
MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162707306,162733554] =>     26249 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3307] =>      3307 nucs 'mol-32-1ef5-084712_3307'

Score:        3063
Aligned:      3307        nucs
Identic:      3275 ( 99%) nucs =>      2896 (100%)       379 ( 95%)
Gaps:           16 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162714399,162717306] EXCISED REGION [162723555,162723944]
 second seq =>  [        4,     2908] EXCISED REGION [     2913,     3307]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6248 nucs [162717307,162723554]
 second seq =>         4 nucs [2909,2912]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162717305,162717308] to [162723553,162723556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [162717304,162717306] to [162723555,162723557]
 second seq =>         3 nucs [2906,2908] to [2913,2915]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [162717307,162717308] to [162723553,162723554]
 second seq =>         0 nucs

162714399 CACATAAATTAAAATGCATTGGGGTTAATTAATATATATTTTTATATGAGCATTTATTTA 162714458
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        4 CACATAAATTAAAATGCATTGGGGTTAATTAATATATATTTTTATATGAGCATTTATTTA 63

162714459 CCTAAGCAAATCTGAATCAAATTTCTTACTTATTTCTGACTGACTATACCAGATTTTACC 162714518
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
       64 CCTAAGCAAATCTGAATCAAATTTCTTAATTATTTCTGACTGACTATACCAGATTTTACC 123

162714519 CTGTGGACACAATATACAACATAATACATGCAAATATGTGTAAGCATGGCTAAATTCATA 162714578
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      124 CTGTGGACACAATATACAACATAATACATGCAAATATGTGTAAGCATGGCTAAATTCATA 183

162714579 TGTACAAAAAAATCTTATAGCTTTCATTTTAGGTTTTTAGTCATGAGATAGTAGCACAAA 162714638
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
      184 TGTACAAAAAAATCTTATAGCTTTCATTTTAGGTTTTTAGTCATGAGATAGTAGCGCAAA 243

162714639 CATAATGGTTTATAAAAAATAGGTGAATCCAAATTACAATTCTGACTAAACGAGACATCT 162714698
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      244 CATAATGGTTTATAAAAAATAGGTGAATCCAAATTACAATTCTGACTAAACGAGACATCT 303

162714699 GTTCATATGGTTAATTTTTTTTCTTTTTTGCCCTGATTGGTAATCTGATGAAGGCTGTAG 162714758
          ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
      304 GTTCATATGGTTAATTTTTTT-CTTTTTTGCCCTGATAGGTAATCTGATGAAGGCTGTAG 362

162714759 ATTAAAGTTTTGGGTAAAGCAGTTTGGCTTAAAAATCTCCTTCTCATTTTTTCCTCCTTT 162714818
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      363 ATTAAAGTTTTGGGTAAAGCAGTTTGGCTTAAAAATCTCCTTCTCATTTTTTCCTCCTTT 422

162714819 TTTAGTTTCAAATGAGTTTAAATTTTCATTTTTGACATTTTAGCTAGGACTGGCAGAATT 162714878
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
      423 TTTAGTTTCAAATGAGTTTAAATTTTCAATTTTGACATTTTAGCTAGGACTGGCAGAATT 482

162714879 GTATAAGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATAAAATCAATTTTTTGT 162714938
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      483 GTATAAGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATAAAATCAATTTTTTGT 542

162714939 TTGCCAAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATTTTAGCTTTTTTGTTT 162714998
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      543 TTGCCAAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATTTTAGCTTTTTTGTTT 602

162714999 TATTTTGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTGTATGCTGAACACAGA 162715058
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      603 TATTTTGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTGTATGCTGAACACAGA 662

162715059 TATTTTAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATCTGAGAAAACTTTTAT 162715118
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      663 TATTTTAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATCTGAGAAAACTTTTAT 722

162715119 AAGCATTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAGTGAACTGTTCTGTCA 162715178
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      723 AAGCATTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAGTGAACTGTTCTGTCA 782

162715179 CCCCCACATGATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCAAAAGGTATTTAAGTT 162715238
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      783 CCCCCACATGATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCAAAAGGTATTTAAGTT 842

162715239 GTTACAATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTTTCTTTTTTATTTTTT 162715298
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      843 GTTACAATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTTTCTTTTTTATTTTTT 902

162715299 TATATTGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATCTGGAGAAGAGTCAGC 162715358
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      903 TATATTGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATCTGGAGAAGAGTCAGC 962

162715359 AAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAGAAAACTTAGGTTCTA 162715418
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      963 AAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAGAAAACTTAGGTTCTA 1022

162715419 CATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATCAAAAAGTTTGGGGAG 162715478
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1023 CATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATCAAAAAGTTTGGGGAG 1082

162715479 TTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAAAATCTATGTAGCTAA 162715538
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1083 TTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAAAATCTATGTAGCTAA 1142

162715539 CTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTCATTACATTTTATGTA 162715598
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1143 CTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTCATTACATTTTATGTA 1202

162715599 ATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATGTCAGAAGTTTGAACC 162715658
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1203 ATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATGTCAGAAGTTTGAACC 1262

162715659 AGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCATCCCGGGTCCACCAT 162715718
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1263 AGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCATCCCGGGTCCACCAT 1322

162715719 TTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCCGAAAGTAGCTAGGGAAAAGAGCTGAATA 162715778
          ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
     1323 TTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCCCAAAGTAGCTAGGGAAAAGAGCTGAATA 1382

162715779 TTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGAGTGCTCACAAAAATT 162715838
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1383 TTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGAGTGCTCACAAAAATT 1442

162715839 GTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGCAAAAAGAAACAAAAG 162715898
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1443 GTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGCAAAAAGAAACAAAAG 1502

162715899 TAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATAGAATGCAAATTCTGTAGAAACTAGAGCACTC 162715958
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     1503 TAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATGGAATGCAAATTCTGTAGAAACTAGAGCACTC 1562

162715959 AAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGGGAAGATAAAATAATC 162716018
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     1563 AAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGGAAAGATAAAATAATC 1622

162716019 TTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGCCTTATAATCAAAACA 162716078
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1623 TTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGCCTTATAATCAAAACA 1682

162716079 AATCCTGAACAAAGTTTAAAAAACCTTCTAACAAAAAGAAGTCTTTCCCTGAGAAAAGAT 162716138
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1683 AATCCTGAACAAAGTTTAAAAAAACTTCTAACAAAAAGAAGTCTTTCCCTGAGAAAAGAT 1742

162716139 TCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAGGGCTCATGTGGGTAC 162716198
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1743 TCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAGGGCTCATGTGGGTAC 1802

162716199 TGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCTTGCTTCATGGCCTGC 162716258
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1803 TGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCTTGCTTCATGGCCTGC 1862

162716259 TTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAGCTCTCTAAAATAAGA 162716318
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1863 TTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAGCTCTCTAAAATAAGA 1922

162716319 TGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTCAATAGGAATATGTGT 162716378
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1923 TGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTCAATAGGAATATGTGT 1982

162716379 GTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAAAGATTTTTAACAAAA 162716438
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1983 GTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAAAGATTTTTAACAAAA 2042

162716439 CGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGATAGGGATCACTAATAA 162716498
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     2043 CGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGATAGGGATCATTAATAA 2102

162716499 GTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATGTCTTTACAGGAGTAT 162716558
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2103 GTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATGTCTTTACAGGAGTAT 2162

162716559 TTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTTTGAAATCTTTTATGA 162716618
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2163 TTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTTTGAAATCTTTTATGA 2222

162716619 TAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTATTACCTTTACATATCA 162716678
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2223 TAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTATTACCTTTACATATCA 2282

162716679 ATAAAAATTTTCATAGTACTCACACATGTTACCATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATG 162716738
          |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||
     2283 ATAAAAATTTTCATAGTACTCACAC--GTTACCATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATG 2340

162716739 AAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTGGTATTATTATTATAT 162716798
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2341 AAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTGGTATTATTATTATAT 2400

162716799 CTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCCATTTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAATAT 162716858
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2401 CTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCCATTTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAATAT 2460

162716859 TAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAATTA 162716918
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2461 TAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAATTA 2520

162716919 GCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTT 162716978
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2521 GCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTT 2580

162716979 CCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAAAGCACAGATACATAG 162717038
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2581 CCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAAAGCACAGATACATAG 2640

162717039 AGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGAAAT 162717098
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2641 AGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGAAAT 2700

162717099 GAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTA 162717158
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2701 GAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTA 2760

162717159 ATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCATGCTGATTGTATTGA 162717218
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2761 ATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCATGCTGATTGTATTGA 2820

162717219 ATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATTCAG 162717278
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2821 ATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATTCAG 2880

162717279 CCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 162717306
          ||||||||||||||||||||||||||||
     2881 CCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 2908

EXCISED REGION

162723555 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 162723614
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2913 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGAGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 2972

162723615 GTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGAGAATT 162723674
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2973 GTAAACTATCACAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGGGAATT 3032

162723675 GAACAATGT----GAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 162723730
          |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3033 GAACA----GTGAGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 3088

162723731 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCACTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 162723790
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3089 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 3148

162723791 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGACACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 162723850
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3149 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 3208

162723851 TGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAT-----AATAAAATTAAAAAATTAAAA 162723905
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||
     3209 TGCGCATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATTAAAAAATTAAAA 3268

162723906 AAATATATGTTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGAT 162723944
          ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3269 AAATATATATTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGAT 3307

Alignment time is 3.26089 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162707306,162733554] =>     26249 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3115] =>      3115 nucs 'mol-32-1f00-112625_3115'

Score:        2906
Aligned:      3117        nucs
Identic:      3088 ( 99%) nucs =>      2435 (100%)       653 ( 97%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162714864,162717306] EXCISED REGION [162723555,162724219]
 second seq =>  [        1,     2441] EXCISED REGION [     2446,     3115]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6248 nucs [162717307,162723554]
 second seq =>         4 nucs [2442,2445]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162717305,162717308] to [162723553,162723556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [162717304,162717306] to [162723555,162723557]
 second seq =>         3 nucs [2439,2441] to [2446,2448]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [162717307,162717308] to [162723553,162723554]
 second seq =>         0 nucs

162714864 AGGACTGGCAGAATTGTATAAGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATA 162714923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGGACTGGCAGAATTGTATAAGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATA 60

162714924 AAATCAATTTTTTGTTTGCCAAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATT 162714983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAATCAATTTTTTGTTTGCCAAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATT 120

162714984 TTAGCTTTTTTGTTTTATTTTGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTG 162715043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTAGCTTTTTTGTTTTATTTTGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTG 180

162715044 TATGCTGAACACAGATATTTTAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATC 162715103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TATGCTGAACACAGATATTTTAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATC 240

162715104 TGAGAAAACTTTTATAAGCATTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAG 162715163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TGAGAAAACTTTTATAAGCATTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAG 300

162715164 TGAACTGTTCTGTCACCCCCACATGATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCA 162715223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGAACTGTTCTGTCACCCCCACATGATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCA 360

162715224 AAAGGTATTTAAGTTGTTACAATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTT 162715283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AAAGGTATTTAAGTTGTTACAATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTT 420

162715284 TCTTTTTTATTTTTTTATATTGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATC 162715343
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TCTTTTTTATTTTTTTATATTGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATC 480

162715344 TGGAGAAGAGTCAGCAAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAG 162715403
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TGGAGAAGAGTCAGCAAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAG 540

162715404 AAAACTTAGGTTCTACATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATC 162715463
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AAAACTTAGGTTCTACATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATC 600

162715464 AAAAAGTTTGGGGAGTTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAA 162715523
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAAGTTTGGGGAGTTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAA 660

162715524 AATCTATGTAGCTAACTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTC 162715583
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AATCTATGTAGCTAACTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTC 720

162715584 ATTACATTTTATGTAATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATG 162715643
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ATTACATTTTATGTAATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATG 780

162715644 TCAGAAGTTTGAACCAGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCA 162715703
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TCAGAAGTTTGAACCAGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCA 840

162715704 TCCCGGGTCCACCATTTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCCGAAAGTAGCTAGG 162715763
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
      841 TCCCGGGTCCACCATTTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCCCAAAGTAGCTAGG 900

162715764 GAAAAGAGCTGAATATTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGA 162715823
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GAAAAGAGCTGAATATTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGA 960

162715824 GTGCTCACAAAAATTGTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGC 162715883
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GTGCTCACAAAAATTGTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGC 1020

162715884 AAAAAGAAACAAAAGTAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATAGAATGCAAATTCTGTA 162715943
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1021 AAAAAGAAACAAAAGTAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATGGAATGCAAATTCTGTA 1080

162715944 GAAACTAGAGCACTCAAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGG 162716003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 GAAACTAGAGCACTCAAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGG 1140

162716004 GAAGATAAAATAATCTTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGC 162716063
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAAGATAAAATAATCTTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGC 1200

162716064 CTTATAATCAAAACAAATCCTGAACAAAGTTTAAAAAACCTTCTAACAAAAAGAAGTCTT 162716123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1201 CTTATAATCAAAACAAATCCTGAACAAAGTTTAAAAAAACTTCTAACAAAAAGAAGTCTT 1260

162716124 TCCCTGAGAAAAGATTCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAG 162716183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TCCCTGAGAAAAGATTCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAG 1320

162716184 GGCTCATGTGGGTACTGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCT 162716243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GGCTCATGTGGGTACTGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCT 1380

162716244 TGCTTCATGGCCTGCTTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAG 162716303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGCTTCATGGCCTGCTTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAG 1440

162716304 CTCTCTAAAATAAGATGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTC 162716363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 CTCTCTAAAATAAGATGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTC 1500

162716364 AATAGGAATATGTGTGTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAA 162716423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATAGGAATATGTGTGTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAA 1560

162716424 AGATTTTTAACAAAACGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGAT 162716483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AGATTTTTAACAAAACGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGAT 1620

162716484 AGGGATCACTAATAAGTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATG 162716543
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AGGGATCATTAATAAGTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATG 1680

162716544 TCTTTACAGGAGTATTTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTT 162716603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TCTTTACAGGAGTATTTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTT 1740

162716604 TGAAATCTTTTATGATAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTAT 162716663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TGAAATCTTTTATGATAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTAT 1800

162716664 TACCTTTACATATCAATAAAAATTTTCATAGTACTCACACATGTTACCATTTTTAAAGTT 162716723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||
     1801 TACCTTTACATATCAATAAAAATTTTCATAGTACTCACAC--GTTACCATTTTTAAAGTT 1858

162716724 TGAAAAAGTCACATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTG 162716783
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TGAAAAAGTCACATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTG 1918

162716784 GTATTATTATTATATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCCATTTTGTTCCAGTAT 162716843
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
     1919 GTATTATTATTATATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTCCTCCCATTTTGTTCCAGTAT 1978

162716844 AATTAATAAGAATATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATT 162716903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AATTAATAAGAATATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATT 2038

162716904 TTTTTTACAAAATTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTT 162716963
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TTTTTTACAAAATTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTT 2098

162716964 ACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAA 162717023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 ACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAA 2158

162717024 AGCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAAC 162717083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AGCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAAC 2218

162717084 ATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAA 162717143
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 ATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAA 2278

162717144 AAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCA 162717203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 AAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCA 2338

162717204 TGCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAA 162717263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TGCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAA 2398

162717264 TCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 162717306
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 2441

EXCISED REGION

162723555 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 162723614
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2446 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGAGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 2505

162723615 GTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGAGAATT 162723674
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2506 GTAAACTATCACAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGGGAATT 2565

162723675 GAACAATGT----GAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 162723730
          |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2566 GAACA----GTGAGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 2621

162723731 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCACTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 162723790
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2622 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 2681

162723791 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGACACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 162723850
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2682 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 2741

162723851 TGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAT-----AATAAAATTAAAAAATTAAAA 162723905
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||
     2742 TGCGCATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATTAAAAAATTAAAA 2801

162723906 AAATATATGTTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGATACTCCCACATTCTCCCAAATC 162723965
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2802 AAATATATATTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGATACTCCCACATTCTCCCAAATC 2861

162723966 TGGAAGGTCAATGTTTATAGATGCATTTTAAAATACATCTATTATAGGAGTATAAAAACT 162724025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2862 TGGAAGGTCAATGTTTATAGATGCATTTTAAAATACATCTATTATAGGAGTATACAAACT 2921

162724026 TCTCCCAAAATAAATACTGACTTAAACTGACAACCAACAATTTCTTTTATTGTTTGTCTG 162724085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2922 TCTCCCAAAATAAATACTGACTTAAACTGACAACCAACAATTTCTTTTATTGTTTGTCTG 2981

162724086 TTGCTTGCTCTATGATGCTAGACAGTGCAAAGGCCATTATATGTATTTTGTTCTTTCATA 162724145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2982 TTGCTTGCTCTATGATGCTAGACAGTGCAAAGGCCATTATATGTATTTTGTTCTTTCATA 3041

162724146 TTTACAATGAGAGTAACATTTGGTTACATTTCATATATATTTTTAATAGTTTCTAAAAGT 162724205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3042 TTTACAATGAGAGTAACATTTGGTTACATTTCATATATATTTTTAATAGTTTCTAAAAGT 3101

162724206 TATTTTTATAATAA 162724219
          ||||||||||||||
     3102 TATTTTTATAATAA 3115

Alignment time is 3.00709 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162707306,162733554] =>     26249 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     4549] =>      4549 nucs 'mol-32-29b3-049442_4549'

Score:        4149
Aligned:      4517        nucs
Identic:      4459 ( 99%) nucs =>       599 (100%)      3860 ( 99%)
Gaps:           34 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162716708,162717306] EXCISED REGION [162723555,162727447]
 second seq =>  [        1,      599] EXCISED REGION [      604,     4512]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6248 nucs [162717307,162723554]
 second seq =>         4 nucs [600,603]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162717305,162717308] to [162723553,162723556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [162717304,162717306] to [162723555,162723557]
 second seq =>         3 nucs [597,599] to [604,606]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [162717307,162717308] to [162723553,162723554]
 second seq =>         0 nucs

162716708 TACCATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTT 162716767
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TACCATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTT 60

162716768 TCATTAGATATTTGTGGTATTATTATTATATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCC 162716827
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TCATTAGATATTTGTGGTATTATTATTATATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCC 120

162716828 CATTTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAATATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTT 162716887
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CATTTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAATATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTT 180

162716888 ATTTGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAATTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGC 162716947
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 ATTTGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAATTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGC 240

162716948 ATGTGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAG 162717007
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ATGTGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAG 300

162717008 AAGATGGATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCAT 162717067
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 AAGATGGATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCAT 360

162717068 GGTCTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTAT 162717127
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGTCTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTAT 420

162717128 TTTCTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGAT 162717187
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTCTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGAT 480

162717188 GTAGTCTATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCA 162717247
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GTAGTCTATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCA 540

162717248 GAAACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 162717306
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 599

EXCISED REGION

162723555 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 162723614
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      604 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGAGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 663

162723615 GTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGAGAATT 162723674
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      664 GTAAACTATCACAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGGGAATT 723

162723675 GAACAATGT----GAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 162723730
          |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      724 GAACA----GTGAGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 779

162723731 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCACTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 162723790
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      780 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 839

162723791 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGACACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 162723850
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      840 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 899

162723851 TGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAT-----AATAAAATTAAAAAATTAAAA 162723905
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||
      900 TGCGCATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATTAAAAAATTAAAA 959

162723906 AAATATATGTTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGATACTCCCACATTCTCCCAAATC 162723965
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      960 AAATATATATTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGATACTCCCACATTCTCCCAAATC 1019

162723966 TGGAAGGTCAATGTTTATAGATGCATTTTAAAATACATCTATTATAGGAGTATAAAAACT 162724025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     1020 TGGAAGGTCAATGTTTATAGATGCATTTTAAAATACATCTATTATAGGAGTATACAAACT 1079

162724026 TCTCCCAAAATAAATACTGACTTAAACTGACAACCAACAATTTCTTTTATTGTTTGTCTG 162724085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1080 TCTCCCAAAATAAATACTGACTTAAACTGACAACCAACAATTTCTTTTATTGTTTGTCTG 1139

162724086 TTGCTTGCTCTATGATGCTAGACAGTGCAAAGGCCATTATATGTATTTTGTTCTTTCATA 162724145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1140 TTGCTTGCTCTATGATGCTAGACAGTGCAAAGGCCATTATATGTATTTTGTTCTTTCATA 1199

162724146 TTTACAATGAGAGTAACATTTGGTTACATTTCATATATATTTTTAATAGTTTCTAAAAGT 162724205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1200 TTTACAATGAGAGTAACATTTGGTTACATTTCATATATATTTTTAATAGTTTCTAAAAGT 1259

162724206 TATTTTTATAATAATATATTAGGTCTTGTGTTCAAATACGTGTGTGTATGTGTACAACAT 162724265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1260 TATTTTTATAATAATATATTAGGTCTTGTGTTCAAATATGTGTGTGTATGTGTACAACAT 1319

162724266 TAACAATGCACATTAATATTGATGATAAAGGAACTTCTTACTTTGTGCATGCAAAAAAGA 162724325
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1320 TAACAATGCACATTAATATTGATGATAAAAGAACTTCTTACTTTGTGCATGCAAAAAAGA 1379

162724326 TTAAGCCCTTATTTTATAATATTGCTTAAGACAATGTTGATGATACTGAGTAAAGTTTTC 162724385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1380 TTAAGCCCTTATTTTATAATATTGCTTAAGACAATGTTGATGATACTGTGTAAAGTTTTC 1439

162724386 ATGAGGTGAACATTGCTAAAATTTACAAAGGGTCTGGTGGTAGGAGTTATATATTTTAAT 162724445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1440 ATGAGGTGAACATTGCTAAAATTTACAAAGGGTCTGGTGGTAGGAGTTATATATTTTAAT 1499

162724446 CCAAAGCACCTTCTAACTAAAAACTGAAGTAATTGTACAACATCATTAAAATATACTTCC 162724505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1500 CCAAAGCACCTTCTAACTAAAAACTGAAGTAATTGTACAACATCATTAAAATATACTTCC 1559

162724506 ACAGATTCTGAGAATCAAATAAAAATTATTTCTTTAATTTCATATCTTCAGTATTTGTAA 162724565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1560 ACAGATTCTGAGAATCAAATAAAAATTATTTCTTTAATTTCATATCTTCAGTATTTGTAA 1619

162724566 CATTACCCTACTCCATAATTAACATATCAATAAATTTCAAAGAAAACATACACATAGAGT 162724625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1620 CATTACCCTACTCCATAATTAACATATCAATAAATTTCAAAGAAAACATACACATAGAGT 1679

162724626 ACTAAAATCTGAATTTTCCTACTTCCTGTCCATCTGTACCCCCTATCATTTATCACCATC 162724685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1680 ACTAAAATCTGAATTTTCCTACTTCCTGTCCATCTGTACCCCCTATCATTTATCACCATC 1739

162724686 TAGACACCCACCATTTAACTAGGGTAAAATAAAAATATACATTTTCTTATTCATTATGGT 162724745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1740 TAGACACCCACCATTTAACTAGGGTAAAATAAAAATATACATTTTCTTATTCATTATGGT 1799

162724746 AAATTTACTATATAAGTTATGCTTTAATGAGCACTCAGTACTTAAACAGAAGACAGCTTA 162724805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1800 AAATTTACTATATAAGTTATGCTTTAATGAGCACTCAGTACTTAAACAGAAGACAGCTTA 1859

162724806 AGATCCAAGACTGAGATATTAAAATCCAAACATTGCAGCCAGAAAGAATAATTAATAAGA 162724865
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1860 AGATCCAAGACTGAGATATTAAAATCCAAACATTGCACCCAGAAAGAATAATTAATAAGA 1919

162724866 TTATCATTAACGGAGACACTCTATATCTGTTCCTTATTTAAGCTATTTTCAGCTCAGATT 162724925
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1920 TTATCATTAACAGAGACACTCTATATCTGTTCCTTATTTAAGCTATTTTCAGCTCAGATT 1979

162724926 TCGATAAGAAAGTTACTCTTCTTACTAGAGCTTTTGAAATAAAGCACTCATCATTGGTGA 162724985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1980 TCGATAAGAAAGTTACTCTTCTTACTAGAGCTTTTGAAATAAAGCACTCATCATTGGTGA 2039

162724986 AATGATGTTCAGCAGAGAACCTTCAACTATCAAACTTAGAACAAGAACACTAACCAGGTC 162725045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     2040 AATGATGTTCAGCAGAGAACCTTCAACTATCAAACTTAGAACAAGAAGACTAACCAGGTC 2099

162725046 TCAAAAATCACAATCAGAAAAAGGCACCATTTACAGAGCAATACCTAATATACAAGAGAA 162725105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2100 TCAAAAATCACAATCAGAAAAAGGCACCATTTACAGAGCAATACCTAATATATAAGAGAA 2159

162725106 GGCAATTTTAAAAGGCATATGAGAAACAAAGCAAAACAACCTTTCCCCAAATATTGATAG 162725165
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2160 GGCAATTTTAAAAGGCATATGAGAAACAAAGCAAAACAACCTTTCACCAAATATTGATAG 2219

162725166 TGATACTTTTATTTGAAAACTGAAATAAAGCAAGCAATTGCAGGAATATTAGATAAATTT 162725225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2220 TGATACTTTTATTTGAAAACTGAAATAAAGCAAGCAATTGCAGGAATATTAGATAAATTT 2279

162725226 CGTTGCAATTTTCATAACATGGAAAAATGAGATTGTGGGAGAGACAAGCATGGGTTAAAT 162725285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2280 CGTTGCAATTTTCATAACATGGAAAAATGAGATTGTGGGAGAGACAAGCATGGGTTAAAT 2339

162725286 ACCTCACTAAATATAGAGTGCAAGAGCATTATAACGTGGGCCGTGCAAACAGTAGAACAT 162725345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2340 ACCTCACTAAATATAGAGTGCAAGAGCATTATAACGTGGGCCGTGCAAACAGCAGAACAT 2399

162725346 TTCAAACCTAAGGCCTACTATTGTTGTGGCTAAGTGTTTTCACCACTTCCTTAGTAAAAA 162725405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2400 TTCAAACCTAAGGCCTACTATTGTTGTGGCTAAGTGTTTTCACCACTTCCTTAGTAAAAA 2459

162725406 GTTACCATATAGATAAAATAAAATACATTTATAAAACTTTTACAGTCTGTTTTAATCAAA 162725465
          ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2460 GTTACCATATAG-----ATAAAATACATTTATAAAACTTTTACAGTCTGTTTTAATCAAA 2514

162725466 TTTACCTCTACATAATCCCCATTCTATAAGTTCAGTTATCAACAAACTCCTTCATAAAGA 162725525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 TTTACCTCTACATAATCCCCATTCTATAAGTTCAGTTATCAACAAACTCCTTCATAAAGA 2574

162725526 ATCCCTTCCTGGATTCTTAGAGTGTATAGGTAGTGATTCTAGATTCAAGAATGAAAAAAA 162725585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 ATCCCTTCCTGGATTCTTAGAGTGTATAGGTAGTGATTCTAGATTCAAGAATGAAAAAAA 2634

162725586 AATCAATTAAAAAGAGCCTTTTACAGGACATTTTATTTATAAGGCCTATTTTTTTTGTTG 162725645
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2635 AATCAATTAAAAAGAGCCTTTTACAGGATATTTTATTTATAAGGCCTATTTTTTTTGTTG 2694

162725646 GGGTTTTAGACTAATGCAATTACAGTAAATTAAAGTTTTCACATTTTATATGTAGATATT 162725705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 GGGTTTTAGACTAATGCAATTACAGTAAATTAAAGTTTTCACATTTTATATGTAGATATT 2754

162725706 ACAAGTCACATATTCCACAAACTCATTTTGAAATAGCAGAGTGCTGTGCGCAGTGGCTCA 162725765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2755 ACAAGTCACATATTCCACAAACTCATTTTGAAATAGCAGAGTGCTGTGCGCAGTGGCTCA 2814

162725766 TGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCATTTGAGCCCAGGAGTT 162725825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 TGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCATTTGAGCCCAGGAGTT 2874

162725826 TGAGACCAGCCTGGGCAATATGGTGAACTTCACTTCTACCAAAAATACAAAAAGAAAAAA 162725885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 TGAGACCAGCCTGGGCAATATGGTGAACTTCACTTCTACCAAAAATACAAAAAGAAAAAA 2934

162725886 CTGATTAGCCAGTTATGGTGGTGCGTGTCCATAGTCCTAGCTACTAGGGAGGCTGAGGAA 162725945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 CTGATTAGCCAGTTATGGTGGTGCGTGTCCATAGTCCTAGCTACTAGGGAGGCTGAGGAA 2994

162725946 GTAGAATCGCTTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGGTGATACCACTGCAC 162726005
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 GTAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGGTGATACCACTGCAC 3054

162726006 TCCAGCCTGGGTAACAGAGGGGGACCCTGTCTCAATAAGAAAAAAAGAAAACATGTAAAA 162726065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 TCCAGCCTGGGTAACAGAGGGGGACCCTGTCTCAATAAGAAAAAAAGAAAACATGTAAAA 3114

162726066 CATCCAAACAATGTAAACTGTTAAAATAGAAGCTGTTAAGATGGCAAATATGCACACAGA 162726125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 CATCCAAACAATGTAAACTGTTAAAATAGAAGCTGTTAAGATGGCAAATATGCACACAGA 3174

162726126 GATAGATGGTAGATGCATTGTGTTATCAGCTGCAAAACTTTTAAAGAAATTTATAATTGA 162726185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 GATAGATGGTAGATGCATTGTGTTATCAGCTGCAAAACTTTTAAAGAAATTTATAATTGA 3234

162726186 CACATCATACAAATTCATTGGGTACAATATGATGGTTTAATACATTTATACATAGTATAA 162726245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3235 CACATCATACAAATTCATTGGGTACAATATGATGGTTTAATACATTTATACATAGTATAA 3294

162726246 TAGTTAAATAAGGGTAATTATTATATCCAACATTGAAAGCATGTATTTCTTTATGGTGGA 162726305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 TAGTTAAATAAGGGTAATTATTATATCCAACATTGAAAGCATGTATTTCTTTATGGTGGA 3354

162726306 AACATTCAAAATCTTCTCTTCTAACTATTTTGAAATATGCATTTATTCTTACTTGCTATA 162726365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 AACATTCAAAATCTTCTCTTCTAACTATTTTGAAATATGCATTTATTCTTACTTGCTATA 3414

162726366 GTCACCATACTATGTAACAGAGCATGTAAAGCAG----------------ATATCAAGTA 162726409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||
     3415 GTCACCATACTATGTAACAGAGCATGTAAAGCAGATATCAAGTACACAAAATATCAAGTA 3474

162726410 CATCTGTTTTCTCTACCTTCAACGCTCCAGTCAAATTTTAGCTATTTATTTATTTCCTTG 162726469
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3475 CATCTGTTTTCTCTACCTTCAATGCTCCAGTCAAATTTTAGCTATTTATTTATTTCCTTG 3534

162726470 TTTTTTCTTGTGGCAAGGACTAATGCAATGCATCTTTAGTCAGCCATCTTGCTGACATCA 162726529
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3535 TTTTTTCTTGTGGCAAAGACTAATGCAATGCATCTTTAGTCAGCCATCTTGCTGACATCA 3594

162726530 CTCCTATATTGACTTTTAAAGTGAATACTGAAAGAAGTAATTGTGGATACTACTACTGTT 162726589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 CTCCTATATTGACTTTTAAAGTGAATACTGAAAGAAGTAATTGTGGATACTACTACTGTT 3654

162726590 CTTTACAATACAACCCTAGCTGGTTACTGCTACCAAGGGCTATCTATTGCTTAATTATGT 162726649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 CTTTACAATACAACCCTAGCTGGTTACTGCTACCAAGGGCTATCTATTGCTTAATTATGT 3714

162726650 CTAATTATATTTTGTTTAATCATCAATTGGGGACATTAATGTAAGTACAAACGCAAGTAC 162726709
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3715 CTAATTATATTTTGTTTAATCATCAATCGGGGACATTAATGTAAGTACAAACGCAAGTAC 3774

162726710 TAGAGGGCTCTTATAAAACTTATAGAGGGCTCGTATAGAACATATATAATGTTCGTAATG 162726769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 TAGAGGGCTCTTATAAAACTTATAGAGGGCTCGTATAGAACATATATAATGTTCGTAATG 3834

162726770 TGTGACCTGTAATAAGGTAGTAATAATGGCTACGATTTATTAACATGTTTTTATACATAA 162726829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 TGTGACCTGTAATAAGGTAGTAATAATGGCTACGATTTATTAACATGTTTTTATACATAA 3894

162726830 TGAAAACTTTAAACGAGGTATTCAATCTAATCAAAGTTATTTAGATAGCTTTTCACAAAC 162726889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3895 TGAAAACTTTAAACGAGGTATTCAATCTAATCAAAGTTATTTAGATAGCTTTTCACAAAC 3954

162726890 AATTAGCAGTATCAAATGCAATCAAGAAGCTGCACCACATACTAATATGGTTTTCTTCTA 162726949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3955 AATTAGCAGTATCAAATGCAATCAAGAAGCTGCACCACATACTAATATGGTTTTCTTCTA 4014

162726950 TATTTAATTTGCTGAGATTGTTTTTTAATCATGTGTGTGGATATTGAATTTTTAATAAGC 162727009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 TATTTAATTTGCTGAGATTGTTTTTTAATCATGTGTGTGGATATTGAATTTTTAATAAGC 4074

162727010 ATTTATTTTGCCAACACTGGGATGACCTTATGAGTATTTTCCTATAATTAATTACTATGA 162727069
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     4075 ATTTATTTTGCCAACACTGGGATGACCTTATGAGTATTTTCCTATAATTAATTACGATGA 4134

162727070 TGAAATGCATTAGTCAAATCTCTAATATTAACTTATCACAGCTTTCCTGGAAAATTTTCA 162727129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 TGAAATGCATTAGTCAAATCTCTAATATTAACTTATCACAGCTTTCCTGGAAAATTTTCA 4194

162727130 AATGATTTACTACAATCTTATTATATATGCTGGTTTCATTTATTGATTTTAAAAATATAT 162727189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 AATGATTTACTACAATCTTATTATATATGCTGGTTTCATTTATTGATTTTAAAAATATAT 4254

162727190 TTATATCTATATTTTGTCAGAGACTGATACTTTTCTCCCAGAATCTTTTCTCTCTTTCTT 162727249
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4255 TTATATCTATATTTTGTCAGAGACTGATACTTTTCTCCCAGAATCTTTTCTCTCTTTATT 4314

162727250 CCTTTTCAATATGAAAACATAAATTGTTTTCCCACAAGCTGTCCAACCTGGTAGAGTTTT 162727309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 CCTTTTCAATATGAAAACATAAATTGTTTTCCCACAAGCTGTCCAACCTGGTAGAGTTTT 4374

162727310 AATGGTTCACTTGGCTGCTTAGTTAGGAGACGACATAGCTTGTTTTTTCTTGATGTTAGA 162727369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 AATGGTTCACTTGGCTGCTTAGTTAGGAGACGACATAGCTTGTTTTTTCTTGATGTTAGA 4434

162727370 AGTAAGACGTAGAATGTAAAGCAAATGATATATGCATTTTCCATGACCTGTACTTAAGAG 162727429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 AGTAAGACGTAGAATGTAAAGCAAATGATATATGCATTTTCCATGACCTGTACTTAAGAG 4494

162727430 CAGCTGCTTACCTAATAC 162727447
          ||||||||||||||||||
     4495 CAGCTGCTTACCTAATAC 4512

Alignment time is 4.38588 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162707306,162733554] =>     26249 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     5685] =>      5685 nucs 'mol-32-29ea-025910_5685'

Score:        5342
Aligned:      5691        nucs
Identic:      5647 ( 99%) nucs =>      4582 (100%)      1065 ( 98%)
Gaps:           19 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162712705,162717306] EXCISED REGION [162723555,162724634]
 second seq =>  [        1,     4596] EXCISED REGION [     4601,     5685]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6248 nucs [162717307,162723554]
 second seq =>         4 nucs [4597,4600]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162717305,162717308] to [162723553,162723556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [162717304,162717306] to [162723555,162723557]
 second seq =>         3 nucs [4594,4596] to [4601,4603]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [162717307,162717308] to [162723553,162723554]
 second seq =>         0 nucs

162712705 ATCTTCTTAGAAAAAAAAACTTTTCATTTCACTGATTTTTTTGTATTATTTTCTTCATTT 162712764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 ATCTTCTTAGAAAAAAAAACTTTTCATTTCACTGATTTTTTTGTATTATTTTCTTCATTT 60

162712765 CAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATCTTTGTATGTTTTCTTCTACTAATTTTGAGACTGG 162712824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAATTTCATTTATTTCTGCTCTGATCTTTGTATGTTTTCTTCTACTAATTTTGAGACTGG 120

162712825 TTTGCTCCTGTTTTTCTAAGTCTTTAGGAGGCATTGTTAAAATATTTATTTGATTTTTTT 162712884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTGCTCCTGTTTTTCTAAGTCTTTAGGAGGCATTGTTAAAATATTTATTTGATTTTTTT 180

162712885 TAACTTTTTTGGTGTAGATGCTGATTGCTATAAACTTTTCTGTTAGTGTTGCTTTGGCTG 162712944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAACTTTTTTGGTGTAGATGCTGATTGCTATAAACTTTTCTGTTAGTGTTGCTTTGGCTG 240

162712945 TATCCCACATAATTTGGTATGTTACGTTTTTATTTTCATTTGTTTCAAGAATCTTCTAAA 162713004
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TATCCCACATAATTTGGTATGTTACGTTTTTATTTTCATTTGTTTCAAGAATCTTCTAAA 300

162713005 TTATTTTCTTAATTTCTACATTTACCCAATGCTCATTCAGGACCATATTGTTTAATTTCC 162713064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTATTTTCTTAATTTCTACATTTACCCAATGCTCATTCAGGACCATATTGTTTAATTTCC 360

162713065 ATATGTTTTTATTGTTTCTAAAGTTTCTTTCATTATTGGATTCTAGGTTTATTCCATTGT 162713124
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 ATATGTTTTTATTGTTTCTAAAGTTTCTTTCATTATTGGATTCTAGGTTTATTCCATTGT 420

162713125 GGTCAGAGAAGACATTGGATTTCATTTTTTTTAAATTTTTTAAAGCTTTGTTTTATGGCC 162713184
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGTCAGAGAAGACATTGGATTTCATTTTTTTAAAATTTTTTAAAGCTTTGTTTTATGGCC 480

162713185 TTACATATGGTCTTTGAGAATGATCCACAGGCTGAGAAGAAAAAATGTATATTCTGCAGT 162713244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTACATATGGTCTTTGAGAATGATCCACAGGCTGAGAAGAAAAAATGTATATTCTGCAGT 540

162713245 TGTCGGGTGAAATGTTATGTAAATATTTATTTGGTTAATTTATCCTATAGTGCTGATTTA 162713304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TGTCGGGTGAAATGTTATGTAAATATTTATTTGGTTAATTTATCCTATAGTGCTGATTTA 600

162713305 GTTTGATGTTTATTTTGTTGGTTTTCTGTCTGGATTATCTGTACCATGCTGAAAGTTGGG 162713364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GTTTGATGTTTATTTTGTTGGTTTTCTGTCTGGATTATCTGTACCATGCTGAAAGTTGGG 660

162713365 TGTTGAAGTCTCCACCTAGTATTGGGGTCTATACCAATACTATAGTTCTAATAATATTTG 162713424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TGTTGAAGTCTCCACCTAGTATTGGGGTCTATACCAATACTATAGTTCTAATAATATTTG 720

162713425 CTTTATATATATGTGTGTGGCTCCAGTGTGGGGTGCCTACACACACACACACACACATAT 162713484
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||
      721 CTTTATATATATGTGTGTGGCTCCAGTGTGGGGTGCCTACACACACACACACA----TAT 776

162713485 ACACACACAATACATATATTACAATAAATATACACAATATGTAATAATAAATATTCTAAT 162713544
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      777 ACACACACAATACATATATTACAATAAATATACACAATATGTAATAATAAATATTCTAAT 836

162713545 TCAGCACAGCTGAATTCTAACACAGCTTATATTTTTGGCACACTTTCTTTACAAATTAGA 162713604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      837 TCAGCACAGCTGAATTCTAACACAGCTTATATTTTTGGCACACTTTCTTTACAAATTAGA 896

162713605 ATTTTAATTAGTAACCTTAATTTTTAGTAAAAACTGAGGAAGAAAGCAATTTTTAACATT 162713664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      897 ATTTTAATTAGTAACCTTAATTTTTAGTAAAAACTGAGGAAGAAAGCAATTTTTAACATT 956

162713665 TGTCAAACATCAGTATTTTTTAGATAAGAATGATTTTATAATTTTAGAAATATGTTTCTT 162713724
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      957 TGTCAAACATCAGTATTTTTTAGATAAGAATGATTTTATAATTTTAGAAATATGTTTCTT 1016

162713725 CATAACATAATTTGTAAATGTACTAATAGTCTCAAATACATTTAGTATTTCTATAAAATG 162713784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1017 CATAACATAATTTGTAAATGTACTAATAGTCTCAAATACATTTAGTATTTCTATAAAATG 1076

162713785 TTAAAAGCCAAGGAAGACATTTATTTTCAACAATTTGTTTTAGTTTTTAATACTTATACA 162713844
          |||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|
     1077 TTAAAAGCCAAGGAAAACATTTATTTTCAACAACTTGTTTTAGTTTTTAATACTTATATA 1136

162713845 TCTTATATGGAAATGATTCAGACATTAATGAAAATTTATCACTTAATTTACCTTAAAAAT 162713904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1137 TCTTATATGGAAATGATTCAGACATTAATGAAAATTTATCACTTAATTTACCTTAAAAAT 1196

162713905 ACATATAATTTCAAATTACATTAAAAGTTTACTTATAAATCTCCAAGTTATTTACATTTA 162713964
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1197 ACATATAATTTCAAATTACATGAAAAGTTTACTTATAAATCTCCAAGTTATTTACATTTA 1256

162713965 CCTAATTTATTTATTTTTTACAGTTAACAATTATACCCAGATTACCTATGAAAATTGAGA 162714024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1257 CCTAATTTATTTATTTTTTACAGTTAACAATTATACCCAGATTACCTATGAAAATTGAGA 1316

162714025 CATTAGACAAATCTAGTCATCCTTTCAAGTCATTTCCCTGCTAATCACTTTTATAGCCAG 162714084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1317 CATTAGACAAATCTAGTCATCCTTTCAAGTCATTTCCCTGCTAATCACTTTTATAGCCAG 1376

162714085 TGATGATCAGTTGTTCATCTCTGTAAGAACTCTAAATTTAAATACATAGTTACTTTGCTG 162714144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1377 TGATGATCAGTTGTTCATCTCTGTAAGAACTCTAAATTTAAATACATAGTTACTTTGCTG 1436

162714145 ATCACTCAGTTTGTACACATATTTTTATTAAACAAATAATATTAAATTAATACTACATAT 162714204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1437 ATCACTCAGTTTGTACACATATTTTTATTAAACAAATAATATTAAATTAATACTACATAT 1496

162714205 GAAAGTGTTAAATAAAGATAATTCTATTTTGGGTTTCTAGTTTTATAACTTTAAAATAAA 162714264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1497 GAAAGTGTTAAATAAAGATAATTCTATTTTGGGTTTCTAGTTTTATAACTTTAAAATAAA 1556

162714265 TATCAGAGATAAATACTATCTTATCTGAGCAGTAAATTCAGGCAAACATGTATGCTGAAA 162714324
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1557 TATCAGAGATAAATACTATCTTATCTGAGCAGTAAATTCAGGCAAACATGTATGCTGAAA 1616

162714325 AATTTGATGACATTTCTGTTTTTATTTTATCAGTAATTTACAAATCAGCATATTTATCAG 162714384
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1617 AATTTGATGACATTTCTGTTTTTATTTTATCAGTAATTTACAAATCAGCATATTTATCAG 1676

162714385 AGATTCACTTAAGTCACATAAATTAAAATGCATTGGGGTTAATTAATATATATTTTTATA 162714444
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1677 AGATTCACTTAAGTCACATAAATTAAAATGCATTGGGGTTAATTAATATATATTTTTATA 1736

162714445 TGAGCATTTATTTACCTAAGCAAATCTGAATCAAATTTCTTACTTATTTCTGACTGACTA 162714504
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     1737 TGAGCATTTATTTACCTAAGCAAATCTGAATCAAATTTCTTAATTATTTCTGACTGACTA 1796

162714505 TACCAGATTTTACCCTGTGGACACAATATACAACATAATACATGCAAATATGTGTAAGCA 162714564
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1797 TACCAGATTTTACCCTGTGGACACAATATACAACATAATACATGCAAATATGTGTAAGCA 1856

162714565 TGGCTAAATTCATATGTACAAAAAAATCTTATAGCTTTCATTTTAGGTTTTTAGTCATGA 162714624
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1857 TGGCTAAATTCATATGTACAAAAAAATCTTATAGCTTTCATTTTAGGTTTTTAGTCATGA 1916

162714625 GATAGTAGCACAAACATAATGGTTTATAAAAAATAGGTGAATCCAAATTACAATTCTGAC 162714684
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1917 GATAGTAGCGCAAACATAATGGTTTATAAAAAATAGGTGAATCCAAATTACAATTCTGAC 1976

162714685 TAAACGAGACATCTGTTCATATGGTTAATTTTTTTTCTTTTTTGCCCTGATTGGTAATCT 162714744
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
     1977 TAAACGAGACATCTGTTCATATGGTTAATTTTTTTTCTTTTTTGCCCTGATAGGTAATCT 2036

162714745 GATGAAGGCTGTAGATTAAAGTTTTGGGTAAAGCAGTTTGGCTTAAAAATCTCCTTCTCA 162714804
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2037 GATGAAGGCTGTAGATTAAAGTTTTGGGTAAAGCAGTTTGGCTTAAAAATCTCCTTCTCA 2096

162714805 TTTTTTCCTCCTTTTTTAGTTTCAAATGAGTTTAAATTTTCATTTTTGACATTTTAGCTA 162714864
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     2097 TTTTTTCCTCCTTTTTTAGTTTCAAATGAGTTTAAATTTTCAATTTTGACATTTTAGCTA 2156

162714865 GGACTGGCAGAATTGTATAAGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATAA 162714924
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2157 GGACTGGCAGAATTGTATAAGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATAA 2216

162714925 AATCAATTTTTTGTTTGCCAAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATTT 162714984
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2217 AATCAATTTTTTGTTTGCCAAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATTT 2276

162714985 TAGCTTTTTTGTTTTATTTTGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTGT 162715044
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2277 TAGCTTTTTTGTTTTATTTTGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTGT 2336

162715045 ATGCTGAACACAGATATTTTAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATCT 162715104
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2337 ATGCTGAACACAGATATTTTAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATCT 2396

162715105 GAGAAAACTTTTATAAGCATTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAGT 162715164
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2397 GAGAAAACTTTTATAAGCATTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAGT 2456

162715165 GAACTGTTCTGTCACCCCCACATGATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCAA 162715224
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2457 GAACTGTTCTGTCACCCCCACATGATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCAA 2516

162715225 AAGGTATTTAAGTTGTTACAATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTTT 162715284
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2517 AAGGTATTTAAGTTGTTACAATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTTT 2576

162715285 CTTTTTTATTTTTTTATATTGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATCT 162715344
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2577 CTTTTTTATTTTTTTATATTGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATCT 2636

162715345 GGAGAAGAGTCAGCAAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAGA 162715404
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2637 GGAGAAGAGTCAGCAAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAGA 2696

162715405 AAACTTAGGTTCTACATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATCA 162715464
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2697 AAACTTAGGTTCTACATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATCA 2756

162715465 AAAAGTTTGGGGAGTTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAAA 162715524
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2757 AAAAGTTTGGGGAGTTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAAA 2816

162715525 ATCTATGTAGCTAACTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTCA 162715584
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2817 ATCTATGTAGCTAACTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTCA 2876

162715585 TTACATTTTATGTAATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATGT 162715644
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2877 TTACATTTTATGTAATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATGT 2936

162715645 CAGAAGTTTGAACCAGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCAT 162715704
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2937 CAGAAGTTTGAACCAGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCAT 2996

162715705 CCCGGGTCCACCATTTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCCGAAAGTAGCTAGGG 162715764
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
     2997 CCCGGGTCCACCATTTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCCCAAAGTAGCTAGGG 3056

162715765 AAAAGAGCTGAATATTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGAG 162715824
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 AAAAGAGCTGAATATTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGAG 3116

162715825 TGCTCACAAAAATTGTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGCA 162715884
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TGCTCACAAAAATTGTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGCA 3176

162715885 AAAAGAAACAAAAGTAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATAGAATGCAAATTCTGTAG 162715944
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     3177 AAAAGAAACAAAAGTAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATGGAATGCAAATTCTGTAG 3236

162715945 AAACTAGAGCACTCAAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGGG 162716004
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
     3237 AAACTAGAGCACTCAAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGGA 3296

162716005 AAGATAAAATAATCTTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGCC 162716064
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3297 AAGATAAAATAATCTTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGCC 3356

162716065 TTATAATCAAAACAAATCCTGAACAAAGTTTAAAAAACCTTCTAACAAAAAGAAGTCTTT 162716124
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3357 TTATAATCAAAACAAATCCTGAACAAAGTTTAAAAAAACTTCTAACAAAAAGAAGTCTTT 3416

162716125 CCCTGAGAAAAGATTCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAGG 162716184
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 CCCTGAGAAAAGATTCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAGG 3476

162716185 GCTCATGTGGGTACTGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCTT 162716244
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 GCTCATGTGGGTACTGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCTT 3536

162716245 GCTTCATGGCCTGCTTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAGC 162716304
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3537 GCTTCATGGCCTGCTTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAGC 3596

162716305 TCTCTAAAATAAGATGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTCA 162716364
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 TCTCTAAAATAAGATGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTCA 3656

162716365 ATAGGAATATGTGTGTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAAA 162716424
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3657 ATAGGAATATGTGTGTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAAA 3716

162716425 GATTTTTAACAAAACGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGATA 162716484
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 GATTTTTAACAAAACGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGATA 3776

162716485 GGGATCACTAATAAGTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATGT 162716544
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3777 GGGATCATTAATAAGTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATGT 3836

162716545 CTTTACAGGAGTATTTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTTT 162716604
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3837 CTTTACAGGAGTATTTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTTT 3896

162716605 GAAATCTTTTATGATAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTATT 162716664
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3897 GAAATCTTTTATGATAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTATT 3956

162716665 ACCTTTACATATCAATAAAAATTTTCATAGTACTCACACATGTTACCATTTTTAAAGTTT 162716724
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
     3957 ACCTTTACATATCAATAAAAATTTTCATAGTACTCACAC--GTTACCATTTTTAAAGTTT 4014

162716725 GAAAAAGTCACATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTGG 162716784
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4015 GAAAAAGTCACATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTGG 4074

162716785 TATTATTATTATATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCCATTTTGTTCCAGTATA 162716844
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4075 TATTATTATTATATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCCATTTTGTTCCAGTATA 4134

162716845 ATTAATAAGAATATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATTT 162716904
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4135 ATTAATAAGAATATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATTT 4194

162716905 TTTTTACAAAATTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTTA 162716964
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4195 TTTTTACAAAATTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTTA 4254

162716965 CTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAAA 162717024
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4255 CTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAAA 4314

162717025 GCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAACA 162717084
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4315 GCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAACA 4374

162717085 TGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAAA 162717144
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4375 TGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAAA 4434

162717145 AATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCAT 162717204
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4435 AATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCAT 4494

162717205 GCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAAT 162717264
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4495 GCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAAT 4554

162717265 CTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 162717306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4555 CTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 4596

EXCISED REGION

162723555 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 162723614
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     4601 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGAGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 4660

162723615 GTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGAGAATT 162723674
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4661 GTAAACTATCACAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGGGAATT 4720

162723675 GAACAATGT----GAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 162723730
          |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4721 GAACA----GTGAGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 4776

162723731 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCACTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 162723790
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     4777 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 4836

162723791 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGACACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 162723850
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4837 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 4896

162723851 TGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAT-----AATAAAATTAAAAAATTAAAA 162723905
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||
     4897 TGCGCATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATTAAAAAATTAAAA 4956

162723906 AAATATATGTTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGATACTCCCACATTCTCCCAAATC 162723965
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4957 AAATATATATTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGATACTCCCACATTCTCCCAAATC 5016

162723966 TGGAAGGTCAATGTTTATAGATGCATTTTAAAATACATCTATTATAGGAGTATAAAAACT 162724025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     5017 TGGAAGGTCAATGTTTATAGATGCATTTTAAAATACATCTATTATAGGAGTATACAAACT 5076

162724026 TCTCCCAAAATAAATACTGACTTAAACTGACAACCAACAATTTCTTTTATTGTTTGTCTG 162724085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5077 TCTCCCAAAATAAATACTGACTTAAACTGACAACCAACAATTTCTTTTATTGTTTGTCTG 5136

162724086 TTGCTTGCTCTATGATGCTAGACAGTGCAAAGGCCATTATATGTATTTTGTTCTTTCATA 162724145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5137 TTGCTTGCTCTATGATGCTAGACAGTGCAAAGGCCATTATATGTATTTTGTTCTTTCATA 5196

162724146 TTTACAATGAGAGTAACATTTGGTTACATTTCATATATATTTTTAATAGTTTCTAAAAGT 162724205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5197 TTTACAATGAGAGTAACATTTGGTTACATTTCATATATATTTTTAATAGTTTCTAAAAGT 5256

162724206 TATTTTTATAATAATATATTAGGTCTTGTGTTCAAATACGTGTGTGTATGTGTACAACAT 162724265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     5257 TATTTTTATAATAATATATTAGGTCTTGTGTTCAAATATGTGTGTGTATGTGTACAACAT 5316

162724266 TAACAATGCACATTAATATTGATGATAAAGGAACTTCTTACTTTGTGCATGCAAAAAAGA 162724325
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     5317 TAACAATGCACATTAATATTGATGATAAAAGAACTTCTTACTTTGTGCATGCAAAAAAGA 5376

162724326 TTAAGCCCTTATTTTATAATATTGCTTAAGACAATGTTGATGATACTGAGTAAAGTTTTC 162724385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     5377 TTAAGCCCTTATTTTATAATATTGCTTAAGACAATGTTGATGATACTGTGTAAAGTTTTC 5436

162724386 ATGAGGTGAACATTGCTAAAATTTACAAAGGGTCTGGTGGTAGGAGTTATATATTTTAAT 162724445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5437 ATGAGGTGAACATTGCTAAAATTTACAAAGGGTCTGGTGGTAGGAGTTATATATTTTAAT 5496

162724446 CCAAAGCACCTTCTAACTAAAAACTGAAGTAATTGTACAACATCATTAAAATATACTTCC 162724505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5497 CCAAAGCACCTTCTAACTAAAAACTGAAGTAATTGTACAACATCATTAAAATATACTTCC 5556

162724506 ACAGATTCTGAGAATCAAATAAAAATTATTTCTTTAATTTCATATCTTCAGTATTTGTAA 162724565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5557 ACAGATTCTGAGAATCAAATAAAAATTATTTCTTTAATTTCATATCTTCAGTATTTGTAA 5616

162724566 CATTACCCTACTCCATAATTAACATATCAATAAATTTCAAAGAAAACATACACATAGAGT 162724625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5617 CATTACCCTACTCCATAATTAACATATCAATAAATTTCAAAGAAAACATACACATAGAGT 5676

162724626 ACTAAAATC 162724634
          |||||||||
     5677 ACTAAAATC 5685

Alignment time is 5.45762 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162707306,162733554] =>     26249 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     7056] =>      7056 nucs 'mol-32-2b08-013103_7056'

Score:        6442
Aligned:      6961        nucs
Identic:      6886 ( 99%) nucs =>       352 (100%)      6534 ( 99%)
Gaps:           41 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162716955,162717306] EXCISED REGION [162723555,162730137]
 second seq =>  [      107,      458] EXCISED REGION [      463,     7056]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6248 nucs [162717307,162723554]
 second seq =>         4 nucs [459,462]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162717305,162717308] to [162723553,162723556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [162717304,162717306] to [162723555,162723557]
 second seq =>         3 nucs [456,458] to [463,465]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [162717307,162717308] to [162723553,162723554]
 second seq =>         0 nucs

162716955 TTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGG 162717014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      107 TTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGG 166

162717015 ATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTG 162717074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      167 ATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTG 226

162717075 TGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCT 162717134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      227 TGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCT 286

162717135 TTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCT 162717194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      287 TTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCT 346

162717195 ATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTG 162717254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      347 ATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTG 406

162717255 TTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 162717306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      407 TTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 458

EXCISED REGION

162723555 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 162723614
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      463 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGAGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 522

162723615 GTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGAGAATT 162723674
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      523 GTAAACTATCACAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGGGAATT 582

162723675 GAACAATGT----GAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 162723730
          |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      583 GAACA----GTGAGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 638

162723731 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCACTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 162723790
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      639 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 698

162723791 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGACACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 162723850
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      699 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 758

162723851 TGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAT-----AATAAAATTAAAAAATTAAAA 162723905
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||
      759 TGCGCATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATTAAAAAATTAAAA 818

162723906 AAATATATGTTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGATACTCCCACATTCTCCCAAATC 162723965
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      819 AAATATATATTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGATACTCCCACATTCTCCCAAATC 878

162723966 TGGAAGGTCAATGTTTATAGATGCATTTTAAAATACATCTATTATAGGAGTATAAAAACT 162724025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
      879 TGGAAGGTCAATGTTTATAGATGCATTTTAAAATACATCTATTATAGGAGTATACAAACT 938

162724026 TCTCCCAAAATAAATACTGACTTAAACTGACAACCAACAATTTCTTTTATTGTTTGTCTG 162724085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      939 TCTCCCAAAATAAATACTGACTTAAACTGACAACCAACAATTTCTTTTATTGTTTGTCTG 998

162724086 TTGCTTGCTCTATGATGCTAGACAGTGCAAAGGCCATTATATGTATTTTGTTCTTTCATA 162724145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      999 TTGCTTGCTCTATGATGCTAGACAGTGCAAAGGCCATTATATGTATTTTGTTCTTTCATA 1058

162724146 TTTACAATGAGAGTAACATTTGGTTACATTTCATATATATTTTTAATAGTTTCTAAAAGT 162724205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1059 TTTACAATGAGAGTAACATTTGGTTACATTTCATATATATTTTTAATAGTTTCTAAAAGT 1118

162724206 TATTTTTATAATAATATATTAGGTCTTGTGTTCAAATACGTGTGTGTATGTGTACAACAT 162724265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1119 TATTTTTATAATAATATATTAGGTCTTGTGTTCAAATATGTGTGTGTATGTGTACAACAT 1178

162724266 TAACAATGCACATTAATATTGATGATAAAGGAACTTCTTACTTTGTGCATGCAAAAAAGA 162724325
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     1179 TAACAATGCACATTAATATTGATGATAAAAGAACTTCTTACTTTGTGCATGCAAAAAAGA 1238

162724326 TTAAGCCCTTATTTTATAATATTGCTTAAGACAATGTTGATGATACTGAGTAAAGTTTTC 162724385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1239 TTAAGCCCTTATTTTATAATATTGCTTAAGACAATGTTGATGATACTGTGTAAAGTTTTC 1298

162724386 ATGAGGTGAACATTGCTAAAATTTACAAAGGGTCTGGTGGTAGGAGTTATATATTTTAAT 162724445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1299 ATGAGGTGAACATTGCTAAAATTTACAAAGGGTCTGGTGGTAGGAGTTATATATTTTAAT 1358

162724446 CCAAAGCACCTTCTAACTAAAAACTGAAGTAATTGTACAACATCATTAAAATATACTTCC 162724505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1359 CCAAAGCACCTTCTAACTAAAAACTGAAGTAATTGTACAACATCATTAAAATATACTTCC 1418

162724506 ACAGATTCTGAGAATCAAATAAAAATTATTTCTTTAATTTCATATCTTCAGTATTTGTAA 162724565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1419 ACAGATTCTGAGAATCAAATAAAAATTATTTCTTTAATTTCATATCTTCAGTATTTGTAA 1478

162724566 CATTACCCTACTCCATAATTAACATATCAATAAATTTCAAAGAAAACATACACATAGAGT 162724625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1479 CATTACCCTACTCCATAATTAACATATCAATAAATTTCAAAGAAAACATACACATAGAGT 1538

162724626 ACTAAAATCTGAATTTTCCTACTTCCTGTCCATCTGTACCCCCTATCATTTATCACCATC 162724685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1539 ACTAAAATCTGAATTTTCCTACTTCCTGTCCATCTGTACCCCCTATCATTTATCACCATC 1598

162724686 TAGACACCCACCATTTAACTAGGGTAAAATAAAAATATACATTTTCTTATTCATTATGGT 162724745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1599 TAGACACCCACCATTTAACTAGGGTAAAATAAAAATATACATTTTCTTATTCATTATGGT 1658

162724746 AAATTTACTATATAAGTTATGCTTTAATGAGCACTCAGTACTTAAACAGAAGACAGCTTA 162724805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1659 AAATTTACTATATAAGTTATGCTTTAATGAGCACTCAGTACTTAAACAGAAGACAGCTTA 1718

162724806 AGATCCAAGACTGAGATATTAAAATCCAAACATTGCAGCCAGAAAGAATAATTAATAAGA 162724865
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     1719 AGATCCAAGACTGAGATATTAAAATCCAAACATTGCACCCAGAAAGAATAATTAATAAGA 1778

162724866 TTATCATTAACGGAGACACTCTATATCTGTTCCTTATTTAAGCTATTTTCAGCTCAGATT 162724925
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1779 TTATCATTAACAGAGACACTCTATATCTGTTCCTTATTTAAGCTATTTTCAGCTCAGATT 1838

162724926 TCGATAAGAAAGTTACTCTTCTTACTAGAGCTTTTGAAATAAAGCACTCATCATTGGTGA 162724985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1839 TCGATAAGAAAGTTACTCTTCTTACTAGAGCTTTTGAAATAAAGCACTCATCATTGGTGA 1898

162724986 AATGATGTTCAGCAGAGAACCTTCAACTATCAAACTTAGAACAAGAACACTAACCAGGTC 162725045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1899 AATGATGTTCAGCAGAGAACCTTCAACTATCAAACTTAGAACAAGAAGACTAACCAGGTC 1958

162725046 TCAAAAATCACAATCAGAAAAAGGCACCATTTACAGAGCAATACCTAATATACAAGAGAA 162725105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1959 TCAAAAATCACAATCAGAAAAAGGCACCATTTACAGAGCAATACCTAATATATAAGAGAA 2018

162725106 GGCAATTTTAAAAGGCATATGAGAAACAAAGCAAAACAACCTTTCCCCAAATATTGATAG 162725165
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     2019 GGCAATTTTAAAAGGCATATGAGAAACAAAGCAAAACAACCTTTCACCAAATATTGATAG 2078

162725166 TGATACTTTTATTTGAAAACTGAAATAAAGCAAGCAATTGCAGGAATATTAGATAAATTT 162725225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2079 TGATACTTTTATTTGAAAACTGAAATAAAGCAAGCAATTGCAGGAATATTAGATAAATTT 2138

162725226 CGTTGCAATTTTCATAACATGGAAAAATGAGATTGTGGGAGAGACAAGCATGGGTTAAAT 162725285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2139 CGTTGCAATTTTCATAACATGGAAAAATGAGATTGTGGGAGAGACAAGCATGGGTTAAAT 2198

162725286 ACCTCACTAAATATAGAGTGCAAGAGCATTATAACGTGGGCCGTGCAAACAGTAGAACAT 162725345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     2199 ACCTCACTAAATATAGAGTGCAAGAGCATTATAACGTGGGCCGTGCAAACAGCAGAACAT 2258

162725346 TTCAAACCTAAGGCCTACTATTGTTGTGGCTAAGTGTTTTCACCACTTCCTTAGTAAAAA 162725405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2259 TTCAAACCTAAGGCCTACTATTGTTGTGGCTAAGTGTTTTCACCACTTCCTTAGTAAAAA 2318

162725406 GTTACCATATAGATAAAATAAAATACATTTATAAAACTTTTACAGTCTGTTTTAATCAAA 162725465
          ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2319 GTTACCATATAG-----ATAAAATACATTTATAAAACTTTTACAGTCTGTTTTAATCAAA 2373

162725466 TTTACCTCTACATAATCCCCATTCTATAAGTTCAGTTATCAACAAACTCCTTCATAAAGA 162725525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2374 TTTACCTCTACATAATCCCCATTCTATAAGTTCAGTTATCAACAAACTCCTTCATAAAGA 2433

162725526 ATCCCTTCCTGGATTCTTAGAGTGTATAGGTAGTGATTCTAGATTCAAGAATGAAAAAAA 162725585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2434 ATCCCTTCCTGGATTCTTAGAGTGTATAGGTAGTGATTCTAGATTCAAGAATGAAAAAAA 2493

162725586 AATCAATTAAAAAGAGCCTTTTACAGGACATTTTATTTATAAGGCCTATTTTTTTTGTTG 162725645
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 AATCAATTAAAAAGAGCCTTTTACAGGATATTTTATTTATAAGGCCTATTTTTTTTGTTG 2553

162725646 GGGTTTTAGACTAATGCAATTACAGTAAATTAAAGTTTTCACATTTTATATGTAGATATT 162725705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2554 GGGTTTTAGACTAATGCAATTACAGTAAATTAAAGTTTTCACATTTTATATGTAGATATT 2613

162725706 ACAAGTCACATATTCCACAAACTCATTTTGAAATAGCAGAGTGCTGTGCGCAGTGGCTCA 162725765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 ACAAGTCACATATTCCACAAACTCATTTTGAAATAGCAGAGTGCTGTGCGCAGTGGCTCA 2673

162725766 TGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCATTTGAGCCCAGGAGTT 162725825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2674 TGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCATTTGAGCCCAGGAGTT 2733

162725826 TGAGACCAGCCTGGGCAATATGGTGAACTTCACTTCTACCAAAAATACAAAAAGAAAAAA 162725885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2734 TGAGACCAGCCTGGGCAATATGGTGAACTTCACTTCTACCAAAAATACAAAAAGAAAAAA 2793

162725886 CTGATTAGCCAGTTATGGTGGTGCGTGTCCATAGTCCTAGCTACTAGGGAGGCTGAGGAA 162725945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2794 CTGATTAGCCAGTTATGGTGGTGCGTGTCCATAGTCCTAGCTACTAGGGAGGCTGAGGAA 2853

162725946 GTAGAATCGCTTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGGTGATACCACTGCAC 162726005
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2854 GTAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGGTGATACCACTGCAC 2913

162726006 TCCAGCCTGGGTAACAGAGGGGGACCCTGTCTCAATAAGAAAAAAAGAAAACATGTAAAA 162726065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2914 TCCAGCCTGGGTAACAGAGGGGGACCCTGTCTCAATAAGAAAAAAAGAAAACATGTAAAA 2973

162726066 CATCCAAACAATGTAAACTGTTAAAATAGAAGCTGTTAAGATGGCAAATATGCACACAGA 162726125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2974 CATCCAAACAATGTAAACTGTTAAAATAGAAGCTGTTAAGATGGCAAATATGCACACAGA 3033

162726126 GATAGATGGTAGATGCATTGTGTTATCAGCTGCAAAACTTTTAAAGAAATTTATAATTGA 162726185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3034 GATAGATGGTAGATGCATTGTGTTATCAGCTGCAAAACTTTTAAAGAAATTTATAATTGA 3093

162726186 CACATCATACAAATTCATTGGGTACAATATGATGGTTTAATACATTTATACATAGTATAA 162726245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3094 CACATCATACAAATTCATTGGGTACAATATGATGGTTTAATACATTTATACATAGTATAA 3153

162726246 TAGTTAAATAAGGGTAATTATTATATCCAACATTGAAAGCATGTATTTCTTTATGGTGGA 162726305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3154 TAGTTAAATAAGGGTAATTATTATATCCAACATTGAAAGCATGTATTTCTTTATGGTGGA 3213

162726306 AACATTCAAAATCTTCTCTTCTAACTATTTTGAAATATGCATTTATTCTTACTTGCTATA 162726365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3214 AACATTCAAAATCTTCTCTTCTAACTATTTTGAAATATGCATTTATTCTTACTTGCTATA 3273

162726366 GTCACCATACTATGTAACAGAGCATGTAAAGCAG----------------ATATCAAGTA 162726409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||
     3274 GTCACCATACTATGTAACAGAGCATGTAAAGCAGATATCAAGTACACAAAATATCAAGTA 3333

162726410 CATCTGTTTTCTCTACCTTCAACGCTCCAGTCAAATTTTAGCTATTTATTTATTTCCTTG 162726469
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3334 CATCTGTTTTCTCTACCTTCAATGCTCCAGTCAAATTTTAGCTATTTATTTATTTCCTTG 3393

162726470 TTTTTTCTTGTGGCAAGGACTAATGCAATGCATCTTTAGTCAGCCATCTTGCTGACATCA 162726529
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3394 TTTTTTCTTGTGGCAAAGACTAATGCAATGCATCTTTAGTCAGCCATCTTGCTGACATCA 3453

162726530 CTCCTATATTGACTTTTAAAGTGAATACTGAAAGAAGTAATTGTGGATACTACTACTGTT 162726589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3454 CTCCTATATTGACTTTTAAAGTGAATACTGAAAGAAGTAATTGTGGATACTACTACTGTT 3513

162726590 CTTTACAATACAACCCTAGCTGGTTACTGCTACCAAGGGCTATCTATTGCTTAATTATGT 162726649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3514 CTTTACAATACAACCCTAGCTGGTTACTGCTACCAAGGGCTATCTATTGCTTAATTATGT 3573

162726650 CTAATTATATTTTGTTTAATCATCAATTGGGGACATTAATGTAAGTACAAACGCAAGTAC 162726709
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     3574 CTAATTATATTTTGTTTAATCATCAATCGGGGACATTAATGTAAGTACAAACGCAAGTAC 3633

162726710 TAGAGGGCTCTTATAAAACTTATAGAGGGCTCGTATAGAACATATATAATGTTCGTAATG 162726769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3634 TAGAGGGCTCTTATAAAACTTATAGAGGGCTCGTATAGAACATATATAATGTTCGTAATG 3693

162726770 TGTGACCTGTAATAAGGTAGTAATAATGGCTACGATTTATTAACATGTTTTTATACATAA 162726829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3694 TGTGACCTGTAATAAGGTAGTAATAATGGCTACGATTTATTAACATGTTTTTATACATAA 3753

162726830 TGAAAACTTTAAACGAGGTATTCAATCTAATCAAAGTTATTTAGATAGCTTTTCACAAAC 162726889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3754 TGAAAACTTTAAACGAGGTATTCAATCTAATCAAAGTTATTTAGATAGCTTTTCACAAAC 3813

162726890 AATTAGCAGTATCAAATGCAATCAAGAAGCTGCACCACATACTAATATGGTTTTCTTCTA 162726949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3814 AATTAGCAGTATCAAATGCAATCAAGAAGCTGCACCACATACTAATATGGTTTTCTTCTA 3873

162726950 TATTTAATTTGCTGAGATTGTTTTTTAATCATGTGTGTGGATATTGAATTTTTAATAAGC 162727009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3874 TATTTAATTTGCTGAGATTGTTTTTTAATCATGTGTGTGGATATTGAATTTTTAATAAGC 3933

162727010 ATTTATTTTGCCAACACTGGGATGACCTTATGAGTATTTTCCTATAATTAATTACTATGA 162727069
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     3934 ATTTATTTTGCCAACACTGGGATGACCTTATGAGTATTTTCCTATAATTAATTACGATGA 3993

162727070 TGAAATGCATTAGTCAAATCTCTAATATTAACTTATCACAGCTTTCCTGGAAAATTTTCA 162727129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3994 TGAAATGCATTAGTCAAATCTCTAATATTAACTTATCACAGCTTTCCTGGAAAATTTTCA 4053

162727130 AATGATTTACTACAATCTTATTATATATGCTGGTTTCATTTATTGATTTTAAAAATATAT 162727189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4054 AATGATTTACTACAATCTTATTATATATGCTGGTTTCATTTATTGATTTTAAAAATATAT 4113

162727190 TTATATCTATATTTTGTCAGAGACTGATACTTTTCTCCCAGAATCTTTTCTCTCTTTCTT 162727249
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     4114 TTATATCTATATTTTGTCAGAGACTGATACTTTTCTCCCAGAATCTTTTCTCTCTTTATT 4173

162727250 CCTTTTCAATATGAAAACATAAATTGTTTTCCCACAAGCTGTCCAACCTGGTAGAGTTTT 162727309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4174 CCTTTTCAATATGAAAACATAAATTGTTTTCCCACAAGCTGTCCAACCTGGTAGAGTTTT 4233

162727310 AATGGTTCACTTGGCTGCTTAGTTAGGAGACGACATAGCTTGTTTTTTCTTGATGTTAGA 162727369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4234 AATGGTTCACTTGGCTGCTTAGTTAGGAGACGACATAGCTTGTTTTTTCTTGATGTTAGA 4293

162727370 AGTAAGACGTAGAATGTAAAGCAAATGATATATGCATTTTCCATGACCTGTACTTAAGAG 162727429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4294 AGTAAGACGTAGAATGTAAAGCAAATGATATATGCATTTTCCATGACCTGTACTTAAGAG 4353

162727430 CAGCTGCTTACCTAATACTTTGTTACTTTTCCTGTGAGTTGGCGTACAAATATTATAGCA 162727489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4354 CAGCTGCTTACCTAATACTTTGTTACTTTTCCTGTGAGTTGGCGTACAAATATTATAGCA 4413

162727490 GTAAGCCAGATTAATCCATGTTCATGAGATAAATGCCCTAGAAATGATGGAGCCTGAGTA 162727549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4414 GTAAGCCAGATTAATCCATGTTCATGAGATAAATGCCCTAGAAATGATGGAGCCTGAGTA 4473

162727550 TCTGTTTCACCTTGTAGGTCAGAGCTTCCAACTAGCCATTCCTTATCTATTTTTATACTT 162727609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     4474 TCTGTTTCACCTTGTAGGTCAGAGCTTCCAACTAGCCATTCCTTATCTATTTTTGTACTT 4533

162727610 TTATATGTGAGATAAATAAAGTTCTGTCTTACTGAAACCACTGCCTTTGATGTTCTTCTA 162727669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4534 TTATATGTGAGATAAATAAAGTTCTGTCTTACTGAAACCACTGCCTTTGATGTTCTTCTA 4593

162727670 TTACAATAACTCAGCTTATGTCTTAACTAACACACATTGTCTCACATGAGATTAGTGTAT 162727729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4594 TTACAATAACTCAGCTTATGTCTTAACTAACACACATTGTCTCACATGAGATTAGTGTAT 4653

162727730 AATTTCATCCAAACAACTACAGTGAACTCATTTCTGACAAAGGTGCGAAGACCTTATACT 162727789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4654 AATTTCATCCAAACAACTACAGTGAACTCATTTCTGACAAAGGTGCGAAGACCTTATACT 4713

162727790 GGGTGAAAGGGTCTCTTCAATACATGGTGCTGGGAAAATCAGATATTCATATGCAGAAGA 162727849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4714 GGGTGAAAGGGTCTCTTCAATACATGGTGCTGGGAAAATCAGATATTCATATGCAGAAGA 4773

162727850 ATGAAACTAGACCCCTATCTCTCACCATACACAAAAATCCAATGCAATGTATTAAAGCCT 162727909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4774 ATGAAACTAGACCCCTATCTCTCACCATACACAAAAATCCAATGCAATGTATTAAAGCCT 4833

162727910 TAAATGTAACATCTCAAACTATGAAATTACTAAAAGAAAACCTTGGGGAAAATCTGCAGG 162727969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4834 TAAATGTAACATCTCAAACTATGAAATTACTAAAAGAAAACCTTGGGGAAAATCTGCAGG 4893

162727970 ACGTGGGTTTGGGCAAAAATTTCATGGGCAATGTCCCACAAGTACAGGCAACAAAAGGCA 162728029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4894 ACGTGGGTTTGGGCAAAAATTTCATGGGCAATGTCCCACAAGTACAGGCAACAAAAGGCA 4953

162728030 AAAATGACAAATGAAATCATATCAAGTTTAAATGTTTCTGCACAGCAAAAGAGTTTGAAG 162728089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4954 AAAATGACAAATGAAATCATATCAAGTTTAAATGTTTCTGCACAGCAAAAGAGTTTGAAG 5013

162728090 GTTACATAAAAAACTAAAAGTTGAGCTACCGTATGATCCAGCAATTCTACTGCTAGAGTA 162728149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5014 GTTACATAAAAAACTAAAAGTTGAGCTACCGTATGATCCAGCAATTCTACTGCTAGAGTA 5073

162728150 GGTTTCTTTTGGTATATATCCTCCCCCGCAAAAAACAAACAAACAAACAAACAAAAA-AA 162728208
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
     5074 GGTTTCTTTTGGTATATATCCTCCCCCGCAAAAAACAAACAAACAAACAAACAAA--CAA 5131

162728209 AAAAACAAAGCAGTATGTTGAAGACATACCTGCACTCTTATGTTTGTTGCAACACTGTTT 162728268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5132 AAAAACAAAGCAGTATGTTGAAGACATACCTGCACTCTTATGTTTGTTGCAACACTGTTT 5191

162728269 ACAATAGTAAAGATTTGGAAGCAACTTATGTGTCCATCAACAGATGAATAGATAAAGAAA 162728328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5192 ACAATAGTAAAGATTTGGAAGCAACTTATGTGTCCATCAACAGATGAATAGATAAAGAAA 5251

162728329 ATGTGGTGCCTATACACAATGGAATACCATTCGGCCAAAAAAAGAATGAGGCCCAGTCAT 162728388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5252 ATGTGGTGCCTATACACAATGGAATACCATTCGGCCAAAAAAAGAATGAGGCCCAGTCAT 5311

162728389 TTGCAGCAACATGGATGAAACTGGAGATTGTCATGATAAATGAAATAAGCCAGGCATTGA 162728448
          ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5312 TTGCAGCAACATGGTTGAAACTGGAGATTGTCATGATAAATGAAATAAGCCAGGCATTGA 5371

162728449 AAGACAAACATCACATATTCTCACTTATTTGTGGGATCTAAAAATCAAAAACATTGAACT 162728508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5372 AAGACAAACATCACATATTCTCACTTATTTGTGGGATCTAAAAATCAAAAACATTGAACT 5431

162728509 CATGGACATAAGAAAGTAGAATCATGGTTGCCAGAGGCTGGTAATGGTAGCAAGGAGTTG 162728568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5432 CATGGACATAAGAAAGTAGAATCATGGTTGCCAGAGGCTGGTAATGGTAGCAAGGAGTTG 5491

162728569 GGTTGGTGGGGAATTGAGATTAATTAATGGGCACACAAGAAAATAGAAAGAATGAATAAG 162728628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5492 GGTTGGTGGGGAATTGAGATTAATTAATGGGCACACAAGAAAATAGAAAGAATGAATAAG 5551

162728629 ACCTACTATATAATAGCACAACAGGGCAACTATAGTCAATAATAACTTAGTAGTATATTT 162728688
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5552 ACCTACTATATAATAGCACAACAGGGCAACTATAGTCAATAATAACTTAGTAGTACATTT 5611

162728689 TAAGATAACTTATGGAGTATAATTGGATTGTATGTAACTCAAAGGTTAAATGCTTGAGGG 162728748
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
     5612 TAAGATAACTTATGGAGTATAATTGGATTGTATGTAACTCAAAGGTTAAGTGCTTGAGGG 5671

162728749 GATGGATCACCCATTCTCCATGATGTGCTTATGTCACATTGCATGCCTGTATCAAAACAT 162728808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5672 GATGGATCACCCATTCTCCATGATGTGCTTATGTCACATTGCATGCCTGTATCAAAACAT 5731

162728809 CTCATGTACCTCATGAATACATACACTTACCATGTACTCAAAAATTAAAAAGAGAAGAAA 162728868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5732 CTCATGTACCTCATGAATACATACACTTACCATGTACTCAAAAATTAAAAAGAGAAGAAA 5791

162728869 ATTAAAAGTATTAGATTTTGTTTATTAAATCTGAAAACCCTAAAATTCAAAACCAGAAAC 162728928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5792 ATTAAAAGTATTAGATTTTGTTTATTAAATCTGAAAACCCTAAAATTCAAAACCAGAAAC 5851

162728929 CAAGTAAAAAGTTATTTTCTCTTAATAAAAGGAATCTTAATATTGGAAGTCTGGAACAGC 162728988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5852 CAAGTAAAAAGTTATTTTCTCTTAATAAAAGGAATCTTAATATTGGAAGTCTGGAACAGC 5911

162728989 TATGATGCCCAAAGATACCAAAACAGGATTTTCATCCCATACTTGATGCTTCATATAACA 162729048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5912 TATGATGCCCAAAGATACCAAAACAGGATTTTCATCCCATACTTGATGCTTCATATAACA 5971

162729049 TGACATAATGTGTATTCAGAAAATTATTTTAAGACATAAATATTTTCTGGAGACCCTGCC 162729108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5972 TGACATAATGTGTATTCAGAAAATTATTTTAAGACATAAATATTTTCTGGAGACCCTGCC 6031

162729109 ATCATGACAGCTTCTTATAAATAAAGCATGGCAACATAGAAAGTAGAAAAATGGAAGTAA 162729168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     6032 ATCATGACAGCTTCTTATAAATAAAGCATGGCAACATAGAAAGTAGAAAAATGGCAGTAA 6091

162729169 CACTCTCCATTTCCCATATCTTTCCAGAGAGTCCTTCTCCCAAACGCTGTCTTGAACTTA 162729228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6092 CACTCTCCATTTCCCATATCTTTCCAGAGAGTCCTTCTCCCAAACGCTGTCTTGAACTTA 6151

162729229 GTCATCTTATTACATAACTATTGCTAACCCTGAGGAATATCAGAAAAAATATCTTTACCC 162729288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6152 GTCATCTTATTACATAACTATTGCTAACCCTGAGGAATATCAGAAAAAATATCTTTACCC 6211

162729289 AGGGTTAATGTCACCCCCAATGACTTAGAGCTTCTATCAGAAAGGCAGTAAAAAAGTTAG 162729348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6212 AGGGTTAATGTCACCCCCAATGACTTAGAGCTTCTATCAGAAAGGCAGTAAAAAAGTTAG 6271

162729349 AGATAACTAGACATGTCTGCTACCAATAGTCTAATGAAAAGCTCCTTTTTTTTTTTTTTT 162729408
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||
     6272 AGATAACTAGACATGTCTGCTACCAATAGTCTAATGAAAAGCTCC--TTTTTTTTTTTTT 6329

162729409 TCAAAATTGCTCTCAGGTTTGTCAAGACTGATGAAAAAGCTTCACAACTTTGAAATATAT 162729468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6330 TCAAAATTGCTCTCAGGTTTGTCAAGACTGATGAAAAAGCTTCACAACTTTGAAATATAT 6389

162729469 TTTTTATTTACCTTTTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAA 162729528
          ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6390 TTTTTATTTACC--TTTTTTTTTTTTGAGATGGAGTTTCACTCTGTCACCCAGGCTGGAA 6447

162729529 TGCAGTGATGCAATCTCTGCTCATTACAGCCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCAATTCTTCT 162729588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6448 TGCAGTGATGCAATCTCTGCTCATTACAGCCTCCGCCTCCAGGGTTCAAGCAATTCTTCT 6507

162729589 GCCTCAGGCTCATAAGTAGCTGGAATTACAGGCACCTGCCACCGGGCCTGGCTAATTTAT 162729648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6508 GCCTCAGGCTCATAAGTAGCTGGAATTACAGGCACCTGCCACCGGGCCTGGCTAATTTAT 6567

162729649 TTGTTTTAGTAGAGATGTGGTTTCACCATGTTAGCCAAGCTGATCTCAAACTCCTGGCCT 162729708
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
     6568 TTGTTTTAGTAGAGATGTGATTTCACCATGTTAGCCAAGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCT 6627

162729709 CAAGCATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGAGCCACCAGGC 162729768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6628 CAAGCATCTGCCCACCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGAGCCACCAGGC 6687

162729769 CAGGCCACATGTTAAAAGTATTTTAACTATTGTTTATAGATATATTTTAATGAATAATTA 162729828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6688 CAGGCCACATGTTAAAAGTATTTTAACTATTGTTTATAGATATATTTTAATGAATAATTA 6747

162729829 GAGACACATGTCAATCAGTGTTGGTTGTTAGTGAGTTAATAACTTTTCAATACTGTGCAC 162729888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6748 GAGACACATGTCAATCAGTGTTGGTTGTTAGTGAGTTAATAACTTTTCAATACTGTGCAC 6807

162729889 ACTCTAACGATTTGAAAATTGGAAAGTTAGAAAATTATGTCTTAAGTAAAAATCTCATAG 162729948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6808 ACTCTAACGATTTGAAAATTGGAAAGTTAGAAAATTATGTCTTAAGTAAAAATCTCATAG 6867

162729949 CCAGCTCAAGTTTTTCACCAAAAGTGCCAATTTAAAATGACTTGCCTTGACAGGTGACAA 162730008
          |||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||
     6868 CCAGCTCAAATTTTTCACCAAAAGTGCCAACTTAAAATGACTTGTCTTGACAGGTGACAA 6927

162730009 ATAAAATTGTATTAGAAACAAATAAAATACTTTACCCCTGCATTATTCTGATCTGAACTA 162730068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6928 ATAAAATTGTATTAGAAACAAATAAAATACTTTACCCCTGCATTATTCTGATCTGAACTA 6987

162730069 TACTTTTATCATTATAGTGAATATTTCAAAAATGTGTCATAGAATCCTGAAAATTTTAAA 162730128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6988 TACTTTTATCATTATAGTGAATATTTCAAAAATGTGTCATAGAATCCTGAAAATTTTAAA 7047

162730129 TAAATATGC 162730137
          |||||||||
     7048 TAAATATGC 7056

Alignment time is 7.34859 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162707306,162733554] =>     26249 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2685] =>      2685 nucs 'mol-32-2fcd-163459_2685'

Score:        2546
Aligned:      2683        nucs
Identic:      2664 ( 99%) nucs =>      2411 (100%)       253 ( 95%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162714889,162717306] EXCISED REGION [162723555,162723815]
 second seq =>  [        1,     2416] EXCISED REGION [     2421,     2681]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6248 nucs [162717307,162723554]
 second seq =>         4 nucs [2417,2420]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162717305,162717308] to [162723553,162723556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [162717304,162717306] to [162723555,162723557]
 second seq =>         3 nucs [2414,2416] to [2421,2423]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [162717307,162717308] to [162723553,162723554]
 second seq =>         0 nucs

162714889 AAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATAAAATCAATTTTTTGTTTGCCAAAAA 162714948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATAAAATCAATTTTTTGTTTGCCAAAAA 60

162714949 GTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATTTTAGCTTTTTTGTTTTATTTTGTTT 162715008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 GTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATTTTAGCTTTTTTGTTTTATTTTGTTT 120

162715009 TTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTGTATGCTGAACACAGATATTTTAATT 162715068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTGTATGCTGAACACAGATATTTTAATT 180

162715069 GTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATCTGAGAAAACTTTTATAAGCATTTCT 162715128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 GTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATCTGAGAAAACTTTTATAAGCATTTCT 240

162715129 TTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAGTGAACTGTTCTGTCACCCCCACATG 162715188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAGTGAACTGTTCTGTCACCCCCACATG 300

162715189 ATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCAAAAGGTATTTAAGTTGTTACAATTT 162715248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCAAAAGGTATTTAAGTTGTTACAATTT 360

162715249 GGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTTTCTTTTTTATTTTTTTATATTGGCT 162715308
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 GGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTTTCTTTTTTATTTTTTTATATTGGCT 420

162715309 GGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATCTGGAGAAGAGTCAGCAAATTCAAAG 162715368
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATCTGGAGAAGAGTCAGCAAATTCAAAG 480

162715369 TAAGCAGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAGAAAACTTAGGTTCTACATATTAATT 162715428
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAAGCAGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAGAAAACTTAGGTTCTACATATTAATT 540

162715429 TATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATCAAAAAGTTTGGGGAGTTGTAATCCC 162715488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATCAAAAAGTTTGGGGAGTTGTAATCCC 600

162715489 CAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAAAATCTATGTAGCTAACTTGAGTCCC 162715548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAAAATCTATGTAGCTAACTTGAGTCCC 660

162715549 AGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTCATTACATTTTATGTAATTGCTTGAA 162715608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTCATTACATTTTATGTAATTGCTTGAA 720

162715609 AGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATGTCAGAAGTTTGAACCAGTGTTTAGA 162715668
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 AGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATGTCAGAAGTTTGAACCAGTGTTTAGA 780

162715669 TGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCATCCCGGGTCCACCATTTAGAATACT 162715728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCATCCCGGGTCCACCATTTAGAATACT 840

162715729 TATTTTTGCTCTTAGATTTCCCGAAAGTAGCTAGGGAAAAGAGCTGAATATTTTGCAGAT 162715788
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TATTTTTGCTCTTAGATTTCCCCAAAGTAGCTAGGGAAAAGAGCTGAATATTTTGCAGAT 900

162715789 GCATGCAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGAGTGCTCACAAAAATTGTAACCCGGA 162715848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCATGCAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGAGTGCTCACAAAAATTGTAACCCGGA 960

162715849 CATAAAGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGCAAAAAGAAACAAAAGTAAATTCACC 162715908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CATAAAGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGCAAAAAGAAACAAAAGTAAATTCACC 1020

162715909 AGAAAAGACATGCCTCATAGAATGCAAATTCTGTAGAAACTAGAGCACTCAAACCAAAAG 162715968
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 AGAAAAGACATGCCTCATGGAATGCAAATTCTGTAGAAACTAGAGCACTCAAACCAAAAG 1080

162715969 GACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGGGAAGATAAAATAATCTTTTATTATC 162716028
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
     1081 GACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGGAAAGATAAAATAATCTTTTATTATC 1140

162716029 TTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGCCTTATAATCAAAACAAATCCTGAAC 162716088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGCCTTATAATCAAAACAAATCCTGAAC 1200

162716089 AAAGTTTAAAAAACCTTCTAACAAAAAGAAGTCTTTCCCTGAGAAAAGATTCACCAGGGC 162716148
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AAAGTTTAAAAAAACTTCTAACAAAAAGAAGTCTTTCCCTGAGAAAAGATTCACCAGGGC 1260

162716149 AGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAGGGCTCATGTGGGTACTGCACCACAG 162716208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAGGGCTCATGTGGGTACTGCACCACAG 1320

162716209 CCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCTTGCTTCATGGCCTGCTTCTGGACAC 162716268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCTTGCTTCATGGCCTGCTTCTGGACAC 1380

162716269 TATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAGCTCTCTAAAATAAGATGAAATATCA 162716328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAGCTCTCTAAAATAAGATGAAATATCA 1440

162716329 TTTCATCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTCAATAGGAATATGTGTGTCATAGTAA 162716388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TTTCATCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTCAATAGGAATATGTGTGTCATAGTAA 1500

162716389 ACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAAAGATTTTTAACAAAACGATCAGGAG 162716448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAAAGATTTTTAACAAAACGATCAGGAG 1560

162716449 GATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGATAGGGATCACTAATAAGTGTGGTGCC 162716508
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
     1561 GATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGATAGGGATCATTAATAAGTGTGGTGCC 1620

162716509 AATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATGTCTTTACAGGAGTATTTTTTGGTGT 162716568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 AATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATGTCTTTACAGGAGTATTTTTTGGTGT 1680

162716569 AAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTTTGAAATCTTTTATGATAGCTTTTGT 162716628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTTTGAAATCTTTTATGATAGCTTTTGT 1740

162716629 TATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTATTACCTTTACATATCAATAAAAATTT 162716688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTATTACCTTTACATATCAATAAAAATTT 1800

162716689 TCATAGTACTCACACATGTTACCATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATGAAAAGTATCA 162716748
          |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TCATAGTACTCACAC--GTTACCATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATGAAAAGTATCA 1858

162716749 AAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTGGTATTATTATTATATCTCTAATTTT 162716808
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 AAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTGGTATTATTATTATATCTCTAATTTT 1918

162716809 TAAATTTACTTTCTTCTCCCATTTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAATATTAAACTAAAA 162716868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TAAATTTACTTTCTTCTCCCATTTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAATATTAAACTAAAA 1978

162716869 TACATATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAATTAGCTCCTAATT 162716928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TACATATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAATTAGCTCCTAATT 2038

162716929 CTTAATGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGA 162716988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CTTAATGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGA 2098

162716989 TCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAAAATAT 162717048
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAAAATAT 2158

162717049 AATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGC 162717108
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGC 2218

162717109 TTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCT 162717168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCT 2278

162717169 TTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTAATGTG 162717228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTAATGTG 2338

162717229 CATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAG 162717288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAG 2398

162717289 TTTTTACTGTTTAAGAAA 162717306
          ||||||||||||||||||
     2399 TTTTTACTGTTTAAGAAA 2416

EXCISED REGION

162723555 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 162723614
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2421 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGAGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 2480

162723615 GTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGAGAATT 162723674
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2481 GTAAACTATCACAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGGGAATT 2540

162723675 GAACAATGT----GAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 162723730
          |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2541 GAACA----GTGAGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 2596

162723731 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCACTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 162723790
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2597 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 2656

162723791 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATG 162723815
          |||||||||||||||||||||||||
     2657 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATG 2681

Alignment time is 2.58237 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162707306,162733554] =>     26249 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     6784] =>      6784 nucs 'mol-32-30f6-153133_6784'

Score:        6342
Aligned:      6793        nucs
Identic:      6725 ( 99%) nucs =>      1969 (100%)      4756 ( 99%)
Gaps:           39 (  1%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162715331,162717306] EXCISED REGION [162723555,162728345]
 second seq =>  [        1,     1974] EXCISED REGION [     1979,     6784]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6248 nucs [162717307,162723554]
 second seq =>         4 nucs [1975,1978]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162717305,162717308] to [162723553,162723556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [162717304,162717306] to [162723555,162723557]
 second seq =>         3 nucs [1972,1974] to [1979,1981]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [162717307,162717308] to [162723553,162723554]
 second seq =>         0 nucs

162715331 TTATCTCAACATCTGGAGAAGAGTCAGCAAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAA 162715390
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTATCTCAACATCTGGAGAAGAGTCAGCAAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAA 60

162715391 CAACAAAAAAGAGAAAACTTAGGTTCTACATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTG 162715450
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 CAACAAAAAAGAGAAAACTTAGGTTCTACATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTG 120

162715451 GATAGCAAGAATCAAAAAGTTTGGGGAGTTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAA 162715510
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GATAGCAAGAATCAAAAAGTTTGGGGAGTTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAA 180

162715511 TGTGCACAAGAAAAATCTATGTAGCTAACTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAAT 162715570
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TGTGCACAAGAAAAATCTATGTAGCTAACTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAAT 240

162715571 GTTTGAAATTCTCATTACATTTTATGTAATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACT 162715630
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 GTTTGAAATTCTCATTACATTTTATGTAATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACT 300

162715631 CTGTCACTGAATGTCAGAAGTTTGAACCAGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGC 162715690
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CTGTCACTGAATGTCAGAAGTTTGAACCAGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGC 360

162715691 TTTTAAGGAGCCATCCCGGGTCCACCATTTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCC 162715750
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTTAAGGAGCCATCCCGGGTCCACCATTTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCC 420

162715751 GAAAGTAGCTAGGGAAAAGAGCTGAATATTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGA 162715810
          .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CAAAGTAGCTAGGGAAAAGAGCTGAATATTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGA 480

162715811 AACCAAAATCAGAGTGCTCACAAAAATTGTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATATT 162715870
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 AACCAAAATCAGAGTGCTCACAAAAATTGTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATATT 540

162715871 AAATTAGGCATGCAAAAAGAAACAAAAGTAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATAGAA 162715930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
      541 AAATTAGGCATGCAAAAAGAAACAAAAGTAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATGGAA 600

162715931 TGCAAATTCTGTAGAAACTAGAGCACTCAAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAA 162715990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TGCAAATTCTGTAGAAACTAGAGCACTCAAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAA 660

162715991 AGAACTTTCCAGGGAAGATAAAATAATCTTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTT 162716050
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGAACTTTCCAGGAAAGATAAAATAATCTTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTT 720

162716051 TATTAAAGGTAGCCTTATAATCAAAACAAATCCTGAACAAAGTTTAAAAAACCTTCTAAC 162716110
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
      721 TATTAAAGGTAGCCTTATAATCAAAACAAATCCTGAACAAAGTTTAAAAAAACTTCTAAC 780

162716111 AAAAAGAAGTCTTTCCCTGAGAAAAGATTCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGT 162716170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAAAAGAAGTCTTTCCCTGAGAAAAGATTCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGT 840

162716171 GGAGAGCTGTAAGGGCTCATGTGGGTACTGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTT 162716230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 GGAGAGCTGTAAGGGCTCATGTGGGTACTGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTT 900

162716231 CTGAATGTGATCTTGCTTCATGGCCTGCTTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATAAC 162716290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTGAATGTGATCTTGCTTCATGGCCTGCTTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATAAC 960

162716291 AAAAAGAAAGAAGCTCTCTAAAATAAGATGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTGGG 162716350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAAAGAAAGAAGCTCTCTAAAATAAGATGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTGGG 1020

162716351 GATAGGGCATTTCAATAGGAATATGTGTGTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGG 162716410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GATAGGGCATTTCAATAGGAATATGTGTGTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGG 1080

162716411 TAAAGGAAGACAAAGATTTTTAACAAAACGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAA 162716470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 TAAAGGAAGACAAAGATTTTTAACAAAACGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAA 1140

162716471 GAGCTTCAGTGATAGGGATCACTAATAAGTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGT 162716530
          |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAGCTTCAGTGATAGGGATCATTAATAAGTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGT 1200

162716531 TGTTGGGCAGATGTCTTTACAGGAGTATTTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGC 162716590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGTTGGGCAGATGTCTTTACAGGAGTATTTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGC 1260

162716591 AAGGTGCAGTTTTTGAAATCTTTTATGATAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGA 162716650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AAGGTGCAGTTTTTGAAATCTTTTATGATAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGA 1320

162716651 ACTCTCTTTTTATTACCTTTACATATCAATAAAAATTTTCATAGTACTCACACATGTTAC 162716710
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||
     1321 ACTCTCTTTTTATTACCTTTACATATCAATAAAAATTTTCATAGTACTCACAC--GTTAC 1378

162716711 CATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCA 162716770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1379 CATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCA 1438

162716771 TTAGATATTTGTGGTATTATTATTATATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCCAT 162716830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1439 TTAGATATTTGTGGTATTATTATTATATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCCAT 1498

162716831 TTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAATATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTATT 162716890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1499 TTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAATATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTATT 1558

162716891 TGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAATTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCATG 162716950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1559 TGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAATTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCATG 1618

162716951 TGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAG 162717010
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1619 TGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAG 1678

162717011 ATGGATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGT 162717070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1679 ATGGATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGT 1738

162717071 CTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTT 162717130
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1739 CTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTT 1798

162717131 CTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTA 162717190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1799 CTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTA 1858

162717191 GTCTATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAA 162717250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GTCTATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAA 1918

162717251 ACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 162717306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 1974

EXCISED REGION

162723555 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 162723614
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGAGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 2038

162723615 GTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGAGAATT 162723674
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2039 GTAAACTATCACAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGGGAATT 2098

162723675 GAACAATGT----GAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 162723730
          |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 GAACA----GTGAGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 2154

162723731 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCACTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 162723790
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2155 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 2214

162723791 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGACACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 162723850
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2215 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 2274

162723851 TGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAT-----AATAAAATTAAAAAATTAAAA 162723905
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||
     2275 TGCGCATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATTAAAAAATTAAAA 2334

162723906 AAATATATGTTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGATACTCCCACATTCTCCCAAATC 162723965
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2335 AAATATATATTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGATACTCCCACATTCTCCCAAATC 2394

162723966 TGGAAGGTCAATGTTTATAGATGCATTTTAAAATACATCTATTATAGGAGTATAAAAACT 162724025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2395 TGGAAGGTCAATGTTTATAGATGCATTTTAAAATACATCTATTATAGGAGTATACAAACT 2454

162724026 TCTCCCAAAATAAATACTGACTTAAACTGACAACCAACAATTTCTTTTATTGTTTGTCTG 162724085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2455 TCTCCCAAAATAAATACTGACTTAAACTGACAACCAACAATTTCTTTTATTGTTTGTCTG 2514

162724086 TTGCTTGCTCTATGATGCTAGACAGTGCAAAGGCCATTATATGTATTTTGTTCTTTCATA 162724145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2515 TTGCTTGCTCTATGATGCTAGACAGTGCAAAGGCCATTATATGTATTTTGTTCTTTCATA 2574

162724146 TTTACAATGAGAGTAACATTTGGTTACATTTCATATATATTTTTAATAGTTTCTAAAAGT 162724205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2575 TTTACAATGAGAGTAACATTTGGTTACATTTCATATATATTTTTAATAGTTTCTAAAAGT 2634

162724206 TATTTTTATAATAATATATTAGGTCTTGTGTTCAAATACGTGTGTGTATGTGTACAACAT 162724265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     2635 TATTTTTATAATAATATATTAGGTCTTGTGTTCAAATATGTGTGTGTATGTGTACAACAT 2694

162724266 TAACAATGCACATTAATATTGATGATAAAGGAACTTCTTACTTTGTGCATGCAAAAAAGA 162724325
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2695 TAACAATGCACATTAATATTGATGATAAAAGAACTTCTTACTTTGTGCATGCAAAAAAGA 2754

162724326 TTAAGCCCTTATTTTATAATATTGCTTAAGACAATGTTGATGATACTGAGTAAAGTTTTC 162724385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     2755 TTAAGCCCTTATTTTATAATATTGCTTAAGACAATGTTGATGATACTGTGTAAAGTTTTC 2814

162724386 ATGAGGTGAACATTGCTAAAATTTACAAAGGGTCTGGTGGTAGGAGTTATATATTTTAAT 162724445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2815 ATGAGGTGAACATTGCTAAAATTTACAAAGGGTCTGGTGGTAGGAGTTATATATTTTAAT 2874

162724446 CCAAAGCACCTTCTAACTAAAAACTGAAGTAATTGTACAACATCATTAAAATATACTTCC 162724505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2875 CCAAAGCACCTTCTAACTAAAAACTGAAGTAATTGTACAACATCATTAAAATATACTTCC 2934

162724506 ACAGATTCTGAGAATCAAATAAAAATTATTTCTTTAATTTCATATCTTCAGTATTTGTAA 162724565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2935 ACAGATTCTGAGAATCAAATAAAAATTATTTCTTTAATTTCATATCTTCAGTATTTGTAA 2994

162724566 CATTACCCTACTCCATAATTAACATATCAATAAATTTCAAAGAAAACATACACATAGAGT 162724625
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2995 CATTACCCTACTCCATAATTAACATATCAATAAATTTCAAAGAAAACATACACATAGAGT 3054

162724626 ACTAAAATCTGAATTTTCCTACTTCCTGTCCATCTGTACCCCCTATCATTTATCACCATC 162724685
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3055 ACTAAAATCTGAATTTTCCTACTTCCTGTCCATCTGTACCCCCTATCATTTATCACCATC 3114

162724686 TAGACACCCACCATTTAACTAGGGTAAAATAAAAATATACATTTTCTTATTCATTATGGT 162724745
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3115 TAGACACCCACCATTTAACTAGGGTAAAATAAAAATATACATTTTCTTATTCATTATGGT 3174

162724746 AAATTTACTATATAAGTTATGCTTTAATGAGCACTCAGTACTTAAACAGAAGACAGCTTA 162724805
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3175 AAATTTACTATATAAGTTATGCTTTAATGAGCACTCAGTACTTAAACAGAAGACAGCTTA 3234

162724806 AGATCCAAGACTGAGATATTAAAATCCAAACATTGCAGCCAGAAAGAATAATTAATAAGA 162724865
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
     3235 AGATCCAAGACTGAGATATTAAAATCCAAACATTGCACCCAGAAAGAATAATTAATAAGA 3294

162724866 TTATCATTAACGGAGACACTCTATATCTGTTCCTTATTTAAGCTATTTTCAGCTCAGATT 162724925
          |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3295 TTATCATTAACAGAGACACTCTATATCTGTTCCTTATTTAAGCTATTTTCAGCTCAGATT 3354

162724926 TCGATAAGAAAGTTACTCTTCTTACTAGAGCTTTTGAAATAAAGCACTCATCATTGGTGA 162724985
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3355 TCGATAAGAAAGTTACTCTTCTTACTAGAGCTTTTGAAATAAAGCACTCATCATTGGTGA 3414

162724986 AATGATGTTCAGCAGAGAACCTTCAACTATCAAACTTAGAACAAGAACACTAACCAGGTC 162725045
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     3415 AATGATGTTCAGCAGAGAACCTTCAACTATCAAACTTAGAACAAGAAGACTAACCAGGTC 3474

162725046 TCAAAAATCACAATCAGAAAAAGGCACCATTTACAGAGCAATACCTAATATACAAGAGAA 162725105
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3475 TCAAAAATCACAATCAGAAAAAGGCACCATTTACAGAGCAATACCTAATATATAAGAGAA 3534

162725106 GGCAATTTTAAAAGGCATATGAGAAACAAAGCAAAACAACCTTTCCCCAAATATTGATAG 162725165
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
     3535 GGCAATTTTAAAAGGCATATGAGAAACAAAGCAAAACAACCTTTCACCAAATATTGATAG 3594

162725166 TGATACTTTTATTTGAAAACTGAAATAAAGCAAGCAATTGCAGGAATATTAGATAAATTT 162725225
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3595 TGATACTTTTATTTGAAAACTGAAATAAAGCAAGCAATTGCAGGAATATTAGATAAATTT 3654

162725226 CGTTGCAATTTTCATAACATGGAAAAATGAGATTGTGGGAGAGACAAGCATGGGTTAAAT 162725285
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3655 CGTTGCAATTTTCATAACATGGAAAAATGAGATTGTGGGAGAGACAAGCATGGGTTAAAT 3714

162725286 ACCTCACTAAATATAGAGTGCAAGAGCATTATAACGTGGGCCGTGCAAACAGTAGAACAT 162725345
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     3715 ACCTCACTAAATATAGAGTGCAAGAGCATTATAACGTGGGCCGTGCAAACAGCAGAACAT 3774

162725346 TTCAAACCTAAGGCCTACTATTGTTGTGGCTAAGTGTTTTCACCACTTCCTTAGTAAAAA 162725405
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3775 TTCAAACCTAAGGCCTACTATTGTTGTGGCTAAGTGTTTTCACCACTTCCTTAGTAAAAA 3834

162725406 GTTACCATATAGATAAAATAAAATACATTTATAAAACTTTTACAGTCTGTTTTAATCAAA 162725465
          ||||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3835 GTTACCATATAG-----ATAAAATACATTTATAAAACTTTTACAGTCTGTTTTAATCAAA 3889

162725466 TTTACCTCTACATAATCCCCATTCTATAAGTTCAGTTATCAACAAACTCCTTCATAAAGA 162725525
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3890 TTTACCTCTACATAATCCCCATTCTATAAGTTCAGTTATCAACAAACTCCTTCATAAAGA 3949

162725526 ATCCCTTCCTGGATTCTTAGAGTGTATAGGTAGTGATTCTAGATTCAAGAATGAAAAAAA 162725585
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3950 ATCCCTTCCTGGATTCTTAGAGTGTATAGGTAGTGATTCTAGATTCAAGAATGAAAAAAA 4009

162725586 AATCAATTAAAAAGAGCCTTTTACAGGACATTTTATTTATAAGGCCTATTTTTTTTGTTG 162725645
          ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
     4010 AATCAATTAAAAAGAGCCTTTTACAGGATATTTTATTTATAAGGCCTATTTTTTTTGTTG 4069

162725646 GGGTTTTAGACTAATGCAATTACAGTAAATTAAAGTTTTCACATTTTATATGTAGATATT 162725705
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4070 GGGTTTTAGACTAATGCAATTACAGTAAATTAAAGTTTTCACATTTTATATGTAGATATT 4129

162725706 ACAAGTCACATATTCCACAAACTCATTTTGAAATAGCAGAGTGCTGTGCGCAGTGGCTCA 162725765
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4130 ACAAGTCACATATTCCACAAACTCATTTTGAAATAGCAGAGTGCTGTGCGCAGTGGCTCA 4189

162725766 TGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCATTTGAGCCCAGGAGTT 162725825
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4190 TGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGCGGGCAGATCATTTGAGCCCAGGAGTT 4249

162725826 TGAGACCAGCCTGGGCAATATGGTGAACTTCACTTCTACCAAAAATACAAAAAGAAAAAA 162725885
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4250 TGAGACCAGCCTGGGCAATATGGTGAACTTCACTTCTACCAAAAATACAAAAAGAAAAAA 4309

162725886 CTGATTAGCCAGTTATGGTGGTGCGTGTCCATAGTCCTAGCTACTAGGGAGGCTGAGGAA 162725945
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4310 CTGATTAGCCAGTTATGGTGGTGCGTGTCCATAGTCCTAGCTACTAGGGAGGCTGAGGAA 4369

162725946 GTAGAATCGCTTGAATCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGGTGATACCACTGCAC 162726005
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4370 GTAGAATCGCTTGAACCCAGGAGGCAGAGGTTGCAGTGAGCCAAGGTGATACCACTGCAC 4429

162726006 TCCAGCCTGGGTAACAGAGGGGGACCCTGTCTCAATAAGAAAAAAAGAAAACATGTAAAA 162726065
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4430 TCCAGCCTGGGTAACAGAGGGGGACCCTGTCTCAATAAGAAAAAAAGAAAACATGTAAAA 4489

162726066 CATCCAAACAATGTAAACTGTTAAAATAGAAGCTGTTAAGATGGCAAATATGCACACAGA 162726125
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4490 CATCCAAACAATGTAAACTGTTAAAATAGAAGCTGTTAAGATGGCAAATATGCACACAGA 4549

162726126 GATAGATGGTAGATGCATTGTGTTATCAGCTGCAAAACTTTTAAAGAAATTTATAATTGA 162726185
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4550 GATAGATGGTAGATGCATTGTGTTATCAGCTGCAAAACTTTTAAAGAAATTTATAATTGA 4609

162726186 CACATCATACAAATTCATTGGGTACAATATGATGGTTTAATACATTTATACATAGTATAA 162726245
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4610 CACATCATACAAATTCATTGGGTACAATATGATGGTTTAATACATTTATACATAGTATAA 4669

162726246 TAGTTAAATAAGGGTAATTATTATATCCAACATTGAAAGCATGTATTTCTTTATGGTGGA 162726305
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4670 TAGTTAAATAAGGGTAATTATTATATCCAACATTGAAAGCATGTATTTCTTTATGGTGGA 4729

162726306 AACATTCAAAATCTTCTCTTCTAACTATTTTGAAATATGCATTTATTCTTACTTGCTATA 162726365
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4730 AACATTCAAAATCTTCTCTTCTAACTATTTTGAAATATGCATTTATTCTTACTTGCTATA 4789

162726366 GTCACCATACTATGTAACAGAGCATGTAAAGCAG----------------ATATCAAGTA 162726409
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||                ||||||||||
     4790 GTCACCATACTATGTAACAGAGCATGTAAAGCAGATATCAAGTACACAAAATATCAAGTA 4849

162726410 CATCTGTTTTCTCTACCTTCAACGCTCCAGTCAAATTTTAGCTATTTATTTATTTCCTTG 162726469
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4850 CATCTGTTTTCTCTACCTTCAATGCTCCAGTCAAATTTTAGCTATTTATTTATTTCCTTG 4909

162726470 TTTTTTCTTGTGGCAAGGACTAATGCAATGCATCTTTAGTCAGCCATCTTGCTGACATCA 162726529
          ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4910 TTTTTTCTTGTGGCAAAGACTAATGCAATGCATCTTTAGTCAGCCATCTTGCTGACATCA 4969

162726530 CTCCTATATTGACTTTTAAAGTGAATACTGAAAGAAGTAATTGTGGATACTACTACTGTT 162726589
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     4970 CTCCTATATTGACTTTTAAAGTGAATACTGAAAGAAGTAATTGTGGATACTACTACTGTT 5029

162726590 CTTTACAATACAACCCTAGCTGGTTACTGCTACCAAGGGCTATCTATTGCTTAATTATGT 162726649
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5030 CTTTACAATACAACCCTAGCTGGTTACTGCTACCAAGGGCTATCTATTGCTTAATTATGT 5089

162726650 CTAATTATATTTTGTTTAATCATCAATTGGGGACATTAATGTAAGTACAAACGCAAGTAC 162726709
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     5090 CTAATTATATTTTGTTTAATCATCAATCGGGGACATTAATGTAAGTACAAACGCAAGTAC 5149

162726710 TAGAGGGCTCTTATAAAACTTATAGAGGGCTCGTATAGAACATATATAATGTTCGTAATG 162726769
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5150 TAGAGGGCTCTTATAAAACTTATAGAGGGCTCGTATAGAACATATATAATGTTCGTAATG 5209

162726770 TGTGACCTGTAATAAGGTAGTAATAATGGCTACGATTTATTAACATGTTTTTATACATAA 162726829
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5210 TGTGACCTGTAATAAGGTAGTAATAATGGCTACGATTTATTAACATGTTTTTATACATAA 5269

162726830 TGAAAACTTTAAACGAGGTATTCAATCTAATCAAAGTTATTTAGATAGCTTTTCACAAAC 162726889
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5270 TGAAAACTTTAAACGAGGTATTCAATCTAATCAAAGTTATTTAGATAGCTTTTCACAAAC 5329

162726890 AATTAGCAGTATCAAATGCAATCAAGAAGCTGCACCACATACTAATATGGTTTTCTTCTA 162726949
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5330 AATTAGCAGTATCAAATGCAATCAAGAAGCTGCACCACATACTAATATGGTTTTCTTCTA 5389

162726950 TATTTAATTTGCTGAGATTGTTTTTTAATCATGTGTGTGGATATTGAATTTTTAATAAGC 162727009
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5390 TATTTAATTTGCTGAGATTGTTTTTTAATCATGTGTGTGGATATTGAATTTTTAATAAGC 5449

162727010 ATTTATTTTGCCAACACTGGGATGACCTTATGAGTATTTTCCTATAATTAATTACTATGA 162727069
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
     5450 ATTTATTTTGCCAACACTGGGATGACCTTATGAGTATTTTCCTATAATTAATTACGATGA 5509

162727070 TGAAATGCATTAGTCAAATCTCTAATATTAACTTATCACAGCTTTCCTGGAAAATTTTCA 162727129
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5510 TGAAATGCATTAGTCAAATCTCTAATATTAACTTATCACAGCTTTCCTGGAAAATTTTCA 5569

162727130 AATGATTTACTACAATCTTATTATATATGCTGGTTTCATTTATTGATTTTAAAAATATAT 162727189
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5570 AATGATTTACTACAATCTTATTATATATGCTGGTTTCATTTATTGATTTTAAAAATATAT 5629

162727190 TTATATCTATATTTTGTCAGAGACTGATACTTTTCTCCCAGAATCTTTTCTCTCTTTCTT 162727249
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
     5630 TTATATCTATATTTTGTCAGAGACTGATACTTTTCTCCCAGAATCTTTTCTCTCTTTATT 5689

162727250 CCTTTTCAATATGAAAACATAAATTGTTTTCCCACAAGCTGTCCAACCTGGTAGAGTTTT 162727309
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5690 CCTTTTCAATATGAAAACATAAATTGTTTTCCCACAAGCTGTCCAACCTGGTAGAGTTTT 5749

162727310 AATGGTTCACTTGGCTGCTTAGTTAGGAGACGACATAGCTTGTTTTTTCTTGATGTTAGA 162727369
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5750 AATGGTTCACTTGGCTGCTTAGTTAGGAGACGACATAGCTTGTTTTTTCTTGATGTTAGA 5809

162727370 AGTAAGACGTAGAATGTAAAGCAAATGATATATGCATTTTCCATGACCTGTACTTAAGAG 162727429
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5810 AGTAAGACGTAGAATGTAAAGCAAATGATATATGCATTTTCCATGACCTGTACTTAAGAG 5869

162727430 CAGCTGCTTACCTAATACTTTGTTACTTTTCCTGTGAGTTGGCGTACAAATATTATAGCA 162727489
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5870 CAGCTGCTTACCTAATACTTTGTTACTTTTCCTGTGAGTTGGCGTACAAATATTATAGCA 5929

162727490 GTAAGCCAGATTAATCCATGTTCATGAGATAAATGCCCTAGAAATGATGGAGCCTGAGTA 162727549
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5930 GTAAGCCAGATTAATCCATGTTCATGAGATAAATGCCCTAGAAATGATGGAGCCTGAGTA 5989

162727550 TCTGTTTCACCTTGTAGGTCAGAGCTTCCAACTAGCCATTCCTTATCTATTTTTATACTT 162727609
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     5990 TCTGTTTCACCTTGTAGGTCAGAGCTTCCAACTAGCCATTCCTTATCTATTTTTATACTT 6049

162727610 TTATATGTGAGATAAATAAAGTTCTGTCTTACTGAAACCACTGCCTTTGATGTTCTTCTA 162727669
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6050 TTATATGTGAGATAAATAAAGTTCTGTCTTACTGAAACCACTGCCTTTGATGTTCTTCTA 6109

162727670 TTACAATAACTCAGCTTATGTCTTAACTAACACACATTGTCTCACATGAGATTAGTGTAT 162727729
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6110 TTACAATAACTCAGCTTATGTCTTAACTAACACACATTGTCTCACATGAGATTAGTGTAT 6169

162727730 AATTTCATCCAAACAACTACAGTGAACTCATTTCTGACAAAGGTGCGAAGACCTTATACT 162727789
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6170 AATTTCATCCAAACAACTACAGTGAACTCATTTCTGACAAAGGTGCGAAGACCTTATACT 6229

162727790 GGGTGAAAGGGTCTCTTCAATACATGGTGCTGGGAAAATCAGATATTCATATGCAGAAGA 162727849
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6230 GGGTGAAAGGGTCTCTTCAATACATGGTGCTGGGAAAATCAGATATTCATATGCAGAAGA 6289

162727850 ATGAAACTAGACCCCTATCTCTCACCATACACAAAAATCCAATGCAATGTATTAAAGCCT 162727909
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6290 ATGAAACTAGACCCCTATCTCTCACCATACACAAAAATCCAATGCAATGTATTAAAGCCT 6349

162727910 TAAATGTAACATCTCAAACTATGAAATTACTAAAAGAAAACCTTGGGGAAAATCTGCAGG 162727969
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6350 TAAATGTAACATCTCAAACTATGAAATTACTAAAAGAAAACCTTGGGGAAAATCTGCAGG 6409

162727970 ACGTGGGTTTGGGCAAAAATTTCATGGGCAATGTCCCACAAGTACAGGCAACAAAAGGCA 162728029
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6410 ACGTGGGTTTGGGCAAAAATTTCATGGGCAATGTCCCACAAGTACAGGCAACAAAAGGCA 6469

162728030 AAAATGACAAATGAAATCATATCAAGTTTAAATGTTTCTGCACAGCAAAAGAGTTTGAAG 162728089
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6470 AAAATGACAAATGAAATCATATCAAGTTTAAATGTTTCTGCACAGCAAAAGAGTTTGAAG 6529

162728090 GTTACATAAAAAACTAAAAGTTGAGCTACCGTATGATCCAGCAATTCTACTGCTAGAGTA 162728149
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6530 GTTACATAAAAAACTAAAAGTTGAGCTACCGTATGATCCAGCAATTCTACTGCTAGAGTA 6589

162728150 GGTTTCTTTTGGTATATATCCTCCCCCGCAAAAAACAAACAAACAAACAAACAAAAA-AA 162728208
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||
     6590 GGTTTCTTTTGGTATATATCCTCCCCCGCAAAAAACAAACAAACAAACAAACAAA--CAA 6647

162728209 AAAAACAAAGCAGTATGTTGAAGACATACCTGCACTCTTATGTTTGTTGCAACACTGTTT 162728268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6648 AAAAACAAAGCAGTATGTTGAAGACATACCTGCACTCTTATGTTTGTTGCAACACTGTTT 6707

162728269 ACAATAGTAAAGATTTGGAAGCAACTTATGTGTCCATCAACAGATGAATAGATAAAGAAA 162728328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     6708 ACAATAGTAAAGATTTGGAAGCAACTTATGTGTCCATCAACAGATGAATAGATAAAGAAA 6767

162728329 ATGTGGTGCCTATACAC 162728345
          |||||||||||||||||
     6768 ATGTGGTGCCTATACAC 6784

Alignment time is 6.49981 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162707306,162733554] =>     26249 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2889] =>      2889 nucs 'mol-32-32f0-079237_2889'

Score:        2775
Aligned:      2887        nucs
Identic:      2876 (100%) nucs =>      2861 (100%)        15 (100%)
Gaps:            2 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162714435,162717306] EXCISED REGION [162723555,162723569]
 second seq =>  [        1,     2870] EXCISED REGION [     2875,     2889]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6248 nucs [162717307,162723554]
 second seq =>         4 nucs [2871,2874]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162717305,162717308] to [162723553,162723556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [162717304,162717306] to [162723555,162723557]
 second seq =>         3 nucs [2868,2870] to [2875,2877]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [162717307,162717308] to [162723553,162723554]
 second seq =>         0 nucs

162714435 TATTTTTATATGAGCATTTATTTACCTAAGCAAATCTGAATCAAATTTCTTACTTATTTC 162714494
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
        1 TATTTTTATATGAGCATTTATTTACCTAAGCAAATCTGAATCAAATTTCTTAATTATTTC 60

162714495 TGACTGACTATACCAGATTTTACCCTGTGGACACAATATACAACATAATACATGCAAATA 162714554
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TGACTGACTATACCAGATTTTACCCTGTGGACACAATATACAACATAATACATGCAAATA 120

162714555 TGTGTAAGCATGGCTAAATTCATATGTACAAAAAAATCTTATAGCTTTCATTTTAGGTTT 162714614
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTGTAAGCATGGCTAAATTCATATGTACAAAAAAATCTTATAGCTTTCATTTTAGGTTT 180

162714615 TTAGTCATGAGATAGTAGCACAAACATAATGGTTTATAAAAAATAGGTGAATCCAAATTA 162714674
          |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTAGTCATGAGATAGTAGCGCAAACATAATGGTTTATAAAAAATAGGTGAATCCAAATTA 240

162714675 CAATTCTGACTAAACGAGACATCTGTTCATATGGTTAATTTTTTTTCTTTTTTGCCCTGA 162714734
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 CAATTCTGACTAAACGAGACATCTGTTCATATGGTTAATTTTTTTTCTTTTTTGCCCTGA 300

162714735 TTGGTAATCTGATGAAGGCTGTAGATTAAAGTTTTGGGTAAAGCAGTTTGGCTTAAAAAT 162714794
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TAGGTAATCTGATGAAGGCTGTAGATTAAAGTTTTGGGTAAAGCAGTTTGGCTTAAAAAT 360

162714795 CTCCTTCTCATTTTTTCCTCCTTTTTTAGTTTCAAATGAGTTTAAATTTTCATTTTTGAC 162714854
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
      361 CTCCTTCTCATTTTTTCCTCCTTTTTTAGTTTCAAATGAGTTTAAATTTTCAATTTTGAC 420

162714855 ATTTTAGCTAGGACTGGCAGAATTGTATAAGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAA 162714914
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 ATTTTAGCTAGGACTGGCAGAATTGTATAAGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAA 480

162714915 CTAGCAATAAAATCAATTTTTTGTTTGCCAAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAG 162714974
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTAGCAATAAAATCAATTTTTTGTTTGCCAAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAG 540

162714975 GAAAGCATTTTAGCTTTTTTGTTTTATTTTGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAAC 162715034
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GAAAGCATTTTAGCTTTTTTGTTTTATTTTGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAAC 600

162715035 CAAAAGTTGTATGCTGAACACAGATATTTTAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACC 162715094
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CAAAAGTTGTATGCTGAACACAGATATTTTAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACC 660

162715095 GGTTTTATCTGAGAAAACTTTTATAAGCATTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTA 162715154
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GGTTTTATCTGAGAAAACTTTTATAAGCATTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTA 720

162715155 ACATTTCAGTGAACTGTTCTGTCACCCCCACATGATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGT 162715214
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 ACATTTCAGTGAACTGTTCTGTCACCCCCACATGATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGT 780

162715215 ACCTTTCCAAAAGGTATTTAAGTTGTTACAATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCT 162715274
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 ACCTTTCCAAAAGGTATTTAAGTTGTTACAATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCT 840

162715275 CAAAAACTTTCTTTTTTATTTTTTTATATTGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTAT 162715334
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 CAAAAACTTTCTTTTTTATTTTTTTATATTGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTAT 900

162715335 CTCAACATCTGGAGAAGAGTCAGCAAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAACAAC 162715394
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CTCAACATCTGGAGAAGAGTCAGCAAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAACAAC 960

162715395 AAAAAAGAGAAAACTTAGGTTCTACATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATA 162715454
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AAAAAAGAGAAAACTTAGGTTCTACATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATA 1020

162715455 GCAAGAATCAAAAAGTTTGGGGAGTTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTG 162715514
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 GCAAGAATCAAAAAGTTTGGGGAGTTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTG 1080

162715515 CACAAGAAAAATCTATGTAGCTAACTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTT 162715574
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CACAAGAAAAATCTATGTAGCTAACTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTT 1140

162715575 GAAATTCTCATTACATTTTATGTAATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGT 162715634
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 GAAATTCTCATTACATTTTATGTAATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGT 1200

162715635 CACTGAATGTCAGAAGTTTGAACCAGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTT 162715694
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CACTGAATGTCAGAAGTTTGAACCAGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTT 1260

162715695 AAGGAGCCATCCCGGGTCCACCATTTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCCGAAA 162715754
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1261 AAGGAGCCATCCCGGGTCCACCATTTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCCCAAA 1320

162715755 GTAGCTAGGGAAAAGAGCTGAATATTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGAAACC 162715814
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTAGCTAGGGAAAAGAGCTGAATATTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGAAACC 1380

162715815 AAAATCAGAGTGCTCACAAAAATTGTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATATTAAAT 162715874
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 AAAATCAGAGTGCTCACAAAAATTGTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATATTAAAT 1440

162715875 TAGGCATGCAAAAAGAAACAAAAGTAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATAGAATGCA 162715934
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
     1441 TAGGCATGCAAAAAGAAACAAAAGTAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATGGAATGCA 1500

162715935 AATTCTGTAGAAACTAGAGCACTCAAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAA 162715994
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATTCTGTAGAAACTAGAGCACTCAAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAA 1560

162715995 CTTTCCAGGGAAGATAAAATAATCTTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATT 162716054
          |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 CTTTCCAGGAAAGATAAAATAATCTTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATT 1620

162716055 AAAGGTAGCCTTATAATCAAAACAAATCCTGAACAAAGTTTAAAAAACCTTCTAACAAAA 162716114
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
     1621 AAAGGTAGCCTTATAATCAAAACAAATCCTGAACAAAGTTTAAAAAAACTTCTAACAAAA 1680

162716115 AGAAGTCTTTCCCTGAGAAAAGATTCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAG 162716174
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGAAGTCTTTCCCTGAGAAAAGATTCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAG 1740

162716175 AGCTGTAAGGGCTCATGTGGGTACTGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGA 162716234
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 AGCTGTAAGGGCTCATGTGGGTACTGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGA 1800

162716235 ATGTGATCTTGCTTCATGGCCTGCTTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAA 162716294
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 ATGTGATCTTGCTTCATGGCCTGCTTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAA 1860

162716295 AGAAAGAAGCTCTCTAAAATAAGATGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTGGGGATA 162716354
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 AGAAAGAAGCTCTCTAAAATAAGATGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTGGGGATA 1920

162716355 GGGCATTTCAATAGGAATATGTGTGTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAA 162716414
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGGCATTTCAATAGGAATATGTGTGTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAA 1980

162716415 GGAAGACAAAGATTTTTAACAAAACGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGC 162716474
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGAAGACAAAGATTTTTAACAAAACGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGC 2040

162716475 TTCAGTGATAGGGATCACTAATAAGTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTT 162716534
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 TTCAGTGATAGGGATCATTAATAAGTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTT 2100

162716535 GGGCAGATGTCTTTACAGGAGTATTTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGG 162716594
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GGGCAGATGTCTTTACAGGAGTATTTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGG 2160

162716595 TGCAGTTTTTGAAATCTTTTATGATAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTC 162716654
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 TGCAGTTTTTGAAATCTTTTATGATAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTC 2220

162716655 TCTTTTTATTACCTTTACATATCAATAAAAATTTTCATAGTACTCACACATGTTACCATT 162716714
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||
     2221 TCTTTTTATTACCTTTACATATCAATAAAAATTTTCATAGTACTCACAC--GTTACCATT 2278

162716715 TTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAG 162716774
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAG 2338

162716775 ATATTTGTGGTATTATTATTATATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCCATTTTG 162716834
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 ATATTTGTGGTATTATTATTATATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCCATTTTG 2398

162716835 TTCCAGTATAATTAATAAGAATATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTATTTGTA 162716894
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TTCCAGTATAATTAATAAGAATATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTATTTGTA 2458

162716895 AAATGTATTTTTTTTACAAAATTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCATGTGTA 162716954
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 AAATGTATTTTTTTTACAAAATTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCATGTGTA 2518

162716955 TTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGG 162717014
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGG 2578

162717015 ATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTG 162717074
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 ATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTG 2638

162717075 TGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCT 162717134
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 TGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCT 2698

162717135 TTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCT 162717194
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCT 2758

162717195 ATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTG 162717254
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 ATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTG 2818

162717255 TTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 162717306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 TTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 2870

EXCISED REGION

162723555 AAAATGATGAGTTCA 162723569
          |||||||||||||||
     2875 AAAATGATGAGTTCA 2889

Alignment time is 2.83522 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162707306,162733554] =>     26249 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2596] =>      2596 nucs 'mol-32-331c-000379_2596'

Score:        2468
Aligned:      2594        nucs
Identic:      2576 ( 99%) nucs =>      2416 (100%)       160 ( 94%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162714884,162717306] EXCISED REGION [162723559,162723725]
 second seq =>  [        1,     2421] EXCISED REGION [     2430,     2596]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6252 nucs [162717307,162723558]
 second seq =>         8 nucs [2422,2429]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [162717304,162717306] to [162723556,162723558]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         0 nucs
 second seq =>         0 nucs
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [162717307,162717308] to [162723557,162723558]
 second seq =>         0 nucs

162714884 AGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATAAAATCAATTTTTTGTTTGCC 162714943
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 AGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATAAAATCAATTTTTTGTTTGCC 60

162714944 AAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATTTTAGCTTTTTTGTTTTATTT 162715003
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATTTTAGCTTTTTTGTTTTATTT 120

162715004 TGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTGTATGCTGAACACAGATATTT 162715063
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTGTATGCTGAACACAGATATTT 180

162715064 TAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATCTGAGAAAACTTTTATAAGCA 162715123
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATCTGAGAAAACTTTTATAAGCA 240

162715124 TTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAGTGAACTGTTCTGTCACCCCC 162715183
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAGTGAACTGTTCTGTCACCCCC 300

162715184 ACATGATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCAAAAGGTATTTAAGTTGTTAC 162715243
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 ACATGATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCAAAAGGTATTTAAGTTGTTAC 360

162715244 AATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTTTCTTTTTTATTTTTTTATAT 162715303
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 AATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTTTCTTTTTTATTTTTTTATAT 420

162715304 TGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATCTGGAGAAGAGTCAGCAAATT 162715363
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATCTGGAGAAGAGTCAGCAAATT 480

162715364 CAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAGAAAACTTAGGTTCTACATAT 162715423
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAGAAAACTTAGGTTCTACATAT 540

162715424 TAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATCAAAAAGTTTGGGGAGTTGTA 162715483
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 TAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATCAAAAAGTTTGGGGAGTTGTA 600

162715484 ATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAAAATCTATGTAGCTAACTTGA 162715543
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 ATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAAAATCTATGTAGCTAACTTGA 660

162715544 GTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTCATTACATTTTATGTAATTGC 162715603
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTCATTACATTTTATGTAATTGC 720

162715604 TTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATGTCAGAAGTTTGAACCAGTGT 162715663
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATGTCAGAAGTTTGAACCAGTGT 780

162715664 TTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCATCCCGGGTCCACCATTTAGA 162715723
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCATCCCGGGTCCACCATTTAGA 840

162715724 ATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCCGAAAGTAGCTAGGGAAAAGAGCTGAATATTTTG 162715783
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCCCAAAGTAGCTAGGGAAAAGAGCTGAATATTTTG 900

162715784 CAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGAGTGCTCACAAAAATTGTAAC 162715843
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 CAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGAGTGCTCACAAAAATTGTAAC 960

162715844 CCGGACATAAAGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGCAAAAAGAAACAAAAGTAAAT 162715903
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CCGGACATAAAGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGCAAAAAGAAACAAAAGTAAAT 1020

162715904 TCACCAGAAAAGACATGCCTCATAGAATGCAAATTCTGTAGAAACTAGAGCACTCAAACC 162715963
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TCACCAGAAAAGACATGCCTCATGGAATGCAAATTCTGTAGAAACTAGAGCACTCAAACC 1080

162715964 AAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGGGAAGATAAAATAATCTTTTA 162716023
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
     1081 AAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGGAAAGATAAAATAATCTTTTA 1140

162716024 TTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGCCTTATAATCAAAACAAATCC 162716083
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 TTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGCCTTATAATCAAAACAAATCC 1200

162716084 TGAACAAAGTTTAAAAAACCTTCTAACAAAAAGAAGTCTTTCCCTGAGAAAAGATTCACC 162716143
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TGAACAAAGTTTAAAAAAACTTCTAACAAAAAGAAGTCTTTCCCTGAGAAAAGATTCACC 1260

162716144 AGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAGGGCTCATGTGGGTACTGCAC 162716203
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 AGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAGGGCTCATGTGGGTACTGCAC 1320

162716204 CACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCTTGCTTCATGGCCTGCTTCTG 162716263
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCTTGCTTCATGGCCTGCTTCTG 1380

162716264 GACACTATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAGCTCTCTAAAATAAGATGAAA 162716323
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GACACTATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAGCTCTCTAAAATAAGATGAAA 1440

162716324 TATCATTTCATCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTCAATAGGAATATGTGTGTCAT 162716383
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TATCATTTCATCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTCAATAGGAATATGTGTGTCAT 1500

162716384 AGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAAAGATTTTTAACAAAACGATC 162716443
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAAAGATTTTTAACAAAACGATC 1560

162716444 AGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGATAGGGATCACTAATAAGTGTG 162716503
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1561 AGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGATAGGGATCATTAATAAGTGTG 1620

162716504 GTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATGTCTTTACAGGAGTATTTTTT 162716563
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 GTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATGTCTTTACAGGAGTATTTTTT 1680

162716564 GGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTTTGAAATCTTTTATGATAGCT 162716623
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTTTGAAATCTTTTATGATAGCT 1740

162716624 TTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTATTACCTTTACATATCAATAAA 162716683
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTATTACCTTTACATATCAATAAA 1800

162716684 AATTTTCATAGTACTCACACATGTTACCATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATGAAAAG 162716743
          ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 AATTTTCATAGTACTCACAC--GTTACCATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATGAAAAG 1858

162716744 TATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTGGTATTATTATTATATCTCTA 162716803
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 TATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTGGTATTATTATTATATCTCTA 1918

162716804 ATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCCATTTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAATATTAAAC 162716863
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCCATTTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAATATTAAAC 1978

162716864 TAAAATACATATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAATTAGCTCC 162716923
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TAAAATACATATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAATTAGCTCC 2038

162716924 TAATTCTTAATGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTT 162716983
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TAATTCTTAATGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTT 2098

162716984 TGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAA 162717043
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAA 2158

162717044 AATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGT 162717103
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 AATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGT 2218

162717104 TAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTT 162717163
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTT 2278

162717164 CTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTA 162717223
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 CTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTA 2338

162717224 ATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATT 162717283
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 ATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATT 2398

162717284 TTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 162717306
          |||||||||||||||||||||||
     2399 TTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 2421

EXCISED REGION

162723559 TGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCAGTAA 162723618
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2430 TGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGAGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCAGTAA 2489

162723619 ACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGAGAATTGAAC 162723678
          ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
     2490 ACTATCACAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGGGAATTGAAC 2549

162723679 AATGT----GAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGAC 162723725
          |        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2550 A----GTGAGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGAC 2596

Alignment time is 2.54518 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162707306,162733554] =>     26249 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2615] =>      2615 nucs 'mol-32-340e-130364_2615'

Score:        2491
Aligned:      2617        nucs
Identic:      2599 ( 99%) nucs =>      2429 (100%)       170 ( 94%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162714871,162717306] EXCISED REGION [162723555,162723731]
 second seq =>  [        1,     2434] EXCISED REGION [     2439,     2615]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6248 nucs [162717307,162723554]
 second seq =>         4 nucs [2435,2438]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162717305,162717308] to [162723553,162723556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [162717304,162717306] to [162723555,162723557]
 second seq =>         3 nucs [2432,2434] to [2439,2441]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [162717307,162717308] to [162723553,162723554]
 second seq =>         0 nucs

162714871 GCAGAATTGTATAAGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATAAAATCAA 162714930
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 GCAGAATTGTATAAGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATAAAATCAA 60

162714931 TTTTTTGTTTGCCAAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATTTTAGCTT 162714990
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TTTTTTGTTTGCCAAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATTTTAGCTT 120

162714991 TTTTGTTTTATTTTGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTGTATGCTG 162715050
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TTTTGTTTTATTTTGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTGTATGCTG 180

162715051 AACACAGATATTTTAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATCTGAGAAA 162715110
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AACACAGATATTTTAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATCTGAGAAA 240

162715111 ACTTTTATAAGCATTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAGTGAACTG 162715170
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 ACTTTTATAAGCATTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAGTGAACTG 300

162715171 TTCTGTCACCCCCACATGATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCAAAAGGTA 162715230
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TTCTGTCACCCCCACATGATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCAAAAGGTA 360

162715231 TTTAAGTTGTTACAATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTTTCTTTTT 162715290
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TTTAAGTTGTTACAATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTTTCTTTTT 420

162715291 TATTTTTTTATATTGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATCTGGAGAA 162715350
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TATTTTTTTATATTGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATCTGGAGAA 480

162715351 GAGTCAGCAAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAGAAAACTT 162715410
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 GAGTCAGCAAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAGAAAACTT 540

162715411 AGGTTCTACATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATCAAAAAGT 162715470
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGGTTCTACATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATCAAAAAGT 600

162715471 TTGGGGAGTTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAAAATCTAT 162715530
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 TTGGGGAGTTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAAAATCTAT 660

162715531 GTAGCTAACTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTCATTACAT 162715590
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GTAGCTAACTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTCATTACAT 720

162715591 TTTATGTAATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATGTCAGAAG 162715650
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTTATGTAATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATGTCAGAAG 780

162715651 TTTGAACCAGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCATCCCGGG 162715710
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TTTGAACCAGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCATCCCGGG 840

162715711 TCCACCATTTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCCGAAAGTAGCTAGGGAAAAGA 162715770
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
      841 TCCACCATTTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCCCAAAGTAGCTAGGGAAAAGA 900

162715771 GCTGAATATTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGAGTGCTCA 162715830
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 GCTGAATATTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGAGTGCTCA 960

162715831 CAAAAATTGTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGCAAAAAGA 162715890
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 CAAAAATTGTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGCAAAAAGA 1020

162715891 AACAAAAGTAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATAGAATGCAAATTCTGTAGAAACTA 162715950
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
     1021 AACAAAAGTAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATGGAATGCAAATTCTGTAGAAACTA 1080

162715951 GAGCACTCAAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGGGAAGATA 162716010
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1081 GAGCACTCAAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGGAAAGATA 1140

162716011 AAATAATCTTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGCCTTATAA 162716070
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AAATAATCTTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGCCTTATAA 1200

162716071 TCAAAACAAATCCTGAACAAAGTTTAAAAAACCTTCTAACAAAAAGAAGTCTTTCCCTGA 162716130
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1201 TCAAAACAAATCCTGAACAAAGTTTAAAAAAACTTCTAACAAAAAGAAGTCTTTCCCTGA 1260

162716131 GAAAAGATTCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAGGGCTCAT 162716190
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GAAAAGATTCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAGGGCTCAT 1320

162716191 GTGGGTACTGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCTTGCTTCA 162716250
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GTGGGTACTGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCTTGCTTCA 1380

162716251 TGGCCTGCTTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAGCTCTCTA 162716310
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TGGCCTGCTTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAGCTCTCTA 1440

162716311 AAATAAGATGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTCAATAGGA 162716370
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 AAATAAGATGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTCAATAGGA 1500

162716371 ATATGTGTGTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAAAGATTTT 162716430
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 ATATGTGTGTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAAAGATTTT 1560

162716431 TAACAAAACGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGATAGGGATC 162716490
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TAACAAAACGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGATAGGGATC 1620

162716491 ACTAATAAGTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATGTCTTTAC 162716550
          |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 ATTAATAAGTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATGTCTTTAC 1680

162716551 AGGAGTATTTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTTTGAAATC 162716610
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 AGGAGTATTTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTTTGAAATC 1740

162716611 TTTTATGATAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTATTACCTTT 162716670
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TTTTATGATAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTATTACCTTT 1800

162716671 ACATATCAATAAAAATTTTCATAGTACTCACACATGTTACCATTTTTAAAGTTTGAAAAA 162716730
          |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||
     1801 ACATATCAATAAAAATTTTCATAGTACTCACAC--GTTACCATTTTTAAAGTTTGAAAAA 1858

162716731 GTCACATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTGGTATTAT 162716790
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1859 GTCACATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTGGTATTAT 1918

162716791 TATTATATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCCATTTTGTTCCAGTATAATTAAT 162716850
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 TATTATATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCCATTTTGTTCCAGTATAATTAAT 1978

162716851 AAGAATATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATTTTTTTTA 162716910
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 AAGAATATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATTTTTTTTA 2038

162716911 CAAAATTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTTACTTCAG 162716970
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 CAAAATTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTTACTTCAG 2098

162716971 TAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAAAGCACAG 162717030
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAAAGCACAG 2158

162717031 ATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAACATGTAAA 162717090
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 ATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAACATGTAAA 2218

162717091 AAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAAAAATGTA 162717150
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 AAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAAAAATGTA 2278

162717151 TTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCATGCTGAT 162717210
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 TTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCATGCTGAT 2338

162717211 TGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAATCTTCCA 162717270
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAATCTTCCA 2398

162717271 ACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 162717306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 2434

EXCISED REGION

162723555 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 162723614
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2439 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGAGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 2498

162723615 GTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGAGAATT 162723674
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2499 GTAAACTATCACAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGGGAATT 2558

162723675 GAACAATGT----GAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 162723730
          |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2559 GAACA----GTGAGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 2614

162723731 T 162723731
          |
     2615 T 2615

Alignment time is 2.59584 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162707306,162733554] =>     26249 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3768] =>      3768 nucs 'mol-32-349d-180022_3768'

Score:        3493
Aligned:      3770        nucs
Identic:      3735 ( 99%) nucs =>      2867 (100%)       868 ( 97%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162714429,162717306] EXCISED REGION [162723555,162724437]
 second seq =>  [        1,     2876] EXCISED REGION [     2881,     3768]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6248 nucs [162717307,162723554]
 second seq =>         4 nucs [2877,2880]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162717305,162717308] to [162723553,162723556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [162717304,162717306] to [162723555,162723557]
 second seq =>         3 nucs [2874,2876] to [2881,2883]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [162717307,162717308] to [162723553,162723554]
 second seq =>         0 nucs

162714429 AATATATATTTTTATATGAGCATTTATTTACCTAAGCAAATCTGAATCAAATTTCTTACT 162714488
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
        1 AATATATATTTTTATATGAGCATTTATTTACCTAAGCAAATCTGAATCAAATTTCTTAAT 60

162714489 TATTTCTGACTGACTATACCAGATTTTACCCTGTGGACACAATATACAACATAATACATG 162714548
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 TATTTCTGACTGACTATACCAGATTTTACCCTGTGGACACAATATACAACATAATACATG 120

162714549 CAAATATGTGTAAGCATGGCTAAATTCATATGTACAAAAAAATCTTATAGCTTTCATTTT 162714608
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 CAAATATGTGTAAGCATGGCTAAATTCATATGTACAAAAAAATCTTATAGCTTTCATTTT 180

162714609 AGGTTTTTAGTCATGAGATAGTAGCACAAACATAATGGTTTATAAAAAATAGGTGAATCC 162714668
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AGGTTTTTAGTCATGAGATAGTAGCGCAAACATAATGGTTTATAAAAAATAGGTGAATCC 240

162714669 AAATTACAATTCTGACTAAACGAGACATCTGTTCATATGGTTAATTTTTTTTCTTTTTTG 162714728
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AAATTACAATTCTGACTAAACGAGACATCTGTTCATATGGTTAATTTTTTTTCTTTTTTG 300

162714729 CCCTGATTGGTAATCTGATGAAGGCTGTAGATTAAAGTTTTGGGTAAAGCAGTTTGGCTT 162714788
          |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 CCCTGATAGGTAATCTGATGAAGGCTGTAGATTAAAGTTTTGGGTAAAGCAGTTTGGCTT 360

162714789 AAAAATCTCCTTCTCATTTTTTCCTCCTTTTTTAGTTTCAAATGAGTTTAAATTTTCATT 162714848
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
      361 AAAAATCTCCTTCTCATTTTTTCCTCCTTTTTTAGTTTCAAATGAGTTTAAATTTTCAAT 420

162714849 TTTGACATTTTAGCTAGGACTGGCAGAATTGTATAAGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACC 162714908
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 TTTGACATTTTAGCTAGGACTGGCAGAATTGTATAAGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACC 480

162714909 CTTGAACTAGCAATAAAATCAATTTTTTGTTTGCCAAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGC 162714968
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 CTTGAACTAGCAATAAAATCAATTTTTTGTTTGCCAAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGC 540

162714969 AGTCAGGAAAGCATTTTAGCTTTTTTGTTTTATTTTGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAG 162715028
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGTCAGGAAAGCATTTTAGCTTTTTTGTTTTATTTTGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAG 600

162715029 AAAAACCAAAAGTTGTATGCTGAACACAGATATTTTAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATT 162715088
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 AAAAACCAAAAGTTGTATGCTGAACACAGATATTTTAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATT 660

162715089 TTTACCGGTTTTATCTGAGAAAACTTTTATAAGCATTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGA 162715148
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 TTTACCGGTTTTATCTGAGAAAACTTTTATAAGCATTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGA 720

162715149 CTATTAACATTTCAGTGAACTGTTCTGTCACCCCCACATGATTATTAGCCAGGAAAACCT 162715208
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 CTATTAACATTTCAGTGAACTGTTCTGTCACCCCCACATGATTATTAGCCAGGAAAACCT 780

162715209 AAATGTACCTTTCCAAAAGGTATTTAAGTTGTTACAATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAA 162715268
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 AAATGTACCTTTCCAAAAGGTATTTAAGTTGTTACAATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAA 840

162715269 ATGCCTCAAAAACTTTCTTTTTTATTTTTTTATATTGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAG 162715328
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ATGCCTCAAAAACTTTCTTTTTTATTTTTTTATATTGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAG 900

162715329 TTTTATCTCAACATCTGGAGAAGAGTCAGCAAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAAC 162715388
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 TTTTATCTCAACATCTGGAGAAGAGTCAGCAAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAAC 960

162715389 AACAACAAAAAAGAGAAAACTTAGGTTCTACATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAAT 162715448
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 AACAACAAAAAAGAGAAAACTTAGGTTCTACATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAAT 1020

162715449 TGGATAGCAAGAATCAAAAAGTTTGGGGAGTTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAA 162715508
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TGGATAGCAAGAATCAAAAAGTTTGGGGAGTTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAA 1080

162715509 AATGTGCACAAGAAAAATCTATGTAGCTAACTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTA 162715568
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AATGTGCACAAGAAAAATCTATGTAGCTAACTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTA 1140

162715569 ATGTTTGAAATTCTCATTACATTTTATGTAATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAA 162715628
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 ATGTTTGAAATTCTCATTACATTTTATGTAATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAA 1200

162715629 CTCTGTCACTGAATGTCAGAAGTTTGAACCAGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTG 162715688
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 CTCTGTCACTGAATGTCAGAAGTTTGAACCAGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTG 1260

162715689 GCTTTTAAGGAGCCATCCCGGGTCCACCATTTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTC 162715748
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 GCTTTTAAGGAGCCATCCCGGGTCCACCATTTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTC 1320

162715749 CCGAAAGTAGCTAGGGAAAAGAGCTGAATATTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAAT 162715808
          ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 CCCAAAGTAGCTAGGGAAAAGAGCTGAATATTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAAT 1380

162715809 GAAACCAAAATCAGAGTGCTCACAAAAATTGTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATA 162715868
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 GAAACCAAAATCAGAGTGCTCACAAAAATTGTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATA 1440

162715869 TTAAATTAGGCATGCAAAAAGAAACAAAAGTAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATAG 162715928
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
     1441 TTAAATTAGGCATGCAAAAAGAAACAAAAGTAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATGG 1500

162715929 AATGCAAATTCTGTAGAAACTAGAGCACTCAAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAG 162715988
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AATGCAAATTCTGTAGAAACTAGAGCACTCAAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAG 1560

162715989 AAAGAACTTTCCAGGGAAGATAAAATAATCTTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCC 162716048
          |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 AAAGAACTTTCCAGGAAAGATAAAATAATCTTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCC 1620

162716049 TTTATTAAAGGTAGCCTTATAATCAAAACAAATCCTGAACAAAGTTTAAAAAACCTTCTA 162716108
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
     1621 TTTATTAAAGGTAGCCTTATAATCAAAACAAATCCTGAACAAAGTTTAAAAAAACTTCTA 1680

162716109 ACAAAAAGAAGTCTTTCCCTGAGAAAAGATTCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAA 162716168
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 ACAAAAAGAAGTCTTTCCCTGAGAAAAGATTCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAA 1740

162716169 GTGGAGAGCTGTAAGGGCTCATGTGGGTACTGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTC 162716228
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 GTGGAGAGCTGTAAGGGCTCATGTGGGTACTGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTC 1800

162716229 TTCTGAATGTGATCTTGCTTCATGGCCTGCTTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATA 162716288
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TTCTGAATGTGATCTTGCTTCATGGCCTGCTTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATA 1860

162716289 ACAAAAAGAAAGAAGCTCTCTAAAATAAGATGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTG 162716348
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 ACAAAAAGAAAGAAGCTCTCTAAAATAAGATGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTG 1920

162716349 GGGATAGGGCATTTCAATAGGAATATGTGTGTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAA 162716408
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGGATAGGGCATTTCAATAGGAATATGTGTGTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAA 1980

162716409 GGTAAAGGAAGACAAAGATTTTTAACAAAACGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATA 162716468
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GGTAAAGGAAGACAAAGATTTTTAACAAAACGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATA 2040

162716469 AAGAGCTTCAGTGATAGGGATCACTAATAAGTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCA 162716528
          |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2041 AAGAGCTTCAGTGATAGGGATCATTAATAAGTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCA 2100

162716529 GTTGTTGGGCAGATGTCTTTACAGGAGTATTTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGT 162716588
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2101 GTTGTTGGGCAGATGTCTTTACAGGAGTATTTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGT 2160

162716589 GCAAGGTGCAGTTTTTGAAATCTTTTATGATAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGA 162716648
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2161 GCAAGGTGCAGTTTTTGAAATCTTTTATGATAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGA 2220

162716649 GAACTCTCTTTTTATTACCTTTACATATCAATAAAAATTTTCATAGTACTCACACATGTT 162716708
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
     2221 GAACTCTCTTTTTATTACCTTTACATATCAATAAAAATTTTCATAGTACTCACAC--GTT 2278

162716709 ACCATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTT 162716768
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 ACCATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTT 2338

162716769 CATTAGATATTTGTGGTATTATTATTATATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCC 162716828
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 CATTAGATATTTGTGGTATTATTATTATATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCC 2398

162716829 ATTTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAATATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTA 162716888
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 ATTTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAATATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTA 2458

162716889 TTTGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAATTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCA 162716948
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 TTTGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAATTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCA 2518

162716949 TGTGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGA 162717008
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TGTGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGA 2578

162717009 AGATGGATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATG 162717068
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2579 AGATGGATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATG 2638

162717069 GTCTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATT 162717128
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2639 GTCTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATT 2698

162717129 TTCTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATG 162717188
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2699 TTCTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATG 2758

162717189 TAGTCTATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAG 162717248
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2759 TAGTCTATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAG 2818

162717249 AAACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 162717306
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2819 AAACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 2876

EXCISED REGION

162723555 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 162723614
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2881 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGAGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 2940

162723615 GTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGAGAATT 162723674
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2941 GTAAACTATCACAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGGGAATT 3000

162723675 GAACAATGT----GAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 162723730
          |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3001 GAACA----GTGAGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 3056

162723731 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCACTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 162723790
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3057 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 3116

162723791 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGACACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 162723850
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3117 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 3176

162723851 TGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAT-----AATAAAATTAAAAAATTAAAA 162723905
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||
     3177 TGCGCATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATTAAAAAATTAAAA 3236

162723906 AAATATATGTTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGATACTCCCACATTCTCCCAAATC 162723965
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3237 AAATATATATTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGATACTCCCACATTCTCCCAAATC 3296

162723966 TGGAAGGTCAATGTTTATAGATGCATTTTAAAATACATCTATTATAGGAGTATAAAAACT 162724025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3297 TGGAAGGTCAATGTTTATAGATGCATTTTAAAATACATCTATTATAGGAGTATACAAACT 3356

162724026 TCTCCCAAAATAAATACTGACTTAAACTGACAACCAACAATTTCTTTTATTGTTTGTCTG 162724085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3357 TCTCCCAAAATAAATACTGACTTAAACTGACAACCAACAATTTCTTTTATTGTTTGTCTG 3416

162724086 TTGCTTGCTCTATGATGCTAGACAGTGCAAAGGCCATTATATGTATTTTGTTCTTTCATA 162724145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3417 TTGCTTGCTCTATGATGCTAGACAGTGCAAAGGCCATTATATGTATTTTGTTCTTTCATA 3476

162724146 TTTACAATGAGAGTAACATTTGGTTACATTTCATATATATTTTTAATAGTTTCTAAAAGT 162724205
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3477 TTTACAATGAGAGTAACATTTGGTTACATTTCATATATATTTTTAATAGTTTCTAAAAGT 3536

162724206 TATTTTTATAATAATATATTAGGTCTTGTGTTCAAATACGTGTGTGTATGTGTACAACAT 162724265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3537 TATTTTTATAATAATATATTAGGTCTTGTGTTCAAATATGTGTGTGTATGTGTACAACAT 3596

162724266 TAACAATGCACATTAATATTGATGATAAAGGAACTTCTTACTTTGTGCATGCAAAAAAGA 162724325
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3597 TAACAATGCACATTAATATTGATGATAAAAGAACTTCTTACTTTGTGCATGCAAAAAAGA 3656

162724326 TTAAGCCCTTATTTTATAATATTGCTTAAGACAATGTTGATGATACTGAGTAAAGTTTTC 162724385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3657 TTAAGCCCTTATTTTATAATATTGCTTAAGACAATGTTGATGATACTGTGTAAAGTTTTC 3716

162724386 ATGAGGTGAACATTGCTAAAATTTACAAAGGGTCTGGTGGTAGGAGTTATAT 162724437
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3717 ATGAGGTGAACATTGCTAAAATTTACAAAGGGTCTGGTGGTAGGAGTTATAT 3768

Alignment time is 4.6741 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162707306,162733554] =>     26249 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     2795] =>      2795 nucs 'mol-32-34a8-075738_2795'

Score:        2635
Aligned:      2794        nucs
Identic:      2773 ( 99%) nucs =>      2483 (100%)       290 ( 96%)
Gaps:           10 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162714816,162717306] EXCISED REGION [162723555,162723853]
 second seq =>  [        1,     2489] EXCISED REGION [     2494,     2792]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6248 nucs [162717307,162723554]
 second seq =>         4 nucs [2490,2493]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162717305,162717308] to [162723553,162723556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [162717304,162717306] to [162723555,162723557]
 second seq =>         3 nucs [2487,2489] to [2494,2496]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [162717307,162717308] to [162723553,162723554]
 second seq =>         0 nucs

162714816 TTTTTTAGTTTCAAATGAGTTTAAATTTTCATTTTTGACATTTTAGCTAGGACTGGCAGA 162714875
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTTAGTTTCAAATGAGTTTAAATTTTCAATTTTGACATTTTAGCTAGGACTGGCAGA 60

162714876 ATTGTATAAGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATAAAATCAATTTTT 162714935
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 ATTGTATAAGAAAAAACAAAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATAAAATCAATTTTT 120

162714936 TGTTTGCCAAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATTTTAGCTTTTTTG 162714995
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      121 TGTTTGCCAAAAAGTTGTTTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATTTTAGCTTTTTTG 180

162714996 TTTTATTTTGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTGTATGCTGAACAC 162715055
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 TTTTATTTTGTTTTTCTGTGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTGTATGCTGAACAC 240

162715056 AGATATTTTAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATCTGAGAAAACTTT 162715115
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 AGATATTTTAATTGTTGCTCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATCTGAGAAAACTTT 300

162715116 TATAAGCATTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAGTGAACTGTTCTG 162715175
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TATAAGCATTTCTTTAGTCATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAGTGAACTGTTCTG 360

162715176 TCACCCCCACATGATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCAAAAGGTATTTAA 162715235
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCACCCCCACATGATTATTAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCAAAAGGTATTTAA 420

162715236 GTTGTTACAATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTTTCTTTTTTATTT 162715295
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 GTTGTTACAATTTGGAAAGCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTTTCTTTTTTATTT 480

162715296 TTTTATATTGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATCTGGAGAAGAGTC 162715355
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TTTTATATTGGCTGGAATGCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATCTGGAGAAGAGTC 540

162715356 AGCAAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAGAAAACTTAGGTT 162715415
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 AGCAAATTCAAAGTAAGCAGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAGAAAACTTAGGTT 600

162715416 CTACATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATCAAAAAGTTTGGG 162715475
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 CTACATATTAATTTATAGTTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATCAAAAAGTTTGGG 660

162715476 GAGTTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAAAATCTATGTAGC 162715535
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 GAGTTGTAATCCCCAAGATGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAAAATCTATGTAGC 720

162715536 TAACTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTCATTACATTTTAT 162715595
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TAACTTGAGTCCCAGAGATCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTCATTACATTTTAT 780

162715596 GTAATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATGTCAGAAGTTTGA 162715655
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 GTAATTGCTTGAAAGCAAAGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATGTCAGAAGTTTGA 840

162715656 ACCAGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCATCCCGGGTCCAC 162715715
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 ACCAGTGTTTAGATGATGGCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCATCCCGGGTCCAC 900

162715716 CATTTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCCGAAAGTAGCTAGGGAAAAGAGCTGA 162715775
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
      901 CATTTAGAATACTTATTTTTGCTCTTAGATTTCCCCAAAGTAGCTAGGGAAAAGAGCTGA 960

162715776 ATATTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGAGTGCTCACAAAA 162715835
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 ATATTTTGCAGATGCATGCAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGAGTGCTCACAAAA 1020

162715836 ATTGTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGCAAAAAGAAACAA 162715895
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 ATTGTAACCCGGACATAAAGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGCAAAAAGAAACAA 1080

162715896 AAGTAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATAGAATGCAAATTCTGTAGAAACTAGAGCA 162715955
          |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
     1081 AAGTAAATTCACCAGAAAAGACATGCCTCATGGAATGCAAATTCTGTAGAAACTAGAGCA 1140

162715956 CTCAAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGGGAAGATAAAATA 162716015
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     1141 CTCAAACCAAAAGGACACTTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGGAAAGATAAAATA 1200

162716016 ATCTTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGCCTTATAATCAAA 162716075
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 ATCTTTTATTATCTTAGGAGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGCCTTATAATCAAA 1260

162716076 ACAAATCCTGAACAAAGTTTAAAAAACCTTCTAACAAAAAGAAGTCTTTCCCTGAGAAAA 162716135
          ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
     1261 ACAAATCCTGAACAAAGTTTAAAAAAACTTCTAACAAAAAGAAGTCTTTCCCTGAGAAAA 1320

162716136 GATTCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAGGGCTCATGTGGG 162716195
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 GATTCACCAGGGCAGAAAGGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAGGGCTCATGTGGG 1380

162716196 TACTGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCTTGCTTCATGGCC 162716255
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TACTGCACCACAGCCCCAGTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCTTGCTTCATGGCC 1440

162716256 TGCTTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAGCTCTCTAAAATA 162716315
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 TGCTTCTGGACACTATGTGTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAGCTCTCTAAAATA 1500

162716316 AGATGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTCAATAGGAATATG 162716375
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 AGATGAAATATCATTTCATCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTCAATAGGAATATG 1560

162716376 TGTGTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAAAGATTTTTAACA 162716435
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 TGTGTCATAGTAAACTACGTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAAAGATTTTTAACA 1620

162716436 AAACGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGATAGGGATCACTAA 162716495
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
     1621 AAACGATCAGGAGGATAACAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGATAGGGATCATTAA 1680

162716496 TAAGTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATGTCTTTACAGGAG 162716555
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 TAAGTGTGGTGCCAATCTGAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATGTCTTTACAGGAG 1740

162716556 TATTTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTTTGAAATCTTTTA 162716615
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1741 TATTTTTTGGTGTAAGGCTGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTTTGAAATCTTTTA 1800

162716616 TGATAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTATTACCTTTACATA 162716675
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 TGATAGCTTTTGTTATCAGGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTATTACCTTTACATA 1860

162716676 TCAATAAAAATTTTCATAGTACTCACACATGTTACCATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCAC 162716735
          ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TCAATAAAAATTTTCATAGTACTCACAC--GTTACCATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCAC 1918

162716736 ATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTGGTATTATTATTA 162716795
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1919 ATGAAAAGTATCAAAACATTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTGGTATTATTATTA 1978

162716796 TATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCCATTTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAA 162716855
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1979 TATCTCTAATTTTTAAATTTACTTTCTTCTCCCATTTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAA 2038

162716856 TATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAA 162716915
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TATTAAACTAAAATACATATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAA 2098

162716916 TTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGT 162716975
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTAGCTCCTAATTCTTAATGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGT 2158

162716976 TTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAAAGCACAGATACA 162717035
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 TTTCCTTTTGTGATCTTTAACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAAAGCACAGATACA 2218

162717036 TAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGA 162717095
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TAGAGAAAAATATAATTAATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGA 2278

162717096 AATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTT 162717155
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 AATGAGGTTAAGCTTAATCCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTT 2338

162717156 TTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCATGCTGATTGTAT 162717215
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 TTAATGTTCTTCTTTCTTGTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCATGCTGATTGTAT 2398

162717216 TGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATT 162717275
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 TGAATTTAATGTGCATCATAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATT 2458

162717276 CAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 162717306
          |||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 CAGCCATTTTCAGTTTTTACTGTTTAAGAAA 2489

EXCISED REGION

162723555 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 162723614
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2494 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGAGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 2553

162723615 GTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGAGAATT 162723674
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2554 GTAAACTATCACAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGGGAATT 2613

162723675 GAACAATGT----GAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 162723730
          |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2614 GAACA----GTGAGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 2669

162723731 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCACTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 162723790
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2670 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 2729

162723791 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGACACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 162723850
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2730 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 2789

162723851 TGC 162723853
          |||
     2790 TGC 2792

Alignment time is 3.82782 s


MATCH = 1, MISMATCH = -10, GAP OPEN = -10, GAP EXTEND = -1, INDEL

First  seq [162707306,162733554] =>     26249 nucs '3 dna:chromosome chromosome:GRCh37:3:1:198022430:1'
Second seq [        1,     3660] =>      3660 nucs 'mol-32-34a8-178360_3660'

Score:        3385
Aligned:      3662        nucs
Identic:      3627 ( 99%) nucs =>      2583 (100%)      1044 ( 98%)
Gaps:           15 (  0%) nucs

Alignment:
 first  seq =>  [162714714,162717306] EXCISED REGION [162723555,162724614]
 second seq =>  [        1,     2591] EXCISED REGION [     2596,     3660]

EXCISED REGION(S):
 first  seq =>      6248 nucs [162717307,162723554]
 second seq =>         4 nucs [2592,2595]

Identity at breakpoints: 
 first  seq =>         4 nucs [162717305,162717308] to [162723553,162723556]
 second seq =>         0 nucs
Identity outside breakpoints: 
 first  seq =>         3 nucs [162717304,162717306] to [162723555,162723557]
 second seq =>         3 nucs [2589,2591] to [2596,2598]
Identity inside breakpoints: 
 first  seq =>         2 nucs [162717307,162717308] to [162723553,162723554]
 second seq =>         0 nucs

162714714 TTTTTTTCTTTTTTGCCCTGATTGGTAATCTGATGAAGGCTGTAGATTAAAGTTTTGGGT 162714773
          ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
        1 TTTTTTTCTTTTTTGCCCTGATAGGTAATCTGATGAAGGCTGTAGATTAAAGTTTTGGGT 60

162714774 AAAGCAGTTTGGCTTAAAAATCTCCTTCTCATTTTTTCCTCCTTTTTTAGTTTCAAATGA 162714833
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
       61 AAAGCAGTTTGGCTTAAAAATCTCCTTCTCATTTTTTCCTCCTTTTTTAGTTTCAAATGA 120

162714834 GTTTAAATTTTCATTTTTGACATTTTAGCTAGGACTGGCAGAATTGTATAAGAAAAAACA 162714893
          |||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
      121 GTTTAAATTTTCAATTTTGACATTTTAGCCAGGACTGGCAGAATTGTATAAGAAAAAACA 180

162714894 AAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATAAAATCAATTTTTTGTTTGCCAAAAAGTTGT 162714953
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      181 AAATCTCCAAGTACCCTTGAACTAGCAATAAAATCAATTTTTTGTTTGCCAAAAAGTTGT 240

162714954 TTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATTTTAGCTTTTTTGTTTTATTTTGTTTTTCTG 162715013
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      241 TTGACTAGTCAATGCAGTCAGGAAAGCATTTTAGCTTTTTTGTTTTATTTTGTTTTTCTG 300

162715014 TGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTGTATGCTGAACACAGATATTTTAATTGTTGC 162715073
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      301 TGACTTGCATGACAGAAAAACCAAAAGTTGTATGCTGAACACAGATATTTTAATTGTTGC 360

162715074 TCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATCTGAGAAAACTTTTATAAGCATTTCTTTAGT 162715133
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      361 TCTGGGCTTAAGATTTTTACCGGTTTTATCTGAGAAAACTTTTATAAGCATTTCTTTAGT 420

162715134 CATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAGTGAACTGTTCTGTCACCCCCACATGATTAT 162715193
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      421 CATTTTTATTTTAGACTATTAACATTTCAGTGAACTGTTCTGTCACCCCCACATGATTAT 480

162715194 TAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCAAAAGGTATTTAAGTTGTTACAATTTGGAAA 162715253
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      481 TAGCCAGGAAAACCTAAATGTACCTTTCCAAAAGGTATTTAAGTTGTTACAATTTGGAAA 540

162715254 GCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTTTCTTTTTTATTTTTTTATATTGGCTGGAAT 162715313
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      541 GCCATTGATTTGAAAATGCCTCAAAAACTTTCTTTTTTATTTTTTTATATTGGCTGGAAT 600

162715314 GCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATCTGGAGAAGAGTCAGCAAATTCAAAGTAAGC 162715373
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      601 GCCATGAGCAGTAAGTTTTATCTCAACATCTGGAGAAGAGTCAGCAAATTCAAAGTAAGC 660

162715374 AGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAGAAAACTTAGGTTCTACATATTAATTTATAG 162715433
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      661 AGATAAATCAACAACAACAACAAAAAAGAGAAAACTTAGGTTCTACATATTAATTTATAG 720

162715434 TTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATCAAAAAGTTTGGGGAGTTGTAATCCCCAAGA 162715493
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      721 TTGTAGTCTCTTAATTGGATAGCAAGAATCAAAAAGTTTGGGGAGTTGTAATCCCCAAGA 780

162715494 TGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAAAATCTATGTAGCTAACTTGAGTCCCAGAGA 162715553
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      781 TGGTCATTGACCCAAAATGTGCACAAGAAAAATCTATGTAGCTAACTTGAGTCCCAGAGA 840

162715554 TCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTCATTACATTTTATGTAATTGCTTGAAAGCAA 162715613
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      841 TCTCGGCAGATCTTAATGTTTGAAATTCTCATTACATTTTATGTAATTGCTTGAAAGCAA 900

162715614 AGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATGTCAGAAGTTTGAACCAGTGTTTAGATGATG 162715673
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      901 AGAAAATTATATAAACTCTGTCACTGAATGTCAGAAGTTTGAACCAGTGTTTAGATGATG 960

162715674 GCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCATCCCGGGTCCACCATTTAGAATACTTATTT 162715733
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
      961 GCAACTGTCCTAGTGGCTTTTAAGGAGCCATCCCGGGTCCACCATTTAGAATACTTATTT 1020

162715734 TTGCTCTTAGATTTCCCGAAAGTAGCTAGGGAAAAGAGCTGAATATTTTGCAGATGCATG 162715793
          |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1021 TTGCTCTTAGATTTCCCCAAAGTAGCTAGGGAAAAGAGCTGAATATTTTGCAGATGCATG 1080

162715794 CAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGAGTGCTCACAAAAATTGTAACCCGGACATAA 162715853
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1081 CAATCAAATCAAAATGAAACCAAAATCAGAGTGCTCACAAAAATTGTAACCCGGACATAA 1140

162715854 AGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGCAAAAAGAAACAAAAGTAAATTCACCAGAAA 162715913
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1141 AGATCAAACAAAATATTAAATTAGGCATGCAAAAAGAAACAAAAGTAAATTCACCAGAAA 1200

162715914 AGACATGCCTCATAGAATGCAAATTCTGTAGAAACTAGAGCACTCAAACCAAAAGGACAC 162715973
          |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1201 AGACATGCCTCATGGAATGCAAATTCTGTAGAAACTAGAGCACTCAAACCAAAAGGACAC 1260

162715974 TTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGGGAAGATAAAATAATCTTTTATTATCTTAGG 162716033
          ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
     1261 TTGTGTTTACATAAGAAAGAACTTTCCAGGAAAGATAAAATAATCTTTTATTATCTTAGG 1320

162716034 AGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGCCTTATAATCAAAACAAATCCTGAACAAAGT 162716093
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1321 AGGAATGTAAGGTCCTTTATTAAAGGTAGCCTTATAATCAAAACAAATCCTGAACAAAGT 1380

162716094 TTAAAAAACCTTCTAACAAAAAGAAGTCTTTCCCTGAGAAAAGATTCACCAGGGCAGAAA 162716153
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1381 TTAAAAAAACTTCTAACAAAAAGAAGTCTTTCCCTGAGAAAAGATTCACCAGGGCAGAAA 1440

162716154 GGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAGGGCTCATGTGGGTACTGCACCACAGCCCCA 162716213
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1441 GGGCAATCTGTGGAAGTGGAGAGCTGTAAGGGCTCATGTGGGTACTGCACCACAGCCCCA 1500

162716214 GTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCTTGCTTCATGGCCTGCTTCTGGACACTATGT 162716273
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1501 GTAATTGCTGATTTCTTCTGAATGTGATCTTGCTTCATGGCCTGCTTCTGGACACTATGT 1560

162716274 GTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAGCTCTCTAAAATAAGATGAAATATCATTTCA 162716333
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1561 GTGTCAATCTAAATAACAAAAAGAAAGAAGCTCTCTAAAATAAGATGAAATATCATTTCA 1620

162716334 TCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTCAATAGGAATATGTGTGTCATAGTAAACTAC 162716393
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1621 TCTTATATTTATTTGGGGATAGGGCATTTCAATAGGAATATGTGTGTCATAGTAAACTAC 1680

162716394 GTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAAAGATTTTTAACAAAACGATCAGGAGGATAA 162716453
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1681 GTGCATAATCAGGAAGGTAAAGGAAGACAAAGATTTTTAACAAAACGATCAGGAGGATAA 1740

162716454 CAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGATAGGGATCACTAATAAGTGTGGTGCCAATCT 162716513
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     1741 CAATTGTTTTAGATAAAGAGCTTCAGTGATAGGGATCATTAATAAGTGTGGTGCCAATCT 1800

162716514 GAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATGTCTTTACAGGAGTATTTTTTGGTGTAAGGC 162716573
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1801 GAGGTTGGACTGGCAGTTGTTGGGCAGATGTCTTTACAGGAGTATTTTTTGGTGTAAGGC 1860

162716574 TGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTTTGAAATCTTTTATGATAGCTTTTGTTATCA 162716633
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1861 TGTGATGGCTTTTGTGCAAGGTGCAGTTTTTGAAATCTTTTATGATAGCTTTTGTTATCA 1920

162716634 GGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTATTACCTTTACATATCAATAAAAATTTTCATA 162716693
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1921 GGTATTTGTGCATGAGAACTCTCTTTTTATTACCTTTACATATCAATAAAAATTTTCATA 1980

162716694 GTACTCACACATGTTACCATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATGAAAAGTATCAAAACA 162716753
          ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     1981 GTACTCACAC--GTTACCATTTTTAAAGTTTGAAAAAGTCACATGAAAAGTATCAAAACA 2038

162716754 TTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTGGTATTATTATTATATCTCTAATTTTTAAAT 162716813
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2039 TTTCTCAGGATTTTTCATTAGATATTTGTGGTATTATTATTATATCTCTAATTTTTAAAT 2098

162716814 TTACTTTCTTCTCCCATTTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAATATTAAACTAAAATACAT 162716873
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2099 TTACTTTCTTCTCCCATTTTGTTCCAGTATAATTAATAAGAATATTAAACTAAAATACAT 2158

162716874 ATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAATTAGCTCCTAATTCTTAA 162716933
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2159 ATATTTTATGTTTTATTTGTAAAATGTATTTTTTTTACAAAATTAGCTCCTAATTCTTAA 2218

162716934 TGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTT 162716993
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2219 TGAAATATAAATGCATGTGTATTTCCTTTTACTTCAGTAGGTTTTCCTTTTGTGATCTTT 2278

162716994 AACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTA 162717053
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2279 AACTAAACTGTGAGAAGATGGATATAAAAAAGCACAGATACATAGAGAAAAATATAATTA 2338

162717054 ATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAAT 162717113
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2339 ATTTTTTGCTTCATGGTCTTGTGATGTAACATGTAAAAAAGAAATGAGGTTAAGCTTAAT 2398

162717114 CCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTT 162717173
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2399 CCTGAAAATTTTATTTTCTCTTTTCTTCAAAAATGTATTGTTTTAATGTTCTTCTTTCTT 2458

162717174 GTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCA 162717233
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2459 GTCATTTTCAAGATGTAGTCTATTTGGTCATGCTGATTGTATTGAATTTAATGTGCATCA 2518

162717234 TAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTT 162717293
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2519 TAGTAAAAATGTCAGAAACTGTTAGCAGAATCTTCCAACATTCAGCCATTTTCAGTTTTT 2578

162717294 ACTGTTTAAGAAA 162717306
          |||||||||||||
     2579 ACTGTTTAAGAAA 2591

EXCISED REGION

162723555 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGGGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 162723614
          |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
     2596 AAAATGATGAGTTCATGTCCTTTGTAGAGACATGGATGAAATTGGAATTCATCATTCTCA 2655

162723615 GTAAACTATCGCAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGAGAATT 162723674
          ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     2656 GTAAACTATCACAAGAACAAAAAACCAAACACCGCTTATTCTCACTCATAGGTGGGAATT 2715

162723675 GAACAATGT----GAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 162723730
          |||||        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2716 GAACA----GTGAGAACACATGGACACAGGAAGGGGAACATCACACTCTGGGGACTGTTG 2771

162723731 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCACTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 162723790
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     2772 TGGGGTGGGGGAAGGGGGGAGGGATAGCATTGGGAGATATACCTAATGCTAAATGATGAG 2831

162723791 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGACACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 162723850
          |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2832 TTAATGGGTGCAGCACACCAGCATGGCACATATATACATATGTAACTGACCTGCACATTG 2891

162723851 TGCACATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAAT-----AATAAAATTAAAAAATTAAAA 162723905
          |||.||||||||||||||||||||||||||||||     |||||||||||||||||||||
     2892 TGCGCATGTACCCTAAAACTTAAAGTATAATAATAATAAAATAAAATTAAAAAATTAAAA 2951

162723906 AAATATATGTTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGATACTCCCACATTCTCCCAAATC 162723965
          ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     2952 AAATATATATTTGGCTGATATCAGTTCAGATTATTCGATACTCCCACATTCTCCCAAATC 3011

162723966 TGGAAGGTCAATGTTTATAGATGCATTTTAAAATACATCTATTATAGGAGTATAAAAACT 162724025
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
     3012 TGGAAGGTCAATGTTTATAGATGCATTTTAAAATACATCTATTATAGGAGTATACAAACT 3071

162724026 TCTCCCAAAATAAATACTGACTTAAACTGACAACCAACAATTTCTTTTATTGTTTGTCTG 162724085
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3072 TCTCCCAAAATAAATACTGACTTAAACTGACAACCAACAATTTCTTTTATTGTTTGTCTG 3131

162724086 TTGCTTGCTCTATGATGCTAGACAGTGCAAAGGCCATTATATGTATTTTGTTCTTTCATA 162724145
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3132 TTGCTTGCTCTATGATGCTAGACAGTGCAAAGGCCATTATATGTATTTTGTTCTTTCATA 3191

162724146 TTTACAATGAGAGTAACATTTGGTTACATTTCATATATATTTTTAATAGTTTCTAAAAGT 162724205
          ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3192 TTTACAATGAGAGTAACACTTGGTTACATTTCATATATATTTTTAATAGTTTCTAAAAGT 3251

162724206 TATTTTTATAATAATATATTAGGTCTTGTGTTCAAATACGTGTGTGTATGTGTACAACAT 162724265
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
     3252 TATTTTTATAATAATATATTAGGTCTTGTGTTCAAATATGTGTGTGTATGTGTACAACAT 3311

162724266 TAACAATGCACATTAATATTGATGATAAAGGAACTTCTTACTTTGTGCATGCAAAAAAGA 162724325
          |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
     3312 TAACAATGCACATTAATATTGATGATAAAAGAACTTCTTACTTTGTGCATGCAAAAAAGA 3371

162724326 TTAAGCCCTTATTTTATAATATTGCTTAAGACAATGTTGATGATACTGAGTAAAGTTTTC 162724385
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
     3372 TTAAGCCCTTATTTTATAATATTGCTTAAGACAATGTTGATGATACTGTGTAAAGTTTTC 3431

162724386 ATGAGGTGAACATTGCTAAAATTTACAAAGGGTCTGGTGGTAGGAGTTATATATTTTAAT 162724445
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3432 ATGAGGTGAACATTGCTAAAATTTACAAAGGGTCTGGTGGTAGGAGTTATATATTTTAAT 3491

162724446 CCAAAGCACCTTCTAACTAAAAACTGAAGTAATTGTACAACATCATTAAAATATACTTCC 162724505
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3492 CCAAAGCACCTTCTAACTAAAAACTGAAGTAATTGTACAACATCATTAAAATATACTTCC 3551

162724506 ACAGATTCTGAGAATCAAATAAAAATTATTTCTTTAATTTCATATCTTCAGTATTTGTAA 162724565
          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3552 ACAGATTCTGAGAATCAAATAAAAATTATTTCTTTAATTTCATATCTTCAGTATTTGTAA 3611

162724566 CATTACCCTACTCCATAATTAACATATCAATAAATTTCAAAGAAAACAT 162724614
          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
     3612 CATTACCCTACTCCATAATTAACATATCAATAAATTTCAAAGAAAACAT 3660

Alignment time is 3.45847 s

