
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3824] =>      3824 nucs 'mol-32-1e7c-046506_3824'

Score:        3790
Aligned:      3823        nucs
Identic:      3820 (100%) nucs =>       595 (100%)      3225 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187734429,187735023] EXCISED REGION [187735025,187738252]
 second seq =>  [        1,      595] EXCISED REGION [      597,     3824]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [187735024,187735024]
 second seq =>         1 nucs [596,596]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187735023,187735023] to [187735024,187735024]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187734429 GTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTCCACCAGGCTAACTTTC 187734488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTCCACCAGGCTAACTTTC 60

187734489 CCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGGAGTCT 187734548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGGAGTCT 120

187734549 GGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATTACCAG 187734608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATTACCAG 180

187734609 TCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGTGCAG 187734668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGTGCAG 240

187734669 GGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTTTTGC 187734728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTTTTGC 300

187734729 TGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGT 187734788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGT 360

187734789 TATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTACAAC 187734848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTACAAC 420

187734849 ATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTT 187734908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTT 480

187734909 TATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTT 187734968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTT 540

187734969 CCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTC 187735023
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTC 595

EXCISED REGION

187735025 GTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACA 187735084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 GTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACA 656

187735085 AGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCT 187735144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 AGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCT 716

187735145 GCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGG 187735204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 GCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGG 776

187735205 ATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAA 187735264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 ATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAA 836

187735265 GTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTC 187735324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 GTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTC 896

187735325 TCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTC 187735384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTC 956

187735385 CTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCT 187735444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 CTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCT 1016

187735445 GACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTT 187735504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 GACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTT 1076

187735505 CCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACT 187735564
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     1077 CCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGCACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACT 1136

187735565 CTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCA 187735624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 CTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCA 1196

187735625 AAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTC 187735684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 AAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTC 1256

187735685 TATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTA 187735744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 TATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTA 1316

187735745 TTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATC 187735804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 TTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATC 1376

187735805 CTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGG 187735864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 CTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGG 1436

187735865 CATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACAT 187735924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 CATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACAT 1496

187735925 GGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTA 187735984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 GGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTA 1556

187735985 GGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGC 187736044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 GGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGC 1616

187736045 TGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGG 187736104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 TGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGG 1676

187736105 AAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTA 187736164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 AAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTA 1736

187736165 TGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTC 187736224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 TGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTC 1796

187736225 CTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATA 187736284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 CTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATA 1856

187736285 TTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTA 187736344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTA 1916

187736345 TATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATAT 187736404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 TATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATAT 1976

187736405 TTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAG 187736464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 TTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAG 2036

187736465 GAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTG 187736524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 GAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTG 2096

187736525 TCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCA 187736584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCA 2156

187736585 TCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCAC 187736644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 TCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCAC 2216

187736645 TCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACA 187736704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 TCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACA 2276

187736705 TTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACC 187736764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACC 2336

187736765 AGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAA 187736824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 AGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAA 2396

187736825 GAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCG 187736884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 GAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCG 2456

187736885 TAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAA 187736944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 TAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAA 2516

187736945 ACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAA 187737004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 ACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAA 2576

187737005 ATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCAC 187737064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 ATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCAC 2636

187737065 ATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTG 187737124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 ATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTG 2696

187737125 GCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGG 187737184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 GCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGG 2756

187737185 CTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGT 187737244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 CTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGT 2816

187737245 TAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAA 187737304
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2817 TAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCACAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAA 2876

187737305 TTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTA 187737364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTA 2936

187737365 GAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGC 187737424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 GAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGC 2996

187737425 AGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGA 187737484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 AGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGA 3056

187737485 AGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATG 187737544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 AGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATG 3116

187737545 GCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATA 187737604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 GCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATA 3176

187737605 GTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACA 187737664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 GTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACA 3236

187737665 AAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCC 187737724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 AAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCC 3296

187737725 AATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCT 187737784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 AATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCT 3356

187737785 GTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTCA 187737844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 GTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTCA 3416

187737845 TCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCCC 187737904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCCC 3476

187737905 CAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGATAGATACATCA 187737964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 CAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGATAGATACATCA 3536

187737965 ATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTTC 187738024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 ATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTTC 3596

187738025 AGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCATGCTAGATTAGG 187738084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3597 AGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCATGCTGGATTAGG 3656

187738085 AGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCTTGTATTATGATG 187738144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 AGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCTTGTATTATGATG 3716

187738145 CCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCAGGCAAGAACTTC 187738204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 CCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCAGGCAAGAACTTC 3776

187738205 AGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTTTTATTATTATTATTATTATT 187738252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 AGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTTTTATTATTATTATTATTATT 3824

Alignment time is 3.09875 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     6640] =>      6640 nucs 'mol-32-1f00-098559_6640'

Score:        6505
Aligned:      6637        nucs
Identic:      6625 (100%) nucs =>      3619 (100%)      3006 (100%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187734611,187738232] EXCISED REGION [187738233,187741246]
 second seq =>  [        1,     3622] EXCISED REGION [     3626,     6640]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [3623,3625]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        22 nucs [3623,3644] to [3626,3647]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [187738231,187738232] to [187738233,187738234]
 second seq =>         2 nucs [3621,3622] to [3626,3627]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187734611 CGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGTGCAGGG 187734670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGTGCAGGG 60

187734671 AAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTTTTGCTG 187734730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTTTTGCTG 120

187734731 GCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTA 187734790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTA 180

187734791 TAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTACAACAT 187734850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTACAACAT 240

187734851 TACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTA 187734910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTA 300

187734911 TCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCC 187734970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCC 360

187734971 CTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTC 187735030
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      361 CTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCTGTACTC 420

187735031 ATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAG 187735090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAG 480

187735091 CTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTC 187735150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTC 540

187735151 TCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTA 187735210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTA 600

187735211 GTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAA 187735270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAA 660

187735271 GTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCC 187735330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCC 720

187735331 TTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTT 187735390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTT 780

187735391 GCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCTGACTGC 187735450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCTGACTGC 840

187735451 TGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTC 187735510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTC 900

187735511 CACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCAT 187735570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCAT 960

187735571 GGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTG 187735630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTG 1020

187735631 CAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTC 187735690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 CAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTC 1080

187735691 CCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCT 187735750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCT 1140

187735751 GTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAG 187735810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAG 1200

187735811 GGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGAC 187735870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGAC 1260

187735871 ACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCC 187735930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCC 1320

187735931 CTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGC 187735990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGC 1380

187735991 TGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTT 187736050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTT 1440

187736051 CTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGAC 187736110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGAC 1500

187736111 TTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAA 187736170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAA 1560

187736171 GATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCA 187736230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCA 1620

187736231 TCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAA 187736290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAA 1680

187736291 AATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCA 187736350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCA 1740

187736351 ACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCA 187736410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCA 1800

187736411 AGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAG 187736470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAG 1860

187736471 CTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGA 187736530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGA 1920

187736531 GCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGT 187736590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGT 1980

187736591 TTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATG 187736650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATG 2040

187736651 CTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCA 187736710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCA 2100

187736711 AAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCAC 187736770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 AAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCAC 2160

187736771 TCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGA 187736830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGA 2220

187736831 TGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAG 187736890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAG 2280

187736891 TTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGA 187736950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGA 2340

187736951 TTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATA 187737010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATA 2400

187737011 TAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAA 187737070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 TAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAA 2460

187737071 CAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGA 187737130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGA 2520

187737131 TTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGG 187737190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGG 2580

187737191 ATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAA 187737250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAA 2640

187737251 GAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGA 187737310
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCACAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGA 2700

187737311 GTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAA 187737370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAA 2760

187737371 TCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGA 187737430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGA 2820

187737431 ATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAG 187737490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAG 2880

187737491 GTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGT 187737550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 GTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGT 2940

187737551 ACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCA 187737610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCA 3000

187737611 GGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAA 187737670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAA 3060

187737671 ATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAA 187737730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 ATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAA 3120

187737731 TAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGT 187737790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGT 3180

187737791 TCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTT 187737850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTT 3240

187737851 TCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCA 187737910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCA 3300

187737911 AAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGATAGATACATCAATATAG 187737970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGATAGATACATCAATATAG 3360

187737971 ATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACA 187738030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 ATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACA 3420

187738031 TAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCATGCTAGATTAGGAGATTA 187738090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3421 TAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCATGCTGGATTAGGAGATTA 3480

187738091 GGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAG 187738150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 GGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAG 3540

187738151 TATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTT 187738210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTT 3600

187738211 TACCAACCCCAGCCTTTCTTTT 187738232
          ||||||||||||||||||||||
     3601 TACCAACCCCAGCCTTTCTTTT 3622

EXCISED REGION

187738233 TTATTATTATTATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGT 187738292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3626 TTATTATTATTATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGT 3685

187738293 TAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGAGCTGCACCCATTAACTCATCGTTTAG 187738352
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3686 TAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCATCGTTTAG 3745

187738353 CATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCGCTCCCCCCACCCCACATCAGTCCCCA 187738412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3746 CATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCGCTCCCCCCACCCCACATCAGTCCCCA 3805

187738413 GAGTGTGATGTTCCCCTTCCTGTGTCCACGTGTTCTCATTGTTCAATACCCATCTGTGAG 187738472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3806 GAGTGTGATGTTCCCCTTCCTGTGTCCACGTGTTCTCATTGTTCAATACCCATCTGTGAG 3865

187738473 TGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTTTGTCCTTGAGATATACTGAGAATCATGATTTCCAA 187738532
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3866 TGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTTTGTCCTTGCGATATACTGAGAATCATGATTTCCAA 3925

187738533 TTTCATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCACCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTC 187738592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3926 TTTCATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCACCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTC 3985

187738593 CATGGTCTTTCTATAGATTAAAGCATGGAAGCTCAAAAAGGAAATACAGGAGGTATAAAC 187738652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3986 CATGGTCTTTCTATAGATTAAAGCATGGAAGCTCAAAAAGGAAATACAGGAGGTATAAAC 4045

187738653 TCAGGTCTCTTACCTCCTTGTCCGATAATTTTCCCTGCTGCCCTACCATACCTGCCACAG 187738712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4046 TCAGGTCTCTTACCTCCTTGTCCGATAATTTTCCCTGCTGCCCTACCATACCTGCCACAG 4105

187738713 TACCTGACTCTATGTCTGTCACCAGAGAAAAGGGATCCTCGTACACATTTGTCAAGGAAC 187738772
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4106 TACCTGACTCTATGTCTGTCACCAGAGAAAAGGGATCCTCGTACACATTTGTCGAGGAAC 4165

187738773 TTCACTGTGGCAGACAGTGGTGATTAGGATTCTCTTCCCCACTGTAACTCACTAGCTCGC 187738832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4166 TTCACTGTGGCAGACAGTGGTGATTAGGATTCTCTTCCCCACTGTAACTCACTAGCTCGC 4225

187738833 TATGGTCAAACAGCTAGTCATTCATTCCCTGGCCTTTGGTGTCAGAACAGTGTCCAGCCT 187738892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4226 TATGGTCAAACAGCTAGTCATTCATTCCCTGGCCTTTGGTGTCAGAACAGTGTCCAGCCT 4285

187738893 TCCTTGCCTCTTAAAGTCTATGGACAGTCTGCTTCACCAGCACCACCCCCATGTCCTGGA 187738952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4286 TCCTTGCCTCTTAAAGTCTATGGACAGTCTGCTTCACCAGCACCACCCCCATGTCCTGGA 4345

187738953 CTAGCCATGGCTCTGAGCAGAGCCAGAGCAAAACACCACTGGCCGGCAAAGGGGTGTGGG 187739012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4346 CTAGCCATGGCTCTGAGCAGAGCCAGAGCAAAACACCACTGGCCGGCAAAGGGGTGTGGG 4405

187739013 AGCATGTGGGAGTCATGCCCAGCCTGGGCTGCTGGTCAGAAGTCTGTGCTTAGAAGAATA 187739072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4406 AGCATGTGGGAGTCATGCCCAGCCTGGGCTGCTGGTCAGAAGTCTGTGCTTAGAAGAATA 4465

187739073 GTTTTCTCCTTGTTATGGGCTGAATTGTGTCATCACTACCTTTTCCGCCCCCAAGAAAAA 187739132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4466 GTTTTCTCCTTGTTATGGGCTGAATTGTGTCATCACTACCTTTTCCGCCCCCAAGAAAAA 4525

187739133 GATGCTGAAGTTCTAACCCCCAGGACCTCAGAATGTAACCTTTCTTGGAGACTGGATCTT 187739192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4526 GATGCTGAAGTTCTAACCCCCAGGACCTCAGAATGTAACCTTTCTTGGAGACTGGATCTT 4585

187739193 TATAGAGGTAATCAAGTTAAAATGAGATGGTTAGGGTGAACTCTCTTCTAATACAGCTGG 187739252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4586 TATAGAGGTAATCAAGTTAAAATGAGATGGTTAGGGTGAACTCTCTTCTAATACAGCTGG 4645

187739253 TGTCCTTGTAAAAAGGAGAAATGTCGACACTGAGAGAAACACCCACACAGGGAGAATGCC 187739312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4646 TGTCCTTGTAAAAAGGAGAAATGTCGACACTGAGAGAAACACCCACACAGGGAGAATGCC 4705

187739313 ATGTGAAGATGAAGGCGGAGATCAGAGCAATGCTTCTTCAAGCCAAGAAACACCAAAGCG 187739372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4706 ATGTGAAGATGAAGGCGGAGATCAGAGCAATGCTTCTTCAAGCCAAGAAACACCAAAGCG 4765

187739373 TTATCAGCAAACCACCATGAGCTGGAAGAAAAGCCTGGAGCAGGTTCTCCTTCCCAGCCC 187739432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4766 TTATCAGCAAACCACCATGAGCTGGAAGAAAAGCCTGGAGCAGGTTCTCCTTCCCAGCCC 4825

187739433 TTAGAAGGAAGCAACCCTGCTGACGCCTTGGTTTCAGACTTCTGGCCTCCAGAACTGTGA 187739492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
     4826 TTAGAAGGAAGCAACCCTGCTGACGCCTTGGTTTCAGATTTCTGGCCTCCAGAACTATGA 4885

187739493 GATGATACATTTCCTTTGTTTACAATGGCCCCAGCAAACTAATAACACCTCTCTTTCTCA 187739552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4886 GATGATACATTTCCTTTGTTTACAATGGCCCCAGCAAACTAATAACACCTCTCTTTCTCA 4945

187739553 ACAGCTAGTGTTCAGAGGGTGCAGCACTGAGGAATCCAGAACTTAAAGTCAGAAAAATGT 187739612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4946 ACAGCTAGTGTTCAGAGGGTGCAGCACTGAGGAATCCAGAACTTAAAGTCAGAAAAATGT 5005

187739613 TTTAACTAGACTGGAGGCTCAGAAGCCATCTTTGATTGCTCCTCCCCAGATAAACACAGC 187739672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5006 TTTAACTAGACTGGAGGCTCAGAAGCCATCTTTGATTGCTCCTCCCCAGATAAACACAGC 5065

187739673 GGCAGGAGAGAAGGCATGAATACACAGGTAGAGTACATAGCCCCAACTTCCCACACAAAA 187739732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5066 GGCAGGAGAGAAGGCATGAATACACAGGTAGAGTACATAGCCCCAACTTCCCACACAAAA 5125

187739733 CACACTTTTGGCCGGCCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCCTTGTGGGAGGCAGAG 187739792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5126 CACACTTTTGGCCGGCCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCCTTGTGGGAGGCAGAG 5185

187739793 GCAGGCAGATAACCTGAAGTCAAGAATTCCAGACCAGCCTGGCCGACAAGGCGAAACCCT 187739852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5186 GCAGGCAGATAACCTGAAGTCAAGAATTCCAGACCAGCCTGGCCGACAAGGCGAAACCCT 5245

187739853 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGAGCATGGTGGCACATGCCTGTAATTCCAGC 187739912
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5246 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGAGCATGGTGACACATGCCTGTAATTCCAGC 5305

187739913 TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGC 187739972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5306 TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGC 5365

187739973 TGAGATCGTCCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAA 187740032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5366 TGAGATCGTCCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAA 5425

187740033 ACAAACAAAAACAAAACAAAACATTTTTTACAAATGTGGAATAAGTAAAATACTGCCCAA 187740092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5426 ACAAACAAAAACAAAACAAAACATTTTTTACAAATGTGGAATAAGTAAAATACTGCCCAA 5485

187740093 ACTACATAAAATCAGTTGTCTGTGATGCTATATGGTAAGCATAAGTCATGTACAATTTCT 187740152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5486 ACTACATAAAATCAGTTGTCTGTGATGCTATATGGTAAGCATAAGTCATGTACAATTTCT 5545

187740153 GCTACAATACAGTAAAGTACACATGTTTTTCACCAGGGTAAAATGTAAACATAAAGAAAA 187740212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5546 GCTACAATACAGTAAAGTACACATGTTTTTCACCAGGGTAAAATGTAAACATAAAGAAAA 5605

187740213 CCCCTGAGCACCTTGGCAAAAATAACACTTCATAAGACCTATTTTACCTCTTTTTTTCCT 187740272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5606 CCCCTGAGCACCTTGGCAAAAATAACACTTCATAAGACCTATTTTACCTCTTTTTTTCCT 5665

187740273 GGGTACACAGGATGGCTGTACTCCCCGCTCTCCTTTGCTGCTAGAATGGGCCACATAACT 187740332
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5666 GGGTACACAGGATGGCTGTACTTCCCGCTCTCCTTTGCTGCTAGAATGGGCCACATAACT 5725

187740333 GATTCTGGCCAATAGACTCTAAGTAGAACTGACCTAAGTGGAAGCAAAGAAGAGGGATGT 187740392
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5726 GATTCTGACCAATAGACTCTAAGTAGAACTGACCTAAGTGGAAGCAAAGAAGAGGGATGT 5785

187740393 GAGTCCTCCATCCTGCCTTTTCCCCTGTCACAGAGAAGTCATATGTCTAGATAGTGGAGA 187740452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5786 GAGTCCTCCATCCTGCCTTTTCCCCTGTCACAGAGAAGTCATATGTCTAGATAGTGGAGA 5845

187740453 TGCAAAATTAACCTAGACTGGACCCTTAAGTCACTGATTGAAAGGGACCTGCCCTGGAGA 187740512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5846 TGCAAAATTAACCTAGACTGGACCCTTAAGTCACTGATTGAAAGGGACCTGCCCTGGAGA 5905

187740513 ACCACCTGTCTGTCAGTGAAGGTTCTGATAGATAGAACTAGGTGTCTCTGAGATTAGGTG 187740572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5906 ACCACCTGTCTGTCAGTGAAGGTTCTGATAGATAGAACTAGGTGTCTCTGAGATTAGGTG 5965

187740573 AGAATGATCTACCCTAACACTAAGCCTAACCCAACTGATGATGGCCCCTTGTGATCTGTC 187740632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5966 AGAATGATCTACCCTAACACTAAGCCTAACCCAACTGATGATGGCCCCTTGTGATCTGTC 6025

187740633 TTTGACCAGTATACTATTCAAAAACAAGCCATTTGGCTGGGCACAGTGGCTCATGCCTGT 187740692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6026 TTTGACCAGTATACTATTCAAAAACAAGCCATTTGGCTGGGCACAGTGGCTCATGCCTGT 6085

187740693 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACC 187740752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6086 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACC 6145

187740753 ACCCTGGCCGGTATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAATATTAGCCGGGCGTG 187740812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6146 ACCCTGGCCGGTATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAATATTAGCCGGGCGTG 6205

187740813 GTGGCTCATGCCTGTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACC 187740872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6206 GTGGCTCATGCCTGTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACC 6265

187740873 CGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCATGATTGTGTCACTACACTCCAGCCTGGGCAACAG 187740932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6266 CGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCATGATTGTGTCACTACACTCCAGCCTGGGCAACAG 6325

187740933 AGAAAGACTCCATCTCC-AAAAAAAAAAAAAAAAGCCACTTGAAAATTATTAACTGGGCA 187740991
          ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6326 AGAAAGACTCCATCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAAGCCACTTGAAAATTATTAACTGGGCA 6385

187740992 TTTCTCATGTTTCTTGTTTGCTGAGCTCACAGCCATTTTGGTGGAGCAACCCACCAAACC 187741051
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6386 TTTCTCATGTTTCTTGTTTGCTGAGCTCACAGCCATTTTGGTGGAGCAACCCACCAAACC 6445

187741052 ATGTTCATGTGATTCCTGCCTGAAATCACAGACTCCAGTCCCCATGATAAAGGAACTGTA 187741111
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6446 ATGTTCATGTGATTCCTGCCTGAAATCACAGACTCCAGTCCCCATGATAAAGGAACTGTA 6505

187741112 TTCCTAACTAGTCCTCCCTTAAGGAAAAAGGATGCTTCCTACCTCACAAAGCAGACATTC 187741171
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6506 TTCCTAACTAGTCCTCCCTTAAGGAAAAAGGATGCTTCCTACCTCACAAAGCAGACATTC 6565

187741172 TCAGACCAGCCCTGATTGTTAGAAATGTATTTCTTCAGACCACCTAAAGCCAGACCCTCT 187741231
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6566 TCAGACCAGCCCTGATTGTTAGAAATGTATTTCTTCAGACCACCTAAAGCCAGACCCTCT 6625

187741232 GTCACTTTCACACAC 187741246
          |||||||||||||||
     6626 GTCACTTTCACACAC 6640

Alignment time is 5.41178 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     8089] =>      8089 nucs 'mol-32-1f58-239355_8089'

Score:        7902
Aligned:      8089        nucs
Identic:      8072 (100%) nucs =>       426 (100%)      7646 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187732398,187732824] EXCISED REGION [187734763,187742424]
 second seq =>  [        1,      427] EXCISED REGION [      428,     8089]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1938 nucs [187732825,187734762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        90 nucs [187732825,187732914] to [187734763,187734852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187732824,187732824] to [187734763,187734763]
 second seq =>         1 nucs [427,427] to [428,428]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187732398 CAGTGTATTCTTATTTTCATTTAGTTCAATGTATCTCACTTTGTTCTGTGTTTTGTTTTG 187732457
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
        1 CAGTGTATTCTTATTTTCATTTAGTTCAATGTATCTCACTTAGTTCTGTGTTTTGTTTTG 60

187732458 TTTTTTTTCACTCAGTGCAGTGTAATTTTCCTTGAGACTTTTTCTTTGACCCATAGATTA 187732517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTTTTCACTCAGTGCAGTGTAATTTTCCTTGAGACTTTTTCTTTGACCCATAGATTA 120

187732518 TGTAAACTGTTGGTTAGTTTCCCAGTGTTTTGAGATTTTCCTATTATCTTTCTGTTATTA 187732577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTAAACTGTTGGTTAGTTTCCCAGTGTTTTGAGATTTTCCTATTATCTTTCTGTTATTA 180

187732578 ATTTCTAATTTGATTTTATTGTGGTCAGAGAACACATTCCACATGATTTTAATTACTTGT 187732637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTCTAATTTGATTTTATTGTGGTCAGAGAACACATTCCACATGATTTTAATTACTTGT 240

187732638 TTATCTTATGGTCCAGAACATGCTCTACATTGGTATATATTCTGTGGTGCCTGAAAACAA 187732697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTATCTTATGGTCCAGAACATGCTCTACATTGGTATATATTCTGTGGTGCCTGAAAACAA 300

187732698 TGTGTATACAGCTGTGTTTTAGTGCAGTGTTATGTAAACGTGGATTAGATCCTGTTGGTT 187732757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGTGTATACAGCTGTGTTTTAGTGCAGTGTTATGTAAACGTGGATTAGATCCTGTTGGTT 360

187732758 GATAGTGGTGTTGAATTCTATATCCTTGATGATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTAT 187732817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GATAGTGGTGTTGAATTCTATATCCTTGATGATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTAT 420

187732818 TGAAAGT 187732824
          |||||||
      421 TGAAAGT 427

EXCISED REGION

187734763 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 187734822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      428 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 487

187734823 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 187734882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      488 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 547

187734883 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 187734942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      548 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 607

187734943 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 187735002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      608 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 667

187735003 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 187735062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      668 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 727

187735063 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 187735122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      728 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 787

187735123 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 187735182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      788 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 847

187735183 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 187735242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      848 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 907

187735243 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 187735302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      908 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 967

187735303 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 187735362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      968 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 1027

187735363 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 187735422
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||
     1028 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAGAACTCTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 1087

187735423 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 187735482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1088 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 1147

187735483 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 187735542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1148 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 1207

187735543 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 187735602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1208 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 1267

187735603 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 187735662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1268 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 1327

187735663 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCA 187735722
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1328 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTACTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTGTCTGTGGCA 1387

187735723 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 187735782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1388 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 1447

187735783 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 187735842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1448 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 1507

187735843 CTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 187735902
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1508 CTCCAAAAGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 1567

187735903 TTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTG 187735962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1568 TTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTG 1627

187735963 ACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGAT 187736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1628 ACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGAT 1687

187736023 TGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCT 187736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1688 TGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGAGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCT 1747

187736083 GTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTC 187736142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1748 GTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTC 1807

187736143 TTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGC 187736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1808 TTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGC 1867

187736203 TGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAG 187736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1868 TGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAG 1927

187736263 TGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTA 187736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1928 TGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTA 1987

187736323 TTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGA 187736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1988 TTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGA 2047

187736383 GATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAA 187736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2048 GATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAA 2107

187736443 GGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 187736502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2108 GGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 2167

187736503 AAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTT 187736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2168 AAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTT 2227

187736563 GTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAG 187736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2228 GTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAG 2287

187736623 TCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAA 187736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2288 TCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAA 2347

187736683 ACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTA 187736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2348 ACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTA 2407

187736743 ATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCC 187736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2408 ATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCC 2467

187736803 AGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGA 187736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2468 AGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGA 2527

187736863 GCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTG 187736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2528 GCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTG 2587

187736923 AGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAG 187736982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2588 AGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAG 2647

187736983 GAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGC 187737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2648 GAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGC 2707

187737043 TACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTC 187737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2708 TACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTC 2767

187737103 TTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTA 187737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2768 TTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTA 2827

187737163 TGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCA 187737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2828 TGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCA 2887

187737223 CATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCA 187737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2888 CATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCA 2947

187737283 GGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATC 187737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2948 GGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATC 3007

187737343 TGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGA 187737402
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     3008 TGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAATCCTCAGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGA 3067

187737403 CACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATT 187737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3068 CACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATT 3127

187737463 CAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTA 187737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3128 CAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTA 3187

187737523 AATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTA 187737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3188 AATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTA 3247

187737583 TTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTA 187737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3248 TTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTA 3307

187737643 TCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATT 187737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3308 TCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATT 3367

187737703 CAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTG 187737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3368 CAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTG 3427

187737763 TGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGT 187737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3428 TGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGT 3487

187737823 CCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGC 187737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3488 CCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGC 3547

187737883 TATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGAT 187737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3548 TATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGAT 3607

187737943 AGAGATTGAGATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCA 187738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3608 AGAGATTGAGATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCA 3667

187738003 TGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGT 187738062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3668 TGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTGCCTGT 3727

187738063 ACCGAAGTCATGCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGT 187738122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3728 ACCGAAGTCATGCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGT 3787

187738123 CATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAG 187738182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3788 CATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAG 3847

187738183 GCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTTTTATTATTAT 187738242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3848 GCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTTTTATTATTAT 3907

187738243 TATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTAGTTACATA 187738302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3908 TATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTAGTTACATA 3967

187738303 TGTATACATGTGCCATGTTGGTGAGCTGCACCCATTAACTCATCGTTTAGCATTAGGTAT 187738362
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3968 TGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCATCGTTTAGCATTAGGTAT 4027

187738363 ATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCGCTCCCCCCACCCCACATCAGTCCCCAGAGTGTGATG 187738422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4028 ATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCGCTCCCCCCACCCCACATCAGTCCCCAGAGTGTGATG 4087

187738423 TTCCCCTTCCTGTGTCCACGTGTTCTCATTGTTCAATACCCATCTGTGAGTGAGAACATG 187738482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4088 TTCCCCTTCCTGTGTCCACGTGTTCTCATTGTTCAATACCCATCTGTGAGTGAGAACATG 4147

187738483 CGGTGTTTGGTTTTTTGTCCTTGAGATATACTGAGAATCATGATTTCCAATTTCATCCAT 187738542
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4148 CGGTGTTTGGTTTTTTGTCCTTGCGATATACTGAGAATCATGATTTCCAATTTCATCCAT 4207

187738543 GTCCCTACAAAGGACATGAACTCACCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTCTTT 187738602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4208 GTCCCTACAAAGGACATGAACTCACCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTCCATGGTCTTT 4267

187738603 CTATAGATTAAAGCATGGAAGCTCAAAAAGGAAATACAGGAGGTATAAACTCAGGTCTCT 187738662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4268 CTATAGATTAAAGCATGGAAGCTCAAAAAGGAAATACAGGAGGTATAAACTCAGGTCTCT 4327

187738663 TACCTCCTTGTCCGATAATTTTCCCTGCTGCCCTACCATACCTGCCACAGTACCTGACTC 187738722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4328 TACCTCCTTGTCCGATAATTTTCCCTGCTGCCCTACCATACCTGCCACAGTACCTGACTC 4387

187738723 TATGTCTGTCACCAGAGAAAAGGGATCCTCGTACACATTTGTCAAGGAACTTCACTGTGG 187738782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4388 TATGTCTGTCACCAGAGAAAAGGGATCCTCGTACACATTTGTCAAGGAACTTCACTGTGG 4447

187738783 CAGACAGTGGTGATTAGGATTCTCTTCCCCACTGTAACTCACTAGCTCGCTATGGTCAAA 187738842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4448 CAGACAGTGGTGATTAGGATTCTCTTCCCCACTGTAACTCACTAGCTCGCTATGGTCAAA 4507

187738843 CAGCTAGTCATTCATTCCCTGGCCTTTGGTGTCAGAACAGTGTCCAGCCTTCCTTGCCTC 187738902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4508 CAGCTAGTCATTCATTCCCTGGCCTTTGGTGTCAGAACAGTGTCCAGCCTTCCTTGCCTC 4567

187738903 TTAAAGTCTATGGACAGTCTGCTTCACCAGCACCACCCCCATGTCCTGGACTAGCCATGG 187738962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4568 TTAAAGTCTATGGACAGTCTGCTTCACCAGCACCACCCCCATGTCCTGGACTAGCCATGG 4627

187738963 CTCTGAGCAGAGCCAGAGCAAAACACCACTGGCCGGCAAAGGGGTGTGGGAGCATGTGGG 187739022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4628 CTCTGAGCAGAGCCAGAGCAAAACACCACTGGCCGGCAAAGGGGTGTGGGAGCATGTGGG 4687

187739023 AGTCATGCCCAGCCTGGGCTGCTGGTCAGAAGTCTGTGCTTAGAAGAATAGTTTTCTCCT 187739082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4688 AGTCATGCCCAGCCTGGGCTGCTGGTCAGAAGTCTGTGCTTAGAAGAATAGTTTTCTCCT 4747

187739083 TGTTATGGGCTGAATTGTGTCATCACTACCTTTTCCGCCCCCAAGAAAAAGATGCTGAAG 187739142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4748 TGTTATGGGCTGAATTGTGTCATCACTACCTTTTCCGCCCCCAAGAAAAAGATGCTGAAG 4807

187739143 TTCTAACCCCCAGGACCTCAGAATGTAACCTTTCTTGGAGACTGGATCTTTATAGAGGTA 187739202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4808 TTCTAACCCCCAGGACCTCAGAATGTAACCTTTCTTGGAGACTGGATCTTTATAGAGGTA 4867

187739203 ATCAAGTTAAAATGAGATGGTTAGGGTGAACTCTCTTCTAATACAGCTGGTGTCCTTGTA 187739262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4868 ATCAAGTTAAAATGAGATGGTTAGGGTGAACTCTCTTCTAATACAGCTGGTGTCCTTGTA 4927

187739263 AAAAGGAGAAATGTCGACACTGAGAGAAACACCCACACAGGGAGAATGCCATGTGAAGAT 187739322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4928 AAAAGGAGAAATGTCGACACTGAGAGAAACACCCACACAGGGAGAATGCCATGTGAAGAT 4987

187739323 GAAGGCGGAGATCAGAGCAATGCTTCTTCAAGCCAAGAAACACCAAAGCGTTATCAGCAA 187739382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4988 GAAGGCGGAGATCAGAGCAATGCTTCTTCAAGCCAAGAAACACCAAAGCGTTATCAGCAA 5047

187739383 ACCACCATGAGCTGGAAGAAAAGCCTGGAGCAGGTTCTCCTTCCCAGCCCTTAGAAGGAA 187739442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5048 ACCACCATGAGCTGGAAGAAAAGCCTGGAGCAGGTTCTCCTTCCCAGCCCTTAGAAGGAA 5107

187739443 GCAACCCTGCTGACGCCTTGGTTTCAGACTTCTGGCCTCCAGAACTGTGAGATGATACAT 187739502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5108 GCAACCCTGCTGACGCCTTGGTTTCAGACTTCTGGCCTCCAGAACTGTGAGATGATACAT 5167

187739503 TTCCTTTGTTTACAATGGCCCCAGCAAACTAATAACACCTCTCTTTCTCAACAGCTAGTG 187739562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5168 TTCCTTTGTTTACAATGGCCCCAGCAAACTAATAACACCTCTCTTTCTCAACAGCTAGTG 5227

187739563 TTCAGAGGGTGCAGCACTGAGGAATCCAGAACTTAAAGTCAGAAAAATGTTTTAACTAGA 187739622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5228 TTCAGAGGGTGCAGCACTGAGGAATCCAGAACTTAAAGTCAGAAAAATGTTTTAACTAGA 5287

187739623 CTGGAGGCTCAGAAGCCATCTTTGATTGCTCCTCCCCAGATAAACACAGCGGCAGGAGAG 187739682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5288 CTGGAGGCTCAGAAGCCATCTTTGATTGCTCCTCCCCAGATAAACACAGCGGCAGGAGAG 5347

187739683 AAGGCATGAATACACAGGTAGAGTACATAGCCCCAACTTCCCACACAAAACACACTTTTG 187739742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5348 AAGGCATGAATACACAGGTAGAGTACATAGCCCCAACTTCCCACACAAAACACACTTTTG 5407

187739743 GCCGGCCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCCTTGTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGAT 187739802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5408 GCCGGCCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCCTTGTGGGAGGCAGAGGCAGGCAGAT 5467

187739803 AACCTGAAGTCAAGAATTCCAGACCAGCCTGGCCGACAAGGCGAAACCCTGTCTCTACTA 187739862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5468 AACCTGAAGTCAAGAATTCCAGACCAGCCTGGCCGACAAGGCGAAACCCTGTCTCTACTA 5527

187739863 AAAATACAAAAAATTAGCTGAGCATGGTGGCACATGCCTGTAATTCCAGCTACTCGGGAG 187739922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5528 AAAATACAAAAAATTAGCTGAGCATGGTGGCACATGCCTGTAATTCCAGCTACTCGGGAG 5587

187739923 GCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTC 187739982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5588 GCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCTGAGATCGTC 5647

187739983 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAAA 187740042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5648 CCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAAACAAACAAAA 5707

187740043 ACAAAACAAAACATTTTTTACAAATGTGGAATAAGTAAAATACTGCCCAAACTACATAAA 187740102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5708 ACAAAACAAAACATTTTTTACAAATGTGGAATAAGTAAAATACTGCCCAAACTACATAAA 5767

187740103 ATCAGTTGTCTGTGATGCTATATGGTAAGCATAAGTCATGTACAATTTCTGCTACAATAC 187740162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5768 ATCAGTTGTCTGTGATGCTATATGGTAAGCATAAGTCATGTACAATTTCTGCTACAATAC 5827

187740163 AGTAAAGTACACATGTTTTTCACCAGGGTAAAATGTAAACATAAAGAAAACCCCTGAGCA 187740222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5828 AGTAAAGTACACATGTTTTTCACCAGGGTAAAATGTAAACATAAAGAAAACCCCTGAGCA 5887

187740223 CCTTGGCAAAAATAACACTTCATAAGACCTATTTTACCTCTTTTTTTCCTGGGTACACAG 187740282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5888 CCTTGGCAAAAATAACACTTCATAAGACCTATTTTACCTCTTTTTTTCCTGGGTACACAG 5947

187740283 GATGGCTGTACTCCCCGCTCTCCTTTGCTGCTAGAATGGGCCACATAACTGATTCTGGCC 187740342
          ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5948 GATGGCTGTACTTCCCGCTCTCCTTTGCTGCTAGAATGGGCCACATAACTGATTCTGGCC 6007

187740343 AATAGACTCTAAGTAGAACTGACCTAAGTGGAAGCAAAGAAGAGGGATGTGAGTCCTCCA 187740402
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6008 AATAGACTCTAAGTAGAACTGACCTAAGTGGAAGCAAAGAAGAGGGATGTGAGTCCTCCA 6067

187740403 TCCTGCCTTTTCCCCTGTCACAGAGAAGTCATATGTCTAGATAGTGGAGATGCAAAATTA 187740462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6068 TCCTGCCTTTTCCCCTGTCACAGAGAAGTCATATGTCTAGATAGTGGAGATGCAAAATTA 6127

187740463 ACCTAGACTGGACCCTTAAGTCACTGATTGAAAGGGACCTGCCCTGGAGAACCACCTGTC 187740522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6128 ACCTAGACTGGACCCTTAAGTCACTGATTGAAAGGGACCTGCCCTGGAGAACCACCTGTC 6187

187740523 TGTCAGTGAAGGTTCTGATAGATAGAACTAGGTGTCTCTGAGATTAGGTGAGAATGATCT 187740582
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6188 CGTCAGTGAAGGTTCTGATAGATAGAACTAGGTGTCTCTGAGATTAGGTGAGAATGATCT 6247

187740583 ACCCTAACACTAAGCCTAACCCAACTGATGATGGCCCCTTGTGATCTGTCTTTGACCAGT 187740642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6248 ACCCTAACACTAAGCCTAACCCAACTGATGATGGCCCCTTGTGATCTGTCTTTGACCAGT 6307

187740643 ATACTATTCAAAAACAAGCCATTTGGCTGGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCA 187740702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6308 ATACTATTCAAAAACAAGCCATTTGGCTGGGCACAGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCA 6367

187740703 CTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCACCCTGGCCG 187740762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6368 CTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACCACCCTGGCCG 6427

187740763 GTATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAATATTAGCCGGGCGTGGTGGCTCATG 187740822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6428 GTATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAATATTAGCCGGGCGTGGTGGCTCATG 6487

187740823 CCTGTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGTGG 187740882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6488 CCTGTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGTGG 6547

187740883 AGGTTGCAGTGAGCCATGATTGTGTCACTACACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTC 187740942
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6548 AGGTTGCAGTGAGCCACGATTGTGTCACTACACTCCAGCCTGGGCAACAGAGAAAGACTC 6607

187740943 CATCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAGCCACTTGAAAATTATTAACTGGGCATTTCTCATGTT 187741002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6608 CATCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAGCCACTTGAAAATTATTAACTGGGCATTTCTCATGTT 6667

187741003 TCTTGTTTGCTGAGCTCACAGCCATTTTGGTGGAGCAACCCACCAAACCATGTTCATGTG 187741062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     6668 TCTTGTTTGCTGAGCTCACAGCCATTTTGGTGGAGCAACCCACCAAACTATGTTCATGTG 6727

187741063 ATTCCTGCCTGAAATCACAGACTCCAGTCCCCATGATAAAGGAACTGTATTCCTAACTAG 187741122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6728 ATTCCTGCCTGAAATCACAGACTCCAGTCCCCATGATAAAGGAACTGTATTCCTAACTAG 6787

187741123 TCCTCCCTTAAGGAAAAAGGATGCTTCCTACCTCACAAAGCAGACATTCTCAGACCAGCC 187741182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6788 TCCTCCCTTAAGGAAAAAGGATGCTTCCTACCTCACAAAGCAGACATTCTCAGACCAGCC 6847

187741183 CTGATTGTTAGAAATGTATTTCTTCAGACCACCTAAAGCCAGACCCTCTGTCACTTTCAC 187741242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6848 CTGATTGTTAGAAATGTATTTCTTCAGACCACCTAAAGCCAGACCCTCTGTCACTTTCAC 6907

187741243 ACACTCGCCTTCTCAGTTCTACCCTCTAGAGCTCGGGAATAACAAGAAACTAGTCCATAC 187741302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6908 ACACTCGCCTTCTCAGTTCTACCCTCTAGAGCTCGGGAATAACAAGAAACTAGTCCATAC 6967

187741303 TTCTCCCAAACTTCTTTCCCCTAGGCTGATGTTTTAATCAATGGAGATTTCTTTCCAGAA 187741362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6968 TTCTCCCAAACTTCTTTCCCCTAGGCTGATGTTTTAATCAATGGAGATTTCTTTCCAGAA 7027

187741363 GCCTTGTTAATCAAGCTATCACTAATCAGTCAAATCCCAATAGAATGCAGGCCAAAACAT 187741422
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7028 GCCTTGTTAATCAAGCTATCACTAATCAGTCAAATCCCAATAGAATGCAGGCCAAAACAT 7087

187741423 TGTCCCAATTATTTTGTTGTGTTAGGATTTTATAATATAAAAAATATATATTTTAAAGAA 187741482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7088 TGTCCCAATTATTTTGTTGTGTTAGGATTTTATAATATAAAAAATATATATTTTAAAGAA 7147

187741483 ATGGAATTCCACCTGGGGCCTAACATTATTTCTGTTTTAGAAAGAGTTGCATCATAGTAA 187741542
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     7148 ATGGAATTCCACCTGGGGCCTAACATTCTTTCTGTTTTAGAAAGAGTTGCATCATAGTAA 7207

187741543 TATTTGTTTTATTTTGCTTTATTGGGATTGAACCTGCCATTATGCTGCTGAGTGTCTCAG 187741602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7208 TATTTGTTTTATTTTGCTTTATTGGGATTGAACCTGCCATTATGCTGCTGAGTGTCTCAG 7267

187741603 TATGAATGTTGGAAATAGCTTTCTCTCACCATTAGCTCAGAAAAAATCTGTCAGCGAAAC 187741662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7268 TATGAATGTTGGAAATAGCTTTCTCTCACCATTAGCTCAGAAAAAATCTGTCAGCGAAAC 7327

187741663 ACAGGTAAATAGATTATGATTGTGTTGACAGCCCTTTTCATAAGCTAATGGGCTCTCTAA 187741722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7328 ACAGGTAAATAGATTATGATTGTGTTGACAGCCCTTTTCATAAGCTAATGGGCTCTCTAA 7387

187741723 CCCATTCGTGACTGCTGTCCCCCACAAGGTCTTATAAGCAGATTGCTCCAGAGTTTGCTG 187741782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7388 CCCATTCGTGACTGCTGTCCCCCACAAGGTCTTATAAGCAGATTGCTCCAGAGTTTGCTG 7447

187741783 AATTTGGCAAATTGATACACTGGGCTCATTTGATTTCCAATTTCTGTGAATGATTGTTAA 187741842
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     7448 AATTTGGCAAATTGATACACTGGGCTCATTTGATTTCCAATTTCTGTGAATGATTGTTAG 7507

187741843 GTAATTTAACAATACATGAGTGTGCTTAGAACGCCTTATGCAGCATTAGTTAGGGTAAAT 187741902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7508 GTAATTTAACAATACATGAGTGTGCTTAGAACGCCTTATGCAGCATTAGTTAGGGTAAAT 7567

187741903 AAGCAATTCAGTTGAGAACAGCAATGTTAACACGGGCAAAATCTACTATCTTCCTTTTTA 187741962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7568 AAGCAATTCAGTTGAGAACAGCAATGTTAACACGGGCAAAATCTACTATCTTCCTTTTTA 7627

187741963 GTAGTGGATTCCCTTCATGTTTTAAGTGGAAATTTTAAAATATGTGCATACATGTGAGAC 187742022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7628 GTAGTGGATTCCCTTCATGTTTTAAGTGGAAATTTTAAAATATGTGCATACATGTGAGAC 7687

187742023 TTCTGAGTCCTATCATTCATATTTGATCATTAGGGCTACTGCAGGAGAGGGAACATACAA 187742082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7688 TTCTGAGTCCTATCATTCATATTTGATCATTAGGGCTACTGCAGGAGAGGGAACATACAA 7747

187742083 TTTTACTTGAAAGACGAAAGAAATCCAGTCAACACAAGGGCTAAAACAAACCAAAAAAAA 187742142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7748 TTTTACTTGAAAGACGAAAGAAATCCAGTCAACACAAGGGCTAAAACAAACCAAAAAAAA 7807

187742143 AAAAAGTGAAACATTTCAACCATACTATAACAATATTTTTTTTTAACTTAAGTTCAAGTA 187742202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7808 AAAAAGTGAAACATTTCAACCATACTATAACAATATTTTTTTTTAACTTAAGTTCAAGTA 7867

187742203 TCTGGTATTGCCGTGGCTGGGGAAATACTTTTATATACTCCTTGTGGGAGTATAAACTGA 187742262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7868 TCTGGTATTGCCGTGGCTGGGGAAATACTTTTATATACTCCTTGTGGGAGTATAAACTGA 7927

187742263 GGTAATATTTCGGAAACACAATTTGGCAAATATTATCAAAAGCCTTTCAAGTGTGCATAC 187742322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7928 GGTAATATTTCGGAAACACAATTTGGCAAATATTATCAAAAGCCTTTCAAGTGTGCATAC 7987

187742323 GCTTTGACGCAGACCCACTGATTTCACTTGTAGGAATTTATTCTAAGGAGATAATACTGG 187742382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7988 GCTTTGACGCAGACCCACTGATTTCACTTGTAGGAATTTATTCTAAGGAGATAATACTGG 8047

187742383 GTATGTGCAAAGATTTATTTACGAAGATGTTTATTGCAACAG 187742424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     8048 GTATGTGCAAAGATTTATTTACGAAGATGTTTATTGCAACAG 8089

Alignment time is 6.51083 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2029] =>      2029 nucs 'mol-32-220d-016057_2029'

Score:        1909
Aligned:      2030        nucs
Identic:      2019 ( 99%) nucs =>       885 ( 99%)      1134 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187731935,187732824] EXCISED REGION [187734763,187735902]
 second seq =>  [        1,      889] EXCISED REGION [      890,     2029]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1938 nucs [187732825,187734762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        90 nucs [187732825,187732914] to [187734763,187734852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187732824,187732824] to [187734763,187734763]
 second seq =>         1 nucs [889,889] to [890,890]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187731935 ATTTTATTTGTCAAATTTTTGTGTGGAGAGTTGTTCATAGTATTCCCTTATTATTCTTTT 187731994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
        1 ATTTTATTTGTCAAATTTTTGTGTGGAGAGTTGTTCATAGTATTCCCTTACTATTCTTTT 60

187731995 AGTGATTCAGTCTGTGATGATATCCTCTGTTTTTTTTCCTGCTATTAATAAGTTGTTTTC 187732054
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGTGATTCAGTCTGTGATGATATCCTCTGTTTTTTTTCCTGCTATTAATAAGTTGTTTTC 120

187732055 CTTCTCTTTCTCTCCATCTCTCCATTTCTATCTCACTCTCTTGCACTTTGATAGAGGTTT 187732114
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTTCTCTTTCTCTCCATCTCTCCATTTCTATCTCACTCTCTTGCACTTTGATAGAGGTTT 180

187732115 ATCAATTTTATTGATCTTTCCAAAGAACAAGCTCTTTGTTTCATTGATTTTTCTATTGTG 187732174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATCAATTTTATTGATCTTTCCAAAGAACAAGCTCTTTGTTTCATTGATTTTTCTATTGTG 240

187732175 TTGTAGTTTTCTATGTCATTGGTTTCTGTTATCTTTATTATTTCTTTCCTTCTGCTTACT 187732234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGTAGTTTTCTATGTCATTGGTTTCTGTTATCTTTATTATTTCTTTCCTTCTGCTTACT 300

187732235 TTGAGTTTATTTTGCTTTACTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGTTGAGGCAGGAACTTGCAT 187732294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
      301 TTGAGTTTATTTTGCTTTACTTTTCTTTTTTTTTTTTTT-GTTGAGGCAGGAACTTGCAT 359

187732295 GATTGACCTGAGACTTTTTACTAATATAAGCATTTAGTACTATAAATCAATCTCTCTCTC 187732354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 GATTGACCTGAGACTTTTTACTAATATAAGCATTTAGTACTATAAATCAATCTCTCTCTC 419

187732355 TCTCTCTCCCCCAGGACTTCTTTAGTTGTATCCCACATATTTGCAGTGTATTCTTATTTT 187732414
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
      420 TCTCTCTCCCCCAGCACTTCTTTAGTTGTATCACACATATTTGCAGTGTATTCTTATTTT 479

187732415 CATTTAGTTCAATGTATCTCACTTTGTTCTGTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTCACTCAGTG 187732474
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 CATTTAGTTCAATGTATCTCACTTAGTTCTGTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTCACTCAGTG 539

187732475 CAGTGTAATTTTCCTTGAGACTTTTTCTTTGACCCATAGATTATGTAAACTGTTGGTTAG 187732534
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 CAGTGTAATTTTCCTTGAGACTTTTTCTTTGACCCATAGATTATGTAAACTGTTGGTTAG 599

187732535 TTTCCCAGTGTTTTGAGATTTTCCTATTATCTTTCTGTTATTAATTTCTAATTTGATTTT 187732594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TTTCCCAGTGTTTTGAGATTTTCCTATTATCTTTCTGTTATTAATTTCTAATTTGATTTT 659

187732595 ATTGTGGTCAGAGAACACATTCCACATGATTTTAATTACTTGTTTATCTTATGGTCCAGA 187732654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 ATTGTGGTCAGAGAACACATTCCACATGATTTTAATTACTTGTTTATCTTATGGTCCAGA 719

187732655 ACATGCTCTACATTGGTATATATTCTGTGGTGCCTGAAAACAATGTGTATACAGCTGTGT 187732714
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 ACATGCTCTACATTGGTATATATTCTGTGGTGCCTGAAAACAATGTGTATACAGCTGTGT 779

187732715 TTTAGTGCAGTGTTATGTAAACGTGGATTAGATCCTGTTGGTTGATAGTGGTGTTGAATT 187732774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TTTAGTGCAGTGTTATGTAAACGTGGATTAGATCCTGTTGGTTGATAGTGGTGTTGAATT 839

187732775 CTATATCCTTGATGATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTATTGAAAGT 187732824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 CTATATCCTTGATGATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTATTGAAAGT 889

EXCISED REGION

187734763 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 187734822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      890 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 949

187734823 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 187734882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      950 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 1009

187734883 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 187734942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1010 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 1069

187734943 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 187735002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1070 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 1129

187735003 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 187735062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1130 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 1189

187735063 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 187735122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1190 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 1249

187735123 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 187735182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1250 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 1309

187735183 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 187735242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1310 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 1369

187735243 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 187735302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1370 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 1429

187735303 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 187735362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1430 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 1489

187735363 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 187735422
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||
     1490 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAGAACTCTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 1549

187735423 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 187735482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1550 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 1609

187735483 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 187735542
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1610 ACCTCTTTAATCTCCTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 1669

187735543 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 187735602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1670 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 1729

187735603 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 187735662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1730 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 1789

187735663 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCA 187735722
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1790 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTACTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTGTCTGTGGCA 1849

187735723 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 187735782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1850 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 1909

187735783 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 187735842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1910 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 1969

187735843 CTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 187735902
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1970 CTCCAAAAGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 2029

Alignment time is 1.65913 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2128] =>      2128 nucs 'mol-32-2874-093375_2128'

Score:        2041
Aligned:      2063        nucs
Identic:      2061 (100%) nucs =>        10 (100%)      2051 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187724361,187724370] EXCISED REGION [187733891,187735943]
 second seq =>  [       13,       22] EXCISED REGION [       76,     2128]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      9520 nucs [187724371,187733890]
 second seq =>        53 nucs [23,75]
ALTERNATIVE REGION(S): 1
 first  seq =>         1 nucs [187734352,187734352]
 second seq =>         1 nucs [537,537]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [21,23] to [74,76]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187724370,187724370] to [187733891,187733891]
 second seq =>         1 nucs [22,22] to [76,76]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187724371,187724371] to [187733890,187733890]
 second seq =>         1 nucs [23,23] to [75,75]

187724361 AAGCAATTTA 187724370
          ||||||||||
       13 AAGCAATTTA 22

EXCISED REGION

187733891 ATATTTTTGCTGGATATAGGATTCTGGATTGACAGTTGTTTTCTTTCAAAACTTGAAAAA 187733950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       76 ATATTTTTGCTGGATATAGGATTCTGGATTGACAGTTGTTTTCTTTCAAAACTTGAAAAA 135

187733951 TATTAGTGCTACTTCCTTCTAGCCTATGTGGTGTCTGATGAGAAATCTACATCTTTTAAA 187734010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      136 TATTAGTGCTACTTCCTTCTAGCCTATGTGGTGTCTGATGAGAAATCTACATCTTTTAAA 195

187734011 TTGCTTTTCTCCTATAGGGAAGGTATCATTTTTCTCTTGCTGCTTTCAAATGATTTTCTT 187734070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      196 TTGCTTTTCTCCTATAGGGAAGGTATCATTTTTCTCTTGCTGCTTTCAAATGATTTTCTT 255

187734071 TGTCTTTAGTTTTCAGAAGTTTGACTATGGTATGTCTTGGTATGAATTTATTGTGAGTCT 187734130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      256 TGTCTTTAGTTTTCAGAAGTTTGACTATGGTATGTCTTGGTATGAATTTATTGTGAGTCT 315

187734131 ATTTCCTTTGAGGCTTAGCCAATTTTGTGAATCTGTCTTTTGCCAAATCTGAGAAGTTTT 187734190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      316 ATTTCCTTTGAGGCTTAGCCAATTTTGTGAATCTGTCTTTTGCCAAATCTGAGAAGTTTT 375

187734191 CAGCTGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGACACTATTTTTTCAGACAAAGGGGTGTCAC 187734250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      376 CAGCTGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGACACTATTTTTTCAGACAAAGGGGTGTCAC 435

187734251 TTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTTTACATAT 187734310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      436 TTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTTTACATAT 495

187734311 GAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAATTCTAGCTCTCAATAGGCC 187734370
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
      496 GAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAACTCTAGCTCTCAATAGGCC 555

187734371 TGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCATTGCTGTTTCCCATATTGT 187734430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      556 TGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCATTGCTGTTTCCCATATTGT 615

187734431 CTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTCCACCAGGCTAACTTTCCC 187734490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      616 CTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTCCACCAGGCTAACTTTCCC 675

187734491 ACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGGAGTCTGG 187734550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      676 ACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGGAGTCTGG 735

187734551 GCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATTACCAGTC 187734610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      736 GCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATTACCAGTC 795

187734611 CGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGTGCAGGG 187734670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      796 CGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGTGCAGGG 855

187734671 AAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTTTTGCTG 187734730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      856 AAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTTTTGCTG 915

187734731 GCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTA 187734790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      916 GCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTA 975

187734791 TAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTACAACAT 187734850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      976 TAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTACAACAT 1035

187734851 TACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTA 187734910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1036 TACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTA 1095

187734911 TCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCC 187734970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1096 TCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCC 1155

187734971 CTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTC 187735030
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1156 CTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCTGTACTC 1215

187735031 ATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAG 187735090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1216 ATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAG 1275

187735091 CTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTC 187735150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1276 CTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTC 1335

187735151 TCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTA 187735210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1336 TCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTA 1395

187735211 GTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAA 187735270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1396 GTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAA 1455

187735271 GTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCC 187735330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1456 GTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCC 1515

187735331 TTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTT 187735390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1516 TTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTT 1575

187735391 GCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCTGACTGC 187735450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1576 GCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCTGACTGC 1635

187735451 TGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTC 187735510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1636 TGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTC 1695

187735511 CACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCAT 187735570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1696 CACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCAT 1755

187735571 GGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTG 187735630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1756 GGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTG 1815

187735631 CAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTC 187735690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1816 CAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTC 1875

187735691 CCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCT 187735750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1876 CCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCT 1935

187735751 GTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAG 187735810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1936 GTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAG 1995

187735811 GGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGAC 187735870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1996 GGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGAC 2055

187735871 ACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCC 187735930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2056 ACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCC 2115

187735931 CTACATGATAGTC 187735943
          |||||||||||||
     2116 CTACATGATAGTC 2128

Alignment time is 1.71864 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3289] =>      3289 nucs 'mol-32-2b13-025041_3289'

Score:        3277
Aligned:      3288        nucs
Identic:      3287 (100%) nucs =>       258 (100%)      3029 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187734766,187735023] EXCISED REGION [187735025,187738054]
 second seq =>  [        1,      258] EXCISED REGION [      260,     3289]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [187735024,187735024]
 second seq =>         1 nucs [259,259]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187735023,187735023] to [187735024,187735024]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187734766 TTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGT 187734825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGT 60

187734826 TCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATA 187734885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATA 120

187734886 TCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAA 187734945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAA 180

187734946 AGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTT 187735005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTT 240

187735006 TGCTGAGGCTTTTCTGTC 187735023
          ||||||||||||||||||
      241 TGCTGAGGCTTTTCTGTC 258

EXCISED REGION

187735025 GTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACA 187735084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      260 GTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACA 319

187735085 AGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCT 187735144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      320 AGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCT 379

187735145 GCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGG 187735204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      380 GCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGG 439

187735205 ATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAA 187735264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      440 ATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAA 499

187735265 GTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTC 187735324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      500 GTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTC 559

187735325 TCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTC 187735384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      560 TCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTC 619

187735385 CTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCT 187735444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      620 CTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCT 679

187735445 GACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTT 187735504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      680 GACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTT 739

187735505 CCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACT 187735564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      740 CCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACT 799

187735565 CTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCA 187735624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      800 CTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCA 859

187735625 AAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTC 187735684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      860 AAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTC 919

187735685 TATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTA 187735744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      920 TATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTA 979

187735745 TTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATC 187735804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      980 TTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATC 1039

187735805 CTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGG 187735864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1040 CTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGG 1099

187735865 CATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACAT 187735924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1100 CATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACAT 1159

187735925 GGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTA 187735984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1160 GGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTA 1219

187735985 GGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGC 187736044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1220 GGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGC 1279

187736045 TGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGG 187736104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1280 TGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGG 1339

187736105 AAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTA 187736164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1340 AAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTA 1399

187736165 TGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTC 187736224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1400 TGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTC 1459

187736225 CTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATA 187736284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1460 CTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATA 1519

187736285 TTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTA 187736344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1520 TTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTA 1579

187736345 TATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATAT 187736404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1580 TATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATAT 1639

187736405 TTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAG 187736464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1640 TTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAG 1699

187736465 GAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTG 187736524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1700 GAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTG 1759

187736525 TCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCA 187736584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1760 TCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCA 1819

187736585 TCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCAC 187736644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1820 TCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCAC 1879

187736645 TCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACA 187736704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1880 TCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACA 1939

187736705 TTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACC 187736764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1940 TTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACC 1999

187736765 AGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAA 187736824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2000 AGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAA 2059

187736825 GAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCG 187736884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2060 GAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCG 2119

187736885 TAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAA 187736944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2120 TAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAA 2179

187736945 ACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAA 187737004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2180 ACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAA 2239

187737005 ATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCAC 187737064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2240 ATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCAC 2299

187737065 ATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTG 187737124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2300 ATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTG 2359

187737125 GCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGG 187737184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2360 GCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGG 2419

187737185 CTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGT 187737244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2420 CTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGT 2479

187737245 TAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAA 187737304
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2480 TAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCACAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAA 2539

187737305 TTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTA 187737364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2540 TTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTA 2599

187737365 GAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGC 187737424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2600 GAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGC 2659

187737425 AGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGA 187737484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2660 AGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGA 2719

187737485 AGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATG 187737544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2720 AGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATG 2779

187737545 GCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATA 187737604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2780 GCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATA 2839

187737605 GTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACA 187737664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2840 GTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACA 2899

187737665 AAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCC 187737724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2900 AAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCC 2959

187737725 AATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCT 187737784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2960 AATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCT 3019

187737785 GTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTCA 187737844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3020 GTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTCA 3079

187737845 TCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCCC 187737904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3080 TCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCCC 3139

187737905 CAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGATAGATACATCA 187737964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3140 CAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGATAGATACATCA 3199

187737965 ATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTTC 187738024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3200 ATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTTC 3259

187738025 AGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTT 187738054
          ||||||||||||||||||||||||||||||
     3260 AGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTT 3289

Alignment time is 2.59774 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3673] =>      3673 nucs 'mol-32-2b4a-026826_3673'

Score:        3650
Aligned:      3672        nucs
Identic:      3670 (100%) nucs =>       481 (100%)      3189 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187734543,187735023] EXCISED REGION [187735025,187738215]
 second seq =>  [        1,      481] EXCISED REGION [      483,     3673]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [187735024,187735024]
 second seq =>         1 nucs [482,482]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187735023,187735023] to [187735024,187735024]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187734543 GAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGAT 187734602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGAT 60

187734603 TACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCA 187734662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCA 120

187734663 GTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGC 187734722
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGC 180

187734723 TTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAAC 187734782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAAC 240

187734783 TATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTT 187734842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTT 300

187734843 TACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGA 187734902
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGA 360

187734903 CCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCA 187734962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCA 420

187734963 TGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGT 187735022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGT 480

187735023 C 187735023
          |
      481 C 481

EXCISED REGION

187735025 GTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACA 187735084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      483 GTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACA 542

187735085 AGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCT 187735144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      543 AGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCT 602

187735145 GCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGG 187735204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      603 GCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGG 662

187735205 ATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAA 187735264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      663 ATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAA 722

187735265 GTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTC 187735324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 GTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTC 782

187735325 TCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTC 187735384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 TCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTC 842

187735385 CTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCT 187735444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 CTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCT 902

187735445 GACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTT 187735504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 GACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTT 962

187735505 CCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACT 187735564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 CCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACT 1022

187735565 CTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCA 187735624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 CTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCA 1082

187735625 AAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTC 187735684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 AAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTC 1142

187735685 TATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTA 187735744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 TATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTA 1202

187735745 TTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATC 187735804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 TTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATC 1262

187735805 CTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGG 187735864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 CTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGG 1322

187735865 CATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACAT 187735924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1323 CATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACAT 1382

187735925 GGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTA 187735984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 GGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTA 1442

187735985 GGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGC 187736044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 GGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGC 1502

187736045 TGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGG 187736104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 TGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGG 1562

187736105 AAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTA 187736164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1563 AAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTA 1622

187736165 TGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTC 187736224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 TGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTC 1682

187736225 CTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATA 187736284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 CTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATA 1742

187736285 TTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTA 187736344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 TTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTA 1802

187736345 TATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATAT 187736404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 TATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATAT 1862

187736405 TTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAG 187736464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 TTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAG 1922

187736465 GAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTG 187736524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 GAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTG 1982

187736525 TCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCA 187736584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 TCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCA 2042

187736585 TCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCAC 187736644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2043 TCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCAC 2102

187736645 TCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACA 187736704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 TCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACA 2162

187736705 TTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACC 187736764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 TTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACC 2222

187736765 AGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAA 187736824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 AGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAA 2282

187736825 GAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCG 187736884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 GAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCG 2342

187736885 TAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAA 187736944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2343 TAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAA 2402

187736945 ACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAA 187737004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2403 ACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAA 2462

187737005 ATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCAC 187737064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2463 ATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCAC 2522

187737065 ATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTG 187737124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2523 ATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTG 2582

187737125 GCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGG 187737184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2583 GCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGG 2642

187737185 CTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGT 187737244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2643 CTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGT 2702

187737245 TAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAA 187737304
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2703 TAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCACAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAA 2762

187737305 TTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTA 187737364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2763 TTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTA 2822

187737365 GAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGC 187737424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2823 GAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGC 2882

187737425 AGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGA 187737484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2883 AGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGA 2942

187737485 AGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATG 187737544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2943 AGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATG 3002

187737545 GCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATA 187737604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3003 GCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATA 3062

187737605 GTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACA 187737664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3063 GTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACA 3122

187737665 AAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCC 187737724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3123 AAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCC 3182

187737725 AATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCT 187737784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3183 AATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCT 3242

187737785 GTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTCA 187737844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3243 GTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTCA 3302

187737845 TCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCCC 187737904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3303 TCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCCC 3362

187737905 CAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGATAGATACATCA 187737964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3363 CAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGATAGATACATCA 3422

187737965 ATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTTC 187738024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3423 ATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTTC 3482

187738025 AGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCATGCTAGATTAGG 187738084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3483 AGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCATGCTGGATTAGG 3542

187738085 AGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCTTGTATTATGATG 187738144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3543 AGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCTTGTATTATGATG 3602

187738145 CCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCAGGCAAGAACTTC 187738204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3603 CCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCAGGCAAGAACTTC 3662

187738205 AGAGTTTACCA 187738215
          |||||||||||
     3663 AGAGTTTACCA 3673

Alignment time is 2.8989 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3927] =>      3927 nucs 'mol-32-2e15-194206_3927'

Score:        3893
Aligned:      3926        nucs
Identic:      3923 (100%) nucs =>       107 (100%)      3816 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187734245,187734351] EXCISED REGION [187734353,187738171]
 second seq =>  [        1,      107] EXCISED REGION [      109,     3927]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [187734352,187734352]
 second seq =>         1 nucs [108,108]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187734352,187734352] to [187734353,187734353]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187734245 TGTCACTTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTTT 187734304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGTCACTTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTTT 60

187734305 ACATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAA 187734351
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ACATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAA 107

EXCISED REGION

187734353 TCTAGCTCTCAATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCAT 187734412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      109 TCTAGCTCTCAATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCAT 168

187734413 TGCTGTTTCCCATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTC 187734472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      169 TGCTGTTTCCCATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTC 228

187734473 CACCAGGCTAACTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGG 187734532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      229 CACCAGGCTAACTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGG 288

187734533 GTCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAG 187734592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      289 GTCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAG 348

187734593 GGTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAA 187734652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      349 GGTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAA 408

187734653 TATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTT 187734712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      409 TATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTT 468

187734713 TCCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAA 187734772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      469 TCCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAA 528

187734773 AATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATT 187734832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      529 AATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATT 588

187734833 TCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTT 187734892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      589 TCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTT 648

187734893 GATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTC 187734952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      649 GATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTC 708

187734953 GGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAG 187735012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      709 GGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAG 768

187735013 GCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAAT 187735072
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      769 GCTTTTCTGTCTGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAAT 828

187735073 ATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACC 187735132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      829 ATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACC 888

187735133 CCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTA 187735192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      889 CCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTA 948

187735193 GAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCA 187735252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      949 GAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCA 1008

187735253 ATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCT 187735312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1009 ATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCT 1068

187735313 TACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGAC 187735372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1069 TACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGAC 1128

187735373 CATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATA 187735432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1129 CATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATA 1188

187735433 TGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAA 187735492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1189 TGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAA 1248

187735493 TCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGAT 187735552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1249 TCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGAT 1308

187735553 TCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTA 187735612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1309 TCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTA 1368

187735613 GGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACA 187735672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1369 GGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACA 1428

187735673 ACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGT 187735732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1429 ACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGT 1488

187735733 GTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTA 187735792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1489 GTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTA 1548

187735793 GATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGC 187735852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1549 GATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGC 1608

187735853 CTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTC 187735912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1609 CTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTC 1668

187735913 AGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATC 187735972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1669 AGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATC 1728

187735973 TTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCA 187736032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1729 TTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCA 1788

187736033 TCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCC 187736092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1789 TCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCC 1848

187736093 AGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACT 187736152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1849 AGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACT 1908

187736153 ACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAG 187736212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1909 ACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAG 1968

187736213 AAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTA 187736272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1969 AAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTA 2028

187736273 AAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTC 187736332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2029 AAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTC 2088

187736333 AGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCT 187736392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2089 AGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCT 2148

187736393 GGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGG 187736452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2149 GGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGG 2208

187736453 CTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCA 187736512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2209 CTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCA 2268

187736513 TTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTT 187736572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2269 TTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTT 2328

187736573 CTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTT 187736632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2329 CTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTT 2388

187736633 TCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCT 187736692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2389 TCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCT 2448

187736693 GCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCA 187736752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2449 GCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCA 2508

187736753 GATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCT 187736812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2509 GATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCT 2568

187736813 AAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCC 187736872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2569 AAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCC 2628

187736873 AGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCC 187736932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2629 AGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCC 2688

187736933 GTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAA 187736992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2689 GTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAA 2748

187736993 CGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACT 187737052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2749 CGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACT 2808

187737053 ATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGG 187737112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2809 ATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGG 2868

187737113 CCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGG 187737172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2869 CCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGG 2928

187737173 AAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAA 187737232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2929 AAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAA 2988

187737233 GCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCAGGTGAAGGGG 187737292
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2989 GCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCACAGGTGAAGGGG 3048

187737293 CAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTT 187737352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3049 CAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTT 3108

187737353 CCCTGACCATTAGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTT 187737412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3109 CCCTGACCATTAGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTT 3168

187737413 ATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTAT 187737472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3169 ATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTAT 3228

187737473 ATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGT 187737532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3229 ATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGT 3288

187737533 ATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGG 187737592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3289 ATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGG 3348

187737593 CTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGT 187737652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3349 CTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGT 3408

187737653 TCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGA 187737712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3409 TCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGA 3468

187737713 TTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATT 187737772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3469 TTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATT 3528

187737773 TGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAA 187737832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3529 TGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAA 3588

187737833 CGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAAT 187737892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3589 CGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAAT 3648

187737893 ATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAG 187737952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3649 ATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAG 3708

187737953 ATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAG 187738012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3709 ATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAG 3768

187738013 AGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCA 187738072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3769 AGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCA 3828

187738073 TGCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCT 187738132
          ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3829 TGCTGGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCT 3888

187738133 TGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACT 187738171
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3889 TGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACT 3927

Alignment time is 3.14772 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     4343] =>      4343 nucs 'mol-32-2f07-050924_4343'

Score:        4090
Aligned:      4193        nucs
Identic:      4182 (100%) nucs =>      4128 (100%)        54 ( 98%)
Gaps:            4 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187734251,187738385] EXCISED REGION [187738534,187738588]
 second seq =>  [        1,     4137] EXCISED REGION [     4289,     4343]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>       148 nucs [187738386,187738533]
 second seq =>       151 nucs [4138,4288]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4137,4137] to [4288,4288]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         1 nucs [4138,4138] to [4288,4288]

187734251 TTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTTTACATAT 187734310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTTTACATAT 60

187734311 GAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAATTCTAGCTCTCAATAGGCC 187734370
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
       61 GAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAACTCTAGCTCTCAATAGGCC 120

187734371 TGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCATTGCTGTTTCCCATATTGT 187734430
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCATTGCTGTTTCCCATATTGT 180

187734431 CTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTCCACCAGGCTAACTTTCCC 187734490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTCCACCAGGCTAACTTTCCC 240

187734491 ACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGGAGTCTGG 187734550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGGAGTCTGG 300

187734551 GCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATTACCAGTC 187734610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 GCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATTACCAGTC 360

187734611 CGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGTGCAGGG 187734670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGTGCAGGG 420

187734671 AAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTTTTGCTG 187734730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTTTTGCTG 480

187734731 GCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTA 187734790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTA 540

187734791 TAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTACAACAT 187734850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTACAACAT 600

187734851 TACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTA 187734910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTA 660

187734911 TCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCC 187734970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCC 720

187734971 CTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTC 187735030
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
      721 CTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCTGTACTC 780

187735031 ATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAG 187735090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAG 840

187735091 CTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTC 187735150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTC 900

187735151 TCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTA 187735210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTA 960

187735211 GTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAA 187735270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAA 1020

187735271 GTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCC 187735330
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCC 1080

187735331 TTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTT 187735390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTT 1140

187735391 GCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCTGACTGC 187735450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCTGACTGC 1200

187735451 TGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTC 187735510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTC 1260

187735511 CACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCAT 187735570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCAT 1320

187735571 GGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTG 187735630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTG 1380

187735631 CAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTC 187735690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTC 1440

187735691 CCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCT 187735750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCT 1500

187735751 GTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAG 187735810
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAG 1560

187735811 GGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGAC 187735870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGAC 1620

187735871 ACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCC 187735930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCC 1680

187735931 CTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGC 187735990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 CTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGC 1740

187735991 TGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTT 187736050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTT 1800

187736051 CTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGAC 187736110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGAC 1860

187736111 TTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAA 187736170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAA 1920

187736171 GATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCA 187736230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCA 1980

187736231 TCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAA 187736290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 TCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAA 2040

187736291 AATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCA 187736350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCA 2100

187736351 ACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCA 187736410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 ACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCA 2160

187736411 AGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAG 187736470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAG 2220

187736471 CTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGA 187736530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 CTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGA 2280

187736531 GCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGT 187736590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 GCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGT 2340

187736591 TTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATG 187736650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATG 2400

187736651 CTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCA 187736710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCA 2460

187736711 AAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCAC 187736770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 AAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCAC 2520

187736771 TCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGA 187736830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 TCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGA 2580

187736831 TGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAG 187736890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAG 2640

187736891 TTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGA 187736950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGA 2700

187736951 TTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATA 187737010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATA 2760

187737011 TAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAA 187737070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 TAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAA 2820

187737071 CAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGA 187737130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 CAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGA 2880

187737131 TTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGG 187737190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGG 2940

187737191 ATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAA 187737250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAA 3000

187737251 GAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGA 187737310
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCACAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGA 3060

187737311 GTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAA 187737370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAA 3120

187737371 TCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGA 187737430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGA 3180

187737431 ATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAG 187737490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAG 3240

187737491 GTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGT 187737550
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 GTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGT 3300

187737551 ACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCA 187737610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 ACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCA 3360

187737611 GGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAA 187737670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAA 3420

187737671 ATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAA 187737730
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 ATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAA 3480

187737731 TAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGT 187737790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGT 3540

187737791 TCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTT 187737850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTT 3600

187737851 TCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCA 187737910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 TCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCA 3660

187737911 AAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGATAGATACATCAATATAG 187737970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 AAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGATAGATACATCAATATAG 3720

187737971 ATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACA 187738030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 ATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACA 3780

187738031 TAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCATGCTAGATTAGGAGATTA 187738090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3781 TAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCATGCTGGATTAGGAGATTA 3840

187738091 GGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAG 187738150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAG 3900

187738151 TATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTT 187738210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 TATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTT 3960

187738211 TACCAACCCCAGCCTTTCTTTTTTATTATTATTATTATTATTAT---ACTTTAAGTTTTA 187738267
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||
     3961 TACCAACCCCAGCCTTTCTTTTTTATTATTATTATTATTATTATTATACTTTAAGTTTTA 4020

187738268 GGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGAG 187738327
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     4021 GGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTG 4080

187738328 CTGCACCCATTAACTCATCGTTTAGCATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCC 187738385
          |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 CTGCACCCATTAACTCATCGTTTA-CATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCC 4137

EXCISED REGION

187738534 TTCATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCACCATTTTTTATGGCTGCATAGT 187738588
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4289 TTCATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCATCATTTTTTATGGCTGCATAGT 4343

Alignment time is 3.49984 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3709] =>      3709 nucs 'mol-32-2fcd-010701_3709'

Score:        3621
Aligned:      3709        nucs
Identic:      3701 (100%) nucs =>       156 (100%)      3545 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187732669,187732824] EXCISED REGION [187734763,187738315]
 second seq =>  [        1,      156] EXCISED REGION [      157,     3709]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1938 nucs [187732825,187734762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        90 nucs [187732825,187732914] to [187734763,187734852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187732824,187732824] to [187734763,187734763]
 second seq =>         1 nucs [156,156] to [157,157]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187732669 GGTATATATTCTGTGGTGCCTGAAAACAATGTGTATACAGCTGTGTTTTAGTGCAGTGTT 187732728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GGTATATATTCTGTGGTGCCTGAAAACAATGTGTATACAGCTGTGTTTTAGTGCAGTGTT 60

187732729 ATGTAAACGTGGATTAGATCCTGTTGGTTGATAGTGGTGTTGAATTCTATATCCTTGATG 187732788
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATGTAAACGTGGATTAGATCCTGTTGGTTGATAGTGGTGTTGAATTCTATATCCTTGATG 120

187732789 ATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTATTGAAAGT 187732824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTATTGAAAGT 156

EXCISED REGION

187734763 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 187734822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      157 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 216

187734823 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 187734882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      217 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 276

187734883 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 187734942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      277 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 336

187734943 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 187735002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      337 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 396

187735003 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 187735062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      397 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 456

187735063 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 187735122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      457 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 516

187735123 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 187735182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      517 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 576

187735183 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 187735242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      577 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 636

187735243 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 187735302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      637 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 696

187735303 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 187735362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      697 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 756

187735363 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 187735422
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||
      757 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAGAACTCTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 816

187735423 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 187735482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      817 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 876

187735483 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 187735542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      877 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 936

187735543 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 187735602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      937 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 996

187735603 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 187735662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      997 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 1056

187735663 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCA 187735722
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1057 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTACTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTGTCTGTGGCA 1116

187735723 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 187735782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1117 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 1176

187735783 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 187735842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1177 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 1236

187735843 CTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 187735902
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1237 CTCCAAAAGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 1296

187735903 TTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTG 187735962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1297 TTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTG 1356

187735963 ACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGAT 187736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1357 ACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGAT 1416

187736023 TGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCT 187736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1417 TGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGAGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCT 1476

187736083 GTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTC 187736142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1477 GTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTC 1536

187736143 TTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGC 187736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1537 TTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGC 1596

187736203 TGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAG 187736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1597 TGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAG 1656

187736263 TGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTA 187736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1657 TGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTA 1716

187736323 TTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGA 187736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1717 TTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGA 1776

187736383 GATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAA 187736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1777 GATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAA 1836

187736443 GGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 187736502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1837 GGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 1896

187736503 AAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTT 187736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1897 AAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTT 1956

187736563 GTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAG 187736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1957 GTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAG 2016

187736623 TCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAA 187736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2017 TCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAA 2076

187736683 ACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTA 187736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2077 ACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTA 2136

187736743 ATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCC 187736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2137 ATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCC 2196

187736803 AGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGA 187736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2197 AGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGA 2256

187736863 GCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTG 187736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2257 GCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTG 2316

187736923 AGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAG 187736982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2317 AGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAG 2376

187736983 GAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGC 187737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2377 GAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGC 2436

187737043 TACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTC 187737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2437 TACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTC 2496

187737103 TTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTA 187737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2497 TTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTA 2556

187737163 TGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCA 187737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2557 TGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCA 2616

187737223 CATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCA 187737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2617 CATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCA 2676

187737283 GGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATC 187737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2677 GGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATC 2736

187737343 TGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGA 187737402
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2737 TGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAATCCTCAGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGA 2796

187737403 CACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATT 187737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2797 CACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATT 2856

187737463 CAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTA 187737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2857 CAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTA 2916

187737523 AATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTA 187737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2917 AATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTA 2976

187737583 TTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTA 187737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2977 TTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTA 3036

187737643 TCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATT 187737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3037 TCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATT 3096

187737703 CAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTG 187737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3097 CAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTG 3156

187737763 TGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGT 187737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3157 TGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGT 3216

187737823 CCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGC 187737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3217 CCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGC 3276

187737883 TATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGAT 187737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3277 TATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGAT 3336

187737943 AGAGATTGAGATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCA 187738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3337 AGAGATTGAGATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCA 3396

187738003 TGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGT 187738062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3397 TGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTGCCTGT 3456

187738063 ACCGAAGTCATGCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGT 187738122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3457 ACCGAAGTCATGCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGT 3516

187738123 CATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAG 187738182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3517 CATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAG 3576

187738183 GCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTTTTATTATTAT 187738242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3577 GCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTTTTATTATTAT 3636

187738243 TATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTAGTTACATA 187738302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3637 TATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTAGTTACATA 3696

187738303 TGTATACATGTGC 187738315
          |||||||||||||
     3697 TGTATACATGTGC 3709

Alignment time is 2.99884 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3592] =>      3592 nucs 'mol-32-2fcd-020402_3592'

Score:        3504
Aligned:      3592        nucs
Identic:      3584 (100%) nucs =>       128 (100%)      3456 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187732697,187732824] EXCISED REGION [187734763,187738226]
 second seq =>  [        1,      128] EXCISED REGION [      129,     3592]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1938 nucs [187732825,187734762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        90 nucs [187732825,187732914] to [187734763,187734852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187732824,187732824] to [187734763,187734763]
 second seq =>         1 nucs [128,128] to [129,129]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187732697 ATGTGTATACAGCTGTGTTTTAGTGCAGTGTTATGTAAACGTGGATTAGATCCTGTTGGT 187732756
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATGTGTATACAGCTGTGTTTTAGTGCAGTGTTATGTAAACGTGGATTAGATCCTGTTGGT 60

187732757 TGATAGTGGTGTTGAATTCTATATCCTTGATGATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTA 187732816
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGATAGTGGTGTTGAATTCTATATCCTTGATGATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTA 120

187732817 TTGAAAGT 187732824
          ||||||||
      121 TTGAAAGT 128

EXCISED REGION

187734763 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 187734822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      129 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 188

187734823 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 187734882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      189 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 248

187734883 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 187734942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      249 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 308

187734943 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 187735002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      309 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 368

187735003 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 187735062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      369 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 428

187735063 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 187735122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      429 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 488

187735123 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 187735182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      489 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 548

187735183 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 187735242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      549 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 608

187735243 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 187735302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      609 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 668

187735303 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 187735362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      669 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 728

187735363 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 187735422
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||
      729 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAGAACTCTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 788

187735423 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 187735482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      789 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 848

187735483 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 187735542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      849 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 908

187735543 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 187735602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      909 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 968

187735603 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 187735662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      969 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 1028

187735663 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCA 187735722
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1029 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTACTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTGTCTGTGGCA 1088

187735723 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 187735782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1089 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 1148

187735783 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 187735842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1149 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 1208

187735843 CTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 187735902
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1209 CTCCAAAAGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 1268

187735903 TTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTG 187735962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1269 TTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTG 1328

187735963 ACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGAT 187736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1329 ACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGAT 1388

187736023 TGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCT 187736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1389 TGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGAGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCT 1448

187736083 GTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTC 187736142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1449 GTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTC 1508

187736143 TTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGC 187736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1509 TTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGC 1568

187736203 TGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAG 187736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1569 TGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAG 1628

187736263 TGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTA 187736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1629 TGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTA 1688

187736323 TTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGA 187736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1689 TTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGA 1748

187736383 GATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAA 187736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1749 GATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAA 1808

187736443 GGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 187736502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1809 GGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 1868

187736503 AAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTT 187736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1869 AAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTT 1928

187736563 GTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAG 187736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1929 GTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAG 1988

187736623 TCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAA 187736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1989 TCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAA 2048

187736683 ACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTA 187736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2049 ACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTA 2108

187736743 ATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCC 187736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2109 ATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCC 2168

187736803 AGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGA 187736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2169 AGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGA 2228

187736863 GCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTG 187736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2229 GCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTG 2288

187736923 AGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAG 187736982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2289 AGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAG 2348

187736983 GAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGC 187737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2349 GAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGC 2408

187737043 TACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTC 187737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2409 TACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTC 2468

187737103 TTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTA 187737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2469 TTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTA 2528

187737163 TGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCA 187737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2529 TGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCA 2588

187737223 CATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCA 187737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2589 CATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCA 2648

187737283 GGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATC 187737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2649 GGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATC 2708

187737343 TGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGA 187737402
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2709 TGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAATCCTCAGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGA 2768

187737403 CACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATT 187737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2769 CACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATT 2828

187737463 CAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTA 187737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2829 CAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTA 2888

187737523 AATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTA 187737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2889 AATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTA 2948

187737583 TTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTA 187737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2949 TTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTA 3008

187737643 TCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATT 187737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3009 TCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATT 3068

187737703 CAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTG 187737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3069 CAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTG 3128

187737763 TGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGT 187737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3129 TGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGT 3188

187737823 CCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGC 187737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3189 CCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGC 3248

187737883 TATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGAT 187737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3249 TATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGAT 3308

187737943 AGAGATTGAGATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCA 187738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3309 AGAGATTGAGATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCA 3368

187738003 TGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGT 187738062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3369 TGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTGCCTGT 3428

187738063 ACCGAAGTCATGCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGT 187738122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3429 ACCGAAGTCATGCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGT 3488

187738123 CATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAG 187738182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3489 CATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAG 3548

187738183 GCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTT 187738226
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3549 GCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTT 3592

Alignment time is 2.86332 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2166] =>      2166 nucs 'mol-32-2fcd-182374_2166'

Score:        2165
Aligned:      2165        nucs
Identic:      2165 (100%) nucs =>       652 (100%)      1513 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187734372,187735023] EXCISED REGION [187735025,187736537]
 second seq =>  [        1,      652] EXCISED REGION [      654,     2166]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [187735024,187735024]
 second seq =>         1 nucs [653,653]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187735023,187735023] to [187735024,187735024]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187734372 GCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCATTGCTGTTTCCCATATTGTC 187734431
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCATTGCTGTTTCCCATATTGTC 60

187734432 TCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTCCACCAGGCTAACTTTCCCA 187734491
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTCCACCAGGCTAACTTTCCCA 120

187734492 CCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGGAGTCTGGG 187734551
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGGAGTCTGGG 180

187734552 CTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATTACCAGTCC 187734611
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 CTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATTACCAGTCC 240

187734612 GCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGTGCAGGGA 187734671
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGTGCAGGGA 300

187734672 AGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTTTTGCTGG 187734731
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTTTTGCTGG 360

187734732 CATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTAT 187734791
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTAT 420

187734792 AGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATT 187734851
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 AGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATT 480

187734852 ACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTAT 187734911
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 ACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTAT 540

187734912 CACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCC 187734971
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 CACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCC 600

187734972 TTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTC 187735023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTC 652

EXCISED REGION

187735025 GTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACA 187735084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      654 GTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACA 713

187735085 AGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCT 187735144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      714 AGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCT 773

187735145 GCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGG 187735204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      774 GCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGG 833

187735205 ATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAA 187735264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      834 ATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAA 893

187735265 GTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTC 187735324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      894 GTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTC 953

187735325 TCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTC 187735384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      954 TCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTC 1013

187735385 CTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCT 187735444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1014 CTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCT 1073

187735445 GACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTT 187735504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1074 GACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTT 1133

187735505 CCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACT 187735564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1134 CCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACT 1193

187735565 CTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCA 187735624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1194 CTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCA 1253

187735625 AAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTC 187735684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1254 AAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTC 1313

187735685 TATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTA 187735744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1314 TATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTA 1373

187735745 TTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATC 187735804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1374 TTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATC 1433

187735805 CTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGG 187735864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1434 CTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGG 1493

187735865 CATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACAT 187735924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1494 CATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACAT 1553

187735925 GGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTA 187735984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1554 GGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTA 1613

187735985 GGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGC 187736044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1614 GGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGC 1673

187736045 TGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGG 187736104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1674 TGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGG 1733

187736105 AAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTA 187736164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1734 AAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTA 1793

187736165 TGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTC 187736224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1794 TGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTC 1853

187736225 CTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATA 187736284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1854 CTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATA 1913

187736285 TTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTA 187736344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1914 TTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTA 1973

187736345 TATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATAT 187736404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1974 TATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATAT 2033

187736405 TTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAG 187736464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2034 TTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAG 2093

187736465 GAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTG 187736524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2094 GAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTG 2153

187736525 TCAAGAGCCACTC 187736537
          |||||||||||||
     2154 TCAAGAGCCACTC 2166

Alignment time is 1.77794 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     4903] =>      4903 nucs 'mol-32-2fee-191694_4903'

Score:        4834
Aligned:      4900        nucs
Identic:      4894 (100%) nucs =>      4763 (100%)       131 ( 99%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187733465,187738232] EXCISED REGION [187738233,187738364]
 second seq =>  [        1,     4768] EXCISED REGION [     4772,     4903]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [4769,4771]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        22 nucs [4769,4790] to [4772,4793]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [187738231,187738232] to [187738233,187738234]
 second seq =>         2 nucs [4767,4768] to [4772,4773]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187733465 TAATTTTTTCTGTTTGAGCGAAGTATAGAAACCTTACTCATCTTTACTTCCCTTTATCCT 187733524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TAATTTTTTCTGTTTGAGCGAAGTATAGAAACCTTACTCATCTTTACTTCCCTTTATCCT 60

187733525 TCCCTATTTTAATCCAAATGTCTTAAATATTTTCTGTACATACATTTGAGACCATGTCAG 187733584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
       61 TCCCTATTTTAATCCAAATGTCTTAAATATTTTCTGTACATACATTTGGGACCATGTCAG 120

187733585 ACAACGTTATGCTTTGCGTAATGTTAAAACAAAGTGTAATGTTGATATGGTTTGCTATAT 187733644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACAACGTTATGCTTTGCGTAATGTTAAAACAAAGTGTAATGTTGATATGGTTTGCTATAT 180

187733645 TTTGCTTCAACAATCAAGCATAATTTGGAAAACTCAAAAGAAGAAAAAAGGTCTTTCGCA 187733704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTGCTTCAACAATCAAGCATAATTTGGAAAACTCAAAAGAAGAAAAAAGGTCTTTCGCA 240

187733705 TTTGCCCATACTTTTCCTTACTATATTCTTTCTTCCTTCCTTATATAGTAAGGTTTCTTC 187733764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTGCCCATACTTTTCCTTACTATATTCTTTCTTCCTTCCTTATATAGTAAGGTTTCTTC 300

187733765 TTTTACCCTTTCTTTCTGTTCAAAGTACATCCATTCATTATCCTTTTAGGGACATTCTGC 187733824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTTACCCTTTCTTTCTGTTCAAAGTACATCCATTCATTATCCTTTTAGGGACATTCTGC 360

187733825 TGGTGACAAATCCTCTTAGTTTTTCTTCATTTTAGAATGTCTTGATTTCCCCTTCACTCC 187733884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGGTGACAAATCCTCTTAGTTTTTCTTCATTTTAGAATGTCTTGATTTCCCCTTCACTCC 420

187733885 TAAAGGATATTTTTGCTGGATATAGGATTCTGGATTGACAGTTGTTTTCTTTCAAAACTT 187733944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TAAAGGATATTTTTGCTGGATATAGGATTCTGGATTGACAGTTGTTTTCTTTCAAAACTT 480

187733945 GAAAAATATTAGTGCTACTTCCTTCTAGCCTATGTGGTGTCTGATGAGAAATCTACATCT 187734004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAAAAATATTAGTGCTACTTCCTTCTAGCCTATGTGGTGTCTGATGAGAAATCTACATCT 540

187734005 TTTAAATTGCTTTTCTCCTATAGGGAAGGTATCATTTTTCTCTTGCTGCTTTCAAATGAT 187734064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTTAAATTGCTTTTCTCCTATAGGGAAGGTATCATTTTTCTCTTGCTGCTTTCAAATGAT 600

187734065 TTTCTTTGTCTTTAGTTTTCAGAAGTTTGACTATGGTATGTCTTGGTATGAATTTATTGT 187734124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTTCTTTGTCTTTAGTTTTCAGAAGTTTGACTATGGTATGTCTTGGTATGAATTTATTGT 660

187734125 GAGTCTATTTCCTTTGAGGCTTAGCCAATTTTGTGAATCTGTCTTTTGCCAAATCTGAGA 187734184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTCTATTTCCTTTGAGGCTTAGCCAATTTTGTGAATCTGTCTTTTGCCAAATCTGAGA 720

187734185 AGTTTTCAGCTGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGACACTATTTTTTCAGACAAAGGGG 187734244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGTTTTCAGCTGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGACACTATTTTTTCAGACAAAGGGG 780

187734245 TGTCACTTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTTT 187734304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGTCACTTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTTT 840

187734305 ACATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAATTCTAGCTCTCAA 187734364
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      841 ACATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAACTCTAGCTCTCAA 900

187734365 TAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCATTGCTGTTTCCCA 187734424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCATTGCTGTTTCCCA 960

187734425 TATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTCCACCAGGCTAAC 187734484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTCCACCAGGCTAAC 1020

187734485 TTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGGA 187734544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGGA 1080

187734545 GTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATTA 187734604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATTA 1140

187734605 CCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGT 187734664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGT 1200

187734665 GCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTT 187734724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTT 1260

187734725 TTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTA 187734784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTA 1320

187734785 TAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTA 187734844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTA 1380

187734845 CAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACC 187734904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACC 1440

187734905 CCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATG 187734964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATG 1500

187734965 CTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCC 187735024
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     1501 CTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCT 1560

187735025 GTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACA 187735084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACA 1620

187735085 AGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCT 187735144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCT 1680

187735145 GCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGG 187735204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGG 1740

187735205 ATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAA 187735264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 ATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAA 1800

187735265 GTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTC 187735324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTC 1860

187735325 TCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTC 187735384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTC 1920

187735385 CTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCT 187735444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCT 1980

187735445 GACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTT 187735504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTT 2040

187735505 CCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACT 187735564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACT 2100

187735565 CTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCA 187735624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 CTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCA 2160

187735625 AAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTC 187735684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 AAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTC 2220

187735685 TATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTA 187735744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTA 2280

187735745 TTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATC 187735804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATC 2340

187735805 CTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGG 187735864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGG 2400

187735865 CATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACAT 187735924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACAT 2460

187735925 GGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTA 187735984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 GGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTA 2520

187735985 GGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGC 187736044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGC 2580

187736045 TGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGG 187736104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 TGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGG 2640

187736105 AAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTA 187736164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTA 2700

187736165 TGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTC 187736224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTC 2760

187736225 CTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATA 187736284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 CTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATA 2820

187736285 TTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTA 187736344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTA 2880

187736345 TATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATAT 187736404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 TATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATAT 2940

187736405 TTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAG 187736464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 TTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAG 3000

187736465 GAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTG 187736524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTG 3060

187736525 TCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCA 187736584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 TCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCA 3120

187736585 TCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCAC 187736644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 TCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCAC 3180

187736645 TCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACA 187736704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACA 3240

187736705 TTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACC 187736764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACC 3300

187736765 AGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAA 187736824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 AGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAA 3360

187736825 GAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCG 187736884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCG 3420

187736885 TAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAA 187736944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 TAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAA 3480

187736945 ACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAA 187737004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 ACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAA 3540

187737005 ATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCAC 187737064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCAC 3600

187737065 ATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTG 187737124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 ATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTG 3660

187737125 GCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGG 187737184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGG 3720

187737185 CTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGT 187737244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 CTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGT 3780

187737245 TAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAA 187737304
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     3781 TAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCACAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAA 3840

187737305 TTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTA 187737364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTA 3900

187737365 GAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGC 187737424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGC 3960

187737425 AGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGA 187737484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 AGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGA 4020

187737485 AGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATG 187737544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 AGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATG 4080

187737545 GCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATA 187737604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 GCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATA 4140

187737605 GTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACA 187737664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 GTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACA 4200

187737665 AAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCC 187737724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCC 4260

187737725 AATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCT 187737784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4261 AATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCT 4320

187737785 GTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTCA 187737844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTCA 4380

187737845 TCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCCC 187737904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 TCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCCC 4440

187737905 CAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGATAGATACATCA 187737964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGATAGATACATCA 4500

187737965 ATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTTC 187738024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4501 ATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTTC 4560

187738025 AGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCATGCTAGATTAGG 187738084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     4561 AGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCATGCTGGATTAGG 4620

187738085 AGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCTTGTATTATGATG 187738144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4621 AGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCTTGTATTATGATG 4680

187738145 CCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCAGGCAAGAACTTC 187738204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4681 CCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCAGGCAAGAACTTC 4740

187738205 AGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTT 187738232
          ||||||||||||||||||||||||||||
     4741 AGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTT 4768

EXCISED REGION

187738233 TTATTATTATTATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGT 187738292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4772 TTATTATTATTATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGT 4831

187738293 TAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGAGCTGCACCCATTAACTCATCGTTTAG 187738352
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4832 TAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCATCGTTTAG 4891

187738353 CATTAGGTATAT 187738364
          ||||||||||||
     4892 CATTAGGTATAT 4903

Alignment time is 3.94871 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3779] =>      3779 nucs 'mol-32-2fee-248456_3779'

Score:        3685
Aligned:      3773        nucs
Identic:      3765 (100%) nucs =>       210 (100%)      3555 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187732615,187732824] EXCISED REGION [187734763,187738325]
 second seq =>  [        1,      210] EXCISED REGION [      211,     3773]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1938 nucs [187732825,187734762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        90 nucs [187732825,187732914] to [187734763,187734852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187732824,187732824] to [187734763,187734763]
 second seq =>         1 nucs [210,210] to [211,211]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187732615 TCCACATGATTTTAATTACTTGTTTATCTTATGGTCCAGAACATGCTCTACATTGGTATA 187732674
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCACATGATTTTAATTACTTGTTTATCTTATGGTCCAGAACATGCTCTACATTGGTATA 60

187732675 TATTCTGTGGTGCCTGAAAACAATGTGTATACAGCTGTGTTTTAGTGCAGTGTTATGTAA 187732734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTCTGTGGTGCCTGAAAACAATGTGTATACAGCTGTGTTTTAGTGCAGTGTTATGTAA 120

187732735 ACGTGGATTAGATCCTGTTGGTTGATAGTGGTGTTGAATTCTATATCCTTGATGATTTTC 187732794
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 ACGTGGATTAGATCCTGTTGGTTGATAGTGGTGTTGAATTCTATATCCTTGATGATTTTC 180

187732795 TGTCTAGTTGTTCCATTAATTATTGAAAGT 187732824
          ||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTCTAGTTGTTCCATTAATTATTGAAAGT 210

EXCISED REGION

187734763 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 187734822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      211 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 270

187734823 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 187734882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      271 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 330

187734883 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 187734942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      331 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 390

187734943 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 187735002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      391 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 450

187735003 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 187735062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      451 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 510

187735063 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 187735122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      511 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 570

187735123 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 187735182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      571 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 630

187735183 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 187735242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      631 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 690

187735243 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 187735302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      691 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 750

187735303 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 187735362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      751 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 810

187735363 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 187735422
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||
      811 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAGAACTCTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 870

187735423 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 187735482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      871 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 930

187735483 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 187735542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      931 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 990

187735543 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 187735602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      991 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 1050

187735603 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 187735662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1051 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 1110

187735663 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCA 187735722
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1111 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTACTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTGTCTGTGGCA 1170

187735723 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 187735782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1171 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 1230

187735783 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 187735842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1231 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 1290

187735843 CTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 187735902
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1291 CTCCAAAAGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 1350

187735903 TTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTG 187735962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1351 TTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTG 1410

187735963 ACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGAT 187736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1411 ACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGAT 1470

187736023 TGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCT 187736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1471 TGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGAGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCT 1530

187736083 GTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTC 187736142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1531 GTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTC 1590

187736143 TTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGC 187736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1591 TTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGC 1650

187736203 TGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAG 187736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1651 TGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAG 1710

187736263 TGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTA 187736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1711 TGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTA 1770

187736323 TTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGA 187736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1771 TTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGA 1830

187736383 GATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAA 187736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1831 GATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAA 1890

187736443 GGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 187736502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1891 GGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 1950

187736503 AAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTT 187736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1951 AAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTT 2010

187736563 GTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAG 187736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2011 GTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAG 2070

187736623 TCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAA 187736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2071 TCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAA 2130

187736683 ACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTA 187736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2131 ACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTA 2190

187736743 ATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCC 187736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2191 ATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCC 2250

187736803 AGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGA 187736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2251 AGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGA 2310

187736863 GCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTG 187736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2311 GCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTG 2370

187736923 AGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAG 187736982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2371 AGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAG 2430

187736983 GAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGC 187737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2431 GAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGC 2490

187737043 TACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTC 187737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2491 TACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTC 2550

187737103 TTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTA 187737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2551 TTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTA 2610

187737163 TGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCA 187737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2611 TGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCA 2670

187737223 CATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCA 187737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2671 CATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCA 2730

187737283 GGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATC 187737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2731 GGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATC 2790

187737343 TGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGA 187737402
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2791 TGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAATCCTCAGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGA 2850

187737403 CACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATT 187737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2851 CACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATT 2910

187737463 CAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTA 187737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2911 CAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTA 2970

187737523 AATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTA 187737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2971 AATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTA 3030

187737583 TTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTA 187737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3031 TTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTA 3090

187737643 TCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATT 187737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3091 TCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATT 3150

187737703 CAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTG 187737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3151 CAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTG 3210

187737763 TGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGT 187737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3211 TGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGT 3270

187737823 CCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGC 187737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3271 CCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGC 3330

187737883 TATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGAT 187737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3331 TATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGAT 3390

187737943 AGAGATTGAGATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCA 187738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3391 AGAGATTGAGATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCA 3450

187738003 TGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGT 187738062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3451 TGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTGCCTGT 3510

187738063 ACCGAAGTCATGCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGT 187738122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3511 ACCGAAGTCATGCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGT 3570

187738123 CATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAG 187738182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3571 CATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAG 3630

187738183 GCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTTTTATTATTAT 187738242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3631 GCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTTTTATTATTAT 3690

187738243 TATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTAGTTACATA 187738302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3691 TATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTAGTTACATA 3750

187738303 TGTATACATGTGCCATGTTGGTG 187738325
          |||||||||||||||||||||||
     3751 TGTATACATGTGCCATGTTGGTG 3773

Alignment time is 3.01751 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2288] =>      2288 nucs 'mol-32-2ff9-220076_2288'

Score:        2222
Aligned:      2288        nucs
Identic:      2282 (100%) nucs =>        51 (100%)      2231 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187732774,187732824] EXCISED REGION [187734763,187736999]
 second seq =>  [        1,       51] EXCISED REGION [       52,     2288]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1938 nucs [187732825,187734762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        90 nucs [187732825,187732914] to [187734763,187734852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187732824,187732824] to [187734763,187734763]
 second seq =>         1 nucs [51,51] to [52,52]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187732774 TCTATATCCTTGATGATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTATTGAAAGT 187732824
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCTATATCCTTGATGATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTATTGAAAGT 51

EXCISED REGION

187734763 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 187734822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       52 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 111

187734823 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 187734882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      112 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 171

187734883 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 187734942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      172 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 231

187734943 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 187735002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      232 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 291

187735003 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 187735062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      292 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 351

187735063 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 187735122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      352 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 411

187735123 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 187735182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      412 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 471

187735183 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 187735242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      472 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 531

187735243 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 187735302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      532 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 591

187735303 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 187735362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      592 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 651

187735363 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 187735422
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||
      652 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAGAACTCTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 711

187735423 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 187735482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      712 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 771

187735483 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 187735542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      772 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 831

187735543 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 187735602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      832 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 891

187735603 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 187735662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      892 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 951

187735663 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCA 187735722
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
      952 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTACTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTGTCTGTGGCA 1011

187735723 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 187735782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 1071

187735783 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 187735842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1072 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 1131

187735843 CTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 187735902
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 CTCCAAAAGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 1191

187735903 TTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTG 187735962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 TTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTG 1251

187735963 ACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGAT 187736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 ACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGAT 1311

187736023 TGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCT 187736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1312 TGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGAGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCT 1371

187736083 GTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTC 187736142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 GTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTC 1431

187736143 TTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGC 187736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 TTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGC 1491

187736203 TGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAG 187736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 TGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAG 1551

187736263 TGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTA 187736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 TGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTA 1611

187736323 TTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGA 187736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 TTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGA 1671

187736383 GATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAA 187736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 GATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAA 1731

187736443 GGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 187736502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 GGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 1791

187736503 AAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTT 187736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 AAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTT 1851

187736563 GTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAG 187736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 GTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAG 1911

187736623 TCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAA 187736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 TCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAA 1971

187736683 ACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTA 187736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 ACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTA 2031

187736743 ATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCC 187736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 ATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCC 2091

187736803 AGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGA 187736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 AGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGA 2151

187736863 GCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTG 187736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2152 GCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTG 2211

187736923 AGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAG 187736982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 AGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAG 2271

187736983 GAATAAGCAACGTGGTG 187736999
          |||||||||||||||||
     2272 GAATAAGCAACGTGGTG 2288

Alignment time is 1.88828 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3293] =>      3293 nucs 'mol-32-3004-163404_3293'

Score:        3281
Aligned:      3292        nucs
Identic:      3291 (100%) nucs =>       523 (100%)      2768 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187734501,187735023] EXCISED REGION [187735025,187737793]
 second seq =>  [        1,      523] EXCISED REGION [      525,     3293]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [187735024,187735024]
 second seq =>         1 nucs [524,524]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187735023,187735023] to [187735024,187735024]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187734501 TGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATG 187734560
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATG 60

187734561 TGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGG 187734620
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGG 120

187734621 AACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGA 187734680
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 AACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGA 180

187734681 GGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGA 187734740
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGA 240

187734741 GAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTC 187734800
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTC 300

187734801 TATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGG 187734860
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGG 360

187734861 TGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGT 187734920
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGT 420

187734921 TGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGAT 187734980
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGAT 480

187734981 CCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTC 187735023
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTC 523

EXCISED REGION

187735025 GTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACA 187735084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      525 GTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACA 584

187735085 AGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCT 187735144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      585 AGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCT 644

187735145 GCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGG 187735204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      645 GCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGG 704

187735205 ATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAA 187735264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      705 ATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAA 764

187735265 GTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTC 187735324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      765 GTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTC 824

187735325 TCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTC 187735384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      825 TCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTC 884

187735385 CTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCT 187735444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      885 CTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATCT 944

187735445 GACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTT 187735504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      945 GACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTT 1004

187735505 CCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACT 187735564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1005 CCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACT 1064

187735565 CTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCA 187735624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1065 CTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCA 1124

187735625 AAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTC 187735684
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1125 AAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTC 1184

187735685 TATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTA 187735744
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1185 TATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTA 1244

187735745 TTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATC 187735804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1245 TTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGATC 1304

187735805 CTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGG 187735864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1305 CTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGG 1364

187735865 CATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACAT 187735924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1365 CATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACAT 1424

187735925 GGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTA 187735984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1425 GGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTA 1484

187735985 GGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGC 187736044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1485 GGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGC 1544

187736045 TGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGG 187736104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1545 TGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGG 1604

187736105 AAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTA 187736164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1605 AAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTA 1664

187736165 TGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTC 187736224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1665 TGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTC 1724

187736225 CTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATA 187736284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1725 CTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATA 1784

187736285 TTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTA 187736344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1785 TTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTA 1844

187736345 TATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATAT 187736404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1845 TATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATAT 1904

187736405 TTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAG 187736464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1905 TTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAG 1964

187736465 GAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTG 187736524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1965 GAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTG 2024

187736525 TCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCA 187736584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2025 TCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCA 2084

187736585 TCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCAC 187736644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2085 TCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCAC 2144

187736645 TCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACA 187736704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2145 TCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACA 2204

187736705 TTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACC 187736764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2205 TTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACC 2264

187736765 AGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAA 187736824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2265 AGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAA 2324

187736825 GAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCG 187736884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2325 GAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCG 2384

187736885 TAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAA 187736944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2385 TAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAA 2444

187736945 ACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAA 187737004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2445 ACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAA 2504

187737005 ATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCAC 187737064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2505 ATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCAC 2564

187737065 ATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTG 187737124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2565 ATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTG 2624

187737125 GCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGG 187737184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2625 GCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGG 2684

187737185 CTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGT 187737244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2685 CTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGT 2744

187737245 TAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAA 187737304
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     2745 TAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCACAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAA 2804

187737305 TTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTA 187737364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2805 TTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTA 2864

187737365 GAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGC 187737424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2865 GAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGC 2924

187737425 AGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGA 187737484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2925 AGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGA 2984

187737485 AGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATG 187737544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2985 AGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATG 3044

187737545 GCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATA 187737604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3045 GCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATA 3104

187737605 GTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACA 187737664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3105 GTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACA 3164

187737665 AAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCC 187737724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3165 AAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCC 3224

187737725 AATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCT 187737784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3225 AATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCT 3284

187737785 GTCTGTTCC 187737793
          |||||||||
     3285 GTCTGTTCC 3293

Alignment time is 2.60092 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2257] =>      2257 nucs 'mol-32-303b-084584_2257'

Score:        2245
Aligned:      2256        nucs
Identic:      2255 (100%) nucs =>       106 (100%)      2149 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187734246,187734351] EXCISED REGION [187734353,187736502]
 second seq =>  [        1,      106] EXCISED REGION [      108,     2257]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [187734352,187734352]
 second seq =>         1 nucs [107,107]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187734352,187734352] to [187734353,187734353]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187734246 GTCACTTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTTTA 187734305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GTCACTTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTTTA 60

187734306 CATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAA 187734351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAA 106

EXCISED REGION

187734353 TCTAGCTCTCAATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCAT 187734412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      108 TCTAGCTCTCAATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCAT 167

187734413 TGCTGTTTCCCATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTC 187734472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      168 TGCTGTTTCCCATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTC 227

187734473 CACCAGGCTAACTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGG 187734532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      228 CACCAGGCTAACTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGG 287

187734533 GTCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAG 187734592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      288 GTCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAG 347

187734593 GGTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAA 187734652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      348 GGTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAA 407

187734653 TATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTT 187734712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      408 TATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTT 467

187734713 TCCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAA 187734772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      468 TCCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAA 527

187734773 AATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATT 187734832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      528 AATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATT 587

187734833 TCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTT 187734892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      588 TCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTT 647

187734893 GATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTC 187734952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      648 GATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTC 707

187734953 GGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAG 187735012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      708 GGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAG 767

187735013 GCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAAT 187735072
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      768 GCTTTTCTGTCTGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAAT 827

187735073 ATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACC 187735132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      828 ATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACC 887

187735133 CCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTA 187735192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      888 CCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTA 947

187735193 GAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCA 187735252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      948 GAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCA 1007

187735253 ATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCT 187735312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1008 ATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCT 1067

187735313 TACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGAC 187735372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1068 TACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGAC 1127

187735373 CATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATA 187735432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1128 CATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATA 1187

187735433 TGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAA 187735492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1188 TGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAA 1247

187735493 TCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGAT 187735552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1248 TCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGAT 1307

187735553 TCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTA 187735612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1308 TCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTA 1367

187735613 GGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACA 187735672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1368 GGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACA 1427

187735673 ACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGT 187735732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1428 ACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGT 1487

187735733 GTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTA 187735792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1488 GTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTA 1547

187735793 GATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGC 187735852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1548 GATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGC 1607

187735853 CTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTC 187735912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1608 CTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTC 1667

187735913 AGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATC 187735972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1668 AGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATC 1727

187735973 TTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCA 187736032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1728 TTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCA 1787

187736033 TCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCC 187736092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1788 TCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCC 1847

187736093 AGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACT 187736152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1848 AGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACT 1907

187736153 ACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAG 187736212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1908 ACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAG 1967

187736213 AAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTA 187736272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1968 AAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTA 2027

187736273 AAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTC 187736332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2028 AAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTC 2087

187736333 AGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCT 187736392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2088 AGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCT 2147

187736393 GGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGG 187736452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2148 GGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGG 2207

187736453 CTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 187736502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2208 CTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 2257

Alignment time is 1.7774 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     4587] =>      4587 nucs 'mol-32-30eb-026394_4587'

Score:        4518
Aligned:      4584        nucs
Identic:      4578 (100%) nucs =>      4464 (100%)       114 ( 99%)
Gaps:            1 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187733765,187738232] EXCISED REGION [187738233,187738347]
 second seq =>  [        1,     4469] EXCISED REGION [     4473,     4587]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [4470,4472]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        22 nucs [4470,4491] to [4473,4494]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [187738231,187738232] to [187738233,187738234]
 second seq =>         2 nucs [4468,4469] to [4473,4474]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187733765 TTTTACCCTTTCTTTCTGTTCAAAGTACATCCATTCATTATCCTTTTAGGGACATTCTGC 187733824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTACCCTTTCTTTCTGTTCAAAGTACATCCATTCATTATCCTTTTAGGGACATTCTGC 60

187733825 TGGTGACAAATCCTCTTAGTTTTTCTTCATTTTAGAATGTCTTGATTTCCCCTTCACTCC 187733884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGGTGACAAATCCTCTTAGTTTTTCTTCATTTTAGAATGTCTTGATTTCCCCTTCACTCC 120

187733885 TAAAGGATATTTTTGCTGGATATAGGATTCTGGATTGACAGTTGTTTTCTTTCAAAACTT 187733944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TAAAGGATATTTTTGCTGGATATAGGATTCTGGATTGACAGTTGTTTTCTTTCAAAACTT 180

187733945 GAAAAATATTAGTGCTACTTCCTTCTAGCCTATGTGGTGTCTGATGAGAAATCTACATCT 187734004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GAAAAATATTAGTGCTACTTCCTTCTAGCCTATGTGGTGTCTGATGAGAAATCTACATCT 240

187734005 TTTAAATTGCTTTTCTCCTATAGGGAAGGTATCATTTTTCTCTTGCTGCTTTCAAATGAT 187734064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTAAATTGCTTTTCTCCTATAGGGAAGGTATCATTTTTCTCTTGCTGCTTTCAAATGAT 300

187734065 TTTCTTTGTCTTTAGTTTTCAGAAGTTTGACTATGGTATGTCTTGGTATGAATTTATTGT 187734124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTTCTTTGTCTTTAGTTTTCAGAAGTTTGACTATGGTATGTCTTGGTATGAATTTATTGT 360

187734125 GAGTCTATTTCCTTTGAGGCTTAGCCAATTTTGTGAATCTGTCTTTTGCCAAATCTGAGA 187734184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GAGTCTATTTCCTTTGAGGCTTAGCCAATTTTGTGAATCTGTCTTTTGCCAAATCTGAGA 420

187734185 AGTTTTCAGCTGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT-GACACTATTTTTTCAGACAAAGGG 187734243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
      421 AGTTTTCAGCTGGCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGACACTATTTTTTCAGACAAAGGG 480

187734244 GTGTCACTTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTT 187734303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTGTCACTTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTT 540

187734304 TACATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAATTCTAGCTCTCA 187734363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
      541 TACATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAACTCTAGCTCTCA 600

187734364 ATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCATTGCTGTTTCCC 187734423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCATTGCTGTTTCCC 660

187734424 ATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTCCACCAGGCTAA 187734483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTCCACCAGGCTAA 720

187734484 CTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGG 187734543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGG 780

187734544 AGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATT 187734603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATT 840

187734604 ACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAG 187734663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAG 900

187734664 TGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCT 187734723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCT 960

187734724 TTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACT 187734783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 TTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACT 1020

187734784 ATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTT 187734843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTTCACATATTTT 1080

187734844 ACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGAC 187734903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGAC 1140

187734904 CCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCAT 187734963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 CCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCAT 1200

187734964 GCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTC 187735023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTC 1260

187735024 CGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACAC 187735083
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACAC 1320

187735084 AAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCC 187735143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCC 1380

187735144 TGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAG 187735203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAG 1440

187735204 GATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGA 187735263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGA 1500

187735264 AGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGT 187735323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGT 1560

187735324 CTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTT 187735383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACCATGCCATTTT 1620

187735384 CCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATC 187735443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 CCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATATGTAACATATC 1680

187735444 TGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCT 187735503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCT 1740

187735504 TCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAAC 187735563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAAC 1800

187735564 TCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCC 187735623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAGGACACCCCCC 1860

187735624 AAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTT 187735683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAACCTATCTTTT 1920

187735684 CTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCT 187735743
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCT 1980

187735744 ATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGAT 187735803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 ATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAGATTATAAGAT 2040

187735804 CCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAG 187735863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 CCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAG 2100

187735864 GCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACA 187735923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACA 2160

187735924 TGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTT 187735983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTT 2220

187735984 AGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAG 187736043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAG 2280

187736044 CTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGG 187736103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 CTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGG 2340

187736104 GAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATT 187736163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 GAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATT 2400

187736164 ATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCT 187736223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 ATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGAAATAACACCT 2460

187736224 CCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATAT 187736283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATAT 2520

187736284 ATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCT 187736343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCT 2580

187736344 ATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATA 187736403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 ATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATA 2640

187736404 TTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGA 187736463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 TTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGA 2700

187736464 GGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATT 187736523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATT 2760

187736524 GTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCC 187736583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCC 2820

187736584 ATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCA 187736643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCA 2880

187736644 CTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTAC 187736703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTGCACCATCTAC 2940

187736704 ATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCAC 187736763
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAGATACCTTCAC 3000

187736764 CAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAA 187736823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 CAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAA 3060

187736824 AGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTC 187736883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTC 3120

187736884 GTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAA 187736943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAA 3180

187736944 AACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATA 187737003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 AACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATA 3240

187737004 AATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCA 187737063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 AATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCA 3300

187737064 CATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCT 187737123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 CATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCT 3360

187737124 GGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTG 187737183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 GGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTG 3420

187737184 GCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTG 187737243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 GCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTG 3480

187737244 TTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAA 187737303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     3481 TTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCACAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAA 3540

187737304 ATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATT 187737363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 ATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATT 3600

187737364 AGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATG 187737423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 AGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTATCTCTTCATG 3660

187737424 CAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAG 187737483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 CAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATATCCAGCACAG 3720

187737484 AAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTAT 187737543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTATATTCACTAT 3780

187737544 GGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAAT 187737603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAAT 3840

187737604 AGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACAC 187737663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 AGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACAC 3900

187737664 AAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGC 187737723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 AAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGC 3960

187737724 CAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGC 187737783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 CAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGC 4020

187737784 TGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTC 187737843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4021 TGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTC 4080

187737844 ATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCC 187737903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4081 ATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCC 4140

187737904 CCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGATAGATACATC 187737963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4141 CCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGATAGATACATC 4200

187737964 AATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTT 187738023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4201 AATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTT 4260

187738024 CAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCATGCTAGATTAG 187738083
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4261 CAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCATGCTGGATTAG 4320

187738084 GAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCTTGTATTATGAT 187738143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4321 GAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCTTGTATTATGAT 4380

187738144 GCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCAGGCAAGAACTT 187738203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4381 GCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCAGGCAAGAACTT 4440

187738204 CAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTT 187738232
          |||||||||||||||||||||||||||||
     4441 CAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTT 4469

EXCISED REGION

187738233 TTATTATTATTATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGT 187738292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4473 TTATTATTATTATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGT 4532

187738293 TAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGAGCTGCACCCATTAACTCATCG 187738347
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     4533 TAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCATCG 4587

Alignment time is 3.54376 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     5968] =>      5968 nucs 'mol-32-310c-163230_5968'

Score:        4778
Aligned:      5021        nucs
Identic:      4994 ( 99%) nucs =>      3916 ( 99%)      1078 (100%)
Gaps:            8 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187728890,187732824] EXCISED REGION [187734763,187735844]
 second seq =>  [      952,     4886] EXCISED REGION [     4887,     5968]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1938 nucs [187732825,187734762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        90 nucs [187732825,187732914] to [187734763,187734852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187732824,187732824] to [187734763,187734763]
 second seq =>         1 nucs [4886,4886] to [4887,4887]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187728890 AAAAATCGCCGTTATTCTGTTCTTTTTCAAGGTGCACTGATTTCACAGTGTTCAAACACA 187728949
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||
      952 AAAAATCGCCGTTATTCTGTTCTTTTTCAAGGTGCACTGATTTCATAGTGTTCAAATACA 1011

187728950 CATGTTTTACAATCAATTTGTACAGTTAACACAATCATCATAGCGATCCTGAGGTGATGT 187729009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1012 CATGTTTTACAATCAATTTGTACAGTTAACACAATCATCATAGCGATCCTGAGGTGATGT 1071

187729010 ACATCCTCAGCTTACGAAGATAACAGGGTTAAGAGATTAAAGTAAGACAGGCATAAGAAA 187729069
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||
     1072 ACATCCTCAGCTTACGAAGATAACAGGGTTAACAGATTAAAGTAAGACAGGCGTAAGAAA 1131

187729070 TTACGAAAGTATTATTTGGGAACTAGTAAATGTCCATGAAGTCTTCACAATTTATGTTCT 187729129
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1132 TTATGAAAGTATTATTTGGGAACTAGTAAATGTCCATGAAGTCTTCACAATTTATGTTCT 1191

187729130 TCTGCCATGGCTCCAGCCAGTCCCTCCGTTTGGGGTCCCTGACTTCCCACAATACCACTG 187729189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1192 TCTGCCATGGCTCCAGCCAGTCCCTCCGTTTGGGGTCCCTGACTTCCCACAATACCACTG 1251

187729190 TTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTT----TGCTTTGTTTTTGAGACAGAGTCTCCCTCTCTC 187729245
          |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||
     1252 TTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTTGCTTTGTTTTTGAGACAGAGTCTCCCTCTCTC 1311

187729246 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGCGACCTCCACCTCTCAGGTTC 187729305
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1312 ACCCAGGCTGGAGTGCAGTGGCATGATCTCGGCTCACTGTGACCTCCACCTCTCAGGTTC 1371

187729306 AAGCAACTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAAGCGTGTGCCACCACAC 187729365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1372 AAGCAACTCTCCTGCCTCAGCCTCCCTAGTAGCTGGGACTACAAGCGTGTGCCACCACAC 1431

187729366 CCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCACGTTGGCCAGGCTGGTCT 187729425
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1432 CCGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGGGTTTCACCACGTTGGCCAGGCTGGTCT 1491

187729426 TGAACTCCTGACCTCAGGTCATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 187729485
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1492 TGAACTCCTGACCTCAGGTCATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG 1551

187729486 CATGAGCCACCATGCCTGGCCAATGTACCACTGTTTATTCACCCATGGAAGAACATCTTC 187729545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1552 CATGAGCCACCATGCCTGGCCAATGTACCACTGTTTATTCACCCATGGAAGAACATCTTC 1611

187729546 TGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTAGTATGAATGGAGCTGTTGTATGCTTTCACATACAGG 187729605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1612 TGGGTTGTTTCCAGTTTGGGGCTAGTATGAATGGAGCTGTTGTATGCTTTCACATACAGG 1671

187729606 ATTTTGCATGAGCACAAATCTTTATTTCTTTGAGATAAATAATCAAAAGTGCAATTGTTG 187729665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1672 ATTTTGCATGAGCACAAATCTTTATTTCTTTGAGATAAATAATCAAAAGTGCAATTGTTG 1731

187729666 GGATGTATGGTAGTTGCATGTATCCTTTTTAAAAAAGGTATTTTCAACCTATTTTCCAAA 187729725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1732 GGATGTATGGTAGTTGCATGTATCCTTTTTAAAAAAGGTATTTTCAACCTATTTTCCAAA 1791

187729726 GAGATTGTACCATTTTACATTCCCTCTAGGAATTTTAAGTGATAGAGTTCTCTCTATGCA 187729785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1792 GAGATTGTACCATTTTACATTCCCTCTAGGAATTTTAAGTGATAGAGTTCTCTCTATGCA 1851

187729786 TATTCCAGATATTAATCCCTCATCATATATGTGATTTGCAAGTATTTTCTTCCCAGTCTG 187729845
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1852 TATTCCAGATATTAATCCCTCATCATATATGTGATTTGCAAGTATTTTCTTCCCAGTCTG 1911

187729846 TAACTTGTCTTTTCATTCTGTTAACAGGGCCTTTTCACAAGGCAAAAATTTTTAATTGTG 187729905
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1912 TAACTTGTCTTTTCATTCTGTTAACAGGGCCTTTTCACAAGGCAAAAATTTTTAATTGTG 1971

187729906 ATAGTGTACTATTTATCACTTTTTACTTTTATGGATTGTGTTTTGGTGTCAAGTTTAAGA 187729965
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1972 ATAGTGTACTATTTATCACTTTTTTCTTTTATGGATTGTGTTTTGGTGTCAAGTTTAAGA 2031

187729966 GCTCTTTGCTCAGCCATTGATCTTGGAGATTTTCTCCCTATAGGTTTTTCTCTTTTTCTG 187730025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2032 GCTCTTTGCTCAGCCATTGATCTTGGAGATTTTCTCCCTATAGGTTTTTCTCTTTTTCTG 2091

187730026 GTTTTTTGTTTCATGCTTTATATTTAATTCCATGATCTGTGTTTAGTTAATTTCTACATA 187730085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2092 GTTTTTTGTTTCATGCTTTATATTTAATTCCATGATCTGTGTTTAGTTAATTTCTACATA 2151

187730086 AGGGTGAAACTTAGGTTGAAGTTTTTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTGCTTGCCAACAGA 187730145
          |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     2152 AGGGTGAGACTTAGGTTGAAGTTTTTGTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTGCTTGCCAACGGA 2211

187730146 CGTCAAATTACTGCAGCACCATATGTTGAAAGGCTATCTTTATTGAATTGTTTCTGTACC 187730205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2212 CGTCAAATTACTGCAGCACCATATGTTGAAAGGCTATCTTTATTGAATTGTTTCTGTACC 2271

187730206 TTTTAAAAAATTGATGAGAGATACGTGTGAGCCTATGTATGTGATTTCTATTCTATTCCA 187730265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2272 TTTTAAAAAATTGATGAGAGATACGTGTGAGCCTATGTATGTGATTTCTATTCTATTCCA 2331

187730266 TTGATCCATGTGTCTATCTCTCTACAAACACTATACAGTATAGATTATTGTAGCTATAAG 187730325
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2332 TTGATCCATGTGTCTATCTCTCTACAAACACTATACAGTATAGATTATTGTAGCTATAAG 2391

187730326 TCTTAAAATCCAGTGGACATATTCCTCCTACTTAATTCTTGTTTTTCAAAGTTGTTTTAG 187730385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2392 TCTTAAAATCCAGTGGACATATTCCTCCTACTTAATTCTTGTTTTTCAAAGTTGTTTTAG 2451

187730386 CTATTTAAATTCCTTTGTCTTTCCATATAACTTTTAGCATAATCTCATTGACACGTACTG 187730445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2452 CTATTTAAATTCCTTTGTCTTTCCATATAACTTTTAGCATAATCTCATTGACACGTACTG 2511

187730446 AAAATCTTGCTGTGATTTGGAGAGAAACTGTGACATATCTGCATATCAATTTGGGAAGAA 187730505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2512 AAAATCTTGCTGTGATTTGGAGAGAAACTGTGACATATCTGCATATCAATTTGGGAAGAA 2571

187730506 TTGATTATTCATTTTTACTATGGTGGTAGGCAGAATATGACTGTTGAAAGAGCTCTGCAT 187730565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2572 TTGATTATTCATTTTTACTATGGTGGTAGGCAGAATATGACTGTTGAAAGAGCTCTGCAT 2631

187730566 TCTAATCCCTGGAACATGTGAATATGTTACTTTCTATGGGAAAGGAGACTTTGCAGATAT 187730625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2632 TCTAATCCCTGGAACATGTGAATATGTTACTTTCTATGGGAAAGGAGACTTTGCAGATAT 2691

187730626 GGGACTTTGATCTCCCCTCAGAGCCTTCATAAAGAACATGCCTTGCCAACACTTTGATTT 187730685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2692 GGGACTTTGATCTCCCCTCAGAGCCTTCATAAAGAACATGCCTTGCCAACACTTTGATTT 2751

187730686 TAGCCCTGTAAGATCCAGTATCAAACTTCAAAAATCCAAAACTGTAAGAAAATAAGTATT 187730745
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2752 TAGCCCTGTAAGATCCAGAATCAAACTTCAAAAATCCAAAACTGTAAGAAAATAAGTATT 2811

187730746 TTTTAAGGCACTAAGTTTGTGGTCATTTGTTAGAGCAGCAATAGGAAACTAATACAATTA 187730805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2812 TTTTAAGGCACTAAGTTTGTGGTCATTTGTTAGAGCAGCAATAGGAAACTAATACAATTA 2871

187730806 TGTTGAATTTTCAAATCAATGAACAAAAATGGTGTCTCTCCATTTATTTAGACCGTCTTT 187730865
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2872 TGTTGAATTTTCAAATCAATGAACAAAAATGGTGTCTCTCCATTTATTTAGACCGTCTTT 2931

187730866 GATTTTTTTCTCAGCATTTTATAGCCTTCAGCATACAAGTCTTGTAAGTATTTTGTTAAG 187730925
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2932 GATTTTTTTCTCAGCATTTTATAGCCTTCAGCATACAAGTCTTGTAAGTATTTTGTTAAG 2991

187730926 TTTATACATAGTGTTTCAGTTTTTGAGCAATGATAAGTGGTATTGTATTTTTAATTTCAA 187730985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2992 TTTATACATAGTGTTTCAGTTTTTGAGCAATGATAAGTGGTATTGTATTTTTAATTTCAA 3051

187730986 TGTCCATGTGTTCATCGATAGTATATAGTAATGTAATTCATTTGTTTATGTTTATCTGCA 187731045
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3052 TGTCCATGTGTTCATCGATAGTATATAGTAATGTAATTCATTTGTTTATGTTTATCTGCA 3111

187731046 TTCTGTAACCTTGCTAAATTCACTTCTTCTTGGAGCCTTTTTTTCGTAGACTCCTTGTAA 187731105
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     3112 TTCTGTAACCTTGCTAAATTCACTTCTTCTAGGAGCCTTTTTTTCGTAGACTCCTTGTAA 3171

187731106 TTTGCTATAAAAGTCTATCATCTACAAATCAAGGCAATTTTATTTTGTTTTTCTAATCTT 187731165
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3172 TTTGCTATAAAAGTCTATCATCTACAAATCAAGGCAATTTTATTTTGTTTTTCTAATCTT 3231

187731166 TATTCTTTTTGTTGCCTTTTCTTACCTAATTGCACTGGCTAGAACTAGAACCAAAACTAT 187731225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3232 TATTCTTTTTGTTGCCTTTTCTTACCTAATTGCACTGGCTAGAACTAGAACCAAAACTAT 3291

187731226 GTTGAATAAAAGTGGTGAAAGTGAAAATTCTCGCCTCATTCCTGATCTTAGGGGGAAAGG 187731285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3292 GTTGAATAAAAGTGGTGAAAGTGAAAATTCTCGCCTCATTCCTGATCTTAGGGGGAAAGG 3351

187731286 ATTCAGTCTTTTATCATTATGTATAATATAAGCTAAAGGGATTTGTAGACATATTCTTTG 187731345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3352 ATTCAGTCTTTTATCATTATGTATAATATAAGCTAAAGGGATTTGTAGACATATTCTTTG 3411

187731346 GTTTCTGAGAGTTTTTTTAAATCACAAATTACTGTTGAATTTTGTCAAACGCTTTTTCTG 187731405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3412 GTTTCTGAGAGTTTTTTTAAATCACAAATTACTGTTGAATTTTGTCAAACGCTTTTTCTG 3471

187731406 CATTGACTAATATAATCATATATTATATTTTTCTTTCTACTTAGCTATTCTAGCAGCCTT 187731465
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3472 CATTGACTAATATAATCATATATTATATTTTTCTTTCTACTTAGCTATTCTAGCAGCCTT 3531

187731466 TCATCCTCAAAATAAACCTTTAGTAGCCTTGAATTCATAAAATAAACCCCACTTGGTTAT 187731525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3532 TCATCCTCAAAATAAACCTTTAGTAGCCTTGAATTCATAAAATAAACCCCACTTGGTTAT 3591

187731526 GGTGCATAATTCCTTTTATAATTGCTGATTTTATTTGAGATTTTTTTCTATTTTGTCCCT 187731585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3592 GGTGCATAATTCCTTTTATAATTGCTGATTTTATTTGAGATTTTTTTCTATTTTGTCCCT 3651

187731586 TTCTATTTTTGAAATTTTTTTTGCTTCTATATTTTTGGGAGATGTTAGTCTGTCGTTTTC 187731645
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3652 TTCTATTTTTGAAATTTTTTTTGCTTCTATATTTTTGGGAGATGTTAGTCTGTCGTTTTC 3711

187731646 TTTATTTGTACTGTCTTTGTCTGGTTTTAAAATCAAAGCAATGCTACCTTTATAAAGTGA 187731705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3712 TTTATTTGTACTGTCTTTGTCTGGTTTTAAAATCAAAGCAATGCTACCTTTATAAAGTGA 3771

187731706 ATTAAGGATTATTCCTTCCTTTTCTATTTTCTAGGACATATGTAGAACTGGTGTTAACTC 187731765
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3772 ATTAAGGATTATTCCTTCCTTTTCTATTTTCTAGGACATATGTAGAACTGGCGTTAACTC 3831

187731766 TTCTTTAGTTTGGAAGAACTCTTTAGTGAAATCATTTGTAACTAGAAATTTCCTTTTTGG 187731825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3832 TTCTTTAGTTTGGAAGAACTCTTTAGTGAAATCATTTGTAACTAGAAATTTCCTTTTTGG 3891

187731826 GAGTTTTTAAAATTCTGAATTCAATTTCCTTAATAATTATAGGGTTATTCAAATGATCTA 187731885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3892 GAGTTTTTAAAATTCTGAATTCAATTTCCTTAATAATTATAGGGTTATTCAAATGATCTA 3951

187731886 TTTCATACTAGATAAGTTGTGGTAGTTTATGGTTTTAAGGAATTGATCCATTTTATTTGT 187731945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3952 TTTCATACTAGATAAGTTGTGGTAGTTTATGGTTTTAAGGAATTGATCCATTTTATTTGT 4011

187731946 CAAATTTTTGTGTGGAGAGTTGTTCATAGTATTCCCTTATTATTCTTTTAGTGATTCAGT 187732005
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4012 CAAATTTTTGTGTGGAGAGTTGTTCATAGTATTCCCTTATTATTCTTTTAGTGATTCAGT 4071

187732006 CTGTGATGATATCCTCTGTTTTTTTTCCTGCTATTAATAAGTTGTTTTCCTTCTCTTTCT 187732065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4072 CTGTGATGATATCCTCTGTTTTTTTTCCTGCTATTAATAAGTTGTTTTCCTTCTCTTTCT 4131

187732066 CTCCATCTCTCCATTTCTATCTCACTCTCTTGCACTTTGATAGAGGTTTATCAATTTTAT 187732125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4132 CTCCATCTCTCCATTTCTATCTCACTCTCTTGCACTTTGATAGAGGTTTATCAATTTTAT 4191

187732126 TGATCTTTCCAAAGAACAAGCTCTTTGTTTCATTGATTTTTCTATTGTGTTGTAGTTTTC 187732185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4192 TGATCTTTCCAAAGAACAAGCTCTTTGTTTCATTGATTTTTCTATTGTGTTGTAGTTTTC 4251

187732186 TATGTCATTGGTTTCTGTTATCTTTATTATTTCTTTCCTTCTGCTTACTTTGAGTTTATT 187732245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4252 TATGTCATTGGTTTCTGTTATCTTTATTATTTCTTTCCTTCTGCTTACTTTGAGTTTATT 4311

187732246 TTGCTTTACTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTGTTGAGGCAGGAACTTGCATGATTGACCTGA 187732305
          |||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||
     4312 TTGCTTTACTTTTCTTTTTTTTTTT----GTTGAGGCAGGAACTTGCATGATTGACCTGA 4367

187732306 GACTTTTTACTAATATAAGCATTTAGTACTATAAATCAATCTCTCTCTCTCTCTCTCCCC 187732365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4368 GACTTTTTACTAATATAAGCATTTAGTACTATAAATCAATCTCTCTCTCTCTCTCTCCCC 4427

187732366 CAGGACTTCTTTAGTTGTATCCCACATATTTGCAGTGTATTCTTATTTTCATTTAGTTCA 187732425
          |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4428 CAGCACTTCTTTAGTTGTATCACACATATTTGCAGTGTATTCTTATTTTCATTTAGTTCA 4487

187732426 ATGTATCTCACTTTGTTCTGTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTCACTCAGTGCAGTGTAATTT 187732485
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4488 ATGTATCTCACTTAGTTCTGTGTTTTGTTTTGTTTTTTTTCACTCAGTGCAGTGTAATTT 4547

187732486 TCCTTGAGACTTTTTCTTTGACCCATAGATTATGTAAACTGTTGGTTAGTTTCCCAGTGT 187732545
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4548 TCCTTGAGACTTTTTCTTTGACCCATAGATTATGTAAACTGTTGGTTAGTTTCCCAGTGT 4607

187732546 TTTGAGATTTTCCTATTATCTTTCTGTTATTAATTTCTAATTTGATTTTATTGTGGTCAG 187732605
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4608 TTTGAGATTTTCCTATTATCTTTCTGTTATTAATTTCTAATTTGATTTTATTGTGGTCAG 4667

187732606 AGAACACATTCCACATGATTTTAATTACTTGTTTATCTTATGGTCCAGAACATGCTCTAC 187732665
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4668 AGAACACATTCCACATGATTTTAATTACTTGTTTATCTTATGGTCCAGAACATGCTCTAC 4727

187732666 ATTGGTATATATTCTGTGGTGCCTGAAAACAATGTGTATACAGCTGTGTTTTAGTGCAGT 187732725
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4728 ATTGGTATATATTCTGTGGTGCCTGAAAACAATGTGTATACAGCTGTGTTTTAGTGCAGT 4787

187732726 GTTATGTAAACGTGGATTAGATCCTGTTGGTTGATAGTGGTGTTGAATTCTATATCCTTG 187732785
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4788 GTTATGTAAACGTGGATTAGATCCTGTTGGTTGATAGTGGTGTTGAATTCTATATCCTTG 4847

187732786 ATGATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTATTGAAAGT 187732824
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4848 ATGATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTATTGAAAGT 4886

EXCISED REGION

187734763 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 187734822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4887 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 4946

187734823 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 187734882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4947 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 5006

187734883 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 187734942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5007 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 5066

187734943 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 187735002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5067 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 5126

187735003 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 187735062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5127 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 5186

187735063 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 187735122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5187 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 5246

187735123 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 187735182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5247 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 5306

187735183 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 187735242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5307 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 5366

187735243 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 187735302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5367 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 5426

187735303 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 187735362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5427 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 5486

187735363 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 187735422
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||
     5487 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAGAACTCTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 5546

187735423 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 187735482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5547 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 5606

187735483 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 187735542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5607 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 5666

187735543 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 187735602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5667 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 5726

187735603 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 187735662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5727 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 5786

187735663 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCA 187735722
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     5787 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTACTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTGTCTGTGGCA 5846

187735723 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 187735782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5847 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 5906

187735783 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 187735842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5907 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 5966

187735843 CT 187735844
          ||
     5967 CT 5968

Alignment time is 4.63343 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2349] =>      2349 nucs 'mol-32-3306-110655_2349'

Score:        2337
Aligned:      2348        nucs
Identic:      2347 (100%) nucs =>       118 (100%)      2229 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187734234,187734351] EXCISED REGION [187734353,187736582]
 second seq =>  [        1,      118] EXCISED REGION [      120,     2349]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [187734352,187734352]
 second seq =>         1 nucs [119,119]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187734352,187734352] to [187734353,187734353]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187734234 AGACAAAGGGGTGTCACTTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTC 187734293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGACAAAGGGGTGTCACTTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTC 60

187734294 AGCCTCAGTTTACATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAA 187734351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AGCCTCAGTTTACATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAA 118

EXCISED REGION

187734353 TCTAGCTCTCAATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCAT 187734412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      120 TCTAGCTCTCAATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCAT 179

187734413 TGCTGTTTCCCATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTC 187734472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      180 TGCTGTTTCCCATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTC 239

187734473 CACCAGGCTAACTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGG 187734532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      240 CACCAGGCTAACTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGG 299

187734533 GTCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAG 187734592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      300 GTCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAG 359

187734593 GGTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAA 187734652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      360 GGTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAA 419

187734653 TATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTT 187734712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      420 TATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTT 479

187734713 TCCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAA 187734772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      480 TCCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAA 539

187734773 AATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATT 187734832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      540 AATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATT 599

187734833 TCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTT 187734892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      600 TCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTT 659

187734893 GATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTC 187734952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      660 GATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTC 719

187734953 GGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAG 187735012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      720 GGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAG 779

187735013 GCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAAT 187735072
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      780 GCTTTTCTGTCTGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAAT 839

187735073 ATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACC 187735132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 ATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACC 899

187735133 CCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTA 187735192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      900 CCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTA 959

187735193 GAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCA 187735252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 GAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCA 1019

187735253 ATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCT 187735312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1020 ATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCT 1079

187735313 TACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGAC 187735372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGAC 1139

187735373 CATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATA 187735432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 CATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATA 1199

187735433 TGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAA 187735492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAA 1259

187735493 TCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGAT 187735552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1260 TCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGAT 1319

187735553 TCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTA 187735612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTA 1379

187735613 GGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACA 187735672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1380 GGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACA 1439

187735673 ACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGT 187735732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 ACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGT 1499

187735733 GTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTA 187735792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 GTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTA 1559

187735793 GATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGC 187735852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 GATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGC 1619

187735853 CTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTC 187735912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTC 1679

187735913 AGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATC 187735972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 AGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATC 1739

187735973 TTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCA 187736032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCA 1799

187736033 TCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCC 187736092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 TCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCC 1859

187736093 AGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACT 187736152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1860 AGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACT 1919

187736153 ACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAG 187736212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 ACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAG 1979

187736213 AAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTA 187736272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 AAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTA 2039

187736273 AAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTC 187736332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2040 AAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTC 2099

187736333 AGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCT 187736392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2100 AGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCT 2159

187736393 GGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGG 187736452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2160 GGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGG 2219

187736453 CTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCA 187736512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 CTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCA 2279

187736513 TTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTT 187736572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 TTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTT 2339

187736573 CTTTTCTCCC 187736582
          ||||||||||
     2340 CTTTTCTCCC 2349

Alignment time is 1.83049 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3962] =>      3962 nucs 'mol-32-3311-170016_3962'

Score:        3906
Aligned:      3961        nucs
Identic:      3956 (100%) nucs =>        99 (100%)      3857 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187734253,187734351] EXCISED REGION [187734353,187738214]
 second seq =>  [        1,       99] EXCISED REGION [      101,     3962]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [187734352,187734352]
 second seq =>         1 nucs [100,100]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187734352,187734352] to [187734353,187734353]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187734253 CATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTTTACATATGA 187734312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 CATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTTTACATATGA 60

187734313 GGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAA 187734351
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAA 99

EXCISED REGION

187734353 TCTAGCTCTCAATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCAT 187734412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      101 TCTAGCTCTCAATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCAT 160

187734413 TGCTGTTTCCCATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTC 187734472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      161 TGCTGTTTCCCATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTC 220

187734473 CACCAGGCTAACTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGG 187734532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      221 CACCAGGCTAACTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGG 280

187734533 GTCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAG 187734592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      281 GTCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAG 340

187734593 GGTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAA 187734652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      341 GGTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAA 400

187734653 TATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTT 187734712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      401 TATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTT 460

187734713 TCCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAA 187734772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      461 TCCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAA 520

187734773 AATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATT 187734832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      521 AATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATT 580

187734833 TCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTT 187734892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      581 TCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTT 640

187734893 GATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTC 187734952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 GATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTC 700

187734953 GGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAG 187735012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 GGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAG 760

187735013 GCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAAT 187735072
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 GCTTTTCTGTCTGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAAT 820

187735073 ATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACC 187735132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      821 ATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACC 880

187735133 CCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTA 187735192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 CCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTA 940

187735193 GAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCA 187735252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 GAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCA 1000

187735253 ATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCT 187735312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 ATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCT 1060

187735313 TACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGAC 187735372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 TACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGAC 1120

187735373 CATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATA 187735432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1121 CATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATA 1180

187735433 TGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAA 187735492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 TGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAA 1240

187735493 TCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGAT 187735552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 TCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGAT 1300

187735553 TCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTA 187735612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 TCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTA 1360

187735613 GGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACA 187735672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 GGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACA 1420

187735673 ACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGT 187735732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 ACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGT 1480

187735733 GTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTA 187735792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1481 GTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTA 1540

187735793 GATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGC 187735852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 GATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGC 1600

187735853 CTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTC 187735912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 CTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTC 1660

187735913 AGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATC 187735972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 AGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATC 1720

187735973 TTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCA 187736032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 TTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCA 1780

187736033 TCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCC 187736092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 TCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCC 1840

187736093 AGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACT 187736152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 AGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACT 1900

187736153 ACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAG 187736212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 ACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAG 1960

187736213 AAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTA 187736272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 AAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTA 2020

187736273 AAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTC 187736332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 AAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTC 2080

187736333 AGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCT 187736392
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 AGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCT 2140

187736393 GGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGG 187736452
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     2141 GGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAGGTGG 2200

187736453 CTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCA 187736512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 CTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCA 2260

187736513 TTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTT 187736572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 TTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTT 2320

187736573 CTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTT 187736632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 CTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTT 2380

187736633 TCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCT 187736692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 TCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCT 2440

187736693 GCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCA 187736752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 GCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCA 2500

187736753 GATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCT 187736812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 GATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCT 2560

187736813 AAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCC 187736872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 AAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCC 2620

187736873 AGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCC 187736932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 AGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCC 2680

187736933 GTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAA 187736992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 GTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAA 2740

187736993 CGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACT 187737052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 CGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACT 2800

187737053 ATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGG 187737112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2801 ATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGG 2860

187737113 CCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGG 187737172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 CCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGG 2920

187737173 AAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAA 187737232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 AAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAA 2980

187737233 GCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCAGGTGAAGGGG 187737292
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2981 GCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCACAGGTGAAGGGG 3040

187737293 CAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTT 187737352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 CAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTT 3100

187737353 CCCTGACCATTAGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTT 187737412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 CCCTGACCATTAGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTT 3160

187737413 ATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTAT 187737472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 ATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTAT 3220

187737473 ATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGT 187737532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 ATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGT 3280

187737533 ATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGG 187737592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 ATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGG 3340

187737593 CTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGT 187737652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 CTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGT 3400

187737653 TCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGA 187737712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 TCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGA 3460

187737713 TTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATT 187737772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3461 TTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATT 3520

187737773 TGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAA 187737832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 TGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAA 3580

187737833 CGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAAT 187737892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 CGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAAT 3640

187737893 ATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAG 187737952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 ATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAG 3700

187737953 ATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAG 187738012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 ATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAG 3760

187738013 AGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCA 187738072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3761 AGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCA 3820

187738073 TGCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCT 187738132
          ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     3821 TGCTGGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCGTGAGTTCT 3880

187738133 TGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCA 187738192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3881 TGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCA 3940

187738193 GGCAAGAACTTCAGAGTTTACC 187738214
          ||||||||||||||||||||||
     3941 GGCAAGAACTTCAGAGTTTACC 3962

Alignment time is 3.06857 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2146] =>      2146 nucs 'mol-32-3311-189068_2146'

Score:        2134
Aligned:      2145        nucs
Identic:      2144 (100%) nucs =>       116 (100%)      2028 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187734236,187734351] EXCISED REGION [187734353,187736381]
 second seq =>  [        1,      116] EXCISED REGION [      118,     2146]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         1 nucs [187734352,187734352]
 second seq =>         1 nucs [117,117]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187734352,187734352] to [187734353,187734353]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187734236 ACAAAGGGGTGTCACTTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAG 187734295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ACAAAGGGGTGTCACTTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTCAG 60

187734296 CCTCAGTTTACATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAA 187734351
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CCTCAGTTTACATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAA 116

EXCISED REGION

187734353 TCTAGCTCTCAATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCAT 187734412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      118 TCTAGCTCTCAATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCAT 177

187734413 TGCTGTTTCCCATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTC 187734472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      178 TGCTGTTTCCCATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTC 237

187734473 CACCAGGCTAACTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGG 187734532
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      238 CACCAGGCTAACTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGG 297

187734533 GTCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAG 187734592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      298 GTCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAG 357

187734593 GGTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAA 187734652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      358 GGTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAA 417

187734653 TATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTT 187734712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      418 TATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTT 477

187734713 TCCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAA 187734772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      478 TCCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAA 537

187734773 AATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATT 187734832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      538 AATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATT 597

187734833 TCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTT 187734892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      598 TCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTT 657

187734893 GATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTC 187734952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      658 GATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTC 717

187734953 GGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAG 187735012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      718 GGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAG 777

187735013 GCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAAT 187735072
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      778 GCTTTTCTGTCTGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAAT 837

187735073 ATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACC 187735132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      838 ATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACC 897

187735133 CCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTA 187735192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      898 CCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTA 957

187735193 GAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCA 187735252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      958 GAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCA 1017

187735253 ATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCT 187735312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1018 ATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCT 1077

187735313 TACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGAC 187735372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1078 TACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGAC 1137

187735373 CATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATA 187735432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1138 CATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATA 1197

187735433 TGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAA 187735492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1198 TGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAA 1257

187735493 TCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGAT 187735552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1258 TCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGAT 1317

187735553 TCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTA 187735612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1318 TCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTA 1377

187735613 GGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACA 187735672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1378 GGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACA 1437

187735673 ACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGT 187735732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1438 ACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGT 1497

187735733 GTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTA 187735792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1498 GTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTA 1557

187735793 GATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGC 187735852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1558 GATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGC 1617

187735853 CTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTC 187735912
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1618 CTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTC 1677

187735913 AGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATC 187735972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1678 AGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATC 1737

187735973 TTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCA 187736032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1738 TTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCA 1797

187736033 TCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCC 187736092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1798 TCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCC 1857

187736093 AGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACT 187736152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1858 AGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACT 1917

187736153 ACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAG 187736212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1918 ACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAG 1977

187736213 AAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTA 187736272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1978 AAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTA 2037

187736273 AAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTC 187736332
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2038 AAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTC 2097

187736333 AGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAG 187736381
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2098 AGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAG 2146

Alignment time is 1.66303 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3756] =>      3756 nucs 'mol-32-33ab-166640_3756'

Score:        3668
Aligned:      3756        nucs
Identic:      3748 (100%) nucs =>       220 (100%)      3528 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187732605,187732824] EXCISED REGION [187734763,187738298]
 second seq =>  [        1,      220] EXCISED REGION [      221,     3756]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1938 nucs [187732825,187734762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        90 nucs [187732825,187732914] to [187734763,187734852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187732824,187732824] to [187734763,187734763]
 second seq =>         1 nucs [220,220] to [221,221]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187732605 GAGAACACATTCCACATGATTTTAATTACTTGTTTATCTTATGGTCCAGAACATGCTCTA 187732664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GAGAACACATTCCACATGATTTTAATTACTTGTTTATCTTATGGTCCAGAACATGCTCTA 60

187732665 CATTGGTATATATTCTGTGGTGCCTGAAAACAATGTGTATACAGCTGTGTTTTAGTGCAG 187732724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CATTGGTATATATTCTGTGGTGCCTGAAAACAATGTGTATACAGCTGTGTTTTAGTGCAG 120

187732725 TGTTATGTAAACGTGGATTAGATCCTGTTGGTTGATAGTGGTGTTGAATTCTATATCCTT 187732784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTATGTAAACGTGGATTAGATCCTGTTGGTTGATAGTGGTGTTGAATTCTATATCCTT 180

187732785 GATGATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTATTGAAAGT 187732824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GATGATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTATTGAAAGT 220

EXCISED REGION

187734763 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 187734822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      221 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 280

187734823 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 187734882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      281 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 340

187734883 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 187734942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      341 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 400

187734943 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 187735002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      401 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 460

187735003 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 187735062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      461 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 520

187735063 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 187735122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      521 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 580

187735123 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 187735182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      581 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 640

187735183 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 187735242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      641 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 700

187735243 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 187735302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      701 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 760

187735303 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 187735362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      761 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 820

187735363 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 187735422
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||
      821 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAGAACTCTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 880

187735423 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 187735482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      881 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 940

187735483 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 187735542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      941 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 1000

187735543 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 187735602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1001 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 1060

187735603 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 187735662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1061 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 1120

187735663 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCA 187735722
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1121 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTACTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTGTCTGTGGCA 1180

187735723 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 187735782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1181 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 1240

187735783 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 187735842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1241 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 1300

187735843 CTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 187735902
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1301 CTCCAAAAGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 1360

187735903 TTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTG 187735962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1361 TTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTG 1420

187735963 ACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGAT 187736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1421 ACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGAT 1480

187736023 TGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCT 187736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1481 TGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGAGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCT 1540

187736083 GTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTC 187736142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1541 GTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTC 1600

187736143 TTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGC 187736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1601 TTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGC 1660

187736203 TGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAG 187736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1661 TGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAG 1720

187736263 TGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTA 187736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1721 TGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTA 1780

187736323 TTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGA 187736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1781 TTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGA 1840

187736383 GATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAA 187736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1841 GATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAA 1900

187736443 GGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 187736502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1901 GGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 1960

187736503 AAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTT 187736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1961 AAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTT 2020

187736563 GTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAG 187736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2021 GTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAG 2080

187736623 TCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAA 187736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2081 TCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAA 2140

187736683 ACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTA 187736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2141 ACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTA 2200

187736743 ATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCC 187736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2201 ATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCC 2260

187736803 AGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGA 187736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2261 AGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGA 2320

187736863 GCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTG 187736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2321 GCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTG 2380

187736923 AGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAG 187736982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2381 AGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAG 2440

187736983 GAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGC 187737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2441 GAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGC 2500

187737043 TACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTC 187737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2501 TACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTC 2560

187737103 TTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTA 187737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2561 TTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTA 2620

187737163 TGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCA 187737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2621 TGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCA 2680

187737223 CATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCA 187737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2681 CATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCA 2740

187737283 GGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATC 187737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2741 GGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATC 2800

187737343 TGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGA 187737402
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2801 TGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAATCCTCAGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGA 2860

187737403 CACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATT 187737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2861 CACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATT 2920

187737463 CAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTA 187737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2921 CAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTA 2980

187737523 AATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTA 187737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2981 AATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTA 3040

187737583 TTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTA 187737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3041 TTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTA 3100

187737643 TCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATT 187737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3101 TCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATT 3160

187737703 CAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTG 187737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3161 CAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTG 3220

187737763 TGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGT 187737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3221 TGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGT 3280

187737823 CCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGC 187737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3281 CCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGC 3340

187737883 TATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGAT 187737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3341 TATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGAT 3400

187737943 AGAGATTGAGATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCA 187738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3401 AGAGATTGAGATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCA 3460

187738003 TGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGT 187738062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3461 TGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTGCCTGT 3520

187738063 ACCGAAGTCATGCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGT 187738122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3521 ACCGAAGTCATGCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGT 3580

187738123 CATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAG 187738182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3581 CATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAG 3640

187738183 GCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTTTTATTATTAT 187738242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3641 GCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTTTTATTATTAT 3700

187738243 TATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTAGTTA 187738298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3701 TATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTAGTTA 3756

Alignment time is 3.24023 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3807] =>      3807 nucs 'mol-32-3419-013542_3807'

Score:        3700
Aligned:      3799        nucs
Identic:      3790 (100%) nucs =>       235 (100%)      3555 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187732589,187732824] EXCISED REGION [187734763,187738325]
 second seq =>  [        1,      236] EXCISED REGION [      237,     3799]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      1938 nucs [187732825,187734762]
 second seq =>         0 nucs

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>        90 nucs [187732825,187732914] to [187734763,187734852]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         1 nucs [187732824,187732824] to [187734763,187734763]
 second seq =>         1 nucs [236,236] to [237,237]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187732589 GATTTTATTGTGGTCAGAGAACACATTCCACATGATTTTAATTACTTGTTTATCTTATGG 187732648
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
        1 GATTTTATTGTGGTCAGAGAACACATTCCACATAATTTTAATTACTTGTTTATCTTATGG 60

187732649 TCCAGAACATGCTCTACATTGGTATATATTCTGTGGTGCCTGAAAACAATGTGTATACAG 187732708
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCCAGAACATGCTCTACATTGGTATATATTCTGTGGTGCCTGAAAACAATGTGTATACAG 120

187732709 CTGTGTTTTAGTGCAGTGTTATGTAAACGTGGATTAGATCCTGTTGGTTGATAGTGGTGT 187732768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTGTGTTTTAGTGCAGTGTTATGTAAACGTGGATTAGATCCTGTTGGTTGATAGTGGTGT 180

187732769 TGAATTCTATATCCTTGATGATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTATTGAAAGT 187732824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGAATTCTATATCCTTGATGATTTTCTGTCTAGTTGTTCCATTAATTATTGAAAGT 236

EXCISED REGION

187734763 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 187734822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      237 TGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATC 296

187734823 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 187734882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      297 AGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCT 356

187734883 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 187734942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      357 ATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCT 416

187734943 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 187735002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      417 AAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGC 476

187735003 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 187735062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      477 TTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCA 536

187735063 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 187735122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      537 AGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGG 596

187735123 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 187735182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      597 CTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTT 656

187735183 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 187735242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      657 GTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTG 716

187735243 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 187735302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      717 TGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAA 776

187735303 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 187735362
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 CTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAAT 836

187735363 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 187735422
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||
      837 ACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAGAACTCTCATGAATCTTCATTATTGCCTC 896

187735423 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 187735482
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 TGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCT 956

187735483 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 187735542
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 ACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTT 1016

187735543 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 187735602
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 CTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTC 1076

187735603 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 187735662
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1077 TGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTT 1136

187735663 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCA 187735722
          ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     1137 AGAAACTACAACCTATCTTTTCTACTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTGTCTGTGGCA 1196

187735723 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 187735782
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 CTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATC 1256

187735783 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 187735842
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 TCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTT 1316

187735843 CTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 187735902
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 CTCCAAAAGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAA 1376

187735903 TTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTG 187735962
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTG 1436

187735963 ACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGAT 187736022
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 ACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGAT 1496

187736023 TGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCT 187736082
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1497 TGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGAGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCT 1556

187736083 GTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTC 187736142
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 GTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTC 1616

187736143 TTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGC 187736202
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 TTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGC 1676

187736203 TGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAG 187736262
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 TGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAG 1736

187736263 TGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTA 187736322
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1737 TGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTA 1796

187736323 TTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGA 187736382
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 TTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGA 1856

187736383 GATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAA 187736442
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 GATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAA 1916

187736443 GGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 187736502
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 GGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGA 1976

187736503 AAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTT 187736562
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1977 AAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTT 2036

187736563 GTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAG 187736622
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 GTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAG 2096

187736623 TCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAA 187736682
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2097 TCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAA 2156

187736683 ACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTA 187736742
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 ACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTA 2216

187736743 ATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCC 187736802
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 ATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCC 2276

187736803 AGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGA 187736862
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 AGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGA 2336

187736863 GCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTG 187736922
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 GCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTG 2396

187736923 AGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAG 187736982
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 AGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAG 2456

187736983 GAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGC 187737042
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 GAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGC 2516

187737043 TACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTC 187737102
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 TACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTC 2576

187737103 TTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTA 187737162
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 TTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTA 2636

187737163 TGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCA 187737222
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 TGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCA 2696

187737223 CATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCA 187737282
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 CATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCA 2756

187737283 GGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATC 187737342
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 GGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATC 2816

187737343 TGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGA 187737402
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     2817 TGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAATCCTCAGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGA 2876

187737403 CACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATT 187737462
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 CACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATT 2936

187737463 CAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTA 187737522
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 CAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTA 2996

187737523 AATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTA 187737582
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2997 AATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTA 3056

187737583 TTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTA 187737642
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTA 3116

187737643 TCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATT 187737702
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATT 3176

187737703 CAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTG 187737762
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3177 CAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTG 3236

187737763 TGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGT 187737822
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 TGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGT 3296

187737823 CCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGC 187737882
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 CCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGC 3356

187737883 TATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGAT 187737942
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 TATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGAT 3416

187737943 AGAGATTGAGATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCA 187738002
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 AGAGATTGAGATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCA 3476

187738003 TGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGT 187738062
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3477 TGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTGCCTGT 3536

187738063 ACCGAAGTCATGCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGT 187738122
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 ACCGAAGTCATGCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGT 3596

187738123 CATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAG 187738182
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 CATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAG 3656

187738183 GCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTTTTATTATTAT 187738242
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 GCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTTTTATTATTAT 3716

187738243 TATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTAGTTACATA 187738302
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 TATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGTTAGTTACATA 3776

187738303 TGTATACATGTGCCATGTTGGTG 187738325
          |||||||||||||||||||||||
     3777 TGTATACATGTGCCATGTTGGTG 3799

Alignment time is 2.9718 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     7894] =>      7894 nucs 'mol-32-3419-026168_7894'

Score:        7748
Aligned:      7891        nucs
Identic:      7878 (100%) nucs =>      3995 (100%)      3883 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187734234,187738232] EXCISED REGION [187738233,187742124]
 second seq =>  [        1,     3999] EXCISED REGION [     4003,     7894]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [4000,4002]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        22 nucs [4000,4021] to [4003,4024]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [187738231,187738232] to [187738233,187738234]
 second seq =>         2 nucs [3998,3999] to [4003,4004]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187734234 AGACAAAGGGGTGTCACTTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTC 187734293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGACAAAGGGGTGTCACTTCATTACTTCCAGGTGGAAGTAAAAATCCAAGTTCTACACTC 60

187734294 AGCCTCAGTTTACATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAATT 187734353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
       61 AGCCTCAGTTTACATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTGGGCAAGAGGAGAAACT 120

187734354 CTAGCTCTCAATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCATT 187734413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CTAGCTCTCAATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGAGCAGGAATGCCTCATT 180

187734414 GCTGTTTCCCATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTCC 187734473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GCTGTTTCCCATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGTAAATCTCTGACTCTCC 240

187734474 ACCAGGCTAACTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGG 187734533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACCAGGCTAACTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTGCCTCGTTACTGCTGGG 300

187734534 TCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGG 187734593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACAATGATGGTGAGGGAGG 360

187734594 GTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAAT 187734653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTACTCGGCTTTTTCTAAT 420

187734654 ATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTT 187734713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGGCAGAAGTCTAGGTTTT 480

187734714 CCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAA 187734773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGTGAGAGTGGTTATTAAA 540

187734774 ATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTT 187734833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 ATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTTTTATCAGTTCTTATTT 600

187734834 CACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTG 187734893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGATTGCTATATCTTCTTG 660

187734894 ATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCG 187734953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 ATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTATCATCTAAAAGATTTCG 720

187734954 GTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGG 187735013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 GTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAGCAGGCTTTTGCTGAGG 780

187735014 CTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATA 187735073
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTTTTCTGTCTGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAGCTCCAAGTCTGGAATA 840

187735074 TAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCC 187735133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTCCTTGGCTTTTGAACCC 900

187735134 CTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAG 187735193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTACATTTGTTTTGTGTAG 960

187735194 AACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAA 187735253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAAAAGTGTGTCTACTCAA 1020

187735254 TCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTT 187735313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGTTAAAACTGGATTTCTT 1080

187735314 ACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACC 187735373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 ACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTTAAAATACTGAGAGACC 1140

187735374 ATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATAT 187735433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATTGCCTCTGGAATAATAT 1200

187735434 GTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAAT 187735493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 GTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTTTACCTACCTCTTTAAT 1260

187735494 CTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATT 187735553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 CTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTGGACTTCTGTCGGGATT 1320

187735554 CCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAG 187735613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGTTATTCTGTATACTTAG 1380

187735614 GACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAA 187735673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGTCATTTAGAAACTACAA 1440

187735674 CCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTG 187735733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTGTGGCACTTCTGTGGTG 1500

187735734 TGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAG 187735793
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAACTTATCTCCACTACTAG 1560

187735794 ATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCC 187735853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 ATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTGGCCTTCTCCAAAGGCC 1620

187735854 TTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCA 187735913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTGAAGAATTAAAAACTCA 1680

187735914 GTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCT 187735973
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCTAATTGACTTTGCATCT 1740

187735974 TTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCAT 187736033
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCAAGGATTGACTTAGCAT 1800

187736034 CTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCA 187736093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 CTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTACTCTCTGTACCAAGCCA 1860

187736094 GATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTA 187736153
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 GATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGACTGTCTTGTAAGACTA 1920

187736154 CAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGA 187736213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 CAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAATCTGCTGATTTATAGA 1980

187736214 AATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAA 187736273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTTAGCAGTGCCAAACTAA 2040

187736274 AAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCA 187736333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTCATCTATTCTTAGCTCA 2100

187736334 GAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTG 187736393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCATTGAGAGATCTATCCTG 2160

187736394 GGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGC 187736453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAGGAGAAGGTAAAGTGGC 2220

187736454 TAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCAT 187736513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 TAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAGAGGGAAAGTTTTCCAT 2280

187736514 TCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTC 187736573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTCTCCTTGTCTGAGCTTC 2340

187736574 TTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTT 187736633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 TTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCTCCCAGTCTGCATGTTT 2400

187736634 CTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTG 187736693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCCCTAAAACTGGACTCTG 2460

187736694 CACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAG 187736753
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCACAGTAATCATGTCCAG 2520

187736754 ATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTA 187736813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACTATCCCAGTTACACCTA 2580

187736814 AGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCA 187736873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 AGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGACCTGAGCTCAACTCCA 2640

187736874 GCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCG 187736933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 GCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTACCTTGAGGAGTCTCCG 2700

187736934 TTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAAC 187736993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 TTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTCATGAGGAATAAGCAAC 2760

187736994 GTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTA 187737053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATGGTAGCTACTTGTACTA 2820

187737054 TGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGC 187737113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 TGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCTGAGTCTTTTCTCAGGC 2880

187737114 CAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGA 187737173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATACATTATGCCAGGAGGA 2940

187737174 AAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAG 187737233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 AAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGCATCCACATAAGGTAAG 3000

187737234 CTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCGCAGGTGAAGGGGC 187737293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     3001 CTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAGGCACAGGTGAAGGGGC 3060

187737294 AGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTC 187737353
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 AGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCAGCATCTGATTCTCTTC 3120

187737354 CCTGACCATTAGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTA 187737413
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 CCTGACCATTAGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAGGAGGACACATCTCTTA 3180

187737414 TCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATA 187737473
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 TCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAGACATTCAGATGCTATA 3240

187737474 TCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTA 187737533
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGGTTTTAAATCTGAAGTA 3300

187737534 TATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGC 187737593
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTATGTTATTATAAGGGGC 3360

187737594 TCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTT 187737653
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTATTATTATCTCCGCTGTT 3420

187737654 CAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGAT 187737713
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTATCGATTCAGCAGCAGAT 3480

187737714 TTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTT 187737773
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 TTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCACAGTGTGTATTTATTT 3540

187737774 GTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAAC 187737833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 GTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAATTGGTCCAGAATAAAC 3600

187737834 GGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATA 187737893
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 GGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAACCTGCTATTAAAAATA 3660

187737894 TCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGA 187737953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 TCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGAGAGATAGAGATTGAGA 3720

187737954 TAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGA 187738013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 TAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTCAAGCATGTCTGCCAGA 3780

187738014 GTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCAT 187738073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 GTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTCCCTGTACCGAAGTCAT 3840

187738074 GCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCTT 187738133
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 GCTGGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTTTCAGTCATGAGTTCTT 3900

187738134 GTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCAG 187738193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 GTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAACAGAGGCTGAAAGCAG 3960

187738194 GCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTT 187738232
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3961 GCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTT 3999

EXCISED REGION

187738233 TTATTATTATTATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGT 187738292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4003 TTATTATTATTATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGT 4062

187738293 TAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGAGCTGCACCCATTAACTCATCGTTTAG 187738352
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4063 TAGTTACATATGTATACATGTGCCATGTTGGTGTGCTGCACCCATTAACTCATCGTTTAG 4122

187738353 CATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCGCTCCCCCCACCCCACATCAGTCCCCA 187738412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4123 CATTAGGTATATCTCCTAATGCTATCCCTCCCCGCTCCCCCCACCCCACATCAGTCCCCA 4182

187738413 GAGTGTGATGTTCCCCTTCCTGTGTCCACGTGTTCTCATTGTTCAATACCCATCTGTGAG 187738472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4183 GAGTGTGATGTTCCCCTTCCTGTGTCCACGTGTTCTCATTGTTCAATACCCATCTGTGAG 4242

187738473 TGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTTTGTCCTTGAGATATACTGAGAATCATGATTTCCAA 187738532
          |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
     4243 TGAGAACATGCGGTGTTTGGTTTTTTGTCCTTGCGATATACTGAGAATCATGATTTCCAA 4302

187738533 TTTCATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCACCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTC 187738592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4303 TTTCATCCATGTCCCTACAAAGGACATGAACTCACCATTTTTTATGGCTGCATAGTATTC 4362

187738593 CATGGTCTTTCTATAGATTAAAGCATGGAAGCTCAAAAAGGAAATACAGGAGGTATAAAC 187738652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4363 CATGGTCTTTCTATAGATTAAAGCATGGAAGCTCAAAAAGGAAATACAGGAGGTATAAAC 4422

187738653 TCAGGTCTCTTACCTCCTTGTCCGATAATTTTCCCTGCTGCCCTACCATACCTGCCACAG 187738712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4423 TCAGGTCTCTTACCTCCTTGTCCGATAATTTTCCCTGCTGCCCTACCATACCTGCCACAG 4482

187738713 TACCTGACTCTATGTCTGTCACCAGAGAAAAGGGATCCTCGTACACATTTGTCAAGGAAC 187738772
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     4483 TACCTGACTCTATGTCTGTCACCAGAGAAAAGGGATCCTCGTACACATTTGTCGAGGAAC 4542

187738773 TTCACTGTGGCAGACAGTGGTGATTAGGATTCTCTTCCCCACTGTAACTCACTAGCTCGC 187738832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4543 TTCACTGTGGCAGACAGTGGTGATTAGGATTCTCTTCCCCACTGTAACTCACTAGCTCGC 4602

187738833 TATGGTCAAACAGCTAGTCATTCATTCCCTGGCCTTTGGTGTCAGAACAGTGTCCAGCCT 187738892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4603 TATGGTCAAACAGCTAGTCATTCATTCCCTGGCCTTTGGTGTCAGAACAGTGTCCAGCCT 4662

187738893 TCCTTGCCTCTTAAAGTCTATGGACAGTCTGCTTCACCAGCACCACCCCCATGTCCTGGA 187738952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4663 TCCTTGCCTCTTAAAGTCTATGGACAGTCTGCTTCACCAGCACCACCCCCATGTCCTGGA 4722

187738953 CTAGCCATGGCTCTGAGCAGAGCCAGAGCAAAACACCACTGGCCGGCAAAGGGGTGTGGG 187739012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4723 CTAGCCATGGCTCTGAGCAGAGCCAGAGCAAAACACCACTGGCCGGCAAAGGGGTGTGGG 4782

187739013 AGCATGTGGGAGTCATGCCCAGCCTGGGCTGCTGGTCAGAAGTCTGTGCTTAGAAGAATA 187739072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4783 AGCATGTGGGAGTCATGCCCAGCCTGGGCTGCTGGTCAGAAGTCTGTGCTTAGAAGAATA 4842

187739073 GTTTTCTCCTTGTTATGGGCTGAATTGTGTCATCACTACCTTTTCCGCCCCCAAGAAAAA 187739132
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4843 GTTTTCTCCTTGTTATGGGCTGAATTGTGTCATCACTACCTTTTCCGCCCCCAAGAAAAA 4902

187739133 GATGCTGAAGTTCTAACCCCCAGGACCTCAGAATGTAACCTTTCTTGGAGACTGGATCTT 187739192
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4903 GATGCTGAAGTTCTAACCCCCAGGACCTCAGAATGTAACCTTTCTTGGAGACTGGATCTT 4962

187739193 TATAGAGGTAATCAAGTTAAAATGAGATGGTTAGGGTGAACTCTCTTCTAATACAGCTGG 187739252
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4963 TATAGAGGTAATCAAGTTAAAATGAGATGGTTAGGGTGAACTCTCTTCTAATACAGCTGG 5022

187739253 TGTCCTTGTAAAAAGGAGAAATGTCGACACTGAGAGAAACACCCACACAGGGAGAATGCC 187739312
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5023 TGTCCTTGTAAAAAGGAGAAATGTCGACACTGAGAGAAACACCCACACAGGGAGAATGCC 5082

187739313 ATGTGAAGATGAAGGCGGAGATCAGAGCAATGCTTCTTCAAGCCAAGAAACACCAAAGCG 187739372
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5083 ATGTGAAGATGAAGGCGGAGATCAGAGCAATGCTTCTTCAAGCCAAGAAACACCAAAGCG 5142

187739373 TTATCAGCAAACCACCATGAGCTGGAAGAAAAGCCTGGAGCAGGTTCTCCTTCCCAGCCC 187739432
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5143 TTATCAGCAAACCACCATGAGCTGGAAGAAAAGCCTGGAGCAGGTTCTCCTTCCCAGCCC 5202

187739433 TTAGAAGGAAGCAACCCTGCTGACGCCTTGGTTTCAGACTTCTGGCCTCCAGAACTGTGA 187739492
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
     5203 TTAGAAGGAAGCAACCCTGCTGACGCCTTGGTTTCAGATTTCTGGCCTCCAGAACTATGA 5262

187739493 GATGATACATTTCCTTTGTTTACAATGGCCCCAGCAAACTAATAACACCTCTCTTTCTCA 187739552
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5263 GATGATACATTTCCTTTGTTTACAATGGCCCCAGCAAACTAATAACACCTCTCTTTCTCA 5322

187739553 ACAGCTAGTGTTCAGAGGGTGCAGCACTGAGGAATCCAGAACTTAAAGTCAGAAAAATGT 187739612
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5323 ACAGCTAGTGTTCAGAGGGTGCAGCACTGAGGAATCCAGAACTTAAAGTCAGAAAAATGT 5382

187739613 TTTAACTAGACTGGAGGCTCAGAAGCCATCTTTGATTGCTCCTCCCCAGATAAACACAGC 187739672
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5383 TTTAACTAGACTGGAGGCTCAGAAGCCATCTTTGATTGCTCCTCCCCAGATAAACACAGC 5442

187739673 GGCAGGAGAGAAGGCATGAATACACAGGTAGAGTACATAGCCCCAACTTCCCACACAAAA 187739732
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5443 GGCAGGAGAGAAGGCATGAATACACAGGTAGAGTACATAGCCCCAACTTCCCACACAAAA 5502

187739733 CACACTTTTGGCCGGCCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCCTTGTGGGAGGCAGAG 187739792
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5503 CACACTTTTGGCCGGCCGCGGTGGCTCATGCCTGTAATCCCAGCCTTGTGGGAGGCAGAG 5562

187739793 GCAGGCAGATAACCTGAAGTCAAGAATTCCAGACCAGCCTGGCCGACAAGGCGAAACCCT 187739852
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5563 GCAGGCAGATAACCTGAAGTCAAGAATTCCAGACCAGCCTGGCCGACAAGGCGAAACCCT 5622

187739853 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGAGCATGGTGGCACATGCCTGTAATTCCAGC 187739912
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     5623 GTCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCTGAGCATGGTGACACATGCCTGTAATTCCAGC 5682

187739913 TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGC 187739972
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5683 TACTCGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACCCGGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGC 5742

187739973 TGAGATCGTCCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAA 187740032
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5743 TGAGATCGTCCCACTGCACTCCAGCCTGGGTGACAGAGTGAGACTCTGTCTCAAAAACAA 5802

187740033 ACAAACAAAAACAAAACAAAACATTTTTTACAAATGTGGAATAAGTAAAATACTGCCCAA 187740092
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5803 ACAAACAAAAACAAAACAAAACATTTTTTACAAATGTGGAATAAGTAAAATACTGCCCAA 5862

187740093 ACTACATAAAATCAGTTGTCTGTGATGCTATATGGTAAGCATAAGTCATGTACAATTTCT 187740152
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5863 ACTACATAAAATCAGTTGTCTGTGATGCTATATGGTAAGCATAAGTCATGTACAATTTCT 5922

187740153 GCTACAATACAGTAAAGTACACATGTTTTTCACCAGGGTAAAATGTAAACATAAAGAAAA 187740212
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5923 GCTACAATACAGTAAAGTACACATGTTTTTCACCAGGGTAAAATGTAAACATAAAGAAAA 5982

187740213 CCCCTGAGCACCTTGGCAAAAATAACACTTCATAAGACCTATTTTACCTCTTTTTTTCCT 187740272
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5983 CCCCTGAGCACCTTGGCAAAAATAACACTTCATAAGACCTATTTTACCTCTTTTTTTCCT 6042

187740273 GGGTACACAGGATGGCTGTACTCCCCGCTCTCCTTTGCTGCTAGAATGGGCCACATAACT 187740332
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6043 GGGTACACAGGATGGCTGTACTTCCCGCTCTCCTTTGCTGCTAGAATGGGCCACATAACT 6102

187740333 GATTCTGGCCAATAGACTCTAAGTAGAACTGACCTAAGTGGAAGCAAAGAAGAGGGATGT 187740392
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6103 GATTCTGACCAATAGACTCTAAGTAGAACTGACCTAAGTGGAAGCAAAGAAGAGGGATGT 6162

187740393 GAGTCCTCCATCCTGCCTTTTCCCCTGTCACAGAGAAGTCATATGTCTAGATAGTGGAGA 187740452
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6163 GAGTCCTCCATCCTGCCTTTTCCCCTGTCACAGAGAAGTCATATGTCTAGATAGTGGAGA 6222

187740453 TGCAAAATTAACCTAGACTGGACCCTTAAGTCACTGATTGAAAGGGACCTGCCCTGGAGA 187740512
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6223 TGCAAAATTAACCTAGACTGGACCCTTAAGTCACTGATTGAAAGGGACCTGCCCTGGAGA 6282

187740513 ACCACCTGTCTGTCAGTGAAGGTTCTGATAGATAGAACTAGGTGTCTCTGAGATTAGGTG 187740572
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6283 ACCACCTGTCTGTCAGTGAAGGTTCTGATAGATAGAACTAGGTGTCTCTGAGATTAGGTG 6342

187740573 AGAATGATCTACCCTAACACTAAGCCTAACCCAACTGATGATGGCCCCTTGTGATCTGTC 187740632
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6343 AGAATGATCTACCCTAACACTAAGCCTAACCCAACTGATGATGGCCCCTTGTGATCTGTC 6402

187740633 TTTGACCAGTATACTATTCAAAAACAAGCCATTTGGCTGGGCACAGTGGCTCATGCCTGT 187740692
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6403 TTTGACCAGTATACTATTCAAAAACAAGCCATTTGGCTGGGCACAGTGGCTCATGCCTGT 6462

187740693 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACC 187740752
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6463 AATCCCAGCACTTTGGGAGGCCAAGGTGGGCAGATCACTTGAGGTCAGGAGTTTGAGACC 6522

187740753 ACCCTGGCCGGTATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAATATTAGCCGGGCGTG 187740812
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6523 ACCCTGGCCGGTATGGTGAAACCCCATCTCTACTAAAAATAAAAATATTAGCCGGGCGTG 6582

187740813 GTGGCTCATGCCTGTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACC 187740872
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6583 GTGGCTCATGCCTGTAGTCCTAGCTACTTGGGAGGCTGAGGCAGGAGAATCACTTGAACC 6642

187740873 CGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCATGATTGTGTCACTACACTCCAGCCTGGGCAACAG 187740932
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6643 CGGGAGGTGGAGGTTGCAGTGAGCCATGATTGTGTCACTACACTCCAGCCTGGGCAACAG 6702

187740933 AGAAAGACTCCATCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAGCCACTTGAAAATTATTAACTGGGCAT 187740992
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6703 AGAAAGACTCCATCTCCAAAAAAAAAAAAAAAAGCCACTTGAAAATTATTAACTGGGCAT 6762

187740993 TTCTCATGTTTCTTGTTTGCTGAGCTCACAGCCATTTTGGTGGAGCAACCCACCAAACCA 187741052
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6763 TTCTCATGTTTCTTGTTTGCTGAGCTCACAGCCATTTTGGTGGAGCAACCCACCAAACCA 6822

187741053 TGTTCATGTGATTCCTGCCTGAAATCACAGACTCCAGTCCCCATGATAAAGGAACTGTAT 187741112
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6823 TGTTCATGTGATTCCTGCCTGAAATCACAGACTCCAGTCCCCATGATAAAGGAACTGTAT 6882

187741113 TCCTAACTAGTCCTCCCTTAAGGAAAAAGGATGCTTCCTACCTCACAAAGCAGACATTCT 187741172
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6883 TCCTAACTAGTCCTCCCTTAAGGAAAAAGGATGCTTCCTACCTCACAAAGCAGACATTCT 6942

187741173 CAGACCAGCCCTGATTGTTAGAAATGTATTTCTTCAGACCACCTAAAGCCAGACCCTCTG 187741232
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6943 CAGACCAGCCCTGATTGTTAGAAATGTATTTCTTCAGACCACCTAAAGCCAGACCCTCTG 7002

187741233 TCACTTTCACACACTCGCCTTCTCAGTTCTACCCTCTAGAGCTCGGGAATAACAAGAAAC 187741292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7003 TCACTTTCACACACTCGCCTTCTCAGTTCTACCCTCTAGAGCTCGGGAATAACAAGAAAC 7062

187741293 TAGTCCATACTTCTCCCAAACTTCTTTCCCCTAGGCTGATGTTTTAATCAATGGAGATTT 187741352
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7063 TAGTCCATACTTCTCCCAAACTTCTTTCCCCTAGGCTGATGTTTTAATCAATGGAGATTT 7122

187741353 CTTTCCAGAAGCCTTGTTAATCAAGCTATCACTAATCAGTCAAATCCCAATAGAATGCAG 187741412
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7123 CTTTCCAGAAGCCTTGTTAATCAAGCTATCACTAATCAGTCAAATCCCAATAGAATGCAG 7182

187741413 GCCAAAACATTGTCCCAATTATTTTGTTGTGTTAGGATTTTATAATATAAAAAATATATA 187741472
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7183 GCCAAAACATTGTCCCAATTATTTTGTTGTGTTAGGATTTTATAATATAAAAAATATATA 7242

187741473 TTTTAAAGAAATGGAATTCCACCTGGGGCCTAACATTATTTCTGTTTTAGAAAGAGTTGC 187741532
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     7243 TTTTAAAGAAATGGAATTCCACCTGGGGCCTAACATTCTTTCTGTTTTAGAAAGAGTTGC 7302

187741533 ATCATAGTAATATTTGTTTTATTTTGCTTTATTGGGATTGAACCTGCCATTATGCTGCTG 187741592
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7303 ATCATAGTAATATTTGTTTTATTTTGCTTTATTGGGATTGAACCTGCCATTATGCTGCTG 7362

187741593 AGTGTCTCAGTATGAATGTTGGAAATAGCTTTCTCTCACCATTAGCTCAGAAAAAATCTG 187741652
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7363 AGTGTCTCAGTATGAATGTTGGAAATAGCTTTCTCTCACCATTAGCTCAGAAAAAATCTG 7422

187741653 TCAGCGAAACACAGGTAAATAGATTATGATTGTGTTGACAGCCCTTTTCATAAGCTAATG 187741712
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7423 TCAGCGAAACACAGGTAAATAGATTATGATTGTGTTGACAGCCCTTTTCATAAGCTAATG 7482

187741713 GGCTCTCTAACCCATTCGTGACTGCTGTCCCCCACAAGGTCTTATAAGCAGATTGCTCCA 187741772
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7483 GGCTCTCTAACCCATTCGTGACTGCTGTCCCCCACAAGGTCTTATAAGCAGATTGCTCCA 7542

187741773 GAGTTTGCTGAATTTGGCAAATTGATACACTGGGCTCATTTGATTTCCAATTTCTGTGAA 187741832
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7543 GAGTTTGCTGAATTTGGCAAATTGATACACTGGGCTCATTTGATTTCCAATTTCTGTGAA 7602

187741833 TGATTGTTAAGTAATTTAACAATACATGAGTGTGCTTAGAACGCCTTATGCAGCATTAGT 187741892
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7603 TGATTGTTAAGTAATTTAACAATACATGAGTGTGCTTAGAACGCCTTATGCAGCATTAGT 7662

187741893 TAGGGTAAATAAGCAATTCAGTTGAGAACAGCAATGTTAACACGGGCAAAATCTACTATC 187741952
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7663 TAGGGTAAATAAGCAATTCAGTTGAGAACAGCAATGTTAACACGGGCAAAATCTACTATC 7722

187741953 TTCCTTTTTAGTAGTGGATTCCCTTCATGTTTTAAGTGGAAATTTTAAAATATGTGCATA 187742012
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7723 TTCCTTTTTAGTAGTGGATTCCCTTCATGTTTTAAGTGGAAATTTTAAAATATGTGCATA 7782

187742013 CATGTGAGACTTCTGAGTCCTATCATTCATATTTGATCATTAGGGCTACTGCAGGAGAGG 187742072
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7783 CATGTGAGACTTCTGAGTCCTATCATTCATATTTGATCATTAGGGCTACTGCAGGAGAGG 7842

187742073 GAACATACAATTTTACTTGAAAGACGAAAGAAATCCAGTCAACACAAGGGCT 187742124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     7843 GAACATACAATTTTACTTGAAAGACGAAAGAAATCCAGTCAACACAAGGGCT 7894

Alignment time is 6.08587 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [187722824,187744762] =>     21939 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     4027] =>      4027 nucs 'mol-32-349d-083950_4027'

Score:        3980
Aligned:      4024        nucs
Identic:      4020 (100%) nucs =>      3951 (100%)        69 (100%)
Gaps:            0 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [187734278,187738232] EXCISED REGION [187738233,187738301]
 second seq =>  [        1,     3955] EXCISED REGION [     3959,     4027]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         3 nucs [3956,3958]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>        22 nucs [3956,3977] to [3959,3980]
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [187738231,187738232] to [187738233,187738234]
 second seq =>         2 nucs [3954,3955] to [3959,3960]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs

187734278 TCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTTTACATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTG 187734337
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TCCAAGTTCTACACTCAGCCTCAGTTTACATATGAGGGTGGTGGCTTGTCATTACCGCTG 60

187734338 GGCAAGAGGAGAAATTCTAGCTCTCAATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGA 187734397
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GGCAAGAGGAGAAACTCTAGCTCTCAATAGGCCTGCACTGATACCTCCTGGCTAGTAGGA 120

187734398 GCAGGAATGCCTCATTGCTGTTTCCCATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGT 187734457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GCAGGAATGCCTCATTGCTGTTTCCCATATTGTCTCCATTGACACCAAAAAGAAGGTGGT 180

187734458 AAATCTCTGACTCTCCACCAGGCTAACTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTG 187734517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATCTCTGACTCTCCACCAGGCTAACTTTCCCACCATCTCTGTGGGGAGGGGACAGGTG 240

187734518 CCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACA 187734577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CCTCGTTACTGCTGGGTCGAACTGGGAGTCTGGGCTATCCATGTGGTCTCCACTTACACA 300

187734578 ATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTA 187734637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATGATGGTGAGGGAGGGTGTTTGATTACCAGTCCGCAGGGAGGAACATTCTAGCCCCTTA 360

187734638 CTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGG 187734697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 CTCGGCTTTTTCTAATATCACCCCAGTGCAGGGAAGAGTTTGAGGACAGCCCAGTGAGGG 420

187734698 CAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGT 187734757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAGAAGTCTAGGTTTTCCATTTGGCTTTTGCTGGCATGAGTGAGAGATCATGCCATGAGT 480

187734758 GAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTT 187734817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGAGTGGTTATTAAAATGTCCAACTATAGTTATAGATTTGTCTATTTCTTCTTTCAGTT 540

187734818 TTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGA 187734877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TTATCAGTTCTTATTTCACATATTTTACAACATTACTCTATGGTGCATACACATTTAGGA 600

187734878 TTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTAT 187734937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGCTATATCTTCTTGATTGAGTGACCCCTTTATCACTTTGGTTGAGATAGAATGGCTAT 660

187734938 CATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAG 187734997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 CATCTAAAAGATTTCGGTCTTGCCATGCTTTCCCTTTCCTGATCCTTTGGCTAAAGACAG 720

187734998 CAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCCGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAG 187735057
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CAGGCTTTTGCTGAGGCTTTTCTGTCTGTACTCATAGGTGCTTCTAGTTACTGGCTTCAG 780

187735058 CTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTC 187735117
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 CTCCAAGTCTGGAATATAAGAGACACAAGAAAGCTGGGGGAACTCACCGTTATGTTGTTC 840

187735118 CTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTA 187735177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CTTGGCTTTTGAACCCCTAGTTAGCCTGCCTTCTCTTTTCTACCTATCAGAATATTCTTA 900

187735178 CATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAA 187735237
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CATTTGTTTTGTGTAGAACAGCCAAGGATTTTAGTTGCACTCAGCAGGAGGAAGAGAGAA 960

187735238 AAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGT 187735297
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAGTGTGTCTACTCAATCTTTCCAGAAGTGAAAGTCTCCACTGAACTTTTGAAATGGTGT 1020

187735298 TAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTT 187735357
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TAAAACTGGATTTCTTACCCCAGTGTCTCATCCTTGCAGATAAAGTGTCATACCCTCTTT 1080

187735358 AAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATT 187735417
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAAATACTGAGAGACCATGCCATTTTCCTTTTTGCAAAACTGTCATGAATCTTCATTATT 1140

187735418 GCCTCTGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTT 187735477
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GCCTCTGGAATAATATGTAACATATCTGACTGCTGTTTAAAGTCTTCGTTATGTAACTTT 1200

187735478 TACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTG 187735537
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TACCTACCTCTTTAATCTCTTGCTCTTCCCTTCCACAGGACCTAGAATCTCAGTGAATTG 1260

187735538 GACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGT 187735597
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GACTTCTGTCGGGATTCCCTGAAAACTCTTCATGGTTTCTTGCTGCCTCAACTTGCTAGT 1320

187735598 TATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGT 187735657
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 TATTCTGTATACTTAGGACACCCCCCAAAAGTGCAAATTTTTTCTTTCCCATTTAAGGGT 1380

187735658 CATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTG 187735717
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 CATTTAGAAACTACAACCTATCTTTTCTATTTCCCTTAGAATTATGACCTACGTTATCTG 1440

187735718 TGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAAC 187735777
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGGCACTTCTGTGGTGTGGACTGCCTATTGCCTGTGTAGAAGTTACATGTGAATATAAAC 1500

187735778 TTATCTCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTG 187735837
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 TTATCTCCACTACTAGATTATAAGATCCTTGAGGGATGAAGCCCTGTATGATTCCTCTTG 1560

187735838 GCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTG 187735897
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GCCTTCTCCAAAGGCCTTGGCACAAGGCATGACACAAAATACATGCACAAAGAACATCTG 1620

187735898 AAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCT 187735957
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AAGAATTAAAAACTCAGTAACTCACATGGTTCCCTACATGATAGTCCATCCAAAAAGTCT 1680

187735958 AATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCA 187736017
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AATTGACTTTGCATCTTTAAGTATTTAGGGAGCTGTTTTCTAGGACTGGCTCTTGAGGCA 1740

187736018 AGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTAC 187736077
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGGATTGACTTAGCATCTAAAGAGAGCTGGTTTCTTGTGTAATTGGAGGGAAAGCACTAC 1800

187736078 TCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGA 187736137
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCTCTGTACCAAGCCAGATCTCTAGGGAAAGACTTTTTGTGGCTTTCAAAACCATAAAGA 1860

187736138 CTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAA 187736197
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 CTGTCTTGTAAGACTACAGGTTGATTATGAAAAGATGGGACGTAGACAGAGATCCAGAAA 1920

187736198 TCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTT 187736257
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 TCTGCTGATTTATAGAAATAACACCTCCTATCATCCAAATTAGTAGTTCAAATTCTTCTT 1980

187736258 AGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTC 187736317
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 AGCAGTGCCAAACTAAAAGGGCATATATTTTAAAATCAGGGTGGAAAAGTGATCTTCTTC 2040

187736318 ATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCAT 187736377
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 ATCTATTCTTAGCTCAGAACATATCTATATCCAACAATATACTTGAGATTGGCTTTGCAT 2100

187736378 TGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAG 187736437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 TGAGAGATCTATCCTGGGAATGAATATTTTCCAAGGAGCTCTCCCACTATCACAAAATAG 2160

187736438 GAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAG 187736497
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GAGAAGGTAAAGTGGCTAGGAAGGGAGGAAGAGCTAGGGATGAGAACAAGAGGAGAGAAG 2220

187736498 AGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTC 187736557
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2221 AGGGAAAGTTTTCCATTCTTGTAATTGTCAAGAGCCACTCCTTGATGATTCCGCCTCCTC 2280

187736558 TCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCT 187736617
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2281 TCCTTGTCTGAGCTTCTTTTCTCCCCATCATGTTTGCTGCAGTATCTTTCTACATGGTCT 2340

187736618 CCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCC 187736677
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 CCCAGTCTGCATGTTTCTCTGCATCACTCCATGCTAAACACAAACACCAAAATCATCTCC 2400

187736678 CTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCA 187736737
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTAAAACTGGACTCTGCACCATCTACATTTTCAAAGAAACCTTATCTCTTCCTTATGGCA 2460

187736738 CAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACT 187736797
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 CAGTAATCATGTCCAGATACCTTCACCAGGCACTCATGGTATATAGCTTTACCTCTCACT 2520

187736798 ATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGA 187736857
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 ATCCCAGTTACACCTAAGCAGGTAAAAGAAGGATGGGAAAAATACAGTCTCTAAGTCAGA 2580

187736858 CCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTA 187736917
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCTGAGCTCAACTCCAGCTCAGTCTCGTAATAGTTTAATGATCTTAGGTAACATATTTTA 2640

187736918 CCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTC 187736977
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 CCTTGAGGAGTCTCCGTTTCATTAAAAACTTGATTTAAAATAATAACTCAAAGGGCTGTC 2700

187736978 ATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATG 187737037
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 ATGAGGAATAAGCAACGTGGTGAATAAATTATATAGCATGTAATAGGTGCTCAATAAATG 2760

187737038 GTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCT 187737097
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 GTAGCTACTTGTACTATGCTCAACCACATTGAACAATTTCCCTTTTGCCAAAATACCCCT 2820

187737098 GAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATA 187737157
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 GAGTCTTTTCTCAGGCCAATGGCCCTGGCAAGATTGCCAAATGTGCCTACAGAAAGAATA 2880

187737158 CATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGC 187737217
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CATTATGCCAGGAGGAAAGGAGACTGGCTGAGGATGAAAGGTGGGTGGGGATGAGACAGC 2940

187737218 ATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAG 187737277
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2941 ATCCACATAAGGTAAGCTGCCCCTTGTTAGAAAGAAATGATGAATGGAGCTCTGAGAGAG 3000

187737278 GCGCAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCA 187737337
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GCACAGGTGAAGGGGCAGGTCCACAAATTCAGAGTGGCCAGGCAGGGTCAGGCAGTTTCA 3060

187737338 GCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAG 187737397
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3061 GCATCTGATTCTCTTCCCTGACCATTAGAGCAATCCTCGGCCTGTCTTTCCACAACTAAG 3120

187737398 GAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAG 187737457
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3121 GAGGACACATCTCTTATCTCTTCATGCAGATGAATTGTCTGTGTTTCTTTAACAGAGAAG 3180

187737458 ACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGG 187737517
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3181 ACATTCAGATGCTATATCCAGCACAGAAGAGAGGTTAGCAGAGGGCAACTCGGCTTGGGG 3240

187737518 TTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTA 187737577
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3241 TTTTAAATCTGAAGTATATTCACTATGGCTTGTACAGTTATAGTACCCATTATGTATGTA 3300

187737578 TGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTAT 187737637
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3301 TGTTATTATAAGGGGCTCTAGGAAATAGTGTCAGGAGACTCACTTCATAAGTATGTTTAT 3360

187737638 TATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTAT 187737697
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3361 TATTATCTCCGCTGTTCAAGCCACACAAAATAAATGTCTGGCATTTCCAGAAATTGCTAT 3420

187737698 CGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCA 187737757
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3421 CGATTCAGCAGCAGATTTTACAAGGCCAATCAATAACAGTTTCCTCCTTTCCCCCTCCCA 3480

187737758 CAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAA 187737817
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3481 CAGTGTGTATTTATTTGTGATGAAGCTGTCTGTTCCTCCTGCGCTTTCTAGTGCTTATAA 3540

187737818 TTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAA 187737877
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3541 TTGGTCCAGAATAAACGGATGATTTCATCTTTTTCCAGGAAAAAAAGAGAGAATAAAAAA 3600

187737878 CCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGA 187737937
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3601 CCTGCTATTAAAAATATCTTCCTCCCCCAGCCAAAAACAAAACTGTGTGTGTGAGGGAGA 3660

187737938 GAGATAGAGATTGAGATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTC 187737997
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3661 GAGATAGAGATTGAGATAGATACATCAATATAGATACAGATATAGATAGTGACTGAATTC 3720

187737998 AAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTC 187738057
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3721 AAGCATGTCTGCCAGAGTGAGACCTTCAGCACATAAGCCACAGTCTGTGATCCTCTTTTC 3780

187738058 CCTGTACCGAAGTCATGCTAGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTT 187738117
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3781 CCTGTACCGAAGTCATGCTGGATTAGGAGATTAGGGGCCCAGAAAGGCATATAGACCCTT 3840

187738118 TCAGTCATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAA 187738177
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3841 TCAGTCATGAGTTCTTGTATTATGATGCCTTAGTATTTTTCAGTGTCACCAACTATCTAA 3900

187738178 CAGAGGCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTT 187738232
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3901 CAGAGGCTGAAAGCAGGCAAGAACTTCAGAGTTTACCAACCCCAGCCTTTCTTTT 3955

EXCISED REGION

187738233 TTATTATTATTATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGT 187738292
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3959 TTATTATTATTATTATTATTATACTTTAAGTTTTAGGGTACATGTGCACAATGTGCAGGT 4018

187738293 TAGTTACAT 187738301
          |||||||||
     4019 TAGTTACAT 4027

Alignment time is 3.12877 s

