558921 ACCTAGGAGAGCACCTTCCCAGTGCACCCATTCCCCTCGGTGCTCTTGGTAAGGCAACAG 194558980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4816 ACCTAGGAGAGCACCTTCCCAGTGCACCCATTCCCCTCGGTGCTCTTGGTAAGGCAACAG 4875

194558981 CTTTCCGAGCCGTCGTTGAAAGACACTGGGCCGAAGTGAGAAGGCCTGGGTTCTAGTCCT 194559040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4876 CTTTCCGAGCCGTCGTTGAAAGACACTGGGCCGAAGTGAGAAGGCCTGGGTTCTAGTCCT 4935

194559041 GTGTCTGCTCTACTACCTGCTGGATGGCCGTGGGCAAGTCACTTCTCCTGGCGCTGCAGT 194559100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4936 GTGTCTGCTCTACTACCTGCTGGATGGCCGTGGGCAAGTCACTTCTCCTGGCGCTGCAGT 4995

194559101 TTTCTCATCCTCAAAAGGGAAGGGGAGCAGGGAATAAGCCCTGCTGCACCTACTTTACAG 194559160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4996 TTTCTCATCCTCAAAAGGGAAGGGGAGCAGGGAATAAGCCCTGCTGCACCTACTTTACAG 5055

194559161 GGTGATTATGAAGCTCAGATAAGATAATGGCTGTAAAAGCTGTTTTTGGACATTACAGGA 194559220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5056 GGTGATTATGAAGCTCAGATAAGATAATGGCTGTAAAAGCTGTTTTTGGACATTACAGGA 5115

194559221 CATTGAGCAGATGCTCCTCTCTCGGGGTAATGGTGATGATGGCAATGATGGTAATGGTGG 194559280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5116 CATTGAGCAGATGCTCCTCTCTCGGGGTAATGGTGATGATGGCAATGATGGTAATGGTGG 5175

194559281 CTGAGTTACTTTTTATGTGCAACTCCTATAAATATCACACGAAGAGATGAATTCCTGGTT 194559340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5176 CTGAGTTACTTTTTATGTGCAACTCCTATAAATATCACACGAAGAGATGAATTCCTGGTT 5235

194559341 TTAGCGGCCTAACTGTATCCACTTCATTCATCCCTGGGTTCTCACCCTAGCTCTGAGGGA 194559400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5236 TTAGCGGCCTAACTGTATCCACTTCATTCATCCCTGGGTTCTCACCCTAGCTCTGAGGGA 5295

194559401 TTCATGTGTAGCTTTGTGAGAGAGTTGGAATGGAATGTCTCAGCGCATCCTTCTCCCTCT 194559460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5296 TTCATGTGTAGCTTTGTGAGAGAGTTGGAATGGAATGTCTCAGCGCATCCTTCTCCCTCT 5355

194559461 GCAGAGTCCAGCGGTCCCTCTTACATGTCCTCCTCCAAGCATCAGGAAATTAGACCGTCG 194559520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5356 GCAGAGTCCAGCGGTCCCTCTTACATGTCCTCCTCCAAGCATCAGGAAATTAGACCGTCG 5415

194559521 GTACCCACATTGAGGTCAAGCTCTCTCTGGTTTCACCTGGAAGAAGGGAGCAGCTGGTGA 194559580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5416 GTACCCACATTGAGGTCAAGCTCTCTCTGGTTTCACCTGGAAGAAGGGAGCAGCTGGTGA 5475

194559581 CCTTAAGTCTTTGCAAGGTATCAGGTGCTAAAACCTAGAACATTCTTTTAACACCCCAGC 194559640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5476 CCTTAAGTCTTTGCAAGGTATCAGGTGCTAAAACCTAGAACATTCTTTTAACACCCCAGC 5535

194559641 TACCTATCTACTCTTATTCAAGCCAGAAAGAAAGGACTCAAAGAGAGGGCTAGGTAGGTC 194559700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5536 TACCTATCTACTCTTATTCAAGCCAGAAAGAAAGGACTCAAAGAGAGGGCTAGGTAGGTC 5595

194559701 ACACCTCTATCTTGTAGGAGAGTATGACTTTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 194559760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5596 ACACCTCTATCTTGTAGGAGAGTATGACTTTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 5655

194559761 TTTACACATATGGTGGGTAAACTTTCATGAATTGCAATTCTGGTTCTGAGAGTCTATATT 194559820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5656 TTTACACATATGGTGGGTAAACTTTCATGAATTGCAATTCTGGTTCTGAGAGTCTATATT 5715

194559821 CTGCCTACCACTTGCCTCTCTCCATAGAATATCCAATAGTCCAAAGGTTATTCTAACTGT 194559880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5716 CTGCCTACCACTTGCCTCTCTCCATAGAATATCCAATAGTCCAAAGGTTATTCTAACTGT 5775

194559881 TACTATTCAAAATAATGTCCATTTATGCCTATCTTAGATAGAACACTATTTCGCAGAAAA 194559940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5776 TACTATTCAAAATAATGTCCATTTATGCCTATCTTAGATAGAACACTATTTCGCAGAAAA 5835

194559941 GGAAGCTGAGGCAATGATAAAGTAAGTTGATAATGGTTACTGAGAGATACTCTGGGCTTC 194560000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5836 GGAAGCTGAGGCAATGATAAAGTAAGTTGATAATGGTTACTGAGAGATACTCTGGGCTTC 5895

194560001 AGGGATCATAATCCCTAATCACCAACTTCTCAGACCTTTTCTGAACACACAGAGGAGCCA 194560060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5896 AGGGATCATAATCCCTAATCACCAACTTCTCAGACCTTTTCTGAACACACAGAGGAGCCA 5955

194560061 GTGCCCTTGTCTGAAGTGAGCTTGCAG 194560087
          |||||||||||||||||||||||||||
     5956 GTGCCCTTGTCTGAAGTGAGCTTGCAG 5982

Alignment time is 4.46746 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2175] =>      2175 nucs 'mol-32-3235-012669_2175'

Score:        2164
Aligned:      2175        nucs
Identic:      2174 (100%) nucs =>       995 (100%)      1179 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194553473,194554467] EXCISED REGION [194554471,194555650]
 second seq =>  [        1,      995] EXCISED REGION [      996,     2175]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [194554468,194554470]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [194554468,194554469] to [194554471,194554472]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [194554463,194554467] to [194554471,194554475]
 second seq =>         5 nucs [991,995] to [996,1000]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

194553473 AGGCAAAGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGA 194553532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGCAAAGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGA 60

194553533 GGAAAATGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAG 194553592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGAAAATGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAG 120

194553593 GAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAG 194553652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAG 180

194553653 GAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGG 194553712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGG 240

194553713 GTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGC 194553772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGC 300

194553773 CAGTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCT 194553832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCT 360

194553833 TTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCC 194553892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCC 420

194553893 CACCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGG 194553952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CACCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGG 480

194553953 AACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGA 194554012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGA 540

194554013 CATCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGG 194554072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CATCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGG 600

194554073 CCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAA 194554132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAA 660

194554133 GGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCA 194554192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCA 720

194554193 GAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAA 194554252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAA 780

194554253 GAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAG 194554312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAG 840

194554313 CTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCC 194554372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCC 900

194554373 TTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCT 194554432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCT 960

194554433 GACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTT 194554467
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTT 995

EXCISED REGION

194554471 GTGTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGG 194554530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      996 GTGTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGG 1055

194554531 AGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTC 194554590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1056 AGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTC 1115

194554591 AGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGG 194554650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1116 AGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGG 1175

194554651 AACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAG 194554710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1176 AACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAG 1235

194554711 TAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGC 194554770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1236 TAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGC 1295

194554771 GTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTC 194554830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1296 GTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTC 1355

194554831 AGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAG 194554890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1356 AGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTACTTAG 1415

194554891 GAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGC 194554950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1416 GAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGC 1475

194554951 AAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATG 194555010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1476 AAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATG 1535

194555011 ATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGT 194555070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1536 ATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGT 1595

194555071 AGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAAT 194555130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1596 AGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAAT 1655

194555131 GGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGA 194555190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1656 GGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGA 1715

194555191 CTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTT 194555250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 CTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTT 1775

194555251 CCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGG 194555310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 CCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGG 1835

194555311 GGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGA 194555370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 GGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGA 1895

194555371 TCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAA 194555430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 TCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAA 1955

194555431 AAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGG 194555490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 AAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGG 2015

194555491 ATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGC 194555550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 ATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGC 2075

194555551 CACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAA 194555610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 CACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAA 2135

194555611 AAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 194555650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 AAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 2175

Alignment time is 1.61455 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     7626] =>      7626 nucs 'mol-32-3235-204012_7626'

Score:        7537
Aligned:      7625        nucs
Identic:      7617 (100%) nucs =>       545 (100%)      7072 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194550670,194551214] EXCISED REGION [194551216,194558295]
 second seq =>  [        1,      545] EXCISED REGION [      547,     7626]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [194551215,194551215]
 second seq =>         1 nucs [546,546]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [545,545] to [546,546]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

194550670 GAAACTAAATCCGCACTTCGATACTGCATCAGATGCGGGACGCAGAGACAGAGAGGAAGG 194550729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAACTAAATCCGCACTTCGATACTGCATCAGATGCGGGACGCAGAGACAGAGAGGAAGG 60

194550730 AACCTGGTAGGCAGTTCCAGCTGAGCCAGCAGAAACCAGCAATGTAGCAAGCTCTCTACA 194550789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AACCTGGTAGGCAGTTCCAGCTGAGCCAGCAGAAACCAGCAATGTAGCAAGCTCTCTACA 120

194550790 AATCAGGGCAGAAGTTCTTCTGAGATAGGTGAACAAATTGTAAACAGACAACAAGAAGTC 194550849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AATCAGGGCAGAAGTTCTTCTGAGATAGGTGAACAAATTGTAAACAGACAACAAGAAGTC 180

194550850 AGAGCCAAGGTTAAGGACCCCTAAGGTAACCCAGACCCCTAAGGGAACCCACCTGATAGG 194550909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGAGCCAAGGTTAAGGACCCCTAAGGTAACCCAGACCCCTAAGGGAACCCACCTGATAGG 240

194550910 CTATTTAAGAAAGTAAGCATTGTCTTAGAAACGGGAAATCGCTGGTGCAGCCAGCACTTG 194550969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CTATTTAAGAAAGTAAGCATTGTCTTAGAAACGGGAAATCGCTGGTGCAGCCAGCACTTG 300

194550970 AGTAAGGCAGTCCCCCGAGGGCAGAGACCATCCTGCATGTTGCCTGCCAGGCACACAGGG 194551029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGTAAGGCAGTCCCCCGAGGGCAGAGACCATCCTGCATGTTGCCTGCCAGGCACACAGGG 360

194551030 GATGTGAAATGCAGATGAATGAAATGCAGATGAATGAATAACGAATCAATTGATTGTAAA 194551089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATGTGAAATGCAGATGAATGAAATGCAGATGAATGAATAACGAATCAATTGATTGTAAA 420

194551090 TACTCCATTTCTTGGCTTTGACCGTATGGAAGTTGTGGAACAGTTCTTGGGGGGAGTGGG 194551149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TACTCCATTTCTTGGCTTTGACCGTATGGAAGTTGTGGAACAGTTCTTGGGGGGAGTGGG 480

194551150 TACAGGTATGTGTTCTGATGGGCCAGGTATGCTGGACAGAGCCCTTGGTGCTGAAGGAAT 194551209
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TACAGGTATGTGTTCTGATGGGCCAGGTATGCTGGACAGAGCCCTTGGTGCTGAAGGAAT 540

194551210 GCATC 194551214
          |||||
      541 GCATC 545

EXCISED REGION

194551216 GTGATCTCCTGGGAACACTTCCAAGCTTCTGGAGGGCTGCAGTTCGGGCCAACCAGTCCA 194551275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      547 GTGATCTCCTGGGAACACTTCCAAGCTTCTGGAGGGCTGCAGTTCGGGCCAACCAGTCCA 606

194551276 AGACGACCTGAGAGAAATCCCAAGGCTCCTGCATTCCTGGATCCTGTAAGGAAGATGCGC 194551335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      607 AGACGACCTGAGAGAAATCCCAAGGCTCCTGCATTCCTGGATCCTGTAAGGAAGATGCGC 666

194551336 TGAAAAGGGCCCCTCTGGGCATCCATCAGCGTTCCAGCAGGACACCTGGCAACGTGTACT 194551395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      667 TGAAAAGGGCCCCTCTGGGCATCCATCAGCGTTCCAGCAGGACACCTGGCAACGTGTACT 726

194551396 ACATACCTCCCTGGAAGGAGCTCCATTGTGTCTGAATGTGGCTGTGGGTGAGGGAGCAAG 194551455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      727 ACATACCTCCCTGGAAGGAGCTCCATTGTGTCTGAATGTGGCTGTGGGTGAGGGAGCAAG 786

194551456 AGGCAGCAGGGTGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTGTGCACGCACATGCATCTGCAGGGTT 194551515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      787 AGGCAGCAGGGTGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTGTGCACGCACATGCATCTGCAGGGTT 846

194551516 TAGACTGTGATGAATGAATATACCAAAAATAAGGATTCTATGTCTATTAGAAGTTTTATT 194551575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      847 TAGACTGTGATGAATGAATATACCAAAAATAAGGATTCTATGTCTATTAGAAGTTTTATT 906

194551576 TAAATTTCCTTCCTTGAGGTCCTTCGTTGAAAAAGGTGGTCATCATTTAATGGAGTTTGG 194551635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      907 TAAATTTCCTTCCTTGAGGTCCTTCGTTGAAAAAGGTGGTCATCATTTAATGGAGTTTGG 966

194551636 CAGCACATTTTCCCAGCAACAAAACAAATTAATCATCTGTAGGCTTGGGGAGCAGATCTT 194551695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      967 CAGCACATTTTCCCAGCAACAAAACAAATTAATCATCTGTAGGCTTGGGGAGCAGATCTT 1026

194551696 CATCCCTATTAGGAGTGTGGGAAAATAGAAAATATTGCTCTGAGTGGAAGCCCAAAGGCC 194551755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1027 CATCCCTATTAGGAGTGTGGGAAAATAGAAAATATTGCTCTGAGTGGAAGCCCAAAGGCC 1086

194551756 AGAATCTCCCAGTTTGGAGCTCATTGCAGAGGACTTTTTGCTTCTTTCTGGCTTCTCGGC 194551815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1087 AGAATCTCCCAGTTTGGAGCTCATTGCAGAGGACTTTTTGCTTCTTTCTGGCTTCTCGGC 1146

194551816 TGCATTCTGAGTAGAAGAGGGTGTGAGACAATGTCCTTCAGATAAACAAGATGTCACTGT 194551875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1147 TGCATTCTGAGTAGAAGAGGGTGTGAGACAATGTCCTTCAGATAAACAAGATGTCACTGT 1206

194551876 GGTGGGGAAATAATGTGAACACATAGAAATTGCTCAAGAAATGAGCACAGATGGAGGGAA 194551935
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1207 GGTGGGGAAATAATGTGAACACATAGCAATTGCTCAAGAAATGAGCACAGATGGAGGGAA 1266

194551936 TGGAGTCAAGGAAGGAGGGAGGGAGTCCATATCATATTTGAAAGACATCTAATCTTTGTT 194551995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1267 TGGAGTCAAGGAAGGAGGGAGGGAGTCCATATCATATTTGAAAGACATCTAATCTTGGTT 1326

194551996 GGAAGGGCACATGTGGGTGGAAAGAATTCAAGGAAGCCTCATTCATTCATTATTTATTAA 194552055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1327 GGAAGGGCACATGTGGGTGGAAAGAATTCAAGGAAGCCTCATTCATTCATTATTTATTAA 1386

194552056 TCCTTTACAAAACTCCATTTAATAGACTTTGGTGCCTGCCATGTGGCAGGTACTGAGCTG 194552115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1387 TCCTTTACAAAACTCCATTTAATAGACTTTGGTGCCTGCCATGTGGCAGGTACTGAGCTG 1446

194552116 GGAGCTGGTCATACAGCCAGAGACAACACATGTATGGCCCTTGCCCTCATGGAGCTTATA 194552175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1447 GGAGCTGGTCATACAGCCAGAGACAACACATGTATGGCCCTTGCCCTCATGGAGCTTATA 1506

194552176 GTCTAGTGGAGAGGAGAGGCCGCCACTGATTAAGACCGCAAGTGCTGTGAAGAAAAAGAA 194552235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1507 GTCTAGTGGAGAGGAGAGGCCGCCACTGATTAAGACCGCAAGTGCTGTGAAGAAAAAGAA 1566

194552236 CAAGCAGAAGCAAGCATAATAGGGGAGGCCCGCTTAGGACTAGGGAAGGTGACATTTAAG 194552295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1567 CAAGCAGAAGCAAGCATAATAGGGGAGGCCCGCTTAGGACTAGGGAAGGTGACATTTAAG 1626

194552296 CAGAAGGCTGAAAAACGAGCAGGATTCCATCCTGTGAAGAGCTCGGGGAAGGGCATGCCG 194552355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1627 CAGAAGGCTGAAAAACGAGCAGGATTCCATCCTGTGAAGAGCTCGGGGAAGGGCATGCCG 1686

194552356 GGTAGAGGGAGCTGCATCTGCAAGGGCCTAAGGCAGTGAGGAACTTGGCTCTGGGAGAAA 194552415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1687 GGTAGAGGGAGCTGCATCTGCAAGGGCCTAAGGCAGTGAGGAACTTGGCTCTGGGAGAAA 1746

194552416 TGGAAAGGAGAGGACAGTGTGTCTAGAGGGTGGAAGGCAGAGACACAGGAAATGAAACAG 194552475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1747 TGGAAAGGAGAGGACAGTGTGTCTAGAGGGTGGAAGGCAGAGACACAGGAAATGAAACAG 1806

194552476 GAGACATAGGAGGGGCCAGATTCTGTAAGGCCTTGTAGGCCTCAGGACACAGAGAGGCGC 194552535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1807 GAGACATAGGAGGGGCCAGATTCTGTAAGGCCTTGTAGGCCTCAGGACACAGAGAGGCGC 1866

194552536 TTGAGTTGCATTTTGAGGGCAATGGGAAGTTGCTGGTGGGTTTGAATCGGGGCTTAGGGT 194552595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1867 TTGAGTTGCATTTTGAGGGCAATGGGAAGTTGCTGGTGGGTTTGAATCGGGGCTTAGGGT 1926

194552596 TTTTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGAAGGAGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAG 194552655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1927 TTTTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGAAGGAGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAG 1986

194552656 TGCAGTGGCGCGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCTT 194552715
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1987 TGCAGTGGTGCGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCTT 2046

194552716 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGGTGCTCACCACCACGCCCGGCTAATTTTT 194552775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2047 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGGTGCTCACCACCACGCCCGGCTAATTTTT 2106

194552776 TTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGACGGGGGCTTAGGTTTTT 194552835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2107 TTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGACGGGGGCTTAGGTTTTT 2166

194552836 AAGCAGTCTGGATGCTCTGTGAGGTAAGGATTGGAAGAGGCAAGAGTGGAGGGAGTGAGA 194552895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2167 AAGCAGTCTGGATGCTCTGTGAGGTAAGGATTGGAAGAGGCAAGAGTGGAGGGAGTGAGA 2226

194552896 ACAGAGCGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGGTGGGGGAAGTGGGGTTGCAGGGA 194552955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2227 ACAGAGCGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGGTGGGGGAAGTGGGGTTGCAGGGA 2286

194552956 AGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCGGGGCTGCTAGATGTGGG 194553015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2287 AGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCGGGGCTGCTAGATGTGGG 2346

194553016 GATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTA 194553075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2347 GATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTA 2406

194553076 TTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAG 194553135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2407 TTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAG 2466

194553136 ATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCACCCTCTGCCACAGATGAG 194553195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2467 ATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCACCCTCTGCCACAGATGAG 2526

194553196 GAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGC 194553255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2527 GAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGC 2586

194553256 TGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAATTGAGCAATTGCTTCTGCCTCAG 194553315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2587 TGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAATCGAGCAATTGCTTCTGCCTCAG 2646

194553316 GAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAATAATGATTGAATAAGAAATGAGATGGGTTGTTATT 194553375
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2647 GAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAGTAATGATTGAATAAGAAATGAGATGGGTTGTTATT 2706

194553376 TTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAAAAGATCATTGCATGATCAAAT 194553435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2707 TTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAAAAGATCATTGCATGATCAAAT 2766

194553436 TTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAGGCAAAGAACATAAATTTCCAC 194553495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2767 TTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAGGCAAAGAACATAAATTTCCAC 2826

194553496 AGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGGAAAATGGAAAGATAATCTCAG 194553555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2827 AGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGGAAAATGGAAAGATAATCTCAG 2886

194553556 AGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCA 194553615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2887 AGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCA 2946

194553616 GAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAA 194553675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2947 GAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAA 3006

194553676 GGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGA 194553735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3007 GGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGA 3066

194553736 CAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCCACAGCTGGCCCTACTGC 194553795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3067 CAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCCACAGCTGGCCCTACTGC 3126

194553796 CTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGG 194553855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3127 CTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGG 3186

194553856 AGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCTCACCCTCTCACCCTTTT 194553915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3187 AGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCTCACCCTCTCACCCTTTT 3246

194553916 CTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTT 194553975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3247 CTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTT 3306

194553976 CTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTG 194554035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3307 CTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTG 3366

194554036 ATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAG 194554095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3367 ATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAG 3426

194554096 CAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGC 194554155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3427 CAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGC 3486

194554156 ATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCG 194554215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3487 ATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCG 3546

194554216 GCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTAC 194554275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3547 GCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTAC 3606

194554276 AAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAG 194554335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3607 AAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAG 3666

194554336 TAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTC 194554395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3667 TAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTC 3726

194554396 CGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAA 194554455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3727 CGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAA 3786

194554456 TGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGC 194554515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3787 TGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGC 3846

194554516 TTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGC 194554575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3847 TTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGC 3906

194554576 ACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACA 194554635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3907 ACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACA 3966

194554636 AGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGA 194554695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3967 AGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGA 4026

194554696 ATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGG 194554755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4027 ATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGG 4086

194554756 AGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAA 194554815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4087 AGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAA 4146

194554816 TTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAG 194554875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4147 TTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAG 4206

194554876 AATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACAC 194554935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4207 AATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACAC 4266

194554936 ATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCT 194554995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4267 ATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCT 4326

194554996 ACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGA 194555055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4327 ACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGA 4386

194555056 GGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTG 194555115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4387 GGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTG 4446

194555116 CATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGT 194555175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4447 CATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGT 4506

194555176 GTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAG 194555235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4507 GTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAG 4566

194555236 AGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTG 194555295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4567 AGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTG 4626

194555296 GTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGG 194555355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4627 GTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGG 4686

194555356 GCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAA 194555415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4687 GCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAA 4746

194555416 CCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCC 194555475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4747 CCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCC 4806

194555476 CAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGT 194555535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4807 CAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGT 4866

194555536 GAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGG 194555595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4867 GAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGG 4926

194555596 AAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCATTCAGC 194555655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4927 AAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCATTCAGC 4986

194555656 CAAATGGCACACGCTGCACACCTGTGTGCCTCCCGGGCCAGAAGGGAAAAGGATCTGGCT 194555715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4987 CAAATGGCACACGCTGCACACCTGTGTGCCTCCCGGGCCAGAAGGGAAAAGGATCTGGCT 5046

194555716 CCAGGGGCCTACCCCTGCAATTCCTCATCGAAAACCAACAGTGATTGCCCATCCACCCCC 194555775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5047 CCAGGGGCCTACCCCTGCAATTCCTCATCGAAAACCAACAGTGATTGCCCATCCACCCCC 5106

194555776 GGCTCACAAGCAGTCCTGCAGAGGGGCCTGATGGTTCCACGTCTCACGCCAGCCAGTTTC 194555835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5107 GGCTCACAAGCAGTCCTGCAGAGGGGCCTGATGGTTCCACGTCTCACGCCAGCCAGTTTC 5166

194555836 CAGGTCTGCGAATGAAGCGGTAGGGCCTGGTGCCCTTCACGGTCCTTTTTGCTCCTACGG 194555895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5167 CAGGTCTGCGAATGAAGCGGTAGGGCCTGGTGCCCTTCACGGTCCTTTTTGCTCCTACGG 5226

194555896 TCTGGCCTTCTGAGTCTGCGTGCTCTGGGCAGATGTGAATCATGTGTTGGCATCCTCCAC 194555955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5227 TCTGGCCTTCTGAGTCTGCGTGCTCTGGGCAGATGTGAATCATGTGTTGGCATCCTCCAC 5286

194555956 AAGGTCCACACCAGTGGAAGCTCAAAGAGCCTTTATTGACTCAGGTGGAAAAATCCAGCA 194556015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5287 AAGGTCCACACCAGTGGAAGCTCAAAGAGCCTTTATTGACTCAGGTGGAAAAATCCAGCA 5346

194556016 TGATCTGGCCCTGTGCACCACTGGTGGTGGAAAGGATAAAAAGTTCTGCAGGGTAGTGAA 194556075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5347 TGATCTGGCCCTGTGCACCACTGGTGGTGGAAAGGATAAAAAGTTCTGCAGGGTAGTGAA 5406

194556076 AGGACTGGTGGATATCATTTTTTAAAGTCTAAAATGTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACC 194556135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5407 AGGACTGGTGGATATCATTTTTTAAAGTCTAAAATGTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACC 5466

194556136 TGTAATCCCAGCACTTCAGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAG 194556195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5467 TGTAATCCCAGCACTTCAGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAG 5526

194556196 GCCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCCCTACTAAAACTACAAAAATTAGCTGGGC 194556255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5527 GCCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCCCTACTAAAACTACAAAAATTAGCTGGGC 5586

194556256 GTGGTGGTGGATGCCGGTAATCCCAGCTACACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCT 194556315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5587 GTGGTGGTGGATGCCGGTAATCCCAGCTACACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCC 5646

194556316 GTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAATAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCA 194556375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5647 GTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAATAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCA 5706

194556376 GCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAATCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACT 194556435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5707 GCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAATCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACT 5766

194556436 CACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGATGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAAT 194556495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5767 CACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGATGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAAT 5826

194556496 GCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACTCAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGG 194556555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5827 GCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACTCAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGG 5886

194556556 CCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGCAACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAAC 194556615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5887 CCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGCAACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAAC 5946

194556616 TGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTTTCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTG 194556675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5947 TGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTTTCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTG 6006

194556676 TAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAAATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGA 194556735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6007 TAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAAATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGA 6066

194556736 AGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGACTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGAT 194556795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6067 AGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGACTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGAT 6126

194556796 TATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACCTTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACA 194556855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6127 TATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACCTTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACA 6186

194556856 GCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAAATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAG 194556915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6187 GCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAAATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAG 6246

194556916 CAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAGTCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAG 194556975
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     6247 CAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAGTCCCTGCCCTCCAACTCACAGCGCAGTGGAG 6306

194556976 ACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAGCAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAA 194557035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6307 ACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAGCAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAA 6366

194557036 AACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGTTGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCAT 194557095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6367 AACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGTTGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCAT 6426

194557096 TTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGTAGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCA 194557155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6427 TTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGTAGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCA 6486

194557156 TTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGGCAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTG 194557215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6487 TTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGGCAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTG 6546

194557216 GAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGCATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGC 194557275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6547 GAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGCATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGC 6606

194557276 CAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACATTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTG 194557335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6607 CAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACATTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTG 6666

194557336 AAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAGCCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGA 194557395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6667 AAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAGCCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGA 6726

194557396 GCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAGGCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAG 194557455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6727 GCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAGGCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAG 6786

194557456 GACATATTGAGGGCCTGAACTGATAGGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAG 194557515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6787 GACATATTGAGGGCCTGAACTGATAGGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAG 6846

194557516 AGCTGAAATCTGCACAAGCATATTTTTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAG 194557575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6847 AGCTGAAATCTGCACAAGCATATTTTTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAG 6906

194557576 CCATGATTATGTAGCAAACAAGAAATCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCT 194557635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6907 CCATGATTATGTAGCAAACAAGAAATCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCT 6966

194557636 TTCACCAATGTATTGGGTACCAGTAGCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGG 194557695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6967 TTCACCAATGTATTGGGTACCAGTAGCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGG 7026

194557696 ATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCAAGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGA 194557755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7027 ATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCAAGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGA 7086

194557756 AGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCCAGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGC 194557815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7087 AGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCCAGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGC 7146

194557816 TAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACGCACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGG 194557875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7147 TAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACGCACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGG 7206

194557876 ATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCCAGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGT 194557935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7207 ATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCCAGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGT 7266

194557936 CTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTCCACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTC 194557995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7267 CTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTCCACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTC 7326

194557996 GGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAACTACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGA 194558055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7327 GGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAACTACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGA 7386

194558056 TACTGTGAAAGGGAAGGATAACACAGAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATA 194558115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7387 TACTGTGAAAGGGAAGGATAACACAGAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATA 7446

194558116 AGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAACCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATAC 194558175
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7447 AGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAGCCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATAC 7506

194558176 ATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGTTAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGG 194558235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7507 ATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGTTAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGG 7566

194558236 ATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAAACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGG 194558295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7567 ATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAAACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGG 7626

Alignment time is 5.61611 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2538] =>      2538 nucs 'mol-32-3240-127154_2538'

Score:        2502
Aligned:      2538        nucs
Identic:      2529 (100%) nucs =>       584 (100%)      1945 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194555067,194555650] EXCISED REGION [194556285,194558234]
 second seq =>  [        1,      584] EXCISED REGION [      589,     2538]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       634 nucs [194555651,194556284]
 second seq =>         4 nucs [585,588]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [585,585] to [588,588]

194555067 AGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGA 194555126
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGA 60

194555127 AAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGC 194555186
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGC 120

194555187 CAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACC 194555246
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACC 180

194555247 TCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGC 194555306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGC 240

194555307 ATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGG 194555366
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGG 300

194555367 CAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTA 194555426
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTA 360

194555427 CTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAG 194555486
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAG 420

194555487 GAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACC 194555546
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACC 480

194555547 ATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAA 194555606
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAA 540

194555607 AAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 194555650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 584

EXCISED REGION

194556285 CACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 194556344
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      589 CACTACAGCCTGGATGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 648

194556345 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 194556404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 708

194556405 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 194556464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 768

194556465 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 194556524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 828

194556525 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 194556584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 888

194556585 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 194556644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 948

194556645 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 194556704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 1008

194556705 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 194556764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 1068

194556765 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 194556824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 1128

194556825 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 194556884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 1188

194556885 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 194556944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 1248

194556945 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 194557004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 1308

194557005 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 194557064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 1368

194557065 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCA----TTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 194557120
          ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||
     1369 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGT----GGCGTTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 1424

194557121 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 194557180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 1484

194557181 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 194557240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 1544

194557241 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 194557300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 1604

194557301 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 194557360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 1664

194557361 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 194557420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 1724

194557421 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 194557480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 1784

194557481 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 194557540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 1844

194557541 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 194557600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 1904

194557601 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 194557660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 1964

194557661 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 194557720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 2024

194557721 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 194557780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 2084

194557781 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 194557840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 2144

194557841 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 194557900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 2204

194557901 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 194557960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 2264

194557961 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 194558020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 2324

194558021 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 194558080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 2384

194558081 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 194558140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 2444

194558141 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 194558200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 2504

194558201 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGG 194558234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGG 2538

Alignment time is 2.45449 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2236] =>      2236 nucs 'mol-32-33ab-136437_2236'

Score:        2200
Aligned:      2236        nucs
Identic:      2227 (100%) nucs =>       168 (100%)      2059 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194555483,194555650] EXCISED REGION [194556285,194558348]
 second seq =>  [        1,      168] EXCISED REGION [      173,     2236]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       634 nucs [194555651,194556284]
 second seq =>         4 nucs [169,172]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [169,169] to [172,172]

194555483 TCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGA 194555542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGA 60

194555543 GACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAA 194555602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAA 120

194555603 ACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 194555650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 168

EXCISED REGION

194556285 CACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 194556344
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      173 CACTACAGCCTGGATGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 232

194556345 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 194556404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      233 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 292

194556405 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 194556464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      293 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 352

194556465 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 194556524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      353 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 412

194556525 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 194556584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      413 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 472

194556585 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 194556644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      473 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 532

194556645 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 194556704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      533 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 592

194556705 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 194556764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      593 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 652

194556765 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 194556824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      653 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 712

194556825 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 194556884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      713 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 772

194556885 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 194556944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      773 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 832

194556945 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 194557004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      833 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 892

194557005 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 194557064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      893 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 952

194557065 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCA----TTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 194557120
          ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||
      953 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGT----GGCGTTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 1008

194557121 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 194557180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 1068

194557181 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 194557240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 1128

194557241 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 194557300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 1188

194557301 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 194557360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 1248

194557361 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 194557420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 1308

194557421 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 194557480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 1368

194557481 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 194557540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 1428

194557541 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 194557600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 1488

194557601 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 194557660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 1548

194557661 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 194557720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 1608

194557721 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 194557780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 1668

194557781 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 194557840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 1728

194557841 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 194557900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 1788

194557901 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 194557960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 1848

194557961 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 194558020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 1908

194558021 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 194558080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 1968

194558081 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 194558140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 2028

194558141 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 194558200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 2088

194558201 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAA 194558260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAA 2148

194558261 ACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGA 194558320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 ACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGA 2208

194558321 GCTGGTCCCGCGTGTAGGTGGTTGGGGG 194558348
          ||||||||||||||||||||||||||||
     2209 GCTGGTCCCGCGTGTAGGTGGTTGGGGG 2236

Alignment time is 1.68166 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     6306] =>      6306 nucs 'mol-32-33b6-112637_6306'

Score:        6236
Aligned:      6309        nucs
Identic:      6295 (100%) nucs =>      2106 (100%)      4189 (100%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194553541,194555650] EXCISED REGION [194556285,194560479]
 second seq =>  [        1,     2107] EXCISED REGION [     2112,     6306]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       634 nucs [194555651,194556284]
 second seq =>         4 nucs [2108,2111]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2108,2108] to [2111,2111]

194553541 GAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGGCC 194553600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGGCC 60

194553601 TGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTCAG 194553660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTCAG 120

194553661 GTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAAGG 194553720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAAGG 180

194553721 TAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCCAC 194553780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCCAC 240

194553781 AGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTCAC 194553840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTCAC 300

194553841 TGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCTCA 194553900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCTCA 360

194553901 CCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCC 194553960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCC 420

194553961 TCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCA 194554020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCA 480

194554021 TCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGA 194554080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGA 540

194554081 GCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCACC 194554140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCACC 600

194554141 CAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTC 194554200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTC 660

194554201 TAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAG 194554260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAG 720

194554261 GAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAG 194554320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAG 780

194554321 TGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTAC 194554380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTAC 840

194554381 AGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACA 194554440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACA 900

194554441 GGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATA 194554500
          |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||
      901 GGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGT---GTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATA 957

194554501 GATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCC 194554560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 GATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCC 1017

194554561 CCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCAC 194554620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 CCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCAC 1077

194554621 ACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAAT 194554680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 ACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAAT 1137

194554681 CTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCA 194554740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 CTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCA 1197

194554741 AGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTA 194554800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 AGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTA 1257

194554801 TACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACA 194554860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACA 1317

194554861 AAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACA 194554920
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 AAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTACTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACA 1377

194554921 AACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGG 194554980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 AACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGG 1437

194554981 AAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTAC 194555040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 AAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTAC 1497

194555041 AAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCC 194555100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 AAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCC 1557

194555101 TATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGA 194555160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 TATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGA 1617

194555161 AAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGC 194555220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 AAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGC 1677

194555221 CTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCC 194555280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCC 1737

194555281 ATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATC 194555340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 ATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATC 1797

194555341 CCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTG 194555400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 CCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTG 1857

194555401 GCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGT 194555460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 GCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGT 1917

194555461 GTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAA 194555520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 GTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAA 1977

194555521 GGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAG 194555580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 GGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAG 2037

194555581 ACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTA 194555640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 ACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTA 2097

194555641 CTTGCTCCAT 194555650
          ||||||||||
     2098 CTTGCTCCAT 2107

EXCISED REGION

194556285 CACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 194556344
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2112 CACTACAGCCTGGATGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 2171

194556345 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 194556404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2172 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 2231

194556405 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 194556464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2232 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 2291

194556465 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 194556524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2292 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 2351

194556525 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 194556584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2352 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 2411

194556585 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 194556644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2412 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 2471

194556645 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 194556704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2472 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 2531

194556705 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 194556764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2532 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 2591

194556765 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 194556824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2592 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 2651

194556825 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 194556884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2652 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 2711

194556885 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 194556944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2712 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 2771

194556945 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 194557004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 2831

194557005 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 194557064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 2891

194557065 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCA----TTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 194557120
          ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||
     2892 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGT----GGCGTTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 2947

194557121 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 194557180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 3007

194557181 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 194557240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3008 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 3067

194557241 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 194557300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 3127

194557301 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 194557360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 3187

194557361 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 194557420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 3247

194557421 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 194557480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 3307

194557481 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 194557540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 3367

194557541 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 194557600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 3427

194557601 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 194557660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 3487

194557661 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 194557720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 3547

194557721 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 194557780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 3607

194557781 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 194557840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 3667

194557841 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 194557900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3668 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 3727

194557901 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 194557960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 3787

194557961 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 194558020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 3847

194558021 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 194558080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 3907

194558081 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 194558140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 3967

194558141 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 194558200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 4027

194558201 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAA 194558260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAA 4087

194558261 ACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGA 194558320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 ACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGA 4147

194558321 GCTGGTCCCGCGTGTAGGTGGTTGGGGGAGGGCTGGGGTGGCAGGGAGGGCATGCAGGAG 194558380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 GCTGGTCCCGCGTGTAGGTGGTTGGGGGAGGGCTGGGGTGGCAGGGAGGGCATGCAGGAG 4207

194558381 GGGCATGCCTGAGAAGTCAGCTGAAGGCCTGGGCTCCTCTGGTGCTGGCGCTTCCGGGTT 194558440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 GGGCATGCCTGAGAAGTCAGCTGAAGGCCTGGGCTCCTCTGGTGCTGGCGCTTCCGGGTT 4267

194558441 TGCAGCTGCACTTCTGGGTGTTTCAGCACACGTCTCTGAATCTAGACTGGGCTGATTTCA 194558500
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 TGCAGCTGCACTTCTGGGTGTTTCAGCACACGTCTCTGAATCTAGACTGGGCTGATTTCA 4327

194558501 AGGAGATGGGTAGGAGGAAGAAATGCACAACCAGGTCTTGCTGAGGAAAAAAAGAGATGT 194558560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     4328 AGGAGATGGGTAGGAGGAAGAAATGCACAACCAGGTTTTGCTGAGGAAAAAAAGAGATGT 4387

194558561 CCATAGTGAGGGCTGTCTGCTCGGATTACAGACAAGGAGCCTTGGGGATGGGAGGATAAG 194558620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 CCATAGTGAGGGCTGTCTGCTCGGATTACAGACAAGGAGCCTTGGGGATGGGAGGATAAG 4447

194558621 GGCTGACCTCACAGGGACAGAGCCTCTTTTGGGCTGCCCTGAGGCCTCTAAACCACAGCC 194558680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 GGCTGACCTCACAGGGACAGAGCCTCTTTTGGGCTGCCCTGAGGCCTCTAAACCACAGCC 4507

194558681 AGCCATGGAGAGCAGAAGGCTCATCTTTAATTGGTACCAGTTTTTCTGGCAAGCTCAATT 194558740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 AGCCATGGAGAGCAGAAGGCTCATCTTTAATTGGTACCAGTTTTTCTGGCAAGCTCAATT 4567

194558741 TAAAGATTCAGCTCAATTGCAATCAACGGGGTAAGCCAACCAGAAAATCAGAAAATCAGT 194558800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 TAAAGATTCAGCTCAATTGCAATCAACGGGGTAAGCCAACCAGAAAATCAGAAAATCAGT 4627

194558801 TGCTCCTCTTGGTGCAATGAGGAGCATCAGCAACCCCAAAGGCATCAGAACATTGGCAGG 194558860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 TGCTCCTCTTGGTGCAATGAGGAGCATCAGCAACCCCAAAGGCATCAGAACATTGGCAGG 4687

194558861 CCTTCACTGGGGAACAGGGTCTCTGCTCCTCTGTCCTCAGCCTGAACTAAGGTAGTCTCC 194558920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 CCTTCACTGGGGAACAGGGTCTCTGCTCCTCTGTCCTCAGCCTGAACTAAGGTAGTCTCC 4747

194558921 ACCTAGGAGAGCACCTTCCCAGTGCACCCATTCCCCTCGGTGCTCTTGGTAAGGCAACAG 194558980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 ACCTAGGAGAGCACCTTCCCAGTGCACCCATTCCCCTCGGTGCTCTTGGTAAGGCAACAG 4807

194558981 CTTTCCGAGCCGTCGTTGAAAGACACTGGGCCGAAGTGAGAAGGCCTGGGTTCTAGTCCT 194559040
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 CTTTCCGAGCCGTCGTTGAAAGACACTGGGCCGAAGTGAGAAGGCCTGGGTTCTAGTCCT 4867

194559041 GTGTCTGCTCTACTACCTGCTGGATGGCCGTGGGCAAGTCACTTCTCCTGGCGCTGCAGT 194559100
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 GTGTCTGCTCTACTACCTGCTGGATGGCCGTGGGCAAGTCACTTCTCCTGGCGCTGCAGT 4927

194559101 TTTCTCATCCTCAAAAGGGAAGGGGAGCAGGGAATAAGCCCTGCTGCACCTACTTTACAG 194559160
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 TTTCTCATCCTCAAAAGGGAAGGGGAGCAGGGAATAAGCCCTGCTGCACCTACTTTACAG 4987

194559161 GGTGATTATGAAGCTCAGATAAGATAATGGCTGTAAAAGCTGTTTTTGGACATTACAGGA 194559220
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 GGTGATTATGAAGCTCAGATAAGATAATGGCTGTAAAAGCTGTTTTTGGACATTACAGGA 5047

194559221 CATTGAGCAGATGCTCCTCTCTCGGGGTAATGGTGATGATGGCAATGATGGTAATGGTGG 194559280
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 CATTGAGCAGATGCTCCTCTCTCGGGGTAATGGTGATGATGGCAATGATGGTAATGGTGG 5107

194559281 CTGAGTTACTTTTTATGTGCAACTCCTATAAATATCACACGAAGAGATGAATTCCTGGTT 194559340
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 CTGAGTTACTTTTTATGTGCAACTCCTATAAATATCACACGAAGAGATGAATTCCTGGTT 5167

194559341 TTAGCGGCCTAACTGTATCCACTTCATTCATCCCTGGGTTCTCACCCTAGCTCTGAGGGA 194559400
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5168 TTAGCGGCCTAACTGTATCCACTTCATTCATCCCTGGGTTCTCACCCTAGCTCTGAGGGA 5227

194559401 TTCATGTGTAGCTTTGTGAGAGAGTTGGAATGGAATGTCTCAGCGCATCCTTCTCCCTCT 194559460
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5228 TTCATGTGTAGCTTTGTGAGAGAGTTGGAATGGAATGTCTCAGCGCATCCTTCTCCCTCT 5287

194559461 GCAGAGTCCAGCGGTCCCTCTTACATGTCCTCCTCCAAGCATCAGGAAATTAGACCGTCG 194559520
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5288 GCAGAGTCCAGCGGTCCCTCTTACATGTCCTCCTCCAAGCATCAGGAAATTAGACCGTCG 5347

194559521 GTACCCACATTGAGGTCAAGCTCTCTCTGGTTTCACCTGGAAGAAGGGAGCAGCTGGTGA 194559580
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5348 GTACCCACATTGAGGTCAAGCTCTCTCTGGTTTCACCTGGAAGAAGGGAGCAGCTGGTGA 5407

194559581 CCTTAAGTCTTTGCAAGGTATCAGGTGCTAAAACCTAGAACATTCTTTTAACACCCCAGC 194559640
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5408 CCTTAAGTCTTTGCAAGGTATCAGGTGCTAAAACCTAGAACATTCTTTTAACACCCCAGC 5467

194559641 TACCTATCTACTCTTATTCAAGCCAGAAAGAAAGGACTCAAAGAGAGGGCTAGGTAGGTC 194559700
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5468 TACCTATCTACTCTTATTCAAGCCAGAAAGAAAGGACTCAAAGAGAGGGCTAGGTAGGTC 5527

194559701 ACACCTCTATCTTGTAGGAGAGTATGACTTTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 194559760
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5528 ACACCTCTATCTTGTAGGAGAGTATGACTTTGTGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG 5587

194559761 TTTACACATATGGTGGGTAAACTTTCATGAATTGCAATTCTGGTTCTGAGAGTCTATATT 194559820
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5588 TTTACACATATGGTGGGTAAACTTTCATGAATTGCAATTCTGGTTCTGAGAGTCTATATT 5647

194559821 CTGCCTACCACTTGCCTCTCTCCATAGAATATCCAATAGTCCAAAGGTTATTCTAACTGT 194559880
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5648 CTGCCTACCACTTGCCTCTCTCCATAGAATATCCAATAGTCCAAAGGTTATTCTAACTGT 5707

194559881 TACTATTCAAAATAATGTCCATTTATGCCTATCTTAGATAGAACACTATTTCGCAGAAAA 194559940
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5708 TACTATTCAAAATAATGTCCATTTATGCCTATCTTAGATAGAACACTATTTCGCAGAAAA 5767

194559941 GGAAGCTGAGGCAATGATAAAGTAAGTTGATAATGGTTACTGAGAGATACTCTGGGCTTC 194560000
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5768 GGAAGCTGAGGCAATGATAAAGTAAGTTGATAATGGTTACTGAGAGATACTCTGGGCTTC 5827

194560001 AGGGATCATAATCCCTAATCACCAACTTCTCAGACCTTTTCTGAACACACAGAGGAGCCA 194560060
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5828 AGGGATCATAATCCCTAATCACCAACTTCTCAGACCTTTTCTGAACACACAGAGGAGCCA 5887

194560061 GTGCCCTTGTCTGAAGTGAGCTTGCAGCCTGGTCCTAGGTGCAGACGGCTGCTGTTTGCT 194560120
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5888 GTGCCCTTGTCTGAAGTGAGCTTGCAGCCTGGTCCTAGGTGCAGACGGCTGCTGTTTGCT 5947

194560121 GTGGAGCAATGGAGCAGGAGGAAGGGAGCGAGGCGGGCTCCCTCGCCAGTCTTAGAATCT 194560180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5948 GTGGAGCAATGGAGCAGGAGGAAGGGAGCGAGGCGGGCTCCCTCGCCAGTCTTAGAATCT 6007

194560181 TAGAATCTTAGAGCTGGATGGATCACTGGGTTTCAAGGGACCTGCAATGTGCTTACCACC 194560240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6008 TAGAATCTTAGAGCTGGATGGATCACTGGGTTTCAAGGGACCTGCAATGTGCTTACCACC 6067

194560241 AGAAACATTTCAAAAGCCATACTTCATGCTGGCCTACATTTAGAACAATTTTGTATGAAG 194560300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6068 AGAAACATTTCAAAAGCCATACTTCATGCTGGCCTACATTTAGAACAATTTTGTATGAAG 6127

194560301 AAAACTAAATATGTTAAAAATTTCTTTTCCTGTGATTTATTAAAGAAATATATGGGCCAG 194560360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6128 AAAACTAAATATGTTAAAAATTTCTTTTCCTGTGATTTATTAAAGAAATATATGGGCCAG 6187

194560361 GCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACCAAGTCGCAGATCACGAGG 194560420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6188 GCACGGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGACCAAGTCGCAGATCACGAGG 6247

194560421 TCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACA 194560479
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6248 TCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACACGGTGAAACCCCGTCTCTACTAAAAATACA 6306

Alignment time is 4.73115 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2107] =>      2107 nucs 'mol-32-33b6-112637_2107'

Score:        2096
Aligned:      2107        nucs
Identic:      2106 (100%) nucs =>       927 (100%)      1179 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194553541,194554467] EXCISED REGION [194554471,194555650]
 second seq =>  [        1,      927] EXCISED REGION [      928,     2107]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         3 nucs [194554468,194554470]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [194554468,194554469] to [194554471,194554472]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         5 nucs [194554463,194554467] to [194554471,194554475]
 second seq =>         5 nucs [923,927] to [928,932]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

194553541 GAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGGCC 194553600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGGCC 60

194553601 TGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTCAG 194553660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTCAG 120

194553661 GTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAAGG 194553720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAAGG 180

194553721 TAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCCAC 194553780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCCAC 240

194553781 AGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTCAC 194553840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTCAC 300

194553841 TGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCTCA 194553900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCTCA 360

194553901 CCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCC 194553960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCC 420

194553961 TCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCA 194554020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCA 480

194554021 TCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGA 194554080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGA 540

194554081 GCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCACC 194554140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCACC 600

194554141 CAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTC 194554200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTC 660

194554201 TAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAG 194554260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAG 720

194554261 GAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAG 194554320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAG 780

194554321 TGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTAC 194554380
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTAC 840

194554381 AGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACA 194554440
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 AGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACA 900

194554441 GGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTT 194554467
          |||||||||||||||||||||||||||
      901 GGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTT 927

EXCISED REGION

194554471 GTGTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGG 194554530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      928 GTGTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGG 987

194554531 AGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTC 194554590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      988 AGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTC 1047

194554591 AGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGG 194554650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1048 AGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGG 1107

194554651 AACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAG 194554710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1108 AACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAG 1167

194554711 TAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGC 194554770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1168 TAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGC 1227

194554771 GTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTC 194554830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1228 GTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTC 1287

194554831 AGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAG 194554890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1288 AGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTACTTAG 1347

194554891 GAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGC 194554950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1348 GAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGC 1407

194554951 AAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATG 194555010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1408 AAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATG 1467

194555011 ATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGT 194555070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1468 ATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGT 1527

194555071 AGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAAT 194555130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1528 AGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAAT 1587

194555131 GGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGA 194555190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1588 GGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGA 1647

194555191 CTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTT 194555250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1648 CTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTT 1707

194555251 CCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGG 194555310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1708 CCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGG 1767

194555311 GGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGA 194555370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1768 GGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGA 1827

194555371 TCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAA 194555430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1828 TCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAA 1887

194555431 AAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGG 194555490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1888 AAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGG 1947

194555491 ATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGC 194555550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1948 ATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGC 2007

194555551 CACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAA 194555610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2008 CACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAA 2067

194555611 AAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 194555650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2068 AAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 2107

Alignment time is 1.56675 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     7200] =>      7200 nucs 'mol-32-340e-111320_7200'

Score:        7122
Aligned:      7199        nucs
Identic:      7192 (100%) nucs =>       641 (100%)      6551 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194550574,194551214] EXCISED REGION [194551216,194557773]
 second seq =>  [        1,      641] EXCISED REGION [      643,     7200]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [194551215,194551215]
 second seq =>         1 nucs [642,642]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [641,641] to [642,642]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

194550574 TCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGAGAGCGAGACTCCTTCTCAAAACAAACAAACAA 194550633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCACGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCGAGAGCGAGACTCCTTCTCAAAACAAACAAACAA 60

194550634 ACAAAAAACTGCTGCGGCAGCTTCTAGGACAAATCTGAAACTAAATCCGCACTTCGATAC 194550693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACAAAAAACTGCTGCGGCAGCTTCTAGGACAAATCTGAAACTAAATCCGCACTTCGATAC 120

194550694 TGCATCAGATGCGGGACGCAGAGACAGAGAGGAAGGAACCTGGTAGGCAGTTCCAGCTGA 194550753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGCATCAGATGCGGGACGCAGAGACAGAGAGGAAGGAACCTGGTAGGCAGTTCCAGCTGA 180

194550754 GCCAGCAGAAACCAGCAATGTAGCAAGCTCTCTACAAATCAGGGCAGAAGTTCTTCTGAG 194550813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCCAGCAGAAACCAGCAATGTAGCAAGCTCTCTACAAATCAGGGCAGAAGTTCTTCTGAG 240

194550814 ATAGGTGAACAAATTGTAAACAGACAACAAGAAGTCAGAGCCAAGGTTAAGGACCCCTAA 194550873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATAGGTGAACAAATTGTAAACAGACAACAAGAAGTCAGAGCCAAGGTTAAGGACCCCTAA 300

194550874 GGTAACCCAGACCCCTAAGGGAACCCACCTGATAGGCTATTTAAGAAAGTAAGCATTGTC 194550933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GGTAACCCAGACCCCTAAGGGAACCCACCTGATAGGCTATTTAAGAAAGTAAGCATTGTC 360

194550934 TTAGAAACGGGAAATCGCTGGTGCAGCCAGCACTTGAGTAAGGCAGTCCCCCGAGGGCAG 194550993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTAGAAACGGGAAATCGCTGGTGCAGCCAGCACTTGAGTAAGGCAGTCCCCCGAGGGCAG 420

194550994 AGACCATCCTGCATGTTGCCTGCCAGGCACACAGGGGATGTGAAATGCAGATGAATGAAA 194551053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGACCATCCTGCATGTTGCCTGCCAGGCACACAGGGGATGTGAAATGCAGATGAATGAAA 480

194551054 TGCAGATGAATGAATAACGAATCAATTGATTGTAAATACTCCATTTCTTGGCTTTGACCG 194551113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGCAGATGAATGAATAACGAATCAATTGATTGTAAATACTCCATTTCTTGGCTTTGACCG 540

194551114 TATGGAAGTTGTGGAACAGTTCTTGGGGGGAGTGGGTACAGGTATGTGTTCTGATGGGCC 194551173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATGGAAGTTGTGGAACAGTTCTTGGGGGGAGTGGGTACAGGTATGTGTTCTGATGGGCC 600

194551174 AGGTATGCTGGACAGAGCCCTTGGTGCTGAAGGAATGCATC 194551214
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AGGTATGCTGGACAGAGCCCTTGGTGCTGAAGGAATGCATC 641

EXCISED REGION

194551216 GTGATCTCCTGGGAACACTTCCAAGCTTCTGGAGGGCTGCAGTTCGGGCCAACCAGTCCA 194551275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      643 GTGATCTCCTGGGAACACTTCCAAGCTTCTGGAGGGCTGCAGTTCGGGCCAACCAGTCCA 702

194551276 AGACGACCTGAGAGAAATCCCAAGGCTCCTGCATTCCTGGATCCTGTAAGGAAGATGCGC 194551335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      703 AGACGACCTGAGAGAAATCCCAAGGCTCCTGCATTCCTGGATCCTGTAAGGAAGATGCGC 762

194551336 TGAAAAGGGCCCCTCTGGGCATCCATCAGCGTTCCAGCAGGACACCTGGCAACGTGTACT 194551395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      763 TGAAAAGGGCCCCTCTGGGCATCCATCAGCGTTCCAGCAGGACACCTGGCAACGTGTACT 822

194551396 ACATACCTCCCTGGAAGGAGCTCCATTGTGTCTGAATGTGGCTGTGGGTGAGGGAGCAAG 194551455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      823 ACATACCTCCCTGGAAGGAGCTCCATTGTGTCTGAATGTGGCTGTGGGTGAGGGAGCAAG 882

194551456 AGGCAGCAGGGTGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTGTGCACGCACATGCATCTGCAGGGTT 194551515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      883 AGGCAGCAGGGTGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTGTGCACGCACATGCATCTGCAGGGTT 942

194551516 TAGACTGTGATGAATGAATATACCAAAAATAAGGATTCTATGTCTATTAGAAGTTTTATT 194551575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      943 TAGACTGTGATGAATGAATATACCAAAAATAAGGATTCTATGTCTATTAGAAGTTTTATT 1002

194551576 TAAATTTCCTTCCTTGAGGTCCTTCGTTGAAAAAGGTGGTCATCATTTAATGGAGTTTGG 194551635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1003 TAAATTTCCTTCCTTGAGGTCCTTCGTTGAAAAAGGTGGTCATCATTTAATGGAGTTTGG 1062

194551636 CAGCACATTTTCCCAGCAACAAAACAAATTAATCATCTGTAGGCTTGGGGAGCAGATCTT 194551695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1063 CAGCACATTTTCCCAGCAACAAAACAAATTAATCATCTGTAGGCTTGGGGAGCAGATCTT 1122

194551696 CATCCCTATTAGGAGTGTGGGAAAATAGAAAATATTGCTCTGAGTGGAAGCCCAAAGGCC 194551755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1123 CATCCCTATTAGGAGTGTGGGAAAATAGAAAATATTGCTCTGAGTGGAAGCCCAAAGGCC 1182

194551756 AGAATCTCCCAGTTTGGAGCTCATTGCAGAGGACTTTTTGCTTCTTTCTGGCTTCTCGGC 194551815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1183 AGAATCTCCCAGTTTGGAGCTCATTGCAGAGGACTTTTTGCTTCTTTCTGGCTTCTCGGC 1242

194551816 TGCATTCTGAGTAGAAGAGGGTGTGAGACAATGTCCTTCAGATAAACAAGATGTCACTGT 194551875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1243 TGCATTCTGAGTAGAAGAGGGTGTGAGACAATGTCCTTCAGATAAACAAGATGTCACTGT 1302

194551876 GGTGGGGAAATAATGTGAACACATAGAAATTGCTCAAGAAATGAGCACAGATGGAGGGAA 194551935
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1303 GGTGGGGAAATAATGTGAACACATAGCAATTGCTCAAGAAATGAGCACAGATGGAGGGAA 1362

194551936 TGGAGTCAAGGAAGGAGGGAGGGAGTCCATATCATATTTGAAAGACATCTAATCTTTGTT 194551995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1363 TGGAGTCAAGGAAGGAGGGAGGGAGTCCATATCATATTTGAAAGACATCTAATCTTGGTT 1422

194551996 GGAAGGGCACATGTGGGTGGAAAGAATTCAAGGAAGCCTCATTCATTCATTATTTATTAA 194552055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1423 GGAAGGGCACATGTGGGTGGAAAGAATTCAAGGAAGCCTCATTCATTCATTATTTATTAA 1482

194552056 TCCTTTACAAAACTCCATTTAATAGACTTTGGTGCCTGCCATGTGGCAGGTACTGAGCTG 194552115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1483 TCCTTTACAAAACTCCATTTAATAGACTTTGGTGCCTGCCATGTGGCAGGTACTGAGCTG 1542

194552116 GGAGCTGGTCATACAGCCAGAGACAACACATGTATGGCCCTTGCCCTCATGGAGCTTATA 194552175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1543 GGAGCTGGTCATACAGCCAGAGACAACACATGTATGGCCCTTGCCCTCATGGAGCTTATA 1602

194552176 GTCTAGTGGAGAGGAGAGGCCGCCACTGATTAAGACCGCAAGTGCTGTGAAGAAAAAGAA 194552235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1603 GTCTAGTGGAGAGGAGAGGCCGCCACTGATTAAGACCGCAAGTGCTGTGAAGAAAAAGAA 1662

194552236 CAAGCAGAAGCAAGCATAATAGGGGAGGCCCGCTTAGGACTAGGGAAGGTGACATTTAAG 194552295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1663 CAAGCAGAAGCAAGCATAATAGGGGAGGCCCGCTTAGGACTAGGGAAGGTGACATTTAAG 1722

194552296 CAGAAGGCTGAAAAACGAGCAGGATTCCATCCTGTGAAGAGCTCGGGGAAGGGCATGCCG 194552355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1723 CAGAAGGCTGAAAAACGAGCAGGATTCCATCCTGTGAAGAGCTCGGGGAAGGGCATGCCG 1782

194552356 GGTAGAGGGAGCTGCATCTGCAAGGGCCTAAGGCAGTGAGGAACTTGGCTCTGGGAGAAA 194552415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1783 GGTAGAGGGAGCTGCATCTGCAAGGGCCTAAGGCAGTGAGGAACTTGGCTCTGGGAGAAA 1842

194552416 TGGAAAGGAGAGGACAGTGTGTCTAGAGGGTGGAAGGCAGAGACACAGGAAATGAAACAG 194552475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1843 TGGAAAGGAGAGGACAGTGTGTCTAGAGGGTGGAAGGCAGAGACACAGGAAATGAAACAG 1902

194552476 GAGACATAGGAGGGGCCAGATTCTGTAAGGCCTTGTAGGCCTCAGGACACAGAGAGGCGC 194552535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1903 GAGACATAGGAGGGGCCAGATTCTGTAAGGCCTTGTAGGCCTCAGGACACAGAGAGGCGC 1962

194552536 TTGAGTTGCATTTTGAGGGCAATGGGAAGTTGCTGGTGGGTTTGAATCGGGGCTTAGGGT 194552595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1963 TTGAGTTGCATTTTGAGGGCAATGGGAAGTTGCTGGTGGGTTTGAATCGGGGCTTAGGGT 2022

194552596 TTTTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGAAGGAGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAG 194552655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2023 TTTTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGAGAAGGAGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAG 2082

194552656 TGCAGTGGCGCGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCTT 194552715
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2083 TGCAGTGGTGCGATCTCTGCTCACTGCAAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCTT 2142

194552716 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGGTGCTCACCACCACGCCCGGCTAATTTTT 194552775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2143 GCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACCACAGGTGCTCACCACCACGCCCGGCTAATTTTT 2202

194552776 TTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGACGGGGGCTTAGGTTTTT 194552835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2203 TTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTCACCATGTTAGCCAGGACGGGGGCTTAGGTTTTT 2262

194552836 AAGCAGTCTGGATGCTCTGTGAGGTAAGGATTGGAAGAGGCAAGAGTGGAGGGAGTGAGA 194552895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2263 AAGCAGTCTGGATGCTCTGTGAGGTAAGGATTGGAAGAGGCAAGAGTGGAGGGAGTGAGA 2322

194552896 ACAGAGCGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGGTGGGGGAAGTGGGGTTGCAGGGA 194552955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2323 ACAGAGCGACAGTTGCGGCGGCCCAGAGTGGGGAGGGTGGGGGAAGTGGGGTTGCAGGGA 2382

194552956 AGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCGGGGCTGCTAGATGTGGG 194553015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2383 AGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCGGGGCTGCTAGATGTGGG 2442

194553016 GATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTA 194553075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2443 GATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTA 2502

194553076 TTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAG 194553135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2503 TTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAG 2562

194553136 ATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCACCCTCTGCCACAGATGAG 194553195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2563 ATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCACCCTCTGCCACAGATGAG 2622

194553196 GAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGC 194553255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2623 GAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGC 2682

194553256 TGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAATTGAGCAATTGCTTCTGCCTCAG 194553315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2683 TGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAATCGAGCAATTGCTTCTGCCTCAG 2742

194553316 GAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAATAATGATTGAATAAGAAATGAGATGGGTTGTTATT 194553375
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2743 GAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAGTAATGATTGAATAAGAAATGAGATGGGTTGTTATT 2802

194553376 TTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAAAAGATCATTGCATGATCAAAT 194553435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2803 TTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAAAAGATCATTGCATGATCAAAT 2862

194553436 TTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAGGCAAAGAACATAAATTTCCAC 194553495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2863 TTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAGGCAAAGAACATAAATTTCCAC 2922

194553496 AGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGGAAAATGGAAAGATAATCTCAG 194553555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2923 AGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGGAAAATGGAAAGATAATCTCAG 2982

194553556 AGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCA 194553615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2983 AGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCA 3042

194553616 GAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAA 194553675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3043 GAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAA 3102

194553676 GGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGA 194553735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3103 GGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGA 3162

194553736 CAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCCACAGCTGGCCCTACTGC 194553795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3163 CAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCCACAGCTGGCCCTACTGC 3222

194553796 CTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGG 194553855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3223 CTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGG 3282

194553856 AGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCTCACCCTCTCACCCTTTT 194553915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3283 AGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCTCACCCTCTCACCCTTTT 3342

194553916 CTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTT 194553975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3343 CTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTT 3402

194553976 CTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTG 194554035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3403 CTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTG 3462

194554036 ATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAG 194554095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3463 ATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAG 3522

194554096 CAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGC 194554155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3523 CAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGC 3582

194554156 ATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCG 194554215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3583 ATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCG 3642

194554216 GCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTAC 194554275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3643 GCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTAC 3702

194554276 AAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAG 194554335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3703 AAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAG 3762

194554336 TAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTC 194554395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3763 TAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTC 3822

194554396 CGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAA 194554455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3823 CGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAA 3882

194554456 TGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGC 194554515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3883 TGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGC 3942

194554516 TTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGC 194554575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3943 TTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGC 4002

194554576 ACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACA 194554635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 ACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACA 4062

194554636 AGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGA 194554695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4063 AGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGA 4122

194554696 ATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGG 194554755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 ATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGG 4182

194554756 AGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAA 194554815
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 AGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAA 4242

194554816 TTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAG 194554875
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4243 TTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAG 4302

194554876 AATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACAC 194554935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 AATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACAC 4362

194554936 ATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCT 194554995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 ATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCT 4422

194554996 ACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGA 194555055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 ACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGA 4482

194555056 GGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTG 194555115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4483 GGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTG 4542

194555116 CATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGT 194555175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 CATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGT 4602

194555176 GTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAG 194555235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 GTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAG 4662

194555236 AGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTG 194555295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4663 AGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTG 4722

194555296 GTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGG 194555355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 GTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGG 4782

194555356 GCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAA 194555415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 GCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAA 4842

194555416 CCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCC 194555475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4843 CCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCC 4902

194555476 CAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGT 194555535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4903 CAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGT 4962

194555536 GAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGG 194555595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4963 GAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGG 5022

194555596 AAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCATTCAGC 194555655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5023 AAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCATTCAGC 5082

194555656 CAAATGGCACACGCTGCACACCTGTGTGCCTCCCGGGCCAGAAGGGAAAAGGATCTGGCT 194555715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5083 CAAATGGCACACGCTGCACACCTGTGTGCCTCCCGGGCCAGAAGGGAAAAGGATCTGGCT 5142

194555716 CCAGGGGCCTACCCCTGCAATTCCTCATCGAAAACCAACAGTGATTGCCCATCCACCCCC 194555775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5143 CCAGGGGCCTACCCCTGCAATTCCTCATCGAAAACCAACAGTGATTGCCCATCCACCCCC 5202

194555776 GGCTCACAAGCAGTCCTGCAGAGGGGCCTGATGGTTCCACGTCTCACGCCAGCCAGTTTC 194555835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5203 GGCTCACAAGCAGTCCTGCAGAGGGGCCTGATGGTTCCACGTCTCACGCCAGCCAGTTTC 5262

194555836 CAGGTCTGCGAATGAAGCGGTAGGGCCTGGTGCCCTTCACGGTCCTTTTTGCTCCTACGG 194555895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5263 CAGGTCTGCGAATGAAGCGGTAGGGCCTGGTGCCCTTCACGGTCCTTTTTGCTCCTACGG 5322

194555896 TCTGGCCTTCTGAGTCTGCGTGCTCTGGGCAGATGTGAATCATGTGTTGGCATCCTCCAC 194555955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5323 TCTGGCCTTCTGAGTCTGCGTGCTCTGGGCAGATGTGAATCATGTGTTGGCATCCTCCAC 5382

194555956 AAGGTCCACACCAGTGGAAGCTCAAAGAGCCTTTATTGACTCAGGTGGAAAAATCCAGCA 194556015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5383 AAGGTCCACACCAGTGGAAGCTCAAAGAGCCTTTATTGACTCAGGTGGAAAAATCCAGCA 5442

194556016 TGATCTGGCCCTGTGCACCACTGGTGGTGGAAAGGATAAAAAGTTCTGCAGGGTAGTGAA 194556075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5443 TGATCTGGCCCTGTGCACCACTGGTGGTGGAAAGGATAAAAAGTTCTGCAGGGTAGTGAA 5502

194556076 AGGACTGGTGGATATCATTTTTTAAAGTCTAAAATGTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACC 194556135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5503 AGGACTGGTGGATATCATTTTTTAAAGTCTAAAATGTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACC 5562

194556136 TGTAATCCCAGCACTTCAGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAG 194556195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5563 TGTAATCCCAGCACTTCAGGAGGCCGAGGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAG 5622

194556196 GCCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCCCTACTAAAACTACAAAAATTAGCTGGGC 194556255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5623 GCCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCCCGTCCCTACTAAAACTACAAAAATTAGCTGGGC 5682

194556256 GTGGTGGTGGATGCCGGTAATCCCAGCTACACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCT 194556315
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     5683 GTGGTGGTGGATGCCGGTAATCCCAGCTACACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCC 5742

194556316 GTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAATAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCA 194556375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5743 GTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAATAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCA 5802

194556376 GCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAATCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACT 194556435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5803 GCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAATCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACT 5862

194556436 CACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGATGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAAT 194556495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5863 CACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGATGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAAT 5922

194556496 GCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACTCAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGG 194556555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5923 GCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACTCAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGG 5982

194556556 CCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGCAACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAAC 194556615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5983 CCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGCAACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAAC 6042

194556616 TGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTTTCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTG 194556675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6043 TGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTTTCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTG 6102

194556676 TAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAAATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGA 194556735
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6103 TAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAAATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGA 6162

194556736 AGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGACTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGAT 194556795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6163 AGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGACTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGAT 6222

194556796 TATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACCTTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACA 194556855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6223 TATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACCTTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACA 6282

194556856 GCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAAATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAG 194556915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6283 GCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAAATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAG 6342

194556916 CAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAGTCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAG 194556975
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     6343 CAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAGTCCCTGCCCTCCAACTCACAGCGCAGTGGAG 6402

194556976 ACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAGCAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAA 194557035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6403 ACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAGCAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAA 6462

194557036 AACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGTTGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCAT 194557095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6463 AACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGTTGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCAT 6522

194557096 TTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGTAGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCA 194557155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6523 TTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGTAGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCA 6582

194557156 TTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGGCAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTG 194557215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6583 TTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGGCAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTG 6642

194557216 GAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGCATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGC 194557275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6643 GAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGCATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGC 6702

194557276 CAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACATTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTG 194557335
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6703 CAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACATTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTG 6762

194557336 AAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAGCCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGA 194557395
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6763 AAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAGCCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGA 6822

194557396 GCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAGGCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAG 194557455
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6823 GCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAGGCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAG 6882

194557456 GACATATTGAGGGCCTGAACTGATAGGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAG 194557515
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6883 GACATATTGAGGGCCTGAACTGATAGGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAG 6942

194557516 AGCTGAAATCTGCACAAGCATATTTTTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAG 194557575
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6943 AGCTGAAATCTGCACAAGCATATTTTTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAG 7002

194557576 CCATGATTATGTAGCAAACAAGAAATCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCT 194557635
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7003 CCATGATTATGTAGCAAACAAGAAATCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCT 7062

194557636 TTCACCAATGTATTGGGTACCAGTAGCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGG 194557695
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7063 TTCACCAATGTATTGGGTACCAGTAGCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGG 7122

194557696 ATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCAAGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGA 194557755
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7123 ATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCAAGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGA 7182

194557756 AGCCAGAAGGTGGAGGCT 194557773
          ||||||||||||||||||
     7183 AGCCAGAAGGTGGAGGCT 7200

Alignment time is 5.22368 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3769] =>      3769 nucs 'mol-32-349d-160565_3769'

Score:        3645
Aligned:      3773        nucs
Identic:      3754 ( 99%) nucs =>      1706 ( 99%)      2048 (100%)
Gaps:           12 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194553936,194555650] EXCISED REGION [194556285,194558338]
 second seq =>  [        1,     1711] EXCISED REGION [     1716,     3769]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       634 nucs [194555651,194556284]
 second seq =>         4 nucs [1712,1715]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [1712,1712] to [1715,1715]

194553936 GGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGA 194553995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGA 60

194553996 AGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAG 194554055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAG 120

194554056 ATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCA 194554115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCA 180

194554116 GAGCGACTATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGA 194554175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAGCGACTATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGA 240

194554176 AGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGG 194554235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGG 300

194554236 CTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATT 194554295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATT 360

194554296 CTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACAT 194554355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACAT 420

194554356 GCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGA 194554415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGA 480

194554416 GCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGTCGTGTT 194554475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||
      481 GCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGT---GTT 537

194554476 TGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAAT 194554535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 TGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAAT 597

194554536 TAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAA 194554595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 TAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAA 657

194554596 GTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACAT 194554655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 GTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACAT 717

194554656 TTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAG 194554715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 TTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAG 777

194554716 AAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGC 194554775
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 AAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGC 837

194554776 AGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTA 194554835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 AGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTA 897

194554836 TATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAGGAAGC 194554895
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
      898 TATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTACTTAGGAAGC 957

194554896 TCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAA 194554955
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 TCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAA 1017

194554956 TGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAG 194555015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 TGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAG 1077

194555016 CCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGA 194555075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 CCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGA 1137

194555076 AAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGG 194555135
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 AAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGG 1197

194555136 CTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGC 194555195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 CTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGC 1257

194555196 ACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGT 194555255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 ACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGT 1317

194555256 GGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCG 194555315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 GGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCG 1377

194555316 GGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACG 194555375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 GGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACG 1437

194555376 AGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATA 194555435
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||.||||.||
     1438 AGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCTCTCTCTACGAAAAGTA 1497

194555436 CAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAG 194555495
          |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 CAAAAA-TTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAG 1556

194555496 GCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTG 194555555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 GCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTG 1616

194555556 CACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGG 194555615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 CACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGG 1676

194555616 AGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 194555650
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 AGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 1711

EXCISED REGION

194556285 CACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 194556344
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1716 CACTACAGCCTGGATGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 1775

194556345 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 194556404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1776 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 1835

194556405 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 194556464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1836 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 1895

194556465 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 194556524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1896 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 1955

194556525 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 194556584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1956 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 2015

194556585 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 194556644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2016 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 2075

194556645 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 194556704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2076 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 2135

194556705 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 194556764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2136 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 2195

194556765 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 194556824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2196 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 2255

194556825 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 194556884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2256 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 2315

194556885 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 194556944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2316 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAAGACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 2375

194556945 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 194557004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2376 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 2435

194557005 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 194557064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2436 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 2495

194557065 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCA----TTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 194557120
          ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||
     2496 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGT----GGCGTTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 2551

194557121 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 194557180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2552 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 2611

194557181 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 194557240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2612 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 2671

194557241 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 194557300
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2672 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCCAGATAAGGCATAGCTAGAAAGACA 2731

194557301 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 194557360
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2732 TTTGCAGCTGGTACAGAGAGGGATAATACCCGCTGAAGGAGATCAGTAGATAATGGGGAG 2791

194557361 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 194557420
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2792 CCACTAAAGGTTTTAGAGAAGGGGACATGCTCAGAGCTGGGTCTTTGGAAGAGTGACCAG 2851

194557421 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 194557480
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2852 GCTAGCATATGAAGCTAGAGCAGATAGCTAAAGAGGACATATTGAGGGCCTGAACTGATA 2911

194557481 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 194557540
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2912 GGAAAAAACAGAGCGGTTGGAGGGATATAGGACAGAGCTGAAATCTGCACAAGCATATTT 2971

194557541 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 194557600
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2972 TTGAAGTTGTGAATCCCAGCTGGCACAAAACAAAGCCATGATTATGTAGCAAACAAGAAA 3031

194557601 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 194557660
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3032 TCCTCAGTCTGTTTGGTGATAGGCCTCTGTTTTCTTTCACCAATGTATTGGGTACCAGTA 3091

194557661 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 194557720
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3092 GCATCAGCACCAGACTTGGACTAAGGGATTCTGGGATTGACTCAAATAGTGGAGAGACCA 3151

194557721 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 194557780
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3152 AGAGAAGAGAATCATGAAGAAATGCTAAGCACTGAAGCCAGAAGGTGGAGGCTGGAGTCC 3211

194557781 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 194557840
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3212 AGGCCAGTAGCTGTGCAGCACATTATTCTCCCTGCTAGGTGCAGCAGTACCTCCTGCACG 3271

194557841 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 194557900
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3272 CACTCCCTTAAGCATCAGGGAATTGGAGCTTCAGGATCCACACAAAGGCCAAGCTTTGCC 3331

194557901 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 194557960
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3332 AGCCTCTGTTAGGGCACAGGCCACTGGTCCTCTGTCTTCAGTACAAACTAAAGTCGTCTC 3391

194557961 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 194558020
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3392 CACCTAGGACAGATTGCATTTCCTCTCAGGACCTCGGTGTGTCTCATTGTAAAATGGAAC 3451

194558021 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 194558080
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3452 TACGCAAGGCCCCTTCCACCTCTTACACTTCACGATACTGTGAAAGGGAAGGATAACACA 3511

194558081 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 194558140
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3512 GAGGCCTGTAGAGTCTGTGCTTAAAAGCCAACATAAGTTAGCTGGGACACTTATTCAAAA 3571

194558141 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 194558200
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3572 CCGTGAAAAAAGAGATCGCTTGCAGTCAAGGATACATGGAAGTACGAGACAGAAGGTGGT 3631

194558201 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAA 194558260
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3632 TAAAAGCCAGAGACTAGGTGGTTTCCTCCAGTGGGATGTAGAGCACTGAGAAGGGTACAA 3691

194558261 ACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGA 194558320
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3692 ACCAGAAAGATGGGAGCATGCCCCGCCAGGGCAGGGGGCCTGGGAATCCGTGGAGTGGGA 3751

194558321 GCTGGTCCCGCGTGTAGG 194558338
          ||||||||||||||||||
     3752 GCTGGTCCCGCGTGTAGG 3769

Alignment time is 2.79166 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     4982] =>      4982 nucs 'mol-32-34a8-063279_4982'

Score:        4926
Aligned:      4981        nucs
Identic:      4976 (100%) nucs =>       555 (100%)      4421 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194551347,194551901] EXCISED REGION [194551903,194556328]
 second seq =>  [        1,      555] EXCISED REGION [      557,     4982]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [194551902,194551902]
 second seq =>         1 nucs [556,556]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [194551902,194551903] to [194551903,194551904]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

194551347 CCTCTGGGCATCCATCAGCGTTCCAGCAGGACACCTGGCAACGTGTACTACATACCTCCC 194551406
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CCTCTGGGCATCCATCAGCGTTCCAGCAGGACACCTGGCAACGTGTACTACATACCTCCC 60

194551407 TGGAAGGAGCTCCATTGTGTCTGAATGTGGCTGTGGGTGAGGGAGCAAGAGGCAGCAGGG 194551466
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGAAGGAGCTCCATTGTGTCTGAATGTGGCTGTGGGTGAGGGAGCAAGAGGCAGCAGGG 120

194551467 TGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTGTGCACGCACATGCATCTGCAGGGTTTAGACTGTGAT 194551526
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTGTGTGTGTGTATATGTGTGTGTGCACGCACATGCATCTGCAGGGTTTAGACTGTGAT 180

194551527 GAATGAATATACCAAAAATAAGGATTCTATGTCTATTAGAAGTTTTATTTAAATTTCCTT 194551586
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAATGAATATACCAAAAATAAGGATTCTATGTCTATTAGAAGTTTTATTTAAATTTCCTT 240

194551587 CCTTGAGGTCCTTCGTTGAAAAAGGTGGTCATCATTTAATGGAGTTTGGCAGCACATTTT 194551646
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTTGAGGTCCTTCGTTGAAAAAGGTGGTCATCATTTAATGGAGTTTGGCAGCACATTTT 300

194551647 CCCAGCAACAAAACAAATTAATCATCTGTAGGCTTGGGGAGCAGATCTTCATCCCTATTA 194551706
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCAGCAACAAAACAAATTAATCATCTGTAGGCTTGGGGAGCAGATCTTCATCCCTATTA 360

194551707 GGAGTGTGGGAAAATAGAAAATATTGCTCTGAGTGGAAGCCCAAAGGCCAGAATCTCCCA 194551766
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAGTGTGGGAAAATAGAAAATATTGCTCTGAGTGGAAGCCCAAAGGCCAGAATCTCCCA 420

194551767 GTTTGGAGCTCATTGCAGAGGACTTTTTGCTTCTTTCTGGCTTCTCGGCTGCATTCTGAG 194551826
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTTGGAGCTCATTGCAGAGGACTTTTTGCTTCTTTCTGGCTTCTCGGCTGCATTCTGAG 480

194551827 TAGAAGAGGGTGTGAGACAATGTCCTTCAGATAAACAAGATGTCACTGTGGTGGGGAAAT 194551886
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGAAGAGGGTGTGAGACAATGTCCTTCAGATAAACAAGATGTCACTGTGGTGGGGAAAT 540

194551887 AATGTGAACACATAG 194551901
          |||||||||||||||
      541 AATGTGAACACATAG 555

EXCISED REGION

194551903 AATTGCTCAAGAAATGAGCACAGATGGAGGGAATGGAGTCAAGGAAGGAGGGAGGGAGTC 194551962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      557 AATTGCTCAAGAAATGAGCACAGATGGAGGGAATGGAGTCAAGGAAGGAGGGAGGGAGTC 616

194551963 CATATCATATTTGAAAGACATCTAATCTTTGTTGGAAGGGCACATGTGGGTGGAAAGAAT 194552022
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      617 CATATCATATTTGAAAGACATCTAATCTTGGTTGGAAGGGCACATGTGGGTGGAAAGAAT 676

194552023 TCAAGGAAGCCTCATTCATTCATTATTTATTAATCCTTTACAAAACTCCATTTAATAGAC 194552082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      677 TCAAGGAAGCCTCATTCATTCATTATTTATTAATCCTTTACAAAACTCCATTTAATAGAC 736

194552083 TTTGGTGCCTGCCATGTGGCAGGTACTGAGCTGGGAGCTGGTCATACAGCCAGAGACAAC 194552142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      737 TTTGGTGCCTGCCATGTGGCAGGTACTGAGCTGGGAGCTGGTCATACAGCCAGAGACAAC 796

194552143 ACATGTATGGCCCTTGCCCTCATGGAGCTTATAGTCTAGTGGAGAGGAGAGGCCGCCACT 194552202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      797 ACATGTATGGCCCTTGCCCTCATGGAGCTTATAGTCTAGTGGAGAGGAGAGGCCGCCACT 856

194552203 GATTAAGACCGCAAGTGCTGTGAAGAAAAAGAACAAGCAGAAGCAAGCATAATAGGGGAG 194552262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      857 GATTAAGACCGCAAGTGCTGTGAAGAAAAAGAACAAGCAGAAGCAAGCATAATAGGGGAG 916

194552263 GCCCGCTTAGGACTAGGGAAGGTGACATTTAAGCAGAAGGCTGAAAAACGAGCAGGATTC 194552322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      917 GCCCGCTTAGGACTAGGGAAGGTGACATTTAAGCAGAAGGCTGAAAAACGAGCAGGATTC 976

194552323 CATCCTGTGAAGAGCTCGGGGAAGGGCATGCCGGGTAGAGGGAGCTGCATCTGCAAGGGC 194552382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      977 CATCCTGTGAAGAGCTCGGGGAAGGGCATGCCGGGTAGAGGGAGCTGCATCTGCAAGGGC 1036

194552383 CTAAGGCAGTGAGGAACTTGGCTCTGGGAGAAATGGAAAGGAGAGGACAGTGTGTCTAGA 194552442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1037 CTAAGGCAGTGAGGAACTTGGCTCTGGGAGAAATGGAAAGGAGAGGACAGTGTGTCTAGA 1096

194552443 GGGTGGAAGGCAGAGACACAGGAAATGAAACAGGAGACATAGGAGGGGCCAGATTCTGTA 194552502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1097 GGGTGGAAGGCAGAGACACAGGAAATGAAACAGGAGACATAGGAGGGGCCAGATTCTGTA 1156

194552503 AGGCCTTGTAGGCCTCAGGACACAGAGAGGCGCTTGAGTTGCATTTTGAGGGCAATGGGA 194552562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1157 AGGCCTTGTAGGCCTCAGGACACAGAGAGGCGCTTGAGTTGCATTTTGAGGGCAATGGGA 1216

194552563 AGTTGCTGGTGGGTTTGAATCGGGGCTTAGGGTTTTTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTG 194552622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1217 AGTTGCTGGTGGGTTTGAATCGGGGCTTAGGGTTTTTTGGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTG 1276

194552623 AGAAGGAGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCTGCTCACTGC 194552682
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
     1277 AGAAGGAGTCTGGCTCTGTCACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGTGCGATCTCTGCTCACTGC 1336

194552683 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACC 194552742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1337 AAGCTCCGCCTCCCGGGTTCACGCCATTCTCTTGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACC 1396

194552743 ACAGGTGCTCACCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTC 194552802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1397 ACAGGTGCTCACCACCACGCCCGGCTAATTTTTTTGTATTTTTAATAGAGATGGGGTTTC 1456

194552803 ACCATGTTAGCCAGGACGGGGGCTTAGGTTTTTAAGCAGTCTGGATGCTCTGTGAGGTAA 194552862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1457 ACCATGTTAGCCAGGACGGGGGCTTAGGTTTTTAAGCAGTCTGGATGCTCTGTGAGGTAA 1516

194552863 GGATTGGAAGAGGCAAGAGTGGAGGGAGTGAGAACAGAGCGACAGTTGCGGCGGCCCAGA 194552922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1517 GGATTGGAAGAGGCAAGAGTGGAGGGAGTGAGAACAGAGCGACAGTTGCGGCGGCCCAGA 1576

194552923 GTGGGGAGGGTGGGGGAAGTGGGGTTGCAGGGAAGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACA 194552982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1577 GTGGGGAGGGTGGGGGAAGTGGGGTTGCAGGGAAGGGCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACA 1636

194552983 GAATGGATAGGACTCGGGGCTGCTAGATGTGGGGATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGT 194553042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1637 GAATGGATAGGACTCGGGGCTGCTAGATGTGGGGATTAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGT 1696

194553043 GACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTATTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTC 194553102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1697 GACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTATTTGTTTACATCATGGAGAAAATTGTC 1756

194553103 ATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAGATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTA 194553162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1757 ATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAGATAATTTCACCAATAATTCAGTGAGTA 1816

194553163 ATGCTCACCCTATCACCCTCTGCCACAGATGAGGAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTT 194553222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1817 ATGCTCACCCTATCACCCTCTGCCACAGATGAGGAAAGGTTAAACAAGACCTGATGTTTT 1876

194553223 CCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGCTGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAA 194553282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1877 CCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGCTGCCTTTCTGTTTACTGGACTGATAAA 1936

194553283 GAAAATAAAATTGAGCAATTGCTTCTGCCTCAGGAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAATA 194553342
          |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     1937 GAAAATAAAATCGAGCAATTGCTTCTGCCTCAGGAAAAGAAATCATGTCCTGAGTGAGTA 1996

194553343 ATGATTGAATAAGAAATGAGATGGGTTGTTATTTTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGA 194553402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1997 ATGATTGAATAAGAAATGAGATGGGTTGTTATTTTAAACTAGGATTTCCTGCCTACCAGA 2056

194553403 AATCGTGGGGAAAAGATCATTGCATGATCAAATTTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGAT 194553462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2057 AATCGTGGGGAAAAGATCATTGCATGATCAAATTTGGGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGAT 2116

194553463 ACGATTAGCTAGGCAAAGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTC 194553522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2117 ACGATTAGCTAGGCAAAGAACATAAATTTCCACAGTGGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTC 2176

194553523 ACAACAGGGAGGAAAATGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAAT 194553582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2177 ACAACAGGGAGGAAAATGGAAAGATAATCTCAGAGACAAAAGCATCTGGGGTATTTGAAT 2236

194553583 GAGTTAAGAGGAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTG 194553642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2237 GAGTTAAGAGGAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAGCCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTG 2296

194553643 GCTCAACCAGGAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTG 194553702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2297 GCTCAACCAGGAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGGGAAATCTGACCAGATGACAGGCTG 2356

194553703 TTGTCTCAGGGTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCA 194553762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2357 TTGTCTCAGGGTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAATGGGTATATGAGTCAAAGGCACCA 2416

194553763 AGGTCACTGCCAGTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGAC 194553822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2417 AGGTCACTGCCAGTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTTGATCTGCACCAGGGTGGGCAGGAC 2476

194553823 TGAGACTCCTTTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCA 194553882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2477 TGAGACTCCTTTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGCTGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCA 2536

194553883 CCCCTCTCCCCACCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCAC 194553942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2537 CCCCTCTCCCCACCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTCCCCTCCTACCCTACATTGGATCAC 2596

194553943 CCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTC 194554002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 CCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTCTCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTC 2656

194554003 CCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGG 194554062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2657 CCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTGATGAGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGG 2716

194554063 GAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGAC 194554122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2717 GAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAGCTACACACAGCCCTCCAGAGCGAC 2776

194554123 TATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGA 194554182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2777 TATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATCCATGAATCAGGGAGTGAAGATGGA 2836

194554183 CTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGC 194554242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2837 CTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCTTAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGC 2896

194554243 TAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCA 194554302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2897 TAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAAACACAAGGGAATCAATTCTGCCCA 2956

194554303 CCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCT 194554362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2957 CCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAGGGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCT 3016

194554363 GGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGC 194554422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3017 GGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGAGCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGC 3076

194554423 CTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTG 194554482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3077 CTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGAGTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTG 3136

194554483 ATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGA 194554542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3137 ATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTCATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGA 3196

194554543 GATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGC 194554602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3197 GATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACATACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGC 3256

194554603 TGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAA 194554662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3257 TGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGCCACCAGGAGGGGAACATTTGTGAA 3316

194554663 CCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCA 194554722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3317 CCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATCCAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCA 3376

194554723 AGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGA 194554782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3377 AGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGTGGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGA 3436

194554783 TGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTC 194554842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3437 TGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTGAGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTC 3496

194554843 CCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGG 194554902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3497 CCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAATTTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGG 3556

194554903 TGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTC 194554962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3557 TGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATGTCACGCACGGGCAAGAATGTGCTC 3616

194554963 GAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGT 194555022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3617 GAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACACATTCCTGTATGATAAGCCTGGGT 3676

194555023 TGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCA 194555082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3677 TGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGCAGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCA 3736

194555083 CCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCT 194555142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3737 CCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCATGACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCT 3796

194555143 GAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAG 194555202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3797 GAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTAGCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAG 3856

194555203 TTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGA 194555262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3857 TTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGAAAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGA 3916

194555263 GAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGG 194555322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3917 GAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTAAAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGG 3976

194555323 TGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAA 194555382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3977 TGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCCAAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAA 4036

194555383 GAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA 194555442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4037 GAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCCTGTCTCTACTAAAAATACAAAAAA 4096

194555443 TTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAG 194555502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4097 TTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAGCTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAG 4156

194555503 AATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCA 194555562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4157 AATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCAGAGACCATGCCACTGCACTCCA 4216

194555563 GCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGA 194555622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4217 GCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAAACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGA 4276

194555623 ACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCATTCAGCCAAATGGCACACGCTGCACACCTGTGT 194555682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4277 ACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCATTCAGCCAAATGGCACACGCTGCACACCTGTGT 4336

194555683 GCCTCCCGGGCCAGAAGGGAAAAGGATCTGGCTCCAGGGGCCTACCCCTGCAATTCCTCA 194555742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4337 GCCTCCCGGGCCAGAAGGGAAAAGGATCTGGCTCCAGGGGCCTACCCCTGCAATTCCTCA 4396

194555743 TCGAAAACCAACAGTGATTGCCCATCCACCCCCGGCTCACAAGCAGTCCTGCAGAGGGGC 194555802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4397 TCGAAAACCAACAGTGATTGCCCATCCACCCCCGGCTCACAAGCAGTCCTGCAGAGGGGC 4456

194555803 CTGATGGTTCCACGTCTCACGCCAGCCAGTTTCCAGGTCTGCGAATGAAGCGGTAGGGCC 194555862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4457 CTGATGGTTCCACGTCTCACGCCAGCCAGTTTCCAGGTCTGCGAATGAAGCGGTAGGGCC 4516

194555863 TGGTGCCCTTCACGGTCCTTTTTGCTCCTACGGTCTGGCCTTCTGAGTCTGCGTGCTCTG 194555922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4517 TGGTGCCCTTCACGGTCCTTTTTGCTCCTACGGTCTGGCCTTCTGAGTCTGCGTGCTCTG 4576

194555923 GGCAGATGTGAATCATGTGTTGGCATCCTCCACAAGGTCCACACCAGTGGAAGCTCAAAG 194555982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4577 GGCAGATGTGAATCATGTGTTGGCATCCTCCACAAGGTCCACACCAGTGGAAGCTCAAAG 4636

194555983 AGCCTTTATTGACTCAGGTGGAAAAATCCAGCATGATCTGGCCCTGTGCACCACTGGTGG 194556042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4637 AGCCTTTATTGACTCAGGTGGAAAAATCCAGCATGATCTGGCCCTGTGCACCACTGGTGG 4696

194556043 TGGAAAGGATAAAAAGTTCTGCAGGGTAGTGAAAGGACTGGTGGATATCATTTTTTAAAG 194556102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4697 TGGAAAGGATAAAAAGTTCTGCAGGGTAGTGAAAGGACTGGTGGATATCATTTTTTAAAG 4756

194556103 TCTAAAATGTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTCAGGAGGCCGA 194556162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4757 TCTAAAATGTGGCCAGGTGCAGTGGCTCACACCTGTAATCCCAGCACTTCAGGAGGCCGA 4816

194556163 GGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCC 194556222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4817 GGCGGGTGGATCACCTGAGGTCAGGAGTTTGAGGCCAGCCTGGCCAACATGGAGAAACCC 4876

194556223 CGTCCCTACTAAAACTACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGATGCCGGTAATCCCAGC 194556282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4877 CGTCCCTACTAAAACTACAAAAATTAGCTGGGCGTGGTGGTGGATGCCGGTAATCCCAGC 4936

194556283 TACACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATA 194556328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     4937 TACACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCCGTCTCAAAAAATA 4982

Alignment time is 3.67185 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [194545650,194566284] =>     20635 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3685] =>      3685 nucs 'mol-32-34be-142061_3685'

Score:        3593
Aligned:      3688        nucs
Identic:      3672 (100%) nucs =>      2685 (100%)       987 ( 99%)
Gaps:           11 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [194552959,194555650] EXCISED REGION [194556285,194557276]
 second seq =>  [        1,     2689] EXCISED REGION [     2694,     3685]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       634 nucs [194555651,194556284]
 second seq =>         4 nucs [2690,2693]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [2690,2690] to [2693,2693]

194552959 GCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCGGGGCTGCTAGATGTGGGGAT 194553018
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCCCTGGAGAGGTGTTCTAATACAGAATGGATAGGACTCGGGGCTGCTAGATGTGGGGAT 60

194553019 TAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTATTT 194553078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TAGGAGGAGAGAAAGATCAAAAGTGACTCCTACATTTCAAATTTGGAAAACTATTTATTT 120

194553079 GTTTACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAGATA 194553138
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTTACATCATGGAGAAAATTGTCATGACCTAAACTTTGGAGAAAAGGAGGAATAAGATA 180

194553139 ATTTCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCACCCTCTGCCACAGATGAGGAA 194553198
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
      181 ATTTCACCAATAATTCAGTGAGTAATGCTCACCCTATCACCCTTTGCCACAGATGAGGAA 240

194553199 AGGTTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGCTGC 194553258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGGTTAAACAAGACCTGATGTTTTCCTGCTCACTGGAGTTTGCTGGGGTTATTGCGCTGC 300

194553259 CTTTCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAATTGAGCAATTGCTTCTGCCTCAGGAA 194553318
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      301 CTTTCTGTTTACTGGACTGATAAAGAAAATAAAATCGAGCAATTGCTTCTGCCTCAGGAA 360

194553319 AAGAAATCATGTCCTGAGTGAATAATGATTGAATAAGAAATGAGATGGGTTGTTATTTTA 194553378
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAGAAATCATGTCCTGAGTGAGTAATGATTGAATAAGAAATGAGATGGGTTGTTATTTTA 420

194553379 AACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAAAAGATCATTGCATGATCAAATTTG 194553438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AACTAGGATTTCCTGCCTACCAGAAATCGTGGGGAAAAGATCATTGCATGATCAAATTTG 480

194553439 GGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAGGCAAAGAACATAAATTTCCACAGT 194553498
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GGAGCCCAAGTAATGGAAGAAGATACGATTAGCTAGGCAAAGAACATAAATTTCCACAGT 540

194553499 GGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGGAAAATGGAAAGATAATCTCAGAGA 194553558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GGGCAAACGAACCAGAAAAAAGTCACAACAGGGAGGAAAATGGAAAGATAATCTCAGAGA 600

194553559 CAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAG 194553618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAAAGCATCTGGGGTATTTGAATGAGTTAAGAGGAAGGGCCTGGAATCAGTCCGCAGAG 660

194553619 CCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGG 194553678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CCTGGGCTCCAAAAGGGTTCAGTGGCTCAACCAGGAGTTCAGGTGGCAAAAGGGAAAGGG 720

194553679 GAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAA 194553738
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GAAATCTGACCAGATGACAGGCTGTTGTCTCAGGGTGAAAGGTAGGGGGTGGAAGGACAA 780

194553739 TGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTT 194553798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGGTATATGAGTCAAAGGCACCAAGGTCACTGCCAGTCCACAGCTGGCCCTACTGCCTT 840

194553799 GATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGC 194553858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GATCTGCACCAGGGTGGGCAGGACTGAGACTCCTTTGGTCACTGGAGTCCGAAAAGGAGC 900

194553859 TGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTC 194553918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGAGGGGCTCCCCTGCTTTCTGCACCCCTCTCCCCACCCTCACCCTCTCACCCTTTTCTC 960

194553919 CCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTC 194553978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCCTCCTACCCTACATTGGATCACCCAGCCAGGGAACTCTCCTCACAGGCTGGGCTTCTC 1020

194553979 TCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTGATG 194554038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTCCTCCTTGGCTAGAAGGCCTCCCTCCTCTGACATCATCATCATCATCAACACTGATG 1080

194554039 AGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAG 194554098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AGCTGGGACTCTGTCAGATGTAGGGAATGCACGGCCGCATGAGCACCAGTGTGACAGCAG 1140

194554099 CTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATC 194554158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CTACACACAGCCCTCCAGAGCGACTATATAAAAAGGCTCACCCAGCAACTGATTGGCATC 1200

194554159 CATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCT 194554218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CATGAATCAGGGAGTGAAGATGGACTGACCCTCAGAAGTGTCTAATAGGATAAGGCGGCT 1260

194554219 TAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAA 194554278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TAGGCTAAGGGCAGAGGCTGTGGCTAGCCAGCAAGAAGTCAGGAAGCTCACTCCTACAAA 1320

194554279 ACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAG 194554338
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 ACACAAGGGAATCAATTCTGCCCACCTGAGTGAGCTTGGAAGTGGATTCTTCCCCAGTAG 1380

194554339 GGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGA 194554398
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GGCCTCCAGAAGAACATGCCGCCTGGCCAACGCCTTGACTACAGCCCTGTGAAACTCCGA 1440

194554399 GCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGA 194554458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GCTGAGGATGCGGCTGAGCCGCGCCTGGACTCCTGACTCACAGGAACTGTGAGCTAATGA 1500

194554459 GTGTGTGTTGTCGTGTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTC 194554518
          |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGTGTGTTGT---GTTTGCGGTGATTTGTAACACAGCAATAGATAACTCATATAGCTTC 1557

194554519 ATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACA 194554578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 ATAGGTGTTGGGAGAATTAAGTGAGATTCTTCTCATGAAGCCCCTGGCACGGGAGGCACA 1617

194554579 TACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGC 194554638
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 TACCAGGGCCTCAGTAAGTTTGGCTGTTAGAATCACCATCACACTTTGTGTGGCACAAGC 1677

194554639 CACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATC 194554698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 CACCAGGAGGGGAACATTTGTGAACCATTTTTTGGGGAAAATCTCACAAAAAGCAGAATC 1737

194554699 CAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGT 194554758
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 CAAGGGGAGTAGTAAAGAAGAGCAAGGCTTAGAGAGTCAGCAAGAGGGGCAGGTGGGAGT 1797

194554759 GGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTG 194554818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 GGGAGAAGTGGCGTGGCAGAGAGATGCTGGAGGTAGAATTTATACGGCAGCGTCTAATTG 1857

194554819 AGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAAT 194554878
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 AGTCCTTCCTTCAGTTATATGTTCCCAGAGGGTATAGAAACAAAGATCAATAAGCAGAAT 1917

194554879 TTCTGTCCTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATG 194554938
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 TTCTGTACTTAGGAAGCTCACTGGTGTGTAGAGAAGTACACAAACGGCATAATACACATG 1977

194554939 TCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACA 194554998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 TCACGCACGGGCAAGAATGTGCTCGAGGCTTTGAGACTGTGGAAAAGGAAGTGATCTACA 2037

194554999 CATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGC 194555058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 CATTCCTGTATGATAAGCCTGGGTTGAATGGAGGATCTTTACAAGGGACAGGTGGGAGGC 2097

194555059 AGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCAT 194555118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 AGTTGAAGAGGTAGGGAAAGGTCACCTGGACCCCCACTGGCCTATAGCATATCTTTGCAT 2157

194555119 GACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTA 194555178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2158 GACTTAGAAAATGGGGGCTCCTCTGAGTGGACCGATTAGAGAAAGTCATGCCTTTGTGTA 2217

194555179 GCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGA 194555238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2218 GCTGCAGCCAGACTGGCACTAGAGTTGTCAAGTAGAAGGTGCCTTTCTGCAAAATAGAGA 2277

194555239 AAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTA 194555298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2278 AAGTCACCTCTTCCTGTGGAGGGAGAGGTCTCATGCCGGGCCATGGAATAGGGCTTGGTA 2337

194555299 AAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCC 194555358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2338 AAAGGAGCATGGGGCCGGGTATGGTGGCTGTTGCCTGTAATCCCAGCACTCTGGGGGGCC 2397

194555359 AAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCC 194555418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2398 AAGGCAGGCAGATCACGAGGTCAAGAGATCTAGACCATCCTGGCCAACATGGGGAAACCC 2457

194555419 TGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAG 194555478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2458 TGTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGGGTGTGGTGGTGTGCACCTGTAATCCCAG 2517

194555479 CTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 194555538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2518 CTACTCAGGAGGATGAGGCAGGAGAATTGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTGCAGTGAG 2577

194555539 CAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAA 194555598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2578 CAGAGACCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGAGACAGAGCAAGACTTTGTCTCAAAGGAAA 2637

194555599 ACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 194555650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2638 ACAAACAAAAAAAAAGGAGCATGAACTGGATTTCAGCTCCTACTTGCTCCAT 2689

EXCISED REGION

194556285 CACTACAGCCTGGACGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 194556344
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2694 CACTACAGCCTGGATGACAGAATGAGACTCTGTCTCAAAAAATAAAAATAACAATAAAAA 2753

194556345 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 194556404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2754 TAGAATAATGTCTAAAATGTGAGAATCAGCAGCATTCACTTCCAGGAAGCATCACAGGAA 2813

194556405 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 194556464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2814 TCTGTGGCAGCCTGGTTGGTTATTCCAGACTCACAGGGCCCAGGAGAAAGAAAGGCTTGA 2873

194556465 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 194556524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2874 TGGGAACGGACGCCATGCCCACTTATGAAATGCTGGCTGCTTTTAACATCTGCAAGCACT 2933

194556525 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 194556584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2934 CAGGCTAGTTTGGAGGGGGGCTGTCTCCCGGCCCCTACCTCCAACTCTTAACCCCCACGC 2993

194556585 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 194556644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2994 AACCCACTTTCAGAGCTGTCTTCAGGCAAACTGCAAATGTGAGAGACTGATAAACATGTT 3053

194556645 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 194556704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3054 TCTAGGTCTGGCCTCCCAGGGTGCTTTTCTGTAATCAAAGCCTCAAGCTCCCAGAAGGAA 3113

194556705 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 194556764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3114 ATTCTGCCTGGGGTAAAGAGTTGTTAGAGGAAGGCTCTGTGGAAGGCAGGCTATCAGAGA 3173

194556765 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 194556824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3174 CTGGGTTCATTTTAATAATCCAGAGATGGATTATTATAGCCTTAATTATTCATATGAACC 3233

194556825 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 194556884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3234 TTGACAACCCAGAGACACCCTTGCAATGACAGCACTGTAAAGAATTCATTCGTTTAACAA 3293

194556885 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 194556944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3294 ATGCTCACCATGCAGCCTCTCCTACAGGTAGCAGCAAATACCAAGTTGGAAAAGGCCAAG 3353

194556945 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 194557004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3354 TCCCTGCCCTCCAACTCACAGCCCAGTGGAGACGTGGTTCTCAATAGTTGTAAAGCAAAG 3413

194557005 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 194557064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3414 CAGAGTTAGGTGAGTGAGATGAGAGAGAGAAAACAAAGACGTCTGAGGCACCACGTGGGT 3473

194557065 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGTAGCA----TTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 194557120
          ||||||||||||||||||||||||||        ||||||||||||||||||||||||||
     3474 TGAGTAAGAAGGCTTCATGGAAAGGT----GGCGTTTGTGATAGCTCCTGAGAAGTCGGT 3529

194557121 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 194557180
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3530 AGCATTTCTGCAGGCTTGGGAGAGAGAGGAGGCCATTCCAAGCCAAGGAGACAGTCTAGG 3589

194557181 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 194557240
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3590 CAAACACAATGCATCAGGGAAGCTTAAGGCGTGTGGAGGGAGCAGAGACAGGCTGGCTGC 3649

194557241 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCC 194557276
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3650 ATGGTGGGTATAAGAAGCCCAGTGGAGGGAGTTGCC 3685

Alignment time is 2.96237 s

